Judul: Karakterisasi dan Aktivitas Antioksidan Ekstrak Pigmen Aktinobakteri.
Abstrak: Aktinobakteri adalah bakteri Gram-positif yang berasal dalam filum Actinobacteria. Aktinobakteri adalah sumber metabolit sekunder yang menjanjikan. Salah satu metabolit sekunder yang dihasilkan aktinobakteri adalah pigmen. Berbagai aktinobakteri mampu menghasilkan beragam jenis pigmen, diantaranya yaitu pigmen berwarna kuning hingga oranye. Pigmen memiliki berbagai aktivitas farmakologi seperti antioksidan. Antioksidan adalah molekul yang menghambat atau menunda kerusakan sel dengan menyumbangkan elektron ke radikal bebas dan menstabilkannya. Pigmen yang dihasilkan oleh bakteri memiliki kapasitas antioksidan dan melindungi bakteri dari kerusakan oksidatif. Penelitian aktivitas antioksidan aktinobakteri berpigmen di Indonesia belum banyak dilaporkan, sehingga penelitian aktivitas antioksidan aktinobakteri berpigmen perlu dilakukan. Penelitian ini bertujuan untuk mengkarakterisasi aktinobakteri berpigmen kuning hingga oranye, menguji aktivitas antioksidan dari ekstrak pigmen antinobakteri,serta menganalisissenyawa dari ekstrak pigmen yang memiliki aktivitas antioksidan tertinggi. Isolat aktinobakteri diisolasi dari rizosfer mangrove di Pantai Cengkrong Trenggalek,sampel tanah merah di kebun area kampusIPB, dan isolat aktinobakteri endofit dari kulit manggis yang telah diidentifikasi oleh peneliti sebelumnya. Isolat aktinobakteri terpilih diidentifikasi menggunakan gen 16S rRNA. Pigmen aktinobakteri diekstraksi sampai memdapat esktrak kasar pigmen. Aktivitas antioksidan ekstrak kasar pigmen diukur menggunakan metode DPPH (1,1- diphenyl-2-picrylhydrazil). Hasil pengukuran aktivitas antioksidan dihitung dalam persen inhibisi lalu digambarkan melalui nilai IC50 (inhibitory capacity). Ekstrak kasar pigmen yang menghasilkan aktivitas antioksidan tertinggi selanjutnya dianalisis menggunakan Liquid Chromatography Mass Spectrophotometer (LCMS) untuk mengidentifikasi profil kimia yang terdapat di dalam ekstrak pigmen dan berpotensi menghasilkan antioksidan. Berdasarkan hasil penelitian diperoleh lima isolat aktinobakteri berpigmen yaitu HRA, HVA, HVB, AGM2.2 dan AGM2.3. Identifikasi berdasarkan gen 16S rRNA menunjukkan bahwa isolat HRA memiliki nilai kemiripan 99,91% dengan Streptomyces gramineus JR-43, isolat HVA memiliki nilai kemiripan 99,22% dengan S. tendae ATCC 19812 dan isolat HVB memiliki nilai kemiripan 81,18% dengan Rhodococcus ruber DSM 43338. Isolat AGM2.2 dan AGM2.3 memiliki kemiripan dengan S. xanthophaeus NRRL B-5414 dengan nilai kemiripan masing masing sebesar 98,95% dan 99,82%. Spektrum UV-Vis ekstrak kasar pigmen isolat HRA adalah 411 nm, isolat HVA 663 nm, isolat HVB 459 nm, isolat AGM2.2 663 nm, dan isolat AGM2.3 664 nm. Konsentrasi hambat (IC50) pigmen ekstrak kasar aktinobakteri berkisar dari 53,38 µg/mL hingga 184,38 µg/mL. Isolat HVB memiliki aktivitas antioksidan paling tinggi. Ekstrak kasar pigmen isolat HVB mengandung senyawa luteolin dan berpotensi sebagai penghasil antioksidan.
Keyword: DPPH, inhibitory concentration, metabolite, luteolin

Judul: Aktivitas Antioksidan Aktinobakteri Endofit Kulit Buah Manggis (Garcinia mangostana L.).
Abstrak: Manggis (Garcinia mangostana L.) merupakan salah satu tanaman yang kaya dengan senyawa bioaktif seperti xanthone, flavonoid dan fenolik. Manggis secara tradisional banyak digunakan untuk mengobati beberapa penyakit. Aktinobakteri endofit dari tanaman berperan penting dalam menghasilkan berbagai macam senyawa bioaktif. Namun, sampai saat ini informasi penelitian terkait keragaman aktinobakteri endofit kulit buah manggis yang memiliki aktivitas antioksidan belum dikaji. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengeksplorasi keragaman aktinobakteri endofit kulit buah manggis dan menentukan aktivitas antioksidannya. Aktinobakteri endofit kulit buah manggis diisolasi, dipurifikasi dan dikarakterisasi morfologinya. Identifikasi molekuler berdasarkan gen 16S rRNA menggunakan primer spesifik aktinobakteri 27F dan 16Sact1114R. Pengukuran aktivitas antioksidan dilakukan untuk supernatan aktinobakteri dan ekstrak etil asetat aktinobakteri serta ekstrak etil asetat kulit buah manggis dibandingkan dengan kontrol asam askorbat, ekstrak etil asetat aktinobakteri dan ekstrak etil asetat kulit buah manggis difraksinasi menggunakan metode Kromatografi Lapis Tipis (KLT) dan dilakukan bioautografi aktivitas antioksidan. Lima isolat aktinobakteri endofit dari kulit buah manggis menunjukkan perbedaan warna miselium aerial, miselium susbtrat, dan tipe rantai spora. Berdasarkan analisis gen 16S rRNA, isolat AGM3.2 menunjukkan kesamaan dengan S. griseochromogenes ATCC 14511 (T) 99.06%. AGM3.1 memiliki kesamaan dengan S. osmaniensis OU-63 (T) 98.35%. Sementara itu, AGM2.3 mirip dengan S. xanthophaeus NBRC B-5414 (T) 99.82% dan AGM2.2 memiliki kemiripan dengan S. xanthophaeus NBRC B-5414 (T) 98.95%. Selain itu, AGM2.1 memiliki homologi dengan S. goshikiensis NBRC 12868 (T) 99.52%. Nilai aktivitas antioksidan dengan metode DPPH dan ABTS yang dihasilkan supernatan AGM2.1 menunjukkan aktivitas antioksidan tertinggi masing-masing 36.96% dan 98.80% penghambatan. Kapasitas antioksidan ekstrak etil asetat AGM2.1 adalah 22.22 μg AEAC/mg ekstrak (DPPH) dan 20.34 μg AEAC/mg ekstrak (ABTS). Ekstrak etil asetat kulit manggis memiliki kapasitas antioksidan sebesar 21.17 μg AEAC/mg ekstrak (DPPH) dan 18.75 μg AEAC/mg ekstrak (ABTS). Deteksi senyawa menggunakan UV 254 nm menunjukkan beberapa spot gelap, sedangkan deteksi menggunakan UV 366 nm pendaran spot warna senyawa lebih teramati pada setiap sampel. Hasil pengamatan menggunakan UV 366 nm menunjukkan, bahwa ekstrak etil asetat kulit manggis dan ekstrak etil asetat aktinobakteri dibandingkan dengan standar α-mangostin memiliki warna spot senyawa yang berbeda. Standar α-mangostin memiliki satu spot senyawa merah tua. Ekstrak kulit manggis diamati sebanyak tujuh spot senyawa biru dan merah tua. Sementara itu, ekstrak etil asetat AGM3.2 memiliki tiga spot senyawa biru dan merah. Ekstrak etil asetat isolat AGM3.1, AGM2.3, AGM2.2 memiliki sembilan spot senyawa biru dan agak kehijauan sedangkan ekstrak etil asetat AGM2.1 memiliki delapan spot senyawa berwarna biru, merah dan hijau. Warna biru menunjukkan sekelompok senyawa flavon, flavanon, flavonol, dan isoflavon, merah menunjukkan antosianidin dan senyawa kehijauan adalah senyawa auron dan flavon. Bioautografi antioksidan menunjukkan bahwa standar α-mangostin memiliki satu spot aktif dengan nilai Rf 0.64. Ekstrak etil asetat kulit buah manggis menunjukkan spot yang sama dengan standar α-mangostin dengan nilai Rf 0.64. Ekstrak etil asetat aktinobakteri AGM3.1, AGM2.3, AGM2.2 dan AGM2.1 memiliki nilai Rf yang sama dengan standar α-mangostin. Namun, senyawa α-mangostin berwarna merah tua sedangkan ekstrak etil asetat keempat aktinobakteri memiliki spot wana biru. Spot warna biru mengindikasikan kelompok senyawa flavon, flavanon, flavonol dan isoflavon. Informasi dari penelitian ini jelas menunjukkan bahwa aktinobakteri endofit dari kulit buah manggis memiliki potensi sebagai antioksidan.
Keyword: antioksidan, aktinobakteri endofit, Garcinia mangostana L., karakterisasi

Judul: Thermal Characteristics and Dynamics of Tropical Cyclone over Western North Pacific Ocean: A Case Study of Typhoon Songda (Chedeng) 2011
Abstrak: The frequent occasion of Tropical Cyclone (TC) over Western North Pacific (WNP) Ocean lies from 10˚N to 26˚N and 121˚E to 170˚E. Sources of TC development come from warm ocean temperature where latent heat is released during condensation processes and subsequently concentrated in the boundary layer. Relative humidity at 850-700 hPa is responsible to produce the most intense storm. Meanwhile, weak vertical wind shear between 850-200 hPa is one of the dynamical factors that lead to the development of TC. Pressure level of 850-200 hPa is chosen to minimize the thermodynamic effect in the lower troposphere. Typhoon Songda (Chedeng in the Philippines) or TSC lasted from May 18th to 30th, 2011 and strengthened into powerful Super Typhoon stage between May 24th and 27th. Long curving track and the exhibition of all sequences of TC life cycle, TSC is then considered as an ideal case of TC. The objective of the study with case of TSC is to investigate the role of thermal characteristics and dynamics on TC intensity. The research is carried out by using Advanced Research of Weather Research and Forecasting model (WRF ARW model) version 3.3. Two domains are employed in the model. The first domain situate from 02˚N to 40˚N and 118˚E to 149˚E and cover spatial resolution () of 33.1 km. The second domain situate from 09˚N to 27˚N and 119˚E to 132˚E with of 11 km. Timestep of the model () is 120 seconds. The model is supported by the following physical parameterization, i.e., Yonsei University Scheme (YSU) in the boundary layer, Kain-Fritsch scheme (KF) in the cumulus, and WRF Single-Moment 3-class scheme in the microphysics. Initial meteorological condition prior to the formation of the cyclone is generated using WRF ARW standard-release model. Sensitivity of the model output is obtained from a selected single-parameter change scenarios, namely, 10 % to 20 % decrease and increase of wind shear initial data at 850-200 hPa, and by 10 % to 20 % decrease of relative humidity initial data at 850-700 hPa. The result showed that the negative correlations between wind shear and intensity are found in wind shear scenarios. Wind shears of 10 ms-1 which lead to strengthening of the wind intensity in the early period of Typhoon development are found in wind shear scenarios. The effect of wind shear changes on wind intensity is statistically significant in the 20 % wind shear scenarios. During mature stage, weak wind intensity occurred when wind shear increase as given in the WRF standard-release and the 20 % decreasing scenario. Different situation is found in the 20 % increasing scenario where wind shear tend to weak and lead to strong wind intensity at this stage. Meanwhile, the reduction of moisture supply at 850-700 hPa resulting from 20 % decreasing relative humidity play a major role in the weakening of wind intensity and reduces mechanical energy of the cycle process as much as 300 J kg-1.
Keyword: