Judul: Analisis Komunitas dan Fungsi Bakteri Rhizosfer Tanaman Padi pada Gradien Salinitas Tanah Pesisir
Abstrak: Salinitas merupakan salah satu cekaman abiotik yang mempengaruhi pertumbuhan dan produktivitas tanaman padi, terutama pada lahan-lahan sawah di daerah pesisir. Cekaman garam menyebabkan ketidakseimbangan ionik dan osmotik di dalam sel tanaman. Berbagai mikrob diketahui berasosiasi dengan rhizosfer tanaman padi dan beberapa diantaranya bermanfaat bagi tanaman. Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui informasi keragaman dan kelimpahan struktur komunitas, serta karakter fungsional bakteri rhizosfer tanaman padi yang ditanam di tanah pesisir dengan tiga taraf salinitas yang berbeda dari taraf sangat rendah hingga taraf moderat. Sampel tanah diambil dari dua jenis tanah yang berbeda dari dua lokasi di Jawa Barat, yaitu tanah marin dari Subang dan fluviomarin dari Indramayu. Populasi dan struktur komunitas bakteri rhizosfer dianalisis pada saat tanaman padi memasuki fase primordia dan pembungaan dengan metode kultur (culture-dependent) dan metode nonkultur (culture independent). Total populasi bakteri rhizosfer berada di kisaran 104-106 CFU / g tanah, dan secara statistik total populasi pada tanah salin moderat tidak berbeda secara signifikan dibandingkan dengan tanah salin rendah dan sangat rendah. Keragaman jenis bakteri rhizosfer dari tanah salin moderat lebih rendah daripada tanah salin rendah dan sangat rendah. Genus Bacillus (filum Firmicutes) ditemukan pada berbagai taraf salinitas tanah baik moderat, rendah, dan sangat rendah, seperti B. subtilis complex. Sekelompok bakteri dari filum Proteobacteria dan Actinobacteria juga diperoleh selain filum Firmicutes pada metode kultur. Analisis pustaka klon menunjukkan adanya lebih banyak filum (11 filum) yang diperoleh dari beragam bakteri rhizosfer tanaman padi pada tanah pesisir Subang dan Indramayu pada fase primordia antara lain Proteobacteria, Acidobacteria, Chloroflexi, Cyanobacteria, Nitrospirae, Gemmatimonadetes, Bacteriodetes, Aquificae, Actinobacteria, Firmicutes, dan Elusimicrobia dibandingkan metode kultur. Firmicutes mendominasi struktur komunitas bakteri rhizosfer tanaman padi pada metode kultur, sedangkan dengan metode nonkultur diketahui Proteobacteria dan Acidobacteria lebih dominan. Metode nonkultur juga memberikan informasi yang jelas adanya sejumlah bakteri dari laut yang terbawa arus intrusi (bakteri transient) sehingga berada bersama-sama dengan bakteri indigenos pada tanah sawah pesisir. Ada kecenderungan bahwa salinitas tanah memiliki efek negatif pada kelimpahan Betaproteobacteria dan efek positif pada kelimpahan Alphaproteobacteria dan Deltaproteobacteria. Hal ini menyebabkan nilai indeks keragaman spesies yang cukup tinggi pada tanah dengan taraf salinitas moderat, dan tidak berbeda secara nyata antara ketiga taraf salinitas, baik dengan metode kultur dan metode nonkultur. Isolat-isolat bakteri rhizosfer yang diperoleh pada metode kultur diketahui memiliki karakter fungsional sebagai penambat N2, pelarut fosfat, pendegradasi selulosa, dan penghasil IAA. Hal ini menunjukkan bahwa pada spesies yang sama yang dapat diperoleh dari lokasi geografis yang berbeda memiliki beragam genotipe meskipun sekuen gen 16S rRNA nya hampir identik, sehingga berakibat pada lebih tingginya keragaman bakteri rhizosfer secara substansial (karakter fungsional). Peningkatan salinitas tanah menyebabkan penurunan pada parameter pertumbuhan tanaman (tinggi tanaman, jumlah anakan efektif, bobot kering tajuk, dan bobot kering akar) pada fase primordia dan fase pembungaan, demikian juga dengan parameter komponen hasil panen (jumlah malai, panjang malai, biji isi per malai, bobot total biji per tanaman, dan bobot kering bulir padi).
Keyword: salinitas, bakteri rhizosfer, tanah pesisir, padi

Judul: Induksi Toleransi Sistemik terhadap Cekaman Salinitas oleh Bakteri asal Tumbuhan Pesisir Jawa pada Tanaman Padi
Abstrak: Salinitas tanah telah banyak dilaporkan menjadi salah satu faktor yang menyebabkan penurunan produktivitas tanaman pertanian di berbagai negara, termasuk di Indonesia. Salah satu alternatif teknologi untuk mengatasi cekaman salinitas tanah adalah dengan memanfaatkan mikrob berguna dalam praktek budidaya pertanian. Beberapa penelitian sebelumnya menunjukkan bahwa tanaman dapat beradaptasi di lingkungan yang tercekam secara abiotik maupun biotik karena tanaman tersebut bersimbiosis dengan mikrob. Pesisir Jawa dengan kondisi salinitas tanahnya yang tinggi merupakan habitat alami tumbuhan yang telah teradaptasi memiliki potensi yang besar untuk diperolehnya bakteri toleran salin yang dapat menginduksi sifat toleransi tanaman padi terhadap cekaman salinitas. Tujuan penelitian adalah untuk mendapatkan bakteri toleran salin asal tumbuhan pesisir Jawa yang dapat menginduksi sifat toleransi tanaman padi terhadap cekaman salinitas dan mengkarakterisasi mekanisme induksi toleransi salinitas sistemik oleh bakteri toleran salin pada tanaman padi. Sebanyak 1358 isolat bakteri toleran salin diperoleh dari 218 tumbuhan pesisir Jawa. Setelah melalui pengujian hemolisis, reaksi hipersensitif dan uji daya kecambah padi diperoleh sebanyak (7.95%) 108 isolat bakteri rizoplan, (6.41%) 87 isolat bakteri endofit akar dan (2.58%) 35 isolat bakteri endofit daun dapat meningkatkan pertumbuhan tanaman padi. Hasil karakterisasi fisiologi 33 isolat terseleksi menunjukkan sebanyak 32 isolat mendegradasi pektin, sebanyak 26 isolat mampu menghasilkan hormon indole acetic acid (IAA), 18 isolat merupakan pelarut fosfat, 15 isolat menghasilkan enzim 1aminocyclopropane-1-carboxylic acid (ACC) deaminase, 3 isolat menghasilkan eksopolisakarida, 5 isolat memfiksasi N2, 27 isolat proteolitik, 24 isolat amilolitik, 15 isolat kitinolitik, 11 isolat menghasilkan hidrogene cyanide (HCN) dan 29 isolat menghasilkan NH3. Pengujian inokulasi dengan metode perlakuan benih terhadap benih padi, jagung dan kedelai yang diinokulasi dengan 15 isolat bakteri terseleksi menunjukkan bahwa isolat E194-3, D183-4 dan isolat E101-1 memiliki tingkat kolonisasi terbaik berturut-turut pada kecambah padi, jagung dan kedelai pada media perkecambahan tanpa NaCl maupun pada media dengan 100 mM NaCl. Sebagian besar isolat menunjukkan tingkat kolonisasi yang tinggi pada daerah rizoplan dibandingkan bagian tanaman lainnya. Hasil penelitian juga menunjukkan bahwa tingkat konisasi isolat bakteri yang diamati bervariasi antar isolat, spesies tanaman, bagian organ tanaman dan konsentrasi NaCl. Pengujian secara gnotobiotik terhadap 12 isolat bakteri terseleksi pada 3 varietas padi yaitu Ciherang, IF8 dan Situbagendit dengan perlakuan NaCl 0,50, 100, 150 dan 200 mM menunjukkan bahwa isolat E194-3 untuk bakteri endofit akar, isolat D150 untuk bakteri endofit daun, dan isolat R146-6 untuk bakteri rizoplan memberikan pengaruh terbaik terhadap pertumbuhan kecambah padi untuk ketiga varietas pada semua perlakuan NaCl adalah. Isolat E194-3 secara nyata meningkatkan rata-rata panjang akar, panjang tajuk, bobot basah dan bobot kering kecambah padi dari ketiga varietas berturut-turut sebesar 21%, 39%, 62% and 49% pada perlakuan NaCl 200 mM dibandingkan kontrol. Hasil seleksi di rumah kaca menggunakan media tanah terhadap 9 isolat bakteri terpilih (D150, E194-3, R146-6, R188-2, E203-1, D205-1, R55-11, E196-1 dan D183-4) yang diinokulasikan pada 2 varietas padi yaitu Ciherang dan IF8 dengan perlakuan NaCl 0, 25, 50, 100, 75, 150 dan 200 mM menunjukkan bahwa tanaman kontrol pada perlakuan NaCl di atas 75 mM mati setelah tanaman berumur 30 HST baik pada varietas Ciherang maupun varietas IF8. Pada tanaman yang diinokulasi dengan isolat bakteri menunjukkan sebanyak 40-100% tanaman hidup pada perlakuan NaCl 0-100 mM, sebanyak 6.7-6.7-
Keyword: endofit, inokulasi, isolasi, kolonisasi, rizoplan

Judul: Closed Knight’s Tour pada Papan Catur Berbentuk Persegi Panjang dengan Ukuran Maksimal 8 × 8
Abstrak: Closed Knight’s Tour merupakan langkah kuda yang mengunjungi setiap kotak pada papan catur tepat satu kali dengan langkah kuda berawal dan berakhir pada kotak yang sama. Graf yang terbentuk dari closed knight’s tour dinotasikan sebagai graf G(m,n), dengan m adalah banyaknya baris dan n adalah banyaknya kolom. Graf tersebut memuat Hamiltonian cycle. Sebuah graf terhubung G adalah graf bipartite jika dan hanya jika graf tersebut tidak memiliki cycle dengan panjang ganjil. Papan catur yang memenuhi syarat cukup untuk memiliki closed knight’s tour adalah papan catur berukuran 5 × 6, 5 × 8, 6 × 6, 6 × 7, 6 × 8, 7 × 8, dan 8 × 8.
Keyword: bipartite, closed knight’s tour, hamiltonian cycle, knight’s tour, teori graf