મેથોટર્ૅકસેટનો ઉપયોગ સામાન્ય રીતે થાય છે કારણ કે તે અન્ય સાયટોટૉક્સિક દવાઓ કરતા ઓછી આડઅસરો સાથે સંકળાયેલ છે અને જ્યારે આડઅસરો થાય છે ત્યારે તે સામાન્ય રીતે હળવા અને ઉલટાવી શકાય તેવું હોય છે.