Judul: Analisis keseragaman genetik tanaman teh (Camellia Sinensis (l) o. Kuntze) asal kultur jaringan, setek, dan biji dengan teknik RAPD
Abstrak: Kultur jaringan melalui induksi tunas aksiler dan penggandaan embrio somatik dikembangkan sebagai eara perbanyakan tanaman teh dalam jumlah yang banyak dengan waktu yang cepat dan tingkat keseragaman yang tinggi. Analisis terhadap variasi somaklonal yang terjadi pada tanaman kultur jaringan merupakan salah satu upaya konservasi tanaman. RAPD (random amplified polymorphic DNA) memanfaatkan kemampuan nukleotida dari suatu primer acak dengan nukleotida pada DNA cetakan yang mengandung basa komplemennya sering digunakan untuk menganalisis tingkat keseragaman genetik. RAPD menggunakan mesin peR (polymerase chain reaction), yaitu alat amplifikasi DNA yang dapat diatur suhunya untuk terjadinya proses sintesis DNA seperti denaturasi DNA, penempelan primer, dan pemanjangan primer. Dalam analisis ini digunakan 8 primer hasil seleksi. yaitu OPA 1. OPA 2. OPA 3. OPA 7, OPA 8, OPB I, OPB 3, dan OPB 7. Sctiap primer menghasilkan pola pita yang spesifik sehingga keseragaman tanaman dapat dilihat dari pola amplifikasi oleh primer tertentu. Primer OPA 8 dan OPB 3 memberikan pita polimorfik yang tinggi sehingga penentuan seragam tidaknya genetik suatu populasi dapat lebih mudah diamati Berdasarkan perbandingan pola pita amplifikasi, kesamaan genetik dihitung dengan menggunakan koefisien Dice. Hasil penelitian menunjukkan tingkat keseragaman genetik rata-rata taRaman teh asal embrio somatik paling tinggi, yaitu sebesar 890/0, diikuti tanaman asal setek dengan tingkat keseragaman genetik rata-rata sebesar 77%, sedangkan tingkat keseragaman genetik rata-rata tanaman teh asal biji sarna dengan tunas wiler sebesar 64%. Ketidakseragaman pada tanaman kultur jaringan khususnya tunas wiler ini dapat disebabkan oleh siklus pengkulturan yang panjang dan tidak teratur, mutasi karena penyerapan zat pengatur tumbuh tertentu pada
Keyword: 

Judul: Analisis Keragaman Genetik Kunyit (Curcuma longa Linn.) Dan Temulawak (Curcuma xanthorrhiza Roxb.) Budidaya Tanah Jawa Berdasarkan Penanda Molekuler RAPD
Abstrak: Penanda molekuler RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) merupakan salah satu teknik yang digunakan dalam analisis keragaman genetik tanaman. Kunyit (Curcuma longa Linn.) dan temulawak (Curcuma xanthorrhiza Roxb.) sebagai tanaman obat herbal potensial memiliki distribusi luas di wilayah Indonesia yang dapat berpengaruh terhadap pola keragaman genetiknya. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pola keragaman genetik dari 12 sampel genus Curcuma yang berasal dari berbagai daerah di Pulau Jawa. Penelitian diawali dengan optimasi isolasi DNA dan amplifikasi DNA, hingga analisis lokus dan konstruksi pohon filogenetik menggunakan metode UPGMA (Unweighted Pair Group Method Arithmatic Mean) dari software NTSYS. Modifikasi protokol isolasi DNA dengan penambahan Proteinase K setelah proses inkubasi dan RNAse setelah proses pencucian menunjukkan hasil paling baik. DNA yang diisolasi memiliki ukuran berkisar pada 9000 bp dengan kualitas pita yang cukup baik. Amplifikasi DNA dengan 20 primer acak terpilih pada 7 sampel kunyit menghasilkan 278 pita DNA dari 177 lokus, dan pada 5 sampel temulawak menghasilkan 184 pita DNA dari 143 lokus yang seluruhnya merupakan pita polimorfik. Analisis kemiripan genetik 7 varietas Curcuma longa Linn. menunjukkan nilai koefisien kemiripan genetik sebesar 42.37% - 94.35% dan 19.58% - 85.31% pada 5 varietas Curcuma xanthorrhhiza Roxb. Hasil pengelompokan pada nilai koefisien kemiripan genetik 51.65% dan 33.17% menunjukkan bahwa 7 varietas kunyit dan 5 varietas temulawak yang diteliti berasal dari dua kelompok besar.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: