Judul: Identifikasi Bakteri dari Ikan Lele (Clarias gariepinus) Sakit Asal Bogor Secara Konvensional dan Biomolekuler
Abstrak: Identifikasi Bakteri dari Ikan Lele (Clarias gariepinus) Sakit Asal Bogor Secara Konvensional dan Biomolekuler. Dibimbing oleh SRI NURYATI dan MUNTI YUHANA. Ikan lele (Clarias gariepinus) merupakan ikan perairan tawar yang banyak dibudidayakan di Indonesia. Intensifikasi budidaya ikan lele dapat memicu timbulnya penyakit bakterial. Budidaya ikan lele pada September 2020 di daerah Parung, Bogor banyak dirugikan oleh wabah penyakit yang menyebabkan terjadinya kematian. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi jenis bakteri secara konvensional dan biomolekuler yang berasal dari ikan lele yang sakit. Isolat bakteri yang diidentifikasi berasal dari ikan lele yang terjangkit penyakit. Isolat tersebut diambil dari sampel ikan lele yang berbeda-beda. Jumlah isolat yang diamati yaitu 6 isolat diantaranya adalah isolat bakteri C4G, E4G, A4G, B2U, B5L, dan EH2. Proses identifikasi dilakukan dengan mengamati hasil baik karakterisasi morfologi maupun fisiologi bakteri tersebut. Pengujian dilakukan melalui pengamatan koloni bakteri, pewarnaan Gram, uji oksidatif dan fermentatif, uji motilitas, uji katalase, uji oksidase, dan uji lanjut Polymerase Chain Reaction (PCR). Bakteri kemudian diuji patogenitasnya melalui prosedur Postulat Koch. Hasil identifikasi menunjukkan isolat bakteri C4G, E4G, A4G, B2U, B5L, dan EH2 merupakan bakteri patogen. Kelompok Staphylococcus pasteuri untuk isolat bakteri C4G, isolat bakteri E4G merupakan kelompok Salmonella enterica, isolat bakteri A4G merupakan kelompok Escherichia coli, isolat bakteri B2U merupakan kelompok Enterobacteri hormaechei, isolat bakteri B5L merupakan kelompok Bacillales bacterium, dan isolat bakteri EH2 merupakan kelompok Aeromonas salmonicida. Bakteri setelah diinjeksikan ke ikan lele ukuran 19-24 cm dengan kepadatan bakteri 106 CFU mL-1 dan dosis 0,1 mL/ekor, ikan tersebut menunjukkan gejala klinis berupa tubuh pucat, dropsi, kurang aktif berenang, sirip geripis, ulcer, hingga kematian. Adanya gejala tersebut menunjukkan bahwa bakteri bersifat patogen untuk ikan lele. Kata kunci: bakteri, Clarias gariepinus, isolat, penyaki, Identification of Catfish (Clarias gariepinus) from Bogor that Infected by Bacteria Conventionally and Biomolecularly. Guided by SRI NURYATI and MUNTI YUHANA. Catfish (Clarias gariepinus) is a freshwater fish that is widely cultivated in Indonesia. Intensification of catfish cultivation can trigger the onset of bacterial diseases. Catfish cultivation in September 2020 in Parung area, Bogor was harmed by the outbreak of diseases that cause death. The study aimed to identify conventional and biomolecular types of bacteria derived from infected catfish. The identified bacterial isolate comes from catfish infected with the disease. The isolates were taken from different catfish samples. The number of isolates observed is 6 isolates including C4G, E4G, A4G, B2U, B5L, and EH2 bacterial isolates. The identification process is carried out by observing the results of both morphological characterization and physiology of the bacteria. Testing is conducted through observation of bacterial colonies, Gram staining, Oxidative and fermentative test, motility test, catalase test, oxidase test, and Polymerase Chain Reaction (PCR) advanced test. The bacteria are then tested for pathogenity through Koch's Postulate procedure. The identification results showed that C4G, E4G, A4G, B2U, B5L, and EH2 bacterial isolates were pathogenic bacteria. Staphylococcus pasteuri group for C4G bacterial isolate, E4G bacterial isolate is Salmonella enterica group, A4G bacterial isolate is Escherichia coli group, B2U bacterial isolate is Enterobacteri hormaechei group, B5L bacterial isolate is Bacillales bacterium group, and EH2 bacterial isolate is Aeromonas salmonicida group. Bacteria after being
Keyword: Bakteri, Identifikasi, Polymerase Chain Reaction (PCR), Sekuensing

Judul: Isolasi dan Identifikasi Bakteri Patogen dari Kolam Pendederan Intensif Lele Dumbo (Clarias gariepinus) di Bogor
Abstrak: Lele dumbo (Clarias gariepinus) merupakan salah satu komoditas ikan air tawar yang digemari di Indonesia karena waktu budidaya yang singkat dan dapat ditebar dengan kepadatan tinggi. Salah satu permasalahan serius yang dihadapi oleh pembudidaya ikan lele adalah penyakit ikan yang disebabkan oleh serangan bakteri. Kematian masal sebesar 70% dari total populasi sering terjadi pada usaha pendederan intensif lele dumbo (Clarias gariepinus) di Clarias Farm, Bogor. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi dan mengidentifikasi bakteri patogen yang menyerang dan menyebabkan kematian masal pada usaha pendederan intensif lele dumbo (Clarias gariepinus) di Clarias Farm, Bogor. Metode penelitian ini dilakukan dua tahap, tahap pertama isolasi dan identifikasi bakteri ikan lele dumbo dari Clarias Farm, Bogor dengan panjang rata-rata 4.96±0.55 cm dan bobot ratarata 2.29±0.53 g. Tahap kedua yaitu uji LD50 ikan lele dari Desa Tegalwaru, Bogor dengan panjang rata-rata 8.94±0.48 cm dan bobot rata-rata 4.82±0.89 g. Hasil yang didapatkan dari dua tahap tersebut yakni terdapat lima bakteri patogen. Kelima bakteri tersebut terbukti patogen pada ikan lele yang dipelihara di Clarias Farm setelah dilakukan beberapa uji patogenisitas. Bakteri-bakteri tersebut adalah Aeromonas hydrophila NFC1, Aeromonas caviae NFC2, Aeromonas sobria NFC3, Stenotrophomonas maltophilia NFW4, dan Pseudomonas luteola NFC5 yang memiliki nilai LD50 masing-masing sebesar 106.1, 106.5, 106.9 , 107.0 dan 106.7 CFU mL-1 . Kelima bakteri tersebut adalah golongan bakteri Gram negatif, termasuk kategori virulen karena memiliki kisaran nilai LD50 antara 106.1 CFU mL-1 (A. hydrophila NFC1) hingga 107.0 CFU mL-1 (Stenotrophomonas maltophilia NFW4).
Keyword: Aeromonas sp., bakteri, Clarias sp., Pseudomonas luteola, Stenotrophomonas maltophilia

Judul: Utilization of terra/MODIS L1B data for analysis of horizontal wind profile in the troposphere
Abstrak: This study was concerned with horizontal wind derived from data collected with the Moderate-resolution Imaging Spectroradiometer (MODIS) on board the NASA’s Earth Observation System (EOS)-Terra satellite. The aim of this study is to develop a method for the estimation of horizontal wind movement in the troposphere based on Navier-Stokes equation. The method was applied to a calibrated and geolocated Terra/MODIS L1B 1 km data set. The data inputs to estimate surface temperature are retrieved from TIR (Thermal Infrared) bands 31 (10.780 μm to 11.280 μm) and 32 (11.770 μm to 12.270 μm). The obtained surface temperatures were later used to approximate geopotential height on a constant-pressure surface by using the modified Poisson equation. The main assumptions used are the hydrostatic equilibrium, ideal gas law, constant lapse rate and constant acceleration of gravity. Based on the distribution of geopotential height, the pressure gradient force is measured by the gradient of geopotential on an isobaric coordinate to present the horizontal wind profile. For certain topographic areas especially in the mountain ranges, there was a disadvantage of using pressure as a vertical coordinate which lead to inaccuracy. In spite of that, Terra/MODIS L1B data with 1 km spatial resolution can be used to estimate the horizontal wind movement in the troposphere.
Keyword: