Judul: Karakteristik massa air arlindo di Perairan Timur Indonesia pada musim timur
Abstrak: Sirkulasi massa air di perairan timur Indonesia yang dikenal secara internasional dengan istilah Indonesian Throughflow (Bray et al., 1996) atau Arus Lintas Indonesia (Arlindo) dalam Bahasa Indonesia (Ilahude dan Gordon, 1996) sangat menarik untuk diteliti. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis massa air Arlindo di perairan timur Indonesia pada musim timur, yang meliputi analisis jalur lintasan Arlindo dan karakteristik massa air yang terlibat di dalamnya. Karakteristik massa air di Samudera Hindia dan di wilayah ekuator bagian barat Samudera Pasifik dianalisis juga sebagai bahan perbandingan. Kegiatan penelitian adalah berupa pengolahan data sekunder yang diperoleh dari the National Oceanographic Data Center (NODC), NOAA, Amerika Serikat. Lintasan Arlindo dianalisis berdasarkan gambar kontur sebaran anomali kedalaman dinamik di lapisan permukaan 0 dbar relatif terhadap permukaan 1000 dbar. Karakteristik massa air dianalisis berdasarkan ciri-ciri core layer (King, 1963) yang terlihat dalam grafik suhu-salinitas (S-S) dan grafik suhu-oksigen (S-O₂). Sebaran nilai anomali kedalaman dinamik di lapisan permukaan 0 dbar relatif terhadap permukaan 1000 dbar menunjukkan nilai yang cukup tinggi di Laut Cina, Laut Sulu, Laut Sulawesi, dan sebagian Samudera Pasifik, yaitu antara 1,8 dyn m sampai 1,9 dyn m. Di sebelah timur Mindanao nilainya lebih kecil (1,5 dyn m sampai 1,7 dyn m), sedang di sebagian Laut Sulu nilainya lebih besar (2,0 dyn m sampai 2,1 dyn m).
Keyword: 

Judul: Analisis Massa Air Arlindo di Laut Sulawesi dari Data Conductivity, Temperature, and Depth (CTD) Argo Float
Abstrak: Arlindo merupakan massa air yang mengalir dari Samudera Pasifik menuju Samudera Hindia melalui perairan Indonesia. Arlindo yang melewati perairan Indonesia terdiri dari dua jalur yaitu jalur barat dan jalur timur. Laut Sulawesi merupakan pintu masuk pertama Arlindo melalui jalur barat yang membawa massa air Pasifik Utara. Penelitian ini bertujuan untuk menggambarkan distribusi dan struktur massa air di Basin Laut Sulawesi serta menghitung kontribusi massa air Arlindo dari sisi barat dan sisi timur Laut Sulawesi. Data yang digunakan berasal dari CTD Argo Float dengan rentang waktu dari September 2016 sampai dengan Desember 2018. Analisis deskriptif digunakan untuk mengetahui distribusi dan struktur massa air. Nilai kontribusi massa air diperoleh melalui pengolahan data menggunakan software berbasis Phyton dengan menggunakan persamaan linier mixing. Terlihat bahwa stratifikasi massa air menunjukkan adanya lapisan massa air yang terdiri dari lapisan tercampur dengan kedalaman 0-80 meter, lapisan termoklin 81-197 meter, dan lapisan homogen pada kedalaman lebih dari 197 meter. Lapisan termoklin menunjukkan adanya massa air North Pacific Subtropical Water (NPSW) yang dicirikan dengan nilai S-max dengan kedalaman 81-168 meter dan kisaran salinitas 34.8-35.02 psu. Sementara itu pada lapisan pertengahan ditemukan massa air North Pacific Intermediate Water (NPIW) dicirikan dengan nilai S-min dengan kisaran salinitas 34.3-34.5 psu. Salinitas maksimum NPSW menurun dari bagian timur ke barat Laut Sulawesi karena proses pencampuran vertikal yang kuat selama perjalanannya, yang konsisten dengan hasil dari kontribusi analisis massa air.
Keyword: Arlindo, Massa air Pasifik (NPSW dan NPIW), Laut Sulawesi, CTD Argo Float, Analisis kontribusi massa air

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA