Judul: Aspek Fisiologi dan Analisis DNA Genom Beberapa Galur Bradyrhizobium japonicum Toleran Asam-Al
Abstrak: Uji fisiologi dan schizotyping telall dilakukan untuk menganalisis keragaman beberapa galur Bradyrhizobium japonicum toleran asam-Al. Duapuluh satu galur B. japonicum toleran asam-Al digunakan sebagai sumber galur untuk uji fisiologi dan enam diantaranya untuk analisis DNA genom. Uji fisiologi yang digunakan adalah uji produksi penisilinase, uji toleransi NaCI 1%, uji produksi H,S, uji produksi 3-ketolaktosa, dan uji aktivitas gelatinase. Analisis DNA genom dilakukan dengan memanfaatkan enzim restriksiAseI,Asnl, Spel, Xbal dan teknik elektroforesis medan berpulsa (pFGE). Dari hasil uji fisiologi, temyata semua galur uji tidak toleran terhadap 1% NaCI, tidak menghasilkan enzim-enzim sisteina desulfurase dan gelatinase, dan tidak mengoksidasi laktosa, namun 95,2% galur uji menghasilkan enzim penisilinase pada konsentrasi Penisilin 100 unit/mi. Dari analisis DNA genom diketahui bahwa ke enam galur uji tidak memiliki plasmid sedangkan urutan enzim restriksi yang memotong jarang adalah Xbal, Spel dan Asnl, Asei. Meskipun galur uji menunjukkan ciri fisiologi yang sarna namun secara genotipe berbeda kecuali dua dari enam galur uji yaitu galur 11 dan 15 yang menunjukkan kemiripan profil DNA.
Keyword: 

Judul: Seleksi Galur-Galur Bradyrhizobium Japonicum Toleran Asam-Aluminium
Abstrak: Bradyrhizobium japonicum merupakan bakteri penambat molekul nitrogen bebas (N2) yang bersimbiosis dengan akar tanaman kedelai dengan cara memben- tuk bintil. Bakteri ini berpotensi untuk meningkatkan produksi kedelai ter- utama pada lahan asam, melalui simbiosis antara B. japonicum toleran asam dengan kedelai yang juga toleran asam. Bradyrhizobium japonicum toleran asam yang diperoleh melalui skrining mikrobiologis dan kemampuannya berkompetisi dalam membentuk bintil akar dapat dievaluasi dengan menggunakan penanda molekuler yang stabil dan handal. Penanda molekuler yang dapat digunakan untuk menelaah aktivitas bakteri di habitat alaminya, antara lain adalah gen inaZ pada plasmid pJL1703, gen xylE pada plasmid pXYLE1, dan gen resistensi kanamisin dari Tn903 yang dibawa transposon mini-Tn5 (pUTmini-Tn5Kan). Penanda molekuler terpilih adalah yang paling stabil dan mampu diekspresikan oleh B. japonicum. Penelitian ini bertujuan : (i) menganalisis kemampuan galur-galur B. japo- nicum toleran asam mengekpresikan gen inaZ, gen xylE dan gen KanR serta kemampuannya dalam membentuk bintil akar, (ii) menentukan gen yang dapat digunakan sebagai penanda molekuler pada B. japonicum, (iii) menelaah kompetisi galur-galur B. japonicum toleran asam dalam membentuk binti akar kedelai dengan menggunakan penanda molekuler yang sesuai. Ketiga gen penanda tersebut masing-masing ditransfer ke B. japonicum dengan teknik konjugasi. Pemindahan gen inaZ dan gen xylE dilakukan secara triparental mating, sedangkan gen Kan secara diparental mating. Mating dilaku- kan di atas filter millipore dengan pori-pori 0.45 um di atas media Luria Agar (LA) yang dimodifikasi…dst
Keyword: Bradyrhizobium Japonicum, Bakteri  Bintil Akar, Konjugasi, Penanda Molekul

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: