Judul: Analysis of Tetracycline Resistance Genes in Escherichia coli from Pig Farms, Pig Slaughter Places, and its Environment in Banten
Abstrak: Kemunculan dan penyebaran resistansi antibiotik akibat penyalahgunaan antibiotik yang berlebihan di industri peternakan telah menjadi ancaman serius bagi kesehatan masyarakat di tingkat global. Peternakan babi, tempat pemotongan babi, dan limbah yang dihasilkan dapat menjadi reservoir dan berperan penting terhadap penyebaran gen resistan antibiotik ke lingkungan sehingga berpotensi mengancam kesehatan masyarakat. Antibiotik golongan tetrasiklin merupakan salah satu antibiotik yang banyak digunakan pada peternakan babi dan masih digunakan untuk mengobati pasien di Puskesmas dan rumah sakit. Beberapa studi telah menunjukkan bahwa antibiotik golongan tetrasiklin telah resistan terhadap Escherichia coli. Sekitar 70% strain E. coli yang diisolasi dari babi di Denmark dari tahun 2004 sampai 2017 menunjukkan resistansi terhadap tetrasiklin. Escherichia coli umumnya digunakan sebagai biomarker untuk memantau resistansi antibiotik karena kemampuannya dalam mentransfer gen resistan ke bakteri lain secara horizontal melalui mobile genetic element (MGE) serta dijadikan indikator dari kualitas mikrobiologi air dan lingkungan. Provinsi Banten memiliki sejumlah peternakan babi dan tempat pemotongan babi untuk memenuhi kebutuhan daging babi di masyarakat. Saat ini, belum tersedia data komprehensif terkait E. coli yang resistan terhadap antibiotik golongan tetrasiklin secara fenotipe dan genotipe dari peternakan babi, tempat pemotongan babi, dan lingkungan di Indonesia sehingga perlu dilakukan penelitian terkait hal tersebut. Tujuan dari penelitian ini adalah: (1) mengkarakteristikkan fenotipe resistansi antibiotik golongan tetrasiklin pada E. coli yang diisolasi dari sampel peternakan babi, tempat pemotongan babi, dan lingkungan; (2) mendeteksi keberadaan, keragaman dan pola gen resistan tetrasiklin pada E. coli yang diisolasi dari sampel peternakan babi, tempat pemotongan babi, dan lingkungan; (3) menganalisis kesesuaian gen resistan tetrasiklin pada E. coli yang diisolasi dari peternakan babi, tempat pemotongan babi, dan lingkungan; (4) menganalisis kesesuaian antara hasil pengujian resistansi antibiotik golongan tetrasiklin secara fenotipe dan genotipe pada E. coli yang diisolasi dari tempat pemotongan babi dan lingkungan di Provinsi Banten. Penelitian ini menggunakan sampel yang diambil dari peternakan babi, tempat pemotongan babi, dan Sungai Cisadane yang dialiri limbah tempat pemotongan babi di Provinsi Banten. Jenis sampel yang diambil dari peternakan babi yaitu feses dan limbah cair (effluent). Jenis sampel dari tempat pemotongan babi yaitu swab lantai dan effluent. Total peternakan babi dan tempat pemotongan babi di Provinsi Banten masing-masing sebanyak 44 peternakan dan 10 tempat pemotongan babi. Pengambilan sampel pada penelitian ini dilakukan di semua peternakan babi dan tempat pemotongan babi yang ada di Provinsi Banten. Sampel feses diambil dari kumpulan feses segar dari babi pada setiap flock yang ada di peternakan babi. Sampel effluent diambil dari limbah cair yang dialirkan langsung ke lingkungan. Sampel sungai diambil pada titik yang dialiri limbah tempat pemotongan babi. Terdapat 2 titik sungai yang dialiri limbah tempat pemotongan babi yang masing-masing diambil bagian upstream dan downsream. Pengambilan sampel effluent dan air sungai mengacu pada Standar Nasional Indonesia (SNI) 6989.59-2008 tentang Metoda Pengambilan Contoh Air Limbah dan International Organization for Standardization (ISO) 19458:2006 tentang Water Quality – Sampling for Microbiological Analysis. Isolasi dan identifikasi E. coli mengacu pada Global Tricycle Surveillance Extended Spectrum Beta-Lactamase (ESBL) E. coli dari World Health Organization (WHO 2021). Uji kepekaan terhadap dua jenis antibiotik golongan tetrasiklin (tetrasiklin dan oksitetrasiklin) menggunakan metode difusi cakram (disk diffusion) Kirby-Bauer mengacu pada Clinical and Laboratory
Keyword: Escherichia coli, limbah, peternakan babi, resistansi tetrasiklin, tempat pemotongan babi

Judul: The Detection of Antibiotic Resistance of Escherichia coli from The  Pig Farm in Badung District Bali Province Through One Health Approach
Abstrak: Resistansi antimikrob atau Antimicrobial Resistance (AMR) saat ini menjadi masalah kesehatan global. Penggunaan antibiotik yang tidak tepat memicu keberadaan bakteri resistan, yang dapat menyebabkan penurunan kemampuan pengobatan antibiotik pada kejadian infeksi bakteri hingga kegagalan pengobatan. Bakteri Escherichia coli (E. coli) adalah bakteri Gram negatif yang bersifat komensal maupun patogen dan telah diketahui resistan pada beberapa jenis antibiotik. Resistansi antibiotik pada E. coli mengindikasikan adanya bakteri resistan di lingkungan dengan potensi penyebarannya. Disain penelitian ini merupakan penelitian eksploratif untuk mengidentifikasi pola resistansi dan gen penyandi resistansi antibiotik pada E. coli dari peternakan babi di Kabupaten Badung, Provinsi Bali, serta menganalisis hubungan kekerabatan bakteri E. coli resistan yang berasal dari hewan, manusia dan lingkungan. Pengambilan sampel dilakukan di 12 peternakan babi, terdiri dari 24 sampel feses babi, 24 sampel swab tangan pekerja kandang dan 12 sampel air limbah. Analisis laboratorium terdiri dari isolasi-identifikasi E. coli menggunakan media McConkey Agar dan uji biokimia IMViC, serta konfirmasi E. coli secara molekuler dengan Polymerase-Chain Reaction (PCR) deteksi gen uspA. Hasil E. coli positif selanjutnya diuji resistansi dengan metode Disk Diffusion Kirby-Bauer terhadap amoksisilin (AML), ampisilin (AMP), sefalotin (KF), seftriakson (CRO), sefotaksim (CTX), seftazidim (CAZ), siprofloksasin (CIP), kolistin sulfat (CT), eritromisin (E), streptomisin (S), tetrasiklin (TE), dan trimethoprim sulfametoksazol (SXT). Isolat E. coli resistan kemudian diuji deteksi E. coli penghasil ESBL dengan Modified Double Disk Sinergy Test (MDDST), diuji gen penyandi resistansi antibiotik dengan PCR, serta analisis kekerabatan isolat yang berasal dari hewan, manusia, dan lingkungan dengan sekuensing metode Sanger dan pohon filogenetik. Jumlah positif E. coli dari sampel feses 100% (24/24), air muara limbah 100% (12/12) dan swab tangan pekerja kandang 16,7% (4/24). Pola resistansi antibiotik menunjukkan pada semua isolat, resistansi tertinggi pada eritromisin, diikuti oleh amoksisillin dan ampisilin, tetrasiklin, streptomisin, trimethoprim sulfametoksazol Berdasarkan pola resistansi, sejumlah 14 isolat dikategorikan sebagai Multi Drug Resistance (MDR), yaitu resistan terhadap tiga atau lebih golongan antibiotik. Gen resistansi yang terdeteksi dari isolat E. coli resistan yaitu gen blaTEM, ampC, tetA, strA dan sul1, sedangkan ermB tidak terdeteksi. Escherichia coli penghasil ESBL tidak terdeteksi. Hasil analisis kekerabatan E. coli resistan asal manusia dan hewan, serta antar isolat hewan yang berasal dari peternakan yang sama memiliki memiliki hubungan kekerabatan yang dekat. Kolaborasi multisektoral yang melibatkan sektor kesehatan manusia, kesehatan hewan dan lingkungan hidup dipandang perlu dalam upaya pengendalian resistansi antibiotik secara nasional dan global., Antimicrobial resistance (AMR) is currently a global health problem. Inappropriate use of antibiotics triggers the existence of resistant bacteria, which can cause a decrease in the ability of antibiotic treatment in the event of bacterial infections and even treatment failure. Escherichia coli (E. coli) are Gram-negative bacteria which are both commensal and pathogenic, also are known to be resistant to several types of antibiotics. Antibiotic resistance in E. coli indicates the presence of resistant bacteria in the environment with the potential to spread. The design of this research was an exploratory study to identify resistance patterns and genes encoding antibiotic resistance in E. coli from the pig farms in Badung Regency, Bali Province, as well as analyzing the relationship between resistant E. coli bacteria originating from animals, human
Keyword: babi, Escherichia coli, gen resistansi, pola resistansi

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: