Judul: Eksplorasi dan Potensi Cendawan Dark Septate Endophyte Sebagai Agens Biokontrol Fusarium oxysporum Penyebab Penyakit Layu Tanaman Tomat.
Abstrak: Penelitian mengenai dark septate endophyte (DSE) di Indonesia masih terbatas, baik terkait dengan keanekaragaman, fungsi maupun perannya secara ekologi dalam mendukung produksi tanaman. DSE salah satu kelompok cendawan endofit yang mampu mengolonisasi akar tanpa menyebabkan gejala penyakit. Karakteristik DSE ditandai dengan adanya pigmentasi gelap pada media agar, memiliki hifa gelap bersepta, memiliki konidia atau hifa steril, dan membentuk mikrosklerotia di dalam jaringan akar. Potensi DSE diketahui mampu meningkatkan performa tanaman, menekan penyakit dan cekaman abiotik seperti gersang, dan asam. Layu fusarium pada tanaman tomat merupakan salah satu penyakit penting yang memengaruhi produksi tomat. Patogen layu fusarium tomat yaitu Fusarium oxysporum f.sp lycopersicii (Fol) mampu bertahan di tanah dalam waktu puluhan tahun. Penelitian ini bertujuan untuk mengeksplorasi dan mengevaluasi potensi cendawan DSE asal tanaman tomat sebagai agens pengendali patogen Fol. Penelitian dilakukan dari bulan Desember 2017 sampai November 2018. Penelitian dilaksanakan di Laboratorium Nematologi, Mikologi Tumbuhan Departemen Proteksi Tanaman IPB dan Balai Penelitian Tanah BBSDLP Cimanggu Bogor. Pengambilan sampel diperoleh dari Goalpara-Sukabumi, Pacet-Cianjur, Cisurupan-Garut, Citapen-Bogor, dan Cisarua-Bogor. Tahapan Penelitian terdiri atas beberapa tahap yaitu (1) eksplorasi dan seleksi DSE; (2) evaluasi potensi DSE terhadap Fol; (3) deteksi senyawa metabolit DSE terpilih; (4) aplikasi DSE di rumah paranet untuk melihat pengaruh DSE dalam menekan perkembangan penyakit layu fusarium, pemacu pertumbuhan tomat dan respons fisiologi tomat. Hasil penelitian menunjukkan bahwa DSE yang berhasil diisolasi dari perakaran tomat sebanyak 49 isolat. Isolat DSE yang berpotensi menghambat Fol dengan daya hambat tertinggi sebesar 76.11% dan 71.07% yaitu isolat DS08-Ic dan DS08-Ib. Potensi kedua isolat tersebut mampu mendegradasi senyawa karbon, nitrogen, fosfor, siderofor (mengkelat besi) dan aktivitas katalase. Terdapat senyawa metabolit berupa hexadecanoic acid dan linolenic acid yang bersifat antimikrobial. Pengaruh isolat DS08-Ic dan DS08-Ib dalam aplikasi rumah paranet mampu menekan perkembangan penyakit layu fusarium dan pemacu pertumbuhan tomat berupa panjang tajuk. Respons fisiologis juga ditunjukkan berupa adanya aktivitas peroksidase yang dihasilkan. Hal tersebut menunjukkan bahwa kolonisasi DSE dan patogen memberikan respons tanaman sebagai bentuk ketahanan. Manfaat penelitian yaitu diperoleh informasi baru bahwa DSE dapat diisolasi dari perakaran tomat asal Indonesia. DSE yang diperoleh memiliki potensi yang dapat dikembangan sebagai agens biokontrol dan pemacu pertumbuhan.
Keyword: Daya hambat, DSE, Fusarium, peroksidase, siderofor

Judul: Exploration of Dark Septate Endophyte (DSE) Fungi from Oil Palm Roots as Biocontrol Agents of Ganoderma boninense
Abstrak: Ganoderma boninense adalah salah satu patogen utama yang menghambat produktivitas kelapa sawit di Indonesia. Keparahan infeksi cendawan G. boninense pada tanaman kelapa sawit di Indonesia yang telah dilaporkan paling besar mencapai 60% dengan luas area yang diserang lebih dari 50%. Infeksi G. boninense di Indonesia paling banyak dilaporkan terjadi di pulau Sumatera dan Jawa. Dampak infeksi cendawan G. boninense menyebabkan lahan kelapa sawit mengalami penurunan produktivitas hingga 85%. Berbagai upaya untuk mengendalikan infeksi G. boninense telah banyak dilakukan namun hingga saat ini belum ada teknik pengendalian yang efektif untuk mengendalikan G. boninense. Oleh karena itu pada penelitian ini dilakukan eksplorasi untuk mencari agens biokontrol potensial baru yang dapat menekan G. boninense. Salah satu kelompok cendawan yang belum banyak dilaporkan untuk mengendalikan G .boninense adalah dark septate endophyte (DSE). Cendawan DSE merupakan salah satu agens hayati yang berpotensi untuk digunakan dalam menekan penyebaran penyakit busuk pangkal batang. Penggunaan DSE telah terbukti menekan perkembangan patogen tular tanah lainnya, seperti Fussarium oxysporum, Rigidoporus microporus, G. boninense (in vitro). Salah satu mekanisme DSE sebagai agens pengendali hayati adalah menghasilkan metabolit sekunder yang bersifat toksik terhadap patogen. Penelitian ini bertujuan memperoleh isolat DSE dari perakaran kelapa sawit yang berpotensi sebagai agens pengendali hayati G. boninense dan menganalisis mekanisme kerja cendawan DSE dalam menghambat G. boninense. Penelitian ini terdiri dari empat kegiatan utama, yaitu: (1) pengamatan asosiasi antara cendawan DSE dan tanaman kelapa sawit dari sampel akar kelapa sawit dilapangan, (2) Isolasi dan karakterisasi DSE, (3) seleksi isolat cendawan DSE Potensial, (4) analisis senyawa metabolit sekunder yang dihasilkan oleh cendawan DSE. Pengamatan asosiasi pada sampel akar kelapa sawit dari lapangan dilakukan untuk melihat hubungan simbiosis cendawan DSE dan tanaman kelapa sawit di alam. Proses isolasi cendawan DSE dilakukan dari sampel akar kelapa sawit. Proses seleksi cendawan DSE dimulai dengan pengujian keamanan hayati yang meliputi uji fitopatogenisitas dan uji hemolisis darah. Selanjutnya isolat non patogen diuji lebih lanjut terkait kemampuannya dalam menghambat perkembangan G. boninense dan kemampuannya sebagai pemacu pertumbuhan. Hasil penelitian menunjukkan bahwa hubungan simbiosis antara tanaman kelapa sawit dan cendawan DSE terjalin secara alami, yang dibuktikan dengan adanya kolonisasi hifa dan struktur mikroskopis di dalam akar kelapa sawit yang diamati. Kolonisasi cendawan DSE banyak ditemukan pada tanaman yang terinfeksi G. boninense. Persentase kolonisasi cendawan DSE pada akar kelapa sawit berkisar 5-60%. Kolonisasi cendawan DSE dapat dipengaruhi oleh beberapa faktor, seperti teknik budidaya, suhu, dan curah hujan. Dari proses isolasi diperoleh 12 isolat cendawan DSE dari akar kelapa sawit. Cendawan DSE yang diperoleh pada penelitian ini sebagian besar diperoleh dari akar tanaman yang sehat dengan persentase isolasi total sebesar 1,71%. Berdasarkan hasil kolonisasi dan isolasi membuktikan bahwa cendawan DSE mampu membentuk simbiosis dengan akar kelapa sawit. Isolat cendawan DSE yang telah diperoleh diuji keamanannya dengan uji fitopatogenisitas dan helolisis. Berdasarkan hasil uji keamanan hayati, diperoleh empat isolat yang tidak patogen, yaitu S51, S14, GS2, dan GS3. Keempat isolat cendawan tersebut juga memiliki kemampuan untuk meningkatkan berat kering tanaman, panjang tajuk, dan panjang akar Brassica rapa sebesar 38-125%, 35-163%, dan 23-140%. Selain meningkatkan pertumbuhan tanaman keempat cendawan DSE memiliki aktivitas antibiosis dan aktivitas kitinolitik. Aktivitas antibiosis cendawan DSE ditunjukkan
Keyword: Antifungal agent, Cladophialophora nyingchiensis, Exophiala pisciphila, secondary metabolites

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: