Judul: Perambatan Cahaya, Koefisien Atenuasi, dan Hubungannya dengan Remote Sensing Reflectance pada Tipe Perairan yang Berbeda
Abstrak: Intensitas cahaya yang merambat di kolom perairan melemah mengikuti kurva eksponensial dengan meningkatnya kedalaman akibat adanya proses atenuasi. Koefisien atenuasi (Kd) merupakan salah satu parameter yang mampu memberikan informasi mengenai ketersediaan cahaya di kolom perairan. Penelitian ini bertujuan mengetahui perambatan cahaya dan Kd di kolom air laut pada tipe perairan yang berbeda serta hubungannya dengan Remote Sensing Reflectance (Rrs). Data penelitian yang digunakan berupa data in situ Downwelling irradiance (Ed) dan kedalaman yang diambil menggunakan Instrument Submersible Marine Environmental Radiometer MER di bagian Timur Laut Teluk Mexico pada April 2000 dan data Rrs satelit SeaWiFS. Metode analisis data untuk perambatan cahaya menggunakan Exponential Curve Fitting, kemudian data hasil dari Exponential Curve Fitting digunakan untuk perhitungan nilai Kd. Nilai Kd 490 dari data in situ dikaitkan dengan nilai Kd 490 dari satelit SeaWiFS menggunakan regresi linear. Perhitungan nilai Kd 490 dilakukan berdasarkan beberapa metode empiris menggunakan data Rrs dan/atau nilai water leaving radiance (Lw) dari satelit SeaWiFS. Hasil penelitian menunjukkan pola perambatan cahaya secara umum berkurang seiring dengan bertambahnya kedalaman. Pengurangan intensitas cahaya terhadap kedalaman sangat tajam pada gelombang merah diikuti dengan gelombang hijau dan paling lambat pada gelombang biru-ungu. Sebaliknya, nilai Kd umumnya paling rendah pada panjang gelombang ungu-biru, semakin meningkat pada panjang gelombang hijau, dan paling tinggi pada panjang gelombang merah. Hubungan nilai Kd 490 in situ dengan satelit menghasilkan nilai R 2 tertinggisebesar 0,71 menggunakan algoritma Tiwari dan Shanmungam 2018.
Keyword: Donwelling irradiance (Ed), Remote Sensing Reflectance (Rrs), Coefficient diffuse Attenuation (Kd), One optical depth

Judul: Pengukuran In-Situ Koefisien Atenuasi Difus dan Hubungannya dengan Pendugaan Kedalaman Perairan Laut Dangkal dengan Penginderaan Jauh Optik.
Abstrak: Pemanfaatan penginderaan jauh untuk estimasi kedalaman kolom air dipengaruhi oleh properti optik, salah satunya adalah proses atenuasi. Atenuasi adalah proses dimana intensitas cahaya secara eksponensial berkurang seiring bertambahnya kedalaman kolom air. Model estimasi kedalaman kolom air dengan menggunakan nilai atenuasi memiliki hubungan secara empiris. Atenuasi memiliki potensi untuk mengetahui kedalaman perairan berdasarkan penetrasi cahaya yang menembus kolom perairan. Penelitian ini bertujuan untuk 1) mengetahui sebaran nilai koefisien atenuasi difus (Kd) dari hasil pengukuran downwelling irradiance (Ed), variabilitas dan faktor kandungan tersuspensi di dalam kolom air yang mempengaruhinya; 2) menganalisis hubungan koefisien atenuasi difus dengan Apparent Optical Properties (AOP) yaitu Remote Sensing Reflectances (Rrs); 3) menganalisis nilai Kd hasil pengukuran lapangan untuk model estimasi kedalaman dibandingkan dengan model estimasi kedalaman citra Landsat 8. Penelitian dilakukan di perairan laut dangkal, disekitar lagun Pulau Air, Pulau Panggang dan Pulau Karang Lebar yang diketahui memiliki karakter optik dan lagun yang unik. Pengukuran nilai Kd(λ) dilakukan dengan menggunakan sensor spektroradiometer TriOS-RAMSES dengan rentang panjang gelombang 320 – 950 nm. Hasil pengukuran nilai Kd(λ) di lapangan dominan dipengaruhi oleh absorbsi di panjang gelombang biru dan hijau oleh klorofil-a, dibuktikan dengan ratio Kd(443) dan Kd(555), serta dibuktikan dengan model estimasi Kd(490) secara empiris. Hasilnya di ketiga area, secara umum memiliki pola yang sama, dimana pada perairan di dalam lagun memiliki nilai Kd(λ) yang tinggi dibandingkan dengan nilai Kd(λ) di bagian tepi dan luar lagun Pulau memiliki nilai Kd(λ) yang rendah. Rata-rata pengukuran nilai Kd(λ) dari ketiga area berbeda secara signifikan dimana rata-rata tertinggi adalah di area lagun Pulau Air (0,367 m-1), diikuti lagun Karang Lebar (0,289 m-1) dan yang terendah di lagun Pulau Panggang (0,17 m-1). Model estimasi kedalaman berdasarkan citra satelit Landsat 8 terbaik adalah menggunakan rasio kanal pada panjang gelombang coastal/aerosol dan hijau. Model estimasi kedalaman berdasarkan rasio nilai Kd(λ) pada kanal 442,96 nm (Coastal/Aerosol) dan 654,59 nm (Merah), lebih baik dibandingkan dengan estimasi dengan Landsat 8, akan tetapi model tersebut tidak konsisten apabila substrat dasar memiliki nilai pantulan yang tinggi. Pola interpolasi estimasi kedalaman berdasarkan rasio kanal pada Landsat 8 dan nilai Kd, secara visual memiliki pola yang hampir mirip. Hasil estimasi kedalaman dengan nilai Kd(λ) dan hasil pengukuran lapangan tidak berbeda nyata secara statistik dengan F = 0,563 < F critical = 4,042.
Keyword: estimasi kedalaman, koefisien atenuasi difus, penginderaan jauh, perairan laut dangkal, properti optik, spektroradiometer

Judul: Study of Tupaia javanica Hepatocytes Culture as In Vitro Replication Media of Nonhuman Primate HBV
Abstrak: Virus hepatitis B (VHB) adalah virus DNA yang menginfeksi organ hati sebagai target utama. Infeksi ini menyebabkan hepatitis yang dapat bersifat kronis dan berlanjut menjadi sirosis, kanker hati bahkan kematian. Pengembangan model in vivo dan in vitro berkaitan dengan hepatitis B menjadi perhatian khusus bagi para peneliti. Kultur hepatosit banyak digunakan untuk mempelajari berbagai ha] terkait hepatitis B baik dari aspek virus, penyakit, pencegahan, dan pengobatan. Pengembangan hepatosit asal hewan kecil sepe1ii Tupaia sp. untuk model in vitro merupakan salah satu altematif dalam penyediaan kultur hepatosit. Tujuan penelitian ini adalah mengembangkan kultur primer dan lestari hepatosit T. javanica yang mampu mendukung replikasi VHB orangutan (OuHBV) dan VHB owa jawa (GiHBV), dan dapat menjawab kebutuhan akan model in vitro kultur hepatosit. Isolasi hepatosit T. javanica dilakukan dengan prosedur sebagai berikut: organ hati yang telah dicacah dalam cawan petri dengan larutan perfusi, diinkubasi pada 37 °C. Suspensi disentrifugasi 300-500 g sehingga didapatkan pelet sel hati. Pelet yang sudah dicuci kemudian diresuspensi dengan Hepatocyte Basal Media untuk menumbuhkan hepatosit dan selanjutnya hepatosit akan ditransformasi menggunakan perangkat Lenti-SV 40. Sodium taurocholate cotransporting polypeptide (NTCP) yang diindikasikan sebagai reseptor hepatosit untuk melekatnya VHB, nampak pada hepatosit baik pada kultur primer maupun kultur yang ditransformasi. Reseptor hepatosit spesifik ini terlihat sebagai pendaran hijau dengan uji imunofluoresensi. Kultur hepatosit primer T. javanica berhasil dikembangkan selama 14 hari untuk mencapai kepadatan 80%, dan inokulasi GiHBV dan OuHBV ke dalam kultur pada hari ke-15 menunjukkan adanya replikasi virus hingga hari ke-8 (berdasarkan hasil PCR). Kuantifikasi virus dengan real-time PCR memperlihatkan replikasi tertinggi pada hari kedua setelah inokulasi. Penjajaran sebagian protein permukaan setelah virus dinokulasikan memperlihatkan kesamaan asam amino dengan virus wild type sebesar 99.29% dan 95.71 % pada GiHBV dan OuHBV., Hepatitis B virus (HBV) is a DNA virus which infects liver as primary target organ. This i11fection causes hepatitis which could become chronic and progress to cirrhosis, liver cancer and even death. Development of in vitro and in vivo model related to hepatitis B is a concern for researchers. Hepatocyte cultures widely used to study a variety of aspects of hepatitis B such as the virus, disease, prevention and treatment. Development qf hepatocyte from small animal e.g. Tupaia sp. for the in vitro model is an alternative of hepatocyte cultures. The purpose of the study is to develop primary and immortal T. javanica hepatocytes cultures capable to replicate orangutan HBV (OuHBV) and javan gibbon HBV (GiHBV), and to answer the need for in vitro model ofhepatocytes. Isolation of hepatocytes from T. javanica was done as followed: mincedliver were transported into petri dish containing perfusion buffer solution to be incubated at 37 °C. The suspension was centrifuged at 300-500 g to obtain liver cell pellets. The washed-pellet was resuspended in Hepatocyte Basal Media to let specific hepatocytes grow and later be transformed by Lenti-SV40 kit. Sodium taurocholate cotransporting polypeptide (NTCP) has been ident(fied as hepatocyte receptor for HBV attachment, and was seen on hepatocytes from both primary and transformed cultures. This hepatocytes specific receptor was shown as green luminenscent by immunofluorescence assay. Primary T. javanica hepatocytes cultures was successfully maintained for
Keyword: Tupaia javanica, in vitro model, hepatocytes culture, hepatitis B virus, Liver cancer, Picornaviridae, Hepadanaviridae, Flaviviridae, Caliciviridae