આ ગીતના પાછળના ફકરાઓમાં મા દુર્ગા અને મા લક્ષ્મીની સ્તુતિ આવતી હોઈ મુસ્લિમ લીગના મોહંમદ અલી ઝીણા અને બીજા નેતાઓએ વાંધો ઉઠાવતા  વંદે માતરમ્ના પ્રથમ બે ફકરાને રાષ્ટ્રીય ગીત તરીકે સ્વીકારાયા હતાં.