ભાજપે પ્રજ્ઞાને સંસદની સંરક્ષણ મંત્રાલયની સમિતિમાંથી દૂર કર્યા છે અને ભાજપ સંસદિય પક્ષની બેઠકમાં ભાગ લે પણ પ્રતિબંધ મૂકીને દેશને એવો સંદેશો આપવાનો પ્રયાસ કર્યો કે પક્ષ સાધ્વી પ્રજ્ઞાના ગોડસે અંગેના વિચારો સાથે સહમત નથી.