Judul: Hubungan senyawa fenilik dengan ketahanan varietas padi terhadap gibberella fujikuroi (Saw.) Wollenw
Abstrak: Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui apakah senyawa fenolik mempunyai korelasi dengan ketahanan tanaman padi terhadap penyakit bakanae. Jika senyawa fenolik berperan dalam ketahanan padi terhadap penyakit bakanae, jenis senyawa fenolik apa saja yang mempunyai peran tersebut. Padi yang diuji adalah varietas Tapus, IR42, Apostol, dan GEB-24. Percobaan dilakukan dengan menggunakan pot dan bak plastik di rumah kaca. Analisis senyawa fenolik dilakukan dengan menggunakan HPLC. Senyawa fenolik berperan dalam ketahanan tanaman padi terhadap serangan patogen. Pada varietas Tapus yang agak tahan terhadap penyakit, kandungan senyawa fenoliknya lebih tinggi dibanding kandungannya pada varietas IR42, Apostol, dan GEB-24 yang rentan.
Keyword: 

Judul: Dampak Penggunaan Fungisida Sintetik terhadap Kelimpahan Cendawan Endofit dan Perkembangan Penyakit Tanaman Padi
Abstrak: Aplikasi fungisida umum digunakan dalam pengendalian penyakit-penyakit padi. Penggunaan fungisida dianggap memiliki pengaruh negatif terhadap organisme non-target termasuk cendawan endofit. Cendawan endofit pada padi telah berhasil diisolasi dan di antaranya mampu meningkatkan pertumbuhan serta ketahanan tanaman inang dari cekaman biotik dan abiotik. Keberadaan cendawan endofit di dalam jaringan tanaman tidak terlepas dari pengaruh keadaan lingkungan sekitarnya, salah satunya adalah pengaruh penggunaan fungisida sintetik. Namun, pengetahuan tentang dampak fungisida terhadap cendawan endofit belum banyak diketahui. Tujuan penelitian ini adalah: (1) mendapatkan informasi mengenai keanekaragaman dan kelimpahan cendawan endofit tanaman padi akibat penggunaan fungisida sintetik; dan (2) mengetahui hubungan antara perubahan keanekaragaman dan kelimpahan cendawan endofit dengan perkembangan penyakit pada tanaman padi karena penggunaan fungisida. Penelitian dilakukan dari bulan Juni 2018 hingga Maret 2019 di Balai Besar Peramalan Organisme Pengganggu Tanaman Jatisari Karawang dan di Laboratorium Mikologi Tumbuhan Departemen Proteksi Tanaman IPB. Tahapan penelitian dimulai dari persiapan lahan, penanaman padi, isolasi cendawan endofit, dan aplikasi fungisida. Percobaan di lapangan terdiri atas dua taraf faktor yaitu fungisida kontak (mankozeb), fungisida sistemik (difenokonazol), dan kontrol sebagai pembanding. Isolasi cendawan endofit dan aplikasi fungisida dilakukan setiap minggu, dimulai saat tanaman berumur 3 hingga 10 minggu setelah tanam (mst). Variabel yang diamati dan dihitung adalah total segmen daun dan batang padi yang dikolonisasi cendawan endofit, jenis dan jumlah spesies cendawan endofit, serta frekuensi kolonisasi cendawan endofit. Selanjutnya dihitung indeks keanekaragaman Shanon-Wiener, indeks kemerataan, dan indeks kesamaan Sorensen cendawan endofit dari setiap perlakuan. Lima isolat cendawan endofit dengan frekuensi kolonisasi tertinggi diuji antagonis terhadap penyebab penyakit busuk pelepah (Sarocladium oryzae) dan juga diuji patogenisitas terhadap benih padi. Tingkat keparahan dan kejadian penyakit tanaman padi juga diamati dalam uji coba lapangan. Hubungan antara cedawan endofit dan keparahan dan kejadian penyakit tanaman padi dianalisis dengan korelasi Pearson. Hasil penelitian menunjukkan bahwa ada peningkatan kolonisasi cendawan endofit dengan pertambahan umur tanaman padi. Terdapat 37 morfospesies cendawan endofit yang berhasil diisolasi dari daun dan batang tanaman padi. Berdasarkan analisis indeks keanekaragaman Shanon-Wiener dan indeks kemerataan, cendawan endofit pada batang lebih beragam daripada daun padi. Berdasarkan analisis indeks kesamaan Sorensen, cendawan endofit antara berbagai perlakuan memiliki kesamaan spesies yang tinggi. Genus dominan cendawan endofit yang mengolonisasi daun dan batang padi yaitu Acremonium, Curvularia, Fusarium, Helminthosporium, Nigrospora, Penicillium, dan Mucor. Pengaruh fungisida terhadap cendawan endofit daun dan batang padi tidak menunjukkan perbedaan yang nyata. Namun, pada batang, frekuensi kolonisasi cendawan endofit menurun selama fase pertumbuhan muda tanaman dengan perlakuan mankozeb dan difenokonazol. Frekuensi kolonisasi genus Nigrospora dan Fusarium juga menurun pada batang dengan perlakuan difenokonazol selama fase pertumbuhan muda tanaman. Mankozeb dan difenokonazol berpengaruh secara nyata mengurangi keparahan penyakit bercak cokelat sempit (Cercospora oryzae) pada 9 dan 10 mst, tetapi tidak memengaruhi keparahan penyakit hawar daun bakteri (Xanthomonas oryzae pv oryzae). Sementara itu, mankozeb dan difenokonazol meningkatkan kejadian penyakit busuk pelepah pada 8 mst. Berdasarkan analisis korelasi Pearson, hubungan antara indeks keanekaragaman cendawan endofit (H’) dengan tingkat keparahan dan kejadian penyakit tidak konsisten di setiap minggu. Dengan perlakuan difenokonazol, indeks keanekaragaman (H’) cendawan endofit pada batang konsisten berkorelasi positif terhadap keparahan penyakit bercak cokelat sempit setiap minggu. Analisis korelasi Pearson antara frekuensi kolonisasi genus dominan
Keyword: difenokonazol, keanekaragaman, kolonisasi, komunitas, mankozeb

Judul: The Construction of Greedy SVP LLL Algorithm
Abstrak: A lattice is a set of all integer linear combination of a set of linearly independent vectors in ℝ𝑛���. The independent vectors are called bases of lattice. Any lattice can be generated from many bases, and these bases have the same cardinality. In the lattice, the most fundamental and renowned problem is the Shortest Vector Problem (SVP). SVP is a tracking problem of the shortest nonzero vector in a lattice with equivalent bases. In two dimensions, SVP problem has resolved exactly by Gauss’ algorithm. When the lattice dimension is higher than two, A.K. Lenstra, H.W. Lenstra and L. Lovasz gave a LLL algorithm to compute approximation of nonzero shortest vector in the lattice. Reduced bases solution obtained from LLL algorithm still be an approximation and has polynomial running time of arbitrary dimension which large enough. In 1994, Schnoor and Euchner modified this LLL algorithm as a new variant which later was named deep insertion LLL algorithm. This algorithm is a modified version of the LLL algorithm to the terms of the exchange step to improve the accuracy of output of LLL reduced bases and applying it to the subset sum problem. The purpose of this research are: (1) Reconstruct the LLL algorithm and deep insertion LLL algorithm using a geometric approach. (2) Construct a greedy SVP LLL algorithm. (3) Implement the three algorithms in a symbolic programming language, and evaluate them experimentally. A bases ℬ=[𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑛���] in ℝ𝑚��� is called reduced LLL with parameter 𝛿��� if satisfies: (a) |𝜇���𝑗���𝑖���|≤12, for every integer 𝑖���,𝑗��� with 1≤𝑖���<𝑗���<𝑛���. (b)𝛿���‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���)‖2≤‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���+1)‖2, for 𝑗���=1,2,…,𝑛���−1,where 𝛿��� is a reduced parameter of real numbers with 14<𝛿���<1. The first requirement is the reduced basis 𝛿��� must “nearly orthogonal” and in its computation case, this requirement can be reached out by using the Gram-Schmidt’s orthogonalization. While the second requirement is called exchange step, or used to called as Lovasz condition. By using both of these requirements, then they establish the LLL algorithm. Then, Schnoor and Euchner modify the LLL algorithm based on the requirements of the exchange step called the deep insertion LLL algorithm, where the exchange step is based on the comparison of the projected vector in orthogonal complement [𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑘���−1]⊥ after j-th reduction. To construct greedy SVP LLL algorithm, the requirements of the exchange step is based on purely by comparing norm of lattice 𝐛���𝑗��� with norm lattice 𝐛���𝑖��� for 𝑖���=1,2,3…,𝑗���−1. The process of insertion reduced vector after the exchange step also has done greedily. Then, we calculate the number of arithmetic operation in greedy SVP LLL algorithm for further analysis. The result of our exprimentation for three algorithms on the certain matrix size shows that the running time of the three algorithms increases propotional to the size of the matrix. The result also shows that by using 𝛿���=34 for the LLL algorithm and the deep insertion LLL algorithm, and the greedy SVP LLL algorithm which is a new variant made by using no parameter of 𝛿���, outperform of the other of two previous algorithm in terms of speed with the same output.
Keyword: LLL algorithm, LLL deep insertion algorithm, greedy SVP LLL algorithm