Judul: Kajian Trend Tata Hijau pada Lanskap Area Permainan Lapangan Golf di Kabupaten Bogor
Abstrak: Melepaskan penat sangat dibutuhkan agar pikiran dapat beristirahat dari aktivitas yang dilakukan setiap hari. Beragam jenis olah raga yang dapat dilakukan dalam melepaskan penat salah satunya adalah golf. Olah raga ini juga menonjolkan lanskap alam sekitar sehingga pemain dapat berolah raga sambil berekreasi. Permainan golf ini dilakukan pada area terbuka dan pemain dapat menikmati keindahan alam sekitar permainan. Estetika lanskap dan fungsi dalam penataan ruang terbuka hijau pada lapangan golf memberikan nilai plus bagi olah raga golf sehingga menarik minat pemain dalam berolah raga. Keberadaan tanaman dalam suatu lanskap akan menghasilkan suatu trend tata hijau tersendiri dalam pemilihan jenis tanaman dan penataan tanaman. Gunung Geulis Golf & Country Club, Padang Golf Bukit Pelangi, dan Sentul Highlands Golf Club merupakan tiga lapangan golf yang terkenal di daerah Bogor. Penataan dan penggunaan tanaman pada tiga lapangan golf memunculkan trend tersendiri yang menjadi ciri khas dari lapangan golf. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui trend tata hijau yang terdapat pada lanskap lapangan golf di wilayah kabupaten Bogor dari segi penataan tanaman yang digunakan untuk estetika dan fungsi penanaman pada area permainan golf tersebut serta menyusun konsep tata hijau pada ketiga lanskap lapangan golf sebagai rekomendasi bagi para pengelola di ketiga lapangan golf. Hasil akhir penelitian ini dibatasi pada produk rekomendasi tata hijau dalam bentuk planting plan. Area studi yang diamati adalah bagian-bagian dari lanskap lapangan golf, yaitu tee box, rough, hazard, green, dan fairway. Keragaman jenis pohon, semak/perdu, groundcover dan rumput pada sebagian besar area studi pada tiga lokasi tergolong rendah. Lapangan golf Gunung geulis memiliki keragaman jenis pohon yang tergolong sedang dengan nilai 1,26. Jenis pohon dengan kelimpahan tertinggi pada lapangan golf Gunung Geulis adalah kelapa (Cocos nucifera), kelimpahan tertinggi pada lapangan golf Rainbow Hills adalah pinus (Pinus merkusii) dan kupu-kupu (Bauhinia purpurea), dan kelimpahan tertinggi pada lapangan golf Sentul Highlands adalah pinus (Pinus merkusii). Fungsi tanaman yang dibutuhkan pada ketiga lapangan golf adalah pembatas visual (screen), penahan erosi, pembatas hole permainan (border), dan peneduh. Secara keseluruhan, pemenuhan fungsi tanaman pada ketiga lokasi tergolong baik. Nilai aspek estetika pada sebagian besar area studi tergolong sedang.
Keyword: area permainan, estetika tanaman, fungsi tanaman, golf, lanskap, lanskap golf, olahraga, pemilihan tanaman, penat, trend

Judul: Trend Tata Hijau, Kualitas Rumput Dan Pohon Pada Area Permainan Lapangan Golf Sedana Golf And Country Club Karawang Jawa Barat
Abstrak: Sedana Golf and Country Club merupakan salah satu lapangan golf terkenal di Karawang, Jawa Barat yang dirancang oleh Mark Rathert di atas tanah seluas 75 hektar. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui trend tata hijau pada area permainan lapangan golf, untuk mengevaluasi kualitas fungsional dan visual rumput, untuk mengevaluasi kualitas visual pohon, dan untuk menyusun rekomendasi tata hijau pada lapangan golf SGCC. Trend tata hijau dapat diketahui dari jenis tanaman dan penataan tanaman yang digunakan. Untuk mengetahui jenis-jenis tanaman yang digunakan pada tiap hole, tanaman-tanaman tersebut dihitung nilai dominansi, frekuensi, kelimpahan, dan indeks keragaman menggunakan metode Shannon-Wiener. Aspek fungsi dan estetika dari masingmasing area juga dinilai dengan cara membandingkan kondisi lapang dengan kriteria ideal yang didapat dari studi pustaka. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa tanaman dengan nilai kelimpahan, frekuensi, dan dominansi tertinggi adalah rumput bermuda (Cynodon dactylon). Indeks keragaman pohon pada sebagian besar lokasi studi tergolong sedang. Demikian pula indeks keragaman jenis semak dan tanaman penutup tanah tergolong rendah. Penilaian aspek fungsi tanaman pada lokasi studi tergolong baik, sedangkan aspek estetika tanaman pada lokasi studi tergolong buruk. Hal tersebut dikarenakan pemilihan jenis tanaman yang monoton dan tiap hole tidak mempunyai pohon penciri yang khas. Secara umum, pola penanaman di SGCC pada bagian tee box dapat dibedakan menjadi tiga tipe, yaitu tipe berkelompok, tipe menerus, dan kombinasi tipe berkelompok dan menerus. Pola penanaman pada bagian fairway dapat dibedakan menjadi dua tipe penanaman, yaitu tipe menerus, dan kombinasi tipe menerus dan berkelompok. Tipe penanaman pada bagian green dibedakan menjadi dua tipe, yaitu tipe menerus dan berkelompok. Kualitas fungsional dan visual rumput lapangan golf SGCC tergolong baik pada area permainan karena telah memenuhi 80% dan 61% dari indikator standar kualitas baik. Sedangkan kualitas visual pohon pada lokasi studi tergolong sangat baik. Trend tata hijau pada lapangan golf SGCC secara keseluruhan menggunakan tanaman jenis palem (Arecaceae) dengan setiap hole ditambahkan vegetasi penyemarak seperti kayu putih (Melaleuca cajuputi), dadap merah (Erythrina crista-galli), nusa indah (Mussaenda philippica), dan tabebuya bunga kuning (Tabebuia rosea). Penataan tanaman pada sebagian besar lokasi studi menggunakan pola linear mengikuti bentukan hole.
Keyword: aspek estetika, aspek fungsi, kualitas rumput, tata hijau, trend

Judul: Reprocessing Crystal Structure of Vibrio  cholerae Multidrug and Toxic Compound Extrusion (MATE) Transporter with  AlphaFold2 as Search Model for Molecular Replacement
Abstrak: Transporter ESBM (Ekstrusi Senyawa Beracun dan Multi Obat) pada Vibrio cholerae telah diidentifikasi sebagai salah satu faktor penyebab resistensi terhadap antibiotik. Namun, struktur ESBM yang tersedia pada RCSB (3MKT) masih memiliki kualitas rendah. Penelitian ini bertujuan memperbaiki struktur kristal transporter ESBM V. cholerae pada database dengan struktur prediksi AlphaFold2. Struktur prediksi AlphaFold2 memiliki tingkat kepercayaan tinggi berdasarkan nilai plDDT sebesar 82,9 dan pTM sebesar 0,851 yang digunakan sebagai model dasar molecular replacement dengan nilai top LLG sebesar 826,549 dan top TFZ sebesar 25,6, dilanjutkan dengan proses refinement. Hasil refinement menunjukkan adanya perbaikan signifikan dalam berbagai parameter struktural seperti Rfree, Rwork, clashscore, Ramachandran outliers, sidechain outliers, dan Real Space Correlation. Superimpose antara struktur hasil refine dengan struktur awal pada database menghasilkan nilai RMSD sebesar 3,086 Å. Proses refinement yang dilakukan menghasilkan struktur yang secara keseluruhan memiliki kualitas yang lebih baik dari struktur database, Multidrug and Toxic Compound Extrusion (MATE) transporter in Vibrio cholerae has been identified as a significant contributor to antibiotic resistance. However, the available MATE structure in the RCSB database (3MKT) has suboptimal quality. This study aimed to enhance the crystal structure of MATE transporter in the database using the AlphaFold2 predicted structure which has a high level of confidence based on a plDDT score of 82.9 and pTM score of 0.851. The predicted structure of AlphaFold2 served as a search model for Molecular Replacement with top LLG and TFZ scores of 826.549 and 25.6, respectively, followed by a refinement process. The refinement process significantly enhanced various structural parameters such as Rfree, Rwork, clashscore, ramachandran outliers, sidechain outliers, and Real Space Correlation. Superimposing the refined structure with the initial structure in the RCSB database revealed an RMSD value of 3.086 Å. The conclusion of this research was the refinement process results had been better quality structure than the database structure
Keyword: AlphaFold2, MATE transporter, molecular replacement, refinement, x-ray crystallography