Judul: Performance of Early Generation Wheat Lines from Four Populations in Indonesian Agroecosystems
Abstrak: Upaya untuk menghasilkan varietas gandum tropika dengan potensi hasil baik dan adaptif di agroekosistem Indonesia terus dilakukan. Tujuan penelitian ini adalah memperoleh informasi tentang keragaan dan mengukur nilai parameter genetik genotipe-genotipe F2:3 dan F2:4 gandum di dataran tinggi. Secara khusus penelitian ini bertujuan untuk (1) memperoleh nilai ragam genetik dan nilai ragam dalam galur dari segregan transgresif putatif F2:3 pada empat famili gandum, (2) memperoleh nilai duga heritabilitas arti luas yang tinggi dari karakter agronomi gandum, (3) memperoleh karakter seleksi sekunder yang memiliki keeratan hubungan dengan daya hasil gandum, (4) memperoleh galur-galur F2:3 dan F2:4 gandum yang berdaya hasil tinggi (5) memperoleh informasi diferensial seleksi dari seleksi berdasarkan karakter hasil. Percobaan pertama adalah evaluasi famili F2:3 segregan transgresif putatif gandum di dataran tinggi di Cipanas. Materi genetik yang digunakan adalah galur-galur segregan transgresif putatif generasi F2:3 hasil seleksi pada generasi F2 dari populasi G1/Se, G2/Se, G3/Se, dan Ja/Se. Penelitian dilaksanakan pada bulan Juni hingga November 2018 di KP. BALITHI, Cipanas, Jawa Barat (1.100 mdpl). Penelitian disusun dalam rancangan kelompok lengkap teracak dengan perbesaran. Lima varietas tetua digunakan sebagai pembanding (kontrol). Pengamatan dilakukan pada karakter agronomi dan komponen hasil. Percobaan kedua adalah keragaan genotipe-genotipe F2:4 gandum dari empat populasi. Materi genetik yang digunakan adalah galur-galur F2:4 hasil seleksi pedigree pada generasi F2:3 dari famili G1/Se, G2/Se, G3/Se, dan Ja/Se. Penelitian dilaksanakan dari bulan Maret hingga Agustus 2019 di KP. BALITHI, Cipanas, Jawa Barat (1.100 mdpl). Penelitian disusun dalam rancangan kelompok lengkap teracak dengan perbesaran. Lima varietas tetua digunakan sebagai pembanding. Pengamatan dilakukan pada karakter agronomi dan komponen hasil. Analisis ragam pada genotipe-genotipe F2:3 gandum menunjukkan bahwa famili F2:3 gandum memberikan kontribusi terhadap perbedaan karakter jumlah anakan produktif, umur panen, jumlah biji malai utama, jumlah biji per tanaman, dan bobot biji per tanaman. Famili F2:3 gandum menunjukkan keragaan yang melebihi tetua terbaiknya pada karakter panjang malai, jumlah biji per tanaman, dan jumlah anakan produktif. Nilai duga heritabilitas arti luas dan nilai koefisien keragaman genetik yang tinggi terdapat pada karakter jumlah anakan produktif, jumlah biji malai utama, bobot biji malai utama, bobot 100 butir, jumlah biji per tanaman dan bobot biji per tanaman. Hasil verifikasi menunjukkan tidak terdapat galur-galur yang terkonfirmasi sebagai segregan transgresif putatif. Seleksi berdasarkan karakter bobot biji per tanaman menghasilkan 30 galur dari empat famili F2:3 gandum dengan diferensial seleksi mencapai 59%. Analisis korelasi pada percobaan pertama menunjukkan bahwa karakter umur berbunga memiliki korelasi negatif dan nyata terhadap karakter jumlah biji per tanaman (r=-0,79*) dan bobot biji per tanaman (r=-0,78*). Karakter jumlah biji per tanaman (r=0,86**) menunjukkan nilai korelasi positif dan signifikan terhadap bobot biji per tanaman. Hasil analisis lintasan menunjukkan bahwa karakter jumlah biji per tanaman memiliki pengaruh langsung yang besar terhadap bobot biji per tanaman yaitu sebesar 0,65 dengan nilai korelasi yang positif dan signifikan (r=0,86**). Karakter umur berbunga memiliki nilai pengaruh langsung sebesar -0,27. Diagram lintasan menunjukkan bahwa koefisien sisa pada famili F2:3 gandum adalah sebesar 0,48 yang berarti bahwa 12 karakter yang diamati mampu menjelaskan ragam total dari bobot biji per tanaman sebesar 52% dan sisanya sebesar 48% dipengaruhi oleh faktor lain. Karakter umur berbunga dan jumlah biji
Keyword: analisis lintasan, diferensial seleksi, gandum tropika, heritabilitas, segregan transgresif

Judul: Pendugaan Komponen Ragam Karakter Agronomi Gandum (Triticum aestivum L.) dan Identifikasi Marka Simple Sequence Repeat (SSR) Terpaut Suhu Tinggi Menggunakan Bulk Segregant Analysis (BSA).
Abstrak: Gandum (Triticum aestivum L.) memiliki peran penting dalam ketahanan pangan dunia karena secara global, spesies ini paling banyak dibudidayakan di dunia. Kebutuhan konsumsi gandum di dunia tahun 2009 sampai tahun 2012 terus meningkat. Sampai saat ini, Indonesia masih sangat tergantung dengan impor gandum. Pengembangan Gandum di Indonesia menghadapi masalah karena adanya perbedaan kondisi agroklimat seperti suhu tinggi dan curah hujan. Dengan demikian, perlu dilakukan pengembangan varietas gandum yang toleran terhadap suhu tinggi baik melalui pemuliaan konvensional atau bioteknologi seperti penanda molekuler. Penelitian ini bertujuan untuk (1) memperoleh informasi mengenai keragaman genetik gandum generasi F3 di dataran tinggi dan generasi F4 di dataran menengah berdasarkan karakter agronomi; (2) memperoleh informasi aksi gen yang mengendalikan karakter agronomi di dua generasi gandum hasil persilangan Oasis x HP1744 menggunakan metode shuttle breeding; (3) memperoleh informasi mengenai hubungan antara karakter-karakter agronomi dan kriteria seleksi pada generasi F4 di dataran menengah; (4) mengidentifikasi dan memperoleh genotipe F4 (Oasis x HP1744) yang beradaptasi dengan stres suhu tinggi; (5) memperoleh marka Simple Sequence Repeat (SSR) yang mampu mengidentifikasi genotipe yang toleransi terhadap suhu tinggi menggunakan bulk segregant analysis; (6) mengetahui hubungan genetik dan tingkat keragaman genetik gandum hasil persilangan antara Oasis x HP1744 di dataran menengah menggunakan marka Simple Sequence Repeat (SSR); (7) mengelompokkan genotipe F4 gandum di dataran menengah berdasarkan kekerabatan. Percobaan untuk mengetahui keragaman genetik dan seleksi dari generasi F3 dilakukan di Kebun Percobaan Pusat Penelitian Tanaman Hias, Cipanas, Bogor dengan ketinggian 1100 m di atas permukaan laut dari bulan April sampai Agustus 2012 dengan menggunakan rancangan perbesaran (Augmented Design). Studi mengenai kendali genetik karakter agronomi gandum menggunakan metode Shuttle Breeding dilakukan di dua lokasi, di Kebun Percobaan Pusat Penelitian Tanaman Hias, Cipanas Bogor pada bulan April 2012 sampai Agustus 2012 dan di dataran menengah di lahan pertanian di Cisarua, Bogor dengan ketinggian 600 m di atas permukaan laut pada bulan Februari sampai Mei 2013. Rancangan penelitian yang digunakan adalah rancangan Augmented. Percobaan untuk keragaman genetik dari generasi F4 dilakukan di dataran menengah di Cisarua, Bogor dengan ketinggian ± 600 m di atas permukaan laut pada bulan Februari sampai Mei 2013. Karakter agronomi dianalisis menggunakan sidik lintas dan seleksi dilakukan untuk genotipe toleran terhadap suhu tinggi. Seleksi marka SSR terpaut suhu tinggi menggunakan bulk segregant analysis dilakukan di Laboratorium Biologi Molekuler, Departemen Agronomi dan Hortikultura, Institut Pertanian Bogor (IPB) dan di Laboratorium Biologi Molekuler, Balai Penelitian Tanaman Serealia, Maros, Sulawesi Selatan pada bulan Juli 2013 sampai Maret 2014. Hasil penelitian untuk generasi F3 menunjukkan bahwa 6 karakter agronomi yang memiliki keragaman genetik yang tinggi adalah karakter kehijauan daun bendera, jumlah anakan total, persentase floret hampa per malai, jumlah biji malai utama, bobot biji malai utama, jumlah biji per malai, bobot biji per malai, jumlah biji per tanaman dan bobot biji per tanaman. Generasi F3 yang terpilih adalah O/HP 21, O/HP 93, O/HP 82, O/HP 6, O/HP 93, O/HP 104, O/HP 22, O/HP 37, O/HP 115, dan O/HP 30, yang digunakan untuk pemilihan pada generasi F4 di lingkungan cekaman suhu tinggi. Karakter agronomi dari generasi F3 yang dikendalikan oleh banyak gen (poligenik), yaitu karakter jumlah anakan total dan jumlah
Keyword: analisis lintas, bulk segregant analysis, diferensial seleksi, index seleksi, jarak genetik, kemiripan genetik, kendali genetik, keragaman genetik, seleksi langsung, seleksi tidak langsung

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: