Judul: Production and Precipitation of Chitinase Enzyme from Chitinolytic Bacteria as Growth Inhibitor of Fusarium proliferatum
Abstrak: Fusarium proliferatum merupakan cendawan patogen yang menyebabkan penyakit pada bawang merah (Allium cepa L.). Cendawan ini menyebabkan pembusukan pada akar dan umbi hingga kematian tanaman. Penggunaan fungisida kimia yang berlebihan dalam mengatasinya berdampak pada lingkungan. Pemilihan penanganan dengan agens hayati merupakan alternatif mencegah dampak buruk pada lingkungan. Penelitian dengan menggunakan ekstrak tanaman dan mikrob antagonis terhadap F. proliferatum telah dilakukan, akan tetapi penggunaan ekstrak tanaman memiliki waktu yang cukup lama, dan penggunaan mikrob antagonis langsung memiliki keterbatasan aktivitas jika lingkungan tidak mendukungnya untuk hidup. Alternatif lain ialah dengan menggunakan enzim kitinase yang dihasilkan secara ekstraseluler oleh bakteri kitinolitik. Kitinase menjadi salah satu pilihan dalam pengembangan agens hayati terhadap Fusarium sp. Penelitian yang sudah dilakukan memberikan informasi bahwa bakteri yang memiliki sifat kitinolitik dapat menghambat pertumbuhan Fusarium sp., dan enzim kitinasenya mampu menghambat pertumbuhan radial miselium Fusarium sp. secara in vitro. Penelitian ini bertujuan untuk memproduksi enzim kitinase dari bakteri kitinolitik terpilih kemudian mengendapkan enzim untuk diujikan sebagai penghambat pertumbuhan F. proliferatum. Hasil seleksi beberapa isolat, didapatkan isolat SG 7 1, SG 3 A2, dan BBP 411 dapat menghasilkan enzim kitinase ekstraseluler dan berpotensi menjadi agens hayati terhadap F. proliferatum. Pengujian kitinolitik secara kualitatif dari terbentuknya zona bening pada media kolidal kitin, dengan nila indeks kitinolitik (IK) 0,1 – 0,3. Ketiga isolat mampu menghambat pertumbuhan F. proliferatum secara in vitro sebesar 38 - 42 %. Ketiga isolat menunjukkan produksi enzim optimum pada kisaran pH 6 – 8, ketiga isolat memiliki aktivitas optimum pada suhu ruang (+ 28 0 C). Pengendapan enzim dengan amonium sulfat optimum pada konsentrasi 60% jenuh dengan peningkatan aktivitas hingga 2,6 kali dibandingkan ekstrak enzim kasarnya. Pengaruh penambahan ion logam didapatkan bahwa ketiga isolat meningkat aktivitasnya hingga 74% ketika ditambahkan Mn2+, Cu2+, Mg2+, Ca2+, Na2+, Zn+, dan K2+. Senyawa etilen diamin tetraasetat (EDTA) dapat menghambat aktivitas enzim. Kitinase hasil pengendapan menunjukkan kenaikan penghambatan pertumbuhan F. proliferatum hingga 15% dibandingkan menggunakan isolat bakteri langsung. Identifikasi secara molekuler dengan 16s rRNA, didapatkan bahwa SG 7 1 dan SG 3 A2 mirip dengan Bacillus cereus dan BBP 411 mirip dengan Bacillus subtilis., Fusarium proliferatum is a fungal pathogen that causes disease in shallots (Allium cepa L.). This fungus causes the rotting of the roots and tubers to the death of the plant. Excessive use of chemical fungicides in overcoming them has an impact on the environment. The selection of treatment with biological agents is an alternative to prevent adverse effects on the environment. Research using plant extracts and microbial antagonists against F. proliferatum has been carried out, but the use of plant extracts takes a long time, and the use of direct antagonist microbes has limited activity if the environment does not support it to live. Another alternative is to use the chitinase enzyme produced extracellularly by chitinolytic bacteria. Chitinase is one of the options in the development of biocontrol agents against Fusarium sp. The results of previous studies provided information that bacteria with chitinolytic properties could inhibit the growth of Fusarium sp., and the chitinase enzyme is able to inhibit the radial growth of Fusarium sp. mycelium in vitro. This study aims
Keyword: Amonium sulfat, antagonis, Bacillus, Indeks kitinolitik

Judul: Selection and Characterization of Bacterial Chitinase  Enzyme as Biocontrol of Fusarium proliferatum
Abstrak: Tanaman bawang merah merupakan tanaman yang memiliki nilai nutrisi dan ekonomi yang penting bagi masyarakat. Produksi bawang merah terkendala oleh serangan cendawan patogen salah satunya Fusarium proliferatum. Cendawan Fusarium proliferatum menyebabkan penyakit layu dan busuk pada bawang merah. Upaya pengendalian terhadap cendawan ini umumnya menggunakan pestisida, namun penggunaan psetisida yang berlebihan akan mengakibatkan kerusakan lingkungan, resistensi patogen dan berdampak negatif terhadap kesehatan manusia. Pengendalian hayati yang dilakukan dengan memanfaatkan agen bakteri endofit. Bakteri endofit dapat menghasilkan enzim hidrolitik seperti kitinase yang bermanfaat sebagai biokontrol cendawan patogen, termasuk F. proliferatum. Penelitian bertujuan menyeleksi, mencirikan karakter enzim, dan melakukan purifikasi parsial enzim kitinase dari bakteri endofit asal bawang merah sebagai pengendali cendawan patogen F. proliferatum. Penelitian diawali dengan menapiskan empat isolat bakteri yaitu ABS 4.1.2, ABP 5.2.2, ABS 5.1 dan BBP 5.21 yang diperoleh dari penelitian sebelumnya. Penapisan dilakukan dengan menguji kemampuan bakteri tersebut dalam menghambat pertumbuhan F. proliferatum secara in vitro dengan metode dual culture dan penentuan aktivitas enzim kitinase. Isolat yang menunjukkan penghambatan terbesar dan aktivitas kitinase yang tinggi ditetapkan sebagai isolat terpilih dan diidentifikasi berdasarkan gen penyandi 16S rRNA. Isolat bakteri terpilih lalu dikultur pada media produksi dan enzim yang dihasilkan diendapkan menggunakan ammonium sulfat dan diukur aktivitas optimum kitinase berdasarkan pH dan suhu. Bobot molekul kitinase dianalisis dengan eletroforesis SDS-PAGE. Kultur sel, enzim ekstrak kasar dan enzim hasil pemekatan diuji dengan metode agar well diffusion dalam menghambat pertumbuhan F. proliferatum. Pengamatan mikroskopis dilakukan untuk mengevaluasi kerusakan hifa F. proliferatum yang disebabkan oleh kitinase. Isolat bakteri ABS 4.1.2 mampu menghasilkan enzim kitinase dan menghambat pertumbuhan F. proliferatum secara in vitro. Enzim kitinase yang dihasilkan dapat diendapkan dengan ammonium sulfat pada konsentrasi 60 %. Aktivitas optimum enzim ekstrak kasar dan enzim hasil pemekatan pada pH 7 dengan aktivitas optimum enzim ekstrak kasar pada suhu 35 oC dan enzim hasil pemekatan pada 45 oC. Bobot molekul enzim ekstrak kasar sebesar 65 kDa dan 32 kDA dan enzim hasil pemekatan sebesar 32 kDa. Isolat ABS 4.1.2 diidentifikasi sebagai Pseudomonas aeruginosa. Kitinase yang dihasilkan ABS 4.1.2 menunjukkan penghambatan pertumbuhan terhadap F. proliferatum. Perlakukan enzim ektrak kasar dan enzim hasil pemekatan menunjukkan perubahan morfologi meliputi lisis, pembengkakan dan pembentukan vakulola pada hifa F. proliferatum. Hasil tersebut menunjukkan bahwa isolat ABS 4.1.2 dan enzim kitinase yang dihasilkan dapat dijadikan kandidat biokontrol F. proliferatum., The onion (Allium cepa L.) is a plant with essential nutritional and economic value for the community. The phytopathogenic fungal attacks, such as Fusarium proliferatum, constrain onion production. Fusarium proliferatum causes wilt and rot diseases in onions. Pesticides are generally used to control this fungus, but excessive use of pesticides causes environmental damage, pathogen resistance, and negative impacts on human health. Biological control is carried out by utilizing endophytic bacterial agents. Endophytic bacteria can produce hydrolytic enzymes such as chitinase, which are useful for the biocontrol of pathogenic fungi, including F. proliferatum. This study aims to select, characterize, and obtain partial purification of the chitinase enzyme from onion endophytic bacteria as a control for the phytopathogenic fungus F. proliferatum. The study was started by screening four bacterial isolates, ABS 4.1.2, ABP 5.2.2, ABS 5.1,
Keyword: Biocontrol, chitinase, Fusarium proliferatum, Pseudomonas aeruginosa

Judul: Persamaan Korteweg-de Vries Orde Tinggi untuk Menggambarkan Gerak Gelombang Internal
Abstrak: The ocean can be considered of layers of fluid that each layer has a constant density. Internal waves are waves occur in the interface of every'two layers with different density. Because it occures underneath the surface of the ocean, it is invisible. One of internal waves is internal solitary waves. One of formulation that can describe intemal waves movement is KdV equation. KdV equation is derived from governing equations of ideal fluid in Lagrange formulation using asymptotic method. On this thesis, KdV equation is derived in higher order and then its solution is derived by using internal solitary waves assumption. An example of a two-layer fluid is a case will be used. By using Mathematica6 software, for this case will be obtained the coefficients in lower and higher order explicitly and the corresponding between coefficients and relative lower layer depths and fluid depths, the corresponding between coefficients and relative densities, and also observed the different between solitary waves in lower and higher order.
Keyword: