Judul: Uji Pergantian antar Spesies Inang Pyricularia grisea Asal Rumput Digitaria ciliaris
Abstrak: Penyakit blas merupakan salah satu faktor biotik yang menyebabkan penurunan produksi padi. Beberapa jenis rumput di sekitar pertanaman padi yang terserang blas juga terserang penyakit blas. Penyakit ini disebabkan oleh Pyricularia grisea. Penelitian ini bertujuan mengetahui kemampuan isolat P. grisea asal rumput Digitaria ciliaris yang diambil dari Jasinga Bogor (R14J1) dalam menginfeksi spesies inang yang berbeda, dan mendeteksi perubahan genotipenya menggunakan penanda molekuler SCAR yaitu CUT1 dan PWL2. Hasil penelitian menunjukkan bahwa isolat R14J1 mampu menginfeksi padi varietas Kencana bali, Cisokan dan rumput Panicum repens. Isolat 173 asal padi yang digunakan sebagai pembanding, mampu menginfeksi padi varietas Kencana bali dan Cisokan. Bercak pada pada Kencana bali, Cisokan dan Panicum repens yang diinfeksi isolat R14J1kemudian direisolasi. Isolat R14J1 awal memiliki ukuran spora yang berbeda dengan spora hasil reisolasi isolat R14J1 dari padi varietas Kencana bali, Cisokan dan P. repens. Spora isolat R14J1 awal memiliki ukuran yang lebih kecil dibanding spora hasil reisolasi isolat R14J1 dari Kencana bali, Cisokan dan P. repens. Amplifikasi isolat R14J1 awal dengan primer CUT1 menghasilkan fragmen DNA, namun tidak menghasilkan fragmen DNA yang diamplifikasi dengan primer PWL2. Sebaliknya, amplifikasi isolat R14J1 yang direisolasi dari Kencana bali dan Cisokan hanya memiliki fragmen DNA hasil amplifikasi dengan PWL2. Sedangkan isolat R14J1 hasil reisolasi dari P. repens memiliki penanda yang sama dengan isolat R14J1 awal. Berdasarkan hasil penelitian dapat disimpulkan bahwa isolat R14J1 mampu menginfeksi padi varietas Kencana bali, Cisokan dan rumput Panicum repens.
Keyword: 

Judul: Ekspresi Gen Penyandi Pathogenesis Related Protein (PR1&PBZ1) pada Padi Indica yang terlibat dalam Sistem Toleransi terhadap Blas Isolat 001
Abstrak: Penyakit blas yang disebabkan oleh patogen Pyricularia grisea adalah salah satu penyakit penting yang mempengaruhi produksi padi. Gen penyandi Pathogenesis Related protein (PR1 dan PBZ1) diketahui terlibat dalam sistem pertahanan tanaman terhadap cekaman penyakit blas. Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari ekspresi gen penyandi pathogenesis related protein (PR1 dan PBZ1) dari tanaman padi indica varietas tahan dan peka yang telah diinfeksi dengan patogen P. grisea isolat 001. Penelitian ini diharapkan memberi informasi mengenai mekanisme sistem pertahanan tanaman padi terhadap penyakit blas sehingga bisa di gunakan sebagai landasan untuk merakit tanaman tahan blas. Penelitian ini dilakukan dalam dua tahap yaitu: Tahap I adalah penapisan ketahanan berbagai varietas padi indica terhadap Pyricularia grisea isolat 001. Tahap II adalah analisis ekspresi gen PBZ1 dan gen PR1. Penapisan pada penelitian ini menggunakan dua isolat yaitu isolat 001M (Muara) dan 001B (BB-Biogen), dengan tetapi hanya 001M yang digunakan untuk penelitian selanjutnya dikarenakan isolat 001M menghasilkan skala penyakit blas menurut standar IRRI yang lebih konsisten/seragam terhadap kelima varietas. Penapisan dilakukan terhadap 5 varietas tanaman padi (Asahan, IR64, Cisadane, Cisanggang dan Kencana Bali). Penapisan dilakukan dengan cara menyuntikkan 1 ml inokulum isolat 001M (3x105 sel/ml) yang diberi tween 20 dengan konsentrasi 0,25% dan 1 ml air yang diberi tween 20 dengan konsentrasi 0,25 % untuk tanaman kontrol. Perlakuan diulang sebanyak 3 kali. Isolasi RNA total diisolasi dari tanaman tahan dan peka pada umur 0, 1, 3 dan 7 hari setelah infeksi. Sintesis cDNA dilakukan dengan menggunakan enzim transkriptase balik Superscript III. Analisis ekspresi untuk gen PR1 dan PBZ1 dilakukan dengan menggunakan metode PCR.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: