Judul: Transformasi tanaman padi javanika Rojolele menggunakan gen cry IB yang berada di bawah promoter terinduksi perlakuan
Abstrak: Penelitian ini dilakukan untuk memperoleh tanaman padi transgenik kultivar Rojolele generasi pertama yang mengandung gen cry IB serta didapatkannya sistem regenerasi yang efisien dengan perbandingan hormon auksin dan sitokinin yang tepat, untuk meregenerasikan kalus padi hasil transformasi. Kalus yang berasal dari skutelum ditumbuhkan dalam medium induksi kalus yang mengandung hormon 2.4-D (2,4 dikloro fenoksiasetat) untuk menghasilkan kalus embriogenik. Kalus embriogenik yang dikecil-kecilkan, ditransformasi melalui Agrobacterium tumefaciens yang membawa PCAMBIA1303 mengandung gen cry IB di bawah kontrol promoter terinduksi perlukaan (mpi) dan ẞ- glukoronidase mengandung intron sebagai gen reporter, dan diko-kultivasi selama 3 hari. Uji Gus dilakukan pada tingkat kalus hasil ko-kultivasi dan daun dari tanaman padi transgenik, sedangkan untuk mengetahui keberhasilan transformasi dan keberadaan gen target dalam genom tanaman, dilakukan uji Gus dan analisis PCR. Hasil penelitian menunjukkan penggunaan media LS + 2.5 mg/L 2.4-D + 30 g sukrosa yang dipadatkan dengan 3.75 g/L phitagel pada proses induksi kalus menghasilkan peresentasi kalus embriogenik sebesar 66.44%. Dari penelitian jumlah regenerasi tanaman, jumlah kalus bertunas, jumlah kalus beregenerasi serta jumlah planlet terbanyak diperoleh dari IAA (Indol Asam Asetat) 0.5 mg/L dan BAP (6-Bensil Amino Purin) 0.3 mg/L. Perbandingan hormon 0.5 mg/L IAA dan 0.3 mg/L BAP ini digunakan dalam media regenerasi tanaman hasil transformasi dengan efisiensi regenerasi mencapai 29.17 %. Hasil uji histokimia, diperoleh hasil positif gen Gus mencapai 100% untuk tingkat kalus, dan 8 tanaman positif gen Gus daun, reaksi ini ditunjukkan dengan terbentuknya warna biru pada kalus dan daun yang diuji. Hasil analisis PCR menunjukkan dari 68 tanaman hasil ko-kultivasi diperoleh 12 tanaman yang mengandung positif gen cry IB...
Keyword: 

Judul: Transformasi Genetik Padi Japonica (Oryza sativa L. subsp. japonica) dengan Gen Penyandi Superoksida Dismutase dari Melastoma malabathricum Menggunakan Perantara Agrobacterium tumefaciens
Abstrak: Cekaman abiotik menginduksi cekaman oksidatif di dalam sel dan jaringan tanaman akibat produksi berlebih spesies oksigen reaktif (ROS) yang berdampak pada kerusakan dan kematian sel tanaman. Tanaman yang toleran terhadap cekaman menunjukkan peningkatan dalam ekspresi gen dan aktivitas protein antioksidan bila mendapat cekaman abiotik. Salah satu enzim antioksidan utama adalah superoksida dismutase (SOD). Beberapa penelitian sebelumnya telah melaporkan bahwa tanaman transgenik yang mengekspresikan secara berlebih (overexpression) gen SOD menunjukkan peningkatan dalam toleransi terhadap cekaman-cekaman abiotik. Tujuan penelitian ini adalah untuk melakukan transformasi genetik padi dengan gen penyandi superoksida dismutase dari Melastoma malabathricum (MmCu/Zn-SOD). Biji dewasa padi japonica cv. Kinmaze diinduksi untuk membentuk kalus pada media induksi kalus yang mengandung 4 mg/l 2,4-D. Sebanyak 604 kalus yang berumur 4 minggu diinokulasikan dengan Agrobacterium tumefaciens LBA4404 yang membawa plasmid pGWB-MmCu/Zn-SOD yang mengandung gen MmCu/ZnSOD di bawah kendali promoter 35S CaMV dan terminator Nos. Kokultivasi berlangsung selama 3 hari pada media yang mengandung 4 mg/l 2,4-D dan 200 mg/l asetosiringon. Kalus yang ditransformasi diseleksi pada media yang mengandung 50 mg/l higromisin dan diregenerasikan pada media yang mengandung 1 mg/l trans-zeatin dan 0,5 mg/l IAA. Jumlah kalus tahan higromisin yang dipindahkan ke media regenerasi adalah 214 kalus atau 35,43% dari jumlah kalus yang diinfeksi. Jumlah tunas transgenik putatif yang berhasil beregenerasi adalah 2 tunas, sehingga efisiensi regenerasi tunas dari kalus tahan higromisin adalah 0,9%. Analisis molekuler terhadap kedua tanaman padi transgenik putatif dengan PCR menggunakan primer spesifik untuk fragmen hibrid dari sekuen promoter 35SCaMV dan sekuen penyandi gen target MmCu/Zn-SOD menunjukkan bahwa seluruh tanaman mengandung gen target MmCuZn-SOD. Efisiensi transformasi dalam penelitian ini adalah 0,33%. Efisiensi regenerasi tunas transgenik putatif yang rendah dapat ditingkatkan dengan melakukan regenerasi kalus transgenik putatif di media regenerasi tanpa penambahan agen seleksi dan tunas yang terbentuk dianalisis secara ketat. Gen MmCu/Zn-SOD yang telah diintroduksikan ke dalam genom tanaman padi Japonica cv. Kinmaze dapat dipindahkan ke varietas-varietas padi Indica yang banyak dibudidayakan petani di Indonesia seperti IR64 dan Ciherang melalui silang balik (backcrossing) yang diikuti dengan seleksi menggunakan marka molekular (gen target) selama beberapa generasi.
Keyword: transformasi genetik, Agrobacterium tumefaciens, Oryza sativa, MmCu/Zn-SOD

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: