Judul: Reproductive biology, food habits, and population connectivity of horseshoe crab (Xiphosura: Limulidae) in Sunda Shelf area
Abstrak: Mimi adalah hewan purba yang mampu bertahan hampir 450 juta tahun dengan bentuk morfologi yang cenderung stabil. Terdapat empat jenis mimi di dunia dan tiga diantaranya dapat ditemukan di perairan Indonesia, yaitu Carcinoscorpius rotundicauda Latreille, 1802, Tachypleus gigas Müller, 1785, dan Tachypleus tridentatus Leach, 1819. Keberadaan ketiga jenis mimi di Indonesia tidak diikuti dengan ketersediaan data yang mencukupi. Informasi dasar tentang biologi mimi di Indonesia belum banyak terungkap. Status konservasi mimi berdasarkan IUCN Red List of Threatened Species adalah terancam punah untuk T. tridentatus, sedangkan dua lainnya C. rotundicauda dan T. gigas berstatus data deficient atau kurang data. Beberapa negara menyatakan mimi mengalami penurunan populasi dan berpotensi untuk menghadapi risiko kepunahan secara global. Akan tetapi, hingga saat ini data dan informasi biologi mimi di Indonesia masih terbatas. Tujuan dari penelitian ini adalah menganalisis karakteristik habitat pemijahan mimi serta beberapa aspek reproduksinya untuk jenis T. gigas di Subang, Jawa Barat, menganalisis jenis makanan mimi serta menguraikan persaingan makanannya berdasarkan DNA-metabarcoding, menganalisis konektivitas populasi yang terdapat di Indonesia untuk jenis T. gigas berdasarkan marka molekuler DNA-mitokondria pada bagian AT-rich untuk mengetahui keterkaitan populasi satu dengan yang lainnya. Metode yang digunakan dalam analisis karakteristik habitat pemijahan adalah pengamatan secara langsung pada bulan penuh dan bulan baru untuk mengetahui keberadaan T. gigas yang sedang memijah dan telur yang telah didepositkan. Pengamatan parameter lingkungan di daerah pemijahan juga diukur untuk mengetahui karakteristik habitatnya. Selanjutnya analisis kebiasaan makanan C. rotundicauda dan T. gigas dilakukan berdasarkan DNA-metabarcoding. Analisis DNA yang berasal dari isi lambung diperoleh dengan tahapan ekstraksi, amplifikasi, elektroforesis, sekuensing DNA, dan pengolahan data bioinformatik. Selain itu, metode serupa juga dilakukan untuk mengetahui konektivitas populasi T. gigas di daerah Paparan Sunda berdasarkan DNA mitokondria bagian AT-rich. Proses analisis data dilakukan dengan menggunakan beberapa perangkat lunak seperti Obitools, RStudio, MEGAX dan DNAsp. Daerah pemijahan mimi yang ditemukan pada penelitian ini terdapat di Subang, Jawa Barat khususnya di Pulau Burung dan Segara Menyan. Indikasi penentuan daerah pemijahan tersebut berdasarkan penemuan sepasang mimi yang sedang melakukan pemijahan, sarang dan telurnnya. Jumlah sarang yang ditemukan pada pengamatan bulan penuh sebanyak 50 sarang dengan total fekunditas 12.422 telur, sedangkan pada bulan baru sebanyak 27 dengan total fekunditas 5.841 telur. Karakteristik habitat yang dijadikan sebagai tempat pemijahan dan peneluran mimi cenderung spesifik, berada di gundukan pasir sekitar genangan air bekas tambak dan di sekitar tanaman mangrove. Rhizophora sp. Jenis substrat dominan pasir halus dan kasar. Sarang mimi yang telah ditemukan sebagian besar terletak di daerah tenang, terlindung dari gangguan gelombang ataupun ombak dan berada di tempat yang cenderung teduh dengan kelembaban yang cukup. Peranan penting mimi dalam sistem ekologi salah satunya sebagai pengendali struktur komunitas bentos. Hasil analisis komposisi jenis makanan berdasarkan DNA-metabarcoding menjelaskan bahwa C. rotundicauda dan T. gigas termasuk kelompok hewan karnivora. Jenis makanan C. rotundicauda dan T. gigas di Balikpapan didominasi oleh polychaeta (Clhoeia parva, Ancistrosyllis groenlandica, Mediosmastus sp.) dan scyphozoa (Lychnorhiza sp., dan Catostylus sp.). Jenis makanan C. rotundicauda di Demak sebagian besar gastropoda (Philine aperta dan Perinella cingulata), sedangkan pada T. gigas sebagian besar palaeonemertea (Callinera sp. dan Tubulanus sp.). Jenis makanan C. rotundicauda di Sumenep yang banyak ditemukan
Keyword: Habitat pemijahan, mimi/belangkas, jenis makanan, single stock, sarang telur, Food habit, horseshoe crab, nest placement, single stock, spawning ground

Judul: Evaluasi karakter morfologi dan analisis variasi genetik mimi (Limulidae) di Demak, Madura, dan Balikpapan berdasarkan penanda Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD).
Abstrak: Mimi (horseshoe crab) merupakan salah satu hewan living fossil animal dari famili Limulidae. Mimi diklasifikasikan kedalam Atlantic horseshoe crab (Limulus polyphemus) dan Asian horseshoe crab (Carcinoscorpius rotundicauda, Tachypleus gigas, dan Tachypleus tridentatus). Informasi tentang mimi Asia di Indonesia hingga saat ini belum banyak diungkap. Berbeda halnya dengan mimi Atlantik yang telah banyak diteliti dan dimanfaatkan. Upaya penggalian informasi dan monitoring populasi mimi di Indonesia dapat dilakukan dengan melibatkan masyarakat lokal khususnya nelayan. Hal tersebut dapat didukung dengan kemampuan dasar dalam membedakan ketiga jenis mimi khususnya dengan menggunakan karakter morfologi. Penggunaan karakter yang tidak tepat berpotensi menimbulkan kesalahan identifikasi, khususnya untuk T. gigas dan T. tridentatus yang terlihat serupa. Dengan demikian perlu adanya evaluasi karakter morfologi yang digunakan sebagai karakter utama untuk identifikasi T. gigas dan T. tridentatus. Selain itu, mimi juga tergolong dalam hewan yang dilindungi. Terdapat dua jenis mimi yang hingga saat ini masih berstatus data deficient yaitu C. rotundicauda dan T. gigas. Kedua jenis tersebut terdapat di beberapa lokasi di Indonesia termasuk Demak, Madura, dan Balikpapan. Oleh karena itu, untuk mengetahui kondisi populasinya perlu adanya kajian tentang keragaman genetik. Identifikasi mimi C. rotundicauda dan genus Tachypleus dapat diidentifikasi berdasarkan bentuk telson. C. rotundicauda mempunyai bentuk telson yang bulat sedangkan genus Tachypleus mempunyai bentuk segitiga. Membedakan kedua jenis spesies dari genus Tachypleus akan lebih tepat dengan menggunakan keberadaan duri-duri yang tersebar di bagian dorsal opisthosoma. Karakter tersebut lebih tepat dan praktis digunakan untuk identifikasi. Analisis RAPD menjelaskan bahwa derajat polimorfisme dan heterozigositas tertinggi pada C. rotundicauda terdapat di Demak dengan nilai masing-masing sebesar 74.67% dan 0.267 Derajat polimorfisme T. gigas terdapat di Madura yaitu sebesar 74.36% dengan nilai heterozigositas sebesar 0.255. Uji perbandingan berpasangan (FST) menunjukkan bahwa C. rotundicauda dan T. gigas di masing-masing lokasi penelitian berbeda satu sama lain. Hal tersebut diduga karena mimi mempunyai wilayah jelajah yang terbatas. Jarak genetik terdekat C. rotundicauda terdapat di antara Demak dan Madura begitu juga dengan T. gigas di Demak dan Madura lebih dekat dibandingkan dengan Balikpapan. Jenis C. rotundicauda dan T. gigas di perairan Demak, Madura, dan Balikpapan berbeda satu sama lain. Mimi jenis C. rotundicauda dan jenis T. gigas mempunyai persentase polimorfisme yang cenderung sedang dan nilai heterozogositas yang cenderung rendah.
Keyword: Carcinoscorpius rotundicauda, duri-duri opisthosoma, Tachypleus gigas, Tachypleus tridentatus

Judul: Construction of Strongly Optimal Binary Linear Code with Minimum Distance 9 and 11
Abstrak: A binary linear code of length n over q F is a subspace of n q F . A code has three parameters that attached to it, namely length, dimension, and minimum distance. A code with length n, dimension k and minimum distance d is often called [n, k, d ]-code. Usually, when two parameters are given, then we want to find a code that has the best value for the last parameter. Based on Gilbert- Varshamov bound, if a [n, k, d ]-code exists and can not be expanded, we call it a strongly optimal code. In this paper, we construct strongly optimal code with minimum distance 9 and 11. In constructing the code, we created a theorem and algorithm based on Gilbert-Varshamov bound before we implement the algorithm to MAPLE programming language. Because of computational limitations, the program can only construct up to k = 10 for d = 9 and k = 12 for d = 11.
Keyword: