કારણ કે હાશિમટોની થાઇરોઈડાઇટિસ એક સ્વયંપ્રતિરક્ષા રોગ છે, દર્દીઓ અન્ય સ્વયંપ્રતિરક્ષા પરિસ્થિતિઓનો વધુ જોખમ ધરાવતા હોય છે, જેમાં સેલીક બીમારી અને ઑટોઇમ્યુન ગેસ્ટ્રિટિસનો સમાવેશ થાય છે, જે બંને લોહ શોષણમાં ઘટાડો કરી શકે છે.