૧૯૨૩માં બાંગ્લાદેશમાં આવેલા પૂરમાં લાખો લોકો બેઘર થયા હતા. ભૂખ્યા અને બેઘર લોકો માટે પ્રફુલ્લચંદ્ર રાયે બંગાળ રિલીફ કમિટીની સ્થાપના કરી, જેમાં તેમણે આર્િથક ભંડોળ ઊભું કર્યું અને અસરગ્રસ્ત વિસ્તારમાં સહાયતા પૂરી પાડી હતી. તેઓ નિયમિત રીતે બ્રહ્મ સમાજ, બ્રહ્મ ગર્લ્સ સ્કૂલ અને ઇન્ડિયન કેમિકલ સોસાયટીમાં આર્િથક સહાય આપતા.