હાલમાં સમગ્રતયા જીએસટી વસૂલાતમાં ચાલી રહેલા શોર્ટફોલ તથા જીએસટી કમ્પેનસેશનની જરૂરિયાત તથા જીએસટી કમ્પેનસેશન સેસ મોબિલાઇઝેશન વચ્ચેનો રેવન્યૂ ગેપ વધી રહ્યો છે તેને પરિણામે જીએસટી વળતરને સમયસર રિલીઝ કરવાનો મુદ્દો કેન્દ્ર અને રાજ્ય સરકારો વચ્ચે તકરારનો મુદ્દો બની ગયો છે.