Judul: Authentication of the Utilization of Alopias pelagicus and Alopias superciliosus Species in Processed Fish Products with High Resolution Melting (HRM)-qPCR Method
Abstrak: Hiu dan pari dimanfaatkan sebagai bahan baku produk olahan hasil perikanan dapat menyebabkan berkurangnya populasi hiu yang kini rentan terhadap kepunahan. Saat ini hiu yang diperdagangkan berupa sirip, daging ikan asin dan rebus, olahan ikan hiu, minyak ikan dan sebagai pengganti pakan ternak yang sulit diidentifikasi dan autentikasi secara morfologi apakah boleh diperdagangkan atau tidak, sehingga perlu menggunakan metode molekuler yaitu DNA barcoding. Autentikasi spesies pada produk hiu dengan pendekatan molekuler perlu dilakukan untuk menelusuri pemanfaatan spesies yang terancam punah dalam produk hiu, baik segar maupun olahan untuk membantu menegakkan kebijakan yang telah dibuat dan ditetapkan. Salah satu metode DNA barcoding yang saat ini sedang dikembangkan adalah metode kombinasi High Resolution Melting (HRM)qPCR. Metode kombinasi High Resolution Melting (HRM)-qPCR dapat meningkatkan spesifisitas dengan biaya yang lebih rendah karena tidak ada analisis tambahan setelah proses PCR seperti elektroforesis gel. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengautentikasi spesies Alopias pelagicus dan Alopias superciliosus pada produk olahan sate ikan asap dan hiu dengan primer spesifik spesies yang telah dirancang untuk berbagai lokasi menggunakan metode kombinasi HRM-qPCR. Metode penelitian terdiri dari pengambilan sampel, desain primer, isolasi DNA, amplifikasi PCR, dan Real-time PCR HRM dengan marka molekuler NADH2, 12S rRNA dan COI. Spesies target dan non target dapat dibedakan dengan sebaran garis pada kurva leleh dan nilai Tm. Nilai Tm Sampel Alopias pelagicus dari daerah Aceh dengan marka NADH2 berkisar 77,286,3°C dan NADH2 untuk spesies Alopias superciliosus berkisar 80,5-98,2°C. Nilai Tm Alopias pelagicus dengan marka 12S rRNA berkisar 77,10−86,2 °C dan marka COI untuk Alopias superciliosus berkisar 60,22−73,21°C. Perbedaan nilai Tm disebabkan oleh adanya perbedaan susunan basa nukleotida pada setiap spesies. Primer spesifik Alopias pelagicus dan Alopias superciliosus diperoleh secara in silico dan memberikan akurasi serta dapat diterapkan untuk mengautentikasi produk olahan hiu secara cepat, tepat dan akurat. Hasil aplikasi HRM-qPCR pada produk olahan sate ikan asap dan hiu adalah bukan jenis Alopias pelagicus dan Alopias superciliosus., Sharks as raw material for processed fishery products can lead to a reduction in shark populations that are vulnerable to extinction. Sharks traded in the form of fins, salted and boiled fish meat, processed shark fish, fish oil and as a substitute for animal feed is difficult to identify and morphologically authenticate to trade or not, so it is necessary to use a molecular method, namely DNA barcoding. Species authentication in shark products with a molecular approach needs to be done to trace the use of endangered species in shark products, both fresh and processed to help enforce policies that have been made and established. One of the DNA barcoding methods currently being developed is the High Resolution Melting (HRM)-qPCR combination method. The combination method of HRMqPCR can increase the specificity at a lower cost because there is no additional analysis after the PCR process such as gel electrophoresis. The purpose of this study was to authenticate the species Alopias pelagicus and Alopias superciliosus in processed products of smoked fish and shark satay with species-specific primers that have been designed for various locations using the HRM-qPCR combination method. The research method consisted of sample collection, primer design, DNA isolation, PCR
Keyword: Alopias pelagicus, Alopias superciliosus, autentikasi, hiu, HRM

Judul: Autentikasi Ikan Hiu Dilindungi pada Produk Perikanan dengan Metode qPCR dan Marka Gen NADH Dehydrogenase subunit 2
Abstrak: Hiu merupakan salah satu hasil perikanan yang memiliki nilai ekonomis tinggi. Perdagangan hiu umumnya berupa potongan tubuh, seperti sirip, daging, kulit, dan ekor sehingga dilakukan identifikasi secara molekuler sebagai upaya mengetahui produk hiu yang diperdagangkan. Tujuan penelitian ini mendesain primer spesifik berbasis gen marka NADH2 pada ikan hiu dilindungi (Rhincodon typus, Sphyrna lewini, S. mokarran, S. zygaena, Carcharhinus longimanus, C. falciformis, Alopias pelagicus, A. pelagicus, dan Rhynchobatus australiae) serta aplikasinya dalam autentikasi produk perikanan berbasis qPCR. Tahapan penelitian terdiri dari perancangan primer spesifik, isolasi DNA, pengujian kuantitas isolat DNA, dan identifikasi menggunakan qPCR. Hasil perancangan primer pada sembilan spesies hiu dilindungi berhasil dilakukan. Primer Alopias pelagicus NADH2 dan Carcharhinus falciformis NADH2 hasil rancangan dapat mengamplifikasi DNA target., Sharks are one of the fishery products that have high economic value. Shark trade is generally in the form of body parts, such as fins, meat, skin, and tails so that molecular identification is carried out to identify the shark products being traded. The purpose of this study was to design specific primes based on the NADH2 marker gene. The primer will be used to identify protected sharks species (Rhincodon typus, Sphyrna lewini, S. mokarran, S. zygaena, Carcharhinus longimanus, C. falciformis, Alopias pelagicus, A. pelagicus, and Rhynchobatus australiae) and their application in qPCR-based authentication of fishery products. The research stages consisted of specific primer design, DNA isolation, testing the quantity of DNA isolate, and identification using qPCR. The results of the primer design on nine protected shark species were successfully implemented. Alopias pelagicus NADH2 and Carcharhinus falciformis NADH2 primers were designed to amplify target DNA.
Keyword: Shark, NADH2, primer, qPCR

Judul: Closed Knight’s Tour pada Papan Catur Berbentuk Persegi Panjang dengan Ukuran Maksimal 8 × 8
Abstrak: Closed Knight’s Tour merupakan langkah kuda yang mengunjungi setiap kotak pada papan catur tepat satu kali dengan langkah kuda berawal dan berakhir pada kotak yang sama. Graf yang terbentuk dari closed knight’s tour dinotasikan sebagai graf G(m,n), dengan m adalah banyaknya baris dan n adalah banyaknya kolom. Graf tersebut memuat Hamiltonian cycle. Sebuah graf terhubung G adalah graf bipartite jika dan hanya jika graf tersebut tidak memiliki cycle dengan panjang ganjil. Papan catur yang memenuhi syarat cukup untuk memiliki closed knight’s tour adalah papan catur berukuran 5 × 6, 5 × 8, 6 × 6, 6 × 7, 6 × 8, 7 × 8, dan 8 × 8.
Keyword: bipartite, closed knight’s tour, hamiltonian cycle, knight’s tour, teori graf