Judul: Produksi, Potensi, dan Karakterisasi Plantarisin dari Lactobacillus plantarum S34 secara in vivo pada mencit ddY.
Abstrak: Resistensi antibiotik merupakan permasalahan yang timbul akibat kesalahan penggunaan antibiotik yang tidak tepat sehingga mikroorganisme dapat menyesuaikan diri untuk bertahan hidup. Beberapa mikroorganisme dilaporkan memiliki resistensi terhadap lebih dari satu jenis antibiotk/multiple drug resistence (MDR). Di Indonesia, keberadaan bakteri yang telah memiliki resistensi terhadap antibiotik telah ditemukan, seperti pada golongan Staphylococcus, Pseudomonas, Proteus, Shigella, Klebsiella, Escherichia, dan Salmonella. Berbagai upaya dilakukan untuk menangani kasus yang disebabkan oleh bakteri MDR, seperti bakteriofag maupun ekstrak kasar plantarisinlorasi bahan berpotensi antimikrob, salah satunya adalah peptida antimikrob seperti plantarisin. Penelitian mengenai plantarisin yang berasal dari Lb. plantarum telah dilakukan sebelumnya dengan mengisolasi Lb. plantarum S34 dari bekasam. Aktivitas antimikrob plantarisin diketahui mampu menghambat pertumbuhan mikroorganisme, seperti Escherichia coli, Listeria innocua, Micrococcus luteus, Enterococcus casseliflavus, Lactococcus lactis lactis, dan Lactobacillus plantarum. Aktivitas antimikrob yang lebar ini menjadikan plantarisin sebagai kandidat senyawa antimikrob yang baru. Sebagai kandidat antimikrob baru, pengujian terhadap keamanan dan efektivitas antimikrob plantarisin S34 baik secara in vitro maupun in vivo harus dilakukan. Pada penelitian ini pengujian terhadap keamanan plantarisin dilakukan secara in vivo dengan pengamatan selama 48 jam dengan dosis 50, 100, 1000, dan 5000 mg/kgBB. Identifikasi berat molekul menggunakan SDS-PAGE menunjukkan adanya pita pada posisi 7.34 kDa dan 5.82 kDa. Protein dengan bobot <10 kDa ini diduga merupakan plantarisin tipe II. Dua buah pita yang muncul diduga sebagai plantarisin EF dan JK. Pita pada posisi 7.34 yang diduga sebagai plantarisin EF juga mirip dengan total bobot molekul dari plantarisin E yang sebesar 3.75 kDa dan plantarisin F sebesar 3.86 kDa. Sedangkan pita dengan ukuran 5.82 memiliki ukuran yang hampir sama dengan berat molekul plantarisin JK jika dihitung menggunakan rata-rata bobot molekul asam amino. Pengujian terhadap aktivitas ekstrak kasar plantarisin menunjukkan aktivitas yang kuat terhadap EPEC K1.1 dan S. aureus, aktivitas baik terhadap S.typhimurium dan Proteus, dan lemah terhadap S. typhosa Hasil pengujian terhadap toksisitas ekstrak kasar plantarisin S34 tidak menunjukkan adanya perubahan yang signifikan. Penurunan maupun kenaikan yang dialami mencit masih berada pada rentang normal mencit. Pengamatan terhadap kadar biokimia darah ureum dan kadar SGPT. Kenaikan kadar ureum dapat diakibatkan oleh pemecahan secara enzimatik ekstrak kasar plantarisin S34 oleh enzim proteolitik. Pemecahan protein ini menghasilkan urea maupun amoniak pada darah yang akan dibuang melalui feses maupu urin. Kadar SGPT meningkat dapat dikarenakan adanya aktivitas penguraian oleh enzim proteolitik yang dihasilkan oleh hati. Namun demikian, peningkatan kadar SGPT masih dalam taraf 5 normal sehingga tidak menunjukkan adanya kelainan pada fungsi organ hati. Pengamatan terhadap organ ginjal maupun hati tidak menunjukkan adanya kerusakan yang diakibatkan oleh pemberian ekstak kasar plantarisin S34. Pemberian ekstrak kasar plantarisin S34 menunjukkan tidak ada gejala toksisitas baik secara analisis hematologi maupun hstopatologi hingga dosis 5000 mg/kgBB.
Keyword: Antimikrob, Keamanan, Lactobacillus plantarum, Plantaricin, Resistensi

Judul: Karakterisasi Plantaricin Asal Empat Galur Lactobacillus plantarum Berdasarkan Sensitivitasnya terhadap Enzim Tripsin
Abstrak: Bakteri asam laktat (BAL) memiliki peran yang sangat penting dalam pengolahan pangan. Bakteri asam laktat berperan aktif dalam proses fermentasi pangan. BAL pada perkembangannya saat ini diharapkan dapat diaplikasikan sebagai agen pengawet pangan alami. Hal tersebut disebabkan oleh kemampuan BAL dalam memproduksi substansi-substansi antimikrob selama metabolismenya. Bakteriosin merupakan salah satu substansi antimikrob yang diproduksi BAL. Supernatan bebas sel netral isolat Lactobacillus plantarum 1A5, 1B1, 2B2, dan 2C12 yang diisolasi dari daging sapi lokal diketahui memiliki aktivitas antimikrob melawan bakteri indikator. Zat aktif pada senyawa antimikrob ini diduga sebagai bakteriosin yang dihasilkan oleh Lactobacillus plantarum atau disebut plantaricin, sehingga perlu dilakukan proses purifikasi untuk mendapatkan plantaricin murni 1A5, 1B1, 2B2, dan 2C12. Penelitian ini dilakukan untuk mempelajari karakteristik plantaricin tersebut terhadap degradasi enzim proteolitik. Sensitivitas plantaricin terhadap enzim proteolitik merupakan kriteria utama dalam karakterisasi plantaricin, karena komponen utama dalam plantaricin adalah peptida yang harus sensitif terhadap enzim proteolitik. Enzim proteolitik yang digunakan dalam penelitian ini adalah enzim tripsin. Pengujian ini sekaligus untuk membuktikan bahwa plantaricin akan terdegradasi dalam saluran pencernaan manusia, tempat terjadinya proses proteolitik oleh enzim tripsin, sehingga plantaricin dapat digunakan sebagai agen pengawet pangan alami. Proses karakterisasi diawali dengan memproduksi plantaricin 1A5, 1B1, 2B2, dan 2C12, melalui tahapan purifikasi. Keempat galur Lactobacillus plantarum ditumbuhkan pada media De Man Rogosa and Sharpe broth (MRSb) yang ditambah yeast extract (YE) 3%, diinkubasi selama 20 jam, kemudian disentrifugasi pada kecepatan 10.000 rpm untuk mendapatkan supernatan antimikrob. Supernatan antimikrob disaring menggunakan membran saring sartorius untuk mendapatkan supernatan bebas sel, yang kemudian dinetralkan pH-nya menjadi 5,8 – 6,2. Proses purifikasi parsial dilakukan dengan menjenuhkan larutan menggunakan amonium sulfat hingga penjenuhan mencapai 80%. Presipitat plantaricin didapat dan didialisis menggunakan membran dialisis. Proses dialisis menghasilkan plantaricin kasar, kemudian plantaricin kasar dimurnikan dengan teknik kromatografi kolom pertukaran kation. Rancangan percobaan yang digunakan pada penelitian produksi plantaricin dan sensitivitas plantaricin 1A5, 1B1, 2B2, 2C12 terhadap enzim tripsin adalah adalah rancangan acak lengkap (RAL) dengan tiga kali ulangan. Rancangan acak lengkap (RAL) pola faktorial 2x4 digunakan pada penelitian uji antagonistik plantaricin 1A5, 1B1, 2B2, dan 2C12 terhadap bakteri indikator dengan ulangan iii sebanyak tiga kali. Faktor perlakuan pertama adalah penggunaan enzim tripsin, dan faktor perlakuan kedua adalah plantaricin asal galur L. plantarum yang berbeda. Hasil karakterisasi plantaricin 1A5, 1B1, 2B2, dan 2C12 terhadap enzim tripsin, memperlihatkan bahwa plantaricin tersebut sensitif terhadap enzim tripsin. Hal tersebut diindikasikan oleh terjadinya penurunan konsentrasi protein plantaricin, serta terjadinya penurunan aktivitas penghambatan plantaricin terhadap bakteri indikator pada uji antagonistik. Persentase penurunan konsentrasi protein terbesar dimiliki oleh plantaricin 2C12 yaitu sebesar 74,27 %. Perlakuan enzim tripsin berbeda nyata (p≤0,05) terhadap diameter zona hambat plantaricin pada uji antagonistik dengan bakteri indikator. Aktivitas antimikrob dari plantaricin tidak sepenuhnya diinaktivasi oleh enzim tripsin. Hal ini terlihat dari masih terbentuknya zona hambat dan masih cukup tingginya nilai activity unit pada uji antagonistik plantaricin 1A5, 1B1, 2B2, dan 2C12 terhadap bakteri indikator Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853, Staphylococcus aureus ATCC 14028, Bacillus cereus, Salmonella enteritidis ser. Thypimurium ATCC 14028, dan Escherichia coli ATCC 25922
Keyword: 

Judul: Thermal Characteristics and Dynamics of Tropical Cyclone over Western North Pacific Ocean: A Case Study of Typhoon Songda (Chedeng) 2011
Abstrak: The frequent occasion of Tropical Cyclone (TC) over Western North Pacific (WNP) Ocean lies from 10˚N to 26˚N and 121˚E to 170˚E. Sources of TC development come from warm ocean temperature where latent heat is released during condensation processes and subsequently concentrated in the boundary layer. Relative humidity at 850-700 hPa is responsible to produce the most intense storm. Meanwhile, weak vertical wind shear between 850-200 hPa is one of the dynamical factors that lead to the development of TC. Pressure level of 850-200 hPa is chosen to minimize the thermodynamic effect in the lower troposphere. Typhoon Songda (Chedeng in the Philippines) or TSC lasted from May 18th to 30th, 2011 and strengthened into powerful Super Typhoon stage between May 24th and 27th. Long curving track and the exhibition of all sequences of TC life cycle, TSC is then considered as an ideal case of TC. The objective of the study with case of TSC is to investigate the role of thermal characteristics and dynamics on TC intensity. The research is carried out by using Advanced Research of Weather Research and Forecasting model (WRF ARW model) version 3.3. Two domains are employed in the model. The first domain situate from 02˚N to 40˚N and 118˚E to 149˚E and cover spatial resolution () of 33.1 km. The second domain situate from 09˚N to 27˚N and 119˚E to 132˚E with of 11 km. Timestep of the model () is 120 seconds. The model is supported by the following physical parameterization, i.e., Yonsei University Scheme (YSU) in the boundary layer, Kain-Fritsch scheme (KF) in the cumulus, and WRF Single-Moment 3-class scheme in the microphysics. Initial meteorological condition prior to the formation of the cyclone is generated using WRF ARW standard-release model. Sensitivity of the model output is obtained from a selected single-parameter change scenarios, namely, 10 % to 20 % decrease and increase of wind shear initial data at 850-200 hPa, and by 10 % to 20 % decrease of relative humidity initial data at 850-700 hPa. The result showed that the negative correlations between wind shear and intensity are found in wind shear scenarios. Wind shears of 10 ms-1 which lead to strengthening of the wind intensity in the early period of Typhoon development are found in wind shear scenarios. The effect of wind shear changes on wind intensity is statistically significant in the 20 % wind shear scenarios. During mature stage, weak wind intensity occurred when wind shear increase as given in the WRF standard-release and the 20 % decreasing scenario. Different situation is found in the 20 % increasing scenario where wind shear tend to weak and lead to strong wind intensity at this stage. Meanwhile, the reduction of moisture supply at 850-700 hPa resulting from 20 % decreasing relative humidity play a major role in the weakening of wind intensity and reduces mechanical energy of the cycle process as much as 300 J kg-1.
Keyword: