Judul: Tipologi komunitas Teripang di Perairan Pantai Belebu, Lampung Selatan
Abstrak: Pada penelitian ini, penetapan stasiun didasarkan pada pengamatan secara visual terhadap homogenitas area Pantai Belebu. Sehingga didapatkan 4 stasiun, dimana masing-masing stasiun terbagi atas 3 substasiun, yaitu daerah tepi pantai, tengah dan tubir. Pengambilan sampel teripang dilakukan pada setiap transek kuadrat dalam suatu belt transek yang berukuran 3mx50m. Identifikasi teripang dilakukan dengan merujuk pada buku Identifikasi Clark and Rowe tahun 1971. Dari hasil pengambilan contoh teripang di Pantai Belebu, didapatkan 7 spesies teripang, yaitu Holothuria atra, H. impatiens, H. persivax, Bohadschia marmorata, Stichopus variegatus, S. horrens dan Synapta maculata. Tiga spesies yang paling sering ditemukan adalah B. marmorata, H. atra dan Synapta maculata. Hasil analisa substrat menunjukkan bahwa rata-rata nilainya adalah 93.09% pasir, 2.74% debu dan 0.03 % liat, Arus 4.067 cm/detik dan kekeruhan 0.79 NTU. Kepadatan teripang tertinggi terdapat pada substasiun II.2 dan IV.2 sebesar 0.0533 ind/m².
Keyword: 

Judul: Struktur komunitas teripang (Holothuroidea) di perairan pantai Pulau Pramuka dan Pulau Tikus, Kepulauan Seribu, Jakarta
Abstrak: Penelitian dilakukan di perairan pantai Pulau Pramuka dan Pulau Tikus, Kepulauan Seribu pada bulan April sampai Juni 2001. Survei pendahuluan dilakukan untuk menentukan stasiun pengamatan dan kondisi umum lokasi pada awal bulan April 2001. Tujuan penelitian ini diantaranya adalah untuk mempelajari struktur komunitas teripang terutama jenis, kepadatan, keanekaragaman, keseragaman, dominansi dan pola penyebaran, juga untuk mengetahui kemiripan komunitas dan asosiasi antar spesies teripang di perairan pantai Pulau Pramuka dan Pulau Tikus. Dari hasil penelitian ini diharapkan dapat digunakan sebagai tambahan informasi dalam rangka pengelolaan sumberdaya teripang di Indonesia, khususnya di Pulau Pramuka dan Pulau Tikus, Kepulauan Seribu. Metode penelitian yang digunakan dalam pengambilan data teripang adalah dengan metode sensus yang menggunakan transek berukuran 10x10 m² dalam luasan tiap stasiun 20x50 m². Data teripang hanya dikumpulkan dan dihitung untuk teripang yang terlihat saja.
Keyword: 

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA