ત્યારબાદ 1951થી ડિપ્લોમા આપવાનું શરૂ થયુ અને જ્યારે 1949માં ગુજરાત યુનિવર્સિટી અસ્તિત્વમા આવી ત્યારે બી. જે. મેડિકલ કોલેજ ગુજરાત યુનિવર્સિટી સાથે જોડાઈ ગઈ હતી.