શકીલે ૨૦૦૩માં ગુજરાતના ભાજપના અગ્રણી હરેન પંડયા તેમ જ આરએસએસના અનેક શાખાપ્રમુખની હત્યાનું ઓપરેશન પાર પાડયું હતું.