કચ્છ યુનિર્વિસટીમાં કેટલાક ડિપાર્ટમેન્ટ એવા છે કે, જે વિદ્યાર્થીઓની સંખ્યા ન મળવાને લીધે ખોટ ખાઈ રહ્યા છે, તે ડિપાર્ટમેન્ટનાં પ્રાધ્યાપકોને તગડો પગાર ચૂકવવામાં આવી રહ્યો છે, તેટલું જ નહીં કાયમી કુલપતિ ન હોવાને લીધે નવા અભ્યાસક્રમો પણ શરૃ કરવામાં આવતા નથી.