ન્યુરોલોજીમાં ટ્રાન્સક્રોનિયલ ડોપ્લરના ઘણા ઉપયોગો છે, જેમાં સબરાચીનોઇડ હેમરેજ બાદ, વાસ્સ્પેશ માટે સ્ક્રીનીંગ, મગજની મૃત્યુમાં રક્તના પ્રવાહની અછતની શોધ, અને સિકલ સેલ રોગમાં સ્ટ્રોકના જોખમનું મૂલ્યાંકન સહિતના છે.