ગાયો માઇક્રોબાઇમમાં ફેરફારોને કારણે સ્વયંપ્રતિરક્ષા બિમારીઓ થઈ શકે છે, જે જઠરાંત્રિય માર્ગની અંદર રહેતા બેક્ટેરિયાની વસ્તી છે.