Judul: Polyploidy Induction of Allium cepa L var. Bima Brebes and Sumenep Using Orizalin and Colchicine In vitro
Abstrak: Preferensi konsumen terhadap bawang merah sangat ditentukan oleh ukuran umbi. Peningkatan ukuran umbi bawang merah lokal perlu dilakukan untuk meningkatkan kriteria pemilihan konsumen dan juga meningkatkan produktivitas bawang merah lokal. Induksi poliploidi pada bawang merah dengan menggunakan orizalin dan kolkisin secara in vitro diharapkan dapat meningkatkan ukuran umbi bawang merah. Tujuan utama penelitian ini adalah untuk mendapatkan metode induksi poliploidi kalus bawang merah menggunakan orizalin dan kolkisin secara in vitro yang diharapkan mampu menggandakan jumlah kromosom dan untuk menghasilkan kandidat baru yang memiliki ukuran umbi yang lebih besar. Untuk mencapai tujuan utama tersebut dilakukan serangkaian percobaan dengan sub tujuan: 1) Memperoleh media terbaik induksi kalus bawang merah varietas Bima Brebes dan Sumenep, 2) Memperoleh nilai LC50 pada kalus bawang merah varietas Bima Brebes dan Sumenep hasil induksi poliploidi dengan oryzalin, 3) Memperoleh nilai LC50 pada kalus bawang merah varietas Bima Brebes dan Sumenep hasil induksi poliploidi dengan kolkisin, dan 4) Mendapatkan mutan putatif poliploid bawang merah varietas Bima Brebes dan Sumenep yang berpotensi memiliki ukuran umbi yang lebih besar. Penelitian ini dilaksanakan pada September 2020 hingga Desember 2021 yang terdiri atas 3 percobaan. Percobaan 1 Induksi kalus bawang merah Bima Brebes dan Sumenep. Percobaan ini dilakukan dengan menggunakan Rancangan Acak Lengkap (RAL) Faktorial. Faktor pertama yaitu konsentrasi 2,4 D (1, 1,5, 2, dan 2,5 ppm), faktor kedua yaitu jenis eksplan (basal, tengah, dan pucuk umbi). Percobaan 2 dibagi menjadi 2 percobaan yaitu (1) Induksi poliploidi kalus bawang merah Bima Brebes dan Sumenep menggunakan orizalin. Percobaan ini menggunakan Rancangan Petak Terpisah (Split plot design). Petak utama yaitu varietas bawang merah (Bima Brebes dan Sumenep), dan anak petak yaitu konsentrasi orizalin 0, 25, 50, 75, 90 dan 120 µM. (2) Induksi poliploidi kalus bawang merah Bima Brebes dan Sumenep menggunakan kolkisin. Percobaan ini menggunakan Rancangan Petak Terpisah (Split plot design). Petak utama yaitu varietas bawang merah (Bima Brebes dan Sumenep), dan anak petak yaitu konsentrasi kolkisin 0, 0,05, 0,1, 0,15, 0,2, dan 0,25%. Percobaan 3 Analisis sitologi, kromosom dan keragaan morfologi mutan putatif. Analisis stomata dilakukan dengan membuat preparat kering dengan cara mengoleskan cat kuku secara tipis pada permukaan daun. Analisis kromosom dilakukan dengan menggunakan metode pencet (squash). Ujung akar bawang merah sebelumnya direndam di dalam larutan HCL 1N 2 menit kemudian diberi pewarna aceto orsein 2%. Analisis jumlah kandungan DNA menggunakan daun muda planlet bawang merah umur 9-10 MST setelah perlakuan orizalin dan kolkisin yang dicacah kemudian dimasukkan ke alat flow cytometry. Hasil penelitian menunjukkan bahwa: 1) media terbaik induksi kalus bawang merah Bima Brebes dan Sumenep yaitu media dengan komposisi (MS + 2,4D 1 ppm + Kinetin 0,5 ppm) dapat menghasilkan kalus remah dengan persentase hidup yang lebih tinggi dibandingkan konsentrasi yang lain. 2) LC50 kalus bawang merah Bima Brebes dengan perlakuan orizalin diperoleh pada konsentrasi 114,7 µM dan kolkisin pada konsentrasi 0,19%. sedangkan LC50 kalus bawang merah Sumenep dengan perlakuan orizalin dan kolkisin berturut-turut terdapat pada konsentrasi 119,1 µM, dan 0,24%. Media regenerasi kalus bawang merah yang optimal adalah MS + vitamin B5 1 ppm + Glycin 2 ppm + BAP 1,5 ppm. 3) Pemberian orizalin 75 µM pada kalus bawang
Keyword: flow cytometry, kromosom, LC50, mutan putatif, poliploid

Judul: Invivo poliploid induction, gene expression analysis of  FLOWERING LOCUS T-2 and effect of photoperiodism on shallot (Allium cepa L.  var. aggregatum)
Abstrak: kuran dan warna umbi menjadi preferensi konsumen, hal tersebut juga menjadi faktor utama dalam usaha peningkatan kualitas bawang merah. True shallot seed (TSS) yang dihasilkan dari bunga bawang memiliki keunggulan karena benih bebas penyakit dan mampu meningkatkan produktivitas bawang merah dibandingkan dengan budidaya menggunakan umbi. Namun varietas bawang merah seperti Rubaru yang memiliki ukuran umbi lebih kecil dibandingkan dengan varietas bawang merah lokal lain dan tidak dapat menghasilkan bunga. Usaha mutasi dengan menggunakan kolkisina diharapkan mampu meningkatkan ukuran dan kualitas umbi. Selain itu, pemahaman terkait mekanisme kerja gen pada pembungaan juga penting untuk usaha pemuliaan melalui teknik hibridisasi. Tujuan utama penelitian ini ialah: 1) Memperoleh bawang merah kultivar Rubaru dengan ploidi yang lebih tinggi dari asalnya melalui penggandaan secara in vivo. 2) Mengidentifikasi sikuen gen AcFT2 pada varietas bawang merah Lokananta, Bima Brebes, Rubaru, Palasa, dan Biru Lancor. 3) Mempelajari ekspresi relatif gen AcFT2 dan korelasinya terkait pembungaan pada lima varietas bawang merah Lokananta dan Bima Brebes. 4) Mempelajari kemampuan berbunga lima varietas bawang merah terhadap perbedaan fotoperiodisme. Penelitian dilakukan pada tahun 2019–2020 yang terdiri atas tiga percobaan, 1) Induksi poliploid bawang merah Rubaru dengan kolkisina, 2) Isolasi dan analisa ekspresi relatif gen AcFT2 3) percobaan perlakuan fotoperiodisme hari panjang dan hari pendek pada bawang merah. Percobaan induksi poliploid dilakukan pada bawang merah Rubaru dengan menggunakan Rancangan Kelompok Lengkap Teracak (RKLT) dengan 6 taraf perlakuan konsentrasi kolkisina yaitu: 0, 0,01, 0,02, 0,05, 0,1 dan 0,2% serta 5 taraf lama perendaman yaitu: 0, 3, 6, 12, dan 24 jam. Percobaan analisa ekspresi gen AcFT2 dilakukan dengan vernalisasi bawang merah varietas Lokananta dan Bima Brebes. Percobaan fotoperiodisme dilakukan dengan penanaman bawang merah pada kondisi natural (10 jam penyinaran) di Rumah Kaca Laboratorium Horticulture Gifu University Jepang selama 60 hari kemudian sebagian di beri perlakuan pemberian cahaya dengan lampu fluorescence selama 4 jam. Aplikasi kolkisina pada umbi secara invivo menghasilkan peningkatan ploidi terbatas hanya pada sel-sel tertentu. Sikuen fragmen gen AcFT2 dapat diidentifikasi pada varietas bawang merah Lokananta, Bima Brebes, Palasa, Rubaru dan Biru Lancor dengan tingkat homologi yang tinggi dengan sikuen gen referensi AcFT2 CUDH2150 dan gen FT genus Allium lainnya. Ekspresi relatif gen AcFT2 like shallot pada varietas bawang merah Lokananta dan Bima Brebes berkorelasi terhadap tingkat pembungaan. Varietas Lokananta menunjukkan ekspresi relatif gen dan jumlah umbel bunga yang tinggi. Perbedaan fotoperiodisitas berpengaruh pada pada jumlah umbel bunga dan umbel bunga terbuka varietas bawang merah Lokananta, Bima Brebes, Palasa, Rubaru dan Biru Lancor. Varietas Lokananta mampu berbunga pembungaan baik pada hari pendek (± 10 jam) maupun hari panjang., Ukuran dan warna umbi menjadi preferensi konsumen, hal tersebut juga menjadi faktor utama dalam usaha peningkatan kualitas bawang merah. True shallot seed (TSS) yang dihasilkan dari bunga bawang memiliki keunggulan karena benih bebas penyakit dan mampu meningkatkan produktivitas bawang merah dibandingkan dengan budidaya menggunakan umbi. Namun varietas bawang merah seperti Rubaru yang memiliki ukuran umbi lebih kecil dibandingkan dengan varietas bawang merah lokal lain dan tidak dapat menghasilkan bunga. Usaha mutasi dengan menggunakan kolkisina diharapkan mampu meningkatkan ukuran dan kualitas umbi. Selain itu, pemahaman terkait mekanisme kerja gen pada pembungaan juga penting untuk usaha pemuliaan
Keyword: LC50, qRT-PCR, flowering induction

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: