Judul: Bacillus pumilus-Specific Bacteriophage Isolated from Ciapus River in Bogor, West Java
Abstrak: Penyakit diare merupakan masalah kesehatan masyarakat di negara-negara berkembang. Penyakit ini menyebabkan kematian pasien diare di Indonesia dengan Case Fatality Rate (CFR) sebesar 1.79%. Pada tahun 2012, UPT Pusat Kesehatan Masyarakat Kecamatan Cigudeg, Bogor melaporkan bahwa jumlah penderita diare di Cigudeg cukup tinggi sebanyak 3180 pasien. Faktor utama penyebab diare pada anak-anak di daerah tersebut adalah kontaminasi bakteri patogen karena sanitasi lingkungan yang buruk. Salmonella sp, Shigella sp Citrobacter, Vagococcus, Haemopillus, Micrococcus, dan Streptococcus diisolasi dari sampel tinja anak-anak penderita diare di Cigudeg. Bakteri lain yaitu Enterococcus sp dan Bacillus sp diisolasi dari air lingkungan daerah Cigudeg. Menariknya, isolat Bacillus sp diidentifikasi sebagai Bacillus pumilus. Hal ini adalah laporan baru adanya B. pumilus yang ditemukan di daerah dengan jumlah penyakit diare tinggi. Bakteri ini merupakan bakteri pembentuk spora yang berkaitan dengan kasus keracunan makanan. Karakterisasi patogenisitas isolat B. pumilus dapat menghasilkan toksin haemolisin yang melisiskan sel darah merah dalam media kultur. Antibiotik biasa digunakan untuk mengobati penyakit yang disebabkan oleh bakteri. Uji antibiotik terhadap B. pumilus menunjukkan bahwa isolat ini resisten terhadap ampisilin dan klindamisin. Cara alternatif untuk mengurangi B. pumilus yaitu dengan aplikasi bakteriofag (fag) sebagai agen biokontrol B. pumilus di lingkungan. Fag pada penelitian ini diisolasi dari Sungai Ciapus dengan menggunakan metode agar dua lapis (double agar overlay). Isolat fag tersebut dapat menginfeksi dan membunuh B. pumilus melalui mekanisme lisis. Ukuran diameter plak FBa1 sebesar 2 mm, plak transparan dengan halo (cincin luar); plak FBa2 berukuran 1mm, plak transparan dengan halo; dan plak FBa3 berukuran 0,5 mm, plak transparan tanpa halo. Konsentrasi isolat fag FBa1 adalah 10.2x108 PFU mL-1, fag FBa2 adalah 5.9x108 PFU mL-1, dan fag FBa3 adalah 8.5x108 PFU mL-1. Konsentrasi fag B. pumilus yang tinggi menunjukkan bahwa secara alami fag ditemukan di sungai ini. Uji kisaran inang menunjukkan bahwa fag FBa1, FBa2, dan FBa3 memiliki aktivitas spesifik untuk Bacillus pumilus. Fag tersebut tidak menginfeksi sel-sel bakteri lainnya. Pengamatan morfologi fag FBa1 menggunakan Transmission Electron Microscope (TEM) dengan pewarnaan negatif menunjukkan kepala fag berbentuk ikosahedral tanpa ekor, diameter fag sebesar 166,67 nm, bentuk fag menyerupai partikel fag. Karakterisasi fag FBa1 dengan SDS-PAGE menunjukkan lima pita protein. Berat molekul masing-masing protein fag FBa1 adalah 70.9 kDa, 54.9 kDa, 33.8 kDa, 28.3 kDa, dan 21,4 kDa. Hasil penelitian ini menunjukkan prospek fag FBa1 untuk diaplikasikan sebagai agen biokontrol B. pumilus di lingkungan.
Keyword: Bacillus pumilus, bakteriofag, diare

Judul: Karakterisasi Fag Litik Proteus mirabilis Resisten Antibiotik Asal Feses Penderita Diare
Abstrak: Penyakit diare masih menjadi salah satu penyebab utama tingginya angka kematian di negara berkembang, termasuk Indonesia. Diare dapat disebabkan oleh berbagai mikroorganisme seperti virus, protozoa dan bakteri enteropatogen. Proteus mirabilis merupakan salah satu bakteri enteropatogen kelompok Gram negatif dari famili Enterobacteriacea yang dapat menyebabkan diare. Sebanyak 94 isolat Proteus berhasil diisolasi dari 518 sampel feses anak penderita diare dengan persentase P. mirabilis sebesar 91.5 % dan P. penneri sebesar 8.5%. Selain itu, terdapat 8 bakteri enteropatogen termasuk Proteus spp dengan jumlah 6 isolat yang berhasil diisolasi dari 100 sampel feses anak penderita diare berumur di bawah 5 tahun. Penggunaan antibiotik yang telah lama dipakai sebagai terapi dalam mengatasi infeksi bakteri patogen saat ini dilaporkan sudah tidak efektif, karena banyaknya bakteri yang telah resisten terhadap antibiotik. P. mirabilis termaksuk bakteri yang telah resisten terhadap antibiotik ampicillin, amoxicillin dan trimethoprim-sulfomethoxazole. Fag litik sebagai virus penginfeksi bakteri dapat digunakan untuk terapi alternatif yang dapat mengendalikan pertumbuhan bakteri patogen manusia. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan dan mengkarakterisasi fag litik yang dapat melisiskan P. mirabilis yang telah resisten terhadap antibiotik. Fag litik P. mirabilis diisolasi dari berbagai sumber fag, yaitu limbah cair rumah tangga, feses ayam dan kambing, limbah padat peternakan ayam, air sungai Ciparigi dan air sungai Situ Letik. Isolasi fag litik P. mirabilis berhasil didapatkan dari limbah peternakan ayam dan air sungai Situ Letik, Dramaga dengan jumlah 3 isolat. Masing-masing isolat menunjukkan morfologi plak yang berbeda dengan diameter mencapai 2 mm pada setiap plak yang muncul. Isolat fag 1 memiliki morfologi plak berbentuk bulat, bening dan memiliki cincin disekitar plak. Isolat fag 2 memiliki morfologi plak berbentuk bulat, samar tanpa ada cincin disekitar plak, sedangkan isolat fag 3 memiliki morfologi plak berbentuk bulat, bening tanpa ada cincin disekitar plak. Ketiga isolat fag ini memiliki tingkat stabilitas yang berbeda walaupun disimpan pada suhu yang sama dan di dalam bufer yang sama, yaitu bufer Saline Magnesium (SM). Isolat fag 1 dan 3 tidak dapat ditumbuhkan kembali saat dilakukan tahapan produksi fag. Hasil kisaran inang isolat fag 2 sebagai fag P. mirabilis yang berhasil dipurifikasi dan diproduksi menunjukkan bahwa fag litik P. mirabilis bersifat spesifik. Fag litik P. mirabilis tidak melisiskan bakteri Salmonella sp., Bacillus pumilus, Photobacterium damselae dan EPEC K.1.1. Analisis morfologi fag P. mirabilis menggunakan transmission electrom microscope (TEM) menunjukkan kepala fag berbentuk heksagonal ikosahedral dan ekor yang panjang berbentuk tabung heliks. Ciri-ciri yang dimiliki oleh fag litik P. mirabilis tersebut termasuk ke dalam ordo Caudovirales famili Myoviridae. Diameter kepala fag P. mirabilis adalah sebesar 68.185 nm, panjang ekor sebesar 109.091 nm dan diameter ekor fag sebesar 18.182 nm. Hasil analisis SDS-PAGE menunjukkan adanya delapan pita protein dengan bobot molekul yang bervariasi sebesar 90.50, 82.03, 74.35, 43.31, 37.37, 30.70, 27.83 dan 20.72 kDa. Molekul protein dengan berat tertentu menunjukkan penyusun komponen fag seperti kepala, ekor dan serabut ekor. Hasil perhitungan terhadap konsentrasi protein fag P. mirabilis menunjukkan bahwa konsentrasi proteinnya sebesar 316.198 μg/mL.
Keyword: diare,, fag litik, Proteus mirabilis

Judul: Penentuan Harga Opsi Put Amerika dengan Simulasi Monte Carlo
Abstrak: An American option is an option that can be exercised at the strike price anytime before or on the date of expiration. In this thesis, Monte Carlo simulation for valuation of American option is presented. Monte Carlo simulation is one of the numerical methods used to determine the price of American options. The simulation provides several examples of initial stock price , rate of interest , exercise time , volatility , and strike price K. The simulation study shows the cost of the option c decreases when S increases, c decreases when r increases, c increases when T increases, c increases when  increases, and c increases when K increases.
Keyword: