Judul: Keparahan Penyakit Kerdil Pisang di Bogor dan Sukabumi, Jawa Barat serta Optimasi Metode Deteksi Berdasarkan Teknik PCR.
Abstrak: Banana bunchy top virus (BBTV) menjadi ancaman dalam produksi pisang. Infeksi BBTV mudah dikenali dari gejalanya yang khas, meliputi daun menguning, garis klorosis yang terbatas di sepanjang daun muda, daun bergaris hijau, daun menyempit dan tersusun di bagian atas tanaman, serta tanaman kerdil. Walaupun demikian, masih diperlukan deteksi di laboratorium untuk mengonfirmasi adanya infeksi BBTV. Penelitian ini bertujuan menganalisis dan membandingkan tingkat keparahan penyakit kerdil pisang di Bogor dan Sukabumi, Jawa Barat serta mengoptimasi metode polymerase chain reaction (PCR) sebagai metode deteksi BBTV dari sampel lapangan. Daun sampel dari tanaman terinfeksi dikoleksi dari Bogor dan Sukabumi, Jawa Barat. Sampel dianalisis dengan menggunakan primer spesifik untuk BBTV yaitu CP1F/CP1R dan mRepF/mRepR. Selanjutnya optimasi metode PCR dilakukan dengan pengenceran DNA templat mulai dari 10-0 sampai 10-10. Berdasarkan pengamatan gejala, keparahan penyakit di Bogor cenderung lebih tinggi dibandingkan dengan di Sukabumi. Kedua primer spesifik berhasil digunakan untuk mengamplifikasi BBTV dari sampel lapangan, walaupun hasil amplifikasi positif lebih banyak dengan menggunakan primer mRepF/mRepR untuk sampel yang menunjukkan gejala ringan, sedang dan berat. Konsentrasi BBTV terendah yang dapat terdeteksi dengan metode PCR yaitu antara 0.03 ng/μL sampai 0.08 ng/μL.
Keyword: kerdil, menguning, pengenceran DNA, polymerase chain reaction, primer spesifik

Judul: Disease Incidence and Molecular Analysis of Banana Bunchy Top Virus in Bogor, West Java
Abstrak: Pisang merupakan salah satu komoditas hortikultura bernilai ekonomi tinggi dan dibudidayakan pada berbagai jenis sistem budi daya pertanian tropika. Banana bunchy top virus (BBTV) yang menyebabkan penyakit kerdil pisang dianggap sebagai virus paling penting yang menginfeksi pertanaman pisang di Asia, Afrika, Australia dan Pasifik Selatan. Penelitian sebelumnya melaporkan bahwa pusat keragaman BBTV dunia terletak dan berasal dari Asia Tenggara, termasuk Indonesia. Namun demikian, insidensi penyakit dan karakter molekuler dari BBTV di Indonesia masih sangat sedikit dimengerti. Tujuan penelitian ini adalah mengarakterisasi variasi gejala, insidensi penyakit, dan karakter molekuler dari BBTV di pertanaman pisang di Bogor, Indonesia. Insidensi penyakit BBTV ditinjau berdasarkan gejala di lapangan. Daun-daun yang menunjukkan gejala dikonfirmasi menggunakan metode immunocapture-polymearse chain reaction (IC-PCR). Karakterisasi molekuler kemudian dilakukan berdasarkan analisis nukleotida dari sikuen virus yang diamplifikasi. Hasil pengamatan menunjukan bahwa insidensi penyakit kerdil pisang di Kabupaten Bogor berkisar dari 3.3% hingga 28.4%. Gejala penyakit yang paling umum dijumpai di lapangan antara lain daun tegak, klorosis dan bergelombang pada tepian daun, serta pengurangan panjang dan jarak petiol dan lebar lamina. Serangga vektor, Pentalonia nigronervosa, ditemukan pada beberapa tanaman di lapangan dan BBTV berhasil dideteksi dari sampel kutu daun tersebut. Karakterisasi molekuler dari DNA-R dan DNA-S pada sampel BBTV mengonfirmasi bahwa isolat-isolat BBTV dari Bogor merupakan bagian dari Asian group, dan jelas terpisah dari South Pacific group. Variasi genetika diantara isolat-isolat BBTV Bogor tidak begitu tinggi, dengan homologi sikuen berkisar dari 97.2% hingga 99.3% dan 96.6% hingga 100% untuk DNA-S dan DNA-R, secara berturut-turut
Keyword: gejala lapangan, immunocapture-polymerase chain reaction, variasi genetika

Judul: Kekonsistenan Hamiltonian pada Gerak Gelombang Interfacial
Abstrak: The interfacial wave is an internal wave that occurs at boundary of two layers fluid. It appears because there is difference of mass density between the two layers. The objective of this thesis is to formulate the motion of internal wave with flat base and flat as well as free upper bound surface. The motion equation obtained is a Hamiltonian system. The Hamiltonian in this system is expressed by variable of wave deviation and horizontal component of potential velocity. Under assumption that interfacial wave moves only in one direction, it can be shown that the Hamiltonian depends on the solution of the wave motion equation. The coefficients of the equation depend on the physical characteristics of the two layers of fluid, i.e. thickness and mass density. The numerical results show that Hamiltonian in the system is constant. It is consistent with Hamiltonian characteristic, which does not depend on time.
Keyword: