Judul: IPB (Bogor Agricultural University)
Abstrak: Infeksi busuk buah pada buah mangga buah disebabkan oleh Lasidiplodia theobromae (Pat.) Griffon & Maubl. (syn. Botryodiplodia theobromae Pat.) mencapai 54% dari total volume ekspor. Hal ini menjadi masalah utama dalam ekspor mangga Indonesia. Pengendalian hayati terpadu selama penyimpanan digunakan sebagai alternatif penggunaan fungisida dalam pengendalian penyakit. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui potensi khamir dan kitosan dalam pengendalian busuk buah mangga selama penyimpanan. Perlakuan tunggal secara in vitro dilakukan dengan uji antagonis, uji kitinolitik khamir, perlakuan kitosan (konsentrasi 0,1%, 0,5%, 1%, 1,5%, dan 2% v/v), dan perlakuan thiram (konsentrasi 0,001%, 0,01%, 0,1%, 0,3%, 0,5%, 0,7%, dan 1% b/v). Perlakuan secara in vivo dilakukan dengan pencelupan isolat uji khamir (20 isolat) , kitosan (0,01%, 0,025%, 0,05%, 0,1%, 0,5%, 1%, 1,5%, dan 2% v/v), dan thiram (konsentrasi 0,1% dan 0,3% b/v) pada buah mangga. Perlakuan kombinasi secara in vivo dengan pencelupan khamir dan kitosan dalam menekan penyakit busuk buah dan mempertahankan penampilan fisik buah. Penelitian ini disusun dalam rancangan acak lengkap dengan 3 ulangan dengan uji berjarak Duncan (DMRT). Cryptococcus albidus var aerius IPB1, C. albidus var aerius PB2, Candida edax IPB, C. terreus A IPB, C. luteolus, C. edax 13, dan C. albidus var aerius 6 mempunyai aktivitas penghambatan terhadap B. theobromae secara in vitro. C. albidus var aerius IPB1 paling efektif dalam menghambat patogen dibandingkan perlakuan khamir lainnya dan kontrol. Aktivitas kitinolitik hanya ditunjukkan oleh Buleromyces albus 7 dan C. edax 13 dengan adanya zona bening pada koloidal kitin agar pada hari ke-7 inkubasi. Konsentrasi kitosan paling efektif dalam menghambat pertumbuhan patogen adalah 2% (v/v) pada hari ke-3 inkubasi dengan tingkat hambatan relatif sebesar 89,74%. Pada uji in vivo, C. albidus var aerius IPB1, Pichia guilliermondi A1, Debaryomyces hansenii C12, Rhodotorula glutinis, dan C. edax 13 mampu menghambat patogen. C. albidus var aerius IPB1 paling efektif dalam menghambat dibandingkan perlakuan khamir lainnya. Konsentrasi kitosan dan thiram paling efektif dalam menghambat pertumbuhan pathogen adalah 2% (4 hari setelah inkubasi) dengan tingkat hambatan relatif sebesar 89,74% dibandingkan pengujian lainnya. Kombinasi C. albidus var aerius IPB 1, R. glutinis, D. hansenii C 12, C. edax 13 dan kitosan menunjukkan pengaruh penghambatan lebih tinggi terhadap penyakit daripada perlakuan tunggal
Keyword: 

Judul: Eksplorasi Khamir dan Bakteri Sebagai Kandidat Agens Antagonis Penyebab Penyakit Busuk Pangkal Batang Jeruk (Botryodiplodia theobromae Pat.)
Abstrak: Jeruk merupakan salah satu tanaman buah tahunan yang banyak diminati oleh masyarakat Indonesia, namun produksi jeruk terus mengalami fluktuasi dari tahun ke tahun. Salah satu penyakit utama yang menyerang pertanaman jeruk di Indonesia adalah penyakit busuk pangkal batang jeruk yang disebabkan oleh cendawan Botryodiplodia theobromae yang telah ditemukan di 11 sentra pertanaman jeruk. Penggunaan batang bawah yang resisten sudah tidak efektif karena perkembangan ras patogen yang cepat di lapangan. Oleh sebab itu, tujuan dari penelitian ini adalah mengisolasi khamir dan bakteri dari kulit batang, akar, dan daun tanaman jeruk sehat dan mengetahui potensinya sebagai agens antagonis B. theobromae in vitro. Penelitian ini dilaksanakan mulai April sampai Agustus 2016. Hasil isolasi didapatkan enam isolat khamir dan sebelas isolat bakteri. Semua isolat khamir dan sembilan isolat bakteri bukan patogen terhadap tanaman dan mamalia. Hasil pengujian in vitro yaitu khamir isolat MAFL001 dan MCFG003 mampu menekan pertumbuhan B. theobromae secara langsung dan memiliki afinitas hiperparasitisme yang tinggi. Isolat MAFL001 juga mampu memproduksi senyawa volatil toksik sementara isolat MCFG003 mampu memproduksi enzim kitinase. Berdasarkan identifikasi morfologi isolat MAFL001 termasuk anggota genus Candida, sementara isolat MCFG003 termasuk anggota genus Rhodotorula. Isolat bakteri TBFG007 dan TBFG008 mampu menghambat pertumbuhan B. theobromae secara langsung dan mampu memproduksi senyawa volatil toksik. Selain itu, isolat TBFG008 juga mampu memproduksi enzim kitinase. Empat isolat ini menunjukkan potensi terbaik sebagai agens antagonis B. theobromae in vitro.
Keyword: bakteri antagonis, Botryodiplodia theobromae, khamir antagonis, penyakit busuk pangkal batang jeruk

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: