ઉસ્માની ખિલાફતની છાયામાં તે ઇસ્લામી એક્તાના પોતાના દૃષ્ટિકોણને અમલી સ્વરૃપ આપવા માટે ઉત્સુક હતા પરંતુ અહીં પણ પોતાના સિદ્ધાંતવાદી સ્વભાવના કારણે તે રહી-રહીને અમલદારોની નજરમાં ખટકવા લાગ્યા ઘણા દેશોની એલચી કચેરીઓનું પણ દબાણ હતું કે અફઘાનીને તેમના હવાલે કરવામાં આવે પરંતુ એના પહેલા કે તેમને તુર્કી છોડવા માટે કહેવામાં આવે ૯, માર્ચ ૧૮૯૭માં જડબાના કેન્સરથી ગ્રસ્ત થઇને દુનિયાને જ છોડી દીધી.