Judul: Deteksi Dan Karakterisasi Parsial Coronavirus Dari Kelelawar Asal Provinsi Gorontalo Dan Sulawesi Utara
Abstrak: Kelelawar dikenal sebagai reservoar alami untuk virus-virus yang baru muncul, seperti Lyssaviruses, Coronavirus, Ebola virus, virus Nipah, dan banyak lainnya. Karena kelimpahan populasi, distribusi yang luas dan mobilitasnya, kelelawar memiliki risiko lebih besar sebagai sumber penularan zoonosis dibandingkan dengan hewan lain. Peran kelelawar sebagai reservoar bagi banyak pathogen semakin mendapat perhatian, setelah ditemukannya kasus epidemik Severe Acute Respiratory Coronavirus (SARS-CoV) pada tahun 2003 dan Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus (MERS-CoV) 2012, sehingga masyarakat ilmiah mulai memberikan perhatian khusus terhadap coronavirus pada kelelawar. Virus yang mirip dengan virus penyebab SARS juga ditemukan pada kelelawar dengan tingkat prevalensi lebih tinggi. Penelitian ini dilakukan sebagai bagian dari proyek besar PREDICT Indonesia, khususnya untuk memeriksa coronavirus pada kelelawar dari Provinsi Gorontalo dan Sulawesi Utara, Indonesia. Dari 151 sampel feses atau sampel usap rektum kelelawar besar pemakan buah (Pteropus alecto) yang dianalisis di laboratorium menggunakan teknik nested Polymerase Chain Reaction (PCR) untuk mengamplifikasi target dari gen RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) dengan ukuran produk 434 pasang basa, ditemukan 65 sampel diduga positif (presumptive positive). Enam belas dari 65 sampel presumptive positive, diperiksa lebih lanjut dengan teknik sekuensing untuk dikonfirmasi sebagai Coronavirus. Pohon filogenetik terhadap 16 sampel yang dikonfirmasi positif coronavirus kemudian dianalisis dengan MEGA-6.0 dan hasilnya menunjukkan bahwa sekuen gen RdRp secara parsial memiliki tingkat kemiripan yang tinggi dengan coronavirus pada kelelawar yang dilaporkan sebelumnya di Indonesia dan Thailand.
Keyword: Coronavirus, Indonesia, Konsensus PCR, Pteropus alecto

Judul: IPB (Bogor Agricultural University)
Abstrak: Kelelawar merupakan reservoir dari virus-virus zoonotik berbahaya. Kelelawar seringkali secara serologis positif terhadap virus namun tidak menunjukkan gejala klinis. Pertahanan tubuh kelelawar terhadap virus menjadi topik yang menarik untuk dikaji. Berbagai penelitian telah dilakukan untuk mengungkapkan komponen kekebalan kelelawar terutama dari aspek molekular. Hingga saat ini, belum banyak peneliti yang mengkaji aspek kekebalan dari sisi morfofisiologi organ kekebalan kelelawar. Tujuan umum dari penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi, mengkarakterisasi, dan menganalisis morfofisiologi limpa kelelawar pemakan buah yang berkaitan dengan peran kelelawar sebagai reservoir virus. Penelitian ini merupakan kajian histologi yang bersifat eksploratif dan deskriptif pada kelelawar pemakan buah (Pteropodidae) yaitu codot besar (Cynopterus titthaecheilus), nyap besar (Rousettus leschenaultii), dan kalong besar (Pteropus vampyrus). Kajian histologi dilakukan pada organ limpa yang difiksasi dengan bouin, paraformaldehida (PFA) 4%, atau neutral buffered formalin (NBF) 10% lalu ditanam dalam parafin. Pewarnaan histologi yang dilakukan meliputi pewarnaan umum, histokimia, dan imunohistokimia. Pengamatan dilakukan dengan mikroskop cahaya dan mikroskop polarisasi. Kajian terbagi menjadi tiga topik yaitu identifikasi struktur dan fungsi umum limpa, identifikasi matriks ekstraselular penyusun rangka penunjang limpa, serta identifikasi tipe aliran darah dan posisi blood spleen barrier atau sawar darah limpa (SDL). Kajian terhadap struktur dan fungsi umum mendeskripsikan bahwa limpa kelelawar pemakan buah seperti mamalia pada umumnya, memiliki pulpa putih dan pulpa merah. Pulpa putih terdiri dari periarteriolar lymphoid sheaths (PALS) dan folikel. Pulpa merah terdiri dari korda splenik, struktur sinus, dan ellipsoid. Zona marginal (ZM) dan sinus marginal (SM) diidentifikasi antara pulpa putih dan pulpa merah. Berdasarkan kajian komparasi morfofisiologi dengan spesies lain, limpa kelelawar pemakan buah diduga tidak memiliki kemampuan yang baik untuk berkontraksi dan menyediakan darah yang cepat, meskipun begitu memiliki kapasitas untuk menyimpan darah. Limpa kelelawar pemakan buah memiliki semua struktur filtrasi yang pernah diidentifikasi pada vertebrata yang mengindikasikan fungsi dominan limpa kelelawar pemakan buah adalah filtrasi patogen darah dan pertahanan yang mendukung ketahanan kelelawar terhadap infeksi virus. Kajian terhadap matriks ekstraselular penyusun rangka limpa mendeskripsikan bahwa jaringan ikat penunjang limpa kelelawar pemakan buah terutama disusun oleh serabut retikular. Serabut retikular secara umum memiliki inti kolagen yang terdiri dari kolagen I dan III dan dilapisi laminin dengan ketebalan yang bervariasi. Serabut elastin tunggal dan pendek diidentifikasi tersebar pada berbagai area limpa sebagai bagian dari serabut retikular. Penelitian ini mengidentifikasi struktur mirip periellipsoidal lymphoid sheaths (PELS) yang belum pernah diidentifikasi pada limpa mamalia. Identifikasi tipe aliran darah dan posisi SDL dilakukan dengan mengamati partikel tinta india yang diinjeksikan melalui intravena. Partikel tinta india berfungsi sebagai penanda dan model pengganti patogen darah. Aliran darah pada limpa kelelawar pemakan buah diidentifikasi memiliki tipe peredaran darah terbuka dan tertutup. Struktur SDL diidentifikasi berada pada area zona marginal (ZM), ellipsoid, dan PELS. Berdasarkan kecepatan pemrosesan tinta india, kelelawar pemakan buah disinyalir memiliki proses induksi kekebalan spesifik yang cepat dibandingkan mamalia lainnya. Kajian ini juga mengidentifikasi lesio kerusakan sel yang diduga terprogram pada 30% kelelawar yang dikaji dan menemukan badan inklusi eosinofilik pada semua limpa kelelawar yang dikaji. Belum banyak penelitian yang menyajikan badan inklusi hasil infeksi alam sehingga temuan ini dapat memberikan gambaran patofisiologi infeksi virus non eksperimental dalam limpa kelelawar pemakan buah. Temuan-temuan morfologi pada limpa
Keyword: anatomi, fisiologi, histologi, imunologi, virus

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: