Judul: Pengaruh Kuersetin, Rutin, Morin, dan Karmin pada  Fibrilasi Protein Prion Pendekatan In Vitro
Abstrak: The conversion of the α-helical, cellular isoform of the prion (PrPC) to the insoluble, β-sheet-rich, infectious, disease-causing isoform (PrPSc) is the fundamental event in the prion diseases which is related Creutzfeldt–Jakob disease. Natural compounds are major sources of small molecule amyloid inhibitors and have been identified with great bioactivities. This study purposed to identify the effects of quercetin, morin, rutin, and carmine as natural compounds on the process of protein fibrillation in a neurodegenerative disease. Thioflavin T (ThT) was used as extrinsic fluorophore on fibrillation detection to determine the effect of bioactive compounds to the fibrillation, followed by Tryptophan as residue that used as intrinsic fluorophore (ITF) and Congo Red as chromophore. This study showed that quercetin has the greatest effect on protein fibrillation both in preincubated and incubated, in ratio 1:5 and 3:5 with around 41% and 44% reduction, respectively, compared to other natural compounds. In conclusion, the role of natural compounds on protein fibrillation showed that quercetin, rutin, morin, and carmine, which have been shown to be effective, may be used in the future development to prevent and disaggregate prion fibrillation in neurodegenerative diseases.
Keyword: Congo Red, neurodegenerative disease, prion (PrPC ), ThT

Judul: The Effect of PfDHFR-TS 3D Protein Structure Mutations on Binding of Drug Candidates: Molecular Docking Study
Abstrak: Plasmodium falciparum adalah jenis parasit malaria yang menyerang manusia dengan infeksi paling parah. Plasmodium falciparum dihydrofolate reductase-thymidylate synthase (PfDHFR-TS) adalah pasangan enzim yang bertanggung jawab atas infeksi di dalam sel darah manusia. Mutasi double dan quadruple asam amino pada domain protein DHFR menyebabkan resistansi terhadap pyrimethamine dan cycloguanil sebagai antifolat. Penambatan molekul digunakan pada antifolat untuk mengkaji pengaruh mutasi protein PfDHFR. Penambatan molekul digunakan pula pada 137 senyawa aktif tanaman untuk memperoleh senyawa yang memiliki potensi menghambat protein yang belum termutasi (wild-type) dan telah termutasi (mutan). Penambatan molekul menggunakan parameter seperti energi bebas Gibbs, ikatan hidrogen dan interaksi hidrofobik untuk menentukan afinitas pengikatan senyawa aktif pada protein. Enam senyawa aktif yaitu korupensamine a, dihydrousambarensine, cryptoquindoline, lactupicrin, cryptolepicarboline dan artoindonesianin a-2 memiliki pengikatan kuat pada protein wild-type dan mutan PfDHFR., Plasmodium falciparum is a type of malaria parasite that attacks humans with the most severe infection. Plasmodium falciparum dihydrofolate reductase-thymidylate synthase (PfDHFR-TS) is an enzyme pair responsible for infection in human blood cells. Double and quadruple amino acid mutations in the DHFR protein domain cause resistance to pyrimethamine and cycloguanil as antifolates. Molecular docking was carried out on antifolates to study the effect of mutations in the PfDHFR protein. Molecular docking was also carried out on 137 plant active compounds to obtain compounds that have potential to inhibit wild-type and mutant protein. Molecular docking uses parameters such as Gibbs free energy, hydrogen bond and hydrophobic interaction to determine the binding affinity of the active compounds to the protein. Six active compounds such as korupensamine a, dihydrousambarensine, cryptoquindoline, lactupicrin, cryptolepicarboline and artoindonesianin a-2 have strong binding to wild type and mutant PfDHFR protein.
Keyword: binding affinity, molecular docking, mutation, Plasmodium falciparum

Judul: Studi peranan segoro anak suaka margasatwa Banyuwangi Selatan sebagai bagian habitat burung wader migran
Abstrak: Daerah-daerah rawa, hutan pantai, hutan payau, padang lumpur, sawah pasang surut, pantai dan tambak-tambak di sepanjang pantai Pulau Jawa merupakan habitat persinggahan yang disukai oleh burung wader migran. Berbagai macam bentuk pemanfaatan wilayah pesisir tersebut sering bertentangan dengan upaya pelestarian burung wader migran. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui penggunaan padang lumpur, hutan payau dan tambak sebagai bagian habitat oleh burung wader migran di Segoro Anak Suaka Margasatwa Banyuwangi Selatan. Penggunaan habitat teresbut akan didekati dari fungsi sebagai tempat mencari makan, minum, bertengger, berlindung, beristirahat dan tidur serta dilakukan pendugaan kelimpahan, penyebaran dan perilaku burung wader migran sehubungan dengan pola penggunaan habitatnya. Penelitian dilakukan di Segoro Anak Suaka Margasatwa Banyuwangi Selatan, Taman Nasional Baluran yang termasuk dalam wilayah administrasi Kecamatan Tegaldlimo dan Kecamatan Purwoharjo, Kabupaten Banyuwangi Propinsi Jawa Timur. Penelitian ini dilaksanakan semenjak pertengahan bulan September sampai cengan akhir bulan November. Daerah estuari (hutan payau, pantai, padang lumpur) dan tambak-tambak milik masyarakat di Segoro Anak Suaka Margasatwa Banyuwangi Selatan persinggahan burung wader migran. merupakan habitat Jenis-jenis burung wader migran yang ditemukan di Segoro Anak terdiri dari 18 jenis burung diantaranya yang terbanyak adalah Charadrius leschenaultii, Numenius phaeopus, Actitis hypoleucos dan Tringa totanus. Sering terlihat burung wader migran mencari makan berupa kepiting, kerang dan fauna benthos lainnya di hutan. payau maupun di padang lumpur Segoro Anak Suaka Margasatwa Banyuwangi Selatan. Benthos sebagai makanan burung wader migran yang teridentifikasi ada 14 jenis, antara lain Balanus, Cerithidae, Thais dan Crassostrea. Hutan payau Segoro Anak Suaka Margasatwa Banyuwangi Selatan digunakan burung wader migran sebagai tempat berlindung, beristirahat, mencari makan serta tempat untuk tidur. Jenis-jenis pohon yang digunakan oleh burung wader migran untuk aktifitas istirahat antara lain Lumnitzera racemosa, Xylocarpus moluccensis dan Rhizophora mucronata dengan jenis burung yang dominan adalah Actitis hypoleucos, Numenius phaeopus, Tringa totanus dan Heteroscelus brevipes…dst
Keyword: