Judul: Analisis Keragaman Ekson 2 Dan Ekson 3 Gen Myostatin Pada Sembilan Bangsa Kambing Lokal Di Indonesia
Abstrak: Kambing lokal Indonesia merupakan ternak ruminansia kecil dengan jumlah bangsa paling tinggi di Asia Tenggara. Kambing merupakan hewan ternak yang paling populer setelah sapi dan ayam di Indonesia. Salah satu yang menjadi masalah dalam upaya produksi ternak kambing lokal Indonesia adalah kualitas bibit unggul yang masih rendah. Identifikasi bangsa kambing lokal Indonesia diperlukan dalam upaya menghasilkan bibit unggul melalui program seleksi. Salah satu gen yang mengatur pertumbuhan kambing adalah gen myostatin. Gen myostatin menyandikan protein myostatin yang mengontrol pertumbuhan dan diferensiasi otot kerangka. Myostatin yang tidak berfungsi akan mengakibatkan terjadinya hipertropi ataupun hiperplasia. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi keragaman ekson 2 dan ekson 3 gen myostatin serta menentukan hubungan kekerabatan serta hubungan genetik antara sembilan bangsa kambing Indonesia. Sampel DNA diekstraksi dari darah kambing yang terdiri dari 80 sampel kambing, yaitu kambing Samosir, kambing Muara, kambing Kacang, kambing Kosta, kambing Peranakan Etawah, kambing Burawa, kambing Gembrong, kambing Boer dan kambing Boerka. Metode Polymerase Chain Reaction-Single Strand Conformation Polymorphism (PCR-SSCP) dan sekuensing DNA digunakan untuk mengidentifikasi keragaman daerah ekson 2 dan ekson 3 gen myostatin pada kambing lokal Indonesia. Hasil amplifikasi dengan PCR daerah ekson 2 dan ekson 3 gen myostatin pada kambing adalah 650 pb. Pensejajaran nukleotida gen myostatin ekson 2 pada sembilan bangsa kambing lokal Indonesia ditemukan mutasi tertentu. Terdapat 12 tipe gen berdasarkan pola migrasi untai tunggal. Berdasarkan hasil sekuensing ditemukan 12 haplotipe pada kambing. Dari hasil pensejajaran nukleotida gen myostatin ekson 3 pada sembilan bangsa kambing lokal Indonesia ditemukan 10 variasi gen myostatin. Variasi yang ditemukan pada ekson 3 mempengaruhi asam amino. Variasi yang ditemukan pada sembilan bangsa kambing menunjukkan bahwa keragaman genetik kambing beragam. Variasi dan tipe gen myostatin yang ditemukan dalam penelitian ini belum dapat dijadikan penanda bagi kambing lokal yang memiliki parameter pertumbuhan yang tinggi. Hasil penelitian ini diharapkan dapat menjadi dasar dalam melakukan seleksi berdasarkan sifat pertumbuhan kambing dalam populasi yang lebih besar dan beragam.
Keyword: myostatin, kambing, SSCP, tipe gen

Judul: Keragaman Genetik Kambing Lokal Berdasarkan Genom Mitokondria
Abstrak: Kambing (Capra hircus) dimasukkan pertama kali ke Indonesia sebagai hewan ternak sekitar tahun 1700-an, yang kemudian berkembang manjadi ternak lokal. Peningkatan mutu ternak kambing sebagian besar dilakukan dengan cara mengawinkan ternak betina dengan jantan unggul yang didatangkan dari daerah lain. Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui keragaman genetik kambing ternak lokal berdasarkan Daerah Pengendali DNA mitokondria. Sampel yang digunakan adalah kambing ternak lokal yang berasal dari Sumatera Utara, Muara-Tapanuli Utara, Samosir, Marica-Sulawesi Selatan, dan Gembrong-Bali. Amplifikasi DNA mitokondria secara in vitro dilakukan dengan metode Polymerase Chain Rection (PCR). Produk amplifikasi yang dihasilkan sebesar 1700 pasang basa. Produk amplifikasi tersebut dipotong dengan lima enzim restriksi, yaitu MboI, DdeI, AluI, HaeIII, dan BamHI. Dari 102 sampel yang dianalisis, ditemukan dua haplotipe. Haplotipe 1 terdapat pada seluruh wilayah, sedangkan haplotipe 2 hanya terdapat pada empat sampel yang berasal dari Marica Sulawesi Selatan. Hasil sekuensing yang telah dialignment dengan beberapa individu kambing yang terdapat pada GenBank, menunjukkan bahwa kambing-kambing ternak lokal di dunia memiliki kekerabatan yang dekat (98,8 %) dan berasal dari induk yang sama.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: