Judul: Karakterisasi dan Kloning Gen Penyandi Glukosa Oksidase (GGOx) dari Aspergillus niger IPBCC 08.610.
Abstrak: Glukosa oksidase digunakan dalam berbagai kegiatan industri maupun pengembangan teknologi enzymatic fuel cell. Penelitian sebelumnya menunjukkan bahwa isolat lokal Aspergillus niger IPBCC 08.610 dapat menghasilkan glukosa oksidase. Penelitian terkait gen penyandi glukosa oksidase (GGOx) dari isolat ini belum dilakukan. Penelitian ini bertujuan mendapatkan gen penyandi glukosa oksidase dari isolat A. niger IPBCC 08.610, mendapatkan karakteristik gen meliputi urutan dan panjang basa serta pola restriksinya, dan mendapatkan koloni trnasforman E. coli DH5α yang membawa gen. Gen penyandi glukosa oksidase didapatkan dari amplifikasi DNA genom dengan primer spesifik dan dikarakterisasi melalui teknik restriksi dengan endonukelase EcoRI dan PstI. Selain itu, gen juga disisipkan pada vektor pGEM®T-Easy dan ditransformasikan pada sel kompeten E. coli DH5α agar dapat dilakukan pengurutan basa nitrogen (sekuensing). Gen penyandi glukosa oksidase dari A niger IPBCC 08.610 memiliki ukuran sebesar 1818 bp. Gen ini dapat direstriksi menjadi dua fragmen berukuran 908 bp dan 980 bp dengan EcoRI. Terdapat tiga koloni transforman yang membawa gen penyandi glukosa oksidase.
Keyword: Aspergillus niger, endonuklease restriksi, gen penyandi glukosa oksidase, kloning, sekuensing

Judul: Pemurnian dengan Kromatografi Penukar Anion dan Karakterisasi Glukosa Oksidase dari Aspergillus niger IPBCC 08.610.
Abstrak: Aspergillus niger (A. niger) merupakan jamur yang mudah tumbuh di lingkungan tropis seperti Indonesia. A. niger mampu menghasilkan enzim yang telah dimanfaatkan di bidang industri. Salah satu enzim yang dihasilkan oleh A. niger adalah enzim glukosa oksidase (GOD). Enzim glukosa oksidase banyak dimanfaatkan sebagai pengawet makanan, komponen sensor glukosa, dan berpotensi untuk aplikasi sel bahan bakar (bio-fuel). Pemanfaatan glukosa oksidase memerlukan peningkatan aktivitas untuk efisiensi proses katalis. Peningkatan aktivitas memerlukan informasi karakterisasi glukosa oksidase sebagai informasi dasar. Penelitian ini bertujuan untuk memurnikan dan mengkarakterisasi enzim glukosa oksidase. Pada penelitian ini enzim glukosa oksidase diisolasi dari isolat lokal A. niger IPBCC dengan kode 08.610 yang diisolasi dari seresah tanaman pagar Dryobalanops di daerah Tarakan, Kalimantan Utara. Tahapan pemurnian yang dilakukan antara lain pengendapan amonium sulfat 80%, dialisis, dan kromatografi penukar anion. Penentuan karakteristik enzim glukosa oksidase terdiri dari pH optimum, suhu optimum, kestabilan pada pH dan suhu optimum, berat molekul, dan kinetika glukosa oksidase. Hasil penelitian diperoleh enzim glukosa oksidase diisolasi dari A. niger IPBCC 08.610 merupakan enzim intraseluler. Fraksi kromatografi penukar anion menghasilkan glukosa oksidase dengan aktivitas spesifik sebesar 773.269 ± 24.504 U/mg dan mengalami peningkatan kemurnian 253.36 kali. Berat molekul ditentukan dengan metode SDS-PAGE menunjukkan terbentuk satu pita dengan berat molekul 49 kDa. pH dan suhu optimum glukosa oksidase ditentukan berdasarkan aktivitas tertinggi pada pH dan suhu uji. pH dan suhu optimum terdapat pada pH 6 dan suhu 30oC. Kestabilan glukosa oksidase pada pH dan suhu optimum menunjukkan glukosa oksidase dapat mempertahankan 50% aktivitasnya hingga menit ke-23 setelah perlakuan. Kinetika GOD untuk menentukan nilai Km dan Vmaks menggunakan fraksi kromatografi penukar anion. Nilai Vmaks adalah 153.10 mmol/detik merupakan laju maksimum glukosa oksidase untuk mengkatalis reaksi hidrolisis glukosa. Nilai Km didapat sebesar 2.9 mM. Pada konsentrasi glukosa 2.9 mM laju reaksi mencapai setengah dari laju maksimal.
Keyword: Aspergillus niger IPBCC 08.610, Glukosa oksidase, Karakterisasi, Kromatografi Penukar Anion, Pemurnian

Judul: Numerical modeling of the hydrodynamics of standing wave and scouring in front of impermeable breakwater with different steepnesses
Abstrak: The aim of this paper is to numerically study the effects of breakwater steepness on the hydrodynamics of standing wave and scouring process in front of impermeable breakwaters. A two-dimensional hydrodynamics model based on the Reynolds Averaged Navier–Stokes (RANS) equations and the Volume of Fluid (VOF) method was developed and then combined with an empirical sediment transport model. Comparisons with an analytical solution and experimental data showed the present model is very accurate in predicting the near bottom velocity and capable of simulating the scour/deposition patterns consistent with experimental data. It was found that the additional terms of bottom shear stress in the momentum equations are necessary to produce a physical scouring pattern. Different breakwater steepnesses produce different characteristics of standing wave, the steady streaming system, and scouring pattern in front of the breakwaters, which also affects the correlations between them. An additional analysis of the turbulence field parameters and the sediment transport rate was also performed. All these important information will be presented in details in this paper and can be worthwhile for designing the breakwater in coastal areas.
Keyword: The RANS–VOF model Standingwave Steadystreamingsystem Scouring pattern Breakwatersteepness