જીવાણુનાશકની શારીરિક પદ્ધતિઓ એવા કેસોમાં ખાસ કરીને અસરકારક છે જ્યાં કોઈ પણ રાસાયણિક એજન્ટોનો ઉપયોગ પ્રતિબંધિત છે (ઉદાહરણ તરીકે, પદાર્થો તેમની ક્રિયા હેઠળ નુકસાન થઈ શકે છે).