Judul: Penapisan isolat streptomyces sp. penghasil senyawa penghambat Escherichia coli resisten ampisilin
Abstrak: Streptomyces sp. adalah bakteri gram positif yang berbentuk filamen, banyak ditemukan di tanah dan bereproduksi dengan spora. Streptomyces sp. memiliki kemampuan yang tinggi dalam menghasilkan senyawa metabolit sekunder, antara lain antibiotik dan senyawa penghambat B-laktamase. Resistensi bakteri terhadap antibiotik B-laktam dapat disebabkan karena adanya B-laktamase, berubahnya permeabilitas membran, dan perubahan PBPS. Tujuan penelitian ini adalah menapis isolat Streptomyces sp. yang menghasilkan senyawa penghambat pertumbuhan Escherichia coli resisten ampisilin, dan untuk mengetahui ketahanan filtrat kultur Streptomyces sp. terhadap pH dan suhu serta aktivitasnya pada beberapa tingkat kepekatan. Sebanyak 70 isolat Streptomyces sp. koleksi laboratorium Bioteknologi Kehutanan PAU, IPB diremajakan pada media penyuburan dan oatmeal. Tiga puluh dua isolat yang tumbuh baik diuji antagonis terhadap bakteri target E. coli 2-2 dan E. coli DH5a pUC 19 resisten ampisilin 100 ug/ml. Filtrat kultur dari 32 isolat Streptomyces sp. baik yang menghasilkan maupun tidak menghasilkan senyawa antibakteri diperoleh dengan menumbuhkan isolat-isolat tersebut pada media fermentasi berdasarkan Kim & Lee (1994). Filtrat kultur hasil fermentasi yang tidak mengandung senyawa antibakteri diuji kemampuannya dalam menghasilkan senyawa penghambat pertumbuhan E. coli resisten ampisilin. Pengujian dilakukan dengan melakukan kombinasi filtrat kultur yang tidak mengandung antibakteri dengan ampisilin 100ug/ml pada media NA, sebagai pembanding dilakukan uji pada media NA yang tidak mengandung ampisilin. Sedangkan filtrat kultur yang mengandung antibakteri diuji aktivitasnya pada media NA yang ditambah ampisilin 100 ug/ml. Uji ketahanan filtrat kultur terhadap suhu dilakukan dengan cara inkubasi filtrat kultur pada suhu 60°, 80°, 100° dan 121° selama 30 menit. Untuk uji ketahanan filtrat kultur terhadap pH asam dan basa, pH filtrat kultur diatur pada pH 2 dan 9 dengan penambahan NaOH dan HCI 1 N. Uji aktivitas filtrat kultur juga dilakukan dengan memekatkan filtrat kultur 5X dan mengencerkan 0,25 X dari konsentrasi awal. Dari uji antagonis 32 isolat Streptomyces sp. diperoleh 2 isolat yang mampu menghasilkan senyawa antibakteri penghambat bakteri target, yaitu isolat 120-P-14E yang menghambat kuat dan 124-A-9 menghambat cukup kuat terhadap E. coli 2-2. Isolat 120-P-14E juga menghambat cukup kuat E. colt DH5α pUC 19. Hasil aktivitas filtrat kultur kedua isolat tersebut menunjukkan bahwa filtrat kultur isolat 120-P-14E mampu menghambat cukup kuat E. coli 2-2 dan E. coli DHSa pUC 19, sedangkan filtrat kultur isolat 124-A-9 menghambat kurang kuat E. coli 2-2. Kombinasi penggunaan ampisilin 100 µg/ml dan filtrat kultur yang tidak mengandung antibakteri pada media NA tidak menghambat pertumbuhan bakteri. Filtrat kultur 120-P-14E masih mempunyai aktivitas penghambatan setelah diberi perlakuan suhu 60°C. Escherichia coli 2-2 dan E. coli DHSa pUC 19 sensitif terhadap kontrol larutan pH 2 dan 9.
Keyword: Fungi

Judul: Penapisan biologis dan isolasi senyawa peptida antimikroba dari Streptomyces sp.
Abstrak: Streptomyces sp. adalah bakteri tanah yang telah dikenal memiliki kemampuan menghasilkan beragam senyawa antibiotik. Penelitian ini dilaksanakan sebagai upaya melakukan penapisan sejumlah isolat Streptomyces sp. dari tanah hutan tropis Indonesia dan mengisolasi senyawa peptida yang memiliki daya antimikrob. 127 isolat Streptomyces sp. koleksi laboratorium bioteknologi kehutanan PAU, lPB, dipilih, dikelompokkan, dan diuji bioaktivitasnya terhadap bakteri target Staphylococcus aureus ATCC 25923 dan Eschericia coli ATCC 25922. Sebanyak 39 isolat (30.71%) mampu menghambat pertumbuhan salah satu atau kedua bakteri target. Dari 39 isolat tersebut, 2 isolat memberikan supernatan media fermentasi yang mampu menghambat kedua bakteri target, yaitu isolat IR-1 dan IR-5, keduanya asal tanah Irian Jaya. Supematan media fermentasi kedua isolat dimurnikan dengan gel filtrasi, sephadex G-75 superfine, tiap fraksi diukur absorbansinya pada 'A. 220 dan 280 nm. Fraksi yang memiliki nilai absorbansi berdekatan disatukan, dan didapatkan 3 kelompok fraksi, yaitu kelompok A, B, dan C. Basil uji bioaktivitas ketiga kelompok fraksi menunjukkan kelompok fraksi A (kumpulan fraksi dengan nilai absorbansi ;;, 1.2) memiliki kemampuan menghambat kedua bakteri target, kemampuan ini berbanding lurus ·dengan konsentrasi larutan. Kelompok fraksi A dari kedua isolat diduga mengandung paling sedikit satu macam peptida (protein) dengan bobot molekul berkisar 58000-61000, yang ditunjukkan oleh satu pita pada basil elektroforesis. Namun keberadaan gula pada fraksi A yang diperlihatkan oleh kromatografi cair kinerja tinggi (KCKT) menunjukkan bahwa fraksi tersebut belum murni. Basil analisis KCKT juga menunjukkan ada 14 jenis asam amino yang terdapat dalam fraksi A kedua isolat dengan konsentrasi total sebesar 3.0514 % bib untuk IR-I dan 2.6130 % bib untuk IR-5. Keberadaan peptida (protein) diperkuat dengan adanya serapan asam amino (ion zwitter) pada spektrum serapan infra merah.
Keyword: 

Judul: Characteristic of Overshooting Top (OT) Based on  Himawari  8  Satellite  as  a  Convective  Cloud  Feature  that  Generates  Extreme Weather in the Java Island Region
Abstrak: Overshooting Top (OT) is a feature at the top of a convective cloud that is associated with extreme weather. Research on OT in tropical Indonesia is still very limited. The existence of geostationary satellites with wide area coverage and fast frequency observations is useful for observing the fast dynamics of the OT life cycle. Therefore, this study intends to analyze the relationship between OT and extreme weather, updraft and thermodynamic conditions of OT when extreme weather occurs, the best objective method for detecting OT in the day time and night time, and the spatiotemporal distribution of OT in the tropical region of Java Island during the 2018-2021 period. Based on visual analysis using visible channel and Himawari 8 sandwich products, 87% of extreme weather events in Java were accompanied by the appearance of OT. It indicates that the presence of the OT pattern is a convection cloud pattern or feature that is closely related to extreme weather events for the Java Island region. The existence of a time lag between the appearance of OT and extreme weather events on Java Island indicates that the OT of convection cloud can be used as a precursor or nowcasting for the appearance of extreme weather. Most of the convective cloud OT features during extreme weather events on Java Island have altitude that were only able to exceed the altitude of the equilibrium level and few were able to exceed the tropopause level of 9 km – 16 km. The difference in atmospheric conditions during extreme weather events on Java Island, which is in the tropics and subtropics, is a strong and unstable convective energy condition characterized by a larger CAPE, as well as unstable KI, LI, SI and TTI values. It is offset by kinematic factors in the form of a weak vertical wind shear (bulk wind shear 0-6 km) and a higher freezing point height. The difference between extreme weather events in the Java Island region and other tropical regions compared to subtropical regions is the strong updraft speed of convection clouds. The IRW Texture COMB algorithm based on the IRW-Texture Gradient modification and the COMB algorithm shows a significant increase in quality for detecting OT and non-OT pixels in Java. Rainy days with rainfall > 50 mm/day are very common in areas with an altitude of > 500 m. On the other hand, the level of convection activity which is indicated by the presence of OT and lightning is significantly reduced in this area. OT of convective clouds appear more frequently during the DJF season and less frequently during the JJA season. OT often appears during the day time and rarely at night time. Most OTs appear in the central part, away from the south and north coasts of Java Island during the day, while OTs that appear near the south and north coasts of Java Island can appear in the morning or afternoon.
Keyword: convective clouds, extreme weather, Overshooting Tops, Himawari 8 Satellite