1976-77માં ઈમરજન્સી દરમિયાન વાજપેયીને અન્ય નેતાઓની સાથે અરેસ્ટ કરી લેવાયા, કેમ કે, તેઓ ઈન્દિરા ગાંધીના આ નિર્ણયની આલોચના કરી રહ્યાં હતા.