Judul: Introduction of MmCu/ZnSOD Gene into Potato (Solanum tuberosum L.) Genome Cultivar IPB CP3 Mediated Agrobacterium tumefaciens
Abstrak: Cekaman abiotik merupakan salah satu faktor penyebab penurunan kualitas dan hasil produksi pertanian. Pada kondisi tercekam, tanaman akan memproduksi reactive oxygen species (ROS) berlebih seperti superosida (O2*-) dan hydroxyl radical (OH*) yang dapat mendegradasi biomolekul penting seperti protein, lipid, karbohidrat dan DNA sehingga menyebabkan kerusakan dan kematian sel. Tujuan dari penelitian ini adalah mengintroduksi gen MmCu/ZnSOD dibawah kendali promotor 35S CaMV ke dalam genom tanaman kentang IPB CP3 untuk meningkatkan toleransinya terhadap cekaman kekeringan dan salinitas melalui detoksifikasi ROS. Transformasi genetik dengan perantara Agrobacterium tumefaciens pada 300 eksplan ruas batang tanpa mata tunas menghasilkan tanaman transgenik putatif dengan efisiensi transformasi dan regenerasi sebesar 47,33% dan 31,09%, secara berurutan. Analisis integrasi menunjukkan bahwa 18 klon transgenik terbukti membawa gen MmCu/ZnSOD di bawah kendali promotor 35S CaMV yang menandakan bahwa klon tersebut transgenik. Uji cekaman kekeringan dan salinitas secara in vitro menunjukkan bahwa keenam klon transgenik memiliki toleransi lebih tinggi dibandingkan non-transgenik berdasarkan jumlah dan panjang akar total.
Keyword: superoksida dismutase, kekeringan, salinitas, kentang, reactive oxygen species

Judul: Transformasi Genetik Kentang (Solanum tuberosum L.) Kultivar Atlantic dengan Gen MmCu/Zn-SOD Penyandi Enzim Superoxide Dismutase.
Abstrak: Kekeringan dan kemasaman tanah adalah tantangan yang dihadapi tanaman kentang saat ini. Kentang merupakan jenis tanaman yang sensitif terhadap kekeringan, sehingga keberlanjutan produksinya dapat terancam jika diterpa kekeringan yang berkepanjangan. Kemasaman tanah mengakibatkan beberapa hara makro dan mikro dapat berada pada status kurang atau tidak tersedia bagi tanaman. Selain, itu kelarutan unsur logam berat yang tinggi khususnya Al dapat membuat tanaman mengalami keracunan. Enzim superoxide dismutase (SOD) adalah enzim antioksidan yang berperan di dalam mekanisme pertahanan pertama tanaman terhadap cekaman reactive oxygen species (ROS). ROS adalah produk samping yang tidak terhindarkan dari metabolisme aerobik, tetapi tidak berbahaya selama konsentrasinya terkontrol oleh antioksidan. Cekaman abiotik, seperti kekeringan dan logam berat, dapat membuat produksi ROS meningkat secara signifikan melampaui konsentrasi antioksidan, sehingga meracuni tanaman. Ekspresi gen SOD secara berlebih untuk mengimbangi produksi ROS dilaporkan telah mampu meningkatkan sifat toleransi tanaman terhadap cekaman kekeringan dan logam berat. Tujuan dari penelitian ini adalah mengintroduksikan gen SOD yang berada di bawah kendali promotor kuat 35S CaMV ke dalam kentang kultivar Atlantic. Gen SOD yang berada di bawah kontrol promotor kuat 35S CaMV diintroduksikan ke dalam kentang menggunakan perantara bakteri Agrobacterium tumefaciens. Sel-sel transforman diseleksi dari sel non transforman dengan menggunakan antibiotik higromisin taraf 25 mg/L dan 10 mg/L. Dari kedua taraf antibiotik tersebut, dosis higromisin 10 mg/L merupakan dosis antibiotik terbaik karena telah mampu menginduksi regenerasi tanaman dalam waktu sekitar 6 minggu dibandingkan dosis 25 mg/L yang memerlukan waktu sekitar 23 minggu. Selain itu, kecepatan waktu regenerasi tanaman dapat lebih terpacu dengan cara penggunaan ruas batang sebagai bahan transformasi, penggunaan zeatin dalam media regenerasi, perpanjangan masa pre culture eksplan sebelum ditransformasi selama 4 hari (1 hari gelap dan 3 hari terang), pemanenan bakteri yang dilakukan pada nilai OD λ600 = 0.2-0.3 disertai peniadaan tahapan pencucian eksplan dan perendaman dengan larutan antibiotik cefotaxime. Berdasarkan hasil analisis PCR terhadap tanaman transgenik putatif, diperoleh satu tanaman transgenik. Uji tantang tanaman transgenik terhadap cekaman kekeringan secara in vitro menggunakan PEG 8000 dengan konsentrasi 8 % menunjukkan bahwa tanaman transgenik bersifat lebih toleran dibandingkan tanaman non transgenik. Tanaman transgenik juga bersifat lebih toleran dibandingkan tanaman non transgenik ketika diuji terhadap cekaman AlCl3 sebanyak 1.6 mM dan pH media 4.5 (sangat masam).
Keyword: kekeringan, kemasaman tanah, alumunium, SOD, ROS

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: