Judul: Keragaman Genetik Tarum (Indigofera Tinctoria L.) Di Pulau Jawa Dan Madura Sebagai Pewarna Alami Batik Berdasarkan Marka Inter-Simpe Sequence Repeats
Abstrak: Tarum (Indigofera tinctoria L.) merupakan anggota dari suku Fabaceae, yang dimanfaatkan sebagai pewarna indigo alami. Saat ini, tarum telah banyak dimanfaatkan kembali sebagai bahan pewarna alami, baik untuk tekstil maupun kosmetik. Penelitian mengenai marga Indigofera di Indonesia masih terbatas pada eksplorasi jenis dan pemanfaatannya untuk peningkatan produksi pakan ternak maupun kualitas warna pada tekstil. Akan tetapi, penelitian mengenai kajian keragaman genetik marga Indigofera, khususnya jenis I. tinctoria L. belum pernah dilakukan. Penelitian ini dilakukan untuk mempelajari keragaman genetik I. tinctoria L. di pulau Jawa dan Madura sebagai pewarna alami batik berdasarkan marka Inter-Simple Sequence Repeats. Penelitian ini dilaksanakan pada bulan April 2014-April 2015. Pengambilan sampel dilakukan di 6 lokasi yang tersebar di pulau Jawa (Cirebon, Serang, Bantul, Gunung Kidul, Kulonprogo, dan Tuban) dan 4 lokasi di pulau Madura (Bangkalan, Sampang, Pamekasan, dan Sumenep). Bahan tumbuhan yang digunakan adalah daun segar dan sehat yang dimasukkan ke dalam plastik berisi silika gel. DNA diisolasi berdasarkan metode CTAB, kemudian diamplifikasi menggunakan GoTaq® Green PCR Mix dengan 15 primer ISSR. Produk hasil PCR dielektroforesis dan difoto menggunakan GelDoc. Pita polimorfik diskor sebagai data biner. Data disusun dalam matriks dan digunakan untuk menghitung koefisien kemiripan simple matching, mengontruksi PCA, dan dendrogram dengan metode UPGMA menggunakan NTSys-PC versi 2.1.1a. Analisis struktur populasi diakukan menggunakan GenAlex versi 6.501. Kelima belas primer yang digunakan menghasilkan 123 pita dan 84 pita diantaranya bersifat polimorfik. Panjang pita yang dihasilkan berkisar 250-2500 pasang basa dan persentase polimorfisme pita berkisar 50-90% dengan rata-rata 68.3%. Pola pita yang dihasilkan bersifat unik sehingga dapat digunakan untuk pembeda antar aksesi. Analisis gugus mengelompokkan 50 aksesi tarum ke dalam empat kelompok berdasarkan 84 pita polimorfik yakni Kelompok I (Bangkalan, Sampang, Pamekasan, dan Sumenep), II (Tuban), III (Bantul, Gunung Kidul, dan Kulonprogo), dan IV (Cirebon dan Serang). Keragaman genetik tarum di pulau Jawa dan Madura tergolong dalam kategori yang tinggi (68.3%), tetapi variasi molekuler di dalam populasi (37%) lebih kecil dari antar populasi (63%). Nilai keragaman (I) paling tinggi dimiliki oleh populasi yang berasal dari Bantul dan Tuban (I=0.35) sedangkan paling rendah dimiliki oleh populasi yang berasal dari Serang (I=0.06). Berdasarkan hasil yang diperoleh, primer ISSR tidak hanya dapat digunakan untuk mempelajari keragaman genetik, tetapi juga dapat digunakan untuk membedakan setiap aksesi tarum (I. tinctoria L.) di pulau Jawa dan Madura.
Keyword: Indigofera tinctoria, Jawa dan Madura, keragaman genetik, marka ISSR

Judul: Perbedaan Karakter Morfoagronomi Tiga Spesies Indigofera Penghasil Warna Biru Alami
Abstrak: Indigofera merupakan salah satu tumbuhan yang banyak dijumpai di Indonesia. Indigofera sudah dikenal sejak lama sebagai tumbuhan penghasil pewarna indigo yakni warna yang umumnya digunakan dalam industri tekstil, khususnya pewarna batik. Penelitian ini bertujuan menganalisis pertumbuhan dan perbedaan karakter morfologi serta aspek agronomi dari tiga spesies Indigofera spp, yakni I. suffruticosa, I. tinctoria, dan I. arrecta yang berasal dari Jawa dan Sumatera. Penelitian ini menggunakan Rancangan Acak Kelompok (RAK) pada tiga spesies Indigofera menggunakan 10 tanaman untuk pengamatan karakter morfologi: panjang dan lebar daun majemuk, panjang tangkai daun, panjang tandan bunga, panjang tangkai bunga, panjang tangkai perbungaan, jumlah polong dalam tandan, dan panjang polong dan 15 tanaman untuk pengamatan karakter agronomi: tinggi tanaman, jumlah cabang, diameter kanopi, bobot basah daun, umur berbunga, umur bunga, dan umur polong. Ketiga spesies Indigofera spp. mempunyai pertumbuhan sigmoid dan relatif cepat sekitar 3-4 bulan. Pada I. suffruticosa memiliki ciri panjang tandan bunga terpanjang, bentuk cabang monopodial membentuk sudut 50°, dan pertumbuhan bunganya serempak. I. tinctoria memiliki ciri bentuk cabang monopodial membentuk sudut 145º, umur berbunga yang lebih cepat (76 hari), dan pertumbuhan bunga tidak serempak. I. arrecta memiliki ciri umur polong yang lebih cepat, daun yang cepat menguning, dan memiliki pertumbuhan tinggi tanaman tertinggi. Spesies yang lebih unggul dalam produksi daun dengan jumlah yang besar adalah I. tinctoria, sedangkan I. arrecta memiliki ciri umur polong lebih pendek (24 hari).
Keyword: agronomy, growth, Indigofera, indigo, morphology

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: