બીજી કેટેગરીમાં પ્રોટીન હોય છે જે એકસરખી નથી પણ જનીની અને માળખાકીય સમાનતાઓને શેર કરે છે, જેમ કે મ્યુસીન, α-amylase (એન્ઝાઇમ), કલ્લીક્રીન (ઉત્સેચકો), અને સાઇસ્ટેટિન.