Judul: Evaluasi Kesehatan Pohon Peneduh di Kota Bandar Lampung Berbasis Sonic Tomography
Abstrak: Shade trees take an important role in urban ecosystem for its function on social, economy and ecology. It also have worth value to provide aesthetic, cool, and enjoyment in urban area. On the other hand the condition of this shade trees were lost attention. Therefor monitoring and evaluation of tree health is became important as a part of tree management. A study was conducted to evaluate health condition of shade trees in Bandar Lampung using visual assesment as well as sonic wave propagation measurement. Eighteen road were choosen as the sample road based on density of shade trees. The result showed that angsana (Pterocarpus indicus) was the dominant species that found 53% of one hundred sample of shade trees. The major deterioration symptoms that appear in trees were epiphytes attack (1%), hollow (1%), cavity (2%), and cancer (2%). Non-destructive evaluation by using PiCUS Sonic Tomograph showed that 70% of shade trees were in healthy condition as indicated with solid wood persentage above 75% from tomogram image.
Keyword: visual assesment, tomogram image, shade trees, NDT

Judul: Ornamental Tree Health Evaluation in City of Bogor Using Visual Observation and Ultrasonic Wave Based Technique
Abstrak: Pohon ornamental dalam ekosistem perkotaan (urban trees) tidak saja memiliki fungsi ekologis, tetapi juga memiliki fungsi sosial dan ekonomis yang sangat penting. Oleh karena itu keberadaan dan kondisi kesehatannya selayaknya mendapat perhatian yang memadai. Cara paling sederhana untuk mengetahui kesehatan pohon adalah dengan pengamatan visual terhadap kondisi fisik pohon tersebut. Akan tetapi dengan metode ini tidak dimungkinkan mengetahui kondisi bagian dalam batang pohon, seperti adanya busuk hati dan kerusakan dalam batang lainnya. Sementara itu sejak beberapa tahun yang lalu telah berkembang teknik evaluasi kesehatan pohon dengan menggunakan gelombang suara, khususnya gelombang ultrasonik. Teknik ini termasuk ke dalam kategori tanpa merusak (non destructive testing/evaluation). Suatu penelitian telah dilakukan untuk mengetahui kesehatan pohon ornamental di sepanjang Jalan Raya Pajajaran Kota Bogor, Jawa Barat, baik secara visual maupun dengan memanfaatkan rambatan gelombang ultrasonik yang dihasilkan dari alat Sylvatest Duo® (frekuensi 22 KHz). Pengamatan secara visual dilakukan terhadap ada tidaknya gejala deteriorasi pada pohon sasaran, dari pangkal batang hingga tajuk pohon. Sedangkan penilaian kesehatan pohon dengan alat Sylvatest Duo® didasarkan atas kecepatan rambatan gelombang.
Keyword: 

Judul: Construction of Saccharomyces cerevisiae KEX2-650  and KEX2-620 Genes Expression Vector in Escherichia coli DH5α
Abstrak: Kex2 merupakan protease spesifik (EC3.4.21.61) asal Saccharomyces cerevisiae yang memiliki fungsi mirip dengan furin pada mamalia dan memiliki homologi sekuen sebesar 47%. Kex2 secara alami merupakan protein intraselular sebagai protein transmembran, khususnya ditemukan pada membran retikulum endoplasmik dan trans golgi. Kex2 merupakan serin-protease yang mengikat ion Ca2+. Protein ini berperan dalam proses pemotongan protein prekursor pheromone mating-factor-α dan killer toxin M1 pada situs spesifik dimana dijumpai pasangan asam amino basa Lys-Arg atau Arg Arg saat protein tersebut dikirim keluar sel melalui jalur sekresi. Fungsi unik Kex2 dalam konversi prepro-protein menjadi protein matang, banyak dimanfaatkan seperti untuk pematangan proinsulin glargine menjadi glargine matang. Hal ini membuat pemilihan sistem ekspresi Kex2 secara ekstraselular pada pengoptimasian proses konversi akan sangat menguntungkan untuk optimasi proses konversi. Kex2 ekstraselular dapat diperoleh melalui rekayasa genetik, seperti delesi transmembran domain. Penelitian ini bertujuan mengkonstruksi varian vektor pD902-KEX2 dengan mengoptimalkan strategi modifikasi penghapusan daerah terminal-C termasuk domain transmembran dan Ser/Thr dari sekuen gen KEX2, serta introduksinya ke dalam Escherichia coli DH5α. Varian KEX2 yang dikonstruksi adalah KEX2-650 (tanpa domain transmembran) dan KEX2-620 (tanpa domain Ser/Thr dan domain transmembran). Plasmid rekombinan dikonstruksi melalui metode mutagenesis terarah dengan teknik PCR terhadap vektor pD902-KEX2-699 menggunakan pasangan primer FP-Kex2-699/RP-Kex2-650 dan FP-Kex2-699/RP-Kex2-620, masing-masing untuk KEX2-650 dan KEX2-620. Seluruh primer untuk mutagenesis terarah yang digunakan mengandung situs BamHI untuk religasi plasmid. Proses PCR pada mutagenesis terarah menghasilkan amplikon DNA dengan panjang sesuai yang diharapkan, yaitu sekitar 5551 pb dan 5461 pb masing-masing untuk KEX2-650 dan KEX2-620. Setelah dilakukan restriksi dengan BamHI dan ligasi, pD902-KEX2-650 dan pD902-KEX2-620 diintroduksi kembali ke E. coli DH5α. Hasil analisis menunjukkan plasmid rekombinan telah berhasil diintroduksi ke dalam E. coli DH5α. Verifikasi PCR dari gen target menunjukkan bahwa satu dari beberapa koloni transforman KEX2-650 yang diperoleh memiliki amplikon yang sesuai dengan panjang yang diharapkan, yaitu sekitar 646 pb. Namun, koloni KEX2-620 tidak menghasilkan amplikon dengan ukuran yang sesuai target (556 pb). Hasil analisis sekuensing DNA dari klon KEX2-650 terpilih, mengkonfirmasi bahwa domain transmembran telah terdelesi dari konstruk gen untuk membentuk konstruk KEX2-650.
Keyword: Escherichia coli DH5α, KEX2 gene, site-directed mutagenesis, Ser/Thr domain, transmembrane domain