Judul: Isolasi Dan Identifikasi Bakteri Kitinolitik Sebagai Agens Biokontrol Cendawan Patogen Pada Kokon Cricula Trifenestrata (Lepidoptera: Saturnidae).
Abstrak: Cricula trifenestrata merupakan salah satu serangga penghasil sutra alam yang belum didomestikasi, sehingga dikenal sebagai ulat sutra liar. C. trifenestrata mengeluarkan air liur yang mengandung protein dan menjadi bahan pembentukan kokon. Kokon ini dikumpulkan untuk diolah menjadi benang sutra. Sutra hasil olahan kokon C. trifenestrata memiliki nilai ekonomi yang tinggi di pasaran karena memiliki serat berwarna kuning emas yang merupakan warna khas kokonnya. Hal inilah yang menjadi pembeda antara C. trifenestrata dengan ulat sutra lainnya. Salah satu patogen yang dikenal menyerang kokon ulat sutra ialah cendawan. Serangan cendawan dapat mengakibatkan kualitas dan kuantitas benang sutra yang dihasilkan mengalami penurunan. Di India, kegagalan panen kokon akibat serangan cendawan mencapai 30-40%. Cendawan memiliki dinding sel yang tersusun atas kompleks kitin dan merupakan target utama bagi agens anti cendawan, misalnya fungisida kimiawi. Namun, adanya dampak negatif yang ditimbulkan dari penggunaan fungisida kimiawi menyebabkan perlu dicari fungisida biologi seperti memanfaatkan bakteri kitinolitik potensial yang mampu menghambat bahkan membunuh cendawan patogen karena menghasilkan enzim kitinase. Bakteri kitinolitik memiliki potensi tinggi sebagai agens pengendali biologi terhadap cendawan patogen pada C. trifenestrata sehingga penurunan kualitas dan kuantitas sutra emas dapat dihindari. Tujuan penelitian ini ialah untuk mengisolasi bakteri kitinolitik dan cendawan patogen asal kokon C. trifenestrata serta identifikasi dan potensinya sebagai biokontrol. Hasil isolasi dari kokon C. trifenestrata di Desa Babakan Lebak, Dramaga, Bogor didapatkan 10 isolat cendawan dan 36 isolat bakteri kitinolitik dengan Indeks Kitinolitik (IK) bervariasi. Isolat bakteri kitinolitik BSEP.3 diketahui mampu menghambat isolat cendawan CSAJ.2 yang diduga sebagai cendawan patogen dengan persentase penghambatan sebesar 50%. Kitinase yang dihasilkannya sebesar 5.11 U/mL pada jam ke-15 waktu inkubasi. Ekstrak kasar kitinasenya memiliki persentase penghambatan sebesar 47.5%. Sekuen hasil amplifikasi gen penyandi 16S rRNA dan konstruksi pohon filogenetik menunjukkan bahwa bakteri BSEP.3 memiliki kemiripan 98% dengan Bacillus amyloliquefaciens galur B5. Sekuen hasil amplifikasi daerah ITS rDNA dan konstruksi pohon filogenetik menunjukkan bahwa isolat cendawan CSAJ.2 memiliki kemiripan 100% dengan Trichoderma virens galur TV242. Aplikasi kitinase ekstrak kasar isolat bakteri kitinolitik BSEP.3 menunjukkan kemampuannya dalam menghambat pertumbuhan cendawan patogen pada kokon ulat sutra emas C. trifenestrata baik secera preventif maupun kuratif.
Keyword: Bacillus amyloliquefaciens, Trichoderma virens, kitinase

Judul: Seleksi Bakteri Kitinolitik Asal Tanah Jambi Sebagai Biokontrol Colletotrichum Capsici.
Abstrak: Colletotrichum capsici merupakan salah satu cendawan patogen penyebab antraknosa pada cabai. Infeksi antraknosa dapat menyebabkan kerugian hasil panen sekitar 50-100%. Salah satu alternatif yang dapat digunakan untuk menghambat pertumbuhan C. capsici ialah dengan menggunakan bakteri kitinolitik. Kitin yang terdapat pada dinding sel cendawan dapat dihidrolisis oleh enzim kitinase yang berasal dari bakteri kitinolitik. Kitinase menghidrolisa polimer kitin pada cendawan menjadi monomer N-asetilglukosamin. Tujuan penelitian ini adalah menseleksi bakteri kitinolitik asal tanah Jambi berdasarkan indeks kitinolitik dan kemampuannya menghambat pertumbuhan C. capsici. Sebagai tambahan dilakukan identifikasi secara molekuler dari isolat kitinolitik terpilih dan karakterisasi kitinase ekstraseluler. Enzim kitinase dari bakteri terpilih selanjutnya digunakan untuk menghambat pertumbuhan C. capsici. Berdasarkan hasil penyeleksian diperoleh dua isolat terbaik berdasarkan kemampuannya mendegradasi kitin dan penghambatannya terhadap C. capsici. Isolat KAHN 15.12 teridentifikasi sebagai Serratia marcescens dan SAHA 12.12 sebagai Bacillus thuringiensis berdasarkan gen 16S rRNA. Aktivitas spesifik kitinase tertinggi isolat KAHN 15.12 sebesar 52.03 U/mg pada jam ke-36 inkubasi dan SAHA 12.12 sebesar 45.67 U/mg pada jam ke-24 inkubasi. Pemekatan kedua isolat dilakukan dengan menggunakan amonium sulfat (b/v). Aktivitas kitinase hasil pengendapan memiliki aktivitas yang lebih tinggi dari kitinase ekstrak kasar. Hasil pemekatan menunjukkan bahwa kitinase KAHN 15.12 mengendap pada konsentrasi 40% dengan kemurnian enzimnya meningkat sebesar 1.92 kali dibandingkan aktivitas enzim kasarnya dengan perolehan sebesar 1.47 %. Isolat SAHA 12.12 mengendap pada konsentrasi 60% dan kemurnian enzim sebesar 3.14 kali dengan perolehan sebesar 1.47 %. Kitinase KAHN 15.12 hasil pengendapan memiliki aktivitas optimum pada pH 7 dan pada suhu 60 oC. Kitinase SAHA 12.12 hasil pengendapan memiliki aktivitas optimum pada pH 8 dan pada suhu 40 oC. Kitinase ini stabil pada suhu optimum selama 180 menit. Hasil pemisahan protein dengan SDSPAGE menunjukkan bahwa bobot molekul dari hasil pengendapan SAHA 12.12 ialah 109.13, 75.99, 61.79, 52.91, dan 43.03 kDa. Analisis zimogram menunjukkan satu protein yang memiliki aktivitas kitinase dengan bobot molekul sebesar 52.91 kDa. Enzim hasil pengendapan SAHA 12.12 memiliki 2 pita dengan bobot molekul 80.02 dan 68.51 kDa. Kedua bobot molekul tersebut memiliki aktivitas kitinase. Hasil uji penghambatan secara in vitro terhadap C. capsici menunjukkan bahwa enzim ekstrak kasar dan hasil pengendapan kedua isolat memiliki efektivitas penghambatan terhadap C. capsici. Hasil tersebut mengindikasikan bahwa kitinase isolat tersebut dapat digunakan sebagai agens biokontrol untuk pengendalian antraknosa pada cabai.
Keyword: Bakteri kitinolitik, Biokontrol, Colletotrichum capsici, Kitinase

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: