Judul: Penerapan synthetic minority oversampling technique (SMOTE) pada identifikasi ikan berbasis DNA Barcoding
Abstrak: Data balancing is one of the methods used to overcome imbalance amount of data in the classes to be classified. Balanced data can improve the performance of classification model. The purpose of this research was to analyze the influences of SMOTE application on the model’s accuracy in classification. Feature extraction was done using k-mers. The classification process began by building the model using Support Vector Machine (SVM) with training data obtained from the Barcode of Life Database (BOLD). The model was tested using testing data from Department of Aquatic Products Technology, Faculty of Fisheries and Marine Science, Bogor Agricultural University. The average percentage of accuracy without using SMOTE was 82.67%, while the average percentage of accuracy using SMOTE was 90.63%. These results show that the application of SMOTE on bulding the model can improve the classification accuracy of fish, both at genus and species level.
Keyword: Data balancing, k-mers, SMOTE -SVM

Judul: Identifikasi Ikan Tuna Dan Tenggiri Berdasarkan Sekuens Dna Barcode Dengan Menggunakan Support Vector Machine (Svm)
Abstrak: Ikan tuna dan tenggiri merupakan salah satu produk perikanan yang banyak diminati masyarakat dan memiliki nilai gizi yang baik bagi kesehatan. Banyak dari produk olahan ikan tuna dan tenggiri ini telah mengalami pemalsuan, yaitu digantikannya kandungan produk yang memiliki nilai jual tinggi dengan kandungan lain yang harganya lebih rendah. Untuk menjamin keamanan pangan, pemalsuan ini harus dicegah, salah satunya dengan melakukan identifikasi kandungan produk olahan tersebut. Identifikasi ini sangat penting untuk menjaga standar kualitas pada industri makanan dan pasar. Salah satu cara yang dilakukan untuk mengidentifikasi pemalsuan yaitu dengan menggunakan metode berbasis DNA barcode. DNA barcode adalah sekuen-sekuen pendek yang diambil dari bagian genom suatu makhluk hidup. Identifikasi DNA barcode dilakukan dengan menggunakan pendekatan komposisi, yaitu melakukan perhitungan jumlah frekuensi kemunculan pasangan basa yang membentuk sekuens DNA barcode. Metode yang digunakan dalam perhitungan frekuensi kemunculan pasangan basa ini adalah ekstraksi fitur k-mers, dengan k yang digunakan adalah 3-mers (trinucleotide) dan 4-mers (tetranucletode). Hasil dari ekstraksi fitur menjadi vektor masukan untuk melakukan identifikasi menggunakan Support Vector Machine (SVM) dengan kernel Radial Basis Function (RBF). Model yang terbentuk dari hasil identifikasi dengan SVM dianalisis dengan menghitung nilai akurasi, sensitivity, specificity dan Fmeasure. Berdasarkan identifikasi dengan menggunakan SVM pada sekuens DNA barcode ikan tuna, tenggiri dan ikan lain hasil akurasi terbaik dengan menggunakan tetranucletide pada tingkat genus yaitu sebesar 99,45% dan 88% pada tingkat spesies.
Keyword: DNA barcode, keamanan pangan, machine learning, support vector machine

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: