Judul: Pengembangan Internet of Things Sistem Observasi Gelombang Pesisir
Abstrak: Gelombang permukaan laut merupakan pergerakan air naik dan turun tegak lurus terhadap permukaan laut. Gelombang yang terjadi di laut memiliki pergerakan yang acak, dinamis, dan kompleks, sehingga pengukuran tinggi dan periode gelombang sulit dirumuskan secara akurat. Dibutuhkan data tinggi gelombang yang real-time agar memudahkan masyarakat untuk dapat memantau kondisi tinggi gelombang dengan mudah. Tujuan penelitian ini yaitu (1) Menghasilkan instrumen wave buoy untuk observasi gelombang pesisir, (2) Menghasilkan website dan aplikasi mobile yang dapat menampilkan hasil pengukuran instrumen wave buoy, (3) Menganalisis data hasil pengukuran instrumen wave buoy. Penelitian dibagi ke dalam 3 tahapan, yaitu perancangan sistem observasi gelombang pesisir, integrasi serta uji lapang dan monitoring. Adapun perancangan sistem obeservasi gelombang terdiri dari 4 bagian yaitu perancangan wahana buoy, perancangan basis data, perancangan website dan perancangan aplikasi mobile. Perancangan wahana terdiri atas perancangan pelampung (buoy), perancangan sistem elektronik dan perancangan perangkat lunak. Perancangan basis data pada penelitian ini didasarkan pada format data hasil pengukuran. Basis data tersebut terdiri dari table sensor, tabel filter dan tabel tinggi gelombang. Perancangan website terdiri atas perancangan header, perancangan menu, perancangan body dan perancangan footer. Perancangan aplikasi mobile dalam penelitian ini dilakukan dengan menggunakan MIT App Inventor sebagai pembuat aplikasi. Perancangan aplikasi mobile dimulai dengan perancangan mockup. Hasil rancangan dari wahana wave buoy terdiri dua bagian yaitu pelampung dan pemberat. Pelampung digunakan untuk membarikan daya apung serta merupakan peletakan dari sistem elektronik. Sistem elektronik pada instrumen wave buoy dibagi ke dalam dua bagian, yaitu sistem elektronik pada instrumen dan sistem elektronik pada base station. ESP Lora32 TTGO versi 1 digunakan sebagai mikrokontroler (pengendali utama). Sensor yang digunakan yaitu sensor accelerometer MPU-6050. Data-data yang diperoleh dari sensor akan diproses oleh mikrokontroler pada buoy. Frekuensi sampling data yang digunakan yaitu 10 Hz dan jumlah data 128 data dengan perulangan setiap 10 menit. Data-data tersebut akan dikirim ke basis data melalui base station. Data yang masuk ke basis data akan diolah menjadi tinggi gelombang dan diteruskan ke ThingSpeak. Selanjutnya data tersebut ditampikan pada website dan aplikasi mobile. Adapun tabel basis data yang telah dibangun meliputi buoy, buoy_filter, dan buoy_h. Tahap selanjutnya adalah menampilkan informasi tinggi gelombang pada basis data ke dalam body website dalam bentuk tabel dan grafik menggunakan modul query. Halaman utama website yang dibuat dalam penelitian ini terdiri atas header, menu, body, dan footer. Header yang digunakan adalah ‘Monitoring Gelombang Pesisir’ pada bagian kiri. Body halaman utama pada website berisi peta lokasi penempatan instrumen, data realtime pengukuran tinggi gelombang, data tinggi gelombang hari sebelumnya, data tinggi gelombang pada bulan saat website diakses serta grafik real-time pengukuran tinggi gelombang. Pada body juga terdapat list dropdown berupa data lokasi penempatan buoy. Bagian footer ditampilkan logo fakultas perikanan dan ilmu kelautan sebagai identitas. Website yang dibangun dapat diakses oleh pengguna melalui alamat url http://laut-pulauseribu.net/buoy. Sedangkan aplikasi yang dibangun memiliki satu halaman utama yaitu halaman yang menampilkan data tinggi gelombang real-time dalam bentuk label dan grafik. Analisa hasil pengukuran lapangan menggunakan MATLAB dengan metode zero crossing analysis. Penempatan instrumen dan pengambilan data di perairan Kepulauan Seribu. Hasil analisis data selama 23 jam diperoleh tinggi gelombang signifikan yang terjadi di Perairan Gosong Semak
Keyword: wave buoy system, Internet of Things, website, aplikasi mobile, perairan Kepulauan Seribu

Judul: Rancang Bangun “Wave Buoy“ Dan Analisis Pengukurannya (Sebagai Alat Pengukur Gelombang Permukaan Di Daerah Pesisir).
Abstrak: Gelombang laut memiliki pergerakan yang acak dan komplek, sehingga tinggi dan periode gelombang sulit untuk diukur dan dirumuskan secara akurat. Pengukuran gelombang laut telah berkembang dan mencapai penggunaan teknologi yang lebih tinggi. Salah satu teknologi dalam pengukuran tinggi gelombang yaitu menggunakan wahana terapung seperti wave buoy dengan dilengkapi oleh sensor untuk melihat pergerakannya sebagai representasi perubahan gelombang. Sensor yang digunakan yaitu dengan menggunakan sensor 10 Degree of Freedom (DOF) dengan empat sensor yang bekerja didalamnya yaitu sensor percepatan, sensor Gyroscope, sensor magnetometer dan sensor tekanan. Tujuan dari penelitian yang dilakukan adalah merancang sebuah wave buoy sebagai salah dasar pembuatan pengukur gelombang permukaan terutama di daerah pesisir dan menganalisa kinerja dari alat yang dihasilkan. Penelitian ini memiliki dua tahap, yaitu perancangan dan uji coba wave buoy. Perancangan wave buoy meliputi pembuatan wahana dan perangkat elektronik serta software. Tahapan uji coba terbagi dalam dua tahap yaitu uji coba laboratorium dan lapangan. Uji laboratorium dilakukan dengan melakukan uji putar dengan periode 3 detik dan 5 detik, dimana jari-jari roda uji yang digunakan sebesar 1 meter. Hasil uji coba dilakukan pengolahan data dengan Fast Fourier Transform (FFT) serta pengukuran nilai kesalahan (error) dari alat yang dihasilkan. Uji coba lapangan dilakukan untuk melihat kinerja pengukuran alat secara langsung di lapangan. Hasil uji coba dilakukan pengolahan dengan Fast Fourier Transform (FFT) serta Continues Wavelet Transform (CWT). Hasil penelitian diperoleh alat pengukur gelombang dengan wahana yang terbuat dari bahan fiberglass (serat fiber) dengan diameter 30 cm dan tinggi 27 cm. Alat yang dihasilkan dapat menyimpan data hingga 2 Gb dengan waktu dengan kecepatan pengukuran sebesar 8 hz. Wahana memiliki nilai metasentrum 2.5, hal ini menunjukan bahwa wahana yang dibuat telah stabil. Hasil uji laboratorium diperoleh dua periode yang signifikan pada hasil FFT yakni periode 2.91 detik dan 4.96 detik. Pengukuran yang dilakukan diperoleh kesalahan sebesar 0.01-0.07 meter. Hasil uji lapangan yang dilakukan selama 24 jam diperoleh 4 periode yang signifikan pada saat pengukuran yakni periode 1 detik, 3.37 detik, 1.20 jam dan 12 jam. Periode signifikan yang diperoleh jika dikelompokan kedalam gelombang dilautan maka diperoleh menjadi gelombang angin (periode 1 detik dan 3.37 detik), gelombang variasi angin (1.20 jam) dan gelombang pasang surut (12 jam). Akan tetapi, keseluran perekaman data diperoleh gelombang dengan periode dibawah 1 detik hingga gelombang dengan periode 12 jam. Kesimpulan yang diperoleh yaitu alat yang dihasilkan dapat berfungsi dengan baik yakni mampu menyimpan data, memiliki nilai akurasi yang tinggi serta mampu merekam gelombang dengan periode kecil hingga periode besar serta mampu membedakan jenis gelombang berdasarkan panjang gelombangnya.
Keyword: gelombang laut, teknologi, wave buoy, sensor, FFT, CWT

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA