તેમના દેહને લઈને અનેક માન્યતાઓ પ્રચલિત છે કહેવાય છે કે સંત ફ્રાન્સિસે પોતાના મૃત્યુ પહેલાં પોતાના એક હાથને દિવ્ય શકિતની મદદથી શરીરથી અલગ કરી દીધો હતો.