યશવંત સિન્હાએ દાવો કર્યો છે કે,2002નાં ગુજરાતનાં કોમી રમખાણો બાદ વાજપેયી ગુજરાતનાં તત્કાલિન સીએમ  નરેન્દ્ર મોદીને પદ પરથી હટાવવા માગતા હતાં.