Judul: Ekstraksi DNA Rongga Mulut Secara Cepat dan Mudah untuk Deferensiasi Alel fto.
Abstrak: Sel epitel rongga mulut yang diperoleh dari sampel mouthwash memiliki konsentrasi DNA yang lebih besar dibandingkan metode lainnya. Laporan ini merupakan hasil penelitian metode isolasi DNA dari sel rongga mulut yang bersifat tidak invasive dan lebih singkat. Sampel mouthwash diperoleh dari 37 orang dewasa dengan rentang usia 19-25 tahun. Dua metode berbeda yakni QIAamp DNA Blood Mini Kit dan fenol-klorofom dibandingkan kemampuannya dalam memproses sampel mouthwash. Selanjutnya hasil analisis dari sampel mouthwash dikonfirmasi dengan hasil yang berasal dari sampel darah dan keduanya memiliki hasil yang sama. Setelah disimpan selama tujuh hari, sampel masih dapat dianalisis. Sehingga metode yang digunakan dalam penelitian ini berpotensi untuk keperluan studi gen fto di masa yang akan datang dengan beberapa keuntungan yakni prosedur yang tidak invasive dan waktu pemrosesan yang lebih singkat.
Keyword: 

Judul: Efisiensi pemakaian bahan ekstraksi pada isolasi Dna Mitokondria (mtDNA) ikan Patin (Pangasius hypophthalmus)
Abstrak: DNA adalah substansi dasar pembawa informasi genetik dan sumber yang dapat dimanipulasi untuk tujuan tertentu baik mumi ilmu peng.etahuan maupun aplikasi sains dan pengobatan. Aplikasi DNA saat ini telah meliputi bidang kedokteran, pertanian, petemakan, arkeologi, farma"i dan kepoJisian (forensik) serta bidang perikanan. Di bidang perikanan, DNA banyak digunakan sebagai penanda (markel) dalam mengukur hubungan kekerabatan antara kelompok ikan dalam populasi, studi taksonomi dan genetika populasi. DNA mitokondria (mtDNA) banyak digunakan dalam analisa DNA untuk mengidentifikasi variasi genetik dan penyebaran populasi ikan. Di Indonesia analisa DNA masih belum banyak dilakukan. Hal ini disebabkan peralatan dan bahan-bahan yang masih sulit ditemukan dan mahal harganya. Salah satunya adalah bahan ekstraksi DNA. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk l1lengetahui pcmakaian bahan ekstraksi yang efisien pada proses isolasi DNA mitokondria (mtDNA) 'kan patin (Pangasi/ls hypophthalm/ls). Penelitian dilaksanakan dari bulan April-Juli 200 I, bertempat di Laboratorium Pengembangb.iakan dan Genetika Ikan, Jurusan BDl', FPIK, il'E. Penelitian terdiri dari saiu kontrol dan 4 perlakuan. Kontrol adalah ekstraksi dcngan mengikuti prosedur yang dikeluarkan oleh Amersham Phormacia dengan menggunakan GenomicPrep Ceils and Tissue DNA [solatioll Kit, yaitu 600 III lal'lltan eel! lysis, 3 III proteinase K, 3 III RNase, 400 III protein precipitation, 600 JlI isopropanol 100%, 600 III etanol dingin (4°C), 100 III DNA hydration dan 20 mg sampel hati ikan patin. Sedangkan perlakuan I - IV adalah ekstraksi dengan bahan 0,75 kali kontrol, 0,5 kali kontrol, 0,25 kali kontrol dan 0,125 kali kontrol. Ekstraksi tahap pertama dilakukan dengan menggel'lls sampel di dalam tabung mikro. Sete1ah itu tabung mikro dipindahkan ke atas es dan ditambahkan lal'lltan cell lysis serta lal'lltan proteinase K. Selanjutnya sampel diinkubasi pada suhu 55°C selama 3 jam. Lal'lltan sel hasil inkubasi ditambah dengan RNase, dibolak-balik sebanyak 25 kali kemudian diinkubasi kembali pada suhu 37°C selama 60 menit. Pengendapan protein dilakukan dengan menambahkan lal'lltan protein precipitation. Setelah divorteks selama 20 detik kemudian disentrifius pada 14000 rpm selama 3 menit. Kemudian larutan supernatan dipindahkan ke tabung mikro bal'll yang telah bedsi isopropanol 100%. Tabung dibolak-balik 50 kali, selanjutnya disentrifius pada 14000 rpm selama I menit. Larutan supernatan dibuang dan tabung mikro dibiarkan kering udara. Selanjlltnya ditambah etanol 70% dingin (4°C) dan diaduk beberapa kali. Tabung mikro disentrifius selama I menit kemudian larutan dibuang dan tabung mikro dikeringkan di atas tissue. Tahap terakhir dilakukan dengan menamb,·hkan larutan DNA /cFdratioll pada masing-l11ilsmg tabung mikro. Setelah tahap ekstraksi selesai kemudian dilakukan pengukuran konsentrasi ekstrak DNP. menggunakan mesin DNA Quantification Hagi] ekstraksi :dielektroforesis menggunakan gel agaros konsentrasi 