Judul: Autentikasi Ikan Kerapu Dari Perairan Aceh Berdasarkan Marka Gen Cytochrome Oxydase Subunit I (Coi).
Abstrak: Ikan kerapu atau groupers merupakan ikan karang ekonomis penting yang banyak diekspor ke Singapura, Thailand, dan Hongkong. Perlindungan terhadap sumberdaya ikan di Indonesia perlu dilakukan, terutama yang memiliki nilai ekonomis dan ekspor yang tinggi. Autentikasi jenis sumberdaya perlu dilakukan dalam hal perlindungannya. Autentikasi spesimen ikan kerapu dapat dilakukan dengan teknik identifikasi molekuler yang dapat membedakan hingga ke tingkat spesies. Tujuan penelitian ini adalah autentikasi ikan kerapu melalui penelusuran variasi basa nukleotida gen COI pada ikan kerapu yang berasal dari Aceh dan mengkaji hubungan kekerabatan antar ikan kerapu tersebut berdasarkan marka molekuler gen COI. Hasil konstruksi pohon filogeni membentuk dua klaster utama yang mengindikasikan pemisahan yang jelas antara famili Serranidae dan Nemipteridae. Famili Serranidae terdiri dari tiga subcalde (subklaster) yaitu genus Cephalopholis, Epinephelus, dan Variola. Sedangkan famili Nemipteridae hanya membentuk satu subklaster yaitu genus Scolopsis. Tiga spesies memiliki kemiripan ≥ 97% yaitu Variola albimarginata, Cephalopholis urodeta, Cephalopholis sexmaculata. Akan tetapi tiga spesies lainnya yaitu Cephalopholis boenak, Epinephelus merra, Scolopsis vosmeri memiliki identifikasi kemiripan ≤ 97%.
Keyword: autentikasi, COI, filogeni, kerapu

Judul: . Keragaman Genetik Dan Rekonstruksi Filogeni Ikan Kerapu Genus Epinephelus Dari Beberapa Perairan Indonesia
Abstrak: Ikan kerapu dari genus Epinephelus merupakan jenis ikan demersal yang sebagian hidupnya di daerah terumbu karang pada perairan tropis dan subtropis. Namun beberapa jenis pada fase juvenil dan larva ditemukan di daerah hutan mangrove dan padang lamun. Jumlah jenis ikan kerapu banyak ditemukan di perairan Indonesia, tercatat ada sekitar 110 spesies yang hidup di perairan Indo-Pasifik. Para nelayan telah melakukan penangkapan ikan kerapu meliputi hampir semua perairan karang yang ada di Indonesia. Hal ini disebabkan karena keuntungan yang diperoleh dalam perdagangan kerapu hidup sangat besar. Eksploitasi yang tinggi dan kurangnya upaya konservasi dapat menyebabkan berkurangnya stok ikan kerapu pada beberapa perairan di Indonesia. Upaya konservasi yang dapat dilakukan adalah dengan menjaga sumberdaya genetik, jenis dan ekosistem ikan tersebut. Sumber daya genetik merupakan tahapan dasar dalam upaya melindungi sumber daya ikan kerapu, melalui teknik DNA barcoding dan studi filogeni. Metode ini akan memudahkan dalam identifikasi bahkan hingga pada tingkatan spesies jika dibandingkan dengan hanya menggunakan metode identifikasi berdasarkan karakter morfologi. Penelitian ini menggunakan sampel ikan kerapu genus Epinephelus sebanyak 39 individu yang diambil dari perairan Lombok 12 individu, Karimunjawa 11 individu, Lampung 4 individu, Kendari, Madura, Numfor dan Tanakeke masing-masing 3 individu. Sampel dipreservasi kemudian dilanjutkan dengan proses ekstraksi, amplifikasi PCR (Polymerase Chain Reaction) dan elektroforesis di Laboratorium Biodiversitas dan Biosistematika Kelautan, Departemen Ilmu dan Teknologi Kelautan, IPB. Tahapan sekuensing selanjutnya dikirim ke Berkeley Sequencing Facility, USA dengan metode Sanger, didapatkan panjang sekuen semua sampel sebesar 526bp. Analisis data menggunakan program MEGA 6.0.5 dengan metode filogenetik Neighbor Joining (NJ) dan Maksimum Likelihood (ML), model evolusi Kimura 2-parameter dan replikasi bootstraps 1000x. Dari pohon filogeni terbentuk sebanyak tujuh clade. yaitu Epinephelus areolatus, Epinephelus merra, Epinephelus fasciatus, Epinephelus longispinis, Epinephelus coioides, Epinephelus ongus dan Epinephelus coeruleopunctatus. Selain itu, jarak genetik terdekat didapatkan adalah Epinephelus ongus dan Epinephelus coeruleopncstatus dengan jarak genetik 0.091 (9%) dan jarak genetik terjauh antara Epinephelus ongus dan Epinephelus merra dengan jarak genetik 0.178 (18%).
Keyword: Keragaman Genetik, Filogeni, Epinephelus, Perairan Indonesia

Judul: Zero-inflated negative binomial models in small area estimation.
Abstrak: The problem of over-dispersion in Poisson data is usually solved by introducing prior distributions which lead to negative binomial models. Poisson data sometime is also suffered by excess zero problems, a condition when data contains too many zero or exceeds the distribution's expectation. Zero Inflated Negative Binomial (ZINB) method can be utilized to solve such problems. This paper demonstrates the adaption of ZINB methods in Small Area Estimation with excess zero data. It is shown that the excess zero problem has substantially influenced the Empirical Bayes (EB) estimates, and the adaption of ZINB methods has improved the precision and reliability of the estimates. Key Words: Small Area Estimation, Zero-Inflation, Poisson-Gamma, Negative Binomial Regression, Empirical Bayes
Keyword: