Judul: Analisis Komunitas Bakteri Fruktosfer Kelapa Sawit Menggunakan Teknik Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism (T-RFLP)
Abstrak: The knowledge about bacterial community could provide basic information for the development of further research. One method that could be used to analize the diversity of microbial community is Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism (T-RFLP). The objective of this research is to analyze the existing bacterial diversity on oil palm fructosphere. The 16S rRNA genes were amplified by PCR using forward primer (27F) and reverse primer (926R) which have been labeled. The PCR product were then digested with four different enzymes, namely BstUI, MspI, DdeI, and Sau96I. The elecroforegram showed that these enzymes produce different patterns due to the unique restriction sites of each enzymes. In general, BstUI and MspI enzymes produce more Terminal Restriction Fragment (TRF) than two other enzymes. From T-RFLP analysis we could identify some bacterial genus. Bacteria that were predicted to be present in oil palm fructosphere were gram-positive and gram-negative bacteria, Proteobacteria, Actinobacteria, soil bacteria, marine bacteria, and bacteria that could not be cultured.
Keyword: 

Judul: Analisis Keragaman Bakteri Filosfer Padi dengan Metode T-RFLP
Abstrak: Lingkungan filosfer merupakan daerah di bagian tanaman yang berada di atas tanah dan dihuni oleh berbagai mikrob seperti bakteri, cendawan, khamir, dan sebagian kecil protozoa. Bakteri merupakan mikrob paling dominan yang menghuni lingkungan filosfer dan biasanya bersifat komensal bagi tanaman inang. Keberadaan bakteri filosfer diduga berperan dalam pertumbuhan dan ketahanan tanaman terhadap serangan patogen. Seperti spesies tanaman lain, padi yang merupakan makanan pokok penduduk dunia terutama Indonesia selama fase hidupnya juga dihuni oleh berbagai mikrob. Lingkungan filosfer tanaman padi dihuni oleh berbagai mikrob yang berperan dalam pertumbuhan dan ketahanan tanaman terhadap patogen seperti Pyricularia oryzae dan Xanthomonas oryzae pv. oryzae. Peran penting bakteri filosfer padi tersebut mendorong eksplorasi agens biokontrol dari lingkungan filosfer padi untuk mengendalikan patogen penting pada padi. Beberapa tahun terakhir, penelitian tentang bakteri filosfer terbatas pada bakteri yang bisa dikulturkan dengan potensi sebagai agens biokontrol dan bakteri patogen yang menyerang bagian daun tanaman. Pengetahuan terkait keragaman bakteri filosfer khususnya di Indonesia masih sangat terbatas, sehingga pada penelitian ini dilakukan analisis keragaman bakteri filosfer dari tanaman padi yang diambil dari daerah Sukabumi, Jasinga dan Situgede, Bogor, Jawa Barat. Analisis keragaman dilakukan dengan metode T-RFLP dengan menggunakan 2 enzim restriksi untuk mengetahui keefektivan masing-masing enzim tersebut. Penelitian ini diawali dengan pengambilan sampel tanaman padi varietas Ciherang yang dibudidayakan di desa Cikembar, Sukabumi, desa Jasinga dan Situgede, Bogor yang merupakan daerah endemik penyakit blas. Tanaman padi sehat diambil di antara tanaman padi yang terserang penyakit blas. Isolasi bakteri filosfer dari sampel daun padi dilakukan untuk memperoleh genom bakteri dengan pendekatan pengkulturan, sedangkan untuk pendekatan metagenomik, genom bakteri filosfer diisolasi secara langsung dari sampel daun padi. Genom bakteri diekstraksi dengan Power Soil DNA Extraction Kit (Mo Bio Laboratories, Inc.). Gen 16S rRNA selanjutnya diamplifikasi dari genom bakteri menggunakan primer universal yaitu 27F berlabel fluoresens (6-FAM) dan 1429R tanpa label fluoresens. Amplikon gen 16S rRNA dipurifikasi dengan Gel/PCR DNA Fragments Kit (Geneaid Biotech Ltd.) dan hasil purifikasi dipotong dengan enzim restriksi MspI dan BstUI (New England, BioLab). Fragmen hasil pemotongan dianalisis dengan Applied Biosystems Genetic Analyzer dan diinterpretasi menggunakan software analisis GeneMapper® v4.0. Program virtual digest (IsPar) pada webtool MiCA III digunakan untuk mencari afiliasi setiap fragmen dengan data yang ada di Ribosomal Database Project (RDP) (R10 U27) 700,829 Good Qulity (> 1200 Bacteria). Hasil isolasi dan enumerasi bakteri filosfer padi menunjukkan bahwa kelimpahan bakteri filosfer padi berkisar antara 105 sampai 107 cfu/gram daun padi. Pada analisis keragaman bakteri dengan T-RFLP, pemotongan dengan enzim MspI menghasilkan lebih banyak TRF dibandingkan enzim BstUI baik pada pendekatan metagenomik maupun pengkulturan. Analisis afiliasi fragmen pada webtool MiCA III menghasilkan 15 kelompok bakteri dari 29 TRF hasil pemotongan dengan enzim MspI. Diantara 15 kelompok bakteri, Betaproteobacteria dan Pseudomonadales ditemukan di semua sampel tanaman padi baik pada fase vegetatif maupun generatif dengan kelimpahan relatif yang berbeda. Selain dua kelompok bakteri tersebut, juga ditemukan beberapa kelompok bakteri lain dengan kelimpahan relatif yang rendah seperti kelompok bakteri Chloroflexales, Sphingobacteriia, Enterobacteriales dan Epsilonproteobacteria. Setiap sampel memiliki komposisi komunitas bakteri filosfer yang berbeda-beda dengan kelimpahan relatif yang berbeda. Hasil analisis pengelompokan (clustering) diperoleh 2 kluster yang terdiri dari sampel padi Sukabumi (kluster 1)
Keyword: bakteri, filosfer, padi, T-RFLP

Judul: Sintesis Superkonduktor YBa2Cu3O7-X Dengan Proses Pelelehan dan Karakterisasinya
Abstrak: Superkonduktor adalah bahan yang memiliki resistansi nol dan dapat melayang di atas magnet. Kedua sifat itu tampak pada saat bahan berada di bawah kondisi parameter kritisnya, yaitu batas kemampuan bahan tersebut dalam: menghantarkan arus tanpa resistansi (Jc) dan mempertahankan superkonduktifitasnya saat berada dalam medan magnet kritis (He) selain kedua parameter ini, superkonduktivitas juga dibatasi oleh suhu kritis (Te) yaitu kondisi suhu yang harus dipenuhi agar bahan dapat menampilkan kedua sifat tersebut. Karena itu penelitian superkonduktor umumnya ditujukan untuk meningkatkan ketiga parameter kritis tersebut, agar bahan ini dapat diaplikasikan seeara nyata. Dalam upaya meningkatkan parameter kritis bahan tersebut, pada penelitian ini dilakukan proses sintesis superkondu1.-tor dengan proses sintering yang kemudian dilanjutkan dengan proses pelelehan. Proses sintering merupakan proses yang telah umum digunakan, dan telah berhasil mendapatkan Te yang tinggi. Namun harga Jc yang diperoleh masih relatif rendah. Hal ini disebabkan karena produk superkonduktor yang dihasilkan melalni proses ini memiliki banyak sumber-sumber "weak link" berupa pori, celah dan cacat kristal lainnya serta mengandung fasa-fasa non-superkonduktif. Proses pelelehan bertujuan untuk mereduksi sumber-sumber "weak link" melalui proses grain alIignment dan mengendalikan kandungan fasa non-superkonduktif seperti fasa Y-211 sehingga harga Je dapat meningkat.
Keyword: