Judul: Konfirmasi Individu F1 Hasil Persilangan Kedelai Lokal dengan Kedelai Introduksi Menggunakan Marka SSR
Abstrak: Kedelai introduksi dengan sifat juvenile (yuwana) panjang telah disilangkan dengan kedelai lokal Grobogan yang memiliki sifat juvenile (yuwana) konvensional. Tujuan penelitian ini adalah menetapkan primer yang menunjukkan pola pita polimorfik terhadap tetua persilangan menggunakan marka SSR sehingga dapat digunakan untuk mengonfirmasi individu F1 hasil persilangan. Metode penetapan primer dilakukan dengan menyurvei 10 pasang primer secara acak untuk memperoleh sepasang primer paling polimorfik terhadap enam kombinasi tetua persilangan. Penetapan primer dilakukan menggunakan PCR berbasis SSR dilanjutkan analisis ukuran pita DNA menggunakan elektroforesis PAGE. Sebanyak 65 individu F1 putative (dugaan) diuji dengan mengamplifikasinya menggunakan primer SSR hasil survei dan hasilnya 49 merupakan tanaman F1 yaitu 42 persilangan normal dan 7 persilangan resiprok. Sebanyak 6 kombinasi persilangan normal yang dilakukan dan 3 persilangan resiprok menunjukkan bahwa 5 persilangan normal berhasil dilakukan kecuali pada Grobogan x PI 632421 dan 2 persilangan resiprok berhasil kecuali PI 159925 X Grobogan.
Keyword: Kedelai, Marka Molekul, Putative, Polimorfisme, SSR

Judul: Analisis Keragaman Genetik 22 Genotipe Kedelai (Glycine max (L.) Merr.) Menggunakan 20 Marka SSR untuk Pemilihan Tetua Persilangan
Abstrak: Analisis keragaman genetik dengan marka molekuler merupakan langkah awal yang penting dalam program pemuliaan kedelai, terutama pada pemilihan tetua persilangan. Tujuan penelitian ini adalah menganalisis keragaman genetik dan jarak genetik 22 genotipe kedelai menggunakan 20 marka SSR untuk pemilihan tetua persilangan, serta analisis tingkat polimorfisme marka SSR yang digunakan. Uji keragaman genetik menunjukkan bahwa 20 marka SSR mampu membagi 22 genotipe kedelai menjadi 3 klaster utama pada koefisien 0.77. Empat aksesi introduksi (PI 159925, PI 471938, PI564718, dan PI 548631) dan sembilan varietas lokal (Grobogan, Anjasmoro, Tanggamus, Biosoy 11, Dega-1, Dena, Dering, Malabar dan Tambora) berpotensi menjadi tetua persilangan karena memiliki jarak genetik yang jauh. Seluruh marka SSR yang digunakan bersifat polimorfik dan sangat informatif dengan rentang nilai Polymorphisme Information Content (PIC) 0.87 – 0.96. Marka Satt131, Satt409, dan Satt100 merupakan marka yang paling baik digunakan untuk analisis.
Keyword: Jarak genetik, kedelai, keragaman genetik, pemilihan tetua, marka SSR

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: