એર ટ્રાફિક કંટ્રોલ (ATC)એ કોયંબતૂરથી ફ્લાઈટને 36,000 ફૂટ ઉપર ઉડવા માટે કહ્યું હતું, જ્યારે બેંગ્લુરુની ફ્લાઈટને 28,000 ફૂટ ઉપર ઉડવા માટેની સૂચના આપી હતી. આ દરમિયાન ફ્લાઈટ નંબર 6E779 27,300 ફૂટ પર અને 6E6505 27,500 ફૂટ પર પહોંચી ગયું હતું. બંને વિમાન ૨૦૦ મીટરનાં અંતર પર સામ-સામે આવી ગયા હતાં. પરંતુ પરિસ્થિતિનો તાગ મળવી લેતા પાયલટે સતર્કતા વાપરીને ફ્લાઈટને ડાયવર્ટ કરી લઈને મોટી દૂર્ઘટનાને થતા ટાળી દીધી હતી.