કેટલાક જન્મજાત અને હસ્તગત હૃદય ખામીઓ સ્ટ્રોક જોખમ વધી: હૃદયના રોગવિજ્ઞાનલક્ષી ફેરફારો હૃદય માં નસ માંથી લોહી ગંઠાવાનું (થ્રોમ્બસ) જાઓ અને પછી મગજ સુધી જવા માટે પરવાનગી આપે છે.