Judul: Pendugaan Parameter Genetik Dan Seleksi Ketahanan Terhadap Layu Bakteri Pada Tomat Hibrida Hasil Persilangan Antar Genotipe Lokal
Abstrak: Produksi yang masih rendah dan serangan penyakit merupakan permasalahan utama dalam budidaya tomat. Penyakit yang banyak menyerang tanaman tomat dan menyebabkan kehilangan hasil yang cukup tinggi adalah layu bakteri yang disebabkan oleh Ralstonia solanacearum. Salah satu upaya yang dapat digunakan untuk mengatasi masalah tersebut adalah menanam varietas berdaya hasil tinggi dan tahan penyakit layu bakteri. Penelitian ini bertujuan untuk memperoleh informasi mengenai parameter genetik, daya gabung, heterosis, interaksi genetik dan lingkungan di dua lingkungan, dan ketahanan terhadap penyakit layu bakteri pada tetua dan populasi hibrida hasil persilangan antar genotipe tomat lokal. Penelitian terdiri atas beberapa percobaan yaitu analisis genetik pada populasi hibrida tomat di dataran rendah dan dataran tinggi, analisis interaksi genetik dan lingkungan terhadap hasil di dua lingkungan, dan seleksi ketahanan terhadap layu bakteri pada tetua dan hibrida hasil persilangan setengah dialel genotipe tomat lokal. Materi genetik yang digunakan yaitu empat genotipe tomat lokal sebagai tetua dan enam F1 hasil persilangan setengah dialel. Empat tetua yang digunakan yaitu Kudamati-1, Ranti, Aceh-5, dan Lombok-4. Kudamati-1 berasal dari Ambon, Ranti berasal dari Situbondo, Aceh-5 berasal dari Aceh, dan Lombok-4 berasal dari Lombok. Penelitian dilaksanakan di Kebun Percobaan Leuwikopo Institut Pertanian Bogor, Dramaga, Bogor (± 196 m dpl) dan di Kebun Percobaan Balai Penelitian Tanaman Sayuran (Balitsa), Lembang (±1 250 m dpl). Hasil penelitian menunjukkan bahwa terdapat keragaman pada tetua dan hibrida yang digunakan dalam penelitian. Pengujian di dua lingkungan menunjukkan bahwa tomat yang diuji di dataran tinggi memiliki keragaan lebih baik dan produksi lebih tinggi. Aceh-5  Lombok-4 memiliki produksi tinggi di dataran rendah dan dataran tinggi jika dibandingkan hibrida lain yang diuji. Pendugaan terhadap daya gabung di masing-masing lokasi menunjukkan bahwa Aceh-5  Lombok-4 memiliki daya gabung khusus tinggi untuk panjang buah, diameter buah, jumlah buah, dan bobot buah. Aceh-5  Lombok-4 juga memiliki nilai heterosis tinggi untuk karakter jumlah dan bobot buah per tanaman. Hasil pengujian ketahanan terhadap penyakit layu bakteri di dataran rendah menunjukkan bahwa terdapat dua hibrida tahan yaitu Kudamati-1  Aceh-5 dan Aceh-5  Lombok-4. Diantara hibrida yang diuji, Aceh-5  Lombok-4 dapat direkomendasikan untuk dikembangkan menjadi varietas hibrida berdaya hasil tinggi dan tahan terhadap layu bakteri di dataran rendah atau dataran tinggi.
Keyword: dialel, daya gabung, keragaman genetik, Ralstonia solanacearum

Judul: Seleksi Dan Studi Pewarisan Serta Pengembangan Marka Ssr Penanda Ketahanan Terhadap Penyakit Layu Bakteri (Ralstonia Solanacearum) Pada Tomat
Abstrak: Tomat yang dimanfaatkan dalam bentuk buah segar ataupun olahan merupakan tanaman sayuran buah penting, baik di Indonesia maupun di dunia. Di Indonesia, kebutuhan tomat masih belum terpenuhi oleh produksi dalam negeri sehingga berpengaruh pada harga yang sering berfluktuasi. Beberapa masalah yang mempengaruhi produksi tomat telah diketahui, salah satunya serangan penyakit layu bakteri. Penyakit yang tersebar luas di area tropis dan subtropis ini disebabkan oleh bakteri Ralstonia solanacearum. Bakteri ini bersifat gram negatif dan merupakan bakteri tular tanah. Penelitian ini terdiri dari empat percobaan, yang meliputi : (1) seleksi tiga puluh genotipe tomat lokal koleksi terhadap karakter ketahanan penyakit layu bakteri (Ralstonia solanacearum) yang bertujuan untuk menyeleksi ketahanan genotipe tomat lokal koleksi terhadap penyakit layu bakteri, (2) studi pewarisan karakter ketahanan terhadap penyakit layu bakteri pada tomat yang bertujuan untuk mempelajari pola pewarisan sifat ketahanan terhadap penyakit layu bakteri pada tomat, dan (3) identifikasi marka SSR (Simple Sequence Repeats) penanda ketahanan terhadap penyakit layu bakteri pada tomat yang bertujuan untuk mendapatkan marka SSR penanda ketahanan terhadap penyakit layu bakteri pada tomat. Percobaan pertama dan kedua dilakukan dengan menggunakan isolat bakteri yang berasal dari tanaman sakit di lapang. Tanaman diinokulasi pada saat minggu keempat setelah semai dengan cara pelukaan ujung akar dan direndam pada 20 mL suspensi bakteri selama 30 menit. Kemudian tanaman disiram oleh suspensi bakteri tersebut. Percobaan ketiga dilakukan melalui tiga tahapan, yaitu: seleksi primer dengan menggunakan dua genotipe tahan dan rentan (hasil dari percobaan pertama), BSA pada populasi F2, dan identifikasi ketahanan tomat koleksi dengan menggunakan primer terpilih. Setiap genotipe tomat lokal koleksi menunjukkan ketahanan yang berbeda. Dari tiga puluh genotipe tomat lokal koleksi terdapat 1 genotipe sangat tahan (Kudamati 1), 8 genotipe tahan (Gondol Lonjong, Khemir, Kudamati 3, Lombok 3, Makasar 3, Situbondo Bulat Kecil, Situbondo Gelombang, dan Tanah Datar), 3 genotipe agak tahan (Aceh 1, Aceh 5, dan Bajawa), 8 agak rentan (Cherry NTT, Kali Acai, Kefamenanu 3, Kefamenanu 6, Kefamenanu7, Makasar 1, Makasar 2, dan Makasar 4), 1 rentan (Meranti 1) dan 9 genotipe sangat rentan (Aceh 2, Aceh 3, Kefamenanu 9, Kefamenanu 12, Kefamenanu 14, Lombok 1, Lombok 2, Lombok 4, dan Meranti 2). Genotipe Kudamati 1 dan Lombok 4 digunakan untuk merakit populasi F1, F1R, dan F2 pada Percobaan Kedua. Pengujian pada populasi F1 menunjukkan bahwa pewarisan sifat ketahanan terhadap penyakit layu bakteri pada tomat tidak dipengaruhi efek maternal dan bersifat dominan tidak sempurna. Uji χ2 pada populasi F2 mengarah pada rasio 9:7 (tahan : rentan) yang menandakan bahwa sifat ini merupakan karakter kualitatif yang dikendalikan oleh dua pasang gen mayor dengan aksi gen duplikat resesif epistasis. Tiga tahapan yang dilakukan pada percobaan tiga menunjukkan bahwa primer TOM-144 diduga bersifat polimorfik sebagai penanda ketahanan terhadap penyakit layu bakteri. Hasil pita amplifikasi menunjukkan bahwa genotipe tahan memiliki ukuran yang berkisar pada 144 bp. Primer TOM-144 mampu mengidentifikasi ketahanan tomat terhadap penyakit layu bakteri. Hasil penelitian ini dapat dimanfaatkan oleh para pemulia untuk dapat mengembangkan varietas tahan berupa galur murni ataupun hibrida. Marka SSR yang didapat juga dapat mengidentifikasi secara cepat ketahanan terhadap penyakit layu bakteri pada genotipe atau varietas lainnya.
Keyword: tomat, Ralstonia solanacearum, seleksi, pewarisan, SSR, PAGE

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: