માઇક્રોફલોરા સામાન્ય રીતે તમારા કોલોનનું રક્ષણ કરે છે, પરંતુ તેની ગેરહાજરીમાં ક્લોસ્ટિરીડિયમ ડિફ્સીફાઇલ (જે સામાન્ય માઇક્રોફ્લોરા બેક્ટેરિયા કરતા મોટાભાગના એન્ટીબાયોટિક્સ માટે વધુ પ્રતિરોધક છે) જેવા અન્ય ચેપી જીવાણુઓ તેમની જગ્યા લઇ શકે છે અને રોગનું કારણ બનાવી શકે છે.