રાષ્ટ્રપતિ પ્રણવ મુખર્જીએ પણ યાકુબ મેમણની દયા અરજીને નકારી કાઢી હતી. મહારાષ્ટ્ર સરકાર અને ગૃહ મંત્રાલયોની ભલામણોને ધ્યાનમાં રાખતા રાષ્ટ્રપતિએ યાકુબ મેમણની દયા અરજીને નકારી કાઢી હતી.