Judul: Identifikasi Marka Molekuler Terpaut Gen Ketahanan Bulai pada Tanaman Jagung (Zea mays L.)
Abstrak: Penyakit bulai adalah adalah penyakit yang disebabkan oleh cendawan Peronosclerospora yang menjadi salah satu penyakit penting pada tanaman jagung serta dapat menimbulkan kerusakan serius di pertanaman seluruh dunia dan berpotensi secara signifikan menyebabkan kehilangan hasil. Identifikasi marka molekuler terpaut lokus tertentu pada tanaman jagung, khususnya penyakit bulai, merupakan langkah strategis dalam meningkatkan ketahanan bulaimelalui program pemuliaan tanaman jagung. Tujuan utama dari penelitian ini adalah mengidentifikasi marka molekuler terpaut karakter ketahanan bulai pada tanaman jagung. Dua set populasi jagung (F3 dan F3:4) masing-masing terdiri dari 198 galur yang berasal dari persilangan R10-4430 (tetua betina) dan Kandora (tetua jantan) digunakan dalam penelitian ini. Populasi F3 digunakan dalam analisis genotipik dan F3:4 digunakan untuk analisis fenotipik. Selain itu kedua tetua persilangan digunakan pada masing-masing analisis. Satu set marka Simple Sequence Repeats (SSR) jagung yang diperoleh dari database tanaman jagung (maizegdb.org) digunakan pada analisis genotipik seluruh populasi dan tetua persilangannya. Penelitian ini berhasil memetakan sebanyak 44 pasang marka SSR ke dalam 10 grup pautan dengan total jarak genetik yang dapat dicakup pada penelitian ini sebesar 460.3 cM (39.75% dari total genom tanaman jagung) dengan jarak rata-rata antar marker sejauh 26.85 cM. Sebanyak tujuh lokus karakter kuantitatif (QTLs) untuk sifat ketahanan bulai berhasil diidentifikasi pada empat kromosom jagung, dengan rincian tiga QTL pada kromosom satu (qDM-Pp1a, qDM-Pp1b1 dan qDM-Pp1b2), satu QTL pada kromosom 5 (qDM-Pp5), dua QTL pada kromosom 6 (qDM-Pp6b1 dan qDM-Pp6b2), dan satu QTL pada kromosom 10 (qDM-Pp10). Efek gen aditif (gen ketahanan) terhadap penyakit bulai dari seluruh QTL sebesar 43.35% sampai dengan 53.71 %.Efek ini erat kaitannya dengan kontribusi alel-alel tetua donor yang diwariskan ke galur anakan secara poligenik terhadap karakter ketahanan tertentu. Pengaruh QTL terhadap fenotip ditunjukkan dengan nilai PVE. Berdasarkan penelitian ini, masing-masing QTL menunjukkan pengaruh yang besar terhadap fenotip dengan nilai PVE-nya lebih dari 10%. Penelitian ini menunjukkan tujuh QTL diidentifikasi terpaut dengan karakter ketahanan bulai, yaitu pada kromosom qDM-Pp1a (marka umc2225), qDM-Pp1b1 (marka bnlg1564), qDM-Pp1b2 (marka bnlg1884), qDM-Pp5 (marka phi048), qDM-Pp6b1 (marka nc010), qDM-Pp6b2 (marka bnlg1443) dan qDM-Pp10 (marka bnlg2190). Penelitian ini berhasil mengidentifikasi beberapa marka molecular yang terpaut sifat resisensi terhadap penyakit bulai pada jagung populasi F3:4 hasil persilangan jagung varietas R10-4430 dan Kandora.
Keyword: Bulai, jagung, ketahanan penyakit, marka molekuler

Judul: Identifikasi dan seleksi jagung Quality Protein Maize (Qpm) resisten penyakit bulai (Peronosclerospora Maydis) dan toleran kemasaman tanah
Abstrak: Jagung merupakan komoditas strategis dalam pembangunan pertanian dan perekonomian Indonesia, karena komoditas ini mempunyai fungsi yang multiguna, baik sebagai pangan maupun pakan. Namun demikian kekurangan jagung yang umum ditanam petani saat ini adalah mutu protein yang rendah,sehingga diperlukan kegiatan pemuliaan yang mampu meningkatkan mutu protein khususnya lisin dan triptofan. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi dan menyeleksi progeni jagung QPM yang toleransi terhadap penyakit bulai dan kemasaman tanah. Materi genetik yang digunakan adalah persilangan antara galur QPM (Srikandi Kuning-1) x galur agak resisten penyakit bulai dan agak toleran kemasaman tanah (Sukmaraga). Penelitian berlangsung dalam empat tahap.Tahap pertama : pembentukan populasi F2 dan identifikasi gen opaque-2 pada populasi F1 dengan marka penyeleksi phi057, di Laboratorium Molekuler Balitsereal pada bulan Februari – Maret 2008. Tahap kedua : skrining populasi F2 hasil seleksi SSR terhadap penyakit bulai, dilaksanakan di Kebun Percobaan Maros, Balitsereal Juni – Agustus 2008 dengan menggunakan rancangan perbesaran (Augmented Design). Tahap ketiga : skrining populasi F2 hasil seleksi SSR terhadap cekamam alumunium (Al3+) dengan menggunakan hematoxilyn dan larutan hara+Al3+10 ppm, di Laboratorium Pemuliaan Tanaman, Balitsereal, pada bulan Juli – September 2008 dengan menggunakan rancangan acak lengkap 2 ulangan, dan Tahap keempat : evaluasi toleransi populasi F2 hasil seleksi SSR terhadap kemasaman tanah dilaksanakan di KP Barambai di Kalimantan Selatan pada bulan Juli – November 2008 dengan menggunakan rancangan acak kelompok 2 ulangan. Hasil penelitian menunjukkan bahwa dari populasi F1 yang diseleksi, diperoleh 210 individu tanaman yang membawa gen opaque-2,selanjutnya populasi tersebut dievaluasi ketahanannya terhadap penyakit bulai (peronosclerospora maydis), aluminium pada larutan hara+Al3+10 ppm serta ketahanannya terhadap kemasaman tanah. Evaluasi terhadap penyakit bulai memperlihatkan bahwa persentase serangan penyakit bulai tertinggi pada pengamatan hari ke 28 dan terdapat 19 tanaman sangat resisten, 53 tanaman resisten, 62 tanaman agak resisten dan 76 tanaman populasi F2 yang rentan terhadap penyakit bulai. Uji lanjut LSI terlihat bahwa terdapat 17 genotipe tanaman sangat resisten dibandingkan dengan NP6215, 50 genotipe tanaman resisten dibandingkan dengan NP6645, 121 genotipe tanaman agak resisten dibandingkan dengan tetua agak resisten dan 170 genotipe tanaman rentan dibandingkan dengan tetua rentan. Resistensi tanamana jagung QPM terhadap penyakit bulai diduga mempunyai aksi gen parsial dominan dengan hertabilitas tinggi. Evaluasi dengan hematoxilyn dan larutan hara + Al3+ 10 ppm mengelompokkan 3 tanaman sangat toleran, 5 tanaman toleran, 12 tanaman agak iv toleran dan 24 tanaman peka. Karakter yang dapat digunakan sebagai karakter seleksi adalah panjang akar, panjang tajuk dan jumlah cabang akar. Tidak terdapat tanaman yang resisten terhadap penyakit bulai dan toleran terhadap cekaman aluminium pada larutan hara + Al3+ 10 ppm, 1 tanaman resisten dan toleran, 5 tanaman agak resisten dan agak toleran dan 5 tanaman rentan terhadap penyakit bulai dan toleran cekaman aluminium pada larutan hara + Al3+ 10 ppm. Evaluasi toleransi populasi F2 terhadap kemasaman tanah menunjukkan bahwa umumnya karakter memberikan respon yang berbeda dan karakter yang dapat digunakan sebagai karakter seleksi adalah bobot tongkol kupasan basah, aspek tanaman, jumlah biji/baris dan hasil. Berdasarkan ketiga karakter seleksi tersebut, populasi F2 toleransinya dikelompokkan menjadi empat kelompok yaitu 60 tanaman sangat toleran, 55 tanaman toleran, 47 tanaman agak toeran dan 59 tanaman peka. Terdapat 4 tanaman yang resisten
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: