આ દરમિયાન તેમણે ગાંધિનગરના પ્લાઝ્મા રીસર્ચ સેન્ટરમાં પોસ્ટ ડોક્ટરલ ફેલો તરીકે કામ કર્યું હતું. ડૉ. પરેશ પ્રજાપતિને મળેલી ફેલોશિપ માટે તેમને વાર્ષિક 36000 જેટલી ગ્રોસ સેલેરી આપવામાં આવશે.