Judul: Kajian Morfologi Dan Genetik Mimi (Xiphosura, Limulidae) Sebagai Dasar Konservasi Dan Pengelolaan Di Pulau Jawa.
Abstrak: Mimi atau belangkas merupakan hewan dari famili Limulidae yang dikenal sebagai living fossils dan di Indonesia merupakan salah satu sumberdaya genetik yang dilindungi oleh SK Menteri Kehutanan No. 12/Kpts-II/1987 dan Peraturan Pemerintah RI No. 7/1999. Keberadaan ketiga spesies Asia yaitu Tachypleus gigas (Muller 1785), Tachypleus tridentatus (Leach 1819), dan Carcinoscorpius rotundicauda (Lattreille 1802) telah dinyatakan near threatened (2010), threatened (2014) dan data deficient (2015) oleh IUCN. Kajian mengenai mimi di Indonesia sangat jarang dilakukan dan belum diketahui dengan jelas status populasinya. Penelitian dilaksanakan pada bulan Oktober 2014 sampai Juni 2015. Penelitian menggunakan metode random sampling, mimi yang tertangkap jaring dibawa ke daratan dan diukur secara hidup-hidup, pengukuran karakteristik morfologi berupa karakter morfometrik yang meliputi panjang (total, telson, badan, prosoma, median ringe, depan occeli, marginal spine (I, II, III, IV, V, VI), ophistoma), tebal ventral messel, lebar maksimum prosoma, jarak antar (mata majemuk, auriculata spine, marginal proses, sudut posterior, sudut anal), lebar dan tinggi pertengahan telson, diameter (capit chelicera, capit pedipalpi, capit kaki jalan (I, II, III, IV)). Sedangkan analisis molekuler meliputi beberapa tahapan diantaranya yaitu isolasi dan ekstraksi DNA, elektroforesis DNA, amplifikasi dan visualisasi fragmen DNA, sekuensing DNA, dan PCR-RFLP. Penelitian ini bertujuan untuk 1) mengkaji karakteristik morfologi mimi dari pesisir Ujung Kulon Banten, Segara Menyan Subang, Semarang, Demak, Rembang, Pantai Kenjeran Surabaya, dan Campur Rejo Gresik, 2) mengidentifikasi mimi berdasarkan marka gen COI dan mengetahui haplotipe dengan menggunakan metode PCR-RFLP di Pulau Jawa (Banten, Segara Menyan Subang, Semarang, Demak, Rembang, dan Surabaya) sebagai informasi dalam penentuan strategi pengelolaan dan konservasi mimi di pesisir Pulau Jawa. Penelitian dilaksanakan pada bulan Oktober 2014 sampai Juli 2015 di lokasi sampling dan Laboratorium Biologi Molekuler MSP IPB FPIK. Secara morfologi, C. rotundicauda Subang memiliki ukuran tubuh lebih kecil, sedangkan Rembang memiliki ukuran rata-rata lebar maksimal prosoma paling besar. T. gigas Surabaya memiliki ukuran tubuh lebih besar. T. tridentatus Subang memiliki ukuran tubuh lebih kecil, Gresik memiliki ukuran tubuh lebih besar. Ukuran tubuh mimi secara berurutan dari yang paling besar T. gigas> T. tridentatus > C. rotundicauda. Subang merupakan lokasi terbanyak ditemukannya mimi (58 individu), serta memiliki ketiga spesies. Sedangkan Rembang merupakan daerah terbanyak ditemukannya spesies C. rotundicauda (21 individu). Identifikasi molekuler T. gigas dari penelitian ini telah menunjukan kepastian taksonomi (taxonomy certainty). Identifikasi spesies T. tridentatus dan C. rotundicauda tidak berhasil dengan menggunakan gen CO1. T. tridentatus identik dengan T. gigas, sedangkan C. rotundicauda perlu dilakukan analisis ulang. PCR-RFLP dengan menggunakan primer F1 dan F2 dapat diaplikasikan pada ketiga spesies mimi. Penggunaan enzim restriksi EcoR1 dapat memberikan hasil pemotongan pita DNA hasil PCR-RFLP. Terjadi ketidaksinkronan antara hasil molekuler dengan morfologi. Secara morfologi teridentifikasi tiga spesies sedangkan secara molekuler T. tridentatus identik dengan T. gigas dan C. rotundicauda perlu dilakukan analisis ulang. Berdasarkan hasil RFLP diperoleh Demak dapat ditentukan sebagai daerah gen stok untuk C. rotundicauda, Subang sebagai gen stok T. gigas, dan Semarang untuk T. tridentatus karena memiliki keanekaragaman haplotipe lebih tinggi dibandingkan dengan lokasi lain.
Keyword: haplotipe, mimi, molekuler, morfologi, Pulau Jawa

Judul: Evaluasi karakter morfologi dan analisis variasi genetik mimi (Limulidae) di Demak, Madura, dan Balikpapan berdasarkan penanda Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD).
Abstrak: Mimi (horseshoe crab) merupakan salah satu hewan living fossil animal dari famili Limulidae. Mimi diklasifikasikan kedalam Atlantic horseshoe crab (Limulus polyphemus) dan Asian horseshoe crab (Carcinoscorpius rotundicauda, Tachypleus gigas, dan Tachypleus tridentatus). Informasi tentang mimi Asia di Indonesia hingga saat ini belum banyak diungkap. Berbeda halnya dengan mimi Atlantik yang telah banyak diteliti dan dimanfaatkan. Upaya penggalian informasi dan monitoring populasi mimi di Indonesia dapat dilakukan dengan melibatkan masyarakat lokal khususnya nelayan. Hal tersebut dapat didukung dengan kemampuan dasar dalam membedakan ketiga jenis mimi khususnya dengan menggunakan karakter morfologi. Penggunaan karakter yang tidak tepat berpotensi menimbulkan kesalahan identifikasi, khususnya untuk T. gigas dan T. tridentatus yang terlihat serupa. Dengan demikian perlu adanya evaluasi karakter morfologi yang digunakan sebagai karakter utama untuk identifikasi T. gigas dan T. tridentatus. Selain itu, mimi juga tergolong dalam hewan yang dilindungi. Terdapat dua jenis mimi yang hingga saat ini masih berstatus data deficient yaitu C. rotundicauda dan T. gigas. Kedua jenis tersebut terdapat di beberapa lokasi di Indonesia termasuk Demak, Madura, dan Balikpapan. Oleh karena itu, untuk mengetahui kondisi populasinya perlu adanya kajian tentang keragaman genetik. Identifikasi mimi C. rotundicauda dan genus Tachypleus dapat diidentifikasi berdasarkan bentuk telson. C. rotundicauda mempunyai bentuk telson yang bulat sedangkan genus Tachypleus mempunyai bentuk segitiga. Membedakan kedua jenis spesies dari genus Tachypleus akan lebih tepat dengan menggunakan keberadaan duri-duri yang tersebar di bagian dorsal opisthosoma. Karakter tersebut lebih tepat dan praktis digunakan untuk identifikasi. Analisis RAPD menjelaskan bahwa derajat polimorfisme dan heterozigositas tertinggi pada C. rotundicauda terdapat di Demak dengan nilai masing-masing sebesar 74.67% dan 0.267 Derajat polimorfisme T. gigas terdapat di Madura yaitu sebesar 74.36% dengan nilai heterozigositas sebesar 0.255. Uji perbandingan berpasangan (FST) menunjukkan bahwa C. rotundicauda dan T. gigas di masing-masing lokasi penelitian berbeda satu sama lain. Hal tersebut diduga karena mimi mempunyai wilayah jelajah yang terbatas. Jarak genetik terdekat C. rotundicauda terdapat di antara Demak dan Madura begitu juga dengan T. gigas di Demak dan Madura lebih dekat dibandingkan dengan Balikpapan. Jenis C. rotundicauda dan T. gigas di perairan Demak, Madura, dan Balikpapan berbeda satu sama lain. Mimi jenis C. rotundicauda dan jenis T. gigas mempunyai persentase polimorfisme yang cenderung sedang dan nilai heterozogositas yang cenderung rendah.
Keyword: Carcinoscorpius rotundicauda, duri-duri opisthosoma, Tachypleus gigas, Tachypleus tridentatus

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: