Judul: Gelombang Soliter Internal pada Laut Dalam untuk Aliran yang Tunak
Abstrak: Gelombang internal adalah suatu gelombang yang terjadi di bawah permukaan air laut. Gelombang ini muncul karena adanya perbedaan rapat massa di setiap lapisan air laut. Salah satu gelombang internal yang memiliki sifat mempertahankan bentuk dan kecepatannya adalah gelombang soliter internal. Penelitian ini mengkaji gerak gelombang soliter internal pada laut dalam. Penurunan persamaan gerak gelombang internal pada laut dalam menggunakan asumsi bahwa aliran fluida berbentuk tunak. Dalam hal ini persamaan dasar fluida dinyatakan dalam formulasi Lagrange dengan ketinggian fluida dari posisi kesetimbangannya yang merupakan peubah Lagrangenya. Metode yang digunakan untuk menurunkan persamaan gerak gelombang internal adalah metode asimtotik. Dalam metode ini, simpangan gelombang internal dinyatakan dalam uraian asimtotik. Selanjutnya dengan menyeimbangkan faktor taklinear dan dispersi, maka diperoleh persamaan gerak gelombang berupa persamaan Benjamin-Ono (BO). Rumusan gelombang soliter internal dari persamaan BO digunakan untuk mengkaji gerak gelombang soliter pada fluida dua lapisan untuk laut dalam. Hasil yang diperoleh adalah profil gelombang soliter pada setiap kedalaman. Gelombang soliter internal yang memiliki amplitudo terbesar dicapai pada batas antara kedua lapisan fluida, sedangkan di permukaan gelombang relatif kecil.
Keyword: 

Judul: Formulasi Lagrange untuk Menggambarkan Gerak Gelombang Soliter Internal pada Laut Dalam
Abstrak: Gelombang internal adalah gelombang yang terjadi di bawah permukaan laut sehingga tidak teramati secara kasat mata. Keberadaan gelombang internal disebabkan oleh perbedaan rapat massa air laut di setiap lapisan. Sama seperti gelombang permukaan air yang merupakan gelombang pada batas antara dua fluida dengan rapat massa yang berbeda, yaitu air dan udara, gelombang internal merupakan gelombang pada batas antara dua lapisan air dengan rapat massa berbeda. Dalam penelitian ini, diturunkan persamaan gerak gelombang internal pada laut dalam untuk aliran yang tidak tunak. Secara khusus dikaji gelombang soliter internal, yaitu gelombang internal yang merambat tanpa mengalami perubahan bentuk dan kecepatan. Gelombang soliter internal terditeksi melalui pola gelap terang yang teratur di permukaan laut. Penurunan persamaan gerak gelombang internal dilakukan dengan menggunakan formulasi Lagrange. Penurunan ini bermula dari persamaan dasar fluida ideal untuk aliran yang tidak tunak, yang diformulasikan dalam peubah Lagrange. Dengan menggunakan metode asimtotik, pada orde yang terendah diperoleh persamaan Benjamin-Ono (BO) untuk kedalaman yang cukup besar. Selanjutnya dibahas penyelesaian persamaan BO dalam bentuk khusus, yaitu yang berupa gelombang soliter. Rumusan gelombang soliter persamaan BO digunakan untuk mengkaji gerak gelombang soliter pada fluida dua lapisan untuk laut dalam. Hasil yang diperoleh adalah profil gelombang soliter pada setiap lapisan. Gelombang soliter internal yang memiliki amplitudo terbesar dicapai pada batas antara kedua lapisan fluida, sedangkan di permukaan gelombang relatif kecil.
Keyword: 

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA