context: Etiología de las infecciones agudas del tracto respiratorio en niños hospitalizados en Chiprehttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4720120/SHA: efd27ff0ac04dd6083266386aaebb5df80f4fa9Autores: Richter, Jan; Panayiotou, Christakis; Tryfonos, Christina; Koptides, Dana; Koliou, Maria; Kalogirou, Nikolas; Georgiou, Eleni; Christodoulou, ChristinaFecha: 2016-01-13DOI: 10.1371/journal.pone.0147041Licencia: cc-byAbstract: Para mejorar la gestión clínica y la prevención de las infecciones virales en niños hospitalizados se necesita una mejor comprensión etiológica. El objetivo del presente estudio fue evaluar el espectro de patógenos virales respiratorios en niños ingresados en el hospital con infecciones agudas de las vías respiratorias en Chipre, para lo cual se recogieron muestras de hisopos nasofaríngeos de 424 niños menores de 12 años con infecciones agudas de las vías respiratorias durante tres temporadas epidémicas y se analizaron para detectar la presencia de los 15 virus respiratorios más comunes; se identificó un patógeno viral en el 86% de las muestras, observándose múltiples infecciones en casi el 20% de las muestras; los virus detectados con mayor frecuencia fueron VRS (30,4%) y Rhinovirus (27,4%). El VRS mostró una estacionalidad clara con picos marcados en enero/febrero, mientras que las infecciones por rinovirus no mostraron una estacionalidad pronunciada casi a lo largo del año; mientras que la incidencia de VRS y PIV3 disminuyó significativamente con la edad, Los datos presentados amplían nuestra comprensión de la epidemiología de las infecciones de las vías respiratorias virales en los niños chipriotas y serán útiles para los médicos e investigadores interesados en el tratamiento y control de las infecciones de las vías respiratorias virales. Texto: Las infecciones de las vías respiratorias virales (IRT) representan un importante problema de salud pública debido a su incidencia mundial, facilidad de transmisión y morbilidad y mortalidad considerables que afectan a personas de todas las edades. Los niños son, en promedio, infectados dos o tres veces más frecuentemente que los adultos, siendo las ITR agudas la infección más común en la infancia [1,2]. Las enfermedades causadas por virus respiratorios incluyen, entre otras, resfriados comunes, faringitis, crup, bronquiolitis, neumonía viral y otitis media. El diagnóstico rápido es importante no sólo para la intervención terapéutica oportuna sino también para la identificación de una epidemia de gripe inicial y la evitación del tratamiento antibiótico innecesario [3 La ITR aguda es más común en niños menores de 5 años y representa entre el 30% y el 50% de las admisiones médicas pediátricas, así como entre el 20% y el 40% de las hospitalizaciones en niños. Las infecciones respiratorias se agrupan durante el invierno y principios de los meses de primavera. Entre los principales agentes virales figuran el virus sincitial respiratorio (VSR), los virus influenza A y B (INF-A, INF-B), los virus parainfluenza (VPI) y los adenovirus humanos (VHAd). Además, hay una lista cada vez mayor de nuevos virus respiratorios que contribuyen significativamente a la carga de infecciones respiratorias agudas, como el metapneumovirus humano (VPH) recientemente identificado y el Bocavirus humano (VHBo) [5]. Las ITR agudas se clasifican como ITR superior (UTRI) e inferior (ITR), según la localización anatómica Las URTIs causan epidemias no graves pero generalizadas que son responsables de la circulación continua de patógenos en la comunidad. Las LRTIs han sido clasificadas como neumonía franca y bronquiolitis con características clínicas, radiológicas y etiológicas que normalmente se superponen [6, 7]. Los virus son nuevamente los principales agentes de las LRTIs a menudo mal diagnosticadas como bacterias de origen y, por lo tanto, tratadas con antibióticos innecesariamente [8]. El objetivo principal de este estudio fue determinar la etiología de las infecciones respiratorias agudas en niños chipriotas y evaluar la epidemiología de los patógenos virales identificados durante tres temporadas epidémicas. El estudio fue aprobado por el Comité Nacional de Bioética de Chipre. Entre noviembre de 2010 y octubre de 2013, se recogieron 485 muestras de hisopos nasofaríngeos de niños de hasta 12 años de edad, que habían sido hospitalizados con infección aguda del tracto respiratorio en el hospital Arzobispo Makarios III de Nicosia. Se registraron datos clínicos y demográficos que incluían síntomas, duración de la hospitalización, diagnóstico y tratamiento. Se recogieron muestras de hisopos nasales utilizando el kit de recogida de transporte viral universal de BD. Se extrajo ARN/DNA viral de 400 μl de muestra utilizando el kit de virus iPrep PureLink en un instrumento de purificación iPrep (Invitrogen). Se estableció y validó un conjunto de cuatro ensayos multiplex de RT-PCR en tiempo real para la detección de los 15 virus respiratorios más comunes de la siguiente manera: ensayo 1: influenzavirus A y B, RSV, ensayo 2: parainfluenzavirus 1-4, ensayo 3: HAdV, enterovirus, HMPV y HBoV y ensayo 4: rinovirus y los coronavirus humanos OC43, NL63 y 229E (Tabla 1). Se utilizaron conjuntos de imprimación y sonda publicados como base para diseñar los ensayos, sin embargo, todas las secuencias de primos/sondas fueron verificadas con alineaciones de secuencias de nueva construcción de todos los virus probados y fueron modificadas, si fuera necesario, para tener en cuenta posibles variaciones de secuencia. Para ello, se obtuvieron todas las secuencias del genoma completo disponibles para cada virus de GenBank, importadas en el Editor de Alineación de Secuencias de BioEdit v7.1.7 y alineadas utilizando ClustalX. En caso de desajustes entre las secuencias de primos/sondas publicadas y las secuencias de destino, se aplicaron modificaciones, como se indica en la Tabla 1. Las alineaciones para los virus, que requerían cambios en los primos/sondas están disponibles en Fasta-Format como suplemento S1-S4 Files. Las concentraciones de primos y las condiciones de reacción para los cuatro ensayos se optimizaron posteriormente para multiplexar. Para evaluar la sensibilidad y especificidad de los ensayos, el laboratorio inscrito durante dos años consecutivos en Control de Calidad para Diagnósticos Moleculares (QCMD) esquemas de evaluación de calidad externa para todos los virus, excepto Bocavirus, que no Se evaluó una posible correlación de prevalencia de virus y edad de infección mediante análisis univariados, se utilizó la prueba exacta de Fisher donde se encontraron recuentos celulares menores de 5 años; de lo contrario, se realizó la prueba de chi-cuadrado; se utilizaron las mismas pruebas estadísticas para comparar la frecuencia de sujetos con infecciones únicas o múltiples entre grupos de edad; además, se utilizó la correlación de Pearson para examinar coinfecciones de diferentes virus; todos los análisis estadísticos se realizaron con StataSE 12 (StatCorp. 2007. College Station, TX, EE.UU.); el presente estudio fue una investigación prospectiva de niños hospitalizados con infecciones respiratorias agudas entre noviembre de 2010 y octubre de 2013 en Chipre; la mediana de edad de los niños fue de 15 meses (rango: 0-140 meses) con 243 hombres y 181 mujeres (proporción masculino/ femenino 1.34). La distribución de la edad se muestra en la figura Los resultados se resumen en la Tabla 2.Los virus más comúnmente detectados fueron el VRS, que se encontró en 129 (30,4%) pacientes y rinovirus en 116 (27,4%) que representan en conjunto casi el 60% de todas las detecciones; con frecuencia moderada se ha detectado VHAd en 31 (7,3%) pacientes, influenza A en 28 (6,6%), HBoV en 24 (5,7%), enterovirus y IVP 3 en 23 (5,4%) pacientes respectivamente, y Influenza B en 21 (5,0%); una baja frecuencia fue exhibida por VPHM con 16 (3,8%) muestras positivas, coronavirus humano OC43 con 13 (3,1%), IVP 1 con 12 (2,8%), IVP 4 con 9 (2,1%), IVP 2 con 7 (1,7%) y VPH NL63 con 6 (1,4%). Coronavirus 229E sólo se pudo detectar en una sola muestra. Las coinfecciones con dos o más virus fueron observadas en 84 de las 364 muestras positivas (ver Tabla 2 ). Las infecciones duales representaron el 17% de todas las muestras positivas y tres virus fueron detectados en el 2,7% de las muestras). Una muestra de un solo paciente mostró una infección cuádruple siendo simultáneamente positiva para VRS, rinovirus, HBoV e influenza B. La Tabla 3 resume la frecuencia de cada virus en infecciones individuales vs. múltiples, así como el número de co-ocurrencias de virus para cada posible combinación de virus. En términos absolutos la combinación más común observada fue VRS/rhinovirus. Sin embargo, como porcentaje, el virus que aparece con mayor frecuencia en infecciones fue VHBo, que se encontró en más del 70% de los casos junto con otro virus, seguido por coronavirus HCoV OC43 y HCoV NL63 con 61% y 67%, respectivamente Por otro lado, los virus más raramente observados en las coinfecciones fueron los virus influenza A y B, así como el VRS. Se calcularon coeficientes de correlación de Pearson para examinar la probabilidad de coinfecciones de diferentes virus. Los resultados del análisis se resumen en la Tabla 1 en la Tabla S1. Se observó correlación significativa (valor P < 0,05) principalmente para coinfecciones con VRS, sin embargo las correlaciones fueron muy débiles (r<0,3) y negativas. Este hallazgo puede explicarse probablemente por el hecho de que las infecciones por VRS ocurrieron predominantemente en los más jóvenes, donde las coinfecciones fueron menos frecuentes. Por otro lado, se observó una correlación positiva significativa para enterovirus y coinfección por rinovirus, lo que puede indicar similitudes en los patrones de circulación y/o modos de transmisión. En cuanto a la estacionalidad, se observaron diferentes patrones de circulación para el VRS, rinovirus y virus influenza (combinados A y B) (Fig 2), con una estacionalidad clara del VRS y la gripe con picos marcados en enero/febrero, mientras que las infecciones por rinovirus no mostraron una estacionalidad pronunciada casi a lo largo del año. Sin embargo, como se han identificado más de 100 cepas diferentes de rinovirus que circulan en todo el mundo en paralelo y sucesivamente, una estacionalidad potencial de serotipos individuales de rinovirus puede ser enmascarada por patrones superpuestos [18, 19]. Los datos fueron analizados con respecto a la distribución por edades de la infección viral (ver Tabla 2 ). En lactantes de hasta 3 meses de edad, el VRS fue con diferencia el patógeno más común (58,1%), seguido por el rinovirus (20,3%) y La incidencia de VRS, sin embargo, disminuye significativamente con el aumento de la edad (valor p < 0,0001) bajando al 13% en niños mayores de 3 años, mientras que la relación inversa se observa para Influenza A y B y HAdV. Los rinovirus, HBoV y enterovirus se observan con mayor frecuencia en niños de 4 meses a 3 años de edad. La dependencia de la edad de la incidencia del virus se visualiza en la figura 3 para los siete virus más frecuentemente observados. La tasa de positividad también mostró una tendencia según el grupo de edad descendiendo del 90,5% en niños menores de 3 meses al 78,3% en niños de 4-12 años (valor p = 0,020). Esto puede indicar un papel creciente de patógenos no incluidos en los ensayos, tales como infecciones bacterianas en niños mayores. En cuanto a las infecciones múltiples, los niños menores de 3 meses de edad y los mayores de 4 años tenían un riesgo significativamente menor de presentar infecciones múltiples en comparación con los otros dos grupos de edad (valor p = 0,014). Esto puede deberse a que los niños muy pequeños tienen un contacto limitado con otros, lo que reduce la posibilidad de una coinfección, mientras que los niños mayores de 3 años ya establecieron inmunidad a un número cada vez mayor de virus encontrados anteriormente. Este estudio examinó por primera vez la etiología de las infecciones respiratorias agudas en niños hospitalizados en Chipre. Se desarrollaron cuatro ensayos multiplex de RT-PCR en tiempo real con el fin de detectar los patógenos virales respiratorios más comunes de manera rápida y rentable. La alta tasa de muestras positivas (85,8%) es prueba de la alta sensibilidad de los ensayos multiplex utilizados y de que la gama de virus incluidos en el análisis es exhaustiva. Muchos estudios previos han mostrado tasas de detección que oscilan entre el 50% y el 75% [20] [22] [23] [24]. Los virus más comunes detectados fueron el VRS y el rinovirus que representan casi el 60% de todos los casos. Ambos virus fueron reportados anteriormente por otros como la mayor etiología para infecciones virales respiratorias en niños pequeños con rinovirus siendo cada vez más reconocidos por su papel en infecciones del tracto respiratorio inferior [20, [25] [26] [28] [30]. Nuestros datos apoyan los resultados de estudios similares realizados en la región de Oriente Medio. Un estudio publicado recientemente encontró que el VRS fue el virus más comúnmente detectado en hisopos nasofaríngeos de niños que presentaban síntomas de ITR y además mostró que las infecciones por VRS siguen un patrón de circulación similar que alcanzó su punto máximo entre diciembre y marzo [31]. Otro estudio ha revelado que la incidencia de VRS y IVP3 disminuye significativamente con la edad, mientras que lo contrario se observa para las infecciones por influenza y adenovirus, tendencia que también se observó en nuestro estudio [26]. Se observaron infecciones mixtas en aproximadamente el 20% de todas las muestras, lo que se encuentra en medio de tasas previamente reportadas que oscilan entre el 10 y casi el 40%. Se encontró HBoV, HCoV y EV con mayor frecuencia en las coinfecciones. Los tres subtipos de VHCo fueron codetectados con varios otros virus, mientras que HBoV fue codetectado principalmente con VHR y VRS. En el caso de infecciones por EV, el EV estuvo casi asociado con la VHR. También se observó la rara presencia de virus InfA e InfB en múltiples infecciones observadas en nuestro estudio [32, 33]. A pesar de que este estudio no permitió investigar una posible asociación entre infecciones múltiples y gravedad de la enfermedad, una revisión de la literatura muestra que tal posible asociación sigue siendo objeto de controversia, ya que hay informes que muestran que no hay relación de infección por virus múltiples con la gravedad de la enfermedad de respiración por un lado o una asociación significativa por el otro. Los estudios han demostrado que la coinfección viral estuvo significativamente asociada con la mayor duración de los síntomas de la enfermedad, pero con una disminución de la gravedad en niños hospitalizados con respecto a la necesidad de oxígeno y la admisión en unidades de cuidados intensivos, mientras que los hallazgos de otros estudios han indicado que los fenotipos clínicos graves fueron más prevalentes en pacientes de coinfección, especialmente en coinfección por VRS que pueden aumentar la gravedad de la enfermedad asociada con VRS en niños [25, [34] [36] [37] [39] [39] [40]. Las infecciones respiratorias virales Dado que los síntomas clínicos de los pacientes con infecciones agudas de las vías respiratorias no suelen permitir una discriminación de la etiología viral o bacteriana, se requieren herramientas de diagnóstico rápidas y fiables para una mejor administración de antibióticos y la aplicación de medidas adecuadas de control de las infecciones [4, 41]. Los datos presentados amplían nuestra comprensión de la epidemiología de las infecciones virales de las vías respiratorias en los niños chipriotas y serán útiles para los médicos e investigadores interesados en el tratamiento y control de las infecciones de las vías respiratorias virales.
question: ¿Cuál es la incidencia de VRS en niños mayores de 3 años?
answers.text: 13%