સીબીઆઇ અનુસાર ગુજરાતના એન્ટી ટેરરીસ્ટ સ્ક્વોડે નવેમ્બર, 2005માં સોહરાબુદ્દીન અને તેની પત્ની ને હૈદરાબાદથી ઉઠાવ્યા હતા અને ગાંધીનગરની પાસે એક નકલી એન્કાઉન્ટરમાં ઠાર માર્યા હતા.