શરીર પર જીએમઓના અસર અણધારી હોઈ શકે છે જ્યારે તેનો ઉપયોગ ત્યાં હંમેશા કોઇ વિચલન જોખમ. દા. ત. ઝેર - ઉદાહરણ તરીકે, સજીવની વંશસૂત્રના ફેરફાર તો બની શકે કે સિવાય ઇચ્છિત ઉત્પાદન "પતાવટ" કરી શકે છે અને નુકસાનકારક પદાર્થો થી થઈ શકે છે.