Judul: Karakterisasi dan Aktivitas Antioksidan Ekstrak Pigmen Aktinobakteri.
Abstrak: Aktinobakteri adalah bakteri Gram-positif yang berasal dalam filum Actinobacteria. Aktinobakteri adalah sumber metabolit sekunder yang menjanjikan. Salah satu metabolit sekunder yang dihasilkan aktinobakteri adalah pigmen. Berbagai aktinobakteri mampu menghasilkan beragam jenis pigmen, diantaranya yaitu pigmen berwarna kuning hingga oranye. Pigmen memiliki berbagai aktivitas farmakologi seperti antioksidan. Antioksidan adalah molekul yang menghambat atau menunda kerusakan sel dengan menyumbangkan elektron ke radikal bebas dan menstabilkannya. Pigmen yang dihasilkan oleh bakteri memiliki kapasitas antioksidan dan melindungi bakteri dari kerusakan oksidatif. Penelitian aktivitas antioksidan aktinobakteri berpigmen di Indonesia belum banyak dilaporkan, sehingga penelitian aktivitas antioksidan aktinobakteri berpigmen perlu dilakukan. Penelitian ini bertujuan untuk mengkarakterisasi aktinobakteri berpigmen kuning hingga oranye, menguji aktivitas antioksidan dari ekstrak pigmen antinobakteri,serta menganalisissenyawa dari ekstrak pigmen yang memiliki aktivitas antioksidan tertinggi. Isolat aktinobakteri diisolasi dari rizosfer mangrove di Pantai Cengkrong Trenggalek,sampel tanah merah di kebun area kampusIPB, dan isolat aktinobakteri endofit dari kulit manggis yang telah diidentifikasi oleh peneliti sebelumnya. Isolat aktinobakteri terpilih diidentifikasi menggunakan gen 16S rRNA. Pigmen aktinobakteri diekstraksi sampai memdapat esktrak kasar pigmen. Aktivitas antioksidan ekstrak kasar pigmen diukur menggunakan metode DPPH (1,1- diphenyl-2-picrylhydrazil). Hasil pengukuran aktivitas antioksidan dihitung dalam persen inhibisi lalu digambarkan melalui nilai IC50 (inhibitory capacity). Ekstrak kasar pigmen yang menghasilkan aktivitas antioksidan tertinggi selanjutnya dianalisis menggunakan Liquid Chromatography Mass Spectrophotometer (LCMS) untuk mengidentifikasi profil kimia yang terdapat di dalam ekstrak pigmen dan berpotensi menghasilkan antioksidan. Berdasarkan hasil penelitian diperoleh lima isolat aktinobakteri berpigmen yaitu HRA, HVA, HVB, AGM2.2 dan AGM2.3. Identifikasi berdasarkan gen 16S rRNA menunjukkan bahwa isolat HRA memiliki nilai kemiripan 99,91% dengan Streptomyces gramineus JR-43, isolat HVA memiliki nilai kemiripan 99,22% dengan S. tendae ATCC 19812 dan isolat HVB memiliki nilai kemiripan 81,18% dengan Rhodococcus ruber DSM 43338. Isolat AGM2.2 dan AGM2.3 memiliki kemiripan dengan S. xanthophaeus NRRL B-5414 dengan nilai kemiripan masing masing sebesar 98,95% dan 99,82%. Spektrum UV-Vis ekstrak kasar pigmen isolat HRA adalah 411 nm, isolat HVA 663 nm, isolat HVB 459 nm, isolat AGM2.2 663 nm, dan isolat AGM2.3 664 nm. Konsentrasi hambat (IC50) pigmen ekstrak kasar aktinobakteri berkisar dari 53,38 µg/mL hingga 184,38 µg/mL. Isolat HVB memiliki aktivitas antioksidan paling tinggi. Ekstrak kasar pigmen isolat HVB mengandung senyawa luteolin dan berpotensi sebagai penghasil antioksidan.
Keyword: DPPH, inhibitory concentration, metabolite, luteolin

Judul: Aktivitas Antioksidan Aktinobakteri Endofit Kulit Buah Manggis (Garcinia mangostana L.).
Abstrak: Manggis (Garcinia mangostana L.) merupakan salah satu tanaman yang kaya dengan senyawa bioaktif seperti xanthone, flavonoid dan fenolik. Manggis secara tradisional banyak digunakan untuk mengobati beberapa penyakit. Aktinobakteri endofit dari tanaman berperan penting dalam menghasilkan berbagai macam senyawa bioaktif. Namun, sampai saat ini informasi penelitian terkait keragaman aktinobakteri endofit kulit buah manggis yang memiliki aktivitas antioksidan belum dikaji. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengeksplorasi keragaman aktinobakteri endofit kulit buah manggis dan menentukan aktivitas antioksidannya. Aktinobakteri endofit kulit buah manggis diisolasi, dipurifikasi dan dikarakterisasi morfologinya. Identifikasi molekuler berdasarkan gen 16S rRNA menggunakan primer spesifik aktinobakteri 27F dan 16Sact1114R. Pengukuran aktivitas antioksidan dilakukan untuk supernatan aktinobakteri dan ekstrak etil asetat aktinobakteri serta ekstrak etil asetat kulit buah manggis dibandingkan dengan kontrol asam askorbat, ekstrak etil asetat aktinobakteri dan ekstrak etil asetat kulit buah manggis difraksinasi menggunakan metode Kromatografi Lapis Tipis (KLT) dan dilakukan bioautografi aktivitas antioksidan. Lima isolat aktinobakteri endofit dari kulit buah manggis menunjukkan perbedaan warna miselium aerial, miselium susbtrat, dan tipe rantai spora. Berdasarkan analisis gen 16S rRNA, isolat AGM3.2 menunjukkan kesamaan dengan S. griseochromogenes ATCC 14511 (T) 99.06%. AGM3.1 memiliki kesamaan dengan S. osmaniensis OU-63 (T) 98.35%. Sementara itu, AGM2.3 mirip dengan S. xanthophaeus NBRC B-5414 (T) 99.82% dan AGM2.2 memiliki kemiripan dengan S. xanthophaeus NBRC B-5414 (T) 98.95%. Selain itu, AGM2.1 memiliki homologi dengan S. goshikiensis NBRC 12868 (T) 99.52%. Nilai aktivitas antioksidan dengan metode DPPH dan ABTS yang dihasilkan supernatan AGM2.1 menunjukkan aktivitas antioksidan tertinggi masing-masing 36.96% dan 98.80% penghambatan. Kapasitas antioksidan ekstrak etil asetat AGM2.1 adalah 22.22 μg AEAC/mg ekstrak (DPPH) dan 20.34 μg AEAC/mg ekstrak (ABTS). Ekstrak etil asetat kulit manggis memiliki kapasitas antioksidan sebesar 21.17 μg AEAC/mg ekstrak (DPPH) dan 18.75 μg AEAC/mg ekstrak (ABTS). Deteksi senyawa menggunakan UV 254 nm menunjukkan beberapa spot gelap, sedangkan deteksi menggunakan UV 366 nm pendaran spot warna senyawa lebih teramati pada setiap sampel. Hasil pengamatan menggunakan UV 366 nm menunjukkan, bahwa ekstrak etil asetat kulit manggis dan ekstrak etil asetat aktinobakteri dibandingkan dengan standar α-mangostin memiliki warna spot senyawa yang berbeda. Standar α-mangostin memiliki satu spot senyawa merah tua. Ekstrak kulit manggis diamati sebanyak tujuh spot senyawa biru dan merah tua. Sementara itu, ekstrak etil asetat AGM3.2 memiliki tiga spot senyawa biru dan merah. Ekstrak etil asetat isolat AGM3.1, AGM2.3, AGM2.2 memiliki sembilan spot senyawa biru dan agak kehijauan sedangkan ekstrak etil asetat AGM2.1 memiliki delapan spot senyawa berwarna biru, merah dan hijau. Warna biru menunjukkan sekelompok senyawa flavon, flavanon, flavonol, dan isoflavon, merah menunjukkan antosianidin dan senyawa kehijauan adalah senyawa auron dan flavon. Bioautografi antioksidan menunjukkan bahwa standar α-mangostin memiliki satu spot aktif dengan nilai Rf 0.64. Ekstrak etil asetat kulit buah manggis menunjukkan spot yang sama dengan standar α-mangostin dengan nilai Rf 0.64. Ekstrak etil asetat aktinobakteri AGM3.1, AGM2.3, AGM2.2 dan AGM2.1 memiliki nilai Rf yang sama dengan standar α-mangostin. Namun, senyawa α-mangostin berwarna merah tua sedangkan ekstrak etil asetat keempat aktinobakteri memiliki spot wana biru. Spot warna biru mengindikasikan kelompok senyawa flavon, flavanon, flavonol dan isoflavon. Informasi dari penelitian ini jelas menunjukkan bahwa aktinobakteri endofit dari kulit buah manggis memiliki potensi sebagai antioksidan.
Keyword: antioksidan, aktinobakteri endofit, Garcinia mangostana L., karakterisasi

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: