Judul: Potensi Senyawa Golongan Flavonoid Sebagai Antagonis Reseptor Estrogen Alfa (3ERT) In Silico
Abstrak: Regulasi pensinyalan reseptor estrogen-α menjadi kunci pengendalian kanker payudara dominan yang merupakan tipe positif hormon reseptor dengan menggunakan peran antagonis reseptor estrogen. Penelitian ini bertujuan mengetahui potensi senyawa golongan flavonoid subkelas flavan-3-ol dan flavon yang diprediksi memiliki peran antagonis terhadap reseptor estrogen-α. Penambatan molekuler dilakukan menggunakan Yasara Structure dengan hasil docking yang divisualisasikan melalui Discovery Studio. Jenis interaksi molekuler ligan-reseptor ditentukan melalui analisis energi bebas ikatan, konstanta disosiasi dan ikatan kimia residu asam amino. Hasil penambatan molekuler ligan uji mendapatkan 3 ligan dari subkelas flavan-3-ol yaitu katekin, epikatekin, gallokatekin dan 3 ligan dari subkelas flavon yaitu apigenin,krisin, luteolin memiliki potensi antagonis terhadap reseptor estrogen α. Namun potensi yang didapatkan dari seluruh ligan uji tidak lebih baik dari ligan alaminya yaiu 4-hidroksitamoksifen (∆G -10.0620 Kkal/mol, Kd 42116.8828) dan ligan pembanding raloksifen (∆G -10.4480 Kkal/mol, Kd 21954.0410) yang juga memiliki interaksi asam amino residu penting (Arg394, Glu353, His524). Simpulan penelitian ini menyatakan ligan dengan potensi terbaik sebagai antagonis reseptor estrogen-α dimiliki oleh epikatekin (∆G -7.9120 Kkal/mol, Kd 1586452.62 pm) dari subkelas flavan-3-ol dengan interaksi kimianya terhadap residu penting Glu353 dan His524.
Keyword: Estrogen Receptors, Flavan-3-ols, Flavones, SERMs

Judul: Penapisan Virtual Interaksi Senyawa Fenolik, Alkaloid, Dan Saponin Dengan Reseptor Estrogen Alfa
Abstrak: Osteoporosis terjadi pada keadaan ketika resorpsi tulang lebih cepat dibandingkan dengan pembentukan tulang. Hal ini dipicu oleh penurunan produksi hormon estrogen. Penggunaan estrogen sebagai pilihan untuk mengatasi osteoporosis dilaporkan memiliki kemugkinan dapat meningkatkan terjadinya kanker, sehingga penelitian untuk menemukan senyawa anti-osteoporosis yang aman perlu dilakukan. Senyawa fenolik, alkaloid, dan saponin ditemukan berlimpah dalam tumbuhan yang dapat dikonsumsi. Beberapa dari tumbuhan tersebut telah diteliti dan menunjukan aktivitas pencegahan osteoporosis. In silico bearti eksperimen dengan basis komputer yang dapat digunakan untuk menjelaskan mekanisme dari interaksi protein (misalnya antara resptor dengan ligan) dengan mekanisme penambatan yang mengidentifikasi pose pengikatan ligan dengan tepat saat ligan terikat di dalam reseptor dan untuk memprediksikan energi afinitas (ΔG) antara ligan dengan resptor. Teknik ini digunakan sebagai penghubung ke tahap analisis berikutnya dengan waktu dan biaya yang singkat untuk menemukan efektivitas dari senyawa dibandingkan dengan menggunakan teknik in vitro atau in vivo secara langsung. Penelitian ini bertujuan untuk menapis kapabilitas ikatan dari beberapa senyawa fenolik, alkaloid, dan saponin pada estrogen reseptor (ER)-α in silico menggunakan beberapa software seperti Autodock4.2, Ligplot+, dan PyMOL. AutoDock digunakan untuk memperkirakan afinitas senyawa pada reseptor dengan mengkalkulasikan nilai ΔG. Kemudian, Ligplot+ dan PyMol digunakan untuk membuat hipotesis bedasarkan visualisasi 2 dan 3 dimensi. Bahan yang digunakan pada penelitian ini adalah sebagai berikut: struktur makromolekul ER-α (1SJ0), 2 kontrol positif (17-b estradiol dan dienestrol) dan 89 ligan. Sampel ligan terdiri dari 32 senyawa fenolik, 40 senyawa alkaloid, dan 17 senyawa saponin. Hasil penelitian, terdapat beberapa ligan yang memiliki potensi esterogenik. Hal ini dapat dilihat dari nilai ΔG yang berada di bawah nilai ΔG dari kontrol positif diensterol (-9.03 Kkal/mol). Kebanyakan dari ligan terlihat menjanjikan untuk dikembangkan lebih lanjut sebagai fitoestrogen. Semua kelompok yang diuji memiliki ligan yang berpotensi antara lain pinoresinol dan matairesinol dari kelompok fenolik, jurubine, taxol, emetine dan reserpine dari kelompok alkaloid, dan cucurbitacin E, protopanaxadiol, astragaloside III, dan sarsasapogenin dari kelompok saponin. Visualisasi penambatan menunjukan bahwa nilai ΔG dipengaruhi oleh ikatan hidrogen dan interaksi hidrofobik. Bedasarkan visualisasi fenolik, residu dominan dari ikatan hidrogen biasanya terikat pada sisi yang berlawanan, yaitu posisi 2: GLU 353, LEU 387, ARG 394 — posisi 3: MET 421, GLY 521, HIS 524. Senyawa fenolik yang terikat pada posisi 2 dan 3 dengan jarak 10.78±0.65 Å dari masing-masing gugus OH umumnya memiliki potensi esterogenik. Selain itu diperlukan tahap penelitian berikutnya secara in vitro dan in vivo untuk memastikan hasil interaksi ini menghasilkan efek positif (agonist).
Keyword: Osteoporosis, Fitoestrogen, Fenolik, Saponin, Alkaloid, In silico

Judul: Diare pada anak sapi akibat infeksi virus corona bovine
Abstrak: Melihat tingginya mortalitas anak sapi yang berumur kurang dari tiga bulan di Indonesia mencapai 20 %, perlu kiranya mempelajari sebab-sebab kematiannya. Diare sering mengakibatkan kematian pada anak sapi yang baru lahir, salah satu sebab diare adalah infeksi virus Corona Bovine. Kasus diare oleh virus Corona Bovine (VCB) belum pernah dilaporkan di Indonesia, meskipun demikian kita harus was- pada terhadap sapi-sapi import. Virus Corona Bovine (VCB) mempunyai 6 karakteristik yaitu 1. Struktur permukaannya mempunyai paku-paku tegak lurus; 2. Ukuran besar 120 nm; 3. Berat jenis 1,18 gr/ml; 4. Replikasi dalam kantung sitoplasma; 5. Mempunyai inti RNA; 6. Mempunyai amplop yang mengandung lemak. VCB banyak menyerang anak sapi umur 5-21 hari dan ditularkan melalui feses, oleh hewan sakit atau hewan carier juga alat-alat yang terkontaminasi feses. Masa inkubasinya 19-24 jam dengan morbiditas dan mortalitas masing-masing mencapai 100% dan 30%, sehingga kerugian ekonomi yang disebabkan oleh infeksi VCB cukup berarti bagi suatu usaha peternakan sapi. Target organ VCB adalah villi usus halus dan usus besar, yang mengakibatkan atropy villi, malabsorpsi dan dehidratasi. ...
Keyword: