Judul: Penapisan bakteri penghasil senyawa antimikrob yang berasosiasi dengan spons Haliclona sp. dan deteksi gen penyandi poliketida sintase dan peptida sintase nonribosom
Abstrak: Sponges are classified in the Porifera phylum have the ability to symbiosis with microorganisms. The symbiont produced useful natural products such as polyketides and nonribosomal peptides that possessed antimicrobial activities. Each polyketide and non-ribosomal peptide are synthesized by the Polyketide Synthase (PKS) dan Non-Ribosomal Peptide Synthase (NRPS) gene. Both of them are multifunctional enzymes that involved in the biosynthesis bioactive compounds that are important in pharmaceutical and other industries.The aims of study was to screened the bacteria producing antimicrobial compounds which is associated with sponge and detect the genes that play a role in the biosynthesis of bioactive compounds. A total of 18 isolates bacteria that associated with Haliclona sp. was tested their antimicrobial activity and finally 12 isolates bacteria that inhibited four pathogenic bacteria growth that consist of Staphylococcus aureus, Enteropathogenic Escherichia coli (EPEC), Pseudomonas aeruginosa, Vibrio harveyi, and two non-pathogenic bacteria that consist of Bacillus subtilis, Escherichia coli, and the two pathogenic fungus Candida albicans and Candida tropicalis. Detection of PKS and NRPS encoding gene performed by Polymerase Chain Reaction (PCR) using specific primers, producing 700 bp and 1000 bp amplicon. One isolate that possessed the best antimicrobial activities and both of PKS and NRPS gene which is Iso 10 are selected for homology test. DNA fragment from Iso 10 KS genome (700 bp) that have been successfully cloned into plasmid pGEMT and sequenced and its homology with other KS domain sequences of about 49-51%.
Keyword: 

Judul: Antimicrobial Activity of Sponge-Haliclona sp.-Associated Bacteria and Their Genetics Analysis
Abstrak: Three marine bacterial isolates isolated from sponge-Haliclona sp. coded as HAL-13, HAL-74, and HAA-01 produced broad spectrum of antimicrobial compounds. Extraction of antimicrobial compounds has been performed using n-butanol and ethyl acetate solvent. Bacterial crude extracts from all of these isolates showed broad spectrum activity against bacterial and fungal test strains, i.e. Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeroginosa, enteropathogenic Escherichia coli K1-1, Candida albicans, and Candida tropicalis. Crude extract from HAL-13 showed the highest antimicrobial activity against bacterial and fungal test strain. Analysis of active spot from thin layer chromatography plate was conducted by bioautography technique. At least one spot from each bacterial crude extract has antimicrobial activity against Staphylococcus aureus and enteropathogenic Escherichia coli K1-1. Purification of antimicrobial compounds from HAL-13 were performed using column chromatography with chloroform-methanol solvent system. Thirty-seven fractions were collected from column chromatography, five fractions of which have antimicrobial activity. DNA fragment of ketosynthase of polyketide synthase genes cluster from HAL-13, HAL-74, HAA-01 were amplified and successfully cloned into pGEMT-Easy. Sequences analysis showed that they had homology with PKS type of 1 B. subtilis BSN5 for HAL 13 and HAA-01, and PKS type 1 of B. amyloliquefaciens for HAL-74.
Keyword: 

Judul: Pengaruh perubahan tata guna lahan terhadap penurunan tinggi muka air danau Toba
Abstrak: Masalah yang dihadapi Daerah Tangkapan Air (DTA) Danau Toba antara lain menurunnya muka air danau, gundulnya DTA danau, berubahnya tata guna lahan sekitarnya, longsoran tebing danau, dan sebagainya. Kondisi ini diperkirakan disebabkan oleh perubahan tata guna lahan dan perubahan iklim global, adanya eksploitasi hutan dengan sistem tebang habis, juga sering terjadi kebakaran hutan. Dalam penelitian ini dipelajari perubahan penurunan tinggi muka air Danau Toba dan pengaruh perubahan tata guma lahan di DTA Danau Toba terhadap penurunan tinggi muka air Danau Toba. Fluktuasi tinggi muka air rataan bulanan Danau Toba dan fluktuasi debit keluaran rataan bulanan Danau Toba diplotkan dalam bentuk grafik garis, sedangkan penggunaan/penutupan lahan di D'TA Danau Toba diplotkan dalam bentuk diagram lingkaran. Untuk mengetahui aliran masuk (inflow) ke Danau Toba digunakan analisis aliran masuk efektif, sedangkan untuk menghaluskan beberapa keragaman acak dan untuk menentukan trend jangka panjang digunakan analisis rata-rata bergerak. Adanya perubahan penggunaan/penutupan lahan dalam skala besar dan bersifat permanen dapat mempengaruhi besar kecilnya debit keluaran yang dihasilkan. Pada tahun 1974 di DTA Danau Toba tujuh jenis penggunaan penutup lahan sedangkan pada tahun 1985 di DTA Danau Toba terdapat sebelas jenis penggunaan/penutupan lahan. Tinggi muka air rataan bulanan Danau Toba sebelum dioperasikan Bendungan Siruar yaitu dari tahun 1957-1981 adalah 905.13 m dpl dan setelah dioperasikan Bendungan Siruar yaitu dari tahun 1982-1997 adalah 904.13 m dpl. Dengan kata lain tinggi muka air rataan bulanan Danau Toba setelah dioperasikan Bendungan Siruar mengalami penurunan ± 1 m. Penurunan ini terlihat sangat jelas pada tahun 1987 yang mempunyai tinggi muka air rataan bulanannya sebesar 902.92 m dpl. yang berarti hampir turun ±3 m dari normal (±905.00 m dpl). Debit keluaran rataan bulanan Danau Toba sebelum dioperasikan Bendungan Siruar yaitu dari tahun 1957-1981 adalah 98.34 m³/detik dan setelah dioperasikan Bendungan Siruar yaitu dari tahun 1982-1998 adalah 93.98 m³/detik. Dengan kata lain debit keluaran rataan bulanan Danau Toba setelah dioperasikan Bendungan Siruar mengalami penurunan ± 5 m/detik. Penurunan ini terlihat jelas pada tahun 1998, debit keluaran rataan bulanan menurun hingga mencapai nilai 49.70 m/detik. Untuk membangkitkan tenaga listrik diperlukan debit sebesar 100 m³/detik, sehingga diperlukan waduk tambahan yang berasal dari Sungai Renun agar debit air mencukupi untuk pembangkit tenaga listrik dan hutan juga dapat menjadi waduk tambahan karena hutan itu berfungsi sebagai reservoir alami. Aliran masuk efektif ke Danau Toba sejak tahun 1957 sampai sekarang menurun. Aliran masuk efektif rataan bulanan Danau Toba dalam keadaan normal adalah sebesar 100 m³/detik, dari nilai aliran masuk efektif rataan bulanan ini dapat dilihat kapan Danau Toba kelebihan (surplus) atau kekurangan (deficit) air. Hasil analisis aliran masuk efektif ke Danau Toba dan analisis rata-rata bergerak menggambarkan adanya penurunan aliran masuk efektif ke Danau Toba mulai tahun 1970. Hal ini menyebabkan volume air yang dikandung palung danau (lake basin) berkurang sehingga tinggi muka air rataan bulanan dan debit keluaran rataan bulanan Danau Toba berkurang. Faktor-faktor yang menyebabkan terjadinya penurunan aliran masuk efektif ke Danau Toba diduga karena: (1) dioperasikannya Bendungan Siruar, (2) adanya perubahan penggunaan/penutup lahan di DTA Danau Toba walaupun informasi data penggunaan/penutup lahan yang tersedia hanya dua tahun yaitu tahun 1974 dan tahun 1985 dan penggunaan/penutup lahan ini
Keyword: