Judul: Potensi Bakteri Endofit Sebagai Agens Pengendali Penyakit Busuk Cabang (Septobasidium Sp.) Pada Lada
Abstrak: Penyakit busuk cabang lada yang disebabkan oleh Septobasidum sp. tergolong penyakit baru dan berpotensi merusak pertanaman lada di Kalimantan Barat. Gejala penyakit busuk cabang Septobasidium sp. pada tanaman lada tergantung pada stadia patogen. Gejala stadia awal respon tanaman tidak menunjukan gangguan pada daun atau cabang tetap segar dan hijau, stadia lanjut bagian tanaman yang terinfeksi terutama daun atau cabang akan rontok secara bertahap sampai tanaman mati. Penyakit busuk cabang lada ditandai dengan adanya rizomorf/miselium berwarna coklat kemerahan yang menginfeksi pada bagian cabang. Miselium dapat menyebar ke seluruh cabang dan mengakibatkan kematian jaringan tanaman lada. Penyakit ini juga sering disebut penyakit ganggang pirang, mati ranting, penyakit capit udang, penyakit hawar lembut (Serawak Malaysia), felt fungi, dan velvet blight. Penelitian ini bertujuan mendapatkan bakteri endofit asal lada yang potensial sebagai agens pengendali hayati penyakit busuk cabang dan pemacu pertumbuhan pada tanaman lada. Penelitian dilaksanakan dari bulan Agustus 2013 sampai bulan April 2015 di Laboratorium Mikologi, Laboratorium Nematologi Tumbuhan Departemen Proteksi Tanaman Institut Pertanian Bogor, Laboratorium Penyakit Tanaman Fakultas Pertanian Universitas Tanjungpura Pontianak, dan Laboratorium Biologi & Kesehatan Tanah Balai Penelitian Tanah Bogor, serta kebun petani di Kecamatan Galing Kabupaten Sambas. Penelitian meliputi tahap in vitro dan in vivo. Tahap in vitro meliputi eksplorasi, uji reaksi hipersensitif, karakterisasi fisiologi dan uji antibiosis bakteri endofit. Eksplorasi bakteri endofit berasal dari contoh akar, cabang, dan daun dari tanaman lada sehat (tidak bergejala) di antar tanaman sehat, tanaman lada sehat di antara tanaman lada sakit, dan lada liar (lada hutan). Isolasi bakteri endofit dari akar batang dan daun dilakukan dengan cara sterilisasi permukaan menggunakan larutan NaOCL 10% dan alkohol 70%. Isolat bakteri yang didapat dimurnikan dan diindentifikasi berdasarkan tipe morfologi koloni bakteri kemudian dilakukan uji reaksi hipersensitif. Tahapan selanjutnya isolat bakteri endofit tersebut dilakukan karakterisasi aktivitas enzim kitinolitik, produksi IAA, penambat nitrogen, pelarut fosfat, pelarut kalium dan produksi senyawa fluorescent. Isolat bakteri endofit diuji antibiosis terhadap Septobasidium sp. dengan metode kultur ganda media PDA. Tahap in vivo meliputi uji kemampuan penghambatan isolat bakteri endofit terhadap Septobasidium sp. pada lada secara langsung, uji pemacu pertumbuhan tanaman, dan uji pemacu ketahanan tanaman menggunakan rancangan acak lengkap (RAL). Metode inokulasi bakteri endofit dengan cara perendaman bibit lada dalam suspensi bakteri endofit. Hasil penelitian in vitro diperoleh 33 isolat bakteri endofit yang diisolasi dari tanaman lada sehat di antara lada sehat, lada sehat di antara lada sakit dan lada hutan, dengan kisaran kerapatan 6.3 x 103–9.2 x 106 cfu g-1 berat basah contoh jaringan tanaman. Hasil uji reaksi hipersensitif terhadap 33 isolat bakteri endofit diperoleh 10 isolat bakteri endofit bersifat bakteri patogenik pada reaksi hipersensitif di daun tembakau, sehingga 23 isolat bakteri endofit yang yang bersifat non patogenik digunakan pada uji selanjutnya. Hasil karakterisasi dari 23 isolat bakteri tersebut, 20 isolat mampu memproduksi IAA, 3 isolat dapat menambat nitrogen, 10 isolat dapat melarutkan fospat, 6 isolat mempunyai aktifitas kitinolitik, 4 isolat mempunyai senyawa fluorescent dan semua isolat bakteri endofit tersebut tidak mampu melarutkan kalium. Hasil uji antibiosis terhadap Septobasidium sp. menunjukkan bahwa 8 isolat, yaitu isolat bakteri SHA3, SHC9, SKA1, SKA3, SKA4, SKD8, SKD10 dan LHD8 mampu menghambat pertumbuhan Septobasidium sp. antara
Keyword: busuk cabang, bakteri endofit, lada, Septobasidium sp

Judul: Isolasi dan Karakterisasi Rhizobakteri untuk Pengendalian Penyakit Busuk Pangkal Batang pada Tanaman Lada
Abstrak: Lada (Piper nigrum l.) merupakan tanaman rempah yang banyak diusahakan di perkebunan rakyat. Daerah sentra produksi lada di Indonesia antara lain provinsi Lampung, Bangka Belitung, Kalimantan Barat, Kalimantan Timur, Bengkulu dan Sulawesi Selatan. Salah satu kendala utama dalam budidaya lada adalah penyakit busuk pangkal batang (BPB) yang disebabkan oleh Phytophthora capcisi. P. capsici termasuk pseudofungi yang bersifat tular tanah yang mudah tersebar melalui tanah terkontaminasi, terbawa oleh aliran air atau bagian tanaman yang sakit. Penyakit BPB pada tanaman lada dapat menyerang seluruh bagian tanaman mulai dari bagian pangkal batang dan akar, batang, daun tua, hingga ke bagian pucuk daun. Penggunaan mikroorganisme sebagai agen biokontrol berpotensi untuk mengurangi penyakit pada tanaman. Salah satu mikroorganisme yang berpotensi digunakan sebagai agen biokontrol adalah bakteri. Tujuan penelitian ini ialah mengeksplorasi rhizobakteri dari tanaman lada (Piper nigrum), cabe jawa (Piper retrofractum), karuk (Piper chaba), sirih (Piper betle) dan lada liar, juga mengevaluasi potensinya sebagai agen hayati P. capsici dan mengidentifikasi bakteri menggunakan metode molekuler. Penelitian ini terdiri dari beberapa tahap antara lain, isolasi rhizobakteri dari tanah perakaran lada, cabe jawa, sirih, karuk, dan lada liar. Isolasi rhizobakteri dilakukan pada medium tryptyc soy agar (TSA), nutrient agar (NA) dan King’s B. Isolat rhizobakteri diuji keamanan hayati dengan uji hipersensitifitas dan hemolisis agar darah. Bakteri hasil seleksi in vitro diseleksi lebih lanjut secara in planta pada bibit lada. Isolat hasil seleksi in planta diuji karakterisasi sebagai calon agen hayati dengan uji gram, uji antibiosis, uji produksi volatile organic compound, uji enzim fosfatase, uji produksi hormon IAA, uji produksi siderofor dan uji glukanase. Selanjutnya diidentifikasi secara molekuler dengan teknik PCR untuk target 16S rRNA menggunakan primer forward 27 F dan primer reverse 1492 R dilanjutkan dengan perunutan DNA. Hasil penelitian menunjukkan 60 isolat dari total 178 isolat yang berhasil diisolasi bereaksi negatif pada uji hipersensitifitas dan uji hemolisis agar darah. Skrining isolat pada bibit lada berumur 10 minggu terhadap P. capsici didapatkan 10 isolat rhizobakteri LD8, LD25, LD82, CJ4, CJ5, LL1, KK1, KK2, KK3 dan KK10 yang memiliki indeks penyakit lebih rendah dibandingkan dengan perlakuan yang lain dan kejadian penyakit 25% - 50%. Hasil uji karakterisasi 10 isolat rhizobakteri menunjukkan 8 isolat mampu memproduksi siderofor, 7 isolat pelarut fosfat, 1 isolat memproduksi IAA tinggi, 2 isolat memproduksi senyawa volatil, 3 isolat menghasilkan β-glukanase, dan 1 isolat dengan persentase penghambatan sebesar 51,60%. Hasil identifikasi molekuler menunjukkan isolat LD82 memiliki homologi 99,08% dengan Burkholderia cepacia, LD25 memiliki homologi 83,01% dengan B. cenocepacia, dan KK1 memiliki homologi 96,83% dengan Enterobacter sp.. Berdasarkan hasil skrining dan uji karakterisasi diketahui terdapat isolat yang potensial sebagai biokontrol P. capsici pada tanaman lada. Penelitian ini diharapkan dapat memberikan pengetahuan tentang rhizobakteri yang dapat berperan sebagai agen hayati pada tanaman lada.
Keyword: Lada, Phytophthora capsici, agen hayati

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: