તો ઘણાં લોકો એમ પણ માને છે કે લગભગ ૭૦૦થી ૮૦૦ વર્ષ પહેલાં દક્ષિણમાં શૈવ જાતિના લોકો અને વૈષ્ણવ જાતિના લોકો વચ્ચે તકલીફ અતિશય વધી ગઇ હતી, ત્યારે તે મતભેદો દૂર કરવા માટે ભગવાન અયપ્પાની પરિકલ્પના કરવામાં આવી હતી, જેથી બંનેના મતભેદ દૂર થઇ જાય.