Judul: Dispersion Model 3D of Salinity in the Eastern part of Jakarta Bay
Abstrak: Perairan sisi timur Teluk Jakarta merupakan perairan dangkal yang memperoleh masukan air tawar dari beberapa sungai, dua diantaranya merupakan sungai dengan debit rata-rata tertinggi di Teluk Jakarta. Proses pencampuran massa air tawar dengan massa air laut di wilayah pesisir dapat mengakibatkan perubahan nilai salinitas. Analisis sebaran salinitas dapat digunakan sebagai indikator proses dinamika massa air di suatu perairan. Dinamika air yang terjadi di perairan sisi timur Teluk Jakarta sangat dipengaruhi oleh Angin Muson dan pasang surut (pasut). Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis pola sebaran salinitas di perairan sisi timur Teluk Jakarta pada 4 musim melalui model hidrodinamika 3 dimensi yang didasarkan pada hipotesa bahwa sebaran salinitas dipengaruhi oleh masukan air tawar, pasang surut dan angin. Model numerik 3 dimensi DHI MIKE 3 Flow Model FM digunakan untuk mengkaji sebaran salinitas di perairan sisi timur Teluk Jakarta. Simulasi model salinitas dilakukan pada empat musim, yaitu Musim Barat, Musim Peralihan I, Musim Timur dan Musim Peralihan II. Model tersebut diverifikasi menggunakan data observasi berupa arus, pasut, suhu dan salinitas. Hasil verifikasi model menunjukkan kesesuaian dengan data hasil pengukuran di sisi timur Teluk Jakarta. Pola arus di sisi timur Teluk Jakarta berdasarkan hasil model hidrodinamika bergerak ke arah utara (Musim Barat dan Musim Peralihan II) dan barat (Musim Peralihan I dan Musim Timur) mengikuti pola pergantian musim, dengan kecepatan berkisar antara <0,01 sampai 0,26 m/s. Kecepatan arus akan semakin kuat pada saat arah angin bersesuaian dengan kondisi muka laut, yaitu pada saat pasang di Musim Timur (kecepatan rata-rata 0.05 m/s) dan pada saat surut di Musim Peralihan II (kecepatan rata-rata 0.10 m/s). Hasil simulasi model salinitas menunjukkan bahwa variasi kecepatan angin, pasut, debit sungai dan curah hujan setiap musimnya merupakan faktor penting dalam mengontrol sebaran salinitas di sisi timur Teluk Jakarta. Pada saat debit sungai dan curah hujan meningkat disertai tingginya kecepatan angin (Musim Barat), pola sebaran massa air bersalinitas rendah (isohaline 28 psu) menyebar luas ke arah laut hingga jarak 4.8 km dari garis pantai pada lapisan permukaan. Sementara itu, pada Musim Timur saat debit sungai dan curah hujan menurun, serta rendahnya kecepatan angin, jarak sebaran massa air bersalinitas rendah di lapisan permukaan berkurang (3.0 km dari garis pantai). Sebaran massa air bersalinitas rendah ini dapat menyebar lebih luas ke arah laut pada saat kondisi surut. Hal ini dikarenakan dorongan energi pasut dari laut melemah, sedangkan aliran air tawar dominan. Masukan air tawar dan pencampuran yang disebabkan oleh angin dan pasut juga memainkan peranan penting terhadap struktur vertikal salinitas di sisi timur Teluk Jakarta. Stratifikasi massa air akan meningkat dengan meningkatnya masukan air tawar, kuatnya angin serta melemahnya energi pasut (surut), dan sebaliknya. Stratifikasi massa air (isohaline 1–28 psu) di Musim Barat dan Musim Peralihan I terbentuk pada lapisan permukaan hingga kolom perairan (stratifikasi tinggi) baik pada kondisi pasang maupun surut, masing-masing mencapai ketebalan 4.4 m (pasang) dan 6.2 m (surut) pada Musim Barat serta 2.2 m (pasang) dan 4.2 m (surut) pada Musim Peralihan I. Sementara itu, stratifikasi massa air (isohaline 1–28 psu) di Musim Timur dan Musim Peralihan II pada saat surut terbentuk pada lapisan permukaan hingga kolom perairan (masing-masing mencapai ketebalan
Keyword: massa air bersalinitas rendah, massa air bersalinitas tinggi, model 3D, sebaran salinitas, Teluk Jakarta, high salinity water, Jakarta Bay, low salinity water, model 3D, salinity dispersion model

Judul: Sebaran Konsentrasi Sedimen Tersuspensi di Teluk Jakarta
Abstrak: Jakarta Bay is the estuary for 13 rivers and the flow of water from all these rivers carries sediment from land to water. This will have an impact on the level of turbidity of the waters in Jakarta Bay.The purpose of this study was to determine the flow pattern and distribution of suspended solids in the West and East monsoons in Jakarta Bay in 2019 using numerical modeling and spatial imagery methods. The two-dimensional model development was carried out using MOHID 2016 for 14 days in 2 scenarios, West Season and East Season. The simulation model had an initial value of 45 mg/L. The image used is a Landsat 8 image with a collection time of 29 December 2018 and 25 July 2019. The validation model used the Root Mean Square Error (RMSE) method with a value of 0.0603 for the tides and 0.05 and 0.11 for the zonal- meridional current component. The surface current velocity in Jakarta Bay in the West Season was in the range of 1.03 – 10.75 cm/s while in the East Season it was in the range of 1.35 – 11.53 cm/s. The concentration of suspended sediment in the West Season was around 67 – 249.5 mg/L and in the East Season it had a concentration of 59 – 249.5 mg/L. The distribution of suspended sediment in both the West and East monsoons followed the pattern of surface currents. The model results showed that the highest suspended sediment concentration occured during the West Season. The image results had a higher suspended sediment concentration than the model results., Teluk Jakarta menjadi muara bagi 13 sungai dan aliran air dari seluruh sungai tersebut membawa sedimen dari darat menuju perairan. Hal ini akan berdampak pada tingkat kekeruhan perairan di Teluk Jakarta. Tujuan penelitian ini adalah mengetahui pola arus dan sebaran padatan tersuspensi pada Musim Barat dan Musim Timur di Teluk Jakarta pada tahun 2019 dengan metode pemodelan numerik dan spasial citra. Pembangunan model dua dimensi dilakukan menggunakan MOHID 2016 selama 14 hari dalam 2 skenario yaitu, Musim Barat dan Musim Timur. Simulasi model memiliki nilai awal (initial condition) sebesar 45 mg/L. Citra yang digunakan adalah Citra Landsat 8 dengan waktu pengambilan 29 Desember 2018 dan 25 Juli 2019. Validasi model menggunakan metode Root Mean Square Error (RMSE) dengan nilai 0.0603 untuk pasang surut serta 0.05 dan 0.11 untuk komponen arus zonal-meridional. Kecepatan arus permukaan di Teluk Jakarta pada Musim Barat berada pada rentang 1.03 – 10.75 cm/s sementara pada Musim Timur berada pada rentang 1.35 – 11.53 cm/s. Konsentrasi sedimen tersuspensi pada Musim Barat sekitar 67 – 249.5 mg/L dan pada Musim Timur memiliki konsentrasi sebesar 59 – 249.5 mg/L. Sebaran sedimen tersuspensi baik saat Musim Barat dan Musim Timur mengikuti pola arus permukaan. Hasil model menunjukan bahwa konsentrasi sedimen tersuspensi tertinggi terjadi saat Musim Barat. Hasil citra memiliki konsentrasi sedimen tersuspensi lebih besar dibandingkan dengan hasil model.
Keyword: current, distribution of sediment, Jakarta Bay, Landsat 8 imagery, modelling, suspended sediment

Judul: Penyusunan Overlap Graph menggunakan Suffix Tree pada DNA Sequence
Abstrak: The DNA sequence assembly is very important in genome analysis. This step aims to reconstruct contigous DNA fragment (contigs) from short fragment by concatenating fragments based on the overlap region among them. This method employs overlap graph for solving the problems. In this graph, nodes represent fragments and edges represent overlap. This research developed a software for constructing overlap graph using suffix tree. The evaluation was conducted by measuring the number of nodes, number of edges, and the execution time in many values of minimum overlap. The minimum overlap is defined as the minimum length of substring which is considered as the overlap region between two fragments. The evaluation results showed that the number of nodes, the number of edges, and the execution time were increased with the decreasing of the minimum overlap value.
Keyword: