Judul: Gene Expression Analysis of Heat Shock Protein-70 in Giant Gourami after Transportation Stress
Abstrak: Respons fisiologis pada tubuh ikan yang terpapar stresor salah satunya adalah sintesis heat shock protein-70 (HSP70). Sintesis HSP70 merupakan respons dari sel yang berfungsi menjaga kelengkapan protein sel, pemindahan protein, menjaga dari pelipatan prematur pada sel dan mencegah penumpukan protein pada sel. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis tingkat ekspresi gen HSP70 pada benih ikan gurami yang terpapar stres transportasi. Penelitian dilakukan dengan mentransportasikan ikan perlakuan (3 ulangan) dengan plastik kemas berukuran 40 × 60 cm2 berisi ikan dengan panjang 6,02±0,62 cm dan bobot 8,28±0,49 g dengan kepadatan 40 ikan per-plastik. Ikan kontrol (1 ulangan) dikemas dengan spesifikasi yang sama seperti ikan perlakuan dan diletakkan dalam akuarium tanpa ditransportasikan. Ikan kemudian langsung dibedah pascatransportasi dan diambil sampel hati (liver) untuk ekstraksi RNA dan kemudian disintesis menjadi cDNA. Sampel cDNA lalu diamplifikasi dengan metode PCR menggunakan primer HSP70 dan β-aktin. Tingkat ekspresi gen ditentukan menggunakan metode PCR semikuantitatif. Hasil elektroforesis menunjukkan bahwa ukuran pita pada sampel primer HSP70 sebesar 267 bp dan primer β-aktin sebesar 192 bp. Analisis ekspresi gen HSP70 pada ikan pasca paparan stres transportasi menunjukkan bahwa tidak ada perbedaan nyata antara ikan kontrol, rentan dan tahan stres setelah dilakukan uji statistik (P>0,05). Stres transportasi tidak memberikan pengaruh yang signifikan terhadap ekspresi gen HSP70 pada hati ikan gurami., One of the physiological responses of fish exposed to stress transportation is the synthesis of heat shock protein-70 (HSP70). Synthesis of HSP70 is a cell response to stressors that function to maintain the completeness of cell proteins, transfer proteins, prevent premature folding of cells, and prevent protein accumulation in cells. This research aimed to analyze the expression level of the HSP70 gene in giant gourami fry exposed to transportation stress. The research was conducted by transporting treated fish (3 replicates) with plastic containers measuring 40 × 60 cm2 containing fish with a length of 6.02±0.62 cm and a weight of 8.28±0.49 g and a density of 40 fish per plastic. Control fish (1 replicate) were packed with the same specifications as the treatment fish and placed in the aquarium without being transported. The fish were then dissected after transport and liver samples were taken for RNA extraction and then synthesized into cDNA. The cDNA samples were then amplified by the PCR method using HSP70 and β-actin primers. Gene expression level was determined by using the semi-quantitative PCR method. Electrophoresis results showed that the band size in the HSP70 primer sample was 267 bp and the β-actin primer was 192 bp. HSP70 gene expression analysis in giant gourami after being exposed to transportation stress showed that there was no significant difference between control, prone to-, and stress-resistant fish after statistical tests (P>0.05). Transport stress did not have a significant effect on the expression of the HSP70 gene in giant gourami liver.
Keyword: Giant Gourami, HSP70, Primer, Stress, Transportation

Judul: Respons Molekuler dan Fisiologis Ikan Gurami Terhadap Kadar dan Sumber Karbohidrat Berbeda: Studi Transkriptomik
Abstrak: Karbohidrat merupakan sumber energi yang memiliki harga yang lebih rendah, suplai lebih banyak, dapat meningkatkan efisiensi penggunaan energi protein, serta dapat menurunkan limbah nitrogen. Akan tetapi, kemampuan ikan dalam memanfaatkan karbohidrat rendah dan dipengaruhi oleh banyak faktor, seperti spesies, ukuran, kadar karbohidrat dan sumber karbohidrat. Oleh sebab itu dibutuhkan upaya produksi ikan yang dapat memanfaatkan karbohidrat dengan baik. Ikan gurami merupakan salah satu ikan yang dapat memanfaatkan karbohidrat tinggi, namun mekanisme pemanfaatannya belum banyak diketahui. Beberapa penelitian menunjukkan bahwa mekanisme pemanfaatan karbohidrat dapat dievaluasi dengan pendekatan respons molekuler dan fisiologis pascaperlakuan pakan berkarbohidrat. Akan tetapi informasi molekuler ikan gurami, baik informasi sekuens gen terkait metabolisme karbohidrat maupun tingkat ekspresi gen masih sangat terbatas. Tujuan umum penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi gen dan mengevaluasi respons molekuler melalui analisis transkriptomik hati, ekspresi gen, serta analisis respons fisiologis ikan gurami pascaperlakuan kadar dan sumber karbohidrat berbeda. Penelitian ini dilaksanakan dalam empat tahap dengan tujuan khusus: 1) untuk mengkarakterisasi seluruh gen yang terekspresi di organ hati dan respons stres metabolik ikan gurami setelah pemberian pakan dengan kadar karbohidrat berbeda; 2) untuk menganalisis ekspresi gen terkait metabolisme nutrien ikan gurami setelah pemberian pakan dengan kadar karbohidrat berbeda; 3) untuk mengevaluasi pengaruh sumber karbohidrat berbeda terhadap profil biokimia darah dan ekspresi gen ikan gurami; dan 4) untuk mengevaluasi respons fisiologis dan pertumbuhan ikan gurami yang diberi pakan dengan sumber karbohidrat berbeda. Penelitian tahap pertama berhasil mengidentifikasi 33.104 unigen dari organ hati ikan gurami dengan metode sekuensing RNA (RNA-seq) yang berbasis next-generation sequencing (NGS). Pakan karbohidrat tinggi menyebabkan 52,81% differentially expressed gene (DEG) mengalami penurunan signifikan. Unigen yang diperoleh berhasil dianotasikan ke dalam tujuh database. Ekspresi gen terkait sistem antioksidan dan respons histo-morfologi hati ikan gurami juga dievaluasi pada penelitian pertama. Data menunjukkan bahwa ikan gurami yang diberi pakan karbohidrat tinggi memiliki ekspresi gen terkait antioksidan (sod1 dan sod2) yang lebih rendah dibanding perlakuan karbohidrat kontrol (P<0,05). Ekspresi gen yang mengontrol tingkat stres oksidatif (noa1) pada perlakuan karbohidrat tinggi lebih rendah pada hari ke-30, tetapi lebih tinggi pada hari ke-60 dibandingkan perlakuan karbohidrat kontrol. Penelitian tahap kedua berhasil menganalisis respons molekuler dan fisiologis ikan gurami pascaperlakuan karbohidrat tinggi. Dari penelitian tahap ini diperoleh hasil bahwa pada hari ke-30, ikan gurami dengan perlakuan karbohidrat tinggi memiliki ekspresi gen terkait glikolisis (gck, pk, hk, dan ldh) yang lebih tinggi dibanding perlakuan karbohidrat kontrol (P<0,05). Pada hari ke-60, ekspresi gen gck dan hk tetap lebih tinggi pada perlakuan karbohidrat tinggi (P<0,05), dan ekspresi gen terkait glikogenolisis (gyp), katabolisme asam amino (gdh), dan sensor energi (ampk) menjadi meningkat signifikan pada perlakuan karbohidrat tinggi (P<0,05). Peningkatan karbohidrat pakan menyebabkan peningkatan aktivitas enzim amilase dan protease, plasma glukosa, glikogen hati, serta protein dan lemak tubuh secara signifikan (P<0,05). Profil biokimia darah dan ekspresi gen terkait metabolisme karbohidrat setelah 60 hari dan postprandial perlakuan sumber karbohidrat berbeda pada penelitian tahap ketiga menunjukkan bahwa sumber karbohidrat secara signifikan memengaruhi plasma glukosa, trigliserida, dan kolesterol ikan gurami (P<0,05), namun tidak memberikan pengaruh signifikan terhadap total protein plasma (P>0,05). Pemberian pakan dengan sumber karbohidrat berbeda, yaitu tepung pollard, tepung dedak, dan tepung palm kernel meal (PKM), secara signifikan memengaruhi
Keyword: carbohydrate, gene expression, Giant gourami, RNA-seq, transcriptome

Judul: Keragaan dan Rencana Pengembangan Usaha KUD Mandiri Inti Bina Warga Kecamatan Subang, Kabupaten Subang, Jawa Barat
Abstrak: Salah satu koperasi yang bergerak di wilayah pedesaan adalah Koperasi Unit Desa (KUD). KUD dimaksudkan untuk mewadahi proses pengalokasikan sumber daya di pedesaan secara optimal. Dengan demikian KUD akan menjadi pusat pelayanan bagi anggotanya dan masyarakat sekitarnya, juga menjadi alat penumbuhan dan sekaligus perangsang pertumbuhan wilayah pedesaan yang bersangkutan.
Keyword: