Judul: Kestabilan Genetik Somaklon Kelapa Sawit (Elaeis guineensis Jacq.) Hasil Kultur In Vitro Menggunakan Marka SSR
Abstrak: Teknik kultur jaringan telah dilakukan sejak tahun 1960 untuk perbanyakan tanaman kelapa sawit dengan karakter agronomis yang penting seperti produktifitas tinggi, resisten terhap hama dan penyakit, serta efisien dalam penyerapan hara dan air. Perbanyakan tanaman kelapa sawit secara kultur jaringan dilakukan dengan menggunakan metode embriogenesis. Sel-sel somatik dari tanaman ortet terpilih diinduksi untuk membentuk kalus yang kemudian berdiferensiasi membentuk bibit (ramet). Namun timbulnya variasi somaklonal pada tanaman kelapa sawit hasil kultur jaringan menjadi suatu kendala. Variasi somaklonal perlu dideteksi lebih awal untuk mengetahui kestabilan genetik tanaman klonal hasil kultur jaringan. Deteksi kestabilan genetik ini dapat dilakukan dengan menggunakan marka SSR. Tujuan penelitian ini adalah untuk menetapkan tingkat kestabilan genetik tanaman klonal hasil perbanyakan kultur jaringan. Sebanyak delapan ortet dari jenis Tenera (D×P) dan 20 tanaman klonalnya masing-masing diekstraksi menggunakan Kit GenElute kemudian diamplifikasi menggunakan 20 pasang primer SSR. Hasil amplifikasi kemudian diseparasi menggunakan PAGE. Pita-pita yang diperoleh dari hasil separasi kemudian diubah menjadi data sesuai format perangkat lunak yang digunakan yaitu NTSys dan PowerMarker. Hasil analisis berdasarkan 20 pasang primer SSR menggunakan perangkat lunak PowerMarker menunjukkan bahwa seluruh primer yang digunakan bersifat polimorfis. Jumlah alel yang dihasilkan sebanyak 55 alel dengan 1-4 alel dihasilkan dari setiap primer. Nilai rata-rata PIC 0.39 dengan nilai PIC terbesar 0.52 yang dihasilkan dari primer mEgCIR0521 dan mEgCIR2569. Hasil analisis keragaman genetik delapan ortet berdasarkan 20 pasang primer SSR menggunakan perangkat lunak NTSys menunjukkan bahwa keragaman genetik antar ortet berkisar 7%-30%. Ortet IS 10 dan IS 20 memiliki kemiripan genetik yang paling besar diantara ortet. Ortet IS 17 adalah ortet yang memiliki kemiripan genetik yang paling rendah dengan ortet-ortet lainnya. Hasil analisis kemiripan genetik ortet dan 20 tanaman klonalnya berdasarkan 20 pasang primer SSR menggunakan perangkat lunak NTSys menunjukkan bahwa 90% tanaman klonal dari ortet IS 10, IS 20, IS 40, dan IS 36 memiliki tingkat kemiripan genetik 100% dengan ortetnya masing masing. Ortet IS 39 memiliki 45% tanaman klonal pada tingkat kemiripan genetik 100%. Penelitian ini menunjukkan bahwa kestabilan genetik tanaman klonal dipengaruhi oleh genotipe ortet. Ortet yang berbeda memberikan respon yang berbeda pada kondisi kultur yang seragam. Tanaman ortet yang menghasilkan tanaman klonal dengan tingkat kestabilan genetik yang tinggi berpotensi menghasilkan tanaman klonal yang identik dengan ortetnya.
Keyword: Elaeis guineensis Jacq., genetic similarity, in vitro culture, somaclonal variation

Judul: Analisis filogenetik kelapa sawit (Elaeis guineensis Jacq) menggunakan marka simple sequence repeat
Abstrak: Produktivitas kelapa sawit dapat ditingkatkan dengan pemuliaan tanaman. Studi kekerabatan dengan marka SSR membantu dalam pemilihan tetua untuk program pemuliaan. Persilangan kelapa sawit dengan jarak genetik jauh dapat menghasilkan keturunan superior berpotensi menjadi kandidat varietas unggul kelapa sawit. Penelitian ini bertujuan menganalisis kekerabatan beberapa aksesi kelapa sawit dan mendapatkan primer SSR dengan tingkat polimorfisme tinggi sehingga dapat digunakan untuk analisis filogenetik. Empat puluh sembilan aksesi kelapa sawit dianalisis menggunakan 20 marka SSR. Marka SSR dipilih berdasarkan tingkat polimorfime dan penyebarannya pada tiap 16 kromosom kelapa sawit. Dendogram dibuat berdasarkan metode Unweighted Pair Group Method Arithmetic (UPGMA) dengan menggunakan software NTSYS-pc (Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System) versi 2.1. Tiga puluh sembilan pasang primer memiliki tingkat polimorfisme pada kisaran 32%-92%. Tingkat kekerabatan dari 49 aksesi kelapa sawit yang dianalisis dengan 20 marka SSR berada pada kisaran 55.28%-87.50%. Nilai koefisien kemiripan genetik sebesar 55.28% dapat membagi populasi kelapa sawit menjadi tujuh kelompok masing-masing terdiri atas 9, 28, 4, 2, 1, 2, dan 3 aksesi. Berdasarkan nilai koefisien kemiripan genetik, dapat dilakukan pemilihan calon tetua untuk pemuliaan kelapa sawit. Kata kunci: keragaman genetik, marka SSR, kelapa sawit.
Keyword: Genetic diversity, SSR markers, Oil palm

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: