Judul: Isolasi dan Seleksi Bacillus sp. dari ikan lele (Clarias sp.) serta Potensinya sebagai Probiotik
Abstrak: Budi daya ikan lele menghadapi berbagai macam permasalahan diantaranya mengenai tingkat pertumbuhannya dan salah satu yang dapat dilakukan adalah dengan meningkatkan kecernaan pakan yang diberikan. Pakan yang diberikan pada ikan tidak semuanya dapat dicerna, ada yang dikeluarkan dalam bentuk feses dan sisa metabolisme lainnya. Oleh karena itu, peningkatan kualitas pakan sangat diperlukan agar pakan yang diberikan dapat lebih banyak terserap oleh ikan sehingga dapat mengurangi penumpukan sisa metabolisme ikan di dasar kolam. Aplikasi probiotik merupakan salah satu cara yang dapat dilakukan untuk mengatasi permasalahan tersebut. Probiotik pada akuakultur selain dapat menekan bakteri patogen di lingkungan akuakultur juga dapat menghasilkan sejumlah metabolit dan enzim-enzim pencernaan untuk mempermudah penyerapan pakan sehingga dapat meningkatkan laju pertumbuhan. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi dan menyeleksi Bacillus sp. dari usus ikan lele serta menguji potensinya sebagai kandidat probiotik pada pakan ikan. Isolasi usus ikan lele sebanyak 1 gram dilakukan dengan pemanasan sampel usus yang telah dimasukkan di dalam tabung reaksi yang telah berisi larutan garam fisiologis steril pada suhu 80 oC selama 10-15 menit. Isolasi menggunakan media Triptone soy agar (TSA) yang ditambahkan 1% susu skim untuk aktivitas proteolitik dan 1% pati untuk aktivitas amilolitik. Seleksi bakteri probiotik meliputi uji patogenitas, uji kepekaan antibiotik dan total padatan tersuspensi. Isolat yang memiliki kemampuan degradasi pakan terbesar selanjutnya akan dibuat kurva pertumbuhan, aktivitas amilase dan protease serta proses pencampuran Bacillus sp. pada pakan ikan. Isolat yang terseleksi sebagai kandidat probiotik selanjutnya diidentifikasi gen 16S-rRNA. Hasil isolasi yang berasal dari usus ikan lele diperoleh 16 isolat bakteri, 14 isolat bakteri hasil dari pewarnaan spora merupakan Bacillus sp. Hasil uji patogenisitas secara in vitro menggunakan media agar-agar darah terdapat 7 isolat bakteri memiliki aktivitas hemolisis gamma (PTB 1.1, PTB 1.2, PTB 1.4, PTB 1.7, STB 1.6, STB 1.1, dan STB 2.1). Isolat-isolat yang memiliki aktivitas gamma hemolisis akan diseleksi lebih lanjut. Uji kepekaan menggunakan 3 jenis antibiotik yaitu rifampisin, amoxicillin dan ciprofloxacin menunjukkan bahwa dari 7 isolat yang diseleksi terdapat 3 isolat yang peka terhadap antibiotik yang diuji (PTB 1.4, PTB 1.7 dan STB 1.6). Tiga isolat terpilih ini diuji kemampuannya dalam mendegradasi pakan ikan. Isolat PTB 1.4 mampu mendegradasi pakan dengan sisa pada kertas saring terkecil yaitu 0,0068 g. Isolat PTB 1.4 juga memiliki indeks proteolitik dan amilolitik sebesar 0,60 dan 0,61. Hasil pengukuran aktivitas enzim amilase isolat PTB 1.4 yang ditambahkan 1.2% pakan tertinggi pada 120 jam pengamatan sebesar 0,399 U/mL dan aktivitas tertinggi protease pada 72 jam pengamatan sebesar 0,065 U/mL. Jumlah inokulum awal pada isolat bakteri PTB 1.4 adalah 108 CFU/mL, setelah digabungkan pada pakan dan CMC kemudian diinkubasi jumlah inokulum akhir menjadi 106 CFU/mL. Berdasarkan BLAST-N isolat PTB 1.4 memiliki nilai homologi sebesar 99% dan hasil pensejajaran 1011 bp menunjukkan isolat PTB 1.4 memiliki kedekatan dengan Bacillus megaterium. Isolat PTB 1.4 sebagai isolat terbaik karena tidak bersifat patogen, peka terhadap antibiotik yang diuji, memiliki aktivitas enzim protease dan amilase serta kemampuan mendegradasi pakan terbaik.
Keyword: Bacillus sp., Clarias sp, pakan, probiotik

Judul: Seleksi Bakteri Asam Laktat sebagai Probiotik untuk Ikan Lele (Clarias sp.).
Abstrak: Ikan lele (Clarias sp.) merupakan salah satu komoditas unggulan budidaya air tawar di Indonesia. Peningkatan produksi ikan lele secara intensif seringkali mengalami berbagai masalah, salah satunya adalah akibat serangan penyakit Motile Aeromonad Septicemia (MAS) yang disebabkan oleh infeksi bakteri Aeromonas hydrophila. Salah satu cara alternatif yang dapat digunakan untuk mengendalikan penyakit ini adalah dengan aplikasi bakteri probiotik. Bakteri Asam Laktat (BAL) dikenal sebagai kandidat probiotik yang tergolong mikroflora normal usus, tidak patogen dan memproduksi bakteriosin dan asam asam organik yang dapat menurunkan pH sehingga menghambat bakteri patogen. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menyeleksi BAL secara in vitro sebagai probiotik yang potensial menghasilkan senyawa antimikrob dan mengevaluasi kinerjanya melalui pakan secara in vivo pada lele normal dan lele gnotobiotik. Penelitian dilakukan melalui peremajaan isolat-isolat BAL pada media selektif Man Ragosa Sharpe (MRS) dan seleksi BAL secara in vitro melalui uji hemolisis pada media agar agar darah dan uji antagonis isolat BAL terhadap A. hydrophila. Isolat BAL terpilih diuji viabilitasnya setelah pencampuran dalam pakan. Hasil seleksi dengan aktivitas penghambatan paling tinggi terhadap A. hydrophila ditunjukkan oleh isolat Pediococcus pentosaceus E2211 sehingga dipilih sebagai kandidat probiotik untuk diaplikasikan pada tahapan in vivo. Ikan uji yang digunakan pada penelitian ini adalah ikan lele normal dan lele gnotobiotik. Ikan lele gnotobiotik adalah ikan lele yang ditiadakan atau direduksi bakterinya baik pada luar tubuh maupun pada saluran pencernaannya menggunakan berbagai jenis antibiotik, sehingga peran probiotik yang diberikan dapat dievaluasi. Ikan uji dengan bobot rata-rata ± 8.76 g dipelihara pada akuarium berukuran 60x30x40 cm dan kepadatan 15 ekor per akuarium. Aplikasi probiotik dilakukan melalui pemberian pakan yang telah disemprotkan 1% (v/w) probiotik P. pentosaceus E2211 (108 cfu/mL) selama 30 hari pemeliharaan hingga selanjutnya diuji tantang dengan A. hydrophila (106 cfu/mL) selama 10 hari. Kinerja probiotik BAL terhadap pertumbuhan ikan lele setelah pengamatan in vivo ditunjukkan melalui data sintasan, rasio konversi pakan, laju pertumbuhan harian, jumlah total bakteri intestin setelah pemeliharaan 30 hari dan gambaran darah ikan lele pascauji tantang selama 10 hari. Isolat BAL terpilih P. pentosaceus E2211 berpotensi sebagai kandidat probiotik untuk ikan lele normal dan lele gnotobiotik (Clarias sp.). Sintasan terbaik pascauji tantang diperoleh pada perlakuan Np dan Gp yaitu sebesar 88.46%, diikuti perlakuan G sebesar 65.38%, sementara pada K+ hanya mencapai 53.84%. Keberadaan mikroflora normal yang berasosiasi dengan P. pentosaceus E2211 pada perlakuan Np menunjukkan kinerja probiotik terbaik dengan nilai laju pertubuhan harian 3.28%, rasio konversi pakan 1.78% dan total bakteri intestin mencapai 108 cfu/mL yang berbeda signifikan dibanding perlakuan lainnya.
Keyword: A. hydrophila, BAL, ikan lele, probiotik, seleksi

Judul: Thermal Characteristics and Dynamics of Tropical Cyclone over Western North Pacific Ocean: A Case Study of Typhoon Songda (Chedeng) 2011
Abstrak: The frequent occasion of Tropical Cyclone (TC) over Western North Pacific (WNP) Ocean lies from 10˚N to 26˚N and 121˚E to 170˚E. Sources of TC development come from warm ocean temperature where latent heat is released during condensation processes and subsequently concentrated in the boundary layer. Relative humidity at 850-700 hPa is responsible to produce the most intense storm. Meanwhile, weak vertical wind shear between 850-200 hPa is one of the dynamical factors that lead to the development of TC. Pressure level of 850-200 hPa is chosen to minimize the thermodynamic effect in the lower troposphere. Typhoon Songda (Chedeng in the Philippines) or TSC lasted from May 18th to 30th, 2011 and strengthened into powerful Super Typhoon stage between May 24th and 27th. Long curving track and the exhibition of all sequences of TC life cycle, TSC is then considered as an ideal case of TC. The objective of the study with case of TSC is to investigate the role of thermal characteristics and dynamics on TC intensity. The research is carried out by using Advanced Research of Weather Research and Forecasting model (WRF ARW model) version 3.3. Two domains are employed in the model. The first domain situate from 02˚N to 40˚N and 118˚E to 149˚E and cover spatial resolution () of 33.1 km. The second domain situate from 09˚N to 27˚N and 119˚E to 132˚E with of 11 km. Timestep of the model () is 120 seconds. The model is supported by the following physical parameterization, i.e., Yonsei University Scheme (YSU) in the boundary layer, Kain-Fritsch scheme (KF) in the cumulus, and WRF Single-Moment 3-class scheme in the microphysics. Initial meteorological condition prior to the formation of the cyclone is generated using WRF ARW standard-release model. Sensitivity of the model output is obtained from a selected single-parameter change scenarios, namely, 10 % to 20 % decrease and increase of wind shear initial data at 850-200 hPa, and by 10 % to 20 % decrease of relative humidity initial data at 850-700 hPa. The result showed that the negative correlations between wind shear and intensity are found in wind shear scenarios. Wind shears of 10 ms-1 which lead to strengthening of the wind intensity in the early period of Typhoon development are found in wind shear scenarios. The effect of wind shear changes on wind intensity is statistically significant in the 20 % wind shear scenarios. During mature stage, weak wind intensity occurred when wind shear increase as given in the WRF standard-release and the 20 % decreasing scenario. Different situation is found in the 20 % increasing scenario where wind shear tend to weak and lead to strong wind intensity at this stage. Meanwhile, the reduction of moisture supply at 850-700 hPa resulting from 20 % decreasing relative humidity play a major role in the weakening of wind intensity and reduces mechanical energy of the cycle process as much as 300 J kg-1.
Keyword: