એકવાર ચાગાઝ રોગનું એક્યુટ તબક્કાનું નિરાકરણ થઈ જાય (સામાન્ય રીતે પ્રારંભિક ચેપના 12 સપ્તાહની અંદર), ટી. ક્રુઝીથી ચેપ ધરાવતા લોકો રોગનો ક્રોનિક તબક્કો દાખલ કરે છે.