Judul: Characterization of genotypes and morphometric  truss phenotypes of puerulus lobster Panulirus spp. from Krui (Lampung) and  Ujung Genteng (Sukabumi)
Abstrak: ABSTRAK NADILA CHAIRUNNISA. Karakterisasi genotipe dan fenotipe truss morfometrik puerulus lobster Panulirus spp. asal Krui (Lampung) dan Ujung Genteng (Sukabumi). Dibimbing oleh DINAR TRI SOELISTYOWATI dan ODANG CARMAN. Lobster (Panulirus spp.) merupakan organisme terumbu karang di daerah tropis-subtropis yang memiliki nilai ekonomis tinggi. Penangkapan berlebih dapat mengakibatkan populasi di alam menurun. Penelitian ini bertujuan menganalisis keragaman genetik dan morfometrik lobster (Panulirus spp.) asal Krui (Lampung) dan Ujung Genteng (Sukabumi) menggunakan metode random amplified polymorphic DNA (RAPD) PCR dan truss morfometrik untuk pengembangan budidaya. Penelitian ini menggunakan 60 ekor lobster. Metode penelitian ini meliputi ekstraksi DNA, analisis keragaman genetik dengan metode RAPD, elektroforesis, dan pengukuran truss morfometrik. Populasi lobster Lampung menunjukkan persentase polimorfisme yang lebih tinggi dibandingkan dengan populasi lobster Sukabumi yaitu sebesar 50% dan kedua populasi memiliki jarak genetik 0,1976. Berdasarkan karakteristik truss morfometrik, lobster asal Krui dan Ujung Genteng dihasilkan 15 dari 24 karakter menunjukkan perbedaan nyata (P<0,05) kecuali untuk karakter kepala bagian depan (A2), kepala bagian belakang (B4, B5), abdomen (C2), telson (D1, D3, D4, D5, D6) tidak berbeda nyata. Koefisien keragaman karakter morfometrik populasi Lampung 0,08-0,31 dan populasi Sukabumi 0,07-0,19., ABSTRACT NADILA CHAIRUNNISA. Characterization of genotypes and morphometric truss phenotypes of puerulus lobster Panulirus spp. from Krui (Lampung) and Ujung Genteng (Sukabumi). Supervised by DINAR TRI SOELISTYOWATI and ODANG CARMAN. Lobsters (Panulirus spp.) are tropical-subtropical coral reef organisms that have high economic value. Overfishing can result in declining populations in nature. This study aims to analyze the genetic and morphometric diversity of lobsters (Panulirus spp.) from Krui (Lampung) and Ujung Genteng (Sukabumi) using random amplified polymorphic DNA (RAPD) PCR and morphometric truss methods for aquaculture development. This study used 60 lobsters. The research methods included DNA extraction, genetic diversity analysis using RAPD method, electrophoresis, and morphometric truss measurement. Lampung lobster population showed a higher percentage of polymorphism compared to Sukabumi lobster population which was 50% and both populations had a genetic distance of 0,1976. Based on morphometric truss characteristics, lobsters from Krui and Ujung Genteng produced 15 out of 24 characters showed significant differences (P<0,05) except for the characters of the front head (A2), back head (B4, B5), abdomen (C2), telson (D1, D3, D4, D5, D6) were not significantly different. The coefficient of variation of morphometric characters of Lampung population was 0,08-0,31 and Sukabumi population was 0,07-0,19.
Keyword: Kata kunci: keragaman genetik, lobster, morfometrik, RAPD, Keywords: genetic diversity, lobster, morphometric, RAPD

Judul: Dinamika Populasi dan Hubungan Keragaman Genetik Sumber Daya Spiny Lobster (Panulirus spp).
Abstrak: Lobster merupakan salah satu komoditas perikanan yang memiliki nilai ekonomis tinggi untuk pasar lokal maupun ekspor. Indonesia memiliki persebaran lobster di seluruh wilayah perairan dengan komposisi spesies yang berbeda. Lobster genus Panulirus merupakan lobster yang memiliki produksi tertinggi dan memiliki keragaman paling besar. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi dan mendeskripsikan spiny lobster (Panulirus spp.) berdasarkan karakter morfologi, keragaman genetik dan dinamika populasi sebagai bahan pengelolaan sumber daya spiny lobster di perairan Indonesia. Penelitian dilakukan mulai bulan September 2015 hingga Mei 2017. Pengambilan sampel dilakukan di beberapa sentra produksi perikanan lobster, yaitu di Aceh Jaya, Jawa, Kalimantan, Sulawesi Tengah, Seram, dan Raja Ampat. Sedangkan untuk analisis dinamika populasi dilakukan di Teluk Palabuhanratu, Sukabumi, Jawa Barat. Identifikasi lobster berdasarkan karakter morfologi dan pola warna menemukan bahwa di perairan Indonesia bisa ditemukan 7 spesies spiny lobster genus Panulirus, yaitu lobster pasir (P. homarus), lobster batu (P. penicillatus), lobster mutiara (P. ornatus), lobster batik (P. longipes dan P. femoristriga), lobster bambu (P. versicolor) dan lobster pakistan (P. polyphagus). Lobster batik terdiri dari 2 spesies yaitu P. longipes dan P. femoristriga yang keduanya merupakan cryptic species. Dalam setiap lokasi pengambilan sampel ditemukan 5 atau 6 spesies lobster, kecuali di perairan Raja Ampat, Papua yang bisa ditemukan sampai 7 spesies lobster. Identifikasi molekular menggunakan ruas gen CO1 berhasil dilakukan untuk 5 spesies lobster, yaitu P. versicolor (12 sampel), P. penicillatus (8 sampel), P. homarus (3 sampel), P. longipes (2 sampel) dan P. femoristriga (4 sampel). Kesamaan runutan nukleotida intraspesies yang paling besar ditemukan pada P. femoristiga (99-100%) dan yang paling kecil pada P. longipes (97%). Perhitungan jarak genetik konstruksi pohon filogeni Neighbour Joining (model K2P, bootstrap 1000x) melibatkan beberapa data yang sudah dipublikasikan dan udang dari genus Penaeus sebagai outgroup. Jarak genetik interspesies Panulirus berkisar antara 0,0016 -0,2211 (rata-rata 0,1486). Sedangkan pada udang Penaeus berkisar antara 0,1398-0,1512 (rata-rata 0,1458). Jarak genetik intraspesies Panulirus yang paling tinggi ditemukan pada P.homarus sebesar 0,0488, kemudian berturut-turut pada P.penicilatus, P. versicolor, P.longipes sebesar 0,013 dan P.fermoristriga sebesar 0,0081. Hasil konstruksi pohon filogeni menemukan bahwa P. versicolor terdiri atas 4 stok indukan, yaitu Selatan Jawa [Banten - Pelabuhan Ratu - Trenggalek - Malang], Barat sampai Utara Sumatera [Aceh], Papua dan sekitarnya [Papua - Seram], dan Sulawesi. Sedangkan untuk P. penicillatus terdiri atas 4 stok indukan, yaitu Selatan Jawa bagian Timur [Malang - Yogyakarta], Selatan Jawa bagian Barat [Palabuhanratu - Banten], Barat Sumatera bagian Utara [Aceh], dan Papua dan sekitarnya [Seram]. Analisis dinamika populasi dilakukan untuk spesies P. penicillatus di Teluk Palabuhanratu. Pola pertumbuhannya adalah allometrik negatif. Koefisien pertumbuhan lobster betina lebih tinggi dibandingkan lobster jantan. Puncak rekrutmen lobster jantan diduga terjadi pada bulan April dan Juli, sedangkan lobster betina pada bulan Mei dan Agustus. Nilai Lr<Lc, menunjukkan lobster betina tertangkap setelah melewati ukuran rata-rata mengerami telur. Laju mortalitas penangkapan (F) lobster jantan lebih tinggi dibandingkan laju mortalitas alaminya, sedangkan lobster betina lebih rendah dibandingkan laju mortalitas alaminya. Lobster jantan telah mengalami overexploitation sedangkan lobster betina belum mengalami overexploitation. Berdasarkan ukuran tubuh, jenis lobster yang tertangkap di Teluk Palabuhanratu didominasi oleh kelompok ukuran dengan panjang karapas 5.0-7.5 (54 %). Sedangkan ukuran panjang karapas yang
Keyword: Dinamika Populasi, Keragaman Genetik, Spiny Lobster

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: