Judul: MSTN Gene Polymorphism of SNP c.4957C>G in Bali Cattle using PCR-RFLP
Abstrak: Gen Myostatin (MSTN) merupakan salah satu gen yang berpengaruh terhadap pertumbuhan sapi pedaging. Penelitian ini bertujuan menganalisis keragaman gen MSTN pada sapi bali menggunakan metode PCR-RFLP. Total sampel DNA sapi yang digunakan adalah 100 ekor sapi bali jantan yang berasal dari BPTU-HPT Denpasar dan BPT-HMT Serading sejumlah masing-masing 50 ekor yang diperoleh dari Aliyya et al. (2020). Analisis keragaman gen MSTN yang dilakukan pada sapi bali menggunakan PCR-RFLP dan enzim restriksi BsrI. Analisis data yang dilakukan meliputi frekuensi genotipe, frekuensi alel, nilai heterosigositas, dan keseimbangan Hardy-Weinberg menggunakan program Popgene32. Panjang produk hasil amplifikasi fragmen gen MSTN pada exon 3 sebesar 451 bp dan satu alel (C) pada sapi bali BPTU-HPT Denpasar dan sapi bali BPT-HMT Serading. Genotipe yang diperoleh adalah genotipe CC (451 bp) dengan frekuensi alel C yaitu 1 (100%). Hasil analisis keragaman menunjukkan bahwa SNP c.4957C>G MSTN pada sapi bali monomorfik atau tidak beragam. Frekuensi alel dan genotipe tidak berada tidak dalam kondisi kesetimbangan Hardy-Weinberg karena hanya satu genotipe yang muncul., The MSTN gene is one of the genes that influence the growth of beef cattle. This study aimed to analyze the polymorphism of the MSTN gene using PCR-RFLP. DNA samples used were from BPTU-HPT Denpasar and BPT-HMT Serading 50 samples each which were obtained from Aliyya et al. (2020). The MSTN gene polymorphism analysis was carried out using PCR-RFLP and BsrI restriction enzyme. Analysis of genotype and allele frequencies, heterozygosity, and Hardy-Weinberg equilibrium were using Popgene32. The result of amplification of the MSTN gene on exon 3 was 451 bp fragments and 1 allele (C) in each sample. Only one genotype was found which was CC (451 bp) with a frequency of allele C was 1 (100%). Based on the results, it can be concluded that the MSTN gene of SNP c.4957C>G in Bali cattle was monomorphic. Allele and genotype frequency was not in Hardy-Weinberg equilibrium due to only one genotype appeared.
Keyword: gen myostatin, myostatin gene, PCR-RFLP, polimorfisme, polymorphism

Judul: Diversity of SNP c.4905 C>G Myostatin Gene (MSTN|Hind-III) in Bali Cattle Using PCR-RFLP Method
Abstrak: Sapi bali merupakan salah satu sumber daya genetik ternak asli Indonesia yang memiliki kemampuan penghasil daging baik secara kuantitas dan kualitas. Gen miostatin merupakan salah satu gen yang mengatur pertumbuhan. Penelitian ini bertujuan menentukan keragaman SNP c.4905C>G gen MSTN pada sapi bali dengan menggunakan metode Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP). Sebanyak 120 sampel DNA digunakan dalam penelitian ini yaitu masing-masing 50 sampel dari BPTU-HPT Denpasar, Bali dan 50 sampel BPTU Serading, NTB. Sebanyak 20 sampel sapi limousin digunakan sebagai pembanding. Keragaman gen MSTN diidentifikasi menggunakan metode PCR-RFLP dengan enzim pemotong Hind-III. Frekuensi alel, genotipe dan keseimbangan Hardy-Weinberg dianalisis menggunakan program PopGene 3.2. Berdasarkan hasil penelitian ditemukan dua genotipe yaitu genotipe GG dan CG. Frekuensi alel gen MSTN pada sapi bali yaitu frekuensi alel C adalah 0,01 dan alel G adalah 0,99, sedangkan pada sapi Limousin, frekuensi alel G adalah 1,00. Berdasarkan hasil yang diperoleh bahwa SNP c.4905 C>G pada sapi bali dan sapi limousin bersifat monomorfik.
Keyword: bali cattle, myostatin gene, PCR-RFLP, SNP

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: