Judul: Karakteristik dan Kemampuan Bacillus spp. Anti Quorum Sensing Penghambat Patogenitas Vibrio Parahaemolyticus pada Udang Vaname
Abstrak: Vibriosis yang disebabkan oleh Vibrio parahaemolyticus masih menjadi masalah pada budidaya udang vaname di Indonesia. Vibriosis dapat dicegah dan dikendalikan dengan mekanisme anti quorum sensing (AQS). Quorum sensing (QS) pada bakteri adalah komunikasi antar sel yang terkait proses regulasi gen dalam merespon perubahan kepadatan populasi sel dengan mensintesis, melepaskan dan mendeteksi molekul sinyal yang disebut autoinduser (AI) (Defoirdt et al. 2004). Ekspresi faktor virulen pada V. parahaemolyticus dipengaruhi oleh sistem quorum sensing. Salah satu strategi anti quorum sensing yaitu dengan mendegradasi molekul sinyal komunikasi sel bakteri (autoinduser). Molekul sinyal QS yang dihasilkan V. parahaemolyticus adalah acyl homoserin lactones (AHL) berupa 3-oxo-C6-HSL. Pendegradasi autoinduser yang umum berperan dalam AQS terhadap bakteri patogen Gram negatif adalah laktonase. Penelitian ini bertujuan untuk menseleksi dan mengkarakterisasi bakteri penghasil AHL laktonase yang berpotensi mampu menghambat patogenitas V. parahaemolyticus pada udang vaname. Penelitian ini meliputi isolasi, seleksi, identifikasi dan karakterisasi bakteri AQS sebagai kandidat agen biokontrol penghambat V. parahaemolyticus. Isolasi bakteri dilakukan dari sampel saluran pencernaan udang vaname, air dan sedimen tambak. Seleksi bakteri AQS meliputi 1). Bioessai bakteri AQS terhadap C. violaceum, parameter yang diamati adalah indeks degradasi AHL; 2). Produksi violacein pada kultur C. violaceum, parameter yang diamati adalah unit violacein; 3). Patogenitas bakteri uji AQS secara in vitro, parameter yang diamati zona bening di sekitar biakan bakteri pada agar darah; 4). Patogenitas bakteri uji AQS secara in vivo, parameter yang diamati adalah kelangsungan hidup PL vaname; 5). Penghambatan bakteri AQS terhadap patogenitas V. parahaemolyticus secara in vitro, parameter yang diamati adalah zona bening disekitar biakan bakteri AQS pada media SWC yang mengandung V. parahaemolyticus; 6). Deteksi keberadaan gen aiiA penyandi AHL laktonase dengan PCR dan sekuensing. Identifikasi bakteri AQS berdasarkan sifat biokimia serta molekuler gen 16S rRNA mengunakan PCR dan sekuensing. Kemampuan bakteri AQS menghambat patogenitas V. parahemolyticus secara in vivo diamati berdasarkan persentase kelangsungan hidup PL vaname yang diberi perlakuan bakteri AQS. Sebanyak 18 dari 111 isolat yang diisolasi menunjukan adanya aktivitas AQS terhadap bioindikator Chromobacterium violaceum. Aktifitas AQS yang dihasilkan dari supernatan kedelapan belas isolat tersebut merupakan hasil inkubasi selama 72 jam pada suhu 30 ºC sebagai masa inkubasi optimum. Sebanyak 11 isolat diduga menggunakan mekanisme AQS dalam menghambat produksi violacein berdasarkan pengukuran unit violacein pada kultur yang diberi supernatan bakteri AQS. Selanjutnya didapat 3 isolat bakteri AQS yang tidak menunjukan aktivitas hemolisis pada agar darah yaitu B5, K4 dan S12. Begitupula dengan uji patogenitas ketiga isolat terhadap larva vaname secara in vivo, menunjukan persentase kelangsungan hidup tergolong tinggi antara 91.67% - 100%, sehingga ketiga isolat tersebut aman untuk digunakan pada uji in vivo. Konfirmasi dan analisis gen aiiA menggunakan Blast-X, isolat B5 dan S12 memiliki kesamaan dengan AHL laktonase pada Bacillus cereus dengan nilai homologi masing-masing adalah 98.75% dan 99.17%, sedangkan K4 memiliki similaritas 99.55% dengan AHL laktonase pada multispesies Bacillus sp. Ketiga isolat tersebut teridentifikasi sebagai Bacillus siamensis (B5), Bacillus cereus (K4) dan Bacillus amyloliquefaciens (S12) dengan nilai homologi berturut-turut adalah 99.93%, 99.25% dan 99.93% berdasarkan gen 16S rRNA. Isolat K4 diduga bekerja hanya mekanisme AQS sedangkan pada isolat B5 dan S12 terjadi dua mekanisme bersama (antibiosis dan AQS) berdasarkan uji
Keyword: anti quorum sensing, AHL laktonase, Vibrio parahaemolyticus

Judul: Bakteri Asosiasi Spons Penghasil Senyawa Bioaktif sebagai Agen Pengendali Vibriosis pada Udang Vaname (L.vannamei).
Abstrak: Salah satu komoditas unggul budidaya perikanan di Indonesia adalah udang vaname (Litopenaeus vannamei). Permintaan udang vaname terus mengalami peningkatan setiap tahun. Namun, produksi udang vaname dapat menurun karena penyakit infeksi yang disebabkan oleh virus dan bakteri. Salah satu penyakit yang saat ini banyak ditemukan dalam budidaya udang adalah vibriosis. Vibriosis disebabkan oleh bakteri Vibrio sp. Sejauh ini, pengendalian populasi bakteri Vibrio sp. dapat dilakukan dengan pemberian immunostimulant, vaksin dan pemberian pakan yang ditambahkan dengan antibiotik. Namun, pemakaian antibiotik secara terus menerus dan dalam dosis yang tidak tepat dapat mengakibatkan resistensi bakteri Vibrio terhadap antibiotik. Saat ini, dikembangkan penelitian terkait senyawa yang dapat menghambat Vibrio menggunakan senyawa bioaktif yang berasal dari mikroba. Beberapa senyawa bioaktif untuk mengatasi populasi bakteri Vibrio sp. terdapat pada ekstrak mikroba yang berasosiasi dengan spons. Selain itu, dapat menjadi agen biokontrol bakteri patogen khususnya Vibrio parahaemolyticus dalam budidaya udang vaname. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan menguji aktivitas senyawa bioaktif yang dihasilkan oleh mikroba asosiasi dengan spons serta kemampuannya dalam mengendalikan vibriosis pada udang vaname dalam aplikasi uji in vivo skala laboratorium. Penelitian diawali dengan uji patogenisitas terhadap 12 isolat bakteri dan 8 isolat aktinomiset potensial untuk mendapatkan isolat yang dapat menghambat pertumbuhan V. parahaemolyticus dan analisis senyawa bioaktif penghambat Vibrio. Seluruh isolat yang digunakan memiliki nilai aktivitas penghambatan yang tinggi terhadap Vibrio parahaemolyticus secara in vitro dan menunujukkan reaksi hemolisis negatif pada agar darah. Seluruh isolat diisolasi dari spons Aaptos sp. dan Hyrtios sp. yang berasal dari pulau Seribu Jakarta. Sebelum dilanjutkan dengan uji tantang isolat bakteri dan isolat aktinomiset potensial dengan V. parahaemolyticus, dilakukan penetuan LC50 Isolat patogen Vibrio. Penetuan LC50 perlu dilakukan untuk mengetahui jumlah konsentrasi V. parahaemolyticus yang mampu mnyebabkan kematian lebih dari 50% pasca larva udang vaname (LC50). Selanjutnya dilakukan uji tantang untuk melihat kemampuannya dalam menghambat serangan V. parahaemolyticus. Selanjutnya, isolat bakteri dan aktinomiset yang menunjukkan aktivitas antibakteri yang tinggi dan stabil pada percobaan secara in vitro maupun in vivo dilakukan identifikasi senyawa bioaktif menggunakan GCMS. Tahapan terakhir penelitian ini yaitu isolasi DNA genom isolat bakteri terpilih menggunakan Genomic DNA Mini Kit (Blood/Cultured Cell) dan identifikasi isolat potensil berdasarkan gen 16S rRNA. Hasil uji patogenisitas menunjukkan bahwa seluruh isolat tidak bersifat patogen terhadap pascalarva udang vaname. Hal tersebut berdasarkan nilai kelangsungan hidup udang vaname yang diberi isolat potensial dengan kepadatan sel 106 cukup tinggi yaitu berkisar antara 80 - 93.3%. Isolat D2.Z13 menunjukkan kelangsungan hidup pascalarva udang vaname tertinggi sebesar 93.3%. Sementara itu, tingkat kelangsungan hidup pascalarva udang vaname yang ditambahkan isolat aktinomiset dengan kepadatan sel 106 berkisar antara 80 - 96.67%. Nilai kelangsungan hidup pascalarva udang vaname dengan pemberian isolat aktinomiset potensial P4.7 diketahui sebagai persentase kelangsungan hidup tertinggi sebesar 96.67%. Selanjutnya, berdasarkan hasil penelitian diperoleh nilai LC50 sebesar 105 sel/mL. Seluruh isolat selanjutnya dilakukan uji tantang dengan V. parahaemolyticus pada pascalarva udang vaname. Nilai kelangsungan hidup pascalarva udang vaname yang diberi isolat bakteri potensial terpilih berkisar antara 80 - 91.11%. Isolat bakteri D2.Z13 menunjukkan perbedaan signifikan terhadap kontrol positif. Sementara itu, nilai kelangsungan hidup pascalarva udang vaname dengan pemberian isolat aktinomiset berkisar 80 - 95.56%. Isolat aktinomiset P4.7 diketahui sebagai persentase
Keyword: Bakteri Asosiasi spons, GC-MS, 16S rRNA, Senyawa bioaktif, Vibriosis

Judul: Kajian frieze groups untuk klasifikasi dan konstruksi desain berdasarkan simetri pada pola
Abstrak: Frieze groups adalah konsep matematika untuk mengklasifikasikan desain pada dua dimensi permukaan yang berulang-ulang dalam satu arah berdasarkan simetri pada pola. Frieze groups merupakan grup yang mempertahankan bentuk pola. Pergerakan bentuk pola terdiri dari translasi, refleksi dan rotasi 180o. Tujuan dari karya ilmiah ini adalah mengkaji sifat Frieze group, mengkaji penggunaan Frieze group dalam mengklasifikasikan simetri pada pola dan mengkonstruksi pola dengan menggunakan software tesselmania. Hasil yang telah diperoleh, bahwa jenis Frieze groups merupakan subgroup dari grup pergerakan pola. Selain itu dapat dilihat dari sifat isomorfik berbagai jenis Frieze groups. Untuk mengkonstruksi sebuah bentuk pola dapat menggunakan salah satu software untuk membentuk sebuah pola bidang datar (dua dimensi) yaitu tesselmania.
Keyword: Frieze groups, Simetri, Pola