Judul: Pendugaan adanya front melalui hubungan antar bebrapa parameter oseanografi di Perairan Teluk Pelabuhan Ratu, Jawa Barat
Abstrak: Naiknya massa air yang lebih dingin dan lebih kaya zat hara karena proses upwelling, akan menciptakan suatu zona trasisi atau zona pertemuan antara massa air yang baru tersebut dengan massa air di sekitarnya. Sehingga pada daerah ini dijumpai parameter seperti suhu, salinitas dan zat-zat hara yang bisa berubah cepat pada jarak horizontal yang relatif dekat. Daerah ini dinamakan front. Tujuan penelitian ini adalah mempelajari hubungan antar kelimpahan plankton, ikan-ikan clupeide, sebaran Suhu Permukaan Laut (SPL) dan parameter oseanografi lainnya untuk melihat keberadaan front di perairan Teluk Pelabuhan Ratu...
Keyword: 

Judul: Kelimpahan, komposisi jenis, penyebaran dan perkembangan suksesi zooplankton di Perairan Teluk Pelabuhan Ratu Jawa Barat
Abstrak: Penelitian dilakukan mulai tanggal 2 April hingga tanggal 31 Mei 1994 di daerah Perairan Teluk Pelabuhan Ratu, Sukabumi Jawa Barat. Pengambilan contoh dilakukan setiap dua minggu sekali. Secara geografis daerah ini terletak antara 6°57' -7°07' Lintang Selatan dan 106°22' 106°33' Bujur Timur. Teluk ini dikeli- lingi oleh pegunungan terjal yang berkelanjutan ke bawah laut, sehingga tidak jauh dari pantai teluk ini mempunyai kedalaman lebih dari 200 m. Teluk Pelabuhan Ratu merupakan tempat bermuaranya Sungai Cimandiri, Cisolok, Cimaja, Cipanyairan, Cibareno, Cipalabuhan dan sungai Citepus. Sungai Cimandiri merupakan sungai terbesar yang alirannya dapat mencapai 200 m ke dalam teluk. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui kelimpahan, komposisi jenis, penyebaran, keragaman, keseragaman, dominansi dan perkembangan suksesi serta berbagai jenis zooplankton di daerah Perairan Teluk Pelabuhan Ratu. Di lokasi penelitian ditetapkan 10 buah stasiun pengambilan contoh dida- sarkan pada perbedaan isodepth dan adanya pengaruh yang berasal dari daratan baik pelabuhan ataupun aliran sungai dan setiap stasiun dibedakan kembali berdasarkan kedalaman. Di perairan Teluk Pelabuhan Ratu kelimpahan zooplankton berkisar antara 15 1749 ind/1, dengan rata-rata kelimpahan 563 ind/1. Berdasarkan perbedaan zonasi, stasiun Cimandiri memiliki kelimpahan tertinggi 666 ind/1. ...
Keyword: 

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA