ત્યાર બાદ ગોધરા જિલ્લા અદાલતના આ હુકમને સરકારે કોર્ટમાં પડકાર્યો હતો અને નિદોર્ષ છૂટી ગયેલા આરોપીઓને સજા કરવાની માગણી કરી હતી.