મહેન્દ્રસિંહ ધોનીનું નામ ઘણી જાણીતી અભિનેત્રીઓ સાથે જોડાયુ પરંતુ બધી અટકળોને ખોટી સાબિત કરીને ધોનીએ 4 જુલાઇ 2010 ના રોજ દહેરાદૂનની સાક્ષી રાવત સાથે લગ્ન કર્યા. ધોની અને સાક્ષીની એક દીકરી પણ છે. તેનું નામ જીવા છે. ધોની સૌથી વધુ કમાણી કરતા ભારતીય ખેલાડી પણ બન્યા. ટેસ્ટ ક્રિકેટમાંથી સન્યાસ લેવા સુધી તેમની વાર્ષિક કમાણી 150 થી 190 કરોડ રુપિયા હતી. ધોનીના ખાનગી જીવન પર વર્ષ 2016 માં 'એમએસ ધોની- ધ અનટોલ્ડ સ્ટોરી' નામની ફિલ્મ પણ બની.