તે દરમિયાન 139 દિવસ સુધી વિદ્યાર્થીઓએ હડતાલ કરી હતી, જેમાં કેટલાકે તો અનશન પણ કર્યું હતું. ચૌહાણની ઘણી આલોચના તેમનાં કેમ્પસથી બહાર રહેવાના કારણે પણ થઇ હતી. આટલું જ નહીં ફિલ્મ જગતના લોકોએ પણ ગજેન્દ્રની યોગ્યતાના અંગે પ્રશ્નો ઉભા કર્યા હતા. વિદ્યાર્થીઓએ તે સમય પૂણેથી લઇને દિલ્હીના જંતર-મંતર સુધી વિરોધ પ્રદર્શન કર્યું હતું, પરંતુ સરકારે પોતાના નિર્ણયને પાછો લીધો ન હતો. નોંધનીય છે કે FTIIના અધ્યક્ષનો કાર્યકાળ 3 વર્ષનો હોય છે.