પોલીસની થીયરી મુજબ સમીર ખાન પાકિસ્તાન ગયો હતો અને તેણે જૈસ-એ-મહમંદ આંતકી સંગઠનમાં તાલીમ લઇ નેપાળ થઇ ભારત પરત ફર્યો હતો.