Judul: Respon retina juvenil ikan kerapu lumpur (epinephelus coioides) terhadap cahaya
Abstrak: Sebagian besar metode penangkapan yang ada didasarkan pada sifat-sifat sensitivitas visual, pola gerak, distribusi penyebaran ikan tujuan penangkapan (Pascoe, 1990). Pengetahuan tentang respon retina ikan kerapu terhadap cahaya diharapkan mampu memberikan pengetahuan dasar untuk mengembangkan metode penagkapan. Adapun penelitian ini menggunakan juvenil ikan kerapu lumpur (Epinephelus coioides) dengan panjang total 12 cm sebagai hewan percobaan dalam pengujian lama waktu yang diperlukan ikan kerapu lumpur untuk merespon cahaya. Penelitian ini terdiri atas dua tahap, yaitu penelitian pendahuluan dan utama. Penelitian pendahuluan dilakukan antara 20 sampai 22 Maret 2002 di karamba jaring apung, Teluk Banten dengan tujuan untuk menentukan intensitas cahaya yang akan digunakan di laboratorium. Penelitian utama dilakukan mulai dari Maret sampai Juni 2002 di Instalasi Pengembangan dan Pengkajian Teknologoi Pertanian, Bojonegara dan laboratorium Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Institut Pertanian Bogor. Metode penelitian yang digunakan adalah observasi dan eksperimental. Pengamatan pola tingkah laku ikan kerapu lumpur dilakukan secara visual sampai kedalaman 3 m yang meliputi tingkah laku makan dan renang. Intensitas cahaya matahari yang masuk ke dalam perairan diukur dengan marine luxmeter sedangkan kecerahan perairan diukur dengan seichi disk. Seluruh pengamatan dan pengukuran dimulai pada saat matahari terbit sampai matahari berada di ketinggian maksimum. Sedangkan untuk penelitian utama perlakuan diberikan mulai tepat tengah malam. Asumsinya adalah cahaya buatan akan lebih efektif digunakan pada malam hari. Rancangan percobaan terdiri 1) rancangan perlakuan satu faktor, yaitu faktor lama pencahayaan dengan taraf perlakuan 30 menit, 60 menit, 90 menit, 120 menit dan...
Keyword: 

Judul: Pengaruh Warna Cahaya yang Berbeda Terhadap Tingkah Laku Berkumpulnya Juvenil Ikan Kerapu Tikus (Cromileptes altivelis)
Abstrak: Umumnya ikan kerapu ditangkap dengan menggunakan pancing, tombak dan perangkap. Alat tangkap tersebut masing-masing mempunyai kelebihan, kekurangan dan tingkat efisiensi yang berbeda. Apabila tingkah laku ikan disekitar alat tangkap serta dalam hubungannya dengan berbagai faktor dapat diketahui, maka akan dapat diketahui cara-cara untuk meningkatkan efisiensi dan kegunaan alat tangkap tersebut. Lebih jauh dari itu, mungkin akan timbul ide untuk menciptakan alat tangkap baru yang lebih sesuai dan bersifat ramah lingkungan. Tingkah laku ikan disekitar daerah iluminasi cahaya dipengaruhi oleh faktor lingkungan seperti suhu, kecerahan, arus, gelombang dan keberadaan makanan atau predator. Hal ini juga berubah berdasarkan kondisi biologis ikan seperti umur, kematangan gonad dan kandungan makanan dalam perut ikan. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis: (1) pola sebaran cahaya dengan warna yang berbeda, (2) tingkah laku pengumpulan juvenil ikan kerapu tikus (Cromileptes altivelis) disekitar daerah iluminasi cahaya, dan (3) untuk menjelaskan hubungan antara tingkah laku pengumpulan juvenil ikan kerapu tikus dengan pola sebaran cahaya. Penelitian ini dilakukan selama Bulan Juni dan Juli 2002 dengan metode eksperimental di Laboratorium Tingkah Laku Ikan, Fakultas Perikanan dan ilmu Kelautan, Institut Pertanian Bogor. Penelitian pendahuluan mengenai pola sebaran cahaya dilakukan pada bulan September 2001 di Stasiun Lapang Kelautan, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Institut Pertanian Bogor, Palabuhanratu, Kabupaten Sukabumi, Jawa Barat. Data yang diperoleh yaitu data primer berupa data pola sebaran cahaya di bawah permukaan air dan data reaksi ikan kerapu tikus terhadap pola sebaran cahaya yang diberikan. Data hasil penelitian berupa pola sebaran cahaya dianalisis secara deskriptif, sedangkan data reaksi ikan terhadap rangsangan cahaya berupa jumlah ikan yang berkumpul, jarak kumpulan ikan tersebut dari sumber cahaya, dan nilai iluminasi cahaya di daerah kumpulan ikan diananlisis secara statistik menggunakan rancangan dasar RAL satu arah. ...
Keyword: 

Judul: Penyusunan Overlap Graph menggunakan Suffix Tree pada DNA Sequence
Abstrak: The DNA sequence assembly is very important in genome analysis. This step aims to reconstruct contigous DNA fragment (contigs) from short fragment by concatenating fragments based on the overlap region among them. This method employs overlap graph for solving the problems. In this graph, nodes represent fragments and edges represent overlap. This research developed a software for constructing overlap graph using suffix tree. The evaluation was conducted by measuring the number of nodes, number of edges, and the execution time in many values of minimum overlap. The minimum overlap is defined as the minimum length of substring which is considered as the overlap region between two fragments. The evaluation results showed that the number of nodes, the number of edges, and the execution time were increased with the decreasing of the minimum overlap value.
Keyword: