Judul: Tinjauan Status Taksonomi Mangifera kemanga Blume di Indonesia
Abstrak: Mangifera kemanga Blume merupakan salah satu jenis buah tropika kerabat mangga dari suku Anacardiaceae yang mulai langka di Indonesia. Secara taksonomi, status jenis M. kemanga masih perlu untuk ditinjau. Sejak M. kemanga pertama kali dipublikasi sebagai jenis dari suku Anacardiaceae, kedudukannya sebagai jenis diperselisihkan. Beberapa peneliti menetapkan M. kemanga sebagai varietas dari Mangifera caesia Jack berdasarkan data ciri morfologi. Penentuan status taksonomi hanya berdasarkan ciri morfologi tersebut menyebabkan status taksonomi M. kemanga masih diperdebatkan. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan meninjau status taksonomi M. kemanga dan hubungannya dengan M. caesia menggunakan pendekatan morfologi dan molekuler. Penelitian ini diharapkan dapat memberikan informasi mengenai status taksonomi yang tepat dari M. kemanga berdasarkan pendekatan karakter morfologi dan penanda molekuler. Selain itu, data penelitian ini diharapkan dapat digunakan untuk keperluan penelitian lebih lanjut terutama dalam mengembangkan pemanfaatan plasma nutfah M. kemanga dan M. caesia. Aksesi M. kemanga dan M. caesia yang diamati dikoleksi dari Pulau Sumatra (Riau, Jambi, Sumatra Selatan, dan Kepulauan Bangka Belitung), Jawa (Bogor), Kalimantan (Kalimantan Timur dan Kalimantan Selatan), dan Bali (Tabanan). Koleksi sampel dilakukan dengan metode jelajah. Dua macam sampel dikoleksi di lapangan, yaitu sampel untuk pengamatan ciri morfologi dan sampel berupa daun segar untuk analisis molekuler. Pengamatan ciri morfologi merujuk pada deskriptor mangga. Prosedur analisis molekuler meliputi empat tahap, yaitu isolasi DNA, amplifikasi, visualisasi DNA dan produk PCR, serta sekuensing. Isolasi DNA dilakukan berdasarkan protokol Geneaid Genomic DNA Mini Kit (Plant) pada 17 aksesi M. kemanga dan 10 aksesi M. caesia. Langkah-langkah isolasi DNA terdiri atas tahap disosiasi jaringan, lisis sel, pengikatan DNA, pencucian dan elusi DNA. DNA sampel diamplifikasi menggunakan sekuen cpDNA trnL-trnF intergenic spacer. Data ciri morfologi ditransformasi ke dalam bentuk data biner dan disusun membentuk matriks data. Skoring data morfologi merujuk pada deskriptor mangga. Matriks data digunakan untuk menghitung koefisien keserupaan simple matching (SM). Koefisien keserupaan SM digunakan untuk mengonstruksi dendrogram menggunakan analisis Sequential Agglomerative Hierarchial and Nested Clustering (SAHN) dengan metode Unweighted Pair Group Method with Arithmatic Average (UPGMA) pada program NTSys-PC versi 2.1.1a. Data morfologi dan sekuen DNA dianalisis hubungan kekerabatannya dengan cara disejajarkan dan dilakukan konstruksi pohon filogenetik berdasarkan metode Maximum Parsimony (MP) dan Neighbor-Joining (NJ) pada program PAUP versi 4.0a169 dan MEGA 11 versi 11.0.8. Pada pensejajaran sekuen, beberapa sekuen dari database GenBank National Center for Biotechnology Information (NCBI) dimasukkan sebagai grup dalam (ingroup) dan grup luar (outgroup). Analisis keragaman genetik menggunakan program DnaSP 6 versi 6.12.03. Pengelompokan aksesi M. kemanga dan M. caesia menggunakan analisis fenetik dan filogenetik menghasilkan pengelompokan yang tidak kongruen. Analisis fenetik berdasarkan ciri morfologi mengelompokkan aksesi M. kemanga berdasarkan asal wilayah geografis dan memisahkannya dari kelompok aksesi M. caesia. Berdasarkan analisis fenetik, seluruh aksesi membentuk dua kelompok (A dan B) dengan koefisien kemiripan 33–77%. Aksesi M. kemanga yang berasal dari Pulau Sumatra (Riau dan Aceh) dan Jawa (Bogor) termasuk ke dalam kelompok A. Sementara itu, aksesi M. caesia yang berasal dari Pulau Kalimantan (Kalimantan Selatan) dan Sumatra (Sumatra Selatan) menempati kelompok B. Hasil analisis filogeni Neighbor-Joining (NJ) juga menunjukkan pengelompokan yang serupa. Sementara itu, analisis filogenetik Maximum Parsimony (MP) berdasarkan ciri morfologi terhadap aksesi M. kemanga dan M. caesia
Keyword: Filogenetik, Mangifera caesia, molekuler, morfologi, trnL-trnF intergenic spacer

Judul: Karakterisasi  Senyawa Odoran pada Buah Kemang (Mangifera kemanga Blume)
Abstrak: Buah kemang (Mangifera kemanga Blume) merupakan spesies Mangifera sp non budidaya yang memiliki tampilan fisik serta rasa yang kurang menarik. Aroma yang kuat dan khas menjadi kelebihan yang dimilki oleh buah kemang membuatnya menarik untuk diteliti. Belum ditemukannya penelitian spesifik terkait penentuan karakteristik senyawa-senyawa odoran yang berperan dalam pembentukan aroma pada buah kemang menjadi alasan dilakukannya penelitian ini. Ekstrak buah kemang dibutuhkan untuk menganalisis senyawa volatil dengan menggunakan GC-MS, sebagai tahap awal dalam menentukan senyawa odoran. Penelitian ini menggunakan 3 metode ekstraksi yaitu maserasi, liquid-liquid microextraction (LLME) dan headspace solid phase microextraction (HS-SPME). Metode ekstraksi maserasi menggunakan pelarut etanol: diklorometana dengan perbandingan 1:1 sebagai pelarut yang bersifat polar dan nonpolar. Ekstraksi LLME menggunakan diklorometana sebagai pelarut dengan terlebih dahulu dilakukan pembuatan sampel cair. Fiber yang digunakan pada ekstraksi HS-SPME menggunakan fiber DVB/CAR/PDMS yang merupakan fiber dengan sifat bipolar dan umum digunakan untuk ekstraksi pada buah-buahan dari genus Mangifera sp. Hasil analisis senyawa volatil dari ketiga ekstrak menggunakan GC-MS didapatkan sejumlah 138 senyawa volatil yang terkonfirmasi berdasarkan nilai LRI dan spektrum m/z, sedangkan berdasarkan penelusuran literatur hanya sejumlah 72 senyawa yang terkonfirmasi memiliki aroma, senyawa tersebut kemudian digolongkan ke dalam 11 golongan berdasarkan gugus fungsinya. Hasil analisis GC-MS terhadap ekstrak LLME diperoleh sejumlah 58 senyawa odoran yang berasal dari 9 golongan, hasil tersebut lebih beragam jika dibandingkan 2 metode ekstraksi lain (maserasi dan HS-SPME), serta ekstraknya memiliki sensasi sensori yang lebih mirip dengan buah kemang segar. Ekstrak LLME digunakan untuk mendeteksi senyawa odoran buah kemang masak (ripe fruit) menggunakan alat GC-MS/O. Metode deteksi nasal impact frequency (NIF) dengan 8 panelis tidak terlatih digunakan untuk mengidentifikasi senyawa odoran. Berdasarkan hasil sniffing panelis, diperoleh sejumlah 45 senyawa yang memberikan sensasi aroma. Senyawa-senyawa tersebut diidentifikasi berdasarkan nilai LRI, m/z dan deskripsi aroma baik dari literatur maupun respon panelis. Senyawa odoran yang terdeteksi terdiri dari 9 senyawa ester, 9 senyawa aromatik, 8 senyawa monoterpen; 7 senyawa sesquiterpen; 2 senyawa furan; serta masing-masing 1 senyawa golongan alkohol, asam lemak, hidrokarbon alifatik dan keton, serta 6 senyawa unknown. Keenam senyawa unknown terdiri dari 3 senyawa odoran yang terdeteksi memiliki aroma oleh panelis tetapi tidak memiliki puncak pada kromatogram, sehingga tidak dapat diidentifikasi senyawanya. Sejumlah 3 senyawa odoran yang lain memiliki puncak kromatogram tetapi berdasarkan nilai LRInya terdeteksi sebagai senyawa yang tidak beraroma (odorless) tetapi panelis merespon sebagai senyawa beraroma. Keenam senyawa unknown tersebut memberikan aroma sweet, fruity, creamy, citrusy, floral, green, woody dan earthy. Sejumlah 9 senyawa odoran yang terdeteksi oleh >50% panelis berkemungkinan sebagai pemberi karakter khusus pada aroma buah kemang masak, yaitu 3-methylbutyl butanoate (NIF 7/8), cis-α-bergamotene (NIF 7/8), 2-phenylethanol (NIF 6/8), ethyl phenylacetate (NIF 6/8), ethyl 3-phenylpropanoate (NIF 6/8), 2,5-dimethyl-4-methoxy-3(2H)-furanone (NIF 5/8), 3-methylbutyl 3-methylbutanoate (NIF 5/8), eugenol (NIF 5/8) dan trans-α-bergamotene (NIF 5/8), senyawa-senyawa tersebut memberikan aroma sweet, fruity, spicy, floral, woody, citrusy, caramel dan moldy seperti dilaporkan pada Mangifera sp. Senyawa cis-α-bergamotene yang terdeteksi oleh 7 orang panelis belum dilaporkan pada genus Mangifera sp. Penelitian lanjutan terkait penentuan komponen aroma aktif perlu dilakukan dengan mengidentifikasi senyawa-senyawa terduga dengan senyawa standarnya dan menghitung odor activity value. Uji rekombinasi aroma dan ommision test dari senyawa-senyawa aroma aktif
Keyword: GC-MS/O, LLME, Mangifera, Mangifera kemanga, senyawa odoran

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: