સતત એવા આક્ષેપો થતા રહે છે કે સંપ્રદાયના વડા એના સભ્યોને સાયન્ટોલોજીમાં શ્રદ્ધા ન ધરાવતા પરિવારજનો અને મિત્રો સાથેના સંબંધ કપાવી નાખે છે, ફ્રજિયાત ગર્ભપાત કરાવે છે, બળજબરીથી ધર્માંતરણ કરાવે છે, પોતાના વિરોધીઓને ડરાવે-ધમકાવે છે.