MD5 માં કેટલીક ખામી છે, તેથી તે અદ્યતન એન્ક્રિપ્શન એપ્લિકેશન્સ માટે ઉપયોગી નથી, પરંતુ તે પ્રમાણભૂત ફાઇલ ચકાસણીઓ માટે તેનો ઉપયોગ કરવા માટે સંપૂર્ણપણે સ્વીકાર્ય છે.