Judul: Pengujian Kemurnian Benih Padi dari Tiga Isolasi jarak Melalui Analisis Citra dengan Pemindaian Bidang Datar, Grow Out Test, dan Mikrosatelit.
Abstrak: Pengujian kemurnian benih padi pada umumnya dilakukan secara visual dengan tingkat subjektivitas yang tinggi. Analisis citra digital dengan pemindaian bidang datar atau Image Analysis-Flatbed Scanning (IA-FS) telah dimanfaatkan untuk mengidentifikasi ciri benih suatu varietas. Penelitian ini bertujuan untuk: (1) mengidentifikasi tipe simpang benih padi berdasarkan karakter morfologi bentuk dan warna melalui metode IA-FS yang dikonfirmasi dengan grow out test (GOT); (2) mendapatkan informasi proporsi tipe simpang dari isolasi jarak yang berbeda melalui metode IA-FS, dan (3) mengkonfirmasi tipe simpang dari isolasi jarak yang berbeda melalui metode IA-FS dengan uji GOT dan mikrosatelit. Penelitian dilaksanakan dalam 2 percobaan. Percobaan pertama adalah pengembangan IA-FS sebagai teknik untuk pengujian kemurnian genetik benih. Sebanyak 1200 butir benih masing-masing dari varietas Aek Sibundong dan Sintanur dipindai dengan IA-FS. Benih dievaluasi tingkat kemurnian berdasarkan 5 parameter bentuk (circularity, feret, min feret, AR dan round) dan 3 parameter warna (red, green dan blue). Kemudian benih tersebut ditanam untuk pengujian kemurnian dengan GOT dan diamati ciri-ciri morfologi tanaman di lapangan. Pada percobaan kedua dilakukan pengujian kemurnian benih padi pada tiga isolasi jarak berdasarkan GOT, IA-FS dan mikrosatelit. Benih Aek Sibundong dan Sintanur ditanam berdampingan dengan isolasi jarak 1, 2, dan 3 m. Masingmasing varietas pada tiap isolasi jarak ditanam sebanyak 400 rumpun (4 baris tanaman) dengan jarak tanam 25 x 40 cm. Pengujian kemurnian benih secara GOT per varietas per isolasi jarak. Setelah pengujian GOT selesai, benih dipanen pada malai batang utama pada masing-masing rumpun. Benih dibagi menjadi 2 yaitu benih untuk pengujian IA-FS dan sebagai bahan tanam untuk pengujian mikrosatelit. Untuk IA-FS sampel benih diambil 1 butir benih per malai (100 butir per baris atau tergantung dari jumlah tanaman yang bisa dipanen sebagai benih). Benih dengan jumlah yang sama digunakan untuk pengujian kemurnian berdasarkan mikrosatelit, namun ditanam secara bulk pada masing-masing baris yang sama. Pengujian mikrosatelit menggunakan 3 primer yaitu RM224, RC12 dan Afrag. Hasil penelitian percobaan pertama menunjukkan bahwa metode IA-FS dapat mengkuantifikasi karakter bentuk dan warna benih serta menguji kebenaran varietas Aek Sibundong dan Sintanur. Tingkat akurasi identifikasi kebenaran varietas menggunakan IA-FS yaitu 99.7% pada saat mengkombinasikan parameter bentuk dan warna, 99.2% berdasarkan bentuk dan 93.6% untuk parameter warna saja. Hasil pengujian kemurnian benih berdasarkan IA-FS tidak berbeda nyata dengan pengujian kemurnian dengan GOT di lapangan. Hasil penelitian percobaan kedua menunjukkan bahwa pada isolasi jarak 1, 2, dan 3 m masih ditemukan tipe simpang yang diduga berasal dari penyerbukan yang tidak dikehendaki pada pertanaman Aek Sibundong dan Sintanur. Kemurnian benih berdasarkan IA-FS relatif sama dengan metode GOT pada ketiga isolasi jarak kecuali kemurnian benih pada pertanaman Sintanur dari isolasi jarak 2, 3, dan 3.4 m . Pengujian kemurnian dengan IA-FS relatif stabil untuk pengujian kemurnian berdasarkan bentuk dan warna. Kemurnian benih secara GOT mencapai 100% hanya terjadi pada pertanaman Sintanur dengan isolasi jarak 3-3.4 m. Namun rendahnya tipe simpang yang ditemukan bukan karena isolasi jarak yang semakin jauh sebagaimana ditunjukkan adanya tipe simpang yang lebih tinggi (6.82-7.14%) pada isolasi jarak 3.8-4.2 m. Tipe simpang lain pada Sintanur ditemukan sebanyak > 10% pada isolasi jarak 1-2.2 m, dan 0-16.67% pada isolasi jarak > 2.4 m. Pada pertanaman Aek
Keyword: Aek Sibundong, kemurnian genetik, morfologi, Sintanur, tipe simpang

Judul: Korelasi antara keragaman penotipik dengan marka isozim pada tanaman sengon (Paraserianthea falcataria) di Kebun Benih Parung Panjang, Bogor
Abstrak: Dewasa ini kegiatan pembangunan hutan tanaman sangat pesat. Selain ditujukan untuk memperbaiki lahan-lahan marjinal, juga untuk keperluan Hutan Tanaman Industri (HTI). Jenis-jenis yang diprioritaskan untuk pembangunan HTI salah satunya adalah sengon (P. falcataria). Untuk pembangunan HTI diperlukan benih dalam jumlah besar dan berkualitas tinggi. Salah satu program tersebut adalah pembangunan kebun benih semai uji keturunan untuk jenis sengon yang dilakukan oleh BTP Balitbang Kehutanan di Parung Panjang, Bogor. Mengingat sulit dan lamanya dalam program pemuliaan dan analisis genetik untuk karakter kuantitatif tanaman kehutanan, diperlukan usaha untuk mempercepat proses tersebut. Sehingga tidak perlu menunggu sampai tanaman tersebut besar, dapat diketahui tanaman tersebut berkualitas baik. Saat ini teknik-teknik yang telah dikembangkan untuk tujuan tersebut adalah identifikasi isoenzim (isozim) dan aplikasi teknologi marka molekuler seperti RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA), RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism), mikro satelit, dan sebagainya. Metoda isozim relatif cepat, murah, dan sederhana, serta dapat mendeteksi enzim yang diekspresikan oleh gen pada alel resesif penentu karakter spesifik yang umumnya sering tertutup oleh penampilan visual. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keragaman genetik ketiga sub populasi (Jonggol, Wamena, dan Kediri), mengetahui jarak genetik antar sub populasi tersebut, dan untuk mengetahui korelasi antara keragaman fenotipik dengan marka isozim, pada tanaman sengon (P. falcataria) di kebun Benih Parung Panjang, Bogor, Penelitian ini terdiri dari dua percobaan yakni di lapangan kebun benih Parung Panjang, Bogor pada tanggal 20 Mei dan 25 Mei 1997 dan di laboratorium Genetika Molekuler Puslitbang Bioteknologi-LIPI, Cibinong, yang dilakukan pada tanggal 19 Mei-10 Juni 1997. Bahan tanaman berupa sampel daun muda sengon yang diambil dari beberapa individu dari satu populasi sengon umur satu tahun di petak 31 dan 32. Dari satu populasi sengon yang terdiri dari 3 sumber benih/provenans (sub populasi) yakni Jonggol, Wamena, dan Kediri yang diambil masing-masing sub populasi 30 sampel berfenotip baik dan 30 sampel berfenotip jelek. Metoda penelitian secara garis besar terdiri dari ekstraksi enzim (± 0,3 gram daun sengon ditambah bufer pengekstrak W (0,6 ml)), pembuatan gel pati kentang 11%, penempatan sampel, elektroforesis dengan menggunakan bufer gel histidine (H), pewarnaan isozim dan fiksasi, dan observasi gel. Untuk analisis data dilakukan dengan bantuan program Biosys-1. Hasil penelitian ini secara umum (tanpa dipisah) menunjukkan bahwa dari 7 lokus yang diamati, 3 lokus diantaranya (AAT-2, EST-4, dan SDH-1) bersifat polimorfik di ketiga sub populasi. Pada pertumbuhan yang digolongkan baik lokus...
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: