Judul: Studi distribusi arah dan kecepatan renang ikan di perairan barat P. Belitung dengan metode hidroakustik pada bulan Juli 2006
Abstrak: Perairan Barat P. Belitung merupakan perairan laut dangkal dengan rata-rata kedalaman 15,05 meter. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui arah dan kecepatan renang ikan di perairan Barat P.Belitung. Penelitian ini menggunakan data arah dan kecepatan renang ikan dibutuhkan guna mendukung informasi tentang keberadaan ikan dan penyebaran daerah penangkapan.
Keyword: 

Judul: Studi distribusi arah dan kecepatan renang ikan pelagis di perairan laut Jawa dengan menggunakan sistem akustik bim terbagi (Split Beam AcousticSystem) pada bulan maret 2005
Abstrak: Indonesia memiliki potensi dan prospek perikanan yang sangat besar dan cerah. Oleh karena itu, perlu adanya pendugaan stok sumber daya ikan di laut (stock assessment) dan pengembangan teknologi penangkapan ikan yang efektif. efisien dan produktif dengan memperhatikan kelestarian sumberdaya alam, yaitu dengan mengetahui tingkah laku ikan. Pendugaan distribusi arah dan kecepatan renang ikan penting dalam mengetahui tingkah laku ikan. Sebagai upaya untuk mendukung tersedianya informasi tersebut, dilakukan penelitian dengan menggunakan Sistem Akustik Bim Terbagi (Split Beam Acoustic System). Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari arah dan kecepatan renang ikan pelagis serta hubungannya dengan faktor-faktor oseanografi fisika. Penelitian dilaksanakan di perairan pesisir Utara Jawa Tengah, pada tanggal 6-11 Maret 2005, dengan posisi 6°10'002" L.S, 109°10'00" B.T dar 6°35'38" L.S, 109°10'00" B.T sampai dengan 6°35'38" L.S. 110°11'38" B.T dan 6°48'00" L.S. 110°11'38" B.Τ. Alat untuk pengambilan data akustik adalah SIMRAD EY 500 Scientific Echosounder, alat untuk pengambilan data oseanografi adalah Current Meter Valeport plus seri 108/308 yang dilengkapi dengan sensor suhu, salinitas dan kedalaman. Desain survei yang digunakan adalah systematic triangular transect. Sebaran suhu di perairan Laut Jawa semakin menurun seiring dengan bertambahnya kedalaman, yaitu dengan kisaran 28,59 °C hingga 30,09 °C. Secara horizontal suhu meningkat seiring bertambahnya jarak dari pantai. Nilai salinitas memiliki karakteristik yang berbeda dengan nilai suhu. Nilai salinitas semakin meningkat dengan semakin dalamnya perairan. Nilai salinitas berkisar antara 32,57 psu hingga 34,15 psu. Secara horizontal nilai salinitas meningkat dengan bertambahnya jarak dari pantai. Kecepatan arus berkisar antara 0,07-0,92 m/detik. Arus semakin cepat ke arah laut lepas, arah arus relatif ke arah Selatan. Berdasarkan data kecepatan renang ikan yang terdeteksi, nilai minimum kecepatan renang ikan adalah 0,19 m/detik dan nilai maksimum adalah 9,99 m/detik, dengan kecepatan rata-rata 3,99 m/detik. Sebaran suhu secara vertikal semakin menurun sedangkan nilai salinitas meningkat seiring dengan bertambahnya kedalaman, kecepatan renang ikan semakin menurun. Sebaran suhu secara horizontal relatif homogen, sedangkan nilai salinitas semakin meningkat dengan bertambahnya jarak dari pantai, arah renang ikan tunggal yang terdeteksi menjauh dari arah pantai dengan kecepatan yang bervariasi. Arah arus di perairan pesisir Utara Jawa Tengah relatif ke arah Selatan, sedangkan arah pergerakan ikan lebih dominan ke arah Barat hingga Timur laut. Hubungan kecepatan renang ikan dengan panjang ikan, dimana semakin panjang tubuh ikan, kecepatan renang ikan relatif semakin tinggi dan nilai TS semakin besar.
Keyword: 

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA