Judul: Kolonisasi dan Cara Kerja Aureobasidium pullulans Dmg 30 DEP dalam Pengendalian Hayati Penyakit Bercak Cokelat pada Tanaman Tomat.
Abstrak: Dampak negatif dari penggunaan pestisida sintetis mulai dirasakan oleh banyak pihak. Pestisida sintetis dilaporkan dapat menyebabkan patogen menjadi resisten serta berdampak buruk terhadap lingkungan dan kesehatan manusia. Kondisi tersebut mendorong peneliti untuk mencari alternatif pengendalian yang lebih ramah lingkungan. Pengendalian hayati merupakan salah satu metode pengendalian yang cukup menjanjikan untuk menjadi alternatif terhadap pestisida sintetis, yang dapat diterapkan secara tunggal maupun menjadi bagian dalam pengendalian hama dan penyakit terpadu. Pengendalian hayati penyakit tumbuhan saat ini masih terfokus pada pengendalian penyakit tular tanah. Pengembangan pengendalian hayati untuk daerah filoplan masih sangat terbatas. Daerah filoplan memiliki kondisi yang fluktuatif sehingga tidak semua mikroorganisme dapat berkembang dengan baik. Aureobasidium pullulans merupakan salah satu mikroorganisme yang dapat berkembang baik di daerah filoplan dan banyak digunakan sebagai agens biokontrol. Namun, laporan terkait penggunaan A. pullulans dalam pengendalian penyakit filoplan di daerah tropis masih sangat terbatas. A. pullulans Dmg 30 DEP asal Indonesia telah dilaporkan sebagai agens biokontrol yang efektif dalam mengendalikan penyakit pascapanen cabai. A. pullulans merupakan khamir yang sangat toleran terhadap kondisi ekstrim, karena memiliki melanin dan dapat memproduksi extracellular polysaccharide (EPS). Kelebihan tersebut menjadikan khamir ini sangat potensial untuk dikembangkan sebagai agens biokontrol di daerah filoplan. Namun, kajian terkait kemampuan kolonisasi dan cara kerja A. pullulans Dmg 30 DEP sebagai agens biokontrol di daerah filoplan belum banyak dilakukan. Salah satu penyakit filoplan penting yang telah tersebar luas di Indonesia adalah penyakit bercak cokelat yang disebabkan oleh Alternaria solani pada tanaman tomat. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui aktivitas biokontrol dari A. pullulans Dmg 30 DEP terhadap penyakit bercak cokelat pada tanaman tomat, mengamati kemampuan kolonisasi A. pullulans Dmg 30 DEP pada permukaan daun tomat, dan mengkaji cara kerja A. pullulan Dmg 30 DEP dalam pengendalian penyakit bercak cokelat pada tanaman tomat. Aktivitas biokontrol dari khamir A. pullulans Dmg 30 DEP diuji secara in vivo dan ad planta. Kemampuan kolonisasi khamir pada daun diamati dengan mikroskop elektron dan pengukuran perkembangan populasi khamir dilakukan dengan metode penghitungan cawan. Cara kerja antibiosis diuji dengan metode dual culture dengan melihat zona hambat yang terbentuk dan produksi VOC dengan metode cawan terbagi dan dilanjutkan dengan mengidentifikasi profil senyawa volatilnya dengan GC-MS. Kemampuan produksi metabolit yang bersifat antimikroba dilakukan dengan metode paper disk assay. Kemampuan lisis dari khamir diuji dengan melihat kemampuan kitinolitik (agar kitin) dan proteolitik (skim milk agar). Adanya kemampuan lisis dari khamir ditunjukkan dengan adanya zona bening dari tepi koloni. Pengujian potensi induksi ketahanan dilakukan dengan mengekstrak tanaman tomat yang diberi perlakuan metabolit dan dinding sel khamir. Ekstrak kasar tersebut selanjutnya dianalisis dengan GCMS. Uji kemampuan produksi hidrogen sianida (HCN) dilakukan dengan metode kertas indikator dan untuk uji kemampuan produksi siderofor dilakukan dengan menumbuhkan khamir uji pada media chrome azurol sulfonat (CAS). Kemampuan hiperparasitisme diobservasi dengan metode slide culture dan melihat kemampuan afinitas khamir pada miselium patogen. Aktivitas biokontrol dari A. pullulans Dmg 30 DEP dipengaruhi oleh kepadatan sel yang diberikan. Kepadatan sel khamir 104 mL-1 dan 105 mL-1 pada uji in vivo dan ad planta (jumlah daun yang bergejala) tidak berbeda dengan kontrol, sebaliknya perlakuan kepadatan sel khamir 106 mL-1 dan 107 mL-1 menunjukkan perbedaan yang
Keyword: Antibiosis, kepadatan sel, khamir antagonis, lisis

Judul: Taktik Pengendalian Busuk Batang Jeruk (Botryodiplodia Theobromae Pat.) Oleh Khamir, Fungi Mikoriza Arbuskular, Dan Kitosan
Abstrak: Penyakit busuk batang (Botryodiplodia theobromae (Pat.)) merupakan salah satu masalah dalam produksi jeruk di Indonesia. Pemanfaatan agens hayati dan kitosan menjadi prioritas dalam komponen pengendalian karena potensinya dalam pengendalian penyakit tanaman telah banyak dilaporkan. Agens hayati seperti khamir dan fungi mikoriza arbuskular (FMA) memiliki berbagai mekanisme dalam menekan perkembangan penyakit tanaman. Khamir telah banyak dimanfaatkan dalam pengendalian penyakit pascapanen dan memperpanjang daya simpan buah dan benih namun laporan tentang pemanfaatan khamir dalam pengendalian penyakit di lapangan belum banyak dilaporkan. Selain memanfaatkan FMA secara langsung, juga dilakukan isolasi bakteri-bakteri simbiotik dari FMA yang diduga berperan sebagai helper bacteria. Kitosan juga diketahui mampu menekan perkembangan penyakit tanaman dengan konsentrasi optimum tertentu yang bergantung pada jenis patogen dan jenis tanamannya. Namun, penelitian tentang potensi khamir, FMA serta bakteri simbiotiknya, kitosan dalam pengendalian penyakit busuk batang jeruk dan mekanismenya belum banyak dilaporkan. Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi potensi khamir, FMA, bakteri simbiotik FMA, dan kitosan baik secara tunggal maupun kombinasi untuk memperoleh taktik dalam mengendalikan penyakit busuk batang jeruk. Mekanisme-mekanisme pengendalian langsung dan tidak langsung dari agens hayati dan kitosan juga dievaluasi pada penelitian ini. Penelitian dilaksanakan di Laboratorium Mikologi Tumbuhan dan Laboratorium Bakteriologi Tumbuhan, Departemen Proteksi Tanaman, Rumah Kaca Cikabayan IPB, dan Laboratorium Pusat Studi Biofarmaka LPPM IPB pada bulan Januari sampai Agustus 2016. Khamir yang digunakan adalah isolat YP koleksi Klinik Tanaman IPB, FMA yang digunakan merupakan formulasi granul komersial, bakteri simbiotik diisolasi dan diseleksi dari FMA, dan kitosan yang digunakan diperoleh dari Departemen Teknologi Hasil Perairan IPB dalam bentuk serbuk yang diseleksi konsentrasi optimumnya. Pengujian-pengujian in vitro yang dilakukan adalah potensi produksi senyawa volatil, produksi enzim kitinase, antibiosis, dan hiperparasitisme dari khamir dan isolat-isolat bakteri hasil isolasi dari FMA, dan penentuan konsentrasi kitosan melalui pengujian penghambatan pertumbuhan radial B. theobromae dan kompatibilitasnya dengan khamir. Hasil pengujian in vitro adalah khamir memiliki mekanisme hiperparasitisme dengan afinitas 26 sel khamir per hifa B. theobromae, produksi senyawa volatil dengan tingkat hambatan relatif (THR) 29.1%, dan produksi enzim kitinase. Isolat bakteri simbiotik terbaik hasil isolasi dari FMA bersifat non-patogenik, Gram positif, memiliki mekanisme produksi senyawa volatil dengan THR 26.7%, antibiosis dengan THR 42.9%, produksi enzim kitinase, dan memiliki homologi 97% dengan B. subtilis asal Vietnam. 2 Kitosan konsentrasi 0.7% terpilih untuk digunakan pada uji in planta karena menekan pertumbuhan radial B. theobromae dengan THR 48.2% dan kompatibel dengan khamir. Pengujian dilanjutkan pada percobaan di rumah kaca dengan perlakuan: (1) Khamir, (2) FMA, (3) B. subtilis, (4) Kitosan, (5) Khamir+FMA, (6) Kitosan+FMA, (7) Khamir+Kitosan, (8) Khamir+FMA+Kitosan, dan (9) Kontrol dengan 3 ulangan dan 5 unit tanaman untuk masing-masing ulangan. Peubahpeubah yang diamati adalah periode laten, insidensi penyakit, keparahan penyakit, laju infeksi, dan nilai area under disease progress curve (AUDPC). Selain mempelajari aplikasi agens hayati dan kitosan dalam penekanan penyakit busuk batang jeruk, kesembilan perlakuan tersebut juga diberikan pada blok pertanaman tanpa inokulasi B. theobromae untuk melihat ada atau tidaknya pengaruh fitotoksisitas dari aplikasi agens hayati dan kitosan. Peubah lain yang diukur dari aplikasi agens hayati dan kitosan pada tanaman yang diinokulasi dan tidak diinokulasi B. theobromae adalah tingkat asosiasi FMA dan kandungan fenol total. Perlakuan Khamir+FMA+Kitosan menunjukkan periode
Keyword: antibiosis, hiperparasitisme, kitinase, senyawa fenol dan volatil

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: