Judul: Detection of antibody anti-Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis in Buffalo at East Sumba Regency
Abstrak: Bakteri Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis (MAP) merupakan agen penyebab penyakit paratuberkulosis yang menyerang ruminansia. Penyakit ini menimbulkan kerugian ekonomi berupa penurunan produksi susu dan karkas, pengafkiran hewan dan penurunan kualitas genetik. Salah satu komoditas ternak di Kabupaten Sumba Timur adalah kerbau. Keberadaan penyakit MAP ini belum pernah dilaporkan sebelumnya di Sumba Timur. Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui infeksi MAP melalui deteksi keberadaan antibodi anti-MAP pada kerbau di Kabupaten Sumba Timur. Sebanyak 36 sampel serum darah kerbau dari sepuluh kecamatan digunakan sebagai sampel. Keberadaan antibodi anti-MAP diuji dengan metode Indirect Enzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA). Berdasarkan hasil uji menunjukkan satu sampel dari kecamatan Karera diduga memiliki antibodi anti MAP dengan nilai %S/P sebesar 68,96, sedangkan sampel asal sembilan kecamatan lainnya tidak terdeteksi adanya antibodi anti-MAP. Penelitian ini membuktikan bahwa infeksi paratuberkulosis tidak terjadi di Kabupaten Sumba Timur., Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis bacteria is causative agent of paratuberculosis disease which attack ruminant. This disease causes high economic losses such as decrease milk production and carcass, animal abandonment and decrease genetic quality. One of the livestock commodities in East Sumba Regency is buffalo. The presence of this disease has never been previously reported in East Sumba. This study was conducted to determine the presence of antibodies in buffaloes in East Sumba Regency. A total of 36 samples of buffalo blood serum from ten districts were used as samples. The presence of MAP infection was observed by the presence of anti-MAP antibodies using the Indirect Enzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA) method. Based on the test results, it showed that one sample from Karera sub-district was suspected to have anti-MAP antibodies with a% S/P value of 68.96, while samples from nine other districts had no detectable anti-MAP antibodies. This study proves that paratuberculosis infection does not occur in East Sumba Regency.
Keyword: Buffalo, ELISA, East Sumba, Johne's Disease, MAP

Judul: IPB (Bogor Agricultural University)
Abstrak: Paratuberkulosis atau Johne’s disease (JD) merupakan penyakit enteritis ganulomatosa kronik pada hewan ruminansia yang disebabkan oleh Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis (MAP). Bakteri ini berbentuk batang kecil, bersifat tahan asam, Gram positif, tumbuhnya lama, dan termasuk dalam kelompok Mycobacterium avium complex (MAC). Gejala klinis yang terlihat, adalah diare profus, penurunan produksi susu, penurunan berat badan, dan kekurusan yang disertai dengan pengeluaran bakteri MAP melalui feses. Paratuberkulosis pada peternakan sapi dapat menyebabkan kerugian ekonomi yang signifikan, karena terjadi penurunan produksi susu, gangguan reproduksi, peningkatan calving interval, pengafkiran dini, penurunan kualitas dan kuantitas daging. Penyakit ini bersifat zoonosis potensial, karena bakteri MAP dilaporkan dapat menginfeksi manusia dan lebih dikenal dengan sebutan Crohn’s disease (CD). Berdasarkan hasil studi dan data-data yang ada, sumber infeksi MAP ke manusia dicurigai dan diyakini berasal dari susu dan produk olahannya, karena MAP dilaporkan tahan terhadap pasteurisasi. Metode uji yang sering digunakan untuk diagnosis paratuberkulosis adalah kultur, polymerase chain reaction (PCR), dan enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). Isolasi dan identifikasi MAP dari sampel feses atau jaringan merupakan uji gold standard. Media padat yang umum dan paling banyak digunakan untuk kultur MAP adalah Herrold’s egg yolk medium (HEYM) dan Lӧ wenstein Jensen (LJ). Herrold’s egg yolk medium merupakan media padat standar untuk isolasi MAP dan secara komersial sudah tersedia, tetapi media ini merupakan produk impor dengan harga yang cukup mahal dengan masa simpan yang cukup pendek (4-6 bulan). Enzyme-linked immonosorbent assay merupakan metode uji serologi yang banyak digunakan untuk diagnosis paratuberkulosis, karena lebih sensitif dibandingkan dengan uji serologi lain, lebih murah, dan lebih cepat. Kit ELISA yang digunakan untuk uji serologi paratuberkulosis di Indonesia merupakan produk impor dengan menggunakan antigen lipoarabinomannan (LAM) atau antigen protoplasmik (PPA). Kit ELISA komersial harganya cukup mahal dengan sensitivitas dan spesifitasnya yang bervariasi. Kejadian ini kemungkinan dipengaruhi oleh perbedaan antigen ataupun isolat yang digunakan. Penelitian ini bertujuan untuk mengembangkan dan mengevaluasi kemampuan media RIVS-M dan memodifikasi media Ogawa untuk kultivasi Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis (MAP) yang lebih sederhana dan ekonomis, mengidentifikasi protein protoplasmik MAP isolat lapang B2788 dan B2789 yang bersifat antigenik, dan mengembangkan enzyme-liked immunosorbent assay (ELISA) paratuberkulosis dengan menggunakan antigen protoplasmik MAP isolat lapang. Metode dalam penelitian ini meliputi pengujian media RIVS-M dan media Ogawa dimodifikasi dengan menumbuhkan suspensi bakteri MAP dalam phosphat buffer saline (PBS) dan feses pada kedua media tersebut. Suspensi bakteri MAP tersebut juga ditumbuhkan pada Herrold’s egg yolk medium (HEYM) komersial. Analisa hasil dilakukan dengan menggunakan metode GraphPad Prims 6 Sofware. Identifikasi dan analisa antigen protoplasmik MAP isolat lapang B2788 dan B2789 dilakukan dengan sodium dodecyl sulphate polyacrilamide gel (SDS-PAGE) dan immunoblotting. Pengembangan uji ELISA paratuberkulosis dengan menggunakan antigen protoplasmik MAP isolat lapang (ELISA PPA-L) dilakukan dengan metode indirect untuk menguji 322 sampel serum (300 negatif dan 22 positif paratuberkulosis). Untuk mengevaluasi metode ELISA PPA-L, serum yang sama juga diuji dengan menggunakan kit ELISA IDEXX paratuberculosis screening antibody test (IDEXX Laboratories, USA). Hasil penelitian menunjukkan bahwa media RIVS-M dan media Ogawa dimodifikasi mempunyai kemampuan dan sensitivitas yang baik untuk menumbuhkan MAP, tetapi kemampuan media HEYM komersial lebih baik dibandingkan kedua media tersebut. Namun demikian, media RIVS-M dan media Ogawa dimodifikasi lebih ekonomis
Keyword: media kultur, antigen protoplasmik, Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis, diagnosis, paratuberkulosis

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: