Judul: Analisis Fertilitas dan Kualitas Genetik Banteng Jawa (Bos javanicus) di Taman Safari Indonesia Bogor
Abstrak: Pemerintah Indonesia telah menyusun strategi dan rencana aksi konservasi (SRAK) banteng (Bos javanicus) yang termuat dalam PerMenHut No. P.58/MENHUT-II/2011. Strategi dan rencana aksi konservasi ini disusun demi mencegah kepunahan salah satu spesies terancam punah berdasarkan P.106/MENLHK/SETJEN/KUM.1/12/2018, sekaligus satwa prioritas tersebut. Kawasan konservasi ex situ seperti Taman Safari Indonesia menjadi bagian yang penting untuk mencapai target populasi internasional tanpa mengganggu populasi di alam. Pertukaran spesies banteng antar lembaga konservasi selain itu, diperlukan untuk menghindari penurunan kualitas genetik maupun inbreeding. Inbreeding dapat berdampak pada penurunan kemampuan reproduksi dan keragaman genetik pada suatu populasi. Rangkaian strategi rencana aksi konservasi (SRAK) tersebut dapat disarikan menjadi dua pokok pikiran utama, yakni pentingnya peningkatan reproduksi dan kualitas genetik. Hal ini juga tertuang dalam Action Indonesia Genetic Specialist Management Plan bertujuan untuk mencapai populasi ex situ yang sehat. Lembaga-lembaga konservasi ex situ diintegrasikan untuk pelaksanaan perkembangbiakan (breeding program) dan rekomendasi transfer satwa dalam rancangan tersebut. Pengembangan teknologi reproduksi berbantuan, khususnya melalui kriopreservasi semen, merupakan metode efektif yang dapat menjadi perwujudan SRAK banteng. Penggunaan semen beku hasil proses kriopreservasi semen memungkinkan transportasi materi genetik jantan banteng jawa dari satu lokasi ke lokasi lain secara efisien. Pemetaan kualitas genetik dari populasi yang ada di dalam suatu lokasi penangkaran juga menjadi hal yang perlu diperhatikan. Hal ini berfungsi sebagai salah satu pencegahan terjadinya penggunaan semen beku untuk perkawinan dengan kekerabatan dekat. Penelitian ini bertujuan untuk mengkaji fertilitas banteng jawa, khususnya banteng jawa jantan sebagai langkah awal pengembangan teknologi reproduksi spesies tersebut. Penelitian ini juga mengevaluasi kualitas genetik banteng jawa yang ada di suatu populasi di lokasi konservasi ex situ, khususnya di Taman Safari Indonesia Bogor (TSI Bogor). Penelitian ini terdiri atas beberapa tahap yang meliputi analisis fertilitas yang dilaksanakan dengan: (i) habituasi dan koleksi semen dan evaluasi semen segar, (ii) kriopreservasi semen dalam kondisi lapang dan evaluasi semen beku (iii) karakterisasi protein kandidat fertilitas, (iv) identifikasi ekspresi gen kandidat fertilitas. Tahapan lain yakni (v) karakterisasi kualitas genetik berdasarkan marka mikrosatelit. Sampel yang digunakan untuk tahapan (i) – (iv) berasal dari tiga ekor banteng jawa jantan yang berada di TSI Bogor. Sampel yang digunakan untuk tahapan (vi) berasal dari enam ekor banteng jawa yang terdiri atas empat ekor jantan dan dua ekor betina yang terdapat di TSI Bogor. Habituasi untuk koleksi semen dengan vagina buatan dan masase transrektal berhasil dilakukan pada penelitian ini dengan pendekatan positive reinforcement. Luaran dari proses habituasi berbeda-beda pada setiap individu, di mana hal ini menjadi dasar untuk metode koleksi semen yang dipilih. Evaluasi kualitas semen segar yang dikoleksi dari tiga ekor banteng jawa pada penelitian ini menunjukkan keragaman kualitas antar-individu. Volume semen, gerakan massa, dan motilitas spermatozoa yang dikoleksi menunjukkan perbedaan signifikan pada metode koleksi yang berbeda. Gambaran ultrasonografi glandula aksesoria jantan, dan komposisi plasma semen juga dilaporkan dalam penelitian ini, dan menjadi laporan pertama pada banteng jawa. Perbedaan signifikan kadar testosteron, dan enzim alkalin fosfatase (ALP) antarindividu juga teramati pada penelitian ini. Penelitian ini juga melaporkan potensi kriopreservasi semen banteng jawa dalam kondisi lapang. Kualitas spermatozoa post-thawing banteng jawa menunjukkan perbedaan signifikan pada seluruh variabel yang diujikan. Hasil menarik ditemukan pada variabel tudung akrosom utuh yang relatif
