Judul: Keragaman Genetik Berbasis RAPD, Uji Proksimat, dan Interaksi Genotipe x Lingkungan beberapa Genotipe Kacang Merah Asal Timor Leste
Abstrak: Kacang merah (Phaseolus vulgaris L.) termasuk famili Leguminoseae dan merupakan komoditas pangan yang dapat meningkatkan pendapatan ekonomi keluarga di beberapa negara berkembang, salah satunya Timor Leste. Biji kacang merah mengandung nutrisi yang tinggi, mencegah berbagai penyakit dan menyuburkan tanah. Kacang merah banyak dibudidayakan oleh masyarakat Timor Leste di daerah dataran tinggi dengan karakter batang pendek, tegak, merambat, dengan potensi hasil rendah. Sampai saat ini belum banyak varietas nasional kacang merah sehingga petani masih menanam kultivar lokal adaftif yang genotipenya masih bercampur sehingga hasil panen masih rendah. Eksplorasi dan evaluasi genotipe-genotipe kacang merah belum dilakukan. Upaya untuk mendapatkan genotipe lokal unggul dengan daya hasil tinggi melalui kegiatan pemuliaan tanaman. Penelitian ini bertujuan (i) mendeskripsikan karakter morfologi, agronomi dan molekuler genotipe-genotipe kacang merah asal Timor Leste; (ii) menduga pengaruh interaksi genotipe dan lingkungan pada genotipegenotipe kacang merah asal Timor Leste; (iii) menduga keeratan hubungan antar karakter agronomi genotipe-genotipe kacang merah asal Timor Leste. Penelitian analisis molekuler dilaksanakan di laboratorium Biologi Molekuler Departamen AGH-Faperta IPB pada bulan November-Januari 2019. Analisis kandungan nutris kacang merah dilaksanakan pada November 2018 dilaboratorium PT. Saraswanti Indo Genetech (SIG) Yasmin Bogor. Percobaan keragaan dan interaksi lingkungan dilaksanakan pada dua lokasi yaitu kebun percobaan Balai Penelitian Tanaman Hias Cipanas Kabupaten Cianjur ,dengan ketinggian tempat 1100 m dpl dan Kampung Sukaresmi, Desa Cipayung, Kecamatan Megamendung, Kabupaten Bogor, dengan ketinggian tempat ± 610 m dpl. Penelitian dilaksanakan pada bulan Juni 2018-Mei 2019. Data yang diperoleh dianalisis menggunakan aplikasi SAS. Penanda marka molekuler RAPD yang dianalisis menggunakan software Ntsyspc (Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System) terhadap genotipe asal Timor Leste dan kontrol kacang merah dapat dipisahkan menjadi 3 gerombol besar. Gerombol 1 terdiri dari IND-M dan IND-T, gerombol 2 terdiri dari TL-LUN, TL-KF1, TL-RW, TL-YELLOW, TL-MAC28, TL-R10, TL-RW, TL-TB, gerombol 3 terdiri dari TL-LB, TL-UMABANO, TL-DCL, TL-R03, TLLM, TL-LL. Analisis proksimat menghasilkan informasi kandungan nutrisi biji kacang merah yang terdiri dari kandungan karbohidrat tertinggi pada genotipe TL-R03, TL-RW, TL-Umabano, TL-LUN, dan terendah di genotipe TL-LB, protein tertinggi terdapat pada empat genotipe yaitu TL-LB, TL-Dcl, TL-KF2, TL-KF1 dan terendah pada TL-R10. Terdapat keragaman pada karakter diantara genotipe-genotipe kacang merah hasil analisis gabungan. Karakter umur berbunga, umur panen, tinggi tanaman, diameter batang, jumlah daun, jumlah cabang, bobot brangkasan, jumlah polong, bobot polong, jumlah biji, bobot 100 biji, bobot biji per plot dan bobot biji per tanaman kecuali pada karakter panjang daun dan lebar daun yang tidak berpengaruh oleh interaksi genotipe dan lingkungan. Jumlah polong, bobot polong dan bobot biji kering perpetak memiliki nilai koefisien korelasi yang nyata dan positif. Bobot polong per tanaman memberikan pengaruh langsung dan tidak langsung yang tertinggi pada bobot biji per tanaman.
Keyword: interaksi genotipe x lingkungan, keragaan, korelasi, nutrisi, RAPD

Judul: Kajian Keanekaragaman Morfologi, Metabolit Primer dan Molekuler Sumber Daya Genetik Kacang-kacangan Underutilized Indonesia
Abstrak: Kacang-kacangan underutilized Indonesia dapat dikembangkan sebagai varietas komersil seperti kedelai dikarenakan kacang-kacangan tersebut juga kaya nutrisi sama seperti kedelai. Selain sebagai bahan pangan sumber protein, kacangkacangan underutilized dapat dimanfaatkan sebagai sumber minyak nabati, pakan, obat-obatan maupun pupuk hijau. Indonesia memiliki keanekaragaman sumber daya genetik kacang-kacangan underutilized yang melimpah, namun informasi potensi genetik dan keragamannya belum banyak diketahui. Kegiatan eksplorasi, koleksi dan karakterisasi plasma nutfah berdasarkan morfologi, metabolit primer dan molekuler sangat diperlukan dalam pengembangan varietas unggul baru dan merupakan tahap awal dalam kegiatan pemulian tanaman kacang-kacangan tersebut. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan informasi tentang keragaan morfologi dan metabolit primer kacang-kacangan underutilized Indonesia. Analisis lebih lanjut untuk mengidentifikasi keragaman genetik dan hubungan kekerabatan antar aksesi kacang-kacangan underutilized berdasarkan penanda morfologi, metabolit primer dan molekuler ISSR. Materi genetik yang digunakan dalam penelitian ini adalah 31 aksesi kacangkacangan underutilized dan satu varietas pembanding yang terdiri atas 8 spesies meliputi 1����� aksesi spesies Vigna unguiculata (14 aksesi kacang tunggak dan 4 aksesi kacang panjang), 2 aksesi spesies V. subterranea (kacang bogor), 2 aksesi spesies Phaseolus lunatus (koro kratok), 1 aksesi spesies P. vulgaris (kacang merah), 1 aksesi spesies Canavalia ensiformis (koro pedang), 2 aksesi spesies Mucuna pruriens (koro benguk), 5 aksesi spesies Psophocarpus tetragonolobus (kecipir) dan 1 varietas spesies Glycine max (kedelai) sebagai tanaman pembanding. Analisis morfologi dilakukan menggunakan rangkuman deskriptor International Board for Plant Genetic Resources Institute dan Guidelines for The Conduct of Test for Distinctness, Homogeneity and Stability. Analisis kandungan metabolit primer menggunakan analisis proksimat. Analisis molekuler menggunakan 11 primer ISSR dengan ekstraksi DNA menggunakan metode cethyl trimethyl ammonium bromide. Data morfologi, metabolit primer dan molekuler dianalisis menggunakan analisis gerombol dan konstruksi dendogram menggunakan perangkat lunak PBSTAT-CL. Analisis komponen utama menggunakan perangkat lunak MINITAB v.16. Hasil penelitian menunjukkan bahwa 31 aksesi kacang-kacangan underutilized dan 1 varietas kedelai yang diamati terdapat 64 karakter beragam dan 2 karakter seragam dari 66 karakter morfologi yang diamati. Karakter sifat kualitatif memiliki keragaman yang lebih luas dibandingkan dengan karakter sifat kuantitatif. Kandungan metabolit primer sumber daya genetik kacang-kacangan underutilized yang diuji berkisar antara 16.72-31.29% protein, 0.35-14.94% lemak dan 26.67- 59.31% karbohidrat. Analisis molekuler menggunakan 11 primer ISSR berhasil mengamplifikasi 80 pita DNA dengan tingkat polimorfisme 100%. Hasil analisis gerombol pada 31 aksesi kacang-kacangan underutilized dan satu varietas pembanding yang diuji berdasarkan penanda morfologi dan molekuler ISSR mampu menjelaskan pengelompokan aksesi secara tegas pada tingkat intraspesifik maupun interspesifik. Hal ini berarti deskriptor yang dikembangkan maupun penanda molekuler yang digunakan mampu mengidentifikasi keragaman genetik kacang-kacangan underutilized yang diuji. Penanda molekuler ISSR dapat mengelompokkan sumber daya genetik kacang-kacangan underutilized yang diuji berdasarkan asal geografis. Karakter yang informatif sebagai penciri morfologi kacang-kacangan underutilized adalah karakter antosianin pada hipokotil, bulu pada permukaan batang, bulu pada permukaan bawah daun, lebar daun terminal, rasio panjang dan lebar daun terminal, panjang polong tua, pengkerutan polong tua dan warna utama biji. Keanekaragaman 31 aksesi kacang-kacangan underutilized dan satu varietas pembanding berdasarkan penanda morfologi, metabolit dan ISSR menunjukkan hubungan kekerabatan yang dekat antar jenis kacang-kacangan dengan tingkat keragaman pada tingkat interspesik kurang dari 40% dan keragaman pada tingkat intraspesifik kurang dari 25%. Hasil analisis komponen utama mendukung hasil analisis
Keyword: interspesifik, intraspesifik, keragaman genetik, legum, ISSR, PCA, pengelompokan, tanaman potensial

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: