Judul: Keanekaragaman Kedondong  (Spondias dulcis Parkinson) di Sumatera Bagian Tengah
Abstrak: Kedondong (Spondias dulcis Parkinson) merupakan tanaman buah tropis yang berasal dari kawasan Malesia Timur dan Kepulauan Pasifik Selatan. Kedondong banyak dibudidayakan di daerah tropik dan subtropik sebagai tanaman buah, makanan dan bahan tanaman obat. Sampai saat ini belum ada koleksi sumber daya plasma nutfah kedondong di Sumatera terutama dari Sumatera bagian tengah. Catatan tentang kedondong di Sumatera Barat dijumpai di satu publikasi tentang keanekaragaman tumbuhan di Sumatera. Sumatera bagian tengah terdiri atas tiga provinsi yaitu Riau, Jambi dan Sumatera Barat. Kondisi geografis kawasan ini memiliki variasi dalam topografinya, mulai dari daerah pesisir, dataran rendah, dataran tinggi, pegunungan, dan kepulauan. Pola curah hujan, iklim, dan suhu di Pulau Sumatera mengakibatkan tumbuhan yang ada menjadi khas dan memiliki strategi adaptasi unik, yaitu tahan terhadap curah hujan tinggi dan iklim basah. Kondisi ini juga akan berdampak pada persebaran kedondong yang umumnya menyukai iklim kering. Keberadaan kedondong dapat dianalis berdasarkan faktor lingkungan dan iklim untuk memprediksi wilayah potensial untuk budidaya kedondong. Berdasarkan pembahasan di atas penting untuk menyediakan informasi variasi morfologi kedondong di Sumatera bagian tengah dan pengelompokannya berdasarkan ciri morfologi serta menganalisis model distribusi kedondong dengan menggunakan metode pemodelan spesies berdasarkan faktor klimatik. Penelitian ini bertujuan menginventarisasi tanaman kedondong di Sumatera bagian tengah untuk menyediakan informasi variasi morfologinya, mengelompokkan sampel berdasarkan ciri morfologi, serta menganalisis data keberadaan kedondong dan data klimatik untuk membuat peta prediksi kesesuaian habitat dan distribusi kedondong. Informasi ini berguna untuk kajian lanjutan di kemudian hari untuk memperoleh kedondong unggul dan dijadikan kultivar formal sehingga nilai jual kedondong menjadi lebih tinggi. Selain itu menganalisis model distribusi kedondong dengan menggunakan metode pemodelan spesies berdasarkan faktor klimatik bermanfaat untuk menemukan lokasi potensial untuk budidaya kedondong sehingga pemanfaatan kedondong di masa mendatang akan terus berlanjut. Eksplorasi dan inventarisasi kedondong dilakukan di 6 Kabupaten/Kota dalam tiga propinsi yang termasuk wilayah Sumatera bagian tengah (Jambi, Sumatra Barat, dan Riau). Sebanyak 50 ciri morfologi digunakan untuk mengamati 50 sampel kedondong hasil eksplorasi. Hasil pengamatan morfologi dikoleksi, direkam. dan diskor sebagai matriks data yang dianalis menggunakan metode UPGMA sedangkan untuk pemetaan distribusi jenis lokasi keberadaan kedondong dicatat menggunakan GPS dan bersama dengan 19 variabel bioklimatik yang diekstrak dari basis data iklim global, WorldClim (Versi terbaru 2.0, www.worldclim.org) diolah menggunakan MaxEnt. Model peta yang diperoleh kemudian divisualisasikan menggunakan DIVA-GIS versi 7.5. Sampel kedondong bervariasi pada ciri warna kulit batang kedondong, demikian juga jumlah pasang anak daun lateral, ujung anak daun, tepi anak daun, pangkal anak daun, bentuk anak daun, warna daun mahkota, warna bakal buah, warna buah mengkal, warna buah matang, bentuk buah, warna daging buah dan rasa buah. Dendrogram hasil analisis membagi koleksi kedondong menjadi dua kelompok utama A dan B. Sampel asal Jambi menunjukkan tingkat kemiripan antar individu lebih dari 50%, kelompok kedondong asal Riau memiliki tingkat kemiripan 37% sedangkan kelompok kedondong asal Sumatera Barat dengan kemiripan 48%. Hal ini mengindikasikan Jambi memiliki tingkat keanekaragaman kedondong terendah sedangkan Riau memiliki tingkat keanekaragaman kedondong tertinggi. Model MaxEnt digunakan dalam analisis untuk memprediksi wilayah iklim yang sesuai untuk budidaya kedondong. Hasil analisis menunjukkan wilayah potensial persebaran kedondong yang lebih luas dari titik keberadaan tanaman kedondong yang ada di lapangan. Model
Keyword: central part of Sumatra, cultivated plant, kedondong, modelling, morphology

Judul: Genetic Diversity of Kweni (Mangifera odorata Griffith) in Sumatra
Abstrak: Kweni (Mangifera odorata Griffith) merupakan mangga harum beraroma khas yang membedakannya dengan mangga komersial (M. indica). Kweni merupakan salah satu buah andalan masyarakat lokal di Sumatra dan memiliki adaptasi yang khas. Bunga kweni tidak mudah rontok ketika curah hujan tinggi sehingga dapat meningkatkan produksi buah dan menjadikan kweni sebagai sumber plasma nutfah untuk pengembangan mangga di Sumatra. Ancaman deforestasi dan alih fungsi lahan menyebabkan pengumpulan plasma nutfah kweni di Sumatra mendesak untuk dilakukan sebelum hilang tanpa diketahui keanekaragaman genetiknya. Kajian keragaman dilakukan berdasarkan ciri morfologi dan molekuler. Tujuan penelitian ini adalah menyediakan informasi keanekaragaman genetik kweni di Sumatra, mencari penanda ciri morfologi dan molekuler spesifik sebagai pembeda antar aksesi kweni dan menghasilkam sebuah sistem pengelompokan variasi kweni berdasarkan penanda ciri morfologi dan inter-simple sequence repeats (ISSR). Aksesi kweni yang diambil berasal dari empat sentra produksi kweni di Sumatra yaitu Provinsi Aceh (Aceh Barat, Nagan Raya, Aceh besar dan Aceh Tamiang), Provinsi Sumatra Barat (Solok, Padang dan Pesisir Selatan), Provinsi Riau (Bengkalis dan Kuantan Singingi), dan Bengkulu (Bengkulu dan Bengkulu Tengah) dengan metode jelajah. Pengamatan ciri morfologi mengacu pada deskriptor mangga. Ekstraksi DNA kweni menggunakan prosedur Geneaid Genomic DNA Mini Kit (Plant). Amplifikasi DNA menggunakan 10 primer ISSR. Data pengamatan ciri morfologi dan molekuler ditransformasikan ke dalam bentuk skor berupa matriks data. Konstruksi dendogram menggunakan metode Unweighted Pair Group Method with Arithmatic Average (UPGMA) melalui program Numerical Taxonomy and Multivariate Analisys System (NTSys) versi 2.20. Analisis komponen utama (principal component analysis/PCA) dan korelasi pearson pada pogram Minitab 19. Analisis struktur populasi menggunakan program Genetic Analysis in Excel (GenAlex) versi 6.501. Untuk memperkirakan K (jumlah populasi dugaan) menggunakan progam STRUCTURE v.2.3.4. Nilai rata-rata dan ragam “likelihood per K” menggunakan STRUCTURE HARVESTER v.0.6.94 dan metode Evanno secara online. Berdasarkan 52 ciri morfologi yang diamati diperoleh 15 ciri yang sangat membedakan antara kelompok aksesi kweni di Sumatra. Lima belas ciri tersebut adalah kepadatan retikulasi areola pada permukaan atas daun, bentuk buah, bobot buah, bentuk ujung buah, permukaan pangkal buah, kedalaman rongga tangkai buah, tipe paruh buah, warna kulit buah masak, ketebalan kulit buah, warna daging buah, ketebalan daging buah, tingkat kemanisan buah, bentuk biji, tebal biji dan tipe embrioni. Dendrogram berdasarkan ciri morfologi membagi aksesi kweni menjadi tiga kelompok dengan koefisien kemiripan 46-100%. Ciri morfologi yang memisahkan kelompok aksesi (I, II dan III) dengan jelas yaitu adanya ciri tingkat kemanisan daging buah (Brix). Kelompok I yang anggotanya paling banyak memiliki tingkat kemanisan yang tinggi, kelompok II memiliki tingkat kemanisan sedang dan kelompok III memiliki tingkat kemanisan yang rendah. Berdasarkan analisis korelasi pearson, buah dengan rasa manis, umumnya memiliki aroma buah yang kuat, daging buah yang berair dan bertekstur lembut. Daging buah yang lembut muncul dari buah yang kedalaman rongga tangkai buah berlekuk dangkal dan warna kulit buah hijau kekuningan. Ciri pangkal buah berlekuk dangkal warna kulit buah hijau kekuningan dan aroma buah yang kuat dapat dijadikan sebagai preferensi konsumen untuk memilih buah kweni yang manis. Pengelompokan berdasarkan 94 pita hasil amplifikasi primer ISSR dengan metode UPGMA mengelompokan 52 aksesi kweni ke dalam empat kelompok pada koefisien kemiripan 65-97% yang cenderung mengelompok berdasarkan lokasi asal aksesi. Kelompok
Keyword: ISSR, morfologi, struktur populasi, Sumatra, tanaman budidaya, cultivated plant, ISSR, morphological character, population structure, Sumatra

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: