જમાત-એ-ઈસ્લામીના પ્રભાવમાં આવનારાં ક્ષેત્રોમાં હિઝબુલ મુજાહિદ્દીનની મજબૂત ઉપસ્થિતિ જમાત-એ-ઈસ્લામીના અલગતાવાદી અને ઉગ્રવાદી વિચારધારનું પ્રત્યક્ષ ઉદાહરણ છે.