પ્રજાપતિ ૧૯૯૬ થી યુનિવર્સિટીના એમ. બી. એ. વિભાગમાં હેડ ઓફ ડિપાર્ટમેન્ટ તરીકે ફરજ બજાવી રહ્યા છે અને તેઓ યુનિવર્સિટીના ઈન્ચાર્જ ઉપકુલપતિ તરીકેનો ચાર્જ પણ સંભાળેલ હોઈ અને તેઓની જ ઉત્તર ગુજરાત યુનિવર્સિટીમાં કુલપતિ તરીકેની પસંદગી થતા યુનિવર્સિટીના કર્મચારી મંડળમાં ખુશી વ્યાપી જવા પામી હતી ત્યારે આજે વિધીવત રીતે તેઓએ યુનિવર્સિટીના કુલપતિ તરીકેનો કાર્યભાળ સંભાળતા યુનિવર્સિટીના અધીકારીઓ સહિત કર્મચારીઓએ નવા કુલપતિનું મોં મીઠું કરાવી પુષ્પગુચ્છ આપી શુભેચ્છાઓ પાઠવી હતી તો બીજી તરફ નવા કુલપતિ સામે અનેક પડકારો રહેવા પામ્યા છે.