Judul: Kultur Meristem Tip Dan Kemoterapi Untuk Eliminasi Virus Onion Yellow Dwarf Virus (Oydv) Pada Bawang Merah
Abstrak: Bawang merah merupakan tanaman hortikultura yang umumnya dibiakkan secara vegetatif menggunakan umbi bibit. Sistem perbanyakan yang demikian dapat menjadi jalur penyebaran virus melalui penanaman umbi bibit yang terinfeksi virus dan kemudian terbawa pada generasi selanjutnya. Berbagai kultivar bawang merah lokal saat ini telah ditemukan terinfeksi virus Onion yellow dwarf virus (OYDV). Infeksi virus menyebabkan kualitas dan kuantitas umbi menurun, sehingga mengurangi produktivitas dan kualitas hasil. Eliminasi virus sangat diperlukan untuk menghasilkan tanaman bebas virus dan mengoptimalkan produktivitas. Kultur meristem tip merupakan metode eliminasi virus yang dilakukan dengan mengisolasi bagian kubah apikal beserta satu atau dua primordia daun dan dikulturkan pada media yang sesuai agar pertumbuhannya optimal. Eliminasi virus juga dapat dilakukan menggunakan metode kemoterapi, dengan mengaplikasikan senyawa ribavirin secara in vitro. Percobaan 1 bertujuan untuk mendapatkan media dengan penambahan zat pengatur tumbuh (ZPT) yang paling baik untuk pertumbuhan tunas meristem tip bawang merah secara in vitro dan mengevaluasi potensi kultur meristem tip dalam mengeliminasi virus OYDV. Percobaan ini menggunakan rancangan kelompok lengkap teracak (RKLT) dengan 3 ulangan. Hasil yang didapat menunjukkan bahwa media tanpa penambahan ZPT merupakan media yang paling efisien untuk pertumbuhan tunas meristem tip. Tunas utama tumbuh tanpa disertai pembentukan kalus. Hasil analisis RT-PCR menunjukkan bahwa seluruh sampel yang dideteksi masih terinfeksi virus OYDV. Percobaan 2 bertujuan untuk mengetahui pengaruh ribavirin terhadap pertumbuhan shoot tip dan mendapatkan konsentrasi ribavirin yang paling sesui untuk mengeliminasi virus OYDV pada dua ukuran shoot tip. Percobaan menggunakan menggunakan RKLT dengan 4 ulangan. Hasil penelitian menunjukkan bahwa penambahan konsentrasi ribavirin secara nyata menghambat pemanjangan tunas cv. Bima Brebes, waktu muncul daun, pemanjangan tunas, dan jumlah daun cv. Tiron. Ukuran shoot tip yang lebih besar (2.1 - 3.0 mm) meningkatkan persentase eksplan tumbuh dan mempercepat waktu muncul daun cv. Bima Brebes dan Tiron. Konsentrasi ribavirin yang diaplikasikan pada percobaan ini belum dapat mengeliminasi virus OYDV pada dua ukuran shoot tip kedua kultivar. Percobaan 3 bertujuan untuk mengevaluasi pertumbuhan tanaman bawang merah asal kultur meristem tip dan tanaman yang berasal dari umbi serta biji dan mengetahui tingkat infeksi OYDV pada tanaman yang berasal dari bahan tanam yang berbeda. Penelitian ini menggunakan RKLT dengan 3 jenis bahan tanam (tanaman yang berasal dari kultur meristem tip, umbi, dan biji) dan 3 ulangan. Hasil yang didapat menunjukkan bahwa tanaman yang berasal dari kultur meristem tip, umbi, dan biji memperlihatkan pertumbuhan yang kurang maksimal. Selama pengamatan ditemukan bahwa tanaman bawang memperlihatkan gejala daun berkerut dan bercak kuning. Persentase tanaman dengan gejala daun berkerut ditemukan pada tanaman kultur meristem tip, umbi, dan biji, masing-masing 6.7%, 60%, dan 40%. Tanaman yang berasal dari bahan tanam biji yang terinfeksi OYDV berdasarkan hasil deteksi DIBA sebesar 80%, sedangkan tanaman yang berasal dari kultur meristem tip dan umbi 100%. Berdasarkan hasil dari percobaan yang dilakukan, media MS tanpa penambahan ZPT cukup efisien untuk pertumbuhan tunas meristem tip. Aplikasi metode kultur meristem tip dan kemoterapi yang diberikan pada dua ukuran shoot tip menunjukkan kedua metode tersebut belum efektif mengeliminasi OYDV, sehingga efektivitas eliminasi virus dapat ditingkatkan dengan menggunakan metode kultur meristem tip yang dikombinasikan dengan metode lainnya yang lebih efisien dalam mengeliminasi virus.
Keyword: DIBA, in vitro, ribavirin, RT-PCR, shoot tip

Judul: Eliminasi Virus Pada Bawang Merah (Allium Cepa Var. Aggregatum) Secara In Vitro Menggunakan Termoterapi Dan Kemoterapi
Abstrak: Bawang merah merupakan salah satu komoditas hortikultura yang penting di Indonesia. Sentra produksi bawang merah di Indonesia terutama di darah Jawa Tengah, Jawa Timur, Jawa Barat, dan Nusa Tenggara Barat. Sebagian besar petani di Indonesia menggunakan umbi sebagai bahan perbanyakan vegetatif. Infeksi virus sangat mudah ditularkan melalui satu generasi ke generasi selanjutnya dan dari satu daerah ke daerah lainnya sehingga dikhawatirkan menurunkan kualitas dan hasil produksi. Infeksi virus pada umbi bawang merah di Indonesia telah dilaporkan, walaupun informasinya masih sangat terbatas. Penelitian ini bertujuan mengembangkan metode eliminasi virus pada bawang merah menggunakan kombinasi termoterapi dan kemoterapi dengan beberapa ukuran eksplan kultur ujung tunas. Penelitian dilaksanakan mulai Januari 2015 sampai dengan Juni 2016, bertempat di Laboratorium Virologi Tumbuhan, Departemen Proteksi Tanaman dan Laboratorium Kultur Jaringan 3, Departemen Agronomi dan Hortikultura, Fakultas Pertanian, Institut Pertanian Bogor. Umbi benih bawang merah terdiri atas dua kultivar, yaitu „Bima Curut‟ dan „Bima Brebes‟, diperoleh dari penangkar benih di desa Tenguli, Brebes, Jawa Tengah. Eksplan berupa ujung tunas diisolasi menjadi tiga ukuran yang berbeda (1 mm, 2 mm, dan 3 mm). Masing-masing eksplan diberi perlakuan suhu (30 oC, 37 oC, dan 25 oC sebagai kontrol) dan diinkubasi selama 4 minggu. Termoterapi dilakukan pada kondisi homogen dan heterogen. Plantlet hasil termoterapi yang masih terinfeksi virus kemudian digunakan sebagai sumber eksplan untuk kemoterapi. Ujung tunas berukuran 2 mm digunakan sebagai eksplan dan ditumbuhkan pada media yang mengandung ribavirin (10 mg L-1, 25 mg L-1, dan kontrol 0 mg L-1), selanjutnya diinkubasi pada suhu 30 oC. Deteksi virus setelah perlakuan menggunakan RT-PCR dengan primer spesifik Carlavirus, Poyvirus, dan Al lexivirus. Benih umbi bawang merah yang diperoleh dari penangkar benih diseleksi lebih dahulu melalui deteksi virus dengan metode dot immunobinding assay (DIBA) menggunakan antibodi OYDV, SLV, dan GCLV. Sebanyak 100 sampel umbi diambil secara acak pada masing-masing kultivar dan ditanam pada styrofoam yang telah diberi air di bawahnya. Setelah 7 hari diambil secara acak 50 sampel daun yang tumbuh dari masing-masing kultivar. Hasil deteksi awal umbi benih bawang merah menunjukkan bahwa kedua kultivar 100 % positif terinfeksi OYDV. Sampel „Bima Curut‟ yang bereaksi positif terhadap antibodi SLV dan GCLV berturut- turut sebanyak 100% dan 90%, sedangkan sampel „Bima Brebes‟ berturut- berturut sebanyak 96% dan 96%. Infeksi OYDV dominan dibandingkan dengan SLV dan GCLV. Hasil deteksi ini mengindikasikan bahwa infeksi virus pada pertanaman bawang merah di Indonesia sangat tinggi. Perlakuan termoterapi pada berbagai tingkatan suhu dan ukuran eksplan menunjukkan bahwa suhu mempengaruhi secara nyata pertumbuhan eksplan sedangkan ukuran eksplan tidak berpengaruh nyata. Pada kultivar Bima Curut, kombinasi perlakuan termoterapi terbaik terhadap pertumbuhan eksplan adalah ukuran eksplan 1 mm dengan kondisi heterogen, sedangkan pada kultivar Bima Brebes adalah kombinasi ukuran eksplan 2 mm dengan suhu heterogen. Konfirmasi melalui RT-PCR pada plantlet hasil termoterapi menunjukkan bahwa semakin kecil ukuran maka tingkat keberhasilan eliminasi semakin tinggi. Seluruh plantlet (100%) yang berasal dari ukuran eksplan 1 mm bebas virus pada semua perlakuan. Tingkat eliminasi pada kultivar Bima Curut dengan ukuran eksplan 2 mm dan 3 mm pada suhu 30 °C terhadap Potyvirus adalah 67%, sedangkan terhadap Carlavirus berturut-turut adalah 33% dan 67%. Tingkat eliminasi pada kultivar Bima
Keyword: Carlavirus, kultur ujung tunas, plantlet bebas virus, Potyvirus, umbi bebas virus

Judul: Asymptotic Distribution of Estimator for the Intensity Function of a Doubly Periodic Poisson Process
Abstrak: In this manuscript, estimation of the intensity function of a doubly periodic Poisson process is discussed. It is assumed that only a single realization of the Poisson process is observed in a bounded window [0,n]. It is also assumed that the period of the intensity function is known. The rate of consistency and asymptotic normality of the estimator are formulated. Finally, a confidence interval for the local intensity function is also formulated.
Keyword: