Judul: Kajian Infeksi Virus Newcastle Disease pada Itik dan Ayam di Beberapa Lokasi di Kabupaten Subang
Abstrak: Newcastle Disease (ND) merupakan penyakit endemik di Indonesia termasuk di Kabupaten Subang. Meskipun saat ini tingginya tingkat kematian yang disebabkan oleh ND dapat dikendalikan dengan vaksinasi, namun ND masih menyebabkan gangguan pada produksi. Selama ini penyidikan tentang ND di Kabupaten Subang masih jarang dan terbatas dilakukan. Diagnosa umumnya ditentukan hanya berdasarkan gejala klinis, perubahan patologi anatomi (PA) dan serologik. Tujuan dari penelitian ini untuk mengetahui keberadaan dan keragaman antigenik virus Newcastle Disease (VND) di Kabupaten Subang, sehingga dapat diambil tindakan pengendalian dan pencegahan ND yang efektif. Sampel usapan kloaka, orofaring dan serum diambil dari 149 ekor itik dan 393 ekor ayam dari penampungan, peternakan dan pasar unggas di 10 kecamatan di Kabupaten Subang. Screening VND pada sampel pool dari 5–7 individu dilakukan dengan Real Time Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (rRT-PCR) matrix (M). Sampel individu yang dipilih berdasarkan jenis usapan, unggas, lokasi dan waktu pengambilan sampel diinokulasi pada telur ayam berembrio SPF melalui 2 kali pasase, sedangkan deteksi antibodi spesifik terhadap ND pada serum diuji dengan hambatan hemaglutinasi (HI). Karakterisasi isolat dilakukan dengan uji hambatan hemaglutinasi (HI) menggunakan antisera LaSota dan Komarov, rRT-PCR fusion (F), dan uji waktu elusi. Hasilnya menunjukkan 19 dari 67 pool kloaka (28.3%) dan 8 dari 67 pool orofaring (11.9%) ayam terdeteksi VND; 18 pool dari 67 pool ayam (26.9%) menunjukkan virus diekskresikan melalui kloaka dan orofaring. Sementara pada sampel itik, VND terdeteksi hanya pada kloaka yaitu 8 dari 30 pool (26.7%). Selain itu rute ekskresi virus ditunjukkan dari hasil inokulasi virus pada telur. Isolasi VND dari sampel individu asal pool positif diperoleh 18 isolat. Karakterisasi keragaman epitop permukaan VND menggunakan antisera LaSota (lentogenik) hasilnya diperoleh rataan (mean) titer HI berkisar 6–8 Log2 dan dengan antisera Komarov (mesogenik) berkisar 9–13 Log2. Afinitas isolat dengan antisera LaSota menunjukkan karakter antigenik yang relatif homogen, hanya beberapa isolat yang menunjukkan variasi yang mencapai 2 Log2, begitu juga dengan antisera Komarov, hanya beberapa isolat yang menunjukkan variasi yang mencapai 4 Log2. Semua isolat VND menunjukkan afinitas yang lebih tinggi terhadap antisera Komarov dibandingkan dengan antisera LaSota yang mengindikasikan semua isolat cenderung masuk ke virus galur ganas. Deteksi patogenisitas dengan rRT-PCR F menunjukkan 100% isolat merupakan galur ganas (mesogenik/velogenik), sesuai dengan hasil uji elusi yang menunjukkan 3 isolat masuk ke galur mesogenik dan 15 isolat masuk ke galur velogenik. Deteksi antibodi spesifik terhadap ND pada 408 serum menunjukkan titer antibodi terdeteksi pada 48 (12%) unggas dengan kisaran titer 1–8 Log2, dimana diantaranya hanya 37 dari 212 (13%) serum ayam yang divaksinasi menunjukkan titer yang protektif. Analisa pada 6 flok ayam ras yang divaksinasi menunjukkan respon antibodi yang tidak merata. Newcastle disease masih endemik di wilayah Subang dan infeksinya bisa bersifat subklinis. Delapan belas isolat VND yang ditemukan mayoritas memiliki karakter yang relatif homogen, hanya beberapa isolat menunjukkan keragaman baik patogenisitas maupun antigenisitasnya. Itik dari Kecamatan Cipeundeuy belum pernah terpapar VND. Vaksinasi ND pada ayam broiler kurang optimal karena sebaran titer antibodi tidak merata. Kajian terhadap sampel yang lebih banyak dan cakupan area yang lebih luas diperlukan agar diperoleh informasi yang lebih menyeluruh. Hasil penelitian ini merupakan sumbangan informasi tentang ND di wilayah Subang
Keyword: Newcastle Disease, deteksi molekuler, deteksi virulensi, keragaman antigenik, antibodi

Judul: Isolasi dan Karakterisasi Biologik Virus Newcastle Disease (NDV)
Abstrak: Newcastle disease (ND) merupakan salah satu penyakit unggas yang sangat penting di industri peternakan. Distribusi ND sudah terjadi di seluruh dunia antara lain Asia, Afrika dan Amerika. Newcastle disease juga merupakan penyakit unggas yang sangat merugikan secara ekonomi karena infeksi yang diakibatkan dapat menyebabkan kematian mencapai 100%. Salah satu cara pengendalian ND adalah vaksinasi, yang telah diaplikasikan selama beberapa dekade pada industri peternakan di seluruh dunia. Di Indonesia, Newcastle disease merupakan penyakit unggas endemik. Upaya pengendaian terutama dilakukan dengan vaksinasi menggunakan berbagai ragam sediaan vaksin ND yang beredar di pasaran. Kasus ND masih dilaporkan terjadi di lapangan walaupun vaksinasi telah diterapkan secara ketat di peternakan ayam komersial. Kemungkinan terjadinya hal tersebut antara lain disebabkan oleh ketidaksesuaian vaksin yang diberikan dengan virus yang bersirkulasi di lapangan. Apalagi diketahui virus Newcastle disease (NDV) merupakan virus RNA yang sangat mudah bermutasi. Banyaknya kasus ND yang terjadi di lapangan tidak dibarengi dengan cukupnya informasi dan publikasi tentang NDV asal Indonesia. Secara umum penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan informasi tentang infeksi NDV pada ayam komersial maupun kampung melalui deteksi genom, isolasi dan identifikasi, serta karakterisasi biologik isolat lapang. Sejumlah 529 sampel usap kloaka dikoleksi dari pasar-pasar tradisional dan peternakan rakyat di daerah Bogor dan Tangerang. Keberadaan NDV ditentukan dengan mendeteksi gen matriks menggunakan teknik real-time reverse transcriptase-PCR (rRT-PCR); 20 sampel dideteksi positif gen matriks . Upaya isolasi virus dari 20 sampel positif PCR pada telur ayam berembrio (TAB) specific pathogen free (SPF) umur 9-11 hari berhasil menumbuhkan 11 isolat yang memperlihatkan aktifitas hemaglutinasi(haemagglutination, HA). Identifikasi menggunakan uji hambatan hemaglutinasi (haemagglutination inhibition, HI) dan rRT-PCR meneguhkan bahwa 11 isolat tersebut adalah NDV. Empat isolat representasi lokasi dipilih untuk karakterisasi patogenisitas dengan metode mean death time (MDT) pada TAB SPF, dan karakterisasi antigenisitas menggunakan metode haemagglutination inhibition (HI) dan virus netralisasi (VN) untuk melihat keragaman antar isolat virus. Uji MDT memperlihatkan dua isolat (APMV-1/Chicken/Tangerang/IISERnc/2012) dan APMV-1/Chicken/Tangerang/ XIIIBSDnc/2012) adalah mesogenik, satu isolat (APMV-1/Chicken/ Tangerang/VIIIBSDbr/2012) termasuk lentogenik, dan satu isolat (APMV-1/Chicken/Tangerang/ TWPRnc/2012) bersifat velogenik. Tiga dari empat isolat menunjukkan hubungan antigenik dengan strain Komarov dan G7 tetapi tidak dengan strain referensi LaSota, sementara isolat velogenik APMV-1/Chicken/Tangerang/ TWPRnc/2012 yang berasal dari ayam kampung menunjukkan reaksi silang tinggi dengan antiserum terhadap tiga strain referensi diatas. Sampel-sampel yang diambil di lapang, baik yang berasal dari pasar dan peternakan rakyat, baik dengan atau tanpa gejala sakit dapat diisolasi virus Newcastle disease dengan karakteristik yang beragam. Perlu dilakukan penelitian lebih lanjut untuk melihat keragamanan genetik dan pathotyping isolat yang diperoleh sehingga dapat memberikan informasi yang lebih mendalam dan bermakna tentang penyakit
Keyword: Newcastle disease, Newcastle disease in Indonesia, mean death time (MDT), real time reverse transcriptation (rRT-PCR)

Judul: Metode Kaczmarz untuk menyelesaikan sistem persamaan linear
Abstrak: A system of linear equations is often involved in science and engineering problems. There are many methods available for solving system of linear equations, both analytically and numerically. Kaczmarz method is one of iterative methods for solving such system. Orthogonal projections are used in this method. The sequence of approximate solutions generated by algorithm for this method is convergent for an arbitrary initial solution. A proof of the convergence is given. If the system of linear equations is consistent, then the sequence of approximate solutions converges to the exact solution. This shows that Kaczmarz method is a good method. Implementation of this method is done using MATLAB R2008b. Some systems of linear equations are generated, and then solved numerically using the program. The results show that the more iteration used in the solution approximation, the smaller norm of residual obtained.
Keyword: