Judul: Identifikasi dan Karakterisasi Fragmen DNA Genom yang Terlibat dalam Biosintesis Antifungi pada Bacillus sp
Abstrak: Bacillus merupakan salah satu genus bakteri yang dikenal sebagai penghasil antifungi. Empat isolat Bacillus asal tanah yaitu Cr 24, Cr 64, Cr 66, dan Cr 68 yang digunakan dalam penelitian ini memiliki karakter pemacu pertumbuhan tanaman dan mampu menghambat pertumbuhan fungi patogen Fusarium oxysporum dan/atau Rhizoctonia solani. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi dan mengkarakterisasi gen penyandi antifungi zwittermicin A, bacilysocin, surfactin, dan iturin A pada Bacillus sp. dengan polymerase chain reaction (PCR). Primer yang digunakan telah dilaporkan sebelumnya dapat mengamplifikasi bagian gen-gen antifungi. Bagian gen resistensi antifungi zwittermicin A (zmaR) berukuran 951 pb dengan kandungan GC sebesar 34,78% berhasil diidentifikasi pada genom Cr 64. Fragmen genom Cr 64 tersebut memiliki homologi dengan gen zmaR (1128 pb) pada Bacillus cereus UW85 dengan tingkat kesamaan 98%. Gen zmaR merupakan bagian dari kelompok gen biosintesis zwittermicin A, sehingga diduga isolat Cr 64 berpotensi memiliki keseluruhan kelompok gen yang menyandikan antifungi zwittermicin A. Fragmen gen penyandi antifungi bacilysocin, surfactin, dan iturin A belum dapat diperoleh dari keempat isolat dengan pasangan primer yang digunakan dalam penelitian ini. Genom isolat Bacillus yang telah dilaporkan memiliki gen antifungi perlu digunakan sebagai kontrol untuk memastikan ketepatan kondisi PCR.
Keyword: 

Judul: Karakterisasi Fragmen Dna Dari Bakteri Antagonis Yang Terlibat Dalam Aktivitas Antifungi Ganoderma Boninense
Abstrak: Kelapa sawit (Elaeis guineensis jacq) merupakan salah satu tanaman komoditi yang telah digunakan secara luas dalam industri makanan, farmasi dan kosmetik. Indonesia merupakan negara yang telah dianugrahi dengan iklim, kondisi lingkungan yang cocok untuk pertumbuhan kelapa sawit dan luas areal yang menyebabkan Indonesia menjadi negara dengan perkebunan kelapa sawit terbesar di dunia. Namun demikian, budidaya kelapa sawit menghadapi beberapa ancaman yang dapat mengurangi tingkat produksi. Busuk pangkal batang (BPB) oleh Ganoderma boninense merupakan ancaman serius pada perkebunan kelapa sawit. Pengendalian penyakit tersebut hingga saat ini telah banyak dilakukan, namun belum menunjukkan hasil yang memuaskan. Pengembangan ketersediaan agen pengendali hayati merupakan solusi yang sangat baik dalam menekan infeksi BPB. Lebih lanjut lagi bahwa pendekatan berbasis bioteknologi molekuler atau penemuan baru senyawa antifungi diperlukan untuk strategi pengendalian yang lebih baik. Pada penelitian ini, 198 isolat bakteri berhasil diisolasi dari tiga jenis sumber isolasi yang berbeda. Empat puluh satu isolat menunjukkan efek penghambatan yang berbeda-beda terhadap miselium G. boninense. Enam belas isolat dipilih untuk diuji lebih lanjut berdasarkan kemampuan percentage inhibiton of radial growth (PIRG) lebih dari 50%. Perbedaan yang signifikan ditunjukkan pada uji kultur ganda (Dual culture assay) pada p>0.05, dimana isolat G.1.22 menunjukkan aktivitas penghambatan tertinggi yaitu 87.86%. Hasil uji filtrat menunjukkan bahwa isolat G.1.22 tahan terhadap pemanasan. Sebaliknya isolat K.3.2 sensitif terhadap pemanasan dan penambahan proteinase K sehingga diasumsikan memiliki senyawa antifungi berupa protein. Hasil identifikasi gen penyandi 16S rRNA menunjukan bahwa isolat G.1.22 dan K.3.2 memiliki tingkat kemiripan 100% dengan Pseudomonas aeruginosa strain B13 (accession number KM588370) dan Bacillus amyloliquefaciens strain SCDB1439 (accession number KM922581). Metode shotgun cloning digunakan untuk kloning sejumlah fargmen DNA kromosom Bacillus amyloliquefaciens JR02. Berdasarkan uji antagonis keseluruhan E. coli T0P 10 rekombinan dengan suspensi G. boninense belum menunjukkan adanya ekspresi gen antifungi. Disamping itu, karakterisasi DNA pengapit mutan transposon mini-Tn5KmR (BglK226) dengan teknik genome walking berhasil dilakukan. Berdasarkan hasil analisis pengurutan DNA dan blasting diperoleh bahwa DNA pengapit memiliki tingkat kemiripan 99% dengan sebagian gen beta-ketoacyl shyntase asal Bukholderia gladioli BSR3.
Keyword: bakteri antagonis, busuk pangkal batang, Ganoderma boninense, genome walking, shotgun cloning

Judul: The impact of oil fuel price subsidy policy on fiscal and national income performance
Abstrak: The objectives of this study was to analyze the impact of oil fuel price subsidy policy on fiscal and national income performance. A simultaneous equestions econometric model of oil fuel price subsidy was estimated using Two – Stage Least Squares (2SLS) method and SYSLIN procedure for the data set period of 1987-2005. The validation model of the oil fuel price subsidy policy used NEWTON method and SIMNLIN procedure. The government policy to increase oil fuel price subsidy showed that surplus of balance of trade was decreased, and the economic growth was decreased. However, the number of poor people was decreased because the inflation rate was decreased. The government policy to decrease oil fuel price subsidy showed that surplus of balance of trade was increased, fiscal deficit was decreased, and the economic growth was increased. However, the number of poor of people was decreased because inflation rate was decreased and income was increased. As the conclusion, the government policy to decrease oil fuel price subsidy was need to increase the surplus of balance of trade, decrease the deficit fiscal, increase the economic growth, and decrease the number of poor people.
Keyword: