સુપ્ત, લાંબી ઇન્ફેક્શન્સની તપાસ માટે આ પદ્ધતિ પણ અસરકારક છે. પી. સી. આર. પદ્ધતિનો ઉપયોગ કરીને એસટીઆઇના વિશ્લેષણથી વાઈરસ અને બેક્ટેરિયાના એક કોશિકાઓની હાજરીમાં પણ પેથોજિનિક એજન્ટને અલગ કરી શકાય છે.