0,8%. Seballyak 3 ~tl sampel DNA dicampur dengan 1 Ill/oading bl!ffer dan dimasukkan ke dalaIll lubang-Iubang pada gel. Marker sebanyak 3 III juga dimasukkan ke dalam gel. Isolasi dan amplifikasi DNA dilakukan dengan PCR. Seba'lyak 2,5 Ili 10 x buffer Ex Taq, 2,0 III deoxyribonucleotide tripho.17Jhate (dNTP), 0,25 III Ex Taq, 'l,o III primer forward dan reverse, I ~tl DNA dan sterile dc·.ltilat,'u' water (SDW) masing-masing 17,25 III dicampur di dalam tabung mikro. Seianjutnya dimasukkan ke dalam mes·in PCR yang telah diprogram untuk proses denaturasi pada suhll 94°C selama 20 detik, annealing pada suhu 55°C selama 30 detile dan proses extension pada suhu nOc selama 1
Keyword: 

Judul: Model Pertumbuhan Ekonomi Perkotaan Berdasarkan Geografi Ekonomi
Abstrak: In economic activity, economic growth means increasing production of goods and services. Economic geography is economic system with respect to spatial dimension. Rapid economic development and structural changes such as rents, residential area, and transportation systems are indicators of progressivity of a country and its economics. A country is said to progress when the production rate of goods and services are increasing, then the volume of goods and services produced are also increasing from time to time. Neoclassical theory of economic growth depends on the increased the supply of factors of production and the rate of technological progress. The production factors are labor and capital. Domar in 1948 stated that production output is a function of capital. As a result, labor is always combined with capital on fixed proportion. Solow in 1956 added labour as one of the variables of production function. This study aims to examine the dynamics of urban growth model based on economic geography, i.e. study of the economic system based on the location and geographical conditions. The urban economic growth model considers the urban area to be divided into two areas, namely residential area and central business district. Urban area is assumed to have centralized workforce and multi sector economic system. The main economic activity in the central business district is production. On the other hand, consumption and saving activities are carried out in the residential area. More over people need to travel from residential area to the business district in their economic activities. This study will also examine the equilibrium solutions of the model and then give simulation on the model. The results of theoretical study show that the dynamic system of urban economic growth model is formulated in the form of linear system of first order differential equations. The variables which determine economic growth are the accumulation of capital and labor inputs. The equilibrium of these variables can be determined. Capital accumulation shows a pattern that follows an exponential function. Simulation study give the following results. The characteristics of urban economic growth are confirmed by the fact that when the elasticity of the urban industrial sector capital increases, then production output of the two sectors, both industrial and service sector, are increased. The industrial production increases sharply, while the service sector production output is relatively stagnant and then increased with a slower rate compared to the industrial sector. Increased elasticity of capital in industrial sector also tends to increase the income of urban residents, the labor wages, and the capital of both sectors. However, housing consumption tends to fall with increases in industrial sector capital elasticity. Furthermore, simulation results demonstrate the spatial and temporal changes in urban land rental values tend to decrease with increasing distance from the central business district and increasing time. Highest land rent is in a location that has the shortest distance to the central business district. The simulations also show increase in consumption following the increase in distance from the central business district. This suggests that the further away from the business district, the more people who rent or buy housing.
Keyword: