Judul: Burkholderia sp. as Antifungal-Producing Bacteria to Suppress Ganoderma boninense in Oil Palm
Abstrak: Indonesia merupakan salah satu produsen minyak kelapa sawit di dunia, sehingga kelapa sawit merupakan salah satu komoditas penting di Indonesia. Indonesia menyediakan 46% minyak kelapa sawit di dunia dan permintaan akan minyak kelapa sawit semakin lama semakin meningkat. Penyakit yang paling banyak ditemukan di perkebunan kelapa sawit adalah busuk pangkal batang yang disebabkan oleh G. boninense. Berbagai usaha telah dilakukan untuk mencegah penyebaran penyakit ini, namun belum menunjukkan hasil yang optimum. Burkholderia sp. yang diisolasi dari rizosfer dan dalam jaringan (endofit) yang berasal dari tanaman kelapa sawit yang sehat menunjukkan potensi dalam menekan pertumbuhan G. boninense secara in vitro. Burkholderia sp. telah dilaporkan sebagai agen biokontrol karena kemampuannya dalam memproduksi beberapa senyawa antifungi. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengisolasi Burkholderia sp indigenus yang berpotensi dalam menghambat pertumbuhan G. boninense secara in vitro dan in vivo, dan profil komunitas bakteri di dalam tanaman setelah diberikan perlakuan Burkholderia sp. dan G. boninense. Lima isolat Burkholderia sp. rizosfer (B313, B51a, B52c, B51b, B52a) dan satu isolat Burkholderia sp. endofit (B212) telah berhasil diisolasi dari perkebunan kelapa sawit. Isolat Burkholderia sp. kemudian digunakan dalam uji antagonis terhadap pertumbuhan G. boninense di dalam media PDA. Burkholderia sp. dengan aktivitas antagonis yang tertinggi kemudian digunakan untuk uji in vivo. Profil komunitas bakteri endofit setelah perlakuan Burkholderia sp. dan G. boninense dianalisis dengan menggunakan DGGE (Denaturing Gradient Gel Electrophoresis). Selanjutnya gen yang diduga terkait dengan biosistesis senyawa antifungi dari Burkholderia sp. dikonfirmasi dengan menggunakan primer spesifik pyrrolnitrin (prn), pyoluteorin (plt), phenazine (phz), dan DAPG (phl). Burkholderia sp. dengan kode B212 menunjukkan aktivitas hambat yang paling tinggi yaitu dengan nilai PIRG 24,38%. Genom dari isolat B212 tersebut menunjukkan hasil PCR dengan ukuran 790 bp menggunakan primer prn. Hasil sekuens menunjukkan bahwa hasil PCR tersebut 99% identik dengan gen prnD parsial dari B. cepacia strain ESR63. Hasil uji in vivo konsorsium B212 dan B52a pada tanaman yang tidak diberikan infeksi G. boninense menunjukkan adanya pertumbuhan tanaman yang lebih baik dibandingkan dengan kontrol. Namun, konsorsium B212 dan B52a tidak menurunkan tingkat infeksi dari G.boninense pada tanaman kelapa sawit. B212 juga cenderung menghambat pertumbuhan tanaman yang diberikan infeksi G. boninense jika dibandingkan dengan kontrol. Analisis DGGE menunjukkan bahwa tanaman yang diberikan Burkholderia sp. memiliki profil komunitas bakteri endofit yang berbeda dengan yang tidak diberikan dengan Burkholderia sp. Sedangkan pemberian G. boninense tidak memberikan profil bakteri endofit yang berbeda dengan kontrol (yang tidak diberikan G. boninense). Burkholderia sp. memiliki potensi sebagai agen biokontrol untuk fungi patogen seperti G. boninense, namun metode aplikasinya belum tepat. Aplikasi Burkholderia sp dan G. boninense pada kelapa sawit secara bersamaan memberikan hasil yang belum memuaskan. Metode aplikasi Burkholderia sp. endofit sebagai biokontrol terhadap G. boninense perlu dioptimasi dan riset yang lebih mendalam. Dari hasil DGGE menunjukkan bahwa introduksi bakteri dari luar dapat mengubah komunitas bakteri yang ada di dalam jaringan tanaman.
Keyword: gen penyandi antibiotik., busuk pangkal batang, agen biokontrol, bakteri endofit, aplikasi perendaman

Judul: Isolation, Identification, and Media Formulation of  Endophytic Bacteria to Limit Ganoderma Fungus Attacks on Oil Palm
Abstrak: Ganoderma boniense merupakan cendawan patogen yang menyebabkan penyakit busuk pangkal batang (BPB) pada tanaman kelapa sawit. Penelitian ini mengkaji suatu alternatif dalam mengendalikan G. boninense melalui pemanfaatan agens pengendali hayati (APH) yang lebih ramah lingkungan daripada penggunaan fungisida komersial. Seleksi bakteri endofit sebagai APH dilakukan melalui isolasi bakteri dari akar kelapa sawit, mengukur persen zona hambatan terhadap isolat G. boninense secara in vitro, dan uji hipersensitif pada tanaman tembakau. Isolat bakteri endofit terpilih A2 dan C5 memiliki daya hambat terhadap G. boninense berturut-turut sebesar 35% dan 47%. Kedua isolat tersebut teridentifikasi secara molekuler berturut-turut sebagai bakteri Lysinibacillus xylanilyticus (99,85%) dan bakteri Aeromonas hydrophila (99,64%). Bakteri endofit terpilih diformulasikan ke dalam formulasi kompos, tepung, dan cair. Ketiga jenis formula dapat mempertahankan viabilitas sel sampai dengan 106 cfu/ml serta lebih stabil dan adaptif pada formulasi cair dengan kepadatan berkisar (8,0–9,0)×106 cfu/ml pada akhir minggu pengamatan dibandingkan formulasi lainnya., Ganoderma boninense is a pathogenic fungus that causes basal stem rot (BSR) diseases in oil palm plantations. This research examined an alternative in controlling G. boninense through the use of biological control agents (BCAs) which was more environmentally friendly than the use of commercial fungicide. Endophytic bacteria as BCAs were selected by isolating bacteria from oil palm roots, measuring the percent zone of inhibition against G. boninense based on in vitro test, and presenting hypersensitivity test on tobacco plant. Selected endophytic bacterias namely A2 and C5 had inhibiton against G. boninense of 35% and 47%, respectively. Those isolates were identified molecularly as Lysinibacillus xylanilyticus (99,85%) and Aeromonas hydrophila (99,64%), respectively. The selected endophytic bacterias were formulated in compost, flour, and liquid formulation. Those three types of formula could maintain cell viability up to 106 cfu/ml and are more stable also adaptive in liquid formulation within a range of (8,0–9,0)×106 cfu/ml at the end of the observation compared to other formulations.
Keyword: basal stem rot (BSR), endophytic bacteria, Ganoderma boninense, media formulation, oil palm

Judul: Tinjauan Matematis pada Model Makroskopik dan Mikroskopik Arus Lalu-lintas
Abstrak: Traffic flow phenomenon can be described through mathematical model such as continuous dynamic model with an ordinary differential equation so that it can be solved with integral factors. In this paper three simple models of traffic flow are discussed, i.e, two macroscopic and one microscopic models. Macroscopic model formulates dynamics of the traffic flow that occurs on a large number of vehicles on a road. While the microscopic model explains drivers’ behavior in their interaction with other vehicles ahead, i.e, car-following model. This paper shows the existence of ordinary differential equation found in the traffic flow model and indicates some different representations in the context of the same model. It also reviews a simple model of traffic flow along a single link, which leads to some unexpected results, i.e, it can express the solution model in term of link outflows as well as trip time. In the microscopic model, simulation is done to illustrate the behavior of the drivers with a sensitivity coefficient as a benchmark parameter.
Keyword: