Judul: Identifikasi Keragaman Gen Calpastatin (CAST|Alu1) pada sapi Bali, Limousin, dan PO di Pusat Pembibitan menggunakan metode PCR-RFLP.
Abstrak: Sumber daya genetik ternak sapi Indonesia saat ini terdiri dari tiga kelompok yaitu ternak asli, ternak lokal dan ternak impor. Tujuan dari penelitian ini adalah mengidentifikasi polimorfisme gen Calpastatin (CAST) pada bangsa sapi pedaging di Pusat Pembibitan (bali, Limosin, dan PO) dengan metode Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCRRFLP). Sampel yang digunakan 124 ekor sapi yang terdiri dari sapi bali 48 ekor, Limousin 16 ekor, dan PO 60 ekor. Data genotipe di hitung menggunakan frekuensi alel, heteresigositas, dan keseimbangan Hardy-Weinberg. Hasil akhir penelitian ini diperoleh panjang fragmen 624 pb yang terdiri atas 2 alel (T dan C) dan 3 genotipe yaitu TT (474 pb), TC (474 pb dan 324 pb) dan CC (324 pb). Identifikasi keragaman gen CAST|AluI menunjukkan bahwa sapi bali, Limousin, dan PO di pusat pembibitan bersifat polimorfik dengan nilai frekuensi alel total yang tertinggi dimiliki oleh alel T dengan nilai 0.57-0.94 dan alel C dengan nilai 0.06-0.42. Berdasarkan hasil tersebut dapat disimpulkan bahwa gen CAST|Alu1 sapi bali, Limousin, dan PO bersifat polimorfik.
Keyword: Gen CAST, keragaman, PCR-RFLP, sapi, sumber daya genetik

Judul: Identifikasi Keragaman Gen Calpastatin (CAST|Alu1) pada Sapi Bali dengan Metode PCR-RFLP.
Abstrak: Gen CAST merupakan salah satu gen yang berpengaruh pada keempukan daging dan berfungsi sebagai penghambat enzim calpain. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi keragaman gen CAST|Alu1 dengan metode Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism. Sampel DNA sapi bali yang digunakan sebanyak 95 sampel yang terdiri atas 46 betina dan 49 jantan. Identifikasi keragaman gen CAST|Alu1 menggunakan pendekatan Polymerase Chain Reaction- Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP) dengan menggunakan enzim restriksi AluI. Frekuensi alel dan genotipe, nilai heterosigositas pengamatan dan harapan, serta keseimbangan Hardy-Weinberg dianalisis menggunakan program Popgen32. Hasil amplifikasi gen CAST|Alu1 pada sapi bali diperoleh panjang fragmen 624 pb dan 2 alel yang terdiri atas alel T dan C serta 3 genotipe yaitu TT (474 pb), TC (474 pb dan 374 pb), dan CC (374 pb). Hasil genotyping CAST|Alu1 menunjukkan bahwa sapi bali di BPTU-HMT Provinsi bali bersifat polimorfik dengan nilai frekuensi alel tertinggi pada alel T (0.895) dibandingkan dengan alel C (0.105). Frekuensi genotipe pada sapi bali tertinggi terjadi pada genotipe TT (0.811), sedangkan genotipe TC (0.168) dan CC (0.021) rendah. Nilai heterosigositas pada sapi bali sangat rendah yaitu 0.1684 yang menunjukkan rendahnya variasi suatu gen dalam populasi. Berdasarkan hasil tersebut dapat disimpulkan bahwa gen CAST|Alu1 pada sapi bali bersifat polimorfik.
Keyword: gen CAST, PCR-RFLP, polimorfisme, sapi bali

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: