Judul: Asal lebah madu impor, Apis melifera di Indonesia berdasarkan daerah intergenik cox1/cox2 DNA mitokondria
Abstrak: Apis mellifera merupakan lebah madu favorit bagi para peternak lebah madu di seluruh dunia. Lebah A. mellifera ini terbagi ke dalam 24 subspesies. Berdasarkan analisis morfometrik dan wilayah persebarannya, berbagai subspesies A. mellifera tersebut dikelompokkan menjadi empat kelompok garis keturunan (lineage) yakni; A (Afrika), M (Eropa Utara dan Barat), C (Eropa Selatan), dan O (Timur Tengah). Apis mellifera di Indonesia pertama diimpor dari Australia dan mulai diimpor ke Indonesia tahun 1972. Hingga saat ini belum ada data mengenai asal dan subspesies A. mellifera di Indonesia. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui asal lebah madu A. mellifera yang ada di Indonesia berdasarkan DNA mitokondria yaitu daerah intergenik diantara gen cytochrome oxidase I dan cytochrome oxidase II (cox1/cox2). Pada daerah intergenik cox1/cox2 ini terdapat dua tipe fragmen DNA; yakni P dan Q yang dapat menentukan kelompok garis keturunan A. mellifera. Hasil amplifikasi daerah intergenik cox1/cox2 dengan menggunakan primer E2 dan H1 menghasilkan fragmen DNA 863 pb. Hasil pemotongan fragmen DNA tersebut dengan DraI menghasilkan satu haplotipe, yang terdiri atas lima pita DNA. Hasil pengurutan dan penjajaran DNA pada darerah intergenik cox1/cox2 menunjukkan bahwa subspesies A. mellifera yang ada di Indonesia termasuk kedalam kelompok garis keturunan C. Subspesies lebah tersebut adalah A m. ligustica dengan persebaran alaminya di Italia yang diimpor ke Indonesia dari Australi.
Keyword: 

Judul: Variasi Gen lrRNA Lebah Madu Apis cerana di Lombok, Sumbawa, dan Flores
Abstrak: Lebah madu Apis cerana merupakan lebah lokal Asia dengan persebaran yang sangat luas. Belum lengkapnya data genetika A. cerana menjadi dasar utama penelitian ini. Tujuan penelitian ini untuk mempelajari variasi genetika A. cerana berdasarkan lrRNA/DraI dan analisis filogenetik antara A. cerana di Indonesia dan Thailand. Koleksi A. c. indica dilakukan di Lombok, Sumbawa, dan Flores. Analisis homologi dilakukan dengan A. cerana dari Thailand (AF140508; AF140509; dan AF140511), serta haplotipe A. cerana dari Pati dan Lombok (AcPt1 dan AcLb4). Jumlah koloni yang diperoleh masing-masing 22, 3, dan 4 koloni untuk Lombok, Sumbawa, dan Flores. Ukuran nukleotida gen lrRNA yang diamplifikasi berkisar antara 625-629 pb dengan basa AT sekitar 88.90%. Berdasarkan analisis lrRNA/DraI, ditemukan dua haplotipe yaitu haplotipe A dan C. Persentase haplotipe A sebesar 72.72, 100, dan 50%, berturut-turut untuk populasi A. c. indica di Lombok, Sumbawa, dan Flores. Persentase haplotipe C sebesar 27.28 dan 50% untuk A. c. indica di Lombok dan Flores. Analisis filogenetik berdasarkan gen lrRNA menggunakan Maximum Parsimony menunjukkan bahwa populasi lebah di Thailand membentuk kelompok yang terpisah dengan A. cerana di Indonesia. Jarak genetik terbesar (3.53%) terjadi antara AF140508 dan AcLb4. Sedangkan nilai jarak genetik terkecil (0.00%) terjadi antara AcPt1 dan AcSbw5. Nilai transisi/transversi (ts/tv) >1 adalah 66.67% dan ts/tv <1 adalah 26.67%.
Keyword: 

Judul: Numerical modeling of the hydrodynamics of standing wave and scouring in front of impermeable breakwater with different steepnesses
Abstrak: The aim of this paper is to numerically study the effects of breakwater steepness on the hydrodynamics of standing wave and scouring process in front of impermeable breakwaters. A two-dimensional hydrodynamics model based on the Reynolds Averaged Navier–Stokes (RANS) equations and the Volume of Fluid (VOF) method was developed and then combined with an empirical sediment transport model. Comparisons with an analytical solution and experimental data showed the present model is very accurate in predicting the near bottom velocity and capable of simulating the scour/deposition patterns consistent with experimental data. It was found that the additional terms of bottom shear stress in the momentum equations are necessary to produce a physical scouring pattern. Different breakwater steepnesses produce different characteristics of standing wave, the steady streaming system, and scouring pattern in front of the breakwaters, which also affects the correlations between them. An additional analysis of the turbulence field parameters and the sediment transport rate was also performed. All these important information will be presented in details in this paper and can be worthwhile for designing the breakwater in coastal areas.
Keyword: The RANS–VOF model Standingwave Steadystreamingsystem Scouring pattern Breakwatersteepness