Judul: Korelasi Populasi Klebsiella Dan Jumlah Kopi Gen Penyandi Kobalt-Prekorin-5a-Deasilase (Cbig) Pada Tempe.
Abstrak: Klebsiella pneumoniae sebagai anggota dari famili Enterobacteriaceae merupakan salah satu mikrob yang penting dalam menghasilkan vitamin B12 pada tempe. Gen cbiG adalah salah satu gen penting pensintesis vitamin B12 yang mengkodekan kobalt-prekorin-5A-deasilase dan gen ini dimiliki oleh Klebsiella penghasil vitamin B12. Real Time Quantitative Polymerase Chain Reaction (qPCR) digunakan untuk mendeteksi dan mengkuantifikasi keberadaan mikrob, sekuen DNA tertentu, ekspresi gen dan lain sebagainya. Suatu sekuen DNA diamplifikasi, kemudian produk hasil amplifikasi dianalisis dan dikuantifikasi dalam waktu yang bersamaan secara real time. Korelasi antara jumlah populasi Klebsiella pada tempe dan kopi gen cbiG dilakukan menggunakan qPCR. Penelitian ini dilakukan untuk mengevaluasi korelasi jumlah populasi Klebsiella pada tempe dan jumlah kopi gen cbiG sebagai indikator produksi vitamin B12 pada tempe dengan tingkat kematangan berbeda (24, 48 dan 72 jam). Sampel tempe diambil dari pengrajin tempe Empang (EMP) dan Warung Jambu (WJB) di Bogor setelah fermentasi tempe selesai (36 jam) kemudian disimpan selama 24, 48 dan 72 jam pada suhu ruang. Kuantifikasi Klebsiella dari tempe dilakukan menggunakan metode pengenceran dan diinokulasikan pada Eosin Methylene Blue Agar (EMBA) menggunakan metode cawan sebar. Isolat Klebsiella yang tumbuh pada EMBA dihitung dan dilakukan uji aktivitas degradasi sitrat pada Simmons’ Citrate Agar (SCA). DNA total diekstraksi dari tempe EMP dan WJB dan digunakan sebagai cetakan (template) DNA untuk mengamplifikasi gen cbiG menggunakan dua pasang primer spesifik Klebsiella, cbiG-F dan cbiG-R dengan gen target 755 bp, serta cbiG-Fnew2 dan cbiG-Rnew2 dengan gen target 250 bp. Ekstrak DNA tempe EMP dan WJB juga digunakan sebagai cetakan untuk mengkuantifikasi kopi gen cbiG menggunakan primer cbiG-Fnew2 dan cbiG-Rnew2 melalui qPCR. Seluruh isolat Klebsiella dari tempe EMP dan WJB menunjukkan karakteristik khusus Klebsiella, yaitu berbentuk bulat, mukoid dan berwarna ungu di bagian tengah koloni pada EMBA. Klebsiella juga mampu mendegradasi sitrat yang terlihat melalui perubahan warna dari hijau menjadi biru pada SCA. Jumlah populasi Klebsiella meningkat berdasarkan tingkat kematangan tempe. Tempe umur 24 jam memiliki jumlah populasi Klebsiella yang lebih rendah dibandingkan tempe umur 48 jam, begitu pula tempe umur 48 jam memiliki jumlah populasi Klebsiella yang lebih rendah dibandingkan tempe umur 72 jam. DNA genom setiap sampel tempe berhasil diisolasi dan gen cbiG juga berhasil diamplifikasi menggunakan PCR. Pita hasil PCR memiliki intensitas yang beragam. Intensitas pita tersebut meningkat berdasarkan tingkat kematangan tempe yang menunjukkan bahwa tempe umur 72 jam memiliki gen cbiG yang paling tinggi dibandingkan dengan tempe umur 48 dan 24 jam. Hasil kuantifikasi kopi gen cbiG menggunakan qPCR menunjukkan bahwa jumlah kopi gen cbiG meningkat berdasarkan tingkat kematangan tempe. Penelitian ini menunjukkan bahwa jumlah populasi Klebsiella berkorelasi dengan jumlah kopi gen cbiG yang meningkat berdasarkan tingkat kematangan tempe tersebut.
Keyword: Gen cbiG, K pneumoniae, qPCR, Tempe, Vitamin B12

Judul: Mempelajari kemampuan inokulum terhadap produksi vitamin B-12 pada tempe kedelai (Glycine max)
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari kemampuan inokulum yang dibuat dengan menggunakan strain kapang Rhizopus oligosporus, Rhizopus arrhizus, dan bakteri Citrobacter freundii, serta Klebsiella pneumoniae dalam memproduksi vitamin B-12 pada tempe kedelai. Penelitian dilakukan di Laboratorium Teknologi Proses, BPP Teknologi di kawasan Puspiptek, Serpong dan Laboratorium Kimia Gizi, Jurusan Gizi Masyarakat dan Sumberdaya Keluarga, Fakultas Pertanian, Institut Pertanian Bogor, dari bulan April 1995 sampai Juli 1996. Bahan yang digunakan dalam penelitian ini adalah biakan murni R. oligosporus strain MS, R. oligosporus strain MS, R. oligosporus strain L1 R. arrhizus strain EN, C. freundii, K. pneumoniae, dan bakteri penguji Lactobacillus leichmannii ATCC 7830. Bahan lain yang digunakan adalah kedelai varietas wilis, beras pandan wangi, media MEA (Malt Extract Agar), media NA (Nutrient Agar), media uji vitamin B-12, dan bahan-bahan yang digunakan untuk ekstraksi serta analisa vitamin B-12. Alat yang digunakan adalah mikroskop binokuler, spektrofotometer (Bausch & Lomb tipe Spectronic 1001) serta alat-alat yang digunakan untuk ekstraksi dan analisa vitamin B-12. Penelitian dilakukan dalam dua tahap yaitu penelitian pendahuluan dan penelitian lanjutan. Penelitian pendahuluan dilakukan terhadap inokulum yang dibuat dengan menggunakan dua strain kapang satu bakteri. Tujuan dari penelitian pendahuluan ini adalah untuk menentukan satu dari tiga perbandingan dua strain kapang yang digunakan dalam pembuatan inokulum. Ketiga perbandingan strain kapang tersebut adalah 80:20, 50:50, dan 30:70. Perbandingan antara kapang dengan K. pneumoniae adalah 1:1 sedangkan perbandingan antara kapang dengan C. freundii adalah 19:1. Tempe kedelai yang dibuat dengan inokulum tersebut kemudian diuji secara organoleptik sehingga diperoleh satu perbandingan strain kapang yang paling disukai oleh panelis. Penelitian lanjutan bertujuan untuk mengetahui kadar vitamin B-12 tempe kedelai yang dibuat dengan menggunakan inokulum satu strain kapang, inokulum dua strain kapang, inokulum satu strain kapang satu bakteri, serta inokulum yang dibuat dengan menggunakan dua strain kapang satu bakteri berdasarkan hasil uji pendahuluan. Kadar vitamin B-12 diamati dengan menggunakan metode mikrobiologi (Pawiroharsono, 1991). Rancangan percobaan yang digunakan adalah desain acak sempurna dengan dua ulangan. Data hasil pengamatan dianalisa dengan uji sidik ragam desain acak sempurna dan uji lanjut Wilayah Berganda Duncan. Hasil penelitian menunjukkan bahwa kadar vitamin B-12 yang dibuat dengan inokulum kapang sangat rendah. Kadar vitamin B-12 pada tempe kedelai yang dibuat dengan menggunakan inokulum kapang ini adalah 7,935 ng/100 g bk (MS), 8,384 ng/100 g bk (L1), 7,288 ng/100 g bk (MS111 50:50), 8,211 ng/100 g bk (MS EN 80:20), 8,612 ng/100 g bk (MS-EN 50:50), 6,711 ng/100 g bk (MSEN 80:20), dan 8,181 ng/100 g bk (LEN 80:20). Penambahan bakteri pada inokulum berpengaruh nyata. terhadap perubahan kadar vitamin B-12 pada tempe kedelai. Vitamin B-12 pada tempe kedelai yang dibuat menggunakan inokulum bakteri meningkat 7907,300 -15263,031 $. Kadar vitamin B12 tempe kedelai untuk inokulum kapang K. pneumoniae (1:1) lebih tinggi dibandingkan inokulum kapang + C. freundii (19:1). Kadar vitamin B-12 tempe kedelai yang dibuat menggunakan inokulum kapang K. pneumoniae meningkat 11755, 678 - 15263,031 sedangkan kadar vitamin B-12 tempe kedelai yang dibuat menggunakan inokulum kapang + C. freundii meningkat 7907,300 -10304,813 %. Kadar vi- tamin B-12 tidak berbeda nyata antara inokulum MS, ENK 80:20 dengan MSCENCE 80:20. Tempe kedelai yang dibuat dengan menggunakan inokulum kapang C. freundii memiliki
Keyword: inokulum, vitamin B-12, tempe kedelai, Glycine max

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: