Judul: Autentikasi Produk Olahan Ikan Sidat dengan Spesies- Spesifik Mini DNA Barcodes.
Abstrak: DNA mini-barcode merupakan salah satu metode autentikasi berbasis DNA yang belum dilakukan di Indonesia, terutama untuk mengautentikasi produk olahan ikan dengan nilai ekonomis tinggi. Sidat memiliki nilai jual yang tinggi serta banyak dijumpai di Indonesia, sehingga berpotensi untuk meningkatkan ekspor perikanan. Tujuan penelitian ini yaitu membandingkan metode DNA mini-barcode dengan DNA full-length serta mendapatkan primer DNA mini-barcode spesies-spesifik dan mengaplikasikannya pada berbagai produk olahan. Tahapan penelitian yang digunakan yaitu isolasi DNA, amplifikasi DNA, pengecekan kualitas dan kuantitas DNA, sekuensing, pembuatan desain primer mini barcode spesies-spesifik dan identifikasi. Amplifikasi DNA dengan mini barcode memiliki tingkat keberhasilan yang lebih tinggi. Primer spesifik berhasil mengamplifikasi baik sampel sidat segar maupun berbagai sampel olahan dengan ukuran produk PCR 219 pb dan 273 pb. Sampel ikan sidat teridentifikasi sebagai spesies Anguilla bicolor bicolor (99-100%) dan Anguilla marmorata (100%).
Keyword: COI, DNA mini-barcode, ikan sidat, primer spesies-spesifik

Judul: Autentikasi aneka produk tuna (Thunnus sp.) dengan metode DNA barcoding
Abstrak: Kasus-kasus penipuan dan pemalsuan penggantian label dalam perdagangan produk perikanan dunia, termasuk tuna, semakin marak terjadi. Kondisi ini menuntut adanya teknik pengembangan dalam penelusuran dan pendeteksian spesies secara cepat dan mudah, dengan hasil yang akurat. Autentikasi spesies berbasis DNA merupakan teknik yang banyak dikembangkan saat ini. Tujuan dari penelitian ini adalah mempelajari autentikasi aneka produk tuna (Thunnus sp) dengan metode DNA barcoding. Penelitian dilaksanakan dalam 2 tahap kegiatan, tahap ke-1 yaitu pengambilan sampel uji produk tuna dan tahap ke-2 berupa pengujian identifikasi spesies tuna dengan DNA barcoding, yang meliputi kegiatan (1) ekstraksi DNA dengan berdasarkan metode CTAB, (2) amplifikasi DNA (PCR) dan (3) identifikasi spesies dengan analisis BLAST dan filogenetik. Sampel tuna yang digunakan meliputi ikan tuna segar dan produk ikan tuna olahan. Sampel tuna segar merupakan ikan tuna jenis Thunnus albacares yang diperoleh dari industri pengolahan tuna dan dikirim dalam bentuk tuna steak segar dengan pengiriman langsung, sedangkan sampel olahan yang digunakan adalah produk sushi dan sashimi ikan tuna dan tuna steak yang dibeli dari restoran dan supermarket. Pengujian identifikasi spesies dilakukan dengan menggunakan pasangan primer COI1 dan COI3 dengan kondisi amplifikasi berupa denaturasi awal (preheating) pada suhu 95 oC selama 5 menit, diikuti sebanyak 39 siklus yang terdiri dari denaturasi 95 oC selama 30 detik, annealing (49-51) oC selama 40 detik dan ekstensi 72 oC selama 60 detik, serta langkah ekstensi akhir 72 oC selama 10 menit.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: