Judul: Isolasi, Karakterisasi, dan Kinetika Mangan Peroksidase dari Trametes versicolor
Abstrak: Mangan peroksidase (MnP) merupakan enzim ligninolitik yang mampu mendegradasi lignin dan berbagai senyawa fenolik sehingga banyak digunakan dalam proses pemutihan kertas, pembuatan bubur kertas, dan sebagai bioremediasi limbah berbahaya. Trametes versicolor dilaporkan menghasilkan MnP dengan aktivitas lebih tinggi dibandingkan jamur pelapuk putih penghasil MnP lainnya. Tujuan penelitian ini adalah mengisolasi MnP dari T. versicolor, memurnikannya, melakukan karakterisasi sifat enzim berupa pH, suhu, kofaktor, dan inhibitor, serta menentukan parameter kinetika MnP (Km dan Vmaks). MnP diisolasi dari T. versicolor yang ditumbuhkan pada media cair dengan campuran sekam padi. Purifikasi enzim secara parsial menggunakan amonium sulfat dengan tingkat kejenuhan 0-80%. MnP mengendap optimal pada kejenuhan 0-20% dengan aktivitas spesifik 13.08 U/mg, kemurnian 2.81 kali, dan perolehan 86.57%. Aktivitas maksimum MnP tercapai pada pH 4 dan suhu 70oC. Ion Fe2+, Cu2+, Ca2+, Zn2+, dan Mn2+ berperan sebagai kofaktor bagi enzim sedangkan Mg2+ dan EDTA sebagai inhibitor. Nilai Km MnP adalah 39.9 μM dengan Vmaks 22.16 U/mL.
Keyword: characterization, manganese peroxidase, purification

Judul: Isolasi, Pemurnian Parsial dan Karakterisasi Lignin Peroksidase dari Trametes versicolor.
Abstrak: Lignin peroksidase (LiP) merupakan salah satu dari enzim ligninolitik yang dapat dihasilkan oleh jamur pelapuk putih T.versicolor. Pemanfaatan enzim ini dapat digunakan untuk produksi bioetanol, bioremediasi, dan pembuatan bubur kertas. Tujuan penelitian ini adalah mengisolasi LiP dari T.versicolor menggunakan sekam padi sebagai sumber lignoselulosa yang digunakan sebagai sumber karbon, memurnikan dan mengkarakterisasi waktu produksi, pH, suhu, ion logam, serta kinetika enzim (Km dan Vmaks). Produksi LiP dengan media cair Erden mempunyai aktivitas maksimum pada hari ke-6 setelah inkubasi. Pemurnian ekstrak kasar menggunakan amonium sulfat kejenuhan 0-80 %. Hasil menunjukkan bahwa fraksi amonium sulfat kejenuhan 0-20 % mempunyai aktivitas spesifik tertinggi sebesar 0.0358 U/mg, protein total 4.3714 mg, tingkat kemurnian 1.0644 kali, dan rendemen 23.4751 %. pH dan suhu optimum LiP dari T.versicolor berada pada pH 3.0 dan suhu 80 ºC. Ion logam yang berperan sebagai aktivator diantaranya Fe2+, Cu2+, Zn2+, dan Mn2+, sedangkan EDTA berperan sebagai inhibitor. Nilai Km dan Vmaks sebesar 0.5340 mM dan 0.4253 U/mL.
Keyword: enzyme purification, lignin peroxidase, Trametes versicolor

Judul: The Construction of Greedy SVP LLL Algorithm
Abstrak: A lattice is a set of all integer linear combination of a set of linearly independent vectors in ℝ𝑛���. The independent vectors are called bases of lattice. Any lattice can be generated from many bases, and these bases have the same cardinality. In the lattice, the most fundamental and renowned problem is the Shortest Vector Problem (SVP). SVP is a tracking problem of the shortest nonzero vector in a lattice with equivalent bases. In two dimensions, SVP problem has resolved exactly by Gauss’ algorithm. When the lattice dimension is higher than two, A.K. Lenstra, H.W. Lenstra and L. Lovasz gave a LLL algorithm to compute approximation of nonzero shortest vector in the lattice. Reduced bases solution obtained from LLL algorithm still be an approximation and has polynomial running time of arbitrary dimension which large enough. In 1994, Schnoor and Euchner modified this LLL algorithm as a new variant which later was named deep insertion LLL algorithm. This algorithm is a modified version of the LLL algorithm to the terms of the exchange step to improve the accuracy of output of LLL reduced bases and applying it to the subset sum problem. The purpose of this research are: (1) Reconstruct the LLL algorithm and deep insertion LLL algorithm using a geometric approach. (2) Construct a greedy SVP LLL algorithm. (3) Implement the three algorithms in a symbolic programming language, and evaluate them experimentally. A bases ℬ=[𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑛���] in ℝ𝑚��� is called reduced LLL with parameter 𝛿��� if satisfies: (a) |𝜇���𝑗���𝑖���|≤12, for every integer 𝑖���,𝑗��� with 1≤𝑖���<𝑗���<𝑛���. (b)𝛿���‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���)‖2≤‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���+1)‖2, for 𝑗���=1,2,…,𝑛���−1,where 𝛿��� is a reduced parameter of real numbers with 14<𝛿���<1. The first requirement is the reduced basis 𝛿��� must “nearly orthogonal” and in its computation case, this requirement can be reached out by using the Gram-Schmidt’s orthogonalization. While the second requirement is called exchange step, or used to called as Lovasz condition. By using both of these requirements, then they establish the LLL algorithm. Then, Schnoor and Euchner modify the LLL algorithm based on the requirements of the exchange step called the deep insertion LLL algorithm, where the exchange step is based on the comparison of the projected vector in orthogonal complement [𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑘���−1]⊥ after j-th reduction. To construct greedy SVP LLL algorithm, the requirements of the exchange step is based on purely by comparing norm of lattice 𝐛���𝑗��� with norm lattice 𝐛���𝑖��� for 𝑖���=1,2,3…,𝑗���−1. The process of insertion reduced vector after the exchange step also has done greedily. Then, we calculate the number of arithmetic operation in greedy SVP LLL algorithm for further analysis. The result of our exprimentation for three algorithms on the certain matrix size shows that the running time of the three algorithms increases propotional to the size of the matrix. The result also shows that by using 𝛿���=34 for the LLL algorithm and the deep insertion LLL algorithm, and the greedy SVP LLL algorithm which is a new variant made by using no parameter of 𝛿���, outperform of the other of two previous algorithm in terms of speed with the same output.
Keyword: LLL algorithm, LLL deep insertion algorithm, greedy SVP LLL algorithm