Judul: Isolasi, Penapisan, Respon Tumbuh Dan Proses Kolonisasi Cendawan Mutualistik Akar
Abstrak: Tujuan penelitian ini ialah untuk mengisolasi, menapis dan menganalisis cendawan mutualistik akar potensial untuk pengembangan pupuk hayati. Analsis proses kolonisasi cendawan pada akar tanaman inang juga dilakukan dengan menggunakan metode pewarnaan biru tripan dan gen penanda GFP. Sebanyak 22 isolat cendawan berhasil diisolasi dari rizoplan kebun karet dari Jasinga serta rizosfer dan rizoplan tanaman gambut dari Kalimantan Tengah. Hasil penapisan terhadap sifat simbiosis menunjukkan bahwa ke-22 isolat tersebut terdiri dari 12 isolat cendawan simbiosis mutualistik akar non mikoriza, 3 isolat cendawan simbiosis mutualistik akar mikoriza, dan 7 isolat cendawan simbiosis parasitik akar. Cendawan Aspergillus niger dan Glomus sp. yang diisolasi dari rizoplan tanaman karet menghasilkan pertumbuhan tanaman inang terbaik. Oleh karena itu kedua isolat tersebut dipilih sebagai isolat simbiosis mutualisme terbaik dan digunakan untuk uji lebih lanjut. Isolat cendawan mutualistik akar terpilih diuji respon tumbuh dan kolonisasinya pada berbagai tanaman inang yaitu Oryza sativa, Zea mays, Pharaserianthes falcataria, Acasia sp., Theobroma cacao, Phaleria macrocarpa dan Brassica sp. Hasil pengujian menunjukkan bahwa inokulasi tunggal cendawan A. niger dan Glomus sp. meningkatkan pertumbuhan seluruh tanaman yang diuji jika dibandingkan dengan kontrol. Tanaman yang diinokulasi A. niger meningkatkan pertumbuhan 3 kali lebih tinggi sedangkan inokulasi Glomus sp. meningkatkan pertumbuhan tanaman 2 kali lebih tinggi dibandingkan kontrol. Kolonisasi cendawan A. niger pada tanaman uji berkisar antara 53-75% sedangkan Glomus sp. berkisar antara 25-70%. Pengaruh berbagai taraf P terhadap peranan A. niger dalam meningkatkan pertumbuhan tanaman diuji menggunakan 8 jenis tanaman tersebut diatas. Pupuk yang digunakan ialah pupuk Johnson dengan konsentrasi P sebesar 25%, 50%, dan 100% pada medium zeolit. Uji lanjut dari kedua cendawan dilakukan dengan inokulasi ganda pada tanaman Centrosema pubescens. Hasil analisis menunjukkan bahwa inokulasi A. niger pada berbagai taraf P meningkatkan respon tumbuh seluruh tanaman secara signifikan dengan respon tertinggi diperoleh pada perlakuan P sebesar 50%. Respon tumbuh tanaman pada perlakuan P sebesar 100% masih menunjukkan respon yang lebih tinggi dibandingkan dengan perlakuan kontrol namun lebih rendah dibandingkan dengan perlakuan P 50%. Introduksi gen GFP pada genom A. niger telah berhasil dilakukan. Berdasarkan analisis PCR dan mikroskop fluoresen dengan filter 512 nm, gen GFP telah terintegrasi pada genom cendawan, bersifat stabil dan terekspresi secara konstitutif pada 3 generasi kultur yang diuji. Analisis proses kolonisasi A. niger yang diamati dengan menggunakan metode pewarnaan dan gen penanda GFP menunjukkan bahwa proses kolonisasi dimulai dengan proses penetrasi hifa ke dalam jaringan epidermis akar, kemudian terbentuk apresorium yang dilanjutkan dengan pembentukan hifa interseluler pada epidermis dan korteks akar serta pembentukkan struktur pembengkakan hifa pada korteks akar. Pada kolonisasi A. niger tidak ditemukan struktur arbuskula seperti pada kolonisasi cendawan mikoriza. Pengamatan analisis kolonisasi menggunakan 9 mikroskop fluoresen dengan filter 512 nm menghasilkan auto fluoresen pada beberapa jaringan akar namun struktur kolonisasi cendawan A. niger-GFP pada akar tanaman masih dapat teramati dan dapat dibedakan dari jaringan akar.
Keyword: 

Judul: Endophytic Fungal Diversity of Local Rice and Their effects on Rice seedling Growth.
Abstrak: Cendawan endofit ialah cendawan yang hidup di dalam jaringan tanaman inang tanpa menyebabkan gejala penyakit. Cendawan endofit potensial sebagai pupuk hayati dan pengendali hayati tanaman, termasuk padi lokal, sehingga dapat digunakan untuk meningkatkan produktivitas tanaman tanaman padi lokal yang ramah lingkungan. Padi lokal merupakan salah satu andalan karena cocok dengan kondisi lingkungan setempat. Namun, produktivitas padi lokal umumnya belum maksimal karena terkendala oleh kesuburan tanah. Produksi padi termasuk padi lokal masih bergantung pada pupuk anorganik. Pupuk anorganik yang digunakan terus menerus dapat mengubah struktur fisik dan kimia tanah yang menyebabkan tanah menjadi tidak subur. Oleh karena itu, perlu diterapkan suatu teknik budi daya padi spesifik yang berwawasan lingkungan dan berkelanjutan. Penelitian ini bertujuan mengisolasi dan menganalisis keragaman cendawan endofit padi lokal kultivar Siam 11 Kalimantan dan potensinya dalam meningkatkan pertumbuhan bibit tanaman inangnya. Isolasi cendawan dilakukan pada seluruh bagian tanaman padi Siam 11 Kalimantan, yaitu akar, pelepah, daun, gabah, biji pecah kulit, sekam, kecambah dan bibit dengan metode sterilisasi permukaan menggunakan NaOCl 1% dan dikulturkan pada media Potato sucrose Agar (PSA) yang mengandung kloramfenikol 500 mg L-1. Identifikasi cendawan menggunakan gabungan karakteristik morfologi dan molekuler. Keragaman cendawan endofit dihitung melalui indeks keragaman Shanon-Wiener. Cendawan endofit di analisis molekuler menggunakan sekuen rDNA dengan primer ITS1 dan ITS4 yang dilanjutkan dengan analisis filogenetik. Cendawan selanjutnya di uji kemampuannya dalam meningkatkan pertumbuhan bibit padi menggunakan filtrat. Kultur pengaruh filtrat cendawan endofit terhadap pertumbuhan tanaman padi diuji pada perkecambahan dan pertumbuhan benih padi. Filtrat cendawan endofit dari satu isolat terbaik dianalisis senyawa bioaktifnya menggunakan Liquid Chromatography-Mass Spectrometry (LC-MS). Data pertumbuhan tanaman padi dianalisis melalui Analisis Variance (ANOVA) menggunakan SAS 9.4. Perbedaan antar perlakuan dilanjutkan dengan uji Tukey pada taraf kepercayaan 95% (p<0,05). Sebanyak 14 kelompok isolat cendawan endofit berhasil diisolasi. Berdasarkan pengamatan morfologi sebanyak 11 isolat memiliki konidia (bersporulasi), sedangkan 3 isolat lainnya tidak bersporulasi. Berdasarkan hasil identifikasi molekuler, keempat belas isolat tersebut terdiri atas tiga belas spesies yaitu Cladosporium oxysporum, C. coloradense, Fusarium keratoplasticum galur 1 dan 2, F. humuli, Penicillium brefeldianum, P. citrinum, Poaceascoma lochii, Pseudopestalotiopsis simitheae, Sarocladium oryzae, Simplicillium obclavatum, Talaromyces macrosporus, T. angelicus, dan T. pinophilus. Bagian tanaman dengan frekuensi kolonisasi cendawan endofit paling tinggi terdapat pada bagian daun, sebesar 11,67%, sedangkan frekuensi kolonisasinya paling rendah terdapat pada bagian sekam yaitu 2,78%. Cendawan Sarocladium oryzae paling sering ditemukan dengan frekuensi 6,39%, atau tingkat dominansi spesies paling tinggi (95,83 %), sedangkan cendawan F. keratoplasticum galur 1, F. humuli, dan T. pinophilus paling jarang ditemukan dengan frekuensi masing-masing sebesar 0,28 % atau dominansinya paling rendah (masing-masing 4,17 %). Keragaman cendawan endofit yang diperoleh berdasarkan analisis keragaman Shanon-Wiener termaksuk dalam kategori sedang yaitu 2,24. Hasil pengujian filtrat asal ke-13 medium kultur yang telah dipisahkan dari miselium terhadap pertumbuhan benih padi lokal umur 14 hari pada kondisi laboratorium, menunjukkan isolat F. keratoplasticum galur 1 memiliki potensi yang paling baik, yaitu menghasilkan nilai peningkatan tinggi tajuk 3,87 cm, panjang akar 3,14 cm, dan bobot kering akar 3,52 mg. Analisis melalui LC-MS dari ekstrak kasar asal filtrat tersebut menunjukkan terdapat lima senyawa yang diduga membantu meningkatkan pertumbuhan tanaman padi, yaitu 2-C-methylerythritol 4-phosphate, asam sitrat, asam sitrakonat, asam DL-malat,
Keyword: 5W+1H

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: