પોલિમરેઝ સાંકળ પ્રતિક્રિયાના તમામ પગલા - ડીએનએને દર્શાવતા, પ્રાઇમરોને લાગુ પાડતા અને ડીએનએ વિસ્તરે છે - જુદા જુદા તાપમાને થાય છે, તેથી પ્રારંભિક મિશ્રણ સાથે મૂકવામાં આવે તે પછી, પગલાંઓ થર્મોસીકલિંગ તરીકે ઓળખાતી પ્રક્રિયા દ્વારા નિયંત્રિત કરી શકાય છે, જેમાં દરેક પગલા લેવા માટે માત્ર લાંબા સમય માટે તાપમાન જરૂરી સ્તરે રાખવામાં આવે છે.