Judul: Ekplorasi dan Karakterisasi Rhizobium sp. dan Azotobacter sp. pada Ekosistem Gunung Papandayan, Kabupaten Garut, Jawa Barat
Abstrak: Eksplorasi keanekaragaman Rhizobium sp. dan Azotobacter sp. pada ekosistem alami seperti pegunungan belum banyak dilaporkan, seperti ekosistem alami Gunung Papandayan. Selain eksplorasi dan karakterisasi bakteri penambat N2 sebagai biakan pemula, perlu juga dilakukan uji patogenitas baik terhadap tanaman maupun binatang. Uji patogenitas tersebut penting dilakukan agar tidak merugikan terhadap lingkungan ketika bakteri tersebut digunakan. Oleh karena itu, eksplorasi, karakterisasi, dan uji patogenitas bakteri tanah penambat N2 Rhizobium sp. dan Azotobacter sp. pada wilayah Gunung Papandayan perlu dilakukan sebagai salah satu landasan untuk menggunakan bakteri tanah ini secara lebih lanjut. Hasil penelitian menunjukkan bahwa bakteri Rhizobium sp. dan Azotobacter sp. terdapat pada seluruh sampel tanah dari enam ekosistem yang dipilih. Enam sampel tersebut adalah tanah Tegal Alun, Puncak Masigit, Puncak Pasir Malang, Pondok Saladah dengan vegetasi yang beragam, Pondok Saladah dengan vegetasi cantigi, dan Kawah Mas Gunung Papandayan. Populasi tertinggi Rhizobium sp. dan Azotobacter sp. terdapat pada tanah Pondok Saladah dengan vegetasi yang beragam yaitu sebesar 1.87 x 104 SPK/gram tanah dan 2.74 x 104 SPK/gram tanah. Tanah Pondok Saladah memiliki vegetasi yang beragam seperti tanaman edelweiss, legum, alang-alang, dan paku-pakuan. Berdasarkan uji hemolisis dan uji hipersensitivitas, bakteri Rhizobium sp. dengan kode RGPT.1 (Rhizobium sp. ICBB 9823), RGPT.4 (Rhizobium sp. ICBB 9824), RGPT.5 (Rhizobium sp. ICBB 9825), serta bakteri Azotobacter sp. dengan kode AZGPT.3 (Azotobacter sp. ICBB 9826), AZGPT.4 (Azotobacter sp. ICBB 9827), dan AZGPT.5 (Azotobacter sp. ICBB 9828) tidak menunjukkan gejala patogenitas. Hasil karakterisasi bakteri menunjukkan keenam bakteri mempunyai ukuran sebesar 0,1-2 μm dan tergolong bakteri Gram negatif.
Keyword: Bakteri penambat N2, patogenitas, karakterisasi

Judul: Characterization and Identification of Nitrogen-Fixing Bacteria in Black Potato and Groundnut Rhizosphere Originated from Bangka
Abstrak: Kasus pembukaan lahan baru di Indonesia telah menjadi masalah yang serius akibat ekspansi perkebunan kelapa sawit, salah satunya terjadi di Bangka Belitung. Hal ini kemudian memberikan dampak negatif terhadap kondisi lahan perkebunan seperti berkurangnya kandungan amonium dan nitrat. Ketersediaan sumber nitrogen yang terbatas bagi tumbuhan memerlukan upaya peningkatan kembali kesuburan tanah tersebut, salah satunya dengan memanfaatkan kemampuan bakteri pemfiksasi nitrogen beserta jenis tanaman inangnya. Para petani di Bangka khususnya Desa Kemuja umumnya menggunakan tanaman kentang hitam dan kacang tanah sebagai soil health promoting plant. Kacang tanah telah banyak diteliti kemampuannya dalam memperbaiki kualitas tanah serta asosiasinya dengan bakteri penambat nitrogen, namun berbeda dengan kentang hitam. Belum ada penelitian tentang peranan kentang hitam sebagai soil health promoting plant ataupun jenis dan peranan mikrob tanah di sekitar perakarannya. Tujuan dari penelitian ini ialah memperoleh isolat-isolat bakteri penambat nitrogen (N) dari rizosfer tanaman kentang hitam dan kacang tanah di lahan perkebunan Desa Kemuja, Bangka, melakukan karakterisasi kemampuannya dalam menambat N, serta melakukan identifikasi dari isolat-isolat terpilih. Metode yang digunakan mencakup 1) pengambilan sampel tanah dan tumbuhan, 2) isolasi dan seleksi bakteri penambat nitrogen, 3) karakterisasi berdasarkan uji produksi ammonia (NH3), uji hemolisis, uji hipersensitivitas, uji sifat antagonistik antar isolat, uji deteksi gen nifH, uji acetylene reduction assay (ARA), uji pelarutan fosfat, uji produksi indole acetic acid (IAA), dan uji produksi hidrogen sianida (HCN), 4) identifikasi isolat terpilih berdasarkan gen 16S rRNA, serta 5) analisis data dan bioinformatik. Total 44 isolat bakteri berhasil diperoleh menggunakan medium N-free dari sampel tanah dan yeast mannitol agar dari sampel bintil akar dan umbi kentang. Tidak ada perbedaan yang nyata terhadap jumlah rata-rata populasi bakteri pada lokasi A dan B namun jumlah populasi bakteri pada rizosfer lebih tinggi dibandingkan tanah kontrol. Indeks Shannon dan inverse Simpson menunjukkan bahwa keanekaragaman bakteri pada rizosfer kacang tanah lebih tinggi dibandingkan rizosfer kentang hitam. Dari total isolat bakteri yang diperoleh, BK1043, BK1042, dan AT1043 mampu menghasilkan NH3, tidak bersifat patogen bagi manusia dan tanaman, serta tidak memiliki sifat antagonis satu dengan yang lain. Berdasarkan deteksi gen nifH dan uji ARA, BK1043 dan AT1043 merupakan bakteri diazotrof. Selain itu, ketiga isolat mampu mensekresikan IAA serta HCN kecuali BK1043. Identifikasi gen 16S rRNA, secara berurutan menunjukkan bahwa isolat BK1043, BK1042, dan AT1043 merupakan bakteri Paenibacillus alginolyticus, Burkholderia cepacia, dan Arthrobacter enclensis. Kata kunci: Bakteri diazotrof, gen 16S rRNA, nifH, rizosfer
Keyword: Bakteri diazotrof, gen 16S rRNA, nifH, rizosfer

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: