ચેન્નઈ એક્સપ્રેસ સ્ટોરી છે મુંબઈમાં રહેનારા 40 વર્ષના રાહુલ (શાહરૂખ ખાન)ની જે પોતાના દાદાની અસ્થિયો પ્રવાહિત કરવા માટે ઘરેથી નીકળ્યો છે, ચેન્નઈ એક્સપ્રેસ ટ્રેનમાં તેની મુલાકાત તમિલનાડુની મીનમ્મા (દીપિકા પાદુકોણ) હોય છે, જે પોતાના ઘરેથી ભાગી ગઈ હતી.