આ ઉપરાંત જે કંપનીઓના અંતિમ સેલ્સ રિટર્ન જીએસટીઆર-1 સિસ્ટમ દ્વારા ઓટો જનરેટ થતાં પરચેઝ રિટર્ન જીએસટીઆર-2એ સાથે મેળ ના ખાતા હોય તેવી કંપનીઓને પણ ચકાસણી માટેની નોટિસ મળી છે.