Judul: Isolation and Potential of Bacteriophage for Control  of Vibrio parahaemolyticus Infection in Whiteleg Shrimp
Abstrak: Vibrio parahaemolyticus yang menghasilkan toxin PirA dan PirB merupakan agen penyebab penyakit acute hepatopancreatic necrosis disease yang menyebabkan kematian massal hingga 100% udang di tambak. Pengendalian penyakit bakterial dapat dilakukan menggunakan antibiotik, akan tetapi penggunaan ini telah dibatasi dan adanya larangan ekspor udang yang teridentifikasi mengandung antibiotik tertentu. Hal ini disebabkan, penggunaan antibiotik yang terus menerus di lingkungan akuakultur dapat menyebabkan bahaya pada organisme akuatik dan manusia sebagai konsumen. Penggunaan bakteriofage (fage) dapat menjadi solusi alternatif ramah lingkungan untuk menggantikan antibiotik. Fage adalah pembunuh bakteri spesifik dan efektif untuk mengendalikan infeksi bakteri. Penelitian ini bertujuan melakukan isolasi dan evaluasi potensi fage untuk pengendalian infeksi V. parahaemolyticus pada udang vaname. Fage diisolasi dari sampel air, sedimen dan udang dari tambak di berbagai daerah di Indonesia, yaitu provinsi Lampung, Banten, Jawa Barat, Jawa Tengah, DI Yogyakarta, Jawa Timur dan Nusa Tenggara Barat. Selanjutnya sampel sedimen dihomogenkan dengan phosphate buffer saline (PBS) 1:1 (b/v) dan usus udang digerus dengan menambahkan PBS 1:1 (b/v). Tiap cairan sampel disentrifugasi, supernatan yang diperoleh ditambahkan V. parahaemolyticus dan diplating menggunakan metode double layer agar, plak yang terbentuk diindikasikan sebagai fage. Penelitian ini menggunakan rancangan acak lengkap dengan dua tahap yaitu uji in vitro dan in vivo. Uji in vitro terdiri dari 6 perlakuan dengan 3 ulangan, yaitu saline magnesium (SM)-buffer tanpa V. parahaemolyticus (KN), SM-buffer dan V. parahaemolyticus 107 CFU/mL (KP), antibiotik klortetrasiklina dan V. parahaemolyticus 107 CFU/mL (KA), fage 107 PFU/mL dan V. parahaemolyticus 107 CFU/mL (FB7), dan fage 108 PFU/mL dan V. parahaemolyticus 107 CFU/mL (FB8), fage 109 PFU/mL dan V. parahaemolyticus 107 CFU/mL (FB9). Uji in vivo dilakukan dengan uji tantang V. parahaemolyticus (105 CFU/mL) pada udang melalui perendaman dan mengaplikasikan densitas fage melalui pakan, dengan cara pakan disemprot campuran suspensi fage dan putih telur, dikering anginkan dan disimpan pada suhu 4 oC sampai digunakan. Uji ini menggunakan 7 perlakuan dengan 3 ulangan, dengan 6 perlakuan sama dengan uji in vitro dan ditambahkan 1 perlakuan yaitu pakan + fage 109 PFU/mL (KF). Uji in vitro dilakukan dengan masing-masing perlakuan dimasukkan ke dalam microplate dan diamati menggunakan spektrofometer. Uji in vivo pada akuarium dilakukan uji tantang dengan V. parahaemolyticus pada hari ke-0 (sebelum perlakuan) dan satu jam kemudian diberi pakan uji sesuai perlakuan dengan penambahan fage dan antibiotik sebanyak 2 kali sehari secara at satiation, kemudian diamati setiap hari selama 7 hari. Parameter yang diukur yaitu kelangsungan hidup, uji hambat bakteri dan parameter sistem imun meliputi total hemocyte count (THC), aktivitas fagositosis (AF), aktivitas respiratory burst (RB), aktivitas phenoloxidase (PO), gejala klinis dan histopatologi. iii Penelitian ini berhasil mengisolasi fage yang bersumber dari air tambak udang di daerah Jawa Timur yang ditandai terbentuknya plak pada media double layer agar, dengan ciri morfologisnya berbentuk titik-titik dan bulat besar, tepian rata dan bergelombang serta memiliki warna plak yang jernih. Plak fage berhasil diperbanyak dengan densitas fage rata-rata 3,5 x 109 PFU/mL. Hasil kisaran inang fage menggunakan 6 bakteri (3 jenis bakteri dan 3 strain V. parahaemolyticus yang berbeda) menunjukkan hanya bakteri V. parahaemolyticus asal Situbondo yang dapat lisis oleh fage hasil isolasi, sedangkan bakteri lainnya tidak. Pada uji in
Keyword: aquaculture, AHPND, bacteriophage, Vibrio parahaemolyticus, whiteleg shrimp

Judul: Control of Vibrio parahaemolyticus Infection in  Pacific White Shrimp Penaeus vannamei through The Biofloc System, Control of Vibrio parahaemolyticus Infection in  Pacific White Shrimp Penaeus vannamei through The Biofloc System
Abstrak: Udang vaname (Penaeus vannamei) merupakan salah satu komoditas utama akuakultur di Indonesia dan dunia. Peluang pengembangan budidaya udang vaname masih sangat besar terutama karena terbukanya target pasar yang luas. Meskipun tren produksi yang cenderung meningkat, kegiatan budidaya udang vaname masih terkendala dengan serangan penyakit terutama penyakit vibriosis yang disebabkan oleh infeksi bakteri Vibrio parahaemolyticus. Beberapa tahun terakhir, infeksi V. parahaemolyticus strain yang memiliki toksin PirA dan PirB dapat menyebabkan penyakit Acute Hepatopancreatic Necrosis Disease (AHPND) serta mendapat perhatian khusus secara global karena penyebarannya yang luas, menyebabkan kerugian ekonomi yang sangat besar, dan menjadi isu keamanan pangan dari produk akuakultur yang perlu diperhatikan. Selanjutnya diketahui patogenisitas V. parahaemolyticus diatur melalui suatu mekanisme quorum sensing (QS), yang memfasilitasi bakteri berkomunikasi melalui molekul-molekul sinyal (autoinducer) untuk dapat mengekspresikan berbagai gen secara bersamaan pada kondisi kepadatan populasi bakteri tertentu, salah satunya untuk mengatur faktor virulensi dan juga patogenisitas. Berdasarkan hal tersebut, salah satu strategi yang dapat dilakukan untuk mengendalikan infeksi V. parahaemolyticus adalah melalui penghambatan mekanisme QS menggunakan teknologi bioflok. Tujuan umum penelitian ini adalah untuk mengevaluasi potensi bioflok dalam mengendalikan infeksi V. parahaemolyticus pada budidaya udang vaname melalui penghambatan quorum sensing dan faktor virulensi V. parahaemolyticus. Rangkaian penelitian ini dilaksanakan dalam empat tahap. Penelitian tahap pertama bertujuan untuk mendapatkan informasi terkait mekanisme aksi penghambatan QS dan faktor virulensi bakteri V. parahaemolyticus dengan penambahan suspensi bioflok (in vitro). Pada penelitian ini suspensi bioflok ditambahkan ke dalam kultur isolat V. parahaemolyticus dengan kepadatan bakteri 103, 105, dan 107 CFU mL-1. Hasil pengamatan menunjukkan suspensi bioflok mampu menurunkan ekspresi gen opaR, pirB, dan T6SS2 pada kepadatan 103 dan 105 CFU mL-1. Selanjutnya bioflok mampu menghambat dan mendestruksi formasi biofilm. Suspensi bioflok secara umum mampu menurunkan aktivitas eksoenzim amilase, protease, dan kitinase V. parahaemolyticus. Penelitian tahap kedua bertujuan untuk mengevaluasi ekspresi gen virulensi V. parahaemolyticus dan imunitas udang vaname yang dibudidayakan pada sistem bioflok serta diuji tantang dengan V. parahaemolyticus. Udang vaname berukuran 0.50±0.09 g dipelihara dalam toples kaca dengan volume air 2.5 L dengan kepadatan 20 ekor L-1. Udang dipelihara selama 5 hari dengan masing-masing perlakuan meliputi perlakuan bioflok (C/N rasio 10), tanpa bioflok, dan masing-masing diuji tantang dengan perendaman (kepadatan 103, 105, dan 107 CFU mL-1) pada hari pertama. Hasil penelitian menunjukkan bahwa perlakuan bioflok dapat menurunkan ekspresi gen regulator opaR, pirB, T6SS1 dan T6SS2 pada media pemeliharaan. Sistem bioflok juga dapat meningkatkan ekspresi gen imunitas dan sintasan udang vaname. Penelitian tahap ketiga bertujuan untuk mengevaluasi pengaruh aplikasi bioflok terhadap performa pertumbuhan, efek proteksi, dan komposisi mikrobiota usus udang vaname yang diuji tantang V. parahaemolyticus. Udang dengan bobot 0.66±0.02 g dipelihara dalam akuarium kaca (volume air 22 L) dengan kepadatan udang 150 m-3. Udang dipelihara selama 28 hari dengan perlakuan bioflok (C/N rasio 10) dan kontrol, masing-masing dilanjutkan dengan uji tantang terhadap V. parahaemolyticus melalui perendaman (kepadatan 105 CFU mL-1) pada hari ke-15. Hasil penelitian menunjukkan bahwa perlakuan bioflok secara signifikan dapat meningkatkan performa pertumbuhan (pertambahan bobot mutlak, laju pertumbuhan spesifik, rasio konversi pakan, sintasan, dan aktivitas enzim pencernaan), memproteksi udang, dan memodulasi komposisi mikrobiota air dan usus udang sekaligus menurunkan kelimpahan V. parahaemolyticus pada usus udang.
Keyword: Udang vaname, Vibrio parahaemolyticus, Bioflok, AHPND, Quorum Sensing

Judul: Metrik Einstein (Anti-) Self-Dual Berdimensi Empat dengan Metode Cartan
Abstrak: Gravitational field equation can be formulated in differential forms (differential geometry), which describes gravity as a manifestation of the curvature of space-time. Curvature of space-time is characterized by a metric that satisfies the gravitational field equation. With differential forms it can be formulated the (anti-) self-dual Einstein equation, which is a modification of the Cartan structure in (anti-) self-dual basis. Calculation of (anti-) self-dual metric with (anti-) self-dual Einstein equation is simpler than the calculation using Christoffel symbols.
Keyword: