Judul: Pemanfaatan Imunostimulan Fikosianin dari Spirulina platensis untuk Mencegah Penyakit Motile Aeromonad Septicaemia (MAS) pada Ikan Mas Cyprinus carpio
Abstrak: Motile aeromonad septicaemia (MAS) adalah penyakit yang sering menyerang ikan mas Cyprinus carpio yang disebabkan oleh bakteri Aeromonas hydrophila. Dibutuhkan upaya dalam penanggulangan infeksi A. hydrophila, salah satunya adalah dengan menggunakan imunostimulan dari bahan alami yaitu Spirulina platensis. Pemanfaatan bioaktif fikosianin S. platensis sebagai peningkat daya tahan tubuh (imunitas) ikan, perlu untuk dilakukan. Aplikasi penambahan fikosianin pada pakan dalam pemeliharaan benih ikan mas diharapkan dapat meningkatkan status kesehatan, sistem imun, daya tahan terhadap infeksi penyakit, dan kinerja pertumbuhan pada ikan mas. Penelitian ini bertujuan untuk menguji kinerja imunostimulan fikosianin yang berasal dari S. platensis untuk mencegah penyakit MAS pada ikan mas C. carpio. Penelitian ada dua tahap, tahap pertama bertujuan untuk menentukan dosis fikosianin dalam pakan yang tepat untuk meningkatkan sistem imun dan resistansi ikan mas terhadap penyakit MAS serta peningkatan kinerja pertumbuhan, sedangkan tahap kedua untuk menguji lama waktu pemberian fikosianin dari dosis yang terbaik untuk meningkatkan sistem imun dan resistansi ikan mas terhadap penyakit MAS. Penelitian pertama terdiri dari 4 perlakuan dan 3 ulangan, yaitu tanpa penambahan fikosianin (K), penambahan fikosianin 150 mg kg-1 pakan (PF1), 250 mg kg-1 pakan (PF2), dan 350 mg kg-1 pakan (PF3) dan setelah 14 hari, ikan diuji tantang dengan A. hydrophila, sedangkan untuk pengamatan kinerja pertumbuhan ikan dipelihara selama 30 hari tanpa uji tantang. Penelitian kedua terdiri atas atas 5 perlakuan dan 3 ulangan, yaitu tanpa pemberian fikosianin (K), pemberian fikosianin selama 1 minggu (F1), 2 minggu (F2), 3 minggu (F3), dan interval 1 minggu (F4) dan setelah 28 hari, ikan diuji tantang dengan A. hydrophila. Bobot awal ikan mas adalah 8.28±0.19 g (tahap pertama) dan 8.72±0.22 g (tahap kedua). Ikan dipelihara dalam akuarium berukuran 60x30x30 cm3 dengan kepadatan 10 ekor/akuarium. Pembuatan pakan dilakukan dengan teknik coating dan pemberian pakan sebanyak 3 kali sehari secara at satiation. Parameter yang diuji meliputi kelangsungan hidup relatif (RPS), total eritrosit, hemoglobin, total leukosit, aktivitas fagositik, aktivitas respiratory burst, aktivitas lisozim, kelimpahan A. hydrophila pada organ hati, ginjal, dan usus, laju pertumbuhan spesifik, jumlah konsumsi pakan, rasio konversi pakan, dan sintasan. Hasil pada penelitian pertama menunjukkan bahwa kelangsungan hidup relatif (RPS) untuk ikan yang diberi pakan fikosianin 150 mg kg-1, 250 mg kg-1, dan 350 mg kg-1 pakan berturut-turut adalah 87.50%, 81.25%, dan 75.00%. Total eritrosit, hemoglobin, total leukosit, aktivitas fagositik, aktivitas respiratory burst, dan aktivitas lisozim menunjukkan hasil yang lebih tinggi daripada kontrol untuk semua perlakuan pemberian fikosianin. Penelitian kedua menunjukkan bahwa nilai RPS untuk ikan yang diberi pakan fikosianin selama 1 minggu, 2 minggu, 3 minggu, dan interval 1 minggu berturut-turut yaitu 65.38%, 69.23%, 76.92%, dan 69.23%. Respons imun ikan yang diberi pakan fikosianin memberikan hasil yang lebih tinggi daripada kontrol. Pemberian pakan fikosianin juga mampu menekan jumlah A. hydrophila di organ hati, ginjal, dan usus. Pemberian pakan dengan dosis 150 mg kg-1 pakan menunjukkan laju pertumbuhan spesifik, laju konsumsi pakan, dan nilai konversi pakan memberikan nilai yang lebih baik dibandingkan dengan kontrol (P<0.05). Hal ini menunjukkan bahwa pemberian fikosianin sebanyak 150 mg kg-1 pakan selama 3 minggu memberikan hasil terbaik untuk meningkatkan kelangsungan hidup, respons imun non-spesifik, kinerja pertumbuhan dan daya tahan tubuh ikan mas
Keyword: Aeromonas hydrophila, Cyprinus carpio, Fikosianin, Spirulina platensis

Judul: Aplikasi Probiotik, Prebiotik dan Sinbiotik Melalui Pakan untuk Pencegahan Infeksi Aeromonas hydrophila pada Ikan Mas Cyprinus carpio
Abstrak: Penyakit motile aeromonad septicemia (MAS) merupakan kendala yang sering dialami dalam budidaya ikan mas. Salah satu alternatif yang dapat dilakukan untuk mengatasi kendala tersebut yaitu dengan aplikasi probiotik, prebiotik dan sinbiotik. Penelitian ini bertujuan untuk menguji efektivitas pemberian bakteri probiotik, prebiotik dan sinbiotik terhadap kelangsungan hidup dan pertumbuhan ikan mas yang diinfeksi dengan A. hydrophila. Sebanyak 15 ekor ikan mas dengan bobot rata-rata 5,09±0,09 g dipelihara di akuarium dengan volume 96 L. Perlakuan yang diberikan yaitu kontrol negatif (K-), kontrol positif (K+) tanpa penambahan probiotik, prebiotik dan sinbiotik, perlakuan penambahan 1% probiotik (A), perlakuan penambahan 2% prebiotik (B) dan perlakuan penambahan sinbiotik (C; 1% probiotik dan 2% prebiotik). Setelah 30 hari, semua perlakuan (kecuali K-) diuji tantang dengan menyuntikkan A. hydrophila sebanyak 100 μL/ekor pada konsentrasi 107 CFU/ml secara intramuskular dan diamati mortalitasnya selama 14 hari. Hasil penelitian menunjukkan bahwa penambahan sinbiotik memberikan kelangsungan hidup yang lebih tinggi (100%) dibandingkan dengan perlakuan kontrol positif (45,83%) serta memberikan pengaruh yang lebih baik terhadap pertumbuhan ikan mas.
Keyword: Aeromonas hydrophila, ikan mas, probotik, prebiotik, sinbiotik

Judul: Penyusunan Overlap Graph menggunakan Suffix Tree pada DNA Sequence
Abstrak: The DNA sequence assembly is very important in genome analysis. This step aims to reconstruct contigous DNA fragment (contigs) from short fragment by concatenating fragments based on the overlap region among them. This method employs overlap graph for solving the problems. In this graph, nodes represent fragments and edges represent overlap. This research developed a software for constructing overlap graph using suffix tree. The evaluation was conducted by measuring the number of nodes, number of edges, and the execution time in many values of minimum overlap. The minimum overlap is defined as the minimum length of substring which is considered as the overlap region between two fragments. The evaluation results showed that the number of nodes, the number of edges, and the execution time were increased with the decreasing of the minimum overlap value.
Keyword: