ગેટ્સે તેના ઇન્વેસ્ટમેંટ મેનેજર અને પરોપકારી સલાહકાર તરીકે, જ્હોન ડી. રોકફેલરે 1901 માં ન્યૂ યોર્કમાં રોકફેલર ઇન્સ્ટિટ્યુટ ઓફ મેડિકલ રિસર્ચ (હવે રોકફેલર યુનિવર્સિટી) ની સ્થાપના કરી હતી.