Judul: Analisis Surut Astronomis Terendah di Perairan Sabang, Sibolga, Padang, Cilacap dan Benoa Menggunakan Superposisi Komponen Harmonik Pasang Surut.
Abstrak: Surut astronomis terendah yang selama ini digunakan sebagai chart datum seperti pada pemetaan, navigasi dan penetapan batasan wilayah ditentukan berdasarkan surut terendah dari superposisi komponen harmonik pasang surut (pasut) dalam selang waktu 18,6 tahun. Namun, sebenarnya saat ini belum ada ketentuan yang baku dalam menentukan surut astronomis terendah sehingga diharapkan melalui suatu analisis terhadap surut astronomis terendah yang selama ini digunakan maka dapat ditemukan suatu cara baru dalam menentukan surut astronomis terendah. Pertama menganalisis amplitudo setiap komponen harmonik pasut untuk memastikan bahwa pada saat surut astronomis terendah setiap komponen harmonik pasut berada dalam amplitudo minimum karena superposisi dari amplitudo minimum setiap komponen harmonik pasut pada waktu yang bersamaan akan menghasilkan surut astronomis terendah yang maksimum. Kedua menganalisis selang waktu 18,6 tahun untuk memastikan bahwa pada saat surut astronomis terendah selang waktu 18,6 tahun berada dalam periode satu gelombang karena terdapat nilai terendah yaitu lembah dalam satu gelombang yang merupakan surut astronomis terendah. Data yang digunakan adalah data pasut satu tahun (2007) dari Bakosurtanal di Perairan Sabang, Sibolga, Padang, Cilacap, dan Benoa yang kemudian diolah menggunakan perangkat lunak World tides (Matlab) dengan metode least squares sehingga menghasilkan komponen harmonik pasut M2, S2, N2, K2, K1, O1, dan P1. Ketujuh komponen ini dipilih berdasarkan persentase amplitudo terbesar dari 35 komponen harmonik pasut yaitu persentase amplitudo di atas 2% dengan kisaran persentase amplitudo kumulatifnya 82,34% sampai 86,40%. Melalui komponen tersebut kemudian dilakukan perkiraan perubahan pasut hingga 18,6 tahun dan 10.000.000 jam (1.140,77 tahun). Hasil analisis pertama menunjukkan bahwa amplitudo minimum setiap komponen harmonik pasut di lima lokasi tidak berada pada waktu yang bersamaan selama 18,6 tahun dan 1.140,77 tahun sedangkan hasil analisis kedua menunjukkan bahwa melalui cara visual terbentuk empat gelombang dalam selang waktu 18,6 tahun sehingga periode satu gelombang adalah 4,65 tahun. Jadi, surut astronomis terendah di Perairan Sabang, Sibolga, Padang, Cilacap, dan Benoa ditentukan berdasarkan superposisi komponen harmonik pasut (M2, S2, N2, K2, K1, O1, dan P1) dalam selang waktu 4,65 tahun. Amplitudo dan waktu surut astronomis terendah tersebut adalah 0,213 m di Sabang (04/03/2007 22:00 WIB), 1,297 m di Sibolga (13/09/2007 07:00 WIB), 1,163 m di Padang (05/03/2007 19:00 WIB), 0,293 m di Cilacap (22/04/2008 19:00 WIB), dan -0,491 m di Benoa (21/04/2008 09:00 WITA).
Keyword: 

Judul: Analisis Variasi Muka Laut di Perairan Sabang, Sibolga, Padang, Cilacap dan Benoa Menggunakan Metode Wavelet.
Abstrak: Adanya data muka laut dari hasil pengukuran stasiun pasang-surut yang terdapat di Sabang, Sibolga, Padang, Cilacap dan Benoa merupakan suatu modal yang sangat mendukung untuk mengetahui mengenai perubahan kondisi laut di daerah tersebut. Kemudian dilakukan analisis dan pengkajian dari data yang telah ada tersebut. Tujuan dari penelitian ini adalah menganalisis pola variasi muka laut di stasiun yang dikaji untuk mengetahui pola rambatannya dan menganalisis periode fluktuasi muka laut pada tiap stasiun melalui spektrum densitas energi untuk mengetahui fenomena-fenomena yang terjadi serta menunjukkan hubungan fluktuasi muka laut antar stasiun melalui spektrum korelasi silang. Pola variasi muka laut yang terjadi di tiap stasiun ditampilkan dalam bentuk grafik dengan menggunakan metode wavelet І dimensi pada perangkat lunak matlab 7.1. Untuk menganalisis variasi muka laut berdasarkan periode dilakukan analisis spektrum densitas energi, sedangkan untuk mengetahui hubungan antara muka laut antar stasiun ditunjukkan dengan analisis spektrum korelasi silang. Penghitungan ini menggunakan perangkat lunak statistica 6. Secara umum tinggi muka laut di stasiun yang dikaji memperlihatkan adanya periode tengah tahunan (semi annual), tinggi muka laut mengalami dua kali maksimum dan dua kali minimum dalam setahun. Terjadinya tinggi maksimum pada periode bulan April hingga bulan Mei (musim peralihan 1) dan pada bulan November ( musim peralihan 2) di stasiun yang dikaji diperkirakan disebabkan oleh adanya gelombang Kelvin yang terbentuk di Samudera Hindia. Periode fluktuasi spektrum densitas energi muka laut yang ditemukan di tiap stasiun mengindikasikan adanya beberapa fenomena seperti fenomena musiman (seasonal), intra musiman (intraseasonal) dan dua mingguan (fortnightly). Hubungan yang erat fluktuasi muka laut terdapat pada korelasi silang antara stasiun Sabang dan Sibolga, Sabang dan Padang, Sibolga dan Padang, Padang dan Cilacap, Cilacap dan Benoa yang mengindikasikan bahwa adanya saling keterkaitan mengenai perubahan muka laut yang terjadi. Hubungan fluktuasi muka laut antara di Padang dan Sibolga sangat erat pada periode 4-6 bulan yang ditunjukkan dengan nilai koherensi sebesar 0,98 untuk periode 4 bulan dan 0,97 untuk periode 6 bulan. Nilai beda fase bernilai negatif yang berarti bahwa fluktuasi muka laut terjadi terlebih dahulu di Padang kemudian diikuti fluktuasi muka laut di Sibolga setelah 12 jam untuk periode 4 bulan dan 2 hari untuk periode 6 bulan. Secara fisik ini berarti bahwa perubahan muka laut berupa perambatan gelombang bermula dari Padang menuju ke Sibolga.
Keyword: 

Judul: Kloning dan Ekspresi Human Interferon-alfa2a pada Yeast Metilotropik Pichia pastoris
Abstrak: Interferon (IFN) is a group of proteins that are secreted by body cells as a result of exposure to biological vertebrates such as: viruses, bacteria, protozoa and other compounds. There are three types of interferon, namely: alpha (α), beta (β) and gamma (γ) IFN. Interferon-α2a belongs to the type I interferon. This protein has a molecular weight of 21.550 kDa and consists of 188 amino acids (23 amino acid of signal peptide and 166 amino acids of mature protein). Interferon-α2a is also known to be used for the treatment of hepatitis C and as anti-tumor and antivirus agents. Regulator gene for IFN production under normal conditions, is in the off position to IFN is not produced. But when there are external stimuli, both viral and bacterial infections, a regulator gene switches on, and IFN production system running. At the time of an attack from a variety of disease agents actually the body will produce IFN, but generally the amount produced is not sufficient to fight the disease agents that multiply very quickly. Therefore IFN intake from outside is needed. This is the beginning of the use of IFN as a drug. Genetic engineering is an activity to manipulate the genes to get new products by creating recombinant DNA through gene insertion. Recombinant DNA technology has been used to produce IFN. Yeast such as Pichia pastoris can be an alternative as the host (system) to express human interferon genes and as a producer of IFN protein. Expression system P. pastoris offers several advantages for the production of recombinant proteins, such as: the high level expression of recombinant proteins, ease of scaling-up fermenter, low cost and ease of transformation techniques and selection of transformed cells such as bacteria . The existence of inducible AOX1 promoter is very strong, easily control the expression of recombinant proteins by induction. AOX1 is a promoter that controls gene expression of alcohol oxidase to metabolize methanol as carbon source of P. pastoris. Therefore,this study aimed to clone human interefron-α2a (hifnα2a) gene in E. coli and express it in metylotrophic yeast P. pastoris. Vector used in this study is pPICZαB (Invitrogen). Ligation process between insert (hifn-α2a gene) and vector (pPICZαB) performed by using T4 DNA ligase, which functions synthesize the formation of phosphodiester bonds linking the nucleotides with nucleotide insert plasmid vectors to produce recombinant (pPICZαB-hifnα2a). This recombinant plasmid transformed into XL1 blue cells (E. coli) by Heat shock method. The results of sequencing analysis (clone 6) using 5'AOX and 3'AOX primers indicate that DNA base sequence of human IFN-α2a genes has been subclone into pPICZαB vector (in frame). Recombinant plasmid (clone 6) linearized using BstX1 enzyme before transformed into X33 yeast cell. Transformation into cell was done by Electroporation. The X33 cell P. pastoris strain was used to express human interferon-α2a. X33 is strains with the phenotype Mut+ (methanol utilization plus) and can be used for positive transformants selection using zeocin. Phase protein production work using Mut+ strain occurred in two phases. The first phase is the use of glycerol to obtain a certain amount of biomass (high cell
Keyword: