મદરેસાઓમાં પારંપરિક ધાર્મિક શિક્ષણની સાથે સાથે મુખ્યપ્રવાહના શિક્ષણને પણ મહત્ત્વ મળે એ માટે કેન્દ્ર સરકારે લઘુમતી મામલાના મંત્રાલયને મહત્ત્વના નિર્દેશ કર્યા છે.