Judul: Pengelompokan Sekuens DNA menggunakan Metode K-Means dan Fitur N-mers Frequency
Abstrak: Deoxyribo Nucleic Acid (DNA) is a nucleic acid that contains genetic instructions stored in the bodies of living organisms. Each species has a unique DNA. However, there are still similarity section among DNA from different species. The similarity information is useful to generate phylogenetic tree which can be developed from the clustering of DNA sequences. The purpose of this study is to implement K-Means clustering on DNA sequence to identify and distinguish species from another based on its common characteristics. Data used in this study consist of 70 species. Data are grouped using the K-Means clustering, and evaluated using the Davies Bouldin Index. The result shows that the best clustering is obtained with 3 clusters.
Keyword: Sequence DNA, n-mers, K-Means, Davies Bouldin Index

Judul: Klasifikasi Fragmen Metagenom menggunakan Fitur Spaced N-Mers dan K-Nearest Neighbour
Abstrak: Metagenome is a study of total DNA from some environmental sources that are directly isolated. The study is conducted by reading the entire DNA of a complete ecosystem (not just one organism). Metagenome refers to the genomic content of complete microbial ecosystems. Since the samples taken from the ecosystems may contain a variety of organisms, it requires a binning process to classify. In this research, k-nearest neighbour (KNN) algorithm was used to classify metagenome fragments and spaced n-mers was used for feature extraction. The research was conducted on two groups of datasets, namely the training organisms and testing organisms with fragment length of 500 bp, 1 kbp, 5 kbp, and 10 kbp. The best accuracy obtained from the training organism dataset reached 99.75% on the fragment test with a length of 10 kbp and k = 3. The highest value of its sensitivity and specificity was also obtained from the same organism dataset, 99.71% and 99.85% respectively.
Keyword: specificity., spaced n-mers, sensitivity, oligonucleotide frequency, metagenome, k-nearest neighbour, DNA

Judul: Pelaksanaan Pembangunan Taman Surya, Kotamadya Surabaya
Abstrak: Kegiatan magang telah elilaksanakan eli Dinas Pertamanan Daerah Kotamadya Tingkat II Surabaya dari bulan Februari 1999 sampai dengan Juni 1999. Kegiatan magalJg dilakukan dengan partisipasi aktif untuk pekeIjaan perencanaan, redesain dan peng<j.wasan, dan melakukan kunjungan lapang untuk kegiatan pelaksanaan dan pemeliharaan. Kegiatan yang elilaksanakan eli lokasi magang adalah pengawasan dan pengamatan kegiatan pembangunan Taman Surya yang berada eli bawah pengawasan Dinas Pertamanan Daerah Kotamadya Tingkat II Surabaya, redesain elemen taman pada pelaksanaan pembangunan Taman Surya serta perencanaan kebun pembibitan. Pelaksanaan pembangunan Taman Surya elimulai dengan pelaksanaan administratif tanggal 27 Oktober 1998 sampai 5 Desember 1998. Proses pelelangan yang dilakukan adalah pelelangan terbatas dan sistem kontrak yang digunakan adalah Fixed Unit Price dan total biaya pelaksanaan Rp. 726,000,000.00. Pelelangan ulang elilaksanakan karena pada pelelangan pertarna harga penawaran terendah berada eli atas harga owner estimate. Pemenang pelelangan adalah Cv. Tunas. Pelaksanaan fisik pekerjaan elimulai tanggal 5 Desember 1998 sampai 25 April 1999 oleh CV Hidayat. PenYrlesaian pekeIjaan mengalami keterlambatan selama 5 minggu. Pengawasan pelaksanaan pekeIjaan elilakukan oleh pihak kontraktor bekeIja sarna dengan pengawas lapang dari Dinas Pertamanan Daerah. Pengawasan dilakukan terhadap jadwal kerja, mutu dan volume pekerjaan. Pada pelaksanaan terdapat beberapa tambahan volume maupunjenis pekerjaan dan pengurangan pekerjaan Pengawasan yang dilakukan dilaporkan dalam laporan mingguan yang dibuat untuk menggambarkan tingkat penyelesaian pekerjaan dan menunjukkan apakah peker,j aan yang dilaksanakan mengalami keterlambatan atau tidak. Laporan mingguan yang ,dibuat oleh kontraktor harns disetujui oleh pengawas lapangan dari Dinas Pertamanan Daerah dan disahkan oleh BPP. Dalam pelaksanaan setiap proyek mempunyai tujuan untuk mencapai suatu pekerjaan yang efisien yaitu pekerjaan dapat diselesaikan dalam waktu yang telah diten1pkan dan hasil pekerjaan mempunyai kualitas sesuai kualifikasi. Faktor-faktor yang mempengaruhi efisiensi dalam pelaksanaan adalah keterampilan tenaga kerja, kelen,gkapan dan ketersediaan alat dan bahan serta sistem dalam manajemen pelaksanaan. Pengaturan tenaga kerja pada pelaksanaan pembangunan Taman Surya didasarkan pada spesifikasi atau keahlian di bidang yang diperlukan. Beberapa pekerjaan menggunakan tenaga kerja dari sub kontraktor sehingga didapatkan tenaga kerja ,yang memang trampil di bidangnya. Kapasitas kerja dipengaruhi oleh cuaca dan keterampilan pekerja. Pada siang hari dengan suhu 32 - 35°C kapasitas kerja dari pekerja akan lebih rendah dari pagi hari, selain itu hujan yang turun juga mempengaruhi produktivitas pekerja. Proses penyediaan beberapa jenis bahan mengalami keterjambatan, karena masalah harga. Penyediaan alat dan bahan dilakukan oleh kontraktor. Beberapa penyebab keterlarnbatan penyelesaian pekeIjaan dapat memberikan tarnba,han waktu bagi pihak kontraktor untuk menyelesaikan pekeIjaan seperti perubahan material, perubahan volume, tidak stabilnya harga, perubahan disain dan pengaruh cuaca. Keterlarnbatan penyelesaian karena hal di atas dapat menimbulkan biaya langsung, perpanjangan waktu dan biaya dampak. Untuk menutupi kekurangan biaya maka diajukan adendum dengan total nilai sebesar Rp. 35,868,000.00. Pergantian pimpinan proyek yang bedangsung sarnpai tiga kali menyebabkan pengawasan yang dilakukan tidak efisien dan komunikasi antara pihak kontraktor dan perencana tentang perubahan kondisi lapang tidak lancar.
Keyword: