આ પ્રક્રિયા સાથે સંકળાયેલા ગૂંચવણોમાં સીએમવી ચેપ , તીવ્ર અને ક્રોનિક અસ્વીકાર, અને પોસ્ટ ટ્રાન્સપ્લાન્ટ લિમ્ફો્રોપોલિફેરેટિવ રોગનો સમાવેશ થાય છે.