Judul: Determination of Three Dimensional Structure and Hydrolyzate Profile of Protein Allergen Arginine Kinase (Pen m 2) by In Silico
Abstrak: Alergi pangan merupakan suatu gangguan kesehatan akibat reaksi hipersensitivitas yang diawali oleh mekanisme imunologis yang terjadi setelah terpapar alergen dari suatu bahan pangan. Kasus alergi pangan banyak terdapat di dunia maupun di Indonesia dan dapat menimbulkan gejala klinis ringan hingga berat. Alergen dalam makanan dapat berupa protein, glikoprotein atau polipeptida. Arginin kinase (dengan kode alergen Pen m 2) merupakan alergen yang terdapat pada udang windu (Penaeus monodon) dan dapat memicu terjadinya alergi. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan struktur tiga dimensi Pen m 2 dan mendapatkan profil hidrolisat enzimatis dan non enzimatis secara in silico dari Pen m 2. Tahap pertama penelitian ialah pencarian identitas dan karakteristik fisikokimia arginin kinase, kemudian tahap kedua ialah penentuan struktur tiga dimensi protein Pen m 2 dengan menggunakan server SWISS-MODEL, dilanjutkan dengan tahap ketiga yaitu pemotongan sekuens protein Pen m 2 secara enzimatis dan non enzimatis dengan menggunakan server expasyPeptideCutter. Hasil penelitian menunjukkan bahwa Pen m 2 merupakan anggota dari keluarga ATP:guanido fosfotransferase dan mengandung pola kinase fosfagen. Dari penelitian ini diperoleh struktur tiga dimensi Arginin kinase (Pen m 2) dengan hasil identitas sekuens 99,61%. Evaluasi struktur tiga dimensi dengan menggunakan plot Ramachandran menjelaskan bahwa lebih banyak asam amino pada daerah yang diizinkan dengan persentase 97,18% yang menyatakan bahwa struktur tiga dimensi pada arginin kinase (Pen m 2) baik. Nilai Molprobity sebesar 0,92 yang juga menunjukkan bahwa struktur tiga dimensi yang diperoleh memiliki kualitas yang baik. Hidrolisis alergen secara in silico oleh enzim pepsin, kimotripsin dan tripsin yang merupakan enzim-enzim proteolitik pada saluran pencernaan manusia, menghasilkan peptida dengan ukuran terpanjang 11 asam amino (313-321) dengan berat molekul 1210 Da (GEHTEAEGGIY). Hal ini menunjukkan terjadinya penurunan alergenisitas arginin kinase (Pen m 2) setelah melalui proses pencernaan, dikarenakan tidak terdapatnya peptida berukuran lebih dari 5000 Da. Namun, hidrolisis alergen menggunakan asam format masih memiliki peptida terpanjang 69 asam amino (114-183) dengan berat molekul 7590 Da (PEGKYV ISTRVRCGRS MEGYPFNPCL TEAQYKEMEA KVSSTLSSLE GELKGTYYPL TGMSKEVQQKLID) yang menunjukkan bahwa masih ada fraksi yang bersifat alergen.
Keyword: Arginine Kinase, In Silico, Protein Hydrolysis, SWISS-MODEL, Shrimp

Judul: Shrimp Allergen Detection Method Validation and Its Application in Protein Allergenicity Variation Test during Boiling Process.
Abstrak: Pangan laut (Seafood) mengandung berbagai macam zat gizi yang bermanfaat untuk kesehatan. Namun pangan laut dapat menimbulkan gangguan kesehatan seperti reaksi imunologis sistemik dan anafilaksis pada penderita alergi. Alergi merupakan reaksi abnormal dari sistem kekebalan tubuh yang dimediasi oleh imunuglobin E (IgE) dan termasuk dalam reaksi hipersensitivitas tipe I. Gejala alergi dapat berupa asma, diare, dan gatal. Dalam beberapa kasus alergi dapat menimbulkan kematian. Gejala alergi yang timbul menyebabkan penderita alergi menghindari pangan penyebab alergi. Namun protein pada pangan tetap dibutuhkan dalam tubuh, sehingga telah dikembangkan pangan hipoalergenik yang dapat menjadi alternatif pangan yang dapat dikonsumsi oleh penderita alergi. Untuk menguji pangan hipoalergenik, diperlukan metode analitik yang handal dan sensitif untuk melindungi pasien penderita alergi terhadap adanya kontaminasi silang atau kesalahan label pada kemasan pangan. Metode yang paling sering digunakan untuk analisis alergi di lapangan adalah ELISA dalam bentuk kit. Selain karena praktis, metode kit juga dapat menghitung alergen protein secara spesifik. Penggunaan antibodi spesifik menyebabkan kit ELISA yang beredar dipasaran cenderung mahal, sehingga diperlukan metode alternatif yang lebih murah yakni menggunakan serum darah penderita alergi. Dengan demikian perlu dilakukan validasi metode pengujian menggunakan serum darah dan didapatkan persamaan yang dapat memprediksi hasil pengujian menggunakan kit dari hasil pengujian menggunakan serum penderita alergi. Metode pengujian menggunakan serum dapat digunakan untuk menguji pengaruh proses pengolahan terhadap tingkat alergenisitas. Pengolahan dengan perlakuan panas pada perebusan menyebabkan protein terdenaturasi dan mengubah sifat alergenisitas dari udang. Data terkait perubahan sifat alergenisitas pada udang yang direbus di Indonesia belum banyak ditemukan sehingga perlu dilakukan karakterisasi terkait perubahan reaktivitas protein alergen untuk mengetahui tingkat alergenisitas udang selama proses perebusan. Tujuan dari penelitian ini yaitu melakukan validasi metode pada pengujian dengan serum penderita alergi, mendapatkan persamaan yang dapat memprediksi jumlah tropomyosin pengujian dengan kit dari hasil pengujian menggunakan serum, dan menganalisis pengaruh perebusan terhadap tingkat alergenisitas udang. Penelitian ini terbagi menjadi tiga tahap. Tahap pertama adalah validasi kinerja metode ELISA pada serum penderita alergi. Tahap kedua adalah Pengujian alergenisitas menggunakan standar untuk memprediksi hasil pengujian menggunakan kit dari hasil pengujian menggunakan serum. Tahap ketiga adalah aplikasi metode pengujian alergenisitas udang setelah perebusan dengan terlebih dahulu melakukan pengujian karakterisasi kimia ekstrak protein udang (Analisis kadar air, kadar protein kasar dan kadar protein terlarut) serta pengujian berat molekul menggunakan elektroforesis SDS PAGE. Metode ELISA menggunakan kit dan serum penderita alergi dalam menguji alergenisitas protein udang merupakan metode yang valid. Berdasarkan hasil penelitian, metode serum memiliki rata-rata LOD sebesar 4,34 μg/mL dan limit kuantifikasi sebesar 14,56 μg/mL dengan presisi yang baik. Perebusan pada udang dapat menurunkan kadar protein terlarut secara signifikan. Proses perebusan juga dapat mempengaruhi profil berat molekul protein ekstrak udang. Ekstrak udang mentah memiliki berat molekul 12.84 kDa sampai 106.78 kDa, dengan pita dominan pada 37.64, 29.40 dan 14.09 kDa. Sedangkan udang rebus memiliki pita polipeptida pada kisaran 29.96 kDa sampai 103.64 kDa, dengan pita dominan pada kisaran 37,18 dan 29.96 kDa. Protein yang tetap ada pada ekstrak udang rebus diduga adalah protein troponin, tropomyosin, paramyosin yang tahan terhadap pemanasan. Berdasarkan analisis alergenisitas perebusan tidak berpengaruh nyata terhadap tingkat alergenisitas pada udang
Keyword: allergy, ELISA, boiling, serum, shrimp, validation

Judul: Pengusahaan tanaman teh di P.T. Perkebunan XII cianten, bogor
Abstrak: Sejarah menyebutkan bahwa Teh (Camellia sinensis) pada mulanya hanya terdapat didataran Asia perbatasan negara negara Muangtai, Burma, India, Laos, Kamboja, dan Cina yang berupa vegetasi hutan liar di wilayah dengan sifat keadaan tanah dan iklim seragam yang baik bagi pertumbuhan teh secara alami. - Cina merupakan negara yang pertama kali mengguna- kan teh sebagai bahan minuman. Buku "Pen Tsao" di ja- man kerajaan Shen Nung pada tahun 2737 SM antara lain telah menulis mengenai teh sebagai hidangan bagi para raja raja di negeri Cina. Pada tahun 780 seorang pe nulis dan ahli tentang teh bernama Lu Yu dalam bukunya yang berjudul "Cha Ching" telah menguraikan mengenai pertanaman teh, cara pemeliharaan, pemetikan daun, pe- ngolahan dan me amu teh sebagai minuman. - Akhir abad keenam teh telah mulai dikenal di ne geri Jepang. Pada tahun 1738 Soichiro Nagatani menemu kan sistim pengolahan teh hijau, dan sejak itu tanaman teh tumbuh dan berkembang dalam suatu areal perkebunan luas. ...
Keyword: