Judul: Keragaman Genetik Ayam Asli Indonesia Yang Langka Berdasarkan Analisis Sekuen Komplit Daerah D-Loop Mitokondria Dan Gen Myxovyrus (Mx) Resistance
Abstrak: Ayam bekisar (BkSr), bekikuk (BKK), leher gundul (GUN), sumatera (SUM) dan walik (WLK) merupakan ayam asli Indonesia yang langka. Karakter molekuler merupakan salah satu kriteria standar teknis utama dalam penetapan rumpun (breed) dan galur ayam di Indonesia yang sampai saat ini masih terbatas datanya. Wabah penyakit viral seperti AI dan ND juga diperkirakan menjadi salah satu penyebab kelangkaan dan hilangnya breed ayam sehingga karakteristik gen yang terkait dengan tingkat kekebalan tubuh ayam terhadap serangan penyakit akan menentukan keberlangsungan hidup ayam. Tujuan penelitian ini adalah untuk menyediakan pangkalan data struktur populasi dan diferensiasi breed dan menduga asal-usul ayam asli Indonesia berdasarkan karakteristik mtDNA d-loop dan gen Mx. Penelitian ini terdiri dari 2 tahapan penelitian yaitu (1). Determinasi breed ayam asli Indonesia yang langka dan ayam Indonesia yang lain berdasarkan analisis sekuen komplit daerah d-loop mitokondria (mtdna d-loop), dan (2). variasi dan evolusi gen Mx ayam berdasarkan sejarah program seleksi dan pembentukan breed ayam. Penelitian ini menggunakan 23 breed ayam Indonesia (mewakili 35% jumlah total breed ayam yang ada di Indonesia), berdasarkan Sartika dan Iskandar (2007). Tiga set data digunakan pada penelitian tahap 1. Data pertama digunakan untuk menentukan haplogroup mtDNA d-loop ayam asli Indonesia dan hubungannya dengan ayam-ayam dari negara-negara lain dengan menggunakan analisis unrooted neighbor-joining (NJ). Data pertama ini terdiri dari 679 sekuen mtDNA d-loop (1227 bp) dari 6 breed ayam asli Indonesia yang langka (BkSr, Bkk, BRG, GUN, SUM dari populasi Indonesia dan Amerika Utara dan WLK), 17 breed ayam Indonesia yang lain (arab golden red ARGj dan ARGb, arab silver ARGs, bangkok BgK, black java (BJ, dari populasi Amerika Utara), cemani CMN, gaga’ GAG, kampung (KPGb, KPGb, KPGg, KPGbd, KPGs dan KPGsl), kate KT, kapas KPS, kedu hitam KDh, kedu lurik KDl, kedu putih KDp, kukuak balenggek AKB, pelung PLg, nunukan NNK, sentul STL, dan serama SRM, 2 ayam ras komersial (broiler BRO, dan layer L), 5 subspesies ayam hutan hijau (dari Bali AHHb, Jawa AHHj, dan Madura AHHm) dan 2 ayam hutan merah (dari Jawa AHMj, dan Sumatera AHMs) dan 154 sekuen perwakilan haplotype mtDNA d-loop ayam di dunia (A-I dan W-Y) (Mioa et al. 2013). Seratus sembilan puluh delapan (198) sekuen mtDNA D-loop ayam asli Indonesia dan ayam hutan telah disimpan di Genbank NCBI dengan no aksesi KR535995-KR536177 dan KT853000-KT853016. Data kedua terdiri dari 524 sekuen mtDNA D-loop (1227 bp) ayam Indonesia dan ayam hutan digunakan untuk memperkirakan struktur populasi dan determinasi spesies, subspecies, breed dan galur ayam. Keragaman haplotype (H) dan keragaman genetik (π) mtDNA d-loop dari 481 individu ayam Indonesia dan ayam ras komersial dihitung dengan menggunakan program DNA Sequence Polymorphism (DnaSP) versi 5.10.01. Struktur populasi dan determinasi breed ayam dianalisis dengan menggunakan program Mr. Bayes versi 3.0. Data ketiga mencakup 616 sekuen mtDNA D-loop ayam (ayam Indonesia=490; ayam dari luar negeri=126) yang digunakan untuk menganalisis aliran genetik dan penyebaran ayam yang dianalisis dengan menggunakan Median Joining Network (MJ) dalam program NETWORK versi 5.0.0.0. Penyebaran ayam berdasarkan 7 wilayah regional State of the World’s Animal Genetic Resources for Food and Agriculture (SoW-AnGR) yang ditetapkan FAO (2007) digunakan untuk menentukan pengelompokan breed ayam: (1). lokal (breed yang
Keyword: Ayam Indonesia, aliran genetik, diferensiasi breed, gen Mx, mtDNA d-loop, struktur populasi

Judul: Analisis keragaman genetik daerah D-Loop DNA mitokondria ayam hutan hijau (Gallus varius)
Abstrak: Analisis keragaman genetik dilakukan pada 30 sampel ayam hutan hijau. (Gallus varius) yang berasal dari Jawa Timur, Bali dan Lombok dengan menggunakan teknik PCR-RFLP. Sebagai pembanding (outgroup) digunakan ayam hutan merah (Sumatera dan Sulawesi) dan beberapa jenis ayam lainnya (ayam pelung, ayam kedu, ayam ras petelur dan ayam kampung). Amplifikasi daerah. D-loop mtDNA ayam dilakukan dengan menggunakan sepasang primer, yaitu L16750 (5'-AGGACTACGGCTTGAAAAGC-3' yang menempel pada tRNA Glutamic acid) dan H1255 (5'-CATCTTGGCATCTTCAGTGCC-3' yang menempel pada tRNA Phenylalanine). Hasil amplifikasi tersebut selanjutnya dipotong dengan menggunakan lima enzim restriksi pemotong empat basa, yaitu: Alu I (AGICT), Hae III (GG CC), Hpa II (CCGG), Mbo I (GATC) dan Rsa I (GTAC). Amplifikasi daerah D-loop pada ayam hutan hijau menghasilkan dua macam ukuran fragmen DNA yang berbeda. Fragmen DNA berukuran 1322 pasang basa (pb) ditemukan pada hampir semua ayam hutan hijau dari ketiga daerah yang berbeda, sedangkan fragmen DNA berukuran 1381 pb hanya ditemukan pada dua sampel ayam hutan hijau (Jawa Timur dan Bali). Analisis dengan menggunakan teknik PCR-RFLP hanya menghasilkan dua macam haplotipe. Hampir semua ayam hutan hijau memiliki haplotipe 1, sedangkan haplotipe II hanya dimiliki oleh ayam hutan hijau yang berasal dari Lombok (satu sampel). Pada kelompok pembanding, ukuran fragmen DNA teramplifikasi yang dihasilkan adalah 1322 pb, dengan pola pita hasil pemotongan berdasarkan analisis PCR-RFLP adalah haplotipe II. Ayam hutan hijau yang berasal dari Lombok (satu sampel) diduga berasal dari induk yang mengalami proses perkawinan campuran dengan ayam hutan merah atau jenis ayam lainnya. Penelitian lebih lanjut dengan menggunakan teknik PCR-Sequencing diharapkan dapat mengungkapkan secara terperinci keragaman genetik intraspesies pada ayam hutan hijau yang ada di Indonesia.
Keyword: Gallus varius, Mitochondrial DNA, D-Loop, Genetic differences, Green jungle fowl

Judul: Pembuatan Film Tipis Cu2ZnSnS4 sebagai Lapisan Penyerap Cahaya pada Sel Surya Menggunakan Metode Elektrodeposisi
Abstrak: Thin film of Cu2ZnSnS4 (CZTS) is an alternative semiconductor used as light absorber layer on solar cell. CZTS can replace silicon that commonly used as commercial semiconductor. The advantage of using CZTS as absorber layer is due to the abundance of its chemical composer on earth, and its high value of absorption coefficient. The absorber layer was made by using electrodeposition method on ITO glass substrates. The films were deposited at room temperature using potentiostatic mode with a potential of –1.05 V for 30, 45, and 60 minutes. After that, the films were annealed at two different temperatures, 180 ºC and 500 °C, for 45 minutes in N2/H2S atmosphere. Based on X-ray diffraction analysis, the polycrystalline thin film obtained fall into kesterite crystal phase. This type of crystal was obtained when the CZTS was annealed at 500 °C in H2S/N2 atmosphere. The value of optical band gap energy for the CZTS thin film was 2.2 eV with the film thickness about 1.228–6.366 μm. The sample of CZTS with electrodeposition time of 45 minutes and annealing temperature of 500 °C showed the best result and in conformity with absorber layers criteria for solar cells.
Keyword: semiconductor, ITO glass, CZTS thin film, electrodeposition