Judul: Identifikasi carnation mottle virus pada tanaman anyelir (Dianthus Caryophyllus L.) melalui reverse transcription- polymerase chain reaction dan sekuen nukleotida
Abstrak: Survei yang dilakukan di daerah pertanaman anyelir (Dianthus caryphyllus L.) di Cianjur dan Bandung, Jawa Barat menemukan beberapa tanaman yang menunjukan gejala belang pada daun. Gejala yang seperti diinduksi oleh virus ini ditandai dengan belang berwarna kuning pada daun, tulang daun menjadi berwarna hijau tua, dan tepi daun sedikit melekuk. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi virus penyebab penyakit belang pada tanaman anyelir dengan menggunakan teknik Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction (RTPCR) dan analisis sekuen nukleotida. Virus ini berhasil dideteksi dengan RT-PCR menggunakan primer spesifik untuk genus Carmovirus (5 'GATCGCGATGA ATCCCACTGTGC3') dan BC58 (5 'TCACATCCTATAAACAACCATTG 3'). RT-PCR berhasil mengamplifikasi fragmen DNA Carmovirus pada daerah gen coat protein dengan ukuran sebesar 1000 bp sesuai dengan desain primer. Produk PCR telah berhasil disekuen. Penjajaran sekuen nukleotida mengindikasikan bahwa isolat virus yang berasosiasi dengan penyakit belang di Jawa Barat adalah Carnation mottle virus (CarMV). Analisis filogenetika menunjukkan bahwa isolat CarMV asal Indonesia memiliki hubungan kekerabatan yang dekat dengan isolat CarMV asal Belanda, Brazil, India, Iran, Israel, dan Spanyol.
Keyword: 

Judul: Deteksi dan identifikasi penyebab penyakit belang pada tanaman lada (Piper nigrum L)
Abstrak: Penyakit belang pada tanaman lada pada awalnya diduga disebabkan oleh mikoplasma, namun hasil penelitian di beberapa negara menunjukka n bahwa penyakit ini disebabkan oleh dua jenis virus yaitu Cucumber Mosaic Virus (CMV) dan Piper Yellow Mottle Virus (PYMV). Tujuan penelitian ini adalah untuk mendeteksi dan mengidentifikasi virus penyebab penyakit belang pada tanaman lada yang terdapa t di pulau Bangka, Lampung, Sukabumi, dan Bogor, serta untuk mengetahui efisiensi tiga jenis serangga vektor dalam penularan virus CMV dan PYMV. Hasil pengamatan yang dilakukan di sembilan kebun petani dibeberapa desa di Pulau Bangka menunjukkan serangan sebesar 95% dengan gejala umum belang dan keriting. Gejala serangan yang sama ditemukan pula di beberapa kebun petani di Lampung dan Bogor, sedangkan pada lokasi di Kebun Percobaan Balai Penelitian Tanaman Rempah dan Obat Sukamulya didominasi gejala be lang. Deteksi daun sakit bergejala keriting dan belang dengan uji ELISA menunjukkan sampel positif bereaksi dengan antiserum CMV dan Banana Streak Virus (BSV). Penularan virus dengan perlakuan jumlah serangga vektor, kontrol, 1, 3, 7, dan 10 ekor menunjukkan bahwa kutu daun Aphis gossypii tidak dapat menularkan kedua jenis virus tersebut. Penularan menggunakan serangga vektor Planococcus minor dan Ferrisia virgata pada perlakuan satu ekor serangga vektor diperoleh hasil bahwa hanya PYMV yang dapat ditula rkan dengan efisiensi 40-100%. Amplifikasi genom virus dengan PCR menggunakan 5’-Badna T dan 3’-SCBVR1 diperoleh amplikon berukuran ± 650 bp. Perunutan nukleutida amplikon hasil PCR menunjukkan adanya homologi sekuen sebesar 85% dengan sekuen PYMV ORF1 yang dilaporkan oleh de Silva et al.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: