Judul: Kajian Infeksi Virus Newcastle Disease pada Itik dan Ayam di Beberapa Lokasi di Kabupaten Subang
Abstrak: Newcastle Disease (ND) merupakan penyakit endemik di Indonesia termasuk di Kabupaten Subang. Meskipun saat ini tingginya tingkat kematian yang disebabkan oleh ND dapat dikendalikan dengan vaksinasi, namun ND masih menyebabkan gangguan pada produksi. Selama ini penyidikan tentang ND di Kabupaten Subang masih jarang dan terbatas dilakukan. Diagnosa umumnya ditentukan hanya berdasarkan gejala klinis, perubahan patologi anatomi (PA) dan serologik. Tujuan dari penelitian ini untuk mengetahui keberadaan dan keragaman antigenik virus Newcastle Disease (VND) di Kabupaten Subang, sehingga dapat diambil tindakan pengendalian dan pencegahan ND yang efektif. Sampel usapan kloaka, orofaring dan serum diambil dari 149 ekor itik dan 393 ekor ayam dari penampungan, peternakan dan pasar unggas di 10 kecamatan di Kabupaten Subang. Screening VND pada sampel pool dari 5–7 individu dilakukan dengan Real Time Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (rRT-PCR) matrix (M). Sampel individu yang dipilih berdasarkan jenis usapan, unggas, lokasi dan waktu pengambilan sampel diinokulasi pada telur ayam berembrio SPF melalui 2 kali pasase, sedangkan deteksi antibodi spesifik terhadap ND pada serum diuji dengan hambatan hemaglutinasi (HI). Karakterisasi isolat dilakukan dengan uji hambatan hemaglutinasi (HI) menggunakan antisera LaSota dan Komarov, rRT-PCR fusion (F), dan uji waktu elusi. Hasilnya menunjukkan 19 dari 67 pool kloaka (28.3%) dan 8 dari 67 pool orofaring (11.9%) ayam terdeteksi VND; 18 pool dari 67 pool ayam (26.9%) menunjukkan virus diekskresikan melalui kloaka dan orofaring. Sementara pada sampel itik, VND terdeteksi hanya pada kloaka yaitu 8 dari 30 pool (26.7%). Selain itu rute ekskresi virus ditunjukkan dari hasil inokulasi virus pada telur. Isolasi VND dari sampel individu asal pool positif diperoleh 18 isolat. Karakterisasi keragaman epitop permukaan VND menggunakan antisera LaSota (lentogenik) hasilnya diperoleh rataan (mean) titer HI berkisar 6–8 Log2 dan dengan antisera Komarov (mesogenik) berkisar 9–13 Log2. Afinitas isolat dengan antisera LaSota menunjukkan karakter antigenik yang relatif homogen, hanya beberapa isolat yang menunjukkan variasi yang mencapai 2 Log2, begitu juga dengan antisera Komarov, hanya beberapa isolat yang menunjukkan variasi yang mencapai 4 Log2. Semua isolat VND menunjukkan afinitas yang lebih tinggi terhadap antisera Komarov dibandingkan dengan antisera LaSota yang mengindikasikan semua isolat cenderung masuk ke virus galur ganas. Deteksi patogenisitas dengan rRT-PCR F menunjukkan 100% isolat merupakan galur ganas (mesogenik/velogenik), sesuai dengan hasil uji elusi yang menunjukkan 3 isolat masuk ke galur mesogenik dan 15 isolat masuk ke galur velogenik. Deteksi antibodi spesifik terhadap ND pada 408 serum menunjukkan titer antibodi terdeteksi pada 48 (12%) unggas dengan kisaran titer 1–8 Log2, dimana diantaranya hanya 37 dari 212 (13%) serum ayam yang divaksinasi menunjukkan titer yang protektif. Analisa pada 6 flok ayam ras yang divaksinasi menunjukkan respon antibodi yang tidak merata. Newcastle disease masih endemik di wilayah Subang dan infeksinya bisa bersifat subklinis. Delapan belas isolat VND yang ditemukan mayoritas memiliki karakter yang relatif homogen, hanya beberapa isolat menunjukkan keragaman baik patogenisitas maupun antigenisitasnya. Itik dari Kecamatan Cipeundeuy belum pernah terpapar VND. Vaksinasi ND pada ayam broiler kurang optimal karena sebaran titer antibodi tidak merata. Kajian terhadap sampel yang lebih banyak dan cakupan area yang lebih luas diperlukan agar diperoleh informasi yang lebih menyeluruh. Hasil penelitian ini merupakan sumbangan informasi tentang ND di wilayah Subang
Keyword: Newcastle Disease, deteksi molekuler, deteksi virulensi, keragaman antigenik, antibodi

Judul: Kajian Infeksi Virus Newcastle Disease pada Itik dan Ayam di Beberapa Lokasi di Kabupaten Subang
Abstrak: Newcastle Disease (VND) di Kabupaten Subang, sehingga dapat diambil tindakan pengendalian dan pencegahan ND yang efektif. Sampel usapan kloaka, orofaring dan serum diambil dari 149 ekor itik dan 393 ekor ayam dari penampungan, peternakan dan pasar unggas di 10 kecamatan di Kabupaten Subang. Screening VND pada sampel pool dari 5–7 individu dilakukan dengan Real Time Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (rRT-PCR) matrix (M). Sampel individu yang dipilih berdasarkan jenis usapan, unggas, lokasi dan waktu pengambilan sampel diinokulasi pada telur ayam berembrio SPF melalui 2 kali pasase, sedangkan deteksi antibodi spesifik terhadap ND pada serum diuji dengan hambatan hemaglutinasi (HI). Karakterisasi isolat dilakukan dengan uji hambatan hemaglutinasi (HI) menggunakan antisera LaSota dan Komarov, rRT-PCR fusion (F), dan uji waktu elusi. Hasilnya menunjukkan 19 dari 67 pool kloaka (28.3%) dan 8 dari 67 pool orofaring (11.9%) ayam terdeteksi VND; 18 pool dari 67 pool ayam (26.9%) menunjukkan virus diekskresikan melalui kloaka dan orofaring. Sementara pada sampel itik, VND terdeteksi hanya pada kloaka yaitu 8 dari 30 pool (26.7%). Selain itu rute ekskresi virus ditunjukkan dari hasil inokulasi virus pada telur. Isolasi VND dari sampel individu asal pool positif diperoleh 18 isolat. Karakterisasi keragaman epitop permukaan VND menggunakan antisera LaSota (lentogenik) hasilnya diperoleh rataan (mean) titer HI berkisar 6–8 Log2 dan dengan antisera Komarov (mesogenik) berkisar 9–13 Log2. Afinitas isolat dengan antisera LaSota menunjukkan karakter antigenik yang relatif homogen, hanya beberapa isolat yang menunjukkan variasi yang mencapai 2 Log2, begitu juga dengan antisera Komarov, hanya beberapa isolat yang menunjukkan variasi yang mencapai 4 Log2. Semua isolat VND menunjukkan afinitas yang lebih tinggi terhadap antisera Komarov dibandingkan dengan antisera LaSota yang mengindikasikan semua isolat cenderung masuk ke virus galur ganas. Deteksi patogenisitas dengan rRT-PCR F menunjukkan 100% isolat merupakan galur ganas (mesogenik/velogenik), sesuai dengan hasil uji elusi yang menunjukkan 3 isolat masuk ke galur mesogenik dan 15 isolat masuk ke galur velogenik. Deteksi antibodi spesifik terhadap ND pada 408 serum menunjukkan titer antibodi terdeteksi pada 48 (12%) unggas dengan kisaran titer 1–8 Log2, dimana diantaranya hanya 37 dari 212 (13%) serum ayam yang divaksinasi menunjukkan titer yang protektif. Analisa pada 6 flok ayam ras yang divaksinasi menunjukkan respon antibodi yang tidak merata. Newcastle disease masih endemik di wilayah Subang dan infeksinya bisa bersifat subklinis. Delapan belas isolat VND yang ditemukan mayoritas memiliki karakter yang relatif homogen, hanya beberapa isolat menunjukkan keragaman baik patogenisitas maupun antigenisitasnya. Itik dari Kecamatan Cipeundeuy belum pernah terpapar VND. Vaksinasi ND pada ayam broiler kurang optimal karena sebaran titer antibodi tidak merata. Kajian terhadap sampel yang lebih banyak dan cakupan area yang lebih luas diperlukan agar diperoleh informasi yang lebih menyeluruh. Hasil penelitian ini merupakan sumbangan informasi tentang ND di wilayah Subang dan dapat menjadi masukan bagi pemerintah daerah dalam menentukan program pengendalian dan pencegahan infeksi VND pada unggas di Kabupaten Subang.
Keyword: Newcastle Disease, deteksi molekuler, deteksi virulensi, keragaman antigenik, antibodi

Judul: Metode Kaczmarz untuk menyelesaikan sistem persamaan linear
Abstrak: A system of linear equations is often involved in science and engineering problems. There are many methods available for solving system of linear equations, both analytically and numerically. Kaczmarz method is one of iterative methods for solving such system. Orthogonal projections are used in this method. The sequence of approximate solutions generated by algorithm for this method is convergent for an arbitrary initial solution. A proof of the convergence is given. If the system of linear equations is consistent, then the sequence of approximate solutions converges to the exact solution. This shows that Kaczmarz method is a good method. Implementation of this method is done using MATLAB R2008b. Some systems of linear equations are generated, and then solved numerically using the program. The results show that the more iteration used in the solution approximation, the smaller norm of residual obtained.
Keyword: