Judul: Deteksi dan Identifikasi Cucurbit aphid-borne yellows polerovirus (CABYV) pada Cucurbitaceae di Jawa
Abstrak: Cucurbitaceae merupakan salah satu komoditas penting di berbagai dunia. Namun, banyak faktor yang membatasi produksinya, seperti infeksi virus. Tujuan penelitian ini adalah mendeteksi dan mengidentifikasi Cucurbit aphid-borne yellows polerovirus (CABYV) pada Cucurbitaceae di Jawa. Gejala yang mengindikasikan adanya infeksi Polerovirus berupa daun menguning dibatasi pertulangan daun yang berwarna hijau dan ukuran daun tua tidak berubah. Total daun bergejala sekitar 600 sampel dikoleksi dari Jawa Barat (Subang dan Bogor), Jawa Tengah (Brebes, Purworejo, dan Kulonprogo), dan Jawa Timur (Nganjuk, Kediri, dan Tulungagung). Frekuensi infeksi virus-virus yang terdapat pada sampel bergejala ditentukan melalui metode Dot immunobinding assay (DIBA) dengan menggunakan 6 antiserum spesifik. Deteksi asam nukleat menggunakan metode Reverse-Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) dan perunutan DNA menggunakan primer spesifik CABYV. Hasil DIBA menunjukkan sampel yang diuji memberikan hasil positif terhadap Cucurbit aphid-borne yellows virus (CABYV) dengan frekuensi berkisar 22.67-83.33%, Cucumber mosaic virus (CMV) berkisar 2-88.89%, Papaya ringspot virus (PRSV) berkisar 0-87.5%, Tobacco mosaic virus (TMV) berkisar 0-89.6%, Squash mosaic virus (SqMV) berkisar 0-39.7%, dan Zucchini yellow mosaic virus (ZYMV) berkisar 3.9-61.11%. RT-PCR berhasil mengamplifikasi DNA berukuran ± 489 pb dan terkonfirmasi sebagai CABYV pada melon asal Nganjuk dan peria asal Bogor. CABYV isolat melon memiliki homologi tertinggi sebesar 100% dengan isolat mentimun asal Tulungagung, sedangkan isolat peria memiliki homologi tertinggi sebesar 96% dengan isolat melon asal Perancis dan labu asal Spanyol. Tulisan ini merupakan laporan pertama mengenai infeksi CABYV pada melon dan peria di Jawa.
Keyword: CABYV, Cucurbitaceae, Indonesia, Polerovirus

Judul: Inventarisasi dan deteksi virus penyebab penyakit mosaik pada famili Cucurbitaceae di Kotamadya Bogor, Pasir Muncang, dan Cibodas
Abstrak: Cucurbitaceae merupakan tanaman introduksi dari negara tropik dan subtropik. Seluruh bagian tanaman ini dapat dimanfaatkan dan sebagian besar memiliki nilai ekonomi yang tinggi. Kotamadya Bogor menjadi salah satu pilihan yang cocok secara geografis untuk menanam Cucurbitaceae. Tahun 2001, Kotamadya Bogor menyumbang hasil pertanian, diantaranya mentimun dan labu siam masing-masing 836 ton dan 15 ton. Tahun 2002, produksi mentimun mengalami penurunan walaupun ada peningkatan luas lahan. Kendala utama yang dapat menjadi pembatas produksi adalah adanya gangguan hama dan infeksi patogen sistemik. Virus merupakan salah satu patogen sistemik penting yang mampu menurunkan produksi tanaman hingga tidak menghasilkan sama sekali. Virus yang biasa ditemukan pada famili Cucurbitaceae diantaranya SqMV (squash mosaic comovirus), WMV-2 (watermelon mosaic potyvirus strain 2), CMV (cucumber mosaic cucumovirus), ZYMV (zucchini yellow mosaic potyvirus), TRSV (tobacco ringspot nepovirus), dan PRSV-W (watermelon of papaya ringspot potyvirus). Pengamatan dan pengambilan 20 sampel Cucurbitaceae dilakukan di Kotamadya Bogor, Pasir Muncang, dan Cibodas. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keberadaan dan persebaran virus yang menginfeksi pertanaman Cucurbitaceae di daerah tersebut, sehingga dapat mempermudah usaha pengendalian dengan mencegah persebarannya. Analisis keberadaan virus pada sampel dengan metode ELISA tidak langsung dilakukan di Laboratorium Virologi Tumbuhan, Departemen Hama dau Penyakit Tumbuhan. KP mosaik di pertanaman Cucurbitaceae di Kotamadya Bogor memiliki kejadian penyakit berkisar antara 3,7%-97% sedangkan di Pasir Muncang 1,36% dan Cibodas 4,33%. Dari 18 sampel di daerah Kotamadya Bogor, 3 sampel mentimun dan melon terinfeksi CMV, 6 sanıpel oyong dan labu siam terinfeksi ZYMV, 10 sampel mentimun, oyong, dan labu siam terinfeksi SqMV, 4 sampel oyong dari pare terinfeksi TRSV, 6 sampel labu siam, meion, pare, dan oyong terinfeksi WMV-2 dan sampel dari Cibodas tidak terdeteksi 6 virus yang diujikan, sedangkan sampel dari Pasir Muncang positif terinfeksi PRSV-W dan TRSV.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: