ઑપરેટિંગ સિસ્ટમના સ્તરે ચાલી રહેલ મૉલવેર સ્કેનર્સ અમુક પ્રકારનાં ચેપને અંધ હોઈ શકે છે જે સિસ્ટમ ડ્રાઇવરોમાં OS સ્તરથી નીચે અને હાર્ડ ડ્રાઈવના વિસ્તારોમાં જ્યાં OS ઍક્સેસ કરી શકતું નથી.