atepeq/tico19 huggingface dataset:
The RCGP RSC data set includes all coded data and all prescribed items including vaccine exposure.
O conjunto de dados do Centro de Pesquisa e Vigilância do RCGP inclui todos os dados codificados e todos os itens prescritos incluindo vacinação.
The RCGP RSC conducts virology surveillance each influenza season, with 100 GPs participating in the 2019-2020 season (Figure 1).
O Centro de Pesquisa e Vigilância do RCGP conduz vigilância em virologia em todas as estações da gripe, com 100 clínicos gerais participando da estação de 2019-2020 (Figura 1).
These virology sampling practices are also recruited to be nationally representative (Figure 1).
Essas práticas de amostragem em virologia também são realizadas de forma que representem todo o país (Figura 1).
GPs take nasopharyngeal swabs from persons showing acute respiratory illness within 7 days of the onset of symptoms.
Os clínicos gerais coletam esfregaços nasofaríngeos de pessoas que apresentam doenças respiratórias agudas nos 7 dias do aparecimento dos sintomas.
Nasopharyngeal swabs are taken from children younger than 5 years showing symptoms of acute bronchitis or bronchiolitis.
Esfregaços nasofaríngeos são feitos em crianças menores de 5 anos que apresentam sintomas de bronquite ou bronquiolite aguda.
Additionally, nasopharyngeal samples are taken from anyone 5 years and older showing acute onset of ILI and respiratory synctial virus.
Além disso, amostras nasofaríngeas são coletadas de pessoas acima dos 5 anos de idade que apresentam sintomas iniciais agudos de doenças com sintomas gripais e vírus sincicial respiratório.
Swabs are tested at the PHE Respiratory Virus Unit for influenza to monitor positivity rates and circulating strains, as well as for measuring vaccine effectiveness.
Os esfregaços são testados na Unidade de Virologia Respiratória da PHE para a influenza, a fim de monitorar as taxas de positivos e de cepas em circulação, bem como para medir a eficácia das vacinas.
The RCGP RSC successfully conducted a pilot collecting serological samples from adults and linking them to a patient’s medical records during the 2018-2019 influenza season.
O Centro de Pesquisa e Vigilância do RCGP conduziu um estudo-piloto com a coleta de amostras sorológicas de adultos e vinculou-as a prontuários médicos de pacientes durante a gripe sazonal de 2018-2019.
This pilot was in collaboration with the PHE Seroepidemiology Unit and added to the residual blood samples submitted to PHE by National Health Service (NHS) laboratories.
Este estudo piloto teve colaboração com a Unidade de Soroepidemiologia da PHE e complementou as amostras de sangue residual enviadas à PHE pelos laboratórios do Serviço de Saúde Nacional (NHS).
Serology can provide important information about background population immunity, and sentinel networks can provide a mechanism for systematic data collection and linkage to medical records and health outcomes.
A sorologia fornece informações importantes sobre a imunidade geral da população, e as redes sentinelas podem fornecer um mecanismo para a coleta sistemática de dados e a vinculação a prontuários médicos e desfechos de saúde.
The serology pilot has demonstrated the ability of the network to collect serology samples in adults.
O estudo piloto de sorologia revelou a capacidade da rede de coletar amostras sorológicas de adultos.
With the COVID-19 outbreak, PHE and RCGP RSC have adapted existing influenza surveillance to monitor the spread of COVID-19 in the community, and this protocol sets out the basis for that collaboration.
Com a epidemia de COVID-19, a PHE e o Centro de Pesquisa e Vigilância do RCGP adaptaram a vigilância atual em influenza para monitorar a propagação da COVID-19 na comunidade, e esse protocolo define a base para a colaboração dessas entidades.
The primary national strategy for COVID-19 infection is containment, with patients who are at high risk managed via the telephone help system NHS111 and the PHE health protection teams, but the RCGP RSC surveillance is entirely separate.
A estratégia nacional primária para a infecção por COVID-19 é o confinamento, com o atendimento a pacientes que apresentam maior risco por meio do sistema de atendimento por telefone NHS111 e das equipes de proteção à saúde PHE, mas o Centro de Pesquisa e Vigilância do RCGP é completamente separado.
The RCGP RSC, by extending its established work, will provide virological and serological surveillance to monitor the temporal and geographical distribution of COVID-19 infection in the community, and assess the effectiveness of the containment strategy.
O Centro de Pesquisa e Vigilância do RCGP, ao estender seu trabalho já estabelecido, fornecerá vigilância virológica e sorológica para monitorar a distribuição temporal e geográfica da infecção por COVID-19 na comunidade, e avaliará a eficácia da estratégia de confinamento.
We would not be working in isolation on this research.
Não trabalharemos isolados nesta pesquisa.
We will share the protocol with UK colleagues and the I-MOVE consortium who have recently obtained EU Horizon 2020 funding from the stream “Advancing knowledge for the clinical and public health response to the novel coronavirus epidemic”.
Compartilharemos o protocolo com os colegas do Reino Unido e o consórcio I-MOVE, que obteve recentemente o financiamento EU Horizon 2020 da corrente de pesquisa "Produção de conhecimentos para a resposta da saúde clínica e pública à nova epidemia de coronavírus".
It is anticipated that great efficiencies in project management will result through this collaboration than that obtained from countries acting alone.
É esperado que uma maior eficiência na gestão do projeto resultará desta colaboração em comparação à eficiência obtida por países que estão agindo sozinhos.
The aim of this study is to identify whether there is undetected community transmission of COVID-19, estimate population susceptibility, and monitor the temporal and geographical distribution of COVID-19 infection in the community.
O objetivo deste estudo é identificar se há transmissão comunitária não detectada da COVID-19, estimar a suscetibilidade da população e monitorar a distribuição temporal e geográfica da infecção por COVID-19 na comunidade.
The objectives of this study are as follows:
Os objetivos deste estudo são os seguintes:
To monitor the burden of suspected COVID-19 activity in the community through primary care surveillance and clinical coding of possible COVID-19 cases referred into the containment pathway
Monitorar atividade suspeita relacionada à COVID-19 na comunidade através da vigilância em atenção primária e codificação clínica de possíveis casos de COVID-19 referidos na rota de contenção
To provide virological evidence on the presence and extent of undetected community transmission of COVID-19 and monitor positivity rates among individuals presenting ILI or acute respiratory tract infections to primary care
Fornecer evidência virológica sobre a presença e extensão de transmissão comunitária não detectada da COVID-19 e monitorar taxas de sorologia positiva entre indivíduos que apresentam doença com sintomas gripais ou infecções agudas do trato respiratório para a atenção primária
To estimate baseline susceptibility to COVID-19 in the community and estimate both symptomatic and asymptomatic exposure rates in the population through seroprevalence monitoring
Estimar a suscetibilidade de base à COVID-19 na comunidade e estimar as taxas de exposição assintomática e sintomática na população por meio do monitoramento de soroprevalência
To pilot implementation of a scheme for collection of convalescent sera with antibody profiles among recovered cases of COVID-19 discharged to the community
A implementação piloto de um esquema para a coleta de soro convalescente com perfis de anticorpos entre os casos recuperados da COVID-19 que receberam alta
We intend to capture the following.
Pretendemos alcançar os seguintes objetivos:
Clinical workload related to reports of COVID-19 using the codes created to flag cases, those being assessed and where the infection is located are excluded (Figures 2-​-44)
Carga de trabalho nas clínicas relacionadas às notificações de COVID-19 usando os códigos criados para sinalizar casos, os casos que estão sendo avaliados e o local da infecção são excluídos (Figuras 2 a 44)
Foreign countries visited in the last 28 days
Países estrangeiros visitados nos últimos 28 dias
Existing codes that may have utility (Tables 1-​-3).3).
Códigos existentes que podem ter utilidade (Tabelas 1 a 3).3).
Many GPs and primary care teams may not realize that important relevant data can be coded.
Muitos clínicos gerais e equipes de atenção primária podem não perceber que dados relevantes podem ser codificados.
There is also the potential during any pandemic to monitor the effectiveness of any transmission control measures.
Também há a possibilidade durante qualquer epidemia de monitorar a eficácia das medidas de controle de transmissão.
Reliable coding of letters and test results that will show an infection has become either confirmed or excluded
Codificação das letras e resultados confiáveis de testes apontarão para a confirmação ou exclusão de uma infecção
The methods will follow the approach used in the current influenza surveillance system and recent serology study, and includes five components: (1) primary care clinical surveillance; (2) virological surveillance; (3) population serological surveillance; (4) convalescent sera in cases; and (5) data curation.
Os métodos seguirão a abordagem usada no sistema atual de vigilância em influenza e no estudo de sorologia recente, e inclui cinco componentes: (1) vigilância clínica de atenção primária; (2) vigilância virológica; (3) vigilância sorológica da população; (4) soros convalescentes nos casos; e (5) curadoria de dados.
The NHS uses the Systematized Nomenclature of Medicine Clinical Terms (SNOMED CT) system of coding, which is normally only updated twice annually.
O Sistema Nacional de Saúde usa o sistema de codificação da Nomenclatura Sistematizada de Termos Clínicos Médicos (SNOMED CT), que geralmente é atualizada apenas duas vezes no ano.
There was added complexity as some computerized medical record (CMR) suppliers use the Read coding systems (Read clinical terms version 3 – CTv3), which is no longer updated.
Há uma complexidade adicional, já que alguns fornecedores de prontuários médicos computadorizados (CMR) usam os sistemas de códigos de leitura (Read clinical terms versão 3 - CTv3), que não são mais atualizados.
Additionally, there were no clinical codes to record COVID-19 in early February 2020.
Além disso, não havia códigos clínicos para registrar a COVID-19 no começo de 2020.
Therefore, the two main GP system suppliers added the five terms shown in Table 4 as system-wide local codes.
Portanto, os dois principais fornecedores para o sistema de clínica geral adicionaram os cinco termos mostrados na Tabela 4 como códigos locais amplos no sistema.
A UK emergency release of SNOMED CT concepts for COVID-19 was also subsequently made available across all CMR systems (Table 4).
Um comunicado de emergência do Reino Unido de conceitos da SNOMED CT para a COVID-19 também foi disponibilizado posteriormente em todos os sistemas CMR (Tabela 4).
The intention is that these will eventually be mapped to the new SNOMED CT concepts as they become available, allowing recording of relevant data (Multimedia Appendix 1).
A intenção é que esses conceitos sejam mapeados em algum momento para os novos conceitos SNOMED CT, conforme fiquem disponíveis, permitindo o registro de dados relevantes (Apêndice Multimídia 1).
The key requirements for this release were the ability to code (Table 4) a case of COVID-19, exposure to risk of infection (travel to an area where there may be a higher risk), contact with anyone infected with COVID-19, a report that a person had been tested for COVID-19, and that the disease had been excluded (likely a negative test).
Os requisitos chave para esse comunicado foram a capacidade de codificar (Tabela 4) um caso de COVID-19, a exposição ao risco de infecção (viagem para uma área onde pode haver um risco maior), contato com uma pessoa infectada com COVID-19, uma notificação de que a pessoa foi testada para COVID-19 e que a doença foi descartada (provavelmente um teste negativo).
In addition, practices are now able to code any foreign travel undertaken, including the ability to record visits to multiple countries (implemented February 8, 2020).
Além disso, as práticas em vigor conseguem codificar todas as viagens realizadas para o exterior, incluindo a capacidade de registrar visitas a vários países (implementação em 8 de fevereiro de 2020).
Figures 2-​-44 show the EMIS web implementation.
As figuras 2 a 44 mostram a implementação Web do EMIS.
Currently, virology samples for influenza surveillance are accompanied by a standard request form.
Atualmente, amostras sorológicas para vigilância da influenza são acompanhadas por um formulário padrão de requisição.
For COVID-19, we will create a new request form that will record:
Para a COVID-19, criaremos um novo formulário de requisição em que constarão:
Date of onset of symptoms
Data do aparecimento dos sintomas
Diagnosis of any of the following:
Diagnóstico de algum dos seguintes:
Acute bronchitis/bronchiolitis in those younger than five years
Bronquite/bronquiolite aguda em menores de cinco anos de idade
Lower respiratory tract infection (LRTI)
Infecção do trato respiratório inferior (ITRI)
History of fever (Y/N); measured (Y/N); if yes, level
Histórico de febre (S/N); medida (S/N); se sim, a temperatura
Shortness of breath (Y/N), if measured: oxygen saturation and respiratory rate
Falta de ar (S/N), se medida: taxa de saturação de oxigênio e taxa de respiração
Recent travel (Y/N); if yes, countries visited in last 14 days
Viagem recente (S/N): se sim, países visitados nos últimos 14 dias
Contact with a named person with confirmed COVID-19 (Y/N) with a free text comment about the level of certainty
Contato com uma pessoa com COVID-19 confirmada (S/N) com um comentário livre sobre o grau de certeza
These codes will be grouped ontologically into “definite”, “probable”, “possible”, and “not a case” using our standard approach to grouping codes (Table 5), which has been used previously across disease areas.
Esses códigos serão agrupados ontologicamente em "comprovado", "provável", "possível" e "descartado" usando nossa abordagem padrão para agrupamento de códigos (Tabela 5), que já foi usada anteriormente para outros grupos de doenças.
The RCGP RSC definition for ILI is shown in Multimedia Appendix 2.
A definição do Centro de Pesquisa e Vigilância do RCGP para doença com sintomas gripais é mostrada no Anexo Multimídia 2.
Public Presentation of Data Using an Observatory and Dashboards
Apresentação pública de dados usando um Observatório e Painéis
We will develop an observatory to present data nationally and a dashboard for feedback to practices about their data quality and collection of virology and serology samples.
Desenvolveremos um observatório para apresentar os dados para todo o país e um painel para comentários sobre as práticas quanto à qualidade dos dados e coleta de amostras sorológicas e virais.
This is based on coding described in Table 4.
Ele é baseado no sistema de códigos descrito na Tabela 4.
Definite case will be presented on our dashboard as “cases” of COVID-19.
Casos confirmados serão apresentados em nosso painel como "casos" de COVID-19.
Possible cases will be presented as “Under investigation” (investigating).
Casos possíveis serão apresentados como "Sob investigação" (em processo de investigação).
“Not a case” will be presented as “Excluded”.
"Descartados" serão apresentados como "Excluídos".
Online data has been established within the initial few weeks in the COVID-19 Observatory (Figure 5), indicating the overall number of patients and rate per 10,000 patients of cases confirmed or under investigation, as well as where the virus is excluded.
Dados on-line foram estabelecidos nas semanas iniciais no Observatório da COVID-19 (Figura 5), indicando o número geral de pacientes e a taxa por 10 mil pacientes de casos confirmados ou sob investigação, bem como os casos excluídos.
We have the option to move to twice weekly surveillance reports with a scope to change this to daily reporting.
Temos a opção de mudar para relatórios de vigilância bissemanais com um escopo para mudar para relatórios diários.
We will continue virology sampling from our sentinel practices, rather than discontinuing as seasonal influenza declines.
Continuaremos com a amostragem viral de nossas práticas sentinelas, em vez de descontinuá-la devido ao término da estação da influenza.
Additionally, we will recruit more surveillance practices.
Além disso, recrutaremos mais práticas de vigilância.
The RCGP RSC virology practices will aim to undertake 200-300 nasopharyngeal swabs per week across the RCGP RSC sentinel network, collecting specimens across all age bands.
Os clínicos gerais de virologia do RSC do RCGP terão como objetivo a realização de 200 a 300 esfregaços nasofaríngeos por semana, em toda a rede sentinela do RSC do RCGP, coletando espécimes de todas as faixas etárias.
In addition to the inclusion criteria for influenza virology surveillance (ILI, acute bronchitis/bronchiolitis), participating practices will take nasopharyngeal swab samples from any people showing acute symptoms of LRTI if the onset of symptoms is within 7 days.
Além dos critérios de inclusão para a vigilância em virologia da influenza (doenças com sintomas gripais, bronquite/bronquiolite aguda), os clínicos gerais participantes coletarão amostras de esfregaços nasofaríngeos de todas as pessoas que apresentarem sintomas agudos de infecção do trato respiratório inferior se o início de aparecimento dos sintomas estiver dentro de 7 dias.
RCGP RSC research officers and practice liaison staff will manage practices to achieve a total national sample of 200-300 swabs per week.
Os funcionários da pesquisa e os funcionários da assistência à clínica geral coordenarão os clínicos gerais para que alcancem um total nacional de amostrar de 200 a 300 esfregaços semanais.
This could be increased if PHE modelers require more samples.
Isso pode ser aumentado se os modeladores de PHE necessitarem de mais amostras.
Samples from each practice would be spread across the following age groups: &lt; 5 years, 5-17 years, 18-64 years, and 65 years and older
Amostras coletadas por cada clínico geral estariam distribuídas entre as seguintes faixas etárias: menores de 5 anos, entre 5 e 17 anos, entre 18 e 64 anos e acima de 65 anos
Samples (swabs or serum) collected will be sent via prepaid envelopes addressed to the appropriate PHE laboratory for analysis.
Amostras (esfregaços ou soro) coletadas serão enviadas por meio de envelopes pré-pagos endereçados aos devidos laboratórios da PHE para análise.
All samples collected will be tested for the presence of influenza and COVID-19.
Todas as amostras coletadas serão testadas para a presença da influenza e da COVID-19.
Additionally, PHE will retrospectively test any influenza virology samples collected between early and mid-February 2020 for COVID-19.
Além disso, a PHE testará retrospectivamente todas as amostras virais de influenza coletadas entre o início e a metade de fevereiro de 2020 para COVID-19.
Practices will still follow the PHE protocol for COVID-19 with respect to people at risk of infection who should be signposted down the containment pathway, rather than physically attend their practice.
Os clínicos gerais continuarão seguindo o protocolo da PHE para a COVID-19 com relação às pessoas com risco de infecção, que deverão ser encaminhadas à rota nacional de contenção, em vez de passarem pela atenção primária.
Direct testing of those who attend surgery remains permitted, but we have also rolled out self-swabbing at home.
O teste rápido dos que passam por cirurgia continua permitido, e também implementamos a colega caseira de amostras de esfregaço.
Summary of processes are detailed in Multimedia Appendix 3.
O resumo dos processos estão detalhados no Apêndice Multimídia 3.
Everyone with an ILI or a respiratory illness who contacts a GP (eg, phones for an appointment) should be asked specifically about recent travel to China and other countries flagged in current PHE advice, or if they have had contact with other people with COVID-19.
Todos que apresentarem uma doença com sintomas gripais ou outra doença respiratória que entre em contato com um clínico geral (para agendar uma consulta, por exemplo), deverão ser indagados especificamente sobre viagens recentes à China e a outros países sinalizados atualmente pela PHE, ou caso tenham tido contato com outras pessoas com COVID-19.
If these screening enquiries are positive, the patient would be advised to not come to the practice but instead to follow the PHE flow sheet.
Se essas perguntas de triagem receberem respostas afirmativas, o paciente é aconselhado a não comparecer à sua consulta, e sim a obedecer à planilha da PHE de direcionamento para o paciente.
This can be by a reception or clinician staff, depending on individual practice protocol.
Isso pode ser feito pela equipe da recepção ou de médicos, dependendo da prática de protocolo individual.
These calls should be coded into the GP CMR system and can be reported as part of the RCGP RSC weekly return.
Essas ligações devem ser codificadas no sistema CMR do clínico geral e podem ser notificadas como parte do retorno semanal ao RSC do RCGP.
We have developed training material to support this coding (Multimedia Appendix 4).
Desenvolvemos material de treinamento como suporte ao sistema de códigos (Apêndice Multimídia 4).
These include prompt cards for:
Estes incluem cartões associativos para:
Practice reception or triage staff: for coding of any patients calling the practice with symptoms of acute respiratory infection with a history of travel to important areas based on PHE advice
Recepção da clínica geral ou equipe de triagem: para a codificação dos pacientes que ligarem para a clínica com sintomas de infecção respiratória aguda e com histórico de viagem para áreas relevantes de acordo com a PHE
Administrative staff or clinicians who code: to encourage consistent coding of results for any suspected cases, including coding of negative results for exclusion
Os funcionários da administração ou médicos que operam os códigos: incentivar o uso consiste dos códigos dos resultados para qualquer caso suspeito, incluindo a codificação de resultados negativos para sua exclusão
Practices participating in virology surveillance will opportunistically collect blood samples from patients coming into the practice for a routine blood test.
Os clínicos gerais que participam na vigilância em virologia colherão, oportunamente, amostras de sangue de pacientes que comparecerem à clínica geral para um teste de sangue de rotina.
Patients who attend their practice for a routine blood test will be asked to provide an additional sample for serology.
Será solicitada dos pacientes que comparecerem à consulta para um teste de sangue de rotina uma amostra adicional para sorologia.
We have conducted initial searches within the RCGP RSC database to look at the number of full blood count (FBC) results and overall rates in adults and children (Figures 6-​-9).9).
Conduzimos buscas iniciais no banco de dados do RSC do RCGP pelo número de resultados de hemogramas completos e as taxas globais em adultos e crianças (Figuras 6 a 9).9).
An FBC is one of the most common tests performed, and we hope this will give an approximate indication of overall numbers of blood tests performed.
Um hemograma completo é um dos testes mais comuns realizados, e esperamos que ele forneça uma estimativa aproximada dos números globais dos teste de sangue realizados.
The sampling rate, per 100,000 patients was highest for children 15-17 years of age and 60 year or older in adults, with the lowest rates in children 0-4 years of age and 18-29 years of age in adults (Figures 6-​-99).
A taxa de amostragem, por 100 mil pacientes, foi mais alta para crianças de 15 a 17 anos de idade e para adultos com 60 anos ou mais, com as menores taxas em crianças de 0 a 4 anos de idade e em adultos de 18 a 29 anos de idade (Figuras 6 a 99).
We will provide 1000 serology baseline samples across all ages that reflect the varying rates of attendance by age.
Forneceremos mil amostras bases de sorologia para todas as idades que refletem as taxas de variação de consulta por idade.
Additionally, we will test if we can obtain these all from virology practices to enhance the yield.
Adicionalmente, testaremos se conseguimos obter todas essas amostras por práticas de virologia para aumentar a produtividade.
A good geographical spread is important, so PHE can advise on areas where serology will most usefully be collected.
Uma boa distribuição geográfica é importante, assim, a PHE pode dar aconselhamento sobre as áreas em que ao teste de sorologia será de maior utilidade.
This will be followed by 800 samples monthly.
Isso será seguido de 800 amostras mensais.
The sample will be stratified with 200 specimens for prepandemic survey (100 for monthly) in the following age groups: &lt; 5 years, 5-17 years, 18-64 years, and 65 years or older.
A amostra será estratificada com 200 espécimes para pesquisa pré-pandêmica (100 por mês) nas seguintes faixas etárias: menores de 5 anos, de 5 a 17 anos, de 18 a 64 anos e acima de 65 anos.
The younger patients, in many practices younger than 14 years, and in nearly all for children younger than 8 years will require pediatric serology surveillance.
Em muitas consultas, pacientes menores de 14 anos, e em quase todas as consultas, crianças menores de 8 anos necessitarão de vigilância sorológica pediátrica.
We will develop a new request form for practices to capture recent travel and exposure to COVID-19.
Desenvolveremos um novo formulário de requisição para que os médicos anotem o histórico recente de viagem e exposição ao COVID-19.
We will pilot a scheme for collecting convalescent serology from people with confirmed cases and who have had an acute virology sample at the time of their infection.
Faremos um esquema piloto para coleta da sorologia convalescente de pessoas com casos confirmados e que não tiveram uma amostra de virologia aguda à época de sua infecção.
This is to identify a carrier state in patients who have recovered from the virus but may continue shedding the virus.
Isso servirá para identificar o status de portador em pacientes que se recuperaram do vírus, mas podem continuar disseminando o vírus.
If there are a small number of cases, this may assist in developing a test kit for patients to take to their own GP and explore its acceptability to patients.
Se houver um pequeno número de casos, essa prática poderá auxiliar o desenvolvimento de um kit de testagem para que os pacientes levem para seu clínico geral, que abordará sua aceitabilidade entre os pacientes.
If there are a large number of COVID-19 cases nationally, convalescent samples could be collected from RCGP RSC practices where there are confirmed cases, with the ability to link to the full medical record.
Se houver um grande número de casos de COVID-19 no país, amostras convalescentes podem ser colhidas por clínicos gerais do RSC do RCGP onde houver casos confirmados, com a possibilidade de vinculá-los ao prontuário médico completo.
This process may include checking pseudonymized NHS numbers for positive individuals at RCGP RSC practices, checking current PHE guidance regarding considerations of infectiousness for confirmed cases, and offering the patient an appointment following the previously mentioned process.
Esse processo pode incluir verificação de números pseudonimizados do NHS de indivíduos em consultórios do RCGP RSC, verificação de diretriz atual da PHE em relação a considerações de infecciosidade de casos confirmados e oferta de consulta ao paciente após o processo mencionado anteriormente.
This needs to be carefully coordinated nationally across the network and may require PHE to ensure individuals are not contacted by multiple agencies.
Isso precisa ser coordenado com cuidado em toda a rede nacional e pode requerer que a PHE garanta que os indivíduos não sejam contatados por múltiplas agências.
RCGP RSC could provide a useful structure to channel the initial contact once PHE has made a request.
O RCGP RSC pode fornecer uma estrutura útil para direcionar o contato inicial assim que a PHE faz uma solicitação.
The RCGP RSC practices participating in the annual influenza virology surveillance have started sampling from patients showing symptoms of a LRTI.
Os consultórios do RCGP RSC que participam da vigilância de virologia da influenza anual começou a coletar amostras de pacientes com sintomas de uma LRTI.
All samples received are being tested for influenza and COVID-19.
Todas as amostras recebidas estão sendo testadas para influenza e COVID-19.
The RCGP RSC will explore ways to collect convalescent samples from any patients tested positive for COVID-19 through the extension of the virological surveillance.
O RCGP RSC estudará maneiras de coletar amostras convalescentes de todos os pacientes com teste positivo para COVID-19 por meio da extensão da vigilância virológica.
From the start, we will be carefully curating data to ensure that it can be used for future studies.
Desde o início, faremos a apuração cuidadosa dos dados para assegurar que possam ser usados em estudos futuros.
Our clinical data will be linked to virology.
Nossos dados clínicos serão ligados à virologia.
We will curate our data using the Findable, Accessible, Interoperable, Reusable principles.
Faremos a apuração dos dados usando os princípios achável, acessível, interoperável e reutilizável.
To facilitate this our data set is listed with Health Data Research UK and the European Health Data Evidence Network.
Para facilitar que esse nosso conjunto de dados seja listado na Health Data Research UK e na European Health Data and Evidence Network.
The statistical methodology is in support of a policy approach to widespread disease outbreak, where so-called nonpharmaceutical interventions (NPIs) are used to respond to an emerging pandemic to produce disease suppression.
A metodologia estatística embasa uma abordagem política para o surto generalizado da doença, em que as assim chamadas intervenções não farmacêuticas (NPIs) são usadas como resposta a uma pandemia emergente para causar supressão da doença.
This policy aims to reduce contact rates in the population and thereby reduce transmission of the virus.
Essa política visa reduzir taxas de contato na população e, assim, reduzir a transmissão do vírus.
To implement this the UK government has recently articulated the desire to implement population self-isolation measures.
Para implementá-la, o governo britânico articulou recentemente o desejo de implementar medidas de autoisolamento da população.
By targeting the reproduction number (R) (the average number of secondary cases each case generates) and aiming to reduce the R to below 1, the policy seeks to reduce case numbers to low levels or (as seen in previous outbreaks with severe acute respiratory syndrome and Ebola) to eliminate human-to-human transmission.
Mirando no número de reprodução (R), o número médio de casos secundários que cada caso gera, e visando reduzir o R para abaixo de 1, a política busca reduzir o número de casos para níveis baixos ou, assim como foi visto em surtos anteriores com síndrome respiratória aguda grave e ebola, eliminar a transmissão humano para humano.
As the experience from the 2009 H1N1 pandemic has shown, NPIs can be a crucial component of pandemic mitigation.
Conforme mostrou a experiência com a pandemia de H1N1 de 2009, NPIs podem ser um componente crucial de mitigação pandêmica.
Key to the focus of our study will be the estimation of peak cases in the population and continual monitoring by data collection and modelling the potential growth and emergence of subsequent peaks in new cases as social distancing measures are relaxed.
O principal foco do estudo será a estimativa do pico de casos na população e o monitoramento contínuo por meio de coleta de dados e modelagem do crescimento potencial e surgimento de picos subsequentes em novos casos conforme as medidas de distanciamento social são relaxadas.
There has already been publication of important disease epidemiological measures concerning the outbreak of COVID-19 in mainland China.
Já houve publicação de medidas epidemiológicas importantes em relação ao surto de COVID-19 na China continental.
A further fundamental measure in pandemic dynamics is the length of time from infection to when a person is infectious to others and the mean duration of infectiousness.
Outra medida fundamental na dinâmica da pandemia é a duração da infecção, quando uma pessoa é contagiosa para outras, e a duração média de infecciosidade.
These factors, if estimated accurately, will give good predictions for the likely length of the pandemic, the final number of infected cases.
Se estimados com precisão, esses fatores darão previsões boas da duração provável da pandemia, o número final de casos infectados.
We intend to apply approximate Bayesian inference (ABC) to (possibly spatially heterogeneous) Susceptible-Exposed- Infectious-Removed (SEIR) stochastic epidemic models.
Pretendemos aplicar inferência bayesiana aproximada (ABC) a modelos epidêmicos estocásticos (possivelmente heterogêneos espaciais) Suscetível-Exposto-Infeccioso-Removido (SEIR).
Such techniques are highly parallelizable and have been successfully applied to many fields including disease transmission modelling.
Essas técnicas são altamente paralelizáveis e foram aplicadas com êxito a muitas áreas, inclusive modelagem de transmissão da doença.
They are particularly suited to situations where likelihood functions are absent and where more traditional approaches such as Markov chain Monte Carlo are impractical.
Elas são especificamente adequadas a situações nas quais funções prováveis são inexistentes e abordagens mais tradicionais são inviáveis, como Monte Carlo via cadeias de Markov.
Such an approach has been demonstrated to work effectively on the ASPREN surveillance data, a network of sentinel GPs and nurse practitioners who report deidentified information on ILIs and other conditions, where issues such as missing data and the need to model the observation process itself has been successfully addressed.
Esse tipo de abordagem demonstrou funcionar eficientemente nos dados de vigilância da ASPREN, uma rede de enfermeiros clínicos e médicos gerais sentinelas que reportam informações sem identificação pessoal sobre ILIs e outras condições, em que problemas como a falta de dados e a necessidade de modelar o próprio processo de observação foram resolvidos com êxito.
Furthermore, peaks in new cases have been estimated by distributional methods.
Além disso, picos em novos casos têm sido estimados por métodos distributivos.
Estimates of the parameters of the SEIR model are tractable on large data sets because of parallelizability, and these methods have been implemented in several R libraries; we intend to use the libraries ABSEIR (deposited on GitHub: https://tinyurl.com/vqu35cj) and abctools (https://tinyurl.com/tfjavz4) to estimate epidemic measures on a weekly basis.
Estimativas dos parâmetros do modelo SEIR são fáceis de lidar em conjuntos grandes de dados por causa da paralelizabilidade, e esses métodos têm sido implementados em várias bibliotecas R. Pretendemos usar as bibliotecas ABSEIR (depositadas no GitHub: https://tinyurl.com/vqu35cj) e abctools (https://tinyurl.com/tfjavz4) para estimar semanalmente medidas epidemiológicas.
Since we are fitting an SIR-epidemic model in the ABC routine, we anticipate that our results will be robust against weekly case data containing relatively small counts.
Uma vez que estamos adaptando um modelo epidêmico SIR na rotina ABC, esperamos que os resultados sejam robustos em relação a dados de casos semanais que têm contagens relativamente pequenas.
For example, see for the ABC methodology applied to the Tristan da Cunha common cold data from 1967, where counts of I (number of infectious cases) and R (number of recovered cases) are in the tens at most.
Por exemplo, veja a metodologia ABC aplicada aos dados de constipação comum de 1967 em Tristão da Cunha, em que as contagens de I (número de casos infecciosos) e R (número de casos recuperados) estão na casa de dezenas no máximo.
Finally, in addition to the above methodology we will employ the Kaplan-Meier method with two outcomes (death and recovery) to estimate the case fatality ratio.
Finalmente, em complemento à metodologia acima, usaremos o método de Kaplan-Meier com dois desfechos (morte e recuperação) para estimar a taxa de mortalidade dos casos.
This approach is independent of the ABC methodology and will allow comparisons between estimates from the two modelling approaches to judge robustness of results.
Essa abordagem é independente da metodologia ABC e permitirá comparações entre estimativas das duas abordagens de modelagem para avaliar a solidez dos resultados.
RCGP RSC’s surveillance with PHE is defined as Health Protection under Regulation 3 of The Health Service (Control of Patient Information) Regulations 2002.
A vigilância do RCGP RSC com a PHE é definida como proteção à saúde no Regulamento 3 das Regulamentações do Serviço de Saúde (Controle de Informações do Paciente) de 2002.
This has been confirmed by PHE’s Caldicott Guardian’s Office.
Isso foi confirmado pelo Escritório do Guardião de Caldicott da PHE.
We do not see any increased risk to practices or practitioners taking part in this surveillance.
Não constatamos aumento de risco a consultórios ou médicos participantes dessa vigilância.
Infection prevention and control advice will follow extant national guidance.
A recomendação para controle e prevenção da infecção seguirá a diretriz nacional vigente.
Any cases identified will be managed according to the PHE/NHS guidance in force at the time, including advice for identified contacts.
Todos os casos identificados serão conduzidos de acordo com a diretriz da PHE/NHS em vigor no momento, inclusive a recomendação para contatos identificados.
However, our training will include reminders about safe handling of specimens and revision of infection control measures anticipated to be high in our practices.
No entanto, nosso treinamento incluirá lembretes sobre tratamento seguro de espécimes e revisão de medidas de controle da infecção com expectativa de serem elevadas nos consultórios.
It is a key part of Regulation 12 about safe care and treatment, periodically inspected by the Care Quality Commission.
Trata-se de uma parte fundamental do Regulamento 12 sobre cuidado e tratamento seguro, inspecionado periodicamente pela Comissão de Qualidade dos Cuidados.
Travel History and Clinical Descriptors of the COVID-19 Infections
Histórico de viagem e descritores clínicos das infecções por COVID-19
The RCGP RSC practices have been advised on the clinical coding that has been made available for COVID-19 across all CMR systems.
Os consultórios do RCGP RSC foram orientados sobre a codificação clínica disponibilizada em relação à COVID-19 em todos os sistemas CMR.
This includes information on coding of clinical descriptors (Table 4) and any recent travel history.
Isso inclui informações sobre codificação de descritores clínicos (Tabela 4) e qualquer histórico de viagem recente.
Establishment of Extended Virology Sampling
Estabelecimento de amostragem de virologia estendida
The RCGP RSC practices participating in the annual influenza virology surveillance have started sampling from patients showing symptoms of LRTI.
Os consultórios do RCGP RSC que participam da vigilância de virologia da influenza anual começaram a coletar amostras de pacientes com sintomas de LRTI.
This has led to initial early identification of background spread in low-risk patients.
Isso tem levado à identificação precoce do histórico de disseminação em pacientes de baixo de risco.
As of March 7, 2020, the surveillance system has detected 2 cases of COVID-19 in low-risk patients with no history of travel through extended virological sampling.
Desde 7 de março de 2020, o sistema de vigilância detectou, por meio de amostragem virológica estendida, dois casos de COVID-19 em pacientes de baixo risco sem histórico de viagem.
This protocol describes how we have adapted a national influenza surveillance system to monitor community spread of an unexpected infection of COVID-19.
Esse protocolo descreve como adaptamos um sistema de vigilância nacional de influenza para monitorar a disseminação comunitária de uma infecção inesperada de COVID-19.
We have rapidly created and incorporated new codes to allow data recording, and are collecting data to monitor the effectiveness of containment strategies.
Temos criado e incorporado rapidamente códigos novos para permitir o registro de dados e estamos coletando dados para monitorar a eficácia de estratégias de confinamento.
Through this surveillance, we intend to find out more about the epidemiology of COVID-19 in ambulatory care.
Por meio dessa vigilância, pretendemos descobrir mais sobre a epidemiologia da COVID-19 no cuidado ambulatório.
In particular, its rate of spread, both temporal and geographical.
Especificamente, sua taxa de disseminação temporal e geográfica.
Our testing of low-risk patients will also inform whether the containment strategy that is based on virology testing of high-risk patients and their contacts plus self-isolation is effective.
Nossos testes em pacientes de baixo risco também informarão se é eficaz a estratégia de confinamento baseada em testes de virologia em pacientes de alto risco e seus contatos somada ao autoisolamento.
Containment should slow the spread, and there may be benefits in the management of spread from intense surveillance.
O confinamento deve retardar a disseminação, e pode haver benefícios no controle da disseminação por meio de vigilância intensa.
However, there may come a point at which the virus spreads more widely into the population, as has happened in Italy.
No entanto, pode chegar a um ponto em que a disseminação do vírus seja maior na população, conforme ocorrido na Itália.
Surveillance of low-risk patients should inform when we reach this tipping point and when infection rates start to remit.
A vigilância de pacientes de baixo risco deve informar quando alcançaremos esse ponto crítico e quando as taxas de infecção começarão a diminuir.
The epidemiology of COVID-19 remains emergent.
A epidemiologia da COVID-19 continua emergente.
The registration-based nature of UK primary care means that we will be able to create a complete picture of the cumulative incidence and duration.
O caráter baseado em registros da atenção básica do Reino Unido indica que seremos capazes de criar um quadro completo da duração e incidência cumulativa.
The surveillance system should be able to identify areas where COVID-19 spread is taking place that might be suitable for trials of antiviral therapy.
O sistema de vigilância deve ser capaz de identificar áreas de ocorrência da disseminação de COVID-19 que possam ser adequadas para ensaios de terapia antiviral.
We could also follow up on the effectiveness or any adverse reactions to these medicines or vaccinations.
Poderíamos também acompanhar a eficácia ou quaisquer reações adversas a esses medicamentos ou vacinas.
Finally, early detection of a confirmed COVID-19 case has exemplified the rapid implementation of this enhanced surveillance in the national network.
Por fim, a detecção precoce de casos confirmados de COVID-19 tem exemplificado a implementação rápida dessa vigilância aprimorada na rede nacional.
Safety of practices is our primary concern.
A segurança dos consultórios é nossa principal preocupação.
The RCGP RSC has operated for over 50 years and has been involved in collecting samples to monitor disease and vaccine effectiveness through the Hong Kong flu pandemic of 1968/69, the Russian flu of 1977/78, and the 2009 Swine flu pandemic.
O RCGP RSC tem operado há mais de 50 anos e participou da coleta de amostras para monitorar doenças e a eficácia de vacinas durante a pandemia de gripe de Hong Kong de 1968/69, a gripe russa de 1977/78 e a pandemia de gripe suína de 2009.
We are not aware of any increased risk to practice staff or other patients from involvement in surveillance.
Não temos ciência de aumento nos riscos a funcionários dos consultórios ou outros pacientes por envolvimento na vigilância.
Pandemic preparedness is part of the role of the RCGP RSC.
A preparação para pandemias faz parte da função do RCGP RSC.
It is plausible that enhanced coding of information from contacts with the practices in RCGP RSC will reduce the likelihood of people who may be suspected COVID-19 cases being brought to the surgery inadvertently.
É plausível que a codificação aprimorada de informações de contatos com os consultórios do RCGP RSC reduza a probabilidade de que pessoas com suspeita de COVID-19 sejam submetidas inadvertidamente a cirurgias.
Where cases are detected unexpectedly, it is probably helpful for that patient, their contacts, and the practice to know.
Quando há detecção inesperada de casos, é provavelmente útil que os pacientes, seus contatos e o consultório tenham conhecimento disso.
The impact on practices has been to close for a day, if a case is found, for deep cleaning and then reopen.
O impacto em consultórios tem sido fechar por um dia, se houver algum caso, para limpeza profunda e depois reabrir.
The principal limitations of our system are the number of data points.
As principais limitações do nosso sistema são o número de pontos de dados.
We are collecting serology and virology data from 100 sites, which covers a small group of the population.
Coletamos dados de sorologia e virologia provenientes de 100 locais, que abrangem um grupo pequeno da população.
This has been satisfactory for monitoring influenza, but we are not certain if this is a sufficiently large sample for the COVID-19 outbreak.
Isso tem sido satisfatório para monitorar influenza, mas não temos certeza se essa amostra é grande o suficiente em relação ao surto de COVID-19.
Our sites (surveillance practices) are currently fixed, and it could be helpful to be able to rapidly onboard practices in regions where there are more cases.
No momento, nossos locais (consultórios de vigilância) são fixos, e seria útil poder instalar rapidamente consultórios em regiões onde há mais casos.
Currently, we will be reporting weekly.
Atualmente, apresentamos relatórios semanais.
Our existing system can be enhanced to twice weekly, but maybe daily or hourly data should be our current approach.
Nosso sistema atual pode ser aprimorado para duas vezes por semana, mas talvez a abordagem deva ser para dados diários ou por hora.
Opportunistic sampling for serology in children younger than 10 years might be limited due to the overall reduced rate of blood tests in children.
A amostragem oportunista para sorologia em crianças menores de 10 anos pode ser limitada devido à taxa reduzida geral de exames de sangue em crianças.
The extended surveillance using the RCGP RSC-PHE network for the emergent COVID-19 outbreak has been established rapidly.
A vigilância estendida por meio da rede RCGP RSC-PHE para o surto emergente de COVID-19 foi estabelecida rapidamente.
The model of getting the appropriate informatics to enable capture of the required data has already been a success, with data recording starting the week the codes were created.
O modelo da obtenção da tecnologia informática adequada para a habilitação da coleta dos dados necessários já é um sucesso, com a gravação dos dados iniciando-se na semana em que os códigos foram criados.
In addition, modifying the existing surveillance system to collect population data in a parallel way has also been effective.
Além disso, modificar o sistema de vigilância atual para coleta dos dados da população de modo paralelo tem sido eficaz.
However, we are at present unsure as to whether the scale of this surveillance provides sufficient data to drive local containment strategies or if reporting infrequently meets the need of our information age.
No entanto, estamos incertos neste momento se a escala da vigilância fornece dados suficientes para conduzir estratégias de confinamento local ou se a apresentação infrequente de relatórios atende às necessidades da nossa era da informação.
Updating the diagnostic criteria of COVID-19 “suspected case” and “confirmed case” is necessary
É necessário atualizar os critérios de diagnóstico de "caso suspeito" e "caso confirmado" de COVID-19