પ્રોટીન-પંપ અવરોધક સામાન્ય રીતે પેટા એસિડ્સ દ્વારા ફાયદાકારક બેક્ટેરિયાને માર્યા જવાથી અટકાવવા માટે તે જ સમયે આપવામાં આવે છે.