Judul: Interaksi Antara Cendawan Endofit Asal Jahe Merah dengan Beberapa Bakteri Patogen pada Manusia
Abstrak: Cendawan endofit hidup pada berbagai jaringan tanaman seperti akar, batang, daun, dan buah. Cendawan tersebut bersifat simbiosis mutualisme atau netral dengan tanaman inang serta berpotensi sebagai sumber penghasil senyawa bioaktif termasuk senyawa antibakteri. Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari interaksi antara cendawan endofit asal jahe merah dengan bakteri patogen manusia Bacillus cereus, Staphylococcus aureus, dan Salmonella typhii. Metode pengujian yang digunakan adalah metode co-culture serta metode oposisi langsung melalui cara gores dan lapis ganda. Terdapat tiga tipe mekanisme cendawan endofit dalam mengendalikan bakteri uji yaitu melalui kontak fisik, produksi senyawa antibakteri, dan kombinasi kedua mekanisme tersebut. Hasil penelitian menunjukkan bahwa cendawan endofit yang diuji yang memiliki mekanisme interaksi secara fisik terhadap B. cereus, S. aureus, dan S. typhii berturut-turut ialah satu, sembilan, dan enam strain. Jumlah cendawan yang memiliki mekanisme interaksi melalui produksi senyawa antibakteri adalah enam strain terhadap S. aureus, dan lima strain terhadap S. typhii, sedangkan cendawan yang memiliki kedua mekanisme ialah sebanyak tiga strain terhadap S. aureus dan dua strain terhadap S. typhii. Hampir seluruh cendawan endofit yang diuji menunjukkan perubahan morfologi hifa sebagai hasil interaksi dengan bakteri uji. Perubahan morfologi yang terjadi ialah perubahan diameter hifa, hifa terpuntir 180o dan 360o, dinding sel hifa berkeriput atau berkelok, pembentukan klamidospora, dan percabangan hifa lebih banyak.
Keyword: antibakteri, cendawan endofit, interaksi, perubahan morfologi hifa

Judul: Potensi Cendawan Endofit Asal Jahe Merah (Zingiber officinale Roscoe) sebagai Pengendali Cendawan Patogen
Abstrak: Cendawan endofit ialah cendawan yang hidup secara mutualistik atau netral di dalam jaringan tanaman dan menghasilkan beragam senyawa metabolit yang dapat digunakan dalam pengembangan kesehatan, pertanian, perkebunan dan lingkungan. Cendawan endofit asal jahe merah (Zingiber officinale) dilaporkan dapat menghambat pertumbuhan cendawan patogen F. oxysporum, namun kemampuannya dalam mengendalikan cendawan patogen tumbuhan lainnya dan patogen manusia belum dilaporkan. Tujuan penelitian ini ialah mempelajari mekanisme cendawan endofit asal jahe merah dalam mengendalikan Fusarium solani, Ganoderma boninense, Phytophthora capsici Cb6, Phytophthora capsici K2 dan Candida albicans melalui uji antagonistik dan ekstrak cendawan secara in vitro, menentukan pelarut untuk mengekstraksi senyawa teraktif dan golongan senyawa kimianya, serta mengetahui potensi cendawan endofit dan ekstraknya untuk mengendalikan P. capsici Cb6 dan P. capsici K2 pada tanaman cabai secara in vivo. Sebanyak 10 isolat dari 6 spesies cendawan endofit asal jahe merah diuji kemampuan antagonistiknya terhadap cendawan F. solani, G. boninense, P. capsici Cb6, P. capsici K2 dan C. albicans. Cendawan endofit yang potensial diekstraksi filtrat dan miselianya dengan cara maserasi. Filtrat kultur diekstraksi menggunakan etil asetat dan n-heksana, sedangkan miselia cendawan menggunakan etil asetat, n-heksana dan etanol. Pada uji antagonistik, seluruh isolat cendawan endofit menghasilkan aktivitas anticendawan terhadap F. solani sebesar 46.00-68.00%, G. boninense sebesar 28.28-57.96%, patogen P. capsici Cb6 sebesar 55.19-75.93%, dan terhadap P. capsici K2 sebesar 58.40-88.00%. Cendawan endofit Talaromyces assiutensis JMa7, T. assiutensis JMbt3 dan Curvularia affinis JMbt9 memiliki hambatan terhadap kedua isolat P. capsici terbaik dengan nilai persentase hambatan lebih dari 70% yang disertai dengan perubahan morfologi hifa yang membentuk lilitan, bercabang dan menggelembung. Kemampuan antagonistik cendawan endofit terhadap C. albicans lebih rendah dari antagonistik terhadap kedua isolat P. capsici. Hanya 3 isolat cendawan endofit yang dapat menghambat C. albicans dengan diameter zona hambat 3.96-11.33 mm. Ketiga cendawan endofit tersebut juga merupakan isolat terbaik terhadap C. albicans sehingga dipilih untuk uji lanjutan yaitu uji aktivitas ekstrak dari filtrat kultur dan miselia cendawan endofit. Ekstrak etil asetat filtrat kultur dari masing-masing 3 isolat cendawan endofit terbaik mempunyai aktivitas penghambatan terhadap P. capsici Cb6 yaitu antara 20.09-33.49%, P. capsici K2 dengan nilai 13.61-23.56% dan C. albicans dengan nilai zona hambat antara 2.00-3.83 mm. Ekstrak filtrat kultur dengan pelarut n-heksana hanya ekstrak cendawan endofit T. assiutensis JMbt3 yang menghambat ketiga cendawan patogen uji. Penghambatan tersebut ialah 26.34% terhadap P. capsici Cb6, 20.94% terhadap P. capsici K2 dan 2 mm nilai diamater zona hambat terhadap C. albicans. Selain terbentuk hambatan juga terjadi perubahan hifa cendawan patogen akibat perlakuan ekstrak etil asetat filtrat kultur T. assiutensis JMbt3 yaitu hifa bercabang dan menggelembung. Ekstrak miselia tidak mempunyai nilai hambat terhadap ketiga isolat uji. Ekstrak etil asetat dari filtrat kultur T. assiutensis JMbt3 dipilih untuk analisis fitokimianya. Hasil analisis fitokimia ekstrak etil asetat filtrat kultur T. assiutensis JMbt3 dengan metode kromatografi lapis tipis (KLT) menunjukkan golongan senyawa bioaktif ialah terpenoid dan bersifat antioksidan. Perlakuan spora dan miselia cendawan endofit belum meningkatkan pertumbuhan tanaman cabai dan menekan busuk pangkal batang P. capsici Cb6 secara in vivo. Ekstrak etil asetat dari filtrat kultur cendawan endofit T. assiutensis JMbt3 336 000 ppm menyebabkan kerusakan pada daun cabai berupa nekrosis, mengering, berguguran dan tidak menekan
Keyword: Candida albicans, cendawan endofit, pelarut, Phytophthora capsici, terpenoid

Judul: The Construction of Greedy SVP LLL Algorithm
Abstrak: A lattice is a set of all integer linear combination of a set of linearly independent vectors in ℝ𝑛���. The independent vectors are called bases of lattice. Any lattice can be generated from many bases, and these bases have the same cardinality. In the lattice, the most fundamental and renowned problem is the Shortest Vector Problem (SVP). SVP is a tracking problem of the shortest nonzero vector in a lattice with equivalent bases. In two dimensions, SVP problem has resolved exactly by Gauss’ algorithm. When the lattice dimension is higher than two, A.K. Lenstra, H.W. Lenstra and L. Lovasz gave a LLL algorithm to compute approximation of nonzero shortest vector in the lattice. Reduced bases solution obtained from LLL algorithm still be an approximation and has polynomial running time of arbitrary dimension which large enough. In 1994, Schnoor and Euchner modified this LLL algorithm as a new variant which later was named deep insertion LLL algorithm. This algorithm is a modified version of the LLL algorithm to the terms of the exchange step to improve the accuracy of output of LLL reduced bases and applying it to the subset sum problem. The purpose of this research are: (1) Reconstruct the LLL algorithm and deep insertion LLL algorithm using a geometric approach. (2) Construct a greedy SVP LLL algorithm. (3) Implement the three algorithms in a symbolic programming language, and evaluate them experimentally. A bases ℬ=[𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑛���] in ℝ𝑚��� is called reduced LLL with parameter 𝛿��� if satisfies: (a) |𝜇���𝑗���𝑖���|≤12, for every integer 𝑖���,𝑗��� with 1≤𝑖���<𝑗���<𝑛���. (b)𝛿���‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���)‖2≤‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���+1)‖2, for 𝑗���=1,2,…,𝑛���−1,where 𝛿��� is a reduced parameter of real numbers with 14<𝛿���<1. The first requirement is the reduced basis 𝛿��� must “nearly orthogonal” and in its computation case, this requirement can be reached out by using the Gram-Schmidt’s orthogonalization. While the second requirement is called exchange step, or used to called as Lovasz condition. By using both of these requirements, then they establish the LLL algorithm. Then, Schnoor and Euchner modify the LLL algorithm based on the requirements of the exchange step called the deep insertion LLL algorithm, where the exchange step is based on the comparison of the projected vector in orthogonal complement [𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑘���−1]⊥ after j-th reduction. To construct greedy SVP LLL algorithm, the requirements of the exchange step is based on purely by comparing norm of lattice 𝐛���𝑗��� with norm lattice 𝐛���𝑖��� for 𝑖���=1,2,3…,𝑗���−1. The process of insertion reduced vector after the exchange step also has done greedily. Then, we calculate the number of arithmetic operation in greedy SVP LLL algorithm for further analysis. The result of our exprimentation for three algorithms on the certain matrix size shows that the running time of the three algorithms increases propotional to the size of the matrix. The result also shows that by using 𝛿���=34 for the LLL algorithm and the deep insertion LLL algorithm, and the greedy SVP LLL algorithm which is a new variant made by using no parameter of 𝛿���, outperform of the other of two previous algorithm in terms of speed with the same output.
Keyword: LLL algorithm, LLL deep insertion algorithm, greedy SVP LLL algorithm