Judul: Potential inhibition of phylospheric actinomycetes of Liliaceae plants against Colletotrichum acutatum
Abstrak: Cabai merupakan salah satu komoditas unggulan hortikultura yang penting bagi masyarakat Indonesia. Antraknosa merupakan penyakit utama peyebab rendahnya produktivitas cabai di Indonesia. Antraknosa disebabkan oleh genus Colletotrichum dan spesies yang paling banyak menyerang cabai di Indonesia saat ini adalah Colletotrichum acutatum. Pengendalian antraknosa secara kimiawi menggunakan fungisida kontak dan sistemik secara intensif. Untuk mengatasi dampak negatif penggunakaan fungisida, diperlukan alternatif pengendalian hayati. Salah satu agens hayati yang digunakan yaitu aktinomiset. Penelitian ini bertujuan mendapatkan isolat aktinomiset filosfer Liliaceae yang berpotensi mengendalikan C. acutatum. Tahapan penelitian yang dilakukan meliputi perbanyakan isolat aktinomiset filosfer Liliaceae dan C. acutatum, karakterisasi morfologi aktinomiset, uji antagonis aktinomiset terhadap C. acutatum, dan identifikasi aktinomiset secara molekuler. Karakterisasi aktinomiset dilakukan dengan menggunakan media yeast starch agar dan international streptomyces project 2. Sebanyak 21 isolat dilakukan uji antagonis secara in vitro dengan metode dual cultre menggunakan rancangan acak lengkap (RAL). Identifikasi isolat aktinomiset filosfer Liliaceae terbaik secara molekuler dengan Teknik PCR menggunakan primer universal untuk yaitu 27F dan 16Sact1114R. Persentase tingkat hambatan relatif (THR) aktinomiset terhadap C. acutatum sebesar 14,32-47,66%. Dua isolat dengan persentase penghambatan tertinggi terhadap penyakit antraknosa secara in vitro adalah ACW23 dan BBH11 sebesar 47,66% dan 44,79%. Hasil identifikasi molekuler kedua isolat tersebut memiliki kemiripan dengan Propionicicella superfundia dan Enemella dayhoffiae, Chili is one of the leading horticultural commodities that is important for the people of Indonesia. Anthracnose is the main disease that causes low chili productivity in Indonesia. Anthracnose is caused by various species of Colletotrichum, and in Indonesia especially by Colletotrichum acutatum. Chemical control of anthracnose used contact and systemic fungicides intensively. To overcome the negative impact of fungicide use, alternative biological control is needed. One of the biological control agents candidates used is actinomycetes. This study aims to obtain phyllospheric actinomycetes Liliaceae isolates that can potentially control C. acutatum. The stages of the research conducted include the propagation of phyllospheric actinomycetes Liliaceae isolates and C. acutatum, morphological characterization of actinomycetes, actinomycetes antagonistic test against C. acutatum, and molecular identification of actinomycetes. Morphological characterization of actinomycetes was conducted with yeast starch agar media and international streptomyces project 2 media. A total of 21 isolates were tested for antagonism in vitro with the dual culture method using a completely randomized design. Identification of the best phyllospheric actinomycetes Liliaceae isolates molecularly by polymerase chain reaction technique using universal primers for 27F and 16Sact1114R. The percentage of relative inhibition rate of actinomycetes against C. acutatum was 14.32-47.66%. Two isolates with the highest percentage of inhibition against anthracnose disease in vitro were ACW23 and BBH11 at 47.66% and 44.79%. The results of molecular identification of the two isolates are similar to Propionicicella superfundia and Enemella dayhoffiae.
Keyword: antraknosa, cabai, pengendalian hayati, Enemella dayhoffiae, Propionicicella superfundia

Judul: Potensi Metabolit Sekunder Cendawan Endofit sebagai Antifungi terhadap Colletotrichum acutatum pada Cabai Merah
Abstrak: Colletotrichum acutatum merupakan salah satu spesies patogen antraknosa pada cabai yang dilaporkan paling banyak ditemukan di Pulau Jawa. C. acutatum juga merupakan patogen antraknosa yang bersifat paling agresif dibandingkan dengan spesies lain (C. gloesporioides dan C. capsici). Cendawan endofit dapat melindungi tanaman inangnya dari hama dan penyakit, salah satu mekanismenya yaitu dengan menghasilkan senyawa metabolit sekunder. Metabolit sekunder cendawan endofit yang bersifat antifungi terhadap patogen tanaman telah banyak dilaporkan baik berupa ekstrak kasar maupun senyawa aktif. Namun, pemanfaatan ekstrak metabolit sekunder cendawan endofit untuk mengendalikan penyakit antraknosa pada cabai yang disebabkan oleh C. acutatum belum dilaporkan. Penelitian ini bertujuan mengevaluasi aktivitas antifungi metabolit sekunder cendawan endofit terhadap C. acutatum secara in vitro dan in vivo. Analisis kromatografi lapis tipis (KLT) dan deteksi senyawa yang menunjukkan aktivitas antifungi dengan metode bioautografi juga dilakukan pada penelitian ini. Penelitian dilaksanakan di Laboratoria Pengembangan Teknologi Industri Agro dan Biomedika-Badan Pengkajian dan Penerapan Teknologi (LAPTIAB-BPPT), Pusat Penelitian Ilmu Pengetahuan dan Teknologi (PUSPIPTEK), Serpong, dan Kebun Percobaan Departemen Proteksi Tanaman, IPB mulai bulan April 2016 sampai Juli 2018. Bahan yang digunakan meliputi isolat C. acutatum dan isolat cendawan endofit Curvularia sp. yang diperoleh dari Laboratorium Mikologi Tumbuhan, Departemen Proteksi Tanaman IPB, cendawan endofit lainnya diisolasi dari tanaman cabai, dan benih cabai varietas Pilar F1 diperoleh dari toko pertanian. Seleksi cendawan endofit hasil isolasi dari bagian tanaman cabai yang berasal dari tiga lokasi, yaitu Cianjur, Bogor, dan Subang dilakukan dengan uji antibiosis dan uji patogenisitas. Isolat cendawan endofit yang didapatkan dari ketiga lokasi sebanyak 113 isolat cendawan endofit. Cendawan endofit yang diisolasi dari bagian akar, batang, daun, dan buah selanjutnya diuji potensinya sebagai antifungi dan didapatkan 57 isolat potensial. Namun dari 57 isolat bersifat antifungi yang diuji patogenisitas hanya terdapat satu isolat yang tidak berpotensi sebagai patogen, yaitu isolat CBR1D14. Pengujian secara in vitro dilakukan dengan menguji aktivitas ekstrak etil asetat (e.a) filtrat kultur dan miselia isolat cendawan endofit CBR1D14 dan Curvularia sp. dalam menghambat perkecambahan konidia dan pertumbuhan radial C. acutatum. Ekstrak etil asetat cendawan endofit yang menunjukkan aktivitas antifungi dipartisi dengan pelarut metanol 90% dan heksana, selanjutnya aktivitas antifungi fraksi ekstrak diuji kembali dengan metode yang sama. Hasil pengujian in vitro menunjukkan bahwa ekstrak etil asetat filtrat kultur CBR1D14 (e.a FCBR) menunjukkan aktivitas paling tinggi dalam menghambat perkecambahan konidia dan pertumbuhan radial C. acutatum. Hasil partisi e.a. FCBR hanya didapatkan fraksi metanol (f.m. FCBR) dan dari hasil partisi ekstrak etil asetat miselia CBR1D14 (e.a. MCBR) didapatkan fraksi metanol (f.m. MCBR) dan fraksi heksana (f.h. MCBR). Fraksi metanol FCBR dan f.m. MCBR menunjukkan aktivitas penghambatan perkecambahan konidia C. acutatum. Selain itu, f.m. MCBR juga menunjukkan penghambatan terhadap pertumbuhan radial C. acutatum, sedangkan f.h. MCBR tidak menunjukkan aktivitas antifungi terhadap C. acutatum. Nilai IC50 dan IC95 f.m. FCBR lebih rendah dibandingkan dengan f.m. MCBR dan fungisida benomil dalam menghambat perkecambahan konidia C. acutatum. Fraksi metanol FCBR dan f.m. MCBR diuji aktivitas antifunginya secara in vivo pada buah cabai dengan metode perendaman buah. Peubah yang diamati pada pengujian ini yaitu insidensi dan diameter bercak penyakit antraknosa pada buah cabai. Fraksi metanol FCBR (IC95 609.90 ppm) dan f.m. MCBR (IC95 1178.27
Keyword: antraknosa, bioautografi, ekstrak miselia, filtrat kultur, perkecambahan konidia

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: