રોગકારક સૂક્ષ્મજંતુઓ દૂર કરવા  ડૉક્ટર ખાસ દવાઓ (એન્ટિબાયોટિક્સ, બેક્ટેરિયોફેસ અથવા આંતરડાના એન્ટીસેપ્ટિક્સ - પરીક્ષણોના પરિણામ પર આધારિત છે) નક્કી કરે છે, પછી પ્રોબાયોટીક્સ અથવા પ્રેબાયોટિક્સ, લેક્ટો-અને બીફાડોબેક્ટેરિયા ની મદદ સાથે આંતરડામાં વસાહત કરવામાં આવે છે.