Judul: Evaluasi Kesehatan Pohon Kenari (Canarium indicum L) dalam Upaya Mitigasi Risiko Pohon Tumbang di Kebun Raya Bogor
Abstrak: Pohon kenari (Canarium indicum L) di Kebun Raya Bogor sudah berumur tua (>100 tahun), memerlukan perhatian untuk mencegah terjadinya risiko tumbang. Penelitian bertujuan mengevaluasi kondisi kesehatan pohon kenari dalam upaya mitigasi risiko pohon tumbang dengan metode Forest Health Monitoring (FHM) dan sonik tomografi, serta mengetahui korelasi dari kedua metode tersebut. Metode FHM merupakan pengamatan visual terhadap kesehatan pohon menggunakan satu indikator yaitu vitalitas pohon dengan satu parameter yaitu kerusakan pohon. Metode sonik tomografi mengevaluasi kesehatan pohon dengan menguji kerusakan bagian batang pohon berdasarkan kecepatan rambatan gelombang bunyi pada bagian kayu yang diuji. Pengamatan kerusakan dilakukan pada 100 pohon kenari. Hasil pengamatan dengan metode FHM menunjukkan bahwa 59 pohon mengalami 81 kerusakan. Sebagian besar kerusakan terjadi pada lokasi 1 (akar) sebanyak 22 kerusakan, diikuti kerusakan pada lokasi 7 (cabang) sebanyak 15 kerusakan dan lokasi 2 (pangkal batang) sebanyak 12 kerusakan. Kerusakan pada lokasi 1 umumnya disebabkan oleh faktor abiotik seperti luka terbuka akibat mesin potong rumput, vandalisme pengunjung, dan gangguan kegiatan proyek. Luka tersebut memudahkan akar terserang oleh jamur pelapuk. Kerusakan pada lokasi 2 juga umumnya disebabkan oleh luka terbuka, batang pecah, brum dan konk. Kerusakan batang pecah umumnya disebabkan oleh puntiran batang karena tiupan angin atau beban cabang yang terlalu besar. Luka terbuka dan batang pecah dapat menjadi pintu masuk spora jamur pelapuk. Hal tersebut dapat dicirikan oleh timbulnya konk dan brum. Konk atau tubuh buah jamur pada ketinggian tertentu juga mencerminkan terjadinya pelapukan pada lokasi tersebut. Selain itu, pelapukan dapat diikuti oleh serangan rayap sehingga batang pohon menjadi gerowong. Batang pecah dan gerowong oleh rayap dapat berlanjut hingga lokasi 3 (batang bawah), bahkan dapat mencapai pada lokasi 4 (batang atas). Hasil pengujian dengan metode sonik tomografi menunjukkan bahwa kerusakan bagian dalam batang terjadi pada 97 pohon berkisar antara 2.0-76.1%. Untuk mengatahui korelasi kedua metode, pengamatan difokuskan pada bagian batang 130 cm dari permukaan tanah. Terdapat 35 pohon kenari yang memiliki kerusakan pada tempat yang sama yaitu pada lokasi kerusakan 1, 2, dan 3. Lokasi kerusakan 1 adalah bagian perakaran terbuka. Lokasi kerusakan 2 adalah bagian pangkal batang. Lokasi 3 adalah batang bagian bawah. Hasil pengukuran tingkat kerusakan pohon dari kedua metode tersebut dibuat analisis korelasi untuk mengetahui tingkat komplementarinya. Nilai korelasi metode FHM dan sonik tomografi pada lokasi kerusakan 1 tidak kuat (r=0.5), pada lokasi kerusakan 2 kuat (r=0.7) dan pada lokasi kerusakan 3 sangat kuat (r=0.8). Penelitian ini membuktikan bahwa kedua metode tersebut dapat digunakan dan terdapat hubungan yang saling melengkapi dalam mengevaluasi kerusakan pohon kenari.
Keyword: FHM, kawasan wisata, kerusakan pohon, sonik tomografi, tomogram

Judul: Tree Health Analysis for Fabaceae Families in Bogor Botanical Garden (BBG)
Abstrak: Kebun Raya Bogor (KRB) merupakan salah satu kawasan konservasi ex- situ yang berada di Kota Bogor. Tempat wisata alam terbuka seperti Kebun Raya Bogor mempunyai jumlah tanaman termasuk pohon besar yang begitu banyak, diharapkan terjamin kesehatannya sehingga memberikan rasa aman dan nyaman bagi pengunjung. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui tipe kerusakan, mengukur tingkat kerusakan, dan menilai tingkat kesehatan pohon famili Fabaceae di Kebun Raya Bogor. Metode penelitian yang digunakan adalah metode forest health monitoring. Kasus kerusakan pohon yang ditemukan di Kluster 3 Kebun Raya Bogor (KRB) sebanyak 55 kasus dengan 10 dari 16 jenis kerusakan, serta 8 dari 9 lokasi kerusakan. Tingkat kerusakan pohon di Plot 2 Kluster 3 FHM KRB relatif rendah dengan nilai PLI sebesar 1,93 dari 6,39. Nilai CLI sebesar 4,35 menunjukkan bahwa pohon pada Kluster 3 FHM KRB dikategorikan dalam kondisi sehat. Pengelolaan pohon yang telah dianalisis nilai kerusakan pohonnya harus dipantau secara teratur menggunakan metode yang paling tepat. Hasil dari analisis ini bisa digunakan sebagai bahan evaluasi untuk pengelolaan lebih lanjut.
Keyword: Forest Health Monitoring, Level Health of Trees, Location, Severity, Tree Damage

Judul: Extracellular Expression of thermostable Geobacillus stearothermophilus T1.2RQ Lipase for Biodiesel Production
Abstrak: The extracellular expression of enzymes in an excellent secretion host such as Bacillus subtilis is a useful strategy for making enzymes of industrial significance more affordable by lowering the cost of its downstream processing. Lipases are a category of hydrolases that catalyze the hydrolysis of triglycerides to glycerol and free fatty acids. Also, lipases catalyze the hydrolysis and transesterification of other esters as well as the synthesis of esters. They can perform very specific biotransformation reactions and are widely used in food, organic synthesis, detergents, cosmetic, and pharmaceutical industries. Geobacillus stearothermophilus T1.2RQ lipase is an industrially-desired thermostable lipolytic enzyme with an excellent hydrolytic and transesterification activity. This study aimed to express T1.2RQ lipase, in B. subtilis WB800 and ensure its secretion into the extracellular medium. Three signal peptides (AmyQ, Epr, LipA) and two promoters (Pgrac01 and Pgrac100) were used in the secretory-expression of T1.2RQ lipase, based on five constructed expression vectors constructed by restriction cloning and PCR mutagenesis. Sangers sequencing was used to verify constructs to ensure they are in the correct reading frame. Recombinants vectors, pHT43 (plasmid control), pHT43-T1.2RQ, pHT43- T1.2RQ_AmyQ, pHT43-T1.2RQ_Epr, and pHT43-T1.2RQ_LipA, were transformed by electroporation into Bacillus subtilis WB800. The electroporation was successful with the optimum condition of 2500V, 200 ohms, 25µF, and 5milliseconds. Recombinant B. subtilis pHT43 (negative control) and pHT43-T1.2RQlip + signal peptides were streaked on the lipidic agar, LA+TBN. All four recombinants, including the negative control (B. subtilis WB800-pHT43), produced clear zones on the TBN agar plate after overnight incubation (fig 2), indicating the presence of a lipolytic enzyme in all of the recombinant B. subtilis cells. pHT43-T1.2RQlip + signal peptides (AmyQ, Epr, and LipA) have clear zones with significantly higher diameters than B. subtilis WB800-pHT43 (negative control). This phenomenon suggests that the recombinant thermostable lipase T1.2RQ introduced into these cells was successfully expressed, thereby increasing the lipolytic capability of its host cells T1.2RQ lipase was expressed in 50ml terrific broth medium (TB) and the expression induced with 1mM IPTG. Lipase activity assay using p-nitrophenyl esters showed that all three signal peptides directed the secretion of T1.2RQ lipase into the extracellular medium. Signal peptide, LipA, resulted in the highest extracellular activity of 5.6 U/mL, which corresponds to a 6-fold increase over the parent B. subtilis WB800 strain. Meanwhile, signal peptides, AmyQ and Epr produced 4.2 U/mL and 3.4 U/mL activity respectively. SDS-Zymogram analysis confirmed that T1.2RQ lipase was correctly processed and secreted in its original size of 44 kDa. An attempt to further increase lipase expression level by promoter optimization showed that, contrary to expectation, promoter Pgrac100 exhibited similar expression levels as the original Pgrac01. Nevertheless, the demonstration of the successful secretion of T1.2RQ lipase in this work confirms the latter as a promising approach for the industrial production of the enzyme
Keyword: Bacillus subtilis, Expression, Extracellular, Heterologous, Lipase, Thermostable