Judul: Simulasi perhitungan gaya apung dan gaya tenggelam rumpon laut dalam di Perairan Selatan Palabuhanratu Kabupaten Sukabumi
Abstrak: Rumpon atau Fish Aggregating Device (FAD), merupakan alat bantu penangkapan yang berfungsi untuk memikat ikan agar berkumpul dalam wilayah penangkapan di sekitar rumpon tersebut dipasang. Penelitian dan informasi mengenai desain konstruksi rumpon masih terbatas, khususnya rumpon laut dalam di perairan selatan palabuhanratu kabupaten sukabumi. Selain itu, belum ada perangkat lunak yang dapat menghitung nilai buoyancy force dari rumpon. Tujuan dari penelitian ini adalah mendeskripsikan rumpon laut dalam, meliputi komponen dan material rumpon, menghitung buoyancy force, sinking force, dan extra buoyancy pada rumpon dengan asumsi arus perairan tidak mempengaruhi, dan membuat suatu perangkat lunak sederhana untuk menghitung nilai buoyancy force, sinking force, dan extra buoyancy dengan menggunakan perangkat lunak Borland Delphi 7. Metode penelitian yang digunakan adalah metode deskriptif. Data yang diamati adalah data tebal, panjang, diameter, lebar, tinggi kerucut ponton, dan jumlah. Sedangkan jenis perhitungan yang dilakukan antara lain perhitungan massa, volume, massa jenis, buoyancy force, sinking force, total buoyancy force, total sinking force, serta extra buoyancy. Rumpon laut dalam di perairan selatan Palabuhanratu memiliki konstruksi yang terdiri dari ponton berlapis fiber dan memiliki 2 buah sekat dan ruang pada ponton diisi sterofoam, 4 buah swivel, tali utama sepanjang 68 gulung, 9 buah hillban berlapis karung, 21 pemberat utama dengan massa per pemberat mencapai 75 kg, 25 atraktor daun kelapa, dan komponen lain seperti tali rafia, selang plastik, serta waring dan pemberat atraktor berupa sebuah batu bata. Rumpon di perairan Palabuhanratu memiliki nilai total buoyancy force sebesar 2.074,87 kg, nilai total sinking force sebesar 1.131,03 kg dan nilai extra buoyancy sebesar 45,49% atau 943,84 kg. Hasil perhitungan yang dilakukan secara manual dibandingkan dengan hasil perhitungan menggunakan aplikasi SoFAD (Software of Fish Aggregating Device), hasil perhitungan memiliki nilai yang persis sama. Dengan demikian aplikasi SoFAD dapat digunakan untuk menghitung nilai buoyancy force, sinking force, dan extra buoyancy komponen rumpon.
Keyword: 

Judul: Rancang Bangun Rumpon Hidup (Bio Fad) Dan Uji Efektivitas Serta Keramahan Lingkungan Secara Spasial Dan Temporal Di Perairan Pesisir Uloulo Kabupaten Luwu
Abstrak: Rumput laut yang dibudidayakan nelayan di perairan pesisir Uloulo Kabupaten Luwu mengalami perkembangan cukup cepat khususnya sejak sepuluh tahun terakhir. Namun seiring dengan perkembangannya, muncul masalah baru yaitu kematian massal juvenil ikan pada saat nelayan memanen rumput laut dan penurunan produksi rumput laut akibat serangan hama. Kedua masalah tersebut jika dikelola dengan tepat justru dapat mendatangkan keuntungan, baik secara ekologis maupun secara ekonomis. Pemanfaatan juvenil dan ikan dewasa di area budidaya rumput laut membutuhkan teknologi yang mampu memikat ukuran ikan yang berbeda. Teknologi yang tepat untuk digunakan adalah rumpon. Informasi mengenai rumpon yang efektif dioperasikan di area budidaya rumput laut masih kurang. Penelitian ini bertujuan yaitu: 1) merancang rumpon yang mampu menarik juvenil dan ikan dewasa agar mudah ditangkap serta dapat dioperasikan di sekitar area budidaya rumput laut; 2) menganalisis struktur komunitas ikan hasil tangkapan di rumpon hidup secara spasial dan temporal; 3) menganalisis sebaran hasil tangkapan dan variasi ukuran ikan baronang lingkis (Siganus canaliculatus) secara spasial dan temporal, dan 4) menentukan jenis rumpon hidup yang efektif dan ramah lingkungan, apakah rumpon yang menggunakan atraktor cottonii (RC) atau gracillaria (RG). Penelitian ini dilaksanakan dalam dua tahap yaitu tahap pertama merancang atau mendesain rumpon hidup pada bulan Juni-Agustus 2014 dan tahap kedua pemasangan rumpon di lokasi penelitian serta pengambilan sampel dari bulan September - Desember 2014 dan Januari-Agustus 2015, untuk menguji efektivitas dan keramahan lingkungan rumpon hidup secara spasial dan temporal di perairan pesisir Uloulo Kabupaten Luwu. Penelitian ini menggunakan metode eksprimen penangkapan ikan (experimental fishing). Pengambilan sampel ikan pada rumpon hidup dengan menggunakan serok melalui beberapa tahapan yaitu; 1) sampling dilakukan oleh dua orang kemudian secara bersamaan menyelam di samping (sisi) rumpon, 2) setelah sampai di ujung bawah rumpon, selanjutnya rumpon dimasukkan kedalam serok dengan cara menyarungi, 3) setelah rumpon benar-benar sudah sepenuhnya berada dalam serok kemudian serok ditarik ke atas perahu bersama dengan rumpon, 4) rumpon digoyang-goyang agar seluruh ikan yang terkumpul di rumpon masuk ke serok, 5) serok dilepaskan dari rumpon kemudian ikan yang tertangkap dikumpulkan di wadah, lalu dihitung berdasarkan jenis, diukur panjang total setiap jenis ikan, berdasarkan rumpon dan habitat (stasiun). Data dianalisis menggunakan statistik multivarian dengan bantuan perangkat lunak (software) PRIMER versi 5.2 (Plymouth Routines In Multivariate Ecological Research). Perancangan rumpon hidup menghasilkan protipe rumpon hidup berbentuk silinder. Rumpon hasil rancangan terdiri atas pelampung (float), badan (body), tali-temali, atraktor dari dua jenis rumput laut, pemberat (sinker) rumpon dan pemberat jangkar. Terdapat perbedaan total gaya apung, total gaya tenggelam dan extra buoyancy rumpon hidup pada air tawar dan air laut. Total gaya apung rumpon hidup di air tawar sebesar 274,378,00 gram, total gaya tenggelam sebesar -175,518,00 gram, dan extra buoyancy sebesar 81%. Selanjutnya total gaya apung rumpon hidup setelah diuji di air laut diperoleh total gaya apung sebesar 281,237,45gram, total gaya tenggelam -6,859,45gram dan extra buoyancy sebesar 98%. Total gaya tenggelam komponen-komponen yang bekerja pada rumpon hidup jauh lebih kecil dari total gaya apung pelampung di air tawar , begitu pula pada air laut Berdasarkan nilai tersebut di atas maka dapat dipastikan bahwa pelampung dapat mengapung dengan baik. Gaya apung tambahan rumpon hidup digunakan untuk mengimbangi berat tambahan
Keyword: Bio FAD, efektif, experimental fishing, ramah lingkungan dan Siganus canaliculatus

Judul: Characterization and Expression of Tomato infectious chlorosis virus Coat Protein Gene in Escherichia coli
Abstrak: Tomato infectious chlorosis virus (TICV) is a member of Crinivirus genus. TICV infects tomato crop in Garut and Cipanas, West Java Indonesia. Tomato initially showed bright interveinal yellowing symptoms. The coat protein gene (CP-TICV) was amplified by RT-PCR from total RNA extracted from infected tomato leaves and the amplified fragment was cloned and completely sequenced. The fragment was subsequently subcloned into the pET-21b expression vector. The recombinant plasmid was transformed to Escherichia coli strain BL21(DE3)pLysS to express the coat protein. The coat protein fused to a 6xhistag, was purified by affinity chromatography using a NiNTA spin column. The identity of the purified protein was confirmed by SDS-PAGE. In this experiment, 792 bp of CP-TICV gene of TICV virus has been successfully cloned, sequenced, and expressed in E. coli. Based on nucleotide sequences alignment analysis, TICV-Indonesia strain showed 100% identity to TICV –Spain strain and 99% identity to North America, France, and California strains and based on amino acid sequences alignment analysis, TICV-Indonesia strain showed 100% identity to TICV –Spain, North America, France strains and 99.2% identity to California strain. CP-TICV showed over expressed in E. coli when it is induced with 1 mM IPTG and incubated at 37oC. Purified CP-TICV-Histag recombinants protein sized 29 kDa based on SDSPAGE analysis.
Keyword: