આધાર નંબર કેટલાક કારણોસર ડિએક્ટિવેટ કરવામાં આવ્યા છે, જેનો ઉલ્લેખ આધાર (એનરોલમેન્ટ અને અપડેટ) રેગ્યુલેશન 2016ના સેક્શન 27 અને 28માં છે. જે હેઠળ જો કોઇ વ્યકતિના એકથી વધારે આધાર નંબર હોય અથવા તો તેના બાયોમેટ્રિક ડેટા અને સપોર્ટિંગ ડોક્યુમેન્ટમાં કંઇ ખોટું હોય તો તેનું આધાર નંબર બંધ કરવામાં આવી શકે છે. પી.પી.ચૌધરીએ જણાવ્યુ હતું કે, UIDAIની ક્ષેત્રીય કચેરીઓને આધાર નંબર ડિએક્ટિવેટ કરવાનો અધિકાર છે.