Judul: Analysis of Diurnal and Seasonal Ozone Fluctuation and  Its Relationship with Precursor (NOx) and Meteorological Factor (Case Study :  Puncak, Bogor)
Abstrak: Puncak merupakan salah satu destinasi wisata di Indonesia. Banyak wisatawan yang mengunjungi Puncak ketika liburan yang berdampak pada peningkatan jumlah kendaraan bermotor, serta peningkatan emisi polutan, seperti NO dan NO2. Kedua polutan tersebut merupakan prekursor pembentuk ozon (O3) pada siang hari. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis hubungan fluktuasi konsentrasi ozon dan konsentrasi prekursornya (NOx) serta faktor meteorologi yang mempengaruhi fluktuasi konsentrasi ozon. Hubungan fluktuasi tersebut dianalisis secara visual dan analisis korelasi. Hasil menunjukkan bahwa terdapat korelasi negatif antara ozon dengan NO dan NO2 pada siang hari. Koefisien korelasi yang didapat antara ozon dengan NO2 lebih besar dibanding dengan NO. Koefisien korelasi Ozon dan NO pada setiap periode Bulan DJF, MAM, JJA, dan SON berturut-turut sebesar -0.55, -0.62, -0.44, dan -0.64 berturut-turut. Korelasi antara faktor meteorologi dengan fluktuasi konsentrasi ozon memiliki hasil yang bervariasi dengan koefisien korelasi terbesar adalah koefisien korelasi antara suhu udara dengan konsentrasi ozon, yaitu 0.70, 0.66, 0.55, dan 0.62 untuk bulan DJF, MAM, JJA, dan SON
Keyword: Ozone, Meteorological factor, NOx, NO, NO²

Judul: Analysis of PM2.5 and Its Precursor Pollutants (NOx) Concentration Fluctuations and Their Relationship with Meteorological Factors in Rural Areas (Case Study: Puncak Bogor)
Abstrak: Wilayah Puncak Bogor merupakan wilayah rural yang didominasi oleh kegiatan pertanian. Salah satu polutan yang dihasilkan oleh aktivitas pertanian adalah ammonia (NH3), yang berkontribusi terhadap pembentukan partikulat sekuder, dengan prekursor NOx. Fluktuasi konsentrasi partikulat dan prekursornya dipengaruhi juga oleh faktor meteorologi. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis hubungan konsentrasi PM2.5 dengan konsentrasi prekursornya (NOx) berdasarkan fluktuasi konsentrasi di wilayah Puncak Bogor serta menganalisis faktor meteorologi yang berkontribusi terhadap fluktuasi konsentrasi PM2.5 dan prekursornya (NOx) di wilayah Puncak Bogor. Data yang digunakan adalah data konsentrasi PM2.5, NOx, NO, NO2, suhu udara, kelembaban relatif, curah hujan, serta arah dan kecepatan angin tahun 2019 dan 2020 yang dianalisis menggunakan korelasi dan regresi linier serta menggunakan package openair di RStudio. Hasil penelitian menunjukkan konsentrasi PM2.5 dengan NOx sebagai prekursornya memiliki korelasi positif yang signifikan baik pada tahun 2019 (r = 0,68) maupun tahun 2020 (r = 0,63). Peningkatan konsentrasi PM2.5 di siang hari serta penurunan konsentrasi di malam hari dikaitkan dengan adanya pengaruh angin lembah dan angin gunung yang berhembus di wilayah Puncak Bogor. Faktor meteorologi (suhu udara, kelembaban relatif, dan kecepatan angin) memiliki nilai korelasi yang kecil terhadap fluktuasi konsentrasi PM2.5, demikian pula terhadap fluktuasi konsentrasi NOx kecuali untuk suhu udara (r = 0,3)., Puncak Bogor is a rural area which is dominated by agricultural activities. One of the pollutants produced by agricultural activities is ammonia (NH3) which contributes to the secondary particulates formation, with the NOx precursor. The fluctuation of particulates and its precursor concentration are also influenced by meteorological factors. This study aims to analyze the relationship between PM2.5 concentration and its precursor (NOx) based on concentration fluctuations in Puncak Bogor and also to analyze the meteorological factors that contribute to the PM2.5 and its precursor (NOx) concentration fluctuations in Puncak Bogor. The data used are concentrations of PM2.5, NOx, NO, NO2, temperature, relative humidity, rainfall, and wind in 2019 and 2020 which were analyzed using correlation and linear regression and also using the openair package in RStudio. The results showed that PM2.5 concentration with NOx as precursors had a significant positive correlation both in 2019 (r = 0,68) and 2020 (r = 0,63). The increased and decreased of PM2.5 concentration during the day and night was influenced by valley and mountain winds that blow to the Puncak Bogor. Meteorological factors (air temperature, relative humidity, and wind speed) had a small correlation value to PM2.5 concentration fluctuations, as well as to NOx concentration fluctuations, except for air temperature (r = 0,3).
Keyword: meteorological factors, NOx, PM2.5, precursors, secondary particulates

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA