Judul: Genetic Diversity Analysis of Oil Palm (Elaeis guineensis Jacq) Based on RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) Using Primer OPJ.
Abstrak: Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) dapat menjadi salah satu alternatif untuk menyeleksi tanaman kelapa sawit berproduktivitas tinggi dan tahan terhadap Ganoderma sp. Pada penelitian ini RAPD digunakan untuk mempelajari keragaman genetik 58 pohon kelapa sawit. Tahapan penelitian dimulai dari isolasi DNA, amplifikasi menggunakan primer OPJ, dan analisis filogenetik menggunakan metode UPGMA (Unweighted Pair Group Method Arithmatic Mean) dengan software NTSYS. DNA hasil isolasi memiliki kualitas yang baik berdasarkan analisis spektofotometri dan elektroforesis gel. Amplifikasi DNA dengan 20 primer seri OPJ menghasilkan 1.592 pita DNA dari 115 lokus, sebesar 68% diantaranya merupakan pita polimorfik. Analisis kemiripan genetik menunjukkan nilai koefisien kemiripan genetik sebesar 49% - 95%. Hasil pengelompokkan populasi kelapa sawit pada nilai kemiripan genetikRandom Amplified Polymorphic DNA (RAPD) dapat menjadi salah satu alternatif untuk menyeleksi tanaman kelapa sawit berproduktivitas tinggi dan tahan terhadap Ganoderma sp. Pada penelitian ini RAPD digunakan untuk mempelajari keragaman genetik 58 pohon kelapa sawit. Tahapan penelitian dimulai dari isolasi DNA, amplifikasi menggunakan primer OPJ, dan analisis filogenetik menggunakan metode UPGMA (Unweighted Pair Group Method Arithmatic Mean) dengan software NTSYS. DNA hasil isolasi memiliki kualitas yang baik berdasarkan analisis spektofotometri dan elektroforesis gel. Amplifikasi DNA dengan 20 primer seri OPJ menghasilkan 1.592 pita DNA dari 115 lokus, sebesar 68% diantaranya merupakan pita polimorfik. Analisis kemiripan genetik menunjukkan nilai koefisien kemiripan genetik sebesar 49% - 95%. Hasil pengelompokkan populasi kelapa sawit pada nilai kemiripan genetik
Keyword: 

Judul: Grouping of Plant Oil Palm (Elaeis guineensis Jacq) Origin of West Java by Simple Sequence Repeats (SSR) Markers
Abstrak: Permasalahan utama yang dihadapi di perkebunan kelapa sawit Indonesia adalah masih rendahnya produktivitas dan kualitas kelapa sawit. Adanya populasi kelapa sawit (Elaeis guineensis Jacq) yang belum diketahui identitasnya dan masih bertahan sejak zaman penjajahan Belanda diduga memiliki ketahanan terhadap serangan Ganoderma sp sehingga dapat digunakan sebagai indukan baru dalam pemuliaan tanaman untuk peningkatan produktivitas. Seleksi kelapa sawit melalui perakitan varietas unggul secara konvensional memerlukan waktu yang sangat lama. Teknik molekuler merupakan solusi yang tepat, cepat, dan akurat. Simple Sequence Repeat (SSR) marker digunakan untuk memperoleh informasi genetik pada penelitian yang bertujuan untuk mengelompokkan 58 pohon kelapa sawit yang belum teridentifikasi sebagai informasi awal untuk mencari indukan baru yang berkualitas. Tahapan penelitian dimulai dari isolasi DNA, uji kuantitatif dan kualitatif DNA, penentuan suhu annealing, amplifikasi DNA, hingga konstruksi pohon filogenetik menggunakan metode UPGMA (Unweighted Pair Group Method Arithmatic mean) dengan software NTSYS. DNA hasil isolasi berukuran 12000 bp dengan kualitas pita yang jelas dan terang. Amplifikasi DNA menghasilkan 859 alel dari 6 lokus. Keseluruhan alel menunjukkan polimorfisme yang cukup tinggi yaitu 93% dengan alel heterozigot lebih mendominasi daripada alel homozigot. Antara individu dalam populasi mempunyai nilai koefisien kemiripan bervariasi antara 42%-98%. Seluruh individu dalam populasi kelapa sawit dapat dikelompokkan menjadi dua kelompok besar pada nilai koefisien kemiripan sebesar 65%. Semakin tinggi nilai koefisien kemiripannya maka semakin spesifik pengelompokkan yang terjadi.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: