બીજા અને ત્રીજા તબક્કામાં લીમ રોગનું નિદાન શ્વાસનળીના રક્તના ચોક્કસ વિશ્લેષણ દ્વારા થઈ શકે છે, જેમાં ચોક્કસ રકમમાં બોર્રેલિઓસિસ ચેપનો સમાવેશ થાય છે.