ઇએફએસ ફાઇલ-લેવલ એન્ક્રિપ્શન પૂરી પાડે છે, જેનો અર્થ છે કે વ્યક્તિગત ફાઇલો અને ફોલ્ડરો એન્ક્રિપ્ટ થઇ શકે છે.