ન્યુમોસિસ્ટને અસર કરતી મુખ્ય દવાઓ ત્રિમોથોપ્રેમ-સલ્ફેમિટોકૅજોલ અને પેન્ટામાઇડિન આઇસોયિયોઅનેટ છે.