Judul: Keseragaman Benih Dan Pohon Induk Di Kebun Sumber Benih Pala (Myristica Fragans Houtt.) Berdasarkan Karakter Morfologi Dan Molekuler
Abstrak: Pala merupakan tanaman tropis asli Indonesia penghasil minyak atsiri dan merupakan komoditas ekspor yang penting. Tingkat keseragaman benih pala tergolong rendah dikarenakan pala merupakan tanaman yang menyerbuk silang. Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi tingkat keseragaman benih, pohon induk dan kebun sumber benih pala di Ambon. Penggunaan karakter morfologi dan molekuler untuk mengukur tingkat keseragaman benih, pohon induk dan antar kebun sumber benih pala. Penelitian dilakukan bulan Agustus 2014 hingga Agustus 2015 di tiga kebun sumber benih di Ambon, dan Laboratorium Pengujian dan Penyimpanan Benih, Kebun percobaan Leuwikopo, dan Laboratorium Biologi Molekuler Tanaman 2, IPB. Karakterisasi dilakukan pada 10 pohon induk dari kebun sumber benih Wakal dan Lula serta 8 pohon induk dari kebun sumber benih Toisapu. Sepuluh sampel daun, buah, fuli dan benih diambil dari setiap pohon. Karakterisasi secara kuantitatif dan kualitatif pada karakter vegetatif, buah, fuli dan benih dan dianalisis tingkat keseragaman menggunakan Gower’s similarity test. Analisis molekuler dilakukan pada bibit tanaman dari 5 benih dari 5 pohon induk yang berbeda dari setiap kebun sumber benih. Analisis molekuler menggunakan marka RAPD dengan menggunakan 19 primer yang berbeda. Daun bibit pala diekstraksi menggunakan metode CTAB yang dimodifikasi dan diamplifikasi dengan metode PCR lalu divisualisasi dengan elektroforesis. Analisis tingkat keseragaman dilakukan dengan menggunakan metode Dice’s. Analisis keseragaman gabungan karakter morfologi dan molekuler juga dilakukan dengan metode Dice’s. Tingkat keseragaman benih secara morfologi menujukkan bahwa benih dari pohon induk kebun sumber benih Lula lebih seragam dengan 6 pohon induk yang menghasilkan benih dengan tingkat keseragaman ≥ 0.80 sedangkan pada Toisapu terdapat 1 pohon induk dan Wakal terdapat 3 pohon induk. Tingkat keseragaman morfologi antar pohon induk, benih secara molekuler dan benih dengan gabungan karakternya menunjukkan bahwa kebun sumber benih Lula dan Toisapu lebih seragam daripada Wakal. Tingkat keseragaman pohon induk pala menunjukkan bahwa kebun sumber benih Lula (0.64–0.81) dan Toisapu (0.64–0.80) lebih seragam dibandingkan kebun Wakal (0.47–0.77). Tingkat keseragaman benih secara molekuler menujukkan bahwa benih kebun sumber Lula (0.93–0.96) dan Toisapu (0.87–0.93) telah seragam daripada kebun Wakal (0.61–0.92). Tingkat keseragaman benih dengan penggabungan karakter menunjukkan bahwa tingkat keseragaman benih kebun sumber Lula (0.91–0.96) dan Toisapu (0.85–0.90) telah seragam daripada kebun Wakal (0.68–0.91). Tingkat keseragaman benih menunjukkan bahwa pohon induk ke-7 dari kebun Wakal menghasilkan benih dengan tingkat keseragaman terendah dengan marka molekuler (0.61) dan penggabungan karakter morfologi dan molekuler (0.68).
Keyword: Analisis Dice’s, Gower’s dissimilarity test, keseragaman benih, marka RAPD, sumber benih

Judul: Genetic Similarity, Factor that Influence Yield and Pollen Dispersal of Nutmeg Population (Myristica fragrans Houtt.)
Abstrak: Indonesia adalah salah satu negara penghasil pala terbesar di dunia. Meskipun demikian harga pala Indonesia lebih rendah dibandingkan negara lain seperti Vietnam. Hal tersebut disebabkan oleh produk pala Indonesia terkontaminasi aflatoksin, kandungan methyl eugenol penyebab kanker tinggi dan produk yang dihasilkan berasal dari jenis yang tidak seragam. Selain pada penambahan produksi, Indonesia juga harus memperbaiki kualitas produk pala. Langkah awal dalam peningkatan produksi dan kualitas pala adalah penyediaan bahan tanaman unggul. Penyediaan bahan tanam unggul diawali oleh proses identifikasi sumber keragaman. Sumber keragaman dapat diidentifikasi berdasar penanda morfologi. Selain untuk identifikasi, penanda morfologi dapat pula digunakan untuk menduga fenotipe kelamin dan hasil. Penanda morfologi memiliki kekurangan yaitu hasil yang diperoleh dipengaruhi oleh faktor lingkungan. Oleh karena itu diperlukan penambahan data dengan pendekatan lain, seperti penanda berbasis DNA yaitu Simple Sequance Repeat (SSR) yang tidak terpengaruh faktor lingkungan. Selain varietas unggul, faktor biotik (proses inisiasi pembungaan, penyerbukan dan pembentukan buah) dan abiotik (curah hujan, intensitas sinar matahari, dan kelembapan) berpengaruh terhadap peningkatan produksi dan kualitas produk pala. Penanda SSR dapat juga digunakan untuk melihat peran pendonor dan pola penyebaran serbuk sari pala. Tujuan penelitian ini adalah untuk memberikan informasi mengenai keragaman fenotipik dan genetik koleksi tanaman pala Balittro yang berasal dari beberapa daerah asal yang berbeda. Selain karakteristik tanaman, infomasi mengenai faktor yang berpengaruh terhadap peningkatan produksi dan kualitas pala juga sangat diperlukan. Informasi ini diharapkan dapat menjadi dasar dalam program pemuliaan tanaman pala di masa mendatang dan dasar dalam merancang kebun induk. Informasi-informasi tersebut diperoleh melalui rangkaian penelitian Posisi pendonor serbuk sari dan iklim yang berpengaruh terhadap produksi buah pala, karakter morfologi yang berhubungan dengan fenotipe kelamin, keragaman populasi pala ex-situ berdasar penanda morfologi dan Simple Sequence Repeats (SSR), korelasi dan analisis lintas karakter morfologi dan hasil serta peran pendonor dan pola penyebaran serbuk sari pada populasi Identifikasi karakter berdasarkan penanda morfologi dan SSR dilakukan terhadap 188 aksesi pala, diuji dengan menggunakan analisis kemiripan dan hubungan kekerabatan. Pengujian dilakukan dengan software MINITAB, SPSS, PAST3, GenAlEx, dan DARWIN. Selain untuk uji keragaman, penanda morfologi juga digunakan untuk pendugaan karakter yang berhubungan dengan fenotipe kelamin dan hasil. Uji hubungan ini dilakukan dengan menggunakan analisis korelasi dan analisis lintas menggunakan software MINITAB. Faktor-faktor yang berpengaruh terhadap produksi buah pala diketahui melalui analisa hubungan antara faktor iklim, cahaya, rasio jumlah pohon jantan dan betina, jarak dan posisi pohon jantan terhadap pohon betina dengan produksi buah pala. Data identifikasi fenotipe kelamin 295 aksesi pala, produksi buah pala tahun 2005-2017, pemetaan letak dan jarak masing-masing aksesi, data iklim dan intensitas cahaya digunakan dalam penelitian ini.Pengujian dilakukan dengan menggunakan software MINITAB. Jarak, arah terbang dan peranan pendonor serbuk sari dalam pembentukan anakan pala diketahui melalui analisis sebaran serbuk sari dengan menggunakan marka SSR. Analisis tetua menggunakan program CERVUS versi 2.0. Keragaman berdasar penanda morfologi tinggi pada karakter habitus, bunga, buah, biji dan fulli namun tidak pada karakter daun. Tidak terdapat karakter yang mampu mencirikan asal populasi tersebut. Penggunaan penanda SSR dalam menganalisis kemiripan genetik menunjukkan adanya pengelompokkan berdasarkan lokasi asal. Hasil analisis keragaman fenotipik dan genetik berbeda kemungkinan disebabkan adanya pengaruh faktor lingkungan pada penampilan fenotipik atau primer yang
Keyword: climate, female tree, male tree, morphology, SSR

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: