Judul: Pengklonan dan Karakterisasi Gen PerL dari Kedelai Peka Cekaman Aluminium
Abstrak: Peroksidase diketahui sebagai salah satu gen yang terinduksi oleh cekaman Aluminium (Al). Pada kedelai kultivar Lumut yang diberi cekaman pH 4 + Al 1,6 mM, terlihat adanya ekspresi gen peroksidase (PerL). cDNA PerL telah diisolasi dari akar tanaman kedelai kultivar Lumut. Penelitian ini bertujuan untuk mengkarakterisasi gen peroksidase dari tanaman kedelai kultivar Lumut yang memiliki sifat peka terhadap cekaman Al. Keberadaan cDNA PerL pada cDNA total diamplifikasi dengan menggunakan primer spesifik yang didesain berdasarkan Arabidopsis thaliana (X71794). cDNA PerL disisipkan ke dalam pGEM®-T Easy dan plasmid rekombinan telah berhasil diintroduksi ke dalam Escherichia coli galur DH5á. Pengurutan cDNA PerL dengan DNA sekuencer ABI Prism Model 310 menghasilkan sekitar 1100 pb yang menyandikan 353 asam amino. Analisis kesejajaran lokal nukleotida dengan Per dari beberapa spesies yang terdaftar di GeneBank menunjukkan bahwa cDNA PerL mempunyai persentase kemiripan sebesar 98% dengan DNA Per dari A. thaliana (X71794). Hasil penelusuran daerah domain terkonservasi menunjukkan bahwa asam amino PerL diduga termasuk ke dalam tipe secretory peroxidase.
Keyword: 

Judul: Ekspresi Gen Gα dan GST Pada Kedelai Kultivar Lumut Yang Mendapat Cekaman Aluminium
Abstrak: Protein G subunit α berinteraksi dengan molekul reseptor yang berlokasi di membran plasma dan terlibat di dalam banyak regulasi sinyal transduksi. Ekspresi gen GST diinduksi oleh cekaman aluminium pada banyak tanaman. Diduga kedua gen ini terlibat dalam mekanisme toleransi tanaman terhadap cekaman aluminium. Tujuan penelitian ini adalah menguji ekspresi gen Gα dan GST kedelai kultivar Lumut yang mendapat cekaman aluminium. Kondisi cekaman dilakukan dengan menggunakan larutan hara. Cekaman yang diberikan yaitu pH 4 dan pH 4+1.6mM Al. Tanaman pada larutan hara pH 6 digunakan sebagai kontrol perlakuan. RNA total diisolasi dengan menggunakan kit Trizol dan sintesis cDNA dilakukan melalui transkriptase balik. Analisis ekspresi kedua gen tersebut dilakukan dengan menggunakan metode PCR. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa gen Gα dan GST diekspresikan tidak begitu berbeda pada tanaman yang diberi cekaman aluminium daripada pH 6 ataupun pH 4. Hal ini menunjukkan bahwa ekspresi gen Gα dan GST tidak terinduksi cekaman aluminium.
Keyword: Analisis Ekspresi Gen, Cekaman Alumunium

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: