Judul: Analisis In Silico Biflavonoid dari Genus Araucaria sebagai Inhibitor Protein DENV NS5 RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) Menggunakan Aplikasi PLANTS
Abstrak: Demam berdarah dengue (DBD) adalah penyakit yang ditularkan oleh nyamuk Aedes aegypti. Infeksi virus dengue ini disebabkan adanya produksi virus DENV pada protein NS5 RNA-dependent RNA polymerase. Balapiravir merupakan senyawa yang mampu menjadi inhibitor NS5 RdRp tetapi tidak dapat menurunkan viremia. Genus Araucaria mengandung senyawa biflavonoid yang telah diteliti berpotensi sebagai antivirus melalui inhibisi NS5 RdRp. Penelitian ini bertujuan memprediksi 23 senyawa turunan biflavonoid dari genus Araucaria sebagai antidengue melalui inhibisi NS5 RdRp berdasarkan parameter penambatan molekuler dengan aplikasi PLANTS, serta hubungan aktivitas dan strukturnya. Aplikasi PLANTS didasarkan pada perilaku koloni semut yang bergerak di sekitar situs pengikatan untuk menemukan konformasi ligan terbaik. Hasil penelitian menunjukkan bahwa terdapat 6 senyawa yang berpotensi sebagai inhibitor NS5 RdRp dengan skor penambatan lebih rendah dibandingkan balapiravir. Senyawa yang paling berpotensi, yaitu senyawa 4’,4’’’-di-O-metil kupresuflavon (22), dengan skor penambatan -96,0786., Dengue fever (DHF) is a disease transmitted by the Aedes aegypti mosquito. Dengue virus infection is caused by the production of DENV virus on the NS5 RNA-dependent RNA polymerase protein. Balapiravir is a compound that can be an inhibitor of NS5 RdRp but cannot reduce viremia. The Araucaria genus contains biflavonoid compounds that have been studied as potential antivirals through NS5 RdRp inhibition. This study aims to predict 23 biflavonoid-derived compounds from the Araucaria genus as antidengue through NS5 RdRp inhibition based on molecular docking parameters with the PLANTS application, as well as activity and structure relationships. The PLANTS application is based on the behavior of ant colonies that move around the binding site to find the best ligand conformation. The results showed that there are 6 compounds that have potential as NS5 RdRp inhibitors with lower docking scores than balapiravir. The most potential compound is 4',4''di-O-methyl-cupresuflavone (22), with a docking score of -96.0786.
Keyword: Araucaria, DBD, NS5 RdRp, PLANTS, DHF

Judul: Simulasi Penambatan Molekuler Biflavonoid Genus Araucaria sebagai Inhibitor DENV NS5 RNA-Dependent RNA Polymerase
Abstrak: Demam Berdarah Dengue (DBD) merupakan penyakit menular yang disebabkan oleh infeksi virus dengue (DENV). NS5 RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) merupakan salah satu protein non-struktural yang berperan penting dalam replikasi virus dengue. Balapiravir merupakan senyawa yang telah diuji secara klinis dapat menghambat aktivitas polimerase pada virus, tetapi senyawa ini memiliki permeasi yang buruk. Biflavonoid genus Araucaria telah diteliti memiliki potensi sebagai antivirus. Penelitian ini bertujuan mengidentifikan senyawa biflavonoid genus Araucaria yang berpotensi menghambat DENV NS5 RdRp secara in silico melalui penambatan molekuler. Penambatan molekuler dilakukan menggunakan aplikasi YASARA Structure. Hasil penelitian menunjukkan 4 senyawa biflavonoid genus Araucaria yang berpotensi sebagai inhibitor DENV NS5 RdRp berdasarkan energi bebas ikatan (∆G), konstanta disosiasi (Kd), dan daerah interaksi. Senyawa 7’’-O-methyl-robustaflavone merupakan senyawa terbaik yang memiliki potensi sebagai inhibitor DENV NS5 RdRp dengan nilai ∆G dan Kd sebesar -10.3540 kkal/mol dan 2,57 x 104 pM., Dengue Hemorrhagic Fever (DHF) is an infectious disease caused by infection with the dengue virus (DENV). NS5 RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) is a non-structural protein that plays an important role in dengue virus replication. Balapiravir is a compound that has been clinically tested to inhibit polymerase activity in viruses, but this compound has poor permeation. Biflavonoids of the genus Araucaria have been studied for their potential as antivirals. This study aimed to identify biflavonoid compounds of the genus Araucaria that have the potential to inhibit DENV NS5 RdRp in silico through molecular docking. Molecular docking was performed using the YASARA Structure application. The results showed that 4 biflavonoid compounds of the Araucaria genus had potential as DENV NS5 RdRp inhibitors based on bond free energy (∆G), dissociation constant (Kd), and interaction site. Compound 7''-O-methyl-robustaflavone is the best compound that has potential as a DENV NS5 RdRp inhibitor with ∆G and Kd values of -10.3540 kcal/mol and 2,57 x 104 pM.
Keyword: Dengue, NS5 RdRp, Biflavonoid, Araucaria, Molecular Docking

Judul: Centrality test for Non-Normal And Skewed Population
Abstrak: The t modified 2 test is more robust than t test for skewed popnlation. This test tolerate the population skewness from -1.2 to 1.2 sample size is reather than 25. The sign test robust to the populated skewed population, but the value of the estimated always close to the size of the tcst. Wilcoxon test is not robust to the population skewness. This test is more suittalble for Symmetric population
Keyword: