Judul: Karakteristik Hidroakustik Kolom Air Di Perairan Barat Sumatera
Abstrak: Pengembangan penelitian mengenai sumberdaya ikan laut dapat dilakukan dengan metode hidroakustik. Penelitian ini bertujuan menduga sebaran ikan pelagis di perairan Barat Sumatera berdasarkan karakteristik hidroakustik. Survei akustik dilaksanakan di perairan barat Sumatera pada 22 Oktober-2 November 2015 dan pengolahan data dilaksanakan pada bulan April – Juni 2016. Alat akustik yang digunakan adalah Simrad EK-60 dengan frekuensi 38 kHZ. Integrasi tiap sel diatur dengan Elementary Sampling Distance Unit (ESDU) per 100 ping dan per 1 m kedalaman untuk mendaptakan Volume Back Scattering Strength (SV) ratarata. Data hasil integrasi dikelompokan per 5000 ping dan 4 layer kedalaman (6- 25 m, 26-50 m, 51-75 m, 76-100 m) di Ms Excel untuk dianalisis keberadaan target ikan. Secara umum nilai SV di perairan barat Sumatera terdistribusi dari -80 dB hingga -50 dB. Objek tersebut diduga didominasi zooplankton, juvenil ikan dan ikan pelagis kecil. Sebaran nilai SV tertinggi terdapat didaerah selatan Pulau Pini dengan kisaran -56 dB dan -53 dB di kedalaman 6-75 m yang diduga kelompok ikan pelagis seperti selar (Selaroides leptolepis), kembung (Rastrelliger sp.) dan layang (Decapterus sp.). Sebaran SV di kedalaman 75-100 m di perairan barat Sumatera merupakan lapisan zooplankton dengan nilai SV dominan -80 dB.
Keyword: hidroakustik, perairan barat Sumatera, ikan pelagis, SV

Judul: Karakteristik Hidroakustik Kolom Air di Perairan Selat Makassar
Abstrak: Perairan Selat Makassar bagian selatan merupakan kawasan perairan yang memiliki potensi sumberdaya perairan yang besar dan kaya nutrient. Daerah ini merupakan titik pertemuan massa air dari Samudera Pasific, dan Laut Flores. Penelitian mengenai stok ikan di Indonesia masih dalam tahap perkembangan, salah satu dari metode yang digunakan adalah aplikasi dari metode akustik. Penelitian ini bertujuan untuk menduga sebaran stok ikan pelagis di perairan Selat Makassar bagian selatan. Data diperoleh dari survei pada bulan Agustus – bulan September 2015 menggunakan Biosonic scientific echosounder system model DTCx. Data diolah menggunakan Echoview 4.8, Microsoft Office 2010, ArcGIS 10.2.2 dan Surfer. Analisis data difokuskan pada lapisan pelagis. Hasil menunjukkan bahwa gerombolan ikan di perairan Selat Makassar dan perairan Kota Balikpapan didominansi oleh gerombolan ikan yang berukuran sama, sedangkan pada perairan Kota Baru didominasi gerombolan ikan yang ukurannya beragam.
Keyword: Selat Makassar, hidroakustik, gerombolan ikan pelagis

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA