પાણીના ભરાવાને લીધે છોડના મૂળ વિસ્તારમાં ઓક્સિજનની ગેરહાજરીને કારણે ઉપયોગી સૂક્ષ્મ સજીવને પ્રતિકૂળ અસર કરે છે જ્યારે હાનિકારક જીવોનો ફેલાવો વધારે છે અને છોડની વૃદ્ધિને નિયંત્રિત કરે છે.