કેટલાંક લોકોનું કહેવું છે કે લગભગ ૭૦૦-૮૦૦ વર્ષ પહેલાં દક્ષિણમાં શૈવ અને વૈષ્ણવો વચ્ચે વૈમનસ્ય ઘણું જ વધી ગયું હતું ત્યારે આ મતભેદો  મનભેદો દૂર કરવાં માટે ભગવાન શ્રી અયાપ્પનની પરિકલ્પના કરવામાં આવી બંનેના સમન્વય માટે જ આ ધર્મતીર્થને વિકસિત કરવામાં આવ્યું.