Judul: Identifikasi Marka Gen Ketahanan Hawar Daun Bakteri pada Galur Padi Introduksi dan Galur Dihaploid
Abstrak: Penyakit Hawar Daun Bakteri (HDB) merupakan penyakit yang disebabkan oleh bakteri patogen Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo). Penyakit ini merupakan salah satu penyakit padi yang paling merusak. Salah satu hal yang paling penting dilakukan adalah menciptakan galur padi baru. Pembentukan galur padi ini dapat dilakukan dengan cara melakukan persilangan varietas padi yang dianggap memiliki sifat ketahanan penyakit HDB. Galur-galur padi yang digunakan terdiri dari 37 galur haploid ganda turunan dari persilangan ganda antara padi Parekaligolara/IR54 dengan padi Bio110/Markuti dan beberapa padi introduksi dari IRRI. Varietas padi diferensial (IRBB) juga di sertakan sebagai varietas pembanding berjumlah 22 varietas dan 1 tanaman peka (TN1) sebagai kontrol. Tiga isolat HDB yang digunakan yaitu ras III, ras IV dan ras VIII yang sering dijumpai di lapang. Primer hasil seleksi yang menghasilkan marka yang bersifat polimorfisme digunakan untuk uji genotipe sifat ketahanan padi terhadap penyakit HDB berjumlah 19 primer. Hasil penelitian menunjukkan ada 4 tanaman yang bersifat tahan terhadap ketiga ras yang diujikan. Hasil analisis asosiasi fenotipe dan genotipe menunjukkan bahwa sifat ketahanan padi terhadap bakteri Xoo ras III berasosiasi dengan 3 marka (Xa7-OP40, Xa1-OP14 dan Xa4-OP50); sifat ketahanan padi terhadap bakteri Xoo ras IV berasosiasi dengan 3 marka (Xa1-OP5, Xa4-OP50 dan Xa26-OP1); sedangkan sifat ketahanan padi terhadap bakteri Xoo ras VIII berasosiasi dengan 3 marka (Xa21-OP6, Xa7-RM20590 dan Xa7-OP40).
Keyword: Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo), marka molekular, galur padi tahan

Judul: MULTILOCATION YIELD TRIAL OF DOUBLED HAPLOID RICE LINES AND THEIR RESISTANCE TO BACTERIAL LEAF BLIGHT (Xanthomonas oryzae pv. oryzae)
Abstrak: Padi (Oryza sativa L.) merupakan komoditas pangan penting di Indonesia. Salah satu upaya meningkatkan produksi padi yaitu perakitan varietas unggul padi. Pada penelitian sebelumnya diperoleh 12 galur dihaploid padi hasil kultur antera dengan potensi hasil tinggi setelah di evaluasi pada uji daya hasil pendahuluan (UDHP) dan uji daya hasil lanjutan (UDHL). Selanjutnya uji multilokasi (UML) dan ketahanan terhadap Organisme Pengganggu Tanaman (OPT) utama perlu dilakukan pada galur-galur tersebut sebagai salah satu syarat pelepasan varietas. Penyakit hawar daun bakteri (HDB) disebabkan oleh bakteri Xanthomonas oryzae pv. oryzae merupakan salah satu penyakit utama pada tanaman padi. Penelitian ini bertujuan 1) mendapatkan informasi keragaan agronomi baik, daya hasil, dan stabilitas galur-galur dihaploid padi pada uji multilokasi, 2) mendapatkan galur-galur dihaploid padi dengan ketahanan terhadap penyakit HDB, dan 3) mendapatkan galur-galur dihaploid padi dengan karakter agronomi yang baik, berdaya hasil tinggi, stabil dari pengujian di enam lokasi serta tahan terhadap penyakit HDB. Uji multiloasi dilaksanakan di enam lingkungan meliputi Bogor I, Bogor II, Karawang, Indramayu, Malang dan Blitar, sedangkan evaluasi HDB dilakukan di Rumah Kaca Balai Besar Penelitian dan Pengembangan dan Sumberdaya Genetik Pertanian (BB Biogen). Varietas komersial pembanding yang digunakan dalam UML adalah Inpari 18 dan Inpari 34, sedangkan untuk evaluasi HDB ditambahkan pembanding Conde (tahan) dan TN-1 (rentan). Parameter analisis stabilitas dilakukan berdasarkan Francis dan Kannenberg, Finlay dan Wilkinson, Eberhart Russell, Kang, Additive Main Effect and Multiplicative Interaction (AMMI) dan Genotype + Genotype by Environment (GGE). Evaluasi ketahanan HDB berdasarkan keparahan penyakit dan intensitas penyakit terhadap patotipe III, IV dan VIII dari Xoo diamati sesuai Standard Evaluation System for Rice dari IRRI. Perbedaan nilai karakter agronomi dan komponen hasil genotipe uji nyata dipengaruhi oleh genotipe (G), lingkungan (E), dan interaksi genotipe dan lingkungan (G×E). Keragaan galur DH padi yang diuji pada percobaan ini termasuk baik dengan nilai rata-rata produktivitas di enam lingkungan antara lain tinggi tanaman sedang (103,3-116,8 cm), umur panen genjah (113,6-117,7 HSS), jumlah anakan produktif (16,9-19,4 anakan per rumpun), panjang malai (26,7-29,8 cm), persentase gabah bernas (71,5%-81,7%), dan bobot 1000 butir (27,2-29,5 g). Produktivitas rata-rata galur uji berkisar 6,38 hingga 7,07 t ha-1, sejumlah 9 galur DH memiliki produktivitas nyata lebih tinggi dari Inpari 18 dan Inpari 34, sedangkan 3 galur lainnya, yaitu RK3, RK5 dan RK6 setara dengan Inpari 18. Analisis korelasi Spearman menunjukkan bahwa parameter stabilitas Kang memiliki korelasi yang kuat dengan hasil. Keterulangan dan hubungan antara parameter hasil dan stabilitas didapatkan pada galur RK12, RK11, RK7, dan RK10 yang merupakan genotipe yang stabil dan produktivitasnya berada di atas rata-rata umum genotipe di enam lingkungan. Galur RK10 dan RK11 juga dikategorikan stabil dengan hasil tinggi berdasarkan plot AMMI II, sedangkan galur RK12, RK7 dan RK10 merupakan genotipe ideal berdasar GGE. Tingkat keparahan dan intensitas penyakit HDB secara signifikan dipengaruhi oleh patotipe, genotipe, dan interaksi antara patotipe dan genotipe, serta ketahanannya relatif lebih baik pada fase generatif. Skrining dengan HDB patotipe III menghasilkan 10 galur yang mempunyai ketahanan dengan komposisi 3 galur DH (RK1, RK2 dan RK5) dengan kriteria tahan (T) pada kedua fase pertumbuhan, sedangkan sisanya (RK3, RK4, RK6, RK7, RK8, RK 9 dan RK10) agak tahan (AT) di fase
Keyword: galur dihaploid padi, hawar daun bakteri, ketahanan, stabilitas

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: