Judul: Analisis Keragaman Komunitas Bakteri pada Lambung Madu Lebah Apis mellifera, Apis cerana, dan Tetragonula laeviceps
Abstrak: Lebah merupakan salah satu polinator tanaman sekaligus agen penghasil madu. Madu tersebut berasal dari nektar yang disimpan dan di proses di dalam lambung madu lebah. Kualitas madu yang dihasilkan oleh lebah dipengaruhi oleh faktor fisik dan kimia serta mikroba yang terdapat pada lambung madu lebah. Bakteri yang sebelumnya telah ditemukan pada lambung madu lebah Apis mellifera, Apis cerana, dan Tetragonula laeviceps adalah bakteri asam laktat (BAL). Penelitian ini bertujuan menganalisis keragaman komunitas bakteri (metagenom bakteri) yang berasal dari lambung madu lebah A. mellifera, A. cerana, dan T. laeviceps dengan menggunakan metode Denaturing Gradient Gel Electrophoresis (DGGE). Penelitian komunitas bakteri yang banyak dilakukan adalah pada saluran pencernaan lebah secara keseluruhan dan masih sedikit penelitian komunitas bakteri di bagian lambung madu lebah. Enam sampel lambung madu yang digunakan berasal dari tiga jenis lebah berbeda yaitu A. mellifera, A. cerana, dan T. laeviceps. Keragaman komunitas bakteri dari sampel lambung madu pada penelitian ini menunjukan perbedaan komposisi komunitas bakteri antara ketiga spesies lebah. Sampel A. cerana nomor satu memiliki kekayaan (jumlah) OTU yang paling banyak yaitu 15 OTU dibandingkan sampel lainnya. Sampel T. laeviceps nomor dua memiliki jumlah persentase OTU dominan yang nilainya paling tinggi yaitu 59.4%. Komunitas bakteri di lambung madu lebah A. mellifera, A. cerana, T. laeviceps menunjukan adanya kesamaan bakteri dari filum Firmicutes, Proteobacteria, Acidobacteri dan Fusobacteria. Filum Actinobacteria dan Bacteroidetes hanya ditemukan pada lambung madu lebah A. cerana.
Keyword: Apis cerana, Apis mellifera, DGGE, komunitas bakteri, lambung madu, Tetragonula laeviceps

Judul: Potensi Bakteri Asam Laktat dari Sarang Lebah Apis dorsata di Kupang sebagai Kandidat Probiotik dan Inhibitor Angiotensin Converting Enzyme.
Abstrak: Kupang memiliki kekayaan alam berupa lebah madu hutan (Apis dorsata) serta iklim yang unik (savana tropis). Sarang lebah madu hutan berukuran besar dan tergantung di atas pohon pada ketinggian 10 m atau lebih dari permukaan tanah. Sumber makanan lebah madu hutan yaitu nektar dan polen. Lebah madu hutan mengumpulkan nektar dan polen dari bunga dan disimpan di sarangnya. Sarang lebah madu hutan diketahui mengandung bakteri asam laktat. Bakteri asam laktat juga terkandung pada bunga. Bakteri asam laktat (BAL) dikenal sebagai probiotik dan beberapa galur bakteri asam laktat mampu menghasilkan inhibitor angiotensin converting enzyme (ACE) dan α-glukosidase. Keragaman dan potensi bakteri asam laktat yang berasal dari sarang lebah madu hutan dan bunga di Kupang sebagai kandidat probiotik penghasil inhibitor ACE dan α-glukosidase perlu diteliti. Tujuan penelitian ini untuk memperoleh data keragaman bakteri asam laktat dari sarang lebah madu hutan dan bunga di Kupang, membuktikan terdapatnya korelasi antara bakteri asam laktat dari sarang lebah madu hutan dan bakteri asam laktat dari bunga, serta memperoleh isolat bakteri asam laktat yang dapat digunakan sebagai kandidat probiotik penghasil inhibitor ACE dan α-glukosidase. Keragaman bakteri asam laktat diteliti dengan metode Denaturing Gradient Gel Electrophoresis (DGGE). Bakteri asam laktat diisolasi dari sarang lebah madu hutan menggunakan media padat Mann, Rogosa, dan Sharpe (MRS) yang diberi penambahan 1% CaCO3. Isolat yang membentuk zona bening pada media padat MRS yang diberi penambahan 1% CaCO3 dikarakterisasi dengan pewarnaan Gram dan uji katalase. Isolat Gram-positif dan katalase negatif dinyatakan sebagai bakteri asam laktat. Isolat BAL dievaluasi sifat probiotiknya termasuk ketahanan terhadap empedu dan pH rendah, aktivitas antibakteri melawan bakteri patogen pada usus manusia, sensitivitas terhadap antibiotik, kemampuan membentuk agregasi, auto-agregasi, ko-agregasi, dan sifat hidrofobisitasnya. Isolat bakteri asam laktat yang memenuhi persyaratan probiotik dievaluasi lebih lanjut kemampuannya dalam menghambat aktivitas ACE dan α-glucosidase. Profil DGGE menunjukkan keragaman bakteri asam laktat pada sarang lebah madu hutan lebih tinggi dari keragaman bakteri asam laktat pada bunga. Bakteri asam laktat dari sarang lebah madu hutan berkorelasi dengan bakteri asam laktat dari bunga. Jenis-jenis OTU (Operational Taxonomy Unit) yang ditemukan pada sarang lebah madu hutan dan bunga berkerabat dekat dengan Lactococcus lactis dan Lactobacillus kunkeei. Isolat BAL yang diperoleh melalui metode pengkulturan pada media padat MRS sebanyak 203 isolat, 81 dari 203 isolat tersebut dinyatakan sebagai isolat bakteri asam laktat. Tiga isolat (MA15, MC1, MC7) lebih tahan terhadap garam empedu 0.3% dan pH rendah dibandingkan dengan isolat lainnya, sehingga ketiga isolat tersebut dipilih untuk dievaluasi lebih lanjut sebagai probiotik. Ketiga isolat terpilih sensitif terhadap antibiotik Amoxicillin dan Thiamphenicol serta memiliki aktivitas antibakteri melawan bakteri patogen usus manusia. Isolat MA15, MC1 dan MC7 memiliki kemampuan untuk membentuk agregasi, auto-agregasi, dan ko-agregasi dengan S. thypimurium dan S. aureus. Isolat MA15 juga dapat membentuk ko-agregasi dengan E. coli. Tiga isolat terpilih bersifat hidrofilik. Isolat MA15 dan MC1 berkerabat dekat dengan Enterococcus faecium yang diketahui merupakan patogen bagi manusia, kedua isolat ini belum dapat direkomendasikan sebagai kandidat probiotik. Isolat MC7 berkerabat dekat dengan L. rhamnosus yang dikenal aman bagi kesehatan manusia, isolat ini dapat direkomendasikan sebagai kandidat probiotik. Isolat MC7 termasuk kedalam spesies yang sama dengan isolat kontrol (L. rhamnosus R23) tetapi
Keyword: angiotensin converting enzyme, Apis dorsata, bakteri asam laktat, probiotik, sarang lebah

Judul: Thermal Characteristics and Dynamics of Tropical Cyclone over Western North Pacific Ocean: A Case Study of Typhoon Songda (Chedeng) 2011
Abstrak: The frequent occasion of Tropical Cyclone (TC) over Western North Pacific (WNP) Ocean lies from 10˚N to 26˚N and 121˚E to 170˚E. Sources of TC development come from warm ocean temperature where latent heat is released during condensation processes and subsequently concentrated in the boundary layer. Relative humidity at 850-700 hPa is responsible to produce the most intense storm. Meanwhile, weak vertical wind shear between 850-200 hPa is one of the dynamical factors that lead to the development of TC. Pressure level of 850-200 hPa is chosen to minimize the thermodynamic effect in the lower troposphere. Typhoon Songda (Chedeng in the Philippines) or TSC lasted from May 18th to 30th, 2011 and strengthened into powerful Super Typhoon stage between May 24th and 27th. Long curving track and the exhibition of all sequences of TC life cycle, TSC is then considered as an ideal case of TC. The objective of the study with case of TSC is to investigate the role of thermal characteristics and dynamics on TC intensity. The research is carried out by using Advanced Research of Weather Research and Forecasting model (WRF ARW model) version 3.3. Two domains are employed in the model. The first domain situate from 02˚N to 40˚N and 118˚E to 149˚E and cover spatial resolution () of 33.1 km. The second domain situate from 09˚N to 27˚N and 119˚E to 132˚E with of 11 km. Timestep of the model () is 120 seconds. The model is supported by the following physical parameterization, i.e., Yonsei University Scheme (YSU) in the boundary layer, Kain-Fritsch scheme (KF) in the cumulus, and WRF Single-Moment 3-class scheme in the microphysics. Initial meteorological condition prior to the formation of the cyclone is generated using WRF ARW standard-release model. Sensitivity of the model output is obtained from a selected single-parameter change scenarios, namely, 10 % to 20 % decrease and increase of wind shear initial data at 850-200 hPa, and by 10 % to 20 % decrease of relative humidity initial data at 850-700 hPa. The result showed that the negative correlations between wind shear and intensity are found in wind shear scenarios. Wind shears of 10 ms-1 which lead to strengthening of the wind intensity in the early period of Typhoon development are found in wind shear scenarios. The effect of wind shear changes on wind intensity is statistically significant in the 20 % wind shear scenarios. During mature stage, weak wind intensity occurred when wind shear increase as given in the WRF standard-release and the 20 % decreasing scenario. Different situation is found in the 20 % increasing scenario where wind shear tend to weak and lead to strong wind intensity at this stage. Meanwhile, the reduction of moisture supply at 850-700 hPa resulting from 20 % decreasing relative humidity play a major role in the weakening of wind intensity and reduces mechanical energy of the cycle process as much as 300 J kg-1.
Keyword: