આ દરમિયાન ડૉક્ટરે ભારતીય બ્રેઈલ લિપિ વિકસાવવાનું અજોડ કામ કર્યું. પણ તેમની આ શોધ એટલે કે, ડૉ. નીલકંઠરાય બ્રેઈલ લિપિએ તેમને જગતભરમાં માન્યતા અપાવી. 1951માં યુદ્ધમાં પોતાની આંખો ગુમાવનાર ડૉ. મેકેન્ઝીના અધ્યક્ષપદે બૈરુતમાં યુનેસ્કોના ઉપક્રમે જે પરિષદ મળી તેમાં અન્ય તમામ બ્રેઈલ લિપિ કરતાં આ ગુજરાતી ડૉ. છત્રપતિની બ્રેઈલ લિપિને સ્વીકૃતિ આપીને એમને મરણોત્તર પારિતોષિક આપવામાં આવ્યું.