Judul: In Silico and In Vitro Study of Antimicrobial Peptide on Growth Performance of Broiler Chickens and Piglets
Abstrak: Industri peternakan ayam broiler dan babi merupakan sektor peternakan yang strategis. Berkembangnya industri ini menyebabkan kebutuhan antibiotik imbuhan pakan meningkat. Antibiotik imbuhan pakan dibutuhkan oleh industri tersebut untuk mengurangi kerugian akibat penyakit diare dan dampak negatif lainnya. Akan tetapi, antibiotik imbuhan pakan mulai dilarang penggunaannya dikarenakan ditemukannya kasus alergi, kanker, resistensi terhadap bakteri patogen, dan dampak merugikan lainnya. Oleh karena itu, diperlukan alternatif baru yang tidak menimbulkan dampak negatif serupa. Salah satu alternatif adalah penggunaan peptida antimikroba (PAM). Peptida antimikroba merupakan peptida aktif yang memiliki aktivitas antimikroba, antifungi, dan antiviral. Keunggulan peptida antimikroba adalah peptida ini mudah didegradasi, tahan suhu tinggi, memiliki spektrum luas melawan bakteri patogen, dan tidak menimbulkan efek resistensi. Mekanisme peptida antimikroba yaitu peptida ini mengenali bakteri patogen melalui pengenalan sinyal dari dinding bakteri berupa lipopolisakarida. Bakteri yang teridentifikasi kemudian diikat oleh peptida ini dan dirusak dinding selnya dan/atau menghambat proses sintesis protein melalui pembentukan oksida reaktif. Kajian eksperimen terkait peptida antimikroba sudah mulai banyak dilakukan. Akan tetapi, penjabaran efek positifnya masih saling tumpang tindih, sehingga terjadi bias diantara penelitian. Metode pendekatan yang digunakan untuk menyelesaikan permasalahan tersebut adalah kajian in silico menggunakan analisis komponen utama dan meta-analisis. Selain itu, di dalam penelitian ini juga dilakukan sintesis peptida antimikroba asal maggot (Hermetia illucens) yaitu cecropin like-peptide 1 (CLP1). Selain itu juga, uji antikanker ekstrak akuades dan etanol maggot terhadap sel kanker leukemia (yaitu MOLT4 dan K562). Kajian in silico menggunakan data yang bersumber dari perpustakaan digital, literatur yang dipergunakan adalah jurnal yang relevan terkait topik penelitian. Kemudian, jurnal tersebut dipilih menggunakan protokol seleksi data dan dibangun model matematika yang merepresentasikan data. In vitro, cecropin asal maggot disintesis menggunakan sistem IVT (In Vitro Translation). Komplemen DNA cecropin ditumpang tindihkan pada fragmen T7-IRES-Kozak dan selanjutnya ditranslasikan menggunakan lisat sel epitelium. Produk peptida CLP1 diidentifikasi menggunakan SDS-PAGE, dot blot, dan mikroskop fluoresen. Ekstrak etanol dan akuades maggot diuji sitotoksiksitasnya pada sel MOLT4 dan K562 kemudian IC50 ditentukan menggunakan regresi linier. Temuan dari pemodelan in silico menggunakan analisis komponen utama, bahwa peptida antimikroba asal serangga yang dikelompokkan menjadi empat kelompok utama yaitu peptida α-heliks, peptida kaya sistein, polipeptida kaya glisin, dan peptida kaya prolin. Peptida kaya sistein memiliki aktivitas penghambatan terhadap tiga jenis mikroba yaitu bakteri gram-negatif, fungi, dan khamir. Peptida ini memiliki asam amino sistein yang membentuk jembatan disulfida sehingga struktur tersiernya menjadi stabil. Peptida lain seperti cecropin (α-heliks) asal maggot memiliki sifat antibakteri dan antikanker. Cecropin like-peptide 1 yang disintesis secara in vitro tidak mampu dideteksi menggunakan SDS-PAGE, dot blot, dan mikroskop fluoresen. Ekstrak akuades dan etanol maggot memiliki IC50 sebesar 123; 114; 204; dan 246 μg mL -1 masing-masing untuk akuades MOLT4, akuades K562, etanol MOLT4, dan etanol K562 secara berurutan. Kajian in silico menggunakan meta-analisis pada ayam broiler dan anak babi menghasilkan temuan sebagai berikut. Pertambahan bobot badan broiler kuadratik nyata (P<0,05) meningkat dengan level maksimum PAM sebesar 346 dan 360 mg kg -1 secara berurutan untuk fase starter dan finisher. Selain itu, populasi E. coli, koliform, dan bakteri aerobik nyata (P<0,05) turun di illeum. Performa pertumbuhan anak babi seperti pertambahan bobot badan signifikan (P<0,05) meningkat. Bobot badan anak
Keyword: antimicrobial peptides, cecropin, Hermetia illucens, meta-analysis, MOLT4

Judul: Evaluasi Efektivitas Probiotic terhadap Performa, Profil Kesehatan dan Kadar Amonia Litter Broiler
Abstrak: Efisiensi penggunaan pakan merupakan kendala utama dalam pemeliharaan broiler. Penggunaan Antibiotic growth promotore (AGP) digunakan untuk mengatasi masalah efiseinsi pakan, namun jika digunakan secara terus menerus akan menyebabkan resistensi pada ternak serta menyisakan residu pada produknya. Pemberian probiotik merupakan salah satu alternatif penggunaan AGP. Probiotik merupakan bakteri hidup yang dimasukkan ke dalam saluran pencernaan untuk meningkatkan efisiensi pakan dengan cara memelihara keseimbangan mikroflora usus. Tujuan dari dilakukannya penelitian ini adalah untuk mengevaluasi metode pemberian probiotik yang paling efektif dalam pencapaian efisiensi ayam broiler sebagai alternatif Antibiotic Growth Promotore (AGP). Penelitian ini dilakukan melalui 2 tahapan. Tahap pertama untuk mengukur performa, profil kesehatan berupa profil darah dan organ dalam serta kadar amonia litter. Tahapan kedua untuk mengukur kecernaan nutrien dan energi metabolis sebagai data pendukung pengukuran performa broiler. Ternak yang digunakan adalah ayam broiler strain Lohmann dengan proporsi jantan dan betina yang sama berjumlah 500 ekor. Ternak tersebut didistribusikan ke dalam 5 perlakuan dan 5 ulangan setiap ulangannya terdiri dari 20 ekor ayam broiler. Rancangan yang digunakan dalam penelitian ini adalah rancangan acak lengkap (RAL). Perlakuan yang digunakan dalam penelitian tahap 1 adalah P0= ransum basal, P1=P0+AGP (zinc bacitrasin 0.04%), P2 = P0 + Probiotik larut air minum, P3= P0 + Probiotik Semprot litter, P4 = P0 + P2+P3. Perlakuan pada penelitian tahap 2 adalah P0= ransum basal, P1=P0+AGP (zinc bacitrasin 0.04%), P2 = P0 + Probiotik larut air minum. Hasil penelitian menunjukkan bahwa penggunaan probiotik larut air minum (P2) dan kombinasi (P4) secara sangat signifikan (P<0.01) dapat memperbaiki performa ayam broiler karena mampu menurunkan nilai FCR dan mortalitas. Konsumsi pakan ayam broiler menurun secara sangat nyata (P<0.01) namun bobot badan dan pertambahan bobot badan tidak berpengaruh terhadap pemberian probiotik. Penggunaan Probiotik larut air minum (P2) dan kombinasi (P4) secara sangat signifikan (P<0.01) menurunkan kadar kolesterol serum darah, meningkatkan haemoglobin darah, meningkatkan bobot usus halus illeum, pan jang jejunum dn illeum, dan menurunkan bobot limpa. Penggunaan probiotik secara dan sangat nyata (P<0.01) meningkatan kecernaan protein kasar dan retensi nitrogen, nyata (P<0.05) meningkatkan kecernaan serat kasar. Penggunaan probiotik larut air minum secara sangat nyata (P<0.01) menurunkan kecernaan lemak kasar dan retensi lemak. Penggunaan probiotik larut air minum sangat nyata (P<0.01) meningkatkan nilai energi metabolis murni dan energi metabolis murni terkoreksi nitrogen. Penggunaan Probotik dengan metode semprot pada litter (P3) dan (P4) secara sangat signifikan menurunkan kadar amonia litter kandang tanpa mengganggu pH dan kadar airnya. Metode penggunaan probiotik yang paling efektif adalah kombinasi (P4). Probiotik herbal mampu menggantikan penggunaan zinc bacitracin sebagai AGP.
Keyword: Air minum, broiler, probiotik, semprot pada litter

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: