Judul: Diversity of Pathogenic Phytophthora sp. Originated from Chili and Host Resistance Selection
Abstrak: Salah satu faktor utama yang menghambat produksi cabai adalah penyakit yang disebabkan oleh Phytophthora. Patogen ini menjadi kendala pada tanaman cabai di seluruh dunia termasuk Indonesia. Studi identifikasi Phytophthora yang menyebabkan infeksi pada cabai dan seleksi ketahanan inang perlu dilakukan untuk menentukan strategi pengendalian yang efektif dan efisien. Penelitian dilakukan dalam tiga bagian, yaitu: (1) identifikasi Phytophthora dari beberapa lokasi tanaman cabai di Jawa, (2) uji virulensi P. capsici asal tanaman cabai di Jawa, dan (3) uji ketahanan dan karakterisasi molekuler genotipe cabai Capsicum annuum. Penelitian ke-1 melakukan eksplorasi, isolasi, dan karakterisasi Phytophthora dari beberapa daerah sentra produksi cabai di Jawa. Isolasi dilakukan dengan menggunakan media CMA yang diperkaya dengan antibiotik ampicilin, rifampicin dan fungisida benomil. Karakterisasi secara morfologi dilakukan terhadap bentuk koloni, kecepatan tumbuh, bentuk sporangium, panjang dan lebar sporangium, sporangiofor, papila, serta tipe kawin. Karakterisasi secara molekuler dilakukan dengan menggunakan primer ITS dan EF-1. Data hasil perunutan basa dianalisis menggunakan BLASTn, restriksi in silico, filogeni, dan analisis diversitas haplotipe. Pada penelitian ke-2 dilakukan uji virulensi menggunakan empat cabai diferensial dan 23 isolat P. capsici. Persiapan sumber inokulum dan cara inokulasi mengikuti metode Bosland dan Lindsey yang dimodifikasi. Penentuan virulensi berdasarkan insidensi penyakit dan keparahan penyakit. Aktivitas pektinase dilakukan secara kualitatif dengan mengukur zona bening yang terbentuk pada media JG. Penelitian ke-3 adalah uji ketahanan dan karakterisasi dengan marka molekuler menggunakan genotipe C. annuum koleksi Departemen Agronomi dan Hortikultura IPB dan varietas komersial. P. capsici yang digunakan terdiri atas empat isolat yang telah diketahui virulensinya. Persiapan inokulum dan cara inokulasi sama seperti pada tahap penelitian sebelumnya. Karakterisasi molekuler menggunakan marka SCAR dilakukan dengan primer OpD04.717-F/OpD04.717-R. Keragaman genetik genotipe cabai dilakukan dengan menggunakan 11 marka simple sequence repeat (SSR). Hasil identifikasi menunjukkan bahwa meskipun secara morfologi terlihat beragam, namun secara molekuler 29 isolat koleksi menunjukkan satu spesies yang sama yaitu P. capsici. Isolat P. capsici yang dikoleksi dari berbagai lokasi pertanaman cabai di Jawa mempunyai keragaman genetik pada daerah ITS dan EF-1-nya. Isolat P. capsici asal cabai di Jawa memiliki virulensi yang beragam. Virulensi isolat bersifat spesifik genotipe, dimana tiap isolat menunjukkan virulensi yang berbeda terhadap empat genotipe cabai yang diuji. Selain itu, hasil penelitian ini juga menunjukkan bahwa virulensi berhubungan dengan aktivitas pektinase yang dihasilkan oleh P. capsici. Hasil pengujian menunjukkan bahwa 41 genotipe cabai yang diuji memiliki ketahanan yang beragam terhadap empat isolat P. capsici. Ketahanan genotipe cabai tersebut bersifat spesifik yang ditunjukkan dengan adanya interaksi genotipe dengan isolat. Hal ini berarti bahwa genotipe cabai hanya tahan terhadap P. capsici dari isolat tertentu. Berdasarkan hasil pengujian diketahui ada enam genotipe yang tahan terhadap isolat CpnsCK1, dua genotipe tahan terhadap KdrRM3, dan satu genotipe tahan terhadap WnsbCK1. Sementara terhadap isolat WnsbCK2 tidak satupun genotipe yang bereaksi tahan. Marka SCAR tidak berasosiasi dengan karakter ketahanan genotipe cabai terhadap isolat P. capsici asal Jawa di rumah kaca. Marka SSR yang digunakan dapat mengidentifikasi antar genotipe cabai. Sebelas marka SSR sangat aplikatif dan efektif dalam membedakan genotipe dalam spesies yang sama, C. annuum. Estimasi diversitas genetik yang dihasilkan oleh marka SSR pada penelitian ini dapat digunakan sebagai panduan bagi pemulia cabai untuk memilih tetua
Keyword: genetic, genotype, isolate, marker, virulence

Judul: Uji Ketahanan terhadap Phytophthora capsici Leonian dan Evaluasi Karakter  Kuantitatif Beberapa Genotipe Cabai (Capsicum sp L.)
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui ketahanan penyakit serta mengevaluasi karakter kuantitatif beberapa genotipe cabai (Capsicum sp L.). Penelitian ini dilaksanakan di laboratorium (Klinik Tanaman) untuk tujuan skrining dan Kebun Percobaan Leuwikopo untuk evaluasi karakter kuantitatif. Penelitian ini menggunakan Rancangan Acak Kelompok 1 faktor yaitu genotipe cabai, berjumlah 17 genotipe. Galur differensial cabai A VRDC (PI 188478, PBC 602, PBC 137 dan Early Ca/wonder) merupakan inang penguji untuk mengetahui ras dari isolat L021 P. capsici yang digunakan. Percobaan di laboratorium terdiri atas 4 ulangan dengan 18 tanaman per ulangan sedangkan di lapang terdiri atas 3 ulangan dengan 5 tanaman per ulangan. Pengujian terhadap galur differensial cabai AVRDC tidak menerapkan ulangan. Jumlah ulangan dan individu tanarnan di lapang lebih sedikit daripada percobaan di laboratorium, hal ini berkaitan dengan keterbatasan jumlah materi genetik yang tersedia. Inokulasi dilakukan terhadap bibit cabai yang diuji dan galur differensial cabai A VRDC yang berumur 28 hari setelah tumbuh. Bibit-bibit tersebut ditanam dalam tray. Metode inokulasi yang diterapkan yaitu metode siram pangkal batang bibit menggunakan pipet. Kerapatan zoospora yang diberikan adalah 5x105 zoospora per lubang tanam. Pengamatan dilakukan terhadap bibit yang tetap hidup pada 21 hari setelah inokulasi serta mengelompokkannya ke dalam kelas ketahanan sebagai berikut: Tahan = 80-100% hidup; Agak Tahan = 50-79% hidup; Agak Rentan = 20-49% hidup dan Rentan = 0-19% hidup. Percobaan di lapang dilakukan dalam polibag beruh.'Ufan 45 cm x 45 cm. Genotipe yang ditanam di lapang tanpa genotipe PSPT-C 17 karena benih tidak berhasil berkecambah. Pengamatan karakter kuantitatif meliputi tinggi tanaman, hari pertama berbunga, hari pertama panen, bobot total panen, bobot buah, panjang buah, diameter buah dan biomassa. Analisis data dilakukan dengan uji F dan Duncan's Multiple Range Test (DMRT) pada taraf 5%, penentuan komponen ragam termasuk koefisien keragaman genotipik dan fenotipik, heritabilitas arti luas serta korelasi fenotipik antar karakter kuantitatif. Genotipe-genotipe yang diuji menunjukkan respon tahan, agak tahan, dan agak rentan. Hasil uji galur differensial cabai A VRDC membuktikan bahwa isolat L021 merupakan ras 1 P. capsici. Genotipe PSPT-Cll bersifat tahan terhadap ras 1 tersebut. Genotipe-genotipe yang diuji merniliki karakter kuantitatif yang berbeda kecuali untuk karakter bobot total panen. Karakter kuantitatif yang memiliki heritabilitas dan koefisien keragaman · genotipik tinggi antara lain bobot buah, panjang buah, diameter buah dan biomassa. Karakter-karakter tersebut memiliki peluang yang lebih besar dalam usaha perbaikan mefalui seleksi. Akan tetapi percobaan ini hanya dilakukan pada satu lokasi dan satu musim sehingga dapat berbias karena adanya pengaruh interaksi antara genotipe dengan lingkungan yaitu musim dan lokasi. Berdasarkan korelasi fenotipik diperoleh korelasi positif sangat nyata antara bobot total panen korelasi fenotipik diperoleh korelasi positif sangat nyata antara bobot total panen dengan tinggi tanaman, bobot buah, panjang buah dan diameter buah. Korelasi ini sebenarnya merupakan korelasi lingkungan cakibat ragam lingkungan yang masih tinggi (KK=33.929%). Kondisi ini dapat terjadi karena pencampuran media tanah yang kurang merata. Genotipe-genotipe yang diuji memiliki ketahanan penyakit dan karah.1:er kuantitatif yang beragam kecuali peubah bobot total panen. Genotipe PSPT-Cl 1 menunjukkan respon tahan terhadap ras 1 P capsici. Keragaman pada karakter kuantitatif tersebut memberi peluang yang lebih besar dalam usaha perbaikan melalui seleksi.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: