Judul: Deteksi Dan Identifikasi Patogen Terbawa Benih Brassicaceae.
Abstrak: Penggunaan benih bermutu merupakan salah satu faktor penentu keberhasilan produksi pertanian karena mampu meningkatkan produksi dan mengurangi adanya permasalahan penyakit di lapangan. Masuknya benih ke suatu negara melalui kegiatan impor berpotensi menjadi sarana masuknya patogen baru, sehingga perlu dilakukan deteksi dan identifikasi terhadap benih tersebut. Penelitian ini bertujuan untuk mendeteksi dan mengidentifikasi patogen terbawa benih Brassicaceae (kubis-kubisan) dan menententukan patogenisitasnya. Pada penelitian ini contoh benih kubis bunga (Brassica oleracea var. italica) asal Amerika Serikat dan benih sawi hijau (B. rapa var. parachinensis), kubis cina (B. rapa f. annua), pakchoy putih (B. rapa subsp. chinensis) dan pakchoy (B. rapa subsp. chinensis) asal Malaysia diiuji menggunakan metode blotter test dengan sterilisasi permukaan maupun tanpa seterilisasi permukaan. Total infeksi cendawan pada benih tanpa sterilisasi permukaan yaitu Aspergillus hitam sebesar 2.4%, Curvularia 1.2%; Aspergillus hijau 1%; Phoma 0.4%; Chaetomium 0.2% dan juga ditemukan gejala bercak cokelat dan gejala bercak kebasahan dengan total kejadian masing-masing 7.8%; dan 5.6%. Pada benih tanpa sterilisasi permukaan infeksi cendawan secara berurutan yaitu Aspergillus hijau 2.8%; Aspergillus hitam 0.6%; Curvularia 0.4%; selain itu juga ditemukan gejala berupa bercak berwarna cokelat 10.2% dan bercak kebasahan 4.2% yang masing-masing disebabkan oleh bakteri. Bakteri yang berasosiasi pada daun yang bergejala bercak cokelat dan bercak kebasahan diisolasi dengan merendam daun tersebut di dalam air steril. Oose bakteri yang terdifusi pada air steril selanjutnya digores pada media untuk mendapatkan biakan murni bakteri. Sebanyak 23 isolat bakteri yang ditemukan selanjutnya diuji respons hipersensitif (HR) dan diperoleh hanya 5 isolat yaitu 3.3, 5.2, 9.1, 9.2, dan 11.1.P yang menginduksi HR yang berasal dari daun kecambah yang bergejala bercak cokelat. Kelima isolat bakteri ini selanjutnya digunakan untuk uji patogenisitas. Uji patogenisitas terhadap tiga belas isolat cendawan terbukti mampu menyebabkan infeksi antara 93.8-100% terhadap benih dan kecambah. Gejala infeksi berupa benih mati tidak berkecambah, benih berkecambah dan mengalami nekrosis dan benih berkecambah lalu mati. Hal ini menunjukkan bahwa cendawan tersebut berpotensi sebagai patogen terhadap benih maupun kecambah Brassicaceae. Hasil identifikasi terhadap cendawan isolat Aspergillus hijau, Aspergillus hitam, Curvularia, Phoma dan Chaetomium masing-masing adalah Aspergillus flavus, A. niger, Curvularia lunata, Phoma lingam dan Chaetomium globosum. Phoma lingam merupakan organisme pengganggu tumbuhan karantina A2 yang sebelumnya dilaporkan hanya tersebar di Jawa Timur. Cendawan ini memiliki miselium aerial, berwarna krem atau kuning kecokelatan dan berubah menjadi cokelat kehitaman dengan bertambahnya umur cendawan, ditemukan piknidia pada benih atau biakan, berwarna cokelat, memiliki satu atau beberapa leher papilla yang mengeluarkan eksudat konidia berwarna merah muda, konidia berbentuk lonjong dengan 2 guttule pada kedua kutubnya. Uji patogenisitas terhadap lima isolat bakteri terhadap kecambah Brassicaceae terbukti mampu menyebabkan luka kebasahan atau luka berwarna cokelat pada daun kecambah yang diinokulasi buatan, baik yang menggunakan metode stubbing ataupun clipping dengan persentase infeksi sebesar 96-100%. Bakteri menyebabkan gejala nekrosis, busuk lunak dan luka kebasahan pada produk pascapanen Brassicaceae dengan persentase infeksi 56-78%. Reisolasi dilakukan terhadap daun kecambah (kotiledon) yang bergejala pada pengujian patogenisitas terhadap kecambah dan diperoleh bakteri dengan karakter koloni dan respons hipersensitif yang sama dengan bakteri yang digunakan untuk inokulasi. Isolat bakteri hasil reisolasi tersebut dimurnikan, selanjutnya bersama dengan isolat bakteri hasil isolasi diidentifikasi secara fenotipik dan genotipik. Hasil
Keyword: Bacillus pumilus, metode blotter test, pengujian patogenisitas, f iPhoma lingamnsect

Judul: Metabolit Cendawan Endofit Untuk Mengendalikan Cendawan Patogen Terbawa Benih Cabai (Capsicum Annuum L.).
Abstrak: Cabai (Capsicum annuum L.) merupakan salah satu komoditas hortikultura penting di Indonesia karena memiliki nilai konsumsi yang tinggi. Infeksi cendawan patogen terbawa benih merupakan salah satu kendala yang menyebabkan rendahnya produksi cabai. Cendawan patogen terbawa benih cabai umumnya adalah Aspergillus flavus, A. niger, A. fumigatus, Alternaria alternata, F. oxysporum, dan F. solani. Cendawan cendawan tersebut menjadi sumber inokulum utama penyebab penyakit di lapangan. Salah satu pengendalian yang ramah lingkungan adalah dengan menggunakan cendawan endofit. Cendawan endofit telah diketahui menghasilkan metabolit yang dapat menghambat pertumbuhan cendawan patogen. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kemampuan metabolit cendawan endofit yang dapat menghambat pertumbuhan cendawan patogen terbawa benih cabai. Penelitian dilakukan di Laboratorium Balai Proteksi Tanaman Pangan dan Hortikultura Medan, Sumatera Utara dan Laboratorium Mikologi Tumbuhan Departemen Proteksi Tanaman, Fakultas Pertanian, Institut Pertanian Bogor. Metode penelitian yang digunakan dengan 5 tahapan, yaitu 1) isolasi cendawan endofit dari tanaman cabai, 2) isolasi cendawan patogen terbawa benih cabai, 3) seleksi cendawan endofit dengan uji patogenisitas, 4) uji in vitro metabolit dan 5) uji in vivo perlakuan perendaman benih pada metabolit cendawan endofit potensial. Hasil penelitian menunjukkan bahwa hasil isolasi cendawan endofit dari akar, batang, daun, dan benih tanaman cabai diperoleh 42 isolat cendawan endofit, dan 12 isolat non patogen diperoleh dari hasil patogenisitas. Hasil uji antagonis dari 12 isolat non patogen diperoleh 4 isolat mampu menghambat pertumbuhan 3 isolat cendawan patogen terbawa benih cabai. Hasil uji metabolit 4 isolat cendawan endofit potensial, 2 isolat diantaranya menunjukkan daya hambat yang tinggi terhadap pertumbuhan ketiga cendawan patogen pada konsentrasi 20%. Hasil analisis metabolit 2 isolat cendawan endofit tersebut yaitu CECL 40 dan CECL 38 menunjukkan metabolit mengandung senyawa bersifat antimikrobial. CECL 40 dan CECL 38 dapat mengendalikan patogen terbawa benih cabai setelah perlakuan perendaman benih dan penyimpanan selama 0, 1, 2, 3, 4 minggu. Adanya penurunan tingkat infeksi cendawan patogen terbawa benih cabai, pada benih direndam dengan metabolit bila dibandingkan dengan kontrol negatif. Daya hambat infeksi CECL 40 tertinggi terhadap Fusarium solani, Aspergillus niger dan Aspergillus fumigatus sebesar 87.5%, 80% dan 57.5% dan daya hambat infeksi CECL 38 tertinggi terhadap F. solani, A. niger dan A. fumigatus sebesar 87.5%, 70%, 55% secara berturut-turut. Hasil identifikasi isolat cendawan endofit CECL 40 adalah hifa steril dan CECL 38 adalah Paecilomyces sp. Pada penelitian ini telah dibuktikan bahwa benih cabai varietas lokal Berastagi, Medan Sumatera Utara terinfeksi cendawan patogen terbawa benih. iv Cendawan patogen tersebut adalah A. fumigatus, A. niger, F. solani, A. flavus, Penicillium sp., Curvularia sp. dengan tingkat infeksi yang berbeda. Aplikasi perendaman benih dengan metabolit cendawan endofit dapat menurunkan tingkat infeksi cendawan patogen terbawa benih, dan metabolit cendawan endofit telah diketahui pula menghasilkan senyawa bersifat antimikrobial
Keyword: antimikrobial, Aspergillus, Fusarium, Paecilomyces, uji patogenisitas

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: