Crysis 3 નું એકંદર ગેમ પ્લેન એ અગાઉના શિર્ષકની સમાન છે જે ખેલાડીઓને નેનોટ્યુટસમાં સજ્જ કરવામાં આવે છે, જેમ કે તેમને વધુ ક્ષમતા અને સ્પીડ જેવા વિશિષ્ટ ક્ષમતાઓ આપે છે.