Judul: Ekotipologi terumbu karang di Pulau Cilik Taman Nasional Laut Karimunjawa
Abstrak: Untuk memenuhi kebutuhan manusia yang semakin berkembang, maka laut merupakan pilihan guna memenuhi kebutuhan tersebut. Sumberdaya di laut yang begitu beranekaragam khususnya terumbu karang menyediakan begitu banyak manfaat bagi kepentingan manusia. Akan tetapi pemanfaatan sumberdaya tersebut harus dilaksanakan secara terarah, terpadu, dan lestari, sehingga sumberdaya yang ada tetap lestari dan terpelihara dengan baik. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui jenis-jenis karang yang terdapat di Taman Nasional Laut Karimunjawa, khususnya Pulau Cilik ditinjau dari bentuk pertumbuhan (lifeform), genus hewan karang, dan hubungannya dengan karakteristik bio-fisik perairan. Dan juga untuk mengetahui indeks keanekaragaman, distribusi spasial hewan karang yang dihubungkan dengan variasi spasial karakteristik bio-fisik perairan. Penelitian dilaksanakan dari tanggal 15 sampai 29 Juli 1996, di Pulau Cilik yang merupakan salah satu pulau yang terdapat di Zona Penyangga Taman Nasional Laut Karimunjawa. Lokasi pengamatan dibagi menjadi 7 stasiun pengamatan. Dasar penentuan letak stasiun yaitu pertama daerah yang relatif terbuka dari pengaruh angin dan gelombang (winward) dan kedua daerah yang relatif terlindung terhadap pengaruh angin dan gelombang (leeward). Pada setiap lokasi pengamatan dilakukan survey pendahuluan (survey visual), dengan bantuan peralatan dasar selam (snorkeling) untuk menentukan stasiun yang dianggap mewakili wilayah ekosistem terumbu karang.
Keyword: 

Judul: Struktur komunitas karang berdasarkan metode transek garis dan transek kuadrat di Pulau Menyawakan Taman Nasional Karimunjawa, Jawa tengah
Abstrak: Ekosistem terumbu karang merupakan salah satu ciri khas ekosistem perairan tropis yang secara ekologi termasuk wilayah yang paling produktif Indonesia memiliki luasan ekosistem terumbu karang seluas 50.000 km² (Dahuri, I 996). Penelitian ekosistem terumbu karang secara berkelanjutan bermanfaat untuk berbagai keperluan, antara lain membantu pemerintah dalam perencanaan pembangunan daerah pesisir. Penelitian ini menggunakan dua metode yaitu metode transek gans dan transek kuadrat. Metode transek garis menggunakan tali meteran sepanjang 20 meter yang diletakkan sesuai kontur dasar perairan dan sejajar dengan garis pantai pada kedalaman 3 dan 10 meter. Metode transek kuadrat menggunakan transek berbentuk bujur sangkar berukuran lxl m² dan diletakkan secara berselingan di atas dan di bawah jalur transek garis setiap interval 5 meter. Hasil pengukuran beberapa parameter lingkungan perairan di P. Menyawakan memperlihatkan nilai pengukuran salinitas, pH dan kecerahan perairan berada dalam kondisi normal, sedangkan suhu perairan rata-rata cukup tinggi yaitu 30,5°. Fenomena El-Nino yang terjadi sepanjang tahun 1997-1998 hampir di seluruh perairan Indonesia merupakan salah satu pemicu terjadinya kenaikan suhu. Tingginya suhu perairan ini telah melampaui kisaran suhu optimum bagi kehidupan karang dan diduga merupakan penyebab utama terjadinya pemutihan karang (coralbleaching).
Keyword: 

Judul: Kloning dan Ekspresi Human Interferon-alfa2a pada Yeast Metilotropik Pichia pastoris
Abstrak: Interferon (IFN) is a group of proteins that are secreted by body cells as a result of exposure to biological vertebrates such as: viruses, bacteria, protozoa and other compounds. There are three types of interferon, namely: alpha (α), beta (β) and gamma (γ) IFN. Interferon-α2a belongs to the type I interferon. This protein has a molecular weight of 21.550 kDa and consists of 188 amino acids (23 amino acid of signal peptide and 166 amino acids of mature protein). Interferon-α2a is also known to be used for the treatment of hepatitis C and as anti-tumor and antivirus agents. Regulator gene for IFN production under normal conditions, is in the off position to IFN is not produced. But when there are external stimuli, both viral and bacterial infections, a regulator gene switches on, and IFN production system running. At the time of an attack from a variety of disease agents actually the body will produce IFN, but generally the amount produced is not sufficient to fight the disease agents that multiply very quickly. Therefore IFN intake from outside is needed. This is the beginning of the use of IFN as a drug. Genetic engineering is an activity to manipulate the genes to get new products by creating recombinant DNA through gene insertion. Recombinant DNA technology has been used to produce IFN. Yeast such as Pichia pastoris can be an alternative as the host (system) to express human interferon genes and as a producer of IFN protein. Expression system P. pastoris offers several advantages for the production of recombinant proteins, such as: the high level expression of recombinant proteins, ease of scaling-up fermenter, low cost and ease of transformation techniques and selection of transformed cells such as bacteria . The existence of inducible AOX1 promoter is very strong, easily control the expression of recombinant proteins by induction. AOX1 is a promoter that controls gene expression of alcohol oxidase to metabolize methanol as carbon source of P. pastoris. Therefore,this study aimed to clone human interefron-α2a (hifnα2a) gene in E. coli and express it in metylotrophic yeast P. pastoris. Vector used in this study is pPICZαB (Invitrogen). Ligation process between insert (hifn-α2a gene) and vector (pPICZαB) performed by using T4 DNA ligase, which functions synthesize the formation of phosphodiester bonds linking the nucleotides with nucleotide insert plasmid vectors to produce recombinant (pPICZαB-hifnα2a). This recombinant plasmid transformed into XL1 blue cells (E. coli) by Heat shock method. The results of sequencing analysis (clone 6) using 5'AOX and 3'AOX primers indicate that DNA base sequence of human IFN-α2a genes has been subclone into pPICZαB vector (in frame). Recombinant plasmid (clone 6) linearized using BstX1 enzyme before transformed into X33 yeast cell. Transformation into cell was done by Electroporation. The X33 cell P. pastoris strain was used to express human interferon-α2a. X33 is strains with the phenotype Mut+ (methanol utilization plus) and can be used for positive transformants selection using zeocin. Phase protein production work using Mut+ strain occurred in two phases. The first phase is the use of glycerol to obtain a certain amount of biomass (high cell
Keyword: