હૂકરને તરત જ જોહ્ન કોટન નામના અન્ય પાદરી સાથે મતભેદ મળી, કારણ કે, વસાહતમાં મત આપવા માટે, એક માણસને તેમની ધાર્મિક માન્યતાઓ માટે તપાસ કરવાની જરૂર હતી.