Judul: Pewarisan Genetik Transgen Hd3a pada Tanaman Nicotiana benthamiana Transgenik
Abstrak: Hd3a gene has been successfully introduced into Nicotiana benthamiana genome. In vitro culture, the putative transgenic of N. benthamiana give a flower very early. This plant must be molecularly analyzed to confirm the integration of Hd3a transgene under the control of 35SCaMV promoter in the genome. The objective of this research was to analyze the integration, stability and genetic inheritance of Hd3a transgene under 35SCaMV promoter in transgenic N. benthamiana. Mendelian inheritance pattern of hpt fused to Hd3a transgene with 3:1 ratio has been detected in T1 generation of transgenic N. benthamiana. This pattern showed that transgenic N. benthamiana is heterozygous for hpt fused to Hd3a transgene. In addition, this result indicated that the transgenic N. benthamiana contains one single copy of hpt and Hd3a transgenes integrated in the genome. The molecular analysis showed that T0 and T1 generation of transgenic N. benthamiana contain Hd3a transgene. Hd3a transgene caused an early flowering phenotype in transgenic N. benthamiana E.26.3 line. Average of flowering time in E.26.3 line is 40,5 days after germination. An early flowering character was not observed in E.21.3 line probably caused by the suppression of Hd3a gene.
Keyword: genetic inheritance, Hd3a gene, Nicotiana benthamiana

Judul: Rekayasa Genetik Nicotiana tabacum cv. SR1 dengan cDNA Gen Gα
Abstrak: Protein G terdiri dari tiga subunit yaitu α, β dan γ. Protein ini berperan dalam transduksi sinyal. Transduksi sinyal sangat penting bagi sel dalam merespon cekaman biotik dan abiotik. Protein G dalam keadaan inaktif berikatan satu sama lain membentuk struktur heterotrimerik. Aktivasi protein G terjadi ketika sel mendapatkan sinyal ektraseluler berupa cekaman biotik maupun abiotik. cDNA gen Gα yang berasal dari kedelai kultivar Slamet telah berhasil diisolasi dan diklon ke dalam vektor pGEMT-easy. Kedelai kultivar Slamet merupakan tanaman yang toleran terhadap keracunan aluminium. Open Reading Frame (ORF) dari cDNA gen Gα yang berasal dari kedelai kultivar Slamet berukuran 1155 pb dan ditranslasikan menjadi 385 asam amino. Tujuan penelitian ini adalah mengkonstruksi vektor ekspresi untuk cDNA gen Gα dan mengintroduksikan gen tersebut kedalam genom Nicotiana tabacum cv. SR1 menggunakan Agrobacterium tumefaciens LBA4404. cDNA gen Gα telah diisolasi dengan primer yang mengandung basa CACC pada primer forward. Kemudian cDNA gen Gα telah berhasil disisipi ke vektor donor pENTRtm/DTOPO ® diantara situs attL1 dan attL2. Plasmid pENTRtm/D-TOPO®-Gα digunakan sebagai plasmid donor untuk reaksi LR dengan vektor target pGWB502. Rekombinasi antara dua pasang situs homolog pada plasmid donor dan plasmid pGWB502 menyebabkan cDNA gen Gα menyisip pada situs gateway dari pGWB502. pGWB502 yang membawa cDNA gen Gα telah berhasil dikonstruksi dan diintroduksikan ke dalam sel A. tumefaciens LBA4404 dengan teknik Tri Parental Mating (TPM). Fragmen cDNA Gen Gα pada vektor pGWB502 (pGWB502-Gα) dikendalikan oleh promoter kuat 35S CaMV dan terpaut dekat dengan gen hygromysin phopotransferase (hpt). Gen hpt digunakan sebagai marker seleksi untuk tanaman transgenik. Transformasi N. tabacum cv. SR1 menggunakan eksplan daun yang diinokulasi dengan A. tumefaciens LBA4404 yang membawa pGWB502-Gα. Eksplan yang telah ditransformasi diseleksi pada media yang mengandung 30 mg L-1 higromisin. Identifikasi tanaman transgenik dilakukan dengan PCR DNA genom tanaman transgenik putatif dengan primer 35S-F dan Gα-R. Hasil PCR DNA genom tanaman transgenik putatif menunjukkan bahwa cDNA gen Gα dari kedelai kultivar Slamet dibawah kendali promoter 35S CaMV telah berhasil terintegrasi ke dalam genom N. tabacum cv. SR1. Ekspresi cDNA gen Gα yang dikendalikan oleh promoter 35S CaMV telah dianalisis dengan qRT PCR. Tanaman transgenik cDNA gen Gα mengalami peningkatan ekspresi cDNA gen Gα sebesar 4.96 kali dibandingkan tanaman non transgenik.
Keyword: Transformasi dengan Agrobacterium tumefaciens, Gα, Nicotiana tabacum cv, SR1, vektor biner, pGWB502

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: