મુબંઈમાં ભારે વરસાદના કારણે રેલ વ્યવહારને પણ અસર થઈ છે. કુલ 24 ટ્રેનો રદ્દ કરાઈ છે અને 21 ટ્રેનોના અંતર ટૂકાવાયા છે. આ ઉપરાંત છ ટ્રેનોના ટાઈમિંગ બદલાયા છે. જેમાં રાજધાની અને અમૃતસર ગોલ્ડન ટેમ્પલનો પણ સમાવેશ થાય છે. ખાસ કરીને વિરાર અને નાલા સોપારા વચ્ચે ટ્રેક પર પાણી ભરાઈ જતા મુંબઈ તરફ આવતી અને મુંબઈ અકિલા તરફ જતી અનેક ટ્રેનોની સેવા ખોરવાઈ છે. મુંબઈમાં ભારે વરસાદના કારણે અમદાવાદ-મુંબઈ ટ્રેન સેવા વ્યવહાર ખોરવાયો છે