કર્નલ ઍલ્બર્ટ સિડની જોહન્સ્ટન અને લીની નીચે સેવા આપતા, થોમસે દાયકાના બાકીના સમય માટે મૂળ અમેરિકનોનો સામનો કર્યો હતો.