Judul: Imunoproteksi Vaksin Protein Toksoid Bakteri Streptococcus Agalactiae Pada Ikan Nila (Oreochromis Niloticus).
Abstrak: Salah satu penyakit infeksi yang sering menyerang ikan nila adalah penyakit streptococcosis yang diakibatkan oleh Streptococcus agalactiae dengan tingkat patogenisitas tinggi. Strategi utama yang telah lama digunakan untuk mengendalikan penyakit yang disebabkan oleh bakteri opurtunistik pada akuakultur adalah antibiotik. Namun penggunaan yang tidak terkendali telah menyebabkan resistensi antibiotik pada bakteri. Alternatif untuk mengendalikan penyakit ini telah dilakukan melalui pengembangan vaksin yang merupakan strategi preventif yang ditentukan oleh kemampuan antigen untuk merangsang sistem kekebalan tubuh hewan sasaran. Salah satu jenis vaksin yang mulai dikembangkan sekarang ini adalah vaksin protein. Protein yang dijadikan vaksin ini disekresikan oleh bakteri secara ekstraseluler (extracellular products, ECP) yang mengandung toksin sehingga dapat menginduksi antibodi antitoksin. Protein dari ECP ini lebih mudah menginduksi respons imun karena dikeluarkan dari sel sehingga lebih mudah bersentuhan dengan inang dan relatif lebih aman karena tidak terdapat lagi bakteri di dalamnya. Penelitian ini bertujuan untuk menghasilkan vaksin protein toksoid dari produk ekstraseluler bakteri S. agalactiae tipe N14G untuk mencegah serangan penyakit streptococcosis pada ikan nila. Penelitian terdiri atas tiga tahap penelitian yaitu : 1) Karakteristik dan patogenisitas protein ECP S. agalactiae pada ikan nila (Oreochromis niloticus), 2) Imunogenisitas protein toksin 89 kDa dari ECP S. agalactiae pada ikan nila dan 3) Efikasi vaksin toksoid ECP 89 kDa untuk pengendalian penyakit Streptococcosis pada ikan nila. Penelitian pertama bertujuan untuk mengevaluasi toksisitas protein berbagai berat molekul protein ECP S. agalactiae hasil fraksinasi dengan SDS-PAGE. Protein dengan berat molekul 76,52 kDa (ECPP76,52), 89 kDa (ECPP89) dan 132,92 kDa (ECPP132,92) dari ECP pekat yang difraksinasi dengan SDS-PAGE dan diisolasi dari gel akrilamid. Ikan nila dengan bobot sekitar 25 g ek-1 masingmasing diinjeksi secara intraperitonial (i.p.) dengan protein dosis 1, 2, 4, 8 dan 16 μg-1 mL-1. Sebagai kontrol positif ikan diinjeksi dengan bakteri utuh S. agalactiae 1x104 CFU mL-1 (WCB) dan ECP crude S. agalactiae (ECPC). Sebagai kontrol negatif ikan diinjeksi dengan larutan PBS. Ikan dipelihara selama 15 hari dengan kepadatan 10 ekor (70 L air). Hasil penelitian menunjukkan bahwa ikan nila yang diinjeksi dengan ECP89, WCB dan ECPC mengalami gejala khas penyakit S. agalactiae. Mortalitas pada perlakuan ECP89 secara umum lebih tinggi (p<0.05) dibandingkan dengan ECPC namun lebih rendah (p<0.05) dibandingkan dengan WCB. Gejala khas terserang S. agalactiae dan mortalitas ikan tidak terjadi pada perlakuan ECPP76,52; 132,92 kDa. Hasil ini menunjukkan bahwa ECP89 merupakan protein toksin dari ECP S. agalactiae yang berpotensi sebagai antigen yang imunogenik. Penelitian kedua bertujuan untuk mengevaluasi respons imun spesifik dan nonspesifik ikan nila setelah pemberian protein toksin 89 kDa dari produk ekstraseluler (ECP89) bakteri S. agalactiae. Ikan nila dengan bobot sekitar 25 g ekor-1, diinjeksi secara i.p. 0,1 mL dengan ECP89 dosis 2 μg mL-1 (ECP89-2), 4 μg mL-1 (ECP89-4), 6 μg mL-1 (ECP89-6) dan 8 μg mL-1 (ECP89-8). Sebagai kontrol positif ikan nila diinjeksi dengan vaksin sel utuh formalin-killed bakteri S. agalactiae 1x109 CFU mL-1 (WCV) dan vaksin ECP bakteri S. agalactiae (ECPV), sedangkan kontrol negatif ikan tidak diinjeksi dengan vaksin (UV). Ikan dipelihara selama 20 hari dengan kepadatan 30 ekor bak-1 (195 L air). Pengamatan respons imun spesifik dan nonspesifik dilakukan setiap 5 hari. Hasil penelitian menunjukkan bahwa penggunaan ECP89-4,
Keyword: ECP, ikan nila, produk ekstraseluler, Streptococcus agalactiae, vaksin protein

Judul: Toksisitas Protein Produk Ekstraseluler Streptococcus agalactiae Isolat NK1 pada Ikan Nila Oreochromis niloticus
Abstrak: Streptococcus agalactiae merupakan patogen utama yang sering menjangkit pada ikan nila. Menurut Sheehan et al. (2009), dari hasil pemeriksaan 1.000 isolat bakteri yang berasal dari 74 lokasi di 14 negara termasuk Indonesia, spesies Streptococcus yang paling umum teridentifikasi adalah S. agalactiae. Di Indonesia sendiri, hasil identifikasi dari 15 isolat yang diambil dari daerah yang terjadi wabah streptococcosis adalah sebanyak 80% merupakan S. agalactiae dan 20% merupakan Streptococcus iniae (Taukhid dan Purwaningsih 2011). Seperti bakteri Gram positif lainnya, bakteri S. agalactiae memiliki beberapa faktor virulensi yang dapat menyebabkan penyakit. Salah satu faktor virulensinya adalah kandungan eksotoksin yang terlarut pada extracellular product (ECP). Toksin protein bakteri Streptococcus merupakan zat antigenik yang kuat dan bekerja secara luas serta menyebabkan kematian dengan gejala yang tidak spesifik seperti nekrosis pada jaringan (Woolf 2000). Penelitian ini dilakukan di Laboratorium Kesehatan Ikan Departemen Budidaya Perairan, Fakultas Perikanan Ilmu Kelautan, Laboratorium Mikrobiologik Terpadu, Fakultas Kedokteran Hewan dan Laboratorium Mikrobiologi dan Biokimia, Pusat Penelitian Sumberdaya Hayati dan Bioteknologi, Institut Pertanian Bogor. Bakteri S. agalactiae yang digunakan merupakan koleksi Balai Penelitian dan Pengembangan Budidaya Air Tawar (BPPBAT) Bogor yaitu isolat NK1. Ikan uji yang digunakan adalah ikan nila dengan rataan bobot tubuh 20 g/ekor. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi fraksi toksik dari ECP S. agalactiae isolat NK1 dan menguji dampak patogenisitas masing-masing fraksi tersebut terhadap ikan nila. Penelitian ini terdiri dari dua tahapan. Tahap pertama menghasilkan 70 fraksi protein dari ECP kasar yang difraksinasi menggunakan kolom kromatografi. Kemudian masing-masing fraksi disuntikkan pada ikan nila dan dihasilkan delapan fraksi yang bersifat toksik (fraksi protein no. 6, 15, 18, 23, 28, 34, 54 dan 70) berdasarkan gejala klinis dan tingkat kematiannya. Selanjutnya dilakukan identifikasi protein berdasarkan berat molekul (SDS-PAGE). Pada tahap kedua, dipilih dua fraksi protein yaitu P23 dan P70 sebagai perlakuan, ECP kasar sebagai kontrol positif dan phosphate buffer saline (PBS) sebagai kontrol negatif. Perlakuan disuntikkan secara intraperitonial pada 10 ekor ikan nila dengan bobot 20 ± 1 gram dan diulang sebanyak tiga kali. Selanjutnya ikan dipelihara selama 14 hari dan dilakukan pengamatan terhadap gejala klinis, gambaran darah dan tingkat kematian. Pengamatan gejala klinis seperti kelainan pada tubuh, mata dan pola renang pada perlakuan P70 muncul lebih cepat yaitu pada jam ke-24. Pengamatan gambaran darah dapat menunjukkan kondisi fisiologis, karena mengungkapkan kondisi yang terjadi dalam tubuh ikan uji. Hasil dari gambaran darah adalah sebagai berikut : 1) Sel darah merah cenderung berfluktuasi pada semua perlakuan, namun pada akhir penelitian jumlah sel darah merah kembali mendekati jumlah normal. 2) Hemoglobin pada semua perlakuan tidak berbeda nyata pada setiap pengambilan sampel, hal ini dikarenakan S. agalactiae isolat NK1 merupakan bakteri non-hemolitik. 3) Hematokrit cenderung berfluktuasi pada semua perlakuan, namun nilai penurunannya tidak lebih rendah dari nilai hematokrit normal, yaitu sebesar 26,75%. 4) Sel darah putih pada hari ketiga pasca uji tantang, jumlah sel darah putih P23 dan P70 meningkat dengan perlakuan P70 memiliki nilai paling tinggi dan berbeda nyata dengan perlakuan lainnya (menurut hasil analisis statistik dengan p<0,05) yaitu 1,063 x 105 sel mm3 -1. 5) Nilai respiratory burst paling tinggi terdapat pada perlakuan ECP kasar (K+) di hari ketiga pasca uji tantang
Keyword: toxicity, extracelluler product, Streptococcus agalactiae, tilapia (Oreochromis niloticus)

Judul: Utilization of terra/MODIS L1B data for analysis of horizontal wind profile in the troposphere
Abstrak: This study was concerned with horizontal wind derived from data collected with the Moderate-resolution Imaging Spectroradiometer (MODIS) on board the NASA’s Earth Observation System (EOS)-Terra satellite. The aim of this study is to develop a method for the estimation of horizontal wind movement in the troposphere based on Navier-Stokes equation. The method was applied to a calibrated and geolocated Terra/MODIS L1B 1 km data set. The data inputs to estimate surface temperature are retrieved from TIR (Thermal Infrared) bands 31 (10.780 μm to 11.280 μm) and 32 (11.770 μm to 12.270 μm). The obtained surface temperatures were later used to approximate geopotential height on a constant-pressure surface by using the modified Poisson equation. The main assumptions used are the hydrostatic equilibrium, ideal gas law, constant lapse rate and constant acceleration of gravity. Based on the distribution of geopotential height, the pressure gradient force is measured by the gradient of geopotential on an isobaric coordinate to present the horizontal wind profile. For certain topographic areas especially in the mountain ranges, there was a disadvantage of using pressure as a vertical coordinate which lead to inaccuracy. In spite of that, Terra/MODIS L1B data with 1 km spatial resolution can be used to estimate the horizontal wind movement in the troposphere.
Keyword: