Judul: Polimorfisme Gen β-Kasein dan Laktoferin serta Hubungannya dengan Protein Susu pada Sapi Friesian-Holstein.
Abstrak: Perbaikan genetik sapi perah domestik dapat dilakukan antara lain melalui seleksi keunggulan pada gen yang diprediksi berasosiasi kuat dengan sifat produksi, kualitas susu dan ketahanan terhadap penyakit, khususnya seleksi untuk gen-gen yang mengontrol protein susu dan resistensi terhadap penyakit. β-kasein merupakan salah satu jenis dari fraksi kasein yang berpengaruh terhadap bentuk dan kestabilan butiran susu dan memiliki kontribusi sebesar 28.4% dari total protein susu, sedangkan laktoferin merupakan salah satu fraksi whey yang merupakan protein antimikrobia dalam susu yang berfungsi sebagai imunitas untuk melawan berbagai macam penyakit. Pemeriksaan dua atau lebih gen-gen protein susu (kasein dan whey protein) secara bersamaan bermanfaat untuk memperhitungkan pengaruh interaksi yang mungkin terjadi antara dua atau lebih gen haplotipe. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi polimorfisme gen β-kasein dan laktoferin dan mengetahui konsistensi hubungan antara genotipe gen β-kasein dan laktoferin baik secara masing-masing maupun interaksi kedua gen dengan protein susu dan somatic cell count (SCC) pada sapi Friesian-Holstein (FH) laktasi pada dua kondisi pemeliharaan berbeda, yaitu intensif di stasiun bibit sapi perah BPPT-SP Cikole dan semi intensif di peternakan rakyat di bawah binaan KPSBU Lembang
Keyword: 

Judul: Kajian genomik dari gen-gen kasein susu untuk seleksi sapi perah Friesian Holstein berkadar protein susu tinggi
Abstrak: Tujuan dari penelitan ini adalah (a) menganalisis sifat-sifat fenotipik kualitas susu sapi perah pada berbagai periode laktasi. (b) mengidentifikasi keragaman Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) gen kasein susu (CSN1S1, CSN2, CSN1S2) pada sapi perah laktasi. (c) menganalisis hubungan keragaman gen-gen kasein susu (CSN1S1, CSN2, CSN1S2, dan CSN3) terhadap sifat protein susu. (d) merekomendasikan desain perkawinan untuk menghasilkan sapi FH bibit pembawa kadar protein susu tinggi. Penelitian ini dilakukan dalam 3 tahapan, yaitu : 1) Phenotyping, yaitu koleksi data sifat kualitas susu (protein) melalui pengukuran langsung di stasiun percobaan Balitnak untuk mendapatkan data fenotipe ternak percobaan (phenotypic database), 2) SNPs genotyping dengan menggunakan teknik Real-Time PCR (RT-PCR) untuk mendapatan data genotype (genotypic database) masing-masing individu sapi FH 3) Pengujian hubungan gen-gen kasein terhadap sifat kualitas susu. Penelitian ini dilaksanakan di stasiun percobaan Balai Penelitan Ternak, Penelitian laboratorium dilakukan di laboratorium Genetika Molekuler Ternak (LGMT) Balai Penelitian Ternak. Ternak yang digunakan dalam studi polimorfisme gen CSN1S1, CSN2, CSN1S2 dan CSN3 dan asosiasi keragaman genetik gen protein CSN1S1, CSN2, CSN1S2 dan CSN3 terhadap kadar protein susu dan komponen susu lainnya adalah sapi perah Friesian Holstein (FH) dari 98 ekor induk laktasi di stasiun percobaan Balai Penelitian Ternak (Balitnak) Ciawi Bogor. Hasil studi Phenotyping, atau pengujian sifat protein susu dalam berbagai periode laktasi menunjukkan bahwa kisaran rataan protein susu pada laktasi ke-1 adalah 3,11-3,45%, sementara untuk laktasi ke-2 adalah 2,73-3,17%, dan untuk laktasi ke-3 adalah 2.83-3.16%. Rataan protein susu pada berbagai periode laktasi tersebut telah memenuhi persyaratan SNI 3141.1:2011 yaitu 2,8%. Kisaran rataan lemak susu pada laktasi ke-1 adalah 3,50-3,97%, sementara untuk laktasi ke-2 adalah 3,36-3,81% dan untuk laktasi ke-3 adalah 3,45-3,64%. Rataan lemak susu pada berbagai periode laktasi tersebut telah memenuhi persyaratan SNI 3141.1:2011 yaitu 3%. Rataan SNF susu pada laktasi ke-1 adalah 7,45-7,98%, sementara untuk laktasi ke-2 adalah 6.74-7.28%, dan untuk laktasi ke 3 adalah 6,40-6,90%. Kandungan SNF tersebut berada di bawah dan di atas dari kadar SNF susu dengan kualitas baik yang disyaratkan oleh Standar Nasional Indonesia, dimana kadar SNF 8% menjadi standar susu berkualitas baik. rataan laktosa susu pada laktasi ke-1 adalah 4,94-5.31%, sementara untuk laktasi ke-2 adalah 4.37-4.94%, dan untuk laktasi ke-3 adalah 3.75-4.92%. Sementara itu, kandungan laktosa tersebut berada di bawah dan di atas dari kadar laktosa susu dengan kualitas baik yang disyaratkan oleh SNI, dimana kadar laktosa susu 4.20 % menjadi standar susu berkualitas baik. Hasil studi SNP genotyping telah teridentifikasi bahwa untuk gen c.192G>A gen CSN1S1 diperoleh 3 genotipe, yaitu AA, AG, dan GG. Pada SNP g.6334A>G gen CSN2 diperoleh genotipe AA, AG, dan GG. Pada SNP c.67A>C gen CSN2 diperoleh genotipe AA, AC, dan CC. Pada SNP g.13231A>T gen CSN1S2 diperoleh genotipe TT, TA, dan AA, SNP g.13975G>T gen CSN3 adalah GG, GT, dan TT. Pada SNP g.14618T>C gen CSN1S1 diperoleh genotipe CC, CT, dan TT. Hasil pengujian hubungan gen-gen kasein terhadap sifat kualitas susu diketahui bahwa terjadi hubungan antara varian genetik gen kasein susu dengan sifat protein susu sapi dan komponen susu lainnya pada sapi Friesian Holstein. Hasil penelitian menunjukkan bahwa kandungan protein susu dipengaruhi oleh varian genetik gen c.192G>A gen CSN1S1 dan c.67A>C gen CSN2. Kadar
Keyword: Casein gene, Friesian Holstein, dairy cows, high milk protein

Judul: Thermal Characteristics and Dynamics of Tropical Cyclone over Western North Pacific Ocean: A Case Study of Typhoon Songda (Chedeng) 2011
Abstrak: The frequent occasion of Tropical Cyclone (TC) over Western North Pacific (WNP) Ocean lies from 10˚N to 26˚N and 121˚E to 170˚E. Sources of TC development come from warm ocean temperature where latent heat is released during condensation processes and subsequently concentrated in the boundary layer. Relative humidity at 850-700 hPa is responsible to produce the most intense storm. Meanwhile, weak vertical wind shear between 850-200 hPa is one of the dynamical factors that lead to the development of TC. Pressure level of 850-200 hPa is chosen to minimize the thermodynamic effect in the lower troposphere. Typhoon Songda (Chedeng in the Philippines) or TSC lasted from May 18th to 30th, 2011 and strengthened into powerful Super Typhoon stage between May 24th and 27th. Long curving track and the exhibition of all sequences of TC life cycle, TSC is then considered as an ideal case of TC. The objective of the study with case of TSC is to investigate the role of thermal characteristics and dynamics on TC intensity. The research is carried out by using Advanced Research of Weather Research and Forecasting model (WRF ARW model) version 3.3. Two domains are employed in the model. The first domain situate from 02˚N to 40˚N and 118˚E to 149˚E and cover spatial resolution () of 33.1 km. The second domain situate from 09˚N to 27˚N and 119˚E to 132˚E with of 11 km. Timestep of the model () is 120 seconds. The model is supported by the following physical parameterization, i.e., Yonsei University Scheme (YSU) in the boundary layer, Kain-Fritsch scheme (KF) in the cumulus, and WRF Single-Moment 3-class scheme in the microphysics. Initial meteorological condition prior to the formation of the cyclone is generated using WRF ARW standard-release model. Sensitivity of the model output is obtained from a selected single-parameter change scenarios, namely, 10 % to 20 % decrease and increase of wind shear initial data at 850-200 hPa, and by 10 % to 20 % decrease of relative humidity initial data at 850-700 hPa. The result showed that the negative correlations between wind shear and intensity are found in wind shear scenarios. Wind shears of 10 ms-1 which lead to strengthening of the wind intensity in the early period of Typhoon development are found in wind shear scenarios. The effect of wind shear changes on wind intensity is statistically significant in the 20 % wind shear scenarios. During mature stage, weak wind intensity occurred when wind shear increase as given in the WRF standard-release and the 20 % decreasing scenario. Different situation is found in the 20 % increasing scenario where wind shear tend to weak and lead to strong wind intensity at this stage. Meanwhile, the reduction of moisture supply at 850-700 hPa resulting from 20 % decreasing relative humidity play a major role in the weakening of wind intensity and reduces mechanical energy of the cycle process as much as 300 J kg-1.
Keyword: