ગંગટોકમાં કેટલીક આફતો અને ભૂસ્ખલન જોવા મળ્યા છે, જેમાં સૌથી મોટું 1977માં થયુ, જેમાં અંદાજે 38 લોકો માર્યા ગયા હતા અને અનેક ઇમારતો નષ્ટ થઇ હતી.