ક્રોનિક એન્નોબ્યુલેશનની સમસ્યા એ છે કે તે ગર્ભાશયની અસ્તર પેશી ઉષ્ણતામાન તરફ દોરી શકે છે, જેને એન્ડોમેટ્રાયલ હાયપરપ્લાસિયા કહેવાય છે , જે ગર્ભાશય કેન્સરમાં વિકસી શકે છે.