Judul: Asal Usul Sapi Pesisir Berdasarkan Penanda DNA Mitokondria pada Daerah D-loop
Abstrak: Sapi adalah salah satu ternak hasil domestikasi. Domestikasi ternak dimulai 8.000-10.000 tahun yang lalu. Itu berasal dari keturunan auroch (Bos primigenius) dari Afrika dan didistribusikan ke Eropa-Asia. Ada dua jenis sapi modern yang berasal dari B. primigenius; mereka adalah sapi tak berpunuk (Bos taurus) dan sapi berpunuk (Bos indicus). Selain itu, ada juga Bos javanicus, yang merupakan keturunan Bibos banteng. Bos javanicus adalah salah satu sapi asli Indonesia, yang berbeda dari B. taurus dan B. indicus. Ada juga beberapa jenis sapi domestik di Indonesia, seperti Sapi Aceh, Sapi Madura, dan Sapi Pesisir. Sapi Pesisir adalah salah satu lokal Indonesia yang merupakan keturunan Bos indicus yang memiliki karakteristik tubuh kecil. Diasumsikan karena persilangan antara sapi Pesisir dan sapi lainnya. Oleh karena itu penelitian ini bertujuan untuk mempelajari asal-usul sapi Pesisir berdasarkan mtDNA D-loop dan untuk mengetahui hubungan filogenetik antara sapi Pesisir dan sapi lainnya. Sampel darah sapi diambil di dua lokasi, Way Krui dan Tanah Rekah. Amplifikasi gen mitokondria menggunakan sepasang primer koleksi Achmad Farajallah, yaitu AF22 (forward) 5'-GCGTACGCAATCTTACGATCA-3' dan AF23 (revers) 5'ATGCAGTTAAGTCCAGCTAC-3'. Penelitian ini berfokus pada daerah d-loop. Hasil sequensing nukleotida diedit menggunakan program Bio Edit versi 7.2.5. Urutan DNA yang diedit diselaraskan menggunakan Clustal W yang termasuk dalam program MEGA versi 6.0. Semua sekuens DNA diparalelkan dengan melibatkan beberapa referensi DNA homolog dalam data publik (NCBI). Rekonstruksi pohon filogenetik dianalisis menggunakan metode Neighbor-Joining berdasarkan Parameter Kimura 2. Hasil analisis mtDNA di wilayah d-loop menunjukkan bahwa ada dua induk pada sapi Pesisir, yaitu Bos indicus dan Bos javanicus. Ruas d-loop sapi pesisir memiliki panjang berfariasi karena adanya proses delesi dan insersi. Sapi pesisir WK, ditemukan basa nukleotida (nt) dengan panjang 22 nt yang mengalami pengulangan secara berurutan (tandem repeat). Motif berulang yang muncul adalah GTACATAATATTA dan ATGTAATAA. Ruas berulang ditemukan pada spesies B. javanicus dan sampel Lampung WK 01 dan sampel WK 13. Kedekatan antara spesies ini adalah karena jarak geografis yang dekat antara Bos indicus yang berasal dari Way Krui, Lampung dan Bos javanicus dari Jawa.
Keyword: Bos indicus, DNA, D-Loop, mitokondria, Sapi pesisir

Judul: Asal-Usul dan Hubungan Kekerabatan Sapi Galekan Berdasarkan Genom D-loop DNA Mitokondria
Abstrak: Sapi Galekan merupakan salah satu hewan ternak lokal Indonesia. Sapi lokal Indonesia sebagai sumber daya genetik yang berasal dari persilangan antara sapi asli Indonesia dengan sapi yang berasal dari luar yang telah masuk ke Indonesia dan telah ditetapkan sebagai sapi lokal Indonesia. Sapi Galekan diperkirakan berasal dari persilangan antara Bos indicus dan Bos javanicus CERZA. Pernyataan lain diperkirakan merupakan hasil persilangan antara Peranakan ongole (PO) dengan sapi Bali. Informasi genetik mengenai sapi Galekan belum tercatat dengan baik dan masih terdapat perbedaan data penelitian. Penelusuran sejarah asal-usul dan hubungan kekerabatan sapi dapat dilakukan dengan menganalisis daerah d-loop DNA mitokondria (mtDNA). Setiap individu yang memiliki indukan yang sama akan memiliki tipe mtDNA yang sama. Hal ini disebabkan mtDNA diturunkan melalui garis maternal. Sapi lokal merupakan salah satu hewan ternak yang memiliki peran penting terhadap kehidupan manusia dan industri ternak Indonesia. Persilangan dan pengembangan sapi lokal Indonesia menyebabkan terbentuknya keragaman genetik dan keterkaitan atau hubungan kekerabatan diantaranya. Penelitian ini diharapkan dapat membantu peningkatan program pemuliaan dan pelestarian sapi Galekan. Data molekuler telah menghasilkan informasi mengenai sejarah dan nenek moyang rumpun sapi. Untuk memahami tentang pewarisan induk atau secara maternal pada sapi Galekan, kami mengalisis urutan nukleotida daerah d-loop serta menganalisis hubungan kekerabatan (filogenetik) antara sapi Galekan dengan sapi Pasundan dan sapi Donggala. Sampel darah sapi yang digunakan sebanyak 30 sampel yaitu 16 sampel dari sapi Galekan yang diambil melalui vena jugularis sapi Galekan dari Unit Pelaksana Teknis Daerah (UPTD) Pusat Pembibitan Ternak dan RPH Dinas Pertanian dan Pangan Kabupaten Trenggalek, Provinsi Jawa Timur, Indonesia. 11 sampel DNA sapi Pasundan berasal dari Pusat Penelitian untuk Bioteknologi, Badan Riset dan Inovasi Nasional (BRIN) dan 3 sampel sapi Donggala berasal dari koleksi sampel Prof. Dr. Jakaria, S. Pt., M.Si. Fakultas Peternakan, IPB. Sampel darah tersebut diamplifikasi dengan metode PCR (Polymerase Chain Reaction). Amplifikasi daerah d-loop dilakukan menggunakan sepasang primer AF22 dan AF23 yang mengapit ujung 3’ gen cyt b hingga ujung 3’ daerah d-loop. Data sekuen d-loop diedit dan disejajarkan dengan sekuen referensi dari Genbank menggunakan CrustalW dalam program MEGA 7.0. Perhitungan jarak genetik menggunakan perhitungan pairwise distance dan rekonstruksi pohon filogenetik dianalisis menggunakan metode Neighbor-Joining (NJ) berdasarkan model Kimura-2- parameter (K2P). Hasil sekuensing didapatkan runutan sekuen d-loop DNA dengan panjang bervariasi yang disebabkan oleh insersi maupun delesi. Terdapat ruas berulang (tandem repeat) dengan panjang 22 nt ditemukan dalam runutan basa nukleotida 11 sampel sapi Galekan dengan motif GTACATAATATTA dan ATGTAATAA. Hasil analisis filogenetik di daerah d-loop menunjukkan dua clade (kelompok); Bos indicus dan Bos javanicus CERZA. Hasil yang diperoleh menunjukkan bahwa sapi Galekan berasal dari dua garis keturunan maternal seperti sapi lokal Indonesia lainnya. Sapi Galekan memiliki hubungan kekerabatan yang dekat dengan spesies pembanding dari sapi Pasundan dan sapi Donggala.
Keyword: local cattle, maternal, Bos indicus, Bos javanicus CERZA

Judul: Hybrid solar cells of ZnO nanoparticles/chlorophyll was modified metal ions (Zn2+ and Cu2+ )
Abstrak: Zinc Oxide (ZnO) is a n-type semiconductor with a wide the energy band (Band Gap) is 3.37 eV at room temperature and 3.34 eV at low temperature with a large exiton binding energy is 60 meV. ZnO has been synthesized by hydrothermal method, resulting in a decrease in particle size over the duration of the hydrothermal changes. Crystallographic structure of ZnO were characterized using XRD, has shown the characteristic pattern of a hexagonal wurtzite structure, the crystallite size increases to changes in particle size. Changes in particle size has also led to a change in the absorption peak of ZnO as has been demonstrated posted under test using the optical properties of UV-Vis spectrophotometer. Changes of this uptake has also led to changes in the energy band gap, which increases its band gap energy of the particle size. In electronic applications, especially in solar cells. Chlorophyll is considered less effective, because of their very nature are easily degraded as a result of several reactions which are acid, lighting and temperature. The results of the stability test using a halogen lamp 34 W/m2 for 5 hours, that the substitution of chlorophyll with metal ions Zn2+ and Cu2+ has been shown to form more stable than natural chlorophyll. The characterization of the optical properties, the combination of ZnO / chlorophyll in the form of hybrid films has led to a shift in the absorption region of ZnO becomes more widely from the UV to Visible. ZnO/chlorophyll has absorption range of 350-515 nm, ZnO / Zn-feofitin 332-401 nm and 332-632 nm for Cu-feofitin. The combination of ZnO/chlorophyll and CuSCN as a solid electrolite in hybrid solar cell, a modified chlorophyll with metal ions Zn2+ and Cu2+ has been shown to form a more stable I-V curve. It is characterized by its fill factor value greater than natural chlorophyll. Nevertheless, solar cells with natural chlorophyll has been able to produce higher efficiency values of chlorophyll were substituted.
Keyword: Hydrothermal, ZnO/Chlorophyll modified, Hybrid Solar Cell