બાબા અમરનાથની વિશેષતા એ છે કે, ત્યાં રહેલી પવિત્ર ગુફાઓમાં પ્રાકૃતિક શિવલિંગનું નિર્માણ થાય છે અને તેના દર્શનનું અનેરુ મહત્વ છે.