ઝઘડિયા એપીએમસીમાં વેપારી વિભાગ, ખેડૂત વિભાગ અને સહકારી ખરીદ વેચાણ મંડળી વિભાગ એમ ત્રણ વિભાગનો સમાવેશ થાય છે.