અલગ અલગ ઓરબીટમાં સેટેલાઇટમાં લાગેલી આ ઘડિયાળોની વચ્ચે સમય અંતર નેવિગેશન રિસિવર કે પૃથ્વી પર કોઇ વસ્તુની સ્પષ્ટ પોઝિશન બતાવવામાં મદદ કરશે. એ‌ટેમિક કલોક ઉપરાંત નેવીગેશન સેેટેલાઇટમાં ક્રિસ્ટલ કલોક પણ હોય છે, પરંતુ તે પરમાણુ ઘડિયાળોની જેમ સ્પષ્ટ જાણકારી આપતી નથી. આ કારણે જો કોઇ સેટેલાઇટની ત્રણ પરમાણુ ઘડિયાળ ખરાબ થઇ જાય તો નવી એટેમિક કલોક સાથે બેકઅપ સેટેલાઇટ લોન્ચ કરવો પડે છે.