Judul: Analisis Penambatan Molekul Senyawa Aktif Brotowali (Tinospora cordifolia) pada Enzim PPAR-γ sebagai agen Antidiabetes
Abstrak: Penambatan molekuler merupakan metode komputasi yang digunakan untuk memprediksi interaksi antara ligan dan reseptor. Senyawa aktif dari Brotowali (Tinospora cordifolia) telah terbukti memiliki potensi sebagai anti diabetes namun potensi dari masing-masing senyawa belum diketahui. Simulasi penambatan molekuler telah dilakukan untuk menguji potensi dari masing-masing senyawa terhadap enzim PPAR-γ dengan parameter energi ikat, binding site similarity (BSS) dan Konstanta Inhibisi. Senyawa aktif yang digunakan adalah Berberine, Isocolumbin, Jatrorrhizine, Magnoflorine, Palmatine dan Tinosporin sebagai ligan uji. Senyawa kontrol yang digunakan adalah Rosiglitazone. Hasil simulasi menunjukan tidak ada senyawa aktif brotowali yang memiliki energi ikat lebih kuat dibandingkan dengan energi ikat rosiglitazone. Presentase BSS yang paling besar dimiliki oleh Berberine dengan presentase sebesar 52%.
Keyword: Enzim PPAR-γ, penambatan molekuler, Tinospora cordifolia

Judul: Analisis Penambatan Molekul Senyawa Aktif Pare (Momordica charantia) pada Enzim Human PPAR untuk Agen Anti-Diabetes
Abstrak: Pare (Momordica charantia) merupakan salah satu tanaman yang memiliki aktivitas anti-diabetes. Senyawa yang terkandung didalam pare berupa Caffeic acid, Catechin, Chlorogenic acid, Epicatechin, Ferulic acid, Gallic acid, Gentisic acid, Kuguacin dan P-coumaric acid yang dipercaya berkhasiat untuk mengobati penyakit diabetes namun belum diketahui potensi dari masing-masing senyawa tersebut. Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi potensi senyawa aktif pare (Momordica charantia) pada enzim human PPARγ sebagai obat anti-diabetes melalui simulasi penambatan molekul (molecular docking). Senyawa kontrol yang digunakan dalam penambatan ini adalah Rosiglitazone dan senyawa uji yang yang digunakan adalah senyawa aktif pare. Epicatechin merupakan senyawa aktit pare yang memiliki potensi sebagai inhibitir enzim human PPARγ untuk agen antidiabetes mengikuti Rosiglitazone. Epicatechin memiliki energi bebas Gibbs ikatan yang kecil, konstanta inhibisi yang kecil, memiliki jumlah kontak hidrofobik yang paling banyak dan memiliki persentase binding site similarity yang besar dibandingkan ligan uji lainnya.
Keyword: Pare, penambatan molekul, enzim human PPARγ, senyawa aktif

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: