Judul: Gene Marker Construction of Plantaricin F Lactobacillus plantarum.
Abstrak: Lactobacillus plantarum merupakan bakteri yang dapat berperan sebagai probiotik. Bakteri ini memiliki plantaricin F yang berguna menghambat pertumbuhan bakteri Gram positif dan negatif. Penelitian ini menggunakan sepuluh isolat L. plantarum (Mar A5, Bst 1, Mar C7, TB(N), Mg Tm 1, Mg PSM B3, TB(S), MKw 9, Bst 5, Mar B4) yang berasal dari buah-buahan tropis (mangga kweni, manggis, markisa, dan terong belanda). Penelitian ini dilakukan untuk konstruksi marka gen pln F dan menganalisis ekspresi relatif gen pln F serta uji aktivitas antibakteri. Pengujian gen pln F menggunakan RT-PCR menghasilkan pita DNA berukuran 70 pb. Hasil pengujian ini selanjutnya dipakai untuk menentukan nilai ekspresi relatif gen pln F menggunakan software CS Analyzer. Nilai ekspresi relatif gen tertinggi didapat dari isolat TB (S) dengan nilai 28.13 Au. Uji aktivitas antibakteri dilakukan untuk melihat hubungan antara gen pln F dengan aktivitas penghambatan isolat terhadap bakteri uji. Uji aktivitas antibakteri dilakukan terhadap lima bakteri antara lain Salmonella typhimurium, Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Bacillus cureus, dan Pseudomonas flouresense. Penghambatan tertinggi terhadap S. aureus terdapat pada isolat Mg PSM B3 dengan diameter penghambatan 2.50 cm. Isolat Mar A5 memiliki penghambatan tertinggi terhadap bakteri S. typhimurium, E. coli, dan P. flouresense dengan diameter penghambatan masing-masing 1.33 cm, 1.83 cm, dan 1.16 cm. Isolat Mar B4 dan Bst 5 memiliki penghambatan tertinggi terhadap bakteri B. cureus dengan diameter sekitar 0.50 cm.
Keyword: 

Judul: Antibacterial activity test of lactobacillus plantarum isolated from tropical fruits and relation to gene expression plantaricin.
Abstrak: Bakteriosin dari strain Lactobacillus plantarum yaitu plantaricin, memiliki kemampuan untuk menghambat pertumbuhan bakteri patogen. Penelitian ini bertujuan menguji aktivitas antibakteri dari isolat L. plantarum yang berasal dari buah-buahan tropis serta mengkorelasikan antara tingkat ekspresi gen pln A dan plnF dengan tingkat aktivitas penghambatan patogen. Isolat L. plantarum dari buah-buahan tropis terlebih dahulu di uji aktivitasnya dengan bakteri patogen Staphylococcus aureus, Salmonella thypimurium, Escherichia coli, Pseudomonas floresense dan Bacillus cereus kemudian diuji analisis ekspresi gen pln dengan RT-PCR. Hasil dari uji aktivitas antibakteri adalah isolat L. plantarum tersebut mampu menghambat pertumbuhan kelima bakteri uji dengan penghambatan relatif tertinggi 1.60 cm untuk E. coli. Pengujian dengan RT-PCR memberikan hasil yang positif untuk ekspresi gen plnA dan plnF dengan ukuran produk ±70 pb. Ekspresi relatif gen plnA terbaik berasal dari isolat TB(P) sebesar 47.123 AU dan ekspresi relatif gen plnF terbaik berasal dari isolat Mar A2 sebesar 215.560 AU. Korelasi antara tingkat ekspresi gen plnF terhadap tingkat penghambatan patogen bernilai positif terhadap bakteri E. coli dan P. floresense dengan nilai masing-masing y = 13.71x + 13.44 dan y = 2.209x + 32.24, sedangkan untuk gen plnA hanya berkorelasi positif untuk E.coli dengan nilai y = 1.998x + 8.816. Simpulan dari penelitian ini isolat L. plantarum memiliki korelasi antara aktivitas antibakteri dengan ekpresi gen plnA dan plnF yang positif terhadap E.coli sehingga dapat dijadikan alternatif pengganti antibiotik untuk mencegah penyakit saluran pencernaan seperti diare.
Keyword: 

Judul: Thermal Characteristics and Dynamics of Tropical Cyclone over Western North Pacific Ocean: A Case Study of Typhoon Songda (Chedeng) 2011
Abstrak: The frequent occasion of Tropical Cyclone (TC) over Western North Pacific (WNP) Ocean lies from 10˚N to 26˚N and 121˚E to 170˚E. Sources of TC development come from warm ocean temperature where latent heat is released during condensation processes and subsequently concentrated in the boundary layer. Relative humidity at 850-700 hPa is responsible to produce the most intense storm. Meanwhile, weak vertical wind shear between 850-200 hPa is one of the dynamical factors that lead to the development of TC. Pressure level of 850-200 hPa is chosen to minimize the thermodynamic effect in the lower troposphere. Typhoon Songda (Chedeng in the Philippines) or TSC lasted from May 18th to 30th, 2011 and strengthened into powerful Super Typhoon stage between May 24th and 27th. Long curving track and the exhibition of all sequences of TC life cycle, TSC is then considered as an ideal case of TC. The objective of the study with case of TSC is to investigate the role of thermal characteristics and dynamics on TC intensity. The research is carried out by using Advanced Research of Weather Research and Forecasting model (WRF ARW model) version 3.3. Two domains are employed in the model. The first domain situate from 02˚N to 40˚N and 118˚E to 149˚E and cover spatial resolution () of 33.1 km. The second domain situate from 09˚N to 27˚N and 119˚E to 132˚E with of 11 km. Timestep of the model () is 120 seconds. The model is supported by the following physical parameterization, i.e., Yonsei University Scheme (YSU) in the boundary layer, Kain-Fritsch scheme (KF) in the cumulus, and WRF Single-Moment 3-class scheme in the microphysics. Initial meteorological condition prior to the formation of the cyclone is generated using WRF ARW standard-release model. Sensitivity of the model output is obtained from a selected single-parameter change scenarios, namely, 10 % to 20 % decrease and increase of wind shear initial data at 850-200 hPa, and by 10 % to 20 % decrease of relative humidity initial data at 850-700 hPa. The result showed that the negative correlations between wind shear and intensity are found in wind shear scenarios. Wind shears of 10 ms-1 which lead to strengthening of the wind intensity in the early period of Typhoon development are found in wind shear scenarios. The effect of wind shear changes on wind intensity is statistically significant in the 20 % wind shear scenarios. During mature stage, weak wind intensity occurred when wind shear increase as given in the WRF standard-release and the 20 % decreasing scenario. Different situation is found in the 20 % increasing scenario where wind shear tend to weak and lead to strong wind intensity at this stage. Meanwhile, the reduction of moisture supply at 850-700 hPa resulting from 20 % decreasing relative humidity play a major role in the weakening of wind intensity and reduces mechanical energy of the cycle process as much as 300 J kg-1.
Keyword: