Judul: Pengukuran Kemiripan Resistensi Gen Plasmodium Falciparum Terhadap Antimalarial Berbasis Ontology
Abstrak: Salah satu kendala di dalam penanganan malaria yang diakibatkan oleh Plasmodium falciparum adalah adanya resistensi terhadap obat antimalarial diantaranya chloroquine dan sulfadoxine-phyrimethamine. Gen yang diketahui resisten terhadap chloroquine adalah P. falciparum chloroquine resistance(pfcrt) dan P. falciparum multidrug resistance 1(pfmdr1). Sedangkan Dihydrofolate reductase (Dhfr) dan dihidropteroat synthase (Dhps) resisten terhadap sulfadoxine-phyrimethamine. Penelusuran kemungkinan gen lain yang resisten dapat dilakukan dengan mengetahui sifat-sifat gen yang berhubungan dengan resistensi tersebut. Salah satu cara untuk menelusuri informasi gen adalah melalui Gene Ontology dengan menghitung kemiripannya secara semantik melalui pendekatan path length metode Wang. Nilai kemiripan diuji pada ketiga komponen dalam Gene Ontology dan sebanyak 6 pasangan gen yang diuji. Nilai kemiripan terbesar 1 diperoleh pasangan gen Pfcrt dan Pfmdr1 pada komponen Molecular Function karena kedua gen memiliki Drug transmembrane transporter activity. Nilai 1 selanjutnya diperoleh pasangan gen Pfcrt dan Pfmdr1 dan pasangan gen Pfmdr1 dan Dhfr pada komponen Biological Processes karena kedua gen memiliki Response to drug. Nilai terbesar kedua diperoleh pasangan gen Pfcrt dan Pfmdr1 pada komponen Cellular Component sebesar 0.714, kedua gen memiliki kemiripan pada beberapa komponen seperti Food vacuole, Membrane dan Integral component of membrane. Nilai terbesar ketiga sebesar 0.565 diperoleh pasangan gen Pfcrt dan Dhfr pada komponen Cellular Component karena memiliki kemiripan pada beberapa komponen seperti Endoplasmic Reticulum dan Cytoplasm. Nilai terbesar terakhir yang diambil dari pasangan gen Dhfr dan Dhps sebesar 0.526 pada komponen Biological Processes karena memiliki kemiripan antara Glycine biosynthetic process dan Dihydrofolate biosynthetic. Dengan demikian penelitian ini diharapkan dapat memberikan informasi awal mengenai resistensi serta dapat mendeteksi gen lain yang terindikasi resistensi sebelum penelitian lebih lanjut secara molekuler.
Keyword: antimalarial, kemiripan, ontology, resisten, wang

Judul: Variasi sekuens gen sitokrom b (cyt b) pada isolat lapangan plasmodium falciparum di Indonesia
Abstrak: Malaria merupakan salah satu dari tiga penyakit infeksi utama penyebab kematian di dunia hingga kini. Upaya penanggulangan penyakit malaria dalam beberapa tahun terakhir ini menjadi semakin sulit karena munculnya resistensi parasit malaria terhadap obat-obatan anti malaria utama. Oleh karena itu, upaya-upaya untuk mendapatkan obat anti malaria alternatif yang memiliki target intervensi kemoterapi baru merupakan prioritas utama saat ini. Atovaquone merupakan obat anti malaria alternatif yang mempunyai struktur yang mirip dengan CoQ (ubiquinone). Seperti pada senyawa lain yang merupakan analog CoQ, obat ini diperkirakan bekerja melalui kompetisi perikatan dengan CoQ pada komplek be, rantai pernafasan di mitokondria. Resistensi terhadap senyawa-senyawa yang mirip Co pada berbagai organisme telah dibuktikan didasari oleh adanya mutasi pada gen sitokrom b (cyt b). Beberapa studi laboratorium dan lapangan melaporkan bahwa kegagalan pengobatan malaria dengan atovaquone juga didasari oleh adanya mutasi pada gen sitokrom h (cyt b) Plasmodium falciparum. Studi ini dimaksudkan untuk mengetahui seberapa luas penyebaran mutasi-mutasi pada gen c 6, khususnya yang berkaitan dengan resistensi terhadap atovaquone pada populasi P. falciparum di Indonesia serta untuk mengetahui apakah mutasi- mutasi yang ada memiliki pola yang berbeda di setiap lokasi geografis yang diperiksa. Tahap-tahap penelitian meliputi (1) studi literatur dan bioinformatika, (2) isolasi genom DNA P. falciparum, (3) polymerase chain reaction secara nested, (4) analisis dengan Restriction fragment length polymorfism, dan (5) sekuensing DNA. Fragmen DNA sebesar 1414 pasang basa (bp) dari elemen 6-kb yang mencakup keseluruhan gen cyr b diamplifikasi dengan cara nested dan hasil PCR kemudian di analisis dengan enzim restriksi (RFLP) dan dibandingkan dengan sekuens rujukan (Genebank, NCBI, Acc no: M 76611). Dari analisis RFLP 30 sampel asal Purworejo, Flores dan Irian Jaya ditemukan ada 47 perubahan situs enzim endonuklease baik yang hilang atau yang muncul pada 10 isolat asal Purworejo dan Flores. Konfirmasi dengan sekuensing dari dua isolat terpilih menunjukkan adanya 9 perubahan nukleotida, dimana enam diantaranya tidak merubah sandi asam amino pada protein apositokrom 6. Sementara tiga mutasi lainnya merubah sandi asam amino pada 1178V, G179A dan A324S, namun selama ini perubahan tersebut belum pernah terkait dengan resistensi terhadap atovaquone. Hasil tersebut mengindikasikan bahwa mutasi pada gen cyr b terjadi secara alami dan karenanya mendukung bukti-bukti sebelumnya bahwa gen tersebut fungsional.
Keyword: Atovaquone, mutasi cyt b, Plasmodium falciparum, ubiquinone

Judul: Rencana bisnis pendirian industri kecil karamel susu di Kecamatan Sukaraja Kabupaten Sukabumi
Abstrak: Jumlah produksi susu segar di Kabupaten Sukabumi cukup besar dan kontinyu. Pengolahan susu menjadi produk olahannya berpotensi dapat memperpanjang masa simpan susu dan meningkatkan nilai ekonomisnya. Salah satu jenis produk olahan susu dengan teknologi pengolahan relatif sederhana sehingga cocok diterapkan di tingkat peternak adalah karamel susu. Sebelum investasi dilaksanakan, diperlukan penyusunan rencana bisnis yang akan dilaksanakan serta pengkajian kelayakannya. Penelitian ini bertujuan untuk menyusun rencana bisnis serta mengkaji kelayakan pendirian industri kecil karamel susu di Kecamatan Sukaraja, Kabupaten Sukabumi. Hasil penelitian ini diharapkan dapat digunakan oleh calon investor, serta dapat dijadikan sebagai salah satu bahan pertimbangan oleh instansi-instansi terkait dalam usaha pemberdayaan peternak. Kajian dilakukan berdasarkan aspek-aspek pada studi kelayakan, yaitu aspek pasar dan pemasaran, aspek teknis dan teknologis. aspek manajemen dan organisasi, aspek lingkungan, aspek keuangan, serta aspek hukum. Hasil kajian aspek pasar dan pemasaran menunjukkan kemampuan yang cukup besar dari pasar dalam menyerap produk. Berdasarkan pendekatan yang dilakukan, jumlah permintaan dan penawaran karamel susu di wilayah Sukabumi pada tahun 1997 masing-masing sebesar 85 180 kg dan 5 082 kg. Hasil ini menunjukkan bahwa peluang pasar produk karamel susu di wilayah Sukabumi cukup besar, apalagi hasil proyeksinya menunjukkan bahwa peluang pasar tersebut akan terus meningkat selama umur proyek. Lokasi industri yang direncanakan terletak di Desa Cimangkok. Kecamatan Sukaraja, Kabupaten Sukabumi. Proses produksi karamel susu akan mengacu pada proses produksi karamel susu di Perusahaan "TK" Pangalengan Bandung. Kapasitas produksi pabrik pada tahun pertama sebesar 27 000 kg per tahun, dan 40 500 kg per tahun untuk tahun kedua dan tahun-tahun berikutnya. Industri ini bersifat padat karya karena cukup banyaknya tenaga kerja yang akan diserap, yaitu 31 orang pada tahun pertama, dan 45 orang mulai dari tahun kedua. Pendirian industri karamel susu yang bersifat padat karya ini akan membantu menyerap pencari kerja, terutama yang berada di sekitar pabrik. Besarnya modal investasi tetap yang dibutuhkan adalah Rp 34.201.500.00 dengan modal kerja sebesar Rp 56.277.000,00, Hasil analisis kelayakan proyek secara keuangan berdasarkan pada perhitungan beberapa kriteria investasi adalah NPV sebesar Rp 129.112.761,00 (positif), Net B/C sebesar 4,27 (>1), IRR 93,8 persen (>18 persen). dan PBP selama 1,85 tahun (<10 tahun). Nilai-nilai tersebut memenuhi syarat bagi kelayakan suatu bisnis. Hasil analisis sensitivitas menunjukkan bahwa kelayakan industri ini mampu bertahan sampai pada penurunan harga produk sebesar 9 persen, kenaikan harga susu segar sebesar 19 persen, atau kenaikan semua bahan-bahan produksi sebesar 14 persen. Bentuk badan usaha industri kecil karamel susu ini adalah perusahaan perorangan. Hasil kajian aspek hukum menunjukkan bahwa tidak ada kesulitan dalam pendirian industri kecil ini. Berdasarkan hasil kajian terhadap aspek-aspek studi kelayakan tersebut. dapat disimpulkan bahwa perencanaan pendirian industri kecil karamel susu di Kecamatan Sukaraja Kabupaten Sukabumi layak untuk direalisasikan
Keyword: