atepeq/tico19 huggingface dataset:
Finally, same as the other HCoVs, SARS-CoV-2 can be detected in fecal samples.
Por fim, do mesmo modo que os outros HCoVs, o SARS-CoV-2 pode ser detectado em amostras fecais.
Whether fecal-oral transmission of SARS-CoV-2 plays an important role as in the case of SARS-CoV at least under some circumstance remains to be clarified by future studies.
Ainda precisa ser esclarecido em estudos futuros se a transmissão oro-fecal do SARS-CoV-2 desempenha um papel importante, como no caso do SARS-CoV, pelo menos em algumas circunstâncias.
It is also of particularly great interest to see whether SARS-CoV-2 might exhibit seasonality as in the cases of community-acquired HCoVs.
É também de grande interesse descobrir se o SARS-CoV-2 pode exibir sazonalidade, como nos casos de HCoVs adquiridos de modo comunitário.
Nevertheless, the features of SARS-CoV-2 including its transmissibility, pathogenicity and sustainable spreading after passages in humans will be influential on the ultimate fate of the ongoing outbreak of COVID-19.
De qualquer forma, as características do SARS-CoV-2, incluindo sua transmissibilidade, patogenicidade e propagação sustentável depois de sua passagem para os seres humanos, influenciarão o desfecho da epidemia atual de COVID-19.
All four community-acquired HCoVs causing mild symptoms have been well adapted to humans.
Todos os HCoVs adquiridos por modo comunitário que causam sintomas brandos se adaptaram bem aos seres humanos.
From another perspective, it might also be true that humans have been well adapted to these four HCoVs.
Sob outra perspectiva, também pode ser verdade que os seres humanos se adaptaram bem a esses quatro HCoVs.
In other words, both could be the survivors of ancient HCoV pandemics.
Em outras palavras, os dois poderiam ser os sobreviventes de pandemias antigas de HCoV.
HCoVs that cause severe diseases in humans and humans who developed severe HCoV diseases have been eliminated.
Os HCoVs que causam doenças graves em seres humanos e a pessoas que desenvolvem doenças graves de HCoVs foram eliminados.
For this to happen, HCoVs have to replicate in humans to sufficient extent to allow the accumulation of adaptive mutations that counteract host restriction factors.
Para que isso aconteça, os HCoVs precisam se replicar nos seres humanos a uma extensão suficiente de modo a permitir a acumulação de mutações adaptativas que neutralizem os fatores de restrição.
In this sense, the longer the SARS-CoV-2 outbreak persists and the more people that it infects, the greater chance that it will fully adapt to humans.
Nesse sentido, quanto maior for o tempo de permanência da epidemia de SARS-CoV-2, mais pessoas serão infectadas, e maior a chance de que o vírus de adapte aos seres humanos.
If it adapts well, its transmission in humans would be difficult to stop by quarantine or other infection control measures.
Se a adaptação for adequada, sua transmissão aos seres humanos seria difícil de controlar com a quarentena ou outras medidas de controle de infecção.
For many years, the four community-acquired CoVs circulate in human populations, triggering common cold in immunocompetent subjects.
Há vários anos, os quatro CoVs adquiridos de modo comunitário circulam nas populações humanas, causando resfriado comum em indivíduos imunocompetentes.
These viruses do not need an animal reservoir.
Esses vírus não precisam de um reservatório animal.
In contrast, highly pathogenic SARS-CoV and MERS-CoV have not adapted to humans well and their transmission within humans cannot be sustained.
Em contrapartida, o SARS-CoV e o MERS-CoV, altamente patogênicos, não se adaptaram bem aos serem humanos, e sua transmissão entre os seres humanos não pode ser sustentada.
They need to maintain and propagate in their zoonotic reservoirs and seek the chance to spillover to susceptible human targets, possibly via one or more intermediate and amplifying hosts.
Eles necessitam manter-se e propagar-se em seus reservatórios zoonóticos e aproveitar a chance de migrar para alvos humanos suscetíveis, possivelmente por meio de um ou mais hospedeiros intermediários e amplificadores.
SARS-CoV-2 has features that are similar to both SARS-CoV/MERS-CoV and the four community-acquired HCoVs.
O SARS-CoV-2 tem características similares ao SARS-CoV, ao MERS-CoV e aos quatro HCoVs adquiridos de modo comunitário.
It is highly transmissible like community-acquired HCoVs, at least for the time being.
Ele é altamente transmissível, da mesma forma que os HCoVs adquiridos de modo comunitário, pelo menos até o momento.
However, it is more pathogenic than community-acquired HCoVs and less pathogenic than SARS-CoV or MERS-CoV.
Entretanto, ele é mais patogênico que os HCoVs adquiridos de modo comunitário e menos patogênico do que o SARS-CoV e o MERS-CoV.
It remains to be seen whether it will adapt fully to humans and circulate within humans without a reservoir or intermediate animal host.
Ainda precisa ser descoberto se ele se adaptará completamente aos seres humanos e circulará entre nós sem um hospedeiro animal reservatório ou intermediário.
Before discussing the animal origins of HCoVs, it will serve us well to discuss the definitions and characteristics of evolutionary, natural, reservoir, intermediate and amplifying hosts of HCoVs.
Antes de discutir as origens animais dos HCoVs, seria útil discutir as definições e características dos hospedeiros evolutivos, naturais, reservatórios, intermediários e amplificadores dos HCoVs.
An animal serves as the evolutionary host of an HCoV if it harbours a closely related ancestor sharing high homology at the level of nucleotide sequence.
Um animal serve como o hospedeiro evolutivo de um HCoV se ele abriga um ancestral de relação direta, compartilhando alta homologia a nível da sequência nucleotídica.
The ancestral virus is usually well adapted and non-pathogenic in this host.
O vírus ancestral geralmente é bem adaptado e não patogênico nesse hospedeiro.
Likewise, a reservoir host harbours HCoV continuously and for long term.
Da mesma forma, um hospedeiro reservatório abriga o HCoV de modo contínuo e duradouro.
In both cases, the hosts are naturally infected and are the natural hosts of HCoV or its parental virus.
Nos dois casos, os hospedeiros são infectados naturalmente e são os hospedeiros naturais do HCoV ou de seu vírus parental.
In contrast, if the HCoV is newly introduced to an intermediate host right before or around its introduction to humans, it is not well adapted to the new host and is often pathogenic.
Em contrapartida, se o HCoV é recém-introduzido a um hospedeiro intermediário logo antes ou perto de sua introdução aos seres humanos, ele não se adapta adequadamente ao novo hospedeiro, e é geralmente patogênico.
This intermediate host can serve as the zoonotic source of human infection and play the role of an amplifying host by allowing the virus to replicate transiently and then transmitting it to humans to amplify the scale of human infection.
Esse hospedeiro intermediário pode servir como a fonte zoonótica da infecção humana e desempenhar a função de um hospedeiro amplificador, permitindo que o vírus replique de forma transiente e, então, transmitindo-o para humanos e aumentando a escala da infecção humana.
An HCoV can undergo a dead-end infection if it cannot sustain its transmission within the intermediate host.
Um HCoV pode ter a infecção interrompida se ele não conseguir sustentar sua transmissão no hospedeiro intermediário.
On the contrary, HCoVs can also adapt to the intermediate host and even establish long-term endemicity.
Em contrapartida, os HCoVs também pode se adaptar ao hospedeiro intermediário e estabelecer endemicidade de longo prazo.
In this case, the intermediate host becomes a natural reservoir host.
Nesse caso, o hospedeiro intermediário torna-se o hospedeiro reservatório natural.
Epidemiological data revealed retrospectively that the index case of SARS had a contact history with game animals.
Dados epidemiológicos revelaram que o paciente zero da SARS teve um histórico de contato com animais de caça.
Subsequent seroprevalence investigations indicated that animal traders had a higher prevalence of anti-SARS-CoV IgG compared with that of the general population.
Investigações posteriores da soroprevalência indicaram que comerciantes de animais tinham uma maior prevalência de IgG antiSARS-CoV, em comparação com a da população geral.
Masked palm civets (Paguma larvata) and a racoon dog in live animal markets were first identified to carry SARS-CoV-like viruses that are almost identical to SARS-CoV.
Civetas de palma mascarada (Paguma larvata) e um cão-guaxinim nos mercados de animais vivos foram identificados inicialmente como portadores de vírus similares ao SARS-CoV.
This was indirectly supported by the fact that no further SARS was reported after killing all civets in the markets.
A identificação foi corroborada indiretamente pelo fato de que nenhuma outra SARS foi notificada após o abate de todas as civetas nos mercados.
However, it has been reported that masked palm civets from the wild or farms without exposure to the live animal markets were largely negative for SARS-CoV, suggesting that masked palm civets might only serve as the intermediate amplifying host but not the natural reservoir of SARS-CoV.
Entretanto, foi relatado que as civetas de palma mascarada selvagens ou de fazendas sem exposição aos mercados de animais vivos eram altamente negativas para o SARS-CoV, sugerindo que as civetas de palma mascarada poderiam ser apenas o hospedeiro intermediário amplificador, mas não o reservatório natural do SARS-CoV.
Notably, since 80% of the different animals in the markets in Guangzhou have anti-SARS-CoV antibodies, the possibilities that multiple species of small mammals might also serve as intermediate amplifying hosts of SARS-CoV cannot be excluded.
Nota-se que 80% dos diferentes animais nos mercados em Guangzhou têm anticorpos antiSARS-CoV; a possibilidade de que várias espécies de pequenos mamíferos possam servir de hospedeiros intermediários amplificadores do SARS-CoV não pode ser excluída.
All of these appear to be dead-end hosts of SARS-CoV.
Todos esses animais parecem ser hospedeiros terminais do SARS-CoV.
Subsequent search for the natural animal host of SARS-CoV unveiled a closely related bat CoV, termed SARS-related Rhinolophus bat CoV HKU3 (SARSr-Rh-BatCoV HKU3), which exists in Chinese horseshoe bats.
A procura subsequente pelo hospedeiro animal natural do SARS-CoV revelou um CoV de morcego de relação estreita, nomeado CoV HKU3 de morcego Rhinolophus relacionado ao SARS (SARSr-Rh-BatCoV HKU3), que existe no morcego-ferradura chinês.
These bats are positive for anti-SARS-CoV antibodies and genome sequence of SARSr-Rh-BatCoV HKU3.
Esses morcegos são positivos para anticorpos antiSARS-CoV e para a sequência genômica do SARSr-Rh-BatCoV HKU3.
This and other bat CoVs share 88-92% nucleotide sequence homology with SARS-CoV.
Este e outros CoVs de morcegos compartilham de 88% a 92% de homologia com o SARS-CoV na sequência nucleotídica.
These studies have laid the foundation for the new concept that bats host emerging human pathogens.
Esses estudos formaram a base para o novo conceito de que os morcegos são o hospedeiro de patógenos humanos emergentes.
Several SARS-like CoVs (SL-CoVs) have also been identified from bats, but none except for one designated WIV1 can be isolated as live virus.
Vários CoVs semelhantes ao SARS (SL-CoVs) também foram identificados em morcegos, mas nenhum CoV, com exceção do designado WIV1, pode ser isolado como vírus vivo.
Human angiotensin converting enzyme 2 (ACE2) is known to be the receptor of SARS-CoV.
Sabe-se que a enzima conversora de angiotensina 2 (ECA2) dos seres humanos é o receptor do SARS-CoV.
WIV1 derived from fecal sample of bats was demonstrated to use bat, civet and human ACE2 as receptor for cell entry.
Demonstrou-se que o WIV1 derivado de amostras fecais de morcegos usa a ECA2 de morcegos, civetas e seres humanos como receptor para entrada nas células.
Intriguingly, sera of convalescent SARS patients were capable of neutralizing WIV1.
É intrigante o fato de que o soro de pacientes convalescentes da SARS foi capaz de neutralizar o WIV1.
Thus far, WIV1 represents the most closely related ancestor of SARS-CoV in bats, sharing 95% nucleotide sequence homology.
Até agora, o WIV1 representa o ancestral com relação mais próxima ao SARS-CoV em morcegos, compartilhando 95% de homologia na sequência nucleotídica.
Albeit the high homology between these two viruses, it is generally believed that WIV1 is not the immediate parental virus of SARS-CoV and bats are not the immediate reservoir host of SARS-CoV.
Apesar da alta homologia entre esses dois vírus, acredita-se, no geral, que o WIV1 não seja o vírus parental imediato do SARS-CoV, e que os morcegos não sejam os hospedeiros reservatórios imediatos do SARS-CoV.
Phylogenetic analysis clusters MERS-CoV to the same group as bat CoV-HKU4 and bat CoV-HKU5.
A análise filogenética agrupa o MERS-CoV no mesmo grupo que o CoV-HKU4 de morcegos e que o CoV-HKU5 de morcegos.
Bat CoV-HKU4 and MERS-CoV utilize the same host receptor, dipeptidyl peptidase 4 (DPP4), for virus entry.
O CoV-HKU4 de morcegos e o MERS-CoV usam o mesmo receptor do hospedeiro, a dipeptidil-peptidase 4 (DPP4), para a entrada do vírus.
RNA-dependent RNA polymerase sequences of MERS-CoV are phylogenetically closer to counterparts in bat beta-CoVs identified from Europe and Africa.
Sequências de polimerase de RNA dependentes de RNA do MERS-CoV são filogeneticamente mais próximas aos homólogos em betaCoVs de morcegos identificados na Europa e na África.
Up to now, no live MERS-CoV can be found in wild bats.
Até agora, nenhum MERS-CoV vivo foi encontrado em morcegos selvagens.
MERS-CoV and its closest relative bat CoV-HKU25 share only 87% nucleotide sequence homology.
O MERS-CoV e seu parente mais próximo, o CoV-HKU25 dos morcegos, compartilham apenas 87% de homologia na sequência nucleotídica.
Thus, bats might not be the immediate reservoir host of MERS-CoV.
Portanto, os morcegos podem não ser o hospedeiro reservatório imediato do MERS-CoV.
On the other hand, studies in Middle East have shown that dromedary camels are seropositive for MERS-CoV-specific neutralizing antibodies, same as camels of Middle East origin in multiple African countries.
Por outro lado, estudos no Oriente Médio mostraram que os dromedários são soropositivos para anticorpos de neutralização específica do MERS-CoV, da mesma forma que camelos do Oriente Médio em vários países da África.
Live MERS-CoV identical to the virus found in humans was isolated from the nasal swabs of dromedary camels, further indicating that camels serve as the bona fide reservoir host of MERS-CoV.
O MERS-CoV vivo, idêntico ao vírus encontrado nos seres humanos, foi isolado de esfregaços nasais de dromedários, aumentado a evidência de que os camelos sirvam como o hospedeiro reservatório legítimo do MERS-CoV.
It is also noteworthy that generally mild symptoms but massive virus shedding were observed in camels experimentally infected with MERS-CoV.
Também vale notar que os sintomas geralmente brandos, porém com transmissão massiva do vírus, foram observados em camelos infectados experimentalmente com o MERS-CoV.
Notably, infected camels shed viruses not only through respiratory route but also through fecal-oral route, which is also the main route for virus shedding from bats.
É notável que os camelos infectados transmitem os vírus não apenas pela rota respiratória, mas também pela rota fecal-oral, que também é a principal rota de transmissão de vírus em morcegos.
However, questions still remain since many confirmed cases of MERS have no contact history with camels prior to symptom onset, plausibly ascribed to human-to-human transmission or unknown transmission routes involving unrecognized animal species that harbour MERS-CoV.
Entretanto, ainda faltam respostas, já que muitos casos confirmados da MERS não têm histórico de contato com camelos antes do aparecimento dos sintomas, que podem ser atribuídos, de forma plausível, à transmissão entre pessoas ou a rotas de transmissão que envolvem espécies animais não identificadas que abrigam o MERS-CoV.
SARS-CoV-2 shares 96.2% nucleotide homology with a bat CoV RaTG13 isolated from Rhinolophus affinis bats.
O SARS-CoV-2 compartilha 96,2% de homologia de nucleotídeos com um CoV RaTG13 de morcego, isolado de morcegos Rhinolophus affinis.
As in the cases of SARS-CoV and MERS-CoV, the sequence divergence between SARS-CoV-2 and RaTG13 is too great to assign parental relationship.
Como nos casos de SARS-CoV e de MERS-CoV, a divergência na sequência entre SARS-CoV-2 e RaTG13 é muito grande para se atribuir uma relação parental.
That is to say, bats might not be the immediate reservoir host(s) of SARS-CoV-2 unless almost identical bat CoVs are found in future.
Ou seja, os morcegos podem não ser os hospedeiros reservatórios imediatos do SARS-CoV-2, a menos que CoVs quase idênticos de morcegos sejam descobertos futuramente.
Presumably, the intermediate animal hosts of SARS-CoV-2 should be among the wildlife species sold and killed at the Huanan Seafood Wholesale Market, with which many of the initial cases of COVID-19 were associated, indicative of a probable animal-to-human transmission event.
Presume-se que os hospedeiros animais intermediários do SARS-CoV-2 devam configurar-se entre espécies selvagens vendidas e abatidas no Mercado de Atacado de Frutos do Mar de Huanan, ao qual muitos dos casos iniciais da COVID-19 foram associados, indicando um provável evento de transmissão de animais a seres humanos.
Several recent studies based on metagenomic sequencing have suggested that a group of endangered small mammals known as pangolins (Manis javanica) could also harbour ancestral beta-CoVs related to SARS-CoV-2.
Vários estudos recentes baseados em sequenciamento metagenômico sugeriram que um grupo de pequenos mamíferos ameaçados de extinção conhecidos como pangolins (Manis javanica) também poderiam abrigar betaCoVs ancestrais relacionados ao SARS-CoV-2.
These novel pangolin CoV genomes share 85-92% nucleotide sequence homology with SARS-CoV-2.
Esses novos genomas de CoV de pangolim compartilham de 85% a 92% de homologia na sequência nucleotídica com o SARS-CoV-2.
However, they are equally closely related to RaTG13 with about 90% identity at the level of nucleotide sequence.
Entretanto, eles também são, da mesma forma, diretamente relacionados ao RaTG13, com cerca de 90% de identidade a nível de sequência nucleotídica.
They cluster into two sub-lineages of SARS-CoV-2-like viruses in the phylogenetic tree, one of which share a more similar receptor binding domain (RBD) with SARS-CoV-2, with 97.4% amino acid sequence identity.
Eles se agrupam em sublinhagens de vírus semelhantes ao SARS-CoV-2 na árvore filogenética, um dos quais compartilha um domínio de ligação ao receptor (DLR) com o SARS-CoV-2, com 97,4% de identidade na sequência de aminoácidos.
In stark contrast, the RBDs of SARS-CoV-2 and RaTG13 are more divergent, albeit a higher degree of sequence homology genome-wide.
Em um enorme contraste, os DLRs do SARS-CoV-2 e do RaTG13 são mais divergentes, embora apresentem um alto grau de homologia sequencial em todo o genoma.
An earlier study on diseased pangolins also reported the detection of viral contigs from lung samples, which turn out to be similarly related to SARS-CoV-2.
Um estudo recente sobre pangolins doentes também relatou a detecção de sequências consenso virais de amostras do pulmão, que são estreitamente relacionadas ao SARS-CoV-2.
This study adopted different assembly methods and manual curation to generate a partial genome sequence comprising about 86.3% of the full-length viral genome.
Esse estudo adotou diferentes métodos de configuração e curadoria manual para gerar uma sequência genômica parcial, correspondendo a cerca de 86,3% do genoma viral no tamanho total.
We cannot exclude the possibility that pangolin is one of the intermediate animal hosts of SARS-CoV-2.
Não podemos excluir a possibilidade de que o pangolim seja um dos hospedeiros animais intermediários do SARS-CoV-2.
However, currently there is no evidence in support of a direct pangolin origin of SARS-CoV-2 due to the sequence divergence between SARS-CoV-2 and pangolin SARS-CoV-2-related beta-CoVs.
Entretanto, atualmente, não há evidência que confirme a origem direta do SARS-CoV-2 do pangolim devido à divergência na sequência entre o SARS-CoV-2 e os betaCoVs relacionados ao SARS-CoV-2 dos pangolins.
In addition, the distance between SARS-CoV-2 and RaTG13 is even shorter than that between SARS-CoV-2 and pangolin SARS-CoV-2-related beta-CoVs.
Além disso, a distância entre o SARS-CoV-2 e o RaTG13 é ainda menor do que a distância entre o SARS-CoV-2 e os betaCoVs relacionados ao SARS-CoV-2 dos pangolins.
The evolutionary pathway of SARS-CoV-2 in bats, pangolins and other mammals remains to be established.
A rota evolutiva do SARS-CoV-2 nos morcegos, pangolins e outros mamíferos ainda precisa ser esclarecida.
Whereas the highest sequence homology has been found in the RBDs between SARS-CoV-2 and pangolin, SARS-CoV-2-related beta-CoVs, SARS-CoV-2 and RaTG13 share the highest genome-wide sequence homology.
Enquanto a homologia sequencial mais alta foi encontrada nos DLRs entre o SARS-CoV-2 e o pangolim, os betaCoVs relacionados ao SARS-CoV-2, o SARS-CoV-2 e o RaTG13 compartilham a homologia sequencial genômica ampla mais alta.
It is highly speculative that the high degree of similarity between the RBDs of pangolin SARS-CoV-2-related beta-CoVs and SARS-CoV-2 is driven by selectivity-mediated convergent evolution.
É altamente especulativo que o alto grau de semelhança entre os DLRs dos betaCoVs de pangolins relacionados ao SARS-CoV-2 e o SARS-CoV-2 decorra da evolução convergente mediada pela seletividade.
A counter-proposal is in favour of a recombination between a pangolin SARS-CoV-2-related beta-CoV and RaTG13 in the third wild animal species.
Um argumento contrário conta a favor da recombinação entre o betaCoV de pangolins relacionados ao SARS-CoV-2 e o RaTG13 na terceira espécie animal selvagem.
As a driving force in evolution, recombination is widespread among beta-CoVs.
Como uma força impulsionadora na evolução, a recombinação está bastante presente nos betaCoVs.
The jury is still out on the immediate zoonotic origin of SARS-CoV-2.
A origem imediata zoonótica do SARS-CoV-2 permanece em investigação.
Besides the highly pathogenic HCoVs, the zoonotic origin of HCoV-229E, HCoV-OC43, HCoV-NL63 and HCoV-HKU1 have also been studied.
Além dos HCoVs altamente patogênicos, a origem zoonótica dos vírus HCoV-229E, HCoV-OC43, HCoV-NL63 e HCoV-HKU1 também foi estudada.
Phylogenetic evidence indicated that both HCoV-NL63 and HCoV-229E might have originated from bat CoVs, while the parental viruses of HCoV-OC43 and HCoV-HKU1 have been found in rodents.
Evidências filogenéticas indicaram que tanto o HCoV-NL63 quanto o HCoV-229E poderiam ter se originado de CoVs de morcegos, enquanto os vírus parentais do HCoV-OC43 e do HCoV-HKU1 foram descobertos em roedores.
It has been reported that a bat CoV termed ARCoV.2 (Appalachian Ridge CoV) detected in North American tricolored bat displayed close relationship with HCoV-NL63.
Foi relatado que um CoV de morcegos denominado ARCoV.2 (CoV de Appalachian Ridge) detectado no morcego tricolor norte-americano apresentava uma relação direta com o HCoV-NL63.
On the other hand, HCoV-229E was genetically related to another bat CoV, termed Hipposideros/GhanaKwam/19/2008, which was detected in Ghana, while camelids have also been suspected as its intermediate host.
Por outro lado, o HCoV-229E era geneticamente relacionado a outro CoV de morcego, denominado Hipposideros/GhanaKwam/19/2008, que foi detectado em Gana, sendo que também há suspeita de que os camelídeos sejam seus hospedeiros intermediários.
For clarity, the current knowledge on animal origins of known HCoVs is summarized in Figure ​1 and Table 2.
Para maior clareza, o conhecimento atual sobre as origens animais de HCoVs conhecidos é resumido na Figura 1 e na Tabela 2.
Phylogenetic analysis has provided evidence for interspecies transmission events of HCoVs in the history.
A análise filogenética forneceu evidências para eventos de transmissão interespécie dos HCoVs ao longo da história.
When HCoV-OC43 crossed species to infect humans from domestic livestock around 1890, a pandemic of respiratory infection was recorded.
Quando o HCoV-OC43 cruzou as espécies e infectou seres humanos a partir de animais domésticos por volta de 1890, uma pandemia de infecção respiratória foi registrada.
The interspecies transmission history of HCoV-229E is less clear.
O histórico de transmissão interespécie do HCoV-229E é menos claro.
Bat alpha-CoVs closely related to HCoV-229E have been found.
AlfaCoVs de morcegos estreitamente relacionados ao HCoV-229E foram descobertos.
Between them there is an alpaca alpha-CoV.
Entre eles, há um alfaCoV de alpacas.
Several lines of evidence support the transmission of virus from bats to humans directly.
Várias linhas de evidência corroboram a transmissão direta do vírus dos morcegos para os seres humanos.
First, humans but not alpacas might have contact with bats in a shared ecological niche.
Primeiro, os seres humanos, mas não as alpacas, podem ter contato com os morcegos em um nicho ecológico compartilhado.
Instead, humans have close contact with alpacas.
Em contrapartida, os seres humanos têm contato direto com as alpacas.
Second, HCoV-229E-related bat alpha-CoVs are diverse and non-pathogenic in bats, whereas alpaca alpha-CoV caused an outbreak of respiratory disease in infected animals.
Segundo, os alfaCoVs de morcegos relacionados ao HCoV-229E são diversos e não patogênicos em morcegos, enquanto o alfaCoV de alpacas causaram uma epidemia de doença respiratória em animais infectados.
Finally, alpaca alpha-CoV has not been found in feral animals.
Por fim, o alfaCoV de alpacas não foi encontrado em animais selvagens.
Thus, the possibility cannot be excluded that alpacas obtain the HCoV-229E-related alpha-CoV from humans.
Portanto, a possibilidade não pode ser excluída de que as alpacas obtêm dos seres humanos o alfaCoV relacionado ao HCoV-229E.
In fact, bats are the direct source of human pathogenic viruses including rabies virus, Ebola virus, Nipah virus and Hendra virus.
Na verdade, os morcegos são a fonte direta de vírus patogênicos para os seres humanos, incluindo o vírus da raiva, o vírus Ebola, o vírus Nipah e o vírus Hendra.
It is therefore not too surprising that bats might transmit HCoV-229E to humans directly.
Portanto, não é surpreendente o fato de que morcegos transmitam HCoV-229E diretamente aos seres humanos.
Alternatively, whereas bat alpha-CoVs serve as the gene pool of HCoV-229E, alpacas and dromedary camels might serve as intermediate hosts that transmit viruses to humans, exactly as in the case of MERS-CoV.
Como alternativa, enquanto os alfaCoVs servem de pool genético do HCoV-229E, as alpacas e dromedários podem servir de hospedeiros intermediários que transmitem os vírus para os seres humanos, exatamente como no caso do MERS-CoV.
MERS-CoV serves as an excellent example of interspecies transmission from bats to dromedary camels and from dromedary camels to humans.
O MERS-CoV serve como um exemplo excelente de transmissão interespécie dos morcegos para os dromedários e dos dromedários para os seres humanos.
The evolutionary origin of MERS-CoV from bats is known at its initial identification and has also been strengthened by subsequent findings.
A origem evolutiva do MERS-CoV a partir dos morcegos é conhecida em sua identificação inicial e foi corroborada por resultados posteriores.
It is obvious that bats provide a rich pool of virus species for interspecies exchange of genetic fragments and interspecies transmission.
É óbvio que os morcegos fornecem um rico pool de espécies virais para troca interespécie de fragmentos genéticos e transmissão interespécie.
Longevity, densely packed colonies, close social interaction and strong ability to fly are all favourable conditions for bats to be an ideal 'virus spreader'.
Longevidade, colônias com alta densidade, interação social estreita e alta capacidade de voo são todas condições favoráveis para que os morcegos sejam o "propagador viral" ideal.
On the other hand, MERS-CoV has been introduced to dromedary camels for decades.
Por outro lado, a introdução do MERS-CoV nos dromedários remonta a décadas.
It is well adapted to these camels that have turned from an intermediate host to a stable and natural reservoir host.
Ele é bem adaptado a esses camelos, e migrou de um hospedeiro intermediário para um hospedeiro reservatório natural e estável.
MERS-CoV causes very mild disease and maintains a relatively low mutation rate in these animals.
O MERS-CoV é causador de uma doença bem branda e sustenta uma taxa relativamente baixa de mutação nesses animais.
Its sporadic transmission to humans is an accident and humans remain a dead-end host of MERS-CoV as its transmission cannot be sustained.
Sua transmissão esporádica aos seres humanos é um acidente, e os seres humanos permanecem hospedeiros terminais do MERS-CoV, já que sua transmissão não pode ser sustentada.
In contrast to the role of camels in the transmission of MERS-CoV, the role of pangolins, if there is any, in the transmission of SARS-CoV-2 is different.
Em contraste com o papel dos camelos na transmissão do MERS-CoV, o papel dos pangolins, se houver algum, na transmissão do SARS-CoV-2, é diferente.
Particularly, pangolin beta-CoVs are highly pathogenic in pangolins.
Especificamente, os betaCoVs de pangolins são altamente patogênicos em pangolins.
They might be a dead-end host for SARS-CoV-2-related beta-CoVs, similar to civets in the case of SARS-CoV.
Eles podem ser um hospedeiro terminal para betaCoVs relacionados ao SARS-CoV-2, de modo parecido às civetas, no caso do SARS-CoV.
Several possibilities for interspecies transmission of SARS-CoV-2 from animals to humans have to be ruled in or ruled out in future studies.
Várias possibilidades para a transmissão interespécie do SARS-CoV-2 de animais para seres humanos precisam ser confirmadas ou descartadas em estudos futuros.
First, bats could be the reservoir host of a SARS-CoV-2-related virus almost identical to SARS-CoV-2.
Primeiro, os morcegos poderiam ser o hospedeiro reservatório de um vírus relacionado ao SARS-CoV-2, quase idêntico ao SARS-CoV-2.
Humans might share the ecological niche with bats through butchering or coal mining.
Seres humanos poderiam compartilhar o nicho ecológico com os morcegos por meio do abate ou das minas de carvão.
Second, pangolins could be one of intermediate amplifying host to which a SARS-CoV-2-related virus had been newly introduced.
Em segundo lugar, os pangolins poderiam ser um dos hospedeiros intermediários amplificadores, no qual um vírus relacionado ao SARS-CoV-2 tivesse sido recém-introduzido.
Humans contract the virus through butchering and consumption of game meat.
Os seres humanos contraem o vírus através do abate e do consumo da carne de caça.
It is possible that many mammals including domestic animals are susceptible to SARS-CoV-2.
É possível que muitos mamíferos, incluindo animais domésticos, sejam suscetíveis ao SARS-CoV-2.
A survey of domestic and wild animals for antibodies is warranted.
Uma pesquisa sobre anticorpos produzidos de animais domésticos e selvagens é necessária.
Third, as mentioned above, recombination and adaptation of SARS-CoV-2 might have occurred in a third species that has contact with both bats and pangolins.
Em terceiro lugar, conforme mencionado acima, a recombinação e a adaptação do SARS-CoV-2 poderia ter ocorrido em uma terceira espécie que tem contato tanto com os morcegos quanto com os pangolins.
The search for the animal origins of SARS-CoV-2 is still on.
A busca pelas origens animais do SARS-CoV-2 ainda está ativa.
Apart from different types of the animal hosts, three major factors on the viral side are also important in facilitating CoVs to cross species barriers.
Além dos diferentes tipos de hospedeiros animais, três fatores principais no vírus são importantes na facilitação para que os CoVs cruzem as barreiras das espécies.
First of all, their relatively high mutation rates in RNA replication.
Primeiro, sua taxa de mutação relativamente alta na replicação do RNA.
In comparison to other single-stranded RNA viruses, the estimated mutation rates of CoVs could be regarded as “moderate” to “high” with an average substitution rate being ~10-4 substitution per year per site 2, depending on the phase of CoV adaptation to novel hosts.
Em comparação a outros vírus de RNA de fita simples, as taxas de mutação estimadas dos CoVs podem ser consideradas de "moderadas" a "altas" com uma taxa média de substituição de aproximadamente 10-4 substituições por ano, por local, dependendo da fase de adaptação do CoV aos novos hospedeiros.
CoVs have a proof-reading exoribonuclease, deletion of which results in exceedingly high mutability and attenuation or even inviability.
Os CoVs têm a exorribonuclease com mecanismo de revisão, cuja exclusão resulta em mutabilidade excessivamente alta e atenuação, ou até mesmo inviabilidade.
Interestingly, the nucleotide analogue Remdesivir is known to suppress CoV replication through inhibition of this exoribonuclease and the RNA-dependent RNA polymerase.
É interessante o fato de que o análogo nucleotídeo remdesivir suprime a replicação do CoV através da inibição dessa exorribonuclease e da polimerase de RNA dependente de RNA.
Remdesivir is one of most promising anti-SARS-CoV-2 agents to be tested in clinical trials.
O remdesivir é um dos agentes antiSARS-CoV-2 mais promissores testados em ensaios clínicos.
Nevertheless, mutation rates of CoVs are about a million times higher than those of their hosts.
Entretanto, as taxas de mutação dos CoVs são quase um milhão de vezes maiores do que as de seus hospedeiros.
In addition, mutation rate is often high when CoVs are not well adapted to the host.
Além do mais, a taxa de mutação geralmente é alta quando os CoVs não estão bem adaptados ao hospedeiro.
Compared to SARS-CoV with a high mutation rate, the mutation rate of SARS-CoV-2 is apparently lower, suggestive of a higher level of adaptation to humans.
Comparada ao SARS-CoV, que tem uma alta taxa de mutação, a taxa de mutação do SARS-CoV-2 é baixa, aparentemente, o que sugere seu nível mais alto de adaptação aos seres humanos.
Presumably, it has already been adapted to another host close to humans.
Presumivelmente, ele já se adaptou a outro hospedeiro que mantém contato com os seres humanos.
In addition to SARS-CoV-2, this also applies to MERS-CoV, which is well adapted to dromedary camels.
Além do SARS-CoV-2, isso também se aplica ao MERS-CoV, que é bem adaptado aos dromedários.
Theoretically, it is unlikely that genetic drift would render vaccines and antivirals against SARS-CoV-2 ineffective quickly.
Teoricamente, é improvável que uma mudança genética tornaria rapidamente ineficazes as vacinas e os antivirais contra o SARS-CoV-2.
Second, the large RNA genome in CoVs exerts extra plasticity in genome modification for mutations and recombination, thereby increasing the probability for interspecies co-evolution, which is advantageous for the emergence of novel CoVs when the conditions become appropriate.
Em segundo lugar, o grande genoma do RNA em CoVs exerce uma plasticidade extra na modificação do genoma para mutações e recombinações, aumentando, portanto, a probabilidade de coevolução interespécie, que é vantajosa para o surgimento de novos CoVs quando as condições se tornam apropriadas.
This is supported by the copious unique open reading frames and protein functions encoded towards the 3′ end of the genome.
Isso é corroborado pela abundância de quadros únicos de leitura e funções proteicas codificadas em relação às últimas três polegadas da extremidade do genoma.
Third, CoVs randomly and frequently switch templates during RNA replication through a unique “copy-choice” mechanism.
Em terceiro lugar, os CoVs trocam os modelos de modo aleatório e frequente durante a replicação de RNA por meio de um mecanismo único de "escolha de cópia".
In a host that serves as the mixing vessel, strand switching occurs frequently during CoV RNA transcription.
Em um hospedeiro que serve como recipiente de mistura, a troca de fitas ocorre com frequência durante a transcrição do RNA do CoV.
Highly homologous full-length and subgenomic RNAs could recombine to generate new CoVs.
RNAs longos altamente homólogos e subgenômicos podem recombinar-se para gerar novos CoVs.
Phylogenetic evidence of natural recombination has been found in both HCoV-HKU1 and HCoV-OC43, as well as animal CoVs such as bat SL-CoV and batCoV-HKU9.
Evidências filogenéticas da recombinação natural foram encontradas tanto no HCoV-HKU1 quanto no HCoV-OC43, bem como em CoVs de animais, como o SL-CoV dos morcegos e o batCoV-HKU9.
Virus-host interaction in relation to transmission
Interação vírus-hospedeiro em relação à transmissão
Besides three viral factors stated above, viral interaction with host receptor is another key factor influential on interspecies transmission.
Além dos três fatores virais mencionados acima, a interação viral com o receptor do hospedeiro é outro fator chave que influencia a transmissão interespécie.
Herein, recombination of SARS-CoV is taken as a typical example, which also showed evidence of positive selection during interspecies transmission events.
Aqui, a recombinação do SARS-CoV é tomada como um típico exemplo, que também mostrou evidências da seleção positiva durante eventos de transmissão interespécie.
Based on the comparative analysis between isolates of human and civet SARS-CoVs, SARS-CoV is thought to undergo rapid adaptation in different hosts, particularly with mutations at the RBD of the S protein.
Com base na análise comparativa entre isolados de SARS-CoVs de seres humanos e civetas, acredita-se que o SARS-CoV passe por uma rápida adaptação em diferentes hospedeiros, principalmente com mutações no DLR da proteína S.
Generally, the RBD in the S protein of a CoV interacts with the cellular receptor and is intensely selected by the host antibody response.
No geral, o DLR na proteína S de um CoV interage com o receptor celular e é selecionado intensamente pela resposta de anticorpo do hospedeiro.
In SARS-CoV, the RBD is in the 318th to 510th amino acids on the S1 fragment, which binds to the human ACE2 as well as its coreceptors for viral entry.
No SARS-CoV, o DLR está nos aminoácidos 318º a 510º no fragmento S1, que se liga à ECA2 humana, bem como a seus correceptores para a entrada viral.
The RBD of SARS-CoV is capable of recognizing the ACE2 receptors of various animals, including bat, civet, mouse and raccoon dog, allowing interspecies transmission of the virus.
O DLR do SARS-CoV é capaz de reconhecer os receptores da ECA2 de vários animais, incluindo morcegos, civetas, camundongos e cães-guaxinins, possibilitando a transmissão interespécie do vírus.
In fact, only 6 amino acid residues were observed to be different from human and civet viral isolates in the RBD and 4 of them locate in the receptor-binding motif for interaction with the ACE2 receptor.
Na verdade, observou-se que apenas seis resíduos de aminoácidos eram diferentes dos isolados virais humanos e de civetas no DLR, e quatro deles se localizam no motivo de ligação ao receptor para interação com o receptor de ECA2.
Civet SARS-CoV has K479N and S487T mutations in its RBD, which might increase the affinity of the interaction of spike protein with human ACE2 receptor.
O SARS-CoV das civetas tem mutações K479N e S487T em seu DLR, o que poderia aumentar a afinidade da interação da proteína spike com o receptor da ECA2 humana.
In other words, these two amino acid substitutions might be critical to viral adaption to humans.
Em outras palavras, essas duas substituições de aminoácidos poderiam ser críticas para a adaptação viral nos seres humanos.
It is noteworthy that SARS-CoV-2 shares the same cellular receptor with SARS-CoV.
Vale notar que o SARS-CoV-2 compartilha o mesmo receptor celular com o SARS-CoV.
A 30% difference between SARS-CoV-2 and SARS-CoV in the S1 unit of the S protein implicates that the binding affinity of its S protein with human ACE2 might have altered.
Um diferença de 30% entre o SARS-CoV-2 e o SARS-CoV na unidade S1 da proteína S implica que a afinidade de ligação da sua proteína S com a ECA2 humana poderia ter sido alterada.
Indeed, a cryo-EM study indicates a 10- to 20-fold higher affinity of this binding than that between human ACE2 and SARS-CoV S protein.
De fato, um estudo com criomicroscopia eletrônica indica uma afinidade de 10 a 20 vezes maior dessa ligação do que entre a ECA2 humana e a proteína S do SARS-CoV.
It will also be of interest to determine whether any other coreceptor might be required for SARS-CoV-2 transmission.
Também será útil determinar se algum outro correceptor pode ser necessário para a transmissão do SARS-CoV-2.
Intriguingly, HCoV-NL63 also binds to ACE2 but with a different part of S.
É intrigante o fato de que o HCoV-NL63 também se liga à ECA2, mas com uma parte diferente da proteína S.
There exist many other HCoV receptors, such as aminopeptidase N for HCoV-229E, and 9-O-acetylated sialic acid for HCoV-OC43.
Existem vários outros receptores de HCoV, como a aminopeptidase N para o HCoV-229E e o ácido siálico 9-O-acetilado para o HCoV-OC43.
They might also account for successful adaptation of these CoVs in humans after interspecies transmission from their animal hosts.
Eles também poderiam responder pela adaptação eficaz desses CoVs em seres humanos depois da transmissão interespécie de seus hospedeiros animais.
In addition to cellular receptors, the outcome of interspecies transmission of HCoVs is also governed by other host dependency and restriction factors.
Além dos receptores celulares, o resultado da transmissão interespécie dos HCoVs também é governada por outros fatores de restrição e dependência com o hospedeiro.
The divergence of these host proteins between humans and natural reservoir hosts of HCoVs such as bats, dromedary camels and rodents might constitute a barrier to interspecies transmission.
A divergência dessas proteínas do hospedeiro entre os seres humanos e os hospedeiros reservatórios naturais dos HCoVs como os morcegos, dromedários e roedores poderia constituir uma barreira à transmissão interespécie.
HCoVs have to usurp host dependency factors and subvert host restriction factors for a successful interspecies transmission.
Os HCoVs precisam usurpar os fatores de dependência com o hospedeiro e subverter os fatores de restrição do hospedeiro para uma transmissão interespécie eficaz.
In this regard, molecular determinants in this important area of virus-host interaction remain to be identified and characterized.
Nesse sentido, os determinantes moleculares nessa importante área da interação vírus-hospedeiro ainda precisam ser identificados e caracterizados.
An unbiased genome-wide screening of host dependency and restriction factors for SARS-CoV-2 using the state-of-the-art technology of CRISPR might be fruitful.
Uma triagem não tendenciosa com alcance a nível de genoma da dependência do hospedeiro e de fatores de restrição para o SARS-CoV-2 usando tecnologia moderna de CRISPR pode render bons resultados.
Emergence of novel HCoVs: back to ground zero
Surgimento de novos HCoVs: de volta à estaca zero
The diversity of bat CoVs provides ample opportunities for the emergence of novel HCoVs.
A diversidade dos CoVs de morcegos fornece amplas possibilidades para o surgimento de novos HCoVs.
In this sense, bat CoVs serve as the gene pool of HCoVs.
Nesse sentido, os CoVs de morcegos servem como um pool genético dos HCoVs.
In addition, rapid mutation and genetic recombination also drive HCoV evolution and serve as two important steps in this process.
Além disso, a rápida mutação e recombinação genética também impulsionam a evolução do HCoV e servem como dois passos importantes neste processo.
For example, the acquisition or loss of novel protein-coding genes has the potential to drastically modify viral phenotypes.
Por exemplo, a aquisição ou perda de genes novos de codificação de proteína tem o potencial de modificar drasticamente os fenótipos virais.
Among SARS-CoV accessory proteins, ORF8 has been thought to be important in adaptation to humans, as SARS-CoV-related bat viruses were isolated but found to encode divergent ORF8 proteins.
Entre as proteínas acessórias do SARS-CoV, acredita-se que a ORF8 seja importante em sua adaptação aos seres humanos, uma vez que os vírus de morcegos relacionados ao SARS-CoV foram isolados, mas descobriu-se que eles codificam proteínas ORF8 divergentes.
A 29-nucleotide deletion characteristic of SARS-CoVs has been found in strains isolated at the beginning of the human epidemic.
Uma característica de exclusão do nucleotídeo 29 dos SARS-CoVs foi descoberta em cepas isoladas no começo da epidemia humana.
This deletion splits ORF8 into ORF8a and ORF8b and is thought to be an adaptive mutation that promotes the switch of hosts.
A exclusão divide a ORF8 em ORF8a e ORF8b, e acredita-se que seja uma mutação adaptativa que promove a alternância de hospedeiros.
Besides, SARS-CoV has a possible recombination history with lineages of alpha- and gamma-CoVs, where a large number of smaller recombinant regions were identified in the RNA-dependent RNA polymerase.
Além disso, o SARS-CoV tem um possível histórico de recombinação com linhagens de alfaCoVs e gamaCoVs, onde um grande número de regiões recombinantes menores foram identificadas na polimerase de RNA dependente de RNA.
Recombination locations were also identified in the nsp9, most of nsp10, and parts of nsp14.
Os locais de recombinação também foram identificados na nsp9, na maior parte da nsp10 e partes da nsp14.
Likewise, it has been shown that the epidemic MERS-CoV experienced recombination events between different lineages, which occurred in dromedary camels in Saudi Arabia.
Da mesma forma, foi demonstrado que o MERS-CoV epidêmico passou por eventos de recombinação entre diferentes linhagens, que ocorreram em dromedários na Arábia Saudita.
Besides SARS-CoV and MERS-CoV, recombination events have also been observed in other HCoVs, in which the HCoVs recombine with other animal CoVs in their non-structural genes.
Além do SARS-CoV e do MERS-CoV, os eventos de recombinação também foram observados em outros HCoVs, nos quais os HCoVs recombinam-se com outros CoVs de animais em seus genes não estruturais.
It should also be cautioned that artificial selection can contribute to unintended changes in viral genomes, most likely resulting from relieving viruses from selection pressures exerted, such as by the host immune system.
Também deve ser advertido que a seleção artificial pode contribuir para mudanças indesejadas nos genomas virais, resultantes provavelmente do alívio da pressão de seleção exercida sobre os vírus, como a pressão do sistema imune do hospedeiro.
An example of these effects is the loss of a full-length ORF4 in the HCoV-229E prototype strain, owing to a two-nucleotide deletion.
Um exemplo desses efeitos é a perda de uma ORF4 longa na cepa protótipo do HCoV-229E, devido à exclusão de dois nucleotídeos.
While intact ORF4 could be observed in bat and camel viruses related to HCoV-229E, the alpaca alpha-CoV displays a single nucleotide insertion, resulting in a frameshift.
Enquanto a ORF4 intacta pode ser observada em vírus de morcegos e camelos relacionados ao HCoV-229E, o alfaCoV de alpacas apresenta uma inserção simples de nucleotídeos, resultando em uma mudança nos quadros.
Last but not least, the evolution of novel HCoVs is also driven by the selection pressure in their reservoir hosts.
Por fim, mas não menos importante, a evolução de novos HCoVs também é impulsionada pela pressão de seleção em seus hospedeiros reservatórios.
Asymptomatic or only mild symptoms were detected when bats were infected with CoVs, indicating the mutual adaptation between CoVs and bats.
Ausência de sintomas ou apenas sintomas leves foram detectados em morcegos ao serem infectados com CoVs, indicando a adaptação mútua entre CoVs e morcegos.
It appeared that bats are well adapted to CoVs anatomically and physiologically.
É provável que os morcegos sejam bem adaptados aos CoVs anatomica e fisiologicamente.
For example, defects in the activation of pro-inflammatory response in bats efficiently reduce the pathology triggered by CoVs.
Por exemplo, defeitos na ativação da resposta pró-inflamatória nos morcegos reduzem com eficiência a patologia desencadeada pelos CoVs.