Judul: Deteksi dan Identifikasi Tobacco mosaic virus pada Tanaman Pare, Oyong, dan Semangka di Jawa
Abstrak: Gejala infeksi virus yang bervariasi ditemukan pada pertanaman cucurbitaceae dengan penyebab yang belum diketahui. Oleh karena banyak virus yang menginfeksi cucurbitaceae, maka tujuan penelitian ini untuk mendeteksi dan mengidentifikasi TMV pada tanaman pare, oyong, dan semangka dengan pendekatan molekuler. Sampel bergejala diambil dari Nganjuk, Jawa Timur; Brebes dan Klaten, Jawa Tengah; serta Bogor dan Subang, Jawa Barat. Frekuensi virus ditentukan secara serologi dengan metode Dot Blot Immunobinding Assay (DIBA) menggunakan 6 antiserum. Deteksi asam nukleat dilakukan dengan teknik Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-PCR/PCR) menggunakan primer universal Tobamovirus, perunutan dan analisis DNA virus. Hasil DIBA menunjukkan frekuensi virus yang terdeteksi yaitu TMV berkisar 5.88-89.58%, PRSV berkisar 11.76-87.50%, CABYV berkisar 23.83-83.33%, CMV berkisar 8.72-88.89%, SqMV berkisar 5.88-39.69%, dan ZYMV berkisar 8.33-61.11%. RT-PCR berhasil mengamplifikasi DNA dari sampel pare asal Bogor, oyong asal Klaten, dan semangka asal Nganjuk. Homologi nukleotida dan asam amino gen Coat Protein (CP) dan parsial gen movement protein (MP) antar isolat TMV sebesar 100%. Ketiga isolat menunjukkan homologi nukleotida dan asam amino gen CP dan MP tertinggi terhadap isolat mentimun dari Brebes, isolat tomat dari Jerman, isolat tembakau dari Korea dan Amerika Serikat, isolat terong dari Afrika serta isolat kedelai dari India. Hal ini menunjukkan keberadaan TMV pada cucurbitaceae selain mentimun di Jawa.
Keyword: Labu-labuan, Indonesia, TMV, Tobamovirus

Judul: Inventarisasi dan deteksi virus penyebab penyakit mosaik pada famili Cucurbitaceae di Kotamadya Bogor, Pasir Muncang, dan Cibodas
Abstrak: Cucurbitaceae merupakan tanaman introduksi dari negara tropik dan subtropik. Seluruh bagian tanaman ini dapat dimanfaatkan dan sebagian besar memiliki nilai ekonomi yang tinggi. Kotamadya Bogor menjadi salah satu pilihan yang cocok secara geografis untuk menanam Cucurbitaceae. Tahun 2001, Kotamadya Bogor menyumbang hasil pertanian, diantaranya mentimun dan labu siam masing-masing 836 ton dan 15 ton. Tahun 2002, produksi mentimun mengalami penurunan walaupun ada peningkatan luas lahan. Kendala utama yang dapat menjadi pembatas produksi adalah adanya gangguan hama dan infeksi patogen sistemik. Virus merupakan salah satu patogen sistemik penting yang mampu menurunkan produksi tanaman hingga tidak menghasilkan sama sekali. Virus yang biasa ditemukan pada famili Cucurbitaceae diantaranya SqMV (squash mosaic comovirus), WMV-2 (watermelon mosaic potyvirus strain 2), CMV (cucumber mosaic cucumovirus), ZYMV (zucchini yellow mosaic potyvirus), TRSV (tobacco ringspot nepovirus), dan PRSV-W (watermelon of papaya ringspot potyvirus). Pengamatan dan pengambilan 20 sampel Cucurbitaceae dilakukan di Kotamadya Bogor, Pasir Muncang, dan Cibodas. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keberadaan dan persebaran virus yang menginfeksi pertanaman Cucurbitaceae di daerah tersebut, sehingga dapat mempermudah usaha pengendalian dengan mencegah persebarannya. Analisis keberadaan virus pada sampel dengan metode ELISA tidak langsung dilakukan di Laboratorium Virologi Tumbuhan, Departemen Hama dau Penyakit Tumbuhan. KP mosaik di pertanaman Cucurbitaceae di Kotamadya Bogor memiliki kejadian penyakit berkisar antara 3,7%-97% sedangkan di Pasir Muncang 1,36% dan Cibodas 4,33%. Dari 18 sampel di daerah Kotamadya Bogor, 3 sampel mentimun dan melon terinfeksi CMV, 6 sanıpel oyong dan labu siam terinfeksi ZYMV, 10 sampel mentimun, oyong, dan labu siam terinfeksi SqMV, 4 sampel oyong dari pare terinfeksi TRSV, 6 sampel labu siam, meion, pare, dan oyong terinfeksi WMV-2 dan sampel dari Cibodas tidak terdeteksi 6 virus yang diujikan, sedangkan sampel dari Pasir Muncang positif terinfeksi PRSV-W dan TRSV.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: