Judul: Struktur Genetik dan Filogenetik Ikan Tuna (Thunnus spp.) di TPI Tanjung Luar, Lombok Berdasarkan DNA Mitokondria
Abstrak: Tuna is the third largest fishery commodities in Indonesia after shrimp and demersal fish. Identification of tuna has been difficult because of the close genetic relationships among these species and the ease with which morphological characters may be removed once a fish has been landed. This research aims to identify species, investigate the genetic and phylogenetic structure of tuna that landed and traded in Tanjung Luar fish market, Lombok. The polymerase chain reaction was used to amplify segment of the mitochondrial control region gene from members of these species. 43 samples fins tuna were collected consists of 34 Thunus albacares and 9 Thunus obesus, with homology analysis of BLAST ranged between 98-100%. The average of sequence was 533 bp and there were 30 nucleotides different. Phylogenetic trees forming two clades, Thunus albacares and Thunus obesus, with genetic distance ranged from 0 to 0,145. The clades revealed after bootstrapping generally corresponded well with expectations. This methodology should prove very useful for enforcing the regulations governing Indonesia's bluefin tuna fishing industry.
Keyword: 

Judul: Penelusuran Keaslian Ikan Tuna (Thunnus Sp.) Dan Produk Olahannya Melalui Teknik Molekuler Dna Barcoding
Abstrak: Kasus mislabeling atau ketidaksesuaian dengan label pada produk perikanan telah banyak dilaporkan di beberapa negara, namun di Indonesia belum banyak dilaporkan. Pengujian keaslian ikan atau autentikasi diperlukan untuk meyakinkan konsumen tentang keakuratan pelabelan. DNA barcoding merupakan urutan pendek DNA dari wilayah standar pada genom yang digunakan untuk identifikasi spesies. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi keaslian ikan tuna dan olahannya melalui teknik molekuler DNA barcoding menggunakan DNA mitokondria cyt b dan COI (cytochrome c oxidase subunit I) sehingga dapat digunakan untuk mencegah adanya pemalsuan/ketidaksesuaian label dan economic fraud. Tahapan penelitian terdiri atas identifikasi morfologi, pengukuran proporsi tuna segar utuh, pengukuran komposisi proksimat, identifikasi berbasis protein, dan identifikasi molekuler. Sampel terdiri atas 5 sampel tuna segar utuh dan 22 sampel olahan tuna berupa tuna steak, sushi tuna, bakso tuna, abon tuna dan tuna kaleng. Identifikasi secara morfologi menunjukkan ke lima sampel tuna segar utuh teridentifikasi sebagai tuna sirip kuning (Thunnus albacares). Komposisi rendemen daging merah ikan tuna 15,88%, daging putih 32,90%, sedangkan rendemen jeroan, kepala, tulang dan kulit masing-masing berkisar 8,19%; 22,87%; 16,03%; dan 4,14%. Komposisi protein tuna segar utuh 25,57%, tuna steak 22,37% dan tuna kaleng dalam minyak 14,91%. Identifikasi berbasis protein menunjukkan profil pola protein tuna segar utuh dan tuna steak terlihat lebih tebal dan jelas, untuk sushi tuna walaupun tidak tebal, namun pola proteinnya sama dengan tuna segar utuh dan tuna steak, sedangkan pola protein olahan bakso tuna, abon tuna dan tuna kaleng terlihat namun tipis. Hasil desain primer dengan gen cyt b menghasilkan urutan basa nukleotida untuk foward 5’GGAATAGGGAGAAGTAGAGGACG3’ dan reverse 5’CTYCTATCCGCAGTCCCATATGTYGG3’ dengan panjang fragmen 620 bp, sedangkan menggunakan gen COI dihasilkan primer dengan urutan basa nukleotida untuk foward dan reverse masing-masing 5’GTGCATGAGCTGGAATAGTTG3’ dan 5’CAGGGTCGAAGAAGGTTG3’ dengan panjang fragmen 583 bp. Hasil isolasi DNA diukur konsentrasi dan kemurnian DNA. Konsentrasi DNA berkisar antara 2 ng/μL sampai 444 ng/μL, kecuali untuk olahan tuna kaleng (Ka1, Ka2 dan Ka4), bola tuna (BoTu) dan sushi tourch tuna (SuTm) konsentrasi DNA yang diperoleh rendah. Kemurnian DNA berkisar antara 0,77 sampai 3,72. Hasil elektroforegram PCR dengan primer cyt b dan COI menunjukkan bahwa semua sampel tuna segar utuh, tuna steak, sushi tuna, bakso tuna, abon tuna dan tuna kaleng berhasil teramplifikasi pada rentang antara 500 bp sampai 750 bp, hal ini sesuai dengan DNA target yaitu 620 bp untuk cyt b dan 583 bp untuk COI, kecuali untuk sampel tuna kaleng dalam minyak (Ka3) tidak teramplifikasi yang ditandai dengan tidak adanya pita target, hal ini diduga bahwa sampel tuna kaleng dalam minyak (Ka3) tidak berisi ikan tuna. Identifikasi spesies berdasarkan analisis BLAST menunjukkan bahwa tuna segar (Ts1) baik menggunakan primer cyt b dan COI teridentifikasi sebagai tuna mata besar (Thunnus obesus) dengan tingkat homologi sebesar 99%, namun secara morfologi teridentifikasi sebagai T. albacares, hal ini disebabkan oleh ukuran yang masih kecil, yaitu panjang cagak (fork length) antara Ts1 dan Ts2 kurang dari 40 cm, sehingga sering terjadi kesalahan identifikasi. Semua olahan tuna baik menggunakan gen cyt b maupun COI teridentifikasi sebagai T. albacares dengan homologi berkisar 98-100%, kecuali untuk tuna steak (St5) teridentifikasi sebagai T. obesus dengan homologi 99%. Konstruksi pohon filogenetik dengan primer cyt b menunjukkan
Keyword: COI, cyt b, desain primer, DNA barcoding, pohon filogenetik tuna

Judul: Kerusakan bantalan rel kereta api di wilaya inspeksi 2 jalan dan bangunan perusahaan jawatan kereta api (pjka),cirebon
Abstrak: Kereta api merupakan salah satu sarana angkutan yang murah, cepat dan aman serta dapat mengangkut barang dalam jumlah besar. Kelancaran operasi sarana angkutan tersebut banyak ditentukan oleh kondisi jalan rel, termasuk kondisi bantalannya. Dalam hal ini bantalan rel kereta api dapat dibuat dari kayu, logam, atau beton. Namun demikian kayu merupakan bahan yang paling banyak digunakan sebagai pembuat bantalan rel kereta api di berbagai negara. Kenyataan menunjukkan bahwa kayu yang digunakan sebagai bantalan rel kereta api sering mengalami berbagai macam kerusakan yang menyebabkan bantalan tidak berfungsi lagi atau menurun fungsinya. Di Indonesia, informasi mengenai jenis dan tingkat kerusakan bantalan kayu masih sangat kurang, pada- hal informasi tersebut sangat penting sebagai dasar pertimbangan dalam rangka pemeliharaan jalan kereta api, agar umur pakainya (service life) lebih lama.
Keyword: bantalan rel