Judul: Keragaman Berbasis Morfologi serta Teknik Isolasi dan Amplifikasi DNA Mikroalga dari Situ Burung dan Situ LSI IPB Dramaga, Bogor
Abstrak: Keragaman mikroalga tersebar di perairan air tawar maupun air laut. Mikroalga berpotensi sebagai sumber biodiesel karena memiliki kandungan lipid yang tinggi. Identifikasi dan studi keragaman mikroalga dapat menjadi landasan bagi studi mengenai potensinya sebagai sumber biodiesel. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi, mengkarakterisasi, dan menganalisis keragaman mikroalga yang bersumber dari perairan air tawar berdasarkan ciri morfologi serta teknik isolasi dan amplifikasi DNA-nya sebagai tahap awal untuk identifikasi berbasis molekuler. Metode yang dilakukan meliputi pengambilan sampel mikroalga, identifikasi morfologi, dan analisis keragaman berdasarkan beberapa indeks ekologi, serta isolasi dan amplifikasi DNA. Hasil identifikasi morfologi ditemukan 38 spesies dari perairan Situ Burung dan Situ LSI IPB yang didominasi oleh divisi Chlorophyta. Keragaman mikroalga di kedua lokasi tergolong sedang, dengan kondisi perairan yang stabil dan indeks kemerataan antarspesies dalam komunitas rendah. Amplifikasi sekuen gen 16s dan 18s rRNA berhasil dilakukan dengan menggunakan primer KWT dan primer SS pada semua sampel hasil isolasi DNA mikroalga Situ Burung dengan hasil pita DNA berukuran lebih dari 250 bp.
Keyword: biodiesel, ecological index, microalgae

Judul: Analisis Metagenomik Mikroalga Prokariot dari Perairan Laut Jawa Timur
Abstrak: Mikroalga adalah kumpulan mikroorganisme uniseluler yang dapat berfotosintesis dan menjadi alternatif bioenergi yang potensial untuk dikembangkan. Sebelumnya, penelitian mengenai boidiversitas mikroalga di laut Jawa Timur telah dilakukan secara morfologis. Penelitian ini bertujuan menganalisis metagenomik mikroalga prokariot di perairan laut Jawa Timur. Sampel dari penelitian sebelumnya, yang berasal dari Madura (M3, M4, M6, M9), Banyuwangi (BW) dan Situbondo (ST), dikulturkan kemudian disekuensing dengan metode NGS (Next Generation Sequencing) menggunakan primer 16S rRNA. Data sekuens dianalisis menggunakan Geneious Prime 2020.1.2 dengan mengacu pada database 16S microbial dari NCBI. Terdapat 6 ordo dan 17 spesies teridentifikasi dari divisi Cyanobacteria. Ordo Oscillatoriales terdapat pada seluruh sampel dengan rata-rata frekuensi 43,25%. Crocosphaera watsonii dan Laspinema etoshii terdapat pada kelima sampel kecuali M6. Situbondo memiliki spesies paling banyak yaitu 16 spesies sedangkan M6 hanya memiliki satu spesies. Indeks keanekaragaman tergolong rendah hingga sedang, sedangkan indeks dominansi tergolong rendah hingga tinggi., Microalgae are mixture of unicellular photoautotroph organisms and have big potential to be developed as an alternative bioenergy. Previous research has been carried out on the diversity of microalgae from East Java Coastal Area using morphological identification. This study aims to analyze the prokaryotic microalgae diversity using metagenomics approach. Seawater samples from previous studies, which came from Madura (M3, M4, M6, and M9), Banyuwangi (BW) and Situbondo (ST), were cultured and then sequenced by NGS applying 16S rRNA primers. Analysis was carried using the Geneious Prime 2020.1.2 program referring to the 16S microbial database from NCBI. There are 6 orders and 17 species classified from the Cyanobacteria division. The Oscillatoriales order is found in all samples with an average frequency of 43,25%. Crocosphaera watsonii and Laspinema etoshii were found in five samples, except M6. Situbondo had the most species, namely 16 species, while the M6 sample only had 1 species. Diversity index is classified as low to moderate, while the dominance index is classified as low to high.
Keyword: 16S rRNA, Cyanobacteria, metagenomics, microalgae, prokaryotes

Judul: Monotonicity Properties of Trapezoid Sum Sequence on Class of Nonconvex and Nonconcave Function
Abstrak: Bernhard Riemann mendefinisikan integral tentu sebagai luas daerah di bawah kurva dari suatu fungsi real taknegatif pada sebuah interval yang tertutup dan terbatas. Beberapa alternatif yang dapat digunakan untuk menghampiri luas tersebut adalah Darboux sums melalui penjumlahan beberapa luas persegi panjang dan trapezoid sum melalui penjumlahan luas trapesium. Trapezoid sum lebih baik dalam menghampiri nilai integral untuk fungsi-fungsi yang well-behaved daripada Darboux sums. Untuk fungsi f yang bernilai real dan kontinu pada interval [a,b], f terintegral Riemann jika dan hanya jika f terintegral Darboux. Pada tesis ini ditunjukkan bahwa f terintegral Riemann jika dan hanya jika f terintegral secara trapesium. Misalkan f adalah suatu fungsi bernilai real yang kontinu pada interval [a,b]. Untuk setiap partisi P_n yang membagi [a,b] menjadi n subinterval dengan jarak yang sama, dibentuk trapezoid sum T_n (f) yang merupakan jumlah luas n trapesium sebagai pendekatan dari nilai integral f pada [a,b]. Jika f adalah fungsi konveks maka barisan trapezoid sum {T_n (f)} bersifat monoton turun dan akan bersifat monoton naik jika f fungsi konkaf. Fokus tesis ini adalah sifat kemonotonan barisan {T_n (f)} untuk fungsi f yang nonkonkaf dan fungsi f yang nonkonveks. Pada tesis ini dibuktikan sifat monoton turun dari {T_n (f)} secara generik tidak terjadi pada kelas fungsi nonkonkaf f, serta secara generik, barisan itu juga tidak monoton naik pada kelas fungsi nonkonveks. Meskipun demikian, sifat generik mengakibatkan bahwa untuk sebarang fungsi f baik di kelas fungsi nonkonkaf maupun nonkonveks, terdapat fungsi g yang menghampiri f sedemikian sehingga ekor barisan {T_n (g)} bersifat monoton. Ditunjukkan pula bahwa himpunan fungsi naik nonkonkaf dengan {T_n (f)} yang tidak monoton turun dense terhadap kelas fungsi naik nonkonkaf f. Hal tersebut juga ditunjukkan untuk himpunan fungsi turun nonkonkaf terhadap kelas fungsi turun nonkonkaf. Lalu, dibuktikan bahwa himpunan fungsi naik nonkonveks dan himpunan fungsi turun nonkonveks dengan {T_n (f)} yang tidak monoton naik, berturut-turut dense terhadap kelas fungsi naik nonkonveks dan turun nonkonveks. Himpunan-himpunan yang dense tersebut mengartikan bahwa setiap fungsi f pada kelas-kelas tersebut, dapat dihampiri oleh suatu fungsi g yang bersesuaian dengan kelas-kelas tersebut sedemikiam sehingga barisan {T_n (g)} tidak monoton., Bernhard Riemann defined definite integral as an area under the curve of a real nonnegative function on a closed bounded interval. The alternatives that can be used to estimate the area are Darboux sum which is sum of rectangular areas and trapezoid sum which is sum of trapezium areas. Trapezoid sum is better than Darboux sum as approximations toward the integral of well-behaved functions. Let f be a real valued continuous function on interval [a,b], f is Riemann integrable if and only if it is Darboux integrable. In this master’s thesis, it showed that f is Riemann integrable if and only if it is trapezium integrable. Let f be a real valued continuous function on interval [a,b]. For each partition P_n that divides the interval [a,b] into n equal length subintervals, defined trapezoid sum T_n (f) which is the total of n trapezium areas as an approach of integral value f on [a,b]. If f is a convex function then the trapezoid sum sequence {T_n (f)} is decreasing
Keyword: monotonicity, nonconcave, nonconvex, trapezoid sum