Judul: Identifikasi Karakter Jaringan Daun dan Pertumbuhan Vegetatif Bibit Kelapa Normal dan Kopyor
Abstrak: Deteksi awal tentang kebenaran suatu bahan tanam merupakan hal yang penting. Salah satu metode yang digunakan dalam mekanisme deteksi awal yaitu dengan pengamatan kuantitatif pada morfologi tanaman. Penelitian bertujuan mempelajari perbedaan karakter vegetatif dan struktur jaringan daun antara bibit kopyor heterozigot (Kk) dan kelapa normal homozigot (KK). Penelitian dilaksanakan pada bulan April hingga September 2019 di Kebun Percobaan Leuwikopo dan Laboratorium Mikro Teknik, Departemen Agronomi dan Hortikultura, Institut Pertanian Bogor, Bogor. Penelitian disusun menggunakan Rancangan Kelompok Lengkap Teracak faktor tunggal yaitu jenis bibit kelapa Genjah yang terdiri atas kelapa kopyor (Kk) (Kopyor Hijau, Kuning, Coklat) dan kelapa normal (KK) Tlogowungu dengan 5 ulangan. Hasil pengamatan pada bibit kelapa yang dipelihara selama 17 minggu setelah adaptasi menunjukkan adanya perbedaan karakter vegetatif pada pertambahan ukuran lingkar batang antara bibit kelapa normal Tlogowungu dan Kopyor Hijau. Perbedaan antar jenis bibit juga terdapat pada ketebalan epidermis bawah daun muda antara kelapa normal Tlogowungu dan Kopyor Hijau serta Kuning.
Keyword: epidermis, genjah, heterozigot, lingkar batang, Tlogowungu

Judul: Studi Kuantitas Endosperma dan Penciri Spesifik Kelapa Kopyor Berbasis Marka Molekuler, Histologi dan Differentially Expressed Gene
Abstrak: Tanaman kelapa (Cocos nucifera L.) adalah tanaman tropika, sering disebut The tree of life karena hampir seluruh bagian tanamannya memiliki manfaat bagi kehidupan manusia. Kelapa kopyor adalah kelapa mutan dengan penampilan yang unik. Endosperma kelapa kopyor cenderung terlepas dari batoknya, dikategorikan kedalam 9 kelas yaitu skor 1 hingga 9. Semakin tinggi skor kuantitas endosperma berarti semakin terlepas endosperma dari batoknya. Tujuan penelitian disertasi ini adalah 1) mengkaji keragaman fenotipik sifat kuantitas endosperma serta keragaman genetik dan struktur populasi kelapa kopyor di Agom Lampung, 2) melakukan analisis tetua jantan berbasis SSR dan kendali genetik sifat kuantitas endosperma, 3) mengevaluasi keragaan progeni dan pendugaan parameter genetik sifat kuantitas endosperma kopyor melalui persilangan terkontrol, 4) mempelajari perbedaan sifat jaringan daun kelapa normal versus kelapa kopyor melalui studi histologi, 5) melakukan analisis DEG guna mengkaji perbedaan ekspresi gen endosperma kelapa normal vs kelapa kopyor. Berdasarkan skoring yang dilakukan terhadap 251 sampel buah kelapa kopyor diperoleh persentase buah kelapa dengan skor 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 berturut turut sebanyak 51.00%, 18.72%, 13.54%, 7.57%, 4.38%, 3.59%, 0.40%, 0.40%, 0.40%. Berdasarkan nilai daya gabung umum dapat diidentifikasi tetua betina bergenotipe unggul untuk sifat kuantitas endosperma yaitu TB-79, TB-60, TB-86, TB-126 dan TB-82. Hasil analisa mengindikasikan bahwa kebun kelapa Agom Lampung memiliki keragaman genetik yang tinggi (Ho = 0.57 dan He = 0.68) sehingga kebun ini perlu dikelola dengan baik sebagai sumber plasma nutfah kelapa kopyor. Analisis molekuler SSR menggunakan DNA daun pohon dewasa dan DNA embrio zigotik buah kelapa kopyor dilakukan untuk mengidentifikasi tetua jantan dari buah kopyor. Analisis tetua jantan (paternal analysis) berbasis SSR berhasil mengidentifikasi 31 tetua jantan dari 53 progeni. Analisis tetua jantan mengindikasikan bahwa tetua donor polen merupakan pohon dewasa anggota populasi Agom Lampung, dengan demikian tetua jantan seperti halnya tetua betina juga merupakan individu yang bersifat heterozigot. Tetua jantan TJ-127, TJ-185, TJ-242 dinilai berpotensi digunakan sebagai tetua jantan unggul untuk pengembangan kelapa kopyor kuantitas endosperma tinggi. Analisis chi square mengindikasikan bahwa sifat kuantitas endosperma merupakan sifat genetik yang dikendalikan oleh 2 gen dan bersifat duplicate recessive epistatic. Nisbah fenotipe buah kelapa dengan kuantitas endosperma rendah : tinggi adalah 15:1. Buah kopyor dengan genotipe endosperma kkkqqq memiliki kuantitas endosperma tinggi (kisaran skor 3-9), dan buah kopyor yang bergenotipe kkkQ-- adalah buah dengan kuantitas endosperma rendah (kisaran skor 1-2). Buah normal berkuantitas endosperma skor 1 ditentukan genotipe K--Q-- atau Kkkqqq. Persilangan terkontrol dengan mating design NC II menghasilkan hanya 12% buah yang berhasil dipanen. Pendugaan keragaman genetik tidak dilakukan karena terbatasnya data, namun beberapa informasi menarik diperoleh dari penelitian ini. Persilangan terkontrol menghasilkan buah kopyor dan buah normal, hal ini mengkonfirmasi bahwa pohon-pohon kelapa tipe Dalam Agom Lampung adalah pohon heterozigot sedangkan pohon Genjah koleksi Balitpalma adalah pohon homozigot. Petani memperoleh bibit kopyor dari buah kelapa normal yang bergenotipe heterozigot Kk. Buah kelapa normal KK dan Kk tidak terlihat bedanya secara visual, ketika telah menjadi bibitpun masih sulit membedakan antara bibit heterozigot dan homozigot. Kajian histologi daun dilakukan untuk menambah informasi yang dapat digunakan sebagai penciri antara bibit kelapa kopyor heterozigot dan bibit kelapa normal. Penelitian histologi daun kelapa kopyor homozigot kk,
Keyword: daya gabung, ekspresi gen, histologi daun, NC-2 mating design

Judul: A Continuous Vaccination Strategy in the SVIR Epidemic Model
Abstrak: Vaccination is conducted to minimize the spread of a disease. The vaccination is usually done several times within a fixed time interval. In the SVIR model, it is assumed that individuals do not get immediate immunity following a vaccination program. So according to process of vaccination on SVIR model, there are two strategies, i.e. the continuous vaccination strategy (CVS) and the pulse vaccination strategy (PVS). In this study, only the CVS strategy in epidemic model SVIR is considered. Results of the study indicate that dynamics of the CVS system depends on the basic reproductive number. If the basic reproductive number is less than one, then the disease-free fixed point is asymptotically stable. It means that the disease will eventually disappear from the population. Conversely, if the basic reproductive number is greater than one, then the endemic fixed point is asymptotically stable, which means that the disease will remain exist in the population. Simulation result shows that the vaccination would minimize the spread of disease by reducing the basic reproductive number. If the time for the vaccinated recipients to obtain the immunity, as well as a possibility of vaccinated recipients to be infected are neglected, then the disease will be eradicated. This condition is called an over-evaluating effect of vaccination.
Keyword: