આઇવીએફ પછી કેટલાક સાઈડ ઇફેક્ટ્સ પણ જોવા મળે છે, સામાન્ય સોજો, એંઠન, કબજિયાત, સ્તનોમાં નરમી, પ્રક્રિયાના તરત જ પછી તારણ પદાર્થની થોડી માત્રાનો સ્ત્રાવ વગેરે.