Judul: Analisis Keragaman Gen CSN1S1 dan Asosiasinya terhadap Kualitas Susu Kambing Silangan Saanen dan Peranakan Etawah (Sapera)
Abstrak: Susu kambing telah mendapatkan perhatian sebagai alternatif penting untuk susu sapi di Indonesia, khususnya karena manfaat nutrisinya yang superior dan kemampuannya untuk dicerna dengan lebih mudah oleh tubuh manusia. Dua bangsa kambing, yaitu Kambing Peranakan Etawah dan Saanen menunjukkan potensi besar dalam meningkatkan produksi susu di Indonesia. Balai Penelitian Ternak Ciawi mengembangkan kambing Silangan dari kedua bangsa ini yang dinamakan Sapera. Salah satu fokus utama dari penelitian terkait susu kambing adalah gen CSN1S1, yang memiliki peran krusial dalam menentukan kualitas protein dalam susu. Memahami variasi dan keragaman dari gen ini, peluang untuk mengoptimalkan produksi susu kambing, baik dari segi kualitas maupun kuantitas. Penelitian menggunakan sampel dari tiga bangsa kambing - Sapera, Saanen, dan Peranakan Etawah. Tujuannya adalah menganalisis keragaman genetik dari gen CSN1S1 dan mengevaluasi hubungannya dengan kualitas susu. Studi ini dilaksanakan dalam dua fase. Pada fase pertama, diambil sampel darah dari 66 kambing Sapera, 15 kambing Saanen, dan 14 kambing PE yang berasal dari Balai Penelitian Ternak, Ciawi. Ekstraksi DNA dari sampel darah dilakukan dengan metode modifikasi DNA Kit Geneaid. DNA yang telah diekstraksi diperbanyak melalui proses PCR dan variasi genetik gen CSN1S1 dianalisis dengan teknik Sanger Sequencing. Pada fase kedua, diambil sampel susu dari 66 kambing Sapera yang sedang berada dalam periode laktasi. Komposisi susu dianalisis dengan alat Lactoscan Milk Analyzer, dan data produksi susu harian dihitung dari total produksi susu di pagi dan sore hari saat pengambilan sampel. Hubungan antara genotipe dengan produksi dan komposisi susu dianalisis dengan menggunakan model General Linear Model. Hasil penelitian menunjukkan ada 15 mutasi yang terjadi pada area parsial intron 11, ekson 12, dan parsial intron 12. Mutasi yang terjadi pada intron 11 terdiri dari 1 insersi 4 bp pada titik g.10090 – g. 10093 Ins AGAA dan 10 mutasi titik atau single nucleotide polymorphism (SNP) pada g. 10098 C>G, g.10112 C>T, g. 10129 C>A, g.10177 G>A, g.10180 A>C, g. 10181 T>A, g.10188 T>C, g.10197 C>T, g.10202 T>C, dan g.10220 C>T. Mutasi yang terjadi pada ekson 12 terdiri dari 2 SNP yaitu g.10243 G>A dan g.10250. Mutasi yang terjadi pada intron 12 yaitu 2 SNP g.10277 G>A dan g.10283 T>G. Mutasi g. 10098 C>G pada intron 11 ditemukan berasosiasi terhadap jumlah produksi susu, yield protein, yield lemak, yield laktosa, dan yield solid non fat (SNF). Mutasi pada g. 10181 T>A pada intron yang sama juga berasosiasi terhadap persentase lemak, laktosa dan total solid pada susu kambing sapera. Mutasi yang terjadi pada daerah ekson 12 dan lainnya tidak berasosiasi terhadap kualitas susu pada penelitian ini. Ditemukan adanya perubahan asam amino dari Arginin menjadi Lysin yang disebabkan oleh mutasi di titik g. 10243 G>A., Goat milk has gained attention as an important alternative to cow's milk in Indonesia, especially due to its superior nutritional benefits and its easier digestibility by the human body. Two goat varieties, namely the Etawah Grade Goat and the Saanen show great potential in increasing milk production in the country. The Ciawi Livestock Research Center developed a hybrid goat from these two breeds called Sapera. A primary focus of goat milk research is the CSN1S1 gene, which plays a crucial role in
Keyword: CSN1S1 gene, milk quality, Sapera goat, SNP, indel

Judul: Keragaman Kualitas Susu dan Keju dari Susu Kambing Peranakan Etawah (PE), Saanen dan Persilangannya
Abstrak: Kualitas susu kambing sangat dipengaruhi oleh kadar protein. Protein susu dibedakan menjadi dua jenis yaitu kasein dan protein whey. Kasein merupakan penyusun terbesar protein susu. Kasein berperan dalam pembuatan produk susu diantaranya keju. Protein merupakan salah satu komponen susu kambing yang dapat mempengaruhi kualitas susu. Kualitas susu merupakan salah satu sifat ekonomis yang penting diperhatikan sekaligus berguna meningkatkan gizi masyarakat. Beberapa gen pengontrol produksi protein susu dari gen kasein adalah αs1-kasein, αs2-kasein, β-kasein dan κ-kasein dan salah satu gen yang mempengaruhi protein whey adalah β-laktoglobulin. Perkembangan teknologi dalam bidang biologi molekuler memungkinkan penggunaan penanda molekuler untuk mengukur status keragaman genetik melalui pemanfaatan gen penciri (marker-assisted selection/ MAS), sehingga seleksi dapat dilakukan dalam jangka waktu yang relatif cepat. Keragaman kualitas susu dan keju dari susu kambing yang berbeda menarik untuk diteliti, khususnya yang berhubungan dengan keberadaan gen pengontrol dari protein susu. Jumlah sampel darah kambing perah yang digunakan dalam penelitian ini adalah 150 ekor terdiri atas Peranakan Etawah (PE) 48 ekor, Saanen 51 ekor dan persilangan PE-Saanen 51 ekor, sedangkan jumlah sampel susu yang digunakan berasal dari 75 ekor kambing perah terdiri atas Peranakan Etawah (PE) 23 ekor, Saanen 29 ekor dan persilangan PE-Saanen 23 ekor. Tahapan kegiatan meliputi: (a) identifikasi keragaman molekuler; dengan metode PCR RFLP (Polymerase Chain Reaction –Restriction Fragment Length Polymorphism dan sekuensing DNA (b) analisis kualitas kimia susu segar; terdiri atas analisis kadar protein, lemak, berat jenis dan bahan kering tanpa lemak (c) pembuatan keju (d) analisis karakteristik keju; terdiri atas waktu koagulasi, nilai pH, total asam tertitrasi, rendemen, kadar air, kadar abu, kadar lemak, kadar protein (e) uji organoleptik terhadap mutu yogurt; berdasarkan skala hedonik yaitu 1 (sangat tidak suka), 2 (tidak suka), 3 (agak suka), 4 (suka) dan 5 (sangat suka). Analisis data yang dilakukan berupa frekuensi alel, analisis General Linear Model (GLM) untuk mengetahui perbedaan kualitas susu dan keju antar bangsa kambing dan analisis statistik non parametrik untuk uji organoleptik. Kualitas susu kambing PE, Saanen dan Persilangan PE-Saanen telah memenuhi syarat mutu susu segar berdasarkan SNI 01-3141-1998 dan Thai Agricultural Standard (2008). Susu kambing PE memiliki nilai berat jenis (BJ= 1.033) dan bahan kering tanpa lemak (BKTL=9.577 %) lebih tinggi (P<0.05) dibandingkan susu kambing Saanen dan Persilangan PE-Saanen. Keju yang berasal dari susu kambing Peranakan Etawah memiliki kadar protein yang lebih tinggi dibandingkan dengan kambing Saanen dan Persilangan PE-Saanen yaitu sebesar 15.84% dengan kadar air yang lebih rendah sebesar 61.84% dan total asam tertitrasi yang lebih tinggi 2.93% laktat, sementara kambing Saanen memiliki kadar protein yang paling rendah sebesar 12.94% dengan kadar air yang lebih tinggi sebesar 71.64% dan total asam tertitrasi yang lebih rendah 2.24% laktat. Kambing Persilangan PE-Saanen memiliki kadar lemak yang lebih tinggi yaitu sebesar 12.67%......dst
Keyword: goat milk, cheese, α-s2 casein and β-lactoglobulin gene

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: