એફએમએસની કેટલીક સ્લીપ સમસ્યાઓ નર્વસ-સિસ્ટમ રસાયણો સેરોટોનિન અને મેલાટોનિનના સ્તરોથી જોડાયેલી હોઇ શકે છે, જે ઊંઘ અને જાગવાની ચક્રને નિયમન કરવામાં મદદ કરે છે.