Judul: Effect of Tempeh Supplementation on Gut Microbiota and Immunoglobulin A Profiles in Sprague Dawley Rats
Abstrak: Penelitian nutrigenomika saat ini telah menunjukkan bahwa interaksi gen dan makanan mempunyai peranan penting dalam menjaga kesehatan yang optimal. Selain itu, studi nutrigenomika juga telah menunjukkan bahwa triliunan bakteri yang ada pada saluran pencernaan manusia, atau yang lebih dikenal dengan mikrobiota usus, dapat mempengaruhi penyerapan nutrisi dan regulasi energi. Hal ini menunjukkan pentingnya peranan mikrobiota usus pada kesehatan manusia dalam perkembangan sistem kekebalan tubuh dan penggunaan energi. Tempe merupakan makanan fermentasi tradisional Indonesia yang terbuat dari kacang kedelai (Glycine max) dan telah menjadi makanan yang populer di dunia terutama bagi kelompok vegetarian. Tempe dihasilkan melalui proses fermentasi kacang kedelai yang melibatkan sejumlah mikroorganisme seperti cendawan, khamir, bakteri asam laktat dan juga beberapa kelompok bakteri Gram negatif. Selama proses fermentasi, terjadi biosintesis vitamin, senyawa fitokimia dan komponen bioaktif lainnya yang dapat berpengaruh terhadap kesehatan. Selain itu, pada tempe masih dapat ditemukan komponen oligosakarida dan polisakarida yang bernilai positif terhadap kesehatan. Mikroorganisme yang ada di dalam tempe akan turut masuk ke dalam saluran pencernaan jika tempe dimakan. Beberapa penelitian telah menunjukkan bahwa aktivitas probiotik dari mikroorganisme mati seringkali menunjukkan pengaruh yang sama dibandingkan dengan mikroorganisme hidup. Kandungan mikroorganisme yang ada di dalam tempe dapat menjadi salah satu alternatif suplemen diet yang mengandung probiotik dan memicu stimulan kekebalan tubuh pada manusia. Imunoglobulin A (IgA) merupakan imunoglobulin utama yang terdapat di saluran pencernaan dan mempunyai peranan dalam melindungi tubuh dari komponen dan juga mikrob asing. Penelitian ini bertujuan menentukan dinamika populasi mikrobiota dan IgA dalam usus tikus Sprague-Dawley (SD). Sebanyak 30 ekor tikus SD betina diberi suplementasi pakan standar yang ditambah dengan kedelai yang belum diberi laru atau tempe (mentah atau masak) selama 28 hari. Teknik real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) dengan primer spesifik terhadap sekuens gen penyandi 16S rRNA digunakan untuk mengkuantifikasi kelompok bakteri spesifik dari sampel feses tikus. Analisis ekspresi gen IgA dilakukan menggunakan metode quantitative RT-PCR, sedangkan protein IgA dianalisis dengan metode enzyme-linked immunosorbent assay dan pewarnaan imunohistokimia. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa tempe dapat memodulasi komposisi mikrobiota usus, namun jenis tempe yang berbeda dapat memberikan perubahan komposisi yang berbeda pula. Hal ini disebabkan oleh keberadaan mikroorganisme yang unik pada setiap tempe. Mikroorganisme yang mati pada tempe masak dan mikroorganisme yang hidup pada tempe mentah terbukti dapat meningkatkan ekspresi gen IgA dan menstimulasi sekresi protein IgA. Proses pemasakan tempe sangat dianjurkan dengan tujuan untuk menginaktivasi mikroorganisme patogen yang tidak diinginkan selama proses fermentasi.
Keyword: tempe, mikrobiota usus, imunitas mucosal, immunoglobulin A

Judul: Analisis Mikrobiologi dan Metagenomik Tepung Tempe
Abstrak: Tempe merupakan pangan fungsional asal Indonesia yang dibuat melalui proses fermentasi dan mempunyai banyak manfaat bagi kesehatan manusia. Kandungan oligosakarida dan mikroba yang masih hidup atau yang sudah mati pada tempe dapat berfungsi sebagai prebiotik, probiotik maupun paraprobiotik. Pembuatan tepung tempe bertujuan untuk memperpanjang masa simpannya. Tempe dibuat melalui proses fermentasi dan besar kemungkinan mikroba tersebut terbawa ke dalam produk tepung tempe. Keberadaan bakteri sebagai probiotik maupun paraprobiotik pada tepung tempe akan sangat bagus untuk kesehatan pencernaan manusia. Oleh karena itu diperoleh tujuan dari penelitian ini yaitu untuk mengetahui komposisi jumlah bakteri hidup dan mati dari kelompok bakteri asam laktat (BAL) dan Enterobacteriaceae sebagai kandidat probiotik dan paraprobiotik pada tepung tempe melalui analisis mikrobiologi dan metagenomik. Sampel tepung tempe dianalisis berdasarkan proses pengeringan yaitu dijemur dan dioven. Bakteri yang dapat dikultur dan tidak dapat dikultur pada tepung tempe secara berturutturut dikuantifikasi menggunakan standar plate count dan qPCR, sedangkan sel bakteri yang rusak akibat proses pengeringan dikuantifikasi menggunakan Propidium Monoazide-Quantitative Polymerase Chain Reaction (PMA-qPCR). Tepung tempe mengandung bakteri hidup sebanyak 4-5 log CFU/g dan bakteri mati dengan sel utuh sebanyak 9 log CFU/g. Jumlah bakteri hanya berbeda sedikit antara kedua proses pengeringan. Berdasarkan analisis qPCR, jumlah bakteri asam laktat (BAL) lebih tinggi dibandingkan jumlah Enterobacteriaceae pada kedua sampel tepung tempe. Populasi bakteri BAL dan Enterobacteriaceae yang diestimasi dengan qPCR lebih tinggi dibandingkan dengan analisis kultur. Komposisi jenis bakteri yang diisolasi dari tepung tempe sebagian besar juga terdapat pada tempe. Hasil ini menunjukkan bahwa tepung tempe kering matahari atau kering oven mempunyai potensi sebagai pangan fungsional karena mengandung bakteri hidup dan mati sebagai kandidat probiotik dan paraprobiotik dengan jumlah tinggi berdasarkan analisis PMA-qPCR.
Keyword: qPCR, PMA-qPCR, probiotics, paraprobiotics, tempeh flour

Judul: Construction of Strongly Optimal Binary Linear Code with Minimum Distance 9 and 11
Abstrak: A binary linear code of length n over q F is a subspace of n q F . A code has three parameters that attached to it, namely length, dimension, and minimum distance. A code with length n, dimension k and minimum distance d is often called [n, k, d ]-code. Usually, when two parameters are given, then we want to find a code that has the best value for the last parameter. Based on Gilbert- Varshamov bound, if a [n, k, d ]-code exists and can not be expanded, we call it a strongly optimal code. In this paper, we construct strongly optimal code with minimum distance 9 and 11. In constructing the code, we created a theorem and algorithm based on Gilbert-Varshamov bound before we implement the algorithm to MAPLE programming language. Because of computational limitations, the program can only construct up to k = 10 for d = 9 and k = 12 for d = 11.
Keyword: