Judul: Karakterisasi Molekuler Spodoptera Litura Nucleopolyhedrovirus (SpltNPV) dari Kabupaten Sukabumi, Jawa Barat.
Abstrak: Ulat grayak (Spodoptera litura) adalah salah satu serangga hama pertanaman penting hampir di seluruh dunia. Serangan dari hama ini mengakibatkan penurunan hasil produksi hingga 90% di beberapa negara. Nucleopolyhedrovirus diketahui memiliki inang lebih dari 400 spesies serangga. S. litura NPV merupakan anggota Alphabaculovirus. Keragaman genetik tidak hanya terjadi pada spesies yang berbeda, pada spesies yang sama dapat terjadi perbedaan genetik yang terpengaruh lingkungan hidupnya. Penelitian ini bertujuan mengetahui karakterisasi molekuler NPV pada larva S. litura dengan menggunakan skuen DNA polymerase. Isolat NPV merupakan koleksi Laboratorium Patologi Serangga yang berasal dari Kabupaten Sukabumi. DNA isolat tersebut kemudian diekstraksi lalu digunakan sebagai template yang akan diamplifikasi dengan primer yang telah disediakan, lalu dilakukan uji homologi dan filogeni. Hasil amplifikasi menunjukkan bahwa isolat SpltNPV Kab. Sukabumi memiliki hubungan kekerabatan yang tinggi dengan isolat NPV yang menginfeksi genus Spodoptera asal Cina, Australia, Kanada dan Amerika Serikat dengan nilai homologi nukleotida dan asam amino lebih dari 80%. Berdasarkan hasil analisis filogeni, isolat SpltNPV Kab. Sukabumi termasuk dalam grup yang sama dengan NPV yang menyerang genus Spodoptera dari Cina, Australia, Kanada dan Amerika Serikat.
Keyword: DNA polymerase, identifikasi, keragaman genetik

Judul: Karakterisasi Molekuler Spodoptera litura Nucleopolyhedrovirus (SpltNPV) Asal Bogor Menggunakan Gen Late Expression Factor-8
Abstrak: Spodoptera litura nucleopolyhedrovirus (SpltNPV) merupakan salah satu agens pengendalian hayati yang telah berhasil dikembangkan sebagai bioinsektisida untuk mengendalikan ulat gayak S. litura. NPV bersifat spesifik inang, sehingga hanya menyerang serangga tertentu. Metode deteksi dengan polymerase chain reaction (PCR) telah digunakan untuk mengidentifikasi Baculovirus. Gen ac17, lef-2, polh, p35 dan 16 s RNA, merupakan gen yang sering digunakan untuk mengidentifikasi NPV. Namun gen lef-8 merupakan gen yang paling conserve untuk digunakan dalam identifikasi NPV. Tujuan penelitian ini adalah mengetahui karakteristik molekuler SpltNPV melalui urutan nukleotida dan asam amino menggunakkan gen lef-8. Isolat NPV diperbanyak di Laboratorium Patologi Serangga. DNA NPV dimurnikan menggunakan metode CTAB. Amplifikasi DNA SpltNPV menggunakan primer forward TCCAAACGTCGATTACG dan reverse GACAGGCAGGTTTCTAA. Karakteristik homologi dan filogeni digunakan untuk mengetahui kekerabatan SpltNPV isolate Bogor dengan NPV dari negara lain yang telah dilaporkan di situs GenBank. Gen lef-8 dapat digunakan untuk mengidentifikasi SpltNPV. Berdasarkan urutan nukleotida dan asam amino gen lef-8, homologi SpltNPV isolat Bogor memiliki kemiripan paling tinggi dengan SpltNPV isolat Jerman yaitu sebesar 99% dan 94%. Berdasarkan filogeni urutan gen lef-8, SpltNPV isolat Bogor masuk ke dalam kelompok yang sama dengan NPV yang menyerang genus Spodoptera dan Amsacta.
Keyword: Gen lef-8, Karakterisasi Molekuler, NPV, Spodoptera litura

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: