Judul: Study of Proteomic Profiles, Distribution of  Glycoproteins, and Antibacterial Activities of Sunda Porcupine’s (Hystrix  javanica) Skin and Quill Extract
Abstrak: Beberapa jenis makhluk hidup, khususnya pada hewan, memiliki struktur kulit yang khas dengan keunikannya masing-masing. Salah satu hewan yang diketahui memiliki keunikan pada struktur dan fungsi kulitnya adalah landak jawa. Landak jawa diketahui memiliki kemampuan penyembuhan luka yang baik dalam waktu yang relatif singkat. Kemampuan tersebut diduga berkaitan dengan komponen bahan aktif yang terkandung dalam kulit maupun duri landak jawa. Komponen bahan aktif yang diketahui berkaitan dengan penyembuhan luka pada kulit adalah protein dan glikoprotein. Protein berfungsi untuk membangun, memperkuat, dan memperbaiki atau mengganti jaringan tubuh yang rusak. Glikoprotein juga diketahui berperan dalam proses penyembuhan luka. Glikoprotein juga sering digunakan sebagai bahan aktif untuk memperbaiki jaringan kulit yang rusak. Glikoprotein berperan dalam migrasi sel dan pembentukan jaringan epidermis. Data tentang profil protein dan distribusi glikoprotein pada kulit landak jawa dan derivatnya sampai saat ini masih sangat terbatas. Data tentang profil protein dan distribusi glikoprotein pada kulit landak jawa dan derivatnya sangat penting untuk diketahui untuk mengindentifikasi jenis protein yang berperan dalam penyembuhan luka. Hal lain yang menjadi keunikan landak jawa adalah durinya. Duri landak jawa biasanya digunakan oleh sebagian masyarakat di Indonesia sebagai bahan obat tradisional. Duri landak jawa diduga memliki aktivitas antibakteri. Aktivitas antibakteri duri landak jawa perlu dibuktikan untuk mendukung penggunaan duri landak jawa sebagai bahan obat tradisional. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi profil protein pada kulit dan duri landak jawa, mengidentifikasi distribusi glikoprotein dalam jaringan kulit landak jawa, dan membuktikan serta menganalisis aktivitas antibakteri pada duri landak jawa. Kajian ini diharapkan dapat memberikan bukti ilmiah untuk mendukung penggunaan kulit dan duri landak jawa sebagai salah satu alternatif pengobatan di masa depan. Sampel yang digunakan dalam penelitian ini adalah landak jawa (Hystrix javanica). Sampel yang digunakan dalam penelitian ini adalah duri dari 15 ekor landak hidup dan kulit dari 4 ekor landak beku. Pengambilan sampel duri dilakukan dengan cara mengumpulkan duri yang rontok secara alami dari tubuh landak (tanpa pencabutan). Duri dikumpulkan sebanyak 300 gram, yang dibagi menjadi 3 ulangan masing-masing 100 gram tiap 5 hewan. Duri yang dipilih adalah tipe duri sejati yang berukuran besar ataupun kecil. Sampel kulit diperoleh dari sampel landak beku dengan ukuran 2x2 cm. Studi profil protein dilakukan dengan metode analisis proteomik menggunakan Liquid Chromatography Mass Spectrometry/Mass Spectrometry (LCMS/MS) tipe LC Vanquish Tandem Q Exactive Plus Mass Spectrometer. Analisis gene ontology dilakukan menggunakan aplikasi online UniProt, dan analisis jalur fisiologis masing-masing protein dilakukan menggunakan aplikasi online STRING. Distribusi glikoprotein dianalisis dengan pengataman histologi menggunakan pewarnaan perodic acid-Schiff dan analisis intensitas glikoprotein dilakukan menggunakan mikroskop cahaya dan aplikasi ImageJ. Pengujian aktivitas antibakteri dilakukan dengan desain rancangan acak lengkap (RAL) menggunakan metode difusi sumuran (agar well diffusion method) dan dianalisis menggunakan perangkat SPSS dengan uji one-way ANOVA dan dilanjutkan uji Duncan dengan taraf uji yaitu 95% (α≤0,05). Hasil analisis protein pada kulit landak jawa dengan menggunakan sistem dokumentasi gel ditemukan pita protein dengan berat molekul berkisar antara 25 kDa – 84 kDa. Hasil pengamatan visual peneliti pada protein kulit ditemukan sekitar 6 pita protein, dengan rincian 4 pita tipis dan 2 pita tebal. 2 pita tebal yang ditemukan memiliki berat molekul protein masing-masing adalah 65 kDa dan
Keyword: antibakteri, glikoprotein, landak jawa, penyembuhan luka, proteomik

Judul: IPB (Bogor Agricultural University)
Abstrak: Pengamatan sederhana terhadap landak jawa di penangkaran menunjukkan penutupan luka pada kulit terjadi dalam waktu yang relatif singkat, jaringan parut yang kecil serta tanpa adanya infeksi walaupun luka berukuran besar dan parah. Beberapa faktor yang penting pada penyembuhan luka adalah komponen darah, kimia darah, struktur kulit sebagai faktor internal, serta komponen antimikroorganisme kulit sebagai faktor eksternal. Interaksi dan kerja sama komponen-komponen ini sangat penting dalam kesuksesan penyembuhan luka. Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi dan mengaji profil penyembuhan luka terbuka pada landak jawa yang mencakup karakteristik dinamika profil darah, karakteristik dinamika morfologi kulit, dan karaktersitik biokimia kulit yang berpotensi sebagai antimikroorganisme. Kajian ini diharapkan dapat menjadi model pembelajaran penyembuhan luka yang setara untuk beberapa hewan ataupun manusia dalam peningkatan penyembuhan luka. Penelitian ini menggunakan 6 ekor landak jawa dewasa (3 jantan dan 3 betina). Perlukaan stadium 3 (full-thickness wound) diterapkan pada regio thoracodorsal dan lumbosacral dengan ukuran 10-11 cm2. Pengamatan tanda klinis dilakukan pada hari ke-0, 3, 7, 10, 14, 21, 30, dan 40. Pengambilan sampel darah dilakukan pada hari ke-0, 7, 14, 21, 30, dan 40, pengambilan sampel ulas kulit untuk penghitungan populasi bakteri dilakukan pada hari ke-0, 3, 7, 10, 14, 21, 30, dan 40 sedangkan pengambilan sampel kulit dengan proses biopsi dilakukan pada hari ke-0, 3, 7, 14, 21, 30, 40, dan 50. Selain itu, sampel tambahan diperoleh dari koleksi 3 ekor landak jawa beku pada suhu -30 ºC. Analisis tanda klinis dilakukan secara langsung, analisis darah dilakukan dengan menggunakan alat Hematology analyzer dan Chemistry analyzer, analisis jumlah bakteri dilakukan dengan menghitung total plate count (TPC) dan identifikasi morfologi, analisis struktur kulit dilakukan dengan pengamatan histologi menggunakan pewarnaan hematoxylin dan eosin, periodic acid Schiff, alcian blue, picrosirius red, serta pencitraan scanning electron microscope, analisis komposisi kimia kulit, seperti asam lemak dilakukan dengan gass chromatography mass spectrometry (GCMS), alfa tokoferol dilakukan dengan high performance liquid chromatography (HPLC), serta identifikasi dan distribusi glycoconjugate dilakukan dengan pewarnaan lektin. Penelitian ini menunjukkan penutupan luka terjadi dalam rentang waktu 30-40 hari pascaperlukaan dengan luka di regio thoracodorsal menutup lebih cepat dibandingkan regio lumbosacral. Dinamika profil darah selama proses penyembuhan luka menunjukkan bahwa proses penutupan luka berlangsung baik. Dinamika eritrosit dan platelet yang meningkat selama proses penyembuhan luka menunjukkan bahwa kedua komponen darah ini diduga menjadi faktor internal yang penting dalam penutupan luka, sedangkan dinamika leukosit dan tanda klinis menunjukkan tidak adanya peradangan persisten pada proses penyembuhan luka landak jawa. Kadar glukosa darah landak jawa yang tinggi jika dibandingkan dengan beberapa hewan menunjukkan tren yang relatif menurun di akhir pengamatan menandakan fisiologi darah dapat menekan potensi penyembuhan luka berlanjut ke tahap kronis. Hari ke-7 merupakan tahap yang memperlihatkan banyaknya komponen darah yang saling berkorelasi positif dengan penyembuhan luka, diikuti hari ke-14 dan 21. Secara umum, proses penyembuhan luka pada landak jawa diawali dengan re-epitelisasi yang dilanjutkan dengan proses kontraksi luka yang progresif. Tahap penyembuhan luka pada kulit landak jawa dapat dibedakan menjadi 4, yaitu hemostasis (hari 0-3), inflamasi atau peradangan (hari 2-14), formasi jaringan (hari 7-30), serta remodeling (hari 21-50 atau lebih). Perubahan pola distribusi karbohidrat netral dan asam teramati pada penyembuhan luka. Kandungan karbohidrat netral
Keyword: asam lemak, bakteri, kolagen, komponen darah, penyembuhan luka

Judul: Thermal Characteristics and Dynamics of Tropical Cyclone over Western North Pacific Ocean: A Case Study of Typhoon Songda (Chedeng) 2011
Abstrak: The frequent occasion of Tropical Cyclone (TC) over Western North Pacific (WNP) Ocean lies from 10˚N to 26˚N and 121˚E to 170˚E. Sources of TC development come from warm ocean temperature where latent heat is released during condensation processes and subsequently concentrated in the boundary layer. Relative humidity at 850-700 hPa is responsible to produce the most intense storm. Meanwhile, weak vertical wind shear between 850-200 hPa is one of the dynamical factors that lead to the development of TC. Pressure level of 850-200 hPa is chosen to minimize the thermodynamic effect in the lower troposphere. Typhoon Songda (Chedeng in the Philippines) or TSC lasted from May 18th to 30th, 2011 and strengthened into powerful Super Typhoon stage between May 24th and 27th. Long curving track and the exhibition of all sequences of TC life cycle, TSC is then considered as an ideal case of TC. The objective of the study with case of TSC is to investigate the role of thermal characteristics and dynamics on TC intensity. The research is carried out by using Advanced Research of Weather Research and Forecasting model (WRF ARW model) version 3.3. Two domains are employed in the model. The first domain situate from 02˚N to 40˚N and 118˚E to 149˚E and cover spatial resolution () of 33.1 km. The second domain situate from 09˚N to 27˚N and 119˚E to 132˚E with of 11 km. Timestep of the model () is 120 seconds. The model is supported by the following physical parameterization, i.e., Yonsei University Scheme (YSU) in the boundary layer, Kain-Fritsch scheme (KF) in the cumulus, and WRF Single-Moment 3-class scheme in the microphysics. Initial meteorological condition prior to the formation of the cyclone is generated using WRF ARW standard-release model. Sensitivity of the model output is obtained from a selected single-parameter change scenarios, namely, 10 % to 20 % decrease and increase of wind shear initial data at 850-200 hPa, and by 10 % to 20 % decrease of relative humidity initial data at 850-700 hPa. The result showed that the negative correlations between wind shear and intensity are found in wind shear scenarios. Wind shears of 10 ms-1 which lead to strengthening of the wind intensity in the early period of Typhoon development are found in wind shear scenarios. The effect of wind shear changes on wind intensity is statistically significant in the 20 % wind shear scenarios. During mature stage, weak wind intensity occurred when wind shear increase as given in the WRF standard-release and the 20 % decreasing scenario. Different situation is found in the 20 % increasing scenario where wind shear tend to weak and lead to strong wind intensity at this stage. Meanwhile, the reduction of moisture supply at 850-700 hPa resulting from 20 % decreasing relative humidity play a major role in the weakening of wind intensity and reduces mechanical energy of the cycle process as much as 300 J kg-1.
Keyword: