Judul: Simulasi perambatan suara dalam kolom air dengan metode persamaan parabolik di Samudera Hindia
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mengkaji pengaruh parameter lingkungan air laut dan parameter akustik terhadap pola perambatan suara di perairan Samudera Hindia bagian Timur (Barat Sumatera-Selatan Jawa). Parameter lingkungan yang digunakan dalam penelitian ini adalah data suhu dan salinitas Samudera Hindia Bagian Timur pada bulan Oktober 2001 dan Agustus 2002 hasil ekspedisi Tropical Ocean Climate Studies (TOCS) oleh Japan Marine Science and Technology (JAMSTEC) bekerjasama dengan Badan Pengkajian dan Penerapan Teknologi (BPPT) Indonesia. Sedangkan parameter akustiknya adalah frekuensi sumber suara, posisi sumber suara dan posisi penerima suara. Data parameter lingkungan diolah dengan dengan Ocean Data View (ODV) menghasilkan output profil suhu, salinitas, densitas dan data tabular kecepatan suara beserta profilnya. Simulasi perambatan suaranya dibantu dengan program Range- dependent Acoustic Model (RAM) versi 1.5 yang ditulis dalam bahasa FORTRAN dan dikembangkan oleh Michael D.Collins (2000). Program ini merupakan salah satu program yang dapat memodelkan perambatan suara dengan menggunakan metode persamaan parabolik. Data kecepatan suara dari ODV bersama parameter akustik yaitu frekuensi sumber suara (dalam penelitian ini menggunakan frekuensi 20, 40, 60, 80 dan 100 Hz) dan posisi sumber suara serta posisi penerima (sumber suara kedalaman 50 meter penerimanya pada kedalaman 10, 50 dan 100 meter; sumber suara 150 meter penerimanya pada kedalaman 100, 150 dan 250 meter; sumber suara 800 meter penerimanya pada kedalaman 700, 800 dan 900 meter) merupakan data input bagi RAM untuk mendapatkan nilai kehilangan energi suara dalam perambatannya. Data nilai kehilangan tersebut diplotkan pada grafik dengan bantuan program matlab. Setiap frekuensi yang disimulasikan (20, 40, 60, 80 dan 100 Hz) memiliki nilai fluktuasi nilai kehilangan yang berbeda dan berubah-ubah pada setiap jarak yang ditempuhnya...
Keyword: perambatan suara; parameter air laut

Judul: Simulasi pola perambatan suara dengan metode parabolik di Perairan Selat Sunda
Abstrak: Di dalam laut, gelombang suara sangat efektif untuk digunakan dalam transmisi informasi atau data dan pendeteksian obyek benda pada jarak ribuan meter. Gelombang suara yang merambat di dalam laut membentuk pola-pola perambatan suara tertentu yang dipengaruhi oleh parameter akustik dan parameter lingkungan di laut. Dengan suatu pemodelan, kedua parameter tersebut dapat disimulasikan sehingga memberikan gambaran tentang pola perambatan suara yang terjadi. Berdasarkan pola perambatan suara tersebut maka jauh dekatnya jarak transmisi atau deteksi suara di dalam laut dapat ditentukan. Penelitian ini bertujuan untuk melihat pengaruh parameter akustik dan lingkungan terhadap pola perambatan suara serta menampilkan hasil simulasi dalam bentuk kurva kehilangan energi suara (fransmission loss) Parameter lingkungan (oseanografis) yang digunakan dalam penelitian ini adalah data suhu, salinitas dan kedalaman di perairan Selat Sunda pada bulan Oktober 1997 dan Maret 1998; parameter tersebut digunakan untuk menghitung kecepatan suara menurut rumus Del Grosso (1974), yaitu Crisp 1402,392 + ACACS+ ACP + ACTSP Kemudian profil suhu, salinitas dan kecepatan suara dibuat tiap jarak dalam satu lintasan dengan menggunakan Matlab. Setelah itu data kecepatan suara, nilai densitas dan kecepatan suara di sedimen (Hamilton, Edwin L. and Richard T. Bachman, 1982) dimasukan ke dalam file masukan (input file) kemudian disimulasikan dengan 10 nilai frekuensi (25, 50, 100, 200, 400, 500, 600, 800 1000 dan 1500 Hz); dan 3 posisi kedalaman suara yaitu 20, 50 dan 70 m; di 3 lintasan yang berbeda...
Keyword: 

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA