Judul: Pemadatan tanah lapisan bawah di petakan sawah dalam usaha menekan laju perkolasi
Abstrak: Kebutuhan air irigasi di sawah ditentukan oleh faktor-faktor penyiapan lahan, penggunaan konsumtif, perkolasi dan rembesan, penggantian lapisan air dan curah hujan efektif. Perkolasi sebagai salah satu faktor penentu kebutuhan air irigasi sebaiknya ditekan serendah mungkin, karena dapat mengakibatkan pemborosan pemakaian air irigasi. Laju perkolasi yang tinggi biasanya dijumpai pada lahan-lahan yang baru dibuka atau baru dijadikan sawah. Pada lahan ini kebutuhan airnya dapat mencapai 3-5 kali lebih besar dari normal. Laju perkolasi di sawah dapat berkurang setelah terbentuknya lapisan kedap (hardpan). Lapisan kedap baru terbentuk setelah tanah sawah dikerjakan antara 4-6 tahun. Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari pengaruh pemadatan tanah terhadap laju perkolasi. Lahan penelitian berlokasi di Lahan Percobaan Leuwikopo, Darmaga. Pengukuran sifat-sifat fisik tanah dilakukan di Laboratorium Fisika dan Mekanika Tanah-FATETA dan Pusat Penelitian Tanah dan Agroklimat, Bogor. ...
Keyword: 

Judul: Pengaruh perlakuan pemadatan dengan dua jenis tamping rammer yang berbeda terhadap perubahan sifat fisik dan mekanika tanah
Abstrak: Secara umum pada lahan sawah baru umumnya boros dalam pemakaian air karena tingkat perkolasi yang tinggi akibat belum terbentuknya lapisan kedap (hardpan). Selain berfungsi untuk mengurangi perkolasi, lapisan kedap ini juga berfungsi untuk menopang manusia, hewan dan alat mesin pertanian sehingga dapat beroperasi dengan baik. Lapisan kedap (hardpan) dengan kekerasan antara 10-20 kgf/cm2 cukup untuk beroperasinya mesin pertanian dengan baik (Sakai, 1998). Tujuan dari penelitian ini adalah mengetahui pengaruh pengolahan tanah dengan perlakuan pemadatan dengan dua jenis tamping rammer yang berbeda terhadap perubahan sifat fisik dan mekanik tanah serta untuk mengetahui pengaruh pemadatan terhadap laju rembesan dan perkolasi pada lahan sawah. Penelitian ini di laksanakan di areal sawah percobaan Sawah Baru-IPB Darmaga, Bogor. Luas lahan yang digunakan adalah 750 m² yang dibagi menjadi 96 petak. Sedangkan pengukuran laboratorium dilaksanakan di laboratorium Fisika dan Mekanika Tanah, Jurusan Teknik Pertanian, Fakultas Teknologi Pertanian, Institut Pertanian Bogor. Lahan penelitian dibagi menjadi 3 (blok) yang tiap bloknya terdiri dari 32 petak dengan ukuran 3 x 2 m untuk tiap petakan. Masing-masing petakan mendapat perlakuan yang berbeda. Perlakuan tersebut adalah kombinasi dari 2 (dua) jenis tamping rammer yaitu TR1 dan TR2, 4 (empat) tingkat kadar air yaitu...
Keyword: Mekanika tanah

Judul: Cloning and Structure Prediction of C-Type Lectin 19 (CTL-19) from Silkworm (Bombyx mori L.)
Abstrak: Bombyx mori L. is a highly significant insect due to its silk production affects several industries. Unfortunately, B. mori farming has recently experienced mortality issues caused by pathogenic infectious diseases. Despite the extensive study of innate immunity of B. mori, information regarding the molecular functions and mode of actions of C-type lectin 19 (CTL-19) in the innate immunity of B. mori remains limited. Therefore, this study aimed to predict the structure of the B. mori CTL-19 also clone and produce the recombinant protein to better understand its role in the silkworm's innate immunity. The open reading frame (ORF) of the CTL-19 gene (945bp) was successfully amplified and cloned to pGEM®-T Easy Vector. The mature protein consists of 294 amino acids with 2 CRDs, 9 conserved cysteine, and two specific carbohydrate binding motifs. Protein threading demonstrated to be superior in order to predict the ligand binding site in comparison to homology modelling. The predicted molecular weight is 33.26 kDa, with pI value of 5.70. Furthermore, molecular docking analysis reveal that BmCTL-19 have ability to bind to various carbohydrate residues. The BmCTL-19 gene will be sub clone into an appropriate expression vector and produce purified recombinant protein to evaluate its properties.
Keyword: Innate immunity, Carbohydrate Binding Motif, Homology modelling, Protein Threading, Molecular docking