ગુજરાતના મુખ્યમંત્રી તરીકેની પસંદગી વખતે પણ જ્યારે વિજય રૂપાણીની પસંદગી કરવામાં આવી ત્યારથી નીતિન પટેલ મોદી સરકાર અને વિજય રૂપાણીથી નારાજ હોય તેવું અવારનવાર જોવા મળ્યું છે.