Judul: α-Amylase Inhibitor Gene Expression of Healthy Sengon (Falcataria moluccana Miq) Healthy and Attacked by Boktor Pests
Abstrak: Sengon (Falcataria moluccana Miq) merupakan salah satu pohon pionir dan memiliki berbagai macam kegunaan. Penanaman sengon secara monokultur menimbulkan terjadinya ledakan hama penggerek batang atau boktor (Xystrocera festiva) yang merusak kayu dan menjatuhkan nilai jual batang sengon. Studi molekuler aktivitas gen α-amilase inhibitor (AAI), yang merupakan salah satu gen ketahanan terhadap hama boktor sangat mendukung program pemuliaan sengon. Penelitian ini bertujuan mengkuantifikasi tingkat ekspresi gen α-amilase inhibitor sengon yang sehat dan terserang hama boktor. Prosedur penelitian ini meliputi isolasi RNA total, sintesis cDNA, perancangan primer spesifik gen AAI (target) dan aktin (kontrol), optimasi suhu annealing primer gen AAI dan aktin, ekspresi gen AAI dan aktin pada Real Time PCR dan analisis data. Fragmen cDNA teramplifikasi pada suhu annealing 61,7oC untuk gen aktin dan 61oC untuk gen AAI. Tingkat ekspresi gen AAI 2 pada pohon sengon yang terserang hama boktor memiliki nilai yang lebih tinggi yaitu 55,60 pada sampel 1 dan 6,96 pada sampel 3.
Keyword: Falcataria moluccana, α-Amilase Inhibitor, Real Time PCR

Judul: Optimasi Metode Deteksi dan Ekspresi Gen α-Amilase Inhibitor pada Sengon (Falcataria moluccana Miq.)
Abstrak: Salah satu permasalahan yang sering terjadi di hutan rakyat maupun hutan tanaman sengon (Falcataria moluccana Miq.) dengan pola penanamannya yang cenderung monokultur adalah serangan hama penggerek batang boktor (Xystrocera festiva Pascoe). Langkah awal pengembangan sengon yang tahan terhadap serangan hama boktor dapat dilakukan dengan cara pendeteksian gen ketahanan terhadap hama boktor dan mengetahui aktivitas gen melalui analisis ekspresi gen. Salah satu gen ketahanan hama boktor pada sengon yaitu α-amilase inhibitor. Penelitian ini bertujuan untuk optimasi metode deteksi dan analisis ekspresi gen α-amilase inhibitor pada sengon. Prosedur kerja dalam penelitian ini meliputi isolasi DNA dan RNA total, uji kualitatif dan kuantitatif DNA dan RNA total, sintesis cDNA, perancangan primer spesifik gen AAI (target) dan aktin (kontrol), optimasi suhu annealing primer gen AAI dan aktin menggunakan template DNA dan cDNA, sekuensing serta optimasi konsentrasi sampel cDNA pada Real Time PCR. Sekuen gen spesifik aktin berhasil diperoleh dari primer TAAct sebesar 121 bp dan menunjukkan kesamaan dengan gen aktin Sarocalamus faberi. Sekuen gen spesifik α-amilase inhibitor diperoleh dari primer GMAAI sebesar 195 bp dan menunjukkan kesamaan dengan gen LTP Rosa chinensis yang mempunyai fungsi dan struktur domain mirip dengan α-amilase inhibitor. Analisis ekspresi gen aktin dan AAI menggunakan primer TAAct dan GMAAI masih perlu dioptimasi lagi.
Keyword: α-amilase inhibitor, aktin, Falcataria moluccana, Real Time PCR

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: