Judul: Studi tentang Pendugaan Densitas dan Sebaran Ikan Pelagis di Laut Banda dengan Menggunakan Sistem Akustik Bim Terbagi.
Abstrak: Penelitian tentang pendugaan nilai densitas dan sebaran ikan pelagis telab dilakukan di Laot Banda padn bulan April 1999. tepatnya di wilayab antara 5'26' LS, 132'35' BT sampai 3'55' LS, 128'1' BT densan menggunakan sistem akustik him terbagi. Tujuan dari penelitian ini adalab untuk menduga densitas ikan pelagis dan sebarannya di Laut Banda pada bulan April 1999 serta menganalisa kondisi oseanografi di Laut Banda. Dalam penelitian ini digunakan Baruna Jaya VIII deugan Instumen akustik berupa Scientific echosounder SIMRAD EK 500 dan Split beam transducer dengan frekuensi 38 kHz. Studi ini menggunakan data oseanografi tabun 1999 yang diperoleh dari BPPT, karena BPPT memiliki data yang diambilnya pada waktu yang bersamaaan dengan pengambilan data akustik. Trek yang digunakan pada penelitian ini ialah trek lurus.
Keyword: 

Judul: Pendugaan densitas dan sebaran spasial ikan pelagik dengan sistem akustik BIM Ganda di perairan Anyer
Abstrak: Penerapan metoue akustik dalam pendekatan pendugaan densitas ikan adalah sesuatu yang baru. Metode ini menggunakan pulsa suara yang dikirim ke dalam laut dan akan terpantul kembali apabila telah mengenai ikan atau target lainnya. Metode ini memiliki keunggulan tersendiri dibandingkan metode yang lain, diantaranya berkecepatan tinggi, real time, akurat dan berketepatan yang baik. Penelitian ini bertujuan untuk mengukur densitas relatif ikan Pelagis sekaligus melihat sebaran spasialnya di perairan Anyer dan Sekitarnya. Penelitian ini dillaksanakan pada tanggal 3 sampai 7 Mei 1996 di Perairan Anyer dan sekitarnya yang memiliki kondisi oseanografi yang khas pada posisi Lintang-Bujur 6,06° LS; 105,60° BT. Trek yang digunakan berbentuk continous pararel yang mewakili siang malam serta tegak lurus dan sejajar garis pantai. Penelitian ini menggunakan Kapal Latih Mahasiswa Stella Maris yang dimiliki oleh Fakultas Perikanan-IPB. Alat yang digunakan adalah satu unit transduser bim ganda yang dipasang pada towed body (berbentuk biofin), satu unit oscilloscope, dua unit komputer beserta piranti lunaknya, sebuah printer berwarna, dan sebuah printer hitam putih. Alat tangkap yang digunakan adalah trawl dasar. Pengukur panjang ikan digunakan untuk mengukur panjang ikan hasil tangkapan, sebuah timbangan, dan kamera. @Hak cipta mili Alat Oseanografi yang digunakan untuk memperoleh data mengenai sebaran vertikal suhu dan salinitas adalah CTD meter. Mekanisme dasar dari sistem akustik bim ganda untuk mendapatkan data kelimpahan dan penyebaran ikan adalah dengan memanfaatkan echogram, oscilloscope, atau suatu sistem yang mampu mengolah sinyal akustik secara otomatis. Sistem otomatis untuk pengukuran amplitudo akustik yang lazim dipergunakan adalah echo integrator. Sistem bim ganda ini memiliki transducer multi elemen yang menghasilkan bim sempit (narrow beam) yaitu 10° dan bim lebar (wide beam) yaitu 25°. Data akustik hasil keluaran echo integrator diolah dengan menggunakan piranti lunak ESP Crunch setelah sebelumnya dimasukkan nilai kalibrasi dan parameternya. ...
Keyword: 

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA