આરએસએસ વિરુદ્ધ સિખ સંસ્થાઓની મુખ્ય ફરિયાદ છે કે, આરએસએસ સિખોની જુદી ઓળખથી ઈનકાર કરે છે અને સિખ ગુરુઓ ખાસ કરીને ગુરુ ગોવિંદ સિંહને હિન્દુ મહાપુરુષ તરીકે દેખાડવાના પ્રયાસો કરે છે.