ગુનાખોરીઓ અને અન્ય મુખ્ય ગુનાઓમાં તપાસ કરવા ઉપરાંત, લશ્કરી ફોજદારી તપાસકર્તાઓ અન્ય ફેડરલ કાયદાનું અમલીકરણ એજન્સીઓ સાથે સંકલન કરે છે અને યુદ્ધના ગુનાઓ અને વિદેશમાં એન્ટિટેરરિઝમ મિશનને પણ હેન્ડલ કરે છે.