આવા સંસ્થાકીય માળખાંના ગેરફાયદા એ વિભાગોના સમગ્ર વ્યૂહાત્મક સંચાલનની જટિલતા છે, જેમાંથી દરેક તેના કાર્યોને પૂર્ણ કરે છે, પરંતુ વ્યૂહાત્મક યોજનાઓના અમલીકરણ, નબળા સુગમતા અને બાહ્ય અને આંતરિક ફેરફારોની પ્રતિક્રિયામાં નબળી રીતે સંકળાયેલા છે, સંચાલકીય વ્યાવસાયીકરણ પર પરિણામોનું ઉચ્ચ ડિગ્રી અવલંબન.