Judul: Pemetaan Lokasi, Identifikasi Morfometri dan Analisa Ancaman Terhadap Danau-danau di Sepanjang Daerah Aliran Sungai Mahakam, Kalimantan Timur
Abstrak: Keunikan dan kekhasan biodiversity dan nilai-nilai ekologis danau-danau di DAS Mahakam harus dijaga kelestariannya karena merupakan faktor penting dalam keanggotaannya sebagai salah satu danau yang menjadi mitra organisasi dunia living Lakes. Upaya konservasi danau ini masih sangat kurang, karena terbatasnya informasi tentang sebaran, jumlah, dan parameter morfometri danau yang ada. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi sebaran danau-danau di sepanjang DAS Mahakam, mengkaji parameter morfometri permukaan (surface dimensions) dan hubungannya dengan karakteristik ekologis disekitamya serta mengidentifikasi permasalahan-permasalahan yang menjadi ancaman bagi kelangsunganjkeberadaan danau-danau di sepanjang DAS Mahakam. Lokasi penelitian (diidentifikasl dari peta rupa bumi yang diterbitkan Bakosurtanal tahun 1991 dan 1993) meliputi sebaran danau-danau yang terdapat di sepanjang Daerah Aliran Sungai (DAS) Mahakam, Kabupaten Kutai dan Kotamadya Samarinda, Propinsi Kalimantan Timur. DAS Mahakam di Kalimantan Timur terbentang melalui daerah Kabupaten Kutai dan Kotamadya Samarinda sepanjang 114°15' BT-117°30' BT dan 01°30' LU-00045'LS yang terbagi menjadi bagian Mahakam hulu, Mahakam tengah, dan Mahakam hilir. Dari pemetaan lokasi menurut peta rupa bumi skala 1:50.000 terdapat total 165 danau tersebar di sepanjang DAS Mahakam (total 28.931,83 ha) dengan masingmasing luas danau sangat bervariasi. Danau-danau tersebut hanya terdapat di DAS Mahakam tengah dan hilir, sedangkan di hulu tidak didapatkan data. Di Mahakam tengah ditemukan danau yang menyebar lebih merata yaitu 64,95% terletak di sebelah Selatan Sungai Mahakam dan 35,05% terletak di sebelah Utara Sungai Mahakam. Bagian Mahakam hilir, terdapat 68 danau di Kotamadya Samarinda dan 97,06% terletak di sebelah Utara dan hanya 2,94% yang terletak di sebelah Selatan Sungai Mahakam. Nilai SDl Danau-danau Mahakam menggambarkan potensi tingkat kesuburan danau yang tergolong rendah. Meskipun pengukuran panjang garis tepi dan SOl menunjukkan danau-danau DAS Mahakam memiliki potensi kesuburan yang rendah, namun karena hampir semua danau memperoleh suplai air dari Sungai Mahakam yang luas daerah tangkapan airjDAS nya sangat besar (77.700 km2 ), maka danaudanau ini diduga memiliki tingkat kesuburan yang tinggi. Permasalahan yang menjadi ancaman bagi Danau-danau Mahakam secara tidak langsung meliputi perubahan tata guna lahan, penebangan dan kebakaran hutan, dan pertumbuhan tanaman air yang tidak terkendali. Sedangkan ancaman langsung dapat berupa pendangkalan dan kegiatan perikanan masyakarat sekitar danau. Disarankan agar seluruh DAS Mahakam dijadikan satu kesatuan pengelolaan sistem konservasi, agar sistem lahan basah dan keanekaragaman hayati didalamnya tidak punah.
Keyword: 

Judul: Analisis Kelembagaan dalam Pengelolaan Keramba Jaring Apung (KJA) Danau Maninjau Sumatera Barat
Abstrak: Danau Maninjau merupakan salah satu danau prioritas Indonesia. Jumlah Keramba Jaring Apung (KJA) yang tercatat oleh Dinas Perikanan dan Ketahanan Pangan Kabupaten Agam sebanyak 17.690 petak, dengan daya dukung danau hanya 6.000 petak. Jumlah KJA yang melebihi daya dukung ini mengakibatkan terjadinya pencemaran kualitas air danau dan penumpukan sedimentasi di dasar danau hingga menyebabkan kematian massal ikan. Penelitian ini bertujuan untuk: 1) mengestimasi kerugian akibat fenomena kematian massal ikan budidaya di Danau Maninjau, 2) mengidentifikasi stakeholder yang terlibat dan mengetahui hak kepemilikan yang berlaku, 3) menganalisis peran stakeholder yang terlibat, 4) menganalisis aturan operasional yang berlaku, dan 5) merekomendasikan pengelolaan untuk kelembagaan yang berkelanjutan. Data yang diperoleh dianalisa dengan analisis loss of earning, analisis hak kepemilikan, analisis stakeholder, analisis konten, dan analisis deskriptif kualitatif dengan kerangka umum Social-Ecological Systems (SES). Hasil estimasi kerugian yang didapatkan akibat adanya fenomena kematian massal ikan adalah sebesar Rp 37.947.000.000. Stakeholder yang terlibat dalam pengelolaan KJA Danau Maninjau adalah DKP Prov.Sumbar, DPK Kab.Agam, DLH Kab.Agam, Pemerintahan Nagari, Kelompok Pembudidaya Ikan, dan LIPI Maninjau. Tidak ada stakeholder yang berada pada posisi owner. Berdasarkan tingkat kepentingan dan pengaruhnya, masih ada stakeholder yang belum berada pada kuadran yang seharusnya. Kelembagaan yang berjalan dalam pengelolaan KJA Danau Maninjau belum sesuai aturan. Rekomendasi pengelolaan untuk kelembagaan berkelanjutan pada pengelolaan KJA Danau Maninjau yaitu, perlu adanya kerjasama pengawasan dan penegakan aturan antara pemerintah dan masyarakat dalam menetapkan jumlah KJA, pemberian edukasi bagi pembudidaya ikan KJA untuk pemberian pakan yang optimal, dan penggunaan KJA yang ramah lingkungan.
Keyword: Danau Maninjau, kelembagaan, Keramba Jaring Apung, Social Ecological Systems

Judul: Kloning dan Ekspresi Human Interferon-alfa2a pada Yeast Metilotropik Pichia pastoris
Abstrak: Interferon (IFN) is a group of proteins that are secreted by body cells as a result of exposure to biological vertebrates such as: viruses, bacteria, protozoa and other compounds. There are three types of interferon, namely: alpha (α), beta (β) and gamma (γ) IFN. Interferon-α2a belongs to the type I interferon. This protein has a molecular weight of 21.550 kDa and consists of 188 amino acids (23 amino acid of signal peptide and 166 amino acids of mature protein). Interferon-α2a is also known to be used for the treatment of hepatitis C and as anti-tumor and antivirus agents. Regulator gene for IFN production under normal conditions, is in the off position to IFN is not produced. But when there are external stimuli, both viral and bacterial infections, a regulator gene switches on, and IFN production system running. At the time of an attack from a variety of disease agents actually the body will produce IFN, but generally the amount produced is not sufficient to fight the disease agents that multiply very quickly. Therefore IFN intake from outside is needed. This is the beginning of the use of IFN as a drug. Genetic engineering is an activity to manipulate the genes to get new products by creating recombinant DNA through gene insertion. Recombinant DNA technology has been used to produce IFN. Yeast such as Pichia pastoris can be an alternative as the host (system) to express human interferon genes and as a producer of IFN protein. Expression system P. pastoris offers several advantages for the production of recombinant proteins, such as: the high level expression of recombinant proteins, ease of scaling-up fermenter, low cost and ease of transformation techniques and selection of transformed cells such as bacteria . The existence of inducible AOX1 promoter is very strong, easily control the expression of recombinant proteins by induction. AOX1 is a promoter that controls gene expression of alcohol oxidase to metabolize methanol as carbon source of P. pastoris. Therefore,this study aimed to clone human interefron-α2a (hifnα2a) gene in E. coli and express it in metylotrophic yeast P. pastoris. Vector used in this study is pPICZαB (Invitrogen). Ligation process between insert (hifn-α2a gene) and vector (pPICZαB) performed by using T4 DNA ligase, which functions synthesize the formation of phosphodiester bonds linking the nucleotides with nucleotide insert plasmid vectors to produce recombinant (pPICZαB-hifnα2a). This recombinant plasmid transformed into XL1 blue cells (E. coli) by Heat shock method. The results of sequencing analysis (clone 6) using 5'AOX and 3'AOX primers indicate that DNA base sequence of human IFN-α2a genes has been subclone into pPICZαB vector (in frame). Recombinant plasmid (clone 6) linearized using BstX1 enzyme before transformed into X33 yeast cell. Transformation into cell was done by Electroporation. The X33 cell P. pastoris strain was used to express human interferon-α2a. X33 is strains with the phenotype Mut+ (methanol utilization plus) and can be used for positive transformants selection using zeocin. Phase protein production work using Mut+ strain occurred in two phases. The first phase is the use of glycerol to obtain a certain amount of biomass (high cell
Keyword: