Judul: Kinetika Inhibisi Dan Analisis In Silico Molekuler Kurkumin Kunyit (Curcuma Longa) Terhadap Histon Asetiltransferase
Abstrak: Kurkumin kunyit (C. longa) sudah diketahui mampu menghambat Histon Asetiltransferase (HAT) p300/CBP associated factor (PCAF) sebagai biomarker kanker. Namun, kinetika inhibisi dan mekanisme molekuler inhibisi PCAF HAT belum diketahui. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kinetika inhibisi dan menganalisis secara molekuler PCAF HAT melalui in silico. Pada kinetika, kurva standar diukur dari larutan yang mengandung KoA 0- 800 pmol dengan total reaksi 100 μL, yang direaksikan dengan 7-Diethylamino-3- (4’-Maleimidylphenyl)-4-Methylcoumarin) (CPM). Uji kinetika menggunakan bufer HEPES, pH 7.5, BSA, dan konsentrasi substrat (H3) secara tepat (20±10 μL), dan masing-masing enzim (PCAF) ditambahkan ke dalam reaksi dengan total reaksi 100 μL, termasuk 10 μL isopropanol dan 5 μL CPM dalam reaksi. Mikroplate diukur dengan OPTIMA MARS flourescence microplate reader dengan pengaturan gain 65 pada gelombang emisi dan eksitasi 482 dan 392 nm. Data dimasukkan dalam plot Dixon. Pada docking molekuler, Kurkumin digambar secara manual menggunakan marvin sketch 6.0. Struktur kristal PCAF HAT diunduh dari Protein Data Bank (kode 1CM0). Simulasi molekuler docking menggunakan aplikasi AutoDock Vina 1.5.6. Visualisasi hasil simulasi menggunakan Ligplot+ 1.5.4. Pembanding data menggunakan uniprot. Hasil penelitian menunjukkan kurkumin dapat menghambat PCAF HAT dengan tipe inhibisi uncompetitive. Hal tersebut didukung dengan analisa molekuler docking in silico yang menunjukkan bahwa kurkumin mengikat residu asam amino yang diprediksi mampu mengubah konformasi enzim-substrat pada proses katalitiknya. Hasil penelitian ini dapat disimpulkan bahwa kurkumin dapat menjadi inhibitor yang spesifik terhadap PCAF HAT.
Keyword: docking, HAT, kinetika, kurkumin

Judul: Simulasi Docking Senyawa Kurkumin dan Analognya sebagai Inhibitor Enzim 12-Lipoksigenase
Abstrak: Kurkumin adalah metabolit sekunder yang dihasilkan dari tanaman kunyi (Curcuma longa) dan temulawak (Curcuma xanthorrhiza) dan temulawak yang dapat dimanfaatkan sebagai terapi inflamasi. Kurkumin dapat menghambat kerja enzim lipoksigenase yang merupakan enzim pendegradasi asam arakidonat yang bertanggung jawab pada efek inflamasi Interaksi kurkumin dengan enzim 12-lipoksigenase dapat dipelajari melalui simulasi docking. Simulasi docking digunakan dalam mendesain obat secara komputasi. Dalam penelitian ini kurkumin dan analognya diinteraksikan dengan enzim lipoksigenase untuk mendapatkan interaksi yang optimum dengan parameter yang diamati adalah energi bebas Gibbs (ΔG) serta ikatan kimia yang terbentuk. Dalam penelitian ini menggunakan metode simulasi docking dengan aplikasi AutoDockVina. Ligan yang digunakan adalah kurkumin enol, kurkumin keto, bisdemetoksikurkumin, demetoksikurkumin, analog 1, dan analog 2 sedangkan reseptornya adalah enzim 12-lipoksigenase. Aplikasi lain yang digunakan adalah PyMol, LigPlot, dan VMD untuk persiapan ligan dan reseptor sertaToxTree untuk prediksi toksisitas berdasarkan QSAR. Hasil yang diperoleh adalah analog 2 memiliki kestabilan yang paling baik dengan nilai ΔG sebesar -8,8 kkal/mol. Analog 2 diprediksi bersifat toksik dan berpotensi sebagai senyawa karsinogenik. Analog 1 merupakan alternatif senyawa sintetik yang potensial sebagai inhibitor enzim 12-lipksigenase berdasarkan nilai energi bebas Gibbs (ΔG) -8,6 kkal/mol, sifat solubilitas, geometri struktur, dan prediksi toksisitas. Gugus fungsi yang berperan dalam interaksi ligan-reseptor secara umum adalah gugus fungsi OH pada struktur aromatik, dan gugus fungsi CO pada struktur rantai tengah.Berdasarkan analisis interaksi kurkumin dan analognya dapat diketahui bahwa kunyit dan temulawak dapat digunakan sebagai terapi herbal untuk mengurangi efek inflamasi.
Keyword: Simulasi docking, Kurkumin, Analog, Enzim 12- Lipoksigenase

Judul: Pengembangan distribusi ILOS multimedia (ILOSmedia)
Abstrak: The development of open source softwares is still going rapidly nowadays, including open source operating systems for desktop computer, netbook, tablet PC, and smartphone. The open source operating systems have considerable contribution to open source software. Linux is an open source operating system that continues to grow since 1991. The characteristics in general Linux are free, can be distributed freely, and free to make changes in it. Linux in its development is divided into several distributions. Each distribution is made as a specific goal so that the operating system can focus on running the desired functions, such as multimedia, networking, education, etc. The objective of of this research is to develop and evaluate the ILOS distribution for multimedia by providing multimedia of open source packages. ILOSmedia uses Ubuntu10.10 and Remastersys as a tool to remaster. ILOSmedia is developed by installing multimedia packages that have been obtained based on the results of questionnaires from 30 respondents from three communities, which are KPLI Bogor, Linux.com forums, and Kaskus.us forums. ILOSmedia also uses the Realtime kernel as kernal Mutimedia. ILOSmedia testing is performed by 11 students of Computer Science who are members of FOKERZ community. The testing process is performed by executing ILOSmedia via live-cd and filled in a questionnaire. The test result shows that ILOSmedia has hardware compatibility on notebook and PC with good performance. As much as 72.727% of respondents believe that the size of the installer ILOSmedia of 1.34 GB and a minimum 10GB hard drive is normal. ILOSmedia has multimedia packages complete with the percentage completeness according to respondents is 45.455% are very complete and 54.545% are complete. Boot speed ILOSmedia have an average of 28.87 seconds and 90.91% of respondents consider that ILOSmedia have a desktop environment that is easy navigation
Keyword: