Judul: Isolasi Dan Karakterisasi Bakteri Endofit Potensial Lengkuas Merah (Alpinia Purpuruta) Dan Analisis Senyawa Antibakterinya
Abstrak: Lengkuas merah (Alpinia purpuruta) merupakan tanaman yang banyak digunakan sebagai obat tradisional dan mengandung senyawa antibakteri. Bakteri endofit adalah mikroorganisme yang bersimbiosis mutualisme dengan tanaman inangnya dan dapat menghasilkan senyawa aktif, salah satunya yaitu senyawa antibakteri. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi bakteri endofit lengkuas merah, menguji aktivitas antibakteri terhadap bakteri patogen, mengkarakterisasi isolat bakteri endofit potensial secara konvensional dan molekuler, mengekstrak senyawa antibakteri yang dihasilkan serta menganalisis senyawa antibakterinya menggunakan GC-MS. Tahap awal penelitian yaitu isolasi bakteri endofit dari lengkuas merah, menguji setiap isolat bakteri endofit terhadap bakteri patogen menggunakan inokulasi titik, isolat potensial dikarakterisasi dan diekstraksi senyawa aktif dengan cara fermentasi 36 jam dalam nutrient broth. Hasil ekstrak diuji aktivitasnya dengan metode difusi sumur dan diperoleh ekstrak etil asetat sebagai fraksi potensial yang selanjutnya dianalisis menggunakan GC-MS yang bertujuan untuk mengetahui komponen senyawa aktif yang memiliki aktivitas antibakteri. Hasil penelitian diperoleh sebanyak 16 isolat bakteri endofit, isolat potensial yang dapat menghambat bakteri patogen Gram positif (Staphylococcus aureus dan Streptococcus mutans) dan Gram negatif (Salmonella sp. dan Escherichia coli) yaitu isolat RL4, BL3 dan DL4. Berdasarkan karakterisasi morfologi, biokimia dan molekuler menggunakan analisis sekuen 16S rRNA diperoleh bahwa isolat RL4 memiliki kemiripan 99% dengan Burkholderia cenocepacia J231, isolat BL3 memiliki kemiripan 99% dengan Burkholderia gladioli BSR3 strain BSR3 sedangkan isolat DL4 memiliki kemiripan 99% dengan Bacillus amyloliquefaciens DSM7. Fraksi aktif hasil ekstraksi yaitu isolat RL4 ekstrak etil asetat. Hasil GC-MS menunjukkan senyawa dalam ekstrak etil asetat yaitu dokosan, eikosan, tetrakosan, heneikosan, heksadekanamida, pentakosan, oktadekan, asam heksanedioat dan pentadekan.
Keyword: bakteri endofit, GC-MS, lengkuas merah, 16S rRNA

Judul: Seleksi dan Karakterisasi Bakteri Endofit serta Senyawa Bioaktif yang dihasilkan sebagai Pengendali Pertumbuhan Fusarium proliferatum.
Abstrak: Bawang merah (Allium cepa L.) merupakan tanaman hortikultura yang memiliki nilai ekonomis tinggi. Faktor penurunan produksi bawang merah salah satunya penyakit layu yang disebabkan oleh serangan F. proliferatum. Serangan F. proliferatum menyebabkan bawang merah mengalami kematian hingga 62.2%. Fusarium proliferatum menyerang pada fase pertumbuhan tanaman yang ditandai warna akar menjadi coklat kekuningan, terbentuk nekrotik, lembab, mudah hancur dan membuat umbi busuk sehingga menyebabkan penurunan hasil panen. Upaya pengendalian F. proliferatum umumnya menggunakan pestisida sintetis, namun keberadaannya di lingkungan dapat merugikan, berbahaya bagi manusia akibat residu yang tertinggal pada tumbuhan dan resistensi patogen. Pengendalian secara hayati F. proliferatum yaitu menggunakan agens biologi misalnya bakteri endofit. Bakteri endofit diketahui memiliki kemampuan untuk menghasilkan senyawa bioaktif anticendawan yang efektif melawan patogen tanaman seperti bawang merah, jagung, padi, dsb. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan untuk menyeleksi dan melakukan karakterisasi bakteri endofit penghasil senyawa bioaktif yang dapat menghambat pertumbuhan F. proliferatum. Isolat bakteri endofit dan cendawan patogen F. proliferatum menggunakan isolat hasil penelitian sebelumnya dengan kode ABP5.2, BBP5.2, DBP4.1, dan DBP4.2. Metode yang digunakan mencakup 1) uji hambatan bakteri endofit terhadap F. proliferatum, 2) uji hipersensitivitas, patogenisitas, dan hemolisis, 3) identifikasi isolat terpilih berdasarkan gen 16S rRNA, 4) ekstraksi senyawa bioaktif dari bakteri endofit, 5) uji aktivitas anticendawan ekstrak kasar, 6) fraksinasi senyawa antimikrob dari bakteri endofit potensial, 7) uji bioautografi senyawa antimikrob, serta 8) identifikasi senyawa antimikrob dengan GC-MS. Isolat bakteri endofit asal tanaman bawang merah ABP5.2, BBP5.2, dan DBP4.1 memiliki aktivitas penghambatan terhadap F. proliferatum serta tidak bersifat patogen bagi manusia dan tanaman. Isolat ABP5.2 terindentifikasi memiliki kemiripan dengan Pseudomonas aeruginosa, sedangkan isolat BBP5.2 dan DBP4.1 memiliki kemiripan dengan Myroides profundi. Isolat BBP5.2 mampu menekan pertumbuhan cendawan patogen tertinggi yaitu sebesar 68.15% melalui mekanisme antibiosis secara langsung yaitu produksi senyawa anticendawan. Berdasarkan analisis Gas Chromathography Mass Spectrophotometry, senyawa yang dihasilkan ekstrak kasar dari isolat BBP5.2 antara lain Hexadecanoic acid, 9- octadecenoic acid, linoleic acid dan piperine.
Keyword: Allium cepa, antifungal compounds, Myroides profundi, 16S rRNA

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: