Judul: Identifikasi dan Kloning Gen CalBsyn ke dalam Plasmid pJ912-AGα-RFP di Escherichia coli
Abstrak: Sistem tampilan permukaan khamir telah menjadi teknik yang semakin popular untuk rekayasa protein dan pembuatan pustaka protein. Protein heterolog yang ditampilkan pada permukaan sel khamir diekspresikan dalam bentuk fusi dengan suatu protein penahan atau protein permukaan. Protein CALB (Candida antratica Lipase B) yang disandikan oleh gen sintetik CalBsyn dapat ditingkatkan efektivitasnya melalui ekspresi pada permukaan sel khamir. Plasmid pJ912-AGα- RFP mengandung gen penyandi protein permukaan, AGα (Agglutinin-α) dan gen penyandi protein penanda ekspresi, RFP (Red fluorescent protein). Penelitian ini bertujuan untuk memperoleh konstruksi vektor pJ912-AGα-RFP-CalBsyn untuk ekspresi protein CALB rekombinan pada permukaan sel khamir Pichia pastoris melalui kloning gen CalBsyn ke dalam plasmid pJ912-AGα-RFP pada Escherichia coli. Gen CalBsyn tanpa sinyal sekresi natifnya diperoleh dari plasmid pJ912- CALB melalui amplifikasi PCR menggunakan pasangan primer mCalB-Sal-F dan mCalB-His-Sal-R. Gen mCalBsyn yang diperoleh berukuran panjang 1004 bp. Baik gen mCalBsyn maupun plasmid pJ912-AGα-RFP dipotong dengan enzim restriksi SalI, kemudian diligasi dan ditransformasi ke dalam E. coli dengan metode kejut panas. Transformasi menghasilkan 11 koloni transforman putatif yang selanjutnya dipurifikasi menjadi koloni-koloni tunggal. Analisis PCR dengan primer AOX1-F dan mCalB-His-Sal-R menunjukkan adanya 34 koloni tunggal dari klon yang dianalisis terindikasi positif membawa plasmid rekombinan pJ912-AGα-RFPCalBsyn.
Keyword: agglutinin-α, Candida antartica Lipase B, sistem tampilan permukaan khamir, Pichia pastoris

Judul: Konstuksi Vektor Dan Ekspresi Protein Rekombinan Lipase Candida Antarctica (Calb) Dengan Cellulose Binding Module (Cbm) Pada Pichia Pastoris
Abstrak: Gen CalBsyn telah dikonstruksi secara sintetik untuk menyandi Candida antarctica lipase B (CALB). Enzim tersebut memiliki peranan penting sebagai biokatalis yang efektif di bidang bioteknologi dan industri. Sekuens gen CalBsyn telah dimodifikasi dengan mengintroduksi mutasi pada tiga asam amino, yaitu V210I, A281E, dan V221D untuk meningkatkan termostabilitas enzim tersebut. Fragmen gen cellulose binding module (cbm) endoglukanase I (egl1) dari Trichoderma reesei difusikan pada ujung karboksil gen CalBsyn pada plasmid rekombinan pGAPZα-CalBsyn. CBMmerupakan suatu domain protein yang umum dijumpai pada enzim selulase dan berfungsi dalam pengikatan enzim pada matrik selulosa. Dalam penelitian ini CBM digunakan untuk memfasilitasi imobilisasi CALB pada matrik selulosa melalui fusi dari dua protein tersebut. Penelitian ini bertujuan mengkonstruksi vektor ekspresi gen CalBsyn yang difusi dengan cbm dan mengekspresikan CALB pada Pichia pastoris SMD1168H. Baik plasmid maupun gen cbm dipotong dengan enzim ClaI. Plasmid rekombinan pGAPZα-CalBsyn-cbm dikonstruksi dengan cara meligasikan gen cbm ke dalam plasmid pGAPZα-CalBsyn. Plasmid rekombinan pGAPZα-CalBsyn-cbm diklon dan diseleksi pada Eschericia coli TOP10F’. Plasmid rekombinan pGPAZα-CalBsyn telah berhasil diintroduksi ke dalam genom P. pastoris SMD1168H melalui metode elektroporasi. Efisiensi transformasi yang diperoleh sebesar 1,01 x 102 cfu/μg DNA. Analisis ekspresi protein rekombinan dilakukan terhadap beberapa galur rekombinan P. pastoris terpilih. Uji aktivitas lipase secara kualitatif pada media seleksi menunjukkan bahwa galur transforman P. pastoris yang diperoleh positif mensekresikan lipase rekombinan (CALB) dan memiliki aktivitas lipolitik. Uji aktivitas lipase secara kuantitatif dari salah satu galur transforman P. pastoris menunjukkan bahwa aktivitas enzim mencapai 6,35 Units/ml pada jam ke-48. Analisis protein dengan SDS-PAGE menunjukkan bahwa CALB berhasil diekspresikan secara ekstraseluler dengan ukuran sekitar 45 kDa.
Keyword: Candida antarctica lipase B, cellulose binding module, recombinant Pichia pastoris

Judul: Analisis nilai sewa ekonomis sebagai sewa sumberdaya dalam pengelolaan hutan tropis di Indonesia
Abstrak: Sumberdaya hutan termasuk dalam kelompok sumberdaya alam yang dapat diperbaharui karena jumlahnya selalu berubah. Sumberdaya hutan sebagai sumberdaya diperbaharui atau pulih dapat digunakan secara bijaksana yaitu menghasilkan penerimaan dan kepuasan ekonomi yang maksimum. Hal ini ber­arti dalam pengeksploitasian sumberdaya hutan diperlukan adanya pelaksanaan pengaturan secara lestari dan dapat memaksimumkan penerimaan bersih pengelola, sehingga dalam waklu bersamaan dapat memelihara dan memperbaiki kapasitas sumberdaya hutan untuk keperluan masa mendatang dan dipergunakan untuk sebesar-besarnya kemakmuran rakyat (Amanat UUD'45, pasal 33 butir c). Menurut Vincent (1990) nilai sewa ekonomis adalah pembebaban terhadap kayu yang ditcrima dalam bentuk kayu bulat baik berupa tegakan atau yang telah ditebang di lokasi hutan. Gray (1983) nilai sewa ekonomis umumnya dibebankan atau diterimakan pada kayu bulat yang diekstraksi atau ditebang dari hutan tersebut dan tidak pada pohon tegakan. Gillis (1980) mengatakan adanya kegagalan dalam sistem nilai sewa atau rente ekonomis untuk menangkap nilai sewa sumberdaya potensial dari hutan tropis. Gillis (1988) mengatakan bahwa nilai sewa ekonomis dapat dikenakan pada beberapa kegiatan sumberdaya alam yang nilainya diperoleh dari nilai pendapatan dikurangi dengan biaya tenaga kerja, material dan input kapital (termasuk biaya pembayaran "normal" sebagai nilai pengembalian dari input kapital). Karena itu dalam ekonomi sumberdaya hutan, konsep nilai tegakan (stumpage value) sangat berkaitan atau berdekatan dengan nilai sewa ekonomis atau economic rent (Davis, 1954). Sedangkan economic rent dalam konsep teori ekonomi modern disebut sebagai quasi-rent (Marshall, 1949; Ferguson and Gould, 1975; Barlow, 1978). Studi Ruzicka (1979) tentang nilai sewa ekonomis hutan tropis di Indonesia selama periode 1972/1973 - 1976/1977 Pemerintah hanya memperoleh 25 % dari rente ekonomis riil sedangkan pengusaha memperoleh windfall profit sebesar 75 persen. Repetto dan Gillis (1988) telah mencoba merangkum berbagai studi tentang besarnya nilai sewa ekonomis yang diterima Pemerintah selama periode 1979-1982 yaitu sebesar 37,3 % di Indonesia. Studi lain untuk Indonesia sebesar 33,2% (Gillis, 1988a) dan sebesar 49,07% selama 1979-1982 (Repetto, 1988), studi WALHI (1991) Pemerintah hanya menerima sekitar 16,19% dari rente ekonomis hutan. Adapun penerimaan Pemerintah dari nilai sewa ekonomis hutan di Philippinaadalah 11,4% (Boado, 1988) dan sebesar 18,17% selama 1979-1982 (Repetto, 1988) serta sebesar 16,5% (Repetto dan Gillis, 1988), sedangkan di Serawak 29% dan Sabah 82,8% (Gillis, 1988b) atau sebesar 83,68% selama 1979-1983 (Repetto, 1988) dan sebesar 81,30% (Repetto dan Gillis, 1988). Studi Vincent (1990) besarnya nilai sewa ekonomis yang diterima Pemerintah Sabah 46,2%, Semenanjung Malaysia 21,8% dan Serawak 18,4 persen. Studi lain yang dilakukan pada tahun 1990 tentang hutan tropis Indonesia telah dibedakan berdasarkan letak lokasi hutan. Pada hutan rawa Pemerintah menerima 43%, di hutan pegunungan 44% dan di hutan dataran rendah sampai sedikit berbukit hanya 21 % dari rente ekonomis hutan (Transtoto, 1992). Ternyata dari berbagai studi, khususnya di hutan tropis Indonesia penerimaan Pemerintah masih relatif kecil dibandingkan yang diterima oleh pengusaha sebagai windfall profit. Hubungannya dengan ini, maka Darusman pada tahun 1976 (Transtoto, 1992) mengusulkan agar tarif pungutan atau nilai sewa ekonomis dinaikan em pat kali dari nilai dua dollar Amerika pada saat itu.
Keyword: Tropical forest, Economic rent, Exploitation, Logging;