Judul: Marka Molekuler untuk Gen Ketahanan Penyakit Blas (Piz dan Piz-t) pada Beberapa Varietas Padi Gogo
Abstrak: Salah satu kendala utama dalam peningkatan produksi padi gogo adalah penyakit blas yang diinfeksi oleh cendawan Pyricularia oryzae, penyebab biji hampa. Peningkatan sifat ketahanan terhadap blas dilakukan melalui persilangan antara padi gogo varietas Way Rarem dengan varietas padi gogo asal Kolombia, Oryzica Llanos-5 yang diduga memiliki beberapa gen Pi sebagai gen tahan blas. Penelitian ini bertujuan memperoleh marka molekuler yang spesifik untuk mendeteksi gen Piz dan Piz-t pada tetua Way Rarem dan Oryzica Llanos-5. Hasil isolasi tujuh tanaman sampel dan kontrol rentan dari beberapa varietas padi gogo diamplifikasi menggunakan primer z56592, zt5659, AP5659-1, AP5659-3 dan AP5659-5 melalui teknik PCR, kemudian dielektroforesis dengan metode silver staining. Elektroforegram menunjukkan pola pita DNA yang tidak sesuai untuk primer z56592, zt5659, AP5659-1, dan AP5659-5 sementara primer AP5659-3 menjadi primer yang spesifik karena memberikan pola pita DNA yang polimorfis. Hasil deteksi dengan primer AP5659-3 menunjukkan bahwa Oryzica Llanos-5 dan Way Rarem mengandung gen Piz-t yang berada pada ukuran alel sekitar 200 bp, sedangkan Kencana Bali, Cirata, dan Situ Bagendit merupakan tanaman rentan yang tidak mengandung gen Piz maupun Piz-t. Dengan demikian, dapat disimpulkan bahwa primer AP5659-3 merupakan marka molekuler yang dapat mendeteksi gen Piz dan Piz-t.
Keyword: Piz gene, Piz-t gene, Upland rice, Molecular marker, Silver staining, Pyricularia oryzae

Judul: Identifikasi Keberadaan Gen Ketahanan Blas Pi Dan Gen Defisiensi Fosfor Pup1 Pada Tanaman Padi Gogo
Abstrak: Peningkatan kualitas tanaman padi gogo yang menjadi salah satu varietas unggul khusunya pada lahan kering masih perlu dilakukan. Keberadaan gen ketahanan blas dan gen defisisensi fosfor menjadi dasar dalam memperoleh tanaman berkualitas baik. Penelitian ini bertujuan mendapatkan padi gogo yang positif mengandung gen-gen Pi dan Pup1 yang diujikan serta ketahanannya terhadap beberapa ras isolat blas. Metode seleksi dilakukan dengan mengamati respon tanaman terhadap serangan blas serta analisis molekular keberadaan gen Pi dan Pup1. Hasil evaluasi respon serangan blas terhadap 42 genotipe diperoleh hanya padi BN.SLP-12 yang tahan untuk semua isolat dan sebanyak 35 genotipe yang diduga membawa gen Pi-20, Pi-23, Pi-b, dan Pi-kh. Terdapat 33 genotipe yang diduga membawa lokus Pup1 dengan 29 diantaranya merupakan hasil persilangan dengan Kasalath dan NIL-C443. Secara umum, semua genotipe yang diujikan memberikan respon tahan terhadap isolat R.033.
Keyword: blas, gen Pi, gen Pup1, padi gogo

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: