Judul: The Detection of Antibiotic Resistance of Escherichia coli from The  Pig Farm in Badung District Bali Province Through One Health Approach
Abstrak: Resistansi antimikrob atau Antimicrobial Resistance (AMR) saat ini menjadi masalah kesehatan global. Penggunaan antibiotik yang tidak tepat memicu keberadaan bakteri resistan, yang dapat menyebabkan penurunan kemampuan pengobatan antibiotik pada kejadian infeksi bakteri hingga kegagalan pengobatan. Bakteri Escherichia coli (E. coli) adalah bakteri Gram negatif yang bersifat komensal maupun patogen dan telah diketahui resistan pada beberapa jenis antibiotik. Resistansi antibiotik pada E. coli mengindikasikan adanya bakteri resistan di lingkungan dengan potensi penyebarannya. Disain penelitian ini merupakan penelitian eksploratif untuk mengidentifikasi pola resistansi dan gen penyandi resistansi antibiotik pada E. coli dari peternakan babi di Kabupaten Badung, Provinsi Bali, serta menganalisis hubungan kekerabatan bakteri E. coli resistan yang berasal dari hewan, manusia dan lingkungan. Pengambilan sampel dilakukan di 12 peternakan babi, terdiri dari 24 sampel feses babi, 24 sampel swab tangan pekerja kandang dan 12 sampel air limbah. Analisis laboratorium terdiri dari isolasi-identifikasi E. coli menggunakan media McConkey Agar dan uji biokimia IMViC, serta konfirmasi E. coli secara molekuler dengan Polymerase-Chain Reaction (PCR) deteksi gen uspA. Hasil E. coli positif selanjutnya diuji resistansi dengan metode Disk Diffusion Kirby-Bauer terhadap amoksisilin (AML), ampisilin (AMP), sefalotin (KF), seftriakson (CRO), sefotaksim (CTX), seftazidim (CAZ), siprofloksasin (CIP), kolistin sulfat (CT), eritromisin (E), streptomisin (S), tetrasiklin (TE), dan trimethoprim sulfametoksazol (SXT). Isolat E. coli resistan kemudian diuji deteksi E. coli penghasil ESBL dengan Modified Double Disk Sinergy Test (MDDST), diuji gen penyandi resistansi antibiotik dengan PCR, serta analisis kekerabatan isolat yang berasal dari hewan, manusia, dan lingkungan dengan sekuensing metode Sanger dan pohon filogenetik. Jumlah positif E. coli dari sampel feses 100% (24/24), air muara limbah 100% (12/12) dan swab tangan pekerja kandang 16,7% (4/24). Pola resistansi antibiotik menunjukkan pada semua isolat, resistansi tertinggi pada eritromisin, diikuti oleh amoksisillin dan ampisilin, tetrasiklin, streptomisin, trimethoprim sulfametoksazol Berdasarkan pola resistansi, sejumlah 14 isolat dikategorikan sebagai Multi Drug Resistance (MDR), yaitu resistan terhadap tiga atau lebih golongan antibiotik. Gen resistansi yang terdeteksi dari isolat E. coli resistan yaitu gen blaTEM, ampC, tetA, strA dan sul1, sedangkan ermB tidak terdeteksi. Escherichia coli penghasil ESBL tidak terdeteksi. Hasil analisis kekerabatan E. coli resistan asal manusia dan hewan, serta antar isolat hewan yang berasal dari peternakan yang sama memiliki memiliki hubungan kekerabatan yang dekat. Kolaborasi multisektoral yang melibatkan sektor kesehatan manusia, kesehatan hewan dan lingkungan hidup dipandang perlu dalam upaya pengendalian resistansi antibiotik secara nasional dan global., Antimicrobial resistance (AMR) is currently a global health problem. Inappropriate use of antibiotics triggers the existence of resistant bacteria, which can cause a decrease in the ability of antibiotic treatment in the event of bacterial infections and even treatment failure. Escherichia coli (E. coli) are Gram-negative bacteria which are both commensal and pathogenic, also are known to be resistant to several types of antibiotics. Antibiotic resistance in E. coli indicates the presence of resistant bacteria in the environment with the potential to spread. The design of this research was an exploratory study to identify resistance patterns and genes encoding antibiotic resistance in E. coli from the pig farms in Badung Regency, Bali Province, as well as analyzing the relationship between resistant E. coli bacteria originating from animals, human
Keyword: babi, Escherichia coli, gen resistansi, pola resistansi

Judul: Beta-Lactam Antibiotic Resistance and Production of Beta-Lactamase Enzyme in Escherichia coli from Chicken
Abstrak: Salah satu masalah kesehatan masyarakat utama abad ke-21 adalah resistansi antimikroba (AMR). Masalah AMR yang sangat penting adalah terkait resistansi antibiotik pada bakteri. Escherichia coli sebagai bakteri komensal pada saluran pencernaan dianggap sebagai reservoir dan pentransmisi resistansi antibiotik. Banyak penelitian resistansi antibiotik pada E. coli telah dilakukan. Penelitian terkait resistansi ampisilin pada E. coli dari berbagai hewan menujukkan angka yang tinggi. Namun, baru sedikit sekali penelitian di Indonesia yang meneliti resistansi sefalosporin pada E. coli asal hewan di Indonesia, terutama asal ayam. Kondisi resistansi seringkali dikaitkan dengan gen yang menyandikan sifat resistansi. Beberapa penelitian di Indonesia telah mendeteksi gen-gen panyandi resistansi antibiotik beta-laktam. Gen-gen penyandi resistansi yang telah dideteksi pada E. coli pada penelitian di luar negeri adalah blaTEM, blaSHV, dan blaCTX-M. Namun, penelitian deteksi ketiga gen tersebut pada isolat E. coli asal ayam di Indonesia belum pernah dilakukan. Tujuan umum penelitian ini adalah mendeteksi resistansi beta-laktam dan melihat aktivitas enzim beta-laktamase yang diproduksi dari E. coli yang berasal dari ayam. Escherichia coli pada penelitian ini berasal dari tiga lokasi berbeda yaitu Sukabumi (25 isolat), Bogor (17 isolat), dan Cianjur (10 isolat). Tiga rangkaian penelitian dilakukan dalam penelitian ini. Penelitian pertama tentang profil resistansi antibiotik pada E. coli. Penelitian pertama bertujuan untuk (1) membandingkan profil resistansi ampisilin tahun 2019 dan 2021 pada isolat E. coli yang sama dan (2) mengetahui profil resistansi ampisilin, setazidim, dan sefotaksim pada E. coli yang berasal dari ayam. Metode yang digunakan untuk uji resistansi antibiotik adalah uji difusi cakram metode Kirby-Bauer pada agar Mueller-Hinton. Uji dilakukan dengan tiga kali pengulangan. Isolat terlebih dahulu direidentifikasi dengan uj-uji identifikasi bakteri secara konvensional meliputi kultur pada agar MacConkey, kultur pada agar eosin-methylene blue, pewarnaan Gram, uji pada agar triple surag iron, uji indol, uji motilitas, uji methyl red, uji Voges-Proskauer, uji sitrat, dan uji urease. Selanjutnya dikonfirmasi dengan pomerase chain reaction (PCR) untuk mendeteksi gen uspA. Kelima puluh dua isolat terkonfirmasi E. coli dan positif gen uspA. Hasil uji resistansi ampisilin pada E. coli sangat tinggi karena seluruh isolat menunjukkan diameter zona hambat 0 mm. Hasil ini sama dengan pengujian resistansi tahun 2019 yang juga memiliki diameter zona hambat uji ampisilin 0 mm. Escherichia coli pada penelitian ini menunjukkan resistansi sefotaksim lebih tinggi daripada seftazidim. Tingkat resistansi tersebut teramati pada ketiga lokasi peternakan. Penelitian kedua adalah terkait gen peyandi resistansi yang ada pada isolat resistan. Isolat yang digunakan pada rangkaian penelitian kedua adalah sebanyak 33 isolat. Isolat tersebut minimal telah resistan dua antibiotik pada rangkaian penelitian sebelumnya (resistan ampisilin + seftazidim + sefotaksim atau ampisilin + seftazidim atau ampisilin + sefotaksim). Penelitian ini bertujuan untuk (1) mendeteksi gen blaTEM, blaSHV, dan blaCTX-M pada isolat E. coli asal ayam yang resistan ampisilin dan seftazidim dan/atau sefotaksim, serta (2) melihat kekerabatan gen blaTEM. Gen-gen penyandi resistansi dideteksi dengan metode PCR. Gen-gen target dalam penelitian ini adalah blaTEM, blaSHV, dan blaCTX-M. Gen blaTEM mendominasi perolehan deteksi gen. Seluruh isolat memiliki gen blaTEM, diikuti oleh lebih dari 50% isolat memiliki gen blaSHV, dan jumlah terendah adalah gen blaCTXM. Kombinasi blaTEM + blaSHV menjadi kombinasi dominan. Gen blaTEM sebagai gen yang paling dominan disekuensing. Lima
Keyword: antibiotik, beta-laktam, Escherichia coli, resistansi, beta-laktamase

Judul: Thermal Characteristics and Dynamics of Tropical Cyclone over Western North Pacific Ocean: A Case Study of Typhoon Songda (Chedeng) 2011
Abstrak: The frequent occasion of Tropical Cyclone (TC) over Western North Pacific (WNP) Ocean lies from 10˚N to 26˚N and 121˚E to 170˚E. Sources of TC development come from warm ocean temperature where latent heat is released during condensation processes and subsequently concentrated in the boundary layer. Relative humidity at 850-700 hPa is responsible to produce the most intense storm. Meanwhile, weak vertical wind shear between 850-200 hPa is one of the dynamical factors that lead to the development of TC. Pressure level of 850-200 hPa is chosen to minimize the thermodynamic effect in the lower troposphere. Typhoon Songda (Chedeng in the Philippines) or TSC lasted from May 18th to 30th, 2011 and strengthened into powerful Super Typhoon stage between May 24th and 27th. Long curving track and the exhibition of all sequences of TC life cycle, TSC is then considered as an ideal case of TC. The objective of the study with case of TSC is to investigate the role of thermal characteristics and dynamics on TC intensity. The research is carried out by using Advanced Research of Weather Research and Forecasting model (WRF ARW model) version 3.3. Two domains are employed in the model. The first domain situate from 02˚N to 40˚N and 118˚E to 149˚E and cover spatial resolution () of 33.1 km. The second domain situate from 09˚N to 27˚N and 119˚E to 132˚E with of 11 km. Timestep of the model () is 120 seconds. The model is supported by the following physical parameterization, i.e., Yonsei University Scheme (YSU) in the boundary layer, Kain-Fritsch scheme (KF) in the cumulus, and WRF Single-Moment 3-class scheme in the microphysics. Initial meteorological condition prior to the formation of the cyclone is generated using WRF ARW standard-release model. Sensitivity of the model output is obtained from a selected single-parameter change scenarios, namely, 10 % to 20 % decrease and increase of wind shear initial data at 850-200 hPa, and by 10 % to 20 % decrease of relative humidity initial data at 850-700 hPa. The result showed that the negative correlations between wind shear and intensity are found in wind shear scenarios. Wind shears of 10 ms-1 which lead to strengthening of the wind intensity in the early period of Typhoon development are found in wind shear scenarios. The effect of wind shear changes on wind intensity is statistically significant in the 20 % wind shear scenarios. During mature stage, weak wind intensity occurred when wind shear increase as given in the WRF standard-release and the 20 % decreasing scenario. Different situation is found in the 20 % increasing scenario where wind shear tend to weak and lead to strong wind intensity at this stage. Meanwhile, the reduction of moisture supply at 850-700 hPa resulting from 20 % decreasing relative humidity play a major role in the weakening of wind intensity and reduces mechanical energy of the cycle process as much as 300 J kg-1.
Keyword: