Judul: Karakterisasi Spesies Stingless Bee asal Bogor, Lebak, dan Luwu Utara Berdasarkan Gen Cytochrome C Oxidase 1
Abstrak: Stingless bee merupakan serangga polinator dengan keanekaragaman yang sangat tinggi. Berdasarkan morfologi, terdapat stingless bee yang bersifat cryptic sehingga perlu diidentifikasi secara molekuler dengan menggunakan DNA barcode berdasarkan gen Cytochrome C Oxidase 1 (COX1). Penelitian ini bertujuan mengkarakterisasi spesies stingless bee asal Bogor (Jawa Barat), Lebak (Banten), dan Luwu Utara (Sulawesi Selatan) menggunakan DNA barcode berdasarkan gen Cytochrome C Oxidase 1 (COX1). Identifikasi morfologi stingless bee berdasarkan karakteristik tubuh, kepala, propodeum, mesoscutum, mesoscutellum, sayap, dan tungkai. Analisis molekuler stingless bee meliputi ekstraksi DNA, amplifikasi gen COX1, sequencing, analisis haplotipe dan analisis bioinformatik. Berdasarkan identifikasi morfologi stingless bee asal Bogor dan Lebak merupakan Tetragonula laeviceps sedangkan stingless bee asal Luwu Utara merupakan T. aff. biroi. Alignment runutan gen COX1 T. laeviceps hasil penelitian ini membentuk enam haplotipe (H1–H6) dengan variasi sebanyak 20–21 nukleotida antara H1 dengan haplotipe lainnya dan jarak genetik antara H1 dengan haplotipe lainnya adalah 0.036–0.038. Tingginya variasi nukleotida dan jarak genetik pada T. laeviceps membentuk dua kelompok pada pohon filogeni T. laeviceps berdasarkan gen COX1 dengan bootstraps masing-masing sebesar 100% dan 99%. Tingginya variasi pada H1 dan membentuk kelompok terpisah dengan H2–H6 memungkinkan adanya proses cryptic spesies pada T. laeviceps
Keyword: DNA barcode, gen COXI, identifikasi morfologi, Tetragonula aff. biroi, Tetragonula laeviceps

Judul: Identifikasi stingless bee (Hymenoptera: Apidae) asal Sulawesi berdasarkan karakteristik morfologi, sarang, dan DNA barcoding
Abstrak: Stingless bee memiliki tingkat keragaman yang tinggi dan wilayah distribusi yang luas di dunia. Indonesia sebagai bagian dari wilayah persebaran Indo-Malaya dan Australasia memiliki potensi tinggi sebagai habitat stingless bee karena iklim tropisnya. Keanekaragaman stingless bee di Indonesia telah tercatat di dalam Catalog Indo-Malayan dan Australasian stingless bee, namun masih terbatas di pulau-pulau yang termasuk ke dalam wilayah Sundaland. Eksplorasi stingless bee di Indonesia khususnya di wilayah Wallacea belum dilakukan secara menyeluruh. Sebagai salah satu pulau yang berada di wilayah Wallacea, Sulawesi memiliki banyak hewan endemik termasuk stingless bee. Terdapat tujuh spesies stingless bee yang telah dilaporkan di Sulawesi yaitu Wallacetrigona incisa (Engel dan Rasmussen), Lepidotrigona terminata (Smith), Tetragonula fuscobalteata (Cameron), T. laeviceps (Smith), T. biroi (Friese), T. pagdeni (Schwarz), dan T. sapiens (Cockerell), namun ciri dari ketujuh spesies tersebut belum terdokumentasi secara lengkap sehingga sering ditemukan kesulitan pada saat proses identifikasi spesies. Identifikasi stingless bee dapat dilakukan dengan melihat ciri morfologi, arsitektur sarang, dan melalui pendekatan molekuler DNA barcoding. Oleh karena itu penelitian ini bertujuan mengeksplorasi keanekaragaman spesies stingless bee di Sulawesi melalui identifikasi morfologi, arsitektur sarang, dan DNA barcoding. Koleksi sampel stingless bee dilakukan di tujuh lokasi yang terleteak di empat kabupaten di Sulawesi Selatan (Maros, Soppeng, Wajo, dan Luwu Utara) dan satu kabupaten di Sulawesi Barat (Polewali). Identifikasi morfologi dilakukan dengan mengamati karakter utama dari stingless bee yaitu warna tubuh, mesonotum, scutellum, propodeum, warna sayap, jumlah hammuli, hind tibia, dan hind basitarsus. Selain itu dilakukan pula pengukuran dari tujuh bagian tubuh stingless bee untuk analisis morfometrik menggunakan metode Principal Component Analysis (PCA). Pengamatan arsitektur sarang dilakukan pada bagian lubang sarang dan susunan sel pengeraman. Tahap identifikasi melalui DNA barcoding meliputi Ekstraksi DNA, amplifikasi gen cytochrome c oxidase I (COI), dan sequencing DNA. Tahap analisis bioinformatik meliputi Basic Local Alignment Search Tool-Nucleotide (BLAST-N) di NCBI (www.ncbi.nml.nih.gov), translasi asam amino, analisis jarak genetik, konstruksi pohon filogenetik, dan analisis laju substitusi kodon. Berdasarkan karakteristik morfologi, sampel stingless bee yang dikoleksi dari 44 koloni terdiri dari tiga spesies stingless bee berukuran kecil (< 4mm) yaitu T. sapiens, T. fuscobalteata, T. aff. biroi, dan dua spesies stingless bee berukuran besar (>= 4 mm) yaitu W. incisa dan L. terminata. Karakteristik morfologi yang teramati berhasil disusun menjadi kunci identifikasi stingless bee khusus untuk wilayah Sulawesi. Hasil analisis morfometrik juga menunjukkan adanya pengelompokan berdasarkan ukuran tubuh. Nilai total PC1 dan PC2 pada analisis morfometrik yaitu 88.75% dengan Eigen value tertinggi pada PC1 0.958 pada karakter panjang tubuh dan PC2 0.546 pada karakter lebar mata. Hal tersebut menunjukkan bahwa karakter panjang tubuh dan lebar mata merupakan karakter yang berperan penting dalam pemisahan spesies pada analisis PCA. Selain ciri morfologi, penelitian ini juga berhasil mengkarakterisasi tipe lubang sarang dan susunan sel pengeraman. Tipe lubang sarang stingless bee endemik W. incisa untuk pertama kalinya didokumentasikan dan dikarakterisasi pada penelitian ini, yaitu tipe celah longitudinal yang sempit dengan pelebaran gumpalan resin yang tebal dan keras. Tetragonula sapiens dan T. fuscobalteata memiliki tipe lubang sarang yang sama yaitu corong pendek dengan bentuk lubang elips, sedangkan T. aff. biroi memiliki tipe lubang sarang yang bervariasi yaitu corong pendek dengan ornamentasi tidak beraturan,
Keyword: Wallacetrigona incisa, stingless bee, arsitektur sarang, gen COI, Wallacea

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: