નદીઓ અને તળાવો ઉદ્યાનની જમીન વિસ્તારના 5% જેટલો હિસ્સો ધરાવે છે અને યલોસ્ટોનમાં પાણીનો સૌથી મોટો ભાગ યલોસ્ટોન તળાવ છે, જે 87,040 એકરને આવરી લે છે અને તે 400 ફૂટ (120 મીટર) ઊંડા સુધી છે.