ધોનીને 2007માં રાજીવ ગાંધી ખેલ રત્ન એવોર્ડથી સન્માનિત કરવામાં આવ્યો હતો જ્યારે 2009માં પદ્મ શ્રીથી સન્માનિત કરવામાં આવ્યો હતો.