Judul: Dinamika Perairan di Selatan Jawa Timur - Bali pada Musim Timur 1990
Abstrak: Lautan masih tetap merupakan suatu tempat mata pencaharian bagi sebagian besar bangsa di Asia Tenggara. Namun penelitian mengenai laut itu sendiri sampai saat ini rnasih sangat sedikit sekali. Dernikian pula halnya dengan Indonesia, yang mempakan negara kepulauan, memiliki wilayah laut seluas 5.8 juta krn2 (terrnasuk Zona Ekonorni Eksklusif seluas 3.7 juta kmz) memiliki 17.508 buah pulau besar dan kecil dan mempunyai garis pantai sepanjang kurang lebih 81.290 km, pemanfaatan dan pengelolaan sumberdaya lautnya belum dilakukan secara optimal. Salah satu penyebab dari kondisi ini diperkirakan akibat minimnya pengetahuan mengenai sifat-sifat laut itu serta potensi yang terkandung di dalamnya. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menganalisa mengapa intensitas upwelling yang terjadi di perairan Selatan Jawa Timur Bali pada tahun 1990 lebih besar dibandingkan dengan lokasi lain di perairan selatan Jawa - Bali serta mengkaji apakah ada pengaruh pasokan massa air dari Selat Lombok terhadap intensitas upwelling yang tinggi yang terjadi di perairan selatan Jawa Timur - Bali.
Keyword: 

Judul: Analisis Spasial Kualitas Perairan Bagian Selatan Selat Bali
Abstrak: Selat Bali merupakan salah satu selat yang memiliki fungsi dan peranan yang sangat penting di bidang sosial maupun ekonomi. Selain sebagai penghubung antara Pulau Jawa dan Pulau Bali, Selat Bali yang merupakan bagian dari WPP 573 memiliki potensi perikanan tangkap pelagis yang tinggi khususnya perikanan lemuru. Analisis mengenai kualitas perairan terhadap parameter fisika-kimia perairan baik pada lapisan permukaan, kolom, maupun dasar menjadi sangat penting diketahui untuk memahami karakteristik massa air di suatu wilayah perairan. Dalam hal pengelolaan sumberdaya perikanan, sangatlah membutuhkan informasi tentang data yang menjelaskan kualitas perairan yang dapat menunjang dan menjadi salah satu dasar dalam rencana pengelolaan sumberdaya perikanan agar dapat berjalan secara optimum dan lestari. Kondisi kualitas perairan Selat Bali sangat dipengaruhi oleh fenomena upwelling yang biasanya terjadi pada musim timur. Penelitian dilakukan di perairan bagian selatan Selat Bali pada bulan Maret 2011 yang merupakan musim peralihan. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui dan membandingkan sebaran parameter fisika-kimia perairan secara horizontal maupun vertikal serta menentukan status mutu perairan. Stasiun pengamatan terdiri 9 titik yang melintang dari wilayah Grajagan, Jawa Timur sampai Jimbaran, Bali yang disesuaikan dengan rute pelayaran KR Baruna Jaya VIII. Stasiun 1 sampai 5 yang relatif dekat wilayah Jawa Timur memiliki kedalaman mencapai 590 meter, stasiun 6 sampai 8 yang berbatasan dengan Samudera Hindia memiliki kedalaman lebih dari 2.500 meter, sedangkan stasiun 9 yang relatif dekat dengan Pulau Bali memiliki kedalaman 46 meter. Pengambilan sampel air dilakukan pada tiga kedalaman berbeda tiap stasiunnya (lapisan permukaan, termoklin, dan dekat dasar perairan) dengan menggunakan Rossete Water Sampler yang terdiri dari 10 tabung Niskin dengan kapasitas 10 liter dan CTD yang dilengkapi dengan alat pHmeter, salinometer, dan DOmeter. Hasil analisis menunjukkan bahwa secara umum distribusi vertikal parameter fisika-kimia perairan terdapat perbedaan karakteristik massa air pada lapisan permukaan, termoklin, dan dasar perairan. Pada wilayah perairan yang termasuk laut dalam, perbedaan karakteristik fisika-kimia perairan pada lapisan dekat dasar sangat mencolok khususnya untuk parameter seperti suhu, salinitas, dan oksigen terlarut (DO). Penentuan status mutu perairan dengan menggunakan Indeks Storet diketahui bahwa pada lapisan permukaan, perairan bagian selatan Selat Bali termasuk kriteria perairan yang baik hingga sedang, pada lapisan termoklin termasuk kriteria perairan yang baik sekali (memenuhi baku mutu) hingga baik, pada lapisan dekat dasar tergolong pada kriteria perairan yang sedang hingga buruk. Berdasarkan Indeks Pencemaran, pada lapisan permukaan di perairan bagian selatan Selat Bali tergolong pada kriteria yang baik hingga tercemar ringan. Berdasarkan Indeks Pencemaran, secara umum wilayah perairan yang relatif jauh dari daratan memiliki kualitas perairan yang lebih baik jika dibandingkan dengan wilayah yang dekat daratan.
Keyword: 

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA