Judul: Analisis Penambatan Molekul Senyawa Aktif Brotowali (Tinospora cordifolia) pada Enzim PPAR-γ sebagai agen Antidiabetes
Abstrak: Penambatan molekuler merupakan metode komputasi yang digunakan untuk memprediksi interaksi antara ligan dan reseptor. Senyawa aktif dari Brotowali (Tinospora cordifolia) telah terbukti memiliki potensi sebagai anti diabetes namun potensi dari masing-masing senyawa belum diketahui. Simulasi penambatan molekuler telah dilakukan untuk menguji potensi dari masing-masing senyawa terhadap enzim PPAR-γ dengan parameter energi ikat, binding site similarity (BSS) dan Konstanta Inhibisi. Senyawa aktif yang digunakan adalah Berberine, Isocolumbin, Jatrorrhizine, Magnoflorine, Palmatine dan Tinosporin sebagai ligan uji. Senyawa kontrol yang digunakan adalah Rosiglitazone. Hasil simulasi menunjukan tidak ada senyawa aktif brotowali yang memiliki energi ikat lebih kuat dibandingkan dengan energi ikat rosiglitazone. Presentase BSS yang paling besar dimiliki oleh Berberine dengan presentase sebesar 52%.
Keyword: Enzim PPAR-γ, penambatan molekuler, Tinospora cordifolia

Judul: Analisis Penambatan Molekul Senyawa Aktif Pare (Momordica charantia) pada Enzim Maltase Glucoamylase untuk Agen Anti- Diabetes.
Abstrak: Molecular Docking dengan reseptor adalah metode komputasi terkenal yang digunakan untuk memprediksi interaksi antara dua molekul. Senyawa fenolik pare (Momordica charantia) sudah terbukti memiliki khasiat dalam pengobatan diabetes namun belum diketahui potensi dari masing-masing senyawa tersebut. Kontrol yang digunakan untuk bahan pembanding bagi ligan uji yaitu miglitol. Parameter yang di analisis yaitu energi ikat (ΔG), konstanta inhibisi (Ki), dan binding site similarity (BSS). Senyawa fenolik yang diuji adalah glitazone, pioglitazone, voglibose, ferulic acid, gallic acid, caffeic acid, p-coumaric, gentisic acid, chlorogenic acid, cianidanol. Hasil simulasi menunjukkan senyawa flavonoid antioksidan cianidanol yang dapat menghambat aktivitas enzim maltase glucoamylase dengan nilai energi ikat sebesar -6.7 kkal mol-1 dibandingkan dengan energi ikat miglitol bernilai -5.4 kkal mol-1. Persentase BSS senyawa cianidanol dibandingkan dengan ligan kontrol miglitol yaitu 94.73% menandakan posisi penambatan yang hampir mirip dan memiliki mekanisme yang serupa seperti pada miglitol. Dapat disimpulkan pula bahwa senyawa flavonoid adalah inhibitor maltase glucoamylase alami.
Keyword: maltase glucoamylase, pare, penambatan molekuler, senyawa fenolik

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: