Judul: Biosistematika Belimbing Merah di Kalimantan dan Pulau Natuna
Abstrak: Belimbing merah termasuk ke dalam anggota Phyllantaceae yang sangat potensial untuk dikembangkan sebagai sumber makanan dan bahan obat. Namun, informasi dasar yang terkait belimbing merah belum tersedia. Literatur yang ada hanya menguraikan manfaat dan kegunaan belimbing merah sebagai bahan obat. Penelitian ini bertujuan untuk menyediakan informasi belimbing merah yang lengkap meliputi informasi morfologi, taksonomi, keragaman genetik, filogenetik, autekologi dan memprediksi lokasi yang sesuai untuk budidaya dan konservasi belimbing merah di Kalimantan dan Pulau Natuna. Penelitian ini terdiri atas 5 bagian yaitu pengamatan variasi belimbing merah menggunakan penanda morfologi dan molekuler, analisis filogenetik menggunakan sekuen trnL-F intergenic spacer dari DNA kloroplas, profil senyawa metabolit buah belimbing merah yang diambil dari beberapa lokasi dan korelasinya dengan morfologi buah, serta pola dan peta distribusi tumbuhan belimbing merah. Selain itu, juga dijelaskan peta model kesesuaian habitat untuk menentukan lokasi yang sesuai dengan habitat alami belimbing merah yang berguna untuk budidaya dan konservasi. Belimbing merah yang ditemukan di lokasi penelitian mempunyai variasi morfologi organ vegetatif dan generatif yaitu ukuran daun, tangkai daun berambut jarang, warna ibu tangkai bunga betina merah, bentuk kepala putik mementol, warna putik merah, tidak ada daun pelindung bunga, panjang tangkai putik 3-4 mm, bentuk buah membulat pada irisan melintang dengan ujung meruncing, dan bentuk biji melonjong. Analisis fenetik menggunakan 20 ciri morfologi organ vegetatif dan generatif membagi belimbing merah menjadi 3 kelompok dengan nilai indeks keserupaan 0.53. Aksesi yang memiliki variasi morfologi organ vegetatif dan generatif tersebut membentuk kelompok tersendiri dan memisah dari belimbing merah (B. angulataMerr.). Aksesi tersebut ditandai dengan nama takson Baccaurea bentuk buah membulat pada irisan melintang. Keragaman genetik belimbing merah (B. angulata) di Kalimantan dan Pulau Natuna memiliki nilai keragaman (H) dan indeks informasi Shannon (I) berturut turut adalah 0.26 dan 0.16, keragaman genetik tersebut tergolong rendah. Namun beberapa populasi memiliki keragaman genetik yang tinggi yaitu populasi Ngabang dan Entikong. Variasi genetik di dalam populasi lebih besar (63 %) dibandingkan dengan variasi antar populasi (37 %) belimbing merah (B. angulata). Pengelompokan dengan metode UPGMA membagi 63 aksesi belimbing merah menjadi 3 kelompok dengan nilai indeks keserupaan 0.63. Informasi keragaman genetik tersebut dapat digunakan untuk program pemuliaan dan menejemen konservasi belimbing merah, dengan model konservasi yang diusulkan adalah insitu dan exsitu. Analisis fenetik belimbing merah (B. angulata Merr.) dan takson Baccaurea bentuk buah membulat pada irisan melintang menggunakan data molekuler juga memisahkan takson Baccaurea bentuk buah membulat pada irisan melintang menjadi kelompok tersendiri. Analisis struktur populasi menggunakan data molekuler yang diolah dengan program STRUCTURE juga menghasilkan pola pengelompokkan yang sama. Analisis filogenetik terhadap 15 jenis Baccaurea menggunakan sekuen trnL-F IGS dari DNA kloroplas mampu memisahkan B. angulata, B. dulcis, dan B. lanceolata pada klada yang berbeda. Penggunan ciri morfologi pada penelitian sebelumnya menunjukkan bahwa ketiga taksa tersebut bersifat politomi. Hasil analisis filogenetik juga menunjukkan bahwa belimbing merah (B.angulata) yang berasal dari Kalimantan dan Pulau Natuna adalah jenis yang sama, dengan nilai persamaa basa nukleotida mencapai 96.9 %. Kladogram yang dihasilkan menunjukkan bahwa takson Baccaurea bentuk buah membulat pada irisan melintang berada pada klada yang memisah cukup jauh dengan belimbing merah (B. angulataMerr.), dengan nilai perbedaan basa nukleotida sebesar 21.4 %.
Keyword: keragaman genetik, MaxEnt, metabolomik, morfologi, struktur populasi, trnL-F intergenic spacer (IGS)

Judul: Keragaman Genetik Berbasis RAPD, Uji Proksimat, dan Interaksi Genotipe x Lingkungan beberapa Genotipe Kacang Merah Asal Timor Leste
Abstrak: Kacang merah (Phaseolus vulgaris L.) termasuk famili Leguminoseae dan merupakan komoditas pangan yang dapat meningkatkan pendapatan ekonomi keluarga di beberapa negara berkembang, salah satunya Timor Leste. Biji kacang merah mengandung nutrisi yang tinggi, mencegah berbagai penyakit dan menyuburkan tanah. Kacang merah banyak dibudidayakan oleh masyarakat Timor Leste di daerah dataran tinggi dengan karakter batang pendek, tegak, merambat, dengan potensi hasil rendah. Sampai saat ini belum banyak varietas nasional kacang merah sehingga petani masih menanam kultivar lokal adaftif yang genotipenya masih bercampur sehingga hasil panen masih rendah. Eksplorasi dan evaluasi genotipe-genotipe kacang merah belum dilakukan. Upaya untuk mendapatkan genotipe lokal unggul dengan daya hasil tinggi melalui kegiatan pemuliaan tanaman. Penelitian ini bertujuan (i) mendeskripsikan karakter morfologi, agronomi dan molekuler genotipe-genotipe kacang merah asal Timor Leste; (ii) menduga pengaruh interaksi genotipe dan lingkungan pada genotipegenotipe kacang merah asal Timor Leste; (iii) menduga keeratan hubungan antar karakter agronomi genotipe-genotipe kacang merah asal Timor Leste. Penelitian analisis molekuler dilaksanakan di laboratorium Biologi Molekuler Departamen AGH-Faperta IPB pada bulan November-Januari 2019. Analisis kandungan nutris kacang merah dilaksanakan pada November 2018 dilaboratorium PT. Saraswanti Indo Genetech (SIG) Yasmin Bogor. Percobaan keragaan dan interaksi lingkungan dilaksanakan pada dua lokasi yaitu kebun percobaan Balai Penelitian Tanaman Hias Cipanas Kabupaten Cianjur ,dengan ketinggian tempat 1100 m dpl dan Kampung Sukaresmi, Desa Cipayung, Kecamatan Megamendung, Kabupaten Bogor, dengan ketinggian tempat ± 610 m dpl. Penelitian dilaksanakan pada bulan Juni 2018-Mei 2019. Data yang diperoleh dianalisis menggunakan aplikasi SAS. Penanda marka molekuler RAPD yang dianalisis menggunakan software Ntsyspc (Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System) terhadap genotipe asal Timor Leste dan kontrol kacang merah dapat dipisahkan menjadi 3 gerombol besar. Gerombol 1 terdiri dari IND-M dan IND-T, gerombol 2 terdiri dari TL-LUN, TL-KF1, TL-RW, TL-YELLOW, TL-MAC28, TL-R10, TL-RW, TL-TB, gerombol 3 terdiri dari TL-LB, TL-UMABANO, TL-DCL, TL-R03, TLLM, TL-LL. Analisis proksimat menghasilkan informasi kandungan nutrisi biji kacang merah yang terdiri dari kandungan karbohidrat tertinggi pada genotipe TL-R03, TL-RW, TL-Umabano, TL-LUN, dan terendah di genotipe TL-LB, protein tertinggi terdapat pada empat genotipe yaitu TL-LB, TL-Dcl, TL-KF2, TL-KF1 dan terendah pada TL-R10. Terdapat keragaman pada karakter diantara genotipe-genotipe kacang merah hasil analisis gabungan. Karakter umur berbunga, umur panen, tinggi tanaman, diameter batang, jumlah daun, jumlah cabang, bobot brangkasan, jumlah polong, bobot polong, jumlah biji, bobot 100 biji, bobot biji per plot dan bobot biji per tanaman kecuali pada karakter panjang daun dan lebar daun yang tidak berpengaruh oleh interaksi genotipe dan lingkungan. Jumlah polong, bobot polong dan bobot biji kering perpetak memiliki nilai koefisien korelasi yang nyata dan positif. Bobot polong per tanaman memberikan pengaruh langsung dan tidak langsung yang tertinggi pada bobot biji per tanaman.
Keyword: interaksi genotipe x lingkungan, keragaan, korelasi, nutrisi, RAPD

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: