Judul: Pengujian ketahanan kekeringan padi gogo pad beberapa macam media
Abstrak: Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui pengaruh jenis media perkecambahan untuk pengujian ketahanan kekeringan pada padi gogo Penelitian ini terdiri dari dua tahap. Tahap I pengujian pada kondisi optimum dan tahap II pada kondisi sub optimum. Kedua tahap percobaan merupakan percobaan faktorial dalam rancangan acak lengkap dengan dua faktor dan tiga ulangan. Faktor pertama adalah media yang terdiri dari tiga macam yaitu tanah, pasir dan bata. Faktor kedua adalah varietas yang terdiri dari tiga macam yaitu varietas Way Rarem, varietas Jatiluhur dan varietas Gajah Mungkur. Jumlah satuan percobaan masing-masing adalah 27 satuan sehingga jumlah keseluruhannya adalah 54 satuan. Pengujian pada kondisi optimum menunjukkan bahwa pengaruh media nyata pada tolok ukur panjang plumula, panjang akar, berat kering plumula, keserempakan tumbuh dan kecepatan tumbuh, sedangkan pengaruh varietas nyata pada panjang plumula dan berat kering plumula. Interaksi antara media dan varietas berpengaruh nyata pada berat kering plumula. Varietas Gajah Mungkur menunjukkan berat kering plumula yang tertinggi pada media tanah dan pasir, namun tidak berbeda nyata dengan varietas Way Rarem dan varietas Jatiluhur pada media bata. Pengujian pada kondisi sub optimum menunjukkan bahwa pengaruh media nyata untuk semua tolok ukur yang diamati, pengaruh varietas nyata pada panjang plumula, berat kering plumula dan keserempakan tumbuh. Interaksi antara media dan varietas berpengaruh nyata pada Panjang plumula. Varietas Gajah Mungkur memiliki panjang plumula yang cenderung lebih tinggi di media tanah, paling rendah di media pasir dan cenderung paling rendah di media bata. Nilai delta dari penelitian ini menunjukkan bahwa pengaruh media nyata pada tolok ukur panjang plumula, panjang akar, daya berkecambah, keserempakan tumbuh dan kecepatan tumbuh. Pengaruh varietas tidak nyata untuk semua tolok ukur yang diamati. Interaksi antara media dan varietas berpengaruh nyata pada panjang plumula. Varietas Gajah Mungkur memiliki nilai delta panjang plumula yang paling rendah di media tanah, tidak nyata antar varietas di media bata dan memiliki nilai yang tertinggi pada media pasir…dst
Keyword: 

Judul: Pengujian Vigor Daya Simpan dengan Metode Pengusangan Cepat Kimia Serta Pengujian Vigor Kekuatan Tumbuh Pada Benih Padi (Oryza sativa L.)
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk untuk mendapatkan metode pengusangan cepat yang terbaik dan mudah untuk pengujian vigor daya simpan benih padi gogo, padi rawa, dan padi sawah. Disamping itu mempelajari korelasi antara Vigor Daya Simpan (VDS) dan Vigor Kekuatan Tumbuh (VKT) benih padi gogo, padi rawa, dan padi sawah. Penelitian ini dilaksanakan di Laboratorium Ilmu dan Teknologi Benih, Departemen Agronomi dan Hortikultura, Fakults Pertanian, Institut Pertanian Bogor, pada bulan April sampai Agustus 2011. Penelitian ini terdiri dari dua percobaan, yaitu percobaan pendahuluan dan percobaan utama. Percobaan pendahuluan bertujuan untuk mendapatkan lamanya waktu pengusangan pada Metode Pengusangan Cepat Kimia (MPCK) pada benih padi, dan mendapatkan tingkat konsentrasi PEG-6000 dan NaCl pada metode kekeringan dan salinitas, serta mendapatkan jumlah kertas yang dapat mensimulasikan cekaman kekeringan pada perlakuan tingkat ketinggian. Waktu pengusangan kimia yang digunakan adalah 0, 30, 60, 90, 120, 150, 180, 210, 240, 270, dan 300 detik. Percobaan potensial air PEG-6000 pada benih padi gogo terdiri dari -1.5, -2.0, -2.5 bar dan tingkat salinitas pada benih padi rawa dengan konsentrasi NaCl 3000, 4000, dan 5000 ppm. Jumlah kertas yang digunakan pada perlakuan tingkat kekeringan, yaitu 1-1 dan 1-2 lembar. Rancangan yang digunakan yaitu Rancangan Kelompok Lengkap Teracak (RKLT) dengan satu faktor yaitu lama waktu pengusangan pada pengujian vigor daya simpan, potensial air PEG-6000 pada pengujian vigor kekuatan tumbuh terhadap kekeringan, konsentrasi NaCl pada pengujian vigor kekuatan tumbuh terhadap salin, dan jumlah kertas pada pengujian vigor kekuatan tumbuh berdasarkan tingkat ketinggian. Percobaan ini menggunakan masing-masing lima genotipe padi gogo, padi rawa, dan padi sawah. Setiap perlakuan diulang sebanyak empat kali menggunkan 25 butir benih/perlakuan, kecuali pada pengujian VKT Kekeringan(Ketinggian) diulang sebanyak tiga kali menggunakan 10 butir benih/genotipe. Percobaan utama terdiri dari tiga pengujian, yaitu pengujian vigor awal benih, pengujian vigor daya simpan (VDS) benih melalui Metode Pengusangan Cepat Kimia (MPCK) dan pengujian vigor kekuatan tumbuh (VKT) benih pada kondisi sub-optimum (cekaman kekeringan dan salinitas), yang diaplikasikan pada 10 genotipe padi gogo, 20 genotipe padi sawah, dan 16 genotipe padi rawa. Lama penderaan yang digunakan hasil dari percobaan pendahuluan, untuk genotipe padi gogo didera selama 123 detik, genotipe padi rawa didera selama 100 detik, dan genotipe padi sawah didera selama 103 detik. Metode cekaman kekeringan terpilih yang diaplikasikan pada genotipe padi gogo dan padi sawah menggunakan potensial air PEG-6000 -2.0 bar (VKT Kekeringan(PEG)) dan pada perlakuan tingkat ketinggian (VKT Kekeringan(Ketinggian)) jumlah kertas yang digunakan 1-1 lembar dengan ketinggian air 2 cm dari permukaan wadah, sedangkan pada cekaman salinitas konsentrasi yang digunakan adalah NaCl 4000 ppm (VKT Salin(NaCl)). Rancangan yang digunakan adalah Rancangan Kelompok Lengkap Teracak (RKLT) satu faktor (genotipe padi), yang diulang sebanyak tiga kali menggunakan 25 butir benih, pada pengujian VKT Kekeringan(Ketinggian) menggunakan 10 butir benih. Terapat korelasi yang signifikan antara VDS dan VKT terhadap kekeringan (0.48-0.67), antara VDS dan VKT salin (0.32-0.35). Genotipe dengan VDS tertinggi berturut-turut untuk padi gogo, padi sawah, dan padi rawa adalah B11592F-MR- 16-1-5-6, B11742-RS*2-4-MR-16-3-2-SI-4-4-MR-3-PN-3-2, dan B13131-7-MR- 1-KA-5. Genotipe dengan VKT Kekeringan(PEG) dan VKT Kekeringan(Ketinggian) tertinggi adalah B12799E-TB-1-1-4 pada padi gogo, B12510-21-SI-3-1-MR-2-PN-3-1 dan B12743-MR-15-5-3-PN-1-4 pada padi sawah, sedangkan genotipe tertinggi VKT Salin(NaCl) pada padi rawa adalah B13143-8-MR-3-KA-14.
Keyword: 

Judul: Mitochondrial DNA Gene Organization and Phylogenetic Relationship of Naja siamensis
Abstrak: Naja siamensis is one of Asiatic cobra in the Family of Elapidae, known as a cryptic snake. It has many morphological variations that lead to misidentification. Misidentification can cause the wrong concept in developing antivenom types due to high snakebite cases occur in Thailand. Thus, an accurate species identification using a molecular approach is crucially required. Mitochondrial DNA has been used widely in snake molecular studies. These studies were aimed to determine the arrangement of the N. siamensis partial mitochondrial genes using reptile-oriented primers and to reveal the phylogenetic relationship among other species of Asian cobra. DNA extraction was carried out based on the standard DNA salting-out protocol and was conducted by bioinformatics analysis using BLASTn and MEGA 6 software. Gene annotation was performed against N. kaouthia complete genome. A total of 3121 bp of N. siamensis mtDNA genes were sequenced consisting of partial of six regions: 16S rRNA, ND1, tRNA-Ile, CRII region, tRNA-Leu, tRNA-Gln, and COI genes. The mtDNA gene organization of N. siamensis was predicted to has a similar pattern with the common Elapidae mtDNA gene organization. This study showed that there is a monophyletic form in Naja genus and N. kaouthia is the closest species with N. siamensis based on partial 16S rRNA and ND1 gene.
Keyword: 16S rRNA, Elapidae, ND1, phylogenetic relationship