Judul: Pereduksian Matriks Komposisi Tegakan Hutan dengan Analisis Komponen Utama dan Diskriminan Kanonik
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk meneliti pengaruh data bergrup dan hadirnya pencilan dalam menjelaskan hasil pereduksian dimensi dengan Analisis Komponen Utama (AKU) yang diluar harapan. Matriks data diidentifikasi begrup berdasarkan informasi yang diperoleh belakangan tentang adanya keanekaan dalam faktor-faktor sistem lahan, altitude dan kelerengan medan dalam suatu kawasan luas yang mencirikan habitat petak contoh. Analisis Ragam Peubah ganda diterapkan untuk melacak determinasi keragaman habitat-habitat terhadap keragaman komposisi-komposisi s spesies.
Keyword: 

Judul: Ordinasi komunitas hutan alam hujan tropika dengan analisis diskriminan: studi kasus di propinsi Kalimantan Timur
Abstrak: Ordinasi merupakan istilah ekologi, adalah suatu prosedur untuk mengubah kelompok data berdimensi ganda dan memproyeksikannya dalam ruang berdimensi rendah, sehingga pola dari kelompok data tersebut mudah terlihat. Manfaat ordinasi ini adalah untuk mendapatkan gambaran hubungan respon spesies dalam komunitas terhadap faktor-faktor lingkungan. Ordinasi dengan analisis diskriminan adalah ordinasi yang menggunakan fungsi diskriminan sebagai sumbu-sumbu ordinasinya. Penggunaan analisis ini didasarkan atas adanya kelompok a priori yang lebih dahulu diketahui secara jelas pengelompokkannya. Landasan yang digunakan untuk mendapatkan fungsi diskriminan adalah dengan cara memaksimumkan keragaman antar kelompok dan meminimumkan keragaman dalam kelompok. Penelitian ini didukung data sekunder tegakan hutan alam yang dikumpulkan dari Permanent Sample Plot dalam kaitannya dengan Proyek Inventarisasi Hutan Nasional yang dilaksanakan oleh Departemen Kehutanan, mencakup sebagian wilayah Propinsi Kalimantan Timur dengan cakupan luas 32000 km². Untuk keperluan penelitian, respon yang diukur adalah kehadiran seluruh spesies pohon dan kerapatannya untuk setiap unit contoh berukuran 100x100 m, tersebar sistematik dalam jarak 20x20 km dalam kawasan hutan. Sebagai peubah bebas (diskriminator) adalah jenis pohon, dinya- takan dalam jumlah individu jenis per hektar dan sebagai peubah tidak bebas adalah banyaknya sistem lahan yang dijumpai dalam wilayah studi. Konsep sistem lahan beranggapan terdapat kaitan yang erat antara jenis-jenis batuan, hidroklimatologi, bentuk lahan, tanah dan makhluk hidup. Sistem lahan yang sama akan dapat ditemukan pada tempat-tempat yang memiliki kombinasi faktor-faktor lingkungan yang sama. Konsep sistem lahan ini telah umum digunakan untuk keperluan evaluasi lahan melalui penafsiran potret udara dan sarana penginderaan jauh lainnya. Tujuan penelitian adalah: (1) mengkaji penggunaan data komposisi dan kerapatan jenis sebagai cerminan adanya perbedaan sistem lahan, (2) sampai sejauhmana penggu- naan analisis diskriminan dapat menggambarkan perbedaan sistem lahan, yang ditun- jukkan oleh perbedaan kelimpahan jenis pada setiap sistem lahannya, dan (3) menentu- kan kontribusi setiap jenis yang berperan dalam setiap sistem lahan. Dari 82 PCP yang digunakan dalam penelitian, teridentifikasi kehadiran 131 jenis pohon yang tercakup dalam 40 suku. Dari jumlah tersebut, kira-kira 34 persen adalah …dst
Keyword: Forest ecology, Natural forest, Ordinasi

Judul: Extracellular Expression of thermostable Geobacillus stearothermophilus T1.2RQ Lipase for Biodiesel Production
Abstrak: The extracellular expression of enzymes in an excellent secretion host such as Bacillus subtilis is a useful strategy for making enzymes of industrial significance more affordable by lowering the cost of its downstream processing. Lipases are a category of hydrolases that catalyze the hydrolysis of triglycerides to glycerol and free fatty acids. Also, lipases catalyze the hydrolysis and transesterification of other esters as well as the synthesis of esters. They can perform very specific biotransformation reactions and are widely used in food, organic synthesis, detergents, cosmetic, and pharmaceutical industries. Geobacillus stearothermophilus T1.2RQ lipase is an industrially-desired thermostable lipolytic enzyme with an excellent hydrolytic and transesterification activity. This study aimed to express T1.2RQ lipase, in B. subtilis WB800 and ensure its secretion into the extracellular medium. Three signal peptides (AmyQ, Epr, LipA) and two promoters (Pgrac01 and Pgrac100) were used in the secretory-expression of T1.2RQ lipase, based on five constructed expression vectors constructed by restriction cloning and PCR mutagenesis. Sangers sequencing was used to verify constructs to ensure they are in the correct reading frame. Recombinants vectors, pHT43 (plasmid control), pHT43-T1.2RQ, pHT43- T1.2RQ_AmyQ, pHT43-T1.2RQ_Epr, and pHT43-T1.2RQ_LipA, were transformed by electroporation into Bacillus subtilis WB800. The electroporation was successful with the optimum condition of 2500V, 200 ohms, 25µF, and 5milliseconds. Recombinant B. subtilis pHT43 (negative control) and pHT43-T1.2RQlip + signal peptides were streaked on the lipidic agar, LA+TBN. All four recombinants, including the negative control (B. subtilis WB800-pHT43), produced clear zones on the TBN agar plate after overnight incubation (fig 2), indicating the presence of a lipolytic enzyme in all of the recombinant B. subtilis cells. pHT43-T1.2RQlip + signal peptides (AmyQ, Epr, and LipA) have clear zones with significantly higher diameters than B. subtilis WB800-pHT43 (negative control). This phenomenon suggests that the recombinant thermostable lipase T1.2RQ introduced into these cells was successfully expressed, thereby increasing the lipolytic capability of its host cells T1.2RQ lipase was expressed in 50ml terrific broth medium (TB) and the expression induced with 1mM IPTG. Lipase activity assay using p-nitrophenyl esters showed that all three signal peptides directed the secretion of T1.2RQ lipase into the extracellular medium. Signal peptide, LipA, resulted in the highest extracellular activity of 5.6 U/mL, which corresponds to a 6-fold increase over the parent B. subtilis WB800 strain. Meanwhile, signal peptides, AmyQ and Epr produced 4.2 U/mL and 3.4 U/mL activity respectively. SDS-Zymogram analysis confirmed that T1.2RQ lipase was correctly processed and secreted in its original size of 44 kDa. An attempt to further increase lipase expression level by promoter optimization showed that, contrary to expectation, promoter Pgrac100 exhibited similar expression levels as the original Pgrac01. Nevertheless, the demonstration of the successful secretion of T1.2RQ lipase in this work confirms the latter as a promising approach for the industrial production of the enzyme
Keyword: Bacillus subtilis, Expression, Extracellular, Heterologous, Lipase, Thermostable