Judul: Pemodelan Klasifikasi Curah Hujan Bulanan di Kabupaten Indramayu dengan Metode Random Forest dan Rotation Forest.
Abstrak: Curah hujan merupakan salah satu unsur iklim yang sangat berperan penting dalam proses pertanian. Kelancaran proses pertanian bergantung pada tinggi dan rendahnya curah hujan serta dampak yang diberikan. Adanya pemodelan yang tepat dalam klasifikasi curah hujan diperlukan untuk memutuskan tindakan yang tepat dalam menghadapi dampak kondisi iklim di masa depan. Pada penelitian ini, pemodelan klasifikasi curah hujan dilakukan di Kabupaten Indramayu pada 3 ZOM, yaitu ZOM 77, 78, dan 79 dengan menerapkan metode random forest dan rotation forest. Klasifikasi ini menempatkan curah hujan ke dalam dua kelas, yaitu curah hujan ekstrem dan curah hujan normal. Pemodelan klasifikasi terbaik dihasilkan oleh metode rotation forest dengan nilai akurasi klasifikasi yang diperoleh pada ZOM 77, 78, dan 79 berturut-turut sebesar 68.74%, 68.92%, dan 67.43%, sedangkan dengan metode random forest berturut-turut sebesar 66.00%, 66.33%, dan 65.87%. Baik pemodelan klasifikasi dengan random forest maupun rotation forest mampu menghasilkan akurasi klasifikasi yang cukup konsisten walaupun nilai yang dihasilkan setiap menjalankan algoritmenya berbeda-beda. Namun, kedua metode tidak dapat mengatasi data tidak seimbang dalam penelitian ini yang ditunjukkan oleh nilai sensitivitas yang rendah dan nilai akurasi dan spesifisitas yang tinggi.
Keyword: curah hujan, klasifikasi, random forest, rotation forest

Judul: Pemodelan Klasifikasi Curah Hujan Kabupaten Indramayu Berdasarkan GPCP dengan Metode Pohon Klasifikasi dan Bagging
Abstrak: Prediksi sifat curah hujan sangat penting dilakukan karena dapat mengantisipasi dampak buruk yang dapat ditimbulkan jika terjadi curah hujan ekstrim. Penelitian ini dilakukan untuk memprediksi sifat curah hujan di Kabupaten Indramayu dengan tiga zona musim (ZOM), yaitu ZOM 77, ZOM 78, dan ZOM 79. Peubah penjelas yang digunakan untuk memprediksi sifat curah hujan tersebut adalah GPCP yang merupakan angka presipitasi bulanan pada suatu cakupan wilayah tertentu yang terdiri dari 49 peubah. Pada praktiknya, data sifat curah hujan dikategorikan menjadi dua kategori yaitu curah hujan ekstrim dan non ekstrim dengan perbandingannya sekitar 30% : 70%. Prediksi klasifikasi curah hujan dilakukan dengan menggunakan analisis pohon klasifikasi dan metode Bagging. Berdasarkan ketepatan klasifikasi yang dihasilkan, metode Bagging lebih baik dibandingkan metode pohon klasifikasi. Penerapan metode Bagging dapat meningkatkan akurasi sekitar 5% dari metode pohon klasifikasi serta nilai spesifisitas yang lebih tinggi, walaupun nilai sensitivitas yang dihasilkan metode Bagging lebih rendah. Selain itu, penelitian ini mengkaji kekonsitenan hasil prediksi dengan menerapkan kedua metode tersebut sebanyak 1000 kali. Berdasarkan hasil kajian ini, peubah GPCP cukup baik dalam memprediksi klasifikasi curah hujan di Kabupaten Indramayu karena akurasi yang dihasilkan ketika memprediksi amatan baru lebih dari 60%.
Keyword: bagging, bootstrap, CART, GPCP

Judul: Extracellular Expression of thermostable Geobacillus stearothermophilus T1.2RQ Lipase for Biodiesel Production
Abstrak: The extracellular expression of enzymes in an excellent secretion host such as Bacillus subtilis is a useful strategy for making enzymes of industrial significance more affordable by lowering the cost of its downstream processing. Lipases are a category of hydrolases that catalyze the hydrolysis of triglycerides to glycerol and free fatty acids. Also, lipases catalyze the hydrolysis and transesterification of other esters as well as the synthesis of esters. They can perform very specific biotransformation reactions and are widely used in food, organic synthesis, detergents, cosmetic, and pharmaceutical industries. Geobacillus stearothermophilus T1.2RQ lipase is an industrially-desired thermostable lipolytic enzyme with an excellent hydrolytic and transesterification activity. This study aimed to express T1.2RQ lipase, in B. subtilis WB800 and ensure its secretion into the extracellular medium. Three signal peptides (AmyQ, Epr, LipA) and two promoters (Pgrac01 and Pgrac100) were used in the secretory-expression of T1.2RQ lipase, based on five constructed expression vectors constructed by restriction cloning and PCR mutagenesis. Sangers sequencing was used to verify constructs to ensure they are in the correct reading frame. Recombinants vectors, pHT43 (plasmid control), pHT43-T1.2RQ, pHT43- T1.2RQ_AmyQ, pHT43-T1.2RQ_Epr, and pHT43-T1.2RQ_LipA, were transformed by electroporation into Bacillus subtilis WB800. The electroporation was successful with the optimum condition of 2500V, 200 ohms, 25µF, and 5milliseconds. Recombinant B. subtilis pHT43 (negative control) and pHT43-T1.2RQlip + signal peptides were streaked on the lipidic agar, LA+TBN. All four recombinants, including the negative control (B. subtilis WB800-pHT43), produced clear zones on the TBN agar plate after overnight incubation (fig 2), indicating the presence of a lipolytic enzyme in all of the recombinant B. subtilis cells. pHT43-T1.2RQlip + signal peptides (AmyQ, Epr, and LipA) have clear zones with significantly higher diameters than B. subtilis WB800-pHT43 (negative control). This phenomenon suggests that the recombinant thermostable lipase T1.2RQ introduced into these cells was successfully expressed, thereby increasing the lipolytic capability of its host cells T1.2RQ lipase was expressed in 50ml terrific broth medium (TB) and the expression induced with 1mM IPTG. Lipase activity assay using p-nitrophenyl esters showed that all three signal peptides directed the secretion of T1.2RQ lipase into the extracellular medium. Signal peptide, LipA, resulted in the highest extracellular activity of 5.6 U/mL, which corresponds to a 6-fold increase over the parent B. subtilis WB800 strain. Meanwhile, signal peptides, AmyQ and Epr produced 4.2 U/mL and 3.4 U/mL activity respectively. SDS-Zymogram analysis confirmed that T1.2RQ lipase was correctly processed and secreted in its original size of 44 kDa. An attempt to further increase lipase expression level by promoter optimization showed that, contrary to expectation, promoter Pgrac100 exhibited similar expression levels as the original Pgrac01. Nevertheless, the demonstration of the successful secretion of T1.2RQ lipase in this work confirms the latter as a promising approach for the industrial production of the enzyme
Keyword: Bacillus subtilis, Expression, Extracellular, Heterologous, Lipase, Thermostable