Judul: Population Dynamics and Morphological Character of Endophytic Actinomycetes from Five Varieties of Rice.
Abstrak: Aktinomiset endofit hidup di dalam jaringan tanaman dan dapat membantu inangnya dalam menekan stress serta tahan terhadap patogen. Keberadaan dan peran biologi aktinomiset endofit pada tanaman padi belum banyak diketahui. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengkaji dinamika populasi dan karakter morfologi aktinomiset endofit asal lima varietas tanaman padi, yaitu IR64, Inpari 9, Ciherang, Inpago 4, dan Inpara 2 dengan beragam tipe ekosistem. Aktinomiset endofit padi diisolasi dengan sterilisasi permukaan dan ditumbuhkan pada media Humic Acid Vitamin-B Agar (HV agar). Purifikasi aktinomiset endofit menggunakan media Yeast Starch Agar (YSA) dengan antibiotik cyclohexamide, nalidixid acid, dan griseovulvin. Sebanyak 137 isolat berhasil diisolasi dari lima varietas dan bagian tanaman yang berbeda. Puncak pertumbuhan koloni aktinomiset berada pada tanaman padi irigasi (IR64, Inpari 9 dan Ciherang) dan padi gogo (Inpago 4) yang berumur 4 minggu, sedangkan pada padi rawa (Inpara 2), populasi aktinomiset endofit tertinggi ditemukan pada tanaman padi umur 2 minggu. Total populasi aktinomiset endofit diperoleh dari bagian akar. Keragaman karakter morfologi aktinomiset endofit paling banyak ditemukan pada batang dan daun yang didominasi oleh miselia aerial berwarna coklat. Penelitian ini menunjukkan bahwa keragaman aktinomiset endofit dipengaruhi oleh umur, varietas, dan tipe ekosistem tanaman padi sehingga perlu dikaji lebih lanjut potensi aktinomiset endofit pada beragam varietas tanaman padi.
Keyword: 

Judul: Identifikasi Aktinomiset Endofit Asal Tanaman Padi Berdasarkan Analisis Gen 16S rRNA dan nifH
Abstrak: Aktinomiset indigenos dikenal memiliki keragaman yang tinggi dan berpeluang untuk mendapatkan novel spesies. Aktinomiset endofit diketahui dapat menjadi pelaku pemfiksasi nitrogen selain mampu menghasilkan senyawa bioaktif dengan beragam fungsi seperti antimikrob, penghasil enzim dan inhibitor enzim, serta hormon pemacu pertumbuhan. Identifikasi molekuler dan peran aktinomiset endofit tanaman padi masih jarang dilakukan, sehingga perlu dikaji. Oleh karena itu penelitian ini bertujuan mengidentifikasi aktinomiset endofit tanaman padi berdasarkan analisis gen 16S rRNA dan nifH serta mengkaji aktivitasnya dalam memfiksasi nitrogen. DNA genom dari tujuh isolat aktinomiset endofit diisolasi menggunakan Genomic DNA Mini Kit, selanjutnya gen 16S rRNA diamplifikasi menggunakan PCR. Analisis kemampuan fiksasi nitrogen dilakukan berdasarkan uji produksi amonia, pertumbuhan di media bebas nitrogen, dan amplifikasi gen nifH melalui PCR. Produk PCR disekuensing dan dianalisis menggunakan software bioinformatika MEGA 5.05 untuk mengkonstruksi pohon filogenetik yang mengindikasikan kekerabatan antar isolat. Analisis sekuen gen 16S rRNA menunjukkan bahwa tujuh isolat (IPBCC.b.14.1531, IPBCC.b.14.1532, IPBCC.b.14.1533, IPBCC.b.14.1534, IPBCC.b.14.1535, IPBCC.b.14.1536, dan IPBCC.b.13.1530) berkerabat dekat dengan Streptomyces spp. Sekuen 16S rRNA dari enam isolat berkerabat dengan S. albolongus, S. cavourensis subsp. cavourensis, S. anulatus, dan S. bungoensis dengan identitas maksimum < 97%, dan satu isolat lainnya berkerabat dekat dengan S. misionensis, dengan identitas maksimum 99%. Berdasarkan analisis sekuen gen nifH, tiga isolat berhasil diamplifikasi menggunakan PCR dan menunjukkan kekerabatannya dengan gen nifH Herbaspirillum sp., dengan nilai kemiripan 93 hingga 99%. Analisis keragaman jarak genetik berdasarkan p-distance, antara tiga isolat dengan Frankia sp., Rhizobium sp., L. ferrooxidans, dan K. pneumonia menunjukkan adanya perbedaan sekuen gen nifH sebesar 18-28% dan lebih dari 59% jika dibandingkan dengan sekuen gen nifH B. japonicum. Hal tersebut mengindikasikan keragaman yang tinggi gen nifH pada isolat aktinomiset endofit padi. Berdasarkan uji in vitro, isolat IPBCC.b.13.1530, IPBCC.b.14.1531, dan IPBCC.b.14.1536 juga mampu tumbuh di media bebas nitrogen dan memproduksi amonia berturut-turut sebesar 0.065 ppm, 0.014 ppm, dan 0.076 ppm pada media bebas nitrogen. Hasil tersebut mengindikasikan bahwa tiga isolat tersebut menjanjikan dalam perannya sebagai bakteri pemfiksasi N2 pada tanaman padi.
Keyword: aktinomiset endofit, gen nifH, tanaman padi, Streptomyces, 16SrRNA

Judul: Closed Knight’s Tour pada Papan Catur Berbentuk Persegi Panjang dengan Ukuran Maksimal 8 × 8
Abstrak: Closed Knight’s Tour merupakan langkah kuda yang mengunjungi setiap kotak pada papan catur tepat satu kali dengan langkah kuda berawal dan berakhir pada kotak yang sama. Graf yang terbentuk dari closed knight’s tour dinotasikan sebagai graf G(m,n), dengan m adalah banyaknya baris dan n adalah banyaknya kolom. Graf tersebut memuat Hamiltonian cycle. Sebuah graf terhubung G adalah graf bipartite jika dan hanya jika graf tersebut tidak memiliki cycle dengan panjang ganjil. Papan catur yang memenuhi syarat cukup untuk memiliki closed knight’s tour adalah papan catur berukuran 5 × 6, 5 × 8, 6 × 6, 6 × 7, 6 × 8, 7 × 8, dan 8 × 8.
Keyword: bipartite, closed knight’s tour, hamiltonian cycle, knight’s tour, teori graf