Judul: Penanganan Data Tidak Seimbang dalam Menentukan Faktor Risiko Tuberkulosis pada Sapi Perah di Bogor.
Abstrak: Tuberkulosis (TB) pada sapi perah yang disebabkan oleh Mycobacterium sp. merupakan zoonosis yang dapat menginfeksi manusia melalui konsumsi susu. Tidak banyak penelitian yang dilakukan meskipun penyakit ini masih menjadi fokus perhatian pemerintah. Salah satu penelitian dilakukan untuk mengetahui faktor risiko penyebab TB pada sapi perah di wilayah Bogor dengan metode klasifikasi. Kasus tersebut merupakan contoh diagnosa medis dengan data tidak seimbang sehingga perlu dilakukan penanganan ketidakseimbangan data sebelum pengklasifikasian. Penelitian ini bertujuan mendapatkan model klasifikasi terbaik menggunakan metode SMOTE C5.0 dan SMOTE Bagging C5.0. Hasil penelitian menunjukkan bahwa SMOTE Bagging C5.0 merupakan model klasifikasi terbaik dengan akurasi total sebesar 80.65%, sensitivitas sebesar 78.57% dan spesifisitas sebesar 81.25%. Adapun faktor risiko penyebab TB pada sapi perah di wilayah Bogor adalah intensitas cahaya di kandang, jumlah ternak dalam satu kawanan, penilaian konformasi tubuh sapi perah, riwayat keberadaan sapi perah bergejala TB di peternakan, tingkat kebersihan kandang, dan suhu udara di peternakan.
Keyword: Bagging, C5.0, faktor risiko, SMOTE, tuberkulosis

Judul: IPB (Bogor Agricultural University)
Abstrak: Tuberkulosis (TB) merupakan penyakit infeksius yang tersebar luas di seluruh dunia yang disebabkan oleh infeksi organisme yang merupakan anggota Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC). Bakteri MTBC adalah kelompok patogen yang menyebabkan morbiditas dan mortalitas yang tinggi pada manusia, serta mengakibatkan kerugian ekonomi pada pertanian di dunia. Tuberkulosis zoonotik dapat menjadi ancaman utama bagi kesehatan masyarakat, tetapi belum ada informasi mengenai kejadian penyakit TB zoonotik dan faktor risikonya pada hewan di Indonesia. Penelitian ini bertujuan mengukur prevalensi kejadian penyakit TB pada sapi perah (bovine tuberculosis/BTB), mengidentifikasi faktor-faktor risiko yang mempengaruhi kejadian penyakit TB pada sapi perah, mengukur asosiasi kejadian penyakit TB pada sapi perah dengan faktor-faktor risiko yang mempengaruhinya, mendeteksi Mycobacterium bovis sebagai penyebab kejadian penyakit TB pada sapi perah dengan metode multiplex polymerase chain reaction (PCR), serta mengembangkan dan menilai kemampuan media modifikasi Ogawa agar (MOA) untuk menumbuhkan M. bovis, dibandingkan dengan media yang digunakan saat ini, yaitu Löwenstein Jensen (LJ) dan modifikasi Ogawa (MO). Penelitian ini merupakan kajian lintas seksional, dilaksanakan di lokasi sentra peternakan sapi perah di wilayah Kabupaten dan Kota Bogor. Seluruh ternak sampel dituberkulinasi dengan Bovituber®PPD. Faktor risiko kejadian penyakit TB pada sapi perah diidentifikasi menggunakan kuesioner yang dibagikan kepada peternak. Dengan menggunakan pertimbangan proporsionalitas populasi ternak, maka jumlah ternak yang dijadikan sampel di Kawasan Usaha Peternakan (KUNAK), Kabupaten Bogor, adalah 166 ekor (50 peternakan), dan di Kebon Pedes, Kota Bogor, 36 ekor (10 peternakan). Prevalensi TB kajian lintas seksional kejadian penyakit TB pada sapi perah di wilayah Bogor adalah 21.78% (SK 95% 16.09-27.47%). Faktor risiko yang signifikan dalam penelitian ini adalah ketinggian tempat <340 mdpl (OR 3.721, SK 95% 1.642-8.433), suhu tempat >28 °C (OR 2.573, SK 95% 1.077-6.145), dan intensitas cahaya di kandang <15 W m-2 (OR 2.749, SK 95% 1.204-6.275). Metode multiplex PCR dapat menjadi alternatif terbaik untuk membedakan M. bovis dan M. tuberculosis. Dari 202 ternak yang telah diuji dengan uji tuberkulin, 44 ekor ternak memberikan hasil yang positif. Dari 44 ternak yang positif terhadap uji tuberkulin, diambil 44 sampel feses dan swab hidung, 43 sampel susu. Peternak yang diambil dahaknya sebagai sampel berjumlah 24 sampel, berasal dari peternakan yang ternaknya positif terhadap uji tuberkulin. Ditemukan M. bovis pada 8 sampel feses ternak, 4 sampel swab hidung ternak, 9 sampel susu ternak. Ditemukan M. tuberculosis pada satu sampel dahak peternak. Tiga ekor sapi memberikan hasil positif M. bovis pada dua jenis sampel, yaitu sampel feses dan susu. Peternak yang positif M. tuberculosis berasal dari peternakan yang ternaknya memberikan hasil positif M. bovis pada sampel fesesnya. Pemeriksaan kultur mikobakteri merupakan diagnosis definitif terhadap TB, tetapi media kultur komersial untuk Mycobacterium bovis masih jarang tersedia. Suspensi bakteri M. bovis dan M. phlei dalam phosphate buffer saline (PBS) dengan konsentrasi 105 cfu/ml masing-masing diinokulasikan 0.1 ml pada media LJ, MO dan MOA, masing-masing lima tabung untuk tiap media. Bakteri M. phlei tumbuh pada semua media mulai hari ke-4. Bakteri M. bovis tumbuh pada media LJ dan MO mulai hari ke-17, tetapi tidak berhasil tumbuh pada media MOA. Perbandingan jumlah koloni M. phlei yang tumbuh pada media LJ dan MOA berbeda nyata secara statistik. Kemampuan media MOA untuk menumbuhkan
Keyword: Mycobacterium bovis, prevalensi, bovine tuberculosis, faktor risiko, PCR, media kultur

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: