Judul: Karakterisasi intron pada gen inositol 1,4,5-triphosphate receptor itpr lebah apis mellifera
Abstrak: Lebah Apis mellifera merupakan salah satu kelompok serangga yang bersifat sosial. Lebah pekerja bertugas mencari pakan dan kembali ke sarang berdasarkan memori yang terbentuk di otak. Bagian otak lebah yang berfungsi mengintegrasikan sinyal yang masuk dari berbagai sumber adalah korpus pedunkulata. Salah satu gen yang terekspresi tinggi di korpus pedunkulata adalah gen inositol 1.4.5- triphosphate receptor (itpr). Gen itpr lebah A. mellifera telah dikarakterisasi sebanyak tiga kilo basa yang terdiri atas tujuh ekson dan enam intron. Ekson satu dan tujuh telah dikarakterisasi berdasarkan CDNA (complementary DNA) dan belum diketahui keberadaan intronnya. Penelitian ini bertujuan untuk mengkarakterisasi runtunan intron pada ekson satu dan tujuh gen itpr. DNA diekstraksi dari toraks lebah pekerja. Peruntunan DNA menggunakan primer yang sama untuk amplifikasi DNA. Hasil peruntunan ekson satu menunjukkan terdapat intron berukuran 83 basa. Intron tersebut diawali dengan basa GT dan diakhiri dengan basa AG. Komposisi basa intron didominasi olch basa AT (90,6%) dan diklasifikasikan ke dalam fase 0. Peruntunan ekson tujuh belum berhasil dilakukan karena kemungkinan daerah penempelan primer pada DNA target hasil purifikasi telah tidak ada.
Keyword: 

Judul: Karakterisasi Ekson dan Intron Gen Defensin 1 pada Apis cerana dan A. dorsata.
Abstrak: Gen defensin lebah menyandikan peptida defensin yang berfungsi untuk mempertahankan tubuh dari bakteri Gram positif dan terdapat dua gen defensin, yaitu gen defensin 1 dan 2. Penelitian ini bertujuan mengkarakterisasi gen defensin 1 yang terdiri dari ekson 2, intron dan ekson 3 pada A. cerana dan A. dorsata asal Indonesia. DNA gen defensin 1 sampel A. cerana dan A. dorsata diamplifikasi menggunakan primer yang didisain berdasarkan GenBank A. mellifera. Sekuen DNA dan asam amino deduksi dianalisis secara bioinformatika. Panjang sekuen DNA gen defensin 1 sampel A. cerana dan A. dorsata yang didapat berturut-turut sebesar 479 dan 458 pb dan panjang asam amino deduktif kedua sampel berturut-turut sebesar 66 dan 65 dengan 6 asam amino sistein yang diduga menyebabkan terbentuknya ikatan α dan β pada peptide sehingga memungkinkan melisis membran sel bakteri melalui pembentukan pori. Variasi nukleotida di antara spesies A. cerana asal Indonesia dan Korea hanya terdapat pada intron 2 sedangkan antara A. dorsata Indonesia dan Malaysia terdapat pada intron 2 dan ekson 3. Topologi pohon filogeni lebah hasil kontruksi berdasarkan gen defensin 1 mendukung penelitian sebelumnya yaitu A. cerana dan A. dorsata berkerabat lebih dekat dengan A. mellifera dibandingkan dengan A. florea.
Keyword: gen defensin 1, pertahanan koloni lebah, filogeni lebah Apis, variasi intron

Judul: Thermal Characteristics and Dynamics of Tropical Cyclone over Western North Pacific Ocean: A Case Study of Typhoon Songda (Chedeng) 2011
Abstrak: The frequent occasion of Tropical Cyclone (TC) over Western North Pacific (WNP) Ocean lies from 10˚N to 26˚N and 121˚E to 170˚E. Sources of TC development come from warm ocean temperature where latent heat is released during condensation processes and subsequently concentrated in the boundary layer. Relative humidity at 850-700 hPa is responsible to produce the most intense storm. Meanwhile, weak vertical wind shear between 850-200 hPa is one of the dynamical factors that lead to the development of TC. Pressure level of 850-200 hPa is chosen to minimize the thermodynamic effect in the lower troposphere. Typhoon Songda (Chedeng in the Philippines) or TSC lasted from May 18th to 30th, 2011 and strengthened into powerful Super Typhoon stage between May 24th and 27th. Long curving track and the exhibition of all sequences of TC life cycle, TSC is then considered as an ideal case of TC. The objective of the study with case of TSC is to investigate the role of thermal characteristics and dynamics on TC intensity. The research is carried out by using Advanced Research of Weather Research and Forecasting model (WRF ARW model) version 3.3. Two domains are employed in the model. The first domain situate from 02˚N to 40˚N and 118˚E to 149˚E and cover spatial resolution () of 33.1 km. The second domain situate from 09˚N to 27˚N and 119˚E to 132˚E with of 11 km. Timestep of the model () is 120 seconds. The model is supported by the following physical parameterization, i.e., Yonsei University Scheme (YSU) in the boundary layer, Kain-Fritsch scheme (KF) in the cumulus, and WRF Single-Moment 3-class scheme in the microphysics. Initial meteorological condition prior to the formation of the cyclone is generated using WRF ARW standard-release model. Sensitivity of the model output is obtained from a selected single-parameter change scenarios, namely, 10 % to 20 % decrease and increase of wind shear initial data at 850-200 hPa, and by 10 % to 20 % decrease of relative humidity initial data at 850-700 hPa. The result showed that the negative correlations between wind shear and intensity are found in wind shear scenarios. Wind shears of 10 ms-1 which lead to strengthening of the wind intensity in the early period of Typhoon development are found in wind shear scenarios. The effect of wind shear changes on wind intensity is statistically significant in the 20 % wind shear scenarios. During mature stage, weak wind intensity occurred when wind shear increase as given in the WRF standard-release and the 20 % decreasing scenario. Different situation is found in the 20 % increasing scenario where wind shear tend to weak and lead to strong wind intensity at this stage. Meanwhile, the reduction of moisture supply at 850-700 hPa resulting from 20 % decreasing relative humidity play a major role in the weakening of wind intensity and reduces mechanical energy of the cycle process as much as 300 J kg-1.
Keyword: