Judul: dentification of Nitrilase Gene Existence in Soil Sample Using Metagenomic Approach.
Abstrak: Nitrilase merupakan enzim yang berperan dalam biotransformasi senyawa nitril (R-CN) secara langsung, sehingga menghasilkan asam karboksilat dan amonia. Selama dekade terakhir ini, beberapa proses pada bidang farmasi maupun industri mengarah kepada proses biotransformasi dengan enzim nitrilase dibandingkan dengan sintesis kimiawi. Beberapa bakteri yang dilaporkan memiliki enzim nitrilase, antara lain Rhodococcus, Grobacterium, dan Pseudomonas. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi keberadaan gen nitrilase dari sampel tanah dengan pendekatan metagenomik. Tiga bakteri kontrol nitrilase dianalisis dengan metode polymerase chain reaction (PCR) menggunakan primer yang telah didesain (H1F-H1R). Deteksi gen nitrilase dengan menggunakan primer H1F-H1R terhadap ketiga isolat bakteri yang telah terbukti memiliki kemampuan dalam biotransformasi senyawa asetonitril menjadi asam asetat menunjukkan bahwa ketiga isolat bakteri tersebut mengandung fragmen gen nitrilase. Keberadaan gen nitrilase dalam tanah dapat diidentifikasi dengan ekstraksi DNA secara langsung dan amplifikasi gen nitrilase dengan primer H1F-H1R. Hasil analisis dengan BLASTN memperlihatkan bahwa fragmen DNA yang diamplifikasi dengan primer H1F-H1R mempunyai homologi yang tinggi yaitu sebesar 98% terhadap Rhodococcus rhodochrous strain tg1-A6 nitrilase gene. Hasil amplifikasi dan sekuensing fragmen DNA ini menunjukkan bahwa keberadaan gen nitrilase pada sampel tanah dapat diidentifikasi dengan pendekatan metagenomik.
Keyword: 

Judul: ABSTRACT  HENDRA MUNANDAR. Detection of Nitrilase Gene as Probe for Detecting Rhodococcus Degrading Nitrile in Sponge-Associated Microbe Community
Abstrak: Biodegradasi nitril telah lama dikaji dan semakin intensif, hal ini sehubungan dengan peranan sistem biokonversi nitril yang banyak diaplikasikan sebagai agen biokatalis dalam menghasilkan berbagai senyawa kimia intermediat. Salah satu enzim yang terlibat dalam biodegradasi nitril adalah nitrilase (EC 3.5.5.1) yang berfungsi menghidrolisis nitril menjadi asam karboksilat dengan melepaskan amonium. Nitrilase telah banyak dipakai di industri, salah satu contohnya adalah produksi lipitor sebagai senyawa statin yang berfungsi menurunkan tingkat kolesterol oleh Pfizer. Meningkatnya perhatian kepada nitrilase mendorong usaha-usaha eksplorasi untuk mendapatkan sumberdaya genetik nitrilase, karena masih terbuka peluang besar untuk menemukan nitrilase dengan aktivitas dan tingkat kestabilan yang tinggi. Kelompok bakteri yang banyak dilaporkan sebagai pendegradasi nitril yang unggul adalah Rhodococcus, sehingga kemungkinan besar berpotensi menyimpan sumber daya genetik nitrilase dengan kemampuan tinggi. Eksplorasi yang dilakukan untuk mendapatkan nitrilase umumnya dari daerah yang tercemar atau terpapar limbah nitril yang terbatas pada wilayah daratan (terestrial), dan masih jarang yang melakukan dari lingkungan laut. Sebagai bakteri Gram positif Rhodococcus memiliki daya tahan hidup yang luar biasa hingga mampu hidup di lingkungan yang cukup ekstrim, termasuk di daerah dengan kadar salinitas yang tinggi. Hal ini terungkap dari penelitian yang menemukan spesies Rhodococcus hidup di dasar (sedimen) laut dalam, sehingga potensi menemukan bakteri tersebut di lingkungan laut terbuka luas. Salah satu potensi sumber daya mikroba di laut adalah mikroba asosiasi spons, yang telah banyak diteliti menyimpan banyak potensi untuk bidang farmasi dan kimiawi. Tingginya komposisi mikroba dalam tubuh spons yang mencapai 40-60% dari bobot tubuh spons menjadikan spons tampak sebagai fermentor alami, dengan kepadatan mikroba mencapai 109 sel/ml spons merupakan peluang besar untuk digali potensinya. Penelitian ini bertujuan untuk melacak Rhodococcus sebagai bakteri pendegradasi nitril yang hidup sebagai bakteri asosiasi spons, dengan cara melacak keberadaan gen nitrilase sebagai salah satu enzim yang berperan dalam sistem biodegradasi nitril mikrobial. Metode yang dipakai didasarkan atas reaksi polimerase chain reaction (PCR) menggunakan primer spesifik untuk gen target, sehingga diperlukan primer yang tepat agar bisa mengamplifikasi gen nitrilase dari DNA genom total bakteri asosiasi spons. Untuk mendapatkan primer yang tepat diperlukan DNA acuan sebagai template bagi pengujian primer hasil desain, oleh karena itu langkah pertama yang dilakukan adalah penapisan untuk menemukan isolat kontrol positif dari kelompok Rhodococcus. Penapisan dilakukan dengan menggunakan media selektif yang hanya memakai senyawa nitril sebagai satu-satunya sumber nitrogen, karbon dan energinya. Isolat yang mampu tumbuh menandakan mampu mendegradasi senyawa nitril dan memiliki sistem enzim pendegradasi nitril., Nitrilase, an hydrolizing enzyme that convert nitrile compounds into corresponding carboxilic acid, is important enzyme for producing several intermediate compounds. Related to stability as an encounter problem of nitrilase, it is required new genetic resources to acquire the better enzyme. Related to megabiodiversity of Indonesia’s natural resources, one of potential sources to be explored is from sponge-microbe association. Gene encoded nitrilase was screening by PCR method with H1 primer that designing based on Rhodococcus genus that known as superior nitrile degrading bacteria. Formerly determining positive control isolate, and TPIK isolate that previously identified as Rhodococcus pyridinivorans was selected. Amplification to the positive control isolate (TPIK) was resulted 914 bp fragment which identified as nitrilase gene that 98% has similar with
Keyword: Rhodococcus, Nitrilase, Nitrile, Biodegradation, Songe-associated microorganism

Judul: Integration of Islamic Stock Markets of OIC Countries Before and During the Russia-Ukraine War Crisis
Abstrak: Pasar saham yang terintegrasi memberikan dampak negatif seperti percepatan co-movement (pergerakan bersama) yang rentan terhadap guncangan ekonomi, maupun krisis pasar global ke pasar domestik. Salah satu krisis yang terjadi pada tahun 2022 adalah perang Rusia-Ukraina yang berdampak pada pasar saham, termasuk pada saham syariah yang dipercaya lebih tahan terhadap guncangan krisis global. Penelitian ini bertujuan untuk meneliti perkembangan, integrasi dan respon lima pasar saham syariah negara OKI pada perang Rusia-Ukraina. Metode yang digunakan adalah VAR/VECM pada indeks DJIMMT25, SPSADS, SPSUAEDS, JII, DJIMT, SPBMIR, dan SPBMIU. Hasil penelitian menunjukkan pergerakan yang sama pada pasar saham UAE dan Arab Saudi, sedangkan Turki mengalami tren positif selama perang. Pasar saham syariah negara OKI selama periode perang Rusia-Ukraina terkointegrasi, sementara pasar saham Malaysia memengaruhi pasar saham syariah empat negara OKI lainnya. Hasil IRF menunjukkan terdapat efek permanen pada volatilitas pasar saham syariah negara OKI akibat guncangan yang diberikan. Namun, respon volatilitas relatif kecil karena kontribusi guncangan lebih didominasi oleh pasar saham itu sendiri, An integrated stock market has negative impacts, such as accelerating co-movement, which is vulnerable to economic shocks and global market crises on the domestic market. One of the crises in 2022 was the Russia-Ukraine war which impacted the stock market, including Sharia stocks which were believed to be more resistant to the shocks of the global crisis. This study examines the development, integration, and response of OIC countries five Islamic stock markets in the Russia-Ukraine war. The method used is VAR/VECM on the DJIMMT25, SPSADS, SPSUUAEDS, JII, DJIMT, SPBMIR, and SPBMIU indices. The results show the same movement in the UAE and Saudi Arabia stock markets, while Turkey experienced a positive trend during the war. The Islamic stock market of the OIC countries during the Russia-Ukraine war was cointegrated. In contrast, the Malaysian stock market influenced the Islamic stock markets of the other four OIC countries. The IRF results show a permanent effect on the volatility of the Islamic stock market in OKI countries due to the shocks given. However, the volatility response is relatively small because the stock market itself dominates the contribution of shocks.
Keyword: co-movement, OIC, Rusia-Ukraine war, sharia stock market integration