બેચેન પગ સિન્ડ્રોમ ધરાવતા દર્દીઓના મગજના કોઈ વિશિષ્ટ રોગવિજ્ઞાનવિષયક ફેરફારો હોવા છતાં, એવું લાગે છે કે મધ્ય-મગજના એક ભાગમાં કોશિકાઓ પૂરતી લોહ મેળવવામાં આવી નથી.