Judul: Pendugaan stok perikanan demerrsal serta analisa hubungan antara hasil tangkapan survei trawl dengan suhu dan salinitas di Perairan Teluk Lampung
Abstrak: Penelitian ini dilaksanakan pada tanggal 5 Februari hingga tanggal 15 Februari 1996 di Perairan Teluk Lampung, Propinsi Lampung dengan menggunakan Kapal Latih Mahasiswa Stella Maris Fakultas Perikanan IPB. Penelitian ini tergabung dalam tim Ekspedisi Ratu-Sebesi Fakultas Perikanan IPB. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menduga dan potensi lestari perikanan demersal di Perairan stok Teluk Lampung serta menganalisa hubungan faktor oseanografi yakni, suhu dan salinitas dengan tangkapan ikan demersal selama survey berlangsung. Metode yang digunakan untuk menduga stok perikamm demersal adalah metode swept area, yaitu suatu metode pendugaan stok dengan cara menyapu dasar perairan di area tertentu menggunakan alat tangkap trawl. Perhitungan utama dalam metode swept area ini adalah menghitung luas area sapuan yang menjadi tempat penelitian. Luas area sapuan dihitung dengan mengetahui lebar bukaan mulut jaring dan jarak yang ditempuh selama pengoperasian trawl. Survei trawl pada penelitian ini dilaksanakan pada tanggal 9 - 15 Februari 1996.
Keyword: 

Judul: Pendugaan stok dan parameter biologi ikan kurisi(Nemipterus japonicus) di Perairan Teluk Lampung
Abstrak: Informasi mengenai stok sumberdaya ikan sangat diperlukan oleh para perencana pembangunan perikanan khususnya bagi pembangunan perikanan tangkap. Dalam rangka mendapat- kan informasi ini diperlukan suatu survei eksplorasi, disamping mengembangkan sistim pengumpulan data statistik hasil tangkapan di tempat-tempat pendaratan ikan. Sampai saat ini satu-satunya pilihan terbaik untuk pendugaan stok ikan demersal adalah dengan menggunakan metode swept area. Prinsip dasar dari metode ini adalah menyapu dasar perairan dengan jaring trawl dasar dan ikan- ikan yang tertangkap merupakan sumber data penelitian. Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Pebruari 1996 dengan mengikuti cruise RATU-SEBESI dengan KM. Stella Maris dengan lokasi di perairan Teluk Lampung. Penelitian ini bertujuan untuk menduga kepadatan stok, biomassa dan potensi penangkapan lestari serta menentukan parameter biologi berupa hubungan panjang-berat ikan kurisi (Nemipterus japonicus). Metode yang digunakan dalam pendugaan stok ikan dalam penelitian ini adalah metode swept area dengan pengoperasian jaring trawl dasar. Disain survei yang digunakan dalam pengoperasian jaring trawl dasar ini adalah stratified random sampling dengan pembagian kedalaman daerah survei menjadi dua strata kedalaman yaitu strata I dengan kedalaman dasar perairan 20 30 meter dan strata II dengan kedalaman dasar perairan lebih dari 30 meter. Disain survei ini digunakan karena ikan kurisi jarang menyebar seragam dan kebanyakan kelimpahan ikan kurisi (Nemipterus japonicus) dihubungkan dengan kedalaman dasar perairan. ...
Keyword: 

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA