Judul: Study of Proteomic Profiles, Distribution of  Glycoproteins, and Antibacterial Activities of Sunda Porcupine’s (Hystrix  javanica) Skin and Quill Extract
Abstrak: Beberapa jenis makhluk hidup, khususnya pada hewan, memiliki struktur kulit yang khas dengan keunikannya masing-masing. Salah satu hewan yang diketahui memiliki keunikan pada struktur dan fungsi kulitnya adalah landak jawa. Landak jawa diketahui memiliki kemampuan penyembuhan luka yang baik dalam waktu yang relatif singkat. Kemampuan tersebut diduga berkaitan dengan komponen bahan aktif yang terkandung dalam kulit maupun duri landak jawa. Komponen bahan aktif yang diketahui berkaitan dengan penyembuhan luka pada kulit adalah protein dan glikoprotein. Protein berfungsi untuk membangun, memperkuat, dan memperbaiki atau mengganti jaringan tubuh yang rusak. Glikoprotein juga diketahui berperan dalam proses penyembuhan luka. Glikoprotein juga sering digunakan sebagai bahan aktif untuk memperbaiki jaringan kulit yang rusak. Glikoprotein berperan dalam migrasi sel dan pembentukan jaringan epidermis. Data tentang profil protein dan distribusi glikoprotein pada kulit landak jawa dan derivatnya sampai saat ini masih sangat terbatas. Data tentang profil protein dan distribusi glikoprotein pada kulit landak jawa dan derivatnya sangat penting untuk diketahui untuk mengindentifikasi jenis protein yang berperan dalam penyembuhan luka. Hal lain yang menjadi keunikan landak jawa adalah durinya. Duri landak jawa biasanya digunakan oleh sebagian masyarakat di Indonesia sebagai bahan obat tradisional. Duri landak jawa diduga memliki aktivitas antibakteri. Aktivitas antibakteri duri landak jawa perlu dibuktikan untuk mendukung penggunaan duri landak jawa sebagai bahan obat tradisional. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi profil protein pada kulit dan duri landak jawa, mengidentifikasi distribusi glikoprotein dalam jaringan kulit landak jawa, dan membuktikan serta menganalisis aktivitas antibakteri pada duri landak jawa. Kajian ini diharapkan dapat memberikan bukti ilmiah untuk mendukung penggunaan kulit dan duri landak jawa sebagai salah satu alternatif pengobatan di masa depan. Sampel yang digunakan dalam penelitian ini adalah landak jawa (Hystrix javanica). Sampel yang digunakan dalam penelitian ini adalah duri dari 15 ekor landak hidup dan kulit dari 4 ekor landak beku. Pengambilan sampel duri dilakukan dengan cara mengumpulkan duri yang rontok secara alami dari tubuh landak (tanpa pencabutan). Duri dikumpulkan sebanyak 300 gram, yang dibagi menjadi 3 ulangan masing-masing 100 gram tiap 5 hewan. Duri yang dipilih adalah tipe duri sejati yang berukuran besar ataupun kecil. Sampel kulit diperoleh dari sampel landak beku dengan ukuran 2x2 cm. Studi profil protein dilakukan dengan metode analisis proteomik menggunakan Liquid Chromatography Mass Spectrometry/Mass Spectrometry (LCMS/MS) tipe LC Vanquish Tandem Q Exactive Plus Mass Spectrometer. Analisis gene ontology dilakukan menggunakan aplikasi online UniProt, dan analisis jalur fisiologis masing-masing protein dilakukan menggunakan aplikasi online STRING. Distribusi glikoprotein dianalisis dengan pengataman histologi menggunakan pewarnaan perodic acid-Schiff dan analisis intensitas glikoprotein dilakukan menggunakan mikroskop cahaya dan aplikasi ImageJ. Pengujian aktivitas antibakteri dilakukan dengan desain rancangan acak lengkap (RAL) menggunakan metode difusi sumuran (agar well diffusion method) dan dianalisis menggunakan perangkat SPSS dengan uji one-way ANOVA dan dilanjutkan uji Duncan dengan taraf uji yaitu 95% (α≤0,05). Hasil analisis protein pada kulit landak jawa dengan menggunakan sistem dokumentasi gel ditemukan pita protein dengan berat molekul berkisar antara 25 kDa – 84 kDa. Hasil pengamatan visual peneliti pada protein kulit ditemukan sekitar 6 pita protein, dengan rincian 4 pita tipis dan 2 pita tebal. 2 pita tebal yang ditemukan memiliki berat molekul protein masing-masing adalah 65 kDa dan
Keyword: antibakteri, glikoprotein, landak jawa, penyembuhan luka, proteomik

Judul: Karakteristik morfologi kulit Landak Jawa (Hystrix javanica): Tinjauan Khusus pada Jaringan Ikat dan Kelenjar Sebasea
Abstrak: Landak jawa (Hystrix javanica) merupakan salah satu hewan endemis Indonesia. Kulit landak jawa memperlihatkan tampilan yang berbeda dengan mamalia pada umumnya, yaitu kulit yang dominan ditutupi oleh duri, dibandingkan rambut yang ditemukan pada sebagian besar mamalia. Observasi yang telah dilakukan sebelumnya memperlihatkan proses persembuhan luka pada kulit landak jawa terjadi dalam waktu yang cukup cepat tanpa adanya bekasi luka. Beberapa komponen yang terlibat dalam proses persembuhan luka adalah jaringan ikat dan sistem imun pada kulit. Jaringan ikat berperan besar terhadap modulasi interaksi antara sel dengan sel serta sel dan matriks dalam menutup luka. Kelenjar sebasea merupakan derivat kulit yang selalu berasosiasi dengan rambut dan memiliki sekreta yang berperan dalam membentuk penghalang fisik dan kimiawi pada permukaan kulit. Sekreta ini membantu dalam mengurangi infeksi selama proses persembuhan luka. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui struktur umum, distribusi jaringan ikat, serta struktur kelenjar sebasea pada kulit landak. Penelitian ini menggunakan tiga ekor landak dewasa. Pengamatan dilakukan pada 6 regio di bagian dorsal pada tubuh landak, yaitu thorakodorsal, thorakolumbar, lumbar dorsal, lumbosacral, radix caudal dan apex caudal. Pengamtan dilakukan pada tingkat makroskopik dan mikroskopik. Pengamatan mikroskopik dilakukan dengan metode pewarnaan Hematoksilin Eosin (HE), Masson Trichrome modifikasi Goldner, Verhoeff’s van Gieson (VVG), alcian blue (AB) pH 2,5, dan periodic acid Schiff (PAS). Metode pewarnaan yang dilakukan merupakan metode pewarnaan untuk mengamati komponen serabut dan non serabut, termasuk komponen karbohidrat pada jaringan ikat dan kelenjar sebasea. Secara umum kulit landak berwarna putih pucat hingga abu-abu kusam, longgar, bergelombang, dan berketombe, kecuali di regio apex caudal (ujung ekor) yang memiliki warna cokelat gelap dan kulit yang kencang. Kulit landak bergelombang karena adanya bagian folikel duri yang timbul ke permukaan kulit yang membentuk kluster duri. Rambut berwarna putih ditemukan tumbuh di sekitar orificium folikel duri. Potongan melintang kulit landak jawa menunjukkan kulit tersusun atas epidermis, dermis, hipodermis dan musculus subcutaneous dengan folikel duri merupakan struktur yang dominan dan utama di dalam kulit. Folikel duri memanjang secara diagonal dari epidermis hingga hipodermis dan m. subcutaneous. Ketebalan kulit bervariasi pada tubuh landak dengan bagian yang paling tebal adalah regio lumbar dorsal dan yang paling tipis adalah regio apex caudal. Jaringan ikat terdistribusi pada membran basalis, dermis, folikel duri, dan hipodermis. Secara umum serabut kolagen merupakan serabut utama dalam kulit landak sedangkan serabut elastin tidak terdeteksi pada semua regio yang diamati. Komponen non serabut dengan kandungan karbohidrat asam ditemukan dengan intesitas yang bervariasi pada hampir semua bagian kulit sedangkan komponen non serabut dengan kandungan karbohidrat netral terdeteksi sangat lemah pada penelitian ini. Folikel duri merupakan struktur yang paling besar dan kompleks pada kulit landak jawa dengan komponen-komponen yang berasosiasi dengannya, seperti susunan jaringan ikat yang padat, sejumlah besar jaringan adiposa, m. arrectores pillorum yang berkembang, dan kelenjar sebasea yang berukuran besar. Selain itu jaringan ikat pada kulit selalu berasosiasi dengan jaringan lemak yang ditemukan melimpah pada folikel duri dan hipodermis. Kelenjar sebasea ditemukan di dekat folikel rambut dan folikel duri. Kelenjar sebasea pada folikel duri berukuran sangat besar dibandingkan dengan folikel rambut. Kelenjar sebasea terdiri atas banyak lobus yang dipisahkan oleh jaringan ikat serta mengeluarkan sekretanya melalui duktus menuju lumen folikel duri. Lobulus
Keyword: Acid carbohydrate, Collagen, Quill follicle, Wild Mammals, Morfologi Kulit, Derivat Kulit, Duri Landak, Hair Follicle, Skin

Judul: Thermal Characteristics and Dynamics of Tropical Cyclone over Western North Pacific Ocean: A Case Study of Typhoon Songda (Chedeng) 2011
Abstrak: The frequent occasion of Tropical Cyclone (TC) over Western North Pacific (WNP) Ocean lies from 10˚N to 26˚N and 121˚E to 170˚E. Sources of TC development come from warm ocean temperature where latent heat is released during condensation processes and subsequently concentrated in the boundary layer. Relative humidity at 850-700 hPa is responsible to produce the most intense storm. Meanwhile, weak vertical wind shear between 850-200 hPa is one of the dynamical factors that lead to the development of TC. Pressure level of 850-200 hPa is chosen to minimize the thermodynamic effect in the lower troposphere. Typhoon Songda (Chedeng in the Philippines) or TSC lasted from May 18th to 30th, 2011 and strengthened into powerful Super Typhoon stage between May 24th and 27th. Long curving track and the exhibition of all sequences of TC life cycle, TSC is then considered as an ideal case of TC. The objective of the study with case of TSC is to investigate the role of thermal characteristics and dynamics on TC intensity. The research is carried out by using Advanced Research of Weather Research and Forecasting model (WRF ARW model) version 3.3. Two domains are employed in the model. The first domain situate from 02˚N to 40˚N and 118˚E to 149˚E and cover spatial resolution () of 33.1 km. The second domain situate from 09˚N to 27˚N and 119˚E to 132˚E with of 11 km. Timestep of the model () is 120 seconds. The model is supported by the following physical parameterization, i.e., Yonsei University Scheme (YSU) in the boundary layer, Kain-Fritsch scheme (KF) in the cumulus, and WRF Single-Moment 3-class scheme in the microphysics. Initial meteorological condition prior to the formation of the cyclone is generated using WRF ARW standard-release model. Sensitivity of the model output is obtained from a selected single-parameter change scenarios, namely, 10 % to 20 % decrease and increase of wind shear initial data at 850-200 hPa, and by 10 % to 20 % decrease of relative humidity initial data at 850-700 hPa. The result showed that the negative correlations between wind shear and intensity are found in wind shear scenarios. Wind shears of 10 ms-1 which lead to strengthening of the wind intensity in the early period of Typhoon development are found in wind shear scenarios. The effect of wind shear changes on wind intensity is statistically significant in the 20 % wind shear scenarios. During mature stage, weak wind intensity occurred when wind shear increase as given in the WRF standard-release and the 20 % decreasing scenario. Different situation is found in the 20 % increasing scenario where wind shear tend to weak and lead to strong wind intensity at this stage. Meanwhile, the reduction of moisture supply at 850-700 hPa resulting from 20 % decreasing relative humidity play a major role in the weakening of wind intensity and reduces mechanical energy of the cycle process as much as 300 J kg-1.
Keyword: