હાશિમોટોની એન્સેફાલોપથીને દુર્લભ માનવામાં આવે છે (યુનાઇટેડ સ્ટેટ્સમાં કેટલાક ડઝન નિદાન કરનારા દર્દીઓ છે) પરંતુ સંભવ છે કે ત્યાં ઘણા વધુ બિનજાપોક્ષિત પીડિત છે જે નિદાન નહી થયેલા અથવા ખોટી રીતે તપાસવામાં આવે છે.