Judul: Identifikasi penggulung daun tanaman pisang Erionota thrax (Lepidoptera: Hesperiidae) berdasarkan DNA barcoding dan morfologi
Abstrak: Tanaman pisang adalah salah satu tanaman budidaya yang menunjukkan adanya interaksi antara tumbuhan dengan serangga, diantaranya dengan penggulung daun tanaman pisang larva Erionota thrax (Lepidoptera: Hesperiidae). Distribusi penggulung daun tanaman pisang ini di Asia Tenggara, termasuk Indonesia. Erionota thrax memiliki beberapa subspesies yang masing-masing didefinisikan berdasarkan karakter morfologi fase imago, karena pada fase larva menunjukkan adanya kesamaan. Ciri spesies E. thrax belum dideskripsi secara lengkap sehingga sering ditemukan kesulitan pada saat proses identifikasi spesies ini. Identifikasi Erionota dapat dilakukan dengan mempelajari ciri morfologi yang meliputi genitalia dan pola sayap, serta melalui pendekatan molekuler DNA barcoding. Oleh karena itu penelitian ini bertujuan mengidentifikasi E. thrax berdasarkan sekuen gen mitokondrial DNA Cytochrome c Oxidase I (COI) pada larva dan karakter morfologi unik pada imago, serta mengeksplorasi variasi genetik pada diversitas haplotipe dan nukleotida populasi E. thrax di Indonesia. Koleksi sampel penggulung daun tanaman pisang dilakukan di sepuluh lokasi pada lima pulau utama di Indonesia, yaitu: Sumatera (Bangka, Metro, Lampung Timur), Jawa (Serang, Cibinong-Bogor, Bantul), Kalimantan (Sambas), Sulawesi (Gorontalo, Palu) dan Papua (Sorong). Identifikasi morfologi dilakukan pada sampel imago penggulung daun tanaman pisang berdasarkan genitalia dan karakter pola sayap yaitu dua spot kuning pada sel diskal. Tahap identifikasi melalui DNA barcoding meliputi Ekstraksi DNA, amplifikasi dan sequencing gen COI. Tahap analisis bioinformatik meliputi Basic Local Alignment Search Tool-Nucleotide (BLAST-N) di NCBI (www.ncbi.nml.nih.gov), analisis jarak genetik dan konstruksi pohon filogeni. Penelitian ini berhasil mendapatkan sekuen DNA gen COI dengan ukuran 630 pb dari empat puluh individu larva penggulung daun tanaman pisang. Konstruksi pohon filogeni empat puluh sekuen DNA larva penggulung daun tanaman pisang hasil penelitian ini dilakukan bersama dengan tiga sekuen DNA dari GenBank yaitu gen COI E. thrax, Erionota sp., dan Suastus gremius. Hasil rekonstruksi pohon filogeni juga menunjukkan adanya pengelompokan larva penggulung daun tanaman pisang berdasarkan lokasi populasi menjadi dua klade yaitu populasi Sundaland (Sumatera, Jawa, Kalimantan, dan Papua), dan populasi Sulawesi. Klade yang terbentuk didukung oleh data distribusi yang sesuai dengan wilayah distribusi Indo-Malaya dan Australasia. Hal tersebut menunjukkan bahwa gen COI dapat digunakan untuk menganalisis hubungan evolusi dan kekerabatan antara larva penggulung daun tanaman pisang di wilayah Indo-Malaya dan Australasia. Berdasarkan gen COI pada E. thrax populasi Sundaland terdapat enam haplotipe di Sumatera, Jawa, Kalimantan, dan Papua yang teridentifikasi sebagai E. thrax thrax serta satu haplotipe E. thrax populasi Sulawesi yang teridentifikasi sebagai E. thrax hasdrubal. Beberapa populasi pada subspesies E. thrax thrax memperlihatkan adanya haplotipe yang sama. Hal ini mengindikasikan adanya aliran genetik antar populasi yang tergantung pada jarak geografis, karena adanya perdagangan pisang sebagai tanaman inang E. thrax serta perpindahan materi genetik antar pulau melalui transportasi laut. Selanjutnya pada penelitian ini diperoleh informasi bahwa sampel imago penggulung daun tanaman pisang termasuk ke dalam E. thrax dengan ciri karakter genitalia jantan berupa sklerotisasi yang kuat pada cincin lateral dan lengan ventral process pada masing-masing basal lateral process. Terdapat beberapa karakter yang membedakan antara populasi Sundaland dan populasi Sulawesi. Ciri genitalia jantan E. thrax populasi Sundaland memiliki M-shape uncus yang pendek; melengkung ujung lateral process yang tumpul dan mencapai eksrimitas uncus pada dorsal dorsum; elongate dorsal ring loop yang luas; panjang valva
Keyword: Erionota thrax, haplotype, population, COI gene, genitalia character

Judul: Karakterisasi morfologi dan variasi gen COI dan COII DNA mitokondria Genus Etiella, Scirpophaga, dan Ostrinia (Lepidoptera: Superfamili Pyraloidea)
Abstrak: Pyraloidea, salah satu superfamili dari Ordo Lepidoptera terdiri dari Famili Pyralidae dan Crambidae. Sebagian besar serangga dalam Superfamili Pyraloidea merupakan serangga penggerek tanaman pertanian. Serangga penggerek Etiella zinckenella (Pyralidae: Phycitinae) dikenal sebagai penggerek polong kedelai. Ostrinia furnacalis (Crambidae: Pyraustinae) sebagai penggerek batang jagung dan Scirpophaga excerptalis (Crambidae: Schoenobiinae) penggerek pucuk tebu. Ketiga spesies serangga tersebut telah dilaporkan dapat menurunkan hasil produksi tanaman pertanian di beberapa wilayah Indonesia. Identifikasi secara tepat dengan menggunakan karakterisasi morfologi dan molekular dapat membantu dalam pengendalian serangga tersebut. Karakterisasi morfologi dilakukan untuk mempelajari perbedaan morfologi. Kunci identifikasi yang ada hanya untuk Ordo Lepidoptera secara umum. Kunci identifikasi serangga penggerek berdasarkan morfologi pada level famili, subfamili, dan genus dalam Ordo Lepidoptera belum ada di Indonesia. Analisis molekular digunakan untuk mendukung data morfologi, sehingga identifikasi suatu spesies serangga akan lebih tepat. Genom DNA mitokondria (DNAmt) merupakan salah satu metode yang digunakan untuk mempelajari keragaman genetik dan hubungan kekerabatan suatu spesies. Gen DNAmt yang banyak digunakan dalam studi molekular sebagai penanda dalam analisis variasi genetik adalah gen Cytochrome c Oxidase I dan II (COI dan COII). Gen COI dan COII memiliki variasi genetik yang tinggi, tidak ada delesi dan insersi. Data molekular gen COI dan COII telah dilakukan untuk E. zinckenella di Italia dan Cina, O. furnacalis di Cina; Vietnam; dan Jepang, sedangkan S. excerptalis hanya ada untuk gen COII di India dan Papua Nugini. Data gen COI dan COII ketiga spesies penggerek tersebut di Indonesia belum ada. Oleh sebab itu, dilakukan karakterisasi molekular pada gen COI dan COII ketiga spesies tersebut sebagai database serangga penggerek di Indonesia. Penelitian ini bertujuan untuk (1) mengkarakterisasi perbedaan morfologi Genus Etiella (Pyralidae; Phycitinae), Genus Scirpophaga (Crambidae; Schoenobiinae), dan Genus Ostrinia (Crambidae; Pyraustinae). (2) mengkarakterisasi variasi gen COI dan COII DNA mitokondria E. zinckenella, S. excerptalis, dan O. furnacalis. Serangga E. zinckenella dari populasi Brebes (Jawa Tengah) dan O. furnacalis dari populasi Bogor (Jawa Barat) yang telah dipelihara di Laboratorium BB-Biogen. S. excerptalis dikoleksi dari pertanaman tebu di Tulang Bawang (Lampung). Tahap karakterisasi morfologi terdiri dari pengamatan karakter eksternal, preparasi venasi sayap dan organ genitalia. Karakterisasi molekular terdiri dari tahap ekstraksi DNA dengan metode CTAB, amplifikasi DNA, dan perunutan DNA. Analisis DNA dilakukan berdasarkan homologi sekuen DNA dan asam amino, serta analisis jarak genetik dan filogeni.
Keyword: COI, Etiella zinckenella, Ostrinia furnacalis, Pyraloidea Scirpophaga excerptalis, COII

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: