ત્યારબાદ, કોંગ્રેસના કોઈ સિનિયરને વડાપ્રધાન પદે બેસાડવાનું કહેનાર પ્રણવ મુખરજી, રાજીવ ગાંધીની કોંગ્રેસમાં એવા ખોવાઈ ગયા કે એક તબક્કે તેમણે પોતાના અપમાન અને અવહેલનાને કારણે કોંગ્રેસમાંથી રાજીનામું સુદ્ધાં આપી દીધું હતું.