Judul: Identifikasi Subtipe, Patogenitas, Dan Filogenetik Virus Avian Influenza Isolat 2012–2013.
Abstrak: Penyakit Avian Influenza (AI) merupakan penyakit infeksius yang sangat penting pada unggas yang disebabkan oleh virus Avian Influenza. Penyakit ini pertama kali masuk ke Indonesia pada tahun 2003 dan telah menyebar secara luas menyebabkan kerugian ekonomi yang besar dan kematian yang tinggi pada peternakan-peternakan unggas. Dewasa ini wabah penyakit AI masih sering terjadi secara sporadis meskipun pada peternakan yang telah rutin divaksin AI. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menentukan subtipe dan patogenitas virus AI serta melakukan analisis filogenetik dan jarak kekerabatan gen hemaglutinin dari virus-virus AI yang diisolasi pada tahun 2012–2013 di daerah Jawa Barat, Jawa Tengah, dan Medan. Sampel diperoleh dari peternakan unggas yang mengalami wabah penyakit AI dan diinokulasikan serta dipropagasi dalam Telur Ayam Berembrio (TAB) specific pathogen free (SPF) berumur 10 hari.Cairan alantois yang dipanen 5 hari setelah inokulasi diuji hemaglutinasi (HA). Cairan alantois dengan HA positif diuji lebih lanjut untuk menentukan subtipe hemaglutinin dan neuraminidase menggunakan real-time reverse transcription polymerase chain reaction (RRT-PCR) dan dipersiapkan untuk proses pengurutan oligonukleotida menggunakan reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). Hasil proses pengurutan oligonukleotida dari gen hemaglutinin digunakan dalam analisis pola asam amino daerah pemotongan gen hemaglutinin dan hubungan kekerabatan antar virus-virus yang diisolasi. Hasil penelitian menunjukkan bahwa semua isolat tergolong ke dalam HPAI H5N1 dengan pola asam amino daerah pemotongan PQRESRRKKR/GLF dan PQRERRRKR/GLF. Isolat-isolat tersebut terbagi ke dalam klaster 2.1 dan klaster 2.3 dan masih memiliki hubungan kekerabatan yang dekat dengan jarak genetik kurang dari 0.3 antara virus yang satu dengan yang lainnya dan juga terhadap beberapa isolat virus AI yang menyebabkan wabah-wabah sebelumnya di Indonesia. Di masa mendatang isolat-isolat yang digunakan dalam penelitian ini dapat dimanfaatkan sebagai alternatif strain virus untuk produksi vaksin AI yang diharapkan dapat melindungi peternakan-peternakan unggas terhadap ancaman wabah AI.
Keyword: Avian Influenza, daerah pemotongan, hemaglutinin, patogenitas, filogenetik

Judul: Karakterisasi Molekuler Gen Hemaglutinin Virus Avian Influenza Subtipe H9N2 yang Diisolasi dari Ayam Layer di Pulau Jawa.
Abstrak: Virus Avian Influenza (VAI) subtipe H9N2 merupakan ancaman bagi peternak layer di seluruh dunia. Infeksi VAI subtipe H9N2 dapat mengakibatkan kerugian ekonomi yang cukup besar bagi peternak layer, karena menyebabkan penurunan produksi telur hingga 70% apabila disertai oleh ko-infeksi bakteri atau virus lain. Pulau Jawa merupakan pulau dengan kepadatan ternak unggas yang paling tinggi di Indonesia. Wabah VAI H9N2 di Pulau Jawa belum pernah dilaporkan, namun mengingat besarnya kemungkinan telah terjadi penyebaran VAI subtipe H9N2 ke pulau Jawa, maka kegiatan surveilans terkait keberadaan virus ini perlu dilakukan, terutama pada peternakan layer yang mengalami penurunan produksi telur secara drastis. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk melakukan karakterisasi secara molekuler isolat VAI subtipe H9N2 yang diisolasi dari ayam layer yang mengalami penurunan produksi telur di Pulau Jawa, serta mempelajari hubungan filogenetiknya dengan VAI subtipe H9N2 yang diisolasi di negara lain yang mengalami wabah H9N2. Tiga puluh tiga isolat arsip suspek VAI H9N2 digunakan pada penelitian ini. Isolat virus di propagasi pada telur ayam berembrio spesific antibody negative (TAB-SAN), kemudian RNA virus diekstraksi dari cairan alantois TAB dan identifikasi virus dilakukan dengan metode reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) terhadap keberadaan gen H9 dan N2. Sekuensing nukleotida terhadap gen hemaglutinin (HA) dilakukan pada isolat virus yang menunjukkan hasil positif terhadap gen H9 dan N2. Karakteristik gen HA dianalisa berdasarkan motif cleavage site, receptor binding site, antigenic site serta ada tidaknya Potential N-Linked Glycosylation Site (PGS) di sekitar receptor binding site. Kedekatan filogenetik dianalisa dengan membandingkan isolat virus pada penelitian ini dengan isolat VAI subtipe H9N2 lainnya pada GenBank melalui pohon filogenetik. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa 13 dari 33 isolat virus merupakan VAI subtipe H9N2 dan masuk ke dalam lineage Y280, clade h9.4.2.5, serta memiliki kedekatan genetik dengan isolat Cina tahun 2013 dan Vietnam tahun 2014 dengan persentase homologi nukelotida sebesar 96.9%–98.8%. Pola susunan asam amino pada cleavage site gen HA dari 13 isolat VAI H9N2 adalah PSR(K)SSR↓GLF yang mengindikasikan bahwa virus pada penelitian ini memiliki patogenisitas yang rendah pada unggas (low pathogenic avian influenza/LPAI).
Keyword: VAI subtipe H9N2, layer, karakterisasi molekuler, gen HA

Judul: Photovoltaic Effect In A CdS/P3HT-Chitosan Junction
Abstrak: A CdS/Polymer junction has been fabricated and it’s photovoltaic effect has been studied. The polymer is a blend of poly-3hexyltiophene (P3HT), chitosan and polyethileneglicol (PEG). Boron in situ doping of CdS using Chemical Bath Deposition (CBD) was investigated. The effect of B-doping and annealing on optical properties as well as on electrical and morphology of CdS film were studied. The structure and morphology of the film were detected by XRay Diffraction (XRD) and Scanning Electron Microscopy (SEM). The polymer film was sandwiched between the CdS semiconductor and an ITO glass to form an ITO/CdS/Polymer/ITO photovoltaic cell. Time constant (τ) and open circuit voltage (Voc) were investigated by using voltage censor. The bandgap of films were determined using absorbance edge method. The results of annealing optical bandgap of undoped CdS shifted from 2,49 eV down to 2,39 eV. Phase transition of CdS due to annealing temperature and induced lattice damage due to doping. The room temperature conductivity of polymer is 3,8 – 6,6 x 10-7 S/cm as function of frequency between 100 – 5000 Hz. The Voc of the fabricated cells ranges between 107 – 286 mV and time constant ranges between 2,5 to 43,75 s.
Keyword: