જોનાથન ઇઝન, ડેવિસએ નોંધ્યું હતું કે માઇક્રોબીયોમનો ઉપયોગ સામાન્ય રીતે સુક્ષ્મસજીવોના સંગ્રહ માટે કરવામાં આવે છે જે શરીરમાં ચોક્કસ નિવાસસ્થાન ધરાવે છે, ઉદાહરણ તરીકે, માનવ આંતરડા.