Judul: Potential of Endophytic Bacteria from Various Plants to Control Meloidogyne spp. on Eggplant (Solanum melongena L.)
Abstrak: Nematoda puru akar (NPA) yang disebabkan oleh Meloidogyne spp. merupakan salah satu penyakit penting pada tanaman terung. Pengendalian Meloidogyne spp. menggunakan nematisida sintetik merupakan pengendalian yang paling banyak diminati oleh petani karena lebih praktis dan mudah didapatkan. Penggunaan nematisida sintetik yang tidak bijaksana dapat menyebabkan resistensi patogen dan pencemaran lingkungan. Keberhasilan bakteri endofit dalam mengendalikan penyakit tular tanah telah banyak dilaporkan. Bakteri endofit merupakan bakteri yang hidup di jaringan tanaman yang dapat meningkatkan pertumbuhan dan kesehatan tanaman inang. Penggunaan bakteri endofit yang diisolasi dari tumbuhan Lantana camara L. serta isolat bakteri endofit asal sawit, pinang, mangrove dan paku-pakuan diharapkan dapat menekan NPA sekaligus memacu pertumbuhan tanaman terung. Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi keefektifan bakteri endofit dalam menekan populasi Melodogyne spp. serta pengaruhnya terhadap pertumbuhan tanaman terung. Penelitian ini dilaksanakan di Laboratorium Nematologi Tumbuhan dan Laboratorium Bakteriologi Tumbuhan serta Rumah Kaca Cikabayan IPB dilaksanakan bulan November 2020 hingga Maret 2022. Penelitian ini mencakup isolasi dan seleksi bakteri asal L. camara, menggunakan isolat koleksi asal kelapa sawit, pinang, mangrove dan paku-pakuan, uji karakterisasi fisiologi bakteri endofit, uji mortalitas nematoda terhadap bakteri endofit dan uji mortalitas nematoda dengan senyawa volatile organic compound (VOC) asal bakteri endofit secara in vitro, pengujian keefektifan bakteri endofit di rumah kaca, dan karakterisasi molekuler bakteri endofit terbaik. Data dianalisis menggunakan rancangan acak lengkap (RAL) dengan uji Tukey pada data uji in vitro dan uji Dunnet pada data uji in vivo pada taraf 5%. Sebanyak 48 isolat bakteri endofit berhasil diisolasi dari tumbuhan L. camara. 23 isolat diantaranya tidak bersifat patogen terhadap tumbuhan dan mamalia. Berdasarkan karakterisasi fisiologi, sebanyak 12 isolat menghasilkan enzim protease, kitinase dan pelarutan fosfat dan 6 isolat diantaranya memproduksi enzim kitinase dengan indeks kitinolitik sebesar 0,33-1,16. Hasil pengujian terhadap mortalitas juvenile 2 Meloidogyne spp. 8 isolat menghasilkan persentase mortalitas sebesar 34,3-96,2%. Lima isolat terpilih dari hasil pengujian mortalitas diuji secara in vivo dan uji VOC yaitu LCA5, LCA13, LCA19, EG26 dan BAT27. Berdasarkan hasil pengujian di rumah kaca, perlakuan lima isolat potensial dapat menurunkan kerusakan akar dan telur Meloidogyne spp. pada tanaman terung. Penekanan kerusakan akar tertinggi ditunjukkan oleh isolat LCA5+LCA13. Kelima isolat yang digunakan berpengaruh nyata terhadap tinggi dan bobot basah tanaman terung. Perlakuan isolat LCA19 menunjukkan pertumbuhan yang lebih baik dibanding perlakuan isolat lain. Hasil pengujian VOC menunjukkan isolat LCA13 memilki pengaruh mortalitas tertinggi terhadap juvenil 2 Meloidogyne spp. Berdasarkan sekuens gen 16S rRNA, tiga isolat memiliki identitas berturut-turut teridentifikasi sebagai: Dyella marensis LCA5, Stenotrophomonas rhizophilla, Root-knot nematode (RKN) caused by Meloidogyne spp. is one of the important diseases of eggplant. Control of Meloidogyne spp. using synthetic nematicides is the most in demand by farmers because it is more practical and easy to obtain. The unwise use of synthetic nematicides can lead to pathogen resistance and environmental pollution. The success of endophytic bacteria in controlling soil borne diseases has been widely reported. Endophytic bacteria are bacteria that live in plant tissue that can increase the growth and health of host plants. The use of endophytic bacteria isolated from Lantana camara L. and isolates of endophytic bacteria from oil palm, areca nut, mangrove and ferns is
Keyword: volatile organic compound, 16S rRNA, homology

Judul: Bakteri Endofit Asal Tanaman Jarak (Jatropha curcas L.) dan Potensinya sebagai Agens Biokontrol Meloidigyne spp. pada Terung.
Abstrak: Terung (Solanum melongena) adalah tanaman yang bertekstur lembut, tebal, dan tumbuh tegak, dan bagian daging buahnya umum dikonsumsi. Terung dibudidayakan secara komersil dalam bentuk sayuran segar, persebarannya dimulai dari India dan Cina lalu diintroduksikan ke Eropa bagian Selatan, Afrika sub-Sahara, dan daerah Mediterania oleh pedagang Arab. Tanaman ini merupakan anggota famili Solanaceae seperti kentang, tomat, dan cabai. Syarat tumbuh terung adalah musim tanam dengan suhu hangat untuk memproduksi hasil panen secara optimum dan terung sangat rentan terhadap kerusakan akibat kondisi terlalu lembab, terlalu panas, beku, kekeringan, dan angin kencang. Selain itu, terung juga rentan terhadap faktor-faktor biotik seperti mikroba patogen dan nematode parasit penyebab penyakit seperti layu verticillium, busuk akar phytophthora, bercak kuning, hawar daun, antraknosa, bercak daun cercospora. Beberapa spesies nematoda menjadi patogen pada terung. Nematoda yang paling umum dikenal sebagai patogen terung adalah nematoda puru akar (Meloidogyne spp) yang berkembang baik pada daerah dengan kandungan air yang tinggi. Spesies nematoda ini menginfeksi bagian akar terung dan menghasilkan puru dengan bentuk tidak beraturan yang dapat menurunkan kemampuan tanaman untuk menyerap air dan hara dari dalam tanah. Bakteri endofit adalah bakteri yang mengolonisasi jaringan tanaman tanpa menimbulkan penyakit pada tanaman tersebut. Bakteri endofit berasosiasi dengan tanaman dalam peningkatan pertumbuhan dan kemampuan menyerap hara, peningkatan ketahanan terhadap cekaman abiotik dan penyakit tanaman. Kajian tentang asosiasi endofit dengan tanaman Jarak pagar dan pemanfaatanya dalam pengendalian penyakit pada tanaman yang lain belum banyak dilaporkan. Penelitian ini bertujuan untuk mengeksplorasi bakteri endofit dari tanaman jarak guna menentukan komponen-komponen biokimia dari bakteri endofit tersebut dan untuk mengevaluasi potensi dari bakteri endofit ini dalam peningkatan pertumbuhan tanaman dan pengendalian Meloidogyne spp. pada terung. Tahapan penelitian ini adalah: 1) penyiapan inokulum Meloidogyne spp.; 2) isolasi bakteri endofit dari akar, batang, buah, dan daun tanaman jarak yang sehat; 3) seleksi bakteri endofit dengan uji hipersensitif dan uji hemolysis; 4) uji kemampuan bakteri endofit dalam mengendalikan Meloidogyne spp. in vitro dan kemampuan meningkatkan pertumbuhan tanaman; 5) karakterisasi bakteri endofit dengan uji aktivitas hidrolitik (kitinolitik, proteolitik, dan lipolitik), produksi HCN, pelarutan fosfat, dan fiksasi nitrogen; 6) identifikasi tiga spesies bakteri endofit terpilih secara molekuler dengan gen target 16S r-RNA; 7) uji kemampuan bakteri endofit dalam menekan populasi Meloidogyne spp. dan meningkatkan pertumbuhan tanaman in planta di rumah kaca. Penelitian ini berhasil mengisolasi 195 isolat bakteri endofit dan 44 isolat menunjukkan hasil negatif pada uji hipersensitif dan uji hemolisis. Berdasarkan pengujian in vitro, sebanyak 9 isolat mampu memproduksi enzim protease, 3 isolat mampu memproduksi enzim kitinase, 1 isolat mampu memproduksi HCN, 12 isolat mampu melarutkan fosfat, dan 5 isolat mampu memfiksasi nitrogen. Isolat SJS54 dan RJS175 menunjukkan hasil terbaik dalam menekan populasi nematoda sebesar 97.5% dan 95.4%. Sementara itu, isolat FJS23 dan FJS24 menunjukkan hasil terbaik dalam peningkatan pertumbuhan tanaman. Berdasarkan uji mortalitas nematoda , uji pertumbuhan tanaman, dan uji-uji fisiologis, isolat RJS175, SJS54, dan FJS23 terpilih sebagai isolat terbaik yang akan diuji di rumah kaca. Hasil identifikasi molekuker pada gen target 16S-rRNA menunjukkan bahwa FJS23, RJS175, dan SJS54 secara berturut-turut adalah Pseudomonas sp., Pseudomonas sp., dan Micrococcus sp. Isolat SJS54 memiliki kemampuan tertinggi dalam meningkatkan tinggi tanaman dan menghambat pertumbuhan nematoda. Sementara
Keyword: Bio-nematisida, mortalitas nematoda, pemicu pertumbuhan, uji hemolisis, uji hipersensitif

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: