એડ્યુઆર્ડો સાન જુઆન, મગુવા ઇન્સ્ટિટ્યુટ ઓફ ટેકનોલોજીથી સ્નાતક થયા ત્યારબાદ તેમણે યુનિવર્સિટી ઓફ વોશિંગ્ટન ખાતે ન્યુક્લિયર એન્જિનિયરીંગનો અભ્યાસ કર્યો.