Judul: Asosiasi Polimorfisme Gen Cytochrome P450 2A6 (CYP2A6) terhadap Asam Lemak Domba
Abstrak: Cytochrome P450 2A6 (CYP2A6) merupakan gen yang mengkodekan anggota dari enzim sitokrom P450 superfamily yang berkontribusi dalam proses oxidasi asam lemak mikrosomal. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi keragaman dan mengetahui asosiasi gen CYP2A6 dengan asam lemak pada domba. Total sampel yang digunakan sebanyak 55 ekor yang terdiri dari 20 ekor domba ekor gemuk (DEG), 15 ekor domba ekor tipis (DET), 10 ekor domba komposit garut (DKG) dan 10 ekor domba compass agrinak (DCA). Identifikasi keragaman gen CYP2A6 dianalisis menggunakan Polymerase Chain Reaction - Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP). Ukuran produk amplifikasi adalah 286 bp. Keragaman hanya ditemukan pada DEG dan DET dengan genotipe GG dan GT, sedangkan DKG dan DCA bersifat monomorfik dengan genotipe TT. Uji Chi square menunjukkan bahwa lokus CYP2A6 berada pada keseimbangan Hardy-Weinberg untuk DEG dan DET, sedangkan DKG dan DCA menyimpang dari keseimbangan. Hasil analisis menunjukkan SNP g.49170107 G>T gen CYP2A6 berasosiasi secara signifikan (P<0.05) dengan dengan konten lemak, total asam lemak jenuh, asam kaprat (C10:0), asam heptadekanoat (C17:0), asam stearat (C18:0), asam heneikosanoat (C21:0), asam behenat (C22:0), asam trikosanoat (C23:0), asam lignoserat (C24:0), asam lemak tidak jenuh total, MUFA total, asam palmitoleat (C16:1), asam elaidat (C18:1n9t), asam oleat (C18:1n9c), asam nervonat (C24:1), PUFA total, asam linolenat (C18:3n3), asam у-linolenat (C18:3n6), asam cis-11,14-eikosedinoat (C20:2), asam homo-у-linolenat (C20:3n6), dan asam arakidonat (C20:4n6). Gen CYP2A6 berpotensi digunakan sebagai penanda seleksi terhadap komposisi asam lemak pada domba.
Keyword: asam lemak, gen CYP2A6, domba, PCR-RFLP

Judul: Keragaman Gen Transforming Growth Factor Beta Receptor 2 (TGFBR2) dan Kaitannya terhadap Asam Lemak pada Domba
Abstrak: Transforming Growth Factor Beta Receptor 2 (TGFBR2) merupakan gen yang berperan penting dalam banyak proses seluler termasuk pertumbuhan, diferensiasi, dan apoptosis. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keragaman dan asosiasi TGFBR2 sebagai gen kandidat untuk komposisi asam lemak pada domba. Sampel domba yang digunakan sebanyak 47 ekor terdiri dari domba ekor gemuk, domba ekor tipis, dan domba komposit garut masing-masing sebanyak 20, 17, dan 10 sampel. Identifikasi keragaman gen TGFBR2|TaqI dianalisis menggunakan Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP). Ukuran produk amplifikasi adalah 488 bp. Hasil keragaman gen TGFBR2 pada semua populasi domba adalah polimorfik dengan 3 genotipe yaitu AA, AG, dan GG. Uji Chi square menunjukkan bahwa lokus TGFBR2 berada pada keseimbangan Hardy-Weinberg untuk domba komposit garut, namun pada kedua populasi domba ekor gemuk dan ekor tipis menyimpang dari kesetimbangan Hardy-Weinberg. Asosiasi gen TGFBR2 berpengaruh nyata (P<0.05) dengan asam lemak jenuh (ALJ) termasuk asam pentadekonoat (C15:0), asam lemak tak jenuh tunggal (ALTJT) yaitu asam miristoleinat (C14:1) dan asam lemak tak jenuh ganda (ALTJG) yaitu asam γ-linolenat (C18:3n6). SNP gen TGFBR2 memiliki potensi untuk dijadikan sebagai penanda genetik untuk seleksi komposisi asam lemak tak jenuh pada domba.
Keyword: asam lemak, gen TGFBR2, PCR-RFLP

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: