Judul: Analisis spektra dan profil DNA Genom bakteri fotosintetik anoksigenik asal tanah sawah
Abstrak: Bakteri fotosintetik anoksigenik (BFA) memiliki kemampuan menambat N₂ yang pada gilirannya dapat disumbangkan sebagai alternatif nutrisi N bagi tanaman khususnya padi sawah. Selain itu bakteri ini mampu memanfaatkan energi cahaya pada bagian infra merah dari spektrum yang tidak digunakan oleh tanaman. Berdasarkan kemungkinan pemanfaatan bakteri di susunlah penelitian yang bertujuan melihat keragaman bakteri fotosintetik anoksigenik (BFA) asal tanah sawah melalui analisis spektra protein dan analisis profil DNA genom. Sebanyak 59 isolat telah diperoleh dari tanah sawah yang berasal dari sejumlah lokasi di daerah Cirebon, Indramayu, Krawang, Sukabumi, Bandung, Cianjur, Bogor, Riau dan Pacitan. Isolat ditumbuhkan pada media minimal sistrom cair 50%, pH 7.2, pada kondisi suhu 32°C, anaerob dan pemberian cahaya terus menerus selama 7 hari. Isolat BFA yang diperoleh umumnya berbentuk batang, dengan warna kultur merah hingga kecoklatan, bersifat gram negatif dan motil. Dari 4 isolat BFA yang diuji pada konsentrasi protein 0.27 mg/ml dan panjang gelombang 200-900 nm, tampak pola spektra yang berbeda-beda. Pola spektra BDG 12 mirip dengan Rhodobacter sphaeroides 2.4.1(R.s 2.4.1), sedangkan IDR 34 mirip dengan CJR 34. Kemiripan tersebut diperkuat oleh hasil analisis elektroforesis medan berpulsa yang menggunakan enzim Ase I dengan waktu pulsa 10-50 detik, waktu pemisahan 20 jam, tegangan listrik 180 volt dan agarosa 1%. Hasil pemotongan Ase I pada DNA genom utuh isolat BDG 12 menunjukan kemiripan dengan R.s 2.4.1 pada potongan DNA yang berukuran 360 - 3 kilo pasang basa. Sementara 8 isolat lain yang diuji menunjukan keragaman genetik yang tinggi.
Keyword: 

Judul: Bakteri Fotosintetik Anoksigenik Sebagai Biokondisioner Di Tambak Udang
Abstrak: Bakteri fotosintetik anoksigenik (BFA) merupakan salah satu kelompok bakteri yang mampu melakukan proses fotosintesis tanpa melakukan hidrolisis air atau menggunakan H₂O sebagai donor elektronnya. Oleh karena itu dalam proses tersebut tidak dihasilkan oksigen (O2). BFA mendapatkan elektron untuk keperluan fotosintesisnya dari senyawa sulfur dan turunannya atau bahan organik. Kemampuan BFA dalam menggunakan senyawa sulfur tersebut memberikan arti yang cukup penting, yaitu sebagai salah satu cara pengendalian biologis dalam mengurangi kadar H2S dalam suatu perairan. Hal ini karena senyawa H₂S dalam sistem perairan, khususnya sistem budidaya tambak, bersifat toksik bagi udang. H₂S banyak dihasilkan dari penguraian senyawa sulfur organik atau anorganik melalui respirasi anaerobik. Penelitian ini bertujuan untuk : i) melihat beberapa karakteristik isolate BFA, ii) melihat kemampuan isolat BFA dalam mengurangi produksi H₂S, dan kemampuannya dalam menghambat pertumbuhan V. harveyi, iii) serta melihat kemampuan hidupnya pada sistem perairan skala laboratorium. Pengujian penurunan produksi H2S dilakukan dalam media cair SWC dengan konsentrasi H2S awal 1,0 mg/L, masing-masing isolat BFA diinokulasikan dengan kepadatan 1 x 10 sel/mL. Kultur tersebut diinkubasi secara anaerobik, pada temperatur ruang (29 - 31°C), selama 96 jam di depan lampu tungsten 50 watt, jarak kultur sampai ke lampu 40 cm dengan intensitas cahaya yang mencapai kultur sekitar 173 - 249 lux. Konsentrasi H2S diukur dengan HACH Spektrofotometer DR 2000, berdasarkan metode reaksi biru metilen, yang mengukur konsentrasi ion S², selanjutnya dikonversi menjadi kadar H₂S dengan melihat data temperatur dan pH pada kondisi tersebut…dst
Keyword: Tambak Udang Windu, Sistem Pengairan, BFA, Elektron, Senyawa Sulfur

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: