Judul: Keragaman Morfologi Aktinomiset Endofit Rhododendron spp. dan Penghambatannya Terhadap Bacillus cereus dan Candida albicans
Abstrak: Pengembangan potensi senyawa bioaktif baru dari metabolit sekunder yang dihasilkan mikrob termasuk aktinomiset endofit tumbuhan semakin berkembang, diantaranya dimanfaatkan sebagai senyawa antimikrob. Mikrob endofit termasuk aktinomiset diketahui dapat menghasilkan senyawa bioaktif yang sama dengan tanaman inangnya. Sebanyak 17 aktinomiset endofit Rhododendron telah berhasil diisolasi dari batang dan daun, serta dikoleksi di Laboratorium Mikrobiologi IPB. Penelitian ini bertujuan mengkaji keragaman morfologi aktinomiset endofit Rhododendron spp. dan kemampuan penghambatannya terhadap Bacillus cereus dan Candida albicans serta mengidentifikasi aktinomiset endofit terpilih berdasarkan gen 16S rRNA. Metode yang digunakan yaitu peremajaan dan karakterisasi isolat aktinomiset endofit, penapisan aktivitas antimikrob menggunakan Bacillus cereus dan Candida albicans, Aktinomiset endofit terpilih berdasarkan aktivitas antimikrob, diidentifikasi dengan cara mengisolasi dan mengamplifikasi gen 16S rRNA menggunakan primer 27F dan 16Sact1114R, serta menganalisis kekerabatannya dengan membandingkan sekuen gen yang sama dari galur-galur bakteri yang tersimpan di GenBank. Semua isolat aktinomiset endofit Rhododendron spp. menunjukkan keragaman morfologi miselia aerial dan penataan rantai spora dengan tipe yang beragam. Berdasarkan keragaman morfologi isolat aktinomiset endofit Rhododendron spp. memiliki karakter genus Streptomyces. Penapisan uji antimikrob terhadap B. cereus dan C. albicans sebanyak 17 isolat mampu menghambat pertumbuhan B. cereus, dan hanya 3 isolat yang dapat menghambat pertumbuhan C. albicans. Satu isolat menghasilkan daya hambat terhadap B. cereus dan C. albicans tertinggi yaitu isolat RJHB 2. Isolat RJHB 2 memiliki homologi sebesar 85% dengan Streptomyces fradiae NBRC 3439 berdasarkan identifikasi gen 16S rRNA.
Keyword: aktinomiset, antimikrob, Rhododendron spp., senyawa bioaktif

Judul: Aktivitas Amilolitik dan Inhibitor -Glukosidase Aktinobakteri Endofit Rhododendron spp.
Abstrak: Indonesia kaya dengan sumberdaya hayati baik tanaman maupun mikrob dengan beragam bioaktivitasnya, diantaranya adalah Rhododendron sp. dan aktinobakteri. Rhododendron banyak digunakan masyarakat sebagai tanaman hias dan obat tradisional. Mikrob endofit yang diketahui dapat hidup dalam jaringan tanaman Rhododendron adalah aktinobakteri. Aktinobakteri dikenal sebagai penghasil senyawa bioaktif dengan beragam fungsi biologi seperti inhibitor - glukosidase. Penelitian ini bertujuan mengkaji aktivitas amilolitik dan inhibitor - glukosidase dari aktinobakteri endofit asal Rhododendron spp. Isolat aktinobakteri diremajakan menggunakan media ISP-4. Bakteri yang tumbuh ditetesi larutan iodin untuk uji aktivitas amilolitik. Aktinobakteri dengan aktivitas amilolitik tertinggi dan terendah diinokulasikan ke dalam tiga media produksi cair, yakni YS, ISP-2 dan ISP-4 untuk uji inhibisi -glukosidase. Kultur aktinobakteri lalu disentrifugasi dan supernatan yang dihasilkan digunakan dalam uji inhibisi α- glukosidase. Hasil penelitian menunjukkan bahwa sebanyak 23 isolat aktinobakteri endofit Rhododendron spp. memiliki aktivitas amilolitik yang beragam. Isolat RJB 1.2 mempunyai indeks amilolitik terbesar dengan nilai 2.48, sedangkan isolat RSS 1 mempunyai indeks amilolitik terkecil dengan nilai 0.21. Aktinobakteri RJB 1.2, RSS 1, dan isolat pembanding BWA 65 ditumbuhkan dalam 3 media menghasilkan inhibisi α-glukosidase bervariasi. Media produksi ISP-2 menghasilkan aktivitas inhibisi α-glukosidase yang tinggi. Media ISP-2 menghasilkan aktivitas inhibisi α-glukosidase RSS 1 sebesar 18.32%, sedangkan RJB 1.2 hanya sebesar 3.10%. Aktinobakteri BWA 65 yang telah diketahui memiliki aktivitas inhibitor α-glukosidase digunakan sebagai pembanding, memiliki nilai inhibisi α-glukosidase sebesar 29.15%. Persentase inhibisi α- glukosidase pada acarbose 500 ppm memiliki nilai sebesar 98.95%. Karakteristik morfologi isolat RJB 1.2, RSS 1 dan BWA 65 sangat beragam dengan miselia tipe spira, retinaculum-apertura dan biverticillus-spira. Berdasarkan sekuen gen 16S rRNA, aktinobakteri endofit terpilih RSS 1 memiliki homologi dengan Streptomyces sp. E5N238 dengan nilai kemiripan sebesar 98%, dan memiliki homologi dengan Streptomyces collinus NBRC 12547 dan Streptomyces tendae M23 dengan nilai kemiripan sebesar 97%. Hasil penelitian menunjukkan bahwa aktinobakteri endofit Rhododendron spp. memiliki aktivitas amilolitik dan inhibisi terhadap α- glukosidase yang beragam.
Keyword: aktinobakteri, amilolitik, endofit, inhibitor α-glukosidase, Rhododendron spp., mikrob

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: