Judul: Visualisasi Pohon Filogenetik Berbasis Web menggunakan Metode Circular Tree Drawing Algorithm
Abstrak: Pohon filogenetik merupakan model dari sejarah evolusi dan hubungan evolusi dari berbagai organisme berdasarkan persamaan atau perbedaan karakteristik. Visualisasi pohon filogenetik merupakan aspek penting dalam analisis filogeni. Visualisasi yang baik akan memberikan analisis dan interpretasi data yang baik. Tujuan penelitian ini adalah membangun aplikasi berbasis web untuk memvisualisasikan pohon filogenetik. Data yang digunakan berformat Newick. Penelitian ini fokus pada visualisasi dengan menggunakan metode circular tree drawing algorithm. Algoritme diimplementasi dalam bahasa JavaScript. Diawali dengan inisialisasi, postorder traversal, dan preorder traversal untuk menghitung koordinat. Koordinat hasil algoritme berada pada rentang -1–1. Perlu dilakukan perbesar dan translasi agar visualisasi dapat terlihat. Pohon di-render dalam fitur Scalable Vector Graphics (SVG) dengan bantuan library Raphaёl. Label untuk setiap leaf ditempatkan di sekeliling lingkaran dan dirotasi agar mudah dibaca. Pengujian telah berhasil dilakukan untuk melihat hasil render untuk data terbesar dengan 163 nodes, 82 leaves, serta data terkecil dengan 5 nodes dan 3 leaves.
Keyword: pohon filogenetik, visualisasi pohon filogenetik, circular tree drawing

Judul: Model visualisasi pohon3D menggunakan Java 3D
Abstrak: Visualisasi komputer adalah berpikir dengan tampilan grafis pada komputer yang dapat meningkatkan kemampuan akal manusia untuk menyelesaikan masalah dan menyadari gagasan-gagasan kreatif. Visualisasi komputer tersebut digunakan oleh International Centre for Research in Agroforestry (ICRAF) yang merupakan lembaga penelitian pertanian internasional salah satunya melalui penelitian Simple Light Interception Model atau SLIM (Vincent et al, 1999a). SLIM merupakan suatu model yang menghitung penyerapan intensitas cahaya di berbagai titik pada suatu plot hutan dan dapat emvisualisasikan suatu plot hutan dengan sejumlah visualisasi pohon. Model Visualisasi Pohon3D ini dibangun sebagai alat bantu dalam SLIM atau program lainnya yang serupa. dengan menampilkan bentuk dari berbagai jenis pohon melalui tampilan grafik tiga dimensi. Model Visualisasi Pohon3D ini merupakan salah satu model representasi pohon dalam komputer. Bentuk pohon yang ditampilkan terdiri dari batang dan tajuk pohon. Tajuk pohon dapat ditampilkan dalam dua tipe, yaitu tipe berdaun dan tipe kerangka. Pembentukan model pohon tersebut membutuhkan parameter ukuran morfologi pohon dan konstanta-konstanta yang dihasilkan perhitungan rumus pada program.
Keyword: 

Judul: Stabilization of Protein by Lactose during Storage in the MPC 85 System
Abstrak: Milk protein is the most valuable component and its stability is important during processing and storage. The stabilization is influenced by moisture and position of milk powder. It is assumed that lactose can acts as stabilizer of protein (protect from protein unfolding). The phenomenon of this stabilization was studied at three water activity (aw 0.23,0.54 and 0.75), with low concentration of lactose addition (5, 15 and 30%) during 6 weeks. Sample preparation'of MPC powders and equilibration at different relative humidity was conducted before storage. Analysis of MPC to investigate the influence of lactose in protein stabilization include solubility test, glass transition (Tg) by TMCT (Thermal Mechanical Compression Test), secondary protein structure (FTIR), and T2 relaxation (NMR) to measure the protein water interaction in MPC85 system. The role of lactose to retain the change of stability during storage can be observed clearly at aw 0.54. In this condition, the rate of solubility and Tg decreasing/week and also the rate of increasing of T2 short proportion/week can be retained by lactose adding. The capability of lactose to retain the rate of change of solubility, Tg and T2 short proportion cannot be observed at low water activity (aw 0.23) because of the small amount of water in the system. At aw 0.75, lactose adding c annot retain the change of stability due to very higher water content and lactose coystallization. Evidence from FTIR suggested that this reduction in solubility was not directly linked to major conformational changes within protein structures.
Keyword: