જે-પાઉચ શસ્ત્રક્રિયા સામાન્ય રીતે ક્રોહન રોગ માટે કરવામાં આવતી નથી કારણ કે એક જોખમ છે કે ક્રોહ્ન પાઉચમાં ફરી દેખાય છે.