Judul: Detection of Zoonosis Pathogen Q Fever in Ruminant Livestock in Aceh
Abstrak: C. burnetii merupakan agen penyebab Q fever pada hewan dan manusia. C. burnetii ditularkan melalui aerosol dengan rute penularan utama dari hewan reservoir kepada manusia melalui inhalasi. C. burnetii dapat berdiam di dalam sel inang dalam jangka waktu lama (persisten) baik pada manusia maupun hewan. Reservoir utama terhadap kasus Q fever yang terjadi pada manusia adalah melalui hewan ruminansia. Ternak ruminansia yang terinfeksi C. burnetii umumnya akan memperlihatkan gejala gangguan reproduksi. Sapi yang terinfeksi C. burnetii dapat menyebabkan abortus, subfertilitas dan metritis. Penelitian ini bertujuan untuk mendeteksi keberadaan C. burneti sebagai penyebab Q fever pada ternak ruminansia di Provinsi Aceh, serta karakterisasi perubahan jaringan akibat infeksi C. burnetii melalui analisa histopatologi dan molekuler. Sampel yang dikoleksi adalah organ hati, paru, limpa dan ginjal sapi dan kambing dari wilayah Banda Aceh dan Aceh Besar sebanyak 100 sampel sapi dan 15 sampel kambing. Deteksi C. burnetii dilakukan dengan metode nested-PCR menggunakan primer Outer Membrane Protein (OMP). Sampel positif nestedPCR selanjutnya dilakukan analisis patologi menggunakan pewarnaan Hematoksilin dan Eosin (HE) untuk melihat lesi yang terjadi di dalam jaringan. Berdasarkan hasil nested-PCR, materi genetik C. burnetii terdeteksi positif pada 2 dari 100 (2%) individu sampel sapi jenis Brahman Cross (BX) yang berasal dari Rumah Potong Hewan (RPH) Banda Aceh. Hasil pewarnaan HE organ paru, hati, limpa dan ginjal tidak menunjukkan adanya perubahan yang signifikan dan lesi patognomonis akibat paparan C. burnetii. Hasil penelitian ini menunjukkan adanya potensi distribusi C. burnetii pada wilayah yang lebih luas. Pengujian menggunakan metode konfirmatif lainnya perlu dilakukan untuk membuktikan keberadaan antigen C. burnetii seperti pewarnaan imunohistokimia serta sequencing deoxyribo nucleic acid (DNA) untuk mempelajari strain C. burnetii yang ada di Indonesia.
Keyword: Q fever, Coxiella burnetii, Ruminants

Judul: Molecular Detection of Zoonosis Q fever in Ruminants in East Java
Abstrak: Q fever merupakan salah satu penyakit zoonotik strategis di Indonesia yang keberadaannya masih diabaikan. Persebaran penyakit zoonotik Q fever mencakup hampir seluruh negara di dunia, kecuali New Zealand, Norwegia, Islandia, dan French Polynesia. Pemerintah Indonesia melalui Keputusan Menteri Pertanian Republik Indonesia (Kepmentan) no.237/KPTS/PK.400/M/3/2019 menetapkan Q fever sebagai salah satu Zoonosis Prioritas yang perlu mendapatkan prioritas baik dalam pencegahan, pengendalian maupun penanggulangannya. Penyakit ini disebabkan oleh bakteri Gram negatif Coxiella burnetii yang bersifat parasit obligat intraseluler. Bakteri ini diklasifikasikan oleh Center of Diseases Control and Prevention ke dalam kelompok agen infeksius yang berpotensi digunakan untuk senjata biologis. Data surveillance Q fever pada hewan di dunia masih terbatas dan menyebabkan distribusi penyakit ini sulit dideteksi. Kesulitan dalam deteksi dini penyakit ini terutama disebabkan oleh gejala klinis yang tidak khas bahkan sering terjadi infeksi subklinis. Maka dari itu Q fever sering diabaikan dalam diferensial diagnosa, sehingga penyakit ini tetap berada pada kelompok ternak dan menimbulkan kerugian ekonomi dalam jangka panjang. Temuan kasus Q fever di Indonesia terutama dilaporkan terdapat pada ruminansia pada rentang tahun 2006 – 2019 dengan cakupan wilayah meliputi Jakarta, Jawa Barat, Yogyakarta, Bali, dan Sumatera Utara. Keberadaan penyakit ini di Jawa Timur belum dikaji ulang sejak penelitian terakhir di tahun 1976. Jawa Timur dikenal sebagai salah satu propinsi yang memiliki kontribusi besar dalam penyediaan pangan asal hewan di Indonesia. Identifikasi dan deteksi penyakit Q fever penting untuk dilakukan, terutama sebagai upaya penyusunan langkah pengendalian terjadinya wabah di manusia. Penelitian ini dilakukan untuk mendeteksi secara molekuler keberadaan bakteri penyebab zoonosis Q fever pada ternak ruminansia di Propinsi Jawa Timur. Penelitian ini dilakukan sejak bulan September 2015 hingga September 2020 yang terdiri dari dua tahap. Tahap pertama merupakan tahapan optimasi metode imunohistokimia untuk mendeteksi keberadaan bakteri C.burnetii di Kabupaten Bogor yang pernah dinyatakan sebagai wilayah endemis penyakit Q fever. Penelitian ini mengambil sampel organ dari sapi dan domba kurban dari wilayah Kabupaten Bogor pada tahun 2015 dan 2016 yang kemudian dideteksi dengan imunohistokimia menggunakan antibodi poliklonal Rabbit anti-C.burnetii, diperoleh dari FKH IPB dan diamati perubahan gambaran histopatologinya dengan pewarnaan Haematoxyline-Eosin (HE). Tahap kedua penelitian adalah penelitian utama dengan tujuan mendeteksi secara molekuler keberadaan bakteri C.burnetii pada ruminansia di Jawa Timur. Sampel penelitian tahap kedua berupa organ hati, limpa, ginjal, paru-paru, dan jantung ruminansia yang diambil dari rumah potong hewan di Surabaya, Malang, dan Madura. Sampel organ yang didapatkan dideteksi secara molekuler dengan metode nested polymerase chain reaction (nested PCR) menggunakan primer dari gen Outer Membrane Protein (OMP) dan gen 16S rRNA kemudian dikonfirmasi dengan imunohistokimia dan diamati perubahan histopatologi dengan pewarnaan HE. Bakteri C.burnetii terdeteksi positif pada organ paru-paru dan limpa sapi kurban di Kabupaten Bogor dengan metode imunohistokimia yang telah dimodifikasi dan dioptimasi. Hasil pemeriksaan imunohistokimia menunjukkan adanya imunoreaksi positif terhadap antibodi C.burnetii pada 4 dari 19 sampel (21%) sapi kurban tahun 2015 dan 3 dari 10 sampel (30%) sapi kurban tahun 2016. Perubahan gambaran histopatologi yang tampak pada sampel positif meliputi kongesti, infiltrasi sel radang, akumulasi mukus, hingga adanya fibrosis pada paru-paru. Pada organ yang positif uji imunohistokimia terhadap bakteri C.burnetii tidak didapatkan lesi patologis yang konsisten. Hal ini diduga berkaitan dengan
Keyword: Coxiella burnetii, Indonesia, kambing lokal, Q fever, zoonosis

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: