કૃષિમાં અન્ય મુખ્ય પેટ્રોલિમય મુદ્દો એ છે કે ખનિજ તેલ પુરવઠાની અસર ખાતરના ઉત્પાદન પર થશે. હેબર-બોશ ખાતર બનાવવાની પ્રક્રિયા માટે હાઇડ્રોજન સ્રોત તરીકે કુદરતી ગેસનો ઉપયોગ એ કૃષિમાં અશ્મિભૂત ઇંધણનો અત્યાર સુધીનો સૌથી મોટો ઉપયોગ છે.[૧૧૯] કુદરતી ગેસ એ હાલમાં હાઇડ્રોજનનો સૌથી સસ્તો પ્રાપ્ય સ્રોત હોવાથી તેનો ઉપયોગ કરવામાં આવે છે.[૧૨૦][૧૨૧] કુદરતી ગેસનો આંશિક રીતે વૈકલ્પિક ઉપયોગ થવાની બીકે તેલનું ઉત્પાદન થશે અને હાઇડ્રોજનનો ઉપયોગ પરિવહનમાં વધશે, ત્યારે કુદરતી ગેસ અતિ મોંઘો બની જશે. હેબર પ્રક્રિયા પુન:પ્રાપ્ય ઉર્જાના (જેમકે વિદ્યુત વિચ્છેદન) ઉપયોગ દ્વારા વ્યાપારીકરણ માટે અક્ષમ હોય અથવા હેબર પ્રક્રિયાના વિકલ્પ તરીકે હાઇડ્રોજનનો કોઇ બીજો સ્રોત પ્રાપ્ય ન હોય અને તે પરિવહન માટે અને કૃષિની જરૂરિયાત પૂર્ણ કરી શકે તેટલા જથ્થામાં ન હોય, તો ખાતરનો આ મુખ્ય સ્રોત ખૂબ જ મોંઘો બની જશે અથવા અપ્રાપ્ય બની જશે. તેને પગલે ખોરાકની અછત અથવા તેની કિંમતોમાં નાટકીય રીતે ઉછાળો આવશે.