Judul: Karakterisasi Dan Pemanfaatan Plasma Nutfah Melalui Pendekatan Pemuliaan Dan Molekuler Untuk Peningkatan Hasil Buah Kopyor Dan Kualitas Benih Kopyor.
Abstrak: Kopyor coconut is one of the commodities that prospectively to increase the income of farmers and local governments. However, its development still faces some problems ie : low production, quality plant material limitations, which is not optimal cultivation techniques and crop management patterns that are less precise. This study aims to: (1) Conduct an inventory existence and record quantity of accession and kopyor coconut varieties from various locations in Indonesia, (2) Evaluate the characteristics of flowering and fruit development the Dwarf kopyor coconut varieties, (3) Identification negative influence of the xenia on kopyor fruits harvested of Tall kopyor and Dwarf kopyor varieties, (4) Develop and evaluate methods of increasing yields kopyor fruit at the farm level through controlled pollination, (5) Determining the genetic mechanisms controlling the kopyor trait of the accession coconut kopyor originating from various locations in Indonesia, (6) Evaluating the genetic diversity of kopyor coconut accessions originating from various locations in Indonesia based on molecular markers, (7) To evaluate patterns of co-segregation between the locus of a number of molecular markers which have been developed for coconut genome and analyzing the linkage of kopyor trait with molecular markers evaluated. The survey results showed that coconut kopyor plants spread in population form at some coconut centers in the area of Java, namely Sumenep and Jember in East Java, Pati, Central Java, Purwakarta, West Java, Tangerang, Banten and Kalianda, South Lampung. In addition it was reported that there is limited kopyor palm plant in Banyuwangi and Ponorogo in East Java, Purbalingga and Purwokerto, Central Java, and in Bogor, West Java. In general, the production of kopyor fruit in all accession kopyor observed at the farm level is relatively low, at under 25% for Tall kopyor accessions and under 40% for coconut Dwarf kopyor accessions. Character of fruit components vary between accessions, with a high value of diversity in the fruit weight and endosperm weight. Endosperm quantity of Dwarf kopyor accessions can be categorized by a score of 1-6 based on the volume of the fruit, while in Tall kopyor has a score of 1-9. The number of female flowers varies between three Dwarf kopyor varieties. The number of female flowers Dwarf kopyor in Kima Atas Experimental Garden, Indonesian Palm Reseacrch institute (IPRI) Manado more than the Dwarf kopyor in the Pati regency, Central Java. The female flower period of three Dwarf kopyor varieties was in male flowers period, allowing the occurrence of self-pollination in the same palm. Dwarf kopyor varieties categorized as direct self-pollinated crops or direct autogamy. viii In general, the development of the fruit in the Dwarf kopyor varieties no different from normal coconut. Dwarf kopyor endosperm kopyor of three varieties began to be distinguished with normal fruit endosperm at the age of 23 weeks after pollination (WAP), with the crumb structure and unstable. Process of endosperm thickening in kopyor coconut start at the age of 23 WAP and reaches a maximum at the age of 41 WAP. Endosperm start regardless of the shell at the age of 32-35 WAP. Endosperm optimal quantity at the age of 41 WAP highest
Keyword: kopyor fruit harvesting, phenology, true-to-type seedling, genetic diversity, kopyor trait.

Judul: Pollen Dispersal Analysis among Pati Dwarf and Kalianda Tall Kopyor Coconut (Cocos nucifera L.) Based on SSR and SNAP Marker to Support Coconut Breeding Program
Abstrak: Kelapa kopyor merupakan kelapa mutan alami asli Indonesia yang harus dilestarikan dan dikembangkan lebih lanjut agar sumberdaya genetik asli Indonesia tersebut dapat dimanfaatkan sepenuhnya untuk kesejahteraan rakyat Indonesia. Abnormalitas fenotipe endosperma kelapa Kopyor diduga sebagai akibat dari defisiensi enzim penting tertentu selama dalam proses perkembangan endospermanya. Namun demikian, identitas enzim yang defisien dari endosperma kelapa Kopyor sampai saat ini masih belum diketahui. Karakteristik mutan pada kelapa Kopyor juga dapat diturunkan secara genetik dari tetua ke progeninya. Salah satu permasalahan yang dihadapi oleh petani kopyor adalah rendahnya kuantitas hasil buah kopyor yang dipanen. Akibatnya produksi buah kelapa kopyor masih belum dapat memenuhi kebutuhan konsumen.Adanya kelapa normal di antara pertanaman kelapa kopyor diduga mempengaruhi produktivitas buah kopyor.Keberadaan pohon dewasa kelapa Dalam berbuah normal diduga berpengaruh negatif terhadap produksi buah kopyor. Pohon tersebut dapat menyebarkan serbuk sari pembawa sifat normal pada bunga betina pohon kelapa kopyor, akibatnya buah yang terbentuk dari penyerbukan akan menjadi buah normal. Keberhasilan penyerbukan pada tanaman juga memerlukan bantuan polinator untuk penyebaran serbuk sari tanaman kelapa maupun pada tanaman lainnya. Studi penyebaran serbuk sari dipelajari dengan menggunakan marka molekular yaitu marka SSR (Single Sequence Repeat) yang mempunyai keunggulan yaitu bersifat kodominan, polimorfismenya tinggi, lokus tersebar di dalam genom dalam jumlah banyak dan sampel DNA yang dibutuhkan sedikit karena dalam melakukan deteksi menggunakan PCR (Polymerase chain reaction) yang dapat menggandakan DNA. Penanda DNA berbasis SNAP adalah satu-satunya penanda DNA yang memiliki sifat bi–alel dan kodominan, sehingga penanda SNAP mampu membedakan alel homozigot dari heterozigot yang efisien. Serangkaian penelitian telah dilakukan dengan tujuan untuk memberikan informasi mengenai tipe penyebaran serbuk sari dan besarnya persentase penyerbukan silang ataupun penyerbukan sendiri pada pertanaman kelapa, efek keberadaan pohon kelapa berbuah normal di dalam pertanaman kelapa berbuah kopyor, efek polinator terhadap produksi buah kopyor sehingga diharapkan produktivitas buah kelapa kopyor dapat ditingkatkan, selain itu juga memberikan informasi dasar genomik dan molekuler yang akan sangat berguna dalam mendukung program pemuliaan kelapa kopyor di masa yang akan datang. Oleh karena itu, penelitian penyebaran serbuk sari kelapa kopyor ini diperlukan untuk menjawab potensi permasalahan budidaya kelapa kopyor di masa depan. Analisis parental digunakan untuk mengevaluasi penyebaran serbuk sari pada kelapa kopyor dengan menggunakan CERVUS version 2.0 software. Keberadaan penyerbukan silang antara kelapa genjah dengan kelapa genjah, kelapa dalam dengan kelapa genjah dan kelapa hibrida dengan kelapa genjah diobservasi di pertanaman populasi kelapa kopyor Genjah Pati. Serbuk sari yang didonasikan dapat berasal dari serbuk sari donor yang berada dalam kisaran jarak tempuh 0-58 meter dari tetua betina yang dievaluasi. Oleh karena itu, selain dengan adanya keberadaan angin, polinator serangga juga dapat berperan penting dalam polinasi kelapa Kopyor. Pola pembungaan dan pembuahan pada tanaman kelapa kopyor tipe Dalam Kalianda menyebabkan rendahnya peluang terbentuknya buah kopyor pada tanaman kelapa berbuah kopyor yang dikelilingi tanaman kelapa normal. Penyerbukan kelapa kopyor oleh kelapa normal dengan jarak penyebaran serbuk sari rata-rata 14,7 m dengan penyebaran terjauh pada jarak 80 m dan penyebaran terdekat pada jarak 0 m. Pohon kelapa Dalam Kalianda menunjukkan rate of selfing sebesar 8,25% dan rate of outcrossing sebesar 91,75% di populasi kelapa Dalam Kalianda. Pertanaman kelapa Dalam Dukuh Seti Pati menunjukkan persebaran
Keyword: kelapa kopyor, endosperma abnormal, analisis parental, pergerakan serbuk sari, penyerbukan silang, penyerbukan sendiri, Marka SSR (mikrosatelit), Marka SNAP

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: