રાજીવ ગાંધીની હત્યાની તપાસ કરતા જસ્ટીસ જૈન કમિશનની અંતરિમ રિપોર્ટમાં કરુણાનિધિ પર લિબરેશન ટાઈગર્સ ઓફ તમિલ ઈલમ (એલટીટીઈ) ને પ્રોત્સાહન આપવાનો આરોપ લગાવવામાં આવ્યો હતો.