Judul: Studi Perbandingan Profil Batimetri Perairan Utara Belitung Hasil Deteksi Sistem AKustik Blm Terbagi Simrad EY 500 dengan Profil Batimetri Dishidros TNI-AL
Abstrak: Peta batimetri memberikan informasi tentang kedalaman dan kontur dasar laut Dasar laut bukanlah suatu daratan yang sederhana tetapi memiliki struktur, bentuk dan kenampakan yang sangat beragam. Selain dari itu dasar laut sebagai bagian dari laut ltu sendiri merupakan suatu sistem yang dinamis, setiap saat perubahan·perubahan akan sering terjadi sehingga perbaikan·perbaikan pada peta batimetri perlu sekali dilakukan agar informasi-informasi mengenai dasar suatu perairan bisa diketahui seiring dengan perubahan yang terjadi.
Keyword: 

Judul: Kombinasi Data Akustik Dan Satelit Untuk Pemetaan Batimetri Di Perairan Dangkal Pulau Tunda
Abstrak: Pengukuran batimetri menggunakan kapal survei akustik sangat terbatas di perairan dangkal sekitar pantai, sehingga penggunaan teknologi citra satelit perlu dilakukan untuk melengkapi keterbatasan tersebut. Informasi topografi dasar laut penting bagi beberapa tujuan seperti alur pelayaran kapal rakyat, pelabuhan, wisata bahari dan lain-lain. Penelitian ini bertujuan menganalisis data batimetri yang ditampilkan pada peta dua dimensi (2D) dan tiga dimensi (3D) berdasarkan kombinasi data akustik dan data citra satelit Worldview-2. Penelitian ini dilakukan dari bulan Juni 2014 hingga Juni 2015, sedangkan pengukuran data lapang dilakukan di perairan dangkal Pulau Tunda pada tanggal 21-24 Agustus 2014. Metode yang digunakan adalah metode akustik dengan melakukan pemeruman di perairan pulau tersebut, kemudian data pemeruman tersebut diinterpolasi dan metode pengolahan citra Worldview-2 menggunakan algoritma Stumpf yang menghitung rasio antar kanal sinar tampak (band 1-5). Penghitungan slope menggunakan ArcGis Benthic Terrain Modeler (BTM). Nilai kedalaman perairan Pulau Tunda berkisar 0,9 m - 52 m berdasarkan data akustik dan data satelit. Nilai kedalaman berdasarkan citra satelit diperoleh dari hasil rasio kanal B1/B3 (coastal band dan green band). Nilai koefisien determinasi (R2) tertinggi adalah 0,73 yang dihubungkan dengan 59 titik kedalaman akustik yang tersebar di sekitar perairan dangkal Pulau Tunda. Nilai kedalaman aktual diperoleh menggunakan persamaan hasil nilai R2 B1/B3 yaitu z = 0,50621+1,36941*B1:B3. Tampilan 3D memperlihatkan kondisi topografi dasar laut yang sangat rata di bagian Timur laut pada kedalaman 52 m, sedangkan di bagian Utara terlihat dasar laut yang hanya berkisar 30-40 m. Nilai slope dari 0∘⃘ hingga 57o yang terdiri dari 3 kategori, yaitu yaitu kategori flat (0o -1o), kategori slope atau miring (1o-30o) dan kategori steeply sloping atau tebing (30o-60o). Berdasarkan tampilan melintang kondisi topografi dasar laut bagian Utara dapat dijadikan informasi dasar sebagai lokasi peletakan perangkap ikan dan lokasi wisata bahari.
Keyword: batimetri, akustik, citra satelit, kedalaman, dasar laut

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA