Judul: Kuantitas dan kualitas DNA organ dalam sapi bali
Abstrak: Sapi Bali merupakan plasma nutfah asli Indonesia yang perlu ditingkatkan produktivitas dan dijaga kelestariannya. Bioteknologi Rekayasa DNA menyediakan pendekatan baru dalam kedua upaya tersebut. Sampel DNA dengan kualitas yang bagus dan kuantitas yang cukup merupakan prasyarat utama yang diperlukan dalam penelitian di atas. Penelitian yang dilaksanakan di Laboratorium Biak Sel dan Jaringan Hewan, Pusat Penelitian dan Pengembangan Bioteknologi, LIPI dan Laboratorium Bioteknologi Hewan dan Biomedis, Pusat Antar Universitas Bioteknologi IPB dari bulan Maret sampai Juli 1999 ini bertujuan untuk mempelajari karakteristik (kuantitas dan kualitas) DNA organ dalam Sapi Bali. DNA diisolasi dari organ dalam (limpa, hati, ginjal, jantung dan paru-paru) dari tiga ekor sapi Bali untuk menentukan organ mana yang paling sesuai digunakan sebagai sumber DNA, berdasarkan tujuan yang diinginkan. Perbedaan kuantitas DNA antar organ dianalisis dengan analisis sidik ragam untuk RAL pola searah yang dilanjutkan dengan uji Tukey. Limpa menghasilkan DNA murni dengan konsentrasi paling tinggi yaitu 3,3 µg/mg sampel jaringan dan disusul oleh hati, paru-paru, jantung dan ginjal yang masing-masing 1,8; 1,5; 0,7 dan 0,5 µg/mg sampel jaringan dengan rasio A260/A280 berkisar antara 1,2 sampai 1,4. RNase cukup efektif untuk menghilangkan kontaminasi RNA dari DNA, tetapi dapat menurunkan tingkat kemurnian DNA terhadap protein (rasio A260/A280 menurun). Dari hasil analisis PCR, didapatkan bahwa semua sampel yang diisolasi menghasilkan DNA dengan kualitas yang baik. Hasil PCR juga menunjukkan adanya variasi genetik antar individu sapi Bali yang mungkin disebabkan oleh mutasi.
Keyword: 

Judul: Keragaman DNA mikrosatelit lokus HEL9 ILSTS6 dan INRA35 pada Sapi Bali di Pulau Bali dan Nusa Penida
Abstrak: Sapi bali (Bos javanicus) adalah salah satu bangsa sapi asal Indonesia yang merupakan domestikasi dari banteng. Tujuan penelitian ini adalah mengidentifikasi keragaman DNA mikrosatelit pada sapi bali yang berada di Pulau Bali dan Nusa Penida dengan menggunakan lokus (HEL9, ILSTS6, dan INRA35). Sampel yang digunakan sebanyak 95 sampel DNA sapi bali yang diambil dari 48 ekor sapi bali di pulau Bali dan 47 ekor sapi bali di pulau Nusa Penida. Tiga penciri mikrosatelit (HEL9, ILSTS6 dan INRA35) digunakan untuk mengidentifikasi keragaman sapi bali. PCR menggunakan aplikasiGenAlex versi 6.501. Data yang dianalisis berupa jumlah alel (na), alel efektif (ne), frekuensi alel, heterosigositas observasi (Ho), heterosigositas harapan (He), polymorphism information content (PIC), dan uji Amova. Hasil penelitian menunjukkan bahwa rata-rata heterosigositas pada sapi bali yang ada di Pulau Bali lebih tinggi dibandingkan Nusa Penida. Jumlah PIC sapi bali berkisar 0.190-0.666. Ketiga lokus yang diuji terhadap sapi bali di pulau Bali dan Nusa Penida berbeda dari marker, frekuensi alel dan tingkat kekerabatan dengan nilai keragaman sebesar 9%...
Keyword: Bali cattle, Microsatellites, Polymorphism, Polymerase chain reaction, DNA markets, Alel number, Effective allel, Ale, Ho, He, PIC

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: