Judul: Ocean Health Index in The Bone Bay Between 2008-2019 Based on The Physical Oceanographic Parameters
Abstrak: Teluk Bone menghubungkan wilayah administratif Provinsi Sulawesi Selatan di sisi barat dengan Sulawesi Tenggara di sisi timur teluk. Orientasi teluk yang terbuka kearah Laut Flores di sisi selatan menyebabkan Arus Lintas Indonesia (Arlindo) yang berasal dari Selat Makassar dan sirkulasi permukaan monsun diduga mempengaruhi dinamika Teluk Bone, sehingga teluk ini memiliki karakteristik oseanografi yang unik seperti produktivitas primer tinggi diikuti dengan melimpahnya tangkapan ikan pelagis penting seperti cakalang dan tuna. Pemantauan perubahan kualitas lingkungan laut secara sinambung di wilayah teluk ini perlu dikaji melalui penentuan indeks kesehatan laut (IKL). Tujuan dari penelitian ini adalah mendeskripsikan karakteristik beberapa parameter oseanografi fisik, kecendrungan (trend) parameter oseanografi serta menghitung nilai IKL di wilayah Teluk Bone menggunakan data keluaran model sirkulasi laut 3-dimensi INDESO dan Copernicus dari 2008-2018 (10 tahun). Hasil penelitian menunjukkan karakteristik oseanografi Teluk Bone dicirikan dengan variasi musiman yang kuat, dimana pada periode musim barat suhu dan tinggi muka laut menjadi maksimum (29.93 oC dan 0.7 m), tetapi salinitas minimum (33.23 psu). Sebaliknya, pada periode musim timur, suhu dan tinggi muka laut menjadi minimum (28.44 oC dan 0.6 m) dan salinitas maksimum (33.26 psu). Pertukaran massa air dari dalam teluk dengan luar teluk menunjukkan volume transpor mengalir kearah utara pada musim peralihan II (Oktober) dan pada musim barat (Februari) kearah selatan sebesar 0.030 Sv (1 Sv = 106 m3/s). Tren data deret-waktu (2008-2018) dari parameter oseanografi di Teluk Bone cenderung mengalami penurunan, misalnya parameter SPL (sekitar -0.0028 oC/tahun), salinitas (-0.0012 psu/tahun), dan tinggi muka laut (-0.0236 m/tahun). Perhitungan IKL dengan nilai estimasi SPL sekitar 1.00, salinitas 1.01, dan tinggi muka laut 1.15, diperoleh nilai IKL Teluk Bone tergolong perairan teluk yang masih berstatus baik., The Bone Bay connects the administrative area of South Sulawesi Province on the west side with Southeast Sulawesi on the east side of the bay. The orientation of the bay that opens towards the Flores Sea on the south side causes recirculation of the Indonesian Through Flow (ITF) originating from the Makassar Strait and the monsoon circulation are considered to affect the Bone Bay dynamics. This bay has unique oceanographic characteristics such as high primary productivity followed by abundance of catches of important pelagic fish such as skipjack and tuna. Continuous monitoring of changes in the quality of the marine environment in the bay area needs to be studied through the determination of the ocean health index (OHI). The objective of this study is to describe the characteristics of several physical oceanographic parameters, to estimate the trend of oceanographic parameters and to calculate the OHI value in the Bone Bay using the model output data of the 3-dimensional ocean general circulation model INDESO and Copernicus between 2008-2018 (10 years). The results showed that the oceanographic characteristics of Bone Bay are characterized by strong seasonal variations, where during the northwest monsoon (NWM) period sea surface temperature (SST) and sea surface height (SSH) are maxima, 29.93 oC and 0.7 m, respectively, but the salinity is minimum (33.23 psu). In contrast, during the southeast monsoon (SEM) period SST and SSH 28.44 oC and 0.6 m, respectively, and salinity is maximum (33.26 psu).
Keyword: Oceanography parameters, Bone Bay, Trend value, Ocean Health Index (OHI), Model output dataset

Judul: Pemodelan Sirkulasi Laut dan Analisis Trajektori Larva Ikan di Teluk Bone
Abstrak: Teluk Bone merupakan salah satu kawasan potensial perikanan yang berada dalam Wilayah Pengelolaan Perikanan Negara Republik Indonesia (WPPNRI 713). Dinamika laut-atmosfer skala regional terjadi di sekitar perairan Teluk Bone yang diduga dapat mempengaruhi karakteristik massa airnya secara langsung maupun tidak langsung. Metode pendekatan pemodelan numerik dengan CROCO (Coastal and Regional Ocean Community Model) dapat digunakan untuk studi pola sirkulasi laut dan keluaran hasil model dapat digunakan untuk melihat penyebaran larva ikan menggunakan ichthyop. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk membangun model sirkulasi laut 3-dimensi dengan CROCO, mendeskripsikan pola sirkulasi laut, dan menganalisis persebaran dan transpor larva ikan dengan metode analisis trajektori di Teluk Bone dalam periode 5 tahun (2017 2021). Pada penelitian ini digunakan model CROCO dengan resolusi 1/36º dan model Ichtyop dalam analisis trajektori. Hasil pemodelan 3-dimensi dengan CROCO sesuai dengan hasil observasi dengan satelit, dimana hasilnya menunjukkan nilai suhu, salinitas dan arus laut berfluktuasi kuat secara musiman. Nilai suhu permukaan laut (SPL) di Teluk Bone pada musim barat mencapai nilai maksimum (31°C), tetapi salinitas rendah dan mencapai nilai minimum pada musim Peralihan I. Pada periode musim timur, suhu mencapai nilai miminum (27°C) tetapi salinitas meningkat dan mencapai maksimum pada musim peralihan II. Pada setiap musim di Teluk Bone terbentuk arus pusaran (eddy) di bagian tengah teluk. Pertukaran massa air dari dalam teluk dengan luar teluk secara total menunjukkan nilai volume transport dominan negatif atau massa air keluar teluk (selatan) dengan kisaran nilai rata-rata -0.08 Sv. Analisis trajektori menunjukkan gerakan partikel mengikuti pola arus musiman, dimana partikel bergerak keluar teluk ke arah tenggara menuju Laut Banda dan sebagian partikel masuk ke dalam teluk dan berputar searah jarum jam saat musim barat dan bergerak ke barat menuju Laut Jawa melewati Selat Selayar dan sebagian partikel masuk dan terakumulasi di dalam teluk saat musim timur., Bone Bay is one of the potential fisheries areas within Fisheries Management Area of the Republic of Indonesia (WPPNRI 713). Regional-scale ocean- atmosphere dynamics occur around the waters of Bone Bay which are thought to affect the characteristics of its water masses directly or indirectly. The numerical modeling approach method with CROCO (Coastal and Regional Ocean Community Model) can be used to study ocean circulation patterns and the model output of CROCO results can then be used to see the distribution of fish larvae using ichthyopes. The purpose of this study is to build a 3-dimensional ocean circulation model with CROCO, describe ocean circulation patterns, and analyze the distribution and transport of fish larvae using the trajectory analysis method in Bone Bay over 5 years period (2017-2021). In this study, the CROCO model was used with a resolution of 1/36º and the Ichtyop model for trajectory analysis. The results of 3-dimensional modeling with CROCO are in accordance with the results of observations with satellites, where the results show the temperature, salinity and ocean currents fluctuate strongly seasonally. The value of sea surface temperature (SST) in Bone Bay during the northwest monsoon (NWM) period reaches a maximum value (31°C), but the salinity is low and reaches a minimum value during the first monsoon break. During the southeast monsoon (SEM)
Keyword: Analisis Trajektori, Arus Eddy, Model CROCO, Teluk Bone, Transpor Volume

Judul: Isolasi Konstruksi dan Rekombinasi Gen Pengkode Reverse Transcriptase asal Simian Retrovirus-2 (SRV-2)
Abstrak: The availability of reverse transcriptase enzym as a valuable component for Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) technique has been providing by foreign companies. Therefore, it needs more cost and time to provide it. This study is an early step to produce in house reverse transcriptase rekombinant enzym from SRV-2. The purpose of this study was isolated, constructed, and rekombined SRV-2 reverse transcriptase gene to entry clone and destination vector. Isolation was done by PCR amplification technique using three pairs of primers, which are RT I (3282-3683), RTII (3261-3900), and RTIII (3169-4133). Construction and recombination in this study used Gateway method from Invitrogen. SRV-2 reverse transcriptase gene was isolated in this study with A-549 cell inoculated SRV-2 as source of virus. This gene amplify by PCR technique and resulted specific band for RTI 401 bp, RTII 639 bp, and RTIII 964 bp. Analysis of pENTR/SD/TOPO and pDEST17 indicated SRV-2 reverse transcriptase gene code has already inserted to this plasmid. This result indicated SRV-2 reverse transcriptase gene have isolated, constructed, and recombined to entry clone and destination vector.
Keyword: