Judul: Seleksi Endofit Sebagai Pemacu Pertumbuhan dan Pengndali Penyakit Lapuk Akar dan Pangkal Batang (Cylaria SP) pada Tanaman Tebu Pembimbing
Abstrak: Endofit adalah bakteri atau cendawan yang secara alami berasosiasi dengan tanaman tanpa menimbulkan dampak negatif pada inangnya. Endofit banyak dipelajari karena bermanfaat sebagai pemacu pertumbuhan (plant growth promotion, PGP) dan juga sebagai pengendali hama atau penyakit tanaman (biological control agent, BCA). Untuk mengetahui jenis endofit yang berpotensi sebagai PGP atau BCA pada tanaman tebu, sebuah studi telah dilakukan sejak Oktober 2015 hingga Februari 2017 bertempat di PT Gunung Madu Plantations (GMP), sebuah perkebunan tebu swasta di Kabupaten Lampung Tengah. Studi dimulai dengan mengisolasi endofit dari lima varietas tebu dan kemudian menyekrining jenis yang berpotensi sebagai patogen melalui uji reaksi hipersensitif dan hemolisis. Endofit yang lolos diuji potensinya sebagai PGP maupun BCA melalui uji in vitro pada bibit tebu yang ditumbuhkan dalam tabung dan juga in vivo pada tebu yang ditanam di dalam pot. PGP yang dipilih adalah yang mampu membuat pertumbuhan tebu lebih baik dari kontrol negatifnya, demikian juga, BCA yang dipilih adalah yang mampu menekan serangan penyakit lapuk akar dan pangkal batang (LAPB, cendawan Xylaria sp.) lebih baik dari kontol negatifnya. Identifikasi morfologis, molekuler, dan uji kemampuan dalam menghasilkan hormon pertumbuhan atau antibiotik hanya dilakukan untuk isolat terbaik. Hasil yang diperoleh pada pengujian in vitro menunjukkan bahwa terdapat sembilan isolat bakteri dan sembilan isolat cendawan yang berpotensi sebagai PGP. Lima isolat bakteri dan empat isolat cendawan berpotensi sebagai BCA. Walaupun begitu, pengujian lebih lanjut pada tebu yang ditanam dalam pot hanya menyisakan tiga isolat terbaik sebagai PGP dan tidak ada yang terpilih sebagai BCA. Ketiga isolat PGP terbaik adalah: bakteri N12 yang diisolasi dari akar varietas GMP3 dan diduga sebagai Bacillus, bakteri L16 yang diisolasi dari daun varietas GMP3 dan diduga sebagai Bacillus atau Domibacillus, serta cendawan C78 yang diisolasi dari batang varietas PS48 dan diduga sebagai Cladosporium. Ketiga isolat tersebut mampu memproduksi hormon pertumbuhan auksin, sitokinin, dan juga giberelin dengan kecenderungan N12 lebih banyak dibanding dua isolat lain.
Keyword: Bacillus, Domibacillus, Cladosporium, Gunung Madu, Lampung

Judul: Potensi Bakteri Endofit Sebagai Agens Biokontrol Penyakit Busuk Pangkal Batang (Ganoderma boninense) pada Tanaman Kelapa Sawit
Abstrak: Kelapa sawit (Elaeis guineensis Jacq.) merupakan salah satu komoditas penting di Indonesia. Salah satu penyakit serius dan merugikan pada perkebunan kelapa sawit adalah penyakit busuk pangkal batang (BPB) yang disebabkan oleh cendawan G. boninense. Mekanisme pengendalian yang biasa dilakukan adalah penggunaan bibit yang toleran, pembuatan parit isolasi, sanitasi batang dan akar yang telah terinfeksi serta penggunaan agens biokontrol seperti Trichoderma. Teknik pengendalian biologis menggunakan bakteri, khususnya bakteri endofit masih belum banyak dilaporkan. Tujuan penelitian ini adalah untuk memperoleh dan mengevaluasi isolat bakteri endofit yang potensial sebagai agens biokontrol penyakit busuk pangkal batang (G. boninense). Penelitian dilakukan sejak bulan Oktober 2018 sampai Juni 2019. Penelitian dilaksanakan di Laboratorium Nematologi Tumbuhan Departemen Proteksi Tanaman IPB dan Laboratorium Bioteknologi PT SMART Tbk, Sentul, Bogor. Penelitian terdiri atas beberapa tahap yaitu: (1) eksplorasi dan seleksi bakteri endofit dari akar kelapa sawit dan akar pinang; (2) evaluasi potensi bakteri endofit terhadap G. boninense secara in-vitro dan rumah kaca; (3) karakterisasi fisiologis dan respons tanaman terkait ketahanan dengan analisis enzim peroksidase dan total protein; (4) identifikasi bakteri endofit secara molekuler. Sebanyak 45 isolat berhasil diisolasi dari akar kelapa sawit dan 43 isolat dari akar pinang. Tujuh isolat lolos dalam uji keamanan hayati yang meliputi uji hipersensitivitas dan hemolisis. Uji antibiosis in-vitro terhadap G. boninense juga digunakan 8 isolat koleksi bakteri endofit Departemen Proteksi Tanaman, total isolat yang diuji dalam uji antibiosis yaitu 15 isolat. Isolat dengan penghambatan tertinggi adalah EG26, EG113, AC112, APE35, dan BAT27 dengan persentase penghambatan masing-masing 56.80%, 56.51%, 56.11%, 53.62%, dan 41.28%. Isolat bakteri endofit mampu menekan kejadian dan keparahan penyakit busuk pangkal batang pada bibit kelapa sawit, dengan persentase penekanan kejadian penyakit berkisar antara 50-100% dan penekanan keparahan penyakit sebesar 60- 100%. Karakterisasi fisiologis menunjukkan isolat BAT27 mampu mendegradasi kitin, isolat APE35 mampu melarutkan fosfat, dan ke 5 isolat mampu memproduksi siderofor. Hasil analisis aktivitas peroksidase menunjukkan bahwa tanaman yang diinokulasi bakteri endofit memiliki nilai unit aktivitas enzim peroksidase yang lebih tinggi dibandingkan dengan kontrol, begitu juga dengan analisis kandungan total protein. Hasil identifikasi molekuler menggunakan sikuens gen 16S rDNA menunjukkan bahwa isolat EG26 identik dengan Bacillus subtilis, EG113 identik dengan B. velezensis, AC112 identik dengan B. toyonensis, APE35 identik dengan B. siamensis, BAT27 identik dengan B. toyonensis. Hasil penelitian menunjukkan bahwa bakteri endofit mampu dimanfaatkan dalam pengelolaan penyakit busuk pangkal batang (G. boninense) pada tanaman kelapa sawit.
Keyword: Bacillus, biokontrol, pemacu pertumbuhan, enzim peroksidase

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: