Judul: In-silico Analysis of cashew nut allergenicity: interaction profiles of Ana o 3 and imunoglobulin.
Abstrak: Terapi makanan hipoalergenik adalah pengembangan dan penggunaan produk makanan dengan alergenisitas yang berkurang untuk membantu individu mengonsumsi pangan beralergen lebih aman. Teknik seperti pemrosesan termal dan pH banyak dieksplorasi untuk mengubah protein alergenik. Kacang mete dapat menyebabkan reaksi alergi. Alergen kacang mete adalah Ana o 3 sebagai alergen yang paling reaktif. Penelitian ini bertujuan untuk meniru proses perlakuan panas dan pH yang dilakukan dalam proses pangan seperti pasteurisasi, pemrosesan suhu sangat tinggi, pemanggangan, dan fermentasi, serta untuk menentukan perubahan alergenisitas dengan mengkarakterisasi afinitas pengikatan antara Ana o 3 dan Imunoglobulin E menggunakan metode in silico. Alergen Ana o 3 diperoleh dari basis data UniProt, sedangkan IgE dibangun berdasarkan antibodi monoklonal PA12P3D08. Simulasi dinamika molekul dilakukan menggunakan Gromacs dan PlayMolecule untuk menilai perubahan struktural di bawah berbagai kondisi suhu dan pH. Pada penelitian diketahui bahwa Ana o 3 adalah protein yang stabil secara termal, berdasarkan karakteristik RMSD, SASA, dan Rg. Perlakuan panas mengurangi energi bebas ikatan Ana o 3 sebesar 30% pada suhu 77°C, 33% pada suhu 87°C, dan sebesar 40% pada suhu 127°C. Namun, energi bebas ikatan kembali ke nilai aslinya yaitu 110 kJ/mol ketika diperlakukan pada suhu 177°C dengan kandungan air 5%. Penurunan pH menjadi 4 dan 4.5 menyebabkan penurunan alergenisitas sebesar 10% dan 6% secara berturut-turut.
Keyword: In silico, molecular docking, imunoglobulin, alergen, alergi

Judul: Isolasi dan Karakterisasi Protein Kacang Kedelai, Kacang Tanah dan Kacang Bogor Untuk Pembuatan Isolat Alergen
Abstrak: Alergi merupakan salah satu reaksi hipersensitivitas yang memiliki manifestasi klinik yang cukup fatal, sehingga diagnosis alergi menjadi sangat penting dilakukan agar reaksi ini dapat dicegah. Namun, saat ini Indonesia masih mengimpor isolat protein alergen untuk keperluan diagnosis alergi, karena pembuatan isolat alergen membutuhkan suatu penelitian yang cukup rumit terlebih dahulu. Oleh karena itu penelitian ini dilakukan dengan tujuan untuk membuat isolat alergen. Kacang-kacangan merupakan golongan pangan penyebab alergi yang sulit diidentifikasi kerena jenisnya yang beragam, sehingga kacang kedelai, kacang tanah dan kacang bogor menjadi prioritas dalam penelitian ini. Kajian literatur menunjukkan bahwa isolat alergen kacang yang digunakan untuk diagnosis alergi merupakan suatu protein crude karena fraksi dan jenis protein yang bersifat alergenik berbeda-beda pada setiap individu. Berdasarkan hal tersebut, maka penelitian ini bertujuan: (1) mengisolasi protein kacang kedelai, kacang tanah dan kacang bogor; (2) mengkarakterisasi isolat protein dengan uji elektroforesis SDS-PAGE, immunoblotting, dan ELISA; (3) mengidentifikasi penggunaan bentuk crude isolat protein kacang untuk diagnosis alergi; dan (4) menguji reaktivitas isolat protein kacang. Tahapan penelitian meliputi isolasi dan karakterisasi. Sebelum diisolasi, total protein awal masing-masing sampel diukur terlebih dahulu dengan metode Kjeldahl. Isolasi protein kacang dilakukan dengan metode pengaturan pH, kemudian kemurnian isolat dianalisis dengan metode Bradford. Tahap karakterisasi dilanjutkan dengan elektroforesis SDS-PAGE, immunoblotting dan ELISA. Untuk pengujian immunoblotting dan ELISA, digunakan serum yang diambil dari 30 penderita alergi pangan yang berbeda-beda (serum 1-6: penderita alergi kacang; serum 7-30: penderita alergi makanan laut (ikan, udang, kerang, kepiting)), dan 1 orang yang tidak mengalami alergi sebagai kontrol negatif. Informasi alergi para penderita ini diketahui melalui proses wawancara. ..dst
Keyword: alergi pangan, isolat alergen, diagnosis alergi

Judul: Tree berdiameter lima adalah graceful
Abstrak: This manuscript presents some proofs that every tree of diameter five is graceful. A graceful tree is a graph which has a graceful labelling. This labelling assigns absolute difference of connected vertices, such that the resulting edge labels are mutually distinct. There are three theorems to be considered. First theorem proves that every tree of diameter four is graceful. Second theorem proves that every tree of diameter five is graceful or nearly graceful. The third theorem improves the second theorem and shows that every tree of diameter five is nearly graceful, which can be transformed into graceful using some certain patterns.
Keyword: Graf, Pelabelan graceful, Bogor Agricultural University, Institut Pertanian Bogor, IPB