Judul: Aplikasi teknik Near Infrared Reflectance dan jaringan saraf tiruan untuk penentuan mutu beras secara non destruktif
Abstrak: Beras merupakan bahan makanan pokok utama Indonesia. Beras merupakan komoditas yang mempunyai nilai strategis dalam stabilitas ekonomi, politik dan sosial sehingga masalah dan penanganan beras perlu mendapatkan prioritas. Pemutuan cita rasa beras di Indonesia masih dilakukan berdasarkan jenis dan aroma yang bersifat subjektif. Untuk itu perlu dibuat metode pengukuran bersifat kuantitatif yang cepat, sederhana dan non destruktif. Pada penelitian ini dibuat pengukuran non destruktif menggunakan teknologi pantulan infra merah dekat (near infrared reflectance) dan jaringan saraf tiruan untuk menentukan kandungan beras. Dari kandungan beras ini akan didapatkan mutu beras. Kandungan beras yang diukur adalah kadar amilosa, karbohidrat, protein, lemak, kadar abu dan kadar air. Pantulan infra merah dekat merupakan salah satu metode analitik yang sangat berkembang karena kecepatannya tinggi, teliti, sederhana dan non destruktif. Pantulan infra merah dekat ini dianalisis dengan mengunakan jaringan saraf tiruan. Jaringan saraf tiruan sebagai metode analisis memiliki kelebihan yaitu dapat memetakan fungsi non linier dan hanya memerlukan data input output tanpa mengetahui dengan jelas prosesnya. Oleh karena itu cocok digunakan untuk menganalisis data pantulan infra merah dekat. Jaringan saraf tiruan digunakan untuk menentukan kandungan beras yaitu kadar air, kadar abu, protein, lemak, karbohidrat dan amilosa. Jaringan saraf tiruan ini dirancang dalam dua model. Jaringan saraf tiruan model pertama hanya menggunakan satu output pada lapisan output untuk masing-masing kandungan beras yang akan diukur. Dengan demikian, pada model pertama diperlukan enam jaringan saraf tiruan. Jaringan saraf tiruan model kedua digunakan untuk menentukan semua kandungan beras yang akan diukur. ...
Keyword: 

Judul: Penentuan komposisi kimia jagung secara nondestruktif dengan metode near infrared reflectance (NIR) dan jaringan saraf tiruan
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mengkaji penerapan teknologi Near Infrared Reflectance (NIR) dan Jaringan Saraf Tiruan (JST) untuk menentukan kadar proksimat dan asam amino jagung. Pada penelitian ini spektrum NIR yang digunakan adalah panjang gelombang 900 – 2000 nm dengan interval 5 nm. Hasil pengukuran adalah data reflektan dari 50 sampel jagung masing-masing 220 titik pengukuran. Data reflektan ini selanjutnya ditransformasi menjadi nilai absorban dengan Log (1/R). Analisis komponen utama digunakan untuk mengekstrak seluruh data absorban dan reflektan menjadi beberapa komponen utama (PC) yang bersifat tidak menghilangkan variasi data asal dan tidak saling berkorelasi. Jaringan saraf tiruan (JST) digunakan untuk kalibrasi penentuan kadar proksimat dan asam amino jagung dengan spektrum NIR. Struktur JST yang dikembangkan terdiri atas tiga lapisan (lapisan input, lapisan terselubung dan lapisan output). Sebagai input digunakan 5, 10 dan 15 komponen utama dari data absorban dan data reflektan dikombinasikan dengan 4, 6, 8, 10 dan 12 noda lapisan terselubung. Output dari JST ini adalah pendugaan komposisi kimia jagung secara simultan dan terpisah. Metode pelatihan JST yang digunakan adalah backpropagation dengan laju pelatihan dan momentum adalah 0.4 dan 0.8 menggunakan fungsi transfer sigmoid. Pada pelatihan JST digunakan 35 sampel dan 15 sampel lainnya digunakan untuk validasi. Untuk mengevaluasi kinerja JST digunakan parameter Standar error validasi (SEv) dan koefisien keragaman (CV) dari hasil pendugaan secara simultan dan terpisah. Hasil pendugaan JST terbaik untuk proksimat diperoleh dengan menggunakan model output komposisi kimia secara terpisah. Protein dapat diduga dengan baik menggunakan input data absorban 10 PC dan 6 noda lapisan terselubung (CV= 0.118%, SEv=0.001%), lemak menggunakan data absorban dengan 10 PC dan 4 noda lapisan terselubung (CV=0.054%, SEv=0.222%), kadar air dengan input data absorban 15 PC dan 6 noda lapisan terselubung (CV=0.047%, SEv=0.004%) dan karbohidrat menggunakan input input data reflektan 15 PC dan 6 noda lapisan terselubung (CV=0.002%, SEv=0.001%). Pendugaan asam amino terbaik JST juga diperoleh dengan output secara terpisah. Tyrosin dan threonin dengan menggunakan input data reflektan, CV dan SEv masing-masing adalah (2.101% dan 0.006%) dan (0.119% dan 0.0003%). Methionin, lysin, arginin dan leusin dengan menggunakan data absorban masing-masing CV dan SEv adalah (0.076% dan 0.0%), ( 0.597% dan 0.001%), (6.633% dan 0.036%) dan (0.340% dan 0.002%). Hasil penelitian ini dapat diterapkan pada industri yang bergerak dalam penentuan mutu jagung sebagai bahan pakan ternak dan pengujian mutu jagung secara rutin dalam skala besar karena hasil prediksi cukup tepat, hemat dalam hal waktu aplikasi dan tidak tergantung pada kapasitas laboratorium.
Keyword: 

Judul: Development of DNA Vaccine Encoding Glycoprotein of Koi Herpes Virus Using Local Isolate.
Abstrak: The aim of this research was to develop DNA vaccine of Koi Herpesvirus in carp. Glycoprotein gene originated from ORF 25 KHV virus that is 1.8 kbp in size, is a potential gene in DNA vaccine construction. The sequencing and similarity analysis of the gene using BLAST software showed that this gene is a GP25 gene and was found to be very similar (99%) to GP25 of KHV virus from the USA and Israel. When this GP25 gene was ligated with pGEMT Easy (pT, 3 kbp in size) vector, plasmid size was increasing up to 5 kb. Following this, a digestion of pT-GP25 plasmid using Sal I enzyme was applied resulted in a GP25 fragment (1.8 kbp). Subsequently, pAct-D6 with a size of 8.5 kbp was also cut using the same enzyme to eleminate a D6 gene with a size of 1.6 kbp. GP25 gene was then ligated with pAct resulted a pAct-GP25 plasmid with a size of 8.8 kbp. As there was only one restriction site applied, ligation can be occurred in two different directions. Thus, in order to determine the plasmid with the desired direction PCR analysis was carried out, and plasmid with the right direction was the one that sized approximately 2.1 kbp (no. 6, 17 and 20). High level of GFP gene expression was detected in all tissues analyzed, i.e. kidney, gil, spleen, and muscle 24 hours after injection which indicated that β-actin promoter of Japanese medaka could be active in common carp. Although not as high as on 24 hours, expression was still detected until day 7 and disappeared after day 28 post injection indicating that pAct-GFP can be remained and β-actin promoter of Japanese medaka can be active in muscle, gills and kidney at least a week after injection. The result of RT-PCR analysis on pAct-GP25 injected common carp showed that GP25 gene expression can be detected 14 days after injection in all tissues observed. The expression level differences between GFP and GP25 genes possibly related to the primer sensitivity on annealing process to cDNA template and the size of PCR targeted DNA fragment, as smaller PCR targeted product will be easier to be amplified than a bigger one. The length of PCR targeted DNA with GP25 primer was 1.8 kbp whereas GFP gene was 0.6 kbp.The challenge test on common carp results showed that all unvaccinated and negative control (not infected with KHV) was alive until the end of the experiment. Whereas, the survival of fish vaccinated with a dose of 12.5 was ranged from 60.9 and 96.7%. In relation to the activity of β-actin promoter that was used in this DNA vaccine, gene expression was occured 24 hours after vaccination and remained until 2 weeks. The control fish that was not injected by GP25 showed no GP25 expression either in the observed tissues or organs and resulted in a lower survival, i.e. 23.3%. The challenge test results has indicated that the fish vaccinated with GP25 at doses of 7.5 and 12.5 μg/100μL were able to produce KHV glycoprotein in their body which would be
Keyword: