Judul: Pendeteksian keragaman DNA mikrosatelit sapi Pesisir Sumatera Barat dengan menggunakan primer INRA 037, BM 2113 serta ILSTS 006
Abstrak: Sapi Pesisir Sumatera Barat merupakan salah satu ternak lokal Indonesia. Sapi Pesisir biasa dimanfaatkan oleh masyarakat setempat sebagai ternak potong. Keberadaannya kurang mendapat perhatian dari pemerintah maupun masyarakat, yang menimbulkan kekhawatiran sapi ini akan mengalami kepunahan. Sapi Pesisir sebagai ternak lokal memiliki beberapa keunggulan, antara lain tahan terhadap penyakit, mampu beradaptasi dengan lingkungan yang kurang mendukung, respon terhadap pakan berkualitas rendah dan sistem pemeliharaannya relatif lebih mudah. Keberadaan sapi Pesisir harus terus dipertahankan kelestariannya dengan segera melakukan program pelestarian dan perbaikan mutu genetik. Penelitian ini bertujuan untuk mendeteksi keragaman mikrosatelit sapi Pesisir Sumatera Barat dengan menggunakan primer INRA 037, BM 2113 serta ILSTS 006. Pendeteksian dilakukan melalui teknik PCR (Polymerase Chain Reaction), yaitu teknik perbanyakan DNA dengan menggunakan enzim Polimerase, melalui siklus perubahan suhu. Sampel darah diambil dari 169 ekor sapi Pesisir yang berasal dari dua lokasi, yaitu 100 sampel darah dari Desa Sungai Liku, Kabupaten Pesisir Selatan dan 69 sampel darah dari Desa Ulakan, Kabupaten Padang Pariaman. Kedua lokasi tersebut dipilih karena memiliki lingkungan dan sistem pemeliharaan yang sama sehingga diasumsikan kondisi ternak juga sama. Sampel kemudian diisolasi dan diamplifikasi dengan ketiga primer di atas. Hasil amplifikasi dengan primer INRA 037 menghasilkan 10 alel, primer BM 2113 menghasilkan 11 alel, sedangkan primer ILSTS 006 menghasilkan 6 alel. Frekuensi alel yang dihasilkan beragam dari 0-50%. Perbandingan genotip antar lokasi pada ketiga primer di atas menunjukkan bahwa sapi Pesisir Sumatera Barat yang diambil dari Desa Ulakan, Kabupaten Padang Pariaman lebih beragam dibandingkan dengan Desa Sungai Liku, Kabupaten Pesisir Selatan. Nilai heterozigositas dari ketiga primer cukup tinggi. Primer INRA 037 mempunyai nilai heterozigositas sebesar 77%, primer BM 2113 nilai heterozigositasnya sebesar 75% sedangkan primer ILSTS 006 memiliki nilai heterozigositas sebesar 73%. Tingginya nilai heterozigositas menunjukkan bahwa sapi Pesisir mempunyai keragaman genetik yang tinggi. Keragaman genetik tersebut kemungkinan disebabkan jauhnya hubungan kekerabatan diantara mereka. Hal ini sangat menguntungkan karena makin jauh hubungan kekerabatan maka kemungkinan terjadinya inbreeding makin kecil, sehingga kemunculan alel resesif youg dapat membawa kematian dan cacat juga makin rendah.
Keyword: sapi pesisir, DNA Mikrosatelit, PCR (Polymerase Chain Reaction), amplifikasi DNA, nilai heterozigositas, keragaman genetik

Judul: Kajian Keragaman Genetik Sapi Bali di Pusat Pembibitan Sapi Bali Menggunakan Penciri Mikrosatelit
Abstrak: Sapi Bali merupakan salah satu plasma nutfah nasional yang telah banyak diketahui memiliki keunggulan sebagai potong dan tersebar hampir diseluruh wilayah Indonesia. Pemanfaatan dan perbaikan mutu genetik sapi Bali tidak bisa mengenyampingkan upaya pelestarian sapi Bali. Saat ini program persilangan dan distribusi bibit sapi Bali yang tidak terarah akan menjadi ancaman terhadap timbulnya erosi genetik pada sapi Bali. Upaya dalam mencegah terjadinya erosi genetik pada sapi Bali khususnya di pusat pembibitan sapi Bali perlu dilakukan karateristik genetik. Salah satu pendekatan untuk melakukan karakteristik genetik memalui pendekatan penciri mikrosatelit. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keragaman mikrosatelit di tiga pusat peternakan BPTU Bali, BPT-HMT Serading Sumbawa di Nusa Tenggara Barat, dan Village Breeding Center Kabupaten Barru di Sulawesi Selatan. Jumlah hewan yang digunakan dalam penelitian ini adalah 96 ekor terdiri dari 32 ekor sapi dari BPTU Provinsi Bali, 32 ekor sapi bali dari BPT-HMT Serading Sumbawa, dan 31 ekor sapi Bali dari Village Breeding Center Kabupaten Barru. Lokus mikrosatelit digunakan untuk menentukan keragaman adalah SPS115 lokus, INRA037, MM12, dan ETH185 berdasarkan metode fragmen floureschenly berlabel. Analisis data mikrosatelit pada sapi Bali di tiga lokasi yang berbeda dilakukan dengan menggunakan Program POPGEN1.2, Cervus, dan POPTREE2. Hasil penelitian menunjukkan bahwa keragaman mikrosatelit pada sapi Bali terdeteksi 32 alel dari tiga lokasi yang berbeda, dan terdapat alel spesifik di setiap lokasi. Nilai rata – rata yang diamati heterosigositas (Ho) dan heterozigositas yang diharapkan (He), masing – masing 0.418 dan 0.604, sedangkan nilai rata-rata polymorphism informative content (PIC) adalah 0.579. Keseimbangan Hardy-Weinberg secara umum menunjukkan bahwa lokus yang digunakan dalam sapi Bali di tiga populasi berada dalam keseimbangan Hardy-Weinberg, kecuali lokus INRA037 dan ETH185. Keragaman genetik antara populasi pada sapi Bali adalah 0.033 (3%), sedangkan laju inbreeding adalah 0.296 (29,6%). pohon genetik di tiga lokasi menunjukkan bahwa populasi sapi Bali di BPTU Bali dan VBC Barru memiliki jarak genetik yang dekat dibandingkan dengan populasi sapi Bali di BPT-HMT Serading Sumbawa. Hasil penelitian ini memberikan informasi bahwa karakteristik sapi Bali di tiga populasi pusat pembibitan berbeda, jadi diperlukan program pemuliaan yang terarah di setiap populasi pusat pembibitan sapi Bali.
Keyword: sapi Bali, keragaman genetik, mikrosatelit

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: