Judul: Potential of Bacterial Isolates from Peatlands as Controlling Agent for the Root Knot Nematodes Meloidogyne incognita
Abstrak: Lahan gambut Indonesia memiliki luas mencapai 14,9 juta hektar dan 35% diantaranya berada di Sumatera. Tanah gambut terbentuk dari adanya akumulasi bahan organik pada kondisi jenuh air dan atau kondisi anaerob. Tanah gambut memiliki kandungan bahan organik tinggi, derajat keasaman rendah, dan kandungan oksigen terlarut rendah yang menyebabkan laju dekomposisi pada lahan gambut menjadi lambat. Namun demikian, lahan gambut merupakan habitat dari berbagai jenis mikrob yang berperan penting dalam ekosistem, salah satunya adalah mikrob dari jenis bakteri. Bakteri merupakan kelompok mikroorganisme yang paling beragam dalam aspek fisiologi terutama terkait keragamannya pada berbagai tipe habitat. Keberadaan mikrob fungsional pada lahan gambut merupakan aspek penting yang perlu dilestarikan. Adanya konsep konservasi pada lahan gambut perlu memerhatikan peran bakteri. Bakteri pada lahan gambut mampu memanfaatkan bahan organik dalam aliran energi dan siklus unsur hara. Salah satu pemanfaatan bakteri gambut adalah dengan memanfaatkan kemampuannya dalam bidang pertanian seperti kemampuannya sebagai agens pengendali hayati penyakit tanaman. Salah satu parasit dari kelompok nematoda yang merupakan parasit penting pada tanaman budidaya dan memiliki kisaran inang yang luas yaitu nematoda puru akar (NPA). NPA merupakan sebutan lain untuk spesies nematoda Meloidogyne spp.. NPA tersebar luas di seluruh dunia dan menyebabkan kehilangan hasil baik di daerah tropis maupun subtropis. Kehilangan hasil yang disebabkan oleh nematoda ini dapat mencapai 5–20%. Potensi bakteri asal gambut sebagai agens pengendali nematoda belum banyak diteliti sehingga perlu dilakukan. Bakteri pada lahan gambut mampu memanfaatkan bahan organik dalam aliran energi dan siklus unsur hara. Adanya sifat dan karakter fisiologi khusus yang dimiliki oleh bakteri asal gambut dapat dimanfaatkan dalam bidang perlindungan tanaman. Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi potensi isolat bakteri asal gambut baik secara in vitro maupun in planta sebagai agens pengendalian M. incognita. Di samping itu, isolat bakteri yang potensial diidentifikasi secara molekuler dengan teknik PCR. Pengujian in vitro terhadap 50 individu juvenil (J2) M. incognita menggunakan 4,5 ml filtrat bakteri dilakukan pada suhu 27 oC. Pengamatan dilakukan terhadap persentase mortalitas nematoda pada 6, 12, 24 jam setelah perlakuan, dan 12 jam setelah pembilasan. Percobaan menggunakan rancangan acak lengkap (RAL) dengan 17 perlakuan dan 3 ulangan. Pengujian terhadap isolat bakteri meliputi: uji Gram dengan larutan KOH 3%, produksi senyawa HCN dengan cyanide detection solution (CDS), dan aktivitas kitinolitik pada media koloidal kitin. Isolat bakteri dengan aktivitas kitinolitik tertinggi kemudian diidentifikasi secara molekuler dengan teknik PCR untuk target 16S rRNA menggunakan primer forward 27 F dan primer reverse 1492 R dilanjutkan dengan perunutan DNA. Sebanyak 15 isolat bakteri asal gambut berhasil ditumbuhkan pada media Agar, 11 isolat bakteri merupakan bakteri Gram positif dan 4 isolat lainnya Gram negatif. Hasil penelitian menunjukkan bahwa 9 isolat bakteri yaitu: GA2 GAA1, GT1 GTA7, GT1 GTB3, GT1 GTB4, GT1 GTB6, GT1 GTB7, GT1 GTC2, GT1 GTC4, and STDHC4 memiliki kemampuan nematisidal in vitro dengan mortalitas mencapai 83–94% serta dapat meningkatkan pertumbuhan tanaman secara in planta hingga 32,23%. Isolat bakteri GT1 GTB4, GT1 GTB7, dan GT1 GTC2 memiliki kemampuan menghasilkan enzim kitinase dengan indeks lisis > 1 dan memiliki persentase keefektifan dalam menekan nematoda secara in planta sebesar 51,18–62,99%. Isolat bakteri GT1 GTB4 dan GT1 GTB7 memiliki homologi 99% dengan Serratia marcescens
Keyword: indeks lisis, kitinase, mortalitas, lysis index, chitinase, nematode mortality

Judul: Potential of Bacterial as Biocontrol Agent for Root-Knot Nematode Meloidogyne incognita and Growth Promoter of Tomato Plant
Abstrak: Meloidogyne incognita atau nematoda puru akar (NPA) adalah nematoda endoparasit akar tanaman. Penggunaan nematisida dinilai efektif, namun berbahaya bagi kesehatan manusia dan lingkungan. Bakteri memproduksi metabolit sekunder dan enzim litik yang bersifat nematisidal. Penelitian bertujuan mengisolasi dan menskrining bakteri yang berpotensi sebagai agen biokontrol M. incognita pada kondisi in vitro dan pemacu pertumbuhan tanaman. Tahapan penelitian meliputi isolasi bakteri, skrining in vitro sel bakteri, uji reaksi hipersensitivitas dan hemolisis, uji in vitro filtrat bakteri terpilih, uji pengaruh bakteri terpilih terhadap pertumbuhan tanaman tomat, serta karakterisasi dan identifikasi molekuler isolat terpilih. Sebanyak 44 isolat terdiri dari 11 bakteri endofit dan 33 bakteri rizosfer berhasil diisolasi serta 14 isolat diantaranya menyebabkan mortalitas J2 sebesar 55,3% hingga 74,2% dan penetasan telur sebesar 6,5% hingga 12,1%. Uji hipersensitivitas dan hemolisis memperoleh dua isolat rizosfer, Z2.1R dan Z1.3R, yang tidak berpotensi patogenik bagi tanaman dan manusia. Filtrat Z2.1R dan Z1.3R yang disaring menyebabkan mortalitas J2 berturut-turut sebesar 70,1% dan 22,2% serta penetasan telur berturut-turut sebesar 10,8% dan 12,8%. Kedua isolat mampu meningkatkan pertumbuhan tinggi tanaman tomat di rumah kaca berturut-turut sebesar 38,2% dan 42,0% dibandingkan dengan kedua kontrol Temik 5G dan akuades steril. Kedua isolat memiliki karakter koloni bundar, tepian rata, elevasi datar, dan termasuk dalam bakteri Gram positif. Identifikasi molekuler menunjukkan bahwa Z2.1R memiliki kemiripan 99,7% dengan Lysinibacillus xylanilyticus dan Z1.3R memiliki kemiripan 95,5% dengan L. sphaericus. Kedua isolat berpotensi menjadi agen biokontrol M. incognita dan memacu pertumbuhan tanaman sehingga perlu diuji lanjut kemampuannya dalam menekan gejala puru akar dan populasi NPA.
Keyword: biocontrol, Lysinibacillus, root-knot nematode, tomato

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: