Judul: Isolation and Identification of Endophytic Fungi in Epiphytic and Hemiepiphytic Orchid Root
Abstrak: Tanaman anggrek bersimbiosis dengan cendawan endofit pada seluruh fase hidupnya termasuk perkecambahan. Penelitian cendawan endofit pada anggrek di Indonesia masih terbatas. Penelitian ini bertujuan mengisolasi dan mengidentifikasi cendawan endofit pada anggrek bernilai ekonomi penting Phalaenopsis amabilis, Dipodium brevilabium, Vanilla planifolia, dan Aerides odorata. Cendawan endofit diisolasi dari peloton akar anggrek yang disterilisasi permukaannya. Identifikasi dilakukan secara morfologi dan molekuler menggunakan sekuens DNA daerah ITS rDNA, dilanjutkan analisis BLAST dan pohon filogenetik. Semua akar anggrek yang diteliti memiliki struktur peloton pada jaringan korteksnya. Diperoleh sebanyak 22 isolat cendawan endofit dari 4 spesies tanaman anggrek yaitu Fusarium, Penicillium, dan miselia sterilia. Pada anggrek P. amabilis diperoleh 5 isolat yaitu 1 isolat Penicillium dan 4 isolat miselia sterilia. Pada anggrek D. brevilabium terdapat 7 isolat yaitu 1 isolat Penicillium dan 6 isolat Fusarium. Pada anggrek V. planifolia didapatkan 6 isolat Fusarium. Pada anggrek A. odorata ditemukan 4 isolat yaitu 1 isolat Penicillium, 2 isolat miselia sterilia, dan 1 isolat belum teridentifikasi. Penicillium ditemukan pada 3 dari 4 spesies anggrek yang diteliti. Satu isolat Penicillium diidentifikasi secara molekuler sebagai Penicillium citrinum. Sebagian besar cendawan endofit pada anggrek P. amabilis ialah cendawan miselia sterilia, sedangkan anggrek D. brevilabium, V. planifolia, dan A. odorata ialah Fusarium.
Keyword: Fusarium, mycelia sterilia, peloton, Penicillium citrinum

Judul: Diversity of Endophytic Fungi Isolated from Epiphytic Orchid Coelogyne pandurata Lindl. and Terrestrial Orchid Geodorum densiflorum (Lam.) Schltr., and Their Potency as a Herbicide
Abstrak: Anggrek hitam Kalimantan (Coelogyne pandurata Lindl.) dan anggrek tanah merah muda (Geodorum densiflorum (Lam.) Schltr.) merupakan anggrek langka yang digunakan sebagai tanaman hias dan berperan penting dalam bidang hortikultura dan juga bidang kesehatan. Anggrek bergantung pada cendawan simbion mutualistik, seperti cendawan endofit dan mikoriza pada sebagian atau pun seluruh fase hidupnya. Cendawan endofit memiliki kemampuan untuk menghasilkan metabolit sekunder yang mampu menginduksi ketahanan tanaman inang terhadap berbagai cekaman abiotik dan biotik. Metabolit sekunder yang diproduksi oleh cendawan endofit dapat digunakan pada bidang pertanian, di antaranya ialah sebagai senyawa herbisida. Namun, belum terdapat laporan mengenai keberadaan cendawan endofit yang diisolasi dari organ tanaman anggrek C. pandurata Lindl. dan G. densiflorum (Lam.) Schltr., serta potensinya sebagai penghasil senyawa herbisida. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan menganalisis keanekaragaman cendawan endofit yang mengolonisasi berbagai organ kedua tanaman anggrek, serta potensinya sebagai penghasil senyawa herbisida. Cendawan diisolasi dari akar, batang, daun, dan bunga tanaman anggrek. Cendawan hasil isolasi diidentifikasi berdasarkan kombinasi karakteristik morfologi dan molekuler menggunakan sekuens DNA daerah rDNA ITS1-5,8S-ITS2. Analisis keanekaragaman cendawan endofit yang dilakukan meliputi analisis frekuensi relatif (%FR), kelimpahan relatif (%KR), indeks keanekaragaman Shannon-Wiener (H’), kemerataan spesies Pielou (E), dominansi Simpson (C), dan indeks kekayaan spesies (R). Uji aktivitas herbisida dilakukan terhadap perkecambahan benih gulma Amaranthus spinosus L. dengan menggunakan filtrat cendawan endofit. Data perkecambahan yang diperoleh kemudian dianalisis menggunakan Analysis of Variance (ANOVA) dan Duncan Multiple Range Test (DMRT) pada taraf 5% (p<0,05) menggunakan aplikasi Minitab 16. Hasil penelitian menunjukkan bahwa cendawan endofit yang diisolasi dari berbagai organ tanaman anggrek beraneka ragam. Sebanyak 21 spesies cendawan endofit yang diperoleh terdiri atas 10 genus yaitu Aspergillus, Cladosporium, Colletotrichum, Curvularia, Fusarium, Hypomontagnella, Musidium, Muyocopron, Nigrospora, dan Penicillium. Fusarium ditemukan di seluruh organ kedua spesies tanaman anggrek, tetapi setiap tanaman anggrek juga berasosiasi dengan spesies cendawan endofit yang berbeda. Spesies Cladosporium endophyticum, Colletotrichum orchidearum, Muyocopron alcornii, dan Penicillium citrinum hanya ditemukan pada tanaman anggrek C. pandurata Lindl.; sedangkan Curvularia pseudobranchyspora, Hypomontagella barbarensis, dan Nigrospora chinensis hanya ditemukan pada tanaman anggrek G. densiflorum (Lam.) Schltr. Keanekaragaman cendawan endofit pada kedua spesies tanaman anggrek tersebut tergolong sedang (H’ = 2,22 pada tanaman anggrek C. pandurata Lindl.; H’ = 2,34 pada tanaman anggrek G. densiflorum (Lam.) Schltr.), dengan indeks kemerataan dan kekayaan spesies yang tinggi (E = 0,96 dan R = 3,11 pada tanaman anggrek C. pandurata Lindl.; E = 0,96 dan R = 3,69 pada tanaman anggrek G. densiflorum (Lam.) Schltr.) serta indeks dominansi yang rendah (C = 0,12 pada C. pandurata Lindl.; C = 0,10 pada G. densiflorum (Lam.) Schltr.). Secara keseluruhan, semua isolat cendawan endofit yang diperoleh mempunyai aktivitas herbisida yaitu dengan menghambat perkecambahan benih gulma A. spinosus L. Isolat cendawan yang menunjukkan aktivitas herbisida paling besar, ialah Aspergillus aculeatus PCP 8.2 dengan persentase perkecambahan 3,33 ± 0,06%, rata-rata panjang plumula 0,36 ± 0,07 cm dan radikula 0,08 ± 0,02 cm., The Borneo black orchid (Coelogyne pandurata Lindl.) and the pink terrestrial orchid (Geodorum densiflorum (Lam.) Schltr.) are endangered orchids species used as ornamental plants and they are also important in horticulture and health. Orchids are dependent on mutualistic symbiosis with fungi, such as endophytic
Keyword: metabolit sekunder, secondary metabolites, Amaranthus spinosus, daerah ITS1-5,8S-ITS2 rDNA, filtrat kultur, karakteristik morfologi, culture filtrate endophytic fungi, ITS1-5,8S-ITS2 rDNA regions, morphological characteristics

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: