Judul: Analysis of Active Compounds in Phyllanthus niruri L. as  potential inhibitors to SARS-CoV-2 3CLpro EPI_ISL_576383 with Molecular  Docking
Abstrak: Coronavirus disease 2019 (COVID- 19) merupakan penyakit yang disebabkan oleh infeksi virus corona SARS-CoV-2. Enzim 3-Chymotrypsin-Like Protease (3CLpro) berperan dalam siklus hidup SARS-CoV-2 sebagai enzim kunci dalam replikasi dan transkripsi virus. Penelitian ini bertujuan menganalisis interaksi molekuler senyawa aktif meniran terhadap reseptor 3CLpro dari SARS-CoV-2 asal Indonesia EPI_ISL_576383 dan menentukan senyawa aktif meniran sebagai inhibitor enzim 3CLpro SARS-CoV-2. Metode yang digunakan dalam penelitian ini yaitu penambatan molekuler menggunakan aplikasi YASARA Structure. Hasil penelitian menunjukkan dari 49 senyawa aktif meniran terdapat tujuh senyawa aktif yang memiliki afinitas pengikatan terhadap 3CLpro antara lain ellagic acid, lupeol, hinokinin, hypophyllanthin, methyl brevifolincarboxylate, quercetin dan niranthin. Senyawa aktif ellagic acid menjadi ligan terbaik dengan energi bebas ikatan (∆G) -4.296 kkal/mol yang berinteraksi dengan 13 residu asam amino. Hasil penelitian dapat digunakan sebagai acauan dalam studi in vitro dan in vivo terhadap enzim 3- Chymotrypsin-Like Protease (3CLpro) SARS-CoV-2., Coronavirus disease 2019 (COVID-19) is a disease caused by infection of coronavirus, SARS-CoV-2. The 3-Chymotrypsin-Like Protease (3CLpro) acts as a key enzyme in the replication and transcription of SARS-CoV-2 virus life cycle. This study aims to analyze the molecular interaction and determine the best ligand from the active compounds in Phyllanthus niruri L. against the 3CLpro receptor from Indonesian EPI_ISL_576383 in SARS-CoV-2 coronavirus. Molecular docking was conducted using YASARA Structure application. The results from 49 active compounds showed seven active compounds that exhibit affinity binding to 3CLpro, such as ellagic acid, lupeol, hinokinin, hypophyllanthin, methyl brevifolincarboxylate, quercetin and niranthin. Ellagic acid is determined as the best ligand out of all the active compounds with free energies of binding (∆G) - 4,296 kcal/mol and shown interaction with 13 amino acid residues. These results can be further used as a reference for in vitro and in vivo studies of SARS-CoV-2 3-Chymotrypsin-Like Protease (3CLpro).
Keyword: 3CLpro inhibitor, molecular docking, Phyllanthus niruri L

Judul: Analisis In Silico Senyawa Golongan Fenolik Sebagai Inhibitor Enzim 3Cl Protease SARS-CoV-2 Asal Pasien Indonesia
Abstrak: Coronavirus disease (COVID-19) merupakan penyakit yang disebabkan oleh SARS-CoV-2. 3Clpro adalah enzim yang memiliki peran utama dalam proses replikasi SARS-CoV-2. Analisis in silico dengan menggunakan 3Clpro asal genom pasien Indonesia sebagai reseptor belum pernah dilakukan sebelumnya. Senyawa fenolik yang memiliki peran sebagai antivirus diduga berpotensi dalam menghambat kerja 3Clpro. Penelitian ini bertujuan menapis 166 senyawa fenolik dan turunannya yang memiliki potensi terbaik dalam menginhibisi 3Clpro (EPI_ISL_576383) menggunakan metode penapisan virtual melalui analisis ΔG, bioavaibilitas dan toksistas ligan, serta visualisasi 2D dan 3D. Bioavaibilitas ligan diprediksi berdasarkan aturan Lipinski. Prediksi toksisitas ligan menggunakan Toxtree dengan parameter Cramer rule. Diperoleh 8 senyawa terbaik dalam menginhibisi 3Clpro yang memiliki potensi sebagai obat COVID-19. Baicalin, quercetagetin, gossypetin, quercitrin, taxifolin, butein, chlorogenic acid, dan catechin hydrate dapat menghambat 3Clpro dengan berikatan hidrogen pada sisi aktif. Senyawa aktif baicalin menjadi ligan terbaik dengan ΔG -8.9 kkal/mol dan berinteraksi dengan sepuluh residu 3Clpro SARS-CoV-2 (EPI_ISL_576383).
Keyword: 3CLpro, phenolic compound, SARS-CoV 2, virtual screening

Judul: Pembangunan Perumahan Pada Wilayah Desakota Kaitannya Dengan Sistem Sosial Masyaraka t Asli
Abstrak: Faktor utama yang banyak mempengaruhi meningkatnya jumlah perumahan dan pemukiman pacta wilayah desakota adalah adanya tekanan populasi sebagai akibat dari migrasi besar-besaran menuju daerah desakota. Dengan kata lain, lokasi perumahan atau pemukiman menjadi tak memiliki banyak pilihan lagi, kota telah sesak dan sasaran selanjutnya para pengais materi di daerab kota adalab wilayah desakota. Masyarakat asli yang sejak lama tinggal di wilayah desakota merupakan bagian dari masyarakat desakota yang perlu diperhatikan. Baik disadari maupun tidak disadari, perubaban pada masyarakat asli desakota akan terjadi karena masyarakat selalu dalam keadaan dinamis. Selain itu perubahanjuga akan terjadi dikarenakan masyarakat adalah sistem yang terdiri dari bagian-bagian yang berhubungan serta berintegrasi secara fungsional, sehingga perubaban pada satu fungsi dari masyarakat akan mempengaruhi fungsi lainnya.
Keyword: