Judul: Pemanfaatan bakteri selulolitik untuk peningkatan kualitas nutrien dan kecernaan daun singkong (Manihot utilissima) serta kinerja pertumbuhan ikan nila (Oreochromis niloticus).
Abstrak: Usaha peningkatan nilai tambah daun singkong (Manihot utilissima) sebagai sumber protein alternatif untuk pakan ikan nila (Oreochromis niloticus) terkendala oleh tingginya kandungan serat kasarnya, padahal kemampuan ikan untuk mencerna pakan berserat terbatas. Pendekatan penggunaan bakteri selulolitik untuk menghidrolisis daun singkong (predigest) diharapkan dapat menurunkan kadar seratnya. Selain itu, bakteri selulolitik juga dapat dimanfaatkan sebagai probiotik yang akan membantu ikan mencerna pakan yang mengandung daun singkong. Dengan demikian, potensi bakteri selulolitik sebagai predigest dan probiotik diharapkan dapat meningkatkan kualitas nutrien daun singkong sehingga kecernaannya meningkat dan pertumbuhan ikan optimal. Tujuan umum penelitian ini adalah mendapatkan bakteri selulolitik yang mampu berperan sebagai predigest dan probiotik untuk meningkatkan kualitas nutrien dan kecernaan daun singkong serta mengevaluasi pengaruhnya terhadap metabolisme dan performa pertumbuhan ikan nila. Secara garis besar penelitian dibagi menjadi empat tahap, yaitu : 1) Seleksi bakteri selulolitik dari saluran pencernaan ikan gurame sebagai kandidat probiotik, 2) Evaluasi pemanfaatan bakteri selulolitik untuk mendegradasi (predigest) daun singkong, 3) Evaluasi pemanfaatan bakteri selulolitik sebagai predigest dan probiotik untuk meningkatkan kecernaan daun singkong dan performa pertumbuhan ikan nila, 4) Evaluasi pengaruh level pemanfaatan daun singkong hasil predigest terhadap performa pertumbuhan ikan nila. Penelitian tahap pertama bertujuan untuk mendapatkan bakteri selulolitik dari saluran pencernaan ikan gurame sebagai kandidat probiotik. Bakteri diisolasi dan diseleksi berdasarkan aktivitas enzim selulolitik, proteolitik, dan amilolitik, sensitivitas bakteri terhadap antibiotik, ketahanan terhadap kondisi pH 2.5 dan 7.5, aktivitas antagonistik terhadap bakteri patogen, kemampuan adhesi, serta sifat patogenisitasnya terhadap ikan nila. Hasil penelitian menunjukkan bahwa dari 10 isolat bakteri yang diuji, diperoleh tiga isolat yang memenuhi kriteria sebagai probiotik yaitu isolat UG3, UG7 dan UG8. Berdasarkan analisis sekuen gen 16SrRNA, bakteri UG3 memiliki indeks kemiripan sebesar 93% dengan Bacillus clausii, isolat UG7 memiliki indeks kemiripan sebesar 96% dengan Bacillus amyloliquefaciens dan isolat UG8 memiliki indeks kemiripan sebesar 88% dengan Bacillus subtilis. Penelitian tahap kedua bertujuan untuk mengevaluasi pemanfaatan bakteri selulolitik dari saluran pencernaan ikan gurame dalam meningkatkan kualitas nutrien daun singkong. Penelitian terdiri dari 3 tahap yaitu penentuan isolat, dosis, suhu dan waktu inkubasi yang berbeda untuk mendapatkan kondisi hidrolisis yang optimum. Parameter yang diamati meliputi glukosa terlarut, kadar Neutral Detergent Fiber (NDF) dan Acid Detergent Fiber (ADF), serta kadar protein, lemak, abu, bahan ekstrak tanpa nitrogen (BETN) dan serat (analisis proksimat). Selain itu, daun singkong yang telah dihidrolisis pada kondisi optimum juga dianalisis profil asam amino, asam sianida dan kandungan mineralnya. Hasil penelitian menunjukkan bahwa isolat UG3 menghasilkan kadar glukosa terlarut tertinggi dan dapat menurunkan kadar fraksi serat kasar dengan nilai yang terbaik. Hasil optimasi kondisi pada dosis 5%, suhu 40o C dan waktu inkubasi 72 jam merupakan kombinasi terbaik untuk menurunkan kadar serat kasar daun singkong. Daun singkong hasil predigest secara umum mengalami kenaikan kuantitas asam amino dibanding daun singkong yang tidak mendapatkan perlakuan predigest. Sementara itu, kandungan asam sianida daun singkong hasil predigest mengalami penurunan yang signifikans dibanding dengan daun singkong tanpa perlakuan. Tahap penelitian ketiga bertujuan untuk mengevaluasi peran bakteri selulolitik sebagai predigest dan probiotik dalam meningkatkan kecernaan daun singkong serta performa pertumbuhan ikan nila. Penelitian ini dilakukan dalam dua tahap, yaitu uji kecernaan dan uji pertumbuhan pada ikan nila. Perlakuan yang
Keyword: Bakteri selulolitik, predigest, probiotik, daun singkong, saluran pencernaan ikan gurame, ikan nila

Judul: IPB (Bogor Agricultural University), Selection and Application of Probiotics in Tilapia (Oreochromis niloticus) through Approach One Health
Abstrak: Probiotik merupakan mikroorganisme hidup tidak patogen yang dapat memberikan keuntungan pada inang dan lingkungannya. Mikroorganisme yang banyak dimanfaatkan sebagai probiotik adalah dari golongan bakteri. Bakteri probiotik umum digunakan dalam budi daya ikan yang diberikan melalui pakan dan air budi daya. Pada penelitian ini bakteri probiotik diisolasi dari saluran cerna ikan nila. Seleksi kandidat bakteri probiotik dilakukan dengan cara menyeleksi bakteri sebagai penghasil enzim pencernaan dan penghasil antibakteri. Adanya masalah resistansi antibiotik pada bakteri menjadikan bakteri probiotik tidak aman untuk digunakan sebagai probiotik karena dapat berpotensi resistan terhadap antibiotik dan membawa gen resistan antibiotik. Penyebaran bakteri resistan dan gen resistan dari bakteri ke bakteri lainnya akan berakibat pada penyebarannya di lingkungan budi daya. Adanya peranan elemen genetik gerak, mobile genetic elements (MGEs) menjadikan bakteri dapat mentrasfer gen resistan antibiotik ke bakteri lainnya. Keberadaaan bakteri resistan antibiotik dapat menjadikan masalah pada berbagai sektor yang mencakup kesehatan hewan, lingkungan dan manusia (One health). Penyakit yang disebabkan oleh bakteri resistan sangat sukar untuk diobati dengan menggunakan antibiotik, sehingga akan berisiko tinggi terhadap kesehatan hewan, manusia dan lingkungan. Penggunaan probiotik yang mengandung bakteri resistan dan gen resistan antibiotik juga akan mempengaruhi terhadap kesehatan hasil produk perikanan. Produk hasil perikanan yang membawa bakteri resistan dan gen resistan dapat berpotensi mempengaruhi kesehatan manusia dan lingkungan. Tujuan umum penelitian ini adalah mendapatkan bakteri sebagai kandidat probiotik yang tidak bersifat resistan dan tidak membawa gen resistan antibiotik tertentu, serta evaluasi kinerjanya dengan cara in vivo menggunakan ikan nila. Penelitian pertama bertujuan untuk mendapatkan koleksi bakteri kandidat probiotik. Bakteri hasil koleksi dikarakterisasi sebagai penghasil enzim pencernaan protease, lipase, amilase dan selulase dengan menggunakan metode disk diffusion. Selain itu, bakteri sebagai kandidat probiotik dikarakterisasi sebagai penghasil antibakteri yang dapat menghambat pertumbuhan bakteri Streptococcus agalactiae, Streptococcus iniae dan Aeromonas hydrohila menggunakan metode disk diffusion pada media agar dan metode kultur bersama dalam media cair. Karakterisasi pola hemolitik menggunakan media agar darah. Hasil penelitian menunjukkan sebanyak 465 isolat bakteri diisolasi dari saluran cerna ikan nila dari beberapa daerah yaitu Sukabumi, Ciamis, Serang, Banjarnegara, Banyumas, Jayapura, Sorong, Manokwari Selatan, Takalar, Lampung, Batam dan Mandiangin. Hasil isolat bakteri sebagai kandidat probiotik dibagi menjadi dua kelompok berdasarkan bentuk sel bakteri. Sebanyak 459 koleksi isolat bakteri yang didapatkan dengan bentuk sel basil dan 6 isolat bakteri bentuk sel kokus. Sejumlah 29,84% (137/459) diidentifikasi dapat menghasilkan enzim pencernaan. Sampel 15,32% (21/137) isolat bakteri dapat menghasilkan enzim pencernaan dan dapat menghambat pertumbuhan bakteri Streptococcus agalactiae dan Streptococcus iniae. Isolat bakteri bentuk sel kokus diidentifikasi memiliki potensi dapat menghambat pertumbuhan bakteri Streptococcus agalactiae, Streptococcus iniae dan Aeromonas hydrophila. Bakteri sebagai kandidat probiotik yang memiliki pola hemolitik g diambil sebagai kandidat probiotik. Penelitian kedua bertujuan mengidentifikasi secara fenotipe dan genotipe isolat bakteri menggunakan primer 16S RNA, mengidentifikasi genom lengkap, mengidentifikasi komposisi sekuen G~C dan menganalisis sifat permukaan sel bakteri. Karakterisasi sifat hidrofobik permukaan sel bakteri menggunakan metode uji agregasi garam, uji spontan agregasi, uji otomatis agregasi, uji agregasi bakteri menggunakan n-hexadecane, serta uji kepatuhan bakteri terhadap bahan polistiren. Selain itu sifat permukaan sel bakteri juga dilakukan dengan metode uji pertumbuhan bakteri dalam media soft agar. sekuen dan memiliki pola pertumbuhan kompak dalam media
Keyword: antibiotik, gen resistan, ikan nila, one health, probiotik, antibiotic, gene resistance, one health, probiotic, tilapia

Judul: Characteristic of Overshooting Top (OT) Based on  Himawari  8  Satellite  as  a  Convective  Cloud  Feature  that  Generates  Extreme Weather in the Java Island Region
Abstrak: Overshooting Top (OT) is a feature at the top of a convective cloud that is associated with extreme weather. Research on OT in tropical Indonesia is still very limited. The existence of geostationary satellites with wide area coverage and fast frequency observations is useful for observing the fast dynamics of the OT life cycle. Therefore, this study intends to analyze the relationship between OT and extreme weather, updraft and thermodynamic conditions of OT when extreme weather occurs, the best objective method for detecting OT in the day time and night time, and the spatiotemporal distribution of OT in the tropical region of Java Island during the 2018-2021 period. Based on visual analysis using visible channel and Himawari 8 sandwich products, 87% of extreme weather events in Java were accompanied by the appearance of OT. It indicates that the presence of the OT pattern is a convection cloud pattern or feature that is closely related to extreme weather events for the Java Island region. The existence of a time lag between the appearance of OT and extreme weather events on Java Island indicates that the OT of convection cloud can be used as a precursor or nowcasting for the appearance of extreme weather. Most of the convective cloud OT features during extreme weather events on Java Island have altitude that were only able to exceed the altitude of the equilibrium level and few were able to exceed the tropopause level of 9 km – 16 km. The difference in atmospheric conditions during extreme weather events on Java Island, which is in the tropics and subtropics, is a strong and unstable convective energy condition characterized by a larger CAPE, as well as unstable KI, LI, SI and TTI values. It is offset by kinematic factors in the form of a weak vertical wind shear (bulk wind shear 0-6 km) and a higher freezing point height. The difference between extreme weather events in the Java Island region and other tropical regions compared to subtropical regions is the strong updraft speed of convection clouds. The IRW Texture COMB algorithm based on the IRW-Texture Gradient modification and the COMB algorithm shows a significant increase in quality for detecting OT and non-OT pixels in Java. Rainy days with rainfall > 50 mm/day are very common in areas with an altitude of > 500 m. On the other hand, the level of convection activity which is indicated by the presence of OT and lightning is significantly reduced in this area. OT of convective clouds appear more frequently during the DJF season and less frequently during the JJA season. OT often appears during the day time and rarely at night time. Most OTs appear in the central part, away from the south and north coasts of Java Island during the day, while OTs that appear near the south and north coasts of Java Island can appear in the morning or afternoon.
Keyword: convective clouds, extreme weather, Overshooting Tops, Himawari 8 Satellite