સરકાર પાસેથી આ એજન્સીઓ વધુ રૂપિયા લઇને કર્મચારીઓને ઓછા પૈસા આપતી હોવાનો, પીએફ-ઇએસઆઇના પૈસાનો યોગ્ય હિસાબ નહીં રખાતો હોવાની અને જે કક્ષાનું કામ હોય તેના કરતા ઓછો પગાર અપાતો હોવાની ફરિયાદ અંગે પણ વિવિધ સંસ્થાઓ દ્વારા તંત્રને આવેદન અપાઇ રહ્યા છે.