Judul: Status Fisiologi dan Studi Keragaman Gen HSP70 sebagai Penentu Ketahanan Cekaman Panas Sapi Friesian Holstein pada Ketinggian Berbeda
Abstrak: Upaya peningkatan produktivitas sapi perah di Indonesia terkendala dengan kondisi mikroklimat Indonesia yang merupakan kepulauan tropis dengan suhu lingkungan dan kelembapan relatif yang tinggi. Kondisi tersebut berpotensi menyebabkan cekaman panas pada sapi perah. Cekaman panas pada sapi perah menyebabkan perubahan respons fisiologi dan pola metabolisme yang berimbas pada penurunan produksi susu pada sapi perah. Untuk mengatasi penurunan produksi susu, dilakukan penyesuaian berbagai faktor lingkungan, seperti iklim mikro, pakan, dan manajemen pemeliharaan. Salah satu pendekatan yang dapat dilakukan untuk mengurangi dampak cekaman panas pada produktivitas ternak adalah melalui program genetik untuk menyeleksi atau memilih hewan dengan kemampuan termotoleran yang tinggi terhadap cekaman panas. Salah satu gen yang berpotensi sebagai marka genetik untuk seleksi sapi perah unggul dengan sifat tahan panas dan produksi tinggi adalah gen HSP70. HSP70 bekerja untuk meningkatkan ambang cekaman panas yang berakibat pada panjangnya jarak translasi protein sehingga menurunkan pengaruh cekaman panas pada mekanisme protein folding dan mengurangi intensitas kerusakan protein akibat unfolding atau misfolding. Penelitian ini terdiri atas 3 tahap, tahap pertama bertujuan untuk mengevaluasi respons fisiologi, profil hematologi, hormonal, kemampuan aklimasi serta produktivitas sapi perah yang dipelihara pada lingkungan dengan ketinggian berbeda. Hasil penelitian menunjukkan bahwa dataran rendah bukan lingkungan yang sesuai untuk pengembangan sapi perah karena di dataran rendah ternak berada pada kondisi di luar zona nyaman sehingga sapi perah rentan mengalami cekaman panas. Lingkungan berpotensi memberikan dampak cekaman panas tertinggi pada sapi perah di dataran rendah, diikuti dataran sedang dan dataran tinggi yang terendah. Peningkatan cekaman panas direspons dengan peningkatan kecepatan respirasi, detak jantung, suhu rektal, suhu kulit, dan suhu tubuh serta penurunan ambang cekaman panas/HTC dan produksi susu. Kemampuan aklimasi sapi perah dalam merespons perubahan kondisi lingkungan tercermin dari nilai koefisien regresi setiap variabel terikat HTC, kecepatan respirasi, denyut jantung, suhu rektal, suhu kulit, dan suhu tubuh berhubungan erat dengan perubahan THI, suhu lingkungan, dan kelembapan relatif. Berdasarkan nilai R2 dan slope tertinggi pada dataran sedang, diikuti dataran rendah, dan dataran tinggi. Hal ini menunjukkan kemampuan aklimasi sapi perah pada dataran sedang lebih baik jika dibandingkan sapi perah pada dataran tinggi dan rendah. Meskipun secara fisiologi sapi perah mampu beradaptasi terhadap cekaman panas, cekaman panas memberikan dampak yang sangat merugikan terhadap produksi susu. Rerata produksi susu di ketiga lokasi penelitian tergolong rendah jika dibandingkan standar produksi susu sapi FH yang berada pada zona nyaman. Penelitian tahan kedua bertujuan untuk mengidentifikasi polimorfisme gen HSP70 pada sapi perah Friesian Holstein yang dipelihara pada lingkungan dengan ketinggian berbeda. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa delesi sitosin pada basa ke 859 AP2 box promotor gen HSP70 menghasilkan dua macam genotipe, yaitu homozygous wild type (CC) dan heterozygous cytosine deletion mutant (C-). Perbedaan lokasi tidak mempengaruhi frekuensi genotipe CC dan C- yang dihasilkan. Frekuensi genotipe C-di setiap lokasi lebih tinggi dari genotipe CC. Persentase lokus heterozigot dalam setiap populasi cukup tinggi sehingga memungkinkan untuk melakukan seleksi sapi perah FH berdasarkan genotipe gen HSP70 lokus ScrFI. Penelitian tahap tiga bertujuan untuk mengidentifikasi hubungan antara keragaman gen HSP70 lokus ScrFI dengan respons fisiologi, ketahanan terhadap cekaman panas, profil hematologi, hormonal, produksi serta kualitas susu pada sapi perah FH. Hasil analisis menunjukkan sapi perah
Keyword: gen HSP70, produksi susu, respons fisiologi, sapi perah

Judul: Identifikasi Keragaman SNP g.1117G>A Gen HSP70 pada Sapi Pedaging menggunakan Teknik PCR-RFLP
Abstrak: Indonesia memiliki sumber daya genetik ternak (SDGT) yang melimpah, termasuk ternak sapi. Sapi lokal mempunyai potensi produksi yang baik pada kondisi lingkungan yang minimal dan mampu memanfaatkan pakan berkualitas rendah serta mempunyai daya reproduksi yang baik. Daerah tropis sering mengalami perubahan suhu di atas zona nyaman yang mengakibatkan tenak mengalami stres dan dapat berdampak pada produksi dan reproduksi. Salah satu kandidat gen yang mempengaruhi toleransi terhadap heat stres adalah gen Heat Shock Protein 70 (HSP70). Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi polimorfisme SNP g.1117G>A gen HSP70 (HSP70|BanI) menggunakan metode PCR-RFLP. Penelitian ini menggunakan 65 sampel DNA 4 bangsa sapi yang terdiri dari 20 ekor sapi PO, 20 ekor sapi Madura, 12 ekor sapi kuantan dan 13 ekor sapi pesisir yang telah dikoleksi oleh Laboratorium Genetika Molekuler Ternak Fakultas Peternakan IPB. Analisa keragaman gen HSP70 dengan metode PCR-RFLP. Enzim yang digunakan untuk pemotongan adalah BanI primer forward 5'-GAAAGGAAAAAAGAGACAGA-3' dan primer reverse 5'-AATACGCAGGAGTAGGTGGT-3'. Keragaman genetik dari gen HSP70 dianalisis menggunakan frekuensi alel, frekuensi genotipe, derajat heterozigositas. Keseimbangan Hardy-Weinberg diuji dengan uji Chi Kuadrat menggunakan aplikasi PopGen 32. Hasil penelitian menunjukkan bahwa Amplifikasi gen HSP70 terletak di 5’UTR dengan suhu annealing 61 ⁰ C selama 15 detik dengan panjang produk 539 pb. Keragaman gen HSP70 pada bangsa sapi pedaging lokal bersifat polimorfik dengan frekuensi alel G sebesar (0,565) lebih tinggi dibanding frekuensi alel A (0,435)., Indonesia has abundant livestock genetic resources, including cattle. Local cattle have good production potential in minimal environmental conditions and are able to utilize low-quality feed and have good reproductive. The tropics often experience changes in temperature above the comfort zone which causes livestock to experience stress and will have an impact on production and reproduction. One candidate gene that affects tolerance to heat stress is the Heat Shock Protein 70 (HSP70) gene. This study aims to identify the SNP g.1117G>A HSP70 gene polymorphism (HSP70|BanI) using the PCR-RFLP method. This study used 65 DNA samples from 4 breeds of cattle consisting of 20 heads of PO cattle, 20 heads of Madura cattle, 12 heads of Kuantan cattle and 13 heads of Pesisir cattle that have been collected by the Laboratory of Animal Molecular Genetics, Faculty of Animal Science IPB. Analysis of the HSP70 gene diversity was done by using the PCR- RFLP method. The enzyme used for cutting was BanI with forward primer 5'-GAAAGGAAAAAAGAGACAGA-3 'and reverse primers 5'-AATACGCAGGAGTAGGTGGT-3'. The variation of the HSP gene was analyzed using allele frequency, genotype frequency, and degree of heterozygosity. Hardy-Weinberg equilibrium was tested by Chi-Square test using PopGen 32 application. The results showed that the HSP70 gene amplification was located at 5’UTR with an annealing temperature of 61 ⁰ C for 15 seconds with a product length of 539 bp. The HSP70 gene in local beef cattle was polymorphic with the allele frequency G (0,565) higher than the A allele frequency (0,435).
Keyword: HSP70, genetic polymorphism, PCR-RFLP, local beef cattle

Judul: Pelabelan Super Vertex Magic
Abstrak: Super vertex magic labeling is labeling on graph with is a set of edges mapped into and is a set of vertices mapped into . It has a vertex magic labeling in which and represents the size and order of the graph respectively. This manuscript proves that paths, cyclics, and disjoint union of cyclics have a super vertex magic labeling. There are four theorems to be discussed. The first theorem proves that path is super vertex magic if and only if is odd and . The second theorem proves that cyclic is super vertex magic if and only if is odd. The third theorem proves that bijection function from an edge set onto of graph can be extended to a super vertex magic labeling if and only if the set amount of edge label that incidents with a vertex in the graph, consists of sequential integers as many as vertices in the graph. The fourth theorem proves that disjoint union of the cyclics consists of cyclics with each cyclic has vertices is super vertex magic if and only if and are odd.
Keyword: