Judul: Prediksi Peptida Bioaktif dari Kolagen Ikan Patin (Pangasianodon hypothalamus) menggunakan Metode In Silico
Abstrak: Prediksi peptida bioaktif pada kolagen ikan patin dapat dilakukan menggunakan metode in silico. Tujuan penelitian ini memprediksi senyawa peptida bioaktif dari kolagen ikan patin serta memprediksi peringkat peptida, karakteristik sensori dan toksisitas pada peptida yang memiliki aktivitas tertentu menggunakan metode in silico. Peptida bioaktif dari kolagen dianalisis dengan software BIOPEP dengan memilih enzim papain, tripsin, pepsin, katepsin dan bromelin sebagai penghidrolisis kolagen. Aktivitas biologis kolagen menggunakan BIOPEP tertinggi pada inhibitor dipeptidyl peptidase IV (DPP IV) yang dihidrolisis dengan papain sebesar 0.1050. Peringkat peptida menggunakan Peptideranker tertinggi pada peptida WG sebesar 0.992 yang dihidrolisis dengan papain, peptida YR sebesar 0.525 yang dihidrolisis dengan tripsin, peptida GF sebesar 0.995 yang dihidrolisis menggunakan pepsin, peptida GF sebesar 0.995 yang dihidrolisis menggunakan katepsin dan peptida WF sebesar 0.994 yang dihidrolisis menggunakan bromelin. Prediksi toksisitas pada peptida mendapatkan hasil tidak beracun sehingga peptida tersebut dapat dikembangkan sebagai sediaan bahan baku fungsional.
Keyword: BIOPEP, pangasius collagen, Dipeptidyl Peptidase IV, in silico

Judul: Characteristics of Active Collagen from the Skin of Patin (Pangasius sp.), Tilapia (Oreochromis niloticus) and Snakehead (Channa striata)
Abstrak: WIDYA RAMADHINI. Karakteristik Kolagen Aktif dari Kulit Ikan Patin (Pangasius sp.), Nila (Oreochromis niloticus) dan Gabus (Channa striata). Dibimbing oleh MALA NURILMALA dan ASADATUN ABDULLAH Pemanfaatan hasil samping kulit ikan patin, nila dan gabus sebagai alternatif pengganti kolagen aktif yang sangat menjanjikan, dengan keunggulan pada aspek fisikokimia dan aspek sosial sebagai upaya pemanfaatan hasil samping industri perikanan menjadi produk yang bernilai tambah. Karakteristik kolagen aktif yang mudah diserap dalam tubuh, memiliki sifat tidak beracun, mudah menyerap air, biocompatible, biodegradable, relatif stabil, dapat disiapkan dalam berbagai bentuk sesuai kebutuhan, dan mudah dilarutkan sehingga pemanfaatannya dalam bidang industri berkembang pesat. Hidrolisis enzimatis kolagen aktif dengan enzim bromelin merupakan metode hidrolisis yang baik dibandingkan dengan papain karena bromeilin teirgolong keilompok einzim proteiasei sulfhidril yang mampu meinguraikan berbagai macam struktur moleikul protein meinjadi asam-asam amino, tahan terhadap suhu tinggi dan dapat meiningkatkan aktivitas antioksidan yang tinggi deingan meinghidrolisis proteiin kompleik s dan meileipaskannya dari ikatan fragmein nya. Tujuan pada penelitian ini adalah menentukan potensi bahan baku, karakteristik terbaik dan aktivitas antioksidan kolagen aktif dari kulit ikan patin, nila dan gabus. Hasil peneltian menujukkan bahwa nilai proksimat protein kulit ikan patin, nila dan gabus yang cukup tinggi berpotensi sebagai bahan baku kolagen aktif. Penelitian ini terdiri dari empat tahap, yaitu 1) preparasi untuk penghilangan protein non kolagen atau lemak dan sisa- sisa daging yang masih menempel, kemudian dilakukan pencucian menggunakan air mengalir. Kulit ikan selanjutnya dipotong dengan menggunakan gunting, kemudian dilakukan analisis proksimat meliputi kadar air, protein, lemak dan abu. 2) pretreatment dengan NaOH dan CH3COOH. Masing masing kulit ikan direndam dengan NaOH 0,1 M selama 10 jam pada suhu 4 °C, kemudian dinetralisasi hingga pH 7 menggunakan akuades. Pretreatment dilanjutkan dengan menggunakan CH3COOH 0,1 M selama 2 jam pada suhu 4 °C, kemudian dilakukan netralisasi hingga pH 7 kembali. 3) ekstraksi dengan menggunakan akuades selama 2 jam pada suhu 40 °C, kemudian dilakukan filtrasi berupan kolagen cair. Residu kemudian dipisahkan. 4) Proses hidrolisis menggunakan enzim bromelin 3% pada suhu 40 °C selama 3 jam. Cairan yang diperoleh selanjutnya disentrifugasi pada suhu 4 °C selama 30 menit. Nilai pH kolagen aktif kulit gabus, patin dan nila sebesar 5,62, 6,06 dan 5,25. Pada hasil derajat hidrolisis kolagen aktif ikan patin sebesar 64,76, nila 75,65 dan gabus 52,88. Tingkat asam amino yang dominan pada kolagen aktif kulit ikan patin, nila dan gabus adalah glutamat, arginin dan prolin. Bobot molekul pada masing masing kolagen aktif kulit ikan patin, nila dan gabus 58,325, 37,987, 28,395 kDa. Aktivitas antioksidan terbaik pada ada pada bahan baku ikan nila. Kulit ikan patin, nila dan gabus berpotensi sebagai kolagen aktif. Karakteristik kolagen aktif terbaik berdasarkan parameter uji berasal dari bahan baku kulit ikan nila. Aktivitas antioksidan terbaik pada metode DPPH dan ABTS ada pada kolagen aktif kulit ikan nila dan masuk dalam kategori kuat. Kata kunci : antioksidan, enzim bromelin, hidrolisis, kolagen aktif, kulit ikan
Keyword: Antioksidan, Hidrolisis, enzim bromelin, kolagen aktif, kulit ikan

Judul: Thermal Characteristics and Dynamics of Tropical Cyclone over Western North Pacific Ocean: A Case Study of Typhoon Songda (Chedeng) 2011
Abstrak: The frequent occasion of Tropical Cyclone (TC) over Western North Pacific (WNP) Ocean lies from 10˚N to 26˚N and 121˚E to 170˚E. Sources of TC development come from warm ocean temperature where latent heat is released during condensation processes and subsequently concentrated in the boundary layer. Relative humidity at 850-700 hPa is responsible to produce the most intense storm. Meanwhile, weak vertical wind shear between 850-200 hPa is one of the dynamical factors that lead to the development of TC. Pressure level of 850-200 hPa is chosen to minimize the thermodynamic effect in the lower troposphere. Typhoon Songda (Chedeng in the Philippines) or TSC lasted from May 18th to 30th, 2011 and strengthened into powerful Super Typhoon stage between May 24th and 27th. Long curving track and the exhibition of all sequences of TC life cycle, TSC is then considered as an ideal case of TC. The objective of the study with case of TSC is to investigate the role of thermal characteristics and dynamics on TC intensity. The research is carried out by using Advanced Research of Weather Research and Forecasting model (WRF ARW model) version 3.3. Two domains are employed in the model. The first domain situate from 02˚N to 40˚N and 118˚E to 149˚E and cover spatial resolution () of 33.1 km. The second domain situate from 09˚N to 27˚N and 119˚E to 132˚E with of 11 km. Timestep of the model () is 120 seconds. The model is supported by the following physical parameterization, i.e., Yonsei University Scheme (YSU) in the boundary layer, Kain-Fritsch scheme (KF) in the cumulus, and WRF Single-Moment 3-class scheme in the microphysics. Initial meteorological condition prior to the formation of the cyclone is generated using WRF ARW standard-release model. Sensitivity of the model output is obtained from a selected single-parameter change scenarios, namely, 10 % to 20 % decrease and increase of wind shear initial data at 850-200 hPa, and by 10 % to 20 % decrease of relative humidity initial data at 850-700 hPa. The result showed that the negative correlations between wind shear and intensity are found in wind shear scenarios. Wind shears of 10 ms-1 which lead to strengthening of the wind intensity in the early period of Typhoon development are found in wind shear scenarios. The effect of wind shear changes on wind intensity is statistically significant in the 20 % wind shear scenarios. During mature stage, weak wind intensity occurred when wind shear increase as given in the WRF standard-release and the 20 % decreasing scenario. Different situation is found in the 20 % increasing scenario where wind shear tend to weak and lead to strong wind intensity at this stage. Meanwhile, the reduction of moisture supply at 850-700 hPa resulting from 20 % decreasing relative humidity play a major role in the weakening of wind intensity and reduces mechanical energy of the cycle process as much as 300 J kg-1.
Keyword: