Judul: Populasi bakteri endofit pada pertanaman lada (Piper nigrum L.) di Provinsi Bangka Belitung dan potensinya sebagai agensia hayati
Abstrak: Lada (Piper nigrum L.) merupakan salah satu komoditas penting di Indonesia. Provinsi Bangka Belitung merupakan salah satu sentra produksi lada yang penting di Indonesia. Produksi lada di wilayah ini mengalami penurunan dari setiap tahunnya. Salah satu penyebab penurunan tersebut adalah tingginya serangan penyakit kuning yang disebabkan oleh nematoda parasit oleh nematoda parasit terutama Meloidogyne incognita dan Radopholus simili. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui populasi dan kelimpahan bakteri endofit pada perkebunan lada di Bangka, baik pada kebun lada yang sehat ataupun yang sakit (yang terserang penyakit kuning) dan meneliti potensinya terhadap pertumbuhan tanaman serta sebagai agensia hayati. Penelitian dilakukan di Laboratorium Nematologi Departemen Proteksi Tanaman, IPB. Tahapan dari penelitian ini meliputi survei kebun lada sehat dan terserang. Contoh tanah dan akar tanaman lada diambil dari kebun sehat dan sakit untuk dilakukan ekstraksi nematoda parasit dan isolasi bakteri endofit dilakukan dengan teknik sterilisasi permukaan. Bakteri endofit yang diperoleh selanjutnya dilakukan pengujian terhadap perkecambahan benih tanaman tomat dan kultur fitrat bakteri endofit terhadap mortalitas larva Meloidogyne spp. Analisis data menggunakan rancangan acak lengkap (RAL). Data yang diperoleh diolah melalui sidik ragam yang dilanjutkan dengan uji Duncan pada taraf 5% dengan menggunakan program SAS 9.1.3. Hasil penelitian menunjukkan bahwa persentase kejadian penyakit kuning di Kabupaten Bangka lebih tinggi dibandingkan dengan Kabupaten Bangka Tengah. Kerapatan populasi bakteri endofit dari akar pada kebun sehat lebih tinggi dibandingkan dengan kebun sakit. Hasil pengujian isolat bakteri endofit terhadap perkecambahan menunjukkan bahwa sebanyak 5 isolat bakteri endofit yaitu EB4, EB7, EB10, EB12, dan EB14 mempunyai kemampuan mempercepat perkecambahan dan memacu pertumbuhan akar tanaman tomat. Hasil uji kultur filtrat isolat bakteri endofit menunjukkan bahwa isolat EB14 memberikan pengaruh paling tinggi terhadap mortalitas Meloidogyne spp. pada uji in vitro.
Keyword: 

Judul: Potensi Bakteri Endofit Sebagai Agens Pengendali Penyakit Busuk Cabang (Septobasidium Sp.) Pada Lada
Abstrak: Penyakit busuk cabang lada yang disebabkan oleh Septobasidum sp. tergolong penyakit baru dan berpotensi merusak pertanaman lada di Kalimantan Barat. Gejala penyakit busuk cabang Septobasidium sp. pada tanaman lada tergantung pada stadia patogen. Gejala stadia awal respon tanaman tidak menunjukan gangguan pada daun atau cabang tetap segar dan hijau, stadia lanjut bagian tanaman yang terinfeksi terutama daun atau cabang akan rontok secara bertahap sampai tanaman mati. Penyakit busuk cabang lada ditandai dengan adanya rizomorf/miselium berwarna coklat kemerahan yang menginfeksi pada bagian cabang. Miselium dapat menyebar ke seluruh cabang dan mengakibatkan kematian jaringan tanaman lada. Penyakit ini juga sering disebut penyakit ganggang pirang, mati ranting, penyakit capit udang, penyakit hawar lembut (Serawak Malaysia), felt fungi, dan velvet blight. Penelitian ini bertujuan mendapatkan bakteri endofit asal lada yang potensial sebagai agens pengendali hayati penyakit busuk cabang dan pemacu pertumbuhan pada tanaman lada. Penelitian dilaksanakan dari bulan Agustus 2013 sampai bulan April 2015 di Laboratorium Mikologi, Laboratorium Nematologi Tumbuhan Departemen Proteksi Tanaman Institut Pertanian Bogor, Laboratorium Penyakit Tanaman Fakultas Pertanian Universitas Tanjungpura Pontianak, dan Laboratorium Biologi & Kesehatan Tanah Balai Penelitian Tanah Bogor, serta kebun petani di Kecamatan Galing Kabupaten Sambas. Penelitian meliputi tahap in vitro dan in vivo. Tahap in vitro meliputi eksplorasi, uji reaksi hipersensitif, karakterisasi fisiologi dan uji antibiosis bakteri endofit. Eksplorasi bakteri endofit berasal dari contoh akar, cabang, dan daun dari tanaman lada sehat (tidak bergejala) di antar tanaman sehat, tanaman lada sehat di antara tanaman lada sakit, dan lada liar (lada hutan). Isolasi bakteri endofit dari akar batang dan daun dilakukan dengan cara sterilisasi permukaan menggunakan larutan NaOCL 10% dan alkohol 70%. Isolat bakteri yang didapat dimurnikan dan diindentifikasi berdasarkan tipe morfologi koloni bakteri kemudian dilakukan uji reaksi hipersensitif. Tahapan selanjutnya isolat bakteri endofit tersebut dilakukan karakterisasi aktivitas enzim kitinolitik, produksi IAA, penambat nitrogen, pelarut fosfat, pelarut kalium dan produksi senyawa fluorescent. Isolat bakteri endofit diuji antibiosis terhadap Septobasidium sp. dengan metode kultur ganda media PDA. Tahap in vivo meliputi uji kemampuan penghambatan isolat bakteri endofit terhadap Septobasidium sp. pada lada secara langsung, uji pemacu pertumbuhan tanaman, dan uji pemacu ketahanan tanaman menggunakan rancangan acak lengkap (RAL). Metode inokulasi bakteri endofit dengan cara perendaman bibit lada dalam suspensi bakteri endofit. Hasil penelitian in vitro diperoleh 33 isolat bakteri endofit yang diisolasi dari tanaman lada sehat di antara lada sehat, lada sehat di antara lada sakit dan lada hutan, dengan kisaran kerapatan 6.3 x 103–9.2 x 106 cfu g-1 berat basah contoh jaringan tanaman. Hasil uji reaksi hipersensitif terhadap 33 isolat bakteri endofit diperoleh 10 isolat bakteri endofit bersifat bakteri patogenik pada reaksi hipersensitif di daun tembakau, sehingga 23 isolat bakteri endofit yang yang bersifat non patogenik digunakan pada uji selanjutnya. Hasil karakterisasi dari 23 isolat bakteri tersebut, 20 isolat mampu memproduksi IAA, 3 isolat dapat menambat nitrogen, 10 isolat dapat melarutkan fospat, 6 isolat mempunyai aktifitas kitinolitik, 4 isolat mempunyai senyawa fluorescent dan semua isolat bakteri endofit tersebut tidak mampu melarutkan kalium. Hasil uji antibiosis terhadap Septobasidium sp. menunjukkan bahwa 8 isolat, yaitu isolat bakteri SHA3, SHC9, SKA1, SKA3, SKA4, SKD8, SKD10 dan LHD8 mampu menghambat pertumbuhan Septobasidium sp. antara
Keyword: busuk cabang, bakteri endofit, lada, Septobasidium sp

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: