Judul: In Silico Study of Cu/Zn-SOD Enzyme Activator and In Vitro Antioxidant Activity of Red Betel (Piper crocatum Ruiz & Pav) From Various Regions in Indonesia
Abstrak: Penyakit degeneratif seperti jantung koroner, kanker, dan stroke merupakan penyakit yang menjadi masalah serius di Indonesia yang diakibatkan oleh radikal bebas dan dapat dicegah dengan senyawa antioksidan. Senyawa antioksidan alami terdiri atas dua jenis yaitu antioksidan enzimatik dan non enzimatik. Superoksida dismutase merupakan antioksidan enzimatik yang mengkatalisis pemutusan dua molekul anion superoksida (O2-) menjadi hidrogen peroksida (H2O2) dan molekul oksigen (O2). Penelitian sebelumnya berhasil mengisolasi senyawa bioaktif yang terkandung di dalam sirih merah, mengandung senyawa flavonoid, alkaloid dan tanin, serta senyawa sirih merah guanidine tartratre dapat meningkatkan enzim glutation peroksidase yang merupakan enzim antioksidan. Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari senyawa aktif sirih merah yang berperan aktif dalam meningkatkan enzim Cu/Zn superoksida dismutase secara in silico serta mengukur kadar total fenolik dan aktivitas antioksidan ekstrak etanol sirih merah dari daerah Banda aceh, Bogor, Bandung, Jogja, Samarinda, Jayapura, Kendari, dan Malang secara in vitro. Penambatan molekuler 69 senyawa aktif sirih merah dan dua ligan pembanding (Trehalosa dan β-amyrin) dilakukan dengan menggunakan YASARA Structure diperoleh senyawa Amino-2-(3-aminopropylamino)-9-(cyclohexylmethyl)- 2,3,4,5,6,7-hexahydro-1H-purin-8-one yang dapat berperan dan meningkatkan enzim Cu/Zn superoksida dismutase dengan nilai energi afinitas -9.1490 kkal/mol, konstanta disosiasi 1.967 µM dan membentuk ikatan hidrogen pada Val7(B), Val146(B), Val146(A), Val5(A), dan Gly49(B). Sedangkan interaksi hidrofobik terjadi pada residu asam amino Asn51(A), Gly145(B), Cys6(A), Val7(A), Asn51(B), Gly54(B), Lys9(B), dan Lys9(A). Hasil in vitro ekstrak etanol 70% sirih merah menunjukkan kadar total fenolik tertinggi diperoleh dari daerah Malang dengan nilai 12.570 mg GAE/g dan nilai peredam DPPH terbaik diperoleh dari daerah Bogor dengan nilai 55.096 µg/mL.
Keyword: Antioksidan, Cu/Zn Superoksida Dismutase, DPPH, Sirih merah, Total Fenolik

Judul: Penambatan molekuler senyawa bioaktif sirih merah (Piper crocatum) terhadap lipoksigenase dan penghambatan malondialdehid in vitro
Abstrak: Penyakit degeneratif terjadi karena beberapa faktor risiko yang berhubungan langsung dengan peradangan. Salah satu agen penyebab inflamasi adalah enzim lipoxygenase (LOX) yang dapat membentuk malondialdehid (MDA) sehingga dibutuhkan obat antiinflamasi yang terbuat dari tanaman herbal salah satunya daun sirih merah (Piper crocatum). Penelitian ini bertujuan menentukan senyawa asal dari ekstrak dan fraksi etanol 70% daun sirih merah yang memiliki penghambatan terbaik terhadap enzim lipoksigenase penyebab terbentuknya malondialdehid (MDA) melalui simulasi penambatan molekuler serta menentukan aktivitas antioksidan tertinggi dari 4 daerah berbeda di pulau Jawa dengan metode thiobarbituric acid (TBA). Senyawa daun sirih merah yang mampu menghambat enzim lipoksigenase yakni ligan nandrolone phenylpropionate dan sofalcone dengan energi afinitas sebesar -10.4 kkal/mol dan -9.1 kkal/mol dengan nilai Ki sebesar 0.0023 µM dan 0.021 µM. Aktivitas antioksidan daun sirih merah terbaik dari daerah asal Bogor ekstrak etanol 70% dengan nilai IC50 sebesar 0.432 µg/mL. Perbedaan kekuatan antioksidan tiap daerah dilakukan analisis PCA dengan hasil tidak terbentuk kluster sehingga antar daerah memiliki karakteristik yang sama, Degenerative diseases occured due to several risk factors which directly related to inflammation. One of the causative agents of inflammation is the lipoxygenase (LOX) enzyme which can form malondialdehyde (MDA) so that anti-inflammatory drugs are needed made from herbal plants such as red betel leaf (Piper crocatum). This study aimed to determine the origin of the compound from the 70% ethanol extract and fraction of red betel leaf which had the best inhibition of the lipoxygenase enzyme that causes malondialdehyde (MDA) formation through molecular docking simulations and to determine the highest antioxidant activity from 4 different areas in Java islands with thiobarbituric acid (TBA) method. Red betel leaf compounds that can inhibited lipoxygenase enzymes are nandrolone phenylpropionate and sofalcone ligands with affinity energies of -10.4 kcal/mol and -9.1 kcal/mol with Ki values of 0.0023 µM and 0.021 µM, respectively. The best antioxidant activity of red betel leaf came from Bogor of 70% ethanol extract with an IC50 value of 0.432 µg/mL. The difference in antioxidant strength of each region was carried out by PCA analysis with the results no clusters were formed so that between regions had the same characteristics.
Keyword: Antioksidan, Daun Sirih Merah, Lipoksigenase, Malondialdehid

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: