Judul: Free Energy from COM Pulling for Membrane Fusion of Human Immunodeficiency Virus Type 1 (HIV-1)
Abstrak: HIV-1 menginfeksi sel target melalui fusi membran dan memediasi sel dengan glikoprotein. Protein gp41 yang sudah terintegrasi dengan membran target akan melipat kembali membentuk 6 bundel heliks bersama protein gp120. Pelipatan kembali struktur protein dapat dicegah menggunakan inhibitor sehingga proses 6 bundel heliks tidak terbentuk. Inhibitor masih bersaing dengan protein dalam hal pelipatan struktur, sehingga perlu dicari besaran energi yang mewakili pelipatan protein. Energi bebas diperoleh dari tarikan COM mewakili kerja yang dilakukan protein untuk melipat kembali. Energi bebas hasil simulasi bernilai -82.4 kJ mol-1 dan energi bebas varian covNHR memiliki nilai sebesar -75 kJ mol-1 dan -45 kJ mol-1. Karakteristik termodinamika dan spektrum UV pada varian covNHR-VQ memiliki afinitas pengikatan yang tinggi serta interaksi yang kuat terhadap peptida protein gp41, sedangkan covNHR-ER memiliki basis pengikatan dan interaksi lebih lemah dibanding covNHR-VQ. Varian covNHR-VQ memiliki nilai energi bebas mendekati energi bebas tarikan COM, sehingga varian memiliki interaksi yang kuat ketika energinya mendekati energi bebas tarikan. Aktivitas inhibitor mencegah protein terlipat kembali sehingga performa pencegahan yang baik yaitu saat energinya bernilai sama atau lebih dari energi saat protein tersebut terlipat. Energi bebas dapat didekatkan sebagai parameter dalam menganalisis interaksi antara inhibitor dengan protein gp41., HIV-1 infects cell through membrane fusion and mediates cell with glycoproteins. The gp41 protein has been integrated with target membrane will be refolding form. Protein folding structure can be prevented using inhibitors. Inhibitor competes with protein in folding structure, so have to find the energy that represents protein folding. Free energy obtained from COM pulling represents the work that protein does refold back. Free energy of simulation results is -82.4 kJ mol-1 and free energy of covNHR variant has a value of -75 kJ mol-1 and -45 kJ mol-1. The thermodynamics and UV spectrum characteristics of covNHR-VQ have a high binding affinity and strong interaction than covNHR-ER. covNHR-VQ has free energy close to free energy from COM puling, and variant has strong interaction when the energy apporaches free energy pulling.
Keyword: COM Pulling, Free Energy, gp41 Protein, HIV-1

Judul: Model Matematika Struktur Umur Infeksi Virus HIV dengan Kombinasi Terapi Obat
Abstrak: Human Immunodeficiency Virus (HIV) adalah virus yang menyerang sel darah putih sebagai sistem kekebalan tubuh manusia. Waktu yang dilewati virus sejak masuk ke dalam sel darah putih sehat disebut dengan umur infeksi. Dari struktur umur infeksi inilah dibentuk suatu model matematika. Walau belum ditemukannya obat secara total bagi penderita HIV, namun berbagai macam terapi obat terhadap virus HIV telah banyak digunakan, diantaranya kombinasi terapi obat Reverse Transcriptase Inhibitor (RTI) dan Protease Inhibitor (PI) serta Entry Inhibitor (EI) dan Protease Inhibitor (PI). Dalam penelitian ini, model struktur umur infeksi virus HIV tanpa dan dengan kombinasi terapi obat dikaji dan dibandingkan melalui Bilangan Reproduksi untuk melihat pengaruh terapi terhadap populasi virus. Dampak kombinasi terapi dan perbandingan keefektifan dua kombinasi terapi dapat diketahui dengan mengkaji Bilangan Reproduksi R dan populasi virus V pada model struktur umur infeksi virus HIV dengan kombinasi terapi obat. Penelitian ini mengkaji tiga model matematika yakni Model I (tanpa terapi Obat), Model II (kombinasi terapi obat RTI dan PI) dan Model III (kombinasi terapi obat EI dan PI).
Keyword: 

Judul: Budidaya lisianthus [Eustoma grandiflorum (Raf.) Shinn.] di Bali Rose, PT. Mid Duta International, Mayungan, Bali
Abstrak: Lisianthus termasuk salah satu jenis bunga potong yang cukup populer. Lisianthus memiliki penampilan bunga yang menarik, namun tanaman ini masih sedikit dibudidayakan di Indonesia. Hal ini menarik minat penulis untuk melaksanakan magang di Kebun Bali Rose. Magang mulai dilaksanakan pada tanggal 11 Februari 2009 hingga 27 Juni 2009 di Bali Rose, PT. Mid Duta International di Banjar Mayungan, Desa Antapan, Kecamatan Baturiti, Kabupaten Tabanan, Bali. Tujuan dari magang ini adalah mempelajari teknik budidaya tanaman Lisianthus yang dikembangkan di Bali Rose, serta meningkatkan pengetahuan dan keterampilan penulis dalam kegiatan budidaya serta manajemen kebun.
Keyword: