જેએનયુ શરૂઆતથી ડાબેરી વિચારધારાનો ગઢ રહ્યો છે, પરંતુ કેટલાક સમયથી વૈચારિક સ્વતંત્રતાના નામે અરાજકતા પોષવામાં આવી રહી છે.