1990 ના દાયકાના અંત ભાગમાં, પ્રોટોહડોરસને તેના સંશોધક દ્વારા સૌપ્રથમ હાઈરસ્રોસૌર તરીકે ગણાવવામાં આવ્યું હતું, અને તેનું નામ આ મૂલ્યાંકનમાં તેના વિશ્વાસને પ્રતિબિંબિત કરે છે.