આ યોજનાનો લાભ લેવા ઇચ્છતા કરદાતા દ્વારા તેની પેન્ડિંગ અપીલ હેઠળની મૂળ વિવાદાસ્પદ રકમની અગાઉથી જ ચુકવણી થઈ ચૂકી હોય, અથવા તેને આવકવેરા ખાતા દ્વારા કરદાતાને મળવાપાત્ર રિફંડો સામે સેટ ઓફના સ્વરૂપે વસૂલ કરવામાં આવી હોય, તો તેવા સંજોગોમાં કરદાતાને રિફંડ મળી શકે કે કેમ, તે યક્ષ પ્રશ્ન હતો.