Judul: Identifikasi Forma Specialis Fusarium oxysporum Asal Bibit Kelapa Sawit dan Seleksi Agens Biokontrol
Abstrak: Penyakit layu fusarium pada tanaman kelapa sawit yang disebabkan oleh F. oysporum f.sp. elaeidis (Foe) merupakan salah satu penyakit penting pada kelapa sawit di berbagai negara produsen kelapa sawit. Di Indonesia, Foe termasuk Organisme Pengganggu Tanaman Karantina Golongan A1 (OPT KA1) atau belum pernah dilaporkan ada di Indonesia. Hasil penelitian terbaru menunjukkan Fusarium spp. berasosiasi dengan berbagai gejala pada kelapa sawit, salah satunya F. oxysporum. Meskipun belum ada laporan yang relevan tentang kehilangan hasil kelapa sawit yang disebabkan oleh penyakit fusarium, eksplorasi agens biokontrol sebagai upaya mencari pengendalian berbasis biokontrol untuk mengantisipasi adanya introduksi patogen tersebut. Penelitian ini bertujuan mengetahui forma specialis F. oxysporum asal bibit kelapa sawit berdasarkan karakter morfologi dan teknik molekuler, serta memperoleh cendawan agens biokontrol yang efektif dalam mengendalikan F. oxysporum pada bibit kelapa sawit in vitro dan in planta. Identifikasi morfologi tiga isolat cendawan F. oxysporum dilakukan pada media PDA dan BLA, identifikasi karakter molekuler dengan teknik PCR dan sikuensing menggunakan primer EF 1 5' -A TGGGT AAGGA(A/G) GACAAGAC-3’ dan EF 2 reverse 5'GGA(G/A)GTACCAGT(G/C)ATCATGTT- 3'. Pengujian cendawan rizosfer calon agens biokontrol dilakukan dengan uji patogenisitas pada tiga benih uji (kacang tanah, mentimun dan cabai). Cendawan yang dinyatakan berpotensi sebagai agens biokontrol selanjutnya diuji kemampuan antagonisme untuk mengetahui potensi dan mekanisme biokontrolnya. Isolat cendawan rizosfer yang berpotensi sebagai agens biokontrol dan empat isolat agens biokontrol koleksi Lab. Mikologi, IPB diidentifikasi berdasarkan karakter morfologi pada media PDA dan WA. Uji antagonisme agens biokontrol dilakukan dengan uji kultur ganda dan pembentukan senyawa volatil in vitro. Pengujian keefektifan tujuh agens biokontrol terhadap tiga isolat F. oxysporum patogenik pada kelapa sawit dilakukan di rumah kaca kebun percobaan Cikabayan, IPB. Berdasarkan karakter morfologi ketiga isolat cendawan patogen diidentifikasi sebagai F. oxysporum. Hasil analisis kekerabatan melalui konstruksi pohon filogenetik menunjukkan F. oxysporum isolat Cikabayan B memiliki kedekatan dengan F. oxysporum f.sp. elaeidis NRLL 22543 asal Suriname. Sementara F. oxysporum isolat Cikabayan A dan isolat Papua tidak berkerabat dekat dengan F. oxysporum f.sp. elaeidis NRLL 22543 asal Suriname, akan tetapi tetap menjadi satu clade monofilotik dengan F. oxysporum f.sp. elaeidis NRLL 22543 asal Suriname. Ketiga isolat F. oxysporum asal bibit kelapa sawit juga memiliki homologi yang tinggi dengan F. oxysporum f.sp. elaeidis NRLL 22543 asal Suriname kecuali isolat Papua. Analisis pairwise distance dengan F. oxysporum f.sp. elaeidis NRLL 22543 asal Suriname menunjukkan bahwa F. oxysporum isolat Cikabayan B, Cikabayan A, dan Papua memiliki jarak genetik 2 yang bervariasi, berturut-turut adalah 0.004, 0.006, dan 0.042. Inokulasi buatan ketiga isolat F. oxysporum pada bibit kelapa sawit in planta menunjukkan bahwa ketiga isolat tersebut bersifat patogenik terhadap bibit kelapa sawit. Hasil uji patogenisitas beberapa cendawan rizosfer di peroleh tiga isolat cendawan rizosfer yang berpotensi sebagai agens biokontrol dan empat isolat agens biokontrol koleksi Laboratorium Mikologi Tumbuhan. Berdasarkan hasil identifikasi morfologi tujuh isolat agens biokontrol, empat isolat termasuk dalam genus Trichoderma, yaitu T. harzianum isolat Gadingrejo 1, T. harzianum isolat Gadingrejo 2, dan T. harzianum isolat Jambi; T. virens isolat Jambi; dan T. inhamatum isolat Jambi, sedangkan dua isolat lainya adalah Gliocladium fimbriatum isolat KLMT 1 dan G. fimbriatum isolat KLMT 2. Hasil uji antagonisme menujukkan tujuh isolat agens
Keyword: Fusarium oxysporum f.sp. nekrotik akar, elaeidis, translation elongation factor -1α, senyawa volatil, Trichoderma inhamatum

Judul: The Potential Of Actinomycetes from Rhizosphere of Liliaceae Plants as Biological Control Agents of Fusarium Basal Rot Disease (Fusarium oxysporum f. sp. cepae) on Shallots
Abstrak: Penyakit moler merupakan salah satu penyakit penting pada tanaman bawang merah yang disebabkan oleh Fusarium oxysporum f. sp. cepae. Patogen ini merupakan patogen tular tanah, yang dapat bertahan di tanah meskipun tidak ada inang. Pengendalian F. oxysporum f. sp. cepae dengan menggunakan fungisida sintetik merupakan pengendalian yang paling diminati oleh petani karena lebih praktis diaplikasikan dan mudah didapatkan. Namun, aplikasi fungisida sintetik ternyata belum efektif dalam mengendalikan penyakit moler. Selain itu, penggunaan fungisida sintetik yang tidak bijaksana dapat menyebabkan resistensi patogen. Keberhasilan aktinomiset dalam mengendalikan penyakit tular tanah telah banyak dilaporkan. Namun, pemanfaatan aktinomiset untuk mengendalikan penyakit moler belum banyak dilakukan. Aktinomiset merupakan penghasil antibiotik terbesar yang potensial dimanfaatkan dalam pengendalian penyakit tanaman. Penggunaan aktinomiset yang diisolasi dari tanaman Liliaceae diharapkan dapat menekan penyakit moler sekaligus memacu pertumbuhan tanaman. Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi dan menyeleksi isolat-isolat aktinomiset yang dapat menekan pertumbuhan F. oxysporum f. sp. cepae sekaligus memacu pertumbuhan tanaman bawang merah. Penelitian terdiri dari empat tahap, yaitu: isolasi, seleksi, karakterisasi dan identifikasi isolat aktinomiset yang potensial. Isolat yang berhasil diisolasi diuji keamanan hayatinya melalui uji hipersensitivitas, uji patogenisitas dan uji hemolisis. Isolat yang lolos seleksi pada ketiga uji tersebut selanjutnya diuji kemampuan antagonismenya terhadap F. oxysporum f. sp. cepae melalui uji dual culture. Isolat yang memberikan penghambatan tertinggi diuji keefektifannya di rumah kaca. Isolat tersebut juga dikarakterisasi kemampuan fisiologinya dalam menghasilkan enzim kitinase, melarutkan fosfat, memproduksi IAA dan menambat nitrogen. Isolat-isolat potensial diidentifikasi secara molekuler menggunakan primer spesifik aktinomiset 27F dan 16Sact1114R. Isolat terbaik yang mampu menekan F. oxysporum f. sp. cepae baik secara in vitro maupun in vivo dianalisis kandungan senyawa bioaktifnya dengan menggunakan Gas Chromatography- Mass Spectrometry (GC-MS). Sebanyak 43 isolat aktinomiset berhasil diisolasi dari tanaman Liliaceae dan 14 isolat diantaranya tidak bersifat patogen pada tumbuhan dan mamalia. Pada pengujian in vitro, 14 isolat tersebut menghasilkan penghambatan terhadap F. oxysporum f. sp. cepae sebesar 3,67-53,67%. Sebanyak 13 isolat mampu memproduksi enzim kitinase dengan indeks kitinolitik sebesar 0,31-1,38. Berdasarkan hasil uji in vitro, sebanyak lima isolat yaitu: ABF 42, ABF 59, ACF 45, AEF 35 dan AEF 45 potensial untuk diuji secara in vivo. Pada pengujian pemacuan pertumbuhan menggunakan metode ragdoll seed germination, isolat ABF 42, ABF 59, AEF 45 dapat meningkatkan daya berkecambah. Isolat ABF 42, ACF 45, AEF 35, AEF 45 dapat meningkatkan panjang hipokotil. Isolat ACF 45 dan AEF 45 dapat meningkatkan bobot basah bawang merah. Berdasarkan hasil pengujian di rumah kaca, perlakuan lima isolat potensial dapat menurunkan kejadian penyakit moler baik pada varietas Bauji maupun varietas Tuk Tuk. Penekanan penyakit tertinggi pada varietas Bauji ditunjukkan oleh perlakuan isolat ABF 59 dan ABF 42 yang diisolasi dari tanaman Zephyrantes rosea. Pada varietas Tuk Tuk penekanan penyakit tertinggi ditunjukkan oleh isolat AEF 45 yang diisolasi dari tanaman Hymenocallis littoralis. Isolat ABF 42, ABF 59 dan AEF 45 juga dapat meningkatkan pertumbuhan tanaman bawang merah. Lima isolat potensial memiliki karakter fisiologi dapat melarutkan fosfat dan menghasilkan IAA. Indeks pelarutan fosfat tertinggi ditunjukkan oleh isolat ACF 45 sebesar 2,06. Produksi IAA tertinggi ditunjukkan oleh isolat AEF 45 sebesar 82,88 ppm. Isolat ABF 42, ACF 45, dan AEF 45 dapat
Keyword: busuk pangkal umbi, enzim kitinase, PGPR, PHT, Streptomyces spp.

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: