ત્યાર બાદ ૧૯૯૯ આસપાસ પણ જ્યારે અટલબિહારી વાજપાઈજીની સરકાર હતી ત્યારે એમની વિરુદ્ધ પણ બે વખત અવિશ્વાસ પ્રસ્તાવ સદનમાં રજૂ થયો. એકમાં તો એમને વાંધો ન આવ્યો પણ બીજા પ્રસ્તાવમાં એમણે ૧ વોટથી સરકાર ગુમાવી દીધી.