અલ્સેરેટિવ કોલેટીસથી વિપરીત, જે કોલોન અને ગુદામાં જ બળતરા પેદા કરે છે, ક્રોહન રોગ રોગને પાચનતંત્રમાં ગમે ત્યાંથી સોજો કરી શકે છે.