વધુમાં, આવા રોગનિવારક અભિગમને શરીરને નુકસાન પહોંચાડી શકે છે, કારણ કે જીવાણુનાશક એજન્ટો માત્ર પેથોજેનિક સૂક્ષ્મજીવાણુઓ પર જ નુકસાનકારક અસર કરે છે, પરંતુ રોગપ્રતિકારક તંત્રની પ્રવૃત્તિને ઘટાડીને ઉપયોગી માઇક્રોફોલોરાનો નાશ કરે છે.