Judul: Diversity, anti Candida albicans potency and bioactive compound of Coffea canephora associated fungi
Abstrak: Tanaman kopi merupakan tanaman tropis yang menjadi komoditas unggulan dalam sub sektor perkebunan di Indonesia. Keberhasilan pertumbuhan dan produksi tanaman kopi ialah adanya interaksinya dengan cendawan endofit yang tumbuh pada semua jaringan tanaman dan cendawan saprob yang tumbuh pada serasah dan rizosfir tanaman. Cendawan endofit dan saprob dilaporkan menghasilkan berbagai senyawa metabolit sekunder yang diantaranya bersifat antimikrob yang menekan pertumbuhan cendawan patogen Candida albicans, penyebab penyakit kandidiasis pada manusia. Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari keanekaragaman cendawan endofit dan saprob pada tanaman kopi robusta (C.canephora), menganalisis potensinya sebagai anti C.albicans, serta menentukan dugaan senyawa aktif yang dapat mengendalikan cendawan patogen tersebut. Sebanyak 30 isolat cendawan yang memiliki karakter morfologi koloni berbeda yaitu tiga isolat dari daun, sembilan isolat dari serasah dan 18 isolat dari rizosfer. Warna koloni yang teramati bagian atas yaitu merah muda, putih, putih keabu-abuan, putih kekuningan, putih kehijauan, hijau muda dan hijau zaitun. Tekstur permukaan koloni beragam yaitu bertekstur halus, menggulung, seperti kapas, dan bergranulla. Hifa cendawan septat dan hanya membentuk spora aseksual. Kecepatan pertumbuhan koloni cepat sampai lambat. Hasil identifikasi berdasarkan karakter morfologi menunjukkan di peroleh tujuh genus yaitu Fusarium, Humicola, Neocosmopora, Rigidosporus, Talaromyces, Tricoderma, dan Xylaria. Sebanyak 17 isolat mempunyai aktivitas anti C.albicans dengan kisaran zona bening antara 2.50 mm – 15.53 mm, dua isolat tergolong dalam penghambat kuat, sembilan isolat tergolong sedang, dan enam tergolong lemah. Penghambatan tertinggi di peroleh dari cendawan Trichoderma TN- 103-1 dari rizosfer. Hasil identifikasi molekuler, 17 isolat positif anti Candida terdiri dari 11 spesies yaitu F.equiseti, F. graminearum, F. oxysporum. F. sinensis, F. solani, H. fuscoatra, R. microporus, T. macrosporus, T. hamatum, T. ovalisporum dan X. curta. Filtrat kultur cendawan dengan anti C.albicans terbaik yaitu T. hamatum TN-103-1 memiliki nilai penghambatan mirip dengan nilai penghambatan pada uji kultur yaitu sebesar 14.40 mm. Hal ini menunjukkan komponen aktif kultur terdapat pada filtrat (ekstraseluler). Filtrat diekstraksi menggunakan pelarut etil asetat dan n-heksana. Ekstrak etil asetat menghasilkan rendemen lebih kecil yaitu sebesar 0.80% dibandingkan ekstrak n-heksana (0.94%). Ekstrak etil asetat T.hamatum TN- 103-1 memiliki nilai konsentrasi hambat minimum 0.5% yang lebih aktif dibandingkan dengan ekstrak n-heksana dengan konsentrasi hambat minimun sebesar 15%, bahkan lebih baik dibandingkan kontrol positif menggunakan nistatin (100.000 U/ml) dengan konsentrasi hambat minimum yang lebih besar yaitu 1.0%. Dugaan senyawa aktif pada ekstrak etil asetat adalah 9-octadecenoic acid., Coffee is a tropical plantation plant that is an essential commodity in Indonesia. The growth and production of the coffee plant are a result of interaction between the coffee plant and endophytic fungi that grow in all plant tissues and saprobes on plant litter and in the rhizosphere. Endophytic and saprophytic fungi are reported to produce various secondary metabolites, including antimicrobials that suppress the growth of the fungal pathogen Candida albicans, the cause of candidiasis in humans. This study aims to study the diversity of endophytic fungi and saprobes on robusta coffee plants (C. canephora), analyze their potential as anti-C. albicans, and determine the suspected active compounds that can control these fungal pathogens. The total of 30 fungal isolates that had different colony morphology characters were obtained. Three isolates were isolated from the leaves,
Keyword: cendawan endofit, cendawan saprob, filtrat ekstrak, ITS rDNA, zona bening

Judul: Potensi Bakteri Endofit Asal Tanaman Kopi Untuk Pengendalian Nematoda Luka Akar Pratylenchus Coffeae (Zimmermann) Filipjev & Schuurmans Stekhoven Dan Pemacu Pertumbuhan Tanaman
