Judul: Kemiripan Genetik Kappaphycus alvarezii Asal Beberapa Daerah di Indonesia.
Abstrak: Red algae Kappaphycus alvarezii produced high economic value karageenan and used in the many industries such as pharmaceutical industry, food industry, stabilizer, and cosmetics. Recently, many cultivations of K. alvarezii has been done in Indonesian seas, such as in sea region Teluk Banten, North seashore of Java, Sulawesi, Bali, Lombok and the other seas area in Indonesia. However, K. alvarezii is one that easily infected by ice-ice disease. Genetic improvement is indispensable to increase productivity and genetic diversity needed on it. Genetic diversity analysis can be seen from genetic similarity. Genetic similarity analysis of K. alvarezii have not been done yet until recent time. One method to analyse genetic similarity is Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP). This study aimed to determine the similarity of six normal K. alvarezii and two samples infected by ice-ice disease collected from Research Group of Naval and Fishery (BRKP) Maros used AFLP with PstI and MseI as restriction enzyme. AFLP with P11 as forward primer and M48, M49, M50 as reverse primer treated to Takalar (TKL), Bone (BNE), Gorontalo (GRL), Tambalang (TMB), Mataram (MTR), Kendari (KND), Takalar ice (TKL+) and Mataram ice (MTR+) amplified 519 fragments in 122 loci in the size of 50 - ~370 bp. Genetic similarity of eight samples based on AFLP product showed high result with similarity coefficient range from 0.7951-0.9210. Genetic similarity of ice-ice infected algae was decrease compared to the normal samples. The similarity between TKL-TKL+ was 0.8176 and MTRMTR+ was 0.8033. The highest similarity was between TKL and TMB, then the lowest was between MTR and TKL+
Keyword: 

Judul: Studi Peran Interaksi Bakteri Patogen Dan Lingkungan Terhadap Penyakit Ice-Ice  Pada Rumput Laut Kappaphycus Alvarezii.
Abstrak: Pengembangan dan peningkatan produksi rumput laut Kappaphycus alvarezii sangat penting perannya dalam upaya memenuhi permintaan berbagai industri yang memanfaatkan rumput laut sebagai bahan dasar produksinya. Indonesia sebagai salah satu negara produsen terbesar, harus mampu menjamin kualitas dan kuantitas produksi budidaya rumput laut dalam rangka persaingan antar produsen rumput laut di dunia. Budidaya merupakan jalan utama dalam mengupayakan pencapaian produksi massal rumput laut. Namun demikian, kegiatan budidaya seringkali dihadapkan suatu masalah terbesar, yakni munculnya wabah penyakit rumput laut. Penyakit semakin dipandang sebagai faktor utama dalam ekologi laut dan dampaknya diperkirakan akan meningkat dengan perubahan lingkungan seperti pemanasan global. Disertasi ini fokus pada pemahaman sebuah "pemutihan" (bleaching) penyakit ice-ice pada makroalga merah Kappaphycus alvarezii, terutama pada musim panas dengan pendugaan suhu yang meningkat dan kepadatan bakteri yang semakin melimpah. Penyakit ice-ice diduga dapat dihasilkan secara in vitro oleh kombinasi dari peningkatan suhu dan kehadiran bakteri patogen. Penelitian ini bertujuan untuk mengkaji: a) jenis bakteri dari rumput laut yang terserang penyakit ice-ice, b) patogenisitas secara in vitro bakteri patogen dengan menggunakan mikropropagul, c) performa secara morfologi dan mikroskopis pada rumput laut yang diinkubasi pada suhu panas dan penginfeksian beberapa jenis bakteri patogen dengan konsentrasi bakteri yang berbeda. Penelitian ini dilakukan melalui metode eksperimen dengan tiga tahapan. Tahapan I: isolasi bakteri dan identifikasi dengan pengujian biokimia dan molekuler melalui sekuensing untuk mengidentifikasi spesies dari bakteri pada rumput laut yang terserang penyakit ice-ice; Tahapan II: Perlakuan penginfeksian bakteri patogen dengan jenis bakteri yang berbeda untuk menentukan tingkat patogenisitas bakteri patogen terhadap rumput laut; Tahapan III: Perlakuan kombinasi suhu dengan jenis dan konsentrasi bakteri yang berbeda untuk mengevaluasi performa morfologi dan mikroskopis jaringan rumput laut K. alvarezii. Hasil penelitian menunjukkan bahwa terdapat lebih dari satu jenis bakteri yang teridentifikasi pada K. alvarezii yang terserang penyakit ice-ice, yakni Shewanella haliotis strain DW01, Vibrio alginolyticus strain ATCC 17749, Stenotrophomonas maltophilia strain IAM 12323, Arthrobacter nicotiannae DSM 20123, Pseudomonas aeruginosa strain SNP0614, Ochrobactrum anthropic strain ATCC 49188, Catenococcus thiocycli strain TG 5-3 dan Bacillus subtilis subsp.spizizenii strain ATCC 6633. Dari kedelapan jenis bakteri tersebut, sebanyak lima jenis (62,5%) masuk dalam kelompok Gammaproteobacteria, lainnya masingmasing satu jenis bakteri (12,5%) adalah Alphaproteobacteria, Firmicutes, dan Actinobacteria. Hasil ini juga menunjukkan bahwa sebagian besar jenis bakteri penyebab penyakit ice-ice adalah Proteobacteria. Uji patogenisitas bakteri dilakukan secara in vitro dengan menggunakan mikropropagul hasil kultur jaringan yang diinfeksikan dengan kedelapan jenis bakteri hasil riset tahap pertama. Seperti yang ditemukan dalam penelitian vi sebelumnya, terdapat delapan jenis bakteri yang mungkin berasosiasi dengan penyakit ice-ice. Penelitian ini bertujuan untuk menguji tingkat patogenisitas dari isolat pada mikropropagul K.alvarezii dengan gejala serangan ice-ice berdasarkan gejala klinis, morfologi dan jaringan rumput laut. Mikropropagul berukuran 2-4 cm direndam dalam air laut yang mengandung 106 bakteri cfu / ml untuk menentukan patogenisitas. Timbulnya gejala ice-ice diamati setiap hari secara visual. Hasil penelitian menunjukkan bahwa bakteri yang paling cepat menimbulkan bleaching pada mikropropagul adalah Stenotrophomonas maltophilia (5 jam pascainfeksi), sedangkan paling lambat adalah dengan V. alginolyticus (44 jam pascainfeksi). Bakteri lainnya dapat menyebabkan gejala ice-ice yakni 15-21 jam pascainfeksi. Selanjutnya, bakteri Shewanella Haliotis dan V. alginolyticus ditemukan di talus sehat. Ini adalah studi pertama yang
Keyword: bakteri, suhu, salinitas, penyakit ice-ice, talus, Kappaphycus alvarezii

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: