Judul: Komposisi dan distribusi vertikal harian zooplankton pazda siang dan malam hari di perairan pantai Bojonegor. Laut banten
Abstrak: Perairan pantai Bojonegara terletak di bagian barat dari Teluk Banten. Perairan ini merupakan perairan dangkal dengan kedalaman maksimum ± 6,10 m. Parameter fisika-kimia yang diukur di perairan ini, secara vertikal relatif stabil dan tidak memperlihatkan pengaruh yang besar terhadap kehidupan zooplankton. Adapun parameter tersebut meliputi suhu air, salinitas, kece- rahan, arus, oksigen terlarut dan pH di berbagai stasiun pada siang dan malam hari. Komposisi zooplankton yang ditemui sejumlah 33 famili yang terdiri dari 45 genera. Komposisi ini didominasi oleh 4 kelompok yaitu ordo Dinoflagellida, Calanoida, Cyclopoida dan Harpacticoida. Kelimpahan zooplankton menyebar homogen di semua stasiun. Hal ini mungkin disebabkan oleh dangkalnya perairan pantai Bojonegara sehingga pencampuran massa air membantu meratakan penyebaran jenis zooplankton. Penyebaran zooplankton secara vertikal ditunjukkan oleh kelimpahannya di berbagai kedalaman. Uji statistik terha- dap kelimpahan zooplankton pada kedalaman yang berbeda tidak menunjukkan perbedaan yang nyata, kecuali pada stasiun II siang dan III malam. Sedangkan pada kelompok dominan, hanya ordo Dinoflagellida di siang hari yang menunjukkan adanya perbedaan kelimpahan yang nyata. Secara keseluruhan, kelimpahan zooplankton pada siang dan malam tidak menunjukkan perbedaan yang mencolok. Be gitu pula dengan kelompok dominan, kecuali ordo Harpacti coida yang memberikan perbedaan kelimpahan yang mencolok antara siang dan malam. Harpacticoida lebih besar dijum pai pada siang hari. Hubungan antara zooplankton dan phytoplankton merupakan proses yang penting dalam pemanfaatan dan pemindahan energi, terutama dalam rantai makanan…
Keyword: 

Judul: Plankton Community Structure in Bojonegara Beach and Surrounding Waters, Banten Bay
Abstrak: Teluk Banten mendapat tekanan dari industri dan penambangan pasir. Salah satu daerah yang banyak dimanfaatkan adalah Kecamatan Bojonegara. Tekanan ini dapat memicu perubahan kualitas perairan. Perubahan parameter fisika dan kimia dapat memengaruhi kehidupan biota akuatik, salah satunya plankton. Penelitian ini bertujuan menganalisis keterkaitan keberadaan plankton dengan parameter fisika dan kimia perairan. Penelitian ini dilakukan selama tiga bulan, mulai dari Oktober hingga Desember 2019 pada enam stasiun. Penelitian menunjukkan bahwa hasil Analisis Komponen Utama (PCA) membentuk dua hingga tiga kelompok kondisi perairan yang dicirikan oleh keberadaan Bacillariophyceae, Cyanophyceae, Dinophyceae, Chrysophyceae, dan Chlorophyceae. Biplot PCA zooplankton membentuk dua kelompok, yaitu protozoa dan rotifera. Berdasarkan struktur komunitas yang terbentuk pada musim hujan terlihat bahwa plankton masih dapat tumbuh dengan baik pada lokasi dan waktu pengamatan. Struktur komunitas fitoplankton dan zooplankton di perairan Bojonegara mencerminkan kondisi yang relatif kurang stabil, yang dipengaruhi oleh kondisi salinitas dan fosfat total., Banten Bay is under pressure from industry and sand mining. One area that is widely used is Bojonegara. This pressure can trigger changes in water quality. Changes in physical and chemical parameters can affect the life of aquatic biota, one of which is plankton. This study aims to analyze the relationship between the presence of plankton with physical and chemical parameters of the waters. This research was conducted for three months, from October to December 2019 at six stations. The research shows that the results of PCA form two to three groups of water conditions characterized by the presence of Bacillariophyceae, Cyanophyceae, Dinophyceae, Chrysophyceae, and Chlorophyceae. Biplot PCA zooplankton form two groups, namely protozoa and rotifers. Based on the community structure formed during the rainy season, it shows that plankton still grow well at the location and time of observation. The community structure of phytoplankton and zooplankton in Bojonegara waters reflects a relatively unstable condition, which is influenced by conditions of total salinity and phosphate.
Keyword: Bojonegara, Plankton, Struktur komunitas, Teluk Banten

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA