ક્રોનિક થાક સિન્ડ્રોમમાં લ્યુપસ અથવા મલ્ટિપલ સ્ક્લેરોસિસ જેવા સ્વયંપ્રતિરક્ષા બિમારીઓ સાથે સામાન્ય લક્ષણો છે, જેમાં પ્રતિકારક પદ્ધતિ ભૂલથી શરીરના તંદુરસ્ત ભાગો પર હુમલો કરે છે.