Judul: Bakteri Endofit Asal Tanaman Arecaceae sebagai Pemacu Pertumbuhan dan Agens Biokontrol Penyakit Bercak Daun pada Kelapa Kopyor (Cocos nucifera L var. Kopyor).
Abstrak: Kelapa (Cocos nucifera L.) merupakan salah satu produk pertanian yang paling lazim dikonsumsi dalam pemenuhan kebutuhan hidup sehari-hari masyarakat. Pada pembudidayaan kelapa sering muncul buah kelapa abnormal, yang dikenal dengan kopyor. Kelapa kopyor memiliki ciri endosperm (daging buah) yang terlepas dari tempurung disertai volume air kelapa yang lebih sedikit dibandingkan kelapa normal. Harga yang jauh lebih mahal dibandingkan kelapa normal menyebabkan usaha budidaya kelapa kopyor semakin diminati. Tanaman muda kelapa kopyor hasil teknik kultur jaringan maupun konvensional menunjukkan kerentanan terhadap serangan patogen penyebab bercak daun di lapangan. Patogen bercak daun pada tanaman kelapa kopyor antara lain tergolong dalam genus Pestalotiopsis, Curvularia dan Colletotrichum. Patogen ini dapat menurunkan kualitas bibit bahkan menyebabkan kematian tanaman. Saat ini, untuk mengendalikan penyakit bercak, penggunaan pestisida sintetik menjadi solusi utama. Penggunaan pestisida sintetik secara terus menerus berdampak buruk bagi lingkungan dan manusia. Salah satu alternatif pengendalian penyakit tanaman adalah dengan pengendalian hayati menggunakan bakteri endofit. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan bakteri endofit dari jaringan akar dan daun dari beberapa tanaman Arecaceae yaitu Pejibaye (Bactris gasipaes), Kelapa Kopyor (Cocos nucifera), Kelapa Sawit (Elaeis guinensis), Aren (Arenga pinnata) dan Nibung (Oncosperma filamentosa) yang berpotensi sebagai agens pengendali hayati penyakit bercak daun dan pemacu pertumbuhan tanaman kelapa kopyor. Penelitian dilakukan di Laboratorium Nematologi Departemen Proteksi Tanaman, dan Laboratorium Riset Pusat Penelitan Bioteknologi dan Bioindustri Indonesia (PPBBI), dari bulan Maret hingga Desember 2016. Metode penelitian meliputi isolasi cendawan patogen bercak daun, isolasi bakteri endofit, seleksi awal bakteri endofit potensial, uji keamanan hayati, uji antibiosis, karakterisasi fisiologi mikroba endofit terseleksi meliputi uji produksi senyawa volatil terhadap perkembangan cendawan patogen, uji potensi pendukung pertumbuhan tanaman, uji pelarutan fosfat, uji produksi hormon auksin (Indole Acetic Acid/IAA), uji penambatan nitrogen, uji floresensi, uji katalase, uji produksi kitinase, pengujian sifat isolat sebagai bakteri endofit meliputi mutasi spontan bakteri endofit dengan antibiotik rifampisin, uji aktivitas enzim peroksidase, aplikasi bakteri endofit potensial pada bibit terserang penyakit bercak daun di pembibitan dan identifikasi molekuler bakteri endofit. Percobaan dilakukan dengan menggunakan rancangan acak lengkap (RAL). Perlakuan yang menunjukkan beda nyata diuji lanjut dengan uji selang berganda Duncan (DMRT) pada taraf 5%. Sebanyak 656 isolat bakteri endofit berhasil diisolasi dari akar dan daun tanaman Arecaceae. Hasil seleksi awal diperoleh 64 isolat bakteri endofit yang mampu menghambat perkembangan koloni patogen bercak daun secara in vitro dan memiliki kemampuan melarutkan fosfat. Hasil uji keamanan hayati iii menunjukkan 40 isolat dari 64 isolat aman terhadap tanaman, hewan dan manusia. Hasil uji konsistensi penghambatan terhadap cendawan penyebab penyakit bercak daun (Pestalotiopsis sp., Curvularia sp., dan Colletotrichum sp.) dan uji karakter fisiologi bakteri diperoleh lima isolat bakteri endofit menunjukkan kemampuan penghambatan patogen bercak daun hingga 86.6%, mampu melarutkan fosfat, menghasilkan IAA, menguraikan peroksida dan menambat nitrogen. Hasil pengujian terhadap benih padi menunjukkan isolat bakteri endofit mampu meningkatkan pertumbuhan tanaman padi. Hasil pengujian isolat bakteri endofit pada bibit kopyor di lapangan menunjukkan perlakuan penyiraman dengan suspensi endofit dapat menurunkan tingkat keparahan penyakit bercak daun dibandingkan dengan kontrol. Tingkat keparahan penyakit bercak daun pada perlakuan bakteri endofit berada pada kisaran 19.5%-26.6%. Nilai ini dibawah kontrol (tanpa bakteri endofit) yang mencapai 35.9%. Nilai AUDPC dan laju infeksi pada perlakuan
Keyword: antibiotik, karakterisasi fisiologi, amplifikasi DNA, tanaman muda

Judul: Seleksi Endofit Sebagai Pemacu Pertumbuhan dan Pengndali Penyakit Lapuk Akar dan Pangkal Batang (Cylaria SP) pada Tanaman Tebu Pembimbing
Abstrak: Endofit adalah bakteri atau cendawan yang secara alami berasosiasi dengan tanaman tanpa menimbulkan dampak negatif pada inangnya. Endofit banyak dipelajari karena bermanfaat sebagai pemacu pertumbuhan (plant growth promotion, PGP) dan juga sebagai pengendali hama atau penyakit tanaman (biological control agent, BCA). Untuk mengetahui jenis endofit yang berpotensi sebagai PGP atau BCA pada tanaman tebu, sebuah studi telah dilakukan sejak Oktober 2015 hingga Februari 2017 bertempat di PT Gunung Madu Plantations (GMP), sebuah perkebunan tebu swasta di Kabupaten Lampung Tengah. Studi dimulai dengan mengisolasi endofit dari lima varietas tebu dan kemudian menyekrining jenis yang berpotensi sebagai patogen melalui uji reaksi hipersensitif dan hemolisis. Endofit yang lolos diuji potensinya sebagai PGP maupun BCA melalui uji in vitro pada bibit tebu yang ditumbuhkan dalam tabung dan juga in vivo pada tebu yang ditanam di dalam pot. PGP yang dipilih adalah yang mampu membuat pertumbuhan tebu lebih baik dari kontrol negatifnya, demikian juga, BCA yang dipilih adalah yang mampu menekan serangan penyakit lapuk akar dan pangkal batang (LAPB, cendawan Xylaria sp.) lebih baik dari kontol negatifnya. Identifikasi morfologis, molekuler, dan uji kemampuan dalam menghasilkan hormon pertumbuhan atau antibiotik hanya dilakukan untuk isolat terbaik. Hasil yang diperoleh pada pengujian in vitro menunjukkan bahwa terdapat sembilan isolat bakteri dan sembilan isolat cendawan yang berpotensi sebagai PGP. Lima isolat bakteri dan empat isolat cendawan berpotensi sebagai BCA. Walaupun begitu, pengujian lebih lanjut pada tebu yang ditanam dalam pot hanya menyisakan tiga isolat terbaik sebagai PGP dan tidak ada yang terpilih sebagai BCA. Ketiga isolat PGP terbaik adalah: bakteri N12 yang diisolasi dari akar varietas GMP3 dan diduga sebagai Bacillus, bakteri L16 yang diisolasi dari daun varietas GMP3 dan diduga sebagai Bacillus atau Domibacillus, serta cendawan C78 yang diisolasi dari batang varietas PS48 dan diduga sebagai Cladosporium. Ketiga isolat tersebut mampu memproduksi hormon pertumbuhan auksin, sitokinin, dan juga giberelin dengan kecenderungan N12 lebih banyak dibanding dua isolat lain.
Keyword: Bacillus, Domibacillus, Cladosporium, Gunung Madu, Lampung

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: