Judul: Kondisi ekosistem terumbu karang di lokasi pengamatan desa Sumberkima, Kecamatan Gerogak, Kabupaten Buleleng, Propinsi Bali
Abstrak: Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui kondisi ekosistem terumbu karang dasarkan nilai Indeks Keanekaragaman (H'), Indeks Keseragaman (E), Indeks Dominansi (C) dan Indeks Mortalitas (MI) lifeform karang di Desa Sumberkima, kecamatan Gerogak, Kabupaten Buleleng, Propinsi Bali. Secara umum kondisi ekosistem terumbu karang di perairan Desa Sumberkima dalam keadaan yang kurang memuaskan. Hal ini ditandai dengan nilai Indeks Keanekaragaman (H") yang terdapat pada kedalaman 3 meter termasuk dalam kategori sedang kecuali pada Stasiun 3 mila Indeks Keanekaragaman (H') sangat kecil yaitu sebesar 0,11 sedangkan pada Stasiun 2 Indeks Keanekaragaman mencapai nilai tertinggi yaitu sebesar 2,5. Pada kedalaman 10 meter, Indeks Keanekaragaman (H') hampir merata di setiap stasiun yaitu dalam kategori sedang, Topi pada Stasiun 1 nilai Indeks Keanekaragaman (H') termasuk dalam kategori tinggi sebesar 2,76. Hal ni menunjukkan bahwa jumlah jenis terumbu karang yang terdapat di piran Desa Sumberkima sangat beranekaragam.. Pada kedalaman 3 meter nilai Indeks Keseragaman (E) rata-rata tergolong dalam kategori tinggi pada setiap stasiun, kecuali pada Stasiun 3 termasuk dalam kategori kecil yaitu sebesar 0,1. Kedalaman 10 meter, nilai Indeks Keseragaman (E) rata-rata bernilai tinggi dan nilai tertinggi terdapat pada Stasiun 2 sebesar 144. Hal ini menunjukkan bahwa terumbu karang yang ada di Desa Sumberkima dalam Jumlah individu setiap jenis karang tidak terlalu mendominasi. Nilai Indeks Dominansi (C) pada kedalaman 3 meter, tidak semuanya tinggi pada sesap stasiun kecuali pada Stasiun 3 nilai Indeks Dominansi (C) sangat tinggi sebesar 0,97, sedangkan pada kedalaman 10 meter nilai Indeks Dominansi (C) semuanya tergolong rendah xpai sedang. Nilai Indeks Dominansi tertinggi terdapat pada Stasiun 5 sebesar 0,52, Hal ni menunjukkan bahwa kecendrungan lifeform karang mendominasi peranan ekologis sangat Persentase penutupan karang hidup yang ada di setiap kadalaman termasuk rendah kecuali di beberapa stasiun. Tapi kondisi lokasi di perairan Desa Sumberkima ini masih bisa digunakan untuk tempat pertumbuhan dan perkembanagan terumbu karang Tingkat Kematian yang terdapat pada setiap stasiun rata-rata merupakan Tingkat Kematian yang tinggi kecuali pada beberapa stasiun tertentu seperti pada Stasiun 2 kedalaman meter. Karena pada stasiun tersebut hanya 0.01 Tingkat Kematiannya.
Keyword: Uniformity Index (E), Dominance Index (C), Mortality Index (MI, coral lifeforms

Judul: Studi Kondisi Ekosistem Terumbu Karang di Daerah Perlindungan Laut Pulau Sebesi, Lampung
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kondisi ekosistem terumbu karang berdasarkan genus karang yang ditemukan, mengetahui struktur komunitas karang berdasarkan indeks keanekaragaman (H'), indeks keseragaman (E), dan indeks dominansi (C) pada stasiun pengamatan di Daerah Perlindungan Laut Pulau Sebesi, Lampung. Penelitian ini dilaksanakan pada tanggal 23 Januari hingga 8 maret 2002 di Daerah Perlindungan Laut Pulau Sebesi, Lampung. Parameter perairan yang diukur adalah suhu, salinitas, derajat keasaman (pH), kecerahan, dan kecepatan arus. Pengamatan terumbu karang dilakukan dengan metode transek garis yang dikembangkan oleh Loya (1979). Data yang diperoleh dianalisis berdasarkan persentase penutupan karang (UNEP, 1993), Indeks Keanekaragaman (H'), Indeks Keseragaman, Indeks Dominansi (C), Indeks Similaritas Bray-Curtis (Clifford dan Stepenshon, 1975). Parameter fisika dan kimia perairan secara umum masih dalam kisaran yang baik bagi pertumbuhan biota karang. Suhu yang terukur memiliki variasi yang cukup kecil, yaitu berkisar antara 29 °C - 30 °C. Salinitas masih dalam kisaran air laut yang normal dan masih dalam ambang yang dapat menunjang pertumbuhan karang, yaitu berkisar antara 32%o - 33%o. pH yang terukur pada stasiun pengamatan mempunyai nilai yang sama, yaitu 8. Penetrasi cahaya sangat tinggi di setiap stasiun pengamatan pada masing-masing kedalaman yaitu sebesar 100%. Penetrasi cahaya sangat besar peranannya untuk fotosintesis alga simbion karang yaitu zooxanthel!ae. Kecepatan arus berkisar antara 0,45m/det - 0,85m/det. Kecepatan arus yang paling tinggi ditemukan di perairan sekitar DPL 1 dan yang paling kecil terdapat pada perairan di DPL 2. Berdasarkan kriteria Gomes dan Yap (1988), pada kedalaman 3 meter kondisi penutupan yang buruk dijumpai pada stasiun 3, 4, dan 5, kondisi sedang dijumpai pada stasiun 1,2, 6, 7, dan 11, sedangkan kategori baik dijumpai pada stasiun 12. Genus yang ditemukan pada kedalaman ini: Acropora, Echinopora, Hydnophora, Montipora, Pocillopora, Porites, Goniastrea, Pavona, Leptoria, Seriatopora, Caulastrea, Favia, Faviles, Goniastrea, Memhna, Millepora, dan beberapa karang lunak yaitu: Sinularia, Sarcophyton, Lobophyton, Oendronephthya, Nephthea, dan Xenia. Pada kedalaman 5 meter, kondisi penutupan yang buruk dijumpai pada stasiun 10, sedangkan pada stasiun 8 dan 9 temasuk kategori sedang. Genus karang yang ditemukan , paling banyak dari kelompok karang lunak, yaitu: Dendromphthya, Sarcophyton, Lobophyton, Sinularia, Xeniay dan Nephthea. Pada kedalaman ini juga ditemukan beberapa karang keras, yaitu Acropora, Hydnophora, Pocillopora, Faviles, dan Porites. Komposisi penutupan karang keras yang ditemukan jauh lebih kecil dibandingkan karang lunak. Pada kedalaman 6 meter, persen penutupan karang yang tergolong dalam kriteria buruk terdapat pada stasiun 1, 2, 3, 4, dan 5, persen penutupan karang yang tergolong sedang ditemukan pada stasiun 11, sedangkan pada stasiun 6 dan 12 persen penutupan karang tergolong baik. Genus karang yang ditemukan pada kedalaman ini adalah: Acropora, Echinopora, Goniopora, Leptoria, Pocillopora, Porites, Monlipira, Fungia, Favites, Favia,Hydnophora, Pachyseris, Pavona, Seriatopora, Leptoria, Heliopora, serta beberapa karang lunak yaitu: Dendronephthya, Sarcophyton, Lobophyton,, Sinularia, dan^ew'a. Secara umum pada stasiun pengamatan tidak ditemukan keanekaragaman yang termasuk tinggi. Keanekaragaman berkisar antara kecil hingga sedang. Pada kedalaman 3, keanekaragaman rendah ditemukan pada stasiun 2, 3,4, 6, dan 12, sedangkan yang termasuk keanekaragaman sedang terdapat pada stasiun 1, 5, 7, dan 11. Pada kedalaman 5 meter, keanekaragaman rendah ditemukan pada stasiun 9 dan 10 sedangkan pada stasiun 8 keanekaragaman tergolong sedang. Secara umum keanekaragaman pada kedalaan 6
Keyword: 

Judul: Kloning dan Ekspresi Human Interferon-alfa2a pada Yeast Metilotropik Pichia pastoris
Abstrak: Interferon (IFN) is a group of proteins that are secreted by body cells as a result of exposure to biological vertebrates such as: viruses, bacteria, protozoa and other compounds. There are three types of interferon, namely: alpha (α), beta (β) and gamma (γ) IFN. Interferon-α2a belongs to the type I interferon. This protein has a molecular weight of 21.550 kDa and consists of 188 amino acids (23 amino acid of signal peptide and 166 amino acids of mature protein). Interferon-α2a is also known to be used for the treatment of hepatitis C and as anti-tumor and antivirus agents. Regulator gene for IFN production under normal conditions, is in the off position to IFN is not produced. But when there are external stimuli, both viral and bacterial infections, a regulator gene switches on, and IFN production system running. At the time of an attack from a variety of disease agents actually the body will produce IFN, but generally the amount produced is not sufficient to fight the disease agents that multiply very quickly. Therefore IFN intake from outside is needed. This is the beginning of the use of IFN as a drug. Genetic engineering is an activity to manipulate the genes to get new products by creating recombinant DNA through gene insertion. Recombinant DNA technology has been used to produce IFN. Yeast such as Pichia pastoris can be an alternative as the host (system) to express human interferon genes and as a producer of IFN protein. Expression system P. pastoris offers several advantages for the production of recombinant proteins, such as: the high level expression of recombinant proteins, ease of scaling-up fermenter, low cost and ease of transformation techniques and selection of transformed cells such as bacteria . The existence of inducible AOX1 promoter is very strong, easily control the expression of recombinant proteins by induction. AOX1 is a promoter that controls gene expression of alcohol oxidase to metabolize methanol as carbon source of P. pastoris. Therefore,this study aimed to clone human interefron-α2a (hifnα2a) gene in E. coli and express it in metylotrophic yeast P. pastoris. Vector used in this study is pPICZαB (Invitrogen). Ligation process between insert (hifn-α2a gene) and vector (pPICZαB) performed by using T4 DNA ligase, which functions synthesize the formation of phosphodiester bonds linking the nucleotides with nucleotide insert plasmid vectors to produce recombinant (pPICZαB-hifnα2a). This recombinant plasmid transformed into XL1 blue cells (E. coli) by Heat shock method. The results of sequencing analysis (clone 6) using 5'AOX and 3'AOX primers indicate that DNA base sequence of human IFN-α2a genes has been subclone into pPICZαB vector (in frame). Recombinant plasmid (clone 6) linearized using BstX1 enzyme before transformed into X33 yeast cell. Transformation into cell was done by Electroporation. The X33 cell P. pastoris strain was used to express human interferon-α2a. X33 is strains with the phenotype Mut+ (methanol utilization plus) and can be used for positive transformants selection using zeocin. Phase protein production work using Mut+ strain occurred in two phases. The first phase is the use of glycerol to obtain a certain amount of biomass (high cell
Keyword: