પોલી એપપ્સનું મૃત્યુ 1804 માં થયું હતું, જ્યારે જેફરસન પ્રમુખ હતા; તેણીની માતા અને માતૃત્વની જેમ, તેણી જન્મ આપ્યાના થોડા સમય બાદ મૃત્યુ પામી.