Judul: Eksplorasi Khamir dan Bakteri Sebagai Kandidat Agens Antagonis Penyebab Penyakit Busuk Pangkal Batang Jeruk (Botryodiplodia theobromae Pat.)
Abstrak: Jeruk merupakan salah satu tanaman buah tahunan yang banyak diminati oleh masyarakat Indonesia, namun produksi jeruk terus mengalami fluktuasi dari tahun ke tahun. Salah satu penyakit utama yang menyerang pertanaman jeruk di Indonesia adalah penyakit busuk pangkal batang jeruk yang disebabkan oleh cendawan Botryodiplodia theobromae yang telah ditemukan di 11 sentra pertanaman jeruk. Penggunaan batang bawah yang resisten sudah tidak efektif karena perkembangan ras patogen yang cepat di lapangan. Oleh sebab itu, tujuan dari penelitian ini adalah mengisolasi khamir dan bakteri dari kulit batang, akar, dan daun tanaman jeruk sehat dan mengetahui potensinya sebagai agens antagonis B. theobromae in vitro. Penelitian ini dilaksanakan mulai April sampai Agustus 2016. Hasil isolasi didapatkan enam isolat khamir dan sebelas isolat bakteri. Semua isolat khamir dan sembilan isolat bakteri bukan patogen terhadap tanaman dan mamalia. Hasil pengujian in vitro yaitu khamir isolat MAFL001 dan MCFG003 mampu menekan pertumbuhan B. theobromae secara langsung dan memiliki afinitas hiperparasitisme yang tinggi. Isolat MAFL001 juga mampu memproduksi senyawa volatil toksik sementara isolat MCFG003 mampu memproduksi enzim kitinase. Berdasarkan identifikasi morfologi isolat MAFL001 termasuk anggota genus Candida, sementara isolat MCFG003 termasuk anggota genus Rhodotorula. Isolat bakteri TBFG007 dan TBFG008 mampu menghambat pertumbuhan B. theobromae secara langsung dan mampu memproduksi senyawa volatil toksik. Selain itu, isolat TBFG008 juga mampu memproduksi enzim kitinase. Empat isolat ini menunjukkan potensi terbaik sebagai agens antagonis B. theobromae in vitro.
Keyword: bakteri antagonis, Botryodiplodia theobromae, khamir antagonis, penyakit busuk pangkal batang jeruk

Judul: Taktik Pengendalian Busuk Batang Jeruk (Botryodiplodia Theobromae Pat.) Oleh Khamir, Fungi Mikoriza Arbuskular, Dan Kitosan
Abstrak: Penyakit busuk batang (Botryodiplodia theobromae (Pat.)) merupakan salah satu masalah dalam produksi jeruk di Indonesia. Pemanfaatan agens hayati dan kitosan menjadi prioritas dalam komponen pengendalian karena potensinya dalam pengendalian penyakit tanaman telah banyak dilaporkan. Agens hayati seperti khamir dan fungi mikoriza arbuskular (FMA) memiliki berbagai mekanisme dalam menekan perkembangan penyakit tanaman. Khamir telah banyak dimanfaatkan dalam pengendalian penyakit pascapanen dan memperpanjang daya simpan buah dan benih namun laporan tentang pemanfaatan khamir dalam pengendalian penyakit di lapangan belum banyak dilaporkan. Selain memanfaatkan FMA secara langsung, juga dilakukan isolasi bakteri-bakteri simbiotik dari FMA yang diduga berperan sebagai helper bacteria. Kitosan juga diketahui mampu menekan perkembangan penyakit tanaman dengan konsentrasi optimum tertentu yang bergantung pada jenis patogen dan jenis tanamannya. Namun, penelitian tentang potensi khamir, FMA serta bakteri simbiotiknya, kitosan dalam pengendalian penyakit busuk batang jeruk dan mekanismenya belum banyak dilaporkan. Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi potensi khamir, FMA, bakteri simbiotik FMA, dan kitosan baik secara tunggal maupun kombinasi untuk memperoleh taktik dalam mengendalikan penyakit busuk batang jeruk. Mekanisme-mekanisme pengendalian langsung dan tidak langsung dari agens hayati dan kitosan juga dievaluasi pada penelitian ini. Penelitian dilaksanakan di Laboratorium Mikologi Tumbuhan dan Laboratorium Bakteriologi Tumbuhan, Departemen Proteksi Tanaman, Rumah Kaca Cikabayan IPB, dan Laboratorium Pusat Studi Biofarmaka LPPM IPB pada bulan Januari sampai Agustus 2016. Khamir yang digunakan adalah isolat YP koleksi Klinik Tanaman IPB, FMA yang digunakan merupakan formulasi granul komersial, bakteri simbiotik diisolasi dan diseleksi dari FMA, dan kitosan yang digunakan diperoleh dari Departemen Teknologi Hasil Perairan IPB dalam bentuk serbuk yang diseleksi konsentrasi optimumnya. Pengujian-pengujian in vitro yang dilakukan adalah potensi produksi senyawa volatil, produksi enzim kitinase, antibiosis, dan hiperparasitisme dari khamir dan isolat-isolat bakteri hasil isolasi dari FMA, dan penentuan konsentrasi kitosan melalui pengujian penghambatan pertumbuhan radial B. theobromae dan kompatibilitasnya dengan khamir. Hasil pengujian in vitro adalah khamir memiliki mekanisme hiperparasitisme dengan afinitas 26 sel khamir per hifa B. theobromae, produksi senyawa volatil dengan tingkat hambatan relatif (THR) 29.1%, dan produksi enzim kitinase. Isolat bakteri simbiotik terbaik hasil isolasi dari FMA bersifat non-patogenik, Gram positif, memiliki mekanisme produksi senyawa volatil dengan THR 26.7%, antibiosis dengan THR 42.9%, produksi enzim kitinase, dan memiliki homologi 97% dengan B. subtilis asal Vietnam. 2 Kitosan konsentrasi 0.7% terpilih untuk digunakan pada uji in planta karena menekan pertumbuhan radial B. theobromae dengan THR 48.2% dan kompatibel dengan khamir. Pengujian dilanjutkan pada percobaan di rumah kaca dengan perlakuan: (1) Khamir, (2) FMA, (3) B. subtilis, (4) Kitosan, (5) Khamir+FMA, (6) Kitosan+FMA, (7) Khamir+Kitosan, (8) Khamir+FMA+Kitosan, dan (9) Kontrol dengan 3 ulangan dan 5 unit tanaman untuk masing-masing ulangan. Peubahpeubah yang diamati adalah periode laten, insidensi penyakit, keparahan penyakit, laju infeksi, dan nilai area under disease progress curve (AUDPC). Selain mempelajari aplikasi agens hayati dan kitosan dalam penekanan penyakit busuk batang jeruk, kesembilan perlakuan tersebut juga diberikan pada blok pertanaman tanpa inokulasi B. theobromae untuk melihat ada atau tidaknya pengaruh fitotoksisitas dari aplikasi agens hayati dan kitosan. Peubah lain yang diukur dari aplikasi agens hayati dan kitosan pada tanaman yang diinokulasi dan tidak diinokulasi B. theobromae adalah tingkat asosiasi FMA dan kandungan fenol total. Perlakuan Khamir+FMA+Kitosan menunjukkan periode
Keyword: antibiosis, hiperparasitisme, kitinase, senyawa fenol dan volatil

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: