Judul: Studi tentang keadaan pasang surut dengan melakukan analisis harmonik menggunakan metoda admiralty di Perairan Teluk Pelabuhan Ratu Kabupaten Sukabumi Jawa Barat
Abstrak: Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui konstanta harmonik pasut dan jenis pasut di Teluk Pelabuhan Ratu, mengetahui pengaruh faktor-faktor astronomi terhadap pasut serta mengetahui penyimpangan antara data hasil pengamatan dengan hasil prediksi menggunakan metoda Admiralty. Penelitian ini dilakukan di 3 stasiun. Stasiun 1 di Desa Cibangban dan stasiun 2 di depan TPI Pelabuhan Ratu pengamatan dilakukan selama 29 hari. Sedangkan stasiun 3 di Desa Loji selama 15 hari. Alat yang digunakan adalah rambu pasut (palm staff). Data ketinggian air dianalisis berdasarkan teori harmonik dengan menggunakan metoda Admiralty. Teori harmonik untuk menganalisis pasut menggunakan anggapan bahwa kurva pasut mempunyai kecenderungan yang sama dengan kurva sinusoidal. Karena itu sebelum diolah dengan metoda Admiralty, data ketinggian air mengalami beberapa penyesuaian. Proses penyesuaian terhadap data. ketinggian air berpengaruh cukup besar terhadap fase komponen perairan dangkal (M4 dan MS4). Tetapi pengaruh tersebut relative ..dst
Keyword: 

Judul: Pemodelan hidrodinamika pasut di Teluk Pelabuhan Ratu untuk komponen pasut M2 dan K1
Abstrak: Kajian mengenai dinamika perairan sangat penting dikembangkan untuk menunjang perencanaan dan pengelolaan lingkungan perairan mengingat dinamika pasut di Teluk Pelabuhan Ratu serta pengaruhnya terhadap dinamika pantai tidak banyak diketahui, sehingga dengan adanya penelitian ini akan memberikan informasi mengenai dinamika pasut (arus pasut, cophase, co-range) yang dapat digunakan sebagai bahan referensi bagi penelitian oseanografi selanjutnya, seperti studi analisis dampak lingkungan (AMDAL), mengetahui hubungan arus dengan distribusi plankton serta transpor sedimen di Teluk Pelabuhan Ratu. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui dinamika pasut di Teluk Pelabuhan Ratu untuk komponen pasut M2 dan K1 dengan pendekatan numerik, yaitu dengan menggunakan metode beda hingga eksplisit. Daerah model perairan Teluk Pelabuhan Ratu merupakan model perairan semi tertutup yang berbentuk empat persegi panjang dengan luas 516.25 km² yaitu pada posisi 6° 57'-7° 11' 50" LS dan 106° 23' 50" 106° 32' 50" BT. Batas terbuka daerah model dimulai dari - dekat Sungai Cibareno sampai Ujung Karangcapis, sedangkan untuk batas tertutup adalah sepanjang pantai Teluk Pelabuhan Ratu. Daeralı model dibagi ke dalam 35x 59 sel yang berbentuk matriks dengan sisi sel (grid) Ax = Ay = 500 m. Pemodelan hidrodinamika pasut di Teluk Pelabuhan Ratu dilakukan untuk 6 hari simulasi (518400 detik) yang dimulai pada tanggal 1722 Juni 1991 untuk masing-masing komponen pasut M2 dan K1. Data masukan untuk keperluan pemodelan ini adalah data pasut pada batas terbuka yang berasal dari model ORI.96, data batimetri, data koefisien viskositas eddy horizontal dan data koefisien gesekan dasar yaitu sebesar 0,003 yang merupakan nilai r yang umum digunakan dalam komputasi (Ramming and Kowalik, 1980). Untuk keperluan verifikasi digunakan ramalan data pengamatan pasut di dua stasiun untuk komponen pasut M2 dan K1, yaitu stasiun Cibangban dan stasiun TPI pada tanggal 17 Juni 16 Juli 1991.
Keyword: 

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA