Judul: Tingkah Laku Ikan Terhadap Lampu LED-RGB pada Bagan Tancap.
Abstrak: Bagan tancap (light fishing) dioperasikan pada malam hari dengan bantuan cahaya lampu. Lampu yang banyak digunakan yaitu lampu merkuri, neon dan LED dengan satu warna cahaya tunggal. Pengoperasiannya memiliki durasi waktu 130–149 menit dari setting ke hauling. Bagan tancap di perairan Pulau Bokor menggunakan lampu merkuri dan neon dengan komsumsi energi yang tinggi, sehingga menghasilkan sebaran intensitas cahaya yang menyebar kesegala arah. Penggunaan intensitas cahaya tersebut belum efektif dan efisien dalam meningkatkan hasil tangkapan, hal ini disebabkan tingkah laku ikan yang terjadi diluar area bagan tancap. Perkembangan teknologi light emitting diode (LED) untuk kegiatan operasi penangkapan bagan tancap memberikan keunggulan seperti memiliki warna cahaya, intensitas cahaya dan energi yang dibutuhkan sedikit. Penggunaan lampu LED dengan warna cahaya yang berbeda menghasilkan tinggi laku ikan yang berbeda. Rekayasa lampu LED dengan kombinasi warna cahaya Red, Green dan Blue (RGB) berbasis mikrokontroler menghasilkan sistem nilai Pulse Width Modulation (PWM) untuk mengatur perubahan intensitas cahaya menjadi halus (smooth). Penelitian cahaya LED-RGB di bagan tancap terhadap respons ikan belum dilakukan. Penelitian dilakukan dengan tingkah laku ikan terhadap penggunaan intensitas cahaya LED-RGB yang berbeda, dengan pendekatan metode observasi bawah air dengan alat hidroakustik yang terdiri dari 3600 imaging sonar/fish finder dan side imaging sonar. Tujuan penelitian ini adalah menentukan zona pencahayaan intensitas cahaya LED-RGB yang berbeda untuk hauling dengan pendekatan pengamatan tingkah laku ikan menggunakan alat hidroakustik. Uji intensitas cahaya LED-RGB yang berbeda dilakukan dengan ILT 5 000 Radiometer pada medium udara dan air. Pengamatan tingkah laku ikan dilakukan pada bagan tancap di perairan Pulau Bokor, Kepulauan Seribu, Jakarta Utara. Menggunakan metode uji coba penangkapan ikan (experimental fishing) dan alat hidroakustik. Karateristik intensitas cahaya LED-RGB pada medium udara dan air menghasilkan penyebaran cahaya secara vertikal dan horizontal, dan terdapat zona pencahayaan yang terdiri dari centre zone (CZ), main zone (MZ), influence zone (IZ) dan shadow zone (SZ). Penggunaan intensitas cahaya LED-RGB secara optimum pada bagan tancap dengan intensitas cahyaa 20 PWM. Intensitas cahaya 20 PWM untuk penarikan jaring (hauling) setara 38.8 Watt/m2 menghasilkan proporsi ikan berada pada catchable area dan komposisi tangkapan ikan sebesar 4,4 kg terdapat lima spesies ikan yang berbeda. Tingkah laku ikan terhadap intensitas cahaya 20 PWM pada waktu 18.00–21.00 WIB dan 00.00–03.00 WIB menghasilkan respons tingkah laku yang sama berdasarkan temporal dan spasial, dan menghasilkan perbedaan jumlah kawanan ikan yang mendekat ke sumber cahaya. Sedangkan dibandingkan dengan cahaya pada bagan tancap kontrol dengan 2 000 Watt (setting) dan 150 Watt (hauling), menghasilkan perbedaan tingkah laku ikan secara temporal dan spasial, dan jumlah kawanan ikan yang berbeda signifikan dengan cahaya LED-RGB. Hasil tangkapan bagan tancap sebesar 12 kg dari 7 jenis ikan yang berbeda pada waktu 18.00-21.00 WIB dan 11 kg dari 7 jenis ikan yang berbeda pada waktu 00.00-03.00 WIB. Sedangkan bagan tancap kontrol komposisi tangkapan sebesar 7 kg dari 3 jenis ikan yang berbeda pada waktu 21.00-00.00 WIB.
Keyword: citra, densitas, formasi pergerakan, optimum

Judul: Penggunaan Intensitas Cahaya LED-RGB terhadap Schooling Ikan dan Hasil Tangkapan Bagan Tancap di Teluk Banten
Abstrak: Penelitian terkait penggunaan teknologi cahaya dengan tipe lampu Light Emitting Diode (LED) sebagai alat bantu pada perikanan tangkap (light fishing) telah berkembang pesat di Indonesia. Salah satu teknologi lampu LED yang berkembang adalah lampu LED High Power Lide (HPL), dengan tiga kombinasi warna berbeda (merah, hijau dan biru) disebut LED-RGB dengan microcontroller berbasis Pulse Width Modulation (PWM) sistem. Belum tersedianya informasi data yang cukup terkait penerapan teknologi LED-RGB untuk perikanan bagan tancap, mendorong penelitian lanjutan untuk menghasilkan informasi penerapan light fishing yang lebih efektif dan efisien. Indikator teknologi lampu LED-RGB yang dapat diterapkan oleh nelayan dengan efektif apabila ketersediaan informasi data yang lebih banyak dan hasil uji coba pada tempat serta waktu yang berbeda. Sehingga tujuan dari penelitian ini adalah untuk mendapatkan rekomendasi intensitas lampu LED-RGB yang efisien dan efektif pada perikanan bagan tancap di Teluk Banten. Empat indikator yang digunakan diantaranya adalah nilai intensitas LED-RGB di medium air; tingkah laku schooling ikan terhadap intensitas LED-RGB; hasil tangkapan ikan bagan tancap terhadap intensitas LED-RGB; dan intensitas LED-RGB pada proses hauling bagan tancap berdasarkan tingkah laku schooling ikan dan hasil tangkapan di Teluk Banten. Pengukuran nilai intensitas cahaya dilakukan melalui uji coba lapang dengan ILT 5000 Research Radiometer untuk menentukan sebaran intensitas cahaya medium air. Pengamatan respons dan tingkah laku schooling ikan dilakukan pada bagan tancap menggunakan 360o imaging sonar dan side-scan sonar. Hasil tangkapan ikan dilakukan pada bagan tancap dengan mengidentifikasi spesies, ukuran panjang dan berat. Penentuan rekomendasi intensitas cahaya LED-RGB untuk proses hauling berdasarkan analisis intensitas cahaya, tingkah laku schooling ikan dan hasil tangkapan. Karakteristik pola sebaran intensitas cahaya 250 PWM, 95 PWM, 20 PWM, dan 5 PWM menghasilkan distribusi yang berbeda. 250 PWM (nilai intensitas cahaya tinggi) yang digunakan pada proses setting dan proses hauling dengan intensitas sedang yaitu 95 PWM dan intensitas rendah yaitu 20 dan 5 PWM. Berdasarkan hasilnya mengindikasikan bahwa 250 PWM memiliki pola yang menyebar merata. Pada 95 PWM, 20 PWM, dan 5 PWM memiliki pola sebaran intensitas terpusat di tengah. Pola sebaran intensitas cahaya yang diukur medium air dibagi menjadi tiga zona adalah center, main dan influence zone baik secara vertikal dan horizontal. Berdasarkan hasil penelitian, distribusi intensitas cahaya LED-RGB dengan PWM dapat meningkatkan konsentrasi ikan pada radius tertentu selama pengoperasian bagan tancap. Berdasarkan analisis secara spasial dan temporal pada posisi dan sebaran ikan target sasaran, dapat disimpulkan bahwa pergerakan tingkah laku ikan mengikuti laju lintasan secara signifikan. Respons tingkah laku schooling ikan terhadap intensitas cahaya LED-RGB diperoleh 95 PWM dapat mengkonsentrasikan schooling ikan secara vertikal cenderung berada pada center zone yaitu radius 1-2 m (1x10-6 W cm-2-3x10-7 W cm-2) dan horizontal pada main zone radius 2-3 m (9x10-7W cm-2-1x10-7 W cm-2). Adaptasi schooling ikan target pada 95 PWM lebih cepat dan lebih konsisten sehingga tingkah laku ikan yang terjadi relatif konstan sebesar 48.67%. Hal ini mengindikasikan bahwa ikan target sasaran lebih cepat terkumpul dan memiliki adaptasi respons yang konsisten, sehingga menyebabkan tingkah laku ikan relatif konstan. Hasil uji coba penangkapan jumlah komposisi hasil tangkapan ikan pada lampu LED-RGB sebanyak 24 jenis, sedangkan lampu neon 4U (22 jenis). Persentase rata-rata komposisi jenis ikan pada lampu
Keyword: fish behavior, neon 4U, pulse width modulation, RGB-LED, schooling fish.

Judul: Penyusunan Overlap Graph menggunakan Suffix Tree pada DNA Sequence
Abstrak: The DNA sequence assembly is very important in genome analysis. This step aims to reconstruct contigous DNA fragment (contigs) from short fragment by concatenating fragments based on the overlap region among them. This method employs overlap graph for solving the problems. In this graph, nodes represent fragments and edges represent overlap. This research developed a software for constructing overlap graph using suffix tree. The evaluation was conducted by measuring the number of nodes, number of edges, and the execution time in many values of minimum overlap. The minimum overlap is defined as the minimum length of substring which is considered as the overlap region between two fragments. The evaluation results showed that the number of nodes, the number of edges, and the execution time were increased with the decreasing of the minimum overlap value.
Keyword: