Judul: Rekayasa Genetik Tanaman Kentang (Solanum tuberosum L.) Kultivar IPB CP1 dengan Gen FBPase/ClRan1 Melalui Perantara Agrobacterium tumefaciens
Abstrak: Budidaya kentang kultivar IPB CP1 diharapkan dapat meningkatkan produksi kentang di Indonesia. Penelitian ini bertujuan mentransformasi kentang (Solanum tuberosum L.) kultivar IPB CP1 dengan gen FBPase/ClRan1 melalui perantara Agrobacterium tumefaciens untuk mendapatkan tanaman transgenik. A. tumefaciens EHA 105 yang membawa gen FBPase/ClRan1 digunakan sebagai vektor dalam mentrasformasi potongan daun dan ruas buku kentang IPB CP1. Potongan daun menghasilkan efisiensi transformasi yang lebih baik dibandingkan dengan ruas buku yaitu 82.5 % dan 7.14 %, sedangkan efisiensi regenerasi ruas buku lebih baik dibandingkan dengan potongan daun yaitu masing-masing sebesar 100 % dan 39.39 %. Integrasi gen FBPase dianalisis dengan menggunakan primer rbcS-F dan FBPase_65R. Pita gen FBPase dengan ukuran 581 pb telah teramplifikasi pada 4 galur kentang yang menunjukkan bahwa galur tersebut merupakan transgenik. Hal serupa terjadi pada analisis integrasi gen ClRan1 dengan menggunakan primer 35S-F1 dan CLRAN1-genome-04R, teramplifikasi pita berukuran 798 pb pada galur yang sama. Penelitian ini menunjukkan adanya perbedaan yang nyata antara bobot umbi, panjang akar, jumlah akar, dan klorofil antara kentang transgenik dan non-transgenik. Namun, kentang transgenik dan non-transgenik tidak berbeda nyata dalam jumlah umbi.
Keyword: Agrobacterium tumefaciens, FBPase/ClRan1, kentang kultivar IPB CP1, transgenik

Judul: Transformasi Genetik Kentang (Solanum Tuberosum L.) Kultivar Nooksack Dengan Gen Fbpase/Clran1 Melalui Perantara Agrobacterium Tumefaciens
Abstrak: Nooksack merupakan salah satu kultivar kentang yang baik untuk diolah menjadi french fries. Kentang kultivar Nooksack berasal dari hasil persilangan konvensional antara kentang kultivar Kennebec dan kentang kultivar A501-13. Keunggulan Nooksack adalah memiliki kualitas umbi yang baik, daging umbi berwarna putih, kandungan pati tinggi, dan memiliki kandungan gula rendah. Hanya saja kentang kultivar Nooksack juga memiliki kekurangan yaitu hasil umbi yang rendah. Oleh sebab itu, produksi tanaman kentang kultivar Nooksack harus ditingkatkan. Fruktosa bisfosfatase terlibat dalam fotosintesis. Pembungkaman ekspresi FBPase menyebabkan penurunan laju fotosintesis dan peningkatan ekspresi FBPase meningkatkan laju fotosintesis. Ekspresi ClRan1 berlebihan pada Arabidopsis dapat meningkatkan pemanjangan akar. Peningkatan ekspresi FBPase yang dikombinasikan dengan peningkatan ekspresi ClRan1 diharapkan dapat meningkatkan produksi umbi kentang. Oleh sebab itu, penelitian ini bertujuan untuk melakukan transformasi genetik tanaman kentang (S. tuberosum L.) kultivar Nooksack dengan gen FBPase/ClRan1 melalui perantara A. tumefaciens. Transformasi genetik dilakukan menggunakan ruas (internode) dan eksplan daun. Jumlah internode dan daun yang digunakan dalam transformasi masing-masing 60 eksplan. Transformasi dilakukan dengan menggunakan A. tumefaciens melalui metode ko-kultivasi. Efisiensi transformasi tanaman kentang dengan menggunakan ruas adalah sebesar 50% sedangkan dengan eksplan daun adalah sebesar 83.33%. Efisiensi regenerasi dari kalus transgenik putatif adalah 6.66% dari kalus yang berasal dari ruas dan 16% dari kalus yang berasal dari daun. Walaupun beberapa tunas diregenerasikan di beberapa kalus, tetapi hanya tiga tunas transgenik putatif yang dapat tumbuh. Analisis PCR membuktikan bahwa dua dari tiga tunas tersebut adalah tunas transgenik yang mengandung gen FBPase/ClRan1. Kedua tanaman transgenik yang mengandung gen FBPase mempunyai laju fotosintesis yang lebih tinggi daripada tanaman non-transgenik. Hal ini mengindikasikan bahwa ekspresi berlebih gen FBPase dapat meningkatkan laju fotosintesis. Tanaman transgenik juga mempunyai akar yang lebih banyak dan lebih panjang daripada tanaman non-transgenik. Hal ini mengindikasikan bahwa ekspresi berlebih gen ClRan1 dapat meningkatkan pertumbuhan akar. Tanaman transgenik yang mengandung gen FBPase/ClRan1 mempunyai produksi umbi yang lebih tinggi daripada tanaman non-transgenik. Hal ini terjadi kemungkinan karena hasil fotosintesis yang tinggi disalurkan ke stolon, sehingga umbinya menjadi banyak dan besar.
Keyword: Kentang kultivar Nooksack, gen FBPase/ClRan1, A. tumefaciens, transgenik

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: