કોટ્ટયમને પોતાનું નામ શબ્દ કોટ્ટમાંથી મળ્યું જે એક મલયાલમ શબ્દ છે, જેનો અર્થ થાય છે કિલ્લો અને અકમ શબ્દનો અર્થ થાય છે અંદર.