Judul: Study of the Interaction of Bestatin and Aminopeptidase N3 in Toxoplasma gondii by In Silico
Abstrak: Toxoplasma gondii telah menginfeksi sebanyak 30% populasi mamalia di dunia. Parasit ini jika menginfeksi wanita hamil dapat menimbulkan kebutaan, retardasi mental, bahkan kematian pada janin. Di Amerika selatan ditemukan isolat tipe baru T. gondii yang resistan terhadap berbagai macam obat anti-T. gondii. T. gondii Aminopeptidase N3 (TgAPN3) merupakan target potensial penambatan molekul yang memilki spesifitas tertinggi pada asam amino alanin. Ligan 4 memiliki stabilitas ikatan lebih baik dibanding ligan 9 pada TgAPN3 karena adanya ikatan koordinasi dengan ion zink yang berperan kuat dalam interaksi protein-ligan. Ligan A10 merupakan kandidat obat anti-T. gondii terbaik dengan terminal C mengandung elektron terkonjugasi, rantai siklik, dan non polar. Konfigurasi ligan A10 terbaik diperoleh dengan adanya kesesuaian bagian hidrofobisitas dengan TgAPN3 serta interaksi intramolekul antar rantai hidrofobik yang juga ditemukan pada ligan A1, A4, dan A6., Toxoplasma gondii has infected 30% of the world's mammal population. If this parasite infects pregnant women, can cause blindness, mental retardation, and death in the fetus. In South America, isolates of a new type of T. gondii were found that were resistant to various anti-T. gondii drugs. T. gondii Aminopeptidase N3 (TgAPN3) is a potential target for molecular docking that has the highest specificity for the alanine amino acid. Ligand 4 has better bond stability than ligand 9 in TgAPN3 because of the coordination bonds with zinc ions which play a strong role in protein-ligand interactions. Ligand A10 is the best candidate for the anti-T. gondii drug with a C terminal containing conjugated electrons, cyclic chain, and non-polar. The best configuration of the ligand A10 was obtained by the suitability of the hydrophobicity section with TgAPN3 and the intramolecular interactions between hydrophobic chains which were also found in the ligands A1, A4, and A6.
Keyword: aminopeptidase N, bestatin, molecular docking, Toxoplasma gondii, aminopeptidase N, bestatin, molecular docking, Toxoplasma gondii

Judul: The Effect of PfDHFR-TS 3D Protein Structure Mutations on Binding of Drug Candidates: Molecular Docking Study
Abstrak: Plasmodium falciparum adalah jenis parasit malaria yang menyerang manusia dengan infeksi paling parah. Plasmodium falciparum dihydrofolate reductase-thymidylate synthase (PfDHFR-TS) adalah pasangan enzim yang bertanggung jawab atas infeksi di dalam sel darah manusia. Mutasi double dan quadruple asam amino pada domain protein DHFR menyebabkan resistansi terhadap pyrimethamine dan cycloguanil sebagai antifolat. Penambatan molekul digunakan pada antifolat untuk mengkaji pengaruh mutasi protein PfDHFR. Penambatan molekul digunakan pula pada 137 senyawa aktif tanaman untuk memperoleh senyawa yang memiliki potensi menghambat protein yang belum termutasi (wild-type) dan telah termutasi (mutan). Penambatan molekul menggunakan parameter seperti energi bebas Gibbs, ikatan hidrogen dan interaksi hidrofobik untuk menentukan afinitas pengikatan senyawa aktif pada protein. Enam senyawa aktif yaitu korupensamine a, dihydrousambarensine, cryptoquindoline, lactupicrin, cryptolepicarboline dan artoindonesianin a-2 memiliki pengikatan kuat pada protein wild-type dan mutan PfDHFR., Plasmodium falciparum is a type of malaria parasite that attacks humans with the most severe infection. Plasmodium falciparum dihydrofolate reductase-thymidylate synthase (PfDHFR-TS) is an enzyme pair responsible for infection in human blood cells. Double and quadruple amino acid mutations in the DHFR protein domain cause resistance to pyrimethamine and cycloguanil as antifolates. Molecular docking was carried out on antifolates to study the effect of mutations in the PfDHFR protein. Molecular docking was also carried out on 137 plant active compounds to obtain compounds that have potential to inhibit wild-type and mutant protein. Molecular docking uses parameters such as Gibbs free energy, hydrogen bond and hydrophobic interaction to determine the binding affinity of the active compounds to the protein. Six active compounds such as korupensamine a, dihydrousambarensine, cryptoquindoline, lactupicrin, cryptolepicarboline and artoindonesianin a-2 have strong binding to wild type and mutant PfDHFR protein.
Keyword: binding affinity, molecular docking, mutation, Plasmodium falciparum

Judul: Karakteristik Suara Song Burung Kenari (Serinus canaria) Postur Besar dan Kecil.
Abstrak: Burung kenari (Serinus canaria) memiliki nyanyian yang sangat bervariasi dengan durasi yang panjang dan merupakan tipe burung bernyanyi open learners. Penelitian ini bertujuan menganalisis karakteristik suara song burung kenari (Serinus canaria). Penelitian dilakukan pada bulan April sampai Juni 2017 di Bogor, Jawa Barat. Perekaman suara song terhadap 12 ekor burung kenari jantan dilakukan dengan menggunakan mikrofon Sennheiser ME66 dan alat perekam Sony PCM-D50. Burung kenari yang digunakan merupakan burung yang pernah mengikuti kontes burung kicau dan memiliki predikat juara kontes burung. Amplitudo, durasi suara, frekuensi, dan volume suara burung dianalisis dengan menggunakan software Raven Pro 1.4. Data tersebut selanjutnya dianalisis deskriptif. Hasil analisis suara menunjukkan bahwa burung kenari memiliki banyak syllable, suara song rapat dan tidak terputus-putus, tempo yang cepat, dan adanya pengulangan suku kata pada setiap suara song. Burung kenari postur kecil memiliki rataan durasi lebih panjang dibandingkan dengan kenari postur besar, tetapi burung kenari besar memiliki rataan max amplitudo, average power, max power, min amplitudo, peak amplitudo, dan peak frekuensi.
Keyword: karakteristik suara (song), kenari, syllable