Judul: Simulasi Refolding Protein 2PTL menggunakan Not Just Another Molecular Dynamics Program (Namd).
Abstrak: Memahami bagaimana proses unfolding dan refolding protein masih menjadi tantangan utama dalam ilmu kehidupan. Salah satu protein yang dapat diamati yaitu protein 2PTL. Protein 2PTL membantu Peptostreptococcus magnus menghindari pertahanan inang melalui sifat pengikatan protein melalui interaksi rantai ringan kappa. Pada penelitian ini dilakukan simulasi dinamika molekul untuk protein 2PTL pada temperatur 500K selama 15 ns untuk simulasi unfolding dan temperatur 200K selama 30 ns untuk simulasi refolding. Dari penelitian ini diperoleh proses unfolding terjadi pada waktu 6.5 ns. Secara geometri, hasil analisis RMSD pada 500K meningkat hingga 7.059Å dan pada 200K mengalami penurunan sebesar 2.683Å. Tingkat kemiripan asam amino proses unfolding dengan struktur native sebesar 36.78%. Setelah dilakukan proses refolding pada 200K dilakukan juga pengecekan tingkat kemiripan asam amino dengan struktur native sebesar 62.264%.
Keyword: NAMD, protein 2PTL, refolding, simulasi dinamika molekul, unfolding

Judul: Pengaruh Mutasi Titik Terhadap Trayektori Unfolding Dan Refolding Protein 1gb1
Abstrak: Mekanisme pelipatan protein merupakan hal yang sangat penting untuk memahami berbagai proses biologi. Salah satunya adalah proses unfolding dan refolding protein 1GB1 yang telah termutasi pada salah satu residunya. Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari pengaruh mutasi titik terhadap dinamika proses unfolding dan refolding protein 1GB1 serta membandingkan trayektori unfolding dan refolding protein 1GB1 yang telah dimutasi dan tidak dimutasi. Penelitian ini dilakukan menggunakan metode simulasi dinamika molekul yang terdiri dari beberapa tahapan diantaranya preparasi dan mutasi protein, minimisasi, pemanasan atau pendinginan, ekuilibrasi, dan production run. Simulasi unfolding dilakukan pada suhu 500 K selama 2 ns dan refolding pada suhu 200 K selama 20 ns. Mutasi titik yang dilakukan mengakibatkan meningkatnya kestabilan termal protein sehingga protein mutan membutuhkan waktu lebih lama baik untuk denaturasi maupun kembali ke native state. Proses unfolding dan refolding protein memiliki trayektori yang berbeda, simulasi refolding membutuhkan waktu yang jauh lebih panjang daripada simulasi unfolding agar struktur protein dapat kembali ke keadaan awal (native state).
Keyword: mutasi titik, protein 1GB1, refolding, simulasi dinamika molekul, unfolding

Judul: Persepsi seniman lukis tradisi Bali terhadap konservasi burung
Abstrak: Ada kecenderungan bahwa jenis dan populasi burung di Bali semakin menurun dari tahun ,ke tahun. Padahal burung sebagai satu komponen dari keanekaragaman hayati mempunyai peranan penting dalam memelihara keseimbangan ekosistem alam. Kepunahan satu (apalagi banyak) jenis burung akan menimbulkan gangguan pada sistem ekologis lingkungan. Karena itu upaya untuk melestarikan burung harus ditingkatkan guna menekan agar laju penurunan jenis dan populasi burung dapat ditekan seminimal mungkin. Seniman lukis tradisi Bali adalah satu potensi yang dapat dijadikan "ujung tombak" dalam upaya meningkatkan partisipasi masyarakat terhadap konservasi burung, sebab (1) seniman mempunyai kedudukan yang cukup dihormati dalam sistem sosiobudaya di Bali; (2) apresiasi seniman terhadap burung biasanya lebih tinggi dibanding kelompok masyarakat lain; (3) seni lukis tradisi sebagai seni budaya tumbuh dan berkembang seiring dengan proses seleksi, adaptasi dan evolusi pada ekosistem alam serta ekos istem sos ial; ( 4) karya lukis dari seniman dapat menjadi media dalam pendidikan dan penyuluhan konservasi burung. Tetapi sebelum berperan sebagai ujung tombak, terlebih dahulu harus ada upaya untuk menelaah persepsi seniman lukis itu sendiri untuk mengetahui tingkat kesadaran dan pemahaman mereka terhadap konservasi burung sehingga pada saat berperan sebagai ujung tombak, mereka sudah mempunyai persamaan persepsi mengenai konservasi burung. Penelitian ini terutama berupaya mengungkap seberapa dalam persepsi seniman lukis tradisi Bali terhadap konservasi burung. Selain itu penelitian ini juga bertujuan mengetahui keadaan avifauna di desa tempat seniman bermukim dan berbagai peubah yang berpengaruh pada persepsi seniman terhadap konservasi burung. Penelitian dilakukan pada empat desa di Bali, yaitu Oesa Batuan, Desa Kamasan, Desa Kerambitan dan Oesa Mas (Ubud). Tiga komponen yang ditelaah adalah avifauna (burung yang terdapat pada desa tempat seniman bermukim), biotipe (tipe habitat tempat burung hidup) dan persepsi seniman terhadap konservasi burung. Data primer untuk avifauna dikumpulkan dpngan menggunakan metode IPA (Indices Ponctuels d'Abondance), untuk biotipe dikumpulkan dengan metode fisiognomi dan untuk persepsi seniman terhadap konservasi burung dikumpulkan melalui wawancara terhadap seniman terkemuka dan kuesioner yang diantar dari pintu-kepintu pada 21 seniman yang menganut gaya lukis Batuan, 21 seniman yang menganut gaya lukis Kamasan, 5 seniman yang menganut gaya lukis Kerambitan dan 41 seniman yang menganut gaya lukis Ubud.
Keyword: