વધુમાં નાઇટ્રોજન ખાતરો કુદરતી બેક્ટેરિયાને કારણે નાઇટ્રસ ઓક્સાઇડ પેદા કરે છે જે ગ્રીનહાઉસ ગેસ છે અને એસિડ રેઈન (મિંગલ, 2013) નું કારણ બની શકે છે.