Judul: Deteksi Dan Identifikasi Pepper Vein Yellows Virus Penyebab Penyakit Kuning Pada Tanaman Mentimun Di Jawa Barat
Abstrak: Survei pada pertanaman mentimun di daerah Jawa Barat dilaporkan adanya gejala menguning dan vein banding. Gejala ini mirip dengan gejala penyakit klorosis pada cabai yang telah dilaporkan di Bali. Penyakit tersebut diketahui diinduksi oleh Pepper vein yellows virus (PeVYV; Polerovirus), yang diketahui memiliki inang yang terbatas pada tanaman cabai. Penelitian ini bertujuan untuk mendeteksi dan mengidentifikasi virus yang berasosiasi dengan penyakit kuning pada tanaman mentimun melalui reverse transcriptionpolymerase chain reaction (RT-PCR) dan analisis sikuen nukleotida. RT-PCR menggunakan sepasang primer spesifik yang mengamplifikasi gen protein selubung PeVYV berhasil mengamplifikasi fragmen DNA berukuran 650 pb. Analisis sikuen nukleotida dari produk RT-PCR menunjukkan bahwa isolat virus penyebab penyakit kuning adalah PeVYV. Penelitian ini merupakan laporan pertama infeksi PeVYV pada tanaman lain selain cabai.
Keyword: Laporan pertama, Polerovirus, reverse transcription-polymerase chain reaction, sikuen nukleotida

Judul: Deteksi Virus Pada Pertanaman Mentimun (Cucumis Sativus L.) Di Tiga Kabupaten Bogor, Karawang, Dan Subang, Jawa Barat
Abstrak: Penyakit virus banyak ditemukan pada pertanaman mentimun di Jawa Barat. Namun sulit membedakan spesies virus penyebab penyakit berdasarkan pengamatan gejala. Penelitian ini bertujuan untuk memperbaharui informasi data virus yang menginfeksi tanaman mentimun di Kabupaten Bogor, Karawang, dan Subang, provinsi Jawa Barat. Sampel daun mentimun diambil dari tanaman bergejala sebanyak 50 sampel tiap lokasi. Insidensi penyakit virus ditentukan secara serologi dengan metode dot blot immunobinding assay (DIBA) menggunakan antiserum Cucurbit aphid yellow borne virus (CABYV), Cucumber green mottle mosaic virus (CGMMV), Cucumber mosaic virus (CMV), Papaya ringspot virus (PRSV), Squash mosaic virus (SqMV), Watermelon mosaic virus (WMV), dan Zucchini yellow mosaic virus (ZYMV). Deteksi asam nukleat dengan reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR/PCR) dilakukan terhadap virus baru yang dominan ditemukan dan yang tidak terdeteksi serologi. Gejala yang ditemukan pada daun mentimun berupa mosaik, klorosis, keriting, dan penebalan tulang daun. Hasil deteksi menunjukkan insidensi penyakit oleh CABYV, CGMMV, CMV, PRSV, SqMV, WMV, dan ZYMV di Bogor berturut-turut adalah 100%, 86%, 98%, 0%, 8%, 32%, dan 6%, di Karawang 100%, 98%, 100%, 14%, 72%, 68%, dan 64%, dan di Subang 100%, 88%, 86%, 2%, 8%, 60%, dan 46%. CABYV, CGMMV, dan CMV merupakan virus yang dominan terdeteksi di tiga kabupaten dan PRSV hanya terdeteksi pada sampel asal Karawang dan Subang. RT-PCR menggunakan primer spesifik PRSV, primer universal Polerovirus dan Begomovirus berhasil mengamplifikasi gen protein selubung PRSV asal Karawang berukuran ~ 470 pb dan Polerovirus asal Subang berukuran ~ 450 pb, dan Begomovirus berukuran ~ 900 pb. WMV dan CGMMV perlu deteksi lebih lanjut menggunakan primer spesifik untuk konfirmasi hasil deteksi serologi. Polerovirus dan CGMMV merupakan virus yang baru ditemukan pada mentimun di Jawa Barat.
Keyword: Begomovirus, CGMMV, mentimun, Polerovirus, PRSV

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: