Judul: Potensi Cendawan Dark Septate Endophyte sebagai Agens Bioremediasi Residu Fungisida Berbahan Aktif Mankozeb
Abstrak: Mankozeb adalah kelompok fungisida ditiokarbamat yang paling banyak digunakan di lapangan. Penggunaan mankozeb yang tidak sesuai, dapat menyebabkan dampak negatif terhadap sistem produksi dan lingkungan pertanian. Bioremediasi merupakan salah satu metode yang menjanjikan untuk meminimalkan dampak negatif dari residu mankozeb. Bioremediasi adalah proses biologi dengan memanfaatkan mikroorganisme yang bersifat ramah lingkungan untuk menghilangkan polutan berbahaya. Cendawan dark septate endophyte (DSE) merupakan kelompok cendawan endofit yang mampu mengolonisasi akar tanaman tanpa menyebabkan penyakit, dan mampu beradaptasi pada lingkungan yang mengandung logam berat. Pemanfaatan cendawan DSE dalam mendegradasi fungisida mankozeb sampai saat ini belum dilaporkan. Penelitian ini bertujuan untuk memperoleh isolat cendawan DSE yang berasal dari lahan yang terkontaminasi akibat penggunaan mankozeb dan memiliki kemampuan dalam mendegradasi mankozeb. Penelitian terdiri atas dua tahap. Tahap pertama adalah pengambilan sampel tanaman cabai yang dilakukan di lahan pertanaman cabai yang telah terpapar oleh penggunaan mankozeb. Pengambilan sampel dilakukan di Kabupaten Bogor dan Cianjur, dari setiap kabupaten diambil tiga desa. Cendawan DSE diisolasi dari bagian akar tanaman cabai. Akar tanaman cabai yang telah disterilisasi diletakkan pada 50% media corn meal agar (CMA) dan diinkubasi dalam kondisi gelap pada suhu 25°C. Koloni cendawan yang terpilih adalah yang menunjukkan hifa berwarna gelap, kemudian dimurnikan dan ditumbuhkan pada media corn meal malt yeast agar (CMMYA), malt yeast agar (MEA), atau oat meal agar (OMA). Pengujian selanjutnya yaitu pengujian pertumbuhan cendawan DSE terhadap benih cabai. Tahap kedua dari penelitian ini yaitu pengujian kemampuan cendawan DSE untuk tumbuh dan toleransi terhadap media pertumbuhan yang telah diberi penambahan beberapa konsentrasi mankozeb. Pengujian dilakukan menggunakan media padat potato dextrose agar (PDA) dan media cair malt extract agar (MEB). Isolat yang terseleksi selanjutnya diuji kemampuannya untuk mendegradasi residu mankozeb pada media cair MEB. Analisis konsentrasi mankozeb yang tersisa diukur dengan menggunakan gas chromatography (GC). Analisis senyawa-senyawa metabolit dari isolat cendawan DSE terpilih menggunakan gas chromatography mass spectrometry (GCMS). Isolat cendawan DSE terpilih dilakukan identifikasi morfologi secara makroskopis dan mikroskopis. Berdasarkan hasil penelitian diperoleh sebanyak 13 isolat cendawan DSE dari akar tanaman cabai. Sembilan isolat cendawan DSE yang mampu memacu pertumbuhan benih cabai digunakan untuk pengujian selanjutnya. Lima isolat cendawan DSE yang mampu bertahan dan tumbuh baik pada media beracun (media PDA yang telah diberi penambahan konsentrasi mankozeb yaitu 100, 200, 400, dan 800 ppm) dipilih dalam pengujian selanjutnya berdasarkan pengukuran pertumbuhan miselium. Pengukuran biomassa cendawan DSE pada media cair MEB yang telah diberi konsentrasi mankozeb yaitu 100, 200, 400, dan 800 ppm, diperoleh dua isolat yang menunjukkan persentase penghambatan di bawah 50%, yaitu isolat MM12 dan MM15.1. Kedua isolat tersebut selanjutnya diuji kemampuannya dalam menurunkan konsentrasi mankozeb selama 14 hari periode inkubasi. Hasil penelitian menunjukkan isolat MM12 dan MM15.1 mampu menurunkan makozeb pada konsentrasi 100 ppm dengan persentase penurunan relatif masing-masing sebesar 59.54 dan 80.18 % selama 14 hari periode inkubasi. Hasil analisis senyawa metabolit menunjukkan kedua isolat cendawan DSE menghasilkan beberapa senyawa metabolit yang berfungsi sebagai antimikrob dan antioksidan seperti Gamma.-Sitosterol, Cyclo (L-prolyl-L-valine), Stigmasta-3,5-diene. Hasil analisis senyawa metabolit dengan perlakuan media pertumbuhan yang diberi konsentrasi mankozeb menunjukkan senyawa-senyawa metabolit yang berbeda dengan perlakuan tanpa pemberian mankozeb. Isolat MM15.1 menghasilkan senyawa beta.- Sitosterol, yaitu senyawa yang
Keyword: degradasi, ditiokarbamat, GCMS, hambatan pertumbuhan relatif, senyawa metabolit

Judul: Exploration of Dark Septate Endophyte (DSE) Fungi from Oil Palm Roots as Biocontrol Agents of Ganoderma boninense
Abstrak: Ganoderma boninense adalah salah satu patogen utama yang menghambat produktivitas kelapa sawit di Indonesia. Keparahan infeksi cendawan G. boninense pada tanaman kelapa sawit di Indonesia yang telah dilaporkan paling besar mencapai 60% dengan luas area yang diserang lebih dari 50%. Infeksi G. boninense di Indonesia paling banyak dilaporkan terjadi di pulau Sumatera dan Jawa. Dampak infeksi cendawan G. boninense menyebabkan lahan kelapa sawit mengalami penurunan produktivitas hingga 85%. Berbagai upaya untuk mengendalikan infeksi G. boninense telah banyak dilakukan namun hingga saat ini belum ada teknik pengendalian yang efektif untuk mengendalikan G. boninense. Oleh karena itu pada penelitian ini dilakukan eksplorasi untuk mencari agens biokontrol potensial baru yang dapat menekan G. boninense. Salah satu kelompok cendawan yang belum banyak dilaporkan untuk mengendalikan G .boninense adalah dark septate endophyte (DSE). Cendawan DSE merupakan salah satu agens hayati yang berpotensi untuk digunakan dalam menekan penyebaran penyakit busuk pangkal batang. Penggunaan DSE telah terbukti menekan perkembangan patogen tular tanah lainnya, seperti Fussarium oxysporum, Rigidoporus microporus, G. boninense (in vitro). Salah satu mekanisme DSE sebagai agens pengendali hayati adalah menghasilkan metabolit sekunder yang bersifat toksik terhadap patogen. Penelitian ini bertujuan memperoleh isolat DSE dari perakaran kelapa sawit yang berpotensi sebagai agens pengendali hayati G. boninense dan menganalisis mekanisme kerja cendawan DSE dalam menghambat G. boninense. Penelitian ini terdiri dari empat kegiatan utama, yaitu: (1) pengamatan asosiasi antara cendawan DSE dan tanaman kelapa sawit dari sampel akar kelapa sawit dilapangan, (2) Isolasi dan karakterisasi DSE, (3) seleksi isolat cendawan DSE Potensial, (4) analisis senyawa metabolit sekunder yang dihasilkan oleh cendawan DSE. Pengamatan asosiasi pada sampel akar kelapa sawit dari lapangan dilakukan untuk melihat hubungan simbiosis cendawan DSE dan tanaman kelapa sawit di alam. Proses isolasi cendawan DSE dilakukan dari sampel akar kelapa sawit. Proses seleksi cendawan DSE dimulai dengan pengujian keamanan hayati yang meliputi uji fitopatogenisitas dan uji hemolisis darah. Selanjutnya isolat non patogen diuji lebih lanjut terkait kemampuannya dalam menghambat perkembangan G. boninense dan kemampuannya sebagai pemacu pertumbuhan. Hasil penelitian menunjukkan bahwa hubungan simbiosis antara tanaman kelapa sawit dan cendawan DSE terjalin secara alami, yang dibuktikan dengan adanya kolonisasi hifa dan struktur mikroskopis di dalam akar kelapa sawit yang diamati. Kolonisasi cendawan DSE banyak ditemukan pada tanaman yang terinfeksi G. boninense. Persentase kolonisasi cendawan DSE pada akar kelapa sawit berkisar 5-60%. Kolonisasi cendawan DSE dapat dipengaruhi oleh beberapa faktor, seperti teknik budidaya, suhu, dan curah hujan. Dari proses isolasi diperoleh 12 isolat cendawan DSE dari akar kelapa sawit. Cendawan DSE yang diperoleh pada penelitian ini sebagian besar diperoleh dari akar tanaman yang sehat dengan persentase isolasi total sebesar 1,71%. Berdasarkan hasil kolonisasi dan isolasi membuktikan bahwa cendawan DSE mampu membentuk simbiosis dengan akar kelapa sawit. Isolat cendawan DSE yang telah diperoleh diuji keamanannya dengan uji fitopatogenisitas dan helolisis. Berdasarkan hasil uji keamanan hayati, diperoleh empat isolat yang tidak patogen, yaitu S51, S14, GS2, dan GS3. Keempat isolat cendawan tersebut juga memiliki kemampuan untuk meningkatkan berat kering tanaman, panjang tajuk, dan panjang akar Brassica rapa sebesar 38-125%, 35-163%, dan 23-140%. Selain meningkatkan pertumbuhan tanaman keempat cendawan DSE memiliki aktivitas antibiosis dan aktivitas kitinolitik. Aktivitas antibiosis cendawan DSE ditunjukkan
Keyword: Antifungal agent, Cladophialophora nyingchiensis, Exophiala pisciphila, secondary metabolites

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: