જ્યારે ખોરાકની અસહિષ્ણુતા અસ્તિત્વમાં હોય, ત્યારે સમસ્યા પાચન તંત્રના સ્તરે હોય છે - ખોરાકને ડાયજેસ્ટ કરવાની GI સિસ્ટમની અસમર્થતા અસ્વસ્થતા જઠરાંત્રિય લક્ષણોને કારણે થાય છે ખાદ્ય એલર્જીથી વિપરીત, ખોરાકની અસહિષ્ણુતા ધરાવતા વ્યક્તિ ખાસ કરીને લક્ષણોનો અનુભવ કર્યા વગર ઓળખી શકાય તેવા ખોરાકની થોડીક માત્રામાં ખાય છે.