ભાગલા વખતે જ પાકિસ્તાનમાં બીજા ધર્મના લોકો સાથે અત્યાચાર શરૂ થઇ ગયો હતો, સમય સાથે પાકિસ્તાનમાં હિંદુ-જૈન-સિખ- બૌદ્ધ ધર્મના આધારે અત્યાચાર વધી ગયો છે.