Judul: Penapisan Virtual Senyawa Aktif Ginseng (Panax ginseng) Terhadap PPARγ dalam Meningkatkan Sensitivitas Insulin
Abstrak: Perubahan demografi di Indonesia menyebabkan timbulnya penyakit degeneratif seperti Diabetes Melitus (DM). DM merupakan gangguan metabolik yang ditandai dengan kondisi hiperglikemia. Sebanyak 90 % kasus DM didominasi oleh DM tipe 2. PPARγ merupakan faktor transkripsi yang berperan mengekspresikan adipogenesis dalam peningkatan senstivitas insulin. Ginseng (Panax ginseng) merupakan tumbuhan herbal yang banyak digunakan dalam pengobatan tradisional dan berpotensi sebagai agonis PPARγ. Penelitian ini bertujuan menyeleksi dan memprediksi senyawa aktif ginseng yang berpotensi sebagai agonis PPARγ dalam meningkatkan sensitivitas insulin pada penderita DM tipe 2. Penelitian dimulai dengan penapisan virtual 72 ligan menggunakan PyRx, analisis toksisitas dan bioavaibilitas, penambatan molekuler menggunakan Autodock Vina, dan visualisasi 2D menggunakan LigPlot+. Terdapat 7 ligan yang memiliki energi afinitas mendekati rosiglitazone dan asam linolenat yaitu ginsenoside Rb1, Rb3, Rc, Ra2, floralginsenoside B, ginsenoside Rd, dan floralginsenoside C. Ginsenoside Rb1 memiliki potensi agonis terbaik berdasarkan energi afinitas sebesar -7.70 kkal/mol, interaksi, dan sisi aktif pengikatan.
Keyword: diabetes, ginseng, penapisan virtual, PPARγ

Judul: Analisis Penambatan Molekul Senyawa Aktif Brotowali (Tinospora cordifolia) pada Enzim PPAR-γ sebagai agen Antidiabetes
Abstrak: Penambatan molekuler merupakan metode komputasi yang digunakan untuk memprediksi interaksi antara ligan dan reseptor. Senyawa aktif dari Brotowali (Tinospora cordifolia) telah terbukti memiliki potensi sebagai anti diabetes namun potensi dari masing-masing senyawa belum diketahui. Simulasi penambatan molekuler telah dilakukan untuk menguji potensi dari masing-masing senyawa terhadap enzim PPAR-γ dengan parameter energi ikat, binding site similarity (BSS) dan Konstanta Inhibisi. Senyawa aktif yang digunakan adalah Berberine, Isocolumbin, Jatrorrhizine, Magnoflorine, Palmatine dan Tinosporin sebagai ligan uji. Senyawa kontrol yang digunakan adalah Rosiglitazone. Hasil simulasi menunjukan tidak ada senyawa aktif brotowali yang memiliki energi ikat lebih kuat dibandingkan dengan energi ikat rosiglitazone. Presentase BSS yang paling besar dimiliki oleh Berberine dengan presentase sebesar 52%.
Keyword: Enzim PPAR-γ, penambatan molekuler, Tinospora cordifolia

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: