Judul: Pengklonan Gen Kitinase Bakterial Menggunakan Teknik Mutagenesis Transposon Dan DNA Pelacak Heterologus
Abstrak: Enzim kitinase bakteri banyak dimanfaatkan dalam berbagai aspek, antara lain untuk mengkonversi kitin menjadi produk turunannya yang berguna dan bernilai ekonomi tinggi. Selain itu biodegradasi kitin ini juga penting untuk mengendalikan cendawan patogen dan serangga hama tertentu yang sensitif terhadap kitinase. Penelitian ini dilakukan dalam dua rangkaian percobaan yaitu (1) pengklonan gen kitinase bakteri isolat CS, (2) penapisan dan pengklonan gen kitinase isolat bakteri asal tanah. Sedangkan tujuan penelitian ini adalah (1) mengisolasi gen kitinase dari bakteri isolat CS dengan memanfaatkan transposon Tn5-mini, (2) mengisolasi dan mengklon gen kitinase bakteri asal tanah dengan memanfaatkan DNA pelacak heterologus, dan (3) mempelajari ekspresi gen kitinase pada E. coli DH5α. Analisis sekuen 16S-rDNA pada isolat CS memperlihatkan bahwa isolat CS paling sekerabat dengan Aeromonas sobria. Mutagenesis transposon menggunakan pUT mini-Tn5 Km1 pada A .sobria CS menghasilkan tiga mutan yang tidak mampu lagi membentuk halo pada medium Agar Kitin dengan frekuensi transkonjugasi sebesar 7.59 x 107. Ketiga jenis mutan ini telah diverifikasi dengan PFGE (Pulsed - Field Gel Electrophoresis ) dan diberi nama chil, chi4 dan chi6. Dari hasil analisis hibridisasi Southern pada masing-masing genom mutan dengan menggunakan gen Km' dari plasmid PUC4K sebagai pelacak, diperoleh fragmen DNA yang membawa transposon hasil potongan Enzim….dst
Keyword: Etknik mutagenesis transposon, DNA pelacak heterologus, Kitin dan Kitinase, Elemen Loncat, Genetika Bakteri

Judul: Isolasi dan pemilahan bakteri termofilik penghasil kitinase dari Indonesia
Abstrak: Enzim merupakan biokatalis yang umumnya berupa protein dan terbagi dalam enam kelas, salah satunya adalah hidrolase. Enzim kitinase merupakan salah satu enzim hidrolase yang dapat mendegradasi senyawa kitin yaitu berupa polimer yang banyak terdapat di alam seperti Crustaceae, serangga dan beberapa jamur. Enzim kitinase yang bersifat tahan panas memiliki beberapa keuntungan dan ini menjadi alasan utama untuk memilih enzim dari bakteri termofil karena stabilitasnya yang tinggi dan resiko kontaminasinya dapat dikurangi. Enzim yang tahan panas umumnya dapat dihasilkan oleh bakteri yang termofil karena lingkungan hidupnya yang ekstrim panas, maka enzim yang dihasilkan juga tahan panas. Untuk itu dilakukan isolasi bakteri termofil yang berasal dari berbagai sumber air panas dan air kawah serta daerah lainnya di Indonesia. Isolasi dilakukan dengan cara menyebar sampel pada media termus modifikasi yang terdiri dari campuran MgSO4.7H2O 0,01%, K2HPO4 0,1%, NaCl 0,1%, (NH4)2SO4 0,7%, ekstrak khamir 0,2%, tripton 0,1% serta koloidal kitin 1%, ditambah agar 2%. Inkubasi dilakukan mulai dari suhu 55°C atau lebih tinggi untuk menyeleksi hanya mikroba termofil yang tumbuh. Isolat yang mampu memecah kitin ditandai dengan terbentuknya halo yaitu areal bening disekitar koloni. Isolat yang dapat memecah kitin selanjutnya digores kembali untuk dimurnikan, lalu disimpan dalam cryobuffer yang terdiri dari 0,5 ml buffer phospat 10 mM, 3,75 ml gliserol dan 20,75 ml H₂O. Isolat-isolat tersebut dipilih yang memiliki aktivitas kitinolitik tinggi dengan cara semikuantitatif berdasarkan indeks kitinolitik (IK) yaitu perbandingan diameter halo dengan diameter koloni. Dari hasil penyebaran sampel didapatkan 31 isolat yang dapat tumbuh pada suhu 55°C, dan 5 isolat yang dapat tumbuh pada suhu 60°C. Dari seluruh isolat tersebut diperoleh 7 isolat yang potensial. Ketujuh isolat tersebut dapat menibentuk halo setelah 1 hari yaitu K29-13, K29-14 dan K29-15 dengan IK 5,0; K29-10, K29-16 dengan IK 4,5; K29-8 dengan IK 4,0 dan K29-7 dengan IK 4,8. Ketujuh isolat tersebut lalu diuji secara kuantitatif dengan metode reduksi kitin. Bakteri yang potensial juga dikarakterisasi awal meliputi bentuk, gram, endospora, dan motilitasnya.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: