Judul: Molecular Identification of Fungi and Genetic Diversity of Agarwood (Aquilaria spp.) in North Aceh District, Aceh Province, Molecular Identification of Fungi and Genetic Diversity of Agarwood (Aquilaria spp.) in North Aceh District, Aceh Province
Abstrak: Gaharu merupakan hasil hutan bukan kayu beraroma wangi berwarna gelap yang terbentuk akibat luka dari family Thymeleaceae jenis Aquilaria dan Gyrinops. Tiga faktor utama dalam pembentukan gaharu yaitu adanya tanaman yang berpotensi menghasilkan gaharu Aquilaria spp., adanya patogen tertentu (cendawan) dan lingkungan yang mendukung. Gaharu telah digunakan sebagai bahan baku industri parfum, kosmetik, upacara keagamaan, dan obat-obatan. Gaharu merupakan salah satu komoditi ekspor dan memiliki nilai jual yang sangat mahal. Negara penghasil gaharu hingga saat ini belum mampu memenuhi kebutuhan pasar dunia. Petani gaharu Indonesia saat ini telah berusaha keras untuk melakukan pemenuhan kebuthan pasar dengan teknik budidaya dan inokulasi. Beberapa spesies yang sedag digalakkan petani Indonesia adalah A. Malaccensis A. microcarpa, A. beccariana, A. hirta, Gyrinops versteegii, A. filaria dan A. cumingiana, A. subintegra dan A. crassna. Beberapa laporan telah dijelaskan bahwabanyak mikroba yang telah digunakan untuk induksi gaharu seperti Aspergillus spp., Penicillium, Fusarium, Lasiodiploidia, Chaetomium, Botryodiplodia spp. Diplodia spp., Fusarium bulbiferum, F. laterium, F. oxysporum, Pythium sp. danTrichoderma sp., dan Fusarium. Provinsi Aceh yang merupakan salah satu daerahprodusen gaharu alami di Indonesia, hingga saat ini belum ada laporan tentangidentitas jenis tanaman dan mikroba yang mampu menghasilkan gaharu dengankualitas super. Oleh karena itu perlu dilakukan karakterisasi dan identifikasiterhadap jenis tanaman dan cendawan penghasil gaharu yang ada di Provinsi Aceh. Tujuan penelitian adalah 1) untuk melakukan karakterisasi dan identifikasi tanaman penghasil gaharu yang ada di Provinsi Aceh; 2) untuk mengkarakterisasi dan mengidentifikasi cendawan penghasil gaharu yang ada di Provisi Aceh dan 3) melakukan pengujian cendawan terhadap tanaman penghasil gaharu yang ada di Provinsi Aceh. Materi genetik yang digunakan adalah 66 aksesi tanaman penghasil gaharu asal Provinsi Aceh untuk karakterisasi dan identifikasi tanaman penghasil gaharu, 100 bibit tanaman penghasil gaharu untuk uji tingkat virulensi dari cendawan hasil isolasi, karakterisasi dan identifikasi serta empat isolat cendawan penghasil gaharu yang diambil dari lokasi penelitian di Aceh. Tanaman penghasil gaharu yang digunakan merupakan tanaman yang tumbuh liar (bukan budidaya) yang ada dilokasi penelitian. Metode yang digunakan dalam penelitian ini meliputi survey lapangan dan uji laboratorium. Survey lapangan dilakukan untuk mengumpulkan data morfologi tanaman dan uji laboratorium dilakukan untuk mendapatkan data molekuler. Uji laboratorium dilakukan dengan menggunakan primer matK, ITS dan trnLtrnF untuk karakterisasi dan identifikasi tanaman penghasil gaharu, dan primer ITS digunakan untuk karakterisasi dan identifikasi cendawan penghasil gaharu. Karakterisasi morfologi dan molekuler dengan menggunakan marka matK, ITS dan trnL-trnF berhasil mengkarakterisasi dan mengidentifikasi tanaman penghasil gaharu asal Kabupaten Aceh Utara Provinsi Aceh. Hasil yang diperoleh adalah terdapat tiga jenis tanaman penghasil gaharu di lokasi penelitian di Aceh yaitu jenis Aquilaria malaccensis, Aquilaria beccarana dan Aquilaria microcarpa. Hasil karakterisasi dan identifikasi terhadap cendawan penghasil gaharu yang ditemukan di Kabupaten Aceh Utara adalah cendawan jenis Fusarium solani. Hasil uji lapangan pemberian cendawan Fusarium solani hasil isolasi dan identifikasi dapat menghasilkan gubal gaharu terhadap pohon Aquilaria microcarpa yang merupakan hasil identifikasi dalam penelitian ini. Hasil analisis GC-MS terhadap gubal yang dihasilkan akibat pemberian isolat dapat menghasilkan senyawa terpenoid dan kromon pada semua perlakuan dan pada perlakuan kontrol negatif hanya diperoleh senyawa terpenoid saja. Hal ini dapat disimpukan bahwa bahwa tanaman penghasil gaharu dan isolat asal lokasi penelitian dapat
Keyword: Aquilaria, Fusarium solani, Kromon, Provinsi Aceh, Terpenoid

Judul: Kandungan Kimia Gaharu dan Ekspresi Gen Sesquiterpene synthase 1 (SesTPS1) pada Aquilaria malaccensis Lamk dan Gyrinops versteegii Domke
Abstrak: Gaharu adalah salah satu Hasil Hutan Bukan Kayu (HHBK) dengan karakter resin berwarna hitam dan wangi yang dimanfaatkan sebagai bahan baku produk industri dan obat-obatan. Tanaman penghasil gaharu endemik Indonesia, seperti Aquilaria malaccensis dan Gyrinops versteegii saat ini, tidak secara otomatis menghasilkan resin beraroma dan berwarna hitam seperti gaharu alami. Teknologi bioinduksi menggunakan cendawan patogen Fusarium solani telah dinilai memiliki pengaruh signifikan membentuk gaharu artifisial. Tanaman yang telah diinokulasi oleh cendawan mengeluarkan zat fitoaleksin sebagai mekanisme pertahanan dan terakumulasi menjadi gaharu yang merupakan metabolit sekunder. Kajian mengenai kandungan senyawa konstituen gaharu sangat diperlukan guna mengidentifikasi kandidat gen yang terlibat sebagai gen pengkode enzim Sesquiterpene synthase. Sesquiterpenoid merupakan senyawa yang dominan pada resin gaharu yang dihasilkan salah satunya melalui jalur biosintesis mevalonate (MVA). Tujuan dari penelitian ini yaitu mengidentifikasi kandungan senyawa kimia pembentuk gaharu yang terbentuk pada tanaman tingkat semai dan pohon jenis A. malaccensis LamK dan G. versteegii Domke setelah diberi perlakuan inokulasi cendawan F. solani asal Jambi dan Malinau. Kemudian, mendeteksi kandidat gen pengkode enzim Sesquiterpene syhnthase 1 (SesTPS1) dan HMG-CoA Reductase 2 (HMGR2) serta menganalisis ekspresi kandidat gen pengkode enzim Sesquiterpene syhnthase 1 (SesTPS1) pada tanaman A. malaccensis Lamk dan G. versteegii Domke. Kandungan senyawa kimia gaharu dianalisis melalui perbandingan pola fragmentasi spektrofotometri massa antara sampel dengan perpustakaan data WILEY 9. Gen pengkode enzim SesTPS1 dan HMGR2 dideteksi menggunakan PCR dengan primer spesifik yang didesain berdasarkan sekuen yang telah diketahui pada database NCBI. Selanjutnya, gen pengkode enzim SesTPS1 dianalisis ekspresinya menggunakan quantitativePCR (qPCR) dengan metode kuantitas relatif. Hasil analisis kandungan senyawa kimia menunjukkan senyawa konstituen gaharu mampu teridentifkasi pada tingkat semai dan pohon, tetapi lebih banyak terdeposit pada tingkat pohon. Sesquiterpenoid merupakan kelompok senyawa penciri gaharu yang teridentifikasi dengan dugaan senyawa cis-jasmone dan aromadenderenepoxide. Penciri gaharu lainnya adalah turunan kromon berupa senyawa 8-methoxy-2-(2-phenylethyl)chromen-4-one dan 7-(benzyloxy)-5-hydroxy-2-methylchromone. Ditinjau berdasarkan jenis tanaman, maka jenis Aquilaria malaccensis memiliki total konsentrasi relatif senyawa penciri gaharu yang lebih tinggi yakni sebesar 18.07% dibandingkan dengan Gyrinops versteegii dengan nilai 4.24%. Senyawa konstituen lainnya berasal dari kelompok aromatik yang terdiri atas benzilaseton, guaiacol, p-ethylguaiacol, syringaldehyde, phenol, dan vanillin dan kelompok asam lemak yang terdiri atas asam laurat, asam oleat, dan asam palmitat, serta kelompok triterpen berupa squalen. Hasil analisis molekuler menunjukkan bahwa kandidat gen pengkode enzim biosintesis gaharu berupa HMGR2 mampu terdeteksi pada A. malaccensis dan G. versteegii dengan panjang 1 500 pb, sedangkan SesTPS1 terdeteksi dengan panjang 1 900 pb pada A. malaccensis dan 1 400 pb pada G. versteegii. Ekspresi kandidat gen pengkode enzim biosintesis sesquiterpene synthase 1 (SesTPS1) pada A. malaccensis yang diinokulasi memiliki nilai 17.2X lebih tinggi dari kontrolnya dan pada G. versteegii yang diinokulasi memiliki nilai ekspresi 44.6X lebih tinggi dibandingkan dengan kontrolnya.
Keyword: Aqularia malaccensis, Gyrinops versteegii, inokulasi fungi, konstituen gaharu, Sesquiterpenoid synthase.

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: