Judul: Respons dan Tingkah Laku Cumi-cumi (Uroteuthis duvaucelli, D’Orbigny 1835) Terhadap Cahaya Lampu Light Emitting Diode
Abstrak: Cumi-cumi merupakan salah satu target utama dalam perikanan dengan menggunakan cahaya (light fishing) di Indonesia. Penangkapan cumi-cumi mengandalkan indera penglihatan berupa rangsangan cahaya agar cumi-cumi mendekati alat tangkap. Respons penerimaan cahaya oleh mata cumi-cumi dipengaruhi oleh berbagai faktor diantaranya warna dan intensitas. Penelitian ini bertujuan untuk menetukan respons tingkah laku dan adaptasi mata cumi-cumi dengan perbedaan warna yaitu biru, putih dan merah dengan intensitas rendah (1.1 x 10-4 – 2.3 x 10-4 W/cm2), sedang (9.6 x 10-4 – 2.0 x 10-3 W/cm2) dan tinggi (9.4 x 10-3 – 1.2 x 10-2 W/cm2) di laboratorium. Penelitian dilakukan pada bulan Desember sampai April 2019 di Laboratorium Bagian Administrasi Pelatihan Perikanan Lapang, Sekolah Tinggi Perikanan, Serang. Penelitian yang dilakukan menggunakan metode uji coba di laboratorium. Faktor percobaan yang dilakukan adalah perbedaan warna cahaya lampu LED (putih, biru dan merah) dan perbedaan intensitas cahaya (rendah, sedang dan tinggi). Pengamatan yang dilakukan yaitu pada adaptasi retina dan respons tingkah laku cumi-cumi. Adaptasi retina cumi-cumi dilakukan dengan pendekatan histologi untuk setiap perlakuan. Respons tingkah laku cumi-cumi dilakukan dengan pengamatan yang berbeda pada setiap perlakuannya dengan cumi-cumi yang memiliki panjang mantel 7.4 ±1.41 cm pada wadah perlakuan. Parameter tingkah laku cumi-cumi yang diamati adalah preferensi zona, frekuensi jetting, nearest neighbor distance (NND), kecepatan renang dan pola pergerakan. Adaptasi retina mata cumi-cumi pada lama pencahayaan 30 menit memiliki nilai rasio tertinggi adalah cahaya lampu warna biru intensitas rendah (1.1 x 10-4 W/cm²) yang memiliki nilai 74.54% dan nilai terendah sebesar 8.95% terjadi pada cahaya lampu warna putih intensitas rendah (1.1 x 10-4 W/cm²). Berikutnya pada lama pencahayaan 90 menit memiliki nilai rasio tertinggi pada cahaya lampu warna putih tinggi (1.2 x10⁻² W/cm²) 56.44% dan terendah pada cahaya lampu warna merah rendah (2.3 x 10-4 W/cm²). Adaptasi retina pada kondisi tanpa cahaya memiliki nilai 7.99%. Tingkah laku cumi-cumi pada kondisi tanpa cahaya bergerak tanpa arah sehingga berada pada semua zona pengamatan. Cumi-cumi berada pada zona redup pada perlakuan lampu warna biru dan putih kecuali pada lampu warna biru dengan intensitas rendah cumi-cumi berada pada zona terang. Penggunaan lampu merah menyebabkan cumi-cumi berada pada zona terang. Peningkatan intensitas yang dilakukan membuat frekuensi jetting pada semua perlakuan meningkat. Jarak antar individu pada lampu biru menyebabkan semakin menjauh, sementara pada lampu putih dam merah jarak antar individu mendekat pada intensitas sedang. Kecepatan renang cumi-cumi memiliki nilai yang berfluktuasi pada setiap warna percobaan. Nilai kecepatan tertinggi 12.27 cm/s terjadi pada warna lampu biru dengan intensitas rendah, sementara kecepatan terendah terjadi pada lampu putih dengan intensitas rendah dengan nilai 4.21 cm/s.
Keyword: cephalopoda, LED DIP, pigmen hitam, jetting, intensitas cahaya

Judul: Respons mimi terhadap cahaya led merah dengan intensitas yang berbeda untuk mitigasi bycatch jaring insang dasar
Abstrak: Mimi merupakan hewan dilindungi yang menjadi permasalahan dalam perikanan karena menjadi bycatch pada jaring insang dasar. Mimi yang tertangkap berpotensi untuk merusak jaring karena mimi yang tersangkut jaring sangat sulit dilepaskan sehingga nelayan terkadang merobek jaring untuk menghemat waktu. Salah satu wilayah di Indonesia yang memiliki permasalahan terkait bycatch adalah perairan Utara Jawa, khususnya Mayangan. Hal ini terbukti adanya dominansi bycatch mimi sebanyak 46% pada Agustus (Supadminingsih 2018). Oleh sebab itu, upaya untuk mengurangi bycatch perlu dilakukan, salah satunya dengan memanfaatkan tingkah laku visual mimi. Tingkah laku visual dipilih karena mimi dominan memanfaatkan visual untuk beraktifitas seperti memijah dan mencari makan. Selain itu mimi memiliki tingkat kepekaan cahaya yang tinggi sehingga dalam penelitian ini cahaya LED merah digunakan sebagai teknologi alternatif untuk mengurangi bycatch. Menurut Utami (2018), LED merah adalah warna yang paling dijauhi oleh mimi dibandingkan warna LED lain. Namun, pada percobaan Utami (2018) sebelumnya, jarak pola manuver mimi dengan sumber cahaya masih cukup dekat dan hal ini dikhawatirkan berpotensi membuat mimi tersangkut jaring. Diduga intensitas pada percobaan sebelumnya belum tepat, oleh karena itu dalam penelitian ini menggunakan LED merah dengan intensitas yang berbeda, yaitu rendah (3.68 × 10-6 W/cm2), sedang (5.47 × 10-6 W/cm2) dan tinggi (1.05 × 10-5 W/cm2). Selain itu, mata mimi yang terpapar oleh cahaya LED merah continous secara terus-menerus dikhawatirkan akan mengalami adaptasi (Bourne dan Danielli 1975), sehingga untuk mencegahnya terjadi, maka digunakan LED merah dengan efek flip-flop. Tujuan dalam penelitian ini adalah menentukan 1) pola sebaran cahaya lampu LED merah dengan intensitas yang berbeda, 2) pola dan waktu respons mimi terhadap lampu LED merah continous dan flip-flop dengan intensitas yang berbeda dan 3) menentukan intensitas lampu LED merah yang tepat untuk mitigasi bycatch mimi. Penelitian dilakukan pada April 2019 di Laboratorium Tingkah Laku Ikan PSP FPIK IPB. Metode yang digunakan dalam penelitian ini adalah eksperimen skala laboratorium dan menggunakan Rancangan Acak Lengkap. Data yang dikumpulkan berupa pola persebaran cahaya dari tiga intensitas berbeda, pola respons dan waktu respons mimi. Data pola persebaran cahaya dan pola respons mimi dianalisis secara deskriptif, sedangkan data waktu respons perpindahan mimi dianalisis secara statistik yaitu uji Anova dan independent samples t-test. Pola persebaran cahaya dari tiga intensitas tidak tersebar secara homogen sehingga orientasi respons mimi juga akan berbeda terhadap pada tiga intensitas. Respons yang ditunjukkan oleh mimi terbagi atas dua kategori, yaitu menjauhi lampu dan mendekati lampu. Respons mimi yang menjauhi lampu tertinggi terdapat pada intensitas rendah, sedangkan pada intensitas sedang dan tinggi mimi menunjukkan tingkah laku yang agresif seperti cenderung menyerang lampu. Respons mimi menjauhi cahaya direpresentasi oleh pola straight to dark (SD) dan light to dark (LD) sedangkan respons mimi mendekati direpresentasi oleh pola straight to light (SL) dan dark to light (DL), sedangkan mimi yang tidak memberi respons disebut stagnan (ST). Dari kelima pola, pola yang dinilai paling baik adalah SD. Mimi yang menunjukkan pola SD tertinggi adalah intensitas rendah, sebanyak 60%. Berdasarkan kriteria pola, intensitas yang paling baik adalah intensitas rendah. Adapun waktu respons tercepat mimi menghindar terdapat pada intensitas rendah selama 32.05 detik dan mimi tidak menunjukkan adanya agresifitas. Hal ini juga dibuktikan dengan uji
Keyword: Arthropoda, jaring insang, mitigasi bycatch, tingkah laku, light emitting diode

Judul: Penyusunan Overlap Graph menggunakan Suffix Tree pada DNA Sequence
Abstrak: The DNA sequence assembly is very important in genome analysis. This step aims to reconstruct contigous DNA fragment (contigs) from short fragment by concatenating fragments based on the overlap region among them. This method employs overlap graph for solving the problems. In this graph, nodes represent fragments and edges represent overlap. This research developed a software for constructing overlap graph using suffix tree. The evaluation was conducted by measuring the number of nodes, number of edges, and the execution time in many values of minimum overlap. The minimum overlap is defined as the minimum length of substring which is considered as the overlap region between two fragments. The evaluation results showed that the number of nodes, the number of edges, and the execution time were increased with the decreasing of the minimum overlap value.
Keyword: