Judul: Penapisan Bakteri Filosfer Padi Penghasil Senyawa Bioaktif Anti-Xanthomonas Oryzae Pv. Oryzae Dan Deteksi Sekuen Gen Penyandi Peptida Non-Ribosomal Sintetase
Abstrak: Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo) adalah bakteri penyebab penyakit hawar daun yang dapat menyebabkan penurunan produksi padi. Bakteri filosfer mampu menghasilkan senyawa bioaktif anti-Xoo yang dapat dijadikan sebagai alternatif agens biokontrol. Penelitian ini bertujuan menyeleksi isolat bakteri filosfer padi penghasil senyawa bioaktif penghambat pertumbuhan Xoo dan mendeteksi keberadaan gen penyandi peptida non-ribosomal sintetasenya. Sepuluh isolat bakteri filosfer padi yang diuji mampu menghasilkan senyawa bioaktif anti-Xoo yang ditunjukkan dengan terbentuknya zona bening di sekitar koloni. Analisa sekuen gen penyandi 16S rRNA menunjukkan bahwa enam isolat (BFR 35, BFR 64, BFR 69, BFR 153, BFR 162, dan BFR 266) termasuk anggota genus Bacillus, tiga isolat (BFR 183, BFR 217, BFR 238) termasuk anggota genus Pseudomonas, dan satu isolat (BFR 203) diidentifikasi sebagai Staphylococcus sciuri. BFR 64, BFR 69, BFR 153, dan BFR 183 terdeteksi memiliki gen penyandi domain A dari peptida non-ribosomal sintetase dengan homologi 91%, 89%, 98%, dan 76% berturut-turut untuk keempat isolat tersebut. Bacillus aerius BFR 153, Pseudomonas cremoricolorata BFR 183, Staphylococcus sciuri BFR 203, dan Pseudomonas parafulva BFR 217 bersifat non-hemolitik sehingga potensial dan aman dikembangkan sebagai agens biokontrol untuk mengendalikan Xoo.
Keyword: Bacillus, domain A, gen 16S rRNA, hemolisis darah

Judul: Penapisan Aktinomiset Filosfer Padi Penghasil Senyawa Bioaktif Anti Xanthomonas oryzae pv. oryzae dan Pyricularia oryzae Penyebab Penyakit Pada Padi.
Abstrak: Padi merupakan salah satu komoditi pangan yang penting di dunia. Namun berbagai macam penyakit pada tanaman padi dapat menyebabkan penurunan produksi padi. Dua penyakit penting yang menyerang tanaman padi antara lain penyakit hawar daun bakteri (HDB) yang disebabkan oleh Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo) dan penyakit blas yang disebabkan oleh cendawan Pyricularia oryzae (Po). Salah satu alternatif yang dapat digunakan untuk mengendalikan penyakit-penyakit tersebut adalah menggunakan mikroba agens pengendali hayati, diantaranya dari jenis aktinomiset. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi aktinomiset dari filosfer padi yang menghasilkan senyawa bioaktif penghambat pertumbuhan Xoo dan Po. Sebanyak 33 isolat telah diisolasi dari filosfer padi varietas Ciherang. Uji antagonisme terhadap Xoo dan Po yang dilakukan menunjukkan semua isolat yang diperoleh mempunyai potensi dalam menghambat pertumbuhan Xoo, dan 28 isolat diantaranya mempunyai potensi menghambat pertumbuhan Po. Uji hipersensitivitas pada tanaman tembakau menunjukkan 27 isolat tidak menimbulkan reaksi hipersensitif pada daun tembakau, sedangkan uji patogenisitas terhadap tanaman padi varietas IR-64 yang dilakukan dengan teknik pengguntingan dan pencelupan daun menunjukkan 18 isolat tidak mengakibatkan gejala penyakit pada tanaman padi. Sebanyak 13 isolat yang memiliki sifat antagonis terhadap kedua patogen tersebut, non patogenik terhadap padi dan tembakau, berpotensi untuk dikembangkan sebagai agens biokontrol terhadap penyakit hawar daun bakteri dan blas. Identifikasi secara molekuler terhadap 4 isolat terbaik (H1.11, H1.8, AFSG 29, dan AFSG 15) menunjukkan bahwa isolat H1.11 memiliki kemiripan dengan Streptomyces sp. (99% dari 983 nukleotida, evalue 0.0, query cover 99%), isolat H1.8 memiliki kemiripan dengan Actinomadura sp. (100% dari 100 nukleotida, e-value 0.0, query cover 100%), dan dua isolat lainnya teridentifikasi sebagai Uncultured bacterium clone.
Keyword: Actinomycetes, Bacterial leaf blight, Phylloshere bacteria, Bioactive compounds

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: