રોગપ્રતિકારક તંત્ર, જેમ કે એચ. આય. વી / એડ્સને નુકસાન પહોંચાડતી તબીબી સ્થિતિ, ફેફસાના કેન્સરનું જોખમ વધારી શકે છે, જેમ કે સ્વયંપ્રતિરક્ષાના રોગો જેમ કે રુમેટોઇડ સંધિવા.