Judul: IPB (Bogor Agricultural University), Selection and Application of Probiotics in Tilapia (Oreochromis niloticus) through Approach One Health
Abstrak: Probiotik merupakan mikroorganisme hidup tidak patogen yang dapat memberikan keuntungan pada inang dan lingkungannya. Mikroorganisme yang banyak dimanfaatkan sebagai probiotik adalah dari golongan bakteri. Bakteri probiotik umum digunakan dalam budi daya ikan yang diberikan melalui pakan dan air budi daya. Pada penelitian ini bakteri probiotik diisolasi dari saluran cerna ikan nila. Seleksi kandidat bakteri probiotik dilakukan dengan cara menyeleksi bakteri sebagai penghasil enzim pencernaan dan penghasil antibakteri. Adanya masalah resistansi antibiotik pada bakteri menjadikan bakteri probiotik tidak aman untuk digunakan sebagai probiotik karena dapat berpotensi resistan terhadap antibiotik dan membawa gen resistan antibiotik. Penyebaran bakteri resistan dan gen resistan dari bakteri ke bakteri lainnya akan berakibat pada penyebarannya di lingkungan budi daya. Adanya peranan elemen genetik gerak, mobile genetic elements (MGEs) menjadikan bakteri dapat mentrasfer gen resistan antibiotik ke bakteri lainnya. Keberadaaan bakteri resistan antibiotik dapat menjadikan masalah pada berbagai sektor yang mencakup kesehatan hewan, lingkungan dan manusia (One health). Penyakit yang disebabkan oleh bakteri resistan sangat sukar untuk diobati dengan menggunakan antibiotik, sehingga akan berisiko tinggi terhadap kesehatan hewan, manusia dan lingkungan. Penggunaan probiotik yang mengandung bakteri resistan dan gen resistan antibiotik juga akan mempengaruhi terhadap kesehatan hasil produk perikanan. Produk hasil perikanan yang membawa bakteri resistan dan gen resistan dapat berpotensi mempengaruhi kesehatan manusia dan lingkungan. Tujuan umum penelitian ini adalah mendapatkan bakteri sebagai kandidat probiotik yang tidak bersifat resistan dan tidak membawa gen resistan antibiotik tertentu, serta evaluasi kinerjanya dengan cara in vivo menggunakan ikan nila. Penelitian pertama bertujuan untuk mendapatkan koleksi bakteri kandidat probiotik. Bakteri hasil koleksi dikarakterisasi sebagai penghasil enzim pencernaan protease, lipase, amilase dan selulase dengan menggunakan metode disk diffusion. Selain itu, bakteri sebagai kandidat probiotik dikarakterisasi sebagai penghasil antibakteri yang dapat menghambat pertumbuhan bakteri Streptococcus agalactiae, Streptococcus iniae dan Aeromonas hydrohila menggunakan metode disk diffusion pada media agar dan metode kultur bersama dalam media cair. Karakterisasi pola hemolitik menggunakan media agar darah. Hasil penelitian menunjukkan sebanyak 465 isolat bakteri diisolasi dari saluran cerna ikan nila dari beberapa daerah yaitu Sukabumi, Ciamis, Serang, Banjarnegara, Banyumas, Jayapura, Sorong, Manokwari Selatan, Takalar, Lampung, Batam dan Mandiangin. Hasil isolat bakteri sebagai kandidat probiotik dibagi menjadi dua kelompok berdasarkan bentuk sel bakteri. Sebanyak 459 koleksi isolat bakteri yang didapatkan dengan bentuk sel basil dan 6 isolat bakteri bentuk sel kokus. Sejumlah 29,84% (137/459) diidentifikasi dapat menghasilkan enzim pencernaan. Sampel 15,32% (21/137) isolat bakteri dapat menghasilkan enzim pencernaan dan dapat menghambat pertumbuhan bakteri Streptococcus agalactiae dan Streptococcus iniae. Isolat bakteri bentuk sel kokus diidentifikasi memiliki potensi dapat menghambat pertumbuhan bakteri Streptococcus agalactiae, Streptococcus iniae dan Aeromonas hydrophila. Bakteri sebagai kandidat probiotik yang memiliki pola hemolitik g diambil sebagai kandidat probiotik. Penelitian kedua bertujuan mengidentifikasi secara fenotipe dan genotipe isolat bakteri menggunakan primer 16S RNA, mengidentifikasi genom lengkap, mengidentifikasi komposisi sekuen G~C dan menganalisis sifat permukaan sel bakteri. Karakterisasi sifat hidrofobik permukaan sel bakteri menggunakan metode uji agregasi garam, uji spontan agregasi, uji otomatis agregasi, uji agregasi bakteri menggunakan n-hexadecane, serta uji kepatuhan bakteri terhadap bahan polistiren. Selain itu sifat permukaan sel bakteri juga dilakukan dengan metode uji pertumbuhan bakteri dalam media soft agar. sekuen dan memiliki pola pertumbuhan kompak dalam media
Keyword: antibiotik, gen resistan, ikan nila, one health, probiotik, antibiotic, gene resistance, one health, probiotic, tilapia

Judul: Aplikasi Probiotik Multispesies Melalui Pakan pada Budidaya Ikan Nila (Oreochromis niloticus) untuk Pencegahan Penyakit Streptococcosis
Abstrak: Streptococcosis merupakan salah satu penyakit yang seringkali muncul pada kegiatan budidaya ikan nila. Penyakit ini disebabkan oleh patogen Streptococcus agalactiae. Salah satu upaya yang dapat diterapkan sebagai pencegahan infeksi patogen S. agalactiae terhadap potensi produksi intensif optimal budidaya ikan nila adalah aplikasi probiotik yang disuplementasi pada pakan. Aplikasi probiotik secara tunggal menghasilkan respons positif terhadap peningkatan respons pertumbuhan dan respons imun inang, akan tetapi aplikasi kombinasi probiotik multispesies yang saling bersinergis dapat memberikan hasil lebih baik dalam menstimulasi pertumbuhan serta sistem imun organisme budidaya. Efektivitas aplikasi probiotik dipengaruhi oleh komposisi probiotik, konsentrasi yang digunakan, viabilitas sel probiotik selama penyimpanan dan pelekatan ketika berada dan bekerja pada saluran pencernaan inang. Salah satu teknik yang dapat digunakan untuk mempertahankan viabilitas sel probiotik yaitu teknik mikroenkapsulasi. Tahap I penelitian ini bertujuan untuk menentukan kombinasi probiotik terbaik yang disuplementasi melalui pakan dan tahap II untuk menentukan aplikasi terbaik dari pemberian mikrokapsul probiotik dan probiotik tanpa mikrokapsul untuk pencegahan streptococcosis. Kombinasi probiotik yang digunakan pada penelitian ini adalah Bacillus cereus P22 CipR, Bacillus subtilis ND2 CefR, Staphylococcus lentus L1k TetR. Tahap I, pengujian kombinasi probiotik disuplementasi pada pakan dengan dosis 1 % dan diberikan selama 14 hari. Perlakuan meliputi K- (kontrol negatif), K+ (kontrol positif), perlakuan kontrol tanpa suplementasi probiotik, K1 (kombinasi P22 CipR dan ND2 CefR), K2 (kombinasi ND2 CefR dan L1k TetR), K3 (kombinasi P22 CipR dan L1k TetR) dan K4 (kombinasi P22 CipR, ND2 CefR dan L1k TetR), pada hari ke 15 semua perlakuan kecuali K-, diinjeksi dengan S. agalactiae N14G RifR dengan kepadatan sel 104 CFU mL-1 sebanyak 0.1 ml per ekor secara intraperitoneal. Pengamatan dilakukan hingga hari ke 21. Hasil kombinasi terbaik tahap 1 diaplikasikan pada tahap II. Tahap II, pengujian mikrokapsul kombinasi probiotik dan kombinasi probiotik tanpa mikrokapsul, yang disuplementasi pada pakan dengan dosis 1 % dan diberikan selama 14 hari. Perlakuan meliputi K- (kontrol negatif), K+ (kontrol positif), perlakuan kontrol tanpa suplementasi mikrokapsul probiotik, PM (mikrokapsul probiotik multispesies) dan PNM (non mikrokapsul probiotik multispesies), pada hari ke 15 semua perlakuan kecuali K-, diinjeksi dengan S. agalactiae N14G RifR, kepadatan sel 104 CFU mL-1 sebanyak 0.1 mL per ekor secara intraperitoneal dan pengamatan dilakukan hingga hari ke 21. Hasil penelitian tahap I menunjukkan setiap perlakuan kombinasi probiotik mampu meningkatkan respons pertumbuhan dan respons imun ikan nila yang diinfeksi S. agalactiae N14G RifR. Perlakuan K3 menunjukkan kelangsungan hidup terbaik sebesar 89.33±6.11 %, laju pertumbuhan spesifik tertinggi sebesar 2.37±0.02 % dan konversi pakan terendah 1.26±0.03. Berdasarkan pengamatan respons imun (indeks fagositik, aktivitas respiratory burst dan aktivitas lisozim) menunjukkan nilai berfluktuasi, setiap perlakuan kombinasi probiotik mengalami peningkatan respons imun yang berbeda nyata (P<0.05) terhadap kontrol. Nilai respons imun tertinggi digambarkan pada perlakuan K3 (kombinasi P22 CipR dan L1k TetR). Nilai indeks fagositik 64.00±2.65 %, aktivitas respiratory burst 0.07±0.00 OD dan aktivitas lisozim 90.94±11.39 IU mL-1 menit-1. Berdasarkan monitoring populasi sel bakteri patogen diperoleh bahwa keberadaan populasi probiotik pada organ target, perlakuan K3 mampu menekan pertumbuhan S. agalactiae lebih baik diantara perlakuan lainnya. Hasil tahap II menunjukkan bahwa perlakuan PM (mikrokapsul kombinasi probiotik P22 CipR dan L1k TetR) merupakan aplikasi terbaik dalam meningkatkan kelangsungan hidup
Keyword: Oreochormis niloticus, Probiotik Multispesies, Streptococcosis

Judul: Thermal Characteristics and Dynamics of Tropical Cyclone over Western North Pacific Ocean: A Case Study of Typhoon Songda (Chedeng) 2011
Abstrak: The frequent occasion of Tropical Cyclone (TC) over Western North Pacific (WNP) Ocean lies from 10˚N to 26˚N and 121˚E to 170˚E. Sources of TC development come from warm ocean temperature where latent heat is released during condensation processes and subsequently concentrated in the boundary layer. Relative humidity at 850-700 hPa is responsible to produce the most intense storm. Meanwhile, weak vertical wind shear between 850-200 hPa is one of the dynamical factors that lead to the development of TC. Pressure level of 850-200 hPa is chosen to minimize the thermodynamic effect in the lower troposphere. Typhoon Songda (Chedeng in the Philippines) or TSC lasted from May 18th to 30th, 2011 and strengthened into powerful Super Typhoon stage between May 24th and 27th. Long curving track and the exhibition of all sequences of TC life cycle, TSC is then considered as an ideal case of TC. The objective of the study with case of TSC is to investigate the role of thermal characteristics and dynamics on TC intensity. The research is carried out by using Advanced Research of Weather Research and Forecasting model (WRF ARW model) version 3.3. Two domains are employed in the model. The first domain situate from 02˚N to 40˚N and 118˚E to 149˚E and cover spatial resolution () of 33.1 km. The second domain situate from 09˚N to 27˚N and 119˚E to 132˚E with of 11 km. Timestep of the model () is 120 seconds. The model is supported by the following physical parameterization, i.e., Yonsei University Scheme (YSU) in the boundary layer, Kain-Fritsch scheme (KF) in the cumulus, and WRF Single-Moment 3-class scheme in the microphysics. Initial meteorological condition prior to the formation of the cyclone is generated using WRF ARW standard-release model. Sensitivity of the model output is obtained from a selected single-parameter change scenarios, namely, 10 % to 20 % decrease and increase of wind shear initial data at 850-200 hPa, and by 10 % to 20 % decrease of relative humidity initial data at 850-700 hPa. The result showed that the negative correlations between wind shear and intensity are found in wind shear scenarios. Wind shears of 10 ms-1 which lead to strengthening of the wind intensity in the early period of Typhoon development are found in wind shear scenarios. The effect of wind shear changes on wind intensity is statistically significant in the 20 % wind shear scenarios. During mature stage, weak wind intensity occurred when wind shear increase as given in the WRF standard-release and the 20 % decreasing scenario. Different situation is found in the 20 % increasing scenario where wind shear tend to weak and lead to strong wind intensity at this stage. Meanwhile, the reduction of moisture supply at 850-700 hPa resulting from 20 % decreasing relative humidity play a major role in the weakening of wind intensity and reduces mechanical energy of the cycle process as much as 300 J kg-1.
Keyword: