૧૯૮૦ના દાયકામાં અફઘાનિસ્તાનમાં સોવિયેત સેના સામેની લડાઈ માટે આતંકીઓ પેદા કરવામાં ખૈબર પખતુનખ્વા વિસ્તારમાં મોટા પાયે મદરેસા ખોલવામાં આવ્યા હતા ત્યારે કયારેક પાકિસ્તાનની રણનીતિનો મહત્ત્વનો ભાગ મનાતા મદરેસા જ હવે તેના ગળાના ફાંસી સમાન બની રહ્યા છે એટલું જ નહિ પણ હવે મદરેસાની ઓળખ તેની સાથે સંકળાયેલાં આતંકી અને કટ્ટરપંથી સંગઠનો સાથે થવા લાગી હતી.