માઇક્રોસ્પોરીડિયોસિસના કિસ્સાઓમાં કોર્નીયલ ચેપ દુર્લભ હોય છે, જ્યારે તે આંખમાં દુખાવો, અતિશય ઉગ્ર, અસ્પષ્ટ દ્રષ્ટિ અને પ્રકાશ સંવેદનશીલતા (ફોટોફોબિયા) સાથે રજૂ કરી શકે છે.