Judul: Korelasi antara keragaman penotipik dengan marka isozim pada tanaman sengon (Paraserianthea falcataria) di Kebun Benih Parung Panjang, Bogor
Abstrak: Dewasa ini kegiatan pembangunan hutan tanaman sangat pesat. Selain ditujukan untuk memperbaiki lahan-lahan marjinal, juga untuk keperluan Hutan Tanaman Industri (HTI). Jenis-jenis yang diprioritaskan untuk pembangunan HTI salah satunya adalah sengon (P. falcataria). Untuk pembangunan HTI diperlukan benih dalam jumlah besar dan berkualitas tinggi. Salah satu program tersebut adalah pembangunan kebun benih semai uji keturunan untuk jenis sengon yang dilakukan oleh BTP Balitbang Kehutanan di Parung Panjang, Bogor. Mengingat sulit dan lamanya dalam program pemuliaan dan analisis genetik untuk karakter kuantitatif tanaman kehutanan, diperlukan usaha untuk mempercepat proses tersebut. Sehingga tidak perlu menunggu sampai tanaman tersebut besar, dapat diketahui tanaman tersebut berkualitas baik. Saat ini teknik-teknik yang telah dikembangkan untuk tujuan tersebut adalah identifikasi isoenzim (isozim) dan aplikasi teknologi marka molekuler seperti RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA), RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism), mikro satelit, dan sebagainya. Metoda isozim relatif cepat, murah, dan sederhana, serta dapat mendeteksi enzim yang diekspresikan oleh gen pada alel resesif penentu karakter spesifik yang umumnya sering tertutup oleh penampilan visual. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keragaman genetik ketiga sub populasi (Jonggol, Wamena, dan Kediri), mengetahui jarak genetik antar sub populasi tersebut, dan untuk mengetahui korelasi antara keragaman fenotipik dengan marka isozim, pada tanaman sengon (P. falcataria) di kebun Benih Parung Panjang, Bogor, Penelitian ini terdiri dari dua percobaan yakni di lapangan kebun benih Parung Panjang, Bogor pada tanggal 20 Mei dan 25 Mei 1997 dan di laboratorium Genetika Molekuler Puslitbang Bioteknologi-LIPI, Cibinong, yang dilakukan pada tanggal 19 Mei-10 Juni 1997. Bahan tanaman berupa sampel daun muda sengon yang diambil dari beberapa individu dari satu populasi sengon umur satu tahun di petak 31 dan 32. Dari satu populasi sengon yang terdiri dari 3 sumber benih/provenans (sub populasi) yakni Jonggol, Wamena, dan Kediri yang diambil masing-masing sub populasi 30 sampel berfenotip baik dan 30 sampel berfenotip jelek. Metoda penelitian secara garis besar terdiri dari ekstraksi enzim (± 0,3 gram daun sengon ditambah bufer pengekstrak W (0,6 ml)), pembuatan gel pati kentang 11%, penempatan sampel, elektroforesis dengan menggunakan bufer gel histidine (H), pewarnaan isozim dan fiksasi, dan observasi gel. Untuk analisis data dilakukan dengan bantuan program Biosys-1. Hasil penelitian ini secara umum (tanpa dipisah) menunjukkan bahwa dari 7 lokus yang diamati, 3 lokus diantaranya (AAT-2, EST-4, dan SDH-1) bersifat polimorfik di ketiga sub populasi. Pada pertumbuhan yang digolongkan baik lokus...
Keyword: 

Judul: Genetic Diversity of Sengon Population (Paraserianthes falcataria (L.) Nielsen) in Community Forest in Java based on RAPD Marker
Abstrak: Paraserianthes falcataria (L) Nielsen yang dikenal dengan nama lokal sengon banyak ditanam pada hutan rakyat di Jawa, karena tergolong pohon yang cepat tumbuh dan multiguna, baik dari daun, batang, dan sistem perakaran. Kebanyakan sengon ditanam secara monokultur sehingga pertanaman ini mempunyai masalah yaitu, mudah terserang hama dan penyakit seperti hama penggerek batang Xystrocera festiva, damping off, dan karat puru. Untuk itu diperlukan sengon unggul yang tahan hama dan penyakit, yang dihasilkan dari program pemuliaan. Untuk melaksanakan program pemuliaan, maka diperlukan keragaman genetik yang tinggi. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui keragaman genetik di antara populasi tanaman sengon pada beberapa hutan rakyat di Jawa. Sampel tanaman sengon diambil dari 9 populasi yaitu, Cianjur, Sukabumi, Garut, Kuningan, Subang, Tasikmalaya dari Jawa Barat, Wonosobo dari Jawa Tengah, Kediri dan Lumajang dari Jawa Timur, dengan jumlah 25 sampel perpopulasi. DNA Sengon diekstraksi dengan menggunakan metode CTAB dan GenElute Plant Genomic DNA miniprep Kit dari SIGMA. Pada proses PCR, DNA tersebut diamplifikasi menggunakan primer OPA-2, OPA-3, OPB-10, OPY-5, dan OPU-5. Analisis data dilakukan dengan program POPGENE, NTSYS, dan GenAlex. Parameter yang diukur adalah heterozigositas harapan (He), Presentase Lokus Polimorfik (PLP), jumlah alel yang diamati (na), jumlah alel efektif (ne), dan jarak genetik. Nilai dugaan heterozigositas harapan (He) seluruh populasi adalah 0,2349, menunjukkan bahwa populasi sengon di Jawa memiliki keragaman genetik yang tinggi. Sebagian besar variasi genetik tersimpan di dalam populasi yaitu sebesar 82%, sedangkan perbedaan antar populasi hanya sebesar 18%. Populasi Garut dan Kediri memiliki jarak genetik terjauh (0,0857) sementara jarak genetik terdekat (0,0123) terdapat pada populasi Tasikmalaya dan Lumajang. Dendrogram jarak genetik menunjukkan bahwa pola penyebaran sengon di Jawa terjadi secara acak, karena populasi yang terdapat pada satu daerah yang sama (Jawa Barat) ternyata memiliki jarak yang dekat dengan provinsi lain.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: