Judul: Bacillus pumilus-Specific Bacteriophage Isolated from Ciapus River in Bogor, West Java
Abstrak: Penyakit diare merupakan masalah kesehatan masyarakat di negara-negara berkembang. Penyakit ini menyebabkan kematian pasien diare di Indonesia dengan Case Fatality Rate (CFR) sebesar 1.79%. Pada tahun 2012, UPT Pusat Kesehatan Masyarakat Kecamatan Cigudeg, Bogor melaporkan bahwa jumlah penderita diare di Cigudeg cukup tinggi sebanyak 3180 pasien. Faktor utama penyebab diare pada anak-anak di daerah tersebut adalah kontaminasi bakteri patogen karena sanitasi lingkungan yang buruk. Salmonella sp, Shigella sp Citrobacter, Vagococcus, Haemopillus, Micrococcus, dan Streptococcus diisolasi dari sampel tinja anak-anak penderita diare di Cigudeg. Bakteri lain yaitu Enterococcus sp dan Bacillus sp diisolasi dari air lingkungan daerah Cigudeg. Menariknya, isolat Bacillus sp diidentifikasi sebagai Bacillus pumilus. Hal ini adalah laporan baru adanya B. pumilus yang ditemukan di daerah dengan jumlah penyakit diare tinggi. Bakteri ini merupakan bakteri pembentuk spora yang berkaitan dengan kasus keracunan makanan. Karakterisasi patogenisitas isolat B. pumilus dapat menghasilkan toksin haemolisin yang melisiskan sel darah merah dalam media kultur. Antibiotik biasa digunakan untuk mengobati penyakit yang disebabkan oleh bakteri. Uji antibiotik terhadap B. pumilus menunjukkan bahwa isolat ini resisten terhadap ampisilin dan klindamisin. Cara alternatif untuk mengurangi B. pumilus yaitu dengan aplikasi bakteriofag (fag) sebagai agen biokontrol B. pumilus di lingkungan. Fag pada penelitian ini diisolasi dari Sungai Ciapus dengan menggunakan metode agar dua lapis (double agar overlay). Isolat fag tersebut dapat menginfeksi dan membunuh B. pumilus melalui mekanisme lisis. Ukuran diameter plak FBa1 sebesar 2 mm, plak transparan dengan halo (cincin luar); plak FBa2 berukuran 1mm, plak transparan dengan halo; dan plak FBa3 berukuran 0,5 mm, plak transparan tanpa halo. Konsentrasi isolat fag FBa1 adalah 10.2x108 PFU mL-1, fag FBa2 adalah 5.9x108 PFU mL-1, dan fag FBa3 adalah 8.5x108 PFU mL-1. Konsentrasi fag B. pumilus yang tinggi menunjukkan bahwa secara alami fag ditemukan di sungai ini. Uji kisaran inang menunjukkan bahwa fag FBa1, FBa2, dan FBa3 memiliki aktivitas spesifik untuk Bacillus pumilus. Fag tersebut tidak menginfeksi sel-sel bakteri lainnya. Pengamatan morfologi fag FBa1 menggunakan Transmission Electron Microscope (TEM) dengan pewarnaan negatif menunjukkan kepala fag berbentuk ikosahedral tanpa ekor, diameter fag sebesar 166,67 nm, bentuk fag menyerupai partikel fag. Karakterisasi fag FBa1 dengan SDS-PAGE menunjukkan lima pita protein. Berat molekul masing-masing protein fag FBa1 adalah 70.9 kDa, 54.9 kDa, 33.8 kDa, 28.3 kDa, dan 21,4 kDa. Hasil penelitian ini menunjukkan prospek fag FBa1 untuk diaplikasikan sebagai agen biokontrol B. pumilus di lingkungan.
Keyword: Bacillus pumilus, bakteriofag, diare

Judul: Escherichia coli strain 275-Specific Bacteriophage Isolated from Ciliwung River in Bogor, West Java.
Abstrak: Infeksi Saluran Kemih (ISK) adalah infeksi yang banyak disebabkan oleh Escherichia coli, salah satunya Escherichia coli strain 275. Bakteri ini diketahui memiliki resistensi terhadap antibiotik, sehingga dalam penanganannya menjadi kurang efektif. Alternatif untuk mengurangi kasus resistensi bakteri ialah terapi bakteriofag. Bakteriofag menginfeksi secara spesifik sel bakteri target dengan memanfaatkan sistem metabolismenya. Sumber bakteriofag ditemukan di habitat sel bakteri inang, diantaranya terdapat di aliran sungai. Tujuan penelitian ini adalah mengisolasi bakteriofag spesifik Escherichia coli strain 275 penyebab ISK dari Sungai Ciliwung di Bogor, Jawa Barat. Isolat fag CK 1 dan CK2 berhasil diisolasi pada titik tengah sungai Ciliwung. Filtrat sampel bakteriofag disiapkan lalu diuji menggunakan metode Double Layer Agar (DLA) dan diindikasikan dengan munculnya plak, selanjutnya dilakukan purifikasi fag. Fag dihitung menggunakan rumus Plaque Forming Units (PFU) pada pengenceran fag 10-4 hingga 10-6 dengan rataan 17,7 x 107 PFU/mL. Uji efektivitas bakteriolitik menggunakan metode spektrofotometer pada kultur Escherichia coli strain 275 dengan fag (kontrol positif) dan tanpa fag (kontrol negatif) yang diamati tiap 1 jam selama 8 jam. Hasil efektivitas fag CK1 dan CK2 menunjukkan efektivitas tinggi pada jam ke-3 dan seterusnya. Efektivitas fag CK1 dan CK2 memiliki tingkat virulensi yang tinggi sesuai dengan jumlah titernya., Urinary Tract Infection (UTI) is an infection that is mostly caused by Escherichia coli, one of it is Escherichia coli strain 275. An alternative to reduce cases of antibiotics resistant-bacterium is bacteriophage therapy. Bacteriophages infect specific target bacterial cells by utilizing their metabolic system. Sources of bacteriophages are found in the habitat of host bacterial cells, including the river. The aim of this study was to isolate the specific bacteriophage Escherichia coli strain 275 that causes UTI from the Ciliwung River in Bogor, West Java. The CK 1 and CK2 phage isolates were isolated at the midpoint of the Ciliwung river. Bacteriophage sample filtrate was prepared then tested using the Double Layer Agar (DLA) method and indicated by the appearance of plaque, then phage purification was carried out. Phages were calculated with an average of 17.7 x 107 PFU / mL. The bacteriolytic effectiveness test used spectrophotometer method with phage (positive) and without phage (negative) which were observed every 1 hour for 8 hours. The results of the effectiveness of CK1 and CK2 phages showed high effectiveness at the 3rd hour onwards. The effectiveness of CK1 and CK2 phages had a high virulence level according to the number of titers.
Keyword: Bacteriophages, Escherichia coli strain 275, Phages

Judul: Penentuan Harga Opsi Put Amerika dengan Simulasi Monte Carlo
Abstrak: An American option is an option that can be exercised at the strike price anytime before or on the date of expiration. In this thesis, Monte Carlo simulation for valuation of American option is presented. Monte Carlo simulation is one of the numerical methods used to determine the price of American options. The simulation provides several examples of initial stock price , rate of interest , exercise time , volatility , and strike price K. The simulation study shows the cost of the option c decreases when S increases, c decreases when r increases, c increases when T increases, c increases when  increases, and c increases when K increases.
Keyword: