Judul: Respons dan Tingkah Laku Cumi-cumi (Uroteuthis duvaucelli, D’Orbigny 1835) Terhadap Cahaya Lampu Light Emitting Diode
Abstrak: Cumi-cumi merupakan salah satu target utama dalam perikanan dengan menggunakan cahaya (light fishing) di Indonesia. Penangkapan cumi-cumi mengandalkan indera penglihatan berupa rangsangan cahaya agar cumi-cumi mendekati alat tangkap. Respons penerimaan cahaya oleh mata cumi-cumi dipengaruhi oleh berbagai faktor diantaranya warna dan intensitas. Penelitian ini bertujuan untuk menetukan respons tingkah laku dan adaptasi mata cumi-cumi dengan perbedaan warna yaitu biru, putih dan merah dengan intensitas rendah (1.1 x 10-4 – 2.3 x 10-4 W/cm2), sedang (9.6 x 10-4 – 2.0 x 10-3 W/cm2) dan tinggi (9.4 x 10-3 – 1.2 x 10-2 W/cm2) di laboratorium. Penelitian dilakukan pada bulan Desember sampai April 2019 di Laboratorium Bagian Administrasi Pelatihan Perikanan Lapang, Sekolah Tinggi Perikanan, Serang. Penelitian yang dilakukan menggunakan metode uji coba di laboratorium. Faktor percobaan yang dilakukan adalah perbedaan warna cahaya lampu LED (putih, biru dan merah) dan perbedaan intensitas cahaya (rendah, sedang dan tinggi). Pengamatan yang dilakukan yaitu pada adaptasi retina dan respons tingkah laku cumi-cumi. Adaptasi retina cumi-cumi dilakukan dengan pendekatan histologi untuk setiap perlakuan. Respons tingkah laku cumi-cumi dilakukan dengan pengamatan yang berbeda pada setiap perlakuannya dengan cumi-cumi yang memiliki panjang mantel 7.4 ±1.41 cm pada wadah perlakuan. Parameter tingkah laku cumi-cumi yang diamati adalah preferensi zona, frekuensi jetting, nearest neighbor distance (NND), kecepatan renang dan pola pergerakan. Adaptasi retina mata cumi-cumi pada lama pencahayaan 30 menit memiliki nilai rasio tertinggi adalah cahaya lampu warna biru intensitas rendah (1.1 x 10-4 W/cm²) yang memiliki nilai 74.54% dan nilai terendah sebesar 8.95% terjadi pada cahaya lampu warna putih intensitas rendah (1.1 x 10-4 W/cm²). Berikutnya pada lama pencahayaan 90 menit memiliki nilai rasio tertinggi pada cahaya lampu warna putih tinggi (1.2 x10⁻² W/cm²) 56.44% dan terendah pada cahaya lampu warna merah rendah (2.3 x 10-4 W/cm²). Adaptasi retina pada kondisi tanpa cahaya memiliki nilai 7.99%. Tingkah laku cumi-cumi pada kondisi tanpa cahaya bergerak tanpa arah sehingga berada pada semua zona pengamatan. Cumi-cumi berada pada zona redup pada perlakuan lampu warna biru dan putih kecuali pada lampu warna biru dengan intensitas rendah cumi-cumi berada pada zona terang. Penggunaan lampu merah menyebabkan cumi-cumi berada pada zona terang. Peningkatan intensitas yang dilakukan membuat frekuensi jetting pada semua perlakuan meningkat. Jarak antar individu pada lampu biru menyebabkan semakin menjauh, sementara pada lampu putih dam merah jarak antar individu mendekat pada intensitas sedang. Kecepatan renang cumi-cumi memiliki nilai yang berfluktuasi pada setiap warna percobaan. Nilai kecepatan tertinggi 12.27 cm/s terjadi pada warna lampu biru dengan intensitas rendah, sementara kecepatan terendah terjadi pada lampu putih dengan intensitas rendah dengan nilai 4.21 cm/s.
Keyword: cephalopoda, LED DIP, pigmen hitam, jetting, intensitas cahaya

Judul: Preferensi Larva Cumi-Cumi Sirip Besar terhadap Perbedaan Warna dan Tingkat Intensitas Cahaya pada Waktu Pengamatan yang Berbeda.
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pola tingkah laku (preferensi) larva cumi-cumi sirip besar berhubungan dengan pengoperasian alat tangkap yang menggunakan cahaya lampu. Penelitian dilakukan dengan memberikan perlakuan stimulasi lampu LED pada larva cumi-cumi, diharapkan dapat diketahui tingkat kesukaan larva cumi-cumi terhadap perbedaan warna cahaya, intensitas cahaya dan waktu pengamatan. Warna cahaya yang diberikan adalah merah, kuning, hijau dan biru, dengan jumlah lampu 1, 2, 3 dan 4 buah untuk mendapatkan perbedaan intensitas cahayanya, sedangkan waktu pengamatan dilakukan dari mulai matahari terbenam hingga jam enam pagi esok harinya. Pengamatan dilakukan selama bulan Juni hingga Oktober 2006 di Pulau Pari dan di Laboratorium Laboratorium Ilmu Kelautan Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan Institut Pertanian Bogor Jl. Pasir Putih Ancol dengan menggunakan larva cumi-cumi dan dipelihara selama penelitian. Tingkat kesukaan (preferensi) larva cumi-cumi ditunjukkan dengan tingkah lakunya mendekati cahaya. Hasil penelitian menunjukan bahwa warna lampu hijau lebih disukai dibandingkan warna lainnya. Hal ini dapat dilihat pada uji t-test dan grafik batang yang berturut-urut menampilkan batang yang tertinggi adalah warna hijau. Pada urutan selanjutnya terdapat warna biru, kemudian warna kuning, dan yang berada diurutan terakhir adalah warna merah. Sedangkan untuk pengamatan preferensi larva cumi-cumi dengan perlakuan perbedaan jumlah lampu yang dipakai, terlihat hasilnya bahwa semakin banyak jumlah lampu yang digunakan maka semakin banyak jumlah larva cumi-cumi yang tertarik pada lampu tersebut. Pada pengamatan dengan pelakuan perbedaan waktu pengamatan dapat terlihat bahwa tingkat kesukaan larva cumi-cumi berubah-ubah sesuai dengan waktu pengamatan. Preferensi larva cumi-cumi tertinggi terjadi tepat setelah matahari terbenam (pukul 18.00-21.00), kemudian terjadi penurunan pada pukul 21.00- 24.00. Pada saat pengamatan tengah malam (pukul 24.00-03.00) preferensi larva cumi-cumi kembali meninggi, dan diikuti penurunan preferensi larva cumi-cumi kembali pada pukul 03.00-06.00.
Keyword: 

Judul: Penyusunan Overlap Graph menggunakan Suffix Tree pada DNA Sequence
Abstrak: The DNA sequence assembly is very important in genome analysis. This step aims to reconstruct contigous DNA fragment (contigs) from short fragment by concatenating fragments based on the overlap region among them. This method employs overlap graph for solving the problems. In this graph, nodes represent fragments and edges represent overlap. This research developed a software for constructing overlap graph using suffix tree. The evaluation was conducted by measuring the number of nodes, number of edges, and the execution time in many values of minimum overlap. The minimum overlap is defined as the minimum length of substring which is considered as the overlap region between two fragments. The evaluation results showed that the number of nodes, the number of edges, and the execution time were increased with the decreasing of the minimum overlap value.
Keyword: