ફ્રાન્સિસ્કો પીઝાર્રોને ચાર ઈન્કાની પ્રિન્સેસ સાથે ચાર બાળકો હતા: બે મૃત્યુ પામ્યા હતા અને તેમના પુત્ર ફ્રાન્સિસ્કોનું 18 વર્ષની વયે અવસાન થયું હતું.