Judul: Konstruksi plasmid rekombinan untuk menghasilkan padi tahan hama penggerek batang (stem borer)
Abstrak: Hama penggerek batang merupakan hama utama padi di Indonesia. Salah satu usaha untuk mengatasi penggerek batang adalah perbaikan genetika tanaman padi. CryLA(b) adalah gen yang diisolasi dari Bacillus thuringiensis yang menyandikan protein spesifik dan dapat melawan secara efektif serangga lepidoptera termasuk penggerek batang. Gen cryIA(b) ini dapat ditransfer ke gen tanaman padi. Untuk transfer ini diperlukan DNA pembawa (vektor) dan media transfer. Tujuan penelitian ini adalah ntuk mentisipkan gen cryIA (b) ke dalam plasmid pCambia 1301 sehingga menghasilkan DNA rekombinan serta mentransformasi DNA rekombinan tersebut ke Agrobacterium tumefaciens LBA 1119 dengan teknik tri-parental mating. Gen cryIA(b) diisolasi dari plasmid pGem-4 dengan menggunakan enzim restriksi Hind III. Pemisahan gen crylA(b) dari media gel agarosa dilakukan dengan menggunakan Sephaglas Brand Prep Kit. Plasmid pCambia 1301 dipotong dengan enzim restriksi Hind III. Pencegahan resirkularisasi plasmid pCambia 1301 dilakukan dengan menghidrolisis gugus fosfat pada ujung 5' memakai enzim calf intestinal alkaline phosphatase (CIAP). Perlakuan perbandingan gen crylA (b) dan plasmid pCambia 1301 adalah 1:1, 3:1, dan 6:1. Seleksi bakteri yang mengandung DNA rekombinan dan telah mengalami transformasi adalah kombinasi antibiotik dan seleksi biru/putih (screening blue/white). Gen cryLA(b) berhasil disisipkan ke dalam plasmid pCambia 1301. DNA rekombinan yang terkonstruksi sudah dapat dipetakan. Pemetaan DNA rekombinan dilakukan dengan memotong DNA rekombinan dengan enzim restriksi Eco RI. Namun demikian transformasi DNA rekombinan ke dalam Agrobacterium tumefaciens LBA 1119 dengan tri-parental mating belum berhasil dilakukan. Penyebab belum berhasilnya transformasi ini memerlukan penelitian lebih lanjut.
Keyword: 

Judul: Konstruksi DNA Rekombinan Plasmid Pcambia 1301-chi Untuk Ketahanan Terhadap Penyakit Busuk Pangkal Batang Pada Tanaman Kelapa Sawit (Elaeis guineensis jacq)
Abstrak: Usaha peningkatan perkebunan kelapa sawit secara rutin tidak terlepas dari masalah hama dan penyakit, antara lain cendawan patogenik Ganoderma spp. Pendekatan yang umum dilakukan uDtuk pengendalian penyakit tersebut antara lain ialah dengan cara mekanis, kimia, atan hayati. Pendekatan lain untuk mengatasi masalah tersebut ialah pemakaian bibit unggul tahan penyakit. Rekayasa genetik menggunakan gen kitinase dilaporkan mampu menghasilkan ketahanan terhadap serangan cendawan patogenik pada tanaman padi . Penelitian ini bertujuan menyediakan dan menguji vektor (pCambia 1301) yang dapat membawa gen kitinase, menyediakan gen chi, mengkonstruksi dan menguji DNA rekombinan serta mentransformasi DNA rekombinan ke tanaman. pCambia dan pBS-G 11 diisolasi dengan Quantum mini prep dari Biorad. se1anjutnya gen chi dalam pBS-G 11 dimurnikan dengan elektroelusi. Konfinnasi keberhasilan kontruksi DNA rekombinan dilakukan dengan metode isolasi plasmid metode Speedy dan dipotong dengan Hindlli. Selanjutnya DNA rekombinan dari E. coli ditransfer ke Agrobocterium tume/aciens dengan metode triparental mating. Keberhasilan metode ini dianaiisis dengan tri-parental mating balik dan seleksi antibiotik Penelitian ini telah berhasi menyisipkan gen chi Ire dalam pCambia-1301. DNA rekombinan terkonstruksi sudah dapat dibuktikan dengan isolasi plasmid metode Speedy. Restriksi DNA rekombinan dengan Hindlll menghasilkan 2 pita, yaitu 12 kb adalah pCambia 1301 dan 1.5 kb adalah gen chi. T ransformasi DNA rekombinan Ire dalamAgrobacterium tume/aciens LBA 4404 telah berhasil dilalrukan dengan metode tri-parental mating. Keberhasilan teknik tri-parental mating sudah dapat dibuktikan dengan teknik tri-parental mating balik dan seleksi antibiotik. Kelemahan metode ini ialah waktu yang digunakan relatif lebih lama dibandingkan analisis dengan menggunakan peR
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: