પહેલા ગુનામાં જ તેને અદાલતે દોષી ઠેરવ્યો એટલે ઓક્ટોબર, ૨૦૧૬ના અંતે તેણે પોતાની સામેના બાકીના ૧૩ આરોપો રદ કરવામાં આવે તો ગેરકાયદેસર કામો ઉપરાંત તાલીબાનીઓ માટે કરેલાં કામો અને લશ્કર-એ-તોયબા, દાઉદ ઈબ્રાહિમ, અલ કાયદા અને જૈશ-એ મોહમદ જેવા આતંકવાદી સંગઠનો સાથેની પોતાની સાંઠગાંઠના તમામ ચિટ્ઠા વિગતવાર ખોલવાની તૈયારી દર્શાવતી અરજી દાખલ કરીને પોતાની સજામાં ઉદારતા દાખવવા અદાલતને અપીલ કરી અને ડિસેમ્બર, ૨૦૧૬ના પહેલા અઠવાડિયામાં એટલે કે જાવેદ ખાનાનીના મોતના અરસામાં જ અદાલતે તેની અરજી મંજૂર કરી હતી.