બૃહસ્પતિનું વાતાવરણ મોટા ભાગે મોલેક્યુલર હાઇડ્રોજન અને હિલીયમ છે, પરંતુ ત્યાં પણ અન્ય રાસાયણિક સંયોજનો છે જે આપણને પરિચિત છે: પાણી, હાઇડ્રોજન સલ્ફાઇડ, એમોનિયા અને મિથેન.