Judul: Verifikasi cacing Lumbricus rubellus Hoffmeister, 1843 dan Pheretima sp. di peternakan berdasarkan morfologi dan barcode DNA menggunakan gen cytochrome oxidase I
Abstrak: Usaha domestikasi dan budidaya cacing tanah telah memberikan keuntungan yang cukup tinggi sehingga budidaya cacing tanah marak dilakukan. Pembudidayaan dilakukan oleh banyak peternak tanpa ada validasi taksonomi spesies cacing yang dibiakkan. Penelitian dilakukan terhadap cacing yang disebut Lumbricus rubellus pada peternakan Pengalengan dan Pheretima sp. di peternakan Kampus IPB Dramaga. Cacing diidentifikasi kembali berdasarkan karakter morfologi dan gen COI dengan mengekstraksi DNA mitokondria. Hasil verifikasi morfologi menunjukkan bahwa cacing yang disebut sebagai L. rubellus pada peternakan Pengalengan adalah Eisenia andrei sedangkan yang disebut Pheretima sp. pada peternakan Kampus IPB adalah Eudrilus eugeniae. Hasil BLAST dan penyejajaran sekuen DNA Gen COI parsial menegaskan hasil identifikasi morfologi. Berdasarkan data nukleotida COI parsial didapatkan bahwa Eisenia andrei dari Pengalengan memiliki jarak genetik 0,0% terhadap Ei. andrei dan 23,4% terhadap L. rubellus pada GenBank. Eu. eugeniae dari Peternakan IPB memiliki jarak genetik 0,3% dengan Eu. eugeniae yang berada di BOLD System.
Keyword: Cultured, Eisenia andrei, Eudrilus eugeniae, identification

Judul: Verification of Lumbricus rubellus Hoffmeister, 1843 and Pheretima sp. in Worm Farm Based on Morphology and Cytochrome Oxidase I Gene DNA Barcode
Abstrak: Usaha domestikasi dan budidaya cacing tanah telah memberikan keuntungan yang cukup tinggi sehingga budidaya cacing tanah marak dilakukan. Pembudidayaan dilakukan oleh banyak peternak tanpa ada validasi taksonomi spesies cacing yang dibiakkan. Penelitian dilakukan terhadap cacing yang disebut Lumbricus rubellus pada peternakan Pengalengan dan Pheretima sp. di peternakan Kampus IPB Dramaga. Cacing diidentifikasi kembali berdasarkan karakter morfologi dan gen COI dengan mengekstraksi DNA mitokondria. Hasil verifikasi morfologi menunjukkan bahwa cacing yang disebut sebagai L. rubellus pada peternakan Pengalengan adalah Eisenia andrei sedangkan yang disebut Pheretima sp. pada peternakan Kampus IPB adalah Eudrilus eugeniae. Hasil BLAST dan penyejajaran sekuen DNA Gen COI parsial menegaskan hasil identifikasi morfologi. Berdasarkan data nukleotida COI parsial didapatkan bahwa Eisenia andrei dari Pengalengan memiliki jarak genetik 0,0% terhadap Ei. andrei dan 23,4% terhadap L. rubellus pada GenBank. Eu. eugeniae dari Peternakan IPB memiliki jarak genetik 0,3% dengan Eu. eugeniae yang berada di BOLD System.
Keyword: Bogor Agricultural University, Institut Pertanian Bogor, IPB, Cultured, Eisenia andrei, Eudrilus eugeniae, identification, Oligochaeta

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: