Judul: Produksi dan karakterisasi biokimiawi protease eschericia coli DH5@ rekombinan
Abstrak: Xanthomonas campesimis pv glycines IFL merupakan isolat bakteri lokat penyebab penyakit bisul pada tanaman kedelai yang menghasilkan protease ekstraseluler dengan kisaran pH optimum luas dan suhu optimum yang cukup tinggi (30-70°C) Produksi dan aktivitas protease Xanthomonas dapat terhambat dengan adanya pembentukan gum xanthan Pengklonan gen protease X. campestris pv glycines IFL ke dalam E. call DH5a dengan menggunakan vektor pRK415 dimaksudkan untuk menghasilkan protease IFL. tanpa kehadiran produk lain sekaligus meningkatkan produksi dan aktivitas enzim tersebut. Penelitian ini bertujuan untuk memproduksi protease E. coli DiSa rekombinan dan melakukan karakterisasi biokimiawi protease rekombinan sekaligus membandingkannya dengan protease X. campestris pv. glycines IFL. selaku donor gen Tahap awal dari penelitian ini adalah pembuktian keberadaan gen protease pada rekombinan dengan cars mengintroduksikan kembali gen tersebut kepada X campestris mutan protease melalui proses konjugasi yang melibatkan tiga tetua (triparental mating). Introduksi gen rekombinan kepada X campestris mutan menyebahkan A campestris kembali mampu memproduksi protease dalam jumlah besar. Aktivitas spesifik (unit aktivitas'mg protein) dari protease X. campestris mutan, X. campestris (pRK415) dan X. campestris (pRK415 rekombinan) dengan waktu fermentasi 48 jam pada media LB adalah 0,045, 0,402 dan 0,051 dan pada media LCT (Limbab Cair Tatu) sebesar 0,077, 0,101 dan 0,176 Pengukuran aktivitas protease dilakukan dengan menggunakan metode Bergmeyer et al (1983) dan penentuan kadar protein dilakukan dengan metode Bradford (1976). Bakteri E. coli DHSx rekombinan yang ditumbuhkan pada media PYGB (Pepton 2%, ektrak khamir 1%, dan gliserol 3%) dengan waktu fermentasi 24 jam memberikan aktivitas protease terbesar dibandingkan bila bakteri tersebut ditumbuhkan pada media LB dan LCT skin 0.5%+ Ca 5mM Aktivitas protease yang dihasilkan pada kondisi optimum ini berkisar antara 0,032 0,042 Unit/ml. Penambahan skim pada media PYGB tidak menambah aktivitas protease yang dihasilkan Penelitian lebih lanjut untuk melihat ekspresi dari gen protease rekombinan pada E coli dilakukan dengan membandingkan karakterisasi biokimia dari enzim tersebut dengan protesse X campestris IFL. Dari hasil karakterisasi pH diketahui bahwa proscase yang dihasilkan oleh E. con DH5u rekombinan memiliki pH optimum 8.5 yang berbeda dengan při optimum dari protease X. campestris IFL yaitu 7.5. Pola penganult suhu terhadap aktivitas kedua enzim hampir sama dan dan suhu optimum keduanya adalah 60°C. Penambahan EDTA pada protease E cow DHSa rekombinan memberikan efek penghambatan yang lebih besar dengan aktivitas sisa 26.145% pada penambahan 5 mM sedangkan aktivitas sisa protease X campestris IFL. pada penambahan yang sama adalah 55% PMSF yang merupakan inhibitor spesifik strin ternyata menghambat protease E. coli DH5a rekombinan dengan aktivitas sisa sebesar 69.47% dan 34.86% pada penambahan 1 dan 5 mM sedangkan aktivitas sisa protease X. campestris IFL pada konsentrasi yang sama adalah 75% dan 25% Hasi karakterisasi biokimiawi protease menunjukan adanya kemiripan antara protease E coù DHSa rekombinan dengan protease X. campestris IFL Dari hasil zimogram dengan menggunakan pewama Comassie Blue diketahui bahwa enzim protease yang ada pada E. coù DHS rekombinan terdiri dari dua jenis dengan berat molekul kurang lebih 49.000 dan 45.000 dalton
Keyword: 

Judul: Telaah pemulihan aktivitas protease Escherichia coli DH5x rekombinan
Abstrak: Pengklonan gen protease Xanthomonas campestris pv. glycines IFL ke dalam E. coli DH5a dimaksudkan untuk meningkatkan produksi dan aktivitas enzim tersebut. Pengklonan tersebut telah berhasil dilakukan dimana fragmen EcoR1 berukuran 6,2 kb dari kromosom Xanthomonas campestris pv. glycines IFL digabungkan dengan vektor pRK 415 (10,5 kb; resisten terhadap tetrasiklin) yang telah dilinierkan dengan EcoRI lalu ditransformasikan ke dalam Escherichia coli DH5a sehingga dihasilkan Escherichia coli DH5a rekombinan (pMB8) yang mengandung insert berukuran 2,9 kb. Penelitian ini bertujuan untuk memperbaiki ekspresi protease rekombinan dengan cara: (1) melakukan subkloning insert dengan menggunakan vektor pIT101 (6,144 kb; resisten terhadap kanamisin dan gentamisin) dan inang E. coli JM107 serta (2) pemulihan/renaturasi aktivitas protease rekombinan. Target yang ingin dicapai ialah: (1) ukuran fragmen DNA penyandi protease yang lebih pendek daripada ukuran insert awal (2,9 kb) dan (2) peningkatan aktivitas protease rekombinan...
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: