કોવિંદને ઉમેદવાર બનાવવાની સાથે જ વિપક્ષી દળો વચ્ચે મતભેદ પણ ઉજાગર થયા હતા  કારણ કે જેડીયૂએ બિહારમાં પોતાના ઘટક દળો- કોંગ્રેસ અને રાષ્ટ્રીય જનતા દળની વિરૂદ્દ જઇને કોવિંદને સમર્થન આપવાની જાહેરાત કરી હતી.