Judul: Endophytic Bacteria of Clove (Syzygium aromaticum L.) Leaves Producing Secondary Metabolites with Antioxidant and Anti-aging Agents
Abstrak: Penuaan merupakan hal yang pasti dialami oleh seluruh makhluk hidup. Namun, penuaan sering terjadi lebih awal karena hadirnya sumber pemicu seperti reactive oxygen species (ROS), radikal bebas, dan akumulasi advanced glycation end products (AGEs). Penuaan dini memberikan dampak signifikan pada sel jaringan dan memicu munculnya berbagai penyakit degeneratif. Antioksidan dan anti-aging merupakan senyawa yang mampu mencegah kerusakan dan penuaan sel. Sumber perolehan antioksidan dan anti-aging tersebar luas di alam. Tanaman cengkeh merupakan tanaman asli Indonesia yang diketahui memiliki beragam manfaat di bidang kesehatan. Perolehan senyawa aktif menggunakan tanaman secara langsung akan membutuhkan biomassa yang banyak dan mengurangi kelestarian tanaman tersebut di lingkungan. Oleh sebab itu, pemanfaatan bakteri endofit menjadi hal yang menjanjikan. Informasi perolehan senyawa aktif berkhasiat anti-aging belum tersedia hingga saat ini. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi bakteri endofit cengkeh dan menentukan sifat anti-aging serta profil metabolit dari ekstrak yang sesuai. Penelitian ini dilakukan melalui beberapa tahapan, yaitu isolasi bakteri endofit, identifikasi bakteri endofit, penapisan melalui toleransi cekaman oksidatif, uji hemolisis, ekstraksi metabolit ekstraseluler dari isolat terpilih, analisis aktivitas antioksidan, aktivitas anti-aging dan aktivitas mitokondria. Identifikasi bakteri endofit dilakukan dengan pewarnaan Gram dan secara molekuler dengan gen 16S rRNA. Aktivitas antioksidan dievaluasi secara in vitro dengan uji 2,2-diphenyl-1-picrylhydrazyl (DPPH). Aktivitas anti-aging dan mitokondria diuji pada tingkat sel menggunakan khamir Schizosaccharomyces pombe sebagai model. Enam isolat bakteri endofit cengkeh diisolasi menggunakan media yang mengandung H2O2 0,2 mM. Semua isolat adalah Gram Positif dan termasuk dalam genus Bacillus, Niallia, dan Cytobacillus. Isolat Bacillus cereus yang diisolasi dari daun cengkeh menggunakan media NA (B. cereus DCN1) ditemukan lebih tahan terhadap cekaman oksidatif kuat (>4mM H2O2), sehingga menunjukkan kemampuan isolat dalam menginduksi dan mengaktifkan respons cekaman oksidatif yang terkenal. Ekstraksi dilakukan menggunakan tiga pelarut berbeda untuk memperluas kemungkinan perolehan senyawa aktif yang berkhasiat anti-aging. Ekstrak etil asetat DCN1 (EAN) dengan rendemen 1,423% menunjukkan aktivitas penghambatan (scavenging) terbesar (>60%), sehingga dilanjutkan untuk analisis berikutnya. EAN memiliki aktivitas antioksidan dengan nilai IC50 sebesar 262,3 µg/mL. EAN memiliki potensi meningkatkan viabilitas S. pombe hingga hari ke-11 inkubasi. Konsentrasi EAN 50 µg/mL sudah mampu memperpanjang umur S. pombe lebih baik daripada perlakuan tanpa ekstrak. Berdasarkan analisis profil metabolit menggunakan LC-MS/MS, EAN mengandung gallic acid, (epi)-gallocatechin, kaempferol, kaempferol 3-o-(6"-malonyl-glucoside), dan rutin. Ekstrak mampu memperpanjang masa hidup khamir S. pombe, kemungkinan dengan meningkatkan aktivitas mitokondria untuk induksi pensinyalan mitokondria (adaptive-mitochondrial ROS signalling). EAN menunjukkan potensi anti-aging yang menjanjikan sebagai sumber dan formulasi produk biofarmasi atau kosmetik., Aging naturally happens in all living organisms. However, aging often occurs earlier due to triggers such as reactive oxygen species (ROS), free radicals, and advanced glycation end Products (AGEs) accumulation. Premature aging significantly impacts tissue cells and triggers the emergence of various degenerative diseases. Antioxidants and anti-aging are compounds that can prevent cell damage and aging. The source of the acquisition of antioxidants and anti-aging is widespread in nature. Clove plants are native to Indonesia and are known to have various health benefits. Obtaining active compounds using plants directly will require a lot of biomass and reduce the sustainability of these plants in the environment. Therefore, the use of endophytic bacteria is promising. Information on acquiring
Keyword: anti-aging, antioxidant, clove, endophytic, Schizosaccharomyces pombe

Judul: The Effect of Ethanol Derived Fraction of Clove Leaves  and Eugenol as Source of Antioxidants in Delaying Aging on Cellular and  Molecular Level
Abstrak: Cengkeh (Syzygium aromaticum) adalah anggota famili Myrtaceae yang dikenal memiliki aktivitas antioksidan dan antivirus yang tinggi. Antioksidan dibutuhkan oleh sel untuk mencegah adanya akumulasi oksigen reaktif (ROS) di dalam sel. Aktivitas antioksidan ekstrak cengkeh diduga berkorelasi dengan perpanjangan masa hidup seluler (aktivitas antipenuaan). Ekstrak kasar daun cengkeh telah dilaporkan memperpanjang masa hidup sel khamir, namun masih kurangnya informasi yang tersedia mengenai aktivitas antipenuaan dari fraksi etanol daun cengkeh dan eugenol. Dengan demikian, tujuan dari penelitian ini adalah untuk menganalisis cara kerja fraksi etanol daun cengkeh (konsentrasi 25, 50,75,100 μg.mL-1 ) dan eugenol (konsentrasi 10, 20, 30 dan 40 μg.mL-1 ) pada tingkat seluler dan molekuler dalam memperpanjang masa hidup organisme model khamir Schizosaccharomyces pombe. Analisis yang di lakukan pada penelitian ini adalah analisis seluler dan analisis molekuler. Analisis seluler yang digunakan dalam penelitian ini terdiri atas analisis viabilitas sel dan uji toleransi khamir terhadap cekaman oksidatif dengan metode spot test assay, analisis CLS (Chronological life span) dengan teknik TPC (total plate count), dan uji aktivitas mitokondria. Analisis molekuler yang dilakukan adalah protein docking dan analisis transkriptomik. Hasil penelitian menunjukkan bahwa fraksi etanol daun cengkeh dan senyawa eugenol dapat memperpanjang umur khamir pada konsentrasi terendah, yakni masing-masing 25 ppm dan 10 ppm. Hasil pengujian juga menunjukkan bahwa fraksi etanol daun cengkeh dan senyawa eugenol dapat menginduksi toleransi khamir terhadap stres oksidatif (1mM, 2mM, dan 3mM H2O2). Analisis penambatan molekul yang telah dilaksanakan mengungkapkan bahwa senyawa eugenol dapat mengikat protein regulator respon sel terhadap stres oksidatif, diantaranya protein sty1 dan ctt1, tetapi tidak pada sisi aktif. Hasil transkriptomik menunjukkan penurunan ekspresi gen mip1 yang menyandikan Mip1 subunit protein TORC1, serta meningkatkan regulasi scr1 yang terlibat dalam aktivitas mitokondria. Penghambatan aktivitas TORC1 serta peningkatan aktivitas mitokondria diketahui meningkatkan usia kronologis khamir. Secara keseluruhan, penelitian ini menunjukkan adanya potensi aktivitas antipenuaan senyawa eugenol dan cara kerjanya pada tingkat molekuler, Clove (Syzygium aromaticum) belongs to Myrtaceae family which is known to have high antioxidant and antiviral activity. Antioxidants are needed by cells to prevent the accumulation of reactive oxygen species (ROS). The antioxidant activity of clove extract presumably correlates with the extension of cellular life span (antiaging activity). Crude extract of clove leaves has been reported to prolong the life span of yeast cells, however lack of information available regarding antiaging activity of its corresponding ethanol fraction and eugenol. Thus, the aim of this study was to analyze the mode of action of ethanol fraction of clove leaves (concentration 25, 50, 75 and 100 μg.mL-1 ) and eugenol (with concentration 10, 20, 30, and 40 μg.mL-1 ) at the cellular and molecular levels in prolonging life span of the yeast model organism Schizosaccharomyces pombe. The analysis carried out in this research were cellular analysis and molecular analysis. Cellular analysis conducted in this study consisted of cell viability analysis and yeast tolerance test against oxidative stress by spot test assay method, CLS (Chronological life span) analysis with TPC (total plate count) technique, and mitochondrial activity test. Molecular analysis carried out were protein docking and transcriptomic analysis. The results showed that the ethanol fraction of clove leaves and eugenol
Keyword: antiaging, TORC1, transcriptomic, Schizosaccharomyces pombe

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: