Germline કોશિકાઓ પર જનીન ઉપચારથી ઘણાં વિવાદો પેદા થાય છે કારણ કે કોઈપણ ફેરફારો વારસાગત થઈ જાય છે (કારણ કે સંતતિને આયોજિત ડીએનએ પ્રાપ્ત થાય છે).