શસ્ત્રક્રિયાના સામાન્ય જોખમો અને એનેસ્થેસિયાના જોખમો ઉપરાંત , થાઇરોઇડ શસ્ત્રક્રિયા તેના પોતાના જોખમો ધરાવે છે.