રાષ્ટ્રીય તપાસ એજન્સી તરફથી ઝાકિર નાઈક વિરુદ્ધ ગેરકાનૂની ગતિવિધિઓ મામલે કેસ ફાઈલ કર્યા બાદ ઈડી દ્વારા ડિસેમ્બર 2016માં તેમની વિરુદ્ધમાં અપરાધિક કેસ દાખલ કરવામાં આવ્યો હતો.