એમઆરઆઈ એ 1930 ના દાયકામાં શોધાયેલ ભૌતિકશાસ્ત્રની ઘટના પર આધારિત છે, જેને અણુ મેગ્નેટિક રેઝોનન્સ અથવા એનએમઆર કહેવાય છે, જેમાં ચુંબકીય ક્ષેત્રો અને રેડિયો તરંગાઓ પરમાણુને નાના રેડિયો સિગ્નલો આપવાનું કારણ આપે છે.