Judul: Mempelajari aspek fisiologi dan genetika resistensi antibiotik tetrasiklin pada baakteri fotosintetik anoksigenik MB-6
Abstrak: Bakteri fotosintetik anoksigenik MB-6 yang diisolasi dari kawasan air hitam Kalimantan Tengah memiliki resistensi alami terhadap tetrasiklin (5 µg/ml), kloramfenikol (100 µg/ml), trimetoprim (100 µg/ml), ampisilin (100 µg/ml), streptomisin (50 µg/ml), dan spektinomisin (50 µg/ml), yang menunjukkan bahwa fenomena resistensi terhadap antibiotik bukanlah suatu fenomena baru, tapi hal ini sudah berlangsung di alam secara sinambung. Sifat resistensi terhadap antibiotik tetrasiklin pada bakteri ini mampu mencapai 15 µg/ml. Penambahan tetrasiklin pada beberapa tingkat konsentrasi menyebabkan meningkatnya sintesis antena pemanen cahaya I dan II, hal tersebut mengindikasikan kemungkinan meningkatnya sintesis asam 8- aminolevulinat (ALA) intrasel. Tetapi hasil asai ALA menunjukkan dengan peningkatan konsentrasi tetrasiklin di media semakin menurunkan konsentrasi ALA ekstrasel. Hal ini kemungkinan ada hubungannya dengan mekanisme resistensi terhadap antibiotik tetrasiklin pada bakteri ini. Usaha kloning molekuler belum berhasil mendapatkan gen penyandi resistensi terhadap tetrasiklin dari isolat MB-6, tapi usaha kloning ini penting untuk memanipulasi bakteri ini selanjutnya.
Keyword: Aspek fisiologis, fotosintetik anoksigenik, bakteri

Judul: Pengaruh pH media terhadap produksi asam d-aminolevulinat ekstraseluler oleh bakteri fotosintetik anoksigenik MB-6
Abstrak: Asam 8-aminolevulinat (ALA) adalah intermediat pertama dalam biosintesis senyawa tetrapirol pada semua makhluk hidup. ALA mempunyai beragam manfaat misalnya sebagai bioherbisida, pemicu pertumbuhan tanaman, insektisida dan untuk terapi kanker. Salah satu cara memproduksi ALA adalah dengan memanfaatkan bakteri fotosintetik anoksigenik. Bakteri fotosintetik anoksigenik MB-6 yang diisolasi dari kawasan air hitam Kalimantan Tengah mempunyai potensi menghasilkan ALA ekstraseluler yang relatif cukup tinggi. Pada kisaran pH media 6.8- 7.5, pertumbuhan sel dan produksi ALA oleh MB-6 meningkat dan mencapai maksimum sebesar 173.6 µM pada pH media 7.0. Pada kisaran pH yang lebih rendah, pertumbuhan sel dan produksi ALA sangat rendah. Demikian juga pada kisaran pH yang lebih tinggi, pertumbuhan sel dan produksi ALA oleh MB-6 menunjukkan penurunan. Pertumbuhan sel dan produksi ALA oleh MB-6 di dalam media limbah cair tahu yang dimodifikasi lebih rendah dibandingkan pertumbuhan dan produksi ALA yang terjadi di dalam media Sistrom. Penambahan LA sebagai inhibitor enzim ALA dehidratase ke dalam media menyebabkan pertumbuhan sel terhambat, namun dengan penambahan LA justru meningkatkan produksi ALA ekstraseluler oleh MB-6.
Keyword: ALA

Judul: The Construction of Greedy SVP LLL Algorithm
Abstrak: A lattice is a set of all integer linear combination of a set of linearly independent vectors in ℝ𝑛���. The independent vectors are called bases of lattice. Any lattice can be generated from many bases, and these bases have the same cardinality. In the lattice, the most fundamental and renowned problem is the Shortest Vector Problem (SVP). SVP is a tracking problem of the shortest nonzero vector in a lattice with equivalent bases. In two dimensions, SVP problem has resolved exactly by Gauss’ algorithm. When the lattice dimension is higher than two, A.K. Lenstra, H.W. Lenstra and L. Lovasz gave a LLL algorithm to compute approximation of nonzero shortest vector in the lattice. Reduced bases solution obtained from LLL algorithm still be an approximation and has polynomial running time of arbitrary dimension which large enough. In 1994, Schnoor and Euchner modified this LLL algorithm as a new variant which later was named deep insertion LLL algorithm. This algorithm is a modified version of the LLL algorithm to the terms of the exchange step to improve the accuracy of output of LLL reduced bases and applying it to the subset sum problem. The purpose of this research are: (1) Reconstruct the LLL algorithm and deep insertion LLL algorithm using a geometric approach. (2) Construct a greedy SVP LLL algorithm. (3) Implement the three algorithms in a symbolic programming language, and evaluate them experimentally. A bases ℬ=[𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑛���] in ℝ𝑚��� is called reduced LLL with parameter 𝛿��� if satisfies: (a) |𝜇���𝑗���𝑖���|≤12, for every integer 𝑖���,𝑗��� with 1≤𝑖���<𝑗���<𝑛���. (b)𝛿���‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���)‖2≤‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���+1)‖2, for 𝑗���=1,2,…,𝑛���−1,where 𝛿��� is a reduced parameter of real numbers with 14<𝛿���<1. The first requirement is the reduced basis 𝛿��� must “nearly orthogonal” and in its computation case, this requirement can be reached out by using the Gram-Schmidt’s orthogonalization. While the second requirement is called exchange step, or used to called as Lovasz condition. By using both of these requirements, then they establish the LLL algorithm. Then, Schnoor and Euchner modify the LLL algorithm based on the requirements of the exchange step called the deep insertion LLL algorithm, where the exchange step is based on the comparison of the projected vector in orthogonal complement [𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑘���−1]⊥ after j-th reduction. To construct greedy SVP LLL algorithm, the requirements of the exchange step is based on purely by comparing norm of lattice 𝐛���𝑗��� with norm lattice 𝐛���𝑖��� for 𝑖���=1,2,3…,𝑗���−1. The process of insertion reduced vector after the exchange step also has done greedily. Then, we calculate the number of arithmetic operation in greedy SVP LLL algorithm for further analysis. The result of our exprimentation for three algorithms on the certain matrix size shows that the running time of the three algorithms increases propotional to the size of the matrix. The result also shows that by using 𝛿���=34 for the LLL algorithm and the deep insertion LLL algorithm, and the greedy SVP LLL algorithm which is a new variant made by using no parameter of 𝛿���, outperform of the other of two previous algorithm in terms of speed with the same output.
Keyword: LLL algorithm, LLL deep insertion algorithm, greedy SVP LLL algorithm