સરકારે તેનો જવાબ સુપ્રીમ કોર્ટના રજીસ્ટ્રી વિભાગમાં સુપરત કર્યો હતો.૨૭ જાન્યુઆરીએ એટર્ની જનરલ મુકુલ રોહતગીએ કોર્ટને જણાવ્યું હતું કે અરુણાચલ પ્રદેશમાં રાષ્ટ્રપતિ શાસન લાદવાનો નિર્ણય લેતી વખતે કેન્દ્ર સરકારે રાજ્યપાલના અહેવાલ અને અન્ય માહિતી પર આધાર રાખ્યો હતો. રાજખોવાએ ૨૮મી જાન્યુઆરીએ પૂર્વોતર રાજ્યમાં પ્રવર્તતી રાજકીય કટોકટી અંગે કેન્દ્ર સરકારને આપેલો પોતાનો રિપોર્ટ સુપ્રીમ કોર્ટને સીલબંધ કવરમાં સુપરત કર્યો હતો. તેમાં એકમાં તેમણે રાજ્યમાં રાષ્ટ્રપતિ શાસન લાદવાની પણ ભલામણ કરી હતી.