કારણ કે મેથોટર્ૅકસેટ કોષ ચયાપચયને અવરોધે છે, તે એવી સ્થિતિઓ માટે સૂચવવામાં આવે છે કે જ્યાં અસામાન્ય કોષ વિકાસ સમસ્યા છે, જેમ કે સૉરાયિસસ અથવા કેન્સર ક્રોહન રોગ અને રુમેટોઇડ સંધિવાના કેટલાક કેસોની સારવાર માટે મેથોટરેકટ પણ ઉપયોગી છે.