બીજી તરફ જ્યારે ભાજપ અયોધ્યામાં બાબરી ધ્વંસને લઇને ઉજવણી કરી રહ્યું હતું ત્યારે વાજપેયીજીએ પોતાને તેનાથી અલગ રાખ્યા હતા અને આ બાબત પર કોઇ ટિપ્પણી પણ કરી ન હતી.