Judul: Analisis Topologi Interaksi Protein-Protein untuk Identifikasi Protein Signifikan Terkait dengan Diabetes Mellitus.
Abstrak: Pendekatan komputasi merupakan salah satu solusi untuk mengatasi masalah efisiensi pada proses penemuan obat. Pada penelitian ini, studi kasus dilakukan pada penyakit diabetes mellitus. Identifikasi protein signifikan dilakukan dengan membangun jaringan protein-protein interaction (PPI) dengan menganalisis bentuk topologinya. Hasil pengukuran menggunakan overall centrality menghasilkan suatu protein signifikan yang mempertimbangkan karakteristik pada semua pengukuran centrality dengan kombinasi linear yang optimal. Hasil dari analisis topologi terhadap PPI menunjukkan bahwa dari 83 kandidat protein penyakit diabetes mellitus, insulin (INS) adalah pusat network protein dengan nilai overall centrality tertinggi. Adapun protein lainnya yang memiliki nilai centrality tinggi memiliki hubungan dekat dengan INS adalah AKT1, INSR, KCNJ11, PPARG, TCF7L2, FOXO1, SOCS3, dan IRS1. Berdasarkan evaluasi uji ketahanan dengan 145 test network yang terdiri atas 9 protein tersebut menunjukkan bahwa INS menjadi pusat netwok dengan akurasi sebesar 60.26%.
Keyword: diabetes mellitus, protein-protein interaction (PPI) network, protein signifikan

Judul: Analisis Interaksi Antar Protein Menggunakan KDominant Skyline untuk Identifikasi Protein Signifikan Terkait Diabetes Mellitus
Abstrak: Diabetes Mellitus merupakan salah satu penyakit yang disebabkan oleh gangguan fungsional protein. Protein dalam tubuh manusia saling berinteraksi satu sama lain dan membentuk kompleks protein, dan kompleks protein akan saling berhubungan dan membentuk modul fungsional. Protein signifikan merupakan protein yang penting untuk merumuskan formula suatu obat. Interaksi antar protein dapat digambarkan dalam bentuk topologi dan dapat digunakan untuk mencari protein signifikan dengan menghitung centrality measures. Penelitian ini bertujuan untuk menerapkan metode k-dominant skyline dalam pencarian protein signifikan terkait Diabetes Mellitus. Metode k-dominant skyline merupakan salah satu metode skyline yang dapat digunakan untuk menganalisis data yang memiliki banyak dimensi untuk mencari data dominan yang lebih penting. Penelitian ini menghasilkan 16 protein signifikan terkait Diabetes Mellitus yaitu protein INS, MTFMT, AKT1, TP53, CAPN10, RFX6, STAT3, PPARG, HK2, APOA1, DCK, SPTBN4, P4HB, TF, JAK2, dan PTPN11, dan terdapat 14 protein yang di konfirmasi memiliki keterkaitan dengan Diabetes Mellitus dengan menggunakan studi literatur. Protein INS merupakan protein sentral dan protein yang sangat berpengaruh terhadap penyakit Diabetes Mellitus.
Keyword: Diabetes Mellitus, k-dominant skyline, protein signifikan

Judul: Mud Crab’s (Scylla serrata Forskal 1775) Response to Different Decaying Level of Gold Snail (Pomacea canaliculata Lamarck 1822) Bait.
Abstrak: Mud crab is well known as omnivorous-vigorous-voracious-opportunistic-scavenger. These intertidal animals applies mainly chemoreception in their predatory behaviour. It has been commonly assumed that non fresh gold snail bait is better than fresh bait in stimulating the mud crab. This research's aim is to analyze mud crab response to different decaying level of gold snail bait. Their response were observed as time required to touch the bait and pattern and direction of the mud crab in approaching the baits. The different decaying level of gold snail baits were shown on Total Volatile Base Nitrogen (TVBN) as 16.3 mg/100g (0 day); 534.1 mg/100g (3 days); and 887.4 mg/100g (6 days). The research was conducted from July 2009 until February 2011. The TVBN test for gold snail baits were conducted at Laboratory of BBPPHP Jakarta. The experiment was conducted in Pemalang. The result showed that the average period of mud crabs to touch the baits were 52.14 minutes; 61.57 minutes and 52.57 minutes. Anova test concluded no sufficient evidence of significant effect of TVBN content of gold snail bait on mud crab’s feeding behaviour. Movement pattern B, i.e. left and right deviation followed by straight forward movement to the bait, was commonly exhibited by the crabs. Consequences of time period required by the mud crab to approach the bait on fishing operation is discussed.
Keyword: