ઘણાં હાર્ડવેર નિદાન પ્રક્રિયાઓની જેમ, મગજના ગણતરી કરેલ ટોમોગ્રાફીમાં સંખ્યાબંધ મતભેદ છે, જેમાં નીચેનાનો સમાવેશ થાય છે: