હકીકત એ છે કે માસ્ટ કોશિકાઓ આંતરડાની માર્ગને રેખા કરે છે અને રોગપ્રતિકારક પ્રતિભાવની દ્રષ્ટિએ તેમની અસરો આપીને, માસ્ટ કોશિકાઓ નીચેના બે જઠરાંત્રિય રોગોમાં ભૂમિકા ભજવવા માટે ફસાઈ છે: