પૂરક એલ કાર્નેટીન સામાન્ય રીતે સારી રીતે સહન કરે છે, તેમ છતાં, એલ કાર્નેટીનના ઉચ્ચ માત્રામાં પાચક અસ્વસ્થતા અને ઝાડા થઈ શકે છે.