Judul: Molecular Characteristics of pmoB Gene Subunit  Methane Monooxigenase Enzyme from Three Types of Methanotrophic Bacteria
Abstrak: Karakterisasi secara molekuler bertujuan untuk menjabarkan perbedaan karakteristik molekuler subunit pmoB dari tiga tipe bakteri metanotrof. Enzim ini merupakan karakter khusus pada bakteri metanotrof yang berfungsi dalam mereduki gas metana sehingga peran dan kontribusinya aktif dalam penurunan dampak pemanasan global. Karakterisasi ini dapat dijadikan acuan untuk melakukan penelitian laboratorium lanjutan mengenai bakteri Metanotrof. Karakterisasi yang digunakan yaitu analisis ukuran gen dengan Blast-N, analisis genom dengan GGDC, analisis FCGR dan GC content Plotgen gen pmoB konstruksi pohon filogenetik serta analisis sekuen nukleotidan dan sekuen asam amino bakteri metanotrof. Metanotrof terdiri atas tipe I, II, dan X. Karakterisasi dari 3 tipe ini terlihat pada perbedaan ukuran gen, yaitu rentang 1,1-1,2 kb. Perbedaan terkecil kandungan GC dalam DDH terlihat pada tipe II dengan persantesi rata-rata 1,3%. Tipe II memiliki kandungan persen content GC tertinggi, yaitu 62,33%. Kekerabatan terdekat yaitu tipe X dan tipe I dengan acuan bakteri Methylocystis capsulatus, dengan nilai 96%., Molecular characterization aims to describe the differences in the molecular characteristics of the pmoB subunit of the pMMO enzyme. This enzyme is a special character in methanotrophic bacteria which functions in reducing methane gas so that its role and contribution is active in reducing the impact of global warming. This characterization can be used as a reference for conducting further laboratory research on MMO bacteria. The characterizations used were analyzing gene size with Blast-N, genome analysis with GGDC, analysis of FCGR and GC content of Plotgen pmoB phylogenetic analysis, sequence analysis and physicochemical analysis of amino acids pmoB. The MMO type consists of types 1, 2, and X. The characterization of these 3 types is seen in gene size 1,1 to 1,2 kb. The smallest difference in GC content in DDH is seen in type 2 with an average percentage of 1,3%. Type 2 has the highest percentage of GC content, which is 62,33%. The closest relative is in type X with the reference of Methylocystis capsulatus bacteria, with a value of 96%.
Keyword: Frequency of chaos game representation, genome to genome distance  calculator, metan monooksigenase, pmoB

Judul: Analisis gen soluble metan monooksigenase (sMMO) bakteri metanotrof asal sawah dengan primer 534f dan 1393r
Abstrak: Bakteri metanotrof merupakan bakteri Gram negatif, bersifat aerob, dan menggunakan metan sebagai sumber karbon untuk menghasilkan energinya. Karakteristik penting dari metanotrof ini ialah memiliki enzim metan monooksigenase (MMO) yang dapat mengkatalisis metan menjadi metanol. Enzim MMO terbagi ke dalam dua tipe, yaitu particulate MMO (pMMO) dan soluble MMO (sMMO). Semua bakteri metanotrof mampu mengekspresikan enzim pMMO, namun sMMO hanya dimiliki beberapa bakteri metanotrof saja. Isolat-isolat bakteri metanotrof (BGM 1, BGM 5, BGM 9,dan SKM 14) yang berasal dari sawah Bogor dan Sukabumi, hanya isolat BGM 9 yang menunjukkan adanya aktivitas enzim sMMO dengan metode Cholorimetric Plate Assay. Fragmen amplikon dari BGM 9 diamplifikasi dan disekuensing. Sekuen yang diperoleh dianalisis dengan menggunakan perangkat bioinformatik seperti BLAST-N dan BLAST-X. Analisis sekuen amplikon menggunakan program BLAST-N dan BLAST-X berturut-turut menunjukkan kemiripan dengan sekuen pada genom Azorhizobium caulinodans ORS 571 (92%) dan gen protein S3 pada ribosom 30S Xanthobacter autotrophicus Py2 (90%). Ketidaksesuaian hasil analisis tersebut dengan gen target diduga disebabkan oleh primer yang kurang spesifik dan keterbatasan informasi database di genetik tentang mikroba dari daerah tropis.
Keyword: Bakteri metanotrof, Enzim metan monooksigenase(MMO), Soluble metan monooksigenase

Judul: Perencanan Lanskap Sunda Kalapa, Jakarta Utara Sebagai Kawasan W isata Sejarah
Abstrak: Perkembangan kota Jakarta dari waktu ke waktu sangatlah cepat, sehingga menyebabkan kota-kota tua banyak yang tergusur untuk dijadikan daerah baru yang lebih modern. Apabila hal tersebut tidak ditanggulangi secara dini maka keberadaan Kota Lama Jakarta akan hilang. Hal inilah yang melatar belakang untuk dilakukan tindakan perlindungan dan revitalisasi kawasan bersejarah Sunda Kalapa.
Keyword: