બોટલમાં પાણી રહેતું હોવાથી હંમેશાં એમાં ભેજ રહે છે, જે બેકટેરિયાને વિકસવા માટે અનુકૂળ વાતાવરણ પૂરું પાડે છે. આ બેક્ટેરિયાના કારણે ડાયરિયા, ઊલટી કે જુલાબ પણ થઇ શકે છે. આમ, બોટલ ઢાંકણવાળી હોય કે સ્ટ્રોવાળી હોય, એની રોજેરોજ સફાઇ થવી અત્યંત આવશ્યક છે, જેથી એમાં કોઇ પણ પ્રકારના બેક્ટેરિયા ઉત્પન્ન ન થઇ શકે.