Judul: Genetic Analysis and Metabolomic Study of Shade Tolerance in Tomato (Solanum lycopersicum Mill.)
Abstrak: Sistem budidaya tanaman di bawah tegakan pohon, tumpang sari atau tanaman sela pada tanaman kehutanan, perkebunan maupun pekarangan merupakan salah satu alternatif solusi dalam menjawab tantangan luas lahan optimum untuk pertanian yang semakin berkurang dan luas kepemilikian lahan petani Indonesia yang masih kecil. Adanya kekurangan cahaya (cekaman naungan) pada sistem budidaya tersebut dapat menyebabkan terganggunya proses metabolisme tanaman, turunnya laju fotosintesis dan penurunan produktivitas tanaman sehingga diperlukan varietas tanaman yang toleran dengan intensitas cahaya rendah dengan memiliki produktivitas yang tinggi. Tanaman tomat potensial digunakan pada sistem budidaya tersebut karena memiliki nilai ekonomi yang tinggi dan terdapat genotipe tomat yang toleran bahkan suka terhadap cekaman naungan. Hal ini menjadikan kegiatan pemuliaan varietas tomat toleran naungan yang berdaya hasil tinggi penting untuk dilakukan sehingga diperlukan informasi tentang karakter seleksi toleransi cekaman naungan (karakter morfologi, fisiologi, metabolomit atau molekuler) dan analisis genetiknya agar kegiatan pemuliaan varietas tomat toleran cekaman naungan yang berdaya hasil tinggi dapat lebih efektif dan efisien. Penelitian dilakukan dari bulan Juli 2016 sampai dengan bulai mei 2019 di Kebun Percobaan PKHT-IPB Pasir Kuda, Ciomas, Bogor dan Laboratorium Pendidikan Pemuliaan Tanaman, Departemen Agronomi dan Hortikultura, Fakultas Pertanian, Institut Pertanian Bogor. Pemberian cekaman naungan dilakukan memberikan naungan paranet plastik 50%. Pengamatan metabolit sekunder dilakukan di Laboratorium Kesehatan Daerah, DKI Jakarta. Penelitian ini diawali dengan menentukan genotipe tomat yang akan digunakan sebagai bahan penelitian. Genotipe tomat yang digunakan pada penelitian ini yaitu genotipe tomat suka naungan (SSH3 dan Apel), genotipe toleran naungan (GIK), genotipe moderat toleran naungan (Intan), dan genotipe peka naungan (Tora IPB dan 4979). Dari genotipe-genotipe tersebut kemudian dibuat populasi persilangan Biparental dan Dialel Lengkap untuk mempelajari pewarisan sifat toleransi naungan pada tanaman tomat. Setelah populasi persilangan diperoleh, dilakukan percobaan pertama yaitu studi analisis genetik toleransi naungan pada tanaman tomat menggunakan populasi biparental. Hasil percobaan menunjukkan bahwa karakter produktivitas, jumlah buah per tanaman, fruit set dan kehijauan daun merupakan karakter tomat yang terkait dengan toleransi cekaman naungan. Karakter-karakter tersebut lebih banyak dikendalikan oleh aksi gen dominan. Adanya interaksi epistasis duplikat pada karakter-karakter tersebut menyebabkan ragam non aditif lebih berperan pada karakter-karakter tersebut kecuali pada karakter fruit set. Sebanyak lebih dari 20 segregan diseleksi berdasarkan karakter toleransi naungan dari populasi F2 persilangan Biparental. Verifikasi terhadap keduapuluh segregan tersebut, hanya diperoleh 4 segregan transgresif tomat yang toleran cekaman naungan. Percobaan ini bertujuan untuk mendapatkan dan mengevaluasi kemajuan seleksi segregan transgesif tomat yang toleran naungan dan berdaya hasil tinggi. Seleksi dilakukan pada generasi F2 percobaan 1 menggunakan indeks seleksi dan hanya karakter hasil. Verifikasi segregan transgresif dilakukan pada generasi F3 sedangkan evaluasi respon seleksi dilakukkan sejak generasi F2 sampai generasi F4. Seleksi pada F2 menggunakan indeks seleksi menghasilkan 11 segregan transgresif putatif sedangkan menggunakan hanya karakter hasil memberikan 20 segregan transgresif putatif. Verifikasi pada populasi F3 menggunakan indeks seleksi menghasilkan 3 segregan transgresif (G370-1, G381-4, dan G384-11), sedangkan menggunakan karakter hasil hanya memberikan 4 segregan transgresif (G370-1, G376-16, G381-4, dan G384-11). Seluruh segregan transgresif menghasilkan produktivitas yang sama atau lebih baik dibandingkan genotipe tetua terbaik. Analisis daya gabung dan analisis genetik toleransi naungan pada tanman tomat juga dilakukan menggunakan populasi persilangan dialel lengkap. Hasil dari percobaan
Keyword: low light stress, secondary metabolites, selection characters, response selection

Judul: Studi adaptasi tanaman tomat (Solanum lycopersicum L.) terhadap intensitas cahaya rendah
Abstrak: Salah satu upaya untuk meningkatkan produksi tomat di Indonesia ialah elalui sistem tanam tumpangsari atau agroforestri. Namun dalam sistem tanam t mpangsari tanaman sela mengalami defisit cahaya karena ternaungi oleh tanaman lain. Defisit cahaya menyebabkan penurunan laju fotosintesis dan s .- tesis karbohidrat, sehingga berpengaruh terhadap metabolisme tanaman. eberapa jenis tanaman beradaptasi terhadap defisit cahaya, sehingga mampu tambuh di bawah naungan, dengan melakukan beberapa perubahan terhadap rakter morfologi, anatomi, fisiologi, maupun fenologi. Rangkaian penelitian ini terdiri atas 4 percobaan, yaitu (1) Penapisan genotipe tomat berdasarkan toleransi terhadap intensitas cahaya rendah, (2) Kajian toleransi pertumbuhan dan produksi genotipe tomat terhadap naungan, (3) Kajian morfologi, anatomi dan fenologi genotipe tomat toleran terhadap naungan, dan (4) Kaj'an fisiologi genotipe tomat toleran naungan terhadap intensitas cahaya rendah. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mempelajari mekanisme adaptasi genotipe tomat secara morfologi, anatomi, fisiologi dan fenologi terhadap intensitas cahaya rendah. Hasil percobaan pertama berupa penapisan 50 genotipe tomat berdasarkan produktivitas relatif terhadap kondisi naungan menghasilkan 4 kelompok genotipe, yaitu 5 genotipe senang, 16 toleran, 15 moderat dan 14 peka naungan. Penapisan 50 genotipe tomat berdasarkan analisa komponen utama menghasilkan 3 klaster, yaitu klaster A, B dan C. Klaster pertama (A) terdiri atas 11 genotipe, sebagian besar disusun oleh kelompok genotipe senang dan toleran. Klaster ke dua (B) terdiri atas 7 genotipe, sebagian besar disusun oleh genotipe peka. Klaster ke tiga (C) terdiri atas 32 genotipe, sebagian besar merupakan genotipe moderat. Kelompok genotipe tomat toleran naungan dicirikan oleh jumlah bunga dan buah, bobot buah per tanaman yang lebih tinggi, dengan bobot per buah lebih rendah, serta umur berbunga dan umur panen yang lebih cepat. Genotipe tomat toleran naumgan dengan produktivitas yang tinggi dapat dianjurkan sebagai komponen pen· sun vegetable agroforestry. Genotipe anjuran tersebut antara lain GI-K, SSH 3, SSH 9, SSH 10, Karina, Apel Belgia intermediet, Medan 4 dan Papua 2. Hasil percobaan kedua menunjukkan bahwa terdapat keragaman yang tinggi terhadap karakter morfologi, fisiologi, fenologi dan kualitas hasil buah pada 50 gen(i)tipe tomat ketika berada pada intensitas cahaya rendah (naungan 50%). Ge otipe senang naungan pada intensitas cahaya rendah mengalami peningkatan tinggi tanaman, jumlah dan luas daun lebih tinggi, peningkatan jumlah bunga dan bualh., rasio klorofil alb lebih rendah, serta mampu mempertahankan kerapatan . t.rnata, padatan total terlarut dan total asam tertitrasi. Perlakuan naungan dan kelompok genotipe pada percobaan ketiga me unjukkan pengaruh interaksi terhadap tinggi tanaman, kerapatan stomata, e ebalan daun, lapisan palisade dan bobot per buah. Genotipe tomat senang umgan jika ditumbuhkan pada cahaya rendah melakukan perubahan dalam karakter morfologi, anatomi dan fenologi. Perubahan tersebut antara lain dengan cara meningkatkan tinggi tanaman, jumlah dan luas daun, menjaga kerapatan stomata tetap tinggi, daun lebih tipis dan lapisan palisade lebih pendek. Karakter Jumlah buah, bobot per buah, umur panen, ketebalan daun dan tinggi palisade merupakan karakter yang berkorelasi nyata dan berpengaruh langsung terhadap rociuksi per tanaman. Kelima karakter tersebut dapat disarankan kepada pemulia -anaman untuk digunakan sebagai karakter seleksi, guna memperoleh genotipe omat yang tahan terhadap naungan dengan produktivitas tinggi. Hasil penelitian pada percobaan keempat menunjukkan bahwa karakter nt sintesis genotipe tomat senang naungan apabila mengalami cekaman naungan an
Keyword: Klorofil, Kerapatan stomata, Laju fotosintesis, Genotipe toleran

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: