Judul: Variation of SNP g.9617965 C>T KIF12 and it’s  Association on Carcass Characteristics and Lamb Meat Quality
Abstrak: Kinesin Family 12 (KIF12) merupakan salah satu gen yang terlibat dalam mediase kaskade antioksidan dalam sel beta sebagai target intraseluler dari kelebihan asupan lemak. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi keanekaeagaman SNP g.9617965 C>T KIF12 dan hubungannya dengan karakteristik karkas dan kualitas daging. Jumlah sampel yang digunakan adalah 40 sampel DNA yang terdiri dari 10 domba ekor tipis (DET), 10 domba compass agrinak (DCA), 10 domba jonggol (DJ), dan 10 domba garut (DG). Identifikasi keragaman KIF12|BfaI dilakukan dengan metode Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP). Hasil penelitian menunjukkan bahwa panjang produk amplifikais adalah 696 bp. Keragaman gen KIF12 ditemukan tiga genotipe yaitu CC, CT, dan TT. Frekuensi alel pada semua jenis domba berada pada keseimbangan Hardy-Weinberg. Titik mutasi gen KIF12 berasosiasi (P<0,05) dengan karakteristik karkas, yaitu panjang karkas. Selain itu, gen KIF12 juga berasosiasi signifikan (P<0,05) dengan kualitas daging yaitu keempukan, susut masak, dan daya mengikat air (DMA). Dapat disimpulkan bahwa gen KIF12 merupakan kandidat gen yang potensial untuk karaktristik karkas dan kualitas daging domba., Kinesin Family 12 (KIF12) is one of gene which involves on mediation an antioxidant cascade in beta cells as an intracellular target of excess fat intake. This study aims to identify the diversity of SNP g. 9617965 C>T KIF12 and association with carcass characteristic and meat quality. The total sample used were 40 ram DNA samples consisted of 10 javanese thin tail (JTT), 10 compass agrinak sheep (CAS), 10 jonggol sheep (JS), and 10 garut sheep (GS). Identification of the diversity of KIF12|BfaI was conducted using the Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP) method. The results showed that the amplification product length was 696 bp. The diversity of the KIF12 gene was found three genotypes namely CC, CT, and TT. The allele frequencyin all types of sheep was in Hardy-Weinberg equilibrium. A SNP of the KIF12 was associated (P<0,05) with characteristic of carcass, including length of carcass. The association of KIF12 with meat quality was significant (P<0,05) associated with tenderness, cooking loss, and water holding capasity (WHC). It could be concluded that KIF12 gene is a potential candidate gene for carcass characteristic and meat quality traits in sheep.
Keyword: carcass characteristic, KIF12 gene, meat quality, sheep

Judul: Investigation of the Genetic Polymorphism of the CYP2A6 and FABP4 gene on Nutritional Value, Meat Quality, and Carcass Characteristics in Sheep
Abstrak: Tingkat konsumsi daging domba di kalangan konsumen disebabkan beberapa faktor yang mempengaruhi, diantaranya nilai gizi yang terkandung dalam daging domba, kualitas daging domba, serta karakteristik karkas yang memperhatikan proporsi perdagingan domba. Diantara gen-gen potensial yang dapat digunakan sebagai penanda nilai gizi, kualitas daging, dan karakteristik karkas pada daging domba Indonesia, yaitu gen cytochrome P450, family 2, subfamily A, polypeptide 6 (CYP2A6) dan gen fatty acid binding protein 4 (FABP4). Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi polimorfisme gen CYP2A6 pada SNP g.49170107 G>T dan gen FABP4 pada SNP g.57536954 C>T, serta mengetahui hubungannya dengan nilai gizi, kualitas daging, dan karakteristik karkas pada domba Indonesia. Total sampel yang digunakan untuk keragaman sebanyak 243 ekor domba dengan sembilan jenis domba Indonesia, yaitu domba texel cross (DTC), domba Barbados cross (DBC), domba compass agrinak (DCA), domba ekor gemuk (DEG), domba ekor tipis (DET), domba garut (DG), domba komposit garut (DKG), domba lokal jambi (DLJ), dan domba jonggol (DJ). Investigasi gen dilakukan dengan identifikasi keragaman gen CYP2A6 dan FABP4 yang dianalisis menggunakan Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP), serta dilakukan asosiasi gen CYP2A6 dan gen FABP4 terhadap parameter yang diuji menggunakan General Linear Model (GLM). Hasil penelitian menunjukkan bahwa gen CYP2A6 bersifat polimorfik yang ditandai dengan adanya dua macam genotipe GG dan TT, sedangan gen FABP4 bersifat monomorfik dengan genotipe TT. Keragaman ditemukan pada DEG, DET, DLJ, dan DJ. Keragaman genotipe gen CYP2A6 berada dalam keseimbangan Hardy-Weinberg. Hasil menunjukkan bahwa gen CYP2A6 secara nyata berasosiasi (P<0,05) dengan nilai gizi diantaranya kolesterol dan mineral Fe. Kualitas daging seperti pH, keempukan, susut masak, dan daya mengikat air tidak memiliki asosiasi dengan gen CYP2A6. Hasil asosiasi gen CYP2A6 secara nyata berasosiasi (P<0,05) dengan karakteristik karkas, yaitu bobot hidup, karkas hangat, persentase karkas, karkas dingin, serta potongan komersial. Berdasarkan hasil asosiasi tersebut menunjukkan bahwa gen CYP2A6 dapat dijadikan sebagai kandidat marker dalam program seleksi domba untuk memperbaiki kualitas daging domba.
Keyword: CYP2A6 gene, FABP4 gene, GLM, PCR-RFLP, sheep

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: