હિંદ મહાસાગરના પાણીમાં આંદામાન, અરેબિયન, ફ્લોરેસ, જાવા અને રેડ સીઝ તેમજ બાંગ્લાદેશની ખાડી, ગ્રેટ ઑસ્ટ્રેલિયન બાઇટ, એડેનની ગલ્ફ, ઓમાનની ગલ્ફ, મોઝામ્બિક ચેનલ અને ફારસી ગલ્ફ જેવા જળાશયોનો સમાવેશ થાય છે.