Judul: Study of Post-Thawing Sperm Characteristics and Proteome Profile of Simmental Bulls of Different Ages
Abstrak: Umur pejantan telah diyakini secara luas dapat memengaruhi tingkat fertilitas. Penuaan pada pejantan berhubungan dengan penurunan berbagai fungsi reproduksi termasuk penurunan fungsi testis. Keadaan tersebut mengakibatkan gangguan spermatogenesis dan penurunan kualitas semen. Keadaan di lapangan saat ini menunjukkan bahwa banyak pejantan berumur lebih dari sepuluh tahun yang masih digunakan untuk produksi semen beku. Selain itu, adanya fakta yang menunjukkan bahwa tingkat penolakan (rejection) semen pada pejantan sapi berumur lebih dari sepuluh tahun dalam jumlah cukup tinggi. Evaluasi kualitas semen yang secara rutin telah dilakukan sejauh ini masih belum cukup akurat untuk memprediksi fertilitas pejantan. Analisis proteomik menjadi pendekatan molekuler yang mampu mengidentifikasi fungsi penting dari protein dan peranannya untuk pengaturan berbagai proses fertilisasi. Teknik yang paling sederhana untuk memprediksi profil proteome adalah menggunakan sodium dodecyl sulphate (SDS)-Page (1D-SDSPage) dan yang terbaru yaitu liquid chromatography tandem mass spectrophotometry (LC MS/MS). Penelitian ini bertujuan untuk mengkaji pengaruh umur sapi Simental terhadap karakteristik semen dan profil proteome sperma pasca thawing. Tahapan penelitian yang dilakukan mencakup 1) kajian terhadap produktivitas pejantan dan karakteristik semen segar, 2) karakterisasi morfo-fungsional sperma pasca thawing, 3) profiling kandidat proteome sperma pasca thawing berdasarkan berat molekul protein, dan 4) identifikasi perbedaan profil proteome sperma pasca thawing pada sapi Simental berbeda umur. Sampel berupa data koleksi, data produksi dan semen beku dari 12 ekor pejantan dibagi menjadi empat kelompok umur, yaitu dua tahun, empat tahun, ≥ 10 tahun dengan rejection semen tinggi (≥ 10 HR) dan ≥ 10 tahun dengan rejection semen rendah (≥ 10 LR). Sebanyak total 1071 data produksi dan koleksi semen pada tahap pertama penelitian dilakukan analisis produktivitas pejantan dan karakteristik semen segarnya. Hasil analisis menunjukkan bahwa tingkat rejection semen pada kelompok ≥10 HR tertinggi secara signifikan (P<0,05), kemudian persentasi frekuensi ejakulasi sebanyak dua kali per koleksi terlihat paling tinggi (P<0,05) pada kelompok umur 4 tahun. Volume semen, konsentrasi dan total konsentrasi sperma terlihat meningkat secara signifikan (P<0,05) hingga umur empat tahun, kemudian menurun (P<0,05) pada kedua kelompok umur ≥ 10 tahun. Kelompok ≥ 10 HR terlihat memiliki volume semen, konsentrasi total sperma, dan motilitas sperma lebih rendah (P<0,05) dibandingkan dengan kelompok ≥ 10 LR. Penelitian tahap dua menggunakan semen beku untuk mengkarakterisasi morfo-fungsional sperma pasca thawing sapi Simental berbeda umur. Hasil penelitian menunjukkan bahwa kedua kelompok umur ≥ 10 tahun terindikasi mengalami kejadian kapasitasi dini yang ditandai dengan persentasi tingkat kapasitasi dan rekasi akrosom paling tinggi (P<0,05) dibandingkan umur empat tahun. Selain itu, kejadian tersebut juga didukung dengan adanya gerakan hiperaktif
Keyword: proteomic, bull, fresh semen, sperm post-thawing, age

Judul: Study on the Semen Characteristics of Superior Simmental Bulls Based Proteome on Quality Semen and Spermatozoa Fertility Biomarkers
Abstrak: Penilaian fertilitas calon pejantan di Indonesia berdasarkan teknik Breeding Soundness Examination (BSE). Teknik BSE mudah dilakukan, dapat diulangi dan berkorelasi dengan kesuburan pejantan. Pengujian BSE meliputi tiga bagian, yaitu pengamatan fisik (pengamatan genetalia eksternal dan internal melalui eksplorasi rektal), pengukuran lingkar skrotum, tingkah laku seksual (libido), dan analisis kualitas semen. Metode evaluasi semen merupakan metode yang paling umum digunakan untuk penilaian pejantan. Namun, penilaian fertilitas pejantan berdasarkan kualitas semen saja belum dapat menggambarkan fertilitas yang sesungguhnya. Penelitian proteomic dibutuhkan sebagai kajian dalam memprediksi fertilitas pejantan. Beberapa laporan terbaru menunjukkan efektivitas komponen protein plasma semen dapat bersifat menguntungkan atau merugikan bagi fertilitas maupun kualitas semen. Tujuan penelitian ini untuk melakukan kajian penilaian fertilitas pejantan melalui penentuan protein penanda fertilitas. Tahapan penelitian yang dilakukan mencakup: 1) karakterisasi pejantan sapi simental berdasarkan hubungan antara konsentrasi testosteron, adiponektin, dan kualitas semen; 2) profil protein plasma semen berdasarkan berat molekul dan hubungannya dengan kualitas semen segar pejantan sapi simental; 3) protein plasma semen yang berkaitan dengan fertilitas dan kualitas semen segar pejantan sapi simental. Sampel plasma semen diambil dari enam ekor sapi simental milik Balai Inseminasi Buatan (BIB) Ungaran dan enam ekor BIB Lembang dengan kisaran umur 3-8 tahun. Kedua belas ekor tersebut dibagi menjadi kelompok pejantan dengan motilitas spermatozoa ≥70% (normal fresh semen) dan motilitas spermatozoa <70% (poor fresh semen). Pengelompokan berdasarkan data sekunder dari kedua BIB tahun 2018-2019. Kelompok normal fresh semen (NFS) dari BIB Ungaran (NFSU), NFS dari BIB Lembang (NFSL), poor fresh semen (PFS) dari BIB Ungaran (PFSU) dan PFS dari Lembang (PFSL). Setiap kelompok masing-masing tiga ekor sapi. Analisis proteomic menggunakan sampel yang berasal dari BIB Lembang (NFSL dan PFSL). Hasil analisis menunjukkan adanya perbedaan signifikan (p<0,05) antara volume semen dan konsentrasi spermatozoa pada sapi NFSU, PFSU, dan NFSL dengan kelompok sapi PFSL. Sampel NFSU (6,10 ml dan 1455,02×106 /ml), PFSU (6,10 dan 1313,98×106 /ml), serta NFSL (6,73 ml dan 1301,74×106 /ml) lebih tinggi dibandingkan dengan kelompok sapi PFSL (4,37 ml dan 731,35×106 /ml). Rata-rata konsentrasi testosteron pada pejantan sapi simental NFSU, PFSU, NFSL, dan PFSL berturut-turut sebanyak 35,36 ng/ml, 30,42 ng/ml, 34,94 ng/ml, dan 33,06 ng/ml. Konsentrasi adiponektin dalam penelitian ini menunjukkan rata-rata sebesar 5,52 µg/ml (NFSU), 7,23 µg/ml (PFSU), 5,95 µg/ml (NFSL), dan 6,86 µg/ml (PFSL). Pola sekresi hormon testosteron dan adiponektin pada semua pejantan (NFSU, PFSU, NFSL, dan PFSL) tidak menunjukkan perbedaan konsentrasi yang signifikan (p<0,05). Parameter evaluasi fertilitas untuk seleksi calon pejantan sapi simental berdasarkan evaluasi semen, pengukuran testosteron, dan adiponektin belum dapat menggambarkan kapasitas fertilitas sapi pejantan yang sebenarnya, sehingga perlu ditambahkan dengan penilaian pejantan secara molekular, salah satunya melalui identifikasi protein plasma semen yang berhubungan langsung dengan fertilitas. Perkembangan penilaian fertilitas pejantan dilakukan dengan identifikasi dan karakterisasi protein penentu fertilitas spermatozoa maupun kualitas semen menggunakan metode 1D-SDS-PAGE (gel electrophoresis) berdasarkan berat molekul protein. Hasil penelitian ini menunjukkan, masing-masing ekspresi protein dengan BM 134-101 kD, 100-71 kD, dan 70 kD tidak ditemukan pada kelompok sapi dengan motilitas spermatozoa <70% (PFSU dan PFSL). Analisis protein berdasarkan BM menggunakan SDS-PAGE dapat dipertimbangkan sebagai indikator tambahan metode BSE. Konfirmasi profiling protein berdasarkan BM, masih perlu dilakukan analisis proteomics menggunakan metode
Keyword: protein, seminal plasma, fertility, semen quality, Simmental bulls

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: