Judul: Type 5 Phosphodiesterase Molecular Bonding by The Active Compound of Senggani (Melastoma malabathricum L.) as a Therapy of Erectile Dysfunction
Abstrak: Disfungsi ereksi disebabkan oleh aktivitas fosfodiesterase tipe 5 (PDE5) yang tinggi sehingga degradasi cGMP menurun dan berakibat otot polos penis mengalami relaksasi secara terus menerus sehingga penis tidak mengalami ereksi. PDE5 perlu diinhibisi dalam mendegradasi cGMP sehingga kadar cGMP meningkat dan menyebabkan kontraksi otot polos lebih lama sehingga penis dapat berereksi. Senggani dilaporkan memiliki sifat sebagai senyawa afrodisiak, namun belum diketahui interaksi dan pengaruh senyawa bioaktif terhadap enzim PDE5. Oleh karena itu, Penelitian ini bertujuan menguji senyawa bioaktif senggani terhadap enzim fosfodiesterase 5 (PDE5) untuk menangani disfungsi ereksi. Penelitian ini menggunakan beberapa software, yaitu PyRx, Discovery Studio Visualizer, AutoDock Tools, AutoDock Vina, dan Ligplot+ 1.5.4. Reseptor yang ialah PDE5 dengan kode PDB: 2H42 dan ligan pembanding sildenafil. Reseptor tersebut digunakan dalam penapisan virtual terhadap 41 senyawa aktif senggani, senyawa hasil seleksi dilanjutkan dengan analisis absorpsi, toksisitas, dan bioavaibilitas. Hasil penambatan molekuler dianalisis melalui parameter energi afinitas (ΔG) dan nilai konstanta inhibisi. Auranamaide dan α-amyrin memiliki potensi terbaik dalam menghambat aktivitas enzim PDE5 dengan nilai ΔG masing-masing sebesar -10,3 dan -10,9 kkal/mol serta nilai konstanta inhibisi sebesar 0.2775 μM dan 0.1010 μM. Simpulannya auranamaide dan α-amyrin memiliki potensi inhibisi enzim PDE5 dalam terapi pengobatan disfungsi ereksi.
Keyword: Erectile dysfunction, molecular docking, phosphodiesterase 5, senggani

Judul: Studi In Silico Pengaruh Senyawa Afrodisiak Cabai Jawa  (Piper retrofractum Vahl) Terhadap Peningkatan Libido  Sapi Jantan
Abstrak: Cabai jawa telah lama dikenal sebagai afrodisiak, namun mekanisme kerjanya belum diketahui. Penelitian ini bertujuan mengetahui interaksi senyawa aktif cabai jawa dengan fosfodiesterase tipe 5 (PDE5) (ID: 1UDT) dan menentukan senyawa yang memiliki potensi afrodisiak sebagai inhibitor PDE5 melalui pendekatan in silico. PDE5 sebagai reseptor dan ligan-ligan uji dipreparasi menggunakan software Discovery Studio dan AutoDock Vina. Lima ligan uji guineensine, piperin, piperlongumin, β-sitosterol, dan filfilin dibandingkan dengan sildenafil sitrat setelah diuji stabilitas dan toksisitas ligan. Pemilihan kelima ligan didasari kemiripan struktur ligan dengan hormon steroid. Hasil analisis penambatan molekuler menunjukkan ligan uji yaitu β-sitosterol memiliki nilai ΔG lebih kecil dibandingkan sildenafil sitrat sebesar -10 kkal/mol serta β-sitosterol dan piperin memiliki aktivitas penambatan terbaik dengan %BSS sebesar 63,6% berdasaran analisis visualisasi 2D dan 3D. β-sitosterol dan piperin berpotensi sebagai afrodisiak dengan bekerja sebagai inhibitor PDE5., Java long pepper (Piper retrofractum Vahl) has known for many years as aphrodisiac in traditional medicine, however the molecular mechanism of this action is not very clear. This study is focused to figure out the interactions between active compounds of long pepper and phosphodiesterase type 5 (PDE5) (ID: 1UDT) and which compounds have aphrodisiac potential as PDE5 inhibitor in silico. PDE5 as receptor and tested ligands were prepared using Discovery Studio and AutoDock Vina. Five tested ligands including guineensine piperine, piperlongumine, β-sitosterol, and filfiline was compared to sildenafil citrate after stability and toxicity test. The five ligand was elected by the structure similarity to steroid hormones. The result of molecular docking showed tested ligands β sitosterol with smaller value of ΔG (-10 kcal/mol) than sildenafil citrate. Piperine and β-sitosterol had best docking activity with %BSS value of 63,6%. β-sitosterol and piperine has potential as aphrodisiac by acting as PDE5 inhibitor.
Keyword: afrodisiak, cabai jawa, in silico, PDE5, sapi jantan

Judul: Utilization of terra/MODIS L1B data for analysis of horizontal wind profile in the troposphere
Abstrak: This study was concerned with horizontal wind derived from data collected with the Moderate-resolution Imaging Spectroradiometer (MODIS) on board the NASA’s Earth Observation System (EOS)-Terra satellite. The aim of this study is to develop a method for the estimation of horizontal wind movement in the troposphere based on Navier-Stokes equation. The method was applied to a calibrated and geolocated Terra/MODIS L1B 1 km data set. The data inputs to estimate surface temperature are retrieved from TIR (Thermal Infrared) bands 31 (10.780 μm to 11.280 μm) and 32 (11.770 μm to 12.270 μm). The obtained surface temperatures were later used to approximate geopotential height on a constant-pressure surface by using the modified Poisson equation. The main assumptions used are the hydrostatic equilibrium, ideal gas law, constant lapse rate and constant acceleration of gravity. Based on the distribution of geopotential height, the pressure gradient force is measured by the gradient of geopotential on an isobaric coordinate to present the horizontal wind profile. For certain topographic areas especially in the mountain ranges, there was a disadvantage of using pressure as a vertical coordinate which lead to inaccuracy. In spite of that, Terra/MODIS L1B data with 1 km spatial resolution can be used to estimate the horizontal wind movement in the troposphere.
Keyword: