Judul: Phenotype and Genotype Analysis of Extended Spectrum Beta Lactamase Producing Escherichia coli from Chicken Slaughtering Effluent in Bogor City
Abstrak: Escherichia coli merupakan bakteri Gram negatif yang terdapat di saluran pencernaan hewan dan manusia (komensal). Escherichia coli mudah resistan terhadap antibiotik karena memiliki kemampuan menghasilkam enzim resistansi antibiotik, salah satunya yaitu extended spectrum beta lactamase (ESBL). Escherichia coli resistan antibiotik dapat menyebar melalui lingkungan, salah satunya melalui cemaran efluen proses pemotonga ayam dari rumah potong hewan unggas (RPH-U) dan tempat pemotongan ayam (TPA). Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi dan menganalisis sifat resistansi antibiotik E. coli penghasil ESBL secara fenotipe dan genotipe yang diisolasi dari sampel limbah cair (efluen) RPH-U dan TPA di Kota Bogor. Desain penelitian ini adalah eksploratif, dengan metode pengambilan sampel secara purposif. Sebanyak 12 sampel efluen digunakan dalam penelitian ini, dengan rincian masing-masing 4 sampel dari 3 RPH-U/TPA yang memiliki kapasitas pemotongan lebih dari 1.000 ekor/hari. Analisis laboratorium terdiri dari analisis fenotipe dan genotipe. Metode yang digunakan untuk analisis fenotipe adalah metode ESBL Ec Tricycle yang terdiri dari metode pengujian presumtif atau praduga dan konfirmasi E. coli penghasil ESBL. Metode pengujian presumtif atau praduga dilakukan dengan kultur sampel pada agar tryptone bile x-glucuronide (TBX) dan MacConkey agar (MCA) yang ditambahkan antibiotik cefotaxim 4µg/ml untuk praduga E. coli penghasil ESBL. Hasil positif pada pengujian sebelumnya dikonfirmasi dengan uji biokimia indol pada agar sulfite indole motility (SIM) dan double disk diffusion test pada Mueller Hinton agar (MHA) untuk mengidentifikasi E. coli penghasil ESBL. Analisis genotipe dilakukan dengan pengujian molekuler menggunakan alat Oxford Nanopore Technologies (ONT) MinION dan analisis bioinformatika menggunakan NanoARG. Analisis genotipe dilakukan untuk mendapatkan sifat resistansi berupa data genotipe dari E. coli penghasil ESBL yang terkonfirmasi pada analisis fenotipe. Escherichia coli penghasil ESBL teridentifikasi dari semua sampel yang berasal dari ketiga RPH-U/TPA di Kota Bogor. Persentase E. coli penghasil ESBL terendah 10,45% dan tertinggi 39,52% dengan rata-rata 17,76%. Gen resistan antibiotika blaCTX-M ditemukan pada semua sampel (100%) diikuti gen blaTEM sebesar 58,3%, yang menunjukkan adanya resistansi terhadap antibiotik cephalosporin generasi ke-3 terutama cefotaksim pada semua sampel. E. coli penghasil ESBL yang menyebar melalui cemaran efluen dapat menjadi ancaman kesehatan terutama terhadap masyarakat yang berada di sepanjang aliran sungai dan menggunakan air sungai sebagai sumber kehidupan sehari-hari. Penerapan higiene dan sanitasi perlu dilakukan perbaikan di RPH-U dan TPA. Sarana dan prasarana IPAL sangat penting dalam mencegah penyebaran bakteri E. coli penghasil ESBL ke lingkungan, sehingga perlu adanya penambahan sarana IPAL di TPA dan perbaikan IPAL di RPH-U. Instansi terkait khususnya dinas yang membidangi kesehatan dan otoritas veteriner di Kota Bogor perlu melakukan kontrol dan pengawasan antibiotik cephalosporin generasi ke-3. Penelitian lebih lanjut tentang kejadian resistansi antibiotik dapat dikembangkan dengan konsep one health pada ternak dan masyarakat di sepanjang aliran sungai di Kota Bogor dan wilayah lain di Indonesia.
Keyword: Antibiotic resistance, Bogor, efluent , extended spectrum beta lactamase, Escherichia coli, Antibiotic resistance, Bogor, efluent, extended spectrum beta lactamase, Escherichia coli

Judul: Tingkat Kejadian Escherichia Coli Penghasil Extended Spectrum Β-Lactamase Pada Feses Ayam Ras Pedaging Di Kota Bogor
Abstrak: Resistensi antibiotik merupakan masalah penting dalam dunia peternakan karena bakteri meningkatkan respon pertahanan diri terhadap antibiotik. Penggunaan antibiotik golongan Sefalosporin generasi ketiga untuk hewan penghasil pangan menyebabkan munculnya bakteri penghasil Extended Spectrum β-laktamase. Extended Spectrum β-laktamase (ESBL) banyak ditemukan di bakteri Escherichia coli pada beberapa tahun terakhir. Keberadaan E. coli penghasil ESBL tersebut tidak hanya ditemukan pada manusia, namun juga pada sebagian besar hewan termasuk hewan ternak serta pada pangan. Gen pengkode ESBL diketahui terdapat di dalam plasmid sehingga mudah ditransfer oleh satu spesies bakteri ke spesies bakteri lain. Masalah kesehatan yang muncul akibat adanya E. coli penghasil ESBL antara lain terjadinya multidrug resistance, kesulitan dalam deteksi dan pengobatan, serta meningkatnya angka kematian. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui tingkat kejadian E. coli penghasil ESBL dan pola resistensinya terhadap antibiotik dari feses ayam ras pedaging di Kota Bogor. Penelitian dilaksanakan pada bulan Juli 2015 sampai Januari 2016. Sebanyak 100 sampel feses diambil dari Sentra Pemotongan Ayam Kota Bogor. Isolasi E. coli dilakukan dengan menumbuhkan bakteri pada agar MacConkey lalu diidentifikasi menggunakan kit API 20E. Konfirmasi E. coli sebagai penghasil ESBL dilakukan dengan metode cakram ganda. Pada penelitian ini digunakan Klebsiella pneumoniae ATCC 700603 dan Escherichia coli ATCC 25922 sebagai kontrol. Adapun pengujian kepekaan E. coli terhadap antibiotik selain Sefalosporin generasi ketiga (sulfametaksazol, ampisilin, doksisiklin, kanamisin, streptomisin, dan eritromisin) dilakukan dengan metode disk diffusion. Escherichia coli yang ditemukan dari penelitian ini sebesar 16 isolat dan 25%nya merupakan E. coli penghasil ESBL. Tingkat resistensi terhadap antibiotik selain Sefalosporin generasi ketiga yaitu 93.7% (ampisilin), 75% (streptomisin), 68.75% (eritromisin), 62.5% (sulfametoksazol), 18.75% (doksisiklin), dan 6.25% (kanamisin). Hasil penelitian menunjukkan bahwa E. coli dari feses ayam ras pedaging di Kota Bogor bersifat multidrug resistance. Sifat multidrug resistance terhadap antibiotik golongan sefalosporin generasi ketiga dan golongan lain sering ditemukan pada bakteri penghasil ESBL. Bakteri komensal indikator yang bersifat multidrug resistance dapat menjadi masalah kesehatan karena E. coli mampu mentransfer gen resistennya kepada bakteri patogen.
Keyword: antibiotik, Escherichia coli, ESBL, resistensi.

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: