પાચનતંત્રના રોગોમાં જો લઘુ ઉપવાસ પ્રયોજાય તો તે ઉત્તમ પરિણામ આપે છે, પરંતુ આવી સ્થિતિમાં જો આહારની ગરબડ વધારે ચાલે, તો તે ઘણી વખત અમ્લપિત્ત, ગેસ્ટ્રોએન્ટાઈટિસ, આફરો, મંદાગ્નિ, અરુચિ જેવા રોગો ઉત્પન્ન કરે છે.