જોકે, ધોનીએ હંમેશા દીપિકા સાથેના સંબંધો વિશે ઈનકાર કર્યો છે. તેણે કહ્યું હતું કે, તેની અને દીપિકા વચ્ચે કશું જ નથી અને આ બધું મીડિયા દ્વારા ઉપજાવી કાઢવામાં આવ્યું છે. તેણે કહ્યું હતું કે, તે છેલ્લા સાડા ત્રણ વર્ષ વાળ વધારી રહ્યો હતો અને મીડિયા દરેક વખતે નવી-નવી છોકરીઓ સાથે તેની લિંક હોવાનું ચગાવ્યું છે. ઉલ્લેખનીય છે કે, પાકિસ્તાન પ્રવાસ વખતે ત્યાંનામ તત્કાલિન રાષ્ટ્રપતિ પરવેઝ મુશર્રફ પણ ધોનીના લાંબા વાળ પર આફરીન થઈ ગયા હતા અને તેમણે ધોનીને વાળ ન કપાવવાની સલાહ પણ આપી હતી.