અગાઉ જીએસટી રિફંડ પ્રક્રિયામાં કેન્દ્ર અને રાજ્ય સ્તરે એક જ ટેક્સ ઓથોરિટી દ્વારા હાથ ધરવામાં આવતી હતી, જેને કરદાતા દ્વારા વહીવટી રીતે એસાઇન કરવામાં આવે છે, પરંતુ ફાળવણી કેન્દ્ર અને રાજ્ય વિભાગના હિસાબી સત્તાવાળાઓ કરવામાં આવતી હતી.