દક્ષિણ પૂર્વ એશિયાના દેશોમાં પણ ઈન્ડોનેશિયા, મલેશિયા, ફિલિપિન્સ, થાઈલેન્ડ, મ્યાંમાર જેવા દેશો ઈસ્લામિક આતંકવાદની સમસ્યાની સામે ઝઝૂમી રહ્યા છે.