એવો અંદાજ છે કે તેના પિતા, થુટમોઝ II, હેટશેપસટ, પત્ની અને થુટમોસ II ના સાવકી બહેનની મૃત્યુ સમયે થુટમોસ III ખૂબ જ નાનું હતું, અને તેથી થોટમોસ III ના સાવકી મા અને કાકી, યુવાન રાજા માટે કારભારી બની હતી.