એ દિવસોમાં જમ્મુ-કાશ્મીર જવા માટે નવી દિલ્હીના સંરક્ષણ મંત્રાલયમાંથી પરમિટ કઢાવવી પડતી. ડો. મુખર્જીએ પરમિટ માટે અરજી આપવાની ના પાડી અને કહ્યું કે જમ્મુ-કાશ્મીર રાજ્ય હિંદુસ્તાનનું અભિન્ન અંગ છે.