Judul: Identifikasi Keragaman Gen Calpastatin (CAST) pada Bangsa Sapi Pedaging dengan Teknik PCR-RFLP.
Abstrak: Gen calpastatin merupakan salah satu gen mempengaruhi keempukan daging dan memiliki fungsi sebagai penghambat protein sel otot. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi keragaman gen CAST pada bangsa sapi pedaging (bali, limousin, dan PO). Total sampel yang digunakan dalam penelitian ini sebanyak 127 sampel, terdiri dari 48 sampel sapi bali, 19 sampel sapi limousin dan 60 sampel sapi PO. Sampel berasal dari darah masing-masing sapi. Teknik PCR-RFLP digunakan untuk mengidentifikasi keragaman gen CAST menggunakan enzim restriksi Cfr13I. Analisis data menggunakan frekuensi alel, frekuensi genotipe, dan keseimbangan Hardy-Weinberg. Fragmen yang dihasilkan dari amplifikasi gen CAST memiliki panjang 624 bp yang terletak pada intron 15 dengan suhu annealing 60 oC selama 10 detik. Hasil genotyping CAST|Cfr13I menunjukkan sapi bali memiliki alel polimorfik, frekuensi alel G (0.68) lebih tinggi dari alel A (0.32). Frekuensi alel G (1.00) pada sapi limousin dan PO. Keragaman gen CAST pada sapi limousin dan PO bersifat monomorfik dan pada populasi sapi bali bersifat polimorfik.
Keyword: gen calpastatin, keragaman, PCR-RFLP, sapi pedaging

Judul: Identifikasi Keragaman Gen Calpastatin (CAST|Alu1) pada sapi Bali, Limousin, dan PO di Pusat Pembibitan menggunakan metode PCR-RFLP.
Abstrak: Sumber daya genetik ternak sapi Indonesia saat ini terdiri dari tiga kelompok yaitu ternak asli, ternak lokal dan ternak impor. Tujuan dari penelitian ini adalah mengidentifikasi polimorfisme gen Calpastatin (CAST) pada bangsa sapi pedaging di Pusat Pembibitan (bali, Limosin, dan PO) dengan metode Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCRRFLP). Sampel yang digunakan 124 ekor sapi yang terdiri dari sapi bali 48 ekor, Limousin 16 ekor, dan PO 60 ekor. Data genotipe di hitung menggunakan frekuensi alel, heteresigositas, dan keseimbangan Hardy-Weinberg. Hasil akhir penelitian ini diperoleh panjang fragmen 624 pb yang terdiri atas 2 alel (T dan C) dan 3 genotipe yaitu TT (474 pb), TC (474 pb dan 324 pb) dan CC (324 pb). Identifikasi keragaman gen CAST|AluI menunjukkan bahwa sapi bali, Limousin, dan PO di pusat pembibitan bersifat polimorfik dengan nilai frekuensi alel total yang tertinggi dimiliki oleh alel T dengan nilai 0.57-0.94 dan alel C dengan nilai 0.06-0.42. Berdasarkan hasil tersebut dapat disimpulkan bahwa gen CAST|Alu1 sapi bali, Limousin, dan PO bersifat polimorfik.
Keyword: Gen CAST, keragaman, PCR-RFLP, sapi, sumber daya genetik

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: