ઓરિજનલ બાઈકમાં રહેલા પેરેલલ-ટ્વિન સેટ-અપના મુકાબલે નિંજા 300 રેપ્લિકામાં સિંગલ-સિલિન્ડર એન્જિન આપેલું છે.