એર ટ્રાફિક કંટ્રોલર (ATC) એ ઈન્ડિગોની ફ્લાઈટ નંબર 6E 779 ને 36,000 ફૂટની ઉડાન ભરવાનું કહ્યુ હતુ જ્યારે ફ્લાઈટ નંબર 6E 6505 ને 28,000 ફૂટની ઉંચાઈ પર ઉડવાનું કહ્યુ હતુ.