Judul: Identifikasi Dan Ekspresi Dari Gen-Gen Yang Responsif Terhadap Skinning Dan Manfaat Curing Pada Ubijalar
Abstrak: Kehilangan kulit dari permukaan umbi bertanggungjawab terhadap kehilangan hasil pascapanen yang signifikan akibat penyakit pada tempat penyimpanan dan kehilangan bobot karena respirasi dan transpirasi yang berlebihan. Sayangnya, tidak ada laporan tentang gen-gen yang terlibat dalam penyembuhan luka pada ubijalar dan pengetahuan yang lebih mendalam tentang penyembuhan luka akan memfasilitasi perbaikan strategi pemuliaan. Sistim Annealing control primer (ACP) digunakan untuk mengidentifikasi gen-gen yang terekspresi setelah kerusakan akibat skinning (kulit yang terkelupas) dari ubijalar kultivar LA 07-146. Total didapati 70 gen yang terekspresi berbeda (DEG) yang dapat direproduksi. Dari 70 DEG ini, 58 terinduksi dan 12 tereduksi. Empat puluh dua diklon dan dari 250 klon yang disolasi, 119 klon dikirim untuk disekuensing. Dari 119 klon ini, 101 klon sama dengan DEG dari tanaman. Kelompok DEG tersebut mewakili 63 unigen: 19 kontig (sekuens dengan tumpang tindih sekurang-kurangnya 50 nukleotida) dan 44 singleton (tidak dapat dibentuk menjadi kontig). Fungsi anotasi dari DEG menunjukkan gen-gen yang terlibat dalam protein yang berhubungan dengan stress dan pertahanan, penyandian redoks, metabolism, sintesis protein dan lokasi akhir protein, regulasi dan signal transduksi. Perubahan ekspresi gen akibat adanya kerusakan akibat skinning yang berhubungan dengan 18 DEG dipelajari lebih lanjut. Ke-18 DEG ini menyandikan gen-gen yang terlibat dalam respons terhadap stress abiotik, biosintesis lignin dan suberin, regulasi transkripsi dan penyandian. Penelitian tentang ekspresi dari 18 DEG meliputi studi tentang kuantitatif dan semi kuantitatif transkripsi balik rantai reaksi polimerase (q/sq RTPCR) dibagi menjadi tiga kategori: gen dengan respon cepat, gen dengan respon lambat dan gen yang respon tidak beraturan. Hasil penelitian menunjukkan bahwa gen-gen dengan respon cepat umumnya berhubungan dengan stress secara umum, gen-gen dari lintasan biosintesis lignin dan suberin ekspresinya meningkat setelah 8 – 12 jam setelah pelukaan (gen-gen dengan respon lambat). Gen-gen yang lain menunjukkan regulasi ekspresi yang meningkat atau menurun tergantung dari waktu pengambilan sampel setelah terjadi pelukaan yang disengaja. Efek curing dalam meregulasi gen-gen yang terinduksi karena skinning pada gen-gen yang responnya karena stres, pelukaan dan gen-gen yang terlibat dalam sintesis lignin dan suberin juga dipelajari. Curing penting untuk penyembuhan luka dengan merangsang penyembuhan kulit dan mengurangi resiko dari infeksi dan pembusukan yang terjadi setelah panen. Pola ekspresi dari gen-gen yang terlibat dalam stress abiotik (IbELIP3), stres karena pelukaan (gen pra-lignin: IbTAL), lignin biosintesis (IbPAL, IbCCOMT, dan IbCAD), dan suberin (IbExt) diinvestigasi pada kultivar ubijalar resisten (LA 10-70) dan rentan (LA 07-146) terhadap kerusakan karena skinning. Pola ekspresi gen-gen yang terinduksi oleh skinning pada kondisi curing (suhu 28-29.5 oC dengan kelembaban relatif 85-90%) dan tanpa curing (suhu 24 ± 1 oC dengan kelembaban relatif RH 50%) pada kultivar ubijalar resisten (LA 10-70) dan rentan (LA 07-146) dari ubijalar juga diteliti. Tujuannya adalah untuk mempelajari transkripsi untuk mengerti tentang ketahanan terhadap mekanisme kerusakan karena skinning yang berasosiasi dengan biosintesis lignin dan pembentukan suberin pada kedua kultivar. Penelitian ini menunjukkan bahwa gen-gen ini diregulasi secara berbeda pada kultivar resistan dan rentan dari ubijalar dengan perbedaan pada waktu induksi pada kondisi curing. Hasil penelitian ini juga menunjukkan bukti dari aliran signal tranduksi yang terkordinasi dari gen pada lintasan biosintesis pra- lignin dan lignin. Keseluruhan, penelitian ini mendemonstrasikan perbedaan besar pada toleransi terhadap skinning
Keyword: lignifikasi, suberin, pelukaan, ubijalar, curing

Judul: Ekseprsi Gen SOD dan GPX pada Kedelai yang Mendapat Cekaman Kekeringan dan Perlakuan Herbisida Paraquat
Abstrak: Enzim antioksidan superoxide dismutase (SOD) dan glutathione peroxidase (GPX) terlibat dalam sistem pertahanan tanaman. Ekspresi kedua gen ini diinduksi oleh banyak faktor, diantaranya adalah cekaman kekeringan dan herbisida paraquat. Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari dan menguji ekspresi kedua gen tersebut pada tanaman kedelai (Glycine max L.) varietas Tidar, Burangrang dan Panderman serta kedelai liar (G. tomentella) yang mendapat cekaman kekeringan dan perlakuan herbisida paraquat. Tanaman ditumbuhkan dalam polibag yang berisi tanah dan pasir dengan perbandingan volume 1:1 dan ditempatkan pada rumah kaca. Cekaman kekeringan diberikan tanpa penyiraman selama 10 hari untuk tiga varietas kedelai budidaya dan 18 hari untuk kedelai liar, setelah batas cekaman dilanjutkan penyiraman kembali untuk penyembuhan tanaman (recovery). Sedangkan aplikasi perlakuan paraquat dengan dosis 90 g bahan aktif/ha. Peubah yang diamati adalah kandungan air media (KAM) dan kandungan air relatif (KAR) daun. RNA total diisolasi dari daun yang sudah berkembang sempurna dengan menggunakan Trizol (Invitrogen) dan sintesis cDNA dilakuakan dengan menggunakan enzim reverse transkripase superscript III. Analisis ekspresi dari kedua gen dilakukan dengan metode PCR. Hasil penelitian menunjukkan bahwa gen SOD dan GPX pada keempat kedelai diekspresikan ketika tanaman mendapat cekaman kekeringan. Cekaman kekeringan menyebabkan meningkatnya ekspresi SOD pada 8 hari setelah perlakuan cekaman dari varietas Tidar sebesar 123.4% dibandingkan dengan tanaman kontrol. Sedangkan varietas Burangrang dan Panderman masing-masing 99.0% dan 84.2% dan untuk kedelai liar 69.8%. Cekaman kekeringan juga menyebabkan meningkatnya ekspresi gen GPX. Ekspresi paling tinggi ditunjukkan oleh kedelai liar pada saat recovery yaitu sebesar 132.3% dibandingkan dengan tanaman kontrol.
Keyword: 

Judul: Cycle Hamilton pada Graf Lengkap, Graf Regular, dan Graf 2-Connected 4-Regular Berorder Kurang dari Sepuluh
Abstrak: Suatu graf disebut graf Hamilton apabila graf tersebut memuat cycle Hamilton, yaitu cycle yang melewati setiap vertex tepat satu kali. Menentukan keberadaan cycle Hamilton pada suatu graf dapat menggunakan syarat cukup yang berupa teorema-teorema yang telah diperkenalkan sejak tahun 1950-an. Beberapa syarat cukup yang dibahas dalam karya ilmiah ini adalah syarat cukup yang berhubungan dengan graf lengkap dan graf regular. Suatu graf lengkap berorder 𝑛������ ≥ 3 dan graf r-regular berorder 𝑛������ ≤ 2𝑟������ + 1 merupakan graf Hamilton, Karena kedua graf tersebut memuat cycle Hamilton. Selanjutnya, syarat cukup tersebut digunakan untuk menentukan keberadaan cycle Hamilton pada graf 2-connected 4- regular berorder kurang dari 10.
Keyword: graf Hamilton, graf regular, graf lengkap, graf 2-connected 4-regular