Judul: Amplifikasi gen penyandi hemolysin dari bakteri vibrio harveyi dengan teknik PCR (Polymerase Chain Reaction)
Abstrak: Vibriosis disease which is caused by lumiunescent Vibrio harveyi until today become a trouble in the cultivation of vannamei shrimp. When the epidemic occurs and the density of bacterial population reachs in thousands times, it causes the mass mortality of the shrimp larvae. Therefore the diagnose method that can accurately and quickly detect this bacterial pathogen is absolutely required. One of method that commonly used is PCR (polymerase chain reaction)-based method. The objective of this research was to evaluate the primer pair application targeted the hemolysin gene, so that primer pair which has been designed can successfully amplify and therefore can detect the presence of hemolysin gene in V. harveyi. This primer pair was designed from the local vannamei strain isolated from Indonesia. Eight vibrio isolates obtained from shrimp, were used in this study. After the cell morphologically tested with Gram staining, then the following methods were applied as follows ; optical density count, hemolysin test, DNA extraction and PCR method optimalization. The result of blood hemolysis test showed that all of V. harveyi isolates produced clear zones surround their colonies on blood agar medium. The PCR result using Myhemo primer pair of F1 5’-GATGGTCAGTGCCTCTCA-3’(forward) and R1 5’- CCCAGTTGTATAGCGGTA-3’(reverse) successfully amplified the hemolysin gene of isolates V-U5 and V-U24 in size of approximately of 518 bp. The PCR programme used in this study was at the following conditions ; DNA denaturation at 94oC for 1 min, primer annealing at 50oC for 1 min and DNA extension at 72 oC for 1min as many as 35 cycles.
Keyword: 

Judul: Isolation and Identification of Pathogenic Vibrio parahaemolyticus in Shrimp Culture
Abstrak: Vibrio parahaemolyticus (Vp) is a halophilic bacterium found in brackish water and is the leading cause of gastroenteritis due to seafood consumption. In Indonesia presence of this pathogen in seafood has caused several export rejection. This research aimed to identify presence of pathogenic Vibrio parahaemolyticus from shrimp cultured in traditional and intensive ponds. Bacterial isolation was carried out using FDA BAM (2004), phenotypic characterization was done using API 20E biochemical test kit and genetic characterization was conducted with Polymerase Chain Reaction (PCR) using a pair of specific primer for each virulent factor gene (tdh and trh genes). Biochemical identification with API 20E biochemical test showed that 16/32(50%) and 6/32 (18.8%) shrimp samples from traditional and intensive ponds contained Vibrio parahaemolyticus, respectively. Eighty one percent (13/16) of Vibrio parahaemolyticus isolated from traditional pond and 50% (3/6) of those obtained from intensive pond were pathogenic due to their possesion of tdh gene. When gen encoding trh was used as the basis for classification, 15/16 (93.8%) and 4/6 ( 66.7%) of Vibrio parahaemolyticus obtained from traditional and intensive ponds, respectively, were pathogenic . Out of the 22 Vibrio parahaemolyticus isolates, 16 (72.7%) were pathogenic based on the possesion of gene encoding for tdh and 19 (86.4%) can be classified as pathogen based on the trh gene. Overall, pathogenic Vibrio parahaemolyticus was found at a frequency of 13-15/32 (43%) of the shrimp samples from traditional pond while 3-4/32 (11%) was found in shrimps from intensive pond, respectively
Keyword: 

Judul: Konsep Desain Ekologis Lanskap Kota Kesultanan Buton Berbasis Budaya Lokal di Kota BauBau, Provinsi Sulawesi Tenggara
Abstrak: Lanskap Kota Kesutanan Buton merupakan kota binaan Kesultanan Buton pada tahun 1332. Kota ini telah ditetapkan sebagai salah satu Jaringan Kota Pusaka Indonesia. Kementerian Pekerjaan Umum Republik Indonesia mempersiapkan kota ini untuk menjadi World Heritage City. Penetapan ini merupakan suatu yang wajar, karena kota tersebut memiliki kekayaan sejarah (artefak) dan budaya sangat kental dengan filosofi kehidupan. Penelitian konsep desain ekologis lanskap kota ini telah menghasilkan suatu konsep desain era kesultanan di masa kejayaannya dan menjadi pembuka penelitian berikutnya yaitu lanskap kota kesultanan berbasis budaya lokal. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis dan mengungkap desain original dan pada masa lampau. Adapun tujuan khusus penelitian ini adalah: 1). Mengidentifikasi karakteristik lanskap kota, 2). Mengkaji elemen-elemen lanskap kota dan tata letaknya, dan makna filosofi dan simbolisme yang mendasarinya, 3). Mengkaji pola tata ruang kota Kesultanan Buton. Penelitian menggunakan metode kuantitatif dan mengambil lokasi di kawasan benteng keraton Buton di Kota BauBau, Provinsi Sulawesi Tenggara. Pengumpulan data dilakukan dengan cara wawancara, studi pustaka, dan survei lapang. Studi pustaka pada naskah lokal dan naskah penelitian dilakukan dengan content analysis dan disesuaiakan dengan artefak lapangan. Hasil penelitian menunjukan tatanan elemen-elemen lanskap kota dan orientasi berbentuk pola tertentu. Tatanannya berbasis jalan poros sebagai sumbu kota. Pola lanskapnya dipengaruhi agama, dan falsafah hidup kesultanannya, yaitu falsafah “Po 5”, yaitu Pomae-maeaka, Popia-piara, Pomaa-masiaka, Poangkaangkataka, dan Pobinci-binciki kuli dan falsafah agama Islam. Kedua konsep ini diderivasi dari manusia dan Sang Nabi, Muhammad Rasulullah Saw sebagai spirit. Lanskap kota merupakan bentukan kombinasi dari faktor strata sosial, spritual-agama, dan kekerabatan. Elemen-elemen lanskap kota terdiri dari benteng, gerbang dan baluara, permukiman, makam, alun-alun, ruang terbuka hijau, jaringan jalan, masjid agung, dan istana. Tata ruang kota didasari dua kelompok permukiman besar. Jalan poros melintasi tengah kota adalah pemisahnya. Pola kota berbentuk huruf Arab Muhammad Rasulullah Saw dan tatanan kotanya simbol seorang ibu. Alun-alun pusat kota simbolisme makrokosmos dan mikrokosmos. Konsep desain ekologis lanskap kota Kesultanan Buton, yaitu rumah sejajar jalan dan saling berhadapan diantaranya Ruang Terbuka Hijau, istana berorientasi timur didepannya ruang hijau jenis buah dan posisinya di bukit memudahkan sultannya memantau kotanya, masjid terbangun pusat kota dan ditinggikan agar memudahkan informasi ibadah terdengar dimana-mana. Konstruksi benteng dan elemennya respon cahaya dan iklim, dan hidrologi, dan elemen parit benteng respon hidrologi dan ruang terbuka hijau.
Keyword: Kesultanan Buton, Kota Pusaka, pola lanskap, eco-desain, spirit kota