Judul: Karakterisasi Molekuler Defisiensi Enzim Glukosa-6-Fosfat Dehidrogenase di Kabupaten Sumba Tengah Nusa Tenggara Timur, Indonesia
Abstrak: Glucose-6-phosphate dehydrogenase deficiency is an X-linked recessive hereditary disease characterized by abnormally low levels of glucose-6-phosphate dehydrogenase (G6PD), the rate limiting enzyme in the pentose phosphate pathway that is important in red blood cell metabolism and the most common human enzyme defect. This research was aim to characterize and model the most common G6PD variants in Central Sumba’s people in order to help Indonesian goverment to design malaria treatment. Methodologies employed included nested PCR, gel electrophoresis purification, primer walking sequencing, and sequence alignment using BLAST. The most common G6PD variant were Vanua lava changing Leu to Pro at position 128 and Viangchan with Val changed to Met at position 291. From Pymol viewer software, substitution in Vanua Lava variant from 128Leu to 128Pro cause the instability of the helices while Viangchan substitution location was in tetrameric interface.
Keyword: Central Sumba district, G6PD deficiency, G6PD Variants, Molecular Characterization

Judul: Asosiasi Polimorfisme Gen KCNJ11 dan ABCC8 dengan Diabetes Mellitus Tipe 2 pada Populasi Masyarakat Bali
Abstrak: Diabetes mellitus Tipe 2 (DMT2) merupakan penyakit yang disebabkan oleh banyak faktor. Kombinasi faktor genetik, kurangnya aktivitas fisik dan asupan nutrisi yang berlebih merupakan penyebab utama timbulnya penyakit ini. Single Nucleotide Polymorphisms (SNP) seperti SNP E23K pada gen KCNJ11 dan SNP A1369S pada gen ABCC8 diketahui dapat meningkatkan resiko DMT2. Kedua gen tersebut memiliki fungsi yang komplementer dalam membentuk KATP channel yang berperan penting dalam mekanisme sekresi insulin. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis prevalensi penyakit DMT2 di Bali dan asosiasinya dengan keberadaan SNP E23K dan A1369S. Analisis terhadap 184 sampel dari empat desa di Bali (Nusa Ceningan, Legian, Penglipuran dan Pedawa) dilakukan dengan metode potong lintang (cross sectional), kemudian sampel dipilih dengan mencocokkan jenis kelamin dan usianya (matched). Analisis asosiasi antara konsentrasi gula darah puasa (Fasting Plasma Glucose; FPG), letak geografis dan genetik telah dilakukan. Metode yang digunakan untuk mendeteksi keberadaan SNP adalah Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphisms (PCR-RFLP). Prevalensi DMT2 pada total populasi terpilih di Bali adalah 4,3%, sedangkan prevalensi hiperglikemia sedang adalah 10,9%. Berdasarkan tingginya prevalensi hiperglikemia sedang, dapat diperkirakan bahwa prevalensi DMT2 di Bali akan meningkat dua kali lipat dalam kurun waktu 10-15 tahun mendatang. Prevalensi hiperglikemia sedang berasosiasi dengan kelompok usia 51-65 tahun dengan frekuensi 25% (p=0,007). Prevalensi DMT2 tidak berasosiasi dengan jenis kelamin (p=0,607). Walaupun tidak signifikan, populasi yang terletak di daerah pesisir pantai (Nusa Ceningan dan Legian) cenderung memiliki konsentrasi FPG yang relatif lebih beragam (96,0±29,4 mg/dL) dibandingkan populasi yang terletak di dataran tinggi (Penglipuran dan Pedawa)(98,2±13,8 mg/dL). Pada penelitian ini, nilai MAF SNP E23K (26,3%) mirip dengan MAF SNP A1369S (26,9%). Polimorfisme E23K dan A1369S beserta kombinasi haplotipe yang terbentuk dari kedua SNPs tersebut tidak menunjukkan asosiasi yang signifikan dengan DMT2 pada populasi total yang dianalisis.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: