Judul: Seleksi Galur-Galur Gandum (Triticum Aestivum L.) Hasil Persilangan Oasis X Hp1744 Pada Dua Agroekosistem
Abstrak: Gandum (Triticum aestivum L.) merupakan tanaman pangan yang dikonsumsi oleh sebagian besar masyarakat dunia. Kebutuhan gandum di Indonesia cenderung meningkat karena beragamnya produk olahan berbasis tepung terigu yang diminati masyarakat. Kebutuhan gandum Indonesia sepenuhnya masih mengandalkan impor. Hal itu disebabkan karena Indonesia belum dapat memproduksi gandum sendiri. Upaya penanaman gandum di Indonesia terkendala oleh faktor iklim. Gandum berasal dari wilayah subtropis, sedangkan Indonesia merupakan negara tropis sehingga menyebabkan tanaman gandum tercekam suhu tinggi. Upaya penanaman gandum di Indonesia harus didukung oleh ketersediaan varietas gandum yang adaptif dan berdaya hasil tinggi di agroekosistem Indonesia. Perakitan varietas gandum toleran suhu tinggi telah dilakukan sehingga telah diperoleh galur-galur gandum yang siap diuji daya hasil dan kemampuan adaptasinya di agroekosistem Indonesia. Tujuan utama penelitian ini adalah untuk mendapatkan galur-galur gandum adaptif di agroeksosistem dataran tinggi dan dataran menengah Indonesia . Tujuan utama dapat diperoleh dengan cara (1) mempelajari keragaan dan keragaman genetik pada generasi F5 dan F6 galur gandum hasil persilangan Oasis x HP1744, (2) mempelajari hubungan antara karakter agronomi dengan daya hasil galur gandum hasil persilangan Oasis x HP1744, (3) memperoleh informasi tentang pengaruh lingkungan pada galur gandum hasil seleksi shuttle breeding, (4) melakukan seleksi galur harapan gandum hasil persilangan Oasis x HP1744 berdasarkan daya hasil dan toleransi terhadap suhu tinggi. Percobaan untuk menyeleksi galur F5 berdasarkan informasi keragaan dan keragaman genetik generasi F5 dilakukan di Kebun Penelitian Tanaman Hias, Cipanas, Bogor dengan ketinggian ± 1100 m dpl dan suhu rata-rata ± 21 oC pada bulan Juli sampai November 2013. Rancangan percobaan yang digunakan adalah rancangan augmented. Materi genetik yang digunakan adalah 75 galur F5 hasil persilangan Oasis x HP1744 dan 6 varietas pembanding berupa Oasis, HP1744, Selayar, Basribay, Rabe, dan Dewata. Percobaan untuk menyeleksi galur F6 berdasarkan pengaruh lingkungan dan untuk mengetahui hubungan antara karakter agronomi dengan daya hasil galur dilakukan pada bulan April sampai September 2014 di kebun petani Malino dan kebun petani Cisarua. Malino mewakili lokasi optimum karena merupakan dataran tinggi dengan ketinggian ± 1600 m dpl dan suhu rata-rata ± 20 oC. Cisarua mewakili lokasi tercekam suhu tinggi karena merupakan dataran menengah dengan ketinggian ± 600 m dpl dan suhu rata-rata ± 24 oC. Rancangan percobaan yang digunakan adalah augmented. Materi genetik yang digunakan adalah 48 galur F6 hasil persilangan Oasis x HP1744 dan 6 varietas pembanding berupa Oasis, HP1744, Guri 1, Guri 2, Selayar, dan Dewata. Analisis ragam dilakukan dengan perangkat lunak R-Statistik, kemudian pengelompokan ragam dilakukan berdasarkan nilai kuadrat tengah harapan. Analisis korelasi dan sidik lintas digunakan untuk memperoleh informasi hubungan antara karakter agronomi dengan daya hasil. Seleksi F5 dilakukan berdasarkan hasil dan karakter sekunder, sedangkan seleksi F6 dilakukan berdasarkan hasil dan indeks sensitivitas. Hasil penelitian pada generasi F5 menunjukkan bahwa galur-galur yang diuji memperlihatkan keragaman genetik pada karakter jumlah anakan total, jumlah anakan produktif, panjang malai, jumlah spikelet, kerapatan spikelet, persentase floret hampa, laju pengisian biji, jumlah biji malai utama, bobot biji malai utama, jumlah biji per tanaman, dan bobot biji per tanaman. Seleksi dilakukan berdasarkan bobot biji per tanaman dan bobot biji malai utama. Seleksi berdasarkan bobot biji per tanaman dapat meningkatkan nilai tengah bobot biji per
Keyword: analisis korelasi, sidik lintas, augmented, cekaman suhu tinggi, heritabilitas, indeks sensitivitas, seleksi langsung, seleksi tak langsung

Judul: Pendugaan Komponen Ragam Karakter Agronomi Gandum (Triticum aestivum L.) dan Identifikasi Marka Simple Sequence Repeat (SSR) Terpaut Suhu Tinggi Menggunakan Bulk Segregant Analysis (BSA).
Abstrak: Gandum (Triticum aestivum L.) memiliki peran penting dalam ketahanan pangan dunia karena secara global, spesies ini paling banyak dibudidayakan di dunia. Kebutuhan konsumsi gandum di dunia tahun 2009 sampai tahun 2012 terus meningkat. Sampai saat ini, Indonesia masih sangat tergantung dengan impor gandum. Pengembangan Gandum di Indonesia menghadapi masalah karena adanya perbedaan kondisi agroklimat seperti suhu tinggi dan curah hujan. Dengan demikian, perlu dilakukan pengembangan varietas gandum yang toleran terhadap suhu tinggi baik melalui pemuliaan konvensional atau bioteknologi seperti penanda molekuler. Penelitian ini bertujuan untuk (1) memperoleh informasi mengenai keragaman genetik gandum generasi F3 di dataran tinggi dan generasi F4 di dataran menengah berdasarkan karakter agronomi; (2) memperoleh informasi aksi gen yang mengendalikan karakter agronomi di dua generasi gandum hasil persilangan Oasis x HP1744 menggunakan metode shuttle breeding; (3) memperoleh informasi mengenai hubungan antara karakter-karakter agronomi dan kriteria seleksi pada generasi F4 di dataran menengah; (4) mengidentifikasi dan memperoleh genotipe F4 (Oasis x HP1744) yang beradaptasi dengan stres suhu tinggi; (5) memperoleh marka Simple Sequence Repeat (SSR) yang mampu mengidentifikasi genotipe yang toleransi terhadap suhu tinggi menggunakan bulk segregant analysis; (6) mengetahui hubungan genetik dan tingkat keragaman genetik gandum hasil persilangan antara Oasis x HP1744 di dataran menengah menggunakan marka Simple Sequence Repeat (SSR); (7) mengelompokkan genotipe F4 gandum di dataran menengah berdasarkan kekerabatan. Percobaan untuk mengetahui keragaman genetik dan seleksi dari generasi F3 dilakukan di Kebun Percobaan Pusat Penelitian Tanaman Hias, Cipanas, Bogor dengan ketinggian 1100 m di atas permukaan laut dari bulan April sampai Agustus 2012 dengan menggunakan rancangan perbesaran (Augmented Design). Studi mengenai kendali genetik karakter agronomi gandum menggunakan metode Shuttle Breeding dilakukan di dua lokasi, di Kebun Percobaan Pusat Penelitian Tanaman Hias, Cipanas Bogor pada bulan April 2012 sampai Agustus 2012 dan di dataran menengah di lahan pertanian di Cisarua, Bogor dengan ketinggian 600 m di atas permukaan laut pada bulan Februari sampai Mei 2013. Rancangan penelitian yang digunakan adalah rancangan Augmented. Percobaan untuk keragaman genetik dari generasi F4 dilakukan di dataran menengah di Cisarua, Bogor dengan ketinggian ± 600 m di atas permukaan laut pada bulan Februari sampai Mei 2013. Karakter agronomi dianalisis menggunakan sidik lintas dan seleksi dilakukan untuk genotipe toleran terhadap suhu tinggi. Seleksi marka SSR terpaut suhu tinggi menggunakan bulk segregant analysis dilakukan di Laboratorium Biologi Molekuler, Departemen Agronomi dan Hortikultura, Institut Pertanian Bogor (IPB) dan di Laboratorium Biologi Molekuler, Balai Penelitian Tanaman Serealia, Maros, Sulawesi Selatan pada bulan Juli 2013 sampai Maret 2014. Hasil penelitian untuk generasi F3 menunjukkan bahwa 6 karakter agronomi yang memiliki keragaman genetik yang tinggi adalah karakter kehijauan daun bendera, jumlah anakan total, persentase floret hampa per malai, jumlah biji malai utama, bobot biji malai utama, jumlah biji per malai, bobot biji per malai, jumlah biji per tanaman dan bobot biji per tanaman. Generasi F3 yang terpilih adalah O/HP 21, O/HP 93, O/HP 82, O/HP 6, O/HP 93, O/HP 104, O/HP 22, O/HP 37, O/HP 115, dan O/HP 30, yang digunakan untuk pemilihan pada generasi F4 di lingkungan cekaman suhu tinggi. Karakter agronomi dari generasi F3 yang dikendalikan oleh banyak gen (poligenik), yaitu karakter jumlah anakan total dan jumlah
Keyword: analisis lintas, bulk segregant analysis, diferensial seleksi, index seleksi, jarak genetik, kemiripan genetik, kendali genetik, keragaman genetik, seleksi langsung, seleksi tidak langsung

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: