Judul: Invivo poliploid induction, gene expression analysis of  FLOWERING LOCUS T-2 and effect of photoperiodism on shallot (Allium cepa L.  var. aggregatum)
Abstrak: kuran dan warna umbi menjadi preferensi konsumen, hal tersebut juga menjadi faktor utama dalam usaha peningkatan kualitas bawang merah. True shallot seed (TSS) yang dihasilkan dari bunga bawang memiliki keunggulan karena benih bebas penyakit dan mampu meningkatkan produktivitas bawang merah dibandingkan dengan budidaya menggunakan umbi. Namun varietas bawang merah seperti Rubaru yang memiliki ukuran umbi lebih kecil dibandingkan dengan varietas bawang merah lokal lain dan tidak dapat menghasilkan bunga. Usaha mutasi dengan menggunakan kolkisina diharapkan mampu meningkatkan ukuran dan kualitas umbi. Selain itu, pemahaman terkait mekanisme kerja gen pada pembungaan juga penting untuk usaha pemuliaan melalui teknik hibridisasi. Tujuan utama penelitian ini ialah: 1) Memperoleh bawang merah kultivar Rubaru dengan ploidi yang lebih tinggi dari asalnya melalui penggandaan secara in vivo. 2) Mengidentifikasi sikuen gen AcFT2 pada varietas bawang merah Lokananta, Bima Brebes, Rubaru, Palasa, dan Biru Lancor. 3) Mempelajari ekspresi relatif gen AcFT2 dan korelasinya terkait pembungaan pada lima varietas bawang merah Lokananta dan Bima Brebes. 4) Mempelajari kemampuan berbunga lima varietas bawang merah terhadap perbedaan fotoperiodisme. Penelitian dilakukan pada tahun 2019–2020 yang terdiri atas tiga percobaan, 1) Induksi poliploid bawang merah Rubaru dengan kolkisina, 2) Isolasi dan analisa ekspresi relatif gen AcFT2 3) percobaan perlakuan fotoperiodisme hari panjang dan hari pendek pada bawang merah. Percobaan induksi poliploid dilakukan pada bawang merah Rubaru dengan menggunakan Rancangan Kelompok Lengkap Teracak (RKLT) dengan 6 taraf perlakuan konsentrasi kolkisina yaitu: 0, 0,01, 0,02, 0,05, 0,1 dan 0,2% serta 5 taraf lama perendaman yaitu: 0, 3, 6, 12, dan 24 jam. Percobaan analisa ekspresi gen AcFT2 dilakukan dengan vernalisasi bawang merah varietas Lokananta dan Bima Brebes. Percobaan fotoperiodisme dilakukan dengan penanaman bawang merah pada kondisi natural (10 jam penyinaran) di Rumah Kaca Laboratorium Horticulture Gifu University Jepang selama 60 hari kemudian sebagian di beri perlakuan pemberian cahaya dengan lampu fluorescence selama 4 jam. Aplikasi kolkisina pada umbi secara invivo menghasilkan peningkatan ploidi terbatas hanya pada sel-sel tertentu. Sikuen fragmen gen AcFT2 dapat diidentifikasi pada varietas bawang merah Lokananta, Bima Brebes, Palasa, Rubaru dan Biru Lancor dengan tingkat homologi yang tinggi dengan sikuen gen referensi AcFT2 CUDH2150 dan gen FT genus Allium lainnya. Ekspresi relatif gen AcFT2 like shallot pada varietas bawang merah Lokananta dan Bima Brebes berkorelasi terhadap tingkat pembungaan. Varietas Lokananta menunjukkan ekspresi relatif gen dan jumlah umbel bunga yang tinggi. Perbedaan fotoperiodisitas berpengaruh pada pada jumlah umbel bunga dan umbel bunga terbuka varietas bawang merah Lokananta, Bima Brebes, Palasa, Rubaru dan Biru Lancor. Varietas Lokananta mampu berbunga pembungaan baik pada hari pendek (± 10 jam) maupun hari panjang., Ukuran dan warna umbi menjadi preferensi konsumen, hal tersebut juga menjadi faktor utama dalam usaha peningkatan kualitas bawang merah. True shallot seed (TSS) yang dihasilkan dari bunga bawang memiliki keunggulan karena benih bebas penyakit dan mampu meningkatkan produktivitas bawang merah dibandingkan dengan budidaya menggunakan umbi. Namun varietas bawang merah seperti Rubaru yang memiliki ukuran umbi lebih kecil dibandingkan dengan varietas bawang merah lokal lain dan tidak dapat menghasilkan bunga. Usaha mutasi dengan menggunakan kolkisina diharapkan mampu meningkatkan ukuran dan kualitas umbi. Selain itu, pemahaman terkait mekanisme kerja gen pada pembungaan juga penting untuk usaha pemuliaan
Keyword: LC50, qRT-PCR, flowering induction

Judul: Induksi Poliploidi pada Bawang Merah (Allium cepa var. aggregatum) dengan Menggunakan Kolkisin
Abstrak: Ukuran umbi merupakan salah satu kriteria preferensi konsumen terhadap bawang merah. Peningkatan ukuran umbi bawang merah lokal selain dapat meningkatkan kriteria pemilihan konsumen juga dapat meningkatkan produktivitas bawang merah lokal. Induksi poliploidi pada bawang merah dengan menggunakan kolkisin diharapkan dapat meningkatkan ukuran umbi bawang merah lokal. Tujuan utama penelitian ini ialah untuk perbaikan kualitas dan kuantitas bawang merah melalui aplikasi kolkisin sehingga ukuran maupun bobot umbi yang dihasilkan menjadi lebih besar. Untuk mencapai tujuan utama tersebut dilakukan serangkaian percobaan dengan sub tujuan: 1) Memperoleh nilai LC50 pada umbi dan biji TSS bawang merah hasil induksi mutasi dengan kolkisin, 2).Menduga beberapa parameter genetik karakter agronomi pada populasi mutan putatif bawang merah populasi M1V2, 3).Memperoleh informasi tentang tingkat ploidi bawang merah hasil induksi poliploid dengan kolkisin Penelitian ini dilaksanakan pada tahun 2014 sampai dengan 2016, yang terdiri atas 2 tahapan percobaan. Percobaan 1 Induksi Poliploidi Umbi Bawang Merah Varietas Bima Brebes dengan menggunakan Kolkisin. Percobaan dilakukan dengan menggunakan Rancangan Kelompok Lengkap Teracak (RKLT) dengan 4 taraf perlakuan konsentrasi kolkisin yaitu: 0, 0.01, 0.02 dan 0.03%. Pada percobaan 2 dibagi menjadi dua percobaan yaitu percobaan 2a. Induksi Poliploid TSS Bawang Merah dengan menggunakan Kolkisin. Varietas yang digunakan adalah Trisula, Batu Ijo dan Bima Brebes dengan menggunakan 5 taraf konsentrasi kolkisin yaitu 0, 0.25, 0.5, 0.75 dan 1%. Umbi hasil panen pada percobaan 2a (M1V1) digunakan sebagai bahan pada percobaan 2b yaitu Pendugaan Parameter Genetik Mutan Putatif Populasi M1V2 hasil Poliploid dengan Kolkisin. Hasil penelitian menunjukkan bahwa: 1) nilai LD50 pada umbi bawang merah Bima Brebes sebesar 0.0092%; sedangkan nilai LD50 pada TSS bawang merah Trisula 0.65%, LD50 pada TSS Batu Ijo 0.24% dan nilai LD50 pada TSS Bima Brebes 0.14%; 2) Induksi poliploid pada TSS dinilai lebih efektif bila dibandingkan dengan umbi dimana hasil pengamatan kromosom menunjukkan tidak ada perubahan kromosom yang dihasilkan pada perlakuan pemberian kolkisin pada umbi; 3) Nilai heritabilitas mutan putatif trisula populasi M1V2 berada pada kisaran rendah - tinggi (11.13-83.39%), dimana karakter yang memiliki nilai heritabilitas tinggi merupakan karakter yang berkaitan dengan ukuran umbi dan daun, sehingga kolkisin efektif dalam meningkatkan keragaman ukuran pada umbi dan daun; 4) Tingkat ploidi yang dihasilkan pada mutan putatif trisula populasi M1V1 adalah mixoploid, 5) Hasil analisis komponen utama dan analisis kluster menunjukkan pengelompokan yang terjadi diantara 28 mutan putatif Trisula populasi M1V2 mengelompok secara acak tidak berdasarkan konsentrasi hal ini menguatkan dugaan bahwa pengaruh kolkisin bersifat acak.
Keyword: kolkisin, LD50, mixoploid, mutan putatif, poliploid, TSS

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: