શંકરાચાર્યે એમ પણ જણાવ્યું હતું કે ૨૦૦૨નાં કોમી રમખાણો પછી તેઓ જાતે ગુજરાત ગયા હતા અને પરિસ્થિતિનો જાતઅનુભવ મેળવ્યો હતો. RSS ધર્મનો ઉપયોગ લોકોને ગેરમાર્ગે દોરવા માટે કરતો હોવાનો આક્ષેપ કરતાં શંકરાચાર્યે સૂચવ્યું હતું કે RSSએ સામાજિક-સાંસ્કૃતિક સંગઠન હોવાનો ડોળ કરવાને બદલે રાજકીય સંગઠન બની જવું જોઈએ.