Judul: Genetic Diversity Analysis of Durian Kura-kura (Durio testudinarius Becc.) Based on Morphology, DNA Barcoding and Simple Sequence Repeat Markers
Abstrak: Durian Kura-kura (Durio testudinarius Becc.) merupakan spesies endemik Kalimantan dari famili Malvaceae yang memiliki karakter yang unik dan berbeda dari kerabat durian pada umumnya, yaitu buah muncul pada pangkal batang utama. Karakter ini merupakan sumber genetik yang berpotensi untuk dimanfaatkan dalam perakitan varietas unggul melalui program pemuliaan tanaman. Sedikitnya informasi dan kajian tentang keragaman genetik jenis ini berdampak pada kegiatan konservasi dan pemanfaatan plasma nutfah melalui program pemuliaan tanaman tidak berjalan dengan optimal. Tujuan umum penelitian ini adalah untuk mengkarakterisasi dan menganalisis keragaman genetik Durian Kura-kura berdasarkan pendekatan morfologi dan molekuler menggunakan DNA barcoding dan marka simple sequence repeat (SSR). Penelitian ini terdiri atas tiga topik dan empat percobaan. Topik pertama (percobaan pertama) yaitu menganalisis keragaman genetik D. testudinarius menggunakan pendekatan karakter morfologi. Percobaan ini menggunakan 50 aksesi dari lima populasi di Kalimantan Barat yaitu Sambas, Landak, Sanggau, Sekadau dan Ketapang. Sebanyak 15 parameter morfologi vegetatif digunakan dalam parameter pada percobaan ini. Dari total parameter uji, sebanyak sembilan parameter menunjukkan keragaman di antara aksesi uji. Karakter tersebut yaitu panjang dan lebar helai daun, rasio panjang-lebar helai daun, permukaan batang, bentuk helaian daun, bentuk ujung dan pangkal daun, tepi helaian daun dan kekilauan permukaan bawah daun. Berdasarkan analisis klaster dengan metode Ward, aksesi-aksesi uji memperlihatkan mengumpul berdasarkan populasi asal masing-masing dan mengelompok menjadi dua grup utama, yaitu grup yang terdiri dari populasi Sekadau, Landak dan Sanggau, dan grup yang terdiri dari populasi Sambas dan Ketapang. Pengelompokkan ini mengindikasikan adanya kemiripan di antara populasi uji. Topik kedua (percobaan kedua) yaitu menganalisis keragaman genetik D. testudinarius menggunakan DNA barcoding. Sebanyak satu sampel dari masing-masing populasi dilakukan pengurutan DNA berdasarkan marka DNA barcoding dari tiga gen kloroplas yaitu rbcL, matK dan trnL-trnF intergenic spacer serta satu wilayah inti internal transcribed spacer (ITS). Hasil analisis variasi nukleotida menunjukkan adanya variasi yang rendah dari lima aksesi uji pada tiga gen kloroplas, namun menunjukkan variasi yang tinggi pada wilayah inti ITS. Hal ini membuktikan bahwa genom kloroplas memiliki laju evolusi yang rendah dibandingkan dengan genom inti. Laju evolusi genom kloroplas dan inti berbeda secara signifikan karena beberapa faktor dalam dan luar, termasuk cara pewarisan, laju mutasi, dan tekanan evolusi yang dihadapi. Analisis filogenetik menunjukkan pengelompokkan kelima aksesi di satu grup yang sama baik berdasarkan gen kloroplas maupun wilayah inti ITS. Secara umum kelima aksesi memperlihatkan hubungan kekerabatan yang dekat dengan D. beccarianus, terlihat dari jarak genetik antar keduanya pada pohon filogenetik. Topik ketiga (percobaan tiga dan empat) yaitu mengembangkan marka SSR spesifik dan menggunakannya dalam analisis keragaman genetik populasi D. testudinarius. Percobaan ketiga menggunakan data pengurutan genom utuh (whole genome sequencing/WGS) dari genom D. testudinarius hasil teknologi next generation sequencing (NGS). Penggalian data SSR menggunakan program MISA dan desain primer memanfaatkan perangkat lunak Primer3 berbasis internet. Sebanyak 20 pasang primer berhasil didesain dan teramplifikasi dengan baik pada sampel DNA genom D. testudinarius. Kedua puluh pasang primer baru ini juga diuji dan dapat teramplifikasi pada 19 sampel DNA genom spesies lainnya dari anggota ordo Malvales. Hal ini menunjukkan kedua puluh pasang primer yang baru ini memiliki tingkat transferabilitas yang luas, terutama pada anggota Malvaceae. Percobaan keempat menggunakan marka SSR spesifik
Keyword: spesies endemik, polimorfik, sumber daya genetik, variasi nukleotida

Judul: Analisis Kekerabatan Progeni Hasil Persilangan Durio zibethinus Murr. x Durio kutejensis Taman Buah Mekarsari Berdasarkan Karakter Vegetatif dan Marka Mikrosatelit.
Abstrak: Durian (Durio sp.) merupakan tanaman buah asli Indonesia dari famili Malvaceae yang memiliki keragaman genetik tinggi di alam. Analisis keragaman genetik durian menjadi informasi dasar untuk pelaksanaan kegiatan seleksi dan persilangan lanjutan dalam program pemuliaan durian. Marka mikrosatelit merupakan salah satu metode analisis penanda molekuler kodominan. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi kekerabatan 5 aksesi durian Mekarsari hasil persilangan Durio zibethinus Murr. (Durian Matahari) x Durio kutejensis (Lai) dan kedua tetuanya dengan 1 outgrup Durio dulcis berdasarkan karakter vegetatif dan marka mikrosatelit. DNA diisolasi menggunakan DNeasy® Plant Pro Kit. Delapan primer mikrosatelit yang digunakan adalah MS1CT-5FD2, MS1CT-6FA1, MS1CT-12FB2, MS1GT-15FB1, MS1GT-22FA2, MS1GT-27FC1, MS1AAC-5FC2, MS1AAC- 19FD1. Analisis marka mikrosatelit menggunakan PCR Type-it Multiplex Master Mix. Analisis filogenetik menggunakan metode algoritma UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean) pada software Phylip. Rata-rata alel yang didapat dari 8 lokus yang diuji ± 7. Terdapat 2 pasang lokus yang memiliki NA paling tinggi yaitu lokus MS1AAC-19 dan MS1GT-22 yang memiliki alel masing-masing 9 serta lokus MS1GT-15 dan MS1GT-27 yang masing-masing memiliki alel 8. DPR 1, DPR 6, DPR 7, DPR 8, dan DPR 13 memiliki jarak kekerabatan yang dekat dengan durian Matahari sebagai tetua betina secara genetik dan morfologi dibanding Lai.
Keyword: Alel, hibridisasi, lokus, simple sequence repeats

Judul: Elektrodeposisi Film Tipis Semikonduktor Cu2ZnSnS4 (CZTS) pada Substrat Kaca ITO
Abstrak: Semiconductor Cu2ZnSnS4 (CZTS) thin film that can be used as absorber layers on solar cell module was made via electrodeposition method. CZTS thin film was electrodeposited on the surface of a silicate glass coated with a thin layer of indium tin oxide (ITO). Deposition process was done using potentiostatic mode at room temperature with a potential of 1.05 V for 30, 45, and 60 minutes, followed with annealing the film at 2 different temperatures, 500 ºC using furnace and 180 ºC using hot plate, both treatments for 45 minutes in N2/H2S atmosphere. The X-ray difractograms were analyzed using Match 2 program and showed that the CZTS thin films had kesterit crystalline structure, with a low percentage of CZTS phase. The thin film also contained secondary phases such as Cu2S, ZnS, and SnS. The obtained CZTS thin films had a thickness between 1.039 and 1.676 μm. Absorption study showed that the band gap energy of CZTS thin films which was annealed using furnace ranged from 1.50 to 1.52 eV, whereas that annealed using the hot plate was not observed. The band gap energy value showed that CZTS thin films can be used as sunlight absorber layers on solar cell. The formation of CZTS crystal film on this investigation was effectively performed using furnace annealing process at a temperature of 500 ºC with deposition time of 45 minutes.
Keyword: Thin film, Electrodeposition, Cu2ZnSnS4