Coenzyme Q10 પૂરકોનો ઉપયોગ અનેક આડઅસરો પેદા કરે છે, જેમાં નીચેનાનો સમાવેશ થાય છે: ચક્કર, થાક, માથાનો દુઃખાવો, હૃદયરોગ, લીવર ઉત્સેચકો, અનિદ્રા, ચીડિયાપણું, ઊબકા, ફોલ્લીઓ, ઝાડા, પ્રકાશ પ્રત્યે સંવેદનશીલતા, લોહીની ખાંડ ઓછી અને પેટના દુખાવાની ઉપલા ઉપદ્રવ.