Judul: Inventarisasi bakteri gram negatif yang terbawa benih dari beberapa varietas kedelai (Glycine max (L.) Merr.)
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk menginventarisasi dan mengidentifikasi bakteri gram negatif yang terbawa benih kedelai melalui isolasi dari beberapa varietas kedelai dan serangkaian pengujian sifat-sifat fisiologisnya. Isolat bakteri yang didapatkan diuji sifat-sifat fisiologisnya, meliputi uji: gram, pembentukan levan, reaksi oksidase, pembusukan kentang, dehidrolisis arginin, hiper- sensitivitas, fluoresensi, oksidatif/fermentatif, hidrolisis gelatin, patogenisitas dan virulensi. Hasil yang diperoleh menunjukkan bahwa: semua isolat yang dipakai memiliki gram negatif; reaksi positif pada uji pembentukan levan terjadi pada isolat-isolat 2, 5, 7, 18, 20, 23 dan 24; reaksi positif uji fluoresensi terjadi pada isolat-isolat 3, 4 dan 6; reaksi positif uji oksidase terjadi pada isolat-isolat 2, 3, 5, 7, 19, 20, 23 dan 24; semua isolat menunjukkan reaksi negatif pada uji fermentatif; reaksi positif uji pembusukan kentang terjadi pada isolat- isolat 2, 3, 5, 6, 18, 20 dan 23; reaksi positif uji dehidrolisis arginin terjadi pada isolat-isolat 3, 4 dan 5; reaksi hipersensitivitas positif terjadi pada isolat-isolat 4, 5, 6, 7, 18, 19, 20, 23 dan 24; reaksi hidrolisis ..dst
Keyword: 

Judul: Keragaman genetik dan pengembangan metode deteksi cepat penyebab pustul bakteri (Xanthomonas axonopodis pv.glycines) pada kedelai
Abstrak: Penyakit pustul bakteri yang disebabkan oleh Xanthomonas axonopodis pv. glycines merupakan salah satu penyakit bakterial penting pada tanaman kedelai yang belum tertangani dengan baik. Oleh karena itu, pemahaman tentang virulensi clan keragaman genetik dari patogen ini serta pengembangan metode deteksi yang cepat dan akurat sangat diperluk.an dalam pengembangan strategi pengendalian penyakit terse but. Penelitian ini bertujuan untuk : (I) menelaah virulensi dan keragaman genetik X axonopodis pv. glycines Xag asal edamame menggunakan teknik PCR-RFLP basil amplifikasi gen 16S-rRNA (ARDRA), teknik ISR 16S-23S-rRNA dan teknik MFLP/PFGE, (2) mengembangkan metode deteksi cepat dan akurat untuk mendeteksi penyakit pustul bakteri pada daun dan benih kedelai secara serologi clan molekular Telah terkoleksi sebanyak 29 isolat X axonopodis pv. glycines dari berbagai pertanaman edamame di )ember, Cipanas, Ciawi dan Bogar. Hasil penelitian menunjuk.kan bahwa isolat-isolat tersebut memiliki tingkat virulensi yang berbeda. Virulensi semua isolat lebih tinggi jika diinokulasi pada tanaman edamame dibanding Wilis atau Orba. Berdasarkan hasil keragaman genetik menggunakan teknik ARDRA, ISR dan MFLP secara berturut-turut diperoleh 6 profil, 7 profit dan 13 profit DNA yang berbeda. Oleh karena itu diperoleh minimal 13 strain X axonopodis pv. glycines yang menginf eksi edamame. lso lat CPI dan JA4 dari Cipanas dan Jember merupakan isolat yang memiliki profil DNA spesifik karena hubungan kekerabatan genetiknya yang cukup jauh dari isolat-isolat lainnya. ..dst
Keyword: ARDRA, lntergenic Spacer Region, patogen, teknik serologi, teknik molekuler

Judul: Thermal Characteristics and Dynamics of Tropical Cyclone over Western North Pacific Ocean: A Case Study of Typhoon Songda (Chedeng) 2011
Abstrak: The frequent occasion of Tropical Cyclone (TC) over Western North Pacific (WNP) Ocean lies from 10˚N to 26˚N and 121˚E to 170˚E. Sources of TC development come from warm ocean temperature where latent heat is released during condensation processes and subsequently concentrated in the boundary layer. Relative humidity at 850-700 hPa is responsible to produce the most intense storm. Meanwhile, weak vertical wind shear between 850-200 hPa is one of the dynamical factors that lead to the development of TC. Pressure level of 850-200 hPa is chosen to minimize the thermodynamic effect in the lower troposphere. Typhoon Songda (Chedeng in the Philippines) or TSC lasted from May 18th to 30th, 2011 and strengthened into powerful Super Typhoon stage between May 24th and 27th. Long curving track and the exhibition of all sequences of TC life cycle, TSC is then considered as an ideal case of TC. The objective of the study with case of TSC is to investigate the role of thermal characteristics and dynamics on TC intensity. The research is carried out by using Advanced Research of Weather Research and Forecasting model (WRF ARW model) version 3.3. Two domains are employed in the model. The first domain situate from 02˚N to 40˚N and 118˚E to 149˚E and cover spatial resolution () of 33.1 km. The second domain situate from 09˚N to 27˚N and 119˚E to 132˚E with of 11 km. Timestep of the model () is 120 seconds. The model is supported by the following physical parameterization, i.e., Yonsei University Scheme (YSU) in the boundary layer, Kain-Fritsch scheme (KF) in the cumulus, and WRF Single-Moment 3-class scheme in the microphysics. Initial meteorological condition prior to the formation of the cyclone is generated using WRF ARW standard-release model. Sensitivity of the model output is obtained from a selected single-parameter change scenarios, namely, 10 % to 20 % decrease and increase of wind shear initial data at 850-200 hPa, and by 10 % to 20 % decrease of relative humidity initial data at 850-700 hPa. The result showed that the negative correlations between wind shear and intensity are found in wind shear scenarios. Wind shears of 10 ms-1 which lead to strengthening of the wind intensity in the early period of Typhoon development are found in wind shear scenarios. The effect of wind shear changes on wind intensity is statistically significant in the 20 % wind shear scenarios. During mature stage, weak wind intensity occurred when wind shear increase as given in the WRF standard-release and the 20 % decreasing scenario. Different situation is found in the 20 % increasing scenario where wind shear tend to weak and lead to strong wind intensity at this stage. Meanwhile, the reduction of moisture supply at 850-700 hPa resulting from 20 % decreasing relative humidity play a major role in the weakening of wind intensity and reduces mechanical energy of the cycle process as much as 300 J kg-1.
Keyword: