પેપ્ટાઇડ બોન્ડ્સના એમાઈન અને કાર્બોનીલ જૂથો એકબીજા તરફ અને એ જ પ્લેનમાં દર્શાવે છે, તેથી હાઇડ્રોજન બંધન અડીને પોલીપેપ્ટાઇડ ચેઇન્સ વચ્ચે થઈ શકે છે.