હિસ્ટોલોજીનો નકારાત્મક પાસા એ માનવ પરિબળ છે, કારણ કે આ વિશ્લેષણનું સંચાલન તે બધા ડૉક્ટરના અનુભવ અને કુશળતા પર આધારિત છે.