Judul: Penapisan Penicillium spp. penghasil antibakter
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk menapis isolat-isolat Penicillium spp. penghasil antibakteri dengan ampisilin sebagai pembanding. Ampisilin 100 g/ml menurunkan tingkat kekeruhan suspensi E. coli 104 sel/ml pada jam ke-5 inkubasi sebesar 45,45%. Antibakteri diproduksi pada media Luria Bertani Broth (LBB) dengan menanam inokulan Penicillium spp. dan menginkubasinya selama 7 hari dalam kondisi statis. Supernatan 12 isolat dari 32 isolat Penicillium spp. yang diuji, menunjukkan kemampuan menurunkan tingkat kekeruhan suspensi E. coli 104 sel/ml, tetapi hanya 4 isolat yaitu isolat IPBCC 88.052 (31,65%), IPBCC 08.603 (28,33%), IPBCC 08.616 (25%), dan IPBCC 08.588 (23,33%) saja yang memiliki persentase penghambatan >20%. Uji konfirmasi yang dilakukan pada dua konsentrasi E. coli 105, dan 106 sel/ml menunjukkan bahwa keempat isolat tersebut memiliki persentase penghambatan pertumbuhan yang semakin kecil pada konsentrasi bakteri yang lebih besar. Pengujian filtrat pekat Penicillium spp. dengan metode Kirby-Bauer terhadap E. coli menunjukkan adanya hambatan. Diameter Zona hambatan filtrat antibakteri E. coli mengalami penurunan pada konsentrasi bakteri semakin meningkat. Isolat IPBCC 88.052 memiliki persentase penghambatan dan diameter zona hambatan tertinggi.
Keyword: E. coli, P. crysogenum, P. notatum, Patulin

Judul: Penapisan biologis dan isolasi senyawa peptida antimikroba dari Streptomyces sp.
Abstrak: Streptomyces sp. adalah bakteri tanah yang telah dikenal memiliki kemampuan menghasilkan beragam senyawa antibiotik. Penelitian ini dilaksanakan sebagai upaya melakukan penapisan sejumlah isolat Streptomyces sp. dari tanah hutan tropis Indonesia dan mengisolasi senyawa peptida yang memiliki daya antimikrob. 127 isolat Streptomyces sp. koleksi laboratorium bioteknologi kehutanan PAU, lPB, dipilih, dikelompokkan, dan diuji bioaktivitasnya terhadap bakteri target Staphylococcus aureus ATCC 25923 dan Eschericia coli ATCC 25922. Sebanyak 39 isolat (30.71%) mampu menghambat pertumbuhan salah satu atau kedua bakteri target. Dari 39 isolat tersebut, 2 isolat memberikan supernatan media fermentasi yang mampu menghambat kedua bakteri target, yaitu isolat IR-1 dan IR-5, keduanya asal tanah Irian Jaya. Supematan media fermentasi kedua isolat dimurnikan dengan gel filtrasi, sephadex G-75 superfine, tiap fraksi diukur absorbansinya pada 'A. 220 dan 280 nm. Fraksi yang memiliki nilai absorbansi berdekatan disatukan, dan didapatkan 3 kelompok fraksi, yaitu kelompok A, B, dan C. Basil uji bioaktivitas ketiga kelompok fraksi menunjukkan kelompok fraksi A (kumpulan fraksi dengan nilai absorbansi ;;, 1.2) memiliki kemampuan menghambat kedua bakteri target, kemampuan ini berbanding lurus ·dengan konsentrasi larutan. Kelompok fraksi A dari kedua isolat diduga mengandung paling sedikit satu macam peptida (protein) dengan bobot molekul berkisar 58000-61000, yang ditunjukkan oleh satu pita pada basil elektroforesis. Namun keberadaan gula pada fraksi A yang diperlihatkan oleh kromatografi cair kinerja tinggi (KCKT) menunjukkan bahwa fraksi tersebut belum murni. Basil analisis KCKT juga menunjukkan ada 14 jenis asam amino yang terdapat dalam fraksi A kedua isolat dengan konsentrasi total sebesar 3.0514 % bib untuk IR-I dan 2.6130 % bib untuk IR-5. Keberadaan peptida (protein) diperkuat dengan adanya serapan asam amino (ion zwitter) pada spektrum serapan infra merah.
Keyword: 

Judul: Thermal Characteristics and Dynamics of Tropical Cyclone over Western North Pacific Ocean: A Case Study of Typhoon Songda (Chedeng) 2011
Abstrak: The frequent occasion of Tropical Cyclone (TC) over Western North Pacific (WNP) Ocean lies from 10˚N to 26˚N and 121˚E to 170˚E. Sources of TC development come from warm ocean temperature where latent heat is released during condensation processes and subsequently concentrated in the boundary layer. Relative humidity at 850-700 hPa is responsible to produce the most intense storm. Meanwhile, weak vertical wind shear between 850-200 hPa is one of the dynamical factors that lead to the development of TC. Pressure level of 850-200 hPa is chosen to minimize the thermodynamic effect in the lower troposphere. Typhoon Songda (Chedeng in the Philippines) or TSC lasted from May 18th to 30th, 2011 and strengthened into powerful Super Typhoon stage between May 24th and 27th. Long curving track and the exhibition of all sequences of TC life cycle, TSC is then considered as an ideal case of TC. The objective of the study with case of TSC is to investigate the role of thermal characteristics and dynamics on TC intensity. The research is carried out by using Advanced Research of Weather Research and Forecasting model (WRF ARW model) version 3.3. Two domains are employed in the model. The first domain situate from 02˚N to 40˚N and 118˚E to 149˚E and cover spatial resolution () of 33.1 km. The second domain situate from 09˚N to 27˚N and 119˚E to 132˚E with of 11 km. Timestep of the model () is 120 seconds. The model is supported by the following physical parameterization, i.e., Yonsei University Scheme (YSU) in the boundary layer, Kain-Fritsch scheme (KF) in the cumulus, and WRF Single-Moment 3-class scheme in the microphysics. Initial meteorological condition prior to the formation of the cyclone is generated using WRF ARW standard-release model. Sensitivity of the model output is obtained from a selected single-parameter change scenarios, namely, 10 % to 20 % decrease and increase of wind shear initial data at 850-200 hPa, and by 10 % to 20 % decrease of relative humidity initial data at 850-700 hPa. The result showed that the negative correlations between wind shear and intensity are found in wind shear scenarios. Wind shears of 10 ms-1 which lead to strengthening of the wind intensity in the early period of Typhoon development are found in wind shear scenarios. The effect of wind shear changes on wind intensity is statistically significant in the 20 % wind shear scenarios. During mature stage, weak wind intensity occurred when wind shear increase as given in the WRF standard-release and the 20 % decreasing scenario. Different situation is found in the 20 % increasing scenario where wind shear tend to weak and lead to strong wind intensity at this stage. Meanwhile, the reduction of moisture supply at 850-700 hPa resulting from 20 % decreasing relative humidity play a major role in the weakening of wind intensity and reduces mechanical energy of the cycle process as much as 300 J kg-1.
Keyword: