સોહરાબુદ્દી શેખ કેસમાં પણ વણઝારાએ ગુજરાત પોલીસ દ્વારા કરવામાં આવેલા એન્કાઉન્ટર માટે પ્રત્યક્ષ અને પરોક્ષ રીતે ભાજપ સરકાર જવાબદાર છે તેવો પત્ર જેલમાંથી લખ્યો હતો.