Judul: Karakterisasi Gen Hormon Pertumbuhan (Chicken Growth Hormone) pada Ayam Lokal Indonesia
Abstrak: Ayam lokal merupakan salah satu sumber daya genetik yang berpotensi untuk dikembangkan. Karakterisasi genetik yang berkaitan dengan sifat produksi dapat diketahui berdasarkan gen, salah satunya adalah gen cGH. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi karakteristik genetik dan mendeteksi situs mutasi pada gen cGH. Sampel yang digunakan adalah ayam kampung, walik, arab dan leher gundul. DNA hasil ekstraksi kemudian dilakukan proses amplifikasi fragmen gen cGH dan sekuensing. Sebanyak 19 sampel berhasil teramplifikasi. Amplifikasi gen cGH menghasilkan produk PCR sepanjang 528 bp. Hasil sekuensing DNA dianalisis menggunakan program MEGA 5. Hasil analisis sekuens fragmen gen cGH menunjukan nilai kesamaan sebesar 99% dengan data sekuens gen cGH pada GenBank. Mutasi pada fragmen gen cGH ditemukan sebanyak 10 situs dengan tipe mutasi transisi dan transversi. Penelitian lanjutan diperlukan untuk mengidentifikasi karakteristik genetik gen cGH pada G. g. spadiceus, G. g. bankiva, G. g. murghi dan G. g. jabouillei.
Keyword: 

Judul: Identifikasi Keragaman Gen Growth Hormone Receptor (GHR|Eco72I) pada Ayam Lokal Indonesia dan Persilangannya.
Abstrak: Gen growth hormone receptor (GHR) merupakan salah satu gen pengontrol sifat pertumbuhan. GHR sebagai reseptor growth hormone (GH) yang terlibat dalam regulator laju pertumbuhan dan deposisi lemak. Mutasi pada intron 5 mempengaruhi laju pertumbuhan pada ayam. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi keragaman gen GHR pada ayam lokal Indonesia dan persilangannya. Sampel yang digunakan dalam penelitian sebanyak 178 ekor ayam yang terdiri atas ayam kampung Ciawi, kampung Sukabumi, ras pedaging, ras petelur, merawang, dan kampung x ras petelur. Amplifikasi gen GHR|Eco72I intron 5 dilakukan dengan metode PCR-RFLP. Hasil produk amplifikasi adalah 326 bp. Genotipe yang ditemukan pada gen GHR|Eco72I adalah AA, GG, dan AG dengan 2 macam alel yaitu alel A dan alel G. Hasil analisis menunjukkan bahwa frekuensi genotipe AA lebih tinggi dibandingkan dengan genotipe lainnya. Frekuensi alel tertinggi adalah alel A sebesar 0.99 dan terendah adalah alel G sebesar 0.01. Populasi ayam kampung Sukabumi dan persilangan kampung x ras petelur berada pada keadaan keseimbangan Hardy-Weinberg. Nilai heterozigositas pengamatan (Ho) pada ayam ras pedaging lebih rendah dari nilai heterozigositas harapan (He), sedangkan nilai heterozigositas pengamatan (Ho) pada ayam kampung Sukabumi dan kampung x petelur lebih tinggi dari nilai heterozigositas harapannya (He). Kesimpulan penelitian ini adalah gen GHR|Eco72I pada ayam kampung Sukabumi, ras pedaging, dan kampung x ras petelur bersifat polimorfik.
Keyword: ayam lokal, gen GHR, keragaman, PCR RFLP

Judul: Numerical modeling of the hydrodynamics of standing wave and scouring in front of impermeable breakwater with different steepnesses
Abstrak: The aim of this paper is to numerically study the effects of breakwater steepness on the hydrodynamics of standing wave and scouring process in front of impermeable breakwaters. A two-dimensional hydrodynamics model based on the Reynolds Averaged Navier–Stokes (RANS) equations and the Volume of Fluid (VOF) method was developed and then combined with an empirical sediment transport model. Comparisons with an analytical solution and experimental data showed the present model is very accurate in predicting the near bottom velocity and capable of simulating the scour/deposition patterns consistent with experimental data. It was found that the additional terms of bottom shear stress in the momentum equations are necessary to produce a physical scouring pattern. Different breakwater steepnesses produce different characteristics of standing wave, the steady streaming system, and scouring pattern in front of the breakwaters, which also affects the correlations between them. An additional analysis of the turbulence field parameters and the sediment transport rate was also performed. All these important information will be presented in details in this paper and can be worthwhile for designing the breakwater in coastal areas.
Keyword: The RANS–VOF model Standingwave Steadystreamingsystem Scouring pattern Breakwatersteepness