Judul: Karakteristik ektomikoriza ascomycota pada pinus merkusii
Abstrak: Ektomikoriza merupakan simbiosis mutualisme antara cendawan tanah dengan akar tumbuhan seperti Pinaceae (Gymnospermae) dan Dipterocarpaceae (Angiospermae). Ektomikoriza berperan dalam efisiensi pengambilan unsur hara mineral dan air, serta melindungi akar dari cekaman faktor abiotik dan biotik. Pinus merkusii adalah tumbuhan hutan yang memiliki nilai ekonomi tinggi dan bersimbiosis secara obligat dengan cendawan ektomikoriza dari kelompok Ascomycota ataupun Basidiomycota. Peran cendawan Ascomycota sebagai cendawan ektomikoriza pada tumbuhan inang di hutan beriklim sedang, sudah banyak dipelajari, namun peran nya di hutan tropis, khususnya pada P. merkusii di Indonesia belum banyak dipelajari. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi cendawan ektomikoriza Ascomycota asal perakaran Shorea spp. dan mempelajari karakteristik ektomikorizanya, respon tumbuh, serta serapan fosfat (P) pada inang P. merkusii. Cendawan hasil isolasi yang diamati karakteristik koloni dan hifanya hanya 6 isolat yang diduga sebagai ektomikoriza berdasarkan hasil sekuen daerah ITS rDNA. Namun, hanya satu isolat yang digunakan sebagai perwakilan cendawan uji untuk mempelajari kemampuannya membentuk ektomikoriza, respon tumbuh, serta serapan fosfat (P) pada inang P. merkusii. Isolat cendawan Ascomycota PM2 koleksi Divisi Mikologi, Departemen Biologi, FMIPA IPB yang diisolasi dari P. merkusii digunakan sebagai kontrol positif dalam penelitian ini. Identifikasi molekuler juga dilakukan pada cendawan kontrol positif . Analisis pohon filogenetik menggunakan model Kimura 2-parameter dengan analisis neighbor joining, bootstrap 1000x pada MEGA 6. Serapan P dianalisis menggunakan metode Bray 1. Inang yang digunakan merupakan bibit hasil perkecambahan biji P. merkusii setelah berumur satu bulan pada media tanam zeolit steril di rumah kaca. Pasir dan tanah digunakan sebagai media tanam bibit P. merkusii dengan perbandingan pasir dan tanah sebesar 9:1. Masing-masing bibit P. merkusii diinokulasi dengan cendawan uji, cendawan kontrol positif, dan agar-agar MMN (kontrol negatif). Setiap perlakuan dipelihara di rumah kaca, disiram setiap hari dengan air steril, dan dipelihara selama tujuh bulan. Setiap minggu tanaman disiram 100 mL pupuk cair larutan MMN 10 % yang mengandung 50 % P tanpa agar-agar dan gula. Penyiraman dilakukan pada pagi dan sore hari. Rancangan percobaan yang digunakan berupa rancangan acak lengkap, dengan masing-masing perlakuan sebanyak 3 ulangan. Akar yang terkolonisasi oleh cendawan uji ataupun cendawan kontrol positif (hasil sintesis ektomikoriza) dianalisis kemiripan sekuennya terhadap inokulan. Sebanyak 14 isolat cendawan berhasil diisolasi dari 60 sampel akar Shorea spp. asal Kawasan Hutan Haurbentes, Jasinga, Bogor, Indonesia. Sebanyak 6 dari 14 isolat merupakan cendawan ektomikoriza. Struktur somatik ke-enam cendawan tersebut berupa hifa steril dan terdapat anastomosis hifa. Morfologi cendawan SL1 yang digunakan sebagai cendawan uji yaitu permukaan koloni iii bertekstur licin, bagian tengah koloni putih, pertumbuhan koloni 25 mm dalam satu bulan pada media MMN. Hifa hialin, septat, tidak memiliki sambungan apit (clamp connection), terdapat anastomosis hifa, dan diameter hifa 2.61 – 4.5 μm. Hasil BLAST-N daerah ITS1, 5.8S, dan ITS2 rDNA pada enam isolat cendawan, memiliki kesamaan dengan Cistella spicicola CBS 731.97 (GU727553) sebesar 91-92%. Analisis filogenetik menunjukkan ke-enam isolat cendawan, merupakan anggota Helotiales, dan genus Cistella, namun berbeda dengan Cistella spicicola CBS 731.97. Oleh karena itu ke-enam cendawan yang diperoleh dalam penelitian ini, diidentifikasi sebagai Cistella sp. SL1, Cistella sp. SS2, Cistella sp. SP3, Cistella sp. SS4, Cistella sp. SC5, dan Cistella sp. SC6. Morfologi cendawan PM2 yang digunakan sebagai
Keyword: Helotiales, ITS rDNA, pohon filogenetik, persen kolonisasi, serapan P

Judul: Identifikasi dan Karakteristik Fisiologi Isolat Asal Ektomikoriza Pinus merkusii
Abstrak: Pinus sp. merupakan tanaman obligat ektomikoriza (ECM) yang tersebar di berbagai belahan bumi. Indonesia ditumbuhi oleh satu jenis spesies saja yaitu P. merkusii. Tanaman ini memiliki berbagai manfaat dari segi lingkungan maupun ekonomi. P. merkusii digunakan sebagai tanaman untuk reboisasi lahan kritis dan sebagai penyimpan cadangan karbon. Selain itu kayu dan resinnya diproduksi secara massal untuk keperluan kebutuhan papan dan bahan baku industri farmasi. Sebagian besar cendawan ECM yang berasosiasi dengan tanaman ini berasal dari divisi Basidiomycota. Berbagai penelitian telah banyak mengulas cendawan ECM dari divisi ini. Cendawan Ascomycota yang secara suksesi lebih stabil karena mengkolonisasi struktur akar yang lebih dalam masih kurang mendapat perhatian. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi dan mempelajari kemapuan fisiologisnya yang dapat membantu meningkatkan respon pertumbuhan inang. Hasil identifikasi menunjukan bahwa isolat Ascomycota yang diperoleh dari ECM P. merkusii adalah genus incerta serdis Scytalidium sp. dari ordo Letiomycetes dan dua isolat dari ordo Helotiales. Salah satu isolat ordo Helotiales tersebut masih belum dapat diindetifikasi lebih jauh sehingga disebut sebagai Helotiales sp. sedangan isolat berikutnya teridentifikasi sebagai genus Glutinomyces. Kedua isolat Helotiales tersebut pada penelitian sebelunya diketahui sebagai cendawan mikoriza non ECM yang diduga sebagai mikoriza golongan ericoid. Sedangkan Scytalidium sp. yang digunakan pada penelitian ini sebelumnya diketahui dapat berasosiasi dengan sclerotium Cenococcum. Kemapuan ketiga isolat tersebut dalam melarutkan fosfat dan menghasilkan hormon IAA serta kinetin dibandingakn dengan C. geophilum yang diketahui memang memiliki karakteristik fisologis tersebut. Hasil dari analisis pelarutan fosfat dapat dikatakan cukup baik. Glutinomyces sp. melarutkan fosfat terbanyak diikuti C. geophilum, Scytalidium sp., dan Helotiales sp. pada media dengan sumber P berasal dari rock phosphate dan sumber C dari glukosa. Kemampuan dalam menghasilkan IAA tanpa prekursor terbanyak dihasilkan oleh Scytalidium sp. yang diikuti oleh Glutinomyces sp., Helotiales sp., dan C. geophilum. Sedangkan kempuan sintesis kinetin tanpa prekursor tertinggi secara berurutan dihasilkan oleh Scytalidium sp., C. geophilum, Glutinomyces sp., dan Helotiales sp. Hasil tersebut dibandingkan dengan perlakuan langsung pada tanaman P. merkusii tidak sepenuhnya sesuai ekspektasi. Hanya C. geophilum sebagai kontrol (+) yang dapat meningkatkan respon tumbuh inang karena hanya isolat ini satusatunya yang dapat membentuk kolonisasi. Sedangkan ketiga isolat yang digunakan pada penelitian ini belum dapat meningkatkan respon pertumbuhan jika dibandingkan dengan kontrol (-) yang kemumngkinan dikarenakan tidak terbentuknya struktur kolonisasi pada akar.
Keyword: scomycota, ECM, fosfat, iaa, kinetin, Pinus merkusii, respon tumbuh

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: