Judul: Molecular and Physiological Studies of Gonadal Maturation and Spawning of Indonesian Leaffish (Pristolepis grootii, Bleeker 1852)
Abstrak: Ikan sepatung (Pristolepis grootii) salah satu jenis ikan endemik Indonesia yang potensial dibudidayakan. Ikan ini disukai masyarakat dan bernilai ekonomi. Ikan ini mampu bertahan hidup di perairan dengan keasaman dan oksigen terlarut rendah, mudah beradaptasi dalam lingkungan budidaya serta dapat menerima pakan buatan. Ikan ini dimanfaatkan sebagai lauk pauk, dan juga ikan hias. Produksi ikan sepatung masih mengandalkan hasil tangkapan dari alam liar. Peningkatan aktivitas penangkapan dan kerusakan habitat menyebabkan penurunan populasi ikan sepatung di alam. Indikasinya adalah sulitnya nelayan mendapatkan ikan sepatung dalam jumlah banyak. Jika penurunan populasi ikan sepatung berlangsung terus-menerus, maka dapat menyebabkan punahnya spesies ini. Oleh karena itu, sebelum ikan ini punah, perlu dilakukan usaha pembudidayaannya. Sebagai langkah awal dalam usaha budidaya ikan liar seperti spesies ini, perlu dilakukan domestikasi/penjinakan di dalam wadah budidaya. Ikan yang baru didomestikasi di lingkungan budidaya biasanya mengalami gangguan fisiologi reproduksi. Hal ini disebabkan perbedaan kondisi lingkungan budidaya dengan alam liar habitatnya. Tujuan umum penelitian ini adalah mendomestikasi ikan sepatung, sedangkan tujuan khusus adalah (1) menganalisis karakter gen penyandi hormon gonadotropin ikan sepatung, (2) mengaji pematangan gonad ikan sepatung yang diinjeksi hormon luteinizing hormone-releasing hormone analogue (LH-RHa), dan (3) mengaji pemijahan ikan sepatung yang diinduksi dengan salmon gonadotropin releasing hormone analogue dan domperidone (sGnRHa+D). Penelitian ini terdiri atas tiga topik. Penelitian pertama dilakukan untuk mengkarakterisasi gen gonadotropin ikan sepatung. Kelenjar hipofisa ikan sepatung diambil, lalu dilakukan ekstraksi total RNA menggunakan GENEzolTM Reagent, cDNA disintesis dan diamplifikasi dengan metode RT-PCR selanjutnya dikloning, dan disekuensing. Penelitian kedua dilakukan untuk memacu pematangan gonad dan menginduksi ekspresi gen gonadotropin. Ikan betina diinjeksi secara intramuskular dengan LH-RHa dosis berbeda (0, 1, 10, dan 50 µg/kg bobot ikan), Penelitian ketiga, ikan betina dan jantan diinjeksi sGnRHa+D dosis 0,5 ml/kg bobot ikan. Telur dan sperma dikeluarkan dengan metode stripping. Fertilisasi dilakukan secara eksternal. Setelah fertilisasi, telur diinkubasi dalam akuarium sampai menetas, dan larva dipelihara sampai umur 3 hari setelah menetas. Hasil penelitian pertama berupa informasi karakteristik gen gonadotropin; follicle-stimulating hormone subunit-β (FSH-β) dan luteinizing hormone subunit-β (LH-β) ikan sepatung. Panjang sekuens parsial gen FSH-β ikan sepatung yang berhasil diisolasi adalah 279 bp, menyandikan 93 residu asam amino termasuk 2 residu prolin dan 8 sistein, serta 2 situs N-glikosilasi. Situs N-glikosilasi teridentifikasi pada urutan asam amino ke 25-27 (NIS: asparagin, isoleusin, serin), dan situs kedua pada urutan asam amino ke 77-79 (YTT: tirosin, treonin, treonin). Panjang sekuens parsial gen LH-β ikan sepatung yang berhasil diisolasi adalah 300 bp, menyandikan 100 residu asam amino termasuk 7 residu sistein, dan 1 situs N-glikosilasi. Situs N-glikosilasi pada LH-β teridentifikasi pada urutan asam amino ke 44-46 (NCT: asparagine, sistein, treonin). FSH-β ikan sepatung menunjukkan kemiripan tertinggi (91%) dengan ikan betok (Anabas testudineus), sedangkan LH-β dengan ikan cupang (Betta splendens) (90%). N-glikosilasi bersifat konservatif bagi FSH-β dan LH-β. Analisis filogenetik FSH-β ikan sepatung menunjukkan kesamaan tertinggi dengan ikan betok (A. testudineus) (nilai bootstrap 81%), sedangkan LH-β dengan ikan cupang (B. splendens) (nilai bootstrap 91%). Pada penelitian kedua, hasil yang diperoleh menunjukkan bahwa injeksi LH-RHa mampu memacu perkembangan dan pematangan gonad, serta menginduksi ekspresi gen FSH-β dan LH-β ikan sepatung, dengan dosis LH-RHa terbaik yakni 50 µg/kg
Keyword: domestikasi,  gonadotropin, endemik, induksi secara hormonal, ikan sepatung, pembenihan ikan

Judul: Identifikasi Follicle-Stimulating Hormone dan Luteinizing Hormone Subunit-β pada Perkembangan Gonad Ikan Gurami Osphronemus goramy Betina
Abstrak: Ikan gurami Osphronemus goramy merupakan komoditas nasional budidaya air tawar yang tersebar di Jawa, Sumatera dan Kalimantan. Produksi budidaya ikan gurami memiliki permasalahan ketergantungan pada pemijahan alami yang mengandalkan sinyal lingkungan dan lambatnya maturasi pertama. Intervensi teknologi rekayasa reproduksi pada ikan gurami dapat dilakukan dengan menggunakan protein rekombinan follicle-stimulating hormone (FSH) dan luteinizing hormone (LH). Secara umum FSH dan LH terdiri dari subunit  yang bersifat umum, dan subunit ꞵ bersifat spesifik mencirikan spesies tertentu, kedua subunit tersebut berasal dari sekuen gen yang berbeda. Informasi sekuen dan ekspresi FSH dan LH subunit-β (OgFSHβ dan OgLHβ) pada ikan gurami penting diketahui untuk membuat protein rekombinan FSH dan LH. Namun, saat ini belum ada laporan mengenai sekuens gen dan analisis ekspresi OgFSHβ dan OgLHβ. Selain informasi sekuens gen, informasi terkait ekspresi gen OgFSHβ dan OgLHβ dalam kaitannya dengan perkembangan gonad ikan gurami, penting untuk diketahui dan dievaluasi. Respons molekuler ekspresi OgFSHβ dan OgLHβ pascainduksi hormon dapat digunakan untuk mengevaluasi efektivitas induksi hormon dalam merangsang pemijahan. Sehingga tujuan dari penelitian ini untuk mengidentifikasi sekuen OgFSHβ dan OgLHβ serta menganalisis ekspresi kedua gen tersebut pada berbagai ukuran bobot ikan gurami serta keterkaitannya dengan perkembangan gonad ikan gurami. Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Agustus 2019 hingga Januari 2020 di Laboratorium Reproduksi dan Genetika Organisme Akuatik, Departemen BDP, FPIK, IPB. Identifikasi gen dilakukan dengan metode polymerase chain reaction (PCR), dilanjutkan dengan kloning gen dan sekuensing. Identifikasi dilakukan secara bertahap diawali dengan identifikasi awal sekuen OgFSHꞵ dan OgLHꞵ. Selanjutnya, dilakukan identifikasi pada bagian 3’-UTR dan 5’-UTR. Pembacaan sekuen hasil identifikasi awal, 3’-UTR dan 5’UTR dirangkai menjadi satu untuk mendapatkan sekuen OgFSHβ dan OgLHβ secara utuh. Tahap penelitian selanjutnya dilakukan pengamatan perkembangan gonad pada calon induk ikan gurami betina dengan bobot tubuh 750 g, 1000 g, dan 1500 g. Parameter uji yang dievaluasi pada tahap ini adalah nilai gonadosomatic index (GSI), hepatosomatic index (HSI) dan pengamatan histologi gonad, serta analisis ekspresi gen OgFSHβ dan OgLHβ pada setiap ukuran bobot tubuh. Analisis ekspresi gen OgFSHꞵ dan OgLHꞵ juga dilakukan untuk mengevaluasi respon molekuler pasca induksi hormon menggunakan LHRH-a dengan dosis 0.75 mL kg-1 bobot tubuh dan 0.75 ml kg-1 larutan fisiologis NaCl 0.9% sebagai kontrol, melalui penyuntikan secara intramuskular. Analisis ekspresi gen OgFSHꞵ dan OgLHꞵ dilakukan dengan mengukur ekspresi messenger ribonucleic acid (mRNA) menggunakan metode real-time quantitative PCR (qPCR). iii Penelitian ini telah berhasil mengidentifikasi urutan lengkap gen OgFSHꞵ dan OgLHꞵ yang masing-masing memiliki 126 dan 142 residu asam amino. Berdasarkan sekuens asam amino yang ditranslasikan dari kedua sekuens tersebut, OgFSHβ memiliki similaritas paling tinggi dengan kelompok ikan Anabantoid (85-94,17%) diikuti oleh Synbranchiformes (71,15%), dan Pleuronectoformes (70,87%). Pada gen OgLHβ diketahui memiliki similaritas paling tinggi pada kelompok ikan Anabantoid (84-85,8%), diikuti oleh Cypriniformes (76,92%), dan ikan Beloniformes (75,76%). Struktur protein OgFSHꞵ memiliki kemiripan dengan struktur FSHꞵ organisme lain, sedangkan struktur protein OgLHꞵ memiliki kemiripan dengan bentuk struktur LHβ Trichogaster tricopterus yang juga merupakan kelompok taksa Anabantoidei yang sama dengan ikan gurami. Tingkat ekspresi mRNA OgFSHβ pada tahap mid-vitelogenesis (kelompok bobot 1000 g) meningkat 3.2 kali dari tahap previtelogenesis (kelompok bobot 750 g). Tingkat ekspresi mRNA OgFSHβ pada tahap maturasi (kelompok bobot
Keyword: identifikasi gen, ikan gurami, LHBeta, perkembangan gonad., FSHBeta

Judul: Tinjauan Matematis pada Model Makroskopik dan Mikroskopik Arus Lalu-lintas
Abstrak: Traffic flow phenomenon can be described through mathematical model such as continuous dynamic model with an ordinary differential equation so that it can be solved with integral factors. In this paper three simple models of traffic flow are discussed, i.e, two macroscopic and one microscopic models. Macroscopic model formulates dynamics of the traffic flow that occurs on a large number of vehicles on a road. While the microscopic model explains drivers’ behavior in their interaction with other vehicles ahead, i.e, car-following model. This paper shows the existence of ordinary differential equation found in the traffic flow model and indicates some different representations in the context of the same model. It also reviews a simple model of traffic flow along a single link, which leads to some unexpected results, i.e, it can express the solution model in term of link outflows as well as trip time. In the microscopic model, simulation is done to illustrate the behavior of the drivers with a sensitivity coefficient as a benchmark parameter.
Keyword: