Judul: Potential of Endophytic Bacteria from Various Plants to Control Meloidogyne spp. on Eggplant (Solanum melongena L.)
Abstrak: Nematoda puru akar (NPA) yang disebabkan oleh Meloidogyne spp. merupakan salah satu penyakit penting pada tanaman terung. Pengendalian Meloidogyne spp. menggunakan nematisida sintetik merupakan pengendalian yang paling banyak diminati oleh petani karena lebih praktis dan mudah didapatkan. Penggunaan nematisida sintetik yang tidak bijaksana dapat menyebabkan resistensi patogen dan pencemaran lingkungan. Keberhasilan bakteri endofit dalam mengendalikan penyakit tular tanah telah banyak dilaporkan. Bakteri endofit merupakan bakteri yang hidup di jaringan tanaman yang dapat meningkatkan pertumbuhan dan kesehatan tanaman inang. Penggunaan bakteri endofit yang diisolasi dari tumbuhan Lantana camara L. serta isolat bakteri endofit asal sawit, pinang, mangrove dan paku-pakuan diharapkan dapat menekan NPA sekaligus memacu pertumbuhan tanaman terung. Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi keefektifan bakteri endofit dalam menekan populasi Melodogyne spp. serta pengaruhnya terhadap pertumbuhan tanaman terung. Penelitian ini dilaksanakan di Laboratorium Nematologi Tumbuhan dan Laboratorium Bakteriologi Tumbuhan serta Rumah Kaca Cikabayan IPB dilaksanakan bulan November 2020 hingga Maret 2022. Penelitian ini mencakup isolasi dan seleksi bakteri asal L. camara, menggunakan isolat koleksi asal kelapa sawit, pinang, mangrove dan paku-pakuan, uji karakterisasi fisiologi bakteri endofit, uji mortalitas nematoda terhadap bakteri endofit dan uji mortalitas nematoda dengan senyawa volatile organic compound (VOC) asal bakteri endofit secara in vitro, pengujian keefektifan bakteri endofit di rumah kaca, dan karakterisasi molekuler bakteri endofit terbaik. Data dianalisis menggunakan rancangan acak lengkap (RAL) dengan uji Tukey pada data uji in vitro dan uji Dunnet pada data uji in vivo pada taraf 5%. Sebanyak 48 isolat bakteri endofit berhasil diisolasi dari tumbuhan L. camara. 23 isolat diantaranya tidak bersifat patogen terhadap tumbuhan dan mamalia. Berdasarkan karakterisasi fisiologi, sebanyak 12 isolat menghasilkan enzim protease, kitinase dan pelarutan fosfat dan 6 isolat diantaranya memproduksi enzim kitinase dengan indeks kitinolitik sebesar 0,33-1,16. Hasil pengujian terhadap mortalitas juvenile 2 Meloidogyne spp. 8 isolat menghasilkan persentase mortalitas sebesar 34,3-96,2%. Lima isolat terpilih dari hasil pengujian mortalitas diuji secara in vivo dan uji VOC yaitu LCA5, LCA13, LCA19, EG26 dan BAT27. Berdasarkan hasil pengujian di rumah kaca, perlakuan lima isolat potensial dapat menurunkan kerusakan akar dan telur Meloidogyne spp. pada tanaman terung. Penekanan kerusakan akar tertinggi ditunjukkan oleh isolat LCA5+LCA13. Kelima isolat yang digunakan berpengaruh nyata terhadap tinggi dan bobot basah tanaman terung. Perlakuan isolat LCA19 menunjukkan pertumbuhan yang lebih baik dibanding perlakuan isolat lain. Hasil pengujian VOC menunjukkan isolat LCA13 memilki pengaruh mortalitas tertinggi terhadap juvenil 2 Meloidogyne spp. Berdasarkan sekuens gen 16S rRNA, tiga isolat memiliki identitas berturut-turut teridentifikasi sebagai: Dyella marensis LCA5, Stenotrophomonas rhizophilla, Root-knot nematode (RKN) caused by Meloidogyne spp. is one of the important diseases of eggplant. Control of Meloidogyne spp. using synthetic nematicides is the most in demand by farmers because it is more practical and easy to obtain. The unwise use of synthetic nematicides can lead to pathogen resistance and environmental pollution. The success of endophytic bacteria in controlling soil borne diseases has been widely reported. Endophytic bacteria are bacteria that live in plant tissue that can increase the growth and health of host plants. The use of endophytic bacteria isolated from Lantana camara L. and isolates of endophytic bacteria from oil palm, areca nut, mangrove and ferns is
Keyword: volatile organic compound, 16S rRNA, homology

Judul: Eksplorasi Bakteri Endofit Asal Tanaman Lamtoro (Leucaena leucocephala L.) sebagai Agens Biokontrol Nematoda Puru Akar (Meloidogyne spp.) pada Tanaman Okra (Abelmoschus esculentus L. Moench)
Abstrak: Nematoda puru akar Meloidogyne spp. merupakan nematoda parasit penting pada okra yang menyebabkan kehilangan hasil dan kerugian secara ekonomi. Gejala yang disebabkan oleh Meloidogyne spp. yaitu tanaman kerdil, layu, daun menguning, dan akar berpuru. Meloidogyne spp. dapat berinteraksi dengan patogen lain seperti Fusarium oxysporum. Tujuan dari penelitian ini adalah mendapatkan bakteri endofit asal tanaman lamtoro yang berpotensi sebagai agen biokontrol terhadap Meloidogyne spp. dan mengetahui pengaruhnya terhadap pertumbuhan tanaman okra (Abelmoschus esculentus). Bakteri endofit diisolasi dari akar dan batang tanaman lamtoro menggunakan metode sterilisasi permukaan dengan NaOCl 1% dan alkohol 70%, kemudian dikulturkan pada media tryptose soy agar (TSA). Isolat bakteri endofit diseleksi keamanan hayatinya menggunakan uji agar darah dan uji hipersensitif. Isolat bakteri endofit terpilih dilakukan uji in vitro terhadap juvenil 2 Meloidogyne spp., cendawan Fusarium oxysporum dan diuji keefektifannya dalam penekanan puru akar pada tanaman okra di rumah kaca. Hasil penelitian diperoleh sebanyak 411 isolat bakteri endofit berhasil diisolasi dari akar dan batang tanaman lamtoro. Hasil uji keamanan hayati sebanyak 5 isolat bakteri endofit tidak berpotensi patogen terhadap mamalia maupun tumbuhan. Hasil pengujian secara in vitro terhadap juvenil 2 Meloidogyne spp. menunjukan bahwa 5 isolat bakteri endofit tersebut mampu menyebabkan mortalitas pada juvenil 2 Meloidogyne spp. berkisar antara 81.67%-98.67% dan menghambat pertumbuhan F. oxysporum berkisar antara 27.33%-45%. Perlakuan bakteri endofit mampu meningkatkan bobot tajuk tanaman okra, menekan keparahan penyakit berkisar antara 69.23%-76.92% dan menekan populasi nematoda berkisar antara 60%-71.41% pada percobaan di rumah kaca. Hasil identifikasi molekuler ke 5 isolat bakteri endofit tersebut meliputi Providencia vermicola (AD7), Providencia rettgeri (AD16 dan BGB21), Proteus vulgaris (AGB40) dan Alcaligenes faecalis (AS8), Nematodes (Meloidogyne spp.) on Okra (Abelmoschus esculentus L. Moench. Supervised by ABDUL MUNIF Root-knot nematodes (Meloidogyne spp.) is a plant parasitic nematode on Okra that causes of yield and economic losses. Symptoms caused by Meloidogyne spp. namely dwarf plants, withered, yellowed leaves, and rooted roots. Meloidogyne spp. can interact with pathogens such as Fusarium oxysporum. The objective at this research was to obtain endophytic bacteria from lamtoro plants as biocontrol agents that have the potential to control Meloidogyne spp. and to study the effects on the growth of okra plants (Abelmoschus esculentus). Endophytic bacteria were isolated from the roots and stems of the lamtoro plant using the surface sterilization method with 1% NaOCl and 70% alcohol, then cultured on tryptic soy agar (TSA) media. Endophytic bacterial isolates were selected for their biological safety using blood agar tests and hypersensitivity tests. Selected endophytic bacterial isolates were tested in vitro against juvenile 2 Meloidogyne spp., Fusarium oxysporum fungi and tested for their effectiveness in suppressing the root gall in okra plants in greenhouses. The results showed 411 endophytic bacterial isolates were successfully isolated from the roots and stems of the lamtoro plants. After biological safety test, 5 endophytic bacterial isolates were not potentially pathogenic to mammals or plants. Under in vitro showed 5 endophytic bacterial isolates were able to cause the percent mortality of juvenile 2 Meloidogyne spp. from 81.67%-98.67% and could inhibit the growth of F. oxysporum from 27.33%-45%. The treatment of endophytic bacteria was able to increase the fresh weight of
Keyword: Alcaligenes, Proteus, root gall, growth promoting, Providencia, Biocontrol Agents, Meloidogyne spp, Abelmoschus esculentus, Leucaena leucocephala, Lamtoro, okra

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: