એસએસએચ ફાઇલ ટ્રાન્સફર પ્રોટોકોલ પરંપરાગત FTP પ્રોટોકોલ સાથે સુસંગત નથી, એટલે કે એસએફટીપી ક્લાયન્ટ્સ FTP સર્વર સાથે વાતચીત કરી શકતા નથી અને તેનાથી ઊલટું.