માઇક્રોસ્કોપિક એનાટોમી સેલ્યુલર સ્ટ્રક્ચર્સ પર કેન્દ્રિત છે, જે હિસ્ટોલોજી અને વિવિધ પ્રકારની માઇક્રોસ્કોપીનો ઉપયોગ કરીને જોઇ શકાય છે.