Judul: Flume Tank Sebagai Sarana Penelitian Tingkah Laku Ikan
Abstrak: Flume tank adalah sebuah alat penelitian yang dibuat untuk mempermudah pengamatan tingkah laku ikan dengan menggunakan instrumentasi yang sederhana. Diharapkan alat ini nantinya akan sangat bermanfaat bagi kegiatan penelitian laboratorium khususnya observasi tingkah laku renang ikan. konstruksi flume tank ini berbentuk melingkar tanpa sudut siku, karena dapat mengurangi turbulensi yang terjadi ketika arus air mulai digerakkan. Dilengkapi dengan penghomogen arus yang dapat meratakan sebaran kecepatan arus yang berputar sehingga kecepatan arus pada setiap bagian merata, terutama di titik pengamatan. Flume tank dilengkapi dengan dua kamera yang dapat merekam dari dua arah yang berbeda yaitu vertikal dan horizontal. Dari dua kamera tersebut nantinya dihasilkan data pengamatan yang akan dianalisis menggunakan software atau program-program pengolahan dan pengeditan film. Data tersebut dapat dianalisis dengan membaca tiap frame yang dihasilkan pada masing-masing software, biasanya dalam 1 detik akan menghasilkan 25 frame. Flume tank ini telah diuji coba untuk mengamati pola dan kecepatan renang ikan bawal. Hasil yang diperoleh dari pengujian tersebut disimpulkan bahwa pola renang ikan bawal dengan tipe body and or caudal fin locomotion undulatory dengan tipe subcarangiform. Sedangkan untuk kecepatan renang ikan bawal telah diperoleh hubungan antara frekeunsi kibasan untuk kecepatan renangnya. Hasil tersebut menunjukkan frekuensi kibasan ekor berpengaruh terhadap kecepatan renang yaitu semakin besar frekuensi kibasan ekor maka kecepatan renang yang dihasilkan akan semakin besar pula.
Keyword: 

Judul: Uji Kinerja Mini Flumetank dan Pengukuran Performa Renang Ikan Bawal (Colossoma macropomum).
Abstrak: Mini flumetank merupakan tangki berarus yang digunakan untuk menguji dan melihat tingkah laku serta performa renang ikan. Tahun 2017 di Laboratorium Tingkah Laku Ikan, Departemen Pemanfaatan Sumberdaya Perikanan, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Intsitut Pertanian Bogor telah dilakukan modifikasi mini flumetank yang dimiliki agar memperoleh konstruksi dan kinerja yang lebih baik. Penelitian ini bertujuan untuk menguji kelayakan mini flumetank sebagai tangki pengamatan tingkah laku renang ikan dan pengamatan performa renang ikan bawal (Colossoma macropomum). Penelitian ini menggunakan metode pengukuran langsung untuk uji kinerja teknis dan metode observasi untuk uji performa renang ikan. Uji kinerja teknis meliputi kecepatan dan kerataan arus, keberadaan gelembung udara, suhu air, dan ketahanan mesin. Hasil penelitian kinerja menunjukkan bahwa mini flumetank memiliki nilai putaran propeler maksimal yaitu 1379 rpm menghasilkan kecepatan arus maksimum 1,4 m/s. Mini flumetank dilengkapi perangkat pengeliminasi gelembung udara dan berfungsi dengan baik. Arus yang terbentuk termasuk kategori arus laminer. Suhu mesin stabil dengan nilai maksimum mencapai 55,1oC. Suhu air mengalami peningkatan antara 0,1oC - 4,3oC. Nilai kebisingan maksimal 48 dB. Daya maksimal yang dibutuhkan motor listrik 411,6 watt. Sedangkan hasil uji performa renang ikan didapatkan pergerakan ikan bawal termasuk pergerakan yang disebut BCF Undulation tipe Subcarangiform. Kecepatan renang sustained sampai dengan maksimum 56,24 cm/s (5,5 BL/s). Uji kinerja menunjukkan bahwa hasil rekonstruksi mini flumetank layak digunakan dalam pengamatan tingkah laku renang ikan.
Keyword: ikan bawal (Colossoma macropomum), kecepatan renang, mini flumetank, uji kinerja

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA