૨૦૦૯ની લોકસભાની ચૂંટણીમાં જ્યારે ભાજપનો બીજી વાર (એ પહેલાં ૨૦૦૪માં) પરાજય થયો અને પક્ષમાં રાજકીય સંકટ પેદા થયું ત્યારે રાષ્ટ્રીય સ્વયંસેવક સંઘે હસ્તક્ષેપ કરીને ગડકરીને ભાજપના રાષ્ટ્રીય અધ્યક્ષ બનાવ્યા હતા.