Judul: Endophytic Fungal Diversity of Local Rice and Their effects on Rice seedling Growth.
Abstrak: Cendawan endofit ialah cendawan yang hidup di dalam jaringan tanaman inang tanpa menyebabkan gejala penyakit. Cendawan endofit potensial sebagai pupuk hayati dan pengendali hayati tanaman, termasuk padi lokal, sehingga dapat digunakan untuk meningkatkan produktivitas tanaman tanaman padi lokal yang ramah lingkungan. Padi lokal merupakan salah satu andalan karena cocok dengan kondisi lingkungan setempat. Namun, produktivitas padi lokal umumnya belum maksimal karena terkendala oleh kesuburan tanah. Produksi padi termasuk padi lokal masih bergantung pada pupuk anorganik. Pupuk anorganik yang digunakan terus menerus dapat mengubah struktur fisik dan kimia tanah yang menyebabkan tanah menjadi tidak subur. Oleh karena itu, perlu diterapkan suatu teknik budi daya padi spesifik yang berwawasan lingkungan dan berkelanjutan. Penelitian ini bertujuan mengisolasi dan menganalisis keragaman cendawan endofit padi lokal kultivar Siam 11 Kalimantan dan potensinya dalam meningkatkan pertumbuhan bibit tanaman inangnya. Isolasi cendawan dilakukan pada seluruh bagian tanaman padi Siam 11 Kalimantan, yaitu akar, pelepah, daun, gabah, biji pecah kulit, sekam, kecambah dan bibit dengan metode sterilisasi permukaan menggunakan NaOCl 1% dan dikulturkan pada media Potato sucrose Agar (PSA) yang mengandung kloramfenikol 500 mg L-1. Identifikasi cendawan menggunakan gabungan karakteristik morfologi dan molekuler. Keragaman cendawan endofit dihitung melalui indeks keragaman Shanon-Wiener. Cendawan endofit di analisis molekuler menggunakan sekuen rDNA dengan primer ITS1 dan ITS4 yang dilanjutkan dengan analisis filogenetik. Cendawan selanjutnya di uji kemampuannya dalam meningkatkan pertumbuhan bibit padi menggunakan filtrat. Kultur pengaruh filtrat cendawan endofit terhadap pertumbuhan tanaman padi diuji pada perkecambahan dan pertumbuhan benih padi. Filtrat cendawan endofit dari satu isolat terbaik dianalisis senyawa bioaktifnya menggunakan Liquid Chromatography-Mass Spectrometry (LC-MS). Data pertumbuhan tanaman padi dianalisis melalui Analisis Variance (ANOVA) menggunakan SAS 9.4. Perbedaan antar perlakuan dilanjutkan dengan uji Tukey pada taraf kepercayaan 95% (p<0,05). Sebanyak 14 kelompok isolat cendawan endofit berhasil diisolasi. Berdasarkan pengamatan morfologi sebanyak 11 isolat memiliki konidia (bersporulasi), sedangkan 3 isolat lainnya tidak bersporulasi. Berdasarkan hasil identifikasi molekuler, keempat belas isolat tersebut terdiri atas tiga belas spesies yaitu Cladosporium oxysporum, C. coloradense, Fusarium keratoplasticum galur 1 dan 2, F. humuli, Penicillium brefeldianum, P. citrinum, Poaceascoma lochii, Pseudopestalotiopsis simitheae, Sarocladium oryzae, Simplicillium obclavatum, Talaromyces macrosporus, T. angelicus, dan T. pinophilus. Bagian tanaman dengan frekuensi kolonisasi cendawan endofit paling tinggi terdapat pada bagian daun, sebesar 11,67%, sedangkan frekuensi kolonisasinya paling rendah terdapat pada bagian sekam yaitu 2,78%. Cendawan Sarocladium oryzae paling sering ditemukan dengan frekuensi 6,39%, atau tingkat dominansi spesies paling tinggi (95,83 %), sedangkan cendawan F. keratoplasticum galur 1, F. humuli, dan T. pinophilus paling jarang ditemukan dengan frekuensi masing-masing sebesar 0,28 % atau dominansinya paling rendah (masing-masing 4,17 %). Keragaman cendawan endofit yang diperoleh berdasarkan analisis keragaman Shanon-Wiener termaksuk dalam kategori sedang yaitu 2,24. Hasil pengujian filtrat asal ke-13 medium kultur yang telah dipisahkan dari miselium terhadap pertumbuhan benih padi lokal umur 14 hari pada kondisi laboratorium, menunjukkan isolat F. keratoplasticum galur 1 memiliki potensi yang paling baik, yaitu menghasilkan nilai peningkatan tinggi tajuk 3,87 cm, panjang akar 3,14 cm, dan bobot kering akar 3,52 mg. Analisis melalui LC-MS dari ekstrak kasar asal filtrat tersebut menunjukkan terdapat lima senyawa yang diduga membantu meningkatkan pertumbuhan tanaman padi, yaitu 2-C-methylerythritol 4-phosphate, asam sitrat, asam sitrakonat, asam DL-malat,
Keyword: 5W+1H

Judul: Keanekaragaman dan Kelimpahan Cendawan Endofit pada Batang Padi
Abstrak: Penelitian ini bertujuan mengetahui keanekaragaman cendawan endofit dari batang padi dan potensinya terhadap pertumbuhan benih padi. Isolasi cendawan diperoleh dari 17 batang padi tidak terserang penggerek dan 17 batang padi terserang penggerek. Cendawan hasil isolasi diuji patogenisitas terhadap benih padi. Benih yang ditanam sebanyak sepuluh bulir benih padi dengan tiga kali ulangan pada tiap isolat yang diujikan dan diinkubasi selama seminggu. Pengamatan perkecambahan benih setelah satu minggu dengan menghitung persentase perkecambahan benih, panjang batang, dan panjang akar. Hasil isolasi cendawan endofit dari batang padi tidak terserang penggerek dan terserang penggerek didapatkan 27 spesies. Cendawan endofit yang mengkolonisasi pada kedua batang diantaranya Nigrospora sp.3, Penicillium, Trichoderma sp.2, Nigrospora sp.4, Verticillium, dan hifa steril cokelat. Cendawan endofit yang dominan pada batang padi adalah Verticillium. Keanekaragaman cendawan pada batang yang terserang penggerek lebih tinggi. Nilai indeks keragaman pada batang tidak terserang penggerek sebesar 2.723 dan batang yang tidak terserang penggerek sebesar 2.192. Indeks kesamaan cendawan endofit pada kedua batang hanya 0.37 sehingga dapat dikatakan bahwa cendawan endofit pada batang tidak terserang dan terserang penggerek berbeda. Cendawan endofit yang meningkatkan pertumbuhan panjang batang dan panjang akar dalam perkecambahan yaitu Nigrospora sp.1; Trichocladium sp.1; Trichocladium sp.2; khamir; Nigrospora sp.3; dan Nomuraea sp.
Keyword: paddy, endophytic fungus, Verticillium

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: