Judul: Pembiakan Massal dan Ketahanan Varietas Padi terhadap Nematoda Aphelenchoides besseyi Christie
Abstrak: Aphelenchoides merupakan genus nematoda yang mempunyai lebih dari 150 spesies, umumnya parasit tumbuhan tingkat tinggi, fungivora, dan beberapa spesies hidup dengan cara keduanya. Penyakit pucuk putih pada padi yang disebabkan oleh Aphelenchoides besseyi merupakan penyakit yang baru muncul di Indonesia. Saat ini, A. besseyi telah tersebar di seluruh Indonesia. Penggunaan varietas tahan merupakan salah satu metode yang menjanjikan dalam pengendalian A. besseyi. Namun, belum ada informasi terkait ketahanan padi terhadap A. besseyi di Indonesia. Penelitian ini dilaksanakan dengan tujuan menemukan metode yang optimal dalam pembiakan massal A. besseyi dan mengevaluasi respons ketahanan sembilan varietas padi terhadap infeksi A. besseyi. Pembiakan massal A. besseyi pada spesies cendawan dapat menjadi metode yang efisien untuk mendapatkan populasi tinggi dan murni dalam waktu yang relatif singkat untuk mendukung berbagai aspek penelitian lebih lanjut. Varietas padi tahan A. besseyi dapat dikembangkan lebih lanjut untuk pengembangan strategi pengendalian berbasis ketahanan tanaman padi. Pembiakan massal A. besseyi diujikan pada kultur cendawan Alternaria padwickii, Fusarium semitectum, dan Botrytis cinerea. Tiga kultur cendawan ditumbuhkan menggunakan media PDA pada cawan petri 9 cm. Nematoda disterilisasi permukaan dengan 0.1 % streptomisin sulfat kemudian dibilas dengan akuades steril sebanyak tiga kali sebelum diinfestasikan ke dalam kultur cendawan. Untuk mendapatkan kondisi yang optimal dalam pembiakan nematoda, kultur cendawan diinkubasi pada tiga suhu yang berbeda. Selanjutnya, 25 nematoda yang telah disterilisasi diinfestasikan ke dalam kultur cendawan ketika miselia telah memenuhi cawan dan diinkubasi pada suhu 20, 25, dan 30 ºC. Setelah 21 hari, nematoda diekstraksi dan dihitung populasinya. Evaluasi respons ketahanan varietas padi terhadap A. besseyi dilakukan dengan menggunakan sembilan varietas padi, yaitu Ciherang, Inpago 7, Inpara 3, Inpara 4, IPB 3S, Prima, Situ Bagendit, Utri Merah, dan Utri Rajapan. Inokulum nematoda A. besseyi diperoleh dari pembiakan in vitro nematoda pada kultur cendawan. Sebanyak 500 nematoda per tanaman diinfestasikan pada fase pembungaan dengan cara menyemprotkan suspensi nematoda ke bagian malai. Parameter yang diamati yaitu panjang malai, jumlah bulir, jumlah bulir bernas dan hampa, berat 100 bulir bernas, jumlah nematoda dan ekspresi gen PBZ1 padi. Deteksi gen PBZ1 dilakukan dengan one step Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction (RT-PCR). Ekstraksi RNA total dilakukan dari setiap varietas padi sebelum dan sesudah infestasi A. besseyi. RNA total selanjutnya diamplifikasi dengan one step RT-PCR menggunakan primer spesifik PBZ1 forward (5’- CAGTGGTCAGTAGAGTGATC-3’) dan PBZ1 reverse (5’- CTGGATAGAGGCAGTATTCC-3’) dengan target amplikon berukuran ±900 pb. DNA hasil RT-PCR divisualisasi menggunakan elektroforesis untuk mendapatkan pita DNA pada gel agarosa. Intensitas DNA gen PBZ1 dikuantifikasi dengan menggunakan software ImageJ Kultur cendawan dan suhu inkubasi yang optimum bagi pembiakan massal A. besseyi yaitu A. padwickii dan F. semitectum pada suhu inkubasi 20 dan 25 ºC. Populasi A. besseyi pada kultur A. padwickii dengan suhu inkubasi 25 ºC sebanyak 9 115 per cawan petri dan faktor reproduksi mencapai 364.4 kali. Pada suhu 30 ºC, A. besseyi tidak mampu memperbanyak populasinya pada semua kultur cendawan yang diujikan. Berdasarkan parameter hasil panen, populasi A. besseyi, dan ekspresi gen PBZ1, respons ketahanan varietas padi terhadap infestasi A. besseyi dibagi menjadi tiga kategori ketahanan yaitu tahan (Ciherang, Utri Merah, dan Utri Rajapan), toleran (Inpago 7, IPB 3S, Prima, dan Situ Bagendit) dan rentan
Keyword: gen PBZ1, respons ketahanan, pembiakan in vitro nematoda, penyakit pucuk putih

Judul: Pengaruh Infeksi Aphelenchoides besseyi Christie pada Benih Terhadap Pertumbuhan Tanaman Padi
Abstrak: Nematoda merupakan parasit penting pada padi, salah satu diantaranya adalah A. besseyi yang menyebabkan penyakit pucuk putih/ white tip. Nematoda A. besseyi bersifat tular benih (seed borne) dan dilaporkan dapat menurunkan hasil padi hingga 50 %. Pengaruh A. besseyi terhadap pertumbuhan tanaman padi di Indonesia belum dilaporkan. Oleh karena itu diperlukan penelitian tentang pengaruh infeksi A. besseyi terhadap pertumbuhan vegetatif dan generatif padi dan kehilangan hasil yang disebabkannya. Penelitian dilakukan di rumah kaca dengan menggunakan lima varietas padi yaitu IPB 3S, HIPA 14, Sintanur, Pertiwi-1, dan Ciherang. Peubah yang diamati adalah pertumbuhan tanaman dan hasil padi bergejala pucuk putih dan padi tidak bergejala. Nematoda A.besseyi diekstrak kembali dari gabah hasil panen dengan metode corong Baermann. Percobaan disusun dengan rancangan faktorial acak lengkap dengan faktor adalah varietas padi dan anak faktor adalah kondisi tanaman dengan tiga kali ulangan dan 4 unit percobaan. Infeksi A. besseyi pada padi menyebabkan tanaman terlambat membentuk anakan pada semua varietas yang diuji. Pada varietas Sintanur A. besseyi menurunkan rata-rata jumlah bulir per malai sebesar 31%. Pada kelima varietas uji A. besseyi tidak mempengaruhi tinggi tanaman dan jumlah anakan
Keyword: anakan, hasil gabah, jumlah nematoda

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: