Judul: Kajian Keanekaragaman Morfologi, Metabolit Primer dan Molekuler Sumber Daya Genetik Kacang-kacangan Underutilized Indonesia
Abstrak: Kacang-kacangan underutilized Indonesia dapat dikembangkan sebagai varietas komersil seperti kedelai dikarenakan kacang-kacangan tersebut juga kaya nutrisi sama seperti kedelai. Selain sebagai bahan pangan sumber protein, kacangkacangan underutilized dapat dimanfaatkan sebagai sumber minyak nabati, pakan, obat-obatan maupun pupuk hijau. Indonesia memiliki keanekaragaman sumber daya genetik kacang-kacangan underutilized yang melimpah, namun informasi potensi genetik dan keragamannya belum banyak diketahui. Kegiatan eksplorasi, koleksi dan karakterisasi plasma nutfah berdasarkan morfologi, metabolit primer dan molekuler sangat diperlukan dalam pengembangan varietas unggul baru dan merupakan tahap awal dalam kegiatan pemulian tanaman kacang-kacangan tersebut. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan informasi tentang keragaan morfologi dan metabolit primer kacang-kacangan underutilized Indonesia. Analisis lebih lanjut untuk mengidentifikasi keragaman genetik dan hubungan kekerabatan antar aksesi kacang-kacangan underutilized berdasarkan penanda morfologi, metabolit primer dan molekuler ISSR. Materi genetik yang digunakan dalam penelitian ini adalah 31 aksesi kacangkacangan underutilized dan satu varietas pembanding yang terdiri atas 8 spesies meliputi 1����� aksesi spesies Vigna unguiculata (14 aksesi kacang tunggak dan 4 aksesi kacang panjang), 2 aksesi spesies V. subterranea (kacang bogor), 2 aksesi spesies Phaseolus lunatus (koro kratok), 1 aksesi spesies P. vulgaris (kacang merah), 1 aksesi spesies Canavalia ensiformis (koro pedang), 2 aksesi spesies Mucuna pruriens (koro benguk), 5 aksesi spesies Psophocarpus tetragonolobus (kecipir) dan 1 varietas spesies Glycine max (kedelai) sebagai tanaman pembanding. Analisis morfologi dilakukan menggunakan rangkuman deskriptor International Board for Plant Genetic Resources Institute dan Guidelines for The Conduct of Test for Distinctness, Homogeneity and Stability. Analisis kandungan metabolit primer menggunakan analisis proksimat. Analisis molekuler menggunakan 11 primer ISSR dengan ekstraksi DNA menggunakan metode cethyl trimethyl ammonium bromide. Data morfologi, metabolit primer dan molekuler dianalisis menggunakan analisis gerombol dan konstruksi dendogram menggunakan perangkat lunak PBSTAT-CL. Analisis komponen utama menggunakan perangkat lunak MINITAB v.16. Hasil penelitian menunjukkan bahwa 31 aksesi kacang-kacangan underutilized dan 1 varietas kedelai yang diamati terdapat 64 karakter beragam dan 2 karakter seragam dari 66 karakter morfologi yang diamati. Karakter sifat kualitatif memiliki keragaman yang lebih luas dibandingkan dengan karakter sifat kuantitatif. Kandungan metabolit primer sumber daya genetik kacang-kacangan underutilized yang diuji berkisar antara 16.72-31.29% protein, 0.35-14.94% lemak dan 26.67- 59.31% karbohidrat. Analisis molekuler menggunakan 11 primer ISSR berhasil mengamplifikasi 80 pita DNA dengan tingkat polimorfisme 100%. Hasil analisis gerombol pada 31 aksesi kacang-kacangan underutilized dan satu varietas pembanding yang diuji berdasarkan penanda morfologi dan molekuler ISSR mampu menjelaskan pengelompokan aksesi secara tegas pada tingkat intraspesifik maupun interspesifik. Hal ini berarti deskriptor yang dikembangkan maupun penanda molekuler yang digunakan mampu mengidentifikasi keragaman genetik kacang-kacangan underutilized yang diuji. Penanda molekuler ISSR dapat mengelompokkan sumber daya genetik kacang-kacangan underutilized yang diuji berdasarkan asal geografis. Karakter yang informatif sebagai penciri morfologi kacang-kacangan underutilized adalah karakter antosianin pada hipokotil, bulu pada permukaan batang, bulu pada permukaan bawah daun, lebar daun terminal, rasio panjang dan lebar daun terminal, panjang polong tua, pengkerutan polong tua dan warna utama biji. Keanekaragaman 31 aksesi kacang-kacangan underutilized dan satu varietas pembanding berdasarkan penanda morfologi, metabolit dan ISSR menunjukkan hubungan kekerabatan yang dekat antar jenis kacang-kacangan dengan tingkat keragaman pada tingkat interspesik kurang dari 40% dan keragaman pada tingkat intraspesifik kurang dari 25%. Hasil analisis komponen utama mendukung hasil analisis
Keyword: interspesifik, intraspesifik, keragaman genetik, legum, ISSR, PCA, pengelompokan, tanaman potensial

Judul: Keragaman Genetik Varietas Lokal Kacang Tunggak (Vigna unguiculata (L.) Walp.) untuk Perakitan Varietas sebagai Alternatif Bahan Pangan.
Abstrak: Kacang tunggak (Vigna unguiculata (L.) Walp) tergolong tanaman pangan kelompok leguminosa yang dapat digunakan sebagai produk pangan maupun pakan. Beberapa karakter unik kacang tunggak adalah morfologi yang beragam, mampu tumbuh pada kondisi tanah yang miskin unsur hara, tahan kekeringan, dan memiliki kadar nutrisi yang tinggi. Salah satu daerah di kepulauan Maluku yang memiliki spesies ini adalah Maluku Barat Daya (MBD) dengan kondisi ketersediaan air yang terbatas. Studi secara komprehensif tentang morfologi, fisiologi, biokimia, dan genetik dari kacang tunggak di daerah ini belum dilakukan dalam upaya pengembangan dan pemanfaatan baik dari segi pemuliaan, konservasi, maupun ekonomis. Secara umum, tujuan penelitian ini adalah untuk memperoleh varietas lokal kacang tunggak yang memiliki produktivitas tinggi, toleran terhadap kekeringan, dan mengandung kadar asam folat tinggi. Beberapa tujuan khusus dari penelitian ini adalah (1) menganalisis keragaman genetik varietas lokal kacang tunggak MBD berdasarkan karakter morfologi pada lokasi berbeda; (2) mengarakterisasi morfofisiologi varietas lokal kacang tunggak MBD terhadap cekaman kekeringan serta mengidentifikasi varietas yang toleran kekeringan; (3) menganalisis kadar asam folat varietas lokal kacang tunggak MBD dan korelasinya dengan karakter fisik sehingga dapat dijadikan penciri tanaman kacang tunggak berpotensi kadar asam folat tinggi; (4) mengidentifikasi sekuen gen dihidrofolat reduktase (DHFR) yang terlibat dalam jalur sintesis folat untuk perakitan varietas dalam pemanfaatan sebagai alternatif bahan pangan. Penelitian ini diharapkan dapat memberikan manfaat dalam menyediakan basis data untuk perakitan varietas unggul dengan produksi tinggi, toleran terhadap cekaman kekeringan, dan potensi kadar asam folat tinggi. Tahapan dalam penelitian terdiri atas analisis keragaman morfologi pada lokasi berbeda, respon morfofisiologi dan identifikasi varietas toleran terhadap cekaman kekeringan pada fase vegetatif dan generatif, kadar asam folat dan identifikasi sekuen gen DHFR yang terlibat dalam jalur sintesisnya. Keragaman morfologi dilakukan pada dua lokasi (Ambon dan Bogor) berdasarkan perbedaan kondisi lingkungan dan menggunakan 40 karakter mengikuti deskriptor dari International Board Plant Genetic Resources (IBPGR 1983). Perlakuan cekaman kekeringan berupa periode pemberian air yang menggambarkan kondisi keterbatasan air pada Kabupaten MBD. Perlakuan dilakukan di rumah kaca untuk pengukuran pada fase vegetatif dan generatif. Analisis kadar asam folat mengikuti serangkaian modifikasi metode yang dimulai dari maserasi, partisi, KLT, HPLC, dan LC-MS. Identifikasi gen DHFR dilakukan dengan amplifikasi PCR menggunakan primer spesifik DHFR dilanjutkan dengan sekuensing. Semua tahapan penelitian menggunakan tujuh varietas lokal yang terdiri atas KM1, KM3, KM4, KM6, KM7, KM8, KM9 dan tiga kultivar dari Balitkabi-Malang (KT1, KT2, KT7) sebagai pembanding. Hasil penelitian menunjukkan bahwa tiap varietas memiliki karakter morfologi yang berbeda. Sebagian besar karakter yang diamati dengan nilai tertinggi dimiliki oleh varietas KM3, KM4, dan KM6. Hasil analisis komponen utama menunjukkan terdapat tiga klaster pada tiap lokasi. Varietas KM3 lebih adaptif, stabil, dan konsisten dari varietas lokal lainnya. Untuk perlakuan cekaman kekeringan pada fase vegetatif dan generatif menunjukkan bahwa periode pemberian air 10 hari sekali menurunkan semua karakter morfologi dan fisiologi kecuali kadar prolin dan panjang akar mengalami peningkatan. Terdapat hubungan yang signifikan antara panjang tajuk dengan kadar air relatif, laju transpirasi, jumlah dan bobot biji serta panjang akar dan kadar prolin. Berdasarkan nilai indeks sensitivitas dan analisis komponen utama diperoleh varietas KM7 tergolong toleran terhadap cekaman kekeringan. Selain perbedaan lokasi dan cekaman kekeringan, hasil analisis kadar
Keyword: cowpea, DHFR gene, different locations, drought stress, folic acid

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: