Judul: Study of the Potential of Dark Septate Endophyte Fungi on Pinus merkusii Jungh et de Vriese Roots
Abstrak: Cendawan Dark septate endophyte (DSE) dikenal sebagai kelompok cendawan endofit yang mampu melakukan kolonisasi pada akar tanaman inang tanpa menyebabkan munculnya gejala penyakit, serta dapat membentuk struktur melanisasi (hifa interseluler, hifa intraseluler dan mikrosklerotia) dalam akar tanaman, sehingga mampu berperan sebagai agen hayati, promotor pertumbuhan pada tanaman inang di bawah cekaman biotik dan abiotik. Selanjutnya kemampuan cendawan DSE untuk mendegradasi lignin dan selulosa belum banyak dipublikasikan terutama berkaitan dengan kemampuan menghasilkan enzim lignase yang berfungsi untuk mendegradasi lignin khususnya pada serasah P. merkusii. Penelitian ini dilakukan untuk mengevaluasi jenis-jenis DSE pada akar P. merkusii, mengevaluasi karakteristik pertumbuhan secara in vitro dan enzimatik isolat DSE, mengevaluasi kemampuan DSE dalam mendekomposisi serasah P. merkusii dan kemampuan antagonis DSE dari akar P. merkusii, mengevaluasi kemapuan DSE dalam meningkatkan pertumbuhan bibit P. merkusii dan mengevaluasi kemampuan DSE dalam menghambat penyakit lodoh yang diakibatkan oleh patogen Fusarium oxysporum pada bibit P. merkusii di rumah kaca. Penelitian dilaksanakan di Laboratorium Biologi Balai Standarisasi Instrumen Pertanian, Jalan Tentara Pelajar No. 12, Kampus Penelitian Pertanian Cimanggu, Bogor, Jawa Barat dan Laboratorium Penyakit Hutan dan Rumah Kaca Departemen Silvikultur Fakultas Kehutanan dan Lingkungan IPB University, Bogor pada bulan September 2020 sampai September 2023. Penelitian dimulai dengan tahap pertama berupa isolasi dan karakteristik isolat DSE dari akar P. merkusii. Isolasi akar P. merkusii yang berasal dari 4 lokasi yaitu Dramaga Bogor, Hutan Pendidikan Gunung Walat Bogor, Taman Nasional Gunung Halimun Salak Bogor dan Kecamatan Dabun Gelang Kab. Gayo Lues, mengikuti metode Surono dan Narisawa (2017). Tahap kedua dilanjutkan uji pertumbuhan secara in vitro dan karakteristik enzimatik isolat DSE. Tahap ketiga melakukan uji kemampuan dekomposisi serasah P. merkusii dan antagonis isolat DSE. Tahap keempat mengevaluasi peran dan identifikasi isolat DSE sebagai pendukung pertumbuhan bibit P. merkusii di rumah kaca. Tahap kelima yaitu mengevaluasi peran isolat DSE terhadap penghambatan penyakit lodoh pada bibit P. merkusii di rumah kaca. Data di analisis menggunakan program microsoft excel dan program SAS dan bila terdapat perbedaan antar perlakuan, dilakuan uji jarak berganda Duncan dengan taraf nyata q=0,05. Hasil isolasi sebanyak 1.160 segmen akar P. merkusii, yang berasal dari 4 lokasi diperoleh sebanyak 25 isolat DSE. Isolasi akar P. merkusii dari kampus Dramaga IPB diperoleh sebanyak 16 isolat (5%), Kecamatan Dabun Gelang Kabupaten Gayo Lues diperoleh 2 isolat (0,79%), Hutan Pendidikan Gunung Walat diperoleh 2 isolat (2%) dan Taman Nasional Gunung Halimun Salak diperoleh 5 isolat (1,74%). Umunya warna hifa miselium isolat DSE yang diperoleh bagian atas berwana hitam dan rata-rata pertumbuhan isolat ≤ 2 mm per hari. Pengujian pertumbuhan secara in vitro dengan menggunakan benih sawi...., Dark septate endophyte (DSE) fungi are known as a group of endophytic fungi that are able to colonize the roots of host plants without causing disease symptoms, and can form melanized structures (intercellular hyphae, intracellular hyphae and microsclerotia) in plant roots, so that they are able to act as biological agents, growth promoter in host plants under biotic and abiotic stresses. Furthermore, the ability of the DSE fungus to degrade lignin and cellulose has not been widely published, especially in relation to its ability to produce the enzyme lignase which functions to
Keyword: antagonis, Fusarium oxysporum, growth promoter, lignoselulolitik

Judul: Exploration of Dark Septate Endophyte (DSE) Fungi from Oil Palm Roots as Biocontrol Agents of Ganoderma boninense
Abstrak: Ganoderma boninense adalah salah satu patogen utama yang menghambat produktivitas kelapa sawit di Indonesia. Keparahan infeksi cendawan G. boninense pada tanaman kelapa sawit di Indonesia yang telah dilaporkan paling besar mencapai 60% dengan luas area yang diserang lebih dari 50%. Infeksi G. boninense di Indonesia paling banyak dilaporkan terjadi di pulau Sumatera dan Jawa. Dampak infeksi cendawan G. boninense menyebabkan lahan kelapa sawit mengalami penurunan produktivitas hingga 85%. Berbagai upaya untuk mengendalikan infeksi G. boninense telah banyak dilakukan namun hingga saat ini belum ada teknik pengendalian yang efektif untuk mengendalikan G. boninense. Oleh karena itu pada penelitian ini dilakukan eksplorasi untuk mencari agens biokontrol potensial baru yang dapat menekan G. boninense. Salah satu kelompok cendawan yang belum banyak dilaporkan untuk mengendalikan G .boninense adalah dark septate endophyte (DSE). Cendawan DSE merupakan salah satu agens hayati yang berpotensi untuk digunakan dalam menekan penyebaran penyakit busuk pangkal batang. Penggunaan DSE telah terbukti menekan perkembangan patogen tular tanah lainnya, seperti Fussarium oxysporum, Rigidoporus microporus, G. boninense (in vitro). Salah satu mekanisme DSE sebagai agens pengendali hayati adalah menghasilkan metabolit sekunder yang bersifat toksik terhadap patogen. Penelitian ini bertujuan memperoleh isolat DSE dari perakaran kelapa sawit yang berpotensi sebagai agens pengendali hayati G. boninense dan menganalisis mekanisme kerja cendawan DSE dalam menghambat G. boninense. Penelitian ini terdiri dari empat kegiatan utama, yaitu: (1) pengamatan asosiasi antara cendawan DSE dan tanaman kelapa sawit dari sampel akar kelapa sawit dilapangan, (2) Isolasi dan karakterisasi DSE, (3) seleksi isolat cendawan DSE Potensial, (4) analisis senyawa metabolit sekunder yang dihasilkan oleh cendawan DSE. Pengamatan asosiasi pada sampel akar kelapa sawit dari lapangan dilakukan untuk melihat hubungan simbiosis cendawan DSE dan tanaman kelapa sawit di alam. Proses isolasi cendawan DSE dilakukan dari sampel akar kelapa sawit. Proses seleksi cendawan DSE dimulai dengan pengujian keamanan hayati yang meliputi uji fitopatogenisitas dan uji hemolisis darah. Selanjutnya isolat non patogen diuji lebih lanjut terkait kemampuannya dalam menghambat perkembangan G. boninense dan kemampuannya sebagai pemacu pertumbuhan. Hasil penelitian menunjukkan bahwa hubungan simbiosis antara tanaman kelapa sawit dan cendawan DSE terjalin secara alami, yang dibuktikan dengan adanya kolonisasi hifa dan struktur mikroskopis di dalam akar kelapa sawit yang diamati. Kolonisasi cendawan DSE banyak ditemukan pada tanaman yang terinfeksi G. boninense. Persentase kolonisasi cendawan DSE pada akar kelapa sawit berkisar 5-60%. Kolonisasi cendawan DSE dapat dipengaruhi oleh beberapa faktor, seperti teknik budidaya, suhu, dan curah hujan. Dari proses isolasi diperoleh 12 isolat cendawan DSE dari akar kelapa sawit. Cendawan DSE yang diperoleh pada penelitian ini sebagian besar diperoleh dari akar tanaman yang sehat dengan persentase isolasi total sebesar 1,71%. Berdasarkan hasil kolonisasi dan isolasi membuktikan bahwa cendawan DSE mampu membentuk simbiosis dengan akar kelapa sawit. Isolat cendawan DSE yang telah diperoleh diuji keamanannya dengan uji fitopatogenisitas dan helolisis. Berdasarkan hasil uji keamanan hayati, diperoleh empat isolat yang tidak patogen, yaitu S51, S14, GS2, dan GS3. Keempat isolat cendawan tersebut juga memiliki kemampuan untuk meningkatkan berat kering tanaman, panjang tajuk, dan panjang akar Brassica rapa sebesar 38-125%, 35-163%, dan 23-140%. Selain meningkatkan pertumbuhan tanaman keempat cendawan DSE memiliki aktivitas antibiosis dan aktivitas kitinolitik. Aktivitas antibiosis cendawan DSE ditunjukkan
Keyword: Antifungal agent, Cladophialophora nyingchiensis, Exophiala pisciphila, secondary metabolites

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: