Judul: Kelimpahan dan Aktivitas Bakteri Nitrifikasi, Denitrifikasi, dan Nitrat Amonifikasi di Tambak Udang Sistem Intensif
Abstrak: Udang merupakan salah satu komoditas unggulan perikanan budidaya di Indonesia. Ekosistem tambak udang memiliki senyawa nitrogen anorganik utama yang dapat terlarut dalam air, yaitu amonia (NH3), nitrat (NO3-), dan nitrit (NO2-). Salah satu permasalahan yang sering dihadapi dalam pengelolaan ekosistem tambak udang yaitu penurunan kualitas air dan sedimen yang disebabkan oleh polusi senyawa nitrogen anorganik. Polusi senyawa nitrogen di lingkungan ekosistem tambak menimbulkan dampak negatif. Senyawa nitrogen anorganik seperti amonia (NH3) dan nitrit (NO2-) dapat menyebabkan keseimbangan ekologi mikroorganisme di dalam tambak terganggu. Upaya pelestarian ekosistem tambak udang terhadap hal tersebut dapat dilakukan melalui pengendalian mikroorganisme dan aktivitasnya dalam proses transformasi senyawa nitrogen. Penelitian ini dilakukan untuk mengkaji kelimpahan maupun aktivitas bakteri serta mendapatkan isolat bakteri potensial yang memiliki aktivitas nitrifikasi, denitrifikasi, dan nitrat amonifikasi dari air kolam tambak udang sistem intensif. Sampel air diambil mulai dari tahap persiapan tambak hingga tahap panen dengan interval waktu 0 hari, 21 hari, 65 hari, dan 89 hari umur udang. Pengambilan sampel dilakukan secara acak pada 4 titik area kolam tambak dengan kedalaman air 60 cm. Analisis parameter kualitas air meliputi suhu, salinitas, pH, konsentrasi oksigen terlarut (DO), nitrat (NO3-), nitrit (NO2-), amonia (NH3), total amonium (TAN), dan kandungan total bahan organik (TOM). Analisis kelimpahan bakteri nitrifikasi, denitrifikasi, dan nitrat amonifikasi dilakukan menggunakan metode MPN. Laju potensial bakteri ditentukan dengan persamaan kinetika Michaelis-Menten. Isolasi bakteri dilakukan dari medium uji MPN yang positif. Isolat bakteri murni yang diperoleh dikarakterisasi morfologi koloni dan morfologi sel dengan pewarnaan Gram. Isolat murni diuji aktivitas oksidasi amonia dan reduksi nitrat. Isolat dengan aktivitas oksidasi amonia dan reduksi nitrat tertinggi dipilih untuk dianalisis kinetika aktivitas, diamati pola pertumbuhannya, dan diidentifikasi secara molekuler berdasarkan gen 16S rRNA. Hasil penelitian menunjukkan kelimpahan tertinggi bakteri nitrifikasi pada air kolam tambak udang sistem intensif terdapat pada hari ke-65 (3,69 log sel mL-1) dan kelimpahan terendah terdapat pada hari ke-0 (2,33 log sel mL-1). Kelimpahan tertinggi bakteri denitrifikasi terdapat pada hari ke-89 (3,42 log sel mL-1) dan kelimpahan terendah terdapat pada hari ke-0 (1,82 log sel mL-1). Kelimpahan tertinggi bakteri nitrat amonifikasi terdapat pada hari ke-65 (3,08 log sel mL-1) dan kelimpahan terendah terdapat pada hari ke-0 (1,31 log sel mL-1). Laju potensial kelompok bakteri nitrifikasi dominan pada hari ke-0 hingga ke-65. Laju potensial kelompok bakteri denitrifikasi dominan pada hari ke-89. Laju potensial kelompok bakteri nitrat amonifikasi lebih rendah dibandingkan nitrifikasi dan denitrifikasi. Sebanyak 32 isolat terseleksi berhasil diperoleh dari air kolam tambak udang sistem intensif, 15 isolat merupakan kelompok bakteri nitrifikasi, 8 isolat termasuk kelompok bakteri denitrifikasi, dan 9 isolat termasuk kelompok bakteri nitrat amonifikasi. Isolat yang memiliki aktivitas oksidasi amonia dan reduksi nitrat terbaik yaitu KN25, KN45, KD12, KD19, KR5, dan KR9. Kecepatan maksimum (Vmax) oksidasi amonia isolat KN25 dan KN45 masing-masing adalah 0,07 mM jam-1 dan 0,15 mM jam-1. Nilai Km isolat KN25 dan KN45 yaitu 0,23 mM dan 0,08 mM. Kecepatan maksimum (Vmax) reduksi nitrat isolat KD12, KD19, KR5, dan KR9 masing-masing adalah 0,06 mM jam-1, 0,03 mM jam-1, 0,18 mM jam-1, dan 0,08 mM jam-1. Nilai Km masing-masing isolat tersebut yaitu 0,37 mM, 0,46 mM, 0,14 mM, dan 0,47 mM. Hasil
Keyword: denitrification, MPN, nitrate ammonification, nitrification

Judul: Struktur Komunitas dan Aktivitas Bakteri Nitrifikasi, Denitrifikasi, dan Nitrat Amonifikasi di Tambak Udang Sistem Intensif
Abstrak: Udang merupakan salah satu komoditas unggulan perikanan budidaya di Indonesia. Tambak udang sebagai suatu ekosistem memiliki senyawa nitrogen anorganik utama yang dapat terlarut dalam air, yaitu amonia (NH3), nitrat (NO3-), dan nitrit (NO2-). Permasalahan yang sering terjadi dalam pengelolaan tambak udang yaitu penurunan kualitas air dan sedimen yang disebabkan oleh akumulasi nitrogen anorganik. Kandungan nitrogen anorganik yang tinggi di ekosistem tambak menimbulkan dampak negatif. Senyawa amonia (NH3) dan nitrit (NO2-) dapat menyebabkan keseimbangan ekologi mikrob di dalam tambak terganggu. Upaya pelestarian ekosistem tambak terhadap hal tersebut dapat dilakukan melalui pengendalian mikroba beserta aktivitasnya dalam proses transformasi senyawa nitrogen anorganik. Penelitian ini bertujuan mengkaji struktur komunitas bakteri berdasarkan gen 16S rRNA dan gen fungsional melalui pendekatan metagenomik serta mengkaji aktivitas bakteri nitrifikasi, denitrifikasi, dan nitrat amonifikasi dalam mentransformasi senyawa nitrogen anorganik. Sampel air dan sedimen diambil dari kolam tambak udang sistem intensif milik Balai Layanan Usaha Produksi Perikanan Budidaya (BLUPPB). Pengambilan sampel air dan sedimen dilakukan pada 2 jenis kolam yang berbeda perlakuan yaitu kolam dengan probiotik terpilih dan kolam dengan probiotik komersial (QuickPro dan Boster Biolacto). Pengambilan sampel air dilakukan pada saat umur pemeliharaan udang 0 hari, 15 hari, 30 hari, 45 hari, 60 hari, 75 hari, dan 90 hari. Di sisi lain, pengambilan sampel sedimen juga dilakukan pada saat umur pemeliharaan udang 0 hari, 30 hari, 60 hari, dan 90 hari. Parameter kualitas air dan sedimen meliputi senyawa nitrogen anorganik dianalisis sesuai prosedur APHA. Analisis kelimpahan bakteri nitrifikasi, denitrifikasi, dan nitrat amonifikasi dilakukan menggunakan metode MPN. Isolasi bakteri dilakukan dari medium uji MPN yang positif. Isolat bakteri murni yang diperoleh dikarakterisasi morfologi koloni dan morfologi sel dengan pewarnaan Gram. Isolat murni diuji aktivitas oksidasi amonia dan reduksi nitrat. Isolat dengan aktivitas oksidasi amonia dan reduksi nitrat tertinggi dipilih untuk dianalisis kinetika aktivitas, diamati pola pertumbuhannya, dan diidentifikasi secara molekuler berdasarkan gen 16S rRNA. Di sisi lain, pendekatan NGS dilakukan untuk mengestimasi struktur komunitas mikroba berdasarkan gen 16S rRNA dan gen fungsional. Analisis kelimpahan gen 16S rRNA dan gen fungsional bakteri nitrifikasi, denitrifikasi, dan nitrat amonifikasi juga dilakukan dengan metode qPCR. Hasil analisis kelimpahan gen bakteri 16S rRNA dengan qPCR menunjukkan bahwa kelimpahan gen bakteri 16S rRNA dan nrfA untuk bakteri nitrat amonifikasi pada kolam probiotik terpilih signifikan lebih tinggi daripada kolam probiotik komersial selama masa pemeliharaan udang. Kelimpahan bakteri gen 16S rRNA pada kolam probiotik terpilih berkisar dari 2,11 ± 0,14 × 108 hingga 2,70 ± 0.38 × 108 salinan g sedimen-1, sedangkan pada kolam probiotik komersial dari 1,38 ± 0.26 × 108 hingga 1,87 ± 0.19 × 108 salinan g sedimen-1. Kelimpahan gen bakteri nitrat amonifikasi (nrfA) pada kolam probiotik terpilih berkisar antara 1,87 ± 0.17 × 105 hingga 2,51 ± 0.15 × 105 salinan gen sedimen-1, sedangkan pada kolam probiotik komersial dari 1,63 ± 0.14 × 105 hingga 2,12 ± 0.21 × 105 salinan gen sedimen-1. Struktur komunitas bakteri berdasarkan gen 16S rRNA pada sedimen tambak menunjukkan bahwa Proteobacteria merupakan filum yang paling melimpah di semua sampel dan menyumbang hingga persentase 33-43%, diikuti oleh Bacteroidetes (8,6-17,5%), Firmicutes (6,1-12,6%), dan Chloroflexi (6,1-12,1%). Secara umum, kelimpahan relatif dari filum Proteobacteria dan
Keyword: denitrification, NGS, nitrate-ammonification, nitrification, qPCR

Judul: Penggunaan Teorema Homeomorphy 2-Manifold dan Teorema Euler Poincare pada Torus 𝑇�� dan Simplicial Complex 𝐾��
Abstrak: Two dimensional topological spaces are said to be homeomorphic if they have the same topological invariant, where one of topological invariant used is an Euler characteristic. Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem and Euler Poincare’s Theorem are used to distinguish two topological spaces. Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem uses Euler characteristic to identify two dimensional topological spaces. Euler Poincare’s Theorem is an alternative way to find Euler characteristic with Betti number, which is topological invariant as well. The objective of this paper is to investigate the homeomorphism of torus 𝑇����� and simplicial complex 𝐾�����. Topological space torus and simplicial complex 𝐾����� have the same Euler characteristic, which is two. Based on Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem topological space torus 𝑇����� and simplicial complex 𝐾����� is homeomorphic.
Keyword: simplicial, torus, Euler, homeomorphism, topology