Judul: Analisis Perubahan Sekuen Nukleotida Gen Squalene Synthase pada Artemisia annua L. Turunan T1 Hasil Induksi Sistem CRISPR
Abstrak: Artemisinin yang terkandung dalam Artemisia annua L. dapat digunakan sebagai anti-malaria. Kadar artemisinin pada A. annua L. cukup rendah, yaitu berkisar 0.1% hingga 1%. Peningkatan kadar artemisinin dapat dilakukan dengan menghambat squalene synthase yang merupakan enzim kunci dalam biosintesis sterol menggunakan sistem Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR). Penelitian ini bertujuan untuk melakukan analisis perubahan sekuen nukleotida gen squalene synthase pada A. annua L. yang sudah diinduksi sistem CRISPR. Analisis Perubahan Sekuen Nukleotida Gen Squalene Synthase dilakukan melalui tahap seleksi benih, isolasi DNA menggunakan Tiangen Kit, amplifikasi DNA dengan PCR, dan sekuensing gen squalene synthase. Hasil penelitian menunjukkan dari 9 sampel tanaman A. annua L. hasil induksi sistem CRISPR tidak semua sampel mengalami perubahan basa nukleotida pada situs target. Perubahan sekuen pada situs target hanya terjadi pada sampel 5 yakni perubahan dari A (Adenin) menjadi T (Timin) dan G (Guanin) menjadi C (Sitosin) yang dapat disebut sebagai substitusi transversi. Sampel lainnya yang disejajarkan dengan nontransgenik menunjukkan perubahan sekuen di luar situs target.
Keyword: Artemisinin, Artemisia annua L, CRISPR/Cas9, gen squalene synthase

Judul: Ekspresi Gen ADS (Amorpha-4,11-Diene Synthase) pada Artemisia annua L. Turunan 3 (T2) Hasil Induksi Gen AaWRKY1
Abstrak: Artemisia annua L. merupakan tanaman obat antimalaria dari Cina yang dibudidayakan di Indonesia. Tanaman ini mengandung senyawa metabolit sekunder berupa senyawa artemisinin. Kadar artemisinin yang rendah perlu ditingkatkan untuk tujuan komersial. Gen AaWRKY1 adalah faktor transkripsi yang dapat menstimulasi gen yang bertanggung jawab dalam biosintesis artemisinin (gen ADS). Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis ekspresi gen ADS pada tanaman transgenik Artemisia turunan 3 (T2) hasil transformasi gen AaWRKY1. RNA diisolasi dari daun muda artemisia menggunakan protokol Rneasy® Total Plant Mini Kit dan dikonversi menjadi cDNA. Optimasi dan validasi qPCR dilakukan pada primer gen β-actin (housekeeping gene) dan gen ADS (target gene). Analisis ekspresi gen ADS dengan menggunakan metode relative quantification. Sebanyak 9 sampel tanaman transgenik Artemisia turunan 3 (T2) yang diinduksi gen AaWRKY1, hanya terdapat satu nomor tanaman yang mengalami overekspresi gen ADS yaitu sampel tanaman W10.4.
Keyword: AaWRKY1, ADS, Artemisia annua L., biosintesis artemisinin, faktor transkripsi

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: