કુદરતી કલોરિનમાં બે સ્થિર આઇસોટોપ્સનો સમાવેશ થાય છે: ક્લોરિન -35 અને ક્લોરિન -37. ક્લોરિન -35 એ તત્વની કુદરતી વિપુલતાના 76% હિસ્સો ધરાવે છે, જેમાં કલોરિન -37 અન્ય તત્વોનો 24% હિસ્સો બનાવે છે.