Judul: Analisis keragaman genetik harimau Sumatera (Panthera tigris sumatrae Pocock, 1929) asal Aceh berdasarkan gen Cytochrome B
Abstrak: Harimau Sumatera (Panthera tigris sumatrae Pocock, 1929) adalah salah satu dari subspesies yang diketahui berada di Indonesia. Di Sumatra diperkirakan populasinya sekitar 400-500 ekor, sementara di Aceh terdapat 110-140 ekor. IUCN (International Union for Conservation of Nature and Natural Resources) mengkategorikan sebagai spesies yang kritis keberadaannya dan terancam punah. Tujuan dari penelitian ini adalah menganalisis keragaman genetik harimau Sumatera asal Aceh dan mengetahui kekerabatannya. Bahan yang digunakan berupa darah awetan sebagai sumber materi DNA yang merupakan koleksi dari Laboratorium Biologi Molekuler, Departemen Biologi FMIPA IPB. Hasil isolasi dan purifikasi DNA kemudian diamplifikasi dengan PCR memakai primer spesifik forward UF-06 5’-AGCAGCAGTCCACCTCCTA- TTCCTT-3’ dan reverse UF-07 5’-GCTTTGGGTGCTGATGGTGGGGCTA-3’. Produk PCR disekuensing dan dianalisis pohon filogeninya. Basa-basa nukleotida yang berbeda antara harimau Sumatera asal Aceh (A1, A2, A3, A4) dan EF551003 (Panthera tigris amoyensis) adalah 16 basa nukleleotida. Hubungan kekerabatan antara keempat harimau Aceh adalah bahwa A2 lebih dekat dengan A3 dan keduanya lebih dekat dengan A4 daripada A1. Hasil Analisis setelah memasukkan outgroup harimau Amoy (Panthera tigris amoyensis), harimau Aceh tidak berubah dan tetap dalam satu cluster. Berdasarkan hasil analisis keragaman genetik di daerah Cyt. B pada harimau Aceh A1, A2, A3, dan A4 didapatkan dua buah situs basa nukleotida spesifik yang mencirikan harimau Sumatera, yaitu basa nukleotida ke 108 (Guanin) dan basa nukleotida ke 121 (Timin).
Keyword: Genetic diversity, Panthera tigris balica, Deoxyribonucleic Acid

Judul: Metode Non-invasif untuk Menentukan Pedigri Harimau Sumatera (Panthera tigris sumatrae) berdasarkan Penanda D-loop dan Mikrosatelit
Abstrak: Harimau sumatera (Panthera tigris sumatrae) merupakan subspesies harimau asal Indonesia yang masih bertahan hidup, dan termasuk hewan langka yang terancam punah. Hasil analisis karakteristik genetiknya dapat digunakan untuk merancang program guna mencegah kepunahan. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis pedigri pada harimau sumatera berdasarkan karakteristik genetik dengan menggunakan penanda genetik D-loop bagian HVS-I dan mikrosatelit. DNA diekstraksi dari rambut harimau sumatera (terdiri atas satu keluarga), yang diambil dari Kebun Binatang Bandung. DNA total hasil ekstraksi dilanjutkan dengan proses amplifikasi dan sekuensing. Data hasil pembacaan sekuen D-loop dianalisis menggunakan software MEGA 4.0. Hasil sekuensing disejajarkan dengan harimau sumatera asal Aceh (kode sampel A1) sebagai pembanding, dan didapat 208 nukleotida dari ketiga sampel yang diteliti (M1, W2, dan Y4) yang berbeda dari sekuen acuan harimau A1. Lokus mikrosatelit FCA 96 hasil amplifikasi digunakan sebagai penanda untuk mengetahui hubungan silsilah keturunan antar individu, sehingga dapat dianalisis karakteristik pedigrinya. Pita yang dihasilkan pada ketiga individu sampel berupa pita sejajar dengan jumlah yang sama sehingga terbukti adanya hubungan keluarga di antara ketiga individu tersebut, dengan penurunan alel yang sama dari induk jantan maupun induk betina.
Keyword: D-loop, mikrosatelit, Panthera tigris sumatrae, pedigri

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: