Judul: Simulasi Molecular Docking Senyawa Kurkumin Dan Analognya Sebagai Selective Androgen Receptor Modulators (SARMs) Pada Kanker Prostat
Abstrak: Kanker menempati peringkat tertinggi sebagai penyebab kematian di negara berkembang. Kanker disebabkan oleh beberapa faktor seperti faktor lingkungan, infeksi, makanan, bahan kimia, ketidakseimbangan metabolisme dan radiasi sinar ultraviolet. Berbagai upaya telah dilakukan untuk mengobati kanker khususnya kanker prostat yaitu dengan cara pembedahan, radioterapi, dan kemoterapi yang bertujuan untuk menghambat maupun merusak perkembangan sel-sel kanker prostat. Namun pengobatan dengan cara tersebut jika tidak ditangani dengan tepat akan merusak sel-sel normal yang ada disekitar area kanker. Salah satu terapi pengobatan kanker prostat adalah dengan menghambat aktivitas androgen pada reseptor androgen dengan penggunaan bahan bioaktif dari hasil sintesis atau isolasi bahan alam sehingga sel kanker pada prostat tidak berkembang dan akhirnya mengalami kematian sel secara terprogram (apoptosis). Kurkumin yang dapat diperoleh dari rimpang kunyit maupun temulawak merupakan komponen bioaktif yang telah lama digunakan oleh masyarakat dalam pengobatan berbagai penyakit diantaranya dapat mengobati kanker khususnya kanker prostat. Dalam perkembangannya kurkumin telah banyak mengalami modifikasi agar didapatkan senyawa yang lebih stabil. Kurkumin yang telah dimodifikasi (analog kurkumin) diperkirakan memiliki aktivitas yang sama dengan kurkumin dalam menghibisi interaksi hormon androgen terhadap reseptornya. Potensi analog kurkumin sebagai kandidat obat dalam pengobatan kanker prostat dapat dilakukan secara in silico melalui penambatan molekular (molecular docking). Keunggulan molecular docking ialah dapat memprediksikan potensi kandidat obat baru terhadap suatu penyakit dengan biaya efektif dan waktu yang cepat melalui penapisan virtual atau secara komputasi. Analog kurkumin berpotensi sebagai kandidat obat dalam pengobatan kanker prostat jika energi ikatan (ΔG) dari analog kurkumin terhadap reseptor androgen lebih stabil jika dibandingkan dengan ligan pembanding (bikalutamida). Dari hasil molecular docking diperoleh energi ikatan (ΔG) dari kurkumin dan analognya yang lebih stabil jika dibandingkan dengan bikalutamida sehingga kurkumin dan analog yang digunakann memiliki potensi sebagai SARMs terhadap reseptor androgen. Analog 2 merupakan ligan yang paling stabil jika dibandingkan dengan analog kurkumin lainnya yaitu sebesar -8,4 kkal/mol. Hal tersebut berkaitan erat dengan interaksi antara analog 2 terhadap reseptor androgen pada pembentukan konformasi yang paling stabil. Ikatan hidrogen pada analog 2 melibatkan residu Arg752, Asn705 dan Thr877. Residu-residu tersebut merupakan area penting (bindingsite) pada pengikatan reseptor androgen terhadap ligan alaminya yaitu hormon androgen. Sehingga analog 2 berpotensi paling besar dalam menghambat aktivitas hormon androgen.
Keyword: kurkumin dan analognya, molecular docking, reseptor androgen

Judul: Simulasi Docking Senyawa Kurkumin dan Analognya sebagai Inhibitor Enzim 12-Lipoksigenase
Abstrak: Kurkumin adalah metabolit sekunder yang dihasilkan dari tanaman kunyi (Curcuma longa) dan temulawak (Curcuma xanthorrhiza) dan temulawak yang dapat dimanfaatkan sebagai terapi inflamasi. Kurkumin dapat menghambat kerja enzim lipoksigenase yang merupakan enzim pendegradasi asam arakidonat yang bertanggung jawab pada efek inflamasi Interaksi kurkumin dengan enzim 12-lipoksigenase dapat dipelajari melalui simulasi docking. Simulasi docking digunakan dalam mendesain obat secara komputasi. Dalam penelitian ini kurkumin dan analognya diinteraksikan dengan enzim lipoksigenase untuk mendapatkan interaksi yang optimum dengan parameter yang diamati adalah energi bebas Gibbs (ΔG) serta ikatan kimia yang terbentuk. Dalam penelitian ini menggunakan metode simulasi docking dengan aplikasi AutoDockVina. Ligan yang digunakan adalah kurkumin enol, kurkumin keto, bisdemetoksikurkumin, demetoksikurkumin, analog 1, dan analog 2 sedangkan reseptornya adalah enzim 12-lipoksigenase. Aplikasi lain yang digunakan adalah PyMol, LigPlot, dan VMD untuk persiapan ligan dan reseptor sertaToxTree untuk prediksi toksisitas berdasarkan QSAR. Hasil yang diperoleh adalah analog 2 memiliki kestabilan yang paling baik dengan nilai ΔG sebesar -8,8 kkal/mol. Analog 2 diprediksi bersifat toksik dan berpotensi sebagai senyawa karsinogenik. Analog 1 merupakan alternatif senyawa sintetik yang potensial sebagai inhibitor enzim 12-lipksigenase berdasarkan nilai energi bebas Gibbs (ΔG) -8,6 kkal/mol, sifat solubilitas, geometri struktur, dan prediksi toksisitas. Gugus fungsi yang berperan dalam interaksi ligan-reseptor secara umum adalah gugus fungsi OH pada struktur aromatik, dan gugus fungsi CO pada struktur rantai tengah.Berdasarkan analisis interaksi kurkumin dan analognya dapat diketahui bahwa kunyit dan temulawak dapat digunakan sebagai terapi herbal untuk mengurangi efek inflamasi.
Keyword: Simulasi docking, Kurkumin, Analog, Enzim 12- Lipoksigenase

Judul: Utilization of terra/MODIS L1B data for analysis of horizontal wind profile in the troposphere
Abstrak: This study was concerned with horizontal wind derived from data collected with the Moderate-resolution Imaging Spectroradiometer (MODIS) on board the NASA’s Earth Observation System (EOS)-Terra satellite. The aim of this study is to develop a method for the estimation of horizontal wind movement in the troposphere based on Navier-Stokes equation. The method was applied to a calibrated and geolocated Terra/MODIS L1B 1 km data set. The data inputs to estimate surface temperature are retrieved from TIR (Thermal Infrared) bands 31 (10.780 μm to 11.280 μm) and 32 (11.770 μm to 12.270 μm). The obtained surface temperatures were later used to approximate geopotential height on a constant-pressure surface by using the modified Poisson equation. The main assumptions used are the hydrostatic equilibrium, ideal gas law, constant lapse rate and constant acceleration of gravity. Based on the distribution of geopotential height, the pressure gradient force is measured by the gradient of geopotential on an isobaric coordinate to present the horizontal wind profile. For certain topographic areas especially in the mountain ranges, there was a disadvantage of using pressure as a vertical coordinate which lead to inaccuracy. In spite of that, Terra/MODIS L1B data with 1 km spatial resolution can be used to estimate the horizontal wind movement in the troposphere.
Keyword: