Judul: Primer Spesifik Ikan Hiu Biru (Prionace glauca) Berbasis Marka Cytochrome B untuk Autentikasi Produk Olahan Ikan Hiu
Abstrak: Primer merupakan aspek krusial yang perlu diperhatikan dalam proses mengidentifikasi spesies pada produk olahan hiu berbasis genetik. Jenis marka mtDNA yang dapat digunakan untuk mengidentifikasi species salah satunya adalah gen cytochrome b. Prionace glauca merupakan spesies ikan hiu yang tersebar luas di perairan Indonesia yang jumlah populasinya terus mengalami penurunan. Mendesain primer cytochrome b spesifik Prionace glauca menjadi tujuan dalam penelitian untuk mengidentifikasi adanya spesies tersebut dalam produk olahan ikan hiu komersil. Primer didesain pada fitur Primer-BLAST pada situs NCBI. Primer diujikan melalui proses amplifikasi pada isolat DNA produk olahan hiu yang meliputi ikan hiu asin (A1), abon ikan hiu (B1 dan B2), ikan hiu asap (C1), ikan hiu empal (E1), dan fillet ikan hiu (F1 dan F2) dengan tingkat kemurnian 0.909-2.106 (A260/280). Pada suhu annealing 55oC teridentifikasi ukuran DNA seluruh sampel yang diujia dalah 500 bp. Sekuens dari sampel yang telah diamplifikasi menunjukkan hasil BLAST spesies yaitu Prionace glauca dengan tingkat kemiripan mencapai 99,66%. Kedekatan genetik pada hasil filogenetik terlihat pada kelompok yang terbentuk dengan spesies target Prionace glauca dengan nilai bootstrap 100%., Primer is an essential aspect of the species identification procedure. One of the DNA sourced at cytochrome B mtDNA is recognized suitable as a marker. Shark species that distribute almost in every Indonesia's sea is Prionace glauca. A pair of specific cytochrome b primers were designed with the Primer-BLAST feature on NCBI. The primer got applied at DNA amplification that run to analyze some products labeled as salted shark meat (A1), shark meat floss (B1 and B2), smoked shark meat (C1), shark empal (E1), and shark meat fillet (F1 and F2), have 0,909-2,106 (A260/280) purity rate. The sizes of all DNA samples were identified at 500 bp at 55oC annealing temperature. Prionace glauca was spotted at BLAST result from the sample's sequence with the percent identity up to 99,66%. The phylogenic tree shows a group containing product and Prionace glauca with 100% bootstrap value.
Keyword: Prionace glauca, Cytochrome b, Ikan hiu, Primer spesifik

Judul: Specific Primary Design for Detection of Shark Species Utilization Prionace glauca and Carcharhinus spp. Using Real-Time PCR Method
Abstrak: Permintaan pasar internasional terhadap hiu yang semakin meningkat, mengakibatkan angka penangkapan beberapa spesies hiu semakin meningkat pula. Spesies Prionace glauca dan Carcharhinus spp. termasuk spesies hiu dilindungi yang masuk dalam daftar IUCN redlist dan Apendix II CITES. Autentikasi menggunakan biomolekuler dengan memanfaatkan DNA perlu dilakukan. Penelitian ini bertujuan membuat primer spesifik secara in silico berbasis gen marka COI dan cyt b pada kelompok hiu yang terancam punah (Prionace glauca dan Carcharhinus spp.) serta aplikasinya secara in vitro untuk autentikasi produk hasil perikanan dengan teknik real-time PCR. Penelitian dilakukan dengan merancang desain primer spesifik spesies target, preparasi sampel, isolasi DNA, amplifikasi DNA, pengujian kualitas dan kuantitas DNA, dan analisis menggunakan real-time PCR. Perancangan primer spesies target Prionace glauca marka gen cyt b dan primer degenerate Carcharhinus spp. marka gen COI berhasil dilakukan secara in silico. Efisien kondisi real-time PCR sampel Prionace glauca dan Carcharhinus spp. telah sesuai dengan standar pengujian menggunakan metode qPCR., International market demand for sharks is increasing, resulting in the number of catches of several shark species also increasing. Prionace glauca and Carcharhinus spp. including protected shark species that are included in the IUCN redlist and CITES Appendix II. Authentication using biomolecular by utilizing DNA is necessary. This study aims to produce in silico specific primers based on COI and cyt b marker genes for endangered sharks (Prionace glauca and Carcharhinus spp.) and to apply them in vitro to authenticate fishery products using real-time PCR techniques. The research was carried out by designing target species-specific primers, sample preparation, DNA isolation, DNA amplification, DNA quality and quantity testing, and analysis using real-time PCR. Primary design of target species Prionace glauca marker cyt b gene and degenerate primer Carcharhinus spp. COI gene markers were successfully carried out in silico. Efficient real-time PCR conditions of Prionace glauca and Carcharhinus spp. complies with testing standards using the qPCR method.
Keyword: CITES, hiu, in silico, IUCN redlist, primer spesifik, shark, specific primer

Judul: Dynamics Model for Rural and Urban Economic Growth
Abstrak: Lewis theory of structural change has focused on mechanisms that allow countries to transform their domestic economic structure to a more modern economy. The proposed model deals with the mechanism of interaction between rural and urban Economic. This model is concerned with the process of labor transfer from rural to urban areas. This study aims to model the dynamics of economic growth in rural and urban areas, including determining the equilibrium solution and to carry out simulation of the model. The simulation results show that the transfer of labor from rural to urban areas will increase the rate of change of capital so that structural changes can be realized. In addition, increased propensity to save in rural areas will also accelerate structural change
Keyword: