Judul: Prediction of Potential Herbal Compounds for Obesity Treatment Using Random Forest
Abstrak: Obesitas dapat menyebabkan berbagai efek negatif untuk kesehatan, termasuk dapat menimbulkan penyakit lain. Penemuan obat baru secara konvensional memerlukan biaya yang besar dan waktu yang lama. Pada penelitian ini akan dibangun model drug-target interaction menggunakan Random Forest untuk menemukan kandidat senyawa herbal sebagai obat obesitas. Permasalahan yang terjadi pada saat pra proses data adalah adanya data tidak seimbang. Pada penelitian ini akan digunakan metode SMOTE untuk mengatasi data tidak seimbang. Hasil penelitian ini menunjukan bahwa model DTI menggunakan Random Forest dapat memprediksi dengan baik. Kinerja terbaik diperoleh dengan menggunakan deskriptor AAC dan pubchem fingerprint yaitu akurasi sebesar 98.05%, precision 97.67%, recall 98.42%, F-measure 98.05% dan AUROC 98.05%. Selanjutnya prediksi model terbaik terhadap data senyawa herbal menghasilkan 270 senyawa herbal yang memiliki potensi untuk penanganan obesitas.
Keyword: Obesity, Drug-Target Interaction, SMOTE, Random Forest

Judul: Identification Pharmacodynamic Interactions of Active Compounds of Diabetes Mellitus Type 2 Herbal Plants Using the Random Forest Method
Abstrak: Interaksi obat-obat didefinisikan sebagai modifikasi efek suatu obat sebagai akibat dari obat lain yang diberikan secara bersamaan atau dengan selang waktu atau bila dua atau lebih obat berinteraksi sehingga keefektifan atau toksisitas suatu obat atau lebih berubah. Interaksi farmakodinamik merupakan salah satu jenis interaksi yang perlu mendapat perhatian khusus karena interaksi ini bekerja secara langsung pada sistem fisiologis tubuh dan bersaing pada reseptor yang sama sehingga dapat bersifat antagonis, aditif, atau sinergis. Oleh karena itu, identifikasi interaksi farmakodinamik perlu dilakukan untuk kemudian dapat diketahui apakah dua obat yang berinteraksi akan berdampak semakin baik atau justru menghambat proses penyembuhan. Konsumsi obat-obatan untuk proses penyembuhan suatu penyakit dalam jangka waktu yang lama akan menyebabkan efek samping yang terakumulasi dan dapat merugikan kesehatan. Untuk mengantisipasi hal ini, penggunaaan tanaman obat menjadi suatu alternatif karena selain efek sampingnya yang relatif lebih aman, tanaman obat yang mengandung senyawa aktif cocok untuk mengobati penyakit metabolik degeneratif yang dipicu oleh mutasi pada banyak gen. Seperti halnya interaksi obat-obat, interaksi senyawa aktif dalam tanaman obat juga dapat menyebabkan terjadinya interaksi farmodinamik. Oleh karena itu, perlu juga dilakukan identifikasi interaksi senyawa aktif sehingga selanjutnya dapat diketahui apakah interaksi senyawa tersebut akan menguntungkan atau merugikan kesehatan. Selanjutnya, ide pendekatan komputasi menggunakan informasi keterhubungan protein target, kesamaan efek samping, dan kesamaan struktur senyawa dilakukan untuk dapat mengidentifikasi interaksi senyawa aktif secara lebih cepat dan efisien dibandingkan dengan metode eksperimental. Pada penelitian ini, identifikasi farmakodinamik diterapkan pada senyawa tanaman obat Diabetes Melitus Tipe 2 yaitu pare (Momordica charantia), sembung (Blumea balsamifera), bratawali (Tinospora crispa), dan jahe (Zingiber officinale) dengan menggunakan peubah penjelas Target Protein Connectedness (TPC), Side Effect Similarity (SES), dan Chemical Similarities (CS) menggunakan metode klasifikasi Random Forest. Pembuatan model klasifikasi dilakukan dengan menggunakan data obat yang berinteraksi farmakodinamik dan tidak berinteraksi pada pangkalan data DrugBank dengan informasi ketiga peubah penjelas TPC, SES dan CS. Berbagai tahapan dilakukan untuk meningkatkan nilai kebaikan model diantaranya melakukan interaksi pada peubah penjelas, penanganan data imbalance, normalisasi data, dan tuning parameter. Dari pencarian di berbagai pangkalan data, diperoleh 21 senyawa aktif dari tanaman jamu Diabetes Melitus Tipe 2 yaitu Quercetin, Benzoic acid, Lycopene, beta- Carotene, Zeaxanthin, Chlorogenic acid, beta-Sitosterol, Squalene, Lutein, Rutin, Melatonin, Eucalyptol, Camphor, Geraniol, Ascorbic acid, Genistein, Curcumin, Linalool, Methylglyoxal, Propyl alcohol, dan Glafenine. Kemudian dari 21 senyawa ini, hanya 100 interaksi senyawa yang dapat dihitung peubah penjelas TPC, SES, dan CS yang kemudian diterapkan pada model klasifikasi Random Forest. Dengan nilai akurasi dan AUC 0,963, terdapat 93 pasang senyawa yang berinteraksi secara farmakodinamik dan 7 sisanya tidak berinteraksi., Drug-drug interactions are defined as modification of the effects of a drug as a result of another drug taken together or with an interval or when two or more drugs interact, which alters the effectiveness or toxicity of one or more drugs. Pharmacodynamic interactions are one type of interaction that needs special attention because these interactions work directly on the body's physiological systems and compete on the same receptors so they can be antagonistic, additive, or synergistic. Therefore, identification of pharmacodynamic interactions needs to be done to then be able to know whether the two drugs
Keyword: interaksi farmakodinamik, chemical similarities, random forest, side effect similarity, target protein connectedness

Judul: Beberapa aspek biologi reproduksi pada buaya
Abstrak: Tulisan ini bertujuan untuk mengetahui hubungan biolo- gi reproduksi buaya seperti organ reproduksi, saa, dewasa kelamin, tingkah laku kelamin, masa bersarang dan penetasan telur dalam hubungannya dengan pelestarian satwa ini. Buaya termasuk amniota yang bersifat carnivora. Ter- dapat sisik epidermal sepanjang tubuhnya. Mempunyai lam- aung pengunyan yang mirip gizzard Letapi tidak mempunyai vesica urinaria. Kaki depan terdiri dari 5 jari, kaki be- lakang terdiri dari 4 jari dan ada cakar sejati. Organ reproduksi buaya jantan terdiri dari testes, epi- didymis, ductus deferens dan penis. Organ reproduksi buaya betina terdiri dari ovarium, oviduct, uterus dan klitoris. Penis dan klitoris berada di ruang kloaka yang paling luar. Oviduct dan uterus mempunyai kelenjar penghasil albumin dan kerabang untuk melapisi sel telur sebelum telur dikeluarkan. Mempunyai dua macam gonadotropin, yaitu FSH dan LH. Dewasa kelamin dicapai pada umur ± 2,5 tahun dimana panjang tubuh maksimum belum tercapai. Buaya mengeluarkan suara yang khas dan bau yang merangsang pasangannya sepan- jang musim kawin. Telur buaya berkerabang keras, berwarna putih atau putih kekuningan dengan bercak-bercak coklat kemerahan. Ukur- annya bervariasi dengan panjang 6,1 - 9,9 cm, lebar 4,2 - 5,7 cm, volume 90 -105 ml dan beratnya 66 - 140 gram. Ada dua macam bentuk sarang yaitu berbentuk gundukan dengan ceruk berbentuk V di atasnya (Crocodylus porosus dan C. novaeguineae) dan berbentuk lubang (C. siamensis dan C. palustris). Masa bersarang untuk sarang berbentuk gundukan adalah pada waktu musim kering dan yang berbentuk lu- bang pada awal musim hujan. Masa pengeraman pada spesies C. porosus 40 - 90 hari, C. novaeguineae 77 - 83 hari, C. palustris C.. siamensis 40. - 60 hari dan tidak ada catatan pada spesies Pada C. porosus dan C. palustris ada kebiasaan induk dalam menjaga sarangnya selama pengeraman, anak bersuara di dalam telur sehingga merupakan panggilan kepada induknya untuk membantu membuka sarang untuk merangsang penetasan te- lur dan membebaskan anaknya dari dalam sarang. Dua spesies lainnya tidak mempunyai sifat semacam ini….
Keyword: