પોલિપીપ્ટાઇડ ચેઇનમાં હાઇડ્રોજન બંધન અને એમિનો એસિડ "આર" જૂથો વચ્ચે હાયડ્રોફોબિક ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓ દ્વારા સ્થાપિત આકારમાં પ્રોટીનને હોલ્ડ કરીને પ્રોટીન માળખું સ્થિર કરવામાં મદદ કરે છે.