Judul: Penjajaran Global Sekuen DNA Menggunakan Algoritme Needleman-Wunsch
Abstrak: Global alignment of DNA sequence aims to determine similarity between two DNA sequences by measuring the matching region which involves the overall nucleotides of two DNA sequences. This research implements the global alignment using Needleman-Wunsch algorithm on the sequence of Ancylostoma duodenale mitochondrion, complete genome (NC_003415.1) and the sequence of Necator americanus mitochondrion, complete genome (NC_003416.2). The result shows that the similarity of these sequences is 83.7% with 6.5% gaps . The second experiment is performed using the sequence of Human papillomavirus type 134, complete genome (NC_014956.1 ) and the sequence of Human papillomavirus type 132, complete genome (NC_014955.1). The result shows that the similarity is 62.9% and gaps of 23.5%. Both results conclude that the Needleman-Wunsch could obtain higher similarity than those of GSA tree and super pairwise alignment
Keyword: 

Judul: Global Sequence alignment of DNA using Rowwise Needleman-Wunsch Algorithm in CUDA
Abstrak: Penjajaran sekuen merupakan hal yang fundamental dalam bioinformatika. Penjajaran sekuen dapat dilakukan untuk menganalisis DNA. Penjajaran sekuen dilakukan dengan menggunakan pemograman dinamis yang memiliki kompleksitas O(mn). Penerapan paralel pada penjajaran sekuen dapat mempercepat proses penjajaran. Implementasi penerapan paralel pada penjajaran sekuen membutuhkan skema partisi seperti rowwise, colunmwise, dan antidiagonal. Tujuan dari penelitian ini adalah menerapkan algoritme global pairwise alignment (Needleman-Wunsch) paralel menggunakan graphic processing unit (GPU) dengan skema partisi rowwise. Hasil penelitian menunjukkan speedup dapat meningkat hingga 5.9 kali untuk sekuen DNA dengan panjang 22 000 bp.
Keyword: Institut Pertanian Bogor, Bogor Agricultural University, IPB, GPU, Needleman-wunsch, Sequence alignment, Rowwise, Scoring matrix, dinisialisasi matriks penskoran, Pengisian matriks, Traceback

Judul: Analisis Sikap dan Faktor-Faktor yang Mempengaruhi Keputusan Kunjungan Konsumen Kafe Baca Di Buku Kafe, Depok Jawa Barat
Abstrak: Kafe dianggap sebagai suatu tempat makan yang berkelas yang mampu menghadirkan suasana santai bersama teman, keluarga dan bersosialisasi dengan rekan bisnis. Keberadaan kafe saat ini sedang menjadi trend seperti Hard Rock Cafe, Planet Hollywood, Fashion Cafe, Café Batavia, Cafe Excelso. Sekarang ini ada kafe yang dapat menciptakan suatu tempat yang nyaman sebagai tempat hiburan sekaligus mencerdaskan dan menyajikan ratusan buku yang menjadi daya tarik tersendiri disebut kafe baca. Kafe baca didirikan untuk meningkatkan minat baca masyarakat yang terbilang masih rendah. Menurut BPS (2006), masyarakat Indonesia belum menjadikan kegiatan membaca sebagai sumber utama mendapatkan informasi. Orang lebih memilih menonton televisi (85,9%), mendengarkan radio (40,3%) dan membaca koran hanya (23,5%). Buku Kafe merupakan pendiri awal untuk kafe baca di depok yang berdiri tahun 2003 dengan segmen pasarnya adalah masyarakat pecinta buku. Pada tahun 2006 muncul pesaing sejenis yaitu Kafe Zoe. Sejak awal berdiri jumlah pengunjung Buku Kafe setiap hari sebanyak 40-50 orang namun sekarang rata-rata konsumen setiap hari hanya 25 orang. Jumlah pengunjung yang menurun diduga tidak hanya karena muncul pesaing sejenis, namun sikap konsumen terhadap atribut kafe juga ikut mempengaruhi keputusan kunjungan. Oleh karena itu riset mengenai sikap konsumen terhadap atribut yang ditawarkan Buku Kafe, faktor-faktor yang mempengaruhi proses keputusan kunjungan konsumen sangat dibutuhkan bagi pihak manajemen
Keyword: