પ્રોટોન બીમ ઉપચાર સામાન્ય રીતે સ્થાનિક ટ્યુમર્સ (સ્ટેજ I, II, અથવા III) માટે વપરાય છે અને સ્ટેજ 4 ગાંઠો (ગાંઠો કે જે શરીરના અન્ય ભાગોમાં ફેલાયેલી છે) માટે અવારનવાર ઉપયોગમાં લેવાય છે.