જળવિદ્યુત દ્વારા વીજળીના ઉત્પાદનમાં ઘણું ઓછું પ્રદૂષણ પેદા થાય છે, પરંતુ જળચર ઇકોસિસ્ટમ્સ પર હજી પણ હાનિકારક અસરો છે .