ફેનીલેકેટોનરીયા આવા રોગ સાથે, મગજના માળખામાં ફેરફાર થાય છે - ન્યુરોલોજીકલ વિકૃતિઓ વિકસાવે છે, માનસિક મંદતા રચાય છે.