ક્રોહન રોગના કેટલાક કિસ્સાઓમાં, બળતરા માત્ર નાના આંતરડાનામાં જ સ્થિત છે- મોટી આંતરડા રોગના કોઈ ચિહ્નો દર્શાવતું નથી.