Judul: Komunitas Fitonematoda dan Karakter Polyphasic Fitonematoda Penting pada Tanaman Kopi Robusta dan Arabika di Jawa Timur
Abstrak: Kopi merupakan salah satu komoditas perkebunan andalan Indonesia. Produktivitas kopi Indonesia dalam rentang tahun 2010-2014 sebesar 532 kg/ha, paling rendah di Asia Tenggara dibandingkan Vietnam 2 270 kg/ha, Thailand 842 kg/ha dan Filipina 716 kg/ha. Fitonematoda merupakan salah satu penyebab penyakit tanaman kopi Robusta dan Arabika. Kurangnya pengetahuan diagnosis serta data fitonematoda yang berasosiasi dengan kopi menjadi tantangan dalam pengelolaannya di lapangan. Fitonematoda tanaman kopi di Indonesia antara lain: Pratylenchus coffeae, Meloidogyne spp., dan Rotylenchulus reniformis, namun yang telah dilaporkan menimbulkan kerusakan tinggi adalah P. coffeae dan Radopholus similis. R. reniformis, Meloidogyne spp., P. coffeae, dan Radopholus arabocoffeae dilaporkan menjadi fitonematoda penting kopi di Vietnam. Informasi komunitas fitonematoda pada kopi di Jawa Timur belum dilaporkan secara lengkap. Persebaran fitonematoda secara horizontal berdasarkan derajat kesehatan tanaman belum dilaporkan pada pertanaman kopi. Selain itu karakter morfologi, morfometri, dan molekuler (polyphasic) pada fitonematoda penting di kopi belum banyak dikaji di Indonesia. Penelitian ini bertujuan untuk: 1) menghitung komunitas fitonematoda pada kopi Robusta dan Arabika serta distribusinya pada derajat kesehatan pertanaman yang berbeda dan 2) mengukur karakter morfologi, morfometri, dan molekuler (polyphasic) fitonematoda dengan nilai prominensi tertinggi pada akar dan tanah kopi Robusta dan Arabika. Sampel tanah dan akar kopi diambil di Kebun Sumber Asin, Belawan, dan Kalisat Jampit di Jawa Timur. Insidensi penyakit diamati pada blok yang diambil sampelnya. Sampel akar dan tanah diambil pada tanaman bergejala penyakit, tanaman diantara tanaman sakit dan sehat, dan tanaman sehat. Ekstraksi nematoda dari sampel akar dilakukan dengan metode pengabutan (mist chamber) dan sampel tanah dengan flotasi sentrifugasi. Peubah analisis komunitas yang diamati adalah frekuensi absolut, populasi absolut, nilai prominensi dan proporsi sebaran fitonematoda penting. Pengamatan karakter morfologi dan morfometri dilakukan pada preparat permanen fitonematoda. Ekstrak DNA fitonematoda diamplifikasi pada D2D3 segmen 28S rRNA dan ITS1-5.8S-ITS2 dengan primer universal. Amplikon dirunut nukleotidanya dan dianalisis hubungan kekerabatannya dengan pohon filogeni. Kebun kopi Robusta berada di ketinggian 598-607 m dpl dengan suhu tanah 26.34-27.56 ℃, sedangkan pada kopi Arabika berada di ketinggian 1088-1125 m dpl dengan suhu tanah 18.42-20.17 ℃. Insidensi penyakit tanaman kopi yang terinfeksi fitonematoda pada kopi Robusta berkisar 0.05-9.75% sedangkan pada kopi Arabika berkisar 21.26-67.44%. Fitonematoda yang ditemukan pada kopi Robusta yaitu P. coffeae, R. reniformis, Meloidogyne sp., dan Hemicriconemoides cocophillus. Frekuensi absolut, populasi absolut dan nilai prominensi paling tinggi yang ditemukan di akar kopi Robusta adalah P. coffeae sebesar 100%, 295.83 ekor per 10 g akar, dan 295.83 secara berurutan. Frekuensi absolut, populasi absolut dan nilai prominensi paling tinggi yang ditemukan di tanah kopi Robusta adalah R. reniformis sebesar 75-100%, 113.19 ekor per 100 ml tanah dan 113.91 secara berurutan. Fitonematoda yang ditemukan pada kopi Arabika adalah Meloidogyne sp., Helicotylenchus sp., Criconemoides sp., Paratylenchus sp., dan R. similis. Frekuensi absolut, populasi absolut dan nilai prominensi paling tinggi ditemukan di akar kopi Arabika adalah R. similis sebesar 25-100%, 279.86 ekor per 10 g akar, dan 259.16 secara berurutan. Frekuensi absolut, populasi absolut dan nilai prominensi paling tinggi yang ditemukan di tanah kopi Arabika paling tinggi adalah Meloidogyne sp. sebesar 25-100%, 94.44 ekor per 100 ml tanah, dan 94.44 secara berurutan. Sebaran horizontal berdasarkan karakter kesehatan tanaman secara umum
Keyword: 28S rRNA, ITS1-5.8S-ITS2, morfologi, nilai prominensi, Pratylenchus coffeae

Judul: Fitonematoda pada Pertanaman Kopi Robusta ( Coffea canephora Pierre et Froehner).
Abstrak: Kopi merupakan komoditas penting dan menjadi salah satu sumber devisa Indonesia. Salah satu patogen yang dapat menurunkan produksi kopi yaitu nematoda. Tujuan penelitian ini yaitu mengetahui komunitas fitonematoda yang ada pada pertanaman kopi Robusta serta persebaran horizontalnya berdasarkan derajat kesehatan tanaman. Penelitian tentang fitonematoda kopi dilakukan pada perkebunan rakyat kopi Robusta di dua desa di Kecamatan Kandangan, Kabupaten Temanggung, Jawa Tengah.Tanaman sampel diambil secara purposif yaitu tanaman sakit, tanaman sehat, dan tanaman yang letaknya di antara tanaman sakit dan sehat. Nematoda pada sampel akar diekstraksi menggunakan metode pengabutan (mist chamber). Perhitungan nematoda meliputi populasi absolut, frekuensi absolut, nilai prominensi, dan indeks populasi. Nematoda diidentifikasi secara morfologi. Data populasi dan identifikasi fitonematoda pada tanah kopi Robusta menggunakan data sekunder. Nematoda dominan pada akar kopi Robusta asal Temanggung adalah Radopholus similis yang ditemukan pada hampir seluruh lahan sampel dengan nilai prominensi 108.3. Pola persebaran horizontal R. similis yaitu terjadi peningkatan populasi pada tanaman yang letaknya di antara tanaman sakit dan sehat. Fitonematoda yang dominan pada tanah di sekitar perakaran kopi Robusta yaitu Rotylenchulus reniformis, Pratylenchus coffeae, dan Hemicriconemoides cocophillus. Nematoda R. reniformis ditemukan pada setiap derajat kesehatan tanaman dan pada setiap lahan sampel. Pola persebaran horizontal R. reniformis yaitu terjadi peningkatan populasi pada tanaman sakit.
Keyword: distribusi horizontal, Radopholus similis, Rotylenchulus reniformis, tanah

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: