Judul: Optimalisasi ekstraksi dan pemurnian isoenzim daun meranti merah (Shorea leprosula Miq)
Abstrak: Studi keragaman genetika pada beberapa spesies tanaman hutan telah dilakukan. Analisis keragaman genetika pada meranti merah (Shorea leprosula MIQ) untuk mempermudah pengadaan bibit yang baik belum dilakukan di Indonesia. Salah satu tahap analisis isoenzim yang perlu diperhatikan adalah pemilihan larutan ekstraksi yang optimal dan perlakuan pemurnian ekstrak, karena larutan ekstraksi dan komposisinya mempengaruhi aktivitas enzim. Optimalisasi ekstraksi dilakukan dengan pemilihan delapan larutan ekstraksi yang dilihat keberhasilannya pada analisis isoenzim daun meranti merah dengan teknik elektroforesis gel pati kentang. Isoenzim yang dianalisis yaitu Aspartat Aminotransferase (AAT), malat dehidrogenase (MDH), fosfoglukonat dehidrogenase (PGD), asam fosfatase (ACP), esterase (EST), dan peroksidase (PER). Selain itu dilakukan pemurnian terhadap ekstrak melalui tahapan sentrifugasi 10000 g selama 10 menit, pengendapan dengan amonium sulfat kejenuhan 70%, dan dialisis. Basil optimalisasi menunjukkan bahwa larutan ekstraksi WWIII (larutan ekstraksi' untuk jaringan dengan kadar fenolik tinggi (Wendel & Weeden, 1989))mampu mengekstraksi isoenzim AAT, MDH, ACP, PER, dan EST dengan baik. Larutan ekstraksi WWIII terdiri dari bufer tris HCl J00mM pH 7.5, PVP JO%, natrium tetraborat Z0OmM, BSA 1%, DIECA 20mM, merkaptoetanol 0.0001%, asam askorbat 250mM, natrium bisulfit 20mM, dan sukrosa 7%. Isoenzim PGD tidak memberikan pita berwarna biru. Pemurnian untuk analisis isoenzim pada gel pati kentang tidak selalu perlu dilakukan. Pengendapan dengan amonium sulfat dan dialisis akan menyebabkan pita isoenzim berkurang aktivitasnya dan dapat menyebabkanjumlah pita berkurang. Pita isoenzim ACP dan EST memberikan hasil lebih baik setelah dialisis dibandingkan setelah pengendapan sehingga dapat digunakan sebagai penanda genetika.
Keyword: 

Judul: Korelasi antara keragaman penotipik dengan marka isozim pada tanaman sengon (Paraserianthea falcataria) di Kebun Benih Parung Panjang, Bogor
Abstrak: Dewasa ini kegiatan pembangunan hutan tanaman sangat pesat. Selain ditujukan untuk memperbaiki lahan-lahan marjinal, juga untuk keperluan Hutan Tanaman Industri (HTI). Jenis-jenis yang diprioritaskan untuk pembangunan HTI salah satunya adalah sengon (P. falcataria). Untuk pembangunan HTI diperlukan benih dalam jumlah besar dan berkualitas tinggi. Salah satu program tersebut adalah pembangunan kebun benih semai uji keturunan untuk jenis sengon yang dilakukan oleh BTP Balitbang Kehutanan di Parung Panjang, Bogor. Mengingat sulit dan lamanya dalam program pemuliaan dan analisis genetik untuk karakter kuantitatif tanaman kehutanan, diperlukan usaha untuk mempercepat proses tersebut. Sehingga tidak perlu menunggu sampai tanaman tersebut besar, dapat diketahui tanaman tersebut berkualitas baik. Saat ini teknik-teknik yang telah dikembangkan untuk tujuan tersebut adalah identifikasi isoenzim (isozim) dan aplikasi teknologi marka molekuler seperti RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA), RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism), mikro satelit, dan sebagainya. Metoda isozim relatif cepat, murah, dan sederhana, serta dapat mendeteksi enzim yang diekspresikan oleh gen pada alel resesif penentu karakter spesifik yang umumnya sering tertutup oleh penampilan visual. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keragaman genetik ketiga sub populasi (Jonggol, Wamena, dan Kediri), mengetahui jarak genetik antar sub populasi tersebut, dan untuk mengetahui korelasi antara keragaman fenotipik dengan marka isozim, pada tanaman sengon (P. falcataria) di kebun Benih Parung Panjang, Bogor, Penelitian ini terdiri dari dua percobaan yakni di lapangan kebun benih Parung Panjang, Bogor pada tanggal 20 Mei dan 25 Mei 1997 dan di laboratorium Genetika Molekuler Puslitbang Bioteknologi-LIPI, Cibinong, yang dilakukan pada tanggal 19 Mei-10 Juni 1997. Bahan tanaman berupa sampel daun muda sengon yang diambil dari beberapa individu dari satu populasi sengon umur satu tahun di petak 31 dan 32. Dari satu populasi sengon yang terdiri dari 3 sumber benih/provenans (sub populasi) yakni Jonggol, Wamena, dan Kediri yang diambil masing-masing sub populasi 30 sampel berfenotip baik dan 30 sampel berfenotip jelek. Metoda penelitian secara garis besar terdiri dari ekstraksi enzim (± 0,3 gram daun sengon ditambah bufer pengekstrak W (0,6 ml)), pembuatan gel pati kentang 11%, penempatan sampel, elektroforesis dengan menggunakan bufer gel histidine (H), pewarnaan isozim dan fiksasi, dan observasi gel. Untuk analisis data dilakukan dengan bantuan program Biosys-1. Hasil penelitian ini secara umum (tanpa dipisah) menunjukkan bahwa dari 7 lokus yang diamati, 3 lokus diantaranya (AAT-2, EST-4, dan SDH-1) bersifat polimorfik di ketiga sub populasi. Pada pertumbuhan yang digolongkan baik lokus...
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: