Judul: Ocean Health Index in The Bone Bay Between 2008-2019 Based on The Physical Oceanographic Parameters
Abstrak: Teluk Bone menghubungkan wilayah administratif Provinsi Sulawesi Selatan di sisi barat dengan Sulawesi Tenggara di sisi timur teluk. Orientasi teluk yang terbuka kearah Laut Flores di sisi selatan menyebabkan Arus Lintas Indonesia (Arlindo) yang berasal dari Selat Makassar dan sirkulasi permukaan monsun diduga mempengaruhi dinamika Teluk Bone, sehingga teluk ini memiliki karakteristik oseanografi yang unik seperti produktivitas primer tinggi diikuti dengan melimpahnya tangkapan ikan pelagis penting seperti cakalang dan tuna. Pemantauan perubahan kualitas lingkungan laut secara sinambung di wilayah teluk ini perlu dikaji melalui penentuan indeks kesehatan laut (IKL). Tujuan dari penelitian ini adalah mendeskripsikan karakteristik beberapa parameter oseanografi fisik, kecendrungan (trend) parameter oseanografi serta menghitung nilai IKL di wilayah Teluk Bone menggunakan data keluaran model sirkulasi laut 3-dimensi INDESO dan Copernicus dari 2008-2018 (10 tahun). Hasil penelitian menunjukkan karakteristik oseanografi Teluk Bone dicirikan dengan variasi musiman yang kuat, dimana pada periode musim barat suhu dan tinggi muka laut menjadi maksimum (29.93 oC dan 0.7 m), tetapi salinitas minimum (33.23 psu). Sebaliknya, pada periode musim timur, suhu dan tinggi muka laut menjadi minimum (28.44 oC dan 0.6 m) dan salinitas maksimum (33.26 psu). Pertukaran massa air dari dalam teluk dengan luar teluk menunjukkan volume transpor mengalir kearah utara pada musim peralihan II (Oktober) dan pada musim barat (Februari) kearah selatan sebesar 0.030 Sv (1 Sv = 106 m3/s). Tren data deret-waktu (2008-2018) dari parameter oseanografi di Teluk Bone cenderung mengalami penurunan, misalnya parameter SPL (sekitar -0.0028 oC/tahun), salinitas (-0.0012 psu/tahun), dan tinggi muka laut (-0.0236 m/tahun). Perhitungan IKL dengan nilai estimasi SPL sekitar 1.00, salinitas 1.01, dan tinggi muka laut 1.15, diperoleh nilai IKL Teluk Bone tergolong perairan teluk yang masih berstatus baik., The Bone Bay connects the administrative area of South Sulawesi Province on the west side with Southeast Sulawesi on the east side of the bay. The orientation of the bay that opens towards the Flores Sea on the south side causes recirculation of the Indonesian Through Flow (ITF) originating from the Makassar Strait and the monsoon circulation are considered to affect the Bone Bay dynamics. This bay has unique oceanographic characteristics such as high primary productivity followed by abundance of catches of important pelagic fish such as skipjack and tuna. Continuous monitoring of changes in the quality of the marine environment in the bay area needs to be studied through the determination of the ocean health index (OHI). The objective of this study is to describe the characteristics of several physical oceanographic parameters, to estimate the trend of oceanographic parameters and to calculate the OHI value in the Bone Bay using the model output data of the 3-dimensional ocean general circulation model INDESO and Copernicus between 2008-2018 (10 years). The results showed that the oceanographic characteristics of Bone Bay are characterized by strong seasonal variations, where during the northwest monsoon (NWM) period sea surface temperature (SST) and sea surface height (SSH) are maxima, 29.93 oC and 0.7 m, respectively, but the salinity is minimum (33.23 psu). In contrast, during the southeast monsoon (SEM) period SST and SSH 28.44 oC and 0.6 m, respectively, and salinity is maximum (33.26 psu).
Keyword: Oceanography parameters, Bone Bay, Trend value, Ocean Health Index (OHI), Model output dataset

Judul: Analysis on Ocean Circulation in Bone Bay and Its Relation to the Distribution of Primary Productivity
Abstrak: Beberapa mekanisme fisik skala besar terjadi di sekitar perairan Teluk Bone, di antaranya ARLINDO dan angin monsun. Hasil penelitian-penelitian terdahulu menunjukkan bahwa fluktuasi variabel permukaan seperti SPL dan klorofil-a berkorelasi dengan total produktivitas primer dan kelimpahan cakalang. Penelitian menggunakan analisis pada rona permukaan telah banyak dilakukan, namun kajian komprehensif menggunakan data observasi lapangan dan pemodelan numerik mengenai interaksi pola sirkulasi laut dengan produktivitas primer di wilayah ini belum pernah dilakukan. Penelitian ini dilakukan untuk menjawab pertanyaan ilmiah: 1) bagaimana pola sirkulasi laut di Teluk Bone, 2) bagaimana pertukaran antara massa air di dalam teluk dengan di luar teluk, 3) bagaimana variabilitas pertukaran volum transpor dari dan ke Teluk Bone, dan 4) bagaimana aspek fisik tersebut berpengaruh terhadap distribusi produktivitas primer laut di wilayah Teluk Bone dan sekitarnya. Data yang digunakan dalam penelitian ini bersumber dari hasil observasi lapangan tanggal 15-19 Oktober 2014 oleh tim BPPL dan Departemen ITK-FPIK IPB, serta hasil keluaran model sirkulasi laut dengan kopel biogeokimia ROMS dan INDESO. Pola arus menunjukkan adanya pengaruh musim dimana pada awal Musim Barat, arus kuat muncul dari arah barat yang memungkinkan massa air dari sisi selatan Teluk Bone memasuki teluk. Rata-rata volum transpor adalah -0.12 Sv dengan simpangan baku sebesar 0.27 Sv. Hal ini menunjukkan bahwa transpor lebih dominan ke arah selatan yang mengindikasikan adanya defisit pada permukaan laut yang memungkinkan terjadinya upwelling. Variabilitas transpor yang diamati dari hasil CWT memperlihatkan adanya variabilitas intra musiman dan variabilitas tahunan. Karakteristik massa air di Teluk Bone pada waktu pengamatan memperlihatkan kemiripan dengan karakteristik massa air di Laut Banda dan Laut Flores. Hasil ini menunjukkan bahwa terdapat pertukaran massa air dari luar teluk ke dalam teluk yang menyebabkan massa air Teluk Bone memiliki jenis massa air yang sama dengan perairan di sekitarnya. Pola musiman yang muncul pada produktivitas primer mengindikasikan adanya pengaruh dinamika perairan terhadap distribusi produktivitas primer dan nutrien akibat pertukaran massa air antara laut lepas dengan massa air di dalam Teluk Bone. Pola sirkulasi laut secara fisik yang memiliki kesamaan dengan pola distribusi produktivitas primer dan faktor pembangkitnya menunjukkan bahwa penyebaran nutrien dipengaruhi dari transpor massa air di dalam Teluk Bone sehingga memungkinkan pergerakan kelimpahan ikan di wilayah ini.
Keyword: Bone Bay, Primary productivity, Numerical modeling, Ocean circulation, Seawater transport

Judul: Isolasi Konstruksi dan Rekombinasi Gen Pengkode Reverse Transcriptase asal Simian Retrovirus-2 (SRV-2)
Abstrak: The availability of reverse transcriptase enzym as a valuable component for Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) technique has been providing by foreign companies. Therefore, it needs more cost and time to provide it. This study is an early step to produce in house reverse transcriptase rekombinant enzym from SRV-2. The purpose of this study was isolated, constructed, and rekombined SRV-2 reverse transcriptase gene to entry clone and destination vector. Isolation was done by PCR amplification technique using three pairs of primers, which are RT I (3282-3683), RTII (3261-3900), and RTIII (3169-4133). Construction and recombination in this study used Gateway method from Invitrogen. SRV-2 reverse transcriptase gene was isolated in this study with A-549 cell inoculated SRV-2 as source of virus. This gene amplify by PCR technique and resulted specific band for RTI 401 bp, RTII 639 bp, and RTIII 964 bp. Analysis of pENTR/SD/TOPO and pDEST17 indicated SRV-2 reverse transcriptase gene code has already inserted to this plasmid. This result indicated SRV-2 reverse transcriptase gene have isolated, constructed, and recombined to entry clone and destination vector.
Keyword: