Judul: Optical Reflectance Analysis of a Rice Field
Abstrak: Konsep dasar fisika dalam aplikasi penginderaan jauh seperti lidar merupakan suatu konsep dasar gelombang elektromagnetik yang memiliki hubungan antara kecepatan cahaya, panjang gelombang, dan frekuensi. Komponen tersebut biasanya digambarkan sebagai bentuk energi berjalan dalam gelombang sinosuidal. Panjang gelombang pada gelombang elektromagnetik dapat memperlihatkan pemantulan optik pada data lidar. Data lidar ini digunakan untuk menganalisis umur padi dan klasifikasi lahan sawah. Metode yang dilakukan pada penelitian ini yaitu menganalisis data lidar menggunakan perangkat lunak NEST dan Fugro-viewer. Klasifikasi lahan sawah dapat diketahui menggunakan pemantulan panjang gelombang dalam teori dasar fisika. Pada penelitian ini, daerah elektromagnetik dari panjang gelombang pada lahan sawah untuk semua kanal berada di daerah ultraviolet, daerah cahaya tampak, dan daerah inframerah dekat hingga tengah. Panjang gelombang dari setiap plot padi memiliki nilai sekitar 170-3580 nm berdasarkan semua kanal lidar di foto permukaannya.
Keyword: Pemantulan, Panjang gelombang, Padi, Data lidar

Judul: Spectral Pattern Analysis of Rice Varieties with Proximal Sensing Method and Sentinel-2 Imagery
Abstrak: Pemantauan pertumbuhan padi melalui berbagai wahana penginderaan jauh seperti satelit Sentinel-2 sudah banyak dilakukan, namun variasi ketinggian dan bauran reflektansi menyebabkan tingkat akurasi berbeda. Proximal sensing memungkinkan pemantauan dekat (ground-level) melalui sensor beresolusi tinggi. Spectroradiometer merupakan perangkat penginderaan proksimal yang mampu merekam pola spektral secara kontinu suatu objek, sehingga informasi yang diperoleh lebih rinci. Penelitian ini bertujuan menganalisis karakteristik pola spektral tanaman padi varietas Ciherang dan Ketan Grendel berdasarkan metode proximal sensing dan menganalisis keterkaitan pola spektral kedua varietas hasil pengukuran spectroradiometer dengan citra Sentinel-2. Berdasarkan analisis spektral, varietas Ciherang mencapai nilai reflektansi maksimum untuk panjang gelombang red-edge dan NIR pada 56 HST kemudian menurun pada 81 HST, sedangkan varietas Grendel baru mencapai nilai reflektansi maksimum pada 81 HST dan menurun pada 86 HST. Berdasarkan regresi linier, hubungan antara nilai reflektan hasil pengukuran spectroradiometer dan citra Sentinel-2 pada 23 HST memiliki nilai R² yang lebih rendah yaitu 0.5869 dan 0.5178. Hal ini dikarenakan tanaman belum berkembang dan permukaan sawah belum tertutup seluruhnya oleh kanopi tanaman. Hubungan nilai spektral pada 56, 81, 86, dan 90 HST menunjukkan nilai reflektansi pengukuran spectroradiometer setara atau ekuivalen dengan nilai reflektansi hasil ekstraksi citra Sentinel-2 dengan rata-rata R² di atas 86%., Rice growth monitoring through remote sensing such as Sentinel-2 imagery has been widely used, yet the accuracy level is different due to variations in altitude and object reflectance. Proximal sensing provides site (ground-level) monitoring via high-resolution sensors. Spectroradiometer is a proximal sensing device that can continuously record the spectral pattern of an object. This research aims to analyze spectral pattern characteristics of Grendel sticky and Ciherang rice varieties based on proximal sensing and to analyze relationship between reflectance value of spectroradiometer and Sentinel-2. Based on spectral analysis, Ciherang variety reached the maximum reflectance value for red-edge and NIR wavelength at 56 DAP and then decreased at 81 DAP, while Grendel variety just reached the maximum value at 81 DAP and decreased at 86 DAP. The relationship between the reflectance value of spectroradiometer and Sentinel-2 at 23 DAP had a lower R² value, 0.5869 and 0.5178. These are because plants have not yet developed and the rice fields surface has not been completely covered by plant canopy. Relationships at 56, 81, 86, and 90 DAP indicated reflectance values of spectroradiometer measurement are equivalent to value of Sentinel-2 image extraction with an average of R² above 86%.
