Judul: In Silico Identification of Bay Leaf (Syzygium polyanthum Wight.) Metabolites As EGFR-Tyrosine Kinase Inhibitor
Abstrak: Syzygium polyanthum Wight. merupakan salah satu tanaman herbal yang telah diketahui memiliki berbagai aktivitas farmakologi termasuk potensi antikanker. Epidermal Growth Factor Receptor-Tyrosine Kinase (EGFR-TK) merupakan sasaran terapi yg menarik karena seringkali terlibat dalam banyak kanker. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi senyawa aktif pada S. polyanthum Wight. yang mempunyai aktivitas penghambatan EGFR-TK dan memprediksi mekanismenya secara in silico. Piranti lunak PLANTS digunakan untuk penambatan molekuler dalam rangka penapisan virtual, dan interaksi ligan secara bersama-sama (combined docking) yang sebelumnya dilakukan penentuan grid box. Untuk analisis interaksi ligan-reseptor dan visualisasi menggunakan Pymol, Ligplot+ dan YASARA. Sebanyak 238 senyawa metabolit dalam daun S. polyanthum Wight. dihasilkan dari studi literatur. Struktur 3 dimensi EGFR-TK (kode:1M17) diunduh dari PDB dengan ligan alami 4-anilinakuinazolina sebagai ko-kristal. Proses validasi reseptor menghasilkan rerata RMSD 1,70 Å yang artinya proses penambatan dapat dianggap valid. Hasil penambatan molekuler diperoleh 5 senyawa terbaik dengan skor penambatan sebagai berikut 1-heptatriakotanol (-108,97), Z-heptatriakonten-2-on (-106,50), 2,6,10,15,19,23-heksametil-1,6,10,14,18,22-tetrakosaheksaen-3-ol (-99,05), hentriakontana (-97,22), dan skualena (-95,78). Sebagai pembanding, 4-anilinokuinazolina dan Gefitinib (inhibitor tirosin kinase komersial) berturut-turut memiliki nilai skor penambatan -97,45 dan -97,97. Dengan demikian kelima senyawa tersebut relatif jauh lebih berpotensi daripada inhibitor komersial yang ada. Hasil analisis penambatan kombinasi menghasilkan nilai skor penambatan sebesar -116,3. Hal ini menunjukkan bahwa kombinasi 5 senyawa terbaik Syzygium polyanthum Wight. tersebut jauh lebih baik dibandingkan dengan senyawa tunggalnya. Dari lima senyawa terbaik 2,6,10,15,19,23-heksametil-1,6,10,14,18,22-tetrakosaheksaen-3-ol, hentriakontana, dan skualena memenuhi tiga dari empat aturan Lipinski sehingga dianggap mirip dengan senyawa obat. Dari prediksi Absorpsi, Distribusi, Metabolisme, Toksisitas (ADMET), beraneka senyawa potensial ini mampu terabsorpsi dan diekskresikan dengan baik serta relatif tidak toksik. 1-heptatriakotanol dan Z-heptatriakonten-2-on memiliki bioavalabilitas cukup rendah. Meskipun demikian senyawa terbaik dalam S. polyanthum Wight. itu memiliki atom dan gugus ciri senyawa obat (pharmacophore) yang terkonfirmasi dari potensi penghambatan EGFR-TK yang sangat baik secara in silico sehingga dapat dikembangkan menjadi senyawa obat.
Keyword: inhibitor EGFR-Tirosin Kinase, kanker, penambatan molekuler, Syzygium polyanthum Wight

Judul: Metabolomic Approach to Identify Anticancer Bioactive Compounds in Indonesian Medicinal Plants
Abstrak: Senyawa antikanker dari produk herbal terus diteliti untuk meningkatkan potensi kekayaan alam Indonesia. Namun, sejauh ini pencarian senyawa aktif dengan metode bioassay-directed fractionation and isolation (BDFI) terkendala oleh proses yang panjang dan terkadang senyawa isolatnya memiliki aktivitas yang lebih rendah daripada ekstraknya. Pendekatan metabolomik menjadi metode alternatif karena waktu analisis yang relatif lebih singkat. Selama ini, penelitian hanya terbatas menduga keberadaan senyawa aktif pada suatu ekstrak tertentu (berdasarkan pustaka memiliki aktivitas antikanker) tanpa pembuktian aktivitas. Fokus penelitian ini adalah mengkaji penggunaan pendekatan metabolomik untuk menemukan senyawa aktif antikanker dari tumbuhan obat Indonesia dan mengevaluasi hasil prediksi senyawa tersebut. Penelitian ini dibagi dalam tiga tahap kegiatan, yaitu (1) pemilihan tumbuhan obat berpotensi antikanker, (2) pemprofilan metabolit dan identifikasi senyawa aktif antikanker dengan pendekatan metabolomik, dan (3) evaluasi senyawa target antikanker. Dalam tahap pemilihan senyawa target, aktivitas antikanker ekstrak daun sirsak (Annona muricata), sambung nyawa (Gynura procumbens), keladi tikus (Typhonium flagelliforme), dan tapak dara (Catharanthus roseus) diuji pada sel MCF7. Ekstrak daun sirsak menunjukkan potensi tertinggi dengan nilai IC50 24,45 µg/mL dan 32,44 µg/mL pada ekstrak etanol p.a. dan 80%, dilanjutkan dengan tapak dara (78,41 µg/mL), sambung nyawa (86 µg/mL), dan keladi tikus (616,79 µg/mL). Sementara untuk aktivitas antioksidan dengan metode DPPH, urutannya ialah daun sambung nyawa (144,68 µg/mL) yang lebih berpotensi, diikuti tapak dara (327,46 µg/mL), sirsak (474,63 µg/mL), dan keladi tikus (693,48 µg/mL). Berdasarkan hasil ini, analisis pada sampel daun sirsak dilanjutkan dengan pendekatan metabolomik karena berpotensi sebagai antikanker tertinggi dibandingkan tiga tumbuhan lainnya. Pada tahap berikutnya, komponen metabolit yang terdapat dalam ekstrak daun sirsak dengan berbagai pelarut dianalisis menggunakan kromatografi cair- spektrometri massa (LC-HRMS) dengan pendekatan metabolomik taktertarget. Tiga puluh lima metabolit telah berhasil diidentifikasi secara putatif dalam ekstrak, yang diketahui berasal dari golongan senyawa alkaloid, flavonoid, dan asetogenin. Aktivitas antikanker terhadap sel kanker payudara MCF7 dari ekstrak etanol p.a. menunjukkan aktivitas tertinggi dengan nilai IC50 22,86 µg/mL, diikuti oleh ekstrak etanol 50% (97,52 µg/mL), etanol 80% (154,92 µg/mL), air (363,41 µg/mL), dan etanol 30% (1713,47 µg/mL). Berdasarkan informasi aktivitas terhadap sel kanker tersebut dan metabolit dalam ekstrak, disiapkan model untuk mendapat informasi senyawa target antikanker. Senyawa aktif dicari dengan pendekatan metabolomik menggunakan informasi kandungan senyawa sebagai prediktor dan aktivitas antikanker sebagai respons. Teknik multivariat orthogonal partial least square discriminant analysis (OPLS-DA) memperlihatkan bahwa tiga metabolit, yaitu annoretikuin, skuadiolin C, dan xilopina, serta enam metabolit (golongan asetogenin) yang belum berhasil teridentifikasi, diduga sebagai senyawa bioaktif antikanker dari daun sirsak. Hasil ini membuktikan bahwa metabolomik yang taktertarget dapat mengidentifikasi senyawa antikanker pada daun sirsak. Penelitian tahap tiga difokuskan pada evaluasi senyawa target secara in silico dan in vitro. Evaluasi secara in silico membuktikan bahwa ada interaksi yang kuat antara struktur senyawa target dan makromolekul protein 3ERT dari sel kanker. Nilai afinitas pengikatan senyawa annoretikuin, skuadiolin C, dan xilopina mendekati doksorubisin, yakni obat antikanker komersial. Evaluasi lebih lanjut dilakukan dengan fraksionasi dari ekstrak daun sirsak dan analisis target senyawa aktif. Evaluasi secara in vitro terhadap enam fraksi menunjukkan peningkatan persentase penghambatan sel kanker (80─96%) lebih tinggi daripada hasil ekstrak etanol (73%). Hasil ini mempertegas bahwa senyawa dugaan dari pendekatan metabolomik dapat digunakan untuk
Keyword: Annona muricata, antikanker, LC-HRMS, metabolomik, tumbuhan obat Indonesia, Annona muricata, anticancer, Indonesian medicinal plants, LC-HRMS, metabolomics

Judul: Performa Kuda Delman sebagai Alat Transportasi di Kota Bogor.
Abstrak: Kuda (Equus caballus) merupakan salah satu ternak yang sejak lama sudah memiliki hubungan dengan manusia. Peran kuda dalam kehidupan manusia dapat dilihat dari fungsinya sebagai mata pencaharin, alat transportasi, olahraga, dan sarana rekreasi. Delman merupakan salah satu alat transportasi tradisional di Kota Bogor yang memanfaatkan tenaga seekor kuda. Delman biasa digunakan untuk memindahkan orang dan barang dari satu tempat ke tempat lain. Kehadiran teknologi sekarang ini telah merubah peran dan fungsi delman dari alat transportasi atau pengangkutan menjadi alat untuk sarana rekreasi.
Keyword: