એક ચિંતા એ છે કે ક્લોરેક્સિડાઇન ખરાબ શ્વાસ પેદા કરવા માટે જાણીતા ચોક્કસ બેક્ટેરિયા સામે અસરકારક ન પણ હોઈ શકે.