જાન્યુઆરી 2016માં મનરેગા ચૂકવણાંઓમાં નેશનલ ઇલેકટ્રોનિક ફંડ મેનેજમેન્ટ સીસ્ટમમાં લાગુ પાડવામાં આવ્યું ત્યારથી  કેન્દ્ર સરકાર આ પ્રક્રિયા ઉપર પ્રભુત્વ ધરાવે છે.