Judul: Study of Tolerance of Cocoa Prope legitimate Seeds Under Drought Stress
Abstrak: Kondisi kekeringan merupakan ancaman bagi budidaya tanaman kakao, karena mengakibatkan kematian benih, menurunkan produksi, meningkatkan serangan hama dan penyakit, serta degradasi lahan. Benih kakao yang toleran dibutuhkan untuk mengatasi permasalahan akibat cekaman kekeringan. Keberadaan batang bawah yang toleran kekeringan sangat bermanfaat dalam pemuliaan benih kakao, karena peranannya yang berhubungan langsung dengan kondisi defisit air pada lingkungan tumbuh tanaman. Batang bawah kakao dapat diproduksi dari perbanyakan biji propelegitim yang tersedia banyak. Benih asal biji propelegitim menjadi alternatif untuk batang bawah kakao yang toleran kekeringan. Tujuan umum penelitian adalah untuk mendapatkan genotipe benih propelegitim kakao harapan yang bersifat toleran kekeringan untuk digunakan sebagai batang bawah kakao. Tujuan khusus penelitian ini adalah untuk: (1) mengidentifikasi toleransi kekeringan benih propelegitim terhadap cekaman kekeringan, (2) mengidentifikasi karakter fisiologi dari genotipe benih propelegitem pada kondisi kekeringan, (3) mengidentifikasi toleransi biji propelegitim terhadap cekaman kekeringan, dan (4) mengidentifikasi sifat toleran kekeringam berbasis marka spesifik asal gen DREB2. Materi genetik koleksi Pusat Penelitian Kopi dan Kakao Indonesia (Puslitkoka) yang terdiri dari 13 klon kakao lindak, yaitu KW 516, KW 617, KW 641, ICCRI 03, Scavina 06, TSH 858, KEE 02, KKM 22, ICS 60, MCC 02, Sulawesi 01, Sulawesi 02, dan Sulawesi 03. Materi genetik merupakan klon-klon unggulan yang diantaranya yaitu KW 516, KW 641, Sulawesi 01, Sulawesi 03, dan KKM 22 terindikasi bersifat toleran, sedangkan ICS 60 tergolong peka. Hasil seleksi toleransi kekeringan benih yang ditumbuhkan pada media tanam berkadar lengas air 25 %, mendapatkan bobot basah akar sebagai kriteria untuk membedakan sifat toleransi kekeringan benih. Analisis indek sensitivitas kekeringan (ISK) dan penurunan relatif (PR) terhadap karakter seleksi mendapatkan 2 tipe sifat toleransi kekeringan pada genotipe benih, yaitu: (1) genotipe bersifat toleran moderat meliputi genotipe benih asal klon KKM 22, ICCRI 03, ICS 60, TSH 858, MCC 02, dan KW 641; dan (2) genotipe bersifat peka meliputi genotipe benih asal klon Scavina 06, KW 516, Sulawesi 01, KEE 02, Sulawesi 03, KW 617, dan Sulawesi 02. Hasil identifikasi terhadap kandungan air relatif, densitas stomata, dan kandungan prolin dari genotipe benih propelegitim yang mengalami cekaman kekeringan, mendapatkan; (1) cekaman kekeringan menyebabkan perubahan signifikan terhadap kandungan air relatif dan kandungan prolin, tetapi tidak mempengaruhi densitas stomata pada genotipe benih, (2) Sebagian genotipe benih bersifat toleran mengalami penurunan kandungan air relatif dan kenaikan prolin yang signifikan berbeda terhadap genotipe benih bersifat peka, sedangkanpenurunan densitas stomata antara kedua kelompok benih cenderung tidak berbeda. Evaluasi sifat toleransi kekeringan pada stadia perkecambahan dalam media yang diinduksi larutan PEG, menjadikan karakter daya berkecambah sebagai kriteria seleksi untuk menentukan toleransi kekeringan dari genotipe biji. Analisis indek senstivitas kekeringan (ISK) dan penurunan relatif (PR) karakter daya berkecambah didapatkan 6 (enam) genotipe biji bersifat toleran moderat, yaitu genotipe biji asal klon Scavina 06, KW 641, ICCRI 03, KW 617, TSH 858, dan Sulawesi 02; dan 7 (tujuh) genotipe biji bersifat peka, yaitu genotipe biji asal klon Sulawesi 03, KEE 02, KKM 22, ICS 60, MCC 02, KW 516, dan Sulawesi 01. Pendugaan sifat toleransi kekeringan klon dan genotipe benih berbasis marka gen DREB2 menunjukkan: (1) 12 klon selain TSH 858 memiliki gen DREB2 atau terindikasi bersifat toleran, (2) benih
Keyword: Seedlings, prope legitimate, cocoa, drought tolerance

Judul: Identifikasi Karakter Morfologi dan Molekuler Toleransi Kekeringan pada Tanaman Kakao (Theobroma cacao L.).
Abstrak: Cekaman kekeringan merupakan salah satu masalah dalam pertanaman maupun produksi kakao. Cekaman kekeringan dapat mengakibatkan perubahan tanaman baik dari morfologi, fisiologi, biokimia, dan molekuler. Kekeringan akan berdampak bagi pertumbuhan dan perkembangan tanaman serta ketidakseimbangan metabolisme oksidatif. Dampak cekaman kekeringan pada tanaman kakao dapat diatasi dengan menggunakan klon unggul atau hibrida unggul yang memiliki toreransi terhadap cekaman kekeringan. Studi pewarisan terhadap toleransi cekaman kekeringan pada tanaman kakao masih terbatas. Penelitian mengenai studi pewarisan toleransi terhadap cekaman kekeringan pada tanaman kakao perlu dilakukan untuk mendapatkan genotipe hibrida kakao toleran cekaman kekeringan. Penelitian ini juga dilakukan untuk mengetahui karakter morfologi yang dapat digunakan untuk seleksi. Pendekatan molekuler dengan gen APX digunakan untuk mengkonfirmasi karakter toleransi terhadap cekaman kekeringan pada tanaman kakao. Berdasarkan hasil penelitian, tanaman pada kondisi tercekam menunjukkan pertumbuhan dan perkembangan yang lebih lambat dibandingkan dengan tanaman dalam kondisi normal. Karakter yang berkaitan dengan sistem perakaran berkaitan dengan respon tanaman terhadap cekaman kekeringan. Berdasarkan hasil analisis ragam menggunakan desai persilangan NC II (North Carolina II), karakter terkait cekaman kekeringan dikendalikan oleh aksi gen aditif. Pola dominan berpengaruh terhadap karakter bobot basah akar dan rasio akar/tajuk. Genotipe persilangan Sulawesi 3 x ICCRI 09 menunjukkan nilai DGK (daya gabung khusus) terbaik pada karakter diameter batang, bobot basah akar, dan bobot kering tajuk. Hasil analisis sekuen DNA gen APX, gen APX teramati merupakan gen APX sitosolik. Dengan basa nukleotida yang dapat membedakan tetua toleran T (timin) dan rentan A (adenin). Asam amino yang dihasilkan pada tetua toleran F (phenylalanine) dan pada tetua rentan I (isoleucine).
Keyword: ekaman kekeringan, DGK, NC II, pola pewarisan, DGU, gen APX

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: