ગંગટોકમાં કોઇ જ રેલ્વે સ્ટેશન નથી. સિલીગુડીમાં ન્યૂ જલપાઇગુડી ગંગટોકથી નજીક રેલ્વે સ્ટેશન આવેલ છે. આ સ્ટેશન માટે કોલકાતા અને નવી દિલ્હી જેવાં પ્રમુખ શહેરો સાથે સીધું જ કનેક્શન છે. કોલકાતાથી ગંગટોક સુધીની યાત્રા અંદાજે 12