તાજેતરમાં એએમટીએસના સત્તાવાળાઓએ સંસ્થાની શેડ્યૂલ પરની જુદી જુદી કેટેગરીની કુલ ૯ર૬ ખાલી જગ્યા પૈકી ટ્રાન્સપોર્ટ મેનેજર વર્કસ મેનેજર ચીફ એકાઉન્ટન્ટ, ડેપ્યુટી ચીફ એકાઉન્ટન્ટ અને ઇન્કવાયરી ઓફિસ એમ કુલ પાંચ જગ્યાને બાકી રાખીને અન્ય કુલ ૯ર૧ જગ્યાને શેડ્યૂલ પરથી રદ કરવાની તેમજ વર્ગ ત્રણ અને વર્ગ ચારમાં ૯-૧૮-ર૭ અને ૧ર-ર૪ અન્વયે અપાતાં પ્રમોશન સમયે નીચલી કેટેગરીની જગ્યા આપોઆપ રદ કરવાની ઠરાવ ગત તા તા.રપ એપ્રિલ ર૦૧રએ મળેલી ટ્રાન્સપોર્ટ કમિટીએ કરીને ભારે વિવાદ સજર્યો છે. બીજી તરફ સંસ્થાની માલિકીની બસ ચલાવવાને બદલે ખાનગી ઓપરેટરોને તંત્ર લાડ લડાવીને ખોટને ત્રણ ગણી કરી રહ્યું છે. આ પણ તંત્રની વિવાદાસ્પદ કામગીરી છે.