રાજન નંદાના પરિવારમાં પત્ની ઋતુ નંદા, પુત્ર નિખિલ નંદા, પુત્રવધૂ શ્વેતા અને પુત્રી નતાશા છે. રાજનના દીકરા નિખિલના લગ્ન બોલિવુડના મહાનાયક અમિતાભ બચ્ચનની પુત્રી શ્વેતા સાથે થયા છે. રાજન નંદાના નિધન અંગે સૌથી પહેલા ઋષિ કપૂરની દીકરી અને રણબીરની બહેન રિદ્ધિમા કપૂર સહાનીએ ઈન્સ્ટાગ્રામ પર રાજન નંદાનો ફોટો શેર કરીને આપી હતી.