જીએસટી લાગુ પાડતા સમયે રાજ્ય સરકારોની સાથે કેન્દ્ર સાથે જે કરાર થયો હોય છે તે અનુસાર તેનાથી થનાર આવકના નુકસાનની કેન્દ્ર સરકાર ભરપાઈ કરે છે.