એફડીએ (FDA) મુજબ, એંડોસ્કોપિક કાર્યવાહી પીડા, પેટના પેટનું ફૂલવું, અપચો, રક્તસ્રાવ, ચેપ, ઉબકા આવવા, ઉલટી થવી, અથવા ઘેનની દવાથી સંબંધિત શ્વાસની સમસ્યાઓ સહિત જોખમો સાથે સંકળાયેલા છે.