Judul: Stratifikasi Massa Air Laut Banda pada Bulan Februari 2016
Abstrak: Arlindo merupakan arus yang membawa massa air dari Samudera Pasifik menuju Samudera Hindia melalui perairan Indonesia. Arus ini masuk ke perairan Indonesia melalui dua jalur yaitu jalur timur dan barat yang kemudian keduanya mengalir menuju Laut Banda sebelum akhirnya keluar ke Samudera Hindia. Tujuan penelitian ini yaitu mendeskripsikan stratifikasi dan komposisi massa air perairan basin utara Laut Banda serta mendeskripsikan pola sirkulasi pada 3 level kedalaman yang mewakili lapisan tercampur, termoklin dan dalam. Data yang digunakan yaitu dari hasil pengukuran CTD dalam survei STOKAS 2016, data keluaran model INDESO dan data batimetri dari GEBCO. Data survey sebanyak 14 stasiun dibagi menjadi 3 transek secara horizontal dengan parameter suhu, salinitas, oksigen terlarut dan densitas. Hasil yang diperoleh menunjukkan massa air yang ditemukan pada lapisan tercampur pada lokasi penelitian adalah massa air Laut Jawa yang paling banyak terdeteksi pada transek 3. Diagram TS cenderung homogen tidak ada nilai salinitas ekstrim. Arah arus lapisan tercampur dan termoklin saling bertolak belakang.
Keyword: Arlindo, batimetri, laut banda, massa air

Judul: Stratifikasi Massa Air Laut Maluku
Abstrak: Laut Maluku merupakan salah satu jalur masuk dari ARLINDO (Arus Lintas Indonesia). Penelitian ini bertujuan untuk mendeskripsikan stratifikasi dan jenis massa air di Laut Maluku, dan mendeskripsikan pola arus pada tiga kedalaman yaitu lapisan tercampur, termoklin dan bawah termoklin. Data yang digunakan merupakan data hasil pengukuran CTD dalam Cruise STOKAS 2015, data keluaran model Indeso dan data citra satelit. Lapisan perairan dapat ditentukan dengan perhitungan gradien suhu setiap satu meter kedalaman, diagram TS-TO-SO digunakan untuk mengetahui jenis massa air, dan hasil keluaran model INDESO digunakan untuk analisis pola arus. Hasil penelitian menunjukkan adanya tiga lapisan yaitu lapisan tercampur, termoklin dan dalam. Lapisan tercampur pada stasiun 3 atau pada tengah-tengah transek memiliki lapisan yang paling tebal dari stasiun yang lainnya, pada lapisan ini terdapat massa air campuran Laut Banda dan Laut Seram. Lapisan termoklin secara umum dari bagian selatan sampai bagian utara memiliki ketebalan lapisan yang semakin tebal. Lapisan dalam terdapat massa air dari South Pacific Subtropical Lower Thermocline Water (SPSLTW).
Keyword: Massa Air, Laut Maluku, Lapisan

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA