Judul: Deteksi dan Identifikasi Endobakteri dalam Hifa Rhizopus spp.
Abstrak: Banyak spesies Rhizopus (Rhizopodaceae, Mucorales) digunakan sebagai agens bio-industri. Laporan adanya endobakteri pada R. microsporus yang memproduksi toksin mendorong munculnya gagasan bahwa Rhizopus spp. agens bio-industri harus bersifat aman. Keamanan Rhizopus inokulan tempe berdasarkan keberadaan endobakteri belum diketahui. Oleh sebab itu, keberadaan endobakteri pada 7 strain Rhizopus spp. asal tempe, dan 4 strain Rhizopus spp. asal substrat lainnya diteliti. Satu strain Rhizopodopsis javensis dan satu strain Escherichia coli digunakan berturut-turut sebagai kontrol negatif dan kontrol positif. Keberadaan endobakteri dideteksi dengan dua cara, yaitu secara molekuler dan pewarnaan. Deteksi secara molekuler menggunakan metode PCR 16S rDNA dengan primer 10F dan 1541R. Konfirmasi dilakukan dengan pewarnaan LIVE/DEAD® Bacterial Viability Kit. Bakteri diidentifikasi secara molekuler melalui pendekatan filogenetik, berdasarkan metode Neighbour-Joining dan model p-distance pada MEGA 6 dengan endobakteri pada Mortierella elongata sebagai outgroup. Hasil penelitian menunjukkan satu kultur, R. microsporus IPBCC 13.1131 asal tempe dari Cilacap, Jawa Tengah, mengandung endobakteri. Adanya endobakteri terkonfirmasi dengan munculnya pendaran merah dan hijau dalam hifa, namun tidak ada endobakteri yang terdeteksi pada spora. Endobakteri ini diidentifikasi sebagai Curtobacterium sp. Adanya endobakteri Curtobacterium pada R. microsporus pertama kali dilaporkan. Metode deteksi ini dapat diusulkan menjadi salah satu prosedur jaminan mutu kualitas Rhizopus spp. agens bio-industri.
Keyword: Curtobacterium, endobakteri, pewarnaan, Mucorales, 16S rDNA

Judul: Profil Metabolit Sekunder Rhizopus microsporus Pembawa Endobakteri.
Abstrak: Curtobacterium sp. dilaporkan terdapat di dalam hifa R. microsporus IPBCC 13.1131 dari tempe segar asal Cilacap. Adanya endobakteri dapat mempengaruhi perilaku cendawan inangnya dan pengaruh endobakteri ini terhadap inangnya belum diketahui. Penelitian ini bertujuan menganalisis profil metabolit sekunder dan deteksi endobakteri R. microsporus IPBCC 13.1127 dari tempe asal Medan. Dua strain R. microsporus, IPBCC 13.1131 dan 13.1137 asal tempe digunakan sebagai pembanding. Metabolit diproduksi pada media cair Glycerol Yeast yang diagitasi pada kecepatan 120 rpm selama 11 hari. Ekstrak etil asetat metabolit ekstraselular R. microsporus dianalisis menggunakan High Performance Liquid Chromatography pada 220 nm. Adanya endobakteri dideteksi dengan pewarnaan LIVE/DEAD® Bacterial Viability Kit dan dikonfirmasi secara molekuler dengan metode PCR menggunakan set primer 10F/1541R. Hasil penelitian menunjukkan profil metabolit sekunder R. microsporus IPBCC 13.1127 lebih mirip dengan profil strain IPBCC 13.1131 (99%) daripada profil strain IPBCC 13.1137 (75%). Deteksi endobakteri menunjukkan bahwa R. microsporus IPBCC 13.1127 mengandung endobakteri. Informasi ini dapat dijadikan pertimbangan perlunya deteksi endobakteri pada starter tempe.
Keyword: Bakteri endohifa, Curtobacterium, HPLC, molekuler, starter tempe

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: