કાર્ડિયાક સ્નાયુની જેમ, મોટા ભાગના આંતરડાની સ્નાયુને ઓટોનોમિક નર્વસ સિસ્ટમ દ્વારા નિયમન કરવામાં આવે છે અને અનૈચ્છિક નિયંત્રણ હેઠળ છે.