context: Infecciones del tracto respiratorio viral en pacientes adultos que asisten a los departamentos de pacientes ambulatorios y de emergencia, Taiwán, 2012–2013: Estudio de espectrometría de masas de la PCR/Electrosprayhttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4635751/SHA: ef6361c7bffb9e92f397d7004bfb3a9c804d7c6aAutores: Shih, Hsin-I; Wang, Hsuan-Chen; Su, Ih-Jen; Hsu, Hsiang-Chin; Wang, Jen-Ren; Sun, Hsiao Fang Sunny; Chou, Chien-Hsuan; Ko, Wen-Chien; Hsieh, Ming-I; Wu, Chi-JungFecha Además, la capacidad de la PCR/electrospray ionization mass spectrometry (PCR/ESI-MS) para detectar enterovirus y rinovirus en muestras respiratorias no ha sido bien evaluada. Tratamos de utilizar PCR/ESI-MS para investigar exhaustivamente la epidemiología viral de los ITR adultos, incluyendo pruebas de rinovirus y enterovirus. Los hisopos nasofaríngeos o de garganta de 267 adultos con ITR agudas (212 ITR superiores y 55 ITR inferiores) que visitaron una clínica local o los departamentos ambulatorios o de emergencia de un centro médico en Taiwán entre octubre de 2012 y junio de 2013 fueron probados en busca de virus respiratorios por aislamiento del virus y PCR/ESI-MS. Los virus respiratorios fueron encontrados en el 23,6%, 47,2% y 47,9% de los 267 casos por aislamiento del virus, PCR/ESI-MS y ambos métodos, respectivamente.Cuando se utilizaron ambos métodos, el virus influenza A (24,3%) y rinovirus (9,4%) fueron los virus identificados con mayor frecuencia, mientras que los coronavirus humanos, metapneumovirus humano (hMPV), enterovirus, adenovirus, virus respiratorios sincitiales y virus de la parainfluenza fueron identificados en pequeñas proporciones de casos (<5% de casos para cada tipo de virus).La coinfección se observó en el 4,1% de los casos.En el grupo control, sólo 1 (2,4%) muestra positiva para virus respiratorio por PCR/ESI-MS. Los pacientes sometidos a tratamiento con esteroides, con malignidad activa o con enfermedad pulmonar obstructiva crónica (EPOC) tenían riesgo de infección por rinovirus, hMPV o parainfluenza, respectivamente. En general, los pacientes inmunocomprometidos, los pacientes con EPOC y los pacientes sometidos a diálisis tenían riesgo de infección por virus respiratorios no influenza. Los rinovirus (12,7%), el virus influenza A (10,9%) y los virus parainfluenza (7,3%) fueron los virus más comunes implicados en los 55 casos de ITR inferiores. Los factores de infección por parainfluenza, vejez e inmunosupresión se asociaron de forma independiente con ITR inferiores. En conclusión, PCR/ESI-MS mejoraron el rendimiento diagnóstico de las ITR virales. Las infecciones por virus respiratorios no influenza se asociaron con pacientes con comorbilidades y con ITR inferiores. Se justifican estudios adicionales que delineen la necesidad clínica de incluir virus respiratorios no-influenza en el trabajo diagnóstico en estas poblaciones. Texto: Las infecciones de las vías respiratorias virales (IRT) en humanos ocurren durante todo el año y representan una causa importante de las visitas clínicas en todo el mundo. En el pasado, las causas virales de las ITR eran en gran parte desconocidas, principalmente debido a la insensibilidad de los métodos basados en cultivos para la detección de virus o al espectro estrecho de detección viral mediante pruebas de ácido nucleico plex único (NATs). Recientemente, el desarrollo de NATs respiratorios múltiples ha permitido la detección simultánea, rápida y sensible de múltiples virus, lo que facilita estudios exhaustivos sobre la epidemiología de las ITR virales. Actualmente, la epidemiología viral de las ITRs se ha estudiado más ampliamente entre las poblaciones pediátricas que con poblaciones adultas en todo el De manera similar, la mayoría de los estudios que describen la etiología viral de las enfermedades respiratorias en Taiwán, un país subtropical en Asia Oriental, se limitaron a poblaciones pediátricas. [2] [3] [4] Así, los estudios entre pacientes adultos carecen de estudios, particularmente en relación con infecciones por virus fastidiosos o recién identificados, como el metapneumovirus humano (hMPV) y el coronavirus humano (hCoV). La superposición de presentaciones clínicas compartidas por diferentes virus respiratorios dificulta el diagnóstico diferencial basado únicamente en los parámetros clínicos. 5 Además, los agentes antivirales eficaces están actualmente restringidos a las infecciones por virus de la gripe. Por lo tanto, una mejor comprensión de la epidemiología de las ITR virales adultas ayudaría al futuro diseño de estrategias diagnósticas, control de infecciones y manejo de pacientes. [6] [7] [8] [9] A pesar del potencial diagnóstico, la capacidad de PCR/ESI-MS para detectar enterovirus humano y rinovirus en muestras respiratorias de pacientes con ITR no ha sido bien evaluada.Los estudios anteriores de PCR/ESI-MS en pacientes con ITR no incluyeron estos 2 virus en los paneles diagnósticos. [6] [7] [8] En este caso, ampliamos estos estudios previos utilizando PCR/ESI-MS para la detección de virus respiratorios. Tratamos de investigar exhaustivamente la epidemiología de ITR virales adultos utilizando PCR/ESI-MS y comparar el desempeño diagnóstico entre PCR/ESI-MS y métodos de cultivo convencionales para identificar virus respiratorios múltiples, clínicamente relevantes, incluyendo enterovirus e rinovirus. Para realizar un estudio epidemiológico integral que incluyó a pacientes con y sin comorbilidad, se inscribió a adultos (de al menos 18 años de edad) con ITR aguda en los 7 días de inicio que fueron tratados en una clínica externa local del hospital YC o en los departamentos ambulatorios o de emergencia del Hospital Universitario Nacional Cheng-Kung (NCKUH), un centro médico afiliado a la universidad en el sur de Taiwán, entre octubre de 2012 y junio de 2013. La ITR aguda se definió como la aparición simultánea de al menos 1 síntoma o signo respiratorio (Tose nueva o empeoramiento, producción de esputo, dolor de garganta, congestión nasal, rinorrea, disnea, sibilancias o tonsias inyectadas) y al menos 1 de los siguientes síntomas: fiebre, escalofríos y tos. Para los pacientes que experimentaron más de un episodio de ITR, el episodio más reciente fue contado como separado sólo si el paciente se recuperó completamente del episodio anterior y hubo un intervalo mínimo de 3 semanas entre el inicio de los 2 episodios. Datos clínicos, de laboratorio y radiológicos y el historial de contacto de cada paciente fueron recuperados. Comorbilidades fueron evaluadas en todos los pacientes con base en el índice de comorbilidad de Charlson (ICC). 10 El uso de esteroides se definió como la recepción de tratamiento con corticosteroides (10 mg de prednisolona o una dosis diaria equivalente) durante más de 2 semanas. Se diagnosticó un estado inmunocomprometido si los pacientes cumplían una de las siguientes condiciones: tratamiento con corticosteroides, órgano sólido o receptor de células madre hematopoyéticas, o quimioterapia para una neoplasia subyacente durante los últimos 6 meses. 11 para la detección e identificación de virus tanto por aislamiento del virus como por PCR/ESI-MS. Las muestras clínicas fueron almacenadas en 48C y transportadas a los sitios del estudio dentro de las 24 horas siguientes a la recolección. Se incluyeron hisopos de garganta de 42 casos sin infecciones respiratorias durante el mes anterior a la inscripción como muestras de control para el análisis PCR/ESI-MS, incluyendo 15 pacientes con infecciones exclusivamente bacterianas (casos documentados de bacteremia o infección del tracto urinario) que fueron ingresados en NCKUH y 27 individuos sin infecciones activas. Estos sujetos sin infecciones activas incluyeron 10 pacientes con enfermedades crónicas estables seguidos en las clínicas NCKUH y 17 individuos sanos cuya información médica fue recolectada mediante un cuestionario clínico.El estudio fue aprobado por la Junta de Revisión Institucional (B-ER-101-31) del hospital del estudio, y todos los pacientes dieron consentimiento informado. Los especímenes respiratorios fueron inoculados en cultivos tisulares apropiados (Renino canino Madin-Darby, MRC-5, A549, y rabdomiosarcoma) para aislar el virus de la gripe humana, el virus de la parainfluenza, el género Enterovirus, el citomegalovirus (CMV), el adenovirus, el virus sincitial respiratorio (RSV), los virus del herpes simplex 1 y 2 (HSV-1 y -2), y el virus de la varicela zoster (VZV). El aislamiento e identificación de virus se realizaron utilizando un método descrito anteriormente 11 y los enterovirus fueron identificados mediante un ensayo de inmunofluorescencia utilizando una mezcla de Chemicon Pan EV que reacciona de forma cruzada con el rinovirus (Diágnóstico de la luz, Chemicon [Millipore], MA). 11, 12 Detección e identificación de virus por PCR/ESI-MS Los ácidos nucleicos totales se extrajeron de 700 mL de muestras de hisopo utilizando un autoextractor de ácido nucleico (MagNA Pure Compact Instrument, Mannheim, Alemania), y el eluato se almacenó en À808C hasta el análisis. Durante los análisis, los ácidos nucleicos extraídos se agregaron tanto a una placa de ensayo del virus respiratorio PLEX-ID como a una placa de ensayo de PLEX-ID Broad Viral I (PLEX-ID, Abbott Laboratories, Abbott Park, Illinois). El ensayo del virus respiratorio PLEX-ID detecta el adenovirus humano, hCoV, hMPV, influenza A y B, parainfluenza tipos 1 a 3 y RSV, 6 mientras que el ensayo PLEX-ID Broad Viral I detecta el adenovirus humano, enterovirus, rinovirus, poliomavirus BK y JC, parvovirus B19, HSV-1 y -2, VZV, virus Epstein-Barr (EBV), CMV y herpesvirus humano (HHV)-8. 13, 14 En este estudio, los virus respiratorios se refieren al adenovirus, hCoV, hMPV, influenza, parainfluenza, RSV, enterovirus y rinovirus. La amplificación del ácido nucleico y los análisis de los productos PCR se realizaron utilizando la plataforma PCR/ESI-MS (PLEX-ID, Abbott Laboratories) siguiendo las instrucciones del fabricante, con el tiempo de retorno de la muestra hasta el resultado en un plazo de 6 a 8 horas. 8, 13 Los análisis PCR/ESI-MS incluyeron desalación automatizada de PCR, adquisición de señales ESI-MS, análisis espectral y notificación de datos. La identificación del organismo se basó en la masa total y las composiciones básicas de los amplicones PCR en comparación con las de la base de datos de firma molecular establecida por el fabricante PLEX-ID. 6, 8, 13, 14 Muestras en las que los resultados PCR/ESI-MS no estaban de acuerdo con los resultados de cultivo a nivel de especie fueron reexaminados por un segundo método molecular. Para los enterovirus, el rinovirus se distinguió del enterovirus mediante un análisis convencional de secuenciación PCR con los imprimadores descritos previamente (Rhinovirus s1 y as) y una búsqueda BLAST. 15 Todos los análisis se realizaron con el Package Statistical for the Social Sciences versión 17.0 (SPSS Inc, Chicago, IL). Las variables continuas se expresaron como valores medios desviaciones estándar de la EA y se compararon con el análisis de la prueba de varianza. Las variables categóricas se compararon con el test exacto de Fisher o x 2; todas las variables biológicamente plausibles con un valor P 0,10 en el análisis univariado se consideraron para su inclusión en el modelo de regresión logística para el análisis multivariado. Durante el período de estudio de 9 meses, se registraron 267 episodios de ITR aguda de 263 pacientes, incluyendo 96 episodios en una clínica local y 171 episodios en NCKUH (19 ambulatorios y 152 en los departamentos de urgencias); por conveniencia, cada episodio fue contado como un caso; en total, 123 (46,1%) casos fueron varones, y 152 (56,9%), 60 (22,5%) y 55 (20,6%) pacientes fueron 18 a 39, 40 a 59 y!60 años de edad, respectivamente. Doscientos y doce (79,4%) pacientes presentaron ITR superior (URTIs), y 55 (20,6%) casos presentados con ITRL. En comparación con los pacientes que asistieron a la clínica local, los pacientes que asistieron al centro de atención médica eran mayores y tenían más comorbilidades ( Tabla 1 ). Los datos demográficos detallados de los 267 casos de ITR y 42 casos de control se presentan en la Tabla 1. Las 267 muestras respiratorias de cada caso de ITR fueron examinadas por virus tanto por aislamiento del virus como por PCR/ESI-MS, y los resultados se presentan en la Tabla 2. Para el aislamiento del virus, se detectaron virus respiratorios en 63 (23,6%) casos, incluyendo influenza A (48 casos, 18,0%), enterovirus (13, 4,9%) y virus de parainfluenza (2, 0,7%) y no se detectaron coinfección. El aislamiento del virus identificó infecciones adicionales de parainfluenza tipo 3 e enterovirus que no fueron encontradas por PCR/ESI-MS en 2 muestras. Por PCR/ESI-MS, se detectaron virus respiratorios en 126 casos (47,2%). La influenza A (65 casos, 24,3%) fue el virus identificado con mayor frecuencia, de los cuales 36 (13,5%) fueron subtipos como virus pandémico H1N1/09, 28 (10,5%) como virus estacional H3N2 y 1 caso como gripe A que coincide tanto con la pandemia H1N1 como con la estacional H3N2. El enterovirus Genus (34, 12,7%) fue el segundo virus detectado con mayor frecuencia, incluyendo rinovirus (25, 9,4%), enterovirus (8, 3,0%) y 1 caso de cultivo negativo para rinovirus y enterovirus. hCoV (13, 4,9%), hMPV (10, 3,7%), adenovirus (6, 2,2%), RSV (6, 2,2%) y parainfluenza (4, 1,5%) fueron detectados en pequeñas proporciones de casos. Se observó la detección simultánea de más de un virus respiratorio en 11 (4,1%) pacientes, y el rinovirus (5 casos) fue más probable que fuera codificado con otro virus respiratorio (Tabla 2). Cabe destacar que 4 virus cultivados identificados como enterovirus debido a la reactividad con la mezcla de Chemicon Pan EV fueron caracterizados como rinovirus por PCR/ESI-MS. Un análisis posterior de las secuencias de PCR de los 4 especímenes clínicos confirmó la existencia de rinovirus pero no enterovirus. PCR/ESI-MS identificó virus respiratorios adicionales en 65 muestras de cultivo negativo, principalmente rinovirus (21 muestras), y un segundo virus respiratorio en 3 muestras de influenza A positiva para cultivo. En general, las tasas positivas de detección de cualquier virus respiratorio por cultivo, PCR/ESI-MS, y ambos métodos fueron 23,6%, 47,2% y 47,9% (128/267), respectivamente. De los 61 especímenes positivos por ambos métodos, PCR/ESI-MS y métodos de cultivo alcanzaron niveles de concordancia del 100% en el nivel de especie para influenza y parainfluenza y del 100% en el nivel de género para el género Enterovirus. En el grupo de control, sólo 1 (2,4%) individuo sano testó positivo para un virus respiratorio (rhinovirus) por PCR/ESI-MS.Con respecto a los herpesvirus, PCR/ESI-MS identificó EBV, HSV-1, CMV y VZV en 128 (47,9%), 25 (9,4%), 7 (2,6%) y 2 (0,7%) muestras de casos de ITR, con tasas de detección similares observadas en el grupo de control.No hubo detección de poliomavirus, parvovirus B19, HSV-2, o virus HHV-8 en muestras de casos con ITR o el grupo de control. Se analizaron los casos positivos para cualquier virus respiratorio, ya sea por cultivo o por PCR/ESI-MS. Las tasas de detección positivas disminuyeron con la edad: 55,3%, 41,7% y 34,5% en los grupos de 18-39, 40-59 y!60 años, respectivamente (P 1⁄4 0,02) (Figura 1A). Se observó una tasa de positividad más alta en pacientes con URTIs que en pacientes con LRTIs (50,5% frente a 38,2%, P 1⁄4 0,10) (Tabla 3 y Figura 1B ). Hubo distribución similar de virus respiratorios en casos del centro clínico y médico local (Tabla 2), y entre pacientes de los 3 grupos de edad (Figura 1A ). De 128 casos con virus respiratorios identificables, la infección por el virus no-influenza fue más frecuente en pacientes con ITRL que en pacientes con ITRL (81,0% [17/21] vs. 48,6% [52/107], P 1⁄4 0,007). Rhinovirus (12,7%), influenza A (10,9%) y parainfluenza (7,3%) fueron los 3 virus respiratorios principales involucrados en 55 casos de ITRL, y la parainfluenza se observó con más frecuencia en el grupo ITRL que en el grupo IRTL (Tabla 3 y Figura 1B ). No hubo variación estacional en ningún virus respiratorio individual durante el período de 9 meses. De 128 pacientes con virus respiratorios identificables, el análisis univariado reveló que los pacientes con 1 de las siguientes afecciones tenían más probabilidades de presentar infecciones por virus respiratorios no influenza: estado inmunocomprometido, enfermedad pulmonar obstructiva crónica (EPOC) e insuficiencia renal crónica en diálisis (OR 5,4, IC 95% 1,2-25,5, P 1⁄4 0,02). El análisis multivariado demostró que el uso de esteroides era un factor de riesgo independiente para la infección por rinovirus (OR 15,3; IC 95% 1,5-154,7; P 1⁄4 0,02), la neoplasia maligna activa fue un factor de riesgo independiente para la infección por hMPV (OR 29,3; IC 95% 2,4-358, P 1⁄4 0,008), y la EPOC fue un factor de riesgo independiente para la infección por parainfluenza (OR 229,2; IC 95% 10,5-5020.8.Mientras se comparaban los grupos URTI y LRTI, los factores que se encontraron asociados con LRTI por análisis univariado incluyeron la vejez (60 años), un índice de comorbilidad alto, insuficiencia cardíaca congestiva, EPOC, neoplasia, estado inmunocomprometido y detección de parainfluenza o VEB, mientras que la detección de influenza A se aso De los 117 episodios de infecciones por virus respiratorios, la artralgia se observó con más frecuencia en infecciones por influenza A que en infecciones por no gripe (66,1% [39/59] vs. 46,6% [27/58], P 1⁄4 0,033); para estos 2 tipos de infecciones, los otros síntomas examinados, incluyendo dolor de garganta, rinorrea, tos, esputo purulento, sibilancias, disnea y dolor de cabeza, fueron detectados a frecuencias similares. De 55 casos de IRT, la coinfección con patógenos bacterianos por cultivo de esputo o cultivo de sangre se encontró en 3 (8,8%) de 34 pacientes que dieron positivo para virus respiratorios y en 2 (9,5%) de 21 pacientes que dieron negativo para virus respiratorios. Cuatro de los 6 casos de influenza A LRTI habían recibido oseltamivir. Dos pacientes fallecieron de neumonía y el empeoramiento de una neoplasia subyacente; uno de estos pacientes resultó positivo para HMPV, y el otro resultó negativo para virus respiratorios. Cuatro Nuestro estudio de la epidemiología viral de las ITR agudas adultas utilizando tecnología PCR/ESI-MS tiene 3 ventajas principales. Primero, ampliamos los estudios previos utilizando PCR/ESI-MS para la detección de virus respiratorios. El ensayo PLEX-ID Broad Viral I, que se dirige a enterovirus, rinovirus, herpesvirus, JC y BK poliomavirus, y parvovirus B19, y las pruebas del Virus Respiratorio PLEX-ID fueron adoptadas para la detección de múltiples virus respiratorios clínicamente relevantes. En segundo lugar, se incluyeron 2 grupos de control (pacientes con infecciones exclusivamente bacterianas e individuos sin infecciones activas) para eliminar artefactos falsos positivos de NATs y estimar la prevalencia de portadores asintomáticos detectables de virus respiratorios. En tercer lugar, este estudio incluyó a pacientes inmunocompetentes e inmunocomprometidos que visitaban una clínica local o un centro médico y que se presentaron con un URTI o LRTI, lo que refleja la verdadera epidemiología viral de los ITR adultos. Al complementar el método de cultivo convencional con PCR/ESI-MS, se logró un aumento de 2 veces en la tasa de detección de virus respiratorios, de 23,6% por cultivo solo a 47,9% por una combinación de ambos métodos. Se observó ganancia diagnóstica tanto para virus culturalbles, especialmente rinovirus, como para virus fastidiosos. Aunque no se comparó una NAT alternativa debido a limitaciones de volumen de muestra, se ha reportado que PCR/ ESI-MS tiene una alta sensibilidad (92,9-100%) y especificidad (99-100%) para la detección de virus respiratorios variables en relación con métodos inmunológicos y basados en PCR como ensayos estándar de oro, con la excepción de parainfluenza (sensibilidad 63,4%). 6 Coincidentemente, encontramos que la parainfluenza tipo 3 fue 1 de sólo 2 virus que no fueron detectados por PCR/ESI-MS. Las causas potenciales que contribuyeron a la menor tasa de detección de parainfluenza permanecen por explorar. La tasa de detección positiva (47,2%) para virus respiratorios por PCR/ESI-MS en el presente estudio fue similar a la de programas paralelos de vigilancia de adultos utilizando NATs (43,2-57%). 5,16-18 pero notablemente superior a un estudio anterior utilizando el sistema de biosensores Ibis T5000 (prototipo de PCR-ESI/ MS) utilizando el kit de vigilancia del virus respiratorio II (35,9%), probablemente porque el kit no fue diseñado para la detección de enterovirus y rinovirus. 8 El enterovirus y rinovirus, ambos miembros del género Enterovirus, contribuyeron al 13,1% de los casos de ITR en nuestro estudio y el 9.8-17,8% de los casos de adultos en otros estudios. 5, 16, 17 Considerando su prevalencia, el enterovirus y el rinovirus deben ser incluidos en los paneles de diagnóstico de virus respiratorios si se indica la detección viral integral. La tasa de codetección (4,1%) estaba dentro del rango de 2,0-7,2% que se ha reportado en otras partes. 5, 16, 17 y el rinovirus fue el virus más frecuentemente involucrado en las coinfección, 18 La influenza A y el rinovirus fueron los 2 virus respiratorios detectados con mayor frecuencia, mientras que hCoV, hMPV, enterovirus, adenovirus, VRS y parainfluenza fueron detectados en pequeñas proporciones de casos, lo cual es similar a la epidemiología viral de los IRT adultos observada por otros grupos de estudio. 5, 16, 17 Las distribuciones similares de virus entre los casos de una clínica local y un centro médico y entre los pacientes de los 3 grupos de edad sugieren que los individuos de todos los grupos de edad son susceptibles a múltiples virus respiratorios que circulan simultáneamente en la comunidad. Se observó una menor tasa de detección positiva en la población anciana, probablemente porque los pacientes adultos mayores arrojan títulos más bajos de virus. 19 Sin embargo, los roles de EBV, HSV-1 y CMV en los ITR adultos permanecen incompletos 20.Además, la asociación univariada entre EBV y LTTIs observada en este estudio puede haber sido causada por el factor de confusión de la edad, particularmente dado que la edad avanzada fue identificada como un factor independiente para la detección de EBV (datos no mostrados). La falta de detección del poliomavirus BK y JC o parvovirus B19 implica que estos virus juegan un papel menor en los ITR adultos y que las células orofaríngeas no están involucradas en la persistencia del poliomavirus BK y JC. 21 Además, la baja tasa de detección positiva de virus respiratorios en el grupo control sugiere una baja posibilidad de artefactos falsos positivos en PCR/ESI-MS o una menor tasa de colonización asintomática de virus respiratorios. Además de la ventaja de la detección sensible, PCR/ ESI-MS posee la capacidad de identificación simultánea de subtipos de virus respiratorios. 22 En este estudio, los virus influenza A fueron subtipos de gripe pandémica H1N1 influenza A y estacional H3N2 influenza. En Europa, ambos virus cocircularon en la comunidad en la temporada de gripe 2012-2013. 23 En el género enterovirus, el rinovirus ácido-lábil se puede diferenciar del enterovirus mediante una prueba de labilidad ácida. 24 mientras que PCR/ESI-MS puede diferenciar rápidamente las 2 especies en una sola prueba, como se demostró en nuestro estudio. Los 13 hCoV fueron subtipos como hCoV-OC43, -229E, y -HKU1, que fue validado además por ensayos convencionales de secuencia de PCR (datos no mostrados). El nuevo HCoV-NL63 identificado no fue detectado durante el periodo de estudio, y se reportó una baja tasa de detección (<1%) en China. 16 Nuestra comprensión de los roles de los virus respiratorios no-influenza en pacientes con comorbilidades o ITRL se ha fortalecido en nuestro estudio. Los pacientes que estaban bajo tratamiento con esteroides, tenían un malignidad activa, o padecían EPOC estaban en riesgo de infecciones por rinovirus, hMPV, o parainfluenza, respectivamente. En general, los pacientes inmunocomprometidos, los pacientes con EPOC y los pacientes sometidos a diálisis estaban en riesgo de infección por virus respiratorios no-influenza. Entre los ITRL, el rinovirus y la parainfluenza fueron clasificados como los patógenos más comunes en primer y tercer lugar, respectivamente, y la parainfluenza fue un factor independiente asociado a los ITRL, un hallazgo consistente con reportes previos de que ambos virus son causas significativas de ITRL. 18, [25] [26] [27] Por otro lado, a pesar de un papel creciente de los virus respiratorios no-influenza, los agentes antivirales y las vacunas actualmente disponibles se dirigen principalmente a la infección por gripe. Aunque la ITR viral es una enfermedad autolimitada, como se observa en la mayoría de nuestros pacientes con ITRL que se recuperaron de la enfermedad sin la ayuda de agentes antivirales, un diagnóstico etiológico definido puede ayudar a reducir el uso injustificado de agentes antiinfluenza o antimicrobianos y/o hospitalizaciones innecesarias, y proporcionar información útil para Sin embargo, observamos que la diferenciación clínica de la infección por influenza de otras infecciones por virus respiratorios es difícil debido a la superposición de síntomas, como se ha descrito anteriormente. 5 En conjunto, la asociación de la infección por el virus de la no gripe con pacientes con comorbilidades o ITSL aquí reportados sugiere que un panel viral respiratorio completo sería apropiado en el diagnóstico de ITR en estas poblaciones. Los costos adicionales incurridos por el uso de un panel completo de evaluaciones basadas en PCR/ESI-MS u otras pruebas moleculares probablemente serían compensados por las reducciones concomitantes en terapia antimicrobiana innecesaria y/o hospitalización. 18 Nuestro estudio tiene algunas limitaciones. Primero, los virus respiratorios parainfluenza de tipo 4 y 3 recién identificados, bocavirus humano, poliomavirus humano KI y poliomavirus WU no fueron incluidos en los paneles. [28] [30] [31] y sus funciones en I En segundo lugar, aunque se han identificado ciertos factores de riesgo para infecciones virales específicas, como las infecciones por hMPV o parainfluenza, estas asociaciones deben ser reexaminadas en estudios clínicos a gran escala adicionales, y debe explorarse el impacto clínico y los mecanismos subyacentes de estas asociaciones. Asimismo, pueden ser necesarios más casos de control para estimar mejor la prevalencia de portadores asintomáticos de virus respiratorios. En tercer lugar, sólo se cubrieron 3 temporadas y no se pudo demostrar la estacionalidad de las infecciones respiratorias virales. En conclusión, en comparación con el aislamiento del virus, PCR/ESI-MS produjo un mayor rendimiento diagnóstico para las ITR virales, con una baja posibilidad de artefactos falsos positivos. La infección por virus respiratorios no-influenza se relacionó significativamente con pacientes con comorbilidades y con ITRL. Se justifican estudios adicionales para delinear la necesidad clínica y los beneficios económicos de incluir
question: ¿Cuál era el propósito de este estudio?
answers.text: investigar exhaustivamente la epidemiología viral de los ITR adultos