Judul: Cassava Genotypes for High Zn-Nutrient Vegetables and Transcriptomic Study of Two Cassava Genotypes with Different Zn Levels
Abstrak: Tanaman ubi kayu menjadi salah satu komoditas pangan penting di Indonesia. Daun ubi kayu biasanya dikonsumsi menjadi sayuran yang diolah menjadi berbagai bahan masakan, sedangkan umbi ubi kayu dapat dimanfaatkan sebagai sumber karbohidrat, pakan ternak, bioethanol, bahan dasar kosmetik dan industri. Daun dan umbi ubi kayu mengandung beragam nutrisi diantaranya mineral esensial, protein, vitamin, dan serat. Mineral Zn (seng) diketahui sebagai salah satu mikromineral esensial bagi manusia yang berperan dalam menjaga dan mempengaruhi fungsi sel yang berkaitan dengan sistem kekebalan imun tubuh, berperan dalam sintesis proein dan hormon pertumbuhan, sehingga kekurangan Zn pada anak-anak/remaja dapat menyebabkan stunting. Pemanfaatan bahan alami (natural-based) seperti sayuran menjadi sumber nutrisi yang lebih baik dan terjangkau. Pengembangan genotipe-genotipe ubi kayu melalui pemuliaan mutasi telah dilakukan oleh tim peneliti ubi kayu IPB University, namun karakter yang diamati masih terbatas pada karakter morfologi dan produksi umbi. Penelitian terkait karakter daun dan kandungan nutrisi potensial masih perlu dipelajari. Selain itu, evaluasi umbi dan daun ubi kayu berdasarkan karakteristik sensori juga diperlukan untuk mengetahui preferensi konsumen terhadap genotipe-genotipe ubi kayu yang telah dikembangkan. Berdasarkan hasil penelitian kami sebelumnya terdapat kandidat mutan putatif generasi M1V9 dan M1V10 (generasi lanjut) yang potensial terkait karakter kandungan nutrisi (Zn) pada daun yaitu G2D1-422, oleh karena itu pada rangkaian penelitian ini dilakukan studi lebih lanjut terkait kandungan nutrisi (Zn), karakter produksi serta uji sensori daun dan umbi pada beberapa genotipe yang telah dikembangkan. Selain itu, perkembangan teknologi berbasis RNA sequencing (transkriptomik) pada tanaman ubi kayu telah banyak berkembang. Percobaan pertama bertujuan untuk mengevaluasi kandungan Zn, produksi/biomassa daun dan karakter morfologi pada mutan ubi kayu menggunakan media larutan hara (teknik hidroponik sederhana) sehingga diperoleh ubi kayu potensial untuk sayuran daun bernutrisi Zn tinggi. Materi genetik yang digunakan pada percobaan ini yaitu mutan putatif G2D1-422 (kadar Zn lebih tinggi dibanding genotipe asal) dan genotipe asal Ratim (G2), serta beberapa mutan putatif generasi lanjut (M1V11) lainnya yaitu G1D1-532, G3D2-413, G4D1-222, G4D3-113, G5D2-223, G6-1-15-4-3, G6-2-15-1-1, G6-2-15-3-3, G6-2-15-5-3, beserta Malang-4 (genotipe asal G4). Karakter tanaman yang diamati terdiri atas jumlah daun, panjang dan lebar daun, warna daun, tinggi tanaman, bobot segar dan kering daun, serta analisis kandungan Zn. Hasil percobaan menunjukkan bahwa mutan putatif G2D1-422 memiliki kadar Zn yang lebih tinggi dibandingkan genotipe asal Ratim (G2). Karakter daun tidak berbeda secara signifikan antara mutan putatif G2D1-422 dengan genotipe asal Ratim (G2). Selain itu, mutan putatif G1D1-532 memiliki bobot basah dan bobot kering daun paling tinggi dibandingkan genotipe lainnya yang diamati. Percobaan kedua bertujuan untuk mengevaluasi karakteristik produksi dan sensori sebagai informasi awal dari preferensi/kesukaan daun dan umbi pada mutan ubi kayu potensial koleksi AGH-IPB dalam rangka pengembangan calon varietas unggul baru ubi kayu yang memenuhi kriteria penerimaan konsumen. Materi genetik yang digunakan sama dengan percobaan pertama yaitu dua genotipe asal dan 10 mutan putatif ubi kayu generasi lanjut. Karakter tanaman yang diamati terdiri atas bobot daun dan umbi, jumlah umbi, panjang dan diameter umbi, serta bobot per umbi; serta tekstur, rasa, dan kesukaan terhadap umbi dan daun berdasarkan uji sensoris. Jumlah panelis pada uji sensori terdiri atas 15 orang. Hasil percobaan menunjukkan bahwa mutan putatif G2D1-422 (genotipe Zn tinggi) memiliki rasa
Keyword: bioinformatics, mutation breeding, sensory test, transcriptomic analysis

Judul: Karakterisasi Ubi Kayu (Manihot esculenta Crantz) Genotipe Gajah Hasil Iradiasi Sinar Gamma pada Generasi M1V2 dan M1V3
Abstrak: Ubi kayu (Manihot esculenta Crantz.) merupakan salah satu sumber pangan utama penghasil karbohidrat, sehingga varietas unggul dengan produktivitas tinggi sangat diperlukan. Pemuliaan mutasi, salah satunya dengan iradiasi sinar gamma, merupakan salah satu strategi untuk menghasilkan varietas unggul pada tanaman membiak vegetatif seperti ubi kayu. Genotipe ‘Gajah’ yang merupakan genotipe ubi kayu lokal asal Kalimantan telah diiradiasi dengan sinar gamma dan generasi M1V1 dievaluasi pada tahun 2014. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi karakter kualitatif dan kuantitatif umbi, mengevaluasi daya simpan beberapa varian ubi kayu generasi M1V2 serta untuk mengidentifikasi karakter kualitatif dan kuantitatif peubah pertumbuhan vegetatif beberapa varian ubi kayu generasi M1V3. Penelitian dilaksanakan di kebun percobaan Cikabayan, Dramaga pada bulan Februari hingga Juni 2015 dan disusun berdasarkan rancangan kelompok lengkap teracak (RKLT) dengan satu faktor, yaitu genotipe ubi kayu, dan tiga ulangan. Genotipe ubi kayu yang digunakan yaitu satu genotipe asal (genotipe ‘Gajah’) dan 12 genotipe hasil mutasi sinar gamma generasi M1V2 yang dipanen pada umur 12 BST. Berdasarkan karakterisasi yang mengacu pada IITA, beberapa genotipe mutan memiliki karakter yang lebih baik dibandingkan genotipe asal. Karakter yang menunjukkan perubahan lebih baik meliputi bobot umbi (U1-15-2), jumlah umbi per tanaman (U3-15-1) dan jumlah umbi ekonomi (U3-15-5). Umbi varian ubi kayu dievaluasi lebih lanjut untuk mengetahui umur simpan umbi. Umbi yang telah dipanen disimpan di laboratorium pasca panen, Departemen Agronomi dan Hortikultura, IPB dan disusun berdasarkan rancangan acak lengkap (RAL). Hasil penelitian menunjukkan bahwa selama masa penyimpanan, bobot umbi mengalami penurunan. Secara visual warna dan aroma umbi terus mengalami perubahan. Serangan cendawan mulai muncul pada permukaan umbi pada 7 hari setelah penyimpanan. Hasil penelitian pertumbuhan vegetatif generasi M1V3 hingga 3 BST, mutan (putatif) (U3–15–3) memiliki jumlah daun yang lebih banyak dibandingkan dengan genotipe asalnya. Berdasarkan karakter kualitatif, adanya keragaman hanya ditemukan pada karakter lobus. Persen off type menunjukkan bahwa terdapat individu tanaman yang menunjukkan perbedaan karakter dari suatu populasi
Keyword: genotipe lokal, pemuliaan mutasi, pasca panen, pangan

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: