ઉદાહરણ તરીકે, આંતરડાના વાયરલ રોગોમાં, તેમજ ડિસ્બેક્ટોરિસિસમાં, સક્રિય ચારકોલ નુકસાન પહોંચાડી શકે છે, કારણ કે તે તે પદાર્થોના આંતરડાની માઇક્રોફલોરાને વંચિત કરશે જે આ રોગવિજ્ઞાનને પ્રતિકાર કરે છે.