Judul: Response of Several Chili Accessions and Molecular Markers to Yellow Leaf Curl Disease
Abstrak: Penyakit daun keriting kuning merupakan penyakit penting tanaman cabai dan menjadi kendala utama dalam produksi cabai. Penyakit ini disebabkan oleh Pepper yellow leaf curl virus (PYLCV) dan ditularkan oleh serangga vektor kutukebul Bemisia tabaci (Hemiptera: Aleyrodidae). Penggunaan varietas tahan direkomendasikan sebagai salah satu cara pengendalian penyakit, tetapi belum tersedia varietas cabai tahan PYLCV secara komersial. Penelitian ini dilakukan untuk mengevaluasi ketahanan 10 aksesi cabai koleksi Balai Besar Penelitian Bioteknologi dan Sumberdaya Genetik Pertanian (BBBiogen) dan mengidentifikasi marka molekuler yang berhubungan dengan sifat ketahanan cabai terhadap PYLCV. Tanaman cabai uji berumur 30 hari setelah tanam diinokulasi PYLCV menggunakan kutukebul dengan periode makan akuisisi dan inokulasi masing-masing 48 jam, dengan 10 ekor kutukebul per tanaman. Respons tanaman diamati berdasarkan gejala, insidensi dan keparahan penyakit. Konfirmasi infeksi PYLCV pada tanaman uji dilakukan dengan metode deteksi polymerase chain reaction (PCR) menggunakan primer universal Begomovirus. Gejala penyakit pada tanaman cabai uji meliputi daun menguning, tulang daun menebal serta memucat, serta tanaman kerdil. Insidensi dan keparahan penyakit pada tanaman cabai uji berturut-turut berkisar 0-36% dan 0-28%; sedangkan pada tanaman kontrol rentan PYLCV, yaitu varietas Bara berturut-turut 88% dan 61%. Delapan dari 10 galur cabai uji menunjukkan respons tahan terhadap PYLCV. Pola polimorfisme pada galur cabai uji diperoleh dengan marka CaBR61 dan CaBR98, walaupun dua marka tersebut tidak dapat digunakan sebagai penanda respons ketahanan terhadap PYLCV., Yellow leaf curl disease is an important disease of chili plants and a major obstacle to chili production. This disease is caused by Pepper yellow leaf curl virus (PYLCV) and is transmitted by the whitefly vector Bemisia tabaci (Hemiptera: Aleyrodidae). The use of resistant varieties is recommended for controlling this disease, but there are no commercially resistant PYLCV varieties available. This study was conducted to evaluate the resistance of 10 chili accessions from the collection of Balai Besar Penelitian Bioteknologi dan Sumberdaya Genetik Pertanian (BBBiogen) and to identify molecular markers associated with chili resistance to PYLCV. Thirty days-old chili plants were inoculated with PYLCV using whitefly with acquisition and inoculation feeding periods of 48 hours each, and 10 whiteflies per plant. Plant response was observed based on symptoms, incidence, and severity of the disease. Confirmation of PYLCV infection in the test plants was carried out by polymerase chain reaction (PCR) detection method using Begomovirus universal primer. Symptoms of the disease in the tested chili plants include leaf yellowing, thickening and blanching of leaf veins, and stunting of the plants. Incidence and severity of the disease in the tested chili plants ranged from 0-36% and 0-28%, respectively; whereas in control plants susceptible to PYLCV, i.e., var. Bara was 88% and 61%, respectively. Eight of the 10 tested chili accessions showed resistant response to PYLCV. Polymorphism patterns in chili accessions were obtained with CaBR61 and CaBR98 markers, although these two markers cannot be used as markers for resistance response to PYLCV.
Keyword: disease incidence, molecular marker, polymorphism, polymerase chain reaction, whitefly

Judul: Morphological Diversity and Resistance of Various Species of Chili Pepper (Capsicum spp.) to Pepper Yellow Leaf Curl Disease
Abstrak: Masyarakat dunia telah menjadikan cabai (Capsicum spp.) sebagai salah satu komoditas hortikultura yang penting dalam penggunaannya di berbagai aspek kehidupan. Peningkatan produktivitas cabai umumnya menghadapi beberapa hambatan, salah satunya adalah serangan hama dan penyakit tanaman. Penyakit daun keriting kuning (Pepper Yellow Leaf Curl Disease/PYLCD) dapat menyebabkan kerusakan dan kehilangan hasil yang tinggi. Penyakit ini disebabkan oleh Pepper yellow leaf curl virus (PYLCV) dan ditularkan melalui serangga vektor kutu kebul (Bemisia tabaci). Pengendalian PYLCD hingga saat ini masih terbatas pada pengendalian serangga vektor. Penggunaan varietas tahan menjadi cara yang lebih efektif untuk mencegah kerusakan akibat PYLCD. Penelitian ini terdiri atas dua kegiatan utama yakni (1) karakterisasi keragaan morfologi dan agronomi serta (2) pengujian respons ketahanan 29 genotipe cabai terhadap penyakit daun keriting kuning. Percobaan pertama bertujuan untuk mendapatkan informasi keragaan karakter agronomi dan morfologi genotipe cabai yang berasal dari 4 spesies berbeda. Pengujian dilakukan di dalam rumah kaca dan dilaksanakan menggunakan rancangan kelompok lengkap teracak (RKLT) satu faktor dengan tiga ulangan. Pengamatan karakter morfologi dan agronomi dilakukan pada 32 karakter meliputi karakter kecambah, daun, batang, bunga, buah, biji dan produktivitas tanaman. Pengamatan karakter didasarkan pada panduan deskripsi cabai IPGRI. Hasil pengamatan menunjukkan adanya keragaman karakter yang cukup besar di antara genotipe uji. Genotipe uji teramati memiliki tinggi yang beragam berkisar dari tanaman yang pendek, sedang, tinggi hingga sangat tinggi. Bentuk serta ukuran tanaman cukup beragam dengan produktivitas berkisar antara 29,23 g hingga 207,92 g buah per tanaman. Percobaan kedua bertujuan untuk mendapatkan informasi respons serta kategori tingkat ketahanan tanaman terhadap penyakit daun keriting kuning. Percobaan dilakukan menggunakan dua unit percobaan yakni (1) penanaman pada kondisi bebas virus (kontrol) dan (2) penanaman pada kondisi terinfeksi virus. Inokulasi virus dilakukan dengan metode inokulasi individu menggunakan serangga vektor kutu kebul. Pengamatan meliputi karakter morfologi dan agronomi serta karakter ketahanan (periode inkubasi, tingkat insidensi dan tingkat keparahan penyakit). Tingkat ketahanan tanaman dikategorikan menjadi lima kategori berdasarkan tingkat keparahan penyakit, yakni sangat rentan, rentan, agak rentan, agak tahan dan tahan. Genotipe Adelina, Red Habanero, Red Chupetinho, F6-074, Jolokia, Fatali, F5-012328-6-2-1, Anies, F4-012328-1AB-3, F5-012328-1AB-2-1, Caman, IPBC3, dan IPBC290 termasuk kategori tanaman tahan. Genotipe F1 Baja, Seloka, Bonita, IPBC12, F4-012328-3-3, Ungara, F5-012328-6-2-2, IPBC15, dan Cakra Putih merupakan tanaman agak tahan. Genotipe Taruna dan IPBC333 termasuk dalam kategori tanaman agak rentan. Genotipe SSP, Bishop Crown dan IPB C5 termasuk dalam kategori tanaman rentan. Genotipe Yuni dan Lemon Drop termasuk kategori tanaman yang sangat rentan terhadap penyakit daun keriting kuning. Hasil pengamatan juga menunjukkan adanya perbedaan keragaan tanaman antara tanaman yang terinfeksi PYLCV dibandingkan dengan tanaman bebas virus (kontrol). Tanaman teramati mengalami penyusutan ukuran daun, dan tinggi tanaman, penyusutan ukuran buah, serta penurunan jumlah buah dan bobot buah per tanaman. Nilai penurunan tersebut diketahui berkorelasi dengan tingkat keparahan penyakit. Tanaman dengan tingkat keparahan penyakit yang lebih besar, cenderung mengalami penurunan keragaan yang lebih besar. Korelasi juga teramati antara tingkat keparahan penyakit dengan umur berbunga tanaman. Tanaman dengan tingkat keparahan penyakit yang lebih berat cenderung berbunga lebih cepat dibandingkan tanaman yang bergejala ringan. Berdasarkan kategori tingkat ketahanan dan karakter lain seperti produktivitas, masing-masing spesies cabai yang diuji memiliki genotipe unggul yang berpotensi untuk
Keyword: Begomovirus, characterization, correlation, interspecies, pepper yellow leaf curl disease

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: