કલામ નાનપણથી જ અધ્યાત્મ અને  ધર્મને યોગ્ય રીતે સમજતા. ડો. કલામ બાળપણમાં પણ કુરાન અને ગીતાનો અભ્યાસ  કરતા અને આજે પણ કરે છે.