Judul: Potensi Metabolit Sekunder Cendawan Endofit sebagai Antifungi terhadap Colletotrichum acutatum pada Cabai Merah
Abstrak: Colletotrichum acutatum merupakan salah satu spesies patogen antraknosa pada cabai yang dilaporkan paling banyak ditemukan di Pulau Jawa. C. acutatum juga merupakan patogen antraknosa yang bersifat paling agresif dibandingkan dengan spesies lain (C. gloesporioides dan C. capsici). Cendawan endofit dapat melindungi tanaman inangnya dari hama dan penyakit, salah satu mekanismenya yaitu dengan menghasilkan senyawa metabolit sekunder. Metabolit sekunder cendawan endofit yang bersifat antifungi terhadap patogen tanaman telah banyak dilaporkan baik berupa ekstrak kasar maupun senyawa aktif. Namun, pemanfaatan ekstrak metabolit sekunder cendawan endofit untuk mengendalikan penyakit antraknosa pada cabai yang disebabkan oleh C. acutatum belum dilaporkan. Penelitian ini bertujuan mengevaluasi aktivitas antifungi metabolit sekunder cendawan endofit terhadap C. acutatum secara in vitro dan in vivo. Analisis kromatografi lapis tipis (KLT) dan deteksi senyawa yang menunjukkan aktivitas antifungi dengan metode bioautografi juga dilakukan pada penelitian ini. Penelitian dilaksanakan di Laboratoria Pengembangan Teknologi Industri Agro dan Biomedika-Badan Pengkajian dan Penerapan Teknologi (LAPTIAB-BPPT), Pusat Penelitian Ilmu Pengetahuan dan Teknologi (PUSPIPTEK), Serpong, dan Kebun Percobaan Departemen Proteksi Tanaman, IPB mulai bulan April 2016 sampai Juli 2018. Bahan yang digunakan meliputi isolat C. acutatum dan isolat cendawan endofit Curvularia sp. yang diperoleh dari Laboratorium Mikologi Tumbuhan, Departemen Proteksi Tanaman IPB, cendawan endofit lainnya diisolasi dari tanaman cabai, dan benih cabai varietas Pilar F1 diperoleh dari toko pertanian. Seleksi cendawan endofit hasil isolasi dari bagian tanaman cabai yang berasal dari tiga lokasi, yaitu Cianjur, Bogor, dan Subang dilakukan dengan uji antibiosis dan uji patogenisitas. Isolat cendawan endofit yang didapatkan dari ketiga lokasi sebanyak 113 isolat cendawan endofit. Cendawan endofit yang diisolasi dari bagian akar, batang, daun, dan buah selanjutnya diuji potensinya sebagai antifungi dan didapatkan 57 isolat potensial. Namun dari 57 isolat bersifat antifungi yang diuji patogenisitas hanya terdapat satu isolat yang tidak berpotensi sebagai patogen, yaitu isolat CBR1D14. Pengujian secara in vitro dilakukan dengan menguji aktivitas ekstrak etil asetat (e.a) filtrat kultur dan miselia isolat cendawan endofit CBR1D14 dan Curvularia sp. dalam menghambat perkecambahan konidia dan pertumbuhan radial C. acutatum. Ekstrak etil asetat cendawan endofit yang menunjukkan aktivitas antifungi dipartisi dengan pelarut metanol 90% dan heksana, selanjutnya aktivitas antifungi fraksi ekstrak diuji kembali dengan metode yang sama. Hasil pengujian in vitro menunjukkan bahwa ekstrak etil asetat filtrat kultur CBR1D14 (e.a FCBR) menunjukkan aktivitas paling tinggi dalam menghambat perkecambahan konidia dan pertumbuhan radial C. acutatum. Hasil partisi e.a. FCBR hanya didapatkan fraksi metanol (f.m. FCBR) dan dari hasil partisi ekstrak etil asetat miselia CBR1D14 (e.a. MCBR) didapatkan fraksi metanol (f.m. MCBR) dan fraksi heksana (f.h. MCBR). Fraksi metanol FCBR dan f.m. MCBR menunjukkan aktivitas penghambatan perkecambahan konidia C. acutatum. Selain itu, f.m. MCBR juga menunjukkan penghambatan terhadap pertumbuhan radial C. acutatum, sedangkan f.h. MCBR tidak menunjukkan aktivitas antifungi terhadap C. acutatum. Nilai IC50 dan IC95 f.m. FCBR lebih rendah dibandingkan dengan f.m. MCBR dan fungisida benomil dalam menghambat perkecambahan konidia C. acutatum. Fraksi metanol FCBR dan f.m. MCBR diuji aktivitas antifunginya secara in vivo pada buah cabai dengan metode perendaman buah. Peubah yang diamati pada pengujian ini yaitu insidensi dan diameter bercak penyakit antraknosa pada buah cabai. Fraksi metanol FCBR (IC95 609.90 ppm) dan f.m. MCBR (IC95 1178.27
Keyword: antraknosa, bioautografi, ekstrak miselia, filtrat kultur, perkecambahan konidia

Judul: Screening of Marine Fungal as Biological Control Agent of Colletotrichum acutatum on Chili Plants
Abstrak: Gejala antraknosa pada cabai berupa bercak coklat konsentris kehitaman pada permukaan buah dan lama kelamaan meluas menjadi busuk lunak atau mengering. Penyakit antraknosa sangat merugikan karena menurunkan hasil produksi. Berbagai pengendalian telah dilakukan oleh petani cabai, namun hasilnya belum optimal. Cendawan laut merupakan salah satu jenis mikrob yang memiliki jalur metabolik yang spesifik dan telah banyak digunakan sebagai sumber obat-obatan pada manusia. Banyak senyawa-senyawa metabolit yang dihasilkan oleh cendawan laut seperti benzopyranone, stemphyperylenol, pleosporalone A dan B, (-)-cercosporamide, dan sesquiterpenes yang memiliki aktivitas anticendawan. Oleh karena itu, cendawan laut berpotensi juga dijadikan sebagai agens pengendalian hayati pada tanaman. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan cendawan laut yang berpotensi menghambat pertumbuhan C. acutatum dan menekan penyakit antraknosa pada cabai, serta mengidentifikasi isolat cendawan laut yang potensial sebagai agens pengendalian hayati. Penelitian dilaksanakan pada bulan Agustus 2019 sampai Januari 2022 di Laboratorium Mikologi Tumbuhan, Departemen Proteksi Tanaman, Fakultas Pertanian dan Laboratorium Mikrobiologi Hasil Perairan, Departemen Teknologi Hasil Perairan, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, serta kegiatan uji in planta dilaksanakan di kebun percobaan Cikabayan, Institut Pertanian Bogor. Sebanyak 27 isolat cendawan laut dari koleksi Laboratorium Mikrobiologi Hasil Perairan, Institut Pertanian Bogor, diuji pada penelitian ini. Cendawan tersebut diisolasi dari tanaman pesisir pinggir pantai (daun magrove dan terong pungo), kayu apung, alga, dan rumput laut. Sebelum digunakan, isolat tersebut diremajakan dengan menggunakan media agar-agar dekstrosa kentang (ADK) yang dimodifikasi dengan penambahan NaCl. Penapisan potensi agens hayati dari koleksi cendawan tersebut dimulai dengan uji antagonisme 27 isolat koleksi tersebut dengan metode kultur biakan ganda (dual culture) pada media ADK. Penapisan selanjutnya dilakukan terhadap 15 isolat terpilih dari pengujian sebelumnya untuk mengetahui potensi produksi senyawa organik volatil dalam menekan pertumbuhan patogen. Pengujian ini menggunakan media ADK dengan konsentrasi 25, 50, 75, dan 100% dilakukan dengan cara menumbuhkan isolat cendawan patogen dan cendawan laut calon agens antagonis pada cawan yang berbeda dengan diameter yang sama, lalu keduanya saling ditangkupkan dan pertemuan kedua cawan ditutup dengan plastik perekat. Pertumbuhan patogen akan terhambat bila calon agens hayati tersebut menghasilkan senyawa volatil yang toksik bagi patogen. Dari 15 isolat terpilih tersebut selanjutnya juga diuji kultur filtratnya dalam menghambat pertumbuhan koloni dengan metode peracunan media. Konsentrasi kultur filtrat yang digunakan dalam pengujian ini adalah 0.25, 0.5, 0.75, dan 1%. Dari 15 isolat yang diuji dalam kemampuan produksi senyawa organik volatil dan kemampuan kultur filtratnya menghambat pertumbuhan koloni C. acutatum terpilih 6 isolat terbaik untuk diuji kemampuan filtratnya dalam menghambat perkecambahan konidia C. acutatum dan keamanan hayatinya. Dari hasil pengujian ini, kemudian dipilih 4 isolat untuk diuji kemampuannya dalam menghasilkan enzim kitinolitik dan menghambat perkembangan penyakit antraknosa pada buah cabai. Semua isolat yang telah diuji kemampuan menghambat perkembangan penyakit antraknosa pada buah cabai tersebut diidentifikasi, baik secara morfologi maupun molekuler. Satu diantara isolat tersebut yang memiliki kemampuan menghasilkan senyawa volatil dideteksi jenis senyawa yang dihasilkan dengan metode gas chromatography mass spectrometry (GC-MS). Dari 27 isolat yang diuji kemampuan menghambat pertumbuhan koloni C. acutatum diperoleh 8 isolat yang menunjukkan penghambatan relatif lebih dari 40%. Selanjutnya dari 15 isolat terpilih termasuk yang menunjukkan penghambatan lebih dari 40% tersebut, ternyata dapat menghasilkan senyawa volatil yang mampu menghambat pertumbuhan
Keyword: anthracnose, identification, disease incidence, volatile organic compounds

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: