Judul: Kajian Geomorfologi Perairan Dangkal Menggunakan Citra Sentinel-2 dan Data Kedalaman Perairan Dengan Pendekatan Analisis Benthic Terrain Modeler
Abstrak: Perairan laut dangkal merupakan wilayah yang dinamis dan mempunyai peran penting bagi ekologi pesisir. Data dan informasi mengenai karakteristik dasar perairan dangkal yang akurat sangat penting untuk pengembangan wilayah pesisir dan Pulau-Pulau kecil. Indonesia yang memiliki ribuan pulau kecil memiliki karakteristik perairan dangkal yang beragam, sehingga untuk melengkapi kebutuhan data perlu pengkajian mengenai geomorfologi habitat bentik. Citra satelit multispektral telah banyak digunakan untuk estimasi kedalaman di perairan dangkal, salah satunya citra satelit Sentinel-2. Penelitian ini mengkaji potensi penggunaan data citra Sentinel-2 untuk mengestimasi kedalaman, dan struktur geomorfologi bentik habitat pada perairan Pulau Lambasina Kabupaten Kolaka. Tujuan penelitian ini adalah (1) menganalisis kemampuan citra Sentinel-2 untuk mengestimasi batimetri dasar perairan dangkal menggunakan tiga algoritma yakni Lyzenga, Stumpf, Suport vector machine ratio transform (SVM), serta (2) untuk mendapatkan struktur kelas geomorfologi dengan menggunakan pendekatan Benthic Terrain Modeler (BTM). Penelitian ini dilaksanakan pada bulan November 2020 hingga Juni 2021 di perairan laut Pulau Lambasina Kecil dan Lambasina Besar, Kabupaten Kolaka, Sulawesi Tenggara. Bahan-bahan yang digunakan, diantaranya Citra Sentinel-2 dan data batimetri (hasil pemeruman Maps sounder). Alat-alat yang digunakan pada penelitian ini berupa perangkat keras seperti echosounder, Global Policy and Strategy (GPS) dan Laptop serta perangkat lunak seperti ArcGIS, QGIS, Envi 5.3, Surfer dan Microsoft Excel. Klasifikasi struktur geomorfologi perairan dangkal, menggunakan Citra Sentinel-2 dan diintegrasikan dengan data hasil pemeruman lapangan dengan pendekatan BTM. Penelitian dilaksanakan dengan beberapa tahapan, diantaranya pra-pengolahan citra, koreksi pasang surut, estimasi kedalaman perairan dangkal (batimetri), uji akurasi data batimetri estimasi dari citra satelit dan mengkombinasi batimetri dari citra satelit dengan data pemeruman untuk mendapatkan kelas struktur geomorfologi perairan dangkal. Kelas struktur geomorfologi perairan dangkal di dapatkan dengan input data Fine Bahthymetry Position Index, Broad Bahthymetry Position Index dan data kemiringan (slope). Estimasi kedalaman maksimum pada perairan laut dangkal Pulau Lambasina Kecil dan Lambasina Besar adalah 20 meter pada setiap algoritma yang digunakan pada citra Sentinel-2. Algoritma (SVM) menjadi model terbaik dibandingkan dengan algoritma Stumpf dan Lyzenga dalam pendugaan kedalaman perairan laut dangkal dengan kondisi perairan yang jernih pada kedua pulau. Kombinasi scale factor yang digunakan pada lokasi penelitian yakni Fine_BPI 86 dan Broad_BPI 139. Terdapat 13 kelas struktur geomorfologi yang didapatkan pada kedua pulau dengan hasil analisis BTM. Kelas struktur geomorfologi yang paling bervariasi didapatkan pada wilayah Pulau Lambasina Besar. Variasi kelas struktur yang tinggi ditemukan pada wilayah terumbu karang diantaranya terdapat flat ridges, narrow depressions, local ridges, crevices, dan steep slopes pada wilayah perairan dangkal Pulau Lambasina Besar yang menandakan pada daerah tersebut memiliki kompleksitas habitat yang cukup tinggi.
Keyword: batimetri, lyzenga, penginderaan jauh, perairan dangkal, stumpf, support vector machine

Judul: Pengembangan Algoritma untuk Pemetaan Batimetri Perairan Dangkal Menggunakan Citra Sentinel-2A di Pulau Kelapa Dua
Abstrak: Pengembangan algoritma untuk pemetaan perairan dangkal dari citra satelit sudah banyak dilakukan namun belum ada algoritma yang baku untuk semua perairan. Tingkat akurasi algoritma yang dikembangkan berbeda untuk perairan yang berbeda. Penelitian ini bertujuan untuk membandingkan dan mengaplikasikan algoritma yang terbaik dalam memetakan batimetri perairan dangkal di Pulau Kelapa Dua. Penelitian ini membandingkan aplikasi algoritma log-linear transform dan log-ratio transform untuk pemetaan perairan dangkal di Pulau Kelapa Dua. Pemetaan batimetri perairan dangkal dengan model log-linear transform dan log-ratio transform menggunakan citra satelit Sentinel-2A dengan kombinasi kanal biru-hijau. Proses pengolahan citra satelit meliputi pra-pengolahan citra, pengaplikasian algoritma log-transform dan uji kesesuaian. Uji kesesuaian model (goodness of fit) melalui analisis uji determinasi, uji chi-squared dan uji RMSE digunakan untuk melihat tingkat kesesuaian model batimetri perairan dangkal. Hasil analisis menunjukkan bahwa algoritma log-ratio transform cenderung lebih baik dalam memetakan batimetri di Pulau Kelapa Dua dengan nilai koefisien determinasi (R2) sebesar 0.64, uji chi-squared (X2) sebesar 3.52 dan uji RMSE sebesar 0.648, sementara itu algoritma log-linear transform memiliki nilai koefisien determinasi (R2) sebesar 0.61, uji chi-squared (X2) sebesar 3.80 dan uji RMSE sebesar 0.742. Kedalaman perairan dangkal di Pulau Kelapa Dua adalah pada kisaran kedalaman 0 - 7 m., The algorithms development for shallow-water mapping from satellite imagery has been widely conducted, however there is no standardized algorithm for all kinds of waters. Various kinds of developed algorithms have different accuracy levels for each type of water. This research aims to compare and apply which algorithm is best for mapping the bathymetry of shallow waters on Kelapa Dua Island. The study compares the application of log-linear transform and log-ratio transform algorithms for mapping shallow water around Kelapa Dua Island. The bathymetry mapping is conducted with the log-linear transform and log-ratio transform models using Sentinel-2A satellite imagery with a combination of blue-green channels. Satellite image processing includes image pre-processing, application of the log-transform algorithms, and suitability testing. Suitability testing of the models (goodness of fit) through determination analysis, the chi-squared test, and the RMSE test is used to assess the level of suitability of the shallow water bathymetry models. The results of the analysis show the log-ratio transform algorithm tends to perform better in mapping bathymetry on Kelapa Dua Island with a coefficient of determination (R2) of 0.64, the chi-squared test (X2) of 3.52, and the RMSE test of 0.648. While the log-linear transform algorithm has a coefficient of determination (R2) of 0.61, chi-squared test (X2) of 3.80, and RMSE test of 0.742, the depth of shallow waters around Kelapa Dua Island ranges from 0-7 m.
Keyword: Log-linear transform, Log-ratio transform, Pemetaan batimetri, Perairan dangkal, Sentinel-2A

Judul: Pemurnian dan karakterisasi protein inhibitor RNA helikase virus hepatitis C
Abstrak: Hepatitis C virus (HCV) infection is the second most common chronic viral infection in the world with global prevalence. This infection is contribution to chronic hepatitis and liver cirrhosis, often leading to hepatocellular carcinoma. There is no effective drug and vaccine available against HCV. The current standard treatment, a combination of pegylated interferon-α with ribavirin, is limited by its suboptimal response rate in a significant patient population, side effects, and affordability. Therefore, development of effective drug is needed. One approach to find out the candidate of antiviral drug is to discover the inhibitor of enzyme that essential for virus replication, such as RNA helicase. Streptomyces chartreusis 5-095 produce the inhibitor of HCV RNA helicase. The aim of this study was to purify the protein inhibitor which has inhibition activity against ATPase activity of RNA helicase HCV from S. chartreusis 5-095. The supernatant of culture S. chartreusis 5-095 exhibited high inhibiton activity against ATPase activity of RNA helicase HCV (approximately 72%) at 10 days of incubation. The extracellular protein inhibitor was partially purified by procedures of precipitation with ammonium sulfate to 65% saturation and gel filtration (Sephadex G50) using methanol water solution (4:6) as an eluen. The purity of protein inhibitor was monitored by SDS PAGE. The protein inhibitor showed a relative molecular mass were estimated to be 14 kDa and increased the purity 23,08 fold than those of the crude protein. The specific activity and IC50 after purification were 13,1338 U/mg and 0,0767 mg/mL, respectively. The activity of purified protein inhibitor showed its stability over pH range from 5-8 and optimum at pH 7,4. The inhibition activity showed its stability up to 70% at temperature 100 oC. The purified protein inhibitor relatively stable its activity at storage in the range of -20 oC to room temperature for 35 days.
Keyword: