Judul: Penelusuran Efek Interaksi Lokasi dan Galur Pada Model Tetap dan Campuran
Abstrak: Analisis AMMI (Additive Main Effects and Multiplicative Interaction) adalah analisis multilokasi untuk mengetahui kestabiIan suatu galur pada berbagai kondisi lokasi. Pada analisis AMMI, faktor galur dan lokasi yang dicobakan diasumsikan sebagai faktor tetap. Namun terkadang pada dasarnya faktor lokasi merupakan faklor acak yang dipilih dari banyak lokasi yang ada di Indonesia. Sehingga perlu dilihat apakah terdapat perbedaan kesimpulan antara faktor lokasi yang diasumsikan sebagai faletor tetap dan faktor acak. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh interaksi antara lokasi dan galur pada model tetap dan model campuran, serta membandingkan pengaruh lokasi dan galur pada model tetap dan model campuran. Hasil pada penelitian ini menunjukkan bahwa terdapat interaksi antara lokasi dan galur pada kedua model. Perbandingan pola interaksi antara model tetap dan model campuran yang dilihat dari biplot AMMI2 pada model tetap dan biplot interaksi pada model campuran memiliki perbedaan dan persamaan. Perbedaan terlihat pada galur yang stabi!, pada model tetap galur yang stabi! adalah galur 1, 3, 4, 7, 8, dan 12. Sedangkan pada biplot model campuran terlihat bahwa hampir seluruh galur yang stabil kecuali galur 2, 6, 8, 9, dan 11. Untuk galur yang spesifik, kedua model memiliki galur spesifik yang hampir sarna. Pada model tetap respon tertinggi di lokasi D adalah galur 11, di lokasi C adalah galur 2, di lokasi A adalah galur 5, sedangkan di lokasi F adalah galur 6 dan 10. Pada model campuran respon tertinggi di lokasi A dan D adalah galur II, di lokasi C adalah galur 2, sedangkan di lokasi F adalab galur 6.
Keyword: 

Judul: Analysis of Multilocation Experimental Data by AMMI Method
Abstrak: Percobaan multilokasi merupakan pengulangan percobaan di beberapa lokasi dengan menggunakan rancangan percobaan dan perlakuan yang sama. Percobaan multilokasi dilakukan untuk mengetahui adaptasi dari faktor perlakuan. Pada percobaan ini terdapat dua pengaruh, yaitu pengaruh utama (lingkungan dan faktor perlakuan) dan pengaruh interaksi antara lingkungan dengan faktor perlakuan. Pengaruh utama bersifat aditif, sedangkan pengaruh interaksi bersifat multiplikatif. AMMI merupakan gabungan dari analisis ragam dan analisis komponen utama. Analisis ragam memeriksa pengarılı aditif faktor utama, sedangkan analisis komponen utama memeriksa pengaruh multiplikatif dari interaksi perlakuan dengan lingkungan. Pengaruh multiplikatif diperoleh dari penguraian interaksi menjadi komponen utama interaksi (KUI). Dengan bantuan biplot, metode AMMI dapat menjelaskan interaksi perlakuan dengan lingkungan. Biplot AMMI-1 merupakan plot antara rataan umum dengan skor komponen 1(KUII) menunjukkan daya adaptasi perlakuan, sedangkan biplot AMMI-2, yaitu plot antara KUII dan KUI2 menggambarkan pengaruh interaksi antara perlakuan dengan lingkungan. Pada penelitian ini digunakan data bobot polong (kg) per petak dari tanaman kacang panjang yang ditanam di sembilan lokasi, yaitu Bengkulu, Maluku, Jambi, Kalimantan Timur, Kalimantan Tengah, Kalimantan Selatan, Sulawesi Selatan, Kalimantan Barat, dan Mataram. Faktor perlakuan yang dicobakan adalah galur-galur kacang panjang sebanyak delapan taraf. Hasil pengolahan dengan menggunakan analisis AMMI diperoleh suatu model yang mengandung pengaruh utama galur dan lingkungan juga terdapat empat buah KUI yang nyata (KUII, KUI2, KUI3, dan KUI4), disebut sebagai model AMMI4. Model AMMI4 ditulis sebagai : Ý = +, +, + Vinjn n=l Plot antara KUII dan KUI2 memperlihatkan bahwa semua galur yang dicobakan stabil. Galur yang paling stabil adalah galur LV 390. Tiga galur yang mempunyai rataan lebih rendah dari rataan umum (13.988 kg) dan stabil adalah galur LV 265, LV 390, dan LV 391. Lima galur lainnya selain stabil juga mempunyai rataan diatas rataan umum. Galur yang memberi rataan hasil paling tinggi adalah galur LV 2316. Galur ini dapat direkomendasikan sebagai galur yang stabil dan berdaya hasil tinggi.
Keyword: 

Judul: Mitochondrial DNA Gene Organization and Phylogenetic Relationship of Naja siamensis
Abstrak: Naja siamensis is one of Asiatic cobra in the Family of Elapidae, known as a cryptic snake. It has many morphological variations that lead to misidentification. Misidentification can cause the wrong concept in developing antivenom types due to high snakebite cases occur in Thailand. Thus, an accurate species identification using a molecular approach is crucially required. Mitochondrial DNA has been used widely in snake molecular studies. These studies were aimed to determine the arrangement of the N. siamensis partial mitochondrial genes using reptile-oriented primers and to reveal the phylogenetic relationship among other species of Asian cobra. DNA extraction was carried out based on the standard DNA salting-out protocol and was conducted by bioinformatics analysis using BLASTn and MEGA 6 software. Gene annotation was performed against N. kaouthia complete genome. A total of 3121 bp of N. siamensis mtDNA genes were sequenced consisting of partial of six regions: 16S rRNA, ND1, tRNA-Ile, CRII region, tRNA-Leu, tRNA-Gln, and COI genes. The mtDNA gene organization of N. siamensis was predicted to has a similar pattern with the common Elapidae mtDNA gene organization. This study showed that there is a monophyletic form in Naja genus and N. kaouthia is the closest species with N. siamensis based on partial 16S rRNA and ND1 gene.
Keyword: 16S rRNA, Elapidae, ND1, phylogenetic relationship