Judul: Machine Learning for The  Identification of Potential Bioactive Compounds of Black Sea Cucumber as an  Anti-Cancer Agent
Abstrak: Sebagai biota laut yang melimpah di Indonesia, teripang keling (Holothuria atra) masih kurang dimanfaatkan. Penelitian sebelumnya mengungkapkan bahwa jenis teripang ini berpotensi sebagai bahan anti kanker. Kendati demikian, penelitian yang spesifik mengidentifikasi senyawa bioaktif teripang keling yang berinteraksi dengan protein kanker belum dilakukan. Kanker menempati urutan ke tiga sebagai penyebab kematian terbanyak di Indonesia. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan mengidentifikasi senyawa bioaktif teripang keling yang berpotensi sebagai anti-kanker melalui pendeketan komputasional yang terdiri dari prediksi interaksi senyawa-protein menggunakan machine learning, validasi menggunakan molecular docking, dan analisis senyawa teridentifikasi menggunakan analisis Absorption, Distribution, Metabolism, Excretion, and Toxicology (ADMET). Penelitian dimulai dengan mengakuisisi data-data yang diperlukan untuk memodelkan machine learning. Data protein kanker diakuisisi dari tiga sumber yakni The Human Protein Atlas, The Cancer Genome Atlas, dan Ijah Analytics. Kemudian, data senyawa-senyawa yang diketahui berinteraksi dengan protein kanker yang didapatkan sebelumnya diakusisi dari BindingDB. Terakhir, data senyawa bioaktif teripang keling didapatkan dari penelitian sebelumnya. Setelah data semua data yang diperlukan diakusisi, data-data tersebut disiapkan melalui tahapan praproses dimana terjadi penanganan missing value, penanganan nilai redundan, dan penarikan sampel data. Kemudian, dilakukan rekayasa fitur (feature engineering) yakni mengekstrak data mentah senyawa dan protein menjadi fitur senyawa dan fitur protein serta kombinasi fitur senyawa-protein. Tahapan selanjutnya yakni melatih model dari tujuh algoritma machine learning yakni Cascade Deep Forest (CDF), Random Forest, XGBoost, LightGBM, K-Nearest Neighbours, Multilayer Perceptron Neural Networks, dan Logistic Regression menggunakan senyawa-senyawa yang diperoleh dari BindingDB dan protein target yang diperoleh dari tiga sumber yang disebutkan sebelumnya. Model yang sudah dilatih kemudian diuji performanya menggunakan metrik performa machine learning seperti akurasi, F1-Score, dan skor AUC. Perbandingan model dilakukan menggunakan skor AUC. Hasil pengujian menunjukkan algoritma CDF menggunakan kombinasi fitur ECFP-AAIndex1 mendapatkan hasil terbaik (AUC = 93,7%). Algoritma dan kombinasi fitur terbaik tersebut kemudian digunakan untuk memprediksi interaksi senyawa bioaktif teripang keling dengan protein kanker. Didapatkan tujuh pasangan senyawa-protein yang diprediksi berinteraksi. Hasil prediksi interaksi tersebut kemudian divalidasi menggunakan molecular docking yang menunjukkan empat senyawa bioaktif teripang keling yakni Afimoxifene, Danazol, Taxifolin, dan Terfenadine berikatan secara baik dengan protein kanker. Sementara itu, hasil analisis ADMET mengungkap bahwa Taxifolin sebagai kandidat senyawa yang paling berpotensi karena lolos paling banyak parameter ADMET. Penelitian ini bermanfaat sebagai landasan penelitian di masa depan terhadap alternatif pengobatan kanker menggunakan sumber daya alam yang melimpah seperti teripang keling.
Keyword: bioactive compound, bioinformatics, black sea cucumber, cancer, machine learning

Judul: The Antioxidant Activity of Fresh Meat and Protein Hydrolysate of Black Sea Cucumber (Holothuria atra)
Abstrak: Teripang dari genus Holothuria merupakan salah satu biota laut Indonesia dengan nilai manfaat dan ekonomi yang tinggi. Selain sebagai komoditi pangan penting, teripang juga berpotensi sebagai sumber antioksidan alami. Penelitian ini bertujuan menentukan komposisi kimia, bobot molekul protein dan aktivitas antioksidan dari daging segar dan hidrolisat protein teripang keling (Holothuria atra). Komposisi kimia teripang ditentukan melalui uji proksimat, sementara uji Bradford untuk menentukan bobot molekul proteinnya. Uji aktivitas antioksidan dilakukan dengan metode 2.2-azinobis 3-etilbenzotiazoline-6- zulfonic acid (ABTS). Analisis data terhadap parameter aktivas antioksidan menggunakan uji normalitas dan uji T sampel independen. Hasil pengujian menunjukkan bahwa teripang keling mengandung protein sebesar 64,71 ± 2,74 (%bk) dengan rentang bobot molekul dari sampel daging segar 18 - 300 kDa dan hidrolisat protein ≤12 kDa. Hasil analisis data menunjukkan bahwa terdapat perbedaan nilai aktivitas antioksidan antara daging teripang segar dan hidrolisat protein teripang berbeda nyata. Aktivitas antioksidan sampel daging segar diperoleh nilai IC50 sebesar 60,74 ± 0,02 ppm dan pada sampel hidrolisat protein sebesar 52,45 ± 0,03 ppm.
Keyword: Teripang Keling, antioxidant, black sea cucumber, hydrolysate protein

Judul: Konsep Desain Taman Rumah Tradisional Minahasa di base camp Hutan Pendidikan Gunung Walat
Abstrak: Hutan Pendidikan Gunung Walat (HPGW) merupakan area hutan yang berfungsi sebagai hutan produksi, wisata pendidikan, dan konservasi. Di tengah-tengah kawasan HPGW terdapat base camp. Sebagai pusat aktivitas dan istirahat pengunjung, base camp harus dapat mendukung salah satu fungsi hutan ini, diantaranya adalah pendidikan. Fungsi pendidikan pada base camp dapat berupa pendidikan budaya yang berpotensi dikembangkan melalui salah satu wisma yang merupakan model rumah tradisional Minahasa, yaitu Wisma Woloan. Namun, rumah tradisional tersebut belum didukung oleh taman yang dapat memperkuat karakter rumah tradisional Minahasa. Untuk itu diperlukan konsep desain taman rumah tradisional Minahasa dengan penerapan unsur budaya agar karakter rumah tradisional ini dapat dimunculkan. Penelitian ini bertujuan untuk membuat konsep desain taman area Wisma Woloan pada base camp HPGW yang didasarkan pertimbangan budaya sehingga memberikan gambaran dan pengetahuan bagi pengguna mengenai taman rumah tinggal masyarakat Minahasa. Tempat kegiatan penelitian berlokasi di Hutan Pendidikan Gunung Walat (HPGW), Sukabumi, Jawa Barat. Metode yang digunakan dalam desain ini adalah metode deskriptif melalui survei, wawancara, dan studi pustaka. Wawancara dan studi pustaka dilakukan untuk mendapatkan informasi mengenai kebudayaan Minahasa. Terdapat empat tahapan dalam penelitian ini, yaitu kajian budaya, inventarisasi, analisis dan sintesis, serta pembuatan konsep desain. Setelah tahapan ini selesai, dibuat gambar siteplan, tampak potongan, serta perspektif sebagai ilustrasi. Dalam penelitian ini, aspek yang akan dibahas mencakup aspek fisik, biofisik, sosial, dan aspek yang berkaitan dengan kebudayaan Minahasa. Wisma Woloan 1 dan 2 yang menjadi objek dalam penelitian ini terletak di sebelah barat base camp. Wisma Woloan 1 terletak di atas air, sedangkan Wisma Woloan 2 terletak di atas tanah yang datar. Jenis tanah yang ada di area ini merupakan tanah latosol merah kekuningan. Tanah jenis ini cukup subur untuk ditanami tanaman. Suhu udara rata-rata tapak adalah 24° C, kelembaban rata-rata 81,8%, dan nilai THI sebesar 23,13. Dari hasil analisis, iklim pada tapak dikategorikan nyaman. Vegetasi yang ada di sekitar Wisma Wolan 1 adalah cempaka (Michelia champaca), puspa (Schima wallichii), dan teratai (Nymphaea lotus), sedangkan di Wisma Woloan 2 terdapat vegetasi matoa (Pometia pinnata), hanjuang (Cordyline sp), sambang dara (Iresine herbstii), dan pisang (Musa sp). Bangunan Wisma Woloan 1 dan 2 berupa rumah panggung dengan ketinggian ± 1,5 m dari tanah. Konstruksi rumah panggung ini terbuat dari kayu yang dapat dibongkar-pasang. Jenis kayu yang digunakan umumnya adalah kayu Cempaka. Di bagian dalam wisma terdapat 2 kamar, 1 kamar mandi, ruang tamu, dapur, dan ruang makan. Bagian luar rumah berupa teras sebagai tempat duduk-duduk untuk menikmati pemandangan. Saat ini kondisi bangunan terawat namun dibutuhkan penataan lanskap di bagian luar rumah tradisional ini.
Keyword: