ક્રોહન રોગના આ પ્રકારથી ચરબી-દ્રાવ્ય વિટામિનો (એ, ડી, ઇ અને કે) ની ઉણપ થઈ શકે છે, કારણ કે બાયલ મીઠું જે તે વિટામિન્સની શક્તિને સરળ બનાવે છે તે ઇયિલમમાં પણ શોષાય છે.