પોતાની જાતને કેરેબિયનમાં અગ્રણી ચિકિત્સક નેતા તરીકે સ્થાપિત કર્યા બાદ, મોર્ગનને જમૈકાના બધા જહાજોના કમાન્ડર-ઇન-ચીફ તરીકે નિયુક્ત કરવામાં આવ્યા હતા અને સ્પેનીશ સામે યુદ્ધ કરવા માટે મોડોડીફોર્ડ દ્વારા એક ધાબળો કમિશન આપવામાં આવ્યું હતું.