પ્રારંભિક રોગો પણ ક્યારેક નિદાન કરવું મુશ્કેલ છે કારણ કે IBD કોશિકાઓમાં પરિણમે છે અને તે માઇક્રોસ્કોપ હેઠળ બાયોપ્સીમાં જોઈ શકાય છે તે કદાચ હાજર ન પણ હોઈ શકે.