ઇશરત જહાં અમદાવાદમાં ૨૦૦૪માં એક એન્કાઉન્ટરમાં તેના ત્રણ સાથીઓ સાથે ઠાર મરાઇ હતી. જોકે આ એન્કાઉન્ટર નકલી હોવાના આક્ષેપ થતાં હોબાળો થયો હતો અને તેના આરોપસર ગુજરાત પોલીસના કેટલાક અધિકારીઓને જેલની હવા ખાવાનો પણ વારો આવ્યો હતો. ગુજરાત પોલીસનો દાવો હતો કે ઇશરત જહાં રાજયના તત્કાલિન સીએમ નરેન્દ્ર મોદી તેમજ ભાજપના નેતા અડવાણી તેમજ વીએચપીના નેતા પ્રવિણ તોગડીયાની હત્યા કરવાના ઇરાદા સાથે ગુજરાત આવી હતી.