ગૌણ માળખું એમિનો એસિડની સાંકળના ત્રિ-પરિમાણીય ફોલ્ડિંગ અથવા કોઇલિંગનું વર્ણન કરે છે (દા. ત. , બીટા-પુટીટેડ શીટ, આલ્ફા હેલિક્સ).