આ પ્રકારની સમસ્યા "સ્વયંપ્રતિરક્ષા રોગ" તરીકે ઓળખાય છે અને ગંભીર બીમારીઓ જેવી કે લ્યુપસ, મલ્ટિપલ સ્ક્લેરોસિસ, અલ્સેટરેટિવ કોલેટીસ, ટાઇપ આઇ ડાયાબિટીસ , અને રુમેટોઇડ સંધિવા આ રોગો કોઈપણ સારા કારણો વગર પ્રતિકારક તંત્રને કારણે થતાં હોય છે, અને પરિણામો ભયંકર થઈ શકે છે.