Judul: Keanekaragaman Cendawan Air Tawar dan Potensinya Sebagai Pengendali Hayati Gulma Air dan Cendawan Patogen Tanaman
Abstrak: Cendawan air tawar ialah cendawan yang seluruh maupun sebagian siklus hidupnya berada di habitat air tawar. Cendawan air tawar berperan sebagai dekomposer, endofit, dan patogen pada hewan, tumbuhan air, maupun manusia. Indonesia memiliki keanekaragaman cendawan yang sangat tinggi. Eksplorasi dan pemanfaatan cendawan tersebut juga belum dilakukan secara maksimal. Oleh karena itu penelitian ini bertujuan untuk mengeksplorasi keanekaragaman cendawan air tawar dan potensinya sebagai pengendali hayati gulma air (Pistia stratiotes L.) dan cendawan patogen pada tanaman (Fusarium oxysporum dan Ganoderma boninense). Cendawan air tawar pada penelitian ini diisolasi dari Danau Telaga Warna, Cisarua, dan Danau Wiratama Mekarsari, Cileungsi, Jawa Barat, Indonesia. Kedua danau dipilih berdasarkan perbedaan faktor abiotik dan biotik pada danau tersebut. Metode yang digunakan untuk mengisolasi cendawan air tawar ialah pengenceran serial, dan identifikasi cendawan yang berhasil diisolasi menggunakan gabungan karakteristik morfologi dan molekuler. Uji patogenisitas semua isolat yaitu sebanyak 27 isolat cendawan air tawar terhadap gulma air P. stratiotes menggunakan agar blok miselium yang diinokulasikan pada permukaan daun gulma.Uji kemampuan cendawan air terpilih yaitu 3 isolat, sebagai pengendali cendawan patogen tanaman dilakukan dengan metode kultur ganda pada media agar dekstrosa kentang. Mekanisme interaksi hifa antara cendawan air tawar dengan cendawan patogen tanaman pada uji antagonistik diamati pada daerah pertemuan antara kedua kultur cendawan tersebut. Pengamatan dilakukan menggunakan mikroskop majemuk. Cendawan air tawar yang berhasil diisolasi dari Danau Telaga Warna dan Danau Wiratama Mekarsari masing-masing sebanyak 17 dan 10 isolat. Berdasarkan hasil identifikasi morfologi dan molekuler menggunakan primer ITS 1 dan ITS 4 untuk mengamplifikasi daerah ITS rDNA, spesies cendawan yang berhasil diisolasi dari Danau Telaga Warna terdiri atas Aspergillus spp., Parengyodontium album, Penicillium citrinum, Pestalotiopsis sp., Phialemoniopsis pluriloculosa, Sarocladium terricola, Talaromyces seksi Talaromyces dan Trametes polyzona, sedangkan spesies cendawan yang berhasil diisolasi dari Danau Wiratama Mekarsari ialah Acremonium polychromum, Fusarium proliferatum, Penicillium citrinum, Stachybotrys chlorohalonata, dan Talaromyces pinophilus. Hasil uji patogenisitas seluruh isolat cendawan air tawar terhadap gulma air P. stratiotes menunjukkan bahwa dua spesies yaitu Stachybotrys chlorohalonata dan Talaromyces seksi Talaromyces memiliki tingkat keparahan penyakit tertinggi. Tiga isolat cendawan air potensial pada uji antagonistik sebagai pengendali cendawan patogen F. oxysporum dan G. boninense ialah Acremonium polychromum, Aspergillus seksi Flavi dan Talaromyces seksi Talaromyces. Hasil uji antagonistik menunjukkan bahwa cendawan air tawar dapat menghambat pertumbuhan F. oxysporum dan G. boninense. Mekanisme interaksi yang terjadi antara cendawan air tawar dengan cendawan patogen tanaman ialah pembentukan klamidospora dan zona antibiosis pada cendawan F. oxysporum, dan hifa keriting dan menurunnya kecepatan pertumbuhan hifa pada F. oxysporum dan G. boninense.
Keyword: Danau Telaga Warna, Danau Wiratama Mekarsari, uji antagonistik, uji patogenisitas

Judul: Senyawa Metabolit Cendawan Endofit Sebagai Alternatif Pengendalian Efektif Cendawan Patogen Terbawa Benih Padi.
Abstrak: Prioritas utama bidang pertanian dalam rangka menjaga stabilitas pangan nasional yaitu peningkatan produksi padi. Salah satu masalah dalam produksi padi disebabkan karena infeksi hama dan penyakit tanaman. Infeksi cendawan patogen terbawa benih pada tanaman padi di Indonesia menjadi masalah utama yang berpengaruh terhadap produksi padi yang menurun dari waktu ke waktu. Pemanfaatan cendawan endofit merupakan salah satu alternatif pengendalian yang dapat digunakan untuk mengendalikan patogen terbawa benih. Perlu adanya metode baru yang ramah lingkungan untuk mengendalikan patogen terbawa benih. Penelitian ini bertujuan untuk mengeksplorasi cendawan endofit potensial asal tanaman padi yang mampu menghambat pertumbuhan cendawan patogen terbawa benih padi dan memanfaatkan metabolit cendawan endofit untuk menekan cendawan patogen benih terbawa benih padi. Penelitian ini terdiri atas 7 tahapan, yaitu 1) isolasi cendawan endofit dengan cara sterilisasi permukaan bagian tanaman padi dengan menggunakan NaOCl 1% dan alkohol 70%, 2) uji patogenisitas cendawan endofit terhadap benih padi varietas Ciherang yang telah disterilisasi permukaan, 3) isolasi cendawan patogen terbawa benih padi asal varietas Ciherang dan Kukubalam dengan metode blotter test, 4) uji antagonis isolat cendawan endofit terhadap cendawan patogen terbawa benih dengan metode kultur ganda, 5) produksi dan analisis senyawa metabolit cendawan endofit, 6) uji senyawa metabolit cendawan endofit secara in vitro, dan 7) uji in vivo senyawa metabolit cendawan endofit dengan 3 media yaitu agar air, kertas, dan lumpur. Cendawan endofit yang berhasil diisolasi sebanyak 21 isolat dan isolat yang digunakan pada uji senyawa metabolit sebanyak 3 isolat cendawan endofit potensial sebagai agen biokontrol terhadap cendawan patogen terbawa benih Fusarium sp.1. Tiga isolat cendawan endofit tersebut yaitu LA6, LA11, dan LA14. Metabolit isolat LA11 menunjukkan persentase penghambatan tertinggi terhadap Fusarium sp.1 yaitu 28.97% dan metabolit isolat LA14 dengan persentase penghambatan 28.72%. Aplikasi metabolit cendawan endofit dengan perendaman benih padi menunjukkan pengurangan infeksi cendawan patogen terbawa benih padi. Hal ini ditunjukkan oleh isolat LA11 dan LA14 mampu menghambat pertumbuhan cendawan patogen terbawa benih secara potensial. Cendawan endofit menghasilkan metabolit yang sebagian senyawa metabolit bersifat antifungal. Senyawa antifungal yang dihasilkan cendawan endofit dapat melindungi tanaman dari serangan mikroba patogen sehingga dapat dimanfaatkan sebagai biokontrol. Metabolit cendawan endofit juga mampu memperbaiki pertumbuhan tanaman dan sistem perakaran tanaman.
Keyword: metabolit sekunder, biokontrol, antifungal, Fusarium sp

Judul: The Construction of Greedy SVP LLL Algorithm
Abstrak: A lattice is a set of all integer linear combination of a set of linearly independent vectors in ℝ𝑛���. The independent vectors are called bases of lattice. Any lattice can be generated from many bases, and these bases have the same cardinality. In the lattice, the most fundamental and renowned problem is the Shortest Vector Problem (SVP). SVP is a tracking problem of the shortest nonzero vector in a lattice with equivalent bases. In two dimensions, SVP problem has resolved exactly by Gauss’ algorithm. When the lattice dimension is higher than two, A.K. Lenstra, H.W. Lenstra and L. Lovasz gave a LLL algorithm to compute approximation of nonzero shortest vector in the lattice. Reduced bases solution obtained from LLL algorithm still be an approximation and has polynomial running time of arbitrary dimension which large enough. In 1994, Schnoor and Euchner modified this LLL algorithm as a new variant which later was named deep insertion LLL algorithm. This algorithm is a modified version of the LLL algorithm to the terms of the exchange step to improve the accuracy of output of LLL reduced bases and applying it to the subset sum problem. The purpose of this research are: (1) Reconstruct the LLL algorithm and deep insertion LLL algorithm using a geometric approach. (2) Construct a greedy SVP LLL algorithm. (3) Implement the three algorithms in a symbolic programming language, and evaluate them experimentally. A bases ℬ=[𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑛���] in ℝ𝑚��� is called reduced LLL with parameter 𝛿��� if satisfies: (a) |𝜇���𝑗���𝑖���|≤12, for every integer 𝑖���,𝑗��� with 1≤𝑖���<𝑗���<𝑛���. (b)𝛿���‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���)‖2≤‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���+1)‖2, for 𝑗���=1,2,…,𝑛���−1,where 𝛿��� is a reduced parameter of real numbers with 14<𝛿���<1. The first requirement is the reduced basis 𝛿��� must “nearly orthogonal” and in its computation case, this requirement can be reached out by using the Gram-Schmidt’s orthogonalization. While the second requirement is called exchange step, or used to called as Lovasz condition. By using both of these requirements, then they establish the LLL algorithm. Then, Schnoor and Euchner modify the LLL algorithm based on the requirements of the exchange step called the deep insertion LLL algorithm, where the exchange step is based on the comparison of the projected vector in orthogonal complement [𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑘���−1]⊥ after j-th reduction. To construct greedy SVP LLL algorithm, the requirements of the exchange step is based on purely by comparing norm of lattice 𝐛���𝑗��� with norm lattice 𝐛���𝑖��� for 𝑖���=1,2,3…,𝑗���−1. The process of insertion reduced vector after the exchange step also has done greedily. Then, we calculate the number of arithmetic operation in greedy SVP LLL algorithm for further analysis. The result of our exprimentation for three algorithms on the certain matrix size shows that the running time of the three algorithms increases propotional to the size of the matrix. The result also shows that by using 𝛿���=34 for the LLL algorithm and the deep insertion LLL algorithm, and the greedy SVP LLL algorithm which is a new variant made by using no parameter of 𝛿���, outperform of the other of two previous algorithm in terms of speed with the same output.
Keyword: LLL algorithm, LLL deep insertion algorithm, greedy SVP LLL algorithm