Judul: Penerapan K-means pada Imbalanced Data untuk Klasifikasi Metagenom.
Abstrak: Metagenom merupakan studi DNA total dari sumber lingkungan yang diisolasi secara langsung. Metagenom didasari pada isolasi dan karakterisasi DNA dari sampel-sampel lingkungan tanpa diperlukannya budidaya dari mikroorganisme. Studi metagenom mengacu pada kandungan genomik dari ekosistem mikroba lengkap. Dikarenakan pada sampel mikroba yang digunakan terdapat bermacam-macam jenis organisme maka perlu dilakukan proses klasifikasi. Pada tahap proses klasifikasi metagenom umumnya terjadi permasalahan imbalanced data yang dapat mempengaruhi keakuratan hasil klasifikasi. Penelitian ini difokuskan untuk mengatasi masalah klasifikasi pada imbalance data pada metagenom dengan K-means sebagai metode clustering dan mengaplikasikan KNN (k-nearest neighbors) sebagai algoritme untuk klasifikasinya. Berdasarkan hasil penelitian ini dapat diketahui bahwa akurasi rata-rata kelas minoritas setelah dilakukan penyeimbangan data mengalami peningkatan sebesar 4,35% untuk k=1. Adapun akurasi rata-rata pada kelas minoritas untuk k= 3 dan k=5 setelah dilakukan penyeimbangan justru mengalami penurunan sebesar masing-masing sebesar 1,21% dan 6,77%.
Keyword: Clustering, DNA, imbalance data, Klasifikasi, KNN, K-means, Metagenom.

Judul: Implementasi map-reduce pada k-means untuk clustering metagenom
Abstrak: Metagenom merupakan DNA yang diperoleh langsung dari lingkungan. Kendala pada rekonstruksi DNA dari metagenom adalah bercampurnya fragmen DNA dari berbagai mikroorganisme serta besarnya ukuran data dari fragmen DNA yang didapat. Penelitian ini bertujuan melakukan pengelompokan untuk memisahkan fragmen DNA antar-mikroorganisme dengan metode k-means. Proses ekstraksi fitur dan clustering menerapkan model map-reduce untuk menangani besarnya ukuran data dari fragmen DNA. Penelitian ini menggunakan metode k-mers frequency untuk ekstraksi fitur dan Euclidean distance untuk ukuran jarak antarfragmen. Evaluasi hasil clustering diukur dengan indeks Davies-Bouldin dan purity. Hasil implementasi map-reduce dievaluasi dengan ukuran speedup. Evaluasi hasil clustering pada dataset yang digunakan menunjukkan pengelompokan dengan 3 cluster dan ekstraksi fitur 3-mer memiliki nilai indeks Davies-Bouldin terbaik yaitu 2.4413. Nilai purity dari hasil clustering tersebut ialah 0.6936 pada tingkat genus. Speedup rata-rata yang diperoleh dari implementasi map-reduce mendekati nilai 3.
Keyword: Euclidean distance, k-means, k-mers frequency, map-reduce, metagenome

Judul: Perdagangan Karet Spesifikasi Teknis antara Thailand dan China
Abstrak: Thailand and China play important roles in the trade of natural rubber because both countries are respectively the biggest exporter and importer of natural rubber in the world. However, there are many problems such as supply shortage of natural rubber to meet the demand for natural rubber and unstable prices. Therefore, it is necessary to examine how the behaviors of both countries affect the supply, demand and price of natural rubber in international trade in particular technical specified rubber (TSR) where this type of rubber have the greatest amount traded between the two countries. This study has two main objectives that include the following: (1) to analyze the factors that influence the export supply, import demand and price for technical specified rubber in Thailand and China, and (2) to analyze the impact of internal factors and external factors alteration to the export supply, import demand and price for technical specified rubber in Thailand and China. This study used econometric analysis and implemented two stage least squares (2SLS) method and simultaneous equation model and used time series secondary data from 1990 to 2010. The results showed that: (1) Thailand’s supply for TSR exports to China was influenced by amount of TSR Thailand export to China in previous year and amount of TSR Thailand production, while Thailand’s supply for TSR exports to non-China was influenced by amount of TSR Thailand production and amount of TSR Thailand exports to China, (2) China’s demand for TSR imports of Thailand influenced by China’s participation in WTO, amount of automotive production in China and China’s real price import of TSR, while China’s demand for TSR imports of non-Thailand influenced by amount of China’s TSR imports from non-Thailand in previous year, amount of automotive production in China and import tariff in China, and (3) world TSR real prices was influenced by world TSR real price in previous year, amount of exports supply of the world in previous year and amount of imports demand of the world, while real price TSR exports of Thailand was influenced by world TSR real price, amount total of TSR Thailand exports and USA fuel real price, while real price TSR import of China was influenced by world TSR real price ratio and real price TSR import of China in previous year. Historical simulation and forecasting simulation results show that increased production quantities of TSR policy in Thailand and abolition of import tax of TSR policy in China performed within TSR rubber trade between Thailand and China because it enabled to increase foreign exchange for Thailand's technical specified rubber exports.
Keyword: shortage, unstable prices, 2SLS, technical specified rubber, WTO