Judul: Isolasi, Karakterisasi, dan Identifikasi Bakteri Pelarut Fosfat yang Memiliki Kemampuan Menambat Nitrogen dari Tanah Bekas Tambang di Hambalang.
Abstrak: Penggunaan pupuk NPK (nitrogen, fosfor, dan kalium) untuk menyuburkan lahan bekas tambang dapat menimbulkan dampak negatif secara fisik dan kimiawi. Salah satu cara alternatif untuk menyediakan makronutrien yang dibutuhkan tanaman, seperti fosfat (P) dan nitrogen (N), yaitu dengan melibatkan suatu agens yang ramah lingkungan. Salah satu agens hayati tersebut ialah kelompok bakteri Plant Growth Promoting Rhizobacteria (PGPR). Tujuan penelitian ini untuk mengisolasi, melakukan karakterisasi, dan mengidentifikasi bakteri pelarut fosfat (BPF) yang memiliki kemampuan untuk menambat nitrogen (BPN). Sebanyak 49 isolat bakteri pelarut P telah diisolasi dari sampel tanah yang diambil dari bekas tambang batu sandy-clay di Hambalang, Bogor, Indonesia. Sejumlah 46 isolat di antaranya diduga mampu menambat N karena dapat tumbuh pada media N-free. Total lima isolat (AR 127.1, AKR 127.1, ANR 286.1, ARA 127.1, dan AR 127.2) dipilih untuk dikarakterisasi lebih lanjut dalam hal menginfeksi daun tembakau, melisiskan darah, morfologi, dan kemampuan untuk menghasilkan indole-3-acetid acid (IAA) serta melarutkan P. Isolat AKR 127.1 dan ARA 127.1 tidak menimbulkan nekrosis pada daun tembakau dan tidak menghasilkan hemolisin (tidak melisiskan darah). Kedua isolat tersebut merupakan bakteri Gram positif, berbentuk batang dengan penataan tunggal yang mampu menghasilkan IAA dan melarutkan P. Konsentrasi IAA yang dihasilkan oleh isolat AKR 127.1 yaitu sebesar 34.23 ppm dan ARA 127.1 sebesar 20.18 ppm. Kemampuan kedua isolat terpilih tersebut dalam melarutkan P, yaitu pada isolat AKR 127.1 sebesar 109.03 ppm dan ARA 127.1 sebesar 92.76 ppm. Berdasarkan identifikasi molekuler dengan gen 16S rRNA, isolat AKR 127.1 dan ARA 127.1 masing-masing memiliki kemiripan dengan Bacillus cereus dan Bacillus aryabhattai.
Keyword: bakteri PGPR, fosfat, Gram positif, IAA, nitrogen

Judul: Karakterisasi Bakteri Pelarut Fosfat Dan Penambat Nitrogen Dari Area Penambangan Batuan Kapur.
Abstrak: Fosfat (P) dan nitrogen (N) adalah makronutrien yang dibutuhkan oleh tumbuhan. Tanaman dapat memanfaatkan fosfat dalam bentuk terlarut (Pi, H2PO4 - atau HPO4 2-) dan nitrogen dalam bentuk anorganik (NO3 - dan NH4 +). Ketersediaan hara, termasuk P dan N di tanah marginal, seperti tanah bekas penambangan batuan kapur, sangatlah terbatas bagi tanaman. Pemupukan menggunakan pupuk kimia, seperti urea, amonium sulfat, dan TSP, dilakukan sebagai salah satu alternatif untuk meningkatkan kandungan hara makro tersebut di dalam tanah. Namun pemakaian yang berlebihan menimbulkan pengaruh kurang baik bagi tanaman dan lingkungan. Agens hayati dari kelompok bakteri plant growth promoting rhizobacteria (PGPR) diharapkan dapat mengurangi pemakainan pupuk kimia. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi dan mengkarakterisasi bakteri pelarut P yang dapat menambat N dari tanah sekitar penambangan batuan kapur. Sampel tanah diambil dari sekitar penambangan batuan kapur PT Indocement, Palimanan, Cirebon. Bakteri pelarut P dari sampel tanah diisolasi pada media Pikovskaya dengan metode pengenceran serial. Isolat pelarut P yang memiliki kemampuan menambat N diseleksi pada media N-free bromthymol blue (NfB). Tingkat kemampuan bakteri dalam melarutkan P secara kualitatif ditentukan berdasarkan nilai indeks pelarutan P (IP). Empat isolat (GPA2.1, GPA2.2, GPC1.7 dan GPC3.7) dipilih berdasarkan nilai IP, kriteria pertumbuhannya pada media selektif, hipersensitivitas terhadap daun tembakau, dan kestabilan pertumbuhannya. Isolat terpilih dianalisis kemampuannya dalam melarutkan P dengan metode kolorimetri dan kemampunnya dalam menambat nitrogen diukur dengan metode Acetylene Reduction Assay. Identifikasi secara morfologi dilakukan dengan pewarnaan Gram, sedangkan secara molekuler dilakukan berdasarkan gen 16s rRNA. Sebanyak 22 isolat bakteri yang mampu melarutkan P dan menambat N berhasil diisolasi. Sembilan dari 22 isolat tidak menimbulkan gejala hipersensitif terhadap daun tembakau. Uji kuantitatif pelarutan P menunjukkan bahwa isolat bakteri GPA1.7 dapat melarutkan P tertinggi dalam media Pikovskaya cair (450 mg/L) pada inkubasi hari ke-5 dan 6, sedangkan isolat bakteri GPC3.7 memiliki aktivitas penambatan N tertinggi (0.291 ppm/jam). Isolat GPA2.1, GPA2.2, dan GPC3.7 merupakan bakteri Gram negatif sedangkan isolat GPC1.7 merupakan bakteri Gram positif. Identifikasi berdasarkan gen 16S rRNA menunjukkan bahwa isolat GPA2.1 berkerabat dekat dengan Pseudomonas oryzihabitans dan Pseudomonas psychrotolerans, sedangkan GPA2.2, GPC1.7 dan GPC3.7 masingmasing berkerabat dekat dengan Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus megaterium, dan Acinetobacter baumannii. Isolat bakteri pelarut P dan penambat N yang didapatkan selanjutnya dapat dimanfaatkan untuk memperbaiki kesuburan tanah pada area bekas tambang batuan kapur.
Keyword: bakteri pelarut P, bakteri penambat N, tanah batuan kapur, 16S rRNA

Judul: Thermal Characteristics and Dynamics of Tropical Cyclone over Western North Pacific Ocean: A Case Study of Typhoon Songda (Chedeng) 2011
Abstrak: The frequent occasion of Tropical Cyclone (TC) over Western North Pacific (WNP) Ocean lies from 10˚N to 26˚N and 121˚E to 170˚E. Sources of TC development come from warm ocean temperature where latent heat is released during condensation processes and subsequently concentrated in the boundary layer. Relative humidity at 850-700 hPa is responsible to produce the most intense storm. Meanwhile, weak vertical wind shear between 850-200 hPa is one of the dynamical factors that lead to the development of TC. Pressure level of 850-200 hPa is chosen to minimize the thermodynamic effect in the lower troposphere. Typhoon Songda (Chedeng in the Philippines) or TSC lasted from May 18th to 30th, 2011 and strengthened into powerful Super Typhoon stage between May 24th and 27th. Long curving track and the exhibition of all sequences of TC life cycle, TSC is then considered as an ideal case of TC. The objective of the study with case of TSC is to investigate the role of thermal characteristics and dynamics on TC intensity. The research is carried out by using Advanced Research of Weather Research and Forecasting model (WRF ARW model) version 3.3. Two domains are employed in the model. The first domain situate from 02˚N to 40˚N and 118˚E to 149˚E and cover spatial resolution () of 33.1 km. The second domain situate from 09˚N to 27˚N and 119˚E to 132˚E with of 11 km. Timestep of the model () is 120 seconds. The model is supported by the following physical parameterization, i.e., Yonsei University Scheme (YSU) in the boundary layer, Kain-Fritsch scheme (KF) in the cumulus, and WRF Single-Moment 3-class scheme in the microphysics. Initial meteorological condition prior to the formation of the cyclone is generated using WRF ARW standard-release model. Sensitivity of the model output is obtained from a selected single-parameter change scenarios, namely, 10 % to 20 % decrease and increase of wind shear initial data at 850-200 hPa, and by 10 % to 20 % decrease of relative humidity initial data at 850-700 hPa. The result showed that the negative correlations between wind shear and intensity are found in wind shear scenarios. Wind shears of 10 ms-1 which lead to strengthening of the wind intensity in the early period of Typhoon development are found in wind shear scenarios. The effect of wind shear changes on wind intensity is statistically significant in the 20 % wind shear scenarios. During mature stage, weak wind intensity occurred when wind shear increase as given in the WRF standard-release and the 20 % decreasing scenario. Different situation is found in the 20 % increasing scenario where wind shear tend to weak and lead to strong wind intensity at this stage. Meanwhile, the reduction of moisture supply at 850-700 hPa resulting from 20 % decreasing relative humidity play a major role in the weakening of wind intensity and reduces mechanical energy of the cycle process as much as 300 J kg-1.
Keyword: