Judul: Peninjauan Status Marga Mukia (Cucurbitaceae) di Malesia
Abstrak: Mukia memiliki hubungan kekerabatan yang dekat dengan marga Cucumis berdasarkan data DNA inti dan kloroplas, namun dua marga tersebut mempunyai perbedaan ciri morfologi yang jelas sehingga status Mukia dan Cucumis masih menjadi perdebatan. Mukia dan Cucumis berbeda pada beberapa ciri yaitu bentuk batang, ukuran dan bentuk daun, ukuran bunga, warna buah, warbna dan bentuk biji. Penelitian ini bertujuan untuk meninjau status taksonomi marga Mukia dan Cucumis di Malesia dengan pendekatan morfologi biji, anatomi daun, dan polen. Penelitian ini dilakukan mulai Desember 2016 sampai Juni 2017. Pengambilan sampel dilakukan dengan metode jelajah di Pulau Sumatera, Jawa, Madura, Kalimantan, Nusa Tenggara Barat, Maluku, dan Papua. Jenis yang diamati antara lain Mukia javanica, Mukia maderaspatana, Mukia rumphiana, Cucumis melo, dan Cucumis sativus. Pengamatan morfologi biji dari lapang dan biji koleksi Herbarium Bogoriense dilakukan menggunakan mikroskop stereo SZ61. Anatomi daun diamati pada sayatan paradermal dan transversal menggunakan mikroskop majemuk Olympus CX21. Polen Mukia dan Cucumis diamati menggunakan scanning electron microscope (SEM). Data morfologi biji dan anatomi daun disusun dalam bentuk matriks kemudian dilakukan analisis berdasarkan koefisien kemiripan simple matching (SM) dan metode Unweighted Pair Group Method with Arithmethic Mean (UPGMA) untuk membuat dendrogram kemiripannya. Mukia dan Cucumis ditemukan pada habitat dan ketinggian tempat yang bervariasi pada beberapa kawasan Malesia. Beberapa jenis Mukia dan Cucumis ditemukan pada habitat bukit, kebun terbuka, pinggir atau tepi jalan, rawa, dan juga pegunungan. Mukia dan Cucumis terdapat pada ketinggian tempat bervariasi (31-350 m dpl). Mukia tumbuh secara liar pada habitat berbukit, kebun terbuka, pinggir atau tepi jalan, rawa, dan juga pegunungan, sedangkan Cucumis banyak ditemukan pada habitat daerah kering dan kebun. Secara morfologi Mukia dan Cucumis berbeda pada beberapa ciri meliputi batang, indumentum, daun, sulur, perbungaan, buah, dan biji. Batang Mukia dan Cucumis dibedakan berdasarkan bentuk, panjang dan kepadatan trikoma. Indumentum daun Mukia dan Cucumis bervariasi pada ukuran dan kerapatannya. Variasi morfologi daun Mukia dan Cucumis sangat tinggi antara lain bentuk, ukuran, tepi, ujung, pangkal, ketebalan, warna dan kepadatan indumentum. Sulur bervariasi pada bentuk dan kerapatan indumentum. Perbungaan bervariasi pada lokasi kemunculan, ukuran, bentuk mahkota, dan bentuk bakal buah. Buah sangat bervariasi pada bentuk, ukuran, warna, dan ornamentasi kulit buah; sedangkan biji bervariasi pada warna, bentuk, ukuran, tekstur permukaan, tepi biji, bentuk sayatan transveral, warna dalam biji, dan permukaan kulit biji bagian dalam. Ciri anatomi daun dari marga Mukia dan Cucumis bervariasi pada tipe stomata, pola dinding epidermis, dan jumlah lapisan palisade. Morfologi polen dari marga Mukia dan Cucumis memiliki persamaan ciri pada index P/E, bentuk, apertur, dan ornamentasi eksin dan dikelompokkan dalam tipe Cucumis melo. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa anatomi daun dan morfologi polen tidak dapat digunakan untuk memisahkan Mukia dan Cucumis. Akan tetapi berdasarkan morfologi biji, pada penelitian ini disimpulkan bahwa Mukia terus diperlakukan berdiri sendiri sebagai marga terpisah dari Cucumis.
Keyword: anatomi daun, morfologi biji, polen

Judul: Tinjauan Status Taksonomi Mangifera kemanga Blume di Indonesia
Abstrak: Mangifera kemanga Blume merupakan salah satu jenis buah tropika kerabat mangga dari suku Anacardiaceae yang mulai langka di Indonesia. Secara taksonomi, status jenis M. kemanga masih perlu untuk ditinjau. Sejak M. kemanga pertama kali dipublikasi sebagai jenis dari suku Anacardiaceae, kedudukannya sebagai jenis diperselisihkan. Beberapa peneliti menetapkan M. kemanga sebagai varietas dari Mangifera caesia Jack berdasarkan data ciri morfologi. Penentuan status taksonomi hanya berdasarkan ciri morfologi tersebut menyebabkan status taksonomi M. kemanga masih diperdebatkan. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan meninjau status taksonomi M. kemanga dan hubungannya dengan M. caesia menggunakan pendekatan morfologi dan molekuler. Penelitian ini diharapkan dapat memberikan informasi mengenai status taksonomi yang tepat dari M. kemanga berdasarkan pendekatan karakter morfologi dan penanda molekuler. Selain itu, data penelitian ini diharapkan dapat digunakan untuk keperluan penelitian lebih lanjut terutama dalam mengembangkan pemanfaatan plasma nutfah M. kemanga dan M. caesia. Aksesi M. kemanga dan M. caesia yang diamati dikoleksi dari Pulau Sumatra (Riau, Jambi, Sumatra Selatan, dan Kepulauan Bangka Belitung), Jawa (Bogor), Kalimantan (Kalimantan Timur dan Kalimantan Selatan), dan Bali (Tabanan). Koleksi sampel dilakukan dengan metode jelajah. Dua macam sampel dikoleksi di lapangan, yaitu sampel untuk pengamatan ciri morfologi dan sampel berupa daun segar untuk analisis molekuler. Pengamatan ciri morfologi merujuk pada deskriptor mangga. Prosedur analisis molekuler meliputi empat tahap, yaitu isolasi DNA, amplifikasi, visualisasi DNA dan produk PCR, serta sekuensing. Isolasi DNA dilakukan berdasarkan protokol Geneaid Genomic DNA Mini Kit (Plant) pada 17 aksesi M. kemanga dan 10 aksesi M. caesia. Langkah-langkah isolasi DNA terdiri atas tahap disosiasi jaringan, lisis sel, pengikatan DNA, pencucian dan elusi DNA. DNA sampel diamplifikasi menggunakan sekuen cpDNA trnL-trnF intergenic spacer. Data ciri morfologi ditransformasi ke dalam bentuk data biner dan disusun membentuk matriks data. Skoring data morfologi merujuk pada deskriptor mangga. Matriks data digunakan untuk menghitung koefisien keserupaan simple matching (SM). Koefisien keserupaan SM digunakan untuk mengonstruksi dendrogram menggunakan analisis Sequential Agglomerative Hierarchial and Nested Clustering (SAHN) dengan metode Unweighted Pair Group Method with Arithmatic Average (UPGMA) pada program NTSys-PC versi 2.1.1a. Data morfologi dan sekuen DNA dianalisis hubungan kekerabatannya dengan cara disejajarkan dan dilakukan konstruksi pohon filogenetik berdasarkan metode Maximum Parsimony (MP) dan Neighbor-Joining (NJ) pada program PAUP versi 4.0a169 dan MEGA 11 versi 11.0.8. Pada pensejajaran sekuen, beberapa sekuen dari database GenBank National Center for Biotechnology Information (NCBI) dimasukkan sebagai grup dalam (ingroup) dan grup luar (outgroup). Analisis keragaman genetik menggunakan program DnaSP 6 versi 6.12.03. Pengelompokan aksesi M. kemanga dan M. caesia menggunakan analisis fenetik dan filogenetik menghasilkan pengelompokan yang tidak kongruen. Analisis fenetik berdasarkan ciri morfologi mengelompokkan aksesi M. kemanga berdasarkan asal wilayah geografis dan memisahkannya dari kelompok aksesi M. caesia. Berdasarkan analisis fenetik, seluruh aksesi membentuk dua kelompok (A dan B) dengan koefisien kemiripan 33–77%. Aksesi M. kemanga yang berasal dari Pulau Sumatra (Riau dan Aceh) dan Jawa (Bogor) termasuk ke dalam kelompok A. Sementara itu, aksesi M. caesia yang berasal dari Pulau Kalimantan (Kalimantan Selatan) dan Sumatra (Sumatra Selatan) menempati kelompok B. Hasil analisis filogeni Neighbor-Joining (NJ) juga menunjukkan pengelompokan yang serupa. Sementara itu, analisis filogenetik Maximum Parsimony (MP) berdasarkan ciri morfologi terhadap aksesi M. kemanga dan M. caesia
Keyword: Filogenetik, Mangifera caesia, molekuler, morfologi, trnL-trnF intergenic spacer

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: