Judul: Studi Kelimpahan, Distribusi, dan Struktur Komunitas Fitoplankton di Perairan Teluk Jakarta
Abstrak: Perairan Teluk Jakarta mempunyai arti penting bagi pertumbuhan dan perkembangan ekonomi Indonesia. Wilayah perairan ini memiliki pelabuhan Tanjung Priok dan Sunda Kelapa yang merupakan pintu gerbang laut baik untuk hubungan nasional (antar pulau) maupun internasional (antar negara). Disamping itu, perairan ini juga merupakan tempat rekreasi dan tempat pencarian ikan bagi para nelayan. Banyaknya aktivitas ekonomi membuat perairan ini mempunyai arti penting bagi provinsi DKI Jakarta. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kelimpahan, distribusi dari struktur komunitas fitoplankton serta dapat menduga tingkat kesuburan perairan Teluk Jakarta berdasarkan parameter biologi, fisika dan kimia perairan. Pengambilan air contoh dilakukan tiga kali yaitu pada tanggal 11 Desember 2000, Februari dan April 2001. Air contoh yang diambil dianalisa untuk mengetahui kelimpahan dan jenis fitoplankton serta dilakukan penganalisaan untuk mengetahui kandungan unsur kimia terlarut. Pengambilan air contoh pada bulan Desember 2000 dilakukan pada 12 stasiun sedangkan pada bulan Februari dan April 2001 dilakukan pada 14 stasiun (tiga stasiun diantaranya berada di sekitar muara sungai). Nilai kelimpahan fitoplankton yang diperoleh mengalami fluktuasi, baik untuk tiap stasiun pada masing-masing waktu pengambilan air contoh, maupun pada ketiga waktu pangambilan contoh (Desember 2002, Februari dan April 2001). Total nilai kelimpahan fitoplankton yang diperoleh pada bulan Desember 2000, Februari dan April 2001 secara berturut-turut adalah sebesar 32.36 juta sel/liter, 33.42 juta sel/litar dan 132.16 juta sel/liter. Sementara nilai rata-rata kelimpahan pada ketiga waktu pengamatan per stasiunnya secara berturut-turut adalah sebesar 2.70 juta sel/liter, 2.23 juta sel/liter dan 8.81 juta sel/liter. Terjadinya fluktuasi nilai kelimpahan fitoplankton yang didapat diduga akibat dari perubahan nilai salinitas dan juga tingginya nilai keiimpahan beberapa jenis fitoplankton yang mendominasi selama pengamatan dilakukan (jenis Chaetoceros, Skeletonema dan Nitzschia). Nilai persentase dari keiimpahan kelompok diatom dan kelompok dinoflagelata untuk bulan Desember 2000, Februari dan April 2001 mengalami perubahan. Untuk kelompok diatom terjadi kenaikan persentase nilai keiimpahan, sebaliknya untuk kelompok dinoflagelata mengalami penurunan, yaitu masing-masing sebesar 0.61 %. Perubahan ini diduga akibat adanya perubahan nilai salinitas pada periode Desember 2000 - April 2001. Mengacu pada kondisi parameter biologi, fisika dan kimia perairan, maka dapat ditarik kesimpulan bahwa perairan Teluk Jakarta pada bulan Desember 2000, Februari dan April 2001 merupakan perairan yang subur. Tingkat kesuburan perairan Teluk Jakarta ini berkisar antara tingkat kesuburan sedang sampai tinggi.
Keyword: 

Judul: Studi Kelimpahan, distribusi dan struktur komunitas fitoplankton secara horizontal di Perairan Teluk Jakarta
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kelimpahan dan distribusi dari struktur komunitas fitoplankton serta dapat menduga tingkat kesuburan perairan Teluk Jakarta berdasarkan parameter biologi, fisika dan kimia perairan. Pengambilan contoh air dilakukan dua kali yaitu pada bulan September dan pada bulan November 1993. Contoh air yang diambil dianalisa untuk mengetahui kelimpahan dan jenis fitoplankton serta dilakukan penganalisaan untuk mengetahui kandungan unsur kimia terlarut. Pengambilan contoh air tersebut dilakukan pada enam lokasi dengan tiap lokasi diambil sebanyak tiga titik dengan jarak an- tar titik satu kilometer. Nilai kelimpahan fitoplankton yang diperoleh mengala- mi fluktuasi, baik untuk tiap lokasi pada masing-masing waktu pengambilan contoh, maupun pada kedua waktu pengam- bilan contoh (September dan November). Untuk bulan Sep- tember, tingginya nilai kelimpahan di wilayah Belencong dan Marina menunjukkan bahwa di kedua wilayah tersebut sedang berlangsung kondisi blooming. Hal ini terjadi karena pertumbuhan yang lebih cepat di kedua wilayah tersebut dibandingkan di wilayah lainnya. Penyebab yang ..dst
Keyword: 

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA