ઘણા કેન્સરની જેમ જિનેટિક્સ એસોફગેઇલ કેન્સરના વિકાસમાં સંભવિત પરિબળ છે, અને પરિવારોમાં કેન્સરના ક્લસ્ટર્સને વિશ્વના કેટલાક પ્રદેશોમાં નોંધવામાં આવ્યું છે.