Judul: Screening Senyawa Aktif Berpotensi Anti Malaria pada Target PfTPI dengan Metode Komputasi Dinamika Molekul
Abstrak: Malaria merupakan penyakit yang disebabkan oleh parasite Plasmodium. Terdapat 5 jenis Plasmodium yang menyebabkan penyakit malaria di manusia antara lain Plasmodium falciparum, Plasmodium vivax, Plasmodium ovale, Plasmodium malariae, dan Plasmodium knowlesi. Plasmodium falciparum adalah penyebab penyakit malaria yang paling berbahaya. Tujuan penelitian ini adalah memprediksi senyawa aktif tumbuhan yang bisa digunakan untuk inhibitor protein Plasmodium falciparum. Penelitian ini melakukan penambatan molekul 50 ligan alami dan 1 ligan sintesis terhadap protein PfTPI. PfTPI adalah salah satu protein dari Plasmodium falciparum yang berfungsi pada proses pembentukan ATP. Simulasi dinamika molekul dilakukan pada ligan sintesis dan 4 ligan alami yang telah diseleksi. Hasil penelitian menunjukkan biscryptolepine dan cryptolepicarboline memiliki energi bebas Gibbs yang cukup tinggi dan kestabilan yang baik saat berikatan dengan protein PfTPI.
Keyword: penambatan molekul, Plasmodium falciparum, simulasi dinamika molekul

Judul: Potensi Senyawa Aktif Tanaman Obat Antimalaria dengan Target P. falciparum Profilin (PfPfn): Docking dan Simulasi Dinamika Molekul
Abstrak: Plasmodium falciparum Profilin (PfPfn) merupakan protein multifungsi yang berperan sebagai pengikat aktin pada tahap invasi sel darah merah, pengikat sekuen prolin, serta berinteraksi dengan polipospoinositida terkait jalur pensinyalan antara membran sel dan sitoskeleton. Simulasi docking dilakukan pada PfPfn dengan 50 senyawa aktif tanaman yang berpotensi sebagai inhibitor PfPfn melalui program Autodock Vina. Simulasi dinamika molekul dilakukan untuk mengetahui kestabilan senyawa yang diuji terhadap PfPfn dengan menggunakan program AMBER18. Hasil simulasi dinamika molekul menunjukkan senyawa strychnopentamine dan liriodenine memiliki potensi sebagai inhibitor dengan rata-rata nilai energi bebas Gibbs sebesar -42.3 kkal mol-1 dan -26 kkal mol-1 dengan kestabilan yang paling baik.
Keyword: Plasmodium falciparum, profilin, docking, simulasi dinamika molekul, energi bebas Gibbs

Judul: Estimation of Additive and Non-Additive Genetic Variances of Body Weight, Egg Weight and Egg Production for Quails (Coturnix coturnix japonica) with an Animal Model Analysis
Abstrak: This study estimates the additive and non-additive variances for egg production and body weight traits of two lines of quails from a long-term selection with the help of the REML method. For the body weight of 42-day-old females (BW42f) and males (BW42m), a total of 7,934 records for line 1 and 7,214 records for line 2 from 21 generations were used in our analyses. Additionally, 1,717 records of females from line 1 and 1,671 records of females from line 2 contained information on their egg production at an age of 42 to 200 days (EN200), on the average egg weight for the first 11 weeks of their laying season (EW1), on the average egg weight from weeks 12 to 23 (EW2), and on their body weight at an age of 200 days (BW200f). A multivariate additive animal model and one-trait dominance models, which include the inbreeding coefficients as covariates, were fitted to the data. The estimates of the heritability gained from our dominance models were smaller than those from the additive model. For line 1, the heritability values decreased for EN200 from 0.35 to 0.32, for EW1 from 0.66 to 0.56, for BW200f from 0.42 to 0.38, and for BW200m from 0.51 to 0.49, respectively. For the first line, the respective ratio (d2) of the dominance variance to the phenotypic variance for EN200, EW1, BW200f and BW200m was 0.08, 0.22, 0.09 and 0.21, and the values for the second line were 0.12, 0.06, 0.001 and 0.23.
Keyword: