Judul: Analisis Genetik dan Efisiensi Seleksi Menggunakan Single Seed Descent pada Kedelai [Glycine max (L.) Merr.] untuk Adaptasi Tanah Masam
Abstrak: Persilangan merupakan salah satu metode untuk menggabungkan sifat-sifat yang diinginkan. Hasil persilangan akan mempermudah usaha dalam menyeleksi tanaman untuk mendapatkan sifat yang diinginkan.Diharapkan dari penelitian ini dapat diseleksi galur-galur yang toleran tanah masam dan berdaya hasil tinggi di tanah masam dari persilangan Argomulyo denganTanggamus. Penelitian ini bertujuan untuk (1) memperoleh informasi tentang aksi gen dan pewarisan sifat karakter agronomi kedelai terhadap cekaman aluminium di tanah masam dan di kultur hara; (2) memperoleh marka RAPD terpaut toleransi cekaman aluminium melalui metode bulk segregrant analisis; (3) memperoleh informasi tentang keragaman genetik karakter pertumbuhan, komponen hasil dan hasil pada F3 dan F4 dengan metode single seed descent; (4) memperoleh galur kedelai yang toleran tanah masam melalui seleksi daya hasil dan marka RAPD; (5) memperoleh informasi tentang keragaan pertumbuhan dan daya hasil galur-galur F5 terseleksi berdasarkan daya hasil dan marka RAPD terpaut toleransi cekaman Al. Studi pewarisan sifat toleransi kedelai terhadap tanah masam dilaksanakan di dua lokasi, yaitu lahan di Jasinga, Kabupaten Bogor mulai bulan Mei sampai Agustus 2012 dan di Rumah Kaca University Farm IPB Cikabayan Bogor bulan Maret 2013. Studi keragaman genetik generasi F3 dan F4 dengan metode single seed descent dilaksanakan di Kebun Percobaan BB Biogen, Cimanggu mulai bulan Oktober 2012 sampai Mei 2013. Seleksi marka RAPD terpaut sifat toleransi aluminium menggunakan metode bulk segregant analysis dilaksanakan di Laboratorium Biomolekuler, Departemen Agronomi dan Hortikultura IPB mulai bulan April 2013 sampai Juni 2013. Perbandingan keragaan galur-galur F5 hasil seleksi karakter agronomi dan marka molekuler di tanah masam dilaksanakan di UPTD lahan kering Tenjo, Kabupaten Bogor pada bulan Oktober 2013 sampai Januari 2014. Rancangan yang digunakan yaitu Augmented Design. Hasil penelitian pewarisan sifat toleransi tanah masam menunjukkan bahwa populasi F2 kedelai hasil persilangan Argomulyo dan Tanggamus memiliki nilai tengah lebih tinggi dari nilai tengah kedua tetua untuk beberapa karakter agronomi yang diamati dan terdapat segregan transgesif. Karakter agronomi yang diamati dikendalikan oleh gen aditif dan epistasis komplementer, kecuali karakter tinggi tanaman yang hanya dikendalikan oleh banyak gen dan aksi gen aditif. Nilai heritabilitas arti luas untuk karakter agronomi yang diamati tergolong rendah sampai sedang. Percobaan pewarisan sifat toleransi terhadap aluminium di kultur hara, karakter panjang akar dikendalikan oleh banyak gen dengan aksi gen aditif dan epistasis duplikat, sedangkan karakter lainnya dikendalikan oleh aksi gen aditif dan epistasis komplementer. Nilai heritabilitas karakter pertumbuhan yang diamati tergolong sedang sampai tinggi. Sifat root re-growth kedelai pada cekaman aluminium dikendalikan oleh banyak gen dengan aksi gen aditif dan epistasis 4 komplementer tetapi bobot kering akar dikendalikan oleh sedikit gen dengan aksi gen aditif dan epistasis komplementer. Studi keragaman karakter agronomi pada populasi kedelai yang dikembangkan dengan metode single seed descent memperlihatkan bahwa populasi F4 memiliki nilai tengah dan ragam genetik tetap tinggi untuk karakter agronomi yang diamati sama dengan populasi F3. Populasi F3 memiliki nilai heritabilitas dan KKG tergolong tinggi untuk karakter-karakter agronomi kedelai sama dengan populasi F4, kecuali karakter bobot 100 biji tergolong sedang. Seleksi marka molekuler terpaut toleransi aluminium dengan metode bulk segregant analysis (BSA) menghasilkan satu marka OPH-12 pada lokus 1200 yang terpaut sifat toleransi aluminium pada kelompok dan individu yang toleran di kultur hara. Marka
Keyword: aditif,, bulk segregant analysis, epistasis duplikat, epistasis komplementer, marka, single seed descent

Judul: Keragaan karakter agronomi galur-galur kedelai, Glycine max (L.) Merr.) F4:5 pada keadaan ternaungi
Abstrak: Kegiatan penelitian dilakukan untuk menguji galur-galur kedelai hasil persilangan kedelai toleran naungan dengan berdaya hasil tinggi dan memperoleh informasi mengenai karakter agronomi galur-galur kedelai F4:5 kedelai pada keadaan ternaungi. Penelitian ini dilaksanakan mulai dari bulan April sampai dengan bulan Agustus 2004 yang berlokasi di Kebun Percobaan Balai Besar Bioteknologi dan Sumberdaya Genetika Pertanian, Cimanggu, Bogor. Rancangan yang digunakan pada penelitian ini adalah augmented design dengan menggunakan Rancangan Acak Lengkap (RAL) satu faktor. Perlakuan yang digunakan adalah 140 galur F5 hasil seleksi dari 12 famili persilangan kedelai F4 dan 4 genotipe tetua sebagai pembanding (Pangrango dan Ceneng sebagai pembanding toleran dan Slamet dan Godek A sebagai pembanding peka) yang diulang 3 kali. Semua perlakuan diuji pada naungan paranet 55%. Namun jumlah galur F5 yang dianalisis hanya 110 galur dari 140 galur. Hal ini disebabkan 110 galur tersebut memiliki jumlah sampel tanaman yang cukup yaitu 5 sampel tanaman, sedangkan sisanya tidak mencukupi 5 sampel. Peubah yang diamati adalah tinggi tanaman, jumlah daun, jumlah cabang produktif dan buku produktif, umur berbunga dan panen, tipe pertumbuhan batang, jumlah polong total, jumlah polong isi, jumlah polong hampa, persentase polong isi dan polong hampa, jumlah biji per polong, dan bobot biji. Hasil uji F menunjukkan adanya keragaman pada galur-galur kedelai generasi F5 yang diuji untuk hampir semua karakter agronomi yang diamati. Hal itu diperlihatkan oleh karakter tinggi tanaman, jumlah daun, jumlah cabang produktif dan buku produktif, umur berbunga dan panen, jumlah polong total, jumlah polong isi, jumlah polong hampa, persentase polong isi dan polong hampa, dan bobot biji, yang berbeda nyata. Namun, karakter jumlah biji per polong tidak berbeda nyata pada galur-galur kedelai generasi F5 yang diuji. Naungan umumnya dapat menyebabkan tanaman mengalami peningkatan tinggi tajuknya, umur panen lebih lambat, jumlah polong sedikit dan hasil biji yang rendah Galur PG25 memiliki jumlah daun, jumlah polong total, jumlah polong isi dan hasil biji yang tertinggi. Galur ini memiliki hasil biji rata-rata 7.12 g/tanaman. Galur CP15 memiliki jumlah cabang produktif dan jumlah buku produktif tertinggi, namun memiliki hasil biji sedang. Hasil biji rata-rata galur CP15 yaitu 4.26 g/tanaman. Berdasarkan pembandingan bobot biji galur-galur yang diuji dengan pembanding toleran diperoleh bahwa 69 galur sangat toleran, 21 galur toleran dan 20 galur peka. Beberapa galur dari kelompok sangat toleran memperlihatkan produktivitas tinggi dan sedang. Galur yang memiliki produktivitas tinggi, yaitu galur PG25 (7.12 g/tanaman) dan galur-galur yang memiliki produktivitas sedang antara lain galur PC3, CG27, GC10, GS14, GC28, GP15, SG11, CP15, dan SC8 dengan kisaran hasil antara 3.55-4.29 g/tanaman.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: