એવું માનવામાં આવે છે કે ગોધરા ટ્રેન હત્યાકાંડ બાદ ફાટી નિકળેલા રમખાણો બાદ સમગ્ર ગુજરાતમાં ફાટી નિકળેલા રમખાણોનો બદલો લેવા માટે કાલુપુરના મુફ્તી સુફિયાને, પાકિસ્તાન સ્થિત રસૂલખાન પાર્ટી સાથે મળીને હૈદરાબાદના અસગરઅલી દ્વારા હરેન પંડ્યાની હત્યા કરાવી હતી.