Judul: Design of Primers Specific to Alopias superciliosus Species for Colorimetric LAMP Identification Method
Abstrak: Tingginya permintaan dunia terhadap ikan hiu paitan (Alopias superciliosus) membuat spesies tersebut mengalami eksploitasi berlebihan dan saat ini masuk kategori vulnerable dan Appendix II CITES. Identifikasi molekuler untuk mendeteksi jenis ikan hiu penting dilakukan untuk memastikan bahwa hiu yang diperdagangkan bukan termasuk jenis hiu yang dilindungi. Deteksi cepat spesies Alopias superciliosus dapat dilakukan dengan LAMP kolorimetri. Penelitian bertujuan mengidentifikasi primer spesifik spesies Alopias superciliosus menggunakan marka gen COI dan NADH2 serta optimasi waktu dan suhu yang digunakan dengan metode LAMP kolorimetri. Penelitian diawali dengan merancang primer DNA mitokondria COI dan NADH2 secara in silico. Selanjutnya primer diuji secara in vitro bersama isolat DNA hasil isolasi. Penelitian secara in silico menghasilkan set primer COI dan NADH2 yang terdiri dariprimer F3, B3, FIP, BIP, dan tambahan primer loop LB. Set primer LB gen COI dapat mendeteksi sampel target pada suhu 65°C selama 30 menit dengan tingkat spesifisitas hingga konsentrasi paling rendah 0,01 pg/µL. Set primer LB gen NADH2 dapat mendeteksi sampel pada suhu 70°C selama 27 menit., The high global demand for Paitan Shark (Alopias superciliosus) has led to overexploitation and the species is currently categorized as vulnerable and Appendix II of CITES. Molecular identification to detect the type of shark is important to ensure that the shark being traded is not a protected species. Rapid detection of Alopias superciliosus species can be done by colorimetric LAMP. This study aims to identify Alopias superciliosus species-specific primers using COI and NADH2 gene markers and optimize the time and temperature used with colorimetric LAMP method. The research began by designing COI and NADH2 mitochondrial DNA primers in silico. Furthermore, the primers were tested in vitro with isolated DNA isolates. In silico research produced COI and NADH2 primer sets consisting of F3, B3, FIP, BIP, and additional LB loop primers. The COI gene LB primer set can detect target samples at 65°C for 30 minutes with specificity up to a concentration of at least 0.01 pg/µL. The NADH2 gene LB primer set can detect samples at 70°C for 27 minutes.
Keyword: Alopias superciliosus, COI, Colorimetric LAMP, NADH2

Judul: Design of Alopias pelagicus Specific Mitochondrial DNA  Primers for Colorimetric LAMP Identification
Abstrak: Alopias pelagicus atau yang biasa dikenal di Indonesia dengan nama hiu monyet atau hiu tikus yang memiliki status konservasi yang sudah terancam punah (endangered). Identikasi produk ikan hiu olahan lebih sulit dilakukan dan membutuhkan metode yang lebih akurat karena ikan telah menjadi bentuk potongan. Metode deteksi cepat yang dapat dikembangkan dan berpotensi untuk digunakan langsung di lapangan adalah loop-mediated isothermal amplification (LAMP) kolorimetri. Penelitian ini bertujuan untuk mendesain primer spesies spesifik dua marka gen, yaitu COI dan NaDH Subunit II dan optimasi proses amplifikasi isothermal spesifik pada ikan hiu Alopias pelagicus serta aplikasinya untuk produk hasil perikanan. Metode yang digunakan adalah ekstraksi DNA, desain primer secara in silico, pengujian LAMP kolorimetri, dan analisis data. Hasil penelitian diperoleh set primer gen COI dan NaDH Subunit II yang memiliki spesifitas terbaik dan dibuktikan secara in-vitro menggunakan metode LAMP kolorimetri. Primer LAMP spesifik menggunakan marka DNA mitokondria COI dan NaDH Subunit II dengan metode loop-mediated isothermal amplification (LAMP) serta memenuhi parameter ideal primer. Pengujian lanjut secara in-vitro menggunakan LAMP dengan optimasi berupa variasi perlakuan suhu dan pilihan set primer yang digunakan memberikan hasil uji in-vitro yang spesifik hanya untuk target Alopias pelagicus pada produk fillet hiu.
Keyword: Alopias pelagicus, LAMP Colorimetrics

Judul: Dynamics Model for Rural and Urban Economic Growth
Abstrak: Lewis theory of structural change has focused on mechanisms that allow countries to transform their domestic economic structure to a more modern economy. The proposed model deals with the mechanism of interaction between rural and urban Economic. This model is concerned with the process of labor transfer from rural to urban areas. This study aims to model the dynamics of economic growth in rural and urban areas, including determining the equilibrium solution and to carry out simulation of the model. The simulation results show that the transfer of labor from rural to urban areas will increase the rate of change of capital so that structural changes can be realized. In addition, increased propensity to save in rural areas will also accelerate structural change
Keyword: