Judul: Karakteristik ektomikoriza ascomycota pada pinus merkusii
Abstrak: Ektomikoriza merupakan simbiosis mutualisme antara cendawan tanah dengan akar tumbuhan seperti Pinaceae (Gymnospermae) dan Dipterocarpaceae (Angiospermae). Ektomikoriza berperan dalam efisiensi pengambilan unsur hara mineral dan air, serta melindungi akar dari cekaman faktor abiotik dan biotik. Pinus merkusii adalah tumbuhan hutan yang memiliki nilai ekonomi tinggi dan bersimbiosis secara obligat dengan cendawan ektomikoriza dari kelompok Ascomycota ataupun Basidiomycota. Peran cendawan Ascomycota sebagai cendawan ektomikoriza pada tumbuhan inang di hutan beriklim sedang, sudah banyak dipelajari, namun peran nya di hutan tropis, khususnya pada P. merkusii di Indonesia belum banyak dipelajari. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi cendawan ektomikoriza Ascomycota asal perakaran Shorea spp. dan mempelajari karakteristik ektomikorizanya, respon tumbuh, serta serapan fosfat (P) pada inang P. merkusii. Cendawan hasil isolasi yang diamati karakteristik koloni dan hifanya hanya 6 isolat yang diduga sebagai ektomikoriza berdasarkan hasil sekuen daerah ITS rDNA. Namun, hanya satu isolat yang digunakan sebagai perwakilan cendawan uji untuk mempelajari kemampuannya membentuk ektomikoriza, respon tumbuh, serta serapan fosfat (P) pada inang P. merkusii. Isolat cendawan Ascomycota PM2 koleksi Divisi Mikologi, Departemen Biologi, FMIPA IPB yang diisolasi dari P. merkusii digunakan sebagai kontrol positif dalam penelitian ini. Identifikasi molekuler juga dilakukan pada cendawan kontrol positif . Analisis pohon filogenetik menggunakan model Kimura 2-parameter dengan analisis neighbor joining, bootstrap 1000x pada MEGA 6. Serapan P dianalisis menggunakan metode Bray 1. Inang yang digunakan merupakan bibit hasil perkecambahan biji P. merkusii setelah berumur satu bulan pada media tanam zeolit steril di rumah kaca. Pasir dan tanah digunakan sebagai media tanam bibit P. merkusii dengan perbandingan pasir dan tanah sebesar 9:1. Masing-masing bibit P. merkusii diinokulasi dengan cendawan uji, cendawan kontrol positif, dan agar-agar MMN (kontrol negatif). Setiap perlakuan dipelihara di rumah kaca, disiram setiap hari dengan air steril, dan dipelihara selama tujuh bulan. Setiap minggu tanaman disiram 100 mL pupuk cair larutan MMN 10 % yang mengandung 50 % P tanpa agar-agar dan gula. Penyiraman dilakukan pada pagi dan sore hari. Rancangan percobaan yang digunakan berupa rancangan acak lengkap, dengan masing-masing perlakuan sebanyak 3 ulangan. Akar yang terkolonisasi oleh cendawan uji ataupun cendawan kontrol positif (hasil sintesis ektomikoriza) dianalisis kemiripan sekuennya terhadap inokulan. Sebanyak 14 isolat cendawan berhasil diisolasi dari 60 sampel akar Shorea spp. asal Kawasan Hutan Haurbentes, Jasinga, Bogor, Indonesia. Sebanyak 6 dari 14 isolat merupakan cendawan ektomikoriza. Struktur somatik ke-enam cendawan tersebut berupa hifa steril dan terdapat anastomosis hifa. Morfologi cendawan SL1 yang digunakan sebagai cendawan uji yaitu permukaan koloni iii bertekstur licin, bagian tengah koloni putih, pertumbuhan koloni 25 mm dalam satu bulan pada media MMN. Hifa hialin, septat, tidak memiliki sambungan apit (clamp connection), terdapat anastomosis hifa, dan diameter hifa 2.61 – 4.5 μm. Hasil BLAST-N daerah ITS1, 5.8S, dan ITS2 rDNA pada enam isolat cendawan, memiliki kesamaan dengan Cistella spicicola CBS 731.97 (GU727553) sebesar 91-92%. Analisis filogenetik menunjukkan ke-enam isolat cendawan, merupakan anggota Helotiales, dan genus Cistella, namun berbeda dengan Cistella spicicola CBS 731.97. Oleh karena itu ke-enam cendawan yang diperoleh dalam penelitian ini, diidentifikasi sebagai Cistella sp. SL1, Cistella sp. SS2, Cistella sp. SP3, Cistella sp. SS4, Cistella sp. SC5, dan Cistella sp. SC6. Morfologi cendawan PM2 yang digunakan sebagai
Keyword: Helotiales, ITS rDNA, pohon filogenetik, persen kolonisasi, serapan P

Judul: Isolasi cendawan ektomikoriza pada pinus merkusii di hutan penelitian gunung dahu, bogor
Abstrak: Pinus merkusii merupakan tumbuhan gymnospermae yang memiliki nilai ekonomi penting karena menghasilkan resin dan kayu yang baik. Selain itu p. Merkusii juga sering digunakan dalam program rebosisasi karena dapat tumbuh di lahan yang kritis. Pertumbuhan dan perkembangan p. Merkusii dipengaruhi oleh cendawan ektomikoriza yang membentuk simbiosis dengan akar tumbuhan tersebut. P. Merkusii bersimbiosis secara obligat dengan cendawan ektomikoriza. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis morfotipe akar, mengisolasi, dan mengkarakterisasi cendawan ektomikoriza yang bersimbiosis dengan p. Merkusii. Sebanyak 70.9% akar yang diperoleh dari 28 sampel bersimbiosis dengan cendawan ektomikoriza. Terdapat 26 morfotipe akar p. Merkusii yang terdiri atas 6 tipe ramifikasi dan 9 warna. Dikotomus cokelat merupakan morfotipe dengan frekuensi, persentase kolonisasi, dan kelimpahan relatif tertinggi. Persentase kolonisasi morfotipe dikotomus cokelat ialah 18.9% sedangkan kelimpahan relatifnya 26.7%. Terdapat 22 isolat yang berhasil diidolasi. Sebanyak 6 isolat yang terdiri dari isolat gd.151(3), gd.151(5a), gd.151(5b), gd.151(5c), gd.174(1), dan isolat gd.174(2) bukan merupakan cendawan ektomikoriza karena bersporulasi yaitu. Terdapat 3 isolat yang diduga cendawan ektomikoriza yaitu isolat gd.134(2b) dan gd.142(5) yang merupakan spesies cenococcum geophilum serta isolat gd.162(1) yang memiliki sambungan apit. Beberapa struktur yang teramati dari berbagai isolat yaitu klamidospora, blastospora, anastomosis, dan papila.
Keyword: ektomikoriza, hutan penelitian gunung dahu, morfotipe, pinus merkusii

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: