Judul: Peningkatan Sensitivitas Deteksi Cemaran Salmonella spp., S. Typhimurium, dan S. Enteritidis Menggunakan Multiplex PCR dengan Tahap Pre-enrichment.
Abstrak: Metode deteksi cepat Salmonella spp., serta serotipe S. Typhimurium dan S. Enteritidis yang umum mencemari karkas ayam telah dikembangkan sehingga aplikasi metode tersebut dapat dilakukan untuk mendeteksi cemaran pada karkas ayam secara spesifik. Penelitian ini dilakukan dalam beberapa tahap yaitu konfirmasi jumlah kultur, kontaminasi artifisial (spike), evaluasi waktu minimal teknik pre-enrichment, dan aplikasi deteksi cemaran Salmonella dengan metode multiplex PCR standar pada karkas ayam. Hasil penelitian menunjukkan penggunaan konsentrasi primer untuk target gen invA sebesar 0.400 μM, STM4497 sebesar 0.120 μM dan Prot6E sebesar 0.400 μM pada suhu annealing sebesar 58oC optimum dalam membedakan kultur murni serovar Typhimurium dan Enteritidis dengan jelas. Waktu pre-enrichment menggunakan media BPW selama 8 jam dapat membantu deteksi multiplex PCR pada jumlah awal total campuran kultur murni kontaminasi artifisial yang sangat rendah hingga 0.73 CFU/mL. Teknik preenrichment 8 jam dapat meningkatkan sensitivitas uji dengan metode multiplex PCR pada karkas ayam yang diduga memiliki jumlah awal cemaran rendah.
Keyword: Salmonella, kultur murni, serotipe, multiplex PCR, pre-enrichment

Judul: Deteksi Kualitatif Salmonella spp., S. Typhimurium dan S. Enteritidis Menggunakan Multiplex Polymerase Chain Reaction.
Abstrak: Pengembangan metode PCR perlu dilakukan untuk mendeteksi beberapa jenis bakteri, yaitu secara multiplex. Tujuan penelitian ini adalah memperoleh kondisi optimum metode multiplex-PCR untuk mendeteksi Salmonella spp., S. Typhimurium dan S. Enteritidis pada karkas ayam. Penelitian ini dilakukan dalam 3 tahap, yaitu pengujian primer, penentuan limit deteksi metode multiplex-PCR dan uji coba deteksi Salmonella spp. pada karkas ayam. Hasil penelitian menunjukkan konsentrasi ekstrak DNA sebesar 553.2 – 1011.4 ng/μL dan kemurnian 1.80 – 1.96. Suhu annealing optimum untuk 3 primer yang digunakan adalah 58 oC dengan konsentrasi primer untuk target gen invA sebesar 0.400 μM, STM4497 sebesar 0.120 μM dan Prot6E sebasar 0.145 μM yang mampu membedakan serovar Typhimurium dan Enteritidis. Limit deteksi metode multiplex-PCR ini untuk Salmonella spp. sebesar 4.7 × 104 sel, S. Typhimurium sebesar 3.5 × 104 sel dan S. Enteritidis sebesar 1.5 × 105 sel. Hasil tersebut menunjukkan bahwa metode multiplex-PCR dengan 3 pasang primer dapat digunakan untuk membedakan Salmonella serovar Typhimurium dan Enteritidis pada karkas ayam.
Keyword: karkas ayam, multiplex-PCR, Salmonella spp., S. Enteritidis, S. Typhimurium

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: