Judul: Global Sequence alignment of DNA using Rowwise Needleman-Wunsch Algorithm in CUDA
Abstrak: Penjajaran sekuen merupakan hal yang fundamental dalam bioinformatika. Penjajaran sekuen dapat dilakukan untuk menganalisis DNA. Penjajaran sekuen dilakukan dengan menggunakan pemograman dinamis yang memiliki kompleksitas O(mn). Penerapan paralel pada penjajaran sekuen dapat mempercepat proses penjajaran. Implementasi penerapan paralel pada penjajaran sekuen membutuhkan skema partisi seperti rowwise, colunmwise, dan antidiagonal. Tujuan dari penelitian ini adalah menerapkan algoritme global pairwise alignment (Needleman-Wunsch) paralel menggunakan graphic processing unit (GPU) dengan skema partisi rowwise. Hasil penelitian menunjukkan speedup dapat meningkat hingga 5.9 kali untuk sekuen DNA dengan panjang 22 000 bp.
Keyword: Institut Pertanian Bogor, Bogor Agricultural University, IPB, GPU, Needleman-wunsch, Sequence alignment, Rowwise, Scoring matrix, dinisialisasi matriks penskoran, Pengisian matriks, Traceback

Judul: Penjajaran sekuen DNA paralel berbasis kolom menggunakan algoritme Needleman-Wunsch dan graphic processing unit (GPU)
Abstrak: Deoxyribo nucleid acid (DNA) merupakan salah satu biomolekul yang berperan penting dalam menyimpan instruksi genetika makhluk hidup. DNA sendiri terdiri atas jutaan nukleotida yang saling berpasangan yang membentuk susunan double helix. Untuk mendapatkan informasi pada dua pasang DNA salah satunya perlu dilakukan proses penjajaran secara lokal maupun global. Salah satu cara yang dapat digunakan adalah menggunakan metode penjajaran global sekuen dengan skema berbasi kolom dengan tujuan untuk mendapatkan kemiripan DNA. Untaian DNA yang dibangkitkan secara acak tersebut diolah menggunakan library yang dimiliki oleh sebuah graphic processing unit yang dinamakan dengan CUDA. CUDA merupakan sebuah platform komputasi yang disediakan oleh NVIDIA untuk memanfaatkan cores yang ada pada GPU untuk digunakan pada proses komputasi. Tujuan penggunaan CUDA pada proses penjajaran DNA adalah untuk mencapai speedup semaksimal mungkin dibandingkan dengan menggunakan CPU. Pada penelitian ini didapatkan hasil speedup menggunakan GPU dibandingkan dengan CPU adalah 7.9 kali.
Keyword: columnwise, graphics processing unit, speedup

Judul: Pengaruh Persepsi Risiko, Pengetahuan Fatwa Merokok, dan Perilaku Merokok terhadap Niat Berhenti Merokok pada Remaja
Abstrak: Persentase perokok remaja semakin meningkat, namun hasil survei menunjukkan banyak perokok remaja sebenarnya ingin berhenti merokok. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis pengaruh persepsi risiko, pengetahuan fatwa merokok, dan perilaku merokok terhadap niat berhenti merokok. Desain penelitian ini adalah cross sectional study, melibatkan 100 remaja yang beragama islam, berusia 13-18 tahun, dan merokok aktif selama tiga bulan terakhir. Persepsi risiko diukur terhadap lima dimensi: fungsi, keuangan, fisik, psikologis, dan sosial. Pengetahuan fatwa merokok mengacu pada fatwa merokok dari MUI. Hasil penelitian menunjukkan bahwa persepsi risiko yang paling tinggi dirasakan contoh adalah risiko fungsi dan yang paling rendah adalah risiko sosial, hanya 32 persen contoh yang mengetahui fatwa yang ditetapkan MUI, rata-rata jumlah rokok yang dihisap adalah 6.3 batang per hari, dan 81 persen contoh adalah perokok harian ringan. Pengetahuan fatwa yang ditetapkan dan jumlah rokok yang dihisap per hari tidak berpengaruh terhadap niat berhenti merokok. Persepsi risiko sosial berpengaruh positif terhadap niat berhenti merokok.
Keyword: Niat berhenti merokok, pengetahuan fatwa merokok, perilaku merokok, persepsi risiko