Judul: Pengkonstruksian Bidirected Overlap Graph Untuk DNA Sequence Assembly
Abstrak: DNA sequencing technologies dapat digunakan untuk memecah gen bakteri menjadi jutaan potongan kecil yang disebut reads. Namun demikian, reads tersebut perlu disambung menjadi contigs agar dapat digunakan. Terdapat 2 metode untuk menyambungkan reads. Yang pertama dengan menggunakan overlap layout consensus (OLC) dan yang lainnya dengan menggunakan de Bruijn graph. Hal penting dalam metode OLC adalah bagian overlap dari masing-masing reads. Pada penelitian ini dikembangkan sebuah sistem untuk membuat bidirected overlap graph yang nantinya akan menghitung berapa jumlah reads yang saling overlap satu sama lain. Suffix array digunakan untuk menentukan fase/bagian overlap dari setiap reads dengan mengindeks setiap suffix dari reads. Waktu adalah parameter penting dalam DNA assembly karena DNA assembly membutuhkan banyak waktu. Untuk mengurangi waktu dilakukan perubahan dari masing-masing suffix dan prefix menjadi suatu nilai tertentu yang bersifat tunggal dan mencari overlap dengan membandingkan setiap reads. Cara ini memberikan dampak positif daripada perbandingan dengan menggunakan string. Perbandingan waktu yang diperlukan antara perbandingan angka dan perbandingan string cukup signifikan. Untuk 2000 dan 5000 reads, sistem dapat memberikan hasil 100% akurat untuk jumlah node dan edge
Keyword: bidirected overlap graph, DNA assembly, overlap layout consensus

Judul: Pembentukan Overlap Graph Menggunakan Acgt Words Tree Pada Sekuens Dna
Abstrak: DNA sequence assembly memiliki peran yang sangat penting dalam analisis genom. Salah satu metode yang digunakan dalam DNA sequence assembly untuk penggabungan potongan-potongan fragmen adalah overlap layout consensus. Teknik overlap layout consensus yang digunakan adalah overlap graph. Pada graf ini, node merepresentasikan fragmen dan edge merepresentasikan overlap. Penelitian ini mengembangkan sebuah perangkat lunak untuk menyusun overlap graph menggunakan ACGT words tree. Evaluasi dilakukan dengan menghitung waktu eksekusi yang kemudian dibandingkan dengan penyusunan menggunakan suffix tree dengan nilai 15, 20, dan 25 pada minimum overlap. Minimum overlap didefinisikan sebagai panjang minimum dari substring yang diperhitungkan dalam overlap di antara 2 fragmen. Hasil evaluasi menunjukkan bahwa penyusunan overlap graph menggunakan ACGT words tree memberikan nilai output pada waktu eksekusi yang lebih cepat dibandingkan dengan penyusunan overlap graph menggunakan suffix tree.
Keyword: DNA sequence assembly, overlap graph, Overlap Layout Consensus, pendeteksian overlap.

Judul: The Change of Family's Milk Consumption during Monetary Crisis
Abstrak: Krisis Moneter yang terjadi di negara kita sejak Juli 1997 lalu menyebabkan harga kebutuhan pokok yang melambung, salah satu diantaranya aclalah kenaikan harga susu. Dengan terjadiuya kenaikau harga susu ini maka terclapat keluarga-keluarga yaug melakukan perubahan kousumsi susu keluarganya. Merupakan ha! yang menarik untuk melihat perubahan pola konsumsi susu yang terjadi clan jenis susu yang seperti apa yang banyak mengalarni perubahan. Dengan melakukan smvei kepacla keluarga-keluarga yang banyak mengkonsumsi susu, yaitu keluarga yang mempunyai anak usia sekolah, clan keluarga yang berasal clari golongan penclapatan menengah, maka akan clapat memberikan gambaran perubahan konsumsi susu keluarga yang terjadi. Dalam masa krisis moneter, maka sebanyak 38.8 % clari 227 responden mengurangi konsumsi susunya dengan sebesar 8.4 % menghentikan konsumsi susunya. Terclapat sebanyak 6.6 % keluarga yang menukar jenis susu yang dikonsumsinya. Konsumsi susu lebih dipentingkan untuk golongan usia balita, dimaua pacla golongan usia ini persentase banyak balita yang tetap konsumsi susunya lebih bcsar dibaudingkan dengan golongan usia anak clan dewasa. Sebagian besar keluarga yang mengurangi konsumsi susunya merupakan keluarga yang mengalami penurunan penclapatan. Jenis susu yang paling peka terhaclap krisis moneter aclalah jenis susu cair dimana jenis susu ini paling banyak persentase keluarga yang mengurangi yaitu sebesar 45.8 %, dibandingkan dengan jenis susu bubuk, kental clan murni. Sedangkan jenis susu kental merupakan jenis susu yang tidak terlalu peka terhaclap krisis moneter dimana jenis susu ini persentase keluarga yang tetap clan naik konsumsi susu kentalnya paling besar, yaitu sebesar 67.1 %.
Keyword: