એક્યુપંક્ચર રોગપ્રતિકારક તંત્રને ઉત્તેજીત કરી શકે છે, કારણ કે કેટલીક ચિંતા એ છે કે એક્યુપંકચર વાસ્તવમાં એક વ્યક્તિની એમએસ દ્વારા રોગપ્રતિકારક કોશિકાઓ સક્રિય કરી શકે છે જે વ્યક્તિના પોતાના માયેલિન અને ચેતાક્ષ પર હુમલો કરી શકે છે.