Judul: enetic Stability Analysis of Micropropagated and Dehydrated Sugarcane (Saccharum officinarum L.) for Cryopreservation
Abstrak: Tebu (Saccharum officinarum L.) merupakan tanaman utama penghasil gula, pada umumnya diperbanyak secara vegetatif. Indonesia merupakan salah satu negara yang diakui sebagai center of origin dan center of biodiversity tebu. Oleh karena itu perlu adanya konservasi plasma nutfah tebu untuk menjaga kekayaan sumber daya genetik. Kekayaan sumber daya genetik adalah modal utama dalam kegiatan pemuliaan tanaman. Metode konservasi yang digunakan dalam penelitian ini ialah kriopreservasi secara vitrifikasi. Sebelum dikriopreservasi, tebu diperbanyak melalui teknik kultur jaringan. Teknik kultur jaringan diyakini dapat menghasilkan tunas yang seragam dalam jumlah besar dan identik dengan induknya (true-to-type). Tujuan penelitian adalah mengetahui respon genotipe dan pengaruh tipe eksplan terhadap multiplikasi tunas in vitro pada tiga frekuensi subkultur (subkultur ketiga, keenam, dan kesembilan), mengetahui pengaruh proses multiplikasi tunas in vitro terhadap kestabilan genetik, mengetahui respon genotipe terhadap proses kriopreservasi tunas apikal secara vitrifikasi, dan mengetahui pengaruh proses kriopreservasi terhadap kestabilan genetik. Percobaan pertama ialah multiplikasi tunas in vitro enam genotipe tebu berdasarkan tipe eksplan dan analisis kestabilan genetik menggunakan penanda SSR. Tunas aksilar enam genotipe tebu (PS 881, PS 865, GMP 3, PSJK 922, TK 386, dan PS 862) ditumbuhkan pada media MS + 0.3 mg l-1 BAP + 0.5 mg l-1 IBA + 100 mg l-1 PVP kemudian disubkultur ke media yang sama setiap tiga minggu. subkultur dilakukan hingga subkultur kesembilan. Daya hidup eksplan, daya regenerasi tunas, rata-rata pertambahan tunas per satu tunas eksplan, dan tinggi tunas diamati pada subkultur ketiga, keenam, dan kesembilan. Analisis kestabilan genetik terhadap populasi biakan tebu subkultur ketiga, keenam, dan kesembilan menggunakan 12 pasang primer SSR yang merupakan hasil skrining dari 20 pasang primer SSR. Dua belas pasang primer tersebut adalah SKM 01, SKM 02, SKM 03, SKM 04, SKM 05, SKM 06, SKM 08, SKM 09, SKM 10, SMs 12, SMs 47, dan SMs 48. Hasil percobaan pertama menunjukkan bahwa respon enam genotipe tebu bervariasi dalam multiplikasi tunas in vitro hingga subkultur kesembilan. Satu tunas per eksplan merupakan tipe eksplan yang paling optimal untuk multiplikasi tunas tebu in vitro. Terdapat pengaruh interaksi antara genotipe dan tipe eksplan terhadap daya regenerasi tunas pada subkultur keenam. Populasi biakan tebu masing-masing genotipe, kecuali PS 862, menunjukkan tingkat kestabilan genetik yang tinggi (koefisien kemiripan >94%) pada subkultur ketiga, keenam, dan kesembilan berdasarkan 12 penanda SSR yang digunakan., Sugarcane (Saccharum officinarum L.) is the main crop producing sugar in Indonesia, generally propagated vegetatively. Indonesia is one of the countries recognized as a sugarcane center of origin and center of biodiversity. Therefore it is necessary to conserve germplasm of sugarcane to maintain the wealth of genetic resources. The wealth of genetic resources is the main capital for plant breeding activities. The conservation method used in this research is cryopreservation vitrification. Sugarcane was propagated through tissue culture techniques before applying cryopreservation. Tissue culture techniques are believed to produce uniform shoots in large numbers and identical to the mother plant (true-to-type). The aim of this research was to know the genotype response and the influence of the type of eksplan to the multiplication of in vitro shoots at three subculture frequencies (third, sixth and ninth), to know the effect of
Keyword: multiplication, genotype, subculture frequency, Tunas in vitro, Genotype tebu, Kriopreservasi tunas

Judul: Konservasi Tunas In vitro dan Populasi Sel Embriogenik Ubi Kayu secara Pertumbuhan Minimal dan Kriopreservasi
Abstrak: Plasma nutfah ubi kayu di Indonesia memiliki keragaman genetik cukup tinggi sehingga perlu dipertahankan dan dilestarikan sebagai sumber gen-gen penting untuk bio-prospeksi di masa datang. Ketersediaan plasma nutfah dapat dijamin dengan penyimpanan atau konservasi, baik secara in situ maupun ex situ. Konservasi ex situ pada ubi kayu tidak mungkin dilakukan pada bank gen benih sehingga umumnya konservasi dilakukan di kebun koleksi atau di laboratorium dengan penyimpanan secara in vitro. Penyimpanan di kebun koleksi atau lapangan beresiko terhadap kehilangan plasma nutfah karena serangan hama, penyakit dan bencana alam. Demikian juga penyimpanan in vitro pada pertumbuhan normal, memiliki banyak kekurangan antara lain perlu pemeliharaan intensif, resiko kehilangan karena kontaminasi, kelalaian dalam pelaksanaan dan kemungkinan terjadinya variasi somaklonal. Alternatif konservasi in vitro adalah penyimpanan secara pertumbuhan minimal dan kriopreservasi, yang memungkinkan untuk menyimpan lebih efektif dan efisien dalam jangka waktu lebih lama. Tujuan utama penelitian ini adalah untuk memperoleh metode konservasi in vitro dua aksesi ubi kayu hasil kegiatan pemuliaan, yaitu aksesi 433 (Genotipe hasil persilangan bersari bebas dari tetua Muara) dan aksesi 450 (Genotipe hasil persilangan bersari bebas dari tetua Adira). Konservasi dilakukan dalam jangka menengah secara pertumbuhan minimal menggunakan zat penghambat tumbuh (retardan) dan penyimpanan jangka panjang secara kriopreservasi. Penelitian terdiri atas empat bagian, mencakup: (1) konservasi in vitro secara pertumbuhan minimal yang dilakukan dengan penambahan retardan serta kemampuan regenerasi planlet setelah penyimpanan selama 9 bulan, (2) pengaruh media dengan perlakuan NAA (25 atau 50 ppm) dan jenis eksplan (daun-bagian adaxial di atas, daun-bagian adaxial di bawah, petiol dan batang in vitro) terhadap induksi kalus ubi kayu (3) pembentukan struktur embrio somatik pada beberapa kombinasi media regenerasi dengan penambahan prolin, ABA dan tembaga sulfat (CuSO4), serta (4) kriopreservasi tunas in vitro dan PEM (populasi sel embriogenik) yang diperoleh dari hasil kegiatan sebelumnya. Hasil penelitian menunjukkan bahwa jenis dan konsentrasi retardan paklobutrazol (konsentrasi 3.4, 6.8 dan 10.2 µM) atau cycocel (konsentrasi 6.3, 12.6 dan 18.9 µM) yang ditambahkan pada media kontrol (MS + arginin 100 ppm) menghasilkan respon yang berbeda pada kedua aksesi. Biakan dikulturkan pada media perlakuan selama 9 bulan tanpa sub kultur. Aplikasi retardan pada media menunjukkan bahwa seluruh perlakuan efektif menghambat pertumbuhan planlet (p<0.05%) dibandingkan kontrol, kecuali cycocel 6.3 µM pada aksesi 433. Perlakuan cycocel 6.3 µM pada aksesi 433 dan perlakuan paklobutrazol 6.8 µM pada aksesi 450 menghasilkan jumlah buku terbanyak dan vigor biakan lebih baik dibandingkan perlakuan kontrol. Regenerasi biakan setelah penyimpanan menunjukkan bahwa perlakuan cycocel 6.3 µM pada aksesi 433 dan perlakuan paklobutrazol 3.4 µM pada aksesi 450 mampu menghasilkan tanaman yang vigor dengan pertumbuhan serta visual biakan tidak berbeda dengan kontrol. Induksi kalus selanjutnya dilakukan untuk mendapatkan populasi sel embriogenik sebagai sumber eksplan pada kegiatan kriopreservasi. Kalus embriogenik hanya dihasilkan pada aksesi 433 yang berasal dari eksplan batang dan daun adaksial di atas (bagian abaksial menempel pada media) dengan penambahan NAA 25 ppm pada media induksi. Kalus embriogenik yang diperoleh kemudian digunakan sebagai sumber eksplan untuk pembentukan struktur embrio somatik. Struktur embrio somatik fase globular diamati terbentuk pada 2 BST, diperoleh pada media induksi embrio somatik yang mengandung CuSO4 dengan penambahan auksin picloram atau 2.4 D. Perkembangan
Keyword: konservasi in vitro, retardan, embriogenesis somatik, desikasi- vitrifikasi, Manihot esculenta Crantz

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: