પ્રધાનમંત્રી નરેન્દ્ર મોદીની સરકારનાં પહેલા કાર્યકાળમાં પણ  નૃપેન્દ્ર મિશ્રા જ  પ્રધાનમંત્રીના મુખ્ય સચિવ હતાં.