Judul: Kerentanan Strain Ikan Nila Terhadap Infeksi Streptococcus Agalactiae Penyebab Penyakit Streptococcosis
Abstrak: Strain ikan nila (Oreochromis niloticus) unggulan hasil pemuliaan telah banyak dilepas untuk meningkatkan produksi perikanan budidaya di Indonesia. Namun ada kendala yang dihadapi yaitu kasus kematian ikan akibat penyakit Streptococcosis yang dikhawatirkan akan menjadi penghambat keberhasilan budidaya ikan nila. Penyakit ini disebabkan oleh infeksi bakteri Streptococcus agalactiae. Penanganan yang kurang baik, padat tebar yang tinggi, lingkungan pemeliharaan yang buruk, manajemen pemberian pakan yang kurang baik menyebabkan terjadinya ketidakseimbangan lingkungan dan akhirnya ketahanan tubuh ikan menjadi menurun sehingga rentan terhadap serangan penyakit. Bakteri S. agalactiae memiliki kisaran inang (host range) yang luas dan kemampuan adaptasi lingkungan yang cukup baik. Berdasarkan potensi infeksi S. agalactiae yang cukup tinggi dan potensial inang yang besar, maka diperlukan informasi mengenai kerentanan antar strain ikan nila unggulan dan variasi respon imun antara ikan nila (cichlidae) dan ikan mas (non-cichlidae). Pertama, melakukan uji kerentanan empat strain ikan nila terhadap infeksi S. agalactiae NK1. Strain ikan nila yang dipergunakan adalah ikan Nila Srikandi, ikan Nila Nirwana, ikan Nila BEST dan ikan Nila Sultana. Keempat strain nila diinfeksi dengan S. agalactiae NK1 pada dosis kepadatan bakteri 103, 104, 105, 106 CFU/ekor dan satu kontrol yang diinjeksi dengan PBS, masing-masing 2 kali ulangan. Nilai LD50 yang diperoleh berkisar antara 103,20-103,45 CFU/ekor . Kedua, melakukan analisis parameter imunologis strain ikan nila dan ikan mas terhadap infeksi S. agalactiae NK1. Dipergunakan ikan Nila Srikandi yang memiliki nilai LD50 tertinggi dan ikan mas yang mewakili kelompok noncichlidae (sebagai kontrol). Ikan diinfeksi dengan S. agalactiae NK1 menggunakan dosis 103 CFU/ekor. Hasil penelitian menunjukkan bahwa ikan nila memperlihatkan perubahan pola renang (berdiam didasar, berenang tidak beraturan dan berenang berputar), perubahan anatomi makroskopis (pigmentasi, eksoptalmi, mata keruh, operkulum jernih, hemoragi pada pangkal sirip). Sintasan ikan Nila Srikandi sebesar 50% dan ikan mas 100% pada 15 hari masa pemeliharaan. Ikan mas tidak menunjukkan perubahan pola renang dan perubahan anatomi. Kematian tercepat terjadi pada ikan Nila Srikandi terjadi pada 96 jam pasca infeksi. Aktivitas lisozim menunjukkan perbedaan yang signifikan antara ikan Nila Srikandi dan ikan mas. Berdasarkan pengamatan terhadap preparat histopatologi diketahui bahwa otak ikan Nila Srikandi yang terinfeksi S. agalactiae mengalami meningoensefalitis, sedangkan pada ikan mas hanya mengalami meningitis. Streptococcus agalactiae merupakan patogen spesifik pada ikan nila, hal ini terbukti dengan sintasan ikan mas yang mencapai 100%.
Keyword: Kerentanan, strain nila, Streptococcus agalactiae

Judul: Virulensi Bakteri Streptococcus Agalactiae Pada Ikan Nila (Oreochromis Niloticus).
Abstrak: Streptococcus agalactiae merupakan salah satu penyebab penyakit streptococcosis dan menyebabkan mortalitas yang signifikan pada berbagai jenis ikan air tawar dan laut di seluruh dunia. Di Indonesia, S. agalactiae telah menyerang budidaya ikan nila di beberapa daerah antara lain Sumatera Selatan, Jawa Tengah dan Jawa Barat. Bakteri yang sangat virulen akan mampu menginfeksi ikan sehat dan menyebabkan sakit. Faktor virulensi bakteri berkaitan dengan kemampuan bakteri menginvasi, bereplikasi dan bertahan terhadap sistem pertahanan tubuh inang, serta kemampuan menyebabkan kerusakan sel selama perkembangan penyakit. Pengetahuan akan karakteristik virulensi bakteri S. agalactiae akan memberikan gambaran kemampuan bakteri dalam menginfeksi dan berkembang dalam tubuh ikan sehingga mampu menyebabkan penyakit pada ikan. Selanjutnya informasi terkait karakteristik faktor virulensi bakteri dan peranannya dalam patogenisitas dapat menjadi acuan dalam mengembangkan upaya-upaya pengendalian serangan S. agalactiae terhadap budidaya ikan nila di Indonesia. Tujuan penelitian ini adalah untuk menguji virulensi S. agalactiae yang menginfeksi ikan nila dan mengkarakterisasi faktor-faktor virulensinya yang berperan dalam perkembangan penyakit. Empat isolat bakteri (N3M, N4M, N17O dan NK1) diuji tingkat virulensinya terhadap ikan nila dengan injeksi secara intraperitoneal. Uji in vitro dilakukan untuk mengetahui karakteristik terkait virulensi, yaitu pengujian resistensi bakteri terhadap whole blood killing, complement mediated killing serta oksigen reaktif. Kemudian dilakukan deteksi gen-gen terkait virulensi yaitu suface immunogenic protein, sip; faktor CAMP, cfb; protein C-β, bac; dan fibrinogen binding protein, fbsA dengan PCR. Hasil uji virulensi menunjukkan bahwa keempat isolat bakteri bersifat virulen. NK1 merupakan isolat paling virulen dengan dosis mematikan 50% (LD50) 104.5 CFU/ml, sementara LD50 N3M 107.75 CFU/ml, N4M >108 CFU/ml, dan N17O 106.67 CFU/ml. Keempat isolat bersifat resisten terhadap aktivitas pertahanan tubuh dalam darah dan serum. Hasil uji blood survival yaitu viabilitas masing-masing bakteri uji yaitu N3M mencapai 91%, N4M mencapai 158%, N17O mencapai 178% dan NK1 mencapai 236 % dari kepadatan awalnya. Hasil uji complement mediated killing menunjukkan semua isolat bakteri uji mampu tumbuh dengan baik dan mencapai viabilitas lebih dari 100%, baik pada perlakuan serum aktif maupun serum inaktif. Viabilitas bakteri pada uji sensitivitas terhadap oksigen reaktif yaitu 38% (N3M), 25% (N4M), 35% (N17O) dan 48% (NK1). NK1 merupakan isolat yang paling resisten terhadap whole blood killing, complement mediated killing dan pemusnahan oleh oksigen reaktif. Hasil identifikasi dengan PCR menunjukkan bahwa N3M, N4M, N17O dan NK1 memiliki gen sip, fbsA dan cfb yang berperan penting dalam menentukan sifat virulensinya.
Keyword: Ikan nila, Streptococcus agalactiae, virulensi

Judul: Utilization of terra/MODIS L1B data for analysis of horizontal wind profile in the troposphere
Abstrak: This study was concerned with horizontal wind derived from data collected with the Moderate-resolution Imaging Spectroradiometer (MODIS) on board the NASA’s Earth Observation System (EOS)-Terra satellite. The aim of this study is to develop a method for the estimation of horizontal wind movement in the troposphere based on Navier-Stokes equation. The method was applied to a calibrated and geolocated Terra/MODIS L1B 1 km data set. The data inputs to estimate surface temperature are retrieved from TIR (Thermal Infrared) bands 31 (10.780 μm to 11.280 μm) and 32 (11.770 μm to 12.270 μm). The obtained surface temperatures were later used to approximate geopotential height on a constant-pressure surface by using the modified Poisson equation. The main assumptions used are the hydrostatic equilibrium, ideal gas law, constant lapse rate and constant acceleration of gravity. Based on the distribution of geopotential height, the pressure gradient force is measured by the gradient of geopotential on an isobaric coordinate to present the horizontal wind profile. For certain topographic areas especially in the mountain ranges, there was a disadvantage of using pressure as a vertical coordinate which lead to inaccuracy. In spite of that, Terra/MODIS L1B data with 1 km spatial resolution can be used to estimate the horizontal wind movement in the troposphere.
Keyword: