Judul: Potential Inhibition of Phyllosphere Bacteria from Cabbage (Brassica oleracea var. capitata) towards Black Rot Disease (Xanthomonas campestris pv. campestris).
Abstrak: Busuk hitam yang disebabkan oleh Xanthomonas campestris pv. campestris merupakan salah satu penyakit penting pada tanaman kubis (Brassica oleracea var. capitata). Serangan busuk hitam pada tanaman kubis di lapangan dapat menyebabkan gagal panen karena dapat menyerang bagian krop yang bernilai ekonomi tinggi hingga 61%. Agens hayati seperti bakteri filosfer telah dilaporkan dapat menghambat pertumbuhan bakteri patogen tanaman. Bakteri filosfer merupakan jenis bakteri yang umumnya ditemukan di permukaan bagian tanaman terutama bagian daun. Penelitian ini bertujuan memperoleh bakteri filosfer asal tanaman kubis yang berpotensi menghambat pertumbuhan penyakit busuk hitam. Bakteri filosfer diisolasi dari pertanaman kubis di Cianjur, Bogor, dan Tegal sedangkan bakteri patogen busuk hitam diisolasi dari pertanaman kubis di Cianjur. Bakteri filosfer dan patogen busuk hitam yang berhasil diisolasi kemudian diremajakan untuk digunakan pada uji selanjutnya yaitu uji hipersensitifitas, uji hemolisis, uji antagonisme secara in vitro, uji antagonisme secara in vivo, dan diidentifikasi menggunakan teknik Polymerase Chain Reaction. Hasil uji antagonisme secara in vitro menunjukkan 6 isolat (dari total 187 isolat) mampu menghasilkan zona hambatan terhadap Xanthomonas campestris pv. campestris. Keenam isolat tersebut juga memiliki kemampuan yang berbeda-beda dalam menghambat keparahan penyakit busuk hitam secara in vivo serta memiliki kemampuan dalam memacu pertumbuhan bibit tanaman kubis. Daya hambatan tertinggi sebesar 62.83% dan keparahan penyakit terendah sebesar 33.90% dihasilkan oleh isolat CA27. Isolat CA27 juga mampu meningkatkan tinggi tanaman hingga 4.18 cm, panjang akar hingga 2.63 cm, serta jumlah daun hingga 2.12 dan nyata lebih tinggi dibandingkan dengan kontrol pada fase pembibitan. Berdasarkan uji Gram dengan larutan KOH 3%, isolat CA27 teridentifikasi sebagai bakteri Gram negatif. Identifikasi lengkap bakteri filosfer sebagai agens biokontrol secara molekuler tidak dilakukan karena adanya pandemi Covid-19.
Keyword: biological control agents, Gram negative bacteria, Integrated Pest Management, PGPR

Judul: Character Diversity of Black Rot Bacterial Strains (Xanthomonas campestris pv. campestris) on Cabbage to Mixture of Active Inggredients Azoxystrobin and Difenokonazole
Abstrak: Salah satu penyakit pada kubis yang ditemukan pada daun yaitu penyakit busuk hitam (black rot) yang disebabkan oleh bakteri Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcc). Gejala khas penyakit black rot pada kubis yaitu adanya lesio kuning yang berbentuk V. Gejala ini dimulai dari tepi daun yang berwarna kuning kemudian klorosis menuju vena tengah daun dan akhirnya menghitam tulang daunnya. Bakteri Xcc dapat menginfeksi kubis pada masa persemaian dengan gejala awal berupa lesio nekrotik dengan titik-titik berwarna hitam pada tepi daun. Pengendalian penyakit busuk hitam di lapangan oleh petani sering menggunakan fungisida yang memiliki spektrum sebagai bakterisida. Fungisida yang spektrum kerjanya tidak spesifik dapat memberikan pengaruh terhadap populasi dari mikroorganisme sekitarnya. Salah satu bahan aktif fungisida yang sering aplikasikan pada tanaman sayuran di daerah Cipanas yaitu campuran azoksistrobin dan difenokonazol. Azoksistrobin telah dilaporkan dapat menghambat pertumbuhan bakteri organotrofik, Actinomycetes, dan cendawan. Penelitian terkait dampak penggunaan campuran bahan aktif azoksistrobin dan difenokonazol terhadap mikroorganisme lain terutama bakteri X. campestris pv. campestris pada kubis belum ada yang melaporkan. Oleh karena itu penelitian ini bertujuan mendapatkan data keanekaragaman secara genetik isolat bakteri X. campestris pv. campestris, mendapatkan data keanekaragaman secara fenotipik isolat bakteri X. campestris pv. campestris, dan mendapatkan data respon resistensi isolat bakteri X. campestris pv. campestris terhadap campuran bahan aktif azoksistrobin dan difenokonazol. Penelitian ini terdiri 5 tahap yaitu pengambilan sampel daun bergejala, isolasi dan seleksi isolat bakteri X. campestris pv. campestris, identifikasi secara molekuler menggunakan primer spesifik dan universal, pengujian isolat bakteri X. campestris pv. campestris dengan campuran bahan aktif azoksistrobin dan difenokonazol, dan uji produksi senyawa eksopolisakarida. Sampel kubis diambil dari lahan di daerah Cianjur, Jawa Barat. Isolat yang berhasil diisolasi kemudian diuji sifat Gram, hipersensitivitas, patogenesitas, dan hidrolisis pati. Identifikasi molekuker dilakukan menggunakan primer spesifik BE1 & BE2 dan primer universal 16S rRNA. Hasil sekuensing kemudian dianalisis keanekaragaman secara genetik menggunakan 5 enzim restriksi secara in silico. Pengujian dilakukan pada bahan aktif azoksistrobin dan difenokonazol. Konsentrasi bahan aktif yang digunakan yaitu 1/4X, 1/2X, 3/4X, X (konsentrasi anjuran), 3/2X, dan 2X. Hasil isolasi bakteri Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcc) didapatkan sebanyak 70 isolat. Hasil isolasi tersebut terdiri dari isolat CHR sebanyak 8 isolat, isolat CLT sebanyak 9 isolat, isolat CDA sebanyak 17 isolat, dan isolat SDA sebanyak 36 isolat. Hasil seleksi isolat dilakukan berdasarkan uji Starch hydrolysis, uji hipersensitivitas, dan uji patogenesitas menunjukkan ada 15 isolat bakteri yang bersifat positif. Hasil analisis PCR menunjukkan terdapat 5 isolat bakteri yaitu CLT01, CDA08, SDA02, SDA22, dan SDA26 X. campestris pv. campestris. Isolat bakteri X.campestris pv. campestris bersifat Gram negatif, patogen terhadap tanaman, dan hidrolisis positif pada media yang mengandung pati. Bakteri X. campestris pv. campestris pada media YDCA memiliki koloni berwarna kuning, mengkilap, elevasi cembung, mucoid (berlendir), dan tepian licin. Hasil sekuensing menggunakan primer universal 16S rRNA dihasilkan bahwa kelima isolat terkonfirmasi sebagai X. campestris pv. campestris dengan kemiripan berkisar 98-100%. Analisis keanekaragaman menggunakan teknik RFLP in silico menunjukkan bahwa kelima isolat bakteri X. campestris pv. campestris memiliki keanekaragaman secara genetik. Pada pengujian dengan bahan aktif, dihasilkan nilai IC50 paling tinggi adalah isolat SDA22, sedangkan nilai paling rendah adalah isolat CDA08. Rata-rata berat eksopolisakarida yang
Keyword: eksopolisakarida, enzim restriksi, RFLP in silico, exopolisacaride, RFLP in silico, restriction enzymes

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: