વર્ષ ૨૦૦6માં પણ ભાજપે તત્કાલિન રાષ્ટ્રપતિ અબ્દુલ કલામ સમક્ષ અરજી કરીને બંધારણની કલમ 324 સેકશન (5) હેઠળ ઇલેકશન કમિશનર તરીકે ચાવલાને દૂર કરવા માંગણી કરી હતી.