Judul: Introduksi Gen c-Lisozim yang Dikontrol oleh Promoter Konstitutif ke dalam Genom Padi Japonica
Abstrak: Beras merupakan makanan pokok untuk setengah penduduk dunia terutama di Asia. Walaupun produksi beras mengalami peningkatan selama lima dekade terakhir, masih terjadi penurunan produktivitas beras akibat cekaman biotik dan abiotik. Bacterial blight (BB) yang di sebabkan oleh bakteri Xanthomonas oryzae adalah salah satu penyakit yang telah lama diidentifikasi sebagai penyebab turunnya produksi beras di wilayah tropis dan subtropis. Penyakit tersebut dapat menyebabkan produktivitas beras berkurang hingga 50%. Penelitian ini bertujuan untuk mengintroduksikan gen c-lisozim ke dalam genom Oryza sativa L. subsp. japonica var kinmaze melalui Agrobacterium tumefaciens, yang berfungsi untuk meningkatkan ketahanan padi terhadap penyakit bakteri sehingga mengurangi penurunan produktivitas beras. Lisozim merupakan enzim 1,4-β-asetilmuramidase. Lisozim memutus ikatan glikosidik antara asam N-asetilmuramik dan N-asetilglukosamin yang menyusun dinding peptidoglikan bakteri, sehingga menyebabkan sel bakteri lisis. Planlet yang diregenerasi pada penelitian ini positif mengandung gen c-lisozim yang menunjukkan efisiensi transformasi sebesar 50.1% dan efisiensi regenerasi 4.74%, Nearly half of the world’s population especially in Asia is dependent on rice as staple food. Despite the marked increase in rice productivity in the last five decades, a significant proportion of rice production is still lost annually due to various abiotic and biotic stress factors. Bacterial rice blight (BB) disease caused by Xanthomonas oryzae is one of the significant and oldest known causes of rice production loss in both tropical and temperate regions of the world. It reduces photosynthesis in infected rice, consequently, resulting in average yield losses of 50%. The objective of this research is to integrate c-lysozyme gene into Oryza sativa L. subsp. japonica var kinmaze genome using Agrobacterium tumefaciens mediated transformation. This is aimed at improving rice resistance against bacterial diseases thereby reducing production losses. Lysozyme is a 1,4-β-acetylmuramidase. It hydrolyzes the glycosidic bond between N-acetylmuramic acid and N-acetylglucosamine that makes up the peptidoglycan wall of bacteria, as a result causing bacterial cell lysis. The plantlets generated in this research tested positive for the c-lysozyme gene depicting 50.1% transformation efficiency and 4.74% regeneration efficiency.
Keyword: Agrobacterium tumefaciens, Bacterial blight, Oryza sativa var kinmaze, Xanthomonas oryzae, Kinmaze rice, Callus transformation, Fusarium

Judul: Transformasi Genetik Padi (Oryza sativa L.) dengan Gen PaCS Penyandi Sitrat Sintase Menggunakan Perantara Agrobacterium tumefaciens
Abstrak: Peningkatan produksi padi (Oryza sativa L.) dapat dilakukan dengan menerapkan intensifikasi dan ekstensifikasi pertanian. Penerapan ekstensifikasi pertanian terkendala oleh berkurangnya lahan pertanian akibat konversi lahan pertanian menjadi lahan perindustrian, perumahan, dan perkantoran. Pemanfaatan lahan marginal terutama tanah jenis ultisol dapat menjadi alternatif untuk menerapkan ekstensifikasi pertanian. Tetapi, tanah ultisol bersifat masam dan berpotensi mengandung Al yang dapat menghambat pertumbuhan tanaman. Perakitan tanaman padi yang toleran cekaman aluminium dapat dilakukan dengan mengintroduksi gen yang berkaitan dengan aktifitas toleransi terhadap cekaman aluminum. Sitrat sintase (CS) terlibat dalam biosintesis asam sitrat. Sitrat memiliki kemampuan mengkelat Al paling kuat diantara asam organik lain. Pada beberapa tanaman, ekspresi gen CS meningkatkan toleransinya terhadap cekaman Al. Penelitian ini bertujuan untuk mentransformasi genetik padi dengan gen penyandi sitrat sintase menggunakan perantara Agrobacterium tumefaciens. Transformasi genetik dilakukan dengan perendaman selama 10 menit kalus embriogenik umur 3 minggu yang berasal dari embrio biji padi kultivar Kasalath dan Nipponbare dalam suspensi Agrobacterium tumefaciens strain LBA4404 yang mengandung plasmid pMSH1-PaCS dengan gen penanda seleksi higromisin. Kokultivasi dilakukan selama tiga hari pada kondisi gelap. Seleksi kalus transgenik menggunakan media yang mengandung higromisin 20 mg/L. Kalus yang resisten higromisin diregenerasikan di media 2N6R yang mengandung 5 mg/L kinetin. Subkultur dilakukan setiap 2 minggu sekali pada media yang sama. Eksplan kalus yang digunakan untuk transfomasi pada padi kultivar Kasalath sebanyak 135 kalus dan Nipponbare sebanyak 240 kalus. Kalus kultivar Kasalath dan Nipponbare yang tahan higromisin sebanyak 2 % dan 35,8% dari jumlah eksplan kalus yang ditransformasi. Terdapat 13 kalus dari kultivar Nipponbare yang beregenerasi menghasilkan tunas dan masing-masing kalus menghasilkan tanaman padi transgenik putatif, sedangkan kalus padi kultivar Kasalath yang diregenerasikan tidak ada yang menghasilkan tunas. Penambahan antibiotik cefotaksim sebanyak 200 mg/L pada media regenerasi dapat menurunkan daya regenerasi dari kedua kultivar. Konfirmasi gen penanda seleksi higromisin dengan primer 35S-F dan hpt-R pada sepuluh nomor kultivar Nipponbare transgenik putatif menghasilkan amplikon dengan ukuran 1100 pb. Konfirmasi gen PaCS dengan menggunakan primer forward 35S-F dan PaCS-R menghasilkan amplikon dengan ukuran 1630 pb untuk padi kultivar Nipponbare transgenik nomor 10, sedangkan untuk padi kultivar Nipponbare transgenik nomor 1 sampai 9 menghasilkan amplikon 900 pb.
Keyword: Agrobacterium tumefacien, Oryza sativa L., sitrat sintase, transformasi genetik

Judul: Penerapan Metode Carathéodory untuk Menentukan Solusi Periodik Persamaan Diferensial Takotonom Orde Dua
Abstrak: Persamaan diferensial takotonom merupakan persamaan diferensial yang secara eksplisit memuat variabel bebas. Persamaan diferensial ini jika diberikan kondisi batas periodik akan menghasilkan suatu solusi periodik. Pada karya ilmiah ini akan dipelajari penggunaan metode Carathéodory untuk mencari solusi periodik dari persamaan diferensial takotonom orde dua yang memiliki syarat batas periodik. Berdasarkan penggunaan metode Carathéodory didapatkan hasil bahwa solusi periodik persamaan diferensial takotonom orde dua adalah solusi dari minimizer persamaan variasional. Untuk menggambarkan solusi periodik dari persamaan diferensial takotonom orde dua digunakan bantuan software Mathematica 6.
Keyword: