Judul: Evaluasi Kesehatan Pohon Kenari (Canarium indicum L) dalam Upaya Mitigasi Risiko Pohon Tumbang di Kebun Raya Bogor
Abstrak: Pohon kenari (Canarium indicum L) di Kebun Raya Bogor sudah berumur tua (>100 tahun), memerlukan perhatian untuk mencegah terjadinya risiko tumbang. Penelitian bertujuan mengevaluasi kondisi kesehatan pohon kenari dalam upaya mitigasi risiko pohon tumbang dengan metode Forest Health Monitoring (FHM) dan sonik tomografi, serta mengetahui korelasi dari kedua metode tersebut. Metode FHM merupakan pengamatan visual terhadap kesehatan pohon menggunakan satu indikator yaitu vitalitas pohon dengan satu parameter yaitu kerusakan pohon. Metode sonik tomografi mengevaluasi kesehatan pohon dengan menguji kerusakan bagian batang pohon berdasarkan kecepatan rambatan gelombang bunyi pada bagian kayu yang diuji. Pengamatan kerusakan dilakukan pada 100 pohon kenari. Hasil pengamatan dengan metode FHM menunjukkan bahwa 59 pohon mengalami 81 kerusakan. Sebagian besar kerusakan terjadi pada lokasi 1 (akar) sebanyak 22 kerusakan, diikuti kerusakan pada lokasi 7 (cabang) sebanyak 15 kerusakan dan lokasi 2 (pangkal batang) sebanyak 12 kerusakan. Kerusakan pada lokasi 1 umumnya disebabkan oleh faktor abiotik seperti luka terbuka akibat mesin potong rumput, vandalisme pengunjung, dan gangguan kegiatan proyek. Luka tersebut memudahkan akar terserang oleh jamur pelapuk. Kerusakan pada lokasi 2 juga umumnya disebabkan oleh luka terbuka, batang pecah, brum dan konk. Kerusakan batang pecah umumnya disebabkan oleh puntiran batang karena tiupan angin atau beban cabang yang terlalu besar. Luka terbuka dan batang pecah dapat menjadi pintu masuk spora jamur pelapuk. Hal tersebut dapat dicirikan oleh timbulnya konk dan brum. Konk atau tubuh buah jamur pada ketinggian tertentu juga mencerminkan terjadinya pelapukan pada lokasi tersebut. Selain itu, pelapukan dapat diikuti oleh serangan rayap sehingga batang pohon menjadi gerowong. Batang pecah dan gerowong oleh rayap dapat berlanjut hingga lokasi 3 (batang bawah), bahkan dapat mencapai pada lokasi 4 (batang atas). Hasil pengujian dengan metode sonik tomografi menunjukkan bahwa kerusakan bagian dalam batang terjadi pada 97 pohon berkisar antara 2.0-76.1%. Untuk mengatahui korelasi kedua metode, pengamatan difokuskan pada bagian batang 130 cm dari permukaan tanah. Terdapat 35 pohon kenari yang memiliki kerusakan pada tempat yang sama yaitu pada lokasi kerusakan 1, 2, dan 3. Lokasi kerusakan 1 adalah bagian perakaran terbuka. Lokasi kerusakan 2 adalah bagian pangkal batang. Lokasi 3 adalah batang bagian bawah. Hasil pengukuran tingkat kerusakan pohon dari kedua metode tersebut dibuat analisis korelasi untuk mengetahui tingkat komplementarinya. Nilai korelasi metode FHM dan sonik tomografi pada lokasi kerusakan 1 tidak kuat (r=0.5), pada lokasi kerusakan 2 kuat (r=0.7) dan pada lokasi kerusakan 3 sangat kuat (r=0.8). Penelitian ini membuktikan bahwa kedua metode tersebut dapat digunakan dan terdapat hubungan yang saling melengkapi dalam mengevaluasi kerusakan pohon kenari.
Keyword: FHM, kawasan wisata, kerusakan pohon, sonik tomografi, tomogram

Judul: Evaluasi Kesehatan Pohon di Taman Margasatwa Ragunan Berbasis Teknologi Sonic Tomograhpy
Abstrak: Taman Margasatwa Ragunan (TMR) bukan saja merupakan kebun binatang terbesar di Indonesia, tetapi juga merupakan “oase hijau” yang sangat luas dan asri di kota metropolitan Jakarta. Lanskap kebun binatang tersebut terhampar seluas 140 hektar dan ditumbuhi sekitar 52.700 pohon yang sangat penting fungsinya, baik secara sosial, ekonomis, maupun ekologis termasuk sebagai peneduh bagi satwa peliharaan. Namun demikian keberadaan pepohonan di TMR juga memiliki risiko berupa patah cabang atau tumbangnya pohon yang mengancam keselamatan satwa, pengunjung, atau properti. Apalagi di area tersebut tumbuh pohon-pohon tua berdiameter besar (old and large trees) yang memiliki nilai ekologis dan historis yang tinggi. Oleh karena itu kesehatan pepohonan di kawasan tersebut perlu dievaluasi secara berkala. Suatu penelitian telah dilakukan untuk mengevaluasi kesehatan pohon di TMR. Pohon sasaran dipilih yang berumur tua dan lokasinya berdekatan dengan target (satwa, pengunjung, properti) sebanyak 50 pohon. Evaluasi kesehatan pohon sasaran dilakukan baik secara visual maupun menggunakan teknologi sonic tomography. Hasil penelitian menunjukkan bahwa lima pohon (10%) tergolong sehat dan tidak membahayakan, 31 pohon (62%) tergolong cukup sehat dan cukup aman, 12 pohon (24%) tergolong kurang sehat dan agak membahayakan, serta masing-masing satu pohon tidak sehat atau membahayakan dan sangat membahayakan. Cacat yang paling banyak ditemukan pada pohon sasaran adalah arsitektur pohon yang buruk (62%), masalah perakaran (58%), dan batang atau cabang kodominan (40%). Sangat penting dilakukan perawatan kondisi kesehatan pohon di TMR. Pohon dengan resiko kegagalan membahayakan atau sangat membahayakan perlu segera dilakukan tindakan berupa penebangan. Terhadap pohon miring dan memiliki batang kodominan perlu diperkuat biomekaniknya dengan bantuan slang dinamis, dan penopangan.
Keyword: evaluasi kesehatan pohon, sonic tomography, taman margasatwa ragunan

Judul: Extracellular Expression of thermostable Geobacillus stearothermophilus T1.2RQ Lipase for Biodiesel Production
Abstrak: The extracellular expression of enzymes in an excellent secretion host such as Bacillus subtilis is a useful strategy for making enzymes of industrial significance more affordable by lowering the cost of its downstream processing. Lipases are a category of hydrolases that catalyze the hydrolysis of triglycerides to glycerol and free fatty acids. Also, lipases catalyze the hydrolysis and transesterification of other esters as well as the synthesis of esters. They can perform very specific biotransformation reactions and are widely used in food, organic synthesis, detergents, cosmetic, and pharmaceutical industries. Geobacillus stearothermophilus T1.2RQ lipase is an industrially-desired thermostable lipolytic enzyme with an excellent hydrolytic and transesterification activity. This study aimed to express T1.2RQ lipase, in B. subtilis WB800 and ensure its secretion into the extracellular medium. Three signal peptides (AmyQ, Epr, LipA) and two promoters (Pgrac01 and Pgrac100) were used in the secretory-expression of T1.2RQ lipase, based on five constructed expression vectors constructed by restriction cloning and PCR mutagenesis. Sangers sequencing was used to verify constructs to ensure they are in the correct reading frame. Recombinants vectors, pHT43 (plasmid control), pHT43-T1.2RQ, pHT43- T1.2RQ_AmyQ, pHT43-T1.2RQ_Epr, and pHT43-T1.2RQ_LipA, were transformed by electroporation into Bacillus subtilis WB800. The electroporation was successful with the optimum condition of 2500V, 200 ohms, 25µF, and 5milliseconds. Recombinant B. subtilis pHT43 (negative control) and pHT43-T1.2RQlip + signal peptides were streaked on the lipidic agar, LA+TBN. All four recombinants, including the negative control (B. subtilis WB800-pHT43), produced clear zones on the TBN agar plate after overnight incubation (fig 2), indicating the presence of a lipolytic enzyme in all of the recombinant B. subtilis cells. pHT43-T1.2RQlip + signal peptides (AmyQ, Epr, and LipA) have clear zones with significantly higher diameters than B. subtilis WB800-pHT43 (negative control). This phenomenon suggests that the recombinant thermostable lipase T1.2RQ introduced into these cells was successfully expressed, thereby increasing the lipolytic capability of its host cells T1.2RQ lipase was expressed in 50ml terrific broth medium (TB) and the expression induced with 1mM IPTG. Lipase activity assay using p-nitrophenyl esters showed that all three signal peptides directed the secretion of T1.2RQ lipase into the extracellular medium. Signal peptide, LipA, resulted in the highest extracellular activity of 5.6 U/mL, which corresponds to a 6-fold increase over the parent B. subtilis WB800 strain. Meanwhile, signal peptides, AmyQ and Epr produced 4.2 U/mL and 3.4 U/mL activity respectively. SDS-Zymogram analysis confirmed that T1.2RQ lipase was correctly processed and secreted in its original size of 44 kDa. An attempt to further increase lipase expression level by promoter optimization showed that, contrary to expectation, promoter Pgrac100 exhibited similar expression levels as the original Pgrac01. Nevertheless, the demonstration of the successful secretion of T1.2RQ lipase in this work confirms the latter as a promising approach for the industrial production of the enzyme
Keyword: Bacillus subtilis, Expression, Extracellular, Heterologous, Lipase, Thermostable