વડતાલ સ્વામિનારાયણ મંદિરની ગાદીપતિ બનવા માટે છેલ્લા ઘણા સમયથી વિવાદ ચાલી રહ્યો છે. મંદિરમાંથી પદભ્રષ્ટ કરાયેલા અજેન્દ્રપ્રસાદ અને આચાર્ય રાકેશપ્રસાદ વચ્ચે આ વિવાદ ચાલી રહ્યો છે. બંને આચાર્યો ગાદીપતિ હોવાનો દાવો કહી રહ્યા છે જેને લઇને કાનૂની જંગ ખેલાયો હતો.