જોન ગ્લેનના ઘણા સન્માનમાં લાઇફટાઇમ અચિવમેન્ટ માટે નેશનલ એર એન્ડ સ્પેસ ટ્રોફી, ઓનરની કોંગ્રેસનલ સ્પેસ મેડલ અને 2012 માં પ્રમુખ ઓબામા તરફથી પ્રેસિડેન્શિયલ મેડલ ઓફ ફ્રીડમનો સમાવેશ થાય છે.