NCIS એજન્ટો પ્રતિ-આતંકવાદ અને બુદ્ધિ કામગીરી હાથ ધરે છે અને વિશ્વભરમાં યુએસ નૌકાદળના હિતોનું રક્ષણ કરવામાં સહાય કરે છે.