Judul: Phylogenetic relationships and genetic population structure of giant clams (Tridacna crocea and tridacna maxima) in Indonesia
Abstrak: There is an increasing concern that heavy-exploitation of marine populations ature populations of giant clam at high risk, leading to long-term consequences to· conservation and fisheries management. Information concerning taxonomy, s tematic, genetic population structure and connectivity of populations are vital for s tial arrangement of marine protected areas (MPAs) and fisheries management fa tne species. However, there is an uncertainty about the relationships between s c·es of Tridacnidae, in particular between species that belong to Chametrachea s· . genus; T. crocea, T maxima and T squamosa, resulted from several studies u.. g different genetic marker and not much is known about connectivity of marine p pulations in the Indonesian Archipelago. This study was carried out in order to el cilfate about the relationships among giant clam species, population structure of crocea and T. maxima, distribution pattern, and connectivity of those giant clam populations across the Indonesian Archipelago. Here we use fragment of 454 bp of the itocnondrial DNA cytochrome c oxidase I gene from T crocea, T maxima, T squamosa, T gigas and several sequences from GenBank as the out groups. The analysis of population structure of T crocea is based on 456 bp fragment of the cytoc::hrome oxidase I gene from 300 individuals collected from 15 localities across the Inda-Malay Archipelago, whereas for T maxima based on 484 bp fragment of the c::ytochrome c oxidase I gene from 211 individuals collected from 14 localities across the Indonesian Archipelago and the Red Sea. The result showed that giant clams formed a monophyletic group. Within Tridacna group, T crocea was closely related to T squamosa than to T maxima and formed monophyletic group. T crocea and T squamosa were sister taxa and sister group to T maxima and T. gigas. T. crocea shows a very strong genetic population structure and isolation by distance, indicating restricted gene flow among almost all sample sites. The observed Cl>₅rvalue of 0.28 is very high compared to other studies on giant clams. According to the pronounced genetic differences, the sample sites can be divided into five groups from West to East: (1) Padang, (2) Java Sea, (3) Makassar Strait (inclwding northern Borneo), (4) eastern coast of Sulawesi (including Sembilan, Komodo, and Kupang), and (5) Biak. This complex genetic population structure and pattern of connectivity can be attributed to the geological history and prevailing current regimes in the Inda-Malay Archipelago. T maxima showed a very strong genetic population structure but limited isolation by distance, indicating restricted gene flow is only among a few sample sites. The observed Cl>₅rvalue of 0.74 is very high compared to other studies on giant clams, even higher than such value in T crocea (0.28) According to the pronounced genetic differences, the sample sites can be divided into four groups from West to East: (1) the Red Sea, (2) Padang (Indian Ocean) and Java Sea, (3) Sulawesi (including Sangalaki, Komodo, and Kupang), and (4) Biak (Western Pacific).
Keyword: Phylogeny, Giant clam, Genetic structure, Population

Judul: Keragaman Genetik Dan Hubungan Kekerabatan Famili Tridacnidae Di Perairan Maluku Utara
Abstrak: Kima dari Genus Tridacna merupakan jenis kima yang berukuran besar, jenis ini selalu hidup menetap (tidak berpindah tempat) pada substrat dan ditemukan pada perairan dangkal sampai pada kedalaman 20 meter terutama pada ekosistem terumbu karang dengan kondisi air yang jernih. Di Indonesia terdapat 7 spesies yang terdiri dari Genus Tridacna dan Hippopus, yaitu Tridacna crocea, Tridacna squamoza, Tridacna maxima, Tridacna derasa, Tridacna gigas, Hippopus hippopus, dan Hippopus porcelanus. Biota ini merupakan salah satu biota laut yang mempunyai nilai ekonomis tinggi sehingga ancaman terhadap perubahan sangat tinggi. Tridacna banyak diburu masyarakat untuk dijual. Cangkangnya dipergunakan sebagai pembutan bahan bagunan dan dagingnya sebagai makanan bergizi. Tingginya permintaan Tridacna ini mengakibatkan terjadinya eksploitasi yang berlebihan dari populasi Tridacna di alam, sehingga populasi tersebut menurun sangat drastis di seluruh Indonesia terutama diakibatkan oleh pengambilan ilegal, penyakit dan parasit, predator, faktor lingkungan dan faktor antropogenik. Upaya pengelolaan dan pemanfaatan dapat dilakukan untuk menjaga sumberdaya genetik, jenis dan ekosistem kima tersebut. Sumber daya genetik merupakan tahapan dasar dalam upaya konservasi kima, melalui teknik DNA barcoding. Metode ini dapat memudahkan dalam tingkat identifikasi bahkan pada tingkat spesies. Analisis keragaman genetik dan Hubungan kekerabatan dengan teknik DNA barcoding yang bertujuan untuk mengetahui informasi urutan basa nukleotida pada molekul. Pengambilan sampel kima dilakukan secara purposive sampling dengan menggunakan metode Transek Garis atau LIT (line Intercept Transect). Penelitian ini menggunakan 3 spesies kima dari genus Tridacna yang terdiri dari Tridacna crocea, Tridacna squamoza, dan Tridacna maxima. Sebanyak 117 sampel, dari perairan Jailolo, Bacan, Morotai, Obi, Weda, dan Buli. Sampel dipreservasi kemudian dilanjutkan dengan ekstrasi, PCR (Polymerase Chain Reaction) dan elektroforesis di Laboratorium Biodiversitas dan Biosistematika Kelautan, Departemen Ilmu dan Teknologi Kelautan IPB. kemudian dilanjutkan dengan tahapan sekuensing, panjang sekuen semua sampel adalah sebesar 456bp. Hasil penelitian ditemukan nilai kepadatan yang paling tertinggi adalah spesies Tridacna crocea adalah (28 ind/m2), Tridacna squamoza (10 ind/m2), Tridacna maxima (8,8 ind/m2) dan nilai kepadatan paling rendah yaitu spesies Tridacna maxima. Ukuran kima yang ditemukan bervariasi di loaksi penelitian dengan jenis yang banyak ditemukan berukuran kecil dan ukuran besar suda sangat langka. Pola pertumbuhan Tridacna crocea, Tridacna squamoza, dan Tridacna maxima adalah allometrik negatif. Nilai keragaman haplotipe dari semua populasi T. crocea, T. squamoza dan T. maxima secara berturut-turut adalah 0.944-1.000, 0.777-1.000. selain itu populasi menunjukan keragaman haplotipe yang tinggi. Struktur genetik ditemukan dalam semua populasi T. crocea, T. squamoza, dan T. maxima dengan nilai Fst masing-masing 3.60-96.40, 0.12-99.88 dan 6.54-93.46. Struktur populasi dan pohon filogenetik menunjukan kedekatan genetik antara populasi T. crocea, T. squamoza, dan T. maxima. Nilai jarak genetik antar populasi T.crocea sebesar 0.010-0.011, T. squamoza sebesar 0.007,0.002,0.017,0.016,0.006, dan T. maxima 0.007, 0.002, 0.017, 0.016, 0.066. kemiripan genetik terjadi karena kondisi dan arah aliran arus sebagai media trasportasi gen antara populasi.
Keyword: allometrik negatif, filogenetik, Tridacna Sp

Judul: Mempelajari Keseimbangan Energi dan Kecepatan Aliran Udara Berdasarkan Letak Kipas pada Model Alat Pengering
Abstrak: A1at pengering efek rumah kaca merupakan alat pengering buatan yang memanfaatkan tenaga surya terkontrol dimana memungkinkan untuk mengatur kondisi operasi alat, sehingga hasilnya memenuhi standar mutu pengeringan. Mengingat beragamnya (posisi) bahan yang dikeringkan, distribusi udara dalam ruang pengering perlu diperhatikan.
Keyword: