arulpm/tripletsmall huggingface dataset:
Judul: Pengembangan Partisipasi Masyarakat dalam Kegiatan Rehabilitasi Hutan
Abstrak: Partisipasi masyarakat dalam kegiatan rehabilitasi hutan adalah sangat penting dalam meningkatkan kesejahteraan masyarakat sekitar hutan dan mengembalikan fungsi hutan itu sendiri.
Keyword: 

Judul: Efektivitas Program Hutan Kenlasyarakatan dalanl Meningkatkan  Kesejahteraan Masyarakat melalui Redistribusi Lahan
Abstrak: Salah satu upaya yang dilakukan Departemen Kehutanan untuk mensukseskan kegiatan rehabilitasi kawasan hutan adalah melalui program hutan kemasyarakatan (HK.m). Pada awalnya, pelaksanaan kegiatan hutan kemasyarakatan menggunakan pendekatan topdown planning, namun ternyata pendekatan tersebut memberikan hasil yang kurang memuaskan.
Keyword: 

Judul: Karakteristik Oosit Domba dari Ovarium yang Disimpan pada Suhu dan Periode Waktu yang Berbeda
Abstrak: The aim of the study was to investigate the characteristic of sheep oocytes from the ovaries that was stored on different temperature at a different period of time. Ovaries obtained from the slaughter house. The ovaries were then stored at 4 ˚C for the period of 2, 5-7 and 8-10 h, 27-28 ˚C for the 2, 5-7 and 8-10 h, and the third group was stored at 37-38 ˚C for 2, 5-7 and 8-10 h. At the end of the storage, the oocytes were collected from the ovaries using the slicing method. Collected oocytes were graded as A, B, C and D based on the layers of the cumulus cell and images of the cytoplasm. The percentage of the oocytes for grade A, B, C and D that was derived from the ovaries stored at 4 ˚C are no differ than the other group (P>0.05). The percentage of oocytes of A’s grade from the ovaries stored at the temperature of 27-28 ˚C for 2 hours were higher than the oocytes from the ovaries that were stored for 5-7 and 8-10 hours (P>0.05). Meanwhile the quantity of oocytes with the grade of B, C and D that was derived from the ovaries stored at the temperature of 27-28 ˚C did have not change compared to the other group (P>0.05). The quantity of oocytes with A’s grade that was derived from the ovaries that was kept at the temperature 37-38 ˚C for 2 hours and 5-7 hours (P<0.05) did not show any changes, however there are descending number of oocytes with the A’s grade that was derieved after 8-10 hours of storage (P<0.05). The number of oocytes with the B’s grade that was collected after 5-7 hours after storing was higher compared to those stored for 2 and 8-10 hours (P<0.05). The number of oocytes with the D’s grade is increasing parallel with the length of time for the storage at the temperature 37-38 ˚C (P<0.05). The percentage of the number of oocytes of the A and B’s grade did have not different among other group except for the group of ovaries stored at the temperature of 37-38 ˚C for 5-7 and 8-10 h. These result suggested that storing the ovaries at 27-28 ˚C and 37-38 ˚C for the duration of 5-7 hours preserve the quality of the oocytes better in compared to storing the ovaries at the temperature of 4 ˚C.
Keyword:
Judul: Analisis Peni1aian Sikap Masyarakat Terhadap Atribut-Atribut Kinerja Pelayanan Publik Pemerintah Daerah Kabupaten Lebak - Banten (Studi Kasus Kecamatan Maja dan Kecamatan Bayah).
Abstrak: Otonomi daerah (otda) adalah trend center issues yang sedang menjadi tinjauan utama ekonomi perwilayahan dalam lima tahun terakhir. Tinjauan ini menjadi sangat krusial karena sifat kekhasan sekaligus keunikan dari otonomi daerah itu sendiri yang telah diberlakukan sejak dikeluarkannya UU No. 22 tabun 1999. Seperti diketabui bersama bahwa otonomi daerah itu sendiri merupakan salah satu model kebijakan ekonomi wilayah yang mencoba merubah sistem sentralistik menjadi desentralistik. Sehingga diharapakan akan mampu menjadi stimulator dalam proses demokratisasi pada sistem pemerintahan khususnya pemerintah daerah. Walaupun dalam implementasinya masih banyak kekurangan, namun ini bisa menjadi sinyal positif atas perubahan negara pasca reformasi.
Keyword: 

Judul: Efek Pemberlakuan Otonomi Daerah terhadap Perbaikan Pelayanan Publik : Analisis Keuangan Daerah
Abstrak: Sentralisasi kekuasaan dan kewenangan selama orde baru melahirkan hubungan yang tidak sehat antara pusat dan daerah. Sehingga pada tahun 1998 terjadi pergeseran peta politik yang memberikan kesadaran pentingnya desentralisasi. Seiring bergulirnya UU No. 22 dan 25 Tahun 1999 maka pemerintah pusat telah memberikan kewenangan yang besar kepada daerah untuk mengelola sendiri daerahnya disamping itu, pemerintah daerah berhak mengalokasikan keuangan daerahnya melalui kebijakan yang dihuat oleh pemerintah daerah dan disetujui badan legislatif daerah. Untuk itu pemerintah daerah diberi tanggung jawab untuk meningkatkan keuangan daerahnya sehingga ketergantungan daerab pada pemerintah pusat dapat dikurangi. Dengan mulai diberlakukannya otonomi daerah pada tangga 1 Januari 2001 diharapkan daerah mampu meningkatkan dan menggali potensi daerahnya sendiri serta bisa meningkatkan pelayanan pada masyarakat.
Keyword: 

Judul: Optimasi Konsentrasi Xilosa dan Glukosa untuk Produksi Xilitol oleh Candida tropicalis
Abstrak: The objectives of this research were to determine the optimum time of incubation to harvest cell of Candida tropicalis and xylitol production, and optimum environtment condition to produce xylitol as well, including substrate and co-substrate concentration. In this research, were done optimization of xylose concentration 50-110 g/L and ratio of xylose and glucose between 6:1-6:4 (%). Fermentation was carried out at 300 C in 125 mL Erlenmeyer flask at 120 rpm for 48 hours. Xylitol concentration was measured by spectrophotometre method (D-sorbytol/D-xylitol kit). The research result showed that good xylose concentration to produce xylitol be in 30-70 g/L with highest product yield of xylose concentration be 30 g/L (Y product/substrate = 0.25 g/g) and the optimum ratio of xylose and glucose be 6:1 (%) which produces 4.81 g/L of xylitol, with addition of glucose was 12 g/L. The adding of glucose as co-substrate 12 – 48 g/L in the fermentation media could not increase xylitol production, but it has role to increase the cell biomass.
Keyword:
Judul: Uji keseragaman famili F8 kedelai dari persilangan kultivar slamet X wase
Abstrak: Tujuan penelitian ini adalah menguji keseragaman genetik berdasarkan produksi biji dari famili-famili kedelai generasi F8 dari persilangan kultivar Slamet dengan Wase. Famili yang diuji terdiri dari 24 famili. Kultivar Slamet digunakan sebagai pembanding Percobaan dilakukan dengan menanam kedelai dengan jarak tanam 40 x 20 cm, dengan 2 biji tiap hubang Setiap famili terdiri dari 80 biji, dan disisipi dengan kultivar Slamet. Analisis ragam produksi biji pada generasi F8 dari persilangan Slamet dengan Wase menunjukkan bahwa 22 famili telah seragam dan 2 famili belum seragam secara genetik. Dari 22 famili yang seragam terdapat satu famili yang memiliki produksi lebih tinggi daripada Slamet yakni FSW22. Galur ini dapat dijadikan sebagai galur harapan.
Keyword: 

Judul: Uji Keseragaman famili F8 kedelai dari persilangan kultivar slamet X wase
Abstrak: Tujuan penelitian ini adalah menguji keseragaman genetik berdasarkan produksi biji dari famili-famili kedelai generasi F8 dari persilangan kultivar Slamet dengan Wase. Famili yang diuji terdiri dari 24 famili. Kultivar Slamet digunakan sebagai pembanding. Percobaan dilakukan dengan menanam kedelai dengan jarak tanam 40 x 20 cm, dengan 2 biji tiap lubang. Setiap famili terdiri dari 80 biji, dan disisipi dengan kultivar Slamet. Analisis ragam produksi biji pada generasi F8 dari persilangan Slamet dengan Wase menunjukkan bahwa 22 famili telah seragam dan 2 famili belum seragam secara genetik. Dari 22 famili yang seragam terdapat satu famili yang memiliki produksi lebih tinggi daripada Slamet yakni FSW22. Galur ini dapat dijadikan sebagai galur harapan.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword:
Judul: Pengembangan dan Rencana Pengelolaan Lanskap Pantai Kota  Makassar sebagai Waterfront City
Abstrak: Kota Makassar dengan panjang pantai sekitar 36,1 km memiliki potensi yang tinggi baik di darat maupun di laut, antara lain, obyek rekreasi, hutan mangrove, kekayaan perikanan, tambak, dan terumbu karang. Akan tetapi, akibat pertumbuhan penduduk dan kebutuhan akan berbagai fasilitas kota telah menimbulkan berbagai perubahan lingkungan, seperti perubahan tata guna lahan, perubahan morfologi pantai, penurunan kualitas perairan, dan kerusakan hutan mangrove. Kawasan pantai dan laut yang merupakan sumber daya milik bersama yang dapat dimanfaatkan oleh semua orang telah menjadi “halaman belakang” tempat membuang segala macam limbah dari berbagai aktivitas manusia. Tujuan penelitian adalah 1) mengevaluasi lanskap pantai Kota Makassar berdasarkan aspek biofisik, sosial, ekonomi, keindahan, dan kenyamanan sehingga diperoleh penggunaan lahan terbaik, dan 2) menyusun rekomendasi pengembangan dan pengelolaan kawasan pantai Kota Makassar sebagai waterfront city.
Keyword: 

Judul: Rencana pengelolaan lanskap Pantai Tanjung Bayang Makassar melalui pendekatan aspek ekologi dan sosial ekonomi
Abstrak: Makassar adalah kota berciri khas pantai dengan kehidupan pesisir. Pantai di Makassar ramai dikunjungi oleh wisatawan dari dalam dan luar negeri. Salah satu pantai yang ramai dikunjungi adalah Pantai Tanjung Bayang. Sebagai tempat wisata, Pantai Tanjung Bayang merupakan tempat wisata yang murah dan pengelolaannya dikerjakan oleh masyarakat. Saat ini, Pantai Tanjung Bayang merupakan tempat wisata yang sangat ramai dikunjungi masyarakat Kota Makassar. Sehingga, aspek ekologi menjadi terabaikan di Pantai Tanjung Bayang. Berdasarkan permasalahan dan potensi tersebut, maka tujuan penelitian adalah menginventarisasi dan menganalisis aspek ekologi, sosial, ekonomi, serta mengacu pada aspek legal, yang terdapat pada lanskap pesisir Pantai Tanjung Bayang. Hasil inventarisasi dan analisis digunakan dalam menentukan rencana pengelolaan Pantai Tanjung Bayang sebagai tempat wisata yang berkelanjutan.
Keyword: 

Judul: Dynamical System of Hepatitis B in Three Groups with Vaccination
Abstrak: The aim of this study is to modify the hepatitis B transmission model in three age groups involving vaccination from the model conducted by Zhoe and Zhang.The method used is to analyze the stability of the fixed point and its basic reproduction number (R_0). Performed stability analysis and numerical simulation to see population dynamics. Next, a sensitivity analysis of the parameters was carried out to see its effect on R_0. From the analysis obtained two fixed points, namely non-endemic and endemic fixed points. Non-endemic fixed points are locally asymptotically stable if R_0 <1 Meanwhile, the endemic fixed point is locally asymptotically stable if R_0 > 1. Hepatitis vaccination affects the number of susceptible population, because the more successful the vaccination, the smaller the number of susceptible populations so that the smaller the population will be infected.
Keyword: Dynamic, Hepatitis B, Vaccine, Mathematical model
Judul: Penentuan Rute Pendistribusian Minuman Ringan Menggunakan Metode Heuristik
Abstrak: Distribution of goods is one important part in marketing activities. Therefore, it should be done effectively and efficiently. In this article, the study is focused on soft-drink distribution in order to minimize distribution cost, which includes two activities, i.e. delivery and pick-up. The methods used are nearest neighbour heuristic, petal heuristic and some other methods for route improvement. The methods for route improvement are 2-opt method, 3-opt method, restricted 2- interchange, and route merge methods. The study case results show that the more improvements are given, the better route will be obtained.
Keyword: 

Judul: Optimasi Rute Pengiriman Barang Menggunakan Metode Heuristik: Studi Kasus di JNE Express Bandar Lampung
Abstrak: Meningkatnya minat masyarakat dalam berbelanja online saat pandemi berdampak pada ketatnya persaingan jasa pengantaran barang untuk mendistribusikan barang dalam waktu singkat dan harga terjangkau, sehingga diperlukan sebuah optimasi dalam menentukan rute pengantaran barang. Dalam karya ilmiah ini optimasi rute dilakukan dengan metode heuristik yaitu pendekatan algoritma Clarke-Wright saving dalam pengelompokan rute dan penggunaan metode nearest neighbour serta aplikasi Lingo 19.0 dalam pengurutan rute. Model diimplementasikan pada pengiriman barang di JNE Express Bandar Lampung. Hasil memperlihatkan bahwa penyelesaian menggunakan Lingo 19.0 lebih optimal dalam mengurutkan rute dibandingkan dengan metode heuristik., The increasing public interest in shopping online during the pandemic has an impact on the tight competition for goods delivery services to distribute goods in a short time and at affordable prices, so optimization is needed in determining the route of delivery of goods. In this scientific paper, route optimization is carried out using a heuristic method, namely the Clarke-Wright savings algorithm approach in route grouping and the use of the nearest neighbor method as well as the Lingo 19.0 application in route sequencing. The model is implemented in the delivery of goods at JNE Express Bandar Lampung. The results show that the solution using Lingo 19.0 is more optimal in sorting routes than the heuristic method.
Keyword: Clarke-Wright savings algorithm, distribution, JNE Express, nearest  neighbor method

Judul: Embriogenesis ikan buta (Astyanax fasciatus)
Abstrak: Ikan buta Astyanax fasciatus adalah spesies ikan unik dari famili Characidae yang menempati perairan dalam gua di Wilayah La Cueva Chica-San Luis Potasi-Mexico. Ikan ini memiliki mata yang tereduksi (Blind Cavefish) dan warna kulit merah muda, pucat serta mengkilap.
Keyword:
Judul: Studi perbanyakan tanaman apel (Malus sylvestris Mill) varietas manalagi melalui teknik kultur jaringan
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan kombinasi perlakuan konsentrasi zat pengatur tumbuh BA asi (sitokinin) dan IBA (auksin) yang optimum untuk inisiasi dan prolife- rasi pucuk serta konsentrasi zat pengatur tumbuh IBA dan kepekatan media MS yang optimum untuk pengakaran pucuk ta- naman apel varietas Manalagi. Penelitian dilaksanakan da- lam tiga percobaan terpisah yaitu percobaan inisiasi, pro- liferasi dan pengakaran. Pada percobaan inisiasi konsen- trasi BA yang digunakan adalah 0.5, 1.0, 2.0 dan 3.0 mg/1 sedangkan konsentrasi IBA adalah 0.0, 0.1 dan 1.0 mg/1. Pada percobaan proliferasi konsentrasi BA yang digunakan 0.25, 0.5, 1.0 dan 2.0 mg/1 sedangkan konsentrasi IBA ada- lah 0.0, 0.05 dan 0.1 mg/1. Sedangkan pada percobaan peng- akaran kepekatan media MS yang digunakan adalah MS penuh, MS 1/2 dan MS 1/4 dengan konsentrasi IBA: 0.5, 2.0 mg/1. 1.0 dan Hasil Percobaan Inisiasi menunjukkan bahwa sampai 5 MST perlakuan IBA berpengaruh terhadap peubah persentase kultur tumbuh, persentase kultur berkalus dan jumlah daun. Persentase kultur tumbuh dan persentase kultur berkalus...
Keyword: 

Judul: Pengusahaan tanaman brokoli, selada dan parsley di PT Tjisarua Selatan Kec. Cisarua, Kab. Bogor, Jawa Barat dan KKN di Desa Cibeureum
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mencari konsentrasi zat pengatur tumbuh yang tepat dari auksin NAA dan sitokinin BAP untuk perbanyakan brokoli dalam teknik kultur jaringan dengan menggunakan pucuk kecambah sebagai bahan tanaman. Penelitian ini dilakukan di Laboratorium Kultur Jaringan Jurusan Budi. Daya Pertanian IPB mulai Pebruari 1989 hingga September 1989. Penelitian ini dibagi menjadi tiga percobaan terpisah dengan menggunakan zat pengatur tumbuh yang berbeda. Per- cobaan pertama hanya menggunakan zat pengatur tumbuh NAA dengan taraf 0.05, 0.10 dan 0.20 mg/1. Percobaan kedua menggunakan zat pengatur tumbuh BAP dengan taraf 0.25, 0.50 dan 0.75 mg/1, sedangkan percobaan ketiga merupakan percobaan faktorial dengan dua faktor yaitu NAA (0.05, 0.10 dan 0.20 mg/1) dan BAP (0.25, 0.50 dan 0.75 mg/1). Semua percobaan ini menggunakan Rancangan Acak Lengkap. Media yang digunakan adalah media Murashige dan Skoog.
Keyword: 

Judul: Metrik Einstein (Anti-) Self-Dual Berdimensi Empat dengan Metode Cartan
Abstrak: Gravitational field equation can be formulated in differential forms (differential geometry), which describes gravity as a manifestation of the curvature of space-time. Curvature of space-time is characterized by a metric that satisfies the gravitational field equation. With differential forms it can be formulated the (anti-) self-dual Einstein equation, which is a modification of the Cartan structure in (anti-) self-dual basis. Calculation of (anti-) self-dual metric with (anti-) self-dual Einstein equation is simpler than the calculation using Christoffel symbols.
Keyword:
Judul: Rancang bangun sistem informasi industri pengolahan buah tomat (Lycopersicum esculentum)
Abstrak: Berdasarkan semakin meningkatnya permintaan buah tomat di pasaran dalam maupun luar negeri, buah tomat sebagai salah satu komoditi hortikultura di Indonesia mendapatkan prioritas dalam pengembangannya. Berbagai cara untuk mempertahankan umur simpan telah dilakukan, antara lain dengan pengawetan dan pengolahan lebih lan- jut buah tomat, karena sifat buah tomat yang mudah ru- sak. Jumlah industri pengolahan buah tomat di Indonesia sampai saat ini masih sangat terbatas. Peningkatan ke- giatan industri tersebut masih dapat dilakukan dengan lebih memanfaatkan sistem informasi yang mampu menunjang industri pengolahan buah tomat. Kualitas dan kuantitas buah tomat, pengolahan lebih lanjut buah tomat pada tingkat industri dengan teknologi proses pengolahan yang tersedia serta kebutuhan dalam proses pengolahan merupa- kan kebutuhan pokok dalam pengembangan kegiatan industri pengolahan buah tomat. ...
Keyword: 

Judul: Rancang Bangun Cyber Extension Agroindustri Tomat (Solanum lycopersicon L.)
Abstrak: Tomat merupakan komoditas agroindustri yang sedang dikembangkan oleh Pemerintah Kabupaten Cianjur. Kegiatan pengembangan agroindustri tomat ini telah berjalan sejak tahun 2009 di Kecamatan Cipanas, Kabupaten Cianjur. Untuk meningkatkan peran serta masyarakat, baik yang berasal dari Kabupaten Cianjur sendiri maupun masyarakat umum dari berbagai kalangan, dibutuhkan penyampaian informasi yang terpadu, mudah diakses, serta terbarukan. Dukungan informasi juga dibutuhkan oleh pelaku agroindustri tomat itu sendiri, seperti petani tomat dan kalangan industri pengolahan tomat. Tujuan penelitian ini adalah melakukan rancang bangun cyber extension untuk komoditas tomat. Pengujian kinerja sistem dilakukan pada perusahaan hortikultura di Kabupaten Cianjur. Metode ini meliputi identifikasi masalah, analisis kebutuhan sistem, desain sistem, implementasi sistem, dan verifikasi sistem. Hasil dari penelitian cyber extension agroindustri tomat ini terdiri dari beberapa informasi seperti jenis varietas unggul tomat, produk olahan tomat, penanganan pasca panen, analisis penyimpanan dan penggudangan, penelitian tentang tomat, rekayasa proses pengolahan produk tomat. Sistem prototipe telah diimplementasikan dengan menggunakan PHP dan MySQL, kinerja sistem telah berjalan dengan baik.
Keyword: agroindustri, cyber extrension, SDLC, tomat

Judul: Metrik Einstein (Anti-) Self-Dual Berdimensi Empat dengan Metode Cartan
Abstrak: Gravitational field equation can be formulated in differential forms (differential geometry), which describes gravity as a manifestation of the curvature of space-time. Curvature of space-time is characterized by a metric that satisfies the gravitational field equation. With differential forms it can be formulated the (anti-) self-dual Einstein equation, which is a modification of the Cartan structure in (anti-) self-dual basis. Calculation of (anti-) self-dual metric with (anti-) self-dual Einstein equation is simpler than the calculation using Christoffel symbols.
Keyword:
Judul: Dinamika Modal Sosial Masyarakat Pesisir dalam Pengelolaan Sumberdaya Pesisir dan Lautan (Studi Kasus pada Desa-Desa Pesisir Kabupaten Asahan)
Abstrak: Distorsi penge1oh sumbthy8 p i s i r dan but sehm ini nxm&Sa pemerintah melakukan k d tdmdap pole pgelolaan sumhhya yang ada melalui pemMakuan UU No. 22 Tahun 1W9 tentang Pemaintah Daemh. Perubah prdgma tersebut tidak diiringi den* mmna aksi yang menyeluruh sehingga rtleuihlkan mpn yang k k d a di ten& msymkat pesisir, khususnya masymh pisir Asahart Mah satu implikasi dari p r k h n repon W u t adalah mrmcdnp perubahan p l a hub- maqadat yang m e r u m refleksi dari m u mid mayadat Peditian dilaksanakan sejak F&r& hingga Mei 2005, mmggunakan p e n d e b studi bus dengan metoda anal& deskripif kualitstif. Penguqmh data dil- dmpn wa- mendalam dan Fwus Group Diss:wsion (FW) sata penelusuran d&umen terkait.
Keyword: 

Judul: Suatu studi tentang peran "sasi laut" dalam pengelolaan dan pemanfaatan sumberdaya hayati laut terhadap masyarakat pesisir di Maluku
Abstrak: Suatu penelitian yang dimaksudkan untuk menganalisis perubahan-perubahan historis (dinamika) yang terjadi dalam praktek-praktek pelaksanaan sasi dan peraturannya selama empat dekade terakhir telah dilakukan di Desa Haya, Liang dan Taar, Propinsi Maluku. Tujuannya adalah untuk mengidentifikasi faktor-faktor yang berperan/mempengaruhi perubahan aturan pemanfaatan sumberdaya yang disasi serta melakukan evaluasi dampak perubahan tersebut dari aspek sosial, politik, ekonomi dan lingkungan
Keyword: Sasi Laut, Sumberdaya Hayati Laut, Masyarakat Pesisir

Judul: Cloning and Structure Prediction of C-Type Lectin 19 (CTL-19) from Silkworm (Bombyx mori L.)
Abstrak: Bombyx mori L. is a highly significant insect due to its silk production affects several industries. Unfortunately, B. mori farming has recently experienced mortality issues caused by pathogenic infectious diseases. Despite the extensive study of innate immunity of B. mori, information regarding the molecular functions and mode of actions of C-type lectin 19 (CTL-19) in the innate immunity of B. mori remains limited. Therefore, this study aimed to predict the structure of the B. mori CTL-19 also clone and produce the recombinant protein to better understand its role in the silkworm's innate immunity. The open reading frame (ORF) of the CTL-19 gene (945bp) was successfully amplified and cloned to pGEM®-T Easy Vector. The mature protein consists of 294 amino acids with 2 CRDs, 9 conserved cysteine, and two specific carbohydrate binding motifs. Protein threading demonstrated to be superior in order to predict the ligand binding site in comparison to homology modelling. The predicted molecular weight is 33.26 kDa, with pI value of 5.70. Furthermore, molecular docking analysis reveal that BmCTL-19 have ability to bind to various carbohydrate residues. The BmCTL-19 gene will be sub clone into an appropriate expression vector and produce purified recombinant protein to evaluate its properties.
Keyword: Innate immunity, Carbohydrate Binding Motif, Homology modelling, Protein Threading, Molecular docking