Judul: Pollen Dispersal and Genetic Diversity Analysis of Bido Coconut from Morotai Island Regency, North Molucas
Abstrak: Tanaman kelapa (Cocos nucifera L.) merupakan tanaman yang setiap bagiannya yaitu buah, batang, daun, dan akar dapat dimanfaatkan sehingga dikenal sebagai pohon kehidupan (tree of life). Secara umum kelapa dibagi menjadi dua tipe yaitu kelapa Dalam (var. typica (Nar.)) dan kelapa Genjah (var. nana (Griff.)). Pemuliaan tanaman kelapa saat ini difokuskan untuk menggabungkan sifat-sifat unggul kelapa Dalam dan kelapa Genjah dengan karakter berbuah mulai umur 3 tahun, internodus lebih pendek, buah berukuran medium hingga besar, kadar minyak tinggi, dan produksi buah tinggi. Kelapa Bido yang ditemukan di Desa Bido memiliki karakter antara kelapa Dalam dan Genjah, sehingga kelapa ini berpeluang sebagai materi genetik untuk pemuliaan kelapa. Saat ini informasi kelapa Bido masih terbatas, sehingga perlu dilakukan penelitian untuk melakukan karakterisasi dan mengkaji keragaman populasi kelapa Bido. Penelitian ini terdiri atas empat percobaan dan masing-masing percobaan memiliki tujuan yaitu 1) mempelajari tipe penyerbukan pada kelapa Bido; 2) melakukan identifikasi tetua jantan dengan marka SSR; 3) mempelajari keragaman populasi kelapa di Desa Bido dengan marka SSR dan dibandingkan dengan struktur genetik populasi kelapa lain yang terdapat di Desa Bido; dan 4) melakukan karakterisasi dan mengkaji keragaman morfologi populasi kelapa Bido pada beberapa generasi. Percobaan pertama mempelajari tentang pola pembungaan kelapa. Penelitian dilaksanakan pada dua lokasi yaitu Kebun Percobaan (KP) Mapanget, Balai Penelitian Tanaman Palma Sulawesi Utara dan di Desa Bido Kabupaten Kepulauan Morotai, Maluku Utara pada bulan Mei hingga Oktober 2020 dan Agustus hingga Oktober 2021. Berdasarkan hasil penelitian diketahui Kelapa Bido, progeni off-type bido, dan Genjah lokal Bido memiliki tipe pembungaan autogami langsung, sedangkan pada kelapa Dalam lokal Bido dan progeni kelapa Bido di KP. Mapanget memiliki tipe pembungaan semi autogami langsung. Percobaan kedua adalah analisis parental menggunakan marka SSR. Pengambilan sampel daun tetua dan pengumpulan benih dilaksanakan pada Juni 2021 di Desa Bido dan pendederan benih kelapa Bido di Kebun Percobaan Mapanget. Analisis molekuler dengan marka 10 marka SSR dilaksanakan pada bulan Juni 2021 hingga September 2022 di Laboratorium Biologi Molekuler Tanaman 1 (PMB Lab 1), Institut Pertanian Bogor dan di Laboratorium Biologi Molekuler (BM), Balai Besar Bioteknologi dan Sumber Daya Genetik. Percobaan dilakukan pada 128 progeni yang berasal dari 13 tetua betina dan 15 progeni di KP. Mapanget yang tidak diketahui tetua betinanya. Analisis data dilakukan menggunakan software Cervux dan Colony. Hasil percobaan menunjukkan bahwa terdapat progeni yang memiliki kandidat tetua jantan yang lebih dari satu. Hal ini disebabkan karena terdapat banyak individu yang memiliki alel yang sama pada semua lokus. Namun dapat diketahui terjadi peluang menyerbuk silang pada kelapa Bido meskipun terjadi tumpang tindih fase antesis dan reseptif. Peluang terjadinya penyerbukan silang oleh faktor ekternal yaitu serangga, karena bunga betina reseptif setelah seluang tandan bunga terbuka. Percobaan ketiga mempelajari tentang keragaman genetik populasi kelapa Bido menggunakan marka SSR. Pengambilan sampel daun populasi kelapa dilaksanakan pada Juni 2021 di Desa Bido dan di Kebun Percobaan Mapanget. Analisis molekuler dengan marka SSR dilaksanakan pada bulan Juni 2021 hingga September 2022 di PMB Lab 1, Institut Pertanian Bogor dan di Laboratorium BM, Balai Besar Bioteknologi dan Sumber Daya Genetik. Percobaan dilakukan pada 136 tanaman yang terdiri atas kelapa Bido, progeni off-type, kelapa Genjah,
Keyword: analisis parental, jarak genetik, keragaman morfologi, simple sequence repeat, tipe pembungaan

Judul: Genetic Diversity of Indonesian Coconut (Cocos nucifera L.) by Whole Genome based Simple Sequence Repeat Molecular Markers
Abstrak: Kelapa (Cocos nucifera L.) merupakan tanaman yang penting di Indonesia karena memiliki banyak kegunaan. Tanaman kelapa tersebar luas di seluruh wilayah Indonesia sehingga menyebabkan keragaman kelapa di Indonesia sangat tinggi. Pemahaman tentang keragaman genetik pada tanaman kelapa akan membantu proses pemuliaan tanaman kelapa. Identifikasi keragaman genetik menggunakan marka molekuler memiliki ketepatan yang tinggi dibandingkan marka morfologi. Marka molekuler Simple Sequence Repeat (SSR) telah banyak digunakan dalam identifikasi keragaman genetik pada tanaman. Tujuan penelitian ini adalah untuk memperoleh persentase coverage genom kelapa Indonesia dengan kelapa kultivar Hainan Tall serta identifikasi lokus SSR genom kelapa Indonesia, memperoleh data in-silico dan identifikasi lokus SSR genom kelapa kultivar Hainan Tall, memperoleh pasangan primer SSR dan primer SSR tervalidasi berbasis genom kelapa kultivar Hainan Tall, serta mendapatkan data keragaman kelapa Indonesia yang diidentifikasi menggunakan marka SSR tervalidasi. Penelitian ini terdiri dari tiga percobaan yaitu analisis in-silico genom dan identifikasi lokus SSR kelapa, pengembangan marka SSR berdasarkan data whole-genome kelapa, dan identifikasi keragaman kelapa Indonesia menggunakan marka SSR whole-genome tervalidasi. Percobaan pertama melaporkan hasil analisis in-silico pada dua data genom kelapa Indonesia, yaitu DMT (Dalam Mapanget) dan GKH (Genjah Kopyor Hijau). Terdapat sebanyak 5.797.081 dan 4.500.078 scaffold dengan ukuran scaffold terpanjang 100 dan 180kb masing-masing untuk kelapa DMT dan GKH. Hasil analisis genom DMT dan GKH dengan kelapa Hainan Tall memiliki persentase coverage masing-masing sebesar 94,47% dan 92,21%. Identifikasi lokus SSR pada genom kelapa Indonesia menunjukkan motif dinukleotida paling sering muncul, dengan motif yang paling sering muncul yaitu AG, disusul AT, AC dan CG. Percobaan kedua menunjukkan 9.521.002 lokus SSR teridentifikasi dari panjang total genom kelapa Hainan Tall yaitu 2.202.455.121bp. Lokus dengan motif dinukleotida hingga heksanukleotida diidentifikasi. Motif dinukleotida yang paling sering muncul yaitu AG, AT, AC dan CG. 906 pasang primer SSR berhasil didesain dari 16 kromosom kelapa Hainan Tall. 20 pasang primer dilakukan amplifikasi pada sampel kelapa Indonesia. 18 primer dapat mengamplifikasi, sedangkan 2 pasang primer tidak dapat mengamplifikasi. Percobaan ketiga menunjukkan keragaman genetik 25 aksesi kelapa Indonesia koleksi BALITPALMA pada 15 lokus SSR polimorfik. Pohon filogenetik yang dihasilkan dari metode neighbour joining membagi 25 aksesi kelapa Indonesia dalam 3 kelompok besar. Kelompok pertama didominasi aksesi tipe Hibrida, kelompok kedua didominasi aksesi tipe Genjah dan Hibrida, serta kelompok ketiga didominasi aksesi tipe Dalam.
Keyword: kelapa Indonesia, data genom, SSR, keragaman genetik

Judul: Removal of Hexavalent Chromium with Scrap Iron Filling.
Abstrak: Chromium is a transition element commonly found in the environment as trivalent and hexavalent forms. Apparently, the hexavalent form is much more toxic than the trivalent form. Textile wastewater treatment is required in order to prevent hexavalent chromium to contaminate the environment. The methods of this research consisted of effect of pH determination, effect of agitating rate determination, effect of agitating time determination, and effect of iron level determination; and its application in textile wastewater sample. The methods used in textile wastewater application are: determination of textile wastewater hexavalent chromium concentration, determination of textile wastewater hexavalent chromium concentration with standard addition method, and removal of hexavalent chromium in textile wastewater with scrap iron filling. Concentration of hexavalent chromium was determined using visible light spectrophotometry method. Optimum conditions of pH, agitating rate, iron amount, and agitating time obtained were pH 3, 450 rpm, 5 grams, and 10 minutes giving concentrations of hexavalent chromium 16.98 ppm, 15.96 ppm, 0.24 ppm, and 0.14 ppm, respectively. Iron filling could effectively remove hexavalent chromium ions from textile wastewater in a relatively short time. Absorbance of hexavalent chromium in textile coloring process wastewater after the addition of iron filling was 0.002, whereas in textile final wastewater was 0.000.
Keyword: