Judul: Perlakuan Panas pada Umbi Bawang Merah untuk Menekan Insidensi Virus di Lapangan
Abstrak: Infeksi virus merupakan salah satu kendala utama dalam produksi bawang merah. Beberapa virus tular umbi seperti OYDV, SLV, dan GCLV dapat menyebabkan penyakit semenjak tahap awal perkembangan tanaman. Salah satu metode pengendalian yang biasa digunakan untuk mengurangi infeksi virus terutama virus-virus tular umbi adalah dengan perlakuan air panas. Tujuan penelitian ini adalah untuk mempelajari pengaruh perlakuan air panas dalam menekan insidensi penyakit akibat infeksi virus di lapangan. Umbi bawang merah dari varietas ‘Bima Brebes’ dan ‘Sumenep’ diberi perlakuan perendaman air panas dengan suhu 50 OC selama 15 dan 30 menit sebelum ditanam. Untuk varietas ‘Tuk-Tuk’, digunakan true shallot seed yang langsung disemai tanpa perlakuan air panas. Insidensi penyakit diamati berdasarkan perkembangan gejala dan dikonfirmasi dengan mendeteksi virus menggunakan metode dot immunobinding assay (DIBA). Hasil penelitian menunjukkan perlakuan air panas tidak berpengaruh terhadap tinggi tanaman dan jumlah rumpun. Gejala infeksi virus dapat diamati sejak minggu pertama dan mencapai > 90% pada minggu ke 8. Gejala penyakit pada varietas Tuk-Tuk terlihat pertama kali pada minggu ke 6 dan hanya mencapai 59.3% pada minggu ke 9. Ketiga jenis virus, yaitu OYDV, SLV, dan GCLV terdeteksi pada sampel daun yang diambil pada minggu ke 7. Hasil skoring DIBA menunjukkan perlakuan air panas cenderung mengurangi titer virus pada tanaman. Titer virus pada varietas Tuk-Tuk lebih rendah bila dibandingkan dengan varietas Bima Brebes dan Sumenep. Oleh karena itu, perlakuan air panas dan penggunaan true shallot seed dapat direkomendasikan untuk mengurangi infeksi virus pada tanaman bawang merah., Virus infection is one of major constraint in shallot (Allium ascalonicum) production. Bulbborne viruses, such as OYDV, SLV, and GCLV are able to cause disease since early stage of plant development. Hot water treatment is commonly used as a control method to reduce virus infection, especially for seedborne viruses. The aim of this research was to study the effect of hot water treatment on shallot bulbs in suppressing virus incidence in field. Bulbs of ‘Bima Brebes’ and ‘Sumenep’ varieties was given hot water treatment (50 OC) for 15 and 30 min before planting, whereas true seed of ‘Tuk-Tuk’ variety was directly sown. Diseases incidence was observed based on symptom development and confirmed by virus detection using dot immunobinding assay (DIBA) method. The result showed that hot water treatment did not effect plant height and number of tillers. Diseases symptoms was readily observed on ‘Bima Brebes’ and ‘Sumenep’ since the 1st week and it reached >90% in the 8st week; whereas disease symptom on ‘Tuk-Tuk’ was observed for the 1st time in the 6st week and it only reached 59.3% in the 9st week. Three viruses, i.e. OYDV, SLV and GCLV was detected from leaf samples taken in the 7st week. DIBA’s score indicated that hot water teatment tends to reduce virus titer on the plant. Virus titer from ‘Tuk-Tuk’ was lower than those from ‘Bima Brebes’ and ‘Sumenep’. Therefore, hot water treatment and the use of true shallot seed could be recommended to reduce viral diseases on shallot.
Keyword: dot immunobinding assay, insidensi penyakit, true shallot seed

Judul: Deteksi Dan Eliminasi Virus Pada Umbi Bawang Merah
Abstrak: Salah satu penyebab rendahnya produksi bawang merah secara nasional adalah ketersediaan benih yang berkualitas tinggi. Kualitas benih bawang merah ditentukan antara lain oleh status kesehatan benih. Benih yang berkualitas adalah benih yang bebas patogen termasuk bebas dari infeksi virus. Oleh karena itu sangat diperlukan upaya untuk menyediakan benih bawang merah yang bebas virus. Tanaman bawang merah dapat terinfeksi oleh virus dari kelompok Potyvirus (OYDV/Onion Yellow Dwarf Virus, SYSV/Shallot Yellow Stripe Virus, dan LYSV/Leek Yellow Stripe Virus), Carlavirus (SLV/Shallot Latent Virus dan GCLV/Garlic Common Latent Virus), dan Alexivirus (MbLV/Shallot Mite borne Latent Virus, Gar-V-B, Gar-V-C, Gar-V-D dan GMV/Garlic Mosaic Virus). Penyakit yang disebabkan oleh virus bersifat sistemik dan apabila sudah ada dalam jaringan benih, akan sulit untuk dieliminasi dan dapat menyebabkan degenerasi. Infeksi virus pada tanaman bawang merah di lapangan maupun umbi di tempat penyimpanan belum banyak diketahui di Indonesia. Tujuan penelitian adalah mendeteksi virus dari umbi bawang merah, mempelajari potensi perlakuan air panas dalam mengeliminasi infeksi virus pada umbi bawang merah dan mempelajari potensi perlakuan air panas yang dikombinasi dengan teknik kultur jaringan dalam mengeliminasi infeksi virus pada umbi bawang merah. Penelitian dilaksanakan mulai Agustus 2013 hingga Juli 2015, bertempat di Laboratorium dan Rumah kaca Virologi Tumbuhan, Departemen Proteksi Tanaman, Fakultas Pertanian, serta Laboratorium Kultur Jaringan, Pusat Kajian Hortikultura Tropika (PKHT), Institut Pertanian Bogor (IPB). Umbi benih bawang merah diambil dari daerah Jawa Barat dan Jawa Tengah. Pengambilan sampel dilakukan dengan metode purpossive sampling, yaitu sampel yang diambil mewakili 2 elemen pelaku usahatani bawang merah (petani dan pedagang) dari 5 daerah penghasil bawang merah (Brebes, Cirebon, Kuningan, Majalengka dan Bandung). Diperoleh 10 kultivar bawang merah yaitu Bima Brebes, Nganjuk, Timur Carwan, Ilokos, Bima Curut, Sumenep, Jawa, Batu Merah, Batu Putih dan Jalaksana. Kegiatan penelitian diawali dengan identifikasi virus menggunakan metode DIBA (Dot blot immunobinding assay) dengan antibodi OYDV, SLV, dan GCLV. Sampel uji terdiri atas umbi, dan daun hasil penanaman umbi (metode growing on test), masing-masing sebanyak 15 sampel/kultivar/daerah. Sampel uji yang positif terinfeksi virus digunakan sebagai bahan perlakuan pemanasan. Pengamatan morfologi umbi bawang merah pada kultivar Bima Curut, Sumenep, Batu Merah dan Jalaksana meliputi karakter diameter, jumlah lapisan dan kekerasan umbi, menggunakan 10 umbi untuk masing-masing karakter. Sampel umbi kultivar Bima Curut, Sumenep, Batu Merah dan Jalaksana yang terinfeksi virus diberi perlakuan air panas pada suhu 40 C, 45 C, 50 C dan 55 C selama 15 dan 30 menit. Umbi bawang merah yang telah diberi perlakuan air panas kemudian ditanam pada media tanah dan pupuk kandang steril. Satu bulan setelah penanaman umbi dilakukan pengujian keberadaan virus dengan metode DIBA. Perlakuan air panas yang paling baik yaitu 45 C dan 50 C selama 15 dan 30 menit dikombinasikan dengan kultur jaringan pada media MS, 2ip 2 mg L-1 dan GA3 0.3 mg L-1. Keberadaan virus pada planlet hasil kultur jaringan dideteksi menggunakan metode RT-PCR. Berdasarkan deteksi virus dengan metode DIBA, sampel bawang merah positif terinfeksi OYDV, SLV dan GCLV dengan rata-rata persentase infeksi virus pada jenis sampel umbi bawang merah berkisar antara 0% sampai 100%, sedangkan pada sampel daun bawang merah jumlah sampel yang terinfeksi virus berkisar antara 53.33% sampai 100%.
Keyword: Dot immuno binding assay, Garlic common latent virus, Shallot latent virus, Onion yellow dwarf virus, RT-PCR

Judul: Perhitungan Energi Disosiasi Ca-O dan C-O pada Gugus Fungsi Hidroksiapatit Menggunakan PemodelanSpektroskopi Inframerah
Abstrak: Modeling the functional groups of hydroxyapatite can be used to obtain absorption wave numbers and the spring constant. Analysis of energy release is done by calculating the functional group dissociation energy. This study is a theoretical calculation of the hydroxyl group (OH-), phosphate (PO43-), and carbonate (CO32-) using spring models. Modeling OH- group obtained wavenumber absorption 3417.4316 cm-1, 3430.6485 cm-1, and 3437.4887 cm-1. Modelling group PO43- absorption wave numbers obtained 1059.3734 cm-1, 1085.2559 cm-1, and 1070.2309 cm-1. CO32- modeling group obtained wavenumber absorption 1187.5995 cm-1, 1167.7597 cm-1, and 1120.2595 cm-1. Bond dissociation energy of CO on the hydroxyl group is 572.3579 kJ/mol. Bond dissociation energy of Ca-O in the carbonate group is 586.9238 kJ/mol, whereas the carbonate group is 677.4847 kJ/mol. Theoretical absorption wave numbers OH- and PO43- consistent with the hypothesis while CO32- group is smaller than the hypothesized value.
Keyword: