atepeq/tico19 huggingface dataset:
Although SARS-CoV and SARS-CoV-2 are very similar due to high nucleotide sequence homology of 82%, they cluster into different branches in the phylogenetic tree.
Aunque el SARS-CoV y el SARS-CoV-2 son muy parecidos debido a una homología de secuencia de nucleótidos alta del 82 %, se categorizan en distintas ramas del árbol filogenético.
SARS-CoV-2 is apparently less pathogenic but more transmissible compared to SARS-CoV and MERS-CoV.
El SARS-CoV-2 aparentemente es menos patógeno, pero más transmisible en comparación con el SARS-CoV y el MERS-CoV.
Asymptomatic subjects infected with SARS-CoV-2 have been reported and might contribute to its rapid spreading around the world.
Se han informado casos de personas asintomáticas infectadas con SARS-CoV-2, lo que podría contribuir a su rápida propagación por todo el mundo.
Comparing and contrasting SARS-CoV-2 with the other six HCoVs reveal similarities and differences of great interest.
Al comparar y contrastar el SARS-CoV-2 con los otros seis coronavirus de humanos, se identifican similitudes y diferencias de gran interés.
First, the incubation period and the duration of the course of HCoV disease are very similar.
En primer lugar, el período de incubación y la duración del curso de la enfermedad por coronavirus de humanos son muy similares.
In this regard, SARS-CoV-2 follows the general trend of the other six HCoVs.
En este aspecto, el SARS-CoV-2 sigue la tendencia general de los otros seis coronavirus de humanos.
Second, the severity of symptoms of COVID-19 lies between SARS-CoV and the four community-acquired HCoVs (i.e. HCoV-229E, HCoV-OC43, HCoV-HKU1 and HCoV-NL63).
En segundo lugar, la gravedad de los síntomas de la COVID-19 se sitúa entre la del SARS-CoV y los cuatro coronavirus de humanos adquiridos en la comunidad (es decir, el HCoV-229E, el HCoV-OC43, el HCoV-HKU1 y el HCoV-NL63).
On one hand, SARS-CoV-2 infection exhibits features that are more commonly seen during infection with community-acquired HCoVs, including the presentation of non-specific, mild or even no symptoms.
Por un lado, la infección por SARS-CoV-2 presenta características que se observan más frecuentemente en infecciones por coronavirus de humanos adquiridos en la comunidad, lo que incluye la presentación de síntomas no específicos o leves o, incluso, la ausencia de síntomas.
On the other hand, a small subset of severe cases of COVID-19 can also be seen as in the case of SARS-CoV infection, although the ratio is a bit lower.
Por otro lado, también se observa un subgrupo pequeño de casos graves de COVID-19 como sucede con la infección por SARS-CoV, aunque la relación es un poco menor.
Third, the transmission of SARS-CoV-2 also shows interesting patterns characteristic of both community-acquired HCoVs and SARS-CoV.
En tercer lugar, la transmisión del SARS-CoV-2 también muestra patrones interesantes característicos tanto de los coronavirus de humanos adquiridos en la comunidad como del SARS-CoV.
On one hand, the transmissibility of SARS-CoV-2 is at least as high as that of community-acquired HCoVs.
Por un lado, la transmisibilidad del SARS-CoV-2 es, al menos, igual de alta que la de los coronavirus de humanos adquiridos en la comunidad.
On the other hand, it remains to be verified whether the transmissibility of SARS-CoV-2 decreases after passages in humans as in the cases of SARS-CoV and MERS-CoV.
Por otro lado, resta verificar si la transmisibilidad del SARS-CoV-2 disminuye tras pases entre humanos, como sucede con el SARS-CoV y el MERS-CoV.
Finally, same as the other HCoVs, SARS-CoV-2 can be detected in fecal samples.
Por último, al igual que con los otros coronavirus de humanos, el SARS-CoV-2 puede detectarse en muestras fecales.
Whether fecal-oral transmission of SARS-CoV-2 plays an important role as in the case of SARS-CoV at least under some circumstance remains to be clarified by future studies.
Si la transmisión fecal-oral del SARS-CoV-2 cumple una función importante, como en el caso del SARS-CoV, al menos en algunas circunstancias, aún debe dilucidarse en estudios futuros.
It is also of particularly great interest to see whether SARS-CoV-2 might exhibit seasonality as in the cases of community-acquired HCoVs.
También reviste especial interés averiguar si el SARS-CoV-2 podría exhibir estacionalidad, como es el caso de los coronavirus de humanos adquiridos en la comunidad.
Nevertheless, the features of SARS-CoV-2 including its transmissibility, pathogenicity and sustainable spreading after passages in humans will be influential on the ultimate fate of the ongoing outbreak of COVID-19.
No obstante, las características del SARS-CoV-2, incluida su transmisibilidad, patogenicidad y propagación sostenible tras pases entre humanos, tendrán influencia en el desenlace final del brote en curso de COVID-19.
All four community-acquired HCoVs causing mild symptoms have been well adapted to humans.
Los cuatro coronavirus de humanos adquiridos en la comunidad que causan síntomas leves se han adaptado bien a los humanos.
From another perspective, it might also be true that humans have been well adapted to these four HCoVs.
Desde otra perspectiva, también podría ser cierto que los humanos se han adaptado bien a estos cuatro coronavirus de humanos.
In other words, both could be the survivors of ancient HCoV pandemics.
En otras palabras, ambos podrían ser sobrevivientes de antiguas pandemias de coronavirus de humanos.
HCoVs that cause severe diseases in humans and humans who developed severe HCoV diseases have been eliminated.
Se han eliminado los coronavirus de humanos que causan enfermedades graves en humanos y los humanos que desarrollaron enfermedades graves por coronavirus de humanos.
For this to happen, HCoVs have to replicate in humans to sufficient extent to allow the accumulation of adaptive mutations that counteract host restriction factors.
Para que esto suceda, los coronavirus de humanos deben replicarse en humanos en una medida suficiente para permitir la acumulación de mutaciones adaptativas que contrarresten los factores de restricción del huésped.
In this sense, the longer the SARS-CoV-2 outbreak persists and the more people that it infects, the greater chance that it will fully adapt to humans.
En este sentido, mientras más tiempo persista el brote de SARS-CoV-2 y cuantas más personas infecte, mayor será la probabilidad de que se adapte completamente a los humanos.
If it adapts well, its transmission in humans would be difficult to stop by quarantine or other infection control measures.
Si se adapta bien, su transmisión en humanos sería difícil de detener mediante la cuarentena u otras medidas de control de la infección.
For many years, the four community-acquired CoVs circulate in human populations, triggering common cold in immunocompetent subjects.
Por muchos años, los cuatro coronavirus adquiridos en la comunidad han circulado en poblaciones humanas y han causado resfriados comunes en personas inmunocompetentes.
These viruses do not need an animal reservoir.
Estos virus no necesitan un reservorio animal.
In contrast, highly pathogenic SARS-CoV and MERS-CoV have not adapted to humans well and their transmission within humans cannot be sustained.
En contraposición, el SARS-CoV y el MERS-CoV altamente patógenos no se han adaptado bien a los humanos y su transmisión entre humanos es insostenible.
They need to maintain and propagate in their zoonotic reservoirs and seek the chance to spillover to susceptible human targets, possibly via one or more intermediate and amplifying hosts.
Necesitan mantenerse y propagarse en sus reservorios zoonóticos y buscan la oportunidad para propagarse a objetivos humanos susceptibles, posiblemente a través de uno o más huéspedes intermedios y amplificadores.
SARS-CoV-2 has features that are similar to both SARS-CoV/MERS-CoV and the four community-acquired HCoVs.
El SARS-CoV-2 tiene características similares tanto al SARS-CoV y al MERS-CoV como a los cuatro coronavirus de humanos adquiridos en la comunidad.
It is highly transmissible like community-acquired HCoVs, at least for the time being.
Es altamente transmisible como los coronavirus de humanos adquiridos en la comunidad, al menos por el momento.
However, it is more pathogenic than community-acquired HCoVs and less pathogenic than SARS-CoV or MERS-CoV.
Sin embargo, es más patógeno que los coronavirus de humanos adquiridos en la comunidad y menos patógeno que el SARS-CoV o el MERS-CoV.
It remains to be seen whether it will adapt fully to humans and circulate within humans without a reservoir or intermediate animal host.
Resta ver si se adaptará completamente a los humanos y circulará entre los humanos sin un huésped animal de reservorio o intermedio.
Before discussing the animal origins of HCoVs, it will serve us well to discuss the definitions and characteristics of evolutionary, natural, reservoir, intermediate and amplifying hosts of HCoVs.
Antes de analizar los orígenes animales de los coronavirus de humanos, nos será útil examinar las definiciones y características de los huéspedes evolutivos, naturales, de reservorio, intermedios y amplificadores de los coronavirus de humanos.
An animal serves as the evolutionary host of an HCoV if it harbours a closely related ancestor sharing high homology at the level of nucleotide sequence.
Un animal actúa como huésped evolutivo de un coronavirus de humanos si alberga a un ancestro estrechamente relacionado que comparte una alta homología a nivel de la secuencia de nucleótidos.
The ancestral virus is usually well adapted and non-pathogenic in this host.
El virus ancestral normalmente está bien adaptado y no es patógeno en este huésped.
Likewise, a reservoir host harbours HCoV continuously and for long term.
De manera similar, un huésped de reservorio alberga a un coronavirus de humanos de forma continua y a largo plazo.
In both cases, the hosts are naturally infected and are the natural hosts of HCoV or its parental virus.
En ambos casos, los huéspedes se infectan naturalmente y son los huéspedes naturales del coronavirus de humanos o su virus parental.
In contrast, if the HCoV is newly introduced to an intermediate host right before or around its introduction to humans, it is not well adapted to the new host and is often pathogenic.
En cambio, si el coronavirus de humanos se introdujo en el huésped intermedio justo antes o casi al mismo tiempo de su introducción en humanos, no está bien adaptado al nuevo huésped y suele ser patógeno.
This intermediate host can serve as the zoonotic source of human infection and play the role of an amplifying host by allowing the virus to replicate transiently and then transmitting it to humans to amplify the scale of human infection.
El huésped intermedio puede actuar como la fuente zoonótica de la infección en humanos y cumplir la función de huésped amplificador al permitir que el virus se replique transitoriamente y, luego, se transmita a humanos para amplificar la escala de la infección en humanos.
An HCoV can undergo a dead-end infection if it cannot sustain its transmission within the intermediate host.
Un coronavirus de humanos puede provocar una infección en el huésped terminal si no puede sostener su transmisión en el huésped intermedio.
On the contrary, HCoVs can also adapt to the intermediate host and even establish long-term endemicity.
Por el contrario, los coronavirus de humanos también pueden adaptarse al huésped intermedio e, incluso, generar endemicidad a largo plazo.
In this case, the intermediate host becomes a natural reservoir host.
En este caso, el huésped intermedio se convierte en un huésped de reservorio natural.
Epidemiological data revealed retrospectively that the index case of SARS had a contact history with game animals.
Los datos epidemiológicos revelaron retrospectivamente que el caso inicial del SARS había tenido contacto con animales de caza.
Subsequent seroprevalence investigations indicated that animal traders had a higher prevalence of anti-SARS-CoV IgG compared with that of the general population.
Investigaciones posteriores sobre la seroprevalencia indicaron que los comerciantes de animales tenían una mayor prevalencia de IgG anti-SARS-CoV en comparación con la de la población general.
Masked palm civets (Paguma larvata) and a racoon dog in live animal markets were first identified to carry SARS-CoV-like viruses that are almost identical to SARS-CoV.
Civetas de las palmeras enmascaradas (Paguma larvata) y un perro mapache en mercados de animales vivos fueron los primeros portadores identificados de virus similares al SARS-CoV que son casi idénticos al SARS-CoV.
This was indirectly supported by the fact that no further SARS was reported after killing all civets in the markets.
Esto fue respaldado indirectamente por el hecho de que no se registraron más casos de SARS luego de matar a todas las civetas de los mercados.
However, it has been reported that masked palm civets from the wild or farms without exposure to the live animal markets were largely negative for SARS-CoV, suggesting that masked palm civets might only serve as the intermediate amplifying host but not the natural reservoir of SARS-CoV.
Sin embargo, se informó que las civetas de las palmeras enmascaradas salvajes o de granjas sin exposición a los mercados de animales vivos mayormente daban negativo en SARS-CoV, lo que sugiere que las civetas de las palmeras enmascaradas solo actuarían como huésped intermedio amplificador, pero no como reservorio natural del SARS-CoV.
Notably, since 80% of the different animals in the markets in Guangzhou have anti-SARS-CoV antibodies, the possibilities that multiple species of small mammals might also serve as intermediate amplifying hosts of SARS-CoV cannot be excluded.
Notablemente, dado que el 80 % de los distintos animales de los mercados de Guangzhou tienen anticuerpos anti-SARS-CoV, no pueden descartarse las posibilidades de que varias especies de pequeños mamíferos también actúen como huéspedes intermedios amplificadores del SARS-CoV.
All of these appear to be dead-end hosts of SARS-CoV.
Todos ellos parecen ser huéspedes terminales del SARS-CoV.
Subsequent search for the natural animal host of SARS-CoV unveiled a closely related bat CoV, termed SARS-related Rhinolophus bat CoV HKU3 (SARSr-Rh-BatCoV HKU3), which exists in Chinese horseshoe bats.
Búsquedas posteriores del huésped animal natural del SARS-CoV revelaron un coronavirus de murciélagos estrechamente relacionado, denominado CoV HKU3 de murciélago Rhinolophus relacionado con el SARS (SARSr-Rh-BatCoV HKU3), que existe en murciélagos de herradura chinos.
These bats are positive for anti-SARS-CoV antibodies and genome sequence of SARSr-Rh-BatCoV HKU3.
Estos murciélagos son positivos en anticuerpos anti-SARS-CoV y la secuencia de genoma del SARSr-Rh-BatCoV HKU3.
This and other bat CoVs share 88-92% nucleotide sequence homology with SARS-CoV.
Este y otros coronavirus de murciélagos comparten una homología de secuencia de nucleótidos del 88-92 % con el SARS-CoV.
These studies have laid the foundation for the new concept that bats host emerging human pathogens.
Estos estudios han sentado las bases del nuevo concepto de que los murciélagos albergan patógenos emergentes en humanos.
Several SARS-like CoVs (SL-CoVs) have also been identified from bats, but none except for one designated WIV1 can be isolated as live virus.
Varios coronavirus similares al SARS (SL-CoV) también se han identificado en murciélagos, pero ninguno, salvo uno denominado WIV1, puede aislarse como virus vivo.
Human angiotensin converting enzyme 2 (ACE2) is known to be the receptor of SARS-CoV.
Se sabe que la enzima convertidora de angiotensina 2 (ACE2) humana es el receptor del SARS-CoV.
WIV1 derived from fecal sample of bats was demonstrated to use bat, civet and human ACE2 as receptor for cell entry.
Se demostró que el WIV1 obtenido de una muestra fecal de murciélagos usa la ACE2 de murciélagos, civetas y humanos como receptor para ingresar a las células.
Intriguingly, sera of convalescent SARS patients were capable of neutralizing WIV1.
Asombrosamente, los sueros de pacientes con SARS convalecientes eran capaces de neutralizar el WIV1.
Thus far, WIV1 represents the most closely related ancestor of SARS-CoV in bats, sharing 95% nucleotide sequence homology.
Hasta el momento, el WIV1 representa el ancestro más estrechamente relacionado del SARS-CoV en murciélagos, que comparte una homología de secuencia de nucleótidos del 95%.
Albeit the high homology between these two viruses, it is generally believed that WIV1 is not the immediate parental virus of SARS-CoV and bats are not the immediate reservoir host of SARS-CoV.
A pesar de la alta homología entre estos dos virus, en general, se cree que el WIV1 no es el virus parental inmediato del SARS-CoV y que los murciélagos no son el huésped de reservorio inmediato del SARS-CoV.
Phylogenetic analysis clusters MERS-CoV to the same group as bat CoV-HKU4 and bat CoV-HKU5.
Según el análisis filogenético, el MERS-CoV se categoriza en el mismo grupo que el CoV-HKU4 de murciélago y el CoV-HKU5 de murciélago.
Bat CoV-HKU4 and MERS-CoV utilize the same host receptor, dipeptidyl peptidase 4 (DPP4), for virus entry.
El CoV-HKU4 de murciélago y el MERS-CoV utilizan el mismo receptor del huésped, la dipeptidil peptidasa 4 (DPP4), para la entrada del virus.
RNA-dependent RNA polymerase sequences of MERS-CoV are phylogenetically closer to counterparts in bat beta-CoVs identified from Europe and Africa.
Las secuencias de ARN polimerasa dependiente de ARN del MERS-CoV filogenéticamente se acercan más a sus contrapartes de betacoronavirus de murciélagos identificados en Europa y África.
Up to now, no live MERS-CoV can be found in wild bats.
Hasta ahora, no puede encontrarse un MERS-CoV vivo en murciélagos salvajes.
MERS-CoV and its closest relative bat CoV-HKU25 share only 87% nucleotide sequence homology.
El MERS-CoV y su pariente más cercano, el CoV-HKU25 de murciélago, comparten una homología de secuencia de nucleótidos de solo el 87 %.
Thus, bats might not be the immediate reservoir host of MERS-CoV.
Por ende, el murciélago podría no ser el huésped de reservorio inmediato del MERS-CoV.
On the other hand, studies in Middle East have shown that dromedary camels are seropositive for MERS-CoV-specific neutralizing antibodies, same as camels of Middle East origin in multiple African countries.
Por otro lado, estudios en Medio Oriente han demostrado que los dromedarios son seropositivos en anticuerpos neutralizadores del MERS-CoV específicamente, al igual que los camellos originarios de Medio Oriente en varios países africanos.
Live MERS-CoV identical to the virus found in humans was isolated from the nasal swabs of dromedary camels, further indicating that camels serve as the bona fide reservoir host of MERS-CoV.
Un MERS-CoV vivo idéntico al virus encontrado en humanos se aisló del exudado nasal de dromedarios, lo que respalda aún más que los camellos actúan como huéspedes de reservorio bona fide del MERS-CoV.
It is also noteworthy that generally mild symptoms but massive virus shedding were observed in camels experimentally infected with MERS-CoV.
Asimismo, cabe destacar que, en general, se observaron síntomas leves, pero una propagación masiva del virus en camellos infectados para investigaciones con MERS-CoV.
Notably, infected camels shed viruses not only through respiratory route but also through fecal-oral route, which is also the main route for virus shedding from bats.
Notablemente, los camellos infectados propagan los virus no solo por vía respiratoria, sino también por vía fecal-oral, que es además la principal vía de propagación de virus de los murciélagos.
However, questions still remain since many confirmed cases of MERS have no contact history with camels prior to symptom onset, plausibly ascribed to human-to-human transmission or unknown transmission routes involving unrecognized animal species that harbour MERS-CoV.
Sin embargo, sigue habiendo preguntas, ya que muchos casos confirmados de MERS no tienen antecedentes de contacto con camellos antes de la aparición de los síntomas, lo que se atribuye razonablemente a la transmisión entre humanos o a vías de transmisión desconocidas que involucran a especies animales no reconocidas que albergan el MERS-CoV.
SARS-CoV-2 shares 96.2% nucleotide homology with a bat CoV RaTG13 isolated from Rhinolophus affinis bats.
El SARS-CoV-2 comparte una homología de nucleótidos del 96,2 % con un coronavirus de murciélagos, RaTG13, aislado de murciélagos Rhinolophus affinis.
As in the cases of SARS-CoV and MERS-CoV, the sequence divergence between SARS-CoV-2 and RaTG13 is too great to assign parental relationship.
Como en los casos del SARS-CoV y el MERS-CoV, la divergencia de secuencia entre el SARS-CoV-2 y el RaTG13 es demasiado grande para asignar una relación parental.
That is to say, bats might not be the immediate reservoir host(s) of SARS-CoV-2 unless almost identical bat CoVs are found in future.
Es decir, los murciélagos podrían no ser los huéspedes de reservorio inmediatos del SARS-CoV-2 a menos que se encuentren en el futuro coronavirus de murciélagos prácticamente idénticos.
Presumably, the intermediate animal hosts of SARS-CoV-2 should be among the wildlife species sold and killed at the Huanan Seafood Wholesale Market, with which many of the initial cases of COVID-19 were associated, indicative of a probable animal-to-human transmission event.
Presumiblemente, los huéspedes animales intermedios del SARS-CoV-2 deberían estar entre las especies silvestres que se venden y se matan en el mercado mayorista de mariscos de Huanan, con el cual se asociaron muchos de los casos iniciales de COVID-19, lo que indica un probable evento de transmisión de animal a humano.
Several recent studies based on metagenomic sequencing have suggested that a group of endangered small mammals known as pangolins (Manis javanica) could also harbour ancestral beta-CoVs related to SARS-CoV-2.
Varios estudios recientes basados en la secuenciación metagenómica han sugerido que un grupo de pequeños mamíferos en peligro, conocidos como pangolines (Manis javanica), también podrían albergar betacoronavirus ancestrales relacionados con el SARS-CoV-2.
These novel pangolin CoV genomes share 85-92% nucleotide sequence homology with SARS-CoV-2.
Los genomas de este nuevo coronavirus de pangolines comparten una homología de secuencia de nucleótidos del 85-92 % con el SARS-CoV-2.
However, they are equally closely related to RaTG13 with about 90% identity at the level of nucleotide sequence.
Sin embargo, están igual de estrechamente relacionados con el RaTG13, con una identidad de alrededor del 90 % a nivel de la secuencia de nucleótidos.
They cluster into two sub-lineages of SARS-CoV-2-like viruses in the phylogenetic tree, one of which share a more similar receptor binding domain (RBD) with SARS-CoV-2, with 97.4% amino acid sequence identity.
Se agrupan en dos sublinajes de virus similares al SARS-CoV-2 en el árbol filogenético, uno de los cuales comparte un dominio de unión al receptor (RBD) más parecido con el SARS-CoV-2, con una identidad de secuencia de aminoácidos del 97,4 %.
In stark contrast, the RBDs of SARS-CoV-2 and RaTG13 are more divergent, albeit a higher degree of sequence homology genome-wide.
En marcado contraste, los RBD del SARS-CoV-2 y el RaTG13 son más divergentes, a pesar de un mayor grado de homología de secuencia en todo el genoma.
An earlier study on diseased pangolins also reported the detection of viral contigs from lung samples, which turn out to be similarly related to SARS-CoV-2.
Un estudio anterior en pangolines enfermos también informó la detección de cóntigos virales en muestras de pulmón, que resultan estar igualmente relacionadas al SARS-CoV-2.
This study adopted different assembly methods and manual curation to generate a partial genome sequence comprising about 86.3% of the full-length viral genome.
Este estudio adoptó distintos métodos de ensamblaje y curación manual para generar una secuencia de genoma parcial que comprendía alrededor del 86,3 % del genoma viral de longitud completa.
We cannot exclude the possibility that pangolin is one of the intermediate animal hosts of SARS-CoV-2.
No podemos descartar la posibilidad de que el pangolín sea uno de los huéspedes animales intermedios del SARS-CoV-2.
However, currently there is no evidence in support of a direct pangolin origin of SARS-CoV-2 due to the sequence divergence between SARS-CoV-2 and pangolin SARS-CoV-2-related beta-CoVs.
Sin embargo, actualmente no hay evidencia que respalde un origen directo en el pangolín del SARS-CoV-2 debido a la divergencia de secuencia entre el SARS-CoV-2 y los betacoronavirus de pangolines relacionados con el SARS-CoV-2.
In addition, the distance between SARS-CoV-2 and RaTG13 is even shorter than that between SARS-CoV-2 and pangolin SARS-CoV-2-related beta-CoVs.
Además, la distancia entre el SARS-CoV-2 y el RaTG13 es incluso menor que la que hay entre el SARS-CoV-2 y los betacoronavirus de pangolines relacionados con el SARS-CoV-2.
The evolutionary pathway of SARS-CoV-2 in bats, pangolins and other mammals remains to be established.
La vía evolutiva del SARS-CoV-2 en murciélagos, pangolines y otros mamíferos aún debe establecerse.
Whereas the highest sequence homology has been found in the RBDs between SARS-CoV-2 and pangolin, SARS-CoV-2-related beta-CoVs, SARS-CoV-2 and RaTG13 share the highest genome-wide sequence homology.
Aunque la homología de secuencia más alta se encontró en los RBD entre el SARS-CoV-2 y el pangolín, los betacoronavirus relacionados con el SARS-CoV-2, el SARS-CoV-2 y el RaTG13 comparten la homología de secuencia de genoma completo más alta.
It is highly speculative that the high degree of similarity between the RBDs of pangolin SARS-CoV-2-related beta-CoVs and SARS-CoV-2 is driven by selectivity-mediated convergent evolution.
Es sumamente especulativo que el alto grado de similitud entre los RBD de los betacoronavirus de pangolines relacionados con el SARS-CoV-2 y el SARS-CoV-2 se deba a la evolución convergente mediada por la selectividad.
A counter-proposal is in favour of a recombination between a pangolin SARS-CoV-2-related beta-CoV and RaTG13 in the third wild animal species.
Una contrapropuesta defiende una recombinación entre los betacoronavirus de pangolines relacionados con el SARS-CoV-2 y el RaTG13 en la tercera especie de animal silvestre.
As a driving force in evolution, recombination is widespread among beta-CoVs.
Como fuerza impulsora en la evolución, la recombinación está extendida entre los betacoronavirus.
The jury is still out on the immediate zoonotic origin of SARS-CoV-2.
Aún no se ha llegado a una conclusión sobre el origen zoonótico inmediato del SARS-CoV-2.
Besides the highly pathogenic HCoVs, the zoonotic origin of HCoV-229E, HCoV-OC43, HCoV-NL63 and HCoV-HKU1 have also been studied.
Además de los coronavirus de humanos altamente patógenos, también se estudió el origen zoonótico del HCoV-229E, el HCoV-OC43, el HCoV-NL63 y el HCoV-HKU1.
Phylogenetic evidence indicated that both HCoV-NL63 and HCoV-229E might have originated from bat CoVs, while the parental viruses of HCoV-OC43 and HCoV-HKU1 have been found in rodents.
La evidencia filogenética indicó que tanto el HCoV-NL63 como el HCoV-229E podrían haberse originado a partir de coronavirus de murciélagos, mientras que los virus parentales del HCoV-OC43 y el HCoV-HKU1 se han encontrado en roedores.
It has been reported that a bat CoV termed ARCoV.2 (Appalachian Ridge CoV) detected in North American tricolored bat displayed close relationship with HCoV-NL63.
Se informó que un coronavirus de murciélagos denominado ARCoV.2 (coronavirus de los montes Apalaches) detectado en un murciélago tricolor de Norteamérica presentaba una relación estrecha con el HCoV-NL63.
On the other hand, HCoV-229E was genetically related to another bat CoV, termed Hipposideros/GhanaKwam/19/2008, which was detected in Ghana, while camelids have also been suspected as its intermediate host.
Por otro lado, el HCoV-229E estaba genéticamente relacionado con otro coronavirus de murciélagos, denominado Hipposideros/GhanaKwam/19/2008, que se detectó en Ghana, aunque también se ha sospechado de los camélidos como huéspedes intermedios.
For clarity, the current knowledge on animal origins of known HCoVs is summarized in Figure ​1 and Table 2.
Para mayor claridad, el conocimiento que se tiene hasta el momento de los orígenes animales de los coronavirus de humanos conocidos se resume en la figura ​1 y la tabla 2.
Phylogenetic analysis has provided evidence for interspecies transmission events of HCoVs in the history.
El análisis filogenético ha brindado evidencia de eventos de transmisión de coronavirus de humanos entre especies en la historia.
When HCoV-OC43 crossed species to infect humans from domestic livestock around 1890, a pandemic of respiratory infection was recorded.
Cuando el HCoV-OC43 cruzó entre especies hasta infectar a los humanos desde animales de ganadería en 1890, se registró una pandemia de infección respiratoria.
The interspecies transmission history of HCoV-229E is less clear.
Los antecedentes de transmisión entre especies del HCoV-229E no se conocen con tanta precisión.
Bat alpha-CoVs closely related to HCoV-229E have been found.
Se han encontrado alfacoronavirus de murciélagos estrechamente relacionados con el HCoV-229E.
Between them there is an alpaca alpha-CoV.
Entre ellos se encuentra un alfacoronavirus de alpacas.
Several lines of evidence support the transmission of virus from bats to humans directly.
Varias líneas de evidencia respaldan la transmisión del virus de murciélagos a humanos directamente.
First, humans but not alpacas might have contact with bats in a shared ecological niche.
En primer lugar, a diferencia de las alpacas, los humanos podrían tener contacto con los murciélagos en un nicho ecológico compartido.
Instead, humans have close contact with alpacas.
En cambio, los humanos tienen contacto estrecho con las alpacas.
Second, HCoV-229E-related bat alpha-CoVs are diverse and non-pathogenic in bats, whereas alpaca alpha-CoV caused an outbreak of respiratory disease in infected animals.
En segundo lugar, los alfacoronavirus de murciélagos relacionados con el HCoV-229E son diversos y no patógenos en los murciélagos, mientras que los alfacoronavirus de alpacas causaron un brote de enfermedad respiratoria en los animales infectados.
Finally, alpaca alpha-CoV has not been found in feral animals.
Por último, no se ha encontrado el alfacoronavirus de alpacas en animales silvestres.
Thus, the possibility cannot be excluded that alpacas obtain the HCoV-229E-related alpha-CoV from humans.
Por lo tanto, no se puede descartar la posibilidad de que las alpacas adquieran el alfacoronavirus relacionado con el HCoV-229E de los humanos.
In fact, bats are the direct source of human pathogenic viruses including rabies virus, Ebola virus, Nipah virus and Hendra virus.
De hecho, los murciélagos son la fuente directa de virus patógenos en los humanos, como el virus de la rabia, el virus del Ébola, el virus Nipah y el virus Hendra.
It is therefore not too surprising that bats might transmit HCoV-229E to humans directly.
Por ende, no sería demasiado sorprendente que los murciélagos transmitieran el HCoV-229E a los humanos directamente.
Alternatively, whereas bat alpha-CoVs serve as the gene pool of HCoV-229E, alpacas and dromedary camels might serve as intermediate hosts that transmit viruses to humans, exactly as in the case of MERS-CoV.
Alternativamente, mientras los alfacoronavirus de murciélagos actúan como acervo genético del HCoV-229E, las alpacas y los dromedarios podrían actuar como huéspedes intermedios que transmiten los virus a los humanos, en concreto en el caso del MERS-CoV.
MERS-CoV serves as an excellent example of interspecies transmission from bats to dromedary camels and from dromedary camels to humans.
El MERS-CoV sirve de excelente ejemplo de transmisión entre especies, de los murciélagos a los dromedarios, y de los dromedarios a los humanos.
The evolutionary origin of MERS-CoV from bats is known at its initial identification and has also been strengthened by subsequent findings.
El origen evolutivo del MERS-CoV en los murciélagos, se descubre con su identificación inicial, y también ha sido respaldado por hallazgos posteriores.
It is obvious that bats provide a rich pool of virus species for interspecies exchange of genetic fragments and interspecies transmission.
Resulta evidente que los murciélagos contribuyen, con un profuso acervo de especies de virus, al intercambio de fragmentos genéticos entre especies y a la transmisión entre especies.
Longevity, densely packed colonies, close social interaction and strong ability to fly are all favourable conditions for bats to be an ideal 'virus spreader'.
La longevidad, las colonias densamente pobladas, la interacción social estrecha y la gran capacidad para volar, son todas condiciones favorables que convierten a los murciélagos en el "propagador de virus" ideal.
On the other hand, MERS-CoV has been introduced to dromedary camels for decades.
Por otro lado, el MERS-CoV se ha introducido en los dromedarios por décadas.
It is well adapted to these camels that have turned from an intermediate host to a stable and natural reservoir host.
Está bien adaptado a estos camellos, que han pasado de ser un huésped intermedio, a ser un huésped de reservorio estable y natural.
MERS-CoV causes very mild disease and maintains a relatively low mutation rate in these animals.
El MERS-CoV causa enfermedad muy leve y mantiene una tasa de mutación relativamente baja en estos animales.
Its sporadic transmission to humans is an accident and humans remain a dead-end host of MERS-CoV as its transmission cannot be sustained.
Su transmisión esporádica a los humanos es un accidente y los humanos siguen siendo un huésped terminal del MERS-CoV, ya que la transmisión es insostenible.
In contrast to the role of camels in the transmission of MERS-CoV, the role of pangolins, if there is any, in the transmission of SARS-CoV-2 is different.
En comparación con el rol de los camellos en la transmisión del MERS-CoV, el rol de los pangolines, si lo hubiera, en la transmisión del SARS-CoV-2 es diferente.
Particularly, pangolin beta-CoVs are highly pathogenic in pangolins.
En particular, los betacoronavirus de pangolines son altamente patógenos en los pangolines.
They might be a dead-end host for SARS-CoV-2-related beta-CoVs, similar to civets in the case of SARS-CoV.
Es posible que sean un huésped terminal de los betacoronavirus relacionados con el SARS-CoV-2, como lo son las civetas en el caso del SARS-CoV.
Several possibilities for interspecies transmission of SARS-CoV-2 from animals to humans have to be ruled in or ruled out in future studies.
Varias posibilidades de transmisión entre especies del SARS-CoV-2 de animales a humanos, deben confirmarse o descartarse en estudios futuros.
First, bats could be the reservoir host of a SARS-CoV-2-related virus almost identical to SARS-CoV-2.
En primer lugar, los murciélagos podrían ser el huésped de reservorio de un virus relacionado con el SARS-CoV-2, casi idéntico al SARS-CoV-2.
Humans might share the ecological niche with bats through butchering or coal mining.
Los humanos podrían compartir el nicho ecológico con los murciélagos, a través de la matanza o la minería de carbón.
Second, pangolins could be one of intermediate amplifying host to which a SARS-CoV-2-related virus had been newly introduced.
En segundo lugar, los pangolines podrían ser uno de los huéspedes amplificadores intermedios en los que un virus relacionado con el SARS-CoV-2 se había introducido recientemente.
Humans contract the virus through butchering and consumption of game meat.
Los humanos contraen el virus a través de la matanza y el consumo de carne de caza.
It is possible that many mammals including domestic animals are susceptible to SARS-CoV-2.
Es posible que muchos mamíferos, incluidos los animales domésticos, sean susceptibles al SARS-CoV-2.
A survey of domestic and wild animals for antibodies is warranted.
Es necesario un estudio de anticuerpos en animales domésticos y silvestres.
Third, as mentioned above, recombination and adaptation of SARS-CoV-2 might have occurred in a third species that has contact with both bats and pangolins.
En tercer lugar, como se mencionó antes, la recombinación y adaptación del SARS-CoV-2 podría haber ocurrido en una tercera especie que tenga contacto tanto con los murciélagos como con los pangolines.
The search for the animal origins of SARS-CoV-2 is still on.
La búsqueda de los orígenes animales del SARS-CoV-2 continúa.
Apart from different types of the animal hosts, three major factors on the viral side are also important in facilitating CoVs to cross species barriers.
Aparte de los distintos tipos de huéspedes animales, tres factores principales en términos virales también cumplen una función importante en facilitar que los coronavirus crucen las barreras de las especies.
First of all, their relatively high mutation rates in RNA replication.
En primer lugar, sus tasas de mutación relativamente altas en la replicación del ARN.
In comparison to other single-stranded RNA viruses, the estimated mutation rates of CoVs could be regarded as “moderate” to “high” with an average substitution rate being ~10-4 substitution per year per site 2, depending on the phase of CoV adaptation to novel hosts.
En comparación con otros virus de ARN monocatenario, las tasas de mutación estimadas de los coronavirus podrían considerarse “moderadas” a “altas”, con una tasa de sustitución promedio de ~10-4 sustituciones por año, por sitio 2, según la fase de adaptación del coronavirus a huéspedes nuevos.
CoVs have a proof-reading exoribonuclease, deletion of which results in exceedingly high mutability and attenuation or even inviability.
Los coronavirus tienen una exorribonucleasa de comprobación de lectura, cuya eliminación da lugar a una mutabilidad extremadamente alta y a la atenuación o, incluso, la inviabilidad.
Interestingly, the nucleotide analogue Remdesivir is known to suppress CoV replication through inhibition of this exoribonuclease and the RNA-dependent RNA polymerase.
Curiosamente, se sabe que el análogo nucleotídico remdesivir suprime la replicación del coronavirus mediante la inhibición de esta exorribonucleasa y de la polimerasa ARN dependiente de ARN.
Remdesivir is one of most promising anti-SARS-CoV-2 agents to be tested in clinical trials.
El remdesivir es uno de los agentes anti-SARS-CoV-2 más prometedores que se hayan probado en ensayos clínicos.
Nevertheless, mutation rates of CoVs are about a million times higher than those of their hosts.
No obstante, las tasas de mutación de los coronavirus son cerca de un millón de veces más altas que las de sus huéspedes.
In addition, mutation rate is often high when CoVs are not well adapted to the host.
Además, la tasa de mutación suele ser alta cuando los coronavirus no están bien adaptados al huésped.
Compared to SARS-CoV with a high mutation rate, the mutation rate of SARS-CoV-2 is apparently lower, suggestive of a higher level of adaptation to humans.
En comparación con el SARS-CoV, que tiene una tasa de mutación alta, la tasa de mutación del SARS-CoV-2 aparentemente es menor, lo que sugiere un nivel más elevado de adaptación a los humanos.
Presumably, it has already been adapted to another host close to humans.
Es de esperar que ya se haya adaptado a otro huésped cercano a los humanos.
In addition to SARS-CoV-2, this also applies to MERS-CoV, which is well adapted to dromedary camels.
Además del SARS-CoV-2, esto también se aplica al MERS-CoV, que está bien adaptado a los dromedarios.
Theoretically, it is unlikely that genetic drift would render vaccines and antivirals against SARS-CoV-2 ineffective quickly.
En teoría, es improbable que la deriva genética haga que las vacunas y los antivirales contra el SARS-CoV-2 pierdan su eficacia rápidamente.
Second, the large RNA genome in CoVs exerts extra plasticity in genome modification for mutations and recombination, thereby increasing the probability for interspecies co-evolution, which is advantageous for the emergence of novel CoVs when the conditions become appropriate.
En segundo lugar, el genoma de ARN largo de los coronavirus ejerce plasticidad adicional en la modificación del genoma para las mutaciones y la recombinación y, de esta manera, aumenta la probabilidad de la coevolución entre especies, lo cual propicia la aparición de nuevos coronavirus cuando se dan las condiciones adecuadas.
This is supported by the copious unique open reading frames and protein functions encoded towards the 3′ end of the genome.
Esto está respaldado por los marcos de lectura abiertos únicos copiosos y las funciones de las proteínas codificadas hacia la dirección 3' del genoma.
Third, CoVs randomly and frequently switch templates during RNA replication through a unique “copy-choice” mechanism.
En tercer lugar, los coronavirus cambian aleatoriamente y con frecuencia de plantillas durante la replicación del ARN mediante un mecanismo único de “copy-choice”.
In a host that serves as the mixing vessel, strand switching occurs frequently during CoV RNA transcription.
En un huésped que actúa como vehículo de mezcla, el cambio de cadena se produce con frecuencia durante la transcripción de ARN del coronavirus.
Highly homologous full-length and subgenomic RNAs could recombine to generate new CoVs.
ARN de longitud completa y subgenómicos altamente homólogos podrían recombinarse para generar nuevos coronavirus.
Phylogenetic evidence of natural recombination has been found in both HCoV-HKU1 and HCoV-OC43, as well as animal CoVs such as bat SL-CoV and batCoV-HKU9.
Se ha encontrado evidencia filogenética de recombinación natural en el HCoV-HKU1 y el HCoV-OC43, así como en coronavirus de animales, como el SL-CoV de murciélago y el CoV-HKU9 de murciélago.
Virus-host interaction in relation to transmission
Interacción virus-huésped en relación con la transmisión
Besides three viral factors stated above, viral interaction with host receptor is another key factor influential on interspecies transmission.
Además de los tres factores virales antes mencionados, la interacción viral con el receptor del huésped es otro factor clave que influye en la transmisión entre especies.
Herein, recombination of SARS-CoV is taken as a typical example, which also showed evidence of positive selection during interspecies transmission events.
En el presente, la recombinación del SARS-CoV se toma como un ejemplo típico, que también mostró evidencia de selección positiva en eventos de transmisión entre especies.
Based on the comparative analysis between isolates of human and civet SARS-CoVs, SARS-CoV is thought to undergo rapid adaptation in different hosts, particularly with mutations at the RBD of the S protein.
Sobre la base del análisis comparativo entre cepas aisladas de SARS-CoV de humanos y civetas, se cree que el SARS-CoV experimenta una rápida adaptación en diferentes huéspedes, en particular con mutaciones en el RBD de la proteína S.
Generally, the RBD in the S protein of a CoV interacts with the cellular receptor and is intensely selected by the host antibody response.
En general, el RBD de la proteína S de un coronavirus interactúa con el receptor celular y es seleccionado intensamente por la respuesta de anticuerpos del huésped.
In SARS-CoV, the RBD is in the 318th to 510th amino acids on the S1 fragment, which binds to the human ACE2 as well as its coreceptors for viral entry.
En el SARS-CoV, el RBD se encuentra en los aminoácidos 318 a 510 en el fragmento S1, que se une a la ACE2 humana y a sus correceptores para la entrada viral.
The RBD of SARS-CoV is capable of recognizing the ACE2 receptors of various animals, including bat, civet, mouse and raccoon dog, allowing interspecies transmission of the virus.
El RBD del SARS-CoV es capaz de reconocer los receptores de ACE2 de varios animales, incluidos el murciélago, la civeta, el ratón y el perro mapache, lo que permite la transmisión entre especies del virus.
In fact, only 6 amino acid residues were observed to be different from human and civet viral isolates in the RBD and 4 of them locate in the receptor-binding motif for interaction with the ACE2 receptor.
De hecho, según se observó, solo 6 residuos de aminoácidos eran diferentes de las cepas aisladas de virus de humanos y civetas en el RBD y 4 de ellos se hallan en el motivo de unión al receptor para la interacción con el receptor de ACE2.
Civet SARS-CoV has K479N and S487T mutations in its RBD, which might increase the affinity of the interaction of spike protein with human ACE2 receptor.
El SARS-CoV de civetas tiene mutaciones K479N y S487T en su RBD, lo que podría aumentar la afinidad de la interacción de la proteína de espiga con el receptor de ACE2.
In other words, these two amino acid substitutions might be critical to viral adaption to humans.
En otras palabras, estas dos sustituciones de aminoácidos podrían ser fundamentales para la adaptación del virus a los humanos.
It is noteworthy that SARS-CoV-2 shares the same cellular receptor with SARS-CoV.
Cabe destacar que el SARS-CoV-2 comparte el mismo receptor celular con el SARS-CoV.
A 30% difference between SARS-CoV-2 and SARS-CoV in the S1 unit of the S protein implicates that the binding affinity of its S protein with human ACE2 might have altered.
Una diferencia del 30 % entre el SARS-CoV-2 y el SARS-CoV en la unidad S1 de la proteína S implica que la afinidad de unión de la proteína S con la ACE2 humana podría haberse alterado.
Indeed, a cryo-EM study indicates a 10- to 20-fold higher affinity of this binding than that between human ACE2 and SARS-CoV S protein.
De hecho, un estudio de criomicroscopía electrónica señala la afinidad 10 a 20 veces mayor de esta unión en comparación con la de la ACE2 humana y la proteína S del SARS-CoV.
It will also be of interest to determine whether any other coreceptor might be required for SARS-CoV-2 transmission.
También será de interés determinar si algún otro correceptor podría ser necesario para la transmisión del SARS-CoV-2.
Intriguingly, HCoV-NL63 also binds to ACE2 but with a different part of S.
Sorprendentemente, el HCoV-NL63 también se une a la ACE2, pero con una parte diferente de la S.
There exist many other HCoV receptors, such as aminopeptidase N for HCoV-229E, and 9-O-acetylated sialic acid for HCoV-OC43.
Existen muchos otros receptores de coronavirus de humanos, como la aminopeptidasa N en el HCoV-229E y el ácido siálico 9-O-acetilado en el HCoV-OC43.
They might also account for successful adaptation of these CoVs in humans after interspecies transmission from their animal hosts.
Es posible que también sean responsables de la adaptación exitosa de estos coronavirus en los humanos, luego de la transmisión entre especies desde sus huéspedes animales.
In addition to cellular receptors, the outcome of interspecies transmission of HCoVs is also governed by other host dependency and restriction factors.
Además de los receptores celulares, el resultado de la transmisión entre especies de los coronavirus de humanos también está determinado por otros factores de dependencia y restricción del huésped.
The divergence of these host proteins between humans and natural reservoir hosts of HCoVs such as bats, dromedary camels and rodents might constitute a barrier to interspecies transmission.
La divergencia de estas proteínas de huésped entre los humanos y los huéspedes de reservorio naturales de los coronavirus de humanos, como los murciélagos, los dromedarios y los roedores, podría constituir un obstáculo para la transmisión entre especies.
HCoVs have to usurp host dependency factors and subvert host restriction factors for a successful interspecies transmission.
Los coronavirus de humanos deben usurpar los factores de dependencia del huésped y subvertir los factores de restricción del huésped para que la transmisión entre especies sea exitosa.
In this regard, molecular determinants in this important area of virus-host interaction remain to be identified and characterized.
A este respecto, los determinantes moleculares en esta importante área de interacción virus-huésped aún deben identificarse y caracterizarse.
An unbiased genome-wide screening of host dependency and restriction factors for SARS-CoV-2 using the state-of-the-art technology of CRISPR might be fruitful.
Podría resultar provechosa una investigación objetiva de genoma completo de los factores de dependencia y restricción del huésped para el SARS-CoV-2 utilizando la tecnología CRISPR de avanzada.
Emergence of novel HCoVs: back to ground zero
Aparición de nuevos coronavirus de humanos: partamos desde cero