Judul: Autentikasi produk tuna (Thunnus sp.) kaleng dengan metode polymerase chain reaction
Abstrak: Autentikasi bahan pangan merupakan salah satu tantangan bagi para pelaku bisnis pangan, termasuk pangan perikanan. Autentikasi konvensional berbasis morfologi memiliki kekurangan utama berupa ketergantungan akan kehadiran ahli dan kelengkapan morfologi dari ikan itu sendiri. Kelengkapan morfologi ikan dari pangan olahan tidak lagi utuh karena telah mengalami proses sterilisasi komersial, misalnya pada produk tuna dalam kaleng. Analisis berbasis protein juga memiliki kekurangan karena proses denaturasi protein selama pemasakan dan sterilisasi yang menyebabkan perubahan pada profil protein yang hendak diamati. Salah satu cara untuk dapat mengindentifikasi spesies yang telah mengalami perubahan bentuk dan denaturasi protein yang diakibatkan oleh proses fisika dan kimia adalah PCR-sequencing. Polymerase chain reaction dilakukan untuk mengamplifikasi gen cyt-b DNA mitokondria. Gen cyt-b dari DNA mitokondria digunakan dalam penelitian ini karena beberapa kelebihan yang dimiliki, yaitu bentuknya yang sirkular relatif lebih resisten terhadap suhu tinggi, kelimpahannya dalam sel tinggi, mengikuti garis keturunan ibu, tidak mengalami rekombinasi, tingkat mutasi sangat tinggi sehingga dapat digunakan untuk studi filogenetik. DNA empat spesies tuna segar dan tuna kaleng dapat diekstraksi menggunakan metode CTAB. DNA hasil ekstraksi kemudian diamplifikasi dengan menggunakan primer fishcytb-f dan cytb1-5r.
Keyword: 

Judul: Autentikasi Ikan tuna (Thunnus sp) dengan metode berbasis PCR-sequencing
Abstrak: Ikan tuna merupakan salah satu komoditas perikanan yang rawan pemalsuan berupa substitusi dengan daging ikan dari spesies yang mirip namun memiliki harga yang lebih rendah. Konsumen sebagai pembeli akan mengalami kerugian (economical fraud) dari pemalsuan sehingga diperlukan suatu cara untuk mengatasi permasalahan tersebut. Autentikasi dengan metode berbasis DNA dapat menjadi salah satu cara mengatasi permasalahan pemalsuan bahan baku daging ikan tuna. Metode berbasis DNA memiliki kelebihan dibandingkan dengan metode berbasis protein diantaranya dapat mendeteksi keaslian suatu produk walaupun telah mengalami proses pengolahan berupa panas dan spesifik untuk setiap organisme. Penelitian ini bertujuan untuk (1) Ekstraksi DNA ikan tuna yang diperoleh dari perusahaan eksportir tuna dan pasar modern (2) Identifikasi spesies berbasis DNA dengan primer spesifik dengan gen target cyt b (3) Karakterisasi DNA ikan tuna hasil autentikasi. Penelitian ini terdiri dari beberapa tahapan yang diawali dengan karakterisasi ikan tuna, ekstraksi DNA menggunakan metode CTAB dan kit vivantis, Proses amplifikasi dengan PCR, elektroforesis, dan penentuan urutan nukleotida. Sampel yang diuji berhasil diekstraksi dan teramplifikasi dengan ukuran yang sesuai yaitu 750 pasang basa. Hasil PCR sequencing menggunakan gen target cyt b berhasil mengidentifikasi bahan baku ikan tuna. Urutan nukleotida hasil PCR sequencing yang telah dicocokkan ke bank data menunjukkan tidak ada pemalsuan berupa subsitusi dengan speises lain. Tingkat homologi merupakan persentase kesamaan spesies yang diuji dengan data yang tersedia di bank data. Spesies yellow fin (Thunnus albacores), albacore (Thunnus alalunga), big eye (Thunnus obesus), dan blue fin (Thunnus macoyyi) memiliki tingkat homologi berturut-turut adalah 99%, 99%, 99%, 100%.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: