Judul: Modul Incremental Sequential Pattern Mining untuk Data Titik Panas Pulau Sumatra.
Abstrak: Indikator kebakaran hutan dapat diketahui berdasarkan titik panas pada suatu wilayah. Informasi dari data titik panas tersebut dapat digunakan dalam pengambilan keputusan atau kebijakan yang tepat untuk penanganan dan pencegahan kebakaran hutan. Penelitian ini bertujuan untuk membuat modul sequential pattern mining yang mampu menangani adanya penambahan data baru sehingga dapat menghasilkan pola sekuensial setelah penambahan data tersebut. Algoritme tersebut dikembangkan dengan menggunakan perangkat lunak R dan menggunakan framework Shiny. Penelitian ini menggunakan algoritme SPADE dalam menentukan pola sekuensial pada data titik panas dengan adanya penambahan data baru. Data yang dianalisis yaitu data titik panas Pulau Sumatra pada tahun 2014. Penambahan modul untuk menangani penambahan data baru telah berhasil dilakukan dalam menghasilkan pola sekuensial yang baru. Adanya penambahan data baru mempengaruhi support dari sekuens dan dapat menghasilkan sekuens yang baru. Algoritme SPADE diterapkan pada data lama titik panas Sumatra 2014 menghasilkan 30 sekuens yang memenuhi minimum support 0.01 dari 7158 data titik panas. Penambahan 3859 data titik panas baru menghasilkan total 31 sekuens.
Keyword: framework shiny, titik panas, sequential pattern mining, SPADE

Judul: Pengembangan Modul Pembaruan Pola Sekuens Titik Panas.
Abstrak: Pola kemunculan titik panas merupakan salah satu indikator kebakaran hutan dan lahan. Dengan teknik data mining yaitu sequential pattern mining, data titik panas yang dikumpulkan secara berkala dapat membangkitkan pola sekuensial kemunculan titik panas. Penelitian sebelumnya telah melakukan incremental sequential pattern mining (ISPM) namun hanya bisa dijalankan di console R. Penelitian ini berfokus pada pengembangan modul pembaruan sekuens titik panas yang mengadopsi ISPM pada aplikasi pembangkitan dan visualisasi pola sekuens titik panas. Data yang digunakan merupakan data titik panas Kementerian Lingkungan Hidup dan Kehutanan Republik Indonesia tahun 2012 sampai dengan 2017. Modul dikembangkan menggunakan metode pengembangan Adaptive Software Development (ASD) sebanyak dua iterasi. Aplikasi dibangun menggunakan Java untuk pembuatan web, library SPMF untuk algoritme SPADE, dan MySQL untuk Database Management System (DBMS). Hasil pengujian menunjukkan bahwa dua tujuan utama yaitu memperbaiki aplikasi dan penambahan modul sudah berhasil dilakukan. Pada penelitian ini juga sudah dilakukan pengujian usability dan didapat nilai efektivitas sebesar 96.88%, dan nilai kepuasan didapat 78%, serta beberapa rekomendasi perbaikan.
Keyword: adaptive software development, Java, sequential pattern mining, SPADE, titik panas

Judul: Heterologous Expression Of Endo-Β-Xylanase From Bacillus Pumilus Strain Bcrs-01 In Escherichia Coli.
Abstrak: Xylanases are glycoside hydrolase family 11 which depolymerise xylan in the plant cell wall, the most excessive form of hemicellulose. Endo-β-xylanases (EC 3.2.1.8) are most important to breakdown β-1,4-glicoside bond of xylan to produce disaccaride xyloolygosaccaride (XOs) and xylose (monomer). Bovine rumen fluids have potential to obtain endo-β-xylanase produced of bacteria. The objectives of this study were to obtain xylanase producing bacteria and to express xynA gene encoding endo-β-xylanase from bacterium in Escherichia coli. Twenty nine isolate bacteria have been succesfully isolated from bovine rumen fluid in agar medium containing birchwood xylan. Isolate BCRS-01 bacterium was previously screened for the high production of xylanase. Based on 16S rRNA gene sequence analysis, BCRS-01 showed high similarity (99%) to Bacillus pumilus (accession number NR043241). The crude xylanase had optimal activity at 55oC, pH 7.0. Furthermore, the crude xylanase exhibited broad pH stability from 4.0 to 10.0 and remained more than 60% and 40% of its activity after incubation at pH 4.0 until 10.0, respectively for 60 min. It also showed a stability at temperature 25-50oC since it retained 80% and 50% of its activity when incubated at 50oC or 30 and 60 min, respectively. The xylanase activity was strongly inhibited by Ca2+ and Cu2+ at concentration 10 mM, and as little as 1 mM for Mn2+. Therefore, this xylanase has potentially used as additive feeds in animal feed industry. The DNA sequence xynA gene encoded endo-β-xylanase was amplified and cloned into the expression vector pET-15by under the control of T7 promoter. The recombinant protein had succesfully expressed in Escherichia coli BL21 (DE3) pLysS. A protein recombinant of approximately, 26.7 kDa was observed on the SDS-PAGE analysis. Crude extract of recombinant endo-β-xylanase demonstrated activity of enzyme at 56 U mL-1 using birchwood xylan as a substrate at 55oC for 10 min.
Keyword: Bacillus pumilus, bovine rumen fluid, endo-β-xylanase, heterologous expression.