Judul: Ketahanan panas Isolat Enterobacter sakazakii asal susu formula dan makanan bayi
Abstrak: Enterobacter sakazakii merupakan bakteri patogen oportunistik, Gram negatif berbentuk batang serta tidak membentuk spora. Keberadaannya diasosiasikan dengan foodborne illness pada bayi. Sejak tahun 1958 tercatat sekitar 111 kasus infeksi oleh bakteri ini dan 26 kasus diantaranya mengakibatkan kematian pada bayi. Kejadian infeksi oleh Enterobacter sakazakii tergolong rendah namun tingkat kematian akibat infeksi bakteri ini sangat tinggi. Di indonesia keberadaan bakteri ini menjadi sorotan setelah pemberitaan mengenai hasil penelitian Estuningsih et al. (2006) diberitakan kepada masyarakat pada awal tahun 2008 yang lalu. Penelitian tersebut menyatakan bahwa 22.73 % sampel susu formula bayi dan 46.7 % sampel makanan bayi asal Indonesia terkontaminasi oleh Enterobacter sakazakii. Pemberitaan ini cukup menggemparkan berbagai kalangan mengingat resiko meningitis, sepsis, dan bacterimia yang dapat disebabkan oleh Enterobacter sakazakii.
Keyword: 

Judul: Isolasi dan Keragaman Genetika Enterobacter sakazakii (Cronobacter spp.) dari Perangkat Terkait Persiapan Susu Formula, Susu Formula dan Makanan Kering Lainnya
Abstrak: Enterobacter sakazakii (Cronobacter spp.) adalah salah satu patogen ―emerging‖ yang dapat menyebabkan penyakit fatal pada bayi berisiko tinggi melalui konsumsi susu formula. Keberadaan patogen ini dalam makanan bayi (untuk usia ≥ 4 bulan) dan susu formula di Indonesia telah dilaporkan oleh Estuningsih et al. (2006a, 2006b). Temuan bakteri ini di dalam dua produk tersebut telah menimbulkan masalah yang cukup besar di awal tahun 2007 karena pemberitaan yang simpang siur sehingga meresahkan dan memicu kekhawatiran berlebihan mengenai bahaya ini di dalam susu formula. Kekhawatiran yang berlebihan tersebut bahkan sempat menyebabkan bayi tidak diberi susu dan diberi makanan lain yang tidak atau kurang tepat seperti susu sapi segar atau air tajin. Sementara itu, temuan E. sakazakii yang beragam baik secara fenotipe maupun genotipe dari berbagai sumber di berbagai belahan dunia telah menyebabkan klasifikasi ulang taksonomi bakteri ini dan telah diusulkan suatu genus baru yakni Cronobacter spp. Di Indonesia, Meutia et al. (2008) juga menemukan patogen ini di dalam susu formula dan makanan bayi dan menyimpulkan bahwa isolat-isolat yang diperolehnya memiliki perbedaan dibandingkan galur-galur E. sakazakii dari luar Indonesia berdasarkan sekuen parsial gen 16S rRNA. Untuk itu, penelitian perlu terus dilakukan untuk mendapat gambaran mengenai keberadaan patogen ini di Indonesia baik pada sumber pangan lain atau perangkat terkait susu formula, karakterisitik fenotipik maupun genotipiknya, keragaman genetika serta perilakunya dalam pangan. Hasil-hasil penelitian tersebut dapat digunakan sebagai data untuk kajian risiko yang penting bagi penyusunan manajemen risiko yang baik, khususnya untuk diterapkan di Indonesia. Penelitian ini bertujuan untuk (1) mengisolasi dan mengidentifikasi E. sakazakii (Cronobacter spp.) dari perangkat terkait susu formula, susu formula dan makanan kering selain susu formula, dan (2) mengevaluasi keragaman genetika isolat-isolat lokal E. sakazakii (Cronobacter spp.) dan membandingkannya dengan isolat yang ada di dunia. Isolasi bakteri dengan menggunakan metode FDA (2002) yang dimodifikasi Iversen dan Forsythe (2004); karakterisasi fenotipik secara biokimiawi menggunakan perangkat API 20E dan api webTM; karakterisasi genotipik yakni isolasi DNA bakteri menggunakan metode esktraksi fenol-kloroform, amplifikasi fragmen gen 16S rRNA dengan Polymerase Chain Reaction (PCR) menggunakan dua pasang primer (16SUNI-L/Saka-2b dan ESA-1/16SUNI-R) dan sekuensing DNA; analisis kekerabatan genetika menggunakan program BLAST pada situs NCBI (www.ncbi.nlm.nih.gov) dan pembentukan pohon filogeni menggunakan metode neighbor-joining pada program MEGA4 (Molecular Evolutionary Genetic Analysis). ..dst
Keyword: Enterobacter sakazakii, Cronobacter spp, powdered infant formula

Judul: The Construction of Greedy SVP LLL Algorithm
Abstrak: A lattice is a set of all integer linear combination of a set of linearly independent vectors in ℝ𝑛���. The independent vectors are called bases of lattice. Any lattice can be generated from many bases, and these bases have the same cardinality. In the lattice, the most fundamental and renowned problem is the Shortest Vector Problem (SVP). SVP is a tracking problem of the shortest nonzero vector in a lattice with equivalent bases. In two dimensions, SVP problem has resolved exactly by Gauss’ algorithm. When the lattice dimension is higher than two, A.K. Lenstra, H.W. Lenstra and L. Lovasz gave a LLL algorithm to compute approximation of nonzero shortest vector in the lattice. Reduced bases solution obtained from LLL algorithm still be an approximation and has polynomial running time of arbitrary dimension which large enough. In 1994, Schnoor and Euchner modified this LLL algorithm as a new variant which later was named deep insertion LLL algorithm. This algorithm is a modified version of the LLL algorithm to the terms of the exchange step to improve the accuracy of output of LLL reduced bases and applying it to the subset sum problem. The purpose of this research are: (1) Reconstruct the LLL algorithm and deep insertion LLL algorithm using a geometric approach. (2) Construct a greedy SVP LLL algorithm. (3) Implement the three algorithms in a symbolic programming language, and evaluate them experimentally. A bases ℬ=[𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑛���] in ℝ𝑚��� is called reduced LLL with parameter 𝛿��� if satisfies: (a) |𝜇���𝑗���𝑖���|≤12, for every integer 𝑖���,𝑗��� with 1≤𝑖���<𝑗���<𝑛���. (b)𝛿���‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���)‖2≤‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���+1)‖2, for 𝑗���=1,2,…,𝑛���−1,where 𝛿��� is a reduced parameter of real numbers with 14<𝛿���<1. The first requirement is the reduced basis 𝛿��� must “nearly orthogonal” and in its computation case, this requirement can be reached out by using the Gram-Schmidt’s orthogonalization. While the second requirement is called exchange step, or used to called as Lovasz condition. By using both of these requirements, then they establish the LLL algorithm. Then, Schnoor and Euchner modify the LLL algorithm based on the requirements of the exchange step called the deep insertion LLL algorithm, where the exchange step is based on the comparison of the projected vector in orthogonal complement [𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑘���−1]⊥ after j-th reduction. To construct greedy SVP LLL algorithm, the requirements of the exchange step is based on purely by comparing norm of lattice 𝐛���𝑗��� with norm lattice 𝐛���𝑖��� for 𝑖���=1,2,3…,𝑗���−1. The process of insertion reduced vector after the exchange step also has done greedily. Then, we calculate the number of arithmetic operation in greedy SVP LLL algorithm for further analysis. The result of our exprimentation for three algorithms on the certain matrix size shows that the running time of the three algorithms increases propotional to the size of the matrix. The result also shows that by using 𝛿���=34 for the LLL algorithm and the deep insertion LLL algorithm, and the greedy SVP LLL algorithm which is a new variant made by using no parameter of 𝛿���, outperform of the other of two previous algorithm in terms of speed with the same output.
Keyword: LLL algorithm, LLL deep insertion algorithm, greedy SVP LLL algorithm