વિશિષ્ટ ડીએનએ ટુકડાઓના નિદાનની તપાસ કરવામાં આવી હોવાને કારણે આનુવંશિક ઊંડાણની પદ્ધતિનો ભાગ્યે જ ઉપયોગ થાય છે.