ફોર્ટ સુમ્પર પર હુમલો અને સિવિલ વોરની શરૂઆતના પગલે, તેમની સ્થિતિ ઝડપથી બદલાઈ ગઈ એપ્રિલ 27, 1861 ના રોજ, મિલરએ 9 મી ઇન્ડિયાના સ્વયંસેવકોના કર્નલ તરીકે ફેડરલ સેવામાં પ્રવેશ કર્યો.