રાષ્ટ્રીય સ્વયંસેવક સંધનાં પ્રમુખ મોહન ભાગવતની અનામતની નીતીની સમીક્ષા અંગેની કોમેન્ટ પર પણ તેમણે વિરોધ વ્યક્ત કર્યો હતો. સોનિયાએ જણાવ્યું કે તે અનામતનાં મુદ્દે પછાત જાતીઓ અને જનજાતીઓની પડખે મજબુત દિવાલની જેમ ઉભા છે. તેમણે કહ્યું કે રાષ્ટ્રીય જનતાંત્રિક ગઠબંધન દુષ્પ્રચાર કરીને કોંગ્રેસને બદનામ કરવાનો પ્રયાસ કરી રહ્યા છે.