Judul: Exploration of Dark Septate Endophyte (DSE) Fungi from Oil Palm Roots as Biocontrol Agents of Ganoderma boninense
Abstrak: Ganoderma boninense adalah salah satu patogen utama yang menghambat produktivitas kelapa sawit di Indonesia. Keparahan infeksi cendawan G. boninense pada tanaman kelapa sawit di Indonesia yang telah dilaporkan paling besar mencapai 60% dengan luas area yang diserang lebih dari 50%. Infeksi G. boninense di Indonesia paling banyak dilaporkan terjadi di pulau Sumatera dan Jawa. Dampak infeksi cendawan G. boninense menyebabkan lahan kelapa sawit mengalami penurunan produktivitas hingga 85%. Berbagai upaya untuk mengendalikan infeksi G. boninense telah banyak dilakukan namun hingga saat ini belum ada teknik pengendalian yang efektif untuk mengendalikan G. boninense. Oleh karena itu pada penelitian ini dilakukan eksplorasi untuk mencari agens biokontrol potensial baru yang dapat menekan G. boninense. Salah satu kelompok cendawan yang belum banyak dilaporkan untuk mengendalikan G .boninense adalah dark septate endophyte (DSE). Cendawan DSE merupakan salah satu agens hayati yang berpotensi untuk digunakan dalam menekan penyebaran penyakit busuk pangkal batang. Penggunaan DSE telah terbukti menekan perkembangan patogen tular tanah lainnya, seperti Fussarium oxysporum, Rigidoporus microporus, G. boninense (in vitro). Salah satu mekanisme DSE sebagai agens pengendali hayati adalah menghasilkan metabolit sekunder yang bersifat toksik terhadap patogen. Penelitian ini bertujuan memperoleh isolat DSE dari perakaran kelapa sawit yang berpotensi sebagai agens pengendali hayati G. boninense dan menganalisis mekanisme kerja cendawan DSE dalam menghambat G. boninense. Penelitian ini terdiri dari empat kegiatan utama, yaitu: (1) pengamatan asosiasi antara cendawan DSE dan tanaman kelapa sawit dari sampel akar kelapa sawit dilapangan, (2) Isolasi dan karakterisasi DSE, (3) seleksi isolat cendawan DSE Potensial, (4) analisis senyawa metabolit sekunder yang dihasilkan oleh cendawan DSE. Pengamatan asosiasi pada sampel akar kelapa sawit dari lapangan dilakukan untuk melihat hubungan simbiosis cendawan DSE dan tanaman kelapa sawit di alam. Proses isolasi cendawan DSE dilakukan dari sampel akar kelapa sawit. Proses seleksi cendawan DSE dimulai dengan pengujian keamanan hayati yang meliputi uji fitopatogenisitas dan uji hemolisis darah. Selanjutnya isolat non patogen diuji lebih lanjut terkait kemampuannya dalam menghambat perkembangan G. boninense dan kemampuannya sebagai pemacu pertumbuhan. Hasil penelitian menunjukkan bahwa hubungan simbiosis antara tanaman kelapa sawit dan cendawan DSE terjalin secara alami, yang dibuktikan dengan adanya kolonisasi hifa dan struktur mikroskopis di dalam akar kelapa sawit yang diamati. Kolonisasi cendawan DSE banyak ditemukan pada tanaman yang terinfeksi G. boninense. Persentase kolonisasi cendawan DSE pada akar kelapa sawit berkisar 5-60%. Kolonisasi cendawan DSE dapat dipengaruhi oleh beberapa faktor, seperti teknik budidaya, suhu, dan curah hujan. Dari proses isolasi diperoleh 12 isolat cendawan DSE dari akar kelapa sawit. Cendawan DSE yang diperoleh pada penelitian ini sebagian besar diperoleh dari akar tanaman yang sehat dengan persentase isolasi total sebesar 1,71%. Berdasarkan hasil kolonisasi dan isolasi membuktikan bahwa cendawan DSE mampu membentuk simbiosis dengan akar kelapa sawit. Isolat cendawan DSE yang telah diperoleh diuji keamanannya dengan uji fitopatogenisitas dan helolisis. Berdasarkan hasil uji keamanan hayati, diperoleh empat isolat yang tidak patogen, yaitu S51, S14, GS2, dan GS3. Keempat isolat cendawan tersebut juga memiliki kemampuan untuk meningkatkan berat kering tanaman, panjang tajuk, dan panjang akar Brassica rapa sebesar 38-125%, 35-163%, dan 23-140%. Selain meningkatkan pertumbuhan tanaman keempat cendawan DSE memiliki aktivitas antibiosis dan aktivitas kitinolitik. Aktivitas antibiosis cendawan DSE ditunjukkan
Keyword: Antifungal agent, Cladophialophora nyingchiensis, Exophiala pisciphila, secondary metabolites

Judul: Study of Dark Septate Endophyte's Metabolites for Control of Oil Palm Stem Base Rot Disease (Elaeis guineensis Jacq.)
Abstrak: Penyakit busuk pangkal batang merupakan penyakit penting pada kelapa sawit yang disebabkan oleh cendawan patogen Ganoderma boninense. Penyakit ini belum dapat dikendalikan secara optimal karena tidak menunjukkan gejala pada periode awal infeksi dan tidak spesifik. Gejala infeksi di pembibitan ditandai dengan daun muda yang jumlahnya tidak normal atau bahkan tidak berkembang, pelepah daun layu dari daun bagian bawah, busuk lanjut di pangkal batang, dan diikuti tumbuhnya tubuh buah cendawan G. boninense. Cendawan ini dapat mempengaruhi produksi kelapa sawit karena mengakibatkan kematian pada kelapa sawit. Berbagai pengendalian telah dilakukan namun hasilnya belum optimal. Cendawan endofit diketahui sebagai salah satu jenis mikrob fungsional yang mampu memproduksi metabolit sekunder, baik secara langsung atau tidak langsung sehingga sangat cocok dijadikan sebagai agens pengendali hayati. Salah satu agens pengendali hayati yang dapat digunakan dalam mengendalikan G. boninense yaitu cendawan Dark Septate Endophyte (DSE). Penelitian ini bertujuan untuk mengkaji potensi metabolit DSE untuk mengendalikan G. boninense pada tanaman kelapa sawit dan mengevaluasi mekanisme kerjanya. Sebanyak tiga isolat cendawan DSE yaitu Cladophialophora nyingchiensis (isolat S5), isolat Exophiala pisciphila (isolat S14) asal tanaman kelapa sawit dari Subang dan isolat Diaporthe pandanicola (isolat TM) asal tanaman kelapa sawit dari Medan yang digunakan pada penelitian ini merupakan isolat koleksi Badan Riset Inovasi Nasional (BRIN) Penelitian ini terdiri atas beberapa tahapan, yaitu: persiapan inokulum G. boninense, uji in vitro isolat cendawan endofit terhadap patogen G. boninense (penyiapan filtrat DSE dan uji keefektifan filtrat DSE), identifikasi senyawa-senyawa yang terkandung dalam filtrat DSE dan uji keefektifan filtrat DSE dalam mengendalikan G. boninense pada bibit kelapa sawit di rumah kaca. Hasil uji in vitro menunjukkan bahwa filtrat ketiga cendawan DSE berpotensi menghambat pertumbuhan G. boninense. Uji pendahuluan dilakukan untuk menentukan konsentrasi filtrat dan masa inkubasi dalam menghasilkan filtrat bagi cendawan DSE yang paling tepat untuk ketiga cendawan DSE tersebut. Masa inkubasi yang paling baik untuk menghasilkan filtrat adalah 2 minggu. Filtrat cendawan DSE yang paling efektif berdasarkan nilai IC55 yaitu filtrat C. nyingchiensis (isolat S51) pada konsentrasi 43,78% dan filtrat D. pandanicola (isolat TM) pada konsentrasi 57,77%. Filtrat tiga isolat DSE tersebut diuji penghambatannya menggunakan metode peracunan media dengan konsentrasi 15%, 30%, 45%, 60% dan 75% (v/v dalam 10 ml media). Hasil menunjukkan bahwa penghambatan paling tinggi, yaitu sebesar 88,63%, terjadi pada perlakuan filtrat isolat S51 dengan konsentrasi 75%, diikuti oleh perlakuan filtrat isolat TM dengan penghambatan sebesar 67,00%. Filtrat isolat S51 selanjutnya diidentifikasi komponen penyusunnya menggunakan Liquid Chromotography-Mass Spectrometry (LCMS). Senyawa-senyawa yang terkandung dalam filtrat isolat S51 di antaranya adalah: heptadecylamine, yadanzioside p, linolein, androstenediol dan oxproline yang melindungi tanaman inang dari serangan G. boninense. Aplikasi filtrat isolat S51 dengan cara disiramkan pada pangkal batang bibit, sebanyak 2 kali, dengan konsentrasi filtrat 75% dapat menekan insidensi dan keparahan penyakit busuk pangkal batang secara eksternal dan internal pada bibit kelapa sawit di rumah kaca. Aplikasi filtrat S51 sebanyak 2 kali dengan konsentrasi 75% memberi pengaruh yang paling baik terhadap tinggi tanaman, jumlah daun dan diameter bonggol tanaman kelapa sawit pada 4 bulan pengamatan di rumah kaca. Filtrat isolat DSE S51 tidak menimbulkan efek fitotoksisitas.
Keyword: Cladophialophora, Exophiala, Diaporthe, LCMS, Biological control, inhibition concentration (IC)

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: