atepeq/tico19 huggingface dataset:
According to demographic studies so far, COVID-19 seems to have different epidemiological features from SARS.
De acordo com estudos demográficos até agora, a COVID-19 parece ter características epidemiológicas diferentes das características da SARS.
In addition to replicating in the lower respiratory tract, SARS-CoV-2 can efficiently replicate in the upper respiratory tract and causes mild or no symptoms in the early phase of infection, similar to other CoVs that cause common colds.
Além de se replicar no trato respiratório inferior, o SARS-CoV-2 consegue se replicar com eficiência no trato respiratório superior e não causa sintomas na fase inicial da infecção (ou causa apenas sintomas leves), de modo semelhante a outros CoVs que causam resfriados comuns.
Therefore, infected patients at the early phase or incubation period can produce a large amount of virus during daily activities, causing great difficulty for the control of the epidemic.
Portanto, os pacientes infectados na fase inicial ou no período de incubação podem produzir uma grande quantidade do vírus durante suas atividades diárias, causando uma grande dificuldade para o controle da epidemia.
However, the transmission of SARS-CoV was considered to occur when the patients are severely ill, while most transmission did not happen at the early phase.
Entretanto, considerou-se que a transmissão do SARS-CoV ocorre quando os pacientes estão gravemente doentes, com a maioria das transmissões não ocorrendo na fase inicial.
Thus, the current outbreak of COVID-19 is much more severe and difficult to control than the outbreak of SARS.
Portanto, a epidemia atual da COVID-19 é muito mais grave e difícil de controlar do que a epidemia da SARS.
Great efforts are currently underway in China including the lockdown of Wuhan and surrounding cities and continuous quarantine of almost the entire population in hopes of interrupting the transmission of SARS-CoV-2.
Grandes esforços estão sendo feitos atualmente na China, incluindo o confinamento de Wuhan e de cidades vizinhas, e a quarentena contínua de quase toda a população, na esperança de interromper a transmissão do SARS-CoV-2.
Although these actions have been dramatically damaging the economy and other sectors of the country, the number of new patients is declining, indicating the slowdown of the epidemic.
Embora essas ações tenham afetado drasticamente a economia e outros setores do país, o número de novos pacientes está diminuindo, indicando a remissão da epidemia.
The most optimistic estimate is that the outbreak will end by March and the downswing phase will last for 3-4 months.
A estimativa mais otimista é de que a epidemia acabe até março, e a fase de desaceleração dure entre 3 e 4 meses.
However, some other experts are not that optimistic.
Entretanto, outros especialistas não estão tão otimistas.
Paul Hunter, et al., estimated that COVID-19, which seems substantially more infectious than SARS, will not end in 2020.
Paul Hunter, et al., estimou que a COVID-19, que parece ser substancialmente mais infecciosa do que a SARS, não acabará em 2020.
Ira Longini, et al., established a model to predict the outcome of the epidemic and suggested that SARS-CoV-2 could infect two-thirds of the global population.
Ira Longini, et al., estabeleceu um modelo para prever o resultado da epidemia e sugeriu que o SARS-CoV-2 pode infectar dois terços da população mundial.
A Canadian group reported that SARS-CoV-2 was detected in both mid-turbinate and throat swabs of patients who recovered and left the hospital 2 weeks earlier, which indicates that the newly identified virus could become a cyclical episode similar to influenza.
Um grupo canadense relatou que o SARS-CoV-2 foi detectado nos esfregaços da garganta e do corneto médio de pacientes que se recuperaram e receberam alta do hospital nas 2 semanas anteriores, o que indica que o novo vírus identificado pode tornar-se um episódio cíclico semelhante à influenza.
However, promising signs have occurred in China based on the declining number of new cases, indicating the current strategies might have been working.
Entretanto, indícios promissores ocorreram na China com base no declínio do número de novos casos, indicando que as estratégias atuais poderiam estar funcionando.
Ebola was originally predicted to cause up to a million cases with half a million deaths.
Previu-se originalmente que o Ebola causasse até um milhão de casos, com meio milhão de mortes.
However, via strict quarantine and isolation, the disease has eventually been put under control.
Entretanto, com a quarentena e o isolamento rígidos, a doença foi mantida sob controle, por fim.
It is possible, similar to SARS-CoV, that SARS-CoV-2 might become weaker in infectivity and eventually die down or become a less pathogenic virus co-existent with humans.
É possível que o SARS-CoV-2, da mesma forma que o SARS-CoV, pode tornar-se mais fraco quanto à sua infectividade e, em algum momento, torne-se um vírus menos patogênico coexistente com os seres humanos.
A comparison of the epidemic of COVID-19 with that of SARS and MERS is provided below (Fig. ​(Fig.55).
Uma comparação da epidemia da COVID-19 com a da SARS e a da MERS encontra-se abaixo (Fig. (Fig.55)).
SARS-CoV-2 is highly transmittable through coughing or sneezing, and possibly also through direct contact with materials contaminated by the virus.
O SARS-CoV-2 é altamente transmissível por tosse e espirro e, possivelmente, por contato direto com materiais contaminados pelo vírus.
The virus was also found in feces, which raises a new possibility of feces-to-mouth transmission.
O vírus também foi encontrado em fezes, o que gera uma nova possibilidade: a da transmissão oral-fecal.
A recent study on 138 cases reported that 41% of the cases were possibly caused by nosocomial infections, including 17 patients with other prior diseases and 40 health-care providers.
Um estudo recente de 138 casos relatou que 41% dos casos foram possivelmente causados por infecções nosocomiais, incluindo 17 pacientes com doenças subjacentes e 40 profissionais de saúde.
Thus, great precaution should be used to protect humans, especially health-care providers, social workers, family members, colleagues, and even bystanders in contact with patients or infected people.
Portanto, uma maior precaução deve ser tomada para proteger as pessoas, principalmente os profissionais de saúde, assistentes sociais, membros da família, colegas de trabalho e pessoas com contato direto com pacientes ou indivíduos infectados.
The first line of defense that could be used to lower the risk of infection is through wearing face masks; both the use of surgical masks and N95 respirator masks (series # 1860s) helps control the spread of viruses.
A primeira linha de defesa que pode ser usada para diminuir o risco de infecção é o uso de máscaras faciais; o uso de máscaras cirúrgicas e de máscaras respiradores N95 (série n.° 1860s) ajuda a controlar a propagação do vírus.
Surgical face masks prevent liquid droplets from a potentially infected individual from traveling through the air or sticking onto surfaces of materials, where they could be passed on to others.
Máscaras faciais cirúrgicas impedem que gotículas de fluidos de um indivíduo potencialmente infectado sejam transportadas no ar ou fiquem aderidas às superfícies dos objetos, onde podem infectar as outras pessoas.
However, only N95 (series # 1860s) masks can protect against the inhalation of virions as small as 10 to 80 nm, with only 5% of the virions being able to penetrate completely; SARS-CoV-2 is similar to SARS-CoV in size and both are approximately 85 nm.
Entretanto, apenas as máscaras N95 (série n.° 1860s) protegem contra a inalação de vírions com tamanho de 10 nm a 80 nm, com apenas 5% dos vírions sendo capazes de penetrá-la completamente; o SARS-CoV-2 é semelhante ao SARS-CoV em tamanho, e os dois têm aproximadamente 85 nm.
Since particles can penetrate even five surgical masks stacked together, health-care providers in direct contact with patients must wear N95 (series # 1860s) masks but not surgical masks.
Já que as partículas conseguem penetrar até cinco máscaras cirúrgicas juntas, os profissionais de saúde em contato direto com os pacientes devem usar as máscaras N95 (série n.° 1860s), mas não máscaras cirúrgicas.
In addition to masks, health-care providers should wear fitted isolation gowns in order to further reduce contact with viruses.
Além das máscaras, os profissionais da saúde devem usar roupões de isolamento para reduzir ainda mais o contato com o vírus.
Viruses can also infect an individual through the eyes.
Os vírus também infectam um indivíduo através dos olhos.
On January 22, 2020, a doctor was infected with SARS-CoV-2 although he wore an N95 mask; the virus might have entered his body through his inflammatory eyes.
Em 22 de janeiro de 2020, um médico foi infectado pelo SARS-CoV-2, embora estivesse usando uma máscara N95; o vírus poderia ter entrado em seu corpo através de seus olhos inflamados.
Thus, health-care providers should also wear transparent face shields or goggles while working with patients.
Portanto, os profissionais de saúde devem usar também protetores faciais transparentes ou óculos de proteção ao atender os pacientes.
For the general public in affected or potentially affected areas, it is highly suggested that everybody wash their hands with disinfectant soaps more often than usual, try to stay indoors for self-quarantine and limit contact with potentially infected individuals.
Para o público em geral em áreas afetadas ou potencialmente afetadas, é altamente recomendado que todos lavem as mãos com sabão desinfetante com maior frequência que o normal, tentem ficar em casa em isolamento e limitem o contato com pessoas potencialmente infectadas.
Three feet is considered an appropriate distance for people to stay away from a patient.
Um metro é considerado uma distância adequada para se manter longe de um paciente.
These actions are effective methods to lower the risk of infection as well as prevent the spread of the virus.
Essas ações são métodos efetivos para diminuir o risco de infecção, bem como impedir a propagação do vírus.
Although SARS-CoV-2 came as a new virus to the human world, its high homology to SARS-CoV as reported on 7 January 2020 should have caused high alert to China based on her deep memory of the SARS outbreak in 2003.
Embora o SARS-CoV-2 tenha surgido como um novo vírus para os seres humanos, sua alta homologia ao SARS-CoV, conforme relatado em 7 de janeiro de 2020, deveria ter causado um grande alerta para a China, com base em seu histórico recente com a epidemia de SARS em 2003.
However, not until 19 January 2020 did the director of the Center of Disease Control of Wuhan comfort the citizens by saying that the novel virus has low contagiousness and limited reproductivity from human to human and that it is not a problem to prevent and contain the disease.
Entretanto, só em 19 de janeiro de 2020 o diretor do Centro de Controle de Doenças de Wuhan tranquilizou os cidadãos, dizendo que o novo vírus tem baixa taxa de contágio e reprodutividade limitada entre seres humanos, e que não era difícil prevenir e conter a doença.
This message remarkably relaxed the alarm of the public, especially when the entire country was preparing for the Spring Festival, and the critical time was missed to contain the disease at its minimal scale in Wuhan.
Essa mensagem deixou as pessoas mais relaxadas, principalmente quando todo o país estava se preparando para o Festival de Primavera, e o período crítico para a contenção da doença em Wuhan em uma escala mínima foi perdido.
The disease control agencies in China may take this hard lesson and make critical improvements in the future.
As agências de controle de doenças na China podem tirar proveito dessa dura lição e fazer melhorias cruciais no futuro.
For example, these agencies should be (1) more careful when making public announcements as every word counts to citizens and can change their attitude and decisions; (2) more sensitive and reactive to unusual information from clinics rather than waiting for formal reports from doctors or officials; (3) more restrictive to contain a potential epidemic at its early stage rather than attempting to comfort the public; and (4) more often to issue targeted and effective drills to increase the public's awareness about epidemic diseases and to test and improve the response system of the society periodically.
Por exemplo, essas agências devem: (1) ser mais cautelosas ao fazer pronunciamentos públicos, já que tudo o que dizem é absorvido pelos cidadãos e pode influenciar suas atitudes e decisões; (2) ser mais sensíveis e reativas a informações incomuns provenientes dos hospitais, em vez de esperar comunicados formais dos médicos e autoridades; (3) ser mais restritivas para conter uma epidemia potencial em seu estágio inicial, em vez de tentar confortar o público; e (4) emitir com maior frequência simulações direcionadas e eficazes para aumentar a consciência do público sobre doenças epidêmicas e testar e melhorar o sistema de resposta da sociedade periodicamente.
The outbreak of COVID-19 caused by the novel virus SARS-CoV-2 started in the end of December 2019.
A epidemia de COVID-19 causada pelo novo vírus SARS-CoV-2 começou no final de dezembro de 2019.
In less than two months, it has spread all over China and near 50 other countries globally at the time of this writing.
Em menos de dois meses, ela se espalhou por toda a China e por quase outros 50 países em todo o mundo, no momento da escrita deste texto.
Since the virus is very similar to SARS-CoV and the symptoms are also similar between COVID-19 and SARS, the outbreak of COVID-19 has created a sense of SARS recurring.
Já que o vírus é muito semelhante ao SARS-CoV, e os sintomas também são similares entre a COVID-19 e a SARS, a epidemia de COVID-19 gerou uma sensação de retorno da SARS.
However, there are some remarkable differences between COVID-19 and SARS, which are essential for containing the epidemic and treating the patients.
Entretanto, há diferenças significativas entre a COVID-19 e a SARS, que são essenciais para a contenção da epidemia e o tratamento dos pacientes.
COVID-19 affects more elderly individuals than youth and more men than women, and the severity and death rate are also higher in elderly individual than in youth.
A COVID-19 afeta mais os idosos do que os jovens, e mais os homens do que as mulheres, e a gravidade e a taxa de mortalidade também são maiores em idosos do que nos jovens.
SARS has higher mortality than COVID-19 (10.91% versus 1.44%).
A SARS tem uma mortalidade maior do que a COVID-19 (10,91% versus 1,44%).
COVID-19 patients transmit the virus even when they are symptomless whereas SARS patients do so usually when they are severely ill, which causes much greater difficulty to contain the spread of COVID-19 than SARS.
Os pacientes com COVID-19 transmitem o vírus quando não apresentam sintomas, enquanto os pacientes com SARS geralmente a transmitem quando estão gravemente doentes, o que gera uma maior dificuldade em conter a propagação da COVID-19 do que da SARS.
This partially explains why SARS-CoV-2 spread much faster and broader than SARS-CoV.
Isso explica, em partes, porque o SARS-CoV-2 se propaga muito mais rapidamente e afeta mais regiões do que o SARS-CoV.
The regular RNA assay for SARS-CoV-2 can be negative in some COVID-19 patients.
O ensaio regular de RNA para o SARS-CoV-2 pode ser negativo em alguns pacientes com COVID-19.
On the other hand, cured patients can be positive for the virus again.
Por outro lado, os pacientes curados podem receber um teste positivo para o vírus novamente.
These findings dramatically increase the risk of virus spreading.
Esses resultados aumentam drasticamente o risco de propagação do vírus.
Given such rapid progress in research on COVID-19, several critical issues remain to be solved, as follows:
Dado o rápido progresso na pesquisa sobre a COVID-19, várias questões cruciais ainda precisam ser resolvidas, conforme se segue:
Where did SARS-CoV-2 come from?
De onde surgiu o SARS-CoV-2?
Although 96% genetic homolog was found between SARS-CoV-2 and two bat SARS-like CoVs, we still cannot conclude that SARS-CoV-2 is from bats.
Embora um homólogo genético de 96% tenha sido encontrado entre o SARS-CoV-2 e dois CoVs de morcegos semelhantes ao SARS, ainda não podemos concluir que o SARS-CoV-2 tenha origem nos morcegos.
What animal was the intermediate species to transmit the virus from the original host, say bats, to humans?
Qual animal foi a espécie intermediária que transmitiu o vírus do hospedeiro original, do morcego, digamos, para os humanos?
Without knowing answers to #1 and 2, we cannot efficiently cut the transmission, and the outbreak can relapse at any time.
Sem saber as respostas para as perguntas n.° 1 e 2, não poderemos cortar a transmissão com eficiência, e a epidemia poderá ter uma reincidência a qualquer momento.
Although molecular modeling and biochemical assays have demonstrated that SARS-CoV-2 binds to ACE2, how exactly does the virus enter the airway cells and cause subsequent pathological changes?
Embora a modelagem molecular e ensaios bioquímicos tenham demonstrado que o SARS-CoV-2 se une ao ECA2, como exatamente o vírus entra nas células da via respiratória e causa mudanças patológicas subsequentes?
Does the virus also bind ACE2-expressing cells in other organs?
O vírus também liga-se às células com expressão de ECA2 nos outros órgãos?
Without clear answers to these questions, we cannot achieve fast and accurate diagnosis and effective treatment.
Sem respostas claras para essas perguntas, não podemos obter um diagnóstico rápido e preciso e um tratamento eficaz.
How long will the epidemic last?
Por quanto tempo durará a epidemia?
How is the virus genetically evolving during transmission among humans?
Como o vírus está evoluindo geneticamente durante a transmissão entre os seres humanos?
Will it become a pandemic worldwide, die down like SARS or relapse periodically like the flu?
Ela se tornará uma pandemia mundial, desaparecerá como a SARS ou terá reincidência sazonal, como a gripe?
It is essential but may take some time to search for answers to the above and many other questions.
É essencial, mas poderá levar algum tempo a procura por respostas para as questões acima e para tantas outras.
However, with whatever expense it may demand, we have no other choice but to stop the epidemic as soon as possible and bring our life back to normal.
Entretanto, independentemente dos esforços necessários, não temos outra escolha a não ser deter a epidemia o mais breve possível e voltar às nossas vidas normais.
Zoonotic origins of human coronaviruses
Origens zoonóticas dos coronavírus humanos
Mutation and adaptation have driven the co-evolution of coronaviruses (CoVs) and their hosts, including human beings, for thousands of years.
A mutação e a adaptação impulsionaram a coevolução dos coronavírus (CoVs) e seus hospedeiros, incluindo os seres humanos, por milhares de anos.
Before 2003, two human CoVs (HCoVs) were known to cause mild illness, such as common cold.
Antes de 2003, sabia-se que dois CoVs humanos (HCoVs) causavam uma doença branda, como um resfriado comum.
The outbreaks of severe acute respiratory syndrome (SARS) and the Middle East respiratory syndrome (MERS) have flipped the coin to reveal how devastating and life-threatening an HCoV infection could be.
As epidemias da síndrome respiratória aguda grave (SARS) e da síndrome respiratória do Oriente Médio (MERS) mudaram o que se pensava sobre os CoVs e revelaram o quanto uma infecção por HCoV pode ser letal e devastadora.
The emergence of SARS-CoV-2 in central China at the end of 2019 has thrusted CoVs into the spotlight again and surprised us with its high transmissibility but reduced pathogenicity compared to its sister SARS-CoV.
O surgimento do SARS-CoV-2 na China central no final de 2019 colocou os CoVS em destaque novamente e surpreendeu a todos com sua alta transmissibilidade e sua patogenicidade reduzida em comparação ao seu irmão SARS-CoV.
HCoV infection is a zoonosis and understanding the zoonotic origins of HCoVs would serve us well.
A infecção por HCoV é zoonótica, e compreender as origens zoonóticas dos HCoVs é de enorme utilidade.
Most HCoVs originated from bats where they are non-pathogenic.
A maioria dos HCoVs originou dos morcegos, nos quais eles são não patogênicos.
The intermediate reservoir hosts of some HCoVs are also known.
Os hospedeiros reservatórios intermediários de alguns HCoVs também são conhecidos.
Identifying the animal hosts has direct implications in the prevention of human diseases.
A identificação dos hospedeiros animais tem implicações diretas na prevenção das doenças nos seres humanos.
Investigating CoV-host interactions in animals might also derive important insight on CoV pathogenesis in humans.
A investigação das interações do hospedeiro do CoV em animais também pode proporcionar informações importantes sobre a patogênesis do CoV em seres humanos.
In this review, we present an overview of the existing knowledge about the seven HCoVs, with a focus on the history of their discovery as well as their zoonotic origins and interspecies transmission.
Neste estudo, apresentamos uma visão geral das informações existentes sobre os sete HCoVs, com um foco no histórico de sua descoberta, bem como suas origens zoonóticas e transmissão interespécie.
Importantly, we compare and contrast the different HCoVs from a perspective of virus evolution and genome recombination.
Uma análise importante é a que fazemos de comparação e contraste entre diferentes HCoVs de uma perspectiva da evolução do vírus e da recombinação do genoma.
The current CoV disease 2019 (COVID-19) epidemic is discussed in this context.
A atual epidemia da doença por CoV 2019 (COVID-19) é discutida neste contexto.
In addition, the requirements for successful host switches and the implications of virus evolution on disease severity are also highlighted.
Além do mais, os requisitos para transição eficaz entre hospedeiros e as implicações da evolução do vírus na gravidade da doença também são destacados.
Coronaviruses (CoVs) belong to the family Coronaviridae, which comprises a group of enveloped, positive-sensed, single-stranded RNA viruses.
Os coronavírus (CoVs) pertencem à família Coronaviridae, que compreende um grupo de vírus encapsulados, de polaridade positiva e de RNA de fita simples.
These viruses harbouring the largest genome of 26 to 32 kilobases amongst RNA viruses were termed “CoVs” because of their crown-like morphology under electron microscope.
Esses vírus que apresentam o maior genoma, entre 26 e 32 quilobases, entre vírus RNA foram denominados "CoVs" devido à sua morfologia de coroa ao serem observados em microscópio eletrônico.
Structurally, CoVs have non-segmented genomes that share a similar organization.
Quanto à estrutura, os CoVs têm genomas não segmentados que compartilham uma organização semelhante.
Approximately two thirds of the genome contain two large overlapping open reading frames (ORF1a and ORF1b), which are translated into the pp1a and pp1ab replicase polyproteins.
Aproximadamente dois terços do genoma contêm duas estruturas de leitura aberta sobrepostas (ORF1a e ORF1b), que são traduzidas nas poliproteínas de replicase pp1a e pp1ab.
The polyproteins are further processed to generate 16 non-structural proteins, designated nsp1~16.
As poliproteínas são transformadas novamente e geram 16 proteínas não estruturais, designadas nsp1 a nsp16.
The remaining portion of the genome contains ORFs for the structural proteins, including spike (S), envelope (E), membrane (M) and nucleoprotein (N).
A porção restante do genoma contém ORFs para as proteínas estruturais, incluindo spike (S), envelope (E), membrana (M) e nucleoproteína (N).
A number of lineage-specific accessory proteins are also encoded by different lineages of CoVs.
Algumas proteínas acessórias de linhagem especifica também são codificadas por diferentes linhagens de CoVs.
Based on the difference in protein sequences, CoVs are classified into four genera (alpha-CoV, beta-CoV, gamma-CoV and delta-CoV), among which the beta-CoV genera contains most HCoVs and is subdivided into four lineages (A, B, C and D).
Com base na diferença nas sequências proteicas, os CoVs são classificados em quatro gêneros (alfaCoV, betaCoV, gamaCoV e deltaCoV), entre os quais o gênero betaCoV contém a maioria dos HCoVs e é subdividido em quatro linhagens (A, B, C e D).
Phylogenetic evidence has shown that bats and rodents serve as the gene source of most alpha-CoVs and beta-CoVs, while birds are the main reservoir of gamma-CoVs and delta-CoVs.
Evidências filogenéticas mostraram que morcegos e roedores servem de fonte genética para a maioria dos alfaCoVs e betaCoVs, enquanto as aves são o principal reservatório de gamaCoVs e deltaCoVs.
For thousands of years, CoVs have constantly crossed species barriers and some have emerged as important human pathogens.
Por milhares de anos, os CoVs cruzaram constantemente as barreiras das espécies, e alguns tornaram-se patógenos humanos relevantes.
To date, seven human CoVs (HCoVs) are known.
Até o momento, sete CoVs humanos (HCoVs) são conhecidos.
Among them HCoV-229E and HCoV-NL63 are alpha-CoVs.
Entre eles, o HCoV-229E e o HCoV-NL63 são alfaCoVs.
The other five beta-CoVs include HCoV-OC43, HCoV-HKU1, severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV), Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV) and SARS-CoV-2.
Os outros cinco betaCoVs incluem HCoV-OC43, HCoV-HKU1, o coronavírus da síndrome respiratória aguda grave (SARS-CoV), o coronavírus da síndrome respiratória do Oriente Médio (MERS-CoV) e o SARS-CoV-2.
HCoV-229E, HCoV-OC43, HCoV-HKU1 and HCoV-NL63 usually cause mild symptoms, like common cold and/or diarrhea.
Os vírus HCoV-229E, HCoV-OC43, HCoV-HKU1 e HCoV-NL63 geralmente causam sintomas leves, como um resfriado comum e/ou diarreia.
In contrast, SARS-CoV, MERS-CoV and the newly-identified SARS-CoV-2 are highly pathogenic, causing severe lower respiratory tract infection in relatively more patients with a higher chance to develop acute respiratory distress syndrome (ARDS) and extrapulmonary manifestations.
Em contrapartida, o SARS-CoV, o MERS-CoV e o recém-identificado SARS-CoV-2 são altamente patogênicos e causam infecção grave do trato respiratório inferior em uma quantidade relativamente maior de pacientes, com uma alta chance de desenvolvimento da síndrome de desconforto respiratório agudo (SDRA) e de manifestações extrapulmonares.
The first HCoV-229E strain, B814, was isolated from the nasal discharge of patients with common cold in mid-1960s.
A primeira cepa de HCoV-229E, B814, foi isolada da coriza de pacientes com resfriado comum na metade da década de 1960.
Since then, more knowledge was accumulated through extensive studies on HCoV-229E and HCoV-OC43, both of which cause self-limiting symptoms.
Desde então, mais conhecimento foi acumulado por meio de estudos abrangentes sobre o HCoV-229E e o HCoV-OC43, sendo que os dois causam sintomas autolimitadores.
Indeed, the concept had been widely accepted that infection with HCoVs is generally harmless until the outbreak of SARS.
De fato, o conceito de que a infecção pelos HCoVs é geralmente inofensiva era amplamente aceito até a epidemia de SARS.
The SARS outbreak occurred in 2003 is one of the most devastating in current history, infecting over 8,000 people with a crude case fatality of approximately 10%.
A epidemia de SARS que ocorreu em 2003 é uma das mais devastadoras da atualidade e infectou mais de 8 mil pessoas, com uma taxa bruta de mortalidade relacionada aos casos confirmados de aproximadamente 10%.
Ten years later, the Middle East respiratory syndrome (MERS) outbreak resulted in a persistent epidemic in the Arabian Peninsula with sporadic spreading to the rest of the world.
Dez anos depois, a epidemia da síndrome respiratória do Oriente Médio (MERS) resultou em uma epidemia persistente na Península Arábica, com propagação esporádica para o resto do mundo.
The 2019 novel HCoV (2019-nCoV), which has subsequently been renamed SARS-CoV-2, is the causative agent of the ongoing epidemic of coronavirus disease 2019 (COVID-19), which has claimed more than 3,120 lives and infected more than 91,000 people as of March 3, 2020.
O novo HCoV de 2019 (2019-nCoV), que foi renomeado posteriormente SARS-CoV-2, é o agente causador da epidemia atual da doença do coronavírus de 2019 (COVID-19), que tirou mais de 3.120 vidas e infectou mais de 91 mil pessoas até 3 de março de 2020.
The alarm has been ringing and the world has to prepare for the coming pandemic of SARS-CoV-2.
O alarme está soando, e o mundo precisa se preparar para a pandemia do SARS-CoV-2 que está chegando.
All seven HCoVs have a zoonotic origin from bats, mice or domestic animals.
Todos os sete HCoVs têm origem zoonótica nos morcegos, camundongos ou animais domésticos.
Multiple lines of evidence support an evolutionary origin of all HCoVs from bats, where viruses are well adapted and non-pathogenic but show great genetic diversity.
Múltiplas linhas de evidência corroboram com a origem evolutiva de todos os HCoVs a partir dos morcegos, onde os vírus são bem adaptados e não patogênicos, mas demonstram grande diversidade genética.
The COVID-19 epidemic has presented enormous medical, scientific, social and moral challenges to China and the world.
A epidemia de COVID-19 apresenta enormes desafios médicos, científicos, sociais e morais para a China e para o restante do mundo.
Tracing the zoonotic origins of HCoVs provides a framework to understand the natural history, driving force and restriction factors of species jumping.
O rastreamento das origens zoonóticas dos HCoVs fornece uma estrutura para entender a história natural, a força impulsionadora e os fatores restritivos da migração do vírus para outras espécies.
This might also guide or facilitate the search for the reservoir, intermediate and amplifying animal host(s) of SARS-CoV-2, with important implications in the prevention of future spillovers.
Isso também pode orientar e facilitar a busca pelos hospedeiros reservatório, intermediário e amplificador do SARS-CoV-2, com implicações importantes na prevenção futura da migração viral entre espécies.
In this review we present an overview of the zoonotic origins, interspecies transmission and pathogenesis of HCoVs.
Neste artigo, apresentamos uma visão geral das origens zoonóticas, da transmissão interespécie e da patogênese dos HCoVs.
Particularly, we highlight and discuss the common theme that parental viruses of HCoVs are typically non-pathogenic in their natural reservoir hosts but become pathogenic after interspecies transmission to a new host.
Em particular, destacamos e discutimos o tema comum de que os vírus parentais dos HCoVs são geralmente não patogênicos em seus hospedeiros reservatórios naturais, mas tornam-se patogênicos após a transmissão interespécie para um novo hospedeiro.
We also review the trend of HCoV evolution in which the increase in transmissibility often comes with the decrease in pathogenicity.
Também revimos a tendência de evolução do HCoV, na qual o aumento da transmissibilidade geralmente vem acompanhado da diminuição da patogenicidade.
The outcome of the ongoing SARS-CoV-2 outbreak is also discussed in this context.
O desfecho da atual epidemia de SARS-CoV-2 também é discutido nesse contexto.
Animal CoVs have been known since late 1930s.
Os CoVs de animais são conhecidos desde o final da década de 1930.
Before the first isolation of HCoV-229E strain B814 from the nasal discharge of patients who had contracted common cold, different CoVs had been isolated in various infected animals, including turkey, mouse, cow, pig, cat and dog.
Antes do primeiro isolamento da cepa B814 do HCoV-229E da coriza de pacientes que contraíram resfriado comum, CoVs diferentes tinham sido isolados em vários animais infectados, incluindo peru, camundongo, vaca, porco, gato e cachorro.
In the past decades, seven HCoVs have been identified.
Nas últimas décadas, sete HCoVs foram identificados.
A brief summary of the history of HCoV discovery in chronological order (Table ​1) would be informative and instructive.
Um breve resumo do histórico da descoberta do HCoV em ordem cronológica (Tabela 1) seria informativo e instrutivo.
The first HCoV-229E strain was isolated from the respiratory tract of patients with upper respiratory tract infection in the year of 1966, and was subsequently adapted to grow in WI-38 lung cell lines.
A primeira cepa de HCoV-229E foi isolada do trato respiratório de pacientes com infecção do trato respiratório superior no ano de 1966, e foi adaptada posteriormente para crescimento em linhagens de células pulmonares WI-38.
Patients infected with HCoV-229E presented with common cold symptoms, including headache, sneezing, malaise and sore-throat, with fever and cough seen in 10~20% cases.
Os pacientes infectados com HCoV-229E apresentaram sintomas de resfriado comum, incluindo dor de cabeça, espirro, mal-estar e dor de garganta, com febre e tosse presentes em 10% a 20% dos casos.
Later in 1967, HCoV-OC43 was isolated from organ culture and subsequent serial passage in brains of suckling mice.
Posteriormente, em 1967, o HCoV-OC43 foi isolado da cultura de órgãos e da passagem serial subsequente em cérebros de camundongos em período de lactação.
The clinical features of HCoV-OC43 infection appear to be similar to those caused by HCoV-229E, which are symptomatically indistinguishable from infection with other respiratory tract pathogens such as influenza A viruses and rhinoviruses.
As características clínicas da infecção por HCoV-OC43 parecem semelhantes às causadas pelo HCoV-229E, que são sintomaticamente indistinguíveis da infecção por outros patógenos do trato respiratório, como os vírus influenza A e os rinovírus.
Both HCoV-229E and HCoV-OC43 are distributed globally, and they tend to be predominantly transmitted during the season of winter in temperate climate.
O HCoV-229E e o HCoV-OC43 estão distribuídos globalmente, e tendem a ser transmitidos predominantemente durante a estação do inverno em climas temperados.
Generally, the incubation time of these two viruses is less than one week, followed by an approximately 2-week illness.
No geral, o período de incubação desses dois vírus é menor que uma semana, acompanhado da doença por aproximadamente 2 semanas.
According to a human volunteer study, healthy individuals infected with HCoV-229E developed mild common cold.
De acordo com um estudo com voluntários humanos, indivíduos saudáveis infectados pelo HCoV-229E desenvolveram um resfriado brando comum.
Only a few immunocompromised patients exhibited severe lower respiratory tract infection.
Apenas alguns pacientes imunocomprometidos exibiram infecção grave do trato respiratório inferior.
SARS, also known as “atypical pneumonia”, was the first well documented HCoV-caused pandemic in human history and the etiological agent is SARS-CoV, the third HCoV discovered.
A SARS, também conhecida como "pneumonia atípica", foi a primeira pandemia documentada causada por HCoV na história do ser humano, e o agente etiológico é o SARS-CoV, o terceiro HCoV descoberto.
The first case of SARS can be traced back to late 2002 in Guangdong Province of China.
O primeiro caso de SARS remonta a 2002 na Província de Guangdong, na China.
The SARS epidemic resulted in 8,096 reported cases with 774 deaths, spreading across many countries and continents.
A epidemia de SARS resultou em 8.096 casos notificados com 774 mortes, espalhando-se por vários países e continentes.
Apart from the super-spreaders, it was estimated that each case could give rise to approximately two secondary cases, with an incubation period of 4 to 7 days and the peak of viral load appearing on the 10th day of illness.
Com exceção dos "superespalhadores", foi estimado que cada pessoa contaminada pode contaminar aproximadamente outras duas, com um período de incubação de 4 a 7 dias, e com o aparecimento do pico da carga viral no décimo dia da doença.
Patients infected with SARS-CoV initially present with myalgia, headache, fever, malaise and chills, followed by dyspnea, cough and respiratory distress as late symptoms.
Os pacientes infectados com SARS-CoV apresentam inicialmente mialgia, dor de cabeça, febre, mal-estar e calafrios, seguidos dos sintomas posteriores de dispneia, tosse e desconforto respiratório.
Lymphopenia, deranged liver function tests, and elevated creatine kinase are common laboratory abnormalities of SARS.
Linfopenia, disfunção hepática e creatina quinase elevada são as anormalidades comuns da SARS em testes laboratoriais.
Diffuse alveolar damage, epithelial cell proliferation and an increase of macrophages are also observed in SARS patients.
Dano alveolar difuso, proliferação das células epiteliais e aumento do número de macrófagos também são observados nos pacientes com SARS.
Approximately 20-30% of patients subsequently require intensive care and mechanical ventilation.
Aproximadamente 20% a 30% dos pacientes necessitam, em algum momento, de tratamento intensivo e de ventilação mecânica.
In addition to lower respiratory tract, multiple organs including gastrointestinal tract, liver and kidney can also be infected in these severe cases, usually accompanied with a cytokine storm, which might be lethal particularly in immunocompromised patients.
Além do trato respiratório inferior, vários órgãos, incluindo o trato gastrointestinal, o fígado e os rins, também podem ser afetados nesses casos graves, geralmente com ocorrência de uma cascata de citocina, que pode ser letal, principalmente em pacientes imunocomprometidos.
The virus was first isolated from the open lung biopsy of a relative of the index patient who travelled to Hong Kong from Guangzhou.
O vírus foi isolado pela primeira vez em uma biópsia de pulmão de um parente do paciente zero que viajava de Guangzhou para Hong Kong.
Since then, tremendous efforts have been dedicated to HCoV research.
Desde então, esforços enormes são dedicados à pesquisa sobre o HCoV.
HCoV-NL63 was isolated from a 7-month-old child from the Netherlands during late 2004.
O HCoV-NL63 foi isolado de um bebê de 7 meses na Holanda no final de 2004.
It was initially found to be prevalent in young children, the elderly and immunocompromised patients with respiratory illnesses.
Descobriu-se inicialmente que o vírus era prevalente em crianças pequenas, idosos e pacientes imunocomprometidos com doenças respiratórias.
Presentation of coryza, conjunctivitis, fever, and bronchiolitis is common in the disease caused by HCoV-NL63.
Os sintomas de coriza, conjuntivite, febre e bronquiolite são comuns na doença causada pelo HCoV-NL63.
Another independent study described the isolation of the same virus from a nasal specimen from an 8-month-old boy suffering from pneumonia in the Netherlands.
Outro estudo independente descreveu o isolamento do mesmo vírus de um espécime nasal de um bebê de 8 meses que sofria de pneumonia na Holanda.
Although it was identified in Netherlands, it is actually distributed globally.
Embora tenha sido identificado na Holanda, ele está disperso em todo o mundo.
It has been estimated that HCoV-NL63 accounts for approximately 4.7% of common respiratory diseases, and its peak incidence occurs during early summer, spring and winter.
Foi estimado que o HCoV-NL63 corresponde aproximadamente a 4,7% das doenças respiratórias comuns, e sua incidência de pico ocorre no inverno, na primavera e no início do verão.
HCoV-NL63 is associated with obstructive laryngitis, also known as croup.
O HCoV-NL63 está associado à laringite obstrutiva, também conhecida como crupe.
In the same year, HCoV-HKU1 was isolated from a 71-year-old man who had been hospitalized with pneumonia and bronchiolitis in Hong Kong.
No mesmo ano, o HCoV-HKU1 foi isolado de um homem de 71 anos hospitalizado com pneumonia e bronquiolite em Hong Kong.
Besides community-acquired pneumonia and bronchiolitis, HCoV-HKU1 was reported to be associated with acute asthmatic exacerbation.
Além da pneumonia e da bronquiolite adquiridas de modo comunitário, relatou-se que o HCoV-HKU1 estava associado à exacerbação da asma aguda.
Similar to HCoV-NL63, HCoV-229E and HCoV-OC43, HCoV-HKU1 was found worldwide, causing mild respiratory diseases.
Do mesmo modo que o HCoV-NL63, o HCoV-229E e o HCoV-OC43, o HCoV-HKU1 foi encontrado no mundo todo, causando doenças respiratórias brandas.
All these four community-acquired HCoVs have been well adapted to humans and are generally less likely to mutate to cause highly pathogenic diseases, though accidents did occur for unknown reasons as in the rare case of a more virulent subtype of HCoV-NL63, which has recently been reported to cause severe lower respiratory tract infection in China.
Todos esses quatro HCoVs adquiridos de modo comunitário se adaptaram bem aos seres humanos e têm geralmente menor chance de sofrerem mutação e causarem doenças altamente patogênicas, embora acidentes tenham ocorrido por razões desconhecidas no raro caso de um subtipo mais virulento do HCoV-NL63, que foi relatado recentemente como causador de infecção grave do trato respiratório inferior na China.
Generally, when these HCoVs acquire the abilities to transmit efficiently and to maintain themselves continuously within humans, they also become less virulent or pathogenic.
No geral, quando esses HCoVs adquirem a capacidade de serem transmitidos de modo eficiente e de se manterem continuamente nos seres humanos, eles também se tornam menos virulentos e menos patogênicos.
MERS-CoV was first isolated in 2012 from the lung of a 60-year-old patient who developed acute pneumonia and renal failure in Saudi Arabia.
O MERS-CoV foi isolado pela primeira vez em 2012 do pulmão de um paciente de 60 anos que desenvolveu pneumonia aguda e falha renal na Arábia Saudita.
Whereas most of the laboratory-confirmed cases originate from the Middle East, imported cases with occasional secondary spreads to close contacts have been reported in various European countries and Tunisia.
Enquanto a maioria dos casos confirmados por laboratório tem origem no Oriente Médio, casos importados com propagação secundária ocasional para contatos próximos foram relatados em vários países europeus e na Tunísia.
Another secondary outbreak occurred in South Korea in 2015 with 186 confirmed cases.
Outra epidemia secundária ocorreu na Coreia do Sul em 2015 com 186 casos confirmados.
Clinical manifestations of MERS resemble those of SARS, characterized by progressive acute pneumonia.
As manifestações clínicas da MERS assemelham-se às da SARS, caracterizadas por pneumonia aguda progressiva.
Unlike SARS, many patients with MERS also developed acute renal failure, which is thus far unique for MERS among HCoV-caused diseases.
Ao contrário da SARS, muitos pacientes com MERS também desenvolvem insuficiência renal aguda, o que é, portanto, bem peculiar para a MERS, entre as doenças causadas por HCoV.
More than 30% of patients present with gastrointestinal symptoms, such as diarrhea and vomiting.
Mais de 30% dos pacientes apresentam sintomas gastrointestinais, como diarreia e vômito.
As of February 14, 2020, over 2500 laboratory confirmed cases were reported with a high case fatality of 34.4%, making MERS-CoV one of the most devastating viruses known to humans.
Até 14 de fevereiro de 2020, mais de 2.500 casos confirmados por laboratório foram relatados com uma alta taxa de mortalidade relacionada aos casos confirmados, de 34,4%, o que tornou o MERS-CoV um dos vírus mais devastadores de conhecimento do homem.
During middle to late December 2019, clusters of pneumonia patients retrospectively known to be associated with SARS-CoV-2 infection were detected in Wuhan, Hubei Province, China.
Da metade para o final de dezembro de 2019, grupos de pacientes com pneumonia, a qual sabia-se retrospectivamente estar associada à infecção por SARS-CoV-2, foram detectados em Wuhan, Província de Hubei, na China.
World Health Organization declared the ongoing outbreak of lower respiratory tract infection caused by SARS-CoV-2 a Public Health Emergency of International Concern and also named the disease COVID-19.
A Organização Mundial da Saúde declarou a epidemia contínua de infecção do trato respiratório inferior causada pelo SARS-CoV-2 uma Emergência de Saúde Pública de Importância Internacional e também nomeou a doença COVID-19.
As of March 3, 2020, 90,053 cases have been confirmed worldwide, with a crude case fatality of 3.4%.
Até 3 de março de 2020, 90.053 casos foram confirmados no mundo, com uma taxa bruta de mortalidade relacionada aos casos confirmados de 3,4%.
Notably, the case fatality in Hubei, China is 4.2%, whereas the one outside of it is 1.2%.
Nota-se que a letalidade relacionado aos casos confirmados em Hubei, na China, é de 4,2%, enquanto a letalidade fora dessa cidade é de 1,2%.
SARS-CoV-2 causes severe respiratory infection like SARS-CoV and MERS-CoV, presented as fever, cough and dyspnea.
O SARS-CoV-2 causa infecção respiratória grave, do mesmo modo que o SARS-CoV e o MERS-CoV, com presença de febre, tosse e dispneia.
Diarrhea is also seen in some patients.
Alguns pacientes também apresentam diarreia.
Pneumonia is one of the most severe symptoms and can progress rapidly to acute respiratory distress syndrome.
A pneumonia é um dos sintomas mais graves e pode evoluir rapidamente para a síndrome do desconforto respiratório agudo.
Although SARS-CoV and SARS-CoV-2 are very similar due to high nucleotide sequence homology of 82%, they cluster into different branches in the phylogenetic tree.
Embora o SARS-CoV e o SARS-CoV-2 sejam muito similares devido à alta homologia de 82% na sequência nucleotídica, eles se agrupam em ramos diferentes na árvore filogenética.
SARS-CoV-2 is apparently less pathogenic but more transmissible compared to SARS-CoV and MERS-CoV.
O SARS-CoV-2 aparentemente é menos patogênico, mas é mais transmissível comparado ao SARS-CoV e ao MERS-CoV.
Asymptomatic subjects infected with SARS-CoV-2 have been reported and might contribute to its rapid spreading around the world.
Foram relatados indivíduos assintomáticos infectados pelo SARS-CoV-2, e eles podem contribuir para a rápida propagação do vírus no mundo.
Comparing and contrasting SARS-CoV-2 with the other six HCoVs reveal similarities and differences of great interest.
A comparação e o contraste do SARS-CoV-2 com os outros seis HCoVs revelam semelhanças e diferenças de grande relevância.
First, the incubation period and the duration of the course of HCoV disease are very similar.
Em primeiro lugar, o período de incubação e a duração da evolução da doença do HCoV são muito semelhantes.
In this regard, SARS-CoV-2 follows the general trend of the other six HCoVs.
Nesse sentido, o SARS-CoV-2 segue a tendência geral dos outros seis HCoVs.
Second, the severity of symptoms of COVID-19 lies between SARS-CoV and the four community-acquired HCoVs (i.e. HCoV-229E, HCoV-OC43, HCoV-HKU1 and HCoV-NL63).
Em segundo lugar, a gravidade dos sintomas da COVID-19 encontra-se entre a gravidade do SARS-CoV e a gravidade dos quatro HCoVs adquiridos de modo comunitário (HCoV-229E, HCoV-OC43, HCoV-HKU1 e HCoV-NL63).
On one hand, SARS-CoV-2 infection exhibits features that are more commonly seen during infection with community-acquired HCoVs, including the presentation of non-specific, mild or even no symptoms.
Por um lado, a infecção por SARS-CoV-2 apresenta características que são mais observadas durante a infecção com HCoVs adquiridos de modo comunitário, incluindo a presença de sintomas não específicos, brandos ou até a ausência de sintomas.
On the other hand, a small subset of severe cases of COVID-19 can also be seen as in the case of SARS-CoV infection, although the ratio is a bit lower.
Por outro lado, um pequeno subgrupo de casos graves de COVID-19 também pode ser observado, como no caso da infecção por SARS-CoV, embora a proporção seja um pouco menor.
Third, the transmission of SARS-CoV-2 also shows interesting patterns characteristic of both community-acquired HCoVs and SARS-CoV.
Em terceiro lugar, a transmissão do SARS-CoV-2 também mostra padrões interessantes, tanto nos HCoVs adquiridos de modo comunitário quanto nos SARS-CoV.
On one hand, the transmissibility of SARS-CoV-2 is at least as high as that of community-acquired HCoVs.
Por um lado, a transmissibilidade do SARS-CoV-2 é, pelo menos, tão alta quanto a dos HCoVs adquiridos na comunidade.
On the other hand, it remains to be verified whether the transmissibility of SARS-CoV-2 decreases after passages in humans as in the cases of SARS-CoV and MERS-CoV.
Por outro lado, deve-se confirmar se a transmissibilidade do SARS-CoV-2 diminui após passar para os seres humanos, como no caso do SARS-CoV e do MERS-CoV.