Judul: Potensi Plantarisin F Rekombinan Dengan Penambahan Edta Dalam Menghambat Salmonella Sp. 38
Abstrak: Salmonella sp. 38 tergolong dalam bakteri gram negatif, yang diisolasi dari feses anak-anak penderita diare. Penggunaan antibiotik untuk pengobatan diare dapat menimbulkan resistensi bakteri, sehingga diperlukan alternatif pengobatan lain. Plantarisin F rekombinan yang dihasilkan Lactococcus lactis pNZ8148 Pln F dapat menjadi alternatif antibakteri alami. Aktivitas antibakteri plantarisin F terhadap bakteri gram negatif dapat ditingkatkan dengan penambahan EDTA. Penelitian ini bertujuan menguji potensi antibakteri plantarisin F rekombinan dengan penambahan EDTA terhadap Salmonella sp. 38. Metode awal adalah memproduksi plantarisin dengan menumbuhkan L. lactis pNZ8148 rekombinan F pada media M17 glukosa. Uji aktivitas antimikroba plantarisin dilakukan secara kualitatif menggunakan metode difusi agar. Purifikasi plantarisin menggunakan amonium sulfat 80% dan kolom filtrasi Sephadex G50. Sampel hasil purifikasi diukur bobot molekul proteinnya menggunakan elektroforesis SDS-PAGE. Plantarisin hasil produksi dan purifikasi diukur konsentrasi proteinnya menggunakan BCA kit. Sampel hasil purifikasi ditambahkan EDTA dengan konsentrasi 1 mM, 5 mM 10 mM dan 20 mM. Hasil produksi diperoleh 200 mL supernatan bebas sel. Hasil purifikasi dengan amonium sulfat 80% menunjukkan aktivitas plantarisin sebesar 14,78 AU/mg dengan kandungan protein sebanyak 13,54 mg. Hasil purifikasi dengan kolom filtrasi Sephadex G-50 menunjukkan aktivitas plantarisin sebesar 22,01 Au/mg dengan kandungan protein sebanyak 5,77 mg. Hasil pengukuran menggunakan elektroforesis SDS-PAGE 16% menunjukan bobot molekul plantarisin F adalah 3,85 kDa. Penambahan 20 mM EDTA pada plantarisin F rekombinan memperlihatkan peningkatan aktivitas antibakteri paling tinggi.
Keyword: EDTA, Lactococcus lactis, Plantarisin F rekombinan, Salmonella sp. 38

Judul: Toksisitas dan Efektivitas Plantarisin E dan F Lactococcus lactis pada Mencit ddY yang diinfeksi EPEC K1.1.
Abstrak: Enterophatogenic Escherichia coli (EPEC) K1.1 merupakan salah satu bakteri gram negatif yang menyebabkan diare dan resisten terhadap beberapa jenis antibiotik. Salah satu solusi untuk mengatasi masalah tersebut adalah dengan mengembangkan bahan antimikrob baru yang memiliki kemampuan membunuh patogen tersebut. Peptida antimikrob/antimicrobial peptides (AMP) merupakan suatu produk metabolisme primer bakteri asam laktat, salah satunya adalah plantarisin, yang memiliki kemampuan membunuh patogen. Karakteristik plantarisin yang mudah didegradasi oleh enzim proteolitik dan tidak membahayakan mikroflora usus menjadikan plantarisin dapat digunakan sebagai kandidat bahan obat. Pada penelitian sebelumnya telah dilakukan seleksi bakteri yang mampu memproduksi plantarisin. Gen penyandi plantarisin E dan F pada bakteri terpilih diisolasi kemudian ditransformasikan pada E.coli BL21 untuk meningkatkan jumlah produksi dan kemurnian bahan tersebut. Selanjutnya gen plantarisin yang telah ditransformasikan ke E.coli BL21 dipindahkan ke vektor produksi Lactococcus lactis NZ3900 untuk memudahkan aplikasi dan produksi plantarisin. Uji aktivitas plantarisin E dan F rekombinan secara in vitro menunjukkan aktivitas antimikrob terhadap E. coli ATCC, Staphylococcus aureus, Listeria monocytogenes, Bacillus cereus, Coliform dan EPEC K1.1. Sebagai kandidat bahan obat, tahap selanjutnya yang harus dilakukan adalah pengujian terhadap keamanan dan efektivitas plantarisin secara in vivo. Uji keamanan atau toksisitas secara in vivo diperlukan untuk menilai keamanan suatu senyawa kimia maupun bahan obat. Uji efektivitas antimikrob secara in vivo diperlukan untuk mengetahui efektivitas plantarisin dalam melawan patogen dalam tubuh makhluk hidup. Oleh karena itu pada penelitian ini dilakukan pengujian untuk mengetahui keamanan dan efektivitas plantarisin E dan F rekombinan pada mencit yang diinfeksi EPEC K1.1 sebagai bakteri patogen. Uji keamanan dilakukan dengan memberikan plantarisin E dan F rekombinan dosis 50, 100, 1000, dan 5000 mg/KgBB secara peroral. Selanjutnya dilakukan pengamatan terhadap keadaan kulit dan bulu, mata, letargi (kelesuan), konvulsi (kejang), tremor (gemetar), diare, dan kematian selama 48 jam. Analisa hematologi, biokimia darah, dan histopatologi organ hati dan ginjal dilakukan pada akhir pengamatan. Uji efektivitas antimikrob dilakukan dengan menginfeksi mencit dengan EPEC K1.1 dosis 108 cfu/mL selama 7 hari. Selanjutnya mencit diberikan NaCl, antibiotik, maltodekstrin, plantarisin E dan F dosis 100, 250, dan 500 mg/KgBB selama 7 hari. Pengamatan gejala klinis seperti letargi (kelesuan), konvulsi (kejang), tremor (gemetar), diare, dan kematian dilakukan selama perlakuan. Analisa hematologi dilakukan pada saat sebelum perlakuan, setelah infeksi EPEC K1.1, dan di akhir perlakuan. Analisa kadar malondialdehid dan histopatologi organ usus halus dilakukan di akhir perlakuan. Hasil uji toksisitas akut menunjukkan bahwa pemberian plantarisin E dan F rekombinan hingga dosis 5000 mg/KgBB tidak mengakibatkan kematian pada 5 kelompok mencit uji. Pengamatan hematologi dan biokimia darah menunjukkan kadar leukosit, eritrosit, hematokrit, hemoglobin, trombosit, urea, kreatinin, SGOT dan SGPT yang normal. Pengamatan histopatologi menunjukkan gambaran sel hati dan ginjal yang normal. Hasil uji efektivitas antimikrob terhadap EPEC K1.1 menunjukkan perbaikan kadar leukosit, hematokrit, dan hemoglobin pada semua kelompok mencit yang diberikan plantarisin E dan F. Pengamatan histopatologi organ usus halus menunjukkan adanya infiltrasi sel radang mononuklear dalam jumlah sedikit (<25) pada kelompok mencit yang diberikan plantarisin E dosis 250 dan 500 mg/KgBB serta plantarisin F dosis 500 mg/KgBB. Plantarisin E dan F rekombinan diduga memiliki aktivitas antioksidan yang ditunjukkan dengan rendahnya kadar malondialdehyde (MDA). Dosis efektif plantarisin E dalam mengatasi diare yang disebabkan
Keyword: rekombinan, plantarisin, EPEC K1.1, mencit ddY

Judul: Thermal Characteristics and Dynamics of Tropical Cyclone over Western North Pacific Ocean: A Case Study of Typhoon Songda (Chedeng) 2011
Abstrak: The frequent occasion of Tropical Cyclone (TC) over Western North Pacific (WNP) Ocean lies from 10˚N to 26˚N and 121˚E to 170˚E. Sources of TC development come from warm ocean temperature where latent heat is released during condensation processes and subsequently concentrated in the boundary layer. Relative humidity at 850-700 hPa is responsible to produce the most intense storm. Meanwhile, weak vertical wind shear between 850-200 hPa is one of the dynamical factors that lead to the development of TC. Pressure level of 850-200 hPa is chosen to minimize the thermodynamic effect in the lower troposphere. Typhoon Songda (Chedeng in the Philippines) or TSC lasted from May 18th to 30th, 2011 and strengthened into powerful Super Typhoon stage between May 24th and 27th. Long curving track and the exhibition of all sequences of TC life cycle, TSC is then considered as an ideal case of TC. The objective of the study with case of TSC is to investigate the role of thermal characteristics and dynamics on TC intensity. The research is carried out by using Advanced Research of Weather Research and Forecasting model (WRF ARW model) version 3.3. Two domains are employed in the model. The first domain situate from 02˚N to 40˚N and 118˚E to 149˚E and cover spatial resolution () of 33.1 km. The second domain situate from 09˚N to 27˚N and 119˚E to 132˚E with of 11 km. Timestep of the model () is 120 seconds. The model is supported by the following physical parameterization, i.e., Yonsei University Scheme (YSU) in the boundary layer, Kain-Fritsch scheme (KF) in the cumulus, and WRF Single-Moment 3-class scheme in the microphysics. Initial meteorological condition prior to the formation of the cyclone is generated using WRF ARW standard-release model. Sensitivity of the model output is obtained from a selected single-parameter change scenarios, namely, 10 % to 20 % decrease and increase of wind shear initial data at 850-200 hPa, and by 10 % to 20 % decrease of relative humidity initial data at 850-700 hPa. The result showed that the negative correlations between wind shear and intensity are found in wind shear scenarios. Wind shears of 10 ms-1 which lead to strengthening of the wind intensity in the early period of Typhoon development are found in wind shear scenarios. The effect of wind shear changes on wind intensity is statistically significant in the 20 % wind shear scenarios. During mature stage, weak wind intensity occurred when wind shear increase as given in the WRF standard-release and the 20 % decreasing scenario. Different situation is found in the 20 % increasing scenario where wind shear tend to weak and lead to strong wind intensity at this stage. Meanwhile, the reduction of moisture supply at 850-700 hPa resulting from 20 % decreasing relative humidity play a major role in the weakening of wind intensity and reduces mechanical energy of the cycle process as much as 300 J kg-1.
Keyword: