Judul: Identifikasi Penciri Morfologi Daun serta Karakterisasi DNA Barcode pada Lima Spesies Shorea
Abstrak: Shorea merupakan genus penghasil kayu komersial yang pada habitat asli keberadaannya sudah jarang ditemukan, sehingga perlu dilakukan upaya penanaman. Identifikasi spesies merupakan hal penting dalam kegiatan penanaman, termasuk pada budidaya Shorea. Penelitian identifikasi karakter penciri morfologi daun terhadap Shorea. leprosula, S. ovalis, S. guiso dan S. parvifolia bertujuan untuk mengkaji karakter penciri agar memudahkan identifikasi di lapangan. Lima daun diambil dari lima individu per spesies. Duabelas variabel morfologi dianalisis PCA dengan software Past dan analisis Clustergram mengunakan software heatmap. Hasil analisis menunjukan bahwa dari duabelas variabel yang diamati, hanya enam variabel yang nilainya dapat mempengaruhi penciri morfologi daun, yaitu keliling daun, luas daun, panjang daun keseluruhan, aspect ratio, form factor dan perimeter ratio of diameter. Bentuk ujung daun dari keempat spesies memiliki nilai yang sama yaitu acuminate (meruncing). Karakter daun S. ovalis mirip dengan S. guiso dan S. leprosula mirip dengan S. parvifolia. Hanya karakter LP (panjang dari pangkal daun ketitik terlebar daun) yang menunjukan nilai berbeda pada keempat Shorea yang dibandingkan. S. ovalis, memiliki nilai LP paling tinggi, disusul S. guiso dan S. leprosula, sedangkan S. parvifolia memiliki nilai LP yang paling rendah. Penelitian karakterisasi DNA barcode pada S. leprosula, S.ovalis, S. guiso S. acuminata dan S. parvifolia bertujuan untuk mendapatkan informasi karakter wilayah ITS 1 dan ITS 2 sebagai kandidat DNA barcode berdasarkan kemudahan amplifikasi, diskriminasi hasil BLAST, barcoding gap dan pohon filogenetik yang terbentuk. Data dianalisis menggunakan software CodonCode aligner V.8.0.2 dan software MEGA. Hasil penelitian menunjukan bahwa DNA Barcode ITS 1 lebih mudah dalam amplifikasi PCR, namun sekuen yang dihasilkan memiliki tingkat kemiripan yang rendah dengan data referensi. Berdasarkan analisis barcoding gap keduanya belum mampu memisahkan jarak intra dan interspesifik, sedangkan berdasarkan konstruksi pohon filogenetik, belum mampu menghasilkan polarisasi karakter pada sampel yang diuji terutama untuk karakter plesimorfik. Oleh karena itu, DNA Barcode ITS 1 dan ITS 2 ini belum bisa digunakan untuk identifikasi spesies dari Shorea terutama pada kelima spesies yang digunakan dalam penelitian ini.
Keyword: DNA barcode, ITS 1, ITS 2, penciri morfologi, Shorea

Judul: Ekstraksi dan Klasifikasi Fitur Geometri Kontur Daun Shorea Berbasis Citra Digital
Abstrak: Shorea merupakan salah satu marga tumbuhan pada susunan hutan hujan tropis yang memiliki 194 spesies serta kualitas kayu yang baik sehingga sering diolah sebagai bahan konstruksi ringan hingga berat. Eksploitasi hutan secara masif telah mengancam kelestarian Shorea di alam. Sebanyak 156 spesies telah tercatat dalam daftar merah IUCN (International Union for Conservation of Nature). Dari 156 spesies tersebut, 59.6% berada pada kategori critically endangered sehingga perlu dilakukan konservasi untuk menyelamatkannya dari kepunahan. Dalam pengumpulan bahan tanaman Shorea pada fase anakan, sering kali kesulitan membedakan antara anakan Shorea jenis yang lain, sehingga dapat megakibatkan kesalahan dalam pengumpulannya. Untuk menghidari kesalahan tersebut, perlu dilakukan identifikasi dengan cepat dan akurat. Karena pentingnya identifikasi bagi botanikus maka diperlukan suatu alat atau sistem untuk mengidentifikasi spesies Shorea dengan mudah. Proses identifikasi dapat dilakukan secara sederhana dengan menggunakan morfologi tumbuhan. Morfologi tumbuhan berfungsi untuk menggambarkan bagaimana wujud atau bentuk tumbuhan. Bagian tumbuhan yang mudah dijumpai dan sering digunakan untuk mengenali jenis tumbuhan adalah daun. Daun memiliki fitur utama yang membedakan setiap jenis tanaman, salah satunya yaitu Kontur daun. Kontur daun berperan penting dalam proses identifikasi karena memiliki arsitektur unik yang membedakan antar jenis tumbuhan. Matematika geometri dapat membantu dalam mengekstraksi citra kontur daun. Untuk menentukan posisi titik konturmenggunakannilai koordinat geometri. Nilai koordinat dapat digunakan untuk menghitung sudut, jarak, kemiringan kontur. Demikian nilai koordinat juga mampu memberikan informasi penting titik kontur yang unik. Pendekatan geometri pada penelitian ini akan digunakan untuk mengekstraksi ciri dengan menghitung nilai jarak, posisi, kemiringan, perubahan sudut, kelengkungan landmark. Kelima fitur tersebut dianalisis untuk mengetahui fitur yang paling berpengaruh dalam mengklasifikasikan spesies Shorea spp (S. acuminata, S. leprosula, S. ovalis, dan S. selanica). Untuk mengklasifikasikan spesies Shorea spp, teknik klasifikasi yang digunakan adalah Support Vector Machine (SVM). Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa pendekatan geometri kontur dapat melakukan ekstraksi nilai fitur jarak, posisi, kemiringan, perubahan sudut, kelengkungan landmark dengan cukup baik. Untuk setiap fitur, dilakukan analisis yang hasilnya menunjukkan bahwa fitur kemiringan merupakan fitur yang dapat membedakan keempat spesies Shorea spp dengan baik. Kemudian, hasil klasifikasi menggunakan SVM untuk identifikasi spesies Shorea spp menghasilkan rataaan akurasi tertinggi sebesar 75.67%.
Keyword: ekstraksi ciri, geometri, Shorea, SVM, kontur daun

Judul: Dynamical System of Hepatitis B in Three Groups with Vaccination
Abstrak: The aim of this study is to modify the hepatitis B transmission model in three age groups involving vaccination from the model conducted by Zhoe and Zhang.The method used is to analyze the stability of the fixed point and its basic reproduction number (R_0). Performed stability analysis and numerical simulation to see population dynamics. Next, a sensitivity analysis of the parameters was carried out to see its effect on R_0. From the analysis obtained two fixed points, namely non-endemic and endemic fixed points. Non-endemic fixed points are locally asymptotically stable if R_0 <1 Meanwhile, the endemic fixed point is locally asymptotically stable if R_0 > 1. Hepatitis vaccination affects the number of susceptible population, because the more successful the vaccination, the smaller the number of susceptible populations so that the smaller the population will be infected.
Keyword: Dynamic, Hepatitis B, Vaccine, Mathematical model