સત્તા પર આવતાંવેંત મહેબૂબા મૂફત્તીએ સૌ પહેલું કામ હૂર્રિયત કોન્ફ્રન્સનાં કટ્ટર અલગાવવાદી નેતા મસર્રત આલમને જેલમાંથી છોડી મૂકવાનું કર્યું હતું.