જગન્નાથ મિશ્રા વૈચારિક રીતે ભલે કોંગ્રેસી હતાં પરંતુ ત્યારબાદ તેઓ વૈચારિક ઘર્ષણના કારણે શરદ પવારની પાર્ટી એનસીપીમાં ગયા હતાં.