બપોરે ૧.૪૫ના સુમારે બંને મસ્જિદમાં અંદાજિત ૪૦૦થી વધુ શ્રદ્ધાળુઓ નમાજ અદા કરી પરત ફરી રહ્યાં હતાં ત્યારે અચાનક સેનાના ગણવેશમાં ઓટોમેટિક રાઇફલ સાથે ધસી આવેલા હુમલાખોરે અંધાધૂંધ ગોળીઓ વરસાવવાની શરૂ કરી દીધી હતી જેના પગલે ભારે નાસભાસ મચી હતી.