Judul: Isolasi, Karakterisasi, dan Ekspresi Kemokin sebagai Penanda Genetik Penyakit Asma pada Hewan Model Macaca fascicularis.
Abstrak: Asma merupakan penyakit poligenik yang ditandai dengan penyumbatan saluran pernafasan yang disebabkan oleh inflamasi. Banyak mediator seluler yang terlibat dalam proses patogenesis asma, salah satunya kemokin yang berfungsi untuk migrasi dan aktivasi leukosit selama inflamasi. Gen pengode kemokin C-C Motif Ligan 7 (CCL7) dan CCL2 diketahui memiliki tingkat ekspresi mRNA yang tinggi pada monyet ekor panjang (MEP) yang mengalami reaksi asma. Monyet ekor panjang asal Indonesia pada penelitian ini telah dikembangkan sebagai hewan model asma dan terdapat variasi dalam respon hipersensitifitas terhadap alergen asma. Berdasarkan respon hipersensitifitas terhadap alergen pencetus asma MEP dibagi ke dalam dua kelompok, yaitu high responder dan low responder. Kelompok high responder merupakan kelompok MEP asma yang memerlukan dosis alergen rendah untuk langsung berespon asma, sebaliknya kelompok low responder memerlukan dosis alergen yang tinggi untuk dapat berespon asma. Penelitian ini difokuskan untuk mencari potensi penanda genetik dengan analisis nukleotida tunggal pada gen CCL7 MEP yang dapat memisahkan kelompok high responder dan low responder. Isolasi dan karakterisasi gen CCL7 telah berhasil dilakukan pada penelitian ini sebagai tahap awal untuk melakukan analisis variasi nukleotida tunggal dan hubungannya dengan tingkat keparahan serta potensi terapi pada MEP asma. Daerah gen pengkode protein CCL7 telah berhasil diisolasi dan dideposit pada genbank dengan kode akses MF062250. Kemiripan yang tinggi antara gen CCL7 MEP dan manusia menunjukkan bahwa MEP berpotensi untuk menggambarkan peran CCL7 dalam asma. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa variasi nukleotida tunggal pada daerah promotor gen CCL7 MEP pada posisi -456 -/A berpotensi menjadi penanda genetik yang dapat membedakan MEP asma berdasarkan tingkat hipersensitifitas terhadap alergen pencetus asma. Evaluasi ekspresi gen CCL7 dan reseptornya pada cairan Broncoalveolar Lavage (BAL) dilakukan dengan teknik RealTime Polymerase Chain Reaction (PCR). Gen CCL7, CCR1, dan CCR3 pada kelompok high responder menunjukkan tren ekspresi yang lebih rendah daripada kelompok low responder. Evaluasi ekspresi gen juga dilakukan terhadap gen CCL2 dan reseptornya CCR2. Hasil menunjukkan bahwa ekspresi gen CCL2 dan CCR2 pada kelompok high responder lebih rendah daripada kelompok low responder. Variasi nukleotida tunggal promotor gen CCL7 pada MEP berhubungan dengan derajat hipersensitifitas kulit terhadap paparan alergen pencetus reaksi asma. Hal ini diduga berpengaruh terhadap regulasi gen pengkode salah satu reseptor CCL7 yaitu CCR2 dan kemokin lain yaitu CCL2. Hasil studi menunjukkan potensi area promotor gen CCL7 sebagai penanda genetik untuk seleksi MEP sebagai hewan model asma berdasarkan tingkat responsifitas terhadap alergen, yakni high responder dan low responder.
Keyword: Asma, CCL7, CCL2, Monyet ekor panjang, penanda genetik

Judul: Karakterisasi Gen C-C Ligan 7 (CCL7) sebagai Penanda Genetik Asma pada Beruk (Macaca nemestrina).
Abstrak: Satwa primata yang telah banyak dikembangkan sebagai hewan model asma adalah Macaca fascicularis. Spesies primata lain juga memiliki potensi untuk dapat dikembangkan sebagai hewan model asma, salah satunya adalah beruk (Macaca nemestrina). Gen CCL7 berpotensi sebagai penanda genetik asma karena mampu mensekresikan kemokin yang berperan dalam proses asma. Tujuan penelitian ini adalah mengkarakterisasi struktur gen CCL7 pada M. nemestrina, membandingkan struktur gen CCL7 M. nemestrina dengan primata lain, serta prediksi struktur tiga dimensi protein CCL7. Gen CCL7 M. nemestrina diamplifikasi menggunakan 5 pasang primer forward dan reverse. Amplikon ditentukan runutan basanya dengan teknik sekuensing. Sekuen nukleotida dan asam amino dianalisis secara bioinformatika. Prediksi struktur tiga dimensi protein CCL7 dilakukan menggunakan program I-TASSER dan divisualisasi dengan program PyMOL. Panjang sekuen gen CCL7 M. nemestrina yang didapat sebesar 2221 pb dan panjang asam amino sebesar 109 asam amino. Variasi nukleotida gen CCL7 pada M. nemestrina dengan M. fascicularis, M. mulata dan H. sapiens terdapat pada daerah ekson 1, ekson 2 dan ekson 3 sebagai daerah CDS (Coding DNA Sequence). Analisis homologi menunjukkan bahwa urutan nukleotida dan asam amino gen CCL7 M. nemestrina homolog dengan tiga spesies primata lain dengan nilai identity lebih dari 90%. Analisis perbandingan daerah CDS menunjukkan bahwa M. nemestrina memiliki kemiripan tinggi dengan tiga spesies primata lain dengan nilai identity lebih dari 90%. Hasil prediksi struktur tiga dimensi protein CCL7 M. nemestrina memiliki kemiripan tinggi dengan H. sapiens dengan nilai identity sebesar 95%. Gen CCL7 M. nemestrina secara molekuler mirip dengan H. sapiens, sehingga M. nemestrina berpotensi untuk digunakan sebagai hewan model asma.
Keyword: asma, gen CCL7, M. nemestrina, struktur tiga dimensi protein CCL7

Judul: Development of IPB Linux Open Source Distribution for Business (ILOSbiz)
Abstrak: The objective of this research is to develop a Linux distribution, ILOSbiz, targeted for office use. This distribution is built through remastering another established distribution, similar to the previously developed ILOS in 2008. In order to know the needed applications to include in ILOSbiz, a survey was conducted involving 15 IPB staffs. We experimented with OpenSUSE and PCLinuxOS using KIWI Image System and My LiveCD to remaster, respectively. PCLinuxOS with My LiveCD was chosen for the final ILOSbiz as it gave better flexibility in the remastering. Comparison with ILOS shows that ILOSbiz has better hardware support.
Keyword: