જો કે, શસ્ત્રક્રિયા, કોઈપણ સર્જીકલ હસ્તક્ષેપની જેમ, કેટલીક ગૂંચવણો હોઇ શકે છે તેથી, સુન્નત કર્યા પછી, ડાઘ પેશીઓની અતિશય જથ્થો સર્જરી કરી શકે છે, ઉપરાંત, શસ્ત્રક્રિયા દરમિયાન  મૂત્રમાર્ગ (મૂત્રમાર્ગ)  માટે યાંત્રિક નુકસાન શક્ય છે, અને ચેપ (એન્ટિસેપ્ટિક પગલાંનો બિનઅનુભવ) પણ શક્ય છે.