Judul: Genotyping of Sengon (Falcataria falcata) Accessions Resistant and Susceptible to Puru Rust using Single Nucleotide Polymorphisms Markers
Abstrak: Sengon (Falcataria falcata) merupakan jenis pohon cepat tumbuh (fast growing species) yang sering digunakan untuk kegiatan reboisasi dan rehabilitasi lahan pada penutupan lahan. Budidaya tanaman sengon memiliki faktor penghambat salah satunya seperti mudahnya terserang penyakit karat puru. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis variasi genetik aksesi sengon yang toleran dan intoleran terhadap serangan karat puru menggunakan penanda SNPs. Evaluasi serangan karat puru pada progeni testing famili sengon dilakukan dengan metode skoring. Sampel yang diuji berjumlah 40 aksesi dari masing-masing 5 aksesi resistan dan 5 aksesi rentan dengan 4 ulangan tiap aksesi. Sampel diuji menggunakan 6 primer SNPs dengan metode High-resolution Melting, data yang diperoleh kemudian digunakan untuk analisis chi-kuadrat dan Principal Component Analysist. Meski semua aksesi terserang penyakit karat tumor, keparahan serangan antara aksesi resistan dan rentan berbeda nyata. Hasil analisis SNPs menunjukkan bahwa semua primer yang digunakan menunjukkan asosiasi dengan sifat toleransi sengon terhadap karat puru.
Keyword: keragaman genetik, hrm

Judul: Analisis Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) Aksesi Sengon (Falcataria moluccana) Resistan dan Rentan Terhadap Penyakit Karat Puru
Abstrak: Sengon banyak ditanam dan dimanfaatkan karena memiliki banyak keunggulan, yaitu bernilai ekonomi tinggi, cepat panen, mudah tumbuh dan dipelihara. Namun, sengon yang ditanam monokultur rentan terkena penyakit karat puru yang disebabkan oleh jamur Uromycladium falcatariae. Tujuan penelitian ini adalah mengevaluasi pertumbuhan uji keturunan sengon di Kediri serta aplikasi markah SNPs pada aksesi progeni sengon yang resistan dan rentan terhadap karat puru. Informasi ini diperlukan sebagai dasar pemuliaan pohon sengon yang resistan. Sampel yang diuji berjumlah total 40 progeni dari masing-masing famili resistan (R02, R08, R09, R12, dan R13) serta rentan (S26, S27, S28, S29, dan S30) dengan ulangan 4 progeni tiap famili. Setiap sampel diuji menggunakan 6 primer SNPs dengan metode High-resolution Melting (HRM) dan data dianalisis menggunakan Khi-Kuadrat dan Principal Component Analysis (PCA). Nilai intensitas dan keparahan serangan pada famili resistan dan rentan tidak berbeda nyata. Hasil analisis SNPs menunjukkan bahwa gen berasosiasi dengan sifat resistansi sengon. Analisis PCA menunjukkan 6 primer mampu memisahkan aksesi resistan dan rentan, sehingga markah SNP dapat digunakan untuk seleksi pohon resistan karat puru.
Keyword: gen, high resolution melting, mutasi, Uromycladium falcatariae

Judul: Persamaan Korteweg-de Vries Orde Tinggi untuk Menggambarkan Gerak Gelombang Internal
Abstrak: The ocean can be considered of layers of fluid that each layer has a constant density. Internal waves are waves occur in the interface of every'two layers with different density. Because it occures underneath the surface of the ocean, it is invisible. One of internal waves is internal solitary waves. One of formulation that can describe intemal waves movement is KdV equation. KdV equation is derived from governing equations of ideal fluid in Lagrange formulation using asymptotic method. On this thesis, KdV equation is derived in higher order and then its solution is derived by using internal solitary waves assumption. An example of a two-layer fluid is a case will be used. By using Mathematica6 software, for this case will be obtained the coefficients in lower and higher order explicitly and the corresponding between coefficients and relative lower layer depths and fluid depths, the corresponding between coefficients and relative densities, and also observed the different between solitary waves in lower and higher order.
Keyword: