Judul: Asosiasi Polimorfisme Gen Cytochrome P450 2A6 (CYP2A6) terhadap Asam Lemak Domba
Abstrak: Cytochrome P450 2A6 (CYP2A6) merupakan gen yang mengkodekan anggota dari enzim sitokrom P450 superfamily yang berkontribusi dalam proses oxidasi asam lemak mikrosomal. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi keragaman dan mengetahui asosiasi gen CYP2A6 dengan asam lemak pada domba. Total sampel yang digunakan sebanyak 55 ekor yang terdiri dari 20 ekor domba ekor gemuk (DEG), 15 ekor domba ekor tipis (DET), 10 ekor domba komposit garut (DKG) dan 10 ekor domba compass agrinak (DCA). Identifikasi keragaman gen CYP2A6 dianalisis menggunakan Polymerase Chain Reaction - Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP). Ukuran produk amplifikasi adalah 286 bp. Keragaman hanya ditemukan pada DEG dan DET dengan genotipe GG dan GT, sedangkan DKG dan DCA bersifat monomorfik dengan genotipe TT. Uji Chi square menunjukkan bahwa lokus CYP2A6 berada pada keseimbangan Hardy-Weinberg untuk DEG dan DET, sedangkan DKG dan DCA menyimpang dari keseimbangan. Hasil analisis menunjukkan SNP g.49170107 G>T gen CYP2A6 berasosiasi secara signifikan (P<0.05) dengan dengan konten lemak, total asam lemak jenuh, asam kaprat (C10:0), asam heptadekanoat (C17:0), asam stearat (C18:0), asam heneikosanoat (C21:0), asam behenat (C22:0), asam trikosanoat (C23:0), asam lignoserat (C24:0), asam lemak tidak jenuh total, MUFA total, asam palmitoleat (C16:1), asam elaidat (C18:1n9t), asam oleat (C18:1n9c), asam nervonat (C24:1), PUFA total, asam linolenat (C18:3n3), asam у-linolenat (C18:3n6), asam cis-11,14-eikosedinoat (C20:2), asam homo-у-linolenat (C20:3n6), dan asam arakidonat (C20:4n6). Gen CYP2A6 berpotensi digunakan sebagai penanda seleksi terhadap komposisi asam lemak pada domba.
Keyword: asam lemak, gen CYP2A6, domba, PCR-RFLP

Judul: Identifikasi Keragaman Gen APOA5 dan Kaitannya terhadap Asam Lemak pada Domba.
Abstrak: Gen apolipoprotein A5 (APOA5) merupakan kunci regulator metabolisme plasma trigliserida plasma (TG) yang menunjukkan keterlibatan dalam penyakit arteri koroner. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi keragaman gen APOA5 dan asosiasinya terhadap asam lemak pada domba. Sampel yang digunakan sebanyak 44 sampel yang terdiri dari 20 ekor domba gemuk (DEG), 16 ekor domba ekor tipis (DET), dan 8 ekor domba komposit garut (DKG). Identifikasi keragaman gen APOA5|BssSI dianalisis menggunakan Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP). Produk amplifikasi memiliki panjang 258 bp. Hasil identifikasi keragaman gen APOA5 pada semua populasi domba bersifat polimorfik dengan 3 genotipe yaitu CC, CT, dan TT. Hasil chi square menunjukkan gen APOA5 (g.26929941 C>T) berada dalam kesetimbangan Hardy-Weinberg, kecuali pada domba DET. Gen APOA5 pada posisi g.26929941 C>T berasosiasi (P<0.05) dengan asam lemak laurat (C12:0) dan asam lemak EPA (C20:5n3). SNP gen APOA5 dapat digunakan sebagai penanda genetik untuk seleksi domba dengan kandungan asam lemak tak jenuh.
Keyword: asam lemak, domba, gen APOA5, PCR-RFLP

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: