બોટનિકલ ગાર્ડન્સ દક્ષિણ ફેડરલ યુનિવર્સિટી તેના સમગ્ર ઇતિહાસમાં, સક્રિય સમાન સંસ્થાઓ સાથે સહકાર છે, જે તેને મોટા રશિયન અને આંતરરાષ્ટ્રીય સરકારી અને બિન-સરકારી સંસ્થાઓ સભ્ય છે.