જ્યારે બાયોએનર્જી પરંપરાગત અશ્મિભૂત ઇંધણ તરીકે જ કાર્બન ડાયોકસાઇડનો જ જથ્થો ઉપયોગ કરે છે, જ્યાં સુધી ઉપયોગમાં લેવાયેલી છોડ બદલાઈ જાય છે, અસર ઘટાડી શકાય છે.