ઇન્દ્રાણીના આ આરોપનું ખંડન કરતા સીબીઆઇએ જણાવ્યું હતું કે તેમની પાસે એવા ઘણા સાક્ષીઓ અને પુરાવા છે જે સ્પષ્ટ કરે છે કે શીનાની હત્યામાં ઇન્દ્રાણીએ મહત્વનો ભાગ ભજવ્યો હતો.