પુણા પોલીસની તપાસમાં સમીમબાનુ સાથે જમીલાને ઘરકંકાસ થતા તેણીએ અફજલ સાથે મળી તેણીની હત્યા કરી હોવાનુ અને ત્યાર બાદ માસૂમ બાળકોને ખાડીમાં ફેકી દીધા હોવાનું બહાર આવતા પુણા પોલીસે માસૂમ શાબીરની હત્યાનો ગુનો નોંધી વધુ તપાસ હાથ ધરી હતી.