Judul: Produksi Jeruk Siam di Sumatera Utara dan Penyakit Kanker Bakteri Serta Simulasi Identifikasi In Silico Xanthomonas citri pv. citri
Abstrak: Jeruk Siam manis adalah tanaman buah penting di Indonesia. Salah satu penghasil utama jeruk tersebut adalah Provinsi Sumatera Utara dengan sentra produksi terbesar di Kabupaten Karo. Kanker jeruk adalah salah satu penyakit yang dapat menyebabkan kerugian hasil yang besar. Pengendalian yang tepat penyakit ini harus didasarkan pada diagnosis yang akurat. Identifikasi bakteri patogen yang cukup sulit dan lama jika berdasarkan gejala dan pengujian konvensional, dapat dibantu dengan teknik molekuler yang lebih sensitif, akurat dan singkat. Tugas akhir ini untuk menggambarkan produksi dan produktivitas jeruk di Provinsi Sumatera Utara, keadaan penyakit kanker jeruk dan cara budidayanya di Kabupaten Karo dan Batubara, serta simulasi identifikasi bakteri penyebab kanker menggunakan teknik PCR-sequencing secara in silico. Produksi jeruk Provinsi Sumatera Utara berfluktuasi dan mengalami penurunan yang signifikan selama dasawarsa terakhir, dari peringkat pertama pada tahun 2010 ke peringkat ke-3 pada tahun 2020 di bawah provinsi Jawa Timur dan Bali. Produktivitas jeruk di pertanaman petani responden dataran tinggi Karo lebih baik daripada petani dataran rendah Kabupaten Batubara. Kejadian penyakit kanker mencapai 100% baik di lokasi observasi Karo maupun Batubara dengan tingkat severita masing-masing 46,8% dan 59,6%. Simulasi identifikasi molekuler bakteri patogen kanker jeruk dari Bogor berdasarkan urutan nukleotida gen 16S rRNA menunjukkan identitas sebagai Xanthomonas citri pv. citri dengan homologi >99% dengan banyak isolat dari beberapa negara. Isolat Bogor tersebut memiliki hubungan filogenetik yang lebih dekat dengan isolat dari Thailand dan India dibandingkan dengan isolat dari negara lain seperti Arab Saudi, Selandia Baru, China, Amerika Serikat dan Belgia.
Keyword: 16S rRNA bacterial gene, disease intensity, phylogenetic tree, homology

Judul: Important Diseases and Production of Siam and Keprok  Citrus in Karo District, North Sumatera Province
Abstrak: Jeruk siam dan keprok merupakan komoditas hortikultura yang digemari masyarakat Indonesia sehingga permintaannya sangat tinggi. Salah satu sentra produksi jeruk di Indonesia yaitu Provinsi Sumatera Utara, namun dalam dasawarsa terakhir tingkat produksinya menurun drastis yang dapat mempengaruhi tingkat produksi jeruk nasional. Penelitian ini bertujuan mengkaji produksi jeruk di Sumatera Utara dan mengetahui masalah penyakit yang sering ditemukan di lapangan. Pengamatan penyakit dilakukan di Kecamatan Dolat Rayat dan Merek, Kabupaten Karo pada bulan April sampai Juni 2020. Data sekunder dikumpulkan dari beberapa sumber seperti internet dan badan statistik tingkat provinsi dan nasional. Produksi jeruk di Sumatera Utara mengalami penurunan dalam periode 2010-2019 yang menjadikan peringkat provinsi ini dari penghasil jeruk terbesar pertama tahun 2010 menjadi ketiga di Indonesia pada tahun 2019 di bawah Provinsi Jawa Timur dan Bali. Produksi jeruk di Kabupaten Karo sebagai sentra tanaman jeruk terbesar berperan penting dalam produksi jeruk Sumatera Utara. Kecamatan Dolat Rayat dan Merek merupakan kecamatan yang mengalami peurunan produksi jeruk secara drastis di Kabupaten Karo. Faktor yang berpengaruh pada tingkat produksi jeruk antara lain letusan gunung berapi, cara budidaya, konversi lahan untuk komoditas lain seperti kopi dan permasalahan organisme pengganggu tanaman. Berdasarkan survei di pertanaman jeruk, penyakit jeruk yang sering ditemukan adalah penyakit kanker jeruk, huanglongbing, cendawan jelaga, dan kudis. Penyakit kanker jeruk memiliki kejadian penyakit yang tinggi di kedua lokasi pengamatan. Cendawan jelaga dan kudis merupakan penyakit dengan kejadian tertinggi di dua kecamatan. Penyakit huanglongbing merupakan penyakit yang paling rendah kejadian dan keparahannya dibandingkan dengan penyakit lain di kedua kecamatan tersebut.
Keyword: Citrus canker, disease intensity, huanglongbing, production rank, scab, sooty mold

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: