Judul: Penambatan Molekuler Katekin, Kaempferol dan Kuersetin terhadap Aktivitas Inhibisi Protein Tirosin Fosfatase 1B.
Abstrak: Protein tyrosine phosphatase 1B (PTP1B) yang terekspresikan secara berlebihan oleh penderita diabetes mellitus tipe II menjadi regulator negatif dalam transduksi sinyal insulin. Katekin dalam teh telah terbukti dapat menghambat PTP1B pada domain katalitiknya secara in vitro. Kaempferol dan kuersetin telah teruji sebagai antidiabetes secara in vivo. Penelitian ini bertujuan menentukan interaksi inhibisi senyawa katekin dan isomernya, kaempferol, serta kuersetin terhadap PTP1B melalui simulasi penambatan molekuler. Substrat fosfotirosin digunakan sebagai kontrol dan thiazolidindion sebagai pembanding. Metode terdiri atas preparasi ligan dan PTP1B, analisis stabilitas, bioaktivitas dan toksisitas ligan, analisis kestabilan PTP1B, validasi metode penambatan, serta penambatan molekuler. Interaksi hidrofobik ligan dengan Cys215, Tyr46 dan Gln262 penting terbentuk dalam mekanisme inhibisi kompetitif yang spesifik terhadap PTP1B. Ligan dengan daya inhibisi tertinggi hingga terendah adalah (-)-Epikatekin, (+)-Katekin, (+)-Galokatekin, (-)-Epigalokatekin, (+)-Epigalokatekin, Kuersetin, (-)-Katekin, (-)-Galokatekin, Kaempferol, dan (+)-Epikatekin. (-)-Epikatekin, (+)-Katekin, dan (+)-Galokatekin berpotensi tinggi sebagai inhibitor kompetitif yang spesifik PTP1B, sedangkan ligan uji sisanya kurang potensial sebagai inhibitor kompetitif.
Keyword: PTP1B, penambatan molekuler, katekin, kaempferol, kuersetin

Judul: Penambatan Molekul Kuersetin dan Turunan Katekin sebagai Inhibitor TNF Alpha secara In Silico
Abstrak: Diabetes Melitus (DM) terbagi menjadi dua jenis yaitu diabetes tipe 1 dan tipe 2. DM tipe 2 dapat terjadi karena adanya sel-sel tubuh resisten terhadap insulin. Senyawa antioksidan dapat menetralisir radikal bebas sehingga dapat mencegah penyakit degeneratif DM. Kuersetin dan katekin merupakan salah satu contoh senyawa antioksidan yang dapat memberikan efek antidiabetik. Senyawa tersebut sebagai ligan dan TNF-α sebagai reseptor. TNF-α merupakan mediator yang secara kritis terlibat dalam pengembangan resistensi insulin dan patogenesis DM tipe 2. Penelitian ini bertujuan mempelajari interaksi molekuler dengan teknik penambatan molekul serta menguji senyawa katekin dan kuersetin dalam menginhibisi TNF-α untuk memperbaiki sensitivitas membran sel terhadap insulin. Ligan uji yang digunakan epikatekin galat, epigalokatekin, katekin, epikatekin, epigalokatekin, dan kuersetin. Penelitian ini menggunakan perangkat lunak seperti AutoDock Vina, MarvinView, Ligplot+, PROCHECK, dan Discovery Studio Visualizer. Hasil terbaik yang diperoleh yaitu senyawa epikatekin galat memiliki energi afinitas sebesar -7.9 kkal/mol dan nilai konstanta inhibisi sebesar 1.595 μM. Residu asam amino yang berperan dalam sisi pengikatan ligan terhadap reseptor yaitu Tyr119 dan Tyr151. Simpulan dari penelitian ini senyawa turunan katekin dan kuersetin memiliki potensi yang baik dalam menurunkan aktivitas TNF-α yang menyebabkan peningkatan pemasukan glukosa ke dalam sel melalui mekanisme inhibisi reseptor TNF-α., Diabetes Melitus (DM) is divided into two types DM type 1 and type 2. T2DM can occur due to the presence of body cells resistant to insulin. Antioxidant compounds can neutralize free radicals to prevent degenerative diseases of DM. Quercetin and catechins are one example of antioxidant compounds that can give an antidiabetic effect. These compounds are as ligands and TNF-α as receptors. TNF-α is a mediator that is critically involved in the development of insulin resistance and pathogenesis T2DM. This study aims to study molecular interactions with molecular docking techniques and to examine catechins and quercetin compounds in inhibiting TNF-α to improve cell membrane sensitivity to insulin. The test ligands used were epicatechin gallate, epigalocatekin, catechin, epicatechin, epigalocatekin, and quercetin. This research uses software such as AutoDock Vina, MarvinView, Ligplot +, PROCHECK, and Discovery Studio Visualizer. The best results obtained were that the epicatechin gallate compound had an energy affinity of -7.9 kcal / mol and inhibition constant value of 1.595 μM. The amino acid residue that plays a role in the binding of ligands to the receptor is Tyr119 and Tyr151. The conclusion of this study that catechin and quercetin derivatives have good potential in reducing TNF-α activity which causes an increase in glucose entry into cells through the mechanism of receptor inhibition.
Keyword: DM type 2, in silico, quercetin, receptor TNF Alpha, catechin derrivates

Judul: Pengembangan Robot Jelajah Bawah Air (RJBA V. 2014) untuk Eksplorasi Bawah Laut
Abstrak: Remotely Operated Vehicle (ROV) is an underwater robotic vehicle that able to perform the underwater movement controlled from the surface via thetered cable and connected to the control system. The purpose of ROV is to observe and work underwater in accordance with the function of making of the robot itself. The ROV V. 2014 is improvement of the previous ROV developed by the Department of Marine Sciences and Technology, Bogor Agricultural University. The ROV V. 2014 has improved power supply system, thrust system, ballast system, and gripper systems. The making of a ROV is divide into four parts : design, programming, electronics, and mechanical/hardware. This new generation of underwater vehicle has dimensions of 65x35x40 cm, total weight ± 19kg, a system of ballasts with ballast tank 14.879 dm3 volume of space, a wide opening claw gripper with a maximum diameter of 8 cm, and 5 thrusters to move the robot horizontally and vertically, thetered cable of the 28 meter long to the surface and joystick to control the maneuver of the vehicle.
Keyword: joystick, thruster, gripper, ballast system, ROV