Jio ઇન્સ્ટિટ્યૂટના ઉદઘાટન પહેલા, શ્રેષ્ઠ સંસ્થાઓની યાદીમાં સમાવેશ અંગે વિવાદ થયો હતો. વિવાદમાં વધારો થયા પછી, માનવ શંસોધન મંત્રાલય હવે સ્પષ્ટતા કરી છે. ઉચ્ચ શિક્ષણ સચિવ આર. સુબ્રમણ્યમ જણાવ્યું હતું કે નિયમો હેઠળ કેટલીક નવી સંસ્થાઓને પણ આ યાદીમાં સાનેલ કરવામાં આવે છે.