કુલ ૭૬૦ કિ. મી. ને સમાવતો કોંકણ રેલવે પ્રોજેક્ટ અઘરો હોવાનું કારણ એ હતું કે તે મહારાષ્ટ્ર, ગોવા અને કર્ણાટક જેવાં ત્રણ મહત્ત્વનાં રાજ્યોમાંથી પસાર થતો હતો.