Judul: Pengaruh Dipping Didalam Larutan Formalin Sebagai Pencegahan Parasit IKan Terhadap Daya Tahan Benih Ikan Mas (Cyprinus carpio L.) Dalam Transportasi dan Dalam Pemeliharaan
Abstrak: Percobaan yang dilakukan meliputi tiga fase, yakni Fase 1, Percobaan Fendahuluan; Fase 2, Perlakuan Dipping dalam Larutan Formalin dan Pengangkutan Benih Ikan dalam Kantong Pengangkut; Fase 3, Pemeliharaan/ Pendederan Benih Ikan. Masing-masing fase dilakukan untuk mencari atau mengetahui kepadatan benih ikan mas tertinggi yang bertahan baik dalam kantong pengangkut; membersihkan benih ikan dari parasit dan untuk mengetahui efektifitas dipping terhadap parasit, mortalitas dan pertumbuhan ikannya sendiri. Percobaan dilakukan di Pasar Benih Ikan Cibaraja Kabupaten Sukabumi, pada tanggal 19 September dan 20 September 1978, dan di Laboratorium Fakultas Perikanan Institut Pertanian Bogor pada tanggal 20 September sampai tanggal 22 Oktober 1978. Pemeliharaan benih ikan mas dilakukan dalam bak- bak teraso, Mortalitas benih ikan diamati setiap hari, sedangkan pertumbuhan benih-benih ikan diukur setiap dua minggu sekali. Benih ikan diberi makanan tambahan berupa pellet, sebanyak tiga prosen dari berat total benih ikan. Makanan yang diberikan dibagi tiga bagian yang sama, dengan setiap bagian diberikan jam 07.00, 12.00 dan 17.00. Hasil fase pertama, kepadatan benih ikan mas yang bertahan baik dalam kantong pengangkut adalah 50 ekor benih dalam satu liter air pengangkut. Jumlah tersebut digunakan untuk fase-fase berikutnya. Pada kepadatan 75 ekor tidak terjadi kematian benih ikan, sedangkan pada kepadatan 100 dan 125 ekor per liter air terjadi kematian benih ikan sebanyak 5 ekor dan 20 ekor benih. Mortalitas benih ikan selama pemeliharaan mencapai kisaran antara 92% 100%. Delapan belas hari setelah penebaran telah tercatat kematian benih ikan sebesar 50% dari populasi asal (25 ekor). Pengamatan pada benih ikan yang mati, ternyata jumlah terbesar ikan terserang parasit. Parasit yang paling banyak adalah Dactylogyrus sp kemudian Myxobolus sp, jumlah yang sedikit adalah Ichthiophthirius sp dan yang paling sedikit adalah Trichodina sp.
Keyword: 

Judul: Pengaruh perbedaan penundaan waktu tebar benih ikan mas (Cyprinus carpio L.) di kolam air sumber terhadap infeksi beberapa jenis ektoparasit
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh penggunaan air sumber sebagai media penundaan waktu tebar benih ikan mas (Cyprinus carpio L.) terhadap infeksi bebera- pa jenis ektoparasit. Penelitian dilakukan di Cijeruk dan Instalasi Cibalagung, Balai Penelitian Perikanan Air Tawar, Bogor, dari awal Desember 1987 - awal Februari 1988. Rancangan percobaan yang digunakan adalah Rancangan Acak Lengkap (RAL), dengan tiga perlakuan dan tiga ulangan. Perlakuan yang digunakan adalah perbedaan penundaan waktu tebar benih ikan di kolam air sumber sebelum dipindah ke kolam penularan (kolam air biasa dari aliran sungai) yaitu: K (penundaan di kolam air sumber selama O minggu, benih ikan langsung ditebar ke kolam penularan), W2 (penundaan di kolam air sumber selama 2 minggu), dan W4 (penundaan di kolam air sumber selama 4 minggu). Analisa data dilakukan dengan mem- bandingkan derajad insidensi dan intensitas setiap jenis ektoparasit pada ketiga perlakuan. Ikan yang digunakan adalah benih ikan mas (Cyprinus carpio L.) berumur 7 hari (±1 cm). Wadah penelitian yang digunakan adalah kolam tanah berukuran 2,5 x 2,5 x 1,2 m2 dengan kedalaman air dipertahankan setinggi 0,6 m sebagai kolam penularan, dan kolam semen berukuran 2,5 x 2,0 x 1,1 m³ dengan kedalaman air dipertahankan setinggi 0,75 m sebagai kolam penundaan. Padat penebaran sebanyak 500 ekor per kolam. Pengambilan ikan contoh dilakukan setiap minggu sekali sebanyak 5 ekor setiap ulangan, dan diamati secara mikroskopis. Ektoparasit yang ditemukan menginfeksi benih ikan mas di kolam selama penelitian adalah jenis Trichodina, Dactylogy- rus, Gyrodactylus, Ichthyophthirius dan Lernaea cyprinacea L. Univers Jenis Trichodina ditemukan menginfeksi benih ikan mas di kolam K mulai minggu ke-1, sedangkan di kolam W2 dan W4 ektoparasit ini ditemukan pada benih ikan mulai minggu ke-2. Insidensi dan intensitasnya menunjukkan jumlah rata-rata lebih tinggi terjadi pada benih ikam di kolam K, kemudian diikuti pada benih ikan di kolam W2, dan terendah terjadi pada benih ikan di kolam W4…dst
Keyword: 

Judul: Penyusunan Overlap Graph menggunakan Suffix Tree pada DNA Sequence
Abstrak: The DNA sequence assembly is very important in genome analysis. This step aims to reconstruct contigous DNA fragment (contigs) from short fragment by concatenating fragments based on the overlap region among them. This method employs overlap graph for solving the problems. In this graph, nodes represent fragments and edges represent overlap. This research developed a software for constructing overlap graph using suffix tree. The evaluation was conducted by measuring the number of nodes, number of edges, and the execution time in many values of minimum overlap. The minimum overlap is defined as the minimum length of substring which is considered as the overlap region between two fragments. The evaluation results showed that the number of nodes, the number of edges, and the execution time were increased with the decreasing of the minimum overlap value.
Keyword: