Judul: Profil Komunitas Mikrobial pada Rizosfer Kelapa Sawit Terinfeksi Ganoderma boninense Menggunakan Next Generation Sequencing
Abstrak: Komunitas pada rizosfer menjadi perhatian utama untuk menemukan mikrob potensial sebagai agen pengendali hayati terhadap Ganoderma boninense pada kelapa sawit. Penelitian bertujuan (i) menguraikan komunitas mikrob rizosfer pada tanaman kelapa sawit terinfeksi G. boninense dan tanaman kelapa sawit sehat, (ii) menggali potensi mikrob sebagai agen pengendali hayati. Identifikasi mikrob pada lingkungan ini menggunakan gen 16S rRNA dan region ITS sebagai marker filogenetik dan teknologi Next Generation Sequencing. Sekuensing gen 16S rRNA menghasilkan 94,650 sekuen pada sampel sehat TH1 (Tanah Health 1), 89,137 sekuen pada TH2, 71,585 sekuen pada sampel terinfeksi TD1 (Tanah Disease 1) dan 99,595 sekuen pada TD2. Komunitas bakteri didominasi oleh Actinobacteria dengan kelimpahan relatif 37-44% dari total sekuen gen 16S rRNA setiap sampel. Kelimpahan Saccharopolyspora yang mencapai 12% pada sampel sehat TH1 dan Pilimelia sebesar 3.94% pada sampel TH2 berpotensi untuk dikembangkan menjadi agen pengendali hayati terhadap G. boninense. Komunitas fungi didominasi oleh Ascomycota dengan kelimpahan relatif 11-51% dari total sekuen region ITS setiap sampel. Kelimpahan Talaromyces yang mencapai 18.40% pada sampel sehat (TH2), Gongronella sebesar 3.02% pada TH1 dan Chaetomium sebesar 2.77% pada TH2 berpotensi untuk dikembangkan sebagai agen pengendali hayati G. boninense.
Keyword: G. boninense, komunitas bakteri, komunitas fungi, rizosfer

Judul: Karakterisasi Fragmen Dna Dari Bakteri Antagonis Yang Terlibat Dalam Aktivitas Antifungi Ganoderma Boninense
Abstrak: Kelapa sawit (Elaeis guineensis jacq) merupakan salah satu tanaman komoditi yang telah digunakan secara luas dalam industri makanan, farmasi dan kosmetik. Indonesia merupakan negara yang telah dianugrahi dengan iklim, kondisi lingkungan yang cocok untuk pertumbuhan kelapa sawit dan luas areal yang menyebabkan Indonesia menjadi negara dengan perkebunan kelapa sawit terbesar di dunia. Namun demikian, budidaya kelapa sawit menghadapi beberapa ancaman yang dapat mengurangi tingkat produksi. Busuk pangkal batang (BPB) oleh Ganoderma boninense merupakan ancaman serius pada perkebunan kelapa sawit. Pengendalian penyakit tersebut hingga saat ini telah banyak dilakukan, namun belum menunjukkan hasil yang memuaskan. Pengembangan ketersediaan agen pengendali hayati merupakan solusi yang sangat baik dalam menekan infeksi BPB. Lebih lanjut lagi bahwa pendekatan berbasis bioteknologi molekuler atau penemuan baru senyawa antifungi diperlukan untuk strategi pengendalian yang lebih baik. Pada penelitian ini, 198 isolat bakteri berhasil diisolasi dari tiga jenis sumber isolasi yang berbeda. Empat puluh satu isolat menunjukkan efek penghambatan yang berbeda-beda terhadap miselium G. boninense. Enam belas isolat dipilih untuk diuji lebih lanjut berdasarkan kemampuan percentage inhibiton of radial growth (PIRG) lebih dari 50%. Perbedaan yang signifikan ditunjukkan pada uji kultur ganda (Dual culture assay) pada p>0.05, dimana isolat G.1.22 menunjukkan aktivitas penghambatan tertinggi yaitu 87.86%. Hasil uji filtrat menunjukkan bahwa isolat G.1.22 tahan terhadap pemanasan. Sebaliknya isolat K.3.2 sensitif terhadap pemanasan dan penambahan proteinase K sehingga diasumsikan memiliki senyawa antifungi berupa protein. Hasil identifikasi gen penyandi 16S rRNA menunjukan bahwa isolat G.1.22 dan K.3.2 memiliki tingkat kemiripan 100% dengan Pseudomonas aeruginosa strain B13 (accession number KM588370) dan Bacillus amyloliquefaciens strain SCDB1439 (accession number KM922581). Metode shotgun cloning digunakan untuk kloning sejumlah fargmen DNA kromosom Bacillus amyloliquefaciens JR02. Berdasarkan uji antagonis keseluruhan E. coli T0P 10 rekombinan dengan suspensi G. boninense belum menunjukkan adanya ekspresi gen antifungi. Disamping itu, karakterisasi DNA pengapit mutan transposon mini-Tn5KmR (BglK226) dengan teknik genome walking berhasil dilakukan. Berdasarkan hasil analisis pengurutan DNA dan blasting diperoleh bahwa DNA pengapit memiliki tingkat kemiripan 99% dengan sebagian gen beta-ketoacyl shyntase asal Bukholderia gladioli BSR3.
Keyword: bakteri antagonis, busuk pangkal batang, Ganoderma boninense, genome walking, shotgun cloning

Judul: Dummy Title
Abstrak: Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Mauris viverra mollis ultrices. Donec imperdiet, odio facilisis lacinia convallis, lorem arcu mollis massa, faucibus hendrerit diam sapien finibus augue. Vestibulum a magna sit amet massa tincidunt efficitur. Etiam sagittis ex turpis. Suspendisse odio sem, tempor feugiat condimentum eget, hendrerit sed tortor. Donec velit turpis, tincidunt id molestie non, commodo nec tellus. Nulla tempor vel enim vel tristique. Proin lobortis orci sit amet urna consequat aliquet. Morbi eu vulputate enim. Sed placerat commodo magna at commodo. Cras sed eros velit. Curabitur imperdiet, justo at tempus eleifend, nisl mi euismod libero, ut volutpat tellus tortor in mi. Donec in scelerisque diam, ac semper justo. Aenean at magna euismod, efficitur dui sed, condimentum purus. Suspendisse potenti. Nam quis faucibus ligula. Sed imperdiet quam at accumsan ullamcorper. Fusce volutpat quam sed orci facilisis vestibulum. Quisque convallis ex quis urna semper, sed porttitor leo iaculis. Aliquam scelerisque dui ut lorem ornare ornare. Donec id viverra eros. Proin pulvinar purus vitae neque molestie maximus., Duis quis est vel neque lobortis suscipit. Morbi eu erat ultrices dui ornare gravida. Nam mattis blandit neque, at egestas mi aliquet sit amet. Nunc sed volutpat augue. Suspendisse faucibus, nisi ut dapibus eleifend, massa ipsum dictum nulla, rutrum consequat ligula lectus fringilla nibh. Sed vel justo vitae tellus dapibus facilisis ac sed libero. Cras et enim quis nunc vulputate lacinia id vel lacus. Cras ultricies suscipit malesuada. Quisque eu congue libero. Nam at dapibus nulla, vel efficitur neque. Etiam blandit sapien at dui interdum rhoncus. Donec vitae libero ornare, posuere sem ut, dignissim nibh. Praesent velit purus, sollicitudin et ligula nec, sollicitudin suscipit tortor. Vivamus vitae magna justo. Maecenas quis velit lacinia, pharetra nisi non, suscipit erat. Suspendisse sodales risus ac vestibulum ullamcorper. Mauris at tincidunt justo. Mauris sagittis, libero vel faucibus condimentum, nulla lacus tempus leo, eget tristique massa ligula non lorem. Integer dictum tortor a venenatis vestibulum. Fusce dapibus bibendum metus ut rutrum. Proin in velit in libero euismod convallis. Aliquam ultrices felis at ante lacinia varius. Cras odio eros, tincidunt vitae varius vel, aliquet et tellus. Vestibulum volutpat molestie tellus, sit amet sodales purus pharetra nec. Curabitur nec nunc velit. Fusce ut tincidunt nisi. In hac habitasse platea dictumst. Donec gravida urna quis auctor tempor. Sed eu diam eget felis luctus fermentum vel vel turpis. Curabitur vitae eros at elit varius interdum. Donec malesuada eleifend dictum. Nulla quam turpis, feugiat id augue a, porttitor sagittis mi. Suspendisse potenti. Integer nisi nisl, ullamcorper sit amet nisi et, vestibulum sollicitudin orci.
Keyword: dummy