Judul: Skrining Aktivitas Isolat Aktinomisetes Tanah Asal Indonesia Penghasil Antibakteri
Abstrak: Wabah baru akibat infeksi bakteri zoonosis terjadi hampir setiap tahun serta berdampak serius terhadap kesehatan manusia dan ekonomi global. Penanggulangan terhadap permasalahan ini dapat dilakukan dengan mencari alternatif antibakteri baru yang relatif mudah diperoleh di alam, berkhasiat, dan aman. Aktinomisetes adalah bakteri tanah yang diminati sebagai sumber antibakteri baru. Penelitian ini bertujuan untuk memperoleh isolat aktinomisetes berasal dari tanah di Indonesia yang menghasilkan senyawa antibakteri penghambat bakteri Salmonella Typhimurium InaCC B.283, Escherichia coli InaCC B.285, Staphylococcus aureus InaCC B.286 dan Bacillus subtilis InaCC B.289. Isolat aktinomisetes berumur 4 hari pada media ISP-2 diuji terhadap 4 bakteri uji. Setelah diinkubasi pada suhu 30°C selama 24 jam, semua isolat diamati dan diukur zona hambatnya yang ditandai dengan terbentuknya zona bening di sekitar potongan agar dan diukur. Pengujian terhadap 299 isolat memberikan hasil bahwa 48 isolat aktinomisetes dapat menghambat pertumbuhan bakteri uji. Dua isolat aktinomisetes yang reproducible membentuk zona bening pada 3 kali pengujian dan memiliki daya hambat terhadap keempat bakteri uji (spektrum luas) dipilih sebagai isolat untuk pengujian selanjutnya. Kandidat aktinomisetes InaCC A.234 dan InaCC A.413 dengan zona hambat terbesar, diinkubasi dalam medium produksi cair selama 2, 3, 4, 5, 6 dan 7 hari pada suhu ruang (28-30°C) untuk mengetahui waktu optimal produksi antibakteri. Hasil skrining bioassay filtrat menunjukkan waktu optimum produksi antibakteri kedua isolat yaitu pada hari ke-5. Prosentase indeks hambat isolat aktinomisetes InaCC A.234 diatas 70% dan InaCC A.413 diatas 80% pada dosis 30 μl, suhu inkubasi 37°C sebanyak 2 kali ulangan. Isolat aktinomisetes InaCC A.413 menunjukkan zona hambat lebih besar dibandingkan dengan isolat aktinomicetes InaCC A.234. Masing-masing isolat aktinomisetes diidentifikasi dengan menggunakan analisa gen 16S rRNA sebagai Streptomyces triostinicus (InaCC A.234) dan S. ginsengisoli (InaCC A.413).
Keyword: aktinomisetes, antibakteri, skrining

Judul: Aktinomiset Rizosfer Penghasil Senyawa Bioaktif Antibakteri Penginfeksi Saluran Kemih
Abstrak: Beberapa bakteri yaitu Escherichia coli, Citrobacter braakii, Acinetobacter calcoaceticus, dan Klebsiella pneumoniae telah didapatkan pada urin penderita ISK sebagai penginfeksi. Laporan di dunia, jumlah penderita ISK cukup tinggi dan terus mengalami kenaikan tiap tahunnya. Komplikasi yang timbul jika infeksi tidak tertangani dengan baik dapat menimbulkan kerusakan ginjal hingga kematian. Kegagalan terapi umumnya disebabkan oleh sifat resisten antibiotik dari bakteri penginfeksi. Kondisi penderita diperparah dengan terdapatnya beberapa bakteri yang telah mengalami Multi Drug Resistance (MDR). Bahaya resistensi antibioik yang terjadi, perlu untuk dicari solusinya agar angka kematian penderita tidak bertambah. Salah satu solusi yang dapat ditawarkan yaitu mencari senyawa antibakteri baru dari lingkungan sekitar. Aktinomiset merupakan salah satu kelompok bakteri yang dapat ditemukan di berbagai relung ekologi, serta memiliki kelimpahan yang tinggi di tanah, terutama pada daerah dekomposisi tanaman. Kelompok bakteri tersebut juga dapat tumbuh dengan subur di daerah tanah kering, seperti pada tanah perkebunan jagung. Beberapa genus aktinomiset mampu memproduksi berbagai senyawa bioaktif antibakteri. Karakter senyawa antibakteri yang dihasilkan dari aktinomiset tanah kering dilaporkan memiliki kualitas yang lebih baik, yaitu lebih stabil, mudah larut, dan tahan terhadap panas dibandingkan senyawa antibakteri dari aktinomiset tanah basah. Berdasarkan karakter senyawa yang dimiliki oleh aktinomiset tanah kering dan bahaya resistensi bakteri penyebab ISK terhadap antibiotik yang sering digunakan, maka dalam penelitian ini telah dilakukan serangkaian teknik untuk menemukan senyawa antibakteri baru dari aktinomiset. Tahap yang telah dilakukan dalam penelitian ini yaitu penapisan potensi antimikrob dari 21 aktinomiset rizosfer yang telah dikoleksi di Divisi Mikrobiologi, Departemen Biologi, FMIPA IPB dengan enam bakteri penginfeksi saluran kemih (Escherichia coli, Citrobacter braakii, Acinetobacter calcoaceticus, dan Klebsiella pneumoniae) dengan metode modifikasi kertas cakram. Aktinomiset potensial yang mampu menghambat pertumbuhan bakteri uji, selanjutnya dikultur dalam medium cair dan supernatannya diujikan kembali terhadap bakteri penginfeksi saluran kemih untuk mengkonfirmasi aktivitas antibakteri senyawa bioaktif yang terkandung. Senyawa bioaktif antibakteri yang terdapat dalam supernatan dipisahkan dari medium kultur cair aktinomiset dengan cara diekstraksi menggunakan pelarut etil asetat. Ekstrak kasar etil asetat yang didapatkan, kemudian dilarutkan, dan diuji aktivitas penghambatannya terhadap bakteri penyebab ISK. Selain itu, ekstrak kasar juga ditentukan kandungan senyawa bioaktifnya dengan metode kromatografi gas, sehingga diketahui kandungan senyawa bioaktif di dalamnya. Aktinomiset penghasil antibakteri penginfeksi saluran kemih diidentifikasi berdasarkan gen 16S rRNA untuk mengetahui jenis isolat aktinomiset potensial. Hasil Penapisan aktinomiset rizosfer terhadap bakteri ISK (E. coli strain 1 hingga 3, C. braakii, A. calcoaceticus, dan K. pneumoniae) diperoleh tiga aktinomiset potensial yang memiliki zona hambat dan spektrum luas. Ketiga isolat tersebut yaitu ARJ 16, ARJ 24, dan ARJ 36. Ketiga aktinomiset potensial menunjukkan kemampuan penghambatan terhadap enam bakteri patogen uji. Kandungan senyawa bioaktif ekstrak kasar ARJ 16 dengan kelimpahan tertinggi yaitu 1,2-dikloro propana, sedangkan senyawa bioaktif tertinggi dalam ekstrak kasar ARJ 24 adalah asam n-Heksadekanoat, serta asam karbonoklorit, 2-kloroetil ester merupakan senyawa dengan konsentrasi yang tinggi dalam ekstrak kasar ARJ 36. Identifikasi aktinomiset potensial berdasarkan gen 16S rRNA menunjukkan bahwa ARJ 16 dan ARJ 24 memiliki kemiripan 99% dengan Streptomyces sp., sedangkan ARJ 36 memiliki kemiripan 98% dengan Streptomyces tendae. Ketiga isolat potensial dalam penelitian ini diharapkan kelak dapat menjadi bahan produksi senyawa antibiotik alternatif untuk terapi ISK.
Keyword: aktinomiset, antibakteri, infeksi saluran kemih

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: