Judul: Identifikasi Melastoma Sp. Di Sekitar Kampus Ipb Menggunakan Dna Barkode Gen Maturase K (Matk).
Abstrak: Melastoma sp. merupakan tumbuhan liar yang banyak tumbuh di Indonesia dan dapat tumbuh sampai ketinggian 1650 mdpl. Tujuan penelitian ini adalah identifikasi spesies Melastoma sp. di Kampus IPB menggunakan DNA barkode gen matK. Primer yang digunakan untuk PCR dan sekuensing adalah primer matK-3F dan matK-3R menghasilkan fragmen nukleotida sekitar 750 pb. Selain identifikasi secara molekular, juga diamati morfologi daun dan bunganya. DNA genom berasal dari daun Melastoma sp. digunakan sebagai DNA cetakan dalam PCR. Fragmen gen matK hasil PCR digunakan untuk sekuensing. Hasil urutan nukleotida kemudian dianalisis menggunakan BLAST pada situs NCBI. Hasil identifikasi Melastoma sp. menunjukkan bahwa morfologi bunga sampel asal Cikabayan, Pool Bus IPB, Rektorat, dan Jasinga Hijau adalah Melastoma malabathricum L. Hasil BLAST pada situs NCBI juga menunjukkan kemiripannya dengan Melastoma malabathricum subsp. normale KP093758.1, meskipun nilai max score sampel tersebut menunjukkan kemiripan terhadap Melastoma saigonense. Sampel asal Fapet adalah Melastoma saigonense.
Keyword: DNA barkode, gen matK, sekuensing

Judul: Identifikasi Melastoma sp. Asal Jambi Menggunakan DNA Barcoding matK (Maturase K)
Abstrak: Melastoma sp. merupakan tumbuhan liar yang banyak tumbuh di Indonesia dan dapat tumbuh hingga ketinggian 1650 mdpl. Tujuan penelitian ini adalah mengidentifikasi spesies Melastoma sp. asal Jambi menggunakan DNA Barcoding matK. Identifikasi dilakukan dengan isolasi DNA, kemudian DNA diamplifikasi dengan metode PCR dan diurutkan basanya secara forward dan reverse. Primer yang digunakan untuk PCR dan pengurutan basa adalah primer matK-3F dan matK- 3R. Panjang urutan basa gen matK yang diperoleh sekitar 750 pb. Hasil pengurutan basa kemudian dianalisis menggunakan program BLAST-N pada situs NCBI dan disejajarkan menggunakan program ClustalW. Jarak genetik dianalisis menggunakan model Tamura 3-Parameter dengan bootstrap 1000x, diperoleh jarak genetik terkecil adalah 0.000 dan tertinggi adalah 0.032. Hasil identifikasi Melastoma sp. menggunakan barcode DNA matK menunjukkan bahwa sampel A1, A3, A4, A5, dan A6 memiliki kedekatan denganMelastoma saigonense, akan tetapi hasil identifikasi berdasarkan morfologi menunjukkan bahwa sampel A1, A3, A4, A5, dan A6 memiliki kesesuaian ciri dengan Melastoma candidum.
Keyword: Melastoma sp., pengurutan basa DNA, GenBank, Tamura 3- parameter, pohon filogenetik

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: