માછલીઘરની ગોઠવણી માટે ઘણા પરિબળોને ધ્યાનમાં લેવાની જરૂર છે, કારણ કે તે કોઈ સ્વ-પર્યાપ્ત તંત્રનો અર્થ નથી, તે સતત પ્રદૂષણ અને સડોના ઉત્પાદનોમાંથી જરૂરી પદાર્થો અને શુદ્ધિકરણની રજૂઆત કરવાની જરૂર છે.