Judul: Keragaman Genetik Monyet Ekor Panjang (Macaca fascicularis) di Pulau Tinjil Berdasarkan Daerah D-loop DNA Mitokondria.
Abstrak: Macaca fascicularis di Pulau Tinjil dikembangbiakan sebagai hewan model pada penelitian biomedis dan bioteknologi. Perbedaan komposisi genetik dan asal populasi dari hewan model dapat mempengaruhi hasil penelitian. Oleh karena itu, analisis komposisi dan keragaman genetik dari M. fascicularis penting untuk pemilihan secara efisien individu yang akan digunakan, konservasi sumber genetik, dan monitoring keragaman genetik dalam fasilitas penangkaran. Penelitian ini bertujuan menganalisis keragaman genetik berdasarkan daerah Dloop DNA mitokondria dan mengonfirmasi asal usul indukan. Sebanyak 15 sampel darah utuh M. fascicularis diekstraksi dengan QIAmp DNA Blood Mini Kit. Daerah D-loop mt-DNA diamplifikasi dengan primer LqqF (forward) dan Saru5 (reverse). Amplikon sebesar 1200 pb ditentukan runutan basanya dengan teknik sekuensing. Data hasil contig sekuen D-loop disejajarkan dengan program MAFFT UGENE. Keragaman genetik dianalisis dengan perangkat lunak DNAsp v6.11. Rekonstruksi pohon filogenetik dibentuk berdasarkan metode neighbour joining menggunakan MEGA X. Panjang sekuen daerah D-loop yang dianalisis yaitu 921-923 pb dengan 93 situs polimorfik dan empat situs indel. Empat belas haplotipe dihasilkan dari 15 individu. Keragaman nukleotida pada daerah D-loop parsial sebesar 0.029 dan keragaman genetik (h) sebesar 0.990. Hasil rekonstruksi pohon filogenetik menunjukan indukan betina pada populasi Tinjil berasal dari dua lokasi, yakni Sumatera selatan dan Jawa.
Keyword: D-loop DNA mitokondria, intraspesies, keragaman genetik, Macaca fascicularis, Pulau Tinjil

Judul: Genetic variability of Long-tailed Macaques (Macaca fascicularis) in Tinjil Island Inferred from on Mitochondrial DNA Dloop Region
Abstrak: Macaca fascicularis di Pulau Tinjil dikembangbiakan sebagai hewan model pada penelitian biomedis dan bioteknologi. Perbedaan komposisi genetik dan asal populasi dari hewan model dapat mempengaruhi hasil penelitian. Oleh karena itu, analisis komposisi dan keragaman genetik dari M. fascicularis penting untuk pemilihan secara efisien individu yang akan digunakan, konservasi sumber genetik, dan monitoring keragaman genetik dalam fasilitas penangkaran. Penelitian ini bertujuan menganalisis keragaman genetik berdasarkan daerah Dloop DNA mitokondria dan mengonfirmasi asal usul indukan. Sebanyak 15 sampel darah utuh M. fascicularis diekstraksi dengan QIAmp DNA Blood Mini Kit. Daerah D-loop mt-DNA diamplifikasi dengan primer LqqF (forward) dan Saru5 (reverse). Amplikon sebesar 1200 pb ditentukan runutan basanya dengan teknik sekuensing. Data hasil contig sekuen D-loop disejajarkan dengan program MAFFT UGENE. Keragaman genetik dianalisis dengan perangkat lunak DNAsp v6.11. Rekonstruksi pohon filogenetik dibentuk berdasarkan metode neighbour joining menggunakan MEGA X. Panjang sekuen daerah D-loop yang dianalisis yaitu 921-923 pb dengan 93 situs polimorfik dan empat situs indel. Empat belas haplotipe dihasilkan dari 15 individu. Keragaman nukleotida pada daerah D-loop parsial sebesar 0.029 dan keragaman genetik (h) sebesar 0.990. Hasil rekonstruksi pohon filogenetik menunjukan indukan betina pada populasi Tinjil berasal dari dua lokasi, yakni Sumatera selatan dan Jawa.
Keyword: Bogor Agricultural University; Institut Pertanian Bogor; IPB; Genetic diversity; Intraspecies; Macaca fascicularis; Mitochondrial DNA D-loop; Tinjil island; Penelitian biomedis; Filogenetik; Polimorfik;D-loop DNA mitokondria;intraspesies;keragaman genetik;Macaca fascicularis;Pulau Tinjil

Judul: Query Expansion based on Bilingual Dictionary Using Conditional Probability
Abstrak: Query expansion is a technique that can be used to bridge vocabulary gaps between queries and documents in the collection. With query expansion, user will be helped to formulate queries well so that user will optimize the search result. In this study, the expansion term was resulted from the translation of bilingual dictionary. Subsequently, several terms of expansion were elected based on the closeness of its relationship with the original query. This research showed that conditional probability can be used to select expansion term in bilingual translation method query expansion. The result of 1000 documents was more than 97% relevan document can be retrieved by this system. The more expansion term used, the larger number relevan document was retrieved.
Keyword: