Judul: Karakterisasi Gen Opsin Sensitif Ultraviolet (UVop) pada Lebah Apis cerana
Abstrak: Lebah memiliki penglihatan trikromatik karena mempunyai tiga fotoreseptor dengan puncak sensitivitas 540 nm (sensitif hijau), 435 nm (sensitif biru) dan 335 nm (sensitif UV). Pada Apis mellifera, gen opsin sensitif UV (UVop) terdiri atas delapan ekson dan tujuh intron. Pada A. cerana belum ada data tentang gen UVop. Dengan demikian, penelitian ini bertujuan untuk mengkarakterisasi gen UVop pada Apis cerana. Primer nukleotida disusun berdasarkan urutan DNA UVop lebah A. mellifera. Penelitian ini berhasil mengkarakterisasi lima ekson dan lima intron dengan ukuran 959 pasang basa. Gen UVop A. cerana terletak pada ekson tiga sampai dengan tujuh berdasarkan cDNA UVop A. mellifera. Analisis homologi ekson tiga sampai dengan lima menunjukkan kesamaan sebesar 96% dan ekson enam sampai dengan tujuh sebesar 97% antara UVop kedua spesies lebah. Pada ekson UVop A. cerana terdapat 21 perbedaan nukleotida yang didominasi oleh transisi basa. Empat perbedaan nukleotida pada ekson menyebabkan perubahan asam amino sedangkan perbedaan nukleotida yang lain merupakan silent mutation. Semua intron UVop A. cerana terletak pada posisi yang sama dengan intron pada UVop A. mellifera. Seluruh intron didominasi oleh basa AT (63.01%) dan diawali dengan basa GT dan diakhiri dengan basa AG.
Keyword: 

Judul: Karakterisasi intron pada gen inositol 1,4,5-triphosphate receptor itpr lebah apis mellifera
Abstrak: Lebah Apis mellifera merupakan salah satu kelompok serangga yang bersifat sosial. Lebah pekerja bertugas mencari pakan dan kembali ke sarang berdasarkan memori yang terbentuk di otak. Bagian otak lebah yang berfungsi mengintegrasikan sinyal yang masuk dari berbagai sumber adalah korpus pedunkulata. Salah satu gen yang terekspresi tinggi di korpus pedunkulata adalah gen inositol 1.4.5- triphosphate receptor (itpr). Gen itpr lebah A. mellifera telah dikarakterisasi sebanyak tiga kilo basa yang terdiri atas tujuh ekson dan enam intron. Ekson satu dan tujuh telah dikarakterisasi berdasarkan CDNA (complementary DNA) dan belum diketahui keberadaan intronnya. Penelitian ini bertujuan untuk mengkarakterisasi runtunan intron pada ekson satu dan tujuh gen itpr. DNA diekstraksi dari toraks lebah pekerja. Peruntunan DNA menggunakan primer yang sama untuk amplifikasi DNA. Hasil peruntunan ekson satu menunjukkan terdapat intron berukuran 83 basa. Intron tersebut diawali dengan basa GT dan diakhiri dengan basa AG. Komposisi basa intron didominasi olch basa AT (90,6%) dan diklasifikasikan ke dalam fase 0. Peruntunan ekson tujuh belum berhasil dilakukan karena kemungkinan daerah penempelan primer pada DNA target hasil purifikasi telah tidak ada.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: