ત્યારબાદ એબરડિનએ 1860 માં તેના બે કોલેજોને એક યુનિવર્સિટીમાં એકસાથે જોડી દીધા, જેમાં માત્ર એક જ નેચરલ ફિલોસોફી પ્રોફેસરશિપ છે, જે ડેવિડ થોમસનને મળ્યું હતું.