Judul: Profil Nutrisi dan Mikrobioma Biawak Kalimantan (Lanthanotus borneensis) menggunakan Next-Generation Sequencing
Abstrak: Biawak Kalimantan (Lanthanotus borneensis) merupakan salah satu satwa yang dilindungi oleh pemerintah Republik Indonesia. Tahun 2019, International Union for Coservation of Nature (IUCN) menetapkan L. borneensis sebagai spesies “endangered’. Penurunan populasi pada Biawak Kalimantan menjadi perhatian utama dalam upaya konservasi. Konservasi merupakan salah satu upaya dalam meningkatkan jumlah populasi Biawak Kalimantan. Upaya konservasi ini tidak hanya melibatkan pelestarian habitat alami, namun penangkaran yang efektif dan pemenuhan nutrisi hewan juga menjadi penting juga untuk dilakukan. Pakan yang diberikan kepada hewan dengan nutrisi yang tepat dapat memengaruhi performa, kesehatan dan reproduksi. Pengaruh pakan dalam meningkatkan performa seperti pertambahan bobot badan, meningkatkan kesehatan dan perkembangan satwa dapat diketahui dengan cara mengetahui diversitas komposisi mikrobiota. Mikrobiota didefinisikan sebagai kumpulan organisme yang hidup dan berinteraksi dengan tubuh inang. Sementara itu, mikrobioma mengacu pada materi genetik dari mikrobiota yang berada di lokasi tertentu dalam tubuh, termasuk bakteri, virus, jamur, eukariotik, dan arkaebakteria, yang secara kolektif membentuk mikrobioma usus di saluran pencernaan. Diversitas DNA spesies pada saluran pencernaan biawak yang tinggi membutuhkan pendekatan untuk mengamplifikasi keragaman tersebut. Belum adanya penelitian mengenai profil mikrobioma Biawak Kalimantan dengan pemberian pakan yang berbeda mendasari untuk dilakukannya penelitian ini. Tujuan dari penelitian ini untuk mengetahui profil mikrobioma dari pemberian berbagai macam pakan menggunakan NGS sehingga dapat ditemukan formulasi pakan yang sesuai sebagai upaya konservasi Biawak Kalimantan. Penelitian ini dilakukan dengan tiga jenis pakan yaitu cacing tanah, udang dan ikan. Komposisi kimia pakan dianalisis dengan metode proksimat yang meliputi kadar air, kadar abu, protein kasar, lemak kasar dan serat kasar. Periode perlakuan diawali penimbangan bobot badan awal biawak Kalimantan kemudian pakan diberikan selama 14 hari. Satu hari setelah perlakuan, dilakukan koleksi sampel feses dengan metode swab kloaka kemudian bobot badan akhir ditimbang lalu dianalisis secara statistika. Selanjutnya, DNA dari sampel feses diekstraksi, diamplifikasi PCR menggunakan primer 515F dan 806R lalu visualisasi dengan elektroforesis. gDNA disekuensing dengan menggunakan Next-Generation Sequencing (NGS) Illumina pada region V4 16S rRNA untuk melihat profil mikrobioma. Hasil menunjukkan bahwa pakan ikan dan udang memiliki komposisi protein serta lemak yang tinggi. Serat kasar dan bahan anorganik paling banyak ditemukan pada cacing. Performa pertambahan bobot badan yang signifikan ditunjukkan oleh perlakuan pakan udang dan ikan (p=0,05). Identifikasi 16S rRNA melalui (NGS) di region V4 pada tiga sampel menghasilkan taksonomi bakteri yang dibagi ke dalam 20 filum, 38 kelas, 80 ordo, 155 famili dan 225 genus. Biawak dengan perlakuan cacing dan ikan, pada tingkat filum didominasi oleh Proteobacteria dan Bakteriodota, filum Firmicutes lebih banyak ditemukan pada perlakuan udang. Komposisi paling melimpah pada tingkat famili paling banyak diisi oleh Alcaligenaceae dan Enterobacteriaceae namun pada perlakuan udang, Mycoplasmataceae lebih dominan. Proporsi jumlah bakteri dari berbagai jenis di tingkat famili pada perlakuan ikan terlihat relatif lebih seimbang dibandingkan cacing dan udang. Famili dari Weeksellaceae, Flavobacteriaceae, Synergistaceae, Pseudoamonacae, Commamonadeaceae, Vibrionaceae, Pseudoalteromonaceae, dan Bakteridaceae terdeteksi bahwa proporsi jumlahnya lebih seimbang dibandingkan pada cacing dan udang, perbandingan proporsi sekitar 2:7:2. Bakteri Weeksellaceae, Aeromonas, Pseudomonas dan Vibrio umum ditemukan pada saluran pencernaan hewan laut seperti ikan laut putih dan penyu (Burtseva et al. 2021). Pada tingkat genus, mikrobioma biawak dengan pakan cacing didominasi oleh genus Alcaligenes, sedangkan pada biawak dengan
Keyword: endangered, conservation, microbiota, metagenomic, reptile

Judul: Isolation and Characterization of Cellulolytic Bacteria from Endemic Indonesian Herbivores
Abstrak: Pakan merupakan hal terpenting untuk memenuhi nutrisi dari ternak. Apabila pakan yang diberikan pada ternak berkualitas buruk maka produk yang dihasilkan oleh ternak akan memburuk kualitas dan menurun produksinya. Salah satu cara yang disarankan untuk meningkatkan kecernaan pakan adalah dengan penggunaan mikroba, dalam penelitian ini yaitu bakteri selulolitik. Untuk mendapatkan bakteri selulolitik, maka dilakukan isolasi bakteri selulolitik dari feses hewan herbivora endemik Indonesia. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk isolasi dan karakterisasi bakteri selulolitik yang berasal dari feses hewan herbivora endemik Indonesia. Karakterisasi tersebut dilakukan melalui pendekatan morfologi, biokimia dan molekuler. Sebelum melakukan isolasi, pengujian kemampuan mikroba feses dalam mencerna pakan serat dilakukan secara in vitro. Rancangan percobaan yang digunakan untuk tahap in vitro adalah rancangan acak kelompok (RAK) faktorial dengan 2 faktor (sumber hijauan dan sumber inokulum feses) dan lima kelompok berupa proses inkubasi sebagai ulangan. Hasil penelitian menunjukkan bahwa terdapat interaksi (P<0,05) antara sumber serat dan feses sumber inokulum terhadap kecernaan bahan kering (KcBK), kecernaan bahan organik (KcBO) dan produksi amoniak. Kecernaan bahan kering dan bahan organik, produksi amonia jerami padi lebih rendah dibandingkan rumput gajah. Mikroba dari inokulum feses gajah memiliki kemampuan paling tinggi dalam mencerna bahan kering dan bahan organik, inokulum feses Anoa memiliki produksi amonia tertinggi. Tidak terdapat interaksi (P>0,05) antara sumber serat dan feses sumber inokulum terhadap nilai pH, produksi VFA total, dan populasi bakteri total. Nilai pH, produksi VFA total, dan populasi bakteri total inkubasi in vitro hampir sama antar perlakuan. Mikroba selulolitik dari inokulum feses herbivora endemik tropis memiliki kemampuan dalam degradasi serat dan fermentasi. Isolat-isolat yang diisolasi termasuk dalam kategori bakteri anaerob fakultatif dengan ciri morfologi berupa kokus Gram-positif, mampu mengfermentasi glukosa, fruktosa, sukrosa, pati, dan selulosa. Berdasarkan indeks selulolitik, isolat-isolat dari feses anoa dan banteng menunjukkan potensi sebagai bakteri pengurai selulosa. Identifikasi molekuler terhadap isolat-isolat dari feses anoa dan banteng menunjukkan kesamaan dengan Enterococcus faecium dan Enterococcus sp. Secara keseluruhan, mikroba selulolitik dari inokulum feses herbivora endemik Indonesia memiliki kemampuan dalam degradasi serat dan fermentasi., Feed is the most crucial element in fulfilling the nutritional requirements of livestock. If poor-quality feed is given to the animals, the quality of products produced by the livestock will deteriorate, and their productivity will decrease. One of the suggested methods to improve feed digestibility is by employing microorganisms, specifically cellulolytic bacteria, in this study. To obtain cellulolytic bacteria, isolation of cellulolytic bacteria from the feces of indigenous Indonesian herbivorous animals was conducted. The objective of this research was to isolate and characterize cellulolytic bacteria derived from the feces of indigenous Indonesian herbivorous animals. The characterization was performed through morphological, biochemical, and molecular approaches. Prior to the isolation, in vitro testing of the fecal microbial ability to digest fibrous feed was carried out. The experimental design used for the in vitro phase was a factorial randomized block design with 2 factors (forage source and fecal inoculum source) and five groups of incubation processes as replicates. The research results revealed that there was an interaction (P<0.05) between fiber sources and fecal inoculum sources concerning dry matter digestibility (DMD), organic matter digestibility (OMD), and ammonia production. Dry matter and
Keyword: Bakter selulolitik, hewan herbivora endemik, mikroba feses, pakan serat, karakteristik fermentasi

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: