સ્વતંત્ર એજન્સીઓ અન્ય એક્ઝિક્યુટીવ બ્રાન્ચ વિભાગો અને એજન્સીઓ મુખ્યત્વે તેમના મેકઅપ, કાર્ય અને ડિગ્રીથી અલગ હોય છે, જેના પર તેઓ પ્રમુખ દ્વારા નિયંત્રિત થાય છે.