Judul: Karakterisasi Spesies Stingless Bee asal Bogor, Lebak, dan Luwu Utara Berdasarkan Gen Cytochrome C Oxidase 1
Abstrak: Stingless bee merupakan serangga polinator dengan keanekaragaman yang sangat tinggi. Berdasarkan morfologi, terdapat stingless bee yang bersifat cryptic sehingga perlu diidentifikasi secara molekuler dengan menggunakan DNA barcode berdasarkan gen Cytochrome C Oxidase 1 (COX1). Penelitian ini bertujuan mengkarakterisasi spesies stingless bee asal Bogor (Jawa Barat), Lebak (Banten), dan Luwu Utara (Sulawesi Selatan) menggunakan DNA barcode berdasarkan gen Cytochrome C Oxidase 1 (COX1). Identifikasi morfologi stingless bee berdasarkan karakteristik tubuh, kepala, propodeum, mesoscutum, mesoscutellum, sayap, dan tungkai. Analisis molekuler stingless bee meliputi ekstraksi DNA, amplifikasi gen COX1, sequencing, analisis haplotipe dan analisis bioinformatik. Berdasarkan identifikasi morfologi stingless bee asal Bogor dan Lebak merupakan Tetragonula laeviceps sedangkan stingless bee asal Luwu Utara merupakan T. aff. biroi. Alignment runutan gen COX1 T. laeviceps hasil penelitian ini membentuk enam haplotipe (H1–H6) dengan variasi sebanyak 20–21 nukleotida antara H1 dengan haplotipe lainnya dan jarak genetik antara H1 dengan haplotipe lainnya adalah 0.036–0.038. Tingginya variasi nukleotida dan jarak genetik pada T. laeviceps membentuk dua kelompok pada pohon filogeni T. laeviceps berdasarkan gen COX1 dengan bootstraps masing-masing sebesar 100% dan 99%. Tingginya variasi pada H1 dan membentuk kelompok terpisah dengan H2–H6 memungkinkan adanya proses cryptic spesies pada T. laeviceps
Keyword: DNA barcode, gen COXI, identifikasi morfologi, Tetragonula aff. biroi, Tetragonula laeviceps

Judul: Identifikasi Stingless Bee asal Riau: Menggunakan Metode Morfologi dan Molekular
Abstrak: Stingless bee adalah serangga polinator penting yang memiliki diversitas tinggi. Identifikasi morfologi sulit dilakukan karena adanya spesies kriptik. Oleh karena itu, identifikasi molekular diperlukan untuk mendukung identifikasi morfologi. Tidak ada karakterisasi stingless bee asal Riau, sehingga penelitian ini bertujuan untuk mempelajari identifikasi morfologi dan molekular dari stingless bee asal Riau. Dua spesies stingless bee dikoleksi dari Rumbio, Riau. Identifikasi morfologi dilakukan berdasarkan karakteristik mulut, tungkai dan tubuh. Runutan nukleotida didapatkan dari gen COI kedua sampel, dilakukan juga analisis bioinformatik dan konstruksi pohon filogeni. Hasil identifikasi menunjukkan satu spesies stingless bee adalah Geniotrigona thoracica (warna tubuh kemerahan, malar space panjang, dua gigi di mandibula). Namun, runutan nukleotida dari copy DNA yang didapat adalah gen COI-like, dikarakterisasikan adanya indels pada alignment DNA dan kodon stop pada asam amino deduksi. Spesies kedua diidentifikasi sebagai Heterotrigona itama (warna tubuh hitam, malar space pendek, satu gigi kecil di mandibula) dan runutan nukleotida prediksi gen COI dikonfirmasi dengan data GenBank sebagai H. itama. Konstruksi pohon mengelompokkan kedua spesies dengan bootstrap 100%, meskipun menggunakan dua gen berbeda.
Keyword: Geniotrigona thoracica, Heterotrigona itama, identifikasi morfologi, gen COI-like, gen COI, DNA barcode

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: