Judul: In Vitro Infectivity Analysis of Simian-Human Immunodeficiency Virus (SHIV) on Peripheral Blood Mononuclear Cell (PBMC) Macaca fascicularis and M. nemestrina
Abstrak: Keterbatasan utama dalam upaya pengembangan vaksin dan pengobatan anti-retroviral terhadap infeksi human immunodeficiency virus type-1 (HIV-1) antara lain adalah ketiadaan model hewan yang dapat menunjukkan semua gejala menonjol infeksi HIV-1 seperti pada manusia. SHIV dikonstruksi untuk mengatasi keterbatasan model SIVmac dan telah dimanfaatkan pada banyak penelitian menggunakan satwa primata untuk mempelajari virus yang memiliki kedekatan dengan HIV-1 pada manusia. Satwa primata Macaca fascicularis dan M. nemestrina digunakan sebagai hewan coba penelitian HIV/AIDS dengan memanfaatkan virus kimera SHIV yang dihasilkan melalui penggantian susunan nukleotida bagian cyclophilin A binding region, gen viral infectivity factor (vif) dan gen negative factor (nef) HIV-1 dengan bagian cyclophilin A binding region, gen vif dan gen nef Simian Immunodeficiency Virus (SIV). Penelitian bertujuan untuk mengkaji model HIV/AIDS pada PBMC satwa primata secara in vitro menggunakan SHIV. Secara khusus, penelitian ini bertujuan untuk menganalisis kemampuan atau daya replikasi SHIV pada kultur sel PBMC asal M. fascicularis dan M. nemestrina secara in vitro. Penelitian dilakukan secara in vitro dengan menggunakan PBMC M. fascicularis dan M. nemestrina. Karakteristik M. fascicularis dan M. nemestrina yang digunakan dalam penelitian ini, yaitu jantan, dewasa dengan umur empat sampai enam tahun. SHIV merupakan hasil kontruksi Budiman Bela dan Silvia Triwidyaningtyas dari Pusat Riset Virologi dan Kanker Patobiologi (PRVKP) FKUI-RSCM. Isolasi PBMC dilakukan dengan metode densitas gradien sentrifugasi. Aktivasi PBMC dilakukan dengan menggunakan agen mitogenik, yaitu phytohaemagglutinin (PHA). PBMC terstimulasi PHA dihitung dengan hemositometer. PBMC terstimulasi PHA diinfeksi dengan supernatan sel transfektan yang mengandung SHIV dengan pengenceran 1:10. PBMC terstimulasi PHA juga diinfeksi dengan supernatan yang mengandung HIV dengan pengenceran 1:10 sebagai pembanding. Kultur PBMC terstimulasi PHA dilakukan selama 21 hari. Pemeliharaan kultur PBMC terstimulasi PHA dilakukan dengan pemberian nutrisi setiap minggu sekali. Supernatan PBMC terstimulasi PHA dikoleksi setiap hari. Pengamatan cytopathic effect (CPE) dilakukan menggunakan mikroskop cahaya. Konfirmasi CPE dilakukan dengan pemeriksaan imunofluoresen terhadap protein p24. Analisis CPE dilakukan secara kualitatif deskriptif dan ekspresi protein p24 dianalisis secara semi kuantitatif. Penggantian cyclophilin A binding region, gen vif dan gen nef HIV-1 dengan cyclophilin A binding region, gen vif dan gen nef SIV dapat meningkatkan kemampuan SHIV dalam menginfeksi PBMC M. fascicularis dan M. nemestrina. Infeksi SHIV pada kultur PBMC terstimulasi PHA M. fascicularis dan M. nemestrina ditandai dengan pembentukan CPE berupa multinucleated giant cell (MGCs). CPE pada kultur PBMC terstimulasi PHA M. fascicularis dan M. nemestrina mengekspresikan protein p24 dengan nilai masing-masing + (<10% sel terwarnai) dan ++ (10%-50% sel terwarnai). Penggantian susunan nukleotida cyclophilin A binding region meningkatkan pengikatan cyclophilin A (CypA) dengan gag SIV. Gen vif berperan sebagai pertahanan balik terhadap apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G (APOBEC3G) yang dapat menghambat replikasi retrovirus. Gen nef berperan dalam perkembangan AIDS dan antagonis terhadap tetherin. CPE dan ekspresi protein p24 pada kultur PHA-stimulated PBMC M. nemestrina lebih banyak dibandingkan pada kultur PHA-stimulated PBMC M. fascicularis. Perbedaan ini disebabkan adanya protein tripartite motif containing 5 (TRIM5) yang dapat membatasi replikasi virus. M. nemestrina mengekspresikan protein TRIMCyp yang tidak membatasi replikasi virus. Sementara itu, M. fascicularis mengekspresikan TRIM5α dan TRIMCyp yang dapat membatasi replikasi HIV-1 atau HIV-2. M. nemestrina memberikan hasil yang lebih baik sebagai model
Keyword: CPE, expression of p24 protein, M. fascicularis, M. nemestrina, SHIV

Judul: Identification and Molecular Characterization of Simian Endogenous Retrovirus in Macaca fascicularis and Macaca nemestrina in Captive Facilities in Bogor
Abstrak: Macaca fascicularis (monyet ekor panjang, MEP) dan M. nemestrina (beruk) merupakan satwa primata endemik Indonesia yang digunakan sebagai hewan model dalam penelitian biomedis untuk menunjang kesehatan manusia, salah satunya pada penelitian pengembangan vaksin Human immunodeficiency virus (HIV). Vaksin konvensional HIV yang telah dikembangkan saat ini tidak efektif akibat tingginya keragaman retrovirus eksogen. Studi terbaru telah dilakukan pendekatan pengembangan jenis vaksin HIV dengan memanfaatkan Human endogenous retrovirus (HERV). HERV juga diketahui menginduksi respon kekebalan, sehingga memungkinkan untuk dilakukan pengembangan terapi terhadap HERV untuk pencegahan kanker. Retrovirus endogen juga ditemukan pada satwa primata salah satunya yaitu Simian endogenous retrovirus (SERV), sehingga retrovirus endogen pada satwa primata ini diharapkan dapat mendukung dalam penelitian vaksin HIV maupun terapi anti-kanker pada manusia. Penelitian dasar berupa identifikasi dan karakterisasi molekuler terhadap retrovirus endogen pada satwa primata Indonesia yang terdeteksi pada sampel MEP dan beruk perlu dilakukan. Penelitian memanfaatkan 131 sampel darah utuh asal MEP dan 58 sampel asal beruk dikoleksi dari Fasilitas Penangkaran Wanara Satwa Loka (WSL) dan PSSP-LPPM IPB di Bogor. Amplifikasi PCR pada sampel DNA dilakukan dengan teknik real-time PCR SYBR Green menggunakan primer spesifik SRV1-5 7585U19 dan SRV1-5 7695L21. Analisis hasil amplifikasi didasarkan pada profil nilai cycle threshold (Ct) <24,0 dan nilai kurva leleh (melt curve) pada suhu kisaran 80,0-82,0ºC. Runutan nukleotida genom utuh dilakukan dengan teknik sekuensing asam nukleat menggunakan metode primer walking dan dianalisis dengan metode bioinformatik yaitu 4peaks, clustalW dan BLAST (NCBI). Pohon filogenetik dikonstruksi dengan metode neighbor-joining menggunakan program MEGA X. Berdasarkan uji tapis dengan teknik real-time PCR SYBR Green, diperoleh dua sampel yang memiliki karakeristik SERV yaitu Mn B1 dan Mn B140910 dengan nilai Tm 82,0ºC dan nilai Ct 22,37-22,54. Analisis runutan genom utuh terhadap dua sampel SERV tersebut diperoleh hasil yang identik dengan total 7991 nukelotida yang disusun atas domain LTR, gag, prt, pol, dan env. Kedua sampel ini memiliki kemiripan (identity) nukleotida 99-100% dengan isolat sampel beruk Mn 92227 asal Indonesia yang berada di Pusat Primata Nasional Universitas Washington (NaPRC UW) sejak tahun 1998 yang terkonfirmasi sebagai novel SERV. Gambaran hasil pohon filogenetik menunjukkan sampel Mn B1 dan Mn B140910 pada genom utuh nukleotida dan asam amino env mengelompok bersama SRV-2 dengan identitas nilai 82% dan 79%, sementara itu asam amino Gag, Prt, dan Pol mengelompok bersama SRV-1, -3, -4, -5, dan -8 dengan identitas 82-88%. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa kedua sampel yang diperoleh merupakan novel SERV asal beruk. Data genetik SERV pada beruk asal Indonesia ini dapat menjadi penelitian dasar dan pertimbangan penggunaan satwa primata sebagai model in vivo yang dapat menunjang perkembangan vaksin HIV dan terapi anti-kanker pada manusia., Macaca fascicularis (long-tailed macaque, MEP) and M. nemestrina (pig-tailed macaque, beruk) are non-human primates commonly used as laboratory animals in biomedical research to support the human health, among others are the in vivo testing for the development of HIV-1 vaccine. Recent studies have explored approaches to HIV vaccine by utilizing Human endogenous retrovirus (HERV) due to the hypervariability of exogenous retroviruses which causes conventional vaccines to be ineffective. HERV is also known induces an immune response, so it is possible to develop therapies against HERV for
Keyword: HIV, M. fascicularis, M. nemestrina, retrovirus, SERV

Judul: Pembuatan dan Karakterisasi Lapisan Tipis Copper oxide (CuO) Sebagai Sensor Gas
Abstrak: Lapisan tipis Copper Oxide (CuO) adalah bahan scmikonduktor yang memiliki sirat sangat scnsitif tcrhadap gas. mcngingat bahan tcrscbut sangat mud-ah mcngabsorpsi gas. DCllgan absorpsi gas ini akan l11crubah resistivitas lapisan tipis tersebut. Dalmn pcmbuatan.lapisan (ipis ini, lllclodc yang digunakan adalah metodc Dcposisi Fasa Cair (Liquid Phase Deposition) yaitu dengan mencmnpurkan 100 ml larutan Copper Sulphal (CuSO, 1I2H,O) 1M dengan 50 ml ammonium 25 %, Kemudian dicuplik 6ml dan dimasukkan ke dalam wadall yang telah terisi aquades 60 ml dan substrat pada dindingnya, kemudian diaduk dengan slirier dan dipanasi pada suhu 75°C selama 1 jam, Pendeposisian ini dilakukan sebanyak 4 kali. Hasil karakterisasi XRD memperlihatkan puncak-puncak CuO yaitu berada pada 28 = 35,306; 38,502; 61.475; 65,538 dengan masing-masing d = 2,5400: 2,3362: 1.5071; 1.4231.
Keyword: