કારણ કે આ નવી વ્યવસ્થામાં ઓનલાઇન રિફંડ આપવાની વાત ભુલાઈ ગઈ છે નવી પદ્ધતિમાં સૌથી મોટી ખામી રિફંડની અવ્યવસ્થાની છે દરેક ડીલરનાં ખાતાંમાંથી નવાં વાહનનાં રજિસ્ટ્રેશન અને ટેક્સ પેટની રકમ કપાઈ જાય છે પરંતુ આરટીઓના ખાતામાં રકમ જમા ન થતી હોય તેવા કિસ્સામાં ડીલર દ્વારા ફરી ઓનલાઇન પેમેન્ટ જમા કરવામાં આવે છે.