Judul: Telaah pemulihan aktivitas protease Escherichia coli DH5x rekombinan
Abstrak: Pengklonan gen protease Xanthomonas campestris pv. glycines IFL ke dalam E. coli DH5a dimaksudkan untuk meningkatkan produksi dan aktivitas enzim tersebut. Pengklonan tersebut telah berhasil dilakukan dimana fragmen EcoR1 berukuran 6,2 kb dari kromosom Xanthomonas campestris pv. glycines IFL digabungkan dengan vektor pRK 415 (10,5 kb; resisten terhadap tetrasiklin) yang telah dilinierkan dengan EcoRI lalu ditransformasikan ke dalam Escherichia coli DH5a sehingga dihasilkan Escherichia coli DH5a rekombinan (pMB8) yang mengandung insert berukuran 2,9 kb. Penelitian ini bertujuan untuk memperbaiki ekspresi protease rekombinan dengan cara: (1) melakukan subkloning insert dengan menggunakan vektor pIT101 (6,144 kb; resisten terhadap kanamisin dan gentamisin) dan inang E. coli JM107 serta (2) pemulihan/renaturasi aktivitas protease rekombinan. Target yang ingin dicapai ialah: (1) ukuran fragmen DNA penyandi protease yang lebih pendek daripada ukuran insert awal (2,9 kb) dan (2) peningkatan aktivitas protease rekombinan...
Keyword: 

Judul: Produksi dan karakterisasi biokimiawi protease eschericia coli DH5@ rekombinan
Abstrak: Xanthomonas campesimis pv glycines IFL merupakan isolat bakteri lokat penyebab penyakit bisul pada tanaman kedelai yang menghasilkan protease ekstraseluler dengan kisaran pH optimum luas dan suhu optimum yang cukup tinggi (30-70°C) Produksi dan aktivitas protease Xanthomonas dapat terhambat dengan adanya pembentukan gum xanthan Pengklonan gen protease X. campestris pv glycines IFL ke dalam E. call DH5a dengan menggunakan vektor pRK415 dimaksudkan untuk menghasilkan protease IFL. tanpa kehadiran produk lain sekaligus meningkatkan produksi dan aktivitas enzim tersebut. Penelitian ini bertujuan untuk memproduksi protease E. coli DiSa rekombinan dan melakukan karakterisasi biokimiawi protease rekombinan sekaligus membandingkannya dengan protease X. campestris pv. glycines IFL. selaku donor gen Tahap awal dari penelitian ini adalah pembuktian keberadaan gen protease pada rekombinan dengan cars mengintroduksikan kembali gen tersebut kepada X campestris mutan protease melalui proses konjugasi yang melibatkan tiga tetua (triparental mating). Introduksi gen rekombinan kepada X campestris mutan menyebahkan A campestris kembali mampu memproduksi protease dalam jumlah besar. Aktivitas spesifik (unit aktivitas'mg protein) dari protease X. campestris mutan, X. campestris (pRK415) dan X. campestris (pRK415 rekombinan) dengan waktu fermentasi 48 jam pada media LB adalah 0,045, 0,402 dan 0,051 dan pada media LCT (Limbab Cair Tatu) sebesar 0,077, 0,101 dan 0,176 Pengukuran aktivitas protease dilakukan dengan menggunakan metode Bergmeyer et al (1983) dan penentuan kadar protein dilakukan dengan metode Bradford (1976). Bakteri E. coli DHSx rekombinan yang ditumbuhkan pada media PYGB (Pepton 2%, ektrak khamir 1%, dan gliserol 3%) dengan waktu fermentasi 24 jam memberikan aktivitas protease terbesar dibandingkan bila bakteri tersebut ditumbuhkan pada media LB dan LCT skin 0.5%+ Ca 5mM Aktivitas protease yang dihasilkan pada kondisi optimum ini berkisar antara 0,032 0,042 Unit/ml. Penambahan skim pada media PYGB tidak menambah aktivitas protease yang dihasilkan Penelitian lebih lanjut untuk melihat ekspresi dari gen protease rekombinan pada E coli dilakukan dengan membandingkan karakterisasi biokimia dari enzim tersebut dengan protesse X campestris IFL. Dari hasil karakterisasi pH diketahui bahwa proscase yang dihasilkan oleh E. con DH5u rekombinan memiliki pH optimum 8.5 yang berbeda dengan při optimum dari protease X. campestris IFL yaitu 7.5. Pola penganult suhu terhadap aktivitas kedua enzim hampir sama dan dan suhu optimum keduanya adalah 60°C. Penambahan EDTA pada protease E cow DHSa rekombinan memberikan efek penghambatan yang lebih besar dengan aktivitas sisa 26.145% pada penambahan 5 mM sedangkan aktivitas sisa protease X campestris IFL. pada penambahan yang sama adalah 55% PMSF yang merupakan inhibitor spesifik strin ternyata menghambat protease E. coli DH5a rekombinan dengan aktivitas sisa sebesar 69.47% dan 34.86% pada penambahan 1 dan 5 mM sedangkan aktivitas sisa protease X. campestris IFL pada konsentrasi yang sama adalah 75% dan 25% Hasi karakterisasi biokimiawi protease menunjukan adanya kemiripan antara protease E coù DHSa rekombinan dengan protease X. campestris IFL Dari hasil zimogram dengan menggunakan pewama Comassie Blue diketahui bahwa enzim protease yang ada pada E. coù DHS rekombinan terdiri dari dua jenis dengan berat molekul kurang lebih 49.000 dan 45.000 dalton
Keyword: 

Judul: Characteristic of Overshooting Top (OT) Based on  Himawari  8  Satellite  as  a  Convective  Cloud  Feature  that  Generates  Extreme Weather in the Java Island Region
Abstrak: Overshooting Top (OT) is a feature at the top of a convective cloud that is associated with extreme weather. Research on OT in tropical Indonesia is still very limited. The existence of geostationary satellites with wide area coverage and fast frequency observations is useful for observing the fast dynamics of the OT life cycle. Therefore, this study intends to analyze the relationship between OT and extreme weather, updraft and thermodynamic conditions of OT when extreme weather occurs, the best objective method for detecting OT in the day time and night time, and the spatiotemporal distribution of OT in the tropical region of Java Island during the 2018-2021 period. Based on visual analysis using visible channel and Himawari 8 sandwich products, 87% of extreme weather events in Java were accompanied by the appearance of OT. It indicates that the presence of the OT pattern is a convection cloud pattern or feature that is closely related to extreme weather events for the Java Island region. The existence of a time lag between the appearance of OT and extreme weather events on Java Island indicates that the OT of convection cloud can be used as a precursor or nowcasting for the appearance of extreme weather. Most of the convective cloud OT features during extreme weather events on Java Island have altitude that were only able to exceed the altitude of the equilibrium level and few were able to exceed the tropopause level of 9 km – 16 km. The difference in atmospheric conditions during extreme weather events on Java Island, which is in the tropics and subtropics, is a strong and unstable convective energy condition characterized by a larger CAPE, as well as unstable KI, LI, SI and TTI values. It is offset by kinematic factors in the form of a weak vertical wind shear (bulk wind shear 0-6 km) and a higher freezing point height. The difference between extreme weather events in the Java Island region and other tropical regions compared to subtropical regions is the strong updraft speed of convection clouds. The IRW Texture COMB algorithm based on the IRW-Texture Gradient modification and the COMB algorithm shows a significant increase in quality for detecting OT and non-OT pixels in Java. Rainy days with rainfall > 50 mm/day are very common in areas with an altitude of > 500 m. On the other hand, the level of convection activity which is indicated by the presence of OT and lightning is significantly reduced in this area. OT of convective clouds appear more frequently during the DJF season and less frequently during the JJA season. OT often appears during the day time and rarely at night time. Most OTs appear in the central part, away from the south and north coasts of Java Island during the day, while OTs that appear near the south and north coasts of Java Island can appear in the morning or afternoon.
Keyword: convective clouds, extreme weather, Overshooting Tops, Himawari 8 Satellite