context: Rotavirus A en animales silvestres y domésticos de zonas con degradación ambiental en la Amazonía brasileñahttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6298726/SHA: f3c309c596c20f48f493b77e714ce957d8777bcbAutores: de Barros, Bruno de Cássio Veloso; Chagas, Elaine Nunes; Bezerra, Luna Wanessa; Ribeiro, Laila Graziela; Duarte Júnior, Jose Wandilson Barboza; Pereira, Diego; da Penha Junior, Edvaldo Tavares; Silva, Julia Rezende; Bezerra, Delana Andreza Melo; Bandeira, Renato Silva; Pinheiro, Helder Henrique Costa; Guerra, Sylvia de Fátima dos Santos Los animales domésticos y principalmente silvestres como murciélagos, pequeños roedores y aves son animales altamente diversificados en relación a sus hábitats y nichos ecológicos y están ampliamente distribuidos geográficamente en ambientes de fragmentación forestal en algunas zonas de la Amazonía, siendo consideradas fuentes importantes de virus que afectan a los seres humanos y otros animales. Debido a las actividades antrópicas, estos animales cambiaron su hábitat natural y se adaptaron a entornos urbanizados, representando así riesgos para la salud humana y animal. Aunque el conocimiento de la diversidad global de virus entéricos es escaso, existen informes que demuestran la detección de rotavirus en animales domésticos y animales de sistemas productivos, como bovinos y cerdos. El presente estudio investigó la prevalencia del Rotavirus A en 648 muestras fecales de diferentes especies animales de la mesoregión noreste del estado de Pará, Brasil, que se caracteriza por ser un área urbanizada con fragmentos forestales. Los especímenes fecales fueron recolectados de octubre de 2014 a abril de 2016 y sometidos a una Reacción en Cadena de Polimerasa en Tiempo Real Cualitativa (RT-qPCR), utilizando el gen NSP3 como objetivo. Se observó que el 27,5% (178/648) de las muestras presentaron resultados positivos para la VRA, con 178 muestras distribuidas en aves (23,6%), caninos (21,35%), quiropteros (17,98%), bovinos (14,6%), caballos (8,43%), pequeños roedores (6,74%), cerdos (3,93%) y felinos (3,37%), demostrando la circulación de la VRA en animales domésticos y sugiriendo que tal proximidad podría causar transmisiones entre diferentes especies y la ocurrencia de reordenamientos en el genoma de la VRA ya descrito en la literatura, asociados a las trazas de degradación ambiental en las áreas estudiadas. Texto: Las enfermedades infecciosas emergentes y reemergentes están aumentando cada año en varios países, con un impacto tanto en las poblaciones humanas como en los animales domésticos y silvestres que viven en áreas con restos forestales considerables [1]. La mayoría de estas enfermedades son de origen viral, lo que sugiere la aparición y reaparición de virus que son desencadenados por actividades humanas que modifican el medio ambiente [2]. Las poblaciones de animales silvestres que habitan fragmentos forestales son grupos estratégicos para estudios de salud pública y transmisión de zoonosis, dado que actúan como indicadores en la asistencia e intervención en las poblaciones humanas, con el objetivo de prevenir brotes y epidemias [3]. La gastroenteritis aguda puede ser causada por infección en el tracto gastrointestinal, causada por diferentes agentes infecciosos o parásitos [4] [5] [6] [7]. Representan una de las principales causas de mortalidad en humanos y en animales jóvenes, contando con alrededor del 25% de mortalidad [8]. El rotavirus se distribuye ampliamente en los animales, que actúan como fuentes de cepas emergentes del rotavirus, con estos animales actuando en la transmisión entre especies y por medio del reasociamiento que conduce a la aparición de nuevas cepas que han sido reportadas en infecciones humanas [9] [10] [11] [12]. El rotavirus (RV) pertenece a la familia Reoviridae y comprende nueve especies conocidas como Rotavirus grupo A a I, con una propuesta reciente de la especie J [13, 14]. El rotavirus A (RVA) está muy extendido en todo el mundo y afecta predominantemente a seres humanos, bovinos y otras especies de mamíferos, así como a aves [15]. Tienen un genoma de ácido ribonucleico de doble cadena (dsRNA), dividido en 11 segmentos de codificación para proteínas estructurales (VP1-VP4, VP6 y VP7) y proteínas no estructurales (NSP1-NSP5/NSP6 Hay registros de una estrecha relación entre la fauna y flora amazónicas y las poblaciones humanas [18], y esta interacción es el efecto de las actividades de urbanización antropogénica que resultan en la deforestación de zonas forestales, causando la degradación de sitios previamente aislados como cuevas y pequeñas cuevas, un proceso continuo y progresivo de la naturaleza que ha llevado no sólo a cambios en los hábitats de la fauna y flora silvestres, sino también a una mayor relación con las poblaciones humanas en entornos rurales y urbanos, contribuyendo a la aparición y aparición de enfermedades diferentes de las que normalmente ocurren en regiones endémicas [19] [20] [22]. Aunque los resultados del VRA ya se han descrito globalmente [12, [23] [25] [26] [28] [30], en Brasil, la ocurrencia, diversidad y papel del rotavirus en estos animales todavía están poco estudiados, teniendo en cuenta el gran número de especies presentes [4, [31 En la Amazonía brasileña, especialmente en el estado de Pará, las mesoregiones metropolitanas de Belém y Nordeste son algunas de las zonas con mayor índice de cambios ambientales [35], que se concentran, junto con el hecho de que el conocimiento de la diversidad global del virus entérico en animales es escaso [36]. Por lo tanto, es importante monitorear la salud de los animales domésticos y silvestres en su hábitat natural, especialmente en áreas con alteraciones antrópicas que tienen una interfaz con comunidades rurales y empresas, para investigar la ocurrencia de VRA en esta población. Estas comunidades son ecológicamente complejas, ya que cuentan con múltiples hospedadores y patógenos sin fin que eventualmente pueden circular en centros urbanos contiguos, además de que también debe considerarse que todavía no existen estudios que demuestren la importancia de estos virus que infectan a esta población, ya que en el contexto de la vigilancia epidemiológica, estos animales se vuelven importantes, ya que pueden ser considerados como fuentes naturales, con la posibilidad de transmisión a los seres humanos [37] [38]. La reacción cualitativa en cadena de la polimerasa en tiempo real (qRT-PCR) utilizó el gen NSP3 y la sonda TaqMan de una región altamente conservada de la proteína no estructural del rotavirus 3 (NSP3), que se utilizó previamente en muestras de origen humano y con bajas cargas virales Los datos de precipitación se obtuvieron del Instituto Nacional Brasileño de Meteorología (Inmethttp://www.inmet.gov.br/) para los años de captura en el Acuerdo Expedito Ribeiro (2014) y Açailândia (2015) de las Plataformas de Recolección de Datos (PCD) de Belém, ubicado a 50 km de Santa Bárbara do Pará, y Tracuateua, ubicado a 50 km de Peixe-Boi y a 100 km de Viseu. Los límites municipales se obtuvieron en el sitio web del Instituto Brasileño de Geografía y Estadística (IBGE) (http://www.ibge.gov.br/) y los datos sobre deforestación y uso de la tierra se obtuvieron de los proyectos PRODES [43] y TerraClass [44]. PRODES cuenta con datos anuales en formato digital desde 2000 y TerraClass presenta datos semestrales desde 2004. La imagen satelital se generó utilizando el sensor Sentinel 2 de la Agencia Espacial Europea (ESA) (https://sentinel.esa.int/web/sentinel/user-guides/sentinel-2-msi) con licencia CC-BY de acceso abierto (http://open.esa.int/) de los años 2017 y 2018. Todos los datos obtenidos se almacenaron en una base de datos geográficos (BDG). El BDG fue importado/almacenado en un SIG para la edición de los elementos gráficos, el establecimiento de relaciones topológicas entre los elementos y sus atributos respectivos, el análisis espacial y la visualización del resultado a través de mapas temáticos. Para el presente estudio, se eligieron fragmentos forestales de tamaño, forma y fisiología similar, considerando una matriz periurbana abierta con uso de suelo similar. Los fragmentos seleccionados fueron distribuidos dentro de las mesoregiones estudiadas, y en cada fragmento seleccionado muestras fecales fueron recolectadas aleatoriamente de animales domésticos y salvajes [45]. Se obtuvieron clases de uso de suelo del mosaico de datos TerraClass de 2004 a 2016, ya que los sitios de estudio se encontraban en un área con alta presencia de nubes, lo que impidió la observación (el área no se observó).El procesamiento de datos, interpretación, visualización y análisis espacial se realizaron en el software ArcGIS (http://www.arcgis Para el análisis de los datos relacionados con la determinación de la riqueza, composición y abundancia de la fauna de los animales estudiados en el área de estudio, considerando los métodos de recolección adoptados y las especies disponibles en cada ciudad, cada muestra fue considerada como una muestra independiente. La riqueza de la fauna silvestre y animales domésticos fue determinada por el número total de especies incluyendo todos los métodos de recolección, y la similitud de las especies fue realizada por el análisis chi-cuadrado entre las muestras de los diferentes tratamientos con la ayuda del software EstimatS 8.0 [46]. Para el cálculo del Test T, se utilizó el software Statistica, y se calcularon los índices de animales infectados en los dos ambientes (fragmento forestal y peridomicil) para cada tratamiento muestreado por área de recolección, utilizando el software Past 1.92. Apuntando a comparar los valores de los índices de diversidad a través del test emparejado, así como el análisis descriptivo Los datos obtenidos para la ocurrencia de la VRA y los cuestionarios fueron insertados en una base de datos para un análisis descriptivo del perfil epidemiológico de la población animal en los tres ecosistemas forestales estudiados.En este análisis se realizaron tratamientos estadísticos descriptivos, utilizando tablas de tipo "columnas de surco" personalizadas, referidas a los datos, con el fin de caracterizar la muestra y cuantificar los resultados mediante valores de frecuencia absoluta utilizando la prueba chi-cuadrado y la prueba T.Population estudio, recolección de especímenes clínicos y metodología de laboratorio.Los animales voladores (aves silvestres y quiroptera) fueron capturados mediante redes de niebla que se abrieron al amanecer (4:00 a.m.) y cerraron por la mañana (9:00 a.m.) y fueron inspeccionados cada hora hasta el cierre, con un esfuerzo de muestreo de 15 días.Esta investigación fue aprobada por National All procedimientos con animales fueron realizados por veterinarios, siendo aves Los especímenes fecales fueron recolectados por estimulación de la ampolla rectal con el uso de un "Zaragatoa", envasados en viales criogénicos, identificados, almacenados en nitrógeno líquido, y posteriormente enviados al Laboratorio. Los animales salvajes (pequeños mamíferos no voladores) fueron atrapados en trampas de contención en vivo de la jaula Tomahawk (tamaño 45x16x16cm) y de aluminio tipo Sherman (tamaño 30x9x8cm). En cada parcela de muestra, se distribuyeron 61 trampas, 20 Shermans y 41 Tomahawks siendo cebos con una mezcla hecha con pasta de maní, sardinas, aceite de hígado de bacalao y harina de maíz, así como frutas como plátano, manzana y piña. Todas las trampas utilizadas fueron inspeccionadas diariamente por la mañana, los cebos fueron intercambiados cuando era necesario y más tarde después de la captura en bolsas de tela y Los animales silvestres fueron sedados con una combinación de ketamina 20mg/kg y xilazina 2mg/kg intramuscularmente y posteriormente, eutanasiados con sobredosis anestésica de lidocaína al 2% en el foramen magnum, de acuerdo con la recomendación del Consejo Nacional para el Control de la Experimentación Animal (CONCEA). De octubre de 2014 a abril de 2016, se recolectaron 1.282 muestras fecales de animales silvestres y domésticos, de las cuales 648 (50,5%) fueron seleccionadas aleatoriamente para investigación RVA y manejadas en Laboratorio de Bioseguridad de Nivel Tres (NB3). El genoma viral fue extraído mediante el protocolo TRIZOL LS REAGENT (INVITRO-GEN, USA/KIT QIAGEN), siguiendo las recomendaciones del fabricante, con menor adaptación según el protocolo descrito en los datos complementarios. [40] para la detección de RVA utilizando el segmento NSP3 de RVA como secuencia génica diana. El ensayo se llevó a cabo en una mezcla que contenía: RNAse-free H 2 O, TaqMan RT-PCR Mix (2x), TAqMan RT Enzyme Mix (40x), imprimaciones para el gen NSP3, Primer NSP3 Forward (20mM), Primer NSP3 Inverso (20mM), sonda NSP3 S (10nm), Plantilla (ARN) 3μL, con un volumen de reacción total de 17μL y ciclo de transcripción inversa de 50°C, 30 minutos, desnaturalización de 95°C, 10 minutos, recocido de 45 ciclos de 95°C, 15 segundos y extensión de 60°C, 1 minuto. Los análisis se consideraron positivos al presentar el umbral de ciclo (TC) 40. Para garantizar un resultado de prueba fiable, las mediciones del control de la contaminación se realizaron con el uso de control animal positivo (prototipo SA11) y un control negativo (agua de úlcera). Todas las muestras positivas de RVA fueron sometidas a reacción en cadena de la transcripción inversa-polimerasa (RT-PCR) de acuerdo con Mijatovic et al [41] para genotipar muestras de bajas cargas virales. La primera ronda fue realizada con imprimaciones de consenso N-VP4F1/N-VP4R1 y la Nested-PCR fue realizada con imprimaciones N-VP4F2/N-VP4R2 para amplificar el gen VP4. Los amplificadores fueron purificados y secuenciados para el gen VP4 usando los mismos imprimadores de Nested-PCR. Las secuencias fueron recolectadas de un secuenciador automático ABI Prism 3130xl ADN Los fragmentos de secuencia fueron ensamblados y editados utilizando la plataforma de software Geneious Bioinformática v.8.1.7. Posteriormente, los datos fueron comparados con otras secuencias de la base de datos del Centro Nacional de Información Biotecnológica GenBank utilizando la herramienta de alineación BLAST para dilucidar el genotipo RVA de las muestras. De octubre de 2014 a abril de 2016, un total de 648 muestras fecales de animales silvestres y domésticos pertenecientes a tres áreas de fragmentos forestales fueron probadas para el gen NSP3 por QPCR cualitativo, y 178 (27,5%) fueron positivas para RVA, distribuidas entre las especies: aves (23,6%), caninos (21,35%), murciélagos (17,98%), bovinos (14,6%), caballos (8,43%), pequeños roedores (6,74%), cerdos (3,93%) y felinos (3,37%). 47 Fue posible detectar cepas virales en todos los géneros de animales estudiados y en el período de recolección ninguno de los animales mostró signos de infección aguda y/o diarrea. Rotavirus A (RVA) detectados en el presente estudio de animales silvestres y domésticos pertenecientes a las tres áreas del fragmento forestal, según la Fig. 2. En relación a los bovinos evaluados, sólo en la ciudad de Viseu, estas especies fueron estudiadas porque fueron creadas extensamente. Además, la mayoría de los animales eran jóvenes con edades que variaban de 1 día a 8 años, antecedentes de vacunación deficiente, falta de asistencia técnica y criados en forma de subsistencia. Los animales no mostraron síntomas de diarrea, solo bajo rendimiento de peso y mal estado de manejo sanitario. En relación a la quiroptera, se distribuyeron 32 (17,98%) muestras positivas de RVA entre las especies de Carollia perspicillata, con 12 (37,5%) siendo todas adultas, 9 (28,12%) muestras de Desmodus rotundus (4 jóvenes y 5 adultos), 5 (15,6%) de Uroderma bilobata (15,62%), 3 (9,37%) de Artibeus lituratus y las especies Artibeus Planirostus, Diaemus iyoug y Glossophagina con 1 (3,12%) cada una. Estos animales procedían de áreas de fragmentos forestales ubicadas cerca de granjas de bovinos y equinos, además de habitar pequeñas granjas de pollos. La figura 3 muestra los resultados obtenidos para todas las especies de animales investigadas en el fragmento forestal así como en la zona del peridomicillus. Las variables antrópicas fueron analizadas para las tres ciudades estudiadas, así como el uso del suelo dentro del rango de los animales, obedeciendo el domicilio, el peridomicil y el fragmento