Judul: Deteksi cucumber mosaic virus (CMV) penyebab penyakit kuning pada tanaman lada
Abstrak: Lada merupakan salah satu tanaman rempah yang memiliki manfaat cukup beragam baik sebagai rempah maupun sebagai obat untuk menyembuhkan berbagai macam penyakit pada manusia seperti sakit perut, demam, dan malaria. Indonesia tercatat sebagai salah satu negara produsen dan pengekspor lada terbesar di dunia. Namun dalam perkembangannya, ekspor lada Indonesia mengalami penurunan karena beberapa tahun terakhir ini banyak negara lain yang mempunyai potensi untuk bersaing menjadi negara produsen dan pengekspor lada. Selain itu, penurunan ini juga disebabkan rusaknya tanaman lada di sentra produksi akibat serangan hama dan penyakit. Salah satunya adalah penyakit kuning yang disebabkan oleh virus. Penelitian ini bertujuan untuk mendeteksi dan mengidentifikasi virus penyebab penyakit kuning pada tanaman lada. Pengamatan penyakit kuning telah dilakukan pada pertanaman lada di Instalasi Penelitian Balai Penelitian Tanaman Rempah dan Obat di Sukabumi. Tanaman yang sakit memperlihatkan gejala bercak klorotik pada daun muda, daun menjadi melengkung dan melepuh. Insiden penyakit kuning di kebun koleksi ini sangat tinggi, mencapai 95,71 % dari 350 tanaman yang diamati. Beberapa daun dari tanaman lada sakit digunakan sebagai bahan untuk deteksi dan identifikasi patogen yang berasosiasi dengan penyakit kuning. Pengujian melalui enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) memperlihatkan bahwa sebagian besar sampel tanaman lada (34 dari 37 tanaman sampel) positif bereaksi dengan serum anti-CMV. Hasil pengujian ini memberi arah deteksi/identifikasi patogen sasaran yang akan dilakukan. dsRNA yang diekstraksi dari tanaman lada sakit dengan metode Doodds et al. (1984) ditemukan terseparasi menjadi empat spesies dalam elektroforesis pada gel agarose. Ukuran keempat spesies dsRNA ini sama dengan ukuran dsRNA CMV yang diektraksi dari tanaman tembakau yang digunakan sebagai standar. Demikian juga reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) yang telah dilakukan dengan menggunakan primer yang didesain berdasarkan sikuen genom CMV-B2 (Suastika 1996) berhasil mengamplifikasi dsRNA yang digunakan sebagai cetakan. Hasil ini sudah sangai cukup untuk mengatakan bahwa penyakit kuning pada tanaman lada berasosiasi dengan CMV. Untuk lebih menyakinkan, virus pada tanaman lada ini telah dimurnikan dengan metode Francki et al. (1979). Pengamatan partikel virus dalam siapan murni dengan mikroskop elektron menemukan bahwa virus berbentuk bulat dan berukuran 28 nm, yang merupakan ciri dari Cucumovirus dimana CMV termasuk di dalamnya.
Keyword: 

Judul: Deteksi dan identifikasi penyebab penyakit belang pada tanaman lada (Piper nigrum L)
Abstrak: Penyakit belang pada tanaman lada pada awalnya diduga disebabkan oleh mikoplasma, namun hasil penelitian di beberapa negara menunjukka n bahwa penyakit ini disebabkan oleh dua jenis virus yaitu Cucumber Mosaic Virus (CMV) dan Piper Yellow Mottle Virus (PYMV). Tujuan penelitian ini adalah untuk mendeteksi dan mengidentifikasi virus penyebab penyakit belang pada tanaman lada yang terdapa t di pulau Bangka, Lampung, Sukabumi, dan Bogor, serta untuk mengetahui efisiensi tiga jenis serangga vektor dalam penularan virus CMV dan PYMV. Hasil pengamatan yang dilakukan di sembilan kebun petani dibeberapa desa di Pulau Bangka menunjukkan serangan sebesar 95% dengan gejala umum belang dan keriting. Gejala serangan yang sama ditemukan pula di beberapa kebun petani di Lampung dan Bogor, sedangkan pada lokasi di Kebun Percobaan Balai Penelitian Tanaman Rempah dan Obat Sukamulya didominasi gejala be lang. Deteksi daun sakit bergejala keriting dan belang dengan uji ELISA menunjukkan sampel positif bereaksi dengan antiserum CMV dan Banana Streak Virus (BSV). Penularan virus dengan perlakuan jumlah serangga vektor, kontrol, 1, 3, 7, dan 10 ekor menunjukkan bahwa kutu daun Aphis gossypii tidak dapat menularkan kedua jenis virus tersebut. Penularan menggunakan serangga vektor Planococcus minor dan Ferrisia virgata pada perlakuan satu ekor serangga vektor diperoleh hasil bahwa hanya PYMV yang dapat ditula rkan dengan efisiensi 40-100%. Amplifikasi genom virus dengan PCR menggunakan 5’-Badna T dan 3’-SCBVR1 diperoleh amplikon berukuran ± 650 bp. Perunutan nukleutida amplikon hasil PCR menunjukkan adanya homologi sekuen sebesar 85% dengan sekuen PYMV ORF1 yang dilaporkan oleh de Silva et al.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: