Judul: Aktivitas Enzim Fibrinolitik Serbuk Moromi
Abstrak: Enzim fibrinolitik memiliki kemampuan untuk menghilangkan bekuan fibrin pada pembuluh darah dan ditemukan pada produk pangan fermentasi, salah satunya yaitu moromi. Moromi mengandung enzim fibrinolitik yang dihasilkan oleh Bacillus cereus dan Bacillus subtilis dan dapat diolah menjadi serbuk probiotik. Penelitian ini bertujuan menganalisis konsentrasi protein, aktivitas proteolitik dan fibrinolitik moromi sebelum dan setelah proses pengeringan. Moromi dapat diolah menjadi serbuk probiotik dengan mengeringkan moromi menggunakan tray dryer dan ditambahkan filler berupa dekstrin. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa serbuk moromi yang dianalisis dengan substrat kasein 2% memiliki aktivitas protease sebesar 0,066 – 0,115 UA/mL dan aktivitas spesifik sebesar 0,357 – 0,097 UA/mg protein, serta serbuk moromi yang dianalisis dengan substrat fibrinogen 1% memiliki aktivitas protease sebesar 0,063 – 0,083 UA/mL dan aktivitas spesifik sebesar 0,264 – 0,019 UA/mg protein. Selanjutnya, serbuk moromi juga memiliki aktivitas fibrinolitik yang dikonfimasi melalui analisis zimografi. Berdasarkan hasil tersebut, serbuk moromi berpotensi untuk dikembangan sebagai serbuk probiotik untuk alternatif pencegahan dan pengobatan penyakit kardiovaskular., Fibrinolytic enzymes can remove fibrin clots in blood vessels and are found in fermented food products, one of which is moromi. Moromi contains fibrinolytic enzymes produced by Bacillus cereus and Bacillus subtilis and can be processed into a probiotic powder. This study aims to analyze the protein concentration and analyze the proteolytic and fibrinolytic activity of moromi before and after the drying process. Moromi can be processed into powder using a tray dryer and with dextrin added as a filler. The results of this study indicate that moromi powder analyzed with 2% casein substrate has protease activity of 0.066 – 0.115 UA/mL and specific activity of 0.357 – 0.097 UA/mg protein, and also moromi powder analyzed with 1% fibrinogen substrate has protease activity of 0.063 – 0.083 UA/mL and specific activity of 0.264 – 0.019 UA/mg protein. Furthermore, moromi powder also has fibrinolytic activity which was confirmed by zymographic analysis. Based on these results, moromi powder may be developed as a probiotic powder for alternative prevention and treatment of cardiovascular disease.
Keyword: moromi, enzim fibrinolitik, serbuk moromi, zimogram, aktivitas enzim

Judul: Molecular Characteristics of Fibrinolytic Enzyme from Bacillus subtilis Originated Moromi through Bioinformatics Studies
Abstrak: Penyakit kardiovaskuler seperti stroke dan jantung merupakan salah satu penyebab kematian di dunia, termasuk Indonesia. Menurut WHO 2017, pada tahun 2016 sekitar 17.9 juta orang meninggal (sebesar 31% dari tingkat kematian di dunia) karena penyakit kardiovaskular, serta dari jumlah ini sebanyak 85% disebabkan oleh serangan jantung dan stroke. Salah satu dasar patofisiologi dari stroke adalah atero-tromboembolik (trombosis), yaitu suatu keadaan dimana bekuan-bekuan darah melekat dan beragregasi pada pembuluh darah yang terluka sehingga menyebabkan penyumbatan aliran darah. Enzim fibrinolitik dari mikroba pangan telah menarik minat ahli medis untuk dikembangkan sebagai agen trombolitik. Di antara bakteri, sebagian besar dari anggota genus Bacillus telah dipelajari mengenai enzim fibrinolitik dan sifat-sifatnya. Genus Bacillus dari berbagai pangan fermentasi yang ditemukan mampu menghasilkan aktivitas protease fibrinolitik yang kuat, antara lain Bacillus natto dari natto, Bacillus amyloliquefaciens DC-4 dari douchi; Bacillus amyloliquefaciens MJ5-41 dari meju; Bacillus licheniformis, Bacillus cereus, Brevibacillus laterosporus, dan Bacillus pumilus dari oncom merah dan tempe gembus; serta Bacillus coagulans dari terasi. Penelitian di Indonesia mengenai enzim fibrinolitik dari pangan fermentasi masih terbatas, padahal Indonesia dikenal sebagai negara yang kaya produk pangan fermentasi seperti tempe, tauco, tempe gembus, oncom merah, tempoyak, jambal roti, dan tuak. Penelitian ini bertujuan untuk melakukan kajian terhadap enzim fibrinolitik mikroba dari produk fermentasi moromi. Dalam mencari informasi dasar dan molekuler enzim fibrinolitik, temuan mikroba fibrinolitik lokal adalah tahap awal yang perlu diikuti oleh tahap berikutnya yaitu mencari informasi mengenai gen penyandi enzim fibrinolitik dan karakterisasinya, serta mencari informasi melalui kajian bioinformatika terkait interaksi yang terjadi antara enzim fibrinolitik dengan substratnya yaitu fibrin dan fibrinogen. Pemanfaatan tools pada bioinformatika dapat memberikan berbagai informasi penting, khususnya dalam studi ini terkait karakteristik molekuler enzim yang diisolasi dari Bacillus subtilis K2 asal pangan fermentasi moromi. Penelitian ini berhasil mengisolasi bakteri penghasil protease fibrinolitik dari pangan fermentasi Indonesia, moromi. Sebanyak tiga isolat menunjukkan aktivitas proteolitik pada media skim milk agar dan juga menunjukkan aktivitas fibrinolitik yang kuat berdasarkan pada uji fibrin plate. Ketiga isolat (K1, K2, dan K3) diidentifikasi menggunakan kit API 50 CHB dan identifikasi molekuler melalui analisis sekuen gen 16S rRNA. Hasil uji biokimia menggunakan kit API 50 CHB menunjukkan bahwa isolat K1 diidentifikasi sebagai Bacillus cereus 1 (99.8%), K2 sebagai Bacillus subtilis (97%), dan K3 sebagai Bacillus cereus (99%). Identifikasi molekuler berdasarkan gen 16S rRNA menunjukkan bahwa K1 dikonfirmasi sebagai Bacillus cereus 1 (100%), K2 sebagai Bacillus subtilis (99.86%), dan K3 sebagai Bacillus cereus (97.56%). Urutan nukleotida didepositkan pada GenBank dengan accession number MK045762 untuk K1, MK652831 untuk K2, dan MK530096 untuk K3. Isolat K2 (Bacillus subtilis K2) yang difermentasi selama 1 hari memiliki aktivitas fibrinolitik yang hampir mirip dengan enzim fibrinolitik komersial, lumbrokinase yang diisolasi dari cacing tanah. Berdasarkan analisis morfologi, biokimia, dan gen penyandi 16S rRNA, satu isolat yang memiliki aktivitas proteolitik dan fibrinolitik tertinggi diidentifikasi sebagai Bacillus subtilis K2. Analisis BLASTn dari sekuens nukleotida menunjukkan homologi sebesar 73.6% dengan gen penyandi enzim pendegradasi fibrin Nattokinase dari Bacillus subtilis subsp. natto yang diisolasi dari kedelai fermentasi di Jepang. Analisis sekuens asam amino putatif melalui Prosite mengindikasikan bahwa Subtilisin K2 tergolong enzim protease serin dengan asam amino aspartat, histidin dan serin yang
Keyword: Bacillus, Bioinformatic, Fibrinolytic, Molecular Docking, Moromi

Judul: Thermal Characteristics and Dynamics of Tropical Cyclone over Western North Pacific Ocean: A Case Study of Typhoon Songda (Chedeng) 2011
Abstrak: The frequent occasion of Tropical Cyclone (TC) over Western North Pacific (WNP) Ocean lies from 10˚N to 26˚N and 121˚E to 170˚E. Sources of TC development come from warm ocean temperature where latent heat is released during condensation processes and subsequently concentrated in the boundary layer. Relative humidity at 850-700 hPa is responsible to produce the most intense storm. Meanwhile, weak vertical wind shear between 850-200 hPa is one of the dynamical factors that lead to the development of TC. Pressure level of 850-200 hPa is chosen to minimize the thermodynamic effect in the lower troposphere. Typhoon Songda (Chedeng in the Philippines) or TSC lasted from May 18th to 30th, 2011 and strengthened into powerful Super Typhoon stage between May 24th and 27th. Long curving track and the exhibition of all sequences of TC life cycle, TSC is then considered as an ideal case of TC. The objective of the study with case of TSC is to investigate the role of thermal characteristics and dynamics on TC intensity. The research is carried out by using Advanced Research of Weather Research and Forecasting model (WRF ARW model) version 3.3. Two domains are employed in the model. The first domain situate from 02˚N to 40˚N and 118˚E to 149˚E and cover spatial resolution () of 33.1 km. The second domain situate from 09˚N to 27˚N and 119˚E to 132˚E with of 11 km. Timestep of the model () is 120 seconds. The model is supported by the following physical parameterization, i.e., Yonsei University Scheme (YSU) in the boundary layer, Kain-Fritsch scheme (KF) in the cumulus, and WRF Single-Moment 3-class scheme in the microphysics. Initial meteorological condition prior to the formation of the cyclone is generated using WRF ARW standard-release model. Sensitivity of the model output is obtained from a selected single-parameter change scenarios, namely, 10 % to 20 % decrease and increase of wind shear initial data at 850-200 hPa, and by 10 % to 20 % decrease of relative humidity initial data at 850-700 hPa. The result showed that the negative correlations between wind shear and intensity are found in wind shear scenarios. Wind shears of 10 ms-1 which lead to strengthening of the wind intensity in the early period of Typhoon development are found in wind shear scenarios. The effect of wind shear changes on wind intensity is statistically significant in the 20 % wind shear scenarios. During mature stage, weak wind intensity occurred when wind shear increase as given in the WRF standard-release and the 20 % decreasing scenario. Different situation is found in the 20 % increasing scenario where wind shear tend to weak and lead to strong wind intensity at this stage. Meanwhile, the reduction of moisture supply at 850-700 hPa resulting from 20 % decreasing relative humidity play a major role in the weakening of wind intensity and reduces mechanical energy of the cycle process as much as 300 J kg-1.
Keyword: