Judul: Hubungan formasi geologi dengan bahan induk dan kelompok tanahnya di daerah gunung walat, sukabumi
Abstrak: Suatu formasi geologi selain dapat menjelaskan waktu juga menjelaskan jenis batuan atau bahan induk tanah. Meskipun demikian, tanah yang terbentuk di atas suatu formasi geologi belum tentu berasal dari batuan atau bahan induk yang terdapat pada formasi geologi tersebut. Oleh karena adanya berbagai proses geologik yang relatif baru memungkinkan terjadinya penutupan suatu formasi geologi oleh bahan-bahan yang lebih muda, sehingga tanah yang mungkin terbentuk cenderung mempunyai susunan mineral yang berbeda dengan formasi geologi tersebut. Di daerah penelitian terdapat tiga formasi geom. logi yaitu formasi Kuarter Volkanik Pangrango Tua (Qvpo), formasi Tersier Oligosen Napal (Tomc), dan formasi Tersier Oligosen Walat (Tow). Formasi Qvpo terdiri dari lahar dan lava basal andesit, labradorit, olivin, hiperstin, dan hornblenda; formasi Tomc terdiri dari napal tufaan globigerina, lempung napal- Jan, batu pasir tufaan, dan lensa-lensa batu gamping; formasi Tow terutama terdiri dari batu pasir kuarsa, yang berlapis silang konglomerat kerikil kuarsa, lempung karbonan, lignit, dan lapisan-lapisan arang tipis (Musper dalam Effendi, 1974). Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari hu- bungan ketiga formasi geologi di daerah penelitian dengan bahan induk dan kelompok tanahnya. Penelitian ini dilaksanakan di daerah gunung Walat, Sukabumi. Peralatan yang digunakan untuk menunjang penelitian ini adalah peta topografi, peta geologi, peralatan lapang serta bahan dan peralatan laboratorium untuk menganalisa sifat kimia, fisik, dan mineral tanah. Profil tanah dibuat berdasarkan pena- rikan kesimpulan dari hasil pemboran dan perbedaan formasi geologinya. Pengamatan tanah melalui pemboran dilakukan dengan sistem Grid. Pengamatan sifat- sifat morfologi tanah di lapang dan pengambilan contoh tanah dilakukan berdasarkan pedoman yang dikemu- kakan dalam Pedoman Pengamatan Tanah di Lapang (Staf Pemetaan Lembaga Penelitian Tanah, 1969). Jenis bahan induk ditentukan berdasarkan cara Mohr dan van Baren (1960) dan klasifikasi tanah yang digunakan adalah Sistem Taksonomi Tanah (Soil Survey Staff, 1975)…dst
Keyword: 

Judul: Karakteristik dan Klasifikasi Tanah pada Formasi Geologi Qvb, Kompleks Volkan Tua Bayah Sukabumi
Abstrak: Jawa Barat merupakan salah satu provinsi yang terkenal dengan aktivitas vulkaniknya. Provinsi ini memiliki sabuk pegunungan di bagian selatan yang salah satunya dikenal sebagai Zona Bogor dengan kompleks volkan tua Bayah di dalamnya. Lokasi penelitian berada pada formasi breksi gunung berapi (Qvb) yang dikelilingi oleh beberapa formasi geologi dan jenis tanah yang beragam. Di Indonesia, penelitian mengenai tanah yang berasal dari bahan induk volkan sangatlah beragam namun penelitian mengenai karakteristik maupun klasifikasi tanah di formasi geologi Qvb kompleks volkan tua Bayah masih sangat terbatas. Penelitian ini bertujuan untuk meneliti karakteristik tanah secara morfologi, fisik, kimia, dan mineralogi serta menetapkan klasifikasi tanahnya berdasarkan Sistem Taksonomi Tanah. Penelitian dilakukan dengan pengambilan contoh tanah dari dua buah singkapan tanah setebal ±170 cm di Desa Gunung Endut (singkapan tanah Qvb 1) dan setebal ±240 cm di Desa Berekah (singkapan tanah Qvb 2), Kabupaten Sukabumi. Pada saat pengambilan sampel tanah dilakukan identifikasi lapang morfologi tanah dan dilanjutkan dengan analisis fisik berupa bobot isi dan tekstur, analisis kimia berupa pH H2O, pH NaF, C-Organik, Kapasitas tukar kation, Kejenuhan basa, Al dan H dapat ditukar, Si, Al, Fe ekstraksi asam oksalat, analisis mineral tanah fraksi pasir total dan fraksi berat, serta menetapkan klasifikasi tanah berdasarkan Soil Taxonomy USDA 2014. Hasil penelitian menunjukkan bahwa rata-rata bobot isi tanah pada singkapan Qvb 1 sebesar 0.86 g/cm3 dan pada singkapan Qvb 2 sebesar 0.89 g/cm3. Secara morfologi dan mineralogi tanah pada singkapan Qvb 2 lebih berkembang dibandingkan tanah pada Qvb 1, hal ini ditunjukkan dengan adanya horison B dan jumlah mineral mudah lapuk yang sedikit. pH H2O kedua tanah tergolong masam dengan rentang 4.31 - 5.31, pH NaF dengan rentang 8.5 – 11 mengindikasikan adanya mineral non kristalin dalam tanah. Kadar C-Organik tanah 0.3-1.79% tergolong rendah, KTK tanah 6.88-15.17 me/100 g tergolong rendah, kejenuhan basa 15.23-48.80% tergolong rendah sampai sedang dan kejenuhan Al 6.93-30.82 % masuk dalam kategori tinggi. Nilai Fe, Al, Si dengan ekstraksi ammonium oksalat dari kedua sampel tanah tergolong rendah, sehingga tidak dapat memenuhi kriteria sifat andik tanah. Hasil analisis mineral fraksi pasir menunjukkan bahwa kedua tanah berasal dari bahan induk volkan yang bersifat andesitik dengan asosiasi mineral hipersten. Berdasarkan sistem Soil Taxonomy USDA 2014 kedua singkapan tanah memiliki epipedon umbrik dengan horison penciri bawah kambik dan diklasifikasikan Humic Dystrudept, amorfik, isohipertermik dan Humic Dystrudept, campuran, isohipertermik.
Keyword: Andesitik, Bahan Volkan, Humic Dystrudept, Isohipertermik, Kompleks Volkan Tua Bayah, Qvb

Judul: Kloning dan Ekspresi Human Interferon-alfa2a pada Yeast Metilotropik Pichia pastoris
Abstrak: Interferon (IFN) is a group of proteins that are secreted by body cells as a result of exposure to biological vertebrates such as: viruses, bacteria, protozoa and other compounds. There are three types of interferon, namely: alpha (α), beta (β) and gamma (γ) IFN. Interferon-α2a belongs to the type I interferon. This protein has a molecular weight of 21.550 kDa and consists of 188 amino acids (23 amino acid of signal peptide and 166 amino acids of mature protein). Interferon-α2a is also known to be used for the treatment of hepatitis C and as anti-tumor and antivirus agents. Regulator gene for IFN production under normal conditions, is in the off position to IFN is not produced. But when there are external stimuli, both viral and bacterial infections, a regulator gene switches on, and IFN production system running. At the time of an attack from a variety of disease agents actually the body will produce IFN, but generally the amount produced is not sufficient to fight the disease agents that multiply very quickly. Therefore IFN intake from outside is needed. This is the beginning of the use of IFN as a drug. Genetic engineering is an activity to manipulate the genes to get new products by creating recombinant DNA through gene insertion. Recombinant DNA technology has been used to produce IFN. Yeast such as Pichia pastoris can be an alternative as the host (system) to express human interferon genes and as a producer of IFN protein. Expression system P. pastoris offers several advantages for the production of recombinant proteins, such as: the high level expression of recombinant proteins, ease of scaling-up fermenter, low cost and ease of transformation techniques and selection of transformed cells such as bacteria . The existence of inducible AOX1 promoter is very strong, easily control the expression of recombinant proteins by induction. AOX1 is a promoter that controls gene expression of alcohol oxidase to metabolize methanol as carbon source of P. pastoris. Therefore,this study aimed to clone human interefron-α2a (hifnα2a) gene in E. coli and express it in metylotrophic yeast P. pastoris. Vector used in this study is pPICZαB (Invitrogen). Ligation process between insert (hifn-α2a gene) and vector (pPICZαB) performed by using T4 DNA ligase, which functions synthesize the formation of phosphodiester bonds linking the nucleotides with nucleotide insert plasmid vectors to produce recombinant (pPICZαB-hifnα2a). This recombinant plasmid transformed into XL1 blue cells (E. coli) by Heat shock method. The results of sequencing analysis (clone 6) using 5'AOX and 3'AOX primers indicate that DNA base sequence of human IFN-α2a genes has been subclone into pPICZαB vector (in frame). Recombinant plasmid (clone 6) linearized using BstX1 enzyme before transformed into X33 yeast cell. Transformation into cell was done by Electroporation. The X33 cell P. pastoris strain was used to express human interferon-α2a. X33 is strains with the phenotype Mut+ (methanol utilization plus) and can be used for positive transformants selection using zeocin. Phase protein production work using Mut+ strain occurred in two phases. The first phase is the use of glycerol to obtain a certain amount of biomass (high cell
Keyword: