બે એપ્લીકેશન પ્રોટોકોલ્સ જે સામાન્ય રીતે NAS સાથે સંકળાયેલા છે તે સન નેટવર્ક ફાઇલ સિસ્ટમ (NFS) અને કોમન ઈન્ટરનેટ ફાઇલ સિસ્ટમ (સીઆઈએફએસ) છે.