context: No hay pruebas creíbles que apoyen las afirmaciones de la ingeniería de laboratorio del SARS-CoV-2https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7054935/SHA: 5a9154aee79901dd8fecd58b7bcd9b7351102d24Autores: Liu, Shan-Lu; Saif, Linda J.; Weiss, Susan R.; Su, LishanFecha: 2020-02-26DOI: 10.1080/22217501.2020.1733440Licencia: cc-byAbstract: nanTexto: La aparición y el brote de una enfermedad respiratoria aguda recientemente descubierta en Wuhan (China) ha afectado a más de 40.000 personas y ha matado a más de 1.000 al 10 de febrero de 2020. Se identificó rápidamente un nuevo coronavirus humano, el SARS-CoV-2, y la enfermedad asociada se conoce ahora como enfermedad por coronavirus descubierta en 2019 (COVID-19) (https://globalbiodefense. com/novel-coronavirus-covid-19-portal/). De acuerdo con lo que se ha informado [1] [2] [3], COVID-2019 parece tener manifestaciones clínicas similares a la del síndrome respiratorio agudo grave (SARS) causado por el SARS-CoV. La secuencia del genoma del SARS-CoV-2 también tiene una identidad del 80% con el SARS-CoV, pero es más similar a algunos beta-coronavirus de murciélagos, siendo el más alto > 96% de identidad [4, 5]. Actualmente, existen especulaciones, rumores y teorías de conspiración que el SARS-CoV-2 es de origen de laboratorio. Algunas personas han alegado que el SARS-CoV-2 humano se filtró directamente de un laboratorio en Wuhan, donde se informó recientemente de un murciélago CoV (RaTG13), que compartió la homología del 96% con el SARS-CoV-2 [4]. Sin embargo, como sabemos, el SARS-CoV humano y el Civet de palma huésped intermedio SARSlike CoV compartieron la homología del 99,8%, con un total de 202 variaciones de un solo nucleótido (nt) identificadas a través del genoma [6]. Dado que hay más de 1.100 diferencias nt entre el SARS-CoV-2 humano y el murciélago RaTG13-CoV [4], que se distribuyen a través del genoma en un patrón natural que ocurre siguiendo las características evolutivas típicas de CoVs, es muy improbable que RaTG13 CoV sea la fuente inmediata del SARS-CoV-2 La ausencia de un patrón objetivo lógico en las nuevas secuencias virales y un pariente cercano en una especie de vida silvestre (bats) son los signos más reveladores de que el SARS-CoV-2 evolucionó por la evolución natural. Se necesita una búsqueda de un huésped animal intermedio entre murciélagos y humanos para identificar a los animales CoVs más estrechamente relacionados con el SARS-CoV-2 humano. Se especula que los pangolinas podrían llevar CoVs estrechamente relacionados con el SARS-CoV-2, pero los datos para fundamentar esto aún no se han publicado (https:// www.nature.com/articcles/d41586-020-00364-2). Otra afirmación en las redes sociales chinas apunta a un artículo de Nature Medicine publicado en 2015 [7], que informa de la construcción de un CoV quimérico con un gen CoV S murciélago (SHC014) en la columna vertebral de un SARS CoV que se ha adaptado para infectar ratones (MA15) y es capaz de infectar células humanas [8]. Sin embargo, esta afirmación carece de cualquier base científica y debe ser descartada debido a una divergencia significativa en la secuencia genética de este constructo con el nuevo SARS-CoV-2 (> 5.000 nucleótidos). El virus SARS adaptado al ratón (MA15) [9] fue generado por el paso en serie de un clon de SARS CoV infeccioso en el tracto respiratorio de los ratones BALB/c. Después de 15 pasajes en ratones, el SARS-CoV obtuvo replicación elevada y patogénesis pulmonar en ratones envejecidos ( Es probable que el MA15 sea altamente atenuado para replicarse en células humanas o pacientes debido a la adaptación del ratón. Se propuso que el gen S de CoV derivado del murciélago, a diferencia de que de los pacientes humanos o virus derivados del civets, no fue capaz de utilizar el ACE2 humano como receptor para la entrada en células humanas [10, 11]. Se propuso que los civets fueran un huésped intermedio de los bat-CoV, capaz de propagar el SARS CoV a los humanos [6, 12]. Sin embargo, en 2013 varios nuevos coronavirus de murciélagos fueron aislados de murciélagos de herradura chinos y el murciélago SARS-like o SL-CoV-WIV1 fue capaz de utilizar ACE2 de humanos, civets y murciélagos de herradura chinos para la entrada [8]. Combinado con la evidencia evolutiva de que el gen murciélago ACE2 ha sido seleccionado positivamente en los mismos sitios de contacto que el gen humano ACE2 para interactuar con SARS CoV [13], se propuso que un huésped intermedio puede no ser necesario y que algunos murciélagos SL-CoV pueden ser capaces de infectar directamente a los huéspedes humanos. Para hacer frente directamente a esta posibilidad, el gen S exacto del coronavirus murciélago SL-SHC014 fue sintetizado y utilizado para generar un virus quimérico en la columna vertebral del ratón adaptado MA15 SARS-CoV. El resultante virus SL-SHC014-MA15 podría efectivamente utilizar eficientemente ACE2 humano y replicarse en células de la vía aérea humana primaria a títulos similares a cepas epidémicas de SARS-CoV. Mientras que SL-SHC014-MA15 puede replicarse de manera eficiente en los pulmones de ratón jóvenes y envejecidos, la infección fue atenuada, y menos antígeno del virus estaba presente en el epitelio de las vías respiratorias en comparación con el SARS MA15, que causa resultados letales en ratones ancianos [7]. Debido a la elevada actividad patógena del virus quimérico SHC014-MA15 en relación con el virus quimérico MA15 con el gen SRAS S humano original en ratones, tales experimentos con el virus quimérico SL-SHC014-MA15 fueron restringidos posteriormente como ganancia de la función (GOF) bajo la política de pausas mandada por el gobierno de los Estados Unidos (https://www.nih.gov/about-nih/who-were/nih-director/statements/nih-lifts La actual epidemia de COVID-2019 ha reiniciado el debate sobre los riesgos de construir tales virus que podrían tener potencial pandémico, independientemente del hallazgo de que estos murciélagos CoVs ya existen en la naturaleza. Sin embargo, tras análisis filogenéticos cuidadosos por múltiples grupos internacionales [5, 14], el SARS-CoV-2 es sin duda distinto de SL-SHC014-MA15, con > 6.000 diferencias de nucleótidos en todo el genoma. Por lo tanto, una vez más no hay pruebas creíbles que apoyen la afirmación de que el SARS-CoV-2 se deriva del virus de SL-SHC014-MA15 quimérico. También hay rumores de que el SARS-CoV-2 fue artificialmente, o intencionalmente, hecho por humanos en el laboratorio, y esto se destaca en un manuscrito enviado a BioRxiv (un sitio de intercambio de manuscritos antes de cualquier revisión por pares), alegando que el SARS-CoV-2 tiene secuencia de VIH en él y por lo tanto fue probablemente generado en el laboratorio. En un artículo de refutación dirigido por un virólogo VIH-1 Dr. Feng Gao, utilizaron análisis bioinformáticos cuidadosos para demostrar que la afirmación original de múltiples inserciones de VIH en el SARS-CoV-2 no es específica del VIH-1 sino aleatoria [15]. Debido a las muchas preocupaciones planteadas por la comunidad internacional, los autores que hicieron la afirmación inicial ya han retirado este informe. La evolución es gradual y acumula mutaciones gradualmente con el tiempo, mientras que los constructos sintéticos normalmente usarían una espina dorsal conocida e introducirían cambios lógicos o dirigidos en lugar de las mutaciones que ocurren al azar que están presentes en virus naturalmente aislados como el murciélago CoV RaTG13. En nuestra opinión, actualmente no hay evidencia creíble para apoyar la afirmación de que el SARS-CoV-2 se originó a partir de una CoV diseñada por un laboratorio. Es más probable que el SARS-CoV-2 sea un CoV recombinante generado en naturaleza entre un murciélago CoV y otro coronavirus en un huésped animal intermedio. Se necesitan más estudios para explorar esta posibilidad y resolver el origen natural del SARS-CoV-2. Debemos enfatizar que, aunque el SARS-CoV-2 no muestra evidencia de origen de laboratorio, los virus con tan grandes amenazas para la salud pública deben ser manejados correctamente en el laboratorio y también debidamente regulados por la comunidad Susan R. Weiss http://orcid.org/0000-0002-8155-4528
question: ¿Cómo se refiere el SARS-CoV-2?
answers.text: como enfermedad por coronavirus descubierta en 2019 (COVID-19)