Judul: In Silico Study: The Potential of Kaffir lime leaves  (Citrus hystrix) as an Alternative to Antibiotic Growth Promoter (AGP) in Broiler  Chickens
Abstrak: Ayam broiler merupakan ternak yang rentan terinfeksi mikroorganisme pa togen, sehingga banyak peternak menggunakan Antibiotic Growth Promoter (AGP). AGP merupakan imbuhan pakan yang diberikan untuk memacu pertum buhan dan memperbaiki saluran pencernaan, namun kini sudah dilarang penggunaannya. Pelarangan AGP menyebabkan peralihan penggunaan imbuhan pakan seperti imbuhan pakan fitogenik. Daun jeruk purut (Citrus hystrix) mem iliki senyawa aktif metabolit sekunder sehingga berpotensi untuk dijadikan im buhan pakan fitogenik. Penelitian ini bertujuan menganalisis potensi senyawa ak tif daun jeruk purut dengan melihat berbagai aktivitas biologi dan kemampuan dalam menghambat bakteri E. coli dan S. aureus menggunakan metode in silico. In silico merupakan metode komputasi yang digunakan untuk memprediksi kiner ja senyawa aktif suatu bahan. Senyawa aktif yang diperoleh berasal dari jurnal terindeks scopus, kemudian dilakukan pencarian kode SMILES, nilai probable activity (Pa), dan prediksi interaksi antara senyawa aktif dengan protein bakteri E.coli dan S.aureus. Hasil yang didapatkan yaitu 143 senyawa aktif memiliki kode SMILES dan 96 dari 143 senyawa aktif memiliki nilai Pa 0,300 pada ak tivitas antibakteri, antioksidan, penghambat glikosiltransferase peptidoglikan, antiinfeksi, imunomodulator, dan antiinflamasi sehingga berpotensi sebagai alter natif AGP. Daun jeruk purut juga mampu menghambat bakteri E. coli dan S. aureus secara in silico., Broiler chickens are livestock that are susceptible to infection with pathogenic microorganisms, so many farmers use Antibiotic Growth Promoter (AGP). AGP is a feed additive given to stimulate growth and improve the digestive tract, but its use is now prohibited. The prohibition of AGP has led to a shift in the use of feed additives such as phytogenic feed additives. Kaffir lime leaves (Citrus hystrix) have active secondary metabolite compounds that have the potential to be used as phytogenic feed additives. This study aims to analyzing the potential of the active compounds and the activity kaffir lime leaves by looking at various biological activities and abilited E. coli and S. aureus bacteria using the in silico method. In silico is a computational method used to predict the performance of the active compound of a material. The active compounds were obtained from scopus indexed journals, then searched for the SMILES code, probable activity (Pa) values, and predicted interactions between the active compounds and the proteins of E.coli and S.aureus bacteria. The results obtained were 143 active compounds had SMILES code and 96 of 143 active compounds had a Pa 0,300 value for antibacterial, antioxidant, peptidoglycan glycosyltransferase inhibitor, anti-infective, immunomodulatory, and anti-inflammatory so that it has the potential to be used as an alternative to AGP. Kaffir lime leaves are also able to inhibit E. coli and S. aureus bacteria in silico.
Keyword: antibiotik growth promoter, in silico

Judul: Effectivity of lime leaves (Citrus sp.) in inhibiting E. coli and S. aureus: A Meta-Analysis
Abstrak: Ayam broiler merupakan ternak yang rentan terinfeksi mikroorganisme patogen, sehingga banyak peternak menggunakan Antibiotic Growth Promoter (AGP). AGP merupakan imbuhan pakan yang diberikan untuk memacu pertumbuhan dan memperbaiki saluran pencernaan, namun kini penggunaan AGP sudah dilarang Pelarangan AGP menyebabkan peralihan penggunaan imbuhan pakan seperti imbuhan pakan fitogenik. Salah satu tanaman yang berpotensi untuk dijadikan sebagai imbuhan pakan fitogenik alternatif AGP adalah daun jeruk. Daun jeruk memiliki senyawa aktif metabolit sekunder. Banyak studi in vitro melaporkan tentang aktivitas daun jeruk terhadap bakteri E.coli dan S. aureus. Kedua bakteri tersebut umum ditemukan pada ayam broiler yang dapat mengganggu kesehatan dan performa ayam broiler. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan untuk mengintegrasikan berbagai studi agar diperoleh informasi yang komprehensif mengenai aktivitas daun jeruk terhadap bakteri E. coli dan S. aureus dengan studi meta-analisis. Penelitian ini dilakukan dengan mengumpulkan studi daun jeruk dari berbagai spesies, asal, metode ekstraksi, dan metode uji antibakteri yang berbeda dan membandingkan perlakuan daun jeruk dengan kontrol dalam menghambat bakteri E. coli dan S. aureus dengan melihat diameter zona hambat. Tahap pertama yang dilakukan yaitu mengintegrasikan 45 studi tentang uji daun jeruk terhadap bakteri E. coli dan 24 studi tentang uji daun jeruk terhadap bakteri S. aureus. Studi tersebut berasal dari Scopus, PubMed, Google Scholar, dan Crossref melalui software Publish or Persish. Artikel yang didapatkan kemudian diseleksi menggunakan software Mendeley dengan melihat judul dan abstrak. Data yang diperlukan dalam penelitian ini adalah kontrol dan perlakuan eksperimen (penambahan daun jeruk) yang meliputi nilai rerata, jumlah sampel, dan standar deviasi. Artikel yang memenuhi syarat tersebut kemudian ditabulasi dengan MS Excel 2010 dan dianalisis menggunakan software OpenMee dengan nilai effect size menggunakan Hedge’s d. Hasil penelitian menunjukkan bahwa daun jeruk sebagai imbuhan pakan fitogenik alternatif AGP efektif dalam menghambat bakteri E. coli dan S. aureus. Kemampuan daya hambat bakteri E. coli dan S. aureus dipengaruhi oleh perbedaan spesies daun jeruk, asal daun jeruk, dan metode ekstraksi, sedangkan perbedaan level dan metode uji antibakteri tidak berpengaruh terhadap daya hambat bakteri E. coli dan S. aureus. Ekstrak daun jeruk pada konsentrasi rendah 5 mg/ml sudah mampu menghambat bakteri E. coli, sedangkan dalam menghambat S. aureus memerlukan konsentrasi terendah 50 mg/ml., Broiler chickens are livestock that are susceptible to infection with pathogenic microorganisms. so that many breeders use antibiotic growth Promoter (AGP). AGP is a feed additive that is given to stimulate growth and improve the digestive tract, but now the use of AGP has been banned. The AGP ban has caused a shift in the use of feed additives such as phytogenic feed additives. One of the plants that has the potential to be used as an alternative phytogenic feed additive to AGP is citrus leaves. Citrus leaves have active secondary metabolites. Many studies in vitro reported on the activity of lime leaves against E. coli and S. aureus. Both of these bacteria are commonly found in broiler chickens which can interfere with the health and performance of broiler chickens. Therefore, this study aims to integrate various studies in order to obtain comprehensive information on the activity of lime leaves against E. coli and S. aureus with
Keyword: Escherichia coli, lime leaf, meta-anaysis, Staphylococcus aureus

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: