Judul: Uji Stabilitas Tanaman Tembakau (Nicotiana tabacum) Transgenik Kultivar SR1 yang Mengandung Gen Gα pada Generasi T2
Abstrak: Protein Gα memiliki peranan penting dalam berbagai proses pertumbuhan dan perkembangan tumbuhan. Gen Gα dari kedelai kultivar Slamet yang dikendalikan oleh promoter kuat 35SCaMV yang dipautkan dengan gen nptII penyandi resisten terhadap kanamisin telah berhasil diintroduksikan ke genom tanaman tembakau (Nicotiana tabacum) SR1 dengan menggunakan Agrobacterium tumefaciens. Penelitian ini bertujuan menganalisis stabilitas integrasi gen Gα di bawah kendali promoter kuat 35SCaMV pada tanaman tembakau kultivar SR1 transgenik. Uji segregasi dilakukan dengan menanam biji tembakau transgenik generasi T1 dan T2 dan nontransgenik pada media MS yang mengandung kanamisin 50 mg/L. Khi-kuadrat digunakan untuk menganalisis segregasi di dalam populasi T1 dan T2. Analisis Khi-kuadrat menunjukkan bahwa gen nptII tanaman tembakau di dalam tanaman transgenik generasi kedua (T1) diwariskan kepada generasi ketiga (T2) mengikuti pola pewarisan Mendel dengan perbandingan 3:1. Hasil analisis ini menunjukkan bahwa terdapat satu salinan gen nptII yang terpaut dengan gen G di dalam genom tanaman transgenik. Pemberian 1.6 mM Al selama 72 jam pada media kultur menunjukkan bahwa akumulasi Al pada akar tanaman transgenik lebih rendah dari pada tanaman nontransgenik. Hal ini memberikan indikasi bahwa Gαberperan mencegah masuknya Al ke dalam akar sehingga tanaman menjadi toleran terhadap cekaman aluminium.
Keyword: Agrobacterium tumefaciens, aluminium, gen Gα, gen nptII, promoter 35SCaMV

Judul: Stabilitas Transgen Dan Ekspressi Gen B11 Pada Tanaman Tembakau Transgenik Generasi T3.
Abstrak: Ion aluminium (Al3+) mendominasi tanah masam yang memiliki pH<5 dan toksik bagi akar tanaman karena selain dapat mengkelat unsur hara, Al3+ dapat merusak sistem perakaran sehingga menyebabkan tanaman mengalami defisiensi usunr hara dan menurunkan produksi tanaman. Beberapa varietas tanaman memiliki mekanisme toleransi terhadap cekaman Al. Tanaman pertanian seperti gandum memiliki mekanisme toleransi terhadap cekaman Al dengan melibatkan pelepasan asam organik seperti asam malat dan asam sitrat dari akar. Asam organik yang dilepaskan akan mengkelat dan mendetoksifikasi Al di zona rhizosfer. Padi merupakan tanaman serealia yang toleran terhadap cekaman Al. Roslim (2011) telah mempelajari dan mengidentifikasi bahwa padi lokal Indonesia var. Hawara Bunar berpotensi sebagai sumber gen toleran Al. Gen penyandi toleransi terhadap cekaman Al, yakni gen B11, telah berhasil diisolasi dari tanaman padi var. Hawara Bunar dan telah berhasil diintroduksikan ke dalam tanaman tembakau di bawah promotor 35S CaMV yang kemudian menghasilkan tanaman tembakau transgenik pembawa gen B11. Uji stabilitas tanaman tembakau transgenik pembawa gen B11 menunjukkan bahwa tanaman tembakau transgenik generasi pertama (T1) membawa copy gen B11 dan analisis fungsi gen B11 pada tembakau transgenik T1 menunjukkan gen B11 dapat meningkatkan toleransi tanaman tembakau terhadap cekaman Al. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk memperoleh tanaman tembakau transgenik yang memiliki transgen B11 yang stabil pada generasi T2 dan T3 serta menganalisis ekspresi gen B11 dan gen-gen lain (STOP1, ALMT1, MATE) yang terkait dengan toleransi terhadap cekaman Al. Biji tanaman tembakau transgenik diseleksi pada media MS yang mengandung higromisin selama 28 hari. Tanaman yang toleran selanjutnya di cek stabilitasnya dengan PCR menggunakan primer gen B11 dan hpt. Ekspresi relatif dari gen B11 dan gen-gen lain (STOP1, ALMT1, MATE) yang terkait dengan toleransi Al dianalisis dengan teknik qPCR. Hasil penelitian menunjukkan bahwa 24 dari 26 nomor tanaman transgenik terpilih yang diseleksi mampu tumbuh pada medium selektif dengan rasio 3:1 untuk toleran:sensitif terhadap hygromicin. Di antara semua nomor yang diuji, terdapat dua nomor T3 secara konsisten menunjukkan 100% tumbuh pada media selektif. Hal ini menunjukkan bahwa kedua nomor tersebut telah homozigot untuk gen hpt. Karena gen hpt terletak dekat dengan left border downstream gen B11, maka hal ini mengindikasikan bahwa gen B11 juga telah homozigot untuk kedua nomor tersebut. Analisis stabilitas genetik tanaman tembakau transgenik menunjukkan bahwa tanaman tembakau transgenik telah membawa gen B11 sampai generasi T3. Analisis ekspresi menunjukkan bahwa peningkatan ekspresi gen B11 diikuti oleh peningkatan ekspresi dari gen STOP1, ALMT1 dan MATE, mengindikasikan adanya hubungan regulasi di antara gen-gen tersebut dalam merespon cekaman Al.
Keyword: Aluminium, gen toletan Al, stabilitas gen, tanaman transgenik

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: