Judul: IPB (Bogor Agricultural University)
Abstrak: Primordial Germ Cells (PGC) merupakan sel prekursor sel gamet jantan maupun betina. Sel ini berasal dari lapis epiblast kemudian bermigrasi melewati mesenterium menuju rigi kelamin. Pada umur 13.5 hari pascakoitus (hpk) sel ini berada di rigi kelamin dan sudah mengalami determinasi jenis kelamin. Primordial Germ Cells (PGC) bersifat totipoten dengan gen penanda OCT-4, sehingga PGC diharapkan dapat digunakan dalam terapi penyakit degenaratif ataupun pada kasus infertilitas. Penelitian ini betujuan untuk profiling protein di dalam conditioned medium (CM) dari sel testikuler mencit umur 5 hari, mengkarakterisasi PGC dan menganalisis kemampuan CM dalam menginduksi PGC menjadi sel gamet jantan yang haploid. Penelitian tahap pertama bertujuan untuk mengkarakterisasi perkembangan sel testikuler dan mengidentifikasi spermatogonial stem cells (SSC) dalam kultur in vitro. Sel testiskuler dari mencit umur 5 hari di kultur dalam Dulbecco’s Modified Eagle Medium (DMEM) yang ditambahkan serum 10%, kemudian diinkubasi pada suhu 37 °C, 5% CO2. Perkembangan sel diamati selama 6 hari yang meliputi viabilitas dan population doubling time (PDT). Sel kultur hari ke-1, ke-3 dan ke-6 diwarnai dengan pewarna Periodic Acid Schiff (PAS) untuk mengidentifikasi dan mengukur luas sel testikuler. Secara spesifik, identifikasi SSC menggunakan pewarnaan imunositokimia menggunakan antibodi OCT-4 dan CD90. Hasil penelitian menunjukkan PDT sel testikuler sebesar 0.63 hari dan viabilitas >90%. Persentase sel Sertoli-like meningkat selama kultur, begitu juga dengan sel fibroblast-like yang meningkat pada hari ke-3 dan menurun pada hari ke-6 walaupun tidak signifikan. Sementara itu, sel spermatogonia-like menurun dari hari ke-1 sebesar 54.3%, menjadi 18.7% pada hari ke-6. Luas sel testikuler meningkat signifikan setelah kultur selama 6 hari. Sel testikuler dan SSC di dalam kultur diduga menghasilkan growth factors di dalam niche. Pada akhir kultur (hari ke-6), medium kultur diganti dengan DMEM tanpa serum dengan tujuan sebagai sumber conditioned medium (CM). Penelitian tahap kedua dilaksanakan untuk menganalisis kandungan protein (profiling) serta kandungan hormon testosteron dalam conditioned medium yang diperoleh dari kultur sel testikuler. Profiling protein menggunakan liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS/MS), dan ditemukan 26 jenis protein yang berperan sebagai struktur sel dan proses seluler. Protein yang paling banyak diidentifikasi dalam CM adalah kolagen, yang terdiri atas beberapa jenis, yaitu: Collagen alpha-1(I) chain (Col1a1), Collagen alpha-2(I) chain (Col1a2), Collagen alpha-1(III) chain (Col3a1), Collagen alpha-1(IV) chain (Col4a1) dan Collagen alpha-2(V) chain (Col5a2). Kolagen berperan sebagai matrix extracellular (ECM) dan akan berinteraksi dengan reseptor. Konsentrasi testosteron di dalam CM adalah 0.542 ng/mL. Kandungan CM sel testikuler diharapkan mendukung proses perkembangan sel germinal. Penelitian tahap ketiga adalah karakterisasi fetus sumber rigi kelamin, serta karakterisasi rigi kelamin sebagai sumber PGC baik secara makroskopis maupun mikroskopis, serta perbanyakan PGC. Penelitian tahap ini menggunakan fetus mencit umur 13.5 hpk sebagai sumber rigi kelamin. Fetus diukur dan ditimbang, rigi kelamin diisolasi untuk preparat histologi dan dikultur. Rigi kelamin diwarnai dengan Hematoksilin Eosin (HE) dan pewarnaan immunositokimia menggunakan antibodi VASA sebagai penanda PGC. Perbanyakan PGC dilakukan dengan kultur in vitro selama 9 hari, medium yang digunakan adalah DMEM+Serum 15% dan DMEM+Serum 15% dengan perlakuan penambahan leukemia inhibitory factor (LIF) 1000 IU/mL. Sel kultur diwarnai pada hari ke-3, ke-6 dan ke-9 kultur dengan pewarnaan immunositokimia menggunakan antibodi OCT-4. Hasil penelitian menunjukkan bahwa fetus umur 13.5 hpk dengan ukuran
Keyword: conditioned medium, PGC, proteomik, sel testikuler, spermatogenesis in vitro

Judul: Efisiensi Isolasi Primordial Germ Cell (PGC) dari Sistem Sirkulasi dan Gonad serta Produksi Germline Chimera pada Ayam KUB
Abstrak: Terdapat sekitar 43 rumpun ayam lokal Indonesia. Beberapa ayam lokal mempunyai populasi sangat terbatas bahkan hampir punah, sehingga beberapa galur yang berpotensi tinggi perlu dilakukan pelestarian secara in-situ atau ex-situ. Salah satu sumber daya genetik ayam lokal hasil pemuliaan adalah galur ayam lokal Kampung Unggul Badan Litbang Pertanian (KUB), hasil seleksi Balai Penelitian Ternak (Balitnak). Galur unggul yang berasal dari rumpun ayam Kampung ini mampu berproduksi telur rata-rata 50% dengan puncak produksi mencapai 65-70%. Sebagai galur baru, maka ayam KUB dapat dikategorikan sebagai sumber daya genetik baru yang perlu dilestarikan. Kegiatan preservasi umumnya dilakukan dengan metode in-situ yang merupakan sistem pemeliharaan hewan di habitat asalnya dan metode ex-situ di luar habitat asal. Preservasi in-situ dan ex-situ dengan sistem pemeliharaan hewan hidup memerlukan biaya pemeliharaan yang tinggi dan resiko penyakit. Pendekatan yang mulai dikembangkan saat ini untuk mengatasi keterbatasan preservasi in-situ dan ex-situ khususnya pada unggas adalah dengan kriopreservasi primordial germ cell (PGC). Primordial germ cell adalah sel progenitor untuk gamet atau leluhur dari spermatozoa dan ovum. PGC dapat diisolasi dari sirkulasi darah embrio umur 2.5-3 hari (stadia 13-16 HH) dan gonad embrio umur 5.5-6 hari (stadia 26-28 HH). Ada beberapa metode yang dikenal untuk mengisolasi PGC-sirkulasi. Salah satu metode baru yang lebih sederhana dan murah adalah metode pemurnian PGC dengan menggunakan buffer lisis ammonium chloride potassium (ACK). Metode ini diharapkan dapat mengatasi prosedur yang rumit dan biaya yang mahal dibanding dengan metode sebelumnya. Metode lainnya adalah pemurnian PGC yang diambil dari gonad embrio dengan cara menginkubasi gonad embrio di dalam larutan medium PBS (-) selama satu jam. Metode pemurnian PGC-gonad ini diharapkan dapat mengatasi masalah rendahnya jumlah PGC yang dipanen dari darah embrio. Kegiatan pemurnian PGC yang diisolasi dari gonad embrio ayam lokal belum pernah dilakukan di Indonesia. Penelitian ini dilakukan dalam tiga tahapan dengan menggunakan metode yang berbeda untuk isolasi PGC-sirkulasi dan PGC-gonad, yaitu: 1. Isolasi dan koleksi PGC-sirkulasi ayam KUB menggunakan metode buffer lisis ammonium chloride-potassium (ACK). 2. Isolasi dan koleksi PGC-gonad ayam KUB menggunakan larutan PBS (-). 3. Transfer donor PGC-sirkulasi dan PGC-gonad ke embrio resipien untuk mendapatkan germline chimera. Hasil penelitian menunjukkan bahwa PGC-sirkulasi dan PGC-gonad ayam KUB mempunyai karakteristik yang sama, yaitu ukuran sel yang besar, bentuk bulat dengan kontur tidak teratur, inti yang sperikal dan besar yang letaknya tidak simetris, droplets lemak terang yang terdistribusi dalam sitoplasma. Sel PGC dapat dibedakan dengan mudah dari sel darah merah dan sel somatis. Rataan jumlah PGC-sirkulasi ayam KUB pada stadia perkembangan embrio 14-18 berturut-turut adalah 37.9; 53.5; 49.8; 38.3; dan 33.5 sel per embrio. Dari stadia 14, jumlah PGC-sirkulasi meningkat dan mencapai puncaknya pada stadia 15, kemudian menurun setelah stadia 15. Dari stadia 17 terlihat sedikit PGC-sirkulasi yang berada dalam sistem peredaran darah embrio. Rataan jumlah PGC-gonad ayam KUB yang diperoleh dari perkembangan embrio umur 6, 7, 8, dan 9 hari berturut-turut adalah 113.7; 143.5; 92.9; dan 85.7 sel per embrio. Dimulai pada hari ke-6 perkembangan embrio, jumlah PGC-gonad secara signifikan meningkat dan mencapai puncaknya pada hari ke-7, hal ini menunjukkan bahwa semua PGC sudah mencapai gonad embrio. Jumlah PGC menurun perlahan-lahan pada hari ke-8 sampai ke-9. Alasan dari
Keyword: Ayam KUB, PGC-sirkulasi, PGC-gonad, germline chimera

Judul: The Solution of Nonlinear Volterra Integral Equation using Linearization Method.
Abstrak: Many natural phenomena can be explained by mathematical models. One of those models is in the form of Volterra integral equation, which is usually nonlinear. Analitically, a nonlinear form is difficult to solve. Therefore, this research is aimed to discuss solution of Volterra integral equation using linearization method. Linearization is done to nonlinear integrand with Taylor series expansion. According to this linearization, a numerical solution of Volterra integral equation is obtained using MATLAB 7.0.1 software. Validity of this method is tested by comparing the approximate with the exact solution. The result of this research shows that the numerical solution agree with the exact solution quite well.
Keyword: