આરઆઇએસસી યોગ્ય લક્ષ્યાંક એમઆરએનએને શોધી કાઢે છે, જ્યાં સીઆરએનએએ પછીથી unwind અને, એવું માનવામાં આવે છે, એન્ટીસેન્સ સ્ટ્રાન્ડ એ એન્ડો- અને એક્નેક્યુલેઝ ઉત્સેચકોના મિશ્રણનો ઉપયોગ કરીને, એમઆરએનએના પૂરક સ્ટ્રાન્ડના અધઃપતનને દિશામાન કરે છે.