Judul: Polimorfisme Gen Calpastatin (CAST|Cfr131) Dengan Metode PCR-RFLP
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi polimorfisme gen calpastatin (CAST|Cfr131) menggunakan metode PCR-RFLP. Penelitian ini menggunakan 95 sapi bali yang terdiri dari 49 jantan dan 46 betina berasal dari BPTU-HPT Provinsi Bali. Polimorfisme gen calpastatin dianalisis menggunakan metode PCR-RFLP. Enzim yang digunakan untuk pemotongan adalah Cfr131 primer forward 5 'TGGGGCCCAATGACGCCATCGATG3' dan primer reverse 5 'GGTGGAGCAGCACTTCTGATCACC3'. Keragaman genetik dari gen calpastatin dianalisis menggunakan frekuensi alel, frekuensi genotipe, derajat heterozigositas. Keseimbangan Hardy-Weinberg diuji dengan uji Chi Kuadrat menggunakan aplikasi PopGen 32. Hasil penelitian menunjukkan bahwa Amplifikasi gen calpastatin terletak di intron 15 dengan suhu annealing 60 ⁰ C selama 10 detik dengan panjang produk 624 pb. Keragaman gen calpastatin pada bangsa sapi bali bersifat polimorfik dengan frekuensi alel G sebesar (0.86) lebih tinggi dibanding frekuensi alel A (0.14).
Keyword: calpastatin, keragaman genetik, PCR-RFLP, sapi bali

Judul: Identifikasi Keragaman Gen Calpastatin (CAST|Alu1) pada Sapi Bali dengan Metode PCR-RFLP.
Abstrak: Gen CAST merupakan salah satu gen yang berpengaruh pada keempukan daging dan berfungsi sebagai penghambat enzim calpain. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi keragaman gen CAST|Alu1 dengan metode Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism. Sampel DNA sapi bali yang digunakan sebanyak 95 sampel yang terdiri atas 46 betina dan 49 jantan. Identifikasi keragaman gen CAST|Alu1 menggunakan pendekatan Polymerase Chain Reaction- Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP) dengan menggunakan enzim restriksi AluI. Frekuensi alel dan genotipe, nilai heterosigositas pengamatan dan harapan, serta keseimbangan Hardy-Weinberg dianalisis menggunakan program Popgen32. Hasil amplifikasi gen CAST|Alu1 pada sapi bali diperoleh panjang fragmen 624 pb dan 2 alel yang terdiri atas alel T dan C serta 3 genotipe yaitu TT (474 pb), TC (474 pb dan 374 pb), dan CC (374 pb). Hasil genotyping CAST|Alu1 menunjukkan bahwa sapi bali di BPTU-HMT Provinsi bali bersifat polimorfik dengan nilai frekuensi alel tertinggi pada alel T (0.895) dibandingkan dengan alel C (0.105). Frekuensi genotipe pada sapi bali tertinggi terjadi pada genotipe TT (0.811), sedangkan genotipe TC (0.168) dan CC (0.021) rendah. Nilai heterosigositas pada sapi bali sangat rendah yaitu 0.1684 yang menunjukkan rendahnya variasi suatu gen dalam populasi. Berdasarkan hasil tersebut dapat disimpulkan bahwa gen CAST|Alu1 pada sapi bali bersifat polimorfik.
Keyword: gen CAST, PCR-RFLP, polimorfisme, sapi bali

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: