વર્ચ્યુઅલ પ્રાઇવેટ નેટવર્ક (વીપીએન) સાથે કહેવાતા "ટનલ મોડ" માં IPsec નો સૌથી વધુ ઉપયોગ થાય છે જો કે, IPsec બે કમ્પ્યુટર્સ વચ્ચે સીધો સંબંધ માટે "પરિવહન મોડ" ને પણ આધાર આપે છે.