Judul: Efektivitas Isolat Fage Litik Shigella sp.
Abstrak: Shigella sp. is the causative agent of shigellosis transmitted through food and water. Bacteriophages are considered as an alternative agent to control this bacterial infection and contamination. The aim of this research is to analyze the effectiveness of lytic phage against Shigella sp. Lytic phages were isolated from household wastewaters of Sindang Barang, Cibeureum and Babakan Darmaga Kabupaten Bogor. One specific phage of Shigella sp. (phage FY51-X) isolated from household wastewaters performed plaque with rounded shape with 1.22 mm in diameter. Number of lytic phage infecting Shigella sp. cells was 1.84 x 108 PFU mL-1. This phage only infected Shigella sp. 51-X of 14 tested bacterial isolates. Phage FY51-X was stable after storage at 20 and 37 °C, but its lytic activity was lost after storage at 60 oC for 60 minutes. Additionaly activity of the phage was lost after incubation for 24 hours in acidic and alkaline conditions. Alkaline condition was more sensitive than acidic condition. Virion of the phage consisted of 8 proteins with molecular weight ranging from 19.65 to 86.18 kDa. Lytic activity of the phage against Shigella sp. 51-X was shown after 4 hours of incubation, however the number of bacterial cells was significantly decreased at 12 hours of incubation.
Keyword: 

Judul: Efektivitas Campuran Fag Litik Spesifik pada EPEC K1.1 dan Salmonella P38 sebagai Biokontrol terhadap Penyakit Diare
Abstrak: Enteropathogenic Escherichia coli (EPEC) merupakan salah satu bakteri penyebab diare di negara berkembang terutama banyak menyerang bayi dan balita. Bakteri EPEC umumnya ditemukan dalam tanah dan air yang menjadi salah satu penyebab dari foodborne disease dan waterborne disease. Mekanisme penyebaran foodborne disease dan waterborne disease terjadi akibat cemaran patogen penyebab penyakit berada dalam makanan dan air sehingga dapat menyebabkan penyakit infeksi bila dikonsumsi oleh manusia atau hewan. Selain bakteri EPEC, diare pun dapat disebabkan oleh beberapa bakteri patogen lainnya, salah satunya adalah Salmonella. Salmonella dapat menyebabkan penyakit pada manusia dengan sindrom gastroenteritis. Bakteri EPEC dan Salmonella merupakan bakteri penyebab gastroenteritis yang banyak ditemukan di Indonesia mencemari makanan atau minuman. Beberapa studi melaporkan bahwa galur Salmonella enteritidis yang diisolasi dari penderita diare di Indonesia resisten terhadap antibiotik ciproflosaksin dan norflosaksin, S. Typhi resisten terhadap kloramfenikol, streptomisin, dan tertrasiklin. Dilaporkan bakteri EPEC K1.1 yang diisolasi dari penderita diare di Depok resisten terhadap antibiotik tetrasiklin dan ampisilin. Adanya bakteri yang resisten terhadap antibiotik jika mencemari makanan dan minuman akan menyebabkan penyakit diare dan mempersulit pengobatan, sehingga diperlukan biokontrol alami yang ramah lingkungan dan dapat mengatasi bakteri patogen tersebut. Biokontrol alami yang dimaksud adalah fag litik yang dapat melisiskan sel bakteri. Hasil penelitian ini diharapkan dapat diaplikasikan sebagai biokontrol pencemaran air dan makanan sehingga dapat mencegah penyakit diare akibat infeksi EPEC dan Salmonella. Fag litik EPEC diisolasi dari limbah cair rumah tangga di daerah Babakan Raya, Darmaga Bogor. Isolat fag litik yang diperoleh dimurnikan dan dibiakkan, selanjutnya diamati morfologinya, dilakukan kuantifikasi fag litik, ditentukan kisaran inangnya, diuji aktivitas campuran fag litik dalam melisis sel EPEC K1.1 dan Salmonella P38, diuji kestabilan penyimpanannya dalam bufer dengan kondisi suhu yang berbeda, dan dilakukan karakterisasi protein fag litik. Pada penelitian ini, diperoleh empat isolat fag litik yaitu: FBd1, FBd2, FBd3 dan FBd4 yang didapat dari titik pengambilan sampel yang berbeda. Konsentrasi fag litik kemudian diukur dengan cara menghitung plak yang terbentuk (Plaque Forming Unit (PFU)). Fag litik FBd3 memiliki konsentrasi tertinggi, yaitu 3.4 x 106 PFU/mL. Kuantifikasi plak menunjukkan bahwa FBd3 memiliki kemampuan infeksi terkuat terhadap bakteri EPEC K1.1, sehingga lebih efektif dalam menginfeksi sel EPEC K1.1 dibandingkan ketiga isolat lainnya. Hal ini memungkinkan peluang FBd3 untuk dapat diaplikasikan sebagai biokontrol terhadap penyakit diare. Uji kisaran inang bertujuan untuk mengetahui spesifisitas fag dalam melisis sel bakteri yang menjadi inangnya. Hasil penelitian menunjukkan bahwa fag litik FBd3 bersifat spesifik terhadap bakteri EPEC K1.1. Spesifisitas inang FBd3 menunjukkan dugaan bahwa di permukaan sel bakteri EPEC K1.1 memiliki reseptor-reseptor yang spesifik terhadap fag litik FBd3 yang tidak dimiliki oleh bakteri lainnya. Berdasarkan pengamatan morfologi fag litik pada Transmission Electron Microscope (TEM), FBd3 termasuk kedalam famili Phodoviridae. Morfologi kepala ikosahedral berdiameter 57.14 nm, ekor pendek non kontraktil berdiameter 12.5 nm dan panjang ekor 33.3 nm. FR38 termasuk kedalam famili Siphoviridae dengan kepala berbentuk heksagonal ikosahedral berdiameter 72.7 nm, ekor non kontraktil dengan panjang 100 nm dan berdiameter sebesar 18.2 nm. Kepala dan ekor fag terdiri dari protein. Protein penyusunnya bervariasi dan memiliki fungsi yang berbeda. Fungsi tersebut meliputi perlindungan fag terhadap ketahanannya di lingkungan dan berperan pada proses replikasi sampai menyebabkan lisis pada
Keyword: Lytic phage, cocktail phage, Salmonella, EPEC

Judul: Kajian perdagangan kakao Indonesia ke Malaysia
Abstrak: Kakao atau dalam bahasa Latinnya Theobroma cocoa L. adalah salah satu komoditas penting perkebunan. Dalam perekonomian suatu negara, komoditas kakao adalah komoditas ekspor, sehingga dapat menambah devisa negara, selain itu dalam proses produksi dan pengolahannya, kegiatan usaha komoditas kakao mampu menyerap tenaga kerja yang cukup besar dan dapat memberikan sumber pendapatan yang kontinyu bagi petaninya. Di Indonesia, kakao adalah komoditas ekspor. Seperti ditunjukkan oleh data dari Badan Pusat Statistik, volume ekspomnya rata-rata meningkat sebesar 28,89 persen per tahun, sedangkan nilainya meningkat rata-rata 28,41 persen per tahun. Oleh karena itu, seperti tercatat dalam Laporan Tahunan ICCO, untuk tahun 1998 pangsa pasar komoditas kakao Indonesia di pasar internasional mencapai 9,97 persen. Ekspor kakao ini bentuknya adalah biji kakao kering. Tujuan ekspor biji kakao kering Indonesia antara lain Amerika Serikat, Singapura, Malaysia, Cina dan Brazillia. Negara-negara tersebut selama sepuluh tahun terakhir merupakan pasar bagi Indonesia. Bagi Indonesia negara-negara tersebut adalah "sepuluh besar pembeli biji kakao kering". Di samping itu, seperti Malaysia atau Brazillia, sebenarnya merupakan negara penghasil kakao. Bahkan sebagai penghasil kakao, Malaysia dan Brazillia termasuk "sepuluh besar produsen kakao dunia". Oleh karena itu, mempelajari hal tersebut khususnya perdagangan komoditas kakao Indonesia ke Malaysia penelitian ini selanjutnya akan mengangkat masalah "Mengapa Indonesia mengekspor kakao ke Malaysia, sementara posisi Malaysia masuk pada sepuluh besar produsen dunia dan bagi Indonesia ekspor kakao tidak hanya ditujukan ke pasar Malaysia saja?" serta "Mengapa Malaysia mengimpor kakao dari Indonesia, mengingat posisi Malaysia adalah produsen yang termasuk dalam sepuluh besar produsen kakao dunia?"..dst
Keyword: kakao, usahatani kakao, perdagangan internasional