Judul: Karakter Agronomi Dan Marka Ssr Sebagai Karakter Seleksi Generasi Awal Untuk Toleransi Suhu Tinggi Pada Padi
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk (1) memperoleh informasi tentang aksi gen dan pewarisan sifat karakter agronomi padi terhadap cekaman suhu tinggi di rumah kaca; (2) memperoleh marka simple sequence repeat (SSR) terpaut toleransi cekaman suhu tinggi melalui metode bulk segregrant analisis dan single marker analysis. Penelitian pertama bertujuan untuk mencari kriteria karakter seleksi dan memilih segregan terbaik di generasi awal berdasarkan beberapa karakter agronomi untuk adaptasi padi terhadap cekaman suhu tinggi. Penelitian dilaksanakan dari bulan September 2014 sampai bulan Januari 2015. Materi genetik yang digunakan adalah 213 individu segregant F2 yang berasal dari persilangan IPB 4S dan Situ Patenggang, 20 individu tetua IPB 4S, 20 individu tetua Situ Patenggang. Semua materi genetik ditanam dalam kondisi tercekam suhu tinggi di rumah kaca Institut Pertanian Bogor. Rata-rata suhu minimum dan maksimum pada penelitian ini adalah 24 °C dan 42.09 °C. Hasil penelitian menunjukkan bahwa karakter: jumlah anakan produktif dan total, jumlah gabah bernas, dan bobot gabah bernas memiliki nilai heritabilitas yang tinggi, aksi gen aditif, dan koefisien keragaman genetik yang tinggi. Karakter-karakter tersebut dapat dijadikan kriteria seleksi pada generasi awal untuk adaptasi padi terhadap cekaman suhu tinggi. Karakter seleksi dapat dilakukan baik dengan satu karakter atau beberapa kriteria karakter. Penelitian kedua bertujuan untuk memperoleh primer SSR terpaut toleran terhadap suhu tinggi dengan menggunakan bulked segregant analysis (BSA) dan dilanjutkan dengan single marker analysis (SMA). Penelitian dilakukan di Laboratorium Biologi Molekuler Tanaman, Departemen Agronomi dan Hortikultura, Institut Pertanian Bogor (IPB). Bahan genetik yang digunakan DNA tetua IPB 4S, Situ Patenggang, DNA genotipe F2, 12 Primer SSR. Hasil penelitian menunjukkan primer SSR RM 337 mengikuti segregasi hukum Mendel, kemudian berdasarkan single marker analysis dengan menggunakan karakter bobot gabah bernas menunjukkan primer SSR RM 337 terpaut toleran terhadap suhu tinggi dengan nilai peluang yang sangat nyata. Genotipe F2 yang memiliki pola pita DNA seperti Situ Patenggang (Tetua toleran) dan daya hasil tinggi di dapatkan 54 genotipe F2. Diferensial seleksi berdasarkan genotyping dengan menggunakan primer RM 337 menghasilkan kenaikan bobot gabah bernas sebesar 37.96%.
Keyword: aksi gen, cekaman suhu tinggi, heritabilitas, karakter seleksi, marka molekuler, SSR

Judul: Seleksi Generasi Awal Toleransi Padi terhadap Cekaman Suhu Tinggi di Dua Lingkungan.
Abstrak: Pemanasan global merupakan salah satu ancaman bagi keberlanjutan produksi pangan karena menimbulkan berbagai dampak merugikan terhadap pertanian di dunia. Cekaman suhu tinggi menjadi salah satu faktor pembatas bagi pertumbuhan dan perkembangan tanaman padi. Genotipe F3 terpilih yang dihasilkan dari penelitian ini diharapkan memiliki daya hasil yang tinggi disertai dengan toleransi terhadap cekaman suhu tinggi. Tujuan dari penelitian pertama ialah untuk mendapatkan informasi pengaruh cekaman suhu tinggi pada pertumbuhan dan perkembangan tanaman padi, dan mengevaluasi genotipe tetua untuk ketahanan terhadap cekaman suhu tinggi. Suhu penelitian menunjukkan perbedaan antar lingkungan sebesar 2 oC yang dapat berpengaruh terhadap pertumbuhan, perkembangan dan produktivitas tanaman. Hasil analisis gabungan menunjukkan beberapa karakter tidak memiliki interaksi genotipe x lingkungan, yaitu pada karakter tinggi tanaman, jumlah anakan produktif, periode pengisian biji, umur anthesis, umur panen, panjang malai dan bobot 100. Tidak adanya interaksi dapat terjadi karena kedua lingkungan memiliki suhu diatas suhu optimum yang dapat menghambat pertumbuhan tanaman. Karakter jumlah gabah isi per malai, jumlah gabah hampa per malai, jumlah gabah total per malai, jumlah anakan total, laju pengisian biji, persentase gabah isi dan bobot gabah isi per tanaman mengalami gangguan akibat cekaman suhu tinggi. Analisis korelasi dan sidik lintas dapat digunakan sebagai dasar pemilihan karakter seleksi. Berdasarkan analisis korelasi menunjukkan bahwa karakter jumlah gabah isi per malai memiliki korelasi positif dengan hasil pada dua lingkungan. Analisis sidik lintas menunjukkan bahwa jumlah gabah isi per malai memberikan langsung maupun tidak langsung paling besar terhadap karakter bobot gabah isi per tanaman. Deteksi genotipe toleran dilakukan menggunakan analisis sterilitas polen dan menggunakan parameter toleransi. Berdasarkan analisis sterilitas polen, menunjukkan bahwa peningkatan suhu menginduksi meningkatnya sterilitas polen pada keseluruhan genotipe yang diuji. Parameter toleransi paling tepat untuk membedakan genotipe toleran dan sensitif adalah SSI dan TOL. Deteksi genotipe toleran dengan analisis sterilitas polen dan parameter toleransi menggolongkan genotipe IPB 4S sebagai genotipe yang sensitif dan genotipe Mekongga toleran terhadap cekaman suhu tinggi. Penelitian kedua adalah studi pewarisan sifat pada generasi F3 terhadap kondisi cekaman suhu tinggi. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi aksi gen yang berperan dalam mengontrol morfologi dan hasil pada kondisi tercekam suhu tinggi serta keterwarisannya, serta untuk melakukan kegiatan seleksi pada populasi F3. Kegiatan seleksi memerlukan beberapa parameter genetik dalam menentukan karakter seleksi, yaitu aksi gen, nilai heritabilitas dan KKG. Pendugaan aksi gen menggunakan perhitungan skewness dan kurtosis pada persebaran F3 pada tiap lingkungan. Hasil analisis aksi gen menunjukkan terdapat keragaman aksi gen baik aditif maupun non aditif yang mengendalikan keragaan morfologi dan karakter hasil. Karakter tinggi tanaman vi panen dan jumlah gabah isi per malai dikendalikan oleh aksi gen aditif pada dua lingkungan. Nilai heritabilitas arti luas bervariasi dari rendah hingga tinggi (0 – 83.76 %) dengan nilai KKG berkisar dari 0-42.50 %. Hanya karakter jumlah gabah isi per malai yang memiliki nilai heritabilitas tinggi disertai KKG yang luas pada dua lingkungan percobaan. Karakter yang digunakan sebagai kriteria seleksi adalah jumlah gabah isi per malai. Hal tersebut dikarenakan karakter tersebut memiliki korelasi dan pengaruh langsung yang kuat terhadap hasil, dikendalikan oleh aksi gen aditif, memiliki nilai heritabilitas yang tinggi disertai KKG yang luas. Seleksi yang dilakukan menggunakan karakter
Keyword: F3, IPB 6R x Situ Patenggang, seleksi, cekaman

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: