Judul: Pewarisan Marka SNP2 Gen Lys-C pada Ikan Lele Clarias gariepinus Generasi Pertama dan Daya Tahan Benih terhadap Infeksi Aeromonas hydrophila.
Abstrak: Ikan lele Clarias gariepinus yang potensial tahan terhadap infeksi Aeromonas hydrophila sudah diidentifikasi menggunakan marka single nucleotide polymorphism (SNP2) pada gen lisozim tipe-C (LYSC). Namun, hasil dari penelitian tersebut belum dianalisis pada keturunan yang dihasilkan. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis pewarisan marka SNP2 gen Lys-C pada ikan lele Clarias gariepinus generasi pertama dan daya tahan benih terhadap infeksi Aeromonas hydrophila. Persilangan ikan lele berbeda genotipe yang dilakukan yaitu(♀TT×♂TT),(♀CC×♂TT),(♀TT×♂CC),dan(♀CT×♂CT).Analisis pewarisan genotipe dilakukan dengan metode polymerase chain reaction dan uji tantang dilakukan dengan menginfeksi ikan menggunakan A.hydrophila. Ikan uji yang digunakan berukuran 11 – 13 cm, bakteri A. hydrophila diinjeksikan secara intramuskular dengan dosis 1 mL per ekor, sebanyak 20 ekor per perlakuan 3 kali ulangan. Parameter yang diamati yaitu tingkat kelangsungan hidup, gambaran sel darah putih, aktivitas fagositik, dan respiratory burst. Persilangan TT><TT menghasilkan 100% keturunan TT dengan tingkat kelangsungan hidup pasca infeksi A. hydrophila tidak berbeda nyata dengan persilangan resiprokal TT dengan CC yaitu berkisar 68,33-78,33% lebih tinggi dibandingkan dengan persilangan heterozigot CT><CT sebesar 45%., The catfish Clarias gariepinus which is potentially resistant to Aeromonas hydrophila infection has been identified using a single nucleotide polymorphism (SNP2) marker in the C-type lysozyme gene (LYSC). However, the results of these studies have not been analyzed in the resulting offspring. This study aimed to analyze the inheritance of the SNP2 marker of the Lys-C gene in the first generation of catfish Clarias gariepinus and the resistance of the fry to Aeromonas hydrophila infection. Crosses of catfish with different genotypes were carried out, namely (♀ TT × ♂ TT), (♀ CC × ♂ TT), (♀ TT × ♂ CC), and (♀ CT × ♂ CT). The analysis of genotypic inheritance was carried out using the polymerase chain reaction method and the challenge test was carried out by infecting fish using A. hydrophila. The test fish used were 11-13 cm in size, A. hydrophila were injected intramuscularly at a dose of 1 mL-1 per fish, as many as 20 fish per treatment with 3 replications. Parameters observed were survival rate, white blood cell appearance, phagocytic activity, and respiratory burst. TT><TT crosses produced 100% of TT progeny with post-infection survival rate of A. hydrophila not significantly different from reciprocal TT crosses with CC, which was 68.33-78.33% higher than heterozygous crosses CT><CT which was 45%.
Keyword: Aeromonas hydrophila, Genotype, Lysozyme, Resistance, SNP

Judul: Kandidat Marka MHC II pada Ikan Lele (Clarias gariepinus) Tahan Penyakit Motile Aeromonad Septicaemia
Abstrak: Salah satu masalah yang krusial yang dihadapi para pembudidaya ikan lele adalah penyakit motile Aeromonad septicaemia (MAS), yang disebabkan oleh bakteri Aeromonas hydrophila. MAS adalah salah satu penyakit akut yang disebabkan oleh bakteri dan dapat menginfeksi pada semua stadia hidup dan jenis ikan air tawar, dan dapat mengakibatkan kematian massal hingga 100%; sehingga menimbulkan kerugian yang sangat besar bagi para pembudidaya ikan. Salah satu alternatif solusi untuk menghindari penggunaan antibiotik dan bahan kimia lain (formalin, klorin, dan kaporit) adalah dengan seleksi ikan berbasis marka molekuler. Seleksi dilakukan dengan bantuan gen yang berkaitan dengan sistem imun. Salah satu gen kandidat marka adalah major histocompability complex (MHC). Gen MHC mengodekan molekul reseptor yang mengenali dan mengikat diri pada peptida asing yang disajikan ke sel-sel kekebalan tubuh, sehingga memulai respons imun. Tujuan penelitian ini adalah untuk mendapatkan kandidat marka MHC II pada seleksi berbasis marka molekuler untuk menghasilkan ikan lele tahan terhadap penyakit MAS. Ikan lele yang digunakan pada penelitian ini adalah ikan lele varietas Mutiara dari BRPI Sukamandi. Induk terseleksi, yakni positif membawa dan negatif marka MHC II yang diidentifikasi menggunakan metode PCR, selanjutnya dipijahkan secara berpasangan (perbandingan antara jantan dan betina 1:1). Setelah mendapatkan lima populasi dari masing-masing kelompok tersebut, selanjutnya masing-masing 500 ekor larva yang telah berumur dua hari dari setiap pasang dipindahkan dan dipelihara dalam akuarium untuk digunakan sebagai sampel dalam pengujian ketahanan terhadap penyakit. Setelah mencapai ukuran 7-8 cm, benih ikan lele baik dari induk yang positif maupun yang negatif marka MHC II kemudian diuji tantang dengan menginjeksi secara intramuskuler bakteri A. hydrophila 0.1 mL/ekor dari stok bakteri 105 cfu/mL setelah sebelumnya dilakukan uji LD50. Uji tantang dilakukan melalui penyuntikan secara intramuskuler. Wadah dan kepadatan ikan uji yang dipergunakan sama dengan uji LD50. Parameter yang diuji antara lain sintasan, analisis marka MHC II, pengamatan gejala klinis, serta parameter hematologi antara lain total eritrosit, total leukosit, aktivitas fagositik, dan hematokrit. Hasil pengamatan menunjukkan bahwa sintasan pada benih ikan yang positif membawa marka MHC II (77.50±4.00%) lebih tinggi dibandingkan benih ikan yang negatif marka MHC II (53.33±4.77%). Hasil amplifikasi PCR dengan menggunakan primer spesifik untuk MHC II menunjukkan pita DNA spesifik berukuran 426 bp pada benih ikan yang positif membawa marka MHC II, sedangkan pada benih ikan yang negatif marka MHC II tidak terdapat pita DNA. Hasil analisis PCR menunjukkan persentase progeni dari induk yang positif membawa marka MHC II secara keseluruhan sebesar 60%, sedangkan persentase progeni dari induk yang negatif membawa marka MHC II sebesar 0%; hal ini mengindikasikan bahwa marka MHC II dapat diwariskan kepada keturunannya. Nilai dari total eritrosit, total leukosit, aktivitas fagositik, dan hematokrit juga menunjukkan pada benih ikan yang postif membawa marka MHC II lebih tinggi dibandingkan benih ikan yang negatif marka MHC II. Dengan demikian marka MHC II dapat dijadikan sebagai marka molekuler untuk perakitan ikan lele tahan penyakit MAS. Ikan lele yang membawa marka MHC II memiliki produk PCR dengan ukuran 426 bp. Marka MHC II dan daya tahan ikan lele terhadap penyakit MAS diwariskan kepada keturunannya. Oleh karena itu, seleksi ikan lele tahan MAS dapat dilakukan dengan berbasis marka MHC II.
Keyword: lele, Aeromonas hydrophila, MAS, marka molekuler, MHC II

Judul: The use of homotopy perturbation methode to solve fuzzy volterra  integral equations
Abstrak: Most phenomena in nature can be explained in mathematical models, such as fuzzy volterra integral equation. The fuzzy volterra integral equation is a nonlinear integral problem, which is usually dificult to solve by an analytical solution. In this paper, fuzzy volterra integral equation is solved using perturbaion homotopy method, which can be written as a power series in p and satisfies a certain homotopy fuction. This manuscript discuss two case studies, i.e. the case of linear and trigonometric kernel function. The result shows that greater approximation order being used, the wider convergence solution area wil be.
Keyword: