બાયોટેકનોલોજી સંશોધનનો એક મહત્વપૂર્ણ ભાગ ચોક્કસ ઔદ્યોગિક એપ્લિકેશન્સ માટે ઑપ્ટીમાઇઝ કરેલા ગુણધર્મો સાથે પ્રોટીનને ડિઝાઇન અથવા સંશોધિત કરવા માટે પ્રોટીન એન્જિનિયરીંગ તકનીકોનો ઉપયોગ કરવાનો છે.