રૂપાણીએ અમરનાથ યાત્રિકો પર થયેલા આતંકી હુમલાને સખ્ત શબ્દોમાં વખોડી કાઢ્યો હતો અને જાહેર કર્યું હતું કે, ભાજપ અને વડાપ્રધાન નરેન્દ્ર મોદીના નેતૃત્વવાળી સરકારે વારંવાર જાહેર કર્યું છે તેમ આતંકવાદ સામે ઝીરો ટોલરન્સ નીતિ મુજબ સખ્ત કાર્યવાહી કરવામાં આવશે.