Judul: Penggunaan daya hantar listrik sebagai indikator media isoosmotik terhadap respon fisiologis, kinerja pertumbuhan, dan sintasan benih ikan bawal air tawar (Colossoma macropomum)
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi penggunaan parameter daya hantar listrik tubuh dan media dalam menentukan media mendekati isoosmotik bagi tubuh ikan bawal air tawar, serta melihat pengaruhnya terhadap respon fisiologis, kinerja pertumbuhan, dan sintasan. Penelitian ini terdiri atas dua tahap yaitu, penelitian pendahuluan untuk menentukan media yang mendekati isoosmotik berdasarkan daya hantar listrik media dan tubuh ikan serta penelitian utama berupa pemeliharaan ikan selama 10 hari pada perlakuan media salinitas yang berbeda (0 ppt, 3 ppt, dan 6 ppt). Masing-masing perlakuan dilakukan dua ulangan dengan diberi pakan diberikan berdasarkan FR 5% selama pemeliharaan. Berdasarkan penelitian pendahuluan diperoleh hubungan korelasi positif antara daya hantar listrik dengan salinitas, dengan persamaan Y = 0,6231+1,618 Χ, dimana Y merupakan daya hantar listrik dan X adalah salinitas. Pada berbagai jenis ukuran ikan bawal air tawar yang digunakan, yaitu 5-6 cm, 6-7 cm, dan 8-9 cm diperoleh daya hantar listrik tubuh ikan berturut-turut sebesar 6,14 mS/cm, 6,05 mS/cm, dan 5,54 mS/cm sehingga diperoleh media yang mendekati isoosmotik bagi tubuh ikan berdasarkan persamaan Y = 0,6231 + 1,618 X, adalah 3,41 ppt, 3,35 ppt, dan 3,04 ppt. Dengan demikian media yang mendekati isoosmotik adalah salinitas 3 ppt. Perlakuan 3 ppt menunjukkan gradien paling kecil terhadap tubuh ikan dan media serta kadar glukosa darah. Kadar eritrosit dan hemoglobin ikan pada semua perlakuan berada dibawah kisaran normal sedangkan kadar leukosit untuk semua perlakuan berada diatas kisaran normal. Berdasarkan hasil kinerja pertumbuhan, perlakuan 3 ppt menunjukkan pertambahan panjang, pertumbuhan bobot, dan laju pertumbuhan harian tertinggi serta tingkat kelangsungan hidup. Jumlah konsumsi pakan tertinggi diperoleh pada perlakuan 0 ppt. Kondisi kualitas air selama pemeliharaan masih berada pada kisaran yang dapat ditolerir oleh ikan.
Keyword: Conductivity, Salinity, Blood glucose level, Growth, Survival rate

Judul: Penggunaan Daya Hantar Listrik (DHL) Sebagai Indikator Isoosmotik untuk Kinerja Pertumbuhan Benih Ikan Patin (Pangasius sp)
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi penggunaan daya hantar listrik media dan tubuh ikan dalam penentuan media isoosmotik serta melihat pengaruhnya terhadap tubuh. Penelitian dilakukan di laboratorium lingkungan, Institut Pertanian Bogor. Penelitian ini dibagi menjadi dua tahap, yaitu penelitian pertama untuk menentukan media isoosmotik berdasarkan daya hantar listrik media dan tubuh ikan (benih ikan patin). Pada tahap pertama didapat korelasi positif diantara daya hantar listrik dengan salinitas, ditunjukkan melalui persamaan Y=0,6231 +1,618X, dimana Y untuk daya hantar listrik dan X untuk salinitas, Kemudian nilai daya hantar listrik tubuh ialah 8,78 ms/cm, 8,77 ms/cm, 8,54 ms/cm dan 7,55 ms/cm untuk ukuran ikan 6 cm, 8 cm, 10 cm and 12 cm, sehingga didapat media yang mendekati isoosmotik bagi benih ikan patin berkisar 4,28 ppt hingga 5,04 ppt. Pada penelitian kedua dilakukan pemeliharaan benih ikan patin berukuran 8 cm selama 10 hari pada salinitas 0 ppt, 4 ppt dan 6 ppt, dengan dua ulangan serta diberi pakan berdasarkan Feeding Rate (FR) sebesar 4%. Pada tahap kedua diperoleh perlakuan 4 ppt dan 6 ppt yang menunjukkan gradien daya hantar listrik terendah, sedangkan nilai glukosa darah cenderung meningkat untuk semua perlakuan hingga akhir pemeliharaan. Berdasarkan hasil pengamatan terhadap kinerja pertumbuhan, ikan yang dipelihara pada media 6 ppt memiliki pertumbuhan panjang, pertumbuhan harian dan laju pertumbuhan harian tertinggi dengan sintasan 97,5%. Pada respons fisiologis untuk setiap perlakuan jumlah eritrosit masih dalam kisaran normal sedangkan jumlah leukosit dan kadar hemoglobin berada diluar kisaran normal. Selama penelitian, kualitas air masih berada pada kisaran yang dapat ditoleransi untuk pemeliharaan benih ikan patin.
Keyword: Conductivity, Salinity, Glucose level, Growth, Survival rate

Judul: Penyusunan Overlap Graph menggunakan Suffix Tree pada DNA Sequence
Abstrak: The DNA sequence assembly is very important in genome analysis. This step aims to reconstruct contigous DNA fragment (contigs) from short fragment by concatenating fragments based on the overlap region among them. This method employs overlap graph for solving the problems. In this graph, nodes represent fragments and edges represent overlap. This research developed a software for constructing overlap graph using suffix tree. The evaluation was conducted by measuring the number of nodes, number of edges, and the execution time in many values of minimum overlap. The minimum overlap is defined as the minimum length of substring which is considered as the overlap region between two fragments. The evaluation results showed that the number of nodes, the number of edges, and the execution time were increased with the decreasing of the minimum overlap value.
Keyword: