ક્રોહન રોગ અને અલ્સેરેટિવ કોલેટીસ વચ્ચેનો તફાવત એ છે કે તેમાંથી પ્રથમ આંતરડાના કોઇ પણ ભાગને અસર કરી શકે છે અને બીજો એક માત્ર જાડા અને સીધો આંતરડાને અસર કરે છે.