બીજી તરફ પ્રદેશ પ્રમુખ પદના મજબૂત દાવેદાર શંકર ચૌધરીને બે બાબત નડી રહી છે જેમાં તાજેતરમાં તેમના ટ્રસ્ટને નીતિ-નીયમ નેવે મૂકીને મેડિકલ કોલેજ આપવામાં આવી અને જ્ઞાતિવાદના ધોરણે કામ કરતા હતા.