Judul: Seleksi dan Identifikasi Bakteri Rizosfer yang Berpotensi sebagai Agens Antagonis Fusarium oxysporum pada Bawang Merah yang diberi Kombinasi Pupuk Organik dan Anorganik.
Abstrak: Penyakit layu fusarium merupakan salah satu penyakit penting tular tanah yang bisa menurunkan produksi bawang merah. Pupuk organik memiliki kelebihan diantaranya memperbaiki sifat fisik, kimia dan biologi tanah sehingga dapat meningkatkan aktivitas mikroba pada tanah yang berperan sebagai antagonis terhadap penyakit layu fusarium. Penelitian ini bertujuan mendapatkan isolat bakteri antagonis yang potensial mengendalikan penyakit layu fusarium (Fusarium oxysporum) dari pertanaman bawang merah yang diberi kombinasi pupuk organik dan anorganik. Sampel yang digunakan dalam penelitian berupa sampel tanah yang diperoleh dari Sukorejo, Nganjuk Jawa Timur. Hasil penelitian menunjukkan bahwa penggunaan pupuk organik dan kombinasinya dengan pupuk anorganik mempengaruhi populasi bakteri rizosfer. Sebanyak 71 isolat dari 512 isolat hasil isolasi, tidak bersifat fitotoksik dan patogenik terhadap mamalia setelah dilakukan uji hipersensitif pada daun tembakau dan uji hemolisis pada media agar darah. Uji daya hambat in vitro kandidat agens antagonis dilakukan dengan metode kultur ganda dan uji produksi senyawa volatil. Berdasarkan hasil uji in vitro diperoleh sebanyak 9 isolat yang berpotensi sebagai antagonis dan memiliki persentase daya hambat di atas 30%. Isolat yang paling tinggi penghambatannya adalah isolat bakteri P1A4B47. Identifikasi berdasarkan analisis sekuen nukleotida gen 16S rRNA hasil sekuensing produk PCR dengan primer 27F dan 1492R menunjukkan bahwa isolat bakteri P1A4B47 memiliki derajat kemiripan sebesar 99.26% dengan Pseudomonas aeruginosa.
Keyword: agens biokontrol, bakteri antagonis, bawang merah, PHT, Pseudomonas aeruginosa

Judul: Seleksi dan Karakterisasi Bakteri Endofit serta Senyawa Bioaktif yang dihasilkan sebagai Pengendali Pertumbuhan Fusarium proliferatum.
Abstrak: Bawang merah (Allium cepa L.) merupakan tanaman hortikultura yang memiliki nilai ekonomis tinggi. Faktor penurunan produksi bawang merah salah satunya penyakit layu yang disebabkan oleh serangan F. proliferatum. Serangan F. proliferatum menyebabkan bawang merah mengalami kematian hingga 62.2%. Fusarium proliferatum menyerang pada fase pertumbuhan tanaman yang ditandai warna akar menjadi coklat kekuningan, terbentuk nekrotik, lembab, mudah hancur dan membuat umbi busuk sehingga menyebabkan penurunan hasil panen. Upaya pengendalian F. proliferatum umumnya menggunakan pestisida sintetis, namun keberadaannya di lingkungan dapat merugikan, berbahaya bagi manusia akibat residu yang tertinggal pada tumbuhan dan resistensi patogen. Pengendalian secara hayati F. proliferatum yaitu menggunakan agens biologi misalnya bakteri endofit. Bakteri endofit diketahui memiliki kemampuan untuk menghasilkan senyawa bioaktif anticendawan yang efektif melawan patogen tanaman seperti bawang merah, jagung, padi, dsb. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan untuk menyeleksi dan melakukan karakterisasi bakteri endofit penghasil senyawa bioaktif yang dapat menghambat pertumbuhan F. proliferatum. Isolat bakteri endofit dan cendawan patogen F. proliferatum menggunakan isolat hasil penelitian sebelumnya dengan kode ABP5.2, BBP5.2, DBP4.1, dan DBP4.2. Metode yang digunakan mencakup 1) uji hambatan bakteri endofit terhadap F. proliferatum, 2) uji hipersensitivitas, patogenisitas, dan hemolisis, 3) identifikasi isolat terpilih berdasarkan gen 16S rRNA, 4) ekstraksi senyawa bioaktif dari bakteri endofit, 5) uji aktivitas anticendawan ekstrak kasar, 6) fraksinasi senyawa antimikrob dari bakteri endofit potensial, 7) uji bioautografi senyawa antimikrob, serta 8) identifikasi senyawa antimikrob dengan GC-MS. Isolat bakteri endofit asal tanaman bawang merah ABP5.2, BBP5.2, dan DBP4.1 memiliki aktivitas penghambatan terhadap F. proliferatum serta tidak bersifat patogen bagi manusia dan tanaman. Isolat ABP5.2 terindentifikasi memiliki kemiripan dengan Pseudomonas aeruginosa, sedangkan isolat BBP5.2 dan DBP4.1 memiliki kemiripan dengan Myroides profundi. Isolat BBP5.2 mampu menekan pertumbuhan cendawan patogen tertinggi yaitu sebesar 68.15% melalui mekanisme antibiosis secara langsung yaitu produksi senyawa anticendawan. Berdasarkan analisis Gas Chromathography Mass Spectrophotometry, senyawa yang dihasilkan ekstrak kasar dari isolat BBP5.2 antara lain Hexadecanoic acid, 9- octadecenoic acid, linoleic acid dan piperine.
Keyword: Allium cepa, antifungal compounds, Myroides profundi, 16S rRNA

Judul: Thermal Characteristics and Dynamics of Tropical Cyclone over Western North Pacific Ocean: A Case Study of Typhoon Songda (Chedeng) 2011
Abstrak: The frequent occasion of Tropical Cyclone (TC) over Western North Pacific (WNP) Ocean lies from 10˚N to 26˚N and 121˚E to 170˚E. Sources of TC development come from warm ocean temperature where latent heat is released during condensation processes and subsequently concentrated in the boundary layer. Relative humidity at 850-700 hPa is responsible to produce the most intense storm. Meanwhile, weak vertical wind shear between 850-200 hPa is one of the dynamical factors that lead to the development of TC. Pressure level of 850-200 hPa is chosen to minimize the thermodynamic effect in the lower troposphere. Typhoon Songda (Chedeng in the Philippines) or TSC lasted from May 18th to 30th, 2011 and strengthened into powerful Super Typhoon stage between May 24th and 27th. Long curving track and the exhibition of all sequences of TC life cycle, TSC is then considered as an ideal case of TC. The objective of the study with case of TSC is to investigate the role of thermal characteristics and dynamics on TC intensity. The research is carried out by using Advanced Research of Weather Research and Forecasting model (WRF ARW model) version 3.3. Two domains are employed in the model. The first domain situate from 02˚N to 40˚N and 118˚E to 149˚E and cover spatial resolution () of 33.1 km. The second domain situate from 09˚N to 27˚N and 119˚E to 132˚E with of 11 km. Timestep of the model () is 120 seconds. The model is supported by the following physical parameterization, i.e., Yonsei University Scheme (YSU) in the boundary layer, Kain-Fritsch scheme (KF) in the cumulus, and WRF Single-Moment 3-class scheme in the microphysics. Initial meteorological condition prior to the formation of the cyclone is generated using WRF ARW standard-release model. Sensitivity of the model output is obtained from a selected single-parameter change scenarios, namely, 10 % to 20 % decrease and increase of wind shear initial data at 850-200 hPa, and by 10 % to 20 % decrease of relative humidity initial data at 850-700 hPa. The result showed that the negative correlations between wind shear and intensity are found in wind shear scenarios. Wind shears of 10 ms-1 which lead to strengthening of the wind intensity in the early period of Typhoon development are found in wind shear scenarios. The effect of wind shear changes on wind intensity is statistically significant in the 20 % wind shear scenarios. During mature stage, weak wind intensity occurred when wind shear increase as given in the WRF standard-release and the 20 % decreasing scenario. Different situation is found in the 20 % increasing scenario where wind shear tend to weak and lead to strong wind intensity at this stage. Meanwhile, the reduction of moisture supply at 850-700 hPa resulting from 20 % decreasing relative humidity play a major role in the weakening of wind intensity and reduces mechanical energy of the cycle process as much as 300 J kg-1.
Keyword: