Judul: Analisis In Silico Senyawa Aktif Tumbuhan Kayu Manis (Cinnamomum burmannii) sebagai Inhibitor 3C-Like Protease (3CLpro) SARS-CoV-2 di Indonesia
Abstrak: Coronavirus disease 2019 (COVID-19) merupakan penyakit yang disebabkan virus SARS-CoV-2. Senyawa aktivitas antivirus berpotensi dapat menghambat enzim 3CLpro yang berperan dalam proses replikasi SARS-CoV-2. Kayu manis memiliki senyawa aktif antivirus, namun potensinya sebagai inhibitor 3CLpro belum diketahui. Penelitian ini bertujuan menganalisis potensi senyawa aktif kayu manis sebagai inhibitor 3CLpro (EPI_ISL_576383) secara in silico. Penambatan molekuler dengan autodock vina dilakukan terhadap 40 ligan uji menunjukkan sembilan ligan uji memiliki afinitas pengikatan lebih baik dibandingkan dengan JRY1 berdasarkan energi bebas Gibbs, konstanta inhibisi, dan interaksi terhadap residu penting, yaitu benzyl benzoate, caffeic acid, 3- phenylacetate, bornyl acetate, hydrocinnamic acid, eugenol, linalool, α-terpineol, dan 3-phenyl-2-propen-1-ol. Benzyl benzoate merupakan senyawa aktif dengan energi bebas Gibbs dan konstanta inhibisi terendah (-4,5 kkal/mol dan 0,498 µM) yang berinteraksi dengan 10 residu penting di sisi aktif 3CLpro. Linalool dan eugenol merupakan senyawa penciri kayu manis yang memiliki energi bebas Gibbs dan kontanta inhibisi (-3,6 kkal/mol dan 2,281 µM) berinteraksi dengan residu sisi aktif 3CLpro., Coronavirus disease 2019 (COVID-19) is a disease caused by the SARSCoV-2 virus. Compounds with antiviral activity have the potential to inhibit the 3CLpro enzyme which plays a role in the SARS-CoV-2 replication process. Cinnamomun burmannii has antiviral active compounds but its potential as 3CLpro inhibitor is still unknown. This study aimed to analyze the potency of the active compound of cinnamon as an inhibitor 3CLpro (EPI_ISL_576383) by in silico method. Molecular docking with Autodock vina performed on 40 test ligands showed that nine test ligands had better binding affinity than JRY1 based on Gibbs free energy, inhibition constants, and interactions with important residues, namely benzyl benzoate, caffeic acid, 3-phenylacetate, bornyl acetate, hydrocinnamic acid, eugenol, linalool, α-terpineol, and 3-phenyl-2-propen-1-ol. Benzyl benzoate is the active compound with Gibbs free energy and lowest inhibition constant (-4.5 kcal/mol and 0.498 µM) which interacts with 10 important residues on the active site of 3CLpro. Linalool and eugenol are characteristic compounds of Cinnamomum burmannii which have Gibbs free energy and inhibition constants (-3.6 kcal/mol and 2.281 µM) that interact with the residue of active site 3CLpro
Keyword: 3CLpro, Cinnamomum burmannii, In silico, SARS-CoV-2

Judul: Analisis In Silico Senyawa Aktif Kulit Kayu Gmelina (Gmelina arborea) Terhadap Penghambatan 3C-like Protease SARS-CoV-2 EPI_ISL_467376
Abstrak: SARS-CoV-2 merupakan virus yang saat ini menyebar ke seluruh dunia, salah satunya yaitu Indonesia. Virus SARS-CoV-2 dapat menyebabkan penyakit COVID-19 dengan berbagai gejala dan dapat menyebabkan kematian. Replikasi virus ini disebabkan adanya aktivitas protein 3C-like Protease. Potensi penghambatan 3C-like Protease oleh senyawa aktif pada kulit kayu gmelina dapat dianalisis secara in silico untuk melihat interaksi senyawa dengan reseptor. Penelitian ini bertujuan mempelajari interaksi antara senyawa aktif kulit kayu gmelina (Gmelina arborea) dalam menghambat reseptor 3C-like Protease SARS-CoV-2 EPI_ISL_467376 melalui uji in silico dengan parameter energi bebas Gibbs (ΔG), konstanta inhibisi, ikatan hidrogen, dan interaksi hidrofobik. Potensi terbaik terlihat pada Balanophonin dengan ΔG -6.6 kkal/mol dan Ki -14.43 μM. Ikatan hidrogen yang dihasilkan sebanyak satu dan interaksi hidrofobik yang dihasilkan sebanyak 15. Berdasarkan parameter tersebut, kulit kayu gmelina berpotensi dalam menghambat 3C-like Protease SARS-CoV-2 EPI_ISL_467376. Kata kunci: Molecular docking, SARS-CoV-2, senyawa aktif, 3C-like Protease, SARS-CoV-2 was a virus that spread all over the world nowadays, one of them was Indonesia. The SARS-CoV-2 virus was able to cause COVID-19 disease with various symptoms and was able to cause death. The replication of this virus was due to protein of 3C-like Protease activity. Inhibition potential of 3C-like Protease by active compounds on gmelina’s bark can be analyzed in silico to see compounds interaction with the receptor. This research aimed to study the interaction between active compounds of gmelina’s bark (Gmelina arborea) in inhibiting the receptor of SARS-CoV-2 3C-like Protease from Indonesia with the parameter of Gibbs free energy (ΔG), inhibition constant, hydrogen bond, and hydrophobic interaction. Best potential was seen on Balanophonin with ΔG -6.6 kcal/mol and Ki -14.43 μM. Based on that parameter, gmelina’s bark had the potential in inhibiting SARS-CoV-2 3C-like Protease from Indonesia. Keywords: Active compounds, molecular docking, SARS-CoV-2, 3C-like Protease
Keyword: Active compounds, Molecular docking, SARS-CoV-2, 3C-like Protease

Judul: Massa Graviton Berdasarkan Teori De Rham- Gabadadze-Tolley Dalam Model Alam Semesta Datar Friedmann-Lemaitre- Roberson-Walker
Abstrak: Teori Relativitas Umum memprediksi ekspansi alam semesta diperlambat, sedangkan hasil observasi supernova tipe Ia mendapati ekspansi alam semesta dipercepat. Teori Relativitas Umum dimodifikasi melalui pendekatan teori gravitasi bermassa nonlinier oleh de Rham-Gabadadze-Tolley (dRGT). Massa graviton dimunculkan untuk dinamika skala sangat besar. Persamaan medan Einstein teori dRGT dapat dirumuskan dari prinsip variasi. Selanjutnya dengan memilih metrik datar Friedmann-Lemaitre-Roberson-Walker dapat diformulasikan bentuk persamaan Friedmann yang relevan dengan model ekspansi dipercepat. Hasil akhirnya, dengan membandingkan massa graviton dari metode Extremely Low Energy (ELE) dapat dihitung massa kritis graviton yaitu sekitar - . .
Keyword: massa graviton, teori dRGT, persamaan medan Einstein, persamaan Friedmann, ekspansi alam semesta dipercepat