Judul: Analisis Integrasi Dan Stabilitas Gen Peroksidase (Perl) Pada Tanaman Tembakau (Nicotiana Tabacum) Kultivar SR1 Transgenik
Abstrak: Peroksidase merupakan salah satu enzim yang bekerja dalam sistem pertahanan diri tumbuhan. Gen peroksidase dari kedelai kultivar Lumut (PerL) yang dipautkan dengan gen hpt telah diintroduksikan ke tanaman tembakau (Nicotiana tabacum) kultivar SR1 sehingga menghasilkan tanaman transgenik. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis integrasi gen PerL dan pewarisan gen hpt pada tanaman tembakau (N.tabacum) kultivar SR1 transgenik putatif. Analisis integrasi menggunakan PCR (Polymerase Chain Reaction) dilakukan untuk mengkonfirmasi keberhasilan integrasi gen PerL di dalam genom tanaman transgenik. Analisis integrasi PerL menggunakan primer 35S-F dan Atprx-R menunjukkan bahwa 6 tanaman transgenik putatif generasi pertama (T0) mengandung gen PerL di bawah kendali promotor 35S CaMV. Analisis segregasi transgen dengan Khi-kuadrat menunjukkan bahwa gen hpt yang dipautkan dengan gen PerL diwariskan ke N. tabacum transgenik generasi kedua (T1) namun tidak mengikuti pola segregasi Mendel untuk satu atau dua gen bebas. Hal ini mengindikasikan terjadinya lebih dari dua kopi gen yang terintegrasi di dalam genom tanaman.
Keyword: gen perL, kultivar SR1, Nicotiana tabacum, stabilitas gen

Judul: Rekayasa Genetik Nicotiana tabacum Kultivar SR1 dengan Gen Peroksidase (PerL) dari Kedelai Kultivar Lumut
Abstrak: Peroksidase merupakan enzim golongan oksidoreduktase yang mengkatalis reaksi oksidasi reduksi. cDNA gen peroksidase (PerL) dari kedelai kultivar Lumut telah berhasil diisolasi dengan panjang 1100 pb. Kedelai kultivar Lumut menunjukkan ekspresi gen peroksidase ketika diberi cekaman pH 4+Al 1,6 mM. Peroksidase merubah H2O2, menjadi air dan oksigen ketika mengoksidasi sejumlah substrat. Tujuan dari penelitian ini adalah merakit vektor ekspresi gen PerL dan mengintroduksikannya ke dalam genom Nicotiana tabacum kultivar SR1 menggunakan Agrobacterium tumefaciens. cDNA gen PerL telah berhasil disisipkan dalam plasmid entry clone pENTRTM/D-TOPO®. cDNA gen PerL yang dibawa oleh plasmid pENTR-PerL telah berhasil disisipkan ke dalam vektor ekspresi pGWB502 dengan sistem gateway cloning. Verifikasi keberhasilan konstruksi plasmid overekspresi pGWB502-PerL dilakukan menggunakan PCR dengan primer 35S-F dan AtprxCb-R menghasilkan pita berukuran 1500 bp. Plasmid pGWB502-PerL telah berhasil diintroduksikan ke dalam A.tumefaciens LBA4404 menggunakan metode triparental mating (TPM) dengan bantuan plasmid penolong pRK2013. Keberhasilan introduksi plasmid pGWB502-PerL ke dalam A. tumefaciens dikonfirmasi menggunakan PCR dengan primer 35S-F dan AtprxCb-R menghasilkan pita berukuran 1500 bp. Transformasi genetik ke Nicotiana tabacum kultivar SR1 telah berhasil dilakukan dengan bantuan bakteri A. tumefaciens LBA4404 yang membawa plasmid rekombinan pGWB502-PerL. Transformasi genetik Nicotiana tabacum kultivar SR1 dilakukan menggunakan eksplan daun dengan teknik ko-kultivasi dan diseleksi pada media yang mengandung 30 mg/L higromisin. Integrasi gen PerL di dalam genom tumbuhan Nocotiana tabacum kultivar SR1 transgenik telah berhasil dikonfirmasi menggunakan PCR dengan primer spesifik 35SF dan AtprxCb-R menghasilkan pita berukuran 1500 bp.
Keyword: Agrobacterium tumefaciens, gen Peroxidase (PerL), Nicotiana tabacum kultivar SR1, pGWB502, pENTRTM/D-TOPO®

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: