Judul: Fluktuasi Ketinggian Tropopause Tropis Dengan Menggunakan Analisis Komponen Utama Dan Spektral
Abstrak: Data ERA-Interim ECMWF dengan parameter ketinggian geopotensial level 100 mb di kawasan tropis selama 30 tahun (Januari 19981 – Desember 2010) digunakan untuk mengidentifikasi fluktuasi tinggi tropopause kawasan tropis. Pola – pola fenomena pembangkit fluktuasi ketinggian tropopause di wilayah kajian teridentifikasi dengan menggunakan metode Analisis Komponen Utama (PCA), analisis spektrum, dan analisis spektrum silang. Tiga komponen utama mampu merepresentasikan 90.4% dari variabilitas total fluktuasi ketinggian tropopause di wilayah tropis. Analisis spektral pada ketinggian komponen utama menunjukkan bahwa fluktuasi ketinggian tropopause tropis didominasi oleh periode 12 bulan dan 45 bulan yang merupakan variasi insolasi orbital dan El Niño-Southern Oscillation (ENSO), sedangkan fenomena lainnya Quasi-Biennial Oscillation (QBO) dan Madden-Julian Oscillation (MJO). Fenomena tersebut memiliki pengaruh yang merata untuk wilayah tropis. Komponen utama kedua menunjukkan bahwa fluktuasi tinggi tropopause di lintang 15o - 20o lebih dipengaruhi oleh variasi insolasi musiman. Komponen utama ketiga dipengaruhi oleh fenomena Semi-Annual Oscillation (SAO) yang berkorelasi tinggi di wilayah ekuator. Respon setiap fenomena tertentu memiliki selisih waktu (time lag) terhadap tinggi tropopause.
Keyword: Analisis Komponen Utama, analisis spektral, geopotensial, insolasi musiman, insolasi orbital

Judul: Identifikasi Pola Medan Suhu di Lapisan Tropopause Kawasan Pasifik Tropis
Abstrak: Fluktuasi suhu tropopause di kawasan pasifik tropis dianalisa dengan menggunakan analisis komponen utama (PCA) dan analisis spektrum. Analisis Komponen utama menunjukkan bahwa 2 komponen utama mempresentasikan 93.1% dari total variabilitas fluktuasi suhu tropopause di kawasan kajian. PCA 1 memiliki osilasi 12 bulan dan 6 bulan sedangkan PCA 2 memiliki osilasi dominan 45 bulan. Osilasi 12 bulan dipengaruhi oleh variasi insolasi akibat orbital bumi, osilasi 6 bulan disebabkan oleh SAO (Semi Annual Oscillation), dan osilasi 45 bulan oleh fenomena ENSO (El-Nino Southern Oscillation). Distribusi vektor eigen PCA 1 menunjukkan bahwa fenomena osilasi 12 bulan dan 6 bulan berinteraksi dengan sel Hadley sehingga fluktuasi suhu tropopause lebih dominan di wilayah Pasifik Tropis bagian Timur namun adanya pengaruh ENSO yang berinteraksi dengan sirkulasi Walker mengakibatkan distribusi vektor eigen PCA lebih berfluktuasi di Pasifik Tropis bagian Barat. Suhu tropopause akan merespon insolasi setelah 1 bulan kemudian.
Keyword: Suhu tropopause, Analisis komponen utama, Spektral, Sirkulasi Walker, Sel Hadley

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA