કાયદાની શરૂઆતના તબક્કે જી. એસ. ટી. ના પોર્ટેલમાં રહેલી ખામીઓને કારણે વેપારીઓને દંડકીય કાર્યવાહી સહન કરવી પડતી હોય છે.