forestal donde se capturaron las trampas de pequeños roedores, aves y diversas especies de animales (Fig 4 y Fig 5). Considerando los factores relacionados con las actividades antrópicas en las tres áreas estudiadas dentro de las tres ciudades del presente estudio, se observó que la ciudad de Santa Bárbara es la que tiene una mejor área de bosque preservado y la ciudad de Viseu una área más pequeña. Sin embargo, en la ciudad de Santa Bárbara se observó una mayor concentración de ocupaciones alrededor del área de fragmento forestal. Se observó en esta zona escogida de la ciudad, la presencia de diferentes familias viviendo en un asentamiento rural, sobreviviendo de la explotación de los recursos forestales y la creación de pequeños animales de subsistencia, como aves de corral y piscicultura, así como productos agrícolas familiares. La cría de animales en pastos nativos sólo se observó en las ciudades de Peixe Boi y Viseu. Se practicó una extensa ganadería con ganado vacuno, equinos para trabajo y pequeños animales (porcinos y cabras). En relación con la zona de pastos más conservada, la ciudad de Peixe Boi tuvo la mayor superficie, según los datos mostrados en la Figura 5, sin embargo, en la ciudad de Viseu se observó una mayor regeneración en los pastos durante el período del estudio, con significativa vegetación secundaria. Al comparar los climas de las tres áreas se observó que el clima predominante es megatermal y húmedo con temperatura media anual alrededor de Los meses de octubre, noviembre y diciembre son los más calurosos, con temperaturas entre 32°C y 34°C y máximos absolutos alrededor de 41°C. Las precipitaciones anuales son bastante altas, generalmente alrededor de 2.350 mm, pero fuertemente concentradas de enero a junio (80%). De septiembre a diciembre, por el contrario, las precipitaciones son raras, alrededor del 7%, con una corta estación seca, de déficit de agua moderado en esos meses. La humedad relativa del aire promedio oscila alrededor del 85%, como se muestra en la figura 6 [48]. La descripción de la precipitación acumulada en el año de captura de los especímenes fecales en comparación con las Normales Climatológicas (CLINO) para el período 1961-1990 de los PCD más cercanos a las localidades del Expedito Ribeiro / Santa Bárbara (Belém PCD), Vila Ananim / Peixe-Boi y Açaiteua / Viseu (Tracauateua PCD) muestran la frecuencia de lluvias en las regiones, lo que facilita la renovación de los pastos y la regeneración de los bosques impactados, siendo un indicador importante de la reducción de los daños causados por la deforestación en la región. El índice medio de deforestación en las tres áreas de estudio se calculó a partir de los datos obtenidos de los sistemas de información del INPE. Se observó que en los años de 2013 a 2014 no hubo cambios en estas regiones; en el período de 2014 a 2015 alrededor del 4,1% de la ciudad de Viseu fue cambiada y el 1,6% de la ciudad de Peixe Boi. En relación con el período de 2016, se observaron grandes cambios en Peixe Boi (79%) y en la ciudad de Viseu (70%), demostrando así que los cambios en el ecosistema natural pueden estar asociados con las frecuencias de VRA en las áreas estudiadas, según la Fig 7. Al evaluar a los animales infectados en relación a los animales no infectados tanto en el fragmento del bosque como en el peridomicilo, considerando como animales del bosque fragmentan a las aves, se obtuvieron la quiroptera y los pequeños roedores y como animales del peridomicilo los caninos, bovinos, cerdos, felinos y caballos, un porcentaje de 37,07% infectados por animales domésticos (86/232) y 22,12 % infectados por animales fragmentados del bosque (92/416). Aplicando el análisis estadístico seleccionado, se obtuvo un valor de Pearson x2 Chi-cuadrado: 16,7159, df = 1 y p < 0,001, lo que significa que la hipótesis fue corroborada, es decir, cuanto mayor sea la degradación del medio ambiente, más probable será la búsqueda de alimentos por animales silvestres en áreas adyacentes, o en el borde del bosque o incluso en la región peridomiciliaria. En este sentido, se debe considerar la posibilidad de contagio con otras especies de animales, incluso humanos, debido a la capacidad del rotavirus para ser transmitido por vía fecal/ oral o por contacto directo con el medio ambiente. Es importante señalar que los animales detectados en este estudio son fuentes importantes de cepas virales. Se seleccionaron, reextractaron y analizaron un total de 80 muestras de heces utilizando PCR para el gen VP4. Ocho cepas (10%) fueron positivas para el gen VP4, siendo 2 cepas despojadas del genotipo P [6] y 6 al tipo P[4], según el presente estudio, se detectó la presencia de VRA circulando en el 27,5% de los animales; 36% en animales domésticos y 64% en animales silvestres, proporcionando un conjunto de datos único con qRT-PCR detectando una baja carga viral de VRA en diferentes especies, lo que además se correlaciona con el índice de deforestación Estos datos son importantes debido a la falta de pruebas para el diagnóstico del VRA en animales, ya que los métodos actuales de detección del VRA no siempre se detectan en estas poblaciones [8]. Con el advenimiento de la RCP en tiempo real (QPCR), hubo un crecimiento exponencial, en comparación con los ensayos convencionales del RPR, ya que su precisión, sensibilidad y especificidad superiores son notables, y es Rotavirus A en animales silvestres y domésticos posible detectar el VRA en una variedad de especies animales utilizando el gen NSP3 [49]. La sensibilidad del RT-qPCR mejoró significativamente la tasa de detección del VRA en muestras clínicas de animales y en este contexto, el presente estudio propuso un interesante estudio métricas utilizando el virus que se propaga en animales silvestres que habitan fragmentos forestales para indicar intervenciones de población humana, con el objetivo de prevenir los brotes de virus apalancados en las características geográficas únicas de Brasil y su En la actualidad, no se han descrito datos en la literatura sobre la detección de RVA utilizando la técnica qPCR en tiempo real en una amplia variedad de especies animales silvestres. Sin embargo, un estudio de Soltan et al. [50] realizado con caballos y bovinos detectó RVA por RT-PCR, RT-PCR comercial y RT-qPCR en 36,7%, 51,4% y 56,9% respectivamente, de manera diferente al presente estudio que mostró mayor positividad para los quiropteros (17,98%), caninos (21,35%), aves (23,6%) y ganado (14,6%). La primera descripción de RVA en quiroptera se registró en heces de Eidolon helvum capturadas en Vihiga, Kenia [51]. Posteriormente, varias cepas de RVA fueron detectadas por diferentes técnicas moleculares que involucraban a quiroptera, en varios países, incluyendo Kenia (E. helvum), China (Rhinolophus hipposideros y Aselliscus stoliczkanus), Francia (Myotis mystacinus), Camerún (E. helvum) y Brasil [31, [51] [53] [53] [54]. El presente estudio muestra la ocurrencia de RVA en el 17,98% de las quiropteras, estando entre las especies Carollia perspicillata (37,5%), Desmodus rotundus (28,12%), Uroderma bilobata (15,6%), Artibeus lituratus (9,37%), Artibeus Planirostus (3,12%), Diaemus iyoug y Glossofagina (3 [56] informó que Desmodus rotundus es una de las tres especies hematófagas de la familia Phyllostomidae, encontrada en toda América del Sur, América Central y México. De las quiropteras positivas para RVA en el presente estudio, una prevalencia de 28,12% fue de Desmodus rotundus. Esta especie se alimenta de aves, puede alimentarse de mamíferos, en su mayoría de tamaño medio o grande, facilitando la diseminación de esporas virales entre la comunidad dentro del hábitat, como se observa en el presente estudio. Estos hallazgos muestran la importancia de los datos epidemiológicos sobre las especies estudiadas debido a la falta de estudios que involucren especies de quiroptera neotropical, y no es posible establecer parámetros comparativos para estos animales. Respecto a la circulación de RVA en caninos y aves, la prevalencia fue del 53% y 29%, respectivamente. Aunque en la región amazónica existen registros de RVA, RVD, RVF y RVG que infectan a las aves [57] [58] y RVD en aves migratorias [59], todos fueron detectados mediante ensayos RT-PCR de manera diferente al presente estudio que detectaron el RVA por RT-qPCR involucrando una variedad de especies animales. Por otro lado, la prevalencia en felinos (16%) y cerdos (22%) fue menor, probablemente porque hay pocos animales de estas especies en la región, así como pocas creaciones. El estudio detectó la presencia de RVA en diferentes especies de animales tanto en áreas cercanas al hogar como en áreas ubicadas en fragmentos de bosque, caracterizadas como restos forestales, ya que se encontraban en ciudades que sufrieron un alto impacto ambiental debido al extractivismo vegetal, la formación de pastos para la cría de ganado, la explotación de recursos naturales y reflejos directos sobre los hábitats de animales silvestres que pueden servir como fuentes víricas, facilitando así la dispersión de RVA entre comunidades de animales coexistentes. Cabe destacar que estos animales tienen mayor contacto con las poblaciones humanas de las áreas estudiadas ya que cohabitan con los humanos de la región, además de tener un alto flujo de movimiento entre los extractos forestales y ambientes elegidos para el presente estudio. Sin embargo, cabe destacar que sólo en las comunidades de Santa Bárbara y Viseu se recogieron especímenes fecales de humanos asintomáticos para diarrea y se probaron para RVA, pero todos La fragmentación del bosque genera muchas consecuencias sobre la biota amazónica, pudiendo alterar la diversidad y la composición de las comunidades animales en los fragmentos e incluso interferir en los procesos ecológicos, sin considerar que los fragmentos de bosque en la Amazonía están influenciados por el clima, lo que posiblemente facilita la dispersión de patógenos por el medio ambiente, ya que los animales silvestres detectados en el presente estudio son asintomáticos y tienen baja carga viral para la VRA. La ocurrencia de VRA en esta población de animales puede explicar la posibilidad de dispersión de cepas virales, ya que existe una proximidad a la población humana, además de las características biológicas de estas especies que pueden representar fuentes importantes de virus gastroenternos, junto con el hecho de que todos los animales fueron asintomáticos para la diarrea. Las aves silvestres tienen una capacidad de vuelo ilimitada, fueron capturadas en una región de interfaz entre el peridomicilo y los fragmentos forestales y se cree que esta región no ha sido influenciada por actividades antrópicas como las observadas en el área del presente estudio. Por otro lado, el método de cría de aves de corral y caninos cercanos a los hogares y al ecosistema forestal, tal como se crean en las comunidades estudiadas, probablemente facilita el contacto directo con posibles fuentes de contaminación, ya que en las zonas el uso de tanques sépticos es deficiente y a veces inexistente, lo que puede facilitar o incluso aumentar el riesgo de dispersión viral en todo el medio ambiente. Las altas tasas de aumento y el análisis del uso del suelo en las zonas investigadas pueden ser indicadores importantes de cómo interactúan estos animales, ya que con la deforestación, las poblaciones de animales silvestres buscan refugio en comunidades cercanas facilitando la dispersión de agentes infecciosos y la posible ocurrencia de A nuestro conocimiento, este es el primer estudio en el que se aplicó un ensayo PCR en tiempo real para la detección de RVA involucrando una amplia variedad de animales domésticos y salvajes, facilitando la utilidad práctica en estudios epidemiológicos y moleculares y ayudando en una perspectiva en la elaboración de control sanitario y monitoreo, evitando posibles brotes en las comunidades estudiadas. La detección de animales positivos fue útil para monitorear la infección del agente en la población animal y para proporcionar una señal de alerta temprana para predecir una epidemia inminente y un riesgo favorable para la población humana, dada la evidencia de la circulación de RVA en los diferentes fragmentos forestales. Además, el ensayo RT-qPCR puede ser una alternativa útil para el diagnóstico diferencial de RV en posibles infecciones mixtas que coexistan clínicamente indistinguibles como las causadas por otras cepas virales que causan gastroenteritis tales como: astrovirus, coronavirus, picobirnavirus, calicivirus, entre otros, como se observó en los estudios de Jing et al. [60] y Waruhiu et al. [61]. La diarrea asociada a infecciones por VRA en cerdos es una causa importante de aumento de la mortalidad y pérdidas económicas en Europa. Los genotipos más prevalentes aislados de heces de lechones diarreicos y no diarreicos belgas en 2012 [62] demuestran una amplia gama de combinaciones de genotipos G / P incluyendo; G3P [6], G4P [6], G5P [6], G4P [7], G5P [7], G9P [7], G9P [13] y G9P [23]. Por otro lado, en el presente estudio fue posible detectar sólo el genotipo P [6], ya que la mayoría de las muestras eran asintomáticas para la diarrea. El hallazgo muestra que diferentes genotipos P de cepas RVA interactúan con antígenos histológicos distintos del grupo sanguíneo (HBGA, ABOH, Lewis) y ácidos siálicos vía VP4 proporcionando una visión de la prevalencia regional y un aumento del potencial zoonótico de algunos El genotipo P [6] fue identificado en lechones en Brasil [64] y en Italia y Japón, parecido al genotipo P [6] humano [65, 66]. En la población de animales estudiados, la transmisión zoonótica puede ser frecuente, ya que los animales viven en contacto con humanos y en condiciones sanitarias precarias. En Brasil, este genotipo fue descrito en poblaciones animales y humanas en estudios de Luchs y otros [32] ; Honma y otros [67] ; Araújo y otros [68] ; Mascarenhas y otros [69] y Lorenzetti y otros [70] tales estudios corroboran la importancia de seguir monitoreando los genotipos para verificar si surgen cepas poco comunes o nuevas cepas y pueden infectar poblaciones animales o transmisiones interespecíficas.En cuanto al genotipo P [4], fue más detectado en nuestras muestras en murciélagos, perros, Este genotipo no es común en animales, siendo más detectados en muestras humanas y ambientales en diversas partes del mundo e incluyendo a nuestra región [71]. Es importante destacar que los indicadores de contaminación ambiental en Brasil son significativos y contribuyen a la posibilidad de transmisión humano-animal [71]. Estos datos requieren investigación adicional en trabajos posteriores para caracterizar mejor la transmisión interespecífica, ya que la ocurrencia de virus entéricos en diferentes matrices demuestra el impacto antropogénico de la población expuesta alrededor y señala el riesgo potencial de infección por la posible exposición de individuos susceptibles. Nuestros hallazgos pueden ser útiles para el seguimiento de la contaminación fecal en el ambiente utilizando animales como posibles fuentes, minimizando así el riesgo de infección por exposición a individuos susceptibles, en este caso diferentes especies animales o incluso poblaciones humanas. RVA fueron detectados en animales silvestres y domésticos utilizando un ensayo RT-qPCR que analizó muestras que tenían baja carga viral para RVA. Aunque las muestras son asintomáticas para la diarrea, es necesario llevar a cabo estrategias para el monitoreo y control de los animales en las áreas estudiadas en la población humana, así como en otras especies de animales, así como la implementación de medidas preventivas dirigidas a futuros brotes en comunidades animales de la población residente en estas áreas impactadas. Por lo tanto, el presente estudio no tiene precedentes en la región y en el país en relación con la investigación del VRA en animales silvestres. Cabe destacar que, aunque la calidad de las muestras analizadas se caracteriza por una baja carga viral detectable, la técnica presentó una buena respuesta analítica en la detección de los animales de origen para el VRA, facilitando la selección de las muestras para futuras pruebas de caracterización genética.
question: ¿El rotavirus es simple o de doble cadena?
answers.text: ácido ribonucleico de doble cadena