Judul: Penentuan perbedaan antara ikan dengan megaplankton melalui analisis beda mean volume backscattering strength(MVBS)
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk membedakan antara ikan dengan megaplankton melalui analisis beda mean volume backscattering strength dan menganalisis hubungan antara penyebaran kawanan ikan dengan faktor-faktor oseanografi (suhu dan salinitas). Data echogram diperoleh dari hasil kerja sama survei akustik di Perairan Selatan Jogjakarta yang dilakukan oleh tim FPIK-IPB dengan Tokyo Unversity of Marine Science and Technology dari tanggal 9-24 Desember 2003. Kedalaman perairan yang diambil dalam pengolahan data akustik ini adalah kedalaman 11,25 hingga 157,50 meter, dan dibagi setiap 11,25 meter kedalaman atau 10 kali nilai resolusi vertikal.
Keyword: 

Judul: Nilai Hambur Balik Plankton Di Perairan Laut Jawa Menggunakan Alat Akustik Simrad ME70
Abstrak: ABSTRAK CHANDRA HEGAR PANGESTU. Nilai Hambur Balik Plankton Di Perairan Laut Jawa Menggunakan Alat Akustik Simrad ME70. Dibimbing oleh Dr. Ir. Sri Pujiyati, M.Si dan Asep Priatna, S.Pi, M.Si. Plankton dibagi menjadi fitoplankton dan zooplankton, fitoplankton merupakan organisme mikroskopis yang mampu menghasilkan bahan organik dari bahan anorganik melalui proses fotosintesis dengan bantuan cahaya Pengolahan data mengenai sebaran dan kelimpahan plankton dilakukan sebagai media untuk melihat wilayah perairan mana saja yang memiliki potensi perikanan yang cukup baik, plankton dijadikan sebuah indikator untuk melihat tinggi atau rendahnya potensi perikanan di wilayah perairan tersebut. Dengan metode akustik maka dapat diketahui besarnya nilai hambur balik planton dalam satuan dB. Penelitian ini bertujuan untuk melihat sebaran nilai Volume backscattering strength plankton (SV) dengan menggunakan alat instrumentasi hidroakustik Simrad ME70 dengan frekuensi yang dianalisis pada frekuensi 116 kHz di perairan Laut Jawa. Setelah mendapatkan data akustik berupa tampilan echogram kemudian data diolah menggunakan software Echoview dengan batas variable -90 dB s/d -70 dB. Data echogram tersebut kemudian diekstrak dalam bentuk data Excel. Nilai SV di perairan Laut Jawa menggunakan alat Akustik Simrad ME 70 Frekuensi 116 KHz menunjukkan selang nilai Volume back Scattering (SV) -88,99 dB sampai -82,56 dB. Hasil penelitian membuktikan bahwa sebaran plankton secara horisontal banyak ditemukan SV besar pada di lokasi tengah perairan. Kelimpahan plankton secara vertikal banyak ditemukan pada kedalaman 20-40m dan berdasarkan waktu memiliki fluktuasi dari waktu ke waktu di setiap perairan. Kata kunci : ME 70, horizontal, vertikal, temporal
Keyword: ME 70, horizontal, vertikal, temporal

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA