પ્રાથમિક તફાવત એ છે કે ઇટીએફ શેરોની જેમ વેપાર કરે છે, જેનો અર્થ થાય છે કે તેમની ભાવ સમગ્ર દિવસમાં વધશે, જ્યારે મ્યુચ્યુઅલ ફંડો માત્ર નેટ એસેટ વેલ્યુના દિવસે જ વેપાર કરે છે.