Judul: Efisiensi Wereng Hijau Dan Wereng Batang Cokelat Sebagai Vektor Virus Pada Tanaman Padi
Abstrak: Penyakit virus pada padi merupakan masalah penting dalam produksi beras di Indonesia. Kehilangan hasil yang disebabkan oleh penyakit tungro dan penyakit kerdil umumnya dilaporkan sejak masa tanam. Penyakit tungro disebabkan oleh infeksi ganda virus, Rice tungro bacilliform virus (RTBV) dan Rice tungro spherical virus (RTSV); sementara penyakit kerdil disebabkan oleh Rice grassy stunt virus (RGSV) atau Rice ragged stunt virus (RRSV). Vektor yang paling efisien dalam menularkan penyakit virus padi telah diketahui, di antaranya wereng hijau, Nephotettix virescens (Distant), untuk penyakit tungro dan wereng batang cokelat, Nilaparvata lugens (Stal.), untuk penyakit kerdil. Penyakit tungro dan kerdil sudah menyebar di Provinsi Jawa Barat yang merupakan salah satu pemasok padi terbesar secara nasional. Diagnosis penyakit tidak dapat mengandalkan hanya dari gejala saja karena gejala yang muncul beranekaragam serta mirip dengan gejala kekurangan hara dan kekeringan sehingga perlu dilakukan diagnosis secara molekuler. Penelitian ini dilakukan dengan tujuan menentukan efisiensi wereng hijau dan wereng batang cokelat dalam menularkan penyakit tungro dan kerdil ke tanaman padi. Selain itu juga dilakukan deteksi virus dengan metode polymerase chain reaction (PCR) untuk mengonfirmasi gejala penyakit tungro dan penyakit kerdil. Penelitian meliputi tiga kegiatan, yaitu (1) pengamatan populasi wereng hijau dan wereng batang cokelat, dan insidensi penyakit tungro dan penyakit kerdil di lapangan; (2) percobaan penularan virus dengan vektor serangga di rumah kaca menggunakan padi varietas IR 64; dan (3) deteksi virus dengan metode PCR dan/atau RT-PCR dan analisis sikuen nukleotida. Pengamatan lapangan dilakukan di Desa Sukamandi Kabupaten Subang Provinsi Jawa Barat pada bulan Oktober - November 2014. Percobaan penularan virus dengan vektor serangga terdiri atas 10 kombinasi perlakuan, yaitu 1 (sumber virus tungro, serangga vektor wereng hijau); 2 (sumber virus kerdil, serangga vektor wereng batang cokelat); 3 (sumber virus tungro, serangga vektor wereng hijau dan wereng batang cokelat); 4 (sumber virus kerdil, serangga vektor wereng hijau dan wereng batang cokelat); 5 (sumber virus tungro dan kerdil, serangga vektor wereng hijau dan wereng batang cokelat); 6 (sumber virus tungro dan kerdil, serangga vektor wereng hijau); 7 (sumber virus tungro dan kerdil, serangga vektor wereng batang cokelat); 8 (tanaman sehat serangga vektor wereng hijau dan wereng batang cokelat); 9 (tanaman sehat, serangga vektor wereng hijau); 10 (tanaman sehat, serangga vektor wereng batang cokelat). Deteksi RTBV, RGSV, dan RRSV dilakukan menggunakan primer spesifik yang mengamplifikasi gen protein selubung. Hasil pengamatan di lapangan menunjukkan bahwa populasi wereng batang cokelat mengalami fluktuasi dan tergolong rendah (0.01-71.67 ekor per 100 tanaman), sedangkan wereng hijau tidak ditemukan. Penyakit tungro tidak ditemukan, sedangkan insidensi penyakit kerdil tergolong rendah (0.01 – 10.52%). Gejala penyakit yang ditemukan pada saat pengamatan terdiri atas gejala kerdil hampa, kerdil rumput dan campuran kerdil hampa dan kerdil rumput. Fluktuasi populasi terjadi karena proses adaptasi setelah migrasi dari lahan sebelumnya. Wereng yang mampu beradaptasi akan bertahan dan berkembangbiak, sedangkan wereng yang tidak mampu beradaptasi pada tempat baru akan mati. Keberadaan musuh alami dan beberapa faktor lingkungan juga mempengaruhi populasi wereng. Pengamatan populasi wereng dilakukan pada masa tanam di musim penghujan, Daerah Sukamandi merupakan sentra padi dimana padi ditanam secara terus menerus tanpa adanya rotasi tanaman dan penanaman dilakukan secara tidak serempak sehingga tanaman padi selalu
Keyword: Rice grassy stunt virus, Rice ragged stunt virus, Rice tungro virus, wereng batang cokelat, wereng hijau

Judul: Tungro Disease in Indonesia: detection, genetic variability, and suitability map of tungro resistant varieties
Abstrak: Penyakit tungro, yang disebabkan oleh infeksi Rice tungro bacilliform virus (RTBV) dan Rice tungro spherical virus (RTSV), masih merupakan salah satu penyakit penting pada tanaman padi di Indonesia. Selain itu, penyakit yang ditularkan oleh wereng hijau secara semipersisten ini masih menjadi salah satu faktor pembatas peningkatan produksi. Kerugian yang diakibatkan oleh penyakit ini pada stadia awal pertumbuhan padi mampu menyebabkan kehilangan hasil hingga 90%, dan tak jarang menyebabkan tanaman menjadi puso. Hingga saat ini penyakit tungro dilaporkan telah menyerang pertanaman padi di 27 propinsi dengan luas serangan penyakit selama tahun 2012 mencapai 6441 ha dan puso 151 ha. Penggunaan varietas tahan merupakan salah satu teknik pengendalian yang efektif. Namun kurangnya jumlah varietas tahan tungro spesifik lokasi yang sesuai dengan preferensi petani, menyebabkan aplikasi di lapangan agak sulit dilakukan. Selain itu, informasi keragaman genetika virus tungro, khususnya isolat Indonesia, masih sangat terbatas. Berdasarkan hal tersebut perlu dipelajari faktorfaktor yang memengaruhi keberadaan penyakit tungro di lapangan, dan informasi mengenai keragaman genetika virus tungro yang sangat penting dalam pengembangan strategi pengendalian virus tungro. Pengembangan teknik deteksi cepat dan akurat perlu dilakukan untuk memudahkan pengambilan keputusan pengendalian penyakit di lapangan. Survei yang dilakukan di beberapa lokasi pertanaman padi di Indonesia menunjukkan bahwa penyakit tungro masih menjadi penyakit penting. Penyakit tungro telah meluas terutama di sentra produksi padi. Penyebaran virus tungro sangat bergantung pada jenis varietas yang dibudidayakan, pola tanam, keberadaan serangga vektor dan sumber inokulum, serta pengelolaan budidaya tanaman padi. Hasil survei menunjukkan spesies gulma yang ditemukan di sekitar persawahan di beberapa lokasi di Jawa Barat, Bali, Nusa Tenggara Barat, Sulawesi Selatan, Sulawesi Barat, Sulawesi Utara, dan Sumatera Selatan berperan menjadi inang alternatif virus tungro. Infeksi RTBV berhasil dideteksi dari enam spesies gulma (F miliacea, C. iria, M vagina/is, L. octovalvis, S. zeylanica, D. sanguinalis, dan E. crusgalli), dan infeksi RTSV berhasil dideteksi dari tiga spesies gulma (F miliacea, L. octovalvis, dan D. sanguinalis). Sanitasi gulma sebelum bertanam padi dinilai sebagai tindakan yang diperlukan dalam pengendalian penyakit tungro., Tungro disease, caused by double infection of Rice tungro bacilliform virus (RTBV) and Rice tungro spherical virus (RTSV), is still considered as an important rice disease in Indonesia. Rice production is affected by this disease, yield loss caused by infection of this viruses in the early stages ofrice growth may even reach 90%. Disease spread is dependent on its insect vector, green leafhopper, by semipersistent manner. Distribution of this disease in Indonesia is reported from 27 provinces with affected area of 6441 ha and 151 hapuso in 2012. The use of resistant varieties is one of the effective management techniques. However, the number of site-specific tungro resistant varieties that suitable with the farmer preferences still limited, so applications in the field is rather difficult to do. In addition, knowledge on genetic variability of tungro virus in Indonesia is very limited. Therefore, it becomes necessary to study all factors influencing the incidence of tungro virus in the field, and information on genetic variability of tungro virus in order to develop disease management strategy. Improvement on detection method of tungro virus also required to assist controlling the disease. Tungro disease
Keyword: Full length genome, LAMP PCR, Rice tungro virus, Strategy of management, Weeds, Rice Production, Disease Management, Tungro virus, virus detection, Serelogical Methods, Weed Species, Virus Inoculum

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: