એટલું જ નહીં, નાયડુએ મોદી સરકાર વિરુદ્ધ લોકસભામાં અવિશ્વાસની દરખાસ્ત રજૂ કરી અને આંધ્રપ્રદેશને મોદી સરકાર દ્વારા વિશેષ રાજ્યનો દરજ્જો અપાતો નથી–એ મતલબના રાજકીય આક્ષેપો કરી એનડીએ સાથે છેડો ફાડી નાખ્યો.