હકીકત એ છે કે બેક્ટેરિયોફૅજ એન્ટિબેક્ટેરિયલ દવાઓ કરતા સૂક્ષ્મજંતુઓ સામે ઓછી સક્રિય છે, તેમનો તેનો ઉપયોગ સુરક્ષિત છે.