Judul: Distribution and Risk of Intestinal Amoeba Transmission to Humans and Wild Long-Tailed Macaques in Sabang City, Aceh Province
Abstrak: Infeksi amoeba pada manusia umumnya non-patogen dan beberapa spesies diantaranya bersifat patogen yang berkontribusi terhadap beban penyakit gastrointestinal di seluruh dunia. Amoeba patogen dan non-patogen juga dapat menginfeksi spesies satwa primata dan berpotensi zoonosis. Penelitian ini menggunakan pendekatan studi cross-sectional yang terbagi dalam tiga tahapan. Tahap pertama bertujuan untuk mengevaluasi efektifitas teknik pewarnaan Wheatley's trichrome yang dikombinasi dengan pengukuran sel berbasis digital. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa morfologi delapan spesies amoeba usus yaitu trofozoit dan kista kompleks Entamoeba histolytica/dispar/moshkovski,Entamoeba harmanii (E. harmanii), Entamoeba coli (E. coli), Entamoeba polecki (E. polecki), Endolimax nana (E. nana), Iodamoeba butschlii (I. butschlii), dan kista Blastocytis sp., serta trofozoit D. fragilis dapat terdeteksi dengan baik. Tahap kedua penelitian ini bertujuan untuk menduga prevalensi dan menganalisis sebaran amoeba usus pada MEP liar dan masyarakat Kota Sabang. Prevalensi amoeba usus pada MEP liar Kota Sabang sebesar 57,6% (102/177). Hasil identifikasi lanjut diketahui sebesar 36,7% (65/177) sampel terverifikasi dengan satu spesies amoeba dan sebesar 20,9% (37/177) sampel terverifikasi lebih dari satu spesies amoeba. Hasil identifikasi tersebut diketahui prevalensi kompleks Entamoeba histolytica/dispar/moshkovski sebesar 10,7% (19/177), prevalensi E. coli sebesar 23,2% (41/177), prevalensi E. pöleck sebesar 18,6% (33/177), prevalensi I. butschlii sebesar 7,9% (14/177), prevalensi E. nana sebesar 9,6% (17/177), prevalensi D. fragilis sebesar 3,4 (6/177), dan prevalensi Blastocystis sp. sebesar 6,2% (11/177). Amoeba dari spesies E. coli dan E. pöleck menjadi spesies amoeba tertinggi pervalensinya di tiga kelompok MEP liar. Kelompok MEP liar yang berada di sekitar lokasi wisata Cot Murong dan TKNI secara spasial lebih terkonsentrasi dengan amoeba usus dibandingkan dengan MEP liar yang berada di lokasi Kebun Mangga. Kecuali D. fragilis yang hanya ditemukan pada kelompok MEP liar yang berada di lokasi Kebun Mangga, semua spesies amoeba yang teridentifikasi dalam penelitan ini ada ditemukan di tiga lokasi kelompok MEP liar. Namun, secara statistik proporsi amoeba dari spesies I. butschlii, E. nana dan D. fragilis berbeda baik yang berada di lokasi Cot Murong, Kebun Mangga maupun TKNI. Berdasarkan hasil pemeriksaan sampel tinja manusia yang mewakili masyarakat Kota Sabang diketahui prevalensi amoeba usus sebesar 47,1% (206/437). Hasil identifikasi lanjut diketahui, prevalensi infeksi tunggal sebesar 33,6% (147/437) dan infeksi campuran (multi infeksi) sebesar 13,5 (59/437). Hasil identifikasi tersebut juga diketahui prevalensi kompleks Entamoeba histolytica/dispar/moshkovskii sebesar 16,9% (74/437), prevalensi E. harmannii sebesar 9,4% (41/437), prevalensi E. coli sebesar 17,8% (78/437), prevalensi E. nana sebesar 10,8% (47/206), prevalensi D. fragilis sebesar 5,5% (24/437), dan prevalensi Blastocystis sp. sebesar 0,7% (3/437). Variabel jenis kelamin sebagai satu-satunya aspek sosiodemografi masyarakat Kota Sabang yang berkorelasi dengan kejadian infeksi amoeba usus. Berdasarkan wilayah administratif, desa/gampong yaitu Keunekai, Balohan, Batee Shok, Cot Ba’U, Iboh, Krueng Raya, dan Paya menjadi desa/gampong yang memiliki proporsi tertinggi ditemukan kejadian infeksi amoeba usus. Sedangkan berdasarkan jangkauan titik konsentrasi kepadatan rumah, sebesar 69,9% (144/147) kejadian infeksi amoeba usus tersebar di pemukiman padat. Penelitian tahap ketiga bertujuan untuk determinasi faktor-faktor yang berpengaruh terhadap kejadian infeksi kompleks Entamoeba histolytica/dispar/moshkovskii. Berdasarkan hasil pemeriksaan sampel tinja responden diketahui prevalensi infeksi kompleks Entamoeba histolytica/dispar/moshkovskii pada kelompok umur ≥ 10 tahun sebesar 26,6% (89/335). Perilaku mencuci tangan dengan air mengalir dan sabun pada saat makan atau menyentuh makan berkorelasi dengan
Keyword: amoeba usus, epidemiologi, masyarakat, monyet ekor panjang

Judul: Identification of Entamoeba histolytica in Long-Tailed Macaque (Macaca fascicularis) at Primate Research Center IPB University with Nested PCR
Abstrak: Monyet ekor panjang banyak ditemukan di Indonesia, khususnya di wilayah Bali, Kalimantan, Sumatra, dan Jawa. Interaksi antara manusia dan monyet ekor panjang meningkatkan risiko transmisi penyakit zoonotik akibat infeksi protozoa pada monyet ekor panjang. Entamoeba spp. diketahui sebagai protozoa yang paling banyak menginfeksi monyet ekor panjang. Spesies Entamoeba histolytica memiliki risiko zoonosis. Spesies ini diketahui sebagai penyebab amoebiasis yang menimbulkan ratusan ribu kasus kematian pada manusia. Oleh karena itu, penelitian ini dilakukan untuk mengidentifikasi spesies Entamoeba yang menginfeksi monyet ekor panjang di Pusat Studi Satwa Primata IPB. Metode nested PCR dipilih karena dianggap sebagai metode yang memiliki sensitivitas dan spesifisitas tinggi dalam mengenali spesies Entamoeba. Hasil penelitian menunjukkan bahwa 6 dari 20 (30%) sampel positif Entamoeba spp. dan 5 dari 20 (25%) sampel tersebut positif Entamoeba histolytica. Upaya pencegahan infeksi Entamoeba histolytica pada monyet ekor panjang dapat dilakukan melalui peningkatan sanitasi kandang, pemerhatian manajemen perkandangan, dan pemberian vaksin., Long-tailed macaques are commonly found in Indonesia, especially in Bali, Kalimantan, Sumatra, and Java. The interaction between humans and long-tailed macaques increases the risk of zoonotic disease transmission due to protozoan infection in long-tailed macaque. Entamoeba spp. is known to be the most common protozoan infects long-tailed macaque. Entamoeba histolytica species cause zoonotic risk. This species also known as the cause of amoebiasis which causes hundreds of thousands of deaths in humans. Therefore, this study was conducted to identify species of Entamoeba that infects long-tailed macaques in Primate Research Center IPB University. The nested PCR method was chosen because it is considered to have high sensitivity and specificity in identifying Entamoeba species. The result showed that 6 out of 20 (30%) samples were positive for Entamoeba spp. and 5 out of 20 (25%) of these samples were positive for Entamoeba histolytica. Prevention of Entamoeba histolytica infection in long-tailed macaques can be done through improving cage sanitation, intensifying cage management, and administering vaccines.
Keyword: Entamoeba histolytica, long-tailed macaque, nested PCR, Macaca fascicularis, Primate Research Center IPB University 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: