મોટા ભાગની હોર્મોન થેરપી પ્રજનનતંત્રના અંત:સ્ત્રાવ સાથે સંકળાયેલી હોવાથી એની આડઅસર પણ પ્રજનન અવયવો અને કાર્યો પર પડે છે.