Judul: Correlation of gelE virulence gene with biofilm formation and gelatinase in Enterococcus faecalis isolates
Abstrak: Seratus dua puluh total sampel arsip digunakan pada penilitian ini. Sampel arsip terdiri atas 60 sampel asal inang ayam pedaging berupa sampel usap kloaka yang dikoleksi dari peternakan ayam pedaging di daerah Cianjur dan 60 sampel asal inang kucing berupa sampel usap anus (22 sampel) dan laring (38 sampel) dari pasien klinik hewan di Kota Depok dengan gejala infeksi saluran pencernaan. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keberadaan faktor virulensi gelatinase yang dikodekan oleh gen virulen gelE serta menguji terkait korelasinya terhadap pembentukan biofilm dan aktivitas gelatinase pada isolat Enterococcus faecalis dari inang ayam dan kucing. Isolasi bakteri dilakukan dengan menggunakan media agar selektif diferensial KF Streptococcus. Konfirmasi molekuler menggunakan teknik polymerase chain reaction (PCR) dengan gen spesifik Efac. Deteksi faktor virulen gelatinase menggunakan gen virulen gelE. Uji fenotipik pembentukan biofilm menggunakan teknik spektrofotometri pada densitas optik 630 nm, sedangkan uji aktivitas gelatinase dilakukan dengan menginkubasi bakteri pada agar Brain Heart Infusion (BHI) dengan gelatin 4%. Analisis hasil dilakukan secara kuantitatif menggunakan uji chi-square dengan P < 0,05 dianggap signifikan secara statistik. Hasil isolasi bakteri didapatkan 21 dari 40 (52,50%) isolat dari usap kloaka ayam dan 10 dari 20 (50%) isolat dari usap anus kucing terkonfirmasi positif E. faecalis secara molekuler. Studi faktor virulensi menunjukkan bahwa 21 isolat (100%) ayam dan 10 isolat (100%) kucing E. faecalis terdeteksi memiliki gen virulen gelE. Isolat kloaka ayam dengan uji fenotipik biofilm didapatkan sebanyak 20 isolat (95,23%) dikategorikan positif kuat dan 1 isolat (4,76%) dikategorikan positif lemah, sedangkan pada isolat anus kucing didapatkan sebanyak 5 isolat (50%) dikategorikan positif kuat dan 5 isolat (50%) dikategorikan positif lemah. Uji fenotipik gelatinase pada isolat ayam adalah 17 isolat (80,95%) positif memiliki aktivitas gelatinase dan 4 isolat (19,04%) negatif gelatinase, sedangkan pada isolat kucing didapatkan sebanyak 6 isolat (60%) positif dan 4 isolat (40%) negatif aktivitas gelatinase. Kedua uji fenotipik memiliki nilai P < 0,05 atau memiliki hubungan yang signifikan antara keberadaan gen virulen gelE dengan pembentukan biofilm dan aktivitas gelatinase. Kesimpulannya adalah gen virulen gelE pada bakteri E. faecalis ditemukan pada semua isolat dari kloaka ayam dan usap anus kucing. Kedua jenis isolat tersebut diketahui mampu untuk pembentukan biofilm dan aktivitas gelatinase. Gen virulen gelE berkorelasi positif pada pembentukan biofilm lemah hingga kuat pada bakteri E. faecalis yang berasal dari isolat asal kloaka ayam dan anus kucing serta berkorelasi positif terhadap aktivitas gelatinase., One hundred and twenty archival samples were used in this study. The archive samples consisted of 60 samples from broiler hosts in the form of cloacal swab samples collected from broiler farms in the Cianjur area and 60 samples from cat hosts in the form of anal swab samples (22 samples) and larynx swabs (38 samples) from veterinary clinic patients in Depok City with symptoms of gastrointestinal tract infections. This study aimed to explore the presence of gelatinase virulence factor encoded by the virulent gene of gelE and to examine its correlation to biofilm formation and gelatinase activity in Enterococcus faecalis isolates from chickens and cats. Bacteria isolation conducted by using KF Streptococcus selective-diffential agar media. Molecular confirmation using polymerase chain reaction (PCR) technique with
Keyword: biofilm, Enterococcus faecalis, gelE, gelatinase

Judul: Identifikasi Grup Filogenetik dan Gen Virulen, serta Resistansi Antibiotik Karbapenem pada isolat Escherichia coli Resistan Kolistin di Bogor, Jawa Barat.
Abstrak: Kontaminasi Escherichia coli patogen di sepanjang rantai suplai ayam pedaging telah menjadi perhatian serius bagi kesehatan masyarakat. Infeksi E. coli patogen yang bersifat multiresistan terhadap antibiotik dapat menyebabkan kegagalan pengobatan. Beberapa studi telah membuktikan bahwa avian pathogenic E. coli (APEC) dan extraintestinal pathogenic E. coli (ExPEC) pada manusia menunjukkan adanya kemiripan genetik, terutama pada gen virulennya. Tujuan penelitian ini adalah melakukan identifikasi grup filogenetik dan gen virulen, serta menguji resistansi antibiotik karbapenem pada isolat arsip E. coli resistan kolistin yang berasal dari rantai suplai ayam pedaging di Bogor, Jawa Barat. Limapuluh delapan isolat dikarakterisasi menggunakan metode polymerase chain reaction (PCR) untuk menentukan grup filogenetiknya (A, B1, B2, atau D) dan mendeteksi profil gen virulennya menggunakan marker genetik APEC (iutA, hlyF, iss, iroN, dan ompT). Pengujian resistansi terhadap antibiotik karbapenem dilakukan dengan metode disk diffusion. Deteksi karbapenemase dilakukan dengan metode modified carbapenem inactivation method (mCIM) dan EDTA carbapenem inactivation method (eCIM), selanjutnya deteksi gen penyandi resistansi blaNDM dan blaKPC menggunakan metode PCR. Hasil penelitian menunjukkan bahwa isolat E. coli arsip yang termasuk dalam grup filogenetik A adalah 34.48%, D 34.48%, B1 17.24% dan B2 13.79%. Deteksi gen virulen menunjukkan adanya ekspresi gen iutA (36%), hlyF (21%), ompT (21%), iroN (10%) dan iss (9%). Grup filogenetik B2 menunjukkan adanya kombinasi gen virulen lebih banyak. Gen virulen iroN, hlyF dan ompT mempunyai asosiasi positif dengan grup filogenetik B2 (P ≤ 0.05). Pengujian resistansi terhadap antibiotik golongan karbapenem menunjukkan 10.34% (6/58) isolat resistan dan 22.41% (13/58) intermediate terhadap imipenem, serta keseluruhan isolat sensitif terhadap meropenem. Hasil deteksi karbapenemase menunjukkan isolat resistan dan intermediate terhadap antibiotik imipenem termasuk dalam serin karbapenemase. Tidak ditemukan adanya ekspresi gen penyandi karbapenemase blaKPC dan blaNDM pada isolat resistan dan intermediate tersebut. Keberadaan isolat E. coli patogen yang memiliki gen virulen marka APEC yang berada dalam plasmidnya, membuktikan bahwa rantai suplai daging ayam berpotensi sebagai reservoir gen virulen ExPEC pada manusia. Ditemukannya isolat yang resistan terhadap kolistin dan imipenem merupakan alarm yang penting bagi kesehatan masyarakat dan hewan.
Keyword: Escherichia coli, gen virulen, grup filogenetik, karbapenem, kolistin

Judul: Bifurkasi Hopf pada Model Siklus Bisnis Kaldor Kalecki tanpa dan dengan Waktu Tunda
Abstrak: Business cycle model is one of dynamical system models in economic. One of the business cycles model is Kaldor-Kalecki model. Kaldor-Kalecki business cycle model that is written in delayed defferential equations, is a business cycle model that involves gross product and capital stock of a company. In this paper Kaldor-Kalecki business cycle model is analyzed using both nondelay and delay in time of capital stock. By Taylor expansion for the time delayed model, an analysis of stability around the fixed points has been done. Furthermore, by using Hopf bifurcation theorem, it can be shown that there exists periodic orbits and limit cycle. In the nondelayed model, changing the parameter of goods market could lead to the occurrence of Hopf bifurcation and the existence of limit cycle. Similarly, for the delayed model, it has been shown that changing the time delay parameter may result in the occurrence of Hopf bifurcation and limit cycle.
Keyword: