1584 માં આર્કબિશપ બોરોમિયો, ચર્ચ માટે મજૂરના આયુષ્યમાં નબળી પડી ગયો હતો, તાવ સાથે બીમાર પડ્યો હતો અને સ્વિત્ઝરલેન્ડથી મિલાન પાછો ફર્યો હતો, જ્યાં તે 3 નવેમ્બરના રોજ મૃત્યુ પામ્યા હતા, જે પ્રમાણમાં 46 વર્ષની હતી.