Judul: Nilai indeks stabilitas statis dan frekuensi Brunt Vaisala di Perairan selatan Bali dan Laut Flores, dalam hubungannya dengan upwelling
Abstrak: Stabilitas statis air adalah kondisi potensial gerakan unit volume air sebagai respon terhadap gangguan distribusi densitas secara menegak. Stabilitas statis air diukur dengan nilai indeks stabilitas statis (E) yang merupakan fungsi perubahan densitas terhadap kedalaman. Bila suatu unit volume air berpindah ke atas, gaya kembali akan menyebabkan percepatan ke bawah ke arah posisi kesetimbangan dan unit volume air akan berosilasi untuk beberapa waktu. Frekuensi osilasi ini disebut Frekuensi Brunt Väisälä atau Frekuensi Bouyancy. Nilai Frekuensi Brunt Väisälä sebanding dengan nilai indeks stabilitas statis. Ada tiga kriteria stabilitas statis yaitu netral (E=0), di mana setelah unit volume air berpindah akan diam di tempat yang baru; tidak stabil (E<0), di mana berpindahnya unit volume air cenderung berlanjut, sehingga menyebabkan pergerakan unit volume air; dan stabil (E>0) di mana berpindahnya unit volume air terjadi pada jarak menegak yang pendek kemudian kembali ke posisi semula. Laut memiliki stratifikasi massa air secara vertikal yaitu air di lapisan dalam mempunyai suhu yang lebih rendah, salinitas dan kandungan zat hara yang tinggi, serta densitas yang lebih tinggi. Perbedaan sebaran densitas disebabkan oleh perbedaan sebaran suhu dan salinitas. Perubahan suhu yang tajam di kolom air pada kedalaman tertentu disebut lapisan termoklin, sedangkan perubahan salinitas yang tajam disebut haloklin.
Keyword: 

Judul: Studi Upwelling di Perairan Selat Bali Bulan Oktober 2004
Abstrak: Upwelling merupakan fenomena alam dimana terangkatnya massa air laut dari lapisan bawah ke lapisan atas. Fenomena ini bisa terjadi di laut terbuka maupun di dekat pantai. Upwelling yang terjadi di pantai akibat adanya pergerakan massa air yang menjauhi pantai. Pergerakan ini mengakibatkan di dekat pantai terjadi kekosongan massa air, sehingga massa air yang berada pada lapisan di bawahnya akan mengisi kekosongan tersebut. Sedangkan upwelling yang terjadi pada tengah samudera karena adanya arus yang memisah sehingga menyebabkan daerah divergensi. Pada daerah ini massa air akan terangkat ke atas karena dua massa air bergerak berlawanan. Upwelling ini terjadi tetap sepanjang tahun hanya intensitasnya yang berubah. Perairan Selat Bali merupakan daerah yang potensial untuk terjadi upwelling karena pengaruh Arus Khatulistiwa Selatan dan angin muson tenggara yang intensif pada musim timur. Upwelling yang terjadi pada perairan ini akibat pengisian kekosongan oleh massa air yang ada pada lapisan bawah. Massa air yang berasal dari bawah ini umumnya mempunyai karakteristik seperti, suhu rendah, salinitas tinggi, DO rendah, dan kandungan zat hara (fosfat, nitrat, silikat) tinggi. Fitoplankton yang berkumpul karena perairan yang kaya akan kandungan zat hara akan menyebabkan kandungan klorofil-a perairan besar. Penggunaan teknologi penginderaan jauh dilakukan untuk lebih mudah mengamati SPL dari suatu perairan yang akan dipelajari sebagai daerah upwelling. Karena teknologi ini mencakup wilayah yang luas dan efisensi terhadap waktu. Tetapi dukungan data-data insitu oseanografi tetap diperlukan. Dari analisis data Citra NOAA-16/AVHRR dan dukungan analisis data oscanografi yaitu suhu, salinitas, DO, klorofil-a, dan tinggi muka laut. Pada bulan Oktober perairan Selat Bali masih terlihat mengalami upwelling walaupun angin muson barat mulai berpengaruh, berarti pula musim timur yang mempengaruhi perairan ini mulai digantikan oleh musim barat, tetapi pengaruhnya belum begitu besar. Dari hasil penelitian pada bulan Oktober di Selat Bali, perairan Selat Bali pada tanggal 1 Oktober yang diduga terjadi upwelling (stasiun 10) mempunyai SPL berdasarkan Citra NOAA-16, yaitu 23-26 °C, suhu konvensional sebesar 23-24 °C. suhu pengukuran CTD sebesar 25,2-25,4 °C, salinitas pengukuran CTD sebesar 32 - 34 psu, terjadi kenaikkan kedalaman lapisan pegat yang ditunjukkan oleh perbandingan termoklin dan haloklin stasiun 5 dan stasiun 10 dimana kedalaman lapisan termoklin maupun haloklin stasiun 5 berada dekat permukaan dibandingkan stasiun 10, kandungan fosfat sebesar 0,02-0,07 ug-at P/1, kandungan silikat sebesar 5,5 ug-at Si/l, kandungan oksigen 6,75 ml/l, dan konsentrasi klorofil 0,66 mg/m³. Tinggi muka laut perairan dekat pantai 10 cm dibawah permukaan laut.
Keyword: 

Judul: Penyusunan Overlap Graph menggunakan Suffix Tree pada DNA Sequence
Abstrak: The DNA sequence assembly is very important in genome analysis. This step aims to reconstruct contigous DNA fragment (contigs) from short fragment by concatenating fragments based on the overlap region among them. This method employs overlap graph for solving the problems. In this graph, nodes represent fragments and edges represent overlap. This research developed a software for constructing overlap graph using suffix tree. The evaluation was conducted by measuring the number of nodes, number of edges, and the execution time in many values of minimum overlap. The minimum overlap is defined as the minimum length of substring which is considered as the overlap region between two fragments. The evaluation results showed that the number of nodes, the number of edges, and the execution time were increased with the decreasing of the minimum overlap value.
Keyword: