Judul: Homogenitas, Stabilitas, dan Konfirmasi PCR Objek Uji Profisiensi E.coli Kering Beku
Abstrak: Objek uji profisiensi parameter bakteri E.coli harus memenuhi syarat, yaitu homogen dan stabil. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan jenis krioprotektan dengan viabilitas biakan kering beku E.coli yang baik, mengevaluasi tingkat homogenitas dan stabilitas biakan kering beku E.coli, dan mengonfirmasi menggunakan PCR dengan primer 16S rRNA. Metode dalam penelitian ini adalah uji krioprotektan yang memperoleh viabilitas paling tinggi, uji homogenitas dan stabilitas biakan kering beku secara kualitatif dan kuantitatif, dan uji konfirmasi menggunakan primer 16S rRNA E.coli dengan PCR. Krioprotektan yang memberikan viabilitas terbaik untuk biakan kering beku E.coli adalah 20% susu skim. Hasil uji homogenitas dan stabilitas secara kualitatif menunjukkan hasil homogen dan stabil. Hasil uji homogenitas dan stabilitas secara kuantitatif menunjukkan biakan kering beku E.coli homogen dan stabil pada standar deviasi 25%. Pemilihan primer ECO-1 dan ECO-2 pada penelitian ini berdasarkan kesesuaiannya terhadap bakteri E.coli, panjang primer, nilai Tm dan selisih antara Tm primer forward dan reverse, %GC, serta nilai self complimentarity dan self 3’ complimentarity. Kultur murni dan sampel biakan kering beku E.coli terkonfirmasi menggunakan PCR dengan primer ECO-1 dan ECO-2.
Keyword: freeze dried culture E.coli, cryoprotectant, 16S rRNA primer, PCR, homogeinety and stability

Judul: Pengembangan Biakan Kering Beku Kultur Campuran untuk Uji Profisiensi Mikrobiologi Parameter Kualitatif
Abstrak: Salmonella Typhimurium dan Escherichia coli adalah dua jenis bakteri yang dapat memengaruhi keamanan pangan. Biakan kering beku kultur campuran Salmonella Typhimurium dan Escherichia coli sebagai objek uji profisiensi dapat digunakan untuk mengevaluasi kemampuan suatu laboratorium dalam menganalisis mutu mikrobiologi sampel pangan. Penelitian bertujuan memperoleh kultur campuran Salmonella Typhimurium dan Escherichia coli yang homogen dan stabil untuk digunakan sebagai objek uji profisiensi (OUP) dengan parameter kualitatif. Penelitian dilakukan dalam 3 tahap, diawali dengan pemilihan jenis krioprotektan terbaik berdasarkan uji viabilitas bakteri, dilanjutkan dengan pengujian homogenitas dan stabilitas sampel, serta diikuti dengan uji konfirmasi dengan metode PCR Standard. Hasil penelitian menunjukkan bahwa krioprotektan terbaik merupakan kombinasi susu skim (10%), sukrosa (5%), trehalosa (5%), dan asam askorbat (0,1%) dengan penurunan jumlah mikroba sebesar 4 Log CFU/mL, yang lebih baik dibandingkan dengan perlakuan tanpa krioprotektan dengan penurunan jumlah mikroba sebesar 8 Log CFU/mL. Uji homogenitas menunjukkan hasil positif Salmonella Typhimurium dan E. coli untuk semua ampul sampel. Hasil uji stabilitas menunjukkan bahwa sampel stabil pada suhu 4oC selama 61 hari. Uji konfirmasi dengan PCR standar menggunakan primer gen Inva dan 16S rRNA menunjukkan bahwa sampel hasil positif untuk Salmonella Typhimurium dan Escherichia coli. Biakan kering beku kultur campuran Salmonella Typhimurium dan Escherichia coli dengan krioprotektan homogen dan stabil pada suhu 4oC selama 61 hari sehingga dapat digunakan sebagai objek uji profisiensi parameter kualitatif.
Keyword: Escherichia coli, freeze dried culture, proficiency testing, Salmonella Typhimurium, Standard PCR

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: