Judul: Identifikasi Keragaman Gen Myostatin (MSTN) serta Asosiasinya dengan Kualitas Daging pada Ayam Kampung dan Ras Pedaging
Abstrak: Ayam kampung merupakan salah satu ayam asli Indonesia yang memiliki daya adaptasi terhadap lingkungan yang tinggi, tetapi daya produktivitasnya masih rendah. Padahal, ayam kampung memiliki potensi sebagai salah satu sumber protein di Indonesia, dan permintaan terhadap daging ayam kampung juga tinggi. Dalam meningkatkan kualitas dan kuantitas ayam kampung dapat dilakukan melalui seleksi secara genetik. Gen myostatin (MSTN) atau Growth Differentiations Factor 8 (GDF8) adalah gen utama dan penentu dalam pengontrol sifat pertumbuhan dan produksi daging yang berperan sebagai regulator negatif dari pertumbuhan otot skeletal. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis keragaman gen myostatin pada ayam kampung dan ras pedaging strain Cobb serta asosiasinya terhadap bobot potong, kualitas sifat fisik, dan kimia daging. Penelitian terdiri atas dua tahap yaitu analisis keragaman gen MSTN dan asosiasi keragaman gen MSTN dengan bobot karkas, sifat fisik (pH, susut masak, keempukan, daya mengikat air) dan sifat kimia (air, protein, lemak) daging pada ayam kampung dan ayam ras pedaging. Total sampel yang digunakan untuk analisis keragaman adalah 138 ekor yang terdiri atas 67 sampel DNA ayam kampung dan 71 sampel DNA ayam ras pedaging. Total sampel yang digunakan untuk asosiasi sifat fisik adalah 30 sampel ayam kampung dan 65 sampel daging dada ayam ras pedaging. Total sampel untuk asosiasi sifat fisik terdiri atas 9 sampel ayam kampung dan 9 sampel ayam ras pedaging yang merupakan perwakilan dari setiap genotipe. Kedua jenis ayam memiliki umur 12 minggu Titik mutasi gen MSTN yang digunakan yaitu c.234G>A pada ekson 1. Genotyping dilakukan menggunakan metode PCR-RFLP (Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism). Analisis data secara deskriptif untuk frekuensi genotipe, frekuensi alel, heterosigositas, keseimbangan Hardy-Weinberg. Asosiasi data genotipe dengan fenotipe dianalisis ragam. Hasil menunjukkan gen MSTN pada populasi ayam kampung dan ayam ras pedaging bersifat polimorfik. Frekuensi genotipe AA lebih tinggi dibandingkan dengan frekuensi genotipe GA dan GG. Gen MSTN c.234G>A berasosiasi dengan bobot potong, karkas, dada, paha atas (thighs), paha bawah (drumsticks), sayap, daging dada, daging paha atas (thighs), daging paha bawah (drumsticks) pada ayam kampung dan bobot sayap pada ayam ras pedaging. Sifat fisik tidak memiliki asosiasi dengan nilai pH, susut masak, keempukan, daya mengikat air pada kedua populasi ayam. Pada sifat kimia, kadar protein pada ayam ras pedaging memiliki asosiasi dengan keragaman gen MSTN. Kesimpulannya, gen MSTN c.234G>A pada ekson 1 dapat digunakan sebagai kandidat untuk marka genetik sifat karkas pada ayam kampung dan ayam ras pedaging.
Keyword: ayam kampung, ayam ras pedaging, gen MSTN, bobot potong, kualitas daging

Judul: Kajian Keragaman Gen-gen Pertumbuhan dan Myostatin sebagai Penciri Karakteristik Karkas Ayam
Abstrak: Ayam asli tidak hanya berkontribusi terhadap konservasi sumber genetik unggas, tetapi juga memainkan peran penting dalam ekonomi di masyarakat. Ayam kampung merupakan ayam asli Indonesia, yang dapat ditemukan dengan mudah di daerah pedesaan. Peningkatan performa ayam kampung dapat dilakukan dengan seleksi dan persilangan, atau dengan pemanfaatan keduanya. Untuk meningkatkan performa pertumbuhan dan karkas ayam kampung, persilangan menghasilkan F2 antara kampung dan ayam ras pedaging strain Cobb dirancang dan kemudian diikuti seleksi berdasarkan gen-gen pengontrol karakteristik karkas. Gen growth hormone (GH), growth hormone receptor (GHR), ghrelin receptor (GHSR), dan myostatin (MSTN) memainkan peran penting dalam pertumbuhan dan perkembangan otot. Penelitian ini bertujuan untuk memberikan informasi keragaman genetik ayam silangan F2 kampung dan ayam ras pedaging berdasarkan gen pengontrol karakteristik karkas, yaitu GH, GHR, GHSR, dan myostatin. Penelitian ini terdiri atas dua (2) tahap: (1) Polimorfisme gen GH, GHR, GHSR, dan myostatin pada ayam kampung dan ayam pedaging, dan (2) Ekspresi dan sekuen utuh gen myostatin pada ayam bobot tinggi dan rendah. Sebanyak 215 ekor ayam terdiri atas 4 populasi ayam (kampung, ras pedaging strain Cobb, silangan F1 dan silangan F2 kampung dan ras pedaging) digunakan untuk penelitian tahap 1. Identifikasi polimorfisme dilakukan dengan teknik PCR-RFLP dengan enzim restriksi EcoRV, Eco72I, Hin6I, dan BsrI masing-masing untuk gen GH, GHR, GHSR, dan myostatin. Komponen karkas pada umur 26 minggu di kampung F2 dan ayam pedaging (42 ekor ayam) digunakan untuk analisis asosiasi. Semua gen yang dianalisis bersifat polimorfik pada semua populasi ayam. Asosiasi signifikan ditemukan antara g.565G>A polimorfisme GHR dengan bobot hidup, bobot karkas, bobot dada, bobot paha atas, bobot otot dada, dan bobot otot paha. Polimorfisme GHSR g.1857T>C berasoasasi secara signifikan dengan bobot hidup, bobot karkas, bobot dada, bobot paha atas, bobot paha bawah, bobot sayap, bobot otot dada, bobot otot paha atas, dan bobot otot paha bawah. Polimorfisme g.4842T>G myostatin berasosiasi dengan bobot hidup, bobot karkas, bobot komponen karkas, bobot otot, dan air bebas pada daging. Efek dari g.4842T>G myostatin ini juga telah dikonfirmasi pada jenis ayam yang berbeda. Dengan demikian, g.4842T>G myostatin merupakan kandidat penting untuk pertumbuhan ayam dan peningkatan massa otot. Penelitian tahap 2 adalah studi validasi untuk membuktikan peran myostatin pada karakteristik karkas. Dua kelompok ayam berdasarkan berat badan umur 12 minggu digunakan dalam penelitian ini. Kelompok ayam ini diperoleh dari populasi silangan F2 kampung dan ayam pedaging. Sekuen lengkap gen myostatin ayam dibatasi menjadi 24 sekuen parsial. Sebanyak 170 mutasi ditemukan di sepanjang gen myostatin termasuk 148 mutasi titik dan 22 indel. Di antara mutasi tersebut, 161 mutasi ditemukan sebagai mutasi novel. Mutasi spesifik ditemukan pada ayam dengan bobot badan rendah dan tinggi, diantaranya adalah 5 mutasi pada ayam dengan bobot badan tinggi dan 25 mutasi pada ayam dengan bobot badan rendah. Dua belas haplotipe ditemukan dalam sekuen coding region gen myostatin, termasuk dua haplotipe spesifik pada ayam dengan bobot badan tinggi dan lima haplotipe pada ayam dengan bobot badan rendah. Tidak ada perbedaan asam amino antara sekuen coding region gen myostatin ayam dengan bobot badan tinggi dan rendah. Ekspresi relatif digunakan untuk menghitung cycles treshold (CT) gen myostatin pada jaringan otot antara ayam dengan bobot badan tinggi dan
Keyword: gen GH, gen GHR, gen GHSR, gen myostatin, keragaman genetik, karkas ayam

Judul: Elektrodeposisi Film Tipis Semikonduktor Cu2ZnSnS4 (CZTS) pada Substrat Kaca ITO
Abstrak: Semiconductor Cu2ZnSnS4 (CZTS) thin film that can be used as absorber layers on solar cell module was made via electrodeposition method. CZTS thin film was electrodeposited on the surface of a silicate glass coated with a thin layer of indium tin oxide (ITO). Deposition process was done using potentiostatic mode at room temperature with a potential of 1.05 V for 30, 45, and 60 minutes, followed with annealing the film at 2 different temperatures, 500 ºC using furnace and 180 ºC using hot plate, both treatments for 45 minutes in N2/H2S atmosphere. The X-ray difractograms were analyzed using Match 2 program and showed that the CZTS thin films had kesterit crystalline structure, with a low percentage of CZTS phase. The thin film also contained secondary phases such as Cu2S, ZnS, and SnS. The obtained CZTS thin films had a thickness between 1.039 and 1.676 μm. Absorption study showed that the band gap energy of CZTS thin films which was annealed using furnace ranged from 1.50 to 1.52 eV, whereas that annealed using the hot plate was not observed. The band gap energy value showed that CZTS thin films can be used as sunlight absorber layers on solar cell. The formation of CZTS crystal film on this investigation was effectively performed using furnace annealing process at a temperature of 500 ºC with deposition time of 45 minutes.
Keyword: Thin film, Electrodeposition, Cu2ZnSnS4