એનોકૉકાર્ટિસ પ્રોફીલેક્સીસ પાછળના ખ્યાલ એ છે કે તે કોઈ પણ બેક્ટેરિયાને મારી નાખવા માટે એન્ટિબાયોટિક્સનો ઉપયોગ કરે છે જે હૃદયની અંદર ચેપ સ્થાપવાની તક પહેલાં તે લોહીના પ્રવાહમાં પ્રવેશ કરે છે.