Judul: Bakteri Sebagai Agens Pengendalian Hayati Rigidoporus microporus, Penyebab Penyakit Busuk Akar Putih Pada Tanaman Karet
Abstrak: Rigidoporus microporus adalah penyebab penyakit busuk akar putih (BAP) yang paling merusak di perkebunan karet seluruh dunia, termasuk di Indonesia. R. microporus sangat sulit dikendalikan karena dapat bertahan hidup di dalam tanah sebagai saprofit dan menjadi sumber inokulum. Kolonisasi R. microporus pada perakaran tanaman karet menyebabkan akar hitam, membusuk, rapuh, dan mudah patah, sedangkan pada infeksi lanjut menyebabkan kematian pada tanaman karet. Pemanfaatan bakteri sebagai agens pengendalian hayati (APH) berpotensi menekan perkembangan infeksi R. microporus karena menghasilkan enzim hidrolitik pendegradasi dinding sel, sedangkan senyawa antibiotik yang disekresikannya dapat menghambat kolonisasi dan menekan intensitas penyakit BAP pada tanaman karet. Bakteri APH, juga bermanfaat sebagai pemacu pertumbuhan tanaman, yaitu meningkatkan ketersediaan nutrisi bagi tanaman dan mensintesis fitohormon. Penelitian bertujuan (1) memperoleh isolat bakteri APH hasil seleksi yang aman, mempunyai aktivitas lisis dan antibiosis terhadap R. microporus; (2) mengetahui pengaruh metabolit antifungal isolat bakteri APH dalam menghambat pertumbuhan R. microporus dan jenis senyawa yang dihasilkan; (3) mengetahui potensi isolat bakteri APH sebagai pemacu pertumbuhan tanaman; (4) mengevaluasi keefektifan isolat bakteri APH dalam menekan kolonisasi R. microporus pada bibit karet; dan (5) mengidentifikasi isolat bakteri APH melalui pendekatan morfologi dan molekuler. ...
Keyword: mycelial abnormalities, hydrolytic enzymes, Rigidoporus microporus, diffusible organic compounds, volatile organic compounds

Judul: Mikrob Rizosfer Dan Endofit Jaringan Akar Tanaman Karet Sebagai Agens Hayati Penyakit Akar Putih (Rigidoporus Lignosus (Klotzsch) Imazeki)
Abstrak: Karet merupakan salah satu komoditas ekspor yang memegang peranan penting bagi perekonomian Indonesia. Penyakit akar putih yang disebabkan oleh Rigidoporus lignosus merupakan salah satu faktor pembatas dalam budidaya tanaman karet. Infeksi patogen ini dapat mengakibatkan kematian tanaman sehingga jumlah tanaman produktif berkurang. Pengendalian penyakit sulit dilakukan karena patogen bersifat tular tanah dan dapat bertahan pada tunggul dan sisa-sisa tanaman yang terinfeksi. Teknik pengendalian yang saat ini banyak digunakan adalah dengan penggunaan agens hayati. Pengendalian ini memiliki nilai lebih karena selain bersifat efektif mengendalikan patogen juga bersifat ramah lingkungan. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan agens hayati dari jaringan akar dan rizosfer tanaman karet yang memiliki potensi mengendalikan R. lignosus penyebab penyakit akar putih pada tanaman karet. Penelitian dilakukan di Laboratorium Mikologi dan Bakteriologi Departemen Proteksi Tanaman, Institut Pertanian Bogor. Metode penelitian meliputi 4 tahapan, yaitu: 1) isolasi bakteri dan cendawan dari rizosfer dan jaringan akar tanaman karet, 2) seleksi bakteri dan cendawan dengan uji patogenisitas, 3) seleksi bakteri dan cendawan secara in vitro dan in vivo, 4) karakterisasi bakteri antagonis, dan 5) identifikasi bakteri dan cendawan antagonis. Hasil isolasi mikrob dari rizosfer dan jaringan tanaman karet diperoleh 131 isolat bakteri dan 28 isolat cendawan, masing-masing terdiri atas 76 isolat bakteri rizosfer, 55 isolat bakteri dari jaringan akar, 13 isolat cendawan dari rizosfer, dan 15 isolat cendawan jaringan akar. Berdasarkan pengujian patogenisitas, sebanyak 99 isolat bakteri dan 18 isolat cendawan bersifat non patogen. Hasil pengujian secara in vitro dan in vivo diperoleh 2 isolat bakteri dan 3 isolat cendawan terbaik yang memiliki tingkat hambatan relatif lebih dari 50%. Isolat tersebut yaitu isolat bakteri rizosfer MR3, isolat bakteri endofit ME8, isolat cendawan endofit CB6, CB8, dan CL3. Hasil pengujian secara in vitro menunjukkan bahwa isolat bakteri MR3, isolat cendawan CB6, dan CB8 memiliki sifat antibiosis dengan menghasilkan senyawa antifungal. Karakterisasi bakteri antagonis menunjukkan bahwa bakteri isolat MR3 memiliki kemampuan dalam memfiksasi nitrogen dan bakteri isolat ME8 mampu melarutkan fosfat dan memfiksasi nitrogen. Isolat cendawan CB8 mampu menghasilkan senyawa volatil dengan daya hambat sebesar 13%. Kemampuan hiperparasitisme juga ditunjukkan oleh isolat cendawan CL3 dan CB8 dengan ditandai aktivitas pelilitan hifa pada pengamatan mikroskopik. Mikrob antagonis yang diisolasi dari rizosfer dan jaringan akar tanaman karet memiliki potensi dalam mengendalikan patogen R. lignosus dengan beberapa mekanisme pengendalian. Mikrob antagonis dapat mengendalikan patogen secara langsung dengan menghasilkan senyawa anti fungal maupun dengan pengendalian secara tidak langsung. Pengendalian secara tidak langsung ini dilakukan dengan cara membantu penyediaan nutrisi bagi tanaman seperti unsur P dan N. Hasil identifikasi bakteri antagonis bedasarkan runutan sebagian gen 16S rRNA menunjukkan bahwa bakteri isolat MR3 memiliki kemiripan dengan Bacillus amyloliquefaciens, sedangkan isolat ME3 memiliki kemiripan dengan B. siamensis. Hasil identifikasi cendawan berdasarkan karakter morfologi untuk isolat CB8, CB6, dan CL3 secara berurutan yaitu hifa steril CB8, Chaetomium sp., dan Penicillium sp. Informasi mengenai pengendalian efektif penyakit akar putih yang disebabkan oleh R. lignosus masih terbatas. Diharapkan penelitian yang telah dilakukan dapat melengkapi dan memberikan informasi ilmiah alternatif cara pengendalian penyakit akar putih karet dengan memanfaatkan mikrob yang bersifat agens antagonis, sehingga pengendalian secara berkelanjutan dapat diterapkan pada budi daya tanaman karet.
Keyword: antibiosis, hiperparasitisme, senyawa volatil organik

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: