પ્રણવ મુખર્જીએ પોતાની કારકિર્દી કોલકત્તાના ડેપ્યૂટી એકાઉટન્ટ જનરલ કાર્યાલયના એક ક્લાર્ક તરીકે શરૂઆત કરી હતી.