આ અગાઉ કેન્દ્ર સરકાર દ્વારા કોર્ટમાં કરાયેલ અરજીમાં કહેવામાં આવ્યું હતુ કે રોહિંગ્યા દેશની સુરક્ષા માટે ખતરો છે એટલા માટે તેઓનું ભારતમાં રહેવુ ઠીક નથી. કેન્દ્ર સરકારે કોર્ટમાં એમ પણ કહ્યું કે આ મામલો કાર્યપાલિકાનો છે અને તેમાં ઉચ્ચ કોર્ટ હસ્તક્ષેપ ના કરે. સરકારનો આરોપ છે કે રોહિંગ્યા મુસલમાનો નેપાળ અને બાંગ્લાદેશના રસ્તેથી ભારતમાં ઘૂસણખોરી કરી છે અને સુરક્ષાને નજરમાં રાખી તેઓને પરત મોકલવા જોઇએ.