જોકે પ્રાણી સંગ્રહાલય વિભાગનો ખર્ચ આવક કરતાં વધારે છે. પ્રાણી સંગ્રહાલયમાં સસ્તન પ્રાણીઓ, પક્ષીઓ અને સરિસૃપ મળીને કુલ ત્રણ પ્રકારના ૧૮૧૫ પ્રાણીઓ તેમજ સ્ટાફના પાછળ વર્ષ ૨૦૧૩-૧૪માં આશરે રૂ.૪.૭૩ કરોડથી વધુ અને વર્ષ ૨૦૧૪-૧૫માં રૂ.૫.૪૪ કરોડથી વધુ ખર્ચાયા હતા.