આઈબીડી (IBD) ના કારણ અંગે એક થીયરી એ છે કે તે એલર્જીક અથવા રોગપ્રતિકારક પ્રતિક્રિયા હોઈ શકે છે, મોટા ભાગે આ હકીકત પર આધારિત છે કે IBD એ રોગપ્રતિકારક મધ્યસ્થીયુક્ત રોગ છે .