દક્ષિણમાં ભગવાન વિષ્ણુની પૂજાનું સવિશેષ મહત્વ હોવાથી અયપ્પાને ભગવાન વિષ્ણુના પુત્ર તરીકે પણ વર્ણવામાં આવ્યા છે.