ટેક્સ નિષ્ણાતોના જણાવ્યા પ્રમાણે જીએસટી પોર્ટલ તથા સોફ્ટવેરની ખામીનો ભોગ છેવટે વેપારીઓએ બનવું પડે છે અને તેના કારણે તેઓને લેટ રિટર્ન ફાઇલ થવાના કારણે પેનલ્ટી ચૂકવવી પડે છે.