Judul: Identifikasi dan uji patogenisitas penyebab busuk pangkal batang jeruk (Citrus sp.) dari beberapa sentra produksi jeruk di Indonesia
Abstrak: Penyakit busuk pangkal batang (BPB) merupakan salah satu penyakit penting karena dapat mematikan tanaman dan saat ini telah berkembang luas di beberapa sentra produksi jeruk di Indonesia. Penyakit disebabkan oleh beberapa spesies seperti Phytophthora nicotianae Dast., P. palmivora dan P. citrophthora, Botryodiplodia theobromae dan atau Diplodia natalensis. Sampai saat ini belum ada identifikasi yang tepat mengenai patogen utamanya. Oleh karena itu, perlu dilakukan identifikasi yang akurat dalam identifikasi awal patogen tanaman sebagai dasar untuk menentukan strategi pengendalian penyakit yang efektif dan efisien. Penelitian bertujuan untuk mengidentifikasi spesies patogen BPB jeruk dari 11 sentra produksi jeruk di Indonesia berdasarkan karakteristik morfologi dan molekulernya, dan mengevaluasi patogenisitas tiap spesies patogen BPB jeruk dari beberapa sentra produksi jeruk di Indonesia. Peubah yang diamati secara makroskopis yaitu warna dan bentuk koloni, lama tumbuh patogen. Secara mikroskopis, karakter morfologis Phytophthora yang diamati yaitu bentuk dan ukuran sporangium, papilla, ada tidaknya sekat dan klamidospora; sedangkan karakter morfologis Diplodia atau Botryodiplodia yang diamati yaitu hifa, stroma, piknidia, konidiofor, klamidospora, bentuk dan ukuran konidia. Identifikasi spesies Phytophthora menggunakan kunci identifikasi Erwin & Ribeiro 1996 sedangkan Diplodia dan atau Botryodiplodia menurut Barnett & Hunter (1998). Identifikasi secara molekuler menggunakan PCR dengan pasangan primer ITS4 dan ITS5. Karakteristik molekuler yang diamati yaitu ukuran fragmen pasangan basa (pb) atau sekuen DNA hasil amplifikasi. Peubah yang diamati pada uji patogenisitas yaitu kejadian penyakit berdasarkan gejala yang terbentuk setelah inokulasi patogen. Hasil isolasi diperoleh 12 isolat yang terdiri dari 1 isolat Phytophthora sp. dari Desa Oehala, Kabupaten Timor Tengah Selatan (TTS), Propinsi Nusa Tenggara Timur (NTT); 11 isolat Botryodiplodia sp. dan atau Diplodia sp. dari Berastagi (Sumatera Utara), Kampar (Riau), Muaro Jambi (Jambi), Tulang Bawang Barat (Lampung), Garut (Jawa Barat), Jember dan Batu-Malang (Jawa Timur), Bangli (Bali), TTS (NTT), Banjarmasin dan Banjarbaru (Kalimantan Selatan).
Keyword: 

Judul: Peran FMA dan PGPR dalam Menginduksi Ketahanan Tanaman Jeruk terhadap Penyakit Busuk Pangkal Batang
Abstrak: Salah satu penyakit penting tanaman jeruk adalah busuk pangkal batang (BPB) atau gumosis. Penyakit BPB dilaporkan terdapat di Sumatera, Jawa, Kalimantan Timur, Sulawesi Selatan, dan Bali. Pengendalian BPB relatif sulit dilakukan karena hampir semua jenis jeruk yang dibudidayakan petani bersifat rentan terhadap BPB. Penelitian bertujuan mengkaji peran fungi mikoriza arbuskular (FMA) dan plant growth promoting rhizobacteria (PGPR) dalam menginduksi ketahanan tanaman jeruk terhadap BPB/gumosis. Penelitian dimulai dengan survei untuk mengoleksi dan mengidentifikasi penyebab BPB jeruk dari daerah sentra produksi jeruk di Indonesia. Pengujian pada bibit jeruk dilakukan menggunakan bibit jeruk dengan batang bawah jenis Japansche citroen (JC) dan batang atas jenis pontianak. Percobaan dilaksanakan dalam rancangan acak lengkap, 8 perlakuan dan 4 ulangan, dan setiap ulangan terdiri atas 2 bibit jeruk. Peubah yang diamati ialah persen kejadian penyakit, keparahan penyakit (panjang dan luas nekrosis), aktivitas enzim peroksidase (PO) dan polifenol oksidase (PPO), dan persentase kolonisasi mikoriza pada akar jeruk. Data hasil pengamatan dianalisis dengan sidik ragam (ANOVA) dan faktor perlakuan yang berpengaruh nyata dilakukan uji lanjut menggunakan uji jarak berganda Duncan (DMRT) pada α0,05. Survei pada dua kebun jeruk di Kabupaten Tulang Bawang Barat (Lampung) diketahui bahwa pada kebun pertama kejadian penyakit lebih dari 90%. Tanaman jeruk dalam kondisi merana dengan banyaknya tetesan gumosis pada batang dan sebagian kulit batang terkelupas serta daun agak menguning, meskipun demikian jeruk masih berbuah. Pada kebun kedua, semua tanaman jeruk telah mati (100%) dan diganti dengan tanaman karet, namun dari sisa-sisa tanaman jeruk nampak adanya gejala penyakit sama seperti pada kebun pertama. Hasil identifikasi berdasar karakter morfologi isolat-isolat cendawan yang diperoleh dari Lampung adalah Botryodiplodia theobromae (Pat.) Griff. & Maubl (syn. Lasiodiplodia theobromae). Isolasi dan identifikasi penyebab BPB jeruk dari 10 daerah juga diperoleh B. theobromae. Khusus dari Soe (NTT) isolat yang diperoleh adalah B. theobromae dan Phytophthora citrophthora. Hasil identifikasi secara molekuler diketahui ukuran fragmen DNA B. theobromae ± 550 bp. Inokulasi patogen pada batang bawah dengan pelukaan menggunakan jarum berhasil menimbulkan infeksi dan gejala nekrosis pada 60 hsi, meskipun perkembangannya sangat lambat. Gejala munculnya gum hingga 60 hsi belum ditemukan. Namun, inokulasi isolat B. theobromae yang sama pada plantlet jeruk berumur 3 bulan, menimbulkan gejala gumosis pada 5 hsi dan tanaman mati pada 8 hsi Hasil analisis sidik ragam (anova) menunjukkan bahwa faktor perlakuan berpengaruh nyata terhadap peubah yang dianalisis yaitu panjang dan luas nekrosis Analisis lanjut menunjukan bahwa aplikasi FMA, PGPR, dan kombinasinya pada perlakuan inokulasi patogen hanya berbeda pengaruhnya pada panjang nekrosis tetapi tidak pada luas nekrosis....dst
Keyword: Botryodiplodia theobromae, induced resistance, citrus, mycorrhizae, PGPR

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: