ગુજરાતમાં વર્ષ 2002ના રમખાણો બાદ વડાપ્રધાન વાજપેયી મોદીને મુખ્યમંત્રી પદેથી હટાવવા માગતા હતા, પરંતુ વાજપેયીને મનાવવામાં જેટલીએ મહત્વપૂર્ણ ભૂમિકા ભજવી હતી તેમ કહેવાય છે.