2002માં તેઓ ગુજરાત ઈન્ટેલીઝન્સ વિભાગમાં ફરજ બજાવતા હતા, ગોધરાના તોફાનની તપાસ કરી રહેલા નાણાવટી પંચ સામે તેમણે એફીડેવીટ કર્ય હતું કે ગોધરા સ્ટેશનના ઘટના બાદ નરેન્દ્ર મોદીના સરકારી બંગલે એક મિટીંગ મળી હતી, આ પ્રકારનું એક એફીડેવીટ તેમણે સુપ્રીમ કોર્ટમાં પણ કર્યુ હતું, જો કે સંજીવ ભટ્ટ મોદીઓ ઉપર જે આરોપ લગાવી રહ્યા હતા તેના સમર્થનમાં અન્ય કોઈ અધિકારી આવ્યા ન્હોતા, ગુજરાત સરકારે તેમની ઉપર વિવિધ પ્રકારની તપાસ બેસાડી હતી જેમાં તેમનું પોસ્ટીંગ જુનાગઢ હોવા છતાં તેઓ ફરજના સ્થળે જુનાગઢ જવાને બદલે અમદાવાદના ઘરેથી ઓફિસ ચલાવતા હતા અને પોતાના સરકારી સ્ટાફનો ઉપયોગ કરતા હતા.