Judul: Identifikasi Molekuler Gen Cytochrome Oxidase Subunit I (COI) Lobster Genus Panulirus di Yogyakarta: sebagai Dasar Pengelolaan Sumberdaya.
Abstrak: Panulirus homarus (lobster pasir) dan Panulirus penicillatus (lobster batu) adalah jenis dari crustase laut yang termasuk dalam genus Panulirus Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi lobster genus Panulirus berdasarkan marka genetik Cytochrome Oxidase Subunit I (COI) yang dapat membantu pengungkapan terjadinya fenomena spesies kriptik sebagai informasi dasar dalam pengelolaan sumberdaya yang akurat. Tahap isolasi dan ekstraksi DNA menghasilkan dua DNA total yang baik untuk diamplifikasi dengan PCR hingga tahap sekuensing gen COI. Gen COI P. homarus dan P. penicillatus disejajarkan dengan beberapa gen COI spesies lain, yaitu genus Palinurus sebagai outgroup yang didapatkan dari GenBank hingga menghasilkan pohon filogeni dan membuktikan perbedaan yang jelas antara genus Panulirus dengan genus Palinurus. Panulirus homarus and Panulirus penicillatus memiliki perbedaan yang signifikan dari spesies Palinurus. Kedua spesies tersebut berbeda secara signifikan berdasarkan gen COI.
Keyword: Panulirus homarus, Panulirus penicillatus, gen COI, identifikasi molekuler

Judul: Karakteristik Gen Cytochrome Oxidase Subunit I (COI) Lobster Panulirus spp. di Perairan Malang, Jawa Timur
Abstrak: Lobster atau udang karang merupakan salah satu anggota kelompok Crustacea yang memiliki nilai ekonomis penting. Lobster merupakan komoditas perikanan yang memberikan konstribusi ekonomi lebih tinggi (88,3%) jika dibandingkan dengan ikan (11,7%). Penelitian ini bertujuan untuk melakukan validasi terhadap lobster Panulirus dan menganalisis hubungan kekerabatan antar spesies berdasarkan teknik DNA barcoding. Sebanyak 7 sampel lobster Panulirus berasal dari Malang yang digunakan adalah spesimen koleksi yang telah diawetkan dalam alkohol. Analisis perbedaan runutan basa nukleotida pada ruas gen COI dibandingkan dengan database pada situs NCBI. Ketiga spesies contoh P. homarus, P. penicillatus, dan P. versicolor dari Malang memiliki nilai persentase kemiripan lebih dari 96% dengan P. homarus, P. penicillatus, dan P. versicolor dari GenBank. Hasil rekonstruksi pohon filogeni menunjukkan bahwa ketiga spesies lobster tersebut memiliki hubungan kekerabatan yang dekat dengan nilai keragaman nukleotida sebesar 0,1860 (18,6%).
Keyword: Panulirus spp, DNA barcoding, COI gene, validation

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: