મૃણાલિની સારાભાઇએ ભારત સરકાર તરફથી 1992માં નેશનલ સિવિલીયન એવોર્ડ્સ પદ્મભૂષણ અને 1965માં પદ્મશ્રીનો એવોર્ડ મળ્યો છે.