મુખર્જીએ સંઘના ભગવા ધ્વજને પરંપરાગત શૈલીમાં (છાતી સામે જમણો હાથ રાખીને) સન્માન ન આપ્યું જોકે, સંઘની પ્રાર્થના સમયે સાવધાનની મુદ્રામાં ઊભા રહ્યા.