Judul: Pendugaan Sebaran Ikan Pelagis dengan Metode Trace Tracking di Perairan Teluk Tomini pada Bulan Oktober 2002
Abstrak: Perairan Teluk Tomini merupakan salah satu perairan laut yang memiliki potensi perikanan yang belum banyak digali. Teluk Tomini diduga menyimpan kekayaan ikan yang besar, karena merupakan teluk yang dilalui garis katulistiwa. Untuk itu perlu dibangun sistem pengelolaan dan pemanfaatan yang baik. Penelitian-penelitian dari segala aspek perlu dilakukan termasuk pendugaan sebaran ikan di Perairan Teluk Tomini. Akustik merupakan salah satu cara untuk dapat meneliti tingkah laku ikan pelagis dengan lebih mudah. Pada metode akustik, informasi tentang sebaran ikan dapat diketahui dengan dua cara yaitu dengan metode echointegrasi layer per layer dan metode trace tracking. Penelitian ini menggunakan metode trace tracking yang merupakan penelusuran echo dari individu ikan pada ping yang berurutan berupa alur pada sound beam.
Keyword: 

Judul: Pendugaan sebaran ikan pelagis dengan metode trace tracking di perairan teluk Tomini pada bulan Oktober 2002
Abstrak: Perairan Teluk Tomini merupakan salah satu perairan laut yang memiliki potensi perikanan yang belum banyak digali. Teluk Tomini diduga menyimpan kekayaan ikan yang besar karena merupakan teluk yang dilalui garis katulistiwa. Untuk itu perlu dibangun sistem pengelolaan dan pemanfaatan yang baik. Penelilitian-penelitian dari segala aspek perlu dilakukan termasuk pendugaan sebaran ikan di Perairan Teluk Tomini. Akustik merupakan salah satu cara untuk dapat meneliti tingkah laku ikan pelagis dengan lebih mudah. Pada metode akustik, informasi tentang sebaran ikan dapat diketahui dengan dua cara yaitu dengan metode echointegrasi layer per layer dan metode trace tracking. Penelitian ini menggunakan metode trace tracking yang merupakan penelusuran echo dari individu ikan pada ping yang berurutan berupa alur pada sound beam Adapun tujuan dari penelitian ini adalah untuk: (1) Menduga pola sebaran ikan pelagis yang terjadi di Perairan Teluk Tomini secara tiga dimensi menurut garis lintang dan bujur serta kedalamannya dengan menggunakan metode trace tracking, (2) Menganalisa pengaruh suhu dan salinitas terhadap sebaran ikan tersebut.. Penelitian ini dilakukan oleh tim peneliti Pusat Penelitian Oseanologi Lembaga Ilmu Pengetahuan Indonesia (P2O-LIPI) pada tanggal 5 - 8 Oktober 2002 di Teluk Tomini dengan menggunakan Kapal Riset Baruna Jaya VII. Jenis track yang digunakan pada saat penelitian dapat dikategorikan dalam arbitrary track design. Pengolahan dan analisis data dilakukan di Bogor pada bulan Mei - Juli 2004. Perolehan data akustik dilakukan dengan menggunakan SIMRAD EK-500 scientific echosounder dengan frekuensi 38 kHz. Parameter lingkungan yang diambil pada penelitian ini adalah suhu, salinitas dan densitas dengan menggunakan CTD Seabird SBE 911 plus. Data akustik diolah dengan menggunakan software EP 500, Microsoft Excel dan Statistica 6.0. Sedangkan data oseanografi diolah dengan menggunakan software Microsoft Excel. Jumlah jejak ikan tunggal yang terdeteksi di lokasi perairan dipilah berdasarkan kelompok target strength (TS) dan lapisan kedalaman dimaksudkan untuk memudahkan pembahasan informasi sebaran ikan pada lokasi pengamatan. Kedalaman deteksi ikan dibagi menjadi dua lapisan kedalaman yaitu, lapisan 0-100 m yang mewakili lapisan renang ikan pelagis kecil dan lapisan 100-300 m yang mewakili lapisan renang ikan pelagis besar...
Keyword: Ikan Pelagis

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA