જીવંત વૃક્ષોમાં હાર્ટ રોટ ઘણા જુદા જુદા ફંગલ એજન્ટો અને પેથોજેન્સ દ્વારા થઈ શકે છે, જે ખુલ્લા જખમો દ્વારા વૃક્ષને દાખલ કરી શકે છે અને આંતરિક શાર્ક લાકડાને ખુલ્લા પાડે છે, જે વૃક્ષના કેન્દ્રના મુખ્ય ભાગમાં ઉતરવાની દિશામાં છે.