ઓમેગા -3 એ ચેપ સામે લડવા માટે મદદ કરી શકે છે કે કેમ તે જાણીતું નથી (જોકે, સામાન્ય ઠંડા તરીકે), સંશોધન સૂચવે છે કે ઓમેગા -3 એ ક્રોહન રોગ, અલ્સેટરેટિવ કોલેટીસ અને રૂયમોટીઇડ સંધિવા જેવા રોગપ્રતિકારક તંત્ર વિકાર સામે રક્ષણ આપી શકે છે.