Judul: Analisis Sekuen Exon 2 Gen Penyandi Lisozim Putih Telur Ayam Kampung (Gallus gallus domesticus).
Abstrak: Lisozim putih telur (EWL) ayam kampung memiliki potensi untuk dikembangkan melalui teknologi rekombinan karena sifat fungsionalnya sebagai antibakteri dan pemberi rasa manis. Teknologi rekombinan ini dapat dilakukan dengan terlebih dahulu mengetahui gen penyandinya. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi sekuen gen penyandi lisozim ayam kampung pada ekson 2 serta menganalisis hasil sekuen parsial ekson 2 berupa pengurutan sekuen, penentuan exon-intron, homologi, phylogenetic tree, dan translasi asam amino berupa pembandingan asam amino serta analisis struktur protein. Penelitian ini berfokus pada ekson 2 karena keterbatasaan waktu yang dimiliki. DNA genom kampung digunakan sebagai template pada ekson 2 untuk proses amplifikasi dengan menggunakan primer yang dirancang berdasarkan urutan gen EWL pada GenBank. Gen LYZ ayam kampung IPB-D1 telah berhasil diidentifikasi dan menghasilkan 840bp, tetapi ada beberapa basa dalam sekuen yang tidak terbaca serta mengalami mutasi. Meskipun demikian, sebagian besar basa lainnya masih dirasa cukup untuk bisa memastikan bahwa gen tersebut adalah lisozim dengan homologi tertinggi dengan gen LYZ Gallus gallus clone-18 dan LYZ Gallus gallus clone-111 dengan kesamaan sebesar 84.31% berdasarkan BLAST-N. Hal ini dibuktikan pula dengan letak percabangan pada pohon filogeni. Sekuen exon 2 mencakup wilayah sisi aktif lisozim Glu35 dan Asp52 sebagai anti bakteri dan sisi aktif pemanis Arg73 sehingga wilayah ini berkaitan dengan aktifitas antibakteri dan rasa manis.
Keyword: asam amino, ayam kampung, ekson, lisozim, sekuen

Judul: Produksi dan Karakteristik Lisozim Kering Beku dari Putih Telur Ayam Kampung
Abstrak: Lisozim putih telur adalah satu protein putih telur dengan persentase sebesar 3%-4% dari berat total protein. Protein ini memiliki banyak kegunaan dalam industri makanan. Lisozim dikenal sebagai bahan pengawet dan sedang banyak diteliti sebagai pemanis. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis lisozim kering beku asal putih telur ayam kampung dari aspek berat lisozim, rendemen, dan kadar protein hasil perlakuan (native/ tanpa pemanasan, pasteurisasi pada suhu 72oC selama 15 detik, dan sterilisasi pada suhu 121 oC selama 15 menit). Lisozim putih telur dari ayam kampung dimurnikan sebanyak 500 g putih telur menjadi kering beku. Hasil penelitian menunjukkan bahwa hasil kering beku untuk berat molekul ayam kampung pada perlakuan tanpa pemanasan, pasteurisasi, dan sterilisasi berturut-turut adalah 15 kDa, 15 kDa, dan 0 kDa. Rendemen terhadap putih telur sebesar 0.02%. Konsentrasi protein lisozim kering beku, semakin menurun dengan makin tingginya suhu perlakuan, berturut-turut sebesar 19.54 mg mL-1, 5.07 mg mL-1, dan 1.32 mg mL-1. Produksi lisozim menjadi kering beku tidak mengakibatkan perubahan penurunan kualitas protein lisozim, tetapi pemanasan pada lisozim kering beku ayam kampung berpengaruh terhadap konsentrasi protein, berat molekul dan karakteristik lisozim. Pemanasan mengakibatkan terjadinya penurunan berat molekul masing-masing sampel dan menunjukkan bahwa pemanasan tinggi mengakibatkan lisozim terdenaturasi menjadi tidak aktif.
Keyword: freeze dried, heating, kampung chicken, lysozyme

Judul: Numerical modeling of the hydrodynamics of standing wave and scouring in front of impermeable breakwater with different steepnesses
Abstrak: The aim of this paper is to numerically study the effects of breakwater steepness on the hydrodynamics of standing wave and scouring process in front of impermeable breakwaters. A two-dimensional hydrodynamics model based on the Reynolds Averaged Navier–Stokes (RANS) equations and the Volume of Fluid (VOF) method was developed and then combined with an empirical sediment transport model. Comparisons with an analytical solution and experimental data showed the present model is very accurate in predicting the near bottom velocity and capable of simulating the scour/deposition patterns consistent with experimental data. It was found that the additional terms of bottom shear stress in the momentum equations are necessary to produce a physical scouring pattern. Different breakwater steepnesses produce different characteristics of standing wave, the steady streaming system, and scouring pattern in front of the breakwaters, which also affects the correlations between them. An additional analysis of the turbulence field parameters and the sediment transport rate was also performed. All these important information will be presented in details in this paper and can be worthwhile for designing the breakwater in coastal areas.
Keyword: The RANS–VOF model Standingwave Steadystreamingsystem Scouring pattern Breakwatersteepness