Judul: Deteksi dan Identifikasi Virus pada Ubi Jalar (Ipomoea batatas L.) di Bogor, Jawa Barat dan Malang, Jawa Timur
Abstrak: Ubi jalar (Ipomoea batatas L.) merupakan salah satu tanaman pangan yang penting dan Jawa merupakan salah satu produsen ubi jalar terbesar di Indonesia. Salah satu faktor yang menjadi pembatas produksi tanaman ubi jalar yaitu adanya infeksi virus. Banyak gejala seperti infeksi virus ditemukan di lapangan, namun masyarakat tidak mengetahui gejala maupun identitas virus pada ubi jalar. Hal ini menyebabkan penyebaran infeksi virus yang semakin meluas karena tidak adanya upaya pengendalian yang dilakukan. Penelitian ini bertujuan mendeteksi dan mengidentifikasi virus pada ubi jalar dengan pendekatan molekuler. Sampel yang bergejala diambil pada beberapa pertanaman ubi jalar di Bogor, Jawa Barat dan Malang, Jawa Timur. Insidensi penyakit diamati berdasarkan gejala dan dideteksi dengan Dot Immunobinding Assay (DIBA), sedangkan identifikasi virus dilakukan dengan menggunakan Polymerase Chain Reaction (PCR) dan perunutan DNA. Berdasarkan pengamatan, insidensi penyakit yang dominan ditemukan di lapangan yaitu bercak kuning sekitar 16.2-100%, bercak ungu tidak beraturan sekitar 9.3-70%, dan bercak ungu beraturan sekitar 13.3-60%. Hasil DIBA menunjukkan bahwa dari 33 sampel yang dideteksi terdapat 18 sampel positif terhadap antiserum Potyvirus, 3 sampel positif terhadap antiserum Cucumber mosaic virus (CMV), dan negatif terhadap antiserum Sweet potato mild mottle virus (SPMMV). RT-PCR sampel bergejala bercak kuning asal Cikarawang dan bercak ungu tidak beraturan asal Cibungbulang dengan primer universal gen CI (cylindrical inclusion) Potyvirus berhasil mengamplifikasi DNA berukuran ±700 pb dan teridentifikasi sebagai Sweet Potato feathery mosaic virus (SPFMV). Sampel bergejala interveinal yellowing asal Malang diamplifikasi dengan primer Potyvirus dan Begomovirus, karena adanya dugaan bahwa gejala disebabkan oleh infeksi ganda Potyvirus dan Begomovirus. Berdasarkan hasil perunutan DNA, Interveinal yellowing disebabkan oleh infeksi ganda Sweet potato virus C (SPVC) dan Pepper yellow leaf curl virus (PYLCV). Infeksi SPFMV pada ubi jalar merupakan virus yang pertama kali dilaporkan di Jawa Barat, sementara SPVC dan PYLCV merupakan virus yang pertama kali dilaporkan menginfeksi tanaman ubi jalar di Indonesia.
Keyword: gejala, molekuler, serologi, ubi jalar, virus

Judul: Inventarisasi Nematoda Parasit pada Umbi Ubi Jalar (Ipomoea batatas L.) di Kabupaten Bogor, Jawa Barat
Abstrak: Ubi jalar (Ipomoea batatas L.) merupakan komoditas penting di Indonesia. Nematoda parasit tanaman merupakan salah satu patogen utama ubi jalar yang dapat menurunkan kuantitas dan kualitas umbi. Penelitian ini dilakukan untuk mengidentifikasi nematoda parasit pada umbi ubi jalar konsumsi. Sampel didapatkan dari lima pasar di Kabupaten Bogor, Jawa Barat, yaitu Pasar Bojonggede, Cibinong, Ciampea, Leuwiliang, dan Jasinga. Nematoda diekstraksi dengan menggunakan metode pengabutan. Analisis komunitas nematoda dilakukan dengan menghitung nilai populasi absolut, frekuensi, dan kelimpahan. Pewarnaan dengan asam fuchsin digunakan untuk mendeteksi nematoda stadia telur, juvenil, dan dewasa. Preparat semipermanen digunakan untuk mempermudah pengamatan karakter morfologi dan identifikasi nematoda. Nematoda parasit terdeteksi pada tiga jenis ubi jalar. Nematoda parasit yang terindentifikasi adalah Meloidogyne, Pratylenchus, dan Helicotylenchus. Nematoda parasit yang memiliki populasi paling dominan adalah Meloidogyne populasi absolut 33,33 nematoda/100 g umbi, frekuensi 66,67%, dan kelimpahan 4 nematoda/100 g umbi pada sampel yang berasal dari Pasar Ciampea. Telur, juvenil termasuk J1, J2, J3, J4, dan betina dewasa Meloidogyne ditemukan di dalam umbi ubi jalar sakit.
Keyword: Absolute population, nematode morphology

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: