Judul: Studi Karakteristik Massa Air Asal Samudera Pasifik di Perairan Timur Indonesia Pada Bulan November - Desember 1996.
Abstrak: Secara geografis perairan Indonesia berbatasan langsung dengan dua samudera besar dunia yaitu Samudera Pasifik dan Samudera. Adanya pergerakan massa air tersebut menyebabkan terciptanya kondisi oseanografi yang khas pada tiap wilayah laut di perairan Indonesia, khususnya di perairan timur. Penelitian mengenai karakteristik massa air ini dilakukan di wilayah perairan timur Indonesia yang tercakup dalam wilayah survei ARLINDO 96. Data ARLINDO 96 diperoleh dari pelayaran ARLINDO CIRCULATION 96 di perairan kawasan timur Indonesia yang meliputi perairan Selat Makassar bagian selatan, Laut Flores, Selat Kambing (antara Alor dan Wetar), Laut Banda, Laut Manui (Banda Utara), Selat Sanana, Laut Seram, dan Selat Lifomatola. Analisis data dilakukan terhadap sebaran menegak dan melintang suhu dan salinitas, diagram T-S (suhu-salinitas), diagram T-0 (suhu-oksigen) dan percampuran massa air menggunakan metode perhitungan Mamayev.
Keyword: 

Judul: Karakteristik massa air arlindo di Perairan Timur Indonesia pada musim timur
Abstrak: Sirkulasi massa air di perairan timur Indonesia yang dikenal secara internasional dengan istilah Indonesian Throughflow (Bray et al., 1996) atau Arus Lintas Indonesia (Arlindo) dalam Bahasa Indonesia (Ilahude dan Gordon, 1996) sangat menarik untuk diteliti. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis massa air Arlindo di perairan timur Indonesia pada musim timur, yang meliputi analisis jalur lintasan Arlindo dan karakteristik massa air yang terlibat di dalamnya. Karakteristik massa air di Samudera Hindia dan di wilayah ekuator bagian barat Samudera Pasifik dianalisis juga sebagai bahan perbandingan. Kegiatan penelitian adalah berupa pengolahan data sekunder yang diperoleh dari the National Oceanographic Data Center (NODC), NOAA, Amerika Serikat. Lintasan Arlindo dianalisis berdasarkan gambar kontur sebaran anomali kedalaman dinamik di lapisan permukaan 0 dbar relatif terhadap permukaan 1000 dbar. Karakteristik massa air dianalisis berdasarkan ciri-ciri core layer (King, 1963) yang terlihat dalam grafik suhu-salinitas (S-S) dan grafik suhu-oksigen (S-O₂). Sebaran nilai anomali kedalaman dinamik di lapisan permukaan 0 dbar relatif terhadap permukaan 1000 dbar menunjukkan nilai yang cukup tinggi di Laut Cina, Laut Sulu, Laut Sulawesi, dan sebagian Samudera Pasifik, yaitu antara 1,8 dyn m sampai 1,9 dyn m. Di sebelah timur Mindanao nilainya lebih kecil (1,5 dyn m sampai 1,7 dyn m), sedang di sebagian Laut Sulu nilainya lebih besar (2,0 dyn m sampai 2,1 dyn m).
Keyword: 

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA