Judul: Keefektifan Formulasi Bakteri Endofit untuk Pengendalian Fusarium oxysporum f.sp cepae pada Tanaman Bawang Merah.
Abstrak: Penyakit busuk pangkal umbi yang disebabkan oleh Fusarium oxysporum f.sp cepae merupakan penyakit penting pada tanaman bawang merah. Penyakit busuk pangkal umbi dapat menyebabkan kehilangan hasil sampai 50%. Pemanfaatan bakteri endofit sebagai agens biokontrol merupakan alternatif yang baik dalam mengendalikan penyakit busuk pangkal umbi pada tanaman bawang merah. Tujuan penelitian ini adalah mempelajari kemampuan bakteri endofit sebagai agens antagonis dan potensinya sebagai pemacu pertumbuhan, dan mengevaluasi keefektifan formulasi bakteri endofit dalam mengendalikan F.oxysporum f.sp cepae secara in vivo pada tanaman bawang merah. Bakteri endofit yang digunakan adalah APE15, APE22, APE33, APE35 dari tumbuhan paku; BAT2-2 dari mangrove; dan MER dari lada. Formulasi bakteri endofit dibuat dalam tiga kombinasi. Formulasi F1 terdiri dari air kelapa, sukrosa, dan minyak nabati. Formulasi F2 terdiri dari air kelapa, sukrosa, dan molase. Formulasi F3 terdiri dari, talk, pepton, CMC, dextrose, bentonit, kalsium karbonat, dan molase. Hasil penelitian menunjukkan bahwa semua isolat bakteri endofit diketahui dapat menekan F. oxysporum f.sp cepae secara in vitro, dan mampu menurunkan penyakit busuk pangkal umbi bawang merah secara in vivo. Isolat BAT2-2 menunjukkan penghambatan lebih baik dibandingkan dengan perlakuan lain. Bakteri endofit diketahui mampu memacu pertumbuhan tanaman bawang merah. Viabilitas bakteri endofit dalam tiga formulasi mengalami fluktuasi selama penyimpanan hingga enam minggu. Viabilitas bakteri endofit paling stabil ditunjukkan oleh formulasi F2. Formulasi F2 isolat BAT2-2 merupakan formulai terbaik dalam menekan kejadian dan keparahan penyakit busuk pangkal umbi dibandingkan dengan perlakuan lain. Penelitian ini memberikan informasi baru bahwa formulasi bakteri endofit berpotensi sebagai agens biokontrol F. oxysporum f.sp cepae dan pemacu pertumbuhan tanaman bawang merah.
Keyword: Agens antagonis, air kelapa, busuk pangkal umbi, talk, viabilitas

Judul: Seleksi dan Karakterisasi Bakteri Endofit serta Senyawa Bioaktif yang dihasilkan sebagai Pengendali Pertumbuhan Fusarium proliferatum.
Abstrak: Bawang merah (Allium cepa L.) merupakan tanaman hortikultura yang memiliki nilai ekonomis tinggi. Faktor penurunan produksi bawang merah salah satunya penyakit layu yang disebabkan oleh serangan F. proliferatum. Serangan F. proliferatum menyebabkan bawang merah mengalami kematian hingga 62.2%. Fusarium proliferatum menyerang pada fase pertumbuhan tanaman yang ditandai warna akar menjadi coklat kekuningan, terbentuk nekrotik, lembab, mudah hancur dan membuat umbi busuk sehingga menyebabkan penurunan hasil panen. Upaya pengendalian F. proliferatum umumnya menggunakan pestisida sintetis, namun keberadaannya di lingkungan dapat merugikan, berbahaya bagi manusia akibat residu yang tertinggal pada tumbuhan dan resistensi patogen. Pengendalian secara hayati F. proliferatum yaitu menggunakan agens biologi misalnya bakteri endofit. Bakteri endofit diketahui memiliki kemampuan untuk menghasilkan senyawa bioaktif anticendawan yang efektif melawan patogen tanaman seperti bawang merah, jagung, padi, dsb. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan untuk menyeleksi dan melakukan karakterisasi bakteri endofit penghasil senyawa bioaktif yang dapat menghambat pertumbuhan F. proliferatum. Isolat bakteri endofit dan cendawan patogen F. proliferatum menggunakan isolat hasil penelitian sebelumnya dengan kode ABP5.2, BBP5.2, DBP4.1, dan DBP4.2. Metode yang digunakan mencakup 1) uji hambatan bakteri endofit terhadap F. proliferatum, 2) uji hipersensitivitas, patogenisitas, dan hemolisis, 3) identifikasi isolat terpilih berdasarkan gen 16S rRNA, 4) ekstraksi senyawa bioaktif dari bakteri endofit, 5) uji aktivitas anticendawan ekstrak kasar, 6) fraksinasi senyawa antimikrob dari bakteri endofit potensial, 7) uji bioautografi senyawa antimikrob, serta 8) identifikasi senyawa antimikrob dengan GC-MS. Isolat bakteri endofit asal tanaman bawang merah ABP5.2, BBP5.2, dan DBP4.1 memiliki aktivitas penghambatan terhadap F. proliferatum serta tidak bersifat patogen bagi manusia dan tanaman. Isolat ABP5.2 terindentifikasi memiliki kemiripan dengan Pseudomonas aeruginosa, sedangkan isolat BBP5.2 dan DBP4.1 memiliki kemiripan dengan Myroides profundi. Isolat BBP5.2 mampu menekan pertumbuhan cendawan patogen tertinggi yaitu sebesar 68.15% melalui mekanisme antibiosis secara langsung yaitu produksi senyawa anticendawan. Berdasarkan analisis Gas Chromathography Mass Spectrophotometry, senyawa yang dihasilkan ekstrak kasar dari isolat BBP5.2 antara lain Hexadecanoic acid, 9- octadecenoic acid, linoleic acid dan piperine.
Keyword: Allium cepa, antifungal compounds, Myroides profundi, 16S rRNA

Judul: Thermal Characteristics and Dynamics of Tropical Cyclone over Western North Pacific Ocean: A Case Study of Typhoon Songda (Chedeng) 2011
Abstrak: The frequent occasion of Tropical Cyclone (TC) over Western North Pacific (WNP) Ocean lies from 10˚N to 26˚N and 121˚E to 170˚E. Sources of TC development come from warm ocean temperature where latent heat is released during condensation processes and subsequently concentrated in the boundary layer. Relative humidity at 850-700 hPa is responsible to produce the most intense storm. Meanwhile, weak vertical wind shear between 850-200 hPa is one of the dynamical factors that lead to the development of TC. Pressure level of 850-200 hPa is chosen to minimize the thermodynamic effect in the lower troposphere. Typhoon Songda (Chedeng in the Philippines) or TSC lasted from May 18th to 30th, 2011 and strengthened into powerful Super Typhoon stage between May 24th and 27th. Long curving track and the exhibition of all sequences of TC life cycle, TSC is then considered as an ideal case of TC. The objective of the study with case of TSC is to investigate the role of thermal characteristics and dynamics on TC intensity. The research is carried out by using Advanced Research of Weather Research and Forecasting model (WRF ARW model) version 3.3. Two domains are employed in the model. The first domain situate from 02˚N to 40˚N and 118˚E to 149˚E and cover spatial resolution () of 33.1 km. The second domain situate from 09˚N to 27˚N and 119˚E to 132˚E with of 11 km. Timestep of the model () is 120 seconds. The model is supported by the following physical parameterization, i.e., Yonsei University Scheme (YSU) in the boundary layer, Kain-Fritsch scheme (KF) in the cumulus, and WRF Single-Moment 3-class scheme in the microphysics. Initial meteorological condition prior to the formation of the cyclone is generated using WRF ARW standard-release model. Sensitivity of the model output is obtained from a selected single-parameter change scenarios, namely, 10 % to 20 % decrease and increase of wind shear initial data at 850-200 hPa, and by 10 % to 20 % decrease of relative humidity initial data at 850-700 hPa. The result showed that the negative correlations between wind shear and intensity are found in wind shear scenarios. Wind shears of 10 ms-1 which lead to strengthening of the wind intensity in the early period of Typhoon development are found in wind shear scenarios. The effect of wind shear changes on wind intensity is statistically significant in the 20 % wind shear scenarios. During mature stage, weak wind intensity occurred when wind shear increase as given in the WRF standard-release and the 20 % decreasing scenario. Different situation is found in the 20 % increasing scenario where wind shear tend to weak and lead to strong wind intensity at this stage. Meanwhile, the reduction of moisture supply at 850-700 hPa resulting from 20 % decreasing relative humidity play a major role in the weakening of wind intensity and reduces mechanical energy of the cycle process as much as 300 J kg-1.
Keyword: