Judul: Keragaman Genetik Dan Rekonstruksi Filogeni Ikan Kerapu Genus Epinephelus Dari Beberapa Perairan Indonesia
Abstrak: Ikan kerapu dari genus Epinephelus merupakan jenis ikan demersal yang sebagian hidupnya di daerah terumbu karang pada perairan tropis dan subtropis. Namun beberapa jenis pada fase juvenil dan larva ditemukan di daerah hutan mangrove dan padang lamun. Jumlah jenis ikan kerapu banyak ditemukan di perairan Indonesia, tercatat ada sekitar 110 spesies yang hidup di perairan Indo-Pasifik. Para nelayan telah melakukan penangkapan ikan kerapu meliputi hampir semua perairan karang yang ada di Indonesia. Hal ini disebabkan karena keuntungan yang diperoleh dalam perdagangan kerapu hidup sangat besar. Eksploitasi yang tinggi dan kurangnya upaya konservasi dapat menyebabkan berkurangnya stok ikan kerapu pada beberapa perairan di Indonesia. Upaya konservasi yang dapat dilakukan adalah dengan menjaga sumberdaya genetik, jenis dan ekosistem ikan tersebut. Sumber daya genetik merupakan tahapan dasar dalam upaya melindungi sumber daya ikan kerapu, melalui teknik DNA barcoding dan studi filogeni. Metode ini akan memudahkan dalam identifikasi bahkan hingga pada tingkatan spesies jika dibandingkan dengan hanya menggunakan metode identifikasi berdasarkan karakter morfologi. Penelitian ini menggunakan sampel ikan kerapu genus Epinephelus sebanyak 39 individu yang diambil dari perairan Lombok 12 individu, Karimunjawa 11 individu, Lampung 4 individu, Kendari, Madura, Numfor dan Tanakeke masing-masing 3 individu. Sampel dipreservasi kemudian dilanjutkan dengan proses ekstraksi, amplifikasi PCR (Polymerase Chain Reaction) dan elektroforesis di Laboratorium Biodiversitas dan Biosistematika Kelautan, Departemen Ilmu dan Teknologi Kelautan, IPB. Tahapan sekuensing selanjutnya dikirim ke Berkeley Sequencing Facility, USA dengan metode Sanger, didapatkan panjang sekuen semua sampel sebesar 526bp. Analisis data menggunakan program MEGA 6.0.5 dengan metode filogenetik Neighbor Joining (NJ) dan Maksimum Likelihood (ML), model evolusi Kimura 2-parameter dan replikasi bootstraps 1000x. Dari pohon filogeni terbentuk sebanyak tujuh clade. yaitu Epinephelus areolatus, Epinephelus merra, Epinephelus fasciatus, Epinephelus longispinis, Epinephelus coioides, Epinephelus ongus dan Epinephelus coeruleopunctatus. Selain itu, jarak genetik terdekat didapatkan adalah Epinephelus ongus dan Epinephelus coeruleopncstatus dengan jarak genetik 0.091 (9%) dan jarak genetik terjauh antara Epinephelus ongus dan Epinephelus merra dengan jarak genetik 0.178 (18%).
Keyword: Keragaman Genetik, Filogeni, Epinephelus, Perairan Indonesia.

Judul: Analisis Filogenetik Beberapa Kerapu Subfamili Epinephelinae (Serranidae) Indo-Pasifik Barat Dari Perairan Indonesia.
Abstrak: Kelompok ikan serranid dari subfamili Epinephelinae terdiri atas sekitar 159 spesies yang termasuk dalam 15 genera, umumnya dikenal sebagai ikan kerapu, rockcods, hinds, dan seabasses. Ikan komersial penting ini merupakan ikan penghuni dasar perairan yang dapat ditemukan di daerah perairan tropis maupun subtropis. Sebagian besar spesies ikan ini menghuni habitat terumbu karang, sedangkan sebagian lainnya hidup di muara atau karang berbatu. Kerapu memiliki nilai ekonomi tinggi, namun kalsifikasi dan hubungan evolusi mereka seringkali terkendala oleh jumlah spesies yang luar biasa banyak, distribusi yang luas, serta kurangnya keahlian dalam identifikasi morfologi. Hal ini menyebabkan apapun jenis ikan yang tertangkap di lapangan dari anggota subfamili Epinephelinae seluruhnya disebut sebagai kerapu. Wilayah Indo-Pasifik memiliki jenis ikan kerapu yang paling beragam daripada daerah lain seperti di Atlantik Barat, Atlantik Timur, dan Pasifik Timur. Oleh karena itu perairan Indo-Pasifik menjadi wilayah yang sangat menarik untuk memahami hubungan filogenetik ikan kerapu khususnya di wilayah perairan Indonesia. Dalam penelitian ini, digunakan ruas gen sitokrom oksidase c subunit 1 (CO1) sebagai penanda molekuler untuk menganalisis hubungan antara beberapa jenis kerapu dari wilayah perairan Indonesia. Spesimen diperoleh dari berbagai macam sumber termasuk hasil pancing tradisional, pasar ikan, dan tempat pelelangan ikan dari beberapa titik sampling yaitu Banda Aceh (Sumatera), Luwuk (Sulawesi), Kupang (East Nusa Tenggara), Pangandaran (West Java), Raja Ampat (Papua), Sinjai, and Selayar Island (South Sulawesi). Jaringan yang digunakan sebagai sumber DNA berasal dari otot dorsal, insang, serta sirip. Seluruh sampel jaringan untuk keperluan analisis molekuler disimpan dalam alkohol 95%. Sebanyak 26 urutan sekuen DNA dari 14 spesies kerapu dari wilayah perairan Indonesia yang termasuk ke dalam 5 genera (Anyperodon, Cephalopholis, Epinephelus, Plectropomus, dan Variola) berhasil diperoleh dan dipelajari hubungan kekerabatannya dalam penelitian ini. Beberapa sekuen juga telah didepositkan ke GenBank. Sebuah pohon filogeni yang dibangun menggunakan metode Neighbor-Joining (NJ) (Kimura 2-parameter) berhasil diperoleh berdasarkan runutan parsial gen CO1 dengan menggunakan Haemulon scuderii sebagai outgroup. Kemunculan Anyperodon dalam kelompok Epinephelus menyebabkan kelompok ini menjadi tidak monofiletik. Genus Cephalopholis lebih primitif dibandingkan genus Epinephelus. Plectropomus dan Variola menempati posisi basal dalam pohon filogeni, hal ini memungkinkan keduanya merupakan kelompok yang yang primitif diantara kelompok subfamili Epinephelinae yang lain. Hingga saat ini identifikasi fenotipik terhadap kelompok ikan serranid dilakukan berdasarkan perbedaan pola warna dan beberapa karakter morfologi, seperti jumlah jari-jari keras dan lunak, serta bentuk sirip ekor. Namun identifikasi berdasarkan pola warna dan beberapa karakter morfologi tersebut seringkali terkendala oleh adanya variasi intraspesifik serta perbedaan morfologi yang sangat mencolok pada satu spesies yang sama antara individu yang masih juvenil dengan individu yang telah dewasa sehingga menimbulkan kebingungan dalam penentuan spesies kelompok ikan serranid. Berkaitan dengan hal tersebut, salah satu contoh kasus yang diungkap dalam penelitian ini adalah penentuan spesies dari individu yang masih juvenile pada genus Epinephelus (Epinephelus erythtrurus). Analisis dilakukan dengan mengombinasikan identifikasi secara morfologi dan secara molekuler (CO1). Hasil penelitian ini diharapkan dapat berguna untuk dunia taksonomi dalam memahami analisis hubungan filogenetik antara beberapa jenis kerapu Indo Pasifik Barat di perairan Indonesia.
Keyword: CO1, Epinephelinae, Filogenetik, Indo Pasifik Barat, Kerapu

Judul: Photosensor producing based on ferroelectric material of Ba0,5Sr0,5TiO3 doped by Ferrium Oxide (Fe2O3) on a P-Type Silicon Substate Si (100) applied as a digital camera with a single pixel image sensor
Abstrak: Thin film Ba0,5Sr0,5TiO3 (BST) doped with Fe2O3 was grown on p-type silicon substrate (100) using chemical solution deposition (CSD). It used the solvent 2-methoxyethanol with annealing temperature of 850°C and the doping treatment Fe2O3 of 2.5, 5, 7.5, 10 % of the mass formed BST. Pure BST had the highest absorption of 600 nm of light wavelength. Additions Fe2O3 moves highest absorption in the range of 560 nm. Fe2O3 addition was strengthening thin film sensitivity to the effects of light. In general, doping Fe2O3 10% was result the best absorbance and current-voltage of BST thin film. Electrical properties of thin films BST include dielectric, photoconductivity, and dissipation energy. Based on the current-voltage (I-V) analysis, pure BST and doped BST showed photodiode properties. Dielectric values obtained in the range from 23.32 to 243. Based on electrical conductivity data and energy dissipation, BST thin films have shown photodiode characteristics and are therefore suitable as light sensors. The image sensor in a digital camera is also a light sensor. This BST thin film has been scientifically proven to be a light sensor and also it can be applied as an image sensor. This is a novelty image sensor based on thin film Ba0.5Sr0.5TiO3.
Keyword: barium strontium titanate, thin film, photodiode, image sensor, digital camera