જો કે, ભાજપે કલેક્ટરના આ આદેશને બિનજરૂરી કહ્યો હતો અને કલેક્ટરને આદેશને પડકાર આપતાં કહેવામાં આવ્યું હતું કે, મોહન ભાગવત શાળામાં રાષ્ટ્રધ્વજ ફરકાવશે. ભાજપ અને આરએસએસનું કહેવું છે કે, ઝંડા કોડ અનુસાર સ્વતંત્રતા દિવસ પર કોઇપણ શાળામાં ધ્વજારોહણ કરી શકાય છે. જો કે, વિવાદ વધતાં આખરે શાળા દ્વારા મોહન ભાગવતને ઝંડો લહેરાવવાની પરવાનગી આપવામાં આવી હતી.