નાઈટ્રોજનયુક્ત પાયા ડીએનએ ડબલ હેલિક્સના અંદરના ભાગમાં હોય છે, જેમાં પ્રત્યેક ન્યુક્લિયોટાઇડના શર્કરા અને ફોસ્ફેટ ભાગો છે જે અણુના બેકબોન બનાવે છે.