Judul: IPB (Bogor Agricultural University)
Abstrak: Primordial Germ Cells (PGC) merupakan sel prekursor sel gamet jantan maupun betina. Sel ini berasal dari lapis epiblast kemudian bermigrasi melewati mesenterium menuju rigi kelamin. Pada umur 13.5 hari pascakoitus (hpk) sel ini berada di rigi kelamin dan sudah mengalami determinasi jenis kelamin. Primordial Germ Cells (PGC) bersifat totipoten dengan gen penanda OCT-4, sehingga PGC diharapkan dapat digunakan dalam terapi penyakit degenaratif ataupun pada kasus infertilitas. Penelitian ini betujuan untuk profiling protein di dalam conditioned medium (CM) dari sel testikuler mencit umur 5 hari, mengkarakterisasi PGC dan menganalisis kemampuan CM dalam menginduksi PGC menjadi sel gamet jantan yang haploid. Penelitian tahap pertama bertujuan untuk mengkarakterisasi perkembangan sel testikuler dan mengidentifikasi spermatogonial stem cells (SSC) dalam kultur in vitro. Sel testiskuler dari mencit umur 5 hari di kultur dalam Dulbecco’s Modified Eagle Medium (DMEM) yang ditambahkan serum 10%, kemudian diinkubasi pada suhu 37 °C, 5% CO2. Perkembangan sel diamati selama 6 hari yang meliputi viabilitas dan population doubling time (PDT). Sel kultur hari ke-1, ke-3 dan ke-6 diwarnai dengan pewarna Periodic Acid Schiff (PAS) untuk mengidentifikasi dan mengukur luas sel testikuler. Secara spesifik, identifikasi SSC menggunakan pewarnaan imunositokimia menggunakan antibodi OCT-4 dan CD90. Hasil penelitian menunjukkan PDT sel testikuler sebesar 0.63 hari dan viabilitas >90%. Persentase sel Sertoli-like meningkat selama kultur, begitu juga dengan sel fibroblast-like yang meningkat pada hari ke-3 dan menurun pada hari ke-6 walaupun tidak signifikan. Sementara itu, sel spermatogonia-like menurun dari hari ke-1 sebesar 54.3%, menjadi 18.7% pada hari ke-6. Luas sel testikuler meningkat signifikan setelah kultur selama 6 hari. Sel testikuler dan SSC di dalam kultur diduga menghasilkan growth factors di dalam niche. Pada akhir kultur (hari ke-6), medium kultur diganti dengan DMEM tanpa serum dengan tujuan sebagai sumber conditioned medium (CM). Penelitian tahap kedua dilaksanakan untuk menganalisis kandungan protein (profiling) serta kandungan hormon testosteron dalam conditioned medium yang diperoleh dari kultur sel testikuler. Profiling protein menggunakan liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS/MS), dan ditemukan 26 jenis protein yang berperan sebagai struktur sel dan proses seluler. Protein yang paling banyak diidentifikasi dalam CM adalah kolagen, yang terdiri atas beberapa jenis, yaitu: Collagen alpha-1(I) chain (Col1a1), Collagen alpha-2(I) chain (Col1a2), Collagen alpha-1(III) chain (Col3a1), Collagen alpha-1(IV) chain (Col4a1) dan Collagen alpha-2(V) chain (Col5a2). Kolagen berperan sebagai matrix extracellular (ECM) dan akan berinteraksi dengan reseptor. Konsentrasi testosteron di dalam CM adalah 0.542 ng/mL. Kandungan CM sel testikuler diharapkan mendukung proses perkembangan sel germinal. Penelitian tahap ketiga adalah karakterisasi fetus sumber rigi kelamin, serta karakterisasi rigi kelamin sebagai sumber PGC baik secara makroskopis maupun mikroskopis, serta perbanyakan PGC. Penelitian tahap ini menggunakan fetus mencit umur 13.5 hpk sebagai sumber rigi kelamin. Fetus diukur dan ditimbang, rigi kelamin diisolasi untuk preparat histologi dan dikultur. Rigi kelamin diwarnai dengan Hematoksilin Eosin (HE) dan pewarnaan immunositokimia menggunakan antibodi VASA sebagai penanda PGC. Perbanyakan PGC dilakukan dengan kultur in vitro selama 9 hari, medium yang digunakan adalah DMEM+Serum 15% dan DMEM+Serum 15% dengan perlakuan penambahan leukemia inhibitory factor (LIF) 1000 IU/mL. Sel kultur diwarnai pada hari ke-3, ke-6 dan ke-9 kultur dengan pewarnaan immunositokimia menggunakan antibodi OCT-4. Hasil penelitian menunjukkan bahwa fetus umur 13.5 hpk dengan ukuran
Keyword: conditioned medium, PGC, proteomik, sel testikuler, spermatogenesis in vitro

Judul: ip
Abstrak: Stem cells atau sel punca merupakan sel yang memiliki kemampuan memperbarui diri dan belum berdiferensiasi secara spesifik. Sel ini secara umum terdiri dari sel punca dewasa dan sel punca embrionik. Sel punca embrionik atau embryonic stem cells (ESC) berasal dari perkembangan embrio tahap blastosis. Blastosis hasil fertilisasi sebagai sumber propagasi ESC sayangnya menimbulkan polemik karena embrio merupakan awal dari kehidupan yang baru sehingga penggunaannya dinilai tidak etis. Salah satu alternatif yang kemudian dikembangkan adalah pseudo embryo yang diperoleh melalui metode partenogenesis. Partenogenesis adalah strategi reproduksi tanpa fertilisasi oleh spermatozoa. Partenogenesis secara alami tidak ditemukan pada mamalia, akan tetapi pemahaman mekanisme seluler aktivasi oosit selama proses fertilisasi memungkinkan proses ini dapat dilakukan. Embrio partenogenesis akan gagal berkembang menjadi individu baru dikarenakan hilangnya kontribusi gen-gen spesifik asal paternal akan tetapi dapat dikultur sampai tahap blastosis untuk kemudian dipropagasi menjadi sel punca. Propagasi blastosis menjadi sel punca membutuhkan beberapa tahapan penting. Blastosis dikultur membentuk koloni primer pada tahap pertama. Koloni primer kemudian dipasase dan dilakukan karakterisasi sampai benar-benar stabil memenuhi kriteria ESC. Koloni primer asal blastosis dapat diarahkan untuk berdiferensiasi dengan metode tertentu salah satunya dengan pemanfaatan conditioned medium. Conditioned medium (CM) adalah medium yang berasal dari kultur sel tertentu, khususnya sel punca dan berbagai jenis sel progenitor lainnya, serta mengandung protein-protein yang disekresikan oleh sel dalam bentuk sekretom. Bukti-bukti ilmiah telah menunjukkan bahwa CM bukan hanya limbah biologis tetapi berpeluang untuk dimanfaatkan. Rangkaian penelitian ini dilakukan untuk menguji potensi CM asal sel otak fetus tikus terhadap diferensiasi neuronal koloni primer dari blastosis fertilisasi dan partenogenetik. Penelitian tahap pertama membuktikan bahwa CM asal sel otak fetus tikus E17 mampu menginduksi diferensiasi neuronal dari koloni primer blastosis fertilisasi. Penambahan CM 50% dapat memerantarai pertumbuhan neurit menghasilkan neuron like cells pada hari ke-7 setelah penambahan CM. Proses diferensiasi awal membentuk struktur menyerupai embryoid bodies, kemudian menjadi round shape cells yang memiliki karakteristik sel neuroepitelial atau radial glial, diikuti dengan perpanjangan neurit. Kandungan dalam CM yang berasal dari sekresi sel otak fetus tikus mendorong terjadinya perpanjangan neurit tersebut. Penelitian tahap kedua mengeksplorasi proses produksi CM untuk mengetahui efek heterogenitas sel dan waktu puasa sel serta mengidentifikasi protein-protein yang ada dalam CM. Hasil penelitian kedua menunjukkan bahwa proses kultur tanpa serum atau proses puasa sel akan memengaruhi heterogenitas sel dan profil sekretom. Berdasarkan analisis dari penelitian tahap ini diketahui bahwa CM1 dengan waktu puasa 24 jam didominasi oleh sel neuron immature. Protein yang terkandung dalam CM1 ini berfungsi untuk pengaturan pertumbuhan sel, stimulasi diferensiasi dan produksi energi. Durasi waktu puasa sel yang lebih panjang yaitu 48 jam menyebabkan dominasi astrosit dan sel glia pada populasi sel. Hal ini disebabkan ketahanan sel glia khususnya astrosit terhadap cekaman stres pada kondisi kultur dan daya hidup astrosit lebih tinggi dibandingkan dengan neuron. Sel progenitor yang masih ada juga memiliki tendensi yang lebih tinggi untuk berdiferensiasi menjadi sel glia pada kondisi tanpa serum. Protein yang disekresikan setelah puasa sel 48 jam yang terkandung dalam CM2 merupakan jenis-jenis protein yang disekresikan oleh astrosit dan lebih berperanan dalam proteksi neuron yang masih tersisa. Identifikasi protein dan analisis fungsional mendasari pemilihan CM1 untuk proses induksi koloni
Keyword: blastosis, conditioned-medium, diferensiasi, koloni primer, neuronal

Judul: Reduksi Reverberasi dengan Narrow Beam Receiver pada Sonar untuk Akurasi Interpretasi Target
Abstrak: Salah satu pembatas utama dalam pendeteksian kelompok ikan adalah reverberasi. Reverberasi dapat sebagian menutupi sinyal echo (echo ikan) sehingga menyyulitkan, kadang tidak memungkinkan penerimaan sinyal. Penutupan sinyal ini terjadi jika besarnya penerimaan sinyal echo lebih kecil daripada peringkat reverberasi pada waktu dan jarak tertentu.
Keyword: