મેથોટ્રેક્સેટ ફેફસાંને અસર કરી શકે છે અને તેથી ઉપચાર શરૂ કરતા પહેલા, ફેફસાના કાર્યનું મૂલ્યાંકન કરવા માટેનાં પરીક્ષણોને ઓર્ડર કરી શકાય છે.