નિપા વાયરસ ચામાચીડિયાની લાળ કે પેશાબના સંપર્કમાં આવેલ ફળ કે અન્ય ખાદ્ય પદાર્થના સેવનથી અથવા તો નિપા વાયરસનો ભોગ બનેલ પ્રાણીના સંપર્કમાં આવવાથી તેનો ચેપ લાગી શકે છે.