આઇબીડી સાથે સંકળાયેલા કેટલાક યકૃત સમસ્યાઓ પ્રાથમિક સ્ક્લેરોઝીંગ કોલેંગિટિસ , ઑટોઇમ્યુન હેપેટાઇટીસ અને પ્રાથમિક પેરિઆરી સિર્રોસિસ છે.