Judul: Analisis Keragaman Ekson 2 Dan Ekson 3 Gen Myostatin Pada Sembilan Bangsa Kambing Lokal Di Indonesia
Abstrak: Kambing lokal Indonesia merupakan ternak ruminansia kecil dengan jumlah bangsa paling tinggi di Asia Tenggara. Kambing merupakan hewan ternak yang paling populer setelah sapi dan ayam di Indonesia. Salah satu yang menjadi masalah dalam upaya produksi ternak kambing lokal Indonesia adalah kualitas bibit unggul yang masih rendah. Identifikasi bangsa kambing lokal Indonesia diperlukan dalam upaya menghasilkan bibit unggul melalui program seleksi. Salah satu gen yang mengatur pertumbuhan kambing adalah gen myostatin. Gen myostatin menyandikan protein myostatin yang mengontrol pertumbuhan dan diferensiasi otot kerangka. Myostatin yang tidak berfungsi akan mengakibatkan terjadinya hipertropi ataupun hiperplasia. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi keragaman ekson 2 dan ekson 3 gen myostatin serta menentukan hubungan kekerabatan serta hubungan genetik antara sembilan bangsa kambing Indonesia. Sampel DNA diekstraksi dari darah kambing yang terdiri dari 80 sampel kambing, yaitu kambing Samosir, kambing Muara, kambing Kacang, kambing Kosta, kambing Peranakan Etawah, kambing Burawa, kambing Gembrong, kambing Boer dan kambing Boerka. Metode Polymerase Chain Reaction-Single Strand Conformation Polymorphism (PCR-SSCP) dan sekuensing DNA digunakan untuk mengidentifikasi keragaman daerah ekson 2 dan ekson 3 gen myostatin pada kambing lokal Indonesia. Hasil amplifikasi dengan PCR daerah ekson 2 dan ekson 3 gen myostatin pada kambing adalah 650 pb. Pensejajaran nukleotida gen myostatin ekson 2 pada sembilan bangsa kambing lokal Indonesia ditemukan mutasi tertentu. Terdapat 12 tipe gen berdasarkan pola migrasi untai tunggal. Berdasarkan hasil sekuensing ditemukan 12 haplotipe pada kambing. Dari hasil pensejajaran nukleotida gen myostatin ekson 3 pada sembilan bangsa kambing lokal Indonesia ditemukan 10 variasi gen myostatin. Variasi yang ditemukan pada ekson 3 mempengaruhi asam amino. Variasi yang ditemukan pada sembilan bangsa kambing menunjukkan bahwa keragaman genetik kambing beragam. Variasi dan tipe gen myostatin yang ditemukan dalam penelitian ini belum dapat dijadikan penanda bagi kambing lokal yang memiliki parameter pertumbuhan yang tinggi. Hasil penelitian ini diharapkan dapat menjadi dasar dalam melakukan seleksi berdasarkan sifat pertumbuhan kambing dalam populasi yang lebih besar dan beragam.
Keyword: myostatin, kambing, SSCP, tipe gen

Judul: Identifikasi Keragaman Gen Myostatin (MSTN|BsrI) pada Ayam Lokal Indonesian dan Persilangannya
Abstrak: Myostatin (MSTN) atau Growth and Differentiation Factor 8 (GDF8) adalah anggota dari Transforming Growth Factor (TGF)-b superfamily yang berfungsi sebagai regulator negatif dari pertumbuhan otot skeletal. Mutasi basa Timin menjadi Guanin pada ekson 2 gen MSTN yang menyebabkan perubahan asam amino leusin menjadi arginin berhubungan dengan bobot badan ayam. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi keragaman gen Myostatin (MSTN) pada ayam lokal indonesia dan persilangannya. Sampel darah yang digunakan dalam penelitian sebanyak 162 ekor ayam yang terdiri dari ayam kampung terseleksi, merawang GO, kapas, sentul, KPt, dan merwang G1. Amplifikasi gen MSTN|BsrI dilakukan dengan metode PCR-RFLP. Hasil produk amplifikasi adalah sepanjang 247 bp. Genotipe yang ditemukan pada gen MSTN BsrI adalah GG, TT, dan GT dengan 2 macam alel yaitu alel G dan alel T. Hasil analisis menunjukkan bahwa frekuensi genotipe TT dan GT lebih tinggi dari frekuensi genotipe GG. Nilai frekuensi alel total untuk semua populasi memperlihatkan bahwa frekuensi alel tertinggi adalah alel T sebesar 0.72 dan terendah adalah alel G sebesar 0.28. Populasi ayam kampung terseleksi, KPt dan merawang G1 berada pada keadaan keseimbangan Hardy-Weinberg. Populasi ayam kampung terseleksi, merawang GO dan merawang G1 memiliki nilai heterosigositas pengamatan (Ho) yang lebih fendah dari nilai heterosigositas harapan (He), sedangkan nilai heterosigositas Bengamatan (Ho) pada ayam KPt dan sentul lebih tinggi dari nilai heterosigositas harapannya (He). Kesimpulan yang dapat diambil dari hasil analisis adalah gen MSTN BsrI pada kampung terseleksi, merawang GO, sentul, silangan kampung x petelur, dan merawang G1 bersifat polimorfik.
Keyword: MSTN, Native Chicken, PCR-RFLP, Polimorphism, G D F 8, T G F, Mutation, Thymine, Local chicken, Myostatin gene, Arginine, Local chicken

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: