Judul: Polymorphisms of calpastatin (CAST) gene and it’s association with growth trait and carcass quality in local sheep
Abstrak: Domba lokal adalah salah satu sumber daya genetik yang sangat potensial untuk dikembangkan. Hal ini disebabkan domba lokal memiliki beberapa kelebihan yakni bersifat prolifik, daya adaptasi terhadap lingkungan dan penyakit yang lebih tinggi, siklus produksi relatif lebih singkat serta relatif sedikit membutuhkan modal. Selain itu, di beberapa daerah yang padat penduduknya seperti pulau Jawa, daging domba mampu mensubstitusi sebagian daging sapi yang masih harus diimpor setiap tahun. Nilai karkas domba sangat dipengaruhi oleh total produksi daging, distribusi dan proporsi daging pada karkas. Gen kalpastatin (CAST) diketahui memiliki hubungan dengan sifat kualitas karkas dan daging pada ternak. Kalpastatin terlibat dalam beragam proses fisiologi dalam tubuh ternak seperti pengaturan turn over protein, pertumbuhan, fusi dan migrasi mioblast. Diduga keragaman gen CAST mempunyai hubungan dengan pertumbuhan dan potensial digunakan sebagai marka gen untuk sifat pertumbuhan pada ternak. Kalpastatin berperan dalam menghambat fungsi enzim kalpain yang terlibat dalam mengatur turn over protein dan pertumbuhan. Penelitian ini terbagi dalam tiga tahapan yaitu 1). Identifikasi keragaman gen CAST pada populasi domba lokal, 2). Hubungan keragaman gen CAST dengan sifat pertumbuhan pada domba lokal, 3). Hubungan keragaman gen CAST dengan kualitas daging dan karkas domba lokal. Metode PCR-SSCP digunakan pada penelitian tahap pertama untuk mengidentifikasi variasi pada gen CAST. Sebanyak 401 ekor domba lokal dari 8 sub populasi digunakan dalam penelitian ini, tiga group merupakan Domba Ekor Tipis (DET) dari Sukabumi, UP3J Jonggol dan Kissar, sedangkan sisanya antara lain domba Priangan dari Margawati dan Wanaraja serta Domba Ekor Gemuk (DEG) dari Donggala, Sumbawa dan pulau Rote. Pada tahap kedua, sebanyak 157 ekor DET yang dikelompokkan berdasarkan genotipe gen CAST dipelihara selama tiga bulan dan diukur parameter pertumbuhannya seperti bobot badan, PBB harian serta ukuran morfometriknya. Pada tahap ketiga sebanyak 33 ekor DET yang mewakili tiga genotipe CAST-11, CAST-12 dan CAST-22 diidentifikasi kualitas karkas dan dagingnya.
Keyword: 

Judul: Identifikasi Keragaman Gen Calpastatin (CAST-NcoI) dengan Teknik PCR-RFLP pada Domba Lokal Indonesia
Abstrak: Domba lokal di Indonesia memiliki beberapa keunggulan, yaitu mampu bertahan pada iklim tropis, bersifat prolifik, tidak mengenal musim kawin, tahan terhadap beberapa macam penyakit dan parasit. Namun, produktivitas domba lokal masih cukup rendah terutama sifat pertumbuhan dan kualitas daging. Salah satu upaya seleksi dilakukan untuk meningkatkan produktivitas domba lokal yaitu berdasarkan pada penciri DNA yang dikenal dengan Marker Asissted Selection (MAS). Gen calpastatin merupakan gen yang berfungsi menghambat degradasi protein sel-sel otot. Pada mamalia, gen calpastatin diduga memiliki keterkaitan dalam sifat pertumbuhan otot dan keempukan daging. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi keragaman gen calpastatin pada domba lokal . Sampel DNA yang digunakan dalam penelitian ini berjumlah 232 sampel, yang terdiri dari Domba Ekor Tipis (DET) Jonggol (38), DET Rote (25), domba Garut Ciomas (25), domba Garut Margawati (23), domba Garut Wanaraja (25), Domba Ekor Gemuk (DEG) Indramayu (25), DEG Madura (25), DEG Donggala (25), dan DEG Sumbawa (21). Amplifikasi gen calpastatin dilakukan dengan teknik PCR, sedangkan untuk menentukkan genotipenya dilakukan dengan teknik Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) menggunakan enzim restriksi NcoI. Analisis data dilakukan dengan menghitung nilai frekuensi alel dan frekuensi genotipe.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: