Judul: Analisis Ekspresi Gen ADP-Glukosa Pirofosforilase pada Tanaman Sagu (Metroxylon sagu Rottb.) Rendemen Pati Tinggi dan Rendah.
Abstrak: Tanaman sagu merupakan tanaman penghasil pati yang cukup banyak tersedia di Indonesia. Tanaman ini dapat dijadikan sumber pati yang potensial untuk memenuhi kebutuhan dunia akan pati yang terus meningkat dalam beberapa dasawarsa terakhir, namun penelitian mengenai pemuliaan tanaman sagu masih belum banyak dikaji. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi perbedaan ekspresi gen penyandi ADP-Glukosa Pirofosforilase pada tanaman sagu rendemen pati tinggi dan tanaman sagu rendemen pati rendah. Metode yang digunakan meliputi isolasi RNA, tahapan DNase, Reverse Transciptase PCR, dan analisis sekuen DNA.Hasil isolasi RNA yang diperoleh cukup baik, yaitu berkisar antara 619.9-1353.0 ng/μL. Ekspresi gen ADP-glukosa pirofosforilase diamati pada elektroforegram hasil amplifikasi DNA dengan menggunakan dua pasang primer, yaitu AGP S-2 dan AGP L-19. Pita DNA yang dihasilkan oleh daun tua maupun daun muda rendemen pati tinggi memiliki intensitas yang lebih tinggi dibandingkan dengan daun tua ataupun daun muda rendemen pati rendah. Dengan kata lain, ekspresi gen ADP-glukosa pirofosforilase berkorelasi atau berbanding lurus dengan rendemen pati sagu. Hasil analisis sekuen diperoleh bahwa gen yang diamplifikasi memiliki kemiripan sebesar 99 % dengan ADP-glukosa pirofosforilase subunit besar dari tanaman sagu.
Keyword: ADP-Glucose Pyrophosphorylase, gene expression, starch yield, sago

Judul: Kloning Gen Penyandi Adp-Glukosa Pirofosforilase Dari Tanaman Sagu (Metroxylon Sagu Rottb.)
Abstrak: Tanaman sagu merupakan tanaman penghasil pati yang sangat potensial karena merupakan tanaman penghasil karbohidrat tertinggi. ADP-glukosa pirofosforilase adalah salah satu enzim yang berperan penting dalam biosintesis pati, sehingga aktivitas enzim ini mempengaruhi rendemen pati yang dihasilkan. Penelitian bertujuan mengisolasi dan mengklon gen AGP dari jaringan tanaman sagu ke dalam E. coli XL1-blue dengan vektor pGEM-T Easy. Fragmen gen target diamplifikasi dari cDNA yang berasal dari mRNA jaringan tanaman sagu dengan teknik Reverse Transcription-PCR menggunakan primer AGP-MS2. Gen AGP target diligasi pada plasmid pGEM-T Easy dengan bantuan enzim T4 ligase. Plasmid rekombinan ditransformasi dengan metode kejutan panas pada sel E. coli XL1-blue dan diseleksi menggunakan medium LB agar yang mengandung ampisilin. Hasil penelitian menunjukkan bahwa amplifikasi gen AGP dengan primer AGP-MS2 menghasilkan amplikon berukuran ±1700 pb, dan gen AGP hasil amplifikasi telah berhasil diklon ke dalam plasmid pGEM-T Easy .
Keyword: Metroxylon sago, gen AGP, isolasi gen, kloning, E. coli XL1-blue, vektor pGEM- T Easy

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: