આ સેવા પ્રદાન કરવા માટે બેંક દ્વારા ચાર્જ પણ વસૂલ કરવામાં આવે છે. બેંકો પ્રમાણે આ ચાર્જીસ અલગ અલગ હોય છે. તેનો ચાર્જ કેટલો હશે તેનો આધાર આપ કેટલા ચેકનું સ્ટોપ પેમેન્ટ કરાવો છો તેના પર પણ રહેલો છે.