ગંગોત્રી શહેર તથા મંદિરનો ઇતિહાસ એકબીજા સાથે ગાઢ રીતે જોડાયેલો છે, એટલે કે ગંગોત્રી મંદિરના કારણે જ શહેર પ્રખ્યાત થયું છે, એમ પણ માનવામાં આવે છે.