કેટલાક મુસ્લિમ સંગઠનોએ મોહન ભાગવતના આ નિવેદનની નિંદા કરી હતી અને સુપ્રીમ કોર્ટના નિર્ણય પર પડકાર ગણાવ્યો હતો.