હાયપોથાલેમસ એ તમારા માસિક ચક્રનું નિયંત્રણ પેનલ હોવાથી, અમુક શરતો કે જે શરીરની સંતુલનને વિક્ષેપિત કરે છે અને હાઇપોથલેમસના તંદુરસ્ત કાર્યક્ષમતામાં દખલ કરે છે તે પણ તમારા માસિક ચક્રમાં દખલ કરી શકે છે.