Judul: Isolasi dan karakterisasi sekuens parsial cDNA hormon pertumbuhan ikan gurami Osphronemus gouramy
Abstrak: Ikan gurami (Osphronemus gouramy) merupakan jenis ikan konsumsi yang memiliki nilai ekonomis yang tinggi. Namun demikian, pengembangan usaha ikan guranti masih mengalami hambatan yaitu membutuhkan waktu yang relatif lama dalam mencapai ukuran konsumsi. Masalah ini mungkin dapat diatasi dengan menggunakan teknik transgenesis. Tahapan awal yang harus dilakukan yaitu dengan pembuatan konstruksi DNA, salah satu komponen yang harus ada yaitu keberadaan gen target yang akan disisipkan, dalam ha1 ini GH (Growth Hormone) yang berasal dari ikan gurami. Dikarenakan gen GH yang berasal dari ikan gurami belum ada maka tahapan awal dalam mendapatkan gen tersebut adalah dengan isolasi cDNA (coinplementa~d eoxyribonzlcleic acid) GH ikan gurami. cDNA disintesis berdasarkan mRNA (messenger RNA) hasil ekstraksi kelenjar pituitari ikan gurami. mRNA spesifik digunakan sebagai cetakan bagi sintesis enzimatik DNA komplementer dengan menggunakan enzim reverse transkriptase. Selanjutnya cDNA di PCR dengan Primer Frl Forward 5'-RCAYCTBCACCWRHTSGC -3' dan API Reverse 5'-CCATCCTAATACGACTCACTATAGGGC- 3'. Produk PCR diligasi ke pGEM-T Easy, transformasi ke bakteri E. coli DHSa, identifikasi transforman, dan sekuensing. Hasil penelitian ini menunjukan bahwa fragmen cDNA GH parsial ikan gurami mempunyai ukuran 700 bp yang menyandikan 169 asam amino dan mengandung elemen-elemen yang konserf untuk gen GI-I. cDNA GH gurami memiliki kesamaan antara 95%-85% dengan ikan lainnya, dimana kesamaan tertinggi 95% adalah dengan ikan sepat rawa Trichogaster leerii.
Keyword: 

Judul: Isolasi dan Identifikasi Sekuen Parsial Gen Penyandi Enzim Histone Acetyltransferase-like pada Ikan Gurami Osphronemus goramy
Abstrak: Ikan gurami merupakan salah satu komoditas budidaya air tawar di Indonesia. Ikan gurami berpotensi untuk dijadikan ikan model pada studi mengenai dampak rekayasa budidaya terhadap perkembangan benih dan larva. Gen penyandi enzim histone acetyltransferase (HATs) berperan dalam proses regulasi ekspresi gen. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengisolasi dan mengidentifikasi sekuen parsial gen penyandi enzim histone acetyltransferase-like pada ikan gurami. RNA total diekstraksi dari organ hati ikan gurami. Primer degenerate oligonukleotida diperoleh dengan menyejajarkan sekuen gen ikan takifugu Takifugu rubripes, ikan sebelah Paralichthys olivaceus dan ikan salmon Atlantik Salmo salar menggunakan perangkat lunak Bioedit v7.2. Dari analisis sekuensing diperoleh susunan nukleotida berukuran 537 bp yang menyandikan 132 residu asam amino. Analisis sekuen dengan BLAST® menunjukkan sekuen gen yang berhasil diisolasi memiliki kesamaan dengan gen penyandi enzim HATs-like kakap putih Lates calcarifer, ikan nila Oreochromis niloticus dan ikan salmon silver Oncorhynchus kisutch dengan persentase kesamaan berkisar antara 91‒99%. Analisis pohon filogenetik menunjukkan bahwa sekuen gen parsial yang diisolasi tersebut berada dalam kelompok teleost dengan nilai bootstrap 64%, terpisah dengan kelompok mamalia dengan nilai bootstrap 100%. Hasil ini membuktikan bahwa gen yang diisolasi merupakan gen penyandi enzim HAT-like.
Keyword: Histone acetyltransferase, isolasi gen, Osphronemus goramy

Judul: Tinjauan Matematis pada Model Makroskopik dan Mikroskopik Arus Lalu-lintas
Abstrak: Traffic flow phenomenon can be described through mathematical model such as continuous dynamic model with an ordinary differential equation so that it can be solved with integral factors. In this paper three simple models of traffic flow are discussed, i.e, two macroscopic and one microscopic models. Macroscopic model formulates dynamics of the traffic flow that occurs on a large number of vehicles on a road. While the microscopic model explains drivers’ behavior in their interaction with other vehicles ahead, i.e, car-following model. This paper shows the existence of ordinary differential equation found in the traffic flow model and indicates some different representations in the context of the same model. It also reviews a simple model of traffic flow along a single link, which leads to some unexpected results, i.e, it can express the solution model in term of link outflows as well as trip time. In the microscopic model, simulation is done to illustrate the behavior of the drivers with a sensitivity coefficient as a benchmark parameter.
Keyword: