હાઈપોથલેમસના ભાગો મગજના અંદરની નજીક છે (મધ્યભાગની બાજુ) એ સ્ટ્રેરા ટર્મિનિસ તરીકે ઓળખાતા બીજા માર્ગ દ્વારા એમીગડાલાના ભાગ સાથે નજીકથી સંદેશાવ્યવહાર કરે છે.