સંગઠનની વાત કરવામાં આવે તો કોંગ્રેસ અને ભાજપની સ્થિતિ ભિન્ન છે. દેશમાં માત્ર છ વર્ષ સુધી શાસન કરનારી ભાજપની સમસ્યાઓ વર્ષ 1947થી અત્યાર સુધી શાસન કરનારી કોંગ્રેસ પાર્ટીની સમસ્યાઓ કરતા વધારે છે. કોંગ્રેસની સરખામણીમાં ભાજપે બે મોટી પછડાટ ખાધી છે. જેના કારણે તે પાછળ છે.