Judul: Bakteri Endofit Asal Tanaman Arecaceae sebagai Pemacu Pertumbuhan dan Agens Biokontrol Penyakit Bercak Daun pada Kelapa Kopyor (Cocos nucifera L var. Kopyor).
Abstrak: Kelapa (Cocos nucifera L.) merupakan salah satu produk pertanian yang paling lazim dikonsumsi dalam pemenuhan kebutuhan hidup sehari-hari masyarakat. Pada pembudidayaan kelapa sering muncul buah kelapa abnormal, yang dikenal dengan kopyor. Kelapa kopyor memiliki ciri endosperm (daging buah) yang terlepas dari tempurung disertai volume air kelapa yang lebih sedikit dibandingkan kelapa normal. Harga yang jauh lebih mahal dibandingkan kelapa normal menyebabkan usaha budidaya kelapa kopyor semakin diminati. Tanaman muda kelapa kopyor hasil teknik kultur jaringan maupun konvensional menunjukkan kerentanan terhadap serangan patogen penyebab bercak daun di lapangan. Patogen bercak daun pada tanaman kelapa kopyor antara lain tergolong dalam genus Pestalotiopsis, Curvularia dan Colletotrichum. Patogen ini dapat menurunkan kualitas bibit bahkan menyebabkan kematian tanaman. Saat ini, untuk mengendalikan penyakit bercak, penggunaan pestisida sintetik menjadi solusi utama. Penggunaan pestisida sintetik secara terus menerus berdampak buruk bagi lingkungan dan manusia. Salah satu alternatif pengendalian penyakit tanaman adalah dengan pengendalian hayati menggunakan bakteri endofit. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan bakteri endofit dari jaringan akar dan daun dari beberapa tanaman Arecaceae yaitu Pejibaye (Bactris gasipaes), Kelapa Kopyor (Cocos nucifera), Kelapa Sawit (Elaeis guinensis), Aren (Arenga pinnata) dan Nibung (Oncosperma filamentosa) yang berpotensi sebagai agens pengendali hayati penyakit bercak daun dan pemacu pertumbuhan tanaman kelapa kopyor. Penelitian dilakukan di Laboratorium Nematologi Departemen Proteksi Tanaman, dan Laboratorium Riset Pusat Penelitan Bioteknologi dan Bioindustri Indonesia (PPBBI), dari bulan Maret hingga Desember 2016. Metode penelitian meliputi isolasi cendawan patogen bercak daun, isolasi bakteri endofit, seleksi awal bakteri endofit potensial, uji keamanan hayati, uji antibiosis, karakterisasi fisiologi mikroba endofit terseleksi meliputi uji produksi senyawa volatil terhadap perkembangan cendawan patogen, uji potensi pendukung pertumbuhan tanaman, uji pelarutan fosfat, uji produksi hormon auksin (Indole Acetic Acid/IAA), uji penambatan nitrogen, uji floresensi, uji katalase, uji produksi kitinase, pengujian sifat isolat sebagai bakteri endofit meliputi mutasi spontan bakteri endofit dengan antibiotik rifampisin, uji aktivitas enzim peroksidase, aplikasi bakteri endofit potensial pada bibit terserang penyakit bercak daun di pembibitan dan identifikasi molekuler bakteri endofit. Percobaan dilakukan dengan menggunakan rancangan acak lengkap (RAL). Perlakuan yang menunjukkan beda nyata diuji lanjut dengan uji selang berganda Duncan (DMRT) pada taraf 5%. Sebanyak 656 isolat bakteri endofit berhasil diisolasi dari akar dan daun tanaman Arecaceae. Hasil seleksi awal diperoleh 64 isolat bakteri endofit yang mampu menghambat perkembangan koloni patogen bercak daun secara in vitro dan memiliki kemampuan melarutkan fosfat. Hasil uji keamanan hayati iii menunjukkan 40 isolat dari 64 isolat aman terhadap tanaman, hewan dan manusia. Hasil uji konsistensi penghambatan terhadap cendawan penyebab penyakit bercak daun (Pestalotiopsis sp., Curvularia sp., dan Colletotrichum sp.) dan uji karakter fisiologi bakteri diperoleh lima isolat bakteri endofit menunjukkan kemampuan penghambatan patogen bercak daun hingga 86.6%, mampu melarutkan fosfat, menghasilkan IAA, menguraikan peroksida dan menambat nitrogen. Hasil pengujian terhadap benih padi menunjukkan isolat bakteri endofit mampu meningkatkan pertumbuhan tanaman padi. Hasil pengujian isolat bakteri endofit pada bibit kopyor di lapangan menunjukkan perlakuan penyiraman dengan suspensi endofit dapat menurunkan tingkat keparahan penyakit bercak daun dibandingkan dengan kontrol. Tingkat keparahan penyakit bercak daun pada perlakuan bakteri endofit berada pada kisaran 19.5%-26.6%. Nilai ini dibawah kontrol (tanpa bakteri endofit) yang mencapai 35.9%. Nilai AUDPC dan laju infeksi pada perlakuan
Keyword: antibiotik, karakterisasi fisiologi, amplifikasi DNA, tanaman muda

Judul: Eksplorasi Cendawan Endofit sebagai Agens Pengendali Hayati Phytophthora capsici Leonian pada Cabai
Abstrak: Tanaman cabai merupakan salah satu komoditas hortikultura yang banyak ditanam di Indonesia. Produktivitas cabai di Indonesia masih di bawah potensi produksi semestinya. Salah satu penyebab produktivitas yang belum optimal adalah adanya penyakit busuk pangkal batang yang disebabkan oleh Phytophthora capsici. Pengendalian yang telah umum dengan penggunaan pestisida sintetis belum mampu mengatasi masalah sehingga pengendalian alternatif diperlukan. Pengendalian hayati merupakan salah satu alternatif pengendalian yang dapat digunakan untuk mengendalikan penyakit tanaman. Agens hayati berupa cendawan endofit untuk mengendalikan Phytophthora capsici pada cabai belum dilaporkan di Indonesia. Oleh karena itu diperlukan penelitian untuk mengeksplorasi cendawan endofit yang memiliki potensi sebagai agens hayati pengendalian P. capsici. Penelitian ini terdiri dari 5 tahapan, yaitu 1) eksplorasi cendawan endofit dari tanaman cabai, 2) uji patogenesitas cendawan endofit, 3) uji penghambatan cendawan endofit terhadap pertumbuhan P. capsici, 4) uji kemampuan kolonisasi cendawan endofit pada bibit cabai, 5) uji penekanan penyakit busuk pangkal batang pada bibit cabai. Cendawan endofit yang berhasil diisolasi sebanyak 138 isolat dengan 8 isolat yang digunakan pada uji in vitro dan in planta berdasarkan hasil uji patogenesitas dan potensinya sebagai plant growth promoting fungi (PGPF). Tiga isolat cendawan endofit menunjukkan daya hambat yang tinggi terhadap pertumbuhan P. capsici, masing-masing sebesar 57.0%, 56.8%, dan 52.6%. Dua isolat cendawan endofit yang diuji mempunyai mekanisme antibiosis ditunjukkan dengan adanya zona bening pada pertemuan miselium patogen dan endofit. Pada pengujian secara in vivo, aplikasi cendawan endofit mampu menekan kejadian penyakit busuk pangkal batang pada bibit cabai dengan tingkat penekanan penyakit sebesar 13.7-27.5%. Penekanan penyakit paling tinggi ditunjukkan oleh isolat PAB2 dan HAJ1 masing-masing sebesar 27.5%, diikuti oleh PBG7 dan MAGR1 masing-masing sebesar 25.5%. Inokulasi cendawan endofit pada bibit cabai menunjukkan respons yang berbeda terhadap pertumbuhan bibit cabai. Perlakuan isolat PBG 7 menunjukkan adanya pengaruh positif terhadap semua parameter pertumbuhan (tinggi tajuk, panjang akar, dan bobot biomassa) dibandingkan kontrol. Isolat HAJ1, HAJ2, PAB2, dan CGB5 merupakan isolat-isolat yang berpotensi sebagai plant growth promoting fungi (PGPF), sebab memiliki pengaruh nyata terhadap tinggi tajuk, panjang akar, dan bobot biomassa bibit cabai. Meskipun keempat isolat ini berdasarkan analisis ragam tidak memiliki pengaruh nyata terhadap bobot kering biomassa, tapi nilai bobot masih cenderung lebih tinggi dibandingkan kontrol. Isolat yang telah diuji teridentifikasi sebagai Penicillium sp.1, Penicillium sp.2, Aspergillus sp., Fusarium sp., hifa steril 1, hifa steril 2, hifa steril 3, dan cendawan belum teridentifikasi.
Keyword: antibiosis, busuk batang, Plant growth promoting fungi, uji patogenisitas

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: