ઘરે ફેલાનીઓ અને અન્ય મોટા ગુનાઓની તપાસ કરવા ઉપરાંત, લશ્કરી ફોજદારી તપાસકર્તાઓ અન્ય ફેડરલ કાયદાનું અમલીકરણ એજન્સીઓ સાથે સંકલન કરે છે અને યુદ્ધના ગુનાઓ અને વિદેશમાં આતંકવાદી વિરોધી અભિયાનો પણ હાથ ધરે છે.