Judul: Ekspresi Gen Penyandi Farnesoic Acid O-Methyl Transferase (Famet) Pada Organ Mandibular Kepiting Scylla Olivacea Fase Intermolt Dan Premolt
Abstrak: Farnesoic Acid O-Methyl Transferase (FAmeT) merupakan enzim untuk mengkonversi Asam Farnesoat (AF) menjadi Metil Farnesoat (MF) sebagai salah satu hormon yang berperan dalam proses metamorfosis dan reproduksi pada krustasea. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui tingkat ekspresi gen penyandi FAmeT pada fase sebelum molting yaitu intermolt dan premolt serta mengetahui urutan oligonukleotida parsial cDNA penyandi FAmeT kepiting Scylla olivacea. Analisis tingkat ekspresi gen dilakukan dengan melakukan ekstraksi RNA organ mandibular kepiting bakau pada masing-masing fase dan dilanjutkan dengan reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). Produk PCR diukur konsentrasinya dengan spektrofotometer dan pendaran RNA pada gel diukur ketebalannya dengan software UN-SCAN IT. Produk PCR yang dihasilkan kemudian dipurifikasi dan dilakukan pengurutan oligonukleotida. Hasil pengurutan oligonukleotida digunakan untuk mengetahui tingkat kesamaan urutan oligonukleotida cDNA penyandi FAmeT Scylla olivacea dengan urutan oligonukleotida cDNA penyandi FameT Scylla serrata, Scylla paramamosain dan Portunus. Hasil penelitian menunjukan bahwa konsentrasi produk PCR cDNA penyandi FAmeT pada organ mandibular kepiting fase premolt lebih tinggi dibanding pada fase intermolt walaupun perbedaannya tidak begitu signifikan. Hasil kuantifikasi konsentrasi produk PCR cDNA penyandi FAmeT menggunakan spektrofotometer menunjukkan rata-rata konsentrasi produk PCR pada fase intermolt adalah 765.4 ng/μl ±9.2, sementara pada fase premolt adalah 790.3 ng/μl ±15.1. Nilai rata-rata hasil kuantifikasi konsentrasi ekspresi berdasarkan ketebalan pendaran pita cDNA penyandi FAmeT pada gel adalah 412.1 ng/μl ±143.3 pada fase intermolt dan fase premolt adalah 442.5 ng/μl ±137.2. Hasil pengurutan oligonukleotida cDNA penyandi FAmeT Scylla olivacea menunjukkan urutan oligonukleotida yang hampir identik dengan 2 jenis Scylla lainnya yaitu Scylla serrata dan Scylla paramamosain yang sebelumnya telah dilaporkan dan didaftarkan di GenBank.
Keyword: Scylla olivacea, enzim, FAmeT, ekspresi gen

Judul: Optimasi Metode Deteksi dan Ekspresi Gen α-Amilase Inhibitor pada Sengon (Falcataria moluccana Miq.)
Abstrak: Salah satu permasalahan yang sering terjadi di hutan rakyat maupun hutan tanaman sengon (Falcataria moluccana Miq.) dengan pola penanamannya yang cenderung monokultur adalah serangan hama penggerek batang boktor (Xystrocera festiva Pascoe). Langkah awal pengembangan sengon yang tahan terhadap serangan hama boktor dapat dilakukan dengan cara pendeteksian gen ketahanan terhadap hama boktor dan mengetahui aktivitas gen melalui analisis ekspresi gen. Salah satu gen ketahanan hama boktor pada sengon yaitu α-amilase inhibitor. Penelitian ini bertujuan untuk optimasi metode deteksi dan analisis ekspresi gen α-amilase inhibitor pada sengon. Prosedur kerja dalam penelitian ini meliputi isolasi DNA dan RNA total, uji kualitatif dan kuantitatif DNA dan RNA total, sintesis cDNA, perancangan primer spesifik gen AAI (target) dan aktin (kontrol), optimasi suhu annealing primer gen AAI dan aktin menggunakan template DNA dan cDNA, sekuensing serta optimasi konsentrasi sampel cDNA pada Real Time PCR. Sekuen gen spesifik aktin berhasil diperoleh dari primer TAAct sebesar 121 bp dan menunjukkan kesamaan dengan gen aktin Sarocalamus faberi. Sekuen gen spesifik α-amilase inhibitor diperoleh dari primer GMAAI sebesar 195 bp dan menunjukkan kesamaan dengan gen LTP Rosa chinensis yang mempunyai fungsi dan struktur domain mirip dengan α-amilase inhibitor. Analisis ekspresi gen aktin dan AAI menggunakan primer TAAct dan GMAAI masih perlu dioptimasi lagi.
Keyword: α-amilase inhibitor, aktin, Falcataria moluccana, Real Time PCR

Judul: Desain Jejaring Pocket Park Sebagai Ruang Resapan Air Hujan di Kota Bogor
Abstrak: Bogor as satelite city which has potential rain fall rates up to 3 000 – 4 000 mm/year may develop pocket park network through transect method to increase availability of society interaction space and rain infiltration area. Contained 331 potential spots as result of radial type network and able to increase green open space needed in Bogor up to 1.41 – 5.65% (based on Visalia City Council pocket park development standard size 1 012 – 4 046 m2). Pocket park network result shall be classtificated by nearest regional function to afford adaptable park. Designing proceed focused to provide pasif interactional space with aplicate of rain garden principle as rain infiltration area. Result of 4 different sample types (commercial, industrial, residential, and gevermential building) able to provide rain water reservoir with capability rates up to 342.2 – 706.4 m3. The practice toward 331 spots may provide rain water and run off reservoir in Bogor up to 113 268.2 – 233 818.4 m3.
Keyword: water catchment, pocket park, green network