ચિલિકા સરોવર બંગાળના ઉપસાગર સાથે જોડાયેલું હોવાથી તેની વિશિષ્ઠતા એ છે કે તે મીઠું અને ખારું બંને પ્રકાર નું ‘બ્રેકીશ’ પાણી ધરાવે છે. આ વિશિષ્ઠતા ને કારણે મીઠા અને ખારા એમ બંને પ્રકારના પાણીના જળચરો, જે સામાન્ય સંજોગોમાં કદી સાથે જોવા ન મળે, તે અહી જોવા મળે છે. આ કારણસર અહી જળચરો નું વિપુલ વૈવિધ્ય છે.