મગફળી કૌભાંડને લઈને પહેલેથી જ માનવામાં આવી રહ્યું હતું કે કૌભાંડમાં નાફેડની ભૂમિકા છે કારણકે ગુજરાતભરમાંથી માત્ર અમુક ગોડાઉન પર જ આ કૌભાંડ આચરવામાં આવ્યો હતો જેમાં પહેલેથી માનવામાં આવી રહ્યું હતું કે આ કૌભાંડ નાફેડ દ્વારા આચરવામાં આવ્યું હોઈ શકે છે પરંતુ આ સમગ્ર મામલાને રાજકીય રૂપ આપી કયાંકને ક્યાંક અસલી ગુનેગારોને બચાવવાના પ્રયાસ થઈ રહ્યા હતા.