Judul: Molecular Identification and Characterization of  Trypanosoma Subgenus Trypanozoon from Banten and Sulawesi
Abstrak: Tripanosomiasis adalah penyakit yang disebabkan oleh parasit protozoa dari genus Trypanosoma dan memberikan dampak ekonomi signifikan pada populasi ternak. Beberapa varian dari penyakit ini termasuk Nagana, Surra, dan Dourine . Ada beberapa spesies dalam subgenus Trypanozoon, seperti T. brucei, T. evansi, dan T. equiperdum yang sulit dibedakan secara morfologi dan dibutuhkan pendekatan molekuler yang lebih tepat. Kesalahan dalam identifikasi spesies bisa mempengaruhi pemahaman epidemiologi penyakit, terutama di Indonesia. Oleh karena itu, ada kebutuhan untuk pengembangan metode molekuler yang lebih akurat, seperti yang menargetkan gen maxicircle dan minicircle, untuk identifikasi yang lebih tepat. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi dan mengetahui kekerabatan isolat Trypanosoma dari subgenus Trypanozoon dan mengetahui karakter biologinya, khususnya dari Sulawesi dan Banten, guna meningkatkan pengawasan dan pemahaman mengenai penyakit tersebut di Indonesia. Delapan isolat Trypanosoma dari sapi dan kerbau, yang berasal dari Sulawesi dan Banten, diperoleh dari laboratorium parasitologi Balai Besar Pengujian Standar Instrumen Veteriner (BBPSIV). Seluruh isolat dipropagasi dalam mencit dan selanjutnya dipurifikasi. Teknik PCR, dengan primer ITS-1, MNC, dan MXC, digunakan untuk identifikasi molekuler, diikuti dengan pengurutan DNA. Dari sembilan sampel, semua menunjukkan hasil positif dengan primer ITS-1 dan MNC, namun hanya tujuh yang positif dengan MXC. Analisis sekuens menunjukkan kemiripan genetik rata-rata 93-94% dengan T. evansi dan T. equiperdum dari berbagai wilayah dunia. Morfologi dan karakteristik biologis isolat Trypanosoma asal Minahasa dan Gowa memiliki morfologi dengan panjang berkisar antara 22-37 µm, kinetoplast DNA subterminal, serta bentuk posterior yang tumpul. Kedua isolat menunjukkan karakteristik biologi yang mirip, termasuk periode prepaten pada hari ke-4 pasca infeksi dan tiga pola parasitemia dengan biotipe 1 memiliki masa infeksi singkat 5-7 hari sementara biotipe 3 berkisar 10-12 hari hingga menyebabkan kematian. Biotipe 2 memiliki dua puncak parasitemia yang diakhiri dengan kematian.
Keyword: Molecular identification, Parasitemia patterns, Trypanosomiasis, Trypanozoon

Judul: Identifikasi Molekuler terhadap Trypanosoma evansi pada Kuda di Bogor dan Bandung
Abstrak: Surra atau trypanosomiasis merupakan penyakit yang disebabkan oleh infeksi parasit darah jenis Trypanosoma evansi. Penyakit ini menimbulkan kerugian ekonomi yang sangat signifikan di industri peternakan kuda di Indonesia. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi keberadaan T. evansi pada kuda dengan teknik molekuler. Sebanyak 33 sampel darah diambil dari kuda di beberapa peternakan di Bogor dan Bandung, Jawa Barat. Metode pemeriksaan yang dilakukan pada penelitian ini adalah pemeriksaan ulas darah tipis yang diwarnai Giemsa dan diobservasi di bawah mikroskop cahaya. Identifikasi lebih lanjut dilakukan menggunakan polymerase chain reaction (PCR) terhadap gen RoTat 1.2 VSG. Hasil pemeriksaan ulas darah menunjukkan bahwa seluruh sampel negatif terhadap T. evansi. Sementara itu, pada pemeriksaan PCR terdeteksi 17 sampel positif terhadap T.evansi. Berdasarkan lokasi, tingkat infeksi T. evansi pada kuda di Bogor dan Bandung, masing-masing sebesar 58,33% dan 33,33%. Kuda betina memiliki tingkat infeksi yang lebih tinggi dibanding kuda jantan. Hasil penelitian ini memberikan informasi mengenai infeksi parasit darah T. evansi pada kuda melalui teknik diagnostik molekuler., Trypanosomiasis, commonly known as surra, is a horse disease caused by the blood parasite Trypanosoma evansi. This disease has a significant economic impact on the equine farm industry. This study aims to discover T. evansi infection in horses in the Bogor and Bandung regions using molecular techniques. Thirty-three horse blood samples were collected from apparently healthy horses on farms in Bogor and Bandung, West Java. Thin blood smears stained with Giemsa were examined under a light microscope for the presence of parasites. The polymerase chain reaction (PCR) approach was used to further identify the RoTat 1.2 VSG gene. The microscopic examination of all samples revealed that all were negative for T. evansi, while the PCR technique revealed that 17 samples were positive for T. evansi. T. evansi infection rates in horses varied by location, with Bogor having a rate of 58.33% and Bandung having a rate of 33.33%. Mares are more susceptible to infection than stallions. The infection rate in mares is higher than in stallions. The results from this study provide baseline information on hemoprotozoan parasite T. evansi infection using a molecular diagnostic technique.
Keyword: horse, polymerase chain reaction (PCR), Trypanosoma evansi

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: