એ દિવસોમાં જન્મુ-કાશ્મીર જવા માટે નવી દિલ્હીના સંરક્ષણ મંત્રાલયમાંથી પરમિટ કઢાવવી પડતી. ડૉ. મુખર્જીએ પરમિટ માટે અરજી આપવાની ના પાડી અને કહ્યું કે, જમ્મુ-કાશ્મીર રાજ્ય હિન્દુસ્તાનનું અવિભાજ્ય અંગ છે.