સબસ્ટ્રેટ (સી) અને એન્ઝાઇમ (ઇ) વચ્ચે, એક બોન્ડ બનાવવામાં આવે છે - ઇસીનું એન્ઝાઇમ-સબસ્ટ્રેટ જટિલ રચાય છે, જેમાં ઘટકો સહસંબંધિત, આયનીય, જલીય અને અન્ય બોન્ડ્સ દ્વારા એકબીજા સાથે જોડાયેલા છે.