Judul: Studi Perbedaan Fenotipe Kambing Perah berdasarkan Analisis Canonical
Abstrak: Kambing perah sebagai penghasil susu alternatif susu sapi dapat ditingkatkan produksinya dengan melakukan perkawinan silang dengan tujuan meningkatkan serta mengkombinasikan sifat-sifat baik antara bangsa yang berbeda. Pewarisan sifat tetua terhadap keturunannya dapat diukur untuk dianalisa persamaan dan kedekatan genetik tetua dan turunannya. Kambing Saanen sebagai kambing perah unggul disilangkan terhadap kambing PE yang memiliki adaptasi baik terhadap iklim tropis menghasilkan kambing Sapera yang diharapkan memiliki kedua sifat baik tetuanya. Kedekatan genetik tetua terhadap hasil silangannya dapat dilihat melalui jarak genetik dimana jarak genetik yang kecil menunjukkan hubungan genetik yang dekat begitupun sebaliknya. Melalui pengukuran morfometrik dapat menjadi tampilan awal pewarisan sifat hasil persilangan bangsa kambing perah. Bangsa kambing perah yang diukur merupakan hasil persilangan dan tetua dari kambing persilang tersebut yaitu kambing Peranakan Etawah (PE), kambing Saanen, dan kambing Sapera. Pengukuran ukuran tubuh dilakukan pada 134 ekor dari tiga bangsa kambing perah yang beda dengan jenis kelamin dan usia yang berbeda. Pengukuran dilakukan pada tinggi pundak (TPu), tinggi pinggul (TPi), panjang badan (PB), lingkar dada (LD), lingkar pinggul (LP), lebar dada (LeD), lebar pinggul (LeP), dalam dada (DaD) yang kemudian dilakukan analisis diskriminan serta analaisis canonical untuk mengetahui jarak genetik ketiga bangsa kambing. Analisis diskriminan dilakukan untuk mengetahui rataan (mean), simpang baku (sd) ragam (s2) serta koefisien variasi dari ketiga bangsa kambing perah. Hasil dari analisis diskriminan kemudian di uji dengan analisis kanonikal untuk mengetahui kedekatan genetik antara ketiga bangsa kambing perah. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa jarak genetik antara kambing Sapera dengan Saanen lebih dekat dibandingkan antara kambing Sapera dengan PE. Hasil pengukuran ukuran tubuh diperoleh bahwa kambing Sapera lebih mendekati kambing Saanen dibandingkan kambing PE dan secara tampilan fenotipe kambing Sapera lebih memiliki kesamaan terhadap kambing Saanen dibandingkan terhadap kambing PE. Kesamaan fenotipe kambing Sapera terhadap kambing Saanen erat kaitannya dengan dominasi genetik kambing Saanen sebagai pejantan yang mewarisi lebih banyak genetik dibandingkan kambing PE sebagai betinanya.
Keyword: Canonical, Morphometric, Saanen, Etawah Grade, Saanen Etawah Cross

Judul: Analisis Keragaman Gen CSN1S1 dan Asosiasinya terhadap Kualitas Susu Kambing Silangan Saanen dan Peranakan Etawah (Sapera)
Abstrak: Susu kambing telah mendapatkan perhatian sebagai alternatif penting untuk susu sapi di Indonesia, khususnya karena manfaat nutrisinya yang superior dan kemampuannya untuk dicerna dengan lebih mudah oleh tubuh manusia. Dua bangsa kambing, yaitu Kambing Peranakan Etawah dan Saanen menunjukkan potensi besar dalam meningkatkan produksi susu di Indonesia. Balai Penelitian Ternak Ciawi mengembangkan kambing Silangan dari kedua bangsa ini yang dinamakan Sapera. Salah satu fokus utama dari penelitian terkait susu kambing adalah gen CSN1S1, yang memiliki peran krusial dalam menentukan kualitas protein dalam susu. Memahami variasi dan keragaman dari gen ini, peluang untuk mengoptimalkan produksi susu kambing, baik dari segi kualitas maupun kuantitas. Penelitian menggunakan sampel dari tiga bangsa kambing - Sapera, Saanen, dan Peranakan Etawah. Tujuannya adalah menganalisis keragaman genetik dari gen CSN1S1 dan mengevaluasi hubungannya dengan kualitas susu. Studi ini dilaksanakan dalam dua fase. Pada fase pertama, diambil sampel darah dari 66 kambing Sapera, 15 kambing Saanen, dan 14 kambing PE yang berasal dari Balai Penelitian Ternak, Ciawi. Ekstraksi DNA dari sampel darah dilakukan dengan metode modifikasi DNA Kit Geneaid. DNA yang telah diekstraksi diperbanyak melalui proses PCR dan variasi genetik gen CSN1S1 dianalisis dengan teknik Sanger Sequencing. Pada fase kedua, diambil sampel susu dari 66 kambing Sapera yang sedang berada dalam periode laktasi. Komposisi susu dianalisis dengan alat Lactoscan Milk Analyzer, dan data produksi susu harian dihitung dari total produksi susu di pagi dan sore hari saat pengambilan sampel. Hubungan antara genotipe dengan produksi dan komposisi susu dianalisis dengan menggunakan model General Linear Model. Hasil penelitian menunjukkan ada 15 mutasi yang terjadi pada area parsial intron 11, ekson 12, dan parsial intron 12. Mutasi yang terjadi pada intron 11 terdiri dari 1 insersi 4 bp pada titik g.10090 – g. 10093 Ins AGAA dan 10 mutasi titik atau single nucleotide polymorphism (SNP) pada g. 10098 C>G, g.10112 C>T, g. 10129 C>A, g.10177 G>A, g.10180 A>C, g. 10181 T>A, g.10188 T>C, g.10197 C>T, g.10202 T>C, dan g.10220 C>T. Mutasi yang terjadi pada ekson 12 terdiri dari 2 SNP yaitu g.10243 G>A dan g.10250. Mutasi yang terjadi pada intron 12 yaitu 2 SNP g.10277 G>A dan g.10283 T>G. Mutasi g. 10098 C>G pada intron 11 ditemukan berasosiasi terhadap jumlah produksi susu, yield protein, yield lemak, yield laktosa, dan yield solid non fat (SNF). Mutasi pada g. 10181 T>A pada intron yang sama juga berasosiasi terhadap persentase lemak, laktosa dan total solid pada susu kambing sapera. Mutasi yang terjadi pada daerah ekson 12 dan lainnya tidak berasosiasi terhadap kualitas susu pada penelitian ini. Ditemukan adanya perubahan asam amino dari Arginin menjadi Lysin yang disebabkan oleh mutasi di titik g. 10243 G>A., Goat milk has gained attention as an important alternative to cow's milk in Indonesia, especially due to its superior nutritional benefits and its easier digestibility by the human body. Two goat varieties, namely the Etawah Grade Goat and the Saanen show great potential in increasing milk production in the country. The Ciawi Livestock Research Center developed a hybrid goat from these two breeds called Sapera. A primary focus of goat milk research is the CSN1S1 gene, which plays a crucial role in
Keyword: CSN1S1 gene, milk quality, Sapera goat, SNP, indel

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: