Judul: Formulasi Bakteri Filosfer Penghasil Senyawa Bioaktif Dan Aplikasinya Dalam Pengendalian Penyakit Hawar Daun Bakteri Pada Padi
Abstrak: Penyakit hawar daun bakteri (HDB) yang disebabkan oleh Xanthomonas oryzae pv. Oryzae (Xoo) dapat menyerang pada setiap stadia pertumbuhan tanaman padi sehingga mengakibatkan penurunan produktivitas padi. Koleksi bakteri filosfer di laboratorium Mikrobilogi, Departemen Biologi, IPB menunjukkan kemampuan dalam menghambat Xoo STG21 secara in-vitro. Namun, koleksi bakteri tersebut belum diuji kemampuan penghambatannya terhadap Xoo dengan tingkat virulensi yang tinggi (Ras IV). Penelitian ini bertujuan untuk mengkonfirmasi kemampuan bakteri filosfer dalam menghambat Xoo Ras IV, memformulasikannya dengan bahan pembawa talk, dan menguji efektivitas formulanya dalam mengendalikan HDB di rumah kaca dan lapangan terbatas. Penelitian ini terdiri dari 4 tahap yaitu : 1) Bioesai penghambatan pertumbuhan Xoo 8004, 2) Optimasi media perbanyakan bakteri filosfer, 3) Formulasi bakteri filosfer dalam bahan pembawa talk, 4) Uji viabilitas formula, dan 5) Uji aplikasi formula bakteri filosfer di rumah kaca dan lapangan terbatas. Delapan (Bacillus subtilis BFV 60, B. altitudinis BFF 69, B. aerophilus BFF 84, B. aerius BFR 153, Pseudomonas parafulva BFR 217, P. cremoricolorata BFR 183, Delftia tsuruhatensis BFR 75, dan Staphylococcus sciuri BFR 203) dari 10 bakteri filosfer yang diuji menunjukkan kemampuan menghambat Xoo 8004 secara in vitro. Nilai indeks penghambatan (IP) tertinggi terhadap Xoo 8004 ditunjukkan oleh Bacillus aerius BFR 153 (2.03), sedangkan IP terendah ditunjukkan Delftia tsuruhatensis BFF 75 (0.17). Konfirmasi kemampuan produksi senyawa bioaktif dilakukan dengan menguji ekstrak kulturnya. Nilai IP ekstrak kultur Pseudomonas parafulva BFR 217 (0.83) tertinggi, sedangkan IP terendah ditunjukkan oleh ekstrak kultur B. aerius BFR 153 (0.17). Kaldu kentang merupakan media perbanyakan yang lebih baik dibandingkan dengan media susu skim-molase dan ekstrak bekatul. Formulasi bakteri dengan bahan pembawa talk mampu mempertahankan 107 CFU Bacillus dan Pseudomonas dalam setiap gram formula yang disimpan di suhu ruang selama 10 minggu. Percobaan rumah kaca menunjukkan aplikasi formula BFV 60, BFF 69, BFR 203 dan BFR 153 berturutturut mampu mereduksi gejala HDB hingga 40.73%, 39.72%, 39.26%, dan 28.07%. Uji lapangan terbatas yang dilakukan di Kabupaten Sukabumi menunjukkan efektivitas formula BFV 60 dan BFF 69 dalam menurunkan gejala HDB konsisten dengan hasil uji di rumah kaca. Aplikasi kedua formula tersebut berturut-turut mampu mereduksi gejala serangan HDB sebesar 45.65 % dan 39.91% dan meningkatkan produktivitas padi sebesar 90.61% dan 72.49%.
Keyword: Bakteri Filosfer, Formulasi, Hawar Daun Bakteri, Xanthomonas oryzae pv. Oryzae

Judul: Aktinomiset Filosfer Padi Sebagai Agens Pengendali Hayati Penyakit Hawar Daun Bakteri Pada Padi
Abstrak: Penyakit hawar daun bakteri (HDB) yang disebabkan oleh bakteri Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo) adalah penyakit yang destruktif serta dapat mengurangi produktivitas padi terutama di Asia. Penggunaan pestisida kimia dalam jangka waktu yang lama dapat memberikan efek toksik pada hasil produksi dan konsumennya. Agens pengendali hayati berbasis mikrob memiliki efisiensi yang tinggi serta aman untuk manusia dan organisme bukan sasaran. Agens pengendali hayati berbasis mikrob juga meninggalkan residu yang sedikit bahkan tidak ada sama sekali pada makanan. Sumber mikrob sebagai agens pengendali hayati untuk mengendalikan penyakit tanaman yang disebabkan patogen dapat berasal dari tanah atau filosfer. Mikrob tanah tidak dapat digunakan secara langsung sebagai agens pengendali hayati karena gagalnya mikrob pengkolonisasi akar dalam mengkolonisasi permukaan daun. Aktinomiset merupakan bakteri Gram positif yang telah diketahui memproduksi senyawa bioaktif hingga 70% dari total keseluruhan senyawa bioaktif yang dapat dihasilkan bakteri termasuk senyawa antimikrob. Beberapa strain aktinomiset telah diketahui dapat melindungi tanaman dari penyakit tanaman. Oleh karena itu penelitian ini bertujuan untuk mencari agens pengendali hayati asal filosfer dalam menekan penyakit hawar daun bakteri di dalam rumah kaca. Sampel daun padi sehat diambil dari wilayah persawahan yang terdapat penyakit HDB di Situgede, Bogor. Sebanyak 22 isolat aktinomiset berhasil diisolasi dari filosfer tanaman padi. Diketahui sebanyak delapan isolat dapat menghambat Xoo menggunakan metode plug agar dan delapan isolat pula yang dapat menghambat Pyricularia oryzae (Po) penyebab penyakit blas padi secara in vitro menggunakan metode dual culture. Supernatan isolat juga diuji aktivitasnya dalam menghambat pertumbuhan baik Xoo dan Po. Kedelapan isolat yang dapat menghambat Xoo tersebut, enam isolat tidak berpotensi sebagai patogen tanaman dan manusia setelah diuji reaksi hipersensitivitas, patogenisitas, serta hemolitik. Analisis sekuen gen 16S rRNA menunjukkan bahwa isolat STG 1 berkerabat dekat dengan Micromonospora chersina, STG 4 dan STG 8 berkerabat dekat dengan Actinomadura sp., STG 11 berkerabat dekat dengan Streptomyces luteogriseus, STG 15 berkerabat dekat dengan Nonomuraea sp., dan STG 16 berkerabat dengan Streptomyces alboniger. Sebanyak empat isolat secara signifikan dapat mengurangi gejala penyakit HDB pada aplikasi di dalam rumah kaca. Tanaman yang diberi formulasi pelet STG 2 memiliki penghambatan relatif terhadap penyakit HDB sebesar 22.81% pada 14 hari setelah inokulasi Xoo, STG 4 sebesar 23.48%, STG 8 sebesar 21.9%, STG 11 sebesar 24.93% dan STG 15 sebesar 25.87% jika dibandingkan dengan tanaman kontrol yang diinokulasi Xoo saja. STG 15 merupakan isolat terbaik dalam menekan gejala HDB pada aplikasi di dalam rumah kaca dan berkerabat dekat dengan Nonomuraea sp.
Keyword: aktinomiset, filosfer, hawar daun bakteri, Nonomuraea, Xanthomonas oryzae pv. oryzae

Judul: Posisi Filogenetik Kura-Kura Carettochelys Insculpta  (Reptillia: Testudinata)
Abstrak: Carettochelys insculpta is an endemic freshwater turtle of southern Papua and northern Australia. Phylogenetic position of this turtle is remain unresolved until now. Most of the research conducted show close relationships of C. insculpta and members of Trionychidae family. However, some of the research show distance between C. insculpta and members of Trionychidae family. This research is conducted to analyze phylogenetic relationship between C. insculpta and other members of Testudinata using 12S rRNA, 16S rRNA, and both gene as markers. DNA samples were obtained from three different organisms of C. insculpta. Two species used as outgroups were Alligator mississippiensis and Iguana iguana. Phylogenetic analysis was carried out using Neighbor-Joining method with Felsenstein 1981 (F81) modeltest. A polytomy tree of Testudinata was produced by using 12S rRNA gene. However, analysis using 16S rRNA and both genes as markers confirmed that C. insculpta was located between the Chelonidae and the Trionychidae family.
Keyword: