arulpm/tripletsmall huggingface dataset:
Judul: Isolasi dan Kloning pada Escherichia coli Gen AaWRKY1 Artemisia annua L
Abstrak: Artemisia annua WRKY1 (AaWRKY1) gene encodes a protein WRKY a transcriptional activator of Amorpha-4,11-diene synthase (ADS). The overexpression farnesil diphosphate AaWRKY1 genes can increase levels of artemisinin. This study was aimed to isolate an AaWRKY1 gene from Artemisia annua L. Amplification of AaWRKY1 gene was done by PCR (Polymerase Chain Reaction) technique using specific primer pairs and cDNA as a template. Subsequently, AaWRKY1 gene fragment was cloned into a cloning vector pJET 1.2 using T4-ligase and transformed into competent cell Escherichia coli DH5α through heat shock method, and grown on LB agar medium containing ampicillin. Result showed that amplification with specific primers of AaWRKY1 gene generated an amplicon fragment of ± 1500 bp. The gene fragment was succesfully cloned into pJET 1.2 and transformed into cells of E. coli DH5α. Confirmation of recombinant clone was carried out using colony PCR to obtain recombinant colonies.
Keyword: Bogor Agricultural University (IPB), pJET 1.2 Vector, colony PCR, cloning, AaWRKY1 gene, Artemisia annua L

Judul: Identifikasi Tanaman Transgenik Artemisia annua L. Hasil Transformasi Gen AaWRKY1 dengan Metode PCR
Abstrak: Artemisinin merupakan senyawa yang diperoleh dari tanaman Artemisia annua L dan banyak digunakan dalam pengobatan malaria. Kadar artemisinin yang rendah pada tanaman ini menyebabkan pengobatan yang menggunakan artemisinin lebih mahal karena ketersediaannya yang sedikit. Salah satu upaya untuk meningkatkan kadar artemisinin pada tanaman Artemisia annua L. yaitu dengan transformasi. Tanaman Artemisia annua L. dalam penelitian ini telah melalui proses transformasi dengan Gen AaWKRY1 pada plasmid pBI121. Tujuan dari penelitian ini yaitu untuk mengidentifikasi keberhasilan transformasi gen AaWRKY1 pada tanaman Artemisia annua L. dengan metode PCR. Identifikasi tanaman hasil transformasi dilakukan dengan seleksi benih Artemisia annua L. pada media seleksi antibiotik, penanaman kecambah tanaman pada media tanah, isolasi DNA daun, amplifikasi DNA menggunakan primer dan mesin PCR, analisis kualitatif dan kuantitatif DNA. Hasil identifikasi menunjukkan sebanyak 23 sampel DNA tanaman Artemisia annua L. yang telah ditransformasi dengan gen AaWRKY1 berhasil teramplifikasi dengan metode PCR dan menghasilkan ukuran pita sekitar 450 bp. Hal ini menunjukkan keberhasilan proses transformasi gen AaWRKY1 pada tanaman Artemisia annua dan membuktikan 23 sampel tanaman tersebut merupakan tanaman transgenik.
Keyword: Artemisia annua L, artemisinin, gen AaWRKY1, PCR

Judul: Formulasi Hamiltonian untuk Menggambarkan Gerak Gelombang Soliter Dimensi Tiga di Permukaan Laut
Abstrak: Gelombang permukaan adalah gelombang yang terjadi perbedaan rapat massa antara air dan udara. Salah satu gelombang permukaan yang ditinjau adalah gelombang soliter. Formulasi gelombang soliter dilakukan dengan menggunakan formulasi Hamiltonian.
Keyword:
Judul: Struktur komunitas makrozoobentos dan kaitannya dengan karakteristik sedimen di areal sekitar penembapan tailing PT Newmont Nusa Tenggara
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mengkaji struktur komunitas makrozoobentos serta kaitannya dengan karakteristik beberapa parameter fisika dan kimia sedimen di sreal sekitar penempatan tailing PT Newmont Nusa Tenggara.
Keyword: 

Judul: Struktur komukitas makrozoobenthos dan kaitannya dengan kualitas lingkungan di perairan Teluk Lampung
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mendeskripsikan struktur komunitas makrozoobenthos, mengidentifiksi karakteristik dan kualitas fisika-kimia perairan dan sedimen serta mengkaji hunungan antara makrozoobenthos dengan kualitas fisika-kimia perairan dan sedimen di perairan Teluk Lampung.
Keyword: 

Judul: Evaluation of Influenza Antibody Titers in Serum and Egg Yolk of Layers Vaccinated with Influenza Vaccines.
Abstrak: Influenza belongs to the Orthomyxoviridae family which causes upper and lower respiratory tract infection. The aim of this study was to evaluate influenza-A specific antibody titers from serum and egg yolk of hens vaccinated with quadrivalent influenza vaccines. Three Hy-line Brown layers were vaccinated with quadrivalent influenza type A and B inactivated vaccines. Vaccination was carried out three times at a dose of 0.25 ml/chicken via the intramuscular route. The first vaccination was carried out at 24 weeks of age, then boosters were performed at 28 and 32 weeks of age. Serum and egg yolk were collected every week for 20 weeks since the first vaccination. Influenza A H3N2 and H1N1 antibody titers were determined using hemagglutination-inhibition (HI) test and agar-gel-precipitation (AGP) test. Influenza-A H3N2 and H1N1 specific antibodies were detected in both serum and egg yolk from the first to twenty weeks after the initial vaccination. Highest HI geometric mean titer (GMT) of H1N1 antibody reached 26.67 HIU at nine weeks post first vaccination (p.f.v), while H3N2 antibody reached 26 HIU at six weeks p.f.v. Our result showed that influenza antibodies can be produced in layers using quadrivalent vaccines and layer chickens are able to produce equivalent antibody levels for each influenza subtype.
Keyword: antibody, egg yolk, influenza, layer chickens, serum
Judul: Pengaruh Jarak Kemalir dan Intensitas Pencucian Terhadap Pertumbuhan dan Produksi Padi Varietas IR-42 pada Tanah Sulfat Masam di Delta Telang, Musi Banyuasin, Sumatera Selatan
Abstrak: Tanah sulfit masam menrpakan tanah potensid yang memptmyai b y a k keadah Kendaia tersebut dishbkan tanah sulfai masam banyak tn- pirit (FeS2) dan mempunyai pH sangat redah Menurut Dent (1986) jika tanah teroksidasi karena drahse, maka senyam pirit akan memhtul senyam Fe(OH)3, SO^'-, H+ sehingga hnah menjadi sangat masam. Kunci untuk memprkmki produktifitas tanah suifat masam yang d i M t-a pada pengelolaan air yang W. Telarik pengetolaan air seperti pembuatan kemdir dan pencucian dapat mengeluarkan unsuruasur penyebab ke- taasti mta menjaga w a n permukaan air ymg &pat menpdaIikan p a agar tidak teroksidasi sehingga tanaman dapat tumbuh dm berproduksi dengan baik
Keyword: 

Judul: Pertumbuhan dan Produksi Padi Sawah pada Kolom Tanah Sulfat Masam Delta Telang, Sumatera Selatan Setelah Perlakuan Pengeringan dan Pencucian
Abstrak: Tanah sulfat masam merupakan salah satu jenis tanah potensial yang masih dapat dikembangkan sebagai lahan ekstensifikasi pertanian untuk menjawab persoalan penyediaan pangan, khususnya beras, di Indonesia. Tanah sulfat masam berkembang dari bahan induk yang kaya pirit (FeS2), bersifat stabil pada kondisi reduktif dan sebaliknya pada kondisi oksidatif. Drainase, baik secara alami maupun buatan, akan menyebabkan terjadinya oksidasi pirit dan menghasilkan Fe3+ S04 2-, dan H+ (Dent, 1986), sehingga mengakibatkan peningkatan kemasaman tanah serta kelarutan Al3+, Fe2+ dan Mn2+ dan dapat mencapai konsentrasi meracun bagi tanaman. Fosfat tersedia akan berkurang karena terikat dalam bentuk Fe- dan Al-fosfat. Kejenuhan basa juga akan berkurang dan berakibat terjadinya kahat hara. Dengan demikian, pemanfaatan tanah sulfat masam sebagai lahan pertanian dihadapkan pada berbagai kendala fisik, kimia maupun biologi.
Keyword: 

Judul: Dynamical System of Hepatitis B in Three Groups with Vaccination
Abstrak: The aim of this study is to modify the hepatitis B transmission model in three age groups involving vaccination from the model conducted by Zhoe and Zhang.The method used is to analyze the stability of the fixed point and its basic reproduction number (R_0). Performed stability analysis and numerical simulation to see population dynamics. Next, a sensitivity analysis of the parameters was carried out to see its effect on R_0. From the analysis obtained two fixed points, namely non-endemic and endemic fixed points. Non-endemic fixed points are locally asymptotically stable if R_0 <1 Meanwhile, the endemic fixed point is locally asymptotically stable if R_0 > 1. Hepatitis vaccination affects the number of susceptible population, because the more successful the vaccination, the smaller the number of susceptible populations so that the smaller the population will be infected.
Keyword: Dynamic, Hepatitis B, Vaccine, Mathematical model
Judul: Penentuan Kurva Efisiensi Detektor Sinar Gamma Dengan Menggunakan Simulasi Monte Carlo
Abstrak: Pengukuran radioaktivitas pada sebuah sampel memegang peranan penting dalam bidang proteksi radiasi pada instalasi-instalasi nuklir. Untuk keperluan tersebut biasaoya digunakan metode spektrometri sinar gamma dengan menggunakan sebuah detektor semikonduktor gennanium. Dalam menggunakan metode tersebut, puncak kurva efisiensi dari sinar gamma pada setiap jenis sampel yang akan diukur harus diketahui terlebih dahulu.
Keyword: 

Judul: Radiasi gamma dari cesium 134 pada tanah
Abstrak: Nilai efisiensi pada pengukuran radiasi gamma sangat dipengaruhi oleh faktor geometri. Pengukuran ini dilakukan terhadap tanah yang dicampur dengan cesium-134 dengan radionuklida yang teratur pada spektrometer gamma. Campuran tanah dengan 134Cs dicacah menggunakan spektrometer gamma pada berbagai ukuran wadah sampel yaitu silinder dengan ukuran 0,2 liter dan 2 liter dan menggunakan Marinelli beaker dengan ukuran 0,5 liter, 1 liter, 2 liter dan 3 liter. Luas permukaan wadah yang kontak dengan detektor juga mempengaruhi nilai efisiensi. Semakin besar nilai perbandingan luas permukaan wadah yang kontak dengan detektor terhadap seluruh luas permukaan sampel maka menjadi semakin besar nilai efisiensi.
Keyword: 

Judul: Lejeuneaceae Subfamily Ptychanthoideae (Hepaticae) in  West Java
Abstrak: Subfamily Ptychanthoideae of the family Lejeuneaceae (Hepaticae) in West Java is still poorly known. Publications on this subfamily are out of dated and written in the 19th or early of 20th century. The last taxonomic treatment of Ptychanthoideae of West Java was in 1933, many species names have changed since then. Studies on Ptychanthoideae of West Java are urgently needed. Studies on the Ptychanthoideae were based on the specimens collected from West Java. A total number of 361 of specimens deposited in the Herbarium Bogoriense (BO), Herbarium Biotrop (BIOT), Gottingen Herbarium (GOET) and Bangi Herbarium (UKMB) were examined, those are old and several recent specimens collected in West Java. Recent collections were made from Telaga Warna, Ciater, Gunung Halimun Salak National Park, Cibodas Botanical Garden, Bodogol Education Center and Conservation (Gunung Gede Pangrango National Park), University of Indonesia Campus Depok, including several collections from Banten Province. Twenty four species of Lejeuneaceae subfamily Ptychanthoideae are known from West Java, belonging to 8 genera namely Acrolejeunea (Spruce) Schiffn. (2 species), Archilejeunea (Spruce) Schiffn. (1 species), Lopholejeunea (Spruce) Schiffn. (10 species), Mastigolejeunea (Spruce) Schiffn. (3 species), Ptychanthus Nees (1 species), Schiffneriolejeunea Verd. (1 species), Spruceanthus Verd. (2 species) and Thysananthus Lindenb. (4 species). Two new records of Ptychanthoideae: Mastigolejeunea indica Steph. and Thysananthus minor Verdoorn are reported for Java. A determination key to the species is presented including their descriptions and illustrations.
Keyword:
Judul: Eksploitasi terhadap Anak yang Bekerja di Indonesia
Abstrak: Forcing children to enter the labour force not only violates the rights of children, but also brings adverse effects to them. The presence of working children can’t be eliminated. Government can reduce the number of working children and protect them from exploitation. This study investigated the determinants of working children, the severity of exploitation of working children, and factors determining exploitation of working children. This study used data resulted from National Labor Force Survey (Sakernas) 2011 and utilized logistic regression as the analytical tool. The result suggests that the most influential determinant of working children is child’s school participation. Children that do not attend school have of being a working children that is 10.370 times greater than that of children that do attend school. Based on the severity of exploitation, there are three provinces which are always of high value severity of exploitation, namely Jakarta, Banten and West Java. The most influential factor of exploitation measured by working hours and access to education is education level of household head. The lower the level of education of head of household, the greater chance the child to be exploited. As for the exploitation measured by wage, girls have a chance 2.357 times greater than that of boys to be exploited measured by wages.
Keyword: 

Judul: Eksploitasi Buruh Anak Pada Industri Kecil, Studi Kasus Pekerja Anak di Industri Alas Kaki, Desa Pasireurih, Kecamatan Tamansari, Kabupaten Bogor.
Abstrak: Tujuan penelitian ini adalah memahami lebih dalam mengenai pengaruh identitas buruh anak pada posisi anak dalam industri kecil, memabami lebih dalam mengenai hubungan produksi dalam struktur industri kecil dipraktekkan untuk melibatkan buruh anak dan mengidentifikasi bagaimana eksploitasi dapat terjadi pada buruh anak.
Keyword: 

Judul: Hydroxyapatite-Chitosan Composite Coating on Stainless Steel 316 to Improve Corrosion Resistance
Abstrak: Metals that were used in bone implantation should have good corrosion resistance that were not easily corroded when implanted into the body. Metal corrosion resistance of stainless steel 316 can be enhanced through the metal coating by hydroxyapatite-chitosan composite with composition ratio of hydroxyapatite (gram) and chitosan 3% (mL) 0.2:0, 0.2:0.1, 0.2:0.5, 0.2:1.0, and 0.2:1.5. Besides improving the corrosion resistance of metal, the presence of chitosan also maintain the position of hydroxyapatite on metal surfaces. Corrosion resistance increases with increasing amount of chitosan added and the best composition of hydroxyapatite-chitosan composite was 0.2:1.0.
Keyword:
Judul: Improvement Calibration Models with bayesian Approach (Cases Medicinal Plants)
Abstrak: Medicinal plants have been used commonly in Indonesia, either as raw material or as traditional medicine product e.g “jamu”’ standardized extracts and phytopharmaca. To ensure the quality of medicinal plants product to be accepted by community and industry, the standardization of active or market compound is one of important things to be searched and determined. The active material can be termine qualitatively and quantitatively by HPLC (High Performance Liquid Chromatography). This process produce concentrate of active material and need more time and costly. The other qualitative methods is using by FTIR (Fourier Transform Infra Red). This process produce chromatogram which depend on respons , fastly and cheaper. The contents of active material in medicine herbs need to be determine accurately and faster. To overcome these problem, accurate and cheaper methods are needed. One of the method is calibration model development which shows the relationship between concentration of active material resulted by HPLC and that by FTIR. This model will decrease processing time and cost.
Keyword: 

Judul: Regresi Proses Gaussian untuk Pemodelan Kalibrasi
Abstrak: Di Indonesia tanaman obat telah lama digunakan oleh masyarakat dan industri dalam pembuatan jamu. Penggunaan tanaman obat yang semakin meluas sudah selayaknya diikuti dengan usaha untuk menjamin kualitas tanaman obat tersebut. Hal ini untuk menjamin agar produksinya dapat bersaing dan diterima oleh masyarakat. Salah satu indikator kualitas tanaman obat adalah konsentrasi senyawa aktifnya. Proses penentuan konsentrasi senyawa aktif yang dikandung oleh suatu tanaman obat perlu dilakukan secara cepat dan akurat. Salah satu metodenya adalah dengan membuat model kalibrasi yang diperoleh dari contoh tanaman obat.
Keyword: 

Judul: Infeksi Virus Parainfluenza Pada Anjing
Abstrak: Virus parainfluenza anjing termasuk famili Paramyxoviridae, berbentuk pleomorf dengan ukuran bervariasi (bergaris tengah antara 100-500 nm), berpembungkus peka ether, berisi genom RNA dan secara serologis mempunyai kesamaan dengan virus SV-5 kera; dikenak sebagai salah satu kausa penting dari sindrom "kennel cough". Infeksinya dapat mengenai anjing semua umur yang belum pernah terinfeksi atau mendapatkan vaksinasi mengakibatkan gejala klinis ringan yang terbatas pada traktus respirasi atu infeksi yang secara klinis tidak memperlihatkan gejala nyata. Gejala klinis yang nampak setelah masa inkubasi (1-5 hari) terlewati berupa batuk yang tidak berat selama beberapa hari, berbagai tingkat tonsilitis dan pharyngitis dan kadang-kadang ditemukan kenaikan temperatur rektal antara 1-2 derajat C dari temperatur normal rat-rata. Anjing terinfeksi mengandung virus pada traktus respirasi bagian atas dan bawah serta limfonoduli sampai hari ke 9 setelah infeksi. Penyebaran virus antar anjing terjadi secara aerogen.
Keyword:
Judul: Profil Leukosit pada Sapi FH (Friesian Holstein) Selama Masa Pertumbuhan
Abstrak: The aim of this study was to investigate the leukocyte profile of growing calves in order to evaluate the need for defining reference values at different age groups. Fifteen Friesian Holstein calves were divided into five groups of age (1, 3, 6, 9, and 12 months). Each animal was examined and considered to be clinically normal at the time of blood collection. Blood samples were taken from jugular vein using EDTA anticoagulated venoject. Differential leukocyte blood were stained by Giemsa and performed microscopically. The results showed that the profile of lymphocytes and total leukocytes showed a relatively stable value at the age of 3-9 months and the highest numbers of leukocyte and lymphocyte were at 12 months of age. The highest numbers of neutrophil were at 1 months of age and the lowest were at 6 months of age.
Keyword: 

Judul: Gambaran Kalsium dan Fosfor Darah Sapi Perah FH (Friesian Holstein) pada Masa Pertumbuhan
Abstrak: The aim of this study was to know the profile of calcium and phosphorus in blood of FH (Friesian Holstein) dairy cow during growth. Twenty five serum samples were collected from healthy dairy cows that divided into five groups. Each group consisted of five dairy cows are differentiated by age, one month, three months, six months, nine months, and twelve months. Blood sampels were taken from the jugular vein, calcium and phosporus of the serum were examined using spectrophotometry. The results showed levels of calcium in blood of dairy cow ranging from 7,5±0,38 to 8,7±0,07 mg/dl. The highest calcium of blood levels was obtained from dairy cows at age three months. Levels of phosphorus in blood of dairy cow ranging from 3,3±1,15 to 6,5±1,75 mg/dl. The highest of phosphorus blood levels was obtained from dairy cows at age six months. The lowest of calcium and phosphorus blood levels was obtained from dairy cows at age nine months.
Keyword: 

Judul: Pola Pernikahan Masyarakat Batak Karo di Perantauan
Abstrak: Pernikahan adalah budaya yang tidak akan pernah berhenti, pernikahan akan terjadi secara berkelanjutan Dasarnya, karena pernikahan merupakan kebutuhan biologis manusia. Indonesia adalah negara yang kaya akan budaya dan etnis. Setiap suku di Indonesia mempunyai tata cara/adat istiadat dalam pelaksanaan pernikahan itu sendiri. Begitupun dengan suku Batak karo yang mempunyai sendiri tata cara pelaksanaan pernikahan. Seiring dengan perkembangan zaman Karo Banyak masyarakat yang merantau ke berbagai daerah di Indonesia, salah satunya Bogor berjalan-jalan. Masyarakat Karo yang merantau ke wilayah Bogor pada umumnya akan berusaha melakukan adaptasi ke negara tempat tinggal baru. Keadaan ini juga terjadi pada perkawinan Karo dalam pola adaptasi di Bogor. Namun adaptasi pernikahan masyarakat Karo di Bogor berupaya menjaga nilai-nilai budaya Karo dan sakralisme perkawinan. Mereka do Karo Dimodifikasi pada pola perkawinan, dengan tetap menjaga nilai budaya pernikahan.
Keyword: Weddings Karo, Adaptation marriage patterns, Attitudes
Judul: Analisis Akad Penguasaan Lahan Pertanian di Desa Ciaruteun Ilir Kecamatan Cibungbulaang
Abstrak: Sistem ijarah dan muzara’ah pada dasarnya merupakan kerjasama pengelolaan lahan yang bertujuan untuk memperoleh hasil yang saling menguntungkan. Akan tetapi, terkadang pelaksanaan muzara’ah dan ijarah tersebut sering kali tidak sesuai dengan kesepakatan awal. Sehingga ada salah satu pihak yang dirugikan. Tujuan dalam penelitian ini ialah untuk mengetahuai pelaksanaan sistem ijarah dan muaza’ah di Desa Ciaruteun Ilir, kemudian untuk mengetahui keuntungan hasil manakah yang lebih menguntungkan petani penggarap dan faktor apa saja yang mempengaruhinya. Sebanyak 80 responden yang terdiri dari 43 responden menggunakan sistem ijarah dan 37 responden menggunakan sistem muzara’ah. Hasil penelitian menunjukan bahwa keuntungan hasil ijarah lebih besar dari hasil muzara’ah serta faktor yang mempengaruhi keuntungan hasil ijarah dan muzara’ah ialah luas lahan dan sertifikasi bibit.
Keyword: keuntungan, ijarah, muzara’ah, uji beda, regresi linear berganda

Judul: Analisis Faktor-faktor yang Memengaruhi Keputusan Petani dalam menggunakan Sistem Bagi Hasil Muzara’ah di Kabupaten Tasikmalaya
Abstrak: Tidak sedikit orang yang memiliki lahan pertanian tetapi tidak mempunyai keahlian dalam mengolahnya, begitu pun sebaliknya banyak orang yang memiliki keahlian dalam bertani tetapi tidak mempunyai lahan pertanian. Islam menawarkan solusi yaitu muamalah yang saling menguntungkan antara dua belah pihak dengan menggunakan akad muzara’ah, sebuah sistem bagi hasil yang mana pemilik lahan bekerja sama dengan petani penggarap dengan masing-masing menyediakan kontribusinya dan di akhir membagi hasilnya sesuai kesepakatan di awal. Penelitian ini bertujuan untuk menjelaskan mekanisme bagi hasil yang dilaksanakan di Kecamatan Cigalontang, Tasikmalaya ditinjau dari segi ekonomi Islam serta menjelaskan pembagian keuntungan dan biaya (profit-cost sharing) yang dilaksanakan antara dua belah pihak. Selain itu, penelitian ini menganalisis faktor-faktor apa saja yang memengaruhi petani dalam memutuskan untuk menggunakan sistem bagi hasil muzara’ah. Metode yang digunakan adalah regresi logistik. Hasil analisis menunjukkan variabel yang signifikan memengaruhi keputusan petani dalam menggunakan sistem bagi hasil muzara’ah adalah tingkat pendidikan, jumlah produksi, sumber pendapatan lain, dan harga.
Keyword: Muzara’ah, Profit-Cost Sharing, Regresi Logistik, Sistem Bagi Hasil

Judul: Electrophoretic Coating of Apatite Compouds on Stainless Steel 316L.
Abstrak: Stainless steel (SS) 316L is a metal which is used to bone plate. However, this metal still has low biocompatibility in a human body. The metal is coated by HAp in order to increase its biocompatibility. HAp on SS 316L is coated by electrophoretic deposition (EPD) method. We used two variables in EPD process, such as voltage and coating time to obtain the best coating. The XRD difractogram showed that SS 316L has been coated by HAp. Physical observation used by microscope optics showed that the best coating is achieved on 120V during 2 minutes.
Keyword: