Judul: Kloning Gen Penyandi Sukrosa Sintase Dari Tanaman Sengon (Paraserianthes falcataria)
Abstrak: Salah satu aspek yang dipelajari dan diteliti untuk meningkatkan kualitas kayu sengon (Paraserianthes falcataria) adalah peningkatan deposisi selulosa. Sukrosa sintase merupakan salah satu enzim kunci yang berperan dalam biosintesis selulosa. Sukrosa sintase mengkatalisis reaksi konversi sukrosa + UDP UDP-glukosa + fruktosa. Enzim ini terlibat dalam biosintesis selulosa dengan cara menghubungkan UDP-Glukosa ke mesin sintesis selulosa (selulosa sintase). Penelitian yang terkait dengan gen penyandi sukrosa sintase yang terlibat pada biosntesis selulosa pada sengon masih terbatas. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengisolasi dan mengkloning gen penyandi sukrosa sintase yang bersumber dari sengon dengan teknik RT-PCR (sintesis cDNA) menggunakan primer yang spesifik. Kandidat gen yang berhasil diisolasi ditransformasikan ke bakteri Escherichia coli menggunakan vektor plasmid pGemT-Easy. Dari hasil sekuensing fragmen cDNA sukrosa sintase diperoleh 341 pb nukleotida yang menyandi 112 asam amino. Studi homologi yang dilakukan pada sekuens basa nukleotida dan protein penyandi sukrosa sintase sengon terhadap basa nukleotida dan protein penyandi sukrosa sintase dari tanaman lain menunjukkan bahwa sekuens gen penyandi sukrosa sintase pada sengon memiliki kesamaan dengan Glycine max, Citrus unshiu, Vigna radiata dan Arabidopsis thaliana dengan tingkat kesamaan masing-masing 79%, 78%, 75% dan 73%.
Keyword: 

Judul: Optimasi Kloning dan Identifikasi Gen Penyandi Tripsin Inhibitor dan -Amilase Inhibitor pada Tanaman Sengon (Falcataria moluccana Miq.)
Abstrak: Sengon (Falcataria moluccana) adalah tanaman cepat tumbuh yang banyak digunakan terutama pada hutan rakyat. Namun, peningkatan tren penggunaan sengon menyebabkan ledakan hama, salah satunya adalah penggerek batang boktor (Xystrocera festiva). Larva boktor menghasilkan enzim -amilase dan tripsin dalam sistem pencernaannya untuk mencerna kulit dan kayu gubal sengon. Beberapa aksesi sengon resisten menunjukkan aktivitas inhibitor tehadap enzim -amilase dan tripsin yang merupakan aspek penting dari program pemuliaan pohon sengon. Pendeteksian gen ketahanan dapat dilakukan dengan pembuatan pustaka genomik melalui metode shotgun cloning dan kloning gen spesifik. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengoptimasi penyiapan bahan kloning dan metode pembuatan pustaka genom serta kloning gen tripsin inhibitor dan -amilase inhibitor pada sengon. Sekuen gen tripsin inhibitor sengon didapatkan berukuran dari 107 bp hingga 308 bp dan memiliki kesamaan dengan Tamarindus indica, Glycine max, Populus trichocarpa dan Populus nigra. Sekuens gen -amilase inhibitor didapatkan berukuran 447 bp dan memiliki kesamaan dengan Phaseolus vulgaris. Namun, sekuens TI dan AAI tersebut masih memiliki nilai E yang rendah.
Keyword: tripsin inhibitor, -amilase inhibitor, F.moluccana, X. festiva

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: