Judul: Rancang Bangun dan Uji Lapang Peraut (Profiler) Suhu dan Salinitas dengan Sistem Telemetri
Abstrak: Suhu dan salinitas memiliki peran penting dalam pembentukan fenomena fisik yang terjadi di laut. Pemantauan secara in-situ dan real time diperlukan untuk mengetahui fenomena-fenomena yang terjadi dalam jangka waktu tertentu. Penelitian ini menerapkan sistem pemantauan suhu dan salinitas perairan berbasis web telemetri dengan menggunakan jaringan GPRS (General Packet Radio Service). Komponen-komponen utama yang digunakan adalah mikrokontroler, MiniPC, modem GPRS, sensor suhu dan salinitas. Casing terbuat dari bahan polyethylene silindris dengan tinggi 37 cm dan diameter 17 cm. Pemrograman dilakukan dengan menggunakan perangkat lunak Arduino IDE untuk mikrokontroler, sedangkan MiniPC menggunakan bahasa pemrograman Python. Uji laboratorium terdiri dari tiga bagian, yaitu uji kedap, kestabilan data, dan uji coba sistem, yang dilakukan di Watertank AIK IPB. Berdasarkan hasil uji lapang yang dilakukan di Pelabuhan Ratu, Jawa Barat, instrumen berhasil melakukan akuisisi data suhu dan salinitas perairan secara profiler dan mengirim data ke database server.
Keyword: instrumen, real time, salinitas, suhu

Judul: Rancang Bangun Instrumen Autonomous Pengukur Parameter Fisik Laut
Abstrak: Kegiatan penelitian dalam bidang kelautan khususnya pengukuran parameter fisik laut membutuhkan sebuah alat ukur yang teliti dan user friendly. Penelitian ini bertujuan merancang dan membuat suatu instrumen autonomous untuk mengukur parameter fisik laut. Pengukuran parameter fisik laut dilakukan dengan alat ukur berbasis mikrokontroler Arduino Yun ATMega32 versi surface mounting device (SMD) yang dilengkapi sensor suhu (DS18B20), pH meter, dan konduktivitas (electrical conductivity meter). Pada sistem yang dirancang, hasil pengukuran disimpan pada data logger. Hasil pada pengujian secara laboratorium menunjukkan pengukuran suhu air tawar rata-rata sebesar 26.58 ºC, pH 7.63, dan salinitas 0 ‰, sedangkan pengukuran suhu pada air laut sebesar 27.42 ºC, pH 8.06, dan salinitas 31.99 ‰. Berdasarkan hasil pengukuran, diperoleh hasil bahwa pengukuran kondisi menggunakan instrumen ini dapat bekerja dengan baik.
Keyword: Autonomous, Instrumen, Mikrokontroler, Arduino YUN ATMega32, pH, Salinitas, Suhu

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA