Judul: Analisis keragaman genetik daerah D-Loop DNA mitokondria ayam hutan hijau (Gallus varius)
Abstrak: Analisis keragaman genetik dilakukan pada 30 sampel ayam hutan hijau. (Gallus varius) yang berasal dari Jawa Timur, Bali dan Lombok dengan menggunakan teknik PCR-RFLP. Sebagai pembanding (outgroup) digunakan ayam hutan merah (Sumatera dan Sulawesi) dan beberapa jenis ayam lainnya (ayam pelung, ayam kedu, ayam ras petelur dan ayam kampung). Amplifikasi daerah. D-loop mtDNA ayam dilakukan dengan menggunakan sepasang primer, yaitu L16750 (5'-AGGACTACGGCTTGAAAAGC-3' yang menempel pada tRNA Glutamic acid) dan H1255 (5'-CATCTTGGCATCTTCAGTGCC-3' yang menempel pada tRNA Phenylalanine). Hasil amplifikasi tersebut selanjutnya dipotong dengan menggunakan lima enzim restriksi pemotong empat basa, yaitu: Alu I (AGICT), Hae III (GG CC), Hpa II (CCGG), Mbo I (GATC) dan Rsa I (GTAC). Amplifikasi daerah D-loop pada ayam hutan hijau menghasilkan dua macam ukuran fragmen DNA yang berbeda. Fragmen DNA berukuran 1322 pasang basa (pb) ditemukan pada hampir semua ayam hutan hijau dari ketiga daerah yang berbeda, sedangkan fragmen DNA berukuran 1381 pb hanya ditemukan pada dua sampel ayam hutan hijau (Jawa Timur dan Bali). Analisis dengan menggunakan teknik PCR-RFLP hanya menghasilkan dua macam haplotipe. Hampir semua ayam hutan hijau memiliki haplotipe 1, sedangkan haplotipe II hanya dimiliki oleh ayam hutan hijau yang berasal dari Lombok (satu sampel). Pada kelompok pembanding, ukuran fragmen DNA teramplifikasi yang dihasilkan adalah 1322 pb, dengan pola pita hasil pemotongan berdasarkan analisis PCR-RFLP adalah haplotipe II. Ayam hutan hijau yang berasal dari Lombok (satu sampel) diduga berasal dari induk yang mengalami proses perkawinan campuran dengan ayam hutan merah atau jenis ayam lainnya. Penelitian lebih lanjut dengan menggunakan teknik PCR-Sequencing diharapkan dapat mengungkapkan secara terperinci keragaman genetik intraspesies pada ayam hutan hijau yang ada di Indonesia.
Keyword: Gallus varius, Mitochondrial DNA, D-Loop, Genetic differences, Green jungle fowl

Judul: Genetic Structure of Gallus varius in Lombok, Sumbawa, Java, and Madura Based On mtDNA Control Region Middle-Lower Section
Abstrak: Ayam hutan hijau (Gallus varius Shaw 1798) adalah salah satu spesies burung terestrial yang diklasifikasi ke dalam ordo Galliformes, famili Phasianidae dan bergenus Gallus. Gallus varius merupakan spesies ayam hutan endemic Indonesia yang persebaran alaminya terdapat di pulau Jawa, Madura, Bawean, Kangean, Bali dan di Kepulauan Sunda Kecil. Spesies ini tercatat memiliki nilai keragaman genetik yang tinggi, berdasarkan informasi genetik dari mtDNA. Informasi genetik dari mtDNA yang banyak digunakan untuk mendeskripsikan keragaman genetik dari G. varius adalah bagian ujung 5’ dari control region. Bagian-bagian lain dari mtDNA masih terbatas penggunaannya untuk mendeskripsikan keragaman genetik dari spesies ini. Sehingga, penggambaran keragaman genetik G. varius masih terbatas, padahal spesies ini mempunyai endemisitas yang unik yang terletak pada daerah persebarannya yang tidak terbatas di satu area (pulau). Naiknya popularitas dari G. varius di mata masyarakat sebagai hewan peliharaan dan sebagai salah satu indukan untuk pembentukan breed ayam lokal, menyebabkan meningkatnya perburuan terhadap spesies ini di alam liar sehingga sumberdaya genetik dari G. varius di setiap daerah persebarannya menjadi terancam. Oleh karena hal tersebut, penelitian ini bertujuan untuk mendeskripsikan variasi dan struktur genetik dari G. varius di Lombok, Sumbawa, Jawa dan Madura berdasarka sekuen DNA control region bagian middle-lower. DNA genom diekstraksi dari ujung calamus bulu G. varius menggunakan kit ekstraksi DNA untuk jaringan, kemudian sekuen DNA control region bagian middle-lower diamplifikasi dan disekuensing menggunakan dua pasang primer yang didisain dari G. varius (NC_007238.1). Tiga belas pasang basa (pb) variasi nukleotida ditemukan dengan nilai keragaman nukleotida 0,0021. Terbentuk tujuh haplotipe antara G. varius sampel dan referensi, dengan nilai keragaman haplotipe 0,7692 dan terdeteksi 5 haplotipe spesifik dan 2 haplotipe bersama (shared haplotype). Keanekaragaman haplotipe yang tinggi, dapat terjadi karena berbagai faktor, seperti ukuran populasi, waktu generasi, dan keragaman genetik nenek moyang (ancestor) atau generasi sebelumnya. Terdapatnya kemungkinan G. varius terdiri dari lebih dari 1 subspesies berdasarkan jarak genetik yang ada, dan juga adanya differensiasi populasi pada G. varius berdasarkan hasil konstruksi network haplotipe.
Keyword: control region, Gallus varius, keragaman haplotipe, middle-lower

Judul: Elektrodeposisi Film Tipis Semikonduktor Cu2ZnSnS4 (CZTS) pada Substrat Kaca ITO
Abstrak: Semiconductor Cu2ZnSnS4 (CZTS) thin film that can be used as absorber layers on solar cell module was made via electrodeposition method. CZTS thin film was electrodeposited on the surface of a silicate glass coated with a thin layer of indium tin oxide (ITO). Deposition process was done using potentiostatic mode at room temperature with a potential of 1.05 V for 30, 45, and 60 minutes, followed with annealing the film at 2 different temperatures, 500 ºC using furnace and 180 ºC using hot plate, both treatments for 45 minutes in N2/H2S atmosphere. The X-ray difractograms were analyzed using Match 2 program and showed that the CZTS thin films had kesterit crystalline structure, with a low percentage of CZTS phase. The thin film also contained secondary phases such as Cu2S, ZnS, and SnS. The obtained CZTS thin films had a thickness between 1.039 and 1.676 μm. Absorption study showed that the band gap energy of CZTS thin films which was annealed using furnace ranged from 1.50 to 1.52 eV, whereas that annealed using the hot plate was not observed. The band gap energy value showed that CZTS thin films can be used as sunlight absorber layers on solar cell. The formation of CZTS crystal film on this investigation was effectively performed using furnace annealing process at a temperature of 500 ºC with deposition time of 45 minutes.
Keyword: Thin film, Electrodeposition, Cu2ZnSnS4