મેરી ફ્લેમિંગની માતા, જેનેટ સ્ટુઅર્ટ, જેમ્સ IV ના એક ગેરકાયદેસર પુત્રી હતી, અને આમ મેરી, સ્કોટિસની રાણીની એક કાકી હતી.