અભિનય બાદ શેખરે દિગ્દર્શન ક્ષેત્રે ઝંપલાવ્યું અને 1987માં મિસ્ટર ઇન્ડિયા ફિલ્મનું દિગ્દર્શન કર્યું કે જે ભારતીય સિને જગતની એક સફળતમ ફિલ્મ ગણાય છે.