Judul: Pemetaan dan klasifikasi sedimen dengan instrumen side scan sonar di Perairan Balongan, Indramayu Jawa Barat
Abstrak: Side scan sonar dalam pencitraan benda-benda di dasar laut dapat menghasilkan berbagai variasi gambar digunakan untuk pencitraan objek-objek dasar laut dan memberikan informasi dalam pengembangan wilayah pantai. Penelitian ini dapat memberikan informasi kuantitatif berupa nilai amplitudo dari objek atau dasar perairan. Tujuan dari penelitian ini adalah memvisualisasikan atau memetakan dasar perairan dan mengklasifikasikan sedimen atau objek di dasar laut secara kualitatif dan kuantitatif, sehingga dapat diketahui karakter sinyal yang khas (unik) dari berbagai substrat. Daerah survei terletak di Perairan Balongan, Indramayu – Jawa Barat pada koordinat 6 ° 21' 48 "LS - 6 ° 22' 54 "LS dan 108 ° 24' 18"BT - 108 ° 25' 49"BT. Pengolahan data dilakukan di Laboratorium Akustik Kelautan, Departemen Ilmu dan Teknologi Kelautan, Institut Pertanian Bogor dan di Pusat Penelitian dan Pengembangan Geologi Laut (PPPGL) di Bandung. Interpretasi dan klasifikasi data akustik side scan sonar dilakukan secara kualitatif dengan menggunakan software SonarPro untuk melihat bentuk geometris dan keunikan dari suatu objek. Pemrosesan data secara kuantitatif menggunakan software sonarWiz.MAP, SonarWeb, xtfToSegy, seisSee dan Matlab dengan metode wavelet. Pengambilan contoh sedimen dilakukan pada 6 jalur transek dengan jarak antar transek 0.5 km. Setiap transek terdapat 3 buah stasiun sampel sedimen dan jumlah total adalah 18 sampel sedimen. Berdasarkan hasil pemetaan dasar laut daerah Balongan terdapat buangan sedimen, paritan dan kerukan sedimen, selain itu terdapat objek seperti box, mooring, potongan pipa, tali, pole. Setiap jenis sedimen memiliki nilai amplitudo yang berbeda yakni: pada lumpur memiliki nilai yang relatif rendah yaitu 200 mV, paritan mencapai 1900 mV pada waktu 28 ms dan buangan sedimen memiliki nilai amplitudo mencapai 800 mV. Nilai amplitudo yang paling besar dimiliki oleh objek single point mooring (SPM) mencapai 2x104 mV. Karakter sinyal yang terbentuk dari objek buatan seperti box dan potongan pipa memiliki suatu bayangan dari objek dapat terlihat dari grafik sinyal yang dihasilkan. Box memiliki nilai amplitudo yang tidak jauh berbeda dengan nilai amplitudo yang dimiliki objek potongan pipa mencapai 5000 mV. Range waktu pada objek ini adalah 19-26 ms. Hasil analisis besar butir yang dilakukan oleh PPPGL memiliki sedimen dasar laut berupa lempung lanauan yang berada di bagian tengah alur dan di bagian barat dan timur alur terdapat pasir lanauan. Klasifikasi ini berdasarkan sifat dari sedimen dapat dicirikan adanya berat fraksi antara butiran kasar dan halus.
Keyword: 

Judul: Kuantifikasi Siny Al Akustik P Ada Beberap A Target Dasar Laut Dengan Instrumen Side Scan Sonar Klein Sistem 3000
Abstrak: Side scan sonar secara kontinyu merekam kondisi lautan sehingga dapat di aplikasikan untuk pendeteksian keberadaan pipa dan kabellaut, pendeteksian g ruktur dangkal dasar laut, pengerukan dasar laut, studi lingkungan, kemiliteran, ~eologi , perikanan serta pertambangan. Semua penelitian akustik pada !£asamya menginterpretasikan nilai backscatter yang dipantulkan oleh objek dasar !!lIut. Pengetahuan akan nilai backscatter tersebut sangat diperlukan karena dapat ~empengaruhi keakuratan dalam menginterpretasi target dasar laut. Tujuan dari p-enelitian ini ialah melakukan analisis backscatter sinyal akustik side scan sonar 9.an mendiskripsikan secara kuantitatif sifat-sifat akustik obyek dasar laut ierdasarkan hasil analisis backscatter sinyal akustik side scan sonar. 'ii Data side scan sonar yang dipergunakan dalam penelitian ini berasal dari ~sil penelitian lapangan yang telah dilakukan oleh Pusat Penelitian dan ~engembangan Geologi Kelautan Bandung dari bulan Februari hingga bulan ~aret pada tahun 2005. Lokasi penelitian ini berada di perairan Tuban Jawa :t;imur yaitu pada koordinat 6° 42'45" LS - 6° 43'57"LS dan 112° 09'16" BT- ~ 12° 09'26" BT. Pengambilan data menggunakan side scan sonar digital Klein ~stem 3000 dengan dual frekuensi yaitu 100 kHz dan 500 kHz. Beberapa ~erangkat lunak yang digunakan seperti SonarPro V75 Beta, SonarWeb Master, tIonarWiz , XtfTo Segy, SeiSee, MatLab, dan Microsoft Excel. .g Dari pengolahan dan perhitungan sinyal akustik side scan sonar diperoleh .Basil berupa image, nilai echo level, nilai backscatter, analisis spektrum amplitudo dan ukuran objek. Objek yang terpindai sebanyak 4 benda yaitu lanau (silt), selang minyak (hose), single point mooring (SPM), dan badan kapal (submerged ship 's body). Nilai echo level terendah dikirimkan oleh silt sebesar -27.92 dB dan nilai tertinggi dikirimkan oleh submerged ship's body sebesar -15.44 dB. Nilai backscatter terendah pada frekuensi 500 kHz dikirimkan oleh silt sebesar -34,91 dB dan nilai tertinggi dikirimkan oleh submerged ship 's body sebesar -24,84. Nilai backscatter terendah pada frekuensi 100 kHz dikirimkan oleh silt sebesar - 40,05 dB dan nilai tertinggi dikirimkan oleh submerged ship 's body sebesar - 29,42. Selang minyak memiliki ukuran panjang sebesar 31 .2 m dan 42.9 m serta @i'JJar sebesar 1.4 m dan 0.5 m. SPM memiliki ukuran panjang 16 m dan 22.1 m ~rta lebar sebesar 8 m dan IS m. Submerged ship 's body memiliki ukuran '2anjang 179.5 m. Nilai spektrum amplitudo silt berada pada kisaran 14 dB - 50 ~. Nilai amplitudo spektrum hose berada pada kisaran 20 dB - 80 dB. Nilai )!!:l1plitudo spektrum SPM berada pada ki saran -6 dB hingga 100 dB. Nilai cs>ektrum amplitudo kapal (submerged ship 's body) berada pad a kisaran 70 dB J!i.ngga 110.
Keyword: 

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA