Judul: Cold Chain System Simulation Effect on Bacterial Community and Quality of Eastern Little Tuna (Euthynnus affinis).
Abstrak: Penanganan pascapanen dan tingkat higienis hasil perairan sangat mempengaruhi kualitas dan tingkat keamanan. Pengendalian rantai dingin menjadi salah satu faktor penentu kualitas ikan dan komunitas bakteri yang tumbuh pada ikan tersebut. Identifikasi jenis bakteri pembusuk dan patogen pada hasil perairan perlu dilakukan karena menentukan kualitas fisik dan kimiawi. Metode identifikasi molekuler dengan sensitivitas yang tinggi menjadi solusi. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi kualitas ikan dan komunitas bakteri yang tumbuh. Prosedur penelitian yang dilakukan meliputi pengumpulan sampel, pengukuran pH, pengukuran drip loss, perlakuan transportasi dan penyimpanan suhu dingin, ekstraksi DNA, sekuensing DNA, analisis sekuen dan analisis bioinformatika. Kesimpulan yang diperoleh dari penelitian ini adalah simulasi sistem rantai dingin yang diterapkan pada ikan tongkol tidak berpengaruh nyata terhadap perubahan nilai aw, pH dan drip loss. Perubahan yang tidak signifikan menunjukkan sampel ikan tongkol masih memiliki kualitas yang baik. Analisis bioinformatika yang dilakukan menunjukkan keragaman dan kelimpahan bakteri dari ordo Clostridiales tertinggi pada sampel dengan perlakuan suhu 10oC., Post-harvest handling and hygienic level of aquatic products greatly affect the quality and level of safety. Cold chain control is one of the determining factors for the quality of fish and the bacterial community that grows on the fish. Identification of the types of spoilage bacteria and pathogens in aquatic products needs to be done because it determines the physical and chemical quality. A molecular identification method with high sensitivity is one of the alternative methods. This study aimed to identify the quality of fish and bacterial communities that grow. The research procedures carried out included sample collection, pH measurement, drip loss measurement, transportation and cold storage treatment, DNA extraction, DNA sequencing, sequence analysis and bioinformatics analysis. The conclusion obtained from this study is that the simulation of the cold chain system applied to tuna does not significantly affect changes in the value of aw, pH and drip loss. The insignificant change indicates that the tuna samples still have good quality. The bioinformatics analysis performed showed the highest diversity and abundance of bacteria from the order Clostridiales in the samples treated at 10oC.
Keyword: bioinformatics analysis, DNA isolation, metagenomic, NGS

Judul: Identifikasi Molekuler Tuna dengan Cytochrome Oxidase Subunit 1 (COI) dan Kualitasnya pada Suhu Penyimpanan yang Berbeda
Abstrak: Kasus penolakan produk ekspor tuna Indonesia diantaranya disebabkan oleh misbranding serta kandungan bakteri patogen dan toksin yang melebihi standar. Penggunaan primer gen COI mitokondria merupakan metode yang efektif untuk mengidentifikasi spesies ikan tuna. Kemunduran mutu ikan dapat diketahui dari kandungan amina biogenik yang terbentuk pada ikan. Kualitas ikan tuna perlu dipertahankan dan ditingkatkan untuk menghasilkan produk sesuai dengan standar mutu dan aman dikonsumsi. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi molekuler sampel ikan tuna dan menentukan pengaruh perbedaan kondisi penyimpanan terhadap kualitas ikan tuna melalui uji sensori, mioglobin, amina biogenik dan profil protein. Penelitian ini dilakukan melalui dua tahap, yaitu 1) preparasi bahan baku dan identifikasi molekuler, 2) penentuan kualitas ikan tuna pada penyimpanan yang berbeda yaitu suhu ruang, suhu dingin dan suhu beku selama 18 hari dengan pengamatan setiap hari untuk parameter uji sensori, sedangkan untuk mioglobin, amina biogenik, serta profil protein dilakukan pengamatan pada hari ke- 0, 1, 2, 3, 4, 8, 14 dan 18. Identifikasi ikan tuna melalui pendekatan molekuler melalui gen COI. Data sensori dan morfometrik dianalisis secara deskriptif; data mioglobin menggunakan rancangan acak lengkap faktorial (RALF) in time, sedangkan amina biogenik menggunakan rancangan acak lengkap (RAL) in time. Hasil penelitian menunjukkan bahwa kemurnian isolat DNA yaitu 1.99 dengan konsentrasi 93.8 ng/μL serta terindentifikasi spesies Thunnus tonggol dengan nilai homologi 99.69%. Panjang baku sampel ikan tuna yaitu 31.889±1.06 cm. Batas penerimaan sensori pada kondisi suhu ruang mencapai 1 hari, penyimpanan suhu dingin mencapai waktu penyimpanan 10 hari dengan nilai skor quality index method (QIM) 11 serta penyimpanan beku menunjukkan pengaruh perlakuan yang baik hingga hari ke-18. Konsentrasi mioglobin tertinggi terdapat pada daging gelap penyimpanan hari pertama yaitu 319.21±14.56 mg/100 g. Kandungan amina biogenik selama 18 hari mengalami kenaikan yang signifikan baik yang disimpan di suhu dingin maupun suhu beku. Kandungan histamin mencapai nilai yang melebihi standar Food and Drug Administration (FDA) (50 μg/g) yaitu pada suhu beku penyimpanan 18 hari dan suhu dingin penyimpanan mulai dari hari ke-8. Penyimpanan suhu beku untuk kandungan kadaverin menunjukkan nilai rata-rata lebih kecil dibandingkan perlakuan suhu dingin yaitu 5.98 μg/g. Putresin penyimpanan suhu beku hari ke-18 juga masih lebih rendah dibandingkan dengan penyimpanan suhu dingin di hari yang sama serta nilai keduanya juga masih tergolong rendah yaitu kurang dari 50 μg/g. Hasil analisis profil protein ikan tuna pada penyimpanan suhu ruang, suhu dingin dan beku memiliki berat molekul berkisar antara 10-100 kDa, serta bobot molekul mioglobin antara14-18 kDa.
Keyword: amina biogenik, QIM, suhu

Judul: Pembangunan Perumahan Pada Wilayah Desakota Kaitannya Dengan Sistem Sosial Masyaraka t Asli
Abstrak: Faktor utama yang banyak mempengaruhi meningkatnya jumlah perumahan dan pemukiman pacta wilayah desakota adalah adanya tekanan populasi sebagai akibat dari migrasi besar-besaran menuju daerah desakota. Dengan kata lain, lokasi perumahan atau pemukiman menjadi tak memiliki banyak pilihan lagi, kota telah sesak dan sasaran selanjutnya para pengais materi di daerab kota adalab wilayah desakota. Masyarakat asli yang sejak lama tinggal di wilayah desakota merupakan bagian dari masyarakat desakota yang perlu diperhatikan. Baik disadari maupun tidak disadari, perubaban pada masyarakat asli desakota akan terjadi karena masyarakat selalu dalam keadaan dinamis. Selain itu perubahanjuga akan terjadi dikarenakan masyarakat adalah sistem yang terdiri dari bagian-bagian yang berhubungan serta berintegrasi secara fungsional, sehingga perubaban pada satu fungsi dari masyarakat akan mempengaruhi fungsi lainnya.
Keyword: