રાજ્ય સરકારનો આરોપ છે કે, તત્કાલીન યમુના એક્સપ્રેસ ઔદ્યોગિક વિકાસ ઓથોરિટીએ યમુના એક્સપ્રેસ માટે મથુરાના ૭ ગામોમાં ૮૫ કરોડ રુપિયાની જમીન ખરીદી હતી.