Judul: Penapisan isolat-isolat bakteri sebagai agen pengendali hayati jamur Rhizoctonia solani
Abstrak: Fungisida kimia memiliki efek negatif yang membahayakan lingkungan dan kesehatan rnanusia Oleh karena itu digunakan bakteri penghasil fimgisida mikrob sebagai alternatifhya. Penelitian ini bertujuan untuk menapis sebanyak 3 f isoIat bakteri yang berpotensi sebagai agen pengendali hayati R. solani dengan diuji daya hambatnya terhadap pertumbuhan R. solani serta kemampuannya menghasilkan surfaktin, kitinase, dan protease.
Keyword: 

Judul: Aktinomiset Rizosfer Kedelai Penghasil Senyawa Bioaktif Antifungi terhadap Fusarium oxysporum
Abstrak: Fusarium oxysporum merupakan salah satu cendawan patogen yang menyerang tanaman kedelai dan menyebabkan penurunan produktivitas kedelai di Indonesia. Fungisida dianggap tidak mampu menyelesaikan masalah tersebut karena dapat meningkatkan resistensi dan menimbulkan permasalahan lingkungan yang lain. Salah satu alasan penting tidak digunakannya fungisida adalah kemampuannya yang dapat menurunkan viabilitas bakteri Rhizobium. Aktinomiset sebagai mikroorganisme yang menghasilkan paling banyak jenis senyawa bioaktif dapat digunakan sebagai solusi dalam menangani masalah tersebut. Penelitian ini bertujuan mengeksplorasi kemampuan aktinomiset rizosfer sebagai penghasil senyawa bioaktif antifungi terhadap F. oxysporum. Uji aktivitas antifungi secara in vitro melalui metode dual culture dilakukan terhadap 20 isolat aktinomiset rizosfer. Pengamatan aktivitas antifungi diamati dari perbandingan pertumbuhan radial sisi yang berhadapan dengan aktinomiset dengan sisi yang tidak berhadapan dengan aktinomiset. Uji hipersensitivitas dan kompatibilitas selanjutnya dilakukan terhadap 10 isolat aktinomiset potensial yang mampu menghambat F. oxysporum dari hasil skrining secara in vitro. Aktivitas antifungi selanjutnya dikonfirmasi secara in planta pada tanah steril dan tanah tidak steril. Sebanyak 5 isolat yang stabil dalam menghambat F. oxysporum in vitro dan in planta, selanjutnya diekstrak metabolitnya. Ekstrak metabolit terbaik ditunjukkan oleh isolat ARK 94 yang selanjutnya dianalisis menggunakan Gas Chromatography- Mass Spectrometry (GC-MS) untuk mengetahui senyawa kimia yang terkandung di dalamnya. Sebanyak 5 isolat terpilih tersebut juga diidentifikasi secara molekuler dengan mengamplifikasi gen 16S rRNA. Persentase penghambatan dari hasil uji aktivitas antifungi secara in vitro pada 10 isolat aktinomiset berkisar antara 38.69% hingga 73.50%. Respon hipersensitif tidak ditunjukkan oleh tanaman tembakau yang telah diinjeksi dengan isolat potensial dan seluruh isolat potensial kompatibel terhadap Bradyrhizobium japonicum. Uji aktivitas antifungi secara in planta menunjukkan bahwa 10 isolat hasil uji aktivitas antifungi in vitro mampu menekan penyakit akibat F. oxysporum secara in planta. Besar penekanan penyakit berkisar antara 36% hingga 80.7% pada tanah steril dan 67% hingga 100% pada tanah tidak steril. Sebanyak 5 isolat yang dipilih untuk diekstrak metabolitnya menunjukkan penghambatan terhadap pertumbuhan hifa F. oxysporum yang berkisar antara 19% hingga 54.09%. Ekstrak metabolit paling potensial, yaitu ARK 94 dianalisis senyawa kimianya menghasilkan 12 senyawa kimia dominan. Sebanyak 7 dari 12 senyawa tersebut memiliki aktivitas antifungi berdasarkan beberapa referensi hasil penelitian sebelumnya. Hasil BLAST sekuen 16S rRNA menunjukkan bahwa 5 isolat terpilih tersebut merupakan genus Streptomyces. ARK 94 menunjukkan konsistensi dalam aktivitasnya menghambat F. oxysporum dalam perlakuan in vitro, in planta, dan ekstrak metabolit.
Keyword: aktinomiset rizosfer, aktivitas antifungi, GC-MS, senyawa bioaktif

Judul: The Construction of Greedy SVP LLL Algorithm
Abstrak: A lattice is a set of all integer linear combination of a set of linearly independent vectors in ℝ𝑛���. The independent vectors are called bases of lattice. Any lattice can be generated from many bases, and these bases have the same cardinality. In the lattice, the most fundamental and renowned problem is the Shortest Vector Problem (SVP). SVP is a tracking problem of the shortest nonzero vector in a lattice with equivalent bases. In two dimensions, SVP problem has resolved exactly by Gauss’ algorithm. When the lattice dimension is higher than two, A.K. Lenstra, H.W. Lenstra and L. Lovasz gave a LLL algorithm to compute approximation of nonzero shortest vector in the lattice. Reduced bases solution obtained from LLL algorithm still be an approximation and has polynomial running time of arbitrary dimension which large enough. In 1994, Schnoor and Euchner modified this LLL algorithm as a new variant which later was named deep insertion LLL algorithm. This algorithm is a modified version of the LLL algorithm to the terms of the exchange step to improve the accuracy of output of LLL reduced bases and applying it to the subset sum problem. The purpose of this research are: (1) Reconstruct the LLL algorithm and deep insertion LLL algorithm using a geometric approach. (2) Construct a greedy SVP LLL algorithm. (3) Implement the three algorithms in a symbolic programming language, and evaluate them experimentally. A bases ℬ=[𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑛���] in ℝ𝑚��� is called reduced LLL with parameter 𝛿��� if satisfies: (a) |𝜇���𝑗���𝑖���|≤12, for every integer 𝑖���,𝑗��� with 1≤𝑖���<𝑗���<𝑛���. (b)𝛿���‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���)‖2≤‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���+1)‖2, for 𝑗���=1,2,…,𝑛���−1,where 𝛿��� is a reduced parameter of real numbers with 14<𝛿���<1. The first requirement is the reduced basis 𝛿��� must “nearly orthogonal” and in its computation case, this requirement can be reached out by using the Gram-Schmidt’s orthogonalization. While the second requirement is called exchange step, or used to called as Lovasz condition. By using both of these requirements, then they establish the LLL algorithm. Then, Schnoor and Euchner modify the LLL algorithm based on the requirements of the exchange step called the deep insertion LLL algorithm, where the exchange step is based on the comparison of the projected vector in orthogonal complement [𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑘���−1]⊥ after j-th reduction. To construct greedy SVP LLL algorithm, the requirements of the exchange step is based on purely by comparing norm of lattice 𝐛���𝑗��� with norm lattice 𝐛���𝑖��� for 𝑖���=1,2,3…,𝑗���−1. The process of insertion reduced vector after the exchange step also has done greedily. Then, we calculate the number of arithmetic operation in greedy SVP LLL algorithm for further analysis. The result of our exprimentation for three algorithms on the certain matrix size shows that the running time of the three algorithms increases propotional to the size of the matrix. The result also shows that by using 𝛿���=34 for the LLL algorithm and the deep insertion LLL algorithm, and the greedy SVP LLL algorithm which is a new variant made by using no parameter of 𝛿���, outperform of the other of two previous algorithm in terms of speed with the same output.
Keyword: LLL algorithm, LLL deep insertion algorithm, greedy SVP LLL algorithm