Judul: Identification of the THY1 Gene Polymorphisms in Candidate IPB-D2 Chicken Line
Abstrak: Gen THY1 merupakan anggota superfamili imunoglobulin yang memiliki kemiripan pada berbagai spesies. Fungsi dari gen THY1 belum sepernuhnya diketahui, namun berperan penting dalam respon imun yaitu berpartisipasi pada aktivasi sel T. Penelitian ini dilakukan untuk mengidentifikasi keragaman gen THY1 pada calon galur ayam IPB-D2 G0 yang dapat dijadikan sebagai kandidat marka genetik sifat ketahanan tubuh terhadap penyakit pada ayam. Penelitian ini dilakukan dengan teknik PCR dan sekuensing DNA. Hasil penelitian menemukan 2 titik SNP pada intron yaitu posisi basa g.2752 C>T dan g.3155 A>G, serta 1 titik SNP pada ekson 3 yaitu posisi basa g.2835 G>A. Kombinasi 3 SNPs membentuk 7 haplotipe. SNP g.2835 G>A merupakan synonymous mutation, bersifat polimorfik, berada pada keseimbangan Hardy-Weinberg, dan beragam. SNP g.2752 C>T dan g.3155 A>G bersifat polimorfik, namun tidak berada pada keseimbangan Hardy-Weinberg, dan keragamannya rendah., The THY1 gene is a member of the immunoglobulin superfamily which has the similarities in various species. The function of the THY1 gene is not fully known, but it plays an important role in the immune response, namely the activation of T cells. This study was conducted to identify the polymorphism of the THY1 gene in candidate IPB-D2 G0 chickens line which can be used as candidates for immunoresistance genetic markers chicken. This research was conducted by PCR techniques and DNA sequencing. The results of the study found 2 SNP points on the intron namely base position g.2752 C> T and g.3155 A> G, and 1 SNP point on exon 3 namely base position g.2835 G> A. The combination of 3 SNPs formed 7 haplotypes. SNP g.2835 G> A is an synonymous mutation, polymorphic, Hardy-Weinberg equilibrium, and varied. SNP g.2752 C> T and g.3155 A> G were polymorphic, but not in the Hardy-Weinberg equilibrium, and the diversity is low.
Keyword: immunity, IPB-D2 Chickens, polymorphisms, SNP, THY1 gene

Judul: Identifikasi Keragaman Gen BG1 Sebagai Kandidat Gen Pengontrol Ketahanan Penyakit Pada Ayam IPB-D2
Abstrak: Ayam IPB-D2 adalah ayam IPB-D1 yang diseleksi berdasarkan konsentrasi IgY dan titer antibodi yang tinggi sebagai parameter ketahanan penyakit ayam. Gen BG1 merupakan salah satu gen yang berperan dalam ketahanan penyakit. Gen BG1 berada di wilayah MHC dan sangat polimorfik. Tujuan penelitian ini adalah mengidentifikasi Single Nucleotide Polymorphism (SNP) gen BG1 pada ayam IPBD2 menggunakan metode direct-sequencing. Penelitian ini menggunakan 46 sampel darah ayam IPB-D2. Hasil sequencing dianalisis untuk memperoleh nilai frekuensi genotipe, frekuensi alel, nilai heterosigositas dan keseimbangan HardyWeinberg (uji chisquare). Penelitian ini ditemukan 8 SNP yaitu g.4817 G>T, g.4865 C>A, g.4944 C>T, g.5040 C>T, g.5069 T>C, g.5075 T>C, g.5089 G>A , g.5367 A>G dan delesi g.5086 – g.5087DelAT. Kombinasi 8 SNP membentuk 6 haplotipe. SNP yang mengubah susunan asam amino yaitu SNP g.4817 G>T cys>phen , SNP g.4865 C>A ser>tyr dan SNP g.5089 G>A gly>glu. Mutasi basa g.4944 C>T beragam dan berada dalam kesetimbangan Hardy Weinberg., IPB-D2 chickens were IPB-D1 chickens that were selected based on high IgY concentrations and ND antibody titer as a parameter of body resistance to disease. BG1 gene is one of the gene that play a role in disease resistance. BG1 gene resides in the MHC region and is highly polymorphic. The purpose of this study was to identify the Single Nucleotide Polymorphism (SNP) of BG1 gene in IPB-D2 chickens using direct-sequencing method. This study used 46 blood samples of IPB-D2 chickens. The sequencing results were analyzed to obtain genotype frequency, allele frequency, heterozygosity and Hardy Weinberg's equilibrium (chisquare test). This results found 8 SNPs that is g.4817 G> T, g.4865 C> A, g.4944 C> T, g. .5040 C>T, g.5069 T>C, g.5075 T>C, g.5089 G>A , g.5367 A>G dan indel mutation g.5086 – g.5087DelAT. The combination of 8 SNPs forms 6 haplotypes. SNPs that changed the amino acid composition were SNP g.4817 G> T cys> phen, SNP g.4865 C> A ser> tyr and SNP g.5089 G> Agly> glu. Mutations g.4944 C> T were diverse and was in Hardy Weinberg equilibrium.
Keyword: BG1 gene, disease resistance, diversity, IPB-D2 Chicken, mutation

Judul: Urban landscape management as a waterfront landscape on the coast of makassar city
Abstrak: Kota Makassar merupakan salah satu kota pesisir yang ada di Indonesia dengan luas 175,77 km2 yang terdiri dari 15 kecamatan dengan panjang garis pantai kurang lebih 32 km. Dalam Rencana Tata Ruang Wilayah (RTRW) Kota Makassar 2015-2034 memiliki tujuan untuk mewujudkan wilayah kota berbasis pada konsep kota tepian air (waterfront city). Sebagai upaya dalam mencapai tujuan tersebut pemerintah melakukan berbagai kegiatan revitalisasi dan reklamasi pada kawasan pesisir. Kegiatan yang terjadi pada pesisir Kota Makassar membawa suatu perubahan pada kondisi pesisir baik itu secara positif ataupun negatif. Dampak negatif terlihat ialah adanya perubahan morfologi akibat adanya pendangkalan pada kawasan pesisir yang menyebabkan penurunan kualitas air laut akibat kurang optimalnya pertukaran air laut, berkurangan kawasan mangrove dan pencemaran lingkungan yang terjadi akibat kegiatan rumah tangga dan industri. Hal ini mempengaruhi kualitas lanskap pesisir, sehingga untuk mengatasi masalah tersebut diperlukan upaya dalam manajemen pengelolaan lanskap yang baik. Penelitian ini memiliki tujuan untuk menginventarisasi, memetakan, mengevaluasi manajemen lanskap pesisir berbasis waterfront city, dan analisis persepsi masyarakat. Metode yang digunakan ialah analisis kesesuaian lahan, analisis keindahan, analisis kenyamanan, dan analisis persepsi masyarakat. Hasil penelitian disusun menjadi rekomendasi strategi pengembangan dan manajemen waterfront city untuk mewujudkan waterfront landscape di Kota Makassar. Berdasarkan analisis kesesuaian lahan lanskap pesisir Kota Makassar berpotensi sebagai pengembangan kawasan wisata, konservasi, dan permukiman. Pengembangan kawasan perlu dilakukan dengan memperhatikan faktor pembatas pada lanskap eksisting setiap fungsi kawasan sebagai upaya peningkatan kualitas lingkungan. Kualitas visual lanskap pesisir Kota Makassar memiliki nilai Scenic Beauty Estimation (SBE) beragam. Kualitas visual tinggi didominasi oleh kawasan dengan pemandangan vegetasi dengan penataan yang baik dan rapi yang memperlihatkan view alam seperti laut dan langit. Sedangkan pada ruang dengan kualitas rendah terlihat kawasan yang tidak tertata baik dan sampah yang berserakan. Tingkat kenyamanan pada ruang terbuka lanskap pesisir memiliki tingkat kenyamanan yang baik pada pagi dan sore hari, sedangkan pada siang hari memiliki tingkat kenyamanan yang tidak nyaman. Analisis persepsi menunjukan bahwa faktor pendidikan dan jarak tempat tinggal memiliki nilai korelasi positif pada setiap aspek persepsi masyarakat terhadap penerapan konsep waterfront city. Hal ini menunjukan bahwa semakin baik tingkat pendidikan dan jarak tinggal responden menilai bahwa penerapan konsep tersebut belum terealisasikan dengan baik. Hal tersebut dapat dilihat dari banyaknya masalah lingkungan dan konflik yang masih terjadi. Selain itu aspek peran pemerintah dan pengawasan merupakan persepsi dengan nilai korelasi terendah yang menunjukan bahwa peran pemerintah dalam pelaksanaan dan pengelolaan waterfront kurang terlihat. Pemerintah sebagai penentu kebijakan perlu berperan aktif dalam penerapan konsep waterfront sehingga dapat menciptakan kondisi yang optimal bagi segala pihak dalam memanfaatkan lanskap pesisir Kota Makassar. Rekomendasi konsep diusulkan yaitu responsible dan resilience dengan strategi pengelolaan yaitu melakukan redevelopment waterfront dengan fungsi mixed use yang terdesentralisasi pada setiap ruang berdasarkan fungsi. Kota Makassar direkomendasikan menjadi tiga zona yaitu zona pariwisata, zona campuran, dan zona konservasi yang didukung oleh program pengelolaan masing-masing.
Keyword: kawasan pesisir, manajemen lanskap, perkotaan, waterfront landscape