કેટલાક નિષ્ણાતો એવી ધારણા કરે છે કે યુનાઇટેડ સ્ટેટ્સમાં હાઇપોથાઇરોડિઝમના મોટાભાગના કેસોની જેમ, ફાઈબ્રોમીઆલ્ગીઆ પણ સ્વયંપ્રતિરક્ષા રોગ છે.