Judul: Kloning Gen Xilanase Termozim Dari Streptomyces costaricanus 45I-3
Abstrak: Biopolymer xylan has a great potential to produce useful end product such as xylose. Xylanases is a group of enzyme that has ability to hydrolyse xylan or polymer of xyloses and xylooligosaccharides. Complete hydrolysis of xylans involves the synergistic action of a xylanolytic enzymes, including ß-xylanase, ß-xylosidase, -glucuronidase, -L-arabinofuranosidase, and acetyl xylan esterase. The aims of this research were to isolate xylanase gene from Streptomyces costaricanus 45I-3 and to clone this gene into competence Escherichia coli DH5 . Genomic DNA was obtained from S. costaricanus 45I-3 that have known has ability to produce thermostabile extracellular xylanase. Genomic DNA was partially digested with restriction enzyme Sau3A1. Genomic DNA fragments of size 4-10 kb were inserted at BamHI site in pBluescript II KS (+) vector and transformed into E. coli DH5 . Based on blue-white selection approximately 12000 recombinant colonies were obtained. The presence of xylanase gene was identified by screening employing congored plate clearance assay. One positive clone containing the xylanase gene was confirmed and was designated as pHS11. Preliminary characterization of pHS11 using EcoRI showed that it contained a 6,0 kb DNA insert. Xylanase were produced has xylanase spesific activity 6,393 U/mg, -xylosidase activity 0,208 U/ml, arabinofuranosidase activity 0,079 U/ml and acetyl xylan esterase activity 0,063 U/ml as well.
Keyword: 

Judul: Analisis Sekuens Gen Penyandi Enzim Xilanase Ekstraseluler pada Streptomyces costaricanus 45I-3
Abstrak: Streptomyces costaricanus 45I-3 isolated from peat soil is a bacterial strain in the group of actinomycetes. This bacterium is known to produce extracellular xylanase. The objectives of this study were to analyze sequence of gene involved in the synthesis of extracellular xylanase. Complete gene encoding xylanase was isolated from the bacterial genome by Inverse Polymerase Chain Reaction (i-PCR). The resulted gene sequence in a total alignment of 1664 bp amplicons, which consisted of two open reading frame (ORF) with opposite direction. ORF1 consisted of 1029 bp and ORF2 (Partial sequence) consisted of 309 bp. BLASTX analysis showed ORF1 homology with xylanase of bacterium enrichment culture clone Xyl8B8 (GenBank accession No. AFH35005.1) that had 95% identity and 99% similarity. ORF2 homolog with glyoxalase bacterium enrichment culture clone Xyl8B8 (GenBank accession No. AFH35007.1) that had 95% identity and 98% similarity. Upstream of the ORF1 sequence was found Ribosome Binding Site (RBS) 7 bp from the start codon and putative promotor sequence at 100 bp (-35) and 77 bp (-10) from the start codon. Analysis of protein sequence deduced from ORF1 showed that there were 2 domains, i.e Glyco_hydrolase 11 (GH11) and Carbohydrate Binding Type 2 (CBM2). Active sites found on the 130 amino acid on GH11 domain. Visualization of 3 dimension structure showed that 1664 bp fragment had 19 area.
Keyword: 

Judul: Analisa deret waktu curah hujan di Daerah Khusus Ibukota Jakarta
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui model deret Fourier yang dominan pada harmonik tertentu, guna menjelas- kan gambaran tentang musim untuk keperiodikan curah hujan bulanan setiap tahun, disamping itu ingin diketahui juga pengaruh korelasi diri dari setiap curah hujan bulanan dan rata-rata bergeraknya sebagai usaha untuk mengetahui ke- teraturan periodik atau menghilangkan keadaan yang eratik dari curah hujan bulanan. Bahan penelitian berupa data curah hujan bulanan yang dihimpun menjadi curah hujan tahunan, dari tahun 1953 sampai tahun 1977 atau selama 25 tahun. Dalam penelitian ini diambil data dari lima stasiun penakar hujan yang data- nya paling lengkap, masing-masing stasiun Jakarta Pusat, Kemayoran, Manggarai, Ragunan dan Jatipadang. Data diperoleh dari Badan Meteorologi dan Geofisika Jakarta. Hasil penelitian menunjukkan bahwa model yang dominan sebagai gambaran musim untuk keperiodikan curah hujan bulan- an setiap tahun adalah model deret Fourier untuk harmonik pertama, dari model diperoleh sari antaranya, diperkirakan bulan Februari akan terjadi curah hujan tertinggi dan bulan Agustus sebagai bulan dimana curah hujan terendah setiap tahun. Di stasiun penakar Jakarta Pusat, Kemayoran dan Manggarai terjadi tiga bulan kering secara berturut-turut pada bulan Juli, Agustus dan September. Sedangkan bulan basah mulai bulan Januari sampai Mei dan bulan Oktober sampai bulan Desember, kecuali di stasiun penakar Kemayoran pada bulan November dan Desember. Di stasiun Ragunan dan Jatipadang diharapkan tidak akan terjadi bulan kering, sedangkan bulan basah terjadi mulai bulan Januari sampai Juni dan bulan Oktober sampai Desember. Perbedaan antara musim hujan dan kemarau lebih jelas nampak untuk daerah-daerah bagian selatan kota atau di- Ragunan dan Jatipadang, kemudian semakin berkurang untuk daerah-daerah Manggarai dan Jakarta Pusat, sedangkan di- Kemayoran perbedaan antara kedua musim paling kecil. Curah hujan pada suatu bulan tertentu ada hubungannya dengan curah hujan pada bulan berikutnya, hubungan ini semakin berkurang dengan curah hujan pada bulan berikutnya lagi, kemudian dengan curah hujan pada bulan ketiga hubungannya sudah tidak ada. Gambaran fluktuasi curah hujan bulanan memperlihatkan pola yang teratur setelah dilakukan perataan (pemulusan) terhadap rata-rata bergerak curah hujan bulanan pada periode tiga bulan.
Keyword: Rainfall, model deret Fourier, Meteorologi, Geofisika