Judul: Studi makrozoobenthos dan habitatnya di perairan pelabuhan tanjung priok dan perairan sekitarnya
Abstrak: Tujuan penelitian ini untuk mendeskripsikan jenis makrozoobenthos yang hidup di perairan Pelabuhan Tanjung Priok dan di perairan sekitarnya, mengkaji hubungan antara komunitas makrozoobenthos dan habitat sebagai tempt hidupnya di perairan Pelabuhan Tanjung Priok dan di perairan sekitarnya (Muara Gembong dan Tanjung Karawang) dan mengkaji pengaruh antara musim kemarau dan musim peralihan terhadap kepadatan makrozoobenthos.
Keyword: 

Judul: Ekotipe komunitas makrozoobenthos pada perairan sungai di Sumatera Selatan dan Lampung
Abstrak: Ekosistem perairan sungai dan laut digolongkan sebagai perairan dengan sistem terbuka (open water system), yang berarti sangat dipengaruhi oleh keadaan lingkungan sekitarnya. Kedua ekosistem ini memiliki keterkaitan yang erat dimana laut merupakan tempat bermuaranya sungai-sungai. Tipe-tipe organisme yang hidup di ekosistem perairan memiliki karakteristik yang berbeda-beda sesuai dengan karakteristik dan jenis perairannya. Organisme benthos adalah organisme yang tinggal di dalam dan/atau di atas sedimen dasar perairan, yang memiliki siklus hidup yang panjang dan pergerakkan yang terbatas (Lind 1979 dalam Suryadiputra, 1993). Peranan benthos meliputi kemampuannya dalam mendaur ulang bahan-bahan organik, membantu proses mineralisasi dan kedudukannya dalam beberapa posisi penting dalam rantai makanan, sehingga dapat dipakai untuk menduga kesuburan perairan. Benthos dipakai sebagai indikator pencemaran, mengingat sifatnya yang menetap dan tidak dapat menghindar dalam kontak dengan air limbah atau bahan pencemar. Penelitian ini dilakukan di Sumatera Selatan dan Lampung yang merupakan kawasan yang potensial bagi pengembangan ekonomi dan industri sehubungan dengan ketersediaan sarana dan prasarana yang terus meningkat. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui struktur dan organisme komunitas makrozoobenthos, Kondisi kualitas perairan dan keterkaitannya dengan struktur komunitas makrozoobenthos pada perairan Sungai di Sumatera Selatan dan Lampung.
Keyword: 

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA