Judul: Struktur Komunitas Makrozoobenthos Sebagai Indikator Kualitas Linglcungan Perairan Di Muara Angke, Jakarta
Abstrak: Salah satu daerah hutan mangrove di pantai Utara Jawa adalah Hutan Lindung Angke Kapuk, pada daerah ini bellnuara Cengkareng Drain dan Sungai Angke. Bagian daratan di sebelah selatan terdapat berbagai kegiatan pemanfaatanlahan, seperti hutan wisata yang berada di sebelah barat daya, kawasan pemukhnan Pantai Indah Kapuk, lapangan golf, dan daerah snaka margasatwa; di sebelah timur muara Sungai Angke merupakan daerah tambak percobaan dan kegiatan peli.kanan lainnya. Kegiatan pemanfaatan lahan tersebut dapat menimbulkan permasalahan bagi lingknngan perairan Hutan Linduug Augke Kapuk yang pada akhimya akan mempengaruhi knaJitas air maupun organisme perall'an. Penelitian ini beltujuan untuk mengetahui kualitas lingkungan pemiran di Hutan Lindlmg Angke Kapuk melalui peudekatan stmktur komunitas makrozoobenthos sebagai indikator kualitas perall'an. Penelitian ini dilaknkan pada Bulan Juli - September 2000 di kawasan perall'an Hutan Lindung Muara Angke, Jakarta Utara. Lokasi penelitian terdhi. atas tiga stasiun dan delapan substasiun yang ditentukan berdasarkan faktor lingkungan dan kerapatan pohon mangrove. Pengambilan contoh dilaknkan sebanyak tiga kali dengan intelval waktu satu bulan. Pengambilan contoh makrozoobenthos dilaknkan dengan menggunakan Ekman Dredge. Analisis knalitas all' dilakukan di LaboratOli. um Fisika-Khnia-Biologi Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan -lPB; analisis snbstrat dilakukan (Ii LaboratOli.um Pusat Penelitian Tanah dan Agroklimatologi Bogor; identifikasi makrozoobenthos dan analisis biomassa(beratkerillg)dilaktikall diLab6ratorium BiologiHewan - PUsat StudIllmu Hayati (PSIH), lPB. Analisis data ll1akrozoobenthos ll1eliputi: kepadatau, keanekaragaman, keseragaman, dan dominansi. Untuk ll1engetahui knalitas lingknngan perah'an dilakukan analisis klIlva ABC (Abundance and Biomass Comparison). Dan pengamatan terhadap maluozoobenthos pada setiap substasiun diperoJeh sebanyak 17 genera yang tergolong dalam 4 kelas dan 3 filum. Keempat kelas tersebut yaitu Kelas Gastropoda Filum Moluska (7 genera); Kelas Pelecypoda Filum Moluska (8 genera); Kelas Malacostraca Filum Cmstacea dan Kelas Polychaeta Filum Amrelida, masing-masing satu genns. Organisme makrozoobenthos banyak ditemukan pada Stasiun III substasiun 1 dengan kepadatan sebesar 42155 ind/m2 (Agnstus 2000). Secara umum komposisijenis ll1aluozoobenthos yang relatifbesar pada tiap snbstasiun adalah Perna viridis. Makrozqobenthos yang tergolong toleran adalah Nereis sp., Perna viridis, Thiara rufis, Melanoides tuberculata, Modiulus demissus, Donax variabilis, Penaeus sp. Nilai indeks keanekaragaman makrozoobenthos tiap substasiun tergolong rendah yaitu 0,17 - 1,84 (Agustus) dan 0,18 - 2,58 (September); nilai indeks keseragaman pada tiap substasiun tergolong rendah - tinggi yaitu 0,17 - 1 (Agustus) dan 0,12 - 1 (September); dan nilai indeks dominansi tergolong rendah sampai tinggi yaitu berkisar antara 0,31 - 0,95 (Agustus) dan 0,17 - 0,95 (September). Hasil pengamatan terhadap parameter fisika - kimiawi perairan Butan Linclung Angke Kapuk menunjukkan kondisi yang masih memungkinkan untuk tumbuhnya makrozoobenthos, telUtama yang mampu beradaptasi pada lingkungan perairan yang kurang baik. Basil pengamatan terhadap substrat dasar perairan diketahui bahwa pada ummnnya tipe substrat di perairanButan Linduug Angke Kapuk aclalah Iiat sampai Iiat berlumpur. Berdasarkan hasil analisis kUlva ABC, indeks-indeks biologi, karakteristik fisikakimiawi perairan, dan komposisi jenis makrozoobenthos, kualitas lingkungan perairanButan Lindung Angke Kapuk dapat digolongkan sebagai lingkungan perairan yang tercemar berat.
Keyword: 

Judul: Struktur komunitas makrozoobenthos sebagai bioindikator kualitas lingkungan perairan di Muara Sungai Cimandiri, Pelabuhan Ratu, Sukabumi Jawa Barat
Abstrak: Perairan estuari Muara Sungai Cimandiri sebagai bagian integral dari Teluk Pelabuhan Ratu sangat rentang terhadap perubahan lingkungan perairan karena menjadi daerah buangan limbah rumah tangga maupun MCK. Dengan demikian, untuk kepentingan pengelolaan, pengembangan, dan pemanfaatan sumberdaya alam pesisir dan laut, khususnya di sekitar perairan estuari muara Sungai Cimandiri diperlukan informasi secara periodik tentang kondisi lingkungan di perairan tersebut. Berdasarkan landasan pemikiran diatas, maka penelitian ini dilakukan dengan tujuan untuk melihat struktur komunitas makrozoobenthos yang dijadikan sebagai indikator biologis dalam menganalisis kualitas lingkungan perairan estuari muara Sungai Cimandiri. Untuk menopang analisis tersebut, juga dilakukan studi tentang kondisi, karakter, dan dinamika berbagai parameter fisika dan kimia perairan estuari muara Sungai Cimandiri. Pengambilan data dilakukan pada bulan Maret sampai bulan Juni 2002 di muara Sungai Cimandiri, Pelabuhan Ratu. Pengambilan contoh Makrozoobenthos dilakukan dengan mengambil contoh substrat dasar menggunakan Petersen Grab yang berukuran (20 cm x 20 cm) pada delapan stasiun pengamatan dengan tiga kali ulangan, kemudian substrat tersebut disaring dengan saringan berdiameter 0,5 mm untuk memisahkan makrozoobanthos dengan komponen dan jenis lainnya. Contoh makrozoobanthos yang didapat selanjutnya dimasukkan dalam botol sampel dan diberi larutan pengawet formalin empat persen. Selanjutnya diidentifikasi dengan menggunakan buku identifikasi dan dibandingkan dengan koleksi makrozoobenthos yang ada di Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Institut Pertanian Bogor dan LIPI Cibinong. Organisme makrozoobenthos yang ditemukan di lokasi penelitian terdiri dari 16 spesies yang terbagi kedalam lima kelas, yaitu Gastropoda (Melanoides granifera, Thiara sp., Clypeomorus sp., Terebra sp., Pleurotoma sp., dan Natica sp.), Bivalvia (Tellina sp. dan Cardium sp.), Polychaeta (Diopatra cuprea, Nereis sp., Sigambra tentaculata, Owenia fusiformis, Cabira incerta), Crustacea (Cirolana sp.), dan Stelleroidea (Ophioderma sp. dan Opiopholis mirabilis). Komposisi terbesar makrozoobenthos antar bulan terdapat pada Bulan Juni, yaitu dari kelas Bivalvia (58.9%). Kepadatan tertinggi terdapat pada Bulan Juni (458 ind/m²), dari kelas Bivalvia. Indeks Keanekaragaman (H') jenis berkisar antara 0.64 (stasiun lima) - 3,44 (stasiun enam). Indeks Keseragaman (E) jenis berkisar antara 0,17 (stasiun lima) - 0,86 (stasiun enam). Indeks Dominansi (D) jenis berkisar antara 0,14 (stasiun enam)-0,74 (stasiun satu). Kisaran nilai indeks-indeks diatas mengindikasikan bahwa telah terjadi gangguan keseimbangan dari struktur komunitas makrozoobenthos pada beberapa stasiun pengamatan di muara Sungai Cimandiri, Pelabuhan Ratu, Sukabumi, Jawa Barat pada tahun 2002.
Keyword: 

Judul: Isolasi Konstruksi dan Rekombinasi Gen Pengkode Reverse Transcriptase asal Simian Retrovirus-2 (SRV-2)
Abstrak: The availability of reverse transcriptase enzym as a valuable component for Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) technique has been providing by foreign companies. Therefore, it needs more cost and time to provide it. This study is an early step to produce in house reverse transcriptase rekombinant enzym from SRV-2. The purpose of this study was isolated, constructed, and rekombined SRV-2 reverse transcriptase gene to entry clone and destination vector. Isolation was done by PCR amplification technique using three pairs of primers, which are RT I (3282-3683), RTII (3261-3900), and RTIII (3169-4133). Construction and recombination in this study used Gateway method from Invitrogen. SRV-2 reverse transcriptase gene was isolated in this study with A-549 cell inoculated SRV-2 as source of virus. This gene amplify by PCR technique and resulted specific band for RTI 401 bp, RTII 639 bp, and RTIII 964 bp. Analysis of pENTR/SD/TOPO and pDEST17 indicated SRV-2 reverse transcriptase gene code has already inserted to this plasmid. This result indicated SRV-2 reverse transcriptase gene have isolated, constructed, and recombined to entry clone and destination vector.
Keyword: