ફિલોજેન્ટિક રીતે કહીએ તો, આર્કાઇયા અને બેક્ટેરિયા એક સામાન્ય પૂર્વજમાંથી અલગ રીતે વિકસાવી હોવાનું માનવામાં આવે છે.