Judul: Kualitas Hutan Kota Berdasarkan Faktor Lingkungan dan Indeks Komunitas Burung pada Tiga Hutan Kota di Jakarta Timur.
Abstrak: Kualitas hutan kota yang baik menunjukkan bahwa penyelenggaraan hutan kota tersebut juga berfungsi dengan baik. Tujuan utama dari penelitian ini adalah membandingkan kualitas hutan kota berdasarkan faktor lingkungan dengan indeks komunitas burung. Penelitian dilakukan di tiga hutan kota Jakarta Timur yaitu Hutan Kota Situ Rawa Dongkal, Hutan Kota Cibubur, dan Hutan Kota Cijantung. Kualitas hutan kota berdasarkan faktor lingkungan diperoleh dengan menjumlahkan skor berdasarkan tingkat keanekaragaman jenis tumbuhan, kebisingan, suhu dan kelembapan udara, serta kerindangan tajuk. Indeks komunitas burung diperoleh dengan menjumlahkan skor dari guild yang meliputi pakan, asal jenis, reproduksi, sarang, waktu aktif, dan habitat utama. Hasil dari penelitian ini menunjukkan bahwa Hutan Kota Situ Rawa Dongkal dan Hutan Kota Cibubur memiliki kategori kualitas menengah, sedangkan Hutan Kota Cijantung memiliki kategori kualitas rendah. Penentuan kualitas hutan kota berdasarkan indeks komunitas burung menunjukkan bahwa ketiga hutan kota tersebut memiliki kategori rendah. Hasil tersebut menunjukkan bahwa penentuan kualitas hutan kota dengan kedua metode tersebut memiliki hasil yang tidak jauh berbeda.
Keyword: burung, faktor lingkungan, kualitas hutan kota, Jakarta Timur

Judul: Pengembangan Indeks Komunitas Burung Sebagai Indikator Kualitas Ruang Terbuka Hijau Perkotaan Di Dki Jakarta
Abstrak: Berbagai jenis burung yang hidup di RTH DKI Jakarta dapat digunakan sebagai bioindikator kualitas lingkungan dengan mengembangkan indeks komunitas burung (IKB). IKB pernah diterapkan di Amerika untuk menilai kualitas lingkungan areal hutan dan pada penelitian ini IKB metode dikembangkan di lingkungan perkotaan Indonesia yang memiliki iklim tropis. Penelitian yang dilakukan pada bulan Mei hingga Juli 2014 ini melalui beberapa tahap yaitu mengidentifikasi jenis burung, menentukan tipe guild, mengelompokkan jenis burung berdasarkan guild, menentukan nilai guild, menentukan kriteria nilai IKB serta menguji dan mengevaluasi IKB. Diperoleh 25 guild yang dikembangkan dari 6 kategori guild dan 36% merupakan kelompok guild generalis serta 64% kelompok guild yang bersifat spesialis. Setelah empat kali proses iterasi diperoleh proporsi dan skor masing-masing tipe guild dan untuk guild yang bersifat generalis dan spesialis memiliki sistem skoring yang berbeda (ascending dan descending). Nilai IKB diperoleh dengan menjumlahkan skor setiap guild,kemudian skor total dikalikan dengan 0.8 (faktor koreksi). Kualitas RTH dibagi menjadi 5 kategori, yaitu sangat rendah, rendah, menengah, baik, dan sangat baik. Berdasarkan hasil pengujian terhadap 21 lokasi RTH terlihat bahwa variasi karakter ekologis jenis burung menentukan nilai IKB di suatu lokasi dan RTH dengan nilai tertinggi adalah Suaka Margasatwa Muara Angke (71.6 ; kualitas baik). Nilai IKB di suatu RTH dipengaruhi oleh komposisi jenis burung dan komposisi tipe guild. Hasil pengembangan IKB untuk DKI Jakarta dapat diaplikasikan untuk beberapa RTH di wilayah kota besar dan kota kecil pulau Jawa karena dianggap memiliki kesamaan secara geografis.
Keyword: komunitas burung, bioindikator, guild, ruang terbuka hijau, DKI Jakarta

Judul: Simulasi Dinamika Molekul Protein 1GB1 Menggunakan Not Just Another Molecular Dynamcs Program (NAMD)
Abstrak: Protein 1GB1 helps Streptomyces griseus to avoid host defense by immunoglobulin binding site properties. The aim of this study are to learn the mechanism of unfolding and molecular dynamics of protein 1GB1 by temperature variance based on some parameters. Coordinate file of 1GB1 that given by NMR (Nuclear Magnetic Resonance) can be downloaded from Protein Data Bank, then it was processed by some steps such as minimization, heating, equilibration and production run using PBC (Periodic Boundary Condition) and PME (Particle Mesh Ewald) methods. Simulation running at 325K, 350K, 375K, 400K, 450K dan 500K. Except simulation 1 ns at 500K, all simulations running for 10 ns. Some parameters shown unfolding process of 1GB1 at 900 ps in 500 K simulation. Secondary structures that broke for the first time is alpha-helix that converted to turn and coil.
Keyword: