Judul: Evaluasi Penggunaan CpG DNA dalam Meningkatkan Ekspresi Gen Imun pada Ikan Kerapu Macan (Epinephelus fuscoguttatus)
Abstrak: Unmethylated Cystidine Phosphate Guanosine Oligodeoxynucleotides (CpG DNA) merupakan salah satu jenis imunostimulan berupa DNA sintetik yang mengandung CpG motif yang terdiri dari sekuens pendek yang mengandung satu atau lebih motif CpG dan berperan sebagai ”danger signal” terhadap sistem kekebalan imun natural maupun bawaan. Tujuan penelitian ini adalah menganalisis kemampuan CpG DNA untuk meningkatkan ekspresi gen Interleukin 1β (IL1β), Cyclooxygenase 2 (COX-2) dan Tumour Necrosis Factor (TNF-α1) pada ikan kerapu macan agar dapat dijadikan sebagai imunostimulan maupun adjuvan vaksin. Analisis tingkat ekspresi gen dilakukan dengan mengekstrak RNA organ Head Kidney (kepala ginjal) dengan perlakuan CpG DNA dan perlakuan PBS sebagai kontrol. Sintesis DNA komplementer (cDNA) dilakukan menggunakan kit Ready To Go You Prime First Strand Beads (GE Healthcare) dengan teknik RT-PCR. Produk PCR yang dihasilkan kemudian di analisis dengan mengukur nilai luminescence photostimulated menggunakan software UN SCAN IT berdasarkan pola (ketebalan fragmen DNA). Hasil yang diperoleh dalam penelitian ini adalah tingkat ekspresi gen serta nilai luminescence photostimulated dari gen IL1β dan gen COX-2 pada perlakuan CpG DNA lebih tinggi dibanding pada perlakuan PBS sebagai kontrol sedangkan tingkat ekspresi gen TNF-α1 pada perlakuan CpG DNA dan perlakuan PBS sebagai kontrol hampir sama walaupun perbedaannya tidak begitu signifikan. Nilai luminescence photostimulated gen IL1β perlakuan CpG DNA yaitu 113684 dan pada perlakuan PBS sebagai kontrol 95610, gen COX-2 perlakuan CpG DNA yaitu 107592 dan pada perlakuan PBS sebagai kontrol 89207 serta gen TNF-α1 perlakuan CpG DNA yaitu 54818 dan pada perlakuan PBS sebagai kontrol 52062.
Keyword: Epinephelus fuscoguttatus, imunostimulan, CpG DNA, ekspresi gen

Judul: Uji aktivitas promoter melalui injeksi secara intramuskular pada ikan mas Cyprinus carpio
Abstrak: Ikan mas Cyprinus carpio merupakan jenis ikan konsumsi air tawar yang sangat populer di Indonesia, khususnya Jawa Barat. Terjadinya wabah koi herpesvirus (KHV) pada budidaya ikan mas dan koi di Indonesia telah mengakibatkan kematian massal. Salah satu langkah pencegahan yang bisa dilakukan adalah dengan vaksinasi menggunakan vaksin DNA. Vaksin DNA adalah vaksin yang berbentuk plasmid DNA yang mengandung sisipan gen imunogenik, misalnya glikoprotein, yang diapit oleh sebuah promoter dan terminator/poliadenilasi. Promoter adalah bagian dari DNA yang merupakan tempat RNA polimerase menempel dan menginisiasi transkripsi, menentukan waktu, tingkat dan tempat ekspresi gen. Dengan demikian, tingkat ekspresi gen imunogenik yang digunakan sebagai vaksin sangat ditentukan oleh promoter yang mengendalikannya. Pada penelitian ini, sebagai langkah awal pengembangan vaksin DNA, dilakukan pengujian aktivitas promoter heat shock, keratin dan β- aktin pada ikan mas yang diinjeksi dengan plasmid yang mengandung gen GFP. Aktivitas promoter tersebut diketahui dengan menganalisis ekspresi gen GFP menggunakan metode PCR dengan cDNA cetakan yang telah disintesis dari mRNA hasil ekstraksi dari beberapa organ dan dengan menggunakan mikroskop fluoresensi. Hasil PCR dengan cetakan cDNA setelah 24 jam dan 1 minggu injeksi menunjukkan bahwa gen GFP terekspresi pada jaringan ginjal, insang, limpa, dan otot yang diperlihatkan dengan keberadaan pita DNA yang sejajar dengan pita DNA kontrol positif. Tingkat ekspresi gen GFP berbeda antara 24 jam dan 1 minggu pasca injeksi (p.i). Pada 24 jam p.i, gen GFP diekspresikan pada semua jaringan dengan menggunakan heat shock-GFP, keratin-GFP, dan β-aktin-GFP, yang ditandai dengan adanya pita DNA produk PCR. Ekspresi gen GFP yang lebih tinggi terdapat pada jaringan otot dibandingkan jaringan lainnya untuk perlakuan keratin-GFP dan β-aktin-GFP. Pada 1 minggu p.i, ekspresi gen GFP menurun yang ditandai dengan intensitas/ketebalan pita DNA produk PCR menurun pada beberapa jaringan. Dengan menggunakan mikroskop fluoresensi, ekspresi gen GFP mulai muncul 8 jam p.i. Ekspresi GFP terdapat pada jaringan ginjal, insang, limpa, dan otot hasil injeksi dengan ketiga konstruksi yang diuji. Tingkat ekspresi GFP setelah 24 jam injeksi mengalami peningkatan bila dibandingkan setelah 8 jam injeksi. Ekspresi GFP mulai melemah ketika 1 minggu p.i. Pengamatan GFP menggunakan mikroskop fluoresensi dilakukan hingga 2 bulan dan diperoleh hasil bahwa ekspresi pada beberapa jaringan semakin melemah, tetapi masih ditemukan pendaran kurang terang pada jaringan otot untuk semua promoter yang diuji. Promoter heat shock, keratin, dan β-aktin bersifat aktif pada ikan mas Cyprinus carpio. Berdasarkan tingkat dan lama waktu ekspresi gen, diduga bahwa promoter keratin lebih baik dalam mengendalikan gen imunogenik dalam pencegahan infeksi virus KHV pada ikan mas.
Keyword: 

Judul: Scheduling of the South American Zone of 2014 FIFA World Cup Qualification.
Abstrak: Dalam kompetisi sepak bola terdapat perangkat-perangkat yang penting dalam penyelenggaraannya. Salah satunya adalah jadwal pertandingan. Penyusunan jadwal pertandingan harus dilakukan dengan hati-hati dan penuh dengan pertimbangan agar pertandingan sepak bola dapat berjalan dengan lancar. Babak kualifikasi Piala Dunia FIFA 2014 Zona Amerika Selatan melibatkan 10 tim nasional yang tergabung dalam satu grup dengan setiap negara memiliki satu stadion yang digunakan dalam setiap periode waktu. Tim-tim dalam zona ini dikelompokkan berdasarkan karakteristik yang dimiliki yaitu tim kuat, tim paling populer, tim populer, dan tim tidak populer. Tujuan karya tulis ini ialah membuat jadwal pertandingan yang memenuhi beberapa preferensi, seperti setiap tim harus bertanding dua kali dengan tim lain sebagai tuan rumah dan tamu di setiap paruh kompetisi, pertandingan klasik antara tim kuat dan popular harus dimainkan di pekan ke-3, 5, dan 7, serta setiap tim sebanyak-banyaknya bertanding dua kali berturut-turut sebagai tuan rumah ataukah tamu. Masalah penjadwalan ini dimodelkan dalam
Keyword: