Judul: Tipe Kerusakan Pohon Hutan Kota (Studi Kasus : Hutan Kota Bentuk Jalur Hijau, Kota Bogor - Jawa Barat)
Abstrak: Nowadays the quality of environment in urban area is getting decrease. One of ways that initiated concerning urban environmental quality management is setting urban forest in appropriate type and form based on main environmental problem issues in certain urban area. Greenbelt is one of urban forest form that most developed today. The greenbelt of roadside has many functions such as providing shade, trapping and absorbing the pollutants, reducing the noise and esthetical function. Trees are the main component to set the greenbelt. As trees are the most important component of greenbelt, health monitoring and maintaining of trees are needed in urban forest management. One of the methods used for monitoring the trees’ health is by inventing the trees’ damages. It is important since trees’ damage is potential in causing accidents and material loss. The aims of this study are to identify level of trees’ damages at roadside, identify types of trees’ damages and identify tress’ damage that potential causing accident. The result from this study hopefully can be useful to providing about the trees’ damage along greenbelt of dr. Semeru roadside and a recommendation to prevent and reduction the trees damage in greenbelt of dr. Semeru street of Bogor city. This study was conducted during 3 months (September-November 2009) along dr. Semeru street. Trees’ damages inventory was using Forest Health Monitoring method by observing three indications of tress’ damages, those were location of the damages, type of damages and level of seriousness condition of the trees. The trees’ damage along greenbelt of dr. Semeru roadside achived 91.38% that equal to 371 trees out of 406 total of trees there. Trees damage level was included as low level since the Damage Index Value (DIV) showed 6.12 (the highest scale is 21). There were 709 tress’ damage types. The biggest to smallest types of trees’ damages consisted of cancer (169 cases = 23.84%), broken or dead branch (116 cases = 16.36%), conks, fruiting bodies, and other indicators of advanced decay (109 cases = 15.37%), open wound (74 cases = 10.44%), brooms on roots or bole (68 cases = 9.59%), excessive brancing or brooms (53 cases = 7.48%), damaged foliage or shoots (29 cases = 40.09%), lost of apical dominance, dead terminal (27 cases = 3.81%), resinosis or gummosis (25 cases = 3.53%), broken bole or roots lees than 0.91 m (23 cases = 3.24%), broken or dead roots beyond 0.91 m (16 cases = 2.26%). There were 22 decay and holed dangerous tress. Cavity treatments can be done to maintain those trees but if the decays and holes were not forgiven, the best treatment is trees cutting.
Keyword: 

Judul: Evaluasi Kerusakan Fisik Pohon dalam Upaya Mitigasi Pohon Tumbang pada Jalur Hijau Jalan di Jakarta Pusat
Abstrak: The presence of trees at the roadside greenbelt has the greatest influence among other vegetation types in improving the environmental quality. Therefore, the physical condition of tree became things to note because can result of a broken tree branches or twigs or fall of a tree which can lead to traffic accidents that would endanger the safety of road users. This study aims to analyze trees phsycal force to find the resistance of a broken tree branches or twigs or fall of a tree. In this case, the roads have been surveyed including H. Agus Salim Street, Teuku Umar Street, Diponegoro Street, Imam Bonjol Street, Sutan Syahrir Street, dan Moh. Yamin Street in Central Jakarta. The collected data are species and number of tree, type of damaged, place of damaged, condition of damaged, and incident of fallen tree in location. The data were analyzed with plant physiognomy approach. There are 1.646 trees were observed in six roadside greenbelt and 1.413 of them were damaged. Based on value of index tree damage classification 650 including healthly trees, 847 low damaged trees, 167 medium damaged trees, and 12 high damaged trees. Handling of each trees adjusted base on type and severity of damaged based on eradication and protection principles.
Keyword: Bogor Agricultural University (IPB), roadside greenbelt, physical damages, mitigate, fallen trees

Judul: Expression of Lipase Genes from Micrococcus luteus in Pichia pastoris
Abstrak: Lipase merupakan enzim yang akhir-akhir ini semakin menarik perhatian berbagai sektor industri. Terkenal karena multifasetnya menjadikan lipase sebagai salah satu enzim hidrolitik dengan permintaan cukup tinggi. Hal tersebut mengharuskan peningkatan eksplorasi, identifikasi, dan pengembangan lipase-lipase jenis baru dengan karakteristik yang sesuai dengan kebutuhan industri. Lipase EMP48-D merupakan lipase baru yang berasal dari bakteri lipolitik Micrococcus luteus yang diisolasi dari tempe. Lipase EMP48-D adalah lipase yang aktif pada pH rendah (lipase asidik), toleransi terhadap suhu tinggi, dan stabil diberbagai pelarut organik. Karakteristik tersebut membuat lipase EMP48-D berpotensi untuk dikembangkan lebih lanjut sehingga dapat diaplikasikan di industri-industri, khususnya untuk bahan baku yang membutuhkan kondisi asam. Gen yang mengkodekan lipase dari EMP48-D sebelumnya telah dioverekspresikan di dalam inang Escherichia coli BL21, optimasi dilakukan dengan penambahan chaperone dan beberapa jenis vektor. Namun aktivitas lipolitik yang dihasilkan masih rendah. Penyebabnya adalah sebagian besar protein hasil overekspresi termanifestasi dalam badan inklusi, akibat keberadaan sinyal peptida bawaan M. luteus yang tidak dikenali oleh sistem E. coli. Berangkat dari hal tersebut untuk memperbaiki ekspresi gen lipase EMP48-D, dilakukan overekspresi ke dalam inang Pichia pastoris. Strategi pertama yang dilakukan berupa optimasi dengan mengeliminasi sinyal peptida bawaan diganti dengan sinyal peptida alpha mating factor (α-MF) yang telah berada dalam vektor pPICZα-A. Lipase EMP48-D berhasil di ekspresikan dalam bentuk protein ekstraseluler dengan kenaikan aktivitas dua kali lipat dari 15,02 ± 2,33 U mg-1 di E. coli BL21 menjadi 31,01 ± 1,08 U mg-1 di P. pastoris. Strategi kedua dilakukan dengan optimasi preferensi kodon agar lebih dikenali oleh sistem P. pastoris. Konstruksi plasmid rekombinan dilakukan di vektor pPIC9K dan pPICZα-A dan ditransformasikan ke dalam P. pastoris galur KM71 (MutS) dan GS115 (Mut+). Optimasi preferensi kodon berhasil menurunkan jumlah pemakaian kodon dalam bentuk Effective Number of Codons (ENc) dari 30 jenis kodon menjadi 20 jenis kodon. Indeks peluang kemunculan kodon atau Codon adaption index (CAI) ditingkatkan dari 0,408 menjadi 0,995. Analisis susunan nukleotida juga menunjukkan sebanyak 432 pb dari 1260 pb berhasil diganti dengan homologi 65,6% dibandingkan sekuen sebelum optimasi serta kandungan GC direduksi dari 76,5% menjadi 44,7%. Aktivitas lipase EMP48-D meningkat 400% dengan plasmid rekombinan pPIC9K dan inang KM71. Aktivitas spesifik optimal dihasilkan pada pH 5,0 pada suhu 40 °C sebesar 145,41 ± 4,83 U mg-1. Lipase EMP48-D memiliki kestabilan yang baik pada kisaran pH 3,0 – 5,0 dengan aktivitas residual mencapai 86,4% setelah inkubasi selama 180 menit pada suhu 40 °C. Lipase EMP48-D juga mampu menghidrolisis berbagai trigliserida rantai panjang terutama minyak zaitun (100%), diikuti dengan minyak biji bunga matahari (88,5%), minyak kanola (74,4%), minyak jagung (73,1%), minyak bekatul (71,8%), minyak kedelai (69,2%), dan minyak kelapa sawit (42,3%). Lipase EMP48-D toleran terhadap pelarut organik, terutama isopropanol (115,7%), diikuti oleh butanol (114,6%), etanol (102,8%), asetonitril (102,2%), dan metanol (101,6%). Sebaliknya pada pelarut organik n-heksana dan n-heptana terjadi penurunan aktivitas menjadi masing-masing 58,9% dan 83,8%. Konsentrasi 0,01 M ion logam (Na+, K+, Ca2+, Mg2+, Mn+) menurunkan hingga 43,1% aktivitas enzim sementara pada konsentrasi yang sama FeCl2 (213,8%) dan FeSO4 (136,2%) diketahui mampu meningkatkan aktivitas relatif enzim. Kapabilitas lipase EMP48-D sebagai katalis reaksi transesterifikasi masih rendah, hanya sekitar 2,95% dan 1,06% yang berhasil mengonversi asam lemak
Keyword: acidic lipase, codon optimization, Micrococcus luteus, overexpression, signal sequence