2002માં કોંગ્રેસે તેમને ગુજરાતની ચુંટણીનું નેતૃત્વ સોંપ્યુ હતું અને સામ્પ્રદાયિક ધ્રુવીકરણના વાવાઝોડામાં બાપૂએ માત ખાવી પડી હતી.