Judul: Pemanfaatan Media Whey dalam Produksi Rekombinan Papain – Like Protease dari Virus SARS-CoV-2
Abstrak: Papain-Like Protease (PLpro) dalam virus SARS-CoV-2 dianggap sebagai target yang layak untuk pengembangan obat untuk mengobati pasien penyakit Coronavirus 2019 (COVID-19). Metode yang umum digunakan untuk menghasilkan PLpro adalah melalui pendekatan rekombinan menggunakan sel inang Escherichia coli yang sederhana dan terjangkau. Namun demikian, hal ini tetap membutuhkan media pertumbuhan yang mahal (Luria Bertani/LB) untuk pertumbuhan sel inang. Penelitian ini bertujuan menginvestigasi kemungkinan whey dapat digunakan untuk memproduksi PLpro SARS-CoV-2 sebagai alternatif media pertumbuhan. Kombinasi medium whey dan LB menggunakan konsentrasi whey yang berbeda (0%, 25%, 50%, dan 100%). Kepadatan sel di setiap medium akan dipantau melalui spektrofotometer UV-Vis dan ekspresi PLpro akan diinduksi dengan menambahkan 1 mM IPTG serta dipelajari melalui SDS-PAGE. Data penelitian dianalisis menggunakan analisis deskriptif. Hasil penelitian menunjukan sel inang E. coli untuk memproduksi papain-like protease (PLpro) dari SARS-CoV2 dapat direkombinasi dengan media whey. Perlakuan terbaik ada pada komposisi medium 50% whey., Papain-Like Protease (PLpro) in SARS-CoV-2 virus is considered a viable target for drug development to treat Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) patients. The commonly used method for PLpro production is through recombinant approach using Escherichia coli as a host cell, which is simple and affordable. However, this still requires expensive growth media (Luria Bertani/LB) for host cell cultivation. This study aims to investigate the possibility of using whey as an alternative growth medium for producing PLpro from SARS-CoV-2. A combination of whey and LB media using different concentrations of whey (0%, 25%, 50%, and 100%) was tested. Cell density in each medium was monitored using a UV-Vis spectrophotometer and PLpro expression was induced by adding 1 mM IPTG, and analyzed using SDS-PAGE. Data were analyzed using descriptive analysis. The results showed that E. coli host cells for PLpro production from SARS-CoV-2 can be successfully recombinant using whey media. The best treatment was found in the medium composition of 50% whey.
Keyword: IPTG, papain-like protease, recombinant protein, whey

Judul: Sifat Antiprotease Putih Telur Unggas Lokal Terhadap Protein-Like Protease dari Virus SARS-CoV-2
Abstrak: Meskipun vaksin COVID-19 telah dikembangkan, kemungkinan virus SARS-CoV-2 dapat terus bermutasi. Upaya menemukan obat COVID-19 yaitu dengan menemukan penghambat yang aman dan efisien terhadap salah satu protein utamanya, yakni papain-like protease (PLPro). Penelitian ini bertujuan menguji sifat antiprotease putih telur ayam kampung dan itik lokal Alabio terhadap PLPro. PLPro yang digunakan merupakan rekombinan protein dari E. coli dengan tingkat kemurnian yang tinggi. Penghambatan putih telur terhadap PLPro dilakukan dengan mengukur aktivitas PLPro dengan tidak adanya atau adanya berbagai konsentrasi putih telur (0%, 0,1%, 0,5%, dan 1%). Data menunjukkan bahwa nilai IC50 dari putih telur itik segar 4-5 kali lebih tinggi dari putih telur ayam segar. Penyimpanan putih telur selama 7 hari pada suhu ruang melemahkan kemampuan penghambatan terhadap PLPro tersebut dengan nilai IC50 jauh di atas 1%. Hal itu disebabkan oleh kemampuan penempelan cystatin putih telur dengan PLPro yang didominasi oleh ikatan hidrogen. Penempelan tersebut menghambat dua sisi aktif PLPro sehingga menjadi tidak aktif., Although COVID-19 vaccines have been developed, there is a possibility that the SARS-CoV-2 virus can continue to mutate. Attempts to find treatments forCOVID-19 involve discovering safe and efficient inhibitors against one of its main proteins, namely papain-like protease (PLPro). This research aims to examine the antiprotease properties of local free-range chicken egg white and Alabio duck egg white against PLPro. The PLPro used is a recombinant protein from E. coli with high purity. Inhibition of PLPro by egg white was conducted by measuring the activity of PLPro in the absence or presence of various concentrations of egg white (0%, 0.1%, 0.5%, and 1%). The data showed that the IC50 value of fresh duck egg white was 4-5 times higher than that of fresh chicken egg white. Storage of egg white for 7 days at room temperature weakened its inhibitory ability against PLPro, with IC50 values significantly above 1%. This is caused by the ability of egg white cystatin to bind with PLPro, predominantly through hidrogen bonding. Such binding inhibits both active sites of PLPro, which caused the enzyme to be inactive.
Keyword: chicken egg white, duck egg white, proteases such as papain-like protease (PlPro)

Judul: Cycle Hamilton pada Graf Lengkap, Graf Regular, dan Graf 2-Connected 4-Regular Berorder Kurang dari Sepuluh
Abstrak: Suatu graf disebut graf Hamilton apabila graf tersebut memuat cycle Hamilton, yaitu cycle yang melewati setiap vertex tepat satu kali. Menentukan keberadaan cycle Hamilton pada suatu graf dapat menggunakan syarat cukup yang berupa teorema-teorema yang telah diperkenalkan sejak tahun 1950-an. Beberapa syarat cukup yang dibahas dalam karya ilmiah ini adalah syarat cukup yang berhubungan dengan graf lengkap dan graf regular. Suatu graf lengkap berorder 𝑛������ ≥ 3 dan graf r-regular berorder 𝑛������ ≤ 2𝑟������ + 1 merupakan graf Hamilton, Karena kedua graf tersebut memuat cycle Hamilton. Selanjutnya, syarat cukup tersebut digunakan untuk menentukan keberadaan cycle Hamilton pada graf 2-connected 4- regular berorder kurang dari 10.
Keyword: graf Hamilton, graf regular, graf lengkap, graf 2-connected 4-regular