Judul: Keseragaman Benih Dan Pohon Induk Di Kebun Sumber Benih Pala (Myristica Fragans Houtt.) Berdasarkan Karakter Morfologi Dan Molekuler
Abstrak: Pala merupakan tanaman tropis asli Indonesia penghasil minyak atsiri dan merupakan komoditas ekspor yang penting. Tingkat keseragaman benih pala tergolong rendah dikarenakan pala merupakan tanaman yang menyerbuk silang. Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi tingkat keseragaman benih, pohon induk dan kebun sumber benih pala di Ambon. Penggunaan karakter morfologi dan molekuler untuk mengukur tingkat keseragaman benih, pohon induk dan antar kebun sumber benih pala. Penelitian dilakukan bulan Agustus 2014 hingga Agustus 2015 di tiga kebun sumber benih di Ambon, dan Laboratorium Pengujian dan Penyimpanan Benih, Kebun percobaan Leuwikopo, dan Laboratorium Biologi Molekuler Tanaman 2, IPB. Karakterisasi dilakukan pada 10 pohon induk dari kebun sumber benih Wakal dan Lula serta 8 pohon induk dari kebun sumber benih Toisapu. Sepuluh sampel daun, buah, fuli dan benih diambil dari setiap pohon. Karakterisasi secara kuantitatif dan kualitatif pada karakter vegetatif, buah, fuli dan benih dan dianalisis tingkat keseragaman menggunakan Gower’s similarity test. Analisis molekuler dilakukan pada bibit tanaman dari 5 benih dari 5 pohon induk yang berbeda dari setiap kebun sumber benih. Analisis molekuler menggunakan marka RAPD dengan menggunakan 19 primer yang berbeda. Daun bibit pala diekstraksi menggunakan metode CTAB yang dimodifikasi dan diamplifikasi dengan metode PCR lalu divisualisasi dengan elektroforesis. Analisis tingkat keseragaman dilakukan dengan menggunakan metode Dice’s. Analisis keseragaman gabungan karakter morfologi dan molekuler juga dilakukan dengan metode Dice’s. Tingkat keseragaman benih secara morfologi menujukkan bahwa benih dari pohon induk kebun sumber benih Lula lebih seragam dengan 6 pohon induk yang menghasilkan benih dengan tingkat keseragaman ≥ 0.80 sedangkan pada Toisapu terdapat 1 pohon induk dan Wakal terdapat 3 pohon induk. Tingkat keseragaman morfologi antar pohon induk, benih secara molekuler dan benih dengan gabungan karakternya menunjukkan bahwa kebun sumber benih Lula dan Toisapu lebih seragam daripada Wakal. Tingkat keseragaman pohon induk pala menunjukkan bahwa kebun sumber benih Lula (0.64–0.81) dan Toisapu (0.64–0.80) lebih seragam dibandingkan kebun Wakal (0.47–0.77). Tingkat keseragaman benih secara molekuler menujukkan bahwa benih kebun sumber Lula (0.93–0.96) dan Toisapu (0.87–0.93) telah seragam daripada kebun Wakal (0.61–0.92). Tingkat keseragaman benih dengan penggabungan karakter menunjukkan bahwa tingkat keseragaman benih kebun sumber Lula (0.91–0.96) dan Toisapu (0.85–0.90) telah seragam daripada kebun Wakal (0.68–0.91). Tingkat keseragaman benih menunjukkan bahwa pohon induk ke-7 dari kebun Wakal menghasilkan benih dengan tingkat keseragaman terendah dengan marka molekuler (0.61) dan penggabungan karakter morfologi dan molekuler (0.68).
Keyword: Analisis Dice’s, Gower’s dissimilarity test, keseragaman benih, marka RAPD, sumber benih

Judul: Analisis Keragaman Morfologi Pala (Myristica fragrans Houtt.) Populasi Tidore, Ternate dan Bogor
Abstrak: Pala Banda (Myristica fragrans Houtt.) adalah spesies pala yang paling banyak dibudidayakan karena memiliki nilai ekonomi paling tinggi dan telah menyebar luas ke berbagai daerah. Tidore dan Ternate di Maluku Utara merupakan salah satu daerah dengan tingkat keanekaragaman pala yang tinggi. Kabupaten Bogor, di sisi lain adalah salah satu pusat pengembangan pala di Jawa Barat. Karakteristik pala Bogor memiliki kemiripan dengan pala asal Maluku Utara, namun tetap terdapat perbedaan yang disebabkan karena adaptasi terhadap lingkungan yang berbeda. Analisis keragaman dan kekerabatan perlu dilakukan untuk memastikan hubungan antar populasi tersebut. Identifkasi keragaman dapat dilakukan dengan menggunakan penanda morfologi. Keragaman genetik pala berdasarkan penanda morfologi telah dipelajari secara luas, namun tidak spesifik untuk pala Banda, atau mencakup wilayah geografis yang berbeda. Informasi keragaman akan bermanfaat dalam pengembangan program pemuliaan tanaman pala. Sampai dengan saat ini peningkatan produksi dan kualitas masih menjadi target utama program pemuliaan pala. Kualitas produksi dan komponen mutu merupakan salah satu faktor keberhasilan perdagangan pala Indonesia di dunia. Komponen hasil merupakan karakter yang dipengaruhi oleh lingkungan dan terkait banyak gen. Pendugaan langsung pada karakter hasil tertentu umumnya sulit dilakukan dan membutuhkan waktu yang panjang. Oleh karena pendugaan komponen hasil seringkali dilakukan melalui karakter lain yang memiliki keeratan hubungan dengan karakter hasil tertentu. Bobot biji dan komponen mutu minyak pala merupakan salah satu produk utama. Hubungan antara komponen pertumbuhan terhadap bobot biji dan mutu dapat diketahui melalui korelasi dan analisis lintas. Karakter yang berkorelasi positif dan memiliki pengaruh langsung yang besar diasumsikan memiliki keeratan terhadap karakter hasil dan dapat digunakan sebagai alternatif karakter penduga komponen hasil Penelitian bertujuan untuk mengetahui keragaman morfologi dan hubungan kekerabatan populasi pala Tidore, Ternate, Bogor, serta mengetahui korelasi antara komponen pertumbuhan dan hasil. Penelitian dilakukan pada bulan November 2017 - Desember 2018. Penelitian dilakukan menggunakan 46 sampel dari delapan lokasi berbeda, tiga di Ternate-Tidore, Maluku Utara (Gurubunga, Jaya dan Marikurubu) lima di Bogor, Jawa Barat (Curugnangka, Cigombong, Ciawi, Leuwisadeng dan Tamansari). Pengamatan menggunakan metode observasi langsung pada karakter habitus, daun, buah, biji, fuli, dan bunga berdasarkan deskriptor tanaman buah tropis IPGRI. Data kuantitatif dianalisis menggunakan software MINITAB 17. Analisis gerombol menggunakan program PBSTAT metode agglomerative UPGMA. Kemiripan antar aksesi dihitung menggunakan jarak Gower. Analisis korelasi dan sidik lintas menggunakan program MINITAB 17. Hasil penelitian menunjukan keragaman morfologi pala terlihat pada bentuk buah, bentuk pangkal dan ujung buah, warna buah dan bentuk pohon. Tebal fuli merupakan karakter dengan nilai keragaman terbesar (50,38%). Keragaman morfologi intra populasi umumnya rendah kecuali pada karakter buah dan berat fuli. Kekerabatan populasi pala Bogor lebih dekat dengan Ternate dibandingkan Tidore. Tingkat kemiripan populasi pala Bogor dengan populasi Ternate mencapai 60%, sementara kemiripan dengan pala Tidore 46%. Panjang dan lebar daun merupakan salah satu karakter yang dapat digunakan untuk menduga komponen hasil, karena memiliki korelasi terhadap bobot biji, bobot buah, tebal fuli dan bobot fuli. Selain panjang dan lebar daun, tebal daun juga dapat digunakan sebagai penduga bobot buah dan bobot fuli. Karakter bentuk buah dan biji agak lonjong dapat digunakan sebagai penseleksi pohon berkadar safrol biji dan myristicin biji tinggi. Hubungan antar komponen mutu tidak memperlihatkan korelasi yang tinggi.
Keyword: bobot biji, fenotipe, kemiripan, keragaman, korelasi

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: