Judul: Proses Fisik Musiman Di Zona ROFI (Region of Freshwater Influence) Muara Sungai Cimandiri Teluk Pelabuhan Ratu.
Abstrak: Perairan pesisir memiliki berbagai fenomena oseanografi masih banyak yang belum terungkap. Salah satu fenomena tersebut adalah bagaimana pengaruh air tawar terhadap dinamika masa air di perairan pesisir. Penelitian ini bertujuan untuk mengkaji dinamika masa air dan menghitung anomali salinitas serta fraksi air tawar di sekitar muara Sungai Cimandiri, Teluk Pelabuhan Ratu, Jawa Barat. Lokasi yang paling dekat dengan mulut sungai mencerminkan fenomena yang sangat menarik karena adanya pengaruh air tawar dan air samudera diantaranya adalah ROFI. ROFI merupakan wilayah antara paparan laut dan muara di mana input lokal daya apung air tawar dari sumber pesisir sebanding dengan, atau melebihi masukan musiman daya apung sebagai heat yang terjadi di seluruh paparan laut. Parameter suhu, salinitas dan densitas diukur dengan menggunakan sensor CTD (conductivity, temperature, depth). Parameter fisik lainnya seperti batimetri, arus, pasang surut, kekeruhan dan kecerahan juga diukur. Pengukuran terhadap parameter fisik air laut tersebut dilakukan pada dua musim yang berbeda, yaitu bulan Januari (mewakili musim barat) dan bulan Agustus (mewakili musim timur) tahun 2016. Hasil analisis pola dan kecepatan arus pada musim barat yang terwakili pada bulan Januari didapatkan kecepatan rata-rata arus dari penjumlahan komponen u dan v adalah 0.21 m/s dengan kecepatan maksimum sebesar 0.42 m/s. Kecepatan arus cenderung menuju arah barat daya dan barat laut pada musim barat. Pada musim timur yang terwakili pada bulan Agustus kecepatan rata-rata arus dari penjumlahan komponen u dan v adalah 0.09 m/s dengan kecepatan maksimum sebesar 0.16 m/s cenderung bergerak menuju arah timur laut dan tenggara. Hasil pengukuran nilai kecerahan air pada musim barat berkisar antara 1.1 – 6.5 m dengan nilai rata-rata 2.2 m. Kecerahan air di pesisir muara Cimandiri berdasarkan hasil pengukuran pada musim timur memiliki sebaran kecerahan yang berkisar antara 0.3 – 5.3 m dengan rata-rata 2.0 m. Hasil pengukuran kekeruhan yang diukur dengan metode Nephelometric adalah NTU (Nephelometric Turbidity Unit) di perairan pesisir muara Cimandiri pada musim barat berkisar antara 0.6 – 23.5 NTU dengan rata-rata 7.7 NTU. Musim timur yang berkisar antara 0.7 – 10.5 NTU dengan rata-rata 3.8 NTU. Hasil analisis terhadap anomali salinitas menggambarkan bahwa masukan air tawar ke teluk tersebut mempengaruhi nilai salinitas pada dua musim. Nilai tertinggi terjadi pada musim barat dan terendah pada musim timur. Musim barat memiliki nilai anomali salinitas adalah berkisar dari 23.70 sampai -1.40 dan rata-ratanya adalah -2.50, sedangkan musim timur berkisar -9.97 sampai -0.88 dan rata-ratanya adalah -1.50. Hasil analisis fraksi air tawar memperlihatkan bahwa musim barat memiliki pengaruh yang lebih besar terhadap fraksi air dari pada musim timur dengan nilai berkisar dari 0.04 % - 0.70 % dengan jumlah 18.07 %, sementara musim timur mempunyai nilai 0.02 % - 0.28 % dengan jumlah adalah 7.30 %. iii Transpor volume air tawar pada musim barat adalah sebesar 1.429.244 m3s-1 sedangkan pada musim timur adalah sebesar 1.066 m3s-1. Stabilitas massa air di kolom perairan lokasi penelitian memiliki stabilitas statis dengan nilai rata-rata N2 sebesar 0.008 Cycl/S dan 0.7 x 103 Cycl/S berturut-turut untuk musim barat dan musim timur.
Keyword: Massa air, ROFI, Muara Sungai Cimandiri, Teluk Pelabuhan Ratu

Judul: Distribusi Sedimen di Sekitar Muara Sungai Cimandiri Teluk Palabuhanratu Sukabumi.
Abstrak: Muara Sungai Cimandiri yang terletak di kepala Teluk Palabuhanratu memberikan masukan sedimen yang cukup besar ke perairan teluk. Penelitian ini bertujuan mempelajari dinamika perairan dan pengaruhnya terhadap sebaran ukuran butir sedimen. Penelitian ini juga memetakan sebaran sedimen di sepanjang pesisir muara Sungai Cimandiri. Sedimen dianalisis dengan fraksinasi dan metode pipet. Data pasang surut, curah hujan, dan debit sungai dianalisis secara time series sedangkan gelombang menggunakan MIKE 21 Spectral Wave FM. Titik pengambilan sampel dilakukan di sepanjang pesisir utara Muara Sungai Cimandiri hingga ke bagian selatan. Pada Musim Barat curah hujan dapat mencapai 726 mm dengan debit sungai sebesar 668.82 m3/s dan menghasilkan masukan sedimen sebesar 189.6 kg/s selanjutnya kecepatan arus di Musim Barat sebesar 11.6-21.7 cm/s dengan tinggi gelombang mencapai 1.05 m, sedangkan pada Musim Timur arus mampu mencapai 13.0-16.1 cm/s, tinggi gelombang 0.9 m, curah hujan 129 mm, dan debit sungai sebesar 376.87 m3/s sehingga masukan sedimen ke perairan hanya 10.62 kg/s. Sedimen yang berada di wilayah penelitian menunjukkan fraksi butir sangat halus, fraksi sedimen pada bagian utara sedikit kasar dibandingkan bagian selatan. Pengaruh jetty menghalangi sebaran sedimen ke utara sedangkan pengaruh penambangan pasir membuat ukuran sedimen di muara sungai lebih halus karena fraksi sedimen kasar diambil untuk penambangan pasir.
Keyword: fraksinasi, sedimen, metode pipet, muara Sungai Cimandiri

Judul: Penyusunan Overlap Graph menggunakan Suffix Tree pada DNA Sequence
Abstrak: The DNA sequence assembly is very important in genome analysis. This step aims to reconstruct contigous DNA fragment (contigs) from short fragment by concatenating fragments based on the overlap region among them. This method employs overlap graph for solving the problems. In this graph, nodes represent fragments and edges represent overlap. This research developed a software for constructing overlap graph using suffix tree. The evaluation was conducted by measuring the number of nodes, number of edges, and the execution time in many values of minimum overlap. The minimum overlap is defined as the minimum length of substring which is considered as the overlap region between two fragments. The evaluation results showed that the number of nodes, the number of edges, and the execution time were increased with the decreasing of the minimum overlap value.
Keyword: