મીડિયા રિપોર્ટ્સ અનુસર, અનવર બાબુ શેખ અંગે કહેવામાં આવે છે કે તેનું કનેક્શન પાકિસ્તાની જાસૂસી એજન્સી આઇએસઆઇ સાથે છે.