તમિળ પરિવારમાં જન્મેલા 64 વર્ષના એસ. જયશંકર દિલ્હીમાં મોટા થયા છે, તેમણે શરૂઆતનું શિક્ષણ એરફોર્સ સ્કૂલમાંથી લીધુ છે, તેમના પિતા કે સુબ્રમણ્યમ તંત્રના અધિકારી હતા, જ્યારે ભાઇ સંજય સુબ્રમણ્યમ એક જાણીતા ઇતિહાસકાર છે.