Judul: Toksisitas Protein Produk Ekstraseluler Streptococcus agalactiae Isolat NK1 pada Ikan Nila Oreochromis niloticus
Abstrak: Streptococcus agalactiae merupakan patogen utama yang sering menjangkit pada ikan nila. Menurut Sheehan et al. (2009), dari hasil pemeriksaan 1.000 isolat bakteri yang berasal dari 74 lokasi di 14 negara termasuk Indonesia, spesies Streptococcus yang paling umum teridentifikasi adalah S. agalactiae. Di Indonesia sendiri, hasil identifikasi dari 15 isolat yang diambil dari daerah yang terjadi wabah streptococcosis adalah sebanyak 80% merupakan S. agalactiae dan 20% merupakan Streptococcus iniae (Taukhid dan Purwaningsih 2011). Seperti bakteri Gram positif lainnya, bakteri S. agalactiae memiliki beberapa faktor virulensi yang dapat menyebabkan penyakit. Salah satu faktor virulensinya adalah kandungan eksotoksin yang terlarut pada extracellular product (ECP). Toksin protein bakteri Streptococcus merupakan zat antigenik yang kuat dan bekerja secara luas serta menyebabkan kematian dengan gejala yang tidak spesifik seperti nekrosis pada jaringan (Woolf 2000). Penelitian ini dilakukan di Laboratorium Kesehatan Ikan Departemen Budidaya Perairan, Fakultas Perikanan Ilmu Kelautan, Laboratorium Mikrobiologik Terpadu, Fakultas Kedokteran Hewan dan Laboratorium Mikrobiologi dan Biokimia, Pusat Penelitian Sumberdaya Hayati dan Bioteknologi, Institut Pertanian Bogor. Bakteri S. agalactiae yang digunakan merupakan koleksi Balai Penelitian dan Pengembangan Budidaya Air Tawar (BPPBAT) Bogor yaitu isolat NK1. Ikan uji yang digunakan adalah ikan nila dengan rataan bobot tubuh 20 g/ekor. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi fraksi toksik dari ECP S. agalactiae isolat NK1 dan menguji dampak patogenisitas masing-masing fraksi tersebut terhadap ikan nila. Penelitian ini terdiri dari dua tahapan. Tahap pertama menghasilkan 70 fraksi protein dari ECP kasar yang difraksinasi menggunakan kolom kromatografi. Kemudian masing-masing fraksi disuntikkan pada ikan nila dan dihasilkan delapan fraksi yang bersifat toksik (fraksi protein no. 6, 15, 18, 23, 28, 34, 54 dan 70) berdasarkan gejala klinis dan tingkat kematiannya. Selanjutnya dilakukan identifikasi protein berdasarkan berat molekul (SDS-PAGE). Pada tahap kedua, dipilih dua fraksi protein yaitu P23 dan P70 sebagai perlakuan, ECP kasar sebagai kontrol positif dan phosphate buffer saline (PBS) sebagai kontrol negatif. Perlakuan disuntikkan secara intraperitonial pada 10 ekor ikan nila dengan bobot 20 ± 1 gram dan diulang sebanyak tiga kali. Selanjutnya ikan dipelihara selama 14 hari dan dilakukan pengamatan terhadap gejala klinis, gambaran darah dan tingkat kematian. Pengamatan gejala klinis seperti kelainan pada tubuh, mata dan pola renang pada perlakuan P70 muncul lebih cepat yaitu pada jam ke-24. Pengamatan gambaran darah dapat menunjukkan kondisi fisiologis, karena mengungkapkan kondisi yang terjadi dalam tubuh ikan uji. Hasil dari gambaran darah adalah sebagai berikut : 1) Sel darah merah cenderung berfluktuasi pada semua perlakuan, namun pada akhir penelitian jumlah sel darah merah kembali mendekati jumlah normal. 2) Hemoglobin pada semua perlakuan tidak berbeda nyata pada setiap pengambilan sampel, hal ini dikarenakan S. agalactiae isolat NK1 merupakan bakteri non-hemolitik. 3) Hematokrit cenderung berfluktuasi pada semua perlakuan, namun nilai penurunannya tidak lebih rendah dari nilai hematokrit normal, yaitu sebesar 26,75%. 4) Sel darah putih pada hari ketiga pasca uji tantang, jumlah sel darah putih P23 dan P70 meningkat dengan perlakuan P70 memiliki nilai paling tinggi dan berbeda nyata dengan perlakuan lainnya (menurut hasil analisis statistik dengan p<0,05) yaitu 1,063 x 105 sel mm3 -1. 5) Nilai respiratory burst paling tinggi terdapat pada perlakuan ECP kasar (K+) di hari ketiga pasca uji tantang
Keyword: toxicity, extracelluler product, Streptococcus agalactiae, tilapia (Oreochromis niloticus)

Judul: Virulensi Bakteri Streptococcus Agalactiae Pada Ikan Nila (Oreochromis Niloticus).
Abstrak: Streptococcus agalactiae merupakan salah satu penyebab penyakit streptococcosis dan menyebabkan mortalitas yang signifikan pada berbagai jenis ikan air tawar dan laut di seluruh dunia. Di Indonesia, S. agalactiae telah menyerang budidaya ikan nila di beberapa daerah antara lain Sumatera Selatan, Jawa Tengah dan Jawa Barat. Bakteri yang sangat virulen akan mampu menginfeksi ikan sehat dan menyebabkan sakit. Faktor virulensi bakteri berkaitan dengan kemampuan bakteri menginvasi, bereplikasi dan bertahan terhadap sistem pertahanan tubuh inang, serta kemampuan menyebabkan kerusakan sel selama perkembangan penyakit. Pengetahuan akan karakteristik virulensi bakteri S. agalactiae akan memberikan gambaran kemampuan bakteri dalam menginfeksi dan berkembang dalam tubuh ikan sehingga mampu menyebabkan penyakit pada ikan. Selanjutnya informasi terkait karakteristik faktor virulensi bakteri dan peranannya dalam patogenisitas dapat menjadi acuan dalam mengembangkan upaya-upaya pengendalian serangan S. agalactiae terhadap budidaya ikan nila di Indonesia. Tujuan penelitian ini adalah untuk menguji virulensi S. agalactiae yang menginfeksi ikan nila dan mengkarakterisasi faktor-faktor virulensinya yang berperan dalam perkembangan penyakit. Empat isolat bakteri (N3M, N4M, N17O dan NK1) diuji tingkat virulensinya terhadap ikan nila dengan injeksi secara intraperitoneal. Uji in vitro dilakukan untuk mengetahui karakteristik terkait virulensi, yaitu pengujian resistensi bakteri terhadap whole blood killing, complement mediated killing serta oksigen reaktif. Kemudian dilakukan deteksi gen-gen terkait virulensi yaitu suface immunogenic protein, sip; faktor CAMP, cfb; protein C-β, bac; dan fibrinogen binding protein, fbsA dengan PCR. Hasil uji virulensi menunjukkan bahwa keempat isolat bakteri bersifat virulen. NK1 merupakan isolat paling virulen dengan dosis mematikan 50% (LD50) 104.5 CFU/ml, sementara LD50 N3M 107.75 CFU/ml, N4M >108 CFU/ml, dan N17O 106.67 CFU/ml. Keempat isolat bersifat resisten terhadap aktivitas pertahanan tubuh dalam darah dan serum. Hasil uji blood survival yaitu viabilitas masing-masing bakteri uji yaitu N3M mencapai 91%, N4M mencapai 158%, N17O mencapai 178% dan NK1 mencapai 236 % dari kepadatan awalnya. Hasil uji complement mediated killing menunjukkan semua isolat bakteri uji mampu tumbuh dengan baik dan mencapai viabilitas lebih dari 100%, baik pada perlakuan serum aktif maupun serum inaktif. Viabilitas bakteri pada uji sensitivitas terhadap oksigen reaktif yaitu 38% (N3M), 25% (N4M), 35% (N17O) dan 48% (NK1). NK1 merupakan isolat yang paling resisten terhadap whole blood killing, complement mediated killing dan pemusnahan oleh oksigen reaktif. Hasil identifikasi dengan PCR menunjukkan bahwa N3M, N4M, N17O dan NK1 memiliki gen sip, fbsA dan cfb yang berperan penting dalam menentukan sifat virulensinya.
Keyword: Ikan nila, Streptococcus agalactiae, virulensi

Judul: He development of Fuzzy Query module on Fuzzy Database Management System
Abstrak: The data and information use are increased with case of those technology is IT (Information Technology), needed to handling fast data and user management. One of the alternative solution to handle those issue is database system. Data can be represented into two types, which are crisp and fuzzy. Data or information with fuzzy data can have more than one purpose and unsolved with logical processing. Until now, data management are still in crisp type, and also doesnot support fuzzy data representation, therefore the research conduct to built system to get data by fuzzy query at RDBMS. The application development consists of the following steps: planning, analizing, designing, implementation, and testing. Hypotetics data are used to test the system. The hypotetics data are cellphone features, where it can be represented into fuzzy set. Two main functions in this research are determining limit of fuzzy sets that can be done by input the parameters, and query structure in fuzzy according to syntax that have been defined. To process fuzzy query, first we transformed fuzzy query into SQL form. The result of this research is to define limits, graphic of membership function, and also data that proceded from fuzzy query process, fuzzy attribute and degree that descend arranged. Keyword: fuzzy database, query fuzzy
Keyword: