Judul: Studi keragaman morfologi dan genetik jamur tiram, Pleurotus sp. dengan teknik PCR-RFLP
Abstrak: Hutan tropis Indonesia merupakan salah satu hutan tropis terluas di dunia. Selain luas, letaknya yang strategis pada garis khatulistiwa menjadikannya memiliki keanekaragaman hayati yang sangat tinggi diantaranya terkandung kekayaan flora, fauna maupun jasad renik yang unik dan bersifat endemik, termasuk juga jamur. Jamur tiram mempunyai manfaat diantaranya sebagai bahan pangan dan sebagai agen biopulping serta biobleaching. Jamur tiram secara morfologi mempunyai keanekaragaman khususnya dalam warna tubuh buah. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui dan membandingkan keanekaragaman jamur tiram baik secara morfologi maupun genetik. Keanekaragaman morfologi Pleurotus sp. diperoleh berdasarkan warna tubuh buah, dan keanekaragaman genetik menggunakan teknik PCR-RFLP, serta aplikasi metode PCR-RFLP pada Pleurotus sp.. Penelitian ini dilaksanakan di Laboratorium Penyakit Hutan dan Laboratorium Silvikultur Fakultas Kehutanan Institiut Pertanian Bogor pada bulan September 2005 sampai dengan April 2006. Pleurotus sp. berdasarkan karakter morfologi berupa warna tubuh buah, dikelompokkan ke dalam empat kelompok yaitu jamur tiram putih (Pleurotus sp. 17, Pleurotus sp. 16 dan Pleurotus sp. 19), berwarna abu (Pleurotus sp. 21 dan Pleurotus sp. 23), berwarna merah (Pleurotus sp. 24) dan berwarna coklat (Pleurotus sp. 5 dan Pleurotus sp. 25). Berdasarkan ukuran diameter tubuh buah, berkisar antara 5-7cm untuk diameter terbesar dan 1-6cm untuk diameter terkecil. Berdasarkan hasil PCR-RFLP dapat terlihat adanya keanekaragaman genetik yaitu fragmen pita DNA yang berbeda ukuran. Hasil PCR-RFLP Pleurotus sp. dikelompokkan menjadi empat kelompok, dimana fragmen DNA Pleurotus sp. 17, Pleurotus sp. 16, Pleurotus sp. 21, dan Pleurotus sp. 23 berukuran 700 bp. Pleurotus sp. 19 berukuran 680 bp, Pleurotus sp. 5 berukuran 790 bp, Pleurotus sp. 24 dan Pleurotus sp. 25 berukuran 750 bp. Pemotongan hasil PCR-RFLP menggunakan enzim restriksi AluI dan HindIII. Empat isolat pertama dilakukan menggunakan kedua enzim tersebut, ternyata hanya AluI yang memperlihatkan adanya pemotongan pita DNA. HindIII tidak memberikan hasil karena tidak mengenali situs pemotongan pada produk amplifikasi DNA yang dihasilkan. Untuk analisis keanekaragaman genetik selanjutnya hanya digunakan enzim restriksi AluI.
Keyword: 

Judul: Keragaman Genetik pada Jamur Tiram  (Pleurotus spp.) Berdasarkan Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD)
Abstrak: Hutan Indonesia memiliki keanekaragamn hayati berupa tumbuhan tingkat tinggi maupun tumbuhan tingkat rendah, seperti jamur pelapuk kayu. Salah satu jenis jamur pelapuk kayu yang potensial sebagai jamur pangan adlah jamur tiram yang memiliki keanekaragaman jenis yang tinggi. Secara teoritis diketahui bahwa sifat tumbuhan dapat diidentifikasi berdasarkan sifat fenotipe dan genotipe. Oleh karena itu, perlu diteliti faktor genetik yang mempengaruhi keanekaragaman jamur tiram. RAPD merupakan salah satu penanda molekuler yang digunakan untuk mmpelajari keanekaragaman genetik populasi organisme. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui hubungan kekerabatan dan jarak genetik anatara beberapa isolat jamur titam yang ada di Indonesia berdasarkan penanda RPAD. Penelitian ini dilakukan di Laboratorium Patologi Hutan dan Laboratorium Sulvikultur, Fakultas Kehutanan, Institut Pertanian Bogor serta Laboratorium Mikrobiologi dan Biokimia, Pusat Studi Ilmu Hayat (PSIH), Institut Pertanian Bogor. Penelitian dilakukan pada bulan September 2005 sampai dengan bulan April 2006. Ada delapan isolat jamur tiram yang digunakan dalam penelitian yaitu Pleurotus sp. 17, Pleurotus sp. 16, Pleurotus sp. 4, Pleurotus sp. 5, Pleurotus sp. 21, Pleurotus sp. 24, Pleurotus sp. 27 dan Pleurotus sp. 9.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: