Judul: Analisis Efek Mutasi Q348 dan S349 pada Penambatan Glukosamin-6-Fosfat Sintase dengan Senyawa Turunan Katekin sebagai Potensi Antibakteri.
Abstrak: Senyawa golongan katekin dan turunannya (katekin, epikatekin, epigalokatekin dan galokatekin) pada minuman teh hijau mempunyai sifat antibakteri salah satunya telah dibuktikan pada penelitian sebelumnya dengan penambatan molekuler dengan reseptor glukosamin-6-fosfat sintase (GlmS) untuk menghambat sintesis peptidoglikan. Penelitian tersebut mengindikasikan pentingnya residu Q348 dan S349 dari reseptor GlmS dalam penambatan dengan ligannya. Penelitian ini bertujuan melakukan mutasi pada residu tersebut dan menganalisis perubahan interaksi sehingga diketahui pentingnya residu yang dimutasi. Mutasi dilakukan secara in silico sebanyak enam kali, menghasilkan mutan Q348E, Q348W, S349T, S349A, Q348E/S349T dan Q348W/S349A. Mutasi menyebabkan perubahan daerah penambatan dan afinitas penambatan sehingga dapat dikatakan bahwa residu Q348 dan S349 pada enzim GlmS memiliki peran penting dalam penambatan dengan ligan uji epikatekin, epigalokatekin, dan galokatekin yang diharapkan sebagai antibakteri. Antara Q348 dan S349, S349 memiliki peran yang paling penting pada fungsi GlmS.
Keyword: GlmS, mutasi, penambatan, katekin, epikatekin

Judul: Potensi Senyawa Turunan Katekin sebagai Antibakteri dalam Menghambat Glukosamin-6-fosfat Sintase secara In Silico
Abstrak: Camellia sinensis atau teh merupakan komoditas perkebunan yang sangat populer. Teh ini diolah menjadi produk olahan minuman, salah satunya adalah teh hijau yang biasa dikonsumsi oleh masyarakat Indonesia. Teh sudah banyak diteliti berkhasiat sebagai antioksidan, antidiabetik, antiinflamasi, antibakteri, antivirus, dan antikanker. Tujuan penelitian ini adalah menguji potensi senyawa flavonoid pada teh hijau, yaitu katekin, epikatekin, galokatekin, dan epigalokatekin sebagai antibakteri melalui penambatan molekul dengan reseptor enzim glukosamin-6- fosfat sintase (GlmS). Reseptor GlmS dihambat oleh senyawa turunan katekin agar glukosamin-6-fosfat yang merupakan senyawa antara sintesis peptidoglikan tidak terbentuk. Penambatan molekul menunjukkan bahwa semua senyawa, kecuali katekin, memiliki residu asam amino yang sama dengan ligan standar. Fruktosa-6-fosfat dipilih menjadi ligan standar berdasarkan reaksi enzimatis yang terjadi. Galokatekin memiliki afinitas yang tinggi dengan GlmS karena memiliki energi afinitas (ΔG) dan konstanta inhibisi yang rendah. Oleh karena itu, galokatekin merupakan inhibitor paling potensial sebagai penghambat sintesis dinding sel bakteri.
Keyword: Catechin, Epicatechin, Epigalocatechin, Galocatechin, GlmS, Camellia sinensis, Antim flamation, Green tea, Antidiabetic, Anti bacterial

Judul: Thermal Characteristics and Dynamics of Tropical Cyclone over Western North Pacific Ocean: A Case Study of Typhoon Songda (Chedeng) 2011
Abstrak: The frequent occasion of Tropical Cyclone (TC) over Western North Pacific (WNP) Ocean lies from 10˚N to 26˚N and 121˚E to 170˚E. Sources of TC development come from warm ocean temperature where latent heat is released during condensation processes and subsequently concentrated in the boundary layer. Relative humidity at 850-700 hPa is responsible to produce the most intense storm. Meanwhile, weak vertical wind shear between 850-200 hPa is one of the dynamical factors that lead to the development of TC. Pressure level of 850-200 hPa is chosen to minimize the thermodynamic effect in the lower troposphere. Typhoon Songda (Chedeng in the Philippines) or TSC lasted from May 18th to 30th, 2011 and strengthened into powerful Super Typhoon stage between May 24th and 27th. Long curving track and the exhibition of all sequences of TC life cycle, TSC is then considered as an ideal case of TC. The objective of the study with case of TSC is to investigate the role of thermal characteristics and dynamics on TC intensity. The research is carried out by using Advanced Research of Weather Research and Forecasting model (WRF ARW model) version 3.3. Two domains are employed in the model. The first domain situate from 02˚N to 40˚N and 118˚E to 149˚E and cover spatial resolution () of 33.1 km. The second domain situate from 09˚N to 27˚N and 119˚E to 132˚E with of 11 km. Timestep of the model () is 120 seconds. The model is supported by the following physical parameterization, i.e., Yonsei University Scheme (YSU) in the boundary layer, Kain-Fritsch scheme (KF) in the cumulus, and WRF Single-Moment 3-class scheme in the microphysics. Initial meteorological condition prior to the formation of the cyclone is generated using WRF ARW standard-release model. Sensitivity of the model output is obtained from a selected single-parameter change scenarios, namely, 10 % to 20 % decrease and increase of wind shear initial data at 850-200 hPa, and by 10 % to 20 % decrease of relative humidity initial data at 850-700 hPa. The result showed that the negative correlations between wind shear and intensity are found in wind shear scenarios. Wind shears of 10 ms-1 which lead to strengthening of the wind intensity in the early period of Typhoon development are found in wind shear scenarios. The effect of wind shear changes on wind intensity is statistically significant in the 20 % wind shear scenarios. During mature stage, weak wind intensity occurred when wind shear increase as given in the WRF standard-release and the 20 % decreasing scenario. Different situation is found in the 20 % increasing scenario where wind shear tend to weak and lead to strong wind intensity at this stage. Meanwhile, the reduction of moisture supply at 850-700 hPa resulting from 20 % decreasing relative humidity play a major role in the weakening of wind intensity and reduces mechanical energy of the cycle process as much as 300 J kg-1.
Keyword: