પોતાની સળંગ કારકિર્દી દરમ્યાન એર ચીફ માર્શલ બી એસ ધનોઆએ વિવિધ પુરસ્કારો પણ જીત્યા છે જેમાં, પરમ વિશિષ્ટ સેવા મેડલ, અતિ વિશિષ્ટ સેવા મેડલ, યુદ્ધ સેવા મેડલ, વાયુસેના મેડલ, ઓપરેશન વિજય મેડલ, સૈન્ય સેવા મેડલ, આઝાદીના 50 વર્ષ પર મેડલ, 30 વર્ષની કારકિર્દીનો મેડલ વગેરે સામેલ છે.