તેમ છતાં પ્રોબાયોટીક્સ લેવા સાથે સંકળાયેલી ઘણી આડઅસરો દેખાતા નથી, હાલ માટે, આ પ્રોડક્ટ્સને વ્યાપક રીતે લાંબા-ગાળાની અભ્યાસ કરવામાં આવ્યો નથી.