arulpm/tripletsmall huggingface dataset:
Judul: Identifikasi Ganoderma spp dan Trichoderma spp menggunakan marka molekuler ITS-RFLP
Abstrak: Genetic informations of Ganoderma spp and Trichoderma spp are needed because Ganoderma spp is one of important fungi patogen in estate crops, whereas Trichoderma spp is fungi that can control Ganoderma spp. Research has been conducted to identify the fungi morphologically and physiologically. Due to the low level of accuracy, the use of ITS-RFLP method is expected to identify the species of Trichoderma spp and Ganoderma spp more accurate and specific. The method used are preparation of pure isolates, genomic DNA isolation, amplification by PCR using primers ITS1_ITS4 and ITS5_ITS4, digesting with restriction enzymes AluI, MspI, MluI, and MnlI, and sequencing amplicons. The size of genomic DNA isolated from six samples were about 3000 bp. Trichoderma spp amplicons size were 680 bp, whereas Ganoderma spp amplicons were ranged from 600 to 700 bp. Restriction enzymes that produce the most polymorphic bands pattern are MspI. Samples with different patterns and size of bands indicated a different species, whereas the similar pattern and size of bands shows close relations.
Keyword: Bogor Agricultural University (IPB), Restriction enzyme, PCR, ITS-RFLP, Ganoderma spp, Trichoderma spp

Judul: Identifikasi Ganoderma spp. Menggunakan Teknik DNA Barcoding
Abstrak: Oil palm is one of comodity plantation which is very important. One of the problems faced by the oil palm plantations are disease, namely Basal Stem Rot (BSR) which caused by Ganoderma spp. If plants were attacked by BSR, sooner or later, they would die and the production will decreased significantly. Consequently, in order to have an effective control of Ganoderma, an accurate identification is needed. This could be achieved by molecular techniques through DNA Barcoding method. The aim of this study was to is to find a specific primer for the identification of Ganoderma spp. that attack estate crops and their shade trees. Based on this research, it showed that the primer pair ITS1_F/ITS4_B has a high percentage of the ability to identify isolates of Ganoderma spp. compared with the other primer pairs, which are primer BenA F/ BenA_R, Gan_ITS1_F/Gan_ITS1_R, CO1_PenF1/CO1_PenR1, CO1_B_F/ CO1_B_R, and Gan_ITS2_F/Gan_ITS2_R. The primer pair ITS1_F/ITS4_B had a potential as a DNA barcode for identification of Ganoderma species.
Keyword: 

Judul: Latar Belakang dan Dampak Keberadaan Anak Jalanan di Perempatan Coca-cola, Kecamatan Pulo Gadung, Jakarta Utara
Abstrak: Munculnya anak jalanan pada umumnya dipengaruhi oleh keadaan ekonomi keluarga yang rendah. Rendahnya pendapatan keluarga tersebut mendorong anak untuk masuk dalam dunia kerja. Keadaan ini diperburuk dengan besarnya jumlah anggota keluarga anak jalanan seringkali mendorong anak untuk bekerja. Mereka mempunyai kewajiban untuk ikut membantu orang tua yang mempunyai pendapatan rendah. Selain itu adanya kakak yang bekerja dapat mendorong adik laki-laki/perempuan untuk ikut bekerja, terutama kakak yang bekerja sebagai anak jalanan.
Keyword:
Judul: Sensitivitas gen sitokrom B (Cyt b) sebagai marka spesifik pada genus Rattus dan Mus untuk menjamin keamanan pangan produk asal daging
Abstrak: Appropriate techniques for detection and identification of origin of species for meat source are very important in the meat product processing to ensure the safety and halal foods. Multiplex PCR, in which many primers were used together for amplification of multiple target regions, is hopefully a suitable technique for meat sources identification. The aim of this study was to determine the specificity and sensitivity of the cytochrome b (cyt b) gene in rats as well as to design primers that can be used for detection of rat meat contamination in some processed meat products. The amplification of cyt b genes was done in seven species with different lengths of fragments which indicated specificity for cyt b genes sequences between species. The products showed specific DNA fragments of 157, 227, 274, 331, 398, 439 and 603 bp from goat, chicken, cattle, sheep, pig, horse and rat meats, respectively. Cyt b gene is sensitive as a specific marker with rats DNA that could be detected and be amplified with 100% success from as low as 1% level of contamination. Results showed that rat DNA in meatballs could be detected from 1% level contamination, otherwise rat DNA in meat floss could be detected from above 2.5% level contamination.
Keyword: 

Judul: Aplikasi Penggunaan Gen Sitokrom B Dengan Teknik Polymerase Chain Reaction (PCR) Sebagai Pendeteksi Campuran Daging Tikus Pada Produk Bakso
Abstrak: Polymerase chain reaction (PCR) technique was developed as a precise and quick method to identify meat species in both of raw meat and meat products. Rat primer has been developed from mitochondrial cytochrome b gene sequence. The aim of this study was to find out the ability and sensitivity level from this primer as contamination detector in meatball, and also to indentify the contamination of rat meats in meatball products which are sold in the Bogor City. Meatball samples were prepared from both mixtures rat meat and beef at different levels (1, 5, 10, 15, 20 and 25%) in meatball. As the result, rat’s meat could be identified start from 5% level and were amplified definitely at level contamination 15%. There were no rat meat found in the market samples or in other words, meatball sold in three big markets in Bogor City (Pasar Anyar, Pasar Bogor dan Pasar Jambu Dua) were free from rat contamination.
Keyword: 

Judul: Persamaan Gelombang Permukaan Dalam Sistem Hamiltonian
Abstrak: Fluida adalah suatu zat yang bentuknya dapat berubah secara kontinu akibat gaya geser. Dua bentuk fluida yang dikenal adalah fluida yang berbentuk cairan dan gas. Dalam tulisan ini akan dibahas fluida yang berbentuk cairan. Persamaan yang memodelkan fenomena gelombang fluida di antaranya adalah sistem Hamiltonian. Persamaan ini berasumsi babwa fluida dalam keadaan ideal di mana fluida tak mampu mampat (inkompresibel), fluida tak rotasional (irrotasional).
Keyword:
Judul: Dampak Penyaluran Kredit Mikro dan Permasalahan Moral Hazard UMKM di BPR XYZ Kabupaten Tasikmalaya
Abstrak: Micro, Small, and Medium Enterprises (MSMEs) have significant contribution to Indonesian economy. Most of them have limited capital access to expand their business. Rural bank (BPR) as one of MFIs have potential to distribute credit with less requirement. Rural bank (BPR) faces moral hazard problems from MSMEs that could threaten its financial sustainabilities. This study analyzed the impact of credit from rural bank (BPR) to development of MSMEs based on business turnover indicator by OLS (Ordinary Least Square) method, while factors that affect MSMEs to conduct moral hazard was analyzed by logistic regression. The analysis showed that credit from rural bank (BPR) had positive influence and increased MSMEs business turnover about 70.88% per year. Factors that affected the development of the business turnover were education, loans, benefits, years of business, and number of employees. Meanwhile, factors that affected MSMEs to conduct moral hazard were dummy of having credit from bank, frequency of loan, savings, and distance to rural bank.
Keyword: 

Judul: Analisis Faktor-Faktor yang Mempengaruhi Akses dan Pembatasan Kredit pada UMKM di Kabupaten Bogor
Abstrak: Micro, small and medium enterprises (MSMEs) have important role to absorb unemployment. However, most ofMSMEs have low access to formal financial institution. Semiformal financial institutions such as Baitul mal wat Tamwil (BMT) can support the needs of MSMEs capital. This study analyzed access MSMEs to conventional and Islamic financial institution and factors that influence credit rationing from financial institution. This research used logistic regression model to determine factors influencing MSMEs acces to BMT and their probability of being credit rationed by the institution. Access to Islamic financial institutions (BMT) are influenced by education and type of business (manufacturing and services). Factors influencing credit rationing are MSMEs’ maturity and frequency of loans
Keyword: 

Judul: Embriogenesis ikan buta (Astyanax fasciatus)
Abstrak: Ikan buta Astyanax fasciatus adalah spesies ikan unik dari famili Characidae yang menempati perairan dalam gua di Wilayah La Cueva Chica-San Luis Potasi-Mexico. Ikan ini memiliki mata yang tereduksi (Blind Cavefish) dan warna kulit merah muda, pucat serta mengkilap.
Keyword:
Judul: Pengaruh Suplementasi PMSG dan hCG pada Proses Fertilisasi In-Vitro dan Kultur Klon Embrio Sapi dengan IGF-I
Abstrak: Sapi merupkan salah satu jenis ternak yang telah memberikan kontribusi besar guna memenuhi kebutuhan protein hewani masyarakat Indonesia Peran sapi semakin penting, karena meskipun masih dalam keadaan laisis ekonomi kebutuhan daging maupun susu diperkirakan masih cukup tinggi. Kebutuhan akan sapi tersebut kurang diimbangi produktifitas sapi-sapi Indonesia, sehingga Indonesia mengimpor sapi baik berupa bakdan, bibit sapi perah maupun susu. Kondisi sernacam ini harus segera diatasi, agar kondisi tidak menjadi lebih buruk.
Keyword: 

Judul: Pengaruh Pemberian PMSG Dan HCG Terhadap Superovulasi Pada Kerbau Lumpur
Abstrak: Di Indonesia kebutauhan akan daging, susu, dan hasil ternak lainnya akan terus meningkat dengan adanya perbaikan pendapatan dan pendidikan masyarakat serta lajunya pertambahan penduduk cukup besar. Perkembangan ternka kerbau dapat memberikan sumbangan yang cukup berarti dalam usaha pemenuhan kebutuhan pangan dan gizi rakyat banyak, karena kerbau merupakan salah satu sumber protein hewani yang tidak kalah mutunya dengan daging sapi. Selain itu kerbau juga sangant sesuai dengan pandangan sosial, pola pertanian dan peternakan tradisional yang masih bertahan di desa-desa.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword:
Judul: Analisis ekonomi dan kebijakan pengembangan tambang tembaga dan emas di kawasan hutan lindung (Studi kasus PT. Newmont Nusa Tenggara di Kabupaten Sumbawa Provinsi Nusa Tenggara)
Abstrak: General pupose of this study is to obtain comprehensive point of view about major policy applied by Newmont Nusa Tenggara (NTT) in Miningba specific location in the bounds of protected forest area.
Keyword: 

Judul: Analisis dampak ekonomi dan sosial tambang emas dan tembaga bagi masyarakat komunal dan pembangunan wilayah Propinsi NTB (Studi kasus : Proyek Batu Hijau PT. Newmont Nusa Tenggara di Kabupaten Sumbawa)
Abstrak: Indonesia adalah salah satu negara di dunia yang memiliki kekayaan sumberdaya mineral yang cukup melimpah. Paradigma pemanfaatan dan pengelolaan sumberdaya mineral yang bercorak senttalistik, berpusat pada negara (state base resources management) menempatkan pemerintah pada posisi yang sangat power full untuk menggunakannya dengan dalih mengejar target pertumbuhan ekonomi (economic growth development), demi peningkatan pendapatan dan devisa negara (state revenue). Konsekuensi paradigma semacam itu, dalam tiga dekade terakhir ini, pertama, daerahdaerah yang kaya sumberdaya mineral justru menjadi daerah pengurasan (massive backwash effect) oleh pemerintah pusat, sehingga kekayaan sumberdaya mineral justru telah memiskinkan sebuah wilayah. Kedua, hampir semua lokasi industri pertambangan di dunia merupakan tempat tinggal masyarakat adat,kornunal/lokal, tidak terkecuali masyarakat lokal Sumbawa.
Keyword: 

Judul: Infeksi Virus Parainfluenza Pada Anjing
Abstrak: Virus parainfluenza anjing termasuk famili Paramyxoviridae, berbentuk pleomorf dengan ukuran bervariasi (bergaris tengah antara 100-500 nm), berpembungkus peka ether, berisi genom RNA dan secara serologis mempunyai kesamaan dengan virus SV-5 kera; dikenak sebagai salah satu kausa penting dari sindrom "kennel cough". Infeksinya dapat mengenai anjing semua umur yang belum pernah terinfeksi atau mendapatkan vaksinasi mengakibatkan gejala klinis ringan yang terbatas pada traktus respirasi atu infeksi yang secara klinis tidak memperlihatkan gejala nyata. Gejala klinis yang nampak setelah masa inkubasi (1-5 hari) terlewati berupa batuk yang tidak berat selama beberapa hari, berbagai tingkat tonsilitis dan pharyngitis dan kadang-kadang ditemukan kenaikan temperatur rektal antara 1-2 derajat C dari temperatur normal rat-rata. Anjing terinfeksi mengandung virus pada traktus respirasi bagian atas dan bawah serta limfonoduli sampai hari ke 9 setelah infeksi. Penyebaran virus antar anjing terjadi secara aerogen.
Keyword:
Judul: Kajian Proses Pembuatan dan Penyimpanan  Kering (Dehydrated Green Pepper ) Disertai Nilai Karakteristik Mutunya
Abstrak: Dalam rangka untuk meningkatkan nilai tambah komoditas lada maka perlu dilakukan diversifikasi produk lada. Lada hijau kering (dehydrate green pepper) merupakan salah satu bentuk diversifikasi produk lada tersebut.
Keyword: 

Judul: Kajian Perubahan Karakteristik Mutu Lada Hijau Kering (Dehydrated Green Pepper) dengan Variasi Penambahan Asam Sorbat dan Cara Pengeringan
Abstrak: Lada (Piper nigrum) merupakan rempah-rempah yang produknya digunakan secara luas pada industri pangan, farmasi, kosmetika atau sebagai bumbu masakan pada rumah tangga. Saat ini Indonesia merupakan negara pengekspor lada terbesar di dunia. Persaingan di pasar dunia mengharuskan dipertimbangkannya diversifikasi produk. Salah satu alternatifnya adalah lada hijau kering.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword:
Judul: Kualitas Fisik Kulit Jadi dari Kulit Biawak Awet Garam (Varanus salvator) yang Disamak dengan Bahan Penyamak Berbeda pada  Konsentrasi yang Berbeda.
Abstrak: Penyamakan yang ada sekarang kebanyakan menggunakan bahan baku dari kulit ternak konvensional(kambing, sapi, kerbau, domba) dan jarang sekali menggunakan kulit ternak non konvensional (reptil, belut, katak, dan sebagainya). Mengingat hal tersebut di atas maka perlu dicari peluang baru untuk menambah diversifikasi produk barang kulit. Biawak merupakan salah satu anggota kelas reptil yang banyak tersebar di daerah tropik dan sub tropik di Afiika dan Asia, kepulauan Indo-Australia dan Australia. Daging biawak saat ini sudah banyak dijual direstoran- restoran bahkan di daerah Sumatra dijadikan makanan istimewa. Kulitnya yang merupakan hasil ikutan mempunyai nilai ekonomis yang tinggi yang dapat dijadikan sebagai kulit samak.
Keyword: 

Judul: Kualitas Kimia dan Organoleptik Kulit Jadi dari Kulit Biawak (Varanus salvator) Awet Kering yang Disamak dengan Konsentrasi Valonea, Sodatan dan Krom yang Berbeda
Abstrak: Biawak merupakau salah satu aliggota kelas reptil yaug dapat rne~igliasillca~i kulit samak yaug mempuuyai kualitas tiuggi. Bahau peuyamak yaug ulnum diguuakan antara laiu uabati (valouea), siutetis (sodatan), dau miueral (krom). Kouseutrasi optimal ketiga bahan penyamak tersebut pada kulit biawak awet keriug belum diketahui, uutuk tujuau tersebut penelitiau iui dilakukau.
Keyword: 

Judul: Courses Scheduling Problem at Junior High School with Integer Linear Programming.
Abstrak: The course scheduling at junior high school is an important task. The purpose of course scheduling is to allocate courses according to their classification and to satisfy teachers preferences on teaching and other constraints. In this paper, the preferences and constraints are accommodated by means of coefficients as weights attached into courses as well as teachers. The problem is formulated as a minimization problem. The preferences and constraints with smaller weights framework indicate more preffered time periods, and vice versa. The scheduling problem in this paper is modeled in term of integer linear programming (ILP) and Lingo 8.0 is used to solve the problem. The result of the research is a fully defined schedule for “Masa Depan” junior high school.
Keyword:
Judul: Model Sistem Perencanaan Produksi Industri Minyak Sawit di PT Perkebunan VII Bah Jambi
Abstrak: Tujuan dari penelitian ini adalah merencanakan pemanfaatan hasil perkebunan kelapa sawit secara optimal dengan pengelolaan pemanenan dan pengangkutan yang e f e k t i f , mengendalikan proses pengolahan kelapa sawlt untuk menghasilkan minyak sawit yang sesuai dengan kuantitas dan kualitas yang diinginkan dan melakukan peramalan permintaan minyak sawit yang dapat dipenuhi oleh produksi pabrik. Metode yang dipakai adalah metode pendekatan sistem dengan menggunakan teknik penundaan drskrit , teknik peramalan "Exponentially Weighted Moving Averaget1 (EM,) teknik regresi sederhana, berganda dan "step wise" beserta dengan uji-u j i multikolinearitas, autokorelasi, kegunaan model, kelayakan model dan u j i t. Wodel sistem perencanaan produksi xndustri w i t di PT Perkebunan VII Bah Jambi terbagi atas enam model, yaitu t i g a buah model yang dibentuk berdasarkan p ses yang t e r j a d i dalam sistem dan t i g a buah model lainnya yang merupakan penerapan dari model regresi sederhana dan berganda yang disesuaikan dengan kondisi dalam sistem.
Keyword: 

Judul: Optimasi Produksi Hasil Olahan Kelapa Sawit Di Pabrik Pengolahan Kelapa Sawit Bah Jambi PT. Perkebunan Nusantara IV
Abstrak: Prospek pasar minyak sawit dunia yang cukup cerah dan peningkatan kebutuhan bahan baku bagi industri hilir di dalam negeri merupakan peluang bagi produsen minyak sawit untuk meningkatkan produksi. Di sisi lain, peningkatan luas areal dan pengusahaan perkebunan kelapa sawit menciptakan iklim persaingan yang ketat antar perusahaan. Oleh karena itu, perusahaan perkebunan kelapa sawit dituntut untuk memanfaatkan sumberdaya yang dimiliki dengan baik agar tujuan untuk memperoleh keuntungan yang tinggi dapat tercapai.
Keyword: 

Judul: Trichomonas Gallinae Penyebab Trichomonosis Pada Unggas
Abstrak: Trichomonas gallinae adalah protozoa yang bergerak aktof dengan keempat flagella yang mempunyai layar dan pada salah satu sisinya terdapat membran seperti sirip ikan yang berombak. Spesies dari genus Trichomonas ini mempunyai arti penting pada unggas, karena dapat menyebabkan infeksi pada alat pencernaan bagian atas.
Keyword:
Judul: IPB (Bogor Agricultural University)
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan bentuk hubungan antara volume dan luas bidang dasar tegakan dengan peubah-peubah keadaan tempat tumbuh (terdiri atas beberapa sifat fisik tanah, ketinggian tempat dari mula laut, kemiringan lapangan, arah menghadap lereng, rata-rata tinggi curah hujan tahunan dan nilai Q) dan peubah-peubah pengarangannya ( terdiri atas umur diadakan penjarangan, derajat pengarangan dan tenggang waktu antara dua penjarangan yang berturutan).
Keyword: 

Judul: IPB (Bogor Agricultural University)
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari kondisi lingkungan tambak dan penerapan teknologi budidaya tambak di Kabupaten Pangkep, serta faktor-faktor yang menentukan daya hasil tambak, Penelitian ini juga mencoba melihat pengaruh pola penggunaan lahan di daerah hulu tambak terhadap kualitas air irigasi tambak, serta dampak potensial dari pengelolaan tambak terhadap perairan estuaria. Penelitian ini dilaksanakan dari bulan Desember 1982 sampai September 1983.
Keyword: 

Judul: Mitochondrial DNA Gene Organization and Phylogenetic Relationship of Naja siamensis
Abstrak: Naja siamensis is one of Asiatic cobra in the Family of Elapidae, known as a cryptic snake. It has many morphological variations that lead to misidentification. Misidentification can cause the wrong concept in developing antivenom types due to high snakebite cases occur in Thailand. Thus, an accurate species identification using a molecular approach is crucially required. Mitochondrial DNA has been used widely in snake molecular studies. These studies were aimed to determine the arrangement of the N. siamensis partial mitochondrial genes using reptile-oriented primers and to reveal the phylogenetic relationship among other species of Asian cobra. DNA extraction was carried out based on the standard DNA salting-out protocol and was conducted by bioinformatics analysis using BLASTn and MEGA 6 software. Gene annotation was performed against N. kaouthia complete genome. A total of 3121 bp of N. siamensis mtDNA genes were sequenced consisting of partial of six regions: 16S rRNA, ND1, tRNA-Ile, CRII region, tRNA-Leu, tRNA-Gln, and COI genes. The mtDNA gene organization of N. siamensis was predicted to has a similar pattern with the common Elapidae mtDNA gene organization. This study showed that there is a monophyletic form in Naja genus and N. kaouthia is the closest species with N. siamensis based on partial 16S rRNA and ND1 gene.
Keyword: 16S rRNA, Elapidae, ND1, phylogenetic relationship