પ્રકૃતિ સિદ્ધાંતને લગતી સૌથી ચર્ચાસ્પદ મુદ્દો એ "ગે જીન" નું અસ્તિત્વ છે, જે લૈંગિક અનુસ્થાપનમાં આનુવંશિક ઘટક તરફ સંકેત કરે છે.