Judul: Studi Fluktuasi Arus Permukaan Frekuensi (Low Frequency) Di Perairan Utara Papua Pada Bulan Oktober 2001 - Agustus 2002
Abstrak: Wilayah perairan di sebelah utara provinsi Papua yang termasuk kedalam Samudera Pasifik Tropis wilayah barat (Wesf Tropical Pacfic Ocean) merupakan wilayah perairan dengan kondisi meteorologi dan oseanografi yang sering beffluktuasi dan terjadi perubahan secara ekstrim. Samudera Pasifik sebagai salah satu pendorong arus lintas Indonesia (ARLINDO) menjadikannya sangat menarik untuk diteliti karena perubahan yang terjadi ikut rnernpengaruhi pertukaran massa air antara Samudera Pasifik dengan Samudera Hindia. Penelitian ini bertujuan untuk : (1). Mendeskripsikan karakteristik fluktuasi angin dan arus permukaan laut pada frekuensi rendah (low frequency); (2). Menganalisis hubungan antara angin dan arus permukaan pada fiekuensi rendah lewat analisis hasil korelasi silang (crosscorrelation) dan spektrum silang (cross-spekfraf). Penelitian ini memanfaatkan data buoy TRITON*sehagai hasil prggran Trapical Afmszp:;ere Ocszn (TAD) cli sainudsta Fasifik oleh Japan Marine Science and Technology Centre (JAMSTEC). Data yang dipakai adalah data angin dan arus pada buoy 10 (7'39'36" LU, 136°41'24"BT). 11 (4°51'36"LU, 137°16'12"BT), dan 12 (2°00'00LU, 138°06'36"BT) selama selang waktu 1 Oktober 2001 sampai 27 Agustus 2002 dengan selang waktu perekaman data satu jam. Namun data arus yang tersedia tidak sepenuhnya kontinu yang menyebabkan data terbagi kedalam beberapa selang data. Data pada buoy 10 terbagi menjadi tiga yaitu 1 Oktober - 14 Desember 2001, 23 Desember 2001 - 7 Juni 2002, dan 16 Juni - 27 Agustus 2002. Hal serupa terjadi pada data buoy 12 sehingga selang data yang ada menjadi 1 Oktober - 14 Desember 2001,28 desember 2001 - 16 Juni 2002, dan 23 Juni - 27 Agsutus 2002. Sedangkan pada buoy 11 data arus terbagi menjadi 2 bagian yaitu 1 Oktober - 15 November 2001 dan 4 Juli - 27 Agustus 2002.
Keyword: 

Judul: Kondisi Arus Geostrofik di Perairan Timur Laut Samudera Hindia pada Bulan Oktober 2001 dan Agustus 2002
Abstrak: Tujuan dilakukannya penelitian ini adalah untuk melihat pola pergerakan arus (arus geostrofik) yang te1jadi di pantai selatan Jawa-Sumbawa pada bulan Oktober 2001 (musim pancaroba I) dan pada bulan Agustus 2002 (musim timur). Penelitian ini dilakukan dengan memanfaatkan data ekspedisi TOCS (Tropical Ocean Climate Studi) kerja sama antara JAMSTEC (Japan Marine-Earth Science and Technology) dengan BPPT Jakarta. Pengukuran data suhu salinitas dan kedalaman dilakukan dengan menggunakan alat XCTD (eXpendable Conductivity, Temperature, Depth). Pengolahan data dilakukan dengan menggunakan software ODV (Ocean Data View) versi 1.3 mp dan microsoft excel. Analisis data meliputi analisis sebaran suhu, salinitas dan densitas air laut dan hasilnya dipakai untuk menganalisis anomali kedalaman dinamik dan arah serta kecepatan arus geostrofik. Sebaran suhu permukaan dari barat ke timur pada kedua waktu pengamatan menunjukkan pola yang hampir sama, yaitu terdapat sebaran nilai suhu yang tinggi di bagian barat mencapai 28.20C-28.930C pada bulan Oktober 2001 dan 28.30C-29.20C di bulan Agustus 2002. Nilai suhu permukaan yang tinggi juga terlihat di bagian timur pengamatan pada bulan Oktober yaitu mencapai kisaran 27.90C-28.90C. Nilai salinitas permukaan yang rendah terlihat di seluruh stasiun pengamatan yang hanya mencapai 32.8 psu-33.7 psu di bulan Oktober 2001 dan 32 psu-33.8 psu di bulan Agustus 2002. Nilai densitas (sigma-t) di beberapa wilayah pada permukaan perairan terlihat berada di bawah Qt=22. Fluktuasi nilai densitas terlihat di permukaan dari nilai Qt =2 l .5 sampai Qt=22. Fluktuasi tersebut palingjelas terlihat di posisi 106° BT dan 8°84' LS pada bulan Oktober 2001 dan 1050 BT dan 8053' LS pada bulan Agustus 2002. Arah arus geostrofik pada bulan Oktober 2001 mengalir ke arah barat daya di pennukaan pada posisi (l 000BT,6068'LS) sampai (1050BT,8050'LS). Hal tersebut menandakan adanya aliran Arus Katulistiwa Selatan (AKS) menuju ke arah barat dan dibelokkan ke barat daya setelah bertemu dengan arus muson barat laut yang datang melalui perairan barat Sumatera. Pada posisi (1050 BT,8050'LS)- (l 100BT, 10025 'LS) arus geostrofik mengalir ke arah timur laut. Pada posisi (l 100BT,10025'LS)-(1200BT,l0052'LS) arus mengalir ke arah selatan, yang diduga merupakan aliran massa air Arlinda. Arah arus geostrofik pada bulan Agustus 2002 mengalir ke barat daya pada posisi (950BT,5019LS)-(1000BT,6073'LS). Hal tersebut menandakan adanya aliran AKS yang berbelok ke barat daya setelah bertemu dengan aliran arus muson barat laut. Kecepatan arus geostrofik terbesar pada pengamatan Oktober 2001 ditemukan di permukaan di antara stasiun 15 (1070BT,9019'LS) dan stasiun 16 (107050'BT,903 7'LS) yaitu mencapai 41.1 cm/detik, dan pada bulan Agustus 2002 ditemukan di permukaan di antara stasiun 20 (1050BT,8053 'LS) dan stasiun 21 (105050'BT,8070'LS) yaitu mencapai kecepatan 73 cm/detik.
Keyword: 

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA