Judul: Sifat Antiprotease Putih Telur Unggas Lokal Terhadap Protein-Like Protease dari Virus SARS-CoV-2
Abstrak: Meskipun vaksin COVID-19 telah dikembangkan, kemungkinan virus SARS-CoV-2 dapat terus bermutasi. Upaya menemukan obat COVID-19 yaitu dengan menemukan penghambat yang aman dan efisien terhadap salah satu protein utamanya, yakni papain-like protease (PLPro). Penelitian ini bertujuan menguji sifat antiprotease putih telur ayam kampung dan itik lokal Alabio terhadap PLPro. PLPro yang digunakan merupakan rekombinan protein dari E. coli dengan tingkat kemurnian yang tinggi. Penghambatan putih telur terhadap PLPro dilakukan dengan mengukur aktivitas PLPro dengan tidak adanya atau adanya berbagai konsentrasi putih telur (0%, 0,1%, 0,5%, dan 1%). Data menunjukkan bahwa nilai IC50 dari putih telur itik segar 4-5 kali lebih tinggi dari putih telur ayam segar. Penyimpanan putih telur selama 7 hari pada suhu ruang melemahkan kemampuan penghambatan terhadap PLPro tersebut dengan nilai IC50 jauh di atas 1%. Hal itu disebabkan oleh kemampuan penempelan cystatin putih telur dengan PLPro yang didominasi oleh ikatan hidrogen. Penempelan tersebut menghambat dua sisi aktif PLPro sehingga menjadi tidak aktif., Although COVID-19 vaccines have been developed, there is a possibility that the SARS-CoV-2 virus can continue to mutate. Attempts to find treatments forCOVID-19 involve discovering safe and efficient inhibitors against one of its main proteins, namely papain-like protease (PLPro). This research aims to examine the antiprotease properties of local free-range chicken egg white and Alabio duck egg white against PLPro. The PLPro used is a recombinant protein from E. coli with high purity. Inhibition of PLPro by egg white was conducted by measuring the activity of PLPro in the absence or presence of various concentrations of egg white (0%, 0.1%, 0.5%, and 1%). The data showed that the IC50 value of fresh duck egg white was 4-5 times higher than that of fresh chicken egg white. Storage of egg white for 7 days at room temperature weakened its inhibitory ability against PLPro, with IC50 values significantly above 1%. This is caused by the ability of egg white cystatin to bind with PLPro, predominantly through hidrogen bonding. Such binding inhibits both active sites of PLPro, which caused the enzyme to be inactive.
Keyword: chicken egg white, duck egg white, proteases such as papain-like protease (PlPro)

Judul: Pemanfaatan Media Whey dalam Produksi Rekombinan Papain – Like Protease dari Virus SARS-CoV-2
Abstrak: Papain-Like Protease (PLpro) dalam virus SARS-CoV-2 dianggap sebagai target yang layak untuk pengembangan obat untuk mengobati pasien penyakit Coronavirus 2019 (COVID-19). Metode yang umum digunakan untuk menghasilkan PLpro adalah melalui pendekatan rekombinan menggunakan sel inang Escherichia coli yang sederhana dan terjangkau. Namun demikian, hal ini tetap membutuhkan media pertumbuhan yang mahal (Luria Bertani/LB) untuk pertumbuhan sel inang. Penelitian ini bertujuan menginvestigasi kemungkinan whey dapat digunakan untuk memproduksi PLpro SARS-CoV-2 sebagai alternatif media pertumbuhan. Kombinasi medium whey dan LB menggunakan konsentrasi whey yang berbeda (0%, 25%, 50%, dan 100%). Kepadatan sel di setiap medium akan dipantau melalui spektrofotometer UV-Vis dan ekspresi PLpro akan diinduksi dengan menambahkan 1 mM IPTG serta dipelajari melalui SDS-PAGE. Data penelitian dianalisis menggunakan analisis deskriptif. Hasil penelitian menunjukan sel inang E. coli untuk memproduksi papain-like protease (PLpro) dari SARS-CoV2 dapat direkombinasi dengan media whey. Perlakuan terbaik ada pada komposisi medium 50% whey., Papain-Like Protease (PLpro) in SARS-CoV-2 virus is considered a viable target for drug development to treat Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) patients. The commonly used method for PLpro production is through recombinant approach using Escherichia coli as a host cell, which is simple and affordable. However, this still requires expensive growth media (Luria Bertani/LB) for host cell cultivation. This study aims to investigate the possibility of using whey as an alternative growth medium for producing PLpro from SARS-CoV-2. A combination of whey and LB media using different concentrations of whey (0%, 25%, 50%, and 100%) was tested. Cell density in each medium was monitored using a UV-Vis spectrophotometer and PLpro expression was induced by adding 1 mM IPTG, and analyzed using SDS-PAGE. Data were analyzed using descriptive analysis. The results showed that E. coli host cells for PLpro production from SARS-CoV-2 can be successfully recombinant using whey media. The best treatment was found in the medium composition of 50% whey.
Keyword: IPTG, papain-like protease, recombinant protein, whey

Judul: Keanekaragaman Bazzania (Marchantiophyta: Lepidoziaceae) di Taman Nasional Gunung Leuser, Aceh Tenggara, Sumatra.
Abstrak: Bazzania merupakan marga besar dari lumut hati berdaun, banyak jenis-jenis dari marga ini yang persebarannya berada di hutan tropis. Keanekaragaman dan kemelimpahan Bazzania meningkat pada hutan hujan pegunungan yang sering berkabut serta berkelembaban tinggi sehingga hutan ini disebut sebagai “hutan lumut”. Marga ini memiliki karakter diagnostik yakni percabangan membentuk pola “Y”, terdapat flagel dan daun tersusun secara incubous. Laporan tentang persebaran Bazzania di Sumatra belum mencakup semua kawasan hutan pegunungan yang ada di Sumatra, termasuk Taman Nasional Gunung Leuser (TNGL). Taman nasional ini merupakan laboratorium alam yang berorientasi pada perlindungan bagi pelbagai jenis tumbuhan termasuk Bazzania. Oleh karena itu penelitian floristik ini dilakukan untuk mengeksplorasi keanekaragaman Bazzania TNGL sebagai upaya pelengkapan daftar jenis Bazzania Sumatra. Eksplorasi spesimen Bazzania dilakukan di sepanjang jalur pendakian di TNGL (1417-2900 m dpl), dimulai dari Rainforest Lodge Kedah sampai Camp Alas. Koleksi spesimen herbarium disimpan di Herbarium Bogoriense (BO). Informasi karakter morfologi yang diamati selanjutnya digunakan dalam menyusun kunci identifikasi dan mempertelakan jenis Bazzania yang terdokumentasi di TNGL. Sebanyak 13 jenis Bazzania ditemukan di TNGL, umumnya tumbuh pada substrat batang pohon, kayu lapuk, dan ranting. Marga Bazzania memiliki variasi struktur umum gametofit yaitu tipe perawakan (kekar, ramping); bentuk pertumbuhan (merayap, mendongak, menggantung); bentuk koloni (mengeset tebal, mengeset tipis), orientasi daun lateral (tersebar mendatar ketika segar maupun kering, tersebar mendatar ketika segar tetapi tergulung masuk ketika kering), susunan daun ventral (menyirap rapat, berjarak renggang). Daun lateral memiliki variasi pada karakter bentuk, ujung, tepi, pangkal daun; kehadiran struktur tambahan seperti cuping di bagian pangkal daun; keberadaan vitta, bentuk sel pada lembaran daun, dan keberadaan trigon. Daun lateral berbentuk asimetris menyegitiga, membundar, membundar telur hingga melancor-melidah; ujung daun bergigi 2-4 dengan torehan dangkal sampai dalam, atau tidak beraturan; tepi mengombak halus, bergigi halus, bergerigi; pangkal bagian dorsal menjantung, membundar dengan tambahan seperti cuping; pangkal bagian ventral lurus, membundar; vita ada atau absen; sel berbentuk isodiametris, persegi, linear; trigon kecil, besar; kutikula halus, berbingkahan. Daun ventral memiliki variasi pada karakter bentuk, tepi, ujung, dan pangkal daun, serta kehadiran bagian daun yang hialin. Daun ventral berbentuk persegi empat, persegi empat memanjang, membundar, membundar telur, menyegitiga, mengginjal; ujung berjelabir, bergerigi, bergigi, rata; tepi mengombak sederhana, bergigi, bergerigi, bercuping dangkal, bercuping dalam; pangkal bebas, atau satu atau kedua sisinya melekat pada daun lateral; hialin absen, semua bagian daun ventral tersusun sel hialin, tidak semua bagian semua bagian daun ventral berhialin. Terdapat 5 jenis Bazzania diketahui sebagai rekaman baru untuk Sumatra yaitu Bazzania horridula, B. adnexa, B. angustifolia, B. fauriana, dan B. oshimensis; empat jenis terakhir juga merupakan rekaman baru untuk Malesia. Bazzania horridula telah dilaporkan ada di Jawa. Persebaran B. adnexa sebelumnya hanya dilaporkan di Australiasia dan China Selatan. Bazzania angustifolia, dan B. fauriana dilaporkan ada di Jepang, Vietnam Utara, Taiwan. Persebaran B. oshimensis meliputi wilayah Asia dan Indo-China (Vietnam, Thailand, Burma, Formosa, Ceylon, India dan Jepang). Kelima jenis tersebut menambah jumlah jenis Bazzania Sumatra yang sebelumnya dilaporkan sebanyak 38 jenis, sekarang menjadi 43 jenis.
Keyword: Bazzania, bryophyta, Gunung Leuser-Aceh, Lepidoziaceae, lumut hati