Judul: Isolasi, identifikasi dan studi awal peran bakteri proteolitik dari bagian eksternal ikan nila gift oreochromis niloticus
Abstrak: Ikan nila GIFT Oreochromis niloticus merupakan salah satu jenis ikan yang telah menjadi komoditas ekspor. Pada budidaya ikan nila masih ditemui kasus penyakit yang disebabkan oleh bakteri patogen. Sifat patogenik dari bakteri dapat disebabkan oleh kemampuan proteolitik dari bakteri patogen. Di lain pihak, enzim protease yang dihasilkan oleh beberapa bakteri probiotik yang hidup pada saluran pencernaan ikan, kulit dan insang dapat membantu bakteri-bakteri tersebut menjalankan peranannya. Namun mekanisme yang terjadi belum diungkap secara jelas. Penelitian ini melalui beberapa tahapan yaitu: 1) pengambilan sampel insang dan lendir pada permukaan kulit ikan nila GIFT dalam keadaan hidup baik dari ikan yang sehat maupun sakit. Bobot ikan sekitar 150-200 gram dan panjangnya ± 20 cm, 2) penapisan isolat proteolitik yaitu dengan melihat zona bening di sekeliling koloni pada media NA+skim milk 0,5%, 3) mengidentifikasi isolat terpilih dengan indeks proteolitik ≥2.00 dengan metode Cowan (1974). 4) uji Postulat Koch secara in vivo yakni penginfeksian (sebanyak 10. 10 dan 108 CFU/ml) isolat dengan IP paling tinggi pada ikan berukuran sama dengan sampel kemudian dilakukan pengamatan tingkah laku (respon makan dan gerak) serta gejala klinis selama masa pemeliharaan 10 hari. 5) uji antibakteri secara in vitro dengan metode kertas cakram. Data yang diperoleh kemudian dianalisis secara deskriptif. Hasil penelitian adalah terdapatnya delapan isolat terpilih yaitu masing- masing 1 isolat dari kulit ikan sakit, kulit ikan sehat, insang ikan sehat. dan 5 isolat dari insang ikan sakit. Berdasarkan hasil telaah morfologi dan fisiologi isolat-isolat terpilih dapat diidentifikasi sebagai Staphylococcus sp. galur T.c2. Necromonas sp. galur T.s2, Enterobacter sp. galur H.n dan Corynebacterium sp. galur H.m. Hasil uji Postulat Koch menunjukkan bahwa Enterobacter sp. galur H.n dan Corynebacterium sp. galur H.m tidak menyebabkan gejala sakit pada ikan. Necromonas sp. galur T.s2 menyebabkan gejala sakit pada ikan namun setelah diisolasi dari ikan-ikan tersebut tidak terdapat dominasi bakteri. Sebaliknya hasil pengujian terhadap ikan yang diinfeksi Staphylococcus sp. galur T.c2 memperlihatkan adanya gejala sakit yang hampir sama dengan inang saat isolasi sehingga diduga bahwa bakteri tersebut merupakan patogen penyebab sakit pada inang. Hasil uji antibakteri untuk mengetahui potensi interaksi isolat proteolitik flora normal dari ikan sehat dan isolat proteolitik patogen dari ikan sakit menunjukkan bahwa Enterobacter sp. galur H.n dan Corynebacterium sp. galur H.m berpotensi menekan Necromonas sp. galur T.s2.
Keyword: 

Judul: Patogenisitas Streptococcus agalactiae pada ikan nila (Oreochromis niloticus)
Abstrak: Streptococcosis akibat infeksi Streptococcus agalactiae merupakan penyakit pada ikan nila yang biasa dihadapi oleh pembudidaya dan dapat menyebabkan kematian yang tinggi. Serangan bakteri S. agalactiae ini telah menyebabkan kematian hingga 60% pada budidaya ikan nila di Sumatera Selatan. Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari proses patogenitas bakteri S. agalactiae tipe 1 dan tipe 2 yang diinfeksikan pada ikan nila Oreochromis niloticus sehingga dapat bermanfaat dalam upaya pengendalian penyakit bakterial pada budidaya ikan nila. Penelitian ini meliputi pengujian kerentanan ikan nila terhadap infeksi bakteri S. agalactiae, distribusi bakteri S. agalactiae di dalam tubuh ikan nila, dan perubahan makroskopis dan mikroskopis akibat infeksi bakteri S. agalactiae pada ikan nila. Parameter yang diamati adalah LD50, distribusi bakteri S. agalactiae di dalam tubuh ikan nila, gejala klinis, mortalitas, dan perubahan makroskopis dan mikroskopis akibat infeksi S. agalactiae pada ikan nila. Hasil penelitian menunjukkan bahwa nilai LD50 yang didapatkan dari penginfeksian bakteri S. agalactiae tipe β-hemolitik adalah 106 CFU/ml, sedangkan pada tipe nonhemolitik sebesar 105 CFU/ml. Proses infeksi S. agalactiae di dalam tubuh ikan nila ditunjukkan dengan distribusi bakteri yang ditemukan di dalam hati, otak, ginjal, dan darah pada hari ke- 3 sampai hari ke-15. Gejala klinis dari serangan bakteri S. agalactiae baik tipe β-hemolitik maupun non-hemolitik tidak berbeda, hanya saja kecepatan timbulnya gejala klinis pada ikan nila berbeda. Bakteri S. agalactiae tipe non-hemolitik pada hari ke-3 banyak menimbulkan gejala klinis dibandingkan dengan tipe β-hemolitik yang muncul banyak pada hari ke-5. Bakteri S. agalactiae tipe non-hemolitik lebih virulen dibandingkan dengan tipe β-hemolitik dilihat dari tingkat kematian yang menginfeksi ikan nila. S. agalactiae baik tipe β-hemolitik maupun non-hemolitik juga menyebabkan perubahan makroskopis dan mikroskopis pada organ hati, otak dan ginjal. Kata kunci : ikan nila, Streptococcus agalactiae, LD50 (Lethal Doses), distribusi bakteri, histopatologi
Keyword: 

Judul: 3D model reconstruction using aerial photo to measure object height
Abstrak: 3D reconstruction, especially for height extraction, using digital aerial photos taken from a non-metric camera and Unmanned Aerial Vehicle (UAV) is a challenging study. The purposes of the study are to determine the factors affect the accuracy of an object’s height reveal from a 3D model and establish procedures to deliver the optimal result. Two or more overlapping aerial photos can be constructed into the 3D model by applying the principles of collinearity and epipolar geometry using 3D reconstruction algorithm. Due to the instability of non-metric digital camera, the camera must be calibrated before 3D reconstruction is processed, in that way the quality of spatial extraction can be then measured. The study is conducted using 24 megapixels resolution Sony NEX7 digital camera and Hexacopter UAV. UAV was flown to a height of 50 m, 60 m and 70 m and placed at a certain position in order to get some height variations of camera. Camera Calibration Toolbox is utilized to calculate intrinsik parameters of the camera and a specific program is developed using MATLAB in order to build the 3D model and to obtain the object’s height. The result validation is done by comparing the height from 3D model with that one measured using Electronic Total Station. The accuracy of the object’s height up to 1 mm successfully achieved, with the largest height prediction error reaches 15.2 cm at 70 m flying height above ground level and average percentage error 4.07 for 20 objects.
Keyword: 3D reconstruction, collinearity, epipolar geometry, UAV