Judul: Detection of Virulence Factor and Resistance Genes in Pathogenic Escherichia coli Ciprofloxacin Resistant from Laying Hens
Abstrak: Avian Pathogenic Escherichia coli (APEC) merupakan penyebab kolibasilosis pada unggas, Sedangkan E. coli strain O157:H7 merupakan agen zoonosis penyebab penyakit hemolytic uremic syndrome (HUS) pada manusia. Penelitian untuk mengungkap faktor virulensi dan resistansi siprofloksasin pada unggas, khususnya ayam layer di Indonesia, masih sangat jarang. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui gen virulensi dan resistansi siprofloksasin asal APEC serta keberadaan E. coli O157:H7 yang diisolasi dari ayam layer. Siprofloksasin merupakan antibiotik golongan flurokuinolon yang sangat penting pada manusia dan hewan. Siprofloksasin pada manusia masuk kedalam kategori Highest Priority Critically Important Antimicrobials for Human Medicine dan pada hewan masuk kedalam kategori Critically Important Antibiotics for Veterinary Medicine. Penelitian ini menggunakan 327 isolat arsip E. coli Balai Besar Pengujian Mutu dan Sertifikasi Obat Hewan-Kementerian Pertanian Republik Indonesia yang diisolasi dari ayam layer pada tahun 2021 dari tujuh provinsi. Seluruh isolat diuji patogenisitasnya menggunakan Congo Red untuk APEC dan Sorbitol MacConkey agar untuk E. coli O157:H7. E. coli yang dinyatakan patogen diuji resistansinya terhadap siprofloksasin dengan metode agar dilution. Isolat yang resistan dan patogen diuji keberadaan gen virulensi dan resistansinya menggunakan uji polymerase chain reaction (PCR). Hasil uji Congo Red menunjukkan sebanyak 59 isolat E. coli bersifat patogen (APEC), sedangkan E. coli O157:H7 tidak ditemukan. Hasil uji resistansi menunjukkan 30 dari 59 isolat APEC resistan terhadap siprofloksasin. Dari 30 isolat APEC resistan siprofloksasin, ditemukan gen virulensi iss pada 29 isolat (96,7%), iutA pada 23 isolat (76,7%), ompT pada 19 isolat (63,3%), hlyF pada 14 isolat (46,7%), dan iroN pada 11 isolat (36,7%). Gen resistansi gyrA dan parC ditemukan pada 30 isolat (100%), qnrA pada 20 isolat (66,7%), qnrB pada 7 isolat (23%) dan qnrS pada 6 isolat (20%). Penelitian ini menunjukkan bahwa gen virulensi dan resistansi banyak ditemukan pada isolat E. coli patogen (APEC) yang resistan terhadap siprofloksasin. Hal ini menunjukkan adanya ancaman serius terhadap efikasi siprofloksasin untuk mengatasi kolibasilosis pada ayam layer., Avian Pathogenic Escherichia coli (APEC) is the cause of colibacillosis in poultry while E. coli strain O157:H7 is a zoonotic agent that causes hemolytic uremic syndrome (HUS) disease in humans. Research to reveal virulence factors and ciprofloxacin resistance in poultry of APEC, especially laying hens in Indonesia is still very rare. This study aimed to determine virulence and ciprofloxacin resistance genes from APEC and E. coli strain O157:H7 isolated from laying hens. Ciprofloxacin is a fluoroquinolone antibiotic which is very important in humans and animals. Ciprofloxacin in humans is included in the category of Highest Priority Critically Important Antimicrobials for Human Medicine and in animals it is included in the category of Critically Important Antibiotics for Veterinary Medicine.This research used 327 E. coli isolates from the archives of the National Veterinary Drug Assay Laboratory-Ministry of Agriculture, which were isolated from laying hens in 2021 from seven provinces. All isolates were tested for pathogenicity using Congo Red for APEC and Sorbitol MacConkey agar for E. coli O157:H7. E. coli which was declared pathogenic was tested for resistance to ciprofloxacin using agar dilution method. Resistant and pathogenic isolates are tested for the presence of virulence and resistance genes using polymerase chain reaction test. The results of
Keyword: Ayam layer,, faktor virulensi, APEC, gen resistan, O157:H7, resistansi siprofloksasin

Judul: Beta-Lactam Antibiotic Resistance and Production of Beta-Lactamase Enzyme in Escherichia coli from Chicken
Abstrak: Salah satu masalah kesehatan masyarakat utama abad ke-21 adalah resistansi antimikroba (AMR). Masalah AMR yang sangat penting adalah terkait resistansi antibiotik pada bakteri. Escherichia coli sebagai bakteri komensal pada saluran pencernaan dianggap sebagai reservoir dan pentransmisi resistansi antibiotik. Banyak penelitian resistansi antibiotik pada E. coli telah dilakukan. Penelitian terkait resistansi ampisilin pada E. coli dari berbagai hewan menujukkan angka yang tinggi. Namun, baru sedikit sekali penelitian di Indonesia yang meneliti resistansi sefalosporin pada E. coli asal hewan di Indonesia, terutama asal ayam. Kondisi resistansi seringkali dikaitkan dengan gen yang menyandikan sifat resistansi. Beberapa penelitian di Indonesia telah mendeteksi gen-gen panyandi resistansi antibiotik beta-laktam. Gen-gen penyandi resistansi yang telah dideteksi pada E. coli pada penelitian di luar negeri adalah blaTEM, blaSHV, dan blaCTX-M. Namun, penelitian deteksi ketiga gen tersebut pada isolat E. coli asal ayam di Indonesia belum pernah dilakukan. Tujuan umum penelitian ini adalah mendeteksi resistansi beta-laktam dan melihat aktivitas enzim beta-laktamase yang diproduksi dari E. coli yang berasal dari ayam. Escherichia coli pada penelitian ini berasal dari tiga lokasi berbeda yaitu Sukabumi (25 isolat), Bogor (17 isolat), dan Cianjur (10 isolat). Tiga rangkaian penelitian dilakukan dalam penelitian ini. Penelitian pertama tentang profil resistansi antibiotik pada E. coli. Penelitian pertama bertujuan untuk (1) membandingkan profil resistansi ampisilin tahun 2019 dan 2021 pada isolat E. coli yang sama dan (2) mengetahui profil resistansi ampisilin, setazidim, dan sefotaksim pada E. coli yang berasal dari ayam. Metode yang digunakan untuk uji resistansi antibiotik adalah uji difusi cakram metode Kirby-Bauer pada agar Mueller-Hinton. Uji dilakukan dengan tiga kali pengulangan. Isolat terlebih dahulu direidentifikasi dengan uj-uji identifikasi bakteri secara konvensional meliputi kultur pada agar MacConkey, kultur pada agar eosin-methylene blue, pewarnaan Gram, uji pada agar triple surag iron, uji indol, uji motilitas, uji methyl red, uji Voges-Proskauer, uji sitrat, dan uji urease. Selanjutnya dikonfirmasi dengan pomerase chain reaction (PCR) untuk mendeteksi gen uspA. Kelima puluh dua isolat terkonfirmasi E. coli dan positif gen uspA. Hasil uji resistansi ampisilin pada E. coli sangat tinggi karena seluruh isolat menunjukkan diameter zona hambat 0 mm. Hasil ini sama dengan pengujian resistansi tahun 2019 yang juga memiliki diameter zona hambat uji ampisilin 0 mm. Escherichia coli pada penelitian ini menunjukkan resistansi sefotaksim lebih tinggi daripada seftazidim. Tingkat resistansi tersebut teramati pada ketiga lokasi peternakan. Penelitian kedua adalah terkait gen peyandi resistansi yang ada pada isolat resistan. Isolat yang digunakan pada rangkaian penelitian kedua adalah sebanyak 33 isolat. Isolat tersebut minimal telah resistan dua antibiotik pada rangkaian penelitian sebelumnya (resistan ampisilin + seftazidim + sefotaksim atau ampisilin + seftazidim atau ampisilin + sefotaksim). Penelitian ini bertujuan untuk (1) mendeteksi gen blaTEM, blaSHV, dan blaCTX-M pada isolat E. coli asal ayam yang resistan ampisilin dan seftazidim dan/atau sefotaksim, serta (2) melihat kekerabatan gen blaTEM. Gen-gen penyandi resistansi dideteksi dengan metode PCR. Gen-gen target dalam penelitian ini adalah blaTEM, blaSHV, dan blaCTX-M. Gen blaTEM mendominasi perolehan deteksi gen. Seluruh isolat memiliki gen blaTEM, diikuti oleh lebih dari 50% isolat memiliki gen blaSHV, dan jumlah terendah adalah gen blaCTXM. Kombinasi blaTEM + blaSHV menjadi kombinasi dominan. Gen blaTEM sebagai gen yang paling dominan disekuensing. Lima
Keyword: antibiotik, beta-laktam, Escherichia coli, resistansi, beta-laktamase

Judul: Simulasi persamaan keadaan bintang dengan pendekatan klasik dan relativistik
Abstrak: Komposisi bintang yang selalu berubah akanmempengaruhi massa dan radius bintang itu sendiri. Dimana semakin tua sebuah bintang, maka bintang akan didominasi oleh unsur-unsur berat. Dengan persamaan politrop dan metode Runge-Kutta orde 4 didapatkan radius dan massa bintang semakin berkurang seiring berkurangnya nilai Ye, sedangkan kerapatan semakin meningkat. Pendekatan terbaik terdapat pada nilai Ye sebesar 0.5 dimana didapatkan bahwa massa bintang katai putih sebesar 1.4Mo sesuai dengan massa Chandrasekhar dengan radius bintang 5000 km dan nilai kerapatan bintang sebesar 5.31x 106 g cm-3. Untuk massa bintang neutron diperoleh nilai 0.05Modan radius bintang sebesar 2300 km, sedangkan kerapatannya bintang neutron diperoleh sebesar 1.84 x 107 g cm-3 dengan menggunakan pendekatan relativistic. Pendekatan relativistic terbukti lebih baik untuk menentukan radius dan massa bintang, dengan pendekatan terbaik pada nilai Ye sebesar 0.5 yaitu pada bintang katai putih
Keyword: Composition of the stars, density of the stars, mass of the stars, radii of the stars