Judul: Ornamental Tree Health Evaluation in City of Bogor Using Visual Observation and Ultrasonic Wave Based Technique
Abstrak: Pohon ornamental dalam ekosistem perkotaan (urban trees) tidak saja memiliki fungsi ekologis, tetapi juga memiliki fungsi sosial dan ekonomis yang sangat penting. Oleh karena itu keberadaan dan kondisi kesehatannya selayaknya mendapat perhatian yang memadai. Cara paling sederhana untuk mengetahui kesehatan pohon adalah dengan pengamatan visual terhadap kondisi fisik pohon tersebut. Akan tetapi dengan metode ini tidak dimungkinkan mengetahui kondisi bagian dalam batang pohon, seperti adanya busuk hati dan kerusakan dalam batang lainnya. Sementara itu sejak beberapa tahun yang lalu telah berkembang teknik evaluasi kesehatan pohon dengan menggunakan gelombang suara, khususnya gelombang ultrasonik. Teknik ini termasuk ke dalam kategori tanpa merusak (non destructive testing/evaluation). Suatu penelitian telah dilakukan untuk mengetahui kesehatan pohon ornamental di sepanjang Jalan Raya Pajajaran Kota Bogor, Jawa Barat, baik secara visual maupun dengan memanfaatkan rambatan gelombang ultrasonik yang dihasilkan dari alat Sylvatest Duo® (frekuensi 22 KHz). Pengamatan secara visual dilakukan terhadap ada tidaknya gejala deteriorasi pada pohon sasaran, dari pangkal batang hingga tajuk pohon. Sedangkan penilaian kesehatan pohon dengan alat Sylvatest Duo® didasarkan atas kecepatan rambatan gelombang.
Keyword: 

Judul: i-Tree Eco Use in Monitoring Tree Health in the Agroforestry System Community Forest in Tugujaya Village, Bogor Regency
Abstrak: Pemantauan kesehatan pohon merupakan kegiatan penting dalam pengelolaan tegakan pada hutan rakyat. Saat ini pemantauan kesehatan pohon banyak dilakukan dengan metode FHM (Forest Health Monitoring) yang hanya memberikan gambaran secara umum kesehatan tegakan, oleh karena itu masih perlu dilakukan penelitian lanjutan dengan metode VTA (Visual Tree Assessment) dan aplikasi i-Tree Eco yang dapat menilai kesehatan pohon sekaligus menghitung serapan dan simpanan karbon pada pohon. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan tingkat kesehatan pohon di Hutan Rakyat Agroforestri Desa Tugujaya, Kecamatan Cigombong, Kabupaten Bogor, berdasarkan tingkat kerusakan yang diderita oleh pohon. Hasil penelitian penggunaan VTA menunjukkan bahwa pohon pada lokasi penelitian didominasi oleh pohon sehat sebesar 97.22%, sedangkan pohon dengan kerusakan ringan terhitung sangat sedikit, sekitar 2.78% atau hanya 4 pohon. Selain dipengaruhi oleh faktor iklim, kesehatan pohon pada lokasi penelitian dipengaruhi juga dengan adanya aktivitas manusia seperti perawatan dan cara pemanenan. Penggunaan perangkat lunak i-Tree Eco dapat mempermudah perhitungan serapan karbon pohon di lokasi penelitian dengan hasil sebanyak 1.502 ton pada areal seluas 24 ha.
Keyword: Carbon sequestration, i-Tree Eco, Forest Health Monitoring, Visual Tree Asessme

Judul: Free Energy from COM Pulling for Membrane Fusion of Human Immunodeficiency Virus Type 1 (HIV-1)
Abstrak: HIV-1 menginfeksi sel target melalui fusi membran dan memediasi sel dengan glikoprotein. Protein gp41 yang sudah terintegrasi dengan membran target akan melipat kembali membentuk 6 bundel heliks bersama protein gp120. Pelipatan kembali struktur protein dapat dicegah menggunakan inhibitor sehingga proses 6 bundel heliks tidak terbentuk. Inhibitor masih bersaing dengan protein dalam hal pelipatan struktur, sehingga perlu dicari besaran energi yang mewakili pelipatan protein. Energi bebas diperoleh dari tarikan COM mewakili kerja yang dilakukan protein untuk melipat kembali. Energi bebas hasil simulasi bernilai -82.4 kJ mol-1 dan energi bebas varian covNHR memiliki nilai sebesar -75 kJ mol-1 dan -45 kJ mol-1. Karakteristik termodinamika dan spektrum UV pada varian covNHR-VQ memiliki afinitas pengikatan yang tinggi serta interaksi yang kuat terhadap peptida protein gp41, sedangkan covNHR-ER memiliki basis pengikatan dan interaksi lebih lemah dibanding covNHR-VQ. Varian covNHR-VQ memiliki nilai energi bebas mendekati energi bebas tarikan COM, sehingga varian memiliki interaksi yang kuat ketika energinya mendekati energi bebas tarikan. Aktivitas inhibitor mencegah protein terlipat kembali sehingga performa pencegahan yang baik yaitu saat energinya bernilai sama atau lebih dari energi saat protein tersebut terlipat. Energi bebas dapat didekatkan sebagai parameter dalam menganalisis interaksi antara inhibitor dengan protein gp41., HIV-1 infects cell through membrane fusion and mediates cell with glycoproteins. The gp41 protein has been integrated with target membrane will be refolding form. Protein folding structure can be prevented using inhibitors. Inhibitor competes with protein in folding structure, so have to find the energy that represents protein folding. Free energy obtained from COM pulling represents the work that protein does refold back. Free energy of simulation results is -82.4 kJ mol-1 and free energy of covNHR variant has a value of -75 kJ mol-1 and -45 kJ mol-1. The thermodynamics and UV spectrum characteristics of covNHR-VQ have a high binding affinity and strong interaction than covNHR-ER. covNHR-VQ has free energy close to free energy from COM puling, and variant has strong interaction when the energy apporaches free energy pulling.
Keyword: COM Pulling, Free Energy, gp41 Protein, HIV-1