નવલખી બંદરે પર્યાવરણની જાળવણી થાય અને પ્રદુષણ ન ફેલાય તે માટે નેશનલ ગ્રીન ટ્રીબ્યુનલ દ્વારા   ગુજરાત પ્રદુષણ નિયંત્રણ બોર્ડને પર્યાવરણ જાળવણીના નિયમોની અમલવારીની જવાબદારી સોપાય છે પરંતુ ભ્રષ્ટાચારના પાપે પ્રદુષણ નિયંત્રણ બોર્ડના અધિકારીઓ  પોર્ટ સતાવાળાઓ પાસે નિયમોનુ પાલન કરવવુ તો ઠીક નવલખી બંદરની હાલત જોવા પણ જવાની તસદી લેતા નથી.