જીન મ્યુટેશનને સામાન્ય રીતે બે પ્રકારમાં વર્ગીકૃત કરી શકાય છે: બિંદુ પરિવર્તન અને બેઝ-જોડી સામેલગીરી અથવા કાઢી નાંખવાની પ્રક્રિયા.