Judul: Deteksi Endobakteri dan Uji Patogenisitas Fusarium oxysporum fsp. cubense terhadap Tanaman Pisang.
Abstrak: Fusarium oxysporum fsp. cubense (Foc) merupakan cendawan penyebab penyakit layu Panama pada tanaman pisang. Keberadaan endobakteri pada Foc koleksi IPBCC belum diketahui. Padahal bakteri endosimbion cendawan dapat mengubah morfologi dan gaya hidup inangnya. Patogenisitas Foc pembawa endobakteri terhadap pisang juga belum diketahui. Oleh sebab itu penelitian ini bertujuan mendeteksi endobakteri pada Foc dan mempelajari patogenisitasnya terhadap pisang ambon dan pisang tanduk. Sebanyak 17 strain Foc dideteksi keberadaan endobakterinya secara molekuler berdasarkan daerah 16S rDNA dengan primer 63F dan 1387R. Keberadaannya dikonfirmasi dengan pewarnaan BacLight yang sediaannya diamati menggunakan mikroskop fluorescence. Beberapa strain Foc pembawa endobakteri diuji dengan cara penyuntikan filtrat pada tulang daun tanaman pisang ambon dan tanduk yang berumur 5 bulan. Hasil penelitian secara molekuler menunjukkan bahwa 41.2% strain Foc membawa endobakteri, yaitu Foc 08, Foc 12, Foc 18, Foc 32A, Foc 33, Foc 37, dan Foc 44. Keberadaanya dikonfirmasi dengan pewarnaan BacLight. Namun, semua strain Foc yang diteliti terdeteksi membawa endobakteri yang ditandai dengan adanya sel bakteri hidup berpendar hijau setelah diwarnai dengan BacLight. Endobakteri banyak ditemukan pada struktur konidia dan hifa bagian tengah. Endobakteri juga ditemukan pada ujung-ujung hifa. Uji patogenisitas beberapa strain Foc pembawa endobakteri pada pisang ambon dan tanduk menunjukkan bahwa filtrat Foc mampu menginduksi terbentuknya gejala sakit pada kedua kultivar pisang tersebut. Uji patogenisitas ini juga menunjukkan bahwa strain-strain Foc yang diuji tergolong ras 4.
Keyword: bakteri, endosimbion, Fusarium oxysporum, pisang, virulen

Judul: Identifikasi dan Deteksi Fusarium oxysporum f. sp. cubense serta Perkembangan Penyakit Layu Fusarium Pisang pada berbagai Perlakuan Gulma dan Glifosat
Abstrak: Fusarium oxysporum f. sp. cubense adalah cendawan penyebab penyakit layu pada tanaman pisang. Penyakit layu fusarium pada pisang tersebar luas pada daerah yang membudidayakan pisang di Asia, Afrika, Australia, Amerika Tengah, dan Selatan. Di Indonesia, penyakit layu fusarium telah menghancurkan ribuan hektar pertanaman pisang, baik perkebunan pisang komersial maupun pertanaman pisang rakyat. Berbagai pendekatan telah dilakukan untuk mengendalikan patogen ini, seperti penggunaan pestisida kimia, praktik budidaya yang baik, dan penggunaan agen biologis tetapi penyakit ini masih menjadi ancaman serius dalam budidaya tanaman pisang. Identifikasi patogen penyebab penyakit pada tanaman merupakan langkah paling penting untuk mengembangkan strategi dalam mengendalikan penyakit tanaman. Informasi tentang distribusi ras Foc pada semua bagian tanaman pisang dan uji patogenisitasnya belum pernah dilakukan di Indonesia sehingga penelitian mengenai aspek ini sangat dibutuhkan. Cendawan Foc adalah patogen tanah, yang dapat bertahan selama puluhan tahun dalam tanah tanpa kehadiran inang utama. Hal ini mengindikasikan bahwa deteksi dini terhadap inokulum Foc sangat diperlukan untuk menentukan strategi pengendalian yang tepat. Teknik pendeteksian sederhana untuk fusarium patogen pada pisang belum diperoleh sehingga penelitian ini diperlukan. Penggunaan herbisida dengan bahan aktif glifosat banyak digunakan petani untuk mengendalikan gulma di sekitar tanaman pisang dan tanaman hortikultura. Informasi tentang dampak aplikasi glifosat pada gulma terhadap perubahan populasi mikroba tanah dan hubungannya dengan kejadian penyakit layu fusarium di Indonesia belum pernah didapatkan sebelumnya. Berdasarkan hal tersebut perlu dilakukan penelitian untuk mempelajari dampak aplikasi glifosat pada gulma terhadap perubahan populasi mikroba rizosfer serta hubungannya dengan penyakit layu fusarium pisang. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi F. oxysporum f. sp. cubense secara morfologi dan molekuler di beberapa bagian tanaman pisang bergejala layu, mempelajari pengembangan teknik deteksi sederhana F. oxysporum f. sp. cubense yang sederhana, sensitif, dan selektif pada tanaman pisang menggunakan potongan bonggol pisang, serta mempelajari pengaruh interaksi konsentrasi glifosat dengan spesies gulma terhadap populasi mikroba tanah, dan keparahan penyakit layu fusarium pisang. Penelitian dilaksanakan dalam tiga tahap secara observasi dan eksperimental di Laboratorium Mikologi Tumbuhan Departemen Proteksi Tanaman Fakultas Pertanian IPB, Laboratorium IPB-Culture Collection (IPB-CC), dan di rumah kasa Universitas Suryakancana Cianjur. Tahap pertama meliputi koleksi dan karakterisasi isolat Fusarium yang diperoleh dari delapan sentra penanaman pisang di Kabupaten Cianjur, dan dua kebun pisang di kecamatan Sungai Lantik kabupaten Lima Puluh Kota. Hasil penelitian karakterisasi morfologi menunjukkan beberapa ciri spesifik yang beragam baik dalam laju pertumbuhan, warna koloni, jumlah konidium, bentuk konidium, dan klamidospora. Pengamatan mikroskopis menghasilkan beberapa kelompok isolat yang mempunyai ciri khas spesies cendawan F. oxysporum dan Fusarium spesies lainnya, terlihat dari bentuk, ukuran makrokonidium dan mikrokonidiumnya. Hasil karakterisasi molekuler memperlihatkan bahwa F. oxysporum f. sp. cubense TR4 merupakan isolat yang paling banyak ditemukan dibandingkan dengan F. oxysporum f. sp. cubense non TR4 dan spesies lainnya. Isolat F. oxysporum f. sp. cubense TR4 dan non TR4 banyak ditemukan di bagian batang semu tanaman pisang. Selain F. oxysporum f. sp. cubense juga ditemukan beberapa spesies Fusarium lain yang berasosiasi dengan gejala layu pada tanaman pisang diantaranya F. solani yang ditemukan pada kultivar pisang Ambon Kuning dan Nangka pada bagian bonggol, akar dan tanah serta F. verticilliodes yang ditemukan pada bagian bonggol pisang Raja Sereh. Penelitian tahap kedua yaitu pengembangan
Keyword: mikroba rizosfer, F. oxysporum f. sp. cubense, uji patogenisitas, Fusarium solani, glifosat, gulma

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: