Judul: Pendugaan Sebaran Ikan Pelagis dengan Metode Trace Tracking di Perairan Teluk Tomini pada Bulan Oktober 2002
Abstrak: Perairan Teluk Tomini merupakan salah satu perairan laut yang memiliki potensi perikanan yang belum banyak digali. Teluk Tomini diduga menyimpan kekayaan ikan yang besar, karena merupakan teluk yang dilalui garis katulistiwa. Untuk itu perlu dibangun sistem pengelolaan dan pemanfaatan yang baik. Penelitian-penelitian dari segala aspek perlu dilakukan termasuk pendugaan sebaran ikan di Perairan Teluk Tomini. Akustik merupakan salah satu cara untuk dapat meneliti tingkah laku ikan pelagis dengan lebih mudah. Pada metode akustik, informasi tentang sebaran ikan dapat diketahui dengan dua cara yaitu dengan metode echointegrasi layer per layer dan metode trace tracking. Penelitian ini menggunakan metode trace tracking yang merupakan penelusuran echo dari individu ikan pada ping yang berurutan berupa alur pada sound beam.
Keyword: 

Judul: Pendugaan Distribusi Ikan Pelagis Di Perairan Teluk Tomini, Perairan Di Sekitar Pulau Una-una dan Pulau Batu Daka Menggunakan Metode Hidroakustik.
Abstrak: Salah satu metode yang dapat digunakan untuk mengetahui distribusi ikan pelagis adalah metode hidroakustik. Penggunaan metode hidroakustik dalam pendugaan stok ikan masih sangat diperlukan untuk mengetahui distribusi ikan secara spasial dan temporal sehingga dapat membantu dalam eksplorasi titik – titik penangkapan ikan. Penelitian ini bertujuan untuk mengungkap sebaran nilai volume backscattering strength (Sv) dan distribusi ikan pelagis yang terdapat di perairan Teluk Tomini, perairan di sekitar Pulau Una-una dan Pulau Batu Daka. Pengambilan data hidroakustik dilaksanakan pada tanggal 10 – 15 Mei 2010 di perairan Teluk Tomini, Sulawesi Tengah yang dilaksanakan oleh Balai Penelitian Perikanan Laut (BPPL) Jakarta. Alat – alat yang digunakan adalah SIMRAD EK60 Scientific Echosounder System, software Echoview 4.0, dongle Echoview 4.0, personal computer, golden software surfer 8.0 dan Microsoft Excel 2007. Proses integrasi nilai volume backscattering strength dilakukan dalam pada software Echoview 4.0, dan dianalisis dengan software Matlab 7.0.1 untuk memperoleh visualisasi pola sebaran dari target terdeteksi. Pada lapisan permukaan (strata kedalaman 0 – 80 meter) nilai rata-rata Sv target terdeteksi pada perairan Teluk Tomini sebesar -82,58 dB, perairan di sekitar Pulau Una-una sebesar -80,89 dB dan Pulau Batu Daka -81,33 dB yang dapat diduga sebagai sekumpulan juvenile atau plankton berukuran besar dengan kisaran densitas yang sama sebesar 2,90 target/m3. Pada lapisan tengah perairan (strata kedalaman 80 – 160 meter) nilai rata-rata Sv target terdeteksi pada perairan Teluk Tomini sebesar - 73,74 dB yang dapat diduga sebagai sekumpulan ikan kecil. Pada strata kedalaman ini densitas target pada perairan Teluk Tomini lebih rendah (sebesar 0,09 target/m3) dibandingkan dengan densitas target pada lapisan permukaan perairan. Pada lapisan dalam (strata kedalaman 160 – 260 meter) nilai rata-rata Sv target terdeteksi pada perairan Teluk Tomini sebesar -61,83 dB yang dapat diduga sebagai sekumpulan ikan kecil dengan kisaran densitas sebesar 0,03 target/m3.
Keyword: 

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA