કેટલાક ક્રોહન રોગની જટીલતા નાના અથવા મોટા આંતરડાનામાં બળતરા સાથે સીધી રીતે સંકળાયેલ નથી અને જેને "પ્રણાલીગત" અથવા "વધારાની આંતરડાની" આડઅસરો કહેવાય છે.