Judul: Potensi Bakteri Kitinolitik sebagai Biokontrol Colletotrichum capsici.
Abstrak: Cendawan patogen Colletotrichum capsici merupakan salah satu penyebab penyakit antraknosa pada tanaman cabai dan menyebabkan penurunan produktivitas cabai di daerah tropis dan subtropis. Bakteri kitinolitik dan kitinase mempunyai potensi sebagai biokontrol cendawan patogen tanaman. Kitin yang terdapat pada dinding sel cendawan dapat didegradasi oleh kitinase. Tujuan penelitian ini yaitu untuk mengetahui potensi bakteri kitinolitik sebagai biokontrol Colletotrichum capsici pada skala rumah kaca. Penelitian sebelumnya telah berhasil mengisolasi bakteri kitinolitik yang bersifat antagonis terhadap Colletotrichum capsici, yaitu Serratia marcescens KAHN 15.12, Bacillus thuringiensis SAHA 12.12, dan BAE 36. Ketiga isolat bakteri digunakan sebagai agens biokontrol dengan menggunakan talek sebagai bahan pembawa. Metode penelitian ini terdiri atas karakterisasi isolat, formulasi agens biokontrol, uji viabilitas isolat, uji in vitro agens biokontrol pada buah cabai, dan uji in vivo pada cabai dalam percobaan rumah kaca. Zona bening dihasilkan disekitar koloni bakteri BAE 36, Serratia marcescens KAHN 15.12, dan Bacillus thuringiensis SAHA 12.12 pada media agar-agar kitin. Indeks kitinolitik tertinggi ditunjukkan oleh isolat bakteri BAE 36 dengan indeks kitinolitik sebesar 3,6. Ketiga bakteri tidak bersifat hipersensitif terhadap tanaman cabai sehingga dapat digunakan sebagai biokontrol. Jumlah sel tertinggi pada isolat BAE 36 terdapat pada jam ke-20, aktivitas kitinase terdapat pada fase stasioner dengan jumlah aktivitas kitinase tertinggi 3.86 U/mg. Ketiga bakteri tidak bersifat antagonis sehingga dapat dikonsorsiumkan pada pembuatan formulasi agens biokontrol. Formulasi BAE 36 dan formulasi konsorsium (BAE 36+Serratia marcescens Bacillus thuringiensis) dapat bertahan pada 12 minggu penyimpanan pada suhu ruang. Hasil penelitian menunjukkan bahwa formulasi isolat bakteri dapat menghambat serangan Colletotrichum capsici 50%-75%. Secara keseluruhan, penelitian ini menunjukkan bahwa formulasi bakteri kitinolitik dapat digunakan sebagai agens biokontrol dari C. capsici.
Keyword: Cabai, gejala antraknosa, talek, rumah kaca

Judul: Seleksi Bakteri Kitinolitik Asal Tanah Jambi Sebagai Biokontrol Colletotrichum Capsici.
Abstrak: Colletotrichum capsici merupakan salah satu cendawan patogen penyebab antraknosa pada cabai. Infeksi antraknosa dapat menyebabkan kerugian hasil panen sekitar 50-100%. Salah satu alternatif yang dapat digunakan untuk menghambat pertumbuhan C. capsici ialah dengan menggunakan bakteri kitinolitik. Kitin yang terdapat pada dinding sel cendawan dapat dihidrolisis oleh enzim kitinase yang berasal dari bakteri kitinolitik. Kitinase menghidrolisa polimer kitin pada cendawan menjadi monomer N-asetilglukosamin. Tujuan penelitian ini adalah menseleksi bakteri kitinolitik asal tanah Jambi berdasarkan indeks kitinolitik dan kemampuannya menghambat pertumbuhan C. capsici. Sebagai tambahan dilakukan identifikasi secara molekuler dari isolat kitinolitik terpilih dan karakterisasi kitinase ekstraseluler. Enzim kitinase dari bakteri terpilih selanjutnya digunakan untuk menghambat pertumbuhan C. capsici. Berdasarkan hasil penyeleksian diperoleh dua isolat terbaik berdasarkan kemampuannya mendegradasi kitin dan penghambatannya terhadap C. capsici. Isolat KAHN 15.12 teridentifikasi sebagai Serratia marcescens dan SAHA 12.12 sebagai Bacillus thuringiensis berdasarkan gen 16S rRNA. Aktivitas spesifik kitinase tertinggi isolat KAHN 15.12 sebesar 52.03 U/mg pada jam ke-36 inkubasi dan SAHA 12.12 sebesar 45.67 U/mg pada jam ke-24 inkubasi. Pemekatan kedua isolat dilakukan dengan menggunakan amonium sulfat (b/v). Aktivitas kitinase hasil pengendapan memiliki aktivitas yang lebih tinggi dari kitinase ekstrak kasar. Hasil pemekatan menunjukkan bahwa kitinase KAHN 15.12 mengendap pada konsentrasi 40% dengan kemurnian enzimnya meningkat sebesar 1.92 kali dibandingkan aktivitas enzim kasarnya dengan perolehan sebesar 1.47 %. Isolat SAHA 12.12 mengendap pada konsentrasi 60% dan kemurnian enzim sebesar 3.14 kali dengan perolehan sebesar 1.47 %. Kitinase KAHN 15.12 hasil pengendapan memiliki aktivitas optimum pada pH 7 dan pada suhu 60 oC. Kitinase SAHA 12.12 hasil pengendapan memiliki aktivitas optimum pada pH 8 dan pada suhu 40 oC. Kitinase ini stabil pada suhu optimum selama 180 menit. Hasil pemisahan protein dengan SDSPAGE menunjukkan bahwa bobot molekul dari hasil pengendapan SAHA 12.12 ialah 109.13, 75.99, 61.79, 52.91, dan 43.03 kDa. Analisis zimogram menunjukkan satu protein yang memiliki aktivitas kitinase dengan bobot molekul sebesar 52.91 kDa. Enzim hasil pengendapan SAHA 12.12 memiliki 2 pita dengan bobot molekul 80.02 dan 68.51 kDa. Kedua bobot molekul tersebut memiliki aktivitas kitinase. Hasil uji penghambatan secara in vitro terhadap C. capsici menunjukkan bahwa enzim ekstrak kasar dan hasil pengendapan kedua isolat memiliki efektivitas penghambatan terhadap C. capsici. Hasil tersebut mengindikasikan bahwa kitinase isolat tersebut dapat digunakan sebagai agens biokontrol untuk pengendalian antraknosa pada cabai.
Keyword: Bakteri kitinolitik, Biokontrol, Colletotrichum capsici, Kitinase

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: