Judul: Variasi gen cytochrome oxidase i (coi) pada lebah trigona di desa batu kucing dan desa bungku, jambi
Abstrak: Lebah trigona merupakan salah satu serangga polinator yang berperan dalam ekosistem. Pendataan keanekaragaman trigona secara morfologi telah dilakukan di indonesia, namun pendataan secara molekular dengan variasi gen cytochrome oxidase i (coi) belum dilakukan. Penelitian ini bertujuan menganalisis kekerabatan antar tiga spesies trigona dan mempelajari variasi gen cytochrome oxidase i (coi) pada lebah trigona di desa batu kucing dan desa bungku, jambi. Jumlah sampel yang dianalisis sebanyak dua individu pada t. Fuscobalteata, t. Laeviceps asal desa batu kucing dan desa bungku, jambi. Primer gen coi di disain berdasarkan melipona bicolor dari genbank. Hasil sekuen gen coi trigona secara parsial menghasilkan panjang nukleotida t. Fuscobalteata dan t. Laeviceps berturut-turut sebesar 724 dan 908 pb dengan komposisi at yang tinggi. Alignment sekuen asam amino t. Fuscobalteata, t. Laeviceps dan t. Chanchamayoensis dengan outgroup melipona bicolor menunjukkan daerah yang conserve sebanyak 161 pb dan variasi ditemukan pada 19 pb. Analisis jarak genetik tertinggi diperoleh antara m. Bicolor dengan t. Laeviceps sebesar 0.023. Konstruksi filogeni dilakukan menggunakan metode maximum parsimony (mp) dan neighbour joining (nj). Hasil kedua konstruksi filogeni menunjukkan kesamaan t. Laeviceps memiliki kekerabatan yang dekat dengan t. Fuscobalteata dibandingkan t. Chanchamayoensis.
Keyword: gen coi, dna mitokondria, trigona

Judul: DNA Barcode of Trigona terminata, T. moorei, T. drescheri and T. thoracica based on Cytochrome oxidase 1 (CO1) gene
Abstrak: Lebah Trigona (Apidae: Meliponinae) yang termasuk ke dalam stingless bees memiliki keanekaragaman yang tinggi di daerah tropis. DNA Barcode adalah teknik identifikasi molekuler yang mendukung identifikasi morfologi berdasarkan sekuen DNA yang telah distandarisasi, pada hewan menggunakan gen cytochrome oxidase 1 (CO1) dari genom mitokondria (mtDNA). Sedikitnya database DNA Barcode Trigona membuat penelitian ini sangat penting untuk dilakukan. Penelitian ini bertujuan menganalisis sekuen gen CO1 Trigona terminata, T. drescheri, T. moorei dan T. thoracica. Empat spesies Trigona yang digunakan dalam penelitian ini berasal dari hutan karet dan desa Batu kucing, Jambi. Sekuen gen CO1 yang telah didapat dilakukan analisis bioinformatik serta konstruksi pohon filogeni menggunakan metode Maximum Parsimony. Penelitian ini menghasilkan parsial sekuen gen CO1 dari empat spesies Trigona dengan panjang sekuen berkisar antara 740-761 bp. Hasil analisis bioinformatik terhadap keempat sekuen tersebut menunjukan nilai homologi dan query cover mencapai 100 % serta e-value yang rendah. Pohon filogeni menunjukkan bahwa T. drescheri, T. laeviceps, T. terminata, T. moorei, dan T. thoracica tergabung ke dalam satu kelompok dengan nilai bootstrap 98 %. Selain itu, berdasarkan gen CO1 diketahui bahwa T. drescheri merupakan spesies terdekat dari T. laeviceps yang mendukung data morfologi yaitu kedua spesies Trigona tersebut berada dalam satu subgenus Tetragonula.
Keyword: stingless bee, Meliponinae, identifikasi molekuler, DNA Barcode, gen CO1, T. thoracica

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: