Judul: Optimasi Kloning dan Identifikasi Gen Penyandi Tripsin Inhibitor dan -Amilase Inhibitor pada Tanaman Sengon (Falcataria moluccana Miq.)
Abstrak: Sengon (Falcataria moluccana) adalah tanaman cepat tumbuh yang banyak digunakan terutama pada hutan rakyat. Namun, peningkatan tren penggunaan sengon menyebabkan ledakan hama, salah satunya adalah penggerek batang boktor (Xystrocera festiva). Larva boktor menghasilkan enzim -amilase dan tripsin dalam sistem pencernaannya untuk mencerna kulit dan kayu gubal sengon. Beberapa aksesi sengon resisten menunjukkan aktivitas inhibitor tehadap enzim -amilase dan tripsin yang merupakan aspek penting dari program pemuliaan pohon sengon. Pendeteksian gen ketahanan dapat dilakukan dengan pembuatan pustaka genomik melalui metode shotgun cloning dan kloning gen spesifik. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengoptimasi penyiapan bahan kloning dan metode pembuatan pustaka genom serta kloning gen tripsin inhibitor dan -amilase inhibitor pada sengon. Sekuen gen tripsin inhibitor sengon didapatkan berukuran dari 107 bp hingga 308 bp dan memiliki kesamaan dengan Tamarindus indica, Glycine max, Populus trichocarpa dan Populus nigra. Sekuens gen -amilase inhibitor didapatkan berukuran 447 bp dan memiliki kesamaan dengan Phaseolus vulgaris. Namun, sekuens TI dan AAI tersebut masih memiliki nilai E yang rendah.
Keyword: tripsin inhibitor, -amilase inhibitor, F.moluccana, X. festiva

Judul: Seleksi dan Optimasi Primer Spesifik Penyandi Gen Tripsin Inhibitor dan Aktin sebagai Marka Molekuler Ketahanan Hama pada Sengon (Falcataria moluccana).
Abstrak: Sengon (F. moluccana) merupakan salah satu pohon yang dikelompokan sebagai pohon yang memiki banyak fungsi, mudah ditanam, cepat tumbuh, serta bernilai ekonomis. Sifat-sifat tersebut menjadikan sengon banyak dibudidayakan di masyarakat. Namun, adanya serangan hama penggerek batang atau boktor (Xystrocera festiva) menyebabkan kerugian besar dalam pembudidayaannya. Penelitian ini bertujuan mendapatkan marka molekuler yang berbasis gen ketahanan dalam upaya pengendalian serangan boktor, yakni gen tripsin inhibitor (TI). Perancangan primer spesifik yang dilakukan menghasilkan lima kandidat primer TI dan empat kandidat primer aktin. DNA sengon berhasil diisolasi pada penelitian ini. Hasil amplifikasi menunjukkan hanya primer AcTI, TaACT, dan AcACT yang menghasilkan amplikon sesuai ukuran target. Analisis homologi pada ketiga amplikon tersebut memiliki tingkat kesamaan yang cukup tinggi terhadap gen penyandi TI dan aktin lainnya di database. Selain itu, ketiga sekuen amplikon tersebut juga menunjukkan adanya prediksi daerah conserved domain. Gen TI nantinya akan dideteksi ekspresinya dengan Real-Time PCR, menggunakan gen aktin sebagai kontrol.
Keyword: aktin, boktor, F. moluccana, primer spesifik, tripsin inhibitor

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: