Judul: Aktinomiset Filosfer Penghasil Senyawa Bioaktif Sebagai Agens Hayati Pengendali Penyakit Blas Daun Padi
Abstrak: Permasalahan utama produksi padi di Indonesia antara lain penyakit yang menyerang tanaman padi yang mengakibatkan penurunan jumlah produksi baik kualitas maupun kuantitas. Penyakit utama pada tanaman padi salah satunya disebabkan oleh cendawan patogen daun Pyricularia oryzae Cav. penyebab penyakit blas. P. oryzae menyerang tanaman padi mulai dari fase vegetatif sampai stadia pembentukan malai atau fase generatif. Serangan blas yang berat dapat mengakibatkan penurunan produksi hingga mencapai 70%. Semakin tinggi dan meluasnya daerah persebaran penyakit blas pada tanaman padi, mendorong dilakukannya berbagai upaya untuk mengendalikan penyakit tersebut, salah satu diantaranya adalah penggunaan senyawa kimia sintetik yang terkendala dari jumlah biaya produksi, keamanan, dan tidak ramah lingkungan. Penggunaan aktinomiset filosfer sebagai agens hayati pengendali penyakit blas daun pada padi masih belum dilakukan. Oleh karena itu penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan aktinomiset asal filosfer sebagai agens hayati dalam mengendalikan penyakit blas skala rumah kaca. Sampel daun padi yang sehat diperoleh dari wilayah persawahan yang terserang penyakit blas di Situgede, Sukabumi dan Jasinga, Jawa Barat. Sebanyak 75 isolat aktinomiset telah berhasil diisolasi dari filosfer tanaman padi. Diperoleh 38 isolat mampu menghambat pertumbuhan P. oryzae secara in vitro menggunakan metode kultur ganda, dan 27 isolat diantaranya termasuk kelompok aktinomiset non-patogen melalui uji hemolitik, hipersensitivitas dan patogenisitas. Analisa sekuen gen 16S rRNA terhadap 22 isolat terpilih menunjukkan bahwa isolat tersebut termasuk dalam genus Streptomyces (15 isolat), Micromonospora (2 isolat), Lentzea (2 isolat), Saccharothrix (2 isolat), dan Gordonia (1 isolat). Deteksi gen penyandi enzim yang berperan untuk biosintesis senyawa bioaktif nonribosomal peptida sintase (NRPS) dan poliketida sintase (PKS-I) menunjukkan bahwa 21 isolat (95.45%) memiliki gen NRPS dan 14 isolat (63.6%) memiliki PKS-I. Sebelas isolat aktinomiset dengan karakteristik pertumbuhan yang tidak membentuk agregat pada media cair selanjutnya diuji in planta untuk mengendalikan serangan penyakit blas di rumah kaca. Pengujian secara in planta menunjukkan aplikasi aktinomiset filosfer mampu menekan penyakit blas sebesar 77 sampai 88%. Isolat JSN1.9, SKB2.14, dan SKB2.3 merupakan tiga isolat terbaik dalam menekan gejala penyakit blas pada aplikasi di rumah kaca dan ketiga isolat tersebut teridentifikasi sebagai Gordonia terrae, Streptomyces griseus, dan Streptomyces albolongus. Hasil penelitian ini menunjukkan persen penghambatan penyakit blas tertinggi di rumah kaca dibandingkan aplikasi bakteri tanah dan rizosfer. Oleh karena itu, aktinomiset filosfer lebih berpotensi untuk dimanfaatkan sebagai agens hayati pengendali penyakit blas daun padi.
Keyword: Blas, non-patogen, NRPS, PKS-I, Pyricularia oryzae

Judul: Bakteri Filosfer Penghasil Senyawa Bioaktif sebagai Pengendali Penyakit Blas pada Padi.
Abstrak: Beras merupakan makanan pokok bagi hampir 50% penduduk dunia dan 90% penduduk Indonesia. Permintaan beras semakin meningkat seiring meningkatnya jumlah penduduk dunia. Indonesia sebagai produsen beras nomor 3 di dunia mengalami berbagai kendala produksi diantaranya adanya serangan patogen Pyricularia oryzae Cav., penyebab penyakit blas pada padi. P. oryzae telah menyerang tanaman padi hampir di semua wilayah di Indonesia dan beberapa negara lain di dunia. Penyakit blas dapat berkembang dengan cepat dan menyebabkan kehilangan hasil sampai 90% pada kondisi lingkungan yang sesuai. Manajemen pengendalian penyakit blas biasanya dilakukan dengan penyemprotan fungisida kimia yang berbahaya bagi lingkungan, manusia, hewan dan produk pertanian. Eksplorasi dan pengembangan agens biokontrol seperti bakteri filosfer padi perlu dilakukan untuk mengurangi penggunaan fungisida kimia. Bakteri filosfer padi diketahui memiliki kemampuan untuk menghasilkan senyawa bioaktif antifungi yang efektif melawan patogen tanaman seperti padi, jagung, kedelai, dsb. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan untuk mengeksplorasi bakteri filosfer padi dengan aktivitas antifungi terhadap P. oryzae serta menganalisis mekanisme antifungi dari bakteri filosfer potensial. Sampel tanaman padi varietas Ciherang diambil dari tiga daerah endemik penyakit blas di Jawa Barat yaitu Cikembar, Sukabumi, serta Situgede dan Jasinga, Bogor Barat. Daun padi tersebut selanjutnya dijadikan sumber isolat bakteri filosfer untuk penapisan aktivitas antifungi terhadap P. oryzae. Isolat bakteri filosfer potensial dan nonpatogenik selanjutnya diidentifikasi berdasarkan gen 16S rRNA dan dideteksi keberadaan gen nonribosomal peptide syntethases (NRPS) dan polyketide synthases (PKS). Kemampuan bakteri filosfer padi dalam memproduksi senyawa bioaktif dilakukan dengan pengujian aktivitas antifungi dari ekstrak kasar dan deteksi gen penyandi antifungi. Pengujian bakteri filosfer sebagai agens biokontrol penyakit blas juga perlu dilakukan dalam skala rumah kaca. Senyawa antifungi dari isolat terbaik dengan aktivitas antifungi yang konstan secara in vitro dan in planta diidentifikasi menggunakan instrumen Liquid Chromatographic-Mass Spectrometry/Mass Spectrometry (LC-MS/MS). Pengaruh senyawa antifungi terhadap morfologi miselium P. oryzae juga diamati dengan Scanning Electron Microscope (SEM) dan mikroskop cahaya. Sebanyak 7 isolat bakteri dengan aktivitas antifungi terhadap P. oryzae dan nonpatogenik berhasil diisolasi dari lingkungan filosfer padi varietas Ciherang. Tujuh isolat tersebut adalah isolat STGG 3, STGG 7, STGG 8, STGG 14, SKBV 1, SKBG 78 dan STGV 8. Aktivitas antifungi dari 7 isolat tersebut berkisar antara 25.45% sampai 61.5% dimana aktivitas terendah ditunjukkan oleh isolat STGV 8 dan tertinggi oleh isolat STGG 14. Isolat-isolat tersebut teridentifikasi sebagai Bacillus sp. STGG 3, B. subtilis STGG 7, B. amyloliquefaciens STGG 8, B. subtilis subsp. subtilis STGG 14, B. subtilis SKBV 1, Enterobacter cloacae STGV 8 dan Brachybacterium paraconglomeratum SKBG 78. Sementara itu, isolat STGG 3, STGG 7 dan STGG 14 diketahui memiliki domain adenylation (A) dan domain ketide synthase (KS) dari NRPS dan PKS, sedangkan isolat SKBV 1 hanya memiliki domain A dari NRPS. Pengujian rumah kaca membuktikan bahwa 7 isolat bakteri filosfer padi mampu menghambat perkembangan penyakit blas dengan nilai penghambatan relatif yang beragam. Isolat STGG 14 menghasilkan persentase penghambatan tertinggi yaitu 70.83%, sedangkan isolat STGV 8 menghasilkan persentase penghambatan terendah yaitu 48.35%. Hasil pengujian rumah kaca linier dengan aktivitas antifungi secara in vitro. Intensitas penyakit blas tanaman padi dengan perlakuan bakteri filosfer maupun fungisida kimia secara signifikan berbeda nyata dengan kontrol patogen P. oryzae. Sementara itu,
Keyword: Padi, Pyricularia oryzae, Bakteri filosfer, Senyawa bioaktif

Judul: Feature Extraction Based on Color, Shape and Texture for Animal Image Retrieval.
Abstrak: The differences in color, shape, and texture characteristics between each animal cause difficulties in animal image retrieval. Therefore, specified technique is needed to obtain pattern from each animal’s feature so that image retrieval might works properly. One of the techniques to obtain the pattern done by feature extraction. This research tries to develop image extraction method in Content Based Image Retrieval approach by using three image visual features (color, shape, texture). In this research, Fuzzy Color Histogram (FCH) for color feature extraction is used through computing the membership function using Cauchy function. In FCH, one color may belong to two bins histogram or more with different membership functions. Then, shape feature is extracted using edge direction histogram, where each image is processed using Sobel edge detection, and then the direction is mapped into a defined bin histogram. For texture feature extraction, the process uses co-occurrence matrix with computing the values of energy, moment, entropy, maximum probability, contrast, correlation and homogeneity. Similarity value between image query and images in database is computed based on its features, those are color, shape, texture, and its combination. Recall and precision value resulted in this research shows the largest average precision value is obtained from searching process using index combination (color, shape, texture) of feature extraction. Keywords: feature extraction, Fuzzy Color Histogram, edge direction histogram, co-occurrence matrix
Keyword: