Judul: Analisis keterkaitan antara lokus CCA 08* dengan pertumbuhan dan kelangsungan hidup benih ikan mas cangkringan (Cyprinus carpio L.)
Abstrak: Ikan mas merupakan jenis ikan yang paling lama dipelihara dan dibudidayakan di dunia. Dewasa ini di Indonesia memiliki beberapa strain ikan mas seperti punten, majalaya, sinyonya, kaca, merah cangkringan, sutisna, raya danu dan wildan, namun yang paling banyak dibudidayakan adalah 3 strain yakni majalaya, punten dan sinyonya. Penelitian dan penerapan teknik marka DNA mempunyai peranan yang penting di dalam pengembangan budidaya ikan. Beberapa teknologi marka DNA ynag banyak dimanfaatkan dalam budidaya ikan antara lain: seleksi berbasis marka DNA yang telah diaplikasikan dalam program penulisan ikan Atkantic salmon, channel catfish, European sea bass dan Javanese flounder.
Keyword: 

Judul: Penggunaan Marka Molekuler dalam Pemuliaan Ikan Mas Tumbuh Cepat dan Tahan Terhadap Infeksi Virus Koiherpes
Abstrak: Ikan mas (Cyprinus carpio L) merupakan salah satu jenis ikan yang tertua yang dibudidayakan di dunia dan merupakan salah satu komoditas ikan pangan strategis, pemasok protein hewani bagi jutaan rakyat Indonesia, baik di pedesaan maupun di perkotaan. Beberapa hal yang mempengaruhi produksi ikan mas di Indonesia di antaranya adalah serangan koi herpesvirus (KHV), hingga saat ini belum ada varietas ikan mas yang tahan terhadap serangan infeksi virus tersebut. Hal lain yang juga sangat mempengaruhi produksi ikan mas adalah adanya indikasi penurunan kualitas genetik ikan mas yang mengakibatkan laju pertumbuhan semakin menurun. Kualitas induk yang baik atau unggul dapat memberikan turunan yang berdampak positif pada peningkatan produksi dan daya tahan terhadap penyakit. Hingga saat ini ikan mas yang memiliki dua karakter yaitu unggul dalam pertumbuhan dan tahan terhadap serangan KHV belum tersedia. Ikan mas yang dapat tumbuh dengan cepat dan tahan terhadap serangan KHV diharapkan dapat menjadi salah satu solusi untuk meningkatkan produksi ikan mas Penggunaan metode seleksi dan hibridisasi untuk meningkatkan pertumbuhan membutuhkan waktu yang cukup lama. Program seleksi dengan menggunakan seleksi individu atau seleksi famili mampu meningkatkan pertumbuhan sekitar 11-15% per generasi (Gjedrem dan Thodesen, 2005). Dengan demikian jika perbaikan kualitas genetik (genetic gain) yang dapat dicapai dari setiap generasi hasil seleksi sekitar 15%, dan jika untuk mendapatkan satu generasi ikan mas membutuhkan waktu dua tahun, maka baru setelah 12 tahun diperoleh efek perbaikan kualitas yang nyata. Selain itu seleksi untuk mendapatkan dua karakter unggul yang berbeda dalam satu individu pada waktu yang bersamaan umumnya sulit dilakukan. Berkembangnya metode seleksi dengan bantuan marka molekuler (marker assisted selection/MAS) merupakan salah satu solusi untuk mempercepat proses seleksi mendapatkan individu dengan karakter yang diinginkan dalam waktu yang singkat. Pada penelitian ini dengan menggunakan MAS dilakukan pemilihan dua karakter unggul yaitu tumbuh cepat dan tahan terhadap KHV pada individu ikan mas. Karakter tumbuh cepat dapat dicirikan dengan keberadaan marka Cca-08. Penetapan penggunaan marka Cca-08 untuk penciri tumbuh cepat berdasarkan hasil penelitian Maskur (2010) yang menindaklanjuti penelitian Aliah (2000). Analisis keberadaan Cca-08 dilakukan dengan menggunakan mikrosatelit. Berdasarkan Alimuddin et al. (2011) diketahui bahwa keberadaan marka Cyca-DAB1*05 (termasuk kelompok major histocompatibility complex / MHC II) dapat menjadi penanda ikan mas yang tahan terhadap serangan KHV dan analisisnya menggunakan PCR dengan primer spesifik. Penelitian ini terdiri atas empat tahap. Penelitian tahap pertama bertujuan untuk mendapatkan induk yang membawa marka pertumbuhan dan ketahanan terhadap penyakit. Stok induk ikan mas yang dianalisis keberadaan markanya berasal dari Balai Pengembangan Benih Ikan Air Tawar (BPBIAT) Wanayasa dan Balai Besar Pengembangan Budidaya Air Tawar (BBPBAT) Sukabumi. Stok induk dari BPBIAT Wanayasa adalah induk-induk yang berasal dari populasi ikan mas hasil seleksi individu di balai tersebut dengan target perbaikan pertumbuhan, sedangkan ikan mas dari BBPBAT Sukabumi merupakan hasil seleksi dengan target tahan terhadap serangan KHV. Ikan mas dari BPBIAT Wanayasa yang dianalisis berjumlah 53 ekor, dan ikan mas dari BBPBAT Sukabumi sebanyak 18 ekor. Hasil penelitian menunjukkan bahwa sebagian besar (92.4%) induk dari BPBIAT Wanayasa membawa marka Cca-08, dan 9.4% yang membawa marka Cyca-DAB1*05. Pada induk BBPBAT Sukabumi, 38.8% membawa Cca-08 dan sebanyak 94.4% induknya membawa marka Cyca-DAB1*05. Penelitian kedua dilakukan untuk mengevaluasi keberadaan
Keyword: 

Judul: Utilization of terra/MODIS L1B data for analysis of horizontal wind profile in the troposphere
Abstrak: This study was concerned with horizontal wind derived from data collected with the Moderate-resolution Imaging Spectroradiometer (MODIS) on board the NASA’s Earth Observation System (EOS)-Terra satellite. The aim of this study is to develop a method for the estimation of horizontal wind movement in the troposphere based on Navier-Stokes equation. The method was applied to a calibrated and geolocated Terra/MODIS L1B 1 km data set. The data inputs to estimate surface temperature are retrieved from TIR (Thermal Infrared) bands 31 (10.780 μm to 11.280 μm) and 32 (11.770 μm to 12.270 μm). The obtained surface temperatures were later used to approximate geopotential height on a constant-pressure surface by using the modified Poisson equation. The main assumptions used are the hydrostatic equilibrium, ideal gas law, constant lapse rate and constant acceleration of gravity. Based on the distribution of geopotential height, the pressure gradient force is measured by the gradient of geopotential on an isobaric coordinate to present the horizontal wind profile. For certain topographic areas especially in the mountain ranges, there was a disadvantage of using pressure as a vertical coordinate which lead to inaccuracy. In spite of that, Terra/MODIS L1B data with 1 km spatial resolution can be used to estimate the horizontal wind movement in the troposphere.
Keyword: