Judul: Struktur Dan Sebaran Meiofauna Pada Ekosistem Lamun Di Perairan Pulau Pari, Kepulauan Seribu
Abstrak: Meiofauna merupakan organisme benthos yang hidup meliang dalam substrat lamun dan berperan penting dalam siklus biogeokimia sejumlah unsur hara penting di pesisir. Tujuan penelitian ini adalah mengkaji (1) struktur dan sebaran komunitas meiofauna pada ekosistem lamun dan (2) hubungan ekologi meiofauna dengan karakteristik lingkungan habitat lamun di Pulau Pari. Penelitian dilakukan pada bulan Maret–Juni 2015 di 2 stasiun penelitian. Sampel meiofauna diambil menggunakan corer (d=4.5 cm , t=15 cm) yang dibenamkan di dalam transek pengamatan lamun berukuran 11 m2. Sejumlah parameter fisika-kimia lingkungan juga diukur. Analisis data yang dilakukan adalah Analisis Komponen Utama. Hasil penelitian menunjukkan bahwa komunitas meiofauna di Pulau Pari terdiri dari 10 fila, 19 kelas, 37 ordo, 81 famili dan 120 genera, dengan Nematoda sebagai jenis yang dominan. Meiofauna paling banyak ditemukan di Stasiun 1 dicirikan oleh kondisi substrat didominasi oleh pasir sedang, kerapatan lamun tinggi, dan nilai redoks potensial yang tinggi sedangkan di Stasiun 2 dicirikan oleh kondisi bahan organik yang tinggi. Hasil analisis komponen utama menunjukkan bahwa kondisi substrat, kerapatan lamun dan redoks potensial memiliki hubungan yang erat terhadap kelimpahan meiofauna di Pulau Pari.
Keyword: lamun, meiofauna, Pulau Pari, substrat

Judul: Struktur Komunitas Meiofauna Interstisial di Substrat Padang Lamun Pulau Pramuka, Kepulauan Seribu
Abstrak: Meiofauna yang hidup dalam ruang interstisial memiliki peranan penting dalam berbagai proses ekologis di padang lamun. Penelitian ini bertujuan untuk (1) Mengetahui struktur komunitas meiofauna interstisial (2) Mengetahui keterkaitan antara kelimpahan meiofauna dengan karakteristik fisika-kimia lingkungan padang lamun. Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Maret – Juli 2014 yang bertempat di Pulau Pramuka, sebelah Selatan (Stasiun 1) dan Tenggara (Stasiun 2) serta Laboratorium FPIK IPB. Pengambilan sampel meiofauna dilakukan dengan cara membenamkan pipa paralon (corer) dengan diameter 4.5 cm dan tinggi 15 cm di sekitar plot pengamatan lamun dengan menggunakan transek 1 x 1 m2. Analisis struktur komunitas meiofauna dan lamun menggunakan perhitungan indeks ekologi. Analisis Komponen Utama digunakan untuk mengetahui hubungan meiofauna dengan parameter fisika-kimia substrat dan vegetasi lamun. Kondisi kualitas perairan Pulau Pramuka secara umum dalam keadaan baik untuk menunjang kehidupan lamun dan meiofauna. Berdasarkan hasil penelitian, meiofauna interstisial yang ditemukan pada substrat pasir padang lamun terdiri dari 6 filum, 8 kelas, 22 ordo, 50 famili dan 55 genera. Komunitas meiofauna didominasi oleh Famili Oxystominidae, (Filum Nematoda). Substrat dengan karakteristik fisika-kimia lingkungan akan mempengaruhi keberadaan jenis meiofauna yang hidup diantara rongga-rongga sedimen.
Keyword: Struktur komunitas, meiofauna, lamun, substrat, Pulau Pramuka

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA