એમએસ યુનિર્વિસટીમાં છેલ્લા કેટલાક સમયથી કરોડો રૃપિયાના ભ્રષ્ટાચાર અને કૌભાંડોની ચર્ચા શિક્ષણ આલમમાં થઇ રહી છે.