Judul: Seleksi Bakteri Kitinolitik Asal Tanah Jambi Sebagai Biokontrol Colletotrichum Capsici.
Abstrak: Colletotrichum capsici merupakan salah satu cendawan patogen penyebab antraknosa pada cabai. Infeksi antraknosa dapat menyebabkan kerugian hasil panen sekitar 50-100%. Salah satu alternatif yang dapat digunakan untuk menghambat pertumbuhan C. capsici ialah dengan menggunakan bakteri kitinolitik. Kitin yang terdapat pada dinding sel cendawan dapat dihidrolisis oleh enzim kitinase yang berasal dari bakteri kitinolitik. Kitinase menghidrolisa polimer kitin pada cendawan menjadi monomer N-asetilglukosamin. Tujuan penelitian ini adalah menseleksi bakteri kitinolitik asal tanah Jambi berdasarkan indeks kitinolitik dan kemampuannya menghambat pertumbuhan C. capsici. Sebagai tambahan dilakukan identifikasi secara molekuler dari isolat kitinolitik terpilih dan karakterisasi kitinase ekstraseluler. Enzim kitinase dari bakteri terpilih selanjutnya digunakan untuk menghambat pertumbuhan C. capsici. Berdasarkan hasil penyeleksian diperoleh dua isolat terbaik berdasarkan kemampuannya mendegradasi kitin dan penghambatannya terhadap C. capsici. Isolat KAHN 15.12 teridentifikasi sebagai Serratia marcescens dan SAHA 12.12 sebagai Bacillus thuringiensis berdasarkan gen 16S rRNA. Aktivitas spesifik kitinase tertinggi isolat KAHN 15.12 sebesar 52.03 U/mg pada jam ke-36 inkubasi dan SAHA 12.12 sebesar 45.67 U/mg pada jam ke-24 inkubasi. Pemekatan kedua isolat dilakukan dengan menggunakan amonium sulfat (b/v). Aktivitas kitinase hasil pengendapan memiliki aktivitas yang lebih tinggi dari kitinase ekstrak kasar. Hasil pemekatan menunjukkan bahwa kitinase KAHN 15.12 mengendap pada konsentrasi 40% dengan kemurnian enzimnya meningkat sebesar 1.92 kali dibandingkan aktivitas enzim kasarnya dengan perolehan sebesar 1.47 %. Isolat SAHA 12.12 mengendap pada konsentrasi 60% dan kemurnian enzim sebesar 3.14 kali dengan perolehan sebesar 1.47 %. Kitinase KAHN 15.12 hasil pengendapan memiliki aktivitas optimum pada pH 7 dan pada suhu 60 oC. Kitinase SAHA 12.12 hasil pengendapan memiliki aktivitas optimum pada pH 8 dan pada suhu 40 oC. Kitinase ini stabil pada suhu optimum selama 180 menit. Hasil pemisahan protein dengan SDSPAGE menunjukkan bahwa bobot molekul dari hasil pengendapan SAHA 12.12 ialah 109.13, 75.99, 61.79, 52.91, dan 43.03 kDa. Analisis zimogram menunjukkan satu protein yang memiliki aktivitas kitinase dengan bobot molekul sebesar 52.91 kDa. Enzim hasil pengendapan SAHA 12.12 memiliki 2 pita dengan bobot molekul 80.02 dan 68.51 kDa. Kedua bobot molekul tersebut memiliki aktivitas kitinase. Hasil uji penghambatan secara in vitro terhadap C. capsici menunjukkan bahwa enzim ekstrak kasar dan hasil pengendapan kedua isolat memiliki efektivitas penghambatan terhadap C. capsici. Hasil tersebut mengindikasikan bahwa kitinase isolat tersebut dapat digunakan sebagai agens biokontrol untuk pengendalian antraknosa pada cabai.
Keyword: Bakteri kitinolitik, Biokontrol, Colletotrichum capsici, Kitinase

Judul: Isolasi, Karakterisasi, dan Identifikasi Bakteri Kitinolitik sebagai Agens Biokontrol Cendawan Colletotrichum capsici dan Fusarium oxysporum
Abstrak: Colletotrichum capsici dan Fusarium oxysporum merupakan cendawan patogen yang menyebabkan penyakit pada tanaman cabai (Capsicum annum L) serta dapat menurunkan produktivitas cabai. Cendawan C.capsici menyerang tanaman cabai dari anakan hingga masa penyimpanan buah cabai, sedangkan F. oxysporum menyebakan penyakit layu fusarium. Penggunakan fungisida memerlukan harga yang tinggi dan memberikan dampak terhadap lingkungan. Serangan cendawan dapat dikendalikan dengan memanfaatkan bakteri penghasil kitinase yang merupakan enzim yang mampu merusak dinding sel cendawan yang tersusun dari senyawa kitin. Tujuan penelitian ini adalah untuk memperoleh bakteri penghasil kitinase sebagai pengendali hayati C.capsici dan F.oxysporum. Metode yang digunakan dalam penelitian ini antara lain: isolasi bakteri kitinase, karakterisasi bakteri kitinase, pengukuran aktivitas enzim, antagonis bakteri dengan cendawan patogen, pengamatan kerusakan hifa cendawan, dan identifikasi 16S rRNA. Isolat BAE36 dan BAD211 adalah bakteri penghasil kitinase yang diperoleh dari rizosfer tanaman cabai di Sagarahiyang, Kabupaten Kuningan, Provinsi Jawa Barat. Kedua isolat termasuk Gram-negatif. Persentase daya hambat BAE36 adalah 66.1% pada C. capsici dan 55% di F. oxysporum. Pengamatan hifa pada uji antagonis menggunakan mikroskop terlihat hifa C. capsici menebal dan permukaan hifa bergelombang sedangkan hifa F. oxysporum tipis dan kosong. Identifikasi dengan 16S rRNA menunjukkan bahwa isolat BAE36 dan BAD211 memiliki kesamaan 99% dengan Lysobacter enzymogenes. Pengendapan enzim L. enzymogenes BAE36 dengan kadar amonium sulfat 30% dapat meningkatkan aktivitas enzim dan lebih mampu menghambat pertumbuhan miselia cendawan C. capsici dan F. oxysporum.
Keyword: cabai merah, gram negatif, kitinolitik, Lysobacter

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: