Judul: Studi identifikasi 19 kultivar mangga Mangifera indica L.dengan analisis isozim
Abstrak: Penelitian ini dilakukan untuk memperoleh pertelaan molekuler 19 kultivar mangga yang telah diketahui karakter morfologinya dan untuk mengetahui hubungan kekerabatan antar 19 kultivar mangga. Analisis isozim dilakukan di Laboratorium PAU-IPB sedangkan pengambilan sampel daun 19 kultivar pohon induk mangga dilakukan di Taman Buah Mekarsari. Penelitian dilakukan pada bulan November 2003 - April 2004. Data hasil analisis isozim yang didapat, dipadukan dengan data morfologi diterjemahkan kedalam bentuk kategori. Kedekatan hubungan kekerabatan antar 19 kultivar mangga diduga dengan metode jarak euclidius menggunakan analisis gerombol yang hasil akhirnya berupa dendrogram. Untuk mengetahui ciri sifat yang akan dijadikan pembeda antar kultivar pada pohon induk dilakukan analisis komponen utama yang hasil akhirnya berupa diagram pencar. Pohon induk mangga yang diidentifikasi terdiri atas 19 kultivar yaitu Golek, Apel Merah, Madu, Pepaya, Okyong, Arumanis, Saigon, Manalagi Situbondo, Indramayu, Apel Hijau, Brazil, Manalagi, Khiao Sawoey, Lalijiwo, Green Bombay, Gedong, Endog, Durih, dan Kopyor. Isozim yang digunakan untuk identifikasi adalah peroksidase (PER), esterase (EST), acid phosphatase (ACP), alcohol dehydrogenase (ADH), dan aspartate aminotransferase (AAT). Isozim alcohol dehydrogenase (ADH) dan aspartate aminotransferase (AAT) kurang akurat dibandingkan dengan isozim peroksidase (PER), esterase (EST), dan acid phosphatase (ACP) dalam membedakan antar kultivar mangga. Sistem isozim acid phosphatase (ACP) dapat dijadikan sebagai pembeda pada kultivar Golek, Madu, Pepaya, Okyong, Manalagi Situbondo, Brazil, Endog dan Kopyor. Peroksidase (PER) dapat digunakan sebagai pembeda pada kultivar Madu, Pepaya, Saigon, Manalagi Situbondo, Indramayu, Apel Hijau dan Khiao Sawoey. Kultivar Arumanis dapat dibedakan dari kultivar lainnya pada sistem isozim esterase (EST) sedangkan kultivar Brazil dapat dibedakan dari kultivar lainnya dengan isozim alcohol dehydrogenase (ADH). Pengelompokkan berdasarkan hubungan kekerabatan pada dendrogram identifikasi 19 kultivar mangga berdasarkan analisis pola pita isozinı dan ciri morfologi bagian vegetatif terbagi menjadi tiga kelompok. Kelompok pertama terdiri dari kultivar Okyong, Golek, Madu, Kopyor, dan Manalagi Situbondo. Kelompok kedua terdiri dari kultivar Green Bombay, Arumanis, Saigon, Endog, Manalagi, dan Khiao Sawoey sedangkan kelompok ketiga terdiri atas Indramayu, Apel Hijau, Apel Merah, Gedong, Brazil, Durih, dan Pepaya. Secara umum diagram pencar 19 kultivar mangga berdasarkan analisis pola pita isozim dan ciri morfologi bagian vegetatif hampir sama dengan diagram pencar 19 kultivar mangga berdasarkan ciri morfologi bagian vegetatif kecuali pada kultivar Apel Merah, Green Bombay, Brazil dan Kopyor. Kultivar mangga yang memiliki kekerabatan yang dekat adalah Manslagi, Endog, dan Lalijiwo.
Keyword: 

Judul: Genetic structure of mangosteen (Garcinia mangostana L.). based on morphology and molecular markers
Abstrak: Pengetahuan tentang variabilitas genetik manggis penting untuk program pemuliaan dan sebagai dasar bagi perbaikan tanaman serta peningkatan daya saing. Manggis dikenal sebagai tanaman buah tropika yang mempunyai mekasisme reproduksi secara apomiksis dengan variasi genetik yang sempit. Penelitian tentang variasi genetik pada manggis sudah cukup banyak dilakukan namun belum terverifikasi dengan baik. Informasi tentang struktur genetik serta hubungan antara keragaman morfologi dan genetik belum tersedia. Untuk itu perlu dilakukan serangkaian kegiatan penelitian yang bertujuan untuk: 1). Mempelajari variasi genetik manggis pada tingkat individu berdasarkan karakter morfologi dan molekuler, 2). Mempelajari hubungan antara variasi morfologi dan genetik, dan 3). Mengungkap struktur genetik empat populasi manggis Indonesia berbasis marka molekuler. Kombinasi antara pendekatan morfologi dengan teknik analisis DNA memegang peranan penting dalam studi keragaman dan identifikasi varietas manggis. Pendekatan ini dapat meningkatkan akurasi dan mempersingkat waktu penelitian. Sebelas marka Inter-simple sequence repeat (ISSR) digunakan untuk mengetahui variasi genetik 22 individu manggis dari berbagai wilayah Sumatera. Hubungan antara karakter morfologi dan molekuler dipelajari menggunakan 33 aksesi manggis yang berasal dari Leuwiliang (Bogor-Jawa Barat), Kiara Pedes (Purwakarta-Jawa Barat), dan Pulau Palas (Tembilahan-Riau). Pengamatan morfologi difokuskan pada 10 karakter buah, dan analisis molekuler dilakukan dengan menggunakan 8 primer RAPD dan 5 primer ISSR. Struktur genetik populasi dipelajari dengan menggunakan 106 sampel tanaman manggis dari empat populasi manggis di Indonesia yaitu Purwakarta (Jawa Barat), Kerinci (Jambi), Tembilahan (Riau) dan Bulukumba (Sulawesi Selatan). Data morfologi dianalisis dengan metode Kruskal Wallis. Pengelompokan berdasarkan morfologi, molekuler dan gabungan morfologi dan mplekuler dianalisis dengan program NTSYSpc 2.1. Struktur genetik populasi dianalisis menggunakan program GenAlex 6.2.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: