મેક્રોફેજનું પ્રાથમિક કાર્ય એ બેક્ટેરિયા અને વાયરસ સામે રક્ષણ આપવાનું છે, તેમ છતાં, ક્યારેક આ સૂક્ષ્મજીવ રોગપ્રતિકારક શક્તિને દૂર કરી શકે છે અને રોગપ્રતિકારક કોશિકાઓને સંક્રમિત કરી શકે છે.