Judul: Konstuksi Vektor Dan Ekspresi Protein Rekombinan Lipase Candida Antarctica (Calb) Dengan Cellulose Binding Module (Cbm) Pada Pichia Pastoris
Abstrak: Gen CalBsyn telah dikonstruksi secara sintetik untuk menyandi Candida antarctica lipase B (CALB). Enzim tersebut memiliki peranan penting sebagai biokatalis yang efektif di bidang bioteknologi dan industri. Sekuens gen CalBsyn telah dimodifikasi dengan mengintroduksi mutasi pada tiga asam amino, yaitu V210I, A281E, dan V221D untuk meningkatkan termostabilitas enzim tersebut. Fragmen gen cellulose binding module (cbm) endoglukanase I (egl1) dari Trichoderma reesei difusikan pada ujung karboksil gen CalBsyn pada plasmid rekombinan pGAPZα-CalBsyn. CBMmerupakan suatu domain protein yang umum dijumpai pada enzim selulase dan berfungsi dalam pengikatan enzim pada matrik selulosa. Dalam penelitian ini CBM digunakan untuk memfasilitasi imobilisasi CALB pada matrik selulosa melalui fusi dari dua protein tersebut. Penelitian ini bertujuan mengkonstruksi vektor ekspresi gen CalBsyn yang difusi dengan cbm dan mengekspresikan CALB pada Pichia pastoris SMD1168H. Baik plasmid maupun gen cbm dipotong dengan enzim ClaI. Plasmid rekombinan pGAPZα-CalBsyn-cbm dikonstruksi dengan cara meligasikan gen cbm ke dalam plasmid pGAPZα-CalBsyn. Plasmid rekombinan pGAPZα-CalBsyn-cbm diklon dan diseleksi pada Eschericia coli TOP10F’. Plasmid rekombinan pGPAZα-CalBsyn telah berhasil diintroduksi ke dalam genom P. pastoris SMD1168H melalui metode elektroporasi. Efisiensi transformasi yang diperoleh sebesar 1,01 x 102 cfu/μg DNA. Analisis ekspresi protein rekombinan dilakukan terhadap beberapa galur rekombinan P. pastoris terpilih. Uji aktivitas lipase secara kualitatif pada media seleksi menunjukkan bahwa galur transforman P. pastoris yang diperoleh positif mensekresikan lipase rekombinan (CALB) dan memiliki aktivitas lipolitik. Uji aktivitas lipase secara kuantitatif dari salah satu galur transforman P. pastoris menunjukkan bahwa aktivitas enzim mencapai 6,35 Units/ml pada jam ke-48. Analisis protein dengan SDS-PAGE menunjukkan bahwa CALB berhasil diekspresikan secara ekstraseluler dengan ukuran sekitar 45 kDa.
Keyword: Candida antarctica lipase B, cellulose binding module, recombinant Pichia pastoris

Judul: Identifikasi dan Kloning Gen CalBsyn ke dalam Plasmid pJ912-AGα-RFP di Escherichia coli
Abstrak: Sistem tampilan permukaan khamir telah menjadi teknik yang semakin popular untuk rekayasa protein dan pembuatan pustaka protein. Protein heterolog yang ditampilkan pada permukaan sel khamir diekspresikan dalam bentuk fusi dengan suatu protein penahan atau protein permukaan. Protein CALB (Candida antratica Lipase B) yang disandikan oleh gen sintetik CalBsyn dapat ditingkatkan efektivitasnya melalui ekspresi pada permukaan sel khamir. Plasmid pJ912-AGα- RFP mengandung gen penyandi protein permukaan, AGα (Agglutinin-α) dan gen penyandi protein penanda ekspresi, RFP (Red fluorescent protein). Penelitian ini bertujuan untuk memperoleh konstruksi vektor pJ912-AGα-RFP-CalBsyn untuk ekspresi protein CALB rekombinan pada permukaan sel khamir Pichia pastoris melalui kloning gen CalBsyn ke dalam plasmid pJ912-AGα-RFP pada Escherichia coli. Gen CalBsyn tanpa sinyal sekresi natifnya diperoleh dari plasmid pJ912- CALB melalui amplifikasi PCR menggunakan pasangan primer mCalB-Sal-F dan mCalB-His-Sal-R. Gen mCalBsyn yang diperoleh berukuran panjang 1004 bp. Baik gen mCalBsyn maupun plasmid pJ912-AGα-RFP dipotong dengan enzim restriksi SalI, kemudian diligasi dan ditransformasi ke dalam E. coli dengan metode kejut panas. Transformasi menghasilkan 11 koloni transforman putatif yang selanjutnya dipurifikasi menjadi koloni-koloni tunggal. Analisis PCR dengan primer AOX1-F dan mCalB-His-Sal-R menunjukkan adanya 34 koloni tunggal dari klon yang dianalisis terindikasi positif membawa plasmid rekombinan pJ912-AGα-RFPCalBsyn.
Keyword: agglutinin-α, Candida antartica Lipase B, sistem tampilan permukaan khamir, Pichia pastoris

Judul: Analisa deret waktu curah hujan di Daerah Khusus Ibukota Jakarta
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui model deret Fourier yang dominan pada harmonik tertentu, guna menjelas- kan gambaran tentang musim untuk keperiodikan curah hujan bulanan setiap tahun, disamping itu ingin diketahui juga pengaruh korelasi diri dari setiap curah hujan bulanan dan rata-rata bergeraknya sebagai usaha untuk mengetahui ke- teraturan periodik atau menghilangkan keadaan yang eratik dari curah hujan bulanan. Bahan penelitian berupa data curah hujan bulanan yang dihimpun menjadi curah hujan tahunan, dari tahun 1953 sampai tahun 1977 atau selama 25 tahun. Dalam penelitian ini diambil data dari lima stasiun penakar hujan yang data- nya paling lengkap, masing-masing stasiun Jakarta Pusat, Kemayoran, Manggarai, Ragunan dan Jatipadang. Data diperoleh dari Badan Meteorologi dan Geofisika Jakarta. Hasil penelitian menunjukkan bahwa model yang dominan sebagai gambaran musim untuk keperiodikan curah hujan bulan- an setiap tahun adalah model deret Fourier untuk harmonik pertama, dari model diperoleh sari antaranya, diperkirakan bulan Februari akan terjadi curah hujan tertinggi dan bulan Agustus sebagai bulan dimana curah hujan terendah setiap tahun. Di stasiun penakar Jakarta Pusat, Kemayoran dan Manggarai terjadi tiga bulan kering secara berturut-turut pada bulan Juli, Agustus dan September. Sedangkan bulan basah mulai bulan Januari sampai Mei dan bulan Oktober sampai bulan Desember, kecuali di stasiun penakar Kemayoran pada bulan November dan Desember. Di stasiun Ragunan dan Jatipadang diharapkan tidak akan terjadi bulan kering, sedangkan bulan basah terjadi mulai bulan Januari sampai Juni dan bulan Oktober sampai Desember. Perbedaan antara musim hujan dan kemarau lebih jelas nampak untuk daerah-daerah bagian selatan kota atau di- Ragunan dan Jatipadang, kemudian semakin berkurang untuk daerah-daerah Manggarai dan Jakarta Pusat, sedangkan di- Kemayoran perbedaan antara kedua musim paling kecil. Curah hujan pada suatu bulan tertentu ada hubungannya dengan curah hujan pada bulan berikutnya, hubungan ini semakin berkurang dengan curah hujan pada bulan berikutnya lagi, kemudian dengan curah hujan pada bulan ketiga hubungannya sudah tidak ada. Gambaran fluktuasi curah hujan bulanan memperlihatkan pola yang teratur setelah dilakukan perataan (pemulusan) terhadap rata-rata bergerak curah hujan bulanan pada periode tiga bulan.
Keyword: Rainfall, model deret Fourier, Meteorologi, Geofisika