Judul: Analisis Ekspresi Gen Hd3a pada Tanaman Kentang (Solanum tuberosum L.) Kultivar Jala Ipam Transgenik
Abstrak: Kentang (Solanum tuberosum L.) adalah tanaman pangan dari kelompok umbi-umbian yang memiliki peran penting dalam ketahanan pangan dunia setelah gandum, jagung, dan padi. Pasokan bahan baku untuk industri pengolahan kentang di Indonesia hampir seluruhnya diperoleh melalui impor karena produksi kentang dalam negeri tidak sesuai kriteria ataupun belum mencukupi permintaan industri. Salah satu upaya pengembangan kultivar unggul yang memiliki produksi dan kualitas yang tinggi dapat dilakukan melalui rekayasa genetik. Protein Hd3a memiliki kemiripan dengan protein StSP6A yaitu sinyal yang menginduksi pengumbian kentang sehingga gen Hd3a memiliki peluang dalam pengembangan produksi kentang. Gen Hd3a di bawah kendali ekspresi promoter 35S CaMV telah ditransformasikan ke dalam genom kentang kultivar Jala Ipam. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis integrasi dan ekspresi gen Hd3a pada kentang kultivar Jala Ipam transgenik (klon JHS1, JHS2, JHS3) dengan tanaman Jala Ipam non-transgenik (JNT) sebagai kontrol. Bahan yang digunakan adalah tanaman generasi G1 yang ditumbuhkan dari umbi G0. Analisis integrasi transgen menggunakan teknik PCR dengan pasangan primer spesifik, sedangkan analisis ekspresi gen Hd3a menggunakan teknik Real-Time Quantitative PCR (qPCR) dengan metode kuantifikasi relatif. Analisis potensi produksi umbi dilakukan berdasarkan penanaman di lapangan menggunakan rancangan acak kelompok lengkap dengan 3 ulangan. Analisis integrasi menunjukkan bahwa gen Hd3a tetap stabil terintegrasi dalam genom kentang Jala Ipam transgenik generasi G1. Semua klon transgenik mengekspresikan gen Hd3a dengan tingkat yang berbeda. Ekspresi paling tinggi terdapat pada klon JHS1 yaitu 9.9 kali terhadap JNT kemudian diikuti oleh klon JHS2 dan JHS3 di bawahnya. Peningkatan ekspresi gen Hd3a berpengaruh signifikan terhadap peningkatan produksi bobot basah umbi per tanaman, tetapi tidak berpengaruh terhadap jumlah umbi per tanaman. Klon JHS1 memiliki bobot umbi paling tinggi dengan kenaikan 1.5 kali dari bobot JNT dan berbeda nyata terhadap bobot umbi klon JSH2 dan JHS3. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa ekspresi gen Hd3a berkorelasi terhadap peningkatan produksi bobot umbi per tanaman, sehingga gen Hd3a memiliki potensi dimanfaatkan untuk pengembangan produksi umbi kentang. Kata kunci: ekspresi relatif, florigen, kentang transgenik, produksi umbiKentang (Solanum tuberosum L.) adalah tanaman pangan dari kelompok umbi-umbian yang memiliki peran penting dalam ketahanan pangan dunia setelah gandum, jagung, dan padi. Pasokan bahan baku untuk industri pengolahan kentang di Indonesia hampir seluruhnya diperoleh melalui impor karena produksi kentang dalam negeri tidak sesuai kriteria ataupun belum mencukupi permintaan industri. Salah satu upaya pengembangan kultivar unggul yang memiliki produksi dan kualitas yang tinggi dapat dilakukan melalui rekayasa genetik. Protein Hd3a memiliki kemiripan dengan protein StSP6A yaitu sinyal yang menginduksi pengumbian kentang sehingga gen Hd3a memiliki peluang dalam pengembangan produksi kentang. Gen Hd3a di bawah kendali ekspresi promoter 35S CaMV telah ditransformasikan ke dalam genom kentang kultivar Jala Ipam. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis integrasi dan ekspresi gen Hd3a pada kentang kultivar Jala Ipam transgenik (klon JHS1, JHS2, JHS3) dengan tanaman Jala Ipam non-transgenik (JNT) sebagai kontrol. Bahan yang digunakan adalah tanaman generasi G1 yang ditumbuhkan dari umbi G0. Analisis integrasi transgen menggunakan teknik PCR dengan pasangan primer spesifik, sedangkan analisis ekspresi gen Hd3a menggunakan teknik Real-Time Quantitative PCR (qPCR) dengan metode kuantifikasi relatif. Analisis potensi produksi umbi dilakukan berdasarkan penanaman di lapangan menggunakan rancangan acak kelompok lengkap dengan 3 ulangan. Analisis integrasi menunjukkan
Keyword: ekspresi relatif, florigen, kentang transgenik, produksi umbi

Judul: Analisis Ekspresi Gen MmPMA pada Tanaman Kentang (Solanum tuberosum L.) Kultivar Jala Ipam Transgenik
Abstrak: Kentang merupakan komoditas hortikultura yang dapat dijadikan sebagai alternatif diversifikasi pangan karena memiliki kadar pati yang tinggi. Di Indonesia, kentang menjadi salah satu tanaman yang banyak diprioritaskan berkaitan dengan manfaatnya, baik digunakan secara langsung maupun dalam bentuk olahan. Kentang olahan di Indonesia masih cukup langka. Hal ini dapat disebabkan oleh kurang tersedianya bibit yang berkualitas. Peningkatan kualitas tanaman kentang dapat dilakukan dengan cara konvensional maupun rekayasa genetika. Secara rekayasa genetika dapat berupa mengintroduksikan gen yang penting bagi tanaman. Salah satu gen yang diduga dapat meningkatkan produksi kentang adalah gen PMA penyandi enzim H+-ATPase membran plasma. H+-ATPase secara umum berperan dalam transpor sekunder yaitu menjaga potensial membran sel tanaman melalui mekanisme proton motive force, berbagai respon cekaman seperti ketahanan pada lahan asam dan cekaman Al, berperan dalam proses pembukaan stomata, serta pengangkutan fotosintat melalui pembuluh floem (phloem loading). Gen PMA yang diisolasi dari tanaman Melastoma malabathricum disebut gen MmPMA. Penelitian ini bertujuan untuk melakukan analisis stabilitas dan ekspresi gen MmPMA pada tanaman kentang kultivar Jala Ipam generasi G1. Penanaman umbi dilakukan menggunakan 7 klon kentang cv. Jala Ipam G0 yang terdiri atas klon non-transgenik (JNT) dan 6 klon transgenik (JP1-JP6) yang ditanam di lapangan uji terbatas di Lembang untuk menghasilkan umbi G1. Selanjutnya dilakukan analisis fenotipe dan analisis molekular. Analisis fenotipe terdiri atas pengukuran lebar pembukaan stomata adaksial dan abaksial serta pengukuran berat umbi per tanaman, sedangkan analisis molekular terdiri atas analisis stabilitas gen MmPMA dan analisis ekspresi gen MmPMA. Produktivitas umbi antarklon berbeda nyata. Secara umum klon transgenik memiliki produktivitas umbi yang lebih tinggi daripada klon non-transgenik dan klon JP3 memiliki produktivitas umbi tertinggi. Stomata pada klon transgenik cenderung membuka lebih lebar daripada klon non-transgenik. Seperti pada produktivitas umbi, JP3 cenderung memiliki stomata terlebar. Analisis stabilitas gen menunjukkan bahwa semua klon transgenik memiliki gen MmPMA di bawah kendali promoter 35S CaMV. Hal ini menunjukkan bahwa gen MmPMA stabil terintegrasi dalam genom klon transgenik hingga generasi G1. Analisis kualitatif ekspresi gen MmPMA menunjukkan bahwa semua klon mengekspresikan gen PMA dan pada analisis ekspresi kuantitatif dengan qRT-PCR menunjukkan bahwa klon JP3 mempunyai ekspresi gen PMA tertinggi yang diikuti oleh klon JP1 yang secara berurutan ekspresinya yaitu 7.61 kali dan 2.05 kali dibandingkan dengan ekspresi gen PMA di klon JNT. Hal ini dapat disimpulkan bahwa semakin tinggi ekspresi gen PMA pada tanaman G1, semakin tinggi produktivitas umbi.
Keyword: analisis ekspresi, gen MmPMA, kentang cv, Jala Ipam, produksi umbi, rekayasa genetika kentang

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: