આ સરકાર 13 મહિના ચાલી અને 1999માં ફરીવાર લોકસભા ઈલેક્શન આવ્યા જેમાં વાજપેયી ત્રીજીવાર વડાપ્રધાન બન્યાં અને આ વખતે તેમણે પોતાનો કાર્યકાળ પૂરો કર્યો.