છતાં, જ્યારે લ્યુપસ અને એમએસ બંને સેન્ટ્રલ નર્વસ પ્રણાલી પર અસર કરી શકે છે, ત્યારે તેઓ અલગ અલગ રીતે આમ કરે છે.