arulpm/tripletsmall huggingface dataset:
Judul: Pendugaan Biomassa Tegakan Jati Menggunakan Citra Landsat 8 OLI di Perum Perhutani KPH Ciamis
Abstrak: Biomassa sangat relevan dengan isu perubahan iklim serta berperan penting dalam siklus karbon. Jati (Tectona grandis Linn. f.) merupakan salah satu jenis kayu tropis berkualitas tinggi, selain memiliki prospek ekonomi Jati juga berperan dalam pengurangan emisi gas karbon dioksida. Penelitian bertujuan untuk menduga potensi biomassa menggunakan nilai indeks vegetasi dengan citra Landsat 8, serta memetakan potensi biomassanya. Pendugaan dan pemetaan dilakukan dengan membangun model pendugaan biomassa dengan y sebagai biomassa dan x adalah indeks vegetasi. Model terbaik adalah y=1141.3NDVI4.7035 dengan nilai R2 sebesar 46.44% serta rata-rata biomassa di atas permukaan sebesar 50.54 ton/ha. Hasil dari uji akurasi pemetaan menunjukkan nilai Overall Accuracy sebesar 50% pada pemetaan dengan 3 kelas biomassa.
Keyword: biomassa, NDVI, pemetaan, Landsat 8

Judul: Pendugaan Potensi Biomassa Atas Tegakan Menggunakan Citra Landsat 8 di Areal Kerja PT Gunung Meranti
Abstrak: Landsat 8 merupakan satelit pemantau sumberdaya alam yang memiliki sensor Onboard Operational Land Imager (OLI) dan Thermal Infrared Sensor (TIRS) dengan 10 buah kanal multispektral dan 1 buah kanal pankromatik.. Penelitian ini bertujuan untuk merumuskan model pendugaan potensi biomassa menggunakan citra Landsat 8 yang terkoreksi atmosfer (BOA reflektan), serta membuat peta sebaran biomassa dari model yang terpilih. Perhitungan biomassa dilakukan dengan menggunakan persamaan alometrik dan destruktif. Pemilihan model terbaik berdasarkan parameter Uji-T berpasangan dan nilai RMSE. Model terpilih pada reflektan adalah Y = 1118.787 exp(-8.98 band 6). Model regresi terbaik digunakan sebagai dasar dalam pembuatan peta sebaran biomassa. Hasil dari evaluasi akurasi menunjukkan nilai Overall accuracy dan Kappa accuracy tertinggi sebesar 43% dan 12.15% pada pemetaan dengan 3 kelas.
Keyword: biomassa, Landsat 8, model penduga biomassa, pemetaan

Judul: Trichomonas Gallinae Penyebab Trichomonosis Pada Unggas
Abstrak: Trichomonas gallinae adalah protozoa yang bergerak aktof dengan keempat flagella yang mempunyai layar dan pada salah satu sisinya terdapat membran seperti sirip ikan yang berombak. Spesies dari genus Trichomonas ini mempunyai arti penting pada unggas, karena dapat menyebabkan infeksi pada alat pencernaan bagian atas.
Keyword:
Judul: Kesuburan Perairan dan Potensi Makanan pada Habitat Hiu Paus (Rhincodon typus Smith, 1828) di Pesisir Kabupaten Probolinggo, Jawa Timur
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis kesuburan perairan dan ketersediaan makanan pada habitat hiu paus (Rhincodon typus) di perairan pesisir Kabupaten Probolinggo, Jawa Timur. Penelitian ini dilakukan pada bulan Februari sampai Maret 2016 dengan mengukur karakteristik fisika dan kimia kualitas air dan pengambilan contoh pada komunitas plankton pada saat kemunculan hiu paus. Terdapat 26 individu hiu paus yang terdiri dari 22 jantan dan 4 betina, kisaran ukuran panjang hiu paus adalah antara 2 sampai 8,5 meter. Kondisi habitat memiliki karakteristik hangat dengan suhu permukaan laut berkisar antara 30 sampai 32°C. Nilai indeks TRIX adalah 4,0008 menunjukkan bahwa perairan pesisir pada kondisi eutrofik. Copepoda diduga merupakan makanan utama hiu paus, karena mendominasi potensi makanan.
Keyword: habitat, hiu paus (Rhincodon typus), pesisir Kabupaten Probolinggo, potensi makanan

Judul: Karakteristik Habitat Hiu Paus, Rhincodon Typus, SMITH 1828 (Elasmobranchii: Rhincodontidae) di Pesisir Kabupaten Probolinggo, Jawa Timur
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk menduga karakteristik habitat dengan mengkaji kondisi lingkungan perairan dan potensi makanan saat hiu paus (Rhincodon typus) muncul ke permukaan. Pelaksanaan penelitian dilakukan dengan pengamatan secara visual terhadap kondisi kondisi lingkungan perairan, tingkah laku, serta pengambilan contoh zooplankton pada saat muncul ke permukaan. Observasi lapangan dilakukan selama 12 hari pada bulan Maret 2015. Hiu paus muncul ke permukaan pada saat cuaca cerah atau sedikit berawan, arus permukaan relatif tenang, dan angin utara berkecepatan rendah. Suhu permukaan air laut berada pada kisaran suhu antara 28,0-29,5 °C. Posisi kemunculan mendekati tepi pantai sekitar 500 meter dengan kedalaman perairan maksimum 20 meter. Ditemukan 72 ekor individu ikan selama waktu pengamatan dengan kisaran jumlah kemunculan 2–14 ekor per hari. Ukuran ikan hiu paus yang teramati berkisar antara 2-8 meter. Kemunculan hiu paus ke permukaan terkait aktivitas makan yang komposisinya didominasi oleh Lucifer dan copepoda.
Keyword: hiu paus (Rhincodon typus), kondisi lingkungan, pesisir Probolinggo

Judul: Konstruksi Algoritme Aritmetik GF(3m) dengan Operasi Dibangkitkan dari Sifat Grup Siklik
Abstrak: Perkembangan teknologi informasi memudahkan seseorang untuk mendapatkan informasi yang dibutuhkan. Untuk mengamankan informasi yang sifatnya rahasia diperlukan suatu teknik pengamanan. Teknik tersebut dapat dilakukan dengan mengamankan baik secara fisik maupun non-fisik. Salah satu pengamanan secara non fisik adalah dengan mengenkripsi informasi rahasia menggunakan teknik kriptografi.
Keyword:
Judul: Pengkuran Sifat Dielektrik Tepung Kacang Hijau Menggunakan Jembatan Wien
Abstrak: Kapasitor adalah komponen listrik yang digunakan untuk menyimpan muatan listrik, biasamya terdici dai dua plat konduktor yang saling berdekatan tapi tidak bersentuhan dan diantara kedua plat tersebut berisi bahan dielektrik. Kemampuannya menyimpan muatan lishik dinyatakan sebagai kapasitansi, yang nilainya ditentukan juga oleh dimensi dari pl" (luas konduktor) dan jarak antara kedua plat tersebut. Pengukuran nilai sifat dielektrik dapat menggunakan berbagai macam metode. Narnun metode pengukurannya memerlukan peralatan yang kompleks juga mnit. Dalam penelitian ini dibuat alat ukur sifat dielektrik bahan padatan berupa tepung yang tneinun&inkan pengukuran yang lebih sederhana. Rangkaian yang digunakan adalah rangkaian jembatan wien dengan sumber ams sinusoidal. Plat kapasitor terbuat dari pcb berlapis tembaga yang disusun secara paralel. Bahan dielektriknya bempa tepung kacang hijau. Tedebih dahulu rancangan alat diuji dengan menggunakan bahan dielektrik udara. Dan;. pengukuran diperoleh beda potensial dan ams yang melewati plat kapasitor uji tersebut. Pengukuran ini untuk mencari pengad perubahan frekuensi terhadap konstanta dielektrik tepung kacang hijau. Pembahan frekuensi yang digunakan mulai dari 819 Hz sampai dengan 200 KHz deugan kenaikan setiap 10 KHz. Hasil yang diperoleh yakni konstanta dielekhik secara bertahap naik dengan nilai. yang ceuderung tidak signifikan kernudian mulai menurun pada frekuensi 160 KHz secara perlahan.
Keyword: 

Judul: Pembuatan Alat Tulis Uji Teknis Sifat Dielektrik Bahan Cair
Abstrak: Kapasitor adalah komponen listrik yang digunakan untuk menyimpan muatan, biasanya terdiri dati dua plat konduktor yang ditempatkan berdekatan tapi tidak bersentuhan. Kemampuan dua sistem plat untuk menyimpan muatan dinyatakan sebagai kapasitansi, yang nilainya ditentukan oleh ukuran, bentuk dan posisi relatif dua plat konduktor serta bahan penyekat antara dua plat konduktor tersebut yang disebut bahan dielektrik.
Keyword: 

Judul: Bakteri Flora Paling Umum Ditemukan Di Rongga Mulut Python Retikulatus Liar
Abstrak: Reticulated python is a non-venomous snake native to South and Southeast Asia. It is the world's longest snake. The purpose of this literature review study is to investigate the common bacterial flora found in oral cavity of the reticulated python. The data for this case study was obtained from several articles, journals, books and credible websites. Based on existing data, there are a wide variety of bacteria in the oral cavity of free-living reticulated pythons. The majority of the organisms were Gram-negative. Pseudomonas spp. were the most commonly isolated bacterial species, being found in 50% of the snakes sampled, and was followed by Staphylococcus sciuri.
Keyword: Reticulated python, snake bites, bacterial flora, oral cavity, microbiology
Judul: Studi Banding Ukuran Tubuh Sapi Madura Kerapan dan Non-Kerapan di Kabupaten Sanlpang Madura
Abstrak: Sapi Madura dianggap sebagai salah satu bangsa sapi asli di Indonesia yang telah terseleksi dan dipertahanltan kemurniannya di Pulau Madura dan pulau sekitamya. Sapi Madura disamping sebagai ternak kerja, tabungan dan sebagai sapi potong, juga berfungsi sebagai biburan dan sarana olalwaga yang merupakan ciri kebudayaan masyarakat, yaitu kempan sapi unti~k sapi jantan dan sapi sonok untuk sapi betina yang merupakan sapi pajangan.
Keyword: 

Judul: Studi Ukuran dan Bentuk Tubuh Jantan Sapi Pesisir, Sapi Bali dan Sapi Peranakan Ongole.
Abstrak: esisir, sapi Bali, dan sapi Peranakan Ongole (PO). Sapi-sapi tersebut dapat beradaptasi terhadap pakan berkualitas rendah, sistem pemeliharaan tradisional, dan memiliki daya tahan tinggi terhadap berbagai penyakit tropis. Potensi baik pada jenis sapi-sapi ini perlu dipertahankan beriringan dengan upaya peningkatan produktivitas melalui seleksi. Keterbatasan informasi atau data performa dan potensi biologis jenis-jenis sapi tersebut, masih menjadi kendala untuk pengembangan lebih lanjut. Pelestarian keragaman fenotipik ternak diperlukan dalam upaya mempertahankan sifat-sifat khas ternak yang dapat dimanfaatkan di masa mendatang. Salah satu cara untuk menentukan keragaman fenotipik sapi lokal Indonesia adalah dengan pengamatan morfometrik pada setiap jenis sapi lokal Indonesia. Identifikasi morfometrik sapi lokal dapat dilakukan dengan cara membandingkan ukuran dan bentuk tubuh. Penelitian ini bertujuan untuk memperoleh informasi fenotipik yang berhubungan dengan karakter morfometrik tubuh sapi Pesisir, sapi Bali dan sapi PO Jantan berdasarkan Analisis Komponen Utama.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword:
Judul: Kebiasaan makanan ikan lidah (Cynoglossus lingua) periode Februari-Juli tahun 2006 di Perairan Ujung Pangkah, Gresik, Jawa Timur
Abstrak: Tujuan penelitian adalah untuk mendapatkan informasi mengenai kebiasaan makanan ikan lidah (C. lingua). Pengambilan ikan contoh dilakukan oleh nelayan menggunakan alat tangkap cager dan jaring insang hanyut (drift gillnet), yang dilaksanakan selama enam bulan yaitu dari bulan Februari sampai Juli Tahun 2006 di perairan Ujung Pangkah.
Keyword: 

Judul: Kebiasaan makanan ikan lidah (Cynoglossus lingua Hamilton-Buchanan) di perairan Ujung Pangkah, Jawa Timur
Abstrak: Penelitian ini dilakukan di perairan Ujung Pangkah, Kabupaten Gresik, Jawa Timur, selama 6 bulan dari bulan Agustus 2005 sampai bulan Januari 2006. Tujuan penelitian adalah untuk mengetahui kebiasaan makanan ikan lidah (Cynoglossus lingua Hamilton-Buchanan). Hasil penelitian diharapkan dapat menjadi sumber informasi mengenai kebiasaan makanan ikan lidah dan informsi tersebut dapat dijadikan dasar untuk pengelolaan ikan lidah terutama di Perairan Ujung Pangkah, Gresik, Jawa Timur.
Keyword: 

Judul: Solusi Geometri Schwarzschild untuk Dimensi 4+1 dengan Invarian Rotasi Isotropik.
Abstrak: Metrik Schwarzschild merupakan solusi eksak pertama dari persamaan medan Einstein dengan mangasumsikan metrik statik dan simetris. Metrik Schwarzschild yang ditemukan oleh Karl Schwarzschild masih dalam dimensi 3+1, namun seiring dengan teori-teori terbaru yang menunjukkan bahwa alam semesta tidak hanya di dimensi 3+1. Maka melalui penambahan dimensi, tujuan penelitian ini memperoleh solusi pada geometri Schwarzschild untuk dimensi 4+1 dengan memodifikasi koordinat bola yang invarian rotasi isotropik dan melalui penurunan rumus seperti koordinat bola, simbol Christoffel, dan tensor Ricci. Selain mendapatkan solusi ini, metrik Schwarzschild dimensi 4+1 dapat digunakan sebagai metrik dasar untuk memperoleh solusi blackhole dan wormhole pada dimensi 4+1. Hasil akhirnya, dengan memanfaatkan modifikasi koordinat bola, metrik Schwarzschild dapat dibentuk sehingga diperoleh solusi geometri Schwarzschild untuk dimensi 4+1.
Keyword: metrik Schwarzschild, persamaan medan Einstein, modifikasi koordinat bola, penambahan dimensi, invarian rotasi isotropik
Judul: Manajemen Panen Kelapa Sawit (Elaeis guineensis Jacq.) Di Kebun Unit Usaha Talo Pino PTPN VII Bengkulu Selatan
Abstrak: Kegiatan magang ini bertujuan untuk memberikan pengetahuan dan pengalaman tentang pengelolaan tanaman kelapa sawit pada kondisi yang sebenarnya dan memberikan pengalaman manajerial pada berbagai kegiatan produksi kelapa sawit. Kegiatan magang ini dilaksanakan di Kebun Unit Usaha Talo Pino PTPN VII Bengkulu Selatan pada bulan Februari sampai dengan bulan Juni 2002.
Keyword: 

Judul: Pengelolaan Panen Tanaman Kelapa Sawit (Elaeis guineensis Jacq.) Di PT. Agrowiyana. Jambi.
Abstrak: Kegialan magang ini dilaksanakan selama empat bulan dari bulan Februari sampai dengan Juni 2001. di PT. Agrowlyana, Kebun PIR•Trans, Propinsi Jambi. Sasaran dari kegiatan magang ini adalah untuk mempelajari teknik dan manajemen pengelolaan panen tanaman kelapa sawit yang menentukan tingkat produktivitas dan kualitas minyak yang dihasilkan.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword:
Judul: Struktur Penguasaan Tanah dan Hubungan Kerja Agrarsi di Desa Jatisari, Lumajang, Jawa Timur
Abstrak: Tujuan penelitian ini adalah: (I) untuk mempelajari struktur penguasaan tanah sawah dan hubungannya dengan kekuatan tawar-menawar (bargaining power) masing-masing pihak yang terlibat dalam ( a ) tarnsaksi penguasaan tanah sawah (Jual-beli, sewa-menyewa dan sakap-menyakap), penentuan nilai tanah dan cara pembayarannya; (b) hubungan kerja agraris dalam hal hak dan kewajiban masing-masing pihak. ( 2 ) untuk mempelajari bentuk dan fungsi hubungan kerja dalam usahatani pada tanah sawah.
Keyword: 

Judul: Sistem Kelembagaan Hubungan Kerja Pertanian Padi Sawah dan Perkembangannya di Pedesaan Kabupaten Lumajang Propinsi Jawa Timur
Abstrak: Unsur-unsur pokok yang diamati dalam studi ini, yaitu: (a) Kelembagaan Hubungan Kerja; (b) Kelembagaan Pertanahan, sebagai salah satu faktor pengaruh terciptanya perkembangan sistem hubungan kerja; dan (c) Dampak perkembangan sistem hubungan kerja. Tujuan penelitian, mengamati: 1. Perkembangan pelapisan rumah tangga petani dan buruh tani berdasarkan luas pemilikan dan penguasaan lahan sawah; 2. Kelembagaan hubungan kerja pertanian (padi sawah) dalam hal bentuk, pembagian pekerjaan, pembagian hasil produksi serta pola hubungan kerja; 3. Perkembangan kelembagaan hubungan kerja pertanian dan faktor-faktor yang mempengaruhi perkembangan kelembagaan hubungan kerja; dan 4. Dampak perkembangan kelembagaan tersebut, terutama yang berkaitan dengan usaha meningkatkan kesejahteraan rumah tangga (petani dan buruh tani).
Keyword: 

Judul: Infeksi Virus Parainfluenza Pada Anjing
Abstrak: Virus parainfluenza anjing termasuk famili Paramyxoviridae, berbentuk pleomorf dengan ukuran bervariasi (bergaris tengah antara 100-500 nm), berpembungkus peka ether, berisi genom RNA dan secara serologis mempunyai kesamaan dengan virus SV-5 kera; dikenak sebagai salah satu kausa penting dari sindrom "kennel cough". Infeksinya dapat mengenai anjing semua umur yang belum pernah terinfeksi atau mendapatkan vaksinasi mengakibatkan gejala klinis ringan yang terbatas pada traktus respirasi atu infeksi yang secara klinis tidak memperlihatkan gejala nyata. Gejala klinis yang nampak setelah masa inkubasi (1-5 hari) terlewati berupa batuk yang tidak berat selama beberapa hari, berbagai tingkat tonsilitis dan pharyngitis dan kadang-kadang ditemukan kenaikan temperatur rektal antara 1-2 derajat C dari temperatur normal rat-rata. Anjing terinfeksi mengandung virus pada traktus respirasi bagian atas dan bawah serta limfonoduli sampai hari ke 9 setelah infeksi. Penyebaran virus antar anjing terjadi secara aerogen.
Keyword:
Judul: Budidaya Karet (Hevea brasillensis Muel. Arg.) di Perkebunan Inti Rakyat Khusus Ia Perkebunan Blambangan Umpu, PTP X Kabupaten Daerah Tingkat II Lampung Utara
Abstrak: Kuliah Kerja Hyata bertujuan mempelajari asp& budidaya karet, terutama pemeliharaan tanman dan penyadapan. Kuliah Kerja Hyata berlangsung selama 3 bulan, yaitu mulai bdan Juni sampai September 1988. Luas Perkebunan Blambangan Umpu sekitar 2 806 ha dan tanaman karet diusahakan pada luasan 2 594 ha. Areal Yang ditanami karet berasal dari hutan priner, hutan sekunder, semak belukar dan sebagian kecil bekas tanaman rakyat.
Keyword: 

Judul: Pengelolaan Tanaman Karet (Hevea Brasiliensis Muel. Arg.) Dengan Aspek Khusus Penyadapan Di Kebun Batulawang Pt Perkebunan Nusantara Viii (Persero) Ciamis, Jawa Barat
Abstrak: Tanaman karet (Hevea brasiliensis Muel. Arg.) merupakan salah satu komoditi perkebunan yang memiliki arti penting bagi perekonomian Indonesia yang merupakan negara produsen karet terbesar kedua setelah Thailand. Luas areal pertanaman karet di Indunesia menunjukkan peningkatan. yaitu dari 3 495 901 hektar pada tahun 1995 meningkat menjadi 3 601 036 hektar pada lahun 2000. Total produksi karet juga menunjukkan peningkatan, yaitu dari I 573 303 ton pada tahun 1995 meningkat menjadi 1 609 557 ton pada tahun 2000 (Direktorat Jenderal Bina Produksi Perkebunan, 2001).
Keyword: 

Judul: Approximation of the Median of Poisson Distribution Using the Relation of Poisson-Gamma Distribution
Abstrak: A major drawback of median is that median cannot usually be defined in closed form, even in the cases where their distribution functions are known. This study gives an approximation of the closed form for the median of the Poisson distribution by using the relation of Poisson-Gamma distribution. The approximation uses elementary techniques based on the monotonicity of certain sequences involving tail probabilities of the Poisson distribution and the Central Limit Theorem. Furthermore, a closed form expression for the mean absolute deviation 􀜧|􀜰􀰒 􀵆 􀜯􀝁􀝀􁈺􀜰􀰒􁈻| is also studied. The median is relevant because of the fact that it minimizes the mean absolute deviation of a Poisson random variable (􀜰􀰒􁈻 by considering median as central tendency.
Keyword:
Judul: Penggunaan Diuron Dalam Mengendalikan Gulma Pada Pertanaman Tebu (Saccharurn Officinamm L.) Lahan Kering
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui efektivitas diuron pada beberapa tingkat dosis dan formulasi dalam mengendalikan gulma pada pertanaman tebu lahan kering.
Keyword: 

Judul: Studi Keefektivan Herbisida Diuron dan Ametrin untuk Mengendalikan Gulma pada Pertanaman Tebu (Saccharum officinarum. L) Lahan Kering
Abstrak: Berdasarkan hasil analisis vegetasi sebelum aplikasi herbisida diuron dan ametrine didapatkan empat spesies gulma dominan yaitu Digitaria adscendens, Borreria alata, Cleome rutidosperma dan Cyperus kyllingia. Spesies gulma lain sebelum aplikasi herbisida ini adalah Commelina diffusa, Fymbristillis milliaceae, Cardiospermum halicacabum dan Centella asiatica. Hasil analisis vegetasi akhir memberikan gambaran umum tentang dominasi gulma setelah aplikasi herbisida.
Keyword: 

Judul: Mitochondrial DNA Gene Organization and Phylogenetic Relationship of Naja siamensis
Abstrak: Naja siamensis is one of Asiatic cobra in the Family of Elapidae, known as a cryptic snake. It has many morphological variations that lead to misidentification. Misidentification can cause the wrong concept in developing antivenom types due to high snakebite cases occur in Thailand. Thus, an accurate species identification using a molecular approach is crucially required. Mitochondrial DNA has been used widely in snake molecular studies. These studies were aimed to determine the arrangement of the N. siamensis partial mitochondrial genes using reptile-oriented primers and to reveal the phylogenetic relationship among other species of Asian cobra. DNA extraction was carried out based on the standard DNA salting-out protocol and was conducted by bioinformatics analysis using BLASTn and MEGA 6 software. Gene annotation was performed against N. kaouthia complete genome. A total of 3121 bp of N. siamensis mtDNA genes were sequenced consisting of partial of six regions: 16S rRNA, ND1, tRNA-Ile, CRII region, tRNA-Leu, tRNA-Gln, and COI genes. The mtDNA gene organization of N. siamensis was predicted to has a similar pattern with the common Elapidae mtDNA gene organization. This study showed that there is a monophyletic form in Naja genus and N. kaouthia is the closest species with N. siamensis based on partial 16S rRNA and ND1 gene.
Keyword: 16S rRNA, Elapidae, ND1, phylogenetic relationship