Judul: Inventarisasi Sampah Laut (Marine Debris) di Padang Lamun Pulau Pramuka, Kepulauan Seribu.
Abstrak: Pulau Pramuka sebagai pusat pemerintahan Kabupaten Administratif Kepulauan Seribu, merupakan pulau pemukiman yang padat penduduk, serta menjadi daerah tujuan wisata. Tingginya aktivitas penduduk setempat dan wisatawan dapatmenghasilkan sampah laut dengan jumlah besar dan berdampak terhadap ekosistem lamun. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui karakteristik sampah laut (marine debris) yang ditemukan di habitat padang lamun Pulau Pramuka. Survey lapang meliputi pengamatan struktur komunitas lamun, parameter fisika kimia perairan, dan inventarisasi sampah laut (marine debris) di 3 stasiun di Pulau Pramuka. Dari lokasi pengamatan ditemukan sebanyak 6 spesies lamun yaitu, Enhalus acoroides, Thalassia hemprichii, Cymodocea serrulata, Cymodocea rotundata, Halophila ovalis dan Syringodium isoetifolium dengan tutupan antara 1,67-47,32%, sedangkan kerapatannya 28-112,76 ind/m2. Sampah laut yang ditemukan dapat diklasifikasikan menjadi 6 jenis yaitu, plastik, logam/metal, karet, kaca, materi organik dan lain–lain. Bobot sampah laut setiap jenis berkisar antara 0,03–2,38 kg sedangkan mikroplastik yang ditemukan terdiri dari jenis fiber, film dan fragmen dengan kelimpahan 20–440 partikel/kg. Kesimpulannya, sampah laut yang diamati pada padang lamun Pulau Pramuka didominasi oleh mikroplastik fiber yang berasosiasi dengan padang monospesifik Thalassia hemprichii, sedangkan padang campuran Enhalus acoroides dan Cymodocea rotundata berasosiasi dengan mikroplastik film dan fragment.
Keyword: Pulau Pramuka, amun, mikroplastik, padang lamun, sampah laut

Judul: Hubungan Ekologis Lamun (Seagrass) Terhadap Kelimpahan dan Keanekaragaman Ikan di Pulau Pramuka Kepulauan Seribu
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kondisi kualitas perairan, sumberdaya lamun dan ikan di Pulau Pramuka serta mengkaji hubungan sumberdaya lamun terhadap kelimpahan dan keanekaragaman ikan. Selain itu juga bertujuan untuk menentukan arahan rekomendasi pengelolaan ekosistem lamun di Pulau Pramuka. Penelitian ini dilaksanakan di Pulau Pramuka, Kepulauan Seribu pada bulan Maret hingga bulan Mei 2009. Data primer yang dikumpulkan mencakup data jenis lamun, jumlah tegakan lamun, persentase penutupan lamun, jumlah dan jenis ikan, serta data parameter lingkungan. Selanjutnya data sekunder yang dikumpulkan meliputi kondisi geografis dan keadaan umum Pulau Pramuka. Analisis data yang digunakan meliputi analisis struktur komunitas lamun untuk menduga indeks nilai penting lamun serta indeks keanekaragaman, keseragaman, dan dominansi ikan. Selain itu, untuk mengetahui keterkaitan kondisi lingkungan dengan sumberdaya lamun dan ikan digunakan analisis komponen utama (PCA) serta analisis korelasi Pearson yang digunakan untuk menduga hubungan sumberdaya lamun dengan kelimpahan dan keanekaragaman ikan. Secara umum kondisi fisika kimia perairan Pulau Pramuka relatif masih dalam keadaan baik bagi kehidupan sumberdaya lamun dan ikan dengan karakteristik perairan yang jernih, dangkal, serta didominasi oleh substrat pasir, namun ekosistem lamun di Pulau Pramuka telah mengalami degradasi dan termasuk kategori kurang sehat. Thalassia hemprichii mempunyai peran yang paling besar dibandingkan dengan jenis lamun lainnya pada perairan pesisir Pulau Pramuka. Hubungan antara kerapatan jenis lamun dengan kelimpahan ikan menunjukkan hasil yang berkorelasi kuat. Hal ini menunjukkan bahwa kerapatan jenis lamun mendukung kehidupan ikan yang berasosiasi dengan ekosistem tersebut. Pengelolaan ekosistem lamun yang berbasis masyarakat (Community Based Management) perlu diterapkan di Pulau Pramuka karena Pulau Pramuka merupakan pulau pemukiman yang masyarakatnya penyumbang terbesar dalam kerusakan ekosistem lamun di pulau tersebut. Upaya pemberdayaan masyarakat dalam pengelolaan ini antara lain: melakukan sosialisasi mengenai arti penting ekosistem lamun serta latihan dan bimbingan moral kepada masyarakat. Selain itu, peningkatan sarana dan prasarana yang menunjang dalam pengolahan limbah sangat diperlukan agar pembuangan limbah tidak mencemari perairan Pulau Pramuka serta perlu dilakukan pengawasan terhadap kegiatan pada eksoistem lamun u
Keyword: Seagrass ecosystem, seagrass community, Thalassia hemprichii, Community Based Management

Judul: Characterization and Expression of Tomato infectious chlorosis virus Coat Protein Gene in Escherichia coli
Abstrak: Tomato infectious chlorosis virus (TICV) is a member of Crinivirus genus. TICV infects tomato crop in Garut and Cipanas, West Java Indonesia. Tomato initially showed bright interveinal yellowing symptoms. The coat protein gene (CP-TICV) was amplified by RT-PCR from total RNA extracted from infected tomato leaves and the amplified fragment was cloned and completely sequenced. The fragment was subsequently subcloned into the pET-21b expression vector. The recombinant plasmid was transformed to Escherichia coli strain BL21(DE3)pLysS to express the coat protein. The coat protein fused to a 6xhistag, was purified by affinity chromatography using a NiNTA spin column. The identity of the purified protein was confirmed by SDS-PAGE. In this experiment, 792 bp of CP-TICV gene of TICV virus has been successfully cloned, sequenced, and expressed in E. coli. Based on nucleotide sequences alignment analysis, TICV-Indonesia strain showed 100% identity to TICV –Spain strain and 99% identity to North America, France, and California strains and based on amino acid sequences alignment analysis, TICV-Indonesia strain showed 100% identity to TICV –Spain, North America, France strains and 99.2% identity to California strain. CP-TICV showed over expressed in E. coli when it is induced with 1 mM IPTG and incubated at 37oC. Purified CP-TICV-Histag recombinants protein sized 29 kDa based on SDSPAGE analysis.
Keyword: