Judul: Analisis Komunitas Mikrob pada Hasil Fermentasi Nata de Coco Menggunakan Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD)
Abstrak: Nata de coco (NDC) secara umum dikenal sebagai makanan kaya serat pangan yang umumnya digunakan sebagai hidangan pencuci mulut. Nata sejatinya adalah molekul selulosa yang terbentuk dari aktivitas katalitik enzim selulosa sintase dengan molekul glukosa sebagai substratnya. Beberapa faktor mempengaruhi kualitas NDC yang dihasilkan seperti nutrisi, temperatur dan pH. Faktor lainnya ialah kultur mikrob campuran yang digunakan sebagai kultur starter seringkali menghasilkan produk lembaran nata dengan mutu yang inkonsisten. Kultur mikrob campuran ini belum terdefinisi dengan baik sehingga diperlukan langkah untuk mengurai komunitas mikrob terkultur dari nata baik dan jelek. Dengan demikian bisa dirancang komunitas mikrob sintetik sebagai kultur starter di waktu yang akan datang. Berdasarkan latar belakang tersebut penelitian ini bertujuan mempelajari komunitas mikrob terkultur pada hasil fermentasi NDC dengan kualitas baik dan jelek menggunakan marka Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD). Sampel yang diambil berasal dari pabrik NDC Kota Sukabumi. Ada dua kelompok sampel yang dianalisis yaitu NDC dengan kualitas baik dan jelek. Sampel nata baik memiliki ketebalan 1,1 cm, tektsur kokoh dan permukaan mulus sedangkan nata jelek memiliki ketebalan 0,5 cm, tekstur agak lembek dan permukaan mulus. Pengambilan sampel dilakukan di lokasi fermentasi NDC, masing-masing diambil sebanyak tiga lembar nata. Metode analisis yang digunakan dibagi menjadi dua yaitu: (1) metode mikrobiologi konvensional dengan melakukan pengamatan dan enumerasi morfologi mikrob, kemudian uji fisiologi pembentukan nata; (2) metode molekuler yang meliputi Polymerase Chain Reaction-Random Amplified Polymorphic DNA (PCR-RAPD), analisis hubungan kekerabatan genetik dengan dendrogram similaritas menggunakan program PAST 4.0, dilanjutkan ke tahapan identifikasi isolat mikrob menggunakan analisis gen 16S rRNA (bakteri) dan ITS (khamir). Dari tiga ulangan sampel untuk tiap mutu NDC (baik dan jelek) diperoleh 24 isolat bakteri dan tujuh isolat khamir yang ditumbuhkan di media padat Coconut Water Agar (CWA) dan Acidified Potato Dextrose Agar (APDA). Seluruh isolat tersebut dibedakan berdasarkan morfologi koloninya. Terdapat enam macam morfotipe koloni mikrob yaitu morfotipe I – V (kelompok bakteri) dan morfotipe VI (kelompok khamir). Berdasarkan analisis data profil RAPD yang dihasilkan, terlihat ada variasi genetik dalam satu morfotipe yang sama bahkan telah dibuktikan ada dua spesies berbeda dari jenis bakteri maupun khamir yang memiliki morfotipe yang sama. Konstruksi dendrogram kekerabatan menunjukkan bahwa keragaman genetik isolat-isolat bakteri cukup tinggi sedangkan keragaman genetik di antara isolat khamir tidak terlalu tinggi. Hasil enumerasi koloni mikrob di media CWA dan identifikasi 16S rRNA meunjukkan bahwa secara umum sampel nata baik mengandung Komagataeibacter intermedius (pembentuk nata) lebih banyak yaitu sebesar 6,1 – 6,5 log CFU g-1 sedangkan sampel nata jelek sebesar 5,3 – 5,6 log CFU g-1 . Ketiga sampel nata baik juga mengandung bakteri Komagataeibacter kakiaceti (bukan pembentuk nata) dengan nilai sebesar 6,4 – 6,8 log CFU g-1, sedangkan untuk nata jelek hanya satu sampel yang memiliki bakteri K. kakiaceti sebanyak 3,7 log CFU g-1. Untuk enumerasi khamir di media APDA, dua sampel nata baik mengandung Zygosaccharomyces bisporus sebanyak 5,1 – 5,4 log CFU g-1 dan satu sampel mengandung Pichia manshurica sebanyak 5 log CFU g-1. Sementara itu ketiga sampel nata jelek mengandung P. manshurica dengan nilai sebesar 2,7 – 4,2 log CFU g-1. Jumlah bakteri dan khamir tersebut ditengarai merupakan faktor penting dalam baik dan jeleknya
Keyword: cultured microbial community, genetic diversity, morphotype, nata de coco, RAPD

Judul: Konsistensi Produksi Nata Dalam Media Fermentasi Yang Mengandung Hidrolisat Ubi Kayu
Abstrak: Nata de coco dikenal sebagai substansi menyerupai agar-agar, berwarna putih hingga krem kekuningan, kokoh, mengkilap, dan tidak lengket, diproduksi oleh beberapa bakteria, yang terbentuk di atas media air kelapa selama fermentasi. Acetobacter xylinum (nama sekarang: Gluconacetobacter xylinus) adalah bakteri yang umum digunakan untuk mensintesis nata de coco. Selain air kelapa terdapat beberapa alternatif untuk membuat nata, seperti jus buah dan ubi kayu. Gluconacetobacter sp. digunakan pada penelitian ini untuk produksi nata dari media hidrolisat ubi kayu (U) yang dibandingkan secara kualitatif dan kuantitatif dengan media air kelapa (K) untuk melihat konsistensi produk nata. Pada media U, glukosa adalah produk utama yang berasal dari hidrolisis ubi kayu secara enzimatis. Fermentasi dilakukan tiga kali dengan menggunakan inokulum dari fermentasi sebelumnya. Semua data dianalisis dengan IBM SPSS Statistics 23. Produk fermentasi nata media U relatif lebih stabil dilihat dari ketebalan, bobot basah, bobot kering, yield, kadar air dan total bakteri (variabel kuantitatif) dan stabil pada warna, tekstur, transparansi, dan permukaan nata (variabel kualitatif). Glukosa lebih cepat dikonsumsi oleh bakteri daripada gula lainnya (fruktosa and sukrosa) berdasarkan hasil High Performance Liquid Chromatography (HPLC). Konsumsi glukosa dan yield nata dipengaruhi oleh jumlah bakteri, akan tetapi yield nata tidak dipengaruhi signifikan oleh konsumsi glukosa. Yield nata dapat dipengaruhi oleh faktor lain seperti nutrisi yang terdapat pada media U. Dinamika pertumbuhan Gluconacetobacter sp. diamati pada media Hassid-Barker Agar (HBA) demikian pula untuk pengukuran jumlah relatif gen 16S rRNA. Pertumbuhan bakteri selama fermentasi pada media U relatif lebih stabil dari fermentasi media K meskipun yield pada media K meningkat secara bertahap dan menjadi lebih besar dari yield fermentasi pada media U. Konsistensi media U terlihat dari stabilitas selama fermentasi yaitu stabil pada dinamika bakteri dan kondisi fisik nata. Kebutuhan gula Gluconacetobacter sp. dapat tercukupi oleh glukosa dari hidrolisat ubi kayu, sehingga tidak diperlukan gula tambahan pada fermentasi nata de coco. Glukosa mudah dikonsumsi Gluconacetobacter sp. sehingga hidrolisat ubi kayu dapat dijadikan media untuk produksi inokulum dan media produksi nata menggantikan media air kelapa.
Keyword: Gluconacetobacter sp., nata, hidrolisat ubi kayu, fermentasi yang stabil

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: