Judul: Identifikasi Enzim Dengan Aktivitas Karbon-Sulfur Liase Pada Bifidobacterium Longum
Abstrak: Bifidobakteria merupakan bakteri anaerob Gram positif yang hidup dalam usus besar manusia sejak bayi. Pertumbuhan bakteri ini terbukti mendukung kesehatan manusia. Informasi mengenai interaksi bifidobakteria dengan usus besar manusia masih terbatas terutama mengenai metabolisme asam amino yang mengandung sulfur sebagai bagian terpenting dari bakteri usus. Rendahnya efisiensi transformasi dan lambatnya pertumbuhan bakteri inilah yang menyebabkan perkembangan informasi metabolismenya terhambat. Bifidobacterium longum 105-A memiliki efisiensi transformasi tertinggi dibandingkan bifidobakteria lainnya, sekitar 104 sampai 106 transforman untuk setiap μg DNA. B. longum 105-A juga memiliki pertumbuhan yang cukup cepat, OD600nm 1 setelah 12 jam. Kunci dari metabolisme asam amino sulfur adalah jalur transsulfurasi, dengan enzim karbon-sulfur (C-S) liase yang berperan untuk menentukan arah jalur ini, sehingga analisa terhadap C-S liase dilakukan. Target enzim C-S liase dipilih dengan metode BLAST. BL105A_1451 dan BL105A_1761 terpilih sebagai target. Pengambilan gen target dilakukan dengan metode PCR menggunakan primer spesifik. Gen target disisipkan kedalam pET- 15b dan ditransformasikan kedalam E. coli DH5α sebagai vektor kloning dan E. coli BL21 sebagai vektor ekspresi. Transformasi dan ekspresi kedua protein pada E. coli berhasil dilakukan yang dibuktikan pada elektroforesis gel agarose dan gel poliakrilamid sodium dodecyl sulfat (SDS-PAGE). Aktivitas C-S liase yang terukur dengan metode 5,5-dithio-bis-(2- nitrobenzoic acid) (DTNB) pada substrat sistationin, menunjukkan hanya ekstrak bebas sel dari E. coli BL21/pET-15b/BL105A_1451 yang beraktivitas sebagai C-S liase. Aktivitas enzim ini sangat tinggi, melebihi aktivitas ekstrak bebas sel E. coli BL21/pET-15b dan E. coli BL21/pET-15b/BL105A_1761. Aktivitas enzim yang tinggi juga ditunjukkan pada substrat L-sistin. Hasil ini menunjukkan BL105A_1451 yang mengekspresikan putative aminotransferase mengenali gugus L-sisteina pada substrat sistationin dan L-sistin, sehingga enzim ini juga dapat bekerja sebagai sisteina desulfidrase. Enzim putative aminotransferase bekerja sebagai sistationin β-liase pada substrat sistationin, sehingga kemungkinan terekspresi pada kodisi L-sisteina sebagai sumber sulfur tunggal. Untuk membuktikan ekspresi C-S liase, dilakukan kultivasi pada B. longum 105-A di bifidobacterial minimal media (BMM) tanpa L-sisteina dan BMM dengan L-sisteina. Hasilnya menunjukkan B. longum 105-A tidak mampu tumbuh tanpa Lsisteina, namun tumbuh baik dengan L-sisteina sebagai sumber sulfurnya. Ekstrak bebas sel dari B. longum 105-A yang ditumbuhkan pada media BMM dengan Lsisteina menunjukkan aktivitas C-S liase terhadap sistationin. Hal ini membuktikan kesamaan aktivitas antara ekstrak bebas sel E. coli BL21/pET-15b/BL105A_1451 dengan B. longum 105-A. Hasil-hasil ini membuktikan bahwa C-S liase diekspresikan dalam kondisi L-sisteina sebagai sumber sulfur pada B. longum 105- A
Keyword: B. longum 105-A, jalur transsulfurasi, aktivitas C-S liase.

Judul: Kloning dan Ekspresi Gen araA dari Bifidobacterium longum pada E. coli BL21(DE3) dan E. coli BL21(DE3)pLysS.
Abstrak: Tagatosa merupakan rare sugar atau gula langka, suatu gula monosakarida yang keberadaannya sangat sedikit di alam. Senyawa ini memiliki karakteristik yang khas sebagai pemanis fungsional, dan merupakan isomer dari galaktosa. Larutan tagatosa 10% dapat menghasilkan tingkat kemanisan 92% serupa dengan sukrosa. Selain itu nilai kalori yang dihasilkan hanya sebesar 1.5 kkal/g. Tagatosa tidak menyebabkan adanya peningkatan gula darah dan ditetapkan sebagai bahan pemanis tambahan yang bersifat aman bagi penderita diabetes dan orang yang memiliki status obesitas. Dua metode yang dapat digunakan dalam proses memproduksi tagatosa, yaitu metode kimiawi dan biologis. Produksi tagatosa dengan metode kimiawi dilakukan dengan menghidrolisis laktosa dilanjutkan dengan proses isomerisasi dengan bantuan katalis kalsium. Namun metode ini memiliki kompleksitas tinggi pada proses purifikasi produk akhirnya, sehingga hal tersebut menyebabkan tingginya biaya produksi. Saat ini produksi tagatosa diarahkan dengan menggunakan metode lain yaitu secara biologis dengan mencari sumber gen araA yang menyandikan enzim L-arabinose isomerase (EC 5.3.1.4). Gen araA yang bersumber dari bakteri termofilik memerlukan ion Co2+ dan Mn2+ sebagai kofaktor kerja enzim untuk mengoptimalkan aktivitas enzim L-arabinose isomerase. Keberadaan ion metal pada produk akhir tagatosa dapat membahayakan kesehatan konsumen. Oleh karenanya, diperlukan gen araA yang bersumber dari bakteri mesofilik seperti Bifidobacterium longum yang dapat aktif pada suhu rendah yang aktif tanpa memerlukan bantuan ion metal. Proses kloning gen araA telah berhasil dilakukan dengan mengamplifikasi gen araA sebesar 1518 pb (pasang basa) yang bersumber dari B. longum BB536 menggunakan primer yang telah didesain sebelumnya dan meligasikannya pada vektor kloning pGEM-T Easy. Protein L-AI dengan ukuran 56 kDa telah berhasil terekspresi dengan baik pada sel E. coli BL21(DE3) menggunakan bantuan vektor ekspresi pET-21b. Akan tetapi, protein L-AI tersebut membentuk aggregat atau inclusion body. Berbagai upaya telah dilakukan untuk mengatasi permasalahan inclusion body tersebut yaitu melakukan solubilisasi dengan menggunakan urea, menurunkan penggunaan konsentrasi IPTG, menurunkan suhu inkubasi, mengubah metode pemecahan sel secara fisik dan mengganti sistem ekspresi sel inang pada E. coli BL21(DE3)pLysS, namun berbagai upaya yang telah dilakukan belum membuahkan hasil yang diinginkan.
Keyword: Bifidobacterium longum, ekspresi, kloning, gen araA, tagatosa

Judul: Approximation of the Median of Poisson Distribution Using the Relation of Poisson-Gamma Distribution
Abstrak: A major drawback of median is that median cannot usually be defined in closed form, even in the cases where their distribution functions are known. This study gives an approximation of the closed form for the median of the Poisson distribution by using the relation of Poisson-Gamma distribution. The approximation uses elementary techniques based on the monotonicity of certain sequences involving tail probabilities of the Poisson distribution and the Central Limit Theorem. Furthermore, a closed form expression for the mean absolute deviation 􀜧|􀜰􀰒 􀵆 􀜯􀝁􀝀􁈺􀜰􀰒􁈻| is also studied. The median is relevant because of the fact that it minimizes the mean absolute deviation of a Poisson random variable (􀜰􀰒􁈻 by considering median as central tendency.
Keyword: