આ સેસની આવક વડાપ્રધાન નરેન્દ્ર મોદીની મહત્ત્વાકાંક્ષી 'સ્વચ્છ ભારત' યોજના પાછળ વાપરવામાં આવશે. આ મુદ્દે નાણા મંત્રાલયે સ્પષ્ટતા કરતા કહ્યું છે કે, જે સર્વિસ ૧૫મી નવેમ્બર પહેલાં મેળવાઈ હશે અને જેના ઈનવોઈઝ ૨૯મી નવેમ્બર પહેલાં બન્યા હશે એ તમામ સર્વિસ પર સ્વચ્છ ભારત સેસ લાગુ નહીં પડે. સ્વચ્છ ભારત સેસની વસૂલાતથી સરકારને રૃ. ૧૦૦ની કરવેરા પાત્ર સેવા પર ૫૦ પૈસા કર ભરવો પડશે.