કેટલીક વખત ફ્રેગ્મેન્ટેશન થાય છે કારણ કે ફાઇલ સિસ્ટમ પ્રથમ વખત બનાવી હતી ત્યારે ફાઇલ સિસ્ટમ માટે ખૂબ જ જગ્યા અનામત કરી હતી, અને તેથી તેની આસપાસના ખુલ્લા વિસ્તારોને છોડી દીધા હતા.