ડીએનએ અને આરએનએ બેઝ પેરિંગ થોડો અલગ છે કારણ કે ડીએનએ બેઝ એડેનિન, થિમસિન, સાયટોસીન અને ગ્વાનિનનો ઉપયોગ કરે છે; આરએનએ ઍડેનિન, યુરેસીલ, સાયટોસીન અને ગ્યુએનિનનો ઉપયોગ કરે છે.