Judul: Sensitivitas Metode Serologi dan Polymerase Chain Reaction untuk Deteksi Virus pada Bawang (Allium spp.).
Abstrak: Infeksi Onion yellow dwarf virus (OYDV), Shallot yellow stripe virus (SYSV) dan Garlic common latent virus (GCLV) sudah banyak dilaporkan di Indonesia. Metode serologi yang sering digunakan untuk deteksi virus pada tanaman adalah enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), dan dot immuno binding assay (DIBA); sedangkan metode molekuler polymerase chain reaction (PCR) merupakan metode molekuler yang banyak digunakan saat ini. Penelitian ini bertujuan mengevaluasi tiga metode deteksi virus, yaitu ELISA, DIBA dan PCR sebagai metode yang akurat dan sensitif untuk mendeteksi virus pada tanaman bawang. Batas sensitivitas tiap metode diuji dengan beberapa tingkat pengenceran cairan perasan tanaman dan antibodi untuk ELISA dan DIBA, serta pengenceran cDNA untuk metode RT-PCR. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa metode DIBA dapat mendeteksi OYDV, GCLV, dan SYSV hingga pengenceran antigen berkisar antara 10-1 hingga 10-2, dengan pengenceran antibodi berkisar antara 1:300 hingga 1:1000. Metode ELISA dapat mendeteksi virus yang sama hingga pengenceran antigen 10-1, 10-3, dan 10-5, dengan pengeceran antibodi berkisar 1:300 hingga 1:1000. Metode PCR merupakan metode yang paling sensitif dibandingkan dengan ELISA dan DIBA karena memiliki akurasi, spesifikasi, efisiensi, dan batas sensitivitas yang lebih tinggi. Metode PCR dapat mendeteksi Potyvirus dan Carlavirus hingga pengenceran cDNA 10-3 dan 10-4, sedangkan deteksi dengan primer spesifik dinilai lebih sensitif karena dapat mengamplifikasi OYDV, GCLV, dan SYSV hingga pengenceran cDNA 10-5.
Keyword: dot immunobinding assay, enzyme-linked immunosorbent assay, Garlic common latent virus, Onion yellow dwarf virus, Shallot yellow stripe virus

Judul: Deteksi Garlic common latent virus dan Shallot latent virus pada Beberapa Fase Pertumbuhan Tanaman Bawang Merah dan Bawang Putih.
Abstrak: Garlic common latent virus (GCLV) dan Shallot latent virus (SLV) adalah anggota genus Carlavirus yang dilaporkan banyak menginfeksi tanaman bawang merah dan bawang putih di Indonesia. Penelitian ini bertujuan untuk mengukur perbedaan titer GCLV dan SLV pada berbagai fase pertumbuhan tanaman bawang merah dan bawang putih sehingga dapat memberikan dasar penentuan metode deteksi virus yang lebih baik. Penelitian disusun menggunakan rancangan acak lengkap (RAL). Kultivar yang digunakan yaitu bawang merah „Bima Curut‟, bawang putih „Sembalun‟, dan bawang merah dan bawang putih konsumsi. Deteksi virus dilakukan dengan metode enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) pada empat fase tumbuh yaitu bakal tunas, tunas, daun 7 hari setelah tanam (HST), dan daun 14 HST. Perubahan titer GCLV dan SLV pada bawang merah dan bawang putih memiliki pola yang sama, yaitu cukup tinggi pada fase bakal tunas, menurun pada fase tunas, kemudian mulai meningkat lagi pada 7 HST dan meningkat tajam pada 14 HST. Insidensi infeksi GCLV dan SLV tidak berbeda nyata antara umbi benih bawang merah („Bima Curut‟) dan bawang putih („Sembalun‟) dengan umbi yang diperoleh di pasar (konsumsi). Hasil penelitian ini menunjukkan pentingnya melakukan deteksi virus pada fase pertumbuhan tanaman yang tepat karena umbi berpotensi sebagai sumber inokulum primer virus di lapangan.
Keyword: Carlavirus, enzyme-linked immunosorbent assay, inokulum primer, titer virus

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: