Judul: . Identifikasi Penanda Ssr Yang Berasosiasi Dengan Jumlah Dan Bobot Tandan Buah Segar Kelapa Sawit (Elaeis Guineensis Jacq.)
Abstrak: Kelapa sawit tergolong ke dalam tanaman tahunan yang berperan penting sebagai sumber minyak nabati dunia. Siklus pemuliaan tanaman kelapa sawit membutuhkan periode waktu yang cukup lama, karena itu seleksi dengan bantuan penanda molekuler sangat diperlukan untuk mempersingkat waktu seleksi. Seleksi dengan bantuan penanda molekuler memerlukan penanda yang berasosiasi dengan karakter yang diinginkan, terutama karakter daya hasil dan komponennya yang merupakan karakter kompleks dan tergantung pada latar belakang genetik. Oleh karena itu, identifikasi penanda yang berasosiasi dengan karakter yang diinginkan menjadi sangat penting. Penelitian ini bertujuan mendapatkan penanda SSR yang berasosiasi dengan karakter jumlah tandan (JT) dan/atau bobot tandan rataan (BTR). Bahan tanam yang digunakan adalah populasi Tenera yang berasal dari persilangan antara Dura Deli dengan Pisifera AVROS. Populasi yang digunakan tersebut memiliki keragaman JT dan BTR yang signifikan berbeda. Sebanyak 18 penanda SSR dari basis data publik diasosiasikan dengan karakter JT dan/atau BTR. Data molekuler dianalisis untuk mengetahui profil penanda SSR yang terdiri dari keragaman alelik, tingkat heterozigositas dan informasi polimorfisme. Asosiasi antara penanda SSR dengan karakter JT dan BTR menggunakan analisis satu penanda dengan pembuatan sidik ragam satu faktor. Hasil penelitian menunjukkan bahwa penanda SSR terkait JT yang terdiri dari 8 penanda (mEgCIR: 0380, 2433, 0801, 2577, 0037, 0781, 3534, dan 3718) mampu mengamplifikasi DNA dengan jumlah alel satu hingga empat dan rataan sebesar 2.3 alel per lokus. Penanda SSR terkait BTR yang terdiri dari 12 penanda (mEgCIR: 0380, 2433, 3428, 0408, 2595, 3160, 0195, 0804, 2387, 3672, 0782, dan 3750) mampu mengamplifikasi DNA dengan jumlah alel satu hingga empat dan rataan sebesar 2.4 alel per lokus. Keragaman alelik cukup rendah karena populasi merupakan hasil persilangan dari tetua yang telah intensif diseleksi. BTR pada populasi Tenera (DxP) berasosiasi secara signifikan dengan penanda mEgCIR3428. Tanaman dengan alel terpanjang (196 pasang basa) pada penanda mEgCIR3428 memiliki rataan BTR tertinggi. Penanda mEgCIR3428 dapat menjadi satu kandidat penanda untuk kegiatan seleksi tetua kelapa sawit Dura Deli dan Pisifera AVROS pada siklus seleksi selanjutnya.
Keyword: analisis satu penanda, analisis satu penanda, bobot tandan rataan, Dura Deli, jumlah tandan, Pisifera AVROS

Judul: Analisis filogenetik kelapa sawit (Elaeis guineensis Jacq) menggunakan marka simple sequence repeat
Abstrak: Produktivitas kelapa sawit dapat ditingkatkan dengan pemuliaan tanaman. Studi kekerabatan dengan marka SSR membantu dalam pemilihan tetua untuk program pemuliaan. Persilangan kelapa sawit dengan jarak genetik jauh dapat menghasilkan keturunan superior berpotensi menjadi kandidat varietas unggul kelapa sawit. Penelitian ini bertujuan menganalisis kekerabatan beberapa aksesi kelapa sawit dan mendapatkan primer SSR dengan tingkat polimorfisme tinggi sehingga dapat digunakan untuk analisis filogenetik. Empat puluh sembilan aksesi kelapa sawit dianalisis menggunakan 20 marka SSR. Marka SSR dipilih berdasarkan tingkat polimorfime dan penyebarannya pada tiap 16 kromosom kelapa sawit. Dendogram dibuat berdasarkan metode Unweighted Pair Group Method Arithmetic (UPGMA) dengan menggunakan software NTSYS-pc (Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System) versi 2.1. Tiga puluh sembilan pasang primer memiliki tingkat polimorfisme pada kisaran 32%-92%. Tingkat kekerabatan dari 49 aksesi kelapa sawit yang dianalisis dengan 20 marka SSR berada pada kisaran 55.28%-87.50%. Nilai koefisien kemiripan genetik sebesar 55.28% dapat membagi populasi kelapa sawit menjadi tujuh kelompok masing-masing terdiri atas 9, 28, 4, 2, 1, 2, dan 3 aksesi. Berdasarkan nilai koefisien kemiripan genetik, dapat dilakukan pemilihan calon tetua untuk pemuliaan kelapa sawit. Kata kunci: keragaman genetik, marka SSR, kelapa sawit.
Keyword: Genetic diversity, SSR markers, Oil palm

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: