બાલાકોટને ભારતીય વાયુ દળ દ્વારા નિશાનો બનાવવા પાછળનું મુખ્ય કારણ એ હતું કે, બાલાકોટનો આ જંગલ વિસ્તાર જૈશ એ મોહમ્મદ આતંકી સંગઠનની મુખ્ય છાવણી હતી, જ્યાં આતંકીઓને તાલીમ આપવામાં આવતી હતી.