Judul: A Hydroacoustic Study on Fish Schools Structure and Its Distribution in Bintuni Bay.
Abstrak: Metode hidroakustik digunakan untuk memperoleh informasi tentang b~ atau kejadian di dalam air dengan memancarkan gelombang suara (akustik) da'i?'menganalisis gema yang diterimanya. ~ Teluk Bintuni sebagai daerah penelitian termasuk perairan dangkal, tenang da: relatif homogen. Evaluasi dan pengkajian terhadap sumberdaya laut di Teluk Biiiuni yang pernah dilakukan selama ini lebih terfokus pada sumberdaya udang d~ sumberdaya ikan demers.al yang terdapat di perairan tersebut. Penelitian ini ber=ujuan untuk mem berikan informasi dan pengetahuan mengenai distribusi dan s4tur kelompok ikan di perairan Teluk Bintuni dengan menggunakan metode ak~tik bim ganda. ;- Penggambaran distribusi kelompok ikan dilakukan dengan cara mejpplotkan deviasi back scattered energy, pada garis lintang dan garis bujur area sutiei, kedalarnan, suhu, serta salinitas dengan bantuan s(?fiware Surfer. Pe~gambaran struktur kelompok ikan dilakukan dengan menganalisis deskriptor ak$tik dengan anal isis statistik, meliputi: analisis komponen utama, analisis ko~lasi kanonik, anal isis gerombol, dan analisis diskriminan. ::J Distribusi kelompok ikan di Teluk Bintuni berdasarkan waktu, garis bujur, gT lintang dan kedalaman tidak memperlihatkan suatu pola tertentu. Be~asarkan garis lintang dan garis bujur keberadaan kelompok ikan terClistribusi di bagian tengah teluk (132.5- 133.53 °BT) dan berdasarkan lapisan kedalaman distribusi kepadatan relatif kelompok ikan terkonsentrasi pada kedalaman 5-30 meter. Struktur kelompok ikan an tar waktu pengamatan kurang terindikasi melalui deskriptor batimetrik, tetapi lebih terindikasi melalui deskriptor morfometrik dan deskriptor energetik. Indikasi struktur kelompok ikan melalui deskriptor batimetrik, morfometrik, dan energetik antar waktu pengamatan memberikan informasi bahwa rata-rata kelompok ikan dilihat dari posisi pada koJom pcrairan bcrada pada lapisan alas, bcrbcntuk lonjong dcngan luas kclompok tel§jlong sempit, memiliki nilai reverberasi sedang, dan cenderung untuk tidak bealang ke dalam bentuk yang sama (bersifat acak).
Keyword: 

Judul: Studi tentang Target Strength Ikan di Perairan Teluk Jakarta dengan Sistem Akustik Bim Terbagi
Abstrak: Pemanfaatan sumberdaya hayati laut terutama sumberdaya perikanan mempunyai potensi cukup besar untuk dimanfaatkan secara lebih optimal. Mengingat Perairan Indonesia yang begitu luas sehingga tidaklah mudah untuk mengelola sumberdaya yang terkandung di dalamnya, maka diperlukan manajemen yang baik untuk pengelolaan sumberdaya hayati. Metode akustik adalah salah satu metode yang dapat digunakan dalam pendeteksian target di bawah air. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pola penyebaran nilai target strength ikan dengan sistem akustik bim terbagi (split beam) baik secara spasial maupun temporal di Perairan Teluk Jakarta sehingga hasilnya dapat dimanfaatkan bagi manajemen sumberdaya perikanan di Perairan Teluk Jakarta. Penelitian ini dilaksanakan dari tanggal 9 sampai 10 September 2000 (musim timur), dengan lokasi pengambilan sampel di Perairan Teluk Jakarta dengan posisi 05° 55.98' LS - 060 03.16' LS dan 106' 42.76' BT - 1060 58.02' BT. Bahan dalam peneiitian ini adalah ikanikan yang terdeteksi di Perairan Teluk Jakarta yang akan diestimasi nilai.target strength-nya. Perangkat penelitian yang digunakan untuk pen9ambilan data adalah satu unit kapal yaitu Kap31 Motor Kencana milik Unit Pelaksana Teknis Unit Penyuluhan Modernisasi Bertahap Dinas Perikanan Daerah Khusus Ibukota Jakarta, seperangkat instrumen akustik Simrad EY 500 Split Beam System, Salinity Conductivity Temperature (SCT) meter dan Global III Positioning System (GPS). Perangkat lunak pemrosesan dan analisis lanjutan menggunakan software Echo Processing System EP-500, Spread-sheet Excel, Surferversi 6.02. Data akustik yang diambil menggunakan rancangan penelitian berupa transek garis yang berbentuk paralel Penelitian akustik ini mengambil data pada 22 titik stasiun. Perekaman data akustik yang diperoleh 36 file, dimana pada stasiun satu dilakukan kalibrasi terhadap echo sounder dengan tujuan mendapatkan data akustik yang lebih akurat, sedangkan untuk stasiun tiga terjadi gangguan sehingga tidak dapat diperoleh data. Distribusi vertikal target tunggal dibagi dalam selang lima meter untuk tiap strata kedalaman. Dalam penelitian ini didapatkan penyebaran target tunggal jumlah ikan cenderung semakin sedikit dari strata II dan III ke strata keda!aman perairan yang semakin dalam. Kecenderungan Ini disebabkan semak!n berkurangnya pakan dengan semakin dalamnya perairan. Persentase frekuensi target memiliki kecenderungan semakin meningkat dari strata kedalaman I sampai strata kedalaman III, hal yang mungkin menyebabken kecenderungan ini adalah adanya avoidance reaction dari target ikan.
Keyword: 

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA