હાશિમોટોની થાઇરોઈડિટિસમાં થાઇરોઇડ એન્ટિબોડીઝ થાઇરોઇડ ગ્રંથિ પર હુમલો કરે છે, તેથી તે થાઇરોઇડ હોર્મોનનું પોતાનું ઉત્પાદન કરતા ઓછું અને ઓછા સક્ષમ છે.