ડિસેમ્બર ૨૦૧૭ના પોતાના ઓડિટ રિપોર્ટમાં નિયંત્રક અને મહાલેખા પરીક્ષકે કહ્યું કે, ૫૩,૯૬૭ કરોડ રૂપિયા, છ વર્ષમાં ૨૦૧૬-૧૭ સુધી સ્વચ્છ ઊર્જા ઉપકર રૂપે એકત્ર કર્યા, તેમાંથી ફક્ત ૨૮ ટકા એટલે કે ૧૫,૪૮૩ કરોડ રૂપિયા NCEEF ને અપાયા.