Judul: Variasi Genetik Antar Aksesi Rambutan (Nephelium lappaceum L.) Berdasarkan Penanda Morfologi Daun dan Inter Simple Sequence Repeat
Abstrak: Salah satu buah tropis yang masih perlu dikembangkan adalah buah rambutan (Nephelium lappaceum L.). Rambutan berasal dari Indonesia dan Malaysia sehingga keragamannya tinggi di kedua daerah asal tersebut. Tingginya keragaman rambutan disebabkan oleh sifat rambutan yang menyerbuk silang. Variasi yang dijumpai bukan hanya antar jenis tetapi juga antar aksesi rambutan. Beberapa aksesi rambutan telah dikembangkan menjadi kultivar unggul. Hingga saat ini, pembeda antar aksesi rambutan umumnya ditandai menggunakan ciri morfologi buah. Penggunaan ciri buah sebagai penanda kurang efektif karena tanaman rambutan bersifat tahunan dan membutuhkan waktu lebih dari dua tahun untuk menghasilkan buah pertama kali. Oleh karena itu, dibutuhkan ciri lain yang lebih mudah digunakan untuk membedakan antar aksesi rambutan. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keragaman genetik serta hubungan antar aksesi rambutan di Indonesia menggunakan penanda morfologi daun dan Inter Simple Sequence Repeat (ISSR). Penelitian dilakukan mulai bulan Maret 2016 hingga Februari 2017. Sampel daun untuk pengamatan morfologi dan molekular diperoleh dari koleksi tanaman rambutan yang berasal dari Kebun Percobaan Cipaku dan Taman Buah Mekar Sari Bogor. Sebanyak 30 aksesi rambutan digunakan sebagai sampel yang terdiri dari 54 pohon untuk pengamatan ciri morfologi daun dan 30 pohon untuk pengamatan molekular. Ciri morfologi daun yang diamati meliputi bentuk bangun daun, jumlah anak daun, ukuran panjang dan lebar, bentuk helaian, ujung, dan bentuk pangkal anak daun. DNA sampel diisolasi menggunakan metode Cetyl Trimethyl Ammonium Bromide (CTAB) dengan beberapa modifikasi. DNA hasil isolasi kemudian diamplifikasi menggunakan enam primer, yang diseleksi dari 31 primer ISSR. Hasil penilaian ciri morfologi daun dan pita DNA disusun dalam bentuk matriks dan digunakan untuk menghitung nilai keserupaan berdasarkan indeks keserupaan Simple Matching dan menyusun dendrogram berdasarkan metode Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean (UPGMA). Sebanyak 8 aksesi rambutan menunjukkan ciri daun spesifik yang dapat digunakan sebagai pembeda antar aksesi. Amplifikasi menggunakan enam primer ISSR menghasilkan 58 pita polimorfik dengan primer ISSR 23 penghasil pita terbanyak. Nilai keserupaan antar aksesi rambutan berdasarkan ciri molekular berkisar antara 48%-93%. Ke-30 aksesi rambutan terbagi menjadi tiga kelompok utama berdasarkan data ISSR. Aksesi Pirba memisah pertama kali dari aksesi lainnya dengan nilai ketidakserupaan 52 %. Beberapa pola pita spesifik ditemukan pada aksesi Pirba menggunakan primer ISSR 1 dan UBC 807. Pengamatan ciri morfologi daun dan ciri molekular menunjukkan variasi yang tinggi pada rambutan. Selain berhasil mendeteksi keragaman antar aksesi rambutan, ciri tersebut juga dapat digunakan sebagai penanda spesifik beberapa aksesi rambutan.
Keyword: aksesi rambutan, keragaman genetik, penanda spesifik, UPGMA

Judul: Analisis Keragaman Dan Keragaan Plasma Nutfah Rambutan (Nephelium Lappaceum L.) Di Indonesia
Abstrak: Indonesia merupakan pusat keragaman rambutan dan kerabatnya, sehingga sumber daya genetiknya sangat besar. Sampai saat ini masih banyak aksesi lokal yang belum teridentifikasi secara lengkap. Upaya pengembangan varietas rambutan memerlukan informasi terkait dengan karakter morfologi, keunggulan aksesi, dan fenologi pembungaan, sementara ketersediaan informasi tersebut masih sangat terbatas. Studi fenologi pembungaan diperlukan untuk mengidentifikasi faktor-faktor yang berperan dalam menginisiasi pembungaan. Penelitian dilaksanakan di Kebun Percobaan (KP) Aripan dan KP Subang Balai Penelitian Tanaman Buah (Balitbu) Tropika, KP Cipaku Balai Pengkajian Teknologi Pertanian (BPTP) Jawa Barat, dan Kabupaten 50 Kota Sumatera Barat dari bulan Juni 2013 sampai Februari 2014. Bahan tanaman yang digunakan adalah 33 aksesi rambutan, baik yang dikoleksi di kebun percobaan maupun yang tumbuh di alam. Aksesi-aksesi rambutan tersebut adalah Korong Gadang, Tangkue, Garuda, Pirba, Bariah, Antalagi, Gula batu, Sukowono, Rapiah, Binjai, Lebak bulus, Padang Bulan, Sinyonya, Kalimantan, Padang, Lekong, Walahar, Simacan, Aceh Medan, Lebak Bulus Kuning, Gendut Kair, Sibabat, Aceh Gundul, Cianjur, Lokal Subang, Aceh Kuning, Aceh Gendut, Aceh Gendong, Aceh SKWL, Kering Manis, Kapulasan Mungo 01, Kapulasan Mungo 02,dan Kapulasan Cipaku. Analisis gerombol berdasarkan 29 karakter morfologi pada 33 aksesi rambutan berhasil memisahkan antar spesies rambutan (Nephelium lappaceum) dengan kapulasan (Nephelium ramboutan-ake) dengan koefisien ketidakmiripan 55%. Aksesi rambutan terbagi dua, yaitu kelompok IIa dan IIb. Kedua kelompok mempunyai ketidakmiripan sebesar 49.43%. Kelompok IIa memiliki karakter bentuk tajuk oblong, bentuk daun obovate, dan bentuk buah lonjong terdiri dari aksesi Kering Manis, Lokal Subang, dan Sinyonya. Kelompok IIb terdiri dari 26 aksesi lainnya memiliki karakter bentuk tajuk spherical,semicircular,broadly pyramidal, bentuk daun elliptic, dan bentuk buah ovoid, bulat, dan lonjong Karakter yang berkorelasi dengan bobot per buah adalah bobot kulit, bobot biji dan bobot aril. Model regresi linier berganda yang berisi karakter panjang anak daun (X1), jumlah tandan per cabang (X2), lebar tandan (X3), lebar buah (X4), bobot per buah (X5), dan bobot aril (X6) dapat menjelaskan keragaman edible portion sebesar 85%. Lokasi penanaman yang berbeda menunjukkan perbedaan dalam waktu inisiasi pembungaan pada rambutan. Inisiasi pembungaan ternyata tidak terkait dengan curah hujan. Aksesi Kering Manis memiliki potensi yang cukup tinggi untuk dikembangkan karena memiliki kerapatan tandan rapat, rasa manis, edible portion sedang dan berkulit tebal.
Keyword: aksesi, plasma nutfah, karakter morfologi, dendrogram, biplot, edible portion.

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: