Judul: Eksplorasi Mikroba Filosfer sebagai Agens Biokontrol Penyebab Penyakit Moler (Fusarium oxysporum f.sp. cepae) Bawang Merah.
Abstrak: Penyakit moler yang disebabkan oleh cendawan Fusarium oxysporum f.sp. cepae (FOCe) merupakan salah satu penyakit penting yang dapat menyebabkan penurunan produksi bawang merah. Telah dilakukan suatu studi yang memperoleh isolat khamir dan bakteri filosfer yang dapat efektif sebagai agens antagonis terhadap FOCe. Eksplorasi mikroba filosfer menggunakan jaringan daun dari tanaman bawang merah dan bawang daun sehat diantara tanaman yang bergejala. Sebanyak 29 isolat dari mikroba filosfer berhasil diisolasi dan dilakukan penapisan menggunakan uji hemolisis pada agar darah dan reaksi hipersensitif pada daun tembakau. Diperoleh 23 isolat mikroba yang tidak berpotensi fitotoksik dan patogenik terhadap mamalia. Uji daya hambat in vitro kandidat agens antagonis dilakukan dengan metode umpan beracun dan uji potensi produksi senyawa volatil. Diperoleh isolat khamir sebanyak lima isolat dengan kode YOK1, YOK2, YOK3, YOK4, dan YSG01 memiliki persentase daya hambat yang rendah (<50%) pada uji in vitro. Sebanyak delapan isolat bakteri dengan kode isolat BSG02, BSG03, BSG06, BSG07, BOK01, BOK02, BOK03 dan BOK08 berpotensi antagonis dan memiliki persentase daya hambat di atas 50%. Mekanisme penghambatan yang dilakukan kedelapan isolat bakteri tersebut adalah mekanisme antibiosis, produksi senyawa volatil dan enzimatis. Isolat BSG02, BSG03, dan BSG07 termasuk kelompok Gram negatif sementara isolat BSG06, BOK01, BOK02, BOK03, dan BOK08 termasuk kelompok Gram positif.
Keyword: agens potensial, bakteri antagonis, bawang daun, uji in vitro

Judul: Seleksi dan Identifikasi Bakteri Rizosfer yang Berpotensi sebagai Agens Antagonis Fusarium oxysporum pada Bawang Merah yang diberi Kombinasi Pupuk Organik dan Anorganik.
Abstrak: Penyakit layu fusarium merupakan salah satu penyakit penting tular tanah yang bisa menurunkan produksi bawang merah. Pupuk organik memiliki kelebihan diantaranya memperbaiki sifat fisik, kimia dan biologi tanah sehingga dapat meningkatkan aktivitas mikroba pada tanah yang berperan sebagai antagonis terhadap penyakit layu fusarium. Penelitian ini bertujuan mendapatkan isolat bakteri antagonis yang potensial mengendalikan penyakit layu fusarium (Fusarium oxysporum) dari pertanaman bawang merah yang diberi kombinasi pupuk organik dan anorganik. Sampel yang digunakan dalam penelitian berupa sampel tanah yang diperoleh dari Sukorejo, Nganjuk Jawa Timur. Hasil penelitian menunjukkan bahwa penggunaan pupuk organik dan kombinasinya dengan pupuk anorganik mempengaruhi populasi bakteri rizosfer. Sebanyak 71 isolat dari 512 isolat hasil isolasi, tidak bersifat fitotoksik dan patogenik terhadap mamalia setelah dilakukan uji hipersensitif pada daun tembakau dan uji hemolisis pada media agar darah. Uji daya hambat in vitro kandidat agens antagonis dilakukan dengan metode kultur ganda dan uji produksi senyawa volatil. Berdasarkan hasil uji in vitro diperoleh sebanyak 9 isolat yang berpotensi sebagai antagonis dan memiliki persentase daya hambat di atas 30%. Isolat yang paling tinggi penghambatannya adalah isolat bakteri P1A4B47. Identifikasi berdasarkan analisis sekuen nukleotida gen 16S rRNA hasil sekuensing produk PCR dengan primer 27F dan 1492R menunjukkan bahwa isolat bakteri P1A4B47 memiliki derajat kemiripan sebesar 99.26% dengan Pseudomonas aeruginosa.
Keyword: agens biokontrol, bakteri antagonis, bawang merah, PHT, Pseudomonas aeruginosa

Judul: The Construction of Greedy SVP LLL Algorithm
Abstrak: A lattice is a set of all integer linear combination of a set of linearly independent vectors in ℝ𝑛���. The independent vectors are called bases of lattice. Any lattice can be generated from many bases, and these bases have the same cardinality. In the lattice, the most fundamental and renowned problem is the Shortest Vector Problem (SVP). SVP is a tracking problem of the shortest nonzero vector in a lattice with equivalent bases. In two dimensions, SVP problem has resolved exactly by Gauss’ algorithm. When the lattice dimension is higher than two, A.K. Lenstra, H.W. Lenstra and L. Lovasz gave a LLL algorithm to compute approximation of nonzero shortest vector in the lattice. Reduced bases solution obtained from LLL algorithm still be an approximation and has polynomial running time of arbitrary dimension which large enough. In 1994, Schnoor and Euchner modified this LLL algorithm as a new variant which later was named deep insertion LLL algorithm. This algorithm is a modified version of the LLL algorithm to the terms of the exchange step to improve the accuracy of output of LLL reduced bases and applying it to the subset sum problem. The purpose of this research are: (1) Reconstruct the LLL algorithm and deep insertion LLL algorithm using a geometric approach. (2) Construct a greedy SVP LLL algorithm. (3) Implement the three algorithms in a symbolic programming language, and evaluate them experimentally. A bases ℬ=[𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑛���] in ℝ𝑚��� is called reduced LLL with parameter 𝛿��� if satisfies: (a) |𝜇���𝑗���𝑖���|≤12, for every integer 𝑖���,𝑗��� with 1≤𝑖���<𝑗���<𝑛���. (b)𝛿���‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���)‖2≤‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���+1)‖2, for 𝑗���=1,2,…,𝑛���−1,where 𝛿��� is a reduced parameter of real numbers with 14<𝛿���<1. The first requirement is the reduced basis 𝛿��� must “nearly orthogonal” and in its computation case, this requirement can be reached out by using the Gram-Schmidt’s orthogonalization. While the second requirement is called exchange step, or used to called as Lovasz condition. By using both of these requirements, then they establish the LLL algorithm. Then, Schnoor and Euchner modify the LLL algorithm based on the requirements of the exchange step called the deep insertion LLL algorithm, where the exchange step is based on the comparison of the projected vector in orthogonal complement [𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑘���−1]⊥ after j-th reduction. To construct greedy SVP LLL algorithm, the requirements of the exchange step is based on purely by comparing norm of lattice 𝐛���𝑗��� with norm lattice 𝐛���𝑖��� for 𝑖���=1,2,3…,𝑗���−1. The process of insertion reduced vector after the exchange step also has done greedily. Then, we calculate the number of arithmetic operation in greedy SVP LLL algorithm for further analysis. The result of our exprimentation for three algorithms on the certain matrix size shows that the running time of the three algorithms increases propotional to the size of the matrix. The result also shows that by using 𝛿���=34 for the LLL algorithm and the deep insertion LLL algorithm, and the greedy SVP LLL algorithm which is a new variant made by using no parameter of 𝛿���, outperform of the other of two previous algorithm in terms of speed with the same output.
Keyword: LLL algorithm, LLL deep insertion algorithm, greedy SVP LLL algorithm