Judul: Expression and Characterization of Lipase from Kosakonia oryzae BL11
Abstrak: Pemanfaatan enzim dalam bidang bioteknologi dan industri semakin meningkat, oleh karena itu pengkajian enzim perlu dilakukan untuk dapat digunakan dalam bidang tersebut. Salah satu enzim yang banyak digunakan dalam proses industri yaitu lipase. Lipase menempati posisi penting dan dikomersialkan karena memiliki potensi untuk diaplikasikan dalam berbagai sektor industri dan bioteknologi seperti zat aditif dalam deterjen, industri makanan, kertas, susu, bahan kimia, farmasi dan produksi biodiesel. Lipase (triacylglycerol acylhydrolases, EC 3.1.1.3) merupakan enzim yang mampu mengkatalisis hidrolisis asam lemak rantai panjang (triasilgliserol) menjadi asam lemak dan gliserol pada permukaan air dengan lemak. Enzim ini menjadi biokatalis pilihan untuk saat ini dan masa depan karena sifatnya yang unik seperti mampu beraktivitas pada rentang suhu dan pH yang beragam serta stabil dalam berbagai pelarut organik. Sifat unik lainnya yaitu dalam kondisi sedikit air, lipase mampu melakukan reaksi yang sebaliknya menyebabkan esterifikasi, alkoholisis dan asidolisis. Beberapa karakteristik tersebut memungkinkan lipase untuk diaplikasikan secara luas dalam proses industri. Permintaan terhadap lipase terus meningkat, namun harga lipase sebagai biokatalis masih belum ekonomis. Hal ini mendorong untuk melakukan eksplorasi enzim lipase yang berasal dari mikrob. Mikrob merupakan penghasil enzim lipase terbanyak. Mikrob penghasil lipase antara lain bakteri, aktinomiset, kapang dan khamir. Bakteri lipolitik dipilih karena memiliki beberapa keunggulan yaitu bersifat stabil, memiliki waktu generasi yang pendek, membutuhkan nutrisi yang sederhana, memiliki aktivitas katalitik yang beragam, dan mudah untuk dilakukan rekayasa secara genetik Lipase yang berasal dari bakteri telah banyak diteliti, termasuk lipase dari Bacillus pumilus, Anoxybacillus flavithermus HBB134 dan Burkholderia cepacia. Terdapat kendala dalam penggunaan bakteri lipolitik yaitu lipase yang dihasilkan relatif sedikit, sehingga perlu adanya pendekatan molekuler. Pendekatan molekuler dilakukan untuk meningkatkan produksi enzim ke tingkat tertinggi dengan kloning dan mengekspresikan gen lipase pada inang yang sesuai. Upaya ini dapat meningkatkan jumlah enzim yang diproduksi dalam waktu singkat dan mengurangi biaya produksi sehingga proses produksi menjadi lebih efisien. Tujuan penelitian ini ialah melakukan ekspresi dan karakterisasi gen lipase dari isolat BL11. Isolat BL11 termasuk dalam kelompok bakteri Gram negatif dan bersifat anaerob fakultatif. Bakteri ini diisolasi dari limbah kulit biji jambu mete dari perkebunan jambu mete, Desa Bone Kancitala, Kecamatan Bone, Kabupaten Muna, Provinsi Sulawesi Tenggara. Identifikasi bakteri menggunakan 16S rRNA sebagai penanda molekuler berdasarkan sekuensing parsial gen 16S rRNA, isolat BL11 berkerabat dekat dengan Kosakonia oryzae., The use of enzymes in the fields of biotechnology and industry is currently increasing, thus enzyme assessment needs to be conducted to support enzyme utilisation. Lipase occupies an important position and is commercialized because it has the potential to be applied in various industrial sectors and biotechnology such as additive compounds in detergents, industrial food, paper, milk, chemicals, pharmaceuticals, and biodiesel production. Lipase (triacylglycerol acylhydrolases, EC 3.1.1.3) is an enzyme that is able to catalyse the hydrolysis of triacylglycerol into fatty acid and glycerol at an oil-water interface, a phenomenon known as interfacial activation. This enzyme has became the alternative biocatalyst this day and in the future due to its unique properties, such as it can be active in a wide spectrum of pH and temperature, as well as considened stable in various organic solvents. Another unique characteristic of lipase is
Keyword: Escherichia coli, Characterization, Cloning, Kosakonia, Enzymes

Judul: Isolation and Cloning of Thermo-halotolerant Lipase Gene from Bacillus tequilensis isolated from Lainea Hot Spring in Southeast Sulawesi
Abstrak: Kebutuhan lipase oleh berbagai bidang industri dengan aplikasi yang beragam membuat lipase perlu diproduksi secara cepat dan banyak. Namun lipase yang diproduksi saat ini belum sepenuhnya sesuai dengan industri yang memerlukan pemrosesan dengan kondisi suhu tinggi dan pelarut organik serta interaksi ion dalam larutan seperti kadar garam atau salinitas. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi bakteri penghasil lipase termo-halotoleran dari sumber air panas, mengkloning dan mengekspresikan gen penyandi lipase serta karakterisasi biokimia lipase termo-halotoleran. Pengayaan dilakukan sebelum mengisolasi bakteri lipolitik dari habitat ekstrim seperti sumber air panas. Pengayaan dilakukan secara langsung pada habitat asli atau in situ enrichment. Bakteri lipolitik diisolasi dari sampel hasil pengayaan in situ dengan metode Spread Plate pada media Rhodamin B–Agar. Isolat bakteri lipolitik diidentifikasi berdasarkan gen 16S rRNA. Gen penyandi lipase diisolasi dengan teknik PCR menggunakan degenerate primer. Gen lipase diklon pada vektor pGEM-T Easy kemudian ditransformasi ke Escherichia coli DH5α untuk preservasi gen dan diklon pada vektor pET24a, ditransformasi ke E. coli BL21 (DE3) pLysS untuk diekspresikan. Ekspresi LipA_BTeq dilakukan 2 perlakuan yaitu mengikutsertakan sekuen signal peptida dan diekspresikan tanpa signal peptida (lipase mature). Analisis massa molekuler protein enzim lipase dilakukan dengan SDS-PAGE dan zimogram. Selain itu dilakukan analisis struktur 3D serta kekerabatan dalam Family lipase dianalisis menggunakan aplikasi MEGA XI. Karakterisasi lipase yang dilakukan adalah suhu optimum, pH optimum, stabilitas enzim terhadap salinitas (larutan NaCl), spesifisitas substrat, ketahanan terhadap pelarut organik, serta pengaruh ion logam. Tujuh belas isolat berhasil diisolasi dari sampel hasil pengayaan. Gen lipase dari 5 isolat bakteri lipolitik berhasil diklon dengan kode isolat HSAS, HSDS2, HSC3.1, HSC3.2 dan HSB3. Hasil identifikasi terhadap isolat HSAS, memiliki tingkat kemiripan 99.5% dengan Bacillus tequilensis strain A13 dengan panjang gen lipase (LipA_Bteq) 639 bp yang menyandikan 213 asam amino dengan 31 asam amino di awal sekuen merupakan sekuen signal peptida. Hasil ekspresi gen lipase menunjukkan perlakuan lipase mature memiliki aktivitas spesifik lebih tinggi (17 ± 1.12 U/mg) daripada yang memiliki signal peptida (8 ± 1.11 U/mg), sehingga lipase mature dipilih untuk dikarakterisasi. Hasil analisis SDS-PAGE dan Zimogram menunjukkan berat protein LipA_Bteq sebesar ~20 kDa. Hasil tersebut dikonfirmasi pula analisis MEGA XI yang membentuk klad dengan subfamily lipase I.4. LipA_Bteq memiliki suhu optimum 30 oC, dan memiliki rentang stabilitas suhu 30 oC - 60 oC dengan rata-rata aktivitas relatif 98 %. LipA_Bteq memiliki ketahanan terhadap konsentrasi NaCl 0.1M sampai 3M, dan memiliki aktivitas optimum pada konsentrasi NaCl 2 M. LipA_Bteq digolongkan sebagai lipase halotoleran karena membutuhkan NaCl untuk mencapai aktivitas optimum. Untuk parameter pH, LipA_Bteq memiliki aktivitas tertinggi pada pH 8. LipA_Bteq memiliki preferensi yang baik pada substrat C6 (rantai pendek). Kehadiran ion logam (Fe3+, Cu2+, Mg2+, Ca2+, Na+, dan Mn2+) dengan konsentrasi 100 mM dalam campuran reaksi mampu meningkatkan aktivitas LipA_Bteq. Disisi lain Zn2+ menurunkan aktivitas lipase sampai 83%. Penambahan pelarut organik 50% metanol, isopropanol dan etanol menurunkan aktivitas enzim, sedangkan kehadiran butanol dan n-heksan meningkatkan aktivitas enzim sebesar 12 % dan 20 % secara berurutan., The need for lipase by various industrial fields with diverse applications makes lipases need to be produced quickly and in large quantities. However, the lipases produced today are not fully suitable
Keyword: lipase bakteri, kloning gen lipase, lipase termo-halotoleran

Judul: Analisa deret waktu curah hujan di Daerah Khusus Ibukota Jakarta
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui model deret Fourier yang dominan pada harmonik tertentu, guna menjelas- kan gambaran tentang musim untuk keperiodikan curah hujan bulanan setiap tahun, disamping itu ingin diketahui juga pengaruh korelasi diri dari setiap curah hujan bulanan dan rata-rata bergeraknya sebagai usaha untuk mengetahui ke- teraturan periodik atau menghilangkan keadaan yang eratik dari curah hujan bulanan. Bahan penelitian berupa data curah hujan bulanan yang dihimpun menjadi curah hujan tahunan, dari tahun 1953 sampai tahun 1977 atau selama 25 tahun. Dalam penelitian ini diambil data dari lima stasiun penakar hujan yang data- nya paling lengkap, masing-masing stasiun Jakarta Pusat, Kemayoran, Manggarai, Ragunan dan Jatipadang. Data diperoleh dari Badan Meteorologi dan Geofisika Jakarta. Hasil penelitian menunjukkan bahwa model yang dominan sebagai gambaran musim untuk keperiodikan curah hujan bulan- an setiap tahun adalah model deret Fourier untuk harmonik pertama, dari model diperoleh sari antaranya, diperkirakan bulan Februari akan terjadi curah hujan tertinggi dan bulan Agustus sebagai bulan dimana curah hujan terendah setiap tahun. Di stasiun penakar Jakarta Pusat, Kemayoran dan Manggarai terjadi tiga bulan kering secara berturut-turut pada bulan Juli, Agustus dan September. Sedangkan bulan basah mulai bulan Januari sampai Mei dan bulan Oktober sampai bulan Desember, kecuali di stasiun penakar Kemayoran pada bulan November dan Desember. Di stasiun Ragunan dan Jatipadang diharapkan tidak akan terjadi bulan kering, sedangkan bulan basah terjadi mulai bulan Januari sampai Juni dan bulan Oktober sampai Desember. Perbedaan antara musim hujan dan kemarau lebih jelas nampak untuk daerah-daerah bagian selatan kota atau di- Ragunan dan Jatipadang, kemudian semakin berkurang untuk daerah-daerah Manggarai dan Jakarta Pusat, sedangkan di- Kemayoran perbedaan antara kedua musim paling kecil. Curah hujan pada suatu bulan tertentu ada hubungannya dengan curah hujan pada bulan berikutnya, hubungan ini semakin berkurang dengan curah hujan pada bulan berikutnya lagi, kemudian dengan curah hujan pada bulan ketiga hubungannya sudah tidak ada. Gambaran fluktuasi curah hujan bulanan memperlihatkan pola yang teratur setelah dilakukan perataan (pemulusan) terhadap rata-rata bergerak curah hujan bulanan pada periode tiga bulan.
Keyword: Rainfall, model deret Fourier, Meteorologi, Geofisika