Judul: Isolasi, Identifikasi dan Karakterisasi Gen Virulen Streptococcus agalactiae sebagai Kandidat Vaksin DNA
Abstrak: Salah satu masalah utama dalam budidaya ikan nila (Oreochromis niloticus) di Indonesia adalah penyakit akibat bakteri Streptococcus agalactiae. Vaksinasi merupakan cara yang paling efektif untuk mencegah dan melindungi penyakit tersebut. Vaksin DNA merupakan teknologi vaksin generasi ketiga berdasarkan antigen yang digunakan. Gen mga adalah DNA-binding protein yang mengaktivasi beberapa gen virulen untuk mengkode protein M, C5a peptidase dan protein Mga. Penelitian ini bertujuan untuk isolasi, identifikasi dan karakterisasi gen mga untuk mendukung pengembangan vaksin DNA. Isolat berbentuk coccus, Gram positif berhasil diisolasi dan diekstraksi dari ikan nila sakit. Berdasarkan gen penyandi 16S rRNA teridentifikasi sebagai bakteri S. agalactiae dengan kesamaan 97% (no. Aksesi GenBank EU075070.1). Gen mga S. agalactiae berhasil diisolasi dengan ukuran 1454 bp. Kloning gen ke vektor pGEM-T easy dan transformasi menggunakan sel kompeten Eschericia coli DH5α dengan metode heat shock berhasil dilakukan dan hasil sekuensing gen tersebut sesuai dengan sekuen gen target. Vektor pGEM-T easy dengan sisipan gen mga berhasil direstriksi menggunakan metode double digestion enzim Sal I dan Not I. Fragmen DNA telah berhasil dikloning ke vektor pMBA yang memiliki promoter β-actin ikan medaka sebagai pMBA-MGA. Analisis sekuen nukleotida berdasarkan primer M13 menunjukkan bahwa klon mengandung gen mga dengan 98% kesamaan terhadap M protein mga S. agalactiae (no. Aksesi GenBank CP003919.1). Peta plasmid telah berhasil digambar menggunakan program Snapgene 1.1.3. Konstruksi gen mga yang dikendalikan oleh promoter β-actin ikan medaka telah berhasil dibuat dan ini merupakan kandidat vaksin DNA untuk mengendalikan infeksi S. agalactiae pada ikan nila
Keyword: vaksin DNA, Streptococcus agalactiae, gen mga, Oreochromis niloticus

Judul: Kandidat vaksin potensial Streptococcus agalactiae untuk pencegahan penyakit Streptococcosis pada ikan nila (Oreochromis niloticus)
Abstrak: Bakteri S. agalactiae berhasil diisolasi dari ikan nila yang dibudidayakan di Waduk Cirata, Klaten dan beberapa perairan di Indonesia. Tujuan utama dari penelitian ini adalah mendapatkan vaksin yang dapat digunakan untuk mencegah penyakit Streptococcosis. Untuk mencapai sasaran utama dilakukan lima tahapan penelitian. Pertama melakukan pengujian karakteristik dan fenotipik S. agalactiae yang menginfeksi ikan nila. Hasil pengujian, diketahui bahwa S. agalactiae termasuk Gram positif, oksidatif fermentatif positif, katalase dan motilitas negatif, tumbuh baik pada media NaCl 6.5%, memiliki dua tipe hemolitik yaitu ß-hemolitik dan non- hemolitik. Kemampuan menghidrolisis gula kedua tipe bakteri bervariatif, bakteri tipe ß-hemolitik memiliki kemampuan menghidrolisis gula lebih banyak termasuk arabinose, sorbitol, lactose, trehalose dibandingkan dengan tipe non-hemolitik. Selain itu, perbedaan kedua tipe bakteri tersebut juga terletak pada kemampuan tumbuh pada media bile salt 40%. Berdasarkan pengujian fenotipik S. agalactiae dapat dikelompokan menjadi bakteri berkapsul yaitu diduga isolat N4M (2), N17O (4) dan isolat NK1 (5) dan bakteri non-kapsul yaitu isolat N3M (1) dan 3 (N14 Kedua, menganalisa keterkaitan antara karakteristik dengan patogenisitas S. agalactiae pada ikan nila. Setelah diuji pada 30 ekor ikan nila ukuran 15 g melalui penyuntikan intraperitonial sebanyak 0.1 ml/ekor ternyata bakteri tipe non-hemolitik lebih virulen dilihat dari kematian, munculnya gejala klinis, perubahan tingkah laku, perubahan patologi anatomi baik secara makroskopis maupun mikroskopis. Bakteri tipe non-hemolitik menyebabkan kematian setelah 6-24 jam sedangkan tipe ß-hemolitik baru menyebabkan kematian setelah 48 jam pasca injeksi. Perubahan pada gejala klinis ikan nila yang diinjeksi bakteri tipe non-hemolitik lebih cepat muncul (perubahan pola renang, respon terhadap pakan dan perubahan pada mata dan clear operculum) rata-rata muncul setelah 6 jam pasca injeksi dan 12 jam pada ikan nila yang diinjeksikan dengan bakteri tipe ß-hemolitik. Selain perubahan secara makroskopis, perubahan pada mikroskopis juga diamati. Perubahan yang terjadi pada pola renang dan perubahan pada mata, perubahan warna ditandai dengan adanya perubahan histologi organ mata, ginjal dan otak. Kesimpulannya adalah S. agalactiae tipe non-hemolitik lebih virulen dari tipe tipe ß-hemolitik. G), secara karakteristik fenotipik isolat S. agalactiae dari ikan, sapi dan manusia tidak berbeda.
Keyword: Streptococcus agalactiae, vaccination, pathogenicity, Oreochromis niloticus, Fisheries

Judul: Perbandingan Hierarchical Token Bucket dan Class Based Queuing untuk Pembatasan Bandwidth
Abstrak: The increased number of users is one of the factors that cause performance decrease in a network. A mechanism of bandwidth arrangement is needed to guarantee network performance level to user. There are few methods of Linux base bandwidth limitation that can be used such as Hierarchical Token Bucket (HTB) and Class Based Queuing (CBQ). The goal of this research is to discover which method is better. The metrics to compare both methods are throughput, jitter, and packet loss. From the experiment, it was discovered that CBQ resulted is higher bandwidth leakage than HTB. Also, the jitter and packet loss produced by CBQ is higher than HTB. We conclude that HTB has a better performance than CBQ.
Keyword: