EE નું નિદાન સામાન્ય રીતે અન્નનળીના બાયોપ્સીનું પ્રદર્શન કરીને બનાવવામાં આવે છે, જેમાં ઇઓસિનોફિલના એસોફાગીયલ પેશીઓને ઘુસણખોરી થાય છે.