Judul: Patogenisitas Dan Imunogenisitas Bakteri Edwardsiella Ictaluri Pada Ikan Patin (Pangasionodon Hypophthalmus).
Abstrak: Salah satu kendala yang dijumpai pada budidaya ikan patin (Pangasionodon hypophthalmus) yaitu serangan penyakit bakterial. Enteric Septicemia of Catfish (ESC) adalah penyakit karena infeksi bakteri Edwardsiella ictaluri yang dapat menyebabkan kematian ikan patin sampai >50%. Penanggulangan penyakit ESC dengan menggunakan antibiotik tidak efektif dilakukan, disamping dapat menimbulkan resistensi dan residu. Sehingga perlu upaya lain yang perlu dilakukan, salah satunya dengan penyediaan isolat sebagai kandidat vaksin, untuk pencegahan serangan ESC di lapangan. Penelitian ini bertujuan untuk melakukan evaluasi potensi dengan mengkaji patogenisitas dan imunogenisitas sel utuh E. ictaluri pada ikan patin. Penelitian dilakukan dalam dua tahap yaitu uji patogenisitas E. ictaluri dan kajian imunogenisitas sel utuh E. ictaluri. Pengujian patogenisitas E. ictaluri dilakukan dengan menggunakan lima perlakuan. Masing-masing 30 ekor ikan patin ukuran 6–10 g/ekor diinjeksi secara intraperitoneal dengan 0,1 mL larutan bakteri kepadatan 102 cfu/mL; 104 cfu/mL; 106 cfu/mL; 108 cfu/mL; 1010 cfu/mL; dan PBS sebagai kontrol. Ikan dipelihara selama tujuh hari pada akuarium berukuran 60×40×45 cm3. Pemeriksaan makroskopis dan mikroskopis dilakukan terhadap organ eksternal (kulit dan abdomen) dan internal (hati, ginjal dan otak). Pengambilan sampel organ internal untuk uji histopatologi pada hari ke-5 dan sampel darah untuk uji gambaran darah pada hari ke-1, 3, dan 5 pascainfeksi. Jumlah kematian ikan dihitung untuk mendapat nilai LD50. Pengamatan gejala klinis dan patologi anatomi ditemukan ikan berenang vertikal, adanya bercak merah pada kulit, pembengkakan abdomen, asites, hati pucat, dan ginjal berwarna merah kehitaman. Hasil histopatologi terlihat terjadinya degenerasi hidropik, degenerasi lemak, Melano Macrofag Center (MMC), nekrosa, hemoragi, dan infiltrasi sel radang pada hati, ginjal, dan otak. Penurunan nilai hematokrit dan hemoglobin pada perlakuan secara statistik berbeda nyata (p<0,05) dengan kontrol. Dosis LD50 didapat 2,8×104 cfu/mL. Hasil uji patogenisitas ini mengindikasikan bahwa E. ictaluri pada ikan patin bersifat sangat patogen, Tahap kedua yaitu kajian imunogenisitas sel utuh E. ictaluri yang didahului dengan penentuan kadar protein sel utuh E. ictaluri menggunakan metode Bradford dan profil protein dilakukan menggunakan SDS PAGE. Hasil uji kadar protein menunjukkan konsentrasi sel utuh bakteri yang tinggi terdapat kandungan protein yang tinggi pula. Hasil SDS PAGE ditemukan ada sebelas pita protein pada sel utuh E. ictaluri yaitu 94.35, 67.14, 60.47, 32.27, 24.84, 22.37, 20.15, 16.34, 14.72, 13.26, 11.33 kDa. Uji imunogenisitas dilakukan menggunakan tiga konsentrasi sel utuh E. ictaluri yaitu 105cfu/ml; 106cfu/ml; 107cfu/ml, dengan waktu pengamatan selama lima minggu. Setiap seminggu sekali dilakukan pengambilan sampel darah ikan untuk mengetahui respon imun non spesifik dan spesifik. Hasil pengujian menunjukkan injeksi sel utuh E. ictaluri mampu meningkatkan respon imun non spesifik dan spesifik pada ikan perlakuan dibanding ikan kontrol. Nilai persentase fagositosis, respiratory burst dan titer antibodi secara statistik menunjukkan hasil berbeda nyata (p<0,05) antara ikan yang diinjeksi sel utuh E. ictaluri dengan ikan kontrol. Hasil uji tantang menunjukkan bahwa injeksi sel utuh E. ictaluri mampu memberikan nilai kelangsungan hidup ikan cukup tinggi dan secara statistik berbeda nyata dengan kontrol (P<0,05), walaupun tidak berbeda nyata pada nilai kelangsungan hidup antar perlakuan. Hasil penelitian juga menunjukkan injeksi sel utuh E. ictaluri efektif meningkatkan kekebalan ikan patin uji dengan nilai RPS (Relative Percent Survival) yaitu 50-62%. Hasil uji imunogenisitas terlihat bahwa sel utuh E. ictaluri bersifat
Keyword: Patogenisitas, imunogenisitas, E. ictaluri, ikan patin

Judul: Vaksin Polivalen Edwardsiella ictaluri Untuk Pencegahan Penyakit Enteric Septicemia of Catfish Pada Ikan Patin (Pangasianodon hypophthalmus).
Abstrak: Kasus kematian akibat penyakit Enteric Septicemia of Catfish (ESC) yang disebabkan oleh bakteri Edwardsiella ictaluri menjadi kendala utama pada budidaya ikan patin di Indonesia. Perbedaan kondisi geografis antar wilayah diduga menjadi faktor penyebab variasi fenotipe dan genotipe isolat E. ictaluri. Karakteristik spesifik isolat dapat menjadi dasar pertimbangan dalam pengembangan riset vaksin polivalen E. ictaluri yang mampu memproteksi terhadap variasi antigen heterolog dan meningkatkan nilai relative percent survival (RPS). Penelitian ini bertujuan untuk mengembangkan vaksin polivalen E. ictaluri untuk pencegahan penyakit ESC pada ikan patin, dengan lima tahap penelitian yaitu 1) karakterisasi fenotipe dan genotipe E. ictaluri, 2) identifikasi gen virulen dan evaluasi korelasi terhadap patogenisitas E. ictaluri, 3) profil protein dan toksisitas protein bakteri E. ictaluri pada ikan patin, 4) efikasi berbagai sediaan vaksin inaktif sel utuh E. ictaluri pada ikan patin didukung kajian uji kualitas dan keamanan vaksin, dan 5) efikasi dan proteksi vaksin inaktif polivalen sel utuh E. ictaluri dengan dan tanpa booster pada ikan patin. Penelitian tahap pertama bertujuan mengidentifikasi isolat E. ictaluri secara fenotipe dan genotipe. Karakteristik terhadap tujuhbelas isolat bakteri yang berasal dari wilayah berbeda yaitu tujuh isolat dari Jawa Barat (PCjG, PJlG), PSb5G, PSb3G, PSb1G, PSmH, P), satu isolat dari Jawa Timur (PTaH), dua isolat dari Riau (PR1G, BRSH), tiga isolat dari Sumatera Selatan (B1, B2, A2), satu isolat dari Jambi (PJbH), satu isolat dari Lampung (S.935G), dan dua isolat dari Kalimantan Selatan (PBm1G, PBm2G) secara biokimia dan API 20E teridentifikasi sebagai E. ictaluri. Seluruh isolat termasuk β-hemolitik namun zona paling terang terlihat pada isolat PSb1G, PJbH, A2, P, dan PBm1G. Aktivitas enzim dan profil antibiotik homolog pada semua isolat. Analisis PCR semua isolat dengan primer spesifik E. ictaluri terdeteksi pada 129 bp. Isolat E. ictaluri asal Indonesia menunjukkan variasi genotipe. Semua isolat memiliki kemiripan 99.56-100% dengan strain E. ictaluri 93-146 complete genome. Penelitian tahap kedua bertujuan mengidentifikasi gen virulen dan menganalisis korelasi gen virulen dan patogenisitas dalam menentukan komposisi penyusun vaksin polivalen E. ictaluri. Identifikasi gen virulen menunjukkan hasil variatif dan secara umum pada semua isolat E. ictaluri memiliki gen T6SS (evpC) dan urease. Kematian ikan patin akibat infeksi E. ictaluri tertinggi sebesar 96.67- 100% terjadi pada ikan yang dinfeksi dengan E. ictaluri PSb1G, PJbH, A2, P, dan PBm1G dengan rerata waktu kematian 3.73-4.58 hari pascainfeksi. Mortalitas ikan patin akibat infeksi ESC tidak dipengaruhi oleh jumlah gen virulen yang dimiliki bakteri E. ictaluri. Infeksi E. ictaluri menyebabkan perubahan abnormalitas patologi klinik, gambaran darah, dan kerusakan jaringan. Penelitian tahap ketiga bertujuan menganalisis profil protein, toksisitas sel utuh, dan extracellular product (ECP) serta korelasinya terhadap patogenisitas. Karakterisasi protein sel utuh dan ECP E. ictaluri menggunakan SDS-PAGE ditunjukkan dengan hasil pengukuran berat molekul (BM) pada masing- masing sediaan. Profil protein sel utuh pada isolat PJbH menunjukkan 14 pita protein pada kisaran 11.18-140 kDa, sedangkan pada isolat P dan PBm1G menunjukkan 10 pita protein pada kisaran 11.18-71.06 kDa. Profil protein ECP terdeteksi hanya ditemukan 2 pita, yaitu 11.18 dan 14.30 kDa. Mortalitas tertinggi terjadi pada perlakuan sel utuh P dan PBm1G sebesar 97.78% dan 100% sedangkan pada PJbH menunjukkan kematian rendah sebesar 15.56%. Toksisitas sel utuh menyebabkan gejala klinis,
Keyword: E. ictaluri, genotype, phenotype, polyvalent, relative percent survival

Judul: Construction of Strongly Optimal Binary Linear Code with Minimum Distance 9 and 11
Abstrak: A binary linear code of length n over q F is a subspace of n q F . A code has three parameters that attached to it, namely length, dimension, and minimum distance. A code with length n, dimension k and minimum distance d is often called [n, k, d ]-code. Usually, when two parameters are given, then we want to find a code that has the best value for the last parameter. Based on Gilbert- Varshamov bound, if a [n, k, d ]-code exists and can not be expanded, we call it a strongly optimal code. In this paper, we construct strongly optimal code with minimum distance 9 and 11. In constructing the code, we created a theorem and algorithm based on Gilbert-Varshamov bound before we implement the algorithm to MAPLE programming language. Because of computational limitations, the program can only construct up to k = 10 for d = 9 and k = 12 for d = 11.
Keyword: