Judul: Penurunan ekspresi gen pho85 sel apoptosis Saccharomyces cerevisiae oleh ekstrak daun ciplukan 33 NHR dan Geobacillus sp. 22a
Abstrak: Tanah vulkanis mengandung unsur selenium (Se) dan sulfur (S) yang tinggi. Tanaman dan mikroba yang dapat bertahan hidup pada kondisi lingkungan ini merupakan spesies akumulator Se. Se anorganik dari tanah terakumulasi dalam sel kemudian diubah menjadi bentuk Se organik.yang terintegrasi dalam protein atau asam amino. Senyawa tersebut berfungsi sebagai prekursor yang menyediakan monometilselenium. Monometilselenium dipercaya sebagai metabolit selenium chemopreventive yang berperan dalam memodulasi apoptosis sel. Hasil penelitian terdahulu menyebutkan bahwa ciplukan (Physalis minima L) 33NHR dan bakteri termofil Geobacillus sp. 22a merupakan spesies akumulator Se (3.04-40.55 ppm), mampu memicu apoptosis sel model S. cerevisiae dengan frekuensi sel petit 3.50-12.00 %. Sampel yang diekstrak dengan air menarik banyak senyawa selenium termasuk selenometionin
Keyword: 

Judul: Potensi Ekstrak Daun Cengkeh dan Eugenol dalam Memodulasi Apoptosis melalui Kajian Molecular Docking
Abstrak: Apoptosis adalah proses kematian sel yang dapat digunakan sebagai salah satu upaya menghindari penyakit seperti kanker, gangguan neurodegeneratif, autoimun dan penyakit kardiovaskular. Mekanisme apoptosis dapat diinduksi dengan adanya senyawa bioakif yang kaya antioksidan. Eugenol merupakan senyawa bioaktif yang banyak terdapat pada cengkeh (Syzygium aromaticum) dan memiliki aktivitas antioksidan. Dalam penelitian ini, potensi induksi apoptosis pada sel khamir yang diberi ekstrak cengkeh dianalisis. Apoptosis pada khamir (Saccharomyces cerevisiae) dapat diamati melalui terbentuknya koloni petite. Potensi pengikatan senyawa yang terkandung di dalam ekstrak cengkeh yakni eugenol terhadap regulator kunci lintasan apoptosis, protein YCA1 juga dianalisis melalui pendekatan molecular docking (penambatan molekuler). Penelitian ini bertujuan menentukan aktivitas modulasi apoptosis ekstrak kasar daun cengkeh pada S. cerevisiae serta menganalisis potensi pengikatan eugenol sebagai senyawa aktif daun cengkeh terhadap protein YCA1. Sebanyak 22 publikasi terkait aktivitas senyawa bioaktif dan tanaman yang memodulasi apoptosis menunjukkan bahwa ekstrak cengkeh memiliki potensi dalam memodulasi apoptosis. Hasil penelitian menunjukkan bahwa ekstrak kasar daun cengkeh dengan konsentrasi 500 ppm meningkatkan frekuensi koloni petite hingga 94,2% pada S. cerevisiae. Senyawa bioaktif eugenol mampu mengikat YCA1 dengan afinitas -4,4 kkal/mol yang diduga dapat memicu terjadinya apoptosis.
Keyword: apoptosis, docking, eugenol, petit

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: