Judul: Distribusi Sedimen Pantai di Ujung Genteng, Sukabumi, Jawa Barat
Abstrak: Distribusi sedimen pantai Ujung Genteng dipengaruhi oleh karakteristik hidrooseanografi Samudera Hindia. Penelitian ini bertujuan mempelajari sebaran jenis dan ukuran butir sedimen pantai dan kaitannya dengan kemiringan pantai dan dinamika perairan Samudera Hindia. Sampel sedimen diambil di enam titik pengamatan dan dianalisis dengan menggunakan metode pengayakan kering. Data hidrooseanografi di wilayah Ujung Genteng dianalisis secara spasial dan temporal, dan data kemiringan pantai dianalisis secara spasial. Pada Musim Barat, tinggi gelombang berkisar 0.99-2.95 m dengan kecepatan arus 0.10-127.60 cm s-1 dan curah hujan 321-590 mm/bulan, sedangkan pada Musim Timur tinggi gelombang berkisar 0.96-3.74 m dengan kecepatan arus berkisar 0.14-104.87 cm s-1 dan curah hujan 0-59 mm/bulan. Tipe kemiringan pantai di seluruh stasiun termasuk kategori pantai datar. Sedimen di Ujung Genteng didominasi oleh pasir sangat kasar dan pasir sedang dimana semakin kearah selatan ukuran butir sedimen semakin besar. Tinggi gelombang dan kecepatan arus yang lebih besar di bagian selatan menyebabkan ukuran butir sedimen yang lebih kasar dan kemiringan pantai yang lebih besar dari pada di bagian utara.
Keyword: sedimen, kemiringan pantai, Ujung Genteng, arus, gelombang

Judul: Sebaran sedimen tersuspensi kaitannya dengan pola arus di pesisir eretan, Indramayu, Jawa Barat
Abstrak: Salah satu aspek yang menjadi permasalahan didaerah pesisir dalam pengembangan potensi dan sumberdaya kelautannya adalah tingkat kekeruhan perairan yang ekstrim yang diakibatkan transpor sedimen yang kurang terkendali selain abrasi dan akresi pantai. Kekeruhan perairan merupakan salah satu masalah pada ekosistem perairan pesisir, tingginya tingkat kekeruhan serta transport sedimen yang tidak terkendali dapat menimbulkan terjadinya sedimentasi dan resuspensi yang berakibat pada pendangkalan alur pelayaran, penurunan kualitas perairan yang berakibat pada turunnya produksi perikanan . Tujuan untuk mempelajari pola sebaran sedimen tersuspensi berdasarkan pola gerak air yang disebabkan oleh angin, gelombang, arus, dan pasang surut. Pola sebaran sedimen yang di ukur kemudian di bandingkan dengan hasil pengolahan data citra. Tinggi gelombang hasil pengukuran dengan Tide Gauge (SP2 Cyberd 1NC. USA) pada tanggal 19 - 25 Juli 2007 di Pantai Eretan berkisar antara 0 – 1.20 m dengan periode antara 0 – 2.24 detik. Arah datang gelombang dominan dari arah timur. Sedangkan untuk gelombang hasil pengunduhan selama 20 tahun diketahui bahwa tinggi gelombang signifikan terjadi pada bulan Februari sebesar 2.09 m di ikuti dengan tinggi gelombang pada bulan Desember yang mencapai 2.10 m sedangkan untuk musim timur dimana diwakili oleh bulan juli sebesar 1.38 m dan bulan Agustus sebesar 1.31 m. Data ini sesuai dengan data Kajian yang dilakukan Pemerintah Kabupaten Indramayu pada tahun 1996 yang menyatakan bahwa tinggi gelombang di pantai Eretan berada pada kisaran diatas 1m (BAPPEDA Jawa Barat, 2007). Kecepatan rata-rata arus berkisar antara 0.012 - 0.024 m/det. Jika didasarkan pada posisi bujur dan lintang, dapat dikatakan bahwa kekecapatan rata-rata dari massa air yang bergerak dari arah timur mengalami perlambatan yaitu 0.024 m/det menjadi 0.014 m/det pada lintang < 6.22 0 dan 0.022 m/det menjadi 0.013 m/det pada lintang 6.23 0 – 6.24 0 , kemudian arah pergerakan mengalami perubahan dengan berbelok ke bagian dalam teluk. Perlambatan yang terjadi disebabkan oleh massa air yang bergerak memasuki perairan yang lebih dangkal sehingga terjadi gesekan yang mengakibatkan pergerakannya diperlambat. Sedangkan pembelokan arah gerak kedalam teluk disebabkan oleh pengaruh angin yang bertiup dari arah barat laut dan utara. Distribusi sedimen di perairan pantai Indramayu umumnya didominasi oleh ukuran kecil yaitu lanau (silt) dan lempung (clay).
Keyword: Bogor Agricultural University, Institut Pertanian Bogor, IPB

Judul: Cloning and Structure Prediction of C-Type Lectin 19 (CTL-19) from Silkworm (Bombyx mori L.)
Abstrak: Bombyx mori L. is a highly significant insect due to its silk production affects several industries. Unfortunately, B. mori farming has recently experienced mortality issues caused by pathogenic infectious diseases. Despite the extensive study of innate immunity of B. mori, information regarding the molecular functions and mode of actions of C-type lectin 19 (CTL-19) in the innate immunity of B. mori remains limited. Therefore, this study aimed to predict the structure of the B. mori CTL-19 also clone and produce the recombinant protein to better understand its role in the silkworm's innate immunity. The open reading frame (ORF) of the CTL-19 gene (945bp) was successfully amplified and cloned to pGEM®-T Easy Vector. The mature protein consists of 294 amino acids with 2 CRDs, 9 conserved cysteine, and two specific carbohydrate binding motifs. Protein threading demonstrated to be superior in order to predict the ligand binding site in comparison to homology modelling. The predicted molecular weight is 33.26 kDa, with pI value of 5.70. Furthermore, molecular docking analysis reveal that BmCTL-19 have ability to bind to various carbohydrate residues. The BmCTL-19 gene will be sub clone into an appropriate expression vector and produce purified recombinant protein to evaluate its properties.
Keyword: Innate immunity, Carbohydrate Binding Motif, Homology modelling, Protein Threading, Molecular docking