Judul: Aktivitas Antimikroba Sekresi Kulit Katak Merah (Leptophryne cruentata) dan Katak Pohon Jawa (Rhacophorus javanus).
Abstrak: Eksplorasi senyawa bioaktif amfibi terutama untuk spesies-spesies yang ada di Indonesia masih jarang dilakukan. Identifikasi jenis senyawa bioaktif yang dapat menghambat pertumbuhan jamur Batrachochytrium dendrobatidis (Bd) bahkan beberapa mikroba, dapat menjadi dasar untuk pengembangan senyawa bioaktif untuk tujuan konservasi, menyediakan informasi mengenai senyawa bioaktif yang dapat digunakan untuk mekanisme pertahanan alami terhadap mikoorganisme dan juga untuk tujuan medis yang berguna bagi manusia. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui aktifitas senyawa bioaktif hasil sekresi kulit dua jenis katak endemik yaitu katak merah (Leptophryne cruentata) dan katak pohon Jawa (Rhacophorus javanus Penelitian dilakukan dari bulan Juni 2011 sampai dengan November 2011. Pengambilan sampel dilakukan di Taman Nasional Gede Pangrango, analisis laboratorium dilakukan di Departeman Biokimia Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Institut Pertanian Bogor, Laboratorium Mikologi dan Laboratorium Bakteri Balai Besar Penelitian Veteriner Bogor. Metode yang digunakan untuk uji antimikroba menggunakan metode difusi sumur agar. Zona hambat diamati pada cawan petri setelah diberikan perlakuan yang merepresentasikan aktivitas antimikroba. Diameter zona bening di sekitar sumur yang berisi sampel sekresi diukur dan dibandingkan dengan diameter zona bening di sekitar sumur yang berisi kontrol positif dan kontrol pelarut. Diameter zona bening sampel sekresi lebih kecil dibandingkan diameter zona bening kontrol positif sehingga direkomendasikan konsentrasi sampel sekresi yang lebih tinggi untuk menghasilkan daya hambat seefektif kontrol positif. Penggunaan kontrol pelarut bertujuan untuk memastikan bahwa diameter zona hambat sampel sekresi yang dihasilkan bukan pengaruh dari pelarut, tetapi murni dari senyawa aktif dalam sampel sekresi tersebut. Pengukuran zona bening yang terbentuk di sekitar sumur menunjukkan bahwa kemampuan sekresi kulit katak Rhacophorus javanus lebih besar dibandingkan sekresi kulit katak Leptophryne cruentata untuk menghambat aktivitas bakteri Escherichia coli dan aktivitas bakteri Staphylococcus aureus. Hal ini berbeda dengan zona bening yang terbentuk di sekitar sumur pada media jamur Trichophyton mentagrophytes dimana kemampuan sekresi kulit katak Rhacophorus javanus lebih kecil dibandingkan sekresi kulit katak Leptophryne cruentata untuk menghambat aktivitas jamur Trichophyton mentagrophytes. Analisis senyawa yang terdapat dalam sampel, menggunakan alat GC-MS (Gas Chromatogaphy - Spektrometer Massa). Pemilihan sampel untuk analisis GC-MS berdasarkan kemampuan sampel dalam menghambat pertumbuhan mikroba yang diamati pada diameter zona bening terbesar untuk masing-masing katak. Senyawa sekresi kulit katak Rhacophorus javanus yang terdeteksi dengan instrumen ini antara lain amina, asam lemak, asam organik, steroid, alkana, vitamin E, alkohol, dan keton. Senyawa-senyawa yang terdeteksi pada sekresi kulit katak Leptophryne cruentata terdiri atas asam lemak, asam organik, amina, amida, alkana, alkohol, steroid, dan asam benzoat. Keberadaan amina pada kedua jenis...dst
Keyword: aktivitas antimikroba, sekresi kulit, Leptophryne cruentata

Judul: . Analisis Filogenetik Spesies Dan Bioaktivitas Sekresi Kulit Katak Terhadap Streptococcus Pneumoniae.
Abstrak: Indonesia memiliki sekitar 450 spesies katak. Sekresi kulit katak diduga dapat dijadikan sumber alternatif bahan antibakteri Streptococcus pneumoniae terkhusus spesies multi-drug resistant (MDR). Tujuan penelitian adalah melakukan analisis filogenetik spesies katak dan menguji aktivitas antibakteri sekresi kulit yang dihasilkan terhadap isolat S. pneumoniae multi-drug resistant (MDR). Penelitian ini menggunakan dua spesies katak yaitu Fejervarya limnocharis dan Limnonectes macrodon. Analisis filogenetik dilakukan berdasarkan sekuen fragmen gen sitokrom oksidase subunit I (COI) mitokondria. Pengeluaran sekresi kulit katak distimulasi dengan menggunakan hormon efinefrin. Aktivitas antibakteri sekresi kulit katak diuji menggunakan teknik sumuran dan teknik perendaman kertas cakram. Hasil analisis filogenetik menunjukkan bahwa katak F. limnocharis memiliki hubungan kekerabatan dekat dengan Fejervarya sp asal Bali. Sekresi kulit katak F. limnocharis diindikasikan mengandung senyawa antibakteri S. pneumoniae multi-drug resistant (MDR) SPN1307 yang lebih kecil dibandingkan kontrol kloramfenikol. Sebaliknya, sekresi kulit katak spesies L. macrodon tidak menunjukkan aktivitas antibakteri terhadap S. pneumoniae multi-drug resistant (MDR) SPN1307. Oleh karena itu, sekresi kulit katak F.limnocahris mempunyai kemampuan untuk dijadikan suatu sumber bahan antibakteri S. pneumoniae multi-drug resistant (MDR) SPN1307. Hasil penelitian menunjukkan bahwa sekresi kulit katak dari F. limnocharis mampu menjadi agen antibakteri terhadap S. pneumoniae MDR/non-MDR. Kemampuan bioaktivitas terhadap S. pneumoniae SPN1307 dan ATCC49619 ditunjukkan dengan metode sumuran yaitu menghasilkan diameter zona bening sebesar 9.00±0.001 mm dan 8.00±0.001 mm, sedangkan untuk L. macrodon tidak menunjukkan adanya kemampuan antibakteri. Hasil pada metode perendaman paper disk selama 5 menit sampel F. limnocharis terhadap S. pneumoniae SPN1307 dan ATCC49619 adalah 11.33±0.057 mm dan 9.70±0.001 mm, serta untuk perendaman paper disk 30 menitnya adalah 9.00±0.032 mm terhadap SPN1307 dan 8.90±0.044 mm pada ATCC49619. Penentuan filogenetik berdasarkan DNA COI untuk memastikan spesies katak yang digunakan adalah benar spesies F. limnocharis dengan kesamaan 97% terhadap spesies F. limnocharis lain yang sebelumnya pernah diteliti di Bali, Indonesia.
Keyword: Antimikroba, Filogenetik molekuler, Sekresi kulit katak, Streptococcus pneumoniae

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: