Judul: Pengaruh Warna Cahaya yang Berbeda Terhadap Tingkah Laku Berkumpulnya Juvenil Ikan Kerapu Tikus (Cromileptes altivelis)
Abstrak: Umumnya ikan kerapu ditangkap dengan menggunakan pancing, tombak dan perangkap. Alat tangkap tersebut masing-masing mempunyai kelebihan, kekurangan dan tingkat efisiensi yang berbeda. Apabila tingkah laku ikan disekitar alat tangkap serta dalam hubungannya dengan berbagai faktor dapat diketahui, maka akan dapat diketahui cara-cara untuk meningkatkan efisiensi dan kegunaan alat tangkap tersebut. Lebih jauh dari itu, mungkin akan timbul ide untuk menciptakan alat tangkap baru yang lebih sesuai dan bersifat ramah lingkungan. Tingkah laku ikan disekitar daerah iluminasi cahaya dipengaruhi oleh faktor lingkungan seperti suhu, kecerahan, arus, gelombang dan keberadaan makanan atau predator. Hal ini juga berubah berdasarkan kondisi biologis ikan seperti umur, kematangan gonad dan kandungan makanan dalam perut ikan. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis: (1) pola sebaran cahaya dengan warna yang berbeda, (2) tingkah laku pengumpulan juvenil ikan kerapu tikus (Cromileptes altivelis) disekitar daerah iluminasi cahaya, dan (3) untuk menjelaskan hubungan antara tingkah laku pengumpulan juvenil ikan kerapu tikus dengan pola sebaran cahaya. Penelitian ini dilakukan selama Bulan Juni dan Juli 2002 dengan metode eksperimental di Laboratorium Tingkah Laku Ikan, Fakultas Perikanan dan ilmu Kelautan, Institut Pertanian Bogor. Penelitian pendahuluan mengenai pola sebaran cahaya dilakukan pada bulan September 2001 di Stasiun Lapang Kelautan, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Institut Pertanian Bogor, Palabuhanratu, Kabupaten Sukabumi, Jawa Barat. Data yang diperoleh yaitu data primer berupa data pola sebaran cahaya di bawah permukaan air dan data reaksi ikan kerapu tikus terhadap pola sebaran cahaya yang diberikan. Data hasil penelitian berupa pola sebaran cahaya dianalisis secara deskriptif, sedangkan data reaksi ikan terhadap rangsangan cahaya berupa jumlah ikan yang berkumpul, jarak kumpulan ikan tersebut dari sumber cahaya, dan nilai iluminasi cahaya di daerah kumpulan ikan diananlisis secara statistik menggunakan rancangan dasar RAL satu arah. ...
Keyword: 

Judul: Respon retina juvenil ikan kerapu lumpur (epinephelus coioides) terhadap cahaya
Abstrak: Sebagian besar metode penangkapan yang ada didasarkan pada sifat-sifat sensitivitas visual, pola gerak, distribusi penyebaran ikan tujuan penangkapan (Pascoe, 1990). Pengetahuan tentang respon retina ikan kerapu terhadap cahaya diharapkan mampu memberikan pengetahuan dasar untuk mengembangkan metode penagkapan. Adapun penelitian ini menggunakan juvenil ikan kerapu lumpur (Epinephelus coioides) dengan panjang total 12 cm sebagai hewan percobaan dalam pengujian lama waktu yang diperlukan ikan kerapu lumpur untuk merespon cahaya. Penelitian ini terdiri atas dua tahap, yaitu penelitian pendahuluan dan utama. Penelitian pendahuluan dilakukan antara 20 sampai 22 Maret 2002 di karamba jaring apung, Teluk Banten dengan tujuan untuk menentukan intensitas cahaya yang akan digunakan di laboratorium. Penelitian utama dilakukan mulai dari Maret sampai Juni 2002 di Instalasi Pengembangan dan Pengkajian Teknologoi Pertanian, Bojonegara dan laboratorium Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Institut Pertanian Bogor. Metode penelitian yang digunakan adalah observasi dan eksperimental. Pengamatan pola tingkah laku ikan kerapu lumpur dilakukan secara visual sampai kedalaman 3 m yang meliputi tingkah laku makan dan renang. Intensitas cahaya matahari yang masuk ke dalam perairan diukur dengan marine luxmeter sedangkan kecerahan perairan diukur dengan seichi disk. Seluruh pengamatan dan pengukuran dimulai pada saat matahari terbit sampai matahari berada di ketinggian maksimum. Sedangkan untuk penelitian utama perlakuan diberikan mulai tepat tengah malam. Asumsinya adalah cahaya buatan akan lebih efektif digunakan pada malam hari. Rancangan percobaan terdiri 1) rancangan perlakuan satu faktor, yaitu faktor lama pencahayaan dengan taraf perlakuan 30 menit, 60 menit, 90 menit, 120 menit dan...
Keyword: 

Judul: Extracellular Expression of thermostable Geobacillus stearothermophilus T1.2RQ Lipase for Biodiesel Production
Abstrak: The extracellular expression of enzymes in an excellent secretion host such as Bacillus subtilis is a useful strategy for making enzymes of industrial significance more affordable by lowering the cost of its downstream processing. Lipases are a category of hydrolases that catalyze the hydrolysis of triglycerides to glycerol and free fatty acids. Also, lipases catalyze the hydrolysis and transesterification of other esters as well as the synthesis of esters. They can perform very specific biotransformation reactions and are widely used in food, organic synthesis, detergents, cosmetic, and pharmaceutical industries. Geobacillus stearothermophilus T1.2RQ lipase is an industrially-desired thermostable lipolytic enzyme with an excellent hydrolytic and transesterification activity. This study aimed to express T1.2RQ lipase, in B. subtilis WB800 and ensure its secretion into the extracellular medium. Three signal peptides (AmyQ, Epr, LipA) and two promoters (Pgrac01 and Pgrac100) were used in the secretory-expression of T1.2RQ lipase, based on five constructed expression vectors constructed by restriction cloning and PCR mutagenesis. Sangers sequencing was used to verify constructs to ensure they are in the correct reading frame. Recombinants vectors, pHT43 (plasmid control), pHT43-T1.2RQ, pHT43- T1.2RQ_AmyQ, pHT43-T1.2RQ_Epr, and pHT43-T1.2RQ_LipA, were transformed by electroporation into Bacillus subtilis WB800. The electroporation was successful with the optimum condition of 2500V, 200 ohms, 25µF, and 5milliseconds. Recombinant B. subtilis pHT43 (negative control) and pHT43-T1.2RQlip + signal peptides were streaked on the lipidic agar, LA+TBN. All four recombinants, including the negative control (B. subtilis WB800-pHT43), produced clear zones on the TBN agar plate after overnight incubation (fig 2), indicating the presence of a lipolytic enzyme in all of the recombinant B. subtilis cells. pHT43-T1.2RQlip + signal peptides (AmyQ, Epr, and LipA) have clear zones with significantly higher diameters than B. subtilis WB800-pHT43 (negative control). This phenomenon suggests that the recombinant thermostable lipase T1.2RQ introduced into these cells was successfully expressed, thereby increasing the lipolytic capability of its host cells T1.2RQ lipase was expressed in 50ml terrific broth medium (TB) and the expression induced with 1mM IPTG. Lipase activity assay using p-nitrophenyl esters showed that all three signal peptides directed the secretion of T1.2RQ lipase into the extracellular medium. Signal peptide, LipA, resulted in the highest extracellular activity of 5.6 U/mL, which corresponds to a 6-fold increase over the parent B. subtilis WB800 strain. Meanwhile, signal peptides, AmyQ and Epr produced 4.2 U/mL and 3.4 U/mL activity respectively. SDS-Zymogram analysis confirmed that T1.2RQ lipase was correctly processed and secreted in its original size of 44 kDa. An attempt to further increase lipase expression level by promoter optimization showed that, contrary to expectation, promoter Pgrac100 exhibited similar expression levels as the original Pgrac01. Nevertheless, the demonstration of the successful secretion of T1.2RQ lipase in this work confirms the latter as a promising approach for the industrial production of the enzyme
Keyword: Bacillus subtilis, Expression, Extracellular, Heterologous, Lipase, Thermostable