Judul: Karakteristik enzim kitinase termostabil dari bakteri termofilik Bacillus sp. 13.26.
Abstrak: Enzim kitinase adalah kelompok enzim hidrolase yang mengkatalisis pemotongan ikatan B-1,4 pada polimer kitin. Enzim kitinase dimanfaatkan diberbagai bidang seperti pertanian, medis, pangan dan lingkungan serta untuk keperluan riset ilmu dasar. Enzim termostabil digunakan secara ekstensif oleh kalangan industri. Peluang menemukan mikroorganisme penghasil enzim kitinase untuk keperluan di atas sangat besar, karena Indonesia memiliki keragaman hayati sangat tinggi. Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari karakteristik biokimia enzim kitinase termostabil dari bakteri termofilik Bacillus sp. 13.26 asal Tompaso, Menado, Sulawesi Utara. Isolat ditumbuhkan pada suhu 55°C di dalam medium Termus cair [0.7% (NH4)2SO4. 0.1% K₂HPO4, 0.1% NaCl, 0.01% MgSO4.7H2O, 0.05% ekstrak khamir, 0.1% bacto tripton, 0.5% koloidal kitin) pada waterbath shaker. Pada akhir fermentasi, biomassa dipisahkan dengan cara sentrifugasi (8000 g, 15 menit, 4°C). Supernatan ditampung kemudian ditambah amonium sulfat pada tingkat kejenuhan 80%. Protein dikumpulkan dengan cara sentrifugasi (9000 g, 20 menit, 4°C) dan didialisis untuk mendapatkan enzim kasar. Enzim kitinase termostabil diperoleh dengan cara memanaskan enzim kasar pada 60°C selama 3 jam. Enzim termostabil dimurnikan lebih lanjut dengan teknik khromatografi penukar ion pada DEAE Sepharose CL-6B yang dielusi secara gradien linear dengan NaCl 0-1 M di dalam bufer Tris-Cl 20 mM pH 7. Aktifitas enzim diuji dengan menentukan jumlah gula pereduksi (N-asetil glukosamin) dengan teknik spektrofotometri pada panjang gelombang 420 nm. Satu unit didefinisikan sebagai jumlah N-asetil glukosamin (umol) yang terbentuk per menit pada kondisi yang disebutkan. Hasil pemurnian dimonitor dengan SDS-PAGE (Sosium Dodecyl Sulfate-Polyacrylamide Gel Electrophoresis). Teknik zimogram diterapkan untuk menduga berat molekul enzim serta mengevaluasi termostababilitas enzim.
Keyword: Characteristic, Chitinase, Termophilic bacteria, Bacillus sp

Judul: Isolasi dan pemilahan bakteri termofilik penghasil kitinase dari Indonesia
Abstrak: Enzim merupakan biokatalis yang umumnya berupa protein dan terbagi dalam enam kelas, salah satunya adalah hidrolase. Enzim kitinase merupakan salah satu enzim hidrolase yang dapat mendegradasi senyawa kitin yaitu berupa polimer yang banyak terdapat di alam seperti Crustaceae, serangga dan beberapa jamur. Enzim kitinase yang bersifat tahan panas memiliki beberapa keuntungan dan ini menjadi alasan utama untuk memilih enzim dari bakteri termofil karena stabilitasnya yang tinggi dan resiko kontaminasinya dapat dikurangi. Enzim yang tahan panas umumnya dapat dihasilkan oleh bakteri yang termofil karena lingkungan hidupnya yang ekstrim panas, maka enzim yang dihasilkan juga tahan panas. Untuk itu dilakukan isolasi bakteri termofil yang berasal dari berbagai sumber air panas dan air kawah serta daerah lainnya di Indonesia. Isolasi dilakukan dengan cara menyebar sampel pada media termus modifikasi yang terdiri dari campuran MgSO4.7H2O 0,01%, K2HPO4 0,1%, NaCl 0,1%, (NH4)2SO4 0,7%, ekstrak khamir 0,2%, tripton 0,1% serta koloidal kitin 1%, ditambah agar 2%. Inkubasi dilakukan mulai dari suhu 55°C atau lebih tinggi untuk menyeleksi hanya mikroba termofil yang tumbuh. Isolat yang mampu memecah kitin ditandai dengan terbentuknya halo yaitu areal bening disekitar koloni. Isolat yang dapat memecah kitin selanjutnya digores kembali untuk dimurnikan, lalu disimpan dalam cryobuffer yang terdiri dari 0,5 ml buffer phospat 10 mM, 3,75 ml gliserol dan 20,75 ml H₂O. Isolat-isolat tersebut dipilih yang memiliki aktivitas kitinolitik tinggi dengan cara semikuantitatif berdasarkan indeks kitinolitik (IK) yaitu perbandingan diameter halo dengan diameter koloni. Dari hasil penyebaran sampel didapatkan 31 isolat yang dapat tumbuh pada suhu 55°C, dan 5 isolat yang dapat tumbuh pada suhu 60°C. Dari seluruh isolat tersebut diperoleh 7 isolat yang potensial. Ketujuh isolat tersebut dapat menibentuk halo setelah 1 hari yaitu K29-13, K29-14 dan K29-15 dengan IK 5,0; K29-10, K29-16 dengan IK 4,5; K29-8 dengan IK 4,0 dan K29-7 dengan IK 4,8. Ketujuh isolat tersebut lalu diuji secara kuantitatif dengan metode reduksi kitin. Bakteri yang potensial juga dikarakterisasi awal meliputi bentuk, gram, endospora, dan motilitasnya.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: