વર્ષ ૨૦૦૬માં શ્રદ્ધાળુઓનો પ્રથમ જથ્થો પહોંચે તે પહેલા જ બાબા બરફાની લુપ્તપ્રાય થઈ ચૂક્યા હતા. એ વખતે શ્રી અમરનાથ શ્રાઈન બોર્ડે એક અભ્યાસ પણ કરાયો હતો. નિષ્ણાતોની ટીમે પવિત્ર ગુફા તથા આસપાસના વિસ્તારોમાં થઈ રહેલ ક્લાઈમેટ ચેઈન્જ અને તેના કારણોનો અભ્યાસ કર્યો હતો.