Judul: Identifikasi Pola Medan Suhu di Lapisan Tropopause Kawasan Pasifik Tropis
Abstrak: Fluktuasi suhu tropopause di kawasan pasifik tropis dianalisa dengan menggunakan analisis komponen utama (PCA) dan analisis spektrum. Analisis Komponen utama menunjukkan bahwa 2 komponen utama mempresentasikan 93.1% dari total variabilitas fluktuasi suhu tropopause di kawasan kajian. PCA 1 memiliki osilasi 12 bulan dan 6 bulan sedangkan PCA 2 memiliki osilasi dominan 45 bulan. Osilasi 12 bulan dipengaruhi oleh variasi insolasi akibat orbital bumi, osilasi 6 bulan disebabkan oleh SAO (Semi Annual Oscillation), dan osilasi 45 bulan oleh fenomena ENSO (El-Nino Southern Oscillation). Distribusi vektor eigen PCA 1 menunjukkan bahwa fenomena osilasi 12 bulan dan 6 bulan berinteraksi dengan sel Hadley sehingga fluktuasi suhu tropopause lebih dominan di wilayah Pasifik Tropis bagian Timur namun adanya pengaruh ENSO yang berinteraksi dengan sirkulasi Walker mengakibatkan distribusi vektor eigen PCA lebih berfluktuasi di Pasifik Tropis bagian Barat. Suhu tropopause akan merespon insolasi setelah 1 bulan kemudian.
Keyword: Suhu tropopause, Analisis komponen utama, Spektral, Sirkulasi Walker, Sel Hadley

Judul: Identifikasi Pola-Pola Tekanan Permukaan Di Kawasan Pasifik Tropis.
Abstrak: Data ERA-Interim ECMWF (Europe Center for Medium Range Weather Forecasting) selama 30 tahun (Januari 1981 – Desember 2010) digunakan dalam mengidentifikasi pola-pola sebaran tekanan permukaan di kawasan Pasifik Tropis dengan menggunakan Analisis Komponen Utama (PCA) dan analisis spektrum. Analisis Komponen Utama mempresentasikan 94% dari total variabilitas data dengan 3 PCA. Hasil dari kedua analisis menyatakan bahwa osilasi dominan yang mempengaruhi sebaran tekanan permukaan ialah osilasi 12 bulan. Osilasi 12 bulan dipengaruhi oleh variasi insolasi akibat orbital bumi, osilasi 6 bulan dipengaruhi oleh SAO (Semi Annual Oscillation) sedangkan osilasi 45 bulan dipengaruhi oleh ENSO (El Niño Southern oscillation). Distribusi geopotensial PCA 1 menunjukkan osilasi 12 bulan berinteraksi dengan variasi insolasi bumi, sedangkan PCA 2 menunjukkan interaksi osilasi 12 bulan dengan sirkulasi Walker terkait fenomena ENSO yang mengakibatkan distribusi geopotensial PCA 2 lebih berfluktuasi di Pasifik Barat, dan PCA 3 hanya dipengaruhi oleh pemanasan permukaan.
Keyword: Tekanan permukaan, Analisis Komponen Utama, Spektral, Sirkulasi Walker, Sirkulasi Hadley.

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA