31 જુલાઇ 2006ના રોજ કાસ્ટ્રોએ સ્ટેટ કાઉન્સીલના પ્રમુખ, કાઉન્સીલ ઓફ મિનીસ્ટર્સના પ્રમુખ, ક્યુબન કોમ્યુનિટી પાર્ટીના ફર્સ્ટ સેક્રેટરી અને સશસ્ત્ર દળોના કમાન્ડર ઇન ચિફના પદની ફરજો તેમના ભાઈ રાઉલ કાસ્ટ્રોને સોંપી હતી. ફિડલને પેટથી ગુદા નીચેના ભાગમાં સતત બ્લીડીંગને કારણે તેમને કરવામાં આવેલી સર્જરીમાંથી બેઠા થયા ત્યાં સુધી આ ફરજોની ફેરબદલી ફક્ત થોડા સમય માટે જ વર્ણવવામાં આવી હતી.[૧૧૭] 2 ડિસેમ્બર 2006ના રોજ ઉતરાણ કરનાર ગ્રાનમા બોટની 50મી જન્મજયંતિના રાષ્ટ્રીય સમારંભમાં હાજરી આપવા માટે કાસ્ટ્રો ભારે બિમાર હતા, જે તેમની વિલંબિત 80મી જન્મજયંતિની ઉજવણી પણ બની ગઇ હતી. કાસ્ટ્રોની ગેરહાજરીએ એવા અહેવાલોને વેગ આપ્યો હતો કે તેમને ટર્મિનલ સ્વાદુપિંડનું કેન્સરછે અને તેઓ સારવારની ના પાડે છે,[૧૧૮]પરંતુ 17 ડિસેમ્બર 2006ના રોજ કાસ્ટ્રોને ટર્મિનલ બિમારી ન હતી અને આકસ્મિક રીતે જ તેમની જાહેર ફરજો પ્રત્યે પરત ફર્યા હતા. [૧૧૯][૧૨૦]