પંરતુ શંકરાચાર્યનું સૌથી મોટું પ્રદાન એ હતું કે તેમણે વિધર્મીઓના ભાવિ આક્રમણો સામે પ્રાચીન ભારતીય વિદ્યાઓ, જ્ઞાનના વારસાને રક્ષણ મળે એવી સમાજ વ્યવસ્થા ગોઠવી, જેણે પેઢી દર પેઢી એમ સદીઓ સુધી ભારતીય જ્ઞાનની રક્ષા કરી.