Judul: Vortisitas arus di Teluk Jakarta Bagian Baratt pada Bulan November 1996
Abstrak: Vortisitas merupakan karakteristik kinematika fluida (air) yang ditunjukkan oleh kecenderungan dari fluida tersebut untuk berotasi. Perdefinisi vortisitas yang bernilai positif menunjukkan arah perputarannya berlawanan arah jarum jam. Peneiitian tentang vortisitas di perairan nusantara khususnya di Teluk Jakarta dengan menggunakan data pengukuran rinci belum ada. Penelitian ini dimulai sejak Juli 1997. Dalam penelitian ini vortisitas telah digunakan terhadap arus hasil pengukuran dengan alat ADCP (Acoustic Doppler Current Profiler) di Teluk Jakarta. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui rotasi arus dan perubahannya terhadap kedalaman dan terhadap waktu pengukuran. Data yang digunakan dalam penelitian ini yaitu data komponen kecepatan arus horizontal (U dan V) dan jarak antar titik pengukuran yang diperoleh dari lintasan ADCP Pulau Onrust-PLTU Muara Karang sebanyak 6 kali (3 kali berangkat-pulang). Adapun proses pengolahan data arus untuk menentukan vortisitas adalah interpolasi linier, perataan berjalan (Moving average), perhitungan vortisitas menggunakan 3 titik untuk mendapatkan nilai di tengahnya, penapisan secara low­ pass (Low pass filtering). Analisis yang dilakukan yaitu dengan membandingkan antar parameter statistik (rataan, gala! baku, dan selang antara maksimum dan minimum) dan dengan melihat perubahan vortisitas pada plot grafiknya. Selain itu juga dihitung bilangan Reynolds untuk mengetahui bentuk aliran arus pada lintasan tersebut.
Keyword: 

Judul: Variabilitas Arus Pada Kedalaman 3 Meter dari Dasar di Laut Jawa Bagian Barat Agustus 2003
Abstrak: Laut Jawa merupakan salah satu perairan Indonesia yang orientasi arah sumbu utamanya berhimpit dengan arah bertiupnya angin muson (muson tenggara dan muson barat laut). Oleh karena itu sirkulasi arus permukaannya dipengaruhi oleh arah bertiupnya angin tersebut. Penelitian ini bertujuan menganalisis variabilitas arus yang terjadi selama bulan Agustus 2003 dengan menggunakan analisis deret waktu (time series analysis) dan membandingkan variabilitas arus yang terjadi pada lokasi pengamatan yang berbeda. Data arus yang digunakan pada penelitian ini diperoleh dari pusat data Unit Pelaksana Teknis Baruna Jaya, Badan Pengkajian dan Penerapan Teknologi Indonesia yang dilakukan selama bulan Agustus 2003 di Laut Jawa bagian barat. Alat yang digunakan dalam pengukuran data arus pada penelitian ini adalah Current Meter 3x0, dengan menggunakan metode mooring. Pemrosesan dan analisis data yang dilakukan terdiri dari beberapa tahap. dimana tahap pertama adalah menguraikan data vektor arus kedalam bentuk komponen-komponennya, yaitu komponen timur-barat (u) dan komponen utara- selatan (v). Selanjutnya dilakukan penapisan untuk memisahkan arus pasang surut dan arus residu dari arus total dengan menggunakan fungsi pembobotan lanczos.. Tahap selanjutnya adalah visualisasi vektor arus yang terjadi dalam bentuk stick plot. Kemudian dilakukan analisis frekuensi sinyal data untuk mencari nilai Power Spectral Density (PSD) dengan menggunakan metode Auto Spectral Density (ASPEC) dan metode Cross Spectral Density (CSPEC) untuk mencari nilai Cross Spectral Density (CSD), dimana untuk CSD dilakukan dalam bentuk koherensi dan beda fase. Koherensi dan beda fase digunakan untuk melihat keterkaitan arus yang terjadi pasa Stasiun A, B dan C. Arus total dan arus residu yang terjadi pada penelitian ini menunjukkan pola (trend) kecepatan arus yang sama pada semua Stasiun A, B dan C, dimana arus cenderung kuat pada 7 hari di awal bulan kemudian melemah, menguat dan melemah kembali di akhir bulan. Kecepatan maksimum arus total yang terjadi pada Stasiun A ditemukan pada tanggal 7 Agustus 2003 dengan kecepatan sebesar 0.45 m/det ke arah tenggara. Stasiun B memiliki nilai kecepatan maksimum sebesar 0.47 m/det yang ditemukan pada tanggal 9 Agustus 2003 ke arah tenggara. Kecepatan maksimum yang terjadi pada Stasiun C ditemukan pada tanggal 12 Agustus 2003 sebesar 0.45 m/det ke arah tenggara. Arah arus residu yang terjadi dominan ke arah tenggara. Stasiun A memiliki kecepatan maksimum arus residu yang terjadi pada tanggal 13 Agustus sebesar 0.32 m/det ke arah tenggara. Kecepatan maksimum pada Stasiun B terjadi pada tanggal 1 Agustus dengan kecepatan sebesar 0.30 m/det ke arah tenggara. Berbeda dengan yang terjadi pada Stasiun A dan B, pada Stasiun C kecepatan maksimum terjadi pada tanggal 20 Agustus sebesar 0.35 m/det ke arah selatan...dst
Keyword: 

Judul: Heterologous Expression Of Endo-Β-Xylanase From Bacillus Pumilus Strain Bcrs-01 In Escherichia Coli.
Abstrak: Xylanases are glycoside hydrolase family 11 which depolymerise xylan in the plant cell wall, the most excessive form of hemicellulose. Endo-β-xylanases (EC 3.2.1.8) are most important to breakdown β-1,4-glicoside bond of xylan to produce disaccaride xyloolygosaccaride (XOs) and xylose (monomer). Bovine rumen fluids have potential to obtain endo-β-xylanase produced of bacteria. The objectives of this study were to obtain xylanase producing bacteria and to express xynA gene encoding endo-β-xylanase from bacterium in Escherichia coli. Twenty nine isolate bacteria have been succesfully isolated from bovine rumen fluid in agar medium containing birchwood xylan. Isolate BCRS-01 bacterium was previously screened for the high production of xylanase. Based on 16S rRNA gene sequence analysis, BCRS-01 showed high similarity (99%) to Bacillus pumilus (accession number NR043241). The crude xylanase had optimal activity at 55oC, pH 7.0. Furthermore, the crude xylanase exhibited broad pH stability from 4.0 to 10.0 and remained more than 60% and 40% of its activity after incubation at pH 4.0 until 10.0, respectively for 60 min. It also showed a stability at temperature 25-50oC since it retained 80% and 50% of its activity when incubated at 50oC or 30 and 60 min, respectively. The xylanase activity was strongly inhibited by Ca2+ and Cu2+ at concentration 10 mM, and as little as 1 mM for Mn2+. Therefore, this xylanase has potentially used as additive feeds in animal feed industry. The DNA sequence xynA gene encoded endo-β-xylanase was amplified and cloned into the expression vector pET-15by under the control of T7 promoter. The recombinant protein had succesfully expressed in Escherichia coli BL21 (DE3) pLysS. A protein recombinant of approximately, 26.7 kDa was observed on the SDS-PAGE analysis. Crude extract of recombinant endo-β-xylanase demonstrated activity of enzyme at 56 U mL-1 using birchwood xylan as a substrate at 55oC for 10 min.
Keyword: Bacillus pumilus, bovine rumen fluid, endo-β-xylanase, heterologous expression.