મીન્કી વ્હેલની ત્રણ પેટાજાતિ છે - નોર્થ એટલાન્ટિક મીન્કી વ્હેલ (બાલેનોપાર્ટા એક્યુટોરોસ્ટેરાટા એયુટીટોરોસ્ટ્રાટા), નોર્થ પેસિફિક એમિંક વ્હેલ (બાલેનોપાર્ટા એક્યુટોરોસ્ટ્રાટા સ્કેમોની), અને દ્વાર્ફ મીન્કી વ્હેલ (જેની વૈજ્ઞાનિક નામ હજુ સુધી નક્કી કરવામાં આવ્યું નથી).