Judul: Kemungkinan Penggunaan Enzyme Linked Immuno Sorbent Assay (ELISA) Dalam Diagnosa Serologis Brucellosis
Abstrak: Masalah yang utama dari Brucellosis adalah kesukaran dalam diagnosa. dimana kasus Bruoellosis baru dapat terdeteksi apabila gejala klinis telah tampak yang berarti penoemaran lingkungan pada tempat sekitar kandang serta ternak yang lain telah terjadi. Masalah lain adalah dimana hewan. tidak menunjukkan gejala yang jelas sedangken hewan tersebut dapat bertindak sebagai reaktor penyakit.
Keyword: 

Judul: IPB (Bogor Agricultural University)
Abstrak: Bruselosis adalah penyakit zoonotik yang menyerang multispesies hewan. Penyakit ini disebabkan oleh genus Brucella yang menimbulkan morbiditas dan kerugian ekonomi yang sangat tinggi pada ternak. Spesies Brucella yang paling patogen pada manusia dan menyerang kambing adalah Brucella melitensis, namun demikian spesies Brucella yang menjadi perhatian utama dalam kesehatan hewan ternak di Indonesia adalah Brucella abortus yang menyerang sapi dan Brucella suis yang menyerang babi. Kajian penyakit Brucella di Indonesia masih fokus pada ruminansia besar, sementara kajian penyakit pada ruminansia kecil khususnya kambing masih belum banyak dilakukan. Penelitian ini bertujuan untuk mendeteksi Brucella spp. pada kambing di Pulau Jawa dan mengembangkan teknik diagnostik indirect Enzyme-linked Immunosorbent Assay I-ELISA untuk diagnosis bruselosis. Deteksi Brucella spp. dilakukan pada kambing-kambing yang dilalulintaskan melalui Balai Karantina (BKP) Kelas II Cilegon (Ngawi), sentra perdagangan kambing di Pulau Jawa (Pasar Ambarawa), peternakan di daerah asal yang diketahui seropositif bruselosis berdasarkan hasil pengujian BKP Kelas II Cilegon (Semarang dan Boyolali), sentra bibit unggul kambing peranakan Etawa (Purworejo), dan Rumah Potong Hewan RPH Propinsi DKI Jakarta. Jumlah sampel yang dideteksi dari survei kambing hidup sebanyak 214 set sampel, terdiri atas sampel serum, usap vagina, dan susu. Jumlah sampel yang dideteksi di RPH Jakarta berjumlah 119 set sampel yang terdiri atas serum, susu, usap vagina, organ uterus, limpa, limfoglandula supramamaria, dan kelenjar susu. Deteksi bruselosis dilakukan secara serologis dengan Rose Bengal test RBT, Complement Fixation test CFT dan Enzyme-linked Immunosorbent Assay ELISA secara paralel. Sampel yang menunjukkan hasil positif secara uji serologis dan terdapat perubahan patologi anatomi, dilakukan kultur bakteri (usap vagina, organ dan susu) dan uji polymerase chains reaction PCR. Pengembangan teknik I-ELISA untuk diagnostik bruselosis pada ruminansia kecil (kambing dan domba) juga dilakukan. Antigen I-ELISA yang digunakan dibuat dengan cara modifikasi dalam pembuatan antigen S-LPS yaitu dengan cara pengendapan. Brucella abortus S99 strain Waybridge digunakan dalam penelitian ini sebagai sumber antigen. Antigen yang digunakan dalam penelitian ini adalah whole S-LPS, endapan, dan supernatan. Hasil penelitian menunjukkan proporsi sampel seropositif bruselosis pada kambing di beberapa kabupaten yang seropositif bruselosis pada sapi dan menunjukkan gejala klinis mirip bruselosis pada kambing di Pulau Jawa adalah 2.3 (5/214) (95% Selang Kepercayaan SK; 0.0209 - 0.0251), sementara itu proporsi sampel seropositif bruselosis pada kambing-kambing yang ada di RPH DKI Jakarta adalah 0.84 1/119 (SK 95%; 0.00826 - 0.00854). Kejadian seropositif bruselosis terjadi pada sampel berasal dari pasar hewan dan lalu lintas hewan. Teknik I-ELISA dengan menggunakan antigen endapan S-LPS baik digunakan untuk pengujian bruselosis pada kambing dan domba. Nilai sensitivitas analitik dan spesifitas masing-masing 100% SK 95 100-100 dan 99.2% SK 95 98.4-100. Nilai kesesuaian uji dengan kit I-ELISA komersial sebesar 0.84. Nilai 0.84 menunjukkan kesesuaian dua teknik I-ELISA sangat baik, sehingga teknik diagnostik ini dapat diterapkan sebagai alternatif pengujian bruselosis pada kambing dan domba. Namun demikian penerapannya tetap harus dilakukan secara paralel dengan RBT. Teknik I-ELISA dengan menggunakan antigen supernatan S-LPS menunjukkan sensitivitas, spesifisitas, akurasi dan koefisien variasi kontrol positif yang lebih baik dari I-ELISA dengan antigen S-LPS. Teknik I-ELISA dalam penelitian ini memiliki kesesuaian yang sangat baik dengan kit I-ELISA komersial. Nilai sensitivitas, spesifisitas dan akurasi I-ELISA dengan antigen supernatan S-LPS masing-masing 98.1%
Keyword: brucellosis, goat, I-ELISA, seroprevalence, sheep

Judul: The Construction of Greedy SVP LLL Algorithm
Abstrak: A lattice is a set of all integer linear combination of a set of linearly independent vectors in ℝ𝑛���. The independent vectors are called bases of lattice. Any lattice can be generated from many bases, and these bases have the same cardinality. In the lattice, the most fundamental and renowned problem is the Shortest Vector Problem (SVP). SVP is a tracking problem of the shortest nonzero vector in a lattice with equivalent bases. In two dimensions, SVP problem has resolved exactly by Gauss’ algorithm. When the lattice dimension is higher than two, A.K. Lenstra, H.W. Lenstra and L. Lovasz gave a LLL algorithm to compute approximation of nonzero shortest vector in the lattice. Reduced bases solution obtained from LLL algorithm still be an approximation and has polynomial running time of arbitrary dimension which large enough. In 1994, Schnoor and Euchner modified this LLL algorithm as a new variant which later was named deep insertion LLL algorithm. This algorithm is a modified version of the LLL algorithm to the terms of the exchange step to improve the accuracy of output of LLL reduced bases and applying it to the subset sum problem. The purpose of this research are: (1) Reconstruct the LLL algorithm and deep insertion LLL algorithm using a geometric approach. (2) Construct a greedy SVP LLL algorithm. (3) Implement the three algorithms in a symbolic programming language, and evaluate them experimentally. A bases ℬ=[𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑛���] in ℝ𝑚��� is called reduced LLL with parameter 𝛿��� if satisfies: (a) |𝜇���𝑗���𝑖���|≤12, for every integer 𝑖���,𝑗��� with 1≤𝑖���<𝑗���<𝑛���. (b)𝛿���‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���)‖2≤‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���+1)‖2, for 𝑗���=1,2,…,𝑛���−1,where 𝛿��� is a reduced parameter of real numbers with 14<𝛿���<1. The first requirement is the reduced basis 𝛿��� must “nearly orthogonal” and in its computation case, this requirement can be reached out by using the Gram-Schmidt’s orthogonalization. While the second requirement is called exchange step, or used to called as Lovasz condition. By using both of these requirements, then they establish the LLL algorithm. Then, Schnoor and Euchner modify the LLL algorithm based on the requirements of the exchange step called the deep insertion LLL algorithm, where the exchange step is based on the comparison of the projected vector in orthogonal complement [𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑘���−1]⊥ after j-th reduction. To construct greedy SVP LLL algorithm, the requirements of the exchange step is based on purely by comparing norm of lattice 𝐛���𝑗��� with norm lattice 𝐛���𝑖��� for 𝑖���=1,2,3…,𝑗���−1. The process of insertion reduced vector after the exchange step also has done greedily. Then, we calculate the number of arithmetic operation in greedy SVP LLL algorithm for further analysis. The result of our exprimentation for three algorithms on the certain matrix size shows that the running time of the three algorithms increases propotional to the size of the matrix. The result also shows that by using 𝛿���=34 for the LLL algorithm and the deep insertion LLL algorithm, and the greedy SVP LLL algorithm which is a new variant made by using no parameter of 𝛿���, outperform of the other of two previous algorithm in terms of speed with the same output.
Keyword: LLL algorithm, LLL deep insertion algorithm, greedy SVP LLL algorithm