Judul: Kerentanan Strain Ikan Nila Terhadap Infeksi Streptococcus Agalactiae Penyebab Penyakit Streptococcosis
Abstrak: Strain ikan nila (Oreochromis niloticus) unggulan hasil pemuliaan telah banyak dilepas untuk meningkatkan produksi perikanan budidaya di Indonesia. Namun ada kendala yang dihadapi yaitu kasus kematian ikan akibat penyakit Streptococcosis yang dikhawatirkan akan menjadi penghambat keberhasilan budidaya ikan nila. Penyakit ini disebabkan oleh infeksi bakteri Streptococcus agalactiae. Penanganan yang kurang baik, padat tebar yang tinggi, lingkungan pemeliharaan yang buruk, manajemen pemberian pakan yang kurang baik menyebabkan terjadinya ketidakseimbangan lingkungan dan akhirnya ketahanan tubuh ikan menjadi menurun sehingga rentan terhadap serangan penyakit. Bakteri S. agalactiae memiliki kisaran inang (host range) yang luas dan kemampuan adaptasi lingkungan yang cukup baik. Berdasarkan potensi infeksi S. agalactiae yang cukup tinggi dan potensial inang yang besar, maka diperlukan informasi mengenai kerentanan antar strain ikan nila unggulan dan variasi respon imun antara ikan nila (cichlidae) dan ikan mas (non-cichlidae). Pertama, melakukan uji kerentanan empat strain ikan nila terhadap infeksi S. agalactiae NK1. Strain ikan nila yang dipergunakan adalah ikan Nila Srikandi, ikan Nila Nirwana, ikan Nila BEST dan ikan Nila Sultana. Keempat strain nila diinfeksi dengan S. agalactiae NK1 pada dosis kepadatan bakteri 103, 104, 105, 106 CFU/ekor dan satu kontrol yang diinjeksi dengan PBS, masing-masing 2 kali ulangan. Nilai LD50 yang diperoleh berkisar antara 103,20-103,45 CFU/ekor . Kedua, melakukan analisis parameter imunologis strain ikan nila dan ikan mas terhadap infeksi S. agalactiae NK1. Dipergunakan ikan Nila Srikandi yang memiliki nilai LD50 tertinggi dan ikan mas yang mewakili kelompok noncichlidae (sebagai kontrol). Ikan diinfeksi dengan S. agalactiae NK1 menggunakan dosis 103 CFU/ekor. Hasil penelitian menunjukkan bahwa ikan nila memperlihatkan perubahan pola renang (berdiam didasar, berenang tidak beraturan dan berenang berputar), perubahan anatomi makroskopis (pigmentasi, eksoptalmi, mata keruh, operkulum jernih, hemoragi pada pangkal sirip). Sintasan ikan Nila Srikandi sebesar 50% dan ikan mas 100% pada 15 hari masa pemeliharaan. Ikan mas tidak menunjukkan perubahan pola renang dan perubahan anatomi. Kematian tercepat terjadi pada ikan Nila Srikandi terjadi pada 96 jam pasca infeksi. Aktivitas lisozim menunjukkan perbedaan yang signifikan antara ikan Nila Srikandi dan ikan mas. Berdasarkan pengamatan terhadap preparat histopatologi diketahui bahwa otak ikan Nila Srikandi yang terinfeksi S. agalactiae mengalami meningoensefalitis, sedangkan pada ikan mas hanya mengalami meningitis. Streptococcus agalactiae merupakan patogen spesifik pada ikan nila, hal ini terbukti dengan sintasan ikan mas yang mencapai 100%.
Keyword: Kerentanan, strain nila, Streptococcus agalactiae

Judul: Karakterisasi Sistem Imun dan Analisis Genetik Lima Strain Nila, Oreochromis niloticus Terhadap Infeksi Streptococcus agalactiae
Abstrak: Ikan nila tergolong famili Cichlidae, dikenal sebagai Oreochromis niloticus. Ikan nila diintroduksi ke Indonesia pada tahun 1969 dari Taiwan. Indukan nila unggul yang telah dirilis di Indonesia sebagai ikan budidaya, yaitu BEST (Bogor Enhancement Strain of Tilapia), GIFT (Genetic Improvement for Farmed Tilapia), Nirwana (Nila Ras Wanayasa), Red-NIFI, dan Srikandi (Nila Ras Sukamandi). Untuk mengoptimalkan upaya pencegahan dan pengobatan streptococcosis, serta peningkatan hasil budidaya perlu diketahui terlebih dahulu informasi mengenai karakterisasi sistem imun pada ikan nila yang dilakukan dengan uji tantang terhadap bakteri S. agalactiae. Perbedaan yang signifikan pada ketahanan penyakit dari strain yang berbeda kemungkinan besar disebabkan karena latar belakang genetik dapat mempengaruhi pembentukan sistem kekebalan tubuhnya. Sampel nila BEST, Nirwana, Red-NIFI, Srikandi, dan GIFT diuji tantang selama 21 hari terhadap bakteri S. agalactiae. Parameter yang diamati terdiri dari diferensiasi leukosit, aktivitas lisozim, titer antibodi, dan tingkat kelangsungan hidup. Analisis genetik dilakukan dengan metode Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) dan Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP). Teknik RAPD menggunakan primer OPA-11, OPA-15, OPA-16, dan OPA-20. Teknik AFLP menggunakan dua enzim yang berbeda, yaitu EcoRI dan MseI. Secara umum tidak ditemukan adanya perbedaan jumlah komponen leukosit secara signifikan pada lima strain nila di hari ke-7 pasca uji tantang. Variasi pada hari ke-14, penurunan limfosit terjadi pada Nirwana dan Srikandi, penurunan monosit dan neutrofil terjadi pada BEST, Red-NIFI, dan GIFT. Proporsi leukosit pada hari ke-21 cenderung kembali pada kondisi awal, kecuali untuk Red-NIFI. Penurunan aktivitas lisozim terjadi di hari ke-7 dan 14, kecuali pada strain BEST di hari ke-14. Hari ke-21 terlihat nilai yang selaras pada kelima strain nila. Tingkat titer antibodi tertinggi di hari ke-7 pada strain BEST dan Srikandi. Titer antibodi tertinggi di hari ke-14 pada Red-NIFI, dan titer antibodi terendah pada BEST. Titer antibodi tertinggi di hari ke-21 pada Red-NIFI dan GIFT, dan titer antibodi terendah pada Nirwana. Tingkat kelangsungan hidup dengan nilai tertinggi ditemukan pada Red-NIFI dan GIFT (60%), diikuti Srikandi (50%). Nilai terendah ditemukan pada BEST dan Nirwana (0%). Berdasarkan parameter uji tantang, secara umum menunjukkan bahwa strain yang resisten terhadap infeksi penyakit S. agalactiae adalah Red-NIFI, selanjutnya diikuti oleh GIFT dan Srikandi. Sementara BEST dan Nirwana merupakan strain yang rentan terhadap agen infeksi, terutama bakteri S. agalactiae. Keterkaitan antara karakteristik sistem imun dan analisis genetik ikan nila menunjukkan korelasi yang positif. Strain nila yang rentan, BEST dan Nirwana memiliki fragmen alel spesifik pada posisi yang sama, dan memiliki hubungan kekerabatan yang paling erat berdasarkan jarak genetiknya.
Keyword: sistem imun, strain ikan nila, Streptococcus agalactiae, analisis genetik

Judul: Utilization of terra/MODIS L1B data for analysis of horizontal wind profile in the troposphere
Abstrak: This study was concerned with horizontal wind derived from data collected with the Moderate-resolution Imaging Spectroradiometer (MODIS) on board the NASA’s Earth Observation System (EOS)-Terra satellite. The aim of this study is to develop a method for the estimation of horizontal wind movement in the troposphere based on Navier-Stokes equation. The method was applied to a calibrated and geolocated Terra/MODIS L1B 1 km data set. The data inputs to estimate surface temperature are retrieved from TIR (Thermal Infrared) bands 31 (10.780 μm to 11.280 μm) and 32 (11.770 μm to 12.270 μm). The obtained surface temperatures were later used to approximate geopotential height on a constant-pressure surface by using the modified Poisson equation. The main assumptions used are the hydrostatic equilibrium, ideal gas law, constant lapse rate and constant acceleration of gravity. Based on the distribution of geopotential height, the pressure gradient force is measured by the gradient of geopotential on an isobaric coordinate to present the horizontal wind profile. For certain topographic areas especially in the mountain ranges, there was a disadvantage of using pressure as a vertical coordinate which lead to inaccuracy. In spite of that, Terra/MODIS L1B data with 1 km spatial resolution can be used to estimate the horizontal wind movement in the troposphere.
Keyword: