Judul: Deteksi dan identifikasi virus gemini pada tanaman tomat
Abstrak: Virus gemini merupakan salah satu patogen yang menyebabkan penyakit pada tanaman hortikultural di antaranya pada tanaman tomat. Anggota virus gemini dikelompokkan menjadi tiga subkelompok berdasarkan struktur genom, serangga vektor dan tanaman inang. Penelitian mengenai virus gemini asal tanaman tomat di Indonesia belum banyak dilaporkan oleh karena itu penelitian ini dilakukan dengan tujuan: (1) mengumpulkan sampel tanaman tomat yang diduga terinfeksi virus gemini, (2) mencoba teknik polymerase chain reaction (PCR) untuk mendeteksi keberadaan virus gemini, (3) mencoba teknik restriction fragment length polymorphism (RFLP) untuk melakukan analisis keragaman sampel, dan (4) menguji kisaran inang. Penelitian ini dilaksanakan sejak bulan November 1999 sampai dengan bulan Desember 2000 di Laboratorium Virologi Tumbuhan dan Rumah Kaca, Jurusan Hama dan Penyakit Tumbuhan, Fakultas Pertanian, Institut Pertanian Bogor.
Keyword: 

Judul: Karakterisasi molekuler virus gemini asal tanaman tomat
Abstrak: Virus gemini merupakan salah satu kelompok patogen utama yang menyerang dan menimbulkan kerusakan yang besar pada tanaman sayuran di daerah tropik dan sub tropik. Pada umumnya kerugian yang ditimbulkan oleh adanya suatu epidemi berkisar antara 30%-100%. Gejala tanaman tomat yang terinfeksi oleh virus gemini kadangkala mirip dengan gejala yang disebabkan oleh infeksi virus yang lain khususnya Potyviridae dan Tobamoviridae. Dengan demikian, gejala penyakit saja tidak cukup untuk digunakan dalam mengidentifikasi virus gemini. Pengetahuan tentang karakter molekuler virus gemini pada tanaman tomat yang bergejala menjadi sangat penting dalam mengidentifikasi virus gemini tersebut. Penelitian ini bertujuan untuk mengamati gejala luar, melakukan purifikasi virus dan mempelajari beberapa karakter molekuler virus gemini asal tanaman tomat. Karakter molekuler yang dipelajari meliputi ukuran dan jenis asam nukleat serta ukuran protein. Deteksi virus dengan metode polymerase chain reaction (PCR) dilakukan untuk memperkuat hasil analisis karakter molekuler. Isolat virus gemini asal tanaman tomat yang diperoleh dari daerah Bandung, Jawa Barat ditularkan dengan serangga vektor B. tabaci dari dan ke tanaman tomat. Gejala yang ditimbulkannya berupa penebalan tulang daun permukaan bawah, daun menggulung ke atas atau ke bawah, berkeriput dan tepi daun mengalami klorosis. Virus gemini isolat Bandung ini berhasil dimurnikan dari daun tomat yang bergejala dengan menggunakan metode yang digunakan ..dst
Keyword: 

Judul: Numerical modeling of the hydrodynamics of standing wave and scouring in front of impermeable breakwater with different steepnesses
Abstrak: The aim of this paper is to numerically study the effects of breakwater steepness on the hydrodynamics of standing wave and scouring process in front of impermeable breakwaters. A two-dimensional hydrodynamics model based on the Reynolds Averaged Navier–Stokes (RANS) equations and the Volume of Fluid (VOF) method was developed and then combined with an empirical sediment transport model. Comparisons with an analytical solution and experimental data showed the present model is very accurate in predicting the near bottom velocity and capable of simulating the scour/deposition patterns consistent with experimental data. It was found that the additional terms of bottom shear stress in the momentum equations are necessary to produce a physical scouring pattern. Different breakwater steepnesses produce different characteristics of standing wave, the steady streaming system, and scouring pattern in front of the breakwaters, which also affects the correlations between them. An additional analysis of the turbulence field parameters and the sediment transport rate was also performed. All these important information will be presented in details in this paper and can be worthwhile for designing the breakwater in coastal areas.
Keyword: The RANS–VOF model Standingwave Steadystreamingsystem Scouring pattern Breakwatersteepness