Judul: Visualisasi Stuktur Tersier Protein Berbasis Web menggunakan Ribbon Drawing
Abstrak: Visualisasi struktur protein sangat penting dalam analisis fungsi dan aktivitas protein. Protein terdiri atas ratusan bahkan hingga ribuan asam amino. Protein direpresentasikan dalam bentuk tiga dimensi yang sulit untuk dimengerti. Dengan menggunakan ribbon model drawing dapat memperjelas bagian dari struktur protein, contohnya pita spiral untuk α-helix dan pita panah untuk β-sheet. Visualisasi dilakukan berbasis web dengan menggunakan Protein Data Bank (PDB) dengan koordinat atom-atom protein. Atom-atom protein tersebut diseleksi dengan memilih atom alpha carbon sebagai backbone dari struktur protein. Hasil seleksi dari atom tersebut menghasilkan bentuk struktur protein. Interpolasi menggunakan Catmull-Rom dilakukan agar membentuk stuktur protein yang lebih halus. Pengujian dilakukan dengan cara melakukan perbandingan jumlah α-helix dan β-sheet yang terdapat pada data PDB dengan hasil visualisasi. Hasil dari perbandingan menunjukkan kesamaan pada jumlah α-helix dan β-sheet pada data PDB maupun hasil visualisasi. Dengan menggunakan Ribbon drawing mampu menunjukkan perbedaan bagian pada struktur tersier protein seperti helix, sheet, dan coil.
Keyword: Catmull-Rom spline, PDB, struktur protein, ribbon model

Judul: Pemodelan Decision Tree untuk Prediksi Struktur Sekunder Protein
Abstrak: Prediksi struktur sekunder protein adalah salah satu masalah yang sudah lama dibahas dalam bidang bioinformatika. Berbagai metode telah diterapkan namun masalah akurasi belum mencapai hasil yang maksimal. Penelitian ini dilakukan untuk membangun suatu model prediksi struktur sekunder protein dengan menggunakan decision tree dengan algoritme C4.5. Penentuan setiap kelas dalam proses klasifikasi struktur sekunder protein dalam penelitian ini berdasarkan pembelajaran terhadap pola masukan dalam proses pelatihan. Data diperoleh dari Protein Data Bank (PDB) yang di-assign dengan format DSSP. Pola masukan dibentuk dengan memanfaatkan sliding window dari sekuen asam amino dengan ekstraksi fitur kimiafisik dan posisi atom. Model prediksi pengujian cross validation tanpa fitur posisi atom menghasilkan nilai akurasi 90.49%, sedangkan untuk pengujian dengan unknown data akurasinya menurun menjadi 51.29%. Kemudian dengan fitur posisi atom menghasilkan akurasi 90.17% untuk metode cross validation dan 50.83% menggunakan unknown data. Hasil penelitian tersebut memperlihatkan akurasi akan optimal jika menggunakan known data dengan cross validation. Fitur posisi atom tidak dibutuhkan dalam memprediksi struktur sekunder protein.
Keyword: Amino acid, Atom position, Decision tree, Physicochemical, Elektro fitur kimiafisik, Decision tree, Algoritme, Fitur posisi alam

Judul: Pengelolaan Tenaga Kerja Pemangkasan Tanaman Menghasilkan Kopi Robusta (Coflea canephora Pierre ex. Froechner) Di PT. Perkebunan Nusantara IX (Persero), Kebun Jollong, Pati, Jawa Tengah.
Abstrak: Tanaman kopi berperan sebagai salah satu komoditi ekspor dan komoditi sosial di Indonesia (Wachj ar, 1984). Dalam pertumbuhan clan ~erkernbangannya, tanarnan kopi sangat dipengaruhi An dibatasi oleh faktor iklim, kondisi tanah, bahan tanarnan, dan teknik budidaya. Oleh karena itu, untuk rnenghasilkan buah yang optimal dilakukan modifikasi teknik budidaya (Syamsulbahri, 1996).
Keyword: