એન્ટિબાયોટિક્સ સાથે તીવ્ર શ્વાસનળીની સારવારમાં, શરીરના ડિસબેક્ટોરિસિસ અને રોગપ્રતિરક્ષામાં તીક્ષ્ણ ઘટાડો થઇ શકે છે, જે હંમેશા પુનઃપ્રાપ્તિની ગતિ પર સારી અસર કરતી નથી.