આ ઉપરાંત, સેમસંગ ગેલેક્સી નોટ 9 ના અન્ય મહત્વપૂર્ણ હાઇલાઇટ એ એસ પેન સપોર્ટ છે. આ વખતે એસ પેન બ્લૂટૂથ સપોર્ટ સાથે આવે છે. આનો અર્થ એ થાય કે એસ પેનનો ઉપયોગ કૅમેરા માટે દૂરસ્થ શટર તરીકે, પ્લે કરવા, થોભાવવા અને ટ્રેકને અવગણો.