Judul: Analisis Keragaman Gen B-Casein Exon 7 dan Hubungannya dengan Produksi dan Komposisi Susu Kambing Sapera
Abstrak: Kesadaran masyarakat akan manfaat susu kambing dapat menjadikan sebuah peluang dan tantangan bagi peternak maupun pemulia untuk menghasilkan kambing perah yang berkualitas. Kambing Sapera, hasil persilangan antara kambing Saanen dan kambing PE, diketahui memiliki produksi susu yang cukup tinggi, kualitas susu yang baik, serta cocok untuk dibudidayakan pada iklim tropis Indonesia. Namun, jumlah produksi dan komposisi susu dapat bervariasi serta dipengaruhi oleh berbagai faktor, salah satunya adalah faktor genetik, sehingga sangat diperlukan seleksi secara genetik untuk meningkatkan kuantitas dan kualitas susu kambing Sapera. Gen CSN2 merupakan salah satu gen yang dapat mempengaruhi komposisi susu kambing. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi keragaman gen CSN2 pada exon 7 serta asosiasinya terhadap produksi dan komposisi susu kambing Sapera. Penelitian ini terdiri dari dua tahap. Tahap pertama yaitu menggunakan 66 sampel darah kambing Sapera, 15 sampel darah kambing Saanen, dan 14 sampel darah kambing PE yang berasal dari Balai Penelitian Ternak, Ciawi. Sampel darah diekstraksi dengan menggunakan prosedur DNA Kit Geneaid yang dimodifikasi. DNA kemudian diamplifikasi dengan metode PCR dan selanjutnya dilakukan metode Sanger Sekuensing untuk menentukan keragaman gen CSN2. Tahap kedua yaitu menggunakan 66 sampel kambing Sapera yang sedang dalam masa laktasi. Sampel susu dilakukan uji komposisi dengan menggunakan Lactoscan Milk Analyzer, sementara data produksi susu harian didapatkan dengan menjumlahkan produksi susu pagi dan sore pada hari pengambilan sampel. Selanjutnya, analisis data hubungan genotipe dengan produksi dan komposisi susu menggunakan persamaan General Linear Model. Hasil penelitian ini menemukan 4 titik SNP yang bersifat monomorfik dan polimorfik. SNP yang bersifat monomorfik di ketiga bangsa kambing perah yaitu posisi g.8913C>A dan g.8915C>T. Sementara itu, SNP g.8946C>T bersifat polimorfik pada ketiga bangsa kambing perah, sedangkan g.8956G>A bersifat polimorfik pada kambing Sapera dan kambing Saanen. Hubungan antara gen CSN2 dengan produksi dan komposisi susu didapatkan SNP g.8946C>T berpengaruh nyata (P<0.05) terhadap kandungan laktosa dan garam mineral, sementara SNP g.8956G>A tidak memiliki pengaruh terhadap produksi maupun komposisi susu kambing Sapera. Komposisi susu kambing Sapera memiliki kualitas “Premium”, kecuali kandungan protein genotipe CC pada SNP g.8946C>T dengan kategori “Baik”.
Keyword: Gen CSN2, kambing Sapera, komposisi susu, produksi susu, SNP, CSN2 gene, milk composition, milk production, Sapera goat, SNP

Judul: Polimorfisme Gen β-Casein (CSN2) g.8913 A>C Pada Kambing Perah di Balitnak.
Abstrak: Protein dalam susu kambing terdiri dari whey dan kasein, dimana kasein menyumbang 80% dari total protein. β-Casein merupakan salah satu tipe kasein yang sensitif terhadap Ca dengan kadar berkisar sampai 50% dari total kasein dalam susu yang produksinya dikode oleh gen β-Casein (CSN2 gene). Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi keragaman gen β-Casein dari kambing perah yang berkaitan dengan sifat produksinya. Sebanyak 70 sampel DNA kambing perah berasal dari Balai Penelitian Ternak Ciawi yang terdiri dari 5 ekor kambing PE jantan, 6 ekor jantan dan 2 ekor betina kambing saanen, 5 ekor jantan dan 49 ekor betina kambing sapera, dan 3 ekor kambing saanPE jantan. Penelitian ini menggunakan metode PCR-RFLP (Polymorphism Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism). Keunggulan metode ini terkait dengan efisiensi waktu dan biaya yang terjangkau. Amplifikasi gen β-Casein di ekson 7 menghasilkan produk PCR sepanjang 416 pb (pasang basa) dengan suhu annealing 570C selama 20 detik. Hasil analisis PCR-RFLP dengan enzim DdeI menghasilkan produk sepanjang 233 pb, 162 pb, dan 21 pb. Frekuensi genotipe CC diperoleh sebesar 100% dengan alel C (1,0) . Hasil penelitian menunjukkan tidak ditemukan adanya polimorfisme pada gen β-Casein di lokus g.8913 A>C.
Keyword: β-Casein genes, dairy goats, PCR-RFLP

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: