Judul: Penelusuran Bakteri yang Memiliki pMMO dan sMMO serta Pemanfaatannya sebagai Pereduksi Emisi Senyawa Metana pada Limbah Cair Kelapa Sawit (Elaeis guineesis Jacq.).
Abstrak: Kelapa sawit merupakan salah satu tumbuhan yang menghasilkan minyak terbesar di Indonesia. Hasil pengolahan buah kelapa sawit menjadi minyak memiliki efek negatif, yakni terciptanya gas metana. Gas metana yang merupakan salah satu gas penyumbang efek rumah kaca. Gas rumah kaca ini yang menyebabkan pemanasan global. Salah satu cara yang dapat dilakukan untuk mengurangi kadar gas metana adalah dengan menggunakan bakteri. Klebsiella sp. yang diisolasi dari limbah cair kelapa sawit. Hasil isolasi tersebut diperoleh 13 isolat koloni tunggal. Setelah di dapatkan isolat tunggal kemudian isolat-isolat tersebut diuji enzim Soluble Methane Monooxygenase (sMMO) dan Particulate Methane Monooxygenase (pMMO). Hasil dari uji sMMO adalah semua isolat tidak memiliki enzim ini. Sedangkan untuk uji enzim pMMO bahwa semua isolat memiliki enzim ini dengan nilai yang berbeda-beda. Isolat-isolat tersebut memiliki rentang nilai berkisar antara 0.010 – 0.022 M. Nilai regresi yang didapatkan dari kurva standar adalah 0.99. Isolat hasil dari uji pMMO diambil satu isolat untuk uji DNA sekuensing dan pohon filogenetika. Hasil yang diperoleh bahwa isolat tersebut adalah Klebsiella sp. Berdasarkan uji Gram diketahui bahwa bakteri ini termasuk bakteri Gram negatif.
Keyword: bakteri, limbah, kelapa sawit, pMMO, sMMO

Judul: Analisis gen soluble metan monooksigenase (sMMO) bakteri metanotrof asal sawah dengan primer 534f dan 1393r
Abstrak: Bakteri metanotrof merupakan bakteri Gram negatif, bersifat aerob, dan menggunakan metan sebagai sumber karbon untuk menghasilkan energinya. Karakteristik penting dari metanotrof ini ialah memiliki enzim metan monooksigenase (MMO) yang dapat mengkatalisis metan menjadi metanol. Enzim MMO terbagi ke dalam dua tipe, yaitu particulate MMO (pMMO) dan soluble MMO (sMMO). Semua bakteri metanotrof mampu mengekspresikan enzim pMMO, namun sMMO hanya dimiliki beberapa bakteri metanotrof saja. Isolat-isolat bakteri metanotrof (BGM 1, BGM 5, BGM 9,dan SKM 14) yang berasal dari sawah Bogor dan Sukabumi, hanya isolat BGM 9 yang menunjukkan adanya aktivitas enzim sMMO dengan metode Cholorimetric Plate Assay. Fragmen amplikon dari BGM 9 diamplifikasi dan disekuensing. Sekuen yang diperoleh dianalisis dengan menggunakan perangkat bioinformatik seperti BLAST-N dan BLAST-X. Analisis sekuen amplikon menggunakan program BLAST-N dan BLAST-X berturut-turut menunjukkan kemiripan dengan sekuen pada genom Azorhizobium caulinodans ORS 571 (92%) dan gen protein S3 pada ribosom 30S Xanthobacter autotrophicus Py2 (90%). Ketidaksesuaian hasil analisis tersebut dengan gen target diduga disebabkan oleh primer yang kurang spesifik dan keterbatasan informasi database di genetik tentang mikroba dari daerah tropis.
Keyword: Bakteri metanotrof, Enzim metan monooksigenase(MMO), Soluble metan monooksigenase

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: