Judul: Aktivitas Antibakteri dari Daun Jamblang (Syzygium cumini (L.) Skeels) Asal Pulau Timor terhadap Escherichia coli pBR322
Abstrak: Resistensi bakteri merupakan persoalan serius dalam dunia medis yang hingga saat ini telah menjadi masalah global. Resistensi bakteri dapat terjadi akibat penggunaan antibiotik secara berlebihan serta tidak teratur sehingga menyebabkan pengobatan terhadap penyakit infeksi bakteri menjadi tidak efektif. Pencarian senyawa antibakteri baru sangat diperlukan untuk mengatasi persoalan tersebut. Penelitian ini bertujuan untuk menguji potensi daun jamblang asal Pulau Timor yang merupakan flora asli Indonesia dalam kemampuannya sebagai antibakteri dan identifikasi senyawa aktif yang berperan sebagai antibakteri. Bahan uji pada penelitian ini terdiri atas 4 jenis yaitu ekstrak etanol, fraksi air, fraksi etil asetat dan fraksi n-heksan yang diperoleh dari daun jamblang. Masing-masing bahan uji diuji kemampuannya dalam menghambat pertumbuhan bakteri Escherichia coli pBR322 menggunakan metode difusi cakram. Hasil penelitian menunjukkan bahwa peningkatan konsentrasi masing-masing bahan uji berbeda signifikan terhadap aktivitas antibakteri yang dihasilkan. Bahan uji fraksi etil asetat memiliki aktivitas terbaik dibandingkan ekstrak dan fraksi lainnya dengan diameter zona hambat terbesar yaitu 13.61±0.02 mm pada konsentrasi 1000 ppm. Hasil pengukuran lebih lanjut konsentrasi hambat minimum (KHM) dan konsentrasi bunuh minimum (KBM) fraksi etil asetat dengan aktivitas antibakteri tertinggi memperlihatkan adanya sifat bakteriostatik pada konsentrasi 600 ppm dan bakterisidal pada konsentrasi 800 ppm yang dibuktikan dengan perubahan morfologi pada sel bakteri hasil analisis mikroskop pemindai elektron (SEM). Penelusuran senyawa aktif fraksi etil asetat yang berperan sebagai antibakteri menggunakan kromatografi cair-spektrometri massa tandem (LC-MS/MS) menunjukkan adanya satu senyawa aktif dari golongan alkaloid jenis kuinolin yaitu Etil 2.7.7 – trimetil – 5 – okso – 4 – fenil - 1.4.5.6.7.8 – heksahidro – 3 - kuinolinkarboksilat dengan presentase kemiripan sebesar 99.91%. Senyawa ini diduga berkontribusi kuat dalam aktivitasnya sebagai antibakteri.
Keyword: Antibakteri, Escherichia coli pBR322, Jamblang (Syzygium cumini (L.) Skeels), Resisten

Judul: Aktivitas Antibakteri Ekstrak Zingiber Zerumbet Asal Pulau Timor Dan Simulasi Docking Inhibisi Senyawa-Senyawa Aktif Terhadap Enzim Mura
Abstrak: Zingiber zerumbet merupakan tanaman herbal yang secara tradisional digunakan sebagai obat borok oleh penduduk di Pulau Timor. Tanaman ini tumbuh secara liar. Dari studi literatur diketahui bahwa tanaman ini memiliki aktivitas antimikroba. Secara empiris penggunaan rimpang tanaman oleh masyarakat di Timor dalam mengobati luka borok menjadi menarik untuk dikaji. Kondisi wilayah Pulau Timor yang kering dengan iklim semi arid menimbulkan dugaan adanya aktivitas senyawa metabolit sekunder yang tinggi dalam menyembuhkan luka borok. Luka borok lebih banyak disebabkan oleh kesalahan penangan luka dan juga serangan bakteri. Tujuan dilakukannya penelitian ini adalah untuk menguji aktivitas antibakteri dan mencari nilai KHTM dari ekstrak tanaman, mengetahui senyawa-senyawa aktif yang terkandung pada ekstrak dengan aktivitas antibakteri terbaik, dan mempelajari interaksi senyawa-senyawa tersebut dengan enzim MurA melalui in silico molecular docking. Senyawa-senyawa aktif dari Z. zerumbet diekstraksi menggunakan pelarut n-heksan, etil asetat, etanol, dan air. Selanjutnya diuji aktivitas antibakteri masing-masing ekstrak menggunakan metode difusi sumur terhadap bakteri Eschericia coli, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, dan Bacillus subtilis. Ekstrak dengan aktivitas terbaik digunakan untuk mencari nilai konsentrasi hambat tumbuh minumun (KHTM) terhadap bakteri. Ekstrak tersebut selanjutnya diuji secara kualitatif kandungan metabolit sekundernya menggunakan metode Harborne yang meliputi uji fenolik hidrokuinon, flavonoid, alkaloid, saponin, tanin dan triterpenoid-steroid, serta dianalisis kandungan senyawa-senyawa aktif menggunakan LCMS. Senyawa-senyawa tersebut selanjutnya digunakan sebagai ligan uji dalam mempelajari penghambatan enzim MurA secara simulasi docking. Hasil penelitian menunjukkan bahwa keempat ekstrak memiliki aktivitas antibakteri dan ekstrak etanol memiliki aktivitas antibakteri terbaik. Nilai KHTM untuk S. aureus, B. subtilis, E. coli dan P. aeruginosa berturut-turut adalah sebesar 50, 100, 150, 250 mg mL-1. Hasil uji fitokimia mengindikasikan ekstrak kasar etanol rimpang tanaman mengandung senyawa-senyawa terpenoid, flavonoid, tanin dan fenolik. Hasil analisis LCMS memperlihatkan bahwa ekstrak kasar etanol mengandung senyawa zerumbon dan gingerglikolipid B. Energi afinitas (ΔGbinding) hasil penambatan molekular untuk ligan alami (substrat), ligan obat (fosfomisin), ligan zerumbon, dan ligan gingerglikolipid B, berturut-turut adalah senilai -10.1, -4.7, -8.3, dan -8,4 kkal mol-1. Hasil simulasi docking menunjukkan bahwa terjadi mekanisme reaksi kompetitif antara ligan uji zerumbon dengan substrat uridine-diphosphate-N-asetylglucosamine pada enzim karena ligan uji menempati tempat yang sama dengan substrat sehingga menghambat terbentuknya peptidoglikan penyusun dinding sel bakteri.
Keyword: Gingerglikolipid B, Jahe Liar, Molecular Docking, Peptidoglikan, Zerumbon

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: