Judul: Isolasi, Seleksi, dan Identifikasi Bakteri Kitinolitik pada Cairan Tanaman Kantong Semar (Nepenthes spp.) sebagai Agens Biokontrol.
Abstrak: Pengendalian hayati meggunakan bakteri kitinolitik merupakan salah satu pengendalian yang potensial dan ramah lingkungan untuk patogen dan hama tanaman. Tanaman kantong semar (Nepenthes spp.) adalah tanaman insektivora yang mencerna serangga sebagai sumber nitrogen dan fosfor. Tanaman ini telah dilaporkan memiliki simbiosis dengan berbagai mikroorganisme seperti bakteri kitinolitik. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi, menyeleksi, dan mengidentifikasi bakteri kitinolitik pada cairan tanaman kantong semar serta mengkaji potensinya sebagai agens biokontrol. Isolasi telah dilakukan dengan metode pengenceran berseri. Seleksi dan karakterisasi meliputi uji Gram, reaksi hipersensitif, aktivitas kitinase, dan potensi antagonis secara in vitro. Identifikasi secara molekuler dilakukan pada isolat bakteri yang memiliki indeks kitinolitik (IK) tinggi dan/ atau menghambat cendawan patogen (Pyricularia oryzae, Helminthosporium oryzae, and Sclerotium rolfsii). Bakteri yang berhasil diisolasi dari cairan tanaman kantong semar sebanyak 49 isolat dari lima spesies Nepenthes. Enam isolat memiliki Gram positif, sedangan yang lainnya Gram negatif. Semua isolat bakteri yang didapatkan tidak bersifat patogenik terhadap tanaman. Terdapat 17 isolat bakteri yang mempunyai aktivitas kitinase. Indeks kitinolitik (IK) tertinggi dimiliki oleh isolat NB1 yaitu sebesar 3.0. isolat tersebut tidak menghambat cendawan patogen namun menyebabkan mortalitas larva nyamuk hingga 100%. Data menunjukkan bahwa aktivitas kitinase tidak berkorelasi dengan daya hambatnya terhadap cendawan patogen. NB1 adalah isolat terpilih yang potensial sebagai agens biokontrol terhadap larva nyamuk, sedangkan NRA5 dan NB9 terhadap P. oryzae dan S. rolfsii. Hasil identifikasi molekuler dan analisis urutan nukleotida gen 16S rRNA pada data di GenBank isolat NB1 dan NB9 masing-masing memiliki homologi tertinggi dengan Chromobacterium aquaticum dan C. haemolyticum sebesar 96%, sedangkan isolat NRA5 dengan Burkholderia arboris sebesar 98%
Keyword: agens biokontrol, bakteri kitinolitik, indeks kitinolitik, Nepenthes

Judul: Seleksi Bakteri Kitinolitik Asal Tanah Jambi Sebagai Biokontrol Colletotrichum Capsici.
Abstrak: Colletotrichum capsici merupakan salah satu cendawan patogen penyebab antraknosa pada cabai. Infeksi antraknosa dapat menyebabkan kerugian hasil panen sekitar 50-100%. Salah satu alternatif yang dapat digunakan untuk menghambat pertumbuhan C. capsici ialah dengan menggunakan bakteri kitinolitik. Kitin yang terdapat pada dinding sel cendawan dapat dihidrolisis oleh enzim kitinase yang berasal dari bakteri kitinolitik. Kitinase menghidrolisa polimer kitin pada cendawan menjadi monomer N-asetilglukosamin. Tujuan penelitian ini adalah menseleksi bakteri kitinolitik asal tanah Jambi berdasarkan indeks kitinolitik dan kemampuannya menghambat pertumbuhan C. capsici. Sebagai tambahan dilakukan identifikasi secara molekuler dari isolat kitinolitik terpilih dan karakterisasi kitinase ekstraseluler. Enzim kitinase dari bakteri terpilih selanjutnya digunakan untuk menghambat pertumbuhan C. capsici. Berdasarkan hasil penyeleksian diperoleh dua isolat terbaik berdasarkan kemampuannya mendegradasi kitin dan penghambatannya terhadap C. capsici. Isolat KAHN 15.12 teridentifikasi sebagai Serratia marcescens dan SAHA 12.12 sebagai Bacillus thuringiensis berdasarkan gen 16S rRNA. Aktivitas spesifik kitinase tertinggi isolat KAHN 15.12 sebesar 52.03 U/mg pada jam ke-36 inkubasi dan SAHA 12.12 sebesar 45.67 U/mg pada jam ke-24 inkubasi. Pemekatan kedua isolat dilakukan dengan menggunakan amonium sulfat (b/v). Aktivitas kitinase hasil pengendapan memiliki aktivitas yang lebih tinggi dari kitinase ekstrak kasar. Hasil pemekatan menunjukkan bahwa kitinase KAHN 15.12 mengendap pada konsentrasi 40% dengan kemurnian enzimnya meningkat sebesar 1.92 kali dibandingkan aktivitas enzim kasarnya dengan perolehan sebesar 1.47 %. Isolat SAHA 12.12 mengendap pada konsentrasi 60% dan kemurnian enzim sebesar 3.14 kali dengan perolehan sebesar 1.47 %. Kitinase KAHN 15.12 hasil pengendapan memiliki aktivitas optimum pada pH 7 dan pada suhu 60 oC. Kitinase SAHA 12.12 hasil pengendapan memiliki aktivitas optimum pada pH 8 dan pada suhu 40 oC. Kitinase ini stabil pada suhu optimum selama 180 menit. Hasil pemisahan protein dengan SDSPAGE menunjukkan bahwa bobot molekul dari hasil pengendapan SAHA 12.12 ialah 109.13, 75.99, 61.79, 52.91, dan 43.03 kDa. Analisis zimogram menunjukkan satu protein yang memiliki aktivitas kitinase dengan bobot molekul sebesar 52.91 kDa. Enzim hasil pengendapan SAHA 12.12 memiliki 2 pita dengan bobot molekul 80.02 dan 68.51 kDa. Kedua bobot molekul tersebut memiliki aktivitas kitinase. Hasil uji penghambatan secara in vitro terhadap C. capsici menunjukkan bahwa enzim ekstrak kasar dan hasil pengendapan kedua isolat memiliki efektivitas penghambatan terhadap C. capsici. Hasil tersebut mengindikasikan bahwa kitinase isolat tersebut dapat digunakan sebagai agens biokontrol untuk pengendalian antraknosa pada cabai.
Keyword: Bakteri kitinolitik, Biokontrol, Colletotrichum capsici, Kitinase

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: