Judul: Kondisi oseanografi perairan Teluk Bone pada bulan Februari 1995 (Musim barat)
Abstrak: Perairan Indonesia yang luasnya lebih besar daripada luas daratan. meru­ pakan kajian yang menarik sebagai obyek penelitian karena sumberdaya hayati laut yang terkandung di dalamnya belum dimanfaatkan secara optimal. Berbagai upaya telah dilakukan untuk mengoptimalkan pemanfaatan sumberdaya hayati laut. karena semak1n disadari bahwa sumberdaya hayati laut ini memegang pe-ranan penting bagi perkembangan ekonomi di Indonesia pada masa mendatang. Teluk Bone yang terletak antara Propinsi Sulawesi Selatan dengan Propinsi Sulawesi Tenggara, yang dibatasi oleh Laut Flores di bagian selatan pada lintang 5°39', merupakan perairan yang jarang dikaji untuk obyek penelitian guna mengetahui kondisi oseanografi perairan tersebut. Pada tahun 1995. Marine Science Education Project (MSEP) dengan melibatkan beberapa mahasiswa dari beberapa universitas, seperti lnstitut Pertanian Bogor. Universitas Diponegoro, Universitas Hasanuddin, Universitas Pattimura, Universitas Riau dan Universitas Sam Ratulangi telah menyelesaikan tiga pelayaran oseanologis di Teluk Bone pada bulan Januari-Februari dengan 25 stasiun pengamatan. Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari kondisi oseanografi perairan Teluk Bone dengan menyajikan sebaran menegak, melintang dan horisontal dari suhu, salinitas, kandungan oksigen, nitrat. fosfat, silikat dan densitas air. Dari informasi sebaran suhu, salinitas. oksigen terlarut, zat hara dan densitas, akan dipelajari fenomena alam yang terjadi. Sebaran suhu di bulan Februari 1995 pada lapisan homogen mempunyai suhu hangat yang berkisar antara 26.00°C - 30.53°C, dengan kecenderungan pada daerah di tengah teluk lapisan homogen semakin tebal. Ketebalan lapisan homogen ini cenderung sama dari selatan ke utara, yaitu sekitar 50 m. Pro/ii menegak suhu menunjukkan bahwa lapisan termoklin berada pada kedalaman antara 50 m-200 m dengan batas atas suhu rata-rata 25.71°C dan batas bawah suhu rata-rata 15.21oC. Pada lapisan permukaan ada kecenderungan nilai suhu permukaan yang tinggi berada di timur dan tenggara teluk.
Keyword: 

Judul: Ocean Health Index in The Bone Bay Between 2008-2019 Based on The Physical Oceanographic Parameters
Abstrak: Teluk Bone menghubungkan wilayah administratif Provinsi Sulawesi Selatan di sisi barat dengan Sulawesi Tenggara di sisi timur teluk. Orientasi teluk yang terbuka kearah Laut Flores di sisi selatan menyebabkan Arus Lintas Indonesia (Arlindo) yang berasal dari Selat Makassar dan sirkulasi permukaan monsun diduga mempengaruhi dinamika Teluk Bone, sehingga teluk ini memiliki karakteristik oseanografi yang unik seperti produktivitas primer tinggi diikuti dengan melimpahnya tangkapan ikan pelagis penting seperti cakalang dan tuna. Pemantauan perubahan kualitas lingkungan laut secara sinambung di wilayah teluk ini perlu dikaji melalui penentuan indeks kesehatan laut (IKL). Tujuan dari penelitian ini adalah mendeskripsikan karakteristik beberapa parameter oseanografi fisik, kecendrungan (trend) parameter oseanografi serta menghitung nilai IKL di wilayah Teluk Bone menggunakan data keluaran model sirkulasi laut 3-dimensi INDESO dan Copernicus dari 2008-2018 (10 tahun). Hasil penelitian menunjukkan karakteristik oseanografi Teluk Bone dicirikan dengan variasi musiman yang kuat, dimana pada periode musim barat suhu dan tinggi muka laut menjadi maksimum (29.93 oC dan 0.7 m), tetapi salinitas minimum (33.23 psu). Sebaliknya, pada periode musim timur, suhu dan tinggi muka laut menjadi minimum (28.44 oC dan 0.6 m) dan salinitas maksimum (33.26 psu). Pertukaran massa air dari dalam teluk dengan luar teluk menunjukkan volume transpor mengalir kearah utara pada musim peralihan II (Oktober) dan pada musim barat (Februari) kearah selatan sebesar 0.030 Sv (1 Sv = 106 m3/s). Tren data deret-waktu (2008-2018) dari parameter oseanografi di Teluk Bone cenderung mengalami penurunan, misalnya parameter SPL (sekitar -0.0028 oC/tahun), salinitas (-0.0012 psu/tahun), dan tinggi muka laut (-0.0236 m/tahun). Perhitungan IKL dengan nilai estimasi SPL sekitar 1.00, salinitas 1.01, dan tinggi muka laut 1.15, diperoleh nilai IKL Teluk Bone tergolong perairan teluk yang masih berstatus baik., The Bone Bay connects the administrative area of South Sulawesi Province on the west side with Southeast Sulawesi on the east side of the bay. The orientation of the bay that opens towards the Flores Sea on the south side causes recirculation of the Indonesian Through Flow (ITF) originating from the Makassar Strait and the monsoon circulation are considered to affect the Bone Bay dynamics. This bay has unique oceanographic characteristics such as high primary productivity followed by abundance of catches of important pelagic fish such as skipjack and tuna. Continuous monitoring of changes in the quality of the marine environment in the bay area needs to be studied through the determination of the ocean health index (OHI). The objective of this study is to describe the characteristics of several physical oceanographic parameters, to estimate the trend of oceanographic parameters and to calculate the OHI value in the Bone Bay using the model output data of the 3-dimensional ocean general circulation model INDESO and Copernicus between 2008-2018 (10 years). The results showed that the oceanographic characteristics of Bone Bay are characterized by strong seasonal variations, where during the northwest monsoon (NWM) period sea surface temperature (SST) and sea surface height (SSH) are maxima, 29.93 oC and 0.7 m, respectively, but the salinity is minimum (33.23 psu). In contrast, during the southeast monsoon (SEM) period SST and SSH 28.44 oC and 0.6 m, respectively, and salinity is maximum (33.26 psu).
Keyword: Oceanography parameters, Bone Bay, Trend value, Ocean Health Index (OHI), Model output dataset

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA