Judul: Struktur Primer Parsial dan Bioinformatika Profenoloksidase Udang Vaname (Litopenaeus vannamei).
Abstrak: Blackspot sangat dipengaruhi oleh adanya radiasi sinar matahari terhadap kulit udang dan umumnya terjadi pada saat panen berlangsung, apabila tidak dilakukan pendinginan setelah panen. Adanya blackspot pada udang sangat dipengaruhi oleh tingginya konsentrasi substrat tirosinase pada kulit chitin udang, oksigen molekuler, dan enzim tirosinase. Tujuan penelitian ini adalah untuk menentukan struktur primer parsial dan bioinformatika proPO udang vaname. Sampel udang vaname diperoleh dari Fresh Market, Jakarta. Penelitian dilakukan dengan tahapan isolasi RNA udang, amplifikasi dan analisis bioinformatika. Hasil isolasi RNA profenoloksidase memiliki nilai konsentrasi 191 mg/mL dengan kemurnian 2.056. Hasil amplifikasi memperoleh gen target dengan panjang 220 bp. Hasil identifikasi merupakan spesies vaname dengan nilai identifikasi 99 dan 100%. Urutan nukleotida yang diperoleh merupakan struktur primer parsial. Prediksi struktur sekunder berupa coil sebanyak 65, helix sebanyak 21 dan strand sebanyak 36. Prediksi model tiga dimensi diperoleh 3 jenis model struktur terbaik. Peptida ligan berupa susunan ASP TRP ASP PHE LEU PRO PRO NH2. Sisi sisi yang berikatan pada residu terletak pada E19 I23 Y27 R30 P32 K50 Y51 L52 V53 P54 L57 V62 L65 R69 F106.
Keyword: asam amino, bioinformatika, ligan, proPO, vaname

Judul: Isolasi, Karakterisasi, Dan Pemurnian Enzim Polyphenoloxidase Dari Udang Vaname (Litopenaeus Vannamei).
Abstrak: Udang merupakan komoditas perikanan penting di Indonesia. Udang merupakan komoditi yang mudah mengalami kerusakan dan memiliki masa simpan terbatas karena adanya proses melanosis (pembentukan blackspot). Blackspot merupakan reaksi enzimatik yang disebabkan oleh enzim polyphenoloxidase (PPO). Pembentukan blackspot pada udang dapat menurunkan harga jual, menurunkan penerimaan konsumen, dan menyebabkan kerugian secara ekonomi. Informasi mengenai PPO dari karapas udang vaname Indonesia belum pernah ada, oleh karena itu tujuan penelitian ini adalah mengisolasi, menentukan karakteristik dan memurnikan enzim polifenoloksidase yang berasal dari karapas udang vaname. Penelitian ini dilakukan dalam tiga tahap. Tahap pertama yaitu mengekstrak enzim PPO dari karapas udang vaname. Tahap kedua yaitu menentukan karakteristik enzim PPO yang meliputi penentuan suhu optimum, pH optimum, substrat optimum, kinetika enzim, pengaruh inhibitor dan ion logam, serta bobot molekul enzim. Tahap ketiga yaitu melakukan pemurnian enzim PPO yang meliputi pengendapan ammonium sulfat, dialisis, dan kromatografi kolom. Enzim PPO telah berhasil diisolasi dari karapas udang vaname menggunakan bufer fosfat 0,05 M pH 7,2 (mengandung NaCl 1 M dan Brij-35 0,2%) perbandingan 1:3. Enzim tersebut kemudian diendapkan menggunakan ammonium sulfat 40% dan didialisis selama 8 jam. Pemurnian lebih lanjut dilakukan menggunakan kromatografi filtrasi gel dengan matriks Sephadex-G150. Kelipatan pemurnian enzim menurun setelah proses dialisis. Ekstrak kasar PPO yang berasal dari karapas udang vaname memiliki aktivitas optimum pada suhu 35 ºC, pH 6 dan konsentrasi L-DOPA 12,5 mM. Nilai Km dan Vmaks enzim PPO vaname yaitu sebesar 2,35 mM dan 38,46 U/mL. Aktivitas PPO dapat dihambat oleh sodium sulfit, EDTA, ion logam Na+, Zn2+, Fe3+ pada konsentrasi 1 dan 5 mM. Penghambatan tertinggi ditunjukkan oleh sodium sulfit pada konsentrasi 5 mM. Dua isoform enzim PPO vaname terdeteksi oleh zimogram dan memiliki bobot molekul sebesar 302,5 kDa dan 337,5 kDa. Kata kunci : Blackspot, karakterisasi, pemurnian, polyphenoloxidase, vaname.Udang merupakan komoditas perikanan penting di Indonesia. Udang merupakan komoditi yang mudah mengalami kerusakan dan memiliki masa simpan terbatas karena adanya proses melanosis (pembentukan blackspot). Blackspot merupakan reaksi enzimatik yang disebabkan oleh enzim polyphenoloxidase (PPO). Pembentukan blackspot pada udang dapat menurunkan harga jual, menurunkan penerimaan konsumen, dan menyebabkan kerugian secara ekonomi. Informasi mengenai PPO dari karapas udang vaname Indonesia belum pernah ada, oleh karena itu tujuan penelitian ini adalah mengisolasi, menentukan karakteristik dan memurnikan enzim polifenoloksidase yang berasal dari karapas udang vaname. Penelitian ini dilakukan dalam tiga tahap. Tahap pertama yaitu mengekstrak enzim PPO dari karapas udang vaname. Tahap kedua yaitu menentukan karakteristik enzim PPO yang meliputi penentuan suhu optimum, pH optimum, substrat optimum, kinetika enzim, pengaruh inhibitor dan ion logam, serta bobot molekul enzim. Tahap ketiga yaitu melakukan pemurnian enzim PPO yang meliputi pengendapan ammonium sulfat, dialisis, dan kromatografi kolom. Enzim PPO telah berhasil diisolasi dari karapas udang vaname menggunakan bufer fosfat 0,05 M pH 7,2 (mengandung NaCl 1 M dan Brij-35 0,2%) perbandingan 1:3. Enzim tersebut kemudian diendapkan menggunakan ammonium sulfat 40% dan didialisis selama 8 jam. Pemurnian lebih lanjut dilakukan menggunakan kromatografi filtrasi gel dengan matriks Sephadex-G150. Kelipatan pemurnian enzim menurun setelah proses dialisis. Ekstrak kasar PPO yang berasal dari karapas udang vaname memiliki aktivitas optimum pada suhu 35 ºC, pH 6 dan konsentrasi L-DOPA 12,5 mM. Nilai Km dan Vmaks
Keyword: Blackspot, karakterisasi, pemurnian, polyphenoloxidase, vaname

Judul: Pengaruh ukuran billboard terhadap kualitas estetika lanskap kota Bogor
Abstrak: Salah satu permasalahan kota yang dialami saat ini antara lain adalah permintaan billboard. Penataan dan pemasangan billboard yang salah dapat menurunkan kualitas estetika lanskap kota. Ukuran billboard relatif besar, mendominasi pandangan sehingga menutupi good view yang berada di belakangnya.
Keyword: