જાણકારોના જણાવ્યા પ્રમાણે સરકાર જીએસટી બિલ રાજ્યસભામાંથી પાસ કરે તો પણ તેની અમલવારીને લઈને હજુ પણ કેટલાક એવા મુદ્દાઓ છે કે જે સરકાર માટે મોટી ચેલેન્જરૂપ બની શકે છે. ખાસ કરીને દેશભરમાં એકસમાન માળખું ઊભું થશે તથા જૂની ટેક્સ વ્યવસ્થાના કારણે નવી ટેક્સ વ્યવસ્થા ઊભી થશે. આવા સંજોગોમાં સરકારે કારગત ઈન્ફર્મેશન ટેકનોલોજીની વ્યવસ્થા ઊભી કરવી પડશે. જેમાં વેપારીઓ કરની ચૂકવણી વિના અવરોધે કરી શકે.