પ્રડર-વિલી સિન્ડ્રોમ ધરાવતા બાળકોમાં અંતઃસ્ત્રાવી સમસ્યાઓ છે જેમાં સેક્સ હોર્મોન્સ (હાઈપોગોનેડિઝમ) ના વિલંબિત અથવા ગેરહાજર સ્ત્રાવ અને વિલંબિત અથવા અપૂર્ણ લૈંગિક વિકાસનો સમાવેશ થાય છે.