Judul: Optimasi Agitasi Dan Aerasi Pada Produksi Xilanase Bacillus Halodurans Cm1 Dengan Metode Permukaan Respon
Abstrak: Xilanase merupakan enzim ekstra seluler yang dapat menghidrolisis xilan (hemiselulosa) menjadi xilosa dan xilooligosakarida. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan kondisi optimum produksi xilanase Bacillus halodurans CM1 dengan menggunakan pendekatan statistik menggunakan metode permukaan respon serta mendapatkan model persamaan kondisi optimum tersebut. Variabel yang digunakan dalam penelitian ini adalah laju aerasi (X1) dan laju agitasi (X2). Desain dua level faktorial menunjukkan bahwa laju agitasi dan aerasi merupakan faktor yang mempengaruhi produksi xilanase, sehingga kemudian dilakukan optimasi dengan menggunakan rancangan komposit terpusat (CCD). Sebanyak 13 percobaan CCD dilakukan dengan menggunakan berbagai variasi agitasi dan aerasi pada fermentor 10 liter dengan volume kerja 8 liter. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa kecepatan agitasi dan interaksi antara kecepatan agitasi dan laju aerasi bersifat signifikan. Model ini dapat digunakan untuk menavigasi desain ruang. Konsentrasi batas atas dan batas bawah agitasi yang diamati adalah 150; 270 (rpm) dan aerasi adalah 0.51; 1.48 (vvm). Model persamaan optimasi aktivitas xilanase berdasarkan hasil penelitian yaitu Y= 344.18 – 37.19X1 + 249.21X2 – 94.48X1X2. Kecepatan agitasi dan laju aerasi yang optimum untuk produksi xilanase adalah 0.67 vvm dan 249.87 rpm. Kondisi ini diuji dan divalidasi secara eksperimental dengan hasil perkiraan aktivitas xilanase secara teoritis adalah 707.51 U/mL dan nilai hasil validasi menunjukkan aktivitas xilanase sebesar 728.67 U/mL, dengan demikian hasil validasi ini menunjukkan bahwa model persamaan optimum adalah valid.
Keyword: aerasi, agitasi, Bacillus halodurans CM1, optimasi, xilanase

Judul: Optimasi Produksi Xilanase dari Bakteri Laut Bacillus subtilis LBF M8 Menggunakan Tongkol Jagung pada Bioreaktor
Abstrak: Keunikan dan karakter seperti sifat halotoreran dan salinitas yang tinggi dari bakteri laut, menjadikannya sebagai sumber alternatif untuk produksi enzim dalam aplikasi industri. Peningkatan skala produksi dalam bioreaktor skala laboratorium merupakan faktor penting sebelum melakukan produksi pada skala industri. Optimasi parameter untuk produksi xilanase telah banyak dilakukan, tetapi hanya sedikit yang berasal dari bakteri laut khususnya Bacillus sp. Penelitian ini bertujuan untuk melakukan optimasi parameter produksi xilanase dengan menggunakan biomassa tongkol jagung sebagai substrat dan peningkatan produksi pada skala bioreaktor. Sebelum dilakukan optimasi produksi, dilakukan uji kualitatif untuk melihat kemampuan xilanolitik isolat Bacillus subtilis LBF M8 menggunakan metode merah congo. Proses optimasi dilakukan pada 2 skala yaitu pada skala flask dan bioreaktor. Konsentrasi biomassa, pH media, suhu produksi, dan kecepatan agitasi menjadi parameter yang dioptimasi pada skala flask, sedangkan pada skala bioreaktor proses optimasi dilakukan pada 2 parameter penting dalam bioreaktor yaitu kecepatan agitasi dan laju aerasi. Xilanase yang dihasilkan kemudian dianalisis kemampuan enzimatiknya menggunakan Sodium Dodecil Sulphate-Polyacrylamide Gel (SDS-PAGE) Thin layer Chromatography (TLC) dan High Performance Liquid Chromatography (HPLC). Berdasarkan aktivitas xilanase tertinggi, konsentrasi 1,5% tongkol jagung, pH media 6, suhu produksi 30OC, dan kecepatan agitasi 200 rpm menjadi kondisi optimum pada skala flask. Pada perbandingan substrat untuk produksi xilanase, aktivitas xilanase tertinggi ditunjukkan pada produksi menggunakan beechwood xylan yang merupakan substrat komersial dibandingkan dengan produksi menggunakan substrat dari limbah pertanian. Tongkol jagung menunjukkan aktivitas xilanase yang lebih tinggi dibandingkan dengan produksi menggunakan limbah pernaian lainnya seperti jerami padi dan ampas tebu. Parameter proses optimasi meningkatkan aktivitas xilanase dari 1.864 U/mL pada 96 jam menjadi 2.963 U/mL pada inkubasi 24 jam. Optimasi laju agitasi dan aerasi dalam bioreaktor dengan kondisi optimum pada skala flask secara signifikan meningkatkan aktivitas xilanase menjadi 4,963 U / mL, dengan kecepatan agitasi 200 rpm dan laju aerasi 1 vvm sebagai kondisi optimum. Berdasarkan hasil analisis SDS-PAGE, xilanase dari B. subtilis LBF M8 tidak membentuk pita tunggal sehingga perlu dilakukan proses pemurnian. Analisis TLC dan HPLC menunjukkan xilanase dari B. subtilis LBF M8 memiliki potensi untuk menghidrolisis xilan untuk menghasilkan xilooligosakarida dengan xilohexosa (X6) sebagai produk utama. Analisis HPLC dan TLC tidak mendeteksi xilosa sebagai produk akhir, jadi tidak diperlukan pemurnian terhadap xilooligosakarida yang dihasilkan.
Keyword: xilanase, Bacillus subtilis, tongkol jagung, bioreaktor

Judul: Posisi Filogenetik Kura-Kura Carettochelys Insculpta  (Reptillia: Testudinata)
Abstrak: Carettochelys insculpta is an endemic freshwater turtle of southern Papua and northern Australia. Phylogenetic position of this turtle is remain unresolved until now. Most of the research conducted show close relationships of C. insculpta and members of Trionychidae family. However, some of the research show distance between C. insculpta and members of Trionychidae family. This research is conducted to analyze phylogenetic relationship between C. insculpta and other members of Testudinata using 12S rRNA, 16S rRNA, and both gene as markers. DNA samples were obtained from three different organisms of C. insculpta. Two species used as outgroups were Alligator mississippiensis and Iguana iguana. Phylogenetic analysis was carried out using Neighbor-Joining method with Felsenstein 1981 (F81) modeltest. A polytomy tree of Testudinata was produced by using 12S rRNA gene. However, analysis using 16S rRNA and both genes as markers confirmed that C. insculpta was located between the Chelonidae and the Trionychidae family.
Keyword: