Judul: Peran Cendawan Dark Septate Endophyte sebagai Agens Biokontrol Penyakit Jamur Akar Putih dan Deteksinya Menggunakan Fluorescence Spectroscopy.
Abstrak: Cendawan dark septate endophyte (DSE) adalah kelompok cendawan endofit yang memiliki hifa melanin gelap, membentuk koloni berwarna gelap pada media agar dan mampu mengolonisasi akar tanaman tanpa menyebabkan gejala penyakit. Cendawan DSE saat ini semakin menarik perannya dalam memacu pertumbuhan tanaman inangnya yang luas terutama pada kondisi cekaman biotik dan abiotik. Laporan yang berkaitan dengan peran cendawan DSE sebagai agens pengendali penyakit jamur akar putih (Rigidoporus microporus), khususnya di Indonesia belum ada. Teknologi fluorescence spectroscopy dapat digunakan sebagai metode deteksi cendawan DSE yang efektif dan efisien. Penelitian ini bertujuan untuk memperoleh isolat cendawan DSE yang memiliki peran sebagai agens pengendali penyakit jamur akar putih dan cara mendeteksi keberadaan cendawan DSE menggunakan fluorescence spectroscopy. Penelitian ini terdiri atas dua kegiatan. Kegiatan pertama adalah isolasi cendawan DSE dari akar dan tanah sekitar perakaran tanaman karet (Hevea brasiliensis), uji patogenesitas, uji dual culture, uji senyawa volatile, dan analisis senyawa metabolit cendawan DSE menggunakan gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS). Selanjutnya dilakukan pengujian cendawan DSE pada tanaman karet batang bawah di rumah kaca menggunakan rancangan acak lengkap (RAL) non faktorial dengan tujuh perlakuan dan lima ulangan. Tahapan kedua adalah mendeteksi cendawan DSE yang terseleksi dari hasil pengujian pada kegiatan pertama menggunakan metode fluorescence spectroscopy. Hasil penelitian diperoleh tiga cendawan DSE APDS 3.2, TBMDS 2.4b, dan TMDS 3.2 yang mampu menghambat pertumbuhan R. microporus penyebab penyakit jamur akar putih secara in vitro dan in vivo. Hasil analisis senyawa metabolit menunjukkan bahwa ketiga isolat cendawan DSE tersebut menghasilkan beberapa senyawa metabolit yang berfungsi sebagai antimikrob seperti acetic acid butyl methyl-phosphinoylmethyl ester dan Ethanone, 1-(4-methyl-1H-imidazol-2-yl). Cendawan DSE APDS 3.2, TBMDS 2.4b dan TMDS 3.2 dapat dideteksi pada panjang gelombang emisi fluorescence berturut-turut 511 nm, 512 nm dan 520 nm. Hasil penelitian ini diharapkan dapat menjadi komponen paket teknologi pengendalian penyakit jamur akar putih yang disebabkan oleh R. microporus.
Keyword: cekaman biotik, GC-MS, Hevea brasiliensis, senyawa metabolit, Rigidoporus microporus, panjang gelombang

Judul: Study of the Potential of Dark Septate Endophyte Fungi on Pinus merkusii Jungh et de Vriese Roots
Abstrak: Cendawan Dark septate endophyte (DSE) dikenal sebagai kelompok cendawan endofit yang mampu melakukan kolonisasi pada akar tanaman inang tanpa menyebabkan munculnya gejala penyakit, serta dapat membentuk struktur melanisasi (hifa interseluler, hifa intraseluler dan mikrosklerotia) dalam akar tanaman, sehingga mampu berperan sebagai agen hayati, promotor pertumbuhan pada tanaman inang di bawah cekaman biotik dan abiotik. Selanjutnya kemampuan cendawan DSE untuk mendegradasi lignin dan selulosa belum banyak dipublikasikan terutama berkaitan dengan kemampuan menghasilkan enzim lignase yang berfungsi untuk mendegradasi lignin khususnya pada serasah P. merkusii. Penelitian ini dilakukan untuk mengevaluasi jenis-jenis DSE pada akar P. merkusii, mengevaluasi karakteristik pertumbuhan secara in vitro dan enzimatik isolat DSE, mengevaluasi kemampuan DSE dalam mendekomposisi serasah P. merkusii dan kemampuan antagonis DSE dari akar P. merkusii, mengevaluasi kemapuan DSE dalam meningkatkan pertumbuhan bibit P. merkusii dan mengevaluasi kemampuan DSE dalam menghambat penyakit lodoh yang diakibatkan oleh patogen Fusarium oxysporum pada bibit P. merkusii di rumah kaca. Penelitian dilaksanakan di Laboratorium Biologi Balai Standarisasi Instrumen Pertanian, Jalan Tentara Pelajar No. 12, Kampus Penelitian Pertanian Cimanggu, Bogor, Jawa Barat dan Laboratorium Penyakit Hutan dan Rumah Kaca Departemen Silvikultur Fakultas Kehutanan dan Lingkungan IPB University, Bogor pada bulan September 2020 sampai September 2023. Penelitian dimulai dengan tahap pertama berupa isolasi dan karakteristik isolat DSE dari akar P. merkusii. Isolasi akar P. merkusii yang berasal dari 4 lokasi yaitu Dramaga Bogor, Hutan Pendidikan Gunung Walat Bogor, Taman Nasional Gunung Halimun Salak Bogor dan Kecamatan Dabun Gelang Kab. Gayo Lues, mengikuti metode Surono dan Narisawa (2017). Tahap kedua dilanjutkan uji pertumbuhan secara in vitro dan karakteristik enzimatik isolat DSE. Tahap ketiga melakukan uji kemampuan dekomposisi serasah P. merkusii dan antagonis isolat DSE. Tahap keempat mengevaluasi peran dan identifikasi isolat DSE sebagai pendukung pertumbuhan bibit P. merkusii di rumah kaca. Tahap kelima yaitu mengevaluasi peran isolat DSE terhadap penghambatan penyakit lodoh pada bibit P. merkusii di rumah kaca. Data di analisis menggunakan program microsoft excel dan program SAS dan bila terdapat perbedaan antar perlakuan, dilakuan uji jarak berganda Duncan dengan taraf nyata q=0,05. Hasil isolasi sebanyak 1.160 segmen akar P. merkusii, yang berasal dari 4 lokasi diperoleh sebanyak 25 isolat DSE. Isolasi akar P. merkusii dari kampus Dramaga IPB diperoleh sebanyak 16 isolat (5%), Kecamatan Dabun Gelang Kabupaten Gayo Lues diperoleh 2 isolat (0,79%), Hutan Pendidikan Gunung Walat diperoleh 2 isolat (2%) dan Taman Nasional Gunung Halimun Salak diperoleh 5 isolat (1,74%). Umunya warna hifa miselium isolat DSE yang diperoleh bagian atas berwana hitam dan rata-rata pertumbuhan isolat ≤ 2 mm per hari. Pengujian pertumbuhan secara in vitro dengan menggunakan benih sawi...., Dark septate endophyte (DSE) fungi are known as a group of endophytic fungi that are able to colonize the roots of host plants without causing disease symptoms, and can form melanized structures (intercellular hyphae, intracellular hyphae and microsclerotia) in plant roots, so that they are able to act as biological agents, growth promoter in host plants under biotic and abiotic stresses. Furthermore, the ability of the DSE fungus to degrade lignin and cellulose has not been widely published, especially in relation to its ability to produce the enzyme lignase which functions to
Keyword: antagonis, Fusarium oxysporum, growth promoter, lignoselulolitik

Judul: The Construction of Greedy SVP LLL Algorithm
Abstrak: A lattice is a set of all integer linear combination of a set of linearly independent vectors in ℝ𝑛���. The independent vectors are called bases of lattice. Any lattice can be generated from many bases, and these bases have the same cardinality. In the lattice, the most fundamental and renowned problem is the Shortest Vector Problem (SVP). SVP is a tracking problem of the shortest nonzero vector in a lattice with equivalent bases. In two dimensions, SVP problem has resolved exactly by Gauss’ algorithm. When the lattice dimension is higher than two, A.K. Lenstra, H.W. Lenstra and L. Lovasz gave a LLL algorithm to compute approximation of nonzero shortest vector in the lattice. Reduced bases solution obtained from LLL algorithm still be an approximation and has polynomial running time of arbitrary dimension which large enough. In 1994, Schnoor and Euchner modified this LLL algorithm as a new variant which later was named deep insertion LLL algorithm. This algorithm is a modified version of the LLL algorithm to the terms of the exchange step to improve the accuracy of output of LLL reduced bases and applying it to the subset sum problem. The purpose of this research are: (1) Reconstruct the LLL algorithm and deep insertion LLL algorithm using a geometric approach. (2) Construct a greedy SVP LLL algorithm. (3) Implement the three algorithms in a symbolic programming language, and evaluate them experimentally. A bases ℬ=[𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑛���] in ℝ𝑚��� is called reduced LLL with parameter 𝛿��� if satisfies: (a) |𝜇���𝑗���𝑖���|≤12, for every integer 𝑖���,𝑗��� with 1≤𝑖���<𝑗���<𝑛���. (b)𝛿���‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���)‖2≤‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���+1)‖2, for 𝑗���=1,2,…,𝑛���−1,where 𝛿��� is a reduced parameter of real numbers with 14<𝛿���<1. The first requirement is the reduced basis 𝛿��� must “nearly orthogonal” and in its computation case, this requirement can be reached out by using the Gram-Schmidt’s orthogonalization. While the second requirement is called exchange step, or used to called as Lovasz condition. By using both of these requirements, then they establish the LLL algorithm. Then, Schnoor and Euchner modify the LLL algorithm based on the requirements of the exchange step called the deep insertion LLL algorithm, where the exchange step is based on the comparison of the projected vector in orthogonal complement [𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑘���−1]⊥ after j-th reduction. To construct greedy SVP LLL algorithm, the requirements of the exchange step is based on purely by comparing norm of lattice 𝐛���𝑗��� with norm lattice 𝐛���𝑖��� for 𝑖���=1,2,3…,𝑗���−1. The process of insertion reduced vector after the exchange step also has done greedily. Then, we calculate the number of arithmetic operation in greedy SVP LLL algorithm for further analysis. The result of our exprimentation for three algorithms on the certain matrix size shows that the running time of the three algorithms increases propotional to the size of the matrix. The result also shows that by using 𝛿���=34 for the LLL algorithm and the deep insertion LLL algorithm, and the greedy SVP LLL algorithm which is a new variant made by using no parameter of 𝛿���, outperform of the other of two previous algorithm in terms of speed with the same output.
Keyword: LLL algorithm, LLL deep insertion algorithm, greedy SVP LLL algorithm