પેનિસમાં આ પ્રકારના દુખાવો થવા પાછલ ઘણાં કારણો જવાબદાર હોય છે. ઘણી વખત એવું થાય છે કે ડૉક્ટરને પણ આ પ્રકારની સમસ્યાને ઓળખવામાં મુશ્કેલી થતી હોય છે. આવા કિસ્સામાં સાઈકોથેરાપી કરવી પડતી હોય છે. પ્રોટેસ્ટમાં સોજો ચઢવાના કારણે પણ આ પ્રકારનો દુખાવો થતો હોય છે. UTI (યુરિનરી ટ્રેક્ટ ઈન્ફેક્શન) પણ આવા દુખાવા માટે જવાબદાર હોઈ શકે છે. ડાયાબિટિશનના દર્દીઓમાં આ પ્રકારની તકલીફ વધારે જોવા મળે છે. અમુક કારણે પ્રોસ્ટેટની સાઈઝમાં વધારો થયો હોય તો પણ ઈજેક્યુલેશન દરમિયાન પીડા થતી હોય છે. પ્રોસ્ટેટની સર્જરી કે પ્રોસ્ટેટ કેન્સર પણ કારણ બની શકે છે. કેટલીક દવાઓની આડઅસરના લીધે પણ આમ થતું હોય છે.