1998ની બીજીવારની લોકસભા ચૂંટણીમાં પાર્ટીને વધારે સીટો મળી અને કેટલીક અન્ય પાર્ટિઓના સહયોગથી વાજપેયીએ એનડીએનું ગઠન કર્યુ અને તે ફરીથી પ્રધાનમંત્રી બન્યા.