આઈએસઆઈ એક સરકારી વિભાગ હોવા છતાં આઈએસઆઈ, પાકિસ્તાન સરકાર પાસેથી માત્ર અબજો રૂપિયા લેતી જ નથી, પરંતુ નશીલી દવાઓની તસ્કરી અને આતંકવાદ દ્વારા પણ ખૂબ નાણા કમાય છે.