Judul: Modul Incremental Sequential Pattern Mining untuk Data Titik Panas Pulau Sumatra.
Abstrak: Indikator kebakaran hutan dapat diketahui berdasarkan titik panas pada suatu wilayah. Informasi dari data titik panas tersebut dapat digunakan dalam pengambilan keputusan atau kebijakan yang tepat untuk penanganan dan pencegahan kebakaran hutan. Penelitian ini bertujuan untuk membuat modul sequential pattern mining yang mampu menangani adanya penambahan data baru sehingga dapat menghasilkan pola sekuensial setelah penambahan data tersebut. Algoritme tersebut dikembangkan dengan menggunakan perangkat lunak R dan menggunakan framework Shiny. Penelitian ini menggunakan algoritme SPADE dalam menentukan pola sekuensial pada data titik panas dengan adanya penambahan data baru. Data yang dianalisis yaitu data titik panas Pulau Sumatra pada tahun 2014. Penambahan modul untuk menangani penambahan data baru telah berhasil dilakukan dalam menghasilkan pola sekuensial yang baru. Adanya penambahan data baru mempengaruhi support dari sekuens dan dapat menghasilkan sekuens yang baru. Algoritme SPADE diterapkan pada data lama titik panas Sumatra 2014 menghasilkan 30 sekuens yang memenuhi minimum support 0.01 dari 7158 data titik panas. Penambahan 3859 data titik panas baru menghasilkan total 31 sekuens.
Keyword: framework shiny, titik panas, sequential pattern mining, SPADE

Judul: Aplikasi Sequential Pattern Mining pada Data Titik Panas di Lahan Gambut Sumatra dan Kalimantan.
Abstrak: Salah satu bentuk penanggulangan terhadap bencana kebakaran hutan dan lahan adalah melakukan pemantauan titik panas menggunakan data pola sekuens. Data pola sekuens titik panas dapat diperoleh menggunakan teknik data mining. Penelitian sebelumnya telah membangun aplikasi visualisasi pola sekuens titik panas menggunakan framework Shiny, namun aplikasi tersebut hanya dapat membangkitkan data pola sekuens secara manual. Tujuan dari penelitian ini adalah membangun modul sequential pattern mining menggunakan framework Shiny dan mengintegrasikan modul sequential pattern mining dengan aplikasi visualisasi sekuens titik panas yang dihasilkan dari hasil penelitian sebelumnya. Data yang digunakan adalah data titik panas pada lahan gambut Sumatra dan Kalimantan tahun 2014 dan 2015. Penelitian ini menggunakan metode sequential pattern mining dan menerapkan algoritme SPADE. Pola sekuens yang dihasilkan dengan menggunakan minimum support 0.01 dan rentang antara 2 hingga 5 hari berjumlah 71 sekuens di Sumatra dan 9 sekuens di Kalimantan. Aplikasi ini memiliki dua modul utama yaitu modul SPADE dan modul visualisasi. Penelitian ini bermanfaat untuk menganalisis pola sekuens serta mendapatkan visualisasi sebaran pola sekuens melalui peta gambut di pulau Sumatra dan Kalimantan.
Keyword: R, sequential pattern mining, Shiny, SPADE, titik panas

Judul: Heterologous Expression Of Endo-Β-Xylanase From Bacillus Pumilus Strain Bcrs-01 In Escherichia Coli.
Abstrak: Xylanases are glycoside hydrolase family 11 which depolymerise xylan in the plant cell wall, the most excessive form of hemicellulose. Endo-β-xylanases (EC 3.2.1.8) are most important to breakdown β-1,4-glicoside bond of xylan to produce disaccaride xyloolygosaccaride (XOs) and xylose (monomer). Bovine rumen fluids have potential to obtain endo-β-xylanase produced of bacteria. The objectives of this study were to obtain xylanase producing bacteria and to express xynA gene encoding endo-β-xylanase from bacterium in Escherichia coli. Twenty nine isolate bacteria have been succesfully isolated from bovine rumen fluid in agar medium containing birchwood xylan. Isolate BCRS-01 bacterium was previously screened for the high production of xylanase. Based on 16S rRNA gene sequence analysis, BCRS-01 showed high similarity (99%) to Bacillus pumilus (accession number NR043241). The crude xylanase had optimal activity at 55oC, pH 7.0. Furthermore, the crude xylanase exhibited broad pH stability from 4.0 to 10.0 and remained more than 60% and 40% of its activity after incubation at pH 4.0 until 10.0, respectively for 60 min. It also showed a stability at temperature 25-50oC since it retained 80% and 50% of its activity when incubated at 50oC or 30 and 60 min, respectively. The xylanase activity was strongly inhibited by Ca2+ and Cu2+ at concentration 10 mM, and as little as 1 mM for Mn2+. Therefore, this xylanase has potentially used as additive feeds in animal feed industry. The DNA sequence xynA gene encoded endo-β-xylanase was amplified and cloned into the expression vector pET-15by under the control of T7 promoter. The recombinant protein had succesfully expressed in Escherichia coli BL21 (DE3) pLysS. A protein recombinant of approximately, 26.7 kDa was observed on the SDS-PAGE analysis. Crude extract of recombinant endo-β-xylanase demonstrated activity of enzyme at 56 U mL-1 using birchwood xylan as a substrate at 55oC for 10 min.
Keyword: Bacillus pumilus, bovine rumen fluid, endo-β-xylanase, heterologous expression.