Judul: Penyusunan dan Analisis Pustaka Genom Sengon (Falcataria moluccana Miq.)
Abstrak: Sengon (Falcataria moluccana Miq.) merupakan tanaman kayu cepat tumbuh dan multifungsi yang memiliki nilai ekonomi yang tinggi. Hutan tanaman sengon (F. moluccana) rentan terhadap hama dan penyakit seperti boktor dan karat puru. Langkah awal untuk keberhasilan pemuliaan pohon sengon (F. moluccana) adalah adanya informasi mengenai genom total sengon (F. moluccana) serta gen yang terlibat dalam pembentukan sengon (F. moluccana) yang tahan terhadap hama dan penyakit melalui penyusunan pustaka genom. Penelitian ini bertujuan untuk mengembangkan metode kloning untuk konstruksi pustaka genom sengon (F. moluccana) dan sekuensing pustaka genom yang dihasilkan. Pustaka genom berhasil disusun menggunakan vektor pGEM-T Easy pada bakteri E. coli strain DH5α yang menghasilkan 9 koloni. Sekuensing DNA dan BLASTn di NCBI menunjukkan kesamaan yang tinggi dari urutan yang diperoleh dengan berbagai gen pohon, yaitu genom nuclear, kloroplas, dan mitokondria yang menunjukkan bahwa pustaka genom yang diperoleh merupakan sebagian genom F. moluccana.
Keyword: BLASTn, F. moluccana, kloning, pustaka genom

Judul: Optimasi Kloning dan Identifikasi Gen Penyandi Tripsin Inhibitor dan -Amilase Inhibitor pada Tanaman Sengon (Falcataria moluccana Miq.)
Abstrak: Sengon (Falcataria moluccana) adalah tanaman cepat tumbuh yang banyak digunakan terutama pada hutan rakyat. Namun, peningkatan tren penggunaan sengon menyebabkan ledakan hama, salah satunya adalah penggerek batang boktor (Xystrocera festiva). Larva boktor menghasilkan enzim -amilase dan tripsin dalam sistem pencernaannya untuk mencerna kulit dan kayu gubal sengon. Beberapa aksesi sengon resisten menunjukkan aktivitas inhibitor tehadap enzim -amilase dan tripsin yang merupakan aspek penting dari program pemuliaan pohon sengon. Pendeteksian gen ketahanan dapat dilakukan dengan pembuatan pustaka genomik melalui metode shotgun cloning dan kloning gen spesifik. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengoptimasi penyiapan bahan kloning dan metode pembuatan pustaka genom serta kloning gen tripsin inhibitor dan -amilase inhibitor pada sengon. Sekuen gen tripsin inhibitor sengon didapatkan berukuran dari 107 bp hingga 308 bp dan memiliki kesamaan dengan Tamarindus indica, Glycine max, Populus trichocarpa dan Populus nigra. Sekuens gen -amilase inhibitor didapatkan berukuran 447 bp dan memiliki kesamaan dengan Phaseolus vulgaris. Namun, sekuens TI dan AAI tersebut masih memiliki nilai E yang rendah.
Keyword: tripsin inhibitor, -amilase inhibitor, F.moluccana, X. festiva

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: