Judul: Aktivitas Antibakteri Ekstrak Zingiber Zerumbet Asal Pulau Timor Dan Simulasi Docking Inhibisi Senyawa-Senyawa Aktif Terhadap Enzim Mura
Abstrak: Zingiber zerumbet merupakan tanaman herbal yang secara tradisional digunakan sebagai obat borok oleh penduduk di Pulau Timor. Tanaman ini tumbuh secara liar. Dari studi literatur diketahui bahwa tanaman ini memiliki aktivitas antimikroba. Secara empiris penggunaan rimpang tanaman oleh masyarakat di Timor dalam mengobati luka borok menjadi menarik untuk dikaji. Kondisi wilayah Pulau Timor yang kering dengan iklim semi arid menimbulkan dugaan adanya aktivitas senyawa metabolit sekunder yang tinggi dalam menyembuhkan luka borok. Luka borok lebih banyak disebabkan oleh kesalahan penangan luka dan juga serangan bakteri. Tujuan dilakukannya penelitian ini adalah untuk menguji aktivitas antibakteri dan mencari nilai KHTM dari ekstrak tanaman, mengetahui senyawa-senyawa aktif yang terkandung pada ekstrak dengan aktivitas antibakteri terbaik, dan mempelajari interaksi senyawa-senyawa tersebut dengan enzim MurA melalui in silico molecular docking. Senyawa-senyawa aktif dari Z. zerumbet diekstraksi menggunakan pelarut n-heksan, etil asetat, etanol, dan air. Selanjutnya diuji aktivitas antibakteri masing-masing ekstrak menggunakan metode difusi sumur terhadap bakteri Eschericia coli, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, dan Bacillus subtilis. Ekstrak dengan aktivitas terbaik digunakan untuk mencari nilai konsentrasi hambat tumbuh minumun (KHTM) terhadap bakteri. Ekstrak tersebut selanjutnya diuji secara kualitatif kandungan metabolit sekundernya menggunakan metode Harborne yang meliputi uji fenolik hidrokuinon, flavonoid, alkaloid, saponin, tanin dan triterpenoid-steroid, serta dianalisis kandungan senyawa-senyawa aktif menggunakan LCMS. Senyawa-senyawa tersebut selanjutnya digunakan sebagai ligan uji dalam mempelajari penghambatan enzim MurA secara simulasi docking. Hasil penelitian menunjukkan bahwa keempat ekstrak memiliki aktivitas antibakteri dan ekstrak etanol memiliki aktivitas antibakteri terbaik. Nilai KHTM untuk S. aureus, B. subtilis, E. coli dan P. aeruginosa berturut-turut adalah sebesar 50, 100, 150, 250 mg mL-1. Hasil uji fitokimia mengindikasikan ekstrak kasar etanol rimpang tanaman mengandung senyawa-senyawa terpenoid, flavonoid, tanin dan fenolik. Hasil analisis LCMS memperlihatkan bahwa ekstrak kasar etanol mengandung senyawa zerumbon dan gingerglikolipid B. Energi afinitas (ΔGbinding) hasil penambatan molekular untuk ligan alami (substrat), ligan obat (fosfomisin), ligan zerumbon, dan ligan gingerglikolipid B, berturut-turut adalah senilai -10.1, -4.7, -8.3, dan -8,4 kkal mol-1. Hasil simulasi docking menunjukkan bahwa terjadi mekanisme reaksi kompetitif antara ligan uji zerumbon dengan substrat uridine-diphosphate-N-asetylglucosamine pada enzim karena ligan uji menempati tempat yang sama dengan substrat sehingga menghambat terbentuknya peptidoglikan penyusun dinding sel bakteri.
Keyword: Gingerglikolipid B, Jahe Liar, Molecular Docking, Peptidoglikan, Zerumbon

Judul: Metabolomics of Indonesian Minor Spices Zingiberaceae Family and It's Potential as Antibacterial
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk (1) melakukan penapisan aktivitas antibakteri dari 12 spesies rempah minor Zingiberaceae dengan uji difusi agar sumur (2) menentukan satu rempah terpilih untuk dilanjutkan ke tahapan fraksinasi dengan aktivitas antibakteri tertinggi, (3) mengorelasikan data profil kimia HPLC berupa selang waktu retensi dan aktivitas antibakteri dengan OPLS untuk memperoleh selang waktu retensi yang paling berkorelasi dengan aktivitas antibakteri dari fraksi teraktif dan (4) mengidentifikasi komponen aktif yang berpotensi sebagai antibakteri dari selang waktu retensi terpilih hasil analisis OPLS dengan melakukan analisis UHPLC-HRMS fraksi teraktif dimana waktu retensi tersebut dominan. Hasil penapisan 12 rempah Zingiberaceae menunjukkan bahwa ekstrak Curcuma purpurascens Blume paling efektif menghambat bakteri S. aureus dibanding rempah lainnya. Curcuma purpurascens Blume juga menunjukkan zona hambat yang cukup besar pada bakteri E. coli meski bukan yang tertinggi. Selanjutnya Curcuma purpurascens Blume dilanjutkan ke tahapan berikutnya (identifikasi komponen aktif). Hasil pengukuran rata-rata diameter zona hambat fraksi Curcuma purpurascens Blume menunjukkan bahwa fraksi metanol memiliki aktivitas antibakteri tertinggi dengan rata-rata diameter zona hambat sebesar 18,12±2,34 mm terhadap S. aureus. Identifikasi senyawa aktif yang berpotensi sebagai antibakteri menggunakan pendekatan metabolomik dengan cara mengorelasikan nilai aktivitas antibakteri dengan profil kimia berupa selang waktu retensi kromatogram dari HPLC menggunakan analisis data multivariat OPLS. Berdasarkan nilai koefisien korelasi dan variabel of influence (VIP), selang waktu retensi yang berkorelasi dengan aktivitas antibakteri adalah selang waktu retensi 16,5-18,0 menit. Identifikasi senyawa aktif yang berpotensi sebagai antibakteri dilakukan dengan cara mencocokkan pola kromatogram fraksi metanol dari HPLC dengan pola kromatogram fraksi metanol dari UHPLC-HRMS. Puncak pada waktu retensi 17,8 menit terdeteksi pada selang waktu retensi 16,5-18,0 menit pada kromatogram HPLC. Puncak ini berkorelasi dengan puncak waktu retensi 16,5 menit pada kromatogram UHPLC-HRMS. Berdasarkan pola fragmentasi spektra massa yang dicocokkan dengan pangkalan data PubChem senyawa yang berhasil diidentifikasi pada waktu retensi 16,5 menit pada UHPLC-HRMS adalah senyawa demethoxycurcumin., This study aims to (1) screen the antibacterial activity of 12 Zingiberaceae minor herb species by agar well diffusion test, (2) determine which herb is selected to proceed to the fractionation stage with the highest antibacterial activity, (3) correlate HPLC chemical profile data in the form of time intervals retention and antibacterial activity with OPLS to obtain the retention time interval that is most correlated with the antibacterial activity of the most active fraction and (4) identify active components that have potential as antibacterial from selected retention intervals resulting from OPLS analysis by conducting UHPLC-HRMS analysis of the most active fraction where retention time is dominant. The screening results of 12 Zingiberaceae spices showed that Curcuma purpurascens Blume extract was the most effective against S. aureus bacteria compared to other spices. Curcuma purpurascens Blume also showed a fairly large inhibition zone for E. coli bacteria, although not the highest. Furthermore, Curcuma purpurascens Blume continued to the fractionation stage. The results of measuring the average inhibition zone diameter of the Curcuma purpurascens Blume fraction showed that the methanol fraction had the highest antibacterial activity with an average inhibition zone diameter of 18.12 ± 2.34 mm against S. aureus. Identifying active compounds that have potential as antibacterial used a metabolomics approach by correlating antibacterial
Keyword: antibakteri, Curcuma purpurascens Blume, demethoxycurcumin, metabolomik

Judul: Implementation of Spatio-Temporal Change Query in Relational Database.
Abstrak: Geographic object changes in various views. Object changes are recorded using a model of static storage. No historical connection between old version data and new version data has been built. For that, a storage model of spatio-temporal queries that can analyze spatio-temporal changes has been developed. The object changes the geometry are grouped according to the taxonomy of Spatio-Temporal Pattern Change. This research has been able to apply the query patterns change including born, expand, merge, contract, split, normal and die. This query based on geometric (area) changes. The implementation of spatio-temporal change queries represents an object changes continuously with easy, change detection is done by comparing two versions of data. Keyword: spatio-temporal change query, spatio-temporal change pattern.
Keyword: