Judul: DNA Barcoding Based on rbcL Markers in Aquatic Plants from the Rote Ndao Region, Rote Island, East Nusa Tenggara
Abstrak: Pulau Rote terletak pada 100 25'-110 00' Lintang Selatan dan 1210 49'- 1230 26' Bujur Timur. Di wilayah Rote Ndao terdapat 96 pulau, dan hanya enam di antaranya yang berpenghuni. Hasil ekspedisi tim Oe Rote tahun 2018 yang menggabungkan survei terestrial dan citra satelit mengungkapkan bahwa terdapat 82 danau di Pulau Rote yang 24 diantaranya merupakan danau air asin. Sebanyak 24 danau air asin dan 2 danau air tawar terdapat di kawasan Laut Mati Rote. Di antara danau tersebut terdapat lima danau yang digunakan untuk penelitian ini yaitu Danau Ledulu, Oendui, Oemasapoka, Oesotimori dan Landu Leko. Danau Ledulu dan Oendui merupakan danau air tawar. Oemasapoka merupakan danau air asin dengan tingkat salinitas yang bervariasi antara 45-50 ppt. Selain itu, terdapat Oesotimori yang memiliki tingkat salinitas lebih dari 100 ppt. Landu leko merupakan wilayah laut yang memisahkan Pulau Rote Barat dengan Pulau Rote Timur, yang mengalami pengeringan air asin danau. Hal ini ditandai dengan kondisi tanah yang hampir kering pada musim kemarau, dan kondisi tanah yang mengandung air pada musim hujan. Di danau-danau tersebut tumbuh beragam tumbuhan air yang berperan sebagai bagian dari ekosistem danau. Tumbuhan air tersebut sampai saat ini belum teridentifikasi dengan baik. Identifikasi spesies tumbuhan air dapat dilakukan baik secara morfologi maupun secara molekuler menggunakan pendekatan DNA barcoding. Namun penggunaan identifikasi secara molekuler DNA barcoding dalam menganalisis lebih cepat dan tepat. Dalam identifikasi molekuler DNA barcoding diperlukan penanda genetik. Consortium for the Barcode of life (CBOL), melaporkan bahwa penanda rbcL (Ribulose-1,5-biphosphate carboxylase–oxygenase large subunit) merupakan penanda utama dalam penandaan tumbuhan, ideal dalam studi filogenetik dan taksonomi tumbuhan, bersifat universal, serta mudah diamplifikasi dan dianalisis. Spesies tumbuhan air di Pulau Rote terutama yang berasal dari lima danau yang berbeda belum pernah diteliti untuk molekuler DNA barcoding. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi dan mempelajari keragaman spesies-spesies tumbuhan air yang tumbuh di danau sekitar Rote Ndao, Pulau Rote, Nusa Tenggara Timur menggunakan penanda rbcL. Pengambilan sampel tumbuhan air sebanyak 20 spesies dilakukan di Danau Ledulu, Oendui, Oemasapoka, Oesotimori dan Landu Leko. Provinsi Nusa Tenggara Timur Kabupaten Rote Ndao. Identifikasi morfologi tumbuhan air dilakukan di Laboratorium Botani Pusat Riset Biologi–BRIN Cibinong. Identifikasi molekuler dilakukan dengan menggunakan penanda rbcL. Isolasi DNA total menggunakan kit Genomic Plant DNA extraction (Intron Biotechnology, Korea). DNA hasil isolasi diamplifikasi menggunakan primer rcbL dengan forward (F) dan reverse (R) yaitu rbcL F (ATG TCA CCA CAA ACA GAG ACT AAA) dan rbcL R (GTA AAA TCA AGT CCA CCR CG). Volume PCR yang digunakan adalah 50 µl yang terdiri dari Green taq 1 x PCR master mix (Biogen, USA) sebanyak 25 µl, DNA 5 µl (154 µg/mL), primer forward dan reverse masing-masing sebanyak 2,5 µl (0,5 µM) dan ddH2O 15 µl. Tahapan PCR yang digunakan yaitu pre-denaturasi 95 °C (5 menit) dilanjutkan dengan 45 siklus denaturasi 94 °C (1 menit), annealing 52 °C (1 menit 30 detik), dan extension 72 °C (1 menit), kemudian diakhiri dengan final extension 72 °C (10 menit). Hasil produk PCR divisualisasi dengan elektroforesis gel agarosa 1,5% dalam buffer TBE 1x dengan voltase 120 volt selama 25-30 menit, kemudian didokumentasikan menggunakan Gel Doc
Keyword: Aquatic plants, DNA barcoding, rbcL genetic marker, Rote Island

Judul: Struktur Komunitas Ikan Terumbu Karang pada Kolom Air dan Sedimen di Perairan Lombok Berdasarkan Sampel DNA Lingkungan
Abstrak: Ikan terumbu karang merupakan organisme yang terkait penting untuk fungsi ekosistem. Ikan terumbu karang juga berfungsi sebagai sumber makanan utama dan bertindak sebagai indikator tekanan dan ketahanan ekosistem. Underwater Visual Census (UVC) adalah metode yang sering digunakan untuk memantau kekayaan dan kelimpahan ikan karang, yang mana pada kondisi ini masih kurangnya pencatatan yang tepat untuk nilai keanekaragaman karena kemampuan terbatas pada proses identifikasi dan pemantauan. DNA lingkungan (eDNA) adalah metode pembaruan untuk memperkirakan kekayaan dan kelimpahan komunitas ikan serta organisme lainnya yang masih sulit teridentifikasi dan terdeteksi dari kolom air dan sedimen. Oleh karena itu, penelitian ini dilakukan untuk mengkaji struktur komunitas ikan terumbu karang dengan membandingkan kolom air dan sedimen menggunakan metode metabarcoding DNA Lingkungan pada tiga daerah perlindungan laut yang berbeda di sekitar Lombok. Penelitian ini dilakukan pada bulan Agustus 2018 pada tiga kawasan perlindungan laut dengan 14 titik pengamatan secara total. Sampel DNA lingkungan diambil dari kolom air dan sedimen menggunakan botol sampel dengan volume 4 L, kemudian dipompa menggunakan alat peristaltik MASTERFLEX nomor 13-310-662 untuk disaring menggunakan kertas saring 0,4 μm. Metabarcoding DNA lingkungan merupakan metode yang digunakan untuk pengidentifikasian serta perhitungan komposisi maupun kelimpahan spesies ikan terumbu karang. Analisis data secara statistik berupa perhitungan indeks Shannon-Wiener (H’), Simpson (D), ANOSIM dan juga PERMANOVA untuk melihat signifikansi antar data analisis. Hasil penelitian menggambarkan struktur komunitas ikan terumbu karang pada komposisi, kekayaan, dan keragaman yang teridentifikasi dari penerapan metode DNA lingkungan. Sebanyak 58 spesies teridentifikasi dari semua kawasan perlindungan. Indeks Shannon-Wiener (H ') menunjukkan bahwa spesies Zona Inti memiliki nilai keanekaragaman yang lebih tinggi dibandingkan dengan dua zona lainnya. Indeks Simpson (D) menunjukkan semua zona memiliki nilai dominansi yang bervariasi. Sedangkan hasil analisis non-metric multidimensional scaling (NMDS) dengan uji Bray-Curtis didapatkan hasil yang berbeda nyata antara kolom air dan sedimen dengan hasil PERMANOVA Adonis Pr (> F) = 0,001 dengan nilai kurang dari 0,05. Hasil ini dapat menjadi acuan dalam penggunaan DNA lingkungan sebagai alternatif pemantauan hayati dan penilaian keanekaragaman karena pengambilan sampel DNA lingkungan memiliki banyak keuntungan karena pengambilan sampel tidak dipengaruhi oleh perubahan kondisi lapangan, visibilitas, atau kurangnya keahlian taksonomi., Coral reef fishes are diverse associated organisms that are essential for ecosystem functioning, carrying out a range of vital ecosystem services, while also serving as a primary source of food and acting as indicators of ecosystem stress and resilience. Underwater Visual Census (UVC) is an often method used in monitoring richness and abundance of reef fish above the coral reef substratum, which many cases the biodiversity is underestimated. The frontier method for estimating the richness and abundance of the fish community and other organisms is environmental DNA (eDNA) which can resolve rare taxa detected from mid-column water and sediment. Therefore, this study was conducted to assess the community structure of coral reef fishes by comparing the mid-column water and sediment of eDNA metabarcoding from three different marine protected reefs surrounding Lombok. This research was conducted in August 2018 in three marine protected areas with 14 sites in total. Environmental DNA sample was taken from mid-column water and sediments using a 4 L bottle, then pumped using peristaltic
Keyword: organic, preservation, integrated system, sustainable

Judul: Dynamic New Keynesian Model for Unemployment and Inflation Rate.
Abstrak: This paper deals with a scientific analysis of the equilibrium level of hiring, employment and unemployment. The basic model being used is a standard new Keynesian model, which states that utility function depends on consumptions and working hours. Utility maximization refers to a standard labour supply equation, with the marginal cost’s dynamics on new Keynesian model simply reflects movements in real wages and productivity. Furthermore, trade-off between output and inflation stabilization can be considered using the new Keynesian Phillips curve. Dynamic general equilibrium model is a model that can be used to study interactions between market imperfections and nominal rigidities, which is capable of overcoming the main shortcoming of the standard new Keynesian model. In the general equilibrium model there are three groups of the economy agents, namely households, firms and monetary authority. The results of this research science that bargaining processes between firms and workers will yield optimal wage. Increase in labour will cause wages to fall, but the unemployment rate can be reduced. An increase in the firm’s monopoly power will shift the labour demand curve downward, which will reduce the number of workers that firm is willing to hire for any given bargained wage.
Keyword: