Judul: Isolasi dan Karakterisasi Bakteri Pengendali Cendawan Patogen Colletotrichum sp. pada Tanaman Bawang Merah (Allium cepa L.).
Abstrak: Salah satu masalah dalam pertanian bawang merah (Allium cepa L.) ialah munculnya penyakit antraknosa, yang disebabkan oleh cendawan patogen Colletotrichum sp. Selama ini cendawan patogen dikendalikan dengan menyemprotkan fungisida sintetik. Penggunaan fungisida menimbulkan dampak negatif pada organisme lain dan lingkungan. Dampak negatif dari penggunaan fungisida yang berlebihan, dapat dikurangi dengan penggunaan agen biokontrol seperti bakteri endofit dan bakteri tanah yang mampu menghambat pertumbuhan cendawan patogen. Tujuan dari penelitian ini ialah mengisolasi bakteri endofit dan bakteri rizosfer dari tanaman bawang merah, serta menguji kemampuan bakteri dalam menghambat pertumbuhan cendawan patogen Colletotrichum sp. Sebanyak 40 isolat bakteri endofit dan 16 isolat bakteri rizosfer berhasil diisolasi dari tanaman bawang merah asal Brebes, Jawa Tengah. Hasil uji antagonis menunjukkan enam isolat mampu menghambat pertumbuhan cendawan Colletotrichum sp. dengan persentase daya hambat pada skala 3 (60-75 %). Sebanyak 4 dari 6 isolat potensial yaitu ABS4.1.2, ABP5.1.3, BBP5.2.1, dan ABP5.2.2, memiliki karakteristik morfologi dan mikroskopis yang berbeda. Hasil uji hipersensitivitas menunjukkan bahwa isolat bakteri endofit tidak bersifat patogen terhadap tanaman. Dua dari enam isolat bakteri endofit yaitu BBP5.2.1 dan DBP4.1.2, menunjukkan reaksi negatif dalam uji hemolisin. Hasil ini menunjukkan bahwa isolat bakteri BBP5.2.1 dan DBP4.1.2 tidak bersifat patogen pada mamalia termasuk manusia. Berdasarkan semua hasil pengujian, diperoleh satu isolat endofit BBP5.2.1 memiliki penghambatan pertumbuhan cendawan patogen terbaik dan tidak bersifat patogen pada tanaman dan mamalia.
Keyword: antagonis, cendawan patogen, persentase daya hambat, uji hemolisin, uji hipersensitivitas

Judul: Seleksi dan Karakterisasi Bakteri Endofit serta Senyawa Bioaktif yang dihasilkan sebagai Pengendali Pertumbuhan Fusarium proliferatum.
Abstrak: Bawang merah (Allium cepa L.) merupakan tanaman hortikultura yang memiliki nilai ekonomis tinggi. Faktor penurunan produksi bawang merah salah satunya penyakit layu yang disebabkan oleh serangan F. proliferatum. Serangan F. proliferatum menyebabkan bawang merah mengalami kematian hingga 62.2%. Fusarium proliferatum menyerang pada fase pertumbuhan tanaman yang ditandai warna akar menjadi coklat kekuningan, terbentuk nekrotik, lembab, mudah hancur dan membuat umbi busuk sehingga menyebabkan penurunan hasil panen. Upaya pengendalian F. proliferatum umumnya menggunakan pestisida sintetis, namun keberadaannya di lingkungan dapat merugikan, berbahaya bagi manusia akibat residu yang tertinggal pada tumbuhan dan resistensi patogen. Pengendalian secara hayati F. proliferatum yaitu menggunakan agens biologi misalnya bakteri endofit. Bakteri endofit diketahui memiliki kemampuan untuk menghasilkan senyawa bioaktif anticendawan yang efektif melawan patogen tanaman seperti bawang merah, jagung, padi, dsb. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan untuk menyeleksi dan melakukan karakterisasi bakteri endofit penghasil senyawa bioaktif yang dapat menghambat pertumbuhan F. proliferatum. Isolat bakteri endofit dan cendawan patogen F. proliferatum menggunakan isolat hasil penelitian sebelumnya dengan kode ABP5.2, BBP5.2, DBP4.1, dan DBP4.2. Metode yang digunakan mencakup 1) uji hambatan bakteri endofit terhadap F. proliferatum, 2) uji hipersensitivitas, patogenisitas, dan hemolisis, 3) identifikasi isolat terpilih berdasarkan gen 16S rRNA, 4) ekstraksi senyawa bioaktif dari bakteri endofit, 5) uji aktivitas anticendawan ekstrak kasar, 6) fraksinasi senyawa antimikrob dari bakteri endofit potensial, 7) uji bioautografi senyawa antimikrob, serta 8) identifikasi senyawa antimikrob dengan GC-MS. Isolat bakteri endofit asal tanaman bawang merah ABP5.2, BBP5.2, dan DBP4.1 memiliki aktivitas penghambatan terhadap F. proliferatum serta tidak bersifat patogen bagi manusia dan tanaman. Isolat ABP5.2 terindentifikasi memiliki kemiripan dengan Pseudomonas aeruginosa, sedangkan isolat BBP5.2 dan DBP4.1 memiliki kemiripan dengan Myroides profundi. Isolat BBP5.2 mampu menekan pertumbuhan cendawan patogen tertinggi yaitu sebesar 68.15% melalui mekanisme antibiosis secara langsung yaitu produksi senyawa anticendawan. Berdasarkan analisis Gas Chromathography Mass Spectrophotometry, senyawa yang dihasilkan ekstrak kasar dari isolat BBP5.2 antara lain Hexadecanoic acid, 9- octadecenoic acid, linoleic acid dan piperine.
Keyword: Allium cepa, antifungal compounds, Myroides profundi, 16S rRNA

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: