Judul: IPB (Bogor Agricultural University)
Abstrak: Tuberkulosis (TB) merupakan penyakit infeksius yang tersebar luas di seluruh dunia yang disebabkan oleh infeksi organisme yang merupakan anggota Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC). Bakteri MTBC adalah kelompok patogen yang menyebabkan morbiditas dan mortalitas yang tinggi pada manusia, serta mengakibatkan kerugian ekonomi pada pertanian di dunia. Tuberkulosis zoonotik dapat menjadi ancaman utama bagi kesehatan masyarakat, tetapi belum ada informasi mengenai kejadian penyakit TB zoonotik dan faktor risikonya pada hewan di Indonesia. Penelitian ini bertujuan mengukur prevalensi kejadian penyakit TB pada sapi perah (bovine tuberculosis/BTB), mengidentifikasi faktor-faktor risiko yang mempengaruhi kejadian penyakit TB pada sapi perah, mengukur asosiasi kejadian penyakit TB pada sapi perah dengan faktor-faktor risiko yang mempengaruhinya, mendeteksi Mycobacterium bovis sebagai penyebab kejadian penyakit TB pada sapi perah dengan metode multiplex polymerase chain reaction (PCR), serta mengembangkan dan menilai kemampuan media modifikasi Ogawa agar (MOA) untuk menumbuhkan M. bovis, dibandingkan dengan media yang digunakan saat ini, yaitu Löwenstein Jensen (LJ) dan modifikasi Ogawa (MO). Penelitian ini merupakan kajian lintas seksional, dilaksanakan di lokasi sentra peternakan sapi perah di wilayah Kabupaten dan Kota Bogor. Seluruh ternak sampel dituberkulinasi dengan Bovituber®PPD. Faktor risiko kejadian penyakit TB pada sapi perah diidentifikasi menggunakan kuesioner yang dibagikan kepada peternak. Dengan menggunakan pertimbangan proporsionalitas populasi ternak, maka jumlah ternak yang dijadikan sampel di Kawasan Usaha Peternakan (KUNAK), Kabupaten Bogor, adalah 166 ekor (50 peternakan), dan di Kebon Pedes, Kota Bogor, 36 ekor (10 peternakan). Prevalensi TB kajian lintas seksional kejadian penyakit TB pada sapi perah di wilayah Bogor adalah 21.78% (SK 95% 16.09-27.47%). Faktor risiko yang signifikan dalam penelitian ini adalah ketinggian tempat <340 mdpl (OR 3.721, SK 95% 1.642-8.433), suhu tempat >28 °C (OR 2.573, SK 95% 1.077-6.145), dan intensitas cahaya di kandang <15 W m-2 (OR 2.749, SK 95% 1.204-6.275). Metode multiplex PCR dapat menjadi alternatif terbaik untuk membedakan M. bovis dan M. tuberculosis. Dari 202 ternak yang telah diuji dengan uji tuberkulin, 44 ekor ternak memberikan hasil yang positif. Dari 44 ternak yang positif terhadap uji tuberkulin, diambil 44 sampel feses dan swab hidung, 43 sampel susu. Peternak yang diambil dahaknya sebagai sampel berjumlah 24 sampel, berasal dari peternakan yang ternaknya positif terhadap uji tuberkulin. Ditemukan M. bovis pada 8 sampel feses ternak, 4 sampel swab hidung ternak, 9 sampel susu ternak. Ditemukan M. tuberculosis pada satu sampel dahak peternak. Tiga ekor sapi memberikan hasil positif M. bovis pada dua jenis sampel, yaitu sampel feses dan susu. Peternak yang positif M. tuberculosis berasal dari peternakan yang ternaknya memberikan hasil positif M. bovis pada sampel fesesnya. Pemeriksaan kultur mikobakteri merupakan diagnosis definitif terhadap TB, tetapi media kultur komersial untuk Mycobacterium bovis masih jarang tersedia. Suspensi bakteri M. bovis dan M. phlei dalam phosphate buffer saline (PBS) dengan konsentrasi 105 cfu/ml masing-masing diinokulasikan 0.1 ml pada media LJ, MO dan MOA, masing-masing lima tabung untuk tiap media. Bakteri M. phlei tumbuh pada semua media mulai hari ke-4. Bakteri M. bovis tumbuh pada media LJ dan MO mulai hari ke-17, tetapi tidak berhasil tumbuh pada media MOA. Perbandingan jumlah koloni M. phlei yang tumbuh pada media LJ dan MOA berbeda nyata secara statistik. Kemampuan media MOA untuk menumbuhkan
Keyword: Mycobacterium bovis, prevalensi, bovine tuberculosis, faktor risiko, PCR, media kultur

Judul: Milk Screening Againts Mycobacterium bovis and Its Transmission Potential in Central and Eastern Regions of Java Island, Indonesia
Abstrak: Tuberkulosis (TB) merupakan penyakit yang menyebar luas, menular, dan terus menjadi penyebab utama kematian. Penyakit ini masih tersebar luas dan sering diabaikan di sebagian besar negara berkembang. Indonesia adalah negara dengan jumlah kasus tuberkulosis terbesar kedua di dunia. Mycobacterium tuberculosis adalah penyebab paling umum dari TB manusia dan Mycobacterium bovis adalah penyebab TB pada sapi (bovine tuberculosis). Bovine tuberculosis pada sapi perah diduga berperan dalam menyebabkan kasus tuberkulosis pada manusia. Bovine tuberculosis (BTB) merupakan penyakit kronis yang menyerang manusia dan hewan dengan potensi zoonosis yang tinggi. Manusia dapat tertular tuberkulosis sapi karena menghirup udara yang terkontaminasi, meminum susu yang tidak dipasteurisasi, dan memakan daging yang tidak dimasak dengan benar. Penyakit ini menjadi beban kesehatan masyarakat dan menyebabkan kerugian ekonomi yang besar karena mengganggu kesehatan hewan, menurunkan produksi, meningkatkan biaya program pemberantasan, dan pembatasan perdagangan. Ancaman BTB terhadap kesehatan masyarakat terutama terkait dengan konsumsi produk susu yang tidak dipasteurisasi yang mengandung M. bovis. M. bovis telah diisolasi dari susu sapi mentah dalam banyak penelitian yang dilakukan di beberapa negara seperti Tanzania, Turki, Zambia, Tunisia, dan Brazil. Susu dan produk susu harus dipastikan bebas dari M. bovis untuk meminimalisasi masalah kesehatan pada masyarakat. Wilayah tengah dan timur Pulau Jawa merupakan sentra peternakan sapi perah di Indonesia yang masih melaporkan tingginya kasus tuberkulosis pada manusia. Provinsi Jawa Timur, Jawa Tengah, dan DI Yogyakarta merupakan provinsi penyumbang susu sapi terbesar di Indonesia dan dengan kasus kejadian tuberkulosis pada manusia tertinggi (Jawa Tengah dan Jawa Timur). Informasi mengenai keberadaan bakteri M. bovis pada susu yang dihasilkan dan potensi penularan BTB di wilayah tersebut belum pernah dilaporkan. Potensi penularan kasus penyakit dapat diperkirakan berdasarkan praktik manajemen pemeliharaan, manajemen kesehatan, higiene sanitasi, dan biosekuriti. Penelitian ini bertujuan untuk mengukur kejadian penyakit melalui skrining susu terhadap keberadaan M. bovis dan memperkirakan potensi penularan bovine tuberculosis antar sapi perah dan ke manusia. Bovine tuberculosis pada sapi perah diduga turut berperan dalam meningkatkan kasus tuberkulosis di Indonesia. Data yang digunakan dalam penelitian ini adalah data yang didapatkan dari kuesioner (karakteristik) dan data dari hasil uji laboratorium (kasus kejadian BTB). Data karakteristik diambil melalui wawancara dengan menggunakan kuesioner terstruktur. Jumlah responden yang diwawancarai adalah 92 peternak. Data uji laboratorium didapat dari pengujian sampel susu yang dikoleksi dari sampel individu pada peternakan sapi perah di wilayah tengah dan timur Pulau Jawa dengan besaran 163 sampel. Besaran sampel ditentukan dengan menggunakan metode purposive sampling dengan pertimbangan wilayah yang diambil adalah wilayah dengan produksi susu sapi paling banyak dan wilayah dengan tingkat kejadian tuberkulosis paling tinggi di manusia. Hasil penelitian ini menunjukkan skrining dengan uji polymerase chain reaction (PCR) tidak ditemukan bakteri M. bovis pada sampel susu yang diuji. Hasil uji PCR juga menunjukkan tidak ditemukan bakteri M. tuberculosis. Hasil skrining menunjukkan bahwa tidak ditemukan adanya kasus kejadian bovine tuberculosis di wilayah tengah dan timur Pulau Jawa. Penghitungan potensi penularan menggunakan metode multiple criteria decision analysis (MCDA) didapatkan hasil skor indeks penularan antar sapi perah sebesar 0,44 dan skor indeks penularan ke manusia sebesar 0,40. Skor indeks ini menunjukkan potensi berada pada kategori sedang sehingga potensi kejadian bovine tuberculosis dan penularannya antar sapi perah dan ke
Keyword: bovine tuberculosis, M. bovis, penularan, susu, zoonosis

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: