ઇવોલ્યુશનરી ઘડિયાળ જનીનોની અંદર આનુવંશિક સિક્વન્સ છે, જે તે નક્કી કરવામાં મદદ કરી શકે છે કે ભૂતકાળની પ્રજાતિઓ જ્યારે સામાન્ય પૂર્વજમાંથી અલગ થઇ ગયા હતા.