Judul: Potency of Endophytic Fungi as Biocontrol Agents of White  Root Disease on Cashew (Anacardium occidentale L.)
Abstrak: Penyakit akar putih merupakan penyakit penting pada jambu mete yang disebabkan oleh cendawan patogen Rigidoporus sp. Cendawan ini menginfeksi akar tanaman sehingga menyebabkan akar menjadi busuk. Pada tanaman dewasa yang produktif, penyakit akar putih menjadi sangat merugikan karena menurunkan hasil panen akibat berkurangnya pohon yang dapat menghasilkan. Berbagai pengendalian telah dilakukan oleh petani jambu mete, namun hasilnya belum optimal. Cendawan endofit diketahui sebagai salah satu jenis mikrob fungsional yang mampu memproduksi metabolit sekunder, baik secara langsung atau tidak langsung sehingga sangat cocok dijadikan sebagai agens pengendali hayati. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan cendawan endofit yang efektif mengendalikan penyakit akar putih pada tanaman jambu mete (Anacardium occidentale L.) dan menganalisis mekanisme kerjanya. Sebanyak lima isolat cendawan endofit yang digunakan pada penelitian ini merupakan isolat koleksi Laboratorium Mikologi Tumbuhan, Departemen Proteksi Tanaman, Fakultas Pertanian, Institut Pertanian Bogor (IPB), adapun cendawan patogen penyebab penyakit akar putih diisolasi dari akar jambu mete terinfeksi asal kebun jambu mete di Kabupaten Karangasem, Bali. Penelitian ini terdiri atas isolasi-identifikasi cendawan patogen, uji in vitro isolat cendawan endofit terhadap patogen Rigidoporus sp. (uji antibiosis dan interaksi cendawan endofit-patogen, uji produksi senyawa organik volatil antifungi, uji aktivitas kitinolitik, uji produksi IAA, dan uji kemampuan melarutkan fosfat), uji kolonisasi cendawan endofit, dan uji keefektifan cendawan endofit dalam mengendalikan cendawan akar putih pada bibit jambu mete di rumah kaca. Isolat patogen Rigidoporus sp. dan lima isolat cendawan endofit diidentifikasi secara molekuler menggunakan pasangan primer universal ITS1 (forward) dan ITS4 (reverse). Isolasi cendawan patogen dari akar jambu mete terinfeksi menghasilkan cendawan patogen yang identik dengan Rigidoporus sp. secara morfologi dan molekuler. Koloni cendawan tersebut memiliki pertumbuhan konsentris pada media PDA, berwarna putih cerah, dengan permukaan yang tampak berserat. Hifa cendawan ini hialin dan bersekat. Struktur mikroskopik lainnya yang menjadi ciri khas dari Rigidoporus sp. juga ditemukan, seperti cystidioles dan clamp connection. Kedua struktur tersebut banyak ditemukan pada bagian hifa. Penyejajaran sekuen nukleotida cendawan hasil amplifikasi dengan database di GenBank menunjukkan bahwa cendawan ini memiliki homologi terdekat sebesar 92,09% dengan Rigidoporus sp. E7081 asal Jawa dan Rigidoporus sp. E7089 asal Sumatra. Hasil uji in vitro menunjukkan bahwa lima isolat cendawan endofit berpotensi menghambat pertumbuhan Rigidoporus sp. dan memacu pertumbuhan tanaman melalui produksi senyawa organik volatil antifungi, enzim kitinase, dan asam indol asetat (IAA). Kemampuan melarutkan fosfat dimiliki empat isolat (kecuali isolat BR32C) dengan efisiensi kelarutan rendah-sedang. Isolat cendawan endofit juga mampu mengolonisasi akar bibit jambu mete dengan persentase 10- 65%. Isolat BR32C merupakan isolat terbaik dalam mengolonisasi jaringan akar, baik pada rambut akar maupun akar lateral. Perlakuan isolat cendawan endofit sebanyak 2x (satu bulan sebelum inokulasi patogen dan satu minggu setelah inokulasi patogen) dengan kerapatan konidia/askospora 105 berhasil menekan insidensi dan keparahan penyakit akar putih pada bibit jambu mete di rumah kaca. Rata-rata persentasi insidensi dan keparahan penyakit paling rendah masing-masing adalah 58,33% dan 15,62%. Isolat BR32C dan VNTB1 merupakan dua isolat dengan keefektifan pengendalian tertinggi, berturut-turut sebesar 83,52% dan 80,30%. Aplikasi cendawan endofit juga berpengaruh positif terhadap pertumbuhan tanaman. Rerata tinggi tanaman dan bobot akar yang diinokulasi lima isolat cendawan endofit lebih baik dibandingkan kontrol. Isolat BR32C teridentifikasi sebagai Trichoderma asperellum, sedangkan VNTB1 teridentifikasi
Keyword: Pengendalian hayati, enzim, mekanisme pengendalian, induksi  ketahanan tanaman

Judul: Mikrob Rizosfer Dan Endofit Jaringan Akar Tanaman Karet Sebagai Agens Hayati Penyakit Akar Putih (Rigidoporus Lignosus (Klotzsch) Imazeki)
Abstrak: Karet merupakan salah satu komoditas ekspor yang memegang peranan penting bagi perekonomian Indonesia. Penyakit akar putih yang disebabkan oleh Rigidoporus lignosus merupakan salah satu faktor pembatas dalam budidaya tanaman karet. Infeksi patogen ini dapat mengakibatkan kematian tanaman sehingga jumlah tanaman produktif berkurang. Pengendalian penyakit sulit dilakukan karena patogen bersifat tular tanah dan dapat bertahan pada tunggul dan sisa-sisa tanaman yang terinfeksi. Teknik pengendalian yang saat ini banyak digunakan adalah dengan penggunaan agens hayati. Pengendalian ini memiliki nilai lebih karena selain bersifat efektif mengendalikan patogen juga bersifat ramah lingkungan. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan agens hayati dari jaringan akar dan rizosfer tanaman karet yang memiliki potensi mengendalikan R. lignosus penyebab penyakit akar putih pada tanaman karet. Penelitian dilakukan di Laboratorium Mikologi dan Bakteriologi Departemen Proteksi Tanaman, Institut Pertanian Bogor. Metode penelitian meliputi 4 tahapan, yaitu: 1) isolasi bakteri dan cendawan dari rizosfer dan jaringan akar tanaman karet, 2) seleksi bakteri dan cendawan dengan uji patogenisitas, 3) seleksi bakteri dan cendawan secara in vitro dan in vivo, 4) karakterisasi bakteri antagonis, dan 5) identifikasi bakteri dan cendawan antagonis. Hasil isolasi mikrob dari rizosfer dan jaringan tanaman karet diperoleh 131 isolat bakteri dan 28 isolat cendawan, masing-masing terdiri atas 76 isolat bakteri rizosfer, 55 isolat bakteri dari jaringan akar, 13 isolat cendawan dari rizosfer, dan 15 isolat cendawan jaringan akar. Berdasarkan pengujian patogenisitas, sebanyak 99 isolat bakteri dan 18 isolat cendawan bersifat non patogen. Hasil pengujian secara in vitro dan in vivo diperoleh 2 isolat bakteri dan 3 isolat cendawan terbaik yang memiliki tingkat hambatan relatif lebih dari 50%. Isolat tersebut yaitu isolat bakteri rizosfer MR3, isolat bakteri endofit ME8, isolat cendawan endofit CB6, CB8, dan CL3. Hasil pengujian secara in vitro menunjukkan bahwa isolat bakteri MR3, isolat cendawan CB6, dan CB8 memiliki sifat antibiosis dengan menghasilkan senyawa antifungal. Karakterisasi bakteri antagonis menunjukkan bahwa bakteri isolat MR3 memiliki kemampuan dalam memfiksasi nitrogen dan bakteri isolat ME8 mampu melarutkan fosfat dan memfiksasi nitrogen. Isolat cendawan CB8 mampu menghasilkan senyawa volatil dengan daya hambat sebesar 13%. Kemampuan hiperparasitisme juga ditunjukkan oleh isolat cendawan CL3 dan CB8 dengan ditandai aktivitas pelilitan hifa pada pengamatan mikroskopik. Mikrob antagonis yang diisolasi dari rizosfer dan jaringan akar tanaman karet memiliki potensi dalam mengendalikan patogen R. lignosus dengan beberapa mekanisme pengendalian. Mikrob antagonis dapat mengendalikan patogen secara langsung dengan menghasilkan senyawa anti fungal maupun dengan pengendalian secara tidak langsung. Pengendalian secara tidak langsung ini dilakukan dengan cara membantu penyediaan nutrisi bagi tanaman seperti unsur P dan N. Hasil identifikasi bakteri antagonis bedasarkan runutan sebagian gen 16S rRNA menunjukkan bahwa bakteri isolat MR3 memiliki kemiripan dengan Bacillus amyloliquefaciens, sedangkan isolat ME3 memiliki kemiripan dengan B. siamensis. Hasil identifikasi cendawan berdasarkan karakter morfologi untuk isolat CB8, CB6, dan CL3 secara berurutan yaitu hifa steril CB8, Chaetomium sp., dan Penicillium sp. Informasi mengenai pengendalian efektif penyakit akar putih yang disebabkan oleh R. lignosus masih terbatas. Diharapkan penelitian yang telah dilakukan dapat melengkapi dan memberikan informasi ilmiah alternatif cara pengendalian penyakit akar putih karet dengan memanfaatkan mikrob yang bersifat agens antagonis, sehingga pengendalian secara berkelanjutan dapat diterapkan pada budi daya tanaman karet.
Keyword: antibiosis, hiperparasitisme, senyawa volatil organik

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: