Judul: Analisis nilai target strength ikan di perairan Selat Makassar dan sekitarnya (Dengan menggunakan sistem akustik BIM ganda)
Abstrak: Metode akustik yang banyak digunakan sekarang ini ada!ah integrasi echo. Keluaran dari integrasi echo adalah densitas relatif dan pengukuran nilai target strength. Target strength adalah kekuatan dari suatu target untuk memantulkan suara dari sebagian energi akustik yang diserap kembali ke transducer. Pengukuran target strength banyak dilakukan dengan menggunakan intensitas target strength. Syarat da!am pengukuran in situ target strength ada!ah bahwa ikan-ikan yang disurvei berada dalam keadaan terpisah satu sama lain. Keadaan demikian dapat dideteksi dengan amplitudo threshold criteria danpulse duration criteria. Tulisan ini bertujuan untuk menganalisis dugaan nilai rata-rata target strength ikan dan distribusinya secara vertikal dan horisontal pada siang dan malam hari dengan menggunakan sistem akustik bim ganda serta untuk memperoleh perbandingan nilai target strength yang diperoleh dengan data oseanografi berdasarkan pustaka. Penelitian dilakukan di sepanjang Paparan Balikpapan sampai Semarang dengan menggunakan Kapal Latih Perikanan Bawal Putih I beserta seperangkat sistem akustik bim ganda pada tanggal 8 Februari sampai 16 Februari I 995. Sebelum survei akustik dilaksanakan, terlebih dahulu dilakukan kalibrasi sistem atau alat melalui Echo Signal Processor (ESP) berdasarkan program Windows 95 (3.11). Analisis penyebaran secara ve1iikal dibuat berdasarkan selang kedalaman 12,37 meter, mulai dari kedalaman 1,3 meter sampai 125 meter di bawah permukaan transducer, dibagi dalam IO strata kedalaman.
Keyword: 

Judul: Studi Tentang In Situ Target Strength Ikan Dengan Sistem Akuistik BIM Ganda Di Perairan Selat Makassar
Abstrak: Penelitian ini adalah suatu hasil kerjasama dengan The Java Sea Pelagic Fishery Assessment Project, yang dilaksanakan dari tanggal 26 Januari hingga 5 Februari 1995 di Selat Makassar, khususnya di bagian paparan Kalimantan. Penelitian bertujuan untuk: (1) mengetahui distribusi spasial target strength ikan pada periode siang dan malam dan (2) membandingkan kesesuaian data akustik dan data penangkapan. Data yang dikumpulkan terdiri dari data dasar akustik (acoustic raw data), jenis dan ukuran panjang cagak ikan, serta suhu dan salinitas perairan. Data tersebut diperoleh di sepanjang 11 garis transek pada arah pelayan dari Balikpapan ke Kepulauan Matasiri dan 13 garis transek pada arah pelayaran dari Kepulauan Matasiri ke Balikpapan. Data ikan diperoleh dari hasil operasi penangkapan dengan pukat cincin, trawl pelagis dan trawl dasar, sedangkan suhu dan salinitas perairan diukur pada 15 stasiun. Data akustik diproses dengan program ESPTS untuk memperoleh nilai rata-rata target strength ikan, kemudian dianalisa distribusinya. Data akustik untuk keperluan verifikasi diambil pada kedalaman dan ketebalan lapisan air yang dijangkau oleh masing-masing alat tangkap di sekitar tempat-tempat operasi alat- alat tangkap tersebut. Distribusi horisontal target strength ikan ditelaah dengan program EVA (Estimation VAriance), sedangkan distribusi vertikal diketahui berdasarkan plot nilai target strength menurut strata kedalaman kolom air hasil stratifikasi secara vertikal dengan ketebalan 10 m. yang dilakukan secara terpisah menurut kategori kedalaman dasar laut…dst
Keyword: energi gelombang suara, intensitas, in situ target strength, sisitem akustik Bima Danda, Selat Makasar

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA