Judul: Karakteristik protease beberapa bakteri patogen
Abstrak: Tujuan penelitian ini adalah untuk mengkarakterisasi protease dari bakteri patogen yaitu: bakteri Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Klebsiella sp. Staphylococcus epidermidis yang diskrining dari koleksi Rumah Sakit Pertamina Jakarta dan A.hydrophila yang diperoleh dari Departemen Budidaya, Perairan Fakultas Perikanan dan llmu Kelautan Institut Pertanian Bogor. Karakter protease patogen ini penting untuk skrining inhibitor protease. Waktu produksi optimum P.aeruginosa, S.epidermidis dan A.hydrophila adalah 48 jam, sedangkan E.coli, adalah 24 jam, S.aureus dan Klebsiella sp. adalah 16 jam. Pengaruh inhibitor spesifik (pMSF dan EDTA) mengindikasikan protease P.aeruginosa, E.coli, S.aureus, Klebsiella sp., S.epidermidis dan A.hydrophila adalah serin metaloprotease. Berat molekul ditentukan dengan menggunakan SDS-P AGE dan zimogram didapatkan berat molekul sekitar 35 kD untuk protease E.coli, S.aureus, Klebsiella sp., S.epidermidis dan A.hydrophila sedangkan protease P.aeruginosa berat molekulnya adalah 36 kD and 42 kD. Protease P.aeruginosa dimurnikan dengan menggunakan Kromatografi kolom Sephadex G-I00.
Keyword: Enzim prptease, Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Klebsiella sp., Staphylococcus epidermidis

Judul: Screening and characterization of protease inhibitor from bacteria associated with sponge Jaspis sp
Abstrak: Tiga galur dari 138 isolat bakteri yang berasosiasi dengan spons dari Waisai, Pulau Raja Ampat, Propinsi Papua Barat, Indonesia, diketahui mampu menghasilkan aktivitas penghambatan terhadap subtilisin (protease serin), termolisin (protease logam), dan ekstrak kasar dari bakteri patogen Eschericia coli enteropathogenic (EPEC) K.1.1, Staphylococcus aureus, dan Pseudomonas aeruginosa. Isolat-isolat tersebut dinamakan sebagai SAB S-12, SAB S-21, and SAB S-17. Metode agar-agar lapis ganda yang terdiri atas lapis kasein dan SWC (sea water complete) digunakan untuk menapis produsen penghambat protease terhadap kelompok bakteri patogen penghasil protease, seperti EPEC K.1.1, S. aureus, dan P. Aeruginosa. Dari ketiga isolat penghasil penghambat protease, isolat SAB S-12 tidak menghasilkan zona penghambatan, hal ini mengindikasikan bahwa galur tersebut memiliki aktivitas penghambatan terbesar. Isolat SAB S-12 memiliki aktivitas penghambatan terbesar terhadap termolisin dan enzim ekstrak kasar dari kelompok bakteri patogen berturut-turut sebesar 91.570% dan 98.846%. Kemudian, isolat SAB S- 21 memiliki aktivitas penghambatan terbesar terhadap termolisin sebesar 70.370%. Kondisi pertumbuhan optimum dari ketiga galur tersebut pada rentang pH 7.0-8.0 dan rentang suhu 40- 50˚C pada media SWC. Semua galur penghambat protease termasuk ke dalam kelompok bakteri Gram-negatif dan berbentuk batang.
Keyword: Streptomyces, Escherichia coli, Aplysina aerophobia

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: