Judul: Molecular Docking of Katuk Leaf (Sauropus androgynus) Flavonoid Active Compound as Antiinflammatory Against COX-2 Enzyme
Abstrak: Cyclooxygenase-2 (COX-2) merupakan enzim pro-inflamasi yang memproduksi prostaglandin. Senyawa flavonoid memiliki peran antiinflamasi berdasarkan uji in vitro dan in vivo. Penelitian ini bertujuan menganalisis interaksi hasil penambatan molekul senyawa aktif flavonoid katuk terhadap enzim COX-2. Penelitian dilakukan dengan metode in silico menggunakan program YASARA structure. Senyawa flavonoid yang digunakan sebagai ligan uji yaitu, apigenin, caffeic acid, chlorogenic acid, ferulic acid, kaempferol, luteolin, myricetin, quercetin dan senyawa hasil isolasi yaitu, sauropunol A, B, C dan D. Ligan alami polmacoxib digunakan sebagai ligan kontrol. Semua ligan uji lolos dalam uji farmakologi, namun beberapa ligan tidak layak dalam uji toksisitas. Seluruh ligan uji kecuali sauropunol C dan D, berinteraksi pada sisi aktif COX-2 (PDB ID:5GMN), yaitu Val509, His94, Ser530, Asn62, Thr198, Thr199, Trp5 dan Gln92. Kaempferol berpotensi dalam menghambat COX-2 dengan ΔG -5,1400 kkal/mol, Kd 0,1691 µM, satu ikatan hidrogen, enam interaksi hidrofobik. Sedangkan ligan kontrol polmacoxib memiliki nilai ΔG lebih rendah, yaitu -2,3050 kkal/mol dengan Kd 20,3492 µM, tiga ikatan hidrogen, delapan ikatan hidrofobik., Cyclooxygenase-2 (COX-2) is a pro-inflammatory enzyme that produces prostaglandins. Flavonoid compounds have anti-inflammatory roles based on in vitro and in vivo tests. This study aimed to analyze the interaction of active flavonoid compounds from katuk with COX-2 enzymes through molecular docking. The study was conducted using in silico methods by YASARA structure program. Flavonoid compounds used as test ligands are apigenin, caffeic acid, chlorogenic acid, ferulic acid, kaempferol, luteolin, myricetin, quercetin and isolated compounds sauropunol A, B, C and D. The natural ligand polmacoxib was used as a control ligand. All ligands passed pharmacological tests, but some ligands were not suitable for toxicity tests. All ligands except sauropunol C and D interacted with active site of COX-2 (Val509, His94, Ser530, Asn62, Thr198, Thr199, Trp5, Gln92). Kaempferol has the potential to inhibit COX-2 with ΔG -5.1400 kcal/mol, Kd 0.1691 µM, one hydrogen bond and six hydrophobic interactions. Meanwhile, the polmacoxib control ligand has a lower ΔG value of -2.3050 kcal/mol with Kd 20.3492 µM, three hydrogen bonds and eight hydrophobic bonds.
Keyword: antiinflammatory, flavonoids, molecular docking, cyclooxygenase-2 (COX-2)

Judul: Molecular docking of flavonoid compounds in bay leaf (Syzygium polyanthum) on the cyclooxygenase-2 as an anti-inflammatory
Abstrak: Inflamasi adalah suatu respon yang disebabkan oleh kerusakan pada jaringan. Obat antiinflamasi memiliki banyak efek samping sehingga dilakukan pengembangan antiinflamasi dari bahan alam. Daun salam memiliki kandungan flavonoid yang diketahui mempunyai aktivitas antiinflamasi. Penelitian ini bertujuan menganalisis interaksi molekuler dan daya inhibisi senyawa flavonoid daun salam pada COX-2 sebagai antiinflamasi. Metode dalam penelitian ini menggunakan senyawa flavonoid daun salam yang ditambatkan pada reseptor enzim COX-2 kode PDB: 4OTJ dengan menggunakan aplikasi YASARA structure. Sisi katalitik pada COX-2 yaitu Tyr 385 dan Ser 530. Hasil penelitian menunjukkan 3 senyawa aktif terbaik yang berpotensi sebagai inhibitor enzim COX-2 berdasarkan analisis energi bebas ikatan (ΔG), konstanta disosiasi (Kd), interaksi ligan-reseptor, uji bioavailabilitas dan toksisitas, yaitu delfinidin, kuersetin dan mirisitrin. Senyawa tersebut merupakan senyawa terbaik yang dapat berpotensi sebagai inhibitor COX-2 berdasarkan parameter yang dianalisis. Ligan yang memiliki energi ikatan yang terendah secara berturut adalah delfinidin (∆G -10,03 kkal/mol), kuersetin (∆G -9,75 kkal/mol), dan mirisitrin (∆G -9,70 kkal/mol).
Keyword: anti-inflammatory bay leaves, cyclooxygenase-2, molecular docking

Judul: Alat Perekam Data Hujan dengan Mode Hemat Daya
Abstrak: Pengukuran intensitas hujan dapat dilakukan dengan beberapa pendekatan, seperti menggunakan perekam data hujan otomatis (automatic rain recorder). Data curah hujan yang terukur oleh tipping bucket akan tersimpan dalam SDcard setiap kejadian hujan terjadi. Penggunaan arduino sebagai komponen utama dipilih karena perangkat open source yang mudah dimodifikasi. Beberapa komponen arduino yang dapat dimodifikasi adalah ATmega dengan konsumsi daya sebesar 12 mA pada 3 volt serta 17 mA pada 5 volt. Adapun FTDI mengkonsumsi daya sebesar 20 mA pada 5 volt. Voltage regulator mengkonsumsi daya sebesar 38 mA pada 5 volt, 64 mA pada 9 volt, 103 mA pada 12 volt, selain itu led mengkonsumsi 1 mA pada 5 volt. Komponen yang dapat dihilangkan pada arduino antara lain FTDI, voltage regulator, serta led. Pengurangan komponen ini bertujuan agar daya tahan baterai menjadi 6.5 kali lebih hemat dibandingkan arduino standar. Setelah bagian bagian tersebut dihilangkan maka total konsumsi daya yang diperlukan oleh mikrokontroler on board arduino adalah 12 mA saat 3 volt dan 17 mA saat 5 volt saat mode kerjanya. Hasil pengujian menunjukkan bahwa pada penggunaan mode sleep lebih efisien daya dibandingkan mode power save. Mode sleep membantu cara penghematan daya pada pembuatan alat perekam data hujan Penggunaan metode ini jika diasumsikan kejadian hujan hanya terjadi selama tiga jam dalam sehari maka dengan menggunakan baterai sebesar 400 mAh dengan tegangan 3 volt maka alat perekam data hujan ini dapat hidup selama 15 Hari….
Keyword: Arduino, Power save, Rain, Automatic recorder, Tipping bucket, Geophysics and Meteorology, Rain fall, Model penakar hujan, Arduino promini, Arduino uno