આમ એનએસજીના બે જવાનો ઓછા થઈ ગયા હતા, આમ છતાં બાકીના કમાન્ડોએ પોતાનું કામ ચાલુ રાખવાનું હતું ટેરેરીસ્ટ અને કમાન્ડો વચ્ચે આખી રાત ફાયરિંગ ચાલતુ રહ્યુ સવારે પાંચ વાગે કમાન્ડો ટેરેરીસ્ટની એકદમ નજીક પહોંચી ગયા અને ટેરેરીસ્ટને ઠાર માર્યા હતા આમ ઓપરેશન અક્ષરધામ પુરા 12 કલાક ચાલ્યુ હતું જેમાં મંદિરમાં દર્શને અર્થે આવેલા લોકો સહિત પોલીસ જવાનો અને એનએસજી કમાન્ડો સહિત 35 લોકો માર્યા ગયા હતા, 2002ના કોમી તોફાન પછી ગુજરાત ઉપર થયેલા આ પહેલી ત્રાસવાદી હુમલો હતો કદાચ ગુજરાત પોલીસ ત્યારે આ સ્થિતિને પહોંચી વળવા માટે સક્ષમ ન્હોતી.