Judul: Study on the Mechanisms of Weed Resistance in Monochoria vaginalis (Burm. f.) C. Presl from Rice Fields Area of West Java toward Methyl Metsulfuron Herbicide
Abstrak: Monochoria vaginalis (Burm. F.) C. Presl merupakan tanaman herba akuatik yang dikenal sebagai gulma paling mengganggu di areal sawah Jawa Barat, Indonesia. Herbisida metil metsulfuron telah lama digunakan pada padi sawah di Jawa Barat dengan intensitas yang cukup tinggi. Namun, kasus resistensi Monochoria vaginalis terhadap herbisida metil metsulfuron di Indonesia belum banyak dilaporkan dan diteliti. Penelitian ini bertujuan untuk (1) mendapatkan informasi mengenai penggunaan herbisida metil metsulfuron di areal padi sawah Jawa Barat, (2) mengklasifikasikan tingkat resistensi Monochoria vaginalis terhadap metil metsulfuron, dan (3) mengidentifikasi mekanisme Target Site Resistance (TSR) pada gen MvALS1 ekotipe Monochoria vaginalis yang resisten. Penelitian dilaksanakan pada bulan Juni 2023 hingga Oktober 2023 di Rumah Kaca Cikabayan dan Laboratorium Bioteknologi Molekuler Tumbuhan 2 IPB. Uji tingkat resistensi dilakukan dengan metode Whole Plant Pot Test menggunakan Rancangan Petak Terbagi (Split Plot Design) dengan 4 ulangan. Petak utama adalah lokasi padi sawah pengambilan benih gulma. Anak petaknya adalah dosis metil metsulfuron: 0, 1, 2, 4, 8, 16, dan 32 g b.a ha-1. Selanjutnya, sekuensing DNA menggunakan metode PCR dilakukan pada semua sampel untuk mengidentifikasi perbedaan basa nukleotida pada gen MvALS1 dari ekotipe resisten. Hasil penelitian menunjukkan bahwa Monochoria vaginalis asal Rawamerta, Karawang menunjukkan tingkat resistensi sedang terhadap metil metsulfuron dengan rasio resistensi 6,00 dan asal Patokbeusi, Subang menunjukkan tingkat resistensi yang rendah terhadap metil metsulfuron dengan rasio resistensi 3,89 dibandingkan Monochoria vaginalis sensitif. Penjajaran basa nukleotida gen MvALS1 menunjukkan bahwa ekotipe M. vaginalis asal Rawamerta dan Patokbeusi mengalami lima substitusi asam amino: Ser-64-Ala, Asp-66-Glu, Asn-240-Asp, Glu-426-Asn, dan Ser-469-Asn dibandingkan dengan sekuen asam amino dengan nomor Genbank AB243613.1. Monochoria vaginalis asal Sukra mengalami tiga substitusi asam amino: Ser-64-Ala, Asp-66-Glu, dan Asn-240-Asp. Studi ini mengkonfirmasi pertama kalinya terjadi substitusi asam amino Ser-64-Ala, Asn-240-Asp, dan Glu-426-Asn pada ekotipe resisten Monochoria vaginalis terhadap metil metsulfuron (inhibitor ALS)., Monochoria vaginalis (Burm. F.) C. Presl is an aquatic herbaceous plant, recognized as the most troublesome weed in rice fields in West Java province, Indonesia. Metsulfuron-methyl has long been used in wetland rice in West Java with a high enough intensity. However, the case of Monochoria vaginalis resistance to metsulfuron-methyl herbicides in Indonesia has not been widely reported and investigated. The study aimed to (1) obtain information about the use of metsulfuron-methyl in West Java rice fields, (2) classify the resistance level of Monochoria vaginalis toward metsulfuron-methyl, and (3) identify Target Site Resistance (TSR) mechanism in the MvALS1 gene of the resistant ecotype of Monochoria vaginalis. Research was conducted from June 2023 until October 2023 at Cikabayan Green House and Plant Molecular Biotechnology Laboratory 2 IPB. The resistance level test of Monochoria vaginalis was performed using the Whole Plant Pot Test method. The experimental design used Split Plot Design with 4 replications. The primary plot was designated for the rice fields where weed seeds were collected. The subplot was the dosage of metsulfuron-methyl: 0, 1, 2, 4, 8, 16, and 32 g a.i ha-1. Following that, all samples were subjected to DNA sequencing using the PCR method to identify mutations in the MvALS1 gene from the resistant ecotype. The result showed that Monochoria vaginalis from Rawamerta, Karawang
Keyword: bioassay, GR50, sekuensing, sulfonilurea, resistensi situs target, sequencing, sulfonylurea, target site resistance

Judul: Identification of Target-site Resistance to Glyphosate on Eleusine indica (L.) Gaertn. from Jonggol Oil Palm Plantation, Bogor, West Java
Abstrak: Resistensi glifosat dapat terjadi melalui mekanisme target-site resistance (TSR) dengan adanya mutasi pada gen target herbisida yaitu 5-enolpiruvil-sikimat-3-fosfat sintase (EPSPS). Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi mekanisme TSR yang berkaitan dengan TIPS mutation pada spesies Eleusine indica yang telah dilaporkan resisten di kebun kelapa sawit asal Jonggol, Bogor, Jawa Barat. Analisis bio-assay dilakukan menggunakan Rancangan Kelompok Lengkap Teracak (RKLT) faktor tunggal yaitu dosis herbisida dengan 8 taraf dosis dan 3 ulangan. Banyaknya satuan percobaan adalah 24 satuan percobaan setiap blok. Percobaan dimulai dengan pengambilan biji E. indica resisten pada Blok II dan Blok V. Biji gulma E. indica ditanam pada pot dengan cara disebar. Gulma yang telah tumbuh dipelihara dengan melakukan penyiangan, penyiraman, dan seleksi pertumbuhan agar seragam. Aplikasi glifosat dilakukan saat gulma berdaun 4 menggunakan delapan taraf dosis yaitu 0, 1/8x, 1/4x, 1/2x, x, 2x, 4x, 8x dengan x adalah dosis rekomendasi, sehingga dosis herbisida glifosat adalah 0, 121,5, 243, 486, 972, 1944, 3888, dan 7776 g ha-1. Volume semprot yang digunakan adalah 400 L ha-1. Persentase kerusakan gulma diperoleh dari biomasa tanaman kemudian analisis regresi dilakukan untuk memperoleh LD50 dan nisbah resistensi. Biotipe E. indica asal Kebun Jonggol Blok V memiliki LD50 sebesar 1737 g ha-1 dengan status resistensi penurunan sensitivitas dan nisbah resistensi 2,343. Blok II masih berstatus sensitif dengan nisbah resistensi 1,588 dan nilai LD50 sebesar 1177,30 g ha-1. Identifikasi TSR dilakukan dengan isolasi dan amplifikasi gen penyandi EPSPS dari DNA genom E. indica asal kebun kelapa sawit Jonggol sebagai biotipe resisten dan asal pinggir jalan kampus IPB Dramaga sebagai biotipe sensitif. Hasil runutan basa nukleotida disejajarkan menggunakan algoritma MUSCLE dan visualisasi hasil penjajaran menggunakan Geneious Prime. Hasil pensejajaran basa nukleotida menunjukkan tidak adanya titik mutasi penyebab resistensi glifosat pada rentang basa 979 sampai dengan 1280 gen penyandi EPSPS. Nilai LD50 yang tinggi pada pada Blok V mengindikasikan adanya potensi resistensi akibat perbedaan basa nukleotida pada titik lain dari gen EPSPS maupun mekanisme non-target-site resistance (NTSR)., Target-site resistance (TSR) to glyphosate is caused by mutation in targeted gene namely 5-enolpyruvyl-shikimate-3-phosphate synthase (EPSPS). This research was aimed to identify TSR mechanism assosiated with TIPS mutation in Eleusine indica biotypes from Oil Palm Plantation in Jonggol which was reported resistant recently. Bio-assay analysis was conducted using a single-factor Randomized Completely Block Design (RCBD), namely herbicide dose with 8 dose levels and 3 replications. The number of experimental units was 24 experimental units per block. The experiment began with the collection of resistant E. indica seeds in Block II and Block V. E. indica seeds were planted in pots by spreading. Weeds that had grown were maintained by weeding, watering, and selecting for uniform growth. Glyphosate application was carried out when the weeds were 4-leafed using eight dose levels, namely 0, 1/8x, 1/4x, 1/2x, x, 2x, 4x, 8x with x being the recommended dose, so that the herbicide dose of glyphosate was 0, 121.5, 243, 486, 972, 1944, 3888, and 7776 g ha-1. The spray volume used was 400 L ha-1. Percentage of weed damage was obtained from plant biomass then regression analysis was conducted to obtain LD50 and resistance ratio. E. indica
Keyword: bio-assay, EPSPS, LD50, resistance index, sequencing

Judul: Bifurkasi Hopf pada Model Siklus Bisnis Kaldor Kalecki tanpa dan dengan Waktu Tunda
Abstrak: Business cycle model is one of dynamical system models in economic. One of the business cycles model is Kaldor-Kalecki model. Kaldor-Kalecki business cycle model that is written in delayed defferential equations, is a business cycle model that involves gross product and capital stock of a company. In this paper Kaldor-Kalecki business cycle model is analyzed using both nondelay and delay in time of capital stock. By Taylor expansion for the time delayed model, an analysis of stability around the fixed points has been done. Furthermore, by using Hopf bifurcation theorem, it can be shown that there exists periodic orbits and limit cycle. In the nondelayed model, changing the parameter of goods market could lead to the occurrence of Hopf bifurcation and the existence of limit cycle. Similarly, for the delayed model, it has been shown that changing the time delay parameter may result in the occurrence of Hopf bifurcation and limit cycle.
Keyword: