Judul: Pc13-35s-Intron-Sma: Vektor Biner Fleksibel Untuk Ekspresi Gen Target Secara Konstitutif Pada Transformasi Tanaman Melalui Agrobacterium
Abstrak: Teknik penyisipan gen target ke dalam tanaman menggunakan vektor alami Agrobacterium telah menjadi hal rutin dalam perakitan tanaman transgenik. Bakteri ini memiliki kemampuan dalam menyalin, memindahkan, dan menyisipkan daerah T-DNA ke dalam kromosom tanaman yang berada pada vektor biner. Vektor biner pC13-35S-Intron-Sma memungkinkan gen target yang disisipkan pada situs SmaI (CCCGGG) diatur ekspresinya oleh promoter kuat 35S dan terminator Nos untuk membentuk cassette ekspresi dengan cepat. Gen target akan mendapat tambahan intron (cat1) di ujung 5’- dan 6 kali histidin di ujung karboksil. Keberadaan intron untuk memastikan ekspresi gen target tidak berasal dari Agrobacterium. Komponen 6 kali histidin dapat berfungsi sebagai penanda untuk purifikasi dan deteksi pada tingkat protein. Untuk mengetahui keberhasilan dari konstruksi pC13-35S-Intron-Sma disisipkan gen enhanced green fluorescent protein (eGFP) pada situs SmaI membentuk pC13-35S-Intron-eGFP dan ditransformasi ke padi varietas Nipponbare menggunakan Agrobacterium EHA105. Infeksi dilakukan pada kalus yang berumur lima hari dan ditanam pada media kultivasi. Pengamatan kalus transforman yang berusia satu bulan setelah infeksi menunjukkan adanya sinyal ekspresi eGFP dengan terbentuknya pendaran berwarna hijau di bawah sinar biru. Hasil ini menunjukkan bahwa vektor biner pC13-35S-Intron-Sma dapat digunakan untuk transformasi tanaman dengan Agrobacterium.
Keyword: vektor biner, eGFP, intron, Agrobacterium, transformasi tanaman

Judul: Konstruksi Gen Stilbena Sintase pada Vektor Ekspresi dengan Metode Gateway dan Transformasi pada Agrobacterium sp.
Abstrak: Bioteknologi modern atau rekayasa genetika telah berkembang sangat pesat dalam dua dasawarsa terakhir dan telah banyak diaplikasikan dalam berbagai bidang, salah satunya dalam bidang rekayasa genetika tanaman. Penyakit busuk pangkal batang yang disebabkan oleh cendawan Ganoderma sp. sering menyerang tanaman kelapa sawit sehingga produksinya menurun. Teknik rekayasa genetika dapat digunakan untuk mengendalikan masalah tersebut, yaitu dengan menyisipkan gen yang dapat meningkatkan ketahanan kelapa sawit terhadap Ganoderma. Gen stilbena sintase (STS) yang diisolasi dari anggur (Vitis vinifera) telah diketahui sebagai gen penghasil senyawa yang berfungsi sebagai anti jamur. Penelitian ini bertujuan menyisipkan gen STS dengan metode yang lebih cepat dan terarah, yaitu metode Gateway. Gen STS kemudian ditransformasikan ke dalam Agrobacterium tumefaciens. Penyisipan gen STS ke dalam vektor donor, vektor destinasi, dan A. tumefaciens telah berhasil dilakukan dengan ditunjukkan hasil elektroforesis gel agarosa 1% berupa pita berukuran sekitar 1500 pb. Gen STS telah berhasil disisipkan pada vektor ekspresi dengan metode Gateway dan ditransformasikan ke dalam A. tumefaciens.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: