Judul: Induksi Mutasi dan Seleksi Invitro Jeruk (Citrus sp.) untuk Peningkatan Ketahanan terhadap Penyakit Huanglongbing
Abstrak: Huanglongbing (HLB) atau Citrus Vein Phloem Degeneration (CVPD) adalah penyakit utama yang merusak tanaman jeruk. HLB mengakibatkan kerugian hingga 100%. Peningkatan ketahanan jeruk perlu dilakukan melalui pendekatan bioteknologi dan pemuliaan mutasi. Kombinasi induksi mutasi dan seleksi secara in vitro diharapkan dapat meningkatkan keragaman dan memunculkan karakter ketahanan terhadap HLB. Penelitian ini bertujuan untuk meningkatkan keragaman genetik tanaman jeruk siam Banyuwangi menggunakan mutagen sinar gama, memperoleh letal dosis 50 (LD50) embrio jeruk siam Banyuwangi dan menghasilkan tunas mutan putatif tahan terhadap penyakit HLB. Penelitian terdiri dari dua tahap yaitu, tahap pertama induksi iradiasi sinar gama dan perkecambahan embrio secara in vitro. Embrio muda jeruk siam Banyuwangi ditanam pada media dasar MS (Murashige dan Skoog) yang dikombinasikan dengan vitamin MW (Morel dan Wetmore) kemudian diberikan perlakuan iradiasi sinar gama pada dosis 0, 45, 50, 55 Gy, selanjutnya embrio ditanam pada MS + Vit MW ditambah Giberelic Acid (GA3) 1 ppm. Tahap kedua tunas putatif mutan diseleksi secara in vitro dengan menggunakan suspensi Candidatus Liberabacter asiaticus (CLas). Hasil pengamatan diperoleh bahwa peningkatan dosis iradiasi sinar gama menurunkan persentase perkecambahan embrio dan menghasilkan LD50 pada dosis 49.9 Gy. Jumlah kecambah dan tunas terbanyak dihasilkan pada dosis 45 Gy. Hasil analisis melalui metode Ward Linkage terdapat dua kelompok utama yang dapat dibedakan mejadi mutan yang mirip dengan tetuanya dan mutan yang jauh dari tetuanya. Hasil analisis tersebut diperoleh 28 tunas dari 60 tunas yang memiliki karakter yang jauh dari tetuanya. Hasil seleksi tunas mutan putatif secara in vitro menggunakan agen penseleksi berupa suspensi patogen CLas diperoleh satu tunas pada setiap dosis iradiasi. Setiap tunas yang lolos seleksi diharapkan memiliki ketahanan terhadap HLB yang selanjutnya akan dievaluasi di lapang.
Keyword: CVPD, Citrus, Huanglongbing, Mutation Breeding

Judul: Citrus Plant Assembly Through Editing Genome as an Effort to Improve Huanglongbing Disease Resistance
Abstrak: DIAN PUJI RAHAYU. Perakitan Tanaman Jeruk Melalui Pengeditan Genom Sebagai Upaya Peningkatan Ketahanan Penyakit Huanglongbing. Dibimbing oleh AGUS PURWITO dan MIA KOSMIATIN Jeruk merupakan salah satu komoditi nasional yang memiliki potensi dan daya saing tinggi hal ini dikarenakan adanya kesadaran masyarakat akan kebutuhan jeruk sebagai sumber gizi. Upaya dalam peningkatan produksi jeruk memiliki berbagai kendala salah satunya yaitu ketidaktahanan tanaman jeruk terhadap serangan penyakit huanglongbing. Huanglongbing merupakan penyakit pada tanaman jeruk yang disebabkan oleh aktivitas bakteri Candidatus Liberibacter asiaticus (CLas) yang dibawa oleh serangga vektor berupa kutu loncat atau Asian Citrus Psyllid (ACP) yaitu Diaphorina citri Kuwayama. Adanya aktivitas bakteri Candidatus Liberibacter asiaticus (CLas) yang menginfeksi tanaman jeruk pada jaringan floem mengakibatkan akumulasi senyawa callose sehingga mengganggu perkembangan tanaman karena proses translokasi nutrisi ke bagian lain tanaman menjadi terganggu yang kemudian menimbulkan gejala penyakit huanglongbing seperti pucuk daun berbercak kuning, daun mengeras dan berukuran kecil. Hingga saat ini berbagai upaya untuk menanggulangi penyakit Huanglongbing masih belum efektif. Cara yang efektif untuk menanggulangi penyakit huanglongbing adalah menggunakan varietas yang tahan. Salah satu cara untuk mendapatkan tanaman yang tahan terhadap penyakit Huanglongbing yaitu dengan pendekatan bioteknologi melalui pengeditan genom. Pengeditan genom yang saat ini banyak digunakan yaitu dengan sistem CRISPR. CRISPR merupakan teknologi modern untuk pengeditan genom yang terdiri dari sekuens atau urutan nukleotida dengan repitisi pendek. Tujuan dari penelitian ini yaitu untuk memodifikasi gen callose synthase sehingga tidak terjadi akumulasi callose yang dihasilkan dari aktivitas bakteri Candidatus Liberibacter asiaticus (CLas) penyebab penyakit Huanglongbing melalui teknik transformasi gen CRISPR/Cas9-gRNA-CsCS ke dalam genom tanaman jeruk dengan bantuan bakteri Agrobacterium tumefaciens. Transformasi gen dilakukan pada 3 jenis eksplan yaitu embiro zigotik, embrio nuselar dan buku kotiledon yang berasal dari 4 jenis jeruk yang terdiri dari jeruk mandarin Ponkan, keprok Terigas, siam Banyuwangi dan fS89. Transformasi dilakukan pada konsentrasi Optical Density (OD600) sebesar 0,2 dan 0,02 dengan perendaman eksplan pada suspensi bakteri Agrobaterium tumefaciens yang telah membawa gen CRISPR/Cas9-gRNA-CsCS selama 20 menit kemudian dikokultivasi selama 3 hari pada kondisi ruang gelap lalu dilakukan seleksi pada media yang mengandung higromisin selanjutnya diregenerasikan pada beberapa komposisi media tanam untuk meregenerasikan eksplan. Eksplan yang beregenerasi kemudian dilakukan Shoot Tip Grafting dan diinokulasi bakteri Candidatus Liberibacter asiaticus (CLas) secara buatan. Hasil yang diperoleh dari penelitian ini yaitu optimasi pada konsentrasi vektor Agrobacterium tumefaciens pada Optical Density (OD600) 0,02 memiliki hasil tertinggi pada semua karakter pengamatan pada semua eksplan pada beberapa jenis jeruk sedangkan optimasi pada Optical Density (OD600) 0,2 memiliki nilai yang lebih rendah. Percepatan pertumbuhan putatif transforman asal eksplan buku kotiledon yang dilakukan pada 6 jenis media tanam (VMW, MT, MS+K0, MS+K1, MS+K2, MS+K3) menunjukkan bahwa tinggi tanaman dan jumlah daun tertinggi pada eksplan embrio nuselar diperoleh pada komposisi media tanam MS yang dikombinasikan dengan kinetin 3 mg/L. Nilai rata-rata tinggi tanaman dan jumlah daun tertinggi pada eksplan embrio zigotik terdapat pada komposisi media MT dan hasil rata-rata tinggi tanaman dan jumlah daun tertinggi pada eksplan buku kotiledon terdapat pada komposisi media tanam MS yang dikombinasikan dengan kinetin 2 dan 3 mg/L. Efisiensi transformasi tertinggi didapatkan pada jenis eksplan embrio nuselar sebesar 14,29%. Efisiensi regenerasi tertinggi terdapat pada jenis eksplan
Keyword: Transformasi, citrus, huanglongbing, in vitro

Judul: Metrik Einstein (Anti-) Self-Dual Berdimensi Empat dengan Metode Cartan
Abstrak: Gravitational field equation can be formulated in differential forms (differential geometry), which describes gravity as a manifestation of the curvature of space-time. Curvature of space-time is characterized by a metric that satisfies the gravitational field equation. With differential forms it can be formulated the (anti-) self-dual Einstein equation, which is a modification of the Cartan structure in (anti-) self-dual basis. Calculation of (anti-) self-dual metric with (anti-) self-dual Einstein equation is simpler than the calculation using Christoffel symbols.
Keyword: