Judul: Analisis pengelolaan dan pengembangan wilayah pesisir Kabupaten Pati di era Otonomi Daerah
Abstrak: Indonesia sebagai salah satu negara kepulauan, mempunyai wilayah pesisir dengan potensi sumber daya alam yang sangat besar. Kabupaten Pati merupakan salah satu kabupaten yang mempunyai potensi sumber daya pesisir cukup banyak khususnya pada perikanan tangkap dan budidaya. Potensi pada perikanan tangkap yaitu memiliki wilayah laut dengan garis pantai sepanjang 60 km dan sumber daya jenis ikan maksimum lestari seperti ikan pantai sebanyak 5.275,00 ton per tahun, udang 264,875 ton per tahun, dan rajungan 1.311,33 ton per tahun (PKSPL-IPB, 2001), sedangkan potensi perikanan budidaya mempunyai luas lahan tambak 10.573 ha (BPS Kabupaten Pati, 2005). Paradigma baru pembangunan daerah dengan diberlakukannya otonomi daerah diyakini dapat membawa angin baru untuk kemajuan pembangunan daerah. Adanya otonomi daerah menuntut pemerintah daerah Kabupaten Pati untuk mengeluarkan sebuah peraturan yang mengatur tentang pengelolaan wilayah pesisir dan laut yang tertuang dalam Peraturan Daerah (Perda) Nomor 4 Tahun 2003. Perda ini membuktikan komitmen Pemda akan pentingnya pengelolaan sumber daya pesisir. Namun, selama tujuh tahun otonomi daerah berlangsung dan empat tahun Perda diberlakukan, belum memberikan hasil yang memuaskan bahkan menyisakan permasalahan di berbagai aspek. Hal ini dapat dilihat melalui kondisi aktual Kabupaten Pati bila ditinjau dari aspek lingkungan, ekonomi, dan sosial. Ditinjau dari aspek lingkungan, terjadi degradasi lingkungan yang ditunjukkan oleh rusaknya ekosistem hutan mangrove sebanyak 90 persen, luasan tingkat kerusakan ekosistem mangrove baik 7,88 ha, sedang 6,70 ha, dan rusak berut 45,20 ha (Dinkautkan Kab. Pati, 2005), dan laju abrasi serta akresi sebesar 3,00 ha dan 42,50 ha (Dinhutbun Kab. Pati, 2001). Ditinjau dari aspek sosial ekonomi yaitu dengan memperhatikan persentase kontribusi sub sektor perikanan terhadap PDRB belum memberikan kontribusi yang penting. Bahkan pada periode tahun 2000-2005, kontribusinya mengalami penurunan dan tingkat produksi ikan di berbagai TPI atau PPI masih fluktuatif. Selain itu, hasil studi dari Bappeda Kabupaten Pati (2005), menunjukkan pengelolaan wilayah pesisir menyimpan potensi konflik kepentingan. Dilihat dari berbagai aspek, pengelolaan wilayah pesisir di Kabupaten Pati belum dapat dikatakan bertusil, Penelitian ini bertujuan untuk (1) mengidentifikasi penyebab belum optimalnya kebijakan pengelolaan wilayah pesisir di Kabupaten Pati melalui analisis kontekstual beberapa produk kebijakan, faktor penyebab kebijakan pengelolaan wilayah pesisir yang belum optimal, dan hubungan antara proses pembuatan terhadap pelaksanaan kebijakan (2) Menganalisis dan mendeskripsikan prioritas pembangunan dan pengelolaan wilayah pesisir melalui pendapat stakeholders. (3) Menganalisis keragaan relatif tingkat perkembangan wilayah pesisir, dan (4) memberikan arahan kebijakan pengelolaan dan pengembangan wilayah pesisir Kabupaten Pati dalam mewujudkan pengelolaan wilayah pesisir terpadu di era otonomi daerah. Pengambilan responden dilakukan teknik clusters sampling dengan jumlah sampel untuk uji PHA sebanyak 30 responden, sedangkan untuk persepsi masyarakat sebanyak 42 responden. Penelitian ini dilaksanakan di wilayah pesisir Kabupaten Pati yang dipilih secara sengaja pada bulan Februari sampai Juni 2007. Data yang digunakan dalam penelitian ini yaitu data primer dan sekunder. Analisis data yang digunakan yaitu kualitatif dan kuantitatif. Analisis kuantitatif yang dilakukan yaitu teknik analisis data pada proses hierarki analitik, skalogram, dan multivariat Kebijakan pengelolaan sumber daya pesisir dan laut yang dilakukan oleh Pemda Kabupaten Pati yang terdapat dalam beberapa produk kebijakan secara keseluruhan berdasarkan analisis kontekstual dilihat dari isinya tidak bertentangan dengan produk kebijakan sebelumnya, namun pada implementasi telah terjadi beberapa penyimpangan dalam pengelolaannya. Contohnya
Keyword: Wilayah pesisir sebagai kawasan strategis, Pengelolaan pesisir secara terpadu

Judul: Pengelolaan Perikanan Rajungan (Portunus Pelagicus Linnaeus, 1758) Dengan Pendekatan Ekosistem (Studi Kasus : Perairan Kabupaten Pati, Provinsi Jawa Tengah)
Abstrak: Rajungan termasuk kelompok kepiting (Portunidae), yang banyak diperdagangkan dan merupakan salah satu komponen perikanan skala kecil bernilai tinggi banyak negara di daerah tropis. Volume produksi rajungan tangkapan yang cenderung meningkat dalam 10 tahun terakhir, harga komoditi yang tinggi, dan pasar yang jelas tersebut mendorong terjadinya peningkatan eksploitasi rajungan dari alam (wild catch) di wilayah perairan Pantai Utara Jawa, termasuk perairan Kabupaten Pati, dengan melakukan kegiatan penangkapan secara terus-menerus tanpa memperhatikan kondisi sumberdaya dan lingkungan. Tingkat pengusahaan rajungan yang demikian dikhawatirkan tidak akan memberikan keberlanjutan baik sumberdaya maupun ekonomi nelayannya. Penelitian ini bertujuan mengkaji status pengelolaan perikanan rajungan dan merumuskan strategi pengelolaan perikanan rajungan dengan pendekatan ekosistem di perairan Kabupaten Pati. Penelitian dilakukan mulai Desember 2014 hingga Februari 2015. Daerah penelitian dibagi menjadi dua zona penangkapan dengan tempat pendaratan di Alasdowo dan Banyutowo (Kecamatan Dukuhseti) serta Keboromo dan Sambiroto (Kecamatan Tayu). Analisis nilai rata-rata, standar deviasi, uji-t, dan analisis komponen utama dilakukan terhadap variabel/indikator dari masing-masing daerah penangkapan rajungan. Performa status pengelolaan perikanan rajungan dinilai dan dianalisis menggunakan indikator pengelolaan perikanan dengan pendekatan ekosistem (EAFM). Status pengelolaan perikanan rajungan di perairan Kabupaten Pati dan sekitarnya termasuk dalam kategori sedang (nilai = 41,03) pada zona 1 dan baik (nilai = 64,72) pada zona 2. Hasil identifikasi konektivitas (densitas) antar indikator EAFM baik dalam satu domain maupun antar domain berkisar antara 13 – 21 atau tergolong kategori tinggi hingga sangat tinggi. Strategi perbaikan pengelolaan diprioritaskan mulai dari strategi pengelolaan konservasi sampai dengan mempertahankan strategi pengelolaan yang sudah ada berdasarkan nilai reference point tiap indikator. Langkah taktis yang dirumuskan dibedakan menjadi : (1) langkah proteksi untuk indikator yang nilainya tergolong kurang atau sedang, dan (2) langkah antisipasi untuk indikator yang nilainya tergolong baik. Langkah proteksi yang dapat menjadi alternatif antara lain mengurangi jumlah trip atau jumlah bubu per trip, penerapan ukuran minimum yang boleh ditangkap, melarang menangkap rajungan kondisi hidup yang sedang bertelur, pengaturan daerah penangkapan terutama pada musim paceklik, dan peningkatan kapasitas SDM dalam pengelolaan SD rajungan berpendekatan ekosistem. Langkah antisipasinya, antara lain mempertahankan penggunaan alat tangkap rajungan yang selektivitas tangkapannya tinggi, menciptakan mata pencaharian alternatif bagi rumah tangga perikanan, meningkatkan komunikasi dan kerjasama antar lembaga, serta peningkatan peran asosiasi/forum rajungan dalam pengelolaan rajungan berpendekatan ekosistem di Kabupaten Pati.
Keyword: rajungan, perairan Pati, EAFM, langkah taktis

Judul: Cloning and Structure Prediction of C-Type Lectin 19 (CTL-19) from Silkworm (Bombyx mori L.)
Abstrak: Bombyx mori L. is a highly significant insect due to its silk production affects several industries. Unfortunately, B. mori farming has recently experienced mortality issues caused by pathogenic infectious diseases. Despite the extensive study of innate immunity of B. mori, information regarding the molecular functions and mode of actions of C-type lectin 19 (CTL-19) in the innate immunity of B. mori remains limited. Therefore, this study aimed to predict the structure of the B. mori CTL-19 also clone and produce the recombinant protein to better understand its role in the silkworm's innate immunity. The open reading frame (ORF) of the CTL-19 gene (945bp) was successfully amplified and cloned to pGEM®-T Easy Vector. The mature protein consists of 294 amino acids with 2 CRDs, 9 conserved cysteine, and two specific carbohydrate binding motifs. Protein threading demonstrated to be superior in order to predict the ligand binding site in comparison to homology modelling. The predicted molecular weight is 33.26 kDa, with pI value of 5.70. Furthermore, molecular docking analysis reveal that BmCTL-19 have ability to bind to various carbohydrate residues. The BmCTL-19 gene will be sub clone into an appropriate expression vector and produce purified recombinant protein to evaluate its properties.
Keyword: Innate immunity, Carbohydrate Binding Motif, Homology modelling, Protein Threading, Molecular docking