Judul: Analisis Bioinformatika untuk Mencari Spesies Bakteri yang Memiliki Kesamaan Sekuen Gen 16S rRNA dengan Bacillus aquimaris galur SH6 dari Basis Data GenBank.
Abstrak: Bacillus aquimaris galur SH6 merupakan salah satu bakteri penghasil endospora yang dapat menghasilkan karotenoid berpigmen jingga. Analisis bioinformatika dilakukan sebagai langkah awal untuk mencari spesies yang memiliki tingkat kesamaan sekuen gen 16S rRNA yang tinggi dengan B.aquimaris galur SH6. Penelitian ini bertujuan mendapatkan dan menganalisis spesies yang memiliki kesamaan gen 16S rRNA yang tinggi dengan B. aquimaris galur SH6 secara bioinformatika. Sekuen gen 16S rRNA B. aquimaris galur SH6 didapatkan dari basis data GenBank. Sekuen tersebut dimasukkan ke dalam aplikasi nucleotide BLAST dari NCBI untuk melihat homologi dengan spesies terdekat. Sebanyak 12 sekuen hasil BLAST diambil. Perbedaan genom sekuen dihitung menggunakan aplikasi Genome-to-Genome Distance Calculator (GGDC) DSMZ. Hasil perhitungan diubah menjadi data berbentuk tabel. Setiap sekuen dibandingkan dengan teknik Frequency of Chaos Game Representation (FCGR) pada laman BIOPHP FCGR. Selain itu, kandungan GC setiap sekuen juga ditentukan menggunakan alat GC plotting pada laman ENDMEMO. Semua sekuen dilakukan pensejajaran dan analisis filogenetik dengan program MEGA X. Berdasarkan data hasil analisis sekuen 16S rRNA dengan GGDC, FCGR, GC Content Plotting, dan kontruksi pohon filogenetik, didapatkan beberapa sekuen bakteri yang paling berhubungan dekat dengan B. aquimaris galur SH6, di antaranya Bacillus aquimaris galur TF-12, Bacillus marisflavi galur TF-11, dan Bacillus haikouensis galur C-89.
Keyword: 16S rRNA, FCGR, GC content, GGDC, phylogenetic tree

Judul: Keragaman genetik Bacillus sp. Rizobakteri pemacu pertumbuhan tanaman berdasarkan sekuen gen 16S rRNA dan amplified rDNA restriction analysis
Abstrak: Sebelas isolat Bacillus sp. rizobakteri pemacu pertumbuhan tanaman telah berhasil diketahui keragaman genetiknya melalui metode sekuens gen 16s rRNA dan ARDRA. Hasil BlastN menunjukkan bahwa tidak terdapat dominansi spesies Bacillus sp. yang digunakan. Penggunaan empat enzim restriksi yaitu HaeIII, CfrI, dan Hinfl telah berhasil menunjukkan keragaman genetik pada Bacillus sp. Penggunaan enzim restriksi RsaI menunjukkan keseragaman pada semua isolat. Hasil dari ARDRA terdiri atas filotipe yaitu Filotipe I (Bacillus sp. Cr24, Cr33, Cr64, dan Cr68), filotipe I1 (Bacillus ps. '2131 dan Cr66), filotipe 111 (Bacillus sp. Cr44 dan Cr71), dan filotipe IV (Bacillus sp. Cr67, Cr 28, dan Cr69) yang dibuat pohon filogenetiknya dengan metode neighbor-joining menggunakan program Treecon 1.3b. Hasil filogenetik menggunakan sekuens gen 16s rRNA juga menunjukkan kekerabatan antar spesies yang digunakan. ARDRA dapat digunakan untuk melihat keragaman spesies berdasarkan situs pemotongannya.
Keyword: 

Judul: Peranan Jasa Transportasi dalam  Menunjang Pembangunan Wilayah  Kaitannya dengan Pelaksanaan  Otonomi Daerah di Provinsi Papua  Khususnya Kabupaten Jayapura
Abstrak: Ketimpangan pembangunan yang terjadi selama Orde Baru telah memicu disintegrasi bangsa, salah satu daerah yang diisukan terancam disintegrasi sebagai akibat ketimpangan pembangunan pada reszim orde baru adalah Provinsi Papua, sehingga untuk meredam aspirasi disintgrasi, dimasa reformasi Provinsi Papua ditetapkan sebagai daerah yang menerima Otonomi Khusus. Dengan adanya otonomi khusus ini diharapkan pemerintah daerah lebih leluasa mengabil kebijakan yang disesuaikan dengan aspirasi dan prioritas permasalahan yang dihadapi masyarakat.
Keyword: