Judul: Tingkah laku ikan kepe-kepe Chelmon rostratus terhadap variasi spektrum cahaya
Abstrak: Reaksi ikan terhadap cahaya secara teoritis dikemukakan berbeda-beda, seperti fototaxis positif, preferensi untuk intensitas cahaya optimum, investigatory reflex, untuk mengelompok dan makan di bawah cahaya, serta disorientasi sebagai akibat kondisi buatan dari gradient intensitas cahaya di bawah air. Sifat dari jenis ikan karang adalah soliter dengan memanfaatkan habitat karang untuk berlindung. mengakibatkan cara-cara penangkapan yang dilakukan sering berakibat pada kerusakan ekosistem habitatnya. Untuk itu perlu diupayakan cara-cara penangkapan yang tidak merusak perairan karang. Penggunaan cahaya untuk beberapa jenis ikan telah menjadi salah satu metoda yang paling berhasil dan maju untuk mengontrol ikan pada proses penangkapan. Penelitian ini telah dilaksanakan sejak Agustus 2005 sampai Oktober 2005. Untuk menentukan respon tingkah laku ikan kepe-kepe sumpit lorek/monyong (Chelmon rostratus) terhadap variasi spektrum cahaya dalam penelitian ini ditentukan respon ikan terhadap spektrum cahaya merah, kuning, hijau, biru dan putih dengan iluminasasi cahaya 50 luks dan dengan lama waktu pencahayaan 5, 15, 30, 60 menit. Aspek pertama meliputi tingkah laku ikan dan aspek ke dua tingkat adaptasi retina ikan terhadap variasi spektrum cahaya. Respon tingkah laku ikan kepe-kepe terhadap variasi spektrum cahaya dan lama waktu penyinaran, melalui analisis deskriptif terhadap respon tingkah laku ikan seperti ketertarikan ikan dengan variasi spektrum cahaya (merah, kuning. hijau, biru dan putih) dan lama waktu penyinaran selama 60 menit, menunjukkan bahwa ikan kepe-kepe lebih tertarik pada spektrum cahaya putih, kemudian biru dan hijau tetapi kurang menyukai spektrum cahaya merah. Adaptasi retina ikan kepe-kepe melalui analisis histologi dan analisis persentase indeks kone terhadap variasi spektrum cahaya (kuning, hijau, biru dan putih) dengan lama waktu penyinaran 5, 15, 30 dan 60 menit menunjukkan bahwa rata-rata indeks kone beradaptasi penuh > 90%, pada penyinaran 60 menit. Semakin lama waktu penyinaran maka semakin meningkat persentase indeks kone. Pada spektrum cahaya merah terjadi peningkatan indeks kone yang lambat dan hanya mencapai 61,90% setelah penyinaran selama 60 menit. Ikan kepe-kepe (Chelmon rostratus) lebih menyukai spektrum warna putih dan menghindari spektrum warna merah. Rata-rata tingkat adaptasi retina ikan telah mencapai tingkat full adapted pada menit ke 60 pada spektrum putih, biru, kuning dan hijau.
Keyword: Light spectrum, Coral reef

Judul: Respons Tingkah Laku Ikan Selar Kuning (Selaroides leptolepsis) terhadap Intensitas Cahaya Lampu Putih dan Biru
Abstrak: Ikan selar merupakan salah satu jenis ikan pelagis yang cukup potensial di Indonesia. Nelayan banyak menangkap ikan selar dengan metode light fishing yang hingga saat ini masih terus dikembangkan teknologinya. Penggunaan cahaya tidak dapat terlepas dari sifat fototaksis positif yang dimiliki ikan. Peranan retina pada mata ikan menjadi penting untuk mengetahui kemampuan adaptasi ikan, sehingga diperlukan penelitian yang lebih banyak mengenai adaptasi retina mata ikan pada ikan hasil tangkapan light fishing guna menunjang pengembangan teknologi penangkapan. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis tingkah laku ikan selar kuning (Selaroides leptolepsis) terhadap warna cahaya dan intensitas yang berbeda, menentukan adaptasi mata ikan selar (Selaroides leptolepsis) terhadap cahaya lampu, menentukan intensitas cahaya yang menjadi preferensi ikan selar kuning (Selaroides leptolepsis). Penelitian dilakukan di Laboratorium Tingkah Laku Ikan, Sekolah Tinggi Perikanan, Banten dan Laboratorium Kesehatan Ikan, Departemen Budidaya Perikanan, IPB untuk pengamatan retina mata ikan melalui metode histologi sehingga dapat dilihat rasio penjuluran sel kon mata ikan pada setiap intensitas cahaya, yaitu 10 lux, 20 lux, 35 lux dan 50 lux dengan dua warna cahaya, yaitu putih dan biru. Hasil penelitian menunjukkan bahwa ikan selar kuning memiliki pola tingkah laku yang hampir sama di setiap perlakuan cahaya putih dan biru dengan intensitas berbeda. Pola yang dibentuk setelah ikan mengelilingi sumber cahaya kemudian menyebar setelah mencapai titik jenuh. Ikan selar kuning sensitif terhadap warna cahaya putih dan biru pada hampir semua intensitas yang diujicobakan dengan kisaran penjuluran sel kon antara 79%-90%. Ikan selar kuning lebih cepat bereaksi pada cahaya dengan iluminasi rendah karena penjuluran ikan lebih maksimal terjadi pada pemaparan 10 lux hingga 35 lux.
Keyword: adaptasi, ikan selar kuning, light fishing, retina

Judul: Penyusunan Overlap Graph menggunakan Suffix Tree pada DNA Sequence
Abstrak: The DNA sequence assembly is very important in genome analysis. This step aims to reconstruct contigous DNA fragment (contigs) from short fragment by concatenating fragments based on the overlap region among them. This method employs overlap graph for solving the problems. In this graph, nodes represent fragments and edges represent overlap. This research developed a software for constructing overlap graph using suffix tree. The evaluation was conducted by measuring the number of nodes, number of edges, and the execution time in many values of minimum overlap. The minimum overlap is defined as the minimum length of substring which is considered as the overlap region between two fragments. The evaluation results showed that the number of nodes, the number of edges, and the execution time were increased with the decreasing of the minimum overlap value.
Keyword: