Judul: Isolasi dan Identifikasi Sekuen Parsial Gen Penyandi Enzim Histone Acetyltransferase-like pada Ikan Gurami Osphronemus goramy
Abstrak: Ikan gurami merupakan salah satu komoditas budidaya air tawar di Indonesia. Ikan gurami berpotensi untuk dijadikan ikan model pada studi mengenai dampak rekayasa budidaya terhadap perkembangan benih dan larva. Gen penyandi enzim histone acetyltransferase (HATs) berperan dalam proses regulasi ekspresi gen. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengisolasi dan mengidentifikasi sekuen parsial gen penyandi enzim histone acetyltransferase-like pada ikan gurami. RNA total diekstraksi dari organ hati ikan gurami. Primer degenerate oligonukleotida diperoleh dengan menyejajarkan sekuen gen ikan takifugu Takifugu rubripes, ikan sebelah Paralichthys olivaceus dan ikan salmon Atlantik Salmo salar menggunakan perangkat lunak Bioedit v7.2. Dari analisis sekuensing diperoleh susunan nukleotida berukuran 537 bp yang menyandikan 132 residu asam amino. Analisis sekuen dengan BLAST® menunjukkan sekuen gen yang berhasil diisolasi memiliki kesamaan dengan gen penyandi enzim HATs-like kakap putih Lates calcarifer, ikan nila Oreochromis niloticus dan ikan salmon silver Oncorhynchus kisutch dengan persentase kesamaan berkisar antara 91‒99%. Analisis pohon filogenetik menunjukkan bahwa sekuen gen parsial yang diisolasi tersebut berada dalam kelompok teleost dengan nilai bootstrap 64%, terpisah dengan kelompok mamalia dengan nilai bootstrap 100%. Hasil ini membuktikan bahwa gen yang diisolasi merupakan gen penyandi enzim HAT-like.
Keyword: Histone acetyltransferase, isolasi gen, Osphronemus goramy

Judul: Isolasi dan Karakterisasi Sekuen Parsial Gen Penyandi Glucose Transporter 1 pada Ikan Gurami Osphronemus goramy
Abstrak: Ikan gurami merupakan ikan herbivora asli Indonesia dan mampu memanfaatkan karbohidrat dengan baik. Evaluasi terhadap kemampuan pencernaan karbohidrat pada ikan dapat dilakukan dengan memanfaatkan gen-gen yang berperan dalam proses metabolisme karbohidrat. Glucose transporter 1 merupakan salah satu gen yang berperan aktif dalam proses metabolisme karbohidrat pada ikan. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengisolasi dan mengkarakterisasi sekuen gen penyandi glucose transporter 1 dari ikan gurami Osphronemus goramy. Isolasi gen glucose transporter 1 dilakukan pada cDNA yang berasal dari organ hati. Hasil isolasi sekuen parsial gen glucose transporter 1 pada ikan gurami, diperoleh susunan nukleotida yang diperoleh sepanjang 434 bp. Analisis basa nukleotida dengan fasilitas BLAST® pada NCBI menunjukkan susunan nukleotida gen glucose transporter 1 ikan gurami memiliki kesamaan yang tinggi dengan gen glucose transporter 1 ikan kerapu muara Amphiprion ocellaris (91%) dan ikan mas Cyprinus carpio (85%). Pada susunan asam amino, gen glucose transporter 1 ikan gurami memiliki kesamaan yang tinggi dengan ikan kerapu muara Epinephelus coioides (95%) dan ikan zebra Danio rerio (90%). Analisis domain protein dilakukan untuk menunjukkan domain protein khas pada sekuen gen glucose transporter 1 ikan gurami. Hasil analisis menunjukkan adanya famili dari domain major facilitator superfamily (MFS) pada susunan nukleotida yang diperoleh, yaitu sugar transporter. Analisis pohon filogenetik terhadap gen glucose transporter 1 ikan gurami diperoleh bahwa jarak genetik gen glucose transporter 1 ikan gurami dari spesies ikan lainnya bernilai 0,0180.
Keyword: Glucose transporter 1, isolasi gen, Osphronemus goramy

Judul: Tinjauan Matematis pada Model Makroskopik dan Mikroskopik Arus Lalu-lintas
Abstrak: Traffic flow phenomenon can be described through mathematical model such as continuous dynamic model with an ordinary differential equation so that it can be solved with integral factors. In this paper three simple models of traffic flow are discussed, i.e, two macroscopic and one microscopic models. Macroscopic model formulates dynamics of the traffic flow that occurs on a large number of vehicles on a road. While the microscopic model explains drivers’ behavior in their interaction with other vehicles ahead, i.e, car-following model. This paper shows the existence of ordinary differential equation found in the traffic flow model and indicates some different representations in the context of the same model. It also reviews a simple model of traffic flow along a single link, which leads to some unexpected results, i.e, it can express the solution model in term of link outflows as well as trip time. In the microscopic model, simulation is done to illustrate the behavior of the drivers with a sensitivity coefficient as a benchmark parameter.
Keyword: