જો કે, અન્ય વૈજ્ઞાનિક રીતે નોંધપાત્ર પ્રજાતિઓના જીનોમ પણ પ્રોજેક્ટના ભાગ રૂપે અનુક્રમે છે, જેમાં ફળની ફ્લાય, માઉસ, ખમીર અને રાઉન્ડવોર્મનો જીનોમ સમાવેશ થાય છે.