Judul: Perbandingan Karakter Morfologi Dan Molekuler Antara Karang Acanthophyllia Deshayesiana (Michelin, 1850) Dengan Cynarina Lacrymalis (Milne Edwards & Haime, 1848)
Abstrak: Cynarina lacrymalis memiliki sinonim yaitu Acanthophyllia deshayesiana sebagaimana terdaftar pada WoRMS (World of Registered Marine Species). Secara klasik, identifikasi karang menggunakan karakter morfologi dari kerangka (skeleton) karang untuk pengklasifikasian dalam dunia taksonomi. Perdebatan identifikasi dan pengklasifikasian berdasarkan karakter morfologi masih meragukan dan cenderung subjektif, sehingga adanya metode molekuler menjadi kajian baru untuk mengkonfirmasi identifikasi dan klasifikasi yang sudah ada. Sistematika pengklasifikasian karang secara klasik menggunakan morfologi kerangka karang dengan tujuan untuk mengetahui hubungan kekerabatan dan evolusinya. Karakter morfologi yang digunakan terdiri dari karakter deskriptif dan morfometrik. Data karakter morfometrik dianalisa dengan analisis Corresspondence Analysis of Principal Coordinates (CAP), dan klaster hierarki Agglomerative Hierarchical Clustering (AHC) menggunakan perangkat lunak XLSTAT 2015. Kladogram berdasarkan karakter deskriptif dan morfometrik dianalisis menggunakan Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean (UPGMA) perangkat lunak PAUP 4. Data molekuler dihasilkan dari beberapa prosedur yaitu ekstraksi DNA total, amplifikasi PCR pada gen target ribosomal DNA dengan marka ITS dan sekuensing. Rekonstruksi pohon filogenetik menggunakan metode Neighbour Joining dengan model kimura 2-parameter 1000 bootstrap replikasi pada MEGA 5.2. Berdasarkan kladogram karakter deskriptif, spesies A. deshayesiana dan C. lacrymalis dapat dibedakan dengan jelas pengelompokkannya secara terpisah, sedangkan pengelompokan berdasarkan karakter morfometrik tidak terlihat pengelompokannya dengan jelas dari hasil analisis CAP, AHC dan kladogram UPGMA. Hasil pohon filogenetik juga menunjukkan perbedaan antara kelompok karang C. lacrymalis dengan A. deshayesiana, hal ini dapat dilihat dari perbedaan jarak genetik sebesar 6,3 ± 4.3% yang berada diatas ambang batas jarak genetik sebesar ≤ 3%. Selain itu karakter molekuler dapat menemukan adanya variasi spesies yang dapat dimungkinkan sebagai subspesies dari kedua karang Penelitian ini menyimpulkan bahwa pengelompokan berdasarkan karakter morfometrik masih tidak jelas, sedangkan karakter deskriptif, dan molekuler sudah dapat membedakan pengelompokan karang C. lacrymalis dan A. deshayesiana secara terpisah. Secara genetik, kedua spesies tersebut memiliki keragaman intraspesies.
Keyword: sinonim spesies, morfologi, molekuler, Cynarina lacrymalis, Acantophyllia deshayesiana

Judul: Karakterisasi Genetik Karang Genus Favites (Faviidae: Scleractinia) di Perairan Kepulauan Spermonde, Sulawesi Selatan
Abstrak: Karang memiliki keanekaragaman spesies yang kaya, meskipun hanya menutupi sebagian kecil lautan, namun di dalamnya menjadi tempat hidup berbagai organisme. Karakter morfologi sebagai pembeda antar taksa pada karang umumnya menggunakan parameter yang didasarkan pada bentuk koloni, struktur dan bentuk rangka seperti koralit, septa, paliform lobe, septocostae, kolumella, dan duri septa. Akan tetapi, karakter morfologi tersebut sering mengalami variasi akibat faktor lingkungan, yang disebut dengan plastisitas fenotifik. Plastisitas fenotifik yang dipengaruhi oleh kondisi lingkungan telah menyebabkan perubahan karakter morfologi (penotifik) walaupun spesiesnya tetap sama. Oleh karena itu pendekatan identifikasi yang handal berdasarkan karakter mofologi dan molekuler dalam bentuk aplikasi DNA barcoding sangat dibutuhkan. Penggunaan penanda genetik Cytochrome c Oxidase subunit I (COI) dalam DNA barcoding telah umum digunakan sebagai pemilah penentuan spesies organisme pada berbagai taksa. Namun demikian, penanda genetik ini ternyata tidak konsisten membedakan antar spesies jika diaplikasikan pada karang ordo Scleractinia. Hal ini terjadi karena ketidak konsistenan dalam pengelompokan (clustering), yaitu suatu spesies masuk ke dalam kelompok tertentu dan kadangkala masuk ke dalam kelompok yang lain. Pada penelitian ini menggunakan pendekatan secara paralel antara karakter morfologi dan molekuler. Model yang digunakan adalah beberapa spesies karang Genus Favites yang dikoleksi dari perairan Kepulauan Spermonde. Data molekulernya juga dikombinasikan dengan beberapa data molekuler karang Favites dari berbagai belahan dunia, yang diperoleh dari Bank Gen (NCBI). Ini bertujuan untuk melihat posisi karang Favites yang berasal dari Perairan Kepulauan Spermonde dengan karang dari lokasi lainnya secara genetik. Karakter morfologi baik deskriptif dan morfometrik seperti diameter koralit, tipe sudut koralit, ada tidaknya paliform lobe, bentuk permukaan koloni, dan duri septa merupakan karakter kunci dalam penentuan spesies pada karang Favites. Akan tetapi karakter ini seringkali dipengaruhi oleh faktor lingkungan. Pada penelitian ini mencoba menyusun pohon filogeni 6 spesies pada karang genus Favites (Favites abdita, F. benattae, F. chinensis, F. flexuosa, F. halicora, dan F. paraflexuosa) yang dikoleksi dari Perairan Kepulauan Spermonde. Pohon filogeni disusun berdasarkan karakter morfologi (deskriptif dan morfometrik) menggunakan metode UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean) pada program PAUP 4.0. Hasil pada penelitian ini memperlihatkan pengelompokan taksa berdasarkan masing-masing spesies. Akan tetapi, jika hanya menggunakan karakter morfometrik dalam menyusun pengelompokannya, tidak memperlihatkan perbedaan yang jelas antar spesies. Hal ini membuktikan bahwa karakter morfometrik sangat plastis dan dipengaruhi oleh faktor lingkungan, bila dibandingkan dengan karakter deskriptif. vi Pada penelitian ini, kami mencoba menggunakan penanda genetik Internal Transcribed Spacer (ITS), yang merupakan fragmen dari gen ribosom dengan panjang sekitar 750 bp. Gen ITS ini diamplifikasi menggunakan mesin PCR dengan primer universal untuk karang. Produk PCR-nya kemudian disekuensing, lalu diolah dengan menggunakan program MEGA 5. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa penentuan spesies sampel yang didasarkan pada karakter morfologi yang digunakan kurang konsisten terhadap data genetik (molekuler) dalam membedakan antar karang jenis Favites di Kepulaun Spermonde. Terdapat beberapa spesimen yang telah teridentifikasi dengan konsisten, yakni baik secara morfologi maupun molekuler sebagai F. abdita. Namun demikian pada beberapa sampel, ada yang secara morfologi adalah F. abdita, akan tetapi berbeda secara molekuler. Ada pula yang secara morfologi adalah F. chinensis, F. flexuosa, dan F. halicora akan tetapi secara molekuler 99% mirip dengan F. abdita. Serta ada yang memang bukan
Keyword: Karang Favites, variasi morfologi, Kepulauan Spermonde, Internal Transcribed Spacer (ITS), penanda genetik

Judul: Dynamical System of Hepatitis B in Three Groups with Vaccination
Abstrak: The aim of this study is to modify the hepatitis B transmission model in three age groups involving vaccination from the model conducted by Zhoe and Zhang.The method used is to analyze the stability of the fixed point and its basic reproduction number (R_0). Performed stability analysis and numerical simulation to see population dynamics. Next, a sensitivity analysis of the parameters was carried out to see its effect on R_0. From the analysis obtained two fixed points, namely non-endemic and endemic fixed points. Non-endemic fixed points are locally asymptotically stable if R_0 <1 Meanwhile, the endemic fixed point is locally asymptotically stable if R_0 > 1. Hepatitis vaccination affects the number of susceptible population, because the more successful the vaccination, the smaller the number of susceptible populations so that the smaller the population will be infected.
Keyword: Dynamic, Hepatitis B, Vaccine, Mathematical model