Judul: In Vitro Infectivity Analysis of Simian-Human Immunodeficiency Virus (SHIV) on Peripheral Blood Mononuclear Cell (PBMC) Macaca fascicularis and M. nemestrina
Abstrak: Keterbatasan utama dalam upaya pengembangan vaksin dan pengobatan anti-retroviral terhadap infeksi human immunodeficiency virus type-1 (HIV-1) antara lain adalah ketiadaan model hewan yang dapat menunjukkan semua gejala menonjol infeksi HIV-1 seperti pada manusia. SHIV dikonstruksi untuk mengatasi keterbatasan model SIVmac dan telah dimanfaatkan pada banyak penelitian menggunakan satwa primata untuk mempelajari virus yang memiliki kedekatan dengan HIV-1 pada manusia. Satwa primata Macaca fascicularis dan M. nemestrina digunakan sebagai hewan coba penelitian HIV/AIDS dengan memanfaatkan virus kimera SHIV yang dihasilkan melalui penggantian susunan nukleotida bagian cyclophilin A binding region, gen viral infectivity factor (vif) dan gen negative factor (nef) HIV-1 dengan bagian cyclophilin A binding region, gen vif dan gen nef Simian Immunodeficiency Virus (SIV). Penelitian bertujuan untuk mengkaji model HIV/AIDS pada PBMC satwa primata secara in vitro menggunakan SHIV. Secara khusus, penelitian ini bertujuan untuk menganalisis kemampuan atau daya replikasi SHIV pada kultur sel PBMC asal M. fascicularis dan M. nemestrina secara in vitro. Penelitian dilakukan secara in vitro dengan menggunakan PBMC M. fascicularis dan M. nemestrina. Karakteristik M. fascicularis dan M. nemestrina yang digunakan dalam penelitian ini, yaitu jantan, dewasa dengan umur empat sampai enam tahun. SHIV merupakan hasil kontruksi Budiman Bela dan Silvia Triwidyaningtyas dari Pusat Riset Virologi dan Kanker Patobiologi (PRVKP) FKUI-RSCM. Isolasi PBMC dilakukan dengan metode densitas gradien sentrifugasi. Aktivasi PBMC dilakukan dengan menggunakan agen mitogenik, yaitu phytohaemagglutinin (PHA). PBMC terstimulasi PHA dihitung dengan hemositometer. PBMC terstimulasi PHA diinfeksi dengan supernatan sel transfektan yang mengandung SHIV dengan pengenceran 1:10. PBMC terstimulasi PHA juga diinfeksi dengan supernatan yang mengandung HIV dengan pengenceran 1:10 sebagai pembanding. Kultur PBMC terstimulasi PHA dilakukan selama 21 hari. Pemeliharaan kultur PBMC terstimulasi PHA dilakukan dengan pemberian nutrisi setiap minggu sekali. Supernatan PBMC terstimulasi PHA dikoleksi setiap hari. Pengamatan cytopathic effect (CPE) dilakukan menggunakan mikroskop cahaya. Konfirmasi CPE dilakukan dengan pemeriksaan imunofluoresen terhadap protein p24. Analisis CPE dilakukan secara kualitatif deskriptif dan ekspresi protein p24 dianalisis secara semi kuantitatif. Penggantian cyclophilin A binding region, gen vif dan gen nef HIV-1 dengan cyclophilin A binding region, gen vif dan gen nef SIV dapat meningkatkan kemampuan SHIV dalam menginfeksi PBMC M. fascicularis dan M. nemestrina. Infeksi SHIV pada kultur PBMC terstimulasi PHA M. fascicularis dan M. nemestrina ditandai dengan pembentukan CPE berupa multinucleated giant cell (MGCs). CPE pada kultur PBMC terstimulasi PHA M. fascicularis dan M. nemestrina mengekspresikan protein p24 dengan nilai masing-masing + (<10% sel terwarnai) dan ++ (10%-50% sel terwarnai). Penggantian susunan nukleotida cyclophilin A binding region meningkatkan pengikatan cyclophilin A (CypA) dengan gag SIV. Gen vif berperan sebagai pertahanan balik terhadap apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G (APOBEC3G) yang dapat menghambat replikasi retrovirus. Gen nef berperan dalam perkembangan AIDS dan antagonis terhadap tetherin. CPE dan ekspresi protein p24 pada kultur PHA-stimulated PBMC M. nemestrina lebih banyak dibandingkan pada kultur PHA-stimulated PBMC M. fascicularis. Perbedaan ini disebabkan adanya protein tripartite motif containing 5 (TRIM5) yang dapat membatasi replikasi virus. M. nemestrina mengekspresikan protein TRIMCyp yang tidak membatasi replikasi virus. Sementara itu, M. fascicularis mengekspresikan TRIM5α dan TRIMCyp yang dapat membatasi replikasi HIV-1 atau HIV-2. M. nemestrina memberikan hasil yang lebih baik sebagai model
Keyword: CPE, expression of p24 protein, M. fascicularis, M. nemestrina, SHIV

Judul: Isolasi dan Karakterisasi Gen pol Simian Retrovirus (SRV) asal Macaca fascicularis dan Macaca nemestrina Isolat Indonesia.
Abstrak: Jumlah penderita HIV AIDS di Indonesia meningkat dari tahun ke tahun. Penelitian pengembangan obat antiviral mutlak diperlukan. Untuk itu, perlu dikembangkan model virus yang memiliki karakteristik mirip dengan HIV mengingat penggunaan virus HIV sebagai virus model memiliki resiko keamanan yang lebih tinggi. Penelitian ini merupakan langkah awal untuk pengembangan virus model HIV dari Simian retrovirus (SRV) isolat Indonesia berdasarkan karakter-karakter spesifiknya. Tujuan penelitian ini adalah melakukan isolasi dan identifikasi gen pol Simian Retrovirus (SRV) isolat Indonesia asal Macaca fascicularis dan Macaca nemestrina yang selanjutnya dapat dikarakterisasi urutan nukleotidanya, dianalisis kekerabatannya, urutan asam aminonya, conserve domainnya, dan pemodelan struktur tiga dimensinya menggunakan analisis bioinformatika. Isolasi dilakukan dengan teknik PCR menggunakan sepasang primer 3284U dan 4925L. Amplifikasi gen pol dengan teknik PCR menghasilkan pita spesifik yang masing-masing berukuran sekitar 1600 bp. Hasil analisis sekuens DNA menunjukkan bahwa virus yang terdapat di dalam sampel Macaca fascicularis adalah SRV 2 sedangkan virus yang terdapat di dalam sampel Macaca nemestrina adalah Simian endogenous retrovirus. Oleh karena itu, virus SRV asal Macaca nemestrina tidak bisa dilakukan pemodelan struktur tiga dimensinya. Hasil isolasi dan permodelan struktur protein gen penyandi reverse transkriptase dan RNase-H SRV 2 asal Macaca fascicularis Indonesia telah berhasil dilakukan. Sisi aktif dari kedua enzim tersebut juga telah berhasil diidentifikasi dan ditentukan urutan asam aminonya. Sisi aktif dari RNase-H terdiri atas tiga asam amino dan reverse transkriptase terdiri atas 27 asam amino. Hubungan kekerabatan enzim dari SRV-2 isolat Indonesia menunjukkan bahwa enzim reverse transkriptase dan RNase-H isolat Indonesia dapat digunakan sebagai model untuk mempelajari enzim dari retrovirus lainnya.
Keyword: 

Judul: Pembuatan dan Karakterisasi Lapisan Tipis Copper oxide (CuO) Sebagai Sensor Gas
Abstrak: Lapisan tipis Copper Oxide (CuO) adalah bahan scmikonduktor yang memiliki sirat sangat scnsitif tcrhadap gas. mcngingat bahan tcrscbut sangat mud-ah mcngabsorpsi gas. DCllgan absorpsi gas ini akan l11crubah resistivitas lapisan tipis tersebut. Dalmn pcmbuatan.lapisan (ipis ini, lllclodc yang digunakan adalah metodc Dcposisi Fasa Cair (Liquid Phase Deposition) yaitu dengan mencmnpurkan 100 ml larutan Copper Sulphal (CuSO, 1I2H,O) 1M dengan 50 ml ammonium 25 %, Kemudian dicuplik 6ml dan dimasukkan ke dalam wadall yang telah terisi aquades 60 ml dan substrat pada dindingnya, kemudian diaduk dengan slirier dan dipanasi pada suhu 75°C selama 1 jam, Pendeposisian ini dilakukan sebanyak 4 kali. Hasil karakterisasi XRD memperlihatkan puncak-puncak CuO yaitu berada pada 28 = 35,306; 38,502; 61.475; 65,538 dengan masing-masing d = 2,5400: 2,3362: 1.5071; 1.4231.
Keyword: