Judul: Ketahanan Bawang Merah (Allium cepa var Ascalonicum) terhadap Colletotrichum gloeosporioides Penz.
Abstrak: Antraknos merupakan salah satu penyakit utama pada bawang merah (Allium cepa var Ascalonicum) yang disebabkan oleh patogen Colletotrichum gloeosporioides Penz. Penggunaan varietas tahan terhadap penyakit akan mengurangi konsumsi penggunaan bahan kimia pada tanaman sehingga dapat menjaga kelestarian lingkungan. Informasi mengenai varietas bawang merah yang tahan terhadap penyakit antraknos masih terbatas sehingga dibutuhkan skrening keparahan penyakit. Kemampuan tanaman untuk merespon serangan patogen perlu diperhatikan. Respon ketahanan yang bersifat konstitutif akan membuat tanaman selalu melakukan mekanisme pertahanan diri walaupun disaat tanaman dalam kondisi sehat. Hal ini dapat mengurangi hasil produksi tanaman tersebut. Sedangkan respon ketahanan yang bersifat inducible akan sangat menguntungkan, karena respon tersebut hanya aktif saat muncul serangan patogen dan mengakibatkan hasil produksi tanaman tetap optimal. Tujuan dari penelitian ini adalah mendapatkan nformasi tentang korelasi senyawa metabolit sekunder dan karakter anatomi daun yang terkait dengan ketahanan patogen Colletotrichum gloeosporioides pada tanaman bawang merah (Allium cepa var ascalonicum) Penelitian ini terdiri dari tiga sub percobaan. Percobaan pertama adalah skrining ketahanan tanaman bawang merah terhadap Colletotrichum gloeosporioides yang dilakukan pada bulan Agustus 2017 sampai bulan Januari 2018 di Rumah kaca Cikabayan dan Laboratorium Klinik Tanaman, Departemen Proteksi Tanaman Fakultas Pertanian, IPB. Percobaan ini menggunakan 14 aksesi bawang merah yang terdiri dari Bima Brebes, Biru Lancor, Manjung, Super Philip, Trisula, Tajuk, Kramat-2, Bauji, Bali Karet, Maja Cipanas, Mentes, Pikatan, Pancasona dan Rubaru. Perkembangan gejala ditaksir merujuk pada metode Galvan et al (1997). Data yang didapat akan dianalisis ANOVA menggunakan aplikasi SAS versi 9.1.3 dan uji lanjut menggunakan uji BNJ. Hasil penelitian menyatakan bahwa Rubaru merupakan varietas yang paling tahan terhadap C. gloeosporioides Penz dengan nilai keparahan penyakit sebesar 30% dan varietas Biru Lancor merupakan varietas yang paling rentan terhadap C. gloeosporioides Penz dengan nilai keparahan penyakit sebesar 95%. Percobaan kedua adalah identifikasi karakter anatomi daun bawang merah terhadap C gloeosporioides. Percobaan ini dilaksanakan pada bulan November 2017 di Laboratorium Mikroteknik, Departemen Agronomi dan Hortikultura, Fakultas Pertanian, IPB. Percobaan ini menggunakan 3 varietas bawang merah yakni Biru Lancor dan Super Philip (rentan), serta Rubaru (tahan). Penelitian ini disusun menggunakan rancangan acak kelompok dengan 2 faktor, yakni faktor genotipe dan perlakuan infeksi patogen. Data yang didapat akan dianalisis sidik ragam ANOVA menggunakan aplikasi SAS versi 9.1.3 dan uji lanjut menggunakan uji Duncan, selanjutnya dilakukan analisis korelasi spearman menggunakan aplikasi SAS versi 9.1.3. Hasil penelitian menunjukkan bahwa jaringan palisade merupakan karakter yang terkait dengan ketahanan bawang merah terhadap C. gloeosporioides. Karakter ketahanan tersebut mengalami peningkatan ketebalan tertinggi pada varietas Rubaru saat terserang patogen C. gloeosporioides. Percobaan ketiga adalah identifikasi metabolit sekunder bawang merah terhadap C gloeosporioides. Percobaan ini dilaksanakan pada bulan November 2017 di Laboratorium Kimia Terpadu Pusat Penelitian dan Pengembangan Hutan Bogor dengan menggunakan dua varietas bawang merah yakni Biru Lancor dan Rubaru. Percobaan ini disusun menggunakan rancangan tersarang dengan dua faktor, yakni factor genotype dan perlakuan infeksi patogen. Data yang didapat akan dianalisis sidik ragam ANOVA menggunakan aplikasi SAS versi 9.1.3 dan data disajikan dalam bentuk bagan histogram. Hasil penelitian menunjukkan bahwa carbamic acid merupakan senyawa elicitor pada jalur transduksi jasmonic acid dan menginduksi respon ketahanan bawang merah terhadap C. gloeosporioides.
Keyword: carbamic acid, mekanisme ketahanan, elicitor, jaringan palisade, skrining

Judul: Isolasi dan Karakterisasi Bakteri Pengendali Cendawan Patogen Colletotrichum sp. pada Tanaman Bawang Merah (Allium cepa L.).
Abstrak: Salah satu masalah dalam pertanian bawang merah (Allium cepa L.) ialah munculnya penyakit antraknosa, yang disebabkan oleh cendawan patogen Colletotrichum sp. Selama ini cendawan patogen dikendalikan dengan menyemprotkan fungisida sintetik. Penggunaan fungisida menimbulkan dampak negatif pada organisme lain dan lingkungan. Dampak negatif dari penggunaan fungisida yang berlebihan, dapat dikurangi dengan penggunaan agen biokontrol seperti bakteri endofit dan bakteri tanah yang mampu menghambat pertumbuhan cendawan patogen. Tujuan dari penelitian ini ialah mengisolasi bakteri endofit dan bakteri rizosfer dari tanaman bawang merah, serta menguji kemampuan bakteri dalam menghambat pertumbuhan cendawan patogen Colletotrichum sp. Sebanyak 40 isolat bakteri endofit dan 16 isolat bakteri rizosfer berhasil diisolasi dari tanaman bawang merah asal Brebes, Jawa Tengah. Hasil uji antagonis menunjukkan enam isolat mampu menghambat pertumbuhan cendawan Colletotrichum sp. dengan persentase daya hambat pada skala 3 (60-75 %). Sebanyak 4 dari 6 isolat potensial yaitu ABS4.1.2, ABP5.1.3, BBP5.2.1, dan ABP5.2.2, memiliki karakteristik morfologi dan mikroskopis yang berbeda. Hasil uji hipersensitivitas menunjukkan bahwa isolat bakteri endofit tidak bersifat patogen terhadap tanaman. Dua dari enam isolat bakteri endofit yaitu BBP5.2.1 dan DBP4.1.2, menunjukkan reaksi negatif dalam uji hemolisin. Hasil ini menunjukkan bahwa isolat bakteri BBP5.2.1 dan DBP4.1.2 tidak bersifat patogen pada mamalia termasuk manusia. Berdasarkan semua hasil pengujian, diperoleh satu isolat endofit BBP5.2.1 memiliki penghambatan pertumbuhan cendawan patogen terbaik dan tidak bersifat patogen pada tanaman dan mamalia.
Keyword: antagonis, cendawan patogen, persentase daya hambat, uji hemolisin, uji hipersensitivitas

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: