Judul: Isolasi dan purifikasi inhibitor RNA helikase virus hepatitis C dari bakteriosin bakteri asam laktat S34
Abstrak: Target molecular therapy is one of method to prevent hepatitis C virus which was developed recently. NS3 Helicase/RNA helicase hepatitis C virus inhibition using inhibitory peptide are target in molecular therapy. Bacteriocin are inhibitory peptides which can inhibit hepatitis C virus through inhibition of NS3 helicase. Bacteriocin is a peptide which is produced by lactic acid bacteria. The aim of this research were to isolate and to purify bacteriocin from S34 lactic acid bacteria which has high activity to inhibit RNA helicase of hepatitis C virus. S34 lactic acid bacteria were identified using 16S RNA amplification and DNA sequencing identification of S34 lactic acid bacteria was Lactobacillus plantarum WCFS1. The bacterial growth reached logaritmic phase at 7 hours and stationary phase at 10 hours. Bacteriocin were isolated and purified by ammonium sulphate precipitation with 80% saturation, gel filtration chromatography, and characterization of bacteriocin through molecular weight analysis and measured protein concentration. Bacteriocin from S34 lactic acid bacteria were included in 2nd class bacteriocin, had 64.20 % of inhibition against RNA helicase hepatitis C virus, had molecular weight about 1.7-4.2 kDa, and specific activity in the amount of 2.84 x 106 U/mg.
Keyword: 

Judul: Isolasi dan Karakterisasi Plantarisin dari Lactobacillus plantarum S34 sebagai Inhibitor RNA Helikase Virus Hepatitis C
Abstrak: Virus hepatitis C adalah anggota dari famili flavivirus yang menyebabkan penyakit Hepatitis C. Lebih dari 130 juta penduduk di seluruh dunia terinfeksi virus hepatitis C yang menyebabkan efek berupa radang, sirosis, dan kanker hati. Penyebaran virus hepatitis C yang sangat cepat dan belum adanya obat maupun vaksin yang efektif menjadi penyebab tingginya penderita penyakit hepatitis C. Beberapa penelitian untuk mencari obat penyakit hepatitis C terus dilakukan, diantaranya adalah terapi target molekular. Terapi target molekular dikembangkan dengan mencari inhibitor enzim RNA helikase virus hepatitis C. Dalam penelitian ini, mikroorganisme yang diisolasi dari Bekasam daging sapi diantaranya adalah Lactobacillus plantarum S34 mempunyai potensi sebagai penghasil plantarisin sebagai inhibitor RNA helikase virus hepatitis C. Masih terbatasnya informasi mengenai plantarisin S34 sebagai peptida inhibitor RNA helikase virus hepatitis C menjadi landasan perlunya penelitian ini dilakukan. Tujuan penelitian ini adalah untuk melakukan isolasi dan karakterisasi plantarisin dari Lactobacillus plantarum S34 sebagai inhibitor RNA helikase virus hepatitis C. Hasil penelitian ini diharapkan dapat memberikan informasi ilmiah mengenai plantarisin dari Lactobacillus plantarum S34 sebagai inhibitor RNA helikase virus hepatitis C. Penelitian ini diawali dengan ekspresi dan purifikasi RNA helikase virus hepatitis C. Enzim RNA helikase virus hepatitis C yang diperoleh di analisis bobot molekulnya dengan metode SDS-PAGE dan dikonfirmasi dengan Western blot. Selanjutnya penelitian dilanjutkan dengan optimasi pertumbuhan Lactobacillus plantarum S34. Biakan Lactobacillus plantarum S34 hasil optimasi pertumbuhan diisolasi plantarisinnya dengan menggunakan garam ammonium sulfat. Hasil pengendapan ammonium sulfat diperoleh ekstrak kasar plantarisin S34. Ekstrak kasar plantarisin S34 dari hasil isolasi diuji aktivitas inhibisinya terhadap RNA helikase virus hepatitis C. Selanjutnya diperoleh nilai aktivitas optimum plantarisin S34 kasar. Plantarisin S34 kasar dengan aktivitas inhibisi terbaik dikarakterisasi dengan berbagai surfaktan, protease inhibitor, dan enzim proteolitik. Selanjutnya plantarisin S34 dipurifikasi dengan teknik kromatografi gel filtrasi menggunakan Sephadex G-50 dengan berbagai eluen. Plantarisin S34 hasil purifikasi terbaik dihitung nilai konsentrasi proteinnya dengan menggunakan kurva standar BSA. Tahap terakhir adalah analisis plantarisin S34 dengan LC-MS dan dihitung bobot molekulnya dengan SDS-PAGE. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa Lactobacillus plantarum S34 tumbuh dengan baik pada media MRS+glukosa 2% pH 6,5 pada suhu 37 ºC selama 20 jam. Plantarisin S34 hasil purifikasi dengan ammonium sulfat 80% mempunyai aktivitas inhibisi terhadap RNA helikase virus hepatitis C sebesar 111,18% dengan 2x pengenceran. Ekstrak kasar plantarisin S34 stabil terhadap SDS, urea, tween-20, Triton X-100, EDTA dan lisozim, katalase, proteinase-K dengan konsentrasi masing-masing 1% dan 0,1 mg/mL. Plantarisin S34 hasil purifikasi dengan kromatografi gel filtrasi mempunyai aktivitas spesifik sebesar 1,49x10-2 U/mg dengan tingkat kemurnian sebesar 18,35 kali. Plantarisin S34 berhasil diisolasi dengan bobot molekul sebesar 6,47 kD.
Keyword: 

Judul: Industri Pertambangan, deagrarianisasi dan dinamika struktur sosial masyarakat desa (Studi kasus Desa Embalut dan Desa Bangunrejo, Kecamatan Tenggarong Seberang, Kabupaten Kutai Kartanegara)
Abstrak: Aktivitas tambang sebenarnya bukan merupakan hal baru di Indonesia, Kegiatan tambang telah berlangsung sejak jaman kerajaan. Catatan Erwiza (2007), menunjukkan jika di Bangka bahwa industri tambang, bahkan beserta ekonomi illegalnya (penambangan liar), bukanlah sebuah fenomena baru, tetapi sudah berlangsung sejak ekonomi politik di abad ke-18 sampai abad ke-21, melintasi rezim yang berbeda dari pra-kolonial, kolonial, pasca-kolonial sampai zaman pasca reformasi ini. Berkembangnya pertambangan di Indonesia tidak terlepas dari kolonial yang menjajah Indonesia. Industrialisasi pertambangan yang berkembang di Desa Bangunrejo dan Desa Embalut, Kecamatan Tenggarong Seberang secara meyakinkan telah membawa pengaruh besar baik dari sisi sosial, ekonomi maupun ekologinya. Desa dan masyarakat di dalamnya semakin terkepung oleh aktivitas tambang. Sejak Tambang luar (open pit mining) diberlakukan kebutuhan tanah semakin meningkat karena praktek penggalian pada permukaan tanah. Tambang terbuka inipun lebih menekankan pada penggunaan teknologi dan alat berat dalam mengambil batubara, tidak seperti tambang dalam yang lebih menggunakan tenaga manusia. Semakin meningkatnya kebutuhan tanah untuk keperluan tambang, alih fungsi lahan tidak terhindarkan. Pada prakteknya, pembebasan lahan dilakukan dengan dua tipe, yaitu pinjam pakai dan ganti putus. Tipe ke dua yaitu ganti putus, menjadi mekanisme yang paling sering digunakan. Mekanisme ini membuat harga tanah di Embalut dan Bangunrejo mengalami peningkatan yang sangat tinggi. Tanah kemudian tidak lagi dipandang sebagai aset produksi namun bergeser menjadi aset investasi. Enam perusahaan yang mengantongi IUP operasi produksi dan IUP eksplorasi di Desa Embalut dan Bangunrejo, yaitu PT. KTD , PT. GDM, PT. BBE, PT. KPC, PT. LT, dan PT. KBE sudah sangat mendominasi penguasaan tanah. Terhitung ke enam perusahaan tambang yang berada di kedua desa itu telah mengantongi izin lokasi untuk penguasaan lahan dengan total luas 14.582 ha. Total luas lahan tambang ke enam perusahaan tambang tersebut bahkan jauh melebihi luas Desa Embalut dan Desa Bangunrejo yang hanya bertotal 5.500 ha. Saat ini aktivitas PT.KTD, yang sudah beroperasi selama 34 tahun, berada dipenghujung operasinya, sehingga sudah nampak daerah-daerah yang direklamasi dan dikembangkan. Daerah yang sudah direklamasi banyak sekali ditanami dengan tanaman-tanaman hutan, seperti trembesi, sengon dan lamtoro. Tapi dengan dominannya tanaman-tanaman tersebut, memperlihatkan bagaimana corak reklamasi yang dilakukan hanya menekankan aspek fisik lingkungan. Padahal dengan kontur tanah yang relatif datar sangat cocok untuk pemanfaatan pertanian, peternakan dan pemukiman. Keberadaan tambang juga mempengaruhi produksi pertanian. Jika dulu dalam dalam 1 hektar mampu menghasilkan 70 karung gabah kering giling dengan penggunaan pupuk 2,5 kwintal, namun untuk saat ini paling maksimal v hanya 60 karung gabah kering giling dengan penggunaan pukuk mencapai 3,5 kwintal. Berdasarkan data sensus pertanian 2013, dari 2400 KK penduduk Desa Bangunrejo, hanya 700 KK yang merupakan keluarga petani. Sedangkan di Desa Embalut, di tahun 2011, jumlah rumah petani hanya ada sebanyak 95 KK, dan keluarga yang anggotanya menjadi buruh tani ada 30 KK. Rata-rata luas penguasaan lahan oleh petani saat ini semakin menyempit. Di Desa Embalut, berdasarkan data pada tiga kelompok tani, Berkat Etam, Karya Baru dan Loa Manik, memperlihatkan jika rata-rata luas penguasaan lahan petani hanya seluas 0,27 ha. Padahal sebelum ada tambang, penguasaan lahan masyarakat Embalut bisa diatas 4 hektar lebih, dan untuk masyarakat transmigrasi (Bangunrejo) minimum menguasai 2 ha tanah. Menyempitnya luas lahan petani tentu
Keyword: mining industry, agrarian-structural change, livelihood system, deagrarianization, changes in social structure