જેકેએલએફ અધ્યક્ષ પર તત્કાલીન કેન્દ્રીયમંત્રી મુફ્તી મોહમ્મદ સઇદની દીકરી રુબૈયા સઇદનું ૧૯૮૯માં અપહરણ કરવા અને ૧૯૯૦ના શરુઆતના દોરમાં ભારતીય વાયુસેનાના ૪ કર્મચારીઓની હત્યામાં કથિતરુપે સામેલ હોવાનો આરોપ છે.