Judul: Karakterisasi Cairan Fermentasi Daun Mangrove Avicennia marina dan Pemanfaatannya untuk Pengendalian Bakteri Penyebab Penyakit Ice-Ice pada Rumput Laut Kappaphycus alvarezii
Abstrak: Budidaya rumput laut dihadapkan pada permasalahan besar, yaitu serangan penyakit ice-ice yang disebabkan oleh faktor abiotik (suhu, salinitas, intensitas cahaya, dan nutrien) dan biotik (jamur dan bakteri). Faktor abiotik menyebabkan abnormal pada rumput laut yang selanjutnya diikuti dengan infeksi bakteri patogen, salah satunya adalah bakteri Stenotrophomonas maltophilia yang memiliki patogenisitas kuat. Kajian dan pengendalian penyakit ice-ice termasuk uji daya tahan rumput laut telah dilakukan, namun hasilnya belum maksimal. Salah satu strategi alternatif yang dapat dilakukan untuk pengendalian penyakit ice-ice adalah dengan penggunaan cairan fermentasi daun mangrove Avicennia marina yang memiliki kandungan metabolit sekunder dan bakteri endofit yang dapat menghambat pertumbuhan bakteri patogen. Fermentasi dilakukan bertujuan untuk menghilangkan atau mengurangi zat antinutrisi, menurunkan toksin, meningkatkan kandungan metabolit, dan mempertahankan bakteri potensial. Bakteri endofit merupakan bakteri yang seluruh atau sebagian siklus hidupnya berada dalam jaringan, berasosiasi, dan tanpa menimbulkan gejala penyakit pada inang. Interaksi antara inang dengan bakteri endofit bersifat simbiosis mutualisme, bakteri endofit mendapatkan tempat hidup dan nutrien untuk bertahan hidup, sedangkan inang mendapatkan manfaat dengan adanya kontribusi metabolit dari bakteri yang dapat membantu pertumbuhan dan ketahanan inang dari serangan patogen. Bakteri endofit mampu memproduksi senyawa antibakteri berupa asam laktat dan bakteriosin yang dapat menghambat pertumbuhan bakteri patogen dan memicu sistem pertahanan tubuh inang. Tujuan umum penelitian ini adalah mengendalikan penyakit ice-ice yang menginfeksi rumput laut Kappaphycus alvarezii melalui penggunaan cairan fermentasi daun mangrove A. marina. Penelitian ini dilakukan dalam tiga tahap, yaitu tahap pertama isolasi dan mengidentifikasi bakteri endofit pada daun mangrove A. marina serta mengevaluasi daya hambatnya terhadap bakteri Stenotrophomonas maltophilia penyebab panyakit ice-ice pada rumput laut. Metode isolasi yang digunakan adalah metode spread plate dengan cara menginokulasikan suspensi daun mangrove yang mengandung bakteri pada media agar sea water complete (SWC) dan thiosulphate citrate bile salt sucrose (TCBS). Uji penghambatan isolat bakteri terhadap S. maltophilia dengan menggunakan metode Kirby-Bauer dan kultur bersama. Hasil isolasi bakteri endofit dari daun mangrove diperoleh 18 isolat dan berdasarkan analisis biokimia dan sekuen gen 16S rRNA, 18 jenis bakteri ini termasuk ke dalam 3 kelompok besar bakteri, yaitu Gammaproteobacteria (4 spesies), Firmicutes (10 spesies), dan Enterobacteria (4 spesies). Bakteri yang mempunyai daya hambat tertinggi terhadap bakteri S. maltophilia adalah Vibrio sp. AMS5, Pseudomonas sp. AMS8 dan Bacillus subtilis AMS11. Berdasarkan hasil penelitian pada tahap ini dapat disimpulkan bahwa bakteri endofit yang teridentifikasi pada daun mangrove A. marina mampu menghambat pertumbuhan S. maltophilia sebagai penyebab penyakit ice-ice. Untuk meningkatkan kualitas hambat dari daun mangrove, maka dilakukan fermentasi spontan (tahap 2). iv Penelitian tahap kedua bertujuan untuk mengidentifikasi bakteri dan senyawa dalam cairan fermentasi daun mangrove A. marina dan mengukur daya hambatnya terhadap bakteri patogen S. maltophilia penyebab penyakit ice-ice pada rumput laut. Cacahan daun A. marina yang sudah tua ditandai dengan warna hijau tua pada permukaan atas daun dan segar dicampurkan dengan gula merah dan air laut steril dengan perbandingan bobot 1:0.25:2, dimasukkan dalam wadah tertutup rapat tanpa pencahayaan, dan difermentasi selama dua minggu. Isolasi bakteri cairan fermentasi dilakukan dengan menggunakan media kultur SWC dan TCBS. Uji daya hambat bakteri dilakukan dengan menggunakan metode Kirby-Bauer. Hasil analisis molekuler dengan target gen 16S rRNA menunjukkan bahwa bakteri dalam
Keyword: Avicennia marina, endofit, fermentasi, ice-ice, mangrove, rumput laut

Judul: Studi Peran Interaksi Bakteri Patogen Dan Lingkungan Terhadap Penyakit Ice-Ice  Pada Rumput Laut Kappaphycus Alvarezii.
Abstrak: Pengembangan dan peningkatan produksi rumput laut Kappaphycus alvarezii sangat penting perannya dalam upaya memenuhi permintaan berbagai industri yang memanfaatkan rumput laut sebagai bahan dasar produksinya. Indonesia sebagai salah satu negara produsen terbesar, harus mampu menjamin kualitas dan kuantitas produksi budidaya rumput laut dalam rangka persaingan antar produsen rumput laut di dunia. Budidaya merupakan jalan utama dalam mengupayakan pencapaian produksi massal rumput laut. Namun demikian, kegiatan budidaya seringkali dihadapkan suatu masalah terbesar, yakni munculnya wabah penyakit rumput laut. Penyakit semakin dipandang sebagai faktor utama dalam ekologi laut dan dampaknya diperkirakan akan meningkat dengan perubahan lingkungan seperti pemanasan global. Disertasi ini fokus pada pemahaman sebuah "pemutihan" (bleaching) penyakit ice-ice pada makroalga merah Kappaphycus alvarezii, terutama pada musim panas dengan pendugaan suhu yang meningkat dan kepadatan bakteri yang semakin melimpah. Penyakit ice-ice diduga dapat dihasilkan secara in vitro oleh kombinasi dari peningkatan suhu dan kehadiran bakteri patogen. Penelitian ini bertujuan untuk mengkaji: a) jenis bakteri dari rumput laut yang terserang penyakit ice-ice, b) patogenisitas secara in vitro bakteri patogen dengan menggunakan mikropropagul, c) performa secara morfologi dan mikroskopis pada rumput laut yang diinkubasi pada suhu panas dan penginfeksian beberapa jenis bakteri patogen dengan konsentrasi bakteri yang berbeda. Penelitian ini dilakukan melalui metode eksperimen dengan tiga tahapan. Tahapan I: isolasi bakteri dan identifikasi dengan pengujian biokimia dan molekuler melalui sekuensing untuk mengidentifikasi spesies dari bakteri pada rumput laut yang terserang penyakit ice-ice; Tahapan II: Perlakuan penginfeksian bakteri patogen dengan jenis bakteri yang berbeda untuk menentukan tingkat patogenisitas bakteri patogen terhadap rumput laut; Tahapan III: Perlakuan kombinasi suhu dengan jenis dan konsentrasi bakteri yang berbeda untuk mengevaluasi performa morfologi dan mikroskopis jaringan rumput laut K. alvarezii. Hasil penelitian menunjukkan bahwa terdapat lebih dari satu jenis bakteri yang teridentifikasi pada K. alvarezii yang terserang penyakit ice-ice, yakni Shewanella haliotis strain DW01, Vibrio alginolyticus strain ATCC 17749, Stenotrophomonas maltophilia strain IAM 12323, Arthrobacter nicotiannae DSM 20123, Pseudomonas aeruginosa strain SNP0614, Ochrobactrum anthropic strain ATCC 49188, Catenococcus thiocycli strain TG 5-3 dan Bacillus subtilis subsp.spizizenii strain ATCC 6633. Dari kedelapan jenis bakteri tersebut, sebanyak lima jenis (62,5%) masuk dalam kelompok Gammaproteobacteria, lainnya masingmasing satu jenis bakteri (12,5%) adalah Alphaproteobacteria, Firmicutes, dan Actinobacteria. Hasil ini juga menunjukkan bahwa sebagian besar jenis bakteri penyebab penyakit ice-ice adalah Proteobacteria. Uji patogenisitas bakteri dilakukan secara in vitro dengan menggunakan mikropropagul hasil kultur jaringan yang diinfeksikan dengan kedelapan jenis bakteri hasil riset tahap pertama. Seperti yang ditemukan dalam penelitian vi sebelumnya, terdapat delapan jenis bakteri yang mungkin berasosiasi dengan penyakit ice-ice. Penelitian ini bertujuan untuk menguji tingkat patogenisitas dari isolat pada mikropropagul K.alvarezii dengan gejala serangan ice-ice berdasarkan gejala klinis, morfologi dan jaringan rumput laut. Mikropropagul berukuran 2-4 cm direndam dalam air laut yang mengandung 106 bakteri cfu / ml untuk menentukan patogenisitas. Timbulnya gejala ice-ice diamati setiap hari secara visual. Hasil penelitian menunjukkan bahwa bakteri yang paling cepat menimbulkan bleaching pada mikropropagul adalah Stenotrophomonas maltophilia (5 jam pascainfeksi), sedangkan paling lambat adalah dengan V. alginolyticus (44 jam pascainfeksi). Bakteri lainnya dapat menyebabkan gejala ice-ice yakni 15-21 jam pascainfeksi. Selanjutnya, bakteri Shewanella Haliotis dan V. alginolyticus ditemukan di talus sehat. Ini adalah studi pertama yang
Keyword: bakteri, suhu, salinitas, penyakit ice-ice, talus, Kappaphycus alvarezii

Judul: Construction of Strongly Optimal Binary Linear Code with Minimum Distance 9 and 11
Abstrak: A binary linear code of length n over q F is a subspace of n q F . A code has three parameters that attached to it, namely length, dimension, and minimum distance. A code with length n, dimension k and minimum distance d is often called [n, k, d ]-code. Usually, when two parameters are given, then we want to find a code that has the best value for the last parameter. Based on Gilbert- Varshamov bound, if a [n, k, d ]-code exists and can not be expanded, we call it a strongly optimal code. In this paper, we construct strongly optimal code with minimum distance 9 and 11. In constructing the code, we created a theorem and algorithm based on Gilbert-Varshamov bound before we implement the algorithm to MAPLE programming language. Because of computational limitations, the program can only construct up to k = 10 for d = 9 and k = 12 for d = 11.
Keyword: