Judul: Keragaman dan Respon Ketahanan Phalaenopsis amabilis (L.) Blume Hasil Iradiasi Protocorm terhadap Dickeya dadantii
Abstrak: Phalaenopsis amabilis (L.) Blume merupakan salah satu anggrek asli Indonesia. Anggrek spesies ini merupakan tetua penting dalam kegiatan pemuliaan, karena memiliki sepal dan petal yang berwarna putih. Warna tersebut dimanfaatkan pemulia sebagai sumber warna putih untuk warna bunga anggrek hibrida yang diinginkan oleh pemulia. Karakter yang tidak diinginkan pada anggrek spesies ini adalah rentan terhadap penyakit busuk lunak. Penyakit ini dapat mematikan tanaman secara cepat, sehingga menjadi kendala dalam budidaya tanaman. Kerugian ekonomi juga merupakan dampak dari penyakit tersebut, karena anggrek Phalaenopsis memiliki nilai ekonomi yang tinggi dalam komoditas anggrek. Peningkatan keragaman genetik untuk memperbaiki karakter tersebut sangat penting dilakukan. Penelitian ini melakukan induksi mutasi menggunakan iradiasi sinar gamma untuk memperoleh karakter tanaman yang tahan terhadap penyakit busuk lunak. Penelitian ini terbagi menjadi dua percobaan, yaitu: (1) keragaman morfologi, stomata dan molekuler antar individu planlet Phalaenopsis amabilis (L.) Blume hasil iradiasi protocorm dan (2) evaluasi metode inokulasi dan respon ketahanan antar individu planlet Phalaenopsis amabilis (L.) Blume hasil iradiasi protocorm terhadap Dickeya dadantii. Keragaman yang dihasilkan dari perlakuan iradiasi perlu dilakukan analisis keragaman yang terdapat pada anggrek Phal. amabilis. Iradiasi mutasi dilakukan pada fase protocorm dan ditumbuhkan menjadi planlet. Terdapat lima populasi planlet yang dievaluasi, yakni planlet tanpa iradiasi protocorm dan planlet hasil iradisi protocorm sebesar 5, 10, 15 dan 20 Gy. Identifikasi keragaman dilakukan berdasarkan karakter morfologi daun, stomata dan molekuler. Keragaman terdapat pada semua karakter yang dievaluasi. Semua karakter morfologi daun yang dievaluasi menunjukkan keragaman, kecuali tebal daun dan tekstur permukaan daun. Keragaman juga terjadi pada karakter stomata, dimana beberapa individu planlet memiliki kerapatan stomata yang rendah, ukuran stomata besar dan jumlah kloroplas tinggi yang diindikasi merupakan tanaman poliploid. Keragaman yang tinggi dihasilkan dari planlet hasil iradiasi protocorm baik pada keragaman morfologi daun maupun stomata. Hasil tersebut menunjukkan iradiasi sinar gamma melalui protocorm berhasil meningkatkan keragaman genetik anggrek Phal. amabilis. Keragaman dikonfirmasi secara genetik melalui analisis molekur menggunakan marka SNAP berbasis gen ketahanan yaitu Pto. Analisis molekuler berdasarkan 11 lokus Pto menunjukkan terjadi keragaman pada planlet kontrol maupun iradiasi. Keragaman terindikasi dengan adanya perubahan alel pada bebrapa planlet di lokus-lokus tertentu. Keragaman diindikasi berasal dari variasi somaklonal dan iradiasi sinar gamma. Keragaman akibat variasi somaklonal terlihat dengan adanya kontrol yang memiliki perubahan alel pada lokus tertentu. Keragaman akibat iradiasi juga ditemukan pada tanaman hasil iradiasi yang juga mengalami perubahan alel pada lokus yang tertentu. Berdasarkan pohon filogenetik dari 11 lokus Pto yang dievaluasi, planlet terbagi menjadi tiga kelompok besar, dimana tanaman wild type sebagai outgroup. Sebagian besar individu planlet berada pada kelompok IIIb. Hasil ini dapat dimanfaatkan sebagai dasar pengelompokan individu berdasarkan kriteria ketahanan planlet yang dievaluasi terhadap penyakit busuk lunak akibat infeksi bakteri Dickeya dadantii. Metode inokulasi dan uji ketahanan tanaman terhadap Dickeya dadantii berhasil dilakukan dengan metode leaf disk assay. Berdasarkan evaluasi metode inokulasi menunjukkan pelukaan jaringan merupakan cara bakteri dalam menginfeksikan penyakit busuk lunak. Densitas bakteri yang dapat menginfeksikan gejala busuk lunak adala OD600=0.2. Hasil densitasis tersebut dijadikan acuan untuk menginfeksikan daun planlet hasil iradiasi yang dievaluasi. Terdapat empat kriteria ketahanan tanaman yaitu tahan, agak rentan, rentan dan sangat rentan. Terdapat empat tanaman yang tahan, dimana ketiga
Keyword: Dickeya dadantii, gen Pto, iradiasi, marka SNAP, penyakit busuk lunak, Phalaenopsis amabilis

Judul: Keragaman Morfologi dan Ketahanan terhadap Infeksi Dickeya dadantii pada Phalaenopsis amabilis (L.) Blume Hasil Iradiasi Sinar Gamma.
Abstrak: Phalaenopsis amabilis banyak digunakan sebagai tetua persilangan dalam pemuliaan anggrek untuk menghasilkan anggrek hibrida. Salah satu kendala dalam budidaya anggrek Phalaenopsis adalah penyakit busuk lunak yang disebabkan oleh Dickeya dadantii, yang dapat menurunkan hasil dan nilai ekonomi. Teknik kultur in vitro, bioteknologi, dan pemuliaan mutasi menjadi alternatif untuk persilangan konvensional dalam memperluas keragaman morfologi P. amabilis untuk menghasilkan anggrek-anggrek hibrida dengan berbagai variasi ukuran, bentuk, warna, motif bunga, serta ketahanan terhadap patogen. Tujuan dari penelitian ini adalah mendapatkan mutan putatif P. amabilis dengan keragaman morfologi yang tinggi dan menunjukkan respon ketahanan terhadap infeksi D. dadantii melalui induksi mutasi sinar gamma. Penelitian ini dilakukan di Laboratorium Kultur Jaringan Tanaman 1 (Departemen Agronomi dan Hortikultura, Fakultas Pertanian IPB), Pusat Aplikasi Isotop dan Radiasi - Badan Tenaga Nuklir Nasional (PAIR BATAN, Jakarta Selatan), dan Laboratorium Bakteriologi (Departemen Proteksi Tanaman, Fakultas Pertanian IPB) pada bulan Juni 2015 sampai bulan April 2017. Bahan tanaman yang digunakan adalah protocorm P. amabilis (L.) Blume asal Jawa Barat, yang diiradiasi sinar gamma. Setelah protocorm membentuk planlet, diamati keragaman morfologi, kemampuan proliferasi protocorm like bodies (plbs), dan pengujian respon infeksi isolat D. dadantii hasil maserasi daun tanaman sakit. Protocorm P. amabilis diiradiasi dengan lima taraf dosis iradiasi sinar gamma, 0 (kontrol), 5, 10, 15, dan 20 Gy menggunakan teknik acute iradiation. Pada pengamatan keragaman morfologi dan proliferasi, percobaan disusun secara RAL satu faktor yaitu dosis iradiasi sinar gamma dengan tiga ulangan, setiap ulangan terdiri atas 600 protocorm, dan dianalisis menggunakan analisis sidik ragam dengan uji lanjut Duncan pada α= 5%. Peubah yang diamati meliputi persentase planlet hidup, jumlah daun, jumlah akar, tinggi planlet, daun variegata, daun tebal, daun ungu, planlet malformasi, dan jumlah plbs sekunder. Potongan daun planlet mutan putatif P. amabilis diinokulasikan menggunakan isolat D. dadantii hasil maserasi dengan konsentrasi 105 cfu/mL. Hasil penelitian menunjukkan bahwa iradiasi sinar gamma mempengaruhi pertumbuhan serta menghasilkan keragaman morfologi pada P. amabilis. Keragaman morfologi terbesar diperoleh dari dosis iradiasi sinar gamma 10 Gy. Pada perlakuan dosis iradiasi sinar gamma 5 dan 15 Gy, tiga planlet mengalami early flowering. Dosis iradiasi sinar gamma 15 Gy memberikan nilai bobot basah dan proliferasi plbs tertinggi. Respon tanaman infeksi terhadap D. dadantii pada lima taraf planlet P. amabilis hasil iradiasi yang diujikan, berupa tanpa gejala, pembusukan jaringan daun, dan hipersensitif. Terdapat beberapa potongan daun planlet mutan putatif P. amabilis yang tahan terhadap infeksi D. dadantii.
Keyword: early flowering, isolat, plbs, proliferasi, protocorm

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: