Judul: Eliminasi Virus Pada Bawang Merah (Allium Cepa Var. Aggregatum) Secara In Vitro Menggunakan Termoterapi Dan Kemoterapi
Abstrak: Bawang merah merupakan salah satu komoditas hortikultura yang penting di Indonesia. Sentra produksi bawang merah di Indonesia terutama di darah Jawa Tengah, Jawa Timur, Jawa Barat, dan Nusa Tenggara Barat. Sebagian besar petani di Indonesia menggunakan umbi sebagai bahan perbanyakan vegetatif. Infeksi virus sangat mudah ditularkan melalui satu generasi ke generasi selanjutnya dan dari satu daerah ke daerah lainnya sehingga dikhawatirkan menurunkan kualitas dan hasil produksi. Infeksi virus pada umbi bawang merah di Indonesia telah dilaporkan, walaupun informasinya masih sangat terbatas. Penelitian ini bertujuan mengembangkan metode eliminasi virus pada bawang merah menggunakan kombinasi termoterapi dan kemoterapi dengan beberapa ukuran eksplan kultur ujung tunas. Penelitian dilaksanakan mulai Januari 2015 sampai dengan Juni 2016, bertempat di Laboratorium Virologi Tumbuhan, Departemen Proteksi Tanaman dan Laboratorium Kultur Jaringan 3, Departemen Agronomi dan Hortikultura, Fakultas Pertanian, Institut Pertanian Bogor. Umbi benih bawang merah terdiri atas dua kultivar, yaitu „Bima Curut‟ dan „Bima Brebes‟, diperoleh dari penangkar benih di desa Tenguli, Brebes, Jawa Tengah. Eksplan berupa ujung tunas diisolasi menjadi tiga ukuran yang berbeda (1 mm, 2 mm, dan 3 mm). Masing-masing eksplan diberi perlakuan suhu (30 oC, 37 oC, dan 25 oC sebagai kontrol) dan diinkubasi selama 4 minggu. Termoterapi dilakukan pada kondisi homogen dan heterogen. Plantlet hasil termoterapi yang masih terinfeksi virus kemudian digunakan sebagai sumber eksplan untuk kemoterapi. Ujung tunas berukuran 2 mm digunakan sebagai eksplan dan ditumbuhkan pada media yang mengandung ribavirin (10 mg L-1, 25 mg L-1, dan kontrol 0 mg L-1), selanjutnya diinkubasi pada suhu 30 oC. Deteksi virus setelah perlakuan menggunakan RT-PCR dengan primer spesifik Carlavirus, Poyvirus, dan Al lexivirus. Benih umbi bawang merah yang diperoleh dari penangkar benih diseleksi lebih dahulu melalui deteksi virus dengan metode dot immunobinding assay (DIBA) menggunakan antibodi OYDV, SLV, dan GCLV. Sebanyak 100 sampel umbi diambil secara acak pada masing-masing kultivar dan ditanam pada styrofoam yang telah diberi air di bawahnya. Setelah 7 hari diambil secara acak 50 sampel daun yang tumbuh dari masing-masing kultivar. Hasil deteksi awal umbi benih bawang merah menunjukkan bahwa kedua kultivar 100 % positif terinfeksi OYDV. Sampel „Bima Curut‟ yang bereaksi positif terhadap antibodi SLV dan GCLV berturut- turut sebanyak 100% dan 90%, sedangkan sampel „Bima Brebes‟ berturut- berturut sebanyak 96% dan 96%. Infeksi OYDV dominan dibandingkan dengan SLV dan GCLV. Hasil deteksi ini mengindikasikan bahwa infeksi virus pada pertanaman bawang merah di Indonesia sangat tinggi. Perlakuan termoterapi pada berbagai tingkatan suhu dan ukuran eksplan menunjukkan bahwa suhu mempengaruhi secara nyata pertumbuhan eksplan sedangkan ukuran eksplan tidak berpengaruh nyata. Pada kultivar Bima Curut, kombinasi perlakuan termoterapi terbaik terhadap pertumbuhan eksplan adalah ukuran eksplan 1 mm dengan kondisi heterogen, sedangkan pada kultivar Bima Brebes adalah kombinasi ukuran eksplan 2 mm dengan suhu heterogen. Konfirmasi melalui RT-PCR pada plantlet hasil termoterapi menunjukkan bahwa semakin kecil ukuran maka tingkat keberhasilan eliminasi semakin tinggi. Seluruh plantlet (100%) yang berasal dari ukuran eksplan 1 mm bebas virus pada semua perlakuan. Tingkat eliminasi pada kultivar Bima Curut dengan ukuran eksplan 2 mm dan 3 mm pada suhu 30 °C terhadap Potyvirus adalah 67%, sedangkan terhadap Carlavirus berturut-turut adalah 33% dan 67%. Tingkat eliminasi pada kultivar Bima
Keyword: Carlavirus, kultur ujung tunas, plantlet bebas virus, Potyvirus, umbi bebas virus

Judul: Kultur Meristem dan Termoterapi untuk Eliminasi Virus pada Bawang Putih
Abstrak: Bawang putih (Allium sativum) merupakan salah satu komoditas hortikultura yang banyak dimanfaatkan oleh masyarakat Indonesia sebagai bahan masakan, obat, dan campuran pakan ternak. Namun demikian, produksi bawang putih lokal belum dapat memenuhi kebutuhan nasional. Hal tersebut disebabkan antara lain oleh rendahnya kesehatan benih, termasuk adanya infeksi virus. Beberapa virus utama yang diketahui menginfeksi bawang putih lokal yaitu OYDV (Onion yellow dwarf virus), GCLV (Garlic common latent virus), dan SLV (Shallot latent virus). Bawang putih diperbanyak secara vegetatif. Di Indonesia, umbi hasil panen akan digunakan kembali sebagai benih pada musim berikutnya. Siklus tersebut dapat menyebabkan virus terbawa benih sehingga terjadi akumulasi virus pada umbi dan menyebabkan penurunan produksi. Salah satu upaya pengendalian virus pada bawang putih adalah dengan penggunaan benih yang sehat. Dengan demikian, diperlukan upaya untuk menyediakan bawang putih lokal yang bebas virus. Penelitian bertujuan untuk mengonfirmasi insidensi OYDV, GCLV dan SLV pada bawang putih di Tawangmangu dan Tegal serta mendapatkan metode eliminasi virus, khususnya OYDV, GCLV, dan SLV melalui metode kultur meristem yang dikombinasikan dengan termoterapi. Deteksi virus dari daun dan umbi bawang putih dilakukan dengan metode DIBA (dot immunobinding assay). Metode kultur meristem untuk eliminasi virus menggunakan eksplan meristem berukuran 1 mm; sedangkan perlakuan termoterapi yang diberikan adalah suhu 25 °C, 28 °C dan 31 °C pada bawang putih kultivar ‘Tawangmangu Baru’. Hasil penelitian menunjukkan bahwa OYDV, GCLV, dan SLV ditemukan di Tawangmangu dan Tegal dengan insidensi virus bervariasi antara 90% hingga 100% dan skor DIBA berkisar antara 0.9 hingga 2.9. Konfimasi selanjutnya dilakukan pada tunas adventif, untuk mengetahui distribusi virus antar siung dalam satu umbi bawang putih. Berdasarkan reaksi DIBA, didapatkan insidensi yang bervariasi antar siung dalam satu umbi, yaitu 54.41 sampai 100% pada OYDV, 83.33 sampai 98.57% pada GCLV, dan 0 sampai 91.27% pada SLV. Hal tersebut menunjukkan bahwa virus tidak terdistribusikan secara merata dalam satu umbi, meskipun setiap siung berasal dari satu tanaman yang sama. Baik pada daun maupun tunas adventif, GCLV menunjukkan insidensi dan titer virus yang paling tinggi, sedangkan SLV selalu menunjukkan hasil yang paling rendah. Insidensi virus yang tinggi juga ditemukan pada benih umbi bawang putih berupa umbi siung, umbi tunggal, dan bulbil. Insidensi virus tertinggi yaitu GCLV pada umbi siung cv ‘Tawangmangu Baru’ dan SLV pada umbi tunggal cv ‘Jawa Lama’ masing-masing sebesar 100%, sedangkan insidensi paling rendah yaitu pada SLV pada umbi siung cv ‘Jawa Lama’ sebesar 72%. Hasil deteksi tersebut mengindikasikan bahwa baik umbi siung, umbi tunggal, maupun bulbil berpotensi untuk membawa dan menularkan virus ke tanaman selanjutnya. Dengan demikian, perlu adanya upaya pencegahan dengan mengurangi inokulum virus pada umbi, dengan menghasilkan benih bebas virus. Kultur in vitro dengan meristem berukuran 1.0 mm yang dikombinasikan dengan termoterapi menunjukkan bahwa perlakuan suhu 28 °C dan 31 °C berpotensi menyebabkan penghambatan terhadap persentase bertahan eksplan, tinggi tunas mikro, dan jumlah daun. Tunas mikro yang tumbuh kemudian dideteksi menggunakan RT-PCR (reverse transcription polymerase chain reaction) untuk mengetahui infeksi virus setelah perlakuan termoterapi. Hasil visualisasi pada gel agarosamasih menunjukkan adanya pita DNA spesifik OYDV dan GCLV; sedangkan pita DNA spesifik SLV tidak teramplifikasi. Berdasarkan hasil RT-PCR tersebut dapat disimpulkan bahwa metode kultur meristem yang dikombinasikan
Keyword: Allium sativum, bulbil, umbi siung, kultur in vitro, umbi tunggal

Judul: Asymptotic Distribution of Estimator for the Intensity Function of a Doubly Periodic Poisson Process
Abstrak: In this manuscript, estimation of the intensity function of a doubly periodic Poisson process is discussed. It is assumed that only a single realization of the Poisson process is observed in a bounded window [0,n]. It is also assumed that the period of the intensity function is known. The rate of consistency and asymptotic normality of the estimator are formulated. Finally, a confidence interval for the local intensity function is also formulated.
Keyword: