Judul: Improvement of Rice Plant Health on Pyricularia oryzae with the Dark Septate Endophytes Fungi
Abstrak: Cendawan dark septate endophytes (DSE) merupakan salah satu kelompok cendawan endofit yang mampu mengolonisasi akar tanpa menyebabkan gejala penyakit. Karakteristik DSE ditandai dengan adanya pigmentasi gelap pada media agar, memiliki hifa gelap berseptat, memiliki konidia atau hifa steril, dan membentuk mikrosklerotia di dalam jaringan akar. Potensi DSE diketahui mampu meningkatkan performa tanaman, menekan penyakit, dan cekaman abiotik seperti kekeringan dan kemasaman. Blas pada tanaman padi merupakan salah satu penyakit yang berpotensi memengaruhi produksi padi. Patogen blas padi yaitu Pyricularia oryzae sulit dikendalikan karena memiliki ras yang banyak dan mudah berubah rasnya. Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi potensi cendawan DSE sebagai agens pengendali patogen blas dan agens dalam meningkatkan kesehatan tanaman padi terhadap penyakit blas. Penelitian dilaksanakan di Balai Penelitian Tanah, Balai Besar Penelitian Tanaman Padi, serta Balai Besar Penelitian dan Pengembangan Bioteknologi dan Sumber Genetik Pertanian. Isolat cendawan DSE yang digunakan adalah APDS 3.2, 4.1 BTG, dan TKC 2.2a merupakan koleksi Balai Penelitian Tanah untuk uji penekanan terhadap patogen blas. Penelitian terdiri atas beberapa tahap yaitu: (1) Evaluasi penekanan DSE terhadap P. oryzae secara in vitro; (2) Aplikasi DSE di rumah paranet untuk melihat pengaruh DSE dalam menekan perkembangan penyakit blas, pemacu pertumbuhan padi, serta respons fisiologi dan biokimia padi. Hasil penelitian menunjukkan pertumbuhan koloni APDS 3.2 tercepat dibanding DSE lainnya, yaitu pada 3 hari setelah inkubasi (HSI) telah memenuhi cawan petri (d= 9 cm);sedangkan 4.1 BTG dan TKC 2.2.a pada 7 HSI. Pertumbuhan koloni P. oryzae tergolong lambat membutuhkan 20 HSI. Persentase penghambatan APDS 3.2 terhadap P. oryzae sebesar 43,75%; sedangkan 4.1 BTG dan TKC 2.2.a masing-masing sebesar 38,60% dan 39,76%. Isolat APDS 3.2 mampu mereduksi penyakit blas sebesar 23,37-51,28%; sedangkan isolat TKC 2.2.a dan 4.1 BTG masing-masing sebesar 20,78-23,07% dan 15,58-18,66%. Hal ini kemungkinan karena kolonisasi DSE mampu menekan keparahan penyakit blas pada tanaman padi. Selain itu, ketiga DSE memiliki aktivitas enzim kitinase dan viabilitas yang baik. Tanaman padi yang diinokulasi DSE memiliki tinggi, jumlah anakan, panjang akar, bobot basah, dan bobot kering relatif lebih tinggi dibandingkan DSE+P. oryzae dan kontrol. Aplikasi DSE menunjukkan serapan hara N, P, K, Fe, kadar abu, dan Si lebih tinggi dibandingkan aplikasi DSE+ P. oryzae . Isolat APDS 3.2 dan 4.1 BTG memiliki Inhibitor Concentration (IC50) terendah dibandingkan TKC 2.2.a dan kontrol (-). Namun IC50 meningkat pada perlakuan DSE+ P. oryzae . Semua isolat DSE memiliki potensi untuk dikembangkan dalam penekanan patogen blas padi dan memacu pertumbuhan tanaman padi.
Keyword: Colonizing, Inducing Growth, Physio-Biochemical, Pigmentation

Judul: Eksplorasi Bakteri Dan Cendawan Endofit Sebagai Agens Pengendali Penyakit Blas (Pyricularia Oryzae) Pada Padi Sawah
Abstrak: Penyakit blas awalnya merupakan masalah utama pada pertanaman padi gogo di Indonesia namun saat ini juga telah menjadi masalah pada pertanaman padi sawah. Informasi terkait penggunaan bakteri dan cendawan endofit sebagai pengendali penyakit blas pada padi khususnya padi sawah masih sangat terbatas. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan bakteri dan cendawan endofit sebagai pengendali penyakit blas. Penelitian ini terdiri atas 5 tahapan, yaitu 1) eksplorasi bakteri dan cendawan endofit dari tanaman padi, 2) seleksi bakteri dan cendawan endofit, 3) uji penghambatan bakteri dan cendawan endofit terhadap pertumbuhan P. oryzae, 4) uji penghambatan pertumbuhan P. oryzae di rumah kaca, 5) identifikasi bakteri dan cendawan endofit. Isolasi bakteri dan cendawan endofit menggunakan sterilisasi permukaan bertingkat dengan alkohol 70 % selama 0.5 menit kemudian dilanjutkan merendam sampel pada NaOCl 1 % selama 1 menit. Isolasi bakteri endofit dilanjutkan dengan menghancurkan bagian tanaman tersebut dengan mortar steril sampai halus dengan penambahan air 1:10. Sebanyak 0.1 ml diambil dari masing-masing suspensi daun, akar dan batang tersebut kemudian ratakan pada media tryptic soy agar (TSA) 20 %. Isolasi cendawan endofit dilakukan dengan meletakkan sampel pada media malt extract agar (MEA) 10% tanpa digerus dan diinkubasi selama 7 hari. Seleksi bakteri endofit dilakukan melalui 3 tahap yaitu pengujian reaksi hipersensitif (HR/hypersensitive reaction) terhadap tanaman tembakau, pengujian terhadap pertumbuhan benih padi (DPM/direct planting method) dan pengujian aktivitas hemolisis bakteri. Seleksi cendawan endofit dilakukan dengan pengujian cendawan endofit terhadap perkecambahan dan perkembangan benih padi. Uji penghambatan bakteri dan cendawan endofit terhadap pertumbuhan P. oryzae secara in vitro di lakukan untuk melihat kemampuan antibiosis pada bakteri dan cendawan endofit. Empat isolat bakteri dan cendawan endofit terbaik diambil untuk dilakukan uji penghambatan pertumbuhan P. oryzae di rumah kaca. Masing-masing isolat yang digunakan di rumah kaca diidentifikasi lebih lanjut. Bakteri dan cendawan endofit yang berhasil diisolasi sebanyak 162 isolat terdiri atas 115 isolat bakteri endofit dan 47 isolat cendawan endofit. Berdasarkan hasil uji patogenesitas dan potensinya sebagai plant growth promoting rhizobacteria (PGPR) dan plant growth promoting fungi (PGPF) masing-masing 19 bakteri endofit dan 14 cendawan endofit terpilih digunakan pada uji in vitro. Empat isolat bakteri endofit dan 4 isolat cendawan endofit yang memiliki aktivitas antibiosis tertinggi dilanjutkan pada uji penghambatan P. oryzae pada padi sawah varietas Kencana Bali. Bakteri dan cendawan endofit yang diuji mempunyai mekanisme antibiosis ditunjukkan dengan adanya zona bening antara pertemuan patogen dan endofit. Pengujian secara in vivo menunjukkan aplikasi mikroba endofit terbukti mampu menekan keparahan penyakit blas pada tanaman padi dengan tingkat penekanan penyakit sebesar 30 sampai 70%. Penekanan penyakit paling stabil mulai dari awal pengamatan sampai pada akhir pengamatan ditunjukkan oleh isolat EB9 dan CEA5. Hasil perlakuan inokulasi bakteri dan cendawan endofit pada tanaman padi di rumah kaca menunjukkan adanya hubungan yang sesuai mulai dari hasil uji in vitro, in vivo sampai hasil pengamatan pada pertumbuhan tanaman padi. Selain dapat menekan pertumbuhan penyakit blas di rumah kaca, perlakuan isolat EB9 dan CEA5 menunjukkan adanya pengaruh positif terhadap semua parameter pertumbuhan (tinggi tajuk, panjang akar, dan bobot biomassa) dibandingkan kontrol. Isolat bakteri endofit yang telah diuji memiliki homologi tertinggi dengan Burkholderia sp. Hu35C, Burkholderia sp. WP1, B. gladioli strain IHB B
Keyword: pengendalian hayati, mikroba endofit, uji antagonis

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: