Judul: Melacak Kekerabatan Brucella melitensis yang Diisolasi dari Rumah Potong Hewan Ruminansia Kecil di Kabupaten Bogor.
Abstrak: Brusellosis merupakan penyakit zoonotik yang telah menyebar ke seluruh dunia dan memiliki dampak penting baik untuk kesehatan manusia maupun hewan. Empat spesies dari Brucella yang menyebabkan penyakit pada manusia dan hewan adalah Brucella abortus, B. suis, B. melitensis dan B. canis dengan B. melitensis sebagai spesies yang paling patogen. Penyakit ini dapat menyebabkan kerugian keuangan pada peternakan karena keguguran janin (abortus) dan gangguan kesuburan pada ternak betina dan sumber penularan jika ternak jantan sudah terinfeksi. Penelitian ini menggunakan 46 contoh pemeriksaan dari Rumah Potong Hewan ruminansia kecil Pemerintah Kabupaten Bogor di daerah Citaringgul Sentul. Tiga puluh dua contoh limpa telah diperiksa sebelumnya dan telah menunjukkan hasil positif ketika diuji dengan teknik CFT dan PCR, namun belum dilakukan sekuensing. Empat belas contoh serum dan limpa diperiksa dengan teknik yang sama. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan hubungan genetik Brucella sp. menggunakan teknik PCR dengan primer pendek khusus untuk B. melitensis, yaitu primer Mar dan primer EFQ1. Teknik pengklonaan telah diterapkan sebelumnya pada lima contoh yang positif PCR dengan primer Mar yang dilanjutkan dengan sekuensing. Pohon filogenik semua Contoh PCR menggunakan primer Mar memberikan hasil homologi yang lebih dekat terhadap B. abortus galur 33295 dengan No. Aksesi CP023214.1. yang berasal dari Contoh Kerbau dari Italia. Contoh Nomor 97 pada penelitian sebelumnya tidak memiliki perbedaan nukleotida dengan Contoh Nomor 13 pada Contoh tambahan. Hasil pemeriksaan PCR menggunakan primer EFQ1 diperoleh negatif B. melitensis. Perbedaan hasil PCR pada contoh uji sebelumnya disebabkan oleh perbedaan master mixperangkat uji master mix dan primer yang digunakan. Perbedaan master mix yang digunakan dapat menyebabkan perbedaan kepekaan yang didapatkan dari hasil pengujian. Penggunaan primer yang berbeda juga dapat menyebabkan perbedaan hasil karena setiap primer dapat menguatkan sekuen yang berbeda..
Keyword: Brucella melitensis, kekerabatan, pengklonaan, primer pendek, sekuensing

Judul: Deteksi Brucellosis Pada Babi Secara Serologis dan Molekuler di Rumah Potong Hewan Kapuk Jakarta dan Ciroyom Bandung.
Abstrak: Brucellosis pada babi merupakan penyakit zoonosis yang disebabkan oleh bakteri Brucella suis. Penyakit ini menjadi masalah dibanyak negara di dunia, baik karena dampak kerugian ekonomi maupun dampak kesehatan veteriner. Data mengenai brucellosis pada babi di Indonesia belum banyak dilaporkan namun beberapa penelitian secara serologis pada babi telah dilakukan dan menunjukkan angka reaktor brucellosis yang cukup tinggi. Pengujian brucellosis secara serologis yang umum digunakan adalah uji aglutinasi diantaranya uji Rose Bengal Test (RBT), metode uji ini memiliki sensitifitas yang cukup tinggi namun spesifisitas yang rendah. Masalah utama dari pengujian ini adalah reaksi silang antara spesies Brucella dan bakteri Gram-negatif lainnya diantaranya Yersinia enterocolitica O:9 yang menunjukkan hasil positif palsu. Pengujian lanjut dengan metode uji yang lebih spesifik diperlukan untuk mengukuhkan diagnosa, diantaranya dengan Complement fixation test (CFT). Pengujian diagnostik molekuler dengan menggunakan Polymerase Chain Reaction (PCR) merupakan salah satu teknik pengujian yang digunakan dalam diagnosis brucellosis. Selain waktu pengujian yang cepat, pengujian dengan PCR juga lebih spesifik. Uji molekuler AMOS-PCR dilakukan untuk mengetahui spesies Brucella abortus, Brucella melintensis Brucella ovis,dan Brucella suis berdasarkan berdasarkan lokasi elemen genetik IS711 yang unik untuk tiap spesies Brucella. Pada penelitian ini dilakukan deteksi brucellosis pada babi di Rumah Potong Hewan Kapuk Jakarta dan Ciroyom Bandung. Pengujian dilakukan secara serologis menggunakan metode RBT dan CFT serta secara molekuler AMOS-PCR untuk mengetahui spesies Brucella yang menginfeksi babi. Sampel penelitian berupa serum, limfonodus dan limpa dikoleksi dari dua RPH tersebut. Hasil pengujian secara serologis menunjukkan bahwa tidak terdeteksi brucellosis pada sampel babi dari Rumah Potong Hewan Kapuk-Jakarta. Sementara hasil pengujian secara serologis dari Rumah Potong Hewan Ciroyom-Bandung menunjukkan 2.5% (1/40) positif dan 7.5% (3/40) positif PCR. Hasil PCR positif menunjukkan terdeteksi dua species Brucella (B. abortus dan B. suis) pada dua sampel organ limfonodus dan Brucella suis pada satu sampel limfonodus, sedangkan dari organ limpa terdektesi dua sampel positif Brucella suis. Hal ini menunjukkan bahwa selain Brucella suis, Brucella abortus juga menginfeksi babi pada penelitian ini.
Keyword: Brucella suis, RBT, CFT, PCR

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: