Judul: Analisis model Phytoplankton, Toxic Phytoplankton, dan Zooplankton pada Lingkungan Perairan
Abstrak: Pada perairan terdapat berbagai macam organisme, salah satunya adalah plankton. Plankton merupakan organisme tingkat pertama yang berfungsi sebagai produsen atau penyedia energi bagi organisme lain. Plankton terdiri atas dua macam, yaitu phytoplankton dan zooplankton. Phytoplankton merupakan kelompok plankton yang bersifat seperti tumbuhan, sedangkan zooplankton merupakan anggota plankton yang bersifat hewani. Berlebihnya phytoplankton pada lingkungan perairan dapat menimbulkan fenomena blooming yang ditandai dengan berubahnya warna air laut yang dikenal dengan brown tides. Istilah yang saat ini sering digunakan di dunia Internasional adalah Harmful Algae Blooms atau HABs. HABs adalah suatu fenomena blooming toxic-phytoplankton di suatu perairan yang dapat menyebabkan kematian biota lain. Karya ilmiah ini membahas model phytoplankton, toxic-phytoplankton, dan zooplankton yang diambil dari Banarjee & Ezio (2011). Berdasarkan model tersebut dilakukan simulasi analisis kestabilan dan nilai parameter. Hasil simulasi menunjukkan bahwa jika tingkat kematian populasi pyhtoplankton meningkat maka populasi toxic-phytoplankton akan meningkat pula. Jika tingkat kematian populasi phytoplankton rendah, maka populasi toxic-phytoplankton juga rendah. Agar kondisi HABs tidak terjadi dalam suatu lingkungan perairan, populasi phytoplankton harus ditingkatkan.
Keyword: Plankton, Model, Stability, Harmful Algae Blooms, Plankton, Kestabilan, Model matematika, Analisis model, Simulasi komputasi

Judul: Model Matematika dan Analisis Kandungan Oksigen Terlarut dalam Badan Air yang Mengalami Eutrofikasi
Abstrak: Eutrofikasi adalah proses pengayaan nutrien melalui proses dekomposisi yang dapat memicu terjadinya perubahan seperti peningkatan produksi alga yang mengakibatkan berkurangnya oksigen terlarut dalam badan air. Pengurangan kandungan oksigen terlarut dapat mengakibatkan kematian terhadap ikan dan komponen akuatik lainnya. Pada penelitian ini dibahas model matematika kandungan oksigen terlarut dalam badan air yang mengalami eutrofikasi. Pada model ini terdapat enam variabel yang dipertimbangkan, yaitu konsentrasi nutrien, populasi alga, populasi makrofita, populasi zooplankton, kepadatan detritus dan konsentrasi oksigen terlarut. Ketika proses eutrofikasi terjadi, alga, makrofita dan zooplankton mati dan tenggelam ke bagian bawah badan air, sehingga terjadi pembusukan oleh dekomposer, yang akhirnya terbentuk detritus yang berlebihan. Detritus tersebut selanjutnya diubah menjadi nutrien melalui proses biokimia. Proses pengubahan detritus menjadi nutrien menggunakan banyak oksigen terlarut, sehingga mengurangi kandungan oksigen terlarut di badan air. Dalam penelitian ini diperoleh enam titik tetap. Selanjutnya dilakukan analisis kestabilan pada titik tetap dengan mula-mula melinearisasi sistem kemudian mencari nilai eigen dari matriks Jacobiannya. Hasil analisis menunjukkan bahwa dari enam titik tetap, satu diantaranya stabil dan lima lainnya tidak stabil. Simulasi menunjukkan bahwa jika laju masuknya nutrisi ke dalam badan air mengalami kenaikan, maka populasi alga, makrofita, zooplankton dan detritus juga meningkat, sedangkan konsentrasi oksigen terlarut menurun. Selain itu, laju pengubahan detritus menjadi nutrien juga mempunyai pengaruh terhadap konsentrasi oksigen terlarut di mana jika laju pengubahan detritus menjadi nutrien meningkat, maka konsentrasi oksigen terlarut di badan air menurun. Simulasi numerik juga menunjukkan bahwa jika laju masuknya nutrisi di badan air adalah nol, maka populasi alga, makrofita, zooplankton dan kepadatan detritus juga cenderung menuju nol setelah periode waktu yang singkat sedangkan konsentrasi oksigen terlarut cenderung menuju nilai maksimum.
Keyword: eutrofikasi, kestabilan, model matematika, oksigen terlarut

Judul: Isolasi Konstruksi dan Rekombinasi Gen Pengkode Reverse Transcriptase asal Simian Retrovirus-2 (SRV-2)
Abstrak: The availability of reverse transcriptase enzym as a valuable component for Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) technique has been providing by foreign companies. Therefore, it needs more cost and time to provide it. This study is an early step to produce in house reverse transcriptase rekombinant enzym from SRV-2. The purpose of this study was isolated, constructed, and rekombined SRV-2 reverse transcriptase gene to entry clone and destination vector. Isolation was done by PCR amplification technique using three pairs of primers, which are RT I (3282-3683), RTII (3261-3900), and RTIII (3169-4133). Construction and recombination in this study used Gateway method from Invitrogen. SRV-2 reverse transcriptase gene was isolated in this study with A-549 cell inoculated SRV-2 as source of virus. This gene amplify by PCR technique and resulted specific band for RTI 401 bp, RTII 639 bp, and RTIII 964 bp. Analysis of pENTR/SD/TOPO and pDEST17 indicated SRV-2 reverse transcriptase gene code has already inserted to this plasmid. This result indicated SRV-2 reverse transcriptase gene have isolated, constructed, and recombined to entry clone and destination vector.
Keyword: