Judul: Endosymbionts Associated with Banana Aphid Pentalonia nigronervosa (Hemiptera: Aphididae)
Abstrak: Banana bunchy top disease caused by Banana bunchy top virus (BBTV), is one of the constraints to banana production worldwide, including in Indonesia. BBTV is transmitted by aphid Pentalonia nigronervosa Coquerel (Hemiptera: Aphididae) in a persistent manner. Several factors affecting the efficiency of insect vector in transmitting the virus are temperature, developmental stage of insect vector, and their association with endosymbionts. The objective of this study is to identify and analyze the genetic diversity of endosymbionts associated with banana aphid P. nigronervosa. Aphid samples were collected around Bogor from banana plants that showed symptoms of BBTV infection and those that looked healthy. Identification of endosymbionts was carried out by polymerase chain reaction (PCR) method using specific primers for nine endosymbionts, namely Buchnera aphidicola, Rickettsia, Wolbachia, Rickettsiella, Serratia symbiotica, Regiella insecticola, Hamiltonella defensa, Arsenophonus sp., Spiroplasma. Confirmation of BBTV infection in plant samples and identification of banana aphid were also carried out by PCR, using BBTV specific primers and mtCOI universal primers, respectively. BBTV infection was confirmed in symptomatic sample plants. Banana aphids collected were identified as P. nigronervosa with 89%-100% homology to accessions in Genbank. Primary endosymbionts (B. aphidicola) were successfully amplified from all aphid samples, while secondary endosymbionts (Rickettsia, Wolbachia, Rickettsiella, Spiroplasma, Arsenophonus, and S. symbiotica) were only successfully amplified from some aphid samples. Endosymbiont diversity was found to be higher in aphids from healthy plants. The relationship between endosymbionts, aphids, and banana bunchy top disease incidence needs further study., Penyakit kerdil pisang yang disebabkan oleh Banana bunchy top virus (BBTV) merupakan salah satu kendala produksi pisang di seluruh dunia, termasuk Indonesia. BBTV ditularkan melalui serangga vektor kutudaun Pentalonia nigronervosa Coquerel (Hemiptera: Aphididae) secara persisten. Beberapa faktor yang memengaruhi efisiensi serangga vektor menularkan virus adalah suhu udara, tahap perkembangan serangga vektor, dan asosiasinya dengan endosimbion. Penelitian dilakukan dengan tujuan mengidentifikasi dan menganalisis keragaman genetik endosimbion dari kutudaun pisang P. nigronervosa. Pengambilan sampel kutudaun dilakukan di sekitar Bogor pada tanaman pisang yang menunjukkan gejala infeksi BBTV maupun yang tampak sehat, masing-masing sebanyak lima tanaman. Identifikasi endosimbion dilakukan dengan metode polymerase chain reaction (PCR) menggunakan primer spesifik sembilan endosimbion, yaitu Buchnera aphidicola, Rickettsia, Wolbachia, Rickettsiella, Serratia symbiotica, Regiella insecticola, Hamiltonella defensa, Arsenophonus sp., Spiroplasma. Konfirmasi infeksi BBTV pada tanaman contoh dan identitas kutudaun juga dilakukan dengan metode PCR, berturut-turut menggunakan primer spesifik BBTV dan primer universal mtCOI. Infeksi BBTV berhasil terkonfirmasi pada tanaman contoh yang menunjukkan gejala. Demikian pula kutudaun pisang yang dikumpulkan berhasil diidentifikasi sebagai P. nigronervosa dengan homologi 89%-100% terhadap aksesi pada Genbank. Endosimbion primer (B. aphidicola) berhasil diamplifikasi dari semua sampel kutudaun; sedangkan endosimbion sekunder (Rickettsia, Wolbachia, Rickettsiella, Spiroplasma, Arsenophonus, S. symbiotica) hanya berhasil diamplifikasi dari beberapa sampel kutudaun. Keragaman endosimbion lebih banyak ditemukan pada kutudaun yang berasal dari tanaman sehat. Hubungan antara endosimbion, kutudaun dan insidensi penyakit kerdil pisang perlu dipelajari lebih lanjut.
Keyword: Banana bunchy top virus, insect vector, polymerase chain reaction, primary endosymbiont, secondary endosymbiont

Judul: The Potential of Pentalonia nigronervosa Coq.  and Pentalonia caladii van der Goot as Vectors of Banana bunchy top virus in Banana
Abstrak: Banana bunchy top disease (BBTD) merupakan penyakit penting pada tanaman pisang di berbagai negara, termasuk di Indonesia. Penyakit tersebut berkontribusi menurunkan hasil panen sebesar 100% karena tanaman yang terinfeksi tidak mampu menghasilkan tandan pisang. Penyebab penyakit kerdil pisang adalah Banana bunchy top virus (BBTV) dan dapat ditularkan melalui serangga vektor, Pentalonia nigronervosa Coq. (Hemiptera: Aphididae) secara persisten sirkulatif non-propagatif. Penelitian sebelumnya melaporkan bahwa ada spesies lain dari Pentalonia yang juga berasosiasi dengan tanaman pisang, yaitu P. caladii. Namun potensi P. caladii sebagai vektor BBTV belum dilaporkan secara jelas. Penelitian bertujuan untuk mengonfirmasi kemampuan P. nigronervosa sebagai vektor BBTV yang paling efektif dan potensi P. caladii sebagai vektor baru dari BBTV. Tahapan penelitian mencakup pengujian terhadap kemampuan Pentalonia dalam mengakuisisi BBTV melalui pendeteksian molekuler dengan metode polymerase chain reaction (PCR) menggunakan primer spesifik BBTV setelah diberi periode makan akuisisi (PMA) selama 24 jam pada sumber inokulum virus; pengujian terhadap kemampuan Pentalonia dalam menularkan BBTV melalui pemberian PMA selama 24 jam pada tanaman inokulum BBTV dan periode makan inokulasi (PMI) selama 48 jam pada tanaman sehat dengan menggunakan 20 ekor kutudaun pada tiap tanaman uji; dan mengetahui periode retensi dari BBTV pada dua spesies Pentalonia melalui metode penularan berseri. Penelitian dilaksanakan mulai bulan Januari hingga bulan November 2021 di Rumah Kasa Kebun Percobaan Cikabayan-IPB, dan Laboratorium Virologi Tumbuhan, Departemen Proteksi Tanaman, Fakultas Pertanian, IPB. Hasil dari pengujian akuisisi menunjukkan bahwa P. nigronervosa memiliki kemampuan akuisisi yang tinggi. Pita DNA spesifik BBTV berukuran 240 pb berhasil diamplifikasi dari semua sampel kutudaun P. nigronervosa, mulai sampel kutudaun tunggal sampai komposit (5, 10, 15, dan 20 ekor kutudaun). Amplifikasi pita DNA spesifik BBTV juga berhasil diperoleh pada sampel kutudaun P. caladii komposit (5 sampai 20 ekor), tetapi tidak berhasil diamplifikasi dari sampel kutudaun tunggal. Namun dengan demikian, P. caladii dapat dinykatakan memiliki kemampuan mengakuisisi virus. Inokulasi virus melalui P. nigronervosa dalam uji penularan menghasilkan insidensi penyakit (IP) sebesar 70% dengan keparahan penyakit (KP) sebesar 58,3%; sedangkan inokulasi melalui P. caladii hanya menghasilkan IP 25% dengan KP 25%. Lebih lanjut, deteksi dengan PCR mengonfirmasi bahwa keberadaan BBTV pada beberapa tanaman yang tidak menunjukkan gejala visual pada sampel tanaman yang diinokulasi P. nigronervosa mencapai IP 90%. Dua spesies kutudaun, P. nigronervosa dan P. caladii telah terbukti dapat mengakuisisi dan menularkan BBTV walaupun dengan efisiensi yang berbeda. Lebih lanjut hasil pengujian retensi BBTV dalam tubuh kutudaun menunjukkan perbedaan periode 2 spesies kutudaun tersebut mempertahankan BBTV. Kutudaun pisang, P. nigronervosa mampu menularkan BBTV sampai dengan hari ke-4 (96 jam) dengan IP berkisar 60 - 100%; sedangkan kutudaun talas, P. caladii hanya mampu menularkan BBTV pada hari ke-1 (24 jam) dengan IP 60% dan tidak ada penularan (0%) pada hari berikutnya. Keseluruhan pengujian yang telah dilakukan dalam penelitian ini memberikan informasi bahwa P. caladii memiliki kemampuan dalam menularkan BBTV walaupun dengan keefektifan yang lebih rendah apabila dibandingkan oleh P. nigronervosa yang sudah banyak dilaporkan sebagai vektor BBTV. Penyebaran P. caladii pada sentra penanaman pisang dan kisaran tanaman inangnya perlu dipelajari untuk mengetahui potensinya menyebarkan BBTV. Lebih lanjut, hal ini akan berpengaruh terhadap strategi pengendalian BBTD.
Keyword: kutudaun pisang, kutudaun talas, penularan berseri, persisten, polymerase chain reaction, banana aphid, persistent, polymerase chain reaction, serial transmission, taro aphid

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: