એક નિયમ તરીકે, મેનોનાઇટ્સને અધિક્રમિક માળખું દ્વારા સંચાલિત કરવામાં આવતું નથી, પરંતુ ત્યાં સ્થાનિક ચર્ચો અને 22 પ્રાદેશિક પરિષદો વચ્ચે એક લેવા-લેવાય છે.