Judul: Identifikasi Keragaman Gen Growth Hormone Receptor (GHR|Eco72I) pada Ayam Lokal Indonesia dan Persilangannya.
Abstrak: Gen growth hormone receptor (GHR) merupakan salah satu gen pengontrol sifat pertumbuhan. GHR sebagai reseptor growth hormone (GH) yang terlibat dalam regulator laju pertumbuhan dan deposisi lemak. Mutasi pada intron 5 mempengaruhi laju pertumbuhan pada ayam. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi keragaman gen GHR pada ayam lokal Indonesia dan persilangannya. Sampel yang digunakan dalam penelitian sebanyak 178 ekor ayam yang terdiri atas ayam kampung Ciawi, kampung Sukabumi, ras pedaging, ras petelur, merawang, dan kampung x ras petelur. Amplifikasi gen GHR|Eco72I intron 5 dilakukan dengan metode PCR-RFLP. Hasil produk amplifikasi adalah 326 bp. Genotipe yang ditemukan pada gen GHR|Eco72I adalah AA, GG, dan AG dengan 2 macam alel yaitu alel A dan alel G. Hasil analisis menunjukkan bahwa frekuensi genotipe AA lebih tinggi dibandingkan dengan genotipe lainnya. Frekuensi alel tertinggi adalah alel A sebesar 0.99 dan terendah adalah alel G sebesar 0.01. Populasi ayam kampung Sukabumi dan persilangan kampung x ras petelur berada pada keadaan keseimbangan Hardy-Weinberg. Nilai heterozigositas pengamatan (Ho) pada ayam ras pedaging lebih rendah dari nilai heterozigositas harapan (He), sedangkan nilai heterozigositas pengamatan (Ho) pada ayam kampung Sukabumi dan kampung x petelur lebih tinggi dari nilai heterozigositas harapannya (He). Kesimpulan penelitian ini adalah gen GHR|Eco72I pada ayam kampung Sukabumi, ras pedaging, dan kampung x ras petelur bersifat polimorfik.
Keyword: ayam lokal, gen GHR, keragaman, PCR RFLP

Judul: Identifikasi Keragaman Gen Growth Hormone (GH|EcoRV) pada Ayam Kampung di Indonesia Menggunakan Metode PCR-RFLP.
Abstrak: Growth hormone (GH) dikenal sebagai salah satu hormon pengontrol pertumbuhan makhluk hidup termasuk produksi telur, pertumbuhan otot, dan pertumbuhan tulang. Tujuan penelitian ini adalah mengidentifikasi keragaman gen GH yang terdapat pada ayam kampung dengan metode Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP). Keragaman gen GH dianalisa dari 106 ekor ayam kampung yang terdiri dari 49 ekor ayam kampung Ciawi dan 57 ekor ayam kampung Sukabumi, sebagai data pembanding digunakan juga 20 ayam Cobb, 10 Isa Brown, dan 10 ayam kampung x Isa Brown. Gen diamplifikasi dengan suhu annealing 60 oC selama 20 detik dengan panjang sekuen 339 pb yang terletak pada intron 3. Hasil amplifikasi dipotong menggunakan enzim EcoRV dengan suhu 37 oC. Data yang diambil adalah frekuensi genotipe, frekuensi alel, heterozigositas, dan keseimbangan Hardy- Weinberg. Hasil penelitian menunjukkan alel G lebih besar dari alel A. Berdasarkan hasil dapat disimpulkan bahwa ayam kampung, Cobb, dan Isa Brown bersifat polimorfik sedangkan ayam kampung x Isa Brown bersifat monomorfik.
Keyword: ayam kampung, gen GH, keragaman, PCR-RFLP

Judul: Thermal Characteristics and Dynamics of Tropical Cyclone over Western North Pacific Ocean: A Case Study of Typhoon Songda (Chedeng) 2011
Abstrak: The frequent occasion of Tropical Cyclone (TC) over Western North Pacific (WNP) Ocean lies from 10˚N to 26˚N and 121˚E to 170˚E. Sources of TC development come from warm ocean temperature where latent heat is released during condensation processes and subsequently concentrated in the boundary layer. Relative humidity at 850-700 hPa is responsible to produce the most intense storm. Meanwhile, weak vertical wind shear between 850-200 hPa is one of the dynamical factors that lead to the development of TC. Pressure level of 850-200 hPa is chosen to minimize the thermodynamic effect in the lower troposphere. Typhoon Songda (Chedeng in the Philippines) or TSC lasted from May 18th to 30th, 2011 and strengthened into powerful Super Typhoon stage between May 24th and 27th. Long curving track and the exhibition of all sequences of TC life cycle, TSC is then considered as an ideal case of TC. The objective of the study with case of TSC is to investigate the role of thermal characteristics and dynamics on TC intensity. The research is carried out by using Advanced Research of Weather Research and Forecasting model (WRF ARW model) version 3.3. Two domains are employed in the model. The first domain situate from 02˚N to 40˚N and 118˚E to 149˚E and cover spatial resolution () of 33.1 km. The second domain situate from 09˚N to 27˚N and 119˚E to 132˚E with of 11 km. Timestep of the model () is 120 seconds. The model is supported by the following physical parameterization, i.e., Yonsei University Scheme (YSU) in the boundary layer, Kain-Fritsch scheme (KF) in the cumulus, and WRF Single-Moment 3-class scheme in the microphysics. Initial meteorological condition prior to the formation of the cyclone is generated using WRF ARW standard-release model. Sensitivity of the model output is obtained from a selected single-parameter change scenarios, namely, 10 % to 20 % decrease and increase of wind shear initial data at 850-200 hPa, and by 10 % to 20 % decrease of relative humidity initial data at 850-700 hPa. The result showed that the negative correlations between wind shear and intensity are found in wind shear scenarios. Wind shears of 10 ms-1 which lead to strengthening of the wind intensity in the early period of Typhoon development are found in wind shear scenarios. The effect of wind shear changes on wind intensity is statistically significant in the 20 % wind shear scenarios. During mature stage, weak wind intensity occurred when wind shear increase as given in the WRF standard-release and the 20 % decreasing scenario. Different situation is found in the 20 % increasing scenario where wind shear tend to weak and lead to strong wind intensity at this stage. Meanwhile, the reduction of moisture supply at 850-700 hPa resulting from 20 % decreasing relative humidity play a major role in the weakening of wind intensity and reduces mechanical energy of the cycle process as much as 300 J kg-1.
Keyword: