કારણ કે ક્રોનિક થાક સિન્ડ્રોમ ધરાવતા લોકોના શરીરમાં સક્રિય પ્રતિરક્ષા પ્રણાલીના ચિહ્નો જોવા મળે છે, વૈજ્ઞાનિકો લાંબા સમયથી માનતા હતા કે ઘણા કિસ્સાઓમાં સક્રિય વાયરલ અથવા બેક્ટેરિયા ચેપ દ્વારા અથવા શરીરમાં છોડતા પહેલા કાયમી રોગપ્રતિકારક તંત્રને કાયમી ધોરણે ચેપ દ્વારા થાય છે.