Judul: Kitinase Bacillus Thuringiensis Saha 12.08 Sebagai Agens Biokontrol Penyakit Hawar Daun Pada Tanaman Kelapa Sawit
Abstrak: Kitin merupakan komponen penyusun utama dinding sel cendawan, miselium dan spora. Curvularia affinis dan Colletotrichum gloeosporioides merupakan cendawan patogen penyebab penyakit bercak daun dan hawar daun pada pembibitan kelapa sawit yang menyebabkan penurunan terhadap nilai jual, sehingga perlu dipelajari lebih lanjut agar dapat dilakukan pencegahan sejak dini. Kitin yang terdapat pada dinding sel cendawan patogen ini mampu didegradasi oleh kitinase. Kitinase merupakan kelompok enzim yang dapat mendegradasi polimer kitin menjadi monomer. Enzim ini ditemukan secara luas pada berbagai organisme khususnya bakteri. Spesies yang paling sering digunakan sebagai agenss biokontrol ialah Bacillus. Bacillus asal Indonesia diketahui berpotensi sebagai penghasil kitinase salah satunya B. thuringiensis SAHA 12.08. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan untuk mengendapkan dan mengkarakterisasi kitinase B. thuringiensis SAHA 12.08 dan mengkaji potensinya sebagai agens biokontrol terhadap cendawan patogen C. affinis dan C. gloeosporioides penyebab hawar daun pada tanaman kelapa sawit secara in vitro dan detached leaf assay menggunakan daun kelapa sawit. . Kitinase B. thuringiensis SAHA 12.08 memiliki aktivitas maksimum pada 60 jam inkubasi dengan aktivitas spesifik sebesar 7.896 U/mg. Aktivitas optimum pada pH 7.0 dan 35 oC. Pengendapan kitinase B. thuringiensis SAHA 12.08 dilakukan dengan menggunakan amonium sulfat. Kitinase ini mengendap maksimal pada konsentrasi 30% amonium sulfat dengan aktivitas spesifik sebesar 17.061 U/mg dan meningkatkan kemurniannya 2.35 kali dibandingkan aktivitas enzim kasarnya. Hasil SDS-PAGE menunjukkan adanya tujuh pita protein dengan bobot molekul yang bervariasi sebesar 107, 102, 82, 63, 55, 46 dan 44 kDa. Analisis zimogram menunjukkan satu protein yang memiliki aktivitas kitinase dengan bobot molekul sebesar 82 kDa. Proses pengendapan merubah sebagian karakter kitinase B. thuringiensis SAHA 12.08 sehingga berbeda dengan karakter kitinase ekstrak kasar. Karakter yang berubah yaitu pH optimum aktivitas kitinase. Kitinase hasil pengendapan memiliki aktivitas optimum pada pH 7 dan pada suhu 45oC. Kitinase ini stabil pada suhu optimum selama 180 menit. Efektivitas penghambatan kitinase B. thuringiensis SAHA 12.08 terhadap cendawan patogen dilakukan secara in vitro dan detached leaf assay menggunakan daun kelapa sawit. Kitinase ini memiliki aktivitas antagonis dan memiliki efektivitas biokontrol terhadap kedua jenis cendawan patogen C. affinis dan C. gloeosporioides. Hasil tersebut mengindikasikan bahwa kitinase isolat tersebut menjanjikan dalam perannya sebagai agens biokontrol penyakit hawar daun pada tanaman kelapa sawit.
Keyword: aktivitas antagonis, Bacillus thuringiensis, Colletotrichum gloeosporioides, Curvularia affinis

Judul: Potensi Kitinolik Bacillus Amyloliquefaciens Saha 12.07 Dan Serratia Marcescens Kahn 15.12 Sebagai Agens Biokontrol Ganoderma Boninense.
Abstrak: Kitin merupakan komponen utama dinding sel filum Basidiomycota terutama Ganoderma. Kitin pada cendawan berfungsi sebagai penyusun dinding sel yang terdapat dalam miselium dan spora. Ganoderma boninense merupakan patogen utama penyebab penyakit busuk pangkal batang kelapa sawit yang menyebabkan penurunan produktifitas kelapa sawit di Indonesia dan Malaysia. Kitin pada cendawan dapat didegradasi secara enzimatik oleh kitinase yang berfungsi sebagai antifungi. Kitinase adalah enzim hidrolitik yang berfungsi untuk mendegradasi kitin menjadi monomer N-asetilglukosamin. Kitinase banyak diproduksi oleh bakteri. Kitinase yang dihasilkan bakteri kitinolitik asal tanah kelapa sawit di Taman Nasional Bukit Dua Belas, Jambi berpotensi sebagai biokontrol yang mampu menghambat pertumbuhan Curvularia affinis dan Colletotrichum gloeosporioides penyebab penyakit hawar kelapa sawit. Namun demikian masih belum ada laporan penghambatan kitinase yang dihasilkan oleh bakteri terhadap G. boninense. Oleh karena itu penelitian ini bertujuan untuk menyeleksi dan mengidentifikasi bakteri kitinolitik asal tanah kelapa sawit TNBDB yang memiliki kemampuan menghambat pertumbuhan G. boninense dan mengkarakterisasi aktivitas kitinase dalam mendegradasi kitin pada G. boninense. Isolat SAHA 12.07 dan KAHN 15.12 mampu menghambat pertumbuhan G. boninense dengan persentase penghambatan masing-masing 68.19 dan 40.29%. Isolat SAHA 12.07 dan KAHN 15.12 teridentifikasi sebagai Bacillus amyloliquefaciens and Serratia marcescens dengan kemiripan 99% berdasarkan 16S rRNA. Isolat SAHA 12.07 memproduksi kitinase optimum pada jam ke-48 inkubasi dan KAHA 15.12 pada jam ke-54 inkubasi dengan aktivitas spesifik masing-masing sebesar 63.35 U/mg dan 143.51 U/mg. Kitinase ekstrak kasar dari SAHA 12.07 dan KAHN 15.12 dapat diendapkan menggunakan aseton masing-masing dengan konsentrasi 60 dan 20%, dengan aktivitas spesifik meningkat masing-masing sebesar 33.372 U/mg dan 1029.2 U/mg. Aktivitas kitinase ekstrak kasar dan hasil pengendapan pada B. amyloliquefaciens SAHA 12.07 dan S. marcescens KAHN 15.12 aktif pada kisaran pH luas antara 4-10 dan juga memiliki spektrum suhu yang luas antara 20-80 °C. Enzim hasil pengendapan pada B. amyloliquefaciens SAHA 12.07 dan S. marcescens KAHN 15.12 memiliki persentase penghambatan lebih tinggi terhadap pertumbuhan miselium G. boninense yaitu masing-masing 54.92 dan 40.84% dibandingkan kitinase ekstrak kasar yaitu masing-masing 11.97 dan 8.45%. Kitinase S. marcescens KAHN 15.12 melepaskan NAG lebih tinggi dibandingkan B. amyloliquefaciens SAHA 12.07.
Keyword: Ganoderma boninense, bakteri kitinolitik, aktivitas kitinase

Judul: Visualisasi Data Spasial di MonetDB Menggunakan OpenJUMP
Abstrak: There are currently the most used data model is relational. This model a database as a set of data that is stored in structural rows and columns. Besides the popullarity, the relational data model is lacking in the implementation of data is large and has a high complexity. Different of the relational model, MonetDB using a column store method to divide the data into sections binary tables . This method is only necessary to call the data, resulting method is faster. Anggi ( 2013 ) have tested the MonetDB as a spatial and non spatial data storage, but not yet visualize data from MonetDB. This result successfully visualize spatial data using a simple query “like” and “and” the average time 1 second , while the complex spatial queries using “joins”, “constains” and “Intersect” with average time more than 20 minutes. So it looks that MonetDB also can process spatial data simple and complex . But in the process of complex spatial data visualization that require run-time is relatively long .
Keyword: visualize, OpenJUMP, MonetDB, spatial data