પોતાના કાર્યકાળ દરમ્યાન સુનીલ ગુપ્તાએ અનેક કેદીઓને બેહાલ થતા જોયા છે, પરંતુ એ બધામાં એમને આતંકવાદી અફઝલ ગુરુનો કિસ્સો સૌથી યાદગાર લાગ્યો છે.