Judul: Molecular Docking of Black Cumin Active Compound to Inhibits Cholinesterase Enzyme in the Development of Alzheimer’s Therapy
Abstrak: Asetilkolinesterase (AChE) dan Butirilkolinesterase (BChE) merupakan dua jenis enzim kolinesterase yang berperan dalam penurunan kadar asetilkolin sebagai gejala khas penyakit alzheimer. Jintan hitam memiliki beragam senyawa aktif yang berpotensi menghambat aktivitas kedua enzim. Penelitian ini bertujuan menganalisis interaksi beberapa senyawa aktif penting dari jintan hitam dalam menghambat aktivitas kedua enzim. Senyawa uji terbaik dipilih berdasar analisis sifat kemiripan obat yang memenuhi kriteria dalam bioavailabilitas, toksisitas dan aspek farmakokinetik sebagai obat. Analisis penambatan molekul dilakukan dengan perangkat lunak komputer PyRx Virtual Screening dan YASARA Structure. Hasil penelitian menunjukkan 7 dari 25 senyawa uji diduga memiliki aktivitas penghambatan pada enzim AChE dan BChE. Senyawa nigelicin berpotensi sebagai inhibitor terbaik AChE (ΔG -7,74 kcal/mol; %BSS 69,23%). Senyawa nigelidin berpotensi sebagai inhibitor terbaik BChE (ΔG -6,73 kcal/mol; %BSS 33,33%). Ikatan inhibitor dan enzim pada keduanya didominasi interaksi hidrofobik dengan cincin aromatik berjajar. Kedua senyawa tergolong kelompok alkaloid jintan hitam yang berpotensi dikembangkan sebagai herbal terapi alzheimer., Acetylcholinesterase (AChE) and Butyrylcholinesterase (BChE) are two types of cholinesterase enzyme that plays important role in reducing acetylcholine as a symptom of alzheimer. Black cumin has a variety of active compounds and the potential to inhibit the activity of both enzymes. This study aims to analyze interaction of some crucial active compounds of black cumin in inhibiting AChE and BChE enzymes. Active compounds selected through drugs-likeness analysis that in compliance with bioavailability, toxicity and pharmacocinetics aspect. Docking simulation doing by the Pyrx Virtual Screening software and the YASARA Structure software. As a result, 7 of the 25 analyze compounds have the potential to inhibit activity of both enzymes. Nigelicin is the best compound that inhibits AChE (ΔG -7,74 kcal/mol; %BSS 69,23%). Nigelidin is the best compound that inhibits BChE (ΔG -6.73 kcal/mol; %BSS 33,33%). Both inhibitor and enzyme complex dominated by hydrophobic with lined aromatic structure. Both compounds are classified as alkaloid of black cumin that potential as alzheimer’s therapy.
Keyword: alzheimer’s disease, acetylcholinesterase, butyrylcholinesterase, black cumin, molecular docking

Judul: Potensi penghambatan enzim asetilkolinesterase oleh ekstrak air jintan hitam (Nigella Sativa L.) sebagai anti-Alzheimer
Abstrak: Jintan hitam (Nigella sativa L.) memiliki potensi sebagai obat herbal anti- Alzheimer namun belum terdapat informasi ilmiah terkait khasiat ekstrak air jintan hitam sebagai anti-Alzheimer. Penghambatan aktivitas enzim Asetilkolinesterase (AChE) merupakan salah satu pengobatan anti-Alzheimer. Penelitan ini bertujuan menguji aktivitas ekstrak air jintan hitam sebagai inhibitor enzim AChE. Ekstraksi jintan hitam dilakukan dengan variasi suhu untuk mengamati jumlah rendemen yang diperoleh. Simplisia diekstraksi dengan diseduh pada suhu 28, 40, 60, dan 80 ˚C selama 15 menit serta direbus (100 ˚C) selama 30 menit. Kandungan fitokimia ekstrak diuji secara kualitatif. Efek inhibisi enzim AChE diukur dari jumlah tiokolin yang dihasilkan menggunakan spektrofotometer (metode Ellman). Senyawa spesifik dalam ekstrak diidentifikasi dengan studi pustaka hasil analisis menggunakan LC-MS. Semua ekstrak mengandung kuinon, glikosida, alkaloid, fenolik, tanin, dan saponin sedangkan flavonoid hanya dimiliki oleh ekstrak 100 ˚C. Kenaikan suhu tidak meningkatkan jumlah rendemen. Ekstrak 80 ˚C menghambat aktivitas enzim AChE sebesar 11.86%(p=2) walaupun tergolong rendah dibandingkan donepezil HCl (97.73%). Senyawa yang kandidat sebagai inhibitor AChE adalah kuinon, glikosida, alkaloid, dan fenolik.
Keyword: water extract, black cumin, AChE, anti-alzheimer

Judul: Utilization of terra/MODIS L1B data for analysis of horizontal wind profile in the troposphere
Abstrak: This study was concerned with horizontal wind derived from data collected with the Moderate-resolution Imaging Spectroradiometer (MODIS) on board the NASA’s Earth Observation System (EOS)-Terra satellite. The aim of this study is to develop a method for the estimation of horizontal wind movement in the troposphere based on Navier-Stokes equation. The method was applied to a calibrated and geolocated Terra/MODIS L1B 1 km data set. The data inputs to estimate surface temperature are retrieved from TIR (Thermal Infrared) bands 31 (10.780 μm to 11.280 μm) and 32 (11.770 μm to 12.270 μm). The obtained surface temperatures were later used to approximate geopotential height on a constant-pressure surface by using the modified Poisson equation. The main assumptions used are the hydrostatic equilibrium, ideal gas law, constant lapse rate and constant acceleration of gravity. Based on the distribution of geopotential height, the pressure gradient force is measured by the gradient of geopotential on an isobaric coordinate to present the horizontal wind profile. For certain topographic areas especially in the mountain ranges, there was a disadvantage of using pressure as a vertical coordinate which lead to inaccuracy. In spite of that, Terra/MODIS L1B data with 1 km spatial resolution can be used to estimate the horizontal wind movement in the troposphere.
Keyword: