Judul: Karakteristik Protein Serupa Silicatein Dari Sponge Asal Perairan Nias Dan Lombok
Abstrak: Penggunaan bahan dasar silika yang berstruktur nano di industri pangan makin berkembang sebagai bahan pengemas aktif, biosensor, penyaring dan antikoagulan. Saat ini bahan dasar silika berstruktur nano dilakukan dengan proses yang menggunakan suhu, pH dan tekanan yang ekstrim serta menggunakan surfaktan. Cara lain untuk membuat silika berstruktur nano adalah menggunakan biokatalis protein serupa silicatein. Protein silicatein diisolasi dari sponge laut diketahui dapat membantu polimerisasi silika pada substrat Tetraethylorthosilicate (TEOS) pada suhu ruang dan pH netral. Sponge yang digunakan dalam penelitian ini berasal dari perairan Nias (N6 dan N20) dan perairan Lombok (MT5, MT36, MT37), Indonesia. Protein diperoleh dengan cara mengisolasi spikula silika terlebih dahulu dari tubuh sponge menggunakan larutan Natrium Hipoklorit 10%. Rendemen spikula silika tertinggi yang diperoleh dengan perendaman larutan 3N HNO3/ 3N H2SO4 dan pencucian dengan aseton 2x diperoleh dari sponge MT37 yaitu sebesar 58% dari berat kering sponge. Rendemen protein tertinggi yang diperoleh dari pelarutan silika spikula dengan larutan buffer 2.5 mM HF/NH4F pH 5 selama 2 jam adalah dari sponge N6, N20, MT5, MT36, MT37 berturut-turut sebesar 3.11%, 0.30%, 3.93%, 7.32% dan 58.5% dari berat kering sponge. Dengan metode Bradford, kandungan protein tertinggi spikula silika adalah dari sponge N6, MT5, MT36, MT37 yaitu 0.012 mg/ml, 0.042 mg/ml, 0.05 mg/ml dan 0.21 mg/ml. Hasil analisa SDS-PAGE menunjukkan bahwa berat molekul protein serupa silicatein dari spons N6 adalah 32, 27, 23 kD sedangkan MT36 dan MT37 adalah 15.5 kD dan 18kD. Ekstrak protein serupa silicatein sebanyak 250 ml dengan kandungan protein sebanyak 0.004 mg/ml direaksikan dengan 1 ml TEOS 13.5 μmol yang diinkubasi selama 12 jam pada pH 6.8 suhu 26oC menghasilkan aktivitas polimerisasi tertinggi sebesar 144 μmol/ml. Penghambatan aktivitas protein dari sponge MT37 dan MT5 oleh senyawa Phenylmethylsulfonylfluorida (PMSF) 1mM sebesar 38.8% dan 35.5% menunjukkan bahwa protein serupa Silicatein yang diisolasi diduga kuat mempunyai sisi aktif serin. Hasil studi kinetika reaksi menunjukkan bahwa reaksi protein serupa silicatein dari sponge MT37 dengan TEOS mengikuti persamaan Michaelis-Menten dengan nilai Vmax yang diperoleh adalah 0.001 μmol/detik, nilai Km yang sebesar 0.01 μmol/ml dan nilai Kcat adalah 0.04 μmol/detik.
Keyword: 

Judul: Screening dan Karakterisasi Bakteri .Laut Penghasil Inhibitor Protease pada Sponge dari Kepulauan Seribu, Jakarta
Abstrak: Dalam dasawarsa terakhir ini, perhatian terhadap protease sebagai target senyawa obat bagi penyakit asal bakteri, virus, malaria serta kanker, bahkan penyakit degeneratif seperti Alzeimer meningkat pesat, karena semakin jelas keterlibatan enzim ini dalam mekanisme molekuler penyakit-penyakit tersebut. Sponge merupakan sumber yang paling produktif menghasilkan komponen bioaktif dari berbagai jenis organisme yang hidup di laut, diantaranya cytotoxic, antifungul, antitumor, antiviral, anr&fouling dan aktivitas penghambatan enzim. Penelitian ini bertujuan untuk melakukan screening Ian karakterisasi isolat bakteri laut penghasil inhibitor protease yang bersimbiosis dengan sponge dari Kepulauan Seribu, Jakarta. Pada akhimya, isolasi komponen bioaktif dari bakteri yang bersimbiosis dengan sponge diharapkan dapat mengatasi keterbatasan produksi menggunakan sponge, sehingga mengurmgi kebutuhan untuk mer~gambil sponge secara langsung dari habitat alamnya. Penelitian dilaksanakan di Laboratorium Bioteh.ologi Hewan dan Biomedis serta Laboratorium Mikrobiologi dan Biokimia, Pusat Penelitian Bioteknologi, Institut Pertanian Bogor dari Bulan Februari sampai Desember 2003. Penelitian dilakukan melalui lima tahap, meliputi: 1) isolasi dan pemumian bakteri laut yang bersimbiosis dengan sponge, 2) screening bakteri patogen penghasil protease dan bakteri laut penghasil inhibitor protease, 3) penentuan waktu propagasi bakteri patogen dan bakteri laut, 4) produksi protease kasar dan optimasi waktu produksi inhibitor serta 5) karakterisasi isolat bakteri laut penghasil inhibitor protease. Analisa parameter yang dilakukan meliputi uji aktivitas protease, uji persentase penghambetan ir-hihitor proteese, analisa konsentresi protein protease kasar dan inhibitor, pewarnaan gram, uji motilitas, uji katalase serta uji fisiologis dan biokimia menggunakan Microbact 24E. Hasil isolasi dan pemumian bakteri laut yang bersimbiosis dengan 10 jenis sponge yang dikoleksi dari perairan Pulau Panggang, wilayah Kepulauan Seribu, diperoleh 96 isolat tunggal dalam media MA. Isolat terbanyak terdapat pada sponge jenis Reniochalina stalagmitis (20 isolat) yang diambil pada kedalaman 10 meter, sedangkan jenis Xetospongia exigua yang diambil pada kedalaman 4 meter merupakan jenis sponge dengan jumlah isolat bakteri yang paling sedikit berhasil diisolasi (2 isolat). Pengukuran IP terhadap 6 isolat bakteri patogen menunjukkan bahwa nilai IP terbesar terdapat pada isolat bakteri Pseudomonas aeruginosa (2.5), kemudian bakteri Escherichia coli (2.2) dark Staphylococcus aureus (2.0). Screening terhadap 96 isolat bakteri laut yang dicobakan terhadap masing-masing bakteri proteolitik P. aeruginosa, E. coli dan S. aureus; dipilih isolat 3A3.2 dan 3A6.2 yang menuiijukkan penghambatan terhadap aktivitas proteolitik P. aeruginosa, isolat 3A6.2 yang menunjukkan penghambatan terhadap aktivitas proteolitik E. coli dan isolat 1 A3 yang menunjukkan penghambatan terhadap aktivitas proteolitik S. aureus. Pengukuran persentase penghambatan inhibitor protease isolat 3A3.2 terhadap protease P. aeruginosa menunjukkan penghambatan terbesar pada waktu fermentasi jam ke-32 sebesar 85.29% dengan kadar protein 0.058 mglml dan pH 8.65. Puncak penghambatan kedua terjadi pada waktu fermentasi jam ke-44 dengan persentase penghambatan sebesar 70% dengan kadar protein 0.0806 mglml dan pH 8.9. Adanya dua puncak aktivitas ini diperkirakan karena adanya kerja inhibitor yang berbeda. Berdasarkan kurva pengukuran absorbansi isolat 3A3.2 pada media fermentasi diketahui bahwa inhibitor pertama diproduksi pada fase stasioner sedangkan inhibitor kedua diproduksi pada fase penurunan jumlah sel bakteri. Pengukuran persentase penghambatan inhibitor protease isolat 3A6.2 terhadap protease P. aeruginosa menunjukkan penghambatan pertama pada waktu inokulum dipindahkan pada media fermentasi yaitu sebesar 91.56% dengan kadar protein 0.0962 mdml dan pH 6.73. Puncak penghambatan kedua terjadi pada waktu fermentasi jan~ ke-8 dengan persentase
Keyword: 

Judul: Dynamical System of Hepatitis B in Three Groups with Vaccination
Abstrak: The aim of this study is to modify the hepatitis B transmission model in three age groups involving vaccination from the model conducted by Zhoe and Zhang.The method used is to analyze the stability of the fixed point and its basic reproduction number (R_0). Performed stability analysis and numerical simulation to see population dynamics. Next, a sensitivity analysis of the parameters was carried out to see its effect on R_0. From the analysis obtained two fixed points, namely non-endemic and endemic fixed points. Non-endemic fixed points are locally asymptotically stable if R_0 <1 Meanwhile, the endemic fixed point is locally asymptotically stable if R_0 > 1. Hepatitis vaccination affects the number of susceptible population, because the more successful the vaccination, the smaller the number of susceptible populations so that the smaller the population will be infected.
Keyword: Dynamic, Hepatitis B, Vaccine, Mathematical model