Judul: Akselerasi Global Pairwise Alignment Dengan Skema Partisi Blocked Column-Wise Pada Sistem Memori Terdistribusi
Abstrak: Algoritme global pairwise alignment (GPA) yang digunakan untuk menyejajarkan sepasang sekuens DNA perlu diparalelisasi untuk mempersingkat waktu eksekusi. Skema partisi berpengaruh terhadap kinerja algoritme GPA paralel mengingat algoritme ini mengadopsi metode pemrograman dinamis. Penelitian ini mempercepat algoritme GPA menggunakan skema partisi blocked column-wise pada sistem memori terdistribusi. Pararelisasi algoritme GPA dilakukan dengan model pemrograman message-passing menggunakan standar message passing interface (MPI). Parameter panjang sekuens yang digunakan bervariasi dari 1000 bp sampai paling panjang 30 000 bp. Hasil yang diperoleh menunjukkan speedup menggunakan 2, 3, dan 4 buah PC berturut-turut adalah 1.79, 2.58, dan 3.37 untuk panjang sekuens 30 000 bp. Sedangkan efisiensi menggunakan jumlah PC dan panjang sekuens yang sama berturut-turut mencapai 89.32%, 85.97%, dan 84.19%. Algoritme GPA paralel yang dikembangkan menunjukkan skalabilitas.
Keyword: message-passing, memori terdistribusi, pairwise alignment, skema partisi

Judul: Implementasi Hybrid Parallelization pada Algoritme Global Pairwise Alignment.
Abstrak: Algoritme pairwise alignment (PA) merupakan salah satu metode yang umum digunakan dalam penjajaran sekuens. PA terbagi menjadi 2 jenis yaitu global pairwise alignment (GPA) dan local pairwise alignment. Perkembangan teknologi yang semakin pesat menyebabkan ukuran data sekuens bertambah besar sehingga pemrosesan data tersebut akan memakan waktu yang sangat lama apabila hanya dikerjakan dalam satu prosesor. Oleh karena itu, suatu metode pemrosesan paralel dibutuhkan untuk mempersingkat waktu komputasi. Penelitian ini bertujuan mempercepat algoritme GPA menggunakan skema partisi data blocked columnwise dengan menggunakan metode hybrid parallelization. Hybrid parallelization dilakukan dengan menggabungkan metode sistem memori terdistribusi dengan sistem memori bersama. Hasil penelitian menunjukkan nilai speedup pada percobaan menggunakan 2, 3, dan 4 komputer masing-masing adalah 5.3, 6.9, dan 7.77 pada ukuran data 16000 pasang basa dan nilai efisiensi berturut-turut adalah 66%, 58%, dan 49%. Kinerja terbaik dicapai menggunakan 4 komputer, sedangkan skalabilitas memori terbaik diperoleh menggunakan 2 komputer.
Keyword: hybrid parallelization, memori bersama, memori terdistribusi, pairwise alignment, pemrosesan paralel

Judul: Elektrodeposisi Film Tipis Semikonduktor Cu2ZnSnS4 (CZTS) pada Substrat Kaca ITO
Abstrak: Semiconductor Cu2ZnSnS4 (CZTS) thin film that can be used as absorber layers on solar cell module was made via electrodeposition method. CZTS thin film was electrodeposited on the surface of a silicate glass coated with a thin layer of indium tin oxide (ITO). Deposition process was done using potentiostatic mode at room temperature with a potential of 1.05 V for 30, 45, and 60 minutes, followed with annealing the film at 2 different temperatures, 500 ºC using furnace and 180 ºC using hot plate, both treatments for 45 minutes in N2/H2S atmosphere. The X-ray difractograms were analyzed using Match 2 program and showed that the CZTS thin films had kesterit crystalline structure, with a low percentage of CZTS phase. The thin film also contained secondary phases such as Cu2S, ZnS, and SnS. The obtained CZTS thin films had a thickness between 1.039 and 1.676 μm. Absorption study showed that the band gap energy of CZTS thin films which was annealed using furnace ranged from 1.50 to 1.52 eV, whereas that annealed using the hot plate was not observed. The band gap energy value showed that CZTS thin films can be used as sunlight absorber layers on solar cell. The formation of CZTS crystal film on this investigation was effectively performed using furnace annealing process at a temperature of 500 ºC with deposition time of 45 minutes.
Keyword: Thin film, Electrodeposition, Cu2ZnSnS4