Judul: Detection and Molecular Identification of Potentially Patulin-Producing Mold in Tropical Fruits
Abstrak: Produksi dan ekspor buah-buahan tropis Indonesia mengalami tren peningkatan dari tahun ke tahun. Salah satu faktor penting yang harus diperhatikan dalam produksi maupun ekspor buah-buahan ialah keamanan pangan. Salah satu cemaran yang dapat ditemukan pada buah adalah mikotoksin, khususnya patulin, yang merupakan hasil metabolit sekunder dari kapang. Patulin merupakan mikotoksin dengan kapang penghasil utamanya ialah Penicillium expansum yang sering ditemukan pada buah apel dan olahannya. Penelitian mengenai spesies kapang penghasil patulin pada buah-buahan tropis Indonesia masih terbatas. Tujuan dari penelitian ini yaitu untuk memperoleh isolat kapang yang tumbuh dari empat jenis buah-buahan tropis, kondisi running optimum polymerase chain reaction (PCR) untuk deteksi gen target isoepoxydon dehydrogenase (idh), dan identitas kapang yang berpotensi sebagai penghasil patulin pada buah-buahan tropis. Penelitian terdiri dari tiga tahap yaitu (1) isolasi kapang dari buah-buahan tropis, (2) optimasi kondisi running PCR dan deteksi gen target idh pada isolat yang diperoleh, serta (3) identifikasi spesies kapang secara molekuler menggunakan gen target internal transcribed spacer (ITS) rDNA yang selanjutnya dilakukan analisis homologi sekuen DNA dengan sekuen yang terdapat di GenBank. Total 26 kapang diisolasi dari empat jenis buah (apel malang, pisang ambon, jeruk medan dan alpukat) yang diperoleh dari lima tempat yang berbeda di Bogor antara lain kios buah, pasar tradisional dan supermarket. Isolat yang diperoleh yaitu 13 isolat dari apel malang, 9 isolat dari pisang ambon, 2 isolat dari jeruk medan dan 2 isolat dari alpukat. Colletotrichum musae PA01 digunakan sebagai kontrol positif kapang penghasil patulin. Hasil optimasi metode PCR untuk deteksi gen idh menunjukkan suhu annealing 54ºC, reagen mix A, dan konsentrasi primer sebesar 0,2 µm merupakan kondisi yang optimum. Deteksi kapang berpotensi menghasilkan patulin dilakukan menggunakan gen target idh dengan primer forward IDH1 dan primer reverse IDH2. Kapang yang positif terdeteksi gen idh adalah isolat kapang yang mempunyai amplikon dengan ukuran 620 bp. Hasil visualisasi produk PCR deteksi gen penghasil patulin ditemukan sebanyak 5 dari 26 (19,2%) isolat yang positif mempunyai gen idh yaitu isolat dengan kode A11, A34, A43, A51, dan B23. Identifikasi spesies dilakukan menggunakan gen ITS rDNA dengan primer universal yaitu primer forward ITS1 dan reverse ITS4. Sekuen DNA isolat kapang selanjutnya dianalisis BLAST dan pohon filogenetik menggunakan sekuen DNA yang terdapat di GenBank sebagai rujukan. Pohon filogenetik dikonstruksi menggunakan metode Maximum Likelihood dengan model yang terbaik dan bootstrap 1000x pada perangkat lunak MEGA X. Hasil penelitian menunjukkan bahwa isolat yang positif mengandung gen idh teridentifikasi sebagai Aspergillus aculeatus, Aspergillus niger, Cladosporium antropophilum, Cladosporium tenuissimum, dan Talaromyces verruculosus., Production and export of tropical fruits have an increasing trend every year. The important factor in the production and export of fruits is food safety. One of the contaminants that may be found in fruit is mycotoxin, especially patulin. The major producer of patulin is Penicillium expansum which is often found in apples and its products. Research on the identification of patulin-producing mold in Indonesian tropical fruit is still limited. This study aimed to obtain contaminant molds from tropical fruits, the optimum polymerase chain reaction (PCR) running condition for isoepoxydon dehydrogenase (idh) gene detection, and the identity of potentially patulin-producing mold. The research consisted of three
Keyword: molecular detection, patulin, toxigenic mold, tropical fruit

Judul: Validation of Patulin Analytical Method in Banana using Reversed Phase-HPLC MWD
Abstrak: Patulin merupakan mikotoksin yang banyak mengontaminasi buah-buahan dan menimbulkan dampak negatif bagi kesehatan. Data kontaminasi patulin pada buah apel telah banyak dilaporkan, sedangkan pada buah tropis selain apel, khususnya pisang, masih sulit ditemukan. Di Indonesia, data kontaminasi patulin pada buah pisang belum ditemukan. Dalam kurun waktu lima tahun berturut-turut, pisang menduduki peringkat pertama produksi tertinggi di Indonesia diantara buah-buahan tropis lainnya, serta memiliki potensi ekspor yang baik. Akan tetapi kerusakan pascapanen banyak terjadi pada buah pisang akibat adanya pertumbuhan kapang, baik toksigenik maupun non toksigenik. Pertumbuhan kapang toksigenik pada buah dapat menimbulkan potensi cemaran mikotoksin. Patulin merupakan mikotoksin yang umum dijumpa pada buah-buahan. Patulin dapat dihasilkan oleh beberapa jenis kapang. Kapang utama penghasil patulin adalah Penicillium expansum. Studi toksisitas patulin pada hewan percobaan menunjukkan patulin memiliki efek negatif terhadap kesehatan, baik bersifat akut maupun subkronis. Patulin dilaporkan dapat menghambat aktivitas beberapa jenis enzim akibat tingginya afinitas patulin terhadap gugus sulfidril. Adanya potensi cemaran patulin pada buah tropis menjadi isu yang penting untuk diperhatikan mengingat dampak negatif kesehatan yang ditimbulkan. Kerugian yang ditimbulkan akibat cemaran mikotoksin tidak terbatas pada kesehatan, tetapi juga kerugian ekonomi akibat penolakan produk di pasar ekspor. Oleh karena itu, sistem pengawasan mutu terhadap peredaran buah-buahan tropis penting dilakukan untuk mengurangi kerugian kesehatan dan ekonomi. Untuk menunjang hal tersebut, diperlukan data terkait prevalensi patulin pada buah pisang dengan metode tervalidasi. Oleh karena itu, tujuan penelitian ini adalah memvalidasi metode analisis patulin pada buah pisang agar diperoleh metode yang siap digunakan untuk analisis patulin pada pisang. Tahapan dalam penelitian ini terdiri dari (1) pembuatan puree pisang, (2) uji unjuk kerja instrumen, (3) orientasi metode analisis, (4) validasi metode analisis, dan (5) aplikasi analisis patulin pada buah pisang. Uji unjuk kerja instrumen meliputi uji linearitas instrumen, penentuan limit deteksi (iLoD) dan kuantifikasi instrumen (iLoQ), dan penentuan presisi waktu retensi. Parameter validasi yang dievaluasi dalam penelitian ini antara lain linearitas metode, limit deteksi metode (LoD metode), akurasi dan presisi metode, dan reprodusibilitas intralab. Penelitian ini menggunakan instrumen reversed phase HPLC-MWD pada panjang gelombang 276 nm dengan fase diam C18 (L 150 mm x i.d. 4.6 mm, 3.5 µm) dan fase gerak ACN : H2O (10:90 v/v), laju alir 0.8 mL/menit. Sampel yang digunakan adalah pisang ambon yang telah mengalami penurunan mutu namun masih dapat dikonsumsi. Volume pengekstrak dan bahan kimia lain yang digunakan adalah setengah kali dari volume metode baku AOAC 2012. Linearitas instrumen dan metode yang digunakan baik, dengan nilai R2 secara berurutan yaitu 0.9939 dan 0.9960. Nilai iLOD dan LOD, masing-masing adalah 10.42 dan 25 ng/g. Rata-rata persen rekoveri yang diperoleh sebesar 91.99% dengan rentang rekoveri 81.65 - 97.08 % dan rata-rata repeatabilitas 5.84%. Metode analisis pada penelitian ini memiliki presisi yang baik pada waktu pengujian berbeda dan tidak terdapat perbedaan signifikan hasil pengujian selama tiga minggu berturut-turut (p>0.05), dengan nilai RSD analisis (3.40 %) lebih kecil daripada RSD Horwitz (23.69%). Pada sampel empat buah pisang yang diambil dari empat tempat penjualan di kota Bogor dan dianalisis dengan metode ini menunjukkan tidak terdeteksi patulin (<LoD) pada semua sampel. Penggunaan volume pelarut setengah kali dari volume baku terbukti dapat digunakan untuk analisis
Keyword: HPLC, mikotoksin, patulin, pisang, validasi metode

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: