Judul: Metode Ekstraksi DNA dan ldentifikasi Gen Kappa Kasein (K-Kasein) pada Sapi Friesian Holstein (FH) di Peternakan Rakyat
Abstrak: Gen-gen kasein (a51-kasein, a52-kasein, β-kasein dan K-kasein) banyak di laporkan bertanggung jawab terhadap sifat kualitas dan kuantitas susu sapi. P enelitian ini bertujuan untuk membandingkan metode ekstraksi DNA fenolkloroform dengan metode pengendapan garam, dan untuk mengidentifikasi gen kappa kasein (K-kasein) sebagai salah satu penciri genetik kualitas susu sapi perah Friesian Holstein (FH) pada petemakan rakyat. Hasil penelitian ini dapat digunakan s ebagai acuan untuk penelitian lanjutan dalam meningkatkan mutu genetik sapi FH. Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Juli hingga November 2004 di Laboratorium Zoologi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Institut Pertanian Bogor. Penelitian menggunakan 78 sampel darah sapi FH betina yang berasal dari Petemakan Pondok Rangon Jakarta, Kebon Pedes Bogor dan Fakultas Peternakan IPB. Tahapan penelitian meliputi pengambilan darah sapi sebagai s umber DNA, ekstraksi DNA, perbanyakan gen K-kasein secara in vitro menggunakan Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP) dengan primer spesifik untuk gen K-kasein, genotyping p roduk PCR menggunakan teknik elektroforesis gel akrilamida yang dilanjutkan dengan pewamaan sensitifitas perak. Pada sampel darah utuh, metode ekstraksi fenol-kloroform lebih baik dari pada metode pengendapan garam. Pada peternakan Pondok Rangon, frekuensi genotipe AA, AB dan BB berturut-turut sebesar 34,21%; 63,16% dan 2,63% sedangkan frekuensi alel A dan B berturut-turut sebesar 65,79% dan 34,21%. Pada petemakan Kebon Pedes Bogor dan Fakultas Petemakan IPB frekuensi gen 100% untuk genotipe AA atau monomorfik.
Keyword: sapi FH, gen K-Kasein, PCR-RFLP

Judul: Identifikasi Keragaman Gen β-laktoglobulin pada Sapi Friesian- Holstein di Balai Pengembangan Perbibitan Ternak Sapi Perah Cikole, Lembang
Abstrak: Kualitas susu sangat dipengaruhi oleh komposisi dan kadar protein yang dikandungnya. Protein dalam susu sapi terdiri dari dua jenis yaitu kasein dan whey. Protein utama dalam whey adalah β-laktoglobulin. Upaya perbaikan kualitas protein dapat dilakukan melalui pendekatan seleksi menggunakan penciri genetik pada tingkat DNA. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi keragaman gen β-laktoglobulin terhadap materi berupa DNA ektsraksi menerapkan metode Polymerase Chain Reaction - Restriction Fragmen Length Polymorphism (PCR-RFLP). DNA ekstraksi berasal dari sampel darah diambil dari secara vena jugularis bersumber dari 88 ekor sapi perah induk laktasi Friesian Holstein (FH) di BPPT-SP Cikole, Lembang. Penelitian genotyping gen β-laktoglobulin ini berlangsung selama enam bulan di Laboratorium Genetika Ternak, bagian Genetika dan Molekuler Ternak, Fakultas Peternakan, Institut Pertanian Bogor. Frekuensi genotipe dan alel serta nilai heterozigositas dihitung menggunakan metode Nei (1987). Kesetimbangan alel dan genotipe berdasarkan hukum Hardy-Weinberg dihitung menerapkan uji chi-square. Genotyping gen β-laktoglobulin pada sapi FH bersifat polimorfik atau beragam. Ada dua tipe alel yang dideteksi, yaitu alel A dan B yang menghasilkan tiga tipe genotipe, yaitu AA, AB dan BB. Frekuensi alel A dan B adalah 0,40 dan 0,60. Nilai heterozigositas yang diperoleh sebesar 0,483. Hasil uji chi-square menunjukkan bahwa χ2 lebih kecil dari χ2 tabel yang artinya gen β-laktoglobulin dari sapi FH pengamatan berada dalam keseimbangan Hardy-Weinberg, dengan varian genotipe untuk AA, AB dan BB berurutan adalah 0,10, 0,60, dan 0,30.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: