Judul: The improvement of tiger shrimp diseases resistance against white spot syndrome virus by transfer of penaeus monodon antiviral gene.
Abstrak: Udang windu Penaeus monodon merupakan salah satu spesies krustase lokal yang dikembangkan sebagai komoditas utama budidaya tambak di Indonesia. Sejak tahun 1990-an, budidaya udang windu mengalami berbagai kendala, baik akibat lingkungan perairan yang kurang mendukung maupun adanya serangan penyakit bakteri dan virus. Virus bintik putih (white spot syndrome virus, WSSV) merupakan penyebab utama berbagai kasus kematian udang windu, yang hingga kini belum dapat diatasi secara tuntas. Kasus penyakit udang akibat serangan virus tidak hanya terjadi di Indonesia, tetapi juga terjadi di negara lain seperti India, Korea, Cina, dan Amerika. Penanggulangan penyakit pada budidaya udang windu telah dilakukan termasuk penggunaan antibiotik, vaksin, immunostimulan, dan teknologi seleksi. Meskipun demikian, metode tersebut memiliki kelemahan, antara lain: dapat menyebabkan berkembangnya strain bakteri yang resisten terhadap antibiotik, residu antibiotik memberikan dampak negatif pada lingkungan akuatik, pemberian vaksin dan imunostimulan harus dilakukan setiap siklus produksi, serta teknologi seleksi membutuhkan waktu, biaya, dan tenaga yang relatif banyak untuk memproduksi keturunan udang tahan penyakit. Sebuah metode baru yang dikenal dengan istilah transgenesis diharapkan dapat mengatasi kelemahan metode sebelumnya. Organisme transgenik yang tahan terhadap patogen dapat diproduksi dengan mengintroduksi gen yang berperan dalam sistem imun dan gen penyandi protein imunogenik dari patogen. Pada penelitian ini dilakukan introduksi gen penyandi protein antivirus udang windu (Penaeus monodon antiviral gene, PmAV) dengan tujuan untuk menghasilkan udang windu yang memiliki resistensi yang tinggi terhadap penyakit virus khususnya WSSV. Dalam rangkaian penelitian untuk memproduksi udang windu transgenik, sebagai tahap awal dilakukan isolasi, karakterisasi, dan kloning promoter antivirus ProAV dan cDNA gen antivirus PmAV dari udang windu sebagai penyusun konstruksi gen yang akan diintroduksi. Sekuen nukleotida promoter dan gen antivirus hasil isolasi dianalisis menggunakan program Genetyx Versi 7 untuk mendapatkan kemiripan (similaritas) sekuen, deduksi asam amino, dan keberadaan motif faktor transkripsi. Analisis kemiripan gen dilakukan melalui penyejajaran (alignment) sekuen pada Bank Gen menggunakan basic local alignment search tool (BLAST-N untuk sekuen nukleotida dan BLAST-P untuk sekuen deduksi asam amino). Sekuen promoter ProAV hasil isolasi selanjutnya diligasi dengan gen EGFP (enhanced green fluorescent protein) sebagai penanda untuk membuat konstruksi gen pProAV-EGFP yang digunakan dalam analisis aktivitas promoter ProAV. Konstruksi gen yang kedua, yaitu pProAVPmAV dibuat dengan menyambungkan promoter ProAV dan cDNA PmAV yang digunakan untuk memproduksi udang transgenik keturunan nol (F0) dan analisis ekspresi gen antivirus pada embrio dan larva. Konstruksi gen pProAV-EGFP ditransfer ke embrio udang windu menggunakan metode transfeksi dengan larutan jetPEI. Aktivitas promoter ProAV diketahui dengan mengamati ekspresi gen penanda EGFP pada embrio dan larva udang windu. Ekspresi gen EGFP dianalisis secara berkala, yakni 12, 18, 24, dan 30 jam setelah transfeksi (jst) menggunakan UV- transilluminator dan metode RT-PCR. Selanjutnya, konstruksi gen pProAV-PmAV ditransfer ke embrio udang windu menggunakan metode yang sama dengan pProAV-EGFP. Ekspresi gen PmAV juga dianalisis menggunakan metode RT-PCR pada rentang waktu sama dengan yang dilakukan pada gen EGFP. Pengamatan performa udang transgenik F0 dilakukan dengan cara uji tantang dengan virus WSSV untuk melihat kelangsungan hidup larva dan pola ekspresi transgen PmAV, serta bobot dan panjang tubuh udang. Data ekspresi gen EGFP dan PmAV dianalisis secara deskriptif. Data kelangsungan hidup udang windu dianalisis ragam (ANOVA) menggunakan program Statistix Versi 3.0 dan dilanjutkan
Keyword: 

Judul: Pengaruh Perendaman White Spot Syndrom Virus (WSSV) dalam Ekstrak Biji Mangrove (Xylocarpus granatum) Terhadap Patogenitasnya pada Wang Windu (Penaeus monodon Fabr.).
Abstrak: Produksi udang windu secara nasional sejak 1994 tidak menunjukkan peningkatan bahkan terjadi penurunan yang tajam sekitar lebih dari 100.000 ton/tahun menjadi dibawah 80.000 ton/tahun sejak 1995 sampai tahun 2000. Berbagai kendala telah diketahui sebagai penghambat peningkatan produksi udang windu di tambak, namun penyakit dikenal sebagai penyebab utama, salah satunya adalah serangan penyakit virus. Salah satu jenis virus yang menginfeksi udang penaeid adalah White Spot Syndrome Virus (WSSV). Serangan WSSV dapat mematikan seluruh udang dalam waktu kurang satu minggu dari gejala serangan pertama terdeteksi. Upaya pengobatan sarnpai saat ini belum berhasil karena belum diteinukan bahan kimia atau antibiotik yang secara efektif dapat ~nembunuh virus White Spot. Upaya untuk inengatasi serangan virus dapat dilakukan dengan cara merangsang respon imun melalui vaksinasi. Tujuan dari penelitian ini adalah lnengetahui pengaruh perendaman &lam ekstrak biji mangrove X~)locarpus granatunz teihadap patogenisitas WSSV pada udang windu. Penelitian ini dilakukan dari bulan Maret sampai dengan Juli 2003. Percobaan penularan serta pengamatan perubahan gejala klilnis (perubahan patologis dan morfologis) udang uji dilakukan di Laboratoriuln Hama dan Penyakit Udang dan Ikan, Eafai Besar Pengembangan Budidaya Air Payau (BBPBAP) Jepara. Preparasi dm pengamatan histologis udang uji difakukan di Laboratorium Kesehatan &an, Jurusan Budidaya Perairan, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, hstitut Pertanian Bogor, Bogor. Tahapan penelitian terdiri dari screening dan adaptasi terhadap udang uji, kemudian pembuatan inokulum virus white spot, percobaan inaktifasi virus, penularan virus perlakuan terhadap udang uji dan uji tantang udang uji dengan virus tanpa perlakuan. Penelitian diawali dengan screening formalin (100 ppm) terhadap udang uji, berasaf dari Jepara, dan mengadaptasikannya seiama seminggu. Kemudian dilakukan pembuatan inokulum virus berdasarkan metode Hameed et al. (1997), yaitu dengan membuat suspensi organ udang terinfeksi pada konsentrasi 10% (wlv), dimana 1 gram organ udang terini-kksi digems dan dilarutkan daiam I0 mi air laut sten'f kemudian disentrifugasi (3000xg, 20 menit; dan 8000xg, 30 menit) dan disaring dengan kertas Miliphore 0 . 4 5 ~ ~se1h ingga didapatkan larutan baku virus dengan konsentrasi 20 mgfml. Inokulum virus dibuat dari udang yang terinfeksi WSSV, yang berasal dari Indramayu, Jawa Barat. Percobaan perendaman virus dalam ekstrak biji mangrove (EBM) dilakukan selama 30 menit dengan dosis 25 ppm, 50 ppm dan 100 ppm, dan konsentrasi virus 2 rn-d ml (pengenceran 10-'1. Kemudian dilakukan uli penularan terhadap udang windu stadia PL 15 secara perendaman selalna 60 menit d e n ~ nko nsentrasi virus 0.02 !nsf!n(!g engemeran 10"). Pada K(-) ?id& di!&_k.ukan uji p~;n~l!.+.rarned, angkar! K ( i - ) udacg uji diinfPksi d~lngsr(v. in~sta nps per!akusr(. EEM. Udeng u;i dipe!ihln da!am z&a:i:m &-&&:a:: 60~,3Gx4G :e!ama 34 ha:i, kcnu.';aZ &!&&a:: :;: &r.%ng menggunakan virus aktif, yang dinokulasi dengan metode dan asal virus yang sa~na, lalu dipelihara selama 14 hari. Sela~nap emeliharaan dilakukan pengamatan gejala klinis pada udang uji yang meliputi pembahan patologis (respon makan dan aktivitas berenang, tubuh kemerahan, perubahan warna hepatopankreas dan mata, serta bintik putih pada karapas) dan morfologi (kemsakan alat gerak dan perubahan warna tubuh, hepatopankreas dan rnata, serta munculnya bintik putih pada karapas) serta pengarnatan histologis: hepatopankreas, insang, limfoid, usus dan kulit untuk mengetahui patogenitas WSSV pasca penularan I dan uji tantang, mortalitas dan pengukuran parameter kualitas air
Keyword: 

Judul: Penggunaan Teorema Homeomorphy 2-Manifold dan Teorema Euler Poincare pada Torus 𝑇�� dan Simplicial Complex 𝐾��
Abstrak: Two dimensional topological spaces are said to be homeomorphic if they have the same topological invariant, where one of topological invariant used is an Euler characteristic. Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem and Euler Poincare’s Theorem are used to distinguish two topological spaces. Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem uses Euler characteristic to identify two dimensional topological spaces. Euler Poincare’s Theorem is an alternative way to find Euler characteristic with Betti number, which is topological invariant as well. The objective of this paper is to investigate the homeomorphism of torus 𝑇����� and simplicial complex 𝐾�����. Topological space torus and simplicial complex 𝐾����� have the same Euler characteristic, which is two. Based on Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem topological space torus 𝑇����� and simplicial complex 𝐾����� is homeomorphic.
Keyword: simplicial, torus, Euler, homeomorphism, topology