Judul: Kondisi ekosistem terumbu karang di lokasi pengamatan desa Sumberkima, Kecamatan Gerogak, Kabupaten Buleleng, Propinsi Bali
Abstrak: Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui kondisi ekosistem terumbu karang dasarkan nilai Indeks Keanekaragaman (H'), Indeks Keseragaman (E), Indeks Dominansi (C) dan Indeks Mortalitas (MI) lifeform karang di Desa Sumberkima, kecamatan Gerogak, Kabupaten Buleleng, Propinsi Bali. Secara umum kondisi ekosistem terumbu karang di perairan Desa Sumberkima dalam keadaan yang kurang memuaskan. Hal ini ditandai dengan nilai Indeks Keanekaragaman (H") yang terdapat pada kedalaman 3 meter termasuk dalam kategori sedang kecuali pada Stasiun 3 mila Indeks Keanekaragaman (H') sangat kecil yaitu sebesar 0,11 sedangkan pada Stasiun 2 Indeks Keanekaragaman mencapai nilai tertinggi yaitu sebesar 2,5. Pada kedalaman 10 meter, Indeks Keanekaragaman (H') hampir merata di setiap stasiun yaitu dalam kategori sedang, Topi pada Stasiun 1 nilai Indeks Keanekaragaman (H') termasuk dalam kategori tinggi sebesar 2,76. Hal ni menunjukkan bahwa jumlah jenis terumbu karang yang terdapat di piran Desa Sumberkima sangat beranekaragam.. Pada kedalaman 3 meter nilai Indeks Keseragaman (E) rata-rata tergolong dalam kategori tinggi pada setiap stasiun, kecuali pada Stasiun 3 termasuk dalam kategori kecil yaitu sebesar 0,1. Kedalaman 10 meter, nilai Indeks Keseragaman (E) rata-rata bernilai tinggi dan nilai tertinggi terdapat pada Stasiun 2 sebesar 144. Hal ini menunjukkan bahwa terumbu karang yang ada di Desa Sumberkima dalam Jumlah individu setiap jenis karang tidak terlalu mendominasi. Nilai Indeks Dominansi (C) pada kedalaman 3 meter, tidak semuanya tinggi pada sesap stasiun kecuali pada Stasiun 3 nilai Indeks Dominansi (C) sangat tinggi sebesar 0,97, sedangkan pada kedalaman 10 meter nilai Indeks Dominansi (C) semuanya tergolong rendah xpai sedang. Nilai Indeks Dominansi tertinggi terdapat pada Stasiun 5 sebesar 0,52, Hal ni menunjukkan bahwa kecendrungan lifeform karang mendominasi peranan ekologis sangat Persentase penutupan karang hidup yang ada di setiap kadalaman termasuk rendah kecuali di beberapa stasiun. Tapi kondisi lokasi di perairan Desa Sumberkima ini masih bisa digunakan untuk tempat pertumbuhan dan perkembanagan terumbu karang Tingkat Kematian yang terdapat pada setiap stasiun rata-rata merupakan Tingkat Kematian yang tinggi kecuali pada beberapa stasiun tertentu seperti pada Stasiun 2 kedalaman meter. Karena pada stasiun tersebut hanya 0.01 Tingkat Kematiannya.
Keyword: Uniformity Index (E), Dominance Index (C), Mortality Index (MI, coral lifeforms

Judul: Studi Keterkaitan Keanekaragaman Bentuk Pertumbuhan Terumbu Karang dengan Ikan Karang di Sekitar Kawasan Perairan Pulau Ru dan Pulau Keringan Wilayah Barat Kepulauan Belitung.
Abstrak: Indonesia sebagai negara kepulauan yang secara geografis terletak di antara Samudera Pasifik dan Samudera Hindia memiliki kekayaan keanekaragamau hayati baik di darat maupun di laut. Sebagai negara tropis, Indonesia memiliki potensi sumberdaya perairan yang cukup besar. Salah satu sumberdaya alam perairan tropis yang penting dan memiliki potensi yang besar adalah kawasan terumbu karang. Teru~nbu karang memiliki nilai dan arti yang sangat penting baik dari segi ekologi laut maupun sosial ekonomi. Ditinjau dari segi ekologi laut, terumbu karang memiliki fungsi antara lain sebagai gudang keanekaragaman hayati, tempat tinggal sementara atau tetap, tempat mencari makan, berpijah, daerah asuhan dan tempat berlangsungnya siklus biologi, kimia, fisika secara global yang memiliki tingkat produktivitas yang sangat tinggi dan juga sebagai pelindung dari henlpasan gelombang (Suharsono, 1996). Dari segi sosial ekonorni, terunlbu karang memiliki nilai ekonomi yang sangat tinggi. Nilai perikanan karang di Asia Tenggara nlencapai 2,4 milyar dollar ASItlm. Sebagai tambahan terumbu karang sangatlah penting untuk pariwisata, tenega kerja, penelitian farmasi (Lauretta Burke, et.a1.,2002). Tujuan dari penelitian ini adalah untuk melihat profil terumbu karang berdasarkan persentase penutupan bentuk pertumbuhan karang, rnengetahui struktur kolnunitas ikan karang dilihat dari keanekaragaman, keseragaman, dan dominansi dan mengetahui ke&aan (preferensi) spesies-spesies ikan karang terhadap habitatnya. Pengambilan data dilaksanakan pada tanggal 28 Juli sampai dengan 8 Agustus 2002 di perairan Pulau Ru dan Pulau Keringan yang mempakan dua pulau dari serangkaian pulau yang terdapat di wilayah barat Kepulauan Belitung, Kabupaten Belitung, Provinsi Bangka Belitung. Pengarnatan biota karang sebagai komponen utama penyusun ekosistem terumbu karang dan berbagai organisme bentik lainnya dilakukan dengan metode transek garis menyinggung (line intercept transect). Pengamatan ikan karang meggunakan metode pencacahan visual (underwater visual census). Pengamatan terhadap ikan karang ini dilakukan pada siang hari ketika ikan karang pada umurnnya beraktifitas. Pengolahan dm analisa data bentuk pertumbuhan menggunakan persentase penutupan karang hidup. Untuk mengetahui keanekaragaman digunakan indeks Shannon, keseragaman dengan indeks keseragaman dail dominansi dengan indeks dominansi. Indeks mortalitas digunakan untuk mengetahui rasio kematian karang. Indeks kesamaan Bray-Curtis digunakan untuk menentukan pola pengelompokan habitat. Pola pengelompokan genus ikan karang ditentukan dengan menggunekan indeks kesamaan Dice. Analisis hubungan antara kondisi habitat dasar dengan ikan karang menggunakan ailalisa Nodul berdasarkan indeks konstansi dan indeks tidelitas. Pertumbuhan terumbu karang sangat dipengaruhi oleh faktor lingkungail yaitu faktor fisika dan kimia perairan. Dengan melihat parameter fisika dan kimia kita dapat melihat apakah terun~bu karang berada dalarn kondisi optimal bagi perturnbuhannya atau tidak. Parameter fisika darl kimia yang diukur adalah suhu, salinitas, pH, kecepatan arus dan kecerahan. Berdasarkan hasil pengamatan tipe terulnbu karang di Pulau Ru dan Pulau Keringan dikatagorikan sebagai terumbu karang tepi reen. Berdasarkan perhitungan persentase penutupan, kondisi bentuk pertumbuhan terumbu karang pada kedalaman 3 meter tergolong dalam kriteria buruk hingga sangat baik. Pada kedalaman 10 meter bentuk pertumbuhan teiumbu karang digolongkan dalam kriteria buruk hingga sedang. Indeks keanekaragaman (H') biota pengisi habitat dasar untuk kedalaman 3 meter mempunyai kisaran sedang hingga sangat tinggi dan untuk kedalaman 10 meter juga mempunyai kisaran sedang hingga sangat tinggi. Dari hasil perhitungan didapat kedalaman 3 meter keanekaraganlan bentai~g terumbu lebih beragam dan lebih baik dibanding pada kedalaman 10 meter karena nilai iildeks menunjukan angka yang lebih tinggi bagi
Keyword: 

Judul: Kloning dan Ekspresi Human Interferon-alfa2a pada Yeast Metilotropik Pichia pastoris
Abstrak: Interferon (IFN) is a group of proteins that are secreted by body cells as a result of exposure to biological vertebrates such as: viruses, bacteria, protozoa and other compounds. There are three types of interferon, namely: alpha (α), beta (β) and gamma (γ) IFN. Interferon-α2a belongs to the type I interferon. This protein has a molecular weight of 21.550 kDa and consists of 188 amino acids (23 amino acid of signal peptide and 166 amino acids of mature protein). Interferon-α2a is also known to be used for the treatment of hepatitis C and as anti-tumor and antivirus agents. Regulator gene for IFN production under normal conditions, is in the off position to IFN is not produced. But when there are external stimuli, both viral and bacterial infections, a regulator gene switches on, and IFN production system running. At the time of an attack from a variety of disease agents actually the body will produce IFN, but generally the amount produced is not sufficient to fight the disease agents that multiply very quickly. Therefore IFN intake from outside is needed. This is the beginning of the use of IFN as a drug. Genetic engineering is an activity to manipulate the genes to get new products by creating recombinant DNA through gene insertion. Recombinant DNA technology has been used to produce IFN. Yeast such as Pichia pastoris can be an alternative as the host (system) to express human interferon genes and as a producer of IFN protein. Expression system P. pastoris offers several advantages for the production of recombinant proteins, such as: the high level expression of recombinant proteins, ease of scaling-up fermenter, low cost and ease of transformation techniques and selection of transformed cells such as bacteria . The existence of inducible AOX1 promoter is very strong, easily control the expression of recombinant proteins by induction. AOX1 is a promoter that controls gene expression of alcohol oxidase to metabolize methanol as carbon source of P. pastoris. Therefore,this study aimed to clone human interefron-α2a (hifnα2a) gene in E. coli and express it in metylotrophic yeast P. pastoris. Vector used in this study is pPICZαB (Invitrogen). Ligation process between insert (hifn-α2a gene) and vector (pPICZαB) performed by using T4 DNA ligase, which functions synthesize the formation of phosphodiester bonds linking the nucleotides with nucleotide insert plasmid vectors to produce recombinant (pPICZαB-hifnα2a). This recombinant plasmid transformed into XL1 blue cells (E. coli) by Heat shock method. The results of sequencing analysis (clone 6) using 5'AOX and 3'AOX primers indicate that DNA base sequence of human IFN-α2a genes has been subclone into pPICZαB vector (in frame). Recombinant plasmid (clone 6) linearized using BstX1 enzyme before transformed into X33 yeast cell. Transformation into cell was done by Electroporation. The X33 cell P. pastoris strain was used to express human interferon-α2a. X33 is strains with the phenotype Mut+ (methanol utilization plus) and can be used for positive transformants selection using zeocin. Phase protein production work using Mut+ strain occurred in two phases. The first phase is the use of glycerol to obtain a certain amount of biomass (high cell
Keyword: