Judul: The Adaptation of Ecology in Butterflyfish Eyes (Chaetodontidae) and Its Respons after Cyanide Treatment
Abstrak: Simian Retrovirus tipe D eksogenus (SRV) merupakan salah satu patogen penyebab sindroma penurunan fungsi kekebalan tubuh (acquired immunodeficiency syndrome, AIDS) pada satwa primata genus Macaca asal Asia. Sekitar tahun 1980-an, isolat-isolat SRV dari Macaca hanya dilaporkan identifikasinya di beberapa pusat penelitian primata di Amerika Serikat, di luar negara asalnya dan setelah satwa-satwa tersebut dipindahkan ke lingkungan yang baru. Retrovirus endogenus dari satwa primata jenis lutung yang diidentifikasi sebagai PO-1-Lu dianggap sebagai asal muasal dari SRV. Pada penelitian ini, dilaporkan untuk pertama kalinya isolasi, perbanyakan virus serta karakterisasi molekular dari SRV yang secara alami menginfeksi satwa primata genus Macaca dari habitat alam di negara asalnya, dalam hal ini Indonesia. Sebagai tambahan, karakterisasi molekular SRV endogenus dari satwa primata lutung Indonesia juga dilakukan. Sel darah perifer berinti tunggal (peripheral blood mononuclear cells, PBMC) asal Macaca fascicularis (Mf) dan M. nemestrina (Mn) diko-kutivasi dengan sel lestari limfosit B manusia, sel Raji, perubahan kelainan sel berupa synctia dapat diamati secara mikroskopis dan diteguhkan dengan uji Immunofluorescense menggunakan antibodi spesifik SRV-2. Analisis Immunoblot terhadap isolat Mf- ET1006 yang telah dimurnikan dari supernatan biakan sel menunjukkan bahwa bagian protein inti (core) dan glikoprotein pembungkus (envelope) bereaksi dengan beberapa serum anti-SRV yang diproduksi di kelinci. Analisis urutan nukleotida dari isolat Mf pada daerah en menunjukkan tingkat homologi yang tinggi (94%) terhadap SRV-2. Sementara itu, tingkat homologi pada daerah env dari isolat Mn adalah 74% sampai dengan 77% terhadap SRV-1, SRV-2, SRV-3 dan isolat Mf, namun menunjukkan tingkat homologi yang lebih tinggi (95%) terhadap SRV PO-1-Lu. Penclitian ini menyimpulkan bahwa isolat SRV dari Mn kemungkinan berbeda dari isolat-isolat SRV lainnya yang telah dipublikasikan. Walaupun secara molekuler isolat Indo-presbytis memiliki kekerabatan dekat dengan SRV-6 namun dari hasil uji-uji lainnya belum dapat disimpulkan bahwa isolat ini termasuk kelompok retrovirus eksogen Identifikasi isolat Mn menunjukkan kemiripan yang dekat terhadap PO- 1-Lu (diisolasi dari Trachypithecus obscurus) mengindikasikan bahwa zoonoses terjadi secara aktif antar primata di Asia. Penularan silang antar-jenis di antara satwa primata dimungkinkan karena beberapa satwa menempati habitat geograpis yang sama. Penelitian ini telah dilaksanakan sejak Oktober 2003 sampai akhir Mei 2005. Topik utama penelitian ini adalah adaptasi ekologi mata ikan Kepe-kepe dan responnya terhadap racun potas. Aspek pertama meliputi struktur otak, fisiologi retina Genis, kepadatan, dan pola mosaik sel kerucut, sumbu dan ketajaman penglihatan serta kadar carotenoid dan retinol mata ikan Kepe-kepe). Aspek kedua adalah respon iris mata terhadap perlakuan racun potas yang dianalisis secara iridologi. Ikan Kepe-kepe mempunyai perbandingan berat otak per berat tubuh yakni 0,001-0,005%. Persentase tersebut relatif sama dengan ikan karang yang lainnnya (Amphiprion sp, Abudeduf saxatilis, Zanclus sp, Lutjanus sp dan Epinephelus sp ). Selanjutnya, rasio berat area otak tertentu per total berat otak menunjukkan bahwa lobus opticus dan telencephalon ikan Kepe-kepe mempunyai persentase rata-rata lebih tinggi yakni 57% dan 19%, sedangkan area lain dari otak seperti hypothalamus, cerebellum dan medulla oblongata berkisar 5 - 16%. Persentase rata-rata rasio berat lobus opticus merupakan porsi terbesar yang mencerminkan indera penglihatan merupakan indera utama ikan Kepe-kepe, yang terungkap sejak juvenil yang ditunjukkan oleh diameter lobus opticusnya lebih besar dibandingkan saat remaja. Selanjutnya, jenis sel kerucut dominan sel kerucut ganda dan
Keyword: Fisiologi retina, Hypothalamus, Cerebelum, Medulla oblongata, Analisis iriodologi, Kadar sianida

Judul: Identification and Characterization of Type D Simian Retrovirus from Macaca fascicularis, M. nemestrina and Presbytes spp. in Indonesia.
Abstrak: Simian Retrovirus tipe D eksogenus (SRV) merupakan salah satu patogen penyebab sindroma penurunan fungsi kekebalan tubuh (acquired immunodeficiency syndrome, AIDS) pada satwa primata genus Macaca asal Asia. Sekitar tahun 1980-an, isolat-isolat SRV dari Macaca hanya dilaporkan identifikasinya di beberapa pusat penelitian primata di Amerika Serikat, di luar negara asalnya dan setelah satwa-satwa tersebut dipindahkan ke lingkungan yang baru. Retrovirus endogenus dari satwa primata jenis lutung yang diidentifikasi sebagai PO-1-Lu dianggap sebagai asal muasal dari SRV. Pada penelitian ini, dilaporkan untuk pertama kalinya isolasi, perbanyakan virus serta karakterisasi molekular dari SRV yang secara alami menginfeksi satwa primata genus Macaca dari habitat alam di negara asalnya, dalam hal ini Indonesia. Sebagai tambahan, karakterisasi molekular SRV endogenus dari satwa primata lutung Indonesia juga dilakukan. Sel darah perifer berinti tunggal (peripheral blood mononuclear cells, PBMC) asal Macaca fascicularis (Mf) dan M. nemestrina (Mn) diko-kutivasi dengan sel lestari limfosit B manusia, sel Raji, perubahan kelainan sel berupa synctia dapat diamati secara mikroskopis dan diteguhkan dengan uji Immunofluorescense menggunakan antibodi spesifik SRV-2. Analisis Immunoblot terhadap isolat Mf- ET1006 yang telah dimurnikan dari supernatan biakan sel menunjukkan bahwa bagian protein inti (core) dan glikoprotein pembungkus (envelope) bereaksi dengan beberapa serum anti-SRV yang diproduksi di kelinci. Analisis urutan nukleotida dari isolat Mf pada daerah en menunjukkan tingkat homologi yang tinggi (94%) terhadap SRV-2. Sementara itu, tingkat homologi pada daerah env dari isolat Mn adalah 74% sampai dengan 77% terhadap SRV-1, SRV-2, SRV-3 dan isolat Mf, namun menunjukkan tingkat homologi yang lebih tinggi (95%) terhadap SRV PO-1-Lu. Penclitian ini menyimpulkan bahwa isolat SRV dari Mn kemungkinan berbeda dari isolat-isolat SRV lainnya yang telah dipublikasikan. Walaupun secara molekuler isolat Indo-presbytis memiliki kekerabatan dekat dengan SRV-6 namun dari hasil uji-uji lainnya belum dapat disimpulkan bahwa isolat ini termasuk kelompok retrovirus eksogen Identifikasi isolat Mn menunjukkan kemiripan yang dekat terhadap PO- 1-Lu (diisolasi dari Trachypithecus obscurus) mengindikasikan bahwa zoonoses terjadi secara aktif antar primata di Asia. Penularan silang antar-jenis di antara satwa primata dimungkinkan karena beberapa satwa menempati habitat geograpis yang sama., Simian Type D retroviruses (SRVs) are one of the causative agents of simian acquired immunodeficiency syndrome (AIDS) in Asian macaques. In the past, SRV isolates from macaques had only been identified at the US primate centers, outside the country of origin and after the animals had been introduced into a new enviroment. The endogenous Type D retrovirus of langurs (PO-1-Lu) has previously been considered a progenitor to the exogenous type D retroviruses. In this study, we reported the first isolation, cultivation and molecular characterization of the Type D Simian Retrovirus naturally infecting wild caught macaques in their natural habitats in the country of origin, in this case, Indonesia. In addition the molecular characterization of the endogenous type D retrovirus from Indonesian langurs has also been observed. When peripheral blood mononuclear cells (PBMC) from Macaca fascicularis (Mf) and M. nemestrina (Mn) were cocultured with Raji human B-cell line, syncytia were observed microscopically and confirmed by immuno- fluoresence assay using antibody to SRV-2. Immunoblot analysis of purified Mf-ET1006 from cell culture supernatans demonstrated that the viral core and envelope proteins reacted with several rabbit
Keyword: Macaca fascicularis, Isolation, isolate SRV, DNA provirus

Judul: Formulasi TSP (Traveling Salesman Problem) menggunakan ILP (Integer Linear Programming)
Abstrak: TSP is a journey of salesman f?om his origin town (place) to visit n-cities (places) only at once, then return to his origin town (place) with a minimum total distance. Its purpose is to minimize the operating expense that is released by the company. Vehicle route at TSP in the form of a Hamiltonian cycle, that is closed path containing all nodes at the graph which representing a network walk. Its problem is to determine a journey route which is feasible (possibly can be passed by) in such a way the vehicle travelled distance passed the route is minimum.
Keyword: