Judul: Analisis Keragaman Genetik Jati Asal Sulawesi Selatan Berdasarkan Marker SSR.
Abstrak: Hasil penelitian menunjukkan bahwa total alel yang terdeteksi pada lima lokus SSR ada 19 alel, jumlah alel tiap lokus minimum 2 alel dan maksimum 5 alel dengan rata-rata 3.8 per lokus. Nilai Polimorphic Information Content (PIC) tertinggi pada lokus ATC02 (0.70) dengan rata-rata 0.52. Rata-rata keragaman genetik tertinggi pada populasi pohon asal Massepe (0.663) untuk semua lokus, kemudian populasi pohon asal Ceddie dan populasi bibit asal Massepe. Nilai indeks fiksasi dalam populasi menunjukkan ekses heterosigositas kecuali pada populasi bibit asal Massepe terjadi defisit heterosigositas yang ditunjukkan dengan nilai Fis yang positif. Lokus AGT10 nyata menyimpang dari hukum Hardy-Weinberg untuk semua populasi yang dianalisis. Koefisien diferensiasi genetik relatif rendah (Gst = 0.022) atau sekitar 2.2 % variasi SSR diantara populasi. Analisis AMOV A menunjukkan komponen dan persentase ragam terbesar terdapat di dalam populasi baik populasi pohon maupun populasi bibit, dibanding antar populasi dalam grup dan antar grup itu sendiri. Persentase ragam untuk populasi pohon dan bibit adalah 93.75 % dan 92.74%. Analisis pengelompokan individu untuk semua populasi dengan metode UPGMA, menunjukkan lima kelompok utama pada koefisien jarak genetik 0.50. lndividu dari empat lokasi mengelompok secara acak dengan jarak genetik yang bervariasi. Penyebaran biji tanaman jati asal Sulawesi Selatan tidak cenderung selalu berdekatan dengan tetuanya.
Keyword: tanaman jati, keragaman genetik, isolasi DNA, Amplifikasi DNA, PCR

Judul: Analisis Keragaman Genetik Graptophyllum pyctum dari 10 Etnis di Indonesia Bagian Barat Berbasis Marka Molekular SRAP
Abstrak: dengan beragam nama lokal dan khasiat sesuai etnis penggunanya. Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui polimorfisme dan filogenetik G. pyctum antar etnis dan aksesi. Isolasi genom dilakukan dengan GeneJET Plant Genomic DNA Purification Mini Kit. Amplifikasi PCR menggunakan primer SRAP. Pengolahan data menggunakan NTSYS dan PopGene 1.3. Terdapat 8 kombinasi primer terpilih dengan persen polimorfik rerata 72,23% dan total 45 lokus. Etnis dengan persen polimorfik tertinggi adalah etnis Kutai (55,56%). Keragaman antar populasi dan aksesinya tergolong sedang (ID<0,69). Etnis Ribun adalah tetua dengan lokus ke-24 dan 41 sebagai lokus penanda. Etnis dengan kekerabatan G. pyvtum terdekat adalah Tasik-Pagatan (ID=0,0094), sedangkan yang terjauh adalah Ribun-Pagatan (ID=0,4359). Sebesar 81,29% keragaman dapat dijelaskan oleh 8 PC teratas yang mencakup 17 alel utama. Terdapat 4 klaster yang memisahkan 28 aksesi secara acak dan tidak mengikuti pola etnis maupun geografisnya.
Keyword: Aksesi, Etnis, G. pyctum, Polimorfisme, SRAP

Judul: Numerical modeling of the hydrodynamics of standing wave and scouring in front of impermeable breakwater with different steepnesses
Abstrak: The aim of this paper is to numerically study the effects of breakwater steepness on the hydrodynamics of standing wave and scouring process in front of impermeable breakwaters. A two-dimensional hydrodynamics model based on the Reynolds Averaged Navier–Stokes (RANS) equations and the Volume of Fluid (VOF) method was developed and then combined with an empirical sediment transport model. Comparisons with an analytical solution and experimental data showed the present model is very accurate in predicting the near bottom velocity and capable of simulating the scour/deposition patterns consistent with experimental data. It was found that the additional terms of bottom shear stress in the momentum equations are necessary to produce a physical scouring pattern. Different breakwater steepnesses produce different characteristics of standing wave, the steady streaming system, and scouring pattern in front of the breakwaters, which also affects the correlations between them. An additional analysis of the turbulence field parameters and the sediment transport rate was also performed. All these important information will be presented in details in this paper and can be worthwhile for designing the breakwater in coastal areas.
Keyword: The RANS–VOF model Standingwave Steadystreamingsystem Scouring pattern Breakwatersteepness