Judul: Akselerasi Global Pairwise Alignment Dengan Skema Partisi Blocked Column-Wise Pada Sistem Memori Terdistribusi
Abstrak: Algoritme global pairwise alignment (GPA) yang digunakan untuk menyejajarkan sepasang sekuens DNA perlu diparalelisasi untuk mempersingkat waktu eksekusi. Skema partisi berpengaruh terhadap kinerja algoritme GPA paralel mengingat algoritme ini mengadopsi metode pemrograman dinamis. Penelitian ini mempercepat algoritme GPA menggunakan skema partisi blocked column-wise pada sistem memori terdistribusi. Pararelisasi algoritme GPA dilakukan dengan model pemrograman message-passing menggunakan standar message passing interface (MPI). Parameter panjang sekuens yang digunakan bervariasi dari 1000 bp sampai paling panjang 30 000 bp. Hasil yang diperoleh menunjukkan speedup menggunakan 2, 3, dan 4 buah PC berturut-turut adalah 1.79, 2.58, dan 3.37 untuk panjang sekuens 30 000 bp. Sedangkan efisiensi menggunakan jumlah PC dan panjang sekuens yang sama berturut-turut mencapai 89.32%, 85.97%, dan 84.19%. Algoritme GPA paralel yang dikembangkan menunjukkan skalabilitas.
Keyword: message-passing, memori terdistribusi, pairwise alignment, skema partisi

Judul: Implementasi Hybrid Parallelization pada Algoritme Global Pairwise Alignment.
Abstrak: Algoritme pairwise alignment (PA) merupakan salah satu metode yang umum digunakan dalam penjajaran sekuens. PA terbagi menjadi 2 jenis yaitu global pairwise alignment (GPA) dan local pairwise alignment. Perkembangan teknologi yang semakin pesat menyebabkan ukuran data sekuens bertambah besar sehingga pemrosesan data tersebut akan memakan waktu yang sangat lama apabila hanya dikerjakan dalam satu prosesor. Oleh karena itu, suatu metode pemrosesan paralel dibutuhkan untuk mempersingkat waktu komputasi. Penelitian ini bertujuan mempercepat algoritme GPA menggunakan skema partisi data blocked columnwise dengan menggunakan metode hybrid parallelization. Hybrid parallelization dilakukan dengan menggabungkan metode sistem memori terdistribusi dengan sistem memori bersama. Hasil penelitian menunjukkan nilai speedup pada percobaan menggunakan 2, 3, dan 4 komputer masing-masing adalah 5.3, 6.9, dan 7.77 pada ukuran data 16000 pasang basa dan nilai efisiensi berturut-turut adalah 66%, 58%, dan 49%. Kinerja terbaik dicapai menggunakan 4 komputer, sedangkan skalabilitas memori terbaik diperoleh menggunakan 2 komputer.
Keyword: hybrid parallelization, memori bersama, memori terdistribusi, pairwise alignment, pemrosesan paralel

Judul: Etno-ornitologi Burung Kancilan Flores (Pachycephala nudigula nudigula Hartert 1897) pada Masyarakat Lio di Taman Nasional Kelimutu
Abstrak: Bare-throathed whistler is one of several wild birds in Kelimutu National Park (TNKL) that is believed to have correlation with Lio Community‟s belief. The estimation of Bare-throated whistler‟s population in Kelimutu National Park was about 186.41-1668.07 individual by the density about 0.0389-0.3481 ind/ha with the sex ratio 6.2:1 that spreaded on area with height of 1100 – 1600 masl. The characteristic of Bare-throated whistler‟s habitat is a natural forest with various canopy level, high plant species diversity and high density. The habitat characteristics related to the availability of food in the form of insects, cover, safety and a nesting site. Generally the most of Lio community knew the existence of Bare-throated whistler directly or from their parents‟ stories. The perceptions of Lio Community to the Bare-throated whistler‟s existence is generally support the conservation efforts. The perceptions construct the Lio Community‟s atitude that tend to be conservative to the existence of Bare-throated whistler. The attitude shown by their behavior that not cathing the Bare-throated whistler from the TNKL‟s area or the outside. The attitude have an important role to the existence of Bare-throated whistler in Kelimutu National Park‟s area.
Keyword: