એણે જૈશ-એ-મોહમ્મદ નામક આતંકવાદી સંગઠનની સ્થાપના કરીને જમ્મુ-કાશ્મીર વિધાનસભા રઘુનાથ મંદિર જ નહીં, ભારતીય સંસદ પર ૨૦૦૧ના ડિસેમ્બરમાં હુમલો કરાવ્યો ત્યારે વાજપેયી જ સત્તામાં હતાં.