Judul: Penetapan Serotipe-H Dan Kandungan Gen CRY Sejumlah Isolat Bacillus Thuringiensis Asal Indonesia Serta Pengujian Toksisitasnya Terhadap Hyposidra Talaca
Abstrak: B. thuringiensis telah lama dikenal sebagai bakteri yang mempunyai sifat insektisidal spesifik, hingga dalam bidang pertanian bakteri ini banyak dipakai untuk pengendalian hama secara hayati untuk jenis serangga tertentu. Selain itu bakteri ini pun banyak terdapat di alam. Namun demikian di Indonesia masalah ini khususnya di sektor perkebunan belum banyak diungkap. Maksud penelitian ini ialah untuk mempelajari kandungan serotipe-H dan gen cry B. thuringiensis serta toksisitasnya terhadap ulat kilan (H. talaca), ulat yang menjadi hama pada tanaman kakao. Dari 92 contoh bahan pemeriksaan yang terdiri atas 55 contoh tanah, 35 contoh daun, dan dua contoh bangkai ulat yang berasal dari berbagai tempat di Indonesia, berturut-turut empat contoh daun, dan satu bangkai ulat mengandung bakteri pembentuk kristal protein (pkp) dan dari contoh-contoh tersebut dapat diisolasi 32 isolat B. thuringiensis dengan perincian 75% berasal dari contoh tanah, 15.6% dari contoh daun dan 9.4% dari bangkai ulat. Ke 32 isolat bakteri pkp tersebut tergolong ke dalam 11 serotipe-H yang berbeda. Berturut-turut adalah serotipe-H 34 dan 35 (masing-masing delapan isolat), serotipe-H 18 (lima isolat), serotipe-H 8, 10, dan 11 (dua isolat), serta serotipe-H 1,3, 30, 31, dan 42 (satu isolat). Selain itu, distribusi serotipe-H 35 adalah yang paling luas dibandingkan dengan yang lainnya. Serotipe-H 34. 35, 30, 31, dan 42 yang sejauh ini dikenal hanya terdiri dari satu subspesies, dalam penelitian ini ditunjukkan bahwa kemungkinan serotipe-serotipe tersebut terdiri dari lebih dari satu subspesies. Semua isolat, dalam sel vegetatifnya, mempunyai satu kristal berbentuk bulat, kecuali satu isolat mempunyai dua kristal dalam satu sel berbentuk bulat dan bipiramida. Selain itu, dilihat dari letak kristal setelah sel vegetatif lisis, dijumpai satu isolat yang kristalnya tetap lengket dengan endospora dan isolat ini termasuk dalam serotipe-H 8. Dengan pewarnaan untuk kristal terlihat bahwa kristal ini adalah kristal protein…dst
Keyword: Ulat kilan, Hyposidratalaca, Serotipe-H, Gen Cry, Interaksi

Judul: Analisis molekuler gen Cry dari galur-galur mutan Bacillus thuringiensis subsp. kurstaki HD-1 dengan teknik PCR (Polymerase Chain Reaction)
Abstrak: Pestisida yang biasa digunakan untuk mengendalikan serangga perusak tanaman (hama) adalah) bahan kimia beracun. Bahan kimia tersebut biasanya mempunyai spektrum daya bunuh yang luas, karena sifatnya ini dapat menimbulkan dampak negatif diantaranya membunuh organisme nontarget, berdampak terhadap kesehatan manusia, dan menyebabkan kerusakan lingkungan serta resistensi hama. Mengingat bahaya dari pestisida tersebut maka dicari alternatif yang lebih aman yaitu penanggulangan secara alami atau hayati yang disebut dengan biocontrol. Salah satunya adalah penggunaan bakteri sebagai biocontrol. Bacillus thuringiensis merupakan bakteri yang memiliki protein toksik yang dapat membunuh serangga perusak tanaman. Salah satu B. thuringiensis yang sudah dimanfaatkan adalah Bacillus thuringiensis subspesies kurstaki HD-1 yang mampu membunuh larva Lepidoptera. Dalam usaha meningkatkan potensi bakteri tersebut sebagai insektisida telah dilakukan mutasi (modifikasi genetik) dengan menggunakan sinar UV, etilmetansulfonat, dan metil-nitro-nitroso- guanidin (Jusuf 1987). Pada penelitian ini dilakukan analisis molekuler untuk mendeteksi perubahan yang terjadi pada gen cry akibat mutasi pada untaian basanya. Teknik analisis molekuler yang dilakukan adalah reaksi rantai polimerase (Polymerase Chain Reaction, PCR). Gen penyandi protein toksik (gen cry) untuk B. thuringiensis subsp. kurstaki HD-1 terdapat pada plasmid. Metode isolasi plasmid yang dipilih adalah metode Allen (Cork & khalil 1996), yaitu isolasi plasmid berdasarkan pada denaturasi alkali. Analisis DNA dari galur-galur mutan B. thuringiensis subsp. kurstaki HD-1 dengan menggunakan teknik PCR menunjukkan bahwa mutasi pada untaian DNA dapat menyebabkan terjadinya perubahan gen cry dari asalnya atau adanya penambahan jenis gen cry baru, seperti pada galur 25S7, 50S1, dan 2EM1 mempunyai gen cry tambahan selain gen cry yang terdapat pada galur liar [cry IA (b)] yaitu gen cry IA, ID, dan IIIA.
Keyword: molecular systems

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: