Judul: Graph Traversing Menggunakan Teknik Branch And Bound Untuk Menemukan Senyawa Herbal Untuk Covid-19
Abstrak: Covid-19 yang disebabkan oleh virus SARS-CoV-2 sudah menjadi pandemi yang mengakibatkan krisis ekonomi dan kesehatan secara global. Terhitung sejak 26 Juni 2021, total kasus Covid-19 yang terdapat di Indonesia sudah menyentuh angka 3,13 Juta kasus. Banyaknya tanaman obat di Indonesia, dapat dimanfaatkan untuk menjadi alternatif pengobatan maupun pencegahan untuk Covid-19. Tujuan dari penelitian ini adalah melakukan Graph Traversing untuk mencari senyawa herbal terbaik yang berinteraksi dengan protein target Covid-19. Teknik yang digunakan pada penelitian ini adalah Branch and Bound. Data yang digunakan pada penelitian ini berasal dari berbagai pangkalan data yang kemudian di satukan menjadi sebuah jejaring tanaman-senyawa-protein-penyakit dan kemudian ditelusuri menggunakan tiga metode pencarian untuk mencari metode pencarian terbaik berdasarkan waktu pencarian dan kompleksitas. Strategi pencarian depth first search merupakan pilihan terbaik dalam penyelesaian masalah ini. Hasil penelitian menunjukkan tanaman seperti Alpinia Officinarum, Areca Catechu, Corydalis Yanhusuo dan Tribulus Terrestris dapat menjadi tanaman obat yang berpotensi mencegah maupun mengobati Covid-19.
Keyword: Branch and Bound, Covid-19, Graph Traversing, Drug-Target Interaction, Herbal Compound

Judul: Studi Literatur Senyawa Bioaktif yang Berpotensi dalam Pengobatan Covid-19
Abstrak: Covid-19 menyebabkan banyak korban jiwa karena ketersediaan rumah sakit yang terbatas. Saat ini belum ada obat yang terbukti ampuh untuk mengobati penyakit tersebut sehingga perlu obat, salah satunya dari bahan alam. Penelitian ini bertujuan meninjau berbagai literatur mengenai senyawa alam yang dapat meningkatkan imunitas tubuh dan mengobati Covid-19 beserta mekanismenya. Bahan alam yang paling sering digunakan masyarakat untuk pencegahan dan pengobatan, yang juga direkomendasikan oleh Pemerintah Indonesia ialah temulawak (Curcuma longa), jahe merah (Zingiber officinale Roscoe var Rubrum), dan jambu biji (Psidium guajava). Berdasarkan studi in silico, senyawa bioaktif kurkumin dari temulawak tidak menunjukkan potensi yang nyata dalam pengobatan Covid-19. Berbeda dengan kurkumin, senyawa bioaktif xantoangelol E, papiriflavonol A, isobavakalkon, dan 4́-O-metilbavakalkon menunjukkan potensiny dengan nilai IC50 terhadap protein SARS-CoV yang rendah. Namun, perlu studi klinis untuk mengevaluasi lebih lanjut potensi senyawa tersebut dalam pengobatan Covid-19., Covid-19 caused much mortality due to the limited availability of hospitals. However, there is no proven drug to treat the disease, so it is necessary to look for drugs, derived from natural compounds. This study aims to review various literature on natural compounds that can increase the body's immune system and treat Covid-19 and its mechanisms. The natural ingredients that are most often used by society to prevent and treat Covid-19, which the Indonesian government also recommends, are temulawak (Curcuma longa), red ginger (Zingiber officinale Roscoe var Rubrum), and guava (Psidium guajava). Based on in silico studies, curcumin of temulawak does not show significant potential in treating Covid-19. In contrast, xanthoangelol E, papiriflavonol A, isobavachalcone, and 4́’-O-methylbavachalcone showed potential in treating Covid-19 with a low IC50 value against SARS-CoV protein. However, further clinical studies are needed to evaluate the potential of these compounds in the treatment of Covid-19.
Keyword: antivirus, Covid-19, natural compounds, SARS-CoV-2

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: