ફોર્ટ સમટર પરના કોન્ફેડરેટ હુમલા અને એપ્રિલ 1861 માં સિવિલ વોરની શરૂઆત સાથે, મેકલેઝે યુ. એસ. આર્મીમાંથી રાજીનામું આપ્યું અને કન્ફેડરેટ સેવામાં મુખ્ય તરીકે એક કમિશન સ્વીકાર્યું.