Judul: Kloning DNA Dari Tebu (Saccharum officinarum L.) Sebagai Penanda Molekuler
Abstrak: Keragaman genetik tetua tebu yang dewasa ini digunakan dalam persilangan cenderung semakin menyempit karena digunakannya varietas tebu komersial. Saccharum officinarum merupakan salah satu tetua untuk pembentukan varietas-varietas tebu komersial. Sejauh ini evaluasi keragaman terhadap species Saccharum officinarum masih terbatas pada pengamatan sifat-sifat morfologis dan sitologisnya. Sifat-sifat morfologis diketahui selain dikendalikan secara genetik, juga sangat dipengaruhi oleh lingkungan. Pemanfaatan teknik-teknik biologi molekuler untuk mempelajari keragaman genetik tebu masih jarang dilakukan dibanding penggunaan teknik ini untuk tanaman budidaya yang lain. Dalam penelitian ini, vektor yang digunakan adalah plasmid pUC 19. Bahan tanaman tebu untuk isolasi DNA genom didapatkan dari Pusat Penelitian Perkebunan Gula Indonesia (P3GI) Pasuruan Jawa Timur. Disamping itu, DNA genom tebu diisolasi dari klon POJ 2878 oleh P3GI Pasuruan dan klon BB 939 oleh Balitbio Cimanggu Bogor. Empat macam pustaka DNA dibuat dengan enzim yang berbeda, yaitu: (a). Pustaka 1 dengan enzim PstI, karena umumnya enzim PstI menghasilkan DNA kopi tunggal, (b). Pustaka 2 dengan enzim EcoRI, karena pada banyak tanaman enzim tersebut menghasilkan DNA kopi berulang, (c). Pustaka 3 dengan dua macam enzim (PstI dan EcoRI) dan dengan mengekstrak DNA dari gel agarose (elution) yang ber- ukuran 0.5-4.4 kb sebagai potongan yang akan diklon, dan (d). Pustaka 4 dengan enzim EcoRI dan dengan mengambil pita DNA yang menyolok diantara potongan DNA hasil elektroforesis gel agarose sebagai potogan yang akan diklon…dst
Keyword: Taksonomi Tanaman Tebu, Sitogenetika Tanaman Tebu, Kloning DNA, Penanda Molekuler, DNA Kopi Tunggal

Judul: Kloning DNA dari Tebu (Saccharum officinarum L.) sebagai Penanda Molekuler
Abstrak: Keragaman genetik tetua tebu yang dewasa ini digunakan dalam persilangan cenderung semakin menyempit karena digunakannya varietas tebu komersial. Saccharum officinarum merupakan salah satu tetua untuk pembentukan varietas-varietas tebu komersial. Sejauh ini evaluasi keragaman terhadap species Saccharum officinarum masih terbatas pada pengamatan sifat-sifat morfologis dan sitologisnya. Sifat-sifat morfologis diketahui selain dikendalikan secara genetik, juga sangat dipengaruhi oleh lingkungan. Pemanfaatan teknik-teknik biologi molekuler untuk mempelajari keragaman genetik tebu masih jarang dilakukan dibanding penggunaan teknik ini untuk tanaman budidaya yang lain. Penelitian ini dilakukan dengan tujuan untuk mengklon DNA kopi tunggal dan DNA kopi berulang dari tanaman tebu (Saccharum officinarum) serta mengkarakterisasi klon yang diperoleh. Dalam penelitian ini, vektor yang digunakan adalah plasmid pUC 19. Bahan tanaman tebu untuk isolasi DNA genom didapatkan dari Pusat Penelitian Perkebunan Gula Indonesia (P3GI) Pasuruan Jawa Timur. Disamping itu, DNA genom tebu diisolasi dari klon POJ 2878 oleh P3GI Pasuruan dan klon BB 939 oleh Balitbio Cimanggu Bogor. dst ...
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: