Judul: Identification of Single Nucleotide Polymorphism (SNP) 5’UTR of Stearoyl-CoA Desaturase (SCD) in Bali Cattle
Abstrak: Sapi bali adalah salah satu sapi asli Indonesia, yang didomestikasi dari banteng (Bibos banteng). Sapi bali memiliki potensi untuk menghasilkan kualitas daging yang baik. Gen SCD adalah salah satu gen yang berperan dalam menentukan kualitas daging dengan mengubah asam lemak jenuh menjadi asam lemak tak jenuh. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi variasi SNP 5’UTR gen SCD di sapi bali. Sebanyak 25 sampel sapi bali disekuensing menggunakan jasa 1st Base Selangor, Malaysia dan 16 sampel berhasil disekuensing. Hasil sekuensing kemudian dianalisis menggunakan program FinchTV. Hasil penelitian menunjukkan bahwa terdapat 1 SNP yaitu pada posisi g.-134A>del gen SCD pada sapi bali yang dapat dijadikan sebagai kandidat marker assited selection pada sapi bali. SNP gen SCD sapi bali pada daerah 5’UTR bersifat polimorfik.
Keyword: 5’UTR, gen SCD, sapi bali, sekuensing

Judul: Keragaman Single Nucleotide Polymorphism (SNP) g.10360 G>A Gen Stearoyl Co-A Desaturase (SCD|AjiI) pada Sapi bali.
Abstrak: Gen Stearoyl Co-A desaturase (SCD) adalah salah satu gen yang mengendalikan sifat-sifat komposisi asam lemak dalam daging. Penelitian ini dilakukan untuk mengidentifikasi keragaman gen SCD pada sapi bali dengan menggunakan metode Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Lenght Polymorpohism (PCR-RFLP). Sampel DNA diperoleh dari BPTU-HPT, Denpasar Bali sebanyak 95 sampel DNA sapi bali yang terdiri atas 49 ekor jantan dan 46 ekor betina. Data genotipe di hitung menggunakan frekuensi genotipe dan alel, nilai heterosigositas, dan keseimbangan Hardy-Weinberg. Gen diamplifikasi pada posisi g.10360 G>A dengan panjang sekuen 569 bp dan dipotong menggunakan enzim AjiI yang memiliki situs potong CAC|GTC. Genotipe yang dihasilkan adalah GG, (317 bp dan 252 bp), AA (569 bp) dan GA (569, 317, dan 252 bp). Frekuensi alel tertinggi ditemukan pada alel A. Hasil identifikasi gen SCD|AjiI ini menunjukkan bahwa sapi bali di BPTU-HPT, Denpasar Bali bersifat polimorfik (beragam).
Keyword: heterosigositas, keragaman, PCR-RFLP, SCD

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: