ટ્રોજન શોધવાનું ખૂબ જ મુશ્કેલ છે. જો કોઈ વ્યક્તિ તેની સિસ્ટમમાં તેના અસ્તિત્વ અંગે શંકા કરે છે, તો તેને "પેકેટ સ્નિફર" નો ઉપયોગ કરવો જોઈએ, જે સાયબર-ક્રીમિનિઅલ કન્ટ્રોલ હેઠળના શંકાસ્પદ સર્વર્સ સાથે કોઈ સંચાર શોધ કરતી વખતે સિસ્ટમ સાથે સંકળાયેલ તમામ ટ્રાફિકનું વિશ્લેષણ કરે છે. આમ છતાં, કેટલાક એન્ટી-વાયરસ પ્રોગ્રામ્સ છે જે ટ્રોજનથી છુટકારો મેળવવા માટે પૂરતી છે.