Judul: Karakterisasi Genom Mitokondria Ikan pada Gen Cytochrome Oxydase Subunit 1 (CO1) dan Cytochrome B (CytB)
Abstrak: Popularity mitochondria genome(mtDNA) is supported by the relatively small size (15-20kb), a relatively rapid rate of mutation, and not having a recombination, therefore the scientists are often using mtDNA to analyze a species, such as DNA barcoding. Segment of mtDNA genes that frequently used in DNA barcoding is CO1 (cytochrome Oxydase 1) and CytB (cytochrome B) as an alternative gene segment. The purpose of this study was to characterize usage of CO1 and CytB on various species of fish from the nucleotide database (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/). The sequences of mtDNA from different taxa are gradually searched and selected. Then the data of nucleotide sequences were analyzed by using some programs, such as ClustalW, Microsoft Office Excel, and CodonW. The results showed that bias in general leads to the third codon A (73%). χ2 test conducted on the deployment of the third codon produced entirely evenly spread on each order. Amino acid that has a combination of 4 and 6 are having bias because they are having a high level of gene expression. Results of T-test for the relationship RSCU on CO1 and CytB not significantly different (α = 0,05 level, tcount <α) so that they are conserved as a marker genes also there might be genetic diversity in fishes’ mtDNA.
Keyword: mitochondria, fishes, CO1, CytB, bias

Judul: Analisis DNA Mitokondria dan Profil Protein Beberapa Ikan Air Tawar Indonesia
Abstrak: Analisis DNA mitokondria (COI) dilakukan untuk mengetahui kekerabatan pada ikan gabus, toman, betutu, baung, dan tor soro yang belum dilaporkan potensinya. Analisis DNA mitokondria (COI) dilakukan dengan tahap desain primer, isolasi DNA, PCR, elektroforesis, dan analisis bioinformatika. Profil protein diidentifikasi menggunakan metode SDS-PAGE, kadar protein albumin diukur menggunakan metode BCG, dan menganalisis keterkaitan gen COI dan protein. Primer yang didesain secara spesisifik teramplifikasi dengan baik pada 500-600 pb. Sekuens ikan gabus yang diperoleh dalam penelitian ini telah didepositkan pada GenBank dengan nomor akses KU204858. Profil protein kelima sampel ikan menunjukkan kesamaan dengan jumlah pita hasil elektroforesis sebanyak 15-18 pada 6,89-156,25 kDa. Kadar protein albumin ikan gabus, toman, betutu, baung, dan tor soro tidak berbeda nyata, namun elektroforegram protein menunjukkan ikan toman dan tor soro memiliki luas area protein albumin yang lebih besar dibandingkan ikan gabus, betutu, dan baung. Analisis DNA Mitokondria dapat diaplikasikan, sehingga menjadi alternatif penentuan sumber albumin.
Keyword: albumin, BCG, COI, DNA, SDS-PAGE

Judul: Perencanam Lanskap Sunda Kalapa, Jakarta Utara Sebagai Kawasan W isata Sejarah
Abstrak: Perkembangan kota Jakarta dari waktu ke waktu sangatlah cepat, cehingga menyebabkan kota-kota tua banyak yang tergusur untuk dijadikan daerah baru yang lebih modern. Apabila hal tersebut tidak ditanggulangi secara dini maka keberadaan Kota lama Jakarta akan hilang. Hal inilah yang melatar belakangi untuk dilakukan tindakan perlindungan dan revitalisasi kawasan bersejarah Sund Kalapa. Adapun tujuan yang ingin dicapai dalam penelitian ini adalah membuat suatu proses perencanaan lanskap sejarah kawasan Sunda Kalapa, Jakarta Utara. Hal ini diharapkan selain menunjang nilai arsitektur bangunan bersejarah dan menambah nilai kualitas lingkungan, juga meningkatkan aktivitas wisata sejarah.
Keyword: