Judul: Daya Hambat Aktinomisetes terhadap Escherichia coli Resisten Antibiotik pada Daging Ayam yang Dilalulintaskan melalui Pelabuhan Tanjung Perak Surabaya.
Abstrak: Kemunculan bakteri yang resisten terhadap antibiotik menjadi masalah baru saat ini karena menyebabkan penyakit infeksi sulit untuk diobati dan tingginya biaya pengobatan. Escherichia coli adalah salah satu bakteri patogen penyebab foodborne disease yang membahayakan kesehatan manusia, selain itu merupakan bakteri komensal yang dapat digunakan untuk memantau tingkat sanitasi dan resistensi antimikroba pada hewan ternak dan produknya. Resistensi bakteri terhadap antibiotik menyebabkan perlu dikembangkan antibiotik jenis baru yang dapat mengendalikan bakteri-bakteri patogen, diantaranya dari mikroorganisme yaitu aktinomisetes. Penelitian ini bertujuan mengukur daya hambat aktinomisetes penghasil antibakteri pada E. coli yang resisten terhadap antibiotik dari daging ayam yang dilalulintaskan melalui pelabuhan Tanjung Perak Surabaya. Sebanyak 89 sampel yang dihitung berdasarkan rumus deteksi penyakit diambil dari daging ayam yang dilalulintaskan melalui Pelabuhan Tanjung Perak Surabaya. Isolat E. coli yang diperoleh dari hasil isolasi dan identifikasi kemudian dilakukan uji resistensi terhadap antibiotik. Bakteri E. coli yang resisten terhadap antibiotik tersebut digunakan pada pengujian daya hambat aktinomisetes. Isolat aktinomisetes yang digunakan dalam penelitian ini berasal dari koleksi laboratorium Mikrobiologi Terapan, Pusat Penelitian Bioteknologi-LIPI, yaitu InaCC 3, InaCC 44, InaCC 46, InaCC 47, dan InaCC 413. Pada pengujian daya hambat aktinomisetes tahap pertama menggunakan lima isolat aktinomisetes berumur 4 hari pada media ISP-2 yang diuji terhadap bakteri E. coli yang resisten antibiotik. Dua dari lima isolat aktinomisetes yaitu InaCC 413 dan InaCC 47 menunjukkan kemampuan menghambat pertumbuhan bakteri E. coli resisten antibiotik yang ditandai dengan timbulnya zona bening disekitar potongan agar. Kedua isolat aktinomisetes tersebut kemudian dilakukan ekstraksi dengan pelarut etil asetat untuk memperoleh senyawa antibakteri yang akan digunakan pada pengujian daya hambat kedua. Hasil isolasi dan identifikasi sampel diketahui 14 dari 89 sampel daging ayam positif E. coli, semua isolat juga menunjukkan resistensi terhadap antibiotik yang digunakan. Pengujian daya hambat aktinomisetes tahap pertama terdapat dua isolat aktinomisetes yang menunjukan daya hambat terhadap pertumbuhan bakteri E. coli yaitu InaCC 47 dan InaCC 413. Berdasarkan rata-rata daya hambat yang dihasilkan, aktinomisetes InaCC 413 dikategorikan mempunyai daya hambat yang kuat dan InaCC 47 mempunyai daya hambat sedang. Daya hambat yang dihasilkan tersebut menunjukkan isolat aktinomisetes mensekresikan metabolit sekunder yang berpotensi untuk dapat digunakan sebagai penghasil antibakteri.
Keyword: aktinomisetes, E. coli, resistensi antibiotik

Judul: Beta-Lactam Antibiotic Resistance and Production of Beta-Lactamase Enzyme in Escherichia coli from Chicken
Abstrak: Salah satu masalah kesehatan masyarakat utama abad ke-21 adalah resistansi antimikroba (AMR). Masalah AMR yang sangat penting adalah terkait resistansi antibiotik pada bakteri. Escherichia coli sebagai bakteri komensal pada saluran pencernaan dianggap sebagai reservoir dan pentransmisi resistansi antibiotik. Banyak penelitian resistansi antibiotik pada E. coli telah dilakukan. Penelitian terkait resistansi ampisilin pada E. coli dari berbagai hewan menujukkan angka yang tinggi. Namun, baru sedikit sekali penelitian di Indonesia yang meneliti resistansi sefalosporin pada E. coli asal hewan di Indonesia, terutama asal ayam. Kondisi resistansi seringkali dikaitkan dengan gen yang menyandikan sifat resistansi. Beberapa penelitian di Indonesia telah mendeteksi gen-gen panyandi resistansi antibiotik beta-laktam. Gen-gen penyandi resistansi yang telah dideteksi pada E. coli pada penelitian di luar negeri adalah blaTEM, blaSHV, dan blaCTX-M. Namun, penelitian deteksi ketiga gen tersebut pada isolat E. coli asal ayam di Indonesia belum pernah dilakukan. Tujuan umum penelitian ini adalah mendeteksi resistansi beta-laktam dan melihat aktivitas enzim beta-laktamase yang diproduksi dari E. coli yang berasal dari ayam. Escherichia coli pada penelitian ini berasal dari tiga lokasi berbeda yaitu Sukabumi (25 isolat), Bogor (17 isolat), dan Cianjur (10 isolat). Tiga rangkaian penelitian dilakukan dalam penelitian ini. Penelitian pertama tentang profil resistansi antibiotik pada E. coli. Penelitian pertama bertujuan untuk (1) membandingkan profil resistansi ampisilin tahun 2019 dan 2021 pada isolat E. coli yang sama dan (2) mengetahui profil resistansi ampisilin, setazidim, dan sefotaksim pada E. coli yang berasal dari ayam. Metode yang digunakan untuk uji resistansi antibiotik adalah uji difusi cakram metode Kirby-Bauer pada agar Mueller-Hinton. Uji dilakukan dengan tiga kali pengulangan. Isolat terlebih dahulu direidentifikasi dengan uj-uji identifikasi bakteri secara konvensional meliputi kultur pada agar MacConkey, kultur pada agar eosin-methylene blue, pewarnaan Gram, uji pada agar triple surag iron, uji indol, uji motilitas, uji methyl red, uji Voges-Proskauer, uji sitrat, dan uji urease. Selanjutnya dikonfirmasi dengan pomerase chain reaction (PCR) untuk mendeteksi gen uspA. Kelima puluh dua isolat terkonfirmasi E. coli dan positif gen uspA. Hasil uji resistansi ampisilin pada E. coli sangat tinggi karena seluruh isolat menunjukkan diameter zona hambat 0 mm. Hasil ini sama dengan pengujian resistansi tahun 2019 yang juga memiliki diameter zona hambat uji ampisilin 0 mm. Escherichia coli pada penelitian ini menunjukkan resistansi sefotaksim lebih tinggi daripada seftazidim. Tingkat resistansi tersebut teramati pada ketiga lokasi peternakan. Penelitian kedua adalah terkait gen peyandi resistansi yang ada pada isolat resistan. Isolat yang digunakan pada rangkaian penelitian kedua adalah sebanyak 33 isolat. Isolat tersebut minimal telah resistan dua antibiotik pada rangkaian penelitian sebelumnya (resistan ampisilin + seftazidim + sefotaksim atau ampisilin + seftazidim atau ampisilin + sefotaksim). Penelitian ini bertujuan untuk (1) mendeteksi gen blaTEM, blaSHV, dan blaCTX-M pada isolat E. coli asal ayam yang resistan ampisilin dan seftazidim dan/atau sefotaksim, serta (2) melihat kekerabatan gen blaTEM. Gen-gen penyandi resistansi dideteksi dengan metode PCR. Gen-gen target dalam penelitian ini adalah blaTEM, blaSHV, dan blaCTX-M. Gen blaTEM mendominasi perolehan deteksi gen. Seluruh isolat memiliki gen blaTEM, diikuti oleh lebih dari 50% isolat memiliki gen blaSHV, dan jumlah terendah adalah gen blaCTXM. Kombinasi blaTEM + blaSHV menjadi kombinasi dominan. Gen blaTEM sebagai gen yang paling dominan disekuensing. Lima
Keyword: antibiotik, beta-laktam, Escherichia coli, resistansi, beta-laktamase

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: