Judul: Analisis Fertilitas dan Kualitas Genetik Banteng Jawa (Bos javanicus) di Taman Safari Indonesia Bogor
Abstrak: Pemerintah Indonesia telah menyusun strategi dan rencana aksi konservasi (SRAK) banteng (Bos javanicus) yang termuat dalam PerMenHut No. P.58/MENHUT-II/2011. Strategi dan rencana aksi konservasi ini disusun demi mencegah kepunahan salah satu spesies terancam punah berdasarkan P.106/MENLHK/SETJEN/KUM.1/12/2018, sekaligus satwa prioritas tersebut. Kawasan konservasi ex situ seperti Taman Safari Indonesia menjadi bagian yang penting untuk mencapai target populasi internasional tanpa mengganggu populasi di alam. Pertukaran spesies banteng antar lembaga konservasi selain itu, diperlukan untuk menghindari penurunan kualitas genetik maupun inbreeding. Inbreeding dapat berdampak pada penurunan kemampuan reproduksi dan keragaman genetik pada suatu populasi. Rangkaian strategi rencana aksi konservasi (SRAK) tersebut dapat disarikan menjadi dua pokok pikiran utama, yakni pentingnya peningkatan reproduksi dan kualitas genetik. Hal ini juga tertuang dalam Action Indonesia Genetic Specialist Management Plan bertujuan untuk mencapai populasi ex situ yang sehat. Lembaga-lembaga konservasi ex situ diintegrasikan untuk pelaksanaan perkembangbiakan (breeding program) dan rekomendasi transfer satwa dalam rancangan tersebut. Pengembangan teknologi reproduksi berbantuan, khususnya melalui kriopreservasi semen, merupakan metode efektif yang dapat menjadi perwujudan SRAK banteng. Penggunaan semen beku hasil proses kriopreservasi semen memungkinkan transportasi materi genetik jantan banteng jawa dari satu lokasi ke lokasi lain secara efisien. Pemetaan kualitas genetik dari populasi yang ada di dalam suatu lokasi penangkaran juga menjadi hal yang perlu diperhatikan. Hal ini berfungsi sebagai salah satu pencegahan terjadinya penggunaan semen beku untuk perkawinan dengan kekerabatan dekat. Penelitian ini bertujuan untuk mengkaji fertilitas banteng jawa, khususnya banteng jawa jantan sebagai langkah awal pengembangan teknologi reproduksi spesies tersebut. Penelitian ini juga mengevaluasi kualitas genetik banteng jawa yang ada di suatu populasi di lokasi konservasi ex situ, khususnya di Taman Safari Indonesia Bogor (TSI Bogor). Penelitian ini terdiri atas beberapa tahap yang meliputi analisis fertilitas yang dilaksanakan dengan: (i) habituasi dan koleksi semen dan evaluasi semen segar, (ii) kriopreservasi semen dalam kondisi lapang dan evaluasi semen beku (iii) karakterisasi protein kandidat fertilitas, (iv) identifikasi ekspresi gen kandidat fertilitas. Tahapan lain yakni (v) karakterisasi kualitas genetik berdasarkan marka mikrosatelit. Sampel yang digunakan untuk tahapan (i) – (iv) berasal dari tiga ekor banteng jawa jantan yang berada di TSI Bogor. Sampel yang digunakan untuk tahapan (vi) berasal dari enam ekor banteng jawa yang terdiri atas empat ekor jantan dan dua ekor betina yang terdapat di TSI Bogor. Habituasi untuk koleksi semen dengan vagina buatan dan masase transrektal berhasil dilakukan pada penelitian ini dengan pendekatan positive reinforcement. Luaran dari proses habituasi berbeda-beda pada setiap individu, di mana hal ini menjadi dasar untuk metode koleksi semen yang dipilih. Evaluasi kualitas semen segar yang dikoleksi dari tiga ekor banteng jawa pada penelitian ini menunjukkan keragaman kualitas antar-individu. Volume semen, gerakan massa, dan motilitas spermatozoa yang dikoleksi menunjukkan perbedaan signifikan pada metode koleksi yang berbeda. Gambaran ultrasonografi glandula aksesoria jantan, dan komposisi plasma semen juga dilaporkan dalam penelitian ini, dan menjadi laporan pertama pada banteng jawa. Perbedaan signifikan kadar testosteron, dan enzim alkalin fosfatase (ALP) antarindividu juga teramati pada penelitian ini. Penelitian ini juga melaporkan potensi kriopreservasi semen banteng jawa dalam kondisi lapang. Kualitas spermatozoa post-thawing banteng jawa menunjukkan perbedaan signifikan pada seluruh variabel yang diujikan. Hasil menarik ditemukan pada variabel tudung akrosom utuh yang relatif
Keyword: Javan banteng, fertility, microsatellite, semen, banteng jawa, fertilitas, mikrosatelit

Judul: Profil Genetik Banteng Jawa di Taman Nasional di Pulau Jawa Dalam Upaya Mendukung Konservasi Banteng di Indonesia
Abstrak: Spesies satwa liar berkuku genap yang dikenal sebagai banteng (Bos javanicus d'Alton 1832) adalah anggota keluarga mamalia ruminansia. Banteng termasuk dalam genus mamalia, famili Bovidae, dan subfamili Bovinae dengan genus Bos dan spesies Bos javanicus d'Alton 1832. Secara taksonomi banteng dibagi menjadi tiga subspesies berdasarkan distribusi geografisnya yaitu B. j. javanicus di Jawa dan Bali, B. j. lowi di Kalimantan, B. j. birmanicus di daratan Asia. Banteng Jawa sekarang ini hanya dapat ditemukan di kawasan konservasi alam seperti Taman Nasional Ujung Kulon (TNUK), Taman Nasional Baluran (TNB), Taman Nasional Alas Purwo (TNAP), dan Taman Nasional Meru Betiri (TNMB). TNUK dan TNB adalah tempat tinggal bagi 500 ekor banteng dari total populasi sekitar 1.000 ekor di Jawa. Setiap tahun populasi satwa ini mengalami pengurangan yang sangat cepat karena konversi lahan, kerusakan habitat, perburuan, sehingga menjadi ancaman serius bagi kelestarian populasi banteng. Populasi banteng di Pulau Jawa juga terancam oleh predasi ajag (Cuon alpinus) dan di habitat aslinya tidak lagi lebih dari 500 individu. Perkembangan pendekatan konservasi genetik telah sukses dalam menyelamatkan berbagai hewan yang terancam punah. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menemukan informasi genetik yang diperlukan dalam manajemen konservasi maupun sebagai wawasan baru untuk kepentingan konservasi banteng selanjutnya. Secara khusus penelitian ini bertujuan: 1) untuk mendapatkan pemodelan spasial distribusi banteng Jawa dan memprediksi peta kesesuaian habitat dari variabel lingkungan yang mempengaruhi keberadaan banteng Jawa di TNUK, 2)Menganalisis sexing individu banteng Jawa yang terdapat di TNUK, 3) Mendapatkan profil genetik individu banteng Jawa berdasarkan marka mitokondria yaitu gen Cytochrome b baik banteng yang terdapat di TNB, TNMB, TNAP maupun di TNUK yang ditemukan. Upaya konservasi banteng jawa memerlukan informasi tentang distribusi habitat banteng serta pemodelan spasial. Data yang telah ada tidak cukup hanya pada studi tentang penggunaan habitat dan faktor-faktor yang mempengaruhinya saja, sehingga diperlukan data yang lebih mendalam. Pemodelan Entropi Maksimum (MaxEnt) memungkinkan identifikasi penggunaan habitat dan faktor-faktor yang mempengaruhinya dengan demikian dapat diketahui kaitan yang mempengaruhi distribusi dan penyebaran habitat banteng. Banteng Jawa dipengaruhi oleh ketinggian, kelerengan serta tutupan lahan. Hal ini terlihat bahwa pada ketinggian 45 mdpl persentase keberadaannya 95 %, dan grafik keberadaan banteng akan menurun pada ketinggian diatas 45 mdpl dan bahkan pada ketinggian 200 mdpl tidak terlihat lagi (0%). Hal tersebut menunjukkan bahwa banteng Jawa tidak menyukai atau tidak memilih tempat dengan ketinggian berkisar 200 - 625 mdpl. Banteng Jawa lebih menyukai daerah yang datar berkaitan dengan lokasi padang pengembalaan yang berada di areal datar dan terbuka. Rasio jenis kelamin yang seimbang dalam populasi kecil merupakan hal penting untuk pengelolaan dan konservasi spesies yang terancam (endanger). Keberhasilan identifikasi jenis kelamin akan berkontribusi pada keberhasilan upaya mempertahankan keseimbangan populasi. Dengan berbasis jenis sampel non-invasif (feces) dan menggunakan penanda molekuler merupakan cara akurat dalam penentuan jenis kelamin populasi alami belakangan ini. Informasi rasio jenis kelamin tersebut penting untuk pengelolaan banteng di areal konservasi terutama tentang perkiraan perkembangan populasi dimasa akan datang. Amplifikasi PCR dari lokus spesifik jenis kelamin merupakan metode yang paling umum digunakan pada sexing molekuler. Hasil identifikasi jenis kelamin yang dilakukan pada penelitian ini, mampu memilah dengan jelas individu jantan dan betina dari seluruh sampel yang dianalisis.
Keyword: Bos javanicus javanicus, spatial modeling, sexing, conservation

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: