Judul: Pengenalan Spesies Nematoda Puru Akar (Meloidogyne spp.) Melalui  Karakter Sidik Perinium Menggunakan Jaringan Syaraf Tiruan
Abstrak: Nematoda adalah hewan mikroskopik yang bentuknya menyerupai cacing dan banyak jenisnya yang dapat menyerang tanaman. Kerusakan tanaman akibat serangan nematoda ini sering tidak khas dan membingungkan. Di antara sekian banyak jenis nematoda yang ada di dalam tanah harus ditentukan jenis nematoda yang mana yang bertanggung jawab dalam kerusakan tanaman, karena tidak semua nematoda merusak tanaman. Untuk mengetahui peran nematoda yang didapatkan dalam ekosistem tanaman, diperlukan identifikasi untuk menentukan jenis nematoda. Kesalahan dalam identifikasi dapat menyebabkan kesalahan dalam pengendalian dan manajemen terhadap nematoda tersebut. Dalam penelitian ini akan dibangun suatu sistem yang mampu mengidentifikasi nematoda parasit tumbuhan menggunakan jaringan syaraf tiruan propagasi balik dengan praproses transformasi wavelet. Data yang digunakan dalam penelitian ini merupakan data citra perineal pattern (sidik perinium). Data citra tersebut berjumlah 24 buah yang berasal dari 4 spesies nematoda yaitu Meloidogyne incognita, M. javanica, M. arenaria, dan M. hapla. Sebelum citra dimasukkan ke dalam jaringan untuk proses pengenalan maka dilakukan proses segmentasi untuk menghilangkan background yang tidak beraturan dan tidak rata yang terdapat pada citra. Citra yang telah mengalami proses segmentasi masih berdimensi cukup besar. Untuk memperkecil dimensi maka dilakukan proses transformasi wavelet sebanyak 3 level. Proses identifikasi nematoda pada penelitian ini menggunakan Jaringan Syaraf Tiruan Propagasi Balik karena dinilai dapat menangani pengenalan pola-pola kompleks dengan sangat baik. Parameter yang diamati adalah nilai akurasi maksimum dengan kombinasi hidden neuron, toleransi kesalahan, level dekomposisi wavelet, dan fungsi pelatihan jaringan syaraf tiruan. Dari hasil percobaan didapatkan nilai akurasi 87.5% yang berasal dari dekomposisi level 1 dengan toleransi kesalahan 0.001 dan hidden neuron 50 menggunakan fungsi pelatihan traingd.
Keyword: 

Judul: Deteksi Dan Identifikasi Spesies Nematoda Puru Akar Meloidogyne Penyebab Umbi Berbintil Pada Kentang
Abstrak: Kentang (Solanum tuberosum L.) adalah tanaman dari famili Solanaceae yang merupakan tanaman pangan keempat utama dunia sesudah gandum, jagung dan padi. Indonesia merupakan salah satu produsen kentang di Asia Tenggara dengan sentra produksi utama di Pulau Jawa, yaitu di provinsi Jawa Barat, Jawa Tengah, dan Jawa Timur. Produksi kentang mengalami penurunan yang disebabkan oleh beberapa faktor salah satunya adalah gangguan hama dan penyakit. Nematoda puru akar/NPA (Meloidogyne spp.) adalah salah satu patogen pada kentang yang berdampak nyata dalam mengurangi kualitas dan kuantitas umbi kentang. Penelitian untuk mendeteksi dan mengidentifikasi spesies Meloidogyne pada kentang di pulau Jawa dilaksanakan di Laboratorium Nematologi Departemen Proteksi Tanaman IPB, Laboratorium Karantina Tumbuhan Tanjung Priok Wilker Pos Bogor, dan Laboratorium Karantina Tumbuhan BBKP Soekarno-Hatta. Contoh umbi kentang yang sakit yaitu umbi berbintil diambil dari Pangalengan (Jawa Barat), Banjarnegara (Jawa Tengah), dan Kota Batu (Jawa Timur). Penelitian dilaksanakan dari bulan Oktober 2014 hingga Maret 2015. Identifikasi secara morfologi dilakukan terhadap pola perineal (sidik pantat) nematoda betina. Identifikasi secara molekuler menggunakan teknik Polymerase Chain Reaction (PCR) dilanjutkan dengan sikuensing fragmen DNA dan analisis filogenetik. DNA nematoda berasal dari ekstraksi nematoda betina dan diamplifikasi dengan PCR menggunakan primer spesifik untuk Meloidogyne incognita (MI-F dan MI-R), M. arenaria (Far dan Rar), dan M. javanica (Fjav dan Rjav). Primer multipleks, yaitu JMV1, JMV2, dan JMV-hapla digunakan untuk mendeteksi M. hapla, M. falax, dan M. chitwoodi. Gejala penyakit oleh NPA di lapangan ditemukan bervariasi, antara lain permukaan umbi tidak rata, bergelombang, tidak normal, dan berbintil dan terkadang disertai dengan adanya infeksi dari patogen lain sehingga umumnya umbi cepat busuk. Pada bagian dalam umbi terdapat bercak-bercak berwarna krem kekuningan (nekrosis) yang terdiri atas nematoda betina dan massa telur. Hasil identifikasi berdasarkan karakter morfologi diikuti (konfirmasi) identifikasi secara molekuler dengan PCR menunjukkan bahwa spesies yang berasosiasi dengan umbi berbintil pada kentang di tiga sentra produksi kentang di Pulau Jawa adalah M. arenaria, M. javanica, dan M. incognita. M. incognita dan M. javanica terdeteksi di Pangalengan, Banjarnegara, dan Kota Batu sedangkan M. arenaria hanya terdeteksi di Pangalengan dan Banjarnegara. Produk PCR kemudian digunakan untuk sikeunsing untuk menunjukkan adanya hubungan filogenetik dan homologi dengan isolat dari negara lain. Isolat M. javanica asal Pangalengan berkerabat sangat dekat dengan isolat M. javanica asal Cina dan Malaysia dengan tingkat homologi yang tinggi yaitu berturut-turut sebesar 95.7% dan 95.4%. Isolat M. incognita asal Pangalengan memiliki hubungan kekerabatan yang sangat dekat dengan isolat asal Cina, India, dan 5 Malaysia dan memiliki nilai homologi yang tinggi dengan M. incognita asal Cina, India, dan Malaysia berturut-turut sebesar 99.8%, 99.6%, dan 99.2%.
Keyword: filogenetik, M. arenaria, M. javanica, M. incognita, pola perineal

Judul: Konsumsi Minuman Beroksigen dan Dampaknya terhadap Performa saat Berolahraga, Profil Lipid, Glukosa Darah dan SGOT/SGPT
Abstrak: Exercise requires more energy (ATP) than normal activities. Oxygen consumption increases, while lung capacity is limited. It causes anaerobic respiration which produces lactic acid that reduces exercise performance. The purpose of this study was to assess the effects of short-term and long-term drinking of oxygenated water on the exercise performance and oxygen saturation (SpO2), lipid profile (cholesterol, triglycerides, LDL, and HDL) and blood glucose, as well as an influence on liver (AST/ALT). This study included (1) ethical clearance submission, (2) selection of potential respondents, (3) socialization and informed consent, (4) short-term experiment, (5) long-term trials, and (6) data processing. Recruitment of respondents was based on inclusion and exclusion criteria and medical check up. In the socialization, the right way of drinking samples was introduced. In the short-term and after long term experiments, twelve male student volunteers drank oxygenated water (50, 80 and 130 ppm) and normal water, 15 minutes before treadmill (10 Kmh) in Somatokinetika Laboratory of Jakarta State University. SpO2 was measured before and after treadmill, and 0, 5, 10, 15 minutes after drinking. In the long-term, seventeen male student volunteers drank oxygenated water (100 ppm) for 21 days and lipid profile, blood glucose, and AST/ALT were analyzed. Before and after intervention, blood plasma was used to measure the parameters in the Laboratory Clinic of dr Katili. Cholesterol, triglycerides, and blood glucose analysis used enzymatic colorymetry method, while HDL analysis used enzymatic colorymetry and precipitation method. LDL was calculated by Friedewald equation and AST/ALT analysis used kinetic method. Oxygenated water had no effect on SpO2 and exercise performance. Interestingly the average of VO2 max and time to fatigue of those drank oxygenated water were higher than those drank normal water. VO2 max (mL/Kg/menit) increased from 45.87 (normal water) to48.89 (50 ppm), 48.03 (80 ppm), 47.40 (130 ppm), and 48.76 (long-term). Time to fatigue was be reached 10.34 minutes (normal water), 11.18 minutes (50 ppm), 11.27 menit (80 ppm), 130 ppm (10.93 minutes) and 11.60 minutes (long-term). Long-term effects also showed the improvements of cholesterol (168.12 to 114.53 mg/dL), LDL (103.94 to 54.41 mg/dL) and the ratio of cholesterol : HDL, however they were also influenced by diet and intensity of activity. HDL, triglycerides, and blood glucose was not affected by oxygenated water and had no harmful effect on the liver.
Keyword: