Judul: Penggunaan Metode Elisa untuk Mendeteksi Citrus Trlsteza Virus (CTV) pada Pertanaman Jeruk (Citrus spp.) dan Serangga Vektor
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui penyebaran penyakit yang disebabkan oleh virus Tristeza pada pertanaman jeruk di kabupaten Garut melalui kegiatan mengindeksi keberadaan virus tersebut dengan uji serologi ELISA dan untuk melihat tingkat kepekaan ELISA dalam mendeteksi CTV dari kutudaun. Sampel tanaman jeruk berasal dari tiga kecamatan yang berbeda di kabupaten Garut, yaitu kecamatan Bayongbong, Samarang dan Wanaraja. Varietas jeruk yang dipilih adalah tiga varietas utama, yaitu jeruk Licin, Keprok Garut dan Siem dengan tiga kriteria umur tanaman, yaitu tanaman yang belum berproduksi, sudah berproduksi 1-3 kali dan berproduksi lebih dari 3 kali. Kutudaun yang digunakan berasal dari kecamatan Bayongbong, Samarang , BPMT Cisurupan serta hasil perbanyakan di rumah kaca. Hasil penelitian menunjukkan bahwa virus Tristeza telah ditemukan di semua pertanaman jeruk di kabupaten Garut sejak tanaman belum berproduksi. Nilai Absorban ELISA (NAE) virus Tristeza di kecamatan Bayongbong umumnya lebih rendah dibandingkan di kecamatan Samarang dan Wanaraja. Di kecamatan Bayongbong, infeksi CTV pada varietas Licin lebih rendah dibandingkan pada varietas Keprok Garut dan Siem, sedangkan di kecamatan Samarang dan Wanaraja tidak terdapat perbedaan infeksi antar varietas yang berbeda. Deteksi VlruS dari serangga yang dikoleksi dari lapang umumnya menunjukkan hasil yang negatif, kecuali pada serangga yang berasal dari kecamatan Samarang. Deteksi virus dari serangga yang diperbanyak di rumah kaca umumnya menunjukkan hasil negatif, walaupun 1 dari 3 ulangan menunjukkan hasil positif Hal ini menunjukkan bahwa ELISA dapat mendeteksi virus dari serangga vektor dan potensial sebagai alat monitoring penyakit di lapang.
Keyword: 

Judul: Insidensi dan Deteksi Citrus tristeza virus  yang Menginfeksi Tanaman Jeruk di Jawa Barat
Abstrak: Citrus is one of the economically important horticultural commodities in Indonesia, but its national production is still not optimal. Tristeza disease caused by Citrus tristeza virus (genus Closterovirus family Closteroviridae) is an important disease in citrus plants and has the potential to cause significant yield losses. This study was conducted to identify and determine the spread of tristeza disease in several citrus-growing areas in West Java Province. The study began with field surveys to citrus farms in four regencies, i.e. Bogor, Bandung, West Bandung, and Garut. Chlorosis symptoms on the farm were observed to determine disease intensity. Samples were then collected from symptomatic and asymptomatic leaves for serological detection by double antibody sandwich enzyme-linked immunosorbent assay (DAS-ELISA) method. Further confirmation through molecular detection was carried out by one-step reverse transcription polymerase chain reaction (one-step RT-PCR) method using CTV-specific primers, i.e. RBP 23-F/RBP 23-R. Field observations showed the variations in citrus cropping conditions and varieties at each observation site. Specific symptoms of CTV infection found involved vein clearing and chlorotic spot, leaf cupping, vein corking, and chlorosis. Disease intensity in the field was classified as moderate to very severe. DAS-ELISA and RT-PCR detection confirmed the distribution of the virus in citrus growing centers in West Java except at KJ Dayat Farm in Bandung. Nucleotide sequence analysis showed that CTV isolates from West Java consist of four virus variants, namely T68, VT, HA16-5, and T30. Further research is needed to determine the distribution area of each variant in Indonesia., Jeruk merupakan komoditas hortikultura penting secara ekonomi di Indonesia, namun produksi nasional masih belum optimal. Penyakit tristeza yang disebabkan oleh Citrus tristeza virus (genus Closterovirus famili Closteroviridae) merupakan salah satu penyakit penting pada tanaman jeruk dan berpotensi menyebabkan kehilangan hasil yang besar. Penelitian ini dilakukan untuk mengidentifikasi dan mengetahui penyebaran penyakit tristeza di beberapa daerah penanaman jeruk di Provinsi Jawa Barat. Penelitian diawali dengan survei pengambilan sampel tanaman jeruk di empat kabupaten, yaitu Bogor, Bandung, Bandung Barat, dan Garut. Gejala klorosis di lapangan diamati untuk menentukan intensitas penyakit. Sampel kemudian dikumpulkan dari daun yang bergejala dan tidak bergejala untuk deteksi virus secara serologi menggunakan metode double antibody sandwich enzyme-linked immunosorbent assay (DAS-ELISA). Konfirmasi lebih lanjut menggunakan deteksi molekuler dengan metode one-step reverse transcription polymerase chain reaction (one-step RT-PCR) menggunakan primer spesifik CTV, yaitu RBP 23-F/RBP 23-R. Pengamatan di lapangan menunjukkan adanya variasi kondisi pertanaman dan varietas jeruk. Gejala spesifik infeksi CTV menunjukkan vein clearing dan chlorotic spot, leaf cupping, vein corking dan klorosis. Intensitas penyakit di lapangan tergolong sedang hingga sangat berat. Deteksi dengan DAS-ELISA dan RT-PCR menunjukkan terdapat infeksi CTV di seluruh lokasi pengamatan kecuali di Kebun KJ Dayat asal Bandung. Analisis sekuen nukleotida menunjukkan bahwa isolat CTV asal Jawa Barat memiliki empat varian virus yaitu T68, VT, HA16-5, dan T30. Perlu penelitian lebih lanjut untuk mengetahui daerah sebar masing-masing varian di Indonesia.
Keyword: RT-PCR, DAS-ELISA, sequence analysis, specific primers, virus variant, analisis sekuens, primer spesifik, varian virus

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: