Judul: Ekspresi Protein Tanaman Kelapa Sawit (Elaeis Guineensis Jacq.) Yang Terinfeksi Ganoderma Boninense Pat. Pada Fase Pembibitan
Abstrak: Busuk pangkal batang (BPB) adalah penyakit pada tanaman kelapa sawit akibat terserang fungi patogen Ganoderma boninense dan merupakan penyakit paling penting pada perkebunan kelapa sawit di Asia Tenggara. BPB dapat membunuh lebih dari 80% tegakan tanaman kelapa sawit yang memiliki setengah masa hidup ekonominya. Sistem pertahanan tanaman terhadap serangan patogen dengan mengaktifkan respon pertahanan dari berbagai komponen. Respon tersebut termasuk induksi gen terkait pathogenesis-related (PR) proteins, seperti glukanase dan kitinase, produksi metabolit sekunder atau penguatan dinding sel. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan isolat G. boninense yang memiliki tingkat virulensi tertinggi secara in vitro berdasarkan aktivitas enzim ekstraseluler dan menetapkan respon tanaman kelapa sawit moderat tahan dan tidak tahan G. boninense berdasarkan aktivitas enzim peroksidase (PO), kitinase, β-1,3-glukanase, fenilalaninamonia liase (PAL), dan polifenol oksidase (PPO). Tahap pertama penelitian, yaitu karakterisasi setiap kultur G. boninesne, analisis aktivitas enzim ekstraseluler G boninense. Tahap kedua, yaitu penanaman tanaman kelapa sawit moderat tahan dan tidak tahan G. boninense, perlakuan tidak dan dengan infeksi G. boninense yang memiliki tingkat virulensi tertinggi, pengamatan gejala BPB, dan analisis aktivitas enzim tanaman kelapa sawit. Hasil penelitian menunjukkan bahwa setiap isolat G. boninense memiliki karakteristik kultur yang berbeda. Isolat G8 memiliki waktu fase eksponensial tercepat. Isolat G2 memiliki tingkat virulensi tertinggi berdasarkan aktivitas enzim ekstraseluler secara in vitro. Korelasi negatif ditunjukkan antara pertumbuhan dan virulensi pada isolat G2. Persentase serangan G. boninense terhadap tanaman kelapa sawit memiliki kecenderungan yang semakin tinggi seiring dengan lamanya waktu perlakuan. Progeni moderat tahan (R1 dan R2) memiliki persentase serangan yang lebih rendah dari progeni tidak tahan (S). Analisis aktivitas enzim pada tanaman kelapa sawit menunjukkan bahwa aktivitas PO dan PPO lebih tinggi pada progeni moderat tahan pada bulan ke-1 setelah perlakuan. Enzim kitinase dan β-1,3-glukanase memiliki aktivitas yang lebih tinggi pada progeni moderat tahan pada bulan ke-3 setelah perlakuan. Aktivitas enzim PAL pada progeni moderat tahan lebih tinggi pada setiap bulan pengamatan. Tanaman kelapa sawit moderat tahan memiliki sistem pertahanan yang lebih baik berdasarkan aktivitas enzim PO, PPO, PAL, kitinase dan β-1,3- glukanase. Enzim PPO dapat dijadikan sebagai kandidat penanda untuk membedakan antara progeni moderat tahan dan tidak tahan terhadap infeksi G. boninense berdasarkan analisis kelompok dan biplot. .
Keyword: busuk pangkal batang, enzim ekstraseluler, interaksi inang-penyakit, kelapa sawit

Judul: Burkholderia sp. as Antifungal-Producing Bacteria to Suppress Ganoderma boninense in Oil Palm
Abstrak: Indonesia merupakan salah satu produsen minyak kelapa sawit di dunia, sehingga kelapa sawit merupakan salah satu komoditas penting di Indonesia. Indonesia menyediakan 46% minyak kelapa sawit di dunia dan permintaan akan minyak kelapa sawit semakin lama semakin meningkat. Penyakit yang paling banyak ditemukan di perkebunan kelapa sawit adalah busuk pangkal batang yang disebabkan oleh G. boninense. Berbagai usaha telah dilakukan untuk mencegah penyebaran penyakit ini, namun belum menunjukkan hasil yang optimum. Burkholderia sp. yang diisolasi dari rizosfer dan dalam jaringan (endofit) yang berasal dari tanaman kelapa sawit yang sehat menunjukkan potensi dalam menekan pertumbuhan G. boninense secara in vitro. Burkholderia sp. telah dilaporkan sebagai agen biokontrol karena kemampuannya dalam memproduksi beberapa senyawa antifungi. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengisolasi Burkholderia sp indigenus yang berpotensi dalam menghambat pertumbuhan G. boninense secara in vitro dan in vivo, dan profil komunitas bakteri di dalam tanaman setelah diberikan perlakuan Burkholderia sp. dan G. boninense. Lima isolat Burkholderia sp. rizosfer (B313, B51a, B52c, B51b, B52a) dan satu isolat Burkholderia sp. endofit (B212) telah berhasil diisolasi dari perkebunan kelapa sawit. Isolat Burkholderia sp. kemudian digunakan dalam uji antagonis terhadap pertumbuhan G. boninense di dalam media PDA. Burkholderia sp. dengan aktivitas antagonis yang tertinggi kemudian digunakan untuk uji in vivo. Profil komunitas bakteri endofit setelah perlakuan Burkholderia sp. dan G. boninense dianalisis dengan menggunakan DGGE (Denaturing Gradient Gel Electrophoresis). Selanjutnya gen yang diduga terkait dengan biosistesis senyawa antifungi dari Burkholderia sp. dikonfirmasi dengan menggunakan primer spesifik pyrrolnitrin (prn), pyoluteorin (plt), phenazine (phz), dan DAPG (phl). Burkholderia sp. dengan kode B212 menunjukkan aktivitas hambat yang paling tinggi yaitu dengan nilai PIRG 24,38%. Genom dari isolat B212 tersebut menunjukkan hasil PCR dengan ukuran 790 bp menggunakan primer prn. Hasil sekuens menunjukkan bahwa hasil PCR tersebut 99% identik dengan gen prnD parsial dari B. cepacia strain ESR63. Hasil uji in vivo konsorsium B212 dan B52a pada tanaman yang tidak diberikan infeksi G. boninense menunjukkan adanya pertumbuhan tanaman yang lebih baik dibandingkan dengan kontrol. Namun, konsorsium B212 dan B52a tidak menurunkan tingkat infeksi dari G.boninense pada tanaman kelapa sawit. B212 juga cenderung menghambat pertumbuhan tanaman yang diberikan infeksi G. boninense jika dibandingkan dengan kontrol. Analisis DGGE menunjukkan bahwa tanaman yang diberikan Burkholderia sp. memiliki profil komunitas bakteri endofit yang berbeda dengan yang tidak diberikan dengan Burkholderia sp. Sedangkan pemberian G. boninense tidak memberikan profil bakteri endofit yang berbeda dengan kontrol (yang tidak diberikan G. boninense). Burkholderia sp. memiliki potensi sebagai agen biokontrol untuk fungi patogen seperti G. boninense, namun metode aplikasinya belum tepat. Aplikasi Burkholderia sp dan G. boninense pada kelapa sawit secara bersamaan memberikan hasil yang belum memuaskan. Metode aplikasi Burkholderia sp. endofit sebagai biokontrol terhadap G. boninense perlu dioptimasi dan riset yang lebih mendalam. Dari hasil DGGE menunjukkan bahwa introduksi bakteri dari luar dapat mengubah komunitas bakteri yang ada di dalam jaringan tanaman.
Keyword: gen penyandi antibiotik., busuk pangkal batang, agen biokontrol, bakteri endofit, aplikasi perendaman

Judul: Implementation of Spatio-Temporal Change Query in Relational Database.
Abstrak: Geographic object changes in various views. Object changes are recorded using a model of static storage. No historical connection between old version data and new version data has been built. For that, a storage model of spatio-temporal queries that can analyze spatio-temporal changes has been developed. The object changes the geometry are grouped according to the taxonomy of Spatio-Temporal Pattern Change. This research has been able to apply the query patterns change including born, expand, merge, contract, split, normal and die. This query based on geometric (area) changes. The implementation of spatio-temporal change queries represents an object changes continuously with easy, change detection is done by comparing two versions of data. Keyword: spatio-temporal change query, spatio-temporal change pattern.
Keyword: