Judul: Deteksi dan Karakterisasi Megalocytivirus pada Budidaya Ikan di Beberapa Daerah di Indonesia
Abstrak: Megalocytivirus termasuk ke dalam anggota famili Iridoviridae dan menyebabkan kerugian ekonomi yang sangat tinggi pada budidaya ikan. Megalocytivirus memiliki tiga spesies yaitu Infectious Spleen and Kidney Necrosis Virus (ISKNV), Red Sea Bream Iridovirus (RSIV) dan Turbot Reddish Body Iridovirus (TRBIV). Penelitian ini bertujuan untuk mendeteksi dan mengkarakterisasi spesies ISKNV, RSIV dan TRBIV yang diambil di beberapa daerah di Indonesia sehingga diperoleh informasi terbaru tentang daerah yang terinfeksi Megalocytivirus. Sampel diambil dari ikan air laut antara lain kerapu, kakap dan bawal bintang, sedangkan sampel ikan air tawar yaitu gurami, nila dan ikan hias air tawar dari beberapa provinsi di Indonesia. Seluruh sampel ikan menunjukan gejala klinis infeksi virus seperti warna tubuh ikan terlihat gelap, nafsu makan berkurang, kematian diatas 40%, kurang aktif berenang dan memisahkan diri dari kelompok ikan lain. Metode untuk deteksi virus menggunakan kit koagglutinasi dan histopatologi, sedangkan identifikasi spesies menggunakan metode Polymerase Chain Reaction (PCR) dengan gen target Major Capsid Protein (MCP) serta identifikasi kekerabatan menggunakan metode sekuensing DNA. Seluruh sampel dari Provinsi Sumatera Utara menunjukan hasil negatif baik secara serologi maupun PCR, lesio pada semua sampel dari provinsi tersebut kemungkinan bukan disebabkan oleh Megalocytivirus. Sampel yang berasal dari 11 provinsi lainnya memberikan hasil yang bervariasi. Semua sampel ikan air tawar terinfeksi ISKNV, sedangkan ikan air laut terinfeksi ISKNV dan RSIV. Virus TRBIV tidak terdeteksi pada semua sampel. Semua isolat ISKNV yang ada di Indonesia memiliki hubungan kekerabatan yang sangat dekat, begitu juga dengan RSIV. Megalocytivirus sudah menyebar dibeberapa provinsi di Indonesia.
Keyword: ISKNV, Megalocytivirus PCR, RSIV, TRBIV

Judul: Prevalensi Dan Karakterisasi Molekuler Infectious Myonecrosis Virus (Imnv) Di Sentra Budidaya Udang Vaname (Litopenaeus Vannamei) Di Propinsi Banten
Abstrak: Udang vaname Pasifik (Litopenaeus vannamei) merupakan udang hasil introduksi yang berkembang baik dan memasyarakat di Indonesia sebagai spesies udang budidaya alternatif selain spesies udang lokal, udang windu (Penaeus monodon) dan udang jerbung (P. merguensis). Saat ini udang vaname telah dibudidayakan secara komersil hampir di seluruh propinsi di Indonesia. Penyakit myonecrosis menjadi satu di antara empat penyakit virus signifikan yang menyerang industri budidaya udang vaname di Indonesia: taura syndrome virus (TSV), white spot syndrome virus (WSSV), infectious myonecrosis virus (IMNV), dan infectious hypodermal and hematopoietic necrosis virus (IHHNV). Wabah myonecrosis pada udang vaname berkontribusi pada turunnya produksi udang di Indonesia dan dunia. Myonecrosis disebabkan oleh infectious myonecrosis virus yang termasuk ke dalam famili Totiviridae, berbentuk icosahedral, diameter 40 nm, merupakan virus dsRNA dengan panjang 8223 – 8230 bp. Pola infeksi IMNV bersifat persisten, kronis dan progresif. Deteksi IMNV dini secara molekuler diperlukan untuk penanganan lebih lanjut untuk mencegah kerugian dan penyebaran penyakit yang lebih luas. Penelitian ini bertujuan untuk mendeteksi secara dini menggunakan metode real time PCR (qRT-PCR) dan menduga prevalensi IMNV di Banten serta karakterisasi molekuler isolat IMNV lapang Banten. Penelitian dilakukan pada bulan Maret – Juni 2015. Pengambilan sampel dilakukan di 24 tambak aktif di empat sentra budidaya udang vaname di Propinsi Banten. Deteksi IMNV pada sampel subklinis menunjukkan metode qRT-PCR mampu mendeteksi secara dini infeksi myonecrosis pada udang vaname. Delapan sampel menunjukkan hasil positif IMNV dengan jumlah salinan 3.44 – 24.72 salinan IMNV/μl. Limit deteksi qRT-PCR hingga <101salinan/μl sedangkan metode RT-PCR memiliki limit deteksi 102 – 103 salinan/μl. Prevalensi IMNV secara keseluruhan di Propinsi Banten adalah 33.3% sedangkan prevalensi di masing-masing sentra budidaya udang vaname yaitu Kota Serang 0%, Kabupaten Serang 0%, Kabupaten Tangerang 14.3% dan Kabupaten Pandeglang 100%. Hasil pairwise comparison sekuens nukleotida parsial ORF1 (fragmen 740 – 1118) isolat Brazil dan isolat lapang Banten memiliki persentase kemiripan 97.9 – 99.2% dan sekuens asam amino menunjukkan persentase kemiripan 99.2 –100%. Hasil pairwise comparison isolat Indonesia dan isolat lapang Banten memiliki persentase kemiripan 98.9 – 99.7% dan sekuens asam amino menunjukkan persentase kemiripan 98.4 –100%. Percabangan pohon filogenetik menunjukkan bahwa telah terjadi diversifikasi genetik antara IMNV Indonesia dan Brazil. Analisis filogenetik juga menunjukkan terjadi variasi pada isolat Indonesia yang masing-masing berkembang membentuk cabang tersendiri terpisah dari kelompok isolat Brazil.
Keyword: prevalensi, IMNV, Litopenaeus vannamei, real time PCR, filogenetik

Judul: Synthesis of Apatite - Chitosan Composite Using Duck Eggshell and Chitosan with Temperature and pH Control
Abstrak: Composite of apatite-chitosan was prepared by using chitosan as polymer matrix. Calcium phosphate was prepared from CaO and (NH4)2HPO4, which the ratio Ca : P had to be 1.67. Chitosan is produced by deacetilase from biopolymer chitin. Duck eggshell (95% CaCO3) as starting material was converted to be calcium oxide (CaO) through calcinations with temperature 1000oC for 5 hours. In-situ and ex-situ methods were prepared from apatite and chitosan (dissolved with acetate acid 2%). Calcium phosphate prepared for bone implantation, but it is too fragile and brittle to be implant into the body. So addition of chitosan can decrease crystalinity and increase mechanic characteristic (tougher). Composite apatite-chitosan was resulted by fast precipitation. Fast precipitation was held in a breaker glass with nitrogen atmosphere, under controlled temperature at 37oC and pH 7, in order to increase amount of hydroxyapatite. Precipitation with CaO which was dropped by (NH4)2HPO4. Hydroxyapatite and chitosan were appearing at samples with in-situ and ex-situ methods which indicating by peak matching of XRD (closed lattice parameter, crystal size), overlapping at FTIR spectra and supporting by SEM picture (homogenous and agglomerated particle). However, it still needs further research to examine biocompatibility osteoconductive degree of sample by in-vivo and in-vitro test.
Keyword: