Judul: Virtual Screening of Active Compounds of Medicinal Plants with Antimalarial Potential: Molecular Docking to PfENR Proteins
Abstrak: Malaria adalah penyakit menular global yang menyerang ratusan juta orang setiap tahun. Penyakit ini disebabkan oleh parasit (protozoa) dan ditularkan melalui nyamuk Anopheles. Terdapat enam spesies plasmodium yang menularkan malaria pada manusia, dan yang paling banyak menyebabkan kematian adalah Plasmodium falciparum. Pengembangan obat antimalaria telah dilakukan sejak lama. Namun Plasmodium falciparum memiliki kemampuan untuk beradapatasi terhadap obat sehingga menyebabkan resistensi obat yang ada. Oleh karena itu perlu dilakukan kombinasi pencarian obat dan target baru. Penelitian ini melakukan penambatan molekuler (molecular docking) terhadap 161 ligan tanaman dengan reseptor berupa protein Plasmodium falciparum Enyl-Acyl Carrier Protein Reductase (PfENR). ENR adalah enzim yang berperan dalam biosintesis asam lemak lemak tipe II yang merupakan komponen utama dalam dinding sel mikroba. Dari 161 ligan yang ditambatkan, diperoleh 18 ligan alami dengan nilai energi afinitas yang paling negatif dari rentang -10,00 kkal/mol hingga -12,56 kkal/mol dan dinyatakan lulus uji Lipinski. Interaksi antara liganprotein juga dianalisis berupa interaksi ikatan hidrogen dan hidrofobik, dimana interaksi ini berpengaruh terhadap nilai afinitas pengikatan dan memberi informasi terkait sisi aktif protein.
Keyword: energy afinitas ikatan, interaksi ligan-protein, penambatan molekul, Plasmodium falciparum

Judul: Virtual Screening Senyawa Obat Antimalaria dengan Target PfODC Berbasis Energi Ikat.
Abstrak: Malaria merupakan salah satu dari masalah kesehatan utama di seluruh dunia. Ada beberapa metode yang digunakan dalam menanggulangi malaria, diantaranya adalah pengendalian vektor nyamuk, penggunaan kelambu, dan vaksin. Saat ini, penggunaan obat dibutuhkan dalam pengendalian malaria. Pada penelitian ini dilakukan penambatan dan simulasi dinamika molekul antara Plasmodium falciparum orotidin 5'-monofosfat dekarboksilase (PfODC) dengan senyawa alami dari berbagai tanaman. Hasil simulasi dinamika molekul menunjukkan bahwa senyawa strychnopentamine memilki potensi sebagai inhibitor dengan nilai energi bebas ikat sebesar -64.7 kkal mol-1 dan kestabilan yang baik berdasarkan nilai RMSD, RMSF, dan jari-jari girasi dalam rentang waktu 100 ns.
Keyword: orotidin 5’-monofosfat dekarboksilase, penambatan molekul, simulasi dinamika molekul, energi ikat

Judul: Bifurkasi Hopf pada Model Siklus Bisnis Kaldor Kalecki tanpa dan dengan Waktu Tunda
Abstrak: Business cycle model is one of dynamical system models in economic. One of the business cycles model is Kaldor-Kalecki model. Kaldor-Kalecki business cycle model that is written in delayed defferential equations, is a business cycle model that involves gross product and capital stock of a company. In this paper Kaldor-Kalecki business cycle model is analyzed using both nondelay and delay in time of capital stock. By Taylor expansion for the time delayed model, an analysis of stability around the fixed points has been done. Furthermore, by using Hopf bifurcation theorem, it can be shown that there exists periodic orbits and limit cycle. In the nondelayed model, changing the parameter of goods market could lead to the occurrence of Hopf bifurcation and the existence of limit cycle. Similarly, for the delayed model, it has been shown that changing the time delay parameter may result in the occurrence of Hopf bifurcation and limit cycle.
Keyword: