ઇસાબેલાએ નવા જમીનોના મૂળ અમેરિકીઓમાં ખાસ રસ લીધો હતો; જ્યારે કેટલાકને સ્પેન પાછા ગુલામ તરીકે લાવવામાં આવ્યા હતા ત્યારે તેમણે ભાર મૂક્યો હતો કે તેઓ પાછા ફર્યા અને ફ્રી થઈ ગયા હતા, અને તેમની ઇચ્છા વ્યક્ત કરી હતી કે "ભારતીયો" ને ન્યાય અને ઔચિત્યની સાથે વર્તવામાં આવશે.