Judul: Analisis Bioinformatika untuk Mencari Spesies Bakteri yang Memiliki Kesamaan Sekuen Gen 16S rRNA dengan Bacillus aquimaris galur SH6 dari Basis Data GenBank.
Abstrak: Bacillus aquimaris galur SH6 merupakan salah satu bakteri penghasil endospora yang dapat menghasilkan karotenoid berpigmen jingga. Analisis bioinformatika dilakukan sebagai langkah awal untuk mencari spesies yang memiliki tingkat kesamaan sekuen gen 16S rRNA yang tinggi dengan B.aquimaris galur SH6. Penelitian ini bertujuan mendapatkan dan menganalisis spesies yang memiliki kesamaan gen 16S rRNA yang tinggi dengan B. aquimaris galur SH6 secara bioinformatika. Sekuen gen 16S rRNA B. aquimaris galur SH6 didapatkan dari basis data GenBank. Sekuen tersebut dimasukkan ke dalam aplikasi nucleotide BLAST dari NCBI untuk melihat homologi dengan spesies terdekat. Sebanyak 12 sekuen hasil BLAST diambil. Perbedaan genom sekuen dihitung menggunakan aplikasi Genome-to-Genome Distance Calculator (GGDC) DSMZ. Hasil perhitungan diubah menjadi data berbentuk tabel. Setiap sekuen dibandingkan dengan teknik Frequency of Chaos Game Representation (FCGR) pada laman BIOPHP FCGR. Selain itu, kandungan GC setiap sekuen juga ditentukan menggunakan alat GC plotting pada laman ENDMEMO. Semua sekuen dilakukan pensejajaran dan analisis filogenetik dengan program MEGA X. Berdasarkan data hasil analisis sekuen 16S rRNA dengan GGDC, FCGR, GC Content Plotting, dan kontruksi pohon filogenetik, didapatkan beberapa sekuen bakteri yang paling berhubungan dekat dengan B. aquimaris galur SH6, di antaranya Bacillus aquimaris galur TF-12, Bacillus marisflavi galur TF-11, dan Bacillus haikouensis galur C-89.
Keyword: 16S rRNA, FCGR, GC content, GGDC, phylogenetic tree

Judul: Analisis Keragaman Genetik Bakteri dalam Teknologi Budidaya Bioflok dengan Teknik ARDRA gen 16S-rRNA
Abstrak: A new approach to reducing farmed waste is aquaculture with biofloc technology (BFT-Bio-flocs technology). Bacteria is the main constituent in aquaculture systems with biofloc. This study aimed to analyze the genetic diversity of bacteria biofloc using 16S-rRNA PCR with ARDRA technique. A total of 38 dominant bacterial isolates was obtained and of these isolates, 16S-rRNA gene was then isolated and amplified using PCR. The 16S-rRNA gene of the isolates was then cut using HaeIII (5’-GG•CC) and HhaI (5’-GCG•C) restriction enzymes resulting an ARDRA pattern which was further used as the binary data for the construction of phylogenetics tree that can be used to estimate the group of bacteria. The result with HaeIII cutting restriction enzyme from bacteria bioflocs obtained 11 ARDRA patterns, while with the restriction enzyme HhaI obtained 8 ARDRA patterns. Phylogenetics of bacterial populations on tree water biofloc cultivation system consisting of at least 13 different bacterial species. Result of sequencing from 2 gene sample 16S-rRNA identified Microbacterium foliurum, and Pseudomonas putida.
Keyword: 

Judul: Peranan Jasa Transportasi dalam  Menunjang Pembangunan Wilayah  Kaitannya dengan Pelaksanaan  Otonomi Daerah di Provinsi Papua  Khususnya Kabupaten Jayapura
Abstrak: Ketimpangan pembangunan yang terjadi selama Orde Baru telah memicu disintegrasi bangsa, salah satu daerah yang diisukan terancam disintegrasi sebagai akibat ketimpangan pembangunan pada reszim orde baru adalah Provinsi Papua, sehingga untuk meredam aspirasi disintgrasi, dimasa reformasi Provinsi Papua ditetapkan sebagai daerah yang menerima Otonomi Khusus. Dengan adanya otonomi khusus ini diharapkan pemerintah daerah lebih leluasa mengabil kebijakan yang disesuaikan dengan aspirasi dan prioritas permasalahan yang dihadapi masyarakat.
Keyword: