Judul: Analisis Keragaman Genetik Kemangi (Ocimum × Africanum Lour.) Berdasarkan Marka Morfologi Dan Inter-Simple Sequence Repeats.
Abstrak: Ocimum × africanum Lour. dikenal sebagai kemangi, merupakan salah satu tanaman indigenous Indonesia yang dimanfaatkan sebagai bumbu masakan dan sayuran. Hingga saat ini spesies tersebut belum dikomersialkan karena masih jauh dari nilai ekonomi yang tinggi, dan budi dayanya masih berada dalam skala rumah tangga. Penelitian untuk mendapatkan informasi keragaman genetik spesies ini dilakukan untuk menghasilkan sejumlah ciri terpilih yang dapat digunakan untuk perbaikan potensi. Keragaman genetik O. × africanum Lour. telah dideskripsi dengan melakukan karakterisasi morfologi dan molekuler. Sampel tanaman yang digunakan berasal dari beberapa lokasi di Indonesia meliputi 33 aksesi O. × africanum Lour. dan 3 aksesi O. basilicum L. sebagai tanaman pembanding. Setiap aksesi dikarakterisasi menggunakan marka morfologi dengan panduan deskriptor UPOV (International Union For the Protection of New Varietas of Plant) dan marka ISSR (Inter-Simple Sequence Repeats) dengan 13 primer. Keserupaan fenetik dianalisis dengan SIMQUAL (Similarity of Qualitative Data) melalui koefisien SM (Simple Matching) menggunakan metode UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmatic Average) pada program NTSYS (Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System) versi 2.11a, analisis komponen utama menggunakan MINITAB release 16, dan struktur genetik di analisis menggunakan GenAlex (Genetic Analysis in Exel). Ocimum × africanum Lour. dan O. basilicum L. bervariasi pada beberapa ciri yaitu tinggi tanaman, pigmen antosianin pada cabang lateral muda dan perbungaan, panjang tangkai daun, ukuran daun, warna daun, bentuk daun, gelombang pada tepi daun, panjang perbungaan, dan waktu berbunga. Dendrogram hasil analisis gugus pada koefisien keserupaan antara 0.39-0.97 secara tegas berhasil memisahkan aksesi O. × africanum Lour. dari spesies pembanding. Pada koefisien keserupaan 0.52 seluruh aksesi membentuk 3 kelompok besar yang terdiri dari 4 sub kelompok. Dua kelompok di antaranya merupakan kelompok dari aksesi O. × africanum Lour. yang dibentuk oleh ciri pigmen antosianin pada cabang lateral muda dan ciri gelombang pada tepi daun. Analisis marka ISSR dengan menggunakan 13 primer berhasil mengamplifikasi 111 pita DNA, dan 108 pita DNA di antaranya bersifat polimorfik. Analisis keserupaan berdasarkan ciri molekuler menghasilkan koefisien keserupaan berkisar antara 0.66-0.97 tetapi tidak memisahkan O. × africanum Lour. dari O. basilicum L. secara tegas. Primer PKBT 10 mampu menghasilkan sebanyak 11 pita polimorfik, sedangkan primer yang menghasilkan pola pita polimorfik paling sedikit adalah primer PKBT 4 dan PKBT 9, masing-masing membentuk 6 pita. Banyaknya jumlah pita DNA hasil amplifikasi tidak berkorelasi dengan tingginya nilai polimorfisme. Marka morfologi dan ISSR tidak mampu menjelaskan pengelompokan aksesi berdasarkan daerah asal sampel. Pengelompokan tersebut dipengaruhi oleh keragaman ciri aksesi di dalam spesies dan didukung oleh hasil analisis komponen utama. Berdasarkan analisis struktur genetik, populasi O. × africanum Lour. menunjukkan bahwa populasi dengan keragaman genetik tertinggi (PLP = 53.91, I= 0.29) adalah populasi Tempuran.
Keyword: Fenetik, Keserupaan, Molekuler, Struktur genetik, Variabilitas

Judul: Kemiripan Dan Potensi Produksi Aksesi Kemangi (Ocimum Sp.) Dari Beberapa Tempat Di Jawa Barat
Abstrak: Sayuran indigenous dapat dijadikan sebagai sayuran alternatif pengganti sayuran komersial. Pemanfaatan sayuran indigenous dapat dilakukan melalui eksplorasi. Sayuran indigenous yang potensial untuk dikembangkan salah satunya adalah kemangi. Kemangi dapat dikonsumsi dalam bentuk segar dan sebagai obat-obatan. Penelitian ini merupakan langkah awal untuk mengembangkan salah satu sayuran indigenous ini menjadi varietas komersial. Tujuan penelitian untuk mengidentifikasi aksesi kemangi (Ocimum sp.) dari beberapa tempat di Jawa Barat dan mendapatkan informasi potensi produksi beberapa aksesi kemangi. Penelitian ini terdiri dari dua percobaan. Percobaan pertama adalah eksplorasi dan kemiripan antar aksesi kemangi (Ocimum sp.) dari beberapa tempat di Jawa Barat. Pengamatan dilakukan berdasarkan deskriptor tanaman kemangi, dan untuk mengetahui kemiripan antar aksesi kemangi dilakukan analisis gerombol. Percobaan kedua adalah evaluasi produksi berbagai aksesi kemangi (Ocimum sp.) dari beberapa tempat di Jawa Barat. Percobaan ini menggunakan Rancangan Kelompok Lengkap Teracak (RKLT) faktor tunggal, yaitu 10 aksesi sebagai perlakuan. Hasil analisis gerombol aksesi dikelompokkan menjadi 4 gerombol. Gerombol I berjumlah 31 aksesi dan terdiri dari empat spesies kemangi yaitu Ocimum tenuiflorum L. (KM 2, KM 3, KM 5, KM 6, KM 7, KM 9, KM 10, KM 11, KM 13, KM 15, KM 16, 17, KM 18, KM 19, KM 20, KM 22, KM 25, KM 26, KM 32, KM 33 dan KM 34), Ocimum basilicum L. (KM 4), Ocimum gratissimum subsp. gratissimum (KM 8, KM 12, KM 14) dan Ocimum americanum L. (KM 24, KM 27, KM 28, KM 29, KM 30 dan KM 31). Gerombol II berjumlah satu aksesi yaitu KM 21 (Ocimum gratissimum subsp. gratissimum), gerombol III berjumlah satu aksesi yaitu KM 1 (Ocimum tenuiflorum L.), dan gerombol IV juga memiliki satu aksesi yaitu KM 23 (Ocimum basilicum L.). Ciri utama gerombol I adalah tidak terdapat warna antosianin batang, terdapat bulu batang, jumlah tunas yang berbunga pada batang lebih dari tiga, dan tidak terdapat warna antosianin pada bagian atas helai daun. Ciri utama gerombol II adalah kerapatan tanaman padat dan terdapat warna antosianin batang. Ciri utama gerombol III adalah kerapatan tanaman padat dan jumlah tunas yang berbunga pada batang berjumlah satu. Ciri utama gerombol IV adalah terdapat warna antosianin pada batang, tidak terdapat bulu pada batang, dan terdapat warna antosianin pada bagian atas helai daun. Secara umum 10 aksesi yang digunakan memiliki potensi untuk dikembangkan menjadi varietas. Aksesi KM 21 dan KM 22 memiliki 7 keunggulan dari 8 karakter yang diamati. Aksesi KM 2 dan KM 10 memiliki 6 keunggulan dari 8 karakter yang diamati. Aksesi KM 1, KM 4, KM 11, KM 25 dan KM 29 memiliki 5 keunggulan dari 8 karakter yang diamati, dan aksesi KM 23 memiliki 4 keunggulan dari 8 karakter yang diamati. Potensi panen kemangi berkisar mulai 4.61 ton ha-1 sampai dengan 9.63 ton ha-1.
Keyword: Analisis gerombol, Ocimum sp, sayuran indigenous

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: