Judul: Karakteristik Hidroakustik di Bagian Utara, Tengah, dan Selatan Teluk Bone
Abstrak: Teluk Bone memiliki kondisi perairan yang khusus. Bentuk Teluk Bone yang menyerupai bejana tertutup, menghadap ke selatan, dengan bentangan 2° (sekitar 120 mil laut), diperkirakan memiliki kondisi perikanan yang khas. Informasi kondisi perikanan di Teluk Bone diungkap menggunakan metode hidroakustik berdasarkan analisis Allocation Threshold. Metode ini dipastikan memberikan informasi kondisi perikanan lebih baik daripada sekedar proses integrasi echo. Data echo dikumpulkan pada bulan April 2014 menggunakan Simrad EY60. Perairan Teluk Bone di bagi kedalam tiga zona utara, tengah dan selatan. Kedalaman Teluk Bone diamati dalam empat lapisan kedalaman (0-25 m), (25-50 m), (50-75 m), dan (75-100 m). Pengolahan data dilakukan menggunakan perangkat lunak Echoview 4.8, Microsoft Office 2010, Matlab R2010a, dan ArcGis 10.2. Kelompok obyek di tiga zonasi dan empat lapisan kedalaman menunjukkan perbedaan. Terdapat variasi keragaman obyek sesuai posisi lintang dan posisi kedalaman. Frekuensi kemunculan paling banyak terdapat di kedalaman (0-25 m) bagian utara. Di wilayah tengah Teluk Bone, paling banyak di kedalaman (75-100 m). Di wilayah selatan Teluk Bone, paling banyak di kedalaman (50-75 m).
Keyword: hidroakustik Teluk Bone, metode echo allocation threshold

Judul: Karakteristik Akustik Kolom Air di sekitar Rumpon Lokasi Teluk Bone, Sulawesi Selatan
Abstrak: Penelitian ini mengintegrasikan data hidroakustik di sekitar rumpon yang terdapat di Teluk Bone Sulawesi Selatan. Data merupalan hasil survei Balai Penelitian Perikanan Laut (BPPL) Kementerian Kelautan dan Perikanan (KKP). Pengambilan data dilakukan pada tanggal 19-24 April 2014 di perairan Teluk Bone. Teluk Bone merupakan teluk yang terletak di Kabupaten Bone, luas wilayah 4559 km2. Beberapa Rumpon yang tersebar di Teluk Bone di investigasi menggunakan metode hidroakustik menggunakan analisis Allocation Threshold. Metoda Echo Allocation Threshold memberikan informasi kondisi perikanan lebih baik daripada sekedar proses integrasi echo. Data echo tersebut dikumpulkan menggunakan Simrad EY60. Perairan Teluk Bone dibagi kedalam tiga bagian yaitu Utara, Tengah dan Selatan. Secara menegak, perairan diamati dalam empat lapisan kedalaman (0-25 m), (25-50 m), (50-75 m), dan (75-100 m). Data diolah dengan bantuan perangkat lunak Echoview 4.8, Microsoft Excel 2010 dan Donggle Echoview 4.8. Kelompok target di tiga zonasi dan empat lapisan kedalaman menunjukkan perbedaan. Terdapat variasi keragaman suatu target sesuai posisi lintang dan kedalaman. Frekuensi kemunculan paling banyak terdapat di kedalaman (0-25 m) bagian Selatan. Wilayah Tengah Teluk Bone, paling banyak di kedalaman (0-25 dan 76- 100 m) sedangkan wilayah Utara Teluk Bone, kemunculan paling banyak di kedalaman (76-100 m). Target yang ditemukan pada Selatan Teluk Bone adalah rata-rata target yang berukuran sedang dengan rentang -51 dB hingga -71 dB. Pada wilayah Tengah Teluk Bone rata-rata target yang ditemukan adalah target berukuran besar dengan -33 dB hingga -51 dB, sedangkan pada Utara Teluk Bone rata-rata target yang paling dominan adalah target berukuran kecil dengan nilai - 71 dB hingga -90 dB, diduga sebagai larva ikan, krustasea dan plankton.
Keyword: Hidroakustik, Rumpon, Integrasi data dengan Echo Allocation Threshold

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA