Judul: Variasi Gene Cytochrome Oxidase 1 pada Apis andreniformis dan Apis dorsata
Abstrak: Distribusi lebah madu Apis andreniformis dan A. dorsata (Hymenoptera: Apidae) adalah di Asia Tenggara, termasuk Indonesia. Analisis morfologi untuk kedua spesies lebah ini sudah banyak dilakukan di Indonesia, namun belum ada data DNA mitokondria berdasarkan gen cytochrome oxidase 1 (CO1). Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis variasi gen CO1 A. andreniformis dan A. dorsata. Analisis filogenetik pada lebah A. andreniformis dilakukan dengan menggabungkan database gen CO1 A. andreniformis asal Nepal dan Cina, lebah A. dorsata digabungkan dengan database gen CO1 A. dorsata asal Kalimantan Selatan, Sabah, Sarawak dan Cina. Hasil sekuen gen CO1 parsial A. andreniformis adalah 582 pb dan A. dorsata 507 pb. Jarak genetik terendah antara sampel A. andreniformis asal Padang Pariaman dengan Nepal dan Cina. Jarak genetik tertinggi pada A. dorsata antara sampel asal Sukabumi dengan sampel asal Kalimantan Selatan, Sabah, Sarawak dan Cina. Analisis filogenetik berdasarkan gen CO1 menunjukkan A. andreniformis asal Indonesia dan Cina mengelompok menjadi satu grup. Analisis filogenetik A. dorsata menunjukkan bahwa sampel asal Sukabumi terpisah dengan A. dorsata asal Kalimantan Selatan, Sabah, Sarawak, dan Cina
Keyword: Apis, open nesting honey bee, dwarf honey bee, giant honey bee, DNA mitochondria, CO1 gene

Judul: Variasi DNA Mitokondria Gen Cytochrome C Oxidase 1 (COX1), Gen Cytochrome C Oxidase 2 (COX2), dan Intergenic Spacer COX1/COX2 Apis cerana asal Indonesia Timur
Abstrak: Apis cerana (Hymenoptera: Apidae) atau dikenal dengan Asian Honeybee memiliki delapan subspesies dengan distribusi di Asia. Penelitian mengenai filogeni dari A. cerana asal beberapa kawasan di Indonesia telah dilakukan melalui gen Cytochrome C Oxidase 1 (COX1) dan Intergenic spacer (IGS) COX1/COX2. Namun penelitian filogeni A. cerana asal Indonesia timur belum dilakukan. Oleh sebab itu, penelitian ini bertujuan menganalisis kekerabatan A. cerana yang terdapat di bagian timur Indonesia melalui gen COX1, gen COX2, dan IGS COX1/COX2. Sampel lebah A. cerana yang digunakan berasal dari Majene (Sulawesi), Ambon, dan Manokwari. Analisis molekular dilakukan dengan ekstraksi, amplifikasi, dan sequencing DNA dilanjutkan dengan analisis bioinformatika dan filogeni. Komposisi rata-rata nukleotida AT pada seluruh sampel DNA adalah 83%. Penelitian ini mendapatkan dua haplotipe baru masing-masing berdasarkan gen COX1 dan gen COX2. Satu haplotipe baru ditemukan berdasarkan IGS COX1/COX2. Lebah A. cerana asal Papua dan Maluku berkerabat dekat dengan A. cerana asal Jawa berdasarkan hasil variasi nukleotida, jarak genetik, dan pohon filogeni gen COX1. Berdasarkan pohon filogeni molekular gen COX1 sangat informatif dalam menunjukkan kekerabatan lebah A. cerana. Gen COX2 dapat menunjukkan kekerabatan antar A. cerana asal Papua dan Maluku dengan Borneo, sedangkan bagian IGS COX1/COX2 tidak dapat menunjukkan kekerabatan antar lokasi A. cerana.
Keyword: Apis cerana, DNA mitokondria, filogeni, haplotipe, variasi genetik

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: