Judul: Bacteriophage isolasion of Escherichia coli strain C15
Abstrak: Infeksi saluran kemih (ISK) merupakan infeksi dengan prevalensi terbesar kedua setelah infeksi pernapasan. Infeksi tersebut sebagian besar ditangani menggunakan antibiotik, sehingga diperlukan penanganan alternatif, salah satunya adalah bakteriofag. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi bakteriofag spesifik E. coli strain C15. Bakteri inang dilakukan reidentifikasi dan diukur waktu pertumbuhannya. Sampel sumber bakteriofag dikoleksi dari tiga tempat, yaitu TPA IPB, salah satu pembuangan sampah di IPB dan tanah kandang kuda IPB. Hasil isolasi bakteriofag kemudian dipurifikasi dan dikuantifikasi menggunakan metode double layer. Bakteriofag hanya berhasil diisolasi pada sampel tanah kandang kuda IPB, karena kondisi dua tempat yang lain tidak mendukung kehidupan bakteri inang. Plak bakteriofag yang diperoleh memiliki ukuran yang berbeda-beda, sehingga menunjukkan terdapat beberapa jenis bakteriofag yang berhasil diisolasi. Ukuran yang berbeda tersebut dipengaruhi oleh tingkat difusi, tingkat adsorpsi, panjang periode laten, serta banyaknya bakteriofag yang keluar dari sel. Kuantifikasi menunjukkan bahwa bakteriofag yang diisolasi sebanyak 3,42 x 107 PFU/mL., Urinary tract infection (UTI) is an infection with the second biggest prevalence in the world after a respiratory infection. Alternative precaution is needed to avoid the overuse of antibiotics, and one of them is the utilization of bacteriophage. This study aims to isolate bacteriophage specific E. coli strain C15. Reidentification was done to the host bacteria, as well as growth measurement. The soil sampled at three locations namely TPA IPB, one of garbage disposals at IPB, and horse stable of IPB were used as bacteriophage source. Isolated bacteriophage then was purified and quantified using the double-layer method. Bacteriophage was managed to get isolated only from the soil of horse stable of IPB, due to the environmental condition of the two former sources that were less supportive to the life of the host bacteria. Bacteriophage’s plaques appeared to be distinctive in size from each other, indicated that there are different kinds of bacteriophages. Those differences in the size of plaques apparently are affected by diffusivity, adsorption rate, latent period, and burst size of bacteriophage. Quantification showed that isolated bacteriophage is 3,42 x 107 PFU/mL.
Keyword: antibiotic, Escherichia coli, double layer, ISK, resistance

Judul: Bakteriofaga Khusus Escherichia coli yang Diisolasi dari Berbagai Contoh Air di Bogor Tengah, Kota Bogor
Abstrak: Keberadaan jasad renik yang sudah tahan terhadap anti jasad renik (antimicrobial resistance, AMR) merupakan ancaman serius dalam dunia kesehatan. Escherichia coli diketahui telah tahan terhadap beberapa anti jasad renik seperti sefalosporin dan fluorokuinolon. Bakteri E. coli dapat menyebabkan masalah serius. Penggunaan faga dalam terapi penyakit yang disebabkan oleh bakteri patogen dinilai cukup menjanjikan karena memiliki kepekaan dan kekhususan yang bagus dibandingkan dengan antibiotika. Tujuan Penelitian adalah mengisolasi E. coli dan mendapatkan faga khusus E. coli serta mencirikan faga yang diperoleh dari beberapa sumber air di Bogor Tengah, Kota Bogor. Contoh air diambil dari tiga titik yang berbeda di Sungai Ciliwung, satu titik air minum hewan, satu titik air ikan hidup dan satu titik air celupan daging di Pasar Merdeka Kota Bogor. Bakteri inang diisolasi terlebih dahulu untuk mendapatkan biakan murni menciri E. coli. Kemudian dilakukan isolasi faga, uji plak, penyimpanan faga, uji bercak, mengukur kadar dan berat molekul protein faga. Bakteri yang diduga E. coli diperoleh dari enam contoh air yang diambil berdasarkan karakter pertumbuhan pada Eosine Methylene Blue Agar (EMBA), Mac Conkey Agar (MCA), pewarnaan Gram, dan Uji IMViC. Faga berhasil diperoleh dari satu isolat bakteri asal air celupan daging dari Pasar Merdeka Kota Bogor dengan kadar sebesar 9,1 x 108 pfu/ml dan tidak ditemukan pada contoh air lainnya. Hasil pemeriksaan menggunakan Analytical Profile Index 20 Enterobacteriaceae (API 20E) menunjukkan kemungkinan besar bakteri inangnnya adalah E. coli (89,5%, low discrimination). Namun demikian, uji lanjutan masih diperlukan untuk mempertegas identitas bakteri inang. Pengujian kisaran inang faga terisolasi menggunakan teknik uji bercak menunjukkan bahwa faga hanya mampu melisis sel bakteri inangnya saja, dan tidak menunjukkan aktivitas litik pada sel bakteri Salmonella, maupun pada lima isolat diduga E. coli yang diperoleh dari penelitian ini, serta pada satu isolat arsip yang menunjukkan persentase rendah sebagai E. coli (37,6%, low discrimination). Bahkan faga terisolasi juga tidak melisiskan bakteri isolat arsip yang telah terkonfirmasi sebagai E. coli dengan API 20E (95%, good identification). Selanjutnya, analisis protein faga dilakukan menggunakan teknik Bradford untuk menghitung kadar protein dan menggunakan teknik Sodium Dodecyl Sulphate–Polyacrylamide Gel Electrophoresis (SDS-PAGE) untuk menentukan berat molekul protein penyusunnya. Hasil menunjukkan faga terisolasi mempunyai kadar protein sebesar 11 µg/ml, namun pada pemeriksaan penentuan berat molekulnya belum membuahkan hasil yang meyakinkan. Pita protein yang diduga asal faga dengan kisaran berat molekul 45 kDa dan 60 kDa terlihat samar-samar, dan menjadi tidak muncul pada pengulangan kedua dan ketiga. Dapat disimpulkan bahwa faga terisolasi memiliki kisaran inang yang sempit, yaitu hanya mampu melisiskan bakteri inang yang diduga kuat adalah E. coli. Upaya pengayaan dan pemurnian stok faga sangat penting dilakukan untuk memiliki jumlah stok faga yang melimpah sehingga dapat digunakan pada berbagai pengujian untuk mengetahui karakteristik dan identitas faga terisolasi tersebut. Kata kunci: analisis protein, Escherichia coli, faga, kisaran inang, tahan terhadap anti jasad renik, The existence of antimicrobials resistant microorganisms is a serious problem in the world. Escherichia coli is known to be resistant to several antibiotics, such as cephalosporin and fluoroquinolones. One of the important bacteria is Escherichia coli. The use of phaga in the therapy of diseases caused by pathogenic bacteria is considered quite promising because
Keyword: antimicrobial resistance, Escherichia coli, host range, phage, protein analysis

Judul: Kekuatan Tiga Tipe Sambungan Kayu Merbau pada Lunas Luar Kapal Ikan
Abstrak: Kapal kayu terdiri dari bagian-bagian yang merupakan satu kesatuan utuh. Bagian-bagian tersebut tidak dapat dipisahkan karena antara satu bagian dengan bagian yang lainnya saling menunjang. Diantara bagian-bagian tersebut, terdapat safu bagian yang merupakan dasar penunjang dari bagian-bagian yang lain pada kapal~ yaitu lunas. Lunas merupakan bagian dilsar pada kap~ awal dari pembangunan sebuah kapal yang juga berperan sebagai tulang punggung kapal. Lunas merupakan tempat menempelnya kerangka lambung atau gading-gading. Lunas juga berfungsi sebagai penyangga badan kapal dan mnatan yang berada di dalam kapal~ Beban yang disangga oleh lunas tergantung dilri besar kapal dan berat muatan yang dibawa oleli kapaL OIeh karena itu, material lunas harus terbnat dari kayu yang kuat, agar pada saat muatan kapal penuh, lUnas mampu menyangga beban dan kapaI tidak mengalami kerusakan. Menurut BKI (1989) kayu material lunas harus termasuk dalam kelompok kayu kelas kuat satu atan di.Ja. Lunas dipasang secara horizontaI searah panjang kap~ oleh karena itu, seIain kuat, lunas juga hams terbuat dari kayu yang panjang. Saat ini terdapat kesulitan untuk mencari kayu yang panjang karena semakin berkurangnya pohon-pohon tinggi di liutan. Siilitnya mencari kayu yang panjang menyebabkan funas kapal tidak seIalu terdiri dari satu batang kayu utuli yang panjang, tetapi juga terdiri diIri dua batang kayu sejenis yang disambung dengan sambungan. Sambungan yang digunakan pada lUnas kapaI harusIah sambungan yang kuat, agar lunas tetap mampu menyangga beban kapal dan muatan kapal.
Keyword: