Judul: Analisis kariotipe tikus laboratorium (Rattus norvegicus dan tikus sawah (Rattus argentiventer)
Abstrak: Analisis kariotipe berfungsi sebagai salah satu cara yang dapat digunakan untuk membedakan atau identifikasi hewan, antar spesies atau dalam spesies yang sama atau untuk mendeteksi adanya kelainan-kelainan kromosom yang terdapat pada suatu individu. Semua bagian sel tubuh hewan dapat digunakan sebagai materi atau bahan untuk analisis kariotipe seperti sel darah, sumsum tulang, rambut dan bagian tubuh lainnya. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan informasi karakteristik kromosom pada tikus laboratorium dan tikus sawah serta sebagai upaya pengembangan teknik analisis kariotipe. Penelitian ini dilakukan di laboratorium Bagian Pemuliaan dan Genetika Ternak, Fakultas Peternakan IPB selama dua bulan yaitu pada bulan Februari-Maret 2005. Objek penelitian ini adalah tikus sawah dan tikus laboratorium masing-masing berjumlah tiga ekor tikus berkelamin jantan dan satu ekor tikus berkelamin betina. Teknik analisis kromosom yang digunakan dalam penelitian ini adalah teknik sumsum tulang dan teknik sperma. Teknik sumsum tulang lebih melihat kromosom dalam jumlah diploid (2n) sedangkan teknik sperma lebih melihat kromosom dalam jumlah haploid (n). Peubah yang diamati pada penelitian ini adalah jumlah kromosom, indeks sentromer, rasio lengan dan panjang relatif kromosom...
Keyword: 

Judul: Kariotipe Tikus (Rodentia, Muridae) dan Kelelawar Pemakan Buah (Megachiroptera, Pteropodidae) dari Gunung Bawakaraeng, Sulawesi Selatan
Abstrak: Mamalia Sulawesi tidak hanya kaya spesies tetapi tingkat endemisitasnya tinggi. Endemisitas tikus (Muridae) dan kelelawar pemakan buah (Pteropodidae) Sulawesi masing-masing mencapai 75.7% dan 10.7%. Studi kromosom maupun data kariotipe untuk spesies tikus dan kelalawar pemakan buah di Indonesia masih sangat kurang. Setidaknya hanya tujuh spesies tikus dan empat spesies kelelawar pemakan buah yang telah dilaporkan status kromosomnya. Hal ini terkait dengan teknik analisis kariotipe yang lebih cocok dilakukan secara laboratorium daripada di lapang. Tikus dan kelelawar telah diperkirakan memiliki laju evolusi kariotipe yang tinggi, sehingga informasi kariotipe baru dan kaitannya dengan filogenetik menjadikan kariotipe sangat penting. Penelitian ini memiliki dua tujuan utama yaitu: (1) untuk menganalisis kariotipe tikus dan kelelawar pemakan buah Sulawesi menggunakan kromosom sumsum tulang dengan teknik G-banding (Giemsa); (2) untuk menganalisis perbedaan teknik kariotipe laboratorium dan lapang. Dua jenis analisis kariotipe dilakukan pada penelitian ini yaitu analisis kariotipe laboratorium dan lapang. Analisis laboratorium digunakan sebagai penelitian uji coba sebelum ke lapang. Analisis kariotipe di laboratorium menggunakan spesimen mencit dengan berbagai perlakuan yang mencakup: (1) perbedaan pengaruh pemberian kolkisin 0.005% dengan waktu 2 dan 3 jam; (2) preservasi sumsum tulang pada larutan Phosphate-Buffered Saline (PBS) selama 2 sampai 15 hari dan (3) preservasi suspensi sel sumsum tulang pada larutan Carnoy selama 2 hari (48 jam) dan 4 hari (96 jam).. Analisis kariotipe di lapang dilakukan pada spesimen yang tertangkap di kawasan gunung Bawakaraeng, Sulawesi Selatan tanpa diikuti perlakuan seperti di laboratorium. Spesimen disuntik menggunakan larutan ragi untuk meningkatkan mitosis dan inhibitor kolkisin untuk menangkap kromosom pada tahap mitosis tersebut. Fiksasi sumsum tulang spesimen dilakukan dengan menggunakan larutan Carnoy. Pewarnaan kromosom menggunakan perwarna Giemsa 4%. Kromosom pada tahap metafase terbaik dipotret dan diketahui jumlah diploid (2n), FN, FNa dan morfologinya. Kualitas kromosom pada perservasi PBS dan Carnoy diamati untuk mengetahui apakah teknik preservasi ini dapat diaplikasikan di lapang. Penelitian ini menunjukkan kualitas kromosom pada analisis kariotipe laboratorium lebih optimal dibandingkan dengan lapang. Mencit memiliki 2n= 40, FN=40, FNa=38 dan bentuk keseluruhan kromosom telosentrik. Satu spesies tikus menunjukkan hasil kariotipe yang paling baik yaitu R. hoffmanni betina (2n= 44, FN = 61, FNa = 59, bentuk kromosom X telosentrik). Dua spesies kelelawar menunjukkan hasil kariotipe yang paling baik yaitu B. bidens jantan (2n = 30, FN = 53, FNa = 50, bentuk kromosom X sub metasentrik dan Y telosentrik) dan T. suhaniahae betina (2n = 38, FN = 64, FNa = 60, bentuk kromosom X metasentrik). T. nigriscens memiliki 2n=38 dan D. viridis 2n=34. Kariotipe empat spesimen lapang merupakan data kariotipe baru. Kualitas kromosom dengan kolkisin 0.005% selama 2 jam menunjukkan hasil yang lebih baik dibandingkan waktu 3 jam. Sementara itu, kromosom pada preservasi PBS menunjukkan degradasi selama batas waktu preservasi, sehingga preservasi PBS tidak dapat diaplikasikan di lapang. Hal tersebut berbeda dengan preservasi Carnoy yang menunjukkan tampilan kromosom yang baik. Suspensi sel dengan preservasi Carnoy yang telah dibuat di lapang dapat dianalisis kembali di kondisi laboratorium. Teknik kariotipe merupakan teknik yang rentan terhadap kondisi lingkungan dan waktu. Satu spesies tikus dari delapan spesies dan dua spesies kelelawar dari lima spesies yang menunjukkan hasil preparat yang optimal. Hasil preparat kromosom spesimen lapang
Keyword: Kariotipe, G-banding, Tikus, Kelelawar, Gunung Bawakaraeng

Judul: Numerical modeling of the hydrodynamics of standing wave and scouring in front of impermeable breakwater with different steepnesses
Abstrak: The aim of this paper is to numerically study the effects of breakwater steepness on the hydrodynamics of standing wave and scouring process in front of impermeable breakwaters. A two-dimensional hydrodynamics model based on the Reynolds Averaged Navier–Stokes (RANS) equations and the Volume of Fluid (VOF) method was developed and then combined with an empirical sediment transport model. Comparisons with an analytical solution and experimental data showed the present model is very accurate in predicting the near bottom velocity and capable of simulating the scour/deposition patterns consistent with experimental data. It was found that the additional terms of bottom shear stress in the momentum equations are necessary to produce a physical scouring pattern. Different breakwater steepnesses produce different characteristics of standing wave, the steady streaming system, and scouring pattern in front of the breakwaters, which also affects the correlations between them. An additional analysis of the turbulence field parameters and the sediment transport rate was also performed. All these important information will be presented in details in this paper and can be worthwhile for designing the breakwater in coastal areas.
Keyword: The RANS–VOF model Standingwave Steadystreamingsystem Scouring pattern Breakwatersteepness