જોકે હાલતો રાજ્ય સરકાર દ્વારા દ્વારકામાં ઘણાં ફેરફાર કરવામાં આવ્યા છે, પરંતુ શાસ્ત્રોમાં દ્વારકા નગરી સાથે જોડાયેલા જે રહસ્યોનો ઉલ્લેખ કરવામાં આવ્યો છે, તે રહસ્યોને ઉકેલવા ૨૦૦૫માં વૈજ્ઞાાનિકોએ ઘણી જહેમત ઉઠાવી હતી, તે સમયે દરિયામાંથી તૂટેલા પથ્થર, અને ૨૦૦ જેટલા અન્ય પથ્થરના જ નમૂનાઓ મળી આવ્યા હતા, પણ તે ઉપરથી કોઇ ઠોસ સંશોધન નહોતું થઇ શક્યું કે તે પથ્થર ભગવાન શ્રીકૃષ્ણએ વસાવેલી દ્વારકા નગરીના જ અંશો હતાં કે નહીં?