Judul: Keanekaragaman Spesies Cendawan pada Buah Jeruk dan Pengembangan Metode Deteksi Dini Berbasis Citra Fluoresens
Abstrak: RINGKASAN NURHOLIS. Keanekaragaman Spesies Cendawan pada Buah Jeruk dan Pengembangan Metode Deteksi Dini Berbasis Citra Fluoresens. Dibimbing oleh WIDODO, SRI HENDRASTUTI HIDAYAT, KIKIN HAMZAH MUTAQIN dan SLAMET WIDODO. Jeruk termasuk salah satu buah-buahan yang paling banyak dikonsumsi di Indonesia. Pemenuhan kebutuhan buah jeruk Indonesia berasal dari produksi dalam negeri dan diimpor dari negara lain. Produksi buah jeruk dalam negeri menghadapi kendala serangan patogen. Cendawan adalah patogen yang paling dominan pada buah jeruk. Keberadaan cendawan patogen harus segera dikendalikan agar tanaman jeruk dapat berproduksi secara maksimal. Deteksi dan identifikasi cendawan patogen yang akurat adalah kunci keberhasilan dalam pengendalian penyakit pada buah jeruk. Oleh karena itu, penelitian untuk mendeteksi dan mengidentifikasi cendawan patogen pada buah jeruk lokal yang akurat penting dilakukan. Importasi buah jeruk berpotensi membawa cendawan patogen eksotik dari negara lain. Cendawan eksotik juga dapat menyebabkan penurunan produksi buah jeruk dalam negeri. Sehingga, keberadaan cendawan patogen pada buah jeruk impor juga sangat penting untuk dideteksi dan diidentifikasi. Tujuan penelitian ini adalah memperoleh data keanekaragaman spesies dan patogenisitas cendawan pada buah jeruk lokal dan impor serta memperoleh metode untuk mendeteksi dini keberadaan cendawan patogen pada buah jeruk impor. Cendawan pada buah jeruk lokal dan impor dideteksi menggunakan metode pembekuan semalaman dengan membekukan buah jeruk pada suhu -20 ºC selama 15 jam. Cendawan yang tumbuh pada permukaan buah jeruk diisolasi dan dibuat biakan murni. Biakan murni cendawan digunakan dalam proses identifikasi secara morfologi dan molekuler. Identifikasi morfologi dilakukan secara makroskopik dan mikroskopik melalui pengamatan miselia dan konidia. Identifikasi molekuler dilakukan dengan teknik PCR menggunakan multilokus DNA. Patogenisitas cendawan ditentukan melalui penyuntikkan suspensi konida sebanyak 100 µl dengan kerapatan 1×105 konidia ml-1 ke dalam buah jeruk. Deteksi dini cendawan patogen dilakukan dengan menyinari buah jeruk menggunakan lampu UV dengan panjang gelombang 352 nm yang didasarkan pada nilai panjang gelombang eksitasi dan emisi fluoresensi senyawa metabolit masing-masing cendawan. Buah jeruk akan berfluoresens bila mengandung cendawan patogen. Bagian yang berfluoresens adalah senyawa metabolit cendawan yang disekresikan oleh cendawan patogen selama proses patogenesis. Hasil penelitian menunjukkan bahwa cendawan dari perkebunan buah jeruk di Kabupaten Banyuwangi dan Malang berhasil dideteksi dan diidentifikasi. Empat spesies cendawan pada buah jeruk asal Kabupaten Banyuwangi diidentifikasi sebagai C. gloeosporioides, F. lateritium, F. equiseti, dan F. verticillioides. Tujuh spesies cendawan pada buah jeruk asal Kabupaten Malang diidentifikasi sebagai L. theobromae, C. gloeosporioides, F. equiseti, F. oxysporum, F. lateritium, C. lunata, dan F. solani. Uji patogenisitas membuktikan semua cendawan dari buah jeruk asal Kabupaten Banyuwangi berperan sebagai patogen. Cendawan dari buah jeruk asal Kabupaten Malang juga berperan sebagai patogen, kecuali C. lunata yang berperan sebagai cendawan non patogen. Masing-masing cendawan memiliki perbedaan virulensi yang dibuktikan dengan nilai keparahan penyakit yang berbeda-beda. Nilai keparahan penyakit tertinggi disebabkan oleh F. oxysporum sebesar 91,11% dan nilai keparahan penyakit terendah sebesar 75,56% disebabkan oleh F. verticillioides. Cendawan terbawa buah jeruk impor juga berhasil dideteksi dan diidentifikasi secara morfologi dan molekuler sebagai A. citri, A. alternata, F. equiseti, F. lateritium, F. oxysporum, C. gloeosporioides, dan P. oxalicum. Uji patogenisitas menunjukkan semua cendawan berperan sebagai patogen yang dibuktikan dengan nilai kejadian penyakit sebesar 100% pada buah jeruk impor dan lokal. Nilai keparahan
Keyword: Identifikasi, molekuler, morfologi, panjang gelombang, pembekuan semalaman

Judul: Deteksi Dini Kerusakan Mekanis Buah Jeruk Indonesia berdasarkan Metode Fluoresen
Abstrak: Indonesia memiliki lebih dari 19 varietas jeruk Siam yang tersebar dibeberapa pulau di Indonesia. Buah jeruk lokal Indonesia telah diekspor ke Papua New Guinea, Malaysia, Hongkong, Pakistan, dan Singapura. Sebagai produk pertanian segar yang diproduksi di negara tropis, jeruk dapat mengalami kerusakan selama proses pemanenan, penanganan pascapanen, dan transportasi. Apabila buah jeruk yang mengalami kerusakan dikemas pada tempat yang sama dengan jeruk normal maka jeruk normal dapat membusuk dalam waktu satu minggu. Oleh sebab itu perlu dilakukan proses sortasi untuk memisahkan buah yang mengalami kerusakan dengan yang normal untuk mencegah buah mengalami kebusukan lebih cepat. Pemisahan buah yang mengalami kerusakan secara manual sulit dilakukan, terutama pada tahap awal terjadinya kerusakan, karena tidak menunjukkan perubahan visual sebelum bagian yang rusak mengalami perubahan warna menjadi coklat karena terjadinya reaksi pencoklatan. Buah jeruk yang mengalami kerusakan pada bagian kulit akan mengeluarkan zat kimia yang dapat diidentifikasi dengan metode fluoresen. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menentukan substansi fluoresen dan karakteristik panjang gelombang absorbsi serta emisi dari beberapa jenis buah jeruk lokal Indonesia, karakterisasi dan klasifikasi kerusakan mekanis buah jeruk lokal Indonesia berdasarkan spektroskopi fluoresen selama penyimpanan, dan mengembangkan metode deteksi dini kerusakan mekanis buah jeruk lokal Indonesia berdasarkan citra fluoresen. Penelitian ini dilakukan dalam tiga tahap. Tahap pertama yaitu menentukan karakteristik spektroskopi fluoresen dari buah jeruk lokal Indonesia. Pada tahap ini telah ditentukan spektra UV-Vis absorbsi, eksitasi, dan emisi fluoresen dari beberapa jenis jeruk lokal Indonesia serta substansi fluoresen yang terkandung pada kulit jeruk lokal Indonesia. Tahap kedua yaitu menganalisis karakteristik spektra fluoresen selama penyimpanan serta klasifikasi jeruk lokal Indonesia yang mengalami kerusakan mekanis menggunakan spektra fluoresen dan analisa diskriminan. Tahap ketiga yaitu mengembangkan metode deteksi kerusakan mekanis jeruk lokal Indonesia berdasarkan citra fluoresen. Program pengolahan citra fluoresen jeruk dibangun untuk mengklasifikasikan citra jeruk pada kelompok sayat, memar, dan kontrol dengan metode jaringan syaraf tiruan (JST). Dari hasil penelitian, telah dianalisia karakteristik spektroskopi fluoresen dari 5 jenis jeruk lokal Indonesia yaitu jeruk siam Medan, siam Pontianak, keprok Batu, siam Garut dan keprok Pulung. Puncak spektra absorban jeruk lokal Indonesia berada pada panjang gelombang 314 nm hingga 380 nm. Jeruk lokal Indonesia mengandung substansi fluoresen dari kelompok polymethoxylated flavone nobiletin, dan tangeretin dan flavanone hesperidin dengan panjang gelombang eksitasi 365 nm dan puncak fluoresen antara 536 nm sampai dengan 552 nm. Hasil penelitian menunjukkan bahwa terdapat perbedaan intensitas fluoresen antara jeruk yang mengalami kerusakan mekanis dengan kontrol sehingga klasifikasi spektra fluoresen dapat digunakan pada sampel jeruk dengan waktu penyimpanan hingga 48 jam. Penyimpanan diatas 48 jam menyebabkan intensitas spektra fluoresen berada pada tingkatan yang sama untuk setiap perlakuan. Hasil pengelompokan spektra fluoresen berdasarkan perlakuan menunjukkan bahwa panjang gelombang fluoresen yang berpengaruh pada hasil pengelompokan adalah spektra pada panjang gelombang 470 nm, 500 nm hingga 510 nm, dan 530 nm hingga 540 nm. Model diskriminan yang dibangun dari dua komponen utama spektra fluoresen yang diproses dengan pretreatment data spektra SGs+MSC+D2 dapat membantu klasifikasi spektra fluoresen berdasarkan perlakuan memar, sayat, dan kontrol dengan akurasi tertinggi sebesar 83,3%. dst....
Keyword: citrus, mechanical defect, fluorescence image, fluorescence spectra

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: