Judul: Karakterisasi dan Kloning Gen Penyandi Glukosa Oksidase (GGOx) dari Aspergillus niger IPBCC 08.610.
Abstrak: Glukosa oksidase digunakan dalam berbagai kegiatan industri maupun pengembangan teknologi enzymatic fuel cell. Penelitian sebelumnya menunjukkan bahwa isolat lokal Aspergillus niger IPBCC 08.610 dapat menghasilkan glukosa oksidase. Penelitian terkait gen penyandi glukosa oksidase (GGOx) dari isolat ini belum dilakukan. Penelitian ini bertujuan mendapatkan gen penyandi glukosa oksidase dari isolat A. niger IPBCC 08.610, mendapatkan karakteristik gen meliputi urutan dan panjang basa serta pola restriksinya, dan mendapatkan koloni trnasforman E. coli DH5α yang membawa gen. Gen penyandi glukosa oksidase didapatkan dari amplifikasi DNA genom dengan primer spesifik dan dikarakterisasi melalui teknik restriksi dengan endonukelase EcoRI dan PstI. Selain itu, gen juga disisipkan pada vektor pGEM®T-Easy dan ditransformasikan pada sel kompeten E. coli DH5α agar dapat dilakukan pengurutan basa nitrogen (sekuensing). Gen penyandi glukosa oksidase dari A niger IPBCC 08.610 memiliki ukuran sebesar 1818 bp. Gen ini dapat direstriksi menjadi dua fragmen berukuran 908 bp dan 980 bp dengan EcoRI. Terdapat tiga koloni transforman yang membawa gen penyandi glukosa oksidase.
Keyword: Aspergillus niger, endonuklease restriksi, gen penyandi glukosa oksidase, kloning, sekuensing

Judul: Konstruksi Gen Glukosa Oksidase untuk Subkloning ke dalam Plasmid pPICZα dengan Penambahan Oligonukleotida Penyandi Spacer Peptida
Abstrak: Glukosa oksidase (EC 1.1.3.4) merupakan flavoenzim yang berasal dari Aspergillus niger. Enzim Glukosa Oksidase (GOX) intraseluler yang berasal dari A. niger memiliki aktivitas yang lebih tinggi dibandingkan dengan aktivitas enzim GOX ekstraselulernya. Enzim GOX intraseluler yang berasal dari A. niger memiliki tingkat produksi yang rendah serta proses pemurnian yang cukup rumit. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan gen penyandi GOX yang siap untuk disisipkan ke dalam plasmid pPICZα untuk kemudian diekspresikan pada Pichia pastoris secara ekstraseluler. Perbanyakan plasmid rekombinan pGEM®-T Easy-GOX dilakukan pada sel bakteri Escherichia coli DH5α. Konstruksi gen GOX dilakukan dengan amplifikasi menggunakan PCR. Amplifikasi dilakukan sebanyak dua kali. Ukuran panjang basa yang diperoleh dari hasil amplifikasi kedua sebesar 1787 bp, terdiri atas situs restriksi XhoI dan oligonukleotida penyandi spacer peptida pada ujung 5’ sekuens gen GOX, serta situs restriksi XbaI pada ujung 3’ sekuens gen GOX.
Keyword: glukosa oksidase, pGEM®-T Easy-GOX, PCR, pPICZα

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: