તે સ્પષ્ટ નથી કે આ બધું શા માટે થાય છે, ખાસ કરીને કારણ કે સીલિયક રોગ ધરાવતા લોકો વજનવાળા હોવાની શક્યતા ઓછી હોય છે અથવા ધૂમ્રપાન કરે છે, હૃદય રોગ માટે બે મુખ્ય જોખમ પરિબળો તેઓ નીચલા કોલેસ્ટ્રોલ ધરાવે છે કેટલાક સંશોધકોએ અનુમાન કર્યું છે કે રોગપ્રતિકારક તંત્રના ગ્લુટેન ઇન્જેશનની પ્રતિક્રિયા દ્વારા ચલાવવામાં આવતી બળતરા પર દોષ હોઈ શકે છે, પરંતુ અભ્યાસોએ હજી સુધી ચોક્કસ સિદ્ધાંતને પુરવાર કર્યું નથી.