અન્ય ક્લોનિંગ સાધનોથી વિપરીત, સુપરડુપર ક્લોન બનાવવાની ઘણી રીતો પૂરી પાડે છે, જેમાં ખૂબ જ પ્રખ્યાત સેન્ડબોક્સ પદ્ધતિનો સમાવેશ થાય છે.