Keyword: Javan banteng, fertility, microsatellite, semen, banteng jawa, fertilitas, mikrosatelit

Judul: Karakteristik Spermatozoa Banteng Jawa (Bos javanicus) Asal Epididimis dan Ejakulat
Abstrak: Banteng (Bos javanicus d’Alton 1832) adalah satwa liar yang dilindungi di Indonesia. Banteng masuk dalam daftar International Union for Conservation of Nature (IUCN) Red List dengan status terancam punah (endangered). Pelestarian satwa liar yang dilindungi di Indonesia salah satunya adalah melalui upaya pelestarian di lembaga konservasi eksitu yakni Taman Safari. Kunci penting suatu lembaga konservasi adalah mengembangbiakkan atau melakukan usaha reproduksi satwa yang dipelihara. Banteng jantan di beberapa lokasi konservasi sangat sedikit dibandingkan dengan betina, sehingga menyebabkan tingginya kejadian inbreeding. Kualitas jantan, termasuk kualitas semen, merupakan salah satu satu faktor keberhasilan reproduksi. Morfologi dan morfometri spermatozoa merupakan salah satu parameter kualitas semen yang penting. Aspek tetrsebut telah dikaji dari berbagai spesies, dan menunjukkan keragaman antarspesies. Morfologi dan morfometri spermatozoa juga berdampak pada beberapa hal seperti kemampuan untuk dibekukan (freezability) dan ketahanan individu terhadap suhu tinggi. Analisis morfometri spermatozoa juga telah dikaitkan dengan fertilitas, inbreeding dan studi filogenetik. Berbagai teknik pewarnaan dan pemeriksaan telah digunakan untuk pemeriksaan morfologi dan morfometri spermatozoa. Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari karakteristik morfologi dan morfometri spermatozoa asal epididimis dan ejakulat, serta mengkaji penggunaan masase transrektal sebagai metode koleksi ejakulat banteng. Hewan sampel berasal dari Taman Safari Indonesia, Cisarua, Bogor. Spermatozoa asal epididimis diperoleh dari banteng yang mati secara alami, sedangkan spermatozoa asal ejakulat berasal dari satu ekor banteng berumur ± 2.4 tahun. Koleksi spermatozoa asal ejakulat dilakukan dengan metode masase transrektal (M) dan kombinasi dengan vagina buatan (MVB) dengan interval satu minggu sekali. Sampel spermatozoa dibuat preparat ulas dan diberi pewarnaan Williams, kemudian dilakukan pengamatan morfologi dan morfometri spermatozoa. Spermatozoa banteng asal epididimis telah berhasil dikoleksi dalam penelitian ini. Spermatozoa asal ejakulat juga berhasil dikoleksi dengan metode masase transrektal (M) maupun metode kombinasi masase transrektal dengan vagina buatan (MVB) dengan lama habituasi sekitar 5 bulan. Metode MVB dapat dijadikan alternatif koleksi semen banteng apabila tidak tersedia betina maupun dummy. Total spermatozoa normal asal epididimis banteng mencapai 72.05±5.11%, sedangkan asal ejakulat dengan metode M dan MVB secara berturut-turut adalah 54.30±1.74% dan 57.45±3.87%. Berbagai jenis abnormalitas kepala, ekor spermatozoa serta teratoid form teramati pada spermatozoa asal epididimis maupun ejakulat. Rentang panjang, lebar, luas kepala, serta panjang ekor spermatozoa banteng berdasarkan penelitian ini secara berturut-turut adalah 9.88±0.01-9.88±0.02 μm, 4.91±0.00-4.94±0.01 μm, 38.12±0.05-38.35±0.11 μm2 dan 60.24±0.06-60.48±0.03 μm.
Keyword: banteng, epididimis, ejakulat, morfologi, morfometri, spermatozoa

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: