ત્યારબાદ રાજા ભૈયાએ મંત્રીમંડળમાંથી રાજીનામું આપવાની ફરજ પડી. તપાસ સીબીઆઇને સોંપવામાં આવ્યા બાદ ગત 15 અને 16 મેના રોજ રાજા ભૈયા સાથે પૂછપરછ કરવામાં આવી હતી અને અદાલતની પરવાનગી બાદ તેમનો લાઇ ડિટેક્ટર ટેસ્ટ કરવામાં આવ્યો. આ પહેલા જો કે, સીબીઆઇએ અદાલતમં રજૂ કરેલી ચાર્જશીટમાં રાજા ભૈયાના નામનો ઉલ્લેખ કર્યો નહોતો.