ગેરકાયદેસર ખનન મામલે વર્ષ 2010માં જ્યારે ભાજપના ધારાસભ્યો પોતાની જ સરકારનો વિરોધ કરી રહ્યા હતા, ત્યારે સ્પીકર તરીકે બોપૈયાએ 11 બાગી ધારાસભ્યો અને 5 અપક્ષ ધારાસભ્યોને અયોગ્ય ઘોષિત કર્યા હતા.