નાના આંતરડાના માળખાકીય અસાધારણતા: હોજરીનો બાયપાસ સર્જરી, નાના આંતરડાના ડાઇવર્ટિક્યુલા, આંધળો લૂપ, આંતરડાની અવરોધ, અને ક્રોહન રોગ ભગંદર એ કેટલાક માળખાકીય પરિબળો છે જે બેક્ટેરિયલ અતિશય વૃદ્ધિમાં સામેલ હોઈ શકે છે.