ઇથેનોલ માટે વધતી મકાઈમાં કૃત્રિમ ખાતર અને હર્બિસાઇડના મોટા પ્રમાણમાં ઉપયોગ થાય છે, અને મકાઈનું ઉત્પાદન, સામાન્ય રીતે, પોષક અને કચરાના પ્રદુષણના વારંવાર સ્ત્રોત છે; ઔદ્યોગિક વિરુદ્ધ વાણિજ્યિક અને સ્થાનિક ખાદ્ય ખેડૂતોની લાક્ષણિક પદ્ધતિઓ વધુ પર્યાવરણને જોખમી ગણવામાં આવે છે.