Judul: Konstruksi plasmid rekombinan untuk menghasilkan padi tahan hama penggerek batang (stem borer)
Abstrak: Hama penggerek batang merupakan hama utama padi di Indonesia. Salah satu usaha untuk mengatasi penggerek batang adalah perbaikan genetika tanaman padi. CryLA(b) adalah gen yang diisolasi dari Bacillus thuringiensis yang menyandikan protein spesifik dan dapat melawan secara efektif serangga lepidoptera termasuk penggerek batang. Gen cryIA(b) ini dapat ditransfer ke gen tanaman padi. Untuk transfer ini diperlukan DNA pembawa (vektor) dan media transfer. Tujuan penelitian ini adalah ntuk mentisipkan gen cryIA (b) ke dalam plasmid pCambia 1301 sehingga menghasilkan DNA rekombinan serta mentransformasi DNA rekombinan tersebut ke Agrobacterium tumefaciens LBA 1119 dengan teknik tri-parental mating. Gen cryIA(b) diisolasi dari plasmid pGem-4 dengan menggunakan enzim restriksi Hind III. Pemisahan gen crylA(b) dari media gel agarosa dilakukan dengan menggunakan Sephaglas Brand Prep Kit. Plasmid pCambia 1301 dipotong dengan enzim restriksi Hind III. Pencegahan resirkularisasi plasmid pCambia 1301 dilakukan dengan menghidrolisis gugus fosfat pada ujung 5' memakai enzim calf intestinal alkaline phosphatase (CIAP). Perlakuan perbandingan gen crylA (b) dan plasmid pCambia 1301 adalah 1:1, 3:1, dan 6:1. Seleksi bakteri yang mengandung DNA rekombinan dan telah mengalami transformasi adalah kombinasi antibiotik dan seleksi biru/putih (screening blue/white). Gen cryLA(b) berhasil disisipkan ke dalam plasmid pCambia 1301. DNA rekombinan yang terkonstruksi sudah dapat dipetakan. Pemetaan DNA rekombinan dilakukan dengan memotong DNA rekombinan dengan enzim restriksi Eco RI. Namun demikian transformasi DNA rekombinan ke dalam Agrobacterium tumefaciens LBA 1119 dengan tri-parental mating belum berhasil dilakukan. Penyebab belum berhasilnya transformasi ini memerlukan penelitian lebih lanjut.
Keyword: 

Judul: Konstruksi Plasmid Rekombinan Cryib Dan Clyiac Di Ba Wah Kontrol Promotor Terinduksi Pelukaan
Abstrak: protein spesifik yang dapat melawan secara efektif hama penggerek batang ordo Lepidoptera. Hama penggerek batang merupakan hama utama tanaman padi di Indonesia. Sifat ketahanan ter!ladap penggerek batang seeara alami tidak terdapat pada tanaman padi, schingga penanganan terhadap penggerck batang memerlukan bioteknologi rekayasa genetika yang akan menghasilkan padi transgenik. Penggunaan promotor terinduksi pelukaan menyebabkan ekspresi gen tidak teljadi secara terus-menerus sehingga mcmpcl'lama kcmungkinan patahnya resistensi hama yang akan mengurangi dampak terhadap lingkungan. Untuk mengintegrasikan gen clylB dan clylAc ke tanaman padi diperlukan DNA pembawa (vektm) dan media transfer. Tujuan penelitian ini adalah menyediakan dua plasmid rekombinan yang masing-m<lsing mcngandung gen clylB dan clylAc di bawah kontrol promotor terinduksi pelukaan maize profeinase inhibitor (M!'I). Adapun tahap penelitian yang dilakukan adalah isoiasi dan pemurnian DNA sisipan (cl)lIB dan c/:)J!Ac) dan DNA pembawa (pCAMBIA 1301), penyambungan (ligasi) DNA sisipan dan DNA pembawa yang dilanjutkan dengan transtbnllasi ke sel I:.:. coli. Koloni DNA rekombinan hasil scleksi birll putih dan seleksi antibiotik kemudian diisolasi dan dilakukan analisis molckuler pcmetaan DNA rckombinan dcngan pemotongan oleh enzim restriksi. Konstruksi vektor clylB eli bawah kontrol promotor terinduksi pelukaan MPl, dengan Illcnyisipkan gen clylB ke dalam plasmid pCAMBIA 1301 telah berhasil dilakukan. Untuk konslruksi veklor clyiAc di bawah kontrol promotor tel'induksi pelukaan MPI belulll berhasil dilakukan, yaitu dcngan tidak tersisipnya gen cl),IAc ke dalam pCAMBIA 1301. Konlirmasi keberhasilan dan ketidakbcrhasilan ini berdasarkan uji elektroforesis gel agarosa hasil pemotongan DNA rekombinan oleh enzim Eeo RI, Kpn I, Kpn I dengan Hind Ill, Kpn I dengan BamI-II, dan BamE I dengan I-lind Ill.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: