જે પછી, વર્ષ 1999 માં, સુપ્રીમ કોર્ટના નિવૃત્ત ન્યાયાધીશ મનોજ મુખર્જીએ નેતાજીના મૃત્યુની તપાસ શરૂ કરી, જેમાં જણાવ્યું હતું કે નેતાજી વિમાન દુર્ઘટનામાં મૃત્યુ પામ્યા નથી.