Judul: Perhitungan Modus Vibrasi Molekul H2O
Abstrak: Pemodelan gugus fungsi molekul H2O dapat digunakan untuk mendapatkan parameter vibrasi dan bilangan gelombang serapan vibrasi molekul H2O. Perhitungan ini merupakan perhitungan teoritik gugus O – H pada molekul H2O dengan menggunakan model osilator harmonik. Parameter vibrasi dari model ini dioptimasi dengan menggunakan metode Particle Swarm Optimization (PSO). Hasil dari optimasi PSO didapatkan parameter vibrasi yaitu panjang ikatan (r0) sebesar 9.7561 × 1011 m, sudut ikatan (θ) sebesar 105.11°, konstanta pegas O–H (kOH) sebesar 775.92 N·m1, konstanta pegas H–H (kHH) sebesar 70.291 N·m1 dan frekuensi vibrasional harmonik (ω) masing-masing 3.0076 × 1014 rad·s1 untuk vibrasi tekuk, 7.0798 × 1014 rad·s1 untuk vibrasi regang antisimetris dan 6.9746 × 1014 rad·s1 untuk vibrasi regang simetris. Tiga frekuensi hasil optimasi PSO bersesuaian dengan bilangan gelombang 1595.6 cm–1, 3755.9 cm–1, dan 3700.2 cm–1. Ketepatan bilangan gelombang serapan pada penelitian ini adalah 98.783%.
Keyword: gugus fungsi, konstanta pegas, vibrasi

Judul: Studi Komputasi pada Carbon Dots Terfungsionalisasi Gugus Amina untuk Pengindraan Hidrogen Peroksida
Abstrak: Dalam penelitian ini, penginderaan hidrogen peroksida (H2O2) diselidiki pada carbon dots yang terfungsionalisasi gugus amina (NH2-Cdots) pada tiga posisi -NH2 yang berbeda, dan atom N berperan sebagai situs aktif menggunakan pendekatan komputasi kuantum. B3LYP dan 6-31G (d,p) sebagai metode fungsional dan basis set yang digunakan dalam teori fungsional kerapatan (TFK) untuk perhitungan keadaan dasar. Sedangkan, CAM-B3LYP dan basis set yang sama digunakan dalam teori fungsional kerapatan-dependen waktu (TFK-DW) untuk perhitungan keadaan tereksitasi. Struktur teroptimasi menunjukkan bahwa H2O2 diadsorpsi secara kimia pada 1-sim lebih baik dibandingkan dengan 2-sim dan 3-sim melalui interaksi ikatan hidrogen C–N⋯H dengan energi adsorpsi -10,61 kcal/mol. Distribusi muatan atom Mulliken dan potensial elektrostatik keduanya digunakan untuk menentukan reaktivitas molekul pada tingkat atom. Orbital molekul Frontier digunakan untuk memahami mekanisme transfer elektron. Selain itu, energi interaksi ikatan hydrogen dan juga klasifikasi tipe interaksinya pada 1-com adalah -6,8067 kcal/mol dan dikategorikan sebagai interaksi ikatan hidrogen. Pada Analisa TFK-DW, spektrum absorpsi UV-Vis dan panjang transfer muatan untuk memahami mekanisme penginderaan H2O2 dalam keadaan tereksitasi pada semua struktur adalah hipokromik dan photo-induced charge difference. Semua analisis menunjukkan 1-sim lebih menguntungkan berinteraksi dengan H2O2 daripada 2-sim dan 3-sim; dan, diyakini bahwa NH2-Cdots mungkin menjadi kandidat potensial untuk merasakan keberadaan H2O2 pada aplikasi kemosensor., In this study, hydrogen peroxide (H2O2) sensing investigated on amine groupfunctionalized carbon dots (NH2-Cdots) at three different -NH2 positions, and the N atom is role-playing as an active site using a quantum computational approach. B3LYP and 6-31G (d,p) as functional methods and basis sets used in density functional theory (DFT) for ground state calculations. Meanwhile, CAM-B3LYP and the same base set were used in the time-dependent density functional theory (TD-DFT) for excited state calculations. The optimized structure showed that H2O2 was chemically adsorbed on 1-sim better than 2-sim and 3-sim through the interaction of C–N⋯H hydrogen bonds with adsorption energy of -10.61 kcal/mol. Mulliken atomic charge distribution and electrostatic potential are both used to determine reactivity molecules at the atomic level. Frontier molecular orbitals are used to understand electron transfer mechanisms. In addition, the hydrogen bond interaction energy and also the classification of the interaction type at 1-com is - 6.8067 kcal/mol and is categorized as a hydrogen bond interaction. In TD-DFT analysis, UV-Vis absorption spectrum and charge transfer length to understand the sensing mechanism of H2O2 in an excited state in all structures are hypochromic and photo-induced charge difference. All analysis shows 1-sim more favorable interacted with H2O2 than 2-sim and 3-sim; and, it is believed that NH2-Cdots may be a potential candidate for sensing the presence of H2O2 to chemosensor applications.
Keyword: carbon dots, gugus amina, hidrogen peroksida, teori fungsional kerapatan, teori fungsional kerapatan-dependen waktu

Judul: Posisi Filogenetik Kura-Kura Carettochelys Insculpta  (Reptillia: Testudinata)
Abstrak: Carettochelys insculpta is an endemic freshwater turtle of southern Papua and northern Australia. Phylogenetic position of this turtle is remain unresolved until now. Most of the research conducted show close relationships of C. insculpta and members of Trionychidae family. However, some of the research show distance between C. insculpta and members of Trionychidae family. This research is conducted to analyze phylogenetic relationship between C. insculpta and other members of Testudinata using 12S rRNA, 16S rRNA, and both gene as markers. DNA samples were obtained from three different organisms of C. insculpta. Two species used as outgroups were Alligator mississippiensis and Iguana iguana. Phylogenetic analysis was carried out using Neighbor-Joining method with Felsenstein 1981 (F81) modeltest. A polytomy tree of Testudinata was produced by using 12S rRNA gene. However, analysis using 16S rRNA and both genes as markers confirmed that C. insculpta was located between the Chelonidae and the Trionychidae family.
Keyword: