જીવંત માછલીઘરની આવશ્યક પ્રવૃત્તિમાંથી સંચયિત કચરા સાથે ડબ્બો ફિલ્ટર ઓવરલોડ થઈ શકે છે, ફાયટોફિલ્ટર આવા ખામીમાંથી પીડાય નથી.