Judul: Identifikasi dan Analisis Ekspresi Gen Lisozim pada Ikan Lele Dumbo Clarias gariepinus yang Diinfeksi Aeromonas hydrophila
Abstrak: Lisozim adalah enzim anti-mikroba yang memiliki peran penting dalam sistem imun. Lisozim mengkatalis proses hidrolisis ikatan β-(1,4)-glycosidic yang merupakan bagian dari penyusun dinding sel bakteri. Sistem ini menjadi salah satu bentuk respons awal ikan terhadap serangan bakteri patogen. Secara umum, lisozim ditemukan dalam bentuk tipe-c dan tipe-g pada ikan. Namun, belum ada laporan mengenai sekuens gen dan analisis ekspresi dari lisozim tipe-c (CgLysC) dan tipe-g (CgLysG) pada ikan lele dumbo. Selain informasi sekuens gen, informasi terkait ekspresi gen juga penting untuk diketahui dan dievaluasi. Sebaran ekspresi gen pada berbagai jaringan akan membantu evaluasi fungsi dan distribusi gen pada spesies terkait. Respons imun juga dapat dievaluasi pascainfeksi bakteri dengan melihat pola ekspresi gen pada rentang waktu tertentu. Sebagai tambahan, informasi terkait studi ontogenetik pada perkembangan awal larva akan membantu peneliti untuk mengetahui perkembangan sistem imun ikan pada berbagai stadia ikan. Informasi-informasi tersebut menjadi penting untuk diketahui sebagai usaha manajemen penyakit pada ikan lele. Berdasarkan kepentingan tersebut, penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi sekuens CgLysC dan CgLysG, menganalisis ekspresi kedua gen lisozim tersebut di berbagai jaringan ikan dan pascauji tantang bakteri Aeromonas hydrophila, serta menganalisis profil ontogenetik gen pada berbagai stadia ikan. Identifikasi gen dilakukan dengan metode polymerase chain reaction (PCR) dilanjutkan dengan kloning gen dan sekuensing. Analisis ekspresi gen dilakukan dengan metode realtime-PCR (qPCR) pada berbagai jaringan ikan sehat, serta pascauji tantang bakteri A. hydrophila. Analisis ontogenetik dilakukan dari telur yang belum dibuahi hingga larva 10 hari pascatetas. Hasil penelitian berhasil mengidentifikasi sekuens CgLysC sepanjang 594 pasang basa yang terdiri dari 387 coding region yang mentranslasikan 129 asam amino dan CgLysG sepanjang 608 pasang basa yang terdiri dari 383 coding region dan mentranslasikan 119 asam amino. Struktur asam amino kedua gen memiliki homologi dan kedekatan evolusi yang tinggi dengan spesies ikan yang lain. Ekspresi CgLysC dan CgLysG terdistribusi diseluruh jaringan uji dengan ekspresi tertinggi pada jaringan imun seperti ginjal depan dan limpa. Pascauji tantang, ekspresi kedua gen termodulasi pada seluruh jaringan uji dengan peningkatan tertinggi berada 12 jam pascauji tantang, menunjukkan peranan penting lisozim bagi respons imun anti-bakteri pada ikan lele dumbo. Profil ontogenetik menunjukkan kedua gen bersifat maternal, ditransmisikan dari induk ke anak. Ekspresi mRNA lisozim pada larva meningkat mulai dari hari kelima pascatetas. Diduga gen lisozim ikan lele mulai stabil terekspresi dan siap memberikan perlindungan bagi ikan sebagai innate immunity mulai dari hari kelima hingga kesepuluh pascatetas.
Keyword: A. hydrophila, lele dumbo, lisozim, ontogenetic, respons imun

Judul: Kandidat Marka MHC II pada Ikan Lele (Clarias gariepinus) Tahan Penyakit Motile Aeromonad Septicaemia
Abstrak: Salah satu masalah yang krusial yang dihadapi para pembudidaya ikan lele adalah penyakit motile Aeromonad septicaemia (MAS), yang disebabkan oleh bakteri Aeromonas hydrophila. MAS adalah salah satu penyakit akut yang disebabkan oleh bakteri dan dapat menginfeksi pada semua stadia hidup dan jenis ikan air tawar, dan dapat mengakibatkan kematian massal hingga 100%; sehingga menimbulkan kerugian yang sangat besar bagi para pembudidaya ikan. Salah satu alternatif solusi untuk menghindari penggunaan antibiotik dan bahan kimia lain (formalin, klorin, dan kaporit) adalah dengan seleksi ikan berbasis marka molekuler. Seleksi dilakukan dengan bantuan gen yang berkaitan dengan sistem imun. Salah satu gen kandidat marka adalah major histocompability complex (MHC). Gen MHC mengodekan molekul reseptor yang mengenali dan mengikat diri pada peptida asing yang disajikan ke sel-sel kekebalan tubuh, sehingga memulai respons imun. Tujuan penelitian ini adalah untuk mendapatkan kandidat marka MHC II pada seleksi berbasis marka molekuler untuk menghasilkan ikan lele tahan terhadap penyakit MAS. Ikan lele yang digunakan pada penelitian ini adalah ikan lele varietas Mutiara dari BRPI Sukamandi. Induk terseleksi, yakni positif membawa dan negatif marka MHC II yang diidentifikasi menggunakan metode PCR, selanjutnya dipijahkan secara berpasangan (perbandingan antara jantan dan betina 1:1). Setelah mendapatkan lima populasi dari masing-masing kelompok tersebut, selanjutnya masing-masing 500 ekor larva yang telah berumur dua hari dari setiap pasang dipindahkan dan dipelihara dalam akuarium untuk digunakan sebagai sampel dalam pengujian ketahanan terhadap penyakit. Setelah mencapai ukuran 7-8 cm, benih ikan lele baik dari induk yang positif maupun yang negatif marka MHC II kemudian diuji tantang dengan menginjeksi secara intramuskuler bakteri A. hydrophila 0.1 mL/ekor dari stok bakteri 105 cfu/mL setelah sebelumnya dilakukan uji LD50. Uji tantang dilakukan melalui penyuntikan secara intramuskuler. Wadah dan kepadatan ikan uji yang dipergunakan sama dengan uji LD50. Parameter yang diuji antara lain sintasan, analisis marka MHC II, pengamatan gejala klinis, serta parameter hematologi antara lain total eritrosit, total leukosit, aktivitas fagositik, dan hematokrit. Hasil pengamatan menunjukkan bahwa sintasan pada benih ikan yang positif membawa marka MHC II (77.50±4.00%) lebih tinggi dibandingkan benih ikan yang negatif marka MHC II (53.33±4.77%). Hasil amplifikasi PCR dengan menggunakan primer spesifik untuk MHC II menunjukkan pita DNA spesifik berukuran 426 bp pada benih ikan yang positif membawa marka MHC II, sedangkan pada benih ikan yang negatif marka MHC II tidak terdapat pita DNA. Hasil analisis PCR menunjukkan persentase progeni dari induk yang positif membawa marka MHC II secara keseluruhan sebesar 60%, sedangkan persentase progeni dari induk yang negatif membawa marka MHC II sebesar 0%; hal ini mengindikasikan bahwa marka MHC II dapat diwariskan kepada keturunannya. Nilai dari total eritrosit, total leukosit, aktivitas fagositik, dan hematokrit juga menunjukkan pada benih ikan yang postif membawa marka MHC II lebih tinggi dibandingkan benih ikan yang negatif marka MHC II. Dengan demikian marka MHC II dapat dijadikan sebagai marka molekuler untuk perakitan ikan lele tahan penyakit MAS. Ikan lele yang membawa marka MHC II memiliki produk PCR dengan ukuran 426 bp. Marka MHC II dan daya tahan ikan lele terhadap penyakit MAS diwariskan kepada keturunannya. Oleh karena itu, seleksi ikan lele tahan MAS dapat dilakukan dengan berbasis marka MHC II.
Keyword: lele, Aeromonas hydrophila, MAS, marka molekuler, MHC II

Judul: Struktur Kristal Film BaxSr1-xTiO3 dengan Variasi Fraksi Mol (x = 0,5 ; 0,6 ; 0,7 ; 0,8)
Abstrak: BaxSr1-xTiO (BST) film has been successfully made by growing BST on substrate surface Si (100) p-type with chemical solution deposition methode and spin coating technique at 3000 rpmrotational speed for 30 seconds. BST film made with mole fraction variation (x = 0,5 ; 0,6 ; 0,7 ; 0,8) and annealing process at a temperature of 850 °C for 22 hours. Characterization of BST samples obtained using X-ray diffractometer. The results of X-ray diffractometer characterization showed that the best crystal structure resulting in x = 0,5 mole fraction with the highest diffraction intensity and 25,55 nm crystal size, while the lowest diffraction intensity is owned by BST films with x = 0,8 mole fraction and the crystal size of 41,86 nm.
Keyword: Bogor Agricultural University (IPB), XRD., chemical solution depositon, BST, Annealing