કુરેશીનો એ પણ દાવો છે કે આ કમિશને અયોધ્યા કેસમાં ભારતીય સુપ્રીમ કોર્ટના ચુકાદા પર પણ ચિંતા વ્યકત કરતાં કહ્યું છે કે ભારતમાં હિન્દુ ચરમપંથ વધી રહ્યો છે તથા અલ્પસંખ્યકોની સમસ્યાઓ વધી છે.