Judul: Nematoda Puru Akar Pada Ubi Jalar (Ipomoea Batatas L.) Dan Potensi Bakteri Probiotik Tanaman Sebagai Agens Biokontrol : Studi Kasus Di Papua Barat
Abstrak: Ubi jalar merupakan salah satu komoditas unggulan di Provinsi Papua Barat. Komoditas ini menjadi makanan pokok bagi sebagian besar penduduk asli Papua Barat. Survei awal yang dilakukan antara April-September 2014 mengamati penurunan kualitas dan kuantitas ubi jalar. Berdasarkan gejala di lapangan, penurunan kualitas hasil disebabkan oleh infeksi nematoda puru akar. Nematoda puru akar (Meloidogyne spp.) dikenal sebagai patogen tanaman penting termasuk ubi jalar. Nematoda puru akar pada ubi jalar belum dilaporkan di Indonesia, khususnya Papua dan Papua Barat. Oleh karena itu, penelitian tentang nematoda puru akar yang berasosiasi dengan ubi jalar penting untuk pengelolaan penyakit ini dengan benar di lapangan. Identifikasi nematoda yang tidak tepat menyebabkan metode pengendalian yang tidak sesuai misalnya aplikasi pestisida sintetis. Pendekatan yang berbeda dalam pengelolaan nematoda puru akar telah dikembangkan di lapangan untuk memfasilitasi penggunaan berbagai mikroorganisme sebagai agens biokontrol yang ramah lingkungan. Bakteri probiotik memiliki potensi yang menjanjikan sebagai agens biokontrol yang dapat dikembangkan. Penelitian lebih lanjut termasuk eksplorasi dan pengujian karakteristik fisiologi bakteri probiotik diperlukan untuk menentukan mekanisme bakteri probiotik mengendalikan nematoda puru akar. Penelitian ini bertujuan untuk mengindentifikasi nematoda puru akar pada ubi jalar di Papua Barat, mendapatkan bakteri probiotik dari ubi jalar yang memiliki potensi tinggi sebagai agens biokontrol dan menganalisis mekanisme pengendalian bakteri probiotik terhadap nematoda puru akar. Tanaman terinfeksi nematoda puru akar menunjukkan berbagai gejala antara lain ubi tidak sepenuhnya berkembang atau berubah menjadi akar yang keras, dan tumbuh akar di permukaan ubi. Pembedahan akar dan teknik pewarnaan dengan asam fuchsin ditemukan betina dewasa dan kelompok telur Meloidogyne spp. di dalam akar terinfeksi. Identifikasi morfologi berdasarkan karakteristik pola perineal betina ditemukan dua spesies Meloidogyne yaitu M. incognita dan M. javanica. Analisis molekuler menggunakan primer spesifik M. incognita dan M. javanica menunjukkan bahwa Meloidogyne asal Papua Barat memiliki homologi yang tinggi dengan spesies serupa dari Malino (Indonesia), India, Malaysia dan Cina. Sebanyak 204 isolat bakteri probiotik berhasil diisolasi dari tanaman ubi jalar dari Papua Barat, yang terdiri dari 81 isolat bakteri endofit dan 123 bakteri rizosfer. Berdasarkan uji respon reaksi hipersensitif , 75 isolat bakteri rizosfer dan 28 isolat bakteri endofit berpotensi patogenik tanaman. Selain itu 46 isolat berpotensi patogenik terhadap mamalia berdasarkan uji pada media Agar darah. Oleh karena itu ada 46 isolat yang memenuhi kriteria untuk menjadi agens biokontrol dan digunakan pada penelitian lebih lanjut. Uji antagonisme 46 isolat terpilih terhadap juvenil 2 Meloidogyne spp. menunjukkan 25 isolat bakteri menyebabkan kematian nematoda 81.25 sampai 100%. Karakterisasi morfologi, pewarnaan gram dan karakterisasi fisiologi dilakukan terhadap 25 isolat bakteri potensial. Semua sel bakteri berbentuk batang, 19 isolat Gram negatif dan 6 isolat Gram positif. Kemampuan bakteri untuk membunuh nematoda dievaluasi berdasarkan kemampuan menghasilkan hidrogen sianida (HCN) serta enzim lipase, kitinase, dan protease. Tidak ada isolat bakteri yang menghasilkan HCN, 22 isolat menghasilkan lipase, 21 isolat menghasilkan protease, dan 3 isolat menghasilkan kitinase. Karakterisasi fisiologi selanjutnya untuk mengevaluasi potensi bakteri dalam memacu pertumbuhan tanaman, termasuk kemampuan untuk menfiksasi nitrogen, menghasilkan hormon pertumbuhan IAA dan melarutkan fosfat. Semua isolat bakteri mampu menfiksasi nitrogen dan menghasilkan IAA dan 19 isolat dapat melarutkan fosfat. Identifikasi molekuler terhadap 25 isolat bakteri menggunakan primer universal 63-F/1387-R diperoleh bakteri
Keyword: Endofit, fitohormon, Meloidogyne sp., rizosfer.

Judul: Bakteri Endofit Asal Tanaman Jarak (Jatropha curcas L.) dan Potensinya sebagai Agens Biokontrol Meloidigyne spp. pada Terung.
Abstrak: Terung (Solanum melongena) adalah tanaman yang bertekstur lembut, tebal, dan tumbuh tegak, dan bagian daging buahnya umum dikonsumsi. Terung dibudidayakan secara komersil dalam bentuk sayuran segar, persebarannya dimulai dari India dan Cina lalu diintroduksikan ke Eropa bagian Selatan, Afrika sub-Sahara, dan daerah Mediterania oleh pedagang Arab. Tanaman ini merupakan anggota famili Solanaceae seperti kentang, tomat, dan cabai. Syarat tumbuh terung adalah musim tanam dengan suhu hangat untuk memproduksi hasil panen secara optimum dan terung sangat rentan terhadap kerusakan akibat kondisi terlalu lembab, terlalu panas, beku, kekeringan, dan angin kencang. Selain itu, terung juga rentan terhadap faktor-faktor biotik seperti mikroba patogen dan nematode parasit penyebab penyakit seperti layu verticillium, busuk akar phytophthora, bercak kuning, hawar daun, antraknosa, bercak daun cercospora. Beberapa spesies nematoda menjadi patogen pada terung. Nematoda yang paling umum dikenal sebagai patogen terung adalah nematoda puru akar (Meloidogyne spp) yang berkembang baik pada daerah dengan kandungan air yang tinggi. Spesies nematoda ini menginfeksi bagian akar terung dan menghasilkan puru dengan bentuk tidak beraturan yang dapat menurunkan kemampuan tanaman untuk menyerap air dan hara dari dalam tanah. Bakteri endofit adalah bakteri yang mengolonisasi jaringan tanaman tanpa menimbulkan penyakit pada tanaman tersebut. Bakteri endofit berasosiasi dengan tanaman dalam peningkatan pertumbuhan dan kemampuan menyerap hara, peningkatan ketahanan terhadap cekaman abiotik dan penyakit tanaman. Kajian tentang asosiasi endofit dengan tanaman Jarak pagar dan pemanfaatanya dalam pengendalian penyakit pada tanaman yang lain belum banyak dilaporkan. Penelitian ini bertujuan untuk mengeksplorasi bakteri endofit dari tanaman jarak guna menentukan komponen-komponen biokimia dari bakteri endofit tersebut dan untuk mengevaluasi potensi dari bakteri endofit ini dalam peningkatan pertumbuhan tanaman dan pengendalian Meloidogyne spp. pada terung. Tahapan penelitian ini adalah: 1) penyiapan inokulum Meloidogyne spp.; 2) isolasi bakteri endofit dari akar, batang, buah, dan daun tanaman jarak yang sehat; 3) seleksi bakteri endofit dengan uji hipersensitif dan uji hemolysis; 4) uji kemampuan bakteri endofit dalam mengendalikan Meloidogyne spp. in vitro dan kemampuan meningkatkan pertumbuhan tanaman; 5) karakterisasi bakteri endofit dengan uji aktivitas hidrolitik (kitinolitik, proteolitik, dan lipolitik), produksi HCN, pelarutan fosfat, dan fiksasi nitrogen; 6) identifikasi tiga spesies bakteri endofit terpilih secara molekuler dengan gen target 16S r-RNA; 7) uji kemampuan bakteri endofit dalam menekan populasi Meloidogyne spp. dan meningkatkan pertumbuhan tanaman in planta di rumah kaca. Penelitian ini berhasil mengisolasi 195 isolat bakteri endofit dan 44 isolat menunjukkan hasil negatif pada uji hipersensitif dan uji hemolisis. Berdasarkan pengujian in vitro, sebanyak 9 isolat mampu memproduksi enzim protease, 3 isolat mampu memproduksi enzim kitinase, 1 isolat mampu memproduksi HCN, 12 isolat mampu melarutkan fosfat, dan 5 isolat mampu memfiksasi nitrogen. Isolat SJS54 dan RJS175 menunjukkan hasil terbaik dalam menekan populasi nematoda sebesar 97.5% dan 95.4%. Sementara itu, isolat FJS23 dan FJS24 menunjukkan hasil terbaik dalam peningkatan pertumbuhan tanaman. Berdasarkan uji mortalitas nematoda , uji pertumbuhan tanaman, dan uji-uji fisiologis, isolat RJS175, SJS54, dan FJS23 terpilih sebagai isolat terbaik yang akan diuji di rumah kaca. Hasil identifikasi molekuker pada gen target 16S-rRNA menunjukkan bahwa FJS23, RJS175, dan SJS54 secara berturut-turut adalah Pseudomonas sp., Pseudomonas sp., dan Micrococcus sp. Isolat SJS54 memiliki kemampuan tertinggi dalam meningkatkan tinggi tanaman dan menghambat pertumbuhan nematoda. Sementara
Keyword: Bio-nematisida, mortalitas nematoda, pemicu pertumbuhan, uji hemolisis, uji hipersensitif

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: