અનિલ નાયકની  ઇન્ચાર્જ કુલપતિ તરીકે  ખોટી રીતે નિમણુંક કરવામાં આવી હોવાની  ગુજરાત હાઇકોર્ટમાં કો-વોરંટો નામની  પિટિશન સુજાણપુર કોલેજના ટ્રસ્ટી  દશરથભાઇ પટેલ દ્વારા કરાતાં કોર્ટે દાખલ કરતાં યુનિવર્સિટીમાં કુલપતિ પદ ફરીવાર કાનુની વિવાદમાં આવી ગયું છે.