જયલલિતાના નિધન પછી શશિકલાને મહાસચિવ પદ સોંપવામાં આવશે કે કેમ તે અંગે શરૂઆતમાં શંકા સેવાતી હતી તે અંગે વિવાદ પણ થયો હતો.