Judul: Pencegahan Penyakit Motile Aeromonad Septicemia pada Benih Ikan Nila (Oreochromis niloticus) Umur 5, 10, dan 15 Hari Melalui Vaksinasi Induk Menggunakan Lipopolisakarida Aeromonas hydrophila
Abstrak: Penyakit Motile Aeromonad Septicemia (MAS) merupakan penyakit yang disebabkan oleh bakteri Aeromonas hydrophila. Bakteri A hydrophila adalah bakteri yang menyerang ikan mulai dari stadia benih hingga dewasa. Penelitian ini bertujuan untuk menguji efikasi vaksin lipopolisakarida (LPS) A. hydrophila yang diberikan ke induk terhadap parameter imun dan ketahanan benih umur 5, 10, dan 15 hari yang dihasilkan terhadap infeksi patogen A. hydrophila. Bobot induk nila yang digunakan 177±13,00 gram dengan panjang induk 20±0,58 cm. Vaksinasi dilakukan dengan metode injeksi intraperitoneal (IP) dengan dosis 0,1 mL LPS A. hydrophila dan 0,1 mL PBS untuk perlakuan kontrol. Uji tantang dilakukan pada benih berumur 5, 10, dan 15 hari setelah menetas dari induk yang divaksin dan tidak divaksin. Pemberian vaksin LPS A. hydrophila pada induk mampu memproteksi benih ikan nila dari penyakit MAS, ditunjukkan pada nilai titer antibodi dan aktivitas lisozim antara perlakuan induk yang divaksin dan tidak divaksin (P<0,05), dengan nilai RPS sebesar 86% dan 71% masing-masing pada benih umur 5 dan 10 hari.
Keyword: Aeromonas hydrophila, imun, lipopolisakarida, nila, vaksin

Judul: Efikasi Vaksin Sel Utuh dan Lipopolisakarida Aeromonas hydrophila pada Benih Ikan Nila untuk Mencegah Motile Aeromonad Septicemia.
Abstrak: Aeromonas hydrophila merupakan bakteri patogen nonspesifik yang dapat menginfeksi berbagai jenis ikan air tawar dan menyebabkan penyakit motile aeromonad septicemia (MAS). Tujuan dari penelitian ini yaitu menentukan substansi vaksin yang paling efektif antara formalin-killed cell (FKC), lipopolisakarida (LPS), dan kombinasi antara keduanya untuk mencegah penyakit MAS pada benih ikan nila. Benih ikan nila yang digunakan memiliki panjang rata-rata 7,92±0,60 cm dengan bobot rata-rata 7,49±1,63 g. Ikan nila kemudian diinjeksi secara intraperitoneal dengan tiga substansi vaksin yaitu LPS, FKC, dan kombinasi antara FKC dan LPS. Benih ikan nila kemudian ditebar dan dipelihara pada akuarium berukuran 60×30×30 cm3 dengan kepadatan 10 ekor per akuarium. Tiga minggu setelah vaksinasi, benih ikan nila diuji tantang dengan menginjeksikan 0,1 mL A. hydrophila 105 CFU mL-1 secara intramuskular. Pengamatan parameter dilakukan sebelum penebaran, setelah vaksinasi, dan setelah uji tantang. Substansi vaksin terbaik yaitu kombinasi antara formalin-killed cell dan lipopolisakarida dengan kelangsungan hidup relatif yang mencapai 86,36%.
Keyword: formalin-killed cell, lipopolisakarida, imunitas, benih, nila

Judul: Penyusunan Overlap Graph menggunakan Suffix Tree pada DNA Sequence
Abstrak: The DNA sequence assembly is very important in genome analysis. This step aims to reconstruct contigous DNA fragment (contigs) from short fragment by concatenating fragments based on the overlap region among them. This method employs overlap graph for solving the problems. In this graph, nodes represent fragments and edges represent overlap. This research developed a software for constructing overlap graph using suffix tree. The evaluation was conducted by measuring the number of nodes, number of edges, and the execution time in many values of minimum overlap. The minimum overlap is defined as the minimum length of substring which is considered as the overlap region between two fragments. The evaluation results showed that the number of nodes, the number of edges, and the execution time were increased with the decreasing of the minimum overlap value.
Keyword: