સ્વામિનારાયણ ભગવાન પણ મૂળીમાં તેના રાજા રામાભાઈના મહેલમાં જ રોકાતા હતા. અહીં શ્રી રણછોડજી-ત્રિકમરાય દેવ, શ્રી હરિ-કૃષ્ણ મહારાજનું મંદિર છે. મૂળી સ્થિત સ્વામિનારાયણ મંદિરે દર પૂનમે મંગળા આરતી અને દર્શન કરવાનો વિશેષ મહિમા છે.