Judul: Identifikasi cendawan endofit asal daun Pegagan (Centella asiatica) berdasarkan morfologi dan penanda molekuler daerah ITS (Internal Transcribed Spacer)
Abstrak: Tanaman Pegagan (Centella asiatica) ialah tanaman tropis yang banyak terdapat di Indonesia dan dimanfaatkan sebagai tanaman obat karena khasiat dari kandungan bioaktifnya. Dalam hidupnya pegagan berasosiasi dengan cendawan endofit, yang bersifat simbiosis mutualistik atau netral. Senyawa bioaktif yang dikandung pegagan dapat dihasilkan oleh cendawan endofit atau hasil dari interaksi antara tanaman pegagan dengan cendawan endofit yang bersimbiosis. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keragaman cendawan endofit asal daun tanaman pegagan secara morfologi dan molekuler menggunakan daerah ITS. Tujuh Isolat cendawan yang berasal dari penelitian sebelumnya kemudian diidentifikasi pada penelitian ini. Identifikasi morfologi meliputi pengamatan koloni, struktur mikroskopis dari hifa dan spora. Identifikasi molekular dilakukan dengan terlebih dahulu mengisolasi DNA genom dengan menggunakan metode CTAB (Cetyl Trimethyl Ammonium Bromide) yang telah dimodifikasi. DNA hasil isolasi kemudian diamplifikasi pada daerah ITS 1 dan ITS 2 termasuk juga daerah 5.8 dengan ITSI dan ITS 4 sebagai pasangan primer. Hasil amplifikasi kemudian diurutkan susunan basanya, dan dianalisis dengan menggunakan program BLASTN. Berdasarkan hasil identifikasi secara morfologi diketahui bahwa ketujuh isolat tersebut teridentifikasi kedalam 5 genus yaitu Aspergilus, Colletotrichum, Fusarium, Mycoleptodiscus, dan Phoma. Berdasarkan hasil identifikasi molekuler menunjukkan bahwa kesemua isolat cendawan termasuk filum Ascomycota dan mempunyai nilai homologi kemiripan dengan data yang ada pada Gene Bank berkisar antara 81% sampai 99%. Ke 7 cendawan tersebut ialah Aspergillus sydowii, Colletotrichum gloeosporiorides, dua isolat Fusarium solani, dua isolat Mycoleptodiscus indicus dan Phoma sp.
Keyword: Molecular identification, Endophytic Fungi, Pegagan (Centella asiatica), ITS region

Judul: Isolation and Identification of Endophytic Fungi in Epiphytic and Hemiepiphytic Orchid Root
Abstrak: Tanaman anggrek bersimbiosis dengan cendawan endofit pada seluruh fase hidupnya termasuk perkecambahan. Penelitian cendawan endofit pada anggrek di Indonesia masih terbatas. Penelitian ini bertujuan mengisolasi dan mengidentifikasi cendawan endofit pada anggrek bernilai ekonomi penting Phalaenopsis amabilis, Dipodium brevilabium, Vanilla planifolia, dan Aerides odorata. Cendawan endofit diisolasi dari peloton akar anggrek yang disterilisasi permukaannya. Identifikasi dilakukan secara morfologi dan molekuler menggunakan sekuens DNA daerah ITS rDNA, dilanjutkan analisis BLAST dan pohon filogenetik. Semua akar anggrek yang diteliti memiliki struktur peloton pada jaringan korteksnya. Diperoleh sebanyak 22 isolat cendawan endofit dari 4 spesies tanaman anggrek yaitu Fusarium, Penicillium, dan miselia sterilia. Pada anggrek P. amabilis diperoleh 5 isolat yaitu 1 isolat Penicillium dan 4 isolat miselia sterilia. Pada anggrek D. brevilabium terdapat 7 isolat yaitu 1 isolat Penicillium dan 6 isolat Fusarium. Pada anggrek V. planifolia didapatkan 6 isolat Fusarium. Pada anggrek A. odorata ditemukan 4 isolat yaitu 1 isolat Penicillium, 2 isolat miselia sterilia, dan 1 isolat belum teridentifikasi. Penicillium ditemukan pada 3 dari 4 spesies anggrek yang diteliti. Satu isolat Penicillium diidentifikasi secara molekuler sebagai Penicillium citrinum. Sebagian besar cendawan endofit pada anggrek P. amabilis ialah cendawan miselia sterilia, sedangkan anggrek D. brevilabium, V. planifolia, dan A. odorata ialah Fusarium.
Keyword: Fusarium, mycelia sterilia, peloton, Penicillium citrinum

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: