Judul: Molecular Docking Analysis of Tannins and It’s Derivatives from Vernonia amygdalina Del to MurA as Anti-Bacterial
Abstrak: Daun Afrika (Vernonia amygdalina Del) mengandung berbagai jenis metabolit sekunder yang memiliki aktivitas antibakteri seperti tanin dan turunannya. Penggunaan antibiotik secara berlebihan dapat menyebabkan resistensi antibiotik, sehingga menurunnya efektivitas obat yang digunakan dalam mencegah atau mengobati infeksi. Penelitian bertujuan menguji potensi antibakteri senyawa turunan tanin dari Vernonia amygdalina Del melalui penghambatan terhadap enzim UDP-N acetylglucosamine enolpyruvyl transferase (MurA) secara penambatan molekuler dengan parameter berupa jenis ikatan kimia, energi afinitas, dan konstanta inhibisi dapat menguatkan potensi tanin dan turunannya sebagai antibakteri. Hasil menunjukkan bahwa beberapa senyawa aktif khas daun Afrika yaitu accertannin, gallic acid, hamamelitannin, dan petunidin 3-glukoside diprediksikan memiliki energi afinitas sebesar -7,4; -6,2; -5,6; dan -6,1 kkal/mol serta konstanta inhibisi sebesar 3,713; 28,205; 77,735; dan 33,397 μm. Ligan uji menunjukkan aktivitas lebih baik dibanding ligan pembanding yang memiliki energi afinitas sebesar -4,5 kkal/mol dan konstanta inhibisi sebesar 498,673 μm. Senyawa aktif tersebut diprediksi dapat menghambat sintesis dinding sel pada bakteri., African leaves (Vernonia amygdalina Del) contain various types of secondary metabolites with antibacterial activity such as tannins and its derivatives. Antibiotic overuse, a key driver of antibacterial resistance has resulted in decreased effectiveness of drugs used in preventing or treating infections. This study aimed to examine the potency of tannins and its derivative from Vernonia amygdalina Del through inhibition of the UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase (MurA) enzyme by molecular docking with parameters such as the type of chemical bond, energy affinity, and inhibition constant strengthens the potential of tannins and its derivatives as anti-bacterial. The results showed tannins were found to contain specific active compounds: accertannin, gallic acid, hamamelitannin, and petunidin 3-glucoside. Prediction of these compounds showed energy affinity equal to -7,4; -6,2; -5,6; and -6,1 kcal/mol and inhibition constants of 3,713; 28,205; 77,735; and 33,397 μm better inhibition activity than the reference ligand which have an energy affinity value equal to -4,5 kcal/mol and an inhibition constant of 498,673 μm. The specific active compound Vernonia amygdalina Del prediction proved to inhibit cell wall synthesis in bacteria.
Keyword: antibacteria, MurA, tannin, Vernonia amygdalina

Judul: Analisis Potensi Daun Torbangun (Plectranthus amboinicus) sebagai Antibakteri terhadap Klebsiella pneumoniae secara in silico
Abstrak: Resistensi antibiotik adalah masalah global. Bakteri Klebsiella pneumoniae merupakan bakteri prioritas untuk ditemukan antibiotiknya karena adanya enzim extended spectrum beta-lactamase (ESBL) yang menyebabkan bakteri ini mudah mengalami resistensi. Daun torbangun diketahui memiliki banyak sekali kandungan flavonoid yang sering diteliti sebagai antibakteri. Penelitian ini bertujuan menganalisis potensi daun torbangun (Plectranthus amboinicus) sebagai antibakteri terhadap Klebsiella pneumoniae dengan metode in silico. Penelitian dilakukan dengan melakukan penambatan molekuler menggunakan aplikasi AutoDock Vina terhadap enzim dari bakteri Klebsiella pneumonia yaitu SHV (Sulfhydryl variable) dengan senyawa kimia yang diambil dari tanaman daun torbangun. Parameter yang digunakan adalah energi bebas ikatan, konstanta inhibisi, serta visualisasi ligan secara 3D dan 2D. Hasil yang diperoleh menunjukkan ligan alami memiliki energi bebas ikatan sebesar -6,7 kcal/mol dan konstanta inhibisi 12,11 µM. Nilai energi bebas ikatan dan konstanta inhibisi dari luteolin 3’Oglucuronide, apigenin 7-glucuronide, dan asam rosmarinat menunjukkan hasil yang lebih baik dibandingkan dengan ligan alami dari SHV-1 (1,4-thiazepine)., Antibiotic-resistant is a global issue. Klebsiella pneumoniae has high priority to find its antibiotic because it has extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) enzyme that makes the bacteria easy to resist the antibiotic. Indian borage is one of the empirical medicinal plants that contain flavonoids being used for treating the disease. This research had the purpose of analyzing Indian borage potential as an antibacterial for Klebsiella pneumoniae in silico. Docking is the method for this research by using AutoDock Vina, an application to attach enzyme ESBL from Klebsiella pneumoniae which mention as SHV (Sulfhydryl variable) and metabolite seconders from the plant. The analyzed parameter was binding free energy, inhibition constant, and visualization in 3D and 2D. Binding free energy and inhibition constant of a native ligand is -6.7 kcal/mol and 12.11 µM. Binding free energy value of apigenin 7-glucuronide and rosmarinic acid perform higher potency than the native ligand of SHV-1 (1,4-thiazepine).
Keyword: Daun torbangun, Klebsiella pneumoniae, Resistensi antibiotik, Penambatan molekuler

Judul: Cycle Hamilton pada Graf Lengkap, Graf Regular, dan Graf 2-Connected 4-Regular Berorder Kurang dari Sepuluh.
Abstrak: Suatu graf disebut graf Hamilton apabila graf tersebut memuat cycle Hamilton, yaitu cycle yang melewati setiap vertex tepat satu kali. Menentukan keberadaan cycle Hamilton pada suatu graf dapat menggunakan syarat cukup yang berupa teorema-teorema yang telah diperkenalkan sejak tahun 1950-an. Beberapa syarat cukup yang dibahas dalam karya ilmiah ini adalah syarat cukup yang berhubungan dengan graf lengkap dan graf regular. ,,,
Keyword: graf Hamilton, graf regular, graf lengkap, graf 2-connected 4-regular.