જોકે માનવ સંસાધન વિકાસ મંત્રાલયે કહ્યું હતુંં કે એસપીક્યુઇએમ યોજના ખરેખર તો સ્વૈચ્છિક યોજના છે અને એવા મદ્રેસાઓ પર જ લાગુ પડશે જે તેમના વિદ્યાર્થીઓને મોડર્ન શિક્ષણ આપવા માગે છે.