Judul: Keragaman dan Struktur Genetik Plasma Nutfah Kelapa Sawit Koleksi Taman Buah Mekarsari Berdasarkan Karakter Agronomi dan Marka Mikrosatelit
Abstrak: Kelapa sawit merupakan salah satu tanaman yang memiliki nilai ekonomi penting sebagai sumber penghasil minyak nabati utama di dunia dan memiliki produktivitas tertinggi dibandingkan dengan tanaman-tanaman penghasil minyak nabati lain. Di Indonesia, kelapa sawit termasuk ke dalam salah satu komoditas perkebunan strategis karena menjadi sumber penghasil devisa utama dan mampu menghidupi jutaan masyarakat yang bergerak pada sektor perkebunan. Keberlanjutan produksi tanaman kelapa sawit di Indonesia pada saat ini dihadapkan pada permasalahan utama yaitu ketersediaan lahan untuk perluasan perkebunan kelapa sawit semakin terbatas. Diperlukan upaya intensifikasi melalui peningkatan potensi genetik tanaman agar produktivitas per hektar dapat meningkat. Karakter laju pertambahan tinggi yang lambat dan karakter arsitektur tajuk kompak merupakan dua karakter penting yang menjadi target seleksi untuk mendukung upaya intensifikasi perkebunan. Makin lambat tanaman bertambah tinggi, makin panjang umur produktif tanaman karena makin mudah tandantandannya untuk dipanen. Pada saat ini, rata-rata laju pertambahan tinggi tanaman dari 37 varietas komersial yang telah dilepas di Indonesia berkisar antara 50-70 cm per tahun yang berarti bahwa pada umur 20 tahun tinggi tanamannya sudah mencapai 10 – 14 meter sehingga tandan-tandannya sudah relatif sulit untuk dipanen. Oleh karena itu masih diperlukan program pemuliaan untuk menghasilkan varietas unggul kelapa sawit yang memiliki karakter laju pertambahan tinggi yang lambat. Karakter tersebut dapat diintegrasikan ke genotipe yang sudah memiliki karakter produksi minyak tinggi. Ketersediaan sumber genetik dan variabilitas genetik yang luas merupakan faktor penentu keberhasilan program pemuliaan tanaman. Populasi kelapa sawit yang umum dibudidayakan di Indonesia merupakan populasi F1 (DxP) hasil persilangan genotipe-genotipe dura sebagai tetua betina dengan genotipe-genotipe pisifera sebagai tetua jantan pada spesies Elaeis guineensis. Upaya untuk merakit varietas DxP yang memiliki kombinasi daya hasil tinggi dan laju pertambahan tinggi yang lambat dimulai dengan merakit dan memperbaiki potensi genetik tetuanya secara bersamaan baik dari populasi dura maupun populasi pisifera. Salah satu plasma nutfah yang dapat digunakan untuk pemuliaan kelapa sawit super pendek yaitu dura Elmina 206 (E206). Populasi dura E206 merupakan populasi yang dikembangkan dari satu tanaman deli dura yang mengalami mutasi spontan. Mutan ini ditemukan di perkebunan kelapa sawit Elmina, Malaysia. Mutan E206 memiliki postur pendek yang berbeda jauh dengan deli dura sehingga dikenal sebagai dura dumpy. Plasma nutfah kelapa sawit lain yang dapat digunakan sebagai sumber untuk karakter pendek yaitu plasma nutfah E. oleifera. Hampir semua genotipe E. oleifera memiliki laju pertambahan tinggi yang super lambat yaitu sekitar 10-12 cm per tahun atau tingginya hanya sekitar 2 – 2.4 m pada usia 20 tahun. Penelitian ini mengkaji keragaman genetik karakter laju pertambahan tinggi tanaman dan karakter-karakter agronomi lain dari plasma nutfah kelapa sawit koleksi Taman Buah Mekarsari. Selain itu, marka mikrosatelit sebagai marka yang bersifat kodominan dan multialelik digunakan pada penelitian ini untuk mengestimasi struktur genetik yang bermanfaat untuk menentukan strategi pemuliaan. Penelitian dilaksanakan mulai bulan Januari 2014 sampai Maret 2017 di Kebun Percobaan PT. Sasaran Ehsan Mekarsari, Cileungsi, Bogor dan di Laboratorium Biologi Molekuler Tanaman (PMB Lab), Departemen Agronomi dan Hortikultura, Fakultas Pertanian, Institut Pertanian Bogor. Penelitian yang dilakukan dibagi menjadi lima bagian yang terdiri atas (1) analisis keragaman karakter agronomi pada 18 populasi dura elit, (2) analisis struktur genetik pada 26 populasi dura elit
Keyword: kelapa sawit, E. guineensis, E. oleifera, karakter seleksi, heterozigositas genetik, analisis biplot

Judul: Genetic Analysis of Oil Palms (Elaeis guineensis Jacq.) from Different Origins
Abstrak: Kelapa sawit saat ini merupakan komoditas strategis andalan Indonesia. Komoditas ini mampu menghasilkan minyak nabati tertinggi di dunia. Disamping itu minyak kelapa sawit diharapkan akan mampu memenuhi permintaan minyak nabati dunia yang terus mengalami peningkatan sebesar 240 juta ton pada tahun 2050. Peningkatan peranan kelapa sawit tidak terlepas dari kontribusi pemuliaan tanaman dalam meningkatkan potensi produksi serta penyediaan bibit unggul. Usaha untuk mendapatkan varietas unggul sangat dipengaruhi oleh ketersediaan plasma nutfah dan keragaman genetik. Pendekatan secara konvensional dan molekuler dapat digunakan untuk menyeleksi dan mendapatkan tanaman sesuai karakter yang diinginkan. Adanya informasi keragaman genetik, pemanfaatan daya gabung dan korelasi karakter serta metode analisis kluster dapat memberikan kemudahan dalam proses seleksi. Disamping itu informasi genetik berbasis genom menambah keyakinan pemulia dalam menghasilkan varietas unggul. Penelitian ini bertujuan untuk (1) mempelajari keragaman genetik kelapa sawit pada karakter komponen tandan dari berbagai origin persilangan, dan (2) mempelajari association mapping pada karakter komponen tandan kelapa sawit. Secara umum informasi keragaan parameter genetik (heritabilitas, daya gabung umum, dan daya gabung khusus), analisis korelasi dan kluster serta informasi genetik berbasis genom (SNP) diharapkan dapat memberikan informasi dasar untuk kegiatan pemuliaan tanaman kelapa sawit dimasa yang akan datang. Upaya untuk memperluas keragaman genetik menjadi penting karena dapat memperkuat pondasi kegiatan pemuliaan tanaman sehingga diperoleh varietas unggul kelapa sawit. Penggunaan berbagai macam populasi dalam program pemuliaan tanaman kelapa sawit memberikan manfaat dalam memaksimalkan sifat-sifat tertentu yang akan dicapai. Kegiatan tersebut dapat dilakukan dalam program persilangan, introduksi maupun mutasi. Umumnya kegiatan persilangan dilakukan untuk mendapatkan progeni-progeni unggul kelapa sawit, sedangkan introduksi dan mutasi lebih mengarah pada pembentukan populasi dasar. Progeni-progeni unggul yang dihasilkan dapat dikonfirmasi genotipenya secara molekuler, sehingga keakuratan karakter dari varietas yang dihasilkan lebih terjaga. Percobaan pertama menghasilkan informasi bahwa progeni terbaik penghasil jumlah tandan banyak terdapat pada P548, P572, P550 pada populasi LaMe. Produksi FFB tertinggi pada progeni P550 (LaMe), progeni P563 (Yangambi) dan P544 (SP540). Sementara itu rerata ukuran tandan terbesar terdapat pada populasi P540 yaitu progeni P579. Produksi OKY tertinggi terdapat pada P546, P546 dan P544. Pertambahan tinggi lambat terdapat pada progeni P560 (31,39 cm/tahun) populasi Yangambi, P546 dan P544 (32,9 cm/tahun) pada populasi LaMe serta P568 dan P578 (36,3 cm/tahun). Komponen tandan OB memberikan informasi bahwa terdapat 5 progeni terbaik dari origin LaMe, 4 progeni dari origin Yangambi dan 3 progeni dari origin SP540. Nilai heritabilitas arti luas (h2 bs) plot basis tinggi dimiliki oleh karakter BNO, FWT, MF, ODM, SF, dan OB. Di sisi lain, FFB, AWB, OKY, KB, dan HI memiliki nilai heritabilitas katagori sedang. Analisis korelasi menunjukkan bahwa OB memiliki korelasi positif dengan BNO, ABW, HI, FWT, MF, ODM. SF dan KF Karakter OKY berkorelasi nyata positif dengan BNO, FFB, ODM, dan OB. Analisis daya gabung diperoleh tetua female (Dura) D8 dan D9 (DA10D x DA3D) mememiliki nilai daya gabung umum tertinggi pada karakter BNO. Pada karakter ABW, tetua dari origin DA115D x DA3D (D10) dan DA115D (D16) memiliki nilai DGU tertinggi pada ABW sedangkan karakter OKY nilai DGU terbaik terdapat pada origin DA10D x DA115D (D14 dan D15). Pada tetua male (Pisifera), nilai DGU terbaik terdapat pada pisifera LaMe yaitu LM2T
Keyword: Daya gabung, GWAS, Hibrida, Variasi genetik, SNP

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: