Judul: Produksi Antibodi Poliklonal Geminivirus, Penyebab Penyakit Daun Keriting Kuning Cabai, dan Kajian Serologinya.
Abstrak: Penyakit daun keriting kuning cabai, yang disebabkan oleh geminivirus telah dilaporkan menyebabkan kerusakan yang sangat berat pada areal pertanaman cabai di Indonesia, terutama di Pulau Jawa. Usaha untuk mengelola penyakit yang disebabkan oleh geminivirus melibatkan pendekatan secara kultur teknis seperti rotasi tanaman, tanaman tumpang gilir, tanaman tahan, tanaman penghalang, dan dengan pendekatan secara kimiawi dan hayati untuk mengendalikan serangga vektor, Bemisia tabaci. Salah satu komponen penting di dalam pengendalian penyakit yang disebabkan oleh geminivirus adalah mendeteksi infeksi sedini mungkin. Oleh karena itu, penelitian ini dilakukan untuk mengembangkan metodologi untuk mendeteksi infeksi geminivirus. Sasaran dari penelitian ini adalah menghasilkan antibodi poliklonal geminivirus dan menggunakannya di dalam teknik serologi untuk mendeteksi geminivirus. Pemumian geminivirus dilakukan dengan menggunakan gradien sesium sulfat (Cs2S04). Kualitas dari preparasi geminivirus mumi ditetapkan menggunakan spektrofotometer (A26of A2so). Preparasi geminivirus mumi ini kemudian digunakan untuk imunisasi pada kelinci untuk menghasilkan antibodi poliklonal geminivirus. Antibodi dipanen sepuluh hari setelah imunisasi terakhir. Dua metode serologi yaitu, gel double-diffasion test, dan modifikasi indirect-enzyme linked immunosorbent assay (I-ELISA) digunakan untuk menentukan titer antibodi. Reaksi positif masih diperoleh pada pengenceran sampai 1/4 dan 1/16384, menggunakan gel double-diffasion test, dan modifikasi I-ELISA, berturut-turut. Reaksi antibodi yang sama ditemukan antar isolat geminivirus dari berbagai lokasi yang berbeda (Bogor dan Segunung, Jawa Barat; Kaliurang dan Kulonprogo, Jogjakarta) dengan metode dot immunobinding assay (DIBA). Menggunakan metode I-ELISA, antobodi poliklonal geminivirus tidak menunjukkan reaksi silang terhadap Cucumber mosaic cucumovirus (CMV), Tobacco mosaic tobamovirus (TMV), dan Chili veinal mottle potyvirus (ChiVMV).
Keyword: Geminivirus, pemurnian, antibodi poliklonal, gel double-diffusion test, I-ELISA, DIBA

Judul: Karakterisasi Begomovirus Penyebab Penyakit Daun Keriting pada Mentimun (Cucumis sativus L.)
Abstrak: Mentimun (Cucumis sativus L.) merupakan salah satu sayuran utama yang dibudidayakan oleh petani di Indonesia. Produktivitas mentimun sangat dipengaruhi oleh budidaya yang kurang intensif dan efisien, serta adanya gangguan hama dan penyakit. Salah satu kendala produksi adalah penyakit yang disebabkan oleh infeksi Begomovirus penyebab penyakit daun keriting. Penyakit daun keriting yang disebabkan oleh Begomovirus pada beberapa jenis pertanaman di Indonesia dilaporkan menyebabkan kehilangan hasil sehingga menimbulkan kerugian yang cukup besar. Pertanaman tembakau di Jawa Timur dilaporkan mengalami kerusakan hingga 30% karena infeksi Tobacco leaf curl begomovirus pada tahun 1984. Sejak awal tahun 2000 pertanaman cabai di daerah Jawa Barat dan Jawa Tengah dilaporkan terinfeksi Begomovirus dan sampai sekarang penyakit kuning yang disebabkan oleh Pepper yellow leaf curl begomovirus belum dapat dikendalikan. Tomato yellow leaf curl begomovirus yang menyebabkan epidemi penyakit daun keriting juga menjadi kendala utama dalam meningkatkan produksi tanaman tomat di Jawa Barat dan Jawa Tengah. Akhir-akhir ini penyakit daun keriting yang disebabkan oleh Begomovirus ditemukan pada tanaman mentimun di Kabupaten Klaten, Jawa Tengah. Penyakit yang sama dilaporkan di Thailand sejak tahun 1996, dan virus penyebab penyakit tersebut memiliki kemiripan sikuen nukleotida yang tinggi dengan isolat Tomato leaf curl New Delhi begomovirus (TLCV-New Delhi). Infeksi Begomovirus pada tanaman Cucurbitaceae telah lama menjadi masalah di beberapa negara, diantaranya Squash leaf curl begomovirus menyebabkan penyakit daun keriting pada labu (Cucurbita maxima) dan Watermelon curly mottle begomovirus menyebabkan penyakit daun menguning dan kerdil pada melon (C. melo) di Amerika Serikat. Identifikasi dan karakterisasi Begomovirus penyebab penyakit daun keriting mentimun di Jawa belum dilakukan secara khusus. Begomovirus hanya dapat ditularkan melalui serangga vektor kutukebul (Bemisia tabaci) dan serangga ini dapat mengolonisasi berbagai spesies tanaman. Hal tersebut sangat berbahaya karena akan mendukung terjadinya ledakan penyakit daun keriting. Oleh karena itu, perlu dilakukan penelitian untuk mengetahui sifat-sifat Begomovirus agar dapat menyusun rekomendasi strategi pengendalian penyakit yang tepat untuk mencegah kerugian oleh infeksi Begomovirus. Penelitian dilakukan dengan tujuan untuk mendeteksi virus-virus yang menginfeksi tanaman mentimun, mengidentifikasi Begomovirus yang menginfeksi mentimun, mempelajari efisiensi penularan Begomovirus melalui serangga vektor B. tabaci dan mengetahui beberapa jenis tanaman inang dari Begomovirus yang menginfeksi mentimun. Penelitian meliputi empat kegiatan pokok yaitu pengumpulan sampel tanaman mentimun dan deteksi beberapa virus pada sampel daun mentimun dari lapangan, identifikasi Begomovirus dengan metode molekular, pengujian efisiensi penularan Begomovirus melalui kutukebul, dan pengujian kisaran inang. Pengamatan gejala dan pengambilan sampel tanaman yang terinfeksi Begomovirus dilakukan di daerah Jawa Barat (Bogor, Subang), Jawa Tengah (Tegal, Sukoharjo), dan Daerah Istimewa Yogyakarta (Sleman). Daun mentimun yang dikumpulkan sebagai sampel adalah daun yang menunjukkan gejala daun keriting, mosaik, melepuh, dan menguning. Gejala yang umum terlihat pada pertanaman mentimun meliputi gejala mosaik kuning cerah, mengeriting, melepuh, penebalan tulang daun, dan reduksi ukuran daun. Infeksi Begomovirus, SqMV, ZyMV, dan CMV berhasil dideteksi pada hampir semua sampel daun, namun infeksi TRSV dan WMV tidak terdeteksi pada semua sampel. Infeksi oleh lebih dari satu jenis virus ditemukan pada beberapa sampel daun dari beberapa lokasi. Sampel asal Bogor dan Sleman (Kalasan dan Ngemplak) yang terinfeksi oleh 4 virus (Begomovirus, SqMV, ZyMV, dan CMV) secara bersamaan menunjukkan gejala yang lebih parah dibandingkan sampel lainnya yaitu berupa daun keriting,
Keyword: Analisis keragaman genetik, efisiensi penularan, Geminivirus, kisaran inang, serangga vektor

Judul: Numerical modeling of the hydrodynamics of standing wave and scouring in front of impermeable breakwater with different steepnesses
Abstrak: The aim of this paper is to numerically study the effects of breakwater steepness on the hydrodynamics of standing wave and scouring process in front of impermeable breakwaters. A two-dimensional hydrodynamics model based on the Reynolds Averaged Navier–Stokes (RANS) equations and the Volume of Fluid (VOF) method was developed and then combined with an empirical sediment transport model. Comparisons with an analytical solution and experimental data showed the present model is very accurate in predicting the near bottom velocity and capable of simulating the scour/deposition patterns consistent with experimental data. It was found that the additional terms of bottom shear stress in the momentum equations are necessary to produce a physical scouring pattern. Different breakwater steepnesses produce different characteristics of standing wave, the steady streaming system, and scouring pattern in front of the breakwaters, which also affects the correlations between them. An additional analysis of the turbulence field parameters and the sediment transport rate was also performed. All these important information will be presented in details in this paper and can be worthwhile for designing the breakwater in coastal areas.
Keyword: The RANS–VOF model Standingwave Steadystreamingsystem Scouring pattern Breakwatersteepness