Judul: Potensi Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV) Isolat Lemah Sebagai Agens Pengendali Penyakit Daun Keriting Kuning pada Tanaman Tomat
Abstrak: Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV), penyebab penyakit daun keriting kuning, sudah banyak dilaporkan mengakibatkan kehilangan hasil yang cukup besar pada berbagai komoditas sayuran di banyak negara tropis dan subtropis di seluruh dunia. Di Indonesia, serangan penyakit daun keriting kuning yang terjadi terutama pada tanaman cabai dan tomat sudah dirasakan sejak tahun 2005. Di Sleman (Yogyakarta) dan Magelang (Jawa Tengah), contohnya, tingkat infeksi TYLCV diestimasi berkisar antara 20 hingga 100%. Kerugian yang ditimbulkan oleh penyakit ini bervariasi dan tercatat dapat mencapai lebih dari 85%. TYLCV memiliki partikel berbentuk ikosahedral kembar, bergenom DNA utas tunggal berukuran sekitar 2,6-2,8 kb, merupakan salah satu anggota dari Begomovirus dari famili Geminiviridae. TYLCV ditularkan oleh serangga vektornya, kutukebul Bemisia tabaci. Mobilitasnya yang sangat tinggi dan inangnya yang banyak serta dapat menularkan virus (TYLCV) secara persisten menyebabkan kutukebul memegang peranan penting dalam epidemiologi penyakit daun keriting kuning, mungkin hal ini pula yang menyebabkan usaha pengendalian penyakit ini yang dilakukan dengan cara menekan populasi serangga vektor menggunakan insektisida kurang berhasil. Di samping itu, efek samping penggunaan insektisida terhadap kesehatan lingkungan seperti residu pada buah tomat dan matinya musuh alami hama dan patogen sudah menjadi perhatian semua pihak. Cara lain yang pernah diterapkan untuk mengendalikan penyakit daun keriting kuning yaitu dengan menggabungkan pengendalian kutukebul dengan musuh alami, seperti parasitoid; predator; dan varietas tomat tahan terhadap Begomovirus juga belum dapat memberikan hasil yang diharapkan. Salah satu alternatif pengendalian yang cukup memberi harapan keberhasilan dan memenuhi persyaratan untuk kesehatan lingkungan adalah dengan melakukan proteksi silang (cross protection). Proteksi silang dalam penelitian ini adalah penggunaan isolat lemah suatu virus (TYLCV) untuk melindungi tanaman (tomat) dari kerusakan ekonomis yang ditimbulkan oleh infeksi isolat ganas virus yang sama (TYLCV). Keberhasilan pengendalian melalui proteksi silang sudah banyak dilaporkan terhadap berbagai jenis virus pada berbagai komoditas tanaman. Namun demikian, penelitian mengenai proteksi silang pada interaksi TYLCV dengan tanaman tomat belum pernah dilakukan di Indonesia maupun di negara lain. Untuk itu dilakukan penelitian mengeksplorasi TYLCV isolat lemah dari populasi alami dan menguji potensinya sebagai agens pengendali penyakit daun keriting kuning pada tanaman tomat.
Keyword: 

Judul: Resistance Screening and Tomato’s  Yield Loss Taxation Against Tomato chlorosis crinivirus Infection
Abstrak: Tomat merupakan tanaman hortikultura penting di Indonesia yang memiliki banyak manfaat. Budi daya tanaman tomat pada daerah tropis seperti Indonesia memiliki banyak faktor pembatas. Salah satu yang menjadi pembatas produksi tomat adalah adanya penyakit kuning yang berasosiasi dengan Tomato chlorosis virus (ToCV) (Closteroviridae: Crinivirus). Tujuan penelitian ini adalah menapis ketahanan duabelas galur tomat dan menaksasi kehilangan hasil tomat akibat infeksi Tomato chlorosis crinivirus. Manfaat dari penelitian ini diharapkan dapat memperoleh sumber ketahanan galur tomat yang dapat digunakan para pemulia dalam merakit varietas tahan dan data kerugian akibat infeksi virus ini. Pengujian penapisan ketahanan dan taksasi kehilangan hasil dilakukan dengan inokulasi buatan menggunakan kutukebul viruliferus Trialeurodes vaporariorum sebagai vektor. Inokulum ToCV diambil dari lapangan dan dideteksi dengan primer spesifik ToCV, tomato infectious chlorosis virus (TiCV) dan primer universal Begomovirus dengan RT-PCR dan PCR. Ketahanan sepuluh galur tomat ditentukan berdasarkan peubah penyakit yaitu waktu inkubasi, insidensi penyakit, keparahan penyakit, tipe gejala, Indeks Keparahan Penyakit (IKP) dan titer virus. Titer virus dideteksi secara serologi dengan metode DAS-ELISA. Peubah agronomi tanaman yang diamati yaitu tinggi tanaman, jumlah daun dan produksi tomat. Produksi tomat dihitung berdasarkan data pengamatan individu tanaman meliputi: jumlah buah yang dihasilkan, bobot buah masing-masing buah per tanaman, dan bobot total buah per tanaman. Pengaruh infeksi ToCV terhadap penghambatan tinggi tanaman, jumlah daun dan produksi tanaman ditentukan berdasarkan tingkat hambatan relatif (THR) tanaman terinfeksi dan kontrol sehat. Taksasi kehilangan hasil tomat akibat infeksi ToCV dengan intensitas penyakit yang berbeda dalam percobaan di rumah kaca. Intensitas penyakit kuning bergejala ringan, sedang dan berat didapatkan dengan menginokulasi tomat menggunakan kutukebul viruliferus berjumlah 1, 3, 5, 7 dan 10 ekor tiap tanaman uji. Peubah penyakit yang diamati adalah waktu inkubasi, insidensi, keparahan penyakit dan AUDPC (Area under disease progress curve), sedangkan peubah agronomi yang diamati yaitu tinggi tanaman, jumlah buah, dan bobot buah. Taksasi kehilangan hasil tomat dihitung berdasarkan data pengamatan individu tanaman dengan tingkat serangan yang berbeda. Hasil panen tanaman bergejala dan tanaman tidak bergejala ditentukan berdasarkan jumlah buah yang dihasilkan, bobot buah masing-masing buah per tanaman, dan bobot total buah per tanaman. Kehilangan hasil akibat penyakit kuning oleh ToCV ditentukan berdasarkan pengamatan intensitas penyakit yang berbeda dengan hasil panen tomat. Interaksi antara intensitas penyakit, Area under disease progress curve (AUDPC) dengan hasil panen dan tinggi tanaman dianalisis dengan analisis korelasi dan regresi. Pengujian penapisan ketahanan dan taksasi kehilangan hasil tomat dirancang dengan rancangan acak lengkap (RAL). Data yang diperoleh ditabulasi dan dianalisis sidik ragam (ANOVA), kemudian diuji lanjut dengan uji Tukey pada taraf 5%. Infeksi ToCV menyebabkan gejala umum yaitu klorosis ringan sampai sedang dan daun menggulung ke atas. Insidensi penyakit kuning berkisar 90,9%-100% menunjukkan semua galur uji rentan terhadap infestasi T. vaporariorum. Tanaman yang terinfeksi ToCV menyebabkan terjadinya penghambatan pertumbuhan dan penurunan jumlah dan bobot buah dibandingkan dengan tanaman sehat. Tingkat hambatan relatif (THR) tomat tipe determinate cenderung lebih tinggi dibandingkan dengan indeterminate. Berdasarkan peubah penyakit diperoleh 4 galur tahan (BISILB#1372ORA, BISILB#703A, BISILB#703B dan BISILB#724A), 5 galur moderat tahan (BISILB#825B, BISILB#60D, BISIKC#402, BISIKC#96D, BISILB#40I) dan 3 galur rentan (BISILB#1029A, BISILB#22, BISILB#724B). Tinggi rendahnya THR pada peubah agronomi menunjukkan tidak berkaitan secara langsung dengan status
Keyword: Penapisan Ketahanan Galur, Taksasi Kehilangan Hasil Tomat, Tomato chlorosis crinivirus, resistance, ToCV, tomato, yield loss

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: