જીવવિજ્ઞાાન ક્ષેત્રના તેમના યોગદાન બદલ ભારત સરકારે ઉબેદ સિદ્દીકીને પદ્મભૂષણ અને પદ્મવિભૂષણથી સન્માનિત કર્યા છે.