Judul: Pemrograman paralel pada pengoreksian DNA sequencing error menggunakan metode Spectral Alignment pada sistem memori bersama
Abstrak: DNA sequencing menggunakan next generation sequencer (NGS) menghasilkan throughput yang besar, namun fragmen-fragmen yang dihasilkan masih mengandung sequencing error. Keberadaan sequencing error dapat meningkatkan kompleksitas graf saat dilakukan proses sequence assembly. Proses error correction dapat mengatasi masalah tersebut. Namun, proses error correction pada program sekuensial membutuhkan waktu eksekusi yang tinggi. Oleh karena itu, paralelisasi dibutuhkan pada proses error correction tersebut. Metode error correction pada penelitian ini adalah metode spectral alignment. Penelitian ini mengimplementasikan proses pencarian dan pengoreksian DNA yang memiliki error secara paralel menggunakan empat thread pada prosesor multicore. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa teknik yang diusulkan mampu meningkatkan speedup pada proses pencarian T-string mencapai 1.98–3.56 dan efisiensi 88.92–98.85%, sedangkan speedup pada proses pengoreksian weak T-string speedup mencapai 1.99–3.74 dan efisensi 93.47–99.91% tergantung pada jumlah thread yang digunakan.
Keyword: DNA sequencing error, parallel computation, spectral alignment.

Judul: Koreksi DNA Sequencing Error dengan Metode Spectral Alignment
Abstrak: Second generation DNA sequencing technology is able to generate reads in a massive amount and in a relatively short time compared to the traditional Sanger Shotgun technology. Graph based DNA sequence assembly is used to handle these big data in assembly step. However, the graph based DNA sequence assembly is sensitive to sequencing error. This problem can be solved by performing an error correction step before or after the assembly process. In this research, a software to detect and correct sequencing error in DNA sequence data was developed by employing spectral alignment technique. This technique is implemented as a pre-processing step before the DNA sequence assembly process. DNA sequences which contain error are generated using MetaSim software. Errors in the data sequences are corrected using the software developed in this research. The results are evaluated using the Velvet assembler by comparing the complexity of the graph produced, represented by the number of nodes in the graph. The evaluation results show that the data sequences with error produce more complex graph than the corrected data sequences. It can be concluded that the correction of DNA sequencing error using spectral alignment method can simplify the complexity of graph produced by the DNA sequence assembly step
Keyword: 

Judul: Iklim Pulau Bali
Abstrak: Curah hujan rata-rata bulanan di Bali berkisar antara 47 mm sampai 327 mm, dengan curah hujan maksimum jatuh pada bulan Januari dan minimum pada bulan Agustus. Total hujan setahun rata-rata di Bali 1901 mm. Pada muim angin barat, curah hujan di utara pegunungan relatif sama dengan di selatan pegunungan, sedangkan pada musim angin timur curah hujan di selatan pegunungan lebih tinggi daripada di utara pegunungan. Isohyet tiap bulan di Bali menunjukkan pengaruh ого- grafis terjadi di bagian timur P. Bali yang mengakibatkan di selatan pegunungan lebih basah daripada di di utara pegunungan selama musim kemarau (monsoon timur). Dari isohyet tersebut dapat juga dilihat bahwa potensi air tertinggi ada di bagian timur P. Bali ini khususnya di bawah kaki G. Agung. Musim angin barat di Bali terjadi pada bulan Desember sampai dengan bulan Maret, dan pada bulan April sampai bulan September merupakan musim angin timur. Musim panca roba terjadi pada bulan Oktober sampai bulan November. ..
Keyword: