જોકે, એ પછી બંને વચ્ચે સતત વિવાદો સર્જાતા રહ્યા અને લોકસભાની ચૂંટણીમાં કોંગ્રેસ અને જેડીએસનાં સૂપડાં સાફ થઇ ગયાં.