યુનિવર્સિટી ઓફ એડિનબર્ગમાં મેડિકલ પ્રોગ્રામમાં ત્રણ વર્ષ પછી, હ્યુટન 1749 માં નેધરલેન્ડ્સમાં યુનિવર્સિટી ઓફ લીડેન ખાતેની ડિગ્રી મેળવવા માટે પેરિસમાં તેમની તબીબી ડિગ્રી પૂરી કરી.