પાણીપુરીના પાણીમાં જીરું પાવડર, સંચળ, મરી પાવડર વગેરે મસાલા નાખવામાં આવે છે, જેને કારણે સ્વાદિષ્ટ હોવાની સાથે તે ખોરાક પચાવવામાં પણ મદદરૂપ થાય છે.