પ્રથમ તબક્કામાં - નાઇટ્રીકરણ, એટલે જે એમોનિયમ નાઇટ્રોજન નાઈટ્રેટ આયન અને નાઇટ્રાઇટ આયન ઓક્સિડેશન થાય છે સૂક્ષ્મજીવિઓ ચોક્કસ પ્રકારના કારણે નાઇટ્રોજન સંયોજનોને ફેરફાર.