Judul: Identifikasi Keragaman Gen Myostatin (MSTN|BsrI) Pada Ayam Kampung.
Abstrak: Myostatin (MSTN) atau Growth and Differentiation Factor 8 (GDF8) adalah anggota dari Transforming Growth Factor (TGF)-β superfamily. yang berfungsi sebagai regulator negatif dari pertumbuhan otot skeletal. Mutasi pada exon 2, dimana basa timin menjadi basa guanine pada gen myostatin, merubah asam amino leusin menjadi arginine mempengaruhi bobot badan ayam. Tujuan dari penelitian ini untuk mengidentifikasi keragaman gen myostatin pada 132 ayam kampung terdiri atas ayam kampung Ciawi dan kampung Sukabumi. Sebagai pembanding untuk melihat keragaman pada populasi yang besar digunakan ayam broiler, nunukan, dan petelur. Keragaman gen diidentifikasi menggunakan metode Polymerase Chain Reaction – Restriction Fragment Length Polymorphism (PCRRFLP) menggunakan enzim restriksi BsrI. Produk amplifikasi sepanjang 247 pb, genotipe pada keragaman gen MSTN|BsrI yang ditemukan adalah GG, GT, dan TT. Hasil dari analisis memperlihatkan bahwa frekuensi genotipe GT dan TT nilainya lebih besar dari genotipe GG. Pada semua populasi frekuensi alel T nilainya lebih besar dari frekuensi alel G yaitu 0.72 dan 0.28. Gen MSTN|BsrI pada populasi kampung Ciawi, dan broiler berada pada keseimbangan Hardy-Weinberg. Populasi kampung Ciawi, dan kampung Sukabumi memiliki nilai heterozigositas pengamatan (Ho) yang lebih besar daripada nilai heterozigositas harapan (He), sedangkan ayam broiler memiliki nilai heterozigositas pengamatan (Ho) yang sama dengan nilai heterozigositas harapan (He). Gen MSTN|BsrI pada populasi kampung Ciawi, kampung Sukabumi, dan broiler bersifat polimorfik.
Keyword: ayam kampung, keragaman, MSTN, PCR-RFLP

Judul: Identifikasi Keragaman Gen Myostatin (MSTN|BsrI) pada Ayam Lokal Indonesian dan Persilangannya
Abstrak: Myostatin (MSTN) atau Growth and Differentiation Factor 8 (GDF8) adalah anggota dari Transforming Growth Factor (TGF)-b superfamily yang berfungsi sebagai regulator negatif dari pertumbuhan otot skeletal. Mutasi basa Timin menjadi Guanin pada ekson 2 gen MSTN yang menyebabkan perubahan asam amino leusin menjadi arginin berhubungan dengan bobot badan ayam. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi keragaman gen Myostatin (MSTN) pada ayam lokal indonesia dan persilangannya. Sampel darah yang digunakan dalam penelitian sebanyak 162 ekor ayam yang terdiri dari ayam kampung terseleksi, merawang GO, kapas, sentul, KPt, dan merwang G1. Amplifikasi gen MSTN|BsrI dilakukan dengan metode PCR-RFLP. Hasil produk amplifikasi adalah sepanjang 247 bp. Genotipe yang ditemukan pada gen MSTN BsrI adalah GG, TT, dan GT dengan 2 macam alel yaitu alel G dan alel T. Hasil analisis menunjukkan bahwa frekuensi genotipe TT dan GT lebih tinggi dari frekuensi genotipe GG. Nilai frekuensi alel total untuk semua populasi memperlihatkan bahwa frekuensi alel tertinggi adalah alel T sebesar 0.72 dan terendah adalah alel G sebesar 0.28. Populasi ayam kampung terseleksi, KPt dan merawang G1 berada pada keadaan keseimbangan Hardy-Weinberg. Populasi ayam kampung terseleksi, merawang GO dan merawang G1 memiliki nilai heterosigositas pengamatan (Ho) yang lebih fendah dari nilai heterosigositas harapan (He), sedangkan nilai heterosigositas Bengamatan (Ho) pada ayam KPt dan sentul lebih tinggi dari nilai heterosigositas harapannya (He). Kesimpulan yang dapat diambil dari hasil analisis adalah gen MSTN BsrI pada kampung terseleksi, merawang GO, sentul, silangan kampung x petelur, dan merawang G1 bersifat polimorfik.
Keyword: MSTN, Native Chicken, PCR-RFLP, Polimorphism, G D F 8, T G F, Mutation, Thymine, Local chicken, Myostatin gene, Arginine, Local chicken

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: