Judul: Antibacterial Activity of Endophytic Bacteria Isolates from Clove Leaf (Syzygium aromaticum) and Identification Based on Morphological and Physiological Characteristics
Abstrak: Infeksi bakteri patogen masih menjadi masalah utama dalam kesehatan yang banyak menimbulkan kematian. Bakteri endofit pada tanaman obat berpotensi sebagai agen penghasil antibakteri. Keberadaan bakteri endofit pada tanaman cengkeh (Syzygium aromaticum) memungkinkannya memproduksi senyawa bioaktif yang sama seperti yang terkandung dalam inangnya. Penelitian ini bertujuan menganalisis aktivitas antibakteri isolat bakteri endofit asal daun cengkeh dan karakterisasi isolat yang potensial. Metode penelitian dilakukan dengan peremajaan isolat dan bakteri uji, skrining potensi aktivitas antibakteri secara disc diffusion, karakterisasi morfologi dan fisiologi isolat paling potensial, penentuan kurva pertumbuhan, serta uji aktivitas antibakteri isolat potensial pada waktu inkubasi optimum. Hasil penelitian menunjukan bahwa isolat bakteri endofit dari daun tanaman cengkeh (Syzygium aromaticum) mempunyai aktivitas antibakteri terhadap bakteri patogen. Isolat DCL1 bersifat bakterisidal kuat terhadap Escherichia coli, sedangkan isolat DCL3 bersifat bakterisidal intermediet terhadap Pseudomonas aeruginosa. Dua isolat bakteri endofit asal daun cengkeh tersebut memiliki kesamaan karakteriskik dengan genera Bacillus berdasarkan karakter morfologi koloni, morfologi sel, dan aktivitas biokimia yang menghasilkan enzim katalase. Aktivitas antibakteri isolat bakteri endofit daun cengkeh DCL1 dan DCL3 paling baik pada jam ke-40 waktu inkubasi optimum berdasarkan kurva pertumbuhan., Pathogenic bacterial infection is still a major health problem that causes many deaths. Endophytic bacteria in medicinal plants have the potential as antibacterial agents. The presence of endophytic bacteria in the clove plant (Syzygium aromaticum) allows it to produce the same bioactive compounds as those contained in its host. This study aims to analyze the antibacterial activity of endophytic bacteria from clove leaves and characterize the potential isolates. The research method was carried out by rejuvenating isolates and testing bacteria, screening for potential antibacterial activity by disc diffusion, morphological and physiological characterizations of the most potential isolates, determining growth curves, and testing the antibacterial activity at optimum incubation times. Based on the results, endophytic bacteria from clove leaf (Syzygium aromaticum) have antibacterial activity against pathogenic bacteria. DCL1 isolate is strong bactericidal against Escherichia coli, while DCL3 isolate is intermediate bactericidal against Pseudomonas aeruginosa. The two isolates of endophytic bacteria from clove leaf have similar characteristics to the Bacillus genera based on colony morphology, cell morphology, and biochemical activity that produce catalase enzymes. The best antibacterial is shown by isolating DCL1 and DCL3 at 40 hours of optimum incubation time based on the growth curve.
Keyword: antibacterial, bioactive compound, disc diffusion, endophytic bacteria, pathogenic bacteria

Judul: Potensi Aktivitas Antioksidan dan Antimutagenik
Metabolit Ekstraseluler Bakteri Endofit Daun Cengkeh (Syzygium aromaticum L.).
Abstrak: Bakteri endofit merupakan bakteri yang hidup di dalam jaringan tanpa menyebabkan gangguan atau kerusakan pada inangnya. Studi menunjukkan bahwa bakteri endofit tumbuhan dapat memproduksi dan mensintesis senyawa bioaktif yang sama seperti inangnya. Bioaktivitas yang dimiliki senyawa tersebut dapat berpotensi sebagai antioksidan dan antimutagenik. Antioksidan berfungsi sebagai penghambat toksisitas radikal bebas. Radikal bebas diketahui merupakan salah satu mutagen pemicu mutasi DNA. Oleh karena itu, aktivitas antioksidan suatu senyawa juga memiliki potensi sebagai senyawa antimutagenik. Ekstrak cengkeh Syzygium aromaticum L. diketahui telah memiliki banyak manfaat dibidang kesehatan. Kelompok bakteri Bacillus sp. juga telah banyak diteliti memiliki manfaat sebagai antioksidan dan antikanker. Informasi aktivitas antioksidan dan antimutagenik ekstrak bakteri endofit Bacillus sp. dari daun cengkeh belum tersedia, hingga saat ini. Oleh karena itu tujuan dari penelitian ini ialah mengisolasi dan menganalisis bakteri endofit kelompok Bacillus sp. dari daun cengkeh yang memiliki aktivitas antioksidan dan antimutagenik. Penelitian ini dilakukan dengan beberapa tahap yaitu, dengan isolasi bakteri endofit, uji patogenisitas, identifikasi bakteri berdasarkan analisis molekuler berbasis 16S rRNA, ekstraksi senyawa bioaktif bakteri, selanjutnya penentuan aktivitas antioksidan menggunakan radikal 2,2-diphenyl-1-picrylhydrazyl (DPPH), dan metode yang digunakan dalam menganalisis kemampuan ekstrak bakteri endofit sebagai agen antimutagenik adalah uji dekolorisasi, efek paparan sinar UV dan uji viabilitas sel, sedangkan aktivitas antimutagenik dianalisis baik secara in vitro dan di level seluler menggunakan khamir Saccharomyces cerevisiae sebagai organisme model. Pendeteksian senyawa aktif asal ekstrak bahan aktif bakteri endofit menggunakan LC-MS. Jumlah bakteri endofit yang berhasil diisolasi dari daun cengkeh sebanyak 10 isolat, diketahui hanya diperoleh satu isolat P1U2 yang dinyatakan tidak patogen terhadap manusia (ditandai dengan tidak terbentuknya zona bening pada media blood agar). Berdasarkan hasil uji karakteristik isolat P1U2 memiliki koloni berwarna kuning, bentuk koloni sel bakteri pada media nutrient agar melingkar, dengan sel yang berbentuk basil, termasuk bakteri gram positif dan memiliki spora. Berdasarkan analisis sekuens 16S rRNA, P1U2 memiliki nilai similarity tertinggi sebesar 99,65% dengan Fictibacillus sp. Ekstraksi ekstraseluler menggunakan pelarut etil asetat diperoleh rendemen sebesar 0,079%. Hasil uji aktivitas antioksidan diketahui bahwa ekstrak P1U2 memiliki nilai IC50 sebesar 161 ppm. Uji antimutagenik dilakukan menggunakan mutagen senyawa toksin hijau malakit. Penambahan ekstrak mengurangi kemampuan S. cerevisiae mendekolorisasi hijau malakit, namun penambahan ekstrak P1U2 mampu meningkatkan viabilitas sel khamir. Berdasarkan analisis efek paparan sinar UV, penambahan ekstrak P1U2 (161 ppm) mampu mempertahankan viabilitas khamir S. cerevisiae dalam menangkal mutagen UV. Hasil analisis LC-MS ekstrak P1U2 menunjukkan keberadaan senyawa quercetin, benzofuran, asam linolenat, euparin, dan aeruginosin. Penelitian sebelumnya melaporkan bahwa quercetin merupakan salah satu senyawa fenol dominan pada cengkeh. Senyawa ini diduga berpotensi besar sebagai antioksidan dan antimutagenik.
Keyword: Antioksidan, Bacillus, Bakteri endofit, Daun cengkeh, Radikal bebas

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: