Judul: Aplikasi Real-Time Pcr Untuk Mendeteksi Bakteri Salmonella Sp. Pada Hasil Perikanan
Abstrak: Salmonella termasuk ke dalam grup bakteri patogen yang menyebabkan foodborne ilness. Penyakit yang disebabkan oleh Salmonella diantara nya adalah gastrodermik, demam tipoid dan dapat menyebabkan kematian. Penelitian ini menggunakan sampel hasil perikanan segar dan olahan yang diperoleh dari pasar tradisional dan pasar modern di Bogor. Tujuan penelitian ini mengaplikasikan real- time PCR untuk mendeteksi bakteri Salmonella sp. pada hasil perikanan. Primer yang digunakan untuk mendeteksi gen target bakteri Salmonella sp.. memiliki panjang amplifikasi 204 bp. Hasil absorbansi dengan rasio 260/280 pada selang 1,6 dan 2,0. Sampel hasil perikanan yang berasal dari pasar tradisional dan pasar modern baik segar dan olahan tidak ditemukan produk yang terkontaminasi bakteri Salmonella, hal ini karena sampel tidak mencapai nilai Threshold Cycle (Ct), tidak mencapai nilai dari melting curve kontrol positif dan tidak menunjukan grafik yang sigmoid.
Keyword: kontaminasi, produk perikanan, real-time PCR, Salmonella

Judul: Deteksi Bakteri Salmonella spp. pada Berbagai Produk Sushi Komersial dan Eksplorasi Kandidat Biosensor DNA.
Abstrak: Keracunan makanan dapat disebabkan oleh berbagai faktor, salah satunya kontaminasi bakteri patogen yaitu Salmonella spp. Metode berbasis molekuler membutuhkan waktu yang cepat, lebih sensitif, dan spesifik. Tujuan penelitian ini adalah mengaplikasikan metode berbasis DNA molekuler untuk mendeteksi bakteri Salmonella spp. pada produk sushi komersial dan merancang serta mengidentifikasi oligonukleotida spesifik dari Salmonella spp. Primer yang digunakan untuk gen invA Salmonella spp. memiliki panjang amplifikasi 941 bp. Terdapat dua sampel produk sushi komersial yang mengandung Salmonella spp. Sampel yang positif mengandung Salmonella spp. yaitu sampel S2.1 dan S2.3. Primer spesifik Salmonella spp. dirancang dalam penelitian ini untuk menciptakan suatu primer spesifik dan berukuran lebih kecil yang diharapkan efisien untuk digunakan sebagai marka deteksi dengan PCR atau sebagai bioreseptor pada kit nukleosensor.
Keyword: DNA molekuler, invA, kontaminasi, nukleosensor, Salmonella, sushi

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: