Judul: Analisis Ekspresi Gen WRINKLED1 pada Mesokarp Buah Kelapa Sawit Tipe Dura dan Hibrida Elaeis oleifera x Elaeis guineensis
Abstrak: Kelapa sawit (Elaeis guineensis Jacq.) merupakan tanaman penghasil minyak nabati paling produktif di dunia. Permintaan minyak nabati semakin meningkat setiap tahun, hal ini mendorong industri kelapa sawit untuk melakukan penelitian dalam rangka meningkatkan produksi minyak nabati. Salah satu upaya yang dilakukan yaitu analisis ekspresi faktor transkripsi gen WRINKLED1 (WRI1) yang berperan dalam biosintesis minyak pada mesokarp buah kelapa sawit. Tujuan penelitian ini yaitu menentukan level ekspresi gen WRI1 pada kelapa sawit. RNA diisolasi dari mesokarp pada empat fase perkembangan buah. RNA dikonversi menjadi cDNA selanjutnya dianalisis menggunakan qPCR. Gen ACTIN (ACT) digunakan sebagai referensi. Analisis ekspresi gen WRI1 dilakukan pada empat fase perkembangan buah kelapa sawit tipe Dura dan hibrida Eo x Eg. Tipe Dura digunakan sebagai perwakilan tanaman yang mempunyai biosintesis minyak yang tinggi, sedangkan hibrida Eo x Eg digunakan sebagai tanaman yang mempunyai biosintesis minyak rendah. Hasil analisis menunjukkan bahwa level ekspresi pada Dura lebih tinggi dibandingkan dengan hibrida Eo x Eg. Hasil penelitian menunjukkan gen WRI1 paling banyak diekspresikan pada perkembangan umur buah 100-120 hari pada tipe Dura maupun hibrida Eo x Eg.
Keyword: Dura, gen WRI1, hibrida Eo x Eg, kelapa sawit, qPCR

Judul: Molecular Analysis of Oil Palm (Elaeis guineensis Jacq.) Flowering Associated Genes and their Potential Application in Breeding Programmes
Abstrak: Kelapa sawit (Elaeis guineensis Jacq.) adalah tanaman tropis yang digunakan dalam industri makanan, kosmetik dan bio-diesel. Tujuan utama dalam pemuliaan kelapa sawit adalah menaikan sex ratio bunga betina terhadap bunga jantan. Faktor lingkungan dan genetik mempunyai peran besar dalam produktivitas kelapa sawit. Ketersediaan air, terutuma di Afrika, dan ketersediaan kandungan kabohidrat mempengaruhi sex ratio kelapa sawit. Pemangkasan daun sawit adalah salah satu cara untuk menginduksi bunga jantan di kelapa sawit namun masih ada beberapa hal terkait efisiensi teknik tersebut, apalagi gen-gen yang berperan dalam proses ini belum diketahui. Penelitian ini bertujuan untuk menyelidiki perubahan fenotipe dan menentukan gen-gen yang terekspresi akibat pemangkasan daun sawit. Dalam disertasi ini, diberikan informasi tentang berapa jumlah faktor lingkungan yang dibutuhkan untuk menginduksi bunga jantan pada kelapa sawit secara efisien. Selain itu, diberitahukan juga berapa waktu yang dibutuhkan oleh kelapa sawit sebelum merespon terhadap stres pemangkasan daun. Informasi ini digunakan untuk pelajari ekspresi gen terkait pembungaan dalam kelapa sawit yang diakibatkan oleh stres pemangkasan daun. Data menunjukan bahwa teknik pemangkasan daun bisa menaikan produksi bunga jantan kelapa sawit sampai 104%. Teknik ini paling efisien di musim kering dan optimum saat cekaman air sama dengan 16.8 mm dalam waktu 60 hari pertama setelah pemangkasan daun. Analisis regresi menunjukan bahwa tanaman kelapa sawit akan memberikan respon terhadap cekaman kabohidrat yang diakibatkan oleh pemangkasan daun merupakan ekspresi gen dalam waktu 30 sampai 60 hari setelah pemangkasan. Kadar gula yang diambil dari jaringan bunga dan daun kelapa sawit 45 hari setelah pemangkasan menunjukan bahwa kadar gula menurun 21% di jaringan bunga dan 55% di jaringan daun dibanding kontrol. Ekspresi gen di jaringan bunga kelapa sawit mengunakan Next Generation Sequencing (NGS) menujukan bahwa mayoritas gen gen yang berperan dalam regulasi cekaman kabohidrat di kelapa sawit terletak di kloroplas dan mitokondria. Analisis fungsi menggunakan Gene Ontology, menujukan bahwa gen gen tersebut berperan dalam metabolisme kabohidrat dan fotosintesis. Analisis ko-ekspresi menujukan keterkaitan antara cekaman kabohidrat dan induksi bunga serta peran zat pertumbuhan tanaman seperti auxin, gibberellin dan jasmonic acid. Ini membuktikan bahwa gen gen dalam lintasan cekaman kabihidrat yang diakibatkan oleh pemangkasan daun berperan dalam induksi bunga di jantan tanaman kelapa sawit.
Keyword: pemangkasan daun, cekaman kabohidrat, induksi bunga, NGS, kelapa sawit

Judul: A Continuous Vaccination Strategy in the SVIR Epidemic Model
Abstrak: Vaccination is conducted to minimize the spread of a disease. The vaccination is usually done several times within a fixed time interval. In the SVIR model, it is assumed that individuals do not get immediate immunity following a vaccination program. So according to process of vaccination on SVIR model, there are two strategies, i.e. the continuous vaccination strategy (CVS) and the pulse vaccination strategy (PVS). In this study, only the CVS strategy in epidemic model SVIR is considered. Results of the study indicate that dynamics of the CVS system depends on the basic reproductive number. If the basic reproductive number is less than one, then the disease-free fixed point is asymptotically stable. It means that the disease will eventually disappear from the population. Conversely, if the basic reproductive number is greater than one, then the endemic fixed point is asymptotically stable, which means that the disease will remain exist in the population. Simulation result shows that the vaccination would minimize the spread of disease by reducing the basic reproductive number. If the time for the vaccinated recipients to obtain the immunity, as well as a possibility of vaccinated recipients to be infected are neglected, then the disease will be eradicated. This condition is called an over-evaluating effect of vaccination.
Keyword: