ગેસ્ટ્રોએન્ટેરાઇટિસ વારંવાર લાંબા સમય સુધી ઝાડા અને વારંવાર ઉલટીને કારણે આંતરડાની ઝેર અથવા  સાલ્મોનેલોસિસ  સાથે ગૂંચવણમાં આવે છે, પરંતુ ઝેરી લક્ષણો માટે ધ્યાન આપવું જોઈએ નહીં કે જે ઝેર માટે લાક્ષણિકતા નથી, જે આવશ્યકપણે ફલૂના આંતરડાના સ્વરૂપમાં દેખાય છે.