Judul: Polimorfisme Gen Calpastatin (CAST|Cfr131) Dengan Metode PCR-RFLP
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi polimorfisme gen calpastatin (CAST|Cfr131) menggunakan metode PCR-RFLP. Penelitian ini menggunakan 95 sapi bali yang terdiri dari 49 jantan dan 46 betina berasal dari BPTU-HPT Provinsi Bali. Polimorfisme gen calpastatin dianalisis menggunakan metode PCR-RFLP. Enzim yang digunakan untuk pemotongan adalah Cfr131 primer forward 5 'TGGGGCCCAATGACGCCATCGATG3' dan primer reverse 5 'GGTGGAGCAGCACTTCTGATCACC3'. Keragaman genetik dari gen calpastatin dianalisis menggunakan frekuensi alel, frekuensi genotipe, derajat heterozigositas. Keseimbangan Hardy-Weinberg diuji dengan uji Chi Kuadrat menggunakan aplikasi PopGen 32. Hasil penelitian menunjukkan bahwa Amplifikasi gen calpastatin terletak di intron 15 dengan suhu annealing 60 ⁰ C selama 10 detik dengan panjang produk 624 pb. Keragaman gen calpastatin pada bangsa sapi bali bersifat polimorfik dengan frekuensi alel G sebesar (0.86) lebih tinggi dibanding frekuensi alel A (0.14).
Keyword: calpastatin, keragaman genetik, PCR-RFLP, sapi bali

Judul: Identifikasi Keragaman Gen Calpastatin (CAST|Alu1) pada sapi Bali, Limousin, dan PO di Pusat Pembibitan menggunakan metode PCR-RFLP.
Abstrak: Sumber daya genetik ternak sapi Indonesia saat ini terdiri dari tiga kelompok yaitu ternak asli, ternak lokal dan ternak impor. Tujuan dari penelitian ini adalah mengidentifikasi polimorfisme gen Calpastatin (CAST) pada bangsa sapi pedaging di Pusat Pembibitan (bali, Limosin, dan PO) dengan metode Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCRRFLP). Sampel yang digunakan 124 ekor sapi yang terdiri dari sapi bali 48 ekor, Limousin 16 ekor, dan PO 60 ekor. Data genotipe di hitung menggunakan frekuensi alel, heteresigositas, dan keseimbangan Hardy-Weinberg. Hasil akhir penelitian ini diperoleh panjang fragmen 624 pb yang terdiri atas 2 alel (T dan C) dan 3 genotipe yaitu TT (474 pb), TC (474 pb dan 324 pb) dan CC (324 pb). Identifikasi keragaman gen CAST|AluI menunjukkan bahwa sapi bali, Limousin, dan PO di pusat pembibitan bersifat polimorfik dengan nilai frekuensi alel total yang tertinggi dimiliki oleh alel T dengan nilai 0.57-0.94 dan alel C dengan nilai 0.06-0.42. Berdasarkan hasil tersebut dapat disimpulkan bahwa gen CAST|Alu1 sapi bali, Limousin, dan PO bersifat polimorfik.
Keyword: Gen CAST, keragaman, PCR-RFLP, sapi, sumber daya genetik

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: