Judul: IPB (Bogor Agricultural University)
Abstrak: Penyakit layu yang disebabkan oleh bakteri Ralstonia solanacearum (E.F. Smith) Yabuuchi et al. merupakan salah satu faktor pembatas dalam budidaya cabai. Insidensi penyakit layu bakteri pada cabai di Indonesia beberapa tahun terakhir mengalami peningkatan. Pengelolan terpadu merupakan rekomendasi pengendalian penyakit layu bakteri yang dinilai paling tepat. Pengelolaan terpadu adalah suatu sistem pengendalian organisme pengganggu tanaman yang melibatkan berbagai teknik. Salah satu komponen dalam sistem pengelolaan terpadu tersebut adalah pengendalian hayati. Pengendalian hayati untuk penyakit layu bakteri yang telah banyak dilaporkan di antaranya dengan memanfaatkan berbagai mikrob rizosfer yang antagonis, strain avirulen R. solanacearum, bakteriofag, ataupun kelompok mikoriza. Penggunaan mikrob endofit dalam pengendalian beberapa jenis pengganggu tanaman cabai telah mulai banyak diteliti, baik organisme pengganggu dari jenis hama (serangga dan herbivora), patogen penyakit, maupun pengaruhnya bagi tanaman dalam menghadapi cekaman abiotik. Namun demikian, pemanfaatan cendawan endofit dalam mengendalikan penyakit layu bakteri pada cabai, khususnya aplikasinya dalam skala lapangan belum banyak dilaporkan. Di samping itu, pengetahuan terkait berbagai mekanisme yang terlibat dalam respons induksi pertahanan tanaman sebagian besar juga masih terbatas pada aktivitas antibiosis secara langsung terhadap patogen dan pengamatan dinamika beberapa senyawa yang terkait sistem pertahanan tanaman. Penelitian ini bertujuan melakukan eksplorasi, seleksi, menguji potensi cendawan endofit yang berasal dari perakaran tanaman cabai dalam meningkatkan ketahanan tanaman cabai terhadap penyakit layu bakteri R. solanacearum dan mengetahui sebagian mekanisme yang terlibat di dalamnya. Kegiatan penelitian dilakukan di Laboratorium Mikologi Tumbuhan dan Laboratorium Bakteriologi Tumbuhan - Departemen Proteksi Tanaman - Institut Pertanian Bogor (IPB); Laboratorium Mikrobiologi, Rumah Kaca dan Lahan Percobaan Balai Pengkajian Teknologi Pertanian (BPTP) Jakarta; lahan percobaan di Jagakarsa - Jakarta Selatan; Laboratorium Mikrobiologi Terapan Pusat Penelitian Bioteknologi Lembaga Ilmu Pengetahuan Indonesia (LIPI), dan di Laboratorium Biotechnology Research Indonesian - The Netherlands (BIORIN) IPB, pada bulan September 2012 hingga Januari 2017. Eksplorasi cendawan endofit dilakukan terhadap sampel akar tanaman cabai sehat dari daerah Garut (Jawa Barat) dan Cipayung (Jakarta Timur). Seleksi awal terhadap isolat cendawan dilakukan dengan uji patogenisitas secara in vitro. Seleksi cendawan endofit dilakukan berdasarkan uji in-vivo kemampuan cendawan endofit dalam menekan perkembangan penyakit layu bakteri cabai dan uji in-vitro aktivitas antibiosis secara langsung. Identifikasi dilakukan terhadap beberapa isolat yang potensial dalam menekan perkembangan penyakit layu bakteri pada cabai tersebut. Uji efikasi terhadap isolat terpilih dilakukan dengan menggunakan sembilan perlakuan, yaitu: tiga perlakuan cendawan terpilih secara tunggal, empat perlakuan cendawan terpilih secara kombinasi, penggunaan bakterisida streptomisin, dan kontrol. Pengamatan mekanisme induksi ketahanan berupa analisis biokimiawi tanaman yang diinduksi oleh cendawan endofit dan analisis antibiosis tidak langsung. Hasil eksplorasi menunjukkan bahwa isolat cendawan yang diperoleh dari akar tanaman cabai daerah Garut, secara makroskopis memiliki keragaman lebih tinggi dibandingkan dengan keragaman isolat dari daerah Cipayung. Uji patogenisitas pada benih cabai menunjukkan bahwa dari sejumlah isolat cendawan yang diuji lebih banyak cendawan yang bersifat potensial patogenik. Uji pengaruh 46 isolat cendawan terpilih dalam memengaruhi pertumbuhan bibit menunjukkan bahwa sebanyak 7 dari isolat-isolat tersebut diketahui konsisten bersifat non patogenik dan memacu pertumbuhan bibit, 2 isolat yang berdasarkan uji patogenisitas bersifat potensial patogenik menunjukkan kekurang-mampuan dalam memacu pertumbuhan bibit, 29 isolat yang berdasarkan uji patogenisitas bersifat potensial patogenik ternyata mampu meningkatkan pertumbuhan bibit, sedangkan 8 isolat
Keyword: Biocontrol, endophytic fungi, Trichoderma asperellum, Fusarium solani f.sp. phaseoli, induce resistanseo

Judul: Seleksi Cendawan Endofit Untuk Pengendalian Penyakit Layu Bakteri (Ralstonia Solanacearum) Pada Tanaman Cabai.
Abstrak: Cabai merupakan salah satu tanaman hortikultura yang mempunyai nilai ekonomi cukup tinggi dan mempunyai kedudukan penting dalam industri pangan di Indonesia. Budidaya cabai sangat bergantung pada musim, cuaca, iklim dan serangan organisme pengganggu tanaman. Salah satu gangguan penyakit penting yang sering menyerang adalah layu bakteri. Layu bakteri disebabkan oleh bakteri Ralstonia solanacearum yang mempunyai kisaran inang yang luas, menginfeksi tanaman melalui akar dan menyerang pembuluh xilem. Penyakit layu bakteri ini sulit untuk dikendalikan karena bakteri dapat bertahan di tanah dan gulma selama bertahun-tahun. Metode yang efektif dan ramah lingkungan sangat diperlukan, yaitu dengan pengendalian hayati. Metode yang perlu dikembangkan misalnya menggunakan cendawan endofit. Cendawan endofit adalah cendawan yang menginfeksi jaringan tanaman tanpa menimbulkan gejala penyakit. Penelitian mengenai cendawan endofit untuk pengendalian penyakit layu bakteri belum pernah dilakukan. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mendapatkan beberapa cendawan endofit dan menguji kemampuan cendawan endofit dalam mengendalikan penyakit layu bakteri. Penelitian ini terdiri atas beberapa tahapan yaitu pengambilan sampel di lapangan, isolasi cendawan endofit dan bakteri R. solanacearum, uji patogenisitas, uji kolonisasi, uji keefektifan cendawan endofit penyakit layu bakteri dan pengaruh cendawan endofit terhadap pertumbuhan. Bakteri R. solanacearum diperoleh dari tanaman bergejala layu di Bogor, sedangkan sampel tanaman cabai sehat diambil dari dua daerah yaitu Bogor (kecamatan Dramaga dan Ciampea) dan Garut (Kecamatan Rancabango dan Panjiwangi), setiap lokasi lahan diambil 10 tanaman cabai. Cendawan endofit diisolasi dari bagian akar dan batang tanaman cabai sehat dengan sterilisasi permukaan. Seluruh cendawan yang berhasil diisolasi berjumlah 110 isolat. Cendawan yang didapatkan dari Bogor berjumlah 32 isolat (18 berasal dari akar dan 14 dari batang), sedangkan dari Garut didapatkan 78 isolat (46 isolat berasal dari akar dan 32 isolat dari batang). Semua cendawan yang didapatkan dari hasil isolasi, diuji patogenisitasnya terhadap perkecambahan benih cabai. Cendawan ditanam pada media PDA dan diinkubasi selama 7 hari. Selanjutnya, 20 benih cabai yang sudah disterilisasi permukaan ditanam di atas media biakan cendawan dan diinkubasi pada suhu ruang. Setelah 7-14 hari, diamati persentase perkecambahan dan panjang kecambah. Sepuluh isolat cendawan endofit didapatkan bersifat nonpatogenik, 7 isolat berasal dari bagian akar dan 3 isolat dari batang. Dua isolat cendawan endofit (B1TW dan B5GB) dapat meningkatkan jumlah daun tanaman cabai dan 5 isolat cendawan endofit (A9.2GB, B5GB, A1SG, A3.2G2, A7.3G2) mampu meningkatkan tinggi tanaman cabai dibandingkan dengan kontrol. Lima isolat cendawan endofit yaitu A1TW, A7.3G2, A9.2GB, A8.1aG2, dan B5GB diuji kemampuannya dalam menekan penyakit layu bakteri. Tiga isolat 5 cendawan endofit mewakili kelompok cendawan yang mampu meningkatkan pertumbuhan tanaman, dan 2 isolat mewakili cendawan endofit yang tidak dapat meningkatkan pertumbuhan tanaman cabai. Berdasarkan kemampuannya menghambat penyakit, didapatkan bahwa isolat B5GB dan A1TW mampu menekan penyakit layu bakteri dengan tingkat penekanan paling tinggi, yaitu sebesar 27% dan 23.33%.
Keyword: Capsicum annuum L, patogenisitas, pengendalian hayati

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: