Judul: Respon Suhu dan Kedalaman Lapisan Tercampur terhadap Fase Aktif Madden Julian Oscillation (MJO) di Laut Banda
Abstrak: Pada periode intraseasonal (20 – 100 hari), fenomena MJO yang merambat ke arah timur di sepanjang wilayah ekuator berdampak signifikan terhadap dinamika laut dan atmosfer, sehingga memicu anomali suhu dan kedalaman lapisan tercampur / Mixed Layer Depth (MLD) di area yang dilewatinya, khususnya dari bagian ekuator Samudera Hindia hingga Samudera Pasifik bagian barat melewati Benua Maritim Indonesia / Indonesian Maritime Continent (IMC). Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis karakteristik propagasi MJO di wilayah IMC dan dampaknya terhadap anomali suhu spasial dan vertikal serta MLD di Laut Banda. Studi ini memanfaatkan data harian Outgoing Longwave Radiation (OLR), angin hPa, dan angin permukaan sebagai variabel atmosfer. Variabel laut yang digunakan antara lain, data anomali Sea Surface Temperature (SST) dan data observasi Argo float di Laut Banda bagian timur. Filter bandpass dengan batas periode 20 – 100 hari dilakukan pada data laut-atmosfer untuk mendapatkan sinyal yang berfluktuasi di dalam periode intraseasonal. Kemudian indeks yang digunakan untuk mengidentifikasi fase aktif MJO adalah Real-Time Multivariate MJO (RMM) pada tahun 2017 hingga 2018 dan difokuskan pada nilai amplitudo RMM tertinggi, yaitu pada musim barat bulan Desember 2017 – Februari 2018. Melalui plot Hovmöller, propagasi kuat MJO ditunjukkan melalui anomali negatif OLR dan anomali positif angin zonal 850hPa dari Samudra Hindia ke Samudra Pasifik menuju Benua Maritim. Kecepatan propagasi MJO diperoleh dari slope negatif OLR yang terbentuk dan diperoleh kecepatan propagasi berkisar 4.918 m/s. Secara spasial, propagasi fase aktif MJO juga terlihat melalui variabel atmosfer dan lautan yang dominan di bagian selatan ekuator dan melewati Laut Banda. Plot deret waktu pada fase aktif MJO secara bersamaan menunjukkan anomali negatif OLR, anomali negatif fluks bahang total, peningkatan angin zonal 850hPa dan angin permukaan, serta berdampak terhadap pendinginan suhu baik spasial ataupun vertikal. Secara spasial, nilai SST saat fase pasif MJO ditunjukkan dengan peningkatan SST berkisar 0.1°C – 1°C yang mendominasi di Laut Banda, Kondisi yang berkebalikan ditunjukkan saat fase aktif MJO berlangsung dengan penurunan berkisar 0.1°C – 0.8°C. Pada fase aktif MJO, pendinginan suhu di kolom air pada lapisan permukaan hingga termoklin (kedalaman 0 hingga 250 m) berkisar 0.1°C – 1°C dan peningkatan suhu berkisar 0.1°C – 0.8°C pada fase pasif MJO pada Januari hingga Februari 2018. Amplitudo tertinggi anomali suhu kolom air ditemukan pada lapisan termoklin. Anomali intraseasonal MLD memperlihatkan adanya fluktuasi yang kuat terjadi pada Januari hingga Maret 2018. Plot tersebut menunjukkan anomali positif MLD mencapai 24.97 m pada 8 Februari saat fase aktif MJO dan sebaliknya, pendangkalan MLD sebesar 9.22 m pada 26 Januari saat fase pasif MJO.
Keyword: Madden Julian Oscillation, intraseasonal scales, mixed layer depth, Maritim Continent, Banda Sea, multi-datasets

Judul: Pengaruh Indian Ocean Dipole (IOD) terhadap propagasi Madden Julian Oscillation (MJO)
Abstrak: Berbagai penelitian dan pengamatan dinamika atmosfer telah dilakukan untuk mempelajari kawasan tropis. MJO dicirikan oleh pembentukan kolam panas di Samudera Hindia bagian Timur dan Pasifik hagian barat, dengan konveksi awan cumulus tebal diatasnya dan dominasi angin baratan. Sedangkan IOD positif dicirian oleh menurunnya suhu permukaan laut di bagian timur Samudera Hindia dan meningkatnya suhu permukaan laut di bagian barat Samudera Hindia dengan dominasi angin timuran. Secara umum pada saat terjadinya MJO maka wilayah Indonesia akan mempnnyai curah hujan di atas normal (Wheeler dan McBride, 2005). Sedangkan pada saat terjadi IOD positif curah hujan di wilayah Indonesia akan di bawah normal (kering) (Saji et al, 1999).
Keyword: 

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA