Judul: Hubungan formasi geologi dengan bahan induk dan kelompok tanahnya di daerah gunung walat, sukabumi
Abstrak: Suatu formasi geologi selain dapat menjelaskan waktu juga menjelaskan jenis batuan atau bahan induk tanah. Meskipun demikian, tanah yang terbentuk di atas suatu formasi geologi belum tentu berasal dari batuan atau bahan induk yang terdapat pada formasi geologi tersebut. Oleh karena adanya berbagai proses geologik yang relatif baru memungkinkan terjadinya penutupan suatu formasi geologi oleh bahan-bahan yang lebih muda, sehingga tanah yang mungkin terbentuk cenderung mempunyai susunan mineral yang berbeda dengan formasi geologi tersebut. Di daerah penelitian terdapat tiga formasi geom. logi yaitu formasi Kuarter Volkanik Pangrango Tua (Qvpo), formasi Tersier Oligosen Napal (Tomc), dan formasi Tersier Oligosen Walat (Tow). Formasi Qvpo terdiri dari lahar dan lava basal andesit, labradorit, olivin, hiperstin, dan hornblenda; formasi Tomc terdiri dari napal tufaan globigerina, lempung napal- Jan, batu pasir tufaan, dan lensa-lensa batu gamping; formasi Tow terutama terdiri dari batu pasir kuarsa, yang berlapis silang konglomerat kerikil kuarsa, lempung karbonan, lignit, dan lapisan-lapisan arang tipis (Musper dalam Effendi, 1974). Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari hu- bungan ketiga formasi geologi di daerah penelitian dengan bahan induk dan kelompok tanahnya. Penelitian ini dilaksanakan di daerah gunung Walat, Sukabumi. Peralatan yang digunakan untuk menunjang penelitian ini adalah peta topografi, peta geologi, peralatan lapang serta bahan dan peralatan laboratorium untuk menganalisa sifat kimia, fisik, dan mineral tanah. Profil tanah dibuat berdasarkan pena- rikan kesimpulan dari hasil pemboran dan perbedaan formasi geologinya. Pengamatan tanah melalui pemboran dilakukan dengan sistem Grid. Pengamatan sifat- sifat morfologi tanah di lapang dan pengambilan contoh tanah dilakukan berdasarkan pedoman yang dikemu- kakan dalam Pedoman Pengamatan Tanah di Lapang (Staf Pemetaan Lembaga Penelitian Tanah, 1969). Jenis bahan induk ditentukan berdasarkan cara Mohr dan van Baren (1960) dan klasifikasi tanah yang digunakan adalah Sistem Taksonomi Tanah (Soil Survey Staff, 1975)…dst
Keyword: 

Judul: Homogenitas bahan induk dan kesuburan alami tanah pada suatu transek lereng di daerah gunung walat, sukabumi
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui homogenitas bahan induk dan kesuburan alami tanah pada suatu transek lereng berdasarkan susunan dan sebaran mineral yang ditunjang oleh data fisik, kimia, dan morfologi tanah. Contoh tanah yang diambil dari beberapa profil dalam suatu transek lereng di daerah Gunung Walat digunakan untuk analisis susunan mineral fraksi pasir dan fraksi berat. Data analisis kimia dan fisik tanah pada tempat yang sama diambil dari hasil penelitian Mahmudi (1933) yang pelaksanaan penelitiannya dilakukan pada saat yang tidak jauh berbeda. Penilaian homogenitas bahan induk didasarkan atas susunan dan sebaran mineral fraksi berat, yang ditunjang oleh fraksi pasir. Hasil penelitian menunjukkan bahwa profil-profil di daerah penelitian dapat dibedakan atas dua kelompok yang disebabkan oleh perbedaan jenis bahan induknya. Bahan induk tanah pada profil kelompok I (AP dan DP) adalah bahan volkanik yang bersusunan andesit dengan asosiasi mi- neral hipersten-augit, sedangkan bahan induk tanah pada kelompok II (BP, CP, EP, dan FP) adalah campuran antara bahan sedimen dari Formasi Walat yang berumur Tersier (Tow) dan bahan volkanik dari Gunung Pangrango yang ber- umur Kuarter (Qvpo) dengan asosiasi mineral hipersten (untuk profil BP dan CP) dan amfibol hijau (untuk pro- fil EP dan FP). Bahan induk dari semua profil yang diamati ternyata tidak homogen. Hal ini disebabkan oleh proses genesis bahan induk, percampuran antara bahan induk sedimen dan volkanik, serta keadaan (posisi dan bentuk) lerengnya. Berdasarkan analisis tekstur dan susunan mineral, kesuburan alami tanah kelompok I bernilai lebih baik dan dalam jangka pendek dapat menyediakan unsur hara yang lebih banyak dari kelompok II…
Keyword: 

Judul: Kloning dan Ekspresi Human Interferon-alfa2a pada Yeast Metilotropik Pichia pastoris
Abstrak: Interferon (IFN) is a group of proteins that are secreted by body cells as a result of exposure to biological vertebrates such as: viruses, bacteria, protozoa and other compounds. There are three types of interferon, namely: alpha (α), beta (β) and gamma (γ) IFN. Interferon-α2a belongs to the type I interferon. This protein has a molecular weight of 21.550 kDa and consists of 188 amino acids (23 amino acid of signal peptide and 166 amino acids of mature protein). Interferon-α2a is also known to be used for the treatment of hepatitis C and as anti-tumor and antivirus agents. Regulator gene for IFN production under normal conditions, is in the off position to IFN is not produced. But when there are external stimuli, both viral and bacterial infections, a regulator gene switches on, and IFN production system running. At the time of an attack from a variety of disease agents actually the body will produce IFN, but generally the amount produced is not sufficient to fight the disease agents that multiply very quickly. Therefore IFN intake from outside is needed. This is the beginning of the use of IFN as a drug. Genetic engineering is an activity to manipulate the genes to get new products by creating recombinant DNA through gene insertion. Recombinant DNA technology has been used to produce IFN. Yeast such as Pichia pastoris can be an alternative as the host (system) to express human interferon genes and as a producer of IFN protein. Expression system P. pastoris offers several advantages for the production of recombinant proteins, such as: the high level expression of recombinant proteins, ease of scaling-up fermenter, low cost and ease of transformation techniques and selection of transformed cells such as bacteria . The existence of inducible AOX1 promoter is very strong, easily control the expression of recombinant proteins by induction. AOX1 is a promoter that controls gene expression of alcohol oxidase to metabolize methanol as carbon source of P. pastoris. Therefore,this study aimed to clone human interefron-α2a (hifnα2a) gene in E. coli and express it in metylotrophic yeast P. pastoris. Vector used in this study is pPICZαB (Invitrogen). Ligation process between insert (hifn-α2a gene) and vector (pPICZαB) performed by using T4 DNA ligase, which functions synthesize the formation of phosphodiester bonds linking the nucleotides with nucleotide insert plasmid vectors to produce recombinant (pPICZαB-hifnα2a). This recombinant plasmid transformed into XL1 blue cells (E. coli) by Heat shock method. The results of sequencing analysis (clone 6) using 5'AOX and 3'AOX primers indicate that DNA base sequence of human IFN-α2a genes has been subclone into pPICZαB vector (in frame). Recombinant plasmid (clone 6) linearized using BstX1 enzyme before transformed into X33 yeast cell. Transformation into cell was done by Electroporation. The X33 cell P. pastoris strain was used to express human interferon-α2a. X33 is strains with the phenotype Mut+ (methanol utilization plus) and can be used for positive transformants selection using zeocin. Phase protein production work using Mut+ strain occurred in two phases. The first phase is the use of glycerol to obtain a certain amount of biomass (high cell
Keyword: