વિવાદો અને ઉઠી રહેલા તમામ પ્રશ્નોના કારણે કૂંભ મેળા પ્રશાસને પણ સ્વામી નિત્યાનંદના આશ્રમ અને કાર્યક્રમ પર નજર ટેકવીને બેઠાં છે.