Judul: Transformasi Genetik Padi Indica (Oryza Sativa L. Subsp. Indica) Cv. Kasalath Dengan Gen Mmcu/Zn-Sod Penyandi Superoksida Dismutase.
Abstrak: Peningkatan produksi padi nasional dapat ditempuh ekstensifikasi lahan pertanian ke lahan marginal. Permasalahan utama lahan marginal adalah cekaman abiotik yang menginduksi cekaman oksidatif pada tanaman sehingga menyebabkan produksi spesies oksigen reaktif (ROS) secara berlebih. ROS menyebabkan kerusakan sel karena menyebabkan terjadinya peroksidasi lipid, dan degradasi rantai DNA. Superoksida dismutase (SOD) dapat mendetoksifikasi ROS. Beberapa tanaman transgenik yang mengekspresikan gen MmCu/Zn-SOD secara berlebihan mempunyai toleransi terhadap cekaman abiotik lebih tinggi daripada tanaman non-transgenik. Tujuan penelitian ini adalah untuk melakukan transformasi genetik padi Indica cv. Kasalath dengan gen MmCu/Zn-SOD penyandi superoksida dismutase. Biji matang padi Indica cv. Kasalath diinduksi menjadi kalus di media 2N6 yang mengandung 2 mg/l 2.4-D selama 7 hari di ruang gelap. Sebanyak 60 kalus hasil pemotongan dari 45 kalus direndam dalam suspensi A. tumefaciens LBA4404 yang membawa plasmid pGWB-MmCu/Zn-SOD. Plasmid pGWBMmCu/ Zn-SOD mengandung gen MmCuZn-SOD dibawah kendali promoter 35S CaMV. Kokultivasi dilakukan di media 2N6-AS yang mengandung 2 mg/l 2.4-D dan 20 mg/l asetosiringon berlangsung selama 3 hari dalam kondisi gelap. Kalus hasil transformasi diseleksi di media 2N6KH50 yang mengandung 50 mg/l higromisin dan diregenerasikan di media N6R yang mengandung 100 mg/L kinetin. Efisiensi transformasi padi Indica kultivar Kasalath adalah sebesar 50%. Sebanyak 4 dari 30 kalus yang tahan higromisin menghasilkan 4 tunas yang beregenerasi sehingga efisiensi regenerasi pada penelitian ini adalah sebesar 13,3%. Analisis integrasi gen dengan PCR menggunakan primer spesifik untuk mendeteksi daerah antara promoter 35S CaMV dan gen MmCu/Zn-SOD menunjukkan bahwa seluruh tanaman transgenik mengandung gen MmCu/Zn- SOD di bawah kendali promoter 35S CaMV. Analisis segregasi pada generasi T1 dan generasi T2 padi cv Kasalath transgenik menunjukkan bahwa resistensi terhadap higromisin yang disandi oleh gen hpt diwariskan kepada generasi berikutnya dengan mengikuti pola Mendelian dengan rasio 3 resisten : 1 sensitif. Rasio segregasi 3:1 mengindikasikan bahwa jumlah gen hpt yang terintegrasi ke dalam genom padi cv. Kasalath transgenik adalah satu salinan. Karena gen MmCu/Zn-SOD terpaut dengan gen hpt, maka gen MmCu/Zn-SOD diwariskan secara stabil kepada generasi berikutnya dan hanya satu salinan yang terintegrasi di dalam genom padi cv. Kasalath transgenik.
Keyword: Transformasi genetik, MmCu/Zn-SOD, transgenik, padi Indica, segregasi

Judul: Analisis Tanaman Padi Kultivar Kasalath Transgenik Generasi T4 yang Mengandung Gen MmCu/Zn-SOD Penyandi Superoksida Dimutase.
Abstrak: Padi (Oryza sativa L) merupakan salah satu tanaman pangan yang sangat penting. Permintaan padi yang meningkat setiap tahun membutuhkan peningkatan produksi. Salah satu upaya untuk meningkatkan produksi adalah perbaikan genetik melalui rekayasa genetik. Tanaman padi varietas Kasalath transgenik yang mengandung gen MmCu/Zn-SOD penyandi superoksida dismutase (SOD) di bawah kendali promoter kuat 35S CaMV telah berhasil dirakit. Padi transgenik ini diharapkan dapat ditanam di lahan marjinal karena SOD berperan dalam detoksifikasi spesies oksigen reaktif yang terbentuk akibat berbagai cekaman, termasuk cekaman di lahan marjinal. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis pola pewarisan dan stabilitas gen MmCu/Zn-SOD pada tanaman padi Kasalath transgenik generasi T4. Analisis pola pewarisan gen MmCu/Zn-SOD didasarkan pada pola pewarisan gen hpt penyandi higromisin fosfotransferase karena kedua gen tersebut terpaut. Analisis pewarisan gen hpt menunjukkan bahwa galur K1/2/1 dan K1/2/2 yang merupakan generasi T4 adalah homozigot, sehingga kedua galur tersebut juga homozigot untuk gen MmCu/Zn-SOD. Analisis PCR dengan primer spesifik menunjukkan bahwa gen MmCu/Zn-SOD di bawah kendali promoter 35S CaMV terintegrasi di dalam genom galur K1/2/1 dan K1/2/2. Hal ini menunjukkan bahwa gen MmCu/Zn-SOD di bawah kendali promoter 35S CaMV diwariskan secara stabil sampai dengan generasi T4.
Keyword: homozigot, MmCu/Zn-SOD, padi transgenik, pewarisan gen

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: