Judul: Identifikasi Pseudomonas syringae pv. lachrymans dari Benih Mentimun dan Teknik Eliminasinya dengan Elektroterapi
Abstrak: Pseudomonas syringae pv. lachrymans adalah bakteri yang menyebabkan penyakit bercak bersudut daun mentimun. Bakteri ini juga diketahui dapat terbawa benih. Patogen ini telah dilaporkan menyebabkan kehilangan hasil yang signifikan. Pengendalian yang lebih efektif diperlukan untuk meminimumkan risiko. Identifikasi yang akurat menjadi syarat dasar untuk mengambil keputusan pengendalian yang tepat. Teknik molekuler seperti polymerase chain reaction (PCR) dapat digunakan untuk deteksi dan identifikasi patogen tumbuhan secara cepat, sensitif dan akurat. Perlakuan benih untuk menghilangkan patogen yang terbawa benih dikategorikan sebagai prinsip pengendalian dengan meminimumkan jumlah inokulum awal. Elektroterapi dengan mengaplikasikan arus listrik ke benih diharapkan menjadi alternatif untuk menghilangkan patogen. Tujuan dari penelitian ini adalah melakukan identifikasi dan eliminasi bakteri patogen dari biji mentimun menggunakan elektroterapi dengan mempertahankan viabilitas benih. Bakteri diisolasi dari mentimun, dan dikarakterisasi berdasarkan morfologi koloni, uji Gram, reaksi hipersensitivitas (HR) dan amplifikasi PCR. Benih yang diinokulasi dengan bakteri dialiri listrik 12 V DC, 1 A dalam larutan elektrolit NaCl dengan dua variabel, yaitu waktu elektroterapi dan konsentrasi NaCl. Bakteri hasil isolasi dari benih mentimun dikonfirmasi sebagai Pseudomonas syringae pv. lachrymans berdasarkan morfologi koloni, Gram negatif, HR positif dan PCR menggunakan pasangan primer D21 dan D22. Elektroterapi pada 0.5 M NaCl dengan tingkat perlakuan selama 35 menit menghasilkan eliminasi total bakteri, tetapi masih mempertahankan tingkat perkecambahan benih dan vigor tanaman yang baik berturut-turut sebesar 93.0% dan 83.3%. Sementara elektroterapi selama 15 menit pada tingkat konsentrasi 2.5 M NaCl hanya menekan populasi bakteri menjadi 5.3 x 105 CFU mL-l tetapi mempertahankan tingkat perkecambahan dan kekuatan benih berturut-turut sebesar 95.0% dan 88.3%. Elektroterapi juga mampu mempertahankan pertumbuhan optimum tanaman, yaitu tinggi tanaman dan panjang akar.
Keyword: arus listrik DC, larutan elektrolit, PCR, populasi bakteri, viabilitas tanaman

Judul: Identifikasi Secara Molekuler dan Teknik Eliminasi dengan Elektroterapi Bakteri Patogen dari Benih Padi.
Abstrak: Bakteri merupakan salah satu kelompok patogen tanaman penting pada padi. Bakteri patogen tanaman padi yang juga dapat terbawa benih antara lain adalah Xanthomonas oryzae pv. oryzae, Burkholderia glumae, Acidovorax avenae subsp. avenae, X. oryzae pv. oryzicola, Pseudomonas fuscovaginae, dan P. syringae pv. syringae. Beberapa dari bakteri tersebut belum dilaporkan ada di Indonesia. Identifikasi bakteri secara akurat menjadi dasar yang penting untuk pengambilan keputusan pengendalian yang tepat. Namun, identifikasi secara konvensional berdasarkan morfologi, fisiologi dan biokimia cukup rumit dan lama sehingga penggunaan metode molekuler diharapkan dapat mengatasi permasalahan tersebut. Pemilihan benih yang sehat atau pembebasan benih dari patogen adalah salah satu upaya pengendalian dengan pendekatan minimisasi inokulum awal patogen penyebab penyakit sejak benih sebagai tahap paling dini dari fase pertumbuhan tanaman. Perlakuan fisik dengan elektroterapi diharapkan menjadi salah satu alternatif pengendalian untuk mengeliminasi patogen terbawa benih. Penelitian ini bertujuan mengetahui bakteri pada benih padi melalui identifikasi secara molekuler dan teknik eliminasi bakteri tersebut dengan penggunaan arus listrik tanpa menurunkan kualitas benih. Penelitian ini terdiri dari dua tahapan yaitu (1) isolasi dan identifikasi secara morfologi dan molekuler, (2) perlakuan elektroterapi pada benih padi untuk mengeliminasi bakteri terbawa benih. Bakteri diisolasi dari benih Ciherang menggunakan media semi selektif S-PG (sucrose phosphate glutamate). Koloni bakteri dari padi pada media S-PG memiliki ciri-ciri bulat, cembung, berwarna coklat kemerahan dan pinggiran koloni berwarna putih susu, bagian B memiliki ciri-ciri berwarna putih susu, berbentuk bulat, tepian rata, permukaan cembung dan tidak berpendar. Analisis nukleotida gen 16S rRNA hasil sekuensing dari amplikon PCR menggunakan primer 63 f dan 1387r dilakukan pada isolat BC2 dan BC6. Isolat BC2 dan BC6 memilik homologi 97% dan 94% dengan nukleotida isolat-isolat A. avenae subsp. avenae yang tersedia dalam GenBank. Elektroterapi terhadap bakteri dan benih padi secara terpisah dengan parameter tegangan 12 Volts DC dan arus 1 A pada kisaran konsentrasi NaCl dalam elektrolit dan kisaran lama waktu elektroterapi menghasilkan treatment window yang pada konsentrasi NaCl 1 dan 1.25 M dan waktu 30, 35 dan 40 menit dapat menekan viabilitas bakteri namun tidak berpengaruh nyata bagi viabilitas benih padi. Elektroterapi benih padi yang diinokulasi dengan bakteri secara buatan pada konsentrasi 1.25 M dengan waktu perlakuan 35 dan 40 menit tidak berpengaruh terhadap viabilitas benih namun efektif untuk menekan populasi bakteri A. avenae subsp. avenae.
Keyword: arus listrik, NaCl, patogen terbawa benih, pengendalian fisik, perlakuan benih

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: