૧ જુલાઇથી જીએસટી લાગુ થયા બાદ ૧૦ મહિનાનો સમય વીતી ગયો છે, પરંતુ હજુ પણ રિટર્નને લઇને કેટલીક વિસંગતતાઓ જોવા મળી રહી છે. જે કંપનીઓના અંતિમ સેલ્સ રિટર્ન જીએસટીઆર-૧ સિસ્ટમમાં ઓટો જનરેટ થતા પર્ચેઝ રિટર્ન જીએસટીઆર-૨-એ સાથે મેચ થતા ન હોય તેવી કંપનીઓને ચકાસણી માટે ડિપાર્ટમેન્ટના ઉચ્ચ અધિકારીઓ દ્વારા નોટિસ મોકલવાની શરૂ કરવામાં આવી છે.