Keyword: Ciherang rice, Grendel sticky rice, reflectance value, spectroradiometer

Judul: Study of Tupaia javanica Hepatocytes Culture as In Vitro Replication Media of Nonhuman Primate HBV
Abstrak: Virus hepatitis B (VHB) adalah virus DNA yang menginfeksi organ hati sebagai target utama. Infeksi ini menyebabkan hepatitis yang dapat bersifat kronis dan berlanjut menjadi sirosis, kanker hati bahkan kematian. Pengembangan model in vivo dan in vitro berkaitan dengan hepatitis B menjadi perhatian khusus bagi para peneliti. Kultur hepatosit banyak digunakan untuk mempelajari berbagai ha] terkait hepatitis B baik dari aspek virus, penyakit, pencegahan, dan pengobatan. Pengembangan hepatosit asal hewan kecil sepe1ii Tupaia sp. untuk model in vitro merupakan salah satu altematif dalam penyediaan kultur hepatosit. Tujuan penelitian ini adalah mengembangkan kultur primer dan lestari hepatosit T. javanica yang mampu mendukung replikasi VHB orangutan (OuHBV) dan VHB owa jawa (GiHBV), dan dapat menjawab kebutuhan akan model in vitro kultur hepatosit. Isolasi hepatosit T. javanica dilakukan dengan prosedur sebagai berikut: organ hati yang telah dicacah dalam cawan petri dengan larutan perfusi, diinkubasi pada 37 °C. Suspensi disentrifugasi 300-500 g sehingga didapatkan pelet sel hati. Pelet yang sudah dicuci kemudian diresuspensi dengan Hepatocyte Basal Media untuk menumbuhkan hepatosit dan selanjutnya hepatosit akan ditransformasi menggunakan perangkat Lenti-SV 40. Sodium taurocholate cotransporting polypeptide (NTCP) yang diindikasikan sebagai reseptor hepatosit untuk melekatnya VHB, nampak pada hepatosit baik pada kultur primer maupun kultur yang ditransformasi. Reseptor hepatosit spesifik ini terlihat sebagai pendaran hijau dengan uji imunofluoresensi. Kultur hepatosit primer T. javanica berhasil dikembangkan selama 14 hari untuk mencapai kepadatan 80%, dan inokulasi GiHBV dan OuHBV ke dalam kultur pada hari ke-15 menunjukkan adanya replikasi virus hingga hari ke-8 (berdasarkan hasil PCR). Kuantifikasi virus dengan real-time PCR memperlihatkan replikasi tertinggi pada hari kedua setelah inokulasi. Penjajaran sebagian protein permukaan setelah virus dinokulasikan memperlihatkan kesamaan asam amino dengan virus wild type sebesar 99.29% dan 95.71 % pada GiHBV dan OuHBV., Hepatitis B virus (HBV) is a DNA virus which infects liver as primary target organ. This i11fection causes hepatitis which could become chronic and progress to cirrhosis, liver cancer and even death. Development of in vitro and in vivo model related to hepatitis B is a concern for researchers. Hepatocyte cultures widely used to study a variety of aspects of hepatitis B such as the virus, disease, prevention and treatment. Development qf hepatocyte from small animal e.g. Tupaia sp. for the in vitro model is an alternative of hepatocyte cultures. The purpose of the study is to develop primary and immortal T. javanica hepatocytes cultures capable to replicate orangutan HBV (OuHBV) and javan gibbon HBV (GiHBV), and to answer the need for in vitro model ofhepatocytes. Isolation of hepatocytes from T. javanica was done as followed: mincedliver were transported into petri dish containing perfusion buffer solution to be incubated at 37 °C. The suspension was centrifuged at 300-500 g to obtain liver cell pellets. The washed-pellet was resuspended in Hepatocyte Basal Media to let specific hepatocytes grow and later be transformed by Lenti-SV40 kit. Sodium taurocholate cotransporting polypeptide (NTCP) has been ident(fied as hepatocyte receptor for HBV attachment, and was seen on hepatocytes from both primary and transformed cultures. This hepatocytes specific receptor was shown as green luminenscent by immunofluorescence assay. Primary T. javanica hepatocytes cultures was successfully maintained for
Keyword: Tupaia javanica, in vitro model, hepatocytes culture, hepatitis B virus, Liver cancer, Picornaviridae, Hepadanaviridae, Flaviviridae, Caliciviridae