Judul: Pemurnian Dan Pengujian Aktivitas Enzim Rekombinan Dna Polimerase Pyrococcus Furiosus Asal Gen Sintetik
Abstrak: Enzim asam deoksiribonukleat (DNA) polimerase merupakan enzim yang berperan sangat luas dalam perkembangan bioteknologi dan biologi molekuler, terutama dalam aplikasi teknik reaksi rantai polimerase (PCR). Penelitian ini bertujuan memurnikan enzim rekombinan DNA polimerase Pyrococcus furiosus (Pol-pfu) agar memperoleh aktivitas yang baik ketika diaplikasikan melalui teknik PCR. Pol-pfu kasar dimurnikan menggunakan metode kromatografi afinitas ion logam. Pemurnian ini menghasilkan 1 pita spesifik pada SDS-PAGE dengan bobot molekul sekitar 92 kD. Pol-pfu dengan konsentrasi 50 μg/mL berhasil digunakan untuk mengamplifikasi sampel DNA yang memiliki ukuran pasangan basa sebesar 200 hingga 2000. Hal ini menunjukkan bahwa Pol-pfu memiliki aktivitas sesuai dengan yang diharapkan, yaitu mampu mengamplifikasi sampel DNA berukuran pasangan basa kecil hingga besar.
Keyword: DNA polimerase, kromatografi afinitas, Pyrococcus furiosus, pemurnian enzim

Judul: Karakterisasi biokimiawi enzim protease dari bacillus subtilis DB104 rekombinan
Abstrak: Melalui teknologi DNA rekombinan, dapat dilakukan kloning gen protease ke dalam mikroba lain sehingga dapat meningkatkan produktivitas dan memperbaiki sifat protease yang diekspresikan. Dalam penelitian ini dilakukan karakterisasi biokimiawi enzim protease hasil ekspresi gen protease asal Bacillus pumilus Y1 yang diisolasi dari limbah cair tahu dengan Bacillus subtilis DB104 sebagai inangnya. Enzim protease Y1 telah dikarakterisasi sifat-sifatnya dan diketahui memiliki aktivitas yang tinggi sehingga merupakan enzim yang potensial untuk dimanfaatkan secara komersial Karakterisasi yang dilakukan terhadap enzim protease B. subtilis DB104 rekombinan meliputi pengaruh suhu, pH, senyawa triton X-100, inhibitor spesifik PMSF dan EDTA, stabilitas enzim, dan pendugaan berat molekul enzim. Pengukuran konsentrasi enzim dilakukan dengan metode Bradford (1976) sedangkan untuk pengujian aktivitas proteolitiknya digunakan metode Bergmeyer et. al. (1983). Produksi protease rekombinan dilakukan dengan menginokulasikan 10% inokulum ke dalam media produksi, yaitu limbah cair tahu + skim 0,5% + CaCl₂ 5 mM, diinkubasi goyang dengan kecepatan 200 rpm pada suhu 37°C selama 10 jam. Inokulum dibuat dengan menginokulasikan 10% kultur Y1 dari media LB + kanamisin (25 µg/ml) ke dalam media yang sama dengan media produksi + kan (25 µg/ml) dan diinkubasi goyang kecepatan 200 rpm pada suhu 37°C selama 10 jam. Filtrat enzim yang diperoleh kemudian diendapkan dengan amonium sulfat 35,1% (b/v) selama semalam hingga diperoleh endapan enzim yang kemudian dilarutkan kembali dalam bufer fosfat 0,01 M pH 8 volume minimal dan ditambah CaCl₂ hingga konsentrasi akhir 2 mM. Enzim inilah yang digunakan untuk analisa. Untuk keperluan elektroforesis, sampel enzim didialisis dan dipekatkan menggunakan polietilen glikol. Suhu optimum protease rekombinan adalah 60°C dengan kisaran pH optimum 6,5 hingga 9. Dengan pemanasan pada suhu 50°C selama beberapa jam dapat menurunkan aktivitas enzim. Kestabilan enzim dapat dijaga dengan penambahan CaCl₂ 2 mM dan penyimpanan pada suhu 4°C. Adanya senyawa triton X-100 hingga konsentrasi 30% dapat mempertahankan aktivitas protease. Protease dihambat oleh PMSF yang merupakan inhibitor spesifik protease serin pada konsentrasi 1 mM dengan aktivitas tersisa 1,5%. Sedangkan oleh EDTA, aktivitas enzim tidak terlalu dihambat. Pada konsentrasi 10 mM EDTA aktivitas enzim masih sekitar 75%. Perkiraan berat molekul protease dilakukan melalui elektroforesis SDS- PAGE dan zimogram. Hasil SDS-PAGE yang memperkiran berat molekul dari sub unit enzim menunjukkan satu macam pita protein dengan berat molekul ± 29 kD. Sedangkan untuk perkiraan berat molekul enzim utuh yang dilakukan melalui zimogram menunjukkan berat molekul sekitar 59,5 kD. Dengan demikian protease utuh diperkirakan terdiri dari dua sub unit dengan berat molekul masing-masing ± 29 kD.
Keyword: 

Judul: Characteristic of Overshooting Top (OT) Based on  Himawari  8  Satellite  as  a  Convective  Cloud  Feature  that  Generates  Extreme Weather in the Java Island Region
Abstrak: Overshooting Top (OT) is a feature at the top of a convective cloud that is associated with extreme weather. Research on OT in tropical Indonesia is still very limited. The existence of geostationary satellites with wide area coverage and fast frequency observations is useful for observing the fast dynamics of the OT life cycle. Therefore, this study intends to analyze the relationship between OT and extreme weather, updraft and thermodynamic conditions of OT when extreme weather occurs, the best objective method for detecting OT in the day time and night time, and the spatiotemporal distribution of OT in the tropical region of Java Island during the 2018-2021 period. Based on visual analysis using visible channel and Himawari 8 sandwich products, 87% of extreme weather events in Java were accompanied by the appearance of OT. It indicates that the presence of the OT pattern is a convection cloud pattern or feature that is closely related to extreme weather events for the Java Island region. The existence of a time lag between the appearance of OT and extreme weather events on Java Island indicates that the OT of convection cloud can be used as a precursor or nowcasting for the appearance of extreme weather. Most of the convective cloud OT features during extreme weather events on Java Island have altitude that were only able to exceed the altitude of the equilibrium level and few were able to exceed the tropopause level of 9 km – 16 km. The difference in atmospheric conditions during extreme weather events on Java Island, which is in the tropics and subtropics, is a strong and unstable convective energy condition characterized by a larger CAPE, as well as unstable KI, LI, SI and TTI values. It is offset by kinematic factors in the form of a weak vertical wind shear (bulk wind shear 0-6 km) and a higher freezing point height. The difference between extreme weather events in the Java Island region and other tropical regions compared to subtropical regions is the strong updraft speed of convection clouds. The IRW Texture COMB algorithm based on the IRW-Texture Gradient modification and the COMB algorithm shows a significant increase in quality for detecting OT and non-OT pixels in Java. Rainy days with rainfall > 50 mm/day are very common in areas with an altitude of > 500 m. On the other hand, the level of convection activity which is indicated by the presence of OT and lightning is significantly reduced in this area. OT of convective clouds appear more frequently during the DJF season and less frequently during the JJA season. OT often appears during the day time and rarely at night time. Most OTs appear in the central part, away from the south and north coasts of Java Island during the day, while OTs that appear near the south and north coasts of Java Island can appear in the morning or afternoon.
Keyword: convective clouds, extreme weather, Overshooting Tops, Himawari 8 Satellite