ભૌમિતિક આઇસોમેરિઝમ એ આઇસોમરના પ્રકાર અંગે ચિંતા કરે છે જ્યાં વ્યક્તિગત અણુ એ જ ક્રમમાં હોય છે, પરંતુ અલગ અલગ સ્વયંને ગોઠવવાનું સંચાલન કરે છે.