Judul: Distribusi Gen Penyandi Sifat Resistensi Antibiotik Tetrasiklin Pada Salmonella spp. Asal Karkas Ayam
Abstrak: Daging ayam merupakan salah satu komoditas pangan sumber protein yang banyak dikonsumsi di Indonesia. Penggunaan tetrasiklin sebagai antibiotik secara kurang tepat menyebabkan terbentuknya sifat resistensi. Sifat resistensi tetrasiklin pada Salmonella spp. diatur oleh gen penyandi resistensi. Penelitian ini bertujuan mendeteksi distribusi gen-gen penyandi resistensi antibiotik tetrasiklin pada Salmonella spp. asal karkas ayam dan menentukan gen yang berkorelasi tinggi dengan sifat resistensi tetrasiklin pada Salmonella spp. asal karkas ayam. Metode penelitian terdiri dari tiga tahapan yaitu ekstraksi DNA dan analisis kemurnian hasil ekstraksi DNA, deteksi gen penyandi, analisis korelasi antara genotipe dan fenotipe, serta frekuensi gen penyandi resistensi tetrasiklin. Hasil deteksi pada 18 isolat mendeteksi distribusi gen tet(A) pada 17 isolat (94,44%), tet(B) pada 15 isolat (83,33%), tet(D) pada 13 isolat (72,22%), tet(C) pada 8 isolat, sedangkan gen tet(E) tidak terdeteksi (0%). Korelasi fenotipe dan genotipe menunjukkan bahwa tet(D) memiliki korelasi paling tinggi yaitu 77,78%, sedangkan gen lainnya memiliki korelasi yang lebih rendah yaitu tet(A) 66,67%, tet(B) 66,67%, dan tet(C) 38,89%. Fenotipe dan genotipe resistensi tetrasiklin tidak selalu memiliki hubungan linear.
Keyword: Tetracycline, chicken, PCR, resistance encoding genes, Salmonella spp., tetracycline

Judul: Identifikasi Sifat Resistensi Antibiotik dan Deteksi Gen Penyandinya pada Salmonella spp. Asal Karkas Ayam Kampung
Abstrak: Daging ayam kampung sudah banyak dikonsumsi di Indonesia seperti halnya ayam ras. Namun, pemeliharaan secara ekstensif memungkinkan paparan bakteri yang bersifat multidrug-resistant (MDR) pada ayam kampung, termasuk melalui transfer gen horizontal. Penelitian ini bertujuan menghubungkan sifat resisten dengan keberadaan gen penyandi resistensi antibiotik pada Salmonella spp. yang diisolasi dari karkas ayam kampung. Identifikasi sifat resisten dilakukan dengan metode difusi cakram Kirby-Bauer dan deteksi gen resistensi antibiotik pada tujuh belas isolat Salmonella spp. dilakukan dengan PCR. Semua (17 dari 17) isolat Salmonella sensitif terhadap ampisilin dan kloramfenikol. Salmonella spp. paling resisten terhadap eritromisin (82,4%; 14 dari 17), sementara penurunan sensitivitas (sifat intermediet) banyak terjadi pada oksitetrasiklin (82,4%; 14 dari 17) dan siprofloksasin (53,0%; 9 dari 17). Salmonella Typhimurium menunjukkan pola resistensi terhadap lebih banyak golongan antibiotik dibandingkan dengan S. Weltevreden dan S. Newport. Gen blaTEM, tetG, cmlA, dan gyrA terdeteksi pada semua (17 dari 17) isolat Salmonella spp. Sifat resisten dan keberadaan gen penyandi resistensi antibiotik tidak selalu berhubungan satu sama lain. Penelitian ini dapat memberikan informasi yang bermanfaat mengenai penyebaran fenotipe dan genotipe resistensi antibiotik pada Salmonella spp. dari ayam kampung., Kampung chicken meats have been widely consumed in Indonesia as well as broiler chicken. However, the extensive rearing allowed exposure of multidrug-resistant (MDR) bacteria to kampung chicken, including through horizontal gene transfer. This study aimed to correlate resistance phenotype with the presence of genes-encoding antibiotics resistance in Salmonella spp. isolated from kampung chicken carcasses. Identification of resistance phenotype was carried out by Kirby-Bauer disc diffusion method, while detection of antibiotics resistance genes in seventeen isolates of Salmonella spp. was carried out by PCR. All (17 of 17) isolates of Salmonella were susceptible to ampicillin and chloramphenicol. Salmonella spp. was most resistant to erythromycin (82.4%; 14 of 17), while the decreased susceptibility (intermediate category) most occurred in oxytetracycline (82.4%; 14 of 17) and ciprofloxacin (53.0%; 9 of 17). Salmonella Typhimurium showed a resistance pattern to more antibiotic groups than S. Weltevreden and S. Newport. The blaTEM, tetG, cmlA, and gyrA genes were present in all (17 of 17) isolates of Salmonella spp. Resistance phenotype and the presence of genes-encoding antibiotics resistance were not always related to each other. This study could provide beneficial information regarding the distribution of antibiotics resistance phenotype and genotype in Salmonella spp. from kampung chicken.
Keyword: antibiotic, kampung chicken, multidrug-resistant, PCR, Salmonella

Judul: Utilization of terra/MODIS L1B data for analysis of horizontal wind profile in the troposphere
Abstrak: This study was concerned with horizontal wind derived from data collected with the Moderate-resolution Imaging Spectroradiometer (MODIS) on board the NASA’s Earth Observation System (EOS)-Terra satellite. The aim of this study is to develop a method for the estimation of horizontal wind movement in the troposphere based on Navier-Stokes equation. The method was applied to a calibrated and geolocated Terra/MODIS L1B 1 km data set. The data inputs to estimate surface temperature are retrieved from TIR (Thermal Infrared) bands 31 (10.780 μm to 11.280 μm) and 32 (11.770 μm to 12.270 μm). The obtained surface temperatures were later used to approximate geopotential height on a constant-pressure surface by using the modified Poisson equation. The main assumptions used are the hydrostatic equilibrium, ideal gas law, constant lapse rate and constant acceleration of gravity. Based on the distribution of geopotential height, the pressure gradient force is measured by the gradient of geopotential on an isobaric coordinate to present the horizontal wind profile. For certain topographic areas especially in the mountain ranges, there was a disadvantage of using pressure as a vertical coordinate which lead to inaccuracy. In spite of that, Terra/MODIS L1B data with 1 km spatial resolution can be used to estimate the horizontal wind movement in the troposphere.
Keyword: