Judul: Analisis Spasial Wisata Selam di Atol Kaledupa Berbasis Habitat Bentik dan Struktur Geomorfologi
Abstrak: Atol Kaledupa sebagai sebuah ekosistem perairan yang pengelolaannya sebagai zona perlindungan bahari dan zona pemanfaatan lokal di Taman Nasional Wakatobi. Berbagai aktivitas yang dilakukan di Atol ini menjadi satu kesatuan yang unik dan menarik termasuk kegiatan wisata. Pengembangan kegiatan wisata dikasawan ini sangat dimungkinkan walaupun bersifat terbatas. Aktivitas wisata yang memanfaatkan sumberdaya alam sebagai daya tariknya dapat menjadi modal dalam mengembangkan sebuah kawasan wisata dengan konsep keterpaduan geomorfologi dan habitat terumbu karangnya. Penelitian ini bertujuan untuk mengkaji kesesuaian wisata berbasis geomorfologi dan habitat terumbu karang. Identifikasi potensi geomorfologi dan habitat terumbu karang dilakukan dengan memanfaatkan Citra Sentinel 2A dan analisis spasial dengan menggunakan Sistem Informasi Geografis untuk memperoleh kesesuaian lokasi wisata selam. Penginderaan Jauh dan Sistem Informasi Geografis dengan ekstensi Benthic Terrain Modeler (BTM) digunakan untuk mengkaji habitat bentik dan geomorfologi perairan dangkal. Tiga belas kelas struktur geomorfologi habitat yang dihasilkan dari penelitian ini adalah Flat plain (17142,32 Ha), dan kelas terendah adalah Crevices, narrow gullies rock outcrops (1,64 Ha). Secara berturut kelas lainnya adalah Broad slope (9104.53 ha), Flat ridge tops, upper slopes (4262.67 ha), Current scoured depressions on a slope (3420.98 ha), Narrow depressions at the base of rock outcrops (2348.20 ha), Rock outcrop highs, narrow ridges (1792.45 ha), Local ridges, boulders, pinnacles on slopes (879.29 ha), Scarp, cliff or small local depressions on a slope (703.02 ha), Local ridges, boulders, pinnacles on broad flat (490.17 ha), Local depressions, current scoured on flat (416.39 ha), Local ridges, boulders, pinnacles on broad depressions (16.63 ha), dan Steep slopes (2.88 ha). Sedangikan Komponen habitat bentik di Atol Kaledupa dikelompokkan menjadi 6 kelas. Distribusi habitat bentik yang ditemukan terdiri dari Karang Hidup (KH), Pasir (P), Lamun (L), Pasir Karang Hidup (PKH), Lamun Karang Hidup (LKH), dan Pasir Rubble (PR). Hasil model spasial kesesuaian wisata berbasi geomorfologi menunjukan kategori sangat sesuai (S1) untuk wisata selam berada pada lokasi-lokasi yang memiliki bentukan geomorfologi kelas Broad Slope di beberapa lokasi yang masuk dam Zona perlindungan bahari da zona pemanfaatan umum.
Keyword: Kaledupa Atoll, Sentinel Image 2A, habitat geomorphology, tourism spatial modeling

Judul: Kajian Geomorfologi Habitat Bentik Perairan Dangkal Pulau Harapan-Kelapa, Kepulauan Seribu
Abstrak: Informasi tentang karakteristik dasar perairan merupakan salah satu variabel penting yang perlu dipertimbangkan dalam pengelolaan ekosistem di perairan pesisir dan laut. Oleh karena itu pengembangan metode dalam penerapan teknologi penginderaan jauh untuk mengkaji karakteristik perairan laut dangkal perlu terus dilakukan. Kajian ini terdiri dari dua bagian utama, yaitu (1) pendugaan kedalaman perairan melalui citra satelit WorldView-2 menggunakan algoritma rasio kanal, dan (2) klasifikasi geomorfologi dasar perairan melalui pendekatan Benthic Terrain Modeler (BTM). BTM merupakan suatu metode untuk menganalisis habitat dasar dan geomorfologi perairan dangkal. Aplikasi BTM memerlukan data kedalaman (batimetri) sebagai input utama. Data kedalaman yang digunakan diperoleh dari integrasi beberapa sumber yaitu data kedalaman dari peta batimetri, data kedalaman hasil survei pemeruman, dan data kedalaman hasil transformasi citra satelit WorldView-2. Survei lapang untuk groundcheck daerah penelitian dan pemeruman menggunakan Mapsounder 585 dilakukan pada bulan Maret 2015. Daerah penelitian dibatasi oleh koordinat 106o33’8,3”-106o35’34,73”BT dan 5o38’41,11”-5o39’41,59”LS. Transformasi citra satelit menjadi data kedalaman dilakukan dengan beberapa pendekatan, diantaranya adalah dengan pemisahan wilayah kajian. Transformasi citra yang dilakukan mampu menghasilkan kedalaman estimasi yang cukup baik hingga kedalaman 17 m. Data kedalaman hasil integrasi dianalisis menggunakan BTM untuk memperoleh nilai Bathymetric Position Index (BPI), dan Slope, serta mengklasifikasi Struktur Geomorfologi. Rentang nilai BPI yang dihasilkan berbanding lurus dengan luas lingkup spasial (scalefactor) yang diberikan. Nilai kelerengan (slope) berada pada rentang 0-75,6o dengan cell size 2x2 m. Nilai-nilai BPI dan nilai kelerengan disusun sebagai kamus klasifikasi digunakan dalam menentukan struktur geomorfologi dasar perairan pulau Harapan-Kelapa. Terdapat 13 kelas struktur geomorfologi di Pulau Harapan-Kelapa, yaitu: Broad slope, Crevices-narrow gullies between rock outcrops, Current scoured depression on slope, Narrow depressions at the base of rock outcrops, Flat plains,Flat ridges tops-upper slopes, Local depression-current scours on flat, Local ridges-boulders-pinnacles on slopes, Local ridges-boulders-pinnacles on broad depression, Local ridges-boulders-pinnacles on broad flats, Rock outcrop highs-narrow ridges, Scarp-cliff-or small local depression on slope, dan Steep slopes.
Keyword: Benthic Terrain Modeler, geomorfologi, citra WorldView-2, rasio kanal, batimetri, Pulau Harapan-Kelapa.

Judul: Kloning dan Ekspresi Human Interferon-alfa2a pada Yeast Metilotropik Pichia pastoris
Abstrak: Interferon (IFN) is a group of proteins that are secreted by body cells as a result of exposure to biological vertebrates such as: viruses, bacteria, protozoa and other compounds. There are three types of interferon, namely: alpha (α), beta (β) and gamma (γ) IFN. Interferon-α2a belongs to the type I interferon. This protein has a molecular weight of 21.550 kDa and consists of 188 amino acids (23 amino acid of signal peptide and 166 amino acids of mature protein). Interferon-α2a is also known to be used for the treatment of hepatitis C and as anti-tumor and antivirus agents. Regulator gene for IFN production under normal conditions, is in the off position to IFN is not produced. But when there are external stimuli, both viral and bacterial infections, a regulator gene switches on, and IFN production system running. At the time of an attack from a variety of disease agents actually the body will produce IFN, but generally the amount produced is not sufficient to fight the disease agents that multiply very quickly. Therefore IFN intake from outside is needed. This is the beginning of the use of IFN as a drug. Genetic engineering is an activity to manipulate the genes to get new products by creating recombinant DNA through gene insertion. Recombinant DNA technology has been used to produce IFN. Yeast such as Pichia pastoris can be an alternative as the host (system) to express human interferon genes and as a producer of IFN protein. Expression system P. pastoris offers several advantages for the production of recombinant proteins, such as: the high level expression of recombinant proteins, ease of scaling-up fermenter, low cost and ease of transformation techniques and selection of transformed cells such as bacteria . The existence of inducible AOX1 promoter is very strong, easily control the expression of recombinant proteins by induction. AOX1 is a promoter that controls gene expression of alcohol oxidase to metabolize methanol as carbon source of P. pastoris. Therefore,this study aimed to clone human interefron-α2a (hifnα2a) gene in E. coli and express it in metylotrophic yeast P. pastoris. Vector used in this study is pPICZαB (Invitrogen). Ligation process between insert (hifn-α2a gene) and vector (pPICZαB) performed by using T4 DNA ligase, which functions synthesize the formation of phosphodiester bonds linking the nucleotides with nucleotide insert plasmid vectors to produce recombinant (pPICZαB-hifnα2a). This recombinant plasmid transformed into XL1 blue cells (E. coli) by Heat shock method. The results of sequencing analysis (clone 6) using 5'AOX and 3'AOX primers indicate that DNA base sequence of human IFN-α2a genes has been subclone into pPICZαB vector (in frame). Recombinant plasmid (clone 6) linearized using BstX1 enzyme before transformed into X33 yeast cell. Transformation into cell was done by Electroporation. The X33 cell P. pastoris strain was used to express human interferon-α2a. X33 is strains with the phenotype Mut+ (methanol utilization plus) and can be used for positive transformants selection using zeocin. Phase protein production work using Mut+ strain occurred in two phases. The first phase is the use of glycerol to obtain a certain amount of biomass (high cell
Keyword: