જીવનનો છેલ્લો સમય શ્રી સદગુરૂ ગોપાળાનંદસ્વામી વડતાલમાં આવીને રહ્યા અને સંવત ૧૯૦૮નાં વૈશાખ સુદ પાચમના રોજ અક્ષરધામમાં ગયા. તેમનો અગ્નિ સંસ્કાર વડતાલમાં જ્ઞાનબાગમાં કરવામાં આવેલ છે.