Judul: Spesifisitas dan Efektivitas Fage Litik  Salmonella sp
Abstrak: Salmonellosis merupakan salah satu penyakit yang ditularkan melalui makanan dan air. Salmonellosis disebabkan oleh bakteri Salmonella sp. Gejala salmonellosis pada manusia dapat berupa sindrom gastroenteritis salah satunya adalah diare. Bakteri Salmonella sp. yang digunakan pada penelitian ini ialah isolat Salmonella p15, p19, p38, dan p84 yang merupakan koleksi Dr. dr. Sri Budiarti. Beberapa studi melaporkan bahwa galur S. enteritidis dan S. typhi yang diisolasi dari penderita diare di Indonesia resisten terhadap antibiotik. S. enteritidis resisten terhadap ciprofloxacin dan norfloxacin. S. typhi resisten terhadap trimetroprim-sulfamethoxazole, chloramphenicol, streptomycin dan tetracycline. Galur S. Weltevreden, S. Kenthucky, S. Typhimurium dan S. Paratyphy C yang diisolasi dari produk segar di Indonesia resisten terhadap antibiotik chloramphenicol, erythromycin, tetracyclin, sulfamethoxazole dan streptomycin. Adanya bakteri Salmonella sp. yang resisten antibiotik ini menyulitkan pengobatan salmonellosis, untuk itu perlu dicari cara pengganti antibiotik untuk menanggulangi masalah penyakit salmonellosis. Salah satunya dengan menggunakan bakteriofage (fage) yang dapat melisiskan sel bakteri. Penelitian ini bertujuan untuk mengkarakterisasi dan menguji efektivitas fage litik dalam melisis Salmonella sp. Hasil penelitian ini diharapkan dapat diaplikasikan sebagai biokontrol pencemaran air dan makanan sehingga dapat mencegah penyakit salmonellosis. Fage diisolasi dari limbah cair rumah tangga di daerah Babakan Raya, Darmaga Bogor. Isolat fage yang diperoleh dimurnikan dan dibiakkan, selanjutnya dilakukan kuantifikasi fage, ditentukan kisaran inangnya, dilakukan uji efektivitasnya dalam melisiskan sel Salmonella sp., dan diamati morfologi lisis sel Salmonella sp. oleh fage dengan SEM. Pada penelitian ini diperoleh empat isolat fage yaitu fage FR15, FR19, FR38, dan FR84. Keempat isolat fage tersebut bersifat spesifik inang. Berdasarkan karakterisasinya, diameter plak (zona bening) fage FR38 dan FR84 sebesar 2 mm, sedangkan fage FR15 dan FR19 sebesar 1 mm. Ukuran plak sebanding dengan efisiensi adsorpsi, panjang periode laten, dan banyaknya progeni yang dilepaskan pada saat sel lisis. Titer fage diukur dengan cara menghitung jumlah plak yang terbentuk (Plague forming units (PFU)), fage FR15 bertiter 25700 PFU/mL, fage FR19 bertiter 33600 PFU/mL, fage FR38 bertiter 11440 PFU/mL, dan fage FR84 bertiter 10720 PFU/mL. Uji efektivitas fage dalam melisis sel Salmonella sp. dilakukan dengan menambahkan fage sebanyak 104 PFU/mL dan 3x104 PFU/mL. Efektivitas fage dalam melisis sel Salmonella sp. di ukur dengan melihat penurunan nilai optical density (OD) dari 0 jam sampai terjadi penurunan OD dengan interval pengukuran nilai OD setiap satu jam sekali. Kemampuan masing-masing fage dalam melisis suspensi bakteri Salmonella sp. berbeda-beda. Kemampuan melisis tersebut dilihat berdasarkan penurunan nilai OD dari masing-masing suspensi bakteri. Penambahan konsentrasi fage FR38 sebanyak 104 PFU/mL memiliki aktivitas...dst
Keyword: Salmonella sp, fage litik, salmonellosis, Scanning Electron Microscope (SEM)

Judul: Efektivitas Campuran Fag Litik Spesifik pada EPEC K1.1 dan Salmonella P38 sebagai Biokontrol terhadap Penyakit Diare
Abstrak: Enteropathogenic Escherichia coli (EPEC) merupakan salah satu bakteri penyebab diare di negara berkembang terutama banyak menyerang bayi dan balita. Bakteri EPEC umumnya ditemukan dalam tanah dan air yang menjadi salah satu penyebab dari foodborne disease dan waterborne disease. Mekanisme penyebaran foodborne disease dan waterborne disease terjadi akibat cemaran patogen penyebab penyakit berada dalam makanan dan air sehingga dapat menyebabkan penyakit infeksi bila dikonsumsi oleh manusia atau hewan. Selain bakteri EPEC, diare pun dapat disebabkan oleh beberapa bakteri patogen lainnya, salah satunya adalah Salmonella. Salmonella dapat menyebabkan penyakit pada manusia dengan sindrom gastroenteritis. Bakteri EPEC dan Salmonella merupakan bakteri penyebab gastroenteritis yang banyak ditemukan di Indonesia mencemari makanan atau minuman. Beberapa studi melaporkan bahwa galur Salmonella enteritidis yang diisolasi dari penderita diare di Indonesia resisten terhadap antibiotik ciproflosaksin dan norflosaksin, S. Typhi resisten terhadap kloramfenikol, streptomisin, dan tertrasiklin. Dilaporkan bakteri EPEC K1.1 yang diisolasi dari penderita diare di Depok resisten terhadap antibiotik tetrasiklin dan ampisilin. Adanya bakteri yang resisten terhadap antibiotik jika mencemari makanan dan minuman akan menyebabkan penyakit diare dan mempersulit pengobatan, sehingga diperlukan biokontrol alami yang ramah lingkungan dan dapat mengatasi bakteri patogen tersebut. Biokontrol alami yang dimaksud adalah fag litik yang dapat melisiskan sel bakteri. Hasil penelitian ini diharapkan dapat diaplikasikan sebagai biokontrol pencemaran air dan makanan sehingga dapat mencegah penyakit diare akibat infeksi EPEC dan Salmonella. Fag litik EPEC diisolasi dari limbah cair rumah tangga di daerah Babakan Raya, Darmaga Bogor. Isolat fag litik yang diperoleh dimurnikan dan dibiakkan, selanjutnya diamati morfologinya, dilakukan kuantifikasi fag litik, ditentukan kisaran inangnya, diuji aktivitas campuran fag litik dalam melisis sel EPEC K1.1 dan Salmonella P38, diuji kestabilan penyimpanannya dalam bufer dengan kondisi suhu yang berbeda, dan dilakukan karakterisasi protein fag litik. Pada penelitian ini, diperoleh empat isolat fag litik yaitu: FBd1, FBd2, FBd3 dan FBd4 yang didapat dari titik pengambilan sampel yang berbeda. Konsentrasi fag litik kemudian diukur dengan cara menghitung plak yang terbentuk (Plaque Forming Unit (PFU)). Fag litik FBd3 memiliki konsentrasi tertinggi, yaitu 3.4 x 106 PFU/mL. Kuantifikasi plak menunjukkan bahwa FBd3 memiliki kemampuan infeksi terkuat terhadap bakteri EPEC K1.1, sehingga lebih efektif dalam menginfeksi sel EPEC K1.1 dibandingkan ketiga isolat lainnya. Hal ini memungkinkan peluang FBd3 untuk dapat diaplikasikan sebagai biokontrol terhadap penyakit diare. Uji kisaran inang bertujuan untuk mengetahui spesifisitas fag dalam melisis sel bakteri yang menjadi inangnya. Hasil penelitian menunjukkan bahwa fag litik FBd3 bersifat spesifik terhadap bakteri EPEC K1.1. Spesifisitas inang FBd3 menunjukkan dugaan bahwa di permukaan sel bakteri EPEC K1.1 memiliki reseptor-reseptor yang spesifik terhadap fag litik FBd3 yang tidak dimiliki oleh bakteri lainnya. Berdasarkan pengamatan morfologi fag litik pada Transmission Electron Microscope (TEM), FBd3 termasuk kedalam famili Phodoviridae. Morfologi kepala ikosahedral berdiameter 57.14 nm, ekor pendek non kontraktil berdiameter 12.5 nm dan panjang ekor 33.3 nm. FR38 termasuk kedalam famili Siphoviridae dengan kepala berbentuk heksagonal ikosahedral berdiameter 72.7 nm, ekor non kontraktil dengan panjang 100 nm dan berdiameter sebesar 18.2 nm. Kepala dan ekor fag terdiri dari protein. Protein penyusunnya bervariasi dan memiliki fungsi yang berbeda. Fungsi tersebut meliputi perlindungan fag terhadap ketahanannya di lingkungan dan berperan pada proses replikasi sampai menyebabkan lisis pada
Keyword: Lytic phage, cocktail phage, Salmonella, EPEC

Judul: Real Option Valuation Using Binomial Decision Trees.
Abstrak: A firm that decides to invest has a choice to invest in real assets. A method which is usually used in valuation of the project is discounted cash flow (DCF) method. But, this method can’t be used in projects that account for value of managerial flexibility, such as decision to suspend operations temporarily. Therefore, this kind of project needs to be assessed using real option. Real option valuation can be done in some ways, including the use of path-dependent simulation, as well as closed-form models like Black-Scholes model, partial differential equation, and binomial or multinomial approaches. In this paper, real option valuation using binomial decisions id discussed. Determination of the project value can be done in three steps. First, calculate the expected present value of the project. Next, calculate volatility of the project using Monte Carlo simulation. Last, construct a binomial tree to model the dynamics of the project value using the parameters of the stochastic process, and then add some decision nodes to model the project’s real options.
Keyword: