જ્યારે વિટામિન ડી થાઇરોઇડ ગ્રંથિ પર સીધી અસર કરતું નથી, ત્યારે તે પ્રતિકારક કાર્યમાં ભૂમિકા ભજવતું નથી અને સ્વયંપ્રતિરક્ષા પ્રતિક્રિયાઓ સામે રક્ષણ માટે તેની ભૂમિકા હોવાનું માનવામાં આવે છે.