Judul: Pengaruh tingkat iluminasi cahaya terhadap adaptasi retina juvenil kerapu tikus (Cromileptes altivelis)
Abstrak: Perairan Indonesia memiliki beranekaragam spesies kerapu. Menurut Ditjen Perikanan (1987 dan 1995), daerah penyebaran ikan kerapu (Epinephelus spp.) di Indonesia meliputi seluruh perairan Sumatera, Jawa, Nusa Tenggara, Kalimantan, Sulawesi, Maluku dan Irian Jaya kecuali laut dalam disekitar Banda. Ikan Kerapu tikus atau kerapu bebek (Cromileptes altivelis) mempunyai nilai ekonomis tinggi di pasar Asia seperti Hongkong, China, Taiwan, Jepang, dan Singapura. Juvenil ikan kerapu tikus berharga cukup mahal untuk ikan hias akuarium, sedangkan ikan dewasanya merupakan salah satu ikan yang berharga tinggi di pasar ikan dunia. Umumnya ikan ini ditangkap dengan menggunakan pancing, tombak dan perangkap (trap). Pengamatan terhadap tingkah laku ikan akan memudahkan kita dalam pengembangan penangkapan ikan. Pengembangan dalam usaha penangkapan dan budidaya ikan diutamakan kepada ikan-ikan yang memiliki nilai ekonomis tinggi, akan tetapi budidaya ikan berekonomis tinggi belum dilakukan secara besar-besaran, saat ini masih dalam tahap penelitian. Tujuan dilakukannya penelitian ini adalah: (1) Menganalisis tingkat adaptasi retina mata juvenil kerapu tikus (Cromileptes altivelis) terhadap iluminasi cahaya; (2) Mengetahui dan membandingkan pengaruh iluminasi cahaya terhadap tingkah laku makan juvenil kerapu tikus (Cromileptes altivelis). Penelitian dilaksanakan pada bulan Agustus 2000 di laboratorium Multi Spesies Hatchery (MSH) ruang Extension dan laboratorium Parasit pada Loka Penelitian Perikanan Pantai Gondol, Kecamatan Gerokgak, Singaraja, Bali. Pengumpulan data menggunakan metode eksperimental dengan menggunakan Rancangan Acak Lengkap (RAL). Analisis data menggunakan metode...
Keyword: 

Judul: Pengaruh Warna Cahaya yang Berbeda Terhadap Tingkah Laku Berkumpulnya Juvenil Ikan Kerapu Tikus (Cromileptes altivelis)
Abstrak: Umumnya ikan kerapu ditangkap dengan menggunakan pancing, tombak dan perangkap. Alat tangkap tersebut masing-masing mempunyai kelebihan, kekurangan dan tingkat efisiensi yang berbeda. Apabila tingkah laku ikan disekitar alat tangkap serta dalam hubungannya dengan berbagai faktor dapat diketahui, maka akan dapat diketahui cara-cara untuk meningkatkan efisiensi dan kegunaan alat tangkap tersebut. Lebih jauh dari itu, mungkin akan timbul ide untuk menciptakan alat tangkap baru yang lebih sesuai dan bersifat ramah lingkungan. Tingkah laku ikan disekitar daerah iluminasi cahaya dipengaruhi oleh faktor lingkungan seperti suhu, kecerahan, arus, gelombang dan keberadaan makanan atau predator. Hal ini juga berubah berdasarkan kondisi biologis ikan seperti umur, kematangan gonad dan kandungan makanan dalam perut ikan. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis: (1) pola sebaran cahaya dengan warna yang berbeda, (2) tingkah laku pengumpulan juvenil ikan kerapu tikus (Cromileptes altivelis) disekitar daerah iluminasi cahaya, dan (3) untuk menjelaskan hubungan antara tingkah laku pengumpulan juvenil ikan kerapu tikus dengan pola sebaran cahaya. Penelitian ini dilakukan selama Bulan Juni dan Juli 2002 dengan metode eksperimental di Laboratorium Tingkah Laku Ikan, Fakultas Perikanan dan ilmu Kelautan, Institut Pertanian Bogor. Penelitian pendahuluan mengenai pola sebaran cahaya dilakukan pada bulan September 2001 di Stasiun Lapang Kelautan, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Institut Pertanian Bogor, Palabuhanratu, Kabupaten Sukabumi, Jawa Barat. Data yang diperoleh yaitu data primer berupa data pola sebaran cahaya di bawah permukaan air dan data reaksi ikan kerapu tikus terhadap pola sebaran cahaya yang diberikan. Data hasil penelitian berupa pola sebaran cahaya dianalisis secara deskriptif, sedangkan data reaksi ikan terhadap rangsangan cahaya berupa jumlah ikan yang berkumpul, jarak kumpulan ikan tersebut dari sumber cahaya, dan nilai iluminasi cahaya di daerah kumpulan ikan diananlisis secara statistik menggunakan rancangan dasar RAL satu arah. ...
Keyword: 

Judul: Penyusunan Overlap Graph menggunakan Suffix Tree pada DNA Sequence
Abstrak: The DNA sequence assembly is very important in genome analysis. This step aims to reconstruct contigous DNA fragment (contigs) from short fragment by concatenating fragments based on the overlap region among them. This method employs overlap graph for solving the problems. In this graph, nodes represent fragments and edges represent overlap. This research developed a software for constructing overlap graph using suffix tree. The evaluation was conducted by measuring the number of nodes, number of edges, and the execution time in many values of minimum overlap. The minimum overlap is defined as the minimum length of substring which is considered as the overlap region between two fragments. The evaluation results showed that the number of nodes, the number of edges, and the execution time were increased with the decreasing of the minimum overlap value.
Keyword: