સરકારની નીતિઓમાં અને યોજનાઓમાં અડચણો ઊભી કરવાનાં આક્ષેપ ઉપરાંત પ્રલોભનો આપી વટાળપ્રવૃત્તિ કરવાનો આરોપ પણ કેટલીક એનજીઓ પર છે. ગુજરાતની નવસર્જન સંસ્થા ઘણા સમયથી વિવાદોમાં છે. દલિતો, પીડિતો માટે કામ કરતી આ સંસ્થા પર વિદેશથી આવેલા ભંડોળની ઉચાપત કરવાનો આરોપ છે. આ સંસ્થાને ફોર્ડ ફાઉન્ડેશન. ક્રિશ્ચિયન એઈ., મિશેરિયર જેવી સંસ્થાઓ તરફથી વિદેશી ભંડોળ મળે છે.