Judul: Telaah Aktivitas Bakteri Penghasil Lipase yang Berasosiasi dengan Tempe.
Abstrak: Tempe is known as fermented food products the origin of Indonesia. In addition as high nutritional value of foodstuffs, tempe is also known as the ecosystem for many types of microorganisms. Total fat content on tempe shows a decrease when compared to the fat content in soybean without fermentation. A decrease in fat levels in tempe is becoming an indicator of existence of lipolytic microorganisms in it. The existence of lipolysis activity in tempe make it more easy to digest and have a distinctive scent of the hydrolysis of the fatty acids. The sample was the traditional foods origin of Indonesia namely tempe. Tempe was collected from various of tempe craftsmen with specific of sample selection category. Observation of physical condition, consistency and aroma of tempe were done during several observation time span after sample collection. Samples of tempe have been observed subsequent of total bacterial population and lipase producing bacteria (lipolytic). The method is the standard plate count which plate count agar medium for enumeration of total bacterial population and Luria- Bertani agar medium emulsified with olive oil and rhodamine B for enumeration of lipolytic bacteria. The role of lipolytic bacteria in the flavour development of tempe also examined in briefly based on the content of free fatty acid profiles were analyzed by gas chromatrography with flame ionizer detector (GC-FID) method. The collection of samples obtained from three different tempe craftsmen in Bogor, hereinafter referred to as CMG, EMP and RTI. The all of those three distinguishing criteria of tempe sample based on cleanliness during the process of tempe production. Changes in physical condition, consistency and aroma of the tempe shows the difference on each type of tempe. The changes observed during the fastest observations occurred in tempe CMG followed by tempe EMG and slowest changes occur in tempe RTI. Total bacteria and lipolytic bacterial populations were carried out employing standard plate count method and showed CMG harbored the highest bacterial population number 2.31 × 109 cfu g-1 followed by EMP 9.78 × 108 cfu g-1 and RTI 4.04 × 106 cfu g-1. Lipolytic bacteria were found in each tempe samples which were approximately 0.1 % of total bacterial population. CMG harbored the highest lipolytic bacterial population number 1.04 × 106 cfu g-1 followed by EMP 2.88 × 105 cfu g-1 and RTI 1.72 × 104 cfu g-1. Tempe aroma and texture showed strong correlation between the numbers of bacterial population during the period or stages of tempe maturation. Moreover, we also found a unique correlation between dynamic of lipolytic population and flavor development. Free faty acid composition on tempe CMG, EMP and RTI are dominated by linoleic, oleic, palmitic, linolenic and stearic acid respectively.
Keyword: tempe, flavor development, lipolytic bacteria, GC-FID, free fatty acid

Judul: Bioprospeksi Lipase Asal Tempe Indonesia: Isolasi, Identifikasi, Kloning, dan Karakterisasi Lipase Novel dari Micrococcus luteus EMP48-D.
Abstrak: Tempe merupakan pangan tradisional asli Indonesia yang dibuat melalui proses fermentasi, umumnya menggunakan Rhizopus oligosporus. Selain R. oligosporus, keberadaan bakteri menjadi sangat penting dalam produksi tempe, yang mana beberapa dari mereka berperan dalam meningkatkan kualitas tempe. Penelitian ini dilakukan untuk mengidentifikasi dan memeriksa hubungan antara bakteri lipolitik yang berasosiasi dengan tempe CMG, EMP dan RTI serta peran mereka dalam pelepasan senyawa asam lemak bebas. Bakteri lipolitik yang ditemukan di setiap sampel tempe memiliki kepadatan sekitar 0.1% dari jumlah total populasi bakteri. Tempe CMG merupakan tempe dengan jumlah populasi bakteri lipolitik tertinggi sebesar 1.04 × 106 cfu g-1 diikuti oleh tempe EMP sebesar 2.88 × 105 cfu g-1, dan tempe RTI sebesar 1.72 × 104 cfu g-1. Profil asam lemak bebas menunjukkan bahwa aktivitas lipolisis terjadi selama fermentasi tempe. Tempe EMP menunjukkan pembebasan pada semua jenis asam lemak bebas dominan pada tempe, sementara tempe CMG lebih aktif dalam membebaskan asam γ-linolenat dan asam stearat dan RTI hanya secara aktif melepaskan asam linolenat. Karakterisasi awal menggunakan gen parsial sekuen 16S rRNA, dari ± 200 isolat lipolitik yang diperoleh menunjukkan sebagian besar isolat yang diidentifikasi tergolong dalam tiga filum dominan. Filum Proteobacteria terbagi menjadi sembilan genus: Serratia, Klebsiella, Citrobacter, Proteus, Morganella, Raoultella, Pseudomonas, Moraxella, dan Acinetobacter; filum Firmicutes terbagi menjadi dua genus: Bacillus dan Staphylococcus; Sementara filum Actinobacteria terbagi menjadi empat genus; Micrococcus, Salinibacterium, Kocuria, dan Barrientosiimonas; Beberapa isolat juga diklasifikasikan sebagai klon yang belum terkulturkan. Lipase bakteri adalah kelompok penting dari enzim yang menawarkan potensi besar dalam sintesis organik, sehingga terdapat minat yang cukup besar dalam upaya mengidentifikasi dan mengembangkan lipase-lipase bakteri jenis baru. Bakteri penghasil lipase (EMP48-D) diisolasi dari sampel tempe. Gen yang mengkodekan lipase dari EMP48 ditransformasikan ke dalam inang Escherichia coli BL21 menggunakan teknik PCR kloning. Prediksi urutan asam amino dari urutan nukleotida (1,356 pb) mengkodekan protein yang terdiri atas 451 residu asam amino dengan berat molekul sekitar 30 kDa berdasarkan hasil deteksi zimogram. Protein yang dideduksi menunjukkan 98% identitas urutan asam amino terhadap lipase dari Micrococcus luteus trpE16. Analisis sekuen juga menunjukkan bahwa protein mengandung G-Y-S-Q-G yang merupakan karakteristik khas dari lipase. Kehadiran sinyal peptida sepanjang 31 residu menunjukkan protein dimungkinkan untuk sekresi ekstraseluler. Struktur 3D yang diprediksi dari lipase EMP48-D menunjukkan topologi membentuk lipatan α/β-hidrolase yang terdiri atas sembilan β-strand dan 12 α-heliks. Ser244, His420 dan Asp388 berperan iii sebagai residu triad katalitik. Residu serin katalitik (Ser244) terletak pada siku nukleofilik antara strand β6 dan helix α4 dalam struktur inti. Lipase EMP48-D menunjukkan variabel spesifisitas/aktivitas hidrolitik yang berbeda terhadap berbagai ester p-nitrophenyl. p-nitrophenyl caprylate (C8) dan p-nitrophenyl laurate (C12) merupakan ester yang paling efisien dihidrolisis dibandingkan dengan jenis ester lainnya. Lipase EMP48-D menunjukkan aktivitas spesifik optimum pada pH 5.0 dan suhu 40 °C sebesar 15.02 ± 2.33 U mg-1. Stabilitas enzim berada pada kisaran pH 4.0 – 5.0 dan dapat mempertahankan 42.13% dari aktivitasnya sekalipun di inkubasi pada suhu 65 °C selama 180 menit. Di antara pelarut organik yang diujikan, 2-propanol aktivitas lipase relatif tampak stabil pada 113.5%, diikuti oleh butanol dengan peningkatan aktivitas relatif sebesar 113%, etanol sebesar 105.2%, asetonitril sebesar 103,7% dan metanol sebesar 102%, sementara pelarut
Keyword: Tempe, bakteri lipolitik, metagenom, Micrococcus luteus, lipase asidik, struktur 3D, transesterifikasi

Judul: Construction of Strongly Optimal Binary Linear Code with Minimum Distance 9 and 11
Abstrak: A binary linear code of length n over q F is a subspace of n q F . A code has three parameters that attached to it, namely length, dimension, and minimum distance. A code with length n, dimension k and minimum distance d is often called [n, k, d ]-code. Usually, when two parameters are given, then we want to find a code that has the best value for the last parameter. Based on Gilbert- Varshamov bound, if a [n, k, d ]-code exists and can not be expanded, we call it a strongly optimal code. In this paper, we construct strongly optimal code with minimum distance 9 and 11. In constructing the code, we created a theorem and algorithm based on Gilbert-Varshamov bound before we implement the algorithm to MAPLE programming language. Because of computational limitations, the program can only construct up to k = 10 for d = 9 and k = 12 for d = 11.
Keyword: