Judul: Pemanfaatan teknik RAPD untuk analisis DNA pisang nangka dan barangan (Musa paradisiaca L.) dalam kultur in-vitro
Abstrak: Teknik Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) telah banyak digunakan untuk menganalisis kestabilan genetik berbagai jenis tanaman yang diperbanyak dengan teknik kultur jaringan. Salah satu aspek penentu kualitas bahan tanaman adalah adanya jaminan kestabilan genetiknya. Penelitian ini bertujuan untuk menggunakan teknik RAPD dalam menetapkan kestabilan genetik pisang Nangka dan Barangan yang diperbanyak dengan teknik kultur jaringan. Bahan tanaman yang digunakan adalah pisang Nangka dan Barangan yang diperbanyak dengan teknik kultur jaringan. Pada kedua varietas tersebut dilakukan analisis DNA pada tiap-tiap fase dalam kultur in- vitro yaitu fase sub-kultur, perakaran dan aklimatisasi. Analisis DNA dilakukan menurut metode Orozco- Castillo et al. (1994); Rogers and Bendich (1994) dan Taylor et al. (1993). Amplifikasi DNA dilakukan melalui proses PCR (Polymerase Chain Reaction) yang menggunakan lima primer acak yaitu primer OPH 4 (GGAAGTCGCC); OPH 12 (ACGCGCATGT); OPH 14 (ACCAGGTTGG); OPC 9 (CTGACCGTCC) dan OPC 16 (CACACTCCAG). Amplifikasi DNA terdiri dari tiga tahapan yaitu denaturasi, annealing dan extention yang berulang sampai 45 siklus. Hasil yang diperoleh menunjukkan bahwa teknik RAPD dapat digunakan untuk menetapkan kestabilan genetik (DNA) pisang Nangka dan Barangan yang diperbanyak dengan teknik kultur jaringan. Untuk masing-masing jenis pisang yang diperbanyak dalam kultur in-vitro, ditemukan adanya keseragaman pola frgamen DNA amplifikasi pada tiap-tiap fase pertumbuhan tanaman.
Keyword: 

Judul: Diversity Analysis of Banana (Musa spp.) Based on RAPD and ISSR Molecular Markers
Abstrak: Persilangan kedua tetua pisang, Musa acuminata (AA) dan Musa balbisiana (BB), menghasilkan keragaman tingkat ploidi yang menghasilkan variasi sifat pada setiap kultivar pisang. Analisis keragaman pisang dengan pendekatan morfologi cenderung lebih mudah untuk dilakukan tetapi dapat karakter tersebut dipengaruhi oleh lingkungan. Oleh karena itu, pada penelitian ini perlu dilakukan analisis keragaman pisang menggunakan marka molekular RAPD dan ISSR untuk mendeteksi perbedaan pada tingkat DNA. Metode yang dilakukan yaitu pengamatan morfologi, isolasi DNA kultivar pisang, amplifikasi DNA menggunakan primer RAPD dan ISSR, dan pengolahan data hasil PCR dengan scoring dan software PAST 4. Analisis keragaman genetik menggunakan marka RAPD dan ISSR pada delapan kultivar pisang menghasilkan 164 pita DNA dengan rata-rata persentase pita polimorfik 78.9%. Jarak kekerabatan terjauh dari seluruh kultivar pisang yang dipelajari terdapat pada pisang Lampung yang merupakan satu-satunya sampel bergenom diploid., Crossing the two parental bananas, Musa acuminata (AA) and Musa balbisiana (BB), results in a diversity of ploidy levels that produce variations in traits in each banana cultivar. Analysis of banana diversity with a morphological approach tends to be easier to do, but the environment can influence the character. Therefore, in this study, it is necessary to analyze banana diversity using RAPD and ISSR molecular markers to detect differences at the DNA level. The methods used were Morphological observation, Isolation of banana cultivar DNA, DNA amplification using RAPD and ISSR primers, and data processing of PCR results with scoring and PAST 4 software. Analysis of genetic diversity using RAPD and ISSR markers on eight banana cultivars produced 164 DNA bands with an average percentage of polymorphic bands of 78.9%. The farthest relationship distance of all studied banana cultivars was found in the Lampung banana, the only diploid genome sample.
Keyword: morfologi, PCR, kekerabatan, marka molekuler, polimorfisme

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: