વિવિધ અભ્યાસોએ થાઇરોઇડની સમસ્યાને જુદી જુદી અંદાજો એમિયેડાઓરોન સાથે આપ્યો છે, પરંતુ એવું લાગે છે કે એમિએડાઓરોન સાથે સારવાર કરાયેલા દર્દીઓના 30 ટકા લોકો હાઇપોથાઇરોડાઇઝમ વિકસાવી શકે છે, અને 10% સુધી હાઇપરથાઇરોઇડિઝમ વિકસાવી શકે છે.