Judul: Correlation of gelE virulence gene with biofilm formation and gelatinase in Enterococcus faecalis isolates
Abstrak: Seratus dua puluh total sampel arsip digunakan pada penilitian ini. Sampel arsip terdiri atas 60 sampel asal inang ayam pedaging berupa sampel usap kloaka yang dikoleksi dari peternakan ayam pedaging di daerah Cianjur dan 60 sampel asal inang kucing berupa sampel usap anus (22 sampel) dan laring (38 sampel) dari pasien klinik hewan di Kota Depok dengan gejala infeksi saluran pencernaan. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keberadaan faktor virulensi gelatinase yang dikodekan oleh gen virulen gelE serta menguji terkait korelasinya terhadap pembentukan biofilm dan aktivitas gelatinase pada isolat Enterococcus faecalis dari inang ayam dan kucing. Isolasi bakteri dilakukan dengan menggunakan media agar selektif diferensial KF Streptococcus. Konfirmasi molekuler menggunakan teknik polymerase chain reaction (PCR) dengan gen spesifik Efac. Deteksi faktor virulen gelatinase menggunakan gen virulen gelE. Uji fenotipik pembentukan biofilm menggunakan teknik spektrofotometri pada densitas optik 630 nm, sedangkan uji aktivitas gelatinase dilakukan dengan menginkubasi bakteri pada agar Brain Heart Infusion (BHI) dengan gelatin 4%. Analisis hasil dilakukan secara kuantitatif menggunakan uji chi-square dengan P < 0,05 dianggap signifikan secara statistik. Hasil isolasi bakteri didapatkan 21 dari 40 (52,50%) isolat dari usap kloaka ayam dan 10 dari 20 (50%) isolat dari usap anus kucing terkonfirmasi positif E. faecalis secara molekuler. Studi faktor virulensi menunjukkan bahwa 21 isolat (100%) ayam dan 10 isolat (100%) kucing E. faecalis terdeteksi memiliki gen virulen gelE. Isolat kloaka ayam dengan uji fenotipik biofilm didapatkan sebanyak 20 isolat (95,23%) dikategorikan positif kuat dan 1 isolat (4,76%) dikategorikan positif lemah, sedangkan pada isolat anus kucing didapatkan sebanyak 5 isolat (50%) dikategorikan positif kuat dan 5 isolat (50%) dikategorikan positif lemah. Uji fenotipik gelatinase pada isolat ayam adalah 17 isolat (80,95%) positif memiliki aktivitas gelatinase dan 4 isolat (19,04%) negatif gelatinase, sedangkan pada isolat kucing didapatkan sebanyak 6 isolat (60%) positif dan 4 isolat (40%) negatif aktivitas gelatinase. Kedua uji fenotipik memiliki nilai P < 0,05 atau memiliki hubungan yang signifikan antara keberadaan gen virulen gelE dengan pembentukan biofilm dan aktivitas gelatinase. Kesimpulannya adalah gen virulen gelE pada bakteri E. faecalis ditemukan pada semua isolat dari kloaka ayam dan usap anus kucing. Kedua jenis isolat tersebut diketahui mampu untuk pembentukan biofilm dan aktivitas gelatinase. Gen virulen gelE berkorelasi positif pada pembentukan biofilm lemah hingga kuat pada bakteri E. faecalis yang berasal dari isolat asal kloaka ayam dan anus kucing serta berkorelasi positif terhadap aktivitas gelatinase., One hundred and twenty archival samples were used in this study. The archive samples consisted of 60 samples from broiler hosts in the form of cloacal swab samples collected from broiler farms in the Cianjur area and 60 samples from cat hosts in the form of anal swab samples (22 samples) and larynx swabs (38 samples) from veterinary clinic patients in Depok City with symptoms of gastrointestinal tract infections. This study aimed to explore the presence of gelatinase virulence factor encoded by the virulent gene of gelE and to examine its correlation to biofilm formation and gelatinase activity in Enterococcus faecalis isolates from chickens and cats. Bacteria isolation conducted by using KF Streptococcus selective-diffential agar media. Molecular confirmation using polymerase chain reaction (PCR) technique with
Keyword: biofilm, Enterococcus faecalis, gelE, gelatinase

Judul: Beta-Lactam Antibiotic Resistance and Production of Beta-Lactamase Enzyme in Escherichia coli from Chicken
Abstrak: Salah satu masalah kesehatan masyarakat utama abad ke-21 adalah resistansi antimikroba (AMR). Masalah AMR yang sangat penting adalah terkait resistansi antibiotik pada bakteri. Escherichia coli sebagai bakteri komensal pada saluran pencernaan dianggap sebagai reservoir dan pentransmisi resistansi antibiotik. Banyak penelitian resistansi antibiotik pada E. coli telah dilakukan. Penelitian terkait resistansi ampisilin pada E. coli dari berbagai hewan menujukkan angka yang tinggi. Namun, baru sedikit sekali penelitian di Indonesia yang meneliti resistansi sefalosporin pada E. coli asal hewan di Indonesia, terutama asal ayam. Kondisi resistansi seringkali dikaitkan dengan gen yang menyandikan sifat resistansi. Beberapa penelitian di Indonesia telah mendeteksi gen-gen panyandi resistansi antibiotik beta-laktam. Gen-gen penyandi resistansi yang telah dideteksi pada E. coli pada penelitian di luar negeri adalah blaTEM, blaSHV, dan blaCTX-M. Namun, penelitian deteksi ketiga gen tersebut pada isolat E. coli asal ayam di Indonesia belum pernah dilakukan. Tujuan umum penelitian ini adalah mendeteksi resistansi beta-laktam dan melihat aktivitas enzim beta-laktamase yang diproduksi dari E. coli yang berasal dari ayam. Escherichia coli pada penelitian ini berasal dari tiga lokasi berbeda yaitu Sukabumi (25 isolat), Bogor (17 isolat), dan Cianjur (10 isolat). Tiga rangkaian penelitian dilakukan dalam penelitian ini. Penelitian pertama tentang profil resistansi antibiotik pada E. coli. Penelitian pertama bertujuan untuk (1) membandingkan profil resistansi ampisilin tahun 2019 dan 2021 pada isolat E. coli yang sama dan (2) mengetahui profil resistansi ampisilin, setazidim, dan sefotaksim pada E. coli yang berasal dari ayam. Metode yang digunakan untuk uji resistansi antibiotik adalah uji difusi cakram metode Kirby-Bauer pada agar Mueller-Hinton. Uji dilakukan dengan tiga kali pengulangan. Isolat terlebih dahulu direidentifikasi dengan uj-uji identifikasi bakteri secara konvensional meliputi kultur pada agar MacConkey, kultur pada agar eosin-methylene blue, pewarnaan Gram, uji pada agar triple surag iron, uji indol, uji motilitas, uji methyl red, uji Voges-Proskauer, uji sitrat, dan uji urease. Selanjutnya dikonfirmasi dengan pomerase chain reaction (PCR) untuk mendeteksi gen uspA. Kelima puluh dua isolat terkonfirmasi E. coli dan positif gen uspA. Hasil uji resistansi ampisilin pada E. coli sangat tinggi karena seluruh isolat menunjukkan diameter zona hambat 0 mm. Hasil ini sama dengan pengujian resistansi tahun 2019 yang juga memiliki diameter zona hambat uji ampisilin 0 mm. Escherichia coli pada penelitian ini menunjukkan resistansi sefotaksim lebih tinggi daripada seftazidim. Tingkat resistansi tersebut teramati pada ketiga lokasi peternakan. Penelitian kedua adalah terkait gen peyandi resistansi yang ada pada isolat resistan. Isolat yang digunakan pada rangkaian penelitian kedua adalah sebanyak 33 isolat. Isolat tersebut minimal telah resistan dua antibiotik pada rangkaian penelitian sebelumnya (resistan ampisilin + seftazidim + sefotaksim atau ampisilin + seftazidim atau ampisilin + sefotaksim). Penelitian ini bertujuan untuk (1) mendeteksi gen blaTEM, blaSHV, dan blaCTX-M pada isolat E. coli asal ayam yang resistan ampisilin dan seftazidim dan/atau sefotaksim, serta (2) melihat kekerabatan gen blaTEM. Gen-gen penyandi resistansi dideteksi dengan metode PCR. Gen-gen target dalam penelitian ini adalah blaTEM, blaSHV, dan blaCTX-M. Gen blaTEM mendominasi perolehan deteksi gen. Seluruh isolat memiliki gen blaTEM, diikuti oleh lebih dari 50% isolat memiliki gen blaSHV, dan jumlah terendah adalah gen blaCTXM. Kombinasi blaTEM + blaSHV menjadi kombinasi dominan. Gen blaTEM sebagai gen yang paling dominan disekuensing. Lima
Keyword: antibiotik, beta-laktam, Escherichia coli, resistansi, beta-laktamase

Judul: Bifurkasi Hopf pada Model Siklus Bisnis Kaldor Kalecki tanpa dan dengan Waktu Tunda
Abstrak: Business cycle model is one of dynamical system models in economic. One of the business cycles model is Kaldor-Kalecki model. Kaldor-Kalecki business cycle model that is written in delayed defferential equations, is a business cycle model that involves gross product and capital stock of a company. In this paper Kaldor-Kalecki business cycle model is analyzed using both nondelay and delay in time of capital stock. By Taylor expansion for the time delayed model, an analysis of stability around the fixed points has been done. Furthermore, by using Hopf bifurcation theorem, it can be shown that there exists periodic orbits and limit cycle. In the nondelayed model, changing the parameter of goods market could lead to the occurrence of Hopf bifurcation and the existence of limit cycle. Similarly, for the delayed model, it has been shown that changing the time delay parameter may result in the occurrence of Hopf bifurcation and limit cycle.
Keyword: