Judul: IPB (Bogor Agricultural University)
Abstrak: Paratuberkulosis atau Johne’s disease (JD) merupakan penyakit enteritis ganulomatosa kronik pada hewan ruminansia yang disebabkan oleh Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis (MAP). Bakteri ini berbentuk batang kecil, bersifat tahan asam, Gram positif, tumbuhnya lama, dan termasuk dalam kelompok Mycobacterium avium complex (MAC). Gejala klinis yang terlihat, adalah diare profus, penurunan produksi susu, penurunan berat badan, dan kekurusan yang disertai dengan pengeluaran bakteri MAP melalui feses. Paratuberkulosis pada peternakan sapi dapat menyebabkan kerugian ekonomi yang signifikan, karena terjadi penurunan produksi susu, gangguan reproduksi, peningkatan calving interval, pengafkiran dini, penurunan kualitas dan kuantitas daging. Penyakit ini bersifat zoonosis potensial, karena bakteri MAP dilaporkan dapat menginfeksi manusia dan lebih dikenal dengan sebutan Crohn’s disease (CD). Berdasarkan hasil studi dan data-data yang ada, sumber infeksi MAP ke manusia dicurigai dan diyakini berasal dari susu dan produk olahannya, karena MAP dilaporkan tahan terhadap pasteurisasi. Metode uji yang sering digunakan untuk diagnosis paratuberkulosis adalah kultur, polymerase chain reaction (PCR), dan enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). Isolasi dan identifikasi MAP dari sampel feses atau jaringan merupakan uji gold standard. Media padat yang umum dan paling banyak digunakan untuk kultur MAP adalah Herrold’s egg yolk medium (HEYM) dan Lӧ wenstein Jensen (LJ). Herrold’s egg yolk medium merupakan media padat standar untuk isolasi MAP dan secara komersial sudah tersedia, tetapi media ini merupakan produk impor dengan harga yang cukup mahal dengan masa simpan yang cukup pendek (4-6 bulan). Enzyme-linked immonosorbent assay merupakan metode uji serologi yang banyak digunakan untuk diagnosis paratuberkulosis, karena lebih sensitif dibandingkan dengan uji serologi lain, lebih murah, dan lebih cepat. Kit ELISA yang digunakan untuk uji serologi paratuberkulosis di Indonesia merupakan produk impor dengan menggunakan antigen lipoarabinomannan (LAM) atau antigen protoplasmik (PPA). Kit ELISA komersial harganya cukup mahal dengan sensitivitas dan spesifitasnya yang bervariasi. Kejadian ini kemungkinan dipengaruhi oleh perbedaan antigen ataupun isolat yang digunakan. Penelitian ini bertujuan untuk mengembangkan dan mengevaluasi kemampuan media RIVS-M dan memodifikasi media Ogawa untuk kultivasi Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis (MAP) yang lebih sederhana dan ekonomis, mengidentifikasi protein protoplasmik MAP isolat lapang B2788 dan B2789 yang bersifat antigenik, dan mengembangkan enzyme-liked immunosorbent assay (ELISA) paratuberkulosis dengan menggunakan antigen protoplasmik MAP isolat lapang. Metode dalam penelitian ini meliputi pengujian media RIVS-M dan media Ogawa dimodifikasi dengan menumbuhkan suspensi bakteri MAP dalam phosphat buffer saline (PBS) dan feses pada kedua media tersebut. Suspensi bakteri MAP tersebut juga ditumbuhkan pada Herrold’s egg yolk medium (HEYM) komersial. Analisa hasil dilakukan dengan menggunakan metode GraphPad Prims 6 Sofware. Identifikasi dan analisa antigen protoplasmik MAP isolat lapang B2788 dan B2789 dilakukan dengan sodium dodecyl sulphate polyacrilamide gel (SDS-PAGE) dan immunoblotting. Pengembangan uji ELISA paratuberkulosis dengan menggunakan antigen protoplasmik MAP isolat lapang (ELISA PPA-L) dilakukan dengan metode indirect untuk menguji 322 sampel serum (300 negatif dan 22 positif paratuberkulosis). Untuk mengevaluasi metode ELISA PPA-L, serum yang sama juga diuji dengan menggunakan kit ELISA IDEXX paratuberculosis screening antibody test (IDEXX Laboratories, USA). Hasil penelitian menunjukkan bahwa media RIVS-M dan media Ogawa dimodifikasi mempunyai kemampuan dan sensitivitas yang baik untuk menumbuhkan MAP, tetapi kemampuan media HEYM komersial lebih baik dibandingkan kedua media tersebut. Namun demikian, media RIVS-M dan media Ogawa dimodifikasi lebih ekonomis
Keyword: media kultur, antigen protoplasmik, Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis, diagnosis, paratuberkulosis

Judul: Deteksi Mycobacterium Avium Subspesies Paratuberculosis Pada Sampel Penyakit Hewan Di Balai Besar Uji Standar Karantina Pertanian
Abstrak: Paratuberkulosis atau Johne’s disease merupakan penyakit infeksius pada ruminansia (sapi, kerbau, domba, dan kambing), disebabkan oleh Mycobacterium avium subspesies paratuberculosis (MAP), ditandai dengan manifestasi enteritis granulomatosa pada saluran pencernaan (usus halus). Infeksi MAP terjadi sejak neonatal dengan masa inkubasi sangat panjang, beberapa bulan sampai tahunan. Gejala klinis pada stadium akhir berupa diare kronis dan kehilangan berat badan yang baru muncul setelah sapi berumur 2 sampai 10 tahun. Penelitian ini menggunakan sampel serum darah sapi sebanyak 361 dari peternakan di daerah Bandung, Bandung Barat, Lebak dan Pandenglang, Yogyakarta dan Klaten, Surabaya, Kebumen, Bandarlampung, Malang, dan Cilegon menggunakan metode sampling by judgement. Pengujian MAP menggunakan Enzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA) menunjukkan ditemukannya seropositif MAP sebanyak 7.20% (26/361) dan 0.55% (2/361) sampel suspect, kemudian dilakukan uji konfirmasi pada feses menggunakan PCR primer IS900, 8 dari 28 sampel menunjukkan hasil positif. Selanjutnya, uji konfirmasi PCR menggunakan primer F57 dan F57 Rn tidak memperlihatkan pita DNA MAP pada semua sampel positif tersebut, sehingga dapat disimpulkan bahwa pada penelitian ini tidak ditemukan seropositif dan DNA spesifik MAP.
Keyword: Kata kunci: ELISA, Paratuberkulosis (Johne’s disease), PCR, ruminansia

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: