Judul: In Silico Phylogenetic, Physicochemical Properties, and Structure Analysis of Phytase from Pseudomonas spp.
Abstrak: Pseudomonas sp. diketahui dapat menghasilkan tiga jenis enzim fitase berbeda yang jarang ditemukan pada bakteri lain. Fitase Pseudomonas sp. memiliki kelebihan dalam meningkatkan aktivitas katalitiknya serta mempertahankan aktivitasnya pada suhu rendah. Namun, fitase Pseudomonas belum banyak diteliti dan belum banyak dimanfaatkan dalam industri. Penelitian ini bertujuan menganalisis enzim fitase berdasarkan kekerabatan filogenetik, sifat fisikokimia, dan struktur setiap jenis enzim fitase pada berbagai spesies Pseudomonas serta mencari fitase Pseudomonas yang berpotensi untuk dikembangkan lebih lanjut. Penelitian ini menggunakan 20 fitase dari 17 spesies Pseudomonas yang didapat dari Uniport dan NCBI dengan metode berupa Neighbor Joining (NJ), Protparam, dan AlphaFold. Hasil penelitian menunjukkan bahwa ke-20 fitase ini terbagi menjadi 3 kelompok, yaitu kelompok Beta Propeller Phytase (BPP), Histidine Acid Phytase (HAP), dan 1 fitase yang belum dapat ditentukan jenisnya. Fitase-fitase tersebut juga menghasilkan struktur, sisi aktif, dan sifat fisikokimia yang berbeda-beda. Perbedaan jenis fitase didukung oleh pohon filogenetiknya, yaitu fitase HAP terletak pada cabang yang berbeda dengan fitase BPP serta jarak kekerabatan yang jauh. Kata kunci: Enzim, filogenetik, fisikokimia, fitase, Pseudomona, Pseudomonas sp. is known to produce three different types of phytase that are rarely found in other bacteria. Pseudomonas sp. phytase has the advantage of increasing its catalytic activity and maintaining its activity at low temperatures, but has not been widely studied and used in industry. This research aims to analyze phytase based on phylogenetic, physicochemical properties and structure of each type of phytase in various species of Pseudomonas and to search for Pseudomonas phytases that have the potential for further development. This research used 20 phytases from 17 Pseudomonas species obtained from Uniport and NCBI using methods such as Neighbor Joining (NJ), Protparam, and AlphaFold. The results showed that 20 phytases were divided into 3 groups. Beta Propeller Phytase (BPP), Histidine Acid Phytase (HAP), and 1 phytase that could not be determined. Phytases produce different structures, active sites and physicochemical properties. Phylogenetic tree also shows the differences of phytase. HAP phytase is located on a different branch from the BPP phytase and has a far distance of genetic relationship Keywords: Enzyme, phylogenetic, physicochemical, phytase, Pseudomonas
Keyword: Enzyme, Phylogenetic, Physicochemical, Phytase, Pseudomonas

Judul: In Silico and In Vitro Characterization and Production Optimization of Phytase Enzyme from Aspergillus niger IPB CC 93 0265
Abstrak: Asam fitat merupakan senyawa kimia yang terdiri dari inositol dan asam fosfat dan merupakan senyawa antinutrien yang terdapat pada bahan pakan unggas monogastrik yang terbuat dari tanaman serealia. Fitase merupakan enzim yang dapat menghidrolisis ikatan fosfoester pada asam fitat sehingga menghasilkan fosfat anorganik dan ester fosfat. Aspergillus merupakan salah satu genus kapang yang dapat menghasilkan fitase dan telah banyak digunakan dalam produksi fitase karena mudah dibudidayakan. A. niger, A. awamori dan A. ficuum merupakan tiga spesies Aspergillus yang menghasilkan fitase dengan struktur dan sifat fisikokimia yang paling sesuai untuk diaplikasikan pada pakan unggas serta memiliki tingkat homologi yang cukup tinggi. Penelitian terdahulu telah membuktikan bahwa kapang A. niger, A. ficuum dan A. awamori merupakan tiga spesies Aspergillus yang menghasilkan fitase dengan karakteristik fisikokimia serta struktur yang homolog dan cocok untuk diaplikasikan pada pakan secara in silico. Namun, belum dilakukan penelitian mengenai perbandingan penambatan molekuler enzim fitase dari ketiga kapang untuk menentukan spesies Aspergillus yang paling cocok. Tujuan dari penelitian ini adalah melakukan simulasi penambatan molekuler pada enzim fitase dari tiga spesies Aspergillus dengan kemiripan tertinggi serta mengoptimalkan kondisi produksi dan karakterisasi sederhana enzim fitase dari spesies Aspergillus yang mempunyai karakteristik terbaik hasil dari molekuler docking sebagai langkah pertama dalam produksi enzim fitase skala besar untuk diterapkan pada pakan unggas. Metode yang digunakan adalah pemodelan struktur dan penambatan molekuler in silico yang dikombinasikan dengan optimasi kondisi produksi secara in vitro meliputi pH, waktu inkubasi dan konsentrasi penginduksi fitase A. niger IPB CC 93 0265. Hasil docking ketiga struktur fitase menggunakan YASARA menunjukkan bahwa fitase 1QFX memiliki skor ΔG paling negatif dan skor Kd terkecil yang menunjukkan afinitas tertinggi terhadap substrat asam fitat. Fitase A. niger IPB CC 93 0265 mempunyai aktivitas spesifik tertinggi setelah produksi 4 hari dengan medium pH 7 dan induser fitat 0,5%. Kemurnian tertinggi diraih dari fraksi dialisis dengan aktivitas spesifik sebesar 0.18 U/µg, persentase yield sebesar 49.61% dan kemurnian meningkat sebesar 4.01 kali lipat dibandingkan ekstrak kasar. Nilai Km terukur 6.583 µmol serta vmaks sebesar 0.139 µmol/menit. Fitase A. niger IPB CC 93 0265 memiliki bobot molekul di rentang 25 – 37 KDa. Kesimpulan dari penelitian ini adalah diantara 3 struktur fitase yang telah dibandingkan dan di-docking dengan asam fitat, fitase 1QFX dari A. niger merupakan fitase yang paling sesuai untuk diaplikasikan pada pakan unggas setelah 4 hari produksi enzim dalam medium pH 7 dan konsentrasi fitat 0,5%., Phytic acid is a chemical compound consisting of inositol and phosphoric acid and is an antinutrient compound found in monogastric poultry feed ingredients made from cereal crops. Phytase is an enzyme that can hydrolyze phosphoester bonds in phytic acid, resulting in inorganic phosphate and phosphate esters. Aspergillus is a genus of mold that can produce phytase and has been widely used in the production of phytase because it is easily cultured. A. niger, A. awamori and A. ficuum are three Aspergillus species that produce phytase with the most suitable structure and physicochemical properties for application in poultry feed and have a fairly high level of homology. Previous research has proven that A. niger, A. ficuum and A. awamori are three Aspergillus
Keyword: Enzyme Activity, Fractionation, Hydrolysis, Phytic acid

Judul: Konsep Taman Rumah Adat Bagas Godang Berbasis Budaya Mandailing, Kabupaten Mandailing Natal, Sumatera Utara.
Abstrak: Kekayaan suatu bangsa tidak terbatas pada kekayaan sumber daya alamnya akan tetapi juga kekayaan budayanya. Taman rumah tradisional merupakan salah satu kekayaan budaya di Indonesia yang dapat menjadi identitas dari suatu budaya tersebut. Budaya Mandailing sudah dikenal sejak abad ke-14 M. Hal tersebut dibuktikan dengan penyebutan nama Mandailing di kitab Negara Kertagama, karangan Mpu Prapanca. Budaya Mandailing awalnya banyak dipengaruhi oleh kepercayaan animisme dan dinamisme yang disebut sipelebegu. Kemudian perkembangan selanjutnya budaya Mandailing bersinggungan dengan Hindu- Budha. Akan tetapi Islam membawa pengaruh yang sangat besar terhadap budaya Mandailing. Hal tersebut dibuktikan dengan adanya filosofi hombar do adat dohot ibadat yaitu adat tidak boleh bertentangan dengan agama. Dalihan Natolu merupakan konsep kekerabatan yang banyak mempengaruhi nilai-nilai kehidupan masyarakat Mandailing. Konsep Dalihan Natolu menjadi konsep dasar yang mempengaruhi pola permukiman adat Mandailing. Dalihan Natolu terdiri dari mora, anak boru, dan kahanggi. Hubungan antara ketiga komponen ini menentukan jarak antar rumah di permukiman adat. Suatu permukiman terdapat Rumah tinggal yang merupakan landmark dari berdirinya suatu permukiman. Rumah tinggal ini disebut Bagas Godang. Bagas Godang bagi masyarakat Mandailing bukan hanya sebagai rumah tinggal seorang raja atau tunggani huta. Godang bermakna sebagai rumah bagi seluruh marga di huta adat tersebut. Bagi masyarakat Mandailing raja tidak hanya berperan sebagai penguasa huta adat, akan tetapi mereka adalah orang yang dituakan yang dapat menyelesaikan berbagai masalah di permukiman adat tersebut. Komplek Bagas Godang terdiri dari Bagas Godang atau kediaman raja, Sopo Godang yaitu tempat peyimpanan instrument alat music dan musyawarah, serta biasanya memiliki Sopo Eme atau lumbung padi, serta Alaman Bolak Selangseutang merupakan halaman.
Keyword: Bagas Godang, taman vernakuler, desain taman, taman tradisional, rumah tinggal