Judul: Penapisan Aktinomiset Rizosfer Penghasil Kitinase dan Penentuan Keragaman Genetiknya
Abstrak: Komunitas mikroba tanah, khususnya kelompok aktinomiset rizosfer merupakan kelompok mikroorganisme yang berperan penting dalam memproteksi tanaman dari cendawan fitopatogen karena mampu memproduksi senyawa agroaktif, salah satunya mikolitk enzim terutama kitinase. Penelitian ini bertujuan mendeteksi aktivitas kitinase dan menganalisis keragaman gen penyandi kitinase famili 19. Sebanyak 50 isolat aktinomiset, 12 isolat (40%) dari rizosfer jagung dan 5 isolat (25%) dari rizosfer kedelai memiliki aktivitas kitinase yang diindikasikan dengan pembentukan zona bening di sekitar koloni pada media kitin agar 0.3% dengan rentang nilai indeks kitinolitik 0.49±0.01–2.15±0.69. Isolat terpilih (ARJ 36, ARJ 81, ARJ 15, ARK 17, ARK 143, dan ARK 103) memiliki aktivitas kitinase yang bervariasi pada pengujian secara kuantitatif dengan rentang nilai 0.157±0.04–0.440±0.09 U/mL. Aktivitas kitinase ini juga terkonfirmasi dengan terdeteksinya gen penyandi kitinase (~385 pb). Tujuh belas isolat teridentifikasi memiliki gen kitinase famili 19 dari Streptomyces dengan tingkat kemiripan 86%- 99.01% dibandingkan dengan basis data NCBI. Tujuh belas isolat kitinolitik tersebut memiliki potensi untuk dikembangkan lebih lanjut sebagai agen biokontrol pengendali cendawan fitopatogen.
Keyword: aktinomiset rizosfer, aktivitas kitinase, gen kitinase famili 19, Streptomyces

Judul: Aktinomiset Rizosfer Kedelai Penghasil Senyawa Bioaktif Antifungi terhadap Fusarium oxysporum
Abstrak: Fusarium oxysporum merupakan salah satu cendawan patogen yang menyerang tanaman kedelai dan menyebabkan penurunan produktivitas kedelai di Indonesia. Fungisida dianggap tidak mampu menyelesaikan masalah tersebut karena dapat meningkatkan resistensi dan menimbulkan permasalahan lingkungan yang lain. Salah satu alasan penting tidak digunakannya fungisida adalah kemampuannya yang dapat menurunkan viabilitas bakteri Rhizobium. Aktinomiset sebagai mikroorganisme yang menghasilkan paling banyak jenis senyawa bioaktif dapat digunakan sebagai solusi dalam menangani masalah tersebut. Penelitian ini bertujuan mengeksplorasi kemampuan aktinomiset rizosfer sebagai penghasil senyawa bioaktif antifungi terhadap F. oxysporum. Uji aktivitas antifungi secara in vitro melalui metode dual culture dilakukan terhadap 20 isolat aktinomiset rizosfer. Pengamatan aktivitas antifungi diamati dari perbandingan pertumbuhan radial sisi yang berhadapan dengan aktinomiset dengan sisi yang tidak berhadapan dengan aktinomiset. Uji hipersensitivitas dan kompatibilitas selanjutnya dilakukan terhadap 10 isolat aktinomiset potensial yang mampu menghambat F. oxysporum dari hasil skrining secara in vitro. Aktivitas antifungi selanjutnya dikonfirmasi secara in planta pada tanah steril dan tanah tidak steril. Sebanyak 5 isolat yang stabil dalam menghambat F. oxysporum in vitro dan in planta, selanjutnya diekstrak metabolitnya. Ekstrak metabolit terbaik ditunjukkan oleh isolat ARK 94 yang selanjutnya dianalisis menggunakan Gas Chromatography- Mass Spectrometry (GC-MS) untuk mengetahui senyawa kimia yang terkandung di dalamnya. Sebanyak 5 isolat terpilih tersebut juga diidentifikasi secara molekuler dengan mengamplifikasi gen 16S rRNA. Persentase penghambatan dari hasil uji aktivitas antifungi secara in vitro pada 10 isolat aktinomiset berkisar antara 38.69% hingga 73.50%. Respon hipersensitif tidak ditunjukkan oleh tanaman tembakau yang telah diinjeksi dengan isolat potensial dan seluruh isolat potensial kompatibel terhadap Bradyrhizobium japonicum. Uji aktivitas antifungi secara in planta menunjukkan bahwa 10 isolat hasil uji aktivitas antifungi in vitro mampu menekan penyakit akibat F. oxysporum secara in planta. Besar penekanan penyakit berkisar antara 36% hingga 80.7% pada tanah steril dan 67% hingga 100% pada tanah tidak steril. Sebanyak 5 isolat yang dipilih untuk diekstrak metabolitnya menunjukkan penghambatan terhadap pertumbuhan hifa F. oxysporum yang berkisar antara 19% hingga 54.09%. Ekstrak metabolit paling potensial, yaitu ARK 94 dianalisis senyawa kimianya menghasilkan 12 senyawa kimia dominan. Sebanyak 7 dari 12 senyawa tersebut memiliki aktivitas antifungi berdasarkan beberapa referensi hasil penelitian sebelumnya. Hasil BLAST sekuen 16S rRNA menunjukkan bahwa 5 isolat terpilih tersebut merupakan genus Streptomyces. ARK 94 menunjukkan konsistensi dalam aktivitasnya menghambat F. oxysporum dalam perlakuan in vitro, in planta, dan ekstrak metabolit.
Keyword: aktinomiset rizosfer, aktivitas antifungi, GC-MS, senyawa bioaktif

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: