બધી વિવિધતાઓની સાથે સાથે વારાણસી આયુર્વેદ અને યોગના પ્રાચીન સમગ્ર ચિકિત્સા વિગ્નાન સાથે પણ જોડાયેલુ છે. આ વિગ્નાનના સંસ્થાપક મહર્ષિ પતંજલિનો વારાણસી સાથે ગાઢ સંબંધ છે.