Judul: Pendugaan Komponen Ragam Karakter Agronomi Gandum (Triticum aestivum L.) dan Identifikasi Marka Simple Sequence Repeat (SSR) Terpaut Suhu Tinggi Menggunakan Bulk Segregant Analysis (BSA).
Abstrak: Gandum (Triticum aestivum L.) memiliki peran penting dalam ketahanan pangan dunia karena secara global, spesies ini paling banyak dibudidayakan di dunia. Kebutuhan konsumsi gandum di dunia tahun 2009 sampai tahun 2012 terus meningkat. Sampai saat ini, Indonesia masih sangat tergantung dengan impor gandum. Pengembangan Gandum di Indonesia menghadapi masalah karena adanya perbedaan kondisi agroklimat seperti suhu tinggi dan curah hujan. Dengan demikian, perlu dilakukan pengembangan varietas gandum yang toleran terhadap suhu tinggi baik melalui pemuliaan konvensional atau bioteknologi seperti penanda molekuler. Penelitian ini bertujuan untuk (1) memperoleh informasi mengenai keragaman genetik gandum generasi F3 di dataran tinggi dan generasi F4 di dataran menengah berdasarkan karakter agronomi; (2) memperoleh informasi aksi gen yang mengendalikan karakter agronomi di dua generasi gandum hasil persilangan Oasis x HP1744 menggunakan metode shuttle breeding; (3) memperoleh informasi mengenai hubungan antara karakter-karakter agronomi dan kriteria seleksi pada generasi F4 di dataran menengah; (4) mengidentifikasi dan memperoleh genotipe F4 (Oasis x HP1744) yang beradaptasi dengan stres suhu tinggi; (5) memperoleh marka Simple Sequence Repeat (SSR) yang mampu mengidentifikasi genotipe yang toleransi terhadap suhu tinggi menggunakan bulk segregant analysis; (6) mengetahui hubungan genetik dan tingkat keragaman genetik gandum hasil persilangan antara Oasis x HP1744 di dataran menengah menggunakan marka Simple Sequence Repeat (SSR); (7) mengelompokkan genotipe F4 gandum di dataran menengah berdasarkan kekerabatan. Percobaan untuk mengetahui keragaman genetik dan seleksi dari generasi F3 dilakukan di Kebun Percobaan Pusat Penelitian Tanaman Hias, Cipanas, Bogor dengan ketinggian 1100 m di atas permukaan laut dari bulan April sampai Agustus 2012 dengan menggunakan rancangan perbesaran (Augmented Design). Studi mengenai kendali genetik karakter agronomi gandum menggunakan metode Shuttle Breeding dilakukan di dua lokasi, di Kebun Percobaan Pusat Penelitian Tanaman Hias, Cipanas Bogor pada bulan April 2012 sampai Agustus 2012 dan di dataran menengah di lahan pertanian di Cisarua, Bogor dengan ketinggian 600 m di atas permukaan laut pada bulan Februari sampai Mei 2013. Rancangan penelitian yang digunakan adalah rancangan Augmented. Percobaan untuk keragaman genetik dari generasi F4 dilakukan di dataran menengah di Cisarua, Bogor dengan ketinggian ± 600 m di atas permukaan laut pada bulan Februari sampai Mei 2013. Karakter agronomi dianalisis menggunakan sidik lintas dan seleksi dilakukan untuk genotipe toleran terhadap suhu tinggi. Seleksi marka SSR terpaut suhu tinggi menggunakan bulk segregant analysis dilakukan di Laboratorium Biologi Molekuler, Departemen Agronomi dan Hortikultura, Institut Pertanian Bogor (IPB) dan di Laboratorium Biologi Molekuler, Balai Penelitian Tanaman Serealia, Maros, Sulawesi Selatan pada bulan Juli 2013 sampai Maret 2014. Hasil penelitian untuk generasi F3 menunjukkan bahwa 6 karakter agronomi yang memiliki keragaman genetik yang tinggi adalah karakter kehijauan daun bendera, jumlah anakan total, persentase floret hampa per malai, jumlah biji malai utama, bobot biji malai utama, jumlah biji per malai, bobot biji per malai, jumlah biji per tanaman dan bobot biji per tanaman. Generasi F3 yang terpilih adalah O/HP 21, O/HP 93, O/HP 82, O/HP 6, O/HP 93, O/HP 104, O/HP 22, O/HP 37, O/HP 115, dan O/HP 30, yang digunakan untuk pemilihan pada generasi F4 di lingkungan cekaman suhu tinggi. Karakter agronomi dari generasi F3 yang dikendalikan oleh banyak gen (poligenik), yaitu karakter jumlah anakan total dan jumlah
Keyword: analisis lintas, bulk segregant analysis, diferensial seleksi, index seleksi, jarak genetik, kemiripan genetik, kendali genetik, keragaman genetik, seleksi langsung, seleksi tidak langsung

Judul: ldentifikasi Segregan Transgresif Gandum (Triticum aestivum L.) Toleran Suhu Tinggi dan Berdaya Hasil Tinggi di Lingkungan Tropika.
Abstrak: Gandum merupakan tanaman subtropik yang menjadi salah satu komoditi pangan dunia. Indonesia adalah salah satu negara pengimpor gandum sehingga usaha untuk memproduksi gandum di dalam negeri perlu dilakukan. Produksi dalam negeri akan berhasil jika didukung oleh ketersediaan varietas yang adaptif untuk kondisi tropik. Pengembangan gandum di Indonesia ditujukan pada perbaikan adaptabilitas gandum terhadap suhu tinggi dan potensi hasil. Tujuan penelitian ini adalah mengidentifikasi segregan-segregan gandum yang toleran terhadap suhu tinggi dan berdaya hasil tinggi pada generasi F3 dan F4. Secara khusus penelitian ini ditujukan untuk (1) menduga nilai parameter genetik karakter hasil dan komponen hasil populasi F3 dan F4 hasil persilangan Selayar (tetua medium toleran) dan Rabe (tetua sensitif), (2) mendapatkan informasi tentang keeratan hubungan antara karakter komponen hasil dan karakter hasil, (3) memperoleh segregan yang toleran suhu tinggi dan berdaya hasil tinggi. Penelitian terdiri dari dua percobaan. Percobaan pertama adalah identifikasi segregan gandum yang memiliki sifat potensi hasil tinggi di dataran tinggi pada kondisi tropik. Materi genetik yang digunakan adalah 58 famili generasi F3 yang dipilih dari gandum generasi F2 dengan metode pedigree. Penelitian ini dilakukan di kebun percobaan Balai Penelitian Tanaman Hias, Cipanas. Percobaan kedua adalah evaluasi segregan terpilih di dataran tinggi dan menengah. Penelitian ini dilakukan di kebun percobaan Balai Penelitian Tanaman Hias, Cipanas (dataran tinggi) dan Cisarua (dataran menegah). Materi genetik yang digunakan terdiri dari 348 famili gandum generasi F4 yang dipilih dari percobaan sebelumnya. Rancangan percobaan yang digunakan pada kedua percobaan adalah rancangan perbesaran (augmented design) dengan menggunakan 6 genotipe pembanding, yaitu 2 varietas nasional (Selayar dan Dewata), 3 galur introduksi dari India (Oasis, Rabe, HP 1744), serta 1 galur introduksi dari Turki (Basribey). Analisis ragam pada penelitian pertama menunjukkan bahwa famili gandum berbeda nyata pada karakter kehijauan daun bendera, umur berbunga, umur panen, persentase floret hampa, jumlah biji per malai, bobot biji per malai, jumlah biji per rumpun, dan bobot biji per rumpun. Karakter ini dapat digunakan sebagai karakter seleksi untuk peningkatan hasil gandum pada dataran tinggi. Berdasarkan hasil seleksi yang dilakukan sebanyak 348 individu terbaik yang dipilih dari 39 famili yang akan ditanam pada musim tanam berikutnya. Seleksi ini dilakukan berdasarkan bobot biji per rumpun yang diindikasikan sebagai potensi hasil dan seleksi berdasarkan multikarakter, yaitu jumlah anakan produktif, persentase floret hampa, dan bobot biji per rumpun. Hasil sidik ragam pada dua lingkungan tropik menunjukkan bahwa keragaman gandum generasi F4 di dataran menengah lebih beragam dibandingkan di dataran tinggi. Hasil analisis ragam menunjukkan bahwa famili berbeda nyata pada karakter jumlah spikelet, umur berbunga, jumlah floret total, jumlah biji per rumpun dan bobot biji per rumpun di derah Cipanas, sedangan pada daerah Cisarua, famili berbeda nyata pada karakter umur berbunga, umur panen, periode pengisian biji, jumlah floret hampa, persentase floret hampa, jumlah biji per malai, bobot biji per malai, jumlah biji per rumpun, dan bobot biji per rumpun. Analisis korelasi pada percobaan pertama menunjukkan bahwa luas daun bendera, jumlah anakan, jumlah anakan produktif, jumlah floret hampa, persentase floret hampa, jumlah biji per malai dan jumlah biji per rumpun berkorelasi positif dengan bobot biji per rumpun. Percobaan kedua menunjukkan karakter jumlah anakan produktif, jumlah biji per malai, bobot
Keyword: gandum, heritabilitas, seleksi, suhu tinggi

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: