જો કે ફરી સમય બદલ્યો અને જ્યારે પાકિસ્તાન એ કાશ્મીર પર આક્રમણ કર્યું અને પછી મહારાજા હરિ સિંહ ભારત પાસેથી મદદ માંગી, સરદાર એ રાજા ને કાશ્મીર ને ભારતમાં વિલય કરવાનો પ્રસ્તાવ મોકલ્યો અને રાજા એ તેનો સહર્ષ સ્વીકાર કર્યો. ભારતીય સેનાએ વિપરીત પરિસ્થિતિનો સામનો કરી પાકિસ્તાની સેના ને પાછી ભગાડવાનાં પ્રયાસો શરુ કરી દીધાં. પરંતું ભારતીય સેના ને એક UNO નામનું ગ્રહણ નડ્યૂ. નહેરુ એ નવા જ જન્મેલા UNO પાસે મદદ માંગી. જ્યારે સેના પાકિસ્તાનીઓ ને પીછે હટ કરાવી રહી હતી અને પાકિસ્તાન નાં કબજા હેઠળ નું કાશ્મીર પાછું મેળવી રહી ત્યારે જ યુદ્ધ વિરામ ની ઘોષણા થઈ અને લગભગ 30% જેટલું કાશ્મીર પાકિસ્તાન નાં કબજા માં જ રહી ગયું. નેહરુના વ્યક્તિગત હિતને કારણે કાશ્મીરનો મુદ્દો ઊભો થયો અને સરદાર પણ કાંઇ નાં કરી શક્યા અને આ મુદ્દો આજે પણ એમ નો એમ જ છે. સરદાર પટેલ કાશ્મીર ને કોઈ પણ પ્રકાર નો વિશેષ દરજ્જો આપવાની વિરૂદ્ધ હતાં, પરંતુ નહેરુએ કાશ્મીર મુદ્દો તેમનાં ગૃહ મંત્રાલયથી દુર રાખવા પટેલને મજબૂર કરાવ્યા હતા. કાશ્મીરનાં મુખ્ય નેતા શેખ અબ્દુલ્લા અને નહેરુ ની નિકટતા ને લીધે સરદાર પણ કાઈ ખાસ નાં કરી શક્યા અને આજે પણ આ મુદ્દો સળગતો જ રહી ગયો.