હકારાત્મક બાજુ હોવા છતાં, એક્યુપંક્ચરની પ્રક્રિયામાં કેટલાક વિરોધાભાસ છે, કારણ કે તેના કેટલાક જૂથોમાં જટિલતા આવી શકે છે.