સ્વામી મુકુંદાનંદે અનુક્રમે ઇન્ડિયન ઇન્સ્ટિટ્યૂટ ઓફ ટેક્નોલોજી અને ઇન્ડિયન ઇન્સ્ટિટ્યૂટ ઓફ મેનેજમેન્ટમાંથી પોતાની ડિગ્રીઓ મેળવી હતી.