એક્યુપંકચરની પાછળનું વિજ્ઞાન સૂચવે છે કે એક્યુપંક્ચર સ્નાયુ, કરોડરજ્જુ અને મગજની ચેતાપ્રેષક પ્રવૃત્તિ સાથે સંકળાયેલ હોઈ શકે છે જે શરીરની એન્ડોર્ફિન્સ ("સારું લાગે છે" રસાયણો) ને ટ્રિગર કરે છે.