Judul: Analisis In Silico Resistensi Mutasi G249R Protein Neuraminidase Virus H1N1 Isolat Indonesia terhadap Zanamivir dan Turunannya
Abstrak: Virus H1N1 menyerang manusia hampir seluruh negara di dunia, termasuk Indonesia menyebabkan pandemi pada tahun 2009. Mutasi pada asam amino neuraminidase virus menyebabkan resistensi terhadap obat antiviral. Penelitian ini bertujuan melakukan analisis in silico resistensi mutasi G249R pada protein neuraminidase virus H1N1 Isolat Indonesia terhadap zanamivir dan turunannya melalui analisis nilai energi ikatan, jenis ikatan kimia yang terbentuk, panjang ikatan, daerah pengikatan serta nilai Ki. Metode terdiri atas pemodelan struktur reseptor neuraminidase dari isolat Guangdong dan Indonesia, penambatan molekuler, visualisasi 2D dan 3D hasil penambatan molekuler, analisis nilai energi ikatan dan konstanta inhibisi. Hasil penelitian menunjukkan ligan-ligan yang dilakukan penambatan molekuler terhadap reseptor neuraminidase isolat California, Guangdong dan Indonesia berikatan dengan daerah pengikatan pada reseptor. Nilai energi ikatan dari hasil penambatan molekuler reseptor neuraminidase Isolat Indonesia dan Guangdong menunjukkan hasil yang lebih kecil dan nilai Ki yang dihasilkan lebih besar dibandingkan isolat California, menandakan adanya mutasi pada reseptor tersebut menyebabkan obat antiviral neuraminidase inhibitor kurang efektif dalam menghambat penyebaran virus H1N1 di wilayah tersebut., The H1N1 virus attacks humans in almost all countries, including Indonesia causing a pandemic in 2009. Mutations in the viral amino acid neuraminidase cause resistance to antiviral drugs. This study aimed to conduct an in silico analysis of the resistance of the G249R mutation in the neuraminidase protein of the Indonesian isolate H1N1 virus to zanamivir and its derivatives through analysis of the bond energy value, type of chemical bond formed, bond length, binding area and Ki value. The method consisted of modelling the structure of neuraminidase receptors from Guangdong and Indonesia isolates, molecular anchoring, 2D and 3D visualization of molecular anchoring results, and analysis of bond energy values and inhibition constants. The results showed that the ligands that were molecularly bonded to the neuraminidase receptor isolates from California, Guangdong and Indonesia bind to the binding site on the receptor. The binding energy value from the results of molecular docking of the neuraminidase receptor. Indonesian and Guangdong isolates showed more minor effects, and the resulting Ki value was more significant than California isolates, indicating that a mutation in the receptor causes the antiviral neuraminidase inhibitor drugs to be less effective in inhibiting the spread of the H1N1 virus in the region.
Keyword: H1N1, mutation, neuraminidase, resistance, zanamivir

Judul: Sensitivitas Virus Avian Influenza Subtipe H5N1 Clade 2.3.2 Asal Indonesia terhadap Obat Antiviral Amantadin
Abstrak: Resitensi antiviral virus Avian Influenza (AI) subtipe H5N1 adalah tantangan pada pengendalian pandemik Influenza. Matrik 2 (M2) inhibitor (amantadin dan rimantadin) dan neuraminidase inhibitor (oseltamivir dan zanamivir) adalah 2 kelas antiviral yang aktif melawan secara spesifik virus influenza dan digunakan untuk pengobatan dan profilaksis infeksi virus influenza. Amantadin mengganggu siklus hidup virus dengan menghambat aliran ion hidrogen pada M2 ion channel virus influenza A. Hal ini mencegah uncouting pada sel inang yang terinfeksi sehingga menghambat pelepasan ribonukleoprotein untuk transkripsi dan replikasi virion dalam nukleus. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kepekaan virus AI subtipe H5N1 Clade 2.3.2 asal Indonesia terhadap obat antiviral amantadin secara molekular dan in vitro. Penelitian ini dilakukan dengan metode Reverse Transcriptase- Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) untuk mengidentifikasi virus AI subtipe H5N1 pada unggas, isolasi ke Telur Ayam Bertunas (TAB) umur 9-11 hari untuk mengisolasi virus AI subtipe H5N1 pada unggas, uji in vitro pada sel Madin Darby Canine Kidney (MDCK) dan uji sekuensing dan pohon filogenetik gen Matrik (M2) untuk mengetahui resistensi virus AI subtipe H5N1 Clade 2.3.2 asal Indonesia terhadap amantadine hydrochloride. Hasil penelitian menunjukkan sebanyak 24 pool sampel bereaksi positip terhadap RT-PCR dengan primer matrik, sebanyak 15 pool sampel bereaksi positif terhadap RT-PCR dengan primer H5 dan sebanyak 11 pool sampel bereaksi positip terhadap RT-PCR dengan primer N1. Sebanyak dua isolat virus AI subtipe H5N1 dapat diisolasi dari sampel yang dikoleksi dari Kota Serang dan sebanyak enam isolat virus AI subtipe H5N1 dari kasus AI pada unggas air di Kabupaten Lamongan. Titer EID50 isolat virus AI subtipe H5N1 adalah >108. Virus AI subtipe H5N1 Clade 2.3.2 asal Indonesia yang diisolasi tahun 2013 dan 2016 mempunyai substitusi asam amino V27I pada protein M2, menimbulkan Cytophatic effect (CPE) dan bereaksi positif Hemaglutinasi (HA) pada sel MDCK konfluen monolayer yang mengandung konsentrasi amantadine hydrochloride tertinggi yang tidak toksik. Kesimpulan penelitian adalah virus AI subtipe H5N1 dapat dideteksi dan diisolasi, dan substitusi asam amino V27I pada protein M2 virus AI subtipe H5N1 Clade 2.3.2 asal Indonesia yang diisolasi tahun 2013 dan 2016 berperan terhadap resistensi amantadine hydrochloride.
Keyword: Avian Influenza Subtipe H5N1 Clade 2.3.2, Resistensi Amantadin, Unggas, Indonesia

Judul: Implementasi Space Time Composite (STC) Data Model Menggunakan Model Data Relasional
Abstrak: The data model is a concept that describes the data stored in the database and the relationship between the data to the user in logic. Development of data models is very important in the design of the database as the basis of the stage of database design to be made. This study aims to apply the concept of Space Time Composite (STC) on the Model Data storage vector data types that can store enough information and describes the process of drafting objects and objects spatiotemporal evolution over time. From the results of the test queries on the data model that have been created, queries in a system are acquired that can help display the information preparation of objects from time to time and know the history of the object polygon and arc that has undergone changes in topology.
Keyword: