Judul: Keragaman Cendawan Pascapanen Pada Umbi Bawang Merah Dari Beberapa Pengecer Di Pasar Tradisional Kota Bogor
Abstrak: Bawang merah (Allium ascalonicum) merupakan komoditas unggulan hortikultura Indonesia setelah cabai merah. Keberadaan cendawan penyebab penyakit pascapanen pada bawang merah dapat menyebabkan kehilangan hasil. Penelitian mengenai keragaman cendawan pascapanen pada umbi bawang merah telah dilakukan oleh beberapa negara di dunia, namun di Indonesia belum pernah dilakukan. Tujuan penelitian ini yaitu untuk memperoleh informasi mengenai keragaman cendawan pascapanen pada umbi bawang merah dari beberapa pengecer di pasar tradisional Kota Bogor. Pengambilan umbi bawang dilakukan pada bulan Januari dan Februari 2016. Penelitian terdiri atas pengambilan umbi bawang merah yang terserang penyakit, isolasi cendawan dari bawang yang terserang penyakit, uji patogenisitas cendawan, identifikasi cendawan penyebab penyakit dan isolasi kembali cendawan penyebab penyakit. Identifikasi cendawan dilakukan secara morfologi dan molekuler. Identifikasi morfologi dilakukan dengan mengamati warna koloni, pola pertumbuhan, ciri struktur somatik dan reproduksi. Identifikasi secara molekuler berdasarkan sekuen DNA daerah ITS1-5.8S-ITS2 rDNA menggunakan primer ITS1 dan ITS4. Pohon filogenetik dikonstruksi menggunakan software Mega7, metode Neighbor Joining (NJ) dengan bootstrap 1000x. Hasil penelitian menunjukkan bahwa cendawan penyebab penyakit pada umbi bawang merah yaitu Alternaria alternata, Aspergillus niger, Colletotrichum gloeosporioides spesies kompleks, Fusarium fujikuroi spesies kompleks, F. oxysporum, F. solani, Penicillium citrinum, dan P. pinophilum. Patogenisitas cendawan tertinggi ditunjukkan oleh Colletotrichum gloeosporioides spesies kompleks.
Keyword: Cendawan pascapanen, Colletotrichum gloeosporioides, ITS, patogenisitas, pohon filogenetik

Judul: Infeksi Virus dan Cendawan pada Umbi dan Biji Bawang Merah serta Pengaruhnya terhadap Insidensi Penyakit dan Produktivitas Tanaman.
Abstrak: Bawang merah merupakan salah satu tanaman sayuran komersial yang paling penting di Indonesia. Salah satu permasalahan dalam sistem budidaya bawang merah yang dapat berpengaruh terhadap penurunan produktivitas adalah penggunaan sumber bibit. Petani bawang merah di Indonesia umumnya menggunakan umbi bibit dari hasil panen sebelumnya sebagai sumber bahan tanam, padahal umbi bawang merah memiliki potensi dalam membawa patogen tular umbi seperti virus dan cendawan. Beberapa kelompok virus yang dilaporkan dapat menginfeksi bawang merah yaitu Potyvirus (OYDV/Onion yellow dwarf virus, dan SYSV/Shallot yellow stripe), Carlavirus (SLV/Shallot latent virus dan GCLV/Garlic common latent virus) dan Allexivirus (SMbLV/Shallot mite borne latent virus dan GMV/Garlic mosaic virus); sedangkan beberapa kelompok cendawan yang dapat menginfeksi bawang merah yaitu Alternaria porri penyebab penyakit bercak ungu, Colletotrichum gloeosporioides penyebab penyakit antraknosa, Peronospora destructor penyebab penyakit embun bulu, dan Fusarium oxysporum penyebab penyakit busuk pangkal batang. Sistem budidaya alternatif menggunakan true shallot seed (TSS) sebagai bahan tanam telah direkomendasikan untuk meningkatkan produktivitas bawang merah di Indonesia, karena TSS lebih sedikit membawa penyakit tular benih. Tetapi, pada kenyataannya hingga saat ini petani bawang merah di Indonesia masih tetap memilih menggunakan umbi bibit sebagai bahan tanam, karena TSS memiliki waktu panen yang lebih lama dibandingkan umbi bibit dan petani juga belum meyakini kelayakan ekonomis dari teknologi TSS terhadap hasil produksi bawang merah. Penelitian dilakukan dengan tujuan untuk mendeteksi virus dan cendawan pada bahan tanam awal (TSS dan umbi bibit) dan umbi yang dipanen; dan untuk membandingkan pertumbuhan dan produktivitas tanaman hasil TSS dan umbi bibit. Penelitian dilaksanakan mulai Januari 2017 hingga Januari 2018, bertempat di Desa Kersana, Kecamatan Kersana, Kabupaten Brebes, Laboratorium Virologi Tumbuhan dan Laboratorium Mikologi Tumbuhan, Departemen Proteksi Tanaman, Fakultas Pertanian, Institut Pertanian Bogor. Bahan tanam yang digunakan yaitu umbi bibit bawang merah dan TSS kultivar Bima, Bauji, Thailand, dan Tuk-Tuk yang diperoleh dari petani di Brebes, Nganjuk, dan toko pertanian di Bogor. Penelitian diawali dengan deteksi virus dan cendawan dari beberapa jenis sumber benih bawang merah. Deteksi virus dilakukan dengan metode DIBA (Dot immunobinding assay) menggunakan antibodi OYDV, SLV, SYSV, dan GCLV. Deteksi dan identifikasi cendawan dilakukan berdasarkan karakter morfologi (metode blotter test) dan molekuler (polymerase chain reaction/PCR). Jumlah sampel yang digunakan yaitu 50 sampel/kultivar untuk umbi bibit, dan 400 benih/kultivar untuk TSS. Hasil pengujian kesehatan benih untuk virus pada empat kultivar TSS menujukkan hasil negatif. Hasil negatif pada pengujian ini mengindikasikan bahwa bahan tanam yang berasal dari TSS bebas dari infestasi virus. Sebaliknya, deteksi virus pada umbi bibit bawang merah menunjukkan bahwa keempat varietas yang diuji positif terinfeksi OYDV, GCLV, SYSV, dan SLV dengan persentase infeksi berkisar antara 66% - 100%. Empat jenis cendawan yang terdeteksi pada TSS dan umbi bibit, yaitu Aspergillus niger, A.flavus, F. solani, dan Rhizopus sp.; sedangkan F.oxysporum hanya ditemukan pada umbi bibit. F. oxysporum yang berhasil dikoleksi berjumlah 4 isolat dan keempat isolat menunjukkan sifat patogenik yang ditandai dengan adanya gejala nekrosis pada bagian basal plate umbi dengan persentase infeksi penyakit mencapai 55%. Sumber benih yang sama digunakan untuk percobaan lapangan untuk mengetahui insidensi penyakit di lapangan dan membandingkan pertumbuhan vegetatif dan produktivitas dari masing-masing bahan tanam. Percobaan lapangan disusun menggunakan rancangan acak kelompok,
Keyword: Allium cepa, busuk pangkal batang, dot immunobinding assay, Fusarium oxysporum, pengujian kesehatan benih

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: