Judul: The Role of Endophytic Fusarium oxysporum of Weeds in the Pathosystem of Banana Wilt Disease
Abstrak: Sembilan isolat Fusarium oxysporum endofit dari gulma dan beragam F. oxysporum patogenik pada tanaman budi daya menunjukkan kemampuan patogenik terhadap buncis. Isolat F. oxysporum f.sp. cubense yang memiliki mortalitas paling rendah yaitu 50%, sedangkan isolat lainnya mortalitas di atas 50%. Sembilan isolat F. oxysporum endofit dari gulma dan F. oxysporum f.sp. cubense diketahui tidak mampu menginfeksi benih timun. Mortalitas benih timun tertinggi terjadi pada perlakuan F. oxysporum f.sp. capsici dan F. oxysporum f.sp. cepae, yaitu sebesar 16.67%. Isolat yang mampu menginfeksi benih jagung, yaitu F. oxysporum E2 F. oxysporum E14, F. oxysporum f.sp. lycopersici, F. oxysporum f.sp. capsici, F. oxysporum E4 F. oxysporum E13, F. oxysporum f.sp. vanillae, F. oxysporum f.sp. cepae namun mortalitasnya di bawah 10%. Uji patogenisitas pada tanaman pisang di dalam botol kultur menunjukkan isolat F. oxysporum E3, E9 dan 14 mengakibatkan kematian seluruh varietas pisang Raja Bulu, Ambon Kuning dan Cavendish hingga 100%. Hanya isolat F. oxysporum E21 yang tidak menyebabkan kematian seluruh ulangan dari varietas pisang Raja Bulu, Ambon Kuning dan Cavendish yang diujikan. Uji patogenisitas pada pisang Raja Bulu yang sudah diaklimatisai menunjukkan 9 isolat endofit menyebabkan penyakit penyakit layu Fusarium dengan insidensi 100%, periode inkubasi 67-75 hari dan tingkat keparahan nekrosis bonggol 58-72%, tingkat keparahan kelayuan daun 52-69% yang sama secara statistika dengan perlakuan F. oxysporum f.sp. cubense. Gulma Commelina sp. mampu dikolonisasi oleh cendawan F. oxysporum E3, F. oxysporum non-patogenik T14a, F. oxysporum f.sp. cubense, F. oxysporum f.sp. vanillae, F. oxysporum f.sp. capsici. Gulma Physalis sp. hanya mampu dikolonisasi oleh isolat E3 dan isolat F. oxysporum non-patogenik T14a dan Peperomia sp. diketahui tidak mampu dikolonisasi oleh semua isolat Fusarium yang diujikan., Nine endophytic Fusarium oxysporum isolates from weeds, and various pathogenic F. oxysporum of cultivated plants showed a pathogenic ability to beans seeds. Isolate F. oxysporum f.sp. cubense has the lowest mortality of Phaseolus vulgaris seeds. Nine endophytic F. oxysporum isolates from weeds and F. oxysporum f.sp. cubense is known to be unable to infect cucumber seeds. The highest mortality of cucumber seeds occurs in the treatment of F. oxysporum f.sp. capsici and F. oxysporum f.sp. cepae, which is 16.67%. Isolates that can infect corn seeds, i.e., F. oxysporum E2, F. oxysporum E14, F. oxysporum f.sp. lycopersici, F. oxysporum f.sp. capsici, F. oxysporum E4, F. oxysporum E13, F. oxysporum f.sp. vanillae, F. oxysporum f.sp. cepae, but the mortality is below 10%. The pathogenicity test of banana plants in culture bottles aimed at isolates of F. oxysporum E3, E9, and 14 resulted in the death of all varieties of Raja Bulu, Ambon Kuning and Cavendish up to 100%. Exclusively F. oxysporum E21 isolates that did not cause the death of all replications of the Raja Bulu, Ambon Kuning, and Cavendish banana varieties tested. The pathogenicity test on the Raja Bulu banana plant showed nine endophytic isolates causing Fusarium wilt disease with 100% incidence, incubation period 67-75 days, and severity of hump necrosis 58-72%, leaf severity with 52-69% similarly static treatment with F. oxysporum f.sp. cubense. Commelina sp. occurred colonized by F. oxysporum E3, F. oxysporum non-patogenik T14a, F. oxysporum f.sp. cubense, F. oxysporum f.sp. vanillae,
Keyword: Inang alternatif, Kolonisasi, Patogenisitas, Pisang Raja Bulu, Buncis, Timun, colony, genetics, morphology, pathogenicity, physiology

Judul: Deteksi Endobakteri dan Uji Patogenisitas Fusarium oxysporum fsp. cubense terhadap Tanaman Pisang.
Abstrak: Fusarium oxysporum fsp. cubense (Foc) merupakan cendawan penyebab penyakit layu Panama pada tanaman pisang. Keberadaan endobakteri pada Foc koleksi IPBCC belum diketahui. Padahal bakteri endosimbion cendawan dapat mengubah morfologi dan gaya hidup inangnya. Patogenisitas Foc pembawa endobakteri terhadap pisang juga belum diketahui. Oleh sebab itu penelitian ini bertujuan mendeteksi endobakteri pada Foc dan mempelajari patogenisitasnya terhadap pisang ambon dan pisang tanduk. Sebanyak 17 strain Foc dideteksi keberadaan endobakterinya secara molekuler berdasarkan daerah 16S rDNA dengan primer 63F dan 1387R. Keberadaannya dikonfirmasi dengan pewarnaan BacLight yang sediaannya diamati menggunakan mikroskop fluorescence. Beberapa strain Foc pembawa endobakteri diuji dengan cara penyuntikan filtrat pada tulang daun tanaman pisang ambon dan tanduk yang berumur 5 bulan. Hasil penelitian secara molekuler menunjukkan bahwa 41.2% strain Foc membawa endobakteri, yaitu Foc 08, Foc 12, Foc 18, Foc 32A, Foc 33, Foc 37, dan Foc 44. Keberadaanya dikonfirmasi dengan pewarnaan BacLight. Namun, semua strain Foc yang diteliti terdeteksi membawa endobakteri yang ditandai dengan adanya sel bakteri hidup berpendar hijau setelah diwarnai dengan BacLight. Endobakteri banyak ditemukan pada struktur konidia dan hifa bagian tengah. Endobakteri juga ditemukan pada ujung-ujung hifa. Uji patogenisitas beberapa strain Foc pembawa endobakteri pada pisang ambon dan tanduk menunjukkan bahwa filtrat Foc mampu menginduksi terbentuknya gejala sakit pada kedua kultivar pisang tersebut. Uji patogenisitas ini juga menunjukkan bahwa strain-strain Foc yang diuji tergolong ras 4.
Keyword: bakteri, endosimbion, Fusarium oxysporum, pisang, virulen

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: