Judul: Proteomic and phenotypic studies of Balitbangtan Superior Kampung Chicken (KUB) on fresh and frozen semen quality
Abstrak: Fenotip adalah karakteristik (struktural, biokimiawi, fisiologis, dan perilaku) yang dapat diamati dari suatu organisme yang diatur oleh genotipe dan lingkungan serta interaksi keduanya. Fenotip pada ayam seperti jengger dan warna bulu telah dilaporkan dapat menggambarkan kualitas semen. Fenotip ini diduga berhubungan dengan konsentrasi hormon testosteron yang berhubungan juga dengan spermatogenesis. Kualitas semen berhubungan dengan kandungan protein pada plasma semen maupun sperma. Analisis protein pada semen dapat dilakukan menggunakan liquid chromatography tandem mass spectrophotometry (LC-MS/MS). Alat tersebut dapat mengidentifikasi protein berdasarkan sifat kimia dan rasio massa/muatan (m/z) protein. Penelitian ini bertujuan untuk mengkarakterisasi semen segar dan hubungannya dengan konsentrasi testosteron, kualitas semen beku, dan kandungan protein semen (plasma semen dan sperma) pada ayam KUB dengan fenotip berbeda. Penelitian ini terdiri atas 1) Karakterisasi kualitas semen ayam KUB berdasarkan perbedaan fenotip dan korelasinya dengan testosteron, 2) Analisis kualitas semen beku ayam KUB berdasarkan perbedaan fenotip, 3) Identifikasi profil protein semen ayam KUB dan fungsinya berdasarkan perbedaan tipe jengger menggunakan SDS-Page dan LC-MS/MS. Sampel semen dan plasma darah yang digunakan pada tahap satu dan dua berasal dari empat kelompok ayam yaitu jengger tunggal bulu penutup merah (JTBM), jenggger tunggal bulu penutup putih (JTBP), jengger pea bulu penutup merah (JPBM), dan jengger pea bulu penutup putih (JPBP). Sampel semen yang digunakan pada tahap tiga dibedakan berdasarkan tipe jengger. Penelitian tahap pertama adalah karakterisasi kualitas semen ayam KUB berdasarkan perbedaan fenotip dan korelasinya dengan testosteron. Hasil penelitian menunjukkan pejantan dengan fenotip JPBM memiliki volume semen paling tinggi dan JTBM adalah yang paling rendah (P<0,05). Pejantan JTBM juga memiliki motilitas dan konsentrasi sperma paling rendah dibandingkan dengan fenotip lainnya.. Diameter taji tidak berbeda nyata pada setiap kelompok (P>0,05), sedangkan panjang taji pada kelompok jengger pea lebih tinggi dari kelompok JTBP (P<0,05), tetapi tidak berbeda nyata dengan kelompok JTBM. Konsentrasi sperma dan testosteron pada kelompok JPBM tidak berbeda dengan kelompok JPBP dan lebih tinggi dibandingkan dengan kelompok JTBP (P<0.05). Diameter dan panjang taji berkorelasi positif dengan konsentrasi testosteron dengan nilai “r” masing-masing 0,57 dan 0,41. Kesimpulan tahap I bahwa kelompok JPBM memiliki kualitas semen paling baik. Penelitian tahap kedua yaitu pembekuan semen menggunakan pengencer ringer laktat kuning telur (RLKT), ringer laktat kuning telur+fruktosa (RLKTF), dan ringer laktat kuning telur+glukosa (RLKTG) yang berasal dari kelompok JTBM, JTBP, JPBM, dan JPBP. Motilitas dan viabilitas sperma post-thawing ayam KUB paling tinggi ditunjukkan pengencer RLKTG (P<0,05). Abnormalitas sperma post-thawing JTBM dalam pengencer RLKTG paling rendah dibandingkan dengan kelompok lainnya. Kesimpulannya kelompok JTBM menunjukkan hasil PTM yang paling baik. Pengencer terbaik dalam mempertahankan kualitas semen post-thawing adalah RLKTG. Penelitian tahap ketiga menggunakan semen (plasma semen dan sperma) dari kelompok jengger tunggal dan jengger pea. Kelompok penelitian menjadi plasma semen jengger tunggal (PSJT), plasma semen jengger pea (PSJP), sperma jengger tunggal (SJT), dan sperma jengger pea (SJP). Sampel dianalisis menggunakan SDS-Page dengan pewarnaan Comassie Brilliant Blue yang dilanjutkan dengan analisis LC-MS/MS. Hasil penelitian menunjukkan bahwa terdapat 10 pita protein yang terbentuk pada kelompok PSJT dan PSJP dengan berat molekul ~5-10 kDa, sampai 101-140 kDa dan dua pita yang tidak terbentuk pada kelompok SJT dan SJP dengan berat molekul ~5-10 kDa dan 21-25 kDa. Hasil dari
Keyword: characteristics of fresh semen, KUB chicken, frozen semen, phenotype, proteomics

Judul: Study on the Semen Characteristics of Superior Simmental Bulls Based Proteome on Quality Semen and Spermatozoa Fertility Biomarkers
Abstrak: Penilaian fertilitas calon pejantan di Indonesia berdasarkan teknik Breeding Soundness Examination (BSE). Teknik BSE mudah dilakukan, dapat diulangi dan berkorelasi dengan kesuburan pejantan. Pengujian BSE meliputi tiga bagian, yaitu pengamatan fisik (pengamatan genetalia eksternal dan internal melalui eksplorasi rektal), pengukuran lingkar skrotum, tingkah laku seksual (libido), dan analisis kualitas semen. Metode evaluasi semen merupakan metode yang paling umum digunakan untuk penilaian pejantan. Namun, penilaian fertilitas pejantan berdasarkan kualitas semen saja belum dapat menggambarkan fertilitas yang sesungguhnya. Penelitian proteomic dibutuhkan sebagai kajian dalam memprediksi fertilitas pejantan. Beberapa laporan terbaru menunjukkan efektivitas komponen protein plasma semen dapat bersifat menguntungkan atau merugikan bagi fertilitas maupun kualitas semen. Tujuan penelitian ini untuk melakukan kajian penilaian fertilitas pejantan melalui penentuan protein penanda fertilitas. Tahapan penelitian yang dilakukan mencakup: 1) karakterisasi pejantan sapi simental berdasarkan hubungan antara konsentrasi testosteron, adiponektin, dan kualitas semen; 2) profil protein plasma semen berdasarkan berat molekul dan hubungannya dengan kualitas semen segar pejantan sapi simental; 3) protein plasma semen yang berkaitan dengan fertilitas dan kualitas semen segar pejantan sapi simental. Sampel plasma semen diambil dari enam ekor sapi simental milik Balai Inseminasi Buatan (BIB) Ungaran dan enam ekor BIB Lembang dengan kisaran umur 3-8 tahun. Kedua belas ekor tersebut dibagi menjadi kelompok pejantan dengan motilitas spermatozoa ≥70% (normal fresh semen) dan motilitas spermatozoa <70% (poor fresh semen). Pengelompokan berdasarkan data sekunder dari kedua BIB tahun 2018-2019. Kelompok normal fresh semen (NFS) dari BIB Ungaran (NFSU), NFS dari BIB Lembang (NFSL), poor fresh semen (PFS) dari BIB Ungaran (PFSU) dan PFS dari Lembang (PFSL). Setiap kelompok masing-masing tiga ekor sapi. Analisis proteomic menggunakan sampel yang berasal dari BIB Lembang (NFSL dan PFSL). Hasil analisis menunjukkan adanya perbedaan signifikan (p<0,05) antara volume semen dan konsentrasi spermatozoa pada sapi NFSU, PFSU, dan NFSL dengan kelompok sapi PFSL. Sampel NFSU (6,10 ml dan 1455,02×106 /ml), PFSU (6,10 dan 1313,98×106 /ml), serta NFSL (6,73 ml dan 1301,74×106 /ml) lebih tinggi dibandingkan dengan kelompok sapi PFSL (4,37 ml dan 731,35×106 /ml). Rata-rata konsentrasi testosteron pada pejantan sapi simental NFSU, PFSU, NFSL, dan PFSL berturut-turut sebanyak 35,36 ng/ml, 30,42 ng/ml, 34,94 ng/ml, dan 33,06 ng/ml. Konsentrasi adiponektin dalam penelitian ini menunjukkan rata-rata sebesar 5,52 µg/ml (NFSU), 7,23 µg/ml (PFSU), 5,95 µg/ml (NFSL), dan 6,86 µg/ml (PFSL). Pola sekresi hormon testosteron dan adiponektin pada semua pejantan (NFSU, PFSU, NFSL, dan PFSL) tidak menunjukkan perbedaan konsentrasi yang signifikan (p<0,05). Parameter evaluasi fertilitas untuk seleksi calon pejantan sapi simental berdasarkan evaluasi semen, pengukuran testosteron, dan adiponektin belum dapat menggambarkan kapasitas fertilitas sapi pejantan yang sebenarnya, sehingga perlu ditambahkan dengan penilaian pejantan secara molekular, salah satunya melalui identifikasi protein plasma semen yang berhubungan langsung dengan fertilitas. Perkembangan penilaian fertilitas pejantan dilakukan dengan identifikasi dan karakterisasi protein penentu fertilitas spermatozoa maupun kualitas semen menggunakan metode 1D-SDS-PAGE (gel electrophoresis) berdasarkan berat molekul protein. Hasil penelitian ini menunjukkan, masing-masing ekspresi protein dengan BM 134-101 kD, 100-71 kD, dan 70 kD tidak ditemukan pada kelompok sapi dengan motilitas spermatozoa <70% (PFSU dan PFSL). Analisis protein berdasarkan BM menggunakan SDS-PAGE dapat dipertimbangkan sebagai indikator tambahan metode BSE. Konfirmasi profiling protein berdasarkan BM, masih perlu dilakukan analisis proteomics menggunakan metode
Keyword: protein, seminal plasma, fertility, semen quality, Simmental bulls

Judul: The Solution of Nonlinear Volterra Integral Equation using Linearization Method.
Abstrak: Many natural phenomena can be explained by mathematical models. One of those models is in the form of Volterra integral equation, which is usually nonlinear. Analitically, a nonlinear form is difficult to solve. Therefore, this research is aimed to discuss solution of Volterra integral equation using linearization method. Linearization is done to nonlinear integrand with Taylor series expansion. According to this linearization, a numerical solution of Volterra integral equation is obtained using MATLAB 7.0.1 software. Validity of this method is tested by comparing the approximate with the exact solution. The result of this research shows that the numerical solution agree with the exact solution quite well.
Keyword: