Judul: Potensi Kitinolik Bacillus Amyloliquefaciens Saha 12.07 Dan Serratia Marcescens Kahn 15.12 Sebagai Agens Biokontrol Ganoderma Boninense.
Abstrak: Kitin merupakan komponen utama dinding sel filum Basidiomycota terutama Ganoderma. Kitin pada cendawan berfungsi sebagai penyusun dinding sel yang terdapat dalam miselium dan spora. Ganoderma boninense merupakan patogen utama penyebab penyakit busuk pangkal batang kelapa sawit yang menyebabkan penurunan produktifitas kelapa sawit di Indonesia dan Malaysia. Kitin pada cendawan dapat didegradasi secara enzimatik oleh kitinase yang berfungsi sebagai antifungi. Kitinase adalah enzim hidrolitik yang berfungsi untuk mendegradasi kitin menjadi monomer N-asetilglukosamin. Kitinase banyak diproduksi oleh bakteri. Kitinase yang dihasilkan bakteri kitinolitik asal tanah kelapa sawit di Taman Nasional Bukit Dua Belas, Jambi berpotensi sebagai biokontrol yang mampu menghambat pertumbuhan Curvularia affinis dan Colletotrichum gloeosporioides penyebab penyakit hawar kelapa sawit. Namun demikian masih belum ada laporan penghambatan kitinase yang dihasilkan oleh bakteri terhadap G. boninense. Oleh karena itu penelitian ini bertujuan untuk menyeleksi dan mengidentifikasi bakteri kitinolitik asal tanah kelapa sawit TNBDB yang memiliki kemampuan menghambat pertumbuhan G. boninense dan mengkarakterisasi aktivitas kitinase dalam mendegradasi kitin pada G. boninense. Isolat SAHA 12.07 dan KAHN 15.12 mampu menghambat pertumbuhan G. boninense dengan persentase penghambatan masing-masing 68.19 dan 40.29%. Isolat SAHA 12.07 dan KAHN 15.12 teridentifikasi sebagai Bacillus amyloliquefaciens and Serratia marcescens dengan kemiripan 99% berdasarkan 16S rRNA. Isolat SAHA 12.07 memproduksi kitinase optimum pada jam ke-48 inkubasi dan KAHA 15.12 pada jam ke-54 inkubasi dengan aktivitas spesifik masing-masing sebesar 63.35 U/mg dan 143.51 U/mg. Kitinase ekstrak kasar dari SAHA 12.07 dan KAHN 15.12 dapat diendapkan menggunakan aseton masing-masing dengan konsentrasi 60 dan 20%, dengan aktivitas spesifik meningkat masing-masing sebesar 33.372 U/mg dan 1029.2 U/mg. Aktivitas kitinase ekstrak kasar dan hasil pengendapan pada B. amyloliquefaciens SAHA 12.07 dan S. marcescens KAHN 15.12 aktif pada kisaran pH luas antara 4-10 dan juga memiliki spektrum suhu yang luas antara 20-80 °C. Enzim hasil pengendapan pada B. amyloliquefaciens SAHA 12.07 dan S. marcescens KAHN 15.12 memiliki persentase penghambatan lebih tinggi terhadap pertumbuhan miselium G. boninense yaitu masing-masing 54.92 dan 40.84% dibandingkan kitinase ekstrak kasar yaitu masing-masing 11.97 dan 8.45%. Kitinase S. marcescens KAHN 15.12 melepaskan NAG lebih tinggi dibandingkan B. amyloliquefaciens SAHA 12.07.
Keyword: Ganoderma boninense, bakteri kitinolitik, aktivitas kitinase

Judul: Kajian Aktinomiset dan Trichoderma spp. sebagai Agens Pengendalian Penyakit Busuk Pangkal Batang Ganoderma boninense pada Kelapa Sawit.
Abstrak: Salah satu penyakit utama yang mempunyai pengaruh besar dalam menurunkan produktivitas kelapa sawit adalah penyakit busuk pangkal batang (BPB) yang disebabkan oleh G. boninense. Penyakit ini mampu menurunkan produksi tanaman sebesar 50% sampai 80%. Gejala infeksi diantaranya tanaman menjadi layu, helai daun tidak terbentuk sempurna, kelapa sawit tidak menghasilkan tandan dan bahkan menyebabkan kematian tanaman. Tingginya tingkat kerusakan dan kerugian yang diakibatkan oleh penyakit BPB mengakibatkan pengendalian terhadap penyakit ini sangat penting untuk dilakukan. Berbagai teknik pengendalian yang telah dilakukan untuk menekan intensitas penyakit BPB telah banyak dilakukan mulai dari pengendalian secara kimiawi, perlakuan fisik, pengendalian kultur teknis, penanaman galur tahan, hingga integrasi beberapa metode pengendalian Salah satu alternatif pengendalian yaitu dengan menggunakan kombinasi bakteri aktinomiset dan cendawan Trichoderma spp. Aktinomiset mampu menghasilkan senyawa antibiotik yang mampu menekan perkembangan G. boninense. Mekanisme tersebut juga didukung dengan kemampuan Trichoderma spp. diantaranya dengan mikoparasitik, menghasilkan senyawa antibiosis dan menginduksi ketahanan. Penelitian ini bertujuan mengevaluasi dan menentukan potensi aktinomiset dan Trichoderma spp serta kombinasinya dalam menekan serangan penyakit busuk pangkal batang yang disebabkan oleh G. boninense pada kelapa sawit. Penelitian ini dilakukan di laboratorium Bakteriologi Tumbuhan Proteksi Tanaman dan Screen House di Desa Sinar sari, Dramaga Bogor. Tahapan penelitian yang dilakukan meliputi penyediaan isolat aktinomiset, Trichoderma spp. dan juga G. boninense. Pengujian penekanan pertumbuhan G. boninense oleh aktinomiset melalui pengujian daya hambat, uji pengaruh senyawa VOC, pengujian senyawa bioaktif melalui peracunan media untuk menghambat pertumbuhan G. boninense. Uji konsentrasi senyawa bioaktif isolat aktinomiset terseleksi terhadap biomassa G. boninense. Uji kemampuan dalam menghasilkan enzim kitinase, glukanase, selulase, fosfatase, penambatan nitrogen dan produksi IAA. Uji kompatibilitas antara aktinomiset dan Trichoderma spp. dilakukan dengan dual culture. Uji in vivo dilakukan dengan aplikasi agens antagonis terhadap bibit kelapa sawit. Sebanyak 7 isolat koleksi aktinomiset yaitu isolat AKTb, AKT19, AKT28, AKT41, AKT52, AKT56 dan AKT57 mampu menghambat pertumbuhan G. boninense sebesar 33,33% - 100,00%. Pengaruh senyawa bioaktif dan senyawa VOC masing masing menghambat dari 27,50% - 89,17% dan 2,87% - 20,23%. Konsentrasi senyawa bioaktif 3% mampu menghambat dan menurunkan biomassa G. boninense. Semua isolat aktinomiset mampu menghasilkan enzim glukanase dengan indeks 0,27 - 1,41, kitinase dengan indeks 0,14 – 0,31 dan selulase dengan indeks 1,09 - 1,98. Isolat AKTb menunjukkan indeks pelarutan fosfat paling tinggi yaitu 2,71. Semua isolat dapat menghasilkan hormon IAA dan isolat yang tidak bisa melarutkan nitrogen hanya terdapat pada isolat AKT19 dan AKT52. Berdasarkan hasil identifikasi molekuler dengan menggunakan primer spesifk 27F dan 16Sact1114R isolat aktinomiset yang potensial menekan pertumbuhan G. boninense yaitu AKT19, AKT28 dan AKT52 memiliki homologi tertinggi dengan Streptomyces gelaticus strain NRRL B-2928. Dua isolat Trichoderma spp. terpilih mampu menghambat G. boninense 90,9 - 93,9 % dan hambatan senyawa VOC sebesar 55,2 - 70,56%. Indeks kitinase dan glukanase yang dihasilkan sebesar 0,29 - 0,89 dan 0,74 - 1,07. Kedua isolat tidak melarutkan fosfat namun mampu menghasilkan IAA. Identifikasi molekuler dengan menggunakan primer ITS 1 dan ITS 4 menunjukkan Trichoderma TGLP mempunyai kedekatan homologi tertinggi dengan Trichoderma asperelum dan Trichoderma TSU mempunyai kedekatan homologi tertinggi dengan Trichoderma yunnanense. Uji kompatibilitas menunjukkan bahwa Trichoderma asperelum dan Trichoderma yunnanense menunjukkan tidak kompatibel dengan semua isolat aktinomiset,
Keyword: Agens hayati, Antagonis, Hiperparasitisme, Kompatibilitas

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: