નરેન્દ્ર મોદી મુખ્યમંત્રી થયા તે જ વર્ષે ગુજરાતમાં કોમી તોફાન થયા, ભાજપ પોતાની બીનસાંપ્રદાઈક છબી ઊભી કરવાનો પ્રયાસ કરી રહી હતી તેની ઉપર પાણી ફરી વળ્યું, ખુદ વડાપ્રધાન બાજપાઈ અમદાવાદ આવ્યા તેમણે પોતાની આંખે અમદાવાદ જોયું, બાજપાઈએ નરેન્દ્ર મોદીને મુખ્યમંત્રી પદેથી હટાલી દેવાનો નિર્ણય કર્યો.