કોઈ પણ કાર્યવાહી તેના જોખમો વિના છે, પરંતુ કોલોનોસ્કોપી સંકળાયેલા લોકો જોખમના ઉપદ્રવ સાથેના ફાયદાથી નાના ગણવામાં આવે છે.