Judul: Aplikasi teknik Near Infrared Reflectance dan jaringan saraf tiruan untuk penentuan mutu beras secara non destruktif
Abstrak: Beras merupakan bahan makanan pokok utama Indonesia. Beras merupakan komoditas yang mempunyai nilai strategis dalam stabilitas ekonomi, politik dan sosial sehingga masalah dan penanganan beras perlu mendapatkan prioritas. Pemutuan cita rasa beras di Indonesia masih dilakukan berdasarkan jenis dan aroma yang bersifat subjektif. Untuk itu perlu dibuat metode pengukuran bersifat kuantitatif yang cepat, sederhana dan non destruktif. Pada penelitian ini dibuat pengukuran non destruktif menggunakan teknologi pantulan infra merah dekat (near infrared reflectance) dan jaringan saraf tiruan untuk menentukan kandungan beras. Dari kandungan beras ini akan didapatkan mutu beras. Kandungan beras yang diukur adalah kadar amilosa, karbohidrat, protein, lemak, kadar abu dan kadar air. Pantulan infra merah dekat merupakan salah satu metode analitik yang sangat berkembang karena kecepatannya tinggi, teliti, sederhana dan non destruktif. Pantulan infra merah dekat ini dianalisis dengan mengunakan jaringan saraf tiruan. Jaringan saraf tiruan sebagai metode analisis memiliki kelebihan yaitu dapat memetakan fungsi non linier dan hanya memerlukan data input output tanpa mengetahui dengan jelas prosesnya. Oleh karena itu cocok digunakan untuk menganalisis data pantulan infra merah dekat. Jaringan saraf tiruan digunakan untuk menentukan kandungan beras yaitu kadar air, kadar abu, protein, lemak, karbohidrat dan amilosa. Jaringan saraf tiruan ini dirancang dalam dua model. Jaringan saraf tiruan model pertama hanya menggunakan satu output pada lapisan output untuk masing-masing kandungan beras yang akan diukur. Dengan demikian, pada model pertama diperlukan enam jaringan saraf tiruan. Jaringan saraf tiruan model kedua digunakan untuk menentukan semua kandungan beras yang akan diukur. ...
Keyword: 

Judul: Pendugaan kadar air, karbohidrat, protein, lemak dan amilosa pada beras Oryza sativa L. dengan teknologi Near Infrared
Abstrak: Beras (Oryza sativa L.) merupakan salah satu jenis serealia yang sangat penting, karena beras merupakan sumber terpenting pangan bagi manusia dan menjadi makanan pokok di sebagian besar negara. Beras menyediakan sekitar 21% dari total kalori pangan bagi penduduk dunia, terutama penduduk Asia termasuk Indonesia. Diperkirakan beras menyumbang 60 - 80% kalori dan 45 - 55% protein dalam umur rata-rata masyarakat Indonesia (Damardjati, 1988). Umumnya untuk mengetahui komposisi kadar air, karbohidrat, protein, lemak, dan amilosa dilakukan dengan cara analisa kimia, namun hal tersebut cukup rumit, memerlukan tenaga intensif dan waktu yang lama. Teknologi NIR (Near Infrared) memungkinkan pengukuran secara cepat dan akurat tanpa membutuhkan bahan-bahan kimia dan tidak menimbulkan polusi. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menduga kandungan kadar air, karbohidrat, protein, lemak dan amilosa pada butir beras dengan menggunakan teknologi NIR. Spektrum NIR antara 700-2500 nm (Dryden, 2003). Pada kisaran panjang gelombang tersebut terjadi penyerapan cahaya (photon) yang besar oleh molekul- molekul CH, OH, CN, atau NH. Radiasi near infrared yang dipantulkan dari sampel dapat digunakan untuk memprediksi karakteristik sampel, data yang diperoleh dimasukkan dalam perhitungan kalibrasi. Jumlah dari radiasi pantulan sampel dijadikan sebagai data reflektan (R) dari sampel. Nilainya diekspresikan sebagi log (1/R), yang memberi nilai tinggi pada level tinggi absorban. Terdapat hubungan yang linear antara log (1/R) dan konsentrasi komponen yang diserap. Bahan yang digunakan dalam penelitian ini adalah beras (Oryza sativa L.) yang diperoleh dari Balai Penelitian dan Pengembangan Pertanian, Cimanggu, Bogor. Beras yang digunakan adalah beras dengan varietas IR64 dan varietas lokal Cianjur dengan tingkat kadar air 11-15%, protein 7-8%, karbohidrat 74-77%, dan lemak 2-3%. Alat yang digunakan pada penelitian ini antara lain sistem NIR dan seperangkat komputer. Pengukuran kadar air, karbohidrat, protein, lemak dan amilosa referensi dilakukan dengan uji kimia proksimat. Sebanyak 35 sampel digunakan untuk proses kalibrasi. Metode kalibrasi yang digunakan adalah metode regresi berganda stepwise. Kisaran panjang gelombang untuk pendugaan kadar air, karbohidrat, protein, lemak dan amilosa beras antara 900-2000 nm dengan interval 5 nm. ...
Keyword: 

Judul: Development of DNA Vaccine Encoding Glycoprotein of Koi Herpes Virus Using Local Isolate.
Abstrak: The aim of this research was to develop DNA vaccine of Koi Herpesvirus in carp. Glycoprotein gene originated from ORF 25 KHV virus that is 1.8 kbp in size, is a potential gene in DNA vaccine construction. The sequencing and similarity analysis of the gene using BLAST software showed that this gene is a GP25 gene and was found to be very similar (99%) to GP25 of KHV virus from the USA and Israel. When this GP25 gene was ligated with pGEMT Easy (pT, 3 kbp in size) vector, plasmid size was increasing up to 5 kb. Following this, a digestion of pT-GP25 plasmid using Sal I enzyme was applied resulted in a GP25 fragment (1.8 kbp). Subsequently, pAct-D6 with a size of 8.5 kbp was also cut using the same enzyme to eleminate a D6 gene with a size of 1.6 kbp. GP25 gene was then ligated with pAct resulted a pAct-GP25 plasmid with a size of 8.8 kbp. As there was only one restriction site applied, ligation can be occurred in two different directions. Thus, in order to determine the plasmid with the desired direction PCR analysis was carried out, and plasmid with the right direction was the one that sized approximately 2.1 kbp (no. 6, 17 and 20). High level of GFP gene expression was detected in all tissues analyzed, i.e. kidney, gil, spleen, and muscle 24 hours after injection which indicated that β-actin promoter of Japanese medaka could be active in common carp. Although not as high as on 24 hours, expression was still detected until day 7 and disappeared after day 28 post injection indicating that pAct-GFP can be remained and β-actin promoter of Japanese medaka can be active in muscle, gills and kidney at least a week after injection. The result of RT-PCR analysis on pAct-GP25 injected common carp showed that GP25 gene expression can be detected 14 days after injection in all tissues observed. The expression level differences between GFP and GP25 genes possibly related to the primer sensitivity on annealing process to cDNA template and the size of PCR targeted DNA fragment, as smaller PCR targeted product will be easier to be amplified than a bigger one. The length of PCR targeted DNA with GP25 primer was 1.8 kbp whereas GFP gene was 0.6 kbp.The challenge test on common carp results showed that all unvaccinated and negative control (not infected with KHV) was alive until the end of the experiment. Whereas, the survival of fish vaccinated with a dose of 12.5 was ranged from 60.9 and 96.7%. In relation to the activity of β-actin promoter that was used in this DNA vaccine, gene expression was occured 24 hours after vaccination and remained until 2 weeks. The control fish that was not injected by GP25 showed no GP25 expression either in the observed tissues or organs and resulted in a lower survival, i.e. 23.3%. The challenge test results has indicated that the fish vaccinated with GP25 at doses of 7.5 and 12.5 μg/100μL were able to produce KHV glycoprotein in their body which would be
Keyword: