Judul: Variasi alel DNA mikrosatelit pada lokus CSN3 dan ETH225 pada sapi fries holland (FH) di BPTU Sapi Perah Baturraden
Abstrak: Produksi susu sapi perah dipengaruhi oleh kemampuan genetik, lingkungan dan interaksi antara genetik dan lingkungannya. Pemuliaan sangat penting diperhatikan untuk memperbaiki mutu genetik ternak. Pemetaan gen pada genom sapi dapat dipakai sebagai penciri genetik untuk menyeleksi sifat-sifat produksi. Mikrosatelit DNA merupakan salah satu penciri genetik yang sudah diaplikasi secara luas untuk mengidentifikasi sejumlah sifat dengan nilai ekonomis tinggi. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan informasi variasi alel DNA mikrosatelit pada lokus CSN3 dan ETH225 pada sapi perah Fries Holland (FH) di BPTU (Balai Penelitian Ternak Unggul) Baturraden. Sepasang primer digunakan untuk mengamplifikasi lokus CSN3 dan ETH225 menggunakan teknik PCR (Polymerase Chain Reaction). Produk yang sudah diamplifikasi dapat divisualisasikan dengan gel poliakrilamida 5% dan dilanjutkan dengan perwarnaan perak (silver staining). Lokus ETH225 dan CSN3 masing-masing memiliki empat alel yaitu A, B, C dan D. Genotipe pada lokus CSN3 yaitu AB, AC, AD dan BD, dan frekuensi genotipe tertinggi yaitu 56,98% untuk genotipe AD dan terendah sebesar 4,65% untuk genotipe AB, sedangkan frekuensi alel tertinggi yaitu alel D sebesar 44,19% dan alel A sebesar 34,30%. Genotipe pada lokus ETH225 yaitu AB, AC dan BD, dan frekuensi genotipe tertinggi sebesar 60,60% untuk genotipe BD dan genotipe terendah AC sebesar 13,13%, sedangkan frekuensi alel tertinggi 43,43% alel B dan 30,30% alel D. Genotipe untuk lokus CSN3 pada EBV tinggi dan sedang yaitu AB, AC, AD, BD sedangkan pada EBV rendah tiga macam genotipe yaitu AB, AD dan BD. Pada lokus CSN3 nilai EBV tinggi, alel yang banyak muncul alel A dan EBV rendah alel yang banyak muncul alel D. Genotipe pada lokus ETH225 untuk EBV tinggi, sedang, rendah yaitu AB, AC dan BD. Frekuensi alel tertinggi pada lokus ETH225 berdasarkan nilai EBV tinggi, sedang dan rendah, yaitu alel B dan alel D. Hasil uji Khi-Kuadrat menunjukan bahwa hubungan antara frekuensi alel dan genotipe tidak berbeda nyata (P>0,05) terhadap nilai pemuliaan tertaksir (tinggi, sedang dan rendah). Kedua penanda genetik pada lokus CSN3 dan ETH225 belum dapat menggambarkan keterkaitan secara langsung pada EBV produksi susu. Lokus CSN3 mempunyai nilai heterozigositas 0,657 dan pada lokus ETH225 0, 679. Rata-rata heterozigositas (H) pada penelitian ini 0,668. Hal ini berarti sapi FH di BPTU Baturraden memiliki keragaman tinggi…dst
Keyword: 

Judul: Identifikasi Keragaman Gen β-laktoglobulin pada Sapi Friesian- Holstein di Balai Pengembangan Perbibitan Ternak Sapi Perah Cikole, Lembang
Abstrak: Kualitas susu sangat dipengaruhi oleh komposisi dan kadar protein yang dikandungnya. Protein dalam susu sapi terdiri dari dua jenis yaitu kasein dan whey. Protein utama dalam whey adalah β-laktoglobulin. Upaya perbaikan kualitas protein dapat dilakukan melalui pendekatan seleksi menggunakan penciri genetik pada tingkat DNA. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi keragaman gen β-laktoglobulin terhadap materi berupa DNA ektsraksi menerapkan metode Polymerase Chain Reaction - Restriction Fragmen Length Polymorphism (PCR-RFLP). DNA ekstraksi berasal dari sampel darah diambil dari secara vena jugularis bersumber dari 88 ekor sapi perah induk laktasi Friesian Holstein (FH) di BPPT-SP Cikole, Lembang. Penelitian genotyping gen β-laktoglobulin ini berlangsung selama enam bulan di Laboratorium Genetika Ternak, bagian Genetika dan Molekuler Ternak, Fakultas Peternakan, Institut Pertanian Bogor. Frekuensi genotipe dan alel serta nilai heterozigositas dihitung menggunakan metode Nei (1987). Kesetimbangan alel dan genotipe berdasarkan hukum Hardy-Weinberg dihitung menerapkan uji chi-square. Genotyping gen β-laktoglobulin pada sapi FH bersifat polimorfik atau beragam. Ada dua tipe alel yang dideteksi, yaitu alel A dan B yang menghasilkan tiga tipe genotipe, yaitu AA, AB dan BB. Frekuensi alel A dan B adalah 0,40 dan 0,60. Nilai heterozigositas yang diperoleh sebesar 0,483. Hasil uji chi-square menunjukkan bahwa χ2 lebih kecil dari χ2 tabel yang artinya gen β-laktoglobulin dari sapi FH pengamatan berada dalam keseimbangan Hardy-Weinberg, dengan varian genotipe untuk AA, AB dan BB berurutan adalah 0,10, 0,60, dan 0,30.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: