કાર્નિટિના પૂરવણીઓમાં અનિચ્છનીય આડઅસરો હોઈ શકે છે તેઓ ઊબકા, વધતી જતી ભૂખ, એક માછલી જેવા શરીરના ગંધ, અને મોટા ડોઝ (દરરોજ પાંચ ગ્રામથી વધુ) માં લેવાતી વખતે રશ થઈ શકે છે.