Judul: Ekspresi Gen c-lisozim dan Ketahanan Kentang Transgenik (cv. Atlantic) terhadap Bakteri Ralstonia solanacearum dan Pectobacterium carotovorum
Abstrak: Kentang (Solanum tuberosum L.) merupakan salah satu tanaman sumber karbohidrat yang cukup penting dan merupakan pangan alternatif pengganti makanan pokok. Produktivitas kentang di Indonesia sangat berfluktuatif yang disebabkan oleh penyakit pada tanaman kentang. Penyakit utama pada tanaman kentang yang disebabkan oleh bakteri adalah layu bakteri (Ralstonia solanacearum) dan busuk umbi (Erwinia carotovora) atau yang sekarang disebut Pectobacterium carotovorum subsp. Carotovorum yang menyebabkan gejala blackleg. Salah satu upaya penanggulangan penyakit ini adalah penggunaan kultivar unggul yang tahan terhadap patogen penyebab penyakit. Salah satu upaya yang dapat dilakukan adalah rekayasa genetika dengan menggunakan gen ketahanan. C-lisozim adalah salah satu gen ketahanan yang telah banyak diketahui dan dimanfaatkan untuk merakit suatu tanaman yang tahan terhadap serangan penyakit yang disebabkan oleh bakteri. Gen c-lisozim telah diintegrasikan dengan tanaman kentang kultivar Atlantic. Analisis ekspresi gen tersebut dilakukan dengan quantitative PCR dan ketahanannya diuji dengan bakteri Ralstonia solanacearum dan Pectobacterium carotovorum subsp. Carotovorum baik secara in vitro dan rumah kaca. Secara in vitro seluruh klon tanaman transgenik (100%) terlihat tahan terhadap kedua bakteri tersebut. Sedangkan di rumah kaca, 6 klon transgenik tahan terhadap R. solanacearum dan P. carotovorum, sedangkan satu klon lainnya tergolong agak tahan. Tanaman transgenik mempunyai bobot basah tajuk, bobot umbi dan jumlah umbi yang lebih tinggi dibandingkan dengan tanaman kentang non-transgenik. Analisis ekspresi gen c-lisozim dengan Real Time Quantitative PCR dengan gen aktin sebagai standar menunjukkan bahwa keenam klon tanaman transgenik mengekspresikan gen c-lisozim jauh lebih tinggi daripada tanaman non-transgenik, yaitu berkisar 12-44 kali. Tingkat ekspresi gen c-lisozim berhubungan erat dengan tingkat resistensi tanaman kentang transgenik terhadap penyakit layu bakteri dan busuk lunak. Klon ATT1 mempunyai resistensi terhadap penyakit layu bakteri dan busuk lunak paling tinggi dan mempunyai ekspresi gen c-lisozim paling tinggi.
Keyword: busuk umbi, kentang, layu bakteri, lisozim, resistensi, transgenik

Judul: Resistensi Kentang (Solanum tuberosum L.) Kultivar Atlantic Transgenik yang Mengandung Gen c-lys Penyandi Lisozim terhadap Bakteri Erwinia carotovora
Abstrak: Kentang (Solanum tuberosum L.) kultivar Atlantic merupakan salah satu kultivar kentang yang rentan terhadap bakteri Erwinia carotovora penyebab penyakit busuk lunak. Lisozim dapat digunakan untuk menanggulangi bakteri ini karena dapat melisis dinding sel bakteri. Transformasi genetik kentang kultivar Atlantic dengan gen c-lys penyandi lisozim telah menghasilkan 28 galur tanaman transgenik putatif. Analisis integrasi gen c-lys di dalam genom tanaman transgenik dengan PCR dan uji resistensi tanaman transgenik terhadap bakteri E. carotovora telah dilakukan hanya terhadap dua galur tanaman transgenik. Pada penelitian ini, analisis integrasi gen c-lys dan uji resistensi kentang transgenik terhadap E. carotovora dilakukan terhadap lima tanaman transgenik putatif lainnya, yaitu Att3, Att4, Att5, Att6 dan Att7. Analisis integrasi gen dengan PCR menunjukkan bahwa kelima tanaman transgenik putatif mengandung gen c-lys di bawah kendali promoter 35S CaMV dan terminator Nos. Uji resistensi tanaman kentang in vitro menunjukkan bahwa kelima tanaman transgenik tersebut semuanya resisten terhadap bakteri E. carotovora, dan semua tanaman non-transgenik terserang oleh bakteri tersebut. Hasil ini menujukkan bahwa gen c-lys di bawah kendali promoter 35S CaMV dan terminator Nos, yang terintegrasi di dalam genom kentang kultivar Atlantic transgenik mampu meningkatkan resistensi tanaman kentang terhadap penyakit busuk lunak.
Keyword: Lysozime, Erwinia carotovora, cultivar Atlantic, Resistance, 35S CaMV promoter and NOS Terminator, Biological sciences, Penyakit busuk lunak, Perbanyakan tanaman in vitro, Tanaman transgenik, Transgenik putatik

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: