Judul: Potential inhibition of phylospheric actinomycetes of Liliaceae plants against Colletotrichum acutatum
Abstrak: Cabai merupakan salah satu komoditas unggulan hortikultura yang penting bagi masyarakat Indonesia. Antraknosa merupakan penyakit utama peyebab rendahnya produktivitas cabai di Indonesia. Antraknosa disebabkan oleh genus Colletotrichum dan spesies yang paling banyak menyerang cabai di Indonesia saat ini adalah Colletotrichum acutatum. Pengendalian antraknosa secara kimiawi menggunakan fungisida kontak dan sistemik secara intensif. Untuk mengatasi dampak negatif penggunakaan fungisida, diperlukan alternatif pengendalian hayati. Salah satu agens hayati yang digunakan yaitu aktinomiset. Penelitian ini bertujuan mendapatkan isolat aktinomiset filosfer Liliaceae yang berpotensi mengendalikan C. acutatum. Tahapan penelitian yang dilakukan meliputi perbanyakan isolat aktinomiset filosfer Liliaceae dan C. acutatum, karakterisasi morfologi aktinomiset, uji antagonis aktinomiset terhadap C. acutatum, dan identifikasi aktinomiset secara molekuler. Karakterisasi aktinomiset dilakukan dengan menggunakan media yeast starch agar dan international streptomyces project 2. Sebanyak 21 isolat dilakukan uji antagonis secara in vitro dengan metode dual cultre menggunakan rancangan acak lengkap (RAL). Identifikasi isolat aktinomiset filosfer Liliaceae terbaik secara molekuler dengan Teknik PCR menggunakan primer universal untuk yaitu 27F dan 16Sact1114R. Persentase tingkat hambatan relatif (THR) aktinomiset terhadap C. acutatum sebesar 14,32-47,66%. Dua isolat dengan persentase penghambatan tertinggi terhadap penyakit antraknosa secara in vitro adalah ACW23 dan BBH11 sebesar 47,66% dan 44,79%. Hasil identifikasi molekuler kedua isolat tersebut memiliki kemiripan dengan Propionicicella superfundia dan Enemella dayhoffiae, Chili is one of the leading horticultural commodities that is important for the people of Indonesia. Anthracnose is the main disease that causes low chili productivity in Indonesia. Anthracnose is caused by various species of Colletotrichum, and in Indonesia especially by Colletotrichum acutatum. Chemical control of anthracnose used contact and systemic fungicides intensively. To overcome the negative impact of fungicide use, alternative biological control is needed. One of the biological control agents candidates used is actinomycetes. This study aims to obtain phyllospheric actinomycetes Liliaceae isolates that can potentially control C. acutatum. The stages of the research conducted include the propagation of phyllospheric actinomycetes Liliaceae isolates and C. acutatum, morphological characterization of actinomycetes, actinomycetes antagonistic test against C. acutatum, and molecular identification of actinomycetes. Morphological characterization of actinomycetes was conducted with yeast starch agar media and international streptomyces project 2 media. A total of 21 isolates were tested for antagonism in vitro with the dual culture method using a completely randomized design. Identification of the best phyllospheric actinomycetes Liliaceae isolates molecularly by polymerase chain reaction technique using universal primers for 27F and 16Sact1114R. The percentage of relative inhibition rate of actinomycetes against C. acutatum was 14.32-47.66%. Two isolates with the highest percentage of inhibition against anthracnose disease in vitro were ACW23 and BBH11 at 47.66% and 44.79%. The results of molecular identification of the two isolates are similar to Propionicicella superfundia and Enemella dayhoffiae.
Keyword: antraknosa, cabai, pengendalian hayati, Enemella dayhoffiae, Propionicicella superfundia

Judul: Screening of Marine Fungal as Biological Control Agent of Colletotrichum acutatum on Chili Plants
Abstrak: Gejala antraknosa pada cabai berupa bercak coklat konsentris kehitaman pada permukaan buah dan lama kelamaan meluas menjadi busuk lunak atau mengering. Penyakit antraknosa sangat merugikan karena menurunkan hasil produksi. Berbagai pengendalian telah dilakukan oleh petani cabai, namun hasilnya belum optimal. Cendawan laut merupakan salah satu jenis mikrob yang memiliki jalur metabolik yang spesifik dan telah banyak digunakan sebagai sumber obat-obatan pada manusia. Banyak senyawa-senyawa metabolit yang dihasilkan oleh cendawan laut seperti benzopyranone, stemphyperylenol, pleosporalone A dan B, (-)-cercosporamide, dan sesquiterpenes yang memiliki aktivitas anticendawan. Oleh karena itu, cendawan laut berpotensi juga dijadikan sebagai agens pengendalian hayati pada tanaman. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan cendawan laut yang berpotensi menghambat pertumbuhan C. acutatum dan menekan penyakit antraknosa pada cabai, serta mengidentifikasi isolat cendawan laut yang potensial sebagai agens pengendalian hayati. Penelitian dilaksanakan pada bulan Agustus 2019 sampai Januari 2022 di Laboratorium Mikologi Tumbuhan, Departemen Proteksi Tanaman, Fakultas Pertanian dan Laboratorium Mikrobiologi Hasil Perairan, Departemen Teknologi Hasil Perairan, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, serta kegiatan uji in planta dilaksanakan di kebun percobaan Cikabayan, Institut Pertanian Bogor. Sebanyak 27 isolat cendawan laut dari koleksi Laboratorium Mikrobiologi Hasil Perairan, Institut Pertanian Bogor, diuji pada penelitian ini. Cendawan tersebut diisolasi dari tanaman pesisir pinggir pantai (daun magrove dan terong pungo), kayu apung, alga, dan rumput laut. Sebelum digunakan, isolat tersebut diremajakan dengan menggunakan media agar-agar dekstrosa kentang (ADK) yang dimodifikasi dengan penambahan NaCl. Penapisan potensi agens hayati dari koleksi cendawan tersebut dimulai dengan uji antagonisme 27 isolat koleksi tersebut dengan metode kultur biakan ganda (dual culture) pada media ADK. Penapisan selanjutnya dilakukan terhadap 15 isolat terpilih dari pengujian sebelumnya untuk mengetahui potensi produksi senyawa organik volatil dalam menekan pertumbuhan patogen. Pengujian ini menggunakan media ADK dengan konsentrasi 25, 50, 75, dan 100% dilakukan dengan cara menumbuhkan isolat cendawan patogen dan cendawan laut calon agens antagonis pada cawan yang berbeda dengan diameter yang sama, lalu keduanya saling ditangkupkan dan pertemuan kedua cawan ditutup dengan plastik perekat. Pertumbuhan patogen akan terhambat bila calon agens hayati tersebut menghasilkan senyawa volatil yang toksik bagi patogen. Dari 15 isolat terpilih tersebut selanjutnya juga diuji kultur filtratnya dalam menghambat pertumbuhan koloni dengan metode peracunan media. Konsentrasi kultur filtrat yang digunakan dalam pengujian ini adalah 0.25, 0.5, 0.75, dan 1%. Dari 15 isolat yang diuji dalam kemampuan produksi senyawa organik volatil dan kemampuan kultur filtratnya menghambat pertumbuhan koloni C. acutatum terpilih 6 isolat terbaik untuk diuji kemampuan filtratnya dalam menghambat perkecambahan konidia C. acutatum dan keamanan hayatinya. Dari hasil pengujian ini, kemudian dipilih 4 isolat untuk diuji kemampuannya dalam menghasilkan enzim kitinolitik dan menghambat perkembangan penyakit antraknosa pada buah cabai. Semua isolat yang telah diuji kemampuan menghambat perkembangan penyakit antraknosa pada buah cabai tersebut diidentifikasi, baik secara morfologi maupun molekuler. Satu diantara isolat tersebut yang memiliki kemampuan menghasilkan senyawa volatil dideteksi jenis senyawa yang dihasilkan dengan metode gas chromatography mass spectrometry (GC-MS). Dari 27 isolat yang diuji kemampuan menghambat pertumbuhan koloni C. acutatum diperoleh 8 isolat yang menunjukkan penghambatan relatif lebih dari 40%. Selanjutnya dari 15 isolat terpilih termasuk yang menunjukkan penghambatan lebih dari 40% tersebut, ternyata dapat menghasilkan senyawa volatil yang mampu menghambat pertumbuhan
Keyword: anthracnose, identification, disease incidence, volatile organic compounds

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: