Judul: Analisis Keragaman Genetik Kedelai Transgenik Turunan Keempat (T4) dan Varietas Unggul Nasional Berbasis Marka SSR
Abstrak: Tanaman kedelai transgenik dapat menambah koleksi plasma nutfah tanaman kedelai dan meningkatkan keberagaman kedelai. Keberagaman pada kedelai membutuhkan karakterisasi secara molekuler untuk mengetahui jarak kekerabatan antar varietas kedelai. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasijarak kekerabatan genetik kedelai transgenik turunan keempat (T4) dan beberapa kedelai varietas unggul nasional menggunakan marka SSR. Tahapan analisis keragaman genetik tersebut diawali dengan isolasi sampel DNA kedelai menggunakan metode Doyle dan Doyle termodifikasi, amplifikasi DNA menggunakan PCR dan selanjutnya analisis polimorfisme dan filogeni.Lima belas sampel DNA kedelai yang diukur memiliki konsentrasi DNA yang berkisar dari 6.4 – 516.4 ng/μl. Hasil amplifikasi sampel DNA kedelai menunjukkan ukuran produk hasil amplifikasi berkisar pada 100-200 pasang basa (bp). Rerata nilai PIC (Polymorphic Information Content) yang diperoleh sebesar 0,36. Hasil dendogram mengelompokkan 15 sampel tanaman kedelai menjadi 2 kelompok utama pada koefisien kemiripan 0,47. Kedelai dengan jarak genetik tertinggi dapat digunakan sebagai tetua dalam persilangan.
Keyword: kedelai transgenik, keragaman genetik, SSR, polimorfik, PIC

Judul: Keragaman Genetik Kedelai (Glycine max L.) Introduksi dan Aksesi Lokal Berdasarkan Marka SSR.
Abstrak: Kedelai (Glycine max L.) merupakan salah satu tanaman yang mempuyai nilai ekonomi tinggi. Peningkatan kebutuhan kedelai nasional menjadi tantangan bagi pemulia kedelai. Ketersediaan sumber keragaman genetika merupakan prasyarat keberhasilan program pemuliaan suatu varietas. Penelitian ini bertujuan menganalisis keragaman genetika 50 aksesi kedelai introduksi dan 46 kedelai aksesi lokal menggunakan 14 marka Simple Sequence Repeats (SSR). Tahapan penelitian dimulai dengan isolasi DNA, PCR, skoring, dan analisis data dengan perangkat lunak NTSYS dan PowerMarker. Hasil penelitian menunjukkan 14 marka SSR yang digunakan bersifat polimorfik. Sebanyak 276 alel berukuran 85- 328 bp dengan kisaran 4-27 alel per lokus berhasil dideteksi. Nilai rerata Polymorphic Information Content (PIC) yang didapat sebesar 0.96 (PIC>0.5), sehingga marka dapat digunakan untuk mendeteksi keragaman genetik kedelai. Nilai rerata diversitas gen sebesar 0.96 menunjukkan keragaman yang cukup tinggi. Analisis klaster menunjukkan 96 aksesi kedelai mengelompok menjadi dua klaster utama pada nilai koefisien kesamaan genetik 0.84. Kelompok pertama terdiri atas 95 aksesi, sedangkan kelompok kedua hanya terdapat satu aksesi (Huang Mao Bai Shui Dou). Hasil analisis keragaman ini digunakan sebagai dasar awal penentuan tetua persilangan program pemuliaan kedelai di Indonsesia.
Keyword: Kedelai (Glycine max L.), keragaman genetik, SSR

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: