Judul: Penyakit Kerdil pada Kentang di Jawa Tengah: Identifikasi dan Taksasi Kehilangan Hasilnya.
Abstrak: Kentang merupakan salah satu tanaman yang penting secara ekonomi di Indonesia. Produksi kentang berfluktuasi dipengaruhi oleh berbagai faktor diantaranya masalah penyakit. Dua tipe gejala kerdil pada sentra produksi kentang di Jawa Tengah (Kabupaten Wonosobo dan Banjarnegara) baru-baru ini telah ditemukan dengan insidensi penyakit berkisar 5-40%. Gejala penyakit ini diduga disebabkan oleh virus dan atau fitoplasma. Penelitian ini bertujuan untuk mendeteksi dan mengidentifikasi penyebab gejala kerdil serta menaksir (taksasi) kehilangan hasil akibat penyakit tersebut. Manfaat dari penelitian ini diharapkan dapat memberikan informasi mengenai penyebab penyakit kerdil pada kentang di Jawa Tengah dan taksasi kehilangan hasilnya sehingga dapat dijadikan acuan untuk melakukan langkah pengelolaan penyakit yang tepat sasaran. Karakterisasi biologi patogen dilakukan dengan menularkan secara mekanis dan melalui penyambungan. Gejala kerdil pada kentang dideteksi secara serologi dengan metode Dot immunobinding assay (DIBA) menggunakan antiserum Potato virus Y (PVY), Potato virus X (PVX), Potato virus S (PVS), Potato leafroll virus (PLRV) dan Cucumber mosaic virus (CMV). Identifikasi patogen dilakukan dengan teknik RT-PCR menggunakan primer universal Potyvirus dan Potexvirus serta primer spesifik CMV; sedangkan deteksi fitoplasma dilakukan dengan teknik nested-PCR menggunakan primer universal fitoplasma. DNA virus dan fitoplasma selanjutnya dirunut dan dianalisis. Kehilangan hasil akibat penyakit ditentukan berdasarkan pengamatan intensitas penyakit dan hasil panen kentang pada lahan yang terinfeksi. Interaksi antara keparahan penyakit, Area under disease progress curve (AUDPC) dengan hasil panen, tinggi tanaman, jumlah umbi dan ukuran umbi dianalisis dengan uji chi-square, analisis korelasi dan regresi. Terdapat dua tipe gejala yang ditemukan di lapangan, yaitu pertama berupa kerdil dengan daun keriting, klorosis dan malformasi daun; dan gejala kedua adalah kerdil dengan rugosa, perubahan warna dan malformasi daun. Penularan secara mekanis daun tanaman bergejala pada tanaman kentang sehat menunjukkan gejala yang berbeda dengan gejala yang ditemukan di lapangan. Penularan melalui penyambungan menggunakan inokulum tanaman bergejala tipe 1 menghasilkan gejala klorosis, mosaik dan keriting; sedangkan penyambungan menggunakan inokulum tanaman bergejala kerdil tipe 2 menghasilkan gejala rugosa. Hasil DIBA terhadap 120 sampel tanaman bergejala kerdil tipe 1 dan 2 bereaksi positif terhadap antiserum Potato virus Y dengan frekuensi 86.25% dan 70%, Potato virus X sebesar 43.75% dan 0% dan Cucumber mosaic virus sebesar 56.25% dan 45%. Reaksi serologi positif CMV dengan intensitas warna ungu lemah diduga karena adanya reaksi non spesifik antiserum. Pada sampel tanaman sakit juga terdeteksi adanya PVY dan PVX dengan RT-PCR, serta Sweet potato little leaf phytoplasma (SPLL) terdeteksi dengan nested PCR berturut-turut menggunakan pasangan primer P1/P7 dan fU5/rU5. Analisis nukleotida dengan menggunakan primer universal virus berhasil mengonfirmasi bahwa penyakit kerdil tipe 1 berasosiasi dengan infeksi ganda PVY strain O dan PVX. Amplifikasi dan analisis nukleotida dengan menggunakan primer universal 16S rRNA fitoplasma dapat mengidentifikasi SPLL pada gejala kerdil 2; sedangkan CMV tidak teramplifikasi dengan primer spesifik. Hal ini menunjukkan bahwa penyakit kerdil tipe 1 pada kentang berasosiasi dengan infeksi ganda antara PVY dan PVX; sedangkan penyakit kerdil tipe 2 berasosiasi dengan infeksi ganda PVY dan SPLL. Kehilangan hasil panen kentang akibat penyakit kerdil di lapangan per individu tanaman mencapai 64.42%. Penyakit ini juga menurunkan kualitas umbi. Umbi yang berasal dari tanaman bergejala kerdil memperlihatkan perubahan ukuran, bentuk dan warna. Kehilangan hasil tanaman kentang per
Keyword: AUDPC, Kerdil kentang, PVX, PVY, SPLL

Judul: Efisiensi Wereng Hijau Dan Wereng Batang Cokelat Sebagai Vektor Virus Pada Tanaman Padi
Abstrak: Penyakit virus pada padi merupakan masalah penting dalam produksi beras di Indonesia. Kehilangan hasil yang disebabkan oleh penyakit tungro dan penyakit kerdil umumnya dilaporkan sejak masa tanam. Penyakit tungro disebabkan oleh infeksi ganda virus, Rice tungro bacilliform virus (RTBV) dan Rice tungro spherical virus (RTSV); sementara penyakit kerdil disebabkan oleh Rice grassy stunt virus (RGSV) atau Rice ragged stunt virus (RRSV). Vektor yang paling efisien dalam menularkan penyakit virus padi telah diketahui, di antaranya wereng hijau, Nephotettix virescens (Distant), untuk penyakit tungro dan wereng batang cokelat, Nilaparvata lugens (Stal.), untuk penyakit kerdil. Penyakit tungro dan kerdil sudah menyebar di Provinsi Jawa Barat yang merupakan salah satu pemasok padi terbesar secara nasional. Diagnosis penyakit tidak dapat mengandalkan hanya dari gejala saja karena gejala yang muncul beranekaragam serta mirip dengan gejala kekurangan hara dan kekeringan sehingga perlu dilakukan diagnosis secara molekuler. Penelitian ini dilakukan dengan tujuan menentukan efisiensi wereng hijau dan wereng batang cokelat dalam menularkan penyakit tungro dan kerdil ke tanaman padi. Selain itu juga dilakukan deteksi virus dengan metode polymerase chain reaction (PCR) untuk mengonfirmasi gejala penyakit tungro dan penyakit kerdil. Penelitian meliputi tiga kegiatan, yaitu (1) pengamatan populasi wereng hijau dan wereng batang cokelat, dan insidensi penyakit tungro dan penyakit kerdil di lapangan; (2) percobaan penularan virus dengan vektor serangga di rumah kaca menggunakan padi varietas IR 64; dan (3) deteksi virus dengan metode PCR dan/atau RT-PCR dan analisis sikuen nukleotida. Pengamatan lapangan dilakukan di Desa Sukamandi Kabupaten Subang Provinsi Jawa Barat pada bulan Oktober - November 2014. Percobaan penularan virus dengan vektor serangga terdiri atas 10 kombinasi perlakuan, yaitu 1 (sumber virus tungro, serangga vektor wereng hijau); 2 (sumber virus kerdil, serangga vektor wereng batang cokelat); 3 (sumber virus tungro, serangga vektor wereng hijau dan wereng batang cokelat); 4 (sumber virus kerdil, serangga vektor wereng hijau dan wereng batang cokelat); 5 (sumber virus tungro dan kerdil, serangga vektor wereng hijau dan wereng batang cokelat); 6 (sumber virus tungro dan kerdil, serangga vektor wereng hijau); 7 (sumber virus tungro dan kerdil, serangga vektor wereng batang cokelat); 8 (tanaman sehat serangga vektor wereng hijau dan wereng batang cokelat); 9 (tanaman sehat, serangga vektor wereng hijau); 10 (tanaman sehat, serangga vektor wereng batang cokelat). Deteksi RTBV, RGSV, dan RRSV dilakukan menggunakan primer spesifik yang mengamplifikasi gen protein selubung. Hasil pengamatan di lapangan menunjukkan bahwa populasi wereng batang cokelat mengalami fluktuasi dan tergolong rendah (0.01-71.67 ekor per 100 tanaman), sedangkan wereng hijau tidak ditemukan. Penyakit tungro tidak ditemukan, sedangkan insidensi penyakit kerdil tergolong rendah (0.01 – 10.52%). Gejala penyakit yang ditemukan pada saat pengamatan terdiri atas gejala kerdil hampa, kerdil rumput dan campuran kerdil hampa dan kerdil rumput. Fluktuasi populasi terjadi karena proses adaptasi setelah migrasi dari lahan sebelumnya. Wereng yang mampu beradaptasi akan bertahan dan berkembangbiak, sedangkan wereng yang tidak mampu beradaptasi pada tempat baru akan mati. Keberadaan musuh alami dan beberapa faktor lingkungan juga mempengaruhi populasi wereng. Pengamatan populasi wereng dilakukan pada masa tanam di musim penghujan, Daerah Sukamandi merupakan sentra padi dimana padi ditanam secara terus menerus tanpa adanya rotasi tanaman dan penanaman dilakukan secara tidak serempak sehingga tanaman padi selalu
Keyword: Rice grassy stunt virus, Rice ragged stunt virus, Rice tungro virus, wereng batang cokelat, wereng hijau

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: