સાધ્વી પ્રજ્ઞા આ બાબાતે છેલ્લા 8 વર્ષથી જેલમાં છે. તેને પહેલા પણ આ બાબતની તપાસ કરનારી એજન્સી એટીએસ પર શોષણનો આરોપ લગાવ્યો હતો. એટીએસે આ બાબતે બે ચાર્જશીટ દાખલ કરી હતી. એટીએસને સાધ્વીને બ્લાસ્ટનું ષડયંત્ર રચવાના આરોપી બનાવ્યા હતા. જો કે તે આ આરોપોને નકારી કાઢ્યા છે.