Judul: Keragaman Genetik Kelapa Sawit Asal Nigeria dan Asosiasi Marka Mikrosatelit (SSR) dengan karakter Virescens
Abstrak: Kelapa sawit merupakan tanaman penghasil minyak sayur utama dunia. Sempitnya sumber genetik kelapa sawit yang tersedia di Indonesia menyebabkan keterbatasan dalam pengembangan program pemuliaan. Salah satu cara untuk memperluas sumber genetik adalah menggunakan populasi introduksi. Hasil eksplorasi dan pemuliaan populasi Nigeria menunjukkan beberapa keunggulan dalam karakter komersial kelapa sawit. Program pemuliaan kelapa sawit memiliki beberapa tujuan yaitu meningkatkan hasil dengan berbasiskan area tanam, meningkatkan kualitas minyak, memperlambat laju penambahan tinggi tanaman, dan mengembangkan varietas yang resisten terhadap berbagai hama dan penyakit. Karakter-karakter minor yang mendukung kualitas panen mulai diperhitungkan dalam perakitan varietas. Karakter warna buah seperti karakter Virescens (Vir) dapat digunakan sebagai indikator kematangan buah pada tandan kelapa sawit. Perbedaan warna buah Vir yang kontras antara buah mentah dan masak dapat memudahkan dan mempersingkat waktu yang dibutuhkan untuk panen tanpa harus memungut buah yang jatuh. Studi ini bertujuan untuk: (1) evaluasi keragaman genetik kelapa sawit famili DP-E; (2) mencari marka yang berasosiasi dengan karakter Virescens. Beberapa marka SSR yang memiliki alel spesifik Pisifera dan Dura diperoleh dari hasil seleksi dari 105 marka SSR. Analisis keragaman genetik famili DP-E berdasarkan 25 marka SSR menunjukkan keragaman yang masih tinggi. Estimasi struktur populasi famili DP-E juga memperlihatkan adanya rekombinasi yang tinggi pada individu progeni. Resolusi peta pautan genetik yang diperoleh dalam studi ini mencakup empat kelompok pautan (KP) dengan total cakupan peta genetik 213.1 cM. Lokus SSR mEgCIR3376 diperoleh sebagai kandidat marka yang terpaut pada karakter Virescens dengan jarak genetik 27.7 cM pada posisi Linkage Group 8. Pengujian marka pada empat populasi verifikasi memberikan hasil yang belum stabil. Individu progeni famili DP-E yang memiliki karakter hasil tinggi, unggul dan Virescens dapat dipilih untuk dilanjutkan ke siklus pemuliaan berikutnya. Marka SSR mEgCIR3376 dapat digunakan sebagai alat bantu pada populasi tetua atau populasi pemuliaan untuk seleksi tanaman yang Virescens dengan persentase keterpautan 72.3%. Eksplorasi marka yang lebih dekat dengan karakter Virescens dapat dilakukan dengan memilih marka-marka SSR yang spesifik terdapat pada LG 8.
Keyword: asosiasi marka, kelapa sawit, keragaman genetik, SSR, virescens

Judul: Analisis filogenetik kelapa sawit (Elaeis guineensis Jacq) menggunakan marka simple sequence repeat
Abstrak: Produktivitas kelapa sawit dapat ditingkatkan dengan pemuliaan tanaman. Studi kekerabatan dengan marka SSR membantu dalam pemilihan tetua untuk program pemuliaan. Persilangan kelapa sawit dengan jarak genetik jauh dapat menghasilkan keturunan superior berpotensi menjadi kandidat varietas unggul kelapa sawit. Penelitian ini bertujuan menganalisis kekerabatan beberapa aksesi kelapa sawit dan mendapatkan primer SSR dengan tingkat polimorfisme tinggi sehingga dapat digunakan untuk analisis filogenetik. Empat puluh sembilan aksesi kelapa sawit dianalisis menggunakan 20 marka SSR. Marka SSR dipilih berdasarkan tingkat polimorfime dan penyebarannya pada tiap 16 kromosom kelapa sawit. Dendogram dibuat berdasarkan metode Unweighted Pair Group Method Arithmetic (UPGMA) dengan menggunakan software NTSYS-pc (Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System) versi 2.1. Tiga puluh sembilan pasang primer memiliki tingkat polimorfisme pada kisaran 32%-92%. Tingkat kekerabatan dari 49 aksesi kelapa sawit yang dianalisis dengan 20 marka SSR berada pada kisaran 55.28%-87.50%. Nilai koefisien kemiripan genetik sebesar 55.28% dapat membagi populasi kelapa sawit menjadi tujuh kelompok masing-masing terdiri atas 9, 28, 4, 2, 1, 2, dan 3 aksesi. Berdasarkan nilai koefisien kemiripan genetik, dapat dilakukan pemilihan calon tetua untuk pemuliaan kelapa sawit. Kata kunci: keragaman genetik, marka SSR, kelapa sawit.
Keyword: Genetic diversity, SSR markers, Oil palm

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: