ઘણા નિષ્ણાતો એવું માને છે કે જે ઉગ્રવાદી હુમલાઓમાં હિંદુ સંગઠનો સાથે જોડાયેલા લોકોનાં નામ આવ્યા, તેમાં એનઆઈની ભૂમિકા શંકાસ્પદ રહી હતી.