Judul: Antibacterial activity test of lactobacillus plantarum isolated from tropical fruits and relation to gene expression plantaricin.
Abstrak: Bakteriosin dari strain Lactobacillus plantarum yaitu plantaricin, memiliki kemampuan untuk menghambat pertumbuhan bakteri patogen. Penelitian ini bertujuan menguji aktivitas antibakteri dari isolat L. plantarum yang berasal dari buah-buahan tropis serta mengkorelasikan antara tingkat ekspresi gen pln A dan plnF dengan tingkat aktivitas penghambatan patogen. Isolat L. plantarum dari buah-buahan tropis terlebih dahulu di uji aktivitasnya dengan bakteri patogen Staphylococcus aureus, Salmonella thypimurium, Escherichia coli, Pseudomonas floresense dan Bacillus cereus kemudian diuji analisis ekspresi gen pln dengan RT-PCR. Hasil dari uji aktivitas antibakteri adalah isolat L. plantarum tersebut mampu menghambat pertumbuhan kelima bakteri uji dengan penghambatan relatif tertinggi 1.60 cm untuk E. coli. Pengujian dengan RT-PCR memberikan hasil yang positif untuk ekspresi gen plnA dan plnF dengan ukuran produk ±70 pb. Ekspresi relatif gen plnA terbaik berasal dari isolat TB(P) sebesar 47.123 AU dan ekspresi relatif gen plnF terbaik berasal dari isolat Mar A2 sebesar 215.560 AU. Korelasi antara tingkat ekspresi gen plnF terhadap tingkat penghambatan patogen bernilai positif terhadap bakteri E. coli dan P. floresense dengan nilai masing-masing y = 13.71x + 13.44 dan y = 2.209x + 32.24, sedangkan untuk gen plnA hanya berkorelasi positif untuk E.coli dengan nilai y = 1.998x + 8.816. Simpulan dari penelitian ini isolat L. plantarum memiliki korelasi antara aktivitas antibakteri dengan ekpresi gen plnA dan plnF yang positif terhadap E.coli sehingga dapat dijadikan alternatif pengganti antibiotik untuk mencegah penyakit saluran pencernaan seperti diare.
Keyword: 

Judul: Gene Marker Construction of Plantaricin F Lactobacillus plantarum.
Abstrak: Lactobacillus plantarum merupakan bakteri yang dapat berperan sebagai probiotik. Bakteri ini memiliki plantaricin F yang berguna menghambat pertumbuhan bakteri Gram positif dan negatif. Penelitian ini menggunakan sepuluh isolat L. plantarum (Mar A5, Bst 1, Mar C7, TB(N), Mg Tm 1, Mg PSM B3, TB(S), MKw 9, Bst 5, Mar B4) yang berasal dari buah-buahan tropis (mangga kweni, manggis, markisa, dan terong belanda). Penelitian ini dilakukan untuk konstruksi marka gen pln F dan menganalisis ekspresi relatif gen pln F serta uji aktivitas antibakteri. Pengujian gen pln F menggunakan RT-PCR menghasilkan pita DNA berukuran 70 pb. Hasil pengujian ini selanjutnya dipakai untuk menentukan nilai ekspresi relatif gen pln F menggunakan software CS Analyzer. Nilai ekspresi relatif gen tertinggi didapat dari isolat TB (S) dengan nilai 28.13 Au. Uji aktivitas antibakteri dilakukan untuk melihat hubungan antara gen pln F dengan aktivitas penghambatan isolat terhadap bakteri uji. Uji aktivitas antibakteri dilakukan terhadap lima bakteri antara lain Salmonella typhimurium, Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Bacillus cureus, dan Pseudomonas flouresense. Penghambatan tertinggi terhadap S. aureus terdapat pada isolat Mg PSM B3 dengan diameter penghambatan 2.50 cm. Isolat Mar A5 memiliki penghambatan tertinggi terhadap bakteri S. typhimurium, E. coli, dan P. flouresense dengan diameter penghambatan masing-masing 1.33 cm, 1.83 cm, dan 1.16 cm. Isolat Mar B4 dan Bst 5 memiliki penghambatan tertinggi terhadap bakteri B. cureus dengan diameter sekitar 0.50 cm.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: