Judul: Specific Protein Analysis as an kopyor indicator in Cocos nucifera
Abstrak: Tanaman kelapa kopyor yang menghasilkan kurang lebih 100% buah kopyor telah berhasil dirakit oleh Unit Penelitian Bioteknologi Perkebunan. Namun sifat kopyornya baru diketahui setelah tanaman berbuah (4-6 tahun setelah tanam). Untuk mempersingkat waktu penulian diperlukan teknik untuk menyeleksi sifat kopyor secara dini, yaitu dengan membandingkan embrio kelapa kopyor dengan embrio kelapa dalam. Tujuan penelitian ini adalah untuk menetapkan kandungan protein embrio kelapa kopyor dan untuk mengetahui penanda sifat kopyor pada kelapa dengan menggunakan metode analisis protein, yaitu elektroforesis SDS-PAGE. Penelitian terdiri atas dua kegiatan, yaitu menentukan kandungan protein embrio kelapa kopyor dan kelapa dalam dengan metode Bradford dan Lowry dan melakukan analisis protein dengan elektroforesis SDS-PAGE. Sampel berupa embrio kelapa kopyor dan embrio kelapa dalam yang terdiri dari 9 genotipe kelapa kopyor yang berasal dari Tangerang dan 6 genotipe kelapa dalam yang berasal dari Unit Penelitian Bioteknologi Perkebunan. Hasil penelitian menunjukkan bahwa kandungan protein embrio kelapa kopyor lebih rendah dari protein embrio kelapa dalam, yaitu sebesar (8,118,19) µg untuk protein embrio kelapa kopyor dan sebesar (11,53 11,16) µg untuk protein embrio kelapa dalam. Selain itu terdapat perbedaan pita-pita protein dari embrio kelapa kopyor dan kelapa dalam yang sekaligus dapat mencirikan sifat kopyor dari kelapa, yaitu pita protein dengan nilai BM 64, 43, 32, dan 25 kDa tidak terdapat pada embrio kelapa dalam; pita protein embrio kelapa kopyor dengan nilai BM 55 kDa mempunyai konsentrasi atau ketebalan pita yang lebih besar dari kelapa dalam dan pita protein dengan BM 36 kDa yang terdapat pada embrio kelapa dalam tidak terdapat pada pita protein embrio kelapa kopyor.
Keyword: 

Judul: Pollen Dispersal Analysis among Pati Dwarf and Kalianda Tall Kopyor Coconut (Cocos nucifera L.) Based on SSR and SNAP Marker to Support Coconut Breeding Program
Abstrak: Kelapa kopyor merupakan kelapa mutan alami asli Indonesia yang harus dilestarikan dan dikembangkan lebih lanjut agar sumberdaya genetik asli Indonesia tersebut dapat dimanfaatkan sepenuhnya untuk kesejahteraan rakyat Indonesia. Abnormalitas fenotipe endosperma kelapa Kopyor diduga sebagai akibat dari defisiensi enzim penting tertentu selama dalam proses perkembangan endospermanya. Namun demikian, identitas enzim yang defisien dari endosperma kelapa Kopyor sampai saat ini masih belum diketahui. Karakteristik mutan pada kelapa Kopyor juga dapat diturunkan secara genetik dari tetua ke progeninya. Salah satu permasalahan yang dihadapi oleh petani kopyor adalah rendahnya kuantitas hasil buah kopyor yang dipanen. Akibatnya produksi buah kelapa kopyor masih belum dapat memenuhi kebutuhan konsumen.Adanya kelapa normal di antara pertanaman kelapa kopyor diduga mempengaruhi produktivitas buah kopyor.Keberadaan pohon dewasa kelapa Dalam berbuah normal diduga berpengaruh negatif terhadap produksi buah kopyor. Pohon tersebut dapat menyebarkan serbuk sari pembawa sifat normal pada bunga betina pohon kelapa kopyor, akibatnya buah yang terbentuk dari penyerbukan akan menjadi buah normal. Keberhasilan penyerbukan pada tanaman juga memerlukan bantuan polinator untuk penyebaran serbuk sari tanaman kelapa maupun pada tanaman lainnya. Studi penyebaran serbuk sari dipelajari dengan menggunakan marka molekular yaitu marka SSR (Single Sequence Repeat) yang mempunyai keunggulan yaitu bersifat kodominan, polimorfismenya tinggi, lokus tersebar di dalam genom dalam jumlah banyak dan sampel DNA yang dibutuhkan sedikit karena dalam melakukan deteksi menggunakan PCR (Polymerase chain reaction) yang dapat menggandakan DNA. Penanda DNA berbasis SNAP adalah satu-satunya penanda DNA yang memiliki sifat bi–alel dan kodominan, sehingga penanda SNAP mampu membedakan alel homozigot dari heterozigot yang efisien. Serangkaian penelitian telah dilakukan dengan tujuan untuk memberikan informasi mengenai tipe penyebaran serbuk sari dan besarnya persentase penyerbukan silang ataupun penyerbukan sendiri pada pertanaman kelapa, efek keberadaan pohon kelapa berbuah normal di dalam pertanaman kelapa berbuah kopyor, efek polinator terhadap produksi buah kopyor sehingga diharapkan produktivitas buah kelapa kopyor dapat ditingkatkan, selain itu juga memberikan informasi dasar genomik dan molekuler yang akan sangat berguna dalam mendukung program pemuliaan kelapa kopyor di masa yang akan datang. Oleh karena itu, penelitian penyebaran serbuk sari kelapa kopyor ini diperlukan untuk menjawab potensi permasalahan budidaya kelapa kopyor di masa depan. Analisis parental digunakan untuk mengevaluasi penyebaran serbuk sari pada kelapa kopyor dengan menggunakan CERVUS version 2.0 software. Keberadaan penyerbukan silang antara kelapa genjah dengan kelapa genjah, kelapa dalam dengan kelapa genjah dan kelapa hibrida dengan kelapa genjah diobservasi di pertanaman populasi kelapa kopyor Genjah Pati. Serbuk sari yang didonasikan dapat berasal dari serbuk sari donor yang berada dalam kisaran jarak tempuh 0-58 meter dari tetua betina yang dievaluasi. Oleh karena itu, selain dengan adanya keberadaan angin, polinator serangga juga dapat berperan penting dalam polinasi kelapa Kopyor. Pola pembungaan dan pembuahan pada tanaman kelapa kopyor tipe Dalam Kalianda menyebabkan rendahnya peluang terbentuknya buah kopyor pada tanaman kelapa berbuah kopyor yang dikelilingi tanaman kelapa normal. Penyerbukan kelapa kopyor oleh kelapa normal dengan jarak penyebaran serbuk sari rata-rata 14,7 m dengan penyebaran terjauh pada jarak 80 m dan penyebaran terdekat pada jarak 0 m. Pohon kelapa Dalam Kalianda menunjukkan rate of selfing sebesar 8,25% dan rate of outcrossing sebesar 91,75% di populasi kelapa Dalam Kalianda. Pertanaman kelapa Dalam Dukuh Seti Pati menunjukkan persebaran
Keyword: kelapa kopyor, endosperma abnormal, analisis parental, pergerakan serbuk sari, penyerbukan silang, penyerbukan sendiri, Marka SSR (mikrosatelit), Marka SNAP

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: