Judul: Potensi Bakteri Endofit Asal Tumbuhan Mangrove sebagai Pengendali Ralstonia solanacearum dan Meloidogyne spp pada Tanaman Tomat.
Abstrak: Tomat merupakan komoditas hortikultura yang banyak ditanam di Indonesia, karena tanaman ini cocok ditanam di segala musim dan ketinggian. Produksi nasional tanaman ini mengalami penurunan hingga 64 165 ton per tahun selama 2013-2016. Penurunan produktivitas dapat disebabkan infeksi bakteri Ralstonia solanacearum dan nematoda Meloidogyne spp. Peningkatan intensitas penyakit terjadi ketika kedua patogen tersebut menyerang secara bersamaan. Penelitian ini dilakukan untuk mengembangkan teknik pengendalian penyakit yang disebabkan infeksi ganda antara Ralstonia solanacearum dan Meloidogyne spp. pada tomat dengan memanfaatkan bakteri endofit. Bakteri endofit diisolasi dari dua genus mangrove yang tumbuh di Indonesia, yaitu Apiapi (Avicennia sp.) dan Bakau (Rhizophora sp.). Penggunaan dua tanaman ini sebagai sumber inang bakteri endofit didasarkan pada potensi mangrove Indonesia yang setara 27% luas hutan mangrove dunia. Penelitian ini bertujuan untuk (1) Eksplorasi dan isolasi bakteri endofit dari tumbuhan mangrove yang berasal dari beberapa lokasi di Pulau Jawa, (2) Menguji dan mengkarakterisasi isolat bakteri endofit yang berpotensi dalam pengendalian Meloidogyne spp. dan R. solanacearum pada tanaman tomat. Sampel tumbuhan mangrove Avicennia sp. dan Rhizophora sp. sebagai sumber endofit diambil dari Pantai Indah Kapuk, Karangsong-Indramayu (Jawa Barat), Baros-Bantul (Yogyakarta), dan Alas Purwo-Banyuwangi (Jawa Timur). Bakteri endofit diisolasi dari mangrove dengan metode sterilisasi permukaan dengan NaOCl 2 % dan alkohol 70%. Sebanyak 843 isolat bakteri endofit berhasil diisolasi dari akar kedua tanaman dan 403 isolat diantaranya menunjukkan reaksi negatif pada pengujian reaksi hipersensitivitas pada tembakau dan hemolisis pada agar darah. Sebanyak 403 isolat tersebut selanjutnya diuji kemampuan antibiosis secara in vitro terhadap R. solanacearum dan Meloidogyne spp. dan 19 isolat bakteri endofit yang menunjukkan kemampuan penekanan terhadap patogen tersebut. Karakterisasi fisiologi terhadap 19 isolat bakteri endofit tersebut menunjukkan 11 isolat bakteri endofit termasuk bersifat Gram negatif dan 8 Gram positif, 14 isolat memproduksi enzim protease, 11 isolat penghasil enzim kitinase, 14 isolat sebagai pelarut fosfat, dan 9 isolat mampu menambat nitrogen. Semua isolat bakteri endofit yang diuji menunjukkan kemampuan memproduksi IAA Pengujian bakteri endofit sebagai pemacu pertumbuhan tanaman pada benih padi varietas Sidenok dan tomat varietas Tantina F1 menunjukkan, bahwa benih tomat dan padi yang diberi perlakuan bakteri endofit menunjukkan pertumbuhan lebih baik dibandingkan kontrol. Peningkatan tinggi tanaman pada tanaman padi dengan perlakuan bakteri endofit mencapai lebih dari 30%, sedangkan untuk tanaman tomat dengan perlakuan endofit JRK5-4, KAT5-1 dan BAT2-2 mampu meningkatkan pertumbuhan mencapai 51-73%. Bakteri endofit isolat BAT2-2 mampu menekan jumlah puru Meloidogyne spp. pada tanaman tomat sebesar 31.4%, sedangkan isolat YRK5-3 mampu mengurangi kerusakan akar akibat Meloidogyne spp. sebesar 34%. Perlakuan bakteri endofit YRK5-3 terhadap tanaman tomat yang diinokulasi R. solanacearum dan Meloidogyne spp. mampu menurunkan jumlah puru akar hingga 31.2% serta kerusakan akar hingga 39.1%. Bakteri endofit isolat BAT2-2 mampu memperpanjang masa inkubasi, dan mengurangi intensitas penyakit sebesar 37.5%. Secara umum perlakuan bakteri endofit KAK2-8 mampu meningkatkan pertumbuhan tanaman tomat, jumlah daun, panjang akar, persentase berbunga, bobot basah hingga bobot kering tanaman.
Keyword: Agens biokontrol, enzim pendegradasi, pemacu pertumbuhan

Judul: Isolasi Bakteri Endofit dan Penguj ian Potensinya untuk Mengendalikan Nematoda Meloidogyne spp. pada Tanaman Tomat (Lycopersicon esculentum Mill.)
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi dan menguji bakteri endofit yang berasal dari tanaman tomat dan cabai untuk mengendalikan nematoda Meloidogyne spp. serta mengetahui pengaruhnya terhadap pertumbuhan tanaman. Bakteri endofit diisolasi dari pertanaman tomat dan cabai yang berasal dari daerah Bogor dan Malang. Isolasi bakteri endofit dengan menggunakan metode sterilisasi permukaan dan homogenisasi jaringan. Sterilisasi permukaan jaringan menggunakan ethanol 80 % dan NaOCl 3 % dan 1,5 %. Bakteri yang didapat selanjutnya dimurnikan dan disimpan dalam media Trytic Soy Broth (TSB) yang dicampur dengan glycerin 20 % pada suhu -79°C sebagai stok. Pengujian bakteri endofit dilakukan secara in vitro dan in vivo. Pengujian in vitro bertujuan untuk melihat pengaruh kultur filtrat bakteri endofit terhadap ketahanan hidup larva Meloidogyne spp., sedangkan uji in vivo bertujuan untuk melihat pengaruh sel bakteri yang diinokulasikan pada tanaman terhadap pertumbuhan tanaman dan pembentukan puru akar yang disebabkan oleh Meloidogyne spp. pada tanaman tomato Uji in vivo dilakukan dirumah kaca Institut Pertanian Bogor dengan metode perlakuan tanah dan perlakuan benih. Hasil uji in vitro menunjukkan bahwa perlakuan isolat bakteri endofit berpengaruh terhadap tingkat ketahanan hidup larva Meloidogyne spp.. Hasil uji di rumah kaca menunjukkan bahwa perlakuan bakteri endofit pada tanaman tomat dapat menekan pembentukan puru akar yang disebabkan oleh Meloidogyne spp. Identifikasi isolat bakteri uji dilakukan dengan melihat karakteristik koloni bakteri dan dengan beberapa pengujian yaitu uji gram (KOH 3 %), pewarnaan gram, uji bakteri tahan panas dan uji flourescent. Hasil identifikasi menunjukkan isolat bakteri uji yang digunakan adalah dari genus Bacillus sp. dan bakteri Pseudomonas flourescent.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: