Judul: Penapisan Senyawa Aktif Mahkota Dewa, Lidah Buaya, dan Pare sebagai Inhibitor Enzim Aldehid Dehidrogenase 1A3 secara In Silico
Abstrak: Kanker ovarium termasuk salah satu penyebab kematian terbesar dari seluruh kematian akibat kanker di Indonesia. Cancer stem cell (CSC) memiliki kemampuan menginisiasi pembentukan tumor dan dapat menyebabkan metastasis. CSC relatif resisten terhadap terapi kanker konvensional dan diperkirakan dapat tinggal di dalam tubuh setelah terapi kamker selesai. Oleh karena itu, perlu adanya terapi baru yang menargetkan CSC yang diharapkan mampu menjadi metode pengobatan kanker yang efisien dan dapat mencegah kekambuhan kanker. Aldehid dehidrogenase 1A3 (ALDH1A3) merupakan salah satu marker permukaan CSC pada kanker ovarium. Enzim ALDH1A3 berperan dalam mengoksidasi retinaldehid menjadi asam retinoat yang dapat menginduksi transkripsi gen yang dapat meregulasi pembentukan tumor. Penelitian bertujuan menapis senyawa aktif yang berasal dari mahkota dewa, lidah buaya, dan pare sebagai inhibitor enzim ALDH1A3 secara in silico dengan metode virtual screening dan molecular docking melalui analisis energi ikatan (ΔG), konstanta inhibisi (Ki), dan ikatan yang terbentuk. Senyawa cucurbitane11 (3,7-dioxo-23,24,25,26,27-penta-norcucurbit-5-en-22-oic acid) berpotensi paling tinngi sebagai inhibitor enzim ALDH1A3 dengan ΔG -9.79 kkal/mol, Ki 0.07 μM, dan %BSS 83.3%, sehingga dapat dijadikan kandidat obat untuk pengobatan kanker ovarium. Senyawa mahkoside A, eriodictiol, daidzein, genistein, pelargonidin, apigenin, katekin, sianidin, dan mangiferin juga berpotensi menghambat kerja enzim ALDH1A3 karena memiliki sisi pengikatan yang juga sama dengan asam retinoat.
Keyword: ALDH1A3, CSC, kanker ovarium, molecular docking, virtual screening

Judul: Penapisan Virtual Senyawa Aktif Tumbuhan Manggis, Meniran dan Klabet sebagai Obat Kanker Ovarium.
Abstrak: Menurut American Cancer Society, kanker menjadi penyebab kematian terbesar kedua didunia setelah penyakit jantung, serta menduduki peringkat kelima dari 24 jenis kanker yang menyerang wanita di Indonesia. Aldehyde dehydrogenase 1A3 (ALDH1A3) merupakan biomarker pada sel punca kanker ovarium. Asam retinoat merupakan produk alami bagi ALDH1A3. Manggis, meniran dan klabet merupakan tumbuhan yang memiliki potensi terhadap pengobatan kanker. Penelitian ini bertujuan menyeleksi dan memprediksi daya inhibisi senyawa aktif terhadap ALDH1A3. Tahap awal penelitian dilakukan penapisan virtual 215 ligan dengan program aplikasi PyRx, dilanjutkan dengan uji farmakokinetik dengan mengakses www.swissadme.ch dan tox.charite.de, dilanjutkan dengan penambatan molekuler menggunakan autodock4 serta visualisasi 2D dengan LigPlot+ dan visualisasi 3D dengan PyMOL. Terdapat 5 ligan yang memiliki energi pengikatan lebih rendah dari pada asam retinoat dengan besar energi pengikatan secara berturut-turut -10.01 kkal/mol, -9.43 kkal/mol, -8.76 kkal/mol, -8.76 kkal/mol dan -8.72 kkal/mol, dengan energi pengikatan asam retinoat sebesar -8.49 kkal/mol, terdapat dua residu asam amino yang berperan penting pada pengikatan ligan, yaitu Gly136 dan Leu471. Hal ini menunjukkan adanya potensi kelima ligan sebagai inhibitor ALDH1A3.
Keyword: kanker ovarium, klabet, manggis, meniran, penapisan virtual

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: