જયારે સિઝેરીયનથી જન્મેલું બાળક માતાના ઉદર અને ગર્ભાશયના મુખ દ્વાર સુધીના ફાયદારુપ બેકટેરિયાના આવરણથી વંચિત રહી જતુ હોવાથી આવા બાળકમાં જીવનભર એલર્જી અને કેટલાક જન્મ વખતે મળતા ચેપીરોગના વાતાવરણનું જીવનભર સોંગાત રુપે મળે છે અને આવા બાળકમાં અસ્થમાં સહીતના રોગોની શકયતા વધુ રહે છે.