Judul: Inhibisi Histon Asetiltransferase Oleh Kuersetin Sebagai Kandidat Antikanker Secara In Silico Dan In Vitro.
Abstrak: Histon asetiltranferase p300-CBP-associated factor (HAT PCAF) mengkatalisis transfer asetil dari asetil KoA ke residu lisin pada histon. Asetilasi histon berperan penting dalam aktivasi transkripsi DNA. Kesalahan pada enzim ini, seperti hiperasetilasi, dapat menyebabkan peningkatan proliferasi sel yang menyebabkan perkembangan sel kanker. Jenis HAT yang paling banyak terdapat pada manusia adalah HAT p300 dan PCAF. Kuersetin menunjukkan potensi penghambatan terhadap HAT p300 pada penelitian sebelumnya, namun pengaruhnya terhadap HAT PCAF belum dilakukan. Oleh karena itu, penelitian ini menggunakan kuersetin untuk menghambat aktivitas HAT PCAF. Penelitian ini menggunakan teknik in silico dan in vitro untuk menguji potensi kuersetin sebagai inhibitor HAT PCAF. Uji in silico menggunakan penambatan molekuler untuk mendapatkan informasi mengenai model pengikatan kuersetin pada HAT PCAF. Selain itu, studi kinetika juga menghasilkan nilai konstanta inhibisi (Ki) kuersetin dan jenis inhibisinya. Penelitian kinetika inhibisi menggunakan metode fluorometri untuk mengukur inhibisi HAT PCAF oleh kuersetin. Hasil penambatan molekuler menunjukkan bahwa kuersetin dapat terikat pada situs pengikatan asetil KoA sehingga dapat menghambat aktivitas asetilasi histon oleh HAT PCAF. Kuersetin berinteraksi dengan asam amino Gln525 dan Cys574 pada rantai A, serta Cys574 and Gln581 pada rantai B HAT PCAF. Kuersetin juga terikat pada situs aktif histon melalui Asp610. Hasil uji kinetika inhibisi HAT PCAF menunjukkan bahwa kuersetin dapat menghambat reaksi asetilasi histon yang diamati dari intensitas fluoresens yang rendah. Analisis dengan plot Dixon menunjukkan bahwa kuersetin dapat berkompetisi dengan histon sehingga memiliki jenis inhibisi kompetitif, dengan nilai konstanta inhibisi (Ki) sebesar 9.575 μM. Hasil uji kinetika inhibisi menunjukkan kesesuaian dengan hasil penambatan molekuler, yaitu kuersetin memiliki kemampuan sebagai inhibitor kompetitif bagi HAT PCAF.
Keyword: histon asetiltransferase, kuersetin, PCAF, obat epigenetik

Judul: Kinetika Inhibisi Dan Analisis In Silico Molekuler Kurkumin Kunyit (Curcuma Longa) Terhadap Histon Asetiltransferase
Abstrak: Kurkumin kunyit (C. longa) sudah diketahui mampu menghambat Histon Asetiltransferase (HAT) p300/CBP associated factor (PCAF) sebagai biomarker kanker. Namun, kinetika inhibisi dan mekanisme molekuler inhibisi PCAF HAT belum diketahui. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kinetika inhibisi dan menganalisis secara molekuler PCAF HAT melalui in silico. Pada kinetika, kurva standar diukur dari larutan yang mengandung KoA 0- 800 pmol dengan total reaksi 100 μL, yang direaksikan dengan 7-Diethylamino-3- (4’-Maleimidylphenyl)-4-Methylcoumarin) (CPM). Uji kinetika menggunakan bufer HEPES, pH 7.5, BSA, dan konsentrasi substrat (H3) secara tepat (20±10 μL), dan masing-masing enzim (PCAF) ditambahkan ke dalam reaksi dengan total reaksi 100 μL, termasuk 10 μL isopropanol dan 5 μL CPM dalam reaksi. Mikroplate diukur dengan OPTIMA MARS flourescence microplate reader dengan pengaturan gain 65 pada gelombang emisi dan eksitasi 482 dan 392 nm. Data dimasukkan dalam plot Dixon. Pada docking molekuler, Kurkumin digambar secara manual menggunakan marvin sketch 6.0. Struktur kristal PCAF HAT diunduh dari Protein Data Bank (kode 1CM0). Simulasi molekuler docking menggunakan aplikasi AutoDock Vina 1.5.6. Visualisasi hasil simulasi menggunakan Ligplot+ 1.5.4. Pembanding data menggunakan uniprot. Hasil penelitian menunjukkan kurkumin dapat menghambat PCAF HAT dengan tipe inhibisi uncompetitive. Hal tersebut didukung dengan analisa molekuler docking in silico yang menunjukkan bahwa kurkumin mengikat residu asam amino yang diprediksi mampu mengubah konformasi enzim-substrat pada proses katalitiknya. Hasil penelitian ini dapat disimpulkan bahwa kurkumin dapat menjadi inhibitor yang spesifik terhadap PCAF HAT.
Keyword: docking, HAT, kinetika, kurkumin

Judul: Pengembangan distribusi ILOS multimedia (ILOSmedia)
Abstrak: The development of open source softwares is still going rapidly nowadays, including open source operating systems for desktop computer, netbook, tablet PC, and smartphone. The open source operating systems have considerable contribution to open source software. Linux is an open source operating system that continues to grow since 1991. The characteristics in general Linux are free, can be distributed freely, and free to make changes in it. Linux in its development is divided into several distributions. Each distribution is made as a specific goal so that the operating system can focus on running the desired functions, such as multimedia, networking, education, etc. The objective of of this research is to develop and evaluate the ILOS distribution for multimedia by providing multimedia of open source packages. ILOSmedia uses Ubuntu10.10 and Remastersys as a tool to remaster. ILOSmedia is developed by installing multimedia packages that have been obtained based on the results of questionnaires from 30 respondents from three communities, which are KPLI Bogor, Linux.com forums, and Kaskus.us forums. ILOSmedia also uses the Realtime kernel as kernal Mutimedia. ILOSmedia testing is performed by 11 students of Computer Science who are members of FOKERZ community. The testing process is performed by executing ILOSmedia via live-cd and filled in a questionnaire. The test result shows that ILOSmedia has hardware compatibility on notebook and PC with good performance. As much as 72.727% of respondents believe that the size of the installer ILOSmedia of 1.34 GB and a minimum 10GB hard drive is normal. ILOSmedia has multimedia packages complete with the percentage completeness according to respondents is 45.455% are very complete and 54.545% are complete. Boot speed ILOSmedia have an average of 28.87 seconds and 90.91% of respondents consider that ILOSmedia have a desktop environment that is easy navigation
Keyword: