Judul: Identification, pathogenicity of bacteria and the use of gene 16SrRNA for ice-ice detection on seaweed aquaculture (Kappaphycus alvarezii)
Abstrak: Penyakit ice-ice menyerang sentra budidaya di beberapa negara produsen rumput laut seperti di Filipina, Malaysia dan Tanzania, yang berakibat penurunan produksi rumput laut hingga 70-100%. Gejala penyakit ice-ice umumnya ditandai dengan pemutihan di pangkal thallus, tengah dan ujung thallus muda, yang dahului perubahan warna thallus menjadi putih bening atau transparan. Pengelolaan budidaya rumput laut yang sehat dan bebas penyakit ice-ice merupakan komponen penting dalam peningkatan produksi rumput laut, sehingga diperlukan teknik deteksi penyakit ice-ice secara cepat dan akurat. Selama ini identifikasi dan deteksi bakteri patogen dilakukan berdasarkan pengamatan gejala klinis, riwayat kejadian penyakit di lokasi budidaya, karakteristik morfologi, fisiologi dan biokimia bakteri. Metode tersebut memiliki peran yang cukup penting sebagai studi awal, namun kurang dapat menentukan hubungan filogenetis bakteri dan ekspresinya sangat dipengaruhi oleh faktor lingkungan. Seiring dengan perkembangan teknologi dalam bidang kesehatan ikan, berbagai teknik identifikasi dan deteksi telah dikembangkan, namun kajian tentang penyakit ice-ice pada budidaya rumput laut belum mendapat perhatian yang serius sehingga kuantitas dan kualitas produksi rumput laut fluktuatif. Metode deteksi yang banyak dikembangkan saat ini adalah metode deteksi secara molekuler melalui analisis DNA genom yang berbasis teknik PCR. Pemanfaatan gen 16S-rRNA telah digunakan sebagai parameter sistematik sebagai penanda untuk identifikasi spesies bakteri. Oleh karena itu, beberapa tahap penelitian telah dilakukan, mengenai isolasi, identifikasi bakteri patogen yang menyebabkan penyakit ice-ice, mekanisme patogenisitas bakteri patogen penyebab penyakit ice-ice dan pemanfaatan sekuen gen 16S-rRNA untuk mendisain primer spesifik PCR dalam deteksi cepat dan akurat.
Keyword: Bakteri Patogen

Judul: Studi Peran Interaksi Bakteri Patogen Dan Lingkungan Terhadap Penyakit Ice-Ice  Pada Rumput Laut Kappaphycus Alvarezii.
Abstrak: Pengembangan dan peningkatan produksi rumput laut Kappaphycus alvarezii sangat penting perannya dalam upaya memenuhi permintaan berbagai industri yang memanfaatkan rumput laut sebagai bahan dasar produksinya. Indonesia sebagai salah satu negara produsen terbesar, harus mampu menjamin kualitas dan kuantitas produksi budidaya rumput laut dalam rangka persaingan antar produsen rumput laut di dunia. Budidaya merupakan jalan utama dalam mengupayakan pencapaian produksi massal rumput laut. Namun demikian, kegiatan budidaya seringkali dihadapkan suatu masalah terbesar, yakni munculnya wabah penyakit rumput laut. Penyakit semakin dipandang sebagai faktor utama dalam ekologi laut dan dampaknya diperkirakan akan meningkat dengan perubahan lingkungan seperti pemanasan global. Disertasi ini fokus pada pemahaman sebuah "pemutihan" (bleaching) penyakit ice-ice pada makroalga merah Kappaphycus alvarezii, terutama pada musim panas dengan pendugaan suhu yang meningkat dan kepadatan bakteri yang semakin melimpah. Penyakit ice-ice diduga dapat dihasilkan secara in vitro oleh kombinasi dari peningkatan suhu dan kehadiran bakteri patogen. Penelitian ini bertujuan untuk mengkaji: a) jenis bakteri dari rumput laut yang terserang penyakit ice-ice, b) patogenisitas secara in vitro bakteri patogen dengan menggunakan mikropropagul, c) performa secara morfologi dan mikroskopis pada rumput laut yang diinkubasi pada suhu panas dan penginfeksian beberapa jenis bakteri patogen dengan konsentrasi bakteri yang berbeda. Penelitian ini dilakukan melalui metode eksperimen dengan tiga tahapan. Tahapan I: isolasi bakteri dan identifikasi dengan pengujian biokimia dan molekuler melalui sekuensing untuk mengidentifikasi spesies dari bakteri pada rumput laut yang terserang penyakit ice-ice; Tahapan II: Perlakuan penginfeksian bakteri patogen dengan jenis bakteri yang berbeda untuk menentukan tingkat patogenisitas bakteri patogen terhadap rumput laut; Tahapan III: Perlakuan kombinasi suhu dengan jenis dan konsentrasi bakteri yang berbeda untuk mengevaluasi performa morfologi dan mikroskopis jaringan rumput laut K. alvarezii. Hasil penelitian menunjukkan bahwa terdapat lebih dari satu jenis bakteri yang teridentifikasi pada K. alvarezii yang terserang penyakit ice-ice, yakni Shewanella haliotis strain DW01, Vibrio alginolyticus strain ATCC 17749, Stenotrophomonas maltophilia strain IAM 12323, Arthrobacter nicotiannae DSM 20123, Pseudomonas aeruginosa strain SNP0614, Ochrobactrum anthropic strain ATCC 49188, Catenococcus thiocycli strain TG 5-3 dan Bacillus subtilis subsp.spizizenii strain ATCC 6633. Dari kedelapan jenis bakteri tersebut, sebanyak lima jenis (62,5%) masuk dalam kelompok Gammaproteobacteria, lainnya masingmasing satu jenis bakteri (12,5%) adalah Alphaproteobacteria, Firmicutes, dan Actinobacteria. Hasil ini juga menunjukkan bahwa sebagian besar jenis bakteri penyebab penyakit ice-ice adalah Proteobacteria. Uji patogenisitas bakteri dilakukan secara in vitro dengan menggunakan mikropropagul hasil kultur jaringan yang diinfeksikan dengan kedelapan jenis bakteri hasil riset tahap pertama. Seperti yang ditemukan dalam penelitian vi sebelumnya, terdapat delapan jenis bakteri yang mungkin berasosiasi dengan penyakit ice-ice. Penelitian ini bertujuan untuk menguji tingkat patogenisitas dari isolat pada mikropropagul K.alvarezii dengan gejala serangan ice-ice berdasarkan gejala klinis, morfologi dan jaringan rumput laut. Mikropropagul berukuran 2-4 cm direndam dalam air laut yang mengandung 106 bakteri cfu / ml untuk menentukan patogenisitas. Timbulnya gejala ice-ice diamati setiap hari secara visual. Hasil penelitian menunjukkan bahwa bakteri yang paling cepat menimbulkan bleaching pada mikropropagul adalah Stenotrophomonas maltophilia (5 jam pascainfeksi), sedangkan paling lambat adalah dengan V. alginolyticus (44 jam pascainfeksi). Bakteri lainnya dapat menyebabkan gejala ice-ice yakni 15-21 jam pascainfeksi. Selanjutnya, bakteri Shewanella Haliotis dan V. alginolyticus ditemukan di talus sehat. Ini adalah studi pertama yang
Keyword: bakteri, suhu, salinitas, penyakit ice-ice, talus, Kappaphycus alvarezii

Judul: Penggunaan Teorema Homeomorphy 2-Manifold dan Teorema Euler Poincare pada Torus 𝑇�� dan Simplicial Complex 𝐾��
Abstrak: Two dimensional topological spaces are said to be homeomorphic if they have the same topological invariant, where one of topological invariant used is an Euler characteristic. Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem and Euler Poincare’s Theorem are used to distinguish two topological spaces. Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem uses Euler characteristic to identify two dimensional topological spaces. Euler Poincare’s Theorem is an alternative way to find Euler characteristic with Betti number, which is topological invariant as well. The objective of this paper is to investigate the homeomorphism of torus 𝑇����� and simplicial complex 𝐾�����. Topological space torus and simplicial complex 𝐾����� have the same Euler characteristic, which is two. Based on Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem topological space torus 𝑇����� and simplicial complex 𝐾����� is homeomorphic.
Keyword: simplicial, torus, Euler, homeomorphism, topology