વૈશ્વિક ભંડોળથી વિપરીત, જેણે દેશોનો ભંડોળનો ઉપયોગ કેવી રીતે કરી શકાય તેના પર સાર્વભૌમત્વનું માપ પૂરું પાડ્યું હતું, PEPFAR કાર્યક્રમની દેખરેખ અને પગલાઓના વધુ પ્રમાણ સાથે હાથ પર અભિગમ લે છે.