ફાઇલ સ્ટોરેજ એન્ક્રિપ્શન ફાઈલ ટ્રાન્સફર એન્ક્રિપ્શન કરતા અલગ છે, જે એક જગ્યાએથી બીજા સ્થળે ડેટાને ખસેડતી વખતે ઉપયોગમાં લેવામાં આવે છે.