Judul: Penelusuran Pemanfaatan Ikan Hiu Dilindungi pada Berbagai Produk dengan Teknik COIBar-RFLP
Abstrak: Pemanfaatan hiu sebagai bahan baku produk perikanan secara berlebihan menyebabkan beberapa spesies hiu terancam punah. Teknik molekuler yang dapat digunakan untuk menelusuri pemanfaatan hiu pada produk perikanan salah satunya adalah COIBar-RFLP. Tujuan penelitian ini yaitu menentukan enzim restriksi yang tepat sebagai penciri spesies hiu dengan analisis in silico dan mengaplikasikannya pada berbagai produk perikanan hiu. Tahapan penelitian adalah dengan penentuan enzim restriksi menggunakan teknik bioinformatika, isolasi DNA, amplifikasi DNA dan pengujian in vitro enzim restriksi terpilih pada produk hasil amplifikasi DNA. Penentuan enzim restriksi dilakukan dengan menggunakan software remap dan DNAstar. Amplifikasi DNA dilakukan dengan primer target fish universal F1R1 pada suhu 60ºC. Produk amplifikasi dipotong dengan dengan enzim restriksi NlaIII dan MseI. Analisis dengan elektroforesis menunjukkan enzim restriksi mampu memotong produk amplifikasi dari sampel DNA spesies hiu S. lewini, A. pelagicus, C. falciformis dan R. australiae dengan pola fragmentasi yang berbeda-beda. perbedaan pola fragmentasi yang dihasilkan dapat digunakan sebagai informasi untuk mencirikan spesies hiu.
Keyword: COIBar-RFLP, enzim restriksi, hiu

Judul: Teknik DNA Barcoding untuk Identifikasi Spesies Produk Hiu yang Didaratkan di Muara Baru, Jakarta dan Status Konservasinya
Abstrak: Hiu sebagai komoditi perikanan yang serba guna menyebabkan tingginya permintaan pasar terhadap produk hiu. Secara akumulatif, hal tersebut mengakibatkan eksploitasi hiu. Banyak perusahaan perikanan lokal di Indonesia mengekspor berbagai jenis produk hiu ke berbagai negara, termasuk daging hiu dan sirip kering. Identifikasi spesies hampir tidak mungkin dilakukan karena sebagian besar hiu ditemukan dengan fitur diagnostik utama yang dihapus, atau dalam kondisi yang sudah diawetkan. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi spesies hiu yang didaratkan di Muara Baru, Jakarta dengan pendekatan molekuler. Variasi fragmen Cytochrome Oxidase 1 (CO1) DNA mitokondria diamplifikasi dan diurut untuk mengidentifikasi motif khas setiap spesies. Dari 71 sampel yang digunakan di dalam penelitian ini berhasil diidentifikasi 21 spesies yang berasal dari 4 famili, yaitu Carcharhinidae, Alopiidae, Sphyrnidae, dan Hemigaleidae. Di antara sampel-sampel tersebut, 1 spesies, yaitu Sphyrna lewini dikategorikan sebagai kritis atau endangered di dalam Daftar Merah IUCN (World Conservation Union). Sisanya, 10 spesies berstatus near threatened, 6 spesies vulnerable, 3 spesies least concern, dan 1 spesies yang belum dievaluasi. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa identifikasi spesies menggunakan DNA barcoding dapat menjadi bagian dari upaya pengelolaan perikanan dan konservasi hiu.
Keyword: DNA barcoding, Hiu, Muara Baru, Konservasi, Mitokondria

Judul: Thermal Characteristics and Dynamics of Tropical Cyclone over Western North Pacific Ocean: A Case Study of Typhoon Songda (Chedeng) 2011
Abstrak: The frequent occasion of Tropical Cyclone (TC) over Western North Pacific (WNP) Ocean lies from 10˚N to 26˚N and 121˚E to 170˚E. Sources of TC development come from warm ocean temperature where latent heat is released during condensation processes and subsequently concentrated in the boundary layer. Relative humidity at 850-700 hPa is responsible to produce the most intense storm. Meanwhile, weak vertical wind shear between 850-200 hPa is one of the dynamical factors that lead to the development of TC. Pressure level of 850-200 hPa is chosen to minimize the thermodynamic effect in the lower troposphere. Typhoon Songda (Chedeng in the Philippines) or TSC lasted from May 18th to 30th, 2011 and strengthened into powerful Super Typhoon stage between May 24th and 27th. Long curving track and the exhibition of all sequences of TC life cycle, TSC is then considered as an ideal case of TC. The objective of the study with case of TSC is to investigate the role of thermal characteristics and dynamics on TC intensity. The research is carried out by using Advanced Research of Weather Research and Forecasting model (WRF ARW model) version 3.3. Two domains are employed in the model. The first domain situate from 02˚N to 40˚N and 118˚E to 149˚E and cover spatial resolution () of 33.1 km. The second domain situate from 09˚N to 27˚N and 119˚E to 132˚E with of 11 km. Timestep of the model () is 120 seconds. The model is supported by the following physical parameterization, i.e., Yonsei University Scheme (YSU) in the boundary layer, Kain-Fritsch scheme (KF) in the cumulus, and WRF Single-Moment 3-class scheme in the microphysics. Initial meteorological condition prior to the formation of the cyclone is generated using WRF ARW standard-release model. Sensitivity of the model output is obtained from a selected single-parameter change scenarios, namely, 10 % to 20 % decrease and increase of wind shear initial data at 850-200 hPa, and by 10 % to 20 % decrease of relative humidity initial data at 850-700 hPa. The result showed that the negative correlations between wind shear and intensity are found in wind shear scenarios. Wind shears of 10 ms-1 which lead to strengthening of the wind intensity in the early period of Typhoon development are found in wind shear scenarios. The effect of wind shear changes on wind intensity is statistically significant in the 20 % wind shear scenarios. During mature stage, weak wind intensity occurred when wind shear increase as given in the WRF standard-release and the 20 % decreasing scenario. Different situation is found in the 20 % increasing scenario where wind shear tend to weak and lead to strong wind intensity at this stage. Meanwhile, the reduction of moisture supply at 850-700 hPa resulting from 20 % decreasing relative humidity play a major role in the weakening of wind intensity and reduces mechanical energy of the cycle process as much as 300 J kg-1.
Keyword: