Judul: Asosiasi dan Ekspresi Gen CYP2A6 dan KIF12 dengan Sifat Flavor dan Odor pada Daging Domba
Abstrak: Gen Cytochrome P450, family 2, subfamili A, polipeptida 6 (CYP2A6) dan protein kinesin KIF12 (KIF12) adalah kandidat gen potensial yang mempengaruhi sifat flavor dan odor pada daging domba (MNA, MI atau skatole, MP, MOA, dan EOA). Tujuan penelitian ini adalah melakukan asosiasi gen tersebut dengan sifat flavor dan odor pada daging domba, serta menganalisis ekspresi gen CYP2A6 pada jaringan hati domba ekor gemuk (DEG). Penelitian dilakukan dalam tiga tahap yaitu identifikasi keragaman gen CYP2A6 dan KIF12, asosiasi gen CYP2A6 dan KIF12 dengan sifat flavor dan odor pada daging domba, serta ekspresi gen CYP2A6. Sampel yang digunakan adalah domba ekor gemuk (DEG) berjumlah 25 ekor. Identifikasi keragaman gen CYP2A6 dan KIF12 dilakukan dengan menggunakan metode Polymerase Chain Reaction - Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP). Asosiasi gen CYP2A6 dan KIF12 dilakukan dengan menggunakan analisis General Linear Model (GLM). Ekspresi gen CYP2A6 dilakukan dengan menggunakan Quantitative Real Time PCR (qRT-PCR). Hasil identifikasi keragaman gen CYP2A6 dan KIF12 bersifat polimorfik. Gen CYP2A6 ditemukan dua genotipe (TT dan GT), sedangkan gen KIF12 ditemukan tiga genotipe (CC, CT, dan TT). Gen CYP2A6 dan KIF12 berada pada kesetimbangan Hardy Weinberg (HWE). Hasil asosiasi menunjukkan bahwa gen CYP2A6 (g.49170107 G>T) (P<0.05) berasosiasi secara signifikan dengan komponen MI atau skatole, namun KIF12 (g.9617965 C>T) tidak terkait secara signifikan dengan sifat flavor dan odor pada daging domba. Genotipe GT menunjukkan nilai MI atau skatole yang lebih besar daripada genotipe TT (P<0.05). Selanjutnya, untuk menganalisis ekspresi mRNA gen CYP2A6 di jaringan hati, sampel domba dibagi menjadi dua kelompok berdasarkan perbedaan genotipe yaitu genotipe GT dan TT. Genotipe TT memiliki sifat flavor dan odor yang lebih rendah dibandingkan genotipe GT. Ekspresi mRNA gen CYP2A6 lebih tinggi (P<0.01) pada domba dengan genotipe TT. Hasil ini memberikan informasi mengenai fungsi gen CYP2A6 pada sifat flavor dan odor terutama pada komponen MI atau skatole di jaringan hati serta gen CYP2A6 dapat dijadikan sebagai kandidat marker seleksi pada program pemuliaan seleksi daging domba dengan kandungan flavor dan odor yang rendah.
Keyword: Domba ekor gemuk, flavor, gen CYP2A6, gen KIF12, odor

Judul: Investigation of the Genetic Polymorphism of the CYP2A6 and FABP4 gene on Nutritional Value, Meat Quality, and Carcass Characteristics in Sheep
Abstrak: Tingkat konsumsi daging domba di kalangan konsumen disebabkan beberapa faktor yang mempengaruhi, diantaranya nilai gizi yang terkandung dalam daging domba, kualitas daging domba, serta karakteristik karkas yang memperhatikan proporsi perdagingan domba. Diantara gen-gen potensial yang dapat digunakan sebagai penanda nilai gizi, kualitas daging, dan karakteristik karkas pada daging domba Indonesia, yaitu gen cytochrome P450, family 2, subfamily A, polypeptide 6 (CYP2A6) dan gen fatty acid binding protein 4 (FABP4). Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi polimorfisme gen CYP2A6 pada SNP g.49170107 G>T dan gen FABP4 pada SNP g.57536954 C>T, serta mengetahui hubungannya dengan nilai gizi, kualitas daging, dan karakteristik karkas pada domba Indonesia. Total sampel yang digunakan untuk keragaman sebanyak 243 ekor domba dengan sembilan jenis domba Indonesia, yaitu domba texel cross (DTC), domba Barbados cross (DBC), domba compass agrinak (DCA), domba ekor gemuk (DEG), domba ekor tipis (DET), domba garut (DG), domba komposit garut (DKG), domba lokal jambi (DLJ), dan domba jonggol (DJ). Investigasi gen dilakukan dengan identifikasi keragaman gen CYP2A6 dan FABP4 yang dianalisis menggunakan Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP), serta dilakukan asosiasi gen CYP2A6 dan gen FABP4 terhadap parameter yang diuji menggunakan General Linear Model (GLM). Hasil penelitian menunjukkan bahwa gen CYP2A6 bersifat polimorfik yang ditandai dengan adanya dua macam genotipe GG dan TT, sedangan gen FABP4 bersifat monomorfik dengan genotipe TT. Keragaman ditemukan pada DEG, DET, DLJ, dan DJ. Keragaman genotipe gen CYP2A6 berada dalam keseimbangan Hardy-Weinberg. Hasil menunjukkan bahwa gen CYP2A6 secara nyata berasosiasi (P<0,05) dengan nilai gizi diantaranya kolesterol dan mineral Fe. Kualitas daging seperti pH, keempukan, susut masak, dan daya mengikat air tidak memiliki asosiasi dengan gen CYP2A6. Hasil asosiasi gen CYP2A6 secara nyata berasosiasi (P<0,05) dengan karakteristik karkas, yaitu bobot hidup, karkas hangat, persentase karkas, karkas dingin, serta potongan komersial. Berdasarkan hasil asosiasi tersebut menunjukkan bahwa gen CYP2A6 dapat dijadikan sebagai kandidat marker dalam program seleksi domba untuk memperbaiki kualitas daging domba.
Keyword: CYP2A6 gene, FABP4 gene, GLM, PCR-RFLP, sheep

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: