Judul: The Early Colonization of Dark Septate Endophyte Fungi on Tomato Seedlings
Abstrak: Keberadaan cendawan endofit yang termasuk dark septate endophyte (DSE) pada tanaman tomat telah banyak dilaporkan. Namun, proses awal kolonisasi DSE secara alami belum pernah dilaporkan. Oleh sebab itu, penelitian ini bertujuan menganalisis kolonisasi awal DSE pada tanaman tomat sejak fase bibit. Kolonisasi awal diamati pada 4 kultivar tomat, yaitu A, T, S, dan K yang benihnya bebas endofit. Deteksi cendawan endofit dilakukan pada 2 tahap. Tahap pertama, yaitu secara in vitro pada benih, untuk mendapatkan bibit bebas endofit dan in planta pada bibit yang ditanam pada campuran kompos dan tanah asal pertanaman tomat, untuk mempelajari kolonisasi awal DSE. Hasil penelitian menunjukkan bahwa benih bebas DSE dan kontaminasi mikrob lain setelah diinkubasi pada PDA selama 3 minggu. Kolonisasi awal DSE terdeteksi pada bibit tomat kultivar A dan T umur 1 minggu setelah tanam (MST), sedangkan pada kultivar S dan K terdeteksi pada 2 MST. Keberadaan DSE ditandai dengan terbentuknya mikrosklerotium pada akar. Koloni DSE dikonfirmasi melalui hasil isolasi DSE dari akar bibit umur 4 MST. Koloni DSE pada media PDA memiliki hifa bersekat, berwarna gelap, dan membentuk klamidospora yang merupakan ciri khas DSE., The presence of endophytic fungi including dark septate endophyte (DSE) in tomato plants has been widely reported. Yet, early DSE colonization in nature is unknown. Therefore, colonization of DSE in tomatoes seedling was studied to determine the time needed for the DSE to colonize the root. The experiment was done using 4 commercial cultivars (A, T, S, and K) of tomato seeds that were free from microbial endophytes. The seedling showed no microbial contamination after being incubated for 3 weeks on PDA. The same seed batch was planted on a mixture of compost and soil from tomato plantation in a seedling tray and incubated for about 3 weeks. Colonization of DSE was detected in root of A and T tomato seedlings at 1 week after seed planting (WAP), and those of S and K cultivars were detected at 2 WAP. The presence of DSE in the root tissue was characterized by the existence of the microsclerotia. DSE colonization was confirmed by isolation of 4 WAP-old roots containing microsclerotia on PDA. The colonies emerged on the media had dark and septate hyphae, and formed chlamydospores which are the characteristics of the DSE.
Keyword: Tomato seeds, Tomato seedlings, Microsclerotia, Tomato cultivars

Judul: Study of the Potential of Dark Septate Endophyte Fungi on Pinus merkusii Jungh et de Vriese Roots
Abstrak: Cendawan Dark septate endophyte (DSE) dikenal sebagai kelompok cendawan endofit yang mampu melakukan kolonisasi pada akar tanaman inang tanpa menyebabkan munculnya gejala penyakit, serta dapat membentuk struktur melanisasi (hifa interseluler, hifa intraseluler dan mikrosklerotia) dalam akar tanaman, sehingga mampu berperan sebagai agen hayati, promotor pertumbuhan pada tanaman inang di bawah cekaman biotik dan abiotik. Selanjutnya kemampuan cendawan DSE untuk mendegradasi lignin dan selulosa belum banyak dipublikasikan terutama berkaitan dengan kemampuan menghasilkan enzim lignase yang berfungsi untuk mendegradasi lignin khususnya pada serasah P. merkusii. Penelitian ini dilakukan untuk mengevaluasi jenis-jenis DSE pada akar P. merkusii, mengevaluasi karakteristik pertumbuhan secara in vitro dan enzimatik isolat DSE, mengevaluasi kemampuan DSE dalam mendekomposisi serasah P. merkusii dan kemampuan antagonis DSE dari akar P. merkusii, mengevaluasi kemapuan DSE dalam meningkatkan pertumbuhan bibit P. merkusii dan mengevaluasi kemampuan DSE dalam menghambat penyakit lodoh yang diakibatkan oleh patogen Fusarium oxysporum pada bibit P. merkusii di rumah kaca. Penelitian dilaksanakan di Laboratorium Biologi Balai Standarisasi Instrumen Pertanian, Jalan Tentara Pelajar No. 12, Kampus Penelitian Pertanian Cimanggu, Bogor, Jawa Barat dan Laboratorium Penyakit Hutan dan Rumah Kaca Departemen Silvikultur Fakultas Kehutanan dan Lingkungan IPB University, Bogor pada bulan September 2020 sampai September 2023. Penelitian dimulai dengan tahap pertama berupa isolasi dan karakteristik isolat DSE dari akar P. merkusii. Isolasi akar P. merkusii yang berasal dari 4 lokasi yaitu Dramaga Bogor, Hutan Pendidikan Gunung Walat Bogor, Taman Nasional Gunung Halimun Salak Bogor dan Kecamatan Dabun Gelang Kab. Gayo Lues, mengikuti metode Surono dan Narisawa (2017). Tahap kedua dilanjutkan uji pertumbuhan secara in vitro dan karakteristik enzimatik isolat DSE. Tahap ketiga melakukan uji kemampuan dekomposisi serasah P. merkusii dan antagonis isolat DSE. Tahap keempat mengevaluasi peran dan identifikasi isolat DSE sebagai pendukung pertumbuhan bibit P. merkusii di rumah kaca. Tahap kelima yaitu mengevaluasi peran isolat DSE terhadap penghambatan penyakit lodoh pada bibit P. merkusii di rumah kaca. Data di analisis menggunakan program microsoft excel dan program SAS dan bila terdapat perbedaan antar perlakuan, dilakuan uji jarak berganda Duncan dengan taraf nyata q=0,05. Hasil isolasi sebanyak 1.160 segmen akar P. merkusii, yang berasal dari 4 lokasi diperoleh sebanyak 25 isolat DSE. Isolasi akar P. merkusii dari kampus Dramaga IPB diperoleh sebanyak 16 isolat (5%), Kecamatan Dabun Gelang Kabupaten Gayo Lues diperoleh 2 isolat (0,79%), Hutan Pendidikan Gunung Walat diperoleh 2 isolat (2%) dan Taman Nasional Gunung Halimun Salak diperoleh 5 isolat (1,74%). Umunya warna hifa miselium isolat DSE yang diperoleh bagian atas berwana hitam dan rata-rata pertumbuhan isolat ≤ 2 mm per hari. Pengujian pertumbuhan secara in vitro dengan menggunakan benih sawi...., Dark septate endophyte (DSE) fungi are known as a group of endophytic fungi that are able to colonize the roots of host plants without causing disease symptoms, and can form melanized structures (intercellular hyphae, intracellular hyphae and microsclerotia) in plant roots, so that they are able to act as biological agents, growth promoter in host plants under biotic and abiotic stresses. Furthermore, the ability of the DSE fungus to degrade lignin and cellulose has not been widely published, especially in relation to its ability to produce the enzyme lignase which functions to
Keyword: antagonis, Fusarium oxysporum, growth promoter, lignoselulolitik

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: