એકવાર બાઉન્ડ થઈ જાય તો, એન્ટિજેન બી સેલ દ્વારા આંતરિક અને પાચન થાય છે અને એન્ટિજેનમાંથી કેટલાક અણુ બીજા પ્રોટીન સાથે જોડાયેલા છે જેને ક્લાસ II MHC પ્રોટીન કહેવાય છે.