સામાન્ય રીતે ક્રોહન રોગ અને આઈબીડીના કારણ વિશે સિદ્ધાંતો છે, પરંતુ આઇબીડીને હાલમાં આઇડિયોપેથીક બીમારી (અજ્ઞાત કારણોસર રોગ) તરીકે વર્ગીકૃત કરવામાં આવે છે.