માનક એમઆરઆઈની જેમ, જે ફક્ત મગજના સ્નેપશોટને પૂરા પાડે છે, એફએમઆરઆઇ બતાવે છે કે કઈ ક્રિયા ચાલુ છે તેની પ્રતિક્રિયામાં પ્રવૃત્તિમાં ફેરફાર થાય છે.