Judul: Amplifikasi dan Karakterisasi Gen Penyandi Lakase LaccI16 Neurospora crassa InaCC F226
Abstrak: Lakase adalah salah satu oksidoreduktase yang sangat bermanfaat dalam berbagai industri diantaranya industri kertas, minuman beralkohol, dan sel bahan bakar biologis. Neurospora crassa InaCC F226 yang merupakan salah satu kapang ligninolitik penghasil lakase digunakan pada penelitian ini. Penelitian ini bertujuan melakukan amplifikasi, pemotongan, serta sekuensing gen penyandi lakase LaccI16 sehingga pada penelitian selanjutnya dapat dilakukan ekspresi berlebih menggunakan gen penyandi lakase tersebut. DNA genom N. crassa InaCC F226 berhasil diisolasi pada penelitian ini. Hasil amplifikasi menunjukkan bahwa gen penyandi lakase LaccI16 berukuran sekitar 1900 bp serta mempunyai dua situs restriksi KpnI dan satu situs restriksi PstI. Gen penyandi lakase LaccI16 juga memiliki tingkat kesesuaian yang tinggi dengan gen penyandi lakase lainnya yang terdapat pada bank data.
Keyword: KpnI, LaccI16, lakase, N. crassa, PstI

Judul: Strukur Prediksi dan Identifikasi Substrat Spesifik Lakase Isolat Lokal Neurospora crassa inaCC F226
Abstrak: Sekuen gen lakase dari isolat lokal Neurospora crassa InaCC F226 telah diidentifikasi bahwa terdapat tiga motif sekuen H-X-H, yang merupakan sekuen khas lakase diantaranya adalah HWH, HSH, dan HXXH. Ketiga motif sekuen tersebut menunjukkan terlibat dalam situs pengikatan atom tembaga. Terdapat tiga copper-binding loop yang mengandung motif sekuen, dengan beberapa residu asam amino lestari. Residu asam amino lestari pada copper-binding loop tersebut diantaranya 274(HWH)G---DG---T-CP pada CBL-1, 314GT-WY(HSH)FS-QYGG--- pada CBL-2, dan 607HPIHL pada CBL-3. Lakase isolat lokal Neurospora crassa (InaCC F226) merupakan enzim multisubunit yang terdiri atas tiga domain fungsional dengan motif struktur greek-key betta barrel yang merupakan struktur khas lakase. Lakase memiliki empat atom tembaga yang memiliki peran penting dalam aktivitas katalitik. Perbaikan struktur prediksi LAC inaCC melalui simulasi dinamika molekuler menunjukkan peningkatan kualitas struktur. Peningkatan persentase daerah disukai pada ramachandran plot (78.8%) dan persentil classchore serta nilai molprobity (99th dan 89th) menunjukkan bahwa struktur lakase menuju perubahan konformasi menjadi konformasi yang lebih stabil dengan resolusi yang lebih baik dibandingkan struktur prediksi awal. Metode MMPBSA diketahui merupakan metode yang lebih akurat dan sensitif dalam perhitungan energi bebas Gibbs ikatan substrat terhadap LAC inaCC. Senyawa aflatoxin dan ABTS merupakan substrat spesifik untuk lakase dari fungi isolat lokal Neurospora crassa inaCC F226.
Keyword: Lakase, Neurospora crassa, Prediksi Struktur, Simulasi Dinamika Molekul, Substrat Spesifik

Judul: Dampak QBO terhadap Curah Hujan yang Dipengaruhi oleh MJO di Indonesia.
Abstrak: QBO memiliki hubungan yang kuat dengan MJO di wilayah tropis selama musim dingin di belahan bumi utara (BBU). Frekuensi dan jumlah hari MJO lebih tinggi ketika fase timuran QBO (QBOE) dibanding fase baratannya (QBOW). Meskipun, QBO dan MJO terhubung erat, tetapi dampak QBO terhadap curah hujan belum diketahui. Penelitian ini dilakukan untuk menganalisis dampak fase – fase QBO terhadap curah hujan saat MJO aktif di Indonesia. Fase QBO ditentukan menggunakan anomali kecepatan angin zonal 50 hPa sedangkan fase MJO ditentukan menggunakan real-time multivariate index (RMMI ). Curah hujan dari TRMMv7 digunakan untuk menganalisis dampak QBO terhadap curah hujan MJO. Total kolom uap air, suhu 100 hPa, dan angin vertikal digunakan untuk menganalisis hubungan QBO-MJO terhadap variabilitas curah hujan. Untuk mengisolasi sinyal MJO, digunakan band-pass filter. Aktivitas konveksi MJO yang dianalisis menggunakan outgoing longwave radiation (OLR) menunjukkan amplitudo lebih besar saat QBOE dibanding QBOW. Sejalan dengan hal tersebut, anomali curah hujan harian meningkat (menurun) hingga 3,3 mm/hari (1,8 mm/hari) dan adanya propagasi ke timur yang lebih (kurang) jelas saat QBOE (QBOW). Selain itu, saat QBOE (QBOW) perubahan peluang curah hujan ekstrem meningkat (menurun) hingga 100% (70%) dan tersebar lebih tinggi (rendah) selama fase basah MJO. Suhu tropopause lebih dingin (hangat), distribusi luas (sempit) dari total kolom uap air, dan vertikal adveksi ke atas (ke bawah) teramati terjadi saat QBOE (QBOW). Pengamatan tersebut mengarah pada adanya konveksi skala besar yang lebih kuat (lemah) dan peningkatan (penurunan) intensitas curah hujan dan peluang curah hujan ekstrem.
Keyword: curah hujan, fase baratan QBO, fase timuran QBO, Indonesia, MJO.