મુકેશ શાહે ગુજરાત યુનિવર્સિટી હેઠળ અમદાવાદની બી. જે. મેડિકલ કોલેજમાંથી ૧૯૮૩માં એમબીબીએસ અને ૧૯૮૭માં ત્યાંથી જ માસ્ટરઇન સર્જરીની ડિગ્રી મેળવી હતી.