Judul: Karakterisasi morfologi dan variasi gen COI dan COII DNA mitokondria Genus Etiella, Scirpophaga, dan Ostrinia (Lepidoptera: Superfamili Pyraloidea)
Abstrak: Pyraloidea, salah satu superfamili dari Ordo Lepidoptera terdiri dari Famili Pyralidae dan Crambidae. Sebagian besar serangga dalam Superfamili Pyraloidea merupakan serangga penggerek tanaman pertanian. Serangga penggerek Etiella zinckenella (Pyralidae: Phycitinae) dikenal sebagai penggerek polong kedelai. Ostrinia furnacalis (Crambidae: Pyraustinae) sebagai penggerek batang jagung dan Scirpophaga excerptalis (Crambidae: Schoenobiinae) penggerek pucuk tebu. Ketiga spesies serangga tersebut telah dilaporkan dapat menurunkan hasil produksi tanaman pertanian di beberapa wilayah Indonesia. Identifikasi secara tepat dengan menggunakan karakterisasi morfologi dan molekular dapat membantu dalam pengendalian serangga tersebut. Karakterisasi morfologi dilakukan untuk mempelajari perbedaan morfologi. Kunci identifikasi yang ada hanya untuk Ordo Lepidoptera secara umum. Kunci identifikasi serangga penggerek berdasarkan morfologi pada level famili, subfamili, dan genus dalam Ordo Lepidoptera belum ada di Indonesia. Analisis molekular digunakan untuk mendukung data morfologi, sehingga identifikasi suatu spesies serangga akan lebih tepat. Genom DNA mitokondria (DNAmt) merupakan salah satu metode yang digunakan untuk mempelajari keragaman genetik dan hubungan kekerabatan suatu spesies. Gen DNAmt yang banyak digunakan dalam studi molekular sebagai penanda dalam analisis variasi genetik adalah gen Cytochrome c Oxidase I dan II (COI dan COII). Gen COI dan COII memiliki variasi genetik yang tinggi, tidak ada delesi dan insersi. Data molekular gen COI dan COII telah dilakukan untuk E. zinckenella di Italia dan Cina, O. furnacalis di Cina; Vietnam; dan Jepang, sedangkan S. excerptalis hanya ada untuk gen COII di India dan Papua Nugini. Data gen COI dan COII ketiga spesies penggerek tersebut di Indonesia belum ada. Oleh sebab itu, dilakukan karakterisasi molekular pada gen COI dan COII ketiga spesies tersebut sebagai database serangga penggerek di Indonesia. Penelitian ini bertujuan untuk (1) mengkarakterisasi perbedaan morfologi Genus Etiella (Pyralidae; Phycitinae), Genus Scirpophaga (Crambidae; Schoenobiinae), dan Genus Ostrinia (Crambidae; Pyraustinae). (2) mengkarakterisasi variasi gen COI dan COII DNA mitokondria E. zinckenella, S. excerptalis, dan O. furnacalis. Serangga E. zinckenella dari populasi Brebes (Jawa Tengah) dan O. furnacalis dari populasi Bogor (Jawa Barat) yang telah dipelihara di Laboratorium BB-Biogen. S. excerptalis dikoleksi dari pertanaman tebu di Tulang Bawang (Lampung). Tahap karakterisasi morfologi terdiri dari pengamatan karakter eksternal, preparasi venasi sayap dan organ genitalia. Karakterisasi molekular terdiri dari tahap ekstraksi DNA dengan metode CTAB, amplifikasi DNA, dan perunutan DNA. Analisis DNA dilakukan berdasarkan homologi sekuen DNA dan asam amino, serta analisis jarak genetik dan filogeni.
Keyword: COI, Etiella zinckenella, Ostrinia furnacalis, Pyraloidea Scirpophaga excerptalis, COII

Judul: Karakterisasi tiga spesies Genus Scirpophaga (Lepidoptera: Crambidae) berdasarkan variasi morfologi dan gen COI serta COII DNA mitokondria
Abstrak: Serangga S. incertulas dan S. innotata merupakan serangga penggerek padi yang mengakibatkan gejala sundep dan beluk, sedangkan S. excerptalis merupakan serangga penggerek pucuk tebu yang mengakibatkan gejala mati pucuk. Ketiga spesies merupakan serangga dari Subfamili Schoenobiinae, Famili Crambidae. Sebagian besar kelompok serangga Famili Crambidae merupakan serangga penggerek dominan di Asia Serangga dalam Scirpophaga seperti S. incertulas, S. innotata dan S. excerptalis memiliki karakter eksternal yang mirip sehingga kemungkinan kesalahan dalam penentuan spesies bisa saja terjadi. Serangga S. innotata dan S. excerptalis mirip berdasarkan karakter warna sayap, sedangkan S. incertulas dan S. innotata berdasarkan karakter genitalia. Selain pada stadia imago, ketiga serangga penggerek juga mirip pada stadia telur dan larva instar satu. Dengan demikian, karakterisasi secara morfologi dan molekuler perlu dilakukan pada stadia telur, larva instar satu dan imago. Karakterisasi morfologi pada ketiga serangga ini dapat dijadikan dasar dalam pembuatan kunci identifikasi stadia imago serangga penggerek Scirpophaga di Indonesia. Karakter yang dapat digunakan untuk membedakan S. incertulas, S. innotata dan S. excerptalis pada stadia imago adalah warna dan spot sayap depan dan belakang, venasi sayap depan, frenulum, anal hair tuft dan genitalia. Akan tetapi karakterisasi morfologi tidak dapat digunakan pada stadia telur dan larva instar satu karena memiliki karakter yang sama dan sulit dibedakan antara ketiga serangga penggerek ini. Stadia telur dan larva instar satu dapat dikarakterisasi dengan menggunakan DNA mitokondria (DNAmt). DNAmt merupakan salah satu metode yang digunakan untuk mempelajari variasi genetik dan hubungan kekerabatan spesies. Gen peyusun DNAmt yang sering digunakan adalah gen cytochrome c oxidase satu dan dua (COI dan COII). Kedua gen ini memiliki laju evolusi dan variasi genetik yang tinggi. Selain itu, gen COI juga digunakan sebagai gen standar penanada genetik (DNA barcode). Tujuan penelitian ini adalah untuk (1) mengkarakterisasi variasi morfologi serangga Scirpophaga incertulas, S. innotata and S. excerptalis pada tiga stadia yang berbeda yaitu stadia telur, larva instar satu dan imago, (2) mengkarakterisasi variasi gen COI dan COII DNA mitokondria pada dua stadia yaitu stadia telur dan larva instar satu dari ketiga serangga penggerek. Koleksi sampel dilakukan pada stadia imago, kemudian dipelihara untuk mendapatkan stadia telur dan larva instar satu. Serangga S. incertulas dikoleksi dari daerah Karawang (Jawa Barat), S. innotata dari Pontianak (Kalimantan Barat) dan S. excerptalis dari Tulang Bawang (Lampung). Pemilihan lokasi berdasarkan keberadaan serangan serangga penggerek.
Keyword: COI, COII, Scirpophaga excerptalis, S. incertulas, S. innotata

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: