Judul: IPB (Bogor Agricultural University)
Abstrak: Infeksi busuk buah pada buah mangga buah disebabkan oleh Lasidiplodia theobromae (Pat.) Griffon & Maubl. (syn. Botryodiplodia theobromae Pat.) mencapai 54% dari total volume ekspor. Hal ini menjadi masalah utama dalam ekspor mangga Indonesia. Pengendalian hayati terpadu selama penyimpanan digunakan sebagai alternatif penggunaan fungisida dalam pengendalian penyakit. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui potensi khamir dan kitosan dalam pengendalian busuk buah mangga selama penyimpanan. Perlakuan tunggal secara in vitro dilakukan dengan uji antagonis, uji kitinolitik khamir, perlakuan kitosan (konsentrasi 0,1%, 0,5%, 1%, 1,5%, dan 2% v/v), dan perlakuan thiram (konsentrasi 0,001%, 0,01%, 0,1%, 0,3%, 0,5%, 0,7%, dan 1% b/v). Perlakuan secara in vivo dilakukan dengan pencelupan isolat uji khamir (20 isolat) , kitosan (0,01%, 0,025%, 0,05%, 0,1%, 0,5%, 1%, 1,5%, dan 2% v/v), dan thiram (konsentrasi 0,1% dan 0,3% b/v) pada buah mangga. Perlakuan kombinasi secara in vivo dengan pencelupan khamir dan kitosan dalam menekan penyakit busuk buah dan mempertahankan penampilan fisik buah. Penelitian ini disusun dalam rancangan acak lengkap dengan 3 ulangan dengan uji berjarak Duncan (DMRT). Cryptococcus albidus var aerius IPB1, C. albidus var aerius PB2, Candida edax IPB, C. terreus A IPB, C. luteolus, C. edax 13, dan C. albidus var aerius 6 mempunyai aktivitas penghambatan terhadap B. theobromae secara in vitro. C. albidus var aerius IPB1 paling efektif dalam menghambat patogen dibandingkan perlakuan khamir lainnya dan kontrol. Aktivitas kitinolitik hanya ditunjukkan oleh Buleromyces albus 7 dan C. edax 13 dengan adanya zona bening pada koloidal kitin agar pada hari ke-7 inkubasi. Konsentrasi kitosan paling efektif dalam menghambat pertumbuhan patogen adalah 2% (v/v) pada hari ke-3 inkubasi dengan tingkat hambatan relatif sebesar 89,74%. Pada uji in vivo, C. albidus var aerius IPB1, Pichia guilliermondi A1, Debaryomyces hansenii C12, Rhodotorula glutinis, dan C. edax 13 mampu menghambat patogen. C. albidus var aerius IPB1 paling efektif dalam menghambat dibandingkan perlakuan khamir lainnya. Konsentrasi kitosan dan thiram paling efektif dalam menghambat pertumbuhan pathogen adalah 2% (4 hari setelah inkubasi) dengan tingkat hambatan relatif sebesar 89,74% dibandingkan pengujian lainnya. Kombinasi C. albidus var aerius IPB 1, R. glutinis, D. hansenii C 12, C. edax 13 dan kitosan menunjukkan pengaruh penghambatan lebih tinggi terhadap penyakit daripada perlakuan tunggal
Keyword: 

Judul: Taktik Pengendalian Busuk Batang Jeruk (Botryodiplodia Theobromae Pat.) Oleh Khamir, Fungi Mikoriza Arbuskular, Dan Kitosan
Abstrak: Penyakit busuk batang (Botryodiplodia theobromae (Pat.)) merupakan salah satu masalah dalam produksi jeruk di Indonesia. Pemanfaatan agens hayati dan kitosan menjadi prioritas dalam komponen pengendalian karena potensinya dalam pengendalian penyakit tanaman telah banyak dilaporkan. Agens hayati seperti khamir dan fungi mikoriza arbuskular (FMA) memiliki berbagai mekanisme dalam menekan perkembangan penyakit tanaman. Khamir telah banyak dimanfaatkan dalam pengendalian penyakit pascapanen dan memperpanjang daya simpan buah dan benih namun laporan tentang pemanfaatan khamir dalam pengendalian penyakit di lapangan belum banyak dilaporkan. Selain memanfaatkan FMA secara langsung, juga dilakukan isolasi bakteri-bakteri simbiotik dari FMA yang diduga berperan sebagai helper bacteria. Kitosan juga diketahui mampu menekan perkembangan penyakit tanaman dengan konsentrasi optimum tertentu yang bergantung pada jenis patogen dan jenis tanamannya. Namun, penelitian tentang potensi khamir, FMA serta bakteri simbiotiknya, kitosan dalam pengendalian penyakit busuk batang jeruk dan mekanismenya belum banyak dilaporkan. Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi potensi khamir, FMA, bakteri simbiotik FMA, dan kitosan baik secara tunggal maupun kombinasi untuk memperoleh taktik dalam mengendalikan penyakit busuk batang jeruk. Mekanisme-mekanisme pengendalian langsung dan tidak langsung dari agens hayati dan kitosan juga dievaluasi pada penelitian ini. Penelitian dilaksanakan di Laboratorium Mikologi Tumbuhan dan Laboratorium Bakteriologi Tumbuhan, Departemen Proteksi Tanaman, Rumah Kaca Cikabayan IPB, dan Laboratorium Pusat Studi Biofarmaka LPPM IPB pada bulan Januari sampai Agustus 2016. Khamir yang digunakan adalah isolat YP koleksi Klinik Tanaman IPB, FMA yang digunakan merupakan formulasi granul komersial, bakteri simbiotik diisolasi dan diseleksi dari FMA, dan kitosan yang digunakan diperoleh dari Departemen Teknologi Hasil Perairan IPB dalam bentuk serbuk yang diseleksi konsentrasi optimumnya. Pengujian-pengujian in vitro yang dilakukan adalah potensi produksi senyawa volatil, produksi enzim kitinase, antibiosis, dan hiperparasitisme dari khamir dan isolat-isolat bakteri hasil isolasi dari FMA, dan penentuan konsentrasi kitosan melalui pengujian penghambatan pertumbuhan radial B. theobromae dan kompatibilitasnya dengan khamir. Hasil pengujian in vitro adalah khamir memiliki mekanisme hiperparasitisme dengan afinitas 26 sel khamir per hifa B. theobromae, produksi senyawa volatil dengan tingkat hambatan relatif (THR) 29.1%, dan produksi enzim kitinase. Isolat bakteri simbiotik terbaik hasil isolasi dari FMA bersifat non-patogenik, Gram positif, memiliki mekanisme produksi senyawa volatil dengan THR 26.7%, antibiosis dengan THR 42.9%, produksi enzim kitinase, dan memiliki homologi 97% dengan B. subtilis asal Vietnam. 2 Kitosan konsentrasi 0.7% terpilih untuk digunakan pada uji in planta karena menekan pertumbuhan radial B. theobromae dengan THR 48.2% dan kompatibel dengan khamir. Pengujian dilanjutkan pada percobaan di rumah kaca dengan perlakuan: (1) Khamir, (2) FMA, (3) B. subtilis, (4) Kitosan, (5) Khamir+FMA, (6) Kitosan+FMA, (7) Khamir+Kitosan, (8) Khamir+FMA+Kitosan, dan (9) Kontrol dengan 3 ulangan dan 5 unit tanaman untuk masing-masing ulangan. Peubahpeubah yang diamati adalah periode laten, insidensi penyakit, keparahan penyakit, laju infeksi, dan nilai area under disease progress curve (AUDPC). Selain mempelajari aplikasi agens hayati dan kitosan dalam penekanan penyakit busuk batang jeruk, kesembilan perlakuan tersebut juga diberikan pada blok pertanaman tanpa inokulasi B. theobromae untuk melihat ada atau tidaknya pengaruh fitotoksisitas dari aplikasi agens hayati dan kitosan. Peubah lain yang diukur dari aplikasi agens hayati dan kitosan pada tanaman yang diinokulasi dan tidak diinokulasi B. theobromae adalah tingkat asosiasi FMA dan kandungan fenol total. Perlakuan Khamir+FMA+Kitosan menunjukkan periode
Keyword: antibiosis, hiperparasitisme, kitinase, senyawa fenol dan volatil

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: