કેફિર પાસે મોટી આંતરડાના સાનુકૂળ બેક્ટેરિયલ સંતુલનને પ્રોત્સાહન, લેક્ટોઝ પાચન સુધારવા, અને કદાચ સ્ટૂલ સુસંગતતામાં સુધારો કરવાની ક્ષમતા છે.