જો દર્દીના શરીરના કોષો સાથે મેળ ન ખાતા કોષોને અસ્થિમજજામાં દાખલ કરવામાં આવે તો આ કોષોને કાં તો દર્દીના શ્વેતકણો ખતમ કરી નાંખે છે અથવા કયારેક નવા દાખલ કરેલ કોષ શરીરનાં અન્ય કોષોને નુકસાન કરી બેસે છે.