એમઆરએએ અનુક્રમમાં ત્રણ અડીને આવેલા નાઇટ્રોજનના પાયાને કોડોન કહેવામાં આવે છે અને તે ચોક્કસ એમિનો એસિડ માટે દરેક કોડ છે જે પ્રોટીન બનાવવા માટે યોગ્ય ક્રમમાં અન્ય એમિનો એસિડ સાથે જોડાય છે.