Judul: Kemungkinan penggunaan beberapa media padatan sebagai media Matriconditioning benih cabai
Abstrak: Percobaan ini bertujuan untuk melihat kemungkinan penggunaan beberapa media padatan sebagai media matriconditioning benih cabai. Percobaan dilaksanakan di Laboratorium Ilmu dan Teknologi Benih dan rumah kaca Kampus Institut Pertanian Bogor. Percobaan menggunakan Rancangan Acak Lengkap (RAL) yang disusun secara faktorial dengan tiga ulangan. Faktor pertama media, yaitu tanpa media (MO), abu gosok (M1), serbuk gergaji (M2), tanah andosol (M3) dan pasir kuarsa (M4). Faktor kedua lama conditioning, yaitu 1 hari (T1) dan 2 hari (T2). Faktor ketiga pengeringan setelah conditioning, yaitu tanpa pengeringan (Pl) dan pengeringan dengan kipas angin (P2). Pengamatan dilakukan terhadap T50 persentase pemunculan radikel (% RE), daya berkecambah (DB), kecepatan tumbuh (KCT) dan bobot kering kecambah normal (BKKN). Hasil penelitian menunjukkan abu gosok, serbuk gergaji, tanah andosol dan pasir kuarsa dapat digunakan sebagai media matriconditioning. Bahan-bahan tersebut secara ideal mempunyai sifat-sifat seperti media yang sudah digunakan dalam matriconditioning. Dari berbagai media yang dapat digunakan untuk perlakuan matriconditioning benih cabai, abu gosok dan serbuk gergaji terbukti paling efektif. Sifat efektifnya ini ditunjukkan dengan berkurangnya secara maksimal waktu yang dibutuhkan untuk mencapai 50% total perkecambahan (T50) serta meningkatnya bobot kering kecambah normal. Conditioning selama 2 hari lebih efektif dibandingkan 1 hari. Pengaruh pengeringan setelah conditioning tidak nyata pada semua tolok ukur, kecuali tolok ukur bobot kering kecambah normal. Pengeringan setelah conditioning menurunkan bobot kering kecambah normal…
Keyword: 

Judul: Pengujian daya simpan dan kesehatan benih cabai, Capsicum annuum L. yang telah diberi perlakuan benih dengan fungisida nabati
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh perlakuan benih dengan fungisida nabati terhadap mutu fisiologis dan kesehatan benih cabai setelah melalui periode penyimpanan pada kondisi simpan berbeda. Percobaan dilakukan di Laboratorium Biologi Molekuler Tanaman, Departemen Agronomi dan Hortikultura, Fakultas Pertanian, IPB pada bulan Februari - Desember 2005. Dalam percobaan ini digunakan benih cabai varietas TIT Super yang telah diinokulasi oleh Pythium spp. dengan tingkat kontaminasi 86%. Penelitian ini menggunakan rancangan split split plot yang terdiri atas petak utama kondisi simpan yaitu ruang non-AC (27-29°C) (K₁) dan ruang ber- AC (16-18°C) (K2), anak petak periode simpan yaitu pada minggu ke-0 (S1), minggu ke-6 (S2), minggu ke-12 (S3), minggu ke-18 (S4), minggu ke 24 (S5) setelah simpan, dan anak-anak petak perlakuan per benih yaitu kontrol benih sehat (T₁), kontrol benih terinfeksi (T2), matriconditioning (T3), Dithane M-45 0.2% (T4), matriconditioning plus minyak cengkeh 0.04% (Ts), matriconditioning plus minyak sereh 0.08% (T6), matriconditioning plus Dithane M-45 0.2% (T7). Kesehatan benih diuji dengan metode blotter test untuk mengetahui tingkat kontaminasi sedangkan mutu fisiologis benih diuji dengan mengecambahkan dalam tray menggunakan arang sekam steril untuk mengetahui viabilitas dan vigor benih dengan peubah potensi tumbuh maksimum, daya berkecambah, indeks vigor, spontanitas tumbuh, T50, laju pertumbuhan kecambah, kecepatan tumbuh relatif. Hasil percobaan menujukkan seluruh perlakuan dan interaksi antar perlakuan memberikan pengaruh yang nyata terhadap peubah-peubah yang diamati, kecuali pada peubah tingkat kontaminasi. Perlakuan matriconditioning, dan matriconditioning plus minyak cengkeh atau plus minyak sereh menunjukkan kecenderungan sebagai perlakuan yang lebih baik daripada perlakuan lainnya karena nilainya lebih tinggi pada peubah potensi tumbuh maksimum, daya berkecambah, spontanitas tumbuh, kecepatan tumbuh relatif dan laju pertumbuhan kecambah. Semua perlakuan benih mampu menurunkan tingkat kontaminasi Pythium spp. (2.94%-10.96%) dibandingkan kontrol (41.3%-60.0%). Agar viabilitas dan vigor benih tetap maksimal maka penyimpanan diutamakan pada kondisi ber-AC. Tingkat efektivitas perlakuan terhadap benih selama penyimpanan relatif dapat dipertahankan selama 18 minggu untuk ruang non-AC dan 24 minggu untuk ruang ber-AC.
Keyword: 

Judul: Penyusunan Overlap Graph menggunakan Suffix Tree pada DNA Sequence
Abstrak: The DNA sequence assembly is very important in genome analysis. This step aims to reconstruct contigous DNA fragment (contigs) from short fragment by concatenating fragments based on the overlap region among them. This method employs overlap graph for solving the problems. In this graph, nodes represent fragments and edges represent overlap. This research developed a software for constructing overlap graph using suffix tree. The evaluation was conducted by measuring the number of nodes, number of edges, and the execution time in many values of minimum overlap. The minimum overlap is defined as the minimum length of substring which is considered as the overlap region between two fragments. The evaluation results showed that the number of nodes, the number of edges, and the execution time were increased with the decreasing of the minimum overlap value.
Keyword: