Judul: Karakterisasi parsial gen B-1,3-glukanase dan kitinase pada kopi arabika coffea arabica L.
Abstrak: Daun muda kopi Arabika dari dua varietas -S 1934 (tahanJ dan BLP 10 (rentan) -digunakan sebagai bioessai untuk uji ketahanan terhadap penyakit karat daun. Daun-daun diinokulasi dengan uredospora H .-astatrix atau aquadest sebagai kontrol dan diinkubasi selama 20 hari. Gejala bercak mulai nampak pada hari ke-12 setelah inokulasi pada kedua varietas dengan intensitas yang berbeda. Rata-rata gejala bercak pada varietas tahan adalah 3 bercak per daun, sedangkan pada varietas rentan 39,5 bercak per daun. Deteksi ekspresi gen glukanase dan kitinase dilakukan pada hari ke-6 dan ke-9, dimana daun-daun sampel dipisahkan dan kemudian dilakukan ekstraksi RNA untuk keperluan analisis RT-PCR dengan menggunakan primer spesifik glukanase dan kitinase. Primer spesifik dirancang dari daerah yang tinggi homologi sekuennya (conserve region) yang merupakan basil alignment beberapa tanaman berbiji. Produk RT-PCR kemudian disekuensing dan dianalisa tingkat homologinya dengan program BlastX....dst
Keyword: kopi arabika, penyakit karat daun, Gen f3-l ,3-glukanase dan Kitinase, isolasi RNA

Judul: Aktivitas Antioksidan, Inhibisi α-Glukosidase dan Identifikasi Senyawa Aktif Kulit Kopi Arabika Gayo (Coffea arabica L.).
Abstrak: Kulit kopi merupakan limbah dari produksi kopi. Kelimpahan kulit kopi mengakibatkan pencemaran jika tidak diolah dengan baik. Kulit kopi arabika gayo (Coffea arabica L.) yang diperoleh dari Kabupaten Aceh Tengah diduga memiliki aktivitas antioksidan yang tinggi dan memiliki kandungan polifenol, yang dapat berfungsi sebagai antioksidan. Senyawa fenol dilaporkan dapat menurunkan kadar gula darah pada penyakit diabetes melitus (DM). DM merupakan kelompok penyakit metabolik dengan kondisi hiperglikemia yang terjadi karena kelainan sekresi insulin, kerja insulin, atau kedua-duanya. Pada penelitian ini, kulit kopi dalam bentuk simplisia diekstraksi dengan metode maserasi dengan pelarut etanol 96% selama 3 jam pada kecepatan 130 rpm di suhu ruang. Ekstrak etanol kulit kopi kemudian difraksinasi sehingga menghasilkan fraksin heksana, fraksi etil asetat, dan fraksi air. Hasil skrining fitokimia menunjukkan bahwa ekstrak kulit kopi mengandung alkaloid, flavonoid, saponin, tanin dan triterpenoid. Kandungan total fenolik paling tinggi adalah ekstrak etanol sedangkan fraksi n-heksana memiliki kandungan total flavonoid tertinggi. Uji aktivitas antioksidan dengan metode DPPH menggunakan 2.2 diphenyl- 1-picrylhydrazyl (DPPH) sebagai senyawa radikal bebas. Aktivitas antioksidan dalam DPPH diekspresikan dengan IC50 (konsentrasi penghambatan). Hasil penelitian menunjukkan bahwa ekstrak dan fraksi yaitu n-heksana, etil asetat, dan air memiliki aktivitas antioksidan tinggi dengan nilai IC50 berturut-turut 12.03 μg/mL, 36.08 μg/mL, 30.27 μg/mL, 11.62 μg/mL. Uji inhibisi aktivitas α-glukosidase menggunakan larutan enzim dengan konsentrasi 0.04 U/mL, larutan substrat dengan konsentrasi 10 mM (akarbos sebagai pembanding). Fraksi n-heksana memiliki nilai IC50 paling rendah yaitu 341.81 μg/mL, hal ini menunjukkan bahwa senyawa yang memiliki kemampuan menghambat α-glukosidase pada penelitian ini adalah senyawa non-polar. Identifikasi senyawa aktif yang memiliki aktivitas inhibisi α-glukosidase menggunakan LC-MS/MS menunjukkan bahwa fraksi n-heksana kulit kopi kemungkinan mengandung senyawa Diacerein, Rhamnetin-3-Oneohesperidosida, Ar-Tumeron, Luteolin 7,4'-diglukuronida-3'-glukosida, Kaempferol 3-(4'',6''-diasetilglukosida)-7-rhamnosida, dan 1,5-dietinilantrakuinon.
Keyword: Antioksidan, Coffea arabica L., fenolik, flavonoid, glikosidase

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: