Judul: Studi Analisis Interaksi Makroalga Dengan Parameter Lingkungan Di Perairan Manokwari Papua Barat
Abstrak: Makroalga di perairan Manokwari memiliki keanekaragaman spesis yang tinggi, namun organisme ini sangat rentan terhadap perubahan kondisi lingkungan baik tekanan alami seperti angin, gelombang, arus, musim dan kondisi lingkungan lainnya menjadi pemicu perubahan habitat makroalga. Tekanan antropogenik seperti limbah domestik, buangan sampah padat, aktivitas masyarakat perkotaan, frekuensi transport kapal di daerah teluk doreri, kegiatan pembangunan tata kota dan aktivitas masyarakat di perairan Manokwari cenderung mempengaruhi pertumbuhan dan perkembangan keanekaragaman spesis makroalga. Di samping itu permasalahan yang muncul adalah pemanfaatan eksploitasi makroalga yang mengancam keberadaan dan kelestariannya, hal tersebut yang melatar belakangi studi ini. Tujuan Penelitian ini adalah (1) Mengkaji komposisi dan jumlah jenis makroalga di perairan intertidal Manokwari, (2) Mengkaji struktur komunitas makroalga yang tersebar di daerah intertidal perairan Manokwari dan (3) Menganalisis hubungan interaksi makroalga dengan lingkungan fisik – kimia perairan Manokwari. Penelitian pengambilan data di lapangan pada bulan Juni 2011 sampai September 2011 (periode musim timur) di 5 lokasi penelitian yaitu: pantai Arfai (stasiun 1), pantai Rendani (stasiun 2), pantai Pasir Putih (Stasiun 3) yang merupakan Teluk Doreri bagian dalam (mainland) dan Pesisir pulau Mansinam (stasiun 4), pesisir pulau Lemon (stasiun 5) yang merupakan Teluk Doreri bagian luar (outland). Posisi lokasi pengambilan sampel menggunakan GPS tipe Garmin XL12 kemudian di plotkan ke dalam peta. Data peta penelitian berdasarkan citra Google earth tahun 2014 dengan pengolahan menggunakan software ArcGis 10.0. Metode pengambilan sampel makroalga menggunakan metode garis transek (line transect) dengan teknik sampling kuadran di letakkan tegak lurus terhadap garis pantai. Pengamatan morfologi eksternal dan identifikasi makroalga berdasarkan bentuk thallus, holdfast, stipe, blade dan karakter percabangan secara langsung mengacu pada beberapa buku identifikasi. Pengukuran parameter lingkungan fisik-kimia dan analisis substrat di lakukan secara in situ dan ex situ di lapangan dan laboratorium. Analisis data terhadap kepadatan jenis, persen penutupan, indeks struktur komunitas menggunakan program exel 2010. Pengkajian hubungan interaksi lingkungan fisik - kimia dan substrat antar stasiun menggunakan prinsip komponen analisis (PCA) sedangkan untuk mengkaji keterkaitan antara interaksi populasi makroalga dengan karakter fisik - kimia dan substrat antar stasiun pengamatan menggunakan analisis faktorial koresponden (CA). Kedua analisis ini di integrasikan dalam perangkat lunak Soft Ware XLSTAT versi 2015.5.03. Hasil penelitian berdasarkan identifikasi di temukan 28 spesies makroalga yang di klasifikasikan ke dalam 3 divisi, 3 kelas, 11 ordo, 16 famili, dan 19 genus. Keseluruhan spesies alga di kelompokkan dalam 3 divisi utama yaitu alga hijau (Chlorophyta) 14 spesies, alga merah (Rhodophyta) 8 spesies dan alga coklat (Phaeophyta) 6 spesies. Arfai (stasiun 1) di temukan 9 spesies alga hijau, 5 spesies alga merah dan 2 spesies alga coklat. Rendani (stasiun 2) di temukan 6 spesies alga hijau, 6 spesies alga merah dan 2 spesies alga coklat. Pasir Putih (stasiun 3) di temukan 7 spesies alga hijau, 6 spesies alga merah dan 2 spesies alga coklat, sedangkan pada lokasi pulau Mansinam (stasiun 4) di temukan 11 spesies alga hijau, 6 spesies alga merah dan 4 spesies alga coklat. Pulau Lemon (stasiun 5) di temukan 11 spesies alga hijau, 6 spesies alga merah dan 4 spesies alga coklat. Analisis kepadatan jenis dan persen penutupan jenis makroalga di daerah outland (lokasi Mansinam dan Lemon) lebih
Keyword: Intertidal, interaksi makroalga, Manokwari, struktur komunitas

Judul: DNA Barcoding, Rekonstruksi Filogenetik dan Struktur Populasi Makroalga Antar Ekoregion Laut Indonesia
Abstrak: Makroalga memiliki banyak manfaat, baik manfaat secara ekologis maupun ekonomis bagi masyarakat. Berdasarkan pentingnya peranan makroalga, maka perlu dilakukan pendataan atau inventarisasi makroalga di berbagai perairan laut di Indonesia. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi jenis secara molekuler dan morfologi, merekonstruksi pohon filogenetik, menganalisis kondisi dan keterkaitan makroalga melalui penutupan, kepadatan, dan indeks ekologi makroalga antar ekoregion laut yang ada di Perairan Kepulauan Seribu, Karimunjawa, Luwuk, dan Wakatobi. Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Juli hingga bulan Agustus 2016 di Perairan Kepulauan Seribu, Karimunjawa, Luwuk, dan Wakatobi. Pada Perairan Kepulauan Seribu dilakukan identifikasi sekaligus membuat rekonstruksi. Tahapan yang digunakan ada tiga, yaitu ekstraksi, PCR dan elektroforesis. Target penanda untuk amplifikasi DNA adalah tufA. Pada ketiga lokasi lainnya dilakukan sampling yang diwakili oleh tiga stasiun pengamatan di setiap lokasi dan setiap stasiun terdiri dari tiga pengulangan. Transek garis dengan membentangkan rollmeter sepanjang 50 meter diletakkan sejajar dengan garis pantai di daerah terumbu karang pada kedalaman 10 meter dan jarak antar transek adalah 10 meter. Pengamatan penutupan dan kepadatan makroalga pada setiap transek dilakukan dengan menggunakan transek kuadrat berukuran 50 cm x 50 cm dengan jarak antar transek kuadrat sebesar 5 meter. Identifikasi dan perhitungan makroalga dihitung di setiap transek kuadrat menggunakan perangkat lunak Coral Point Count with Excell Extension (CPCe). Analisis data yang dilakukan untuk menghitung penutupan, kepadatan, Indeks Keanekaragaman (H’), Indeks Kemerataan (E), dan Indeks Dominasi (D). Hasil dari Kepulauan Seribu yang teramplifikasi dengan baik berjumlah 3 sampel dari total 9 sampel. Hasil penelitian dari perairan Karimunjawa (Jawa Tengah), Luwuk (Sulawesi Tengah), dan Wakatobi (Sulawesi Tenggara) ditemukan 16 spesies makroalga. Terdapat perbedaan nyata untuk penutupan dan kepadatan makroalga dari ketiga lokasi pengamatan (p<0.05). Spesies Jania adhaerens memiliki penutupan dan kepadatan terbesar di Luwuk, diikuti oleh Wakatobi dan terendah di Karimunjawa. Keanekaragaman dan kemerataan makroalga yang tertinggi terdapat di Wakatobi namun paling rendah untuk indeks dominan. Hasil analisis cluster berdasarkan kepadatan dan spesies-spesies yang ditemukan di ketiga wilayah menunjukkan bahwa Wakatobi dan Luwuk memiliki tingkat kemiripan yang tinggi.
Keyword: DNA barcoding, filogenetik, keanekaragaman, makroalga

Judul: A Continuous Vaccination Strategy in the SVIR Epidemic Model
Abstrak: Vaccination is conducted to minimize the spread of a disease. The vaccination is usually done several times within a fixed time interval. In the SVIR model, it is assumed that individuals do not get immediate immunity following a vaccination program. So according to process of vaccination on SVIR model, there are two strategies, i.e. the continuous vaccination strategy (CVS) and the pulse vaccination strategy (PVS). In this study, only the CVS strategy in epidemic model SVIR is considered. Results of the study indicate that dynamics of the CVS system depends on the basic reproductive number. If the basic reproductive number is less than one, then the disease-free fixed point is asymptotically stable. It means that the disease will eventually disappear from the population. Conversely, if the basic reproductive number is greater than one, then the endemic fixed point is asymptotically stable, which means that the disease will remain exist in the population. Simulation result shows that the vaccination would minimize the spread of disease by reducing the basic reproductive number. If the time for the vaccinated recipients to obtain the immunity, as well as a possibility of vaccinated recipients to be infected are neglected, then the disease will be eradicated. This condition is called an over-evaluating effect of vaccination.
Keyword: