Judul: Distribusi Sedimen Pantai di Ujung Genteng, Sukabumi, Jawa Barat
Abstrak: Distribusi sedimen pantai Ujung Genteng dipengaruhi oleh karakteristik hidrooseanografi Samudera Hindia. Penelitian ini bertujuan mempelajari sebaran jenis dan ukuran butir sedimen pantai dan kaitannya dengan kemiringan pantai dan dinamika perairan Samudera Hindia. Sampel sedimen diambil di enam titik pengamatan dan dianalisis dengan menggunakan metode pengayakan kering. Data hidrooseanografi di wilayah Ujung Genteng dianalisis secara spasial dan temporal, dan data kemiringan pantai dianalisis secara spasial. Pada Musim Barat, tinggi gelombang berkisar 0.99-2.95 m dengan kecepatan arus 0.10-127.60 cm s-1 dan curah hujan 321-590 mm/bulan, sedangkan pada Musim Timur tinggi gelombang berkisar 0.96-3.74 m dengan kecepatan arus berkisar 0.14-104.87 cm s-1 dan curah hujan 0-59 mm/bulan. Tipe kemiringan pantai di seluruh stasiun termasuk kategori pantai datar. Sedimen di Ujung Genteng didominasi oleh pasir sangat kasar dan pasir sedang dimana semakin kearah selatan ukuran butir sedimen semakin besar. Tinggi gelombang dan kecepatan arus yang lebih besar di bagian selatan menyebabkan ukuran butir sedimen yang lebih kasar dan kemiringan pantai yang lebih besar dari pada di bagian utara.
Keyword: sedimen, kemiringan pantai, Ujung Genteng, arus, gelombang

Judul: Distribusi Sedimen di Sekitar Muara Sungai Cimandiri Teluk Palabuhanratu Sukabumi.
Abstrak: Muara Sungai Cimandiri yang terletak di kepala Teluk Palabuhanratu memberikan masukan sedimen yang cukup besar ke perairan teluk. Penelitian ini bertujuan mempelajari dinamika perairan dan pengaruhnya terhadap sebaran ukuran butir sedimen. Penelitian ini juga memetakan sebaran sedimen di sepanjang pesisir muara Sungai Cimandiri. Sedimen dianalisis dengan fraksinasi dan metode pipet. Data pasang surut, curah hujan, dan debit sungai dianalisis secara time series sedangkan gelombang menggunakan MIKE 21 Spectral Wave FM. Titik pengambilan sampel dilakukan di sepanjang pesisir utara Muara Sungai Cimandiri hingga ke bagian selatan. Pada Musim Barat curah hujan dapat mencapai 726 mm dengan debit sungai sebesar 668.82 m3/s dan menghasilkan masukan sedimen sebesar 189.6 kg/s selanjutnya kecepatan arus di Musim Barat sebesar 11.6-21.7 cm/s dengan tinggi gelombang mencapai 1.05 m, sedangkan pada Musim Timur arus mampu mencapai 13.0-16.1 cm/s, tinggi gelombang 0.9 m, curah hujan 129 mm, dan debit sungai sebesar 376.87 m3/s sehingga masukan sedimen ke perairan hanya 10.62 kg/s. Sedimen yang berada di wilayah penelitian menunjukkan fraksi butir sangat halus, fraksi sedimen pada bagian utara sedikit kasar dibandingkan bagian selatan. Pengaruh jetty menghalangi sebaran sedimen ke utara sedangkan pengaruh penambangan pasir membuat ukuran sedimen di muara sungai lebih halus karena fraksi sedimen kasar diambil untuk penambangan pasir.
Keyword: fraksinasi, sedimen, metode pipet, muara Sungai Cimandiri

Judul: Cloning and Structure Prediction of C-Type Lectin 19 (CTL-19) from Silkworm (Bombyx mori L.)
Abstrak: Bombyx mori L. is a highly significant insect due to its silk production affects several industries. Unfortunately, B. mori farming has recently experienced mortality issues caused by pathogenic infectious diseases. Despite the extensive study of innate immunity of B. mori, information regarding the molecular functions and mode of actions of C-type lectin 19 (CTL-19) in the innate immunity of B. mori remains limited. Therefore, this study aimed to predict the structure of the B. mori CTL-19 also clone and produce the recombinant protein to better understand its role in the silkworm's innate immunity. The open reading frame (ORF) of the CTL-19 gene (945bp) was successfully amplified and cloned to pGEM®-T Easy Vector. The mature protein consists of 294 amino acids with 2 CRDs, 9 conserved cysteine, and two specific carbohydrate binding motifs. Protein threading demonstrated to be superior in order to predict the ligand binding site in comparison to homology modelling. The predicted molecular weight is 33.26 kDa, with pI value of 5.70. Furthermore, molecular docking analysis reveal that BmCTL-19 have ability to bind to various carbohydrate residues. The BmCTL-19 gene will be sub clone into an appropriate expression vector and produce purified recombinant protein to evaluate its properties.
Keyword: Innate immunity, Carbohydrate Binding Motif, Homology modelling, Protein Threading, Molecular docking