કેટલાક કિસ્સાઓમાં એલ-કાર્નેટીન પૂરક ચોક્કસ આડઅસર (ઊબકા, પેટની ખેંચાણ, ઝાડા, અને "શંકુ" શરીરની ગંધ સહિત) પેદા કરી શકે છે.