Judul: Penapisan Senyawa Aktif Mahkota Dewa, Lidah Buaya, dan Pare sebagai Inhibitor Enzim Aldehid Dehidrogenase 1A3 secara In Silico
Abstrak: Kanker ovarium termasuk salah satu penyebab kematian terbesar dari seluruh kematian akibat kanker di Indonesia. Cancer stem cell (CSC) memiliki kemampuan menginisiasi pembentukan tumor dan dapat menyebabkan metastasis. CSC relatif resisten terhadap terapi kanker konvensional dan diperkirakan dapat tinggal di dalam tubuh setelah terapi kamker selesai. Oleh karena itu, perlu adanya terapi baru yang menargetkan CSC yang diharapkan mampu menjadi metode pengobatan kanker yang efisien dan dapat mencegah kekambuhan kanker. Aldehid dehidrogenase 1A3 (ALDH1A3) merupakan salah satu marker permukaan CSC pada kanker ovarium. Enzim ALDH1A3 berperan dalam mengoksidasi retinaldehid menjadi asam retinoat yang dapat menginduksi transkripsi gen yang dapat meregulasi pembentukan tumor. Penelitian bertujuan menapis senyawa aktif yang berasal dari mahkota dewa, lidah buaya, dan pare sebagai inhibitor enzim ALDH1A3 secara in silico dengan metode virtual screening dan molecular docking melalui analisis energi ikatan (ΔG), konstanta inhibisi (Ki), dan ikatan yang terbentuk. Senyawa cucurbitane11 (3,7-dioxo-23,24,25,26,27-penta-norcucurbit-5-en-22-oic acid) berpotensi paling tinngi sebagai inhibitor enzim ALDH1A3 dengan ΔG -9.79 kkal/mol, Ki 0.07 μM, dan %BSS 83.3%, sehingga dapat dijadikan kandidat obat untuk pengobatan kanker ovarium. Senyawa mahkoside A, eriodictiol, daidzein, genistein, pelargonidin, apigenin, katekin, sianidin, dan mangiferin juga berpotensi menghambat kerja enzim ALDH1A3 karena memiliki sisi pengikatan yang juga sama dengan asam retinoat.
Keyword: ALDH1A3, CSC, kanker ovarium, molecular docking, virtual screening

Judul: Molecular Design of Cervical Cancer Drug Candidate from Indonesian Herbal Plants: Computational Exploration
Abstrak: Kanker serviks adalah penyakit yang menyebabkan sekitar 300.000 kematian di seluruh dunia, sebagian besar disebabkan oleh human papillomavirus (HPV), yang ditularkan melalui hubungan seksual. Pengobatan saat ini untuk pra-kanker serviks adalah ablasi dan eksisi, keduanya merupakan metode bedah dengan risiko tinggi. Oleh karena itu, diperlukan alternatif obat untuk menghambat angiogenesis. Penelitian ini menyeleksi kandidat obat antikanker serviks dengan mekanisme penghambatan angiogenesis secara in silico melalui virtual screening dari 100 senyawa dari tanaman herbal Indonesia yang diprediksi memiliki aktivitas inhibisi angiogenesis. Ligan uji dengan nilai afinitas tertinggi diseleksi untuk penelitian lebih lanjut tentang bioavailabilitas dan toksisitasnya. Tiga senyawa terpilih adalah isogemichalcone C (-12,53 kcal/mol), jasmolactone D (-12,37 kcal/mol), dan jasmolactone C (-12,07 kcal/mol), yang memiliki nilai afinitas lebih tinggi dibandingkan tivozanib (-12,05 kcal/mol), obat paten untuk inhibisi angiogenesis kanker.
Keyword: penapisan virtual, penghambat tirosin kinase, angiogenesis, kanker serviks

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: