ચાગાસના બીમારીના તીવ્ર તબક્કા બાદ, મોટાભાગના સારવાર ન થાય તેવા લોકો દાખલ કરે છે જેને રોગનું ક્રોનિક અનિશ્ચિત (અથવા ગુપ્ત) સ્વરૂપ કહેવાય છે.