Judul: Study of Actinomycetes-derived Biopigment for Potency Antimicrobial Activity.
Abstrak: Aktinomiset merupakan kelompok bakteri Gram-positif yang cukup populer karena kemampuannya menghasilkan senyawa dari metabolit sekunder. Salah satu metabolit sekunder dari aktinomiset yang memiliki aktivitas biologis adalah pigmen. Pigmen yang dihasilkan oleh aktinomiset cukup beragam, hal ini dikarenakan aktinomiset mampu menghasilkan berbagai warna koloni pada pertumbuhannya. Pigmen merupakan senyawa bioaktif dengan aplikasi yang cukup luas. Pigmen pada umumnya digunakan dalam bidang industri makanan dan minuman, serta pewarna pada industri tekstil, dan industri farmasi. Pigmen dapat dibagi atas dua kelompok, yaitu pigmen sintetis dan pigmen alami. Pigmen yang sering digunakan dalam industri adalah pigmen sintetis sedangkan pigmen alami sedikit jarang digunakan. Dewasa ini, penggunaan pigmen sintetis mulai berkurang karena efek samping dari penggunaannya terhadap lingkungan dan kesehatan. Terkait hal tersebut timbul adanya peluang pencarian pigmen alami salah satunya dari mikroba. Pigmen yang dihasilkan oleh mikroba mampu memberikan berbagai keuntungan dalam hal segi biaya dan waktu (keefektifan). Salah satu kelompok mikroba yang mampu menghasilkan pigmen adalah aktinomiset. Penelitian ini menggunakan aktinomiset yang sebelumnya telah berhasil diisolasi dari filosfer padi dan aktinomiset asosiasi spons. Aktinomiset yang digunakan adalah Gordonia terrae JSN1.9, Micromonospora tulbaghiae SCA54.P2, dan Micromonospora chalcea HV11.P3. Ketiga aktinomiset tersebut menghasilkan pigmen masing-masing berwarna orange/jingga, kuning, dan hitam. Laporan sebelumnya mengungkapkan aktivitas antifungi, antibakteri, dan antioksidan yang dimiliki oleh aktinomiset tersebut. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui aktivitas antimikroba dari fraksi aktif pigmen yang dihasilkan oleh ketiga aktinomiset, efek kerusakan yang ditimbulkan oleh fraksi aktif pigmen terbaik terhadap sel mikrob uji, dan identifikasi senyawa yang ada pada fraksi aktif. Penelitian ini diawali dengan peremajaan kultur aktinomiset menggunakan medium international streptomyces project 2 (ISP2) atau international streptomyces project 4 (ISP4) dan dilanjutkan produksi dan ekstraksi pigmen untuk memperoleh ekstrak kasar pigmen. Absorbansi maksimum dari ekstrak pigmen diukur menggunakan spektrofotometer UV-Vis. Aktivitas antimikroba ekstrak kasar diujikan pada mikroba Bacillus subtilis ATCC 6633, Escherichia coli ATCC 8739, Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853, Staphylococcus aureus ATCC 25293, dan Candida albicans ATCC 10231. Selanjutnya dilakukan fraksinasi pigmen dengan kromatografi lapis tipis (KLT), uji bioautografi untuk konfirmasi aktivitas antimikroba, dan isolasi fraksi aktif dengan KLT preparatif. Efek kerusakan pada sel mikroba uji diamati menggunakan scanning electron microscopy (SEM) dan senyawa yang ada pada fraksi aktif dianalisis menggunakan liquid chromatography mass spectrometer (LC-MS) untuk selanjutnya diidentifikasi. Aktinomiset yang digunakan pada penelitian ini memiliki kecepatan pertumbuhan yang berbeda. Spesies G. terrae JSN1.9 menghasilkan warna pigmen terbaik pada masa inkubasi 10 hari, dan kedua aktinomiset Micromonospora menghasilkan warna pigmen terbaik pada masa inkubasi 14 hari. Media terbaik untuk G. terrae JSN1.9 adalah ISP2 dengan menggunakan sumber karbon glukosa, sedangkan kedua spesies Micromonospora tumbuh optimum pada media ISP4 dengan konsentrasi NaCl (0,1%). Ekstraksi menggunakan pelarut kloroform atau metanol menghasilkan rendemen masing-masing sebesar 9,27%; 2,79%; dan 6,43% pada media produksi terbaik. Ketiga ekstrak pigmen aktinomiset memiliki absorbansi maksimum pada panjang gelombang 410 nm, 409 nm, dan 324 nm (kelompok pigmen karotenoid atau melanin). Ekstrak kasar dan fraksi aktif pigmen menunjukkan aktivitas antimikroba terhadap bakteri Gram-positif (B. subtilis ATCC 6633 dan S. aureus ATCC 25293) dan C. albicans ATCC 10231. Aktivitas antimikroba ditunjukkan dengan adanya zona hambat pada ketiga mikrob uji tersebut. Hasil penelitian menunjukkan bahwa fraksi aktif memiliki
Keyword: aktinomiset, C. albicans, Gram-positif, pigmen

Judul: Antimicrobial, Antioxidant, and Toxicity Activity of Marine Actinomycetes Biopigment Extract
Abstrak: Aktinomiset merupakan bakteri Gram-positif yang mempunyai potensi sebagai sumber metabolit sekunder baru. Salah satu metabolit sekunder tersebut adalah biopigmen. Biopigmen yang dihasilkan oleh aktinomiset mempunyai berbagai aktivitas biologis. Penelitian ini bertujuan menguji kemampuan antimikrob, antioksidan, dan toksisitas ekstrak biopigmen aktinomiset laut kode HV11.P3 dan SCA54.P2. Aktivitas antimikrob diuji terhadap beberapa mikrob patogen dan menunjukkan hasil terbaik dalam menghambat pertumbuhan Bacillus subtilis ATCC 19659 untuk ekstrak HV11.P3 kemudian Escherichia coli ATCC 8739 untuk SCA54.P2.Aktivitas antioksidan terhadap radikal DPPH menunjukkan nilai IC50 231,084 μg/ml untuk HV11.P3 dan 369,296 μg/ml untuk SCA54.P2. Hasil uji toksisitas berupa nilai LC50 yaitu 94,603 μg/ml untuk HV11.P3 dan 131,220 μg/ml untuk SCA54.P2 menggunakan metode Brine Shrimp Lethality Test (BSLT). Senyawa kimia penyusun ekstrak diidentifikasi menggunakan GC-MS. Hasilnya senyawa 1H-Purine-2,6-dione, 3,7-dihydro-1,3,7-trimethyl- (CAS) menjadi penyusun dominan ekstrak HV11.P3 dengan peak area 44,65% dan 5-Methoxypyrrolidin-2-one dengan luas peak area 30,23% untuk ekstrak biopigmen SCA54.P2. Analisis gen 16S rRNA menunjukkan bahwa HV11.P3 memiliki kesamaan terdekat dengan Micromonospora chalcea strain 1464-217L dan SCA54.P2 dengan Micromonospora tulbaghiae strain TVU1., Actinomycetes are Gram-positive bacteria that have potency as a source of new secondary metabolites. One of those secondary metabolites is biopigments. Biopigments produced by actinomycetes have various biological activities. This study aimed to determine antimicrobial, antioxidant, and toxicity activity from marine actinomycetes biopigment extract coded as HV11.P3 and SCA54.P2. Antimicrobial activities were tested against several pathogenic bacteria and showed the best result for inhibiting Bacillus subtilis ATCC 19659 for HV11.P3 and Escherichia coliATCC 8739 for SCA54.P2. The antioxidant activity against DPPH radical showed IC50 value 231,084 μg/ ml for HV11.P3 and 369,296 μg/ ml for SCA54.P2. The toxicity test results (LC50) based on Brine Shrimp Lethality Test (BSLT) were 94,603 μg/ ml and 131,220 μg/ ml for HV11.P3 and SCA54.P2, respectively. The major chemical compounds of HV11.P3 extract were identified as 1H-Purine-2,6-dione, 3,7-dihydro-1,3,7-trimethyl- (CAS) (peak area 44,65%) and 5-Methoxypyrrolidin-2-one for SCA54.P2 (peak area 30,23%). The 16S rRNA gene analysis showed that HV11.P3 had the closest similarity with Micromonospora chalcea strain 1464-217L and SCA54.P2 with Micromonospora tulbaghiae strain TVU1.
Keyword: BSLT, DPPH, Extract, GC-MS, 16S rRNA gene

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: