Judul: Analisis molekuler gen Cry dari galur-galur mutan Bacillus thuringiensis subsp. kurstaki HD-1 dengan teknik PCR (Polymerase Chain Reaction)
Abstrak: Pestisida yang biasa digunakan untuk mengendalikan serangga perusak tanaman (hama) adalah) bahan kimia beracun. Bahan kimia tersebut biasanya mempunyai spektrum daya bunuh yang luas, karena sifatnya ini dapat menimbulkan dampak negatif diantaranya membunuh organisme nontarget, berdampak terhadap kesehatan manusia, dan menyebabkan kerusakan lingkungan serta resistensi hama. Mengingat bahaya dari pestisida tersebut maka dicari alternatif yang lebih aman yaitu penanggulangan secara alami atau hayati yang disebut dengan biocontrol. Salah satunya adalah penggunaan bakteri sebagai biocontrol. Bacillus thuringiensis merupakan bakteri yang memiliki protein toksik yang dapat membunuh serangga perusak tanaman. Salah satu B. thuringiensis yang sudah dimanfaatkan adalah Bacillus thuringiensis subspesies kurstaki HD-1 yang mampu membunuh larva Lepidoptera. Dalam usaha meningkatkan potensi bakteri tersebut sebagai insektisida telah dilakukan mutasi (modifikasi genetik) dengan menggunakan sinar UV, etilmetansulfonat, dan metil-nitro-nitroso- guanidin (Jusuf 1987). Pada penelitian ini dilakukan analisis molekuler untuk mendeteksi perubahan yang terjadi pada gen cry akibat mutasi pada untaian basanya. Teknik analisis molekuler yang dilakukan adalah reaksi rantai polimerase (Polymerase Chain Reaction, PCR). Gen penyandi protein toksik (gen cry) untuk B. thuringiensis subsp. kurstaki HD-1 terdapat pada plasmid. Metode isolasi plasmid yang dipilih adalah metode Allen (Cork & khalil 1996), yaitu isolasi plasmid berdasarkan pada denaturasi alkali. Analisis DNA dari galur-galur mutan B. thuringiensis subsp. kurstaki HD-1 dengan menggunakan teknik PCR menunjukkan bahwa mutasi pada untaian DNA dapat menyebabkan terjadinya perubahan gen cry dari asalnya atau adanya penambahan jenis gen cry baru, seperti pada galur 25S7, 50S1, dan 2EM1 mempunyai gen cry tambahan selain gen cry yang terdapat pada galur liar [cry IA (b)] yaitu gen cry IA, ID, dan IIIA.
Keyword: molecular systems

Judul: Eksistensi gen penyandi protein &-endotoksin pada beberapa isolat bakteri tanah
Abstrak: Protein S-endotoksin telah lama digunakan sebagai pestisida hayati karena selektifitas toksisitasnya yang tinggi. Bahan aktif ini diproduksi oleh bakreri Bacillus thuringiensis pada masa sporulasi. Material genetik penyandi protein 8-Endotoksin terdapat pada plasmid yang disebut dengan gen cry. Penelitian untuk mengisolasi dan mengidentifikasi bakteri B. thuringiensis semakin berkembang. Salalı satu teknik yang digunakan adalah polymerase chain reaction. Teknik ini paling sensitif dan relatif mudah. Penentuan keberadaan gen cry pada 24 buah isolat bakteri tanah pada penelitian ini menggunakan teknik polymerase chain reaction dengan 8 primer, yaitu Cry IA, IA(b), IA(c), IB, IC, ID, IE, dan IIIA. Sebagai kontrol digunakan lima macam galur bakteri B. thuringiensis. Pada semua isolat yang diteliti tidak terdapat gen cry 1A, 1A(b), IA(c), 1B, 1C, ID, IE, dan 3A. Di dalam B. thuringiensis subsp. kurstaki HD-1 terdapat gen cry 1C dan 1E. Pada B. thuringiensis Berliner subsp. kurstaki HD-1 dari Thuricide " HP terdapat gen cry 1C.
Keyword: pestisida hayati, bacillus thuringiensis, teknik polymerase chain reaction, gen cry

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: