Judul: Peningkatan Pelekatan Sel Escherichia coli melalui Penambahan Fosfat pada Kondisi Aerobik.
Abstrak: Eksploitasi bahan bakar fosil dapat menimbulkan dampak negatif bagi lingkungan. Oleh karena itu, penggunaan energi alternatif termasuk dengan memanfaatkan mikrob dalam mengoksidasi substrat atau limbah organik dan inorganik yang menghasilkan energi listrik berperan penting dalam mengatasi hal tersebut. Teknologi pemanfaatan mikroba sebagai penghasil energi listrik dikenal dengan Microbial Fuel Cell (MFC). Salah satu tantangan terbesar dalam pengembangan teknologi MFC ialah menghasilkan pelekatan sel. Kemampuan sel untuk melekat yang diperantarai melalui pili dimanfaatkan sebagai mediator transfer elektron (bionanowires) dalam aplikasi MFC. Pelekatan sel bakteri dapat meningkat dengan merekayasa struktur permukaan atau matriks menggunakan protein. Sementara itu, peningkatan hidrofobisitas sel bakteri menggunakan polimer kationik dan peningkatan “shear force” antara permukaan dengan protein pelekatan yang dihasilkan bakteri menyebabkan peningkatan pelekatan sel. Selain itu, rekayasa metabolisme protein dengan meningkatkan aktivitas enzim fosfotransasetilase melalui pengaturan suhu dapat meningkatkan pelekatan sel. Dengan adanya peningkatan aktivitas PTA diduga menyebabkan terakumulasinya asetil fosfat (AcP) yang merupakan senyawa intermediet berenergi tinggi dan berperan dalam meningkatkan ekspresi-ekspresi gen pembentukan pili. Dalam menjalankan aktivitasnya, PTA diketahui memanfaatkan fosfat inorganik dalam reaksinya mengubah asetil koenzim A menjadi asetil fosfat. Selain itu, keberadaan oksigen menyebabkan aktifnya siklus asam trikarboksilat (TCA) dan mengarahkan metabolisme membentuk asetat sehingga AcP terakumulasi. Penambahan fosfat pada media kultivasi dan pemberian level oksigenasi yang berbeda diharapkan dapat meningkatkan produksi AcP sehingga meningkatkan pelekatan sel. Oleh karena itu, tujuan dari penelitian ini adalah mengevaluasi pengaruh penambahan variasi konsentrasi fosfat terhadap pelekatan sel Escherichia coli melalui pembentukan pili dan mengetahui pengaruh peningkatan level oksigenasi terhadap pelekatan sel melalui peningkatan pertumbuhan sel. Galur E.coli yang digunakan dalam penelitian ini yaitu E.coli BW25113. Tahap awal penelitian ialah pembuatan media pra-kultivasi dan kultivasi. Media kultivasi merupakan media minimum yang tidak mengandung fosfat dan selanjutnya dilakukan penambahan variasi konsentrasi fosfat (0 g/L, 1.33 g/L, 3.32 g/L, 6.64 g/L, dan 9.97 g/L). Setelah itu, sampel dikultivasi dengan kecepatan pengadukan 120 rpm selama 24 jam pada suhu 37 ºC. Tahap berikutnya adalah penentuan pengaruh penambahan fosfat terhadap pelekatan sel yang diukur berdasarkan nilai indeks kolonisasi sel pada plat pvc 96-well, pengukuran bobot kering sel (Dry Cell Weight), konsumsi fosfat, fluks karbon, dan visualisasi pili. Untuk penentuan pengaruh level oksigenasi terhadap pelekatan sel dilakukan tahapan yang sama hanya konsentrasi fosfat yang digunakan yaitu 0 g/L dan 9.97 g/L serta diberikan kecepatan pengadukan yang berbeda (120 rpm dan 200 rpm). Analisis nilai indeks kolonisasi didasarkan pada nilai absorbansi yang terukur dari permukaan padat polyvinylchlorida pada 492 nm dan dinyatakan sebagai jumlah sel yang melekat. Pengukuran DCW dilakukan berdasarkan metode pengukuran optical density menggunakan spektrofotometer pada 660 nm. Kemudian analisis konsumsi fosfat dilakukan berdasarkan metode reduksi oleh timah klorida(II) menggunakan spektrofotometer pada 690 nm. Adapun fluks karbon diamati pada profil asam organik (piruvat dan asetat) menggunakan kromatografi cair kinerja tinggi (KCKT). Tahap akhir adalah visualisasi pili melalui pemanfaatan mikroskop pemayar elektron (SEM). Untuk mengkonfirmasi pengaruh fosfat terhadap pelekatan sel E.coli maka dilakukan tahapan yang sama dengan menggunakan galur E.coli yang telah dihilangkan gen pta-nya. Hasil yang diperoleh menunjukkan bahwa konsentrasi fosfat 9.97 g/L memberikan pengaruh signifikan dalam peningkatan pelekatan sel melalui peningkatan nilai Ics dan konsumsi fosfat. Selain itu, penambahan fosfat menyebabkan
Keyword: Escherichia coli, oksigenasi, pelekatan sel, penambahan fosfat

Judul: Peningkatan pelekatan Escherichia coli di bahan padatan elektroda melalui penambahan fosfat pada media kultivasi
Abstrak: Peningkatan pelekatan sel E. coli pada permukaan bahan elektroda dilakukan dengan menambahkan fosfat pada media kultivasi. Penelitian ini diawali dengan menentukan pengaruh jenis bahan elektroda yang akan digunakan dalam percobaan pelekatan sel, kemudian dilanjutkan dengan membandingkan dua strain bakteri E. coli dengan dan tanpa gen rpoS. Selain itu, dilakukan penentuan pengaruh penambahan fosfat terhadap pelekatan sel. Data hasil pengukuran menunjukkan bahwa penggunaan jenis elektroda karbon menghasilkan pelekatan sel E. coli yang lebih baik dibandingkan dengan jenis elektroda lainnya (grafit, tembaga, alumunium, dan stainless steel), dan oleh karena itu uji selanjutnya digunakan bahan karbon. Pada uji selanjutnya dengan menggunakan dua strain E. coli, diperoleh bahwa penghilangan rpoS pada strain E. coli juga menunjukkan rata-rata pelekatan sel yang lebih tinggi dibandingkan dengan strain induk. Pada pengujian terakhir, bakteri dikultivasi dengan penambahan konsentrasi fosfat yang berbeda dalam media yaitu 1.33, 3.32, 6.64, 9.97, 13.29, dan 19.93 g/L. Hasil pengujian memperlihatkan bahwa semakin tinggi konsentrasi fosfat ditambahkan, semakin tinggi pula pelekatan sel pada elektroda diperoleh. Namun pada konsentrasi tertinggi penambahan fosfat, pelekatan sel mulai mengalami kondisi stasioner. Hal tersebut menunjukkan bahwa penambahan fosfat yang optimum adalah pada konsentrasi 13.29 g/L.
Keyword: cell adhesion, electrode, Escherichia coli, MFC, rpoS mutant

Judul: Pendugaan Curah Hujan Dengan Bayesian Network Studi Kasus: Curah Hujan di Daerah Indramayu
Abstrak: The objective of this study was to built the probabilistic modeling and to compare the Bayesian Networks (BNs) method which considers the spatial dependencies among variables for predict rainfall to Auto Regressive Integrated Moving Average (ARIMA) method which assumes the spatial independencies among variables. This research use rainfall data of 14 stations in period 1979 to 2001 in Indramayu, West Java. A network is generated by K2 algorithm, and this networks is used to built probabilistic model using multinomial BNs. The rainfall prediction is based on the combination of Gaussian BNs and ARIMA (BNARIMA). The result shows that BNARIMA is more effective to represent the spatial dependencies among the stations and to predict rainfall than ARIMA.
Keyword: