Judul: Analisis Senyawa Bioaktif Asal Bakteri yang Berasosiasi dengan Spons Sebagai Antioksidan dan Antipenuaan
Abstrak: Penuaan merupakan proses hilangnya kemampuan sel untuk memperbaiki struktur dan fungsi normalnya. Akumulasi senyawa Reactive Oxygen Species (ROS) dan Advanced Glycation End Products (AGEs) disebut sebagai faktor utama terjadinya penuaan yang lebih cepat. Penuaan pada tingkat yang akut dapat memicu kerusakan pada jaringan kulit hingga menyebabkan munculnya beragam penyakit degeneratif. Antioksidan merupakan senyawa yang memiliki mekanisme untuk mencegah pembentukan atau mendegradasi senyawa ROS. Mekanisme lain yakni antiglikasi diketahui mampu menghambat reaksi pembentukan senyawa AGEs. Kedua mekanisme tersebut dilaporkan sebagai uji antipenuaan secara in vitro. Uji secara in vivo dari senyawa yang berpotensi sebagai agen antipenuaan dapat dilakukan menggunakan berbagai jenis organisme model salah satunya adalah khamir Schizosaccharomyces pombe. Sumber senyawa bioaktif alami yang diketahui memiliki aktivitas antioksidan, antiglikasi atau antipenuaan pada S. pombe sangat beragam dan didominasi oleh senyawa dari tanaman. Salah satu sumber senyawa bioaktif yang dilaporkan memiliki beragam fungsi farmasi adalah senyawa yang dihasilkan dari bakteri yang berasosiasi dengan spons. Penelitian ini menggunakan 7 isolat bakteri yang berasosiasi dengan spons yang diperoleh dari penelitian sebelumnya. Lima isolat bakteri yang berasosiasi dengan spons Stylotella sp. dilaporkan mampu menghasilkan senyawa bioaktif sebagai antibakteri dan antioksidan metode Cupric Ion Reducing Antioxidant Capacity (CUPRAC). Satu isolat bakteri lain yakni yang berasosiasi dengan spons Petrosia sp. diketahui memiliki aktivitas antibakteri dan 1 isolat bakteri lain yang berasosiasi dengan spons Jaspis sp. dilaporkan mampu menghasilkan senyawa bioaktif sebagai antibakteri dan antikanker. Telaah pustaka menunjukkan bahwa sampai saat ini belum ada laporan senyawa bioaktif yang dihasilkan dari bakteri yang berasosiasi dengan spons tersebut yang memiliki aktivitas antioksidan terhadap radikal 2,2-diphenyl-1-picrylhydrazyl (DPPH) dan 2,2'-azino-bis (3-ethyl benzothiazoline-6-sulphonicacid (ABTS), antiglikasi serta antipenuaan menggunakan organisme model S. pombe. Oleh sebab itu, penelitian ini bertujuan untuk menentukan nilai aktivitas antioksidan (DPPH dan ABTS) dan antiglikasi dari 7 ekstrak kasar bakteri sampel, mengidentifikasi fraksi aktif antioksidan dari ekstrak kasar terpilih serta menentukan mekanisme antipenuaan dari ekstrak kasar dan fraksi aktif terpilih pada organisme model khamir S. pombe. Penelitian ini dimulai dengan meremajakan dan mengekstraksi senyawa bioaktif dari 7 bakteri sampel menggunakan pelarut etil asetat. Ekstrak yang diperoleh kemudian ditentukan nilai aktivitas antioksidan dengan menggunakan radikal DPPH dan ABTS serta diuji aktivitas antiglikasi. Ekstrak kasar yang memiliki aktivitas antioksidan terkuat dipilih untuk difraksionasi menggunakan metode Kromatografi Lapis Tipis (KLT) dan dilakukan bioautografi antioksidan. Fraksi aktif antioksidan terpilih kemudian diisolasi menggunakan metode KLT preparatif. Tahapan selanjutnya yakni uji aktivitas antipenuaan dari fraksi aktif antioksidan terpilih dan kelima ekstrak kasar bakteri sampel menggunakan organisme model khamir S. pombe. Uji antipenuaan dilakukan menggunakan metode spot dilanjutkan dengan analisis Chronological Life Span (CLS) dari ekstrak dan fraksi terpilih pada konsentrasi terbaik. Ekstrak dan fraksi aktif terpilih yang memiliki aktivitas antipenuaan pada S. pombe dianalisis lanjut pada aspek molekuler dan seluler. Aspek molekuler yang diamati meliputi ekspresi gen-gen yang berhubungan dengan penuaan dan sistem antioksidatif, dilanjutkan dengan analisis ekspresi protein menggunakan western blot. Aktivitas protein target juga dianalisis untuk mengetahui pengaruh dari ekstrak dan fraksi aktif terpilih tersebut. Beberapa aspek seluler yang dianalisis meliputi aktivitas mitokondria, kuantifikasi ROS intraseluler dan analisis pola distribusi siklus sel. Fraksi aktif terpilih kemudian ditentukan kandungan senyawa dominan menggunakan metode Liquid Chromatography Mass Spectrometry
Keyword: antioksidan, antipenuaan, Schizosaccharomyces pombe, katalase, L-arginin

Judul: Potency of Bacterial Yellow Pigment Extract as a Source of Natural Antioxidants
Abstrak: Keanekaragaman yang dimiliki oleh mikrob dapat menghasilkan berbagai senyawa metabolit sekunder yang unik dan menunjukkan perannya dalam bidang industri dan farmakologi. Penggunaan metabolit sekunder seperti pigmen bakteri saat ini menarik perhatian untuk diteliti, karena pigmen bakteri memiliki banyak keunggulan baik dalam produksi maupun aktivitasnya. Bakteri penghasil pigmen dapat ditemukan di berbagai habitat mulai dari laut hingga tanah rizosfer. Pigmen yang disintesis oleh bakteri pada habitat tertentu merupakan bentuk mekanisme adaptasi sel bakteri untuk kelangsungan hidup di dalam habitatnya. Bakteri dapat memproduksi berbagai jenis pigmen seperti melanin, prodigiosin, pyocyanin, violacein, karotenoid, dan lain-lain. Pigmen bakteri telah banyak dilaporkan memiliki aktivitas biologis termasuk antioksidan, antimikroba, antikanker, dan sun protection. Penelitian sebelumnya telah berhasil mengisolasi bakteri penghasil pigmen kuning yang berasal dari tanah rizosfer dan bakteri yang berasosiasi dengan spons. Pigmen dari beberapa bakteri tersebut diduga memiliki potensi sebagai antioksidan. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan menentukan aktivitas antioksidan secara in vitro dari ekstrak pigmen kuning bakteri dan dilanjutkan pada khamir Schizosaccharomyces pombe ARC039 yang digunakan sebagai organisme model. Penelitian ini diawali dengan meremajakan dan mengekstraksi pigmen kuning dari 14 isolat bakteri menggunakan pelarut metanol. Ekstrak yang diperoleh kemudian ditentukan aktivitas antioksidannya menggunakan radikal DPPH. Dua isolat yang memiliki aktivitas antioksidan terbaik diidentifikasi berdasarkan gen 16S rRNA dan kemudian dipilih untuk dianalisis lebih lanjut terkait aktivitas antioksidannya berdasarkan pelarut ekstraksi dan radikal yang berbeda. Ekstrak dari pelarut yang memiliki aktivitas antioksidan terbaik dipilih untuk dilakukan fraksinasi dengan menggunakan metode Kromatografi Lapis Tipis (KLT) dan dilanjutkan bioautografi antioksidan. Fraksi aktif yang diperoleh dari uji bioautografi antioksidan kemudian diisolasi menggunakan metode KLT preparatif. Fraksi aktif tersebut kemudian ditentukan aktivitas antioksidannya terhadap radikal DPPH dan ABTS. Ekstrak kasar pigmen dan fraksi aktif terpilih kemudian diuji pada level seluler menggunakan organisme model S. pombe ARC039 untuk mengetahui respon toleransi khamir terhadap cekaman oksidatif (H2O2) dan aktivitas mitokondrianya. Selanjutnya, senyawa metabolit yang terkandung dalam fraksi aktif terpilih dianalisis menggunakan liquid chromatography massspectrophotometry (LC-MS/MS). Analisis aktivitas antioksidan dari 14 isolat bakteri penghasil pigmen kuning menunjukkan bahwa isolat SAB E-3 dan SAB E-6 memiliki aktivitas antioksidan terbaik dalam meredam radikal DPPH. Hasil identifikasi berdasarkan gen 16S rRNA menunjukkan bahwa SAB E-3 memiliki kemiripan dengan Pseudomonas oryzihabitans IAM 1568 (99,37%) dan SAB E-6 memiliki kemiripan dengan Micrococcus aloeverae AE-6 (98,18%). Kedua isolat tersebut kemudian diekstraksi menggunakan beberapa pelarut organik untuk mengetahui pengaruh pelarut ekstraksi terhadap aktivitas antioksidan. Ekstrak kasar pigmen dari kedua isolat yang diekstraksi menggunakan metanol mengandung senyawa fenolik dan flavonoid tertinggi yang mungkin berkontribusi terhadap aktivitas antioksidan. Selain itu, berdasarkan analisis UV-Vis, kedua ekstrak kasar pigmen yang dihasilkan oleh masing-masing bakteri diduga sebagai karotenoid. Ekstrak kasar pigmen dari P. oryzihabitans SAB E-3 dan M. aloeverae SAB E-6 yang diekstraksi menggunakan metanol memiliki aktivitas antioksidan terbaik dalam meredam radikal DPPH dengan nilai IC50 masing-masing sebesar 190,73 µg/mL dan 248,14 µg/mL, sedangkan aktivitas antioksidan terhadap radikal ABTS memiliki nilai IC50 masing-masing sebesar 187,71 µg/mL dan 983,79 µg/mL. Oleh sebab itu, kedua ekstrak ini dipilih untuk dilakukan fraksinasi dan dilanjutkan uji bioautografi. Hasil analisis bioautografi menunjukkan bahwa ekstrak P. oryzihabitans SAB E-3 memiliki lima fraksi aktif dan M. aloeverae SAB E-6 memiliki tiga fraksi
Keyword: Antioksidan, LC-MS/MS, ekstrak pigmen kuning, KLT, S. pombe

Judul: Construction of Strongly Optimal Binary Linear Code with Minimum Distance 9 and 11
Abstrak: A binary linear code of length n over q F is a subspace of n q F . A code has three parameters that attached to it, namely length, dimension, and minimum distance. A code with length n, dimension k and minimum distance d is often called [n, k, d ]-code. Usually, when two parameters are given, then we want to find a code that has the best value for the last parameter. Based on Gilbert- Varshamov bound, if a [n, k, d ]-code exists and can not be expanded, we call it a strongly optimal code. In this paper, we construct strongly optimal code with minimum distance 9 and 11. In constructing the code, we created a theorem and algorithm based on Gilbert-Varshamov bound before we implement the algorithm to MAPLE programming language. Because of computational limitations, the program can only construct up to k = 10 for d = 9 and k = 12 for d = 11.
Keyword: