Judul: Isolasi DNA dari lingkungan dan studi transformasi, Bacillus subtilis DB104
Abstrak: Aplikasi enzim di bidang bioteknologi semakin menuntut adanya enzim- enzim yang memiliki stabilitas tinggi terhadap lingkungan ekstrim, seperti pada temperatur tinggi, pH ekstrim dan kandungan logam tinggi. Dari sekian banyak mikroba ekstrim penghasil enzim yang memiliki nilai ekonomi tinggi, terdapat keterbatasan dalam mengkulturkannya, sehingga sulit untuk memproduksi enzim. Saat ini telah berkembang teknik produksi enzim secara molekular, yaitu dengan memilah gen penyandi enzim dari DNA total asal lingkungan, mengklonkan ke inang yang sesuai dan mengekspresikannya. Isolasi langsung DNA total telah memungkinkan untuk memperoleh gen-gen penting dari berbagai mikroorganisme yang terdapat di lingkungan. Penelitian ini bertujuan (1) mengkoleksi isolat DNA dari berbagai lingkungan dengan kondisi ekstrim yang dapat digunakan untuk penelitian lanjut di bidang bioteknologi dan (2) mempelajari transformasi Bacillus subtilis DB104. Penelitian didahului dengan pengambilan sampel dari berbagai lokasi yang dinilai potensial mengandung mikroba-mikroba ekstrim. Koleksi sampel tersebut adalah Sumber Air Panas Cimanggu-Ciwidey, kawah Gunung Tangkuban Perahu, kali Sunter, sungai Ciliwung, dan tempat pembuangan sampah Jatinegara. Dari koleksi sampel ini didapatkan sepuluh situs terbaik yang dipersiapkan untuk tahapan isolasi DNA langsung.
Keyword: 

Judul: Penggunaan diatomit, bentonit dan zeolit sebagai matriks pengikat untuk isolasi DNA tanah, gambut, bakteri dan daun
Abstrak: milik IP Tanah dan lingkungannya merupakan komunitas alam yang paling kompleks. Komunitas yang beragam ini menyimpan banyak potensi genetik yang dapat dikembangkan untuk bioteknologi. Metode yang umum digunakan di laboratorium konvensional hanya dapat menumbuhkan sangat kecil dari total mikroorganisme yang ada dari berbagai sampel tanah dan lingkungan. Ilmu biologi molekuler dapat digunakan untuk mempelajari keragaman biodiversitas yang tidak bisa dipelajari menggunakan teknologi laboratorium konvensional biasa. Metode untuk mengisolasi DNA merupakan langkah yang paling penting sebelum melakukan analisis biologi molekuler. Semua teknik yang dilakukan secara umum untuk mencari cara yang cepat, mudah dan murah tetapi dapat memberikan hasil yang baik yaitu menghasilkan DNA yang utuh, memiliki konsentrasi yang cukup untuk analisis dan memiliki tingkat kemurnian yang baik, serta bebas dari berbagai kontaminan yang dapat mengganggu analisis selanjutnya Penelitian ini dilaksanakan di Laboratorium Mikrobiologi dan Bioteknologi Lingkungan, Pusat Penelitian Lingkungan Hidup (PPLH) Kampus Darmaga, Institut Pertanian Bogor serta Laboratorium Bioteknologi Molekuler PT. Saraswanti Indo Genetech. Penelitian ini berlangsung mulai bulan November 2004 sampai bulan Maret 2005. Di dalam penelitian ini digunakan diatomit...
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: