Judul: Distribusi Aphelenchoides besseyi Christie Nematoda Terbawa Benih Padi di Pulau Jawa
Abstrak: Aphelenchoides besseyi merupakan nematoda penting pada padi dan bersifat terbawa benih. Nematoda ini menyebabkan nekrotik dan disintegrasi floem yang dikenal dengan penyakit pucuk putih. Infeksi A. besseyi pada tanaman padi dapat menimbulkan kehilangan hasil secara signifikan dan dapat mengurangi kualitas benih. A. besseyi tersebar di banyak negara salah satunya sebagai dampak dari transportasi benih. Berdasarkan Peraturan Menteri Pertanian (Permentan) No. 51/2015, A. besseyi dikategorikan sebagai organisme pengganggu tumbuhan karantina (OPTK) A2, dengan distribusi terbatas di Jawa, Sumatera, dan Kalimantan Selatan, walaupun demikian informasi detail mengenai distribusi A. besseyi di Pulau Jawa belum tersedia. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan untuk mendeteksi dan mengidentifikasi A. besseyi terbawa benih padi secara morfologi dan molekuler serta menentukan distribusinya di sebagian besar sentra produksi padi Pulau Jawa. Penelitian dilaksanakan dari bulan Juli 2016 sampai September 2017 di Laboratorium Nematologi Tumbuhan dan Laboratorium Bakteriologi Tumbuhan, Departemen Proteksi Tanaman, IPB. Sampel benih padi terdiri atas 26 varietas yang diperoleh dari produsen benih, toko pertanian, dan petani di berbagai kota/kabupaten di Pulau Jawa. Ekstraksi A. besseyi dilakukan dengan metode corong Baermann, sedangkan untuk isolasi DNA dilakukan dengan metode Doyle dan Doyle (1990) yang dimodifikasi. Identifikasi secara morfologi dilakukan dengan mengamati karakter morfologi kunci A. besseyi serta dengan melakukan pengukuran morfometri berdasarkan formula de Man (1880). Identifikasi secara molekuler dilakukan menggunakan polymerase chain reaction yang mengamplifikasi wilayah yang meliputi internal transcribed spacer (ITS) dan 18S rRNA. Hasil amplifikasi fragmen DNA target selanjutnya disikuensing dan dilakukan analisis filogenetika. Berdasarkan pengamatan morfologi dan molekuler, A. besseyi berhasil dideteksi pada 74.32% sampel benih dari hampir semua varietas padi. A. besseyi telah terdistribusi di Banten (Lebak), Jawa Barat (Bogor, Sukabumi, Subang, dan Indramayu), Jawa Tengah (Klaten, Sragen, Sukoharjo, Boyolali, Pati, dan Pemalang), Daerah Istimewa Yogyakarta (Kotamadya Yogyakarta dan Sleman), Jawa Timur (Magetan, Blitar, Tuban, Gresik, Nganjuk, dan Banyuwangi). Analisis nukleotida sikuen 18S rRNA isolat A. besseyi asal Indonesia menunjukkan nilai homologi 94% dengan sikuen asal Vietnam, Spanyol, Brazil, Jepang, Taiwan dan Belanda. Isolat A. besseyi asal Indonesia menunjukkan homologi 99% dan 98% dengan A. besseyi asal India, Cina, Amerika Serikat dan Taiwan berdasarkan analisis nukleotida pada ITS.
Keyword: homologi nukleotida, identifikasi molekuler, identifikasi morfometri, pucuk putih

Judul: Karakterisasi Morfologi dan Morfometri Nematoda Aphelenchoides besseyi Christie pada Beberapa Varietas Padi.
Abstrak: Aphelenchoides besseyi merupakan nematoda parasit terbawa benih yang menyebabkan penyakit pucuk putih pada padi. Identifikasi A. besseyi secara morfologi dan morfometri pada beberapa varietas padi di Jawa Tengah dan Daerah Istimewa Yogyakarta (DIY) belum pernah dilaporkan, sehingga penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keberadaan A. besseyi pada beberapa varietas padi di Jawa Tengah dan DIY serta menelaah karakter morfologi dan morfometrinya. Sampel benih diperoleh dari kios pertanian di Kecamatan Weru (Sukoharjo), Cawas (Klaten), Banguntapan (Bantul), Wonosari (Gunung Kidul), dan hasil perbanyakan petani di Cilacap Selatan (Cilacap). Metode yang dilakukan antara lain: pengambilan sampel benih, ekstraksi nematoda, penghitungan populasi, identifikasi morfologi dan morfometri. A. besseyi ditemukan berasosiasi dengan varietas Pandan wangi, Sintanur, Pepe, Inpari 33, Prima, dan Sembada 168 dengan populasi berkisar 1.4 sampai 27.2 ekor per 5 g benih padi. Ciri khas A. besseyi yang ditemukan bibir set off dengan stomatostilet, bulbus median berukuran besar dan berbentuk oval, star shaped mucro pada ujung ekor. Vulva pada nematoda betina terletak pada 60-75% panjang tubuh, dan spikula pada nematoda jantan berbentuk seperti duri mawar (rose thorn shaped spicule). Hasil pengukuran morfometri dengan karakteristik panjang tubuh (L) (0.55-0.84 μm), panjang stilet (S) (10.81- 12.92 mm), diameter tubuh maksimum (W) (14.09-22.87 mm), panjang ekor (T) (36.93 – 53.51 mm), panjang esofagus (ES) (58.17 – 86.51 mm). Persentase posisi dari katub esofagus dari anterior tubuh sampai setengah dari katub (bulb) dibagi dengan total panjang esofagus dari dasar kelenjar esofagus (MB) (100.11 – 146.52%). Persentase jarak vulva dari anterior dibagi dengan panjang tubuh (V) (55.35-85.67%), a (L/W) (29.58-52.04), b (L/MB) (8.12-14.97), dan c (L/T) (11.94- 19.92).
Keyword: benih, ekstraksi, identifikasi, kios, pengukuran

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: