Judul: Treatment Disease of Motile Aeromonas Septicemia in Carp Using Water Plant Simplicia Pothos tener Wall
Abstrak: Dalam budidaya ikan mas secara intensif, peluang terjadinya penyakit infeksi lebih besar. Salah satu penyakit yang sering menginfeksi adalah penyakit motile aeromonas septicemia (MAS) yang disebabkan oleh bakteri Aeromonas hydrophila. Penggunaan antibiotik dapat menjadi pilihan untuk mengatasi infeksi bakteri, namun antibiotik memiliki dampak negatif yaitu dapat mengembangkan dan menyebarkan resistensi terhadap bakteri patogen. Oleh karena itu, diperlukan sebuah alternatif penggunaan bahan alami yang lebih aman dan ramah lingkungan, diantaranya yang berasal dari tanaman. Penggunaan tanaman terestrial sebagai obat sudah banyak digunakan dan dikembangkan, namun penggunaannya bersaing dengan kebutuhan manusia. Salah satu tanaman yang potensial adalah Pothos tener Wall yang merupakan tanaman air yang berasal dan tersebar di pulau Sulawesi dan Maluku. Sejauh ini belum ada penelitian terkait pengobatan ikan mas yang terinfeksi A. hydrophila menggunakan simplisia tanaman P. tener Wall. Dengan demikian, penelitian ini bertujuan untuk menguji efektifitas pemberian simplisia tanaman air P. tener Wall dalam kantung celup sebagai upaya pengobatan terhadap ikan mas yang telah diinfeksi A. hydrophila. Penelitian ini menggunakan rancangan acak lengkap (RAL) yang terdiri dari dua tahap. Ikan uji yang digunakan adalah ikan mas dengan bobot rata-rata 10 ± 2 g. Pada tahap I terdiri dari enam perlakuan dan tahap II terdiri dari lima perlakuan dengan masing-masing perlakuan terdiri dari tiga ulangan. Simplisia tanaman air P. tener Wall dimasukkan kedalam kantung celup. Pada tahap I, ikan mas diuji tantang dengan bakteri A. hydrophila (106 CFU mL-1) yang diinjeksikan secara intramuscular dengan volume 0.1 mL/ekor pada semua ikan baik perlakuan maupun kontrol positif, sedangkan ikan pada kontrol negatif diinjeksikan dengan larutan PBS. Kemudian setelah terlihat gejala klinis berupa perubahan tingkah laku ataupun gejala klinis seperti kemerahan pada sirip dan hemoragi pada permukaan tubuh, akuarium ikan diberi masing-masing kantung celup dengan konsentrasi 0.1 g L-1 (C1), 0.2 g L-1 (C2), kontrol antibiotik oxytetracycline 0.05 g L-1 (KA), kontrol terestrial Allium sativum 0.15 g L-1 (KT) selama 15 hari tanpa pergantian. Pada tahap II dilakukan dengan skema uji tantang yang sama dengan tahap I, kemudian saat gejala klinis terlihat diberikan kantung celup dengan konsentrasi terbaik yaitu 0.1 g L-1 (C1) dengan perbedaan perlakuan dengan pergantian kantung celup sehari sekali (F1), tiga hari sekali (F3), dan lima hari sekali (F5). Parameter pengamatan meliputi gambaran darah terdiri dari total eritrosit (TE), total leukosit (TL), konsentrasi hemoglobin (Hb), dan persentase hematokrit (Hc). Respons imun ikan terdiri respiratory burst (RB), aktivitas fagositik (AF), dan aktivitas lisozim (AL), perhitungan jumlah bakteri, gejala klinis, histopatologi, tingkat kelangsungan hidup (TKH), Relative Percent Survival (RPS), dan Mean Time to Death (MTD). Hasil penelitian menunjukkan bahwa pada parameter gambaran darah dan respons imun pada tahap I di perlakuan C1 dan KA berbeda nyata (P<0.05) dengan kontrol positif, hasil yang sama juga didukung dengan parameter gejala klinis, kepadatan bakteri di hati, dan perubahan histopatologi yang mengalami penurunan kepadatan bakteri sehinga proses pemulihan lebih cepat dan menghasilkan nilai TKH, RPS, dan MTD pada perlakuan C1 yang tidak berbeda nyata dengan KA. Selanjutnya, konsentrasi yang terbaik pada tahap I diuji dengan frekuensi pemberian yang berbeda (tahap II) menunjukkan pada perlakuan F3 dan F5 berbeda nyata (P<0.05) dengan kontrol positif. Hasil yang sama juga
Keyword: Aeromonas hydrophila, Ikan Mas, Immunostimulant, Pengobatan, Pothos tener Wall

Judul: Pemberian Probiotik Saccharomyces Cerevisiae Dan Prebiotik Mannan Oligosakarida Untuk Pengendalian Infeksi Aeromonas Hydrophila Pada Ikan Mas Cyprinus Carpio.
Abstrak: Aeromonas hydrophila merupakan bakteri penyebab penyakit motile aeromonad septicaemia (MAS) yang menyerang berbagai ikan budidaya air tawar, termasuk ikan mas C. carpio, menyebabkan terjadinya kematian yang tinggi hingga mencapai 90%. Beberapa strategi alternatif yang aman untuk pengendalian penyakit bakterial diantaranya adalah probiotik, prebiotik, dan sinbiotik. Manipulasi respons imun organisme akuatik dan kinerja pertumbuhan dapat diberikan melalui pakan. Pada beberapa penelitian, pakan yang mengandung imunostimulan dapat meningkatkan kerja sistem imun non spesifik pada ikan. Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi pengaruh pemberian probiotik S. cerevisiae, prebiotik mannan oligosakarida, dan gabungan keduanya (sinbiotik) melalui pakan terhadap imunitas dan kinerja pertumbuhan ikan mas yang diuji tantang A. hydrophila. Desain eksperimen yang digunakan pada penelitian ini adalah rancangan acak lengkap yang terdiri atas lima perlakuan dengan tiga ulangan. Pada pengujian in vivo, ikan mas (6,24±0,02 g), dipelihara di akuarium (40 x 30 x 30 cm3; volume 40 L), dengan kepadatan 10 ekor per akuarium. Ikan uji diberi pakan secara at satiation dengan frekuensi tiga kali sehari, yakni pada pukul 08.00 WIB, 12.00 WIB, dan 16.00 WIB selama masa pemeliharaan. Ikan diberi perlakuan pakan tanpa suplementasi yakni kontrol positif (K+) dan kontrol negatif (K-), pakan perlakuan probiotik S. cerevisiae 0,2% (Pro), prebiotik MOS 0,2% (Pre), dan gabungan probiotik 0,2% dan prebiotik 0,2% (Sin). Uji tantang bakteri A. hydrophila dilakukan pada hari ke-33, melalui injeksi intramuscular (IM) dengan dosis 10-7 CFU mL-1. Kematian ikan diamati setiap hari selama 10 hari. Pengambilan data parameter imunitas dan kepadatan bakteri patogen di organ hati dan ginjal dilakukan pada hari ke-34, 37, dan 41. Variabel pengamatan kinerja pertumbuhan meliputi, bobot akhir (Wt), jumlah konsumsi pakan (JKP), Specific Growth Rate (SGR), Feed Convertion Ratio (FCR), kelangsungan hidup dan rasio panjang usus (RPU), dan total probiotik S. cerevisiae dan total bakteri di usus ikan mas. Respons imunitas yang diamati terdiri dari jumlah sel darah merah (eritrosit), sel darah putih (leukosit), hematokrit, hemoglobin, aktivitas fagositosis, respiratory burst, serta total A. hydrophila pada organ hati dan ginjal ikan uji. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa pemberian pakan yang mengandung probiotik S. cerevisiae, prebiotik MOS, dan sinbiotik dapat meningkatkan SGR, JKP dan bobot akhir (wt), serta nilai FCR yang lebih rendah dibandingkan dengan kontrol. Bobot akhir (Wt), SGR, pada perlakuan sinbiotik menunjukkan hasil tertinggi diikuti dengan perlakuan prebiotik dan probiotik dibandingkan dengan kontrol positif dan kontrol negatif. Bakteri usus total (TBC) pada perlakuan prebiotik (8,64±0,03) menunjukkan nilai tertinggi dan diikuti oleh perlakuan sinbiotik (8,37±0,1). Nilai rasio panjang usus (RPU) menunjukkan bahwa perlakuan probiotik, prebiotik, dan sinbiotik lebih tinggi dibandingkan dengan kontrol. Total S. cerevisiae pada usus mengindikasikan bahwa probiotik yang diberikan mampu bertahan hidup pada saluran pencernaan inang dan melakukan fungsi-fungsinya. Terjadi peningkatan parameter gambaran darah pada hari ke-30 sebelum uji tantang, yang meliputi eritrosit (Et), hemoglobin (Hb), hematokrit (Ht), leukosit (Lc), aktivitas fagositik (AF), dan respiratory burst (RB) pada perlakuan probiotik, prebiotik, dan sinbiotik dan menunjukkan hasil yang lebih tinggi dibandingkan dengan kontrol. Pasca uji tantang terjadi fluktuasi nilai parameter gambaran darah pada setiap perlakuan, untuk parameter SDM, Hb, dan Ht pada H-34 mengalami penurunan, dan mulai meningkat kembali pada hari ke-37 hingga hari ke-41, karena merupakan proses
Keyword: Cyprinus carpio, probiotik, prebiotik, sinbiotik, A. hydrophila

Judul: Penyusunan Overlap Graph menggunakan Suffix Tree pada DNA Sequence
Abstrak: The DNA sequence assembly is very important in genome analysis. This step aims to reconstruct contigous DNA fragment (contigs) from short fragment by concatenating fragments based on the overlap region among them. This method employs overlap graph for solving the problems. In this graph, nodes represent fragments and edges represent overlap. This research developed a software for constructing overlap graph using suffix tree. The evaluation was conducted by measuring the number of nodes, number of edges, and the execution time in many values of minimum overlap. The minimum overlap is defined as the minimum length of substring which is considered as the overlap region between two fragments. The evaluation results showed that the number of nodes, the number of edges, and the execution time were increased with the decreasing of the minimum overlap value.
Keyword: