ગંગાજીનાં શુદ્ધિકરણની વાત સરકાર કેમ ગંભીરતાથી નથી લેતી તે એક ચર્ચાસ્પદ મુદો છે, કેગના રિપોર્ટમાં ૨૦૧૭માં કહેવાયું હતું કે નમામિ ગંગે યોજના માટે જુદી જુદી એજન્સીઓ, સંસ્થાનો અને સરકાર પાસે ૨,૬૦૦ કરોડ રૂપિયા પડી રહ્યા છે જેનો ઉપયોગ હજુ સુધી થયો નથી, આ રિપોર્ટમાં એવું કહેવાયું છે કે મે ૨૦૧૭ સુધી યુપી બિહાર, ઝારખંડ અને પશ્ચિમ બંગાળનાં રાજ્યોએ નદીસંરક્ષણ ક્ષેત્રે કોઈ કામગીરી કરી નથી.