સક્રિય પ્રતિરક્ષા થોડા આડઅસરો છે તે સ્વયંપ્રતિરક્ષા બિમારીઓ અને એલર્જીમાં સામેલ થઈ શકે છે, પરંતુ સામાન્ય રીતે સમસ્યાઓ ઉભી થતી નથી.