તૈયારી ઘણીવાર કોલોનોસ્કોપીનો સૌથી અસ્વસ્થ ભાગ છે કારણ કે પ્રકાશની કઠિનતા અથવા " સંધિકાળ ઊંઘ " નો ઉપયોગ સામાન્ય રીતે કોઈપણ અગવડતા અટકાવવા પ્રક્રિયા દરમ્યાન થાય છે.