Judul: Penerapan Algoritme Floyd Warshall untuk mencari Shortest Path pada Directed Overlap Graph
Abstrak: Teknologi sequencing telah berkembang sejak tahun 1970. Teknologi sequencing menggunakan teknik shotgun untuk memotong genom menjadi banyak fragmen. Potongan-potongan fragmen akan disusun menjadi genom yang utuh dengan teknik assembly. Penelitian sebelumnya melakukan teknik assembly dengan pendekatan overlap-layout-consensus (OLC) sehingga didapatkan graf overlap. Hasil dari graf overlap akan dicari jalur terpendek untuk menemukan contigs (kumpulan reads). Teknik pencarian jalur terpendek dilakukan dengan menggunakan algoritme Floyd Warshall. Dari percobaan diperoleh kumpulan contigs dari beberapa nilai overlap yaitu 10, 15, 20, 25, dan 30 yang diuji dengan BLAST. Hasil uji BLAST berhasil mengidentifikasi data contigs sebagai neuclotide dari organisme Acidiphilium multivorum AIU301 plasmid pACMV4. Selain itu diperoleh data waktu eksekusi program berbanding terbalik dengan rata-rata dari setiap nilai overlap yang dimasukkan.
Keyword: algoritme Floyd Warshall, graf overlap, shortest path

Judul: Pembentukan Overlap Graph Menggunakan Acgt Words Tree Pada Sekuens Dna
Abstrak: DNA sequence assembly memiliki peran yang sangat penting dalam analisis genom. Salah satu metode yang digunakan dalam DNA sequence assembly untuk penggabungan potongan-potongan fragmen adalah overlap layout consensus. Teknik overlap layout consensus yang digunakan adalah overlap graph. Pada graf ini, node merepresentasikan fragmen dan edge merepresentasikan overlap. Penelitian ini mengembangkan sebuah perangkat lunak untuk menyusun overlap graph menggunakan ACGT words tree. Evaluasi dilakukan dengan menghitung waktu eksekusi yang kemudian dibandingkan dengan penyusunan menggunakan suffix tree dengan nilai 15, 20, dan 25 pada minimum overlap. Minimum overlap didefinisikan sebagai panjang minimum dari substring yang diperhitungkan dalam overlap di antara 2 fragmen. Hasil evaluasi menunjukkan bahwa penyusunan overlap graph menggunakan ACGT words tree memberikan nilai output pada waktu eksekusi yang lebih cepat dibandingkan dengan penyusunan overlap graph menggunakan suffix tree.
Keyword: DNA sequence assembly, overlap graph, Overlap Layout Consensus, pendeteksian overlap.

Judul: Enrichment of organic selenium, inorganic selenium and  vitamin E in quail products through its supplementation in the diet and its potency  of quail eggs as an ingredient in selenium-rich egg juice
Abstrak: This study was aimed to achieve an optimum level of combine organic selenium, inorganic selenium and vitamin E in obtaining the best production and reproduction as well as the highest level of selenium in quail eggs. This study was conducted from January to August 2008. Numbers of observed quails were 720 (360 females and 360 males). The treatments were applied when the quails were six weeks old. Nine treatment diets were: To (commercial diet), T1(0.46 ppm inorganic Se + 43.50 ppm vitamin E), T2 (0.46 ppm inorganic Se + 87.00 ppm vitamin E), T3 (0.92 ppm inorganic Se + 43.50 ppm vitamin E), T4 (0.92 ppm inorganic Se +87.00 ppm vitamin E), T5 (0.46 ppm organic Se + 43.50 ppm vitamin E), T6 (0.46 ppm organic Se + 87.00 ppm vitamin E), T7(0.92 ppm organic Se + 43.50 vitamin E) and T8(0.92 ppm organic Se + 87.00 ppm vitamin E).
Keyword: egg yolk, glutathione peroxidase ( GSH-Px), hedonic test, rank test