આ સિદ્ધાંત અનુસાર, પ્રોટીન પરમાણુઓ એમિનો એસિડ અવશેષો મોટી સંખ્યામાં જે પેપ્ટાઇડ બંધથી દ્વારા જોડાયેલ છે સમાવેશ થાય છે.