Judul: Potensi Antimikroba Oligomer Kitosan yang Dihasilkan dengan Menggunakan Enzim Termostabil Kitosanase LH 28.38
Abstrak: Pengembangan kitin, kitosan, dan turunannya pada saat ini mendapat banyak perhatian di berbagai bidang seperti bioteknologi, pangan, medis, dan pertanian. Kitin merupakan biopolimer rantai lurus yang tersusun dari P1onomer N-asetil glukosamin yang dihubungkan oleh ikatan ~ (1-+4). Kitosan adaIah polisakarida alami hasil dari proses deasetilasi kitin. Oligomer kitosan mempakan produk hidrolisis kitosan. Keunggulan oligomer kitosan dibandingkan kitosan adalah dapat larut dalam air dan mudah diserap tubuh sehingga mempunyai aplikasi lebih baik secara in vivo. Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari potensi antimikroba oligomer kitosan yang dihasilkan secara enzimatis dengan menggunakan enzim kitosanase LH 28.38 yang diproduksi dari Bacillus coagulans LH 28.38. Bakteri ini diisolasi dari Lahendong, Sulawesi-Utara. Oligomer kitosan ini diharapkan dapat menjadi salah satu antimikroba alami yang dapat diterapkan pada bidang pangan. Penelitian ini dilakukan pada bulan Juli 2003 dan berakhir pada bulan Juni 2004. Penelitian ini dilakukan di Laboratorium Mikrobiologi dan Biokimia, Pusat Penelitian Bioteknologi (PPBIP AU), Institut Pertanian Bogor. Enzim kitosanase LH 28.38 dihasilkan dengan menginkubasikan Bacillus coagulans LH 28.38 pada suhu 55°C selama 7 hari pada media cair thermus. Setelah inkubasi selama 7 hari dilakukan pemisahan biomassa dengan cara sentrifugasi menghasilkan enzim yang telah bebas dari kultur se!. Enzim yang telah bebas dari kultur sel ini mempunyai aktifitas 0,089 U/ml dengan aktifitas spesifik sebesar 0,343 U/mg protein. Enzim yang telah bebas dari kultur sel diendapkan dengan menggunakan garam ammonium sulfat hingga mencapai tingkat kejenuhan 80 % menghasilkan presipitat. Presipitat dilarutkan ke dalam 50 mM buffer fosfat-sitrat pH 5,0 sampai volume 20 m!. Larutan enzim yang dihasilkan disebut enzim kasar. Enzim kasar ini mempunyai aktifitas 0,164 U/ml dan aktifitas spesifik 0,478 U/mg protein. Enzim kasar ini digunakan untuk menghidrolisis kitosan menjadi oligomer kitosan dengan aktifitas 0,164 U/mg kitosan. Oligomer kitosan dihasilkan dengan mereaksikan 14 ml soluble kitosan 0,5 % dan 7 ml enzim kasar LH 28.38 yang mempunyai aktifitas 0,164 U/mg kitosan pada suhu 55°C pada enam variasi waktu yaitu 30, 60, 90, 120, 150, dan 180 menit. Larutan tersebut kemudian dikeringkan menggunakanfreeze drying dan dilarutkan kembali ke dalam 8 ml larutan 50 mM buffer asetat pH 5,5. Larutan oligomer kitosan ini disebut larutan oligomer kitosan kasar. Larutan oligomer kitosan ini digunakan untuk uji antimikroba. Uji antimikroba dilakukan dengan menggunakan dua metoda yaitu metoda difusi agar dan metoda kontak. Uji antimikroba dilakukan terhadap empa[ bakteri uji yaitu Bacillus cereus, Eschericia coli, Pseudomonas aeruginosa, dan Staphylococcus aureus. Bakteri Bacillus cereus dan Staphylococcus aureus mewakili bakteri gram positif sedangkan bakteri Eschericia coli dan Pseudomonas aeruginosa mewakili bakteri gram negatif. Pada metoda difusi agar dilakukari pada tiga variasi pH yaitu 5,5 ,6,0 dan 7,0. Sebanyak 65 !!llarutan oligomer kitosan yang dihasilkan tiap variasi waktu hidrolisis, dimasukkan ke dalam sumur-sumur agar yang telah diinokulasikan kultur bakteri uji. Setelah inkubasi 24 jam, oligomer kitosan memberikan hasil positif terhadap keempat bakteri uji pada pH 5,5 dan 6,0, sedangkan pada pH 7,0 tidak menunjukkan aktifitas antimikroba terhadap keempat bakteri uji. Indek penghambatan terbesar untuk masing-masing bakteri Bacillus cereus, Eschericia coli, Pseudomonas aeruginosa, dan Staphylococcus aureus adalah 2,331 pada pH 5,5, 1,339 pada pH 6,0, 1,876 pda pH 6,0 dan 1,946 pada pH 5,5. Pada metoda kontak, 1
Keyword: 

Judul: Analisis beberapa sifat biokimiawi dan kinetika dari kitosanase crude bacillus sp. asal Indonesia
Abstrak: Kitosan, adalah kelompok polimer hasil deasetilasi sebagian atau menyuluruh (100%) dari kitin. Oligomer dari kitosan atau oligosakarida dari kitosan mempunyai banyak karakteristik yang menguntungkan, diantaranya : anti bakteri, anti fungi, aktifitas hipokolesterolemik, anti hipertensi, anti tumor, dan efek peningkatan sistem kekebalan tubuh. Kitooligosakarida ini didapat dari proses depo)imerisasi kitosan. Produksi kitooligosakarida dapat dilakukan dengan proses kimia dan hidrolisis enzimatis. Proses hidrolisis dengan enzim lebih menguntungkan karena berbagai alasan, diantaranya : hasil yang lebih spesifik yaitu lebih banyak oligomer dan tidak menghasilkan senyawa toksik, serta lebih ramah terhadap lingkungan. Kitosanase (EC. 3.2.1.99) adalah enzim yang mengkatalisis reaksi endohidrolisis ileata p (1,4) antara N-asetil-D-glukosamin dan D-glukosamin pada kitosan terasetilasi sebagian. Kitosanase merupakan enzim yang tennasuk dalam kelas enzim hidrolisis. Dari hasil karakterisasi yang dilakukan sebelumnya oleh Chasanah e/ al. (2002), diketahui bahwa Kitosanase crude Bacillus licheniformis MB-2 hasil dialisis memiliki suhu optimum 80°C dan pH optimum 6. Enzim yang dihasilkan oleh Bacillus licheniformis MB-2 ini stabil pada pH 5-9. Pemanasan 100°C selama 30 menit dan 90°C selama 60 menit menurunkan aktifitasnya hingga 49% dan 60%. Kitosanase crude hasil dial isis diuji stabilitasnya pada pH 3-11 selama 30 menit dan suhu 70° C selama 0, 30, 60 sampai 240 menit, suhu 80° C selama 0, 25,50 sampai 175 menit, suhu 90° C selama 0,25,50,75,100,125 menit, dan ~~uhu 100° C selama 0, 10, 20, 30, 40, 50 menit menggunakan inkubator. Gel hasil elektroforesis dilepaskan dari cetakan, kemudian gel direndam dalam buffer peri~uci SDS dan Buffer renaturasi, kemudiari di-overlay. Gel substrat ditumpukkan pada gel hasil elektroforesis. Overlay dilakukan pada suhu 55°C selama 1 jam. Setelah 1 jam gel yang berisi subtrat diwarnai dengan Congo Red 0,1 % selama 15-30 menit. Pada tahap akhir gel dicuci dengan larutan NaC11M (beberapa kali) kurang lebih selama 10 menit. Munculnya zona bening menunjukkan adanya aktifitas enzim pada pita protein yang bersangkutan. Data hasil analisis aktifitas spesifik dari masing masing-masing kitosanase crude hasil dialisis dari isolat (B. licheniformis, B. coagulans LH 28.38, B. licheniformis T7) pada penentuan suhu optimum diubah menjadi data konstanta reaksi yang besarnya adalah jumlah mol N-asetil glukosaminl (mol solubel kitosan x detik) untuk tiap mg protein enzim. Hasil konstanta masing masing kemudian dicari nilai lognya. Masing-masing data suhu diubah ke OK, kemudian diplmgkatkan dengan koefisien pangkat -1. Hasilnya diplotkan terhadap masingmasing nilai log konstanta reaksinya. Data kemiringan hasil regresi linear keduannya adalah - Ea atau -Eda / 2,303 R ( R = 8,314 J oK-I morl). Hasil Ea atau Eda yang diperoleh mempunyai satuan J /( mol soluble kitosan). Hasil ini kemudian diubah sehingga satuannya menjadi J / (100 ell, 1 % soluble kitosan) / untuk tiap mg enzim. Dari penelitian yang telah dilakukan dapat diambil kesimpulan bahwa, kitosanase crude Bacillus licheniformis MB-2 Stabil pada pH 5-9, dan terdenaturasi pada pH dibawah 5 dan diatas 9 pada suhu ruang. Kitosanase crude Bao£llus licheniformis MB-2 stabil pada suhu 70°C selama 210 menit, suhu 80°C selama 150 menit, suhu 90°C selama 75 menit, dan suhu 100°C selama 30 menit, pada perlakuan pH 6 (Buffer Enzim). Analisis dengan zimogram lebih sensitif dibandingkan analisis dengan assay dalam menganalisa stabilitas terhadap pH dan
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: