Judul: Evaluasi Ketahanan Ikan Mas Turunan Ketiga Yang Mempunyai Marka Molekuler Cyca-DAB1*05 Terhadap Infeksi Bakteri Aeromonas hydrophila
Abstrak: Serangan penyakit merupakan salah satu kendala utama dalam kegiatan budidaya ikan mas Cyprinus carpio, yang dapat menyebabkan kerugian ekonomi yang cukup tinggi, sehingga perlu penanganan yang cukup serius guna mengurangi tingkat kerugian yang ditimbulkan. Adanya infeksi akan ditanggapi oleh sistem pertahanan tubuh khususnya imun non-spesifik sebagai pertahanan pertama terhadap infeksi. Respons imun non-spesifik tersebut dapat diamati melalui uji gambaran darah. Tujuan penelitian ini adalah untuk menguji pengaruh infeksi bakteri Aeromonas hydrophila pada ikan mas turunan ketiga (F3) yang membawa marka molekuler Cyca-DAB1*05 terhadap gambaran darah sebagai respresentasi tanggap kebal ikan mas, serta tingkat kelangsungan hidup ikan mas pascainfeksi. Penelitian ini dilakukan dengan menginfeksikan bakteri A. hydrophila sebanyak 0,1 mL dengan kepadatan bakteri 108 cfu/mL pada ikan mas yang membawa marka molekuler Cyca-DAB1*05. Sebagai kontrol digunakan ikan mas tanpa marka (tidak diseleksi kandungan marka molekulernya), yang diperoleh dari pembudidaya ikan di Bogor, diinfeksi dengan bakteri sebagai kontrol positif, dan diinjeksi dengan bufer fosfat salin sebagai kontrol negatif. Masing-masing perlakuan terdiri atas tiga ulangan. Sebanyak 180 ekor ikan mas diuji tantang menggunakan A. hydrophila, dan ikan dipelihara dalam akuarium berukuran 100x100x60 cm3. Uji tantang dilakukan selama 14 hari. Parameter yang diamati meliputi gambaran darah dan kelangsungan hidup ikan. Darah diambil pada hari ke-0, 3, 7 dan 14 pascainfeksi untuk menghitung total sel darah merah, hemoglobin, hematokrit, total sel darah putih, dan diferensial leukosit. Hasil penelitian terhadap gambaran darah menunjukkan bahwa ikan mas yang membawa marka molekuler Cyca-DAB1*05 memiliki imunitas yang lebih baik dibandingkan ikan mas kontrol. Pada hari ke-3 pascainfeksi, terjadi penurunan total sel darah merah, hemoglobin dan hematokrit. Sebaliknya, pada hari ke-3, total sel darah putih meningkat sebagai indikasi respons imun non-spesifik. Hari ke-7 merupakan puncak dari kinerja respons imun non-spesifik yang ditandai dengan peningkatan total sel darah putih dibandingkan hari ke-3, serta adanya peningkatan persentase monosit dan neutrofil yang berperan dalam mengeliminasi patogen. Hari ke-14, respons imun non-spesifik mengalami penurunan, terlihat dari berkurangnya total sel darah putih, dan diiringi dengan peningkatan total sel darah merah, hemoglobin dan hematokrit. Pengamatan terhadap tingkat kelangsungan hidup menunjukkan ikan mas yang membawa marka molekuler Cyca-DAB1*05 memiliki tingkat kelangsungan hidup 2,6 kali lebih tinggi dibandingkan ikan mas tanpa marka. Dengan demikian, profil gambaran darah ikan mas sejalan dengan daya tahannya terhadap infeksi A. hydrophila.
Keyword: ikan mas, Aeromonas hydrophila, marka molekuler, Cyca-DAB1*05

Judul: Pengaruh penyuntikan bakteri Aeromonas hydrophila secara intraperitoneal terhadap ikan mas (Cyprinus carpio Linn.) berukuran ramoan dari varietas Majalaya, Sinyonya dan hibridnya
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh infeksi bakteri Aeromonas hydrophila terhadap ikan mas berukuran ramoan dari varitas Majalaya, Sinyonya dan Hibridnya. Penelitian ini dilaksanakan di kolam penelitian Balai Penelitian Perikanan Air Tawar, Stasiun Percobaan Cibalagung Bogor, sejak tanggal 21 Maret sampai 11 Mei 1988. Ikan mas Varitas Majalaya, Sinyonya dan hibridnya yang digunakan berukuran ramoan (5-8 cm), dipelihara dalam kolam berukuran 4 x 2,5 x 0,8 m³ sebanyak 9 buah dan disekat menjadi 2 bagian. Media air berasal dari air Sungai Cikaret yang telah melalui filter. Kedalaman air dipertahankan 50 cm dan diatur supaya air tetap mengalir dari inlet ke outlet. Pakan berupa pellet remahan Indofeed sebanyak 5% berat biomassa perhari, dan diberikan 2 kali sehari. Perlakuan penyuntikan adalah penyuntikan secara intraperitoneal 0,1 ml larutan bakteri, yaitu seba- nyak (A) 1,66 x 104 bakteri/ml, (B) 1,66 x 105 bakteri/ml, (C) 1,66 x 106 bakteri/ml, (D) 1,66 x 107 bakteri/ml, (E) 1,66 x 108 bakteri/ml, dan (K) phosphat buffer saline steril 0,1 ml. Tiap varitas diinfeksi sebanyak 50 ekor pada tiap perlakuan. Pengamatan terhadap gejala klinis yang timbul dan jumlah kematian dilakukan tiap 12 jam sekali, dimulai pasca infeksi 1 hari dengan mengambil sampel ikan 10 ekor. Pengamatan dilakukan selama 21 hari. Untuk memastikan bahwa ikan-ikan yang mati disebabkan oleh bakteri Aeromonas hydrophila, maka dilakukan isolasi kembali bakteri dari organ ginjal dan daerah bekas suntikan, pada pasca infeksi 2 hari, 3 hari, 4 hari, 7 hari dan 14 hari, lalu dilakukan identifikasi bakteri. Penempatan wadah perlakuan dilakukan secara acak dengan menggunakan metode bilangan acak, sedangkan analisa data dilakukan se- cara deskriptif. ...
Keyword: 

Judul: The Construction of Greedy SVP LLL Algorithm
Abstrak: A lattice is a set of all integer linear combination of a set of linearly independent vectors in ℝ𝑛���. The independent vectors are called bases of lattice. Any lattice can be generated from many bases, and these bases have the same cardinality. In the lattice, the most fundamental and renowned problem is the Shortest Vector Problem (SVP). SVP is a tracking problem of the shortest nonzero vector in a lattice with equivalent bases. In two dimensions, SVP problem has resolved exactly by Gauss’ algorithm. When the lattice dimension is higher than two, A.K. Lenstra, H.W. Lenstra and L. Lovasz gave a LLL algorithm to compute approximation of nonzero shortest vector in the lattice. Reduced bases solution obtained from LLL algorithm still be an approximation and has polynomial running time of arbitrary dimension which large enough. In 1994, Schnoor and Euchner modified this LLL algorithm as a new variant which later was named deep insertion LLL algorithm. This algorithm is a modified version of the LLL algorithm to the terms of the exchange step to improve the accuracy of output of LLL reduced bases and applying it to the subset sum problem. The purpose of this research are: (1) Reconstruct the LLL algorithm and deep insertion LLL algorithm using a geometric approach. (2) Construct a greedy SVP LLL algorithm. (3) Implement the three algorithms in a symbolic programming language, and evaluate them experimentally. A bases ℬ=[𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑛���] in ℝ𝑚��� is called reduced LLL with parameter 𝛿��� if satisfies: (a) |𝜇���𝑗���𝑖���|≤12, for every integer 𝑖���,𝑗��� with 1≤𝑖���<𝑗���<𝑛���. (b)𝛿���‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���)‖2≤‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���+1)‖2, for 𝑗���=1,2,…,𝑛���−1,where 𝛿��� is a reduced parameter of real numbers with 14<𝛿���<1. The first requirement is the reduced basis 𝛿��� must “nearly orthogonal” and in its computation case, this requirement can be reached out by using the Gram-Schmidt’s orthogonalization. While the second requirement is called exchange step, or used to called as Lovasz condition. By using both of these requirements, then they establish the LLL algorithm. Then, Schnoor and Euchner modify the LLL algorithm based on the requirements of the exchange step called the deep insertion LLL algorithm, where the exchange step is based on the comparison of the projected vector in orthogonal complement [𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑘���−1]⊥ after j-th reduction. To construct greedy SVP LLL algorithm, the requirements of the exchange step is based on purely by comparing norm of lattice 𝐛���𝑗��� with norm lattice 𝐛���𝑖��� for 𝑖���=1,2,3…,𝑗���−1. The process of insertion reduced vector after the exchange step also has done greedily. Then, we calculate the number of arithmetic operation in greedy SVP LLL algorithm for further analysis. The result of our exprimentation for three algorithms on the certain matrix size shows that the running time of the three algorithms increases propotional to the size of the matrix. The result also shows that by using 𝛿���=34 for the LLL algorithm and the deep insertion LLL algorithm, and the greedy SVP LLL algorithm which is a new variant made by using no parameter of 𝛿���, outperform of the other of two previous algorithm in terms of speed with the same output.
Keyword: LLL algorithm, LLL deep insertion algorithm, greedy SVP LLL algorithm