એસોફગેઇલ મ્યોટોમીમાં સામેલ જોખમોમાં બરોળ, લીવર, અથવા પેટ તેમજ પોસ્ટ ઑપરેટિવ ચેપ સહિતની આસપાસની અંગોનો સમાવેશ થાય છે.