Judul: Analysis of Cu-SOD Gene Expression as Candidates for Molecular Marker Selection for Nitrite Stress-Resistant Catfish (Clarias gariepinus)
Abstrak: Nitrit merupakan salah satu zat toksik yang secara alami berada dalam perairan. Paparan nitrit dapat menginduksi produksi reactive oxygen species (ROS) yang bisa merusak fisiologi sel dalam tubuh ikan. Sekuens gen Cu-SOD adalah gen yang mengodekan regulasi kerja enzim antioksidan untuk mereduksi dampak ROS. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis kinerja ekspresi gen Cu-SOD benih lele terhadap paparan nitrit pada uji tantang LC70. Metode yang digunakan adalah lethal concentration 70 (LC70). Sesuai hasil penentuan konsentrasi LC70, benih ikan lele diberi paparan nitrit sebesar 32,3 mg/L. Terdapat dua jenis sampel yaitu ikan yang aktif dan lemas yang masing-masing diambil pada jam 6, 12, dan 24. Pada jam ke-0, 4 ikan perlakuan nitrit diambil sebagai sampel awal. Sampel ikan diambil pada bagian ventral, tepatnya organ dan otot badan di bawah insang hingga mendekati ekor. Pengambilan sampel kualitas air dilakukan pada jam 0, 12, dan 24. Ekspresi relatif gen Cu-SOD pada benih lele yang aktif dari jam ke-0 hingga 12 relatif sama dan meningkat secara signifikan pada jam ke-24. Pada benih lele yang lemas, ekspresi gen jam ke-0 dan 6 tidak menunjukkan perbedaan yang signifikan antara keduanya, kemudian menurun pada jam ke-12 yang menunjukkan berbeda nyata, dan pada jam ke-24 meningkat secara signifikan. Perbedaan nyata pada ekspresi gen Cu-SOD antara ikan yang aktif dan lemas hanya terjadi pada jam ke-6. Dengan demikian, gen Cu-SOD berpotensi digunakan sebagai marka dengan membandingkan sekuen DNA ikan yang aktif dan lemas pada jam ke-6 paska tantang nitrit., Nitrite is a toxic substance that naturally occurs in waters. Nitrite exposure can induce the production of reactive oxygen species (ROS) which can damage the physiology of cells in the fish body. Cu-SOD gene sequences are genes that encode the regulation of antioxidant enzymes to reduce the impact of ROS. This study aims to analyze the performance of Cu-SOD gene expression of catfish fry against nitrite stress in the LC70 challenge test. The method used were lethal concentration 70 (LC70). According to the results of determining the concentration of LC70, catfish fry were given exposure to nitrite of 32.3 mg / L. There were two types of samples, namely active and limp fish, which were taken at 6, 12, and 24 hours respectively. At 0 hours, 4 fish treated with nitrite were taken as initial samples. Fish samples were taken in the ventral part, to be precise about organ and body muscle under the gills to approach the tail. Water quality samples were taken at 0, 12, and 24 hours. Relative expression of Cu-SOD gene in active catfish fry from 0 to 12 hours was relatively the same and increased significantly at 24 hours. In limp catfish fry, gene expression at 0 and 6 hours did not show a significant difference between the two, then decreased at 12 hours which showed significantly different, and at 24 hours increased significantly. The real difference in Cu-SOD gene expression between active and limp fish only occurred at the 6th hour. Thus, the Cu-SOD gene could potentially be used as a marker by comparing the DNA sequences of active and limp fish at 6 hours post nitrite
Keyword: Expression, Nitrite, LC70, ROS, Cu-SOD

Judul: Analisis Ekspresi Gen Stresor pada Benih Ikan Lele Clarias gariepinus Pascacekaman Nitrit
Abstrak: Tantangan yang dihadapi dalam budidaya intensif ikan lele adalah akumulasi amonia dan nitrit yang berasal dari amonifikasi sisa pakan dan ekskresi ikan. Amonia dan nitrit bersifat toksik dan dapat menyebabkan stres pada ikan. Salah satu respons fisiologis dari tubuh ikan terhadap paparan amonia dan nitrit adalah terjadinya transkripsi gen stresor yang mengodekan protein heat shock protein-70 (HSP-70) dan Cu-superoxide dismutase (Cu-SOD). Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis tingkat ekspresi gen HSP-70 dan Cu-SOD pada benih ikan lele Clarias gariepinus pascacekaman nitrit. Penelitian ini menggunakan lethal concentration 50 (LC50) nitrit yaitu 10 mg.L-1 untuk mematikan 50% populasi benih lele dalam kurun waktu 24 jam, menggunakan tiga akuarium yang masing-masing berisi 30 ekor benih ikan lele dengan volume 10 L yang dilengkapi dengan aerasi. Pada jam ke-0, 3, 6, dan 12 selama perlakuan, RNA total diekstraksi dari whole body ikan lele menggunakan pereaksi GENEzol (Geneaid, Taiwan). RNA total hasil isolasi dikuantifikasi menggunakan GeneQuant DNA calculator dan sintesis cDNA dilakukan menggunakan kit ReverTraAce® qPCR RT Master Mix with gDNA Remover (Toyobo, Jepang). Ekspresi gen dianalisis menggunakan metode real-time PCR (qPCR) menggunakan mesin Rotor Gene (Corbett research, USA). Tingkat ekspresi gen HSP-70 dan Cu-SOD meningkat pada jam ke-3 dan ke-6 dibandingkan kondisi awal dengan pola yang berbeda. Nilai ekspresi gen tertinggi terjadi pada jam ke-3 pascacekaman nitrit 10 mg.L-1. Berdasarkan hasil yang diperoleh, gen Cu-SOD lebih berpeluang menjadi gen penanda untuk seleksi ikan lele tahan cekaman nitrit.
Keyword: Clarias gariepinus, Cu-superoxide dismutase (Cu-SOD), heat shock protein-70 (HSP-70), nitrit

Judul: Penggunaan Teorema Homeomorphy 2-Manifold dan Teorema Euler Poincare pada Torus 𝑇�� dan Simplicial Complex 𝐾��
Abstrak: Two dimensional topological spaces are said to be homeomorphic if they have the same topological invariant, where one of topological invariant used is an Euler characteristic. Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem and Euler Poincare’s Theorem are used to distinguish two topological spaces. Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem uses Euler characteristic to identify two dimensional topological spaces. Euler Poincare’s Theorem is an alternative way to find Euler characteristic with Betti number, which is topological invariant as well. The objective of this paper is to investigate the homeomorphism of torus 𝑇����� and simplicial complex 𝐾�����. Topological space torus and simplicial complex 𝐾����� have the same Euler characteristic, which is two. Based on Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem topological space torus 𝑇����� and simplicial complex 𝐾����� is homeomorphic.
Keyword: simplicial, torus, Euler, homeomorphism, topology