Judul: Identification of Shark and Stingray Species in Processed Seafood Products using the Long-read Sequencing Method
Abstrak: Tren konsumsi daging hiu dan pari yang semakin meningkat tiap tahunnya serta tingginya eksploitasi menyebabkan jumlah populasi hiu dan pari di alam semakin mengalami penyusutan. Identifikasi produk olahan ikan hiu dan pari menggunakan teknik metabarcoding berbasis Long-read Sequencing perlu dilakukan untuk menganalisis berbagai spesies dalam sampel olahan. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi spesies hiu dan pari sebagai bahan baku produk olahan hasil perikanan komersial mengggunakan teknologi Long-read Sequencing dan Sanger Sequencing. Sampel yang digunakan adalah produk hiu dan pari olahan yang didapat dari daerah Perairan Utara Pulau Jawa. Proses sekuensing dilakukan dengan menggunakan Long-read Sequencing dan diverifikasi dengan Sanger Sequencing. Metode Long-read Sequencing berhasil mengidentifikasi 9 spesies dalam produk campuran (mixed-species). Hasil identifikasi dengan Sanger Sequencing berhasil mengidentifikasi 14 spesies, berupa 7 jenis hiu dan 7 jenis pari. Hasil spesies yang teridentifikasi tersebut menunjukkan terdapat 8 spesies yang terdaftar sebagai terancam keberlanjutannya berdasarkan IUCN Red List. Enam spesies yang teridentifikasi juga terdaftar dalam Apendiks II CITES., The increasing trend in the consumption of shark and ray meat each year, and high exploitation rates, have led to a significant decline in shark and ray populations. Identifying processed shark and ray products using metabarcoding techniques based on Long-read Sequencing is necessary to analyze species in processed samples. This study aimed to identify sharks and rays species used as raw materials in commercial fishery products using Long-read Sequencing and Sanger Sequencing technologies. The samples used included processed shark and ray products obtained from the Northern Waters of Java Island. The sequencing process was carried out using Long-read Sequencing and verified with Sanger Sequencing. The Long-read Sequencing method successfully identified 9 species in mixed products. Identification results with Sanger Sequencing successfully identified 14 species, comprising 7 shark species and 7 ray species. The identified species indicated that 8 species are listed as threatened according to the IUCN Red List. Additionally, 6 of the identified species are listed in Appendix II CITES.
Keyword: sequencing, hiu, long-read, pari, sanger

Judul: Pemanfaatan Teknik Next Generation  Sequencing untuk Identifikasi Spesies Produk Olahan Ikan Hiu
Abstrak: Penangkapan ikan hiu yang masif dan tak terkontrol menyebabkan hiu rentan terhadap kepunahan. Autentikasi produk olahan ikan hiu menggunakan teknik Next Generation Sequencing perlu dilakukan untuk menganalisis lebih dari satu spesies dari sampel kompleks. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi spesies hiu yang digunakan dalam produk hiu asin dan gulai hiu yang didapat dari daerah Aceh dengan menggunakan teknik Next Generation Sequencing. Proses sekuensing dilakukan dengan menggunakan Next Generation Sequencing dan diverifikasi dengan PCR, diikuti dengan Sanger sequencing. Hasil sekuensing dengan metode Next Generation Sequencing (NGS) terdeteksi empat spesies yaitu Carcharhinus falciformis, Galeocerdo cuvier, Aetomylaeus nichofii, Centrophorus granulosus. Spesies tersebut diverifikasi dengan PCR dan diikuti dengan sanger sekuensing. Mitogenom pada spesies Carcharhinus falciformis memiliki ukuran 16701 bp dan Galeocerdo cuvier memiliki ukuran 16713 bp yang terdiri dari 13 gen penyandi protein, 22 gen tRNA, 2 gen rRNA dan 1 wilayah kontrol atau D-loop. Carcharhinus falciformis dan Aetomylaeus nichofii terdaftar sebagai spesies rentan dalam daftar IUCN red list., Massive and uncontrolled shark fishing make sharks vulnerable to extinction. Authentication of processed shark products using the Next Generation Sequencing technique needed to analyze more than one species from complex samples. This study aimed to identify the shark species in salted shark products and shark curry obtained from Aceh region. The sequencing process was carried out using the Next Generation Sequencing (NGS) and verified by the Sanger sequencing. The NGS method detected four species, namely Carcharhinus falciformis, Galeocerdo cuvier, Aetomylaeus nichofii, Centrophorus granulosus in the sample products. These species were verified by Sanger sequencing. The mitogenome of Carcharhinus falciformis has a size of 16701 bp and Galeocerdo cuvier has a size of 16713 bp consisting of 13 protein-coding genes, 22 tRNA genes, 2 rRNA genes and 1 control region or D-loop. Carcharhinus falciformis and Aetomylaeus nichofii are listed as a vulnerable species on the IUCN red list.
Keyword: Aceh, sequencing, DNA, mitogenome, high-throughput

Judul: Pengaruh tekanan operasi terhadap karakteristik curahan air dan erosi percikan yang dihasilkan oleh orbitor sprinkler
Abstrak: Irigasi curah (sprinkler irrigation) merupakan sistem irigasi yang diusahakan sedemikian rupa sehingga pemberian air untuk kebutuhan pertumbuhan tanaman menyerupai keadaan hujan dan biasa disebut dengan overhead irrigation. Karena sistem irigasi ini dibuat menyerupai hujan, maka ada beberapa hal penting yang perlu diperhatikan, karena hujan atau butiran air yang jatuh ke permukaan tanah dengan kecepatan dan jumlah tertentu dapat menyebabkan terjadinya kerusakan tanah atau erosi. Erosi adalah salah satu bentuk kerusakan tanah sebagai akibat hilangnya lapisan atas/lapisan olah tanah (top soil). Kehilangan ini disebabkan oleh proses penghancuran dan pengangkutan lapisan olah tanah dari suatu tempat ke tempat lain oleh media atau kekuatan alam seperti air, angin atau gaya gravitasi. Masalah khusus ini bertujuan untuk mempelajari pengaruh tekanan operasi terhadap karakteristik curahan air yang dihasilkan oleh Orbitor Sprinkler dan pengaruhnya terhadap kerusakan tanah, khususnya erosi percikan. Dari hasil pengukuran didapat bahwa karakteristik curahan air yang dihasilkan oleh nosel dalam pengoperasian ..dst
Keyword: