Judul: Analisis Sekuen Exon 3-4 Gen Penyandi Lisozim Putih Telur Ayam Kampung (Gallus gallus domesticus).
Abstrak: Lisozim putih telur (EWL) ayam kampung memiliki sifat fungsional berupa antibakteri dan pemberi rasa manis yang sangat potensial untuk dikembangkan menggunakan teknologi rekombinan dengan terlebih dahulu melakukan isolasi gen penyandinya. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi sekuen gen penyandi lisozim ayam kampung dan menganalisis sekuens berupa pengurutan sekuen, penentuan ekson-intron, homologi, pohon filogeni dan translasi asam amino berupa pembandingan asam amino serta analisis struktur protein. Penelitian ini difokuskan pada ekson 3-4 gen EWL ayam kampung. DNA genom ayam kampung IPB-D1 digunakan sebagai cetakan pada ekson 3-4 untuk tahapan amplifikasi gen EWL. Primer untuk amplifikasi didesain berdasarkan urutan sekuen EWL dari Genebank, menghasilkan amplikon dengan ukuran 1071bp yang meliputi ekson 3-4 dan beberapa intron di sekitarnya. Meskipun hasil urutan sekuen terdapat beberapa titik yang tidak terbaca, analisis BLAST-N pada urutan yang dapat dibaca telah dikonfirmasi. Berdasarkan BLAST-N, fragmen yang sesuai dengan gen parsial EWL ayam kampung pada ekson 3-4 adalah gen lisozim Gallus gallus haplotype LA dan Gallus gallus haplotype LB, dengan kesamaan sebesar 91.38%. Variasi asam amino pada ekson 3-4 lisozim ayam kampung diyakini tidak berpengaruh pada sifat antibakteri, karena lokasi struktural yang relatif berbeda pada ekson 3-4 terhadap residu asam amino yang terlibat dalam sifat katalitik, selain itu salah satu asam amino yang bertanggung jawab terhadap rasa manis yang terdapat di wilayah ekson 3 juga tidak terjadi mutasi.
Keyword: asam amino, ayam kampung, ekson, lisozim, sekuen

Judul: Analisis Sekuen Exon 2 Gen Penyandi Lisozim Putih Telur Ayam Kampung (Gallus gallus domesticus).
Abstrak: Lisozim putih telur (EWL) ayam kampung memiliki potensi untuk dikembangkan melalui teknologi rekombinan karena sifat fungsionalnya sebagai antibakteri dan pemberi rasa manis. Teknologi rekombinan ini dapat dilakukan dengan terlebih dahulu mengetahui gen penyandinya. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi sekuen gen penyandi lisozim ayam kampung pada ekson 2 serta menganalisis hasil sekuen parsial ekson 2 berupa pengurutan sekuen, penentuan exon-intron, homologi, phylogenetic tree, dan translasi asam amino berupa pembandingan asam amino serta analisis struktur protein. Penelitian ini berfokus pada ekson 2 karena keterbatasaan waktu yang dimiliki. DNA genom kampung digunakan sebagai template pada ekson 2 untuk proses amplifikasi dengan menggunakan primer yang dirancang berdasarkan urutan gen EWL pada GenBank. Gen LYZ ayam kampung IPB-D1 telah berhasil diidentifikasi dan menghasilkan 840bp, tetapi ada beberapa basa dalam sekuen yang tidak terbaca serta mengalami mutasi. Meskipun demikian, sebagian besar basa lainnya masih dirasa cukup untuk bisa memastikan bahwa gen tersebut adalah lisozim dengan homologi tertinggi dengan gen LYZ Gallus gallus clone-18 dan LYZ Gallus gallus clone-111 dengan kesamaan sebesar 84.31% berdasarkan BLAST-N. Hal ini dibuktikan pula dengan letak percabangan pada pohon filogeni. Sekuen exon 2 mencakup wilayah sisi aktif lisozim Glu35 dan Asp52 sebagai anti bakteri dan sisi aktif pemanis Arg73 sehingga wilayah ini berkaitan dengan aktifitas antibakteri dan rasa manis.
Keyword: asam amino, ayam kampung, ekson, lisozim, sekuen

Judul: Implementasi Space Time Composite (STC) Data Model Menggunakan Model Data Relasional
Abstrak: The data model is a concept that describes the data stored in the database and the relationship between the data to the user in logic. Development of data models is very important in the design of the database as the basis of the stage of database design to be made. This study aims to apply the concept of Space Time Composite (STC) on the Model Data storage vector data types that can store enough information and describes the process of drafting objects and objects spatiotemporal evolution over time. From the results of the test queries on the data model that have been created, queries in a system are acquired that can help display the information preparation of objects from time to time and know the history of the object polygon and arc that has undergone changes in topology.
Keyword: