Judul: Keragaman gen Toll-Like Receptor4 pada ayam lokal dan persilangan kampung - broiler
Abstrak: Ayam kampung merupakan salah satu ayam lokal Indonesia yang telah terkenal dengan kelezatan dan ketahanannya terhadap penyakit, terutama tahan terhadap Salmonella. Salah satu penciri genetik ketahanan ayam pada bakteri ini adalah gen Toll-like Receptor 4 (TLR4). TLR4 (toll-like receptor 4) merupakan gen pengkode protein TLR4 yang mengontrol sinyal imun non spesifik sebagai pertahanan pertama terhadap serangan bakteri S. entiritidis. Tujuan penelitian ini adalah mengidentifikasi keragaman gen TLR4 pada ayam lokal Indonesia dan persilangannya (kampung, broiler, KB, KBKB, BK, kapas, sentul, dan merawang). Gen TLR4 berhasil digenotyping pada 214 ayam dengan teknik PIRA-PCR. Genotyping dilakukan pada exon 2 dengan panjang produk 220 bp. Enzim restriksi MscI memotong produk PCR dengan panjang fragmen 196 bp dan 24 bp, diperoleh dua alel (G dan A), dan tiga genotipe (GG, AG, dan AA). Hasil penelitian menunjukkan bahwa ayam KBKB, KB, kampung, merawang, dan sentul bersifat polimorfik (0.05-0.33). Ayam broiler, BK, dan kapas bersifat monomorfik. Keragaman tertinggi ditunjukkan oleh rumpun ayam lokal yaitu kampung, merawang, dan sentul. Nilai PIC tertinggi berada pada ayam lokal (ayam kampung) dengan kategori sedang (0.40). Kata kunci : ayam lokal, genotyping, keragaman, TLR4
Keyword: Genotyping, Local chicken, Polymorphism, TLR4, Salmonella e., Protein coding gene, Immue system, Monomerphics, Heterozygosity

Judul: Identifikasi Keragaman Gen Insulin-Like Growth Factor- I Receptor (IGF-IR|AluI) pada Ayam Lokal dengan Metode PCR-RFLP.
Abstrak: Gen Insulin-Like Growth Factor-I Receptor (IGF-IR) adalah gen yang berperan penting dalam pertumbuhan, sifat karkas, dan kualitas daging terutama pada ayam. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi keragaman gen IGFIR dengan menggunakan enzim retriksi AluI melalui metode PCR-RFLP pada beberapa ayam lokal indonesia. Sampel yang digunakan pada penelitian ini sebanyak 198 ekor ayam lokal indonesia, yang terdiri atas 69 ekor ayam kampung ciawi, 56 ekor ayam kampung sukabumi, 25 ekor ayam merawang, 23 ekor ayam pelung, dan 25 ekor ayam sentul. Panjang produk hasil PCR adalah 351 bp. Hasil genotyping menghasilkan 2 genotipe, yaitu AG (351 pb, 92 pb, dan 259 pb), dan GG (92 pb dan 259 pb). Frekuensi genotip AG (0.556) memiliki nilai yang paling tinggi dibandingkan dengan genotip GG (0.444). Sehingga frekuensi alel G (0.72) lebih tinggi dibandingkan frekuensi alel A (0.28). Populasi ayam kampung sukabumi dan ayam kampung ciawi berada pada keadaan keseimbangan Hardy- Weinberg. Nilai heterozigositas pengamatannya lebih tinggi dari pada nilai heterozigositas harapan (Ho>He). Disimpulkan bahwa gen IGF-IR pada ayam lokal Indonesia bersifat polimorfik.
Keyword: ayam lokal Indonesia, Gen IGF-IR, PCR-RFLP, polimorfik

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: