આંદોલનકારીઓમા પણ મતભેદો ઊભા થવા લાગ્યા હતા અને આ આંદોલન ત્રણ ભાગમાં વહેચાઈ ગયું, પહેલું જુથ NDFB પોતાના માટે અલગ રાજ્યની માંગ કરી રહ્યું હતું તો બીજું જુથ બોડો લીબેરશન ટાઇગર (BLT)  વધુ સ્વયત્તા ની માંગ કરી રહ્યું હતું અને બોડો સિવાયના લોકોને ટાર્ગેટ કરી રહ્યું હતુ તો ત્રીજું જુથ ઓલ બોડો સ્ટુડન્ટ્સ યુનિયન (ABSU) વધારે રાજકીય સત્તાઓની તથા રાજ્યના વહીવટમાં સામેલગીરી માંગી રહ્યું હતું.