Judul: Screening of Halophilic and Halotolerant  Protease-producing Microorganisms from the Bima Salt Pond with Krosok Salt  Media
Abstrak: Kebutuhan protease di Indonesia semakin meningkat seiring berjalannya waktu, namun masih bergantung pada impor. Keperluan akan protease tahan garam untuk memenuhi industri tersebut, bisa didapatkan dari mikroorganisme ladang garam. Penelitian ini bertujuan mengisolasi dan mengidentifikasi mikroorganisme halofilik dan halotoleran yang diisolasi dari Ladang Garam di daerah Bima menggunakan media artifisial dengan penambahan garam krosok dari Bima untuk melihat potensi mikroorganisme tersebut sebagai penghasil enzim protease. Metode identifikasi mikroorganisme meliputi isolasi, seleksi isolat proteolitik dengan nilai IP>1, pewarnaan Gram, ekstraksi DNA, amplifikasi, dan sekuensing gen 16S rRNA. Hasil penelitian menunjukkan sebanyak 116 isolat halofilik dan 43 isolat halotoleran berhasil diisolasi pada media dengan penambahan 15%, 20%, dan 5% garam krosok Bima. Sebanyak 28 isolat bersifat proteolitik yang ditandai dengan zona bening pada media susu skim 2%. Identifikasi 8 dari 9 isolat proteolitik terpilih berdasarkan gen 16S rRNA memiliki kemiripan 99%-100%. Isolat BM3-4a, BM4-7a, BM4-2a, BM16-2a, BM4-3a, BM4-4a, dan BM7-2b mirip Halobacillus sp. dan isolat BM4-1a mirip Bacillus sp., The demand for protease in Indonesia is growing steadily, but it was still dependent on imports. The need for salt-resistant protease to fulfill the industry could be obtained from solar salt pond microorganisms. This study aimed to isolate and identify halophilic and halotolerant microorganisms isolated from Salt Ponds in Bima using artificial media with the addition of solar salt from Bima to assess the potential of these microorganisms as protease enzyme producers. Microorganism identification methods included isolation, selection of proteolytic isolates with IP>1 value, Gram staining, DNA extraction, amplification, and 16S rRNA gene sequencing. The results showed that 116 halophilic isolates and 43 halotolerant isolates were successfully isolated on media with the addition of 15%, 20%, and 5% Bima solar salt. A total of 28 isolates were proteolytic characterized by a clear zone on 2% skim milk media. Identification of 8 out of 9 selected proteolytic isolates based on 16S rRNA gene had 99%-100% similarity. Isolates BM3-4a, BM4-7a, BM4-2a, BM16-2a, BM4-3a, BM4-4a, and BM7-2b were similar to Halobacillus sp., and isolate BM4-1a was similar to Bacillus sp.
Keyword: bakteri halofilik, bakteri halotoleran, garam krosok, protease

Judul: Isolasi dan pemilahan mikroba termofil penghasil enzim-enzim ekstraseluler
Abstrak: Penggunaan enzim yang dihasilkan oleh mikroorganisme yang berasal dari lingkungan yang ekstrim seperti suhu yang tinggi (termofil) dan pH yang tinggi (alkalofil) telah berhasil mengatasi keterbatasan penggunaan enzim sebagai biokatalis. Mikroorganisme yang dapat hidup pada lingkungan yang ekstrim banyak terdapat di berbagai wilayah Indonesia. Akan tetapi penelitian mengenai enzim-enzim ekstrim tersebut belum banyak dilakukan di Indonesia. Tujuan dari penelitian ini adalah melakukan isolasi dan pemilahan terhadap mikroorganisme yang diperoleh dari beberapa wilayah di Indonesia yang menghasilkan enzim-enzim ekstraseluler seperti protease, amilase, selulase pada suhu yang tinggi (termofil) dan pH yang tinggi (alkalofil), serta melakukan analisis enzim- enzim yang potensial untuk digunakan di industri. Dalam penelitian digunakan mikroba yang sudah diisolasi dari Kawah Sikidang-Dieng, tanah horison O pada kedalaman 5-15 cm dari hutan tropis Batu Ampar Kalimantan Timur (Streptomyces dan mikroba alkalofil), mikroba dari gigi biawak yang ada di tempat pembiakan di Perumahan Bintaro Jakarta, dan mikroba ekstrim halofilik dari Bledug Kuwu, Grobogan (Jawa Tengah). Selain itu juga dilakukan pengambilan sampel berupa tanah, lumut, dan air, yang berasal dari sumber air panas Pancuran Tujuh di Baturaden, Jawa Tengah. Isolasi mikroba termofil dilakukan mulai suhu 50°C, sedangkan mikroba alkalofil dilakukan pada media Luria Agar (LA) pH 10. Mikroba yang dapat hidup pada suhu 70°C atau lebih ditumbuhkan pada media Thermus. Sedangkan untuk pemilahan (uji selektif) mikroba penghasil enzim protease, selulase, dan amilase ditumbuhkan pada media LA, Yeast and Mold (YM) atau Thermus yang mengandung susu skim 2%, a-selulosa1,2%, atau soluble starch 0,3%. Analisis enzim protease dilakukan dengan metode Bergmeyer et al. (1983) dan analisis enzim amilase dilakukan dengan metode Bernfield (1955). Untuk penentuan berat molekul protein enzim protease, filtrat enzim diendapkan dengan (NH4)2SO4 sebanyak 35% (w/v) dan filtrat enzim yang mengendap dilarutkan lagi dalam buffer universal pH 8. Kemudian dilakukan dialisis dengan metode Harris (1989) menggunakan kantong dialisis ukuran 12.000 D (SIGMA). Penentuan berat molekul enzim protease dilakukan dengan SDS-PAGE dan teknik zimogram. Dari hasil isolasi dan pemilahan mikroba-mikroba termofil dan alkalofil yang menghasilkan enzim protease dan amilase ekstraseluler berdasarkan pembentukan zona bening (halo) dan kemampuan tumbuhnya, diperoleh beberapa isolat yang potensial untuk diteliti lebih lanjut. Isolat-isolat tersebut adalah isolat 40 A yang berasal dari gigi biawak, isolat A3 dan Streptomyces 961-1 yang berasal dari hutan tropis Batu Ampar Kalimantan Timur, dan isolat 2A1PT dan 2A2PT yang berasal dari sumber air panas Pancuran Tujuh Baturaden, Jawa Tengah. Sedangkan dari analisis enzim protease dan amilase terhadap isolat-isolat potensial tersebut diperoleh hasil isolat 40 A menghasilkan enzim protease dengan aktivitas proteolitik yang tinggi, termasuk protease netral, dan mempunyai kisaran suhu optimum yang cukup luas yaitu 45-60°C. Isolat A3 menghasilkan protease yang unik yaitu aktif pada kisaran pH (buffer universal + kasein) yang luas yaitu 5.9-10, dan aktivitas proteasenya sangat tinggi (12,10-18,96 U/mg protein). Isolat 2A1PT dan 2A2PT menghasilkan enzim amilase dengan aktivitas optimum pada suhu 60°C. Isolat 2A1PT menghasilkan enzim protease yang lebih tinggi aktivitasnya dibandingkan dengan isolat 2A2PT. Sedangkan isolat Streptomyces 961-1 menghasilkan enzim protease dan amilase dengan aktivitas yang jauh lebih kecil dibandingkan dengan isolat 40A, A3, dan 2A1PT. Dari hasil penentuan berat molekul enzim protease isolat A3 diperkirakan isolat A3 menghasilkan sekitar enam
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: