Judul: Mutagenesis EMS dan Transposon pada Xanthomonas campestris pv. glycines VR 32 dalam upaya memperoleh galur non patogenik
Abstrak: Penyakit bisul bakteri yang disebabkan oleh Kanthomonas campestris pv. glycines merupakan salah satu penyakit bakterial penting pada tanaman kedelai di Indonesia. Sampai saat ini mekanisme patogenisitas bakteri ini belum diketahui secara pasti. Untuk mempelajari gen-gen yang terlibat dalam pembentukan bisul bakteri, perlu dicari galur non patogenik baik secara alamiah maupun melalui mutagenesis. Dalam penelitian ini dilakukan mutagenesis kimiawi dengan menggunakan ethyl metanesulfonate (EMS) dan mutagenesis hayati dengan menggunakan transposon Tn 5. Patogenisitas suatu bakteri dapat disebabkan oleh banyak faktor, antara lain enzim, toksin, eksopolisakarida, lipopolisakarida dan lain-lain. Tiga faktor yang dianalisis pada mutan hasil mutagenesis ini adalah keberadaan kapsul, enzim protease dan enzim katalase. Sedangkan tingkat patogenisitas dari mutan-mutan tersebut diuji dengan menggunakan teknik bioasai kotiledon. Melalui mutagenesis tranposon diperoleh mutan yang bersifat non patogenik yaitu mutan nomor 715. Mutan ini menunjukkan hasil positif untuk uji kapsul, uji protease dan uji katalase. Selain itu juga diperoleh mutan-mutan yang menurun tingkat patogenisitasnya yaitu sebanyak 9 mutan dari mutasi dengan transposon dan 7 mutan dari mutasi dengan EMS. Seluruh mutan ini menunjukkan hasil positif untuk ketiga uji yang dilakukan. Walaupun semua analisis mutan memberikan hasil positif namun bukan berarti ketiga faktor tersebut yaitu kapsul, protease dan katalase tidak ikut terlibat dalam mekanisme patogenisitas. Karena kemungkinan patogenisitas bakteri Xanthomonas campestris pv. glycines disandikan oleh banyak gen yang bekerjanya saling bergantung.
Keyword: Trasposon, kedelai

Judul: Konstruksi dan karakterisasi mutan protease Xanthomonas campestris pv. Glycines 8ra hasil mutagenesis transposon
Abstrak: Tujuan pada penelitian ini adalah (1) Mengkonstruksi mutan protease negatif X: campestris pv. glycines Sra dengan menggunakan mutagenesis transposon. Dalam hal ini transposon yang digunakan adalah Omegon-Km (Fellay et al., 1989); (2) Mengetahui jcnis protease yang dimiliki oleh X campestris pv. glyci11e.1· Sra; dan (3) Mengklon bagian gen protease yang dapat digunakan untuk mengklon gen struktural galur-galur X cam­pestris pv. glyci11e.1·. Mutagenesis dengan transposon dilakukan dengan konjugasi dua tetua antara X: campes/ris pv. glycines Sra dan E. coli S17-1 (pJFF350). Nilai frekuensi transkonjugasi yang diperoleh adalah I. 9 X 10·7 transkonjugan per resipien. Dari hasil mutagenesis tersebut diperoleh satu mutan protease negatif yaitu X: campestris pv. glyci11es RSSA. Hasil analisis skizotipe dengan Pulsedjield gel electrophoresis (PFGE) menggunakan enzim restriksi Ase I dan SpeI dapat membedakan dengan jelas galur RSSA dengan galur Sra. Plasmid rekombinan pLRD.6 yang diperoleh dari penelitian ini merupakan plasmid yang dikonstruksi dari X campestris pv. g!yci11es RSSA. Pada plasmid tersebut terdapat bagian gen protease yang dapat digunakan sebagai pelacak. Pelacak yang dimaksud adalah fragmen DNA yang berukuran 6.2 kb ketika pLRD.6 dipotong dengan enzim restriksi Asel. Pada penelitian ini pengklonan gen protease dengan pelacak tersebut menghasilkan tiga transforman dengan DNA insert berukuran sekitar 6.2 kb, akan tetapi i11serl tersebut bukan rnerupakan fragrnen DNA yang diinginkan. dst ...
Keyword: Xanthomonas campestries pv. glycines

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: