Judul: Identification and Molecular Docking Analysis of Patikan Kebo (Euphorbia hirta) Ethanol Extract Active Compound as Interleukin-6 Inhibitor
Abstrak: Pneumonia adalah salah satu penyakit pernapasan mematikan, khususnya di negara berkembang. Kasus ini semakin marak berkembang beriringan dengan munculnya kasus Covid-19. Penderita Covid-19 dengan pneumonia, diketahui memiliki kadar Interleukin(IL)-6 yang meningkat secara signifikan. Berbagai bahan herbal terbukti mampu menghambat aktivitas IL-6 termasuk daun patikan kebo. Penelitian dilakukan dengan analisis senyawa aktif daun patikan kebo menggunakan instrumen LC-MS dan dilanjutkan dengan metode uji in silico yang meliputi penambatan molekuler dengan aplikasi YASARA, analisis bioavaibilitas dan toksisitas. Hasil analisis LC-MS menunjukkan sebanyak 23 senyawa aktif berhasil diperoleh dari ekstrak etanol daun patikan kebo. Berdasarkan hasil penelitian metode in silico, senyawa neocomplanoside memiliki hasil pengikatan terbaik dibandingkan senyawa aktif daun patikan kebo lainnya terhadap IL-6, yaitu dengan nilai ΔG sebesar -5,386 kkal/mol serta konstanta disosiasi 112,72 μM. Senyawa neocomplanoside juga diprediksi dapat diserap baik oleh tubuh karena telah memenuhi aturan Lipinski dan tidak bersifat toksik, sehingga aman untuk dikonsumsi. Dengan demikian, simpulan penelitian ini senyawa aktif neocomplanoside memiliki kemampuan pengikatan terbaik dengan nilai ΔG lebih besar dari hydroxychloroquine dan L-tartaric-acid, yang merupakan ligan pembanding dan ligan alaminya., Pneumonia is one of the deadliest respiratory diseases, especially in developing countries. Pneumonia cases are increasingly growing in tandem with the emergence of Covid-19 cases. Covid-19 patients with pneumonia are known to had significantly increased levels of IL-6. Various herbal materials have been shown to be able to inhibit IL-6 activity, including Patikan Kebo leaves. The research was conducted by analyzing the active compounds of Patikan Kebo leaves using the LC-MS instrument, and continued with in silico method, which included molecular docking with the YASARA application, bioavailability, and toxicity analysis. The result of LC-MS analysis showed there are 23 active compounds obtained from ethanol extract of Patikan Kebo leaves. Based on the in silico results, neocomplanoside has the best binding affinity compared to other active compounds of Patikan Kebo leaves that interact with IL-6, with the value of ΔG -5,386 kcal/mol and dissociation constant 112.72 μM. Neocomplanoside is also predicted to be well absorbed by the body because it has complied with the Lipinski test and are not toxic, so it is safe for consumption. Thus, this study concludes neocomplanoside with the best binding ability has a greater ΔG value than hydroxychloroquine and L-tartaric-acid as the comparative and natural ligands.
Keyword: Pneumonia Covid-19, Patikan kebo, Interleukin-6, Penambatan molekuler

Judul: Analisis Potensi Daun Torbangun (Plectranthus amboinicus) sebagai Antibakteri terhadap Klebsiella pneumoniae secara in silico
Abstrak: Resistensi antibiotik adalah masalah global. Bakteri Klebsiella pneumoniae merupakan bakteri prioritas untuk ditemukan antibiotiknya karena adanya enzim extended spectrum beta-lactamase (ESBL) yang menyebabkan bakteri ini mudah mengalami resistensi. Daun torbangun diketahui memiliki banyak sekali kandungan flavonoid yang sering diteliti sebagai antibakteri. Penelitian ini bertujuan menganalisis potensi daun torbangun (Plectranthus amboinicus) sebagai antibakteri terhadap Klebsiella pneumoniae dengan metode in silico. Penelitian dilakukan dengan melakukan penambatan molekuler menggunakan aplikasi AutoDock Vina terhadap enzim dari bakteri Klebsiella pneumonia yaitu SHV (Sulfhydryl variable) dengan senyawa kimia yang diambil dari tanaman daun torbangun. Parameter yang digunakan adalah energi bebas ikatan, konstanta inhibisi, serta visualisasi ligan secara 3D dan 2D. Hasil yang diperoleh menunjukkan ligan alami memiliki energi bebas ikatan sebesar -6,7 kcal/mol dan konstanta inhibisi 12,11 µM. Nilai energi bebas ikatan dan konstanta inhibisi dari luteolin 3’Oglucuronide, apigenin 7-glucuronide, dan asam rosmarinat menunjukkan hasil yang lebih baik dibandingkan dengan ligan alami dari SHV-1 (1,4-thiazepine)., Antibiotic-resistant is a global issue. Klebsiella pneumoniae has high priority to find its antibiotic because it has extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) enzyme that makes the bacteria easy to resist the antibiotic. Indian borage is one of the empirical medicinal plants that contain flavonoids being used for treating the disease. This research had the purpose of analyzing Indian borage potential as an antibacterial for Klebsiella pneumoniae in silico. Docking is the method for this research by using AutoDock Vina, an application to attach enzyme ESBL from Klebsiella pneumoniae which mention as SHV (Sulfhydryl variable) and metabolite seconders from the plant. The analyzed parameter was binding free energy, inhibition constant, and visualization in 3D and 2D. Binding free energy and inhibition constant of a native ligand is -6.7 kcal/mol and 12.11 µM. Binding free energy value of apigenin 7-glucuronide and rosmarinic acid perform higher potency than the native ligand of SHV-1 (1,4-thiazepine).
Keyword: Daun torbangun, Klebsiella pneumoniae, Resistensi antibiotik, Penambatan molekuler

Judul: Cycle Hamilton pada Graf Lengkap, Graf Regular, dan Graf 2-Connected 4-Regular Berorder Kurang dari Sepuluh.
Abstrak: Suatu graf disebut graf Hamilton apabila graf tersebut memuat cycle Hamilton, yaitu cycle yang melewati setiap vertex tepat satu kali. Menentukan keberadaan cycle Hamilton pada suatu graf dapat menggunakan syarat cukup yang berupa teorema-teorema yang telah diperkenalkan sejak tahun 1950-an. Beberapa syarat cukup yang dibahas dalam karya ilmiah ini adalah syarat cukup yang berhubungan dengan graf lengkap dan graf regular. ,,,
Keyword: graf Hamilton, graf regular, graf lengkap, graf 2-connected 4-regular.