Judul: Autentikasi aneka produk tuna (Thunnus sp.) dengan metode DNA barcoding
Abstrak: Kasus-kasus penipuan dan pemalsuan penggantian label dalam perdagangan produk perikanan dunia, termasuk tuna, semakin marak terjadi. Kondisi ini menuntut adanya teknik pengembangan dalam penelusuran dan pendeteksian spesies secara cepat dan mudah, dengan hasil yang akurat. Autentikasi spesies berbasis DNA merupakan teknik yang banyak dikembangkan saat ini. Tujuan dari penelitian ini adalah mempelajari autentikasi aneka produk tuna (Thunnus sp) dengan metode DNA barcoding. Penelitian dilaksanakan dalam 2 tahap kegiatan, tahap ke-1 yaitu pengambilan sampel uji produk tuna dan tahap ke-2 berupa pengujian identifikasi spesies tuna dengan DNA barcoding, yang meliputi kegiatan (1) ekstraksi DNA dengan berdasarkan metode CTAB, (2) amplifikasi DNA (PCR) dan (3) identifikasi spesies dengan analisis BLAST dan filogenetik. Sampel tuna yang digunakan meliputi ikan tuna segar dan produk ikan tuna olahan. Sampel tuna segar merupakan ikan tuna jenis Thunnus albacares yang diperoleh dari industri pengolahan tuna dan dikirim dalam bentuk tuna steak segar dengan pengiriman langsung, sedangkan sampel olahan yang digunakan adalah produk sushi dan sashimi ikan tuna dan tuna steak yang dibeli dari restoran dan supermarket. Pengujian identifikasi spesies dilakukan dengan menggunakan pasangan primer COI1 dan COI3 dengan kondisi amplifikasi berupa denaturasi awal (preheating) pada suhu 95 oC selama 5 menit, diikuti sebanyak 39 siklus yang terdiri dari denaturasi 95 oC selama 30 detik, annealing (49-51) oC selama 40 detik dan ekstensi 72 oC selama 60 detik, serta langkah ekstensi akhir 72 oC selama 10 menit.
Keyword: 

Judul: Autentikasi produk tuna (Thunnus sp.) kaleng dengan metode polymerase chain reaction
Abstrak: Autentikasi bahan pangan merupakan salah satu tantangan bagi para pelaku bisnis pangan, termasuk pangan perikanan. Autentikasi konvensional berbasis morfologi memiliki kekurangan utama berupa ketergantungan akan kehadiran ahli dan kelengkapan morfologi dari ikan itu sendiri. Kelengkapan morfologi ikan dari pangan olahan tidak lagi utuh karena telah mengalami proses sterilisasi komersial, misalnya pada produk tuna dalam kaleng. Analisis berbasis protein juga memiliki kekurangan karena proses denaturasi protein selama pemasakan dan sterilisasi yang menyebabkan perubahan pada profil protein yang hendak diamati. Salah satu cara untuk dapat mengindentifikasi spesies yang telah mengalami perubahan bentuk dan denaturasi protein yang diakibatkan oleh proses fisika dan kimia adalah PCR-sequencing. Polymerase chain reaction dilakukan untuk mengamplifikasi gen cyt-b DNA mitokondria. Gen cyt-b dari DNA mitokondria digunakan dalam penelitian ini karena beberapa kelebihan yang dimiliki, yaitu bentuknya yang sirkular relatif lebih resisten terhadap suhu tinggi, kelimpahannya dalam sel tinggi, mengikuti garis keturunan ibu, tidak mengalami rekombinasi, tingkat mutasi sangat tinggi sehingga dapat digunakan untuk studi filogenetik. DNA empat spesies tuna segar dan tuna kaleng dapat diekstraksi menggunakan metode CTAB. DNA hasil ekstraksi kemudian diamplifikasi dengan menggunakan primer fishcytb-f dan cytb1-5r.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: