પાટણ હેમચંદ્રાચાર્ય યુનિવર્સિટીમાં કુલપતિ ડો. બી. એ. પ્રજાપતિ પર છેલ્લા કેટલાક માસથી પાટણ ધારાસભ્ય દ્વારા ગંભીર આક્ષેપો કરવામાં આવી રહ્યા છે જેને પગલે તેઓએ પ્રેસ યોજી માહિતી આપતાં જણાવ્યું હતું કે, પાટણ યુનવર્સિટીના કુલપતિ આર્કિટેક ભવનમાં પ્રોફેસરની ભરતીમાં પોતાના પુત્રને યુજીસી અને સરકારના નિયમોનું ઉલ્લઘન કરી નોન ક્રિમીલીયર સર્ટી રજુ કરી પોતાની આવક છુપાવી હતી.