કમનસીબે, આ પ્રક્રિયાના ઉચ્ચ જોખમવાળા સ્વભાવનો તેનો ઉપયોગ મર્યાદિત છે હકીકતમાં, એલોજેનિક સ્ટેમ સેલ ટ્રાંસપ્લાન્ટમાં સારવાર સંબંધિત મૃત્યુ દર 30% સુધી હોઇ શકે છે.