Judul: Analisis profil DNA genom sejumlah isolat Xanthomonas campestris pv. glycines dengan menggunakan elektrophoresis gel Medan berpulsa (pulsed-field gel electrophoresis)
Abstrak: Penyakit bisul bakteri merupakan salah satu dari tiga penyakit bakterial pada tanaman kedelai di Indonesia yang belum dapat ditanggulangi dengan baik, sehingga menjadi salah satu sebab utama rendahnya produksi kedelai di Indonesia. Schizotyping merupakan salah satu metode analisis profil DNA dengan menggunakan Pulsed-Field Gel Electrophoresis. Analisis profil DNA genom Xanthomonas campestris pv. glycines merupakan langkah awal untuk memahami mekanisme patogenesis secara molekuler, dan untuk studi epidemiologi penyakit bisul bakteri pada kedelai. Penelitian ini dilakukan dengan tujuan: (i) mengisolasi dan mengkoleksi Xanthomonas campestris pv. glycines dari berbagai daerah pertanaman kedelai di pulau Jawa, (ii) menelaah schizotipe masing-masing isolat, dan (iii) melakukan analisis hubungan kekerabatan dan filogenetik dari isolat-isolat yang terkumpul...dst
Keyword: Molecular biology, Soybean, Xanthomonas campestris, Schirotyping, Pulsed-field gel electrophoresis

Judul: Isolasi dan penapisan bakteri filosfer jagung dan singkong yang dapat menekan pertumbuhan Xanthomonas campestris pv. glycines
Abstrak: Kebutuhan kedelai sebagai bahan pangan semakin meningkat, sementara produksinya tidak men• cukupi kebutuhan tersebut. Salah satu penyebab rendahnya produksi kedelai ialah serangan penyakit. Penyakit asal bakteri yang banyak menyerang kedelai di Indonesia yaitu penyakit bisul baktcri yang disebabkan olehXanthomonas campestris pv. glycines (Xcg). Pengcndalian penyakit secara kimiawi kini mulai dihindari mengingat darnpak negatifnya bagi lingkungan. Pengendalian hayati menggunakan agens biokontrol merupakan salah satu cara pengendalian penyakit yang rarnal1 lingkungan dan berpotensi untuk dikembangkan. Tanarnan yang ditanarn secara tumpang sari cenderung lebih jarang terserang penyakit, mungkin karena aclanya rnigrasi bakteri antartanarnan yang dapat menghambat pertumbuhan bakteri patogen tanarnan. Kedelai biasanya ditanarn secara tumpang sari dengan jagung atau singkong. Oleh karena itu, mungkin ada bakteri asal tanaman jagung dan singkong yang dapat menekan pertumbuhan Xcg. Penapisan bakteri filosfer dari daun jagung clan singkong dilakukan dengan analisis nukleasi es menggunakan Xcg yang telah dilabel dengan gen inaZ, yaitu Xcg YR32 (Ice'). Analisis nukleasi es di· lakukan dengan asai tabung beku clan asai tetes beku (droplet freezing assay). Bakteri filosfer yang mem• berikan nilai Nf (persentase jumlah tabung/tetes yang membe'ku dibagi dengan jumlah totaJ tabung/tetes) kecil berarti isolat tersebut berpotensi sebagai agens biokontrol Xcg. Bakteri fil9sfer dari permukaan jagung dan singkong yang berhasil diisolasi ada 24 isolat Penapisan dengan analisis nukleasi es menunjukkan bahwa ada satu isolat, yakni isolat JC26 yang memberikan nilai Nf kecil sehingga berpotensi sebagai agens biokontrol Xcg. Isolat JC26 mungkin marnpu mengaktifkan sistem imun (systemic acquired resistance = SAR) tanaman kedelai sehingga pertumbuhan Xcg dapat ditekan.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: