દેશી કપાસ ઉગાડતા મોટા ભાગના ખેડૂતો સેન્દ્રિય ખાતરો વાપરતા હોય છે અને તેમાં રોગ-જીવાતના પ્રશ્નો નહિવત હોવાથી જંતુનાશક રસાયણોનો ઉપયોગ ટાળતા હોય છે.