Judul: Seleksi Bakteri Asam Laktat (BAL) sebagai Pensintesis Vitamin B12 (Kobalamin)
Abstrak: Vitamin B12 (kobalamin) merupakan nutrisi penting bagi manusia dan hewan. Hal tersebut dikarenakan vitamin B12 memiliki fungsi untuk sintesis dan regulasi DNA, degradasi asam lemak, metabolisme asam amino, dan menghambat perkembangan anemia pernisiosa pada hewan. Vitamin B12 hanya disintesis oleh beberapa bakteri dan arkea. Defisiensi vitamin B12 dapat menyebabkan megaloblastik anemia, penyakit arteri perifer, dan berbagai gangguan neurologis. Sumber vitamin B12 lebih tinggi pada bahan pangan hewani daripada bahan pangan nabati. Hal tersebut menyebabkan vegetarian mengalami defisiensi vitamin B12. Berdasarkan hal tersebut perlu dilakukan penelitian tentang bakteri penghasil vitamin B12. Bakteri yang digunakan pada penelitian ini merupakan bakteri asam laktat (BAL) yang diisolasi dari tempe dan beberapa dari koleksi laboratorium Bioprospeksi Mikrob Pusat Penelitian Bioteknologi IPB. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan bakteri yang mampu mensintesis vitamin B12 melalui analisis HPLC. Penelitian ini diawali dengan isolasi BAL dari tempe dan peremajaan BAL koleksi laboratorium Bioprospeksi Mikrob. Isolat BAL yang diperoleh kemudian diskrining menggunakan media uji vitamin B12 untuk mendapatkan kandidat BAL yang mampu mensintesis vitamin B12. Isolat yang terpilih, dilihat pertumbuhannya pada media uji vitamin B12 dengan melakukan kurva tumbuh. Langkah selanjutnya adalah sekuensing gen 16S rRNA untuk identifikasi BAL yang berhasil diisolasi dari tempe. Kandungan vitamin B12 pada BAL dianalisis menggunakan HPLC. Bakteri asam laktat yang diisolasi dari tempe sebanyak empat isolat dan BAL dari koleksi laboratorium Bioprospeksi Mikrob sebanyak enam isolat. Hasil skrining BAL pensintesis vitamin B12 sebanyak delapan isolat, kemudian dilakukan kurva tumbuh. Setiap isolat memiliki fase puncak eksponensial (log) yang berbeda. Hasil sekuensing BAL yang diisolasi dari tempe berkerabat dekat dengan Limosilactobacillus fermentum. Berdasarkan hasil analisis HPLC vitamin B12 panjang gelombang yang terdeteksi bervariasi, puncak standar vitamin B12 muncul pada waktu retensi menit ke-10. Pada sampel 5.1.1, 5.1.2, 5.2,1, H2.34, dan NHC9 puncak muncul pada waktu retensi menit ke-10, tetapi puncak sangat rendah. Pada sampel 6.1.1, E1222, dan NHC8 puncak muncul pada waktu retensi menit ke- 9,7. Puncak yang sangat rendah menunjukkan bahwa kandungan vitamin B12 pada sampel sangat rendah. Panjang gelombang untuk vitamin B12 berkisar antara 361- 550 nm, sehingga vitamin B12 pada kontrol negatif dan isolat NHC8 tidak terdeteksi karena panjang gelombang yang dihasilkan diluar range.
Keyword: HPLC, tempe, Limosilactobacillus fermentum, media uji vitamin B12

Judul: Kajian Senyawa Antimikroba Bakteri Asam Laktat Isolat ASI yang Berpotensi sebagai Probiotik
Abstrak: Senyawa antimikroba yang berasal dari bakteri asam laktat (BAL) berpotensi dapat menggantikan penggunaan pengawet sintetik yang digunakan dalam makanan. BAL dapat menghasilkan senyawa antimikroba seperti asam organik (laktat, asetat, dan propionat), hidrogen peroksida, diasetil, bakteriosin, maupun senyawa antimikroba lainnya. Diantara berbagai metabolit tersebut, bakteriosin merupakan senyawa antimikroba yang sangat menjanjikan untuk digunakan sebagai pengawet alami makanan. Tujuan penelitian ini adalah melakukan seleksi bakteri asam laktat isolat ASI yang memiliki aktivitas penghambatan tinggi terhadap bakteri uji (Listeria monocytogenes), mengkaji senyawa antimikroba yang dihasilkan, mengetahui potensinya dalam menghasilkan senyawa bakteriosin, dan mengkaji pengaruh waktu inkubasi terhadap aktivitas antimikroba. Penelitian ini terdiri dari dua tahap, yaitu : (1) seleksi awal isolat bakteri asam laktat (BAL) potensi probiotik yang memiliki aktivitas penghambatan tinggi terhadap bakteri Listeria monocytogenes dan (2) seleksi BAL yang berpotensi menghasilkan bakteriosin. Tahap kedua terbagi menjadi 4 bagian yaitu : (a) pengujian aktivitas antimikroba dengan metode kontak, (b) penentuan fase stasioner, (c) mempelajari pengaruh waktu inkubasi terhadap aktivitas antimikroba (inkubasi BAL sampai kira-kira awal fase stasioner dan membandingkannya dengan inkubasi BAL selama 24 jam), dan (d) pengujian aktivitas antimikroba protein terendapkan (presipitasi dengan ammonium sulfat). Bakteri asam laktat (BAL) yang digunakan adalah BAL isolat ASI yang berpotensi sebagai probiotik sebanyak 24 isolat. Isolat-isolat tersebut antara lain : Lactobacillus pentosus (A7), Lactobacillus rhamnosus (A15, A23, A24, A29, A31, R21, R23, R24, R26, R34, B10, B16), Lactobacillus acidophillus1(A8, A22), Pediococcus pentosaceus2 (A16), Lactobacillus rhamnosus2 (B11) dan beberapa isolat yang belum diketahui genusnya (A14, A20, A27, R22, R25, R27, B13). Bakteri asam laktat (BAL) tersebut bersifat homofermentatif, kecuali isolat A20 yang bersifat heterofermentatif. Kultur bakteri uji yang digunakan adalah Listeria monocytogenes, Bacillus cereus, dan Staphylococcus aureus. Bakteri uji L. monocytogenes digunakan pada setiap tahapan sedangkan bakteri uji Bacillus cereus dan Staphylococcus aureus digunakan pada saat mempelajari pengaruh waktu inkubasi terhadap aktivitas antimikroba dan pengujian aktivitas protein terendapkan (presipitasi dengan ammonium sulfat). Hasil penelitian menunjukkan BAL isolat ASI yang berpotensi sebagai probiotik memiliki sifat penghambatan yang baik terhadap bakteri L. monocytogenes. Dari 24 isolat BAL yang diuji, dipilih 50 % isolat BAL (12 isolat) yang memiliki aktivitas penghambatan terbaik terhadap L. monocytogenes. Diameter penghambatan L. monocytogenes oleh keduabelas isolat tersebut ≥ 7.7 mm. Isolat-isolat tersebut adalah A7, A15, A22, A24, R21, R22, R23, R24, R25, R26, R27 dan B16. Dari 12 isolat BAL yang diuji, terdapat 8 isolat BAL (A7, A15, A22, A24, R21, R24, R26, dan R27) yang berpotensi menghasilkan senyawa bakteriosin dengan waktu inkubasi BAL selama 24 jam. Supernatan bebas sel kedelapan isolat BAL tersebut memiliki aktivitas penghambatan terhadap L. monocytogenes dibandingkan kontrol (MRSB), namun tidak menginaktivasi atau menurunkan jumlah L. monocytogenes. L. monocytogenes dapat tumbuh pada MRSB atau kontrol sebesar 1.3 log sedangkan pertumbuhan L. monocytogenes pada kedelapan supernatan BAL tersebut sekitar 0.4-1.0 log. Senyawa antimikroba pada supernatan bebas sel yang tidak dinetralisasi dapat menurunkan jumlah L. monocytogenes berkisar antara 2.0-4.9 log. Masing-masing isolat BAL (A7, A22, A24, R21, R24, dan R27) membutuhkan waktu yang berbeda untuk mencapai awal fase stasioner. Awal fase stasioner isolat BAL (A7, A22, A24, R21, R24, dan R27) diperkirakan masingmasing pada jam ke-15, ke-10, ke-13, ke-13, ke-17, dan ke-13.
Keyword: 

Judul: Thermal Characteristics and Dynamics of Tropical Cyclone over Western North Pacific Ocean: A Case Study of Typhoon Songda (Chedeng) 2011
Abstrak: The frequent occasion of Tropical Cyclone (TC) over Western North Pacific (WNP) Ocean lies from 10˚N to 26˚N and 121˚E to 170˚E. Sources of TC development come from warm ocean temperature where latent heat is released during condensation processes and subsequently concentrated in the boundary layer. Relative humidity at 850-700 hPa is responsible to produce the most intense storm. Meanwhile, weak vertical wind shear between 850-200 hPa is one of the dynamical factors that lead to the development of TC. Pressure level of 850-200 hPa is chosen to minimize the thermodynamic effect in the lower troposphere. Typhoon Songda (Chedeng in the Philippines) or TSC lasted from May 18th to 30th, 2011 and strengthened into powerful Super Typhoon stage between May 24th and 27th. Long curving track and the exhibition of all sequences of TC life cycle, TSC is then considered as an ideal case of TC. The objective of the study with case of TSC is to investigate the role of thermal characteristics and dynamics on TC intensity. The research is carried out by using Advanced Research of Weather Research and Forecasting model (WRF ARW model) version 3.3. Two domains are employed in the model. The first domain situate from 02˚N to 40˚N and 118˚E to 149˚E and cover spatial resolution () of 33.1 km. The second domain situate from 09˚N to 27˚N and 119˚E to 132˚E with of 11 km. Timestep of the model () is 120 seconds. The model is supported by the following physical parameterization, i.e., Yonsei University Scheme (YSU) in the boundary layer, Kain-Fritsch scheme (KF) in the cumulus, and WRF Single-Moment 3-class scheme in the microphysics. Initial meteorological condition prior to the formation of the cyclone is generated using WRF ARW standard-release model. Sensitivity of the model output is obtained from a selected single-parameter change scenarios, namely, 10 % to 20 % decrease and increase of wind shear initial data at 850-200 hPa, and by 10 % to 20 % decrease of relative humidity initial data at 850-700 hPa. The result showed that the negative correlations between wind shear and intensity are found in wind shear scenarios. Wind shears of 10 ms-1 which lead to strengthening of the wind intensity in the early period of Typhoon development are found in wind shear scenarios. The effect of wind shear changes on wind intensity is statistically significant in the 20 % wind shear scenarios. During mature stage, weak wind intensity occurred when wind shear increase as given in the WRF standard-release and the 20 % decreasing scenario. Different situation is found in the 20 % increasing scenario where wind shear tend to weak and lead to strong wind intensity at this stage. Meanwhile, the reduction of moisture supply at 850-700 hPa resulting from 20 % decreasing relative humidity play a major role in the weakening of wind intensity and reduces mechanical energy of the cycle process as much as 300 J kg-1.
Keyword: