Judul: Identifikasi Forma Specialis Fusarium oxysporum Asal Bibit Kelapa Sawit dan Seleksi Agens Biokontrol
Abstrak: Penyakit layu fusarium pada tanaman kelapa sawit yang disebabkan oleh F. oysporum f.sp. elaeidis (Foe) merupakan salah satu penyakit penting pada kelapa sawit di berbagai negara produsen kelapa sawit. Di Indonesia, Foe termasuk Organisme Pengganggu Tanaman Karantina Golongan A1 (OPT KA1) atau belum pernah dilaporkan ada di Indonesia. Hasil penelitian terbaru menunjukkan Fusarium spp. berasosiasi dengan berbagai gejala pada kelapa sawit, salah satunya F. oxysporum. Meskipun belum ada laporan yang relevan tentang kehilangan hasil kelapa sawit yang disebabkan oleh penyakit fusarium, eksplorasi agens biokontrol sebagai upaya mencari pengendalian berbasis biokontrol untuk mengantisipasi adanya introduksi patogen tersebut. Penelitian ini bertujuan mengetahui forma specialis F. oxysporum asal bibit kelapa sawit berdasarkan karakter morfologi dan teknik molekuler, serta memperoleh cendawan agens biokontrol yang efektif dalam mengendalikan F. oxysporum pada bibit kelapa sawit in vitro dan in planta. Identifikasi morfologi tiga isolat cendawan F. oxysporum dilakukan pada media PDA dan BLA, identifikasi karakter molekuler dengan teknik PCR dan sikuensing menggunakan primer EF 1 5' -A TGGGT AAGGA(A/G) GACAAGAC-3’ dan EF 2 reverse 5'GGA(G/A)GTACCAGT(G/C)ATCATGTT- 3'. Pengujian cendawan rizosfer calon agens biokontrol dilakukan dengan uji patogenisitas pada tiga benih uji (kacang tanah, mentimun dan cabai). Cendawan yang dinyatakan berpotensi sebagai agens biokontrol selanjutnya diuji kemampuan antagonisme untuk mengetahui potensi dan mekanisme biokontrolnya. Isolat cendawan rizosfer yang berpotensi sebagai agens biokontrol dan empat isolat agens biokontrol koleksi Lab. Mikologi, IPB diidentifikasi berdasarkan karakter morfologi pada media PDA dan WA. Uji antagonisme agens biokontrol dilakukan dengan uji kultur ganda dan pembentukan senyawa volatil in vitro. Pengujian keefektifan tujuh agens biokontrol terhadap tiga isolat F. oxysporum patogenik pada kelapa sawit dilakukan di rumah kaca kebun percobaan Cikabayan, IPB. Berdasarkan karakter morfologi ketiga isolat cendawan patogen diidentifikasi sebagai F. oxysporum. Hasil analisis kekerabatan melalui konstruksi pohon filogenetik menunjukkan F. oxysporum isolat Cikabayan B memiliki kedekatan dengan F. oxysporum f.sp. elaeidis NRLL 22543 asal Suriname. Sementara F. oxysporum isolat Cikabayan A dan isolat Papua tidak berkerabat dekat dengan F. oxysporum f.sp. elaeidis NRLL 22543 asal Suriname, akan tetapi tetap menjadi satu clade monofilotik dengan F. oxysporum f.sp. elaeidis NRLL 22543 asal Suriname. Ketiga isolat F. oxysporum asal bibit kelapa sawit juga memiliki homologi yang tinggi dengan F. oxysporum f.sp. elaeidis NRLL 22543 asal Suriname kecuali isolat Papua. Analisis pairwise distance dengan F. oxysporum f.sp. elaeidis NRLL 22543 asal Suriname menunjukkan bahwa F. oxysporum isolat Cikabayan B, Cikabayan A, dan Papua memiliki jarak genetik 2 yang bervariasi, berturut-turut adalah 0.004, 0.006, dan 0.042. Inokulasi buatan ketiga isolat F. oxysporum pada bibit kelapa sawit in planta menunjukkan bahwa ketiga isolat tersebut bersifat patogenik terhadap bibit kelapa sawit. Hasil uji patogenisitas beberapa cendawan rizosfer di peroleh tiga isolat cendawan rizosfer yang berpotensi sebagai agens biokontrol dan empat isolat agens biokontrol koleksi Laboratorium Mikologi Tumbuhan. Berdasarkan hasil identifikasi morfologi tujuh isolat agens biokontrol, empat isolat termasuk dalam genus Trichoderma, yaitu T. harzianum isolat Gadingrejo 1, T. harzianum isolat Gadingrejo 2, dan T. harzianum isolat Jambi; T. virens isolat Jambi; dan T. inhamatum isolat Jambi, sedangkan dua isolat lainya adalah Gliocladium fimbriatum isolat KLMT 1 dan G. fimbriatum isolat KLMT 2. Hasil uji antagonisme menujukkan tujuh isolat agens
Keyword: Fusarium oxysporum f.sp. nekrotik akar, elaeidis, translation elongation factor -1α, senyawa volatil, Trichoderma inhamatum

Judul: Isolasi, Karakterisasi, dan Identifikasi Bakteri Kitinolitik sebagai Agens Biokontrol Cendawan Colletotrichum capsici dan Fusarium oxysporum
Abstrak: Colletotrichum capsici dan Fusarium oxysporum merupakan cendawan patogen yang menyebabkan penyakit pada tanaman cabai (Capsicum annum L) serta dapat menurunkan produktivitas cabai. Cendawan C.capsici menyerang tanaman cabai dari anakan hingga masa penyimpanan buah cabai, sedangkan F. oxysporum menyebakan penyakit layu fusarium. Penggunakan fungisida memerlukan harga yang tinggi dan memberikan dampak terhadap lingkungan. Serangan cendawan dapat dikendalikan dengan memanfaatkan bakteri penghasil kitinase yang merupakan enzim yang mampu merusak dinding sel cendawan yang tersusun dari senyawa kitin. Tujuan penelitian ini adalah untuk memperoleh bakteri penghasil kitinase sebagai pengendali hayati C.capsici dan F.oxysporum. Metode yang digunakan dalam penelitian ini antara lain: isolasi bakteri kitinase, karakterisasi bakteri kitinase, pengukuran aktivitas enzim, antagonis bakteri dengan cendawan patogen, pengamatan kerusakan hifa cendawan, dan identifikasi 16S rRNA. Isolat BAE36 dan BAD211 adalah bakteri penghasil kitinase yang diperoleh dari rizosfer tanaman cabai di Sagarahiyang, Kabupaten Kuningan, Provinsi Jawa Barat. Kedua isolat termasuk Gram-negatif. Persentase daya hambat BAE36 adalah 66.1% pada C. capsici dan 55% di F. oxysporum. Pengamatan hifa pada uji antagonis menggunakan mikroskop terlihat hifa C. capsici menebal dan permukaan hifa bergelombang sedangkan hifa F. oxysporum tipis dan kosong. Identifikasi dengan 16S rRNA menunjukkan bahwa isolat BAE36 dan BAD211 memiliki kesamaan 99% dengan Lysobacter enzymogenes. Pengendapan enzim L. enzymogenes BAE36 dengan kadar amonium sulfat 30% dapat meningkatkan aktivitas enzim dan lebih mampu menghambat pertumbuhan miselia cendawan C. capsici dan F. oxysporum.
Keyword: cabai merah, gram negatif, kitinolitik, Lysobacter

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: