એન્ડર્ટેરેક્ટોમીના પગલે સ્ટ્રોકનું જોખમ અંદાજે પાંચ ટકા હોવાનો અંદાજ છે અને મોટેભાગે જ્યારે ધમની તકતીનો ભાગ શસ્ત્રક્રિયા દરમિયાન તૂટી જાય છે અને મગજના બીજા ભાગમાં એક જહાજને તોડે છે.