arulpm/tripletsmall huggingface dataset:
Judul: Uji ketahanan beberapa varietas padi (Oryza sativa) terhadap patogen BRS (Bacterial Red Stripe)
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk membandingkan ketahanan tujuh varietas padi yaitu Semeru, Krueng Aceh, Cisadane, IR 64, IR 48, IR 36, IR 54 dan tiga galur harapan yaitu ML77b- 4-Kp-2 (GH no. 744), B6680-Mr-9-3 (GH no. 733) dan B71360- Mr-22 (GH no. 777), terhadap serangan bakteri Pseudomonas penyebab penyakit BRS. Percobaan dilakukan di rumah kaca dengan menggunakan kantong plastik hitam (polibag) dan tanah lumpur serta pupuk urea, TSP dan KCL. Percobaan ini menggunakan Rancangan Acak Lengkap. Inokulum bakteri diperoleh dari tanaman padi yang terserang patogen BRS di daerah Laladon, Bogor. Inokulasi dilakukan pada saat tanaman padi berumur delapan minggu dengan metode penyemprotan. Suspensi bakteri untuk inokulasi berupa inokulum bakteri yang dicampur dengan PS (Potato Sukrose Gula kentang). Gejala BRS muncul sepuluh hari setelah inokulasi. Pengamatan dilakukan segera setelah gejala muncul sebanyak sepuluh kali dengan selang waktu dua hari.
Keyword: Oryza sativa, Padi, Patogen BRS, Bacterial Red Stripe

Judul: Pengaruh cara inokulasi patogen garis merah bakteri (bacterial red stripe/BRS) terhadap timbulnya gejala penyakit pada berbagai stadia tanaman padi varietas IR-64
Abstrak: Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui hakekat patogen BRS dan stadia tanaman tertentu yang dapat atau mudah diserang oleh patogen tersebut dengan menerapkan empat cara inokulasi. Penelitian ini dilaksanakan di rumah kaca dan laboratorium penyakit Sentra Peramalan Hama dan Penyakit Tanaman Pangan, Jatisari, Karawang, Jawa Barat. Tanaman yang digunakan sebagai tanaman uji adalah padi (Oryza sativa L) varietas IR-64 yang berumur 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, dan 10 minggu. Inokulasi dilakukan dengan cara penyemprotan (spray), tusuk jarum (needle prick), karborundum (carborundum), dan suntik (injection). Setiap perlakuan dilaksanakan dengan tiga ulangan dan dua kon- trol. Isolasi dan reisolasi patogen dilakukan pada media PSA (Potato Sukrose Agar). Sedangkan untuk identifikasi digunakan medium selektif S-PG. Stadia tanaman yang menunjukkan gejala pada metode penyemprotan adalah 5 10 minggu, tusuk jarum adalah 6- 10 minggu, dan karborundum adalah 8 10 minggu. kan pada metode suntik tidak muncul gejala atau bercak penyakit. Gejala yang ditimbulkan tanaman akibat perlakuan inokulasi berbeda. Gejala khas penyakit BRS ditunjukkan oleh tanaman padi yang mendapat perlakuan penyemprotan. Masa inkubasi penyebab penyakit BRS pada tanaman padi dengan umur yang berbeda dengan ketiga cara inokulasi berkisar antara 12 25 hari. Hasil identifikasi isolat penyebab penyakit BRS asal padi adalah Pseudomonas. Spesiesnya belum diketahui.
Keyword: 

Judul: Konstruksi Hukum Grup Kurva Eliptik Atas F3m
Abstrak: Elliptic curves upon F3m can be divided in two cases, i.e. supersingular and nonsupersingular case. Based on group laws on elliptic curves, a new arithmetic upon F3m can be formulated as an addition process of two random points on the curve. This addition process can then be applied to the ElGamal algorithm.
Keyword:
Judul: Analisis Perkembangan Daya Saing Alas Kaki Indonesia di China Periode 2005 - 2015.
Abstrak: Sektor non migas memiliki peran yang sangat penting dalam meningkatkan nilai ekspor Indonesia. Alas kaki merupakan salah satu komoditas unggulan ekspor Indonesia. Adanya kerjasama ACFTA diharapkan dapat meningkatkan pangsa pasar produk sepatu olahraga dan sepatu casual Indonesia di China. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis dayasaing alas kaki Indonesia di China selama periode 2005 sampai 2015. Penelitian ini juga menggunakan analisis Reveleated Comparative Advantage, Intra-Industry Trade, Porter’s Diamond dan Trade Balance. Hasil analisis RCA menunjukan bahwa berdaya saing di China dan model porter’s diamond menunjukan bahwa dayasaing kompetitif alas kaki yang kuat. Hasil IIT menunjukan bahwa produk sepatu casual cenderung memiliki integrasi sangat kuat sedangkan produk sepatu olahraga cenderung memiliki integrasi kuat. Hasil Trade Balance menunjukan bahwa produk sepatu casual maupun produk sepatu olahraga cenderung memiliki nilai impor yang lebih besar dibandingkan nilai ekspor dari tahun ke tahun.
Keyword: Alas kaki, IIT, Porter’s Diamond, RCA, Trade Balance

Judul: Analisis Dayasaing dan Faktor-Faktor yang Memengaruhi Aliran Ekspor Alas Kaki Indonesia di Kawasan ASEAN dan China
Abstrak: Footwear is one of the leading export commodities of Indonesia. Agreement of the ASEAN-China Free Trade Area (ACFTA) is expected to improve the competitiveness of Indonesian footwear in Southeast Asia and China markets. The purpose of this research is to analyze the competitiveness of Indonesian footwear and analyze the factors affecting Indonesian footwear exports to China and Southeast Asia countries. This research use a Gravity Model with panel data method, covering five countries export destination from 2000 to 2011. Independent variables used are GDP of Indonesia, GDP of the destination countries, the economic distances, the real exchange rate of rupiah and dummy implementation of ACFTA. In addition, this research also uses Revealed Comparative Advantages (RCA) method to analyze the competitiveness of Indonesian footwear. The value of RCA shows that Indonesian footwear has high competitiveness both in the markets of Southeast Asia as well as world markets in total. Indonesian footwear exports flow is influenced by real GDP of Indonesia, nominal GDP of the destination country, and the real exchange rate of rupiah
Keyword: 

Judul: Penggunaan metode homotopi untuk menyelesaikan model populasi volterra
Abstrak: Most phenomena in nature can be explained in mathematical models. One of the mathematical models explaining population growth is Volterra equation. Volterra population equation is a nonlinear integral equation. This equation can be solved using homotopy method, which is an analytical approximation method to obtain the solution of nonlinear problems. In this paper, Volterra population model is solved using homotopy method, which gives a recursive formula to be solved using MAPLE software. The result shows that the greater approximation order we use, the wider convergence solution area will be.
Keyword:
Judul: Sinkage prediction of Terrestrial Robotic Vehicle (TRV) using plate sinkage test
Abstrak: Plate sinkage tests method have been performed by many researchers to assess the sinkage of conventional off-road vehicles, one of it is Bekker’s model. The need of sinkage prediction for Terrestrial Robotic Vehicles (TRV) is necessary, hence the objectives of this study was to determine sinkage prediction for TRV based on plate sinkage test method. The methodology used in this study was the measurement of sinkage of several plates with different area and contact shape ratio on a terrain with different physical and mechanical properties. The plate sinkage test’s results were compared with the observed sinkage of TRV in static and dynamic states. Microsoft Excel and SPSS 17 software were employed to process and analyze data. The results showed that linear regression models of plate sinkage tests with the highest coefficient of determination is the model plate sinkage tests Z’5. The test plate sinkage model is Z’5= -7.903 + 0.100 P + 0.303 KA for soil types CL (clay loam) with a moisture content content of 29.43%, up 32.29% and bulk density g/cm3 1.06 g/cm3 until 1.18 g/cm3.
Keyword: Terrestrial Robotic Vehicle,, soil characteristics, sinkage prediction model for TRV, plate sinkage test

Judul: Sinkage prediction model of a four-wheel tractor based on plate sinkage test
Abstrak: Sinkage of a tractor on a field will cause motion resistance which reduces its traction. This will lead to the reduction of tractor’s efficiency. This study was conducted to predict the sinkage of a four-wheel tractor based on plate sinkage test. The parameters used for the plate sinkage test were load, physical and mechanical properties of soil (water content, bulk density and penetration resistance) and the dimensional parameters of the plate (the plate area and contact shape ratio). The method used were predicting sinkage using plate sinkage test with special consideration on contact shape ratio and comparing the model with Bekker’s sinkage model (1960). The test resulted that water content and load on area of plate were significantly affect the depth of sinkage as a parameters. The model which is has the best correlation to the sinkage of tractor is k2 model i.e. 7 6 6 69
Keyword: tractor, sinkage, shape ratio index, plate sinkage

Judul: Ornithonyssus Bursa (Berlese, 1888) Famili Macronyssidae yang Menyerang Unggas Dan Penaggulangannnya
Abstrak: Ornithonyssus bursa adalah tungau penghisap darah pada unggas di daerah tropis dan subtropis. Tungau ini relatif kecil, dengan panjang tubuh antara 700-1000 mikron dan lebarnya 250-490 mikron. Tubuhnya bulat berwarna coklat kekuningan sebelum menghisap darh dan berwarna merah setelah menghisap darah dari induk semangnya.
Keyword:
Judul: Mempelajari Pola Respirasi dan Pengawetan dengan   Cara Pengeringan dari Buah Salak (Salacca edulis Reinw.)
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari pola respfrasi buah salak yang baru dipanen sampai mengalami kebusukan dan mempelajari pengawetan buah salak dengan cara pengeringan.
Keyword: 

Judul: Mempelajari Penyimpanan Segar Salak Bali (Salacca edulis Reinw.) dengan Atmosfir Termodifikasi dan Kondisi Vakum
Abstrak: Salak (Salacca edulis Reinw.) merupakan tanaman asli Indonesia yang sangat umum dikenal di masyarakat. Sebagai komoditi yang mudah rusak, usaha untuk mengembangkan penanganan lepas panen buah salak Bali perlu diperhatikan. Salak Bali mempunyai nilai ekonomis yang cukup tinggi, banyak digemari masyarakat serta mempunyai peluang pasar ekspor yang masih terbuka luas.
Keyword: 

Judul: Centrality test for Non-Normal And Skewed Population
Abstrak: The t modified 2 test is more robust than t test for skewed popnlation. This test tolerate the population skewness from -1.2 to 1.2 sample size is reather than 25. The sign test robust to the populated skewed population, but the value of the estimated always close to the size of the tcst. Wilcoxon test is not robust to the population skewness. This test is more suittalble for Symmetric population
Keyword:
Judul: Produksi Sirup Fruktosa dari Inulin Umbi Dahlia Dalam Reaktor Sinambung Unggun Terkemas Menggunakan Enzim Inulinase Imobil
Abstrak: Sirup fruktosa merupakan alternatif bahan pemanis lain yang kebutuhannya semakin lama semakin meningkat. Selain dari pati, sirup ini dapat juga diproduksi dari inulin yang berasal dari umbi dahlia (Dahlia pinnata Cav.) yang relatif mudah dibudidayakan di Indonesia. Gula cair dari inulin ini mempunyai banyak kelebihan dibandingkan gula cair dari pati, diantaranya rendemennya tinggi (sampai 97 persen) dan prosesnya singkat (hanya 1 tahap).
Keyword: 

Judul: Produksi sirup fruktosa dari inulin dahlia (Dahlia pinnata. Cav) secara curah menggunakan sel khamir
Abstrak: Jumlah penduduk Indonesia dari tahun ke tahun cenderung Cipts Dilimdiin meningkat, sehingga konsumsi akan gula pun cenderung meningkat pula. Ketersediaan pemanis terutama pemanis alami saat ini sangat kurang. Dua jenis sumber pemanis alami yang telah ada saat ini yaitu gula kristal dari tebu dan gula cair (dari pati), sampai saat ini belum dapat mencukupi kekurangan akan pemanis tersebut. Pada tahun 1990 BPS melaporkan impor gula kristal dan pemanis lainnya mencapai 258 958.05 ton. Sedangkan untuk tahun 1991 pemerintah merencanakan impor gula sebesar 2 000 000 ton (Kompas, Pebruari 1991). Mengingat keterbatasan areal yang sesuai untuk tanaman tebu serta besarnya modal yang diperlukan untuk merehabilitasi dan mendirikan pabrik-pabrik gula kris- tal, maka untuk beberapa dasawarsa ke depan diperkirakan Indonesia masih akan kekurangan gula. Untuk mengatasi hal tersebut selain melakukan impor pemanis, pemerintah juga melakukan berbagai jenis usaha lain guna memenuhi kebutuhan gula dalam negri. Salah satu usaha tersebut adalah pendirian industri pengolahan gula cair.
Keyword: 

Judul: Perbandingan Metode Kekar Biweight Midcovariance dan Minimum Covariance Determinant dalam Analisis Korelasi Kanonik
Abstrak: Canonical Correlation Analysis (CCA) is a multivariate linear used to identify and quantify associations between two sets of random variables. Its standard computation is based on sample covariance matrices, which are however very sensitive to outlying observations. The robust methods are needed. There are two robust methods, i.e robust Biweight Midcovariance (BICOV) and Minimum Covariance Determinant (MCD) methods. The objective of this research is to compare the performance of both methods based on mean square error. The data simulations are generated from various conditions. The variation data consists of the proportion of outliers, and the kind of outliers: shift, scale, and radial outlier. The performance of robust BICOV method in CCA is the best compared to MCD and Classic.
Keyword:
Judul: Pengaruh Pemberian Zat Pengatur Tumbuh Hydrasil terhadap Pertumbuhan, Komponen Hasil dan Hasil Kedelai (Glycine mex (L.) Merril) Varietas Merbabu dan Wilis
Abstrak: Percobaan ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh pemberian zat pengatur tumbuh Hydrasil pada beberapa taraf konsentrasi yang berbeda terhadap pertumbuhan, komponen hasil dan hasil kedelai varietas blerbabu dan Wilis. Percobaan dilaksanakan mulai bulan Oktober 1988 sampai bulan pebruari 1989 di Kebun Percobaan IPB Darmaga IV , Bogor.
Keyword: 

Judul: Pengaruh Pemberian Hydrasil terhadap Pertumbuhan Hasil dan Komponen Hasil Kedelai (Glycine max (L.) Merr.)
Abstrak: Penelitian dilaksanakan di Kebun Percobaan Agronomi IPB Darmaga I V dan Rumah Kaca Agronomi Baranangsiang, BOgor pada bulan September 1984 hingga Januari1985. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui pengaruh pemberian Hydrasil pada 2 varietas kedelai (Galunggung dan Americana) dengan konsentrasi berbeda-beda terhadap pertumbuhan, hasil dan komponen hasil serta kandungan N biji kedelai.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword:
Judul: Analisis kebijakan perubahan fungsi cagar alam pulau rambut menjadi suaka margasatwa
Abstrak: Pulau Rambut saat ini mengalami berbagai tekanan yang dapat mengancam kelestarian ekosistem dan keanekaragarnannya. Mengingat pentingnya Pulau Rambut dan krisisnya kondisi kawasan tersebut, maka Menteri Kehutanan dan Perkebunan mengeluarkan Surat Keputusan Perubahan Fungsi Cagar Alam Pulau Rambut menjadi Suaka Margasatwa pada tahun 1999. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui dan menggali potensi Pulau Rambut. serta persepsi stakeholders/key persons mengenai Pulau Rambut. Selain itu. penelitian ini menganalisis alternatif pengelolaan yang optimal dalam pemanfaatan Pulau Rambut, sebagai wujud analisis kebijakan perubahan fungsi cagar alam Pulau Rambut men. adi suaka margasatwa.
Keyword: 

Judul: Perencanaan interpretasi di suaka margasatwa Pulau Rambut, Kepulauan Seribu DKI Jakarta
Abstrak: Pulau Rambut pertama kali ditetapkan sebagai Cagar Alam pada tahun 1939 melalui Keputusan Gubernur Jenderal Hindia Belanda No.7/1939. Selanjutnya, pada tahun 1970 pemerintah Indonesia memperkuat status kawasan ini sebagai Cagar Alam melalui Keputusan Pemerintah No.11/I/20 tertanggal 28 Mei 1970. Kemudian melalui Keputusan Menteri Kehutanan dan Perkebunan Indonesia No. 275/Kpts-II/1999, ditetapkan menjadi Suaka Margasatwa. Perubahan status kawasan ini disebabkan oleh terjadinya perubahan kondisi alami di Pulau Rambut, sehingga perlu adanya upaya pengelolaan habitat di Pulau Rambut.
Keyword: 

Judul: Photosensor producing based on ferroelectric material of Ba0,5Sr0,5TiO3 doped by Ferrium Oxide (Fe2O3) on a P-Type Silicon Substate Si (100) applied as a digital camera with a single pixel image sensor
Abstrak: Thin film Ba0,5Sr0,5TiO3 (BST) doped with Fe2O3 was grown on p-type silicon substrate (100) using chemical solution deposition (CSD). It used the solvent 2-methoxyethanol with annealing temperature of 850°C and the doping treatment Fe2O3 of 2.5, 5, 7.5, 10 % of the mass formed BST. Pure BST had the highest absorption of 600 nm of light wavelength. Additions Fe2O3 moves highest absorption in the range of 560 nm. Fe2O3 addition was strengthening thin film sensitivity to the effects of light. In general, doping Fe2O3 10% was result the best absorbance and current-voltage of BST thin film. Electrical properties of thin films BST include dielectric, photoconductivity, and dissipation energy. Based on the current-voltage (I-V) analysis, pure BST and doped BST showed photodiode properties. Dielectric values obtained in the range from 23.32 to 243. Based on electrical conductivity data and energy dissipation, BST thin films have shown photodiode characteristics and are therefore suitable as light sensors. The image sensor in a digital camera is also a light sensor. This BST thin film has been scientifically proven to be a light sensor and also it can be applied as an image sensor. This is a novelty image sensor based on thin film Ba0.5Sr0.5TiO3.
Keyword: barium strontium titanate, thin film, photodiode, image sensor, digital camera
Judul: Pengaruh penambahan protamin dan kalium sorbat terhadap daya awet pindang ikan kembung (Rastrelliger sp) Presto
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh penambahan protamin dan efek sinergis penambahan campuran protamin dan kalium sorbat terhadap daya awet pindang kembung presto selama penyimpanan. Adapun konsentrasi protamin dan kalium sorbat masing-masing 2 persen (berat protamin/berat ikan) dan 0,5 persen (berat kalium sorbat/ berat ikan). Sebagai pembanding diberikan perlakuan kontrol yang tidak diberi bahan pengawet tambahan. Ikan kembung direndam dalam larutan garam 20 persen yang telah diberi perlakuan selama 2 jam secara (v/v) terpisah, lalu dimasak dalam autoclave pada suhu 100°C, tekanan 1,1 Atm. Pindang presto yang telah masak dikeringkan pada suhu pada suhu 50°C selama 30 menit lalu didingikan pada suhu kamar. Pengemasan secara vakum dilakukan setelah pindang presto menjadi dingin. Pengamatan dan pengujian dilakukan dilakukan setiap minggu selama 4 minggu penyimpanan, yang meliputi uji organoleptik, mikrobiologi, kandungan TVN, nilai TBA, nilai pH dan kadar air. Disamping itu pada minggu awal dan akhir pengamatan dilakukan pengujian terhadap kadar lemak, kadar protein dan kadar abu. ...
Keyword: 

Judul: Mempelajari Pengaruh Protamin dan Glysin sebagai Bahan Pengawet dalam Pengolahan Pindang Ikan Kembung (Rastrelliger sp)
Abstrak: Penelitian laboratorium telah dilakukan dengan tujuan untuk mempelajari pengaruh protamin dan glysin untuk meningkatkan daya awet pindang ikan kembung (Rastrelliqer sp) . Sebelum dimasak ikan dipisahkan menjadi empat kelompok. Kelompok I sebagai kontrol (Ao), kelompok I1 (A1) direndam dalam larutan glysin 20% (w/w), kelompok I11 (A2) direndam dalam larutan protamin 1% (w/w) dan kelompok IV (A3) direndam dalam larutan protamin 1% dan glysin 20% (w/w). Setelah itu dilakukan pemindangan dan disimpan pada suhu kamar selama 3 minggu dan dilakukan pengamatan. Rancangan penelitian yang digunakan adalah rancangan acak lengkap pola faktorial dengan dua kali ulangan.
Keyword: 

Judul: Penggunaan Teorema Homeomorphy 2-Manifold dan Teorema Euler Poincare pada Torus 𝑇�� dan Simplicial Complex 𝐾��
Abstrak: Two dimensional topological spaces are said to be homeomorphic if they have the same topological invariant, where one of topological invariant used is an Euler characteristic. Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem and Euler Poincare’s Theorem are used to distinguish two topological spaces. Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem uses Euler characteristic to identify two dimensional topological spaces. Euler Poincare’s Theorem is an alternative way to find Euler characteristic with Betti number, which is topological invariant as well. The objective of this paper is to investigate the homeomorphism of torus 𝑇����� and simplicial complex 𝐾�����. Topological space torus and simplicial complex 𝐾����� have the same Euler characteristic, which is two. Based on Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem topological space torus 𝑇����� and simplicial complex 𝐾����� is homeomorphic.
Keyword: simplicial, torus, Euler, homeomorphism, topology
Judul: Analisis spasial stuktur komunitas fitoplankton di perairan Teluk Hurun, Lampung
Abstrak: Penelitian dengan judul Analisis Spasial Struktur Komunikasi Fitoplankton di PErairan Teluk Hurun, Lampung, dilaksanakan pada bulan Juni 2005 bersamaan dengan penelitian yang diadakan oleh P2O LIPI di perairan Teluk Hurun, Lampung.
Keyword: 

Judul: Kondisi komunitas zooplankton di perairan teluk Hurun, Lampung
Abstrak: Penelitian dengan topik Kondisi Komunitas Zooplankton di Perairan Teluk Hurun, Lampung, dilaksanakan pada bulan Juni 2005 bersamaan dengan proyek penelitian yang diadakan oleh P2O LIPI di perairan Teluk Hurun, Lampung. Analisis laboratorium dilaksanakan di Laboratorium Biologi Laut, FPIK, IPB. Penentuan stasiun dilakukan dengan menggunakan GPS dengan jumlah 12 stasiun dan pengamatan dilakukan pada saat pasang dan surut. Parameter yang diukur meliputi data jumlah dan jenis zooplankton serta beberapa parameter fisika-kimia perairan. Analisis ya ng dilakukan meliputi komposisi dan kelimpahan, indeks komunitas (keanekaragaman, keseragaman, dominansi serta sebaran Morisita) serat analisis grafik frontier untuk menggambarkan kondisi dan stabilitas komunitas zooplankton.
Keyword: 

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA