Judul: Penggunaan sistem akustik Bim Ganda untuk menduga densitas relatif ikan di perairan Selat Sunda bagian selatan
Abstrak: Hasil penelitian ini melaporkan, dari sebanyak 32 file data echo integrator yang diperoleh dari 4 trek, diduga nilai densitas relatif ikan rata-rata wilayah yang disurvei sebesar 0,1334 volt. Selain itu diperoleh kesimpulan bahwa pada batas-batas tertentu, semakin dekat dengan garis pantai maka nilai densitas ikan semakin membesar. Ditemukan juga jika pada siang hari, meskipun sebaran vertikal ikannya berada pada kedalaman 1,0 151,0 meter, densitas relatif ikan, relatif lebih kecil dibandingkan densitas relatif ikan pada malam hari yang menyebar di kedalaman 61,0 meter, tetapi jika dihubungkan dengan data kedalaman yang diperoleh sulit dikatakan apakah jika pada malam hari ikan benar-benar melakukan migrasi ke lapisan atas perairan, sebab data echointegrator malam hari yang diperoleh berasal dari perairan yang dangkal (sekitar 70 meter). Dihubungkan dengan data-data oseanografi yang diperoleh, semua perbedaan-perbedaan nilai densitas ikan baik secara spasial maupun temporal diduga dipengaruhi oleh kondisi lingkungan yang ada di sekitarnya seperti pencahayaan, kecerahan, suhu, salinitas dan lain-lain yang pada akhirnya akan merubah tingkah laku dan orientasi ikan di perairan terhadap transducer.
Keyword: 

Judul: Pendugaan densitas ikan dengan sistem akustik BIM terbagi dan pengaaruh lingkungan terhadap penyebaran ikan di Selat Sunda Bagian Utara
Abstrak: Penelitian yang dilakukan ini bertujuan untuk mengetahui densitas ikan dan penyebarannya secara spasial dan untuk mengetahui pengaruh lingkungan terhadap penyebaran dan densitas ikan di Selat Sunda. Alat-alat yang digunakan meliputi alat akustik split beam model SIMRAD EY-500 dengan frekuensi 70 kHz, split beam transducer yang dilengkapi komputer dan printer. Alat Sea bird Profiler digunakan untuk mengambil data suhu dan salinitas. Penelitian ini dilakukan pada bulan Maret 1998 mulai dari posisi 05°42'06" LS; 106°08'46" BT hingga 05°53'80" LS; 105°15'92" BT. Desain survei akustik yang digunakan adalah transek paralel sistematis dan menetapkan posisi stasiun-stasiun. Kalibrasi alat akustik juga dilakukan dengan bola sphere berdiameter 47,8 mm. Data-data yang diambil meliputi data akustik yaitu nilai target strength ikan tunggal, nilai volume backscattering strength (Sv) dan nilai densitas ikan ikan/1000m³). Data parameter lingkungan meliputi data suhu biologi yaitu data panjang dan berat ikan-ikan yang tertangkap nelayan oleh alat purse seine di Tempat Pelelangan Ikan (TPI) Labuan.
Keyword: 

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA