Judul: Transformasi Genetik Tanaman Jarak Pagar (Jatropha curcas L.) Melalui Jalur Tabung Polen.
Abstrak: Jarak pagar merupakan tanaman potensial penghasil bahan bakar nabati maupun untuk keperluan bidang farmasi, kosmetik dan lainnya. Upaya peningkatan produksi melalui perbaikan genetik, teknik budidaya dan sistem usaha tani lainnya perlu terus dilakukan. Pengembangan jarak pagar masih menghadapi banyak kendala antara lain belum tersedianya varietas dengan produktivitas tinggi, karena itu, upaya perbaikan genetik perlu terus dilakukan baik menggunakan metode pemuliaan konvensional maupun bioteknologi. Transformasi jarak pagar dengan media Agrobacterium maupun particle bombardment telah banyak dilakukan, namun keberhasilan memperoleh tanaman transgenik dewasa masih rendah akibat hambatan regenerasi pada kultur jaringannya. Transformasi tanaman melalui jalur tabung polen merupakan metode alternatif untuk mengatasi kendala rendahnya keberhasilan transformasi tanaman-tanaman tertentu yang sulit diperbanyak melalui kultur in vitro. Tujuan utama penelitian ini ialah untuk memperoleh metode transformasi genetik secara langsung melalui jalur tabung polen pada tanaman jarak pagar. Penelitian terdiri atas tiga percobaan. Percobaan I terdiri atas dua tahap percobaan, bertujuan untuk memperoleh informasi pengaruh perlakuan konsentrasi dan waktu penetesan DNA plasmid pCAMBIA1301 pada proses transformasi langsung melalui jalur tabung polen terhadap pembentukan buah, biji dan perkecambahan tiga genotipe tanaman jarak pagar. Percobaan I tahap pertama disusun dalam rancangan petak terbagi. Konsentrasi DNA plasmid sebagai petak utama (0.05, 0.25, 0.50 μg μL-1) dan waktu penetesan plasmid DNA sebagai anak petak (1, 2, 4, 7 dan 10 jam setelah polinasi). Percobaan I tahap kedua disusun dalam rancangan kelompok lengkap teracak faktor tunggal dengan 15 kombinasi perlakuan konsentrasi dengan waktu tetes DNA plasmid dan 1 kontrol wild type. Percobaan II merupakan kelanjutan percobaan I tahap kedua yang bertujuan untuk memperoleh informasi keberhasilan transformasi berdasarkan pengujian secara histokimia dan molekuler pada tanaman-tanaman transgenik putatif generasi T0. Percobaan III terdiri atas dua tahap bertujuan untuk memperoleh informasi pembentukan buah dan biji jarak pagar pada transformasi langsung melalui jalur tabung polen menggunakan plasmid pCAMBIA1301 yang membawa gen OsDREB1A serta efisiensi keberhasilannya berdasarkan analisis histokimia dan molekuler pada tanaman-tanaman transgenik putatif generasi T0. Percobaan III tahap pertama disusun dalam rancangan petak terbagi. Konsentrasi DNA plasmid pCAMBIA1301-OsDREB1A sebagai petak utama (0.05, 0.25, 0.50 μg μL-1) dan waktu penetesan plasmid DNA sebagai anak petak (1, 2, 4, 7 dan 10 jam setelah polinasi). Percobaan III tahap kedua disusun dalam rancangan kelompok lengkap teracak faktor tunggal dengan 15 kombinasi perlakuan konsentrasi dengan waktu tetes DNA plasmid pCAMBIA1301-OsDREB1A dan 1 kontrol wild type. Hasil penelitian menunjukkan bahwa konsentrasi dan waktu pemberian DNA plasmid tidak berpengaruh nyata terhadap pembentukan buah dan biji serta perkecambahan jarak pagar IP3A, IP3P dan JcUMM18. Namun, konsentrasi DNA plasmid berpengaruh nyata terhadap persentase buah panen jarak pagar JcUMM18 dan waktu aplikasi DNA plasmid berpengaruh nyata terhadap persentase buah dipanen dan berat biji per buah jarak pagar IP3A. Kombinasi konsentrasi DNA plasmid dan waktu tetes berpengaruh nyata terhadap tingkat perkecambahan benih genotipe IP3A, tetapi tidak berpengaruh nyata terhadap peubah-peubah lain pada tiga genotipe jarak pagar yang diujikan. Konsentrasi DNA plasmid 0.05-0.5 μg μL- 1 dan waktu penetesan plasmid 1-10 jam setelah polinasi dapat diterapkan pada transformasi genetik jarak pagar melalui jalur tabung polen. Efisiensi transformasi melalui jalur tabung polen tiga genotipe jarak pagar (IP3A, IP3P dan JcUMM18) berkisar antara 1.5-16.7% berdasarkan analisis histokimia dan
Keyword: DNA plasmid, OsDREB1A, pCAMBIA1301, tetes stigma

Judul: Rekayasa Genetik Tembakau (Nicotiana Tabacum L. Cv. Sr1) Dan Jarak Pagar (Jatropha Curcas L.) Dengan Gen Inhibitor Of Meristem Activity (Ima)
Abstrak: Tanaman jarak pagar (Jatropha curcas L.) merupakan salah satu tanaman yang pada awalnya merupakan tanaman yang digunakan sebagai tanaman pagar. Tanaman ini berpotensi sebagai penghasil bahan baku energi terbarukan. Keuntungan jarak pagar sebagai sumber bahan biodiesel antara lain, 1) minyak jarak pagar tidak termasuk dalam kategori minyak makan (non edible oil) sehingga pemanfaatan jarak pagar sebagai bahan baku biodiesel tidak akan mengganggu penyediaan kebutuhan minyak makan nasional, 2) tanaman jarak pagar ini dapat beradaptasi dengan lahan pada kondisi kering (curah hujan <500 mm per tahun), 3) dapat tumbuh pada lahan dengan kesuburan rendah (lahan marjinal dan lahan kritis, 4) biji jarak pagar mengandung minyak dengan rendemen 30–40%. Rendahnya produktivitas tanaman jarak pagar menjadi perhatian utama dalam pemulian tanaman. Rasio bunga betina yang sangat sedikit dibandingkan dengan bunga jantan merupakan salah satu factor pembatas produktivitas. Salah satu strategi untuk meningkatkan kualitas produktivitas jarak pagar yaitu dengan teknologi rekayasa genetika. Metode transformasi merupakan metode yang diaplikasikan untuk mengintroduksikan gen IMA ke tanaman tersebut. Gen Inhibitor of Meristem Activity (IMA). Gen IMA telah diisolasi dari tanaman tomat (Solanum lycopersicum L.) dan telah berhasil dilakukan ekspresi berlebih pada tanaman tomat. Gen IMA berperanan dalam pertumbuhan dan perkembangan pada meristem pucuk, mampu menginduksi pembungaan dan perkembangan ovul. Tujuan penelitian ini adalah dapat mengetahui peranan gen IMA pada pertumbuhan tanaman melalui konstruksi gen dalam vektor ekspresi, analisis gen pada tanaman model tembakau dan tanaman target jarak pagar. Pada penelitian pertama dilakukan konstruksi gen IMA ke dalam vektor ekspresi A. tumefaciens LBA4404. Metode yang digunakan untuk konstruksi adalah metode gateway. Metode ini diawali dengan desain primer spesifik gateway. Konstruksi gen IMA dirancang dengan dua arah yaitu sens dan antisens. Diperoleh koloni A. tumefaciens LBA4404 yang membawa plasmid pGWB402- IMA sens dan antisens. Koloni tersebut dapat digunakan untuk transformasi pada tanaman. Pada penelitian kedua dilakukan introduksi gen IMA ke dalam tanaman tembakau. Gen yang ditransformasi dalam bentuk orientasi sens dan antisens. Tembakau dengan gen IMA sens memberikan ciri morfologi yang lebih kecil dibandingkan dengan tanaman non transgenik. Sedangkan gen IMA antisens memperlihatkan ukuran morfologi tanaman yang lebih besar dari tanaman non transgenik. Berdasarkan hasil PCR tanaman transgenik sens dan antisens menunjukkan hasil yang positif membawa gen IMA. Analisis segregasi pada biji tanaman T0 dan T1 berdasarkan sifat ketahanan terhadap antibiotik pada masingmasing tanaman. Hasilnya diperoleh data 3:1 berdasarkan hasil analisis chisquare. Ini mengindikasikan bahwa gen IMA diwariskan pada turunan kedua. Pada penelitian ketiga dilakukan introduksi gen IMA sens dan antisens ke tanaman jarak pagar. Tujuannya adalah mengintroduksi gen IMA sens dan antisens ke tanaman Jarak Pagar. Transformasi berhasil dilakukan pada tanaman jarak pagar dengan gen IMA sens berdasarkan hasil analisis PCR. Tetapi dalam kultur in vitro menghadapi kendala pada proses pengakaran dan aklimatisasi. Diharapkan pada penelitian selanjutnya dapat ditemukan metode yang baik untuk pengakaran dan aklimatisasi.
Keyword: Jatropha curcas, pGWB402, IMA, inhibitor

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: