Judul: Studi Poliandri Pada Penyu Hijau (Chelonia mydas) Melalui Analisis DNA Mikrosatelit (STRs)
Abstrak: Penyu adalah nama umum untuk anggota ordo Testudines (Reptilia) yang hidup di laut. Penyu mempunyai kemampuan untuk menyimpan sperma, bahkan sperma musim kawin sebelumnya masih bisa membuahi telur yang baru. Dengan kata lain, proses mounting atau deposisi sperma oleh penyu jantan tidak segera diikuti dengan fertilisasi. Untuk mencapai daerah perkawinan dan peneluran, penyu seringkali harus menempuh perjalanan sejauh 3000 km. Ada peluang penyu melakukan perkawinan dengan lebih dari 1 jantan. Untuk mempelajari pola perkawinan pada induk, dapat dilakukan dengan menganalisis DNA mikrosatelit atau ruas DNA pendek berulang. Alel-alel dalam setiap lokus mikrosatelit bersifat polimorfik dan kodominan. Pola pewarisan alel DNA mikrosatelit mengikuti hukum pewarisan Mendel. Dengan begitu analisis terhadap jenis-jenis alel DNA mikrosatelit bisa digunakan untuk mempelajari berbagai fenomena perkawinan penyu. Tujuan penelitian ini adalah mempelajari pola reproduksi pada induk Chelonia mydas dan kompensasi telur (pejantan) dari tukik/populasi penyu yang menetas di Kawasan Konservasi Penyu Taman Pesisir Pangumbahan Kabupaten Sukabumi Provinsi Jawa Barat. Hasil penelitian ini diharapkan bisa menjadi salah satu sumber informasi tentang poliandri dan genetik mikrosatelit pada penyu. Bahan yang digunakan adalah 120 sampel jaringan tukik yang baru keluar dari sarang sebanyak 10 sarang dan masing-masing diambil 12 sampel per sarang. Pengambilan sampel dilakukan di kawasan Konservasi Penyu Taman Pesisir Pangumbahan Kabupaten Sukabumi Provinsi Jawa Barat. Ekstraksi dan isolasi DNA dari sampel jaringan tukik menggunakan metode fenol mengikuti metode standar Sambrook et al. (1989). Amplifikasi dilakukan menggunakan metode PCR. Visualisasi produk PCR DNA Mikrosatelit dilakukan menggunakan metode polyacrilamide gel electrophoresis (PAGE) 8% yang dilanjutkan dengan pewarnaan sensitif perak. Pita-pita DNA yang muncul di atas gel poliakrilamida kemudian diskors sebagai alel. Pita DNA yang bermigrasi paling cepat pada suatu lokus disebut alel a, kemudian berturut-turut alel b, c, dan seterusnya. Semua sampel yang berhasil diamplifikasi bersifat polimorfik. Lokus D108 memiliki keragaman genotip dan alel tertinggi, yaitu 37 genotip dan 11 alel, kemudian diikuti lokus B103 dan C102 masing-masing 21 dan 27 genotip, dan masing-masing 9 alel. Komposisi alel antar sarang menunjukkan adanya alel sharing. Untuk lokus D108 sebanyak 100% merupakan alel sharing diantara sepuluh sarang, alel a merupakan alel sharing antar sarang 2 dan 6, alel b antar sarang 1, 2 dan 5, alel c antar sarang 1, 5, 6 dan 7, alel d antar sarang 1, 5, 7 dan 8, alel e dan f antar sarang 2, 3, 4, 5, 6, 7, dan 8, alel g antar sarang 3, 4 dan 5, alel h antar sarang 1, 5, 9 dan 10, alel i dan j antar sarang 1, 2, dan 5, sedangkan alel k antar sarang 1, 3, 9 dan 10. Selanjutnya untuk lokus B103 sebanyak 77.77%, alel a merupakan alel sharing antar sarang 2 dan 10, alel b antar sarang 2 dan 9, alel c antar sarang 4, 5..dst
Keyword: Polyandry, Taman Pesisir Pangumbahan, Genotipe

Judul: Kekerabatan antar Pantai Peneluran Penyu Hijau (Chelonia mydas) di Pangandaran dan Pangumbahan.
Abstrak: Kepulauan Indonesia yang strategis dan didukung dengan panjangnya garis pantai menjadikannya sebagai lokasi peneluran berbagai spesies penyu yang ada di dunia. Penyu hijau (Chelonia mydas) adalah salah satu dari enam spesies penyu yang ditemukan bertelur di Kepulauan Indonesia. Penelitian ini bertujuan mengetahui adanya kekerabatan penyu hijau (Chelonia mydas) antar pantai peneluran Pangandaran dan Pangumbahan. Ekstraksi DNA total diambil dari jaringan tepi karapas dari 11 individu penyu hijau, yaitu satu sampel (T) dari Pangandaran dan 10 sampel dari Pangumbahan (A, B, C, D, E, F, H, I, Q, dan S). Amplifikasi ruas D-Loop dilakukan dengan menggunakan primer LCM15382 (forward) dan H950g (reverse). Panjang sekuen ruas D-Loop yang didapat 763 bp. Hasil pensejajaran menggunakan software MEGA 6.06 terhadap sekuen antar sampel yang didapat kemudian dibandingkan dengan ruas mtDNA homolog yang ada di database menunjukkan adanya empat kelompok kekerabatan. Kelompok kekerabatan pertama dibentuk oleh sampel A, B, dan D dengan kawasan peneluran Pasifik Selatan. Kelompok kekerabatan kedua dibentuk oleh sampel Q dengan kawasan peneluran Brazil. Kelompok kekerabatan ketiga dibentuk oleh sampel E Pangumbahan dengan kawasan peneluran Mozambik Utara. Kelompok kekerabatan keempat dibentuk oleh sampel T dengan kawasan peneluran Australia.
Keyword: Chelonia mydas, filogeografi, kekerabatan, mtDNA

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: