બીજું, ગુનાની તપાસ પદ્ધતિએ શક્તિશાળી ગુનેગારો સામે પોતાને નિઃસહાય પુરવાર કરી છે. એ તો સ્પષ્ટ જ છે કે તપાસ એજન્સીઓ, સ્થાનિક પોલીસ, સીબીઆઈ કે એનઆઈએ માર્શાલિંગમાં, અસરકારક કાયદાકીય વ્યવસ્થામાં ઝડપથી માન્યતા મેળવતા એવા પ્રથમદર્શી પુરાવાને રક્ષણ આપવામાં એક સરખી રીતે અસમર્થ રહ્યા છે. સાક્ષીઓ હોસ્ટાઇલ થાય છે, ન્યાયમૂર્તિઓની બદલી થાય છે અને મુકદ્દમા એજન્સીઓ બદલાવી એ ગંભીર ચિંતાજનક વિષય છે અને તેનાથી આપણા ગણતંત્ર માટે લાંબા ગાળાના કમજોર પરિણામો ભોગવવાની સાથે તપાસ પ્રણાલી અને ન્યાયતંત્ર ઉપરથી લોકોનો ભરોસો નબળો પડ્યો છે. સોહરાબુદ્દીન કેસની સુનાવણી કરનાર જજ લોયાના મૃત્યુનો વિવાદથી આ ભયમાં નોંધપાત્ર વધારો થયો છે, ખાસ કરીને જ્યારે સર્વોચ્ચ અદાલતે પણ વધતા જતા નુકશાનકારક પુરાવાની નોંધ લેવાનો ઇનકાર કર્યો ત્યારે.