Judul: Keragaman fungsional reseptor rasa pahit TAS2R38 pada monyet Dunia Lama
Abstrak: Hewan dapat mengenali dan membedakan lima rasa utama yaitu, manis, umami, pahit, asam dan asin. Hewan menggunakan persepsi rasa untuk mengevaluasi makanan sebelum dicerna. Persepsi rasa pahit sangat penting karena membantu hewan mendeteksi dan menghindari kompenen makanan yang memiliki potensi racun. Persepsi rasa pahit diperantarai oleh kelompok reseptor rasa pahit, TAS2R pada permukaan sel-sel rasa di lidah. Salah satu reseptor rasa pahit yang banyak dipelajari adalah TAS2R38, yang disandikan oleh gen TAS2R38. TAS2R38 umumnya terekspresi sebagai protein utuh dan fungsional pada sebagian besar mamalia. Beberapa studi menunjukkan bahwa keragaman TAS2R38 menyebabkan variasi sensitivitas terhadap molekul pahit phenylthiocarbamide (PTC) pada mamalia. Beberapa spesies Primata omnivora dan pemakan buah memiliki reseptor TAS2R38 fungsional dan umumnya sensitif terhadap PTC. Subfamili Colobinae merupakan anggota kelompok Primata yang unik karena makanan utamanya adalah daun. Persepsi rasa pahit pada Colobinae menarik untuk dipelajari karena tanaman memproduksi metabolit sekunder yang mungkin beracun sebagai pertahanan diri terhadap herbivora. Spesies-spesies anggota Colobinae terdistribusi di Asia (Asia colobines) dan Afrika (African colobines). Sebagian besar spesies dalam kelompok Asian colobines memiliki reseptor TAS2R38 dengan sensitivitas rendah terhadap PTC dibandingkan dengan Macaca sp., anggota subfamili Cercopithecinae. Beberapa mutasi asam amino pada TAS2R38 di Asian colobines bertanggung jawab atas turunnya sensitivitas terhadap PTC. Reseptor TAS2R38 di African colobines menunjukkan respons yang lebih besar terhadap PTC dibandingkan dengan kerabatnya di Asia, tetapi lebih rendah dari Macaca. Sehingga, sensitivitas rendah terhadap PTC adalah karakteristik umum subfamili Colobinae sebagai adaptasi untuk memakan daun. Karakteristik umum ini diperkirakan sudah diturunkan oleh nenek moyangnya. Tetapi, beberapa perbedaan TAS2R38 di tingkat asam amino pada kedua kelompok Colobinae menunjukkan bahwa TAS2R38 berkembang secara independen setelah pemisahan kedua kelompok ini. Anggota lain dari Famili Cercopithecidae adalah subfamili Cercopithecinae. Cercopithecinae memiliki sensitivitas tinggi terhadap PTC, tetapi data untuk spesies allopatric seperti monyet Sulawesi. Secara umum, monyet Sulawesi adalah pemakan buah. Karakteristik umum TAS2R38 pada monyet Sulawesi adalah sensitif terhadap PTC. Monyet Sulawesi memiliki alel TAS2R38 fungsional dengan sensitivitas tinggi terhadap PTC yang ditemui di empat spesies anggotanya, mungkin merupakan tipe nenek moyang. Namun, beberapa individu menunjukkan TAS2R38 non-fungsional yang disebabkan oleh oleh mutasi, menandakan adaptasi TAS2R38 dengan kondisi lingkungan spesifik.
Keyword: bitter taste perception, PTC, TAS2R38, Colobinae, Cercopithecinae, adaptation

Judul: Variation of T2R38 Gene Encoding PTC Bitter Taste Receptor in Leaf-Eating Monkey
Abstrak: Pengenalan rasa mamalia diperantarai oleh reseptor yang terdapat pada sel kuncup perasa di daerah lidah. Reseptor rasa disandikan oleh kelompok gen reseptor rasa tipe 1 (T1R) dan tipe 2 (T2R). Gen T2R38 merupakan anggota dari kelompok gen T2R yang berfungsi menyandikan reseptor rasa pahit dari komponen phenylthiocarbamide (PTC). Gen T2R38 telah diteliti pada manusia, simpanse dan makaka Jepang. Hasil penelitian tersebut menunjukkan terjadinya polimorfisme intra spesies. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui variasi dari gen T2R38 penyandi reseptor rasa pahit PTC pada Trachypithecus cristatus, T. auratus dan Presbytis melalophos. DNA didapatkan dari sampel feses monyet pemakan daun di Kebun Binatang Ragunan, Jakarta. Hasil sekuens menunjukkan gen T2R38 pada monyet pemakan daun memiliki ukuran 1,002 bp dan merupakan single open reading frame. Gen T2R38 pada tiga spesies monyet pemakan daun memiliki dua situs nukleotida yang spesifik dan berbeda dari gen T2R38 pada Macaca mullata. Analisis sekuens gen T2R38 pada monyet pemakan daun menunjukkan bahwa semua gen T2R38 berfungsi menyandikan reseptor rasa pahit untuk PTC, berdasarkan perbandingannya dengan gen T2R38 pada manusia.
Keyword: monyet pemakan daun, variasi, PTC, T2R38, rasa pahit

Judul: Numerical modeling of the hydrodynamics of standing wave and scouring in front of impermeable breakwater with different steepnesses
Abstrak: The aim of this paper is to numerically study the effects of breakwater steepness on the hydrodynamics of standing wave and scouring process in front of impermeable breakwaters. A two-dimensional hydrodynamics model based on the Reynolds Averaged Navier–Stokes (RANS) equations and the Volume of Fluid (VOF) method was developed and then combined with an empirical sediment transport model. Comparisons with an analytical solution and experimental data showed the present model is very accurate in predicting the near bottom velocity and capable of simulating the scour/deposition patterns consistent with experimental data. It was found that the additional terms of bottom shear stress in the momentum equations are necessary to produce a physical scouring pattern. Different breakwater steepnesses produce different characteristics of standing wave, the steady streaming system, and scouring pattern in front of the breakwaters, which also affects the correlations between them. An additional analysis of the turbulence field parameters and the sediment transport rate was also performed. All these important information will be presented in details in this paper and can be worthwhile for designing the breakwater in coastal areas.
Keyword: The RANS–VOF model Standingwave Steadystreamingsystem Scouring pattern Breakwatersteepness