Judul: Autentikasi Ikan tuna (Thunnus sp) dengan metode berbasis PCR-sequencing
Abstrak: Ikan tuna merupakan salah satu komoditas perikanan yang rawan pemalsuan berupa substitusi dengan daging ikan dari spesies yang mirip namun memiliki harga yang lebih rendah. Konsumen sebagai pembeli akan mengalami kerugian (economical fraud) dari pemalsuan sehingga diperlukan suatu cara untuk mengatasi permasalahan tersebut. Autentikasi dengan metode berbasis DNA dapat menjadi salah satu cara mengatasi permasalahan pemalsuan bahan baku daging ikan tuna. Metode berbasis DNA memiliki kelebihan dibandingkan dengan metode berbasis protein diantaranya dapat mendeteksi keaslian suatu produk walaupun telah mengalami proses pengolahan berupa panas dan spesifik untuk setiap organisme. Penelitian ini bertujuan untuk (1) Ekstraksi DNA ikan tuna yang diperoleh dari perusahaan eksportir tuna dan pasar modern (2) Identifikasi spesies berbasis DNA dengan primer spesifik dengan gen target cyt b (3) Karakterisasi DNA ikan tuna hasil autentikasi. Penelitian ini terdiri dari beberapa tahapan yang diawali dengan karakterisasi ikan tuna, ekstraksi DNA menggunakan metode CTAB dan kit vivantis, Proses amplifikasi dengan PCR, elektroforesis, dan penentuan urutan nukleotida. Sampel yang diuji berhasil diekstraksi dan teramplifikasi dengan ukuran yang sesuai yaitu 750 pasang basa. Hasil PCR sequencing menggunakan gen target cyt b berhasil mengidentifikasi bahan baku ikan tuna. Urutan nukleotida hasil PCR sequencing yang telah dicocokkan ke bank data menunjukkan tidak ada pemalsuan berupa subsitusi dengan speises lain. Tingkat homologi merupakan persentase kesamaan spesies yang diuji dengan data yang tersedia di bank data. Spesies yellow fin (Thunnus albacores), albacore (Thunnus alalunga), big eye (Thunnus obesus), dan blue fin (Thunnus macoyyi) memiliki tingkat homologi berturut-turut adalah 99%, 99%, 99%, 100%.
Keyword: 

Judul: Autentikasi aneka produk tuna (Thunnus sp.) dengan metode DNA barcoding
Abstrak: Kasus-kasus penipuan dan pemalsuan penggantian label dalam perdagangan produk perikanan dunia, termasuk tuna, semakin marak terjadi. Kondisi ini menuntut adanya teknik pengembangan dalam penelusuran dan pendeteksian spesies secara cepat dan mudah, dengan hasil yang akurat. Autentikasi spesies berbasis DNA merupakan teknik yang banyak dikembangkan saat ini. Tujuan dari penelitian ini adalah mempelajari autentikasi aneka produk tuna (Thunnus sp) dengan metode DNA barcoding. Penelitian dilaksanakan dalam 2 tahap kegiatan, tahap ke-1 yaitu pengambilan sampel uji produk tuna dan tahap ke-2 berupa pengujian identifikasi spesies tuna dengan DNA barcoding, yang meliputi kegiatan (1) ekstraksi DNA dengan berdasarkan metode CTAB, (2) amplifikasi DNA (PCR) dan (3) identifikasi spesies dengan analisis BLAST dan filogenetik. Sampel tuna yang digunakan meliputi ikan tuna segar dan produk ikan tuna olahan. Sampel tuna segar merupakan ikan tuna jenis Thunnus albacares yang diperoleh dari industri pengolahan tuna dan dikirim dalam bentuk tuna steak segar dengan pengiriman langsung, sedangkan sampel olahan yang digunakan adalah produk sushi dan sashimi ikan tuna dan tuna steak yang dibeli dari restoran dan supermarket. Pengujian identifikasi spesies dilakukan dengan menggunakan pasangan primer COI1 dan COI3 dengan kondisi amplifikasi berupa denaturasi awal (preheating) pada suhu 95 oC selama 5 menit, diikuti sebanyak 39 siklus yang terdiri dari denaturasi 95 oC selama 30 detik, annealing (49-51) oC selama 40 detik dan ekstensi 72 oC selama 60 detik, serta langkah ekstensi akhir 72 oC selama 10 menit.
Keyword: 

Judul: Characteristics of Diurnal Rainfall and its Relationship with Wind Speed and Direction in Bogor City
Abstrak: Kota Bogor merupakan wilayah yang dikelilingi pegunungan dan terbuka terhadap angin laut sehingga menerima curah hujan relatif tinggi. Distribusi curah hujan diantaranya dipengaruhi oleh arah dan kecepatan angin. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis karakteristik curah hujan serta hubungannya dengan arah dan kecepatan angin. Analisis curah hujan serta angin dilakukan dengan mengamati pola, persentase kejadian dan peluang curah hujan bulanan. Hasil analisis data tahun 2017-2020 menunjukkan Kota Bogor memiliki pola curah hujan monsunal semi ekuatorial dengan puncak musim hujan terjadi pada bulan April dan Oktober. Pola curah hujan diurnal menunjukkan adanya peningkatan curah hujan pada siang hari hingga malam hari dengan puncak curah hujan terjadi pada sore hari. Angin dari arah lautan memengaruhi terjadinya hujan konvektif, sedangkan kecepatan angin yang lebih rendah dari arah pegunungan menyebabkan hujan orografis pada malam hari hingga pagi hari. Curah hujan diurnal pada bulan Desember hingga Februari menunjukkan curah hujan dapat terjadi setiap jam, berbeda dengan bulan Juni hingga Agustus yang hampir tidak ada curah hujan pada malam hari hingga awal siang hari. Angin Monsun Barat yang bersifat basah memengaruhi pembentukan hujan setiap jam. Sementara itu, kecepatan angin per menit bersifat tidak stabil saat awal kejadian hingga turunnya hujan dengan arah angin yang berasal dari semua arah. Kejadian hujan rata-rata pada bulan Desember hingga Februari terjadi setiap jam, terjadi peningkatan pada pukul 15.00-18.00 WIB. Peluang curah hujan bulanan lebih dari 60 mm/bulan sebesar 1 dan lebih dari 100 mm/bulan sebesar 0,9., Bogor City is surrounded by mountains and open to sea breezes, receiving relatively high rainfall. Rainfall distribution is influenced by wind direction and speed. This study aims to analyze the characteristics of rainfall and its relationship with wind direction and speed. Analysis of rainfall and wind is done by observing the pattern, percentage of occurrence, and chance of monthly rainfall. The results of data analysis from 2017-2020 show that Bogor City has a semi-equatorial monsoonal rainfall pattern with the peak of the rainy season occurring in April and October. Diurnal rainfall patterns show increased rainfall from day to night with peak rainfall occurring in the afternoon. Winds from the ocean influence convective rainfall, while lower wind speeds from the mountains cause orographic rainfall at night into the morning. Diurnal rainfall in December to February shows that rainfall can occur every hour, in contrast to June to August where there is almost no rainfall during the night to early afternoon. Wet Western Monsoon winds influence the formation of hourly rainfall. Meanwhile, the wind speed per minute is unstable from the beginning of the event to the rainfall with wind direction coming from all directions. Average rainfall events in December through February occur hourly, with an increase at 15:00-18:00 WIB. The probability of monthly rainfall of more than 60 mm/month is 1 and more than 100 mm/month is 0.9.
Keyword: Bogor, rainfall, wind speed, wind direction