મોટાભાગના એન્ટીબેક્ટેરિયલ દવાઓની નકારાત્મક લક્ષણ તેમના હાનિકારક અસર માત્ર પેથોજેનિક પર જ નથી, પરંતુ ફાયદાકારક સુક્ષ્મસજીવો, આંતરડાની માઇક્રોફલોરા સહિત.