Judul: Identifikasi Keragaman Gen Calpastatin (CAST-NcoI) dengan Teknik PCR-RFLP pada Domba Lokal Indonesia
Abstrak: Domba lokal di Indonesia memiliki beberapa keunggulan, yaitu mampu bertahan pada iklim tropis, bersifat prolifik, tidak mengenal musim kawin, tahan terhadap beberapa macam penyakit dan parasit. Namun, produktivitas domba lokal masih cukup rendah terutama sifat pertumbuhan dan kualitas daging. Salah satu upaya seleksi dilakukan untuk meningkatkan produktivitas domba lokal yaitu berdasarkan pada penciri DNA yang dikenal dengan Marker Asissted Selection (MAS). Gen calpastatin merupakan gen yang berfungsi menghambat degradasi protein sel-sel otot. Pada mamalia, gen calpastatin diduga memiliki keterkaitan dalam sifat pertumbuhan otot dan keempukan daging. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi keragaman gen calpastatin pada domba lokal . Sampel DNA yang digunakan dalam penelitian ini berjumlah 232 sampel, yang terdiri dari Domba Ekor Tipis (DET) Jonggol (38), DET Rote (25), domba Garut Ciomas (25), domba Garut Margawati (23), domba Garut Wanaraja (25), Domba Ekor Gemuk (DEG) Indramayu (25), DEG Madura (25), DEG Donggala (25), dan DEG Sumbawa (21). Amplifikasi gen calpastatin dilakukan dengan teknik PCR, sedangkan untuk menentukkan genotipenya dilakukan dengan teknik Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) menggunakan enzim restriksi NcoI. Analisis data dilakukan dengan menghitung nilai frekuensi alel dan frekuensi genotipe.
Keyword: 

Judul: Identifikasi Keragaman Gen Miostatin dan Pengaruhnya Terhadap Sifat Pertumbuhan Domba Lokal Indonesia.
Abstrak: Salah satu kendala yang dihadapi dalam upaya produksi ternak domba lokal Indonesia adalah laju pertumbuhan yang masih rendah. Deteksi dini potensi genetik ternak dengan memanfaatkan teknologi DNA melalui penentuan genotipe gen-gen tertentu yang mengontrol sifat bernilai ekonorni merupakan hal yang perlu dilakukan dalam upaya menghasilkan bibit yang unggul melalui program seleksi. Pertumbuhan merupakan sifat yang dikendaIikan oleh banyak gen (multigen). Salah satu gen penting yang mempengaruhi pertumbuhan ternak domba adalah gen rniostatin. Miostatin atau growth difforentiation foctor-8 (GDF-8) merupakan anggota dari superfamili transforming growth factor-p (TGF-~) yang mengontrol pertumbuhan dan diferensiasi otot kerangka. Miostatin yang tidak berfungsi akan mengakibatkan terjadinya hypertropi (peningkatan diameter serabut otot) ataupun hyperplasia (peningkatan jurnIah serabut otot). Pada jenis ternak yang berbeda, daerah penyandi (coding region) merniliki tingkat kesamaan yang tinggi namun merniliki tingkat perbedaan yang tinggi pada daerah promotor. Kejadian double muscling pada bangsa sapi Belgian Blue dan Piedmontese diketahui sebagai akibat mutasi pada daerah penyandi gen rniostatin, namun pada bangsa domba Texel yang merniliki fenotipe double muscling tidak menunjukkan adanya keragaman pada daerah penyandi gen rniostatin jika dibandingkan dengan domba yang normal. Diduga bahwa yang bertanggung jawab terhadap fenotipe double muscling pada bangsa domba Texel adalah daerah promotor gen rniostatin. Penelitian ini bertujuan untuk memperoleh informasi keragaman daerah promotor dan ekson 1 gen rniostatin serta mengetahui pengaruhnya terhadap beberapa parameter pertumbuhan domba lokal Indonesia. Sebanyak 147 sampel DNA domba yang berasal dari tiga daerah yang berbeda, yaitu 37 ekor dari UP3 Jonggol IPB, 60 ekor dari Stasiun Penelitian BALITNAK CiIebut, dan 50 ekor dari petemakan Ali Yusuf Farm Cibanteng digunakan dalam penelitian ini. Beberapa parameter pertumbuhan domba (hobot badan, lingkar paha, lingkar shank belakang, dan lingkar shank depan) diukur untuk mengetahui pengaruh genotipe gen rniostatin. Metode Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (pCR-RFLP), Polymerase Chain Reaction-Single Strand Conformation Polymorphism (pCR-SSCP), dan sekuensing DNA digunakan untuk mengidentifikasi keragaman daerah promotor dan ekson 1 gen rniostatin domba., Sumantri, Cece, Farajallah, Achmad
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: