જોકે, કેટલાક કિસ્સાઓમાં, રોગપ્રતિકારક તંત્ર પોતાના કોષો અને પેશીઓ સામે કામ કરવા માટે શરૂ થાય છે (જેમ કે પેથોલોજીકલ પ્રક્રિયા એલર્જી, સ્વયંપ્રતિરક્ષા પ્રક્રિયાઓ સાથે થાય).