એનક્રિપ્ટ થયેલ હાર્ડ ડ્રાઇવ્સ પરના ફોલ્ડર્સને સુગરસિંક સાથે બેકઅપ કરી શકાતા નથી જ્યાં સુધી BoxCryptor નો ઉપયોગ તેમને એન્ક્રિપ્ટ કરવા માટે થતો ન હતો.