Judul: Screening and characterization of protease inhibitor from bacteria associated with sponge Jaspis sp
Abstrak: Tiga galur dari 138 isolat bakteri yang berasosiasi dengan spons dari Waisai, Pulau Raja Ampat, Propinsi Papua Barat, Indonesia, diketahui mampu menghasilkan aktivitas penghambatan terhadap subtilisin (protease serin), termolisin (protease logam), dan ekstrak kasar dari bakteri patogen Eschericia coli enteropathogenic (EPEC) K.1.1, Staphylococcus aureus, dan Pseudomonas aeruginosa. Isolat-isolat tersebut dinamakan sebagai SAB S-12, SAB S-21, and SAB S-17. Metode agar-agar lapis ganda yang terdiri atas lapis kasein dan SWC (sea water complete) digunakan untuk menapis produsen penghambat protease terhadap kelompok bakteri patogen penghasil protease, seperti EPEC K.1.1, S. aureus, dan P. Aeruginosa. Dari ketiga isolat penghasil penghambat protease, isolat SAB S-12 tidak menghasilkan zona penghambatan, hal ini mengindikasikan bahwa galur tersebut memiliki aktivitas penghambatan terbesar. Isolat SAB S-12 memiliki aktivitas penghambatan terbesar terhadap termolisin dan enzim ekstrak kasar dari kelompok bakteri patogen berturut-turut sebesar 91.570% dan 98.846%. Kemudian, isolat SAB S- 21 memiliki aktivitas penghambatan terbesar terhadap termolisin sebesar 70.370%. Kondisi pertumbuhan optimum dari ketiga galur tersebut pada rentang pH 7.0-8.0 dan rentang suhu 40- 50˚C pada media SWC. Semua galur penghambat protease termasuk ke dalam kelompok bakteri Gram-negatif dan berbentuk batang.
Keyword: Streptomyces, Escherichia coli, Aplysina aerophobia

Judul: Screening dan Karakterisasi Bakteri .Laut Penghasil Inhibitor Protease pada Sponge dari Kepulauan Seribu, Jakarta
Abstrak: Dalam dasawarsa terakhir ini, perhatian terhadap protease sebagai target senyawa obat bagi penyakit asal bakteri, virus, malaria serta kanker, bahkan penyakit degeneratif seperti Alzeimer meningkat pesat, karena semakin jelas keterlibatan enzim ini dalam mekanisme molekuler penyakit-penyakit tersebut. Sponge merupakan sumber yang paling produktif menghasilkan komponen bioaktif dari berbagai jenis organisme yang hidup di laut, diantaranya cytotoxic, antifungul, antitumor, antiviral, anr&fouling dan aktivitas penghambatan enzim. Penelitian ini bertujuan untuk melakukan screening Ian karakterisasi isolat bakteri laut penghasil inhibitor protease yang bersimbiosis dengan sponge dari Kepulauan Seribu, Jakarta. Pada akhimya, isolasi komponen bioaktif dari bakteri yang bersimbiosis dengan sponge diharapkan dapat mengatasi keterbatasan produksi menggunakan sponge, sehingga mengurmgi kebutuhan untuk mer~gambil sponge secara langsung dari habitat alamnya. Penelitian dilaksanakan di Laboratorium Bioteh.ologi Hewan dan Biomedis serta Laboratorium Mikrobiologi dan Biokimia, Pusat Penelitian Bioteknologi, Institut Pertanian Bogor dari Bulan Februari sampai Desember 2003. Penelitian dilakukan melalui lima tahap, meliputi: 1) isolasi dan pemumian bakteri laut yang bersimbiosis dengan sponge, 2) screening bakteri patogen penghasil protease dan bakteri laut penghasil inhibitor protease, 3) penentuan waktu propagasi bakteri patogen dan bakteri laut, 4) produksi protease kasar dan optimasi waktu produksi inhibitor serta 5) karakterisasi isolat bakteri laut penghasil inhibitor protease. Analisa parameter yang dilakukan meliputi uji aktivitas protease, uji persentase penghambetan ir-hihitor proteese, analisa konsentresi protein protease kasar dan inhibitor, pewarnaan gram, uji motilitas, uji katalase serta uji fisiologis dan biokimia menggunakan Microbact 24E. Hasil isolasi dan pemumian bakteri laut yang bersimbiosis dengan 10 jenis sponge yang dikoleksi dari perairan Pulau Panggang, wilayah Kepulauan Seribu, diperoleh 96 isolat tunggal dalam media MA. Isolat terbanyak terdapat pada sponge jenis Reniochalina stalagmitis (20 isolat) yang diambil pada kedalaman 10 meter, sedangkan jenis Xetospongia exigua yang diambil pada kedalaman 4 meter merupakan jenis sponge dengan jumlah isolat bakteri yang paling sedikit berhasil diisolasi (2 isolat). Pengukuran IP terhadap 6 isolat bakteri patogen menunjukkan bahwa nilai IP terbesar terdapat pada isolat bakteri Pseudomonas aeruginosa (2.5), kemudian bakteri Escherichia coli (2.2) dark Staphylococcus aureus (2.0). Screening terhadap 96 isolat bakteri laut yang dicobakan terhadap masing-masing bakteri proteolitik P. aeruginosa, E. coli dan S. aureus; dipilih isolat 3A3.2 dan 3A6.2 yang menuiijukkan penghambatan terhadap aktivitas proteolitik P. aeruginosa, isolat 3A6.2 yang menunjukkan penghambatan terhadap aktivitas proteolitik E. coli dan isolat 1 A3 yang menunjukkan penghambatan terhadap aktivitas proteolitik S. aureus. Pengukuran persentase penghambatan inhibitor protease isolat 3A3.2 terhadap protease P. aeruginosa menunjukkan penghambatan terbesar pada waktu fermentasi jam ke-32 sebesar 85.29% dengan kadar protein 0.058 mglml dan pH 8.65. Puncak penghambatan kedua terjadi pada waktu fermentasi jam ke-44 dengan persentase penghambatan sebesar 70% dengan kadar protein 0.0806 mglml dan pH 8.9. Adanya dua puncak aktivitas ini diperkirakan karena adanya kerja inhibitor yang berbeda. Berdasarkan kurva pengukuran absorbansi isolat 3A3.2 pada media fermentasi diketahui bahwa inhibitor pertama diproduksi pada fase stasioner sedangkan inhibitor kedua diproduksi pada fase penurunan jumlah sel bakteri. Pengukuran persentase penghambatan inhibitor protease isolat 3A6.2 terhadap protease P. aeruginosa menunjukkan penghambatan pertama pada waktu inokulum dipindahkan pada media fermentasi yaitu sebesar 91.56% dengan kadar protein 0.0962 mdml dan pH 6.73. Puncak penghambatan kedua terjadi pada waktu fermentasi jan~ ke-8 dengan persentase
Keyword: 

Judul: Construction of Strongly Optimal Binary Linear Code with Minimum Distance 9 and 11
Abstrak: A binary linear code of length n over q F is a subspace of n q F . A code has three parameters that attached to it, namely length, dimension, and minimum distance. A code with length n, dimension k and minimum distance d is often called [n, k, d ]-code. Usually, when two parameters are given, then we want to find a code that has the best value for the last parameter. Based on Gilbert- Varshamov bound, if a [n, k, d ]-code exists and can not be expanded, we call it a strongly optimal code. In this paper, we construct strongly optimal code with minimum distance 9 and 11. In constructing the code, we created a theorem and algorithm based on Gilbert-Varshamov bound before we implement the algorithm to MAPLE programming language. Because of computational limitations, the program can only construct up to k = 10 for d = 9 and k = 12 for d = 11.
Keyword: