Judul: Computational Study of Benzene and Nitrobenzene Nitration Mechanism: Computational Video Tutorials Preparations for Physical Organic Chemistry
Abstrak: Perhitungan kimia komputasi melalui metode Nudged Elastic Band (NEB) dapat dimanfaatkan untuk meningkatkan kegiatan belajar mengajar (KBM) dalam mempelajari suatu mekanisme reaksi organik. Akan tetapi, perhitungan semacam ini masih sulit diterapkan ke dalam KBM karena memiliki beban komputasi yang tinggi untuk menghasilkan akurasi yang baik. NEB menggunakan suatu level perhitungan untuk mengkalkulasi struktur dan sifat dari senyawa yang terlibat dalam reaksi sehingga tinggi rendahnya akurasi dan beban komputasi sangat bergantung pada hal tersebut. Penelitian ini mencari level perhitungan yang akurat dan efisien dari segi waktu untuk menjelaskan mekanisme reaksi nitrasi benzena dan nitrobenzena secara komputasi dengan menggunakan metode NEB dalam pembuatan video tutorial dan membuat video tutorial yang memvisualkan langkahlangkah kerja sebagai bahan ajar. Dari tiga level perhitungan yang diujikan (HF-3c, PBEh-3c, B3LYP-D3), PBEh-3c berhasil menghasilkan geometri struktur yang akurat dengan waktu yang cukup rendah, yaitu 1 jam 30 menit. Akan tetapi, level ini masih belum efisien karena akurasi energi yang buruk. Walaupun belum efisien, alur diagram energi nitrasi benzena pada level PBEh-3c cukup mirip dengan level M06-2x yang lebih akurat dalam nitrasi. Oleh sebab itu, level ini masih dapat digunakan sebagai media pembelajaran pada KBM berupa video tutorial., Computational chemistry calculations via Nudged Elastic Band (NEB) method can improve teaching and learning activities (KBM) in studying an organic reaction mechanism. However, this kind of calculation is still difficult to be applied to KBM because it has a high computational load to produce good accuracy. NEB uses a calculation level to calculate the structure and properties of compounds involved in the reaction, so the accuracy and computational load depend highly on it. This research is looking for an accurate and time-efficient calculation level to explain the mechanism of the nitration reaction of benzene and nitrobenzene computationally using the NEB method in preparing video tutorials and tutorial videos that visualize the work steps as teaching materials in KBM. From the three calculation levels tested (HF-3c, PBEh-3c, B3LYP-D3), PBEh-3c managed to get an accurate structural geometry with an adequately low time, which is 1 hour 30 minutes. However, this level still is not efficient due to poor energy accuracy. Although it is inefficient, the flow from the energy diagram of benzene nitration at the PBEh-3c level is quite similar to the M06-2x level, which is more accurate in nitration. Therefore, this level can still be used as a learning medium in KBM as a tutorial video.
Keyword: kimia komputasi, mekanisme reaksi, NEB, nitrasi

Judul: Studi Komputasi pada Carbon Dots Terfungsionalisasi Gugus Amina untuk Pengindraan Hidrogen Peroksida
Abstrak: Dalam penelitian ini, penginderaan hidrogen peroksida (H2O2) diselidiki pada carbon dots yang terfungsionalisasi gugus amina (NH2-Cdots) pada tiga posisi -NH2 yang berbeda, dan atom N berperan sebagai situs aktif menggunakan pendekatan komputasi kuantum. B3LYP dan 6-31G (d,p) sebagai metode fungsional dan basis set yang digunakan dalam teori fungsional kerapatan (TFK) untuk perhitungan keadaan dasar. Sedangkan, CAM-B3LYP dan basis set yang sama digunakan dalam teori fungsional kerapatan-dependen waktu (TFK-DW) untuk perhitungan keadaan tereksitasi. Struktur teroptimasi menunjukkan bahwa H2O2 diadsorpsi secara kimia pada 1-sim lebih baik dibandingkan dengan 2-sim dan 3-sim melalui interaksi ikatan hidrogen C–N⋯H dengan energi adsorpsi -10,61 kcal/mol. Distribusi muatan atom Mulliken dan potensial elektrostatik keduanya digunakan untuk menentukan reaktivitas molekul pada tingkat atom. Orbital molekul Frontier digunakan untuk memahami mekanisme transfer elektron. Selain itu, energi interaksi ikatan hydrogen dan juga klasifikasi tipe interaksinya pada 1-com adalah -6,8067 kcal/mol dan dikategorikan sebagai interaksi ikatan hidrogen. Pada Analisa TFK-DW, spektrum absorpsi UV-Vis dan panjang transfer muatan untuk memahami mekanisme penginderaan H2O2 dalam keadaan tereksitasi pada semua struktur adalah hipokromik dan photo-induced charge difference. Semua analisis menunjukkan 1-sim lebih menguntungkan berinteraksi dengan H2O2 daripada 2-sim dan 3-sim; dan, diyakini bahwa NH2-Cdots mungkin menjadi kandidat potensial untuk merasakan keberadaan H2O2 pada aplikasi kemosensor., In this study, hydrogen peroxide (H2O2) sensing investigated on amine groupfunctionalized carbon dots (NH2-Cdots) at three different -NH2 positions, and the N atom is role-playing as an active site using a quantum computational approach. B3LYP and 6-31G (d,p) as functional methods and basis sets used in density functional theory (DFT) for ground state calculations. Meanwhile, CAM-B3LYP and the same base set were used in the time-dependent density functional theory (TD-DFT) for excited state calculations. The optimized structure showed that H2O2 was chemically adsorbed on 1-sim better than 2-sim and 3-sim through the interaction of C–N⋯H hydrogen bonds with adsorption energy of -10.61 kcal/mol. Mulliken atomic charge distribution and electrostatic potential are both used to determine reactivity molecules at the atomic level. Frontier molecular orbitals are used to understand electron transfer mechanisms. In addition, the hydrogen bond interaction energy and also the classification of the interaction type at 1-com is - 6.8067 kcal/mol and is categorized as a hydrogen bond interaction. In TD-DFT analysis, UV-Vis absorption spectrum and charge transfer length to understand the sensing mechanism of H2O2 in an excited state in all structures are hypochromic and photo-induced charge difference. All analysis shows 1-sim more favorable interacted with H2O2 than 2-sim and 3-sim; and, it is believed that NH2-Cdots may be a potential candidate for sensing the presence of H2O2 to chemosensor applications.
Keyword: carbon dots, gugus amina, hidrogen peroksida, teori fungsional kerapatan, teori fungsional kerapatan-dependen waktu

Judul: Penyakit ORF pada kambing dan domba serta permasalahannya di Indonesia
Abstrak: Penyakit ORF adalah penyakit menular yang disebabkan oleh virus famili Pox viridae, dalam genus Parapox yang mempunyai afinitas khusus hanya pada sel atau jaringan epithel pada kambing, domba, sapi, kuda, babi, tupai, anjing, marmut, kelinci, musang, dan kijang. Hewan yang sangat rentan terhadap penyakit ini hanya pada kambing dan domba. Virus mempunyai susunan yang sangat kompleks, berinti DNA dan berserabut ganda (double stranded) serta mempunyai coat dan envelope di lapisan luarnya. Penularan melalui kontak dengan hewan penderita teru tama pada bagian kulit yang tidak di tumbuhi bulu, tanah, padangan, makanan yang tercemar dan kontak kelamin. Sering menyerang anak kambing dan domba dengan gejala klinis berupa erythema, papula, vericle, pustula. Bagian tubuh yang sering terkena antara lain, bibir, mulut, hidung cornea, pangkal ekor, vulva, anus dan ambing. Secara pathologi anatomi menunjukkan ulkus-ulkus pada selaput lendir mulut, lidah, gusi, pallatum, pharing, rumen omasum, dan mastitis. Keropeng dapat terjadi pada kulit sekitar bibir, hidung, mata, mulut, interdigitalis, ekor, alat genital (scrotum, vulva, ambing), anus dan bagian tubuh yang jarang ditumbuhi oleh bulu. Kulit yang mengalami proliferasi membentuk kutil yang kemudian terjadi keratinisasi membentuk semacam kudis dan keropeng. Bila terjadi infeksi sekunder jantung memperlihatkan bercak-bercak haemorragi, timbunan cairan peritonial, pneumoni bersifat haemorragi dan nekrotik pada lobus epicalis, tracheitis, haemorragi pada capsula dan cortex ginjal, limpa membengkak adanya pembendungan, degenerasi hati berwarna merah kekuningan, haemorragi kelenjar mamae dan traktus digestifus mengalami peradangan. ...
Keyword: