વિરોધી દળો એનપીઆરની પ્રક્રિયાને એનઆરસીનું જ પહેલું પગલું ગણાવી રહ્યા છે, જ્યારે ગૃહમંત્રી અમિત શાહે એ આશ્વાસન આપ્યું છે કે એનપીઆર અને એનઆરસી અલગ અલગ છે અને એનપીઆરથી કોઈ પણ નાગરિકતાને કોઈ ખતરો નથી.