Judul: Produksi Senyawa Kinin Oleh Mikroorganisme Endofitik Pada Tanaman Cinchona ledgeriana Moens Dengan Berbagai Konsentrasi Sukrosa
Abstrak: Pemanfaatan mikroorganisme endofitik untuk memproduksi senyawa aktif yang Terdapat di dalam jaringan tanaman sangat potensial untuk dikembangkan. Mikroorganisme endofitik adalah mikroorganisme yang hidup di dalam jaringan tanaman dan berinteraksi dengan tanaman yang ditumpanginya.
Keyword: 

Judul: Potensi Metabolit Mikrob Endofit untuk Mengendalikan Aspergillus flavus Link. Terbawa Benih Kacang Tanah
Abstrak: Kacang tanah (Arachis hypogaea L.) merupakan salah satu tanaman pangan penting di Indonesia karena bijinya memiliki kandungan gizi yang tinggi. Konsumsi kacang tanah akan terus meningkat seiring dengan pertambahan jumlah penduduk di Indonesia. Peningkatan konsumsi kacang tanah di Indonesia tidak diikuti oleh peningkatan produksi kacang tanah. Penurunan produksi ini dapat disebabkan oleh beberapa faktor teknis budidaya yang kurang baik, seperti pengolahan tanah, pemupukan, pemanenan, pengendalian hama dan penyakit serta penggunaan benih bermutu rendah. Mutu benih kacang tanah yang rendah dapat disebabkan oleh infeksi dari cendawan terbawa benih. Aspergillus flavus merupakan cendawan penting yang memengaruhi mutu benih, dapat menghasilkan aflatoksin yang bersifat racun bagi tanaman, manusia, mamalia, dan unggas. Pengendalian cendawan terbawa benih umumnya dengan cara perlakuan benih secara kimiawi dengan aplikasi fungisida sintetik. Meskipun demikian, perlu dilakukan pengembangan cara pengendalian A. flavus terbawa benih yang lebih efektif, efisien, ramah lingkungan, dan berkelanjutan. Senyawa metabolit mikrob endofit merupakan salah satu cara pengendalian cendawan terbawa benih yang potensial untuk dikembangkan. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi mikrob endofit potensial dari jaringan tanaman kacang tanah serta untuk mengetahui potensi mikrob endofit sebagai agens biokontrol terhadap A. flavus cendawan patogen terbawa benih kacang tanah. Penelitian ini dilaksanakan di Laboratorium Nematologi, Laboratorium Mikologi Tumbuhan Departemen Proteksi Tanaman Fakultas Pertanian Institut Pertanian Bogor dan rumah kaca Cikabayan IPB pada bulan Januari sampai Desember 2016. Percobaan dilakukan menggunakan rancangan acak lengkap (RAL). Adapun metode penelitian meliputi isolasi A. flavus, isolasi mikrob endofit dari tanaman kacang tanah, uji patogenesitas mikrob endofit, uji potensi mikrob endofit sebagai penghasil senyawa volatil dan uji enzim kitinolitik, uji penghambatan mikrob endofit terhadap A. flavus, ekstraksi dan uji metabolit mikrob endofit, uji perlakuan benih dengan senyawa metabolit dan identifikasi mikrob endofit. Perlakuan yang menunjukkan beda nyata diuji lanjut dengan uji selang berganda Duncan (DMRT) pada taraf 5%. Berdasarkan hasil isolasi mikrob endofit dari akar, batang, dan daun tanaman serta benih kacang tanah, diperoleh 63 isolat cendawan endofit dan 191 isolat bakteri endofit. Melalui uji patogenisitas terhadap isolat mikrob endofit, terdapat 33 isolat cendawan endofit dan 37 bakteri endofit yang bersifat nonpatogenik terhadap tumbuhan. Hasil seleksi cendawan endofit 3 cendawan yang memiliki penghambatan terbaik adalah CED-5 (51.47%), CEA-11 (51.32%), dan CEB-2 (50.73%), sedangkan untuk bakteri endofit yang memiliki 3 penghambatan terbaik yaitu BE2B2-1 (71.64%), BE2B2-2 (69.05%), dan BE2B2-5 (65.25%). Identifikasi cendawan endofit dilakukan dengan mengamati morfologi secara makroskopis dan mikroskopis 3 isolat yang memiliki penghambatan terbaik dalam uji kultur ganda yaitu CEA-11 diduga sebagai Penicillium sp., CED-5 adalah hifa steril 1, dan CEB-2 adalah Monascus sp. Sementara itu, identifikasi bakteri endofit dilakukan dengan teknik molekuler dan perunutan DNA menunjukkan bahwa BE2B2-1 (94%) adalah Enterobacter sp., BE2B2-2 (98%) adalah Bacillus sp., BE2B2-5 (97%) adalah Acinetobacter sp. Isolat Enterobacter sp. memiliki aktivitas antimikrob lebih tinggi terhadap A. flavus di in vitro dengan daya hambat hingga 61.70%, daya hambat infeksi hingga 77.22% dengan metode growing on test, dan peningkatan perkecambahan benih kacang tanah hingga 4.25%. Berdasarkan dampak metabolit sekunder terhadap tanaman inang, mikrob endofit memiliki potensi besar untuk digunakan sebagai pengendali patogen terbawa benih dan bahkan dapat berperan sebagai plant growth promoting benih kacang tanah. Hasil penelitian ini diharapkan dapat
Keyword: antibiosis, benih, hipersensitif, kitinase, senyawa volatil

Judul: The Construction of Greedy SVP LLL Algorithm
Abstrak: A lattice is a set of all integer linear combination of a set of linearly independent vectors in ℝ𝑛���. The independent vectors are called bases of lattice. Any lattice can be generated from many bases, and these bases have the same cardinality. In the lattice, the most fundamental and renowned problem is the Shortest Vector Problem (SVP). SVP is a tracking problem of the shortest nonzero vector in a lattice with equivalent bases. In two dimensions, SVP problem has resolved exactly by Gauss’ algorithm. When the lattice dimension is higher than two, A.K. Lenstra, H.W. Lenstra and L. Lovasz gave a LLL algorithm to compute approximation of nonzero shortest vector in the lattice. Reduced bases solution obtained from LLL algorithm still be an approximation and has polynomial running time of arbitrary dimension which large enough. In 1994, Schnoor and Euchner modified this LLL algorithm as a new variant which later was named deep insertion LLL algorithm. This algorithm is a modified version of the LLL algorithm to the terms of the exchange step to improve the accuracy of output of LLL reduced bases and applying it to the subset sum problem. The purpose of this research are: (1) Reconstruct the LLL algorithm and deep insertion LLL algorithm using a geometric approach. (2) Construct a greedy SVP LLL algorithm. (3) Implement the three algorithms in a symbolic programming language, and evaluate them experimentally. A bases ℬ=[𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑛���] in ℝ𝑚��� is called reduced LLL with parameter 𝛿��� if satisfies: (a) |𝜇���𝑗���𝑖���|≤12, for every integer 𝑖���,𝑗��� with 1≤𝑖���<𝑗���<𝑛���. (b)𝛿���‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���)‖2≤‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���+1)‖2, for 𝑗���=1,2,…,𝑛���−1,where 𝛿��� is a reduced parameter of real numbers with 14<𝛿���<1. The first requirement is the reduced basis 𝛿��� must “nearly orthogonal” and in its computation case, this requirement can be reached out by using the Gram-Schmidt’s orthogonalization. While the second requirement is called exchange step, or used to called as Lovasz condition. By using both of these requirements, then they establish the LLL algorithm. Then, Schnoor and Euchner modify the LLL algorithm based on the requirements of the exchange step called the deep insertion LLL algorithm, where the exchange step is based on the comparison of the projected vector in orthogonal complement [𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑘���−1]⊥ after j-th reduction. To construct greedy SVP LLL algorithm, the requirements of the exchange step is based on purely by comparing norm of lattice 𝐛���𝑗��� with norm lattice 𝐛���𝑖��� for 𝑖���=1,2,3…,𝑗���−1. The process of insertion reduced vector after the exchange step also has done greedily. Then, we calculate the number of arithmetic operation in greedy SVP LLL algorithm for further analysis. The result of our exprimentation for three algorithms on the certain matrix size shows that the running time of the three algorithms increases propotional to the size of the matrix. The result also shows that by using 𝛿���=34 for the LLL algorithm and the deep insertion LLL algorithm, and the greedy SVP LLL algorithm which is a new variant made by using no parameter of 𝛿���, outperform of the other of two previous algorithm in terms of speed with the same output.
Keyword: LLL algorithm, LLL deep insertion algorithm, greedy SVP LLL algorithm