Judul: Autentikasi Kerupuk Udang Dengan Metode DNA Barcoding
Abstrak: Kerupuk udang merupakan makanan ringan yang berbahan dasar tepung tapioka dengan tambahan udang dan bumbu-bumbu lain. Autentikasi kerupuk udang dapat menjadi quality control yang tepat seiring dengan pemberlakuan Masyarakat Ekonomi ASEAN (MEA). Tujuan penelitian ini adalah mendesain primer spesifik untuk udang, autentikasi produk kerupuk udang, dan menentukan spesies udang yang digunakan sebagai bahan baku pada produk kerupuk udang. Primer COI yang telah didesain memiliki persentase GC 50%, suhu lebur 57 °C, dan panjang gen target 613 pb. Ekstrak DNA memiliki konsentrasi 0,3-3,9 ng/μL. Elektroforegram menunjukkan sembilan sampel berhasil teramplifikasi pada 500-750 pb. Analisis BLAST menunjukkan sampel teridentifikasi sebagai Litopenaeus vannamei, Metapenaeus ensis, Fenneropenaeus merguiensis, dan Sphyraena flavicauda dengan tingkat homologi 95% sampai 100%. Komposisi nukleotida yang didapatkan memiliki basa pirimidin yang lebih banyak dari basa purin, dengan basa terbanyak timin (33,0%) dan basa tersedikit guanin (17,8%). Analisis filogenetik menunjukkan L. vannamei memiliki kekerabatan yang lebih dekat dengan F. Merguiensis dibanding M. ensis.
Keyword: COI, jarak genetik, PCR, pohon filogeni

Judul: Deteksi Bahan Baku Ikan pada Produk Olahan Melalui Gen Penanda COI.
Abstrak: Bahan baku ikan yang terbatas dan tingginya harga bahan baku seringkali menjadi alasan terjadinya pemalsuan produk. Deteksi bahan baku ikan dapat dilakukan menggunakan metode DNA barcoding. Tujuan penelitian ini yaitu menentukan bahan baku ikan yang terkandung dalam suatu produk olahan perikanan berdasarkan urutan sekuen DNA. Isolasi DNA dilakukan sesuai protokol kit Qiagen, amplifikasi DNA menggunakan metode PCR kemudian dilakukan sekuensing. Hasil analisis profil protein sampel produk olahan menunjukan bahwa pada sampel terdapat protein Myosin Heavy Chain (MHC). Isolat DNA memiliki konsentrasi berkisar dari 2,6-106,55 ng/μg, dengan kemurnian yang berkisar 1,22-2,00. Elektroferogram menunjukan 6 dari 7 sampel produk olahan teramplifikasi pada DNA target sebesar 655 bp. Analisis BLAST menunjukkan sampel terdeteksi sebagai Thunnus albacares, Upeneus sp., Nemipterus mesoprion, dan Himantura gerrardi. Spesies Himantura gerradi termasuk spesies yang memiliki resiko kepunahan. Komposisi nukleotida yang diperoleh memiliki perbandingan basa pirimidin yang lebih besar dibanding dengan basa purin. Analisis filogeni menunjukkan sampel memiliki kekerabatan dengan spesies tersebut berdasarkan cabang pohon yang terbentuk.
Keyword: DNA barcoding, PCR, pohon filogeni

Judul: Mathematical model of Hematopoietic Stem Cell in Chronic Myelogenous Leukemia with and without Therapy
Abstrak: Leukemia or blood cancer is a diverse group of neoplastic disease, characterized by the multiplication of abnormal leukocytes or malignant transformation of blood-forming cells in bone marrow and lymphoid tissues. One of the most common types of leukemia is Chronic Myelogenous Leukemia (CML), which is usually diagnosed by the presence of certain chromosomal abnormalities, the so-called Philadelphia chromosome (Ph). One of the treatments of CML is Granulocyte Colony-Stimulating Factor (G-CSF). In this paper, we discuss two Hematopoietic Stem Cell (HSC) models, i.e. HSC without treatment and HSC with G-CSF treatment. The model of HSC without treatment included three equations representing the dynamics of HSC, leukocyte and platelet. Whereas, the model of HSC with G-CSF treatment includes the previous three equations and adds two more equations representing G-CSF injection and G-CSF circulation. The stability behavior of the system approaching the equilibrium points in the simulation study is carried out using Mathematica 7.0. The simulation results show that the G-CSF treatment can successfully decrease the number of HSC, which means reducing the CML.
Keyword: