મેનિંગોકોક્કલ મેનિંગોએન્સેફાલિઆટિસ મેનિન્જોકૉસેમિયા સાથેની સમાન નિશાનીઓ ધરાવે છે અને નિદાન કરવામાં આવે છે, ખાસ પ્રયોગશાળા અભ્યાસોની મદદથી મેન્નિકોકોકલ ચેપની અન્ય અભિવ્યક્તિઓ જેવી.