Judul: Pemanfaatan Media Whey dalam Produksi Rekombinan Papain – Like Protease dari Virus SARS-CoV-2
Abstrak: Papain-Like Protease (PLpro) dalam virus SARS-CoV-2 dianggap sebagai target yang layak untuk pengembangan obat untuk mengobati pasien penyakit Coronavirus 2019 (COVID-19). Metode yang umum digunakan untuk menghasilkan PLpro adalah melalui pendekatan rekombinan menggunakan sel inang Escherichia coli yang sederhana dan terjangkau. Namun demikian, hal ini tetap membutuhkan media pertumbuhan yang mahal (Luria Bertani/LB) untuk pertumbuhan sel inang. Penelitian ini bertujuan menginvestigasi kemungkinan whey dapat digunakan untuk memproduksi PLpro SARS-CoV-2 sebagai alternatif media pertumbuhan. Kombinasi medium whey dan LB menggunakan konsentrasi whey yang berbeda (0%, 25%, 50%, dan 100%). Kepadatan sel di setiap medium akan dipantau melalui spektrofotometer UV-Vis dan ekspresi PLpro akan diinduksi dengan menambahkan 1 mM IPTG serta dipelajari melalui SDS-PAGE. Data penelitian dianalisis menggunakan analisis deskriptif. Hasil penelitian menunjukan sel inang E. coli untuk memproduksi papain-like protease (PLpro) dari SARS-CoV2 dapat direkombinasi dengan media whey. Perlakuan terbaik ada pada komposisi medium 50% whey., Papain-Like Protease (PLpro) in SARS-CoV-2 virus is considered a viable target for drug development to treat Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) patients. The commonly used method for PLpro production is through recombinant approach using Escherichia coli as a host cell, which is simple and affordable. However, this still requires expensive growth media (Luria Bertani/LB) for host cell cultivation. This study aims to investigate the possibility of using whey as an alternative growth medium for producing PLpro from SARS-CoV-2. A combination of whey and LB media using different concentrations of whey (0%, 25%, 50%, and 100%) was tested. Cell density in each medium was monitored using a UV-Vis spectrophotometer and PLpro expression was induced by adding 1 mM IPTG, and analyzed using SDS-PAGE. Data were analyzed using descriptive analysis. The results showed that E. coli host cells for PLpro production from SARS-CoV-2 can be successfully recombinant using whey media. The best treatment was found in the medium composition of 50% whey.
Keyword: IPTG, papain-like protease, recombinant protein, whey

Judul: Potential Active Compound Of White Turmeric (Curcuma  Zedoaria) as PLpro SARS-Cov-2’s Inhibitor by In Silico
Abstrak: SARS-CoV-2 yang menjadi penyebab COVID-19 diketahui mengkode dua protease, yaitu 3CL-Pro (protease utama) dan PLpro (Papain Like protease). PLpro berperan dalam proses pematangan replikasi virus dan dapat menghambat respon imun sel inang melalui penghilangan ubiquitin atau deubiquitinasi (DUBs). Hal ini menjadikan PLpro sebagai target obat yang baik. Kunyit putih (Curcuma zedoaria) merupakan tanaman herbal yang diketahui memiliki berbagai jenis bioaktivitas seperti antikanker dan antimikroba. Namun, belum pernah dilakukan penelitian terkait potensinya sebagai antivirus. Penelitian ini bertujuan menguji potensi senyawa tanaman kunyit putih dalam menghambat aktivitas proteolitik PLpro SARS-CoV-2 yang dimulai dengan analisis bioavaibilitas ligan, validasi dan penambatan molekuler terarah menggunakan YASARA Structure, analisis interaksi ligan-reseptor menggunakan Discovery Studio, dan visualisasi binding pose menggunakan PyMol. Seluruh ligan uji merupakan inhibitor kompetitif. Epicurzerenone merupakan ligan dengan potensi inhibisi terbaik berdasarkan energi ikatan sebesar -4.734 kkal/mol, interaksi, dan sisi aktif pengikatan. Kata kunci : kunyit putih, Papain Like Protease (PLpro), penambatan molekuler, SARS CoV-2., SARS-CoV-2, which causes COVID-19, is known to encode two proteases, namely 3CL-Pro (main protease) and PLpro (Papain Like protease). PLpro plays a role in the maturation process of viral replication and can inhibit host cell immune responses through ubiquitin removal or deubiquitination (DUBs). This makes PLpro a good drug target. White turmeric (Curcuma zedoaria) is an herbal plant that is known to have various types of bioactivity such as anticancer and antimicrobial. However, no research has been conducted regarding its potential as an antiviral. This study aimed to examine the potential of white turmeric plant compounds in inhibiting the proteolytic activity of PLpro SARS-CoV-2 starting with analysis of ligand bioavailability, validation and directed molecular anchoring using YASARA Structure, analysis of ligand-receptor interactions using Discovery Studio, and visualization of binding poses using PyMol. All test ligands were competitive inhibitors. Epicurzerenone is the ligand with the best inhibitory potential based on the binding energy of -4.734 kcal/mol, interactions, and the active binding site. Keywords : molecular docking, Papain-like protease (PLpro), SARS CoV-2, white turmeric.
Keyword: kunyit putih, Papain Like Protease (PLpro), penambatan molekuler, SARS-CoV-2, molecular docking, white  turmeric

Judul: Cycle Hamilton pada Graf Lengkap, Graf Regular, dan Graf 2-Connected 4-Regular Berorder Kurang dari Sepuluh
Abstrak: Suatu graf disebut graf Hamilton apabila graf tersebut memuat cycle Hamilton, yaitu cycle yang melewati setiap vertex tepat satu kali. Menentukan keberadaan cycle Hamilton pada suatu graf dapat menggunakan syarat cukup yang berupa teorema-teorema yang telah diperkenalkan sejak tahun 1950-an. Beberapa syarat cukup yang dibahas dalam karya ilmiah ini adalah syarat cukup yang berhubungan dengan graf lengkap dan graf regular. Suatu graf lengkap berorder 𝑛������ ≥ 3 dan graf r-regular berorder 𝑛������ ≤ 2𝑟������ + 1 merupakan graf Hamilton, Karena kedua graf tersebut memuat cycle Hamilton. Selanjutnya, syarat cukup tersebut digunakan untuk menentukan keberadaan cycle Hamilton pada graf 2-connected 4- regular berorder kurang dari 10.
Keyword: graf Hamilton, graf regular, graf lengkap, graf 2-connected 4-regular