કોલોનોસ્કોપીની કાર્યવાહી એકથી દોઢ કલાક લાગી શકે છે અને તેને ઘણીવાર એન્ડોસ્કોપી સેન્ટરમાં અથવા આઉટપેશન્ટ પ્રક્રિયા તરીકે હોસ્પિટલમાં કરવામાં આવે છે.