Judul: Long-Read Sequences Analysis with MinION Oxford Nanopore Technology of Balsa (Ochroma pyramidale (Cav. ex Lam.) Urb.)
Abstrak: Balsa (O. pyramidale) merupakan salah satu spesies tanaman hutan cepat tumbuh bernilai ekonomi yang diintroduksi ke Indonesia dengan informasi genetik yang masih terbatas. Penelitian ini bertujuan untuk menghasilkan data genomik dan menganalisis hubungan kekerabatan balsa (O. pyramidale) berbasis long-read sequences dengan teknologi Oxford Nanopore (ONT). Penelitian terdiri dari beberapa tahapan yaitu ekstraksi DNA, uji kualitas dan kuantitas DNA, proses sekuensing DNA menggunakan mesin MinION ONT, dan analisis bioinformatik. Hasil penelitian menunjukkan bahwa proses sekuensing pada balsa (O. pyramidale) menghasilkan sekuen partial whole genome kloroplas sebesar 155.430 bp yang dapat digunakan untuk analisis hubungan kekerabatan berbasis DNA barcode pada genom kloroplas. Analisis filogeni menunjukkan bahwa jenis balsa (O. pyramidale) secara genetik (multi-genotipe) berada satu clade dengan sesama jenis O. pyramidale pada setiap penggunaan gen atau marka baik rbcL, matK, maupun kombinasi gen rbcL dan matK. Jenis gen atau marka yang cocok digunakan dalam analisis hubungan kekerabatan pada balsa (O. pyramidale) dapat menggunakan matK dan kombinasi rbcL dan matK., Balsa (O. pyramidale) is one of the fast-growing forest plant species with high economic value and was introduced to Indonesia, but there is not much genetic information available. The main objective of this research was to generate genomic data and analyze the phylogeny of balsa (O. pyramidale) based on long-read sequences with Oxford Nanopore Technology (ONT). The research consisted of several steps: i) DNA extraction, ii) testing the quality and quantity of DNA, iii) the DNA sequencing process using a machine MinION ONT, and vi) bioinformatic analysis. Research results showed that the sequencing process in balsa (O. pyramidale) produced partial whole-genome chloroplast of 155,430 bp which can be used for relationship analysis based on DNA barcodes on the genome. Phylogeny analysis showed that balsa (O. pyramidale) genetically (multi-genotype) is positioned in the same clade with other O. pyramidale deposited samples in every use of genes or markers rbcL, matK, or a combination of genes rbcL and matK. MatK or a combination of both rbcL and matK can be recommended to be used for analysis phylogeny of balsa (O. pyramidale).
Keyword: matK, MinION, Ochroma pyramidale, phylogenetic, rbcL

Judul: Analysis of Long-read Sequences with MinION Technology on Kapur (Dryobalanops aromatica C.F Gaertn).
Abstrak: Salah satu spesies penting dari famili Dipterokarpa adalah kayu kapur (D. aromatica C.F Gaertn) dengan status konservasi rentan (vulnerable). Status tersebut mencerminkan perlunya upaya konservasi genetik berbasis sains yang didukung dengan teknologi baru, salah satunya adalah Oxford Nanopore Technology (ONT) MinION yang mampu menyajikan analisis long-read DNA sequences yang terjangkau. Saat ini penggunaan ONT masih jarang dilakukan pada pohon hutan asli Indonesia. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan data sekuens whole genome liputan rendah (low coverage) dan memanfaatkannya untuk menganalisis kekerabatan D. aromatica. Prosedur penelitian mencakup tahapan isolasi dan sekuensing DNA hingga analisis bioinformatika. Hasil menunjukkan bahwa sekuensing DNA D. aromatica dengan pembacaan urutan basa DNA long-read 1,55 Gb dengan genom parsial kloroplas D. aromatica 148.856 bp. Analisis kekerabatan menunjukan D. aromatica berkerabat dekat dengan D. rappa dengan marka kombinasi gen (matK dan rbcL) lebih direkomendasikan untuk digunakan dalam analisis lanjutan D. aromatica., One important species of the dipterocarps is kapur (D. aromatica C.F. Gaertn) with a vulnerable conservation status. This status indicates the need for science based conservation through new technology, among other Oxford Nanopore Technoloy (ONT) MinION, that is able to provide affordable analysis for long-read DNA sequences. Nowadayas, the use of ONT is still rare being applied to native Indonesian forest trees. The objective of this study was to generate long- read sequence data of the whole genome with low coverage and use it to analyze genetic relationship D. aromatica. The research procedure included DNA isolation and sequencing to bioinformatics analysis. The results showed that DNA sequencing of D. aromatica resulted in 1,55 Gb of DNA base long read sequences in which a partial chloroplast genome length was constructed with a total of 148.856 bp. The genetic relationship analysis showed that D. aromatica was closely related to D. rappa with a combined marker of matK and rbcL are recommended for future use of phylogenetic analysis of D. aromatica.
Keyword: Dryobalanops aromatica, genome, markers, MinION, sequencing

Judul: Akupuntur pada Kasus Konstipasi Kucing Persia.
Abstrak: Seekor kucing betina ras persia bernama Lucy telah mengalami konstipasi yang berulang kali sehingga terjadi kronis. Terapi akupuntur digunakan sebagai pengobatan alternatif dalam studi kasus ini dengan tujuan meningkatkan motilitas gastrointestinal. Studi kasus ini bertujuan untuk mengetahui efek akupuntur pada kasus konstipasi di kucing Lucy. Terapi akupuntur dilakukan dengan menggunakan dry neddle pada titik BL-21, BL-25, CV-4, CV-6, CV-12, GV-1, ST-25, dan ST-36. Terapi dilaksanakan selama 15 menit setiap terapi dan dilakukan seminggu 3 kali sampai terjadi perkembangan persembuhan. Berdasarkan hasil pemeriksaan fisik dan pemeriksaan penunjang radiografi, terdapat penumpukan feses yang banyak dari kolon hingga rektum. Kucing dapat defekasi dengan lancar setelah terapi ke-3 dan kondisi kucing yang awalnya buruk semakin membaik.
Keyword: akupuntur, dry needle akupuntur, konstipasi, motilitas gastrointestinal