Judul: Antirheumatoid Potency of Biflavonoid Active Compounds from Araucaria Genus by In Silico Docking to Proteasome 20S
Abstrak: Rheumatoid arthritis (RA) merupakan penyakit rematik yang menyerang sistem persendian akibat inflamasi. Obat RA yang umum digunakan hanya menghambat satu jalur inflamasi. Senyawa isoginkgetin dari kelompok biflavonoid mampu menghambat beberapa jalur inflamasi melalui proteasom 20S. Struktur proteasom PDB ID 5LE5 dan 5LF7 digunakan untuk mengeksplorasi situs aktif baru yang mungkin ditambati ligan dan mengidentifikasi keserupaan situs ikat ligan terbaik. Kandidat obat RA ditapis dengan variasi struktur 23 ligan biflavonoid dari genus Araucaria menggunakan Autodock Vina. Ligan oknaflavon (U23) memiliki potensi penghambatan tertinggi untuk kedua reseptor. Selain itu, kelompok amentoflavon dengan subtituen metil di posisi 7 dan 7′′ juga menunjukkan potensi penghambatan tertinggi. Keberadaan variasi struktur dan muatan tidak nyata memengaruhi skor Vina (ΔG). Ligan terbaik U23 menempati situs aktif yang berbeda di kedua target. Pada struktur 5LE5, biflavonoid cenderung berinteraksi dengan rantai L (subunit β1), dan juga menempati situs aktif rantai K (subunit β5) struktur 5LF7., Rheumatoid arthritis (RA) is rheumatism that attacks the joints through inflammation. Commonly used RA drugs only inhibit one pathway. Isoginkgetin, a biflavonoid, can inhibit several inflammatory pathways via the 20S proteasome. The PDB IDs 5LE5 and 5LF7 of proteasome structures were used to explore possible new active sites and identify binding site similarity among the best ligands. Autodock Vina was employed to screen RA drug candidates from structure variations of 23 biflavonoid ligands of the Araucaria genus. Ochnaflavone (U23) showed the highest inhibition potential on both receptors. Moreover, the amentoflavone group with methyl substituents at 7 and 7′′ positions also showed the highest inhibitory potential. The presence of structure and charge variations did not significantly affect the Vina scores (ΔG). U23 occupied different active sites on both targets. In the 5LE5 structure, biflavonoids interacted with the L chain (β1 subunit) and occupied the active site of the K chain (β5 subunit) of the 5LF7 structure.
Keyword: biflavonoid, binding site similarity, molecular docking, proteasome, rheumatoid arthritis

Judul: Hubungan Struktur dan Aktivitas Senyawa Biflavonoid Genus Araucaria sebagai Inhibitor Enzim α-Glukosidase secara In Silico
Abstrak: Diabetes melitus (DM) merupakan penyakit gangguan metabolik yang ditandai dengan tingginya kadar gula dalam darah. Indonesia menempati urutan ke-5 jumlah penderita DM tertinggi di dunia. Acarbose, agen antidiabetik komersial yang bekerja dengan menghambat α-glukosidase, penggunaannya dalam jangka panjang menimbulkan efek samping sehingga senyawa potensial dari bahan alam diperlukan sebagai alternatif. Pengembangan obat baru perlu diprediksi melalui metode in silico agar menghemat biaya dan waktu karena dapat dilakukan dengan cepat secara komputasi. Genus Araucaria, kelompok tanaman yang mengandung biflavonoid, diprediksi dapat menurunkan kadar glukosa darah melalui inhibisi α-glukosidase. Penelitian ini bertujuan mengkaji interaksi molekuler dengan teknik simulasi penambatan molekuler, serta menguji potensi senyawa biflavonoid genus Araucaria sebagai inhibitor α-glukosidase secara in silico berdasarkan struktur dan gugus fungsinya. Hasil penambatan molekuler menunjukkan bahwa ligan uji (5), diprediksi sebagai ligan yang paling berpotensi sebagai inhibitor α-glukosidase dengan nilai ∆G -8,6 kkal/mol, Ki 0,489 μM, dan Binding Site Similarity 68,75% terhadap keseluruhan residu sekitar reseptor., Diabetes mellitus (DM) is a metabolic disorder characterized by high blood sugar levels. Indonesia ranks 5th with the highest number of DM sufferers in the world. Acarbose, a commercial antidiabetic agent that works by inhibiting α-glucosidase, its long-term use often causes side effects, so potential compounds from natural ingredients need as alternatives. New drug development needs to be predicted through in silico method to save costs and time because it is done computationally fast. The genus Araucaria, a group of plants containing biflavonoids, is predicted to lower blood glucose levels through α-glucosidase inhibition. This study examines the molecular interactions with molecular docking simulation techniques and examines the potential of biflavonoid compounds of the genus Araucaria as α-glucosidase inhibitors using in silico analysis of their structure and functional groups. The molecular docking results showed that the test ligand (5), was predicted to be the ligand with the most potential as an α-glucosidase inhibitor with ∆G -8,6 kcal/mol, Ki 0,489 M, and Binding Site Similarity 68,75% of the total residue around the receptor.
Keyword: α-Glukosidase, Diabetes, Araucaria, Penambatan Molekuler

Judul: Perilaku Reproduksi dan Karakteristik Mikrohabitat tempat Bertelur Burung Gosong (Megapodius reinwardtii Dummont 1823) Di Taman Buru Pulau Moyo
Abstrak: Burung gasang (Megapodius reinwardtii) merupakan jenis burung terestrial yang selalu berpasangan sepanjang hidupnya. Burung ini dilindungi berdasarkan SK Menteri Kehutanan No. 882/Kpts-II/1992 tanggal 28 September 1992. Penyebaran satwa ini hanya terbatas di wilayah Indonesia bagian timur.
Keyword: