Judul: Cloning and Characterization of Lipase-Phospholipase Thraustochytrids in E. coli BL.21 (DE)
Abstrak: Lipase-fosfolipase merupakan enzim multifungsi yang menggabungkan peran lipase dan fosfolipase dalam satu protein yang ditemukan pada thraustochytrids. Enzim ini ditemukan pada Aurantiochytrium limacinum yang berperan penting dalam kompetisi mikroba serta perolehan asam lemak dari lingkungan. Kemampuan enzim yang unik memiliki potensi untuk pengaplikasian lebih luas terutama dalam industri bioteknologi. Informasi detail terkait enzim dibutuhkan untuk efisiensi dalam pemanfaatannya. Penelitian ini bertujuan untuk mengkloning gen lipase-fosfolipase ke E. coli BL21 (DE3) dan mengkarakterisasi enzim lipase-fosfolipase dengan metode spektrofotometri dan titrasi. Gen lipase-fosfolipase dari thraustochytrids dikloning pada vektor ekspresi pET28a yang ditransformasi ke E. coli BL21 (DE3). Koloni E. coli BL21 yang terkonfirmasi membawa gen target diuji secara kualitatif menggunakan agar plate dengan substrat lesitin dan tributirin. Setelah ekspresi heterolog, enzim lipase-fosfolipase mampu menghidrolisis substrat tributirin dan lesitin pada agar plate. E. coli BL21 rekombinan yang memiliki aktivitas pada uji kualitatif digunakan untuk menghasilkan ekstrak kasar enzim. Lipase-fosfolipase diekspresikan secara intraseluler. Ekstrak enzim digunakan untuk karakterisasi enzim berdasarkan suhu, pH, substrat preferensi lipase dan fosfolipase. Enzim memiliki karakteristik biokimia optimal pada suhu 50 °C, pH 9,5, preferensi substrat lipase yaitu p-nitrofenil laurat (112,8 U/mL) yang termasuk asam lemak bebas rantai sedang dengan aktivitas spesifik lipase 10,26 U/mg, dan preferensi substrat fosfolipase yaitu fosfatidilserin (1149,3 U/mL) dengan aktivitas spesifik 104,48 U/mL. Aktivitas spesifik enzim fosfolipase 10 kali lebih besar dari aktivitas spesifik lipase. Penelitian awal menunjukkan bahwa enzim lipase-fosfolipase berhasil dikloning pada E. coli BL21 (DE3) dan enzim memiliki karakteristik dengan suhu tinggi, pH basa, dan karakteristik spesifik substrat yang variatif.
Keyword: kloning, karakterisasi enzim, lipase-fosfolipase, thraustochytrids

Judul: Karakterisasi Isolat Bakteri Lipolitik 3GUU dan Kloning Gen Penyandi Lipase Unik
Abstrak: Lipase merupakan biokatalis hidrolisis ester karboksilat rantai panjang. Penggunaan enzim dalam dunia industri sangat jarang digunakan karena harga biokatalis yang belum ekonomis. Bioprospeksi mikroba penghasil lipase merupakan salah satu solusi yang dapat digunakan. Penelitian ini bertujuan mengkarakterisasi dan mengkloning gen penyandi lipase unik dari isolat terpilih penghasil lipase. Penentuan isolat bakteri penghasil lipase dengan menumbuhkan bakteri pada media Luria Bertani dengan 1% Rhodamine B, dan 1% minyak zaitun. Isolat yang mampu menghasilkan lipase, diseleksi menggunakan uji Paranitrophenil Palmitat (pNPP). Hasil analisis 16S rRNA menunjukkan isolat T118 diidentifikasi sebagai Pseudomonas fluorescens (99%), suhu optimum enzim lipase 40⁰C, pH optimum 8.5, dengan substrat terbaik oktanoat. Isolat IT52 adalah Bacillus sp. (100%), suhu optimum 50⁰C, pH optimum 8, dengan substrat terbaik stearat. Isolat IT17 adalah Bacillus sp. (100%), suhu optimum 50⁰C, pH optimum 8, dengan substrat terbaik dodekanoat, dan isolat HM12 Stenotrophomonas maltophilia (100%) suhu optimum 60⁰C, pH optimum 9, dengan substrat terbaik dodekanoat. Lipase HM12 telah diklon pada E.coli dan sekuen asam amino menunjukkan kemiripan 99% dengan lipase Stenotrophomonas maltophilia yang telah dipublikasi. Analisis struktural lipase menunjukkan kemiripan dengan struktur enzim lipase pada C.antartica.
Keyword: Kloning, Lipase, Stenotrophomonas

Judul: Pendugaan Curah Hujan Dengan Bayesian Network Studi Kasus: Curah Hujan di Daerah Indramayu
Abstrak: The objective of this study was to built the probabilistic modeling and to compare the Bayesian Networks (BNs) method which considers the spatial dependencies among variables for predict rainfall to Auto Regressive Integrated Moving Average (ARIMA) method which assumes the spatial independencies among variables. This research use rainfall data of 14 stations in period 1979 to 2001 in Indramayu, West Java. A network is generated by K2 algorithm, and this networks is used to built probabilistic model using multinomial BNs. The rainfall prediction is based on the combination of Gaussian BNs and ARIMA (BNARIMA). The result shows that BNARIMA is more effective to represent the spatial dependencies among the stations and to predict rainfall than ARIMA.
Keyword: