Judul: Kontribusi maternal kuda Arab (Equus ferus caballus) pada populasi poni Sulawesi Utara berdasarkan D-loop mitokondria parsial.
Abstrak: Poni Sulawesi Utara diklasifikasikan ke dalam empat subpopulasi, yaitu poni Minahasa, Minahasa Selatan, Manado dan Tomohon. Keempat populasi poni tersebut memiliki karakteristik warna rambut dan ukuran tubuh yang berbeda dengan lebar pinggul sebagai pembeda anatar subpopulasi poni lokal Sulawesi Utara. Keempat poni diperkirakan berasal dari introgesi kuda Thoroughbred dan kuda Arab. Sebagian data yang menunjukkan struktur genetik dan hubungan asal-usul populasi poni Sulawesi Utara telah dikaji melalui morfometrik, warna tubuh dan keragaman protein darah. Tujuan penelitian ini untuk menganalisis asal-usul tetua betina pada poni Sulawesi Utara melalui DNA mitokondria. Bagian dari mtDNA D-loop parsial, Hyper Variable Segments 1 (HVS1), digunakan untuk mengetahui tetua betina kuda Arab (Equus ferus caballus) yang ditemukan pada sebelas poni Sulawesi Utara (Tomohon, Amurang, Kawangkoan) dan dilakukan melalui metode “sequencing” D-loop mitochondrial DNA parsial. Produk isolasi DNA diamplifikasi pada daerah D-loop parsial mitokondria dengan metode PCR, primer forward EA 177 5’ AGCTCCACCATCAACACCCAA-3’ dan primer reverse EA 178 5’-CCATGGACTGAATAACACCTTATGGTTG-3’, pada kondisi predenaturasi 95°C selama tiga menit, denaturasi 95°C selama satu menit, penempelan primer pada suhu 57°C selama satu menit, tahap pemanjangan ruas DNA pada suhu 72°C selama 2 menit, tahap pemanjangan akhir ruas DNA pada suhu 72°C selama 5 menit sebanyak 30 siklus, dan diakhiri dengan tahapan pendinginan pada suhu 15°C selama 15 menit. Sepanjang 368 pasang basa dari daerah HVS1 dianalisis (HVS-1: posisi nukleotida 15.469-15.834) terhadap daerah kontrol mitokondria (d-loop: pasang nukleotida 15.469-16.660). Analisis terhadap ruas HVS1 menggunakan metode Neighbour Joining dan p-distance dengan pengulangan 1000x. Keragaman haplotipe melalui sekuen D-loop HVS 1 dapat digunakan untuk membedakan Equus caballus (no. Acc X79547.1) terhadap intraspesies poni lokal Sulawesi Utara. Analisis filogenetik menunjukkan bahwa sebelas poni Sulawesi Utara merupakan anggota spesies Equus caballus. Enam poni asal Sulawesi Utara diduga memiliki hubungan kekerabatan maternal dengan kuda USA-Egyptian, diantaranya poni Kawangkoan (no. 1, 2, 3, 4) dan poni Amurang (no. 2 dan 5) dengan jarak genetik antara 0 hingga 6,5%. Karakter haplotipe yang sama pada poni Kawangkoan no. 4 ditemukan pada USA-Egyptian (no. Acc KC840716.1) dengan jarak genetik 0%. Poni ini memiliki hubungan kekerabatan maternal dengan kuda USA-Egyptian. Poni Amurang (no. 1, 3, 4), poni Kawangkoan (no. 5) dan poni Tomohon tidak ditemukan karakter haplotipe kuda Arab. Poni Amurang (no. 1, 4, 3), poni Kawangkoan (no. 5) dan poni Tomohon tidak memiliki hubungan kekerabatan maternal dengan kuda Arab.
Keyword: Equus caballus, partial mtDNA D-loop sequencing, phylogenetic, USA-Egyptian horse, Arabian horses

Judul: Genetic ability of north sulawesi local horse to be indonesian horse stock
Abstrak: Penelitian ini dilakukan dalam lima kajian. Penelitian pertama untuk mempelajari karakterisasi morfologi, keragaman genetik dan jarak genetik kuda lokal Sulawesi Utara. Tujuan penelitian adalah mendapatkan keragaman morfometri dari kuda lokal di Minahasa. Bobot badan dan ukuran tubuh diperoleh dari 193 kuda betina dan 309 kuda jantan dewasa. Analisis multivarian digunakan untuk mendeskripsikan baik bentuk maupun ukuran tubuh dari empat sub-populasi kuda di Sulawesi Utara yaitu, Tomohon, Manado, Minahasa Selatan dan Minahasa. Metode statistic yang digunkkan adalah general linear model (PROCGLM), analisis diskriminan (PROCDISCRIM) dan analisis komponen utama (PROCPRINCOMP) dari paket statistik SAS versi 9.2 dan MEGA 4 untuk membuat konstruksi filogenitas. Hasil menunjukkan bahwa sub-populasi di Tomohon memiliki ukuran tubuh dan bobot badan lebih tinggi (P<0.05) dari ketiga sub-populasidi ketiga daerah lainnya (Manado, Minahasa Selatan dan Minahasa). Lebar pinggul adalah peubah pembeda paling utama yang membedakan kuda lokal di Sulwesi Utara. Hasil ini mendukung strategi pemberdayaan dalam rangka memperkenalkan pemanfaatan dan pengembangan sumberdaya ternak kuda lokal. Penelitian kedua adalah menganalisis karakteristik pola warna bulu kuda lokal Sulawesi Utara dengan tujuan untuk mendapatkan keragaman fenotip dan genotip dari pola warna bulu kuda Sulawesi Utara. Penelitian ini dilakukan di empat lokasi di Sulawesi Utara (Tomohon, Manado, Minahasa Selatan dan Minahasa). Analisis jarak genetik didasarkan pada penampilan warna bulu dimana hasilnya menunjukkan bahwa warna bulu yang terdapat pada keempat daerah tersebut adalah bay, chestnut, bay-cream, chestnut-cream, roan, black, white dan spotted.
Keyword: sulawesi utara, indonesia

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: