Judul: Tingkat Kerentanan Sumber Daya Ikan Sidat (Anguilla bicolor bicolor Mcclelland, 1844) di Sungai Cimandiri, Palabuhanratu
Abstrak: Sungai Cimandiri merupakan salah satu habitat ikan sidat. Tingkat kerentanan ikan sidat di Sungai Cimandiri setiap tahun mengalami peningkatan. Hal ini disebabkan oleh pengaruh dari lingkungan fisik dan kualitas perairan yang mengalami degradasi akibat aktivitas manusia di sekitar Sungai Cimandiri. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menentukan tingkat resiko potensi kerentanan sumber daya ikan berbasis data kerentanan untuk mengkaji keberlanjutan spesies ikan sidat di Sungai Cimandiri, Palabuhanratu. Analisis dilakukan dengan kajian mengenai kerentanan menggunakan software PSA (Productivity and Susceptability Anayisis). Hasil penelitian menunjukkan bahwa nilai kerentanan sumber daya ikan sidat telah mendekati kondisi rentan. Tingkat kerentanan ikan sidat di Sungai Cimandiri yang tertinggi pada bulan Oktober dengan nilai produktivitas rendah dan resiko kerentanan tinggi. Nilai Produktivitas bulan Oktober yaitu 1.3, sedangkan nilai susceptabilitas adalah sebesar 2.5, dengan indeks kerentanan 2.3. Tingkat kerentanan di Sungai Cimandiri berdasarkan analisis yang dilakukan pada bulan Juli sampai Oktober menunjukkan tingkat kerentanan sedang hingga sangat rentan., Cimandiri River is one of eel habitat. The level of vulnerability eels in the Cimandiri River each year has been increasing. It caused by the influence of physical environment and degradation water quality due to human activities around Cimandiri River. The purpose of this study was to determine the risk potential vulnerability level of fish resources based vulnerability data to assess the sustainability of fish species in Cimandiri River, Palabuhanratu. The analysis was performed with software vulnerability assessment of the PSA (Productivity and Susceptibility Analysis). The results showed that the value of the vulnerability of eel resources has approached the vulnerable condition. The highest vulnerability level of eels in the Cimandiri River happen in October with low productivity and high risk vulnerabilities. Value Productivity in October was 1.3, while the value of susceptibility was 2.5, the vulnerability index of 1.8. The vulnerability level in Cimandiri River based on the analysis conducted in July and October showed the vulnerability of moderate to highly susceptible.
Keyword: Ikan sidat, tingkat kerentanan, Sungai Cimandiri

Judul: Konsep Pengelolaan Konservasi Sidat (Anguilla sp.) di Sungai Cimandiri, Sukabumi Jawa Barat
Abstrak: Ikan sidat merupakan salah satu ikan yang termasuk dalam jenis ikan katadromus, yang berarti bahwa ikan sidat melakukan pemijahan di laut dalam dan pada stadia larva beruaya ke sungai hingga mencapai usia dewasa kemudian kembali lagi ke laut. Ikan sidat memiliki nilai ekonomi tinggi, kandungan gizi yang tinggi, dan cita rasa yang lezat sehingga diminati pasar internasional. Permintaan ikan sidat (Anguilla bicolor) di Indonesia sangat besar, yaitu mencapai 600.000 ton per tahun (WWF 2018). Namun, kondisi tersebut dibatasi oleh ketersediaan benih di alam, umur glass eel, dan kualitas air untuk budidaya. Hal tersebut dapat berdampak pada jumlah populasi benih sidat yang beruaya ke muara sungai, serta menjadi penyebab penurunan populasi pada stadia elver di alam. DAS Cimandiri merupakan salah satu DAS yang memiliki potensi dalam pemenuhan kebutuhan ikan sidat dengan stadia glass eel. Kegiatan penangkapan glass eel dilakukan nelayan di muara sungai Cimandiri demi memenuhi kebutuhan perusahaan budidaya ikan sidat dan meningkatkan perekonomian nelayan sidat. Penangkapan ikan sidat di hulu sungai Cimandiri tidak didasari oleh faktor ekonomi, melainkan kegiatan rekreasi memancing yang dilakukan oleh komunitas. Jenis ikan sidat yang banyak ditemukan di sungai Cimandiri umumnya adalah Anguilla bicolor dan Anguilla marmorata. Ikan sidat dengan jenis Anguilla bicolor bicolor dan Anguilla marmorata masuk ke dalam kategori Near Threatened (Hampir Terancam) dan Least Concern (Kekhawatiran Minimal). Oleh karenanya, pengelolaan sidat di Sungai Cimandiri harus berbasis konservasi dengan mempertimbangkan tingkat rasio ekologi, sosio-ekonomi, dan ekosistemnya. Salah satu upaya dalam pengelolaan ikan sidat dapat dilakukan melalui pendekatan dalam mewujudkan pengelolaan kawasan yang ideal. Namun, bagaimanapun alternatif pengelolaan yang akan diterapkan, perlu adanya pelibatan stakeholder yang komprehensif, sehingga dalam pengelolaan sumber daya alam tidak menimbulkan konflik sosial. Kajian pengelolaan konservasi ikan sidat di Sungai Cimandiri didasarkan atas identifikasi persepsi masyarakat dan perkembangan kualitas lingkungan serta ketersediaan sidat di Sungai Cimandiri. Analisis strategi pengelolaan sungai menjadi acuan dasar dalam penentuan pengelolaan ikan sidat berkelanjutan di Sungai Cimandiri dengan konsep pengelolaan berbasis masyarakat. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisa kondisi kualitas lingkungan muara Sungai Cimandiri, memetakan potensi keterlibatan stakeholder dalam pelestarian ikan sidat di Sungai Cimandiri, dan mengkaji strategi pengelolaan seumber daya ikan sidat di Sungai Cimandiri berdasarkan stadia. Penentuan titik lokasi penangkapan sidat, dilakukan atas dasar arahan dari key informan dan berbagai referensi penelitian mengenai titik daerah penangkapan sidat. Penelitian dilakukan di lokasi penangkapan sidat baik muara, tengah maupun hulu sungai Cimandiri. Pengumpulan data kualitas air dilakukan dengan menggunakan data sekunder dari hasil penelitian yang sebelumnya pernah dilakukan oleh peneliti lain di area penangkapan ikan sidat. Pengambilan data responden pelaku kegiatan penangkapan sidat dan stakeholder terkait sebagai key informan dilakukan melalui wawancara secara mendalam. Hasil penelitian menunjukkan bahwa hasil penghitungan jumlah bobot dan skor dari skoring kualitas air diketahui sebesar 425 yang berarti kondisi kualitas air di sungai Cimandiri sangat baik. Terhadap parameter-parameter kualitas air dilakukan juga penghitungan indeks kualitas air, menghasilkan nilai 85, yang berarti bahwa indeks kualitas air sangat baik. Masyarakat yang menangkap sidat di muara sungai didasari atas dasar kebutuhan ekonomi, sedangkan untuk masyarakat yang menangkap sidat di tengah dan hulu sungai sebagai kesukaan dalam kegiatan memancing. Hasil analisis SWOT menunjukkan bahwa dalam pengelolaan perikanan sidat
Keyword: Eel fish, stakeholder, Cimandiri River

Judul: Penyusunan Overlap Graph menggunakan Suffix Tree pada DNA Sequence
Abstrak: The DNA sequence assembly is very important in genome analysis. This step aims to reconstruct contigous DNA fragment (contigs) from short fragment by concatenating fragments based on the overlap region among them. This method employs overlap graph for solving the problems. In this graph, nodes represent fragments and edges represent overlap. This research developed a software for constructing overlap graph using suffix tree. The evaluation was conducted by measuring the number of nodes, number of edges, and the execution time in many values of minimum overlap. The minimum overlap is defined as the minimum length of substring which is considered as the overlap region between two fragments. The evaluation results showed that the number of nodes, the number of edges, and the execution time were increased with the decreasing of the minimum overlap value.
Keyword: