Judul: Identifikasi Populasi Mutan Artemisia annua L. Hasil Induksi Sistem CRISPR.
Abstrak: Artemisia annua L. (A annua) adalah tanaman yang mengandung artemisinin, senyawa yang efektif mengobati malaria. Walaupun demikian, kandungan artemisinin sangat kecil pada A annua. Dalam rangka meningkatkan kandungan artemisinin, dilakukan rekayasa jalur metabolik dengan sistem clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR). Tujuan penelitian ini adalah mengidentifikasi tanaman populasi A annua yang mengalami mutasi setelah diinduksi oleh sistem CRISPR. Penelitian ini dimulai dengan preparasi benih, sterilisasi benih, isolasi DNA tanaman, optimasi suhu annealing primer, amplifikasi DNA tanaman, dan analisis dengan elektroforesis. Identifikasi yang dilakukan menunjukkan bahwa terdapat 46 tanaman yang berhasil diamplifikasi dan sebanyak 24 tanaman lainnya tidak berhasil diamplifikasi. Ukuran amplikon artemisia adalah berkisar 700 bp sedangkan ukuran amplikon plasmid yang merupakan kontrol positif hanya berkisar 500 bp. Sebanyak 46 sampel DNA kembali diamplifikasi dan dianalisis dengan elektroforesis QIAxcel. Sebanyak 39 sampel ditemukan mengalami mutasi. Ukuran basa nukleotida bervariasi yaitu 465 bp, 466 bp, 467 bp, dan 468 bp sedangkan ukuran plasmid adalah 468 bp.
Keyword: Artemisia annua L., artemisinin, CRISPR/Cas9

Judul: Analisis Perubahan Sekuen Nukleotida Gen Squalene Synthase pada Artemisia annua L. Turunan T1 Hasil Induksi Sistem CRISPR
Abstrak: Artemisinin yang terkandung dalam Artemisia annua L. dapat digunakan sebagai anti-malaria. Kadar artemisinin pada A. annua L. cukup rendah, yaitu berkisar 0.1% hingga 1%. Peningkatan kadar artemisinin dapat dilakukan dengan menghambat squalene synthase yang merupakan enzim kunci dalam biosintesis sterol menggunakan sistem Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR). Penelitian ini bertujuan untuk melakukan analisis perubahan sekuen nukleotida gen squalene synthase pada A. annua L. yang sudah diinduksi sistem CRISPR. Analisis Perubahan Sekuen Nukleotida Gen Squalene Synthase dilakukan melalui tahap seleksi benih, isolasi DNA menggunakan Tiangen Kit, amplifikasi DNA dengan PCR, dan sekuensing gen squalene synthase. Hasil penelitian menunjukkan dari 9 sampel tanaman A. annua L. hasil induksi sistem CRISPR tidak semua sampel mengalami perubahan basa nukleotida pada situs target. Perubahan sekuen pada situs target hanya terjadi pada sampel 5 yakni perubahan dari A (Adenin) menjadi T (Timin) dan G (Guanin) menjadi C (Sitosin) yang dapat disebut sebagai substitusi transversi. Sampel lainnya yang disejajarkan dengan nontransgenik menunjukkan perubahan sekuen di luar situs target.
Keyword: Artemisinin, Artemisia annua L, CRISPR/Cas9, gen squalene synthase

Judul: Persamaan Korteweg-de Vries Orde Tinggi untuk Menggambarkan Gerak Gelombang Internal
Abstrak: The ocean can be considered of layers of fluid that each layer has a constant density. Internal waves are waves occur in the interface of every'two layers with different density. Because it occures underneath the surface of the ocean, it is invisible. One of internal waves is internal solitary waves. One of formulation that can describe intemal waves movement is KdV equation. KdV equation is derived from governing equations of ideal fluid in Lagrange formulation using asymptotic method. On this thesis, KdV equation is derived in higher order and then its solution is derived by using internal solitary waves assumption. An example of a two-layer fluid is a case will be used. By using Mathematica6 software, for this case will be obtained the coefficients in lower and higher order explicitly and the corresponding between coefficients and relative lower layer depths and fluid depths, the corresponding between coefficients and relative densities, and also observed the different between solitary waves in lower and higher order.
Keyword: