Judul: Analisis enzim pemotong pada polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) untuk mendeteksi campuran daging babi dan sapi
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis beberapa jenis enzim pemotong dalam metode PCR-RFLP untuk mendeteksi pencampuran daging babi dan sapi dalam berbagai konsentrasi. Sampel daging sapi dan babi diperoleh dari pasar di Kota Bogor dan DNA diekstraksi menggunakan metode presipitasi amonium asetat. Primer universal sitokrom b digunakan untuk mengamplifikasi mtDNA menggunakan polymerase chain reaction. Amplikon dipotong menggunakan enzim pemotong Hinf I, Alu I, Hae III, dan Taq I. Hasil memperlihatkan bahwa Hinf I memotong amplikon sapi namun tidak memotong amplikon babi, Alu I memotong amplikon sapi dan babi, Hae III memotong amplikon sapi dan babi, dan Taq I memotong amplikon sapi namun tidak memotong amplikon babi. Enzim Hae III merupakan enzim yang lebih spesifik untuk memperlihatkan hasil pemotongan pada campuran daging babi dan sapi pada konsentrasi rendah daging babi dan konsentrasi rendah daging sapi.
Keyword: Bogor Agricultural University, Institut Pertanian Bogor, IPB, Enzim Pemotong, PCR-RFLP, Sitokrom b, mtDNA;

Judul: Analisis Enzim Pemotong pada Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP) untuk Mendeteksi Campuran Daging Babi dan Sapi
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis beberapa jenis enzim pemotong dalam metode PCR-RFLP untuk mendeteksi pencampuran daging babi dan sapi dalam berbagai konsentrasi. Sampel daging sapi dan babi diperoleh dari pasar di Kota Bogor dan DNA diekstraksi menggunakan metode presipitasi amonium asetat. Primer universal sitokrom b digunakan untuk mengamplifikasi mtDNA menggunakan polymerase chain reaction. Amplikon dipotong menggunakan enzim pemotong Hinf I, Alu I, Hae III, dan Taq I. Hasil memperlihatkan bahwa Hinf I memotong amplikon sapi namun tidak memotong amplikon babi, Alu I memotong amplikon sapi dan babi, Hae III memotong amplikon sapi dan babi, dan Taq I memotong amplikon sapi namun tidak memotong amplikon babi. Enzim Hae III merupakan enzim yang lebih spesifik untuk memperlihatkan hasil pemotongan pada campuran daging babi dan sapi pada konsentrasi rendah daging babi dan konsentrasi rendah daging sapi
Keyword: restriction enzymes, PCR-RFLP, cytochrome b, mtDNA

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: