કારણ કે તે પ્રમાણમાં નવી ટેકનોલોજી છે અને અન્ય તકનીકો સમાન પ્રશ્નોના જવાબ આપી શકે છે કે જે એફએમઆરઆઇ કરી શકે છે, એફએમઆરઆઇ સામાન્ય રીતે ક્લિનિકલ અથવા હોસ્પિટલ સેટિંગ્સમાં ઉપયોગમાં લેવાતી નથી.