Judul: Analisis Ekspresi Gen Hd3a pada Tanaman Kentang (Solanum tuberosum L.) Kultivar Jala Ipam Transgenik
Abstrak: Kentang (Solanum tuberosum L.) adalah tanaman pangan dari kelompok umbi-umbian yang memiliki peran penting dalam ketahanan pangan dunia setelah gandum, jagung, dan padi. Pasokan bahan baku untuk industri pengolahan kentang di Indonesia hampir seluruhnya diperoleh melalui impor karena produksi kentang dalam negeri tidak sesuai kriteria ataupun belum mencukupi permintaan industri. Salah satu upaya pengembangan kultivar unggul yang memiliki produksi dan kualitas yang tinggi dapat dilakukan melalui rekayasa genetik. Protein Hd3a memiliki kemiripan dengan protein StSP6A yaitu sinyal yang menginduksi pengumbian kentang sehingga gen Hd3a memiliki peluang dalam pengembangan produksi kentang. Gen Hd3a di bawah kendali ekspresi promoter 35S CaMV telah ditransformasikan ke dalam genom kentang kultivar Jala Ipam. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis integrasi dan ekspresi gen Hd3a pada kentang kultivar Jala Ipam transgenik (klon JHS1, JHS2, JHS3) dengan tanaman Jala Ipam non-transgenik (JNT) sebagai kontrol. Bahan yang digunakan adalah tanaman generasi G1 yang ditumbuhkan dari umbi G0. Analisis integrasi transgen menggunakan teknik PCR dengan pasangan primer spesifik, sedangkan analisis ekspresi gen Hd3a menggunakan teknik Real-Time Quantitative PCR (qPCR) dengan metode kuantifikasi relatif. Analisis potensi produksi umbi dilakukan berdasarkan penanaman di lapangan menggunakan rancangan acak kelompok lengkap dengan 3 ulangan. Analisis integrasi menunjukkan bahwa gen Hd3a tetap stabil terintegrasi dalam genom kentang Jala Ipam transgenik generasi G1. Semua klon transgenik mengekspresikan gen Hd3a dengan tingkat yang berbeda. Ekspresi paling tinggi terdapat pada klon JHS1 yaitu 9.9 kali terhadap JNT kemudian diikuti oleh klon JHS2 dan JHS3 di bawahnya. Peningkatan ekspresi gen Hd3a berpengaruh signifikan terhadap peningkatan produksi bobot basah umbi per tanaman, tetapi tidak berpengaruh terhadap jumlah umbi per tanaman. Klon JHS1 memiliki bobot umbi paling tinggi dengan kenaikan 1.5 kali dari bobot JNT dan berbeda nyata terhadap bobot umbi klon JSH2 dan JHS3. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa ekspresi gen Hd3a berkorelasi terhadap peningkatan produksi bobot umbi per tanaman, sehingga gen Hd3a memiliki potensi dimanfaatkan untuk pengembangan produksi umbi kentang. Kata kunci: ekspresi relatif, florigen, kentang transgenik, produksi umbiKentang (Solanum tuberosum L.) adalah tanaman pangan dari kelompok umbi-umbian yang memiliki peran penting dalam ketahanan pangan dunia setelah gandum, jagung, dan padi. Pasokan bahan baku untuk industri pengolahan kentang di Indonesia hampir seluruhnya diperoleh melalui impor karena produksi kentang dalam negeri tidak sesuai kriteria ataupun belum mencukupi permintaan industri. Salah satu upaya pengembangan kultivar unggul yang memiliki produksi dan kualitas yang tinggi dapat dilakukan melalui rekayasa genetik. Protein Hd3a memiliki kemiripan dengan protein StSP6A yaitu sinyal yang menginduksi pengumbian kentang sehingga gen Hd3a memiliki peluang dalam pengembangan produksi kentang. Gen Hd3a di bawah kendali ekspresi promoter 35S CaMV telah ditransformasikan ke dalam genom kentang kultivar Jala Ipam. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis integrasi dan ekspresi gen Hd3a pada kentang kultivar Jala Ipam transgenik (klon JHS1, JHS2, JHS3) dengan tanaman Jala Ipam non-transgenik (JNT) sebagai kontrol. Bahan yang digunakan adalah tanaman generasi G1 yang ditumbuhkan dari umbi G0. Analisis integrasi transgen menggunakan teknik PCR dengan pasangan primer spesifik, sedangkan analisis ekspresi gen Hd3a menggunakan teknik Real-Time Quantitative PCR (qPCR) dengan metode kuantifikasi relatif. Analisis potensi produksi umbi dilakukan berdasarkan penanaman di lapangan menggunakan rancangan acak kelompok lengkap dengan 3 ulangan. Analisis integrasi menunjukkan
Keyword: ekspresi relatif, florigen, kentang transgenik, produksi umbi

Judul: . Transformasi Genetik Tanaman Kentang (Solanum Tuberosum L.) Kultivar Jala Ipam Dengan Gen Hd3a.
Abstrak: Kentang merupakan salah satu bahan pangan yang dapat dimanfaatkan sebagai pangan tanpa diproses dan pangan olahan. Kentang French fries beku merupakan kentang olahan yang sangat penting. Produksi kentang untuk French fries beku masih sedikit, sehingga peningkatan produksi bibit dan perakitan kultivar baru menjadi penting untuk dilakukan. Jala Ipam merupakan kultivar kentang yang cocok untuk produksi French fries beku. Rekayasa genetik dengan gen Hd3a dapat memperbaiki produktivitas kultivar ini. Hd3a merupakan mobile florigen pada tanaman padi yang mempunyai homologi dengan FT (flowering locus T) dari Arabidopsis. Ekspresi berlebih gen Hd3a menginduksi pembungaan dan pengumbian pada kentang cv. Andigena transgenik. Penelitian ini bertujuan untuk melakukan transformasi genetik kentang Jala Ipam dengan gen Hd3a. Transformasi genetik dilakukan dengan perantara Agrobacterium tumefaciens strain LBA4404 yang membawa plasmid p2K1-Hd3a yang mengandung gen Hd3a di bawah kendali promoter rolC dan A. tumefaciens yang membawa plasmid pCambia1300-Hd3a yang mengandung gen Hd3a di bawah kendali promoter 35S CaMV. Ruas batang (internode) digunakan sebagai eksplan yang ditransformasi. Eksplan mulai membentuk kalus 2 minggu setelah kokultivasi. Efisiensi transformasi pada penelitian ini adalah sebesar 18% untuk tanaman yang ditransformasi dengan p2K1-Hd3a dan 7% untuk tanaman yang ditransformasi dengan pC1300-Hd3a. Analisis molekuler dengan PCR dilakukan untuk mengetahui integrasi gen Hd3a di dalam tanaman transgenik. PCR dilakukan dengan menggunakan pasangan primer rolC-F dan Hd3a-FP-R untuk tanaman transgenik putatif yang dihasilkan dari transformasi menggunakan plasmid p2K1-Hd3a dan pasangan primer 35S-F dan Hd-R untuk tanaman transgenik putatif yang dihasilkan dari transformasi menggunakan plasmid pC1300-Hd3a. Analisis PCR menunjukkan bahwa dua dari tiga tanaman transgenik putatif adalah tanaman transgenik yang mengandung gen Hd3a di bawah kendali promoter rolC dan keempat tanaman transgenik putatif semuanya adalah tanaman transgenik yang mengandung gen Hd3a di bawah kendali promoter 35S CaMV. Hasil ini menunjukkan bahwa proses transformasi genetik kentang kultivar Jala Ipam dengan gen Hd3a telah berhasil dengan baik.
Keyword: Kentang kultivar Jala Ipam, gen Hd3a, Agrobacterium tumefaciens, promoter rolC, promoter 35S CaMV

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: