આ ઉપરાંત અમિત જેઠવા હત્યા કેસમાં પણ મોહન ઝાએ સરકારનું નુકશાન ઘટાડવાનો પુરતો પ્રયત્ન કર્યો હતો, આ પ્રકારના કેસમાં તેમને પોતાના સાથી આઈપીએસ સતીષ વર્મા સાથે પણ ઘર્ષણમાં ઉતરવું પડ્યું હતું, આમ મોહન ઝાએ પોતાના કાર્યકાળ દરમિયાન તેમને સોંપવામાં આવેલા ટાસ્ક પાર પાડયા છે.