Judul: Type 5 Phosphodiesterase Molecular Bonding by The Active Compound of Senggani (Melastoma malabathricum L.) as a Therapy of Erectile Dysfunction
Abstrak: Disfungsi ereksi disebabkan oleh aktivitas fosfodiesterase tipe 5 (PDE5) yang tinggi sehingga degradasi cGMP menurun dan berakibat otot polos penis mengalami relaksasi secara terus menerus sehingga penis tidak mengalami ereksi. PDE5 perlu diinhibisi dalam mendegradasi cGMP sehingga kadar cGMP meningkat dan menyebabkan kontraksi otot polos lebih lama sehingga penis dapat berereksi. Senggani dilaporkan memiliki sifat sebagai senyawa afrodisiak, namun belum diketahui interaksi dan pengaruh senyawa bioaktif terhadap enzim PDE5. Oleh karena itu, Penelitian ini bertujuan menguji senyawa bioaktif senggani terhadap enzim fosfodiesterase 5 (PDE5) untuk menangani disfungsi ereksi. Penelitian ini menggunakan beberapa software, yaitu PyRx, Discovery Studio Visualizer, AutoDock Tools, AutoDock Vina, dan Ligplot+ 1.5.4. Reseptor yang ialah PDE5 dengan kode PDB: 2H42 dan ligan pembanding sildenafil. Reseptor tersebut digunakan dalam penapisan virtual terhadap 41 senyawa aktif senggani, senyawa hasil seleksi dilanjutkan dengan analisis absorpsi, toksisitas, dan bioavaibilitas. Hasil penambatan molekuler dianalisis melalui parameter energi afinitas (ΔG) dan nilai konstanta inhibisi. Auranamaide dan α-amyrin memiliki potensi terbaik dalam menghambat aktivitas enzim PDE5 dengan nilai ΔG masing-masing sebesar -10,3 dan -10,9 kkal/mol serta nilai konstanta inhibisi sebesar 0.2775 μM dan 0.1010 μM. Simpulannya auranamaide dan α-amyrin memiliki potensi inhibisi enzim PDE5 dalam terapi pengobatan disfungsi ereksi.
Keyword: Erectile dysfunction, molecular docking, phosphodiesterase 5, senggani

Judul: Aktivitas Antagonis Senyawa Aktif Kayu Secang (Caesalpinia sappan L.) Terhadap Reseptor Androgen In Silico Sebagai Antikanker Prostat
Abstrak: Kanker prostat merupakan pertumbuhan sel yang tidak normal akibat mutasi gen yang meregulasi proses proliferasi pada sel epitel prostat, serta dipengaruhi oleh hormon androgen dan reseptornya. Penelitian ini bertujuan menentukan senyawa aktif kayu secang (Caesalpinia sappan L.) yang berpotensi sebagai antikanker prostat melalui penghambatan reseptor androgen secara in silico. Sebanyak 35 senyawa aktif kayu secang diperoleh dari publikasi, kemudian ditambatkan secara molekuler pada reseptor androgen menggunakan perangkat lunak PLANTS. Hasil penelitian menunjukkan senyawa aktif sappanone B menjadi senyawa yang paling potensial sebagai antikanker prostat karena memiliki aktivitas antagonis dengan tidak membentuk ikatan hidrogen pada Asn705 dan Thr877 serta memiliki nilai penambatan -93,1328. Nilai tersebut lebih negatif dibandingkan ligan alami dihidrotestosteron dengan nilai penambatan -92,2929 dan ligan pembanding bikalutamida dengan nilai penambatan -83,2453, sehingga berpotensi memiliki afinitas ikatan antagonis terhadap reseptor androgen yang lebih kuat., Prostate cancer is an abnormal cell growth due to gene mutations that regulate the proliferation process in prostate epithelial cells, and is influenced by androgen hormone and its receptors. This study aims to determine the active compounds of sappan wood (Caesalpinia sappan L.) that have potential as prostate anticancer through androgen receptor inhibition in silico. A total of 35 active compounds of sappan wood were obtained from publications, then molecularly docked to androgen receptors using PLANTS software. The results showed that sappanone B is the most potential compound as a prostate anticancer because it has antagonistic activity by not forming hydrogen bonds on Asn705 and Thr877 and has a docking score of -93.1328. This value is more negative than the natural ligand dihydrotestosterone with a docking score of -92.2929 and the comparative ligand bicalutamide with a docking score of -83.2453, so it has the potential to have a stronger antagonistic binding affinity to androgen receptors.
Keyword: Androgen, Caesalpinia sappan L., Kanker Prostat, Penambatan Molekuler, Sappanone B

Judul: Utilization of terra/MODIS L1B data for analysis of horizontal wind profile in the troposphere
Abstrak: This study was concerned with horizontal wind derived from data collected with the Moderate-resolution Imaging Spectroradiometer (MODIS) on board the NASA’s Earth Observation System (EOS)-Terra satellite. The aim of this study is to develop a method for the estimation of horizontal wind movement in the troposphere based on Navier-Stokes equation. The method was applied to a calibrated and geolocated Terra/MODIS L1B 1 km data set. The data inputs to estimate surface temperature are retrieved from TIR (Thermal Infrared) bands 31 (10.780 μm to 11.280 μm) and 32 (11.770 μm to 12.270 μm). The obtained surface temperatures were later used to approximate geopotential height on a constant-pressure surface by using the modified Poisson equation. The main assumptions used are the hydrostatic equilibrium, ideal gas law, constant lapse rate and constant acceleration of gravity. Based on the distribution of geopotential height, the pressure gradient force is measured by the gradient of geopotential on an isobaric coordinate to present the horizontal wind profile. For certain topographic areas especially in the mountain ranges, there was a disadvantage of using pressure as a vertical coordinate which lead to inaccuracy. In spite of that, Terra/MODIS L1B data with 1 km spatial resolution can be used to estimate the horizontal wind movement in the troposphere.
Keyword: