પાકિસ્તાની મીડિયાના અહેવાલ મુજબ મુશર્રફ એક દુર્લભ પ્રકારની બીમારી અનિલોઇડોસિસથી પીડિત છે જેમાં શરીરમાં બચેલું પ્રોટીન જુદાં-જુદાં અંગોમાં જમા થવા લાગે છે.