Judul: Ekspresi Gen Myostatin pada Sapi Crossbred Belgian Blue dan Peranakan Ongole
Abstrak: Gen MSTN merupakan salah satu anggota keluarga protein transforming growth factor- β (TGF-β) yang merupakan satu-satunya penghambat pertumbuhan otot rangka. Gen ini dikenal sebagai salah satu faktor regulasi negatif dari pertumbuhan otot rangka. Hewan yang mengalami defisiensi myostatin menunjukkan peningkatan massa otot yang dikenal sebagai double muscling atau otot ganda. SNP dan indel 11-bp gen MSTN yang berasosiasi dengan fenotipe otot ganda pada sapi persilangan Belgian Blue dengan sapi PO juga ditemukan dan dapat dijadikan sebagai penciri fenotipe otot ganda dan normal. Adapun informasi terkait ekpresi gen MSTN untuk melihat peran gen MSTN tersebut pada fenotipe normal dan otot ganda pada sapi Belgian Blue dan silangannya dengan sapi PO belum tersedia informasinya. Oleh karena itu, penelitian ini dilakukan dengan tujuan menganalisis ekspresi gen MSTN pada sapi silangan BB dengan PO dikaitkan dengan genotipe dan fenotipe normal dan otot ganda. Ternak yang digunakan dalam penelitian ini yaitu sapi Belgian Blue (n=3 ekor), Peranakan Ongole (PO) (n=3 ekor), silangan F1 (n=3 ekor) dan salingan F2 (n=3 ekor) berasal dari Balai Embrio Ternak (BET) Cipelang Bogor, Jawa Barat. Sapi silangan F1 merupakan generasi pertama hasil persilangan (BBxPO) (B. Taurus × B. Indicus) dengan komposisi darah 50% BB dan 50% PO. Sedangkan sapi F2 merupakan generasi kedua hasil persilangan F1 dengan sapi Belgian Blue dengan komposisi dara 75% BB dan 25% PO. Identifikasi genotipe gen MSTN pada sapi berotot ganda dan silangannya dianalisis menggunakan teknik PCR- RFLP. Analisis ekspresi gen MSTN pada sapi berotot ganda dan silangannya dianalisis dengan teknik qRT-PCR. Perbedaan genotipe dan fenotipe sapi dianalisis dengan uji t menggunakan program minitab 19. Genotyping berhasil dilakukan dengan menggunakan enzim restriksi NmuCI (Tsp451) dan diperoleh tiga genotipe, yaitu genotipe del.11/del.11 yang menunjukkan fenotipe berotot ganda yang terdapat pada sapi Belgian Blue dan satu persilangan F2. Genotipe heterozigot +/del.11 ditemukan pada tiga persilangan F1 dan satu persilangan F2. Sapi PO dengan fenotipe otot normal menunjukkan genotipe +/+. Level transkrip mRNA gen MSTN pada genotipe del.11/del.11 signifikan lebih rendah dari +/del.11 (P<0,05). Namun, level mRNA gen MSTN antara genotipe del.11/del.11 dan genotipe +/+ tidak berbeda nyata secara statistik. Demikian juga pada genotipe +/del.11 dan +/+ (P>0,05). Hasil uji statistik yang tidak berbeda nyata dikarena jumlah sampel yang sangat terbatas. Ekspresi gen MSTN antar fenotipe menunjukkan perbedaan yang signifikan, dimana fenotipe berotot ganda memiliki level mRNA gen MSTN yang lebih rendah dibandingkan dengan fenotipe berotot normal (P<0,05).
Keyword: Cattle, Crossbreeding, MSTN gene, PCR-RFLP, qRT-PCR

Judul: MSTN Gene Polymorphism of SNP c.4957C>G in Bali Cattle using PCR-RFLP
Abstrak: Gen Myostatin (MSTN) merupakan salah satu gen yang berpengaruh terhadap pertumbuhan sapi pedaging. Penelitian ini bertujuan menganalisis keragaman gen MSTN pada sapi bali menggunakan metode PCR-RFLP. Total sampel DNA sapi yang digunakan adalah 100 ekor sapi bali jantan yang berasal dari BPTU-HPT Denpasar dan BPT-HMT Serading sejumlah masing-masing 50 ekor yang diperoleh dari Aliyya et al. (2020). Analisis keragaman gen MSTN yang dilakukan pada sapi bali menggunakan PCR-RFLP dan enzim restriksi BsrI. Analisis data yang dilakukan meliputi frekuensi genotipe, frekuensi alel, nilai heterosigositas, dan keseimbangan Hardy-Weinberg menggunakan program Popgene32. Panjang produk hasil amplifikasi fragmen gen MSTN pada exon 3 sebesar 451 bp dan satu alel (C) pada sapi bali BPTU-HPT Denpasar dan sapi bali BPT-HMT Serading. Genotipe yang diperoleh adalah genotipe CC (451 bp) dengan frekuensi alel C yaitu 1 (100%). Hasil analisis keragaman menunjukkan bahwa SNP c.4957C>G MSTN pada sapi bali monomorfik atau tidak beragam. Frekuensi alel dan genotipe tidak berada tidak dalam kondisi kesetimbangan Hardy-Weinberg karena hanya satu genotipe yang muncul., The MSTN gene is one of the genes that influence the growth of beef cattle. This study aimed to analyze the polymorphism of the MSTN gene using PCR-RFLP. DNA samples used were from BPTU-HPT Denpasar and BPT-HMT Serading 50 samples each which were obtained from Aliyya et al. (2020). The MSTN gene polymorphism analysis was carried out using PCR-RFLP and BsrI restriction enzyme. Analysis of genotype and allele frequencies, heterozygosity, and Hardy-Weinberg equilibrium were using Popgene32. The result of amplification of the MSTN gene on exon 3 was 451 bp fragments and 1 allele (C) in each sample. Only one genotype was found which was CC (451 bp) with a frequency of allele C was 1 (100%). Based on the results, it can be concluded that the MSTN gene of SNP c.4957C>G in Bali cattle was monomorphic. Allele and genotype frequency was not in Hardy-Weinberg equilibrium due to only one genotype appeared.
Keyword: gen myostatin, myostatin gene, PCR-RFLP, polimorfisme, polymorphism

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: