૧૯૫૦માં નહેરુ-લિયાકત ચર્ચાનાં ફળ સ્વરૂપ ર્ધાિમક લઘુમતીઓના સંરક્ષણના પ્રશ્ન પર દીનદયાળજી સહમત ન હતા, કારણ કે પૂર્વ પાકિસ્તાન(આજના બાંગલાદેશ)ના ૧ કરોડથી પણ વધુ હિંદુઓ સાથે વિશ્વાસઘાત થયો છે એમ તેઓ માનતા.