Judul: Molecular Detection of Zoonosis Q fever in Ruminants in East Java
Abstrak: Q fever merupakan salah satu penyakit zoonotik strategis di Indonesia yang keberadaannya masih diabaikan. Persebaran penyakit zoonotik Q fever mencakup hampir seluruh negara di dunia, kecuali New Zealand, Norwegia, Islandia, dan French Polynesia. Pemerintah Indonesia melalui Keputusan Menteri Pertanian Republik Indonesia (Kepmentan) no.237/KPTS/PK.400/M/3/2019 menetapkan Q fever sebagai salah satu Zoonosis Prioritas yang perlu mendapatkan prioritas baik dalam pencegahan, pengendalian maupun penanggulangannya. Penyakit ini disebabkan oleh bakteri Gram negatif Coxiella burnetii yang bersifat parasit obligat intraseluler. Bakteri ini diklasifikasikan oleh Center of Diseases Control and Prevention ke dalam kelompok agen infeksius yang berpotensi digunakan untuk senjata biologis. Data surveillance Q fever pada hewan di dunia masih terbatas dan menyebabkan distribusi penyakit ini sulit dideteksi. Kesulitan dalam deteksi dini penyakit ini terutama disebabkan oleh gejala klinis yang tidak khas bahkan sering terjadi infeksi subklinis. Maka dari itu Q fever sering diabaikan dalam diferensial diagnosa, sehingga penyakit ini tetap berada pada kelompok ternak dan menimbulkan kerugian ekonomi dalam jangka panjang. Temuan kasus Q fever di Indonesia terutama dilaporkan terdapat pada ruminansia pada rentang tahun 2006 – 2019 dengan cakupan wilayah meliputi Jakarta, Jawa Barat, Yogyakarta, Bali, dan Sumatera Utara. Keberadaan penyakit ini di Jawa Timur belum dikaji ulang sejak penelitian terakhir di tahun 1976. Jawa Timur dikenal sebagai salah satu propinsi yang memiliki kontribusi besar dalam penyediaan pangan asal hewan di Indonesia. Identifikasi dan deteksi penyakit Q fever penting untuk dilakukan, terutama sebagai upaya penyusunan langkah pengendalian terjadinya wabah di manusia. Penelitian ini dilakukan untuk mendeteksi secara molekuler keberadaan bakteri penyebab zoonosis Q fever pada ternak ruminansia di Propinsi Jawa Timur. Penelitian ini dilakukan sejak bulan September 2015 hingga September 2020 yang terdiri dari dua tahap. Tahap pertama merupakan tahapan optimasi metode imunohistokimia untuk mendeteksi keberadaan bakteri C.burnetii di Kabupaten Bogor yang pernah dinyatakan sebagai wilayah endemis penyakit Q fever. Penelitian ini mengambil sampel organ dari sapi dan domba kurban dari wilayah Kabupaten Bogor pada tahun 2015 dan 2016 yang kemudian dideteksi dengan imunohistokimia menggunakan antibodi poliklonal Rabbit anti-C.burnetii, diperoleh dari FKH IPB dan diamati perubahan gambaran histopatologinya dengan pewarnaan Haematoxyline-Eosin (HE). Tahap kedua penelitian adalah penelitian utama dengan tujuan mendeteksi secara molekuler keberadaan bakteri C.burnetii pada ruminansia di Jawa Timur. Sampel penelitian tahap kedua berupa organ hati, limpa, ginjal, paru-paru, dan jantung ruminansia yang diambil dari rumah potong hewan di Surabaya, Malang, dan Madura. Sampel organ yang didapatkan dideteksi secara molekuler dengan metode nested polymerase chain reaction (nested PCR) menggunakan primer dari gen Outer Membrane Protein (OMP) dan gen 16S rRNA kemudian dikonfirmasi dengan imunohistokimia dan diamati perubahan histopatologi dengan pewarnaan HE. Bakteri C.burnetii terdeteksi positif pada organ paru-paru dan limpa sapi kurban di Kabupaten Bogor dengan metode imunohistokimia yang telah dimodifikasi dan dioptimasi. Hasil pemeriksaan imunohistokimia menunjukkan adanya imunoreaksi positif terhadap antibodi C.burnetii pada 4 dari 19 sampel (21%) sapi kurban tahun 2015 dan 3 dari 10 sampel (30%) sapi kurban tahun 2016. Perubahan gambaran histopatologi yang tampak pada sampel positif meliputi kongesti, infiltrasi sel radang, akumulasi mukus, hingga adanya fibrosis pada paru-paru. Pada organ yang positif uji imunohistokimia terhadap bakteri C.burnetii tidak didapatkan lesi patologis yang konsisten. Hal ini diduga berkaitan dengan
Keyword: Coxiella burnetii, Indonesia, kambing lokal, Q fever, zoonosis

Judul: Molecular Detection of Coxiella burnetii Causes of Zoonotic Q Fever in Cattle at the Bandung Regency Slaughterhouse
Abstrak: Query fever (Q fever) merupakan penyakit zoonosis yang disebabkan oleh bakteri Gram-negatif bersifat obligat intraseluler yaitu Coxiella burnetii. Hewan ternak menjadi sumber utama penularan pada hewan lainnya maupun manusia. Sapi termasuk salah satu hewan sangat rentan terhadap infeksi akan tetapi umumnya tidak menunjukkan gejala klinis. C. burnetii pada sapi dapat menyebabkan abortus dan beberapa gangguan reproduksi lainnya. Distribusi C. burnetii sudah menyebar luas hampir ke seluruh dunia termasuk di Indonesia, dan penularan utamanya melalui aerosol. Studi dan laporan mengenai kasus Q fever pada hewan di Indonesia masih sangat terbatas hingga saat ini karena diagnosa klinis yang sulit dilakukan untuk deteksi dini. Kabupaten Bandung adalah salah satu wilayah di Jawa barat yang rentan terhadap penyebaran Q fever karena jumlah ternak yang tinggi khususnya sapi. Penelitian ini bertujuan untuk mendeteksi keberadaan C. burnetii sebagai penyebab Q fever pada berbagai organ sapi di Kabupaten Bandung. Sampel organ diambil dari 240 ekor sapi yang dipotong di empat Rumah Potong Hewan (RPH) di Kabupaten Bandung. Metode yang digunakan untuk mendeteksi keberadaan C. burnetii dalam sampel adalah nested Polymerase Chain Reaction (PCR) menggunakan primer outer membrane protein (OMP). Sampel positif hasil nested-PCR dilakukan pembuatan preparat histopatologi dengan pewarnaan hematoksilin-eosin (HE) untuk analisis lesi patologi. Lima ekor (2,08%) sapi Brahman cross terdeteksi positif C. burnetii yang berada dalam tiga organ jantung (1,25%) dan dua organ paru (0,83%). Gambaran histopatologi secara umum tidak menunjukkan adanya lesi signifikan dan spesifik terhadap infeksi C. burnetii melalui pewarnaan HE. Berdasarkan hasil tersebut, penelitian ini mengonfirmasi adanya infeksi subklinis C. burnetii pada populasi sapi di Kabupaten Bandung tanpa disertai lesi spesifik. Penelitian lanjutan mengenai Q fever diharapkan dapat dilakukan dengan beberapa metode lain seperti pewarnaan imunohistokimia atau sequencing., Coxiella burnetii, an obligate intracellular Gram-negative bacterium, is responsible for causing the zoonotic disease called Q fever. Livestock animals serve as the primary reservoir of infection for both animals and humans. Cattle are highly prone to infection; however, they typically remain asymptomatic. Coxiella burnetii in cattle can result in abortion and various other reproductive problems. C. burnetii has achieved global distribution, encompassing Indonesia, and its primary mode of transmission is by aerosols. There is a scarcity of studies and reporting on instances of Q fever in animals in Indonesia due to the challenging nature of clinical diagnosis for early detection. Bandung Regency, located in West Java, is susceptible to the transmission of Q fever due to its significant animal population, particularly cattle. The objective of this study is to identify the existence of C. burnetii as the etiological agent responsible for Q fever in cattle in Bandung Regency. Total 240 cattle slaughtered at four slaughterhouses (RPH) in Bandung Regency were used to collect organ samples. The technique employed for identifying the existence of C. burnetii in samples is nested polymerase chain reaction (PCR) with primers specific to the outer membrane protein (OMP). The PCR-positive samples were processed into histopathology slides and stained with hematoxylin-eosin (HE) for the examination of pathological abnormalities. Out of the total of five Brahman cross cattle, which accounts for 2,08% of the sample, three hearts (1,25%) and two lungs (0,83%) were found
Keyword: Q fever, Coxiella burnetii, nested-PCR, cattle

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: