હાઈડ્રોસેફાલિક સિન્ડ્રોમ સાથેના રોગના મુખ્ય કારણોમાં મગજના વિકાસ, ન્યુયુઅનફેક્શન, સગર્ભાવસ્થા દરમિયાન સમસ્યાઓ, શ્રમ દરમિયાન નકારાત્મક પરિબળો, સેરેબ્રલ હેમરેજ, ગર્ભાશયમાંના ચેપ,  મગજનો  ઇસ્કેમિયા અથવા  હાયપોક્સિયા,  અને ગર્ભની પૂર્વજરૂરીકરણનો સમાવેશ થાય છે.