Judul: Mendeteksi Serotyping Salmonella Hadar, S. Typhimurium, dan S. Enteritidis menggunakan Real Time Polymerase Chain Reaction.
Abstrak: Kontaminasi Salmonella pada produk pangan seperti karkas ayam perlu diwaspadai, sehingga diperlukan metode cepat dan akurat deteksi Salmonella untuk memonitornya. Penelitian ini bertujuan untuk memperoleh konsentrasi primer dan kondisi optimum PCR, mengevaluasi spesifisitas primer, menentukan limit deteksi untuk mendeteksi Salmonella pada karkas ayam menggunakan real time polymerase chain reaction (rt-PCR). Tahapan penelitian yaitu ekstraksi DNA, optimasi kondisi rt-PCR, konfirmasi spesifisitas dan limit deteksi, serta uji coba pada sampel. Pengujian dengan rt-PCR diawali dengan denaturasi awal pada 95 oC selama 1 menit diikuti dengan 35 siklus yang terdiri dari 15 detik denaturasi pada 95 oC, 30 detik annealing pada 52 oC, 35 detik ekstensi pada 72 oC dan ekstensi akhir pada 72 oC selama 5 menit. Kemudian dilanjutkan dengan tahap melting dengan transisi suhu 60-90 oC dengan laju 0.5 oC/detik. Primer yang digunakan untuk mendeteksi keberadaan Salmonella spp. adalah InvA119 yang spesifik sampai siklus ke-30, untuk S. Typhimurium adalah STM311 yang spesifik sampai siklus ke-25, dan untuk S. Enteritidis adalah Prot6E yang spesifik sampai siklus ke-22. Limit deteksi dengan konsentrasi primer 0.5 μM berdasarkan konsentrasi DNA untuk ketiga target gen tersebut berturut-turut sebesar 0.0002, 0.022, dan 0.218 ng atau setara dengan 3.8 x 101, 4.1 x 103, dan 2.6 x 104 sel per mL.
Keyword: karkas ayam, rt-PCR, Salmonella, S. Enteritidis, S. Typhimurium

Judul: Deteksi Salmonella Hadar, Salmonella Typhimurium, dan Salmonella Enteritidis Menggunakan Polymerase Chain Reaction (PCR)
Abstrak: Sebagai upaya penanganan kasus keracunan pangan, metode deteksi Salmonella dalam waktu yang singkat dan akurat perlu dikembangkan. Penelitian ini bertujuan untuk melakukan verifikasi metode polymerase chain reaction (PCR) untuk mendeteksi Salmonella spp., S. Enteritidis dan S. Typhimurium pada karkas ayam. Tahapan uji adalah konfirmasi kultur Salmonella, ekstraksi DNA, optimasi suhu annealing primer, uji spesifisitas primer, penentuan limit deteksi PCR, dan uji coba pada sampel. Berdasarkan hasil penelitian, kemurnian DNA hasil ekstraksi berada dalam rentang standar (1.8 – 2.0). Primer yang digunakan untuk mendeteksi keberadaan 3 serovar tersebut adalah InvAc, STM4497c, dan Prot6E. Suhu annealing yang digunakan untuk ketiga primer adalah 52 °C dan limit deteksi PCR dengan konsentrasi primer 0.5 μM untuk ketiga target gen, masing-masing sebesar 1.9 x 104 sel (InvA), 4.0 x 104 sel (STM4497), 2.0 x 103 sel (Prot6E). Pengujian pada sampel masih perlu dikembangkan karena batas limit deteksi yang masih rendah, yaitu sebesar 4.0 x 104 sel.
Keyword: karkas ayam, PCR, Salmonella spp., S. Enteritidis, S. Typhimurium

Judul: Keanekaragaman Bazzania (Marchantiophyta: Lepidoziaceae) di Taman Nasional Gunung Leuser, Aceh Tenggara, Sumatra.
Abstrak: Bazzania merupakan marga besar dari lumut hati berdaun, banyak jenis-jenis dari marga ini yang persebarannya berada di hutan tropis. Keanekaragaman dan kemelimpahan Bazzania meningkat pada hutan hujan pegunungan yang sering berkabut serta berkelembaban tinggi sehingga hutan ini disebut sebagai “hutan lumut”. Marga ini memiliki karakter diagnostik yakni percabangan membentuk pola “Y”, terdapat flagel dan daun tersusun secara incubous. Laporan tentang persebaran Bazzania di Sumatra belum mencakup semua kawasan hutan pegunungan yang ada di Sumatra, termasuk Taman Nasional Gunung Leuser (TNGL). Taman nasional ini merupakan laboratorium alam yang berorientasi pada perlindungan bagi pelbagai jenis tumbuhan termasuk Bazzania. Oleh karena itu penelitian floristik ini dilakukan untuk mengeksplorasi keanekaragaman Bazzania TNGL sebagai upaya pelengkapan daftar jenis Bazzania Sumatra. Eksplorasi spesimen Bazzania dilakukan di sepanjang jalur pendakian di TNGL (1417-2900 m dpl), dimulai dari Rainforest Lodge Kedah sampai Camp Alas. Koleksi spesimen herbarium disimpan di Herbarium Bogoriense (BO). Informasi karakter morfologi yang diamati selanjutnya digunakan dalam menyusun kunci identifikasi dan mempertelakan jenis Bazzania yang terdokumentasi di TNGL. Sebanyak 13 jenis Bazzania ditemukan di TNGL, umumnya tumbuh pada substrat batang pohon, kayu lapuk, dan ranting. Marga Bazzania memiliki variasi struktur umum gametofit yaitu tipe perawakan (kekar, ramping); bentuk pertumbuhan (merayap, mendongak, menggantung); bentuk koloni (mengeset tebal, mengeset tipis), orientasi daun lateral (tersebar mendatar ketika segar maupun kering, tersebar mendatar ketika segar tetapi tergulung masuk ketika kering), susunan daun ventral (menyirap rapat, berjarak renggang). Daun lateral memiliki variasi pada karakter bentuk, ujung, tepi, pangkal daun; kehadiran struktur tambahan seperti cuping di bagian pangkal daun; keberadaan vitta, bentuk sel pada lembaran daun, dan keberadaan trigon. Daun lateral berbentuk asimetris menyegitiga, membundar, membundar telur hingga melancor-melidah; ujung daun bergigi 2-4 dengan torehan dangkal sampai dalam, atau tidak beraturan; tepi mengombak halus, bergigi halus, bergerigi; pangkal bagian dorsal menjantung, membundar dengan tambahan seperti cuping; pangkal bagian ventral lurus, membundar; vita ada atau absen; sel berbentuk isodiametris, persegi, linear; trigon kecil, besar; kutikula halus, berbingkahan. Daun ventral memiliki variasi pada karakter bentuk, tepi, ujung, dan pangkal daun, serta kehadiran bagian daun yang hialin. Daun ventral berbentuk persegi empat, persegi empat memanjang, membundar, membundar telur, menyegitiga, mengginjal; ujung berjelabir, bergerigi, bergigi, rata; tepi mengombak sederhana, bergigi, bergerigi, bercuping dangkal, bercuping dalam; pangkal bebas, atau satu atau kedua sisinya melekat pada daun lateral; hialin absen, semua bagian daun ventral tersusun sel hialin, tidak semua bagian semua bagian daun ventral berhialin. Terdapat 5 jenis Bazzania diketahui sebagai rekaman baru untuk Sumatra yaitu Bazzania horridula, B. adnexa, B. angustifolia, B. fauriana, dan B. oshimensis; empat jenis terakhir juga merupakan rekaman baru untuk Malesia. Bazzania horridula telah dilaporkan ada di Jawa. Persebaran B. adnexa sebelumnya hanya dilaporkan di Australiasia dan China Selatan. Bazzania angustifolia, dan B. fauriana dilaporkan ada di Jepang, Vietnam Utara, Taiwan. Persebaran B. oshimensis meliputi wilayah Asia dan Indo-China (Vietnam, Thailand, Burma, Formosa, Ceylon, India dan Jepang). Kelima jenis tersebut menambah jumlah jenis Bazzania Sumatra yang sebelumnya dilaporkan sebanyak 38 jenis, sekarang menjadi 43 jenis.
Keyword: Bazzania, bryophyta, Gunung Leuser-Aceh, Lepidoziaceae, lumut hati