Judul: Ketahanan Ayam IPB D1 yang Memiliki Gen TLR4 terhadap Infeksi Bakteri Salmonella Enteritidis
Abstrak: Ayam IPB D1 merupakan hasil persilangan antara ayam pelung, sentul, kampung dan broiler. Persilangan ayam ini dilakukan oleh para peneliti dari Fakultas Peternakan-Institut Pertanian Bogor dengan tujuan mendapatkan galur ayam pedaging yang dikembangbiakan oleh masyarakat dengan sistem pemeliharaan tradisional yaitu dengan cara diumbar (back yard). Salah satu penyakit bakterial yang umumnya menyerang unggas adalah Salmonellosis, oleh sebab itu dilakukan penelitian untuk mengetahui ketahanan ayam IPB D1 ini terhadap agen penyakit Salmonellosis dengan menggunakan penciri genetik gen TLR4 (Toll-Like Receptor 4). Gen TLR4 merupakan salah satu gen yang mengontrol ketahanan ayam terhadap infeksi bakteri Gram negatif salah satunya Salmonella Enteritidis, melalui respon imun non-specific. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui ketahanan ayam IPB D1 yang memiliki gen TLR4 terhadap infeksi S. Enteritidis. Total sampel yang digunakan adalah sebanyak 11 ekor. Penelitian ini dilakukan melalui beberapa tahapan pengujian keberadaan gen TLR4 dengan uji Polymerase Chain Reaction (PCR) dan sekuensing serta pengamatan respon kekebalannya melalui pemeriksaan jumlah leukosit, diferensial leukosit serta gambaran umum darahnya dan kemampuan kekebalannya dalam menghambat pertumbuhan bakteri S. Enteritidis pada saat sebelum maupun setelah ditantang dengan bakteri S. Enteritidis. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa ayam IPB D1 yang memiliki gen TLR4 (genotipe GG dan AG) memiliki ketahanan terhadap bakteri S. Enteritidis berdasarkan gambaran leukosit dan darahnya secara umum. Secara in vitro sistem kekebalan humoralnya mampu menghambat pertumbuhan bakteri S. Enteritidis melalui uji clearance.
Keyword: Ayam IPB D1, Gen TLR, Respon imun non-specifi, Salmonella Enteritidis

Judul: Polimorfisme Gen BG1 serta Asosiasinya dengan Sifat Ketahanan Tubuh pada Calon Galur Ayam IPB-D2
Abstrak: Ayam IPB-D1 merupakan ayam lokal komposit dari ayam lokal (ayam kampung, ayam sentul, ayam pelung) dan ayam meat type (broiler). Komposisi genetik 25% ayam meat type pada ayam IPB-D1, memungkinkan ayam IPB-D1 mengalami penurunan ketahanan penyakit. Calon galur ayam IPB-D2 merupakan hasil persilangan dari ayam IPB-D1 yang di desain berdasarkan konsentrasi IgY total ≥ 10 mg mL-1 dan titer antibodi ND ≥ 3 log 2 HI unit. Pembentukan calon galur ayam IPB-D2 bertujuan menghasilkan ayam dengan daya tahan tubuh dan produktivitas yang tinggi. Ayam IPB-D2 dikembangkan agar dapat beradaptasi dengan sistem pemeliharaan ekstensif untuk memenuhi kebutuhan protein hewani masyarakat. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi keragaman SNP gen BG1 pada ayam IPB-D2 dan mengetahui asosiasinya dengan konsentrasi total IgY dan titer antibodi ND. Sebanyak 85 sampel DNA ayam IPB-D2 di sekuensing untuk mengetahui keragaman gen BG1. Gen BG1 merupakan gen kandidat pengontrol ketahanan penyakit ayam yang berada di wilayah MHC. Gen BG1 berfungsi menghambat aktivasi sel limfosit untuk menyeimbangkan fungsi limfosit. Data fenotipe yang digunakan dalam penelitian ini adalah konsentrasi total titer antibodi IgY dan ND. Imunoglobulin Yolk merupakan antibodi spesifik pada ayam yang dapat menetralkan mikroorganisme penyebab penyakit. Titer antibodi ND digunakan untuk mendeteksi keberadaan antibodi dalam tubuh. Hasil penelitian menemukan 6 titik mutasi g.4489 G>T di ekson 19, g.4712 C>T, g.4741 T>C, g.4747 T>C, g.4749 T>C, g.4761 G>A di ekson 20 dan delesi 2 basa g.4758-g.4759 delAT. Kodon stop prematur menyebabkan semua kodon setelahnya menjadi tidak aktif sehingga hanya SNP g.4489 G>T sisteina>fenilalanina dan g.4712 C>T glutamina>kodon stop, yang dapat diasosiasikan. Data asosiasi dianalisis menggunakan model GLM dengan software SAS 9.4 dan uji-t. Gen BG1 hanya dapat digunakan untuk membedakan antara genotipe ternak tetapi tidak dapat digunakan sebagai penanda seleksi untuk konsentrasi total IgY dan titer antibodi ND.
Keyword: ayam IPB-D2, gen BG1, kodon stop prematur, titer antibodi ND, total konsentrasi IgY

Judul: Penggunaan Teorema Homeomorphy 2-Manifold dan Teorema Euler Poincare pada Torus 𝑇�� dan Simplicial Complex 𝐾��
Abstrak: Two dimensional topological spaces are said to be homeomorphic if they have the same topological invariant, where one of topological invariant used is an Euler characteristic. Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem and Euler Poincare’s Theorem are used to distinguish two topological spaces. Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem uses Euler characteristic to identify two dimensional topological spaces. Euler Poincare’s Theorem is an alternative way to find Euler characteristic with Betti number, which is topological invariant as well. The objective of this paper is to investigate the homeomorphism of torus 𝑇����� and simplicial complex 𝐾�����. Topological space torus and simplicial complex 𝐾����� have the same Euler characteristic, which is two. Based on Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem topological space torus 𝑇����� and simplicial complex 𝐾����� is homeomorphic.
Keyword: simplicial, torus, Euler, homeomorphism, topology