સાન જુઆન પણ કેરેબિયનમાં સૌથી મહત્વપૂર્ણ બંદરોમાંનું એક છે અને તેમાં ઓઇલ રિફાઇનિંગ, ખાંડ પ્રોસેસિંગ, બ્યુઈંગ, ફાર્માસ્યુટિકલ્સ અને વધુ માટે સુવિધાઓ છે.