Judul: Deteksi Antibodi Terhadap Simian Retrovirus Tipe-D Serotipe-2 (Srv-2) Pada Kera Di Indonesia Menggunakan Teknik Enzymelinked Immunosorbnet Assay (Elisa)
Abstrak: SR V dari keluarga Retroviridae dikenal sebagai penyebab gangguan sistem pertahanan tubuh pada primata genus Macaca (Gardner et al., 1988; Gardner, M.B., 1996; Gyuris et aI., 1993) sejak virus ini telah diisolasi dan diidentifikasi pada beberapa fasilitas penelitian primata di Amerika Serikat (Gardner et al., 1988). Simian Retrovirus tipe D (SRV) dikenal endemik pada primata genus Macaca asal Asia (Gardner ,M.B.,1996; Gardner et al., 1988). Prototipe dari virus ini dikenal dengan nama Mason Pfizer Monkey Virus (MPMV) yang telah diisolasi dari Macaca mulatta pada tahun 1970 di Mason Institute, Worchester, MA. SRV terbagi atas beberapa serotipe yang masing-masing mempunyai karakteristik yang berbeda-beda. Umumnya, pada transmisi SRV secara eksperimental akan mengakibatkan gejala umum berupa penurunan berat badan, adanya infeksi sekunder akibat imunosupresi, lymphadenopathy, atropi timus, dan anemia (Gardner et al.,1988). Selain hal tersebut diatas, virus ini juga dapat menyebabkan penyakit nononkogenik termasuk imunodefisiensi (Bandineui, 1985). Penelitian terhadap adanya infeksi SRV pada primata dari jenis kera belum banyak dilakukan sehingga informasi tentang hal tersebut masih sangat minim. Pada beberapa penelitian yang dilakukan untuk melihat ada tidaknya kemungkinan primata dari jenis kera terinfeksi oleh SRV, telah dilaporkan kemungkinan adanya antibodi terhadap SRV meskipun dalam jumlah yang relatif kecil (Lowenstine et al., 1986; Kalter et al., 1997; Iskandriati et aI., 1998a). Dengan demikian dipandang perlu untuk dilakukan penelitian lebih Ian jut tentang kemungkinan adanya infeksi SRV pada kera, terutama terhadap SRV Tipe-D serotipe-2 (SRV-2). Hal ini mengingat beberapa jenis kera termasuk jenis satwa yang sudah diambang kepunahan (endangered species). Penelitian ini dilakukan dengan tujuan untuk mendeteksi ada tidaknya antibodi terhadap Simian Retrovirus Tipe-D Serotipe-2 (SRV-2) pada kera di Indonesia yang selanjutnya dapat dijadikan acuan untuk mengetahui kondisi keterpaparan primata dari jenis kera yang ada di Indonesia terhadap SRV-2. Penelitian dilal."ukan dengan pengujian serologis terhadap 205 sampel kera dari tiga spesies kera yang ada• di indonesia. Uji serologis yang dilakukan menggunakan Enzyme-lynked Immunosorbent Ass£ry (ELISA) untuk penapisan (screening) dan Western Blot untuk peneguhan (confirmatory).
Keyword: 

Judul: Identification and Characterization of Type D Simian Retrovirus from Macaca fascicularis, M. nemestrina and Presbytes spp. in Indonesia.
Abstrak: Simian Retrovirus tipe D eksogenus (SRV) merupakan salah satu patogen penyebab sindroma penurunan fungsi kekebalan tubuh (acquired immunodeficiency syndrome, AIDS) pada satwa primata genus Macaca asal Asia. Sekitar tahun 1980-an, isolat-isolat SRV dari Macaca hanya dilaporkan identifikasinya di beberapa pusat penelitian primata di Amerika Serikat, di luar negara asalnya dan setelah satwa-satwa tersebut dipindahkan ke lingkungan yang baru. Retrovirus endogenus dari satwa primata jenis lutung yang diidentifikasi sebagai PO-1-Lu dianggap sebagai asal muasal dari SRV. Pada penelitian ini, dilaporkan untuk pertama kalinya isolasi, perbanyakan virus serta karakterisasi molekular dari SRV yang secara alami menginfeksi satwa primata genus Macaca dari habitat alam di negara asalnya, dalam hal ini Indonesia. Sebagai tambahan, karakterisasi molekular SRV endogenus dari satwa primata lutung Indonesia juga dilakukan. Sel darah perifer berinti tunggal (peripheral blood mononuclear cells, PBMC) asal Macaca fascicularis (Mf) dan M. nemestrina (Mn) diko-kutivasi dengan sel lestari limfosit B manusia, sel Raji, perubahan kelainan sel berupa synctia dapat diamati secara mikroskopis dan diteguhkan dengan uji Immunofluorescense menggunakan antibodi spesifik SRV-2. Analisis Immunoblot terhadap isolat Mf- ET1006 yang telah dimurnikan dari supernatan biakan sel menunjukkan bahwa bagian protein inti (core) dan glikoprotein pembungkus (envelope) bereaksi dengan beberapa serum anti-SRV yang diproduksi di kelinci. Analisis urutan nukleotida dari isolat Mf pada daerah en menunjukkan tingkat homologi yang tinggi (94%) terhadap SRV-2. Sementara itu, tingkat homologi pada daerah env dari isolat Mn adalah 74% sampai dengan 77% terhadap SRV-1, SRV-2, SRV-3 dan isolat Mf, namun menunjukkan tingkat homologi yang lebih tinggi (95%) terhadap SRV PO-1-Lu. Penclitian ini menyimpulkan bahwa isolat SRV dari Mn kemungkinan berbeda dari isolat-isolat SRV lainnya yang telah dipublikasikan. Walaupun secara molekuler isolat Indo-presbytis memiliki kekerabatan dekat dengan SRV-6 namun dari hasil uji-uji lainnya belum dapat disimpulkan bahwa isolat ini termasuk kelompok retrovirus eksogen Identifikasi isolat Mn menunjukkan kemiripan yang dekat terhadap PO- 1-Lu (diisolasi dari Trachypithecus obscurus) mengindikasikan bahwa zoonoses terjadi secara aktif antar primata di Asia. Penularan silang antar-jenis di antara satwa primata dimungkinkan karena beberapa satwa menempati habitat geograpis yang sama., Simian Type D retroviruses (SRVs) are one of the causative agents of simian acquired immunodeficiency syndrome (AIDS) in Asian macaques. In the past, SRV isolates from macaques had only been identified at the US primate centers, outside the country of origin and after the animals had been introduced into a new enviroment. The endogenous Type D retrovirus of langurs (PO-1-Lu) has previously been considered a progenitor to the exogenous type D retroviruses. In this study, we reported the first isolation, cultivation and molecular characterization of the Type D Simian Retrovirus naturally infecting wild caught macaques in their natural habitats in the country of origin, in this case, Indonesia. In addition the molecular characterization of the endogenous type D retrovirus from Indonesian langurs has also been observed. When peripheral blood mononuclear cells (PBMC) from Macaca fascicularis (Mf) and M. nemestrina (Mn) were cocultured with Raji human B-cell line, syncytia were observed microscopically and confirmed by immuno- fluoresence assay using antibody to SRV-2. Immunoblot analysis of purified Mf-ET1006 from cell culture supernatans demonstrated that the viral core and envelope proteins reacted with several rabbit
Keyword: Macaca fascicularis, Isolation, isolate SRV, DNA provirus

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: