Judul: Perbandingan pendugaan densitas ikan demersal dengan metode hidroakustik BIM berbagi dan metode Swept area di perairan laut Jawa
Abstrak: Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Oktober dan Desember 2005 di perairan Laut Jawa. Penelitian ini dilaksanakan pada letak koordinat 5,4° LU - 6,4° LU dan 109,1° BT - 111,4° BT. Penelitian ini dilakukan dengan memprgunakan data dari balai Riset Perikanan Laut (BRPL) Jakarta yang merupakan hasil survei pengkajian stok ikan di Sumatera, Laut Jawa hingga Flores pada bulan September hingga Desember 2005.
Keyword: 

Judul: Studi pendugaan densitas ikan-ikan pelagik kecil dengan menggunakan Dual-Beam Acoustic System di perairan laut Jawa bagian barat
Abstrak: Penelitian dengan menggunakan metode Akustik untuk menduga kelimpahan ikan merupakan hal yang baru dalam dunia perikanan. Metode ini menggunakan pulsa suara yang dikirim ke dalam laut yang akan terpantul kembali apabila telah mengenai ikan ataupun target lainnya. Metode inipun terus berkembang sejalan dengan kemajuan ilmu pengetahuan dan teknologi. Scientific Echo Sounder dengan Dual-Beam Acoustic System (sistim akustik dengan bim ganda) kini mulai diperkenalkan ke Indonesia sebagai salah satu pengembangan dari metode Akustik. Tujuan penelitian ini adalah menduga densitas ketersediaan ikan-ikan pelagis kecil di Perairan Laut Jawa bagian barat serta menduga penyebaran ikan-ikan tersebut secara horisontal maupun vertikal pada siang dan malam hari. Penelitian ini berlangsung dari tanggal 79 Mei 1995 di Perairan Laut Jawa bagian Barat (106°16′04 LS; 4°59'97 BT109°30′27 LS; 6°36′01 BT). Survei akustik dilakukan dengan pola mengikuti kemiringan relatif garis pantai yang dilalui yang dibagi ke dalam enam leg dimana leg 1 mengikuti kemiringan garis pantai Pulau Sumatera sedangkan untuk leg 2 sampai 6 mengikuti kemiringan garis pantai Pulau Jawa. Pengambilan data akustik ini dilakukan selama pelayaran dengan jarak satu mil laut. ...
Keyword: 

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA