Judul: Keragaman dan Respon Ketahanan Phalaenopsis amabilis (L.) Blume Hasil Iradiasi Protocorm terhadap Dickeya dadantii
Abstrak: Phalaenopsis amabilis (L.) Blume merupakan salah satu anggrek asli Indonesia. Anggrek spesies ini merupakan tetua penting dalam kegiatan pemuliaan, karena memiliki sepal dan petal yang berwarna putih. Warna tersebut dimanfaatkan pemulia sebagai sumber warna putih untuk warna bunga anggrek hibrida yang diinginkan oleh pemulia. Karakter yang tidak diinginkan pada anggrek spesies ini adalah rentan terhadap penyakit busuk lunak. Penyakit ini dapat mematikan tanaman secara cepat, sehingga menjadi kendala dalam budidaya tanaman. Kerugian ekonomi juga merupakan dampak dari penyakit tersebut, karena anggrek Phalaenopsis memiliki nilai ekonomi yang tinggi dalam komoditas anggrek. Peningkatan keragaman genetik untuk memperbaiki karakter tersebut sangat penting dilakukan. Penelitian ini melakukan induksi mutasi menggunakan iradiasi sinar gamma untuk memperoleh karakter tanaman yang tahan terhadap penyakit busuk lunak. Penelitian ini terbagi menjadi dua percobaan, yaitu: (1) keragaman morfologi, stomata dan molekuler antar individu planlet Phalaenopsis amabilis (L.) Blume hasil iradiasi protocorm dan (2) evaluasi metode inokulasi dan respon ketahanan antar individu planlet Phalaenopsis amabilis (L.) Blume hasil iradiasi protocorm terhadap Dickeya dadantii. Keragaman yang dihasilkan dari perlakuan iradiasi perlu dilakukan analisis keragaman yang terdapat pada anggrek Phal. amabilis. Iradiasi mutasi dilakukan pada fase protocorm dan ditumbuhkan menjadi planlet. Terdapat lima populasi planlet yang dievaluasi, yakni planlet tanpa iradiasi protocorm dan planlet hasil iradisi protocorm sebesar 5, 10, 15 dan 20 Gy. Identifikasi keragaman dilakukan berdasarkan karakter morfologi daun, stomata dan molekuler. Keragaman terdapat pada semua karakter yang dievaluasi. Semua karakter morfologi daun yang dievaluasi menunjukkan keragaman, kecuali tebal daun dan tekstur permukaan daun. Keragaman juga terjadi pada karakter stomata, dimana beberapa individu planlet memiliki kerapatan stomata yang rendah, ukuran stomata besar dan jumlah kloroplas tinggi yang diindikasi merupakan tanaman poliploid. Keragaman yang tinggi dihasilkan dari planlet hasil iradiasi protocorm baik pada keragaman morfologi daun maupun stomata. Hasil tersebut menunjukkan iradiasi sinar gamma melalui protocorm berhasil meningkatkan keragaman genetik anggrek Phal. amabilis. Keragaman dikonfirmasi secara genetik melalui analisis molekur menggunakan marka SNAP berbasis gen ketahanan yaitu Pto. Analisis molekuler berdasarkan 11 lokus Pto menunjukkan terjadi keragaman pada planlet kontrol maupun iradiasi. Keragaman terindikasi dengan adanya perubahan alel pada bebrapa planlet di lokus-lokus tertentu. Keragaman diindikasi berasal dari variasi somaklonal dan iradiasi sinar gamma. Keragaman akibat variasi somaklonal terlihat dengan adanya kontrol yang memiliki perubahan alel pada lokus tertentu. Keragaman akibat iradiasi juga ditemukan pada tanaman hasil iradiasi yang juga mengalami perubahan alel pada lokus yang tertentu. Berdasarkan pohon filogenetik dari 11 lokus Pto yang dievaluasi, planlet terbagi menjadi tiga kelompok besar, dimana tanaman wild type sebagai outgroup. Sebagian besar individu planlet berada pada kelompok IIIb. Hasil ini dapat dimanfaatkan sebagai dasar pengelompokan individu berdasarkan kriteria ketahanan planlet yang dievaluasi terhadap penyakit busuk lunak akibat infeksi bakteri Dickeya dadantii. Metode inokulasi dan uji ketahanan tanaman terhadap Dickeya dadantii berhasil dilakukan dengan metode leaf disk assay. Berdasarkan evaluasi metode inokulasi menunjukkan pelukaan jaringan merupakan cara bakteri dalam menginfeksikan penyakit busuk lunak. Densitas bakteri yang dapat menginfeksikan gejala busuk lunak adala OD600=0.2. Hasil densitasis tersebut dijadikan acuan untuk menginfeksikan daun planlet hasil iradiasi yang dievaluasi. Terdapat empat kriteria ketahanan tanaman yaitu tahan, agak rentan, rentan dan sangat rentan. Terdapat empat tanaman yang tahan, dimana ketiga
Keyword: Dickeya dadantii, gen Pto, iradiasi, marka SNAP, penyakit busuk lunak, Phalaenopsis amabilis

Judul: Regenerasi, Keragaman dan Ketahanan Propagul Klonal Anggrek Phalaenopsis Hibrida terhadap Infeksi Dickeya dadantii
Abstrak: Anggrek Phalaenopsis merupakan tanaman hias yang banyak digemari oleh masyarakat karena memiliki keragaman baik dalam warna, bentuk bunga maupun karakteristik lainnya yang unik, oleh karena itu banyak orang yang ingin mengusahakannya, sehingga penyediaan bibit menjadi faktor penting dalam agribisnis anggrek. Kelemahan perbanyakan anggrek secara konvensional adalah membutuhkan waktu yang lama. Salah satu usaha untuk meningkatkan produksi bibit secara cepat, banyak dan seragam adalah melalui kultur jaringan. Salah satu kelemahan propagasi klonal in vitro adalah kemungkinan adanya variasi somaklonal. Disisi pemuliaan tanaman, variasi somaklonal berguna untuk mendapatkan keragaman genetik baru yang belum ada sebelumnya. Secara umum penelitian ini bertujuan untuk mengembangkan protokol propagasi klonal anggrek Phalaenopsis dan mengidentifikasi adanya variasi somaklonal pada planlet yang dihasilkan. Penelitian ini terbagi menjadi 2 percobaan: (1) multiplikasi tunas anggrek Phalaenopsis pada media perlakuan BAP dan analisis keragaman genetik planlet klonal dengan marka SNAP pada Phalaenopsis „Salbellina-IPB‟ no 1102- 44 hasil multiplikasi dan (2) evaluasi respon ketahanan propagul klonal anggrek terhadap bakteri dickeya dadantii. Percobaan pertama bertujuan untuk mengevaluasi respon beberapa genotipe anggrek Phalaenopsis terhadap konsentrasi BAP dalam multiplikasi anggrek Phalaenopsis in vitro dan analisis keragaman planlet klonal anggrek Phal. „Salbellina-IPB‟ no 1102-44 dengan marka SNAP. Terdapat satu populasi anggrek hibrida multigenotipe yaitu, Phal. amabilis x KHM 421 dan dua genotipe hibrida Phalaenopsis „Salbellina-IPB‟ yaitu Phalaenopsis „Salbellina-IPB‟ no 1102-38 dan Phalaenopsis „Salbellina-IPB‟ no 1102-44 yang diuji dalam penelitian ini. Perlakuan zat pengatur tumbuh BAP yang digunakan yaitu 0 μM, 11.09 μM, 22.19 μM, 33.29 μM dan 44.39 μM. Hasil penelitian menunjukkan bahwa media terbaik untuk jumlah tunas dan jumlah daun terbanyak adalah pada perlakuan 22.19 μM BAP pada ketiga anggrek hibrida Phalaenopsis. Media terbaik untuk pertumbuhan akar adalah pada 0 μM BAP pada populasi Phal. amabilis x KHM 421, sedangkan untuk pertambahan jumlah PLBs adalah pada media dengan penambahan 11.09 μM BAP dan hanya pada populasi Phal. amabilis x KHM 421. Hasil analisis molekuler dengan marka SNAP berdasarkan 11 lokus Pto pada planlet klonal Phal. „Salbellina-IPB‟ no 1102-44 menunjukkan adanya keragaman sebesar 18.8%. Keragaman ditemukan pada planlet klonal dari perlakuan 22.19 μM dan 44.39 μM BAP. Keragaman ini diduga berasal dari variasi somaklonal terlihat dengan adanya penambahan BAP dengan beberapa tingkatan. Keragaman dapat diidentifikasi karena perubahan alel pada beberapa planlet di lokus-lokus tertentu. Percobaan kedua bertujuan untuk mengevaluasi respon ketahanan Phalaenopsis „Salbellina-IPB‟ no 1102-44 menggunakan metode leaf disk v terhadap bakteri Dickeya dadantii. Terdapat lima kriteria ketahanan yaitu tahan, agak tahan, rentan, agak rentan dan sangat rentan berdasarkan pengamatan pada 24 jam setelah inokulasi. Terdapat tiga tanaman yang tahan, dimana dua aksesi yang tahan berasal dari perlakuan media 22.19 μM (T2-15 dan T2-17), sementara satu aksesi lainnya yang tahan berasal dari perlakuan media 44.39 μM (T4-23).
Keyword: BAP, Dickeya dadantii, gen Pto, marka SNAP, Phalaenopsis

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: