Judul: DNA Barcode of Fungus Growing Termites and Fungal Symbionts in Thailand.
Abstrak: Simbiosis merupakan proses penting dalam pengembangan biodiversitas seperti antara serangga dan fungi. Rayap penumbuh cendawan Termitidae: Macrotermitinae merupakan kelompok rayap yang unik karena mampu menumbuhkan cendawan Basidiomikotina: Termitomyces pada sarangnya dalam suatu hubungan mutualisme. Kelompok rayap ini memiliki peran penting sebagai dekomposer utama. Tetapi, studi menyeluruh tentang rayap penumbuh cendawan dan simbion cendawan relatif masih terbatas dan hubungan kompleks rayapcendawan simbion menjadi isu yang menarik untuk diteliti. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi spesies rayap dan cendawan simbion menggunakan DNA barcoding, membandingkannya dengan identifikasi menggunakan morfologi, dan untuk menemukan hubungan ko-evolusi antara rayap dan cendawan simbionnya. Sebanyak tiga genus (Macrotermes, Odontotermes, dan Ancistrotermes) dan dua spesies rayap (Macrotermes annandalei dan Ancistrotermes pakistanicus) teridentifikasi dari enam koloni yang ditemukan menggunakan DNA barkode. Keenam koloni tersebut menumbuhkan genus spesifik Termitomyces dengan satu spesies teridentifikasi, yaitu T. cylindricus. Hasil identifikasi secara morfologi mendukung hasil identifikasi molekular pada sampel rayap. Namun, sampel cendawan lebih banyak teridentifikasi menggunakan pendekatan molekular karena keterbatasan karakter morfologi jamur yang teramati untuk identifikasi. Hubungan inang-simbion dengan spesifisitas tinggi ditemukan antara M. annandalei dan Termitomyces sp. Group1. Hubungan spesifisitas inang lebih rendah ditemukan pada klade Termitomyces Group2 sehingga data tambahan diperlukan untuk hasil yang lebih signifikan.
Keyword: DNA Barcoding, koevolusi, Macrotermitinae, Termitomyces, mutualisme

Judul: Analisis Kekerabatan Rayap Tanah Macrotermes gilvus Hagen (Blattodea: Termitidae) dan Inventarisasi Bakteri Simbionnya di Bogor
Abstrak: Rayap tanah M. gilvus yang termasuk ke dalam subfamili Macrotermitinae tersebar luas di Asia Tenggara: Indonesia, Malaysia, Singapura, Myanmar, Filipina, Vietnam, dan Thailand. Kajian tentang rayap ini sudah banyak dilakukan, akan tetapi kajian tentang hubungan kekerabatan rayap pada beberapa lokasi belum ada, sedangkan keanekaragaman bakteri simbion di dalam saluran pencernaannya masih sedikit informasinya. Tujuan penelitian ini adalah untuk menganalisis kekerabatan rayap tanah M. gilvus dari Cagar Alam Yanlappa (CA Yanlappa), Jasinga dan Kampus IPB Dramaga. Rayap dikoleksi dengan memasang tujuh transek (1m x 10m) pada masing-masing lokasi dan semua rayap yang dikoleksi berada di dalam transek. Rayap hasil koleksi digunakan untuk tiga perlakuan: a) uji agonistik; b) molekuler rayap; dan c) identifikasi morfologi, fisiologi, dan molekuler bakteri simbion. Pengujian agonistik digunakan untuk melihat bahwa rayap-rayap tersebut berasal dari tetua yang sama atau tidak. Masing-masing koloni diadu dalam suatu arena tertutup dengan koloni yang lain sampai semua koloni rayap hasil koleksi berpasangan dan diamati agresifitasnya. DNA total rayap hasil ekstraksi kemudian diamplifikasi menggunakan gen COI dari DNAmt, dan disekuensing. Bakteri simbion diisolasi dari saluran pencernaan rayap kemudian digerus dan diencerkan, lalu di-platting ke media Nutrient Agar (NA). Koloni bakteri yang tumbuh di media kemudian dimurnikan dan diidentifikasi berdasarkan karakter mofologi dan fisiologi. Koloni bakteri yang murni kemudian diekstraksi untuk identifikasi molekuler. Tiga koloni rayap dari masing-masing lokasi dikoleksi. Perilaku agresif rayap hanya teramati pada rayap-rayap yang berasal dari koloni yang berbeda. Hasil pengujian agonistik menunjukkan bahwa rayap berasal dari tetua yang berbeda. Hasil amplifikasi gen COI pada koloni rayap dari masing-masing lokasi disekuensing. Hasil sekuensing nukleotida dari empat koloni (dua koloni dari masing-masing lokasi) menunjukkan homologi dengan M. gilvus dari Laos (No. aksesi AB909015) dengan kemiripan 97% berdasarkan BLAST-N. Hal ini berarti bahwa hasil identifikasi berdasarkan morfologi dan molekuler menunjukkan hasil yang sama yaitu M. gilvus. Delapan isolat bakteri (tiga isolat dari rayap CA Yanlappa dan lima isolat dari rayap Kampus IPB) dari hasil isolasi saluran pencernaan dikoleksi kemudian disekuensing. Hasil sekuensing nukleotida dari delapan isolat menunjukkan homologi dengan Paenibacillus naphthalenovorans, Kocuria palustris, Stenotrophomonas sp., Escherichia coli, Kluyvera sp., Ochrobactrum sp., Chryseobacterium sp., dan Pseudomonas nitroreducens (J4M1, J5P1, J5P2, D4M1, D6P1, D6P2, D6P3, dan D6P5 secara berurutan).
Keyword: Termitidae, Macrotermitinae, agonistik, gen COI, gen 16S rRNA

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: