Judul: Study on the Semen Characteristics of Superior Simmental Bulls Based Proteome on Quality Semen and Spermatozoa Fertility Biomarkers
Abstrak: Penilaian fertilitas calon pejantan di Indonesia berdasarkan teknik Breeding Soundness Examination (BSE). Teknik BSE mudah dilakukan, dapat diulangi dan berkorelasi dengan kesuburan pejantan. Pengujian BSE meliputi tiga bagian, yaitu pengamatan fisik (pengamatan genetalia eksternal dan internal melalui eksplorasi rektal), pengukuran lingkar skrotum, tingkah laku seksual (libido), dan analisis kualitas semen. Metode evaluasi semen merupakan metode yang paling umum digunakan untuk penilaian pejantan. Namun, penilaian fertilitas pejantan berdasarkan kualitas semen saja belum dapat menggambarkan fertilitas yang sesungguhnya. Penelitian proteomic dibutuhkan sebagai kajian dalam memprediksi fertilitas pejantan. Beberapa laporan terbaru menunjukkan efektivitas komponen protein plasma semen dapat bersifat menguntungkan atau merugikan bagi fertilitas maupun kualitas semen. Tujuan penelitian ini untuk melakukan kajian penilaian fertilitas pejantan melalui penentuan protein penanda fertilitas. Tahapan penelitian yang dilakukan mencakup: 1) karakterisasi pejantan sapi simental berdasarkan hubungan antara konsentrasi testosteron, adiponektin, dan kualitas semen; 2) profil protein plasma semen berdasarkan berat molekul dan hubungannya dengan kualitas semen segar pejantan sapi simental; 3) protein plasma semen yang berkaitan dengan fertilitas dan kualitas semen segar pejantan sapi simental. Sampel plasma semen diambil dari enam ekor sapi simental milik Balai Inseminasi Buatan (BIB) Ungaran dan enam ekor BIB Lembang dengan kisaran umur 3-8 tahun. Kedua belas ekor tersebut dibagi menjadi kelompok pejantan dengan motilitas spermatozoa ≥70% (normal fresh semen) dan motilitas spermatozoa <70% (poor fresh semen). Pengelompokan berdasarkan data sekunder dari kedua BIB tahun 2018-2019. Kelompok normal fresh semen (NFS) dari BIB Ungaran (NFSU), NFS dari BIB Lembang (NFSL), poor fresh semen (PFS) dari BIB Ungaran (PFSU) dan PFS dari Lembang (PFSL). Setiap kelompok masing-masing tiga ekor sapi. Analisis proteomic menggunakan sampel yang berasal dari BIB Lembang (NFSL dan PFSL). Hasil analisis menunjukkan adanya perbedaan signifikan (p<0,05) antara volume semen dan konsentrasi spermatozoa pada sapi NFSU, PFSU, dan NFSL dengan kelompok sapi PFSL. Sampel NFSU (6,10 ml dan 1455,02×106 /ml), PFSU (6,10 dan 1313,98×106 /ml), serta NFSL (6,73 ml dan 1301,74×106 /ml) lebih tinggi dibandingkan dengan kelompok sapi PFSL (4,37 ml dan 731,35×106 /ml). Rata-rata konsentrasi testosteron pada pejantan sapi simental NFSU, PFSU, NFSL, dan PFSL berturut-turut sebanyak 35,36 ng/ml, 30,42 ng/ml, 34,94 ng/ml, dan 33,06 ng/ml. Konsentrasi adiponektin dalam penelitian ini menunjukkan rata-rata sebesar 5,52 µg/ml (NFSU), 7,23 µg/ml (PFSU), 5,95 µg/ml (NFSL), dan 6,86 µg/ml (PFSL). Pola sekresi hormon testosteron dan adiponektin pada semua pejantan (NFSU, PFSU, NFSL, dan PFSL) tidak menunjukkan perbedaan konsentrasi yang signifikan (p<0,05). Parameter evaluasi fertilitas untuk seleksi calon pejantan sapi simental berdasarkan evaluasi semen, pengukuran testosteron, dan adiponektin belum dapat menggambarkan kapasitas fertilitas sapi pejantan yang sebenarnya, sehingga perlu ditambahkan dengan penilaian pejantan secara molekular, salah satunya melalui identifikasi protein plasma semen yang berhubungan langsung dengan fertilitas. Perkembangan penilaian fertilitas pejantan dilakukan dengan identifikasi dan karakterisasi protein penentu fertilitas spermatozoa maupun kualitas semen menggunakan metode 1D-SDS-PAGE (gel electrophoresis) berdasarkan berat molekul protein. Hasil penelitian ini menunjukkan, masing-masing ekspresi protein dengan BM 134-101 kD, 100-71 kD, dan 70 kD tidak ditemukan pada kelompok sapi dengan motilitas spermatozoa <70% (PFSU dan PFSL). Analisis protein berdasarkan BM menggunakan SDS-PAGE dapat dipertimbangkan sebagai indikator tambahan metode BSE. Konfirmasi profiling protein berdasarkan BM, masih perlu dilakukan analisis proteomics menggunakan metode
Keyword: protein, seminal plasma, fertility, semen quality, Simmental bulls

Judul: IPB (Bogor Agricultural University)
Abstrak: Sapi bali merupakan sapi asli Indonesia yang memiliki banyak keunggulan, antara lain mudah beradaptasi dengan berbagai jenis pakan, kondisi lingkungan dan iklim yang ekstrim, serta memiliki kondisi reproduksi yang baik. Prediksi fertilitas calon pejantan unggul, termasuk sapi bali, dilakukan melalui Breeding Soundness Examination (BSE). Hal ini dinilai kurang akurat karena belum mampu menggambarkan secara utuh mengenai kompetensi spermatozoa untuk fertilisasi. Hal ini mengakibatkan perlu dilakukannya investigasi komprehensif yang mengaitkan kualitas semen dengan angka konsepsi di lapangan. Indikator penentu potensi fertilitas pejantan adalah melalui pemeriksaan kualitas semen. Evaluasi semen yang umumnya dilakukan secara konvensional belum sepenuhnya mampu mendeskripsi prediksi fertilitas secara tepat dan akurat, sehingga dieksplorasi dengan memanfaatkan kemajuan teknologi, seperti penggunaan Computer-Assisted Sperm Analysis (CASA) hingga perangkat mikrofluida. CASA dapat memeriksa ribuan sel spermatozoa sekaligus dengan lebih akurat dan objektif, bahkan mencakup berbagai parameter uji dalam satu waktu. Perangkat mikrofluida menjadi salah satu alternatif penguji kualitas semen dengan alat dan bahan sederhana, volume sampel kecil, harga terjangkau, waktu singkat, dapat digunakan secara mandiri, dan praktis digunakan di segala tempat. Pengujian kualitas semen secara mendalam hingga tingkat molekuler juga mulai dikembangkan melalui pendekatan teknologi omic yang mampu mengkaji molekul transkripsi dan translasi di dalam spermatozoa. Teknologi ini mampu menyajikan data ekspresi gen untuk memvalidasi fungsi spermatozoa dalam spermatogenesis, fertilisasi, dan perkembangan embrio sebagai parameter fertilitas pejantan. Penggunaan teknologi ini dalam perkembangan industri peternakan telah menjadi metode utama yang dapat diterapkan secara luas untuk memprediksi potensi fertilitas pejantan melalui analisis transkriptom spermatozoa. Penelitian bertujuan untuk 1) mengkaji karakteristik semen sapi bali, 2) menganalisis berbagai parameter kinematic motilitas dan morfologi abnormalitas spermatozoa menggunakan CASA dan kaitannya dengan fertlitas, 3) menguji penggunaan perangkat mikrofluida berbasis benang dalam menganalisis kualitas semen pada parameter viabilitas spermatozoa, dan 4) mempelajari ekspresi gen PRM1 dan imunolkalisasi protein PRM1 spermatozoa pada sapi bali dengan tingkat fertilitas berbeda. Penelitian pertama dilakukan dengan mengelompokkan sapi bali yang dibagi menjadi kelompok fertilitas suprior dan baik (SF dan GF) berdasarkan nilai conception rate (%CR). Semen beku dikoleksi dan dievaluasi secara mikroskopis, meliputi motilitas, viabilitas, keutuhan membran plasma (MPU), abnormalitas, dan fragmentasi DNA spermatozoa. Perbedaan kualitas semen pada masing-masing kelompok dianalisis menggunakan independent-sample t-test. Rerata %CR kelompok SF dan GF masing-masing adalah 89,43±0,19% dan 81,03±0,75%. Motilitas, viabilitas, MPU, abnormalitas, dan fragmentasi DNA spermatozoa pada kelompok SF dan GF adalah 59,32±2,09% vs 51,90±1,64% (P<0,05), 66,57±0,95% vs 65,64±1,20% (P>0,05), 69,20 ±2,76 vs 64,18±2,50% (P>0,05), 1,92±0,15% vs 2,32±0,13% (P<0,05), dan 2,17±0,29% vs 3,03±0,23% (P<0,05). Perbedaan signifikan antara karakteristik kualitas semen beku sapi antara kelompok SF dan GF ditemukan pada parameter motilitas progresif, abnormalitas dan fragmentasi DNA spermatozoa. Namun, seluruh parameter memiliki korelasi kuat dengan tingkat fertilitas, yang mana parameter motilitas, viabilitas dan keutuhan membran plasma spermatozoa berkorelasi positif, sedangkn abnormalitas dan fragmentasi DNA spermatozoa memiliki korelasi negatif dengan tingkat fertilitas sapi bali. Karakteristik semen sapi bali dengan demikian, dapat dijadikan sebagai indikator awal dalam memprediksi fertilitas pejantan. Penelitian kedua dilakukan dengan mengevaluasi semen berdasarkan parameter kinematika motilitas spermatozoa (progressive motility/PM, curvilinear velocity/VCL, average path/VAP, straight line velocity/VSL, the amplitude of the lateral head displacement/ALH, dan beat-cross frequency/BCF) dan morfologi abnormal (proximal droplet, distal droplet, bent tail, dan coiled tail)
Keyword: biomarka, fertilitas pejantan, mikrofluida, PRM1, sapi bali, Bali cattle, biomarkers, male fertility, microfluidics, PRM1

Judul: Closed Knight’s Tour pada Papan Catur Berbentuk Persegi Panjang dengan Ukuran Maksimal 8 × 8
Abstrak: Closed Knight’s Tour merupakan langkah kuda yang mengunjungi setiap kotak pada papan catur tepat satu kali dengan langkah kuda berawal dan berakhir pada kotak yang sama. Graf yang terbentuk dari closed knight’s tour dinotasikan sebagai graf G(m,n), dengan m adalah banyaknya baris dan n adalah banyaknya kolom. Graf tersebut memuat Hamiltonian cycle. Sebuah graf terhubung G adalah graf bipartite jika dan hanya jika graf tersebut tidak memiliki cycle dengan panjang ganjil. Papan catur yang memenuhi syarat cukup untuk memiliki closed knight’s tour adalah papan catur berukuran 5 × 6, 5 × 8, 6 × 6, 6 × 7, 6 × 8, 7 × 8, dan 8 × 8.
Keyword: bipartite, closed knight’s tour, hamiltonian cycle, knight’s tour, teori graf