Judul: Struktur Komunitas Zooplankton di Perairan Teluk Jakarta
Abstrak: Waktu pengambilan data dilakukan tiga kali yaitu bulan Oktober 2003, Mei dan Oktober 2004. Lokasi pengambilan sampel terdiri dari 23 titik stasiun yang terbagi dalam empat Zona, yaitu Zona A, B, C, dan D. Masing-masing Zona berjarak 5 Km, 10 Km, 15 Km dan 20 Km. Dari hasil pengamatan didapat 52 jenis Zooplankton yang termasuk dalam Filum Protozoa, Coelenterata, Ctenophora, Annelida, Chaetognata, Arthoropoda, Protochordata, Mollusca, Echinodermata dan beberapa stadia Larvae. Dari Filum diatas terbagi dalam 12 Kelas yaitu Crustacea, Cilliata, Mollusca, Urochordata, Polychaeta, Sarcodina, Echinodermata, Hydrozoa, Sagittoidea, Larvae, Actyropyga dan Tentaculata. Dari pengambilan contoh zooplankton pada keempat Zona maka kelimpahan tertinggi ditemukan pada stasiun C5 (Zona C) dengan nilai 94.884 ind/m3 dan kelimpahan terendah pada stasiun A3 dan A4 (Zona A) dengan nilai 3.346 ind/m3. Apabila nilai kelimpahan total di rata-ratakan maka Zona D memiliki nilai tertinggi yaitu sebesar 63.833 ind/m3 dan Zona A memiliki nilai terendah yaitu 8.810 ind/m3. Komposisi jenis di dominasi oleh kelas Crustacea dengan persentase tertinggi pada Zona C sebesar 50 %. Kelimpahan total rata-rata Zooplankton semakin jauh ke pantai semakin meningkat. Dari nilai indeks keanekaragaman, keseragaman dan dominansi selama pengamatan didapat nilai sebagai berikut; nilai indeks keanekaragaman rata-rata 1,457 atau berkisar antara 1,341 – 1,581, nilai indeks keseragaman rata-rata 0,478 atau berkisar antara 0,438 – 0,518, sedangkan nilai indeks dominansi berkisar antara 0,267 – 0,342. Secara umum bahwa perairan Teluk Jakarta memiliki keanekaragaman zooplankton yang rendah (< 2,30), keseragaman yang terjadi relatif sedang dalam arti bahwa jumlah individu setiap jenis tidak jauh berbeda atau dengan kata lain tidak ada individu yang mendominasi.
Keyword: 

Judul: Struktur Komunitas Fitoplankton Di Perairan Teluk Jakarta
Abstrak: Teluk Jakarta merupakan perairan yang sangat subur sebagai akibat dari pasokan nutrien yang sangat melimpah dari limbah domestik dan industri. Teluk Jakarta dimanfaatkan oleh manusia untuk berbagai kegiatan, antara lain sebagai pintu gerbang hubungan lalu lintas nasional dan internasional, sebagai sumber perikanan bagi penduduk ibu kota, sebagai obyek pariwisata dan rekreasi dan juga sebagai perairan penampung bahanbahan buangan yang dimuntahkan ke dalam teluk oleh berbagai aliran sungai dari daratan. Adanya berbagai macam tekanan terhadap lingkungan laut, menyebabkan kondisi perairan Teluk Jakarta mengalami kemunduran sepanjang tahun. Salah satu cara untuk mengetahui kondisi perairan Teluk Jakarta adalah dengan mempelajari struktur komunitas fitoplankton yang terdapat di perairan. Kegiatan penelitian meliputi dua tahap. Tahap pertama, yaitu pengambilan data fisika dan air contoh dilakukan pada tanggal 23 Januari 2001. Sementara pengamatan dilaboratorium dilakukan dari tanggal 25 Januari hingga 28 Februari 2001. Lokasi penelitian terdiri dari 5 stasiun, yaitu Stasiun 1, stasiun 2, stasiun 3 (di perairan pantai) serta stasiun 4 dan 5 ( jauh dari pantai). Pengamatan yang dilakukan meliputi dua parameter, yaitu parameter biologi dan fisika. Pengumpulan data meliputi data primer dan data sekunder. Data primer di peroleh melalui pengukuran dan pengamatan langsung dilapangan, meliputi kedalaman, suhu, salinitas, posisi dan pengambilan air contoh fitoplankton. Sementara data sekunder yang digunakan adalah data kelimpahan fitoplankton dan parameter fisika hasil pengamatan BPPL pada musim barat Januari 1999 dan 2000. Analisa data struktur komunitas fitoplankton meliputi kelimpahan, keragaman, kewajaran dan dominansi. Sementara untuk analisa suksesi fitoplakton digunakan Grafik Suksesi Frontier (Frontier, 1985).
Keyword: 

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA