જયારે ઓર્ડર 66 જારી કરવામાં આવ્યું હતું, ત્યારે ઘણા ક્લોન ટ્રોપર્સ માનતા હતા કે તે ખોટા આદેશ છે અને તેમને હત્યા કરવાને બદલે જેઈડીઆઈનું રક્ષણ કરવાનું શરૂ કર્યું હતું.