Judul: Kloning gen CYP71AV asal Artemisia annua di dalam Escherichia coli DH-5α
Abstrak: Infection of malaria caused 1.7-2.5 million people die each year. Artemisia annua contains artemisinin compounds effective to eradicate malaria types that are resistant to quinine and chloroquine. CYP71AV is a gene that has critical role in the biosynthesis of artemisinin by catalyzing the oxidation of intermediate products Amorpha-4,11-diene, which are highly produced in the biosynthesis of artemisinin. This study aimed to clone the CYP71AV gene through recombinant DNA technology. CYP71AV gene from total cDNA was amplified using specific primers. CYP71AV gene was inserted into pGEM-T Easy plasmid. The recombinant plasmid containing CYP71AV gene introduced into Escherichia coli strain DH5-α. CYP71AV gene sequencing produce approximately 1571 base pairs encoding 523 amino acids. Local alignment analysis of nucleotides with CYP71AV of several species listed in GeneBank showed that the cDNA CYP71AV have 98% similarity with complete cds A.annua (JQ254992.1). Domain analysis showed that the CYP71AV gene has three conserved domain
Keyword: Bogor Agricultural University (IPB), Artemisia annua., clone, cDNA CYP71AV

Judul: Isolasi dan Kloning pada Escherichia coli Gen AaWRKY1 Artemisia annua L
Abstrak: Artemisia annua WRKY1 (AaWRKY1) gene encodes a protein WRKY a transcriptional activator of Amorpha-4,11-diene synthase (ADS). The overexpression farnesil diphosphate AaWRKY1 genes can increase levels of artemisinin. This study was aimed to isolate an AaWRKY1 gene from Artemisia annua L. Amplification of AaWRKY1 gene was done by PCR (Polymerase Chain Reaction) technique using specific primer pairs and cDNA as a template. Subsequently, AaWRKY1 gene fragment was cloned into a cloning vector pJET 1.2 using T4-ligase and transformed into competent cell Escherichia coli DH5α through heat shock method, and grown on LB agar medium containing ampicillin. Result showed that amplification with specific primers of AaWRKY1 gene generated an amplicon fragment of ± 1500 bp. The gene fragment was succesfully cloned into pJET 1.2 and transformed into cells of E. coli DH5α. Confirmation of recombinant clone was carried out using colony PCR to obtain recombinant colonies.
Keyword: Bogor Agricultural University (IPB), pJET 1.2 Vector, colony PCR, cloning, AaWRKY1 gene, Artemisia annua L

Judul: Karakteristik lompatan hidrolik terhadap pelimpah terjunan pada saluran segi empat
Abstrak: Aliran dengan kecepatan tinggi dalam kondisi superkritis yang melintasi bangunan pelimpah, sebelum bergerak lebih jauh ke arah hilir saluran dimana bilangan Froude (F) lebih besar dari satu harus diubah menjadi aliran subkritis dimana bilangan Froudenya lebih kecil dari satu. Aliran yang meninggalkan kaki pelimpah merupakan aliran yang memiliki kandungan energi yang amat berarti sehingga dapat menimbulkan pengikisan yang besar. Pengubahan bilangan Froude dari kondisi superkritis ke subkritis dimaksudkan agar terjadi perubahan kandungan energi, sehingga aliran menjadi non erosive. Agar daya erosive aliran dapat berkurang, maka biasanya pada bagian hilir dari bangunan pelimpah dibuatkan suatu bangunan peredam energi. Erosi yang terjadi di hilir bangunan pelimpah dapat disebabkan dari keberadaan bangunan pelimpah itu sendiri, maupun bangunan peredam energi yang kurang tepat. Hal ini terutama menyangkut beberapa kejadian lompatan hidrolik yang timbul pada bangunan peredam energi tersebut.. Suatu metode yang efektif untuk menjamin bahwa lompatan hidrolik selalu terjadi pada daerah yang dilindungi, adalah dengan menggunakan bangunan peredam energi yang terdiri dari beberapa tipe dengan..dst
Keyword: