મુખ્ય સમસ્યા એ છે કે એમઆરએસએ પેનિસિલિન અથવા ઓક્સાકિલિન જેવા અનેક પ્રકારની પ્રથમ લીટી એન્ટિબાયોટિક્સ સામે પ્રતિરોધક છે.