ભૂગર્ભ જળ પ્રદૂષિત થવાનું કારણ આડેધડ બોર કરીને પાણી ખેંચી લેવું, કેમિકલ ખાતરોનો ઉપયોગ, જમીનની સપાટી પર ઔદ્યોગિક કચરાનો ફેલાવો આ બધાને કારણે જમીન, જળસ્ત્રોત પ્રદૂષિત થાય છે અને આખરે આ પ્રદૂષણ ભૂગર્ભ જળ સુધી પહોંચે છે.