અફજલ ગુરૂની પત્નીએ 2006માં દયા અરજી દાખલ કરી, જેને સુપ્રીમ કોર્ટ તરફથી ફગાવવામાં આવી અને પછી રાષ્ટ્રપતિ પ્રણવ મુખર્જીએ પણ અફજલની દયા અરજી ફગાવી હતી.