કમ્પાઉન્ડ હેટરોઝાઇગસ મ્યૂટેટેશન એ જ જનીન માટે બંને એલિલેટ્સ પર થાય છે તેવા વિવિધ પરિવર્તનના પરિણામે થાય છે.