Judul: Phenotype and Genotype Analysis of Extended Spectrum Beta Lactamase Producing Escherichia coli from Chicken Slaughtering Effluent in Bogor City
Abstrak: Escherichia coli merupakan bakteri Gram negatif yang terdapat di saluran pencernaan hewan dan manusia (komensal). Escherichia coli mudah resistan terhadap antibiotik karena memiliki kemampuan menghasilkam enzim resistansi antibiotik, salah satunya yaitu extended spectrum beta lactamase (ESBL). Escherichia coli resistan antibiotik dapat menyebar melalui lingkungan, salah satunya melalui cemaran efluen proses pemotonga ayam dari rumah potong hewan unggas (RPH-U) dan tempat pemotongan ayam (TPA). Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi dan menganalisis sifat resistansi antibiotik E. coli penghasil ESBL secara fenotipe dan genotipe yang diisolasi dari sampel limbah cair (efluen) RPH-U dan TPA di Kota Bogor. Desain penelitian ini adalah eksploratif, dengan metode pengambilan sampel secara purposif. Sebanyak 12 sampel efluen digunakan dalam penelitian ini, dengan rincian masing-masing 4 sampel dari 3 RPH-U/TPA yang memiliki kapasitas pemotongan lebih dari 1.000 ekor/hari. Analisis laboratorium terdiri dari analisis fenotipe dan genotipe. Metode yang digunakan untuk analisis fenotipe adalah metode ESBL Ec Tricycle yang terdiri dari metode pengujian presumtif atau praduga dan konfirmasi E. coli penghasil ESBL. Metode pengujian presumtif atau praduga dilakukan dengan kultur sampel pada agar tryptone bile x-glucuronide (TBX) dan MacConkey agar (MCA) yang ditambahkan antibiotik cefotaxim 4µg/ml untuk praduga E. coli penghasil ESBL. Hasil positif pada pengujian sebelumnya dikonfirmasi dengan uji biokimia indol pada agar sulfite indole motility (SIM) dan double disk diffusion test pada Mueller Hinton agar (MHA) untuk mengidentifikasi E. coli penghasil ESBL. Analisis genotipe dilakukan dengan pengujian molekuler menggunakan alat Oxford Nanopore Technologies (ONT) MinION dan analisis bioinformatika menggunakan NanoARG. Analisis genotipe dilakukan untuk mendapatkan sifat resistansi berupa data genotipe dari E. coli penghasil ESBL yang terkonfirmasi pada analisis fenotipe. Escherichia coli penghasil ESBL teridentifikasi dari semua sampel yang berasal dari ketiga RPH-U/TPA di Kota Bogor. Persentase E. coli penghasil ESBL terendah 10,45% dan tertinggi 39,52% dengan rata-rata 17,76%. Gen resistan antibiotika blaCTX-M ditemukan pada semua sampel (100%) diikuti gen blaTEM sebesar 58,3%, yang menunjukkan adanya resistansi terhadap antibiotik cephalosporin generasi ke-3 terutama cefotaksim pada semua sampel. E. coli penghasil ESBL yang menyebar melalui cemaran efluen dapat menjadi ancaman kesehatan terutama terhadap masyarakat yang berada di sepanjang aliran sungai dan menggunakan air sungai sebagai sumber kehidupan sehari-hari. Penerapan higiene dan sanitasi perlu dilakukan perbaikan di RPH-U dan TPA. Sarana dan prasarana IPAL sangat penting dalam mencegah penyebaran bakteri E. coli penghasil ESBL ke lingkungan, sehingga perlu adanya penambahan sarana IPAL di TPA dan perbaikan IPAL di RPH-U. Instansi terkait khususnya dinas yang membidangi kesehatan dan otoritas veteriner di Kota Bogor perlu melakukan kontrol dan pengawasan antibiotik cephalosporin generasi ke-3. Penelitian lebih lanjut tentang kejadian resistansi antibiotik dapat dikembangkan dengan konsep one health pada ternak dan masyarakat di sepanjang aliran sungai di Kota Bogor dan wilayah lain di Indonesia.
Keyword: Antibiotic resistance, Bogor, efluent , extended spectrum beta lactamase, Escherichia coli, Antibiotic resistance, Bogor, efluent, extended spectrum beta lactamase, Escherichia coli

Judul: Keberadaan Escherichia coli Penghasil Extended Spectrum β-Lactamase (ESBL) di Lingkungan Sentra Pemotongan Ayam Pondok Rumput Kota Bogor.
Abstrak: Rumah potong hewan unggas (RPHU) memiliki peran penting dalam penyebaran bakteri E. coli penghasil ESBL ke dalam rantai pasokan daging bagi konsumen. Tujuan penelitian ini adalah untuk mendeteksi E. coli penghasil ESBL di lingkungan rumah pemotongan unggas di Bogor. Isolat E. coli penghasil ESBL (n=20) dikumpulkan dari 84 sampel lingkungan. Isolat yang diperoleh diidentifikasi menggunakan kit API 20E™. Sampel berasal dari tujuh titik pengambilan sampel yang berbeda dengan jangka waktu seminggu. ESBL dalam penelitian ini dikonfirmasi menggunakan kit MAST® D68C. Sebanyak 20 isolat E. coli penghasil ESBL diuji terhadap 18 agen antimikroba dengan metode disc diffussion dan interpretasi resistensi dilakukan sesuai pedoman Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI 2014). Isolat E. coli penghasil ESBL menunjukkan resistensi terhadap 18 agen antimikroba dan 100% isolat menunjukkan resistensi terhadap lebih dari 9 antibiotik (multiple-drug resistance). Isolat yang resisten pada antibiotik penisilin (100%), amoksisilin (100%), ampisilin (100%), sefotaksim (100%), sefpodosim (100%), seftazidim (100%), streptomisin (95%), gentamisin (85%), trimetoprim-sulfametoksazol (85%), tetrasiklin (70%), kanamisin (65%), siprofloksasin (60%), norfloksasin (55%), doksisiklin (45%), kolistin sulfat (45%), sefalotin (30%), neomisin (15%), dan polimiksin B (15%). Bakteri E. coli penghasil ESBL yang berasal dari lingkungan RPHU (n=20) ditemukan pada wadah karkas (20%), wadah jeroan (10%), lantai area penanganan karkas dan jeroan (25%), pisau (15%), air di bak penampungan (5%) dan mesin pencabut bulu (25%). Dengan ditemukannya bakteri resisten di lingkungan RPHU dapat menyebabkan terjadinya transmisi gen resistensi ke bakteri lain yang bisa menyebar ke karkas sehingga akan menimbulkan resistensi antibiotik yang berpotensi bahaya bagi manusia.
Keyword: Resistensi antimikroba, lingkungan, E. coli penghasil ESB

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: