Judul: Isolasi Dan Karakterisasi Gen Pembungaan Pada Kelapa Sawit (Elaeis Guineensis Jacq.).
Abstrak: Ukuran tandan yang direpresentasikan dengan jumlah buah menjadi parameter utama pada produksi kelapa sawit (Elaeis guineensis Jacq.). Jumlah buah dapat ditentukan pada fase awal perkembangan bunga yang dipengaruhi oleh berbagai faktor, termasuk properti genetik pohon. Jumlah buah yang tinggi diperoleh dari pohon yang mempunyai proporsi bunga betina lebih tinggi. Keberadaan gen MADS-box berperan penting pada penentuan identitas bunga jantan dan betina kelapa sawit. Gen SQUAMOSA (SQUA), gen GLOBOSA (GLO) dan gen DEFICIENS (DEF) termasuk dalam famili besar gen MADS-box yang berperan terhadap perkembangan sepal, petal dan stamen. Tujuan penelitian ini adalah menganalisis metode isolasi, mengidentifikasi dan mengkarakterisasi gen yang terkait dengan pembungaan dari kelapa sawit menggunakan teknik PCR. DNA genom bunga jantan dan betina yang diisolasi menggunakan metode CTAB+PVP menghasilkan kuantitas dan kualitas DNA paling baik dibandingkan metode isolasi lainnya. Isolasi DNA genom dari bunga betina lebih efesien dibandingkan dari bunga jantan. DNA genom bunga jantan dari pohon yang mempunyai bunga jantan lebih banyak (P1) dan DNA genom bunga betina dari pohon yang mempunyai bunga betina lebih banyak (P2) diidentifikasi menggunakan tiga primer; BMS, BMG dan BMD. Primer BMS, BMG dan BMD masing-masing menghasilkan produk PCR berukuran 1200 pb; 1200 pb dan 1300 pb; 1200 pb dan 1300 pb pada DNA P1 dan P2. Analisis BLASTn menunjukkan bahwa produk PCR mempunyai homologi yang tinggi dengan gen SQUA1, gen GLO2, DNA repetitive dan pentatricopeptide repeat-containing protein dari kelapa sawit. Analisis posisi ekson dan intron menunjukkan fragmen DNA P1 dan P2 teramplifikasi primer BMS mempunyai dua ekson (ekson 1 dan 2) dan sekuen diantaranya adalah intron. Sekuen fragmen DNA P1 dan P2 teramplifikasi primer BMG mempunyai empat ekson (ekson 1, 2, 3 dan 4) dan sekuen diantaranya adalah intron. Analisis alignment menggunakan APE menunjukkan sekuen fragmen DNA P1 dan P2 yang teramplifikasi primer BMS mempunyai keragaman sekuen pada ekson 1 dan intron. Perbedaan satu nukleotida pada bagian ekson menghasilkan translasi asam amino yang berbeda. Fragmen DNA P1 dan P2 teramplifikasi primer BMG mempunyai keragaman ukuran fragmen dan keragaman sekuen intron. Fragmen DNA terkait pentatricopetide-repeat containing protein hanya terdapat pada P2.
Keyword: Elaeis guineensis Jacq, bunga jantan dan betina, MADS-box, SQUAMOSA, GLOBOSA

Judul: Molecular Analysis of Oil Palm (Elaeis guineensis Jacq.) Flowering Associated Genes and their Potential Application in Breeding Programmes
Abstrak: Kelapa sawit (Elaeis guineensis Jacq.) adalah tanaman tropis yang digunakan dalam industri makanan, kosmetik dan bio-diesel. Tujuan utama dalam pemuliaan kelapa sawit adalah menaikan sex ratio bunga betina terhadap bunga jantan. Faktor lingkungan dan genetik mempunyai peran besar dalam produktivitas kelapa sawit. Ketersediaan air, terutuma di Afrika, dan ketersediaan kandungan kabohidrat mempengaruhi sex ratio kelapa sawit. Pemangkasan daun sawit adalah salah satu cara untuk menginduksi bunga jantan di kelapa sawit namun masih ada beberapa hal terkait efisiensi teknik tersebut, apalagi gen-gen yang berperan dalam proses ini belum diketahui. Penelitian ini bertujuan untuk menyelidiki perubahan fenotipe dan menentukan gen-gen yang terekspresi akibat pemangkasan daun sawit. Dalam disertasi ini, diberikan informasi tentang berapa jumlah faktor lingkungan yang dibutuhkan untuk menginduksi bunga jantan pada kelapa sawit secara efisien. Selain itu, diberitahukan juga berapa waktu yang dibutuhkan oleh kelapa sawit sebelum merespon terhadap stres pemangkasan daun. Informasi ini digunakan untuk pelajari ekspresi gen terkait pembungaan dalam kelapa sawit yang diakibatkan oleh stres pemangkasan daun. Data menunjukan bahwa teknik pemangkasan daun bisa menaikan produksi bunga jantan kelapa sawit sampai 104%. Teknik ini paling efisien di musim kering dan optimum saat cekaman air sama dengan 16.8 mm dalam waktu 60 hari pertama setelah pemangkasan daun. Analisis regresi menunjukan bahwa tanaman kelapa sawit akan memberikan respon terhadap cekaman kabohidrat yang diakibatkan oleh pemangkasan daun merupakan ekspresi gen dalam waktu 30 sampai 60 hari setelah pemangkasan. Kadar gula yang diambil dari jaringan bunga dan daun kelapa sawit 45 hari setelah pemangkasan menunjukan bahwa kadar gula menurun 21% di jaringan bunga dan 55% di jaringan daun dibanding kontrol. Ekspresi gen di jaringan bunga kelapa sawit mengunakan Next Generation Sequencing (NGS) menujukan bahwa mayoritas gen gen yang berperan dalam regulasi cekaman kabohidrat di kelapa sawit terletak di kloroplas dan mitokondria. Analisis fungsi menggunakan Gene Ontology, menujukan bahwa gen gen tersebut berperan dalam metabolisme kabohidrat dan fotosintesis. Analisis ko-ekspresi menujukan keterkaitan antara cekaman kabohidrat dan induksi bunga serta peran zat pertumbuhan tanaman seperti auxin, gibberellin dan jasmonic acid. Ini membuktikan bahwa gen gen dalam lintasan cekaman kabihidrat yang diakibatkan oleh pemangkasan daun berperan dalam induksi bunga di jantan tanaman kelapa sawit.
Keyword: pemangkasan daun, cekaman kabohidrat, induksi bunga, NGS, kelapa sawit

Judul: Tinjauan Matematis pada Model Makroskopik dan Mikroskopik Arus Lalu-lintas
Abstrak: Traffic flow phenomenon can be described through mathematical model such as continuous dynamic model with an ordinary differential equation so that it can be solved with integral factors. In this paper three simple models of traffic flow are discussed, i.e, two macroscopic and one microscopic models. Macroscopic model formulates dynamics of the traffic flow that occurs on a large number of vehicles on a road. While the microscopic model explains drivers’ behavior in their interaction with other vehicles ahead, i.e, car-following model. This paper shows the existence of ordinary differential equation found in the traffic flow model and indicates some different representations in the context of the same model. It also reviews a simple model of traffic flow along a single link, which leads to some unexpected results, i.e, it can express the solution model in term of link outflows as well as trip time. In the microscopic model, simulation is done to illustrate the behavior of the drivers with a sensitivity coefficient as a benchmark parameter.
Keyword: