Judul: Penambatan molekular senyawa flavonoid daun salam (Syzghium polyanthum Wight.) terhadap RdRp dan Endoribonuklease SARS-CoV-2
Abstrak: RNA- dependent RNA polymerase dan Endoribonuklease merupakan protein non – struktural dari virus SARS-CoV-2 yang memiliki peran sintesis virus pada inang dan memainkan peran sentral dalam siklus replikasi dan transkripsi. Daun salam mengandung senyawa flavonoid yang memiliki berbagai macam peran sebagai antioksidan, antidiabetik, dan inhibitor lipase. Efektivitas senyawa flavonoid daun salam dalam proses penghambatan RdRp dan endoribonuklease belum diketahui. Penelitian ini bertujuan menganalisis potensi senyawa flavonoid daun salam sebagai inhibitor antivirus dari SARS-CoV-2 terhadap enzim RNA dependent RNA-polymerase dan endoribonuklease. Penelitian dilakukan dengan teknik penapisan virtual secara In silico melalui analisis energi bebas gibbs, konstanta inhibisi dan interaksi residu menggunakan YASARA structure. Sebagian besar senyawa flavonoid daun salam berpotensi sebagai inhibitor pada reseptor endoribonuklease dan RNA-dependent RNA polymerase SARS-CoV-2. Senyawa katekin pada daun salam memiliki potensi terbaik dalam menginhibisi enzim endoribonuklease dengan energi bebas gibbs -7,643 kkal/mol, KI 2,478 µM, satu ikatan hidrogen, dan 10 interaksi hidrofobik, sedangkan senyawa orientin pada reseptor RNA-dependent RNA polymerase memiliki potensi terbaik dalam menginhibisi enzim dengan energi bebas gibbs -5,662 kkal/mol, KI 70,341 µM, tiga ikatan hidrogen, dan 11 interaksi hidrofobik.
Keyword: Endoribonuklease, Flavonoid, Penapisan virtual, RNA-dependent RNA, polymerase

Judul: Analisis Potensi Senyawa Flavonoid pada Daun Salam sebagai Inhibitor Papain-Like Protease SARS-CoV-2 secara In Silico
Abstrak: SARS-CoV-2 menyandi enzim papain-like protease (PLpro) yang berperan dalam proses replikasi virus. Hal tersebut menjadikan enzim PLpro sebagai target penting dalam pengembangan obat antivirus yang baru. Daun salam (Syzygium polyanthum) merupakan salah satu tanaman obat di Indonesia yang berasal dari famili Myrtaceae. Tanaman ini dilaporkan memiliki kandungan flavonoid yang potensial sebagai anti-SARS-CoV-2. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi senyawa flavonoid daun salam sebagai kandidat inhibitor enzim PLpro SARS-CoV-2 melalui uji in silico, serta menganalisis interaksi molekuler senyawa flavonoid tersebut dengan sisi aktif enzim PLpro. Metode yang digunakan dalam penelitian ini adalah penapisan virtual menggunakan perangkat lunak YASARA Structure. Hasil penelitian menunjukkan 9 dari 11 senyawa uji memiliki aktivitas penghambatan terhadap enzim PLpro, antara lain kuersitrin, mirisitrin, mirisetin, kuersetin, epigalokatekin-3-galat, delfinidin, malvidin, kuersetagetin, dan flavan-3-ol. Senyawa kuersitrin berpotensi sebagai inhibitor terbaik PLpro dengan energi ikatan sebesar -7.3450 kkal/mol dan konstanta disosiasi sebesar 4.13 x 106 pM, sehingga senyawa ini dapat dikembangkan sebagai obat anti SARS-CoV-2., SARS-CoV-2 encodes papain-like protease (PLpro) that plays an essential role in viral replication, making it an important target for developing new antiviral drugs. Bay leaf (Syzygium polyanthum) is one of the medicinal plants in Indonesia that comes from the Myrtaceae family. This plant is reported to contain flavonoids that are potential as antivirus SARS-CoV-2. This study aims to identify the flavonoid compounds of the bay leaf as a candidate for SARS-CoV-2 PLpro enzyme inhibitor through an in silico test, as well as to analyze the molecular interaction of flavonoid compounds with the active site of the PLpro enzyme. Virtual screening doing by the YASARA Structure software. As a result, 9 of the 11 analyze compounds have the potential to inhibit the activity of the PLpro enzyme, such as quercitrin, myricitrin myricetin, quercetin, epigallocatechin-3-gallate, delphinidin, malvidin, quercetagetin, and flavan-3-ol. Quercitrin is the best compound that inhibits PLpro with a binding energy of -7.3450 kcal/mol and a dissociation constant of 4.13 x 106 pM, so it can be used as an anti-SARS-CoV-2 drug development agent.
Keyword: bay leaf, flavonoid, PLpro, SARS-CoV-2, virtual screening

Judul: Penggunaan Teorema Homeomorphy 2-Manifold dan Teorema Euler Poincare pada Torus 𝑇�� dan Simplicial Complex 𝐾��
Abstrak: Two dimensional topological spaces are said to be homeomorphic if they have the same topological invariant, where one of topological invariant used is an Euler characteristic. Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem and Euler Poincare’s Theorem are used to distinguish two topological spaces. Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem uses Euler characteristic to identify two dimensional topological spaces. Euler Poincare’s Theorem is an alternative way to find Euler characteristic with Betti number, which is topological invariant as well. The objective of this paper is to investigate the homeomorphism of torus 𝑇����� and simplicial complex 𝐾�����. Topological space torus and simplicial complex 𝐾����� have the same Euler characteristic, which is two. Based on Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem topological space torus 𝑇����� and simplicial complex 𝐾����� is homeomorphic.
Keyword: simplicial, torus, Euler, homeomorphism, topology