Judul: Deteksi Molekuler Gen Penyandi Resistensi Antibiotika pada Salmonella spp dari Peternakan Ayam di Bandung dan Purwakarta
Abstrak: Resistensi antibiotika kini telah menjadi masalah serius di dunia kesehatan.Penggunaan antibiotika pada ternak menjadi salah satu faktor yang berperan pada penyebaran bakteri resisten di lingkungan.Salmonella merupakan salah satu agen bakteri yang dapat menyebar ke manusia melalui makanan atau foodborne disease.Resistensi terhadap Salmonella diakibatkan penggunaan antibiotika yang kurang bijaksana salah satunya sebagai pencegahan.Tujuan penelitian ini adalah melakukan isolasi dan identifikasi Salmonella spp serta mendeteksi keberadaan gen resistensi antibiotika pada Salmonella spp asal peternakan ayam di Bandung dan Purwakarta. Sebanyak 70 isolat diambil dari peternakan ayam layer dan breeder di Bandung dan Purwakarta. Tiga puluh tiga isolat positif Salmonella spp berdasarkan hasil uji biokimia dan 21 isolat dikonfirmasi sebagaiSalmonella spp dengan menggunakan PCR. Semua isolat diuji menggunakan antibiotika ampisilin, tetrasiklin, gentamisin, eritromisin, asam nalidiksat, oksitetrasiklin, kloramfenikol dan enroflokassin dengan menggunakan metode disk diffusion. Gen resistensi antibiotika yang dideteksi adalah ampC, tet(A) dan tet(B) dengan menggunakan single polymerase chain reaction (PCR). gen qnr(A), qnr(B) dan qnr(S) dideteksi dengan menggunakan multiplex PCR. Hasil penelitian menunjukkan seluruh isolat Salmonella spp yang berasal dari daerah Bandung dan Purwakarta terhadap Tetrasiklin 100%, Oksitetrasiklin dan Ampisilin 95.2%, Asam Nalidiksat 90.4%, Eritromisin 85.7%, Enrofloksasin 76.2%, Gentamisin 47.6%, Kloramfenikol 38.1%. Adapun gen penyandi resistensi pada isolat Salmonella spp yang berhasil dideteksi, diantaranya ampC (95.2%), tet(A) 61.9%, tet(B) 38.1%, qnr(A) 28.5%, qnr(B) 14.3%, qnr(S) 23.8%, qnr(A) dan qnr(B) 14.3%, qnr(A) dan qnr(S) 9.5%. Hasil uji sensitifitas dan deteksi gen resistensi menunjukkan hampir keseluruhan isolat resisten terhadap beberapa antibiotika.
Keyword: antibiotika, gen, resistensi, Salmonella

Judul: Deteksi Gen Penyandi Resistensi Antibiotik pada Escherichia coli dan Salmonella sp. yang Diisolasi dari Beberapa Peternakan Unggas di Jawa Barat.
Abstrak: Industri perunggasan menggunakan antibiotik sebagai pencegahan, pemacu pertumbuhan dan pengobatan penyakit infeksi bakerial. Oleh karena itu banyak menimbulkan bakteri resisten. Escherichia coli dan Salmonella sp. adalah bakteri penting pada hewan. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi dan mengidentifikasi E. coli dan Salmonella sp., menguji sensitivitas dan deteksi gen penyandi resistensi E. coli and Salmonella sp.. Seratus lima sampel swab kloaka unggas digunakan dalam penelitian ini. Isolasi dan identifikasi bakteri menggunakan kaldu tetrationat (khusus Salmonella sp.), kemudian dikultur pada media agar selektif (agar Mac Conkey dan eosin methylene blue untuk E.coli, Salmonella-Shigella untuk Salmonella sp.), pengujian biokimia dan pewarnaan Gram. Isolat bakteri dikonfirmasi dengan amplifikasi gen uspA E. coli dan invA Salmonella sp. menggunakan PCR. Tetrasiklin, oksitetrasiklin, ampisilin, gentamisin, asam nalidiksat, siprofloksasin, enrofloksasin, eritromisin dan kloramfenikol adalah antibiotik yang digunakan dalam penelitian ini. Metode difusi cakram Kirby-Bauer digunakan untuk mendeteksi resistensi bakteri terhadap antibiotik. Hasil uji sensitivitas menunjukkan bahwa E. coli resisten terhadap tetrasiklin (92.3%), oksitetrasiklin (92.3%), ampisilin (100%), gentamisin (61.6%), asam nalidiksat (94.3%), siprofloksasin (69.2%), enrofloksasin (65.4%), eritromisin (96.2%) dan kloramfenikol (0%). Salmonella sp. resisten terhadap tetrasiklin (75%), oksitetrasiklin (75%), ampisilin (75%), gentamisin (12.5%), asam nalidiksat (100%), siprofloksasin (12.5%), enrofloksasin (0%), eritromisin (100%) dan kloramfenikol (0%). Hasil deteksi gen penyandi resistensi antibiotik pada E. coli dan Salmonella sp. berturut-turut yaitu tetA (83.3% dan 33.3%) positif, blaTEM (100% dan 100%) positif, aac(3)-IV (3.1% dan 0%) positif, gyrA (100% dan 100%) positif ermB (6% dan 0%) positif. Hasil penelitian menunjukkan bahwa E. coli dan Salmonella sp. dapat diisolasi dari swab kloaka unggas. Semua isolat E. coli resisten terhadap ampisilin. Semua isolat Salmonella sp. resisten terhadap asam naidiksat dan eritromisin. Gen penyandi resistensi antibiotik yaitu tetA, blaTEM, aac(3)-IV, gyrA dan ermB genes terdeteksi pada isolat E. coli dan gen tetA, blaTEM dan gyrA terdeteksi pada isolat Salmonella sp..
Keyword: antibiotik, resisten, Escherichia coli, gen, Salmonella sp

Judul: Thermal Characteristics and Dynamics of Tropical Cyclone over Western North Pacific Ocean: A Case Study of Typhoon Songda (Chedeng) 2011
Abstrak: The frequent occasion of Tropical Cyclone (TC) over Western North Pacific (WNP) Ocean lies from 10˚N to 26˚N and 121˚E to 170˚E. Sources of TC development come from warm ocean temperature where latent heat is released during condensation processes and subsequently concentrated in the boundary layer. Relative humidity at 850-700 hPa is responsible to produce the most intense storm. Meanwhile, weak vertical wind shear between 850-200 hPa is one of the dynamical factors that lead to the development of TC. Pressure level of 850-200 hPa is chosen to minimize the thermodynamic effect in the lower troposphere. Typhoon Songda (Chedeng in the Philippines) or TSC lasted from May 18th to 30th, 2011 and strengthened into powerful Super Typhoon stage between May 24th and 27th. Long curving track and the exhibition of all sequences of TC life cycle, TSC is then considered as an ideal case of TC. The objective of the study with case of TSC is to investigate the role of thermal characteristics and dynamics on TC intensity. The research is carried out by using Advanced Research of Weather Research and Forecasting model (WRF ARW model) version 3.3. Two domains are employed in the model. The first domain situate from 02˚N to 40˚N and 118˚E to 149˚E and cover spatial resolution () of 33.1 km. The second domain situate from 09˚N to 27˚N and 119˚E to 132˚E with of 11 km. Timestep of the model () is 120 seconds. The model is supported by the following physical parameterization, i.e., Yonsei University Scheme (YSU) in the boundary layer, Kain-Fritsch scheme (KF) in the cumulus, and WRF Single-Moment 3-class scheme in the microphysics. Initial meteorological condition prior to the formation of the cyclone is generated using WRF ARW standard-release model. Sensitivity of the model output is obtained from a selected single-parameter change scenarios, namely, 10 % to 20 % decrease and increase of wind shear initial data at 850-200 hPa, and by 10 % to 20 % decrease of relative humidity initial data at 850-700 hPa. The result showed that the negative correlations between wind shear and intensity are found in wind shear scenarios. Wind shears of 10 ms-1 which lead to strengthening of the wind intensity in the early period of Typhoon development are found in wind shear scenarios. The effect of wind shear changes on wind intensity is statistically significant in the 20 % wind shear scenarios. During mature stage, weak wind intensity occurred when wind shear increase as given in the WRF standard-release and the 20 % decreasing scenario. Different situation is found in the 20 % increasing scenario where wind shear tend to weak and lead to strong wind intensity at this stage. Meanwhile, the reduction of moisture supply at 850-700 hPa resulting from 20 % decreasing relative humidity play a major role in the weakening of wind intensity and reduces mechanical energy of the cycle process as much as 300 J kg-1.
Keyword: