Judul: Penampakan biofilm pada Escherichia coli enteropatogen
Abstrak: Escherichia coli enteropatogen (EPEC) merupakan salah satu bakteri penyebab diare di negara-negara berkembang. Bakteri ini mampu melekat pada mukosa usus dan menyebabkan lessi pada mikrofili. Biofilm merupakan salah satu usaha mikroorganisme untuk bertahan hidup di lingkungannya, yang terbentuk dari sekumpulan mikroorganisme beserta produk ekstraseluler yang dihasilkannya dan melekat pada substrat biologi seperti sel, jaringan dan matrik polimer maupun substrat non biologi termasuk substrat sintetik. Penelitian secara in vitro telah dilaporkan, adanya korelasi positif antara virulensi dengan kemampuan membentuk biofilm pada Salmonella enteritidis. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan informasi mengenai pembentukan biofilin pada EPEC, dengan harapan dapat digunakan untuk pengembangan strategi pengendalian terhadap infeksi EPEC. Empat galur EPEC yaitu K 1.1, RB 1.2, D 44 dan I 2.5, kontrol negatif Escherichia coli (E. coli) non patogen serta kontrol positif Salmonella sp telah digunakan dalam penelitian ini. Uji pembentukan biofilm dilakukan dengan mengkulturkan berbagai konsentrasi bakteri ke dalam adherent test medium (ATM) dan diinkubasi dalam orbital shaker suhu 37°C dengan kecepatan 200 rpm. Seluruh galur EPEC dan Salmonella sp. mampu membentuk biofilm yang ditandai dengan terbentuknya filamen pada dinding tabung, sedangkan E. coli non patogen tidak menampakan kemampuan tersebut. Konsentrasi minimal bagi EPEC untuk membentuk biofilm adalah 10' sel/ml. Penambahan 1 mg/ml nitrogen. 10 mg/ml dan 5 mg/ml fosforus, 0.02 mg/ml magnesium menghambat pembentukan biofilm sedangkan penambahan 0.01 mg/ml kalsium, 0.014 mg/ml besi, dan 5 mg/ml sulfur mampu meningkatkan pembentukan biofilm. Biofilm E. coli yang terbentuk dilihat proteinnya dengan elektroforesis Sodium Dodecyl Sulfate (SDS) poliakrilamid 12,5%. Hasil yang diperoleh menunjukkan adanya pita-pita protein yang mirip antara keempat galur EPEC yang tidak dijumpai pada E. coli non patogen.
Keyword: Biofilm

Judul: karakterisasi Biofilm Pada escherichia coli Enteropatogen
Abstrak: Escherichia coli Enteropatogen (EPEC) merupakan bakteri penyebab penyakit diare pada bayi dim anak-anak di negara berkembang. Secara in vitro, bakteri EPEC Kl.l, D4.4, 12.5 dan RBl.2 mampu membentuk biofilm pada substrat kaca. Dalam penelitian ini dilakukan karakterisasi biofilm pada EPEC yang diisolasi dari penderita diare. Sebanyak 30 isolat EPEC diuji pembentukan biofilmnya dengan menginkubasi bakteri dalam adherence lest medium dengan kecepatan 200 rpm selama 24 jam. Biofilm yang terbentuk ditentukan konsentrasi proteinnya dengan metode Bradford. Karakterisasi di lakukan pada 7 isolat dengan menguji pembentukan biofilm pada berbagai pH dan suhu. Visualisasi lipopolisakarida dan protein dalam biofilm masing-masing menggunakan SDS poliakrilamid 15 dim 12.5%.
Keyword: 

Judul: Utilization of terra/MODIS L1B data for analysis of horizontal wind profile in the troposphere
Abstrak: This study was concerned with horizontal wind derived from data collected with the Moderate-resolution Imaging Spectroradiometer (MODIS) on board the NASA’s Earth Observation System (EOS)-Terra satellite. The aim of this study is to develop a method for the estimation of horizontal wind movement in the troposphere based on Navier-Stokes equation. The method was applied to a calibrated and geolocated Terra/MODIS L1B 1 km data set. The data inputs to estimate surface temperature are retrieved from TIR (Thermal Infrared) bands 31 (10.780 μm to 11.280 μm) and 32 (11.770 μm to 12.270 μm). The obtained surface temperatures were later used to approximate geopotential height on a constant-pressure surface by using the modified Poisson equation. The main assumptions used are the hydrostatic equilibrium, ideal gas law, constant lapse rate and constant acceleration of gravity. Based on the distribution of geopotential height, the pressure gradient force is measured by the gradient of geopotential on an isobaric coordinate to present the horizontal wind profile. For certain topographic areas especially in the mountain ranges, there was a disadvantage of using pressure as a vertical coordinate which lead to inaccuracy. In spite of that, Terra/MODIS L1B data with 1 km spatial resolution can be used to estimate the horizontal wind movement in the troposphere.
Keyword: