Judul: Struktur sebaran spasial dan asosiasi komunitas makrozoobentos pada ekosistem Padang lamun di Perairan Teluk Banten, Kabupaten Serang, Jawa Barat
Abstrak: Ekosistem perairan pesisir dan laut adalah suatu lingkungan perairan yang menjadi tempat berlangsungnya hubungan timbal balik antara jasad hidup (komponen biotik) dengan lingkungan fisik perairan (komponen abiotik), dan antar komponen biotik itu sendiri (Odum, 1971). Organisme makrozoobentos merupakan salah satu organisme akuatik yang hidup di dasar perairan, yang kehidupannya dipengaruhi oleh keadaan habitat dan kondisi lingkungan perairan. Sebagai habitat, ekosistem padang lamun mendukung kehidupan makrozoobentos dengan memberikan tempat menempel, naungan dan mencari makan. Keberadaan padang lamun dapat mempengaruhi struktur dan penyebaran makrozoobentos, karena fungsinya sebagai sumber nutrien yang potensial bagi organisme yang berasosiasi. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui struktur, sebaran spasial dan asosiasi komunitas makrozoobentos yang terdapat pada ekosistem padang lamun. Penelitian dilaksanakan pada tanggal 425 Nopember 1995, bertempat di perairan Teluk Banten. Kab. Serang, Jawa Barat. Lokasi penelitian dibagi 4 stasiun pengamatan, yang masing-masing terletak di Teluk Grenyang, Margagiri, Pulau Tarahan dan Sekantung. Pengambilan contoh makrozoobentos dilakukan pada suatu hamparan lamun dengan menggunakan metode survey kombinasi, antara metode transek garis dan metode kuadrat. Plot kuadrat yang digunakan berukuran 1 x 1 meter. Pengamatan yang dilakukan meliputi parameter: fisika-kimia perairan (suhu, kecerahan, kedalaman, pH, salinitas, DO, nitrat, fosfat dan amonia), fisika-kimia sedimen (tekstur, pH dan c-organik) serta parameter biologi (makrozoobentos dan padang lamun). Dari pengamatan diperoleh kisaran hasil pengukuran sebagai berikut: suhu 29,9-32,4 °C, kecerahan 35,4-117,5 cm, kedalaman 39,0-128,0 cm, pH air 6,5-7,8, pH sedimen 7,52-8, 12, salinitas 32,3-35,000, DO 6,02-9,79 mg/l, nitrat 0,01-0,12 mg/l, amonia 0,01-0,04 mg/l, ortofosfat 0,003-0,034 mg/l dan c-organik 0,40-2,25 %. Sebaran spasial kualitas perairan berdasarkan Analisis Komponen Utama (PCA), menjelaskan pada stasiun I (Teluk Grenyang) sebaran parameter relatif merata, stasiun II (Margagiri) dicirikan dengan tingkat kecerahan dan kedalaman yang rendah, stasiun III (Tarahan) dicirikan dengan salinitas yang tinggi, dan stasiun IV (Sekantung) dicirikan dengan nilai suhu, DO, c-organik, ortofosfat dan nitrat yang tinggi. ...
Keyword: 

Judul: Variasi Spasial dan Temporal Struktur Komunitas Makrozoobentos di Daerah Estuari Pantai Mayangan, Jawa Barat.
Abstrak: Ekosistem Pantai Mayangan yang dicirikan oleh keberadaan daerah estuari merupakan suatu kawasan yang subur karena mendapat masukan bahan organik dari sungai maupun dari hasil pendaurulangan serasah mangrove yang tumbuh di sekitar Pantai Mayangan, sehingga daerah ini memiliki produktivitas yang tinggi dan mendukung kelangsungan hidup beragam biota akuatik, akan tetapi kondisi lingkungannya rentan mengalami gangguan baik dari kegiatan antropogenik maupun secara alamiah. Biota makrozoobentos mampu memberikan gambaran kondisi ekologis suatu habitat karena hewan ini hidup relatif menetap di dasar perairan atau hidup di dasar endapan (substrat) sehingga secara langsung dapat terpapar oleh bahan organik yang masuk ke dalam suatu perairan. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kondisi ekologis Pantai Mayangan lewat deskripsi indeks keanekaragaman, indeks keseragaman dan indeks dominansi makrozoobentos serta membandingkan secara spasial dan temporal; mendeskripsikan kondisi fisika-kimia air dan sedimen sebagai indikator kondisi perairan Pantai Mayangan; serta mengetahui hubungan antara komunitas makrozoobentos dengan parameter fisikakimia air dan sedimen dasar perairan. Penelitian ini dilaksanakan dari Mei-Oktober 2011 dengan interval pengambilan sampel satu kali dalam satu bulan. Lokasi penelitian terdiri atas delapan stasiun yang ditentukan berdasarkan keterwakilan lokasi yang ada di Pantai Mayangan. Parameter fisika-kimia yang dikaji meliputi kedalaman, kecerahan, suhu, salinitas, oksigen terlarut (DO) dan pH. Analisis parameter fisika-kimia perairan dilakukan in situ sedangkan analisis C-organik dan tekstur substrat dilakukan di Laboratorium Rutin Ilmu Tanah, Departemen Ilmu Tanah, Fakultas Pertanian, IPB. Identifikasi biota makrozoobentos dilakukan di Laboratorium Biologi Makro Satu dan Biologi Mikro, Departemen Manajemen Sumber Daya Perairan, FPIK, IPB. Analisis data yang digunakan meliputi analisis struktur komunitas, pengelompokan stasiun, analisis kanonikal korespondensi/canonical correspondence analysis (CCA) serta uji parametrik analisis ragam satu arah (ANOVA) dan uji non-parametrik Kruskal Wallis. Makrozoobentos yang ditemukan selama penelitian terdiri atas 41 genera yang termasuk ke dalam 32 famili, 14 ordo dan lima kelas. Kelompok famili Paratanaidae, kelas Malacostraca merupakan jenis makrozoobentos yang paling banyak ditemukan. Secara keseluruhan, kelompok tipe makan yang paling banyak ditemukan adalah detritus feeder, deposit feeder, shredders dan lainnya (gabungan dari beberapa kelompok tipe makan suspension feeder, gathering collector, carnivorous dan omnivorous). Kepadatan jenis tertinggi ditemukan di stasiun VII pada Mei, Juni, Juli, Agustus dan Oktober; sedangkan pada September kepadatan tertinggi ditemukan di stasiun VI dengan nilai kepadatan secara berurutan adalah 2622 Ind./m2, 2733 Ind./m2, 5267 Ind./m2, 4889 Ind./m2, 3800 Ind./m2, 2156 Ind./m2. Kepadatan jenis tertinggi dimiliki oleh Leptochelia sp. dari kelas Malacostraca. Karakteristik lingkungan perairan pada delapan lokasi penelitian di Pantai Mayangan selama enam bulan pengambilan sampel dengan kedalaman yang berkisar antara 0,5-5,5 m, suhu antara 27-35 oC, kecerahan antara 0,20-1,21 m, salinitas antara 22‰-39‰, DO antara 1,60-7,6 mg/l, pH antara 6-8,5, kisaran persentase C-organik pada Mei berkisar antara 0,24%-5,19% dan pada Oktober berkisar antara 0,32%-6,54%. Secara keseluruhan, stasiun I dan II memiliki tekstur substrat pasir dan lumpur liat, stasiun III dan IV memiliki tekstur substrat pasir, stasiun V dan VI memiliki tektur substrat yang seimbang antara pasir, debu dan liat; sedangkan stasiun VII dan VIII memiliki tekstur substrat lumpur debu dan liat. Biota makrozoobentos yang paling banyak ditemukan di stasiun VI, VII dan VIII yaitu Leptochelia sp; sementara di stasiun I sampai V lebih banyak ditemukan jenis Polychaeta. Bivalvia banyak ditemukan pada
Keyword: 

Judul: Pemurnian dan karakterisasi protein inhibitor RNA helikase virus hepatitis C
Abstrak: Hepatitis C virus (HCV) infection is the second most common chronic viral infection in the world with global prevalence. This infection is contribution to chronic hepatitis and liver cirrhosis, often leading to hepatocellular carcinoma. There is no effective drug and vaccine available against HCV. The current standard treatment, a combination of pegylated interferon-α with ribavirin, is limited by its suboptimal response rate in a significant patient population, side effects, and affordability. Therefore, development of effective drug is needed. One approach to find out the candidate of antiviral drug is to discover the inhibitor of enzyme that essential for virus replication, such as RNA helicase. Streptomyces chartreusis 5-095 produce the inhibitor of HCV RNA helicase. The aim of this study was to purify the protein inhibitor which has inhibition activity against ATPase activity of RNA helicase HCV from S. chartreusis 5-095. The supernatant of culture S. chartreusis 5-095 exhibited high inhibiton activity against ATPase activity of RNA helicase HCV (approximately 72%) at 10 days of incubation. The extracellular protein inhibitor was partially purified by procedures of precipitation with ammonium sulfate to 65% saturation and gel filtration (Sephadex G50) using methanol water solution (4:6) as an eluen. The purity of protein inhibitor was monitored by SDS PAGE. The protein inhibitor showed a relative molecular mass were estimated to be 14 kDa and increased the purity 23,08 fold than those of the crude protein. The specific activity and IC50 after purification were 13,1338 U/mg and 0,0767 mg/mL, respectively. The activity of purified protein inhibitor showed its stability over pH range from 5-8 and optimum at pH 7,4. The inhibition activity showed its stability up to 70% at temperature 100 oC. The purified protein inhibitor relatively stable its activity at storage in the range of -20 oC to room temperature for 35 days.
Keyword: