Judul: Analisis keragaman genetik daerah D-Loop DNA mitokondria ayam hutan hijau (Gallus varius)
Abstrak: Analisis keragaman genetik dilakukan pada 30 sampel ayam hutan hijau. (Gallus varius) yang berasal dari Jawa Timur, Bali dan Lombok dengan menggunakan teknik PCR-RFLP. Sebagai pembanding (outgroup) digunakan ayam hutan merah (Sumatera dan Sulawesi) dan beberapa jenis ayam lainnya (ayam pelung, ayam kedu, ayam ras petelur dan ayam kampung). Amplifikasi daerah. D-loop mtDNA ayam dilakukan dengan menggunakan sepasang primer, yaitu L16750 (5'-AGGACTACGGCTTGAAAAGC-3' yang menempel pada tRNA Glutamic acid) dan H1255 (5'-CATCTTGGCATCTTCAGTGCC-3' yang menempel pada tRNA Phenylalanine). Hasil amplifikasi tersebut selanjutnya dipotong dengan menggunakan lima enzim restriksi pemotong empat basa, yaitu: Alu I (AGICT), Hae III (GG CC), Hpa II (CCGG), Mbo I (GATC) dan Rsa I (GTAC). Amplifikasi daerah D-loop pada ayam hutan hijau menghasilkan dua macam ukuran fragmen DNA yang berbeda. Fragmen DNA berukuran 1322 pasang basa (pb) ditemukan pada hampir semua ayam hutan hijau dari ketiga daerah yang berbeda, sedangkan fragmen DNA berukuran 1381 pb hanya ditemukan pada dua sampel ayam hutan hijau (Jawa Timur dan Bali). Analisis dengan menggunakan teknik PCR-RFLP hanya menghasilkan dua macam haplotipe. Hampir semua ayam hutan hijau memiliki haplotipe 1, sedangkan haplotipe II hanya dimiliki oleh ayam hutan hijau yang berasal dari Lombok (satu sampel). Pada kelompok pembanding, ukuran fragmen DNA teramplifikasi yang dihasilkan adalah 1322 pb, dengan pola pita hasil pemotongan berdasarkan analisis PCR-RFLP adalah haplotipe II. Ayam hutan hijau yang berasal dari Lombok (satu sampel) diduga berasal dari induk yang mengalami proses perkawinan campuran dengan ayam hutan merah atau jenis ayam lainnya. Penelitian lebih lanjut dengan menggunakan teknik PCR-Sequencing diharapkan dapat mengungkapkan secara terperinci keragaman genetik intraspesies pada ayam hutan hijau yang ada di Indonesia.
Keyword: Gallus varius, Mitochondrial DNA, D-Loop, Genetic differences, Green jungle fowl

Judul: Genetic Structure of Gallus varius in Lombok, Sumbawa, Java, and Madura Based On mtDNA Control Region Middle-Lower Section
Abstrak: Ayam hutan hijau (Gallus varius Shaw 1798) adalah salah satu spesies burung terestrial yang diklasifikasi ke dalam ordo Galliformes, famili Phasianidae dan bergenus Gallus. Gallus varius merupakan spesies ayam hutan endemic Indonesia yang persebaran alaminya terdapat di pulau Jawa, Madura, Bawean, Kangean, Bali dan di Kepulauan Sunda Kecil. Spesies ini tercatat memiliki nilai keragaman genetik yang tinggi, berdasarkan informasi genetik dari mtDNA. Informasi genetik dari mtDNA yang banyak digunakan untuk mendeskripsikan keragaman genetik dari G. varius adalah bagian ujung 5’ dari control region. Bagian-bagian lain dari mtDNA masih terbatas penggunaannya untuk mendeskripsikan keragaman genetik dari spesies ini. Sehingga, penggambaran keragaman genetik G. varius masih terbatas, padahal spesies ini mempunyai endemisitas yang unik yang terletak pada daerah persebarannya yang tidak terbatas di satu area (pulau). Naiknya popularitas dari G. varius di mata masyarakat sebagai hewan peliharaan dan sebagai salah satu indukan untuk pembentukan breed ayam lokal, menyebabkan meningkatnya perburuan terhadap spesies ini di alam liar sehingga sumberdaya genetik dari G. varius di setiap daerah persebarannya menjadi terancam. Oleh karena hal tersebut, penelitian ini bertujuan untuk mendeskripsikan variasi dan struktur genetik dari G. varius di Lombok, Sumbawa, Jawa dan Madura berdasarka sekuen DNA control region bagian middle-lower. DNA genom diekstraksi dari ujung calamus bulu G. varius menggunakan kit ekstraksi DNA untuk jaringan, kemudian sekuen DNA control region bagian middle-lower diamplifikasi dan disekuensing menggunakan dua pasang primer yang didisain dari G. varius (NC_007238.1). Tiga belas pasang basa (pb) variasi nukleotida ditemukan dengan nilai keragaman nukleotida 0,0021. Terbentuk tujuh haplotipe antara G. varius sampel dan referensi, dengan nilai keragaman haplotipe 0,7692 dan terdeteksi 5 haplotipe spesifik dan 2 haplotipe bersama (shared haplotype). Keanekaragaman haplotipe yang tinggi, dapat terjadi karena berbagai faktor, seperti ukuran populasi, waktu generasi, dan keragaman genetik nenek moyang (ancestor) atau generasi sebelumnya. Terdapatnya kemungkinan G. varius terdiri dari lebih dari 1 subspesies berdasarkan jarak genetik yang ada, dan juga adanya differensiasi populasi pada G. varius berdasarkan hasil konstruksi network haplotipe.
Keyword: control region, Gallus varius, keragaman haplotipe, middle-lower

Judul: Pembuatan Film Tipis Cu2ZnSnS4 sebagai Lapisan Penyerap Cahaya pada Sel Surya Menggunakan Metode Elektrodeposisi
Abstrak: Thin film of Cu2ZnSnS4 (CZTS) is an alternative semiconductor used as light absorber layer on solar cell. CZTS can replace silicon that commonly used as commercial semiconductor. The advantage of using CZTS as absorber layer is due to the abundance of its chemical composer on earth, and its high value of absorption coefficient. The absorber layer was made by using electrodeposition method on ITO glass substrates. The films were deposited at room temperature using potentiostatic mode with a potential of –1.05 V for 30, 45, and 60 minutes. After that, the films were annealed at two different temperatures, 180 ºC and 500 °C, for 45 minutes in N2/H2S atmosphere. Based on X-ray diffraction analysis, the polycrystalline thin film obtained fall into kesterite crystal phase. This type of crystal was obtained when the CZTS was annealed at 500 °C in H2S/N2 atmosphere. The value of optical band gap energy for the CZTS thin film was 2.2 eV with the film thickness about 1.228–6.366 μm. The sample of CZTS with electrodeposition time of 45 minutes and annealing temperature of 500 °C showed the best result and in conformity with absorber layers criteria for solar cells.
Keyword: semiconductor, ITO glass, CZTS thin film, electrodeposition