સબાસ્ટિયન ક્યારેય લગ્ન નહોતા, અને 4 ઓગસ્ટ, 1578 ના રોજ મોરોક્કો સામે યુદ્ધના ઝુંબેશના પ્રયાસમાં યુદ્ધમાં મૃત્યુ પામ્યા.