Judul: Analisis keseragaman genetik tanaman teh (Camellia Sinensis (l) o. Kuntze) asal kultur jaringan, setek, dan biji dengan teknik RAPD
Abstrak: Kultur jaringan melalui induksi tunas aksiler dan penggandaan embrio somatik dikembangkan sebagai eara perbanyakan tanaman teh dalam jumlah yang banyak dengan waktu yang cepat dan tingkat keseragaman yang tinggi. Analisis terhadap variasi somaklonal yang terjadi pada tanaman kultur jaringan merupakan salah satu upaya konservasi tanaman. RAPD (random amplified polymorphic DNA) memanfaatkan kemampuan nukleotida dari suatu primer acak dengan nukleotida pada DNA cetakan yang mengandung basa komplemennya sering digunakan untuk menganalisis tingkat keseragaman genetik. RAPD menggunakan mesin peR (polymerase chain reaction), yaitu alat amplifikasi DNA yang dapat diatur suhunya untuk terjadinya proses sintesis DNA seperti denaturasi DNA, penempelan primer, dan pemanjangan primer. Dalam analisis ini digunakan 8 primer hasil seleksi. yaitu OPA 1. OPA 2. OPA 3. OPA 7, OPA 8, OPB I, OPB 3, dan OPB 7. Sctiap primer menghasilkan pola pita yang spesifik sehingga keseragaman tanaman dapat dilihat dari pola amplifikasi oleh primer tertentu. Primer OPA 8 dan OPB 3 memberikan pita polimorfik yang tinggi sehingga penentuan seragam tidaknya genetik suatu populasi dapat lebih mudah diamati Berdasarkan perbandingan pola pita amplifikasi, kesamaan genetik dihitung dengan menggunakan koefisien Dice. Hasil penelitian menunjukkan tingkat keseragaman genetik rata-rata taRaman teh asal embrio somatik paling tinggi, yaitu sebesar 890/0, diikuti tanaman asal setek dengan tingkat keseragaman genetik rata-rata sebesar 77%, sedangkan tingkat keseragaman genetik rata-rata tanaman teh asal biji sarna dengan tunas wiler sebesar 64%. Ketidakseragaman pada tanaman kultur jaringan khususnya tunas wiler ini dapat disebabkan oleh siklus pengkulturan yang panjang dan tidak teratur, mutasi karena penyerapan zat pengatur tumbuh tertentu pada
Keyword: 

Judul: Analisis sebaran genetik hasil persilangan tanaman karet RRIM 600 dan PN 1546 menggunakan teknik RAPD
Abstrak: Siklus pemuliaan tanaman karet (Hevea brasiliensis Muell Arg.) yang membutuhkan waktu 25-30 tahun merupakan permasalahan dalam perakitan klon unggul karet. Deteksi dini klon unggulan karet dibutuhkan untuk menyelesaikan permasalahan ini, salah satunya dapat diatasi dengan memanfaatkan teknik random amplified polymorphic DNA (RAPD) yang merupakan salah satu jenis penanda molekuler DNA. Teknik RAPD dapat digunakan untuk melihat keragaman genetik melalui deteksi pola polimorfisme ruas nukleotida. Penelitian ini bertujuan untuk melihat keragaman genetik tanaman karet hasil persilangan jauh antara klon karet RRIM 600 dengan PN 1546 menggunakan teknik RAPD. Amplifikasi DNA dilakukan dengan menggunakan 16 primer kombinasi dan 40 primer RAPD. Pengolahan data dilakukan dengan menggunakan program NTSYS 2.02. Amplifikasi DNA dengan 16 primer kombinasi menghasilkan lima kandidat primer penanda molekuler, primer D spesifik untuk RRIM 600, primer C dan M spesifik untuk PN 1546, sedangkan primer N dan I spesifik untuk perpaduan kedua sifat tetua. Hasil amplifikasi DNA dengan 40 primer OPH-OPJ (1-20) menggunakan metode RAPD memperlihatkan keragaman genetik yang tinggi dengan nilai koefisien yang diperoleh sebesar 0.89-0.98. Terbentuk dua kelompok besar pada koefisien 0.89 untuk 27 tanaman karet. Dendogram hasil analisis juga memperlihatkan dua tetua terpisah pada percabangan yang berbeda yang menunjukkan bahwa kedua tetua memiliki hubungan kekerabatan yang jauh.
Keyword: RAPD technique, Eschercia coli, Hevea brasiliensis, Bogor Agricultural University, Institut Pertanian Bogor, IPB

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: