પ્રોટોનેશન એ હાઇડ્રોજનના કરતા અલગ છે જે પ્રોટોનેશન દરમિયાન પ્રોટોન પ્રજાતિના ચાર્જમાં ફેરફાર થાય છે, જ્યારે ચાર્જ હાઇડ્રોજનેશન દરમિયાન અકબંધ છે.