ભારતમાં માલ્યા પર મની લોન્ડ્રિંગનો પણ કેસ ચાલી રહ્યો છે. હાલમાં જ તેણે પોતાની ઉપર લાગેલા આરોપોને રાજકારણથી પ્રેરિત ગણાવ્યા હતા. તેણે ભારતમાં પોતાની પ્રોપર્ટીને ઈડીના કબજાથી રિલીઝ કરવાની અપીલ કરી જેથી તેને વેચી બેંકોનું દેવું ચૂકવી શકે. પરંતુ ઈડીએ તેની મંજૂરી આપવાની ના પાડી દીધી.