Judul: Optimasi Transformasi Genetik Talas Satoimo Menggunakan Gen Oshox4 Berdasarkan Ragam Waktu Ko-Kultivasi dan Optical Density Agrobacterium tumefaciens
Abstrak: Satoimo (Colocasia esculenta var. antiquorum) memiliki kandungan gizi yang baik seperti protein, amilosa, tepung dengan sifat lambat untuk dicerna, tiamin, riboflavin, fosfor, magnesium dan besi. Tanaman ini dapat dijadikan sebagai alternatif pangan untuk mendukung penganekaragaman pangan. Tanah marginal yang merupakan jenis tanah dengan kandungan air terbatas diproyeksikan untuk budidaya tanaman ini, sehingga dibutuhkan tanaman yang tahan terhadap cekaman kekeringan. Salah satu gen yang berperan dalam toleransi terhadap cekaman kekeringan adalah gen Oshox4. Oshox4 merupakan gen yang termasuk ke dalam kelompok HD-ZIP 1 (homeodomain-leucine zipper), gen ini memiliki fungsi pengaturan respon tanaman terhadap cekaman kekeringan. Pengintegrasian gen Oshox4 ke dalam genom talas Satoimo melalui transformasi yang dimediasi oleh Agrobacterium tumefaciens diharapkan dapat meningkatkan ketahanan hidup tanaman tersebut pada lingkungan dengan ketersediaan air yang terbatas. Transformasi genetik menggunakan Agrobacterium tumefaciens adalah salah satu metode yang dapat digunakan untuk menghasilkan tanaman unggul dengan sifat tersebut. Tujuan dari penelitian ini adalah mendapatkan kondisi optimal untuk transformasi genetik talas Satoimo yang dimediasi oleh Agrobacterium tumefaciens. Transformasi genetik dilakukan dengan menggunakan vektor biner yang mengandung gen Oshox4 dan gen hpt. Bahan tanaman yang digunakan dalam penelitian ini adalah meristem, akar, daun, tangkai daun dan pangkal batang talas Satoimo. Transformasi dilakukan dengan menggunakan tiga waktu ko-kultivasi yaitu 1, 2, dan 3 hari serta dua optical density A. tumefaciens yaitu 0.5 dan 0.7. Tanaman putatif transgenik diseleksi menggunakan media MS yang mengandung higromisin 10 mg/l. Integrasi gen target dianalisis berdasarkan keberadaan gen Oshox4 dan gen hpt pada genom tanaman putatif transgenik menggunakan teknik PCR. Hasil penelitian menunjukkan bahwa tanaman putatif-transgenik yang berasal dari pangkal batang dapat bertahan hidup pada media seleksi yang mengandung higromisin dan beberapa di antaranya mengandung gen hpt dan Oshox4. Hal ini menunjukkan bahwa gen Oshox4 telah berhasil di integrasikan ke dalam genom talas Satoimo.
Keyword: cekaman kekeringan, Colocasia esculenta var. antiquorum, gen hpt, talas

Judul: Transformasi Genetik Padi Japonica (Oryza sativa L. subsp. japonica) dengan Gen Penyandi Superoksida Dismutase dari Melastoma malabathricum Menggunakan Perantara Agrobacterium tumefaciens
Abstrak: Cekaman abiotik menginduksi cekaman oksidatif di dalam sel dan jaringan tanaman akibat produksi berlebih spesies oksigen reaktif (ROS) yang berdampak pada kerusakan dan kematian sel tanaman. Tanaman yang toleran terhadap cekaman menunjukkan peningkatan dalam ekspresi gen dan aktivitas protein antioksidan bila mendapat cekaman abiotik. Salah satu enzim antioksidan utama adalah superoksida dismutase (SOD). Beberapa penelitian sebelumnya telah melaporkan bahwa tanaman transgenik yang mengekspresikan secara berlebih (overexpression) gen SOD menunjukkan peningkatan dalam toleransi terhadap cekaman-cekaman abiotik. Tujuan penelitian ini adalah untuk melakukan transformasi genetik padi dengan gen penyandi superoksida dismutase dari Melastoma malabathricum (MmCu/Zn-SOD). Biji dewasa padi japonica cv. Kinmaze diinduksi untuk membentuk kalus pada media induksi kalus yang mengandung 4 mg/l 2,4-D. Sebanyak 604 kalus yang berumur 4 minggu diinokulasikan dengan Agrobacterium tumefaciens LBA4404 yang membawa plasmid pGWB-MmCu/Zn-SOD yang mengandung gen MmCu/ZnSOD di bawah kendali promoter 35S CaMV dan terminator Nos. Kokultivasi berlangsung selama 3 hari pada media yang mengandung 4 mg/l 2,4-D dan 200 mg/l asetosiringon. Kalus yang ditransformasi diseleksi pada media yang mengandung 50 mg/l higromisin dan diregenerasikan pada media yang mengandung 1 mg/l trans-zeatin dan 0,5 mg/l IAA. Jumlah kalus tahan higromisin yang dipindahkan ke media regenerasi adalah 214 kalus atau 35,43% dari jumlah kalus yang diinfeksi. Jumlah tunas transgenik putatif yang berhasil beregenerasi adalah 2 tunas, sehingga efisiensi regenerasi tunas dari kalus tahan higromisin adalah 0,9%. Analisis molekuler terhadap kedua tanaman padi transgenik putatif dengan PCR menggunakan primer spesifik untuk fragmen hibrid dari sekuen promoter 35SCaMV dan sekuen penyandi gen target MmCu/Zn-SOD menunjukkan bahwa seluruh tanaman mengandung gen target MmCuZn-SOD. Efisiensi transformasi dalam penelitian ini adalah 0,33%. Efisiensi regenerasi tunas transgenik putatif yang rendah dapat ditingkatkan dengan melakukan regenerasi kalus transgenik putatif di media regenerasi tanpa penambahan agen seleksi dan tunas yang terbentuk dianalisis secara ketat. Gen MmCu/Zn-SOD yang telah diintroduksikan ke dalam genom tanaman padi Japonica cv. Kinmaze dapat dipindahkan ke varietas-varietas padi Indica yang banyak dibudidayakan petani di Indonesia seperti IR64 dan Ciherang melalui silang balik (backcrossing) yang diikuti dengan seleksi menggunakan marka molekular (gen target) selama beberapa generasi.
Keyword: transformasi genetik, Agrobacterium tumefaciens, Oryza sativa, MmCu/Zn-SOD

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: