Judul: Studi In Silico Potensi Antiaterosklerosis Daun Jati Belanda dan Daun Salam melalui Regulasi Lintasan Persinyalan NFKappa B
Abstrak: The IKK2 (inhibitory-κB kinase β) receptor is an important molecule in activation cascade of the transcription factor NF-κB that triggers inflammation. Inflammation is the initial cause of atherosclerosis which characterized by thickening of blood vessel walls. The active compounds of jati belanda (JBL) and salam (SLM) leaves have anti-atherosclerotic properties, but their role in inhibiting the activation of NF-κB still unkown. The purpose of this study is to examine the bioactive compounds of JBL and SLM that can inhibit the activation of NF-κB, and predict interactions with the active site of the IKK2 enzyme. Molecular docking using YASARA Structure software obtained 7 test ligands with ideal binding energy and Ki (inhibitor constant). Quercetin, JBL and SLM marker compounds have binding free energy values of -5.383 cal/mol. Kaempferol is the test ligand with the best binding free energy and Ki, -7.373 cal/mol and 3.8864 x 10-6 μM. The results showed that kaempferol is the test ligands with the best potential in inhibiting the IKK2 enzyme based on energy affinity, inhibitory constants, and binding of amino acid residues., Reseptor IKK2 (inhibitory-κB kinase β) merupakan molekul penting dalam kaskade aktivasi faktor transkripsi NF-κB yang memicu inflamasi. Inflamasi adalah penyebab awal terjadinya aterosklerosis yang ditandai dengan penebalan dinding pembuluh darah. Senyawa aktif daun jati belanda (JBL) dan salam (SLM) memiliki sifat antiaterosklerosis, namun belum diketahui perannya dalam penghambatan aktivasi NF-κB. Penelitian ini bertujuan menguji senyawa bioaktif JBL dan SLM yang dapat menghambat pengaktifan NF-κB, serta interaksinya dengan sisi aktif enzim IKK2. Penambatan molekuler menggunakan perangkat lunak YASARA Structure didapatkan 7 ligan uji dengan energi bebas pengikatan dan Ki (konstanta inhibisi) yang baik. Kuersetin, senyawa penciri JBL dan SLM memiliki nilai energi bebas pengikatan sebesar -5,383 kal/mol. Kaemferol memiliki nilai energi bebas pengikatan dan Ki terbaik, yaitu -7,373 kal/mol dan 3,8864 x 10-6 μM. Hasil penelitian menunjukkan bahwa kaemferol (JBL) merupakan ligan dengan potensi terbaik dalam menginhibisi enzim IKK2 berdasarkan energi afinitas, konstanta inhibisi, dan pengikatan residu asam amino.
Keyword: aterosklerosis, atherosclerosis, IKK2, jati belanda, NF-KB, Salam

Judul: Aktivitas Antioksidan Fraksi Flavonoid Daun Jati Belanda dan Salam Serta Peranannya dalam Memodulasi Apoptosis Sel Khamir
Abstrak: Dua tanaman yang tengah dikembangkan sebagai fitofarmaka pengendali penyakit kardiovaskuler dan aterosklerosis adalah jati belanda dan salam. Syaefudin (2008) melaporkan bahwa ekstrak daun jati belanda dan salam memiliki aktivitas antioksidasi yang setara dengan α-tokoferol (vitamin E) 200 ppm. Jati belanda juga diketahui dapat menghambat terjadinya aterosklerosis serta berpotensi sebagai agen antihiperlipidemia (Sulistiyani et al. 2003) dan antihiperkolesterolemia (Darusman et al. 2009). Oleh karena itu, tumbuhan ini berpeluang untuk dijadikan sebagai obat penyakit degeneratif, seperti kardiovaskuler (Darusman et al. 2002). Tahapan kerja radikal bebas dalam menyebabkan penyakit kardiovaskuler, khususnya yang disebabkan oleh aterosklerosis sudah mulai banyak dikaji. Oksidasi terhadap lipoprotein pengangkut kolesterol atau lipoprotein berdensitas rendah (LDL, low density lipoprotein) akan menghasilkan LDL teroksidasi (ox- LDL) yang mudah ditangkap oleh makrofag sehingga membentuk sel busa (foam cells). Penimbunan sel busa dalam pembuluh darah merupakan fenomena khas pada patogenesis aterosklerosis awal (Spagnoli et al. 2007). Oleh karena itu, pengaturan pembentukan sel busa menjadi langkah yang tepat untuk mencegah terjadinya aterosklerosis. Regulasi ini dapat dilakukan dengan menginduksi atau menghambat terjadinya apoptosis sel makrofag oleh antioksidan (Tabas & Moore 2011; Tabas & Ron 2011). Penelitian yang berusaha mengungkap dan memanfaatkan fenomena apoptosis sebagai dasar pengobatan umumnya menggunakan model Saccharomyces cerevisiae (sel khamir). Penggunaan sel khamir sebagai model didasarkan pada kemiripan fenomena apoptosis yang terjadi di sel tersebut dengan sel mamalia, termasuk manusia (Madeo et al. 2002). Sel khamir yang mengalami apoptosis dapat diketahui dengan mengamati terjadinya kondensasi dan fragmentasi DNA sel, pembentukan sel petite (cell shrinkage), eksternalisasi fosfatidilserin, pembentukan badan apoptosis, serta pelepuhan pada membran (membrane blebbing) (Kerr et al. 1972; Hacker 2000; Granot et al. 2003; Ziegler & Groscurth 2004). Penelitian ini bertujuan membandingkan daya antioksidasi fraksi flavonoid kedua tanaman serta perananannya dalam memodulasi apoptosis sel khamir. Hasil penelitian diharapkan dapat memberikan informasi yang lebih lengkap mengenai mekanisme seluler metabolit sekunder kedua tanaman dalam mengobati penyakit degeneratif. Selain itu, hasil penelitian ini juga menjadi bagian dari upaya saintifikasi jamu dan komersialisasi tanaman herbal yang banyak digunakan oleh masyarakat Indonesia. Daun jati belanda dan salam diperoleh dari Kebun Cikabayan, Pusat Studi Biofarmaka, IPB. Ekstraksi dedaunan kedua tanaman menggunakan teknik maserasi. Berdasarkan uji fitokimia yang dilakukan oleh Sulistiyani et al. (2011), dedaunan tanaman mengandung beberapa metabolit sekunder, seperti flavonoid, tanin, dan hidrokuinon. Penelitian ini menggunakan senyawa metabolit sekunder...dst
Keyword: antioksidan, apoptosis, membran blebbing, Syzygium polyanthum, Guazuma ulmifolia

Judul: Implementation of Spatio-Temporal Change Query in Relational Database.
Abstrak: Geographic object changes in various views. Object changes are recorded using a model of static storage. No historical connection between old version data and new version data has been built. For that, a storage model of spatio-temporal queries that can analyze spatio-temporal changes has been developed. The object changes the geometry are grouped according to the taxonomy of Spatio-Temporal Pattern Change. This research has been able to apply the query patterns change including born, expand, merge, contract, split, normal and die. This query based on geometric (area) changes. The implementation of spatio-temporal change queries represents an object changes continuously with easy, change detection is done by comparing two versions of data. Keyword: spatio-temporal change query, spatio-temporal change pattern.
Keyword: