Judul: Evaluasi Ketahanan Ikan Mas Turunan Ketiga Yang Mempunyai Marka Molekuler Cyca-DAB1*05 Terhadap Infeksi Bakteri Aeromonas hydrophila
Abstrak: Serangan penyakit merupakan salah satu kendala utama dalam kegiatan budidaya ikan mas Cyprinus carpio, yang dapat menyebabkan kerugian ekonomi yang cukup tinggi, sehingga perlu penanganan yang cukup serius guna mengurangi tingkat kerugian yang ditimbulkan. Adanya infeksi akan ditanggapi oleh sistem pertahanan tubuh khususnya imun non-spesifik sebagai pertahanan pertama terhadap infeksi. Respons imun non-spesifik tersebut dapat diamati melalui uji gambaran darah. Tujuan penelitian ini adalah untuk menguji pengaruh infeksi bakteri Aeromonas hydrophila pada ikan mas turunan ketiga (F3) yang membawa marka molekuler Cyca-DAB1*05 terhadap gambaran darah sebagai respresentasi tanggap kebal ikan mas, serta tingkat kelangsungan hidup ikan mas pascainfeksi. Penelitian ini dilakukan dengan menginfeksikan bakteri A. hydrophila sebanyak 0,1 mL dengan kepadatan bakteri 108 cfu/mL pada ikan mas yang membawa marka molekuler Cyca-DAB1*05. Sebagai kontrol digunakan ikan mas tanpa marka (tidak diseleksi kandungan marka molekulernya), yang diperoleh dari pembudidaya ikan di Bogor, diinfeksi dengan bakteri sebagai kontrol positif, dan diinjeksi dengan bufer fosfat salin sebagai kontrol negatif. Masing-masing perlakuan terdiri atas tiga ulangan. Sebanyak 180 ekor ikan mas diuji tantang menggunakan A. hydrophila, dan ikan dipelihara dalam akuarium berukuran 100x100x60 cm3. Uji tantang dilakukan selama 14 hari. Parameter yang diamati meliputi gambaran darah dan kelangsungan hidup ikan. Darah diambil pada hari ke-0, 3, 7 dan 14 pascainfeksi untuk menghitung total sel darah merah, hemoglobin, hematokrit, total sel darah putih, dan diferensial leukosit. Hasil penelitian terhadap gambaran darah menunjukkan bahwa ikan mas yang membawa marka molekuler Cyca-DAB1*05 memiliki imunitas yang lebih baik dibandingkan ikan mas kontrol. Pada hari ke-3 pascainfeksi, terjadi penurunan total sel darah merah, hemoglobin dan hematokrit. Sebaliknya, pada hari ke-3, total sel darah putih meningkat sebagai indikasi respons imun non-spesifik. Hari ke-7 merupakan puncak dari kinerja respons imun non-spesifik yang ditandai dengan peningkatan total sel darah putih dibandingkan hari ke-3, serta adanya peningkatan persentase monosit dan neutrofil yang berperan dalam mengeliminasi patogen. Hari ke-14, respons imun non-spesifik mengalami penurunan, terlihat dari berkurangnya total sel darah putih, dan diiringi dengan peningkatan total sel darah merah, hemoglobin dan hematokrit. Pengamatan terhadap tingkat kelangsungan hidup menunjukkan ikan mas yang membawa marka molekuler Cyca-DAB1*05 memiliki tingkat kelangsungan hidup 2,6 kali lebih tinggi dibandingkan ikan mas tanpa marka. Dengan demikian, profil gambaran darah ikan mas sejalan dengan daya tahannya terhadap infeksi A. hydrophila.
Keyword: ikan mas, Aeromonas hydrophila, marka molekuler, Cyca-DAB1*05

Judul: Aplikasi Probiotik, Prebiotik dan Sinbiotik Melalui Pakan untuk Pencegahan Infeksi Aeromonas hydrophila pada Ikan Mas Cyprinus carpio
Abstrak: Penyakit motile aeromonad septicemia (MAS) merupakan kendala yang sering dialami dalam budidaya ikan mas. Salah satu alternatif yang dapat dilakukan untuk mengatasi kendala tersebut yaitu dengan aplikasi probiotik, prebiotik dan sinbiotik. Penelitian ini bertujuan untuk menguji efektivitas pemberian bakteri probiotik, prebiotik dan sinbiotik terhadap kelangsungan hidup dan pertumbuhan ikan mas yang diinfeksi dengan A. hydrophila. Sebanyak 15 ekor ikan mas dengan bobot rata-rata 5,09±0,09 g dipelihara di akuarium dengan volume 96 L. Perlakuan yang diberikan yaitu kontrol negatif (K-), kontrol positif (K+) tanpa penambahan probiotik, prebiotik dan sinbiotik, perlakuan penambahan 1% probiotik (A), perlakuan penambahan 2% prebiotik (B) dan perlakuan penambahan sinbiotik (C; 1% probiotik dan 2% prebiotik). Setelah 30 hari, semua perlakuan (kecuali K-) diuji tantang dengan menyuntikkan A. hydrophila sebanyak 100 μL/ekor pada konsentrasi 107 CFU/ml secara intramuskular dan diamati mortalitasnya selama 14 hari. Hasil penelitian menunjukkan bahwa penambahan sinbiotik memberikan kelangsungan hidup yang lebih tinggi (100%) dibandingkan dengan perlakuan kontrol positif (45,83%) serta memberikan pengaruh yang lebih baik terhadap pertumbuhan ikan mas.
Keyword: Aeromonas hydrophila, ikan mas, probotik, prebiotik, sinbiotik

Judul: The Construction of Greedy SVP LLL Algorithm
Abstrak: A lattice is a set of all integer linear combination of a set of linearly independent vectors in ℝ𝑛���. The independent vectors are called bases of lattice. Any lattice can be generated from many bases, and these bases have the same cardinality. In the lattice, the most fundamental and renowned problem is the Shortest Vector Problem (SVP). SVP is a tracking problem of the shortest nonzero vector in a lattice with equivalent bases. In two dimensions, SVP problem has resolved exactly by Gauss’ algorithm. When the lattice dimension is higher than two, A.K. Lenstra, H.W. Lenstra and L. Lovasz gave a LLL algorithm to compute approximation of nonzero shortest vector in the lattice. Reduced bases solution obtained from LLL algorithm still be an approximation and has polynomial running time of arbitrary dimension which large enough. In 1994, Schnoor and Euchner modified this LLL algorithm as a new variant which later was named deep insertion LLL algorithm. This algorithm is a modified version of the LLL algorithm to the terms of the exchange step to improve the accuracy of output of LLL reduced bases and applying it to the subset sum problem. The purpose of this research are: (1) Reconstruct the LLL algorithm and deep insertion LLL algorithm using a geometric approach. (2) Construct a greedy SVP LLL algorithm. (3) Implement the three algorithms in a symbolic programming language, and evaluate them experimentally. A bases ℬ=[𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑛���] in ℝ𝑚��� is called reduced LLL with parameter 𝛿��� if satisfies: (a) |𝜇���𝑗���𝑖���|≤12, for every integer 𝑖���,𝑗��� with 1≤𝑖���<𝑗���<𝑛���. (b)𝛿���‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���)‖2≤‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���+1)‖2, for 𝑗���=1,2,…,𝑛���−1,where 𝛿��� is a reduced parameter of real numbers with 14<𝛿���<1. The first requirement is the reduced basis 𝛿��� must “nearly orthogonal” and in its computation case, this requirement can be reached out by using the Gram-Schmidt’s orthogonalization. While the second requirement is called exchange step, or used to called as Lovasz condition. By using both of these requirements, then they establish the LLL algorithm. Then, Schnoor and Euchner modify the LLL algorithm based on the requirements of the exchange step called the deep insertion LLL algorithm, where the exchange step is based on the comparison of the projected vector in orthogonal complement [𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑘���−1]⊥ after j-th reduction. To construct greedy SVP LLL algorithm, the requirements of the exchange step is based on purely by comparing norm of lattice 𝐛���𝑗��� with norm lattice 𝐛���𝑖��� for 𝑖���=1,2,3…,𝑗���−1. The process of insertion reduced vector after the exchange step also has done greedily. Then, we calculate the number of arithmetic operation in greedy SVP LLL algorithm for further analysis. The result of our exprimentation for three algorithms on the certain matrix size shows that the running time of the three algorithms increases propotional to the size of the matrix. The result also shows that by using 𝛿���=34 for the LLL algorithm and the deep insertion LLL algorithm, and the greedy SVP LLL algorithm which is a new variant made by using no parameter of 𝛿���, outperform of the other of two previous algorithm in terms of speed with the same output.
Keyword: LLL algorithm, LLL deep insertion algorithm, greedy SVP LLL algorithm