ક્રોહન રોગ માટેનો પ્રોટોકોસિસ વેરિયેબલ છે, અને તે સમયની સાથે કેવી રીતે રોગ બદલાય છે અને તે કેવી રીતે દવાઓ સાથે અથવા શસ્ત્રક્રિયા સાથે સારવાર માટે પ્રતિક્રિયા આપે છે તેના આધારે અલગ હોઈ શકે છે.