Judul: Konstruksi Vektor Rekombinan untuk Mengedit Gen Lanceolate Menggunakan Sistem CRISPR/Cas9 pada Tanaman Tomat (Solanum lycopersicum L.).
Abstrak: Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats/CRISPR associated 9 protein (CRISPR/Cas9) adalah salah satu alat untuk mengedit genom yang baru-baru ini telah berhasil digunakan untuk berbagai tanaman. Tomat (Solanum lycopersicum L.) adalah tanaman model yang ideal untuk menguji sistem CRISPR/Cas9 dalam pengeditan gen karena ketersediaan metodologi transformasi yang efisien dan ketersediaan urutan genom yang berkualitas tinggi, dan mempunyai genom diploid. Tujuan dari penelitian ini adalah membuat konstruksi vektor rekombinan yang membawa oligonukleotida gRNA untuk memutasikan gen lanceolate (LA) pada tanaman tomat. Gen lanceolate merupakan gen yang terlibat dalam pembuatan daun majemuk pada tomat. Supresi gen LA akan membuat daun majemuk berukuran besar berubah menjadi daun tunggal berukuran kecil. Oligonukleotida gRNA berhasil disisipkan ke dalam vektor pRGEB32 sehingga memperoleh vektor rekombinan. Vektor rekombinan ini berhasil diintroduksikan ke dalam Escherichia coli DH5α dan dipindahkan ke dalam Agrobacterium tumefaciens LBA4404 menggunakan metode triparental mating. Koloni PCR mengonfirmasi bahwa oligonukleotida gRNA berhasil disisipkan ke dalam pRGEB32 dan A. tumefaciens LBA4404 mengandung plasmid rekombinan ini.
Keyword: gen lanceolate, pengeditan gen, sistem CRISPR/Cas9, Solanum lycopersicum L., vektor rekombinan

Judul: Penyuntingan Empat Gen Terkait Hasil Produksi pada Padi Thailand menggunakan CRISPR-Cas9 : Validasi Gen dan Konstruksi Vektor.
Abstrak: Sistem Clustered Regulary Interspaced Short Palindromic Repeats -CRISPR assosiated protein 9 (CRISPR-Cas9) merupakan teknik yang akurat dan efisien sebagai alat untuk memodifikasi genom. Implementasi CRISPR-Cas9 pada padi indica masih jarang digunakan dibandingkan padi japonica. Penelitian ini bertujuan mengkonstruksi vektor rekombinan yang membawa sgRNA untuk mengedit 4 gen pada 2 varietas padi Thailand (JHN dan PTT1). Gen yang menjadi target dalam penelitian ini dalah Tad1, Gn1a, Roc5, dan DL, yang telah diketahui memiliki potensi untuk meningkatkan produksi padi. Lokasi gen target dari dua varietas padi Thailand telah dikonfirmasi dan digunakan untuk merancang single guide RNA. Oligo sgRNA telah disisipkan ke vektor ekspresi pRGEB32 diikuti dengan verifikasi plasmid di Echerichia coli strain XL-1 Blue kemudian ditransformasikan ke Agrobacterium tumefaciens. Hasil percobaan menunjukan oligo sgRNA telah berhasil disisipkan pada pRGEB32 yang dibuktikan dengan PCR koloni dan hasil perunutan DNA. Vektor rekombinan telah berhasil ditransformasi ke dalam A. tumefaciens EHA105 dengan mengintroduksi sel kompeten dengan plasmid rekombinan yang diisolasi dari koloni E. coli positif.
Keyword: CRISPR-Cas9, gen produksi, Oryza sativa L, indica, penyuntingan gen

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: