જીએસટી નેટવર્કે અમલમાં મૂકેલ જીએસટીએન સોફ્ટવેરના કારણે જુદા જુદા રિપોર્ટ જેવા કે, જીએસટીઆર-1 અને જીએસટીઆર-3બી સરખામણી, જીએસટીઆર-2એ અને જીએસટીઆર-3બીની સરખામણી, જીએસટીઆર-1 અને ઇ-વે-બિલની સરખામણી, જીએસટીઆર-3બી નિકાસ અને આઇસગેટના ડેટાની સરખામણી કરીને નીકળેલી ભૂલોને જીએસટીએન પોર્ટલ દ્વારા એસએમએસથી દર્શાવેલ તફાવતને જરૂરી સ્પષ્ટતા કરવા માટે 2થી 5 દિવસનો સમય આપવામાં આવે છે.