મંદિરના ઇતિહાસ તરફ એક નજર નાખીએ તો વિક્રમ સંવત ૧૧૫૫માં એ સમયના મહામંત્રી સજ્જનશાહે શંખેશ્વરનું દેરાસર બંધાવ્યું હતું, પરંતુ બાદમાં ૧૪મી સદીમાં અલ્લાઉદ્દીન ખીલજીએ આ દેરાસરનો નાશ કર્યો હતો.