Judul: Mempelajari faktor-faktor pembuatan zimogram protease mikroba
Abstrak: Pengukuran aktivitas spesifik pada filtrat enzim yang belum murni dipengaruhi oleh keberadaan kontaminan, isozim, atau enzim-enzim lain yang segolongan sehingga tidak mewakili kondisi katalitik yang sebenarnya dari enzim subjek. Untuk menghilangkan faktor-faktor kesalahan tersebut, aktivitas enzim subjek dapat ditampakkan secara murni melalui teknik zimogram. Pada zimogram, aktivitas enzim ditampakkan secara in situ pada gel hasil elektroforesis, berupa pita yang merupakan enzim subjek. Teknik ini dapat bermanfaat untuk memperkirakan ukuran berat molekul dan konsentrasi enzim subjek yang ada. Adapun kendala penggunaan teknik ini adalah bagaimana memperoleh teknik zimogram yang tepat untuk menampilkan aktivitas enzim subjek. Dalam penelitian ini dipelajari faktor-faktor yang mempengaruhi kerberhasilan pembuatan zimogram protease mikroba, terutama dari Bacillus pumilus (YI) dan Xanthomonas campestris (axonopodis) pv. glycines (YR32). Dua macam teknik zimogram dicoba, yakni zimogram blotting film X-Ray dan zimogram kopolimerisasi substrat, dengan substrat yang dicoba adalah kasein, hemoglobin, albumin, dan gelatin. Larutan enzim B. pumilus (Y1), X. c. (a) pv. glycines (YR32), papain 0,5%, dan tripsin 2% yang diteteskan pada film X-Ray menampakkan aktivitas protease dengan lepasnya lapisan gelatin pada film. Meskipun demikian zimogram X-Ray ternyata tidak berhasil diterapkan bagi keempat cairan enzim yang disebut diatas. Zimogram ini baru memberikan hasil yang nyata pada enzim tripsin 20%. Dari hasil ini disimpulkan bahwa metode ini hanya cocok untuk protease yang memiliki konsentrasi dan/atau aktivitas yang tinggi yang hanya dapat dicapai melalui tingkat pemurnian yang tinggi. Pada zimogram kopolimerisasi substrat, kegagalan berupa penampakan aktivitas enzim berupa jalur bening atau tidak tampak aktivitas enzim karena tidak ada situs pemotongan oleh enzim. Pada sebab pertama selama elektroforesis enzim terikat oleh substrat sehingga migrasinya tidak mencapai posisi yang sebenarnya, karenanya perkiraan berat molekul tidak dapat dilakukan. Substrat kasein, hemoglobin, dan albumin, menampakkan aktivitas enzim berupa jalur bening untuk semua protease yang dicoba, kecuali protease X. c. (a.) pv. glycines (YR32) yang tidak menampakkan aktivitas enzim sama sekali pada substrat hemoglobin dan albumin. Substrat yang cocok untuk keperluan zimogram protease adalah gelatin, di mana pada kopolimerisasi gelatin 0,5% sistem SDS, protease X. c. (u) pv. glycines (YR32) menampakkan satu pita aktivitas protease yang diperkirakan memiliki berat molekul sekitar 45 kDa. Protease yang tampak ini diketahui merupakan protease serin karena terhambat oleh penambahan PMSF 1 mM. Filtrat enzim yang digunakan memiliki aktivitas sebesar 0,352 IU/ml dengan aktivitas spesifik 0,49 IU/mg. Protease B. pumilus (Y1) menampilkan 3 pita aktivitas enzim pada kopolimerisasi gelatin 0.5 % sistem non-SDS, dengan perkiraan berat molekul masing-masing sekitar 31 kDa, 27 kDa, dan 24 kDa. Ketiganya merupakan protease serin yang terhambat oleh PMSF 1 mM. Tiga pita aktivitas enzim ini tampak pada penggunaan sampel filtrat enzim yang memiliki aktivitas 0,435 IU/ml dengan aktivitas spesifik 0,64 IU/mg Pada filtrat enzim dengan aktivitas 0,210 IU/ml dan aktivitas spesifik 0,65 IU/mg hanya tampak pita yang berukuran 27 kD dan 24 kD.
Keyword: 

Judul: Karakterisasi protease baru dari baru dari beberapa isolat vibrio sp. asal laut
Abstrak: Protease merupakan biokatalisator yang memiliki nilai komersial yang tinggi. Protease mikroba memiliki potensi yang cerah untuk terus dikembangkan dalam rangka suplai kebutuhan protease yang terus meningkat. Produsen protease mikroba yang telah banyak diteliti dan dikembangkan adalah kapang dan bakteri gram positif. Sebenarnya beberapa bakteri gram negatif telah dilaporkan memiliki kemampuan proteolitik. Akan tetapi, protease dari bakteri gram negatif asli Indonesia belum banyak diteliti dan dikembangkan. Dari golongan Vibrio sp. yang berasal dari perairan laut Jawa Timur diharapkan diperoleh protease-protease baru dengan sifat-sifat yang menguntungkan. Seleksi awal mikroba penghasil protease ekstraselular dari sebanyak 54 isolat Vibrio sp. dilakukan dengan membandingkan nilai Indeks Proteolitik (IP) sehingga ditetapkan sepuluh isolat potensial yang memiliki nilai IP tertinggi. Seleksi lanjutan dilakukan dengan menentukan aktivitas kaseinolitik dari ekstrak kasar enzim yang diproduksi oleh kesepuluh isolat potensial tersebut. Dari tahap ini ditetapkan empat isolat terpilih yang memiliki aktivitas tertinggi yaitu: W4.3B, S9.4P, W4.2B dan W3.6B. Karakterisasi protease dilakukan terhadap ekstrak kasar enzim yang dihasil- kan oleh keempat isolat terpilih. Enzim-enzim ini aktif pada kondisi alkali dengan aktivitas optimum pada pH 8. Suhu optimum untuk aktivitas kaseinolitiknya berkisar antara 50-60°C. Enzim-enzim tersebut bersifat relatif stabil terhadap pemanasan pada suhu 50°C, bahkan untuk isolat S9.4P dan W3.6B aktivitas tersisa setelah pemanasan selama 60 menit masih melebihi setengah dari aktivitas awal. EDTA (1, 5, 10 mM) menunjukkan efek penghambatan yang lebih kuat di- bandingkan dengan PMSF/ fenilmetilsulfonil fluorida (1, 5, 10 mM). Penghambatan oleh EDTA maksimal pada taraf konsentrasi 1 mM untuk protease dari isolat $9.4P, W4.2B dan W3.6B serta taraf konsentrasi 5 mM untuk protease dari W4.3B sehing- ga aktivitas yang tersisa berturut-turut 24.45%, 21.95%, 39.68% dan 45.41%. Penghambatan oleh PMSF maksimal hanya menyebabkan penurunan hingga aktivitas tersisa sebesar 66.58% (taraf konsentrasi 5 mM) untuk protease dari isolat W4.3B sedangkan untuk yang lain sebesar 86.09% (S9.4P), 65.87% (W4.2B) dan 71.18% W3.6B) pada taraf konsentrasi 10 mM. ( Pada percobaan penambahan ion logam dalam bentuk garam kloridanya (2 mM) langsung terhadap ekstrak kasar enzim, protease dari isolat W4.3B meningkat aktivitasnya dengan penambahan ion logam Zn dan K masing-masing sebesar 59.61 % dan 58.64%. Protease dari isolat S9.4P sedikit meningkat aktivitasnya dengan penambahan ion Ca dan Co masing-masing sebesar 22.46% dan 22.21%, begitu juga dengan protease dari isolat W3.6B yang meningkat aktivitasnya sebesar 26.48% dan 35.00% karena penambahan ion Zn dan Mg. Penambahan ion logam relatif tidak berpengaruh pada protease dari isolat W4.2B. Penambahan beberapa ion logam dalam benuk garam kloridanya (2mM) pada ekstrak kasar enzim yang telah dihambat dengan EDTA (1 mM) menunjukkan terjadinya pemulihan aktivitas. Terlihat pula adanya pengaruh kombinasi ion logam ter- hadap fenomena pemulihan aktivitas tersebut. Aktivitas protease tersisa setelah penghambatan oleh EDTA untuk masing-masing isolat sebagai berikut: 34.60% (W4.3B), 30.66% (S9.4P), 32.51% (W4.2B), dan 39.97% (W3.6B). Aktivitas pro- tease dari isolat W4.3B setelah ditambah ion logam adalah 78.48% (Ca), 110.24% (Zn), 122.59% (Ca, Zn), 19.83% (K) dan 44.24% (Na). Untuk isolat S9.4P sebagai berikut: 83.75% (Ca), 65.86% (Zn), 96.40% (Ca, Zn), 92.39% (Co). Sedangkan pada isolat W4.2B adalah 79.15% (Ca), 89.41% (Zn), 92.95% (Ca, Zn). Dan pada isolat yang terakhir, W3.6B, sebagai berikut: 90.09% (Ca), 77.96% (Zn), 116.93%
Keyword: 

Judul: Characteristic of Overshooting Top (OT) Based on  Himawari  8  Satellite  as  a  Convective  Cloud  Feature  that  Generates  Extreme Weather in the Java Island Region
Abstrak: Overshooting Top (OT) is a feature at the top of a convective cloud that is associated with extreme weather. Research on OT in tropical Indonesia is still very limited. The existence of geostationary satellites with wide area coverage and fast frequency observations is useful for observing the fast dynamics of the OT life cycle. Therefore, this study intends to analyze the relationship between OT and extreme weather, updraft and thermodynamic conditions of OT when extreme weather occurs, the best objective method for detecting OT in the day time and night time, and the spatiotemporal distribution of OT in the tropical region of Java Island during the 2018-2021 period. Based on visual analysis using visible channel and Himawari 8 sandwich products, 87% of extreme weather events in Java were accompanied by the appearance of OT. It indicates that the presence of the OT pattern is a convection cloud pattern or feature that is closely related to extreme weather events for the Java Island region. The existence of a time lag between the appearance of OT and extreme weather events on Java Island indicates that the OT of convection cloud can be used as a precursor or nowcasting for the appearance of extreme weather. Most of the convective cloud OT features during extreme weather events on Java Island have altitude that were only able to exceed the altitude of the equilibrium level and few were able to exceed the tropopause level of 9 km – 16 km. The difference in atmospheric conditions during extreme weather events on Java Island, which is in the tropics and subtropics, is a strong and unstable convective energy condition characterized by a larger CAPE, as well as unstable KI, LI, SI and TTI values. It is offset by kinematic factors in the form of a weak vertical wind shear (bulk wind shear 0-6 km) and a higher freezing point height. The difference between extreme weather events in the Java Island region and other tropical regions compared to subtropical regions is the strong updraft speed of convection clouds. The IRW Texture COMB algorithm based on the IRW-Texture Gradient modification and the COMB algorithm shows a significant increase in quality for detecting OT and non-OT pixels in Java. Rainy days with rainfall > 50 mm/day are very common in areas with an altitude of > 500 m. On the other hand, the level of convection activity which is indicated by the presence of OT and lightning is significantly reduced in this area. OT of convective clouds appear more frequently during the DJF season and less frequently during the JJA season. OT often appears during the day time and rarely at night time. Most OTs appear in the central part, away from the south and north coasts of Java Island during the day, while OTs that appear near the south and north coasts of Java Island can appear in the morning or afternoon.
Keyword: convective clouds, extreme weather, Overshooting Tops, Himawari 8 Satellite