Judul: Identification, pathogenicity of bacteria and the use of gene 16SrRNA for ice-ice detection on seaweed aquaculture (Kappaphycus alvarezii)
Abstrak: Penyakit ice-ice menyerang sentra budidaya di beberapa negara produsen rumput laut seperti di Filipina, Malaysia dan Tanzania, yang berakibat penurunan produksi rumput laut hingga 70-100%. Gejala penyakit ice-ice umumnya ditandai dengan pemutihan di pangkal thallus, tengah dan ujung thallus muda, yang dahului perubahan warna thallus menjadi putih bening atau transparan. Pengelolaan budidaya rumput laut yang sehat dan bebas penyakit ice-ice merupakan komponen penting dalam peningkatan produksi rumput laut, sehingga diperlukan teknik deteksi penyakit ice-ice secara cepat dan akurat. Selama ini identifikasi dan deteksi bakteri patogen dilakukan berdasarkan pengamatan gejala klinis, riwayat kejadian penyakit di lokasi budidaya, karakteristik morfologi, fisiologi dan biokimia bakteri. Metode tersebut memiliki peran yang cukup penting sebagai studi awal, namun kurang dapat menentukan hubungan filogenetis bakteri dan ekspresinya sangat dipengaruhi oleh faktor lingkungan. Seiring dengan perkembangan teknologi dalam bidang kesehatan ikan, berbagai teknik identifikasi dan deteksi telah dikembangkan, namun kajian tentang penyakit ice-ice pada budidaya rumput laut belum mendapat perhatian yang serius sehingga kuantitas dan kualitas produksi rumput laut fluktuatif. Metode deteksi yang banyak dikembangkan saat ini adalah metode deteksi secara molekuler melalui analisis DNA genom yang berbasis teknik PCR. Pemanfaatan gen 16S-rRNA telah digunakan sebagai parameter sistematik sebagai penanda untuk identifikasi spesies bakteri. Oleh karena itu, beberapa tahap penelitian telah dilakukan, mengenai isolasi, identifikasi bakteri patogen yang menyebabkan penyakit ice-ice, mekanisme patogenisitas bakteri patogen penyebab penyakit ice-ice dan pemanfaatan sekuen gen 16S-rRNA untuk mendisain primer spesifik PCR dalam deteksi cepat dan akurat.
Keyword: Bakteri Patogen

Judul: Karakterisasi Cairan Fermentasi Daun Mangrove Avicennia marina dan Pemanfaatannya untuk Pengendalian Bakteri Penyebab Penyakit Ice-Ice pada Rumput Laut Kappaphycus alvarezii
Abstrak: Budidaya rumput laut dihadapkan pada permasalahan besar, yaitu serangan penyakit ice-ice yang disebabkan oleh faktor abiotik (suhu, salinitas, intensitas cahaya, dan nutrien) dan biotik (jamur dan bakteri). Faktor abiotik menyebabkan abnormal pada rumput laut yang selanjutnya diikuti dengan infeksi bakteri patogen, salah satunya adalah bakteri Stenotrophomonas maltophilia yang memiliki patogenisitas kuat. Kajian dan pengendalian penyakit ice-ice termasuk uji daya tahan rumput laut telah dilakukan, namun hasilnya belum maksimal. Salah satu strategi alternatif yang dapat dilakukan untuk pengendalian penyakit ice-ice adalah dengan penggunaan cairan fermentasi daun mangrove Avicennia marina yang memiliki kandungan metabolit sekunder dan bakteri endofit yang dapat menghambat pertumbuhan bakteri patogen. Fermentasi dilakukan bertujuan untuk menghilangkan atau mengurangi zat antinutrisi, menurunkan toksin, meningkatkan kandungan metabolit, dan mempertahankan bakteri potensial. Bakteri endofit merupakan bakteri yang seluruh atau sebagian siklus hidupnya berada dalam jaringan, berasosiasi, dan tanpa menimbulkan gejala penyakit pada inang. Interaksi antara inang dengan bakteri endofit bersifat simbiosis mutualisme, bakteri endofit mendapatkan tempat hidup dan nutrien untuk bertahan hidup, sedangkan inang mendapatkan manfaat dengan adanya kontribusi metabolit dari bakteri yang dapat membantu pertumbuhan dan ketahanan inang dari serangan patogen. Bakteri endofit mampu memproduksi senyawa antibakteri berupa asam laktat dan bakteriosin yang dapat menghambat pertumbuhan bakteri patogen dan memicu sistem pertahanan tubuh inang. Tujuan umum penelitian ini adalah mengendalikan penyakit ice-ice yang menginfeksi rumput laut Kappaphycus alvarezii melalui penggunaan cairan fermentasi daun mangrove A. marina. Penelitian ini dilakukan dalam tiga tahap, yaitu tahap pertama isolasi dan mengidentifikasi bakteri endofit pada daun mangrove A. marina serta mengevaluasi daya hambatnya terhadap bakteri Stenotrophomonas maltophilia penyebab panyakit ice-ice pada rumput laut. Metode isolasi yang digunakan adalah metode spread plate dengan cara menginokulasikan suspensi daun mangrove yang mengandung bakteri pada media agar sea water complete (SWC) dan thiosulphate citrate bile salt sucrose (TCBS). Uji penghambatan isolat bakteri terhadap S. maltophilia dengan menggunakan metode Kirby-Bauer dan kultur bersama. Hasil isolasi bakteri endofit dari daun mangrove diperoleh 18 isolat dan berdasarkan analisis biokimia dan sekuen gen 16S rRNA, 18 jenis bakteri ini termasuk ke dalam 3 kelompok besar bakteri, yaitu Gammaproteobacteria (4 spesies), Firmicutes (10 spesies), dan Enterobacteria (4 spesies). Bakteri yang mempunyai daya hambat tertinggi terhadap bakteri S. maltophilia adalah Vibrio sp. AMS5, Pseudomonas sp. AMS8 dan Bacillus subtilis AMS11. Berdasarkan hasil penelitian pada tahap ini dapat disimpulkan bahwa bakteri endofit yang teridentifikasi pada daun mangrove A. marina mampu menghambat pertumbuhan S. maltophilia sebagai penyebab penyakit ice-ice. Untuk meningkatkan kualitas hambat dari daun mangrove, maka dilakukan fermentasi spontan (tahap 2). iv Penelitian tahap kedua bertujuan untuk mengidentifikasi bakteri dan senyawa dalam cairan fermentasi daun mangrove A. marina dan mengukur daya hambatnya terhadap bakteri patogen S. maltophilia penyebab penyakit ice-ice pada rumput laut. Cacahan daun A. marina yang sudah tua ditandai dengan warna hijau tua pada permukaan atas daun dan segar dicampurkan dengan gula merah dan air laut steril dengan perbandingan bobot 1:0.25:2, dimasukkan dalam wadah tertutup rapat tanpa pencahayaan, dan difermentasi selama dua minggu. Isolasi bakteri cairan fermentasi dilakukan dengan menggunakan media kultur SWC dan TCBS. Uji daya hambat bakteri dilakukan dengan menggunakan metode Kirby-Bauer. Hasil analisis molekuler dengan target gen 16S rRNA menunjukkan bahwa bakteri dalam
Keyword: Avicennia marina, endofit, fermentasi, ice-ice, mangrove, rumput laut

Judul: Penggunaan Teorema Homeomorphy 2-Manifold dan Teorema Euler Poincare pada Torus 𝑇�� dan Simplicial Complex 𝐾��
Abstrak: Two dimensional topological spaces are said to be homeomorphic if they have the same topological invariant, where one of topological invariant used is an Euler characteristic. Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem and Euler Poincare’s Theorem are used to distinguish two topological spaces. Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem uses Euler characteristic to identify two dimensional topological spaces. Euler Poincare’s Theorem is an alternative way to find Euler characteristic with Betti number, which is topological invariant as well. The objective of this paper is to investigate the homeomorphism of torus 𝑇����� and simplicial complex 𝐾�����. Topological space torus and simplicial complex 𝐾����� have the same Euler characteristic, which is two. Based on Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem topological space torus 𝑇����� and simplicial complex 𝐾����� is homeomorphic.
Keyword: simplicial, torus, Euler, homeomorphism, topology