Judul: Korelasi antara keragaman penotipik dengan marka isozim pada tanaman sengon (Paraserianthea falcataria) di Kebun Benih Parung Panjang, Bogor
Abstrak: Dewasa ini kegiatan pembangunan hutan tanaman sangat pesat. Selain ditujukan untuk memperbaiki lahan-lahan marjinal, juga untuk keperluan Hutan Tanaman Industri (HTI). Jenis-jenis yang diprioritaskan untuk pembangunan HTI salah satunya adalah sengon (P. falcataria). Untuk pembangunan HTI diperlukan benih dalam jumlah besar dan berkualitas tinggi. Salah satu program tersebut adalah pembangunan kebun benih semai uji keturunan untuk jenis sengon yang dilakukan oleh BTP Balitbang Kehutanan di Parung Panjang, Bogor. Mengingat sulit dan lamanya dalam program pemuliaan dan analisis genetik untuk karakter kuantitatif tanaman kehutanan, diperlukan usaha untuk mempercepat proses tersebut. Sehingga tidak perlu menunggu sampai tanaman tersebut besar, dapat diketahui tanaman tersebut berkualitas baik. Saat ini teknik-teknik yang telah dikembangkan untuk tujuan tersebut adalah identifikasi isoenzim (isozim) dan aplikasi teknologi marka molekuler seperti RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA), RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism), mikro satelit, dan sebagainya. Metoda isozim relatif cepat, murah, dan sederhana, serta dapat mendeteksi enzim yang diekspresikan oleh gen pada alel resesif penentu karakter spesifik yang umumnya sering tertutup oleh penampilan visual. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keragaman genetik ketiga sub populasi (Jonggol, Wamena, dan Kediri), mengetahui jarak genetik antar sub populasi tersebut, dan untuk mengetahui korelasi antara keragaman fenotipik dengan marka isozim, pada tanaman sengon (P. falcataria) di kebun Benih Parung Panjang, Bogor, Penelitian ini terdiri dari dua percobaan yakni di lapangan kebun benih Parung Panjang, Bogor pada tanggal 20 Mei dan 25 Mei 1997 dan di laboratorium Genetika Molekuler Puslitbang Bioteknologi-LIPI, Cibinong, yang dilakukan pada tanggal 19 Mei-10 Juni 1997. Bahan tanaman berupa sampel daun muda sengon yang diambil dari beberapa individu dari satu populasi sengon umur satu tahun di petak 31 dan 32. Dari satu populasi sengon yang terdiri dari 3 sumber benih/provenans (sub populasi) yakni Jonggol, Wamena, dan Kediri yang diambil masing-masing sub populasi 30 sampel berfenotip baik dan 30 sampel berfenotip jelek. Metoda penelitian secara garis besar terdiri dari ekstraksi enzim (± 0,3 gram daun sengon ditambah bufer pengekstrak W (0,6 ml)), pembuatan gel pati kentang 11%, penempatan sampel, elektroforesis dengan menggunakan bufer gel histidine (H), pewarnaan isozim dan fiksasi, dan observasi gel. Untuk analisis data dilakukan dengan bantuan program Biosys-1. Hasil penelitian ini secara umum (tanpa dipisah) menunjukkan bahwa dari 7 lokus yang diamati, 3 lokus diantaranya (AAT-2, EST-4, dan SDH-1) bersifat polimorfik di ketiga sub populasi. Pada pertumbuhan yang digolongkan baik lokus...
Keyword: 

Judul: Studi keragaman tripsin inhibitor dan keragaman genetik isoenzim pohon plus sengon (Paraserianthes falcataria (L) Nilesen) pada hutan rakyat di Jawa Barat
Abstrak: Penelitian ini bertujuan : (1) Mengetahui keragaman nilai TIA (Aktivitas Tripsin Inhibitor) pada tegakan pohon plus sengon. (2) Mengetahui keragaman genetik tegakan pohon plus sengon dengan marka isozim. (3) Mengetahui korelasi nilai TIP. dengan marka isozim. Penelitian ini terdiri dari dua percobaan yang berbeda. Percobaan penelitian pertama adalah penelitian mengenai aktivitas tripsin inhibitor pohon plus sengon sebanyak 18 buah pada populasi Subang, Cianjur, dan Sukabumi. Percobaan ini menggunakan rancangan acak lengkap (RAL) dan rancangan acak lengkap (RAL) faktorial dengan dua faktor. Faktor pertama bagian pohon yang digunakan yaitu kayu dan kulit dan faktor kedua adalah umur pohon yang digunakan terdiri dari 4, 5. 8. dan 10 tahun. Banyaknya ulangan adalah satu sampai lima (1-5). Percobaan penelitian kedua adalah mengenai keragaman genetik isoenzim pohon plus sengon sebanyak 18 buah pada lokasi Subang, Cianjur dan Sukabumi. Analisis isoenzim dilakukan dengan menggunakan metode yang dikembangkan oleh Hartati dkk. (1996) pada tanaman sengon. Hasil penelitian kemudian diamati dalam bentuk pita atau bandmorph. Semua tipe pita yang terbentuk diinterpretasikan sebagai lokus dan alel dan dijadikan dasar dalam pengukuran parameter-parameter yang ada dalam suatu populasi. yaitu frekuensi alel. persentase lokus polimorpik. rata-rata jumlah alel per lokus dan rata-rata alel efektif, derajat heterozigositas, indeks fiksasi, dan jarak genetik. Selain percobaan di atas dilakukan pengujian hubungan atau korelasi antara keragaman aktivitas tripsin inhibtor (percobaan pertama) dan marka isoenzim pohon plus (percobaan kedua) dilihat dari zimogramnya. Hasil penelitian percobaan pertama menunjukkan bahwa kisaran nilai aktivitas tripsin inhibitor pada kayu pohon plus sengon pada seluruh lokasi (Subang, Cianjur,dan Sukabumi) pengambilan contoh adalah 5,28 - 9,7 TIU/mg contoh. Nilai aktivitas terendah terdapat pada kayu pohon plus sengon (4 tahun) di Subang dan tertinggi terdapat pada pohon plus sengon (10 tahun) di Sukabumi. Kisaran nilai aktivitas tripsin inhibitor pada kulit pohon plus sengon pada seluruh lokasi (Subang, Cianjur, Sukabumi) pengambilan contoh adalah 6,55 - 18,75 TIU/mg contoh. Pada umumnya pada masing-masing lokasi mengalami penurunan aktivitas sejalan dengan bertambahnya umur pohon. Percobaan kedua menunjukkan penyebaran alel dalam lokus beragam pada tiga belas lokus yang diperoleh. Delapan lokus diantaranya (PER-A, PER-C, PER-B, AAT-B, ACP-A, ACP-B, EST-B dan ENP-B) bersifat polimorpik di Subang dan 3 lokus bersifat polimorpik (PER-A, ADH-B, dan AAT-B) di populasi Cianjur. Rata-rata indeks fiksasi seluruh populasi adalah - 0,1997. Nilai negatif menunjukkan bahwa kecenderungan semua populasi kelebihan heterozygositas. Secara keseluruhan populasi sengon di jawa Barat memiliki nilai keragaman genetik yang rendah dilihat dari rer.dahnya nilai Fsr (16,7 persen), sehingga dapat dikatakan sengon di P. Jawa memiliki kekerabatan genetik yang dekat satu sama lain. Dan berdasarkan analisa kelompok terdapat dua kelompok, yaitu (1) subang dan (2) sukabumi dan Cianjur. Korelasi aktivitas tripsin inhibitor dengan marka isozim memperlihatkan nilai korelasi yang rendah, tetapi apabila dilihat dari pola pita pada zimogram maka ada pola-pola pita yang khas yang menunjukkan nilai TIA yang rendah atau tinggi pada lokus-Iokus tertentu. Pada populasi Subang lokus EST-B dan ENP-B (15.32.028) memiliki pola pita yang khas untuk nilai TIA yang rendah (kulit dan kayu) dan tinggi (15.32.022)
Keyword: Acacia auriculiformis, Acacia mangium, Paraserianthes falcataria, Eucaliptus, Gmelina arborea

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: