Judul: Xylocarpus granatum Endophytic Actinobacteria: Presence and Activity of Antioxidants
Abstrak: Xylocarpus granatum menghasilkan berbagai senyawa bioaktif dengan aktivitas biologis yang beragam, salah satunya sebagai antioksidan. Aktinobakteri endofit juga dapat menghasilkan senyawa bioaktif. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keberadaan aktinobakteri endofit X. granatum dan mengetahui aktivitas antioksidannya. Metode penelitian diawali dengan isolasi aktinobakteri endofit dari buah, biji, dan daun menggunakan media selektif Humic acid (HV). Selanjutnya dilakukan karakterisasi isolat yang diperoleh menggunakan empat media berbeda yaitu YSA, ISP2, ISP3, dan ISP4. Aktivitas antioksidan dari supernatant aktinobakteri dan ekstrak etil asetat aktinobakteri dilakukan menggunakan metode DPPH. Hasil penelitian menunjukkan bahwa dari X. granatum diperoleh 15 isolat aktinobakteri endofit dari buah, biji, dan daun. Isolat aktinobakteri endofit X. granatum menunjukkan perbedaan warna pada miselium aeria dan miselium substrat, serta perbedaan penataan rantai spora. Supernatan XGF11, XGF12, dan XGF4 menghasilkan aktivitas antioksidan tertinggi yaitu: 57.30%, 49.77%, dan 41.90% penghambatan. Kapasitas antioksidan ekstrak etil asetat XGF12 adalah 501.60 μg AEAC/mg ekstrak, 465.47 μg AEAC/mg ekstrak untuk ekstrak etil asetat XGF11, dan 455.53 μg AEAC/mg ekstrak untuk ekstrak etil asetat XGF4. Ekstraksi DNA aktinobakteri endofit dilakukan berdasarkan Presto Mini gDNA Bacteria Kit. Berdasarkan hasil analisis gen 16S rRNA, isolat XGF11 dan XGF12 menunjukkan kemiripan masing-masing 99.42% dan 99.16% dengan Streptomyces xylanilyticus SR2-123 dan XGF4 memiliki kemiripan 99.82% dengan Brevibacterium sediminis FXJ8.269., Xylocarpus granatum produces various bioactive compounds with diverse biological activities, one of them as an antioxidant. Endophytic actinobacteria can also produce bioactive compounds. This study aimed to explore the existence of the endophytic actinobacteria of X. granatum and determine its antioxidant activity. The research method begins with the isolation of endophytic actinobacteria from fruits, seeds, and leaves using selective media Humic Acid (HV). Furthermore, characterizing the obtained isolates using four different media, namely YSA, ISP2, ISP3, and ISP4. Measured antioxidant activity for actinobacterial supernatants and actinobacterial ethyl acetate extracts using the DPPH method. The results showed that from X. granatum, 15 isolates of endophytic actinobacteria were obtained from fruit, seeds, and leaves. Endophytic actinobacteria isolates from X. granatum showed different colors of aerial mycelium, substrate mycelium, and spore chain type. XGF11, XGF12, and XGF4 isolates produced high antioxidant activity of the supernatant; 57.30%, 49.77%, and 41.90% inhibition, respectively. The antioxidant capacity of XGF12 ethyl acetate extract was 501.60 μg AEAC/mg extract and 465.47 μg AEAC/mg extract for XGF11 ethyl acetate extract. DNA extraction and 16S rRNA amplification from endophytic actinobacteria X. granatum according to Presto Mini gDNA Bacteria Kit Protocol. Based on 16S rDNA gene analysis, isolates XGF12 and XGF11 showed 99.16% and 99.42% similarities with Streptomyces xylanilyticus, respectively. Meanwhile, XGF4 showed to have 99.82% similarities with Brevibacterium sediminis.
Keyword: Keragaman, DPPH, Endofit, Ekstrak etil asetat, 16S rRNA, Diversity, endophytes, ethyl acetate extract

Judul: Aktivitas Antioksidan dan Antiglikasi dari Aktinobakteri Rizosfer dan Endofit Xylocarpus granatum.
Abstrak: Pemanfaatan bakteri endofit seperti aktinobakteri merupakan salah satu cara alternatif untuk memperoleh senyawa bioaktif yang sama dengan tumbuhan induknya. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi senyawa dari aktinobakteri rizosfer dan endofit Xylocarpus granatum yang memunyai aktivitas antioksidan dan antiglikasi. Supernatan kultur aktinobakteri diekstraksi menggunakan etil asetat dengan nisbah 1:1 (v/v). Aktivitas antioksidan diuji menggunakan 2,2-difenil-1- pikrilhidrazil. Kromatografi lapis tipis bioautografi dan uji fitokimia digunakan untuk memprediksi senyawa aktif. Kemampuan antiglikasi ditetapkan berdasarkan penghambatan pembentukan advanced glycation end products. Sebanyak 15 isolat aktinobakteri telah diisolasi dari rizosfer, buah, dan daun X. granatum. Lima isolat dari rizosfer, dua isolat dari buah, dan tiga isolat dari daun telah diuji aktivitasnya sebagai antioksidan dan antiglikasi. Isolat XR2 memiliki aktivitas antioksidan tertinggi dengan nilai IC50 1719 mg/L. Sementara itu, aktivitas antiglikasi tertinggi dimililiki oleh isolat XR8 dengan nilai IC50 328 mg/L. Ekstrak etil asetat aktinobakteri rizosfer lebih berpotensi sebagai antioksidan dan antiglikasi dibandingkan aktinobakteri endofit.
Keyword: aktinobakteri, antiglikasi, antioksidan, Xylocarpus granatum

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: