લ્યુપસ, ખાસ કરીને એસએલઇ ધરાવતા દર્દીઓમાં, રોગપ્રતિકારક તંત્ર સ્વસ્થ પેશીઓમાં કહેવાતા સ્વતઃ એન્ટિજેન્સ અથવા સ્વ-એન્ટિજેન્સમાં એન્ટિજેન પર હુમલો કરે છે.