તોફાનો બાદ એક આક્ષેપ એવો પણ થયો હતો કે, તત્કાલીન મુખ્ય પ્રધાન મોદી ૨૭ ફેબ્રુઆરી ૨૦૦૨ના રોજ કોઈ પણ અધિકારીને જાણ કર્યા વિના ગાંધીનગર છોડીને રહસ્યમય રીતે ગોધરા ગયા હતા.