Judul: Studi Fisiologi dan Molekuler Pembungaan pada Bawang Merah (Allium cepa var. aggregatum).
Abstrak: Pembungaan merupakan suatu proses fisiologis yang kompleks dan melibatkan sejumlah faktor eksternal dan internal. Pada bawang merah, pembungaan diperlukan untuk memperbaiki sifat tanaman melalui breeding program dan dalam upaya menghasilkan benih true shallot seeds (TSS). Beberapa sifat penting tanaman dapat diturunkan ke generasi berikutnya melalui proses hibridisasi. Manipulasi faktor lingkungan seperti perlakuan vernalisasi dapat dilakukan untuk menginduksi pembentukan bunga bawang merah. Mekanisme pengaturan perubahan meristem vegetatif menjadi inflorensia pembungaan berhubungan dengan proses fisiologi dan biokimia serta adaptasi tanaman terhadap perubahan lingkungan. Proses metabolisme yang terjadi pada fase transisi tersebut menghasilkan sejumlah senyawa metabolit yang menggambarkan aktifitas biologi dan biokimia dalam tanaman. Penelitian ini bertujuan untuk 1) mendapatkan informasi keragaan karakter pembungaan dan metabolit sekunder bawang merah terkait dengan perlakuan vernalisasi untuk induksi pembungaan, 2) informasi keterkaitan antara stadia perkembangan umbi yang mendapat perlakuan vernalisasi dengan karakter pembungaan bawang merah, 3) mendapakan informasi keterkaitan antara komposisi metabolit sekunder dengan karakter pembungaan bawang merah, dan 4) mengidentifikasi, dan menganalisis keragaman gen LEAFY terkait pembungaan pada tanaman bawang merah. Penelitian pendahuluan dilakukan untuk mengidentifikasi karakter morfologi terkait pola pembungaan dari 40 genotipe bawang merah yang ditanam di dataran rendah dan di dataran tinggi. Selanjutnya, 5 genotipe bawang merah digunakan sebagai bahan tanam yang mewakili masing-masing tipe pembungaan untuk diidentifikasi perubahan metabolomik dan karakter morfologi bawang merah terkait kemampuan berbunga. Analisis kelompok hierarki terhadap karakter morfologi dan metabolomik menunjukkan terdapat 3 kelompok bawang merah yang mengelompok sesuai pola pembungaanya. Genotipe Bentanis, Bima Brebes dan Tajuk terkonfirmasi sebagai genotipe yang sensitif terhadap pembungaan, dengan kandungan senyawa proline dan nitrogen (ammonium carbamate dan nitrogen oxide) yang lebih rendah, tetapi memiliki kandungan senyawa acyclic ditherphene alcohol (phytol) yang lebih tinggi. Genotipe Ilokos dan Sumenep merupakan genotipe yang tidak sensitif terhadap pembungaan, yang memiliki kandungan senyawa organosulfur (thiophene dan trisulfide) yang lebih tinggi. Pada perlakuan vernalisasi, genotipe Sumenep juga menghasilkan senyawa proline yang tertinggi diantara genotipe lainnya. Penelitian terhadap pengaruh vernalisasi pada stadia perkembangan umbi dilakukan pada genotipe Bima Brebes. Perlakuan vernalisasi secara signifikan meningkatkan karakter reproduktif tanaman seperti diameter umbel (53.6956.68 mm) dan persen berbunga (70.3779.63%) dibandingkan tanaman yang tidak divernalisasi (29.63%). Vernalisasi yang diberikan pada stadia awal perkembangan umbi (stadia embrio dan tunas 1 cm) terbukti lebih efektif dalam menerima perlakuan vernalisasi untuk menginduksi kemampuan berbunga bawang merah dibandingkan perlakuan lainnya. Vernalisasi pada stadia tunas 2 cm (S2) merupakan stadia yang tidak sensitif terhadap perlakuan vernalisasi, stadia ini memiliki karakter yang sama dengan perlakuan tanpa vernalisasi (S0). Hasil analisis korelasi menunjukkan bahwa karakter jumlah umbel dan diameter umbel memiliki korelasi positif yang sangat nyata terhadap persen berbunga bawang merah. Semakin besar jumlah umbel dan diameter umbel semakin meningkatkan persen berbunga bawang merah. Analisis metabolomik menghasilkan 104 metabolit sekunder spesifik dari 4 perlakuan vernalisasi, dan mengelompokkan bawang merah menjadi 3 kelompok stadia yang berbeda. Perlakuan vernalisasi pada stadia awal perkembangan umbi (stadia embrio dan tunas 1 cm) mampu menginduksi perubahan vegetatif menjadi fase reproduktif. Penelitian ini menunjukkan bahwa perlakuan vernalisasi stadia awal tersebut dapat meningkatkan kandungan senyawa phytol dan 2-propanone yang dapat menjadi indikator penting yang menunjukkan tanaman telah memasuki fase reproduktif. Sebaliknya, umbi tanpa perlakuan vernalisasi dan vernalisasi
Keyword: gen LEAFY, morfologi, metabolomik, phytol, vernalisasi

Judul: Kajian Fotoperiode dan Vernalisasi untuk Induksi Pembungaan Bawang Merah (Allium cepa L. Aggregatum group) di Dataran Rendah.
Abstrak: Pembungaan merupakan kunci penting dalam usaha produksi benih. Pembungaan pada genus Allium sangat dipengaruhi oleh fotoperiode dan vernalisasi. Fotoperiode dan vernalisasi dilaporkan sebagai faktor penting dalam memacu pembungaan bawang merah di dataran tinggi, namun pengaruhnya di dataran rendah belum pernah dilaporkan. Tujuan penelitian ini adalah mengkaji pengaruh fotoperiode dan vernalisasi dalam menginduksi pembungaan bawang merah di dataran rendah. Penelitian ini dilakukan di Kebun Percobaan Pasir Kuda IPB, Ciomas, Bogor pada bulan Desember 2015 - Mei 2016 menggunakan rancangan petak terpisah dengan 3 ulangan. Petak utama berupa fotoperiode yang terdiri dari 3 taraf, yaitu alami (kontrol), extension 4 jam, dan night break 2 jam. Anak petak berupa kombinasi antara vernalisasi dan varietas, dimana perlakuan vernalisasi terdiri dari 2 taraf, yaitu suhu 10 °C dan suhu ruang (kontrol), sementara varietas bawang merah yang digunakan terdiri dari 2 macam, yaitu Brebes dan Sumenep. Hasil penelitian menunjukkan bahwa perlakuan vernalisasi 10 °C mampu memacu pembungaan bawang merah varietas Brebes dan Sumenep di dataran rendah. Perlakuan cahaya tambahan (extension 4 jam dan night break 2 jam) bahkan menyebabkan penurunan pembungaan bawang merah pada kedua varietas tersebut. Hal ini menunjukkan bahwa varietas bawang merah yang digunakan dalam penelitian ini merupakan jenis tanaman hari pendek. Perlakuan vernalisasi 10 °C lebih efektif dalam meningkatkan pembungaan bawang merah, sementara perlakuan cahaya tambahan tidak meningkatkan pembungaan. Hal tersebut terlihat dari hasil dimana pada perlakuan vernalisasi 10 °C dengan kombinasi perlakuan fotoperiode alami mampu menginduksi pembungaan bawang merah sebesar 19.66% pada varietas Brebes dan 6.84% pada varietas Sumenep, sementara pada perlakuan extension 4 jam hanya berbunga sebesar 13.68% pada varietas Brebes dan 0.86% pada varietas Sumenep. Perlakuan night break dengan kombinasi perlakuan vernalisasi 10 °C menghasilkan bunga paling rendah, yaitu sebesar 1.71% pada varietas Brebes dan 0.86% pada varietas Sumenep. Tanaman bawang merah dengan perlakuan cahaya tambahan manapun, namun tanpa perlakuan vernalisasi tidak menghasilkan tanaman berbunga pada kedua varietas tersebut. Perlakuan cahaya tambahan dan vernalisasi juga menurunkan pertumbuhan tanaman bawang merah, namun tidak berpengaruh pada parameter berat kering daun dan kadar klorofil total. Perlakuan vernalisasi 10 °C menurunkan pengumbian bawang merah varietas Brebes dan Sumenep, dimana penurunan produksi umbi pada varietas Brebes lebih besar dibandingkan dengan varietas Sumenep.
Keyword: bawang merah, fotoperiode, pembungaan, tanaman hari pendek, vernalisasi

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: