Judul: Identitas Durian Tengkurak dari Kalimantan Barat.
Abstrak: Suatu eksplorasi terhadap durian endemik (Durio testudinarum Becc.) yang sudah langka statusnya dilakukan di Kalimantan Barat pada bulan April 2013 hingga Agustus 2014. Kegiatan ini menemukan durian baru yang mirip dengan D. testudinarum, masyarakat lokal menyebutnya durian tengkurak. Tujuan dari penelitian ini adalah mengkaji identitas, persebaran dan keanekaragaman durian tengkurak di Kalimantan Barat. Eksplorasi dilakukan di 10 Kabupaten yaitu Mempawah, Landak, Bengkayang, Sanggau, Sekadau, Sintang, Kapuas Hulu, Melawi, Kayong Utara, dan Ketapang, di Kalimantan Barat. Pengamatan morfologi dan anatomi dilakukan di Laboratorium Sistematika Tumbuhan IPB Bogor dan pengamatan spesimen pembanding di Herbarium Bogoriense LIPI Cibinong. Pengambilan sampel tumbuhan durian tengkurak di lapangan menggunakan metode eksplorasi. Semua individu yang berasal dari satu lokasi dianggap sebagai satu populasi. Setiap individu tumbuhan dikoleksi bagian ranting, daun, bunga, dan buah. Sampel dibuat spesimen herbarium sebanyak dua duplikat. Pengamatan morfologi meliputi 32 karakter mengikuti deskriptor durian. Pengamatan anatomi daun dilakukan terhadap tipe, bentuk dan susunan trikoma daun dari permukaan bawah dengan membuat irisan paradermal dengan metode sediaan utuh dan irisan melintang dengan metode parafin. Persamaan fenetik dianalisis dengan koefisien Simple Maching (SM) dan metode UPGMA. Kegiatan ini menemukan jenis durian yang oleh masyarakat lokal disebut durian tengkurak di dua Kabupaten yaitu Sekadau dan Kapuas Hulu. Di Kabupaten Sekadau ditemukan di empat lokasi yaitu Hutan Rawak, Bukit Rejunak, Hutan Tembaga, dan Bukit Merindang, sedangkan di Kabupaten Kapuas Hulu ditemukan di satu lokasi yaitu Bukit Sagu. Total semua individu pohon yang ditemukan dan diamati adalah 35 individu. Durian tengkurak bervariasi pada karakter morfologi daun, bunga, dan buah. Tujuh variasi karakter baru ditemukan yaitu variasi pertulangan daun lateral bagian bawah, jumlah kelopak dan mahkota bunga, kedudukan putik terhadap benang sari, munculnya bunga dan buah di dahan pohon, variasi area tanpa duri pada ujung buah dan warna kulit buah. Di permukaan bawah daun durian tengkurak ditemukan lima tipe trikoma dengan susunan saling berhimpitan. Susunan trikoma mulai dari lapisan terluar hingga terdalam secara berurutan adalah complex peltate scale, simple peltate scale, four-armed stellate, flat stellate hair, dan one celled stalk with a hemispherical glandular head. Berdasarkan analisis gugus, durian tengkurak dari Kalimantan Barat terpisah dari kelompok durian yang berbuah di batang dengan koefisien keserupaan sebesar 50%. Durian tengkurak berbeda dengan jenis lainnya pada beberapa karakter yaitu posisi perbungaan di pangkal batang dekat permukaan tanah hingga di cabang pohon, bentuk ujung kuncup bunga bundar, warna daun kelopak hijau hingga hijau kekuningan, warna daun mahkota putih, warna kulit buah coklat hingga hijau kekuningan, bentuk duri buah mengerucut dan piramid, warna aril buah putih susu, dan buah ini tidak dikonsumsi. Durian tengkurak pada koefisien keserupaan sebesar 65% membentuk tiga kelompok yang dipisahkan berdasarkan lima karakter yaitu bentuk daun mahkota, ujung mahkota, area tanpa duri pada ujung buah, warna kulit buah dan bentuk duri. Durian tengkurak dari Kalimantan Barat memiliki kemiripan dengan D. testudinarum, tetapi memiliki buah yang lebih kecil (diameter 5-8 cm), kulit buah coklat, aril putih susu dan sangat tipis (<1 mm) dan buah ini tidak dikonsumsi. Kami menyimpulkan bahwa durian tengkurak adalah jenis baru dan varietas baru dengan nama Durio tanjungpurensis Navia, sp. nov. dan Durio tanjungpurensis var. tembaganensis Navia, var. nov.
Keyword: Durian kura, Durian tengkurak, Durio tanjungpurensis, Durio tanjungpurensis var tembaganensis, new species

Judul: Genetic Diversity Analysis of Durian Kura-kura (Durio testudinarius Becc.) Based on Morphology, DNA Barcoding and Simple Sequence Repeat Markers
Abstrak: Durian Kura-kura (Durio testudinarius Becc.) merupakan spesies endemik Kalimantan dari famili Malvaceae yang memiliki karakter yang unik dan berbeda dari kerabat durian pada umumnya, yaitu buah muncul pada pangkal batang utama. Karakter ini merupakan sumber genetik yang berpotensi untuk dimanfaatkan dalam perakitan varietas unggul melalui program pemuliaan tanaman. Sedikitnya informasi dan kajian tentang keragaman genetik jenis ini berdampak pada kegiatan konservasi dan pemanfaatan plasma nutfah melalui program pemuliaan tanaman tidak berjalan dengan optimal. Tujuan umum penelitian ini adalah untuk mengkarakterisasi dan menganalisis keragaman genetik Durian Kura-kura berdasarkan pendekatan morfologi dan molekuler menggunakan DNA barcoding dan marka simple sequence repeat (SSR). Penelitian ini terdiri atas tiga topik dan empat percobaan. Topik pertama (percobaan pertama) yaitu menganalisis keragaman genetik D. testudinarius menggunakan pendekatan karakter morfologi. Percobaan ini menggunakan 50 aksesi dari lima populasi di Kalimantan Barat yaitu Sambas, Landak, Sanggau, Sekadau dan Ketapang. Sebanyak 15 parameter morfologi vegetatif digunakan dalam parameter pada percobaan ini. Dari total parameter uji, sebanyak sembilan parameter menunjukkan keragaman di antara aksesi uji. Karakter tersebut yaitu panjang dan lebar helai daun, rasio panjang-lebar helai daun, permukaan batang, bentuk helaian daun, bentuk ujung dan pangkal daun, tepi helaian daun dan kekilauan permukaan bawah daun. Berdasarkan analisis klaster dengan metode Ward, aksesi-aksesi uji memperlihatkan mengumpul berdasarkan populasi asal masing-masing dan mengelompok menjadi dua grup utama, yaitu grup yang terdiri dari populasi Sekadau, Landak dan Sanggau, dan grup yang terdiri dari populasi Sambas dan Ketapang. Pengelompokkan ini mengindikasikan adanya kemiripan di antara populasi uji. Topik kedua (percobaan kedua) yaitu menganalisis keragaman genetik D. testudinarius menggunakan DNA barcoding. Sebanyak satu sampel dari masing-masing populasi dilakukan pengurutan DNA berdasarkan marka DNA barcoding dari tiga gen kloroplas yaitu rbcL, matK dan trnL-trnF intergenic spacer serta satu wilayah inti internal transcribed spacer (ITS). Hasil analisis variasi nukleotida menunjukkan adanya variasi yang rendah dari lima aksesi uji pada tiga gen kloroplas, namun menunjukkan variasi yang tinggi pada wilayah inti ITS. Hal ini membuktikan bahwa genom kloroplas memiliki laju evolusi yang rendah dibandingkan dengan genom inti. Laju evolusi genom kloroplas dan inti berbeda secara signifikan karena beberapa faktor dalam dan luar, termasuk cara pewarisan, laju mutasi, dan tekanan evolusi yang dihadapi. Analisis filogenetik menunjukkan pengelompokkan kelima aksesi di satu grup yang sama baik berdasarkan gen kloroplas maupun wilayah inti ITS. Secara umum kelima aksesi memperlihatkan hubungan kekerabatan yang dekat dengan D. beccarianus, terlihat dari jarak genetik antar keduanya pada pohon filogenetik. Topik ketiga (percobaan tiga dan empat) yaitu mengembangkan marka SSR spesifik dan menggunakannya dalam analisis keragaman genetik populasi D. testudinarius. Percobaan ketiga menggunakan data pengurutan genom utuh (whole genome sequencing/WGS) dari genom D. testudinarius hasil teknologi next generation sequencing (NGS). Penggalian data SSR menggunakan program MISA dan desain primer memanfaatkan perangkat lunak Primer3 berbasis internet. Sebanyak 20 pasang primer berhasil didesain dan teramplifikasi dengan baik pada sampel DNA genom D. testudinarius. Kedua puluh pasang primer baru ini juga diuji dan dapat teramplifikasi pada 19 sampel DNA genom spesies lainnya dari anggota ordo Malvales. Hal ini menunjukkan kedua puluh pasang primer yang baru ini memiliki tingkat transferabilitas yang luas, terutama pada anggota Malvaceae. Percobaan keempat menggunakan marka SSR spesifik
Keyword: spesies endemik, polimorfik, sumber daya genetik, variasi nukleotida

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: