Judul: Analisis Filogenetik Hyposidra talaca Nucleopolyhedrovirus dengan sekuen DNA Polymerase
Abstrak: Tanaman teh merupakan bagian dari sektor pertanian yang menyumbang devisa untuk Indonesia hingga US$ 126 juta pada tahun 2015, yang mengalami penurunan dari tahun sebelumnya yang mencapai US$ 165 juta. Hama dan penyakit sangat berperan dalam penurunan produksi. Salah satu hama yang penting pada tanaman teh yaitu Hyposidra talaca. Hama ini dapat dikendalikan dengan menggunakan pengendalian biologis seperti Nucleopolyhedrovirus (NPV). Kelebihan penggunaan teknik PHT dengan NPV bersifat ramah lingkungan, tidak ada residu berbahaya, spesifik inang dan tidak menimbulkan serangga resisten terhadap NPV. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengkarakterisasi NPV dengan menggunakan urutan DNA Polymerase NPV. Virus NPV diisolasi dari larva Hyposidra talaca terinfeksi yang dikumpulkan dari lapangan. DNA hasil isolasi digunakan sebagai template reaksi PCR untuk menjelaskan gen DNA Ploymerase yang dipilih. Hasil pensejajaran DNA Polymerase HytaNPV memberikan informasi hubungan HytaNPV dengan NPV yang diisolasi dari daerah lain. Analsis homologi menunjukkan isolat HytaNPV Bogor memiliki kesamaan tertinggi dengan Buzura NPV dari China masing- masing sebesar 75.4% dan 78%. Berdasarkan analisis filogeni HytaNPV berada dalam satu group dengan NPV dari genus Buzura.
Keyword: DNA Polymerase, Hyposidra talaca, karakterisasi molekuler, NPV

Judul: Karakterisasi Molekuler Sekuen Parsial DNA Polimerase Hyposidra talaca Nucleopolyhedrovirus (HytaNPV)
Abstrak: Hyposidra talaca (Walker) adalah hama penting pada tanaman teh. Larva H. talaca adalah hama yang dapat menyebabkan kerugian antara 40-100% di musim kemarau jika kontrol yang tepat tidak dilakukan. H. talaca memiliki musuh alami seperti predator, parasitoid, dan patogen. Salah satu entomopatogen H. talaca adalah NPV. Penelitian ini bertujuan untuk memperoleh karakteristik molekuler melalui sekuens nukleotida isolat NPV yang berasal dari H. talaca yang dikumpulkan dari Kebun Teh Gunung Mas, PTPN 8, Bogor dengan teknik molekuler. Spesies yang sama dari lokasi yang berbeda dapat memiliki variabilitas genetik, oleh karena itu karakterisasi molekuler dengan Polymerase Chain Reaction (PCR) pada sekuen DNA polimerase adalah salah satu cara untuk mempelajari genetik HytaNPV. NPV diisolasi dari larva H. talaca terinfeksi yang dikumpulkan dari lapangan. Isolat DNA digunakan sebagai cetakan untuk PCR untuk amplifikasi gen DNA polimerase dengan target amplikon ±1 000 pb. DNA hasil PCR disekuens untuk memperoleh data urutan nukleotida. Hasil sekuensing DNA polimerase HytaNPV disejajarkan dengan data BLAST Genbank untuk memberikan informasi tentang hubungan HytaNPV dengan NPV yang diisolasi dari daerah lain. Berdasarkan analisis urutan DNA polimerase, HytaNPV Bogor memiliki tingkat homologi 93.9% dengan HytaNPV yang diisolasi dari India. HytaNPV Bogor memiliki hubungan genetik dengan NPV yang menginfeksi Buzura suppressaria dari Cina dan Australia. HytaNPV Bogor sangat mirip dengan NPV yang menginfeksi H. talaca dari India.
Keyword: Entomopatogen, variabilitas genetik, polymerase chain reaction, karakteristik molekuler, teh

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: