Judul: The improvement of tiger shrimp diseases resistance against white spot syndrome virus by transfer of penaeus monodon antiviral gene.
Abstrak: Udang windu Penaeus monodon merupakan salah satu spesies krustase lokal yang dikembangkan sebagai komoditas utama budidaya tambak di Indonesia. Sejak tahun 1990-an, budidaya udang windu mengalami berbagai kendala, baik akibat lingkungan perairan yang kurang mendukung maupun adanya serangan penyakit bakteri dan virus. Virus bintik putih (white spot syndrome virus, WSSV) merupakan penyebab utama berbagai kasus kematian udang windu, yang hingga kini belum dapat diatasi secara tuntas. Kasus penyakit udang akibat serangan virus tidak hanya terjadi di Indonesia, tetapi juga terjadi di negara lain seperti India, Korea, Cina, dan Amerika. Penanggulangan penyakit pada budidaya udang windu telah dilakukan termasuk penggunaan antibiotik, vaksin, immunostimulan, dan teknologi seleksi. Meskipun demikian, metode tersebut memiliki kelemahan, antara lain: dapat menyebabkan berkembangnya strain bakteri yang resisten terhadap antibiotik, residu antibiotik memberikan dampak negatif pada lingkungan akuatik, pemberian vaksin dan imunostimulan harus dilakukan setiap siklus produksi, serta teknologi seleksi membutuhkan waktu, biaya, dan tenaga yang relatif banyak untuk memproduksi keturunan udang tahan penyakit. Sebuah metode baru yang dikenal dengan istilah transgenesis diharapkan dapat mengatasi kelemahan metode sebelumnya. Organisme transgenik yang tahan terhadap patogen dapat diproduksi dengan mengintroduksi gen yang berperan dalam sistem imun dan gen penyandi protein imunogenik dari patogen. Pada penelitian ini dilakukan introduksi gen penyandi protein antivirus udang windu (Penaeus monodon antiviral gene, PmAV) dengan tujuan untuk menghasilkan udang windu yang memiliki resistensi yang tinggi terhadap penyakit virus khususnya WSSV. Dalam rangkaian penelitian untuk memproduksi udang windu transgenik, sebagai tahap awal dilakukan isolasi, karakterisasi, dan kloning promoter antivirus ProAV dan cDNA gen antivirus PmAV dari udang windu sebagai penyusun konstruksi gen yang akan diintroduksi. Sekuen nukleotida promoter dan gen antivirus hasil isolasi dianalisis menggunakan program Genetyx Versi 7 untuk mendapatkan kemiripan (similaritas) sekuen, deduksi asam amino, dan keberadaan motif faktor transkripsi. Analisis kemiripan gen dilakukan melalui penyejajaran (alignment) sekuen pada Bank Gen menggunakan basic local alignment search tool (BLAST-N untuk sekuen nukleotida dan BLAST-P untuk sekuen deduksi asam amino). Sekuen promoter ProAV hasil isolasi selanjutnya diligasi dengan gen EGFP (enhanced green fluorescent protein) sebagai penanda untuk membuat konstruksi gen pProAV-EGFP yang digunakan dalam analisis aktivitas promoter ProAV. Konstruksi gen yang kedua, yaitu pProAVPmAV dibuat dengan menyambungkan promoter ProAV dan cDNA PmAV yang digunakan untuk memproduksi udang transgenik keturunan nol (F0) dan analisis ekspresi gen antivirus pada embrio dan larva. Konstruksi gen pProAV-EGFP ditransfer ke embrio udang windu menggunakan metode transfeksi dengan larutan jetPEI. Aktivitas promoter ProAV diketahui dengan mengamati ekspresi gen penanda EGFP pada embrio dan larva udang windu. Ekspresi gen EGFP dianalisis secara berkala, yakni 12, 18, 24, dan 30 jam setelah transfeksi (jst) menggunakan UV- transilluminator dan metode RT-PCR. Selanjutnya, konstruksi gen pProAV-PmAV ditransfer ke embrio udang windu menggunakan metode yang sama dengan pProAV-EGFP. Ekspresi gen PmAV juga dianalisis menggunakan metode RT-PCR pada rentang waktu sama dengan yang dilakukan pada gen EGFP. Pengamatan performa udang transgenik F0 dilakukan dengan cara uji tantang dengan virus WSSV untuk melihat kelangsungan hidup larva dan pola ekspresi transgen PmAV, serta bobot dan panjang tubuh udang. Data ekspresi gen EGFP dan PmAV dianalisis secara deskriptif. Data kelangsungan hidup udang windu dianalisis ragam (ANOVA) menggunakan program Statistix Versi 3.0 dan dilanjutkan
Keyword: 

Judul: Tingkat efektivitas white spot syndrom virus (wssv) terhadap post larva udang windu (panaeus monodon fabr) melalui perendaman selama 60 menit dalam berbagai konsentrasi
Abstrak: Penurunan produksi budidaya udang windu salah satunya adalah akibat penyakit bintik putih, yang disebabkan oleh White Spot Syndrome Virus (WSSV). Penyakit ini sangat ganas, kematian 100% terjadi dalam Waktu 3-10 hari sejak gejala klinis telihat. Upaya pengendalian penyakit tersebut dilakukan melalui pengendalian lingkungan, peningkatan daya tahan tubuh udang maupun peningkatan genetis. Salah satu unsur pengendalian lingkungan dapat dilakukan melalui filtrasi maupun pengenceran, yang menjadi permasalahan adalah berapa tingkat kerusakan virus yang berada di lingkungan yang masih dapat ditolerir oleh udang Penelitian ini dilaksanakan pada bulan September 2002-Maret 2003, yang dilaksanakan di Divisi Manajemen Kesehatan Akuatik, Balai Besar Pengembangan Budidaya Air Payau (BBPBAP) Jepara, Jawa Tengah dan di Laboratorium Kesehatan Ikan, Jurusan Budidaya Perairan, FPIK, IPB, Bogor. Udang Windu yang digunakan berasal dari Hatchery BBPBAP Jepara, Jawa Tengah, stadia PL-17, yang sebelumnya sudah diskrining dengan formalin 100 ppm, kemudian diaklimatisasi selama 7 hari. Sumber WSSV yang diinfeksikan berasal dari udang windu yang positif terinfeksi WSSV. Uji penularan WSSV dilakukan dengan cara perendaman pada konsentrasi virus 2000 ng/ml, 200 ng/ml, 20 ng/ml, 2 ng/ml, 02 ng/ml dan 0,02 ng/ml, yang direndam selama 60 menit. Udang dipelihara selama 30 hari, diberi pakan berupa artemia dan pakan pelet Penentuan keberhasilan penginfeksian WSSV didasarkan pada mortalitas udang uji selama pemeliharaan, gejala klinis berupa perubahan tingkah laku dan morfologi udang secara visual, prevalensi dan adanya kelainan pada inti sel yang dilihat secara histologi.
Keyword: increasing the shrimp's immune system, genetic improvement, environmental control

Judul: Penggunaan Teorema Homeomorphy 2-Manifold dan Teorema Euler Poincare pada Torus 𝑇�� dan Simplicial Complex 𝐾��
Abstrak: Two dimensional topological spaces are said to be homeomorphic if they have the same topological invariant, where one of topological invariant used is an Euler characteristic. Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem and Euler Poincare’s Theorem are used to distinguish two topological spaces. Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem uses Euler characteristic to identify two dimensional topological spaces. Euler Poincare’s Theorem is an alternative way to find Euler characteristic with Betti number, which is topological invariant as well. The objective of this paper is to investigate the homeomorphism of torus 𝑇����� and simplicial complex 𝐾�����. Topological space torus and simplicial complex 𝐾����� have the same Euler characteristic, which is two. Based on Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem topological space torus 𝑇����� and simplicial complex 𝐾����� is homeomorphic.
Keyword: simplicial, torus, Euler, homeomorphism, topology