Judul: Genetic Variation and Gene Expression Analysis of Barramundi (Lates Calcarifer, Bloch 1790) in Different Populations
Abstrak: Permintaan pasar yang tinggi terhadap ikan kakap putih, mendorong terjadinya peningkatan produksi benih yang dibudidayakan. Suplai benih ikan ini berasal dari pembenihan dan pendederan di hatcheri skala rumah tangga (HSRT) menggunakan induk hasil seleksi dengan sifat unggul pertumbuhan asal Australia dan induk dari perairan lokal Indonesia. Tujuan umum penelitian ini adalah menganalisis variasi genetik (genotipe dan pertumbuhan) dengan marka DNA mikrosatelit serta ekspresi gen terkait imunitas dan stres suhu pada ikan kakap putih berbeda populasi. Penelitian tahap pertama bertujuan untuk mengevaluasi variasi genotipe dan pertumbuhan ikan kakap putih lokal (Situbondo dan Lampung) dengan ikan populasi Australia. Penelitian ini menggunakan tiga populasi benih ikan kakap putih yaitu ikan kakap putih Australia (KA), lokal Situbondo (KS) dan Lampung (KL). Ikan kakap putih sebanyak sepuluh individu dari setiap populasi digunakan untuk analisis variabilitas mikrosatelit menggunakan dua lokus mikrosatelit (Lca21 dan Lca 32). Data alel mikrosatelit diolah menggunakan program Microsoft excel dan dianalisis menggunakan software genetic analysis in excel (GenAlEx 6.51b2). Hasil penelitian menunjukkan bahwa jumlah alel setiap lokus pada masing-masing populasi berkisar 2-8 alel dengan tingkat heterozigositas populasi berturut-turut sebesar 0,539 (KA); 0,850 (KS); dan 0,650 (KL). Pertumbuhan panjang dan bobot tubuh serta laju pertumbuhan spesifik ikan kakap putih KA lebih tinggi dibandingkan ikan kakap putih KS dan KL (P<0,05); sedangkan ikan kakap putih KS dan KL adalah sama (P>0,05). Berdasarkan hasil riset pertama, maka penelitian kedua dilakukan menggunakan ikan kakap putih KS dan KA. Penelitian tahap kedua bertujuan mengevaluasi tingkat ekspresi gen imunitas pasca infeksi nervous necrosis virus (NNV) pada populasi ikan kakap putih KS dan KA. Tingkat ekspresi gen terkait imunitas ikan kakap putih menggunakan sampel hati, ginjal depan, dan limpa diamati pada 48 dan 96 jam pasca infeksi (hpi). Kelangsungan hidup dan parameter darah ikan kakap putih dievaluasi setelah infeksi NNV. Hasil penelitian menunjukkan bahwa jumlah sel darah merah dan hemoglobin (Hb) ikan kakap putih KS pasca infeksi NNV pada 96 jam pascainfeksi (hpi) lebih tinggi (P<0,05) dibandingkan ikan kakap putih KA pasca infeksi NNV. Jumlah sel darah putih dan limfosit ikan kakap putih KS pada 48 hpi lebih tinggi (P<0,05) dibandingkan KA, tetapi mulai menurun pada 96 hpi pada ikan kakap putih KS. Total sel darah putih ikan kakap putih KA meningkat dari 48 ke 192 hpi. Tingkat ekspresi gen tumor necrosis factor α (TNFα) dan interleukin 1β (IL1β) secara signifikan lebih tinggi di hati, ginjal depan, dan limpa pada ikan kakap putih KS dibandingkan dengan ikan kakap putih KA pada 48 hpi, sedangkan ekspresi gen major histocompatibility complex IIα (MHCIIα) pada ikan kakap putih KS secara signifikan lebih tinggi dibandingkan dengan ikan kakap putih KA pada 96 hpi. Selanjutnya, kelangsungan hidup ikan kakap putih KS (42,0±4,47%) lebih tinggi dibandingkan dengan ikan kakap putih KA (20,0±7,07%) dan tidak ada kematian yang teramati pada kontrol tanpa infeksi NNV. Hasil ini menunjukkan peran penting dari semua gen dalam respons imunitas ikan kakap putih melawan infeksi virus. Tingkat kelangsungan hidup yang lebih tinggi pada ikan kakap putih KS sejalan dengan profil darahnya. Penelitian tahap ketiga bertujuan untuk mengevaluasi tingkat ekspresi gen terkait stres suhu dingin (15 oC) pada populasi ikan kakap putih KS dan
Keyword: barramundi, infection, genetic variation, growth rate, temperature stress, viral

Judul: Isolasi, Identifikasi, dan Uji Patogenisitas Bakteri Penyebab Penyakit Black Body Syndrome pada Ikan Kakap Putih Lates calcarifer B.
Abstrak: Wabah penyakit menjadi salah satu ancaman utama terhadap keberlanjutan produksi budidaya ikan kakap putih (Lates calcarifer). Beberapa tahun terakhir muncul wabah penyakit yang menyerang kakap putih pada ukuran 3–9 cm. penyakit ini memiliki gejala klinis berupa perubahan warna tubuh menjadi hitam, hemoragi pada perut bagian bawah, luka pada tubuh, hilangnya nafsu makan, serta memisahkan diri dari kelompoknya. Penyakit ini dikenal dengan sebutan black body syndrome (BBS) atau warga lokal menyebutnya sebagai tubuh hitam. Penanggulangan yang dilakukan saat ini adalah perendaman dengan air tawar dan pemberian acriflavine 3-5 mg L-1, tetapi cara ini kurang efektif dikarenakan penyebab penyakit BBS ini belum diketahui secara pasti. Penelitian ini bertujuan untuk: (1) mengisolasi dan mengidentifikasi penyebab BBS. (2) Menguji patogenisitas dari masing-masing bakteri yang diperoleh dari penyakit BBS. Penelitian ini terdiri dari dua tahap. Tahap pertama adalah isolasi dan identifikasi bakteri penyebab penyakit BBS. Tahap kedua, uji patogenisitas bakteri penyebab penyakit BBS. Tahap pertama ikan yang memiliki gejala sakit BBS diambil untuk kemudian diisolasi bakteri patogennya. Organ bagian dalam ikan berupa hati, limpa, dan ginjal digerus untuk kemudian ditumbuhkan pada media umum Marine Agar (MA). Bakteri yang tumbuh pada MA kemudian dipindahkan ke media selektif Thiosulfate Citrate Bile Salt Sucrose (TCBS) Agar dan Cytophaga Agar untuk mendapatkan biakan murni. Bakteri kemudian diidentifikasi menggunakan uji biokimia (kit API) dan secara molekuler (16S rRNA). Tahap kedua yaitu uji patogenisitas bakteri penyebab BBS, dimulai dengan uji lethal dose 50 (LD50) bakteri yang didapat dari hasil identifikasi. Hasil uji LD50 yaitu bakteri yang memiliki tingkat virulensi paling tinggi (nilai LD50 paling rendah) kemudian digunakan untuk uji patogenisitas. Uji patogenisitas menggunakan rancangan acak lengkap dengan empat perlakuan dan tiga ulangan. Perlakuan (A) ikan kakap putih yang diinjeksi dengan bakteri Pseudomonas stutzeri L01, (B) ikan kakap putih yang diinjeksi dengan bakteri Vibrio harveyi, (C) ikan kakap putih yang diinjeksi dengan campuran P. stutzeri L01 dan V. harveyi, serta (K) ikan kakap putih yang diinjeksi dengan phosphate buffered saline (PBS) sebagai kontrol. Parameter uji yang diamati antara lain: gejala klinis, mortalitas, rata-rata waktu kematian (RWK), gambaran darah, serta histopatologi organ dalam ikan kakap putih. Hasil penelitian menunjukkan bahwa berdasarkan isolasi dan karakterisasi bakteri penyebab penyakit BBS didapatkan lima isolat bakteri. Uji biokimia menggunakan kit API didapatkan bakteri dua jenis Pseudomonas stutzeri (L01 dan L02), Vibrio harveyi, dan Bacillus cereus. Berdasarkan uji secara molekuler didapatkan lima jenis bakteri yaitu: P. stutzeri L01, V. harveyi, dan B. cereus, Salinococcus roseus, dan P. stutzeri L02, kemudian gejala klinis yang dihasilkan berupa perubahan warna tubuh benih ikan kakap putih menjadi hitam, hemoragi pada bagian perut bawah, munculnya luka pada tubuh, membusuknya organ bagian dalam tubuh ikan. Kelima bakteri kemudian diuji LD50, kemudian didapatkan hasil P. stutzeri L01 dan V. harveyi merupakan bakteri paling virulen dengan LD50 sebesar 8.4 × 107 CFU mL-1 dan 6.2 × 107 CFU mL-1. Kedua bakteri ini kemudian diuji patogenisitasnya. Hasil uji patogenisitas menunjukkan bahwa perlakuan campuran P. stutzeri L01 dan V. harveyi menyebabkan mortalitas pada ikan kakap putih sebesar 58.33%, lebih tinggi dibandingkan dengan perlakuan injeksi bakteri tunggal dan kontrol (P<0.05). RWK ikan kakap putih perlakuan campuran P. stutzeri L01 dan V.
Keyword: Black body syndrome, Lates calcarifer, Pseudomonas stutzeri L01, Vibrio harveyi

Judul: Kajian frieze groups untuk klasifikasi dan konstruksi desain berdasarkan simetri pada pola
Abstrak: Frieze groups adalah konsep matematika untuk mengklasifikasikan desain pada dua dimensi permukaan yang berulang-ulang dalam satu arah berdasarkan simetri pada pola. Frieze groups merupakan grup yang mempertahankan bentuk pola. Pergerakan bentuk pola terdiri dari translasi, refleksi dan rotasi 180o. Tujuan dari karya ilmiah ini adalah mengkaji sifat Frieze group, mengkaji penggunaan Frieze group dalam mengklasifikasikan simetri pada pola dan mengkonstruksi pola dengan menggunakan software tesselmania. Hasil yang telah diperoleh, bahwa jenis Frieze groups merupakan subgroup dari grup pergerakan pola. Selain itu dapat dilihat dari sifat isomorfik berbagai jenis Frieze groups. Untuk mengkonstruksi sebuah bentuk pola dapat menggunakan salah satu software untuk membentuk sebuah pola bidang datar (dua dimensi) yaitu tesselmania.
Keyword: Frieze groups, Simetri, Pola