Abstrak: Kopi merupakan tanaman perkebunan yang memiliki potensi ekspor yang cukup tinggi. Sebelum abad 19, Indonesia merupakan negara penghasil kopi terbesar di dunia setelah Brazil, namun saat ini produksi terus menurun dan telah tergeser oleh negara lain. Salah satu faktor penyebabnya adalah serangan nematoda luka akar Pratylenchus coffeae. Penurunan produksi akibat nematoda tersebut mencapai 28.7-78.4% pada kopi Robusta dan pada kopi Arabika, tanaman hanya dapat bertahan selama dua tahun. Upaya pengendalian terhadap P. coffeae telah dilakukan di antaranya secara kultur teknis, penggunaan bahan tanam tahan, kimiawi dan pengendalian biologis. Salah satu teknik pengendalian biologi adalah dengan pemanfaatan bakteri endofit. Penelitian mengenai eksplorasi dan penggunaan bakteri endofit pada tanaman kopi sebagai agens pengendali nematoda P. coffeae belum banyak dilakukan. Penelitian bertujuan memperoleh isolat tunggal maupun konsorsium bakteri endofit asal tanaman kopi yang efektif untuk mengendalikan nematoda luka akar P. coffeae dan memacu pertumbuhan tanaman. Ruang lingkup penelitian meliputi: 1) isolasi bakteri endofit dari bagian akar, batang dan daun sehat tanaman kopi untuk memperoleh isolat tunggal dan konsorsium; 2) penapisan bakteri endofit melalui uji hipersensitif dan hemolisis; 3) pengelompokan isolat tunggal bakteri endofit menurut golongan pseudomonad fluoresen, Bacillus, Aktinomiset dan bukan ketiganya; 4) penyiapan inokulum P. coffeae; 5) uji in vitro bakteri endofit terhadap mortalitas P. coffeae dan pemacuan pertumbuhan tanaman; 6) karakterisasi bakteri endofit mencakup pengujian aktivitas hidrolisis (kitinolitik, proteolitik, dan lipolitik), produksi HCN, kemampuan pelarutan fosfat (P), penambatan nitrogen (N2); 7) uji potensi bakteri endofit dalam menekan populasi P. coffeae dan memacu pertumbuhan tanaman di rumah kaca; dan 8) identifikasi secara molekuler dengan sekuensing gen 16S rRNA terhadap 2 isolat tunggal terbaik di rumah kaca. Hasil isolasi diperoleh 264 isolat tunggal dan 27 konsorsium bakteri endofit. Hasil seleksi melalui uji hipersensitif dan hemolisis, diperoleh 78 isolat tunggal dan 9 konsorsium bakteri endofit yang tidak bersifat patogen terhadap tumbuhan dan mammalia. Pengujian in vitro menunjukkan bahwa sebanyak 77 dari 78 isolat tunggal dan 9 konsorsium dapat menekan nematoda P. coffeae dengan persentase mortalitas nematoda antara 6.7-100%, dan 16.7-65.8%. Hasil uji pemacuan pertumbuhan diperoleh sebanyak 16 isolat tunggal (19.5%) yang memacu pertumbuhan batang dan 13 isolat tunggal (16.9%) mampu memacu pertumbuhan akar. Konsorsium bakteri endofit yang dapat memacu pertumbuhan batang sebanyak 6 konsorsium (60%) dan memacu pertumbuhan akar sebanyak satu konsorsium (10%). Berdasarkan seleksi awal tersebut dipilih 23 isolat tunggal dan 4 konsorsium bakteri endofit untuk karakterisasi fisiologis. Dua puluh tiga isolat tersebut terdiri atas 9 isolat yang mampu menekan P. coffeae saja, 10 isolat memacu pertumbuhan batang dan/atau akar, dan 4 isolat dapat menekan P. coffeae serta memacu pertumbuhan tanaman. Bakteri endofit konsorsium terseleksi sebanyak 4 konsorsium, terdiri atas satu konsorsium yang mampu menekan populasi P. coffeae saja, satu konsorsium dapat memacu pertumbuhan saja, serta 2 konsorsium yang mampu menekan P. coffeae dan memacu pertumbuhan tanaman. Berdasarkan karakterisasi fisiologis, diperoleh: 1) isolat tunggal bakteri endofit C939A31 memiliki kemampuan aktivitas proteolitik, kitinolitik, lipolitik, dan fiksasi N2, serta kemampuan menekan P. coffeae 66.7%; C939A32 memiliki kemampuan aktivitas lipolitik, pelarutan P dan fiksasi N2, serta kemampuan menekan P. coffeae 100%; I308A32 memiliki kemampuan aktivitas proteolitik, lipolitik, pelarutan P dan fiksasi N2, serta kemampuan menekan P. coffeae 77.9%;
Keyword: isolat tunggal, konsorsium, karakterisasi fisiologis, mortalitas

Judul: Perbandingan Answer Set Programming dan Iterative Deepening Search dalam Menyelesaikan Game N-puzzle
Abstrak: N-puzzle is one of the known NP-complete problems in the field of puzzles and games. The purpose of N-puzzle is to arrange numbers from 1 to (n2-1) in an n x n grid, with one grid contains a blank square. The research aims to compare the use of Answer Set Programming (ASP), as one of the currently used formalism to express and solve hard computational problems, with the traditional Iterative Deepening Search (IDS) in solving the N-puzzle. An encoding of N-puzzle problem and solver was devised and executed using the DLV system, while IDS is implemented as an ad-hoc program solving the N-puzzle problem. The result of experiment shows that the ASP using DLV is more effective in finding solutions, because it requires no depth parameters to find solutions, while IDS does. On the other hand, the IDS implementation was more efficient in terms of execution time.
Keyword: