પોઝિટ્રોન ઉત્સર્જન ટોમોગ્રાફીમાં કેટલાક મતભેદ છે. પી. ટી. ટી. અભ્યાસ ગર્ભવતી અને સ્તનપાન કરાવતી સ્ત્રીઓમાં, તેમજ તે દર્દીઓ જેમણે કોઈ પણ હલનચલન વગર, અભ્યાસ માટે આવશ્યક સમયને બહાર કાઢવા સક્ષમ ન હોય તેવા સ્વૈચ્છિક રીતે, નહી.