Judul: Respon retina juvenil ikan kerapu lumpur (epinephelus coioides) terhadap cahaya
Abstrak: Sebagian besar metode penangkapan yang ada didasarkan pada sifat-sifat sensitivitas visual, pola gerak, distribusi penyebaran ikan tujuan penangkapan (Pascoe, 1990). Pengetahuan tentang respon retina ikan kerapu terhadap cahaya diharapkan mampu memberikan pengetahuan dasar untuk mengembangkan metode penagkapan. Adapun penelitian ini menggunakan juvenil ikan kerapu lumpur (Epinephelus coioides) dengan panjang total 12 cm sebagai hewan percobaan dalam pengujian lama waktu yang diperlukan ikan kerapu lumpur untuk merespon cahaya. Penelitian ini terdiri atas dua tahap, yaitu penelitian pendahuluan dan utama. Penelitian pendahuluan dilakukan antara 20 sampai 22 Maret 2002 di karamba jaring apung, Teluk Banten dengan tujuan untuk menentukan intensitas cahaya yang akan digunakan di laboratorium. Penelitian utama dilakukan mulai dari Maret sampai Juni 2002 di Instalasi Pengembangan dan Pengkajian Teknologoi Pertanian, Bojonegara dan laboratorium Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Institut Pertanian Bogor. Metode penelitian yang digunakan adalah observasi dan eksperimental. Pengamatan pola tingkah laku ikan kerapu lumpur dilakukan secara visual sampai kedalaman 3 m yang meliputi tingkah laku makan dan renang. Intensitas cahaya matahari yang masuk ke dalam perairan diukur dengan marine luxmeter sedangkan kecerahan perairan diukur dengan seichi disk. Seluruh pengamatan dan pengukuran dimulai pada saat matahari terbit sampai matahari berada di ketinggian maksimum. Sedangkan untuk penelitian utama perlakuan diberikan mulai tepat tengah malam. Asumsinya adalah cahaya buatan akan lebih efektif digunakan pada malam hari. Rancangan percobaan terdiri 1) rancangan perlakuan satu faktor, yaitu faktor lama pencahayaan dengan taraf perlakuan 30 menit, 60 menit, 90 menit, 120 menit dan...
Keyword: 

Judul: Pengaruh tingkat iluminasi cahaya terhadap adaptasi retina juvenil kerapu tikus (Cromileptes altivelis)
Abstrak: Perairan Indonesia memiliki beranekaragam spesies kerapu. Menurut Ditjen Perikanan (1987 dan 1995), daerah penyebaran ikan kerapu (Epinephelus spp.) di Indonesia meliputi seluruh perairan Sumatera, Jawa, Nusa Tenggara, Kalimantan, Sulawesi, Maluku dan Irian Jaya kecuali laut dalam disekitar Banda. Ikan Kerapu tikus atau kerapu bebek (Cromileptes altivelis) mempunyai nilai ekonomis tinggi di pasar Asia seperti Hongkong, China, Taiwan, Jepang, dan Singapura. Juvenil ikan kerapu tikus berharga cukup mahal untuk ikan hias akuarium, sedangkan ikan dewasanya merupakan salah satu ikan yang berharga tinggi di pasar ikan dunia. Umumnya ikan ini ditangkap dengan menggunakan pancing, tombak dan perangkap (trap). Pengamatan terhadap tingkah laku ikan akan memudahkan kita dalam pengembangan penangkapan ikan. Pengembangan dalam usaha penangkapan dan budidaya ikan diutamakan kepada ikan-ikan yang memiliki nilai ekonomis tinggi, akan tetapi budidaya ikan berekonomis tinggi belum dilakukan secara besar-besaran, saat ini masih dalam tahap penelitian. Tujuan dilakukannya penelitian ini adalah: (1) Menganalisis tingkat adaptasi retina mata juvenil kerapu tikus (Cromileptes altivelis) terhadap iluminasi cahaya; (2) Mengetahui dan membandingkan pengaruh iluminasi cahaya terhadap tingkah laku makan juvenil kerapu tikus (Cromileptes altivelis). Penelitian dilaksanakan pada bulan Agustus 2000 di laboratorium Multi Spesies Hatchery (MSH) ruang Extension dan laboratorium Parasit pada Loka Penelitian Perikanan Pantai Gondol, Kecamatan Gerokgak, Singaraja, Bali. Pengumpulan data menggunakan metode eksperimental dengan menggunakan Rancangan Acak Lengkap (RAL). Analisis data menggunakan metode...
Keyword: 

Judul: Penyusunan Overlap Graph menggunakan Suffix Tree pada DNA Sequence
Abstrak: The DNA sequence assembly is very important in genome analysis. This step aims to reconstruct contigous DNA fragment (contigs) from short fragment by concatenating fragments based on the overlap region among them. This method employs overlap graph for solving the problems. In this graph, nodes represent fragments and edges represent overlap. This research developed a software for constructing overlap graph using suffix tree. The evaluation was conducted by measuring the number of nodes, number of edges, and the execution time in many values of minimum overlap. The minimum overlap is defined as the minimum length of substring which is considered as the overlap region between two fragments. The evaluation results showed that the number of nodes, the number of edges, and the execution time were increased with the decreasing of the minimum overlap value.
Keyword: