Judul: Karakterisasi Gen hdc Pengkode Enzim Histidin Dekarboksilase pada Isolat Bakteri Ikan Tuna (Thunnus sp) dan Cakalang (Katsuwonus pelamis)
Abstrak: Indonesia merupakan salah satu produsen ikan tuna di dunia. Laporan Rapid Alert System for Food and Feed (RASFF) Uni Eropa pada tahun 2007 mencatat terdapat 22 kasus impor tuna Indonesia yang mengandung histamin melebihi batas keamanan pangan. Food and Drugs Adminsitration Amerika serikat (US-FDA) melaporkan terdapat 7 kasus pada tahun 2007 dan 13 kasus pada tahun 2008 tentang penolakan tuna Indonesia akibat kadar histamin yang melebihi ambang batas keamanan pangan. Ikan-ikan golongan scombridae seperti tuna dan cakalang secara alami memiliki kandungan histidin dalam jumlah yang tinggi yang dapat diubah menjadi histamin oleh bakteri pembentuk histamin yang memiliki enzim histidin dekarboksilase. Untuk dapat mengembangkan metode yang dapat mendeteksi adanya histamin secara dini dan akurat, maka perlu dilakukan isolasi gen pengkode enzim histidin dekarboksilase dengan metode berbasis PCR-sequencing. Adapun tujuan dari penelitian ini adalah mendapatkan isolat bakteri dari ikan tuna dan cakalang; mendapatkan gen pengkode enzim histidin dakarboksilase dari isolat bakteri ikan tuna dan cakalang dan karakterisasi gen pengkode enzim histidin dekarboksilase dari isolat bakteri ikan tuna dan cakalang.
Keyword: 

Judul: Deteksi Bakteri Penghasil Histamin melalui Gen Histidine Decarboxylase (hdc) pada Ikan Tuna, Tongkol, dan Cakalang
Abstrak: Bakteri penghasil histamin dapat diidentifikasi dengan mendeteksi gen histidin dekarboksilase (hdc). Tujuan penelitian ini yaitu menentukan kadar histamin pada daging ikan tuna, tongkol, dan cakalang, mengidentifikasi jenis bakteri pembentuk histamin dan menganalisis bioinformatika melalui konstruksi pohon filogeni. Kadar histamin diuji menggunakan spektrofluorometer, sedangkan analisis DNA bakteri penghasil enzim hdc menggunakan PCR. Kadar histamin yang terdeteksi dari ikan tuna, tongkol, dan cakalang yaitu sebesar 2.96±0.22 ppm, 2.14±0.23 ppm, dan 1.02±0.97 ppm. Jenis bakteri pembentuk histamin yang berhasil diidentififikasi baik menggunakan primer spesifik hdc maupun primer universal 16S rRNA yaitu Morganella morganii, Enterobacter hormaechei, Klebsiella aerogenes dan Enterobacter bugandensis. Konstruksi pohon filogeni menunjukkan bahwa bakteri M. morganii dan E. hormaechei berkerabat dekat pada satu cabang, serta bakteri Klebsiella aerogenes, Enterobacter bugandensis, dan Escherichia fergusonii juga berkerabat dekat, namun ketiganya tidak berkerabat dengan bakteri Peptoniphilus stercorisuis dan Vagococcus carniphilus.
Keyword: 16S rRNA, PCR, pohon filogeni

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: