Judul: The Potential of Daldinia sp. as Antimicrobial
Abstrak: Cendawan telah banyak dilaporkan sebagai agen biokontrol ataupun penggunaannya dalam bidang medis. Daldinia merupakan genus dari famili Xylariaceae yang dapat mengeluarkan metabolit sekunder, seperti beberapa concentricols dan cytochalasin. Metabolit sekunder ini dapat berfungsi sebagai antibakteri dan anticendawan. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan mengetahui kemampuan Daldinia sebagai antimikroba terhadap Fusarium oxysporum f. sp. cubense (foc) IPBCC 19 1472, Escherichia coli ATCC 8739, dan Staphylococcus aureus ATCC 6538 patogen. Metode yang digunakan yakni terdiri atas pengambilan sampel Daldinia dari sekitar kampus Dramaga IPB, isolasi sampel, pengamatan morfologi sampel hasil isolasi, uji antagonis Daldinia terhadap mikroba patogen melalui dual culture. Semua galur Daldinia sp. dapat menghambat cendawan patogen foc IPBCC 19 1472, yaitu melalui mekanisme kompetisi ruang. Namun semua galur Daldinia tidak mampu menghambat bakteri patogen Escherichia coli ATCC 8739 dan Staphylococcus aureus ATCC 6538. Foc IPBCC 19 1472 dapat dihambat hingga 54,4 ± 5,1% oleh Daldinia sp. 3 dan paling rendah sebesar 37,3 ± 7,7% oleh Daldinia sp. 1., Daldinia is a genus from the Xylariaceae family that can produce secondary metabolites, such as some concentricols and cytochalasins. These secondary metabolites can function as antibacterial and antifungal agents. Therefore, this study aimed to determine the ability of Daldinia as an antimicrobial against pathogens Fusarium oxysporum f. sp. cubense (foc) IPBCC 19 1472, Escherichia coli ATCC 8739, and Staphylococcus aureus ATCC 6538. The method consisted of taking Daldinia samples from around the Darmaga IPB campus, sample isolation, morphological observations of isolated samples, and antagonistic study of all Daldinia sp. strains against pathogenic microbes through dual culture. All Daldinia sp. strains can inhibit the pathogenic fungus foc IPBCC 19 1472 through space competition. However, all Daldinia sp. strains could not inhibit pathogenic bacteria Escherichia coli ATCC 8739 and Staphylococcus aureus ATCC 6538. Foc IPBCC 19 1472 can be inhibited up to 54.4 ± 5.1% by Daldinia sp. 3, and the lowest was 37,3 ± 7,7% by Daldinia sp. 1.
Keyword: Dual culture, Escherichia coli, foc, Staphylococcus aureus, uji antagonis

Judul: Pemanfaatan Senyawa Metabolit Bakteri Endofit Untuk Menekan Cendawan Patogen Terbawa Benih Kedelai.
Abstrak: Salah satu kendala dalam penyediaan benih kedelai yang bermutu adalah patogen terbawa benih yang dapat menyebabkan kejadian penyakit pada tanaman di lapangan. Cendawan merupakan salah satu kelompok patogen terbawa benih yang penting. Salah satu pengendalian cendawan patogen terbawa benih adalah dengan menggunakan bakteri endofit. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan bakteri potensial dan mengetahui kemampuan bakteri endofit beserta senyawa metabolitnya untuk menghambat pertumbuhan cendawan patogen terbawa benih. Penelitian ini dilaksanakan di Laboratorium Balai Proteksi Tanaman Pangan dan Hortikultura Medan Sumatera Utara dan Laboratorium Mikologi Tumbuhan Departemen Proteksi Tanaman Fakultas Pertanian Institut Pertanian Bogor.Isolasi bakteri endofit dari tanaman kedelai dilakukan dengan menggunakan metode sterilisasi permukaan sedangkan isolasi cendawan patogen dilakukan dengan metode inkubasi yaitu blotter test. Pemilahan bakteri yang berpotensi dilakukan dengan uji respons hipersensitif pada daun tembakau dan uji daya hambat bakteri terhadap cendawan Fusarium oxysporum. Ekstraksi senyawa metabolit dilakukan dari ketiga bakteri yang berpotensi.Senyawa metabolit yang diperoleh diuji terhadap cendawan patogen secara in vitro dan in vivo untuk mengetahui metabolit yang paling berpotensi menekan pertumbuhan F. oxysporum. Hasil pengujian menunjukkan dari 48 isolat bakteri endofit nonpatogenik yang dapat diisolasi terdapat tiga bakteri endofit potensial yang mampu menghambat pertumbuhan cendawan patogen Fusarium oxysporum. secara in vitro. Ketiga isolat bakteri endofit tersebut adalah EDA 3 (Listeria sp.), EBA 6 (Pseudomonas sp.), dan EBA 7 (Xenorhabdus sp.) dengan daya penghambatan sebesar 60.14%, 57.69%, 57.08% secara berturut-turut. Senyawa metabolit dari ketiga bakteri yang menunjukkan daya hambat tertinggi berasal dari bakteri Xenorhabdus sp. dan Listeria sp. yaitu sebesar 34.88% dan 25.53% secara berturut-turut. Perlakuan perendaman benih dengan senyawa metabolit bakteri endofit Xenorhabdus sp. dan Listeria sp. juga mampu menurunkan infeksi F. oxysporum.Xenorhabdus sp. mampu menekan tingkat infeksi sebesar 76.67-89.47% pada metode blotter test dan growing on test. Listeria sp. mampu menekan tingkat infeksi sebesar 63.16-78.24% pada metode blotter test dan growing on test. Bakteri endofit asal tanaman kedelai yang memiliki potensi untuk menghambat pertumbuhan F. oxysporum adalah Listeria sp., Pseudomonas sp. dan Xenorhabdus sp. secara in vitro.Senyawa metabolit yang berpotensi dalam menghambat pertumbuhan F. oxysporum adalah Xenorhabdus sp. dan Listeria sp. secara in vitro dan in vivo. Penelitian ini diharapkan dapat menjadi pedoman dalam pengembangan pengendalian cendawan patogen terbawa benih penyebab penyakit tanaman.
Keyword: blotter test, Fusarium oxysporum, respons hipersensitif

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: