Judul: Potency of Endophytic Fungi as Biocontrol Agents of White  Root Disease on Cashew (Anacardium occidentale L.)
Abstrak: Penyakit akar putih merupakan penyakit penting pada jambu mete yang disebabkan oleh cendawan patogen Rigidoporus sp. Cendawan ini menginfeksi akar tanaman sehingga menyebabkan akar menjadi busuk. Pada tanaman dewasa yang produktif, penyakit akar putih menjadi sangat merugikan karena menurunkan hasil panen akibat berkurangnya pohon yang dapat menghasilkan. Berbagai pengendalian telah dilakukan oleh petani jambu mete, namun hasilnya belum optimal. Cendawan endofit diketahui sebagai salah satu jenis mikrob fungsional yang mampu memproduksi metabolit sekunder, baik secara langsung atau tidak langsung sehingga sangat cocok dijadikan sebagai agens pengendali hayati. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan cendawan endofit yang efektif mengendalikan penyakit akar putih pada tanaman jambu mete (Anacardium occidentale L.) dan menganalisis mekanisme kerjanya. Sebanyak lima isolat cendawan endofit yang digunakan pada penelitian ini merupakan isolat koleksi Laboratorium Mikologi Tumbuhan, Departemen Proteksi Tanaman, Fakultas Pertanian, Institut Pertanian Bogor (IPB), adapun cendawan patogen penyebab penyakit akar putih diisolasi dari akar jambu mete terinfeksi asal kebun jambu mete di Kabupaten Karangasem, Bali. Penelitian ini terdiri atas isolasi-identifikasi cendawan patogen, uji in vitro isolat cendawan endofit terhadap patogen Rigidoporus sp. (uji antibiosis dan interaksi cendawan endofit-patogen, uji produksi senyawa organik volatil antifungi, uji aktivitas kitinolitik, uji produksi IAA, dan uji kemampuan melarutkan fosfat), uji kolonisasi cendawan endofit, dan uji keefektifan cendawan endofit dalam mengendalikan cendawan akar putih pada bibit jambu mete di rumah kaca. Isolat patogen Rigidoporus sp. dan lima isolat cendawan endofit diidentifikasi secara molekuler menggunakan pasangan primer universal ITS1 (forward) dan ITS4 (reverse). Isolasi cendawan patogen dari akar jambu mete terinfeksi menghasilkan cendawan patogen yang identik dengan Rigidoporus sp. secara morfologi dan molekuler. Koloni cendawan tersebut memiliki pertumbuhan konsentris pada media PDA, berwarna putih cerah, dengan permukaan yang tampak berserat. Hifa cendawan ini hialin dan bersekat. Struktur mikroskopik lainnya yang menjadi ciri khas dari Rigidoporus sp. juga ditemukan, seperti cystidioles dan clamp connection. Kedua struktur tersebut banyak ditemukan pada bagian hifa. Penyejajaran sekuen nukleotida cendawan hasil amplifikasi dengan database di GenBank menunjukkan bahwa cendawan ini memiliki homologi terdekat sebesar 92,09% dengan Rigidoporus sp. E7081 asal Jawa dan Rigidoporus sp. E7089 asal Sumatra. Hasil uji in vitro menunjukkan bahwa lima isolat cendawan endofit berpotensi menghambat pertumbuhan Rigidoporus sp. dan memacu pertumbuhan tanaman melalui produksi senyawa organik volatil antifungi, enzim kitinase, dan asam indol asetat (IAA). Kemampuan melarutkan fosfat dimiliki empat isolat (kecuali isolat BR32C) dengan efisiensi kelarutan rendah-sedang. Isolat cendawan endofit juga mampu mengolonisasi akar bibit jambu mete dengan persentase 10- 65%. Isolat BR32C merupakan isolat terbaik dalam mengolonisasi jaringan akar, baik pada rambut akar maupun akar lateral. Perlakuan isolat cendawan endofit sebanyak 2x (satu bulan sebelum inokulasi patogen dan satu minggu setelah inokulasi patogen) dengan kerapatan konidia/askospora 105 berhasil menekan insidensi dan keparahan penyakit akar putih pada bibit jambu mete di rumah kaca. Rata-rata persentasi insidensi dan keparahan penyakit paling rendah masing-masing adalah 58,33% dan 15,62%. Isolat BR32C dan VNTB1 merupakan dua isolat dengan keefektifan pengendalian tertinggi, berturut-turut sebesar 83,52% dan 80,30%. Aplikasi cendawan endofit juga berpengaruh positif terhadap pertumbuhan tanaman. Rerata tinggi tanaman dan bobot akar yang diinokulasi lima isolat cendawan endofit lebih baik dibandingkan kontrol. Isolat BR32C teridentifikasi sebagai Trichoderma asperellum, sedangkan VNTB1 teridentifikasi
Keyword: Pengendalian hayati, enzim, mekanisme pengendalian, induksi  ketahanan tanaman

Judul: Senyawa Metabolit Cendawan Endofit Sebagai Alternatif Pengendalian Efektif Cendawan Patogen Terbawa Benih Padi.
Abstrak: Prioritas utama bidang pertanian dalam rangka menjaga stabilitas pangan nasional yaitu peningkatan produksi padi. Salah satu masalah dalam produksi padi disebabkan karena infeksi hama dan penyakit tanaman. Infeksi cendawan patogen terbawa benih pada tanaman padi di Indonesia menjadi masalah utama yang berpengaruh terhadap produksi padi yang menurun dari waktu ke waktu. Pemanfaatan cendawan endofit merupakan salah satu alternatif pengendalian yang dapat digunakan untuk mengendalikan patogen terbawa benih. Perlu adanya metode baru yang ramah lingkungan untuk mengendalikan patogen terbawa benih. Penelitian ini bertujuan untuk mengeksplorasi cendawan endofit potensial asal tanaman padi yang mampu menghambat pertumbuhan cendawan patogen terbawa benih padi dan memanfaatkan metabolit cendawan endofit untuk menekan cendawan patogen benih terbawa benih padi. Penelitian ini terdiri atas 7 tahapan, yaitu 1) isolasi cendawan endofit dengan cara sterilisasi permukaan bagian tanaman padi dengan menggunakan NaOCl 1% dan alkohol 70%, 2) uji patogenisitas cendawan endofit terhadap benih padi varietas Ciherang yang telah disterilisasi permukaan, 3) isolasi cendawan patogen terbawa benih padi asal varietas Ciherang dan Kukubalam dengan metode blotter test, 4) uji antagonis isolat cendawan endofit terhadap cendawan patogen terbawa benih dengan metode kultur ganda, 5) produksi dan analisis senyawa metabolit cendawan endofit, 6) uji senyawa metabolit cendawan endofit secara in vitro, dan 7) uji in vivo senyawa metabolit cendawan endofit dengan 3 media yaitu agar air, kertas, dan lumpur. Cendawan endofit yang berhasil diisolasi sebanyak 21 isolat dan isolat yang digunakan pada uji senyawa metabolit sebanyak 3 isolat cendawan endofit potensial sebagai agen biokontrol terhadap cendawan patogen terbawa benih Fusarium sp.1. Tiga isolat cendawan endofit tersebut yaitu LA6, LA11, dan LA14. Metabolit isolat LA11 menunjukkan persentase penghambatan tertinggi terhadap Fusarium sp.1 yaitu 28.97% dan metabolit isolat LA14 dengan persentase penghambatan 28.72%. Aplikasi metabolit cendawan endofit dengan perendaman benih padi menunjukkan pengurangan infeksi cendawan patogen terbawa benih padi. Hal ini ditunjukkan oleh isolat LA11 dan LA14 mampu menghambat pertumbuhan cendawan patogen terbawa benih secara potensial. Cendawan endofit menghasilkan metabolit yang sebagian senyawa metabolit bersifat antifungal. Senyawa antifungal yang dihasilkan cendawan endofit dapat melindungi tanaman dari serangan mikroba patogen sehingga dapat dimanfaatkan sebagai biokontrol. Metabolit cendawan endofit juga mampu memperbaiki pertumbuhan tanaman dan sistem perakaran tanaman.
Keyword: metabolit sekunder, biokontrol, antifungal, Fusarium sp

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: