વિપક્ષી દળો એનપીઆરની પ્રક્રિયાને એનઆરસીનું જ પગલું કહી રહ્યા  છે જયારે ગૃહમંત્રી અમિત શાહે આ સ્પષ્ટ કર્યું છે કે એનઆરપી અને એનઆરસી અલગ અલગ છે અને એનપીઆરથી કોઈની પણ નાગરિકતાને કોઈ જોખમ નથી.