Judul: Kloning dan Ko-ekspresi Lipase dan Chaperon Ralstonia pickettii BK6 Asal Limbah Kulit Biji Jambu Mete
Abstrak: Enzim lipase yang dihasilkan bakteri Ralstonia menarik perhatian besar karena potensial bioteknologinya. Namun, enzim ini membutuhkan chaperon untuk membentuk lipase dalam konformasi aktif. Tujuan penelitian ini adalah mengkloning dan ko-ekspresi lipase dengan chaperon spesifiknya dari Ralstonia pickettii BK6 serta mengkarakterisasi sifat biokimia dari lipase tersebut. Bakteri lipolitik diisolasi dari limbah kulit biji jambu mete yang diinokulasi di media agar-agar Luria Bertani dengan metode sebar. Identifikasi bakteri secara molekuler berdasarkan gen 16S rRNA, sedangkan gen lipase (lipRM) dan chaperon (lifRM) diisolasi dengan teknik PCR yang melibatkan primer RM_LC_lip yang telah didesain sebelumnya. Kedua gen dikonstruksi dalam bentuk sistem operon baik ke vektor plasmid pGEM®-T Easy maupun ke pET15by. Vektor pGEM®-T Easy rekombinan dikloning ke Escherichia coli DH5α dengan metode kejut panas. Plasmid rekombinan pET15by dikoekspresikan ke E. coli BL21 (DE3) pLyss, sedangkan pGEM®-T Easy dikoekspresikan ke DH5α, HB101, dan S17_1λ pir. Protein dipurifikasi secara parsial dan penentuan massa molekuler lipase berdasarkan analisis SDS-PAGE dan zimogram pada media TCN. Selain itu, lipase dikarakterisasi beberapa sifat biokimianya. Hasil penelitian menunjukkan bahwa isolat BK6 identik 99% dengan Ralstonia pickettii. Struktur gen lipase dan chaperon dari isolat BK6 berupa sistem operon. LipRM tersusun atas 330 asam amino dengan 43-residu sebagai signal peptida yang memiliki massa molekuler sekitar 30 kDa. LifRM memiliki 350 asam amino yang diidentifikasi mengandung signal peptida sebanyak 26 residu. Ko-ekspresi lipase dan chaperon spesifiknya dengan mekanisme pelipatan secara in vivo menghasilkan lipase dalam konformasi aktif. LipRM memiliki aktivitas optimum pada suhu 50-55 ºC pH 8.0 dengan substrat spesifik ester laurat (C12). Triasilgliserol pada minyak kelapa sawit lebih efektif dihidrolisis dibandingkan dengan minyak zaitun, minyak kanola, minyak kulit padi, minyak jagung, minyak bunga matahari, dan minyak kedelai. Konsentrasi 1 mM ion logam (Fe2+, Cu2+, Mg2+, Ca2+, Na+, Mn+, K+, or Zn2+) menurunkan hingga 50% aktivitas enzim. Namun, penambahan pelarut organik 30%, seperti butanol, propanol, metanol, etanol, dan n-heksan mampu meningkatkan aktivitas enzim secara signifikan. LipRM stabil terhadap pemberian metanol 40-70%, etanol 80%, dan SDS 1%, tetapi pemberian larutan deterjen 5% seperti, triton X-100, tween-20, tween-80, dan SDS menghambat aktivitas enzim. Aktivitas spesifik lipase BK6 yang terpurifikasi secara parsial pada E. coli BL21 (DE3) pLyss, DH5α, HB101, dan S17_1λ pir masing-masing sebesar 1.19 ± 0.24 U/mg, 32.29 ± 0.54 U/mg, 42.87 ± 3.81 U/mg, dan 173.16 ± 8.77 U/mg. Hasil penelitian ini dapat menjadi salah satu strategi dalam mengekspresikan lipase dalam konformasi aktif khususnya yang termasuk kelompok lipase subfamili I.2.
Keyword: Chaperon, limbah kulit biji jambu mete, lipase, R. pickettii

Judul: Karakterisasi Isolat Bakteri Lipolitik 3GUU dan Kloning Gen Penyandi Lipase Unik
Abstrak: Lipase merupakan biokatalis hidrolisis ester karboksilat rantai panjang. Penggunaan enzim dalam dunia industri sangat jarang digunakan karena harga biokatalis yang belum ekonomis. Bioprospeksi mikroba penghasil lipase merupakan salah satu solusi yang dapat digunakan. Penelitian ini bertujuan mengkarakterisasi dan mengkloning gen penyandi lipase unik dari isolat terpilih penghasil lipase. Penentuan isolat bakteri penghasil lipase dengan menumbuhkan bakteri pada media Luria Bertani dengan 1% Rhodamine B, dan 1% minyak zaitun. Isolat yang mampu menghasilkan lipase, diseleksi menggunakan uji Paranitrophenil Palmitat (pNPP). Hasil analisis 16S rRNA menunjukkan isolat T118 diidentifikasi sebagai Pseudomonas fluorescens (99%), suhu optimum enzim lipase 40⁰C, pH optimum 8.5, dengan substrat terbaik oktanoat. Isolat IT52 adalah Bacillus sp. (100%), suhu optimum 50⁰C, pH optimum 8, dengan substrat terbaik stearat. Isolat IT17 adalah Bacillus sp. (100%), suhu optimum 50⁰C, pH optimum 8, dengan substrat terbaik dodekanoat, dan isolat HM12 Stenotrophomonas maltophilia (100%) suhu optimum 60⁰C, pH optimum 9, dengan substrat terbaik dodekanoat. Lipase HM12 telah diklon pada E.coli dan sekuen asam amino menunjukkan kemiripan 99% dengan lipase Stenotrophomonas maltophilia yang telah dipublikasi. Analisis struktural lipase menunjukkan kemiripan dengan struktur enzim lipase pada C.antartica.
Keyword: Kloning, Lipase, Stenotrophomonas

Judul: Implementasi Space Time Composite (STC) Data Model Menggunakan Model Data Relasional
Abstrak: The data model is a concept that describes the data stored in the database and the relationship between the data to the user in logic. Development of data models is very important in the design of the database as the basis of the stage of database design to be made. This study aims to apply the concept of Space Time Composite (STC) on the Model Data storage vector data types that can store enough information and describes the process of drafting objects and objects spatiotemporal evolution over time. From the results of the test queries on the data model that have been created, queries in a system are acquired that can help display the information preparation of objects from time to time and know the history of the object polygon and arc that has undergone changes in topology.
Keyword: