Judul: Pengaruh khlorin terhadap daya hidup dan profil resistensi antobiotika bakteri fekal koloform dan escherichia coli 0157=H7 dan limbah cair rumah potong ayam
Abstrak: Penyakit diare yang ditularkan melalui air ( Water Borne Enteric Illness) merupakan salah satu penyakit utama di yang dapat menyebabkan kematian pada manusia. Penyakit Water Borne Enteric Illness adalah mikroorganisme enterik, yaitu mikroorganisme yang berkembangbiak di saluran usus dan diekskresikan melalui feses (Gaudy dan Gaudy, 1985). Eschericia. coli dapat mencemari lingkungan Rumah Potong Ayam (RPA) melalui beberapa cara, misalnya melalui tangan pekerja dan peralatan yang digunakan atau dapat berasal dari hewannya sendiri (Smeltzer, 1984). Beberpa galur E. coli menyebabkan gastroenteritis akut atau enteritis disentri pada manusia dan hewan. Salah satu cara untuk mendapatkan produk unggas berkualitas baik adalah dengan menggunakan desinfektan sehingga mengurangi jumlah mikroorganisme yang berakibat dapat memperpanjang masa simpan (shelf life) produk akhir. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui kemampuan khlorin dalam menginaktifasi dan mengurangi jumlah bakteri peranannya di dalam perkembangan resistensi antibiotika. Koliform, Fekal Koliform, £. coli dan £. coli 0157:H7. Selain itu penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kemungkinan berperannya unggas sebagai reservoir bakteri patogen £. coli 0157:H7. Penelitian dilakukan di laboratorium Kesehatan Masyarakat Veteriner FKH-IPB dan laboratorium Toksikologi Balitvet pada bulan Maret sampai dengan bulan Juni 1994. Parameter yang diukur dalam peneliian ini adalah jumlah Koliform sebelum dan sesudah khlorinasi, jumlah Fekal Koliform sebelum dan sesudah khlorinasi, pengukuran kadar khlor bebas dan pengukuran resistensi antibiotika bakteri Koliform, Fekal Koliform, E. coli dan E. coli O157:H7 sebelum dan sesudah khlorinasi. Rancangan yang digunakan adalah Rancangan Acak Lengkap dengan 15 ulangan. Metoda analisanya menggunakan analisis sidik ragam, untuk mengetahui adanya perbedaan antar perlakuan dilakukan uji Duncan. Untuk mengetahui perbedaan yang nyata antara proporsi isolat yang resisten antibiotika dari tiga macam dosis khlorin digunakan test non-parametrik Friedmann dan Kruskal-Wallis (Mustafa, 1990). Dari hasil penelitian ini diperoleh kesimpulan bahwa khlorin efektif untuk membunuh bakteri Koliform, Fekal Koliform, E. coli dan E. coli O157:H7 dari limbah cair RPA Tangerang dan RPA Parung. Pada efluen RPA Tangerang dapat diberikan khlorin dosis 70 ppm dan diperlukan pengolahan limbah, sedangkan pada RPA Parung dapat digunakan dosis khlorin 50 ppm sebelum efluen dialirkan ke badan air. Efektifitas khlorin dipengaruhi oleh chlorine demand dalam air limbah, sedangkan chlorine demand dipengaruhi oleh volume dan kualitas efluen yang dihasilkan. Unggas dapat berperan sebagai reservoir E. coli O157:H7 karena bakteri tersebut ditemukan, baik pada limbah cair RPA Tangerang maupun RPA Parung. Bakteri Koliform, Fekal Koliform, E.coli dan E.coli O157:H7 bersifat resisten terhadap enam macam antibiotika yaitu tetrasiklin, khloramfenikol, ampisilin, asam nalidiksat, sulfonamid kombinasi dan kotrimoksasol. Khlorin tidak berpengaruh terhadap terjadinya resistensi antibiotika pada mikroorganisme.
Keyword: 

Judul: Pengendalian Escherichia coli Patogen dari Limbah Cair Rumah Sakit Menggunakan Bakteriofag
Abstrak: Escherichia coli dikenal sebagai bakteri patogen yang sering mengontaminasi limbah cair rumah sakit yang dapat membahayakan bagi manusia dan lingkungan. Kekhawatiran akan kemunculan bakteri yang resisten terhadap antibiotik dan disinfektan yang diakibatkan ketidakefektifan pengolahan limbah telah mendorong ditemukannya strategi alternatif untuk mengendalikan cemaran bakteri patogen pada limbah cair rumah sakit. Pemanfaatan bakteriofag untuk mengendalikan cemaran bakteri patogen pada limbah cair merupakan alternatif potensial untuk pengolahan limbah cair rumah sakit. Bakteriofag memiliki keunggulan dalam hal spesifisitasnya sehingga dapat diaplikasikan untuk membunuh bakteri patogen tertentu saja tanpa mengganggu komunitas mikrob di lingkungan. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi dan mengidentifikasi bakteri E. coli patogen dari limbah cair rumah sakit, mendapatkan dan menguji kemampuan isolat bakteriofag dalam mengendalikan E. coli patogen dari limbah cair rumah sakit. Limbah cair diambil dari titik efluen, bak klorinasi dan efluen instalasi pengolahan air limbah rumah sakit. Penghitungan populasi bakteri dilakukan untuk memperoleh jumlah total dan E. coli pada limbah cair rumah sakit. Isolat E. coli selanjutnya dikarakterisasi secara biokimia dan molekuler dengan menggunakan sekuen 16S rRNA. Uji patogenitas dilakukan dengan melihat aktivitas hemolitik pada media agar darah. Kerentanan terhadap senyawa antimikrobial diuji dengan menggunakan 9 jenis antibiotik dan disinfektan klorin dengan berbagai konsentrasi berbeda. Fag diisolasi dari berbagai sumber air berbeda. Isolat fag yang diperoleh dikarakterisasi untuk mengetahui kisaran inang, karakteristik mikrograf elektron serta kerentanan terhadap perlakuan suhu, pH dan klorin. Uji efektivitas fag terhadap E. coli dilakukan secara invitro pada media cair dan invivo pada limbah cair steril. Uji efektivitas kombinasi fag-klorin dilakukan pada limbah cair rumah sakit steril dan nonsteril. Hasil perhitungan populasi bakteri pada limbah cair rumah sakit memperlihatkan bakteri ditemukan pada ketiga titik pengambilan sampel yaitu influen, bak klorinasi dan efluen. Karakterisasi bakteri dari limbah cair secara biokimia berhasil memperoleh 32 isolat E. coli yang memperlihatkan aktivitas hemolitik pada media agar darah sebagai salah satu ciri bakteri patogen. Sebanyak 10 isolat bakteri E. coli yang diuji kerentanannya terhadap antibiotik memperlihatkan resistensi terhadap beberapa jenis antibiotik. Isolat E. coli juga memperlihatkan resistensi terhadap klorin dengan konsentrasi 100 ppm, 10 ppm dan 1 ppm. Hal ini mengindikasikan inefektivitas proses pengolahan limbah untuk mengendalikan cemaran bakteri pada limbah cair rumah sakit dan menguatkan kekhawatiran akan kemunculan bakteri yang resisten antibiotik dan disinfektan. Isolasi fag E. coli dari berbagai sumber berhasil memperoleh sebanyak enam isolat fag dengan karakteristik berbeda seperti ukuran dan bentuk plak. Isolat fag merupakan fag yang dapat menginfeksi E. coli dengan kisaran inang terhadap strain E. coli yang luas. Karakterisasi virion dengan mikroskop elektron menunjukkan bahwa isolat fag termasuk Famili Myoviridae. Enam isolat fag memperlihatkan ketahanan terhadap perlakuan suhu, pH dan klorin. Uji efektivitas secara in vitro pada media cair memperlihatkan kemampuan isolat fag dalam mengurangi populasi bakteri E. coli dengan perlakuan campuran (cocktail) fag mampu mereduksi populasi bakteri dengan persentase tertinggi. Persentase penurunan populasi bakteri E. coli terlihat lebih rendah setelah jam ke- 12 perlakuan. Pada limbah cair steril, perlakuan fag mampu mereduksi populasi bakteri E. coli dengan persentase penurunan yang stabil sampai akhir pengamatan. Jumlah fag yang diaplikasikan dan ketersediaan nutrisi merupakan faktor yang mempengaruhi perbedaan efektivitas pada media cair dan limbah cair. Efektivitas perlakuan
Keyword: Bakteriofag, Escherichia coli, Limbah rumah sakit

Judul: The Construction of Greedy SVP LLL Algorithm
Abstrak: A lattice is a set of all integer linear combination of a set of linearly independent vectors in ℝ𝑛���. The independent vectors are called bases of lattice. Any lattice can be generated from many bases, and these bases have the same cardinality. In the lattice, the most fundamental and renowned problem is the Shortest Vector Problem (SVP). SVP is a tracking problem of the shortest nonzero vector in a lattice with equivalent bases. In two dimensions, SVP problem has resolved exactly by Gauss’ algorithm. When the lattice dimension is higher than two, A.K. Lenstra, H.W. Lenstra and L. Lovasz gave a LLL algorithm to compute approximation of nonzero shortest vector in the lattice. Reduced bases solution obtained from LLL algorithm still be an approximation and has polynomial running time of arbitrary dimension which large enough. In 1994, Schnoor and Euchner modified this LLL algorithm as a new variant which later was named deep insertion LLL algorithm. This algorithm is a modified version of the LLL algorithm to the terms of the exchange step to improve the accuracy of output of LLL reduced bases and applying it to the subset sum problem. The purpose of this research are: (1) Reconstruct the LLL algorithm and deep insertion LLL algorithm using a geometric approach. (2) Construct a greedy SVP LLL algorithm. (3) Implement the three algorithms in a symbolic programming language, and evaluate them experimentally. A bases ℬ=[𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑛���] in ℝ𝑚��� is called reduced LLL with parameter 𝛿��� if satisfies: (a) |𝜇���𝑗���𝑖���|≤12, for every integer 𝑖���,𝑗��� with 1≤𝑖���<𝑗���<𝑛���. (b)𝛿���‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���)‖2≤‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���+1)‖2, for 𝑗���=1,2,…,𝑛���−1,where 𝛿��� is a reduced parameter of real numbers with 14<𝛿���<1. The first requirement is the reduced basis 𝛿��� must “nearly orthogonal” and in its computation case, this requirement can be reached out by using the Gram-Schmidt’s orthogonalization. While the second requirement is called exchange step, or used to called as Lovasz condition. By using both of these requirements, then they establish the LLL algorithm. Then, Schnoor and Euchner modify the LLL algorithm based on the requirements of the exchange step called the deep insertion LLL algorithm, where the exchange step is based on the comparison of the projected vector in orthogonal complement [𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑘���−1]⊥ after j-th reduction. To construct greedy SVP LLL algorithm, the requirements of the exchange step is based on purely by comparing norm of lattice 𝐛���𝑗��� with norm lattice 𝐛���𝑖��� for 𝑖���=1,2,3…,𝑗���−1. The process of insertion reduced vector after the exchange step also has done greedily. Then, we calculate the number of arithmetic operation in greedy SVP LLL algorithm for further analysis. The result of our exprimentation for three algorithms on the certain matrix size shows that the running time of the three algorithms increases propotional to the size of the matrix. The result also shows that by using 𝛿���=34 for the LLL algorithm and the deep insertion LLL algorithm, and the greedy SVP LLL algorithm which is a new variant made by using no parameter of 𝛿���, outperform of the other of two previous algorithm in terms of speed with the same output.
Keyword: LLL algorithm, LLL deep insertion algorithm, greedy SVP LLL algorithm