નેપિયર એથિ-કેથોલિક હતા, જેમ કે કેથોલીક અને પોપેસી (પોપના કાર્યાલય) વિરુદ્ધના 1593 પુસ્તક દ્વારા પુરાવા મળ્યા હતા, જેનું નામ એ પ્લેન ડિસ્કવરી ઓફ ધ આખા રેવિલેશન ઓફ સેન્ટ જ્હોન હતું .