Judul: Isolasi dan Identifikasi Gen Penyandi Hormon Insulin-like Growth Factor-1 (IGF-1) Secara Parsial pada Ikan Cupang Betta imbellis.
Abstrak: Betta imbellis merupakan salah satu spesies ikan cupang alam yang tengah dikembangkan di Balai Riset Budidaya Ikan Hias Depok. Hormon insulin-like growth factor-1 (IGF-1) merupakan salah satu hormon yang berperan dalam pertumbuhan ikan. Hormon IGF-1 berfungsi sebagai mediator kerja dari hormon pertumbuhan (GH) dalam mengatur pertumbuhan. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengisolasi dan mengidentifikasi gen penyandi hormon IGF-1 secara parsial pada ikan cupang B. imbellis. cDNA disintesis dari RNA total yang diisolasi dari organ hati. Amplifikasi gen dilakukan dengan menggunakan metode polymerase chain reaction (PCR) dengan primer F-IGF-1 dan R-IGF-1 yang didesain dengan menyejajarkan sekuen gen IGF-1 dari Ictalurus punctatus, Clarias batrachus, Oreochromis niloticus, Tachysurus fulvidraco, dan Danio rerio. Hasil amplifikasi PCR menunjukkan adanya pita DNA yang berukuran 280 bp dan 361 bp. Analisis nukleotida menunjukkan bahwa kedua cDNA masing-masing menyandikan 92 dan 119 residu asam amino, dan merupakan varian IGF-1 berdasarkan sekuen domain E. Sekuen cDNA tersebut memiliki bagian yang merupakan domain khas IGF-1 dan domain khas ini memiliki tingkat homologi yang tinggi terhadap gen IGF-1 ikan gurami. Analisis pohon filogenetik menunjukkan bahwa gen IGF-1 B. imbellis berada dalam grup IGF-1 ikan yang ada di pangkalan data Genbank.
Keyword: Betta imbellis, domain khas, insulin-like growth factor-1, isolasi, primer, varian

Judul: Isolasi dan Identifikasi Gen Penyandi Growth Hormone secara Parsial pada Ikan Cupang Betta imbellis
Abstrak: Betta imbellis merupakan ikan hias air tawar dengan tingkat produksi yang cukup tinggi dan masih memerlukan pengembangan dalam memproduksinya. Growth hormone (GH) merupakan salah satu hormon yang berperan dalam pengaturan pertumbuhan, sistem metabolisme, reproduksi, fungsi kekebalan tubuh, dan osmoregulasi. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengisolasi dan mengidentifikasi gen penyandi GH pada ikan cupang B. imbellis. RNA yang disintesis menjadi cDNA diisolasi dari organ otak. Hasil amplifikasi PCR menunjukkan bahwa sekuen parsial gen GH B. imbellis memiliki susunan nukleotida sebesar 460 bp yang menyandikan 153 residu asam amino. Berdasarkan analisis basa nukleotida, GH B. imbellis memiliki tingkat kesamaan yang tinggi dengan ikan Betta splendens (98%) dan Osphronemus goramy (89%). Tingkat kesamaan susunan asam amino B. imbellis juga tinggi dengan Betta splendens (98%) dan Osphronemus goramy (95%). Analisis pohon filogenetik menunjukkan bahwa gen GH B. imbellis berada pada klaster ikan Family Osphronemidae. Pengukuran pertumbuhan panjang tubuh menunjukkan bahwa nilai koefisien keragaman meningkat pada akhir dibandingkan awal pemeliharaan. Hal ini berarti bahwa terjadi ketidakseragaman pertumbuhan ikan B. imbellis.
Keyword: Betta imbellis, growth hormone, isolasi gen

Judul: Thermal Characteristics and Dynamics of Tropical Cyclone over Western North Pacific Ocean: A Case Study of Typhoon Songda (Chedeng) 2011
Abstrak: The frequent occasion of Tropical Cyclone (TC) over Western North Pacific (WNP) Ocean lies from 10˚N to 26˚N and 121˚E to 170˚E. Sources of TC development come from warm ocean temperature where latent heat is released during condensation processes and subsequently concentrated in the boundary layer. Relative humidity at 850-700 hPa is responsible to produce the most intense storm. Meanwhile, weak vertical wind shear between 850-200 hPa is one of the dynamical factors that lead to the development of TC. Pressure level of 850-200 hPa is chosen to minimize the thermodynamic effect in the lower troposphere. Typhoon Songda (Chedeng in the Philippines) or TSC lasted from May 18th to 30th, 2011 and strengthened into powerful Super Typhoon stage between May 24th and 27th. Long curving track and the exhibition of all sequences of TC life cycle, TSC is then considered as an ideal case of TC. The objective of the study with case of TSC is to investigate the role of thermal characteristics and dynamics on TC intensity. The research is carried out by using Advanced Research of Weather Research and Forecasting model (WRF ARW model) version 3.3. Two domains are employed in the model. The first domain situate from 02˚N to 40˚N and 118˚E to 149˚E and cover spatial resolution () of 33.1 km. The second domain situate from 09˚N to 27˚N and 119˚E to 132˚E with of 11 km. Timestep of the model () is 120 seconds. The model is supported by the following physical parameterization, i.e., Yonsei University Scheme (YSU) in the boundary layer, Kain-Fritsch scheme (KF) in the cumulus, and WRF Single-Moment 3-class scheme in the microphysics. Initial meteorological condition prior to the formation of the cyclone is generated using WRF ARW standard-release model. Sensitivity of the model output is obtained from a selected single-parameter change scenarios, namely, 10 % to 20 % decrease and increase of wind shear initial data at 850-200 hPa, and by 10 % to 20 % decrease of relative humidity initial data at 850-700 hPa. The result showed that the negative correlations between wind shear and intensity are found in wind shear scenarios. Wind shears of 10 ms-1 which lead to strengthening of the wind intensity in the early period of Typhoon development are found in wind shear scenarios. The effect of wind shear changes on wind intensity is statistically significant in the 20 % wind shear scenarios. During mature stage, weak wind intensity occurred when wind shear increase as given in the WRF standard-release and the 20 % decreasing scenario. Different situation is found in the 20 % increasing scenario where wind shear tend to weak and lead to strong wind intensity at this stage. Meanwhile, the reduction of moisture supply at 850-700 hPa resulting from 20 % decreasing relative humidity play a major role in the weakening of wind intensity and reduces mechanical energy of the cycle process as much as 300 J kg-1.
Keyword: