Judul: The Application of DNA Barcoding and DNA Metabarcoding for Marine Sponges Identification in Dampier Strait
Abstrak: Identifikasi spesies dapat dilakukan dengan berbagai metode diantaranya adalah dengan pengamatan morfologi dan pendekatan molekuler. Sifat plastisitas dari morfologi spons menyebabkan biota ini menantang untuk diidentifikasi. Upaya identifikasi dengan pendekatan molekuler dapat menjadi salah satu alternatif dalam kajian spons. Penelitian ini berujuan untuk mengidentifikasi spons dari sampel yang tidak utuh dengan pendekatan DNA barcoding dan DNA metabarcoding. Sampel spons yang diambil adalah sampel dengan tampak morfologi luar yang berbeda. Identifikasi dengan pendekatan molekuler dimulai dari ekstraksi DNA spons dan dilanjutkan dengan amplifikasi DNA. Analisis DNA barcoding menggunakan primer LCO 1490 dan HCO 2198, sedangkan analisis DNA metabarcoding menggunakan primer mlCOIlintf dan dgHCO2198 yang menargetkan gen Cytochrome Oxidase Subunit I (COI). Produk PCR kemudian dielektroforesis dan kualitas pita DNA yang baik akan dilanjutkan pada tahap sekuensing. Analisis genetik dengan metode DNA barcoding mendeteksi 4 jenis yaitu Halichondria sp., Stylissa carteri, Xestospongia deweerdtae, dan Theonella sp. dari 5 sampel yang teramplifikasi. Analisis DNA metabarcoding mendeteksi sebanyak 138 Operational Taxonomic Units (OTUs) dan 65.884 reads atau sekuen yang terdiri dari tiga kelompok yakni kelompok eukariot, kelompok bakteri, dan kelompok yang tidak teridentifikasi secara taksonomi (unassigned). Sampel spons pada penelitian ini dapat diidentifikasi dengan pendekatan DNA barcoding dan DNA metabarcoding. Penggunaan primer yang berbeda menyebabkan adanya perbedaan biota yang terdeteksi. Identifikasi spons dengan metode DNA barcoding menghasilkan taksonomi hingga tingkat spesies. Penggunaan metode DNA metabarcoding dapat mendeteksi tujuh genus spons serta memungkinkan deteksi spons jenis lain yang tidak terdeteksi dengan DNA barcoding. Genus spons yang terdeteksi pada analisis ini menggunakan metode molekuler diantaranya genus Agelas, Paratetilla, Pseudoceratina, Haliclona, Theonella, Halichondria, Xestospongia dan dua spesies diantaranya Xestospongia deweerdtae dan Stylissa carteri. Penerapan kedua metode ini juga sama-sama mendeteksi DNA non-target atau DNA selain spons. Rekomendasi untuk penelitian selanjutnya yakni preservasi yang lebih baik, dan penggunaan primer yang lebih spesifik.
Keyword: DNA Barcoding, DNA Metabarcoding, Porifera

Judul: Sponge Biodiversity Study Using DNA Metabarcoding in Dampier Strait, Raja Ampat Island, West Papua
Abstrak: Kepulauan Raja Ampat memiliki kawasan konservasi, salah satunya adalah Selat Dampier. Spons merupakan invertebrata laut dari filum Porifera dengan rongga dan struktur tubuhnya sederhana, serta memiliki kemampuan filter feeder. Tujuan dari penelitian ini adalah mengidentifikasi spons menggunakan DNA Metabarcoding di Selat Dampier. Metode DNA Metabarcoding adalah pendekatan molekuler yang berasal dari satu gabungan sampel melalui proses ekstraksi seluruh DNA dari sampel tertentu sehingga didapatkan taksonomi spesies. Metode yang dilakukan adalah pengambilan sampel, ekstraksi DNA, amplifikasi DNA, sekuensing DNA, identifikasi spesies, analisis sekuens, serta rekonstruksi pohon filogenetik. Terdapat 13 spesies spons yang berhasil diidentifikasi berdasarkan similarity dan query cover. Komposisi genus tertinggi adalah Callyspongia dan Pseudoceratina. Spons memiliki kandungan bioaktif yang digunakan sebagai antibakteri, antimikrobial, antikanker, antiparasit, serta antibiotik. Rekonstruksi pohon filogenetik untuk melihat tingkat kekerabatan spesies spons dengan model Kimura 2-parameter, serta pendekatan Neighbor Joining dan Maximum Likelihood, The Raja Ampat Islands have conservation areas, one of which is the Dampier Strait. Sponges are marine invertebrates from the phylum Porifera with simple body cavities and structures, and have filter feeder capabilities. The aim of this study is to identify sponsors using DNA Metabarcoding in the Dampier Strait. The DNA Metabarcoding method is a molecular approach that originates from a combined sample through the process of extracting all of the DNA from a particular sample in order to obtain a species taxonomy. The methods used were sampling, DNA extraction, DNA amplification, DNA sequencing, species identification, sequence analysis, and phylogenetic tree reconstruction. There are 13 species of sponges that have been identified based on similarity and query cover. The highest genus composition being Callyspongia and Pseudoceratina. Sponges contain bioactive compounds that are used as antibacterial, antimicrobial, anticancer, antiparasitic, and antibiotics. Reconstruction of phylogenetic trees to see the degree of kinship of sponge species with Kimura 2-parameter model, as well as the Neighbor Joining and Maximum Likelihood approaches.
Keyword: Dampier strait, DNA Metabarcoding, Phylogenetics, Sponge

Judul: Dynamic New Keynesian Model for Unemployment and Inflation Rate.
Abstrak: This paper deals with a scientific analysis of the equilibrium level of hiring, employment and unemployment. The basic model being used is a standard new Keynesian model, which states that utility function depends on consumptions and working hours. Utility maximization refers to a standard labour supply equation, with the marginal cost’s dynamics on new Keynesian model simply reflects movements in real wages and productivity. Furthermore, trade-off between output and inflation stabilization can be considered using the new Keynesian Phillips curve. Dynamic general equilibrium model is a model that can be used to study interactions between market imperfections and nominal rigidities, which is capable of overcoming the main shortcoming of the standard new Keynesian model. In the general equilibrium model there are three groups of the economy agents, namely households, firms and monetary authority. The results of this research science that bargaining processes between firms and workers will yield optimal wage. Increase in labour will cause wages to fall, but the unemployment rate can be reduced. An increase in the firm’s monopoly power will shift the labour demand curve downward, which will reduce the number of workers that firm is willing to hire for any given bargained wage.
Keyword: