Judul: IPB (Bogor Agricultural University)
Abstrak: Sapi madura sebagai salah satu plasma nutfah sapi lokal Indonesia yang memiliki tiga kegunaan yaitu sebagai sapi karapan, sapi sonok dan sapi pedaging. Sapi madura mulai dikembangkan sebagai sapi pedaging untuk memenuhi kebutuhan daging nasional. Salah satu strategi yang diterapkan untuk meningkatkan populasi sapi madura yaitu melalui inseminasi buatan (IB) menggunakan semen beku. Seleksi sapi madura unggul dilakukan melalui metode breeding soundness examination (BSE) dengan kualitas semen yang baik dan berdasarkan standar nasional Indonesia (SNI). Pemeriksaan kualitas semen konvensional masih belum akurat untuk memprediksi fertilitas dengan persentase conception rate yang belum maksimal. Analisis berbasis omic dengan pemanfaatan biomarka banyak dikembangkan untuk mengidentifikasi faktor molekuler yang mempengaruhi fertilitas pejantan. Evaluasi kualitas spermatozoa dikombinasikan dengan penggunaan beberapa biomarka, dianggap dapat lebih akurat untuk seleksi fertilitas pejantan. Protein heat shock protein 70 member 2 (HSP70-2), protamin 1 (PRM1) dan ostepontin (OPN) merupakan 3 major protein yang terseleksi dan berkorelasi terhadap kualitas semen infertilitas, penurunan kualitas fungsional spermatozoa, hingga perkembangan awal embrio. Tujuan penelitian ini adalah mengkaji pemanfaatan HSP70-2, PRM1 dan OPN sebagai biomarka penanda fertilitas. Penelitian terdiri dari 4 bagian tujuan spesifik, diantaranya (1) menganalisis karakteristik spermatozoa post-thawing dengan perbedaan tingkat fertilitas di lapangan, (2) menganalisis ekspresi gen dan konsentrasi protein HSP70-2, PRM1 dan OPN spermatozoa serta korelasinya terhadap kualitas spermatozoa pada tingkat fertilitas berbeda, (3) mengidentifikasi karakteristik berat molekul protein HSP70-2, PRM1 dan OPN pada spermatozoa, dan (4) menganalisis pemanfaatan protein HSP70-2, PRM1 dan OPN untuk menilai fertilitas spermatozoa sapi Madura. Penelitian bagian pertama dengan tujuan menganalisis karakteristik spermatozoa post-thawing sapi madura dengan perbedaan tingkat fertilitas di lapangan. Sapi madura dikelompokkan ke dalam tingkat fertilitas berbeda berdasarkan pengolahan data %first service conception rate (%FSCR) menggunakan data iSIKHNAs tahun 2018-2020. Hasil pengelompokkan tingkat fertilitas sapi madura unggul menjadi 3 tingkat fertilitas yaitu high fertility (HF) (80,86%; n= 2 ekor), medium fertility (MF) (73,12%, n= 4 ekor) dan low fertility (LF) (69,92%; n= 2 ekor). Kualitas semen pada semua karakteristik spermatozoa post-thawing kecuali indeks fragmentasi DNA spermatozoa (DFI), signifikan lebih tinggi (P<0,05) pada sapi madura HF dibandingkan dengan MF dan LF. Indeks fragmentasi DNA spermatozoa pada sapi madura HF signifikan paling rendah (P<0,05) dibandingkan MF dan LF. Hasil evaluasi karakteristik spermatozoa yang diukur diketahui berkorelasi positif (P<0,01) terhadap tingkat fertilitas (TF), dengan parameter DFI berkorelasi negatif terhadap TF yang artinya semakin sedikit fragmentasi DNA yang ditemukan maka tingkat fertilitas tinggi. Hasil penelitian bagian dua dengan tujuan menganalisis ekspresi gen dan konsentrasi protein HSP70-2, PRM1 dan OPN spermatozoa post-thawing sapi Madura dan korelasinya terhadap kualitas spermatozoa pada tingkat fertilitas berbeda. qRT-PCR dengan PPIA sebagai gen housekeeping. Kelompok pejantan madura HF mengekspresikan mRNA HSP70-2 signifikan paling tinggi (P<0,01), dan menunjukkan adanya pengaruh kelimpahan ekspresi terhadap parameter kualitas spermatozoa, terutama motilitas, plasma membran utuh, dan akrosom spermatozoa (P<0,01). Tingkat transkrip PRM1 tidak berbeda secara signifikan antara kelompok MF dan LF. Namun, ekspresi PRM1 signifikan lebih tinggi pada kelompok sapi pejantan HF (P<0,05), serta menunjukkan pengaruh pada motilitas spermatozoa (P<0,01), akrosom utuh, dan DFI spermatozoa (P<0.05) pejantan HF. Ekspresi OPN tidak berbeda antar kelompok fertilitas dan tidak menunjukkan pengaruh yang signifikan dengan kualitas spermatozoa. Sementara, konsentrasi protein dengan ELISA dilakukan
Keyword: biomarka, fertilitas, spermatozoa, omic, sapi madura

Judul: Analisis Protein dan Kualitas Post-Thawing Spermatozoa Sapi Friesian Holstein dengan Perbedaan Tingkat Fertilitas.
Abstrak: Sapi Friesian Holstein (FH) secara luas dikembangbiakkan di Indonesia dengan teknologi inseminasi buatan (IB) untuk meningkatkan populasi dan produksi susu. Teknologi IB menggunakan semen beku dari sapi jantan yang memiliki status reproduksi dan kesuburan yang baik. Analisis kualitas spermatozoa saat ini masih didasarkan pada karakteristik makro- dan mikroskopis yang masih belum dapat menginterpretasikan fertilitas pejantan karena penurunan kualitas spermatozoa post-thawing. Kriopreservasi spermatozoa dapat menginduksi terdegradasinya membran sel spermatozoa yang memicu kerusakan deoxyribo nucleic acid (DNA) dan protein tertentu yang dapat mengubah fungsi dan memengaruhi fertilitas. Beberapa protein dalam spermatozoa dan plasma seminal dilaporkan dapat digunakan sebagai protein penanda terhadap tingkat fertilitas. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis kualitas dan protein spermatozoa pada semen beku post-thawing dari sapi FH dengan tingkat fertilitas yang berbeda. Penelitian dilakukan dalam tiga tahap. Tahap pertama yaitu klasifikasi pejantan FH menjadi dua kategori tingkat fertilitas diantaranya high fertile (HF) dan low fertile (LF) berdasarkan data efisiensi reproduksi menggunakan data sekunder Sistem Informasi Kesehatan Hewan Nasional (iSIKHNAS) Jawa Barat tahun 2017 – 2018. Tahap kedua adalah evaluasi kualitas semen beku post-thawing. Tahap ketiga adalah ekstraksi dan analisis protein spermatozoa dari semen beku sapi FH post-thawing dengan Sodium Dodecyl Sulfate Polyacrylamide Gel-Electrophoresis (SDS-PAGE). Uji t-test pada taraf nyata 95% digunakan pada penelitian ini, dengan satu faktor yaitu tingkat fertilitas sapi. Tingkat fertilitas sapi (fertilitas tinggi dan rendah) sebagai perlakuan dan jumlah sapi jantan sebagai ulangan. Korelasi antara karakteristik kualitas spermatozoa terhadap tingkat fertilitas dianalisis dengan uji korelasi Spearman. Hasil penelitian menunjukkan bahwa motilitas spermatozoa tidak berbeda nyata antara sapi jantan dengan tingkat HF dan LF (P> 0.05). Sapi jantan dengan tingkat HF memiliki persentase viabilitas spermatozoa, keutuhan membran plasma dan akrosom spermatozoa yang lebih tinggi dibandingkan dengan sapi pada tingkat LF (P <0.05). Sapi jantan dengan tingkat HF berkorelasi positif terhadap hasil evaluasi viabilitas, Membran Plasma Utuh (MPU) dan Tudung Akrosom Utuh (TAU), namun berkorelasi negative terhadap parameter morfologi spermatozoa. Spermatozoa sapi jantan FH dalam kelompok tingkat HF mengandung protein dengan berat molekul (BM) sekitar 33.71 kDa yang tidak terdapat pada kelompok sapi FH dengan tingkat LF. Kisaran protein dengan BM 33.71 kDa diprediksi sebagai protein yang dapat digunakan sebagai biomarker atau protein penanda spesifik pada pejantan sapi dengan potensi daya fertilitas tinggi.
Keyword: biomarker, fertility, Friesian Holstein, protein, spermatozoa

Judul: Closed Knight’s Tour pada Papan Catur Berbentuk Persegi Panjang dengan Ukuran Maksimal 8 × 8
Abstrak: Closed Knight’s Tour merupakan langkah kuda yang mengunjungi setiap kotak pada papan catur tepat satu kali dengan langkah kuda berawal dan berakhir pada kotak yang sama. Graf yang terbentuk dari closed knight’s tour dinotasikan sebagai graf G(m,n), dengan m adalah banyaknya baris dan n adalah banyaknya kolom. Graf tersebut memuat Hamiltonian cycle. Sebuah graf terhubung G adalah graf bipartite jika dan hanya jika graf tersebut tidak memiliki cycle dengan panjang ganjil. Papan catur yang memenuhi syarat cukup untuk memiliki closed knight’s tour adalah papan catur berukuran 5 × 6, 5 × 8, 6 × 6, 6 × 7, 6 × 8, 7 × 8, dan 8 × 8.
Keyword: bipartite, closed knight’s tour, hamiltonian cycle, knight’s tour, teori graf