કેટલાંક રોહિંગ્યા મુસ્લિમોના પાકિસ્તાનની ગુપ્તચર સંસ્થા આઈએસઆઈ અને પાકિસ્તાન સ્થિત ઇસ્લામિક સ્ટેટ જેવાં આતંકી સંગઠનો સાથે સંબંધ હોવાના ગુપ્તચર અહેવાલો સરકાર પાસે છે.