મુખર્જીનાં અનુસાર 2012માં રાષ્ટ્રપતિ ઇલેક્શનનાં સમયે તેમણે શિવસેનાં સુપ્રીમો બાલઠાકરે સાથે મુલાકાત થઇ હતી.