1560 માં, મેરીની માતા મૃત્યુ પામ્યા, એક નાગરિક યુદ્ધના મધ્ય ભાગમાં તેણે જોહ્ન નોક્સ સહિત પ્રોટેસ્ટન્ટોને દબાવી દેવાનો પ્રયત્ન કરીને ઉભા થયા.