Judul: In Silico and In Vitro Study of Piper crocatum Ruiz & Pav as HMG-CoA Reductase Inhibitor and Inhibition of Malondialdehyde Formation
Abstrak: Penimbunan plak kolesterol dalam dinding pembuluh darah terjadi akibat molekul LDL (Low Density Lipoprotein) teroksidasi oleh radikal bebas, yang merupakan salah satu faktor resiko terjadinya penyakit jantung koroner. Enzim yang berperan dalam pembentukan kolesterol adalah enzim hidroksil metilglutaril-KoA reduktase (HMG-KoA reduktase). Enzim ini berperan mereduksi HMG-CoA menjadi mevalonat yang selanjutnya diubah menjadi kolesterol. Dalam kondisi hiperlipidemia, terjadi peningkatan reactive oxygen species (ROS), sehingga menimbulkan peroksidasi lipid di dalam tubuh dan menghasilkan produk oksidasi yaitu malondialdehida (MDA). Keberadaan ROS dapat dinetralisir dengan senyawa yang berpotensi sebagai antioksidan. Pemanfaatan tanaman herbal menjadi alternatif dalam mengobati berbagai penyakit. Sirih merah mengandung senyawa aktif yang berpotensi sebagai inhibitor HMG-KoA reduktase dan antioksidan, seperti flavonoid, alkaloid, polifenol, fenolik, tanin, dan minyak atsiri. Penelitian sebelumnya telah banyak dilakukan penghambatan HMG-KoA reduktase secara in vivo. Penemuan obat dapat dipermudah dan dipercepat dengan prediksi pengikatan molekul ligan pada protein secara komputasi. Penelitian sebelumnya telah berhasil melakukan analisis senyawa aktif yang terkandung dalam ekstrak dan fraksi sirih merah. Penelitian mengenai penghambatan HMG-KoA reduktase secara in silico dan in vitro oleh sirih merah belum dilakukan. Penelitian ini menguji potensi senyawa ekstrak etanol, fraksi air, fraksi etil asetat, dan fraksi n-heksan sirih merah sebagai inhibitor HMG-KoA reduktase secara in silico dan in vitro serta penghambatan pembentukan malondialdehida. Senyawa sirih merah dilakukan virtual screening menggunakan PyRx dan dilanjutkan analisis kelarutan dan toksisitas ligan. Penambatan molekul senyawa uji dilakukan menggunakan autodock vina terhadap ligan dengan energi afinitas tertinggi terhadap HMG-KoA reduktase (kode PDB: 1HWK) berdasarkan virtual screening. Ekstraksi sirih merah dilakukan dengan metode maserasi menggunakan etanol 70%, kemudian difraksinasi bertingkat menggunakan pelarut n-heksan, etil asetat, dan air. Penghambatan HMG-KoA reduktase in silico, kemudian dibuktikan secara in vitro dengan konsentrasi akhir sampel 50 ppm, 100 ppm dan 200 ppm. Atorvastatin digunakan sebagai kontrol positif. Pengahmbatan pembentukakan malondialdehida dilakukan dengan metode tiobarbituric acid (TBA) untuk melihat potensi aktivitas antioksidan sampel.Hasil virtual screening menunjukkan ligan terpilih yaitu glabrescione, galokatekin, schisandrin B, 4-(4-methoxy-phenylamino)-2,3-dihydro-1H-4a,9-diaza- cyclopenta[b]fluorene-10-carbonitrile, 4-({4,6-Bis[(3R,5S)-3,5-diamino-1-piperidinyl]- 1,3,5-triazin-2-yl}amino)benzenesulfonamide, dan 1,1'-(1,4-Butanediyl)bis{2,6-dimethyl- 4-[(3-methyl-1,3-benzothiazol-2(3H)-ylidene)methyl]pyridinium} dan senyawa dengan energi afinitas tertinggi yaitu 4-({4,6-Bis[(3R,5S)-3,5-diamino-1-piperidinyl]-1,3,5- triazin-2-yl}amino)benzenesulfonamide sebesar -8.3 kkal/mol, berinteraksi dengan residu asam amino Ser684, Asp690, Lys691, Lys692, Lys735. Penghambatan terbesar HMG- KoA reduktase secara in vitro terdapat pada fraksi etil asetat 200 ppm yaitu sebesar 94% dan aktivitas tertinggi penghambatan pembentukan malondialdehida pada fraksi etil asetat serta terendah pada semua konsentrasi adalah fraksi air., The buildup of Cholesterol plaque in artery walls occurs due to oxidation of LDL (Low Density Lipoprotein) molecules by free radicals, which is a risk factor for coronary heart disease. The enzyme that plays a role in the formation of cholesterol is the hydroxyl methylglutaril-CoA reductase (HMG-CoA reductase) enzyme. In hyperlipidemic conditions, there is an increase in reactive oxygen species (ROS), causing lipid peroxidation in the body and producing oxidation products, malondialdehyde (MDA). The presence of ROS can be neutralized with compounds that may act as antioxidants. Utilization of herbal plants is an alternative in treating various diseases. Red betel contains active compounds that have the potential to act as HMG-CoA reductase inhibitors, such as flavonoids, alkaloids, polyphenols, phenolics, tannins, and essential oils. Previous studies have carried out the inhibition of HMG-CoA
Keyword: Bioactive compounds, HMG-CoA reductase, red betel

Judul: Penambatan molekuler senyawa bioaktif sirih merah (Piper crocatum) terhadap lipoksigenase dan penghambatan malondialdehid in vitro
Abstrak: Penyakit degeneratif terjadi karena beberapa faktor risiko yang berhubungan langsung dengan peradangan. Salah satu agen penyebab inflamasi adalah enzim lipoxygenase (LOX) yang dapat membentuk malondialdehid (MDA) sehingga dibutuhkan obat antiinflamasi yang terbuat dari tanaman herbal salah satunya daun sirih merah (Piper crocatum). Penelitian ini bertujuan menentukan senyawa asal dari ekstrak dan fraksi etanol 70% daun sirih merah yang memiliki penghambatan terbaik terhadap enzim lipoksigenase penyebab terbentuknya malondialdehid (MDA) melalui simulasi penambatan molekuler serta menentukan aktivitas antioksidan tertinggi dari 4 daerah berbeda di pulau Jawa dengan metode thiobarbituric acid (TBA). Senyawa daun sirih merah yang mampu menghambat enzim lipoksigenase yakni ligan nandrolone phenylpropionate dan sofalcone dengan energi afinitas sebesar -10.4 kkal/mol dan -9.1 kkal/mol dengan nilai Ki sebesar 0.0023 µM dan 0.021 µM. Aktivitas antioksidan daun sirih merah terbaik dari daerah asal Bogor ekstrak etanol 70% dengan nilai IC50 sebesar 0.432 µg/mL. Perbedaan kekuatan antioksidan tiap daerah dilakukan analisis PCA dengan hasil tidak terbentuk kluster sehingga antar daerah memiliki karakteristik yang sama, Degenerative diseases occured due to several risk factors which directly related to inflammation. One of the causative agents of inflammation is the lipoxygenase (LOX) enzyme which can form malondialdehyde (MDA) so that anti-inflammatory drugs are needed made from herbal plants such as red betel leaf (Piper crocatum). This study aimed to determine the origin of the compound from the 70% ethanol extract and fraction of red betel leaf which had the best inhibition of the lipoxygenase enzyme that causes malondialdehyde (MDA) formation through molecular docking simulations and to determine the highest antioxidant activity from 4 different areas in Java islands with thiobarbituric acid (TBA) method. Red betel leaf compounds that can inhibited lipoxygenase enzymes are nandrolone phenylpropionate and sofalcone ligands with affinity energies of -10.4 kcal/mol and -9.1 kcal/mol with Ki values of 0.0023 µM and 0.021 µM, respectively. The best antioxidant activity of red betel leaf came from Bogor of 70% ethanol extract with an IC50 value of 0.432 µg/mL. The difference in antioxidant strength of each region was carried out by PCA analysis with the results no clusters were formed so that between regions had the same characteristics.
Keyword: Antioksidan, Daun Sirih Merah, Lipoksigenase, Malondialdehid

Judul: Implementation of Spatio-Temporal Change Query in Relational Database.
Abstrak: Geographic object changes in various views. Object changes are recorded using a model of static storage. No historical connection between old version data and new version data has been built. For that, a storage model of spatio-temporal queries that can analyze spatio-temporal changes has been developed. The object changes the geometry are grouped according to the taxonomy of Spatio-Temporal Pattern Change. This research has been able to apply the query patterns change including born, expand, merge, contract, split, normal and die. This query based on geometric (area) changes. The implementation of spatio-temporal change queries represents an object changes continuously with easy, change detection is done by comparing two versions of data. Keyword: spatio-temporal change query, spatio-temporal change pattern.
Keyword: