Judul: Deteksi Gen Penyandi Gaharu δ-Guaiene pada Tanaman Aquilaria malaccensis Lamk dan Gyrinops versteegii Domke
Abstrak: Produktivitas gaharu sebagai salah satu hasil hutan bukan kayu (HHBK) yang memiliki prospek tinggi untuk dikembangkan di Indonesia semakin menurun. Untuk itu diperlukan bibit gaharu unggul yang dipastikan dapat menghasilkan gaharu dengan kualitas tinggi. Salah satu komponen dominan yang menyebabkan bau khas pada gaharu adalah guaiene. Tujuan penelitian ini adalah mendeteksi gen guaiene dengan beberapa primer spesifik serta optimasi tahapan PCR untuk ekspresi gen guaiene pada dua jenis tanaman yaitu A. malaccensis dan G. versteegii. Metode deteksi gen guaiene meliputi, isolasi DNA dan RNA, perancangan primer spesifik gen guaine, sitensis cDNA, serta PCR dengan primer spesifik tersebut dilanjutkan dengan sekuensing produk PCR. Sekuen gen spesifik guaiene berhasil dideteksi pada DNA dengan ukuran 135 bp pada G. versteegii dan 133 bp pada A. malaccensis yang memiliki kesamaan tertinggi dengan Aquilaria sinensis. Sekuen gen spesifik guaiene berhasil dideteksi pada cDNA dengan ukuran 133bp yang memiliki kesamaan tertinggi dengan A. crassna. Primer yang dapat mendeteksi gen guaiene adalah Am3-δG dengan suhu annealing optimum 56.5 dan 57˚C.
Keyword: Aquilaria malaccensis, δ -guaiene, Gyrinops versteegii, primer

Judul: Identifikasi Gen Penyandi Enzim 3-hydroxy-3- methylglutaryl coenzyme A reductase (HMGR) pada Tanaman Penghasil Gaharu Aquilaria malaccensis Lamk dan Gyrinops versteegii Domke
Abstrak: Penanda molekuler serta identifikasi dan isolasi gen penyandi gaharu perlu dilakukan untuk seleksi bibit gaharu. Salah satu gen yang terlibat dalam proses pembetukan gaharu yaitu gen penyandi enzim 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase (HMGR). Tujuan penelitian ini yaitu mengidentifikasi gen HMGR dan Actin pada tanaman penghasil gaharu Aquilaria malaccensis Lamk dan Gyrinops versteegii Domke. Penelitian ini dilakukan dengan cara mengisolasi DNA genom dan total RNA, sintesis cDNA, PCR dengan primer spesifik gen HMGR_1 dan QAct_1, dan sekuensing produk PCR. Amplikon diperoleh dengan A. malaccensis DNA template pada suhu annealing 54.8 oC untuk gen HMGR dan 57 oC untuk gen Aktin. PCR dengan G. versteegii DNA template teramplifikasi pada suhu annealing 54.8 oC untuk gen HMGR dan 55.8 oC untuk gen Aktin. Template cDNA pada A. malaccesnis dan G. versteegii teramplifikasi pada suhu annealing 56 oC untuk gen HMGR dan Aktin. Sekuens gen penyandi HMGR baik pada DNA genom dan cDNA dari kedua jenis tanaman sama dengan A. sinensis. Sedangkan sekuens gen Actin baik pada DNA genom dan cDNA dari kedua jenis tanaman sama dengan A. microcarpa pada gene bank.
Keyword: Aktin, Aquilaria malaccensis, Gyrinops versteegii, HMGR

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: