Judul: Kajian Trend Tata Hijau pada Lanskap Area Permainan Lapangan Golf di Kabupaten Bogor
Abstrak: Melepaskan penat sangat dibutuhkan agar pikiran dapat beristirahat dari aktivitas yang dilakukan setiap hari. Beragam jenis olah raga yang dapat dilakukan dalam melepaskan penat salah satunya adalah golf. Olah raga ini juga menonjolkan lanskap alam sekitar sehingga pemain dapat berolah raga sambil berekreasi. Permainan golf ini dilakukan pada area terbuka dan pemain dapat menikmati keindahan alam sekitar permainan. Estetika lanskap dan fungsi dalam penataan ruang terbuka hijau pada lapangan golf memberikan nilai plus bagi olah raga golf sehingga menarik minat pemain dalam berolah raga. Keberadaan tanaman dalam suatu lanskap akan menghasilkan suatu trend tata hijau tersendiri dalam pemilihan jenis tanaman dan penataan tanaman. Gunung Geulis Golf & Country Club, Padang Golf Bukit Pelangi, dan Sentul Highlands Golf Club merupakan tiga lapangan golf yang terkenal di daerah Bogor. Penataan dan penggunaan tanaman pada tiga lapangan golf memunculkan trend tersendiri yang menjadi ciri khas dari lapangan golf. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui trend tata hijau yang terdapat pada lanskap lapangan golf di wilayah kabupaten Bogor dari segi penataan tanaman yang digunakan untuk estetika dan fungsi penanaman pada area permainan golf tersebut serta menyusun konsep tata hijau pada ketiga lanskap lapangan golf sebagai rekomendasi bagi para pengelola di ketiga lapangan golf. Hasil akhir penelitian ini dibatasi pada produk rekomendasi tata hijau dalam bentuk planting plan. Area studi yang diamati adalah bagian-bagian dari lanskap lapangan golf, yaitu tee box, rough, hazard, green, dan fairway. Keragaman jenis pohon, semak/perdu, groundcover dan rumput pada sebagian besar area studi pada tiga lokasi tergolong rendah. Lapangan golf Gunung geulis memiliki keragaman jenis pohon yang tergolong sedang dengan nilai 1,26. Jenis pohon dengan kelimpahan tertinggi pada lapangan golf Gunung Geulis adalah kelapa (Cocos nucifera), kelimpahan tertinggi pada lapangan golf Rainbow Hills adalah pinus (Pinus merkusii) dan kupu-kupu (Bauhinia purpurea), dan kelimpahan tertinggi pada lapangan golf Sentul Highlands adalah pinus (Pinus merkusii). Fungsi tanaman yang dibutuhkan pada ketiga lapangan golf adalah pembatas visual (screen), penahan erosi, pembatas hole permainan (border), dan peneduh. Secara keseluruhan, pemenuhan fungsi tanaman pada ketiga lokasi tergolong baik. Nilai aspek estetika pada sebagian besar area studi tergolong sedang.
Keyword: area permainan, estetika tanaman, fungsi tanaman, golf, lanskap, lanskap golf, olahraga, pemilihan tanaman, penat, trend

Judul: Trend Tata Hijau pada Lanskap Area Permainan Lapangan Golf Klub Golf Bogor Raya
Abstrak: Arrangement of plants is important in a golf course landscape which it add beauty, functions for comfort. The purpose of this research was to know the trend of green system in each landscape units of KGBR golf course that indicated by plant diversity and arrangement of plants. The research was also aimed to draw up recommendation on the green system of golf course. Diversity of plants on KGBR golf course were observed including value of frequency, value of abundance, dominance of species, and diversity index of plant. The function and aesthetic aspects of the plants was also analyzed by comparing the existing condition with ideal criteria obtained from study of literatures. Results of studies indicated that the plant with highest value of dominance, frequency, and abundance in most of golf course was Bermuda grass (Cynodon dactylon var. ’tifway’). The trend of green system in KGBR was designed with the concept of arboretum or collection of trees species ,which can be seen from the plants selection was mostly the type of trees. The diversity index of trees and shrubs in most of study area was classified in medium diversity. Meanwhile, groundcover plants in most of study area was classified in low diversity. Study area with highest diversity index of tree species (2,98) was found in area of 10th hole. The functional aspect in most of area studies is good and very good. The trend of plants arrangement in tee box and fairway in KGBR can grouped into three types, such as: line planting type, group planting type, and combination both line and group planting type. The plant arrangement in green areas was classified into two types, such as arrangement that only used tree formation with line type and arrangement that used the combination of trees, shrubs, and groundcover plants with line and group types.
Keyword: 

Judul: Reprocessing Crystal Structure of Vibrio  cholerae Multidrug and Toxic Compound Extrusion (MATE) Transporter with  AlphaFold2 as Search Model for Molecular Replacement
Abstrak: Transporter ESBM (Ekstrusi Senyawa Beracun dan Multi Obat) pada Vibrio cholerae telah diidentifikasi sebagai salah satu faktor penyebab resistensi terhadap antibiotik. Namun, struktur ESBM yang tersedia pada RCSB (3MKT) masih memiliki kualitas rendah. Penelitian ini bertujuan memperbaiki struktur kristal transporter ESBM V. cholerae pada database dengan struktur prediksi AlphaFold2. Struktur prediksi AlphaFold2 memiliki tingkat kepercayaan tinggi berdasarkan nilai plDDT sebesar 82,9 dan pTM sebesar 0,851 yang digunakan sebagai model dasar molecular replacement dengan nilai top LLG sebesar 826,549 dan top TFZ sebesar 25,6, dilanjutkan dengan proses refinement. Hasil refinement menunjukkan adanya perbaikan signifikan dalam berbagai parameter struktural seperti Rfree, Rwork, clashscore, Ramachandran outliers, sidechain outliers, dan Real Space Correlation. Superimpose antara struktur hasil refine dengan struktur awal pada database menghasilkan nilai RMSD sebesar 3,086 Å. Proses refinement yang dilakukan menghasilkan struktur yang secara keseluruhan memiliki kualitas yang lebih baik dari struktur database, Multidrug and Toxic Compound Extrusion (MATE) transporter in Vibrio cholerae has been identified as a significant contributor to antibiotic resistance. However, the available MATE structure in the RCSB database (3MKT) has suboptimal quality. This study aimed to enhance the crystal structure of MATE transporter in the database using the AlphaFold2 predicted structure which has a high level of confidence based on a plDDT score of 82.9 and pTM score of 0.851. The predicted structure of AlphaFold2 served as a search model for Molecular Replacement with top LLG and TFZ scores of 826.549 and 25.6, respectively, followed by a refinement process. The refinement process significantly enhanced various structural parameters such as Rfree, Rwork, clashscore, ramachandran outliers, sidechain outliers, and Real Space Correlation. Superimposing the refined structure with the initial structure in the RCSB database revealed an RMSD value of 3.086 Å. The conclusion of this research was the refinement process results had been better quality structure than the database structure
Keyword: AlphaFold2, MATE transporter, molecular replacement, refinement, x-ray crystallography