તેઓ અમદાવાદની સાલ હોસ્પિટલ, ર્સ્ટલિંગ હોસ્પિટલ, એપોલો હોસ્પિટલ અને શેલ્બી હોસ્પિટલમાં વિઝિટિંગ ગેસ્ટ્રોએન્ટ્રોલોજીસ્ટ તરીકે પણ સેવાઓ આપે છે. ડો. સંજય રાજપૂતે ૪૦,૦૦૦થી પણ વધુ ડાયગ્નોસ્ટીક અને થેરાપ્યુટિક એન્ડોસ્કોપીક પ્રોસીજર્સ પરફાર્મ કરી છે.