ત્યાર બાદ નીલિમાએ 1990માં રાજેશ ખટ્ટર સાથે લગ્ન કર્યાં હતાં, પરંતુ આ લગ્ન પણ લાંબો સમય સુધી ચાલ્યા નહોતા અને વર્ષ 2001માં બંને એકબીજાથી અલગ થઈ ગયાં હતાં.