આનુવંશિક રીતે સુધારેલા ઉત્પાદનોમાં નવલકથા પ્રોટીન હોય છે જે લોકોમાં એલર્જીક પ્રતિક્રિયાઓ કરી શકે છે, જે જીએમઓના ઘટકોમાંના એક અથવા ફક્ત નવા પદાર્થ માટે એલર્જીવાળા લોકોમાં એલર્જીક હોય છે.