ફેફસાના કેન્સરમાં ઉપયોગમાં લેવાતી ગાંઠના માર્કર્સના ઉદાહરણોમાં બિન-નાનાં સેલ ફેફસાના કેન્સરમાં કેર્સિનોફ્રેયોનિક એન્ટિજેન ( સીઇએ ) અને ચેતાકોષ-વિશિષ્ટ ઉન્નતીકરણ (એનએસઇ) નો સમાવેશ થાય છે, જેનો ઉપયોગ નાના સેલ ફેફસાના કેન્સરને અનુસરવા માટે થાય છે.