તેમછતાં, તેમ છતાં, ફોર્મેટમાં કોઈ બિલ્ટ-ઇન કૉપિ પ્રોટેક્શન નથી, કોઈક અન્ય કન્ટેનર ફોર્મેટમાં પોતાની FLAC ફાઇલને એન્ક્રિપ્ટ કરી શકે છે