Judul: Pemetaan struktur dasar laut dengan menggunakan sub bottom profiler dan side scan sonar
Abstrak: Akuisisi data akustik dengan topik Pemetaan Struktur Dasar Laut dengan menggunakan Sub Bottom Profiler dan Side Scan Sonar, dilaksanakan pada Desember 2006-Februari 2007 di BPPT, Jakarta, dengan wilayah kajian Perairan Pulau Kangean. Pemrosesan data akustik dilakukan dengan prinsip image processing dan pemodelan. Pemrosesan data dilakukan dengan prinsip image processing dan pemodelan. Pemrisessan dimulai dengan konversi data hardcopy menjadi digital, penetapan titik-titik koordinat, klasifikasi dan generalisasi, pemodelan permukaan dan lapisan, overlay data akustik dengan sampel coring dan bathimetri, penetapan dan koreksi obyek pada dasar laut, layout berupa peta dan model volume lapisan.
Keyword: 

Judul: Komputasi Data Side Scan Sonar Klein 3000 untuk Identifikasi Target Dasar Laut
Abstrak: Side scan sonar memberikan informasi mengenai topografi dasar laut yang sangat diperlukan dalam berbagai aplikasi kelautan seperti jalur aman bagi pelayaran, industri kelautan, survei rute pipa dan kabel bawah laut, deteksi bahan tambang, pencarian daerah tangkapan khususnya ikan demersal, pencarian kapal karam, dan sebagainya. Penelitian ini dapat memberikan informasi kuantitatif berupa nilai backscatter dalam desibel dari objek atau target yang terdeteksi. Tujuan dari penelitian ini adalah menganalisis data side scan sonar secara kuantitatif dan kualitatif serta memperjelas hasil image processing dari side scan sonar menggunakan transformasi wavelet kontinu. Lokasi survei berada di Perairan Selat Sunda pada koordinat 5° 40' 00" LS - 6° 00' 00" LS dan 105° 40' 00" BT - 106° 10' 00" BT. Pengolahan data dilakukan di Laboratorium Akustik Kelautan, Departemen Ilmu dan Teknologi Kelautan, Institut Pertanian Bogor dan di Pusat Penelitian dan Pengembangan Geologi Laut (PPPGL) di Bandung. Interpretasi dan klasifikasi data akustik side scan sonar dilakukan secara kualitatif dengan menggunakan software SonarPro untuk mengetahui dimensi atau ukuran dari target. Pemrosesan data secara kuantitatif menggunakan software sonarWiz.MAP, SonarWeb, xtfToSegy, seisSee dan Matlab dengan metode wavelet.
Keyword: 

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA