જ્યારે વ્યાજ વસૂલ કરવાની વ્યવસ્થા જ નહીં હોવાથી અત્યાર સુધી વ્યાજ વેપારીએ જાતે જ ગણતરી કરીને ભરપાઇ કરવાનું રહેતંુ હતું, પરંતુ મોટાભાગના વેપારીઓ વ્યાજ ગણતરી કરીને ભરપાઇ કરતા નહીં હોવાથી જીએસટી વિભાગે મોડું રિટર્ન ફાઇલ કરનાર વેપારીઓ પાસેથી વ્યાજ વસૂલવા જીએસટીના તમામ કમિશનરને આદેશ કરવામાં આવ્યો છે.