Judul: Modifikasi Metode Runge-Kutta Orde 4 pada Persamaan Pendulum
Abstrak: Sistem persamaan diferensial pada pendulum sederhana merupakan sistem persamaan diferensial tak linear. Dalam tulisan ini, penulis menggunakan metode numerik untuk menyelesaikan persamaan tersebut. Metode numerik yang digunakan adalah metode Runge-Kutta orde 4 (RK4) serta modifikasinya dengan memanfaatkan fungsi energi pada persamaan pendulum sederhana. Selanjutnya, hasil perhitungan numerik tersebut dibandingkan dengan hasil pendekatan analitik (dengan linearisasi) dan hasil yang diperoleh menggunakan Mathematica 11. Hasil penelitian menunjukkan bahwa, galat relatif antara pendekatan analitik dan pendekatan numerik modifikasi metode Runge-Kutta orde 4 (RK4 modif) lebih baik dibandingkan dengan pendekatan numerik metode RK4 klasik untuk simpangan yang kecil. Selanjutnya, ketika hasil pendekatan numerik dari RK4 modif dan RK4 klasik dibandingkan dengan hasil numerik dari Mathematica 11, dapat dilihat bahwa galat relatif dari metode RK4 modif lebih baik daripada galat relatif metode RK4 klasik.
Keyword: pendulum sederhana, persamaan diferensial, metode Runge- Kutta

Judul: Metode Beda Hingga untuk Persamaan Diferensial Biasa Orde Dua Linear dengan Syarat Batas Dirichlet
Abstrak: Persamaan diferensial dapat digunakan untuk memodelkan suatu fenomena dinamis. Seringkali model tersebut sangat kompleks yang mengakibatkan penyelesaian persamaan diferensial secara analitik sulit dilakukan sehingga dibutuhkan suatu pendekatan numerik untuk mencari solusi persamaan. Secara umum pendekatan numerik menggunakan prinsip hampiran sehingga hasil solusi numerik akan memiliki selisih nilai dengan hasil solusi analitik. Karya ilmiah ini berfokus pada penyelesaian persamaan diferensial biasa orde dua linear secara numerik menggunakan metode beda hingga. Solusi khusus dalam penelitian ini diperoleh dengan menggunakan syarat batas Dirichlet yang menspesifikasi nilai solusi fungsi pada nilai variabel bebas tertentu. Metode beda hingga bekerja dengan mengganti suatu persamaan diferensial dengan syarat batas menjadi sebuah sistem persamaan linear yang dilakukan dengan mendiskretisasi daerah asal dan mengubah turunan pada persamaan dengan hampiran beda hingga pusat. Hasil penelitian menunjukkan bahwa pendekatan secara numerik menggunakan metode beda hingga hasilnya tidak berbeda jauh dengan metode analitik, hal ini terlihat dari nilai MAPE yang memiliki kisaran kurang dari 10% pada setiap kasus.
Keyword: persamaan diferensial biasa orde dua linear, syarat batas Dirichlet, metode beda hingga

Judul: Characterization and Expression of Tomato infectious chlorosis virus Coat Protein Gene in Escherichia coli
Abstrak: Tomato infectious chlorosis virus (TICV) is a member of Crinivirus genus. TICV infects tomato crop in Garut and Cipanas, West Java Indonesia. Tomato initially showed bright interveinal yellowing symptoms. The coat protein gene (CP-TICV) was amplified by RT-PCR from total RNA extracted from infected tomato leaves and the amplified fragment was cloned and completely sequenced. The fragment was subsequently subcloned into the pET-21b expression vector. The recombinant plasmid was transformed to Escherichia coli strain BL21(DE3)pLysS to express the coat protein. The coat protein fused to a 6xhistag, was purified by affinity chromatography using a NiNTA spin column. The identity of the purified protein was confirmed by SDS-PAGE. In this experiment, 792 bp of CP-TICV gene of TICV virus has been successfully cloned, sequenced, and expressed in E. coli. Based on nucleotide sequences alignment analysis, TICV-Indonesia strain showed 100% identity to TICV –Spain strain and 99% identity to North America, France, and California strains and based on amino acid sequences alignment analysis, TICV-Indonesia strain showed 100% identity to TICV –Spain, North America, France strains and 99.2% identity to California strain. CP-TICV showed over expressed in E. coli when it is induced with 1 mM IPTG and incubated at 37oC. Purified CP-TICV-Histag recombinants protein sized 29 kDa based on SDSPAGE analysis.
Keyword: