Judul: Aktinomiset Endofit Artemisia vulgaris Asal Thailand dan Indonesia: Keanekaragaman, Aktivitas Antibakteri dan Pelarut Fosfat.
Abstrak: Aktinomiset endofit merupakan bakteri yang mengkolonisasi inang tanpa adanya efek negatif yang merugikan serta menghasilkan beragam senyawa metabolit sekunder seperti antibiotik dan kemampuan melarutkan fosfat dalam tanah. Salah satu inang yang dikolonisasi oleh aktinomiset endofit adalah tanaman yakni Artemisia vulgaris. Artemisia vulgaris dikenal dengan nama god ju la lum pha (Thailand) dan baru cina (Indonesia) adalah tanaman obat yang digunakan dalam mengobati muntah, epilepsi, diare, masalah konstipasi, dan masalah menstruasi. Eksistensi aktinomiset endofit Artemisia vulgaris asal Thailand dan Indonesia serta potensinya belum pernah dilaporkan. Penelitian ini bertujuan mengkaji keragaman aktinomiset endofit tanaman Artemisia vulgaris asal Thailand dan Indonesia serta potensinya sebagai antibakteri dan pelarut fosfat. Metode yang digunakan meliputi isolasi, uji aktivitas antibakteri dan pelarut fosfat, serta identifikasi secara molekuler. Isolat AvTcrs-22, AvTcrs-30, dan AvIr-13 menunjukkan hasil yang positif terhadap uji antibakteri dan pelarut fosfat sedangkan AvIcrs-09 hanya mampu menghasilkan aktivitas antibakteri. Hasil identifikasi molekuler menunjukkan bahwa 3 isolat AvTcrs-22, AvIr-13, dan AvTcrs-30, berkerabat dekat dengan genus Streptomyces dengan nilai kemiripan berturut-turut 98.00%, 97.51%, dan 93.95% sedangkan AvIcrs-09 berkerabat dekat dengan genus Microbispora dengan nilai kemiripan sebesar 97,77%. Informasi yang diperoleh mengindikasikan keragamaan aktinomiset endofit A. vulgaris asal Thailand dan Indonesia dan sebagian diantaranya memiliki potensi sebagai antibakteri dan pelarut fosfat.
Keyword: Artemisia vulgaris, aktinomiset endofit, antibakteri, pelarut fosfat, Thailand, Indonesia

Judul: Analisis Komunitas Aktinobakteri Endofit Pegagan (Centella Asiatica L. Urban) Berdasarkan Gen 16s Rrna Dan Potensinya Sebagai Antidiabetes
Abstrak: Aktinobakteri endofit tanaman obat memiliki potensi sebagai sumber beragam senyawa bioaktif termasuk antidiabetes. Pengetahuan tentang keragaman genetik aktinobakteri endofit Centella asiatica penting sebagai dasar untuk mengeksplorasi aktinobakteri endofit potensial dari tanaman tersebut. Analisis keragaman melalui pendekatan metagenomik (culture-independent) dengan teknik PCR-DGGE (Polymerase Chain Reaction - Denaturing Gradient Gel Electrophoresis), merupakan langkah yang efisien dalam mempelajari komunitas aktinobakteri endofit. Penelitian ini bertujuan mengkaji keragaman aktinobakteri tanah rizosfer dan endofit C. asiatica melalui pendekatan metagenomik dengan PCR-DGGE berdasarkan gen 16S rRNA dan gen inhibitor α-glukosidase. DNA genom total tanah rizosfer dan jaringan tanaman diekstraksi menggunakan Soil DNA Isolation Kit dan Genomic DNA Mini Kit (Plant). Gen 16S rRNA aktinobakteri diamplifikasi menggunakan teknik nested-PCR (27F, 16Sact1114R dan P338F-GC, P518R). Keragaman aktinobakteri berdasarkan gen 16S rRNA dianalisis dengan DGGE pada gel poliakrilamida. Produk PCR hasil pemotongan pita DNA pada gel poliakrilamida disekuensing dan dianalisis menggunakan software bioinformatika untuk konstruksi pohon filogenetik. Gen penyandi inhibitor α-glukosidase di amplifikasi menggunakan primer vldA-F dan vldA-R. Isolat Streptomyces sp. BWA 65 digunakan sebagai kontrol positif. Hasil separasi produk gen 16S rRNA pada gel DGGE diperoleh 16 pita dominan dari tanah rizosfer dan jaringan tanaman C. asiatica. Pola distribusi pita menunjukkan bahwa komunitas aktinobakteri pada jaringan tanaman lebih beragam dibandingkan dengan tanah rizosfer meskipun tidak berbeda secara signifikan berdasarkan analisis Shannon-Wiener (2.176-2.57). Analisis BLAST.N menunjukkan 7 pita berkerabat dengan famili Streptomycetaceae (83-100%), 5 pita adalah famili Micromonosporaceae (99-100%), 1 pita adalah famili Gordoniaceae (99%), dan 3 pita lainnya masih dinyatakan sebagai unculturable (87-99%). Dari famili tersebut diperoleh 6 genus, yaitu genus Streptomyces, Micromonospora, Verrucosispora, Actinoplanes, Couchioplanes, dan Gordonia. Persentase kemiripan terhadap strain pembanding dalam database menunjukkan bahwa sebanyak 6, 5, 1, dan 4 spesies masing-masing sebesar 100, 99, 98, dan < 97%. Kemiripan < 97%, menarik untuk diungkap sebagai spesies aktinobakteri endofit baru dari C. asiatica. Amplifikasi PCR gen inhibitor α-glukosidase menunjukkan hasil positif pada sampel tanah rizosfer, akar dan daun C. asiatica. Hasil penelitian menunjukkan bahwa beragam aktinobakteri endofit dapat ditemukan berasosiasi dengan C. asiatica dan dapat dipelajari lebih lanjut terkait fungsinya dalam bidang kesehatan.
Keyword: 16S rRNA, aktinobakteri endofit, Centella asiatica, inhibitor α-glukosidase, metagenomik, PCR-DGGE.

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: