નેહરુ કેબિનેટમાંથી રાજીનામું આપ્યા પછી પણ મુકરજીનો ૩૭૦ સામે વિરોધ નહોતો, આ કલમના જમ્મુ અને લડાખમાં અમલ સામે જ તેમનો વિરોધ હતો.