ઓક્ટોબર ૧૯૯૮માં પાકિસ્તાનના વડાપ્રધાન નવાઝ શરીફે મુશર્રફને ચીફ ઓફ ધ આર્મી સ્ટાફ તરીકે નિયુક્ત કર્યા.