Judul: Efektivitas Ekstrak Daun Paci-paci Leucas lavandulaefolia untuk Pencegahan dan Pengobatan Infeksi Penyakit MAS Motile Aeromonad Septicaemia Ditinjau dari Patologi Makro dan Hematologi Ikan Lele Dumbo Clarias sp.
Abstrak: Ikan lele dumbo Clarias sp. termasuk komoditas yang banyak dibudidayakan secara intensif. Budidaya ikan lele dombo ini dihadapkan pada kendala penyakit MAS (Motile Aeromonad Septicaemia) yang disebabkan oleh Aeromonas hydrophila. Penyakit ini sering timbul sebagai wabah di Asia Tenggara sampai sekarang dan menimbulkan kematian dengan derajat penularan yang tinggi pada ikan-ikan air tawar. Penggunaan antibiotik untuk penanggulangan penyakit bakterial secara terus menerus dan tidak terkontrol menyebabkan timbulnya resistensi bakteri. Karena itu, penanggulangan penyakit ikan sedang diarahkan pada penggunaan bahan-bahan alami yang terbukti efektif, murah, aman terhadap manusia dan ramah lingkungan. Paci-paci (Leucas lavandulaefolia) merupakan salah satu tanaman obat yang banyak digunakan untuk pengobatan tradisional pada manusia dan sekarang ini mulai dicobakan untuk pengendalian penyakit pada sistem budidaya ikan. Senyawa aktif yang terkandung dalam daun dan akar paci-paci yaitu minyak atsiri, flavonoid, tannin, saponin, alkaloid dan metanol diketahui bersifat sebagai antimikroba dan dapat meningkatkan sistem kekebalan tubuh ikan. Informasi mengenai potensi tanaman paci-paci sebagai imunostimulan untuk meningkatkan daya tahan tubuh ikan terhadap infeksi A. hydrophila masih kurang. Karena itu, dilakukan penelitian ini yang bertujuan untuk mengetahui efektivitas ekstrak daun paci-paci baik untuk pencegahan dan pengobatan infeksi penyakit MAS (Motile Aeromonad Septicaemia) yang disebabkan oleh A. hydrophila secara in vivo ditinjau dari patologi makro dan parameter hematologi ikan lele dumbo (Clarias sp.). Penelitian ini dilakukan bulan Maret sampai Oktober 2007. Tempat penelitian di Laboratorium Kesehatan Ikan dan Laboratorium Kaca 1, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, IPB. Penelitian ini terdiri dari 2 tahap yaitu uji LD-50 dan uji in vivo. Uji LD-50 dilakukan untuk mendapatkan konsentrasi bakteri yang akan diinfeksikan pada uji in vivo. Uji ini dilakukan dengan cara menyuntikkan bakteri A. hydrophila pada ikan lele dumbo dengan konsentrasi 104, 105, 106, 107 dan 108 cfu/ml sebanyak 0.1 ml/ekor. Jumlah ikan uji 10 ekor tiap perlakuan. Sedangkan uji in vivo dilakukan untuk melihat pengaruh ekstrak daun paci-paci lewat injeksi secara intramuskular terhadap daya tahan, patologi makro dan parameter hematologi ikan lele dumbo setelah diinfeksi A. hydrophila. Sehingga dari pengujian ini dapat dilihat potensi tanaman paci-paci sebagai imunostimulan. Penelitian ini terdiri atas 4 perlakuan yaitu pencegahan, pengobatan, kontrol positif dan kontrol negatif dan masing-masing perlakuan terdiri atas 3 ulangan. Jumlah ikan uji masing-masing 10 ekor tiap ulangan. Ikan uji perlakuan pencegahan diinjeksi ekstrak paci-paci dosis 4 g/100 ml sebanyak 0.1 ml/ekor dan tujuh hari kemudian diuji tantang dengan A. hydrophila 105 cfu/ml. Ikan uji perlakuan pengobatan dan kontrol positif diinfeksi A. hydrophila 105 cfu/ml sebanyak 0.1 ml/ekor sedangkan ikan uji perlakuan kontrol negatif diinjeksikan PBS sebanyak 0.1 ml/ekor. Setelah gejala klinis muncul pada jam ke 18 pasca infeksi, ikan uji perlakuan pengobatan diinjeksi ekstrak paci-paci dosis 8 g/100 ml sebanyak 0.1 ml/ekor.
Keyword: 

Judul: Efektivitas Ekstrak Paci-Paci (Leucas Lavandulaefolia) Untuk Pencegahan Dan Pengobatan Penyakit Mas (Motile Aeromonad Septicaemia) Pada lkan Lele Dumbo (Clarias Sp.)
Abstrak: Telah dilakukan pengujian secara in vitro dan in vivo untuk mengetahui potensi tanaman paci-paci (Leucas Lavandulaefolia) sebagai bahan antibakterial alami baik pencegahan maupun pengobatan terhadap infeksi bakteri A. hydrophila pada ikan Lele Dumbo (Clarias sp.). Bagian tanaman yang digunakan yaitu bagian daun, dikeringkan dalam ruang terbuka, kemudian dibuat bubuk dengan diblender 10 gr bubuk paci-paci dilarutkan dalam 100 ml akuades steril dan direbus pada suhu 90 °c selama 30 menit. Uji in vivo dilakukan dengan menggunakan 4 perlakuan yaitu kontrol negatif, kontrol positif, · pencegahan dan pengobatan: Hasil penelitian menunjukkan bahwa secara in vitro ekstrak paci-paci mempunyai sifat antibakterial terhadap A. hydrophila yang ditunjukkan adanya zona bening disekitar kertas saring, dan didapat konsentrasi efektif sebesar 2 gr/100 ml akuades. Sedangkan pada uji in vivo pemberian ekstrak paci-paci efektif untuk pencegahan dan pengobatan scrta · didapat mortalitas perlakuan pencegahan sebesar 26.67 %, pengobatan 46.67 % lebih rendah dibanding perlakuan yang tidak diberi ekstrak (kontrol positif) 53.33 %.
Keyword: 

Judul: Penyusunan Overlap Graph menggunakan Suffix Tree pada DNA Sequence
Abstrak: The DNA sequence assembly is very important in genome analysis. This step aims to reconstruct contigous DNA fragment (contigs) from short fragment by concatenating fragments based on the overlap region among them. This method employs overlap graph for solving the problems. In this graph, nodes represent fragments and edges represent overlap. This research developed a software for constructing overlap graph using suffix tree. The evaluation was conducted by measuring the number of nodes, number of edges, and the execution time in many values of minimum overlap. The minimum overlap is defined as the minimum length of substring which is considered as the overlap region between two fragments. The evaluation results showed that the number of nodes, the number of edges, and the execution time were increased with the decreasing of the minimum overlap value.
Keyword: