Judul: IPB (Bogor Agricultural University)
Abstrak: Newcastle Disease (ND) merupakan salah satu penyakit penting dalam dunia perunggasan karena penyakit ini bersifat sangat menular, menyebar dengan cepat, serta dapat menyerang semua jenis unggas pada segala umur (Alexander dan Jones 2000). Virus ND tidak memiliki kecepatan mutasi tinggi seperti virus AI, namun subtipe dan subgenotipe virus ND baru terus ditemukan, mengindikasikan adanya proses evolusi yang dialami. Keragaman genom virus menjadi salah satu penyebab kegagalan vaksinasi dan kegagalan diagnosis yang secara simultan menyebabkan kegagalan pengendalian ND di dunia termasuk Indonesia. Salah satu cara yang dapat diupayakan dalam penanggulangan ND adalah dengan menghasilkan antibodi ND yang dapat dijadikan sebagai reagen imunodiagnostik dan imunoterapi. Delapan isolat lapang dari kasus klinis ND dijadikan sebagai kandidat antigen pada produksi antibodi. Berdasarkan karakterisasi patotipe dan genotipe pada 8 isolat tersebut diperoleh 3 isolat termasuk dalam virus ND virulen, dan berdasarkan analisis filogenetik, 1 isolat yaitu NDV/Ck/GS/14 termasuk dalam genotipe VII subgenotipe (h), dan 1 isolat lainnya NDV/Ck/BGR/11 termasuk virus ND genotipe VII subgenotipe (i). Menurut Miller et al. 2015, virus ND genotipe VII sub genotipe (h) dan (i) merupakan subgenotipe baru virus ND yang menimbulkan wabah pada beberapa negara seperti Pakistan dan Israel serta berhasil diisolasi pada beberapa daerah di Indonesia seperti Banjarmasin, Sukorejo, Gianyar, Sragen, Kudus, Makasar dan Bali dalam kurun waktu 2009 dan 2010. Hasil ini menunjukkan bahwa virus ND virulen genotipe VII subgenotipe (h) dan (i) juga ditemukan beredar dan menimbulkan wabah pada ayam-ayam yang divaksinasi pada beberapa peternakan ayam komersil di Jawa Barat pada tahun 2011 dan 2014. Hal ini mengindikasikan bahwa program vaksinasi belum efektif dalam mengendalikan virus ND. Isolat NDV/Ck/BGR/11 yang termasuk virus ND genotipe VIIi dipilih sebagai antigen pada produksi antibodi. Produksi antibodi ND berhasil dilakukan dalam waktu 38 hari dengan menyuntikkan antigen NDV/Ck/BGR/11 tanpa menggunakan adjuvan. Waktu produksi yang lebih singkat, serta tanpa menggunakan adjuvan membuat antibodi ND genotipe VII yang diproduksi pada penelitian ini lebih ekonomis dibandingkan dengan antibodi poliklonal ND komersil. Purifikasi dan karakterisasi merupakan suatu proses yang harus dilakukan sebelum antibodi digunakan sebagai kandidat reagen. Hasil purifikasi dengan menggunakan ammonium sulfat dan Protein A Purification Kit menghasilkan antibodi murni yang mengandung whole IgG (tidak terdenaturasi), heavy chain IgG, dan light chain IgG berdasarkan hasil analisis berat molekul dengan SDS-PAGE. Berdasarkan hasil AGPT menunjukkan bahwa antibodi ND genotipe VII yang diproduksi membentuk garis presipitasi dengan virus ND homolog dan heterolog. Hal ini menunjukkan bahwa antibodi ini dapat digunakan untuk mendeteksi semua antigen ND dengan tingkat virulensi yang berbeda. Antibodi yang telah dipurifikasi digunakan sebagai antibodi primer pada pemeriksaan IHK. Berdasarkan hasil pemeriksaan IHK, antibodi ND genotipe VII, memberikan hasil uji yang relatif sama dengan menggunakan antibodi ND komersil. Berdasarkan VNT, antibodi ND genotipe VII memiliki kemampuan yang baik dalam menetralisasi virus ND isolat lapang. Berdasarkan hasil penelitian ini, antibodi ND genotipe VII yang diproduksi memiliki potensi sebagai reagen imunodiagnostik dan imunoterapi. Antibodi genotipe VII ini diharapkan mampu menggantikan antibodi ND komersil sebagai reagen imunodiagnostik yang lebih ekonomis.
Keyword: Newcastle Disease, antigen, antibodi, imunodiagnostik, imunoterapi

Judul: Isolasi dan Karakterisasi Biologik Virus Newcastle Disease (NDV)
Abstrak: Newcastle disease (ND) merupakan salah satu penyakit unggas yang sangat penting di industri peternakan. Distribusi ND sudah terjadi di seluruh dunia antara lain Asia, Afrika dan Amerika. Newcastle disease juga merupakan penyakit unggas yang sangat merugikan secara ekonomi karena infeksi yang diakibatkan dapat menyebabkan kematian mencapai 100%. Salah satu cara pengendalian ND adalah vaksinasi, yang telah diaplikasikan selama beberapa dekade pada industri peternakan di seluruh dunia. Di Indonesia, Newcastle disease merupakan penyakit unggas endemik. Upaya pengendaian terutama dilakukan dengan vaksinasi menggunakan berbagai ragam sediaan vaksin ND yang beredar di pasaran. Kasus ND masih dilaporkan terjadi di lapangan walaupun vaksinasi telah diterapkan secara ketat di peternakan ayam komersial. Kemungkinan terjadinya hal tersebut antara lain disebabkan oleh ketidaksesuaian vaksin yang diberikan dengan virus yang bersirkulasi di lapangan. Apalagi diketahui virus Newcastle disease (NDV) merupakan virus RNA yang sangat mudah bermutasi. Banyaknya kasus ND yang terjadi di lapangan tidak dibarengi dengan cukupnya informasi dan publikasi tentang NDV asal Indonesia. Secara umum penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan informasi tentang infeksi NDV pada ayam komersial maupun kampung melalui deteksi genom, isolasi dan identifikasi, serta karakterisasi biologik isolat lapang. Sejumlah 529 sampel usap kloaka dikoleksi dari pasar-pasar tradisional dan peternakan rakyat di daerah Bogor dan Tangerang. Keberadaan NDV ditentukan dengan mendeteksi gen matriks menggunakan teknik real-time reverse transcriptase-PCR (rRT-PCR); 20 sampel dideteksi positif gen matriks . Upaya isolasi virus dari 20 sampel positif PCR pada telur ayam berembrio (TAB) specific pathogen free (SPF) umur 9-11 hari berhasil menumbuhkan 11 isolat yang memperlihatkan aktifitas hemaglutinasi(haemagglutination, HA). Identifikasi menggunakan uji hambatan hemaglutinasi (haemagglutination inhibition, HI) dan rRT-PCR meneguhkan bahwa 11 isolat tersebut adalah NDV. Empat isolat representasi lokasi dipilih untuk karakterisasi patogenisitas dengan metode mean death time (MDT) pada TAB SPF, dan karakterisasi antigenisitas menggunakan metode haemagglutination inhibition (HI) dan virus netralisasi (VN) untuk melihat keragaman antar isolat virus. Uji MDT memperlihatkan dua isolat (APMV-1/Chicken/Tangerang/IISERnc/2012) dan APMV-1/Chicken/Tangerang/ XIIIBSDnc/2012) adalah mesogenik, satu isolat (APMV-1/Chicken/ Tangerang/VIIIBSDbr/2012) termasuk lentogenik, dan satu isolat (APMV-1/Chicken/Tangerang/ TWPRnc/2012) bersifat velogenik. Tiga dari empat isolat menunjukkan hubungan antigenik dengan strain Komarov dan G7 tetapi tidak dengan strain referensi LaSota, sementara isolat velogenik APMV-1/Chicken/Tangerang/ TWPRnc/2012 yang berasal dari ayam kampung menunjukkan reaksi silang tinggi dengan antiserum terhadap tiga strain referensi diatas. Sampel-sampel yang diambil di lapang, baik yang berasal dari pasar dan peternakan rakyat, baik dengan atau tanpa gejala sakit dapat diisolasi virus Newcastle disease dengan karakteristik yang beragam. Perlu dilakukan penelitian lebih lanjut untuk melihat keragamanan genetik dan pathotyping isolat yang diperoleh sehingga dapat memberikan informasi yang lebih mendalam dan bermakna tentang penyakit
Keyword: Newcastle disease, Newcastle disease in Indonesia, mean death time (MDT), real time reverse transcriptation (rRT-PCR)

Judul: Penggunaan Teorema Homeomorphy 2-Manifold dan Teorema Euler Poincare pada Torus 𝑇�� dan Simplicial Complex 𝐾��
Abstrak: Two dimensional topological spaces are said to be homeomorphic if they have the same topological invariant, where one of topological invariant used is an Euler characteristic. Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem and Euler Poincare’s Theorem are used to distinguish two topological spaces. Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem uses Euler characteristic to identify two dimensional topological spaces. Euler Poincare’s Theorem is an alternative way to find Euler characteristic with Betti number, which is topological invariant as well. The objective of this paper is to investigate the homeomorphism of torus 𝑇����� and simplicial complex 𝐾�����. Topological space torus and simplicial complex 𝐾����� have the same Euler characteristic, which is two. Based on Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem topological space torus 𝑇����� and simplicial complex 𝐾����� is homeomorphic.
Keyword: simplicial, torus, Euler, homeomorphism, topology