વિદ્યાસાગરના અંતિમ દિવસો કર્માતારના જનજાતિ સમુદાયોને હોમિયોપથી સારવાર આપવામાં વીત્યા. ઈ. સ. ૧૮૯૧માં તેમનું પ્રાણપંખેરું ઊડી ગયું.