Judul: Deskripsi Morfologi, Identifikasi Molekuler dan Filogeni Berudu di Pulau Jawa Berdasarkan Gen 12S rRNA dan 16S rRNA
Abstrak: Identifikasi spesies pada sebagian besar berudu sulit dilakukan karena karakter morfologi yang mudah dikenali sangat beragam. Selain itu, berudu dan Anura dewasa yang ditemukan pada lokasi yang sama tidak mudah untuk saling dihubungkan terutama pada spesies-spesies yang melakukan aktivitas breeding dan non-breeding tidak di lokasi yang sama atau berdekatan. Identifikasi spesies berudu paling sulit dilakukan pada berudu yang berada pada tahap 23 – 25 dalam proses metamorfosisnya karena merupakan tahap awal diferensiasi oral disc. Hasil identifikasi spesies berudu dapat menjadi data dasar dalam manajemen habitat demi kelestarian jenis Anura. Oleh karena itu diperlukan klustering data molekular yang menjadi alternatif pelengkap untuk memperkuat identifikasi spesies. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi spesies berudu di Pulau Jawa berdasarkan karakter morfologi dan molekuler, dan mengetahui posisi filogeni berudu berdasarkan gen 12S dan 16S rRNA. Sampel berudu yang dianalisis berjumlah 94 individu. Identifikasi morfologi dilakukan berdasarkan kunci identifikasi Iskandar (1998). Deskripsi morfologi dan morfometrika berudu dilakukan berdasarkan Altig (2007), dan tahap perkembangan berudu ditentukan berdasarkan Gosner (1960). Genom diekstraksi dari jaringan menggunakan metode fenol-kloroform (Farajallah 2002). Ruas gen target (12S dan 16S rRNA) diamplifikasi menggunakan pasangan primer AF05 (5’-ACTGGGATTAGATACCCCACTAT) dan AF08 (5’-ATGTTTTTGGTAAACAGGCG) dengan suhu annealing 550C. Jarak genetik antar sampel dihitung berdasarkan jumlah perbedaan nukleotida dan model subsitusi Kimura 2 Paramater (K2P) menggunakan program MEGA v.4. Rekonstruksi filogeni dilakukan dengan metode Maximum Parsimony dengan bootstrap 1000 kali berdasarkan gen 12S rRNA, gen 16S rRNA dan gabungan gen 12S dan 16S rRNA (disimbolkan dengan 12S-16S rRNA). Identifikasi morfologi menunjukkan bahwa berudu terdiferensiasi dalam 17 spesies dari 6 famili. Berdasarkan nilai terendah dari jarak genetik, hasil identifikasi morfologi yang kongruen dengan hasil identifikasi molekuler antara lain P. leucomystax, P. aspera, L. microdiscus, dan R. margaritifer. Spesies yang hasil identifikasi morfologi tidak kongruen dengan hasil identifikasi molekuler adalah F. limnocharis, sedangkan spesies yang belum dapat dipastikan adalah O. hosii. Percabangan monofiletik pada Anura didukung dengan baik pada penelitian ini kecuali kelompok Rhacophorid berdasarkan gen 12S rRNA. Spesies P. aspera berkerabat lebih dekat dengan Bufo berdasarkan gen 12S rRNA dan gen 16S rRNA, sedangkan berdasarkan gen 12S-16S rRNA spesies ini berkerabat lebih dekat dengan B. japonicus. Spesies F. limnocharis berkerabat lebih dekat dengan F. iskandari berdasarkan gen 12S rRNA, 16S rRNA dan 12S-16S rRNA.
Keyword: Identifikasi, Berudu, 12S dan 16S rRNA, Filogeni, Pulau Jawa

Judul: Karakterisasi Morfogenetik Nudibranch dari Beberapa Populasi di Indonesia.
Abstrak: Nudibranch memiliki keanekaragaman spesies yang tinggi dengan karakter morfologi yang kompleks dan menantang untuk diidentifikasi ke dalam tingkat spesies. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui spesies nudibranch dengan menggunakan morfologi dan karakteristik molekuler. Rekonstruksi pohon filogenetik menggunakan metode Neighbor-joining dengan model parameter Kimura-2 dan 1000 nilai bootstrap. Jarak genetik within and between spesies juga diamati. Sebanyak 51 sampel jaringan dan 18 spesimen dikumpulkan dari populasi yang berbeda di Indonesia. Berdasarkan 18 spesimen yang dikumpulkan, total lima spesies diidentifikasi berdasarkan karakter morfologi (Chromodoris magnifica, Phyllidia elegans, Phyllidia varicosa, Phyllidia coelestis, Phyllidiella pustulosa). Hasil barcode DNA menggunakan gen Cytochrome Oxidase I (COI) menunjukkan 18 spesies dari 51 sampel dianalisis. Rekonstruksi pohon filogenetik tersebut menunjukkan 18 clade yang termasuk dalam lima famili termasuk tiga spesies kelompok Phyllidiella (Phyllidiella pustulosa, Phyllidiella nigra, Phyllidiella picta), tiga spesies kelompok Phyllidia (Phyllidia elegans, Phyllidia coelestis, Phyllidia varicosa), empat spesies kelompok Chromodoris (Chromodoris magnifica, Chromodoris annae, Chromodoris quadricolor, Chromodoris striatella), dan masing-masing spesies di kelompok Goniobranchus (Goniobranchus geometricus), Elysia (Elysia cf marginata), Plakobranchus (Plakobranchus papua), Glossodoris (Glossodoris rufomarginata), Nembrotha (Nembrotha cristata), Mexichromis (Mexichromis multituberculata), Dorisprismatica (Dorisprismatica atromar), dan Tritonidae (Tritonia sp 2). Studi ini menunjukkan bahwa barcode DNA dapat digunakan untuk mengidentifikasi nudibranch sampai tingkat spesies, dan mempercepat eksplorasi spesies yang akan menjadi sumber informasi dalam mengelola sumber daya dan menjaga stabilitas ekosistem.
Keyword: DNA barcoding, coral triangle, coral reefs, molecular genetik, morfologi, nudibranch

Judul: Elektrodeposisi Film Tipis Semikonduktor Cu2ZnSnS4 (CZTS) pada Substrat Kaca ITO
Abstrak: Semiconductor Cu2ZnSnS4 (CZTS) thin film that can be used as absorber layers on solar cell module was made via electrodeposition method. CZTS thin film was electrodeposited on the surface of a silicate glass coated with a thin layer of indium tin oxide (ITO). Deposition process was done using potentiostatic mode at room temperature with a potential of 1.05 V for 30, 45, and 60 minutes, followed with annealing the film at 2 different temperatures, 500 ºC using furnace and 180 ºC using hot plate, both treatments for 45 minutes in N2/H2S atmosphere. The X-ray difractograms were analyzed using Match 2 program and showed that the CZTS thin films had kesterit crystalline structure, with a low percentage of CZTS phase. The thin film also contained secondary phases such as Cu2S, ZnS, and SnS. The obtained CZTS thin films had a thickness between 1.039 and 1.676 μm. Absorption study showed that the band gap energy of CZTS thin films which was annealed using furnace ranged from 1.50 to 1.52 eV, whereas that annealed using the hot plate was not observed. The band gap energy value showed that CZTS thin films can be used as sunlight absorber layers on solar cell. The formation of CZTS crystal film on this investigation was effectively performed using furnace annealing process at a temperature of 500 ºC with deposition time of 45 minutes.
Keyword: Thin film, Electrodeposition, Cu2ZnSnS4