જનીન પરિવર્તનથી વિપરીત જે રંગસૂત્ર પર ડીએનએના એક જજન અથવા મોટા સેગમેન્ટને બદલે છે, રંગસૂત્ર પરિવર્તનો સમગ્ર રંગસૂત્રને અસર કરે છે અને અસર કરે છે.