દાયકાઓથી સાયકલોટ્રોનનો ઉપયોગ ઉચ્ચ-ઊર્જા ભૌતિક પ્રયોગમાં કરવામાં આવે છે, અને તે પણ કેન્સર અને અન્ય શરતો માટે તબીબી સારવારમાં ઉપયોગી છે.