સદભાગ્યે, એસઆઇઆઇબી (એસઆઇબીઓ) તેની સારવાર કરવા માટે શ્રેષ્ઠ માર્ગ નક્કી કરવા માટે વધુ વ્યાપકપણે સંશોધન કરી રહ્યું છે, જોકે ઘણા ઉપચાર પહેલાથી જ અસ્તિત્વ ધરાવે છે, જેમ કે રાઇફેક્સિમિન (બ્રાન્ડ નામ Xifaxan) નામના એન્ટીબાયોટીક જેવી કે જે નાના આંતરડામાં સ્થાનિક સ્તરે રહે છે, તેમજ લો- FODMAP ખોરાક અથવા ચોક્કસ કાર્બોહાઇડ્રેટ આહાર (એસસીડી), જે બેક્ટેરિયા માટે ખોરાક પુરવઠો મર્યાદિત કરવા માટે રચાયેલ છે.