Judul: Nilai indeks stabilitas statis dan frekuensi Brunt Vaisala di Perairan selatan Bali dan Laut Flores, dalam hubungannya dengan upwelling
Abstrak: Stabilitas statis air adalah kondisi potensial gerakan unit volume air sebagai respon terhadap gangguan distribusi densitas secara menegak. Stabilitas statis air diukur dengan nilai indeks stabilitas statis (E) yang merupakan fungsi perubahan densitas terhadap kedalaman. Bila suatu unit volume air berpindah ke atas, gaya kembali akan menyebabkan percepatan ke bawah ke arah posisi kesetimbangan dan unit volume air akan berosilasi untuk beberapa waktu. Frekuensi osilasi ini disebut Frekuensi Brunt Väisälä atau Frekuensi Bouyancy. Nilai Frekuensi Brunt Väisälä sebanding dengan nilai indeks stabilitas statis. Ada tiga kriteria stabilitas statis yaitu netral (E=0), di mana setelah unit volume air berpindah akan diam di tempat yang baru; tidak stabil (E<0), di mana berpindahnya unit volume air cenderung berlanjut, sehingga menyebabkan pergerakan unit volume air; dan stabil (E>0) di mana berpindahnya unit volume air terjadi pada jarak menegak yang pendek kemudian kembali ke posisi semula. Laut memiliki stratifikasi massa air secara vertikal yaitu air di lapisan dalam mempunyai suhu yang lebih rendah, salinitas dan kandungan zat hara yang tinggi, serta densitas yang lebih tinggi. Perbedaan sebaran densitas disebabkan oleh perbedaan sebaran suhu dan salinitas. Perubahan suhu yang tajam di kolom air pada kedalaman tertentu disebut lapisan termoklin, sedangkan perubahan salinitas yang tajam disebut haloklin.
Keyword: 

Judul: Analisis Spasial Kualitas Perairan Bagian Selatan Selat Bali
Abstrak: Selat Bali merupakan salah satu selat yang memiliki fungsi dan peranan yang sangat penting di bidang sosial maupun ekonomi. Selain sebagai penghubung antara Pulau Jawa dan Pulau Bali, Selat Bali yang merupakan bagian dari WPP 573 memiliki potensi perikanan tangkap pelagis yang tinggi khususnya perikanan lemuru. Analisis mengenai kualitas perairan terhadap parameter fisika-kimia perairan baik pada lapisan permukaan, kolom, maupun dasar menjadi sangat penting diketahui untuk memahami karakteristik massa air di suatu wilayah perairan. Dalam hal pengelolaan sumberdaya perikanan, sangatlah membutuhkan informasi tentang data yang menjelaskan kualitas perairan yang dapat menunjang dan menjadi salah satu dasar dalam rencana pengelolaan sumberdaya perikanan agar dapat berjalan secara optimum dan lestari. Kondisi kualitas perairan Selat Bali sangat dipengaruhi oleh fenomena upwelling yang biasanya terjadi pada musim timur. Penelitian dilakukan di perairan bagian selatan Selat Bali pada bulan Maret 2011 yang merupakan musim peralihan. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui dan membandingkan sebaran parameter fisika-kimia perairan secara horizontal maupun vertikal serta menentukan status mutu perairan. Stasiun pengamatan terdiri 9 titik yang melintang dari wilayah Grajagan, Jawa Timur sampai Jimbaran, Bali yang disesuaikan dengan rute pelayaran KR Baruna Jaya VIII. Stasiun 1 sampai 5 yang relatif dekat wilayah Jawa Timur memiliki kedalaman mencapai 590 meter, stasiun 6 sampai 8 yang berbatasan dengan Samudera Hindia memiliki kedalaman lebih dari 2.500 meter, sedangkan stasiun 9 yang relatif dekat dengan Pulau Bali memiliki kedalaman 46 meter. Pengambilan sampel air dilakukan pada tiga kedalaman berbeda tiap stasiunnya (lapisan permukaan, termoklin, dan dekat dasar perairan) dengan menggunakan Rossete Water Sampler yang terdiri dari 10 tabung Niskin dengan kapasitas 10 liter dan CTD yang dilengkapi dengan alat pHmeter, salinometer, dan DOmeter. Hasil analisis menunjukkan bahwa secara umum distribusi vertikal parameter fisika-kimia perairan terdapat perbedaan karakteristik massa air pada lapisan permukaan, termoklin, dan dasar perairan. Pada wilayah perairan yang termasuk laut dalam, perbedaan karakteristik fisika-kimia perairan pada lapisan dekat dasar sangat mencolok khususnya untuk parameter seperti suhu, salinitas, dan oksigen terlarut (DO). Penentuan status mutu perairan dengan menggunakan Indeks Storet diketahui bahwa pada lapisan permukaan, perairan bagian selatan Selat Bali termasuk kriteria perairan yang baik hingga sedang, pada lapisan termoklin termasuk kriteria perairan yang baik sekali (memenuhi baku mutu) hingga baik, pada lapisan dekat dasar tergolong pada kriteria perairan yang sedang hingga buruk. Berdasarkan Indeks Pencemaran, pada lapisan permukaan di perairan bagian selatan Selat Bali tergolong pada kriteria yang baik hingga tercemar ringan. Berdasarkan Indeks Pencemaran, secara umum wilayah perairan yang relatif jauh dari daratan memiliki kualitas perairan yang lebih baik jika dibandingkan dengan wilayah yang dekat daratan.
Keyword: 

Judul: Penyusunan Overlap Graph menggunakan Suffix Tree pada DNA Sequence
Abstrak: The DNA sequence assembly is very important in genome analysis. This step aims to reconstruct contigous DNA fragment (contigs) from short fragment by concatenating fragments based on the overlap region among them. This method employs overlap graph for solving the problems. In this graph, nodes represent fragments and edges represent overlap. This research developed a software for constructing overlap graph using suffix tree. The evaluation was conducted by measuring the number of nodes, number of edges, and the execution time in many values of minimum overlap. The minimum overlap is defined as the minimum length of substring which is considered as the overlap region between two fragments. The evaluation results showed that the number of nodes, the number of edges, and the execution time were increased with the decreasing of the minimum overlap value.
Keyword: