Judul: Karakterisasi dan Aktivitas Antioksidan Ekstrak Pigmen Aktinobakteri.
Abstrak: Aktinobakteri adalah bakteri Gram-positif yang berasal dalam filum Actinobacteria. Aktinobakteri adalah sumber metabolit sekunder yang menjanjikan. Salah satu metabolit sekunder yang dihasilkan aktinobakteri adalah pigmen. Berbagai aktinobakteri mampu menghasilkan beragam jenis pigmen, diantaranya yaitu pigmen berwarna kuning hingga oranye. Pigmen memiliki berbagai aktivitas farmakologi seperti antioksidan. Antioksidan adalah molekul yang menghambat atau menunda kerusakan sel dengan menyumbangkan elektron ke radikal bebas dan menstabilkannya. Pigmen yang dihasilkan oleh bakteri memiliki kapasitas antioksidan dan melindungi bakteri dari kerusakan oksidatif. Penelitian aktivitas antioksidan aktinobakteri berpigmen di Indonesia belum banyak dilaporkan, sehingga penelitian aktivitas antioksidan aktinobakteri berpigmen perlu dilakukan. Penelitian ini bertujuan untuk mengkarakterisasi aktinobakteri berpigmen kuning hingga oranye, menguji aktivitas antioksidan dari ekstrak pigmen antinobakteri,serta menganalisissenyawa dari ekstrak pigmen yang memiliki aktivitas antioksidan tertinggi. Isolat aktinobakteri diisolasi dari rizosfer mangrove di Pantai Cengkrong Trenggalek,sampel tanah merah di kebun area kampusIPB, dan isolat aktinobakteri endofit dari kulit manggis yang telah diidentifikasi oleh peneliti sebelumnya. Isolat aktinobakteri terpilih diidentifikasi menggunakan gen 16S rRNA. Pigmen aktinobakteri diekstraksi sampai memdapat esktrak kasar pigmen. Aktivitas antioksidan ekstrak kasar pigmen diukur menggunakan metode DPPH (1,1- diphenyl-2-picrylhydrazil). Hasil pengukuran aktivitas antioksidan dihitung dalam persen inhibisi lalu digambarkan melalui nilai IC50 (inhibitory capacity). Ekstrak kasar pigmen yang menghasilkan aktivitas antioksidan tertinggi selanjutnya dianalisis menggunakan Liquid Chromatography Mass Spectrophotometer (LCMS) untuk mengidentifikasi profil kimia yang terdapat di dalam ekstrak pigmen dan berpotensi menghasilkan antioksidan. Berdasarkan hasil penelitian diperoleh lima isolat aktinobakteri berpigmen yaitu HRA, HVA, HVB, AGM2.2 dan AGM2.3. Identifikasi berdasarkan gen 16S rRNA menunjukkan bahwa isolat HRA memiliki nilai kemiripan 99,91% dengan Streptomyces gramineus JR-43, isolat HVA memiliki nilai kemiripan 99,22% dengan S. tendae ATCC 19812 dan isolat HVB memiliki nilai kemiripan 81,18% dengan Rhodococcus ruber DSM 43338. Isolat AGM2.2 dan AGM2.3 memiliki kemiripan dengan S. xanthophaeus NRRL B-5414 dengan nilai kemiripan masing masing sebesar 98,95% dan 99,82%. Spektrum UV-Vis ekstrak kasar pigmen isolat HRA adalah 411 nm, isolat HVA 663 nm, isolat HVB 459 nm, isolat AGM2.2 663 nm, dan isolat AGM2.3 664 nm. Konsentrasi hambat (IC50) pigmen ekstrak kasar aktinobakteri berkisar dari 53,38 µg/mL hingga 184,38 µg/mL. Isolat HVB memiliki aktivitas antioksidan paling tinggi. Ekstrak kasar pigmen isolat HVB mengandung senyawa luteolin dan berpotensi sebagai penghasil antioksidan.
Keyword: DPPH, inhibitory concentration, metabolite, luteolin

Judul: Study of Actinomycetes-derived Biopigment for Potency Antimicrobial Activity.
Abstrak: Aktinomiset merupakan kelompok bakteri Gram-positif yang cukup populer karena kemampuannya menghasilkan senyawa dari metabolit sekunder. Salah satu metabolit sekunder dari aktinomiset yang memiliki aktivitas biologis adalah pigmen. Pigmen yang dihasilkan oleh aktinomiset cukup beragam, hal ini dikarenakan aktinomiset mampu menghasilkan berbagai warna koloni pada pertumbuhannya. Pigmen merupakan senyawa bioaktif dengan aplikasi yang cukup luas. Pigmen pada umumnya digunakan dalam bidang industri makanan dan minuman, serta pewarna pada industri tekstil, dan industri farmasi. Pigmen dapat dibagi atas dua kelompok, yaitu pigmen sintetis dan pigmen alami. Pigmen yang sering digunakan dalam industri adalah pigmen sintetis sedangkan pigmen alami sedikit jarang digunakan. Dewasa ini, penggunaan pigmen sintetis mulai berkurang karena efek samping dari penggunaannya terhadap lingkungan dan kesehatan. Terkait hal tersebut timbul adanya peluang pencarian pigmen alami salah satunya dari mikroba. Pigmen yang dihasilkan oleh mikroba mampu memberikan berbagai keuntungan dalam hal segi biaya dan waktu (keefektifan). Salah satu kelompok mikroba yang mampu menghasilkan pigmen adalah aktinomiset. Penelitian ini menggunakan aktinomiset yang sebelumnya telah berhasil diisolasi dari filosfer padi dan aktinomiset asosiasi spons. Aktinomiset yang digunakan adalah Gordonia terrae JSN1.9, Micromonospora tulbaghiae SCA54.P2, dan Micromonospora chalcea HV11.P3. Ketiga aktinomiset tersebut menghasilkan pigmen masing-masing berwarna orange/jingga, kuning, dan hitam. Laporan sebelumnya mengungkapkan aktivitas antifungi, antibakteri, dan antioksidan yang dimiliki oleh aktinomiset tersebut. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui aktivitas antimikroba dari fraksi aktif pigmen yang dihasilkan oleh ketiga aktinomiset, efek kerusakan yang ditimbulkan oleh fraksi aktif pigmen terbaik terhadap sel mikrob uji, dan identifikasi senyawa yang ada pada fraksi aktif. Penelitian ini diawali dengan peremajaan kultur aktinomiset menggunakan medium international streptomyces project 2 (ISP2) atau international streptomyces project 4 (ISP4) dan dilanjutkan produksi dan ekstraksi pigmen untuk memperoleh ekstrak kasar pigmen. Absorbansi maksimum dari ekstrak pigmen diukur menggunakan spektrofotometer UV-Vis. Aktivitas antimikroba ekstrak kasar diujikan pada mikroba Bacillus subtilis ATCC 6633, Escherichia coli ATCC 8739, Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853, Staphylococcus aureus ATCC 25293, dan Candida albicans ATCC 10231. Selanjutnya dilakukan fraksinasi pigmen dengan kromatografi lapis tipis (KLT), uji bioautografi untuk konfirmasi aktivitas antimikroba, dan isolasi fraksi aktif dengan KLT preparatif. Efek kerusakan pada sel mikroba uji diamati menggunakan scanning electron microscopy (SEM) dan senyawa yang ada pada fraksi aktif dianalisis menggunakan liquid chromatography mass spectrometer (LC-MS) untuk selanjutnya diidentifikasi. Aktinomiset yang digunakan pada penelitian ini memiliki kecepatan pertumbuhan yang berbeda. Spesies G. terrae JSN1.9 menghasilkan warna pigmen terbaik pada masa inkubasi 10 hari, dan kedua aktinomiset Micromonospora menghasilkan warna pigmen terbaik pada masa inkubasi 14 hari. Media terbaik untuk G. terrae JSN1.9 adalah ISP2 dengan menggunakan sumber karbon glukosa, sedangkan kedua spesies Micromonospora tumbuh optimum pada media ISP4 dengan konsentrasi NaCl (0,1%). Ekstraksi menggunakan pelarut kloroform atau metanol menghasilkan rendemen masing-masing sebesar 9,27%; 2,79%; dan 6,43% pada media produksi terbaik. Ketiga ekstrak pigmen aktinomiset memiliki absorbansi maksimum pada panjang gelombang 410 nm, 409 nm, dan 324 nm (kelompok pigmen karotenoid atau melanin). Ekstrak kasar dan fraksi aktif pigmen menunjukkan aktivitas antimikroba terhadap bakteri Gram-positif (B. subtilis ATCC 6633 dan S. aureus ATCC 25293) dan C. albicans ATCC 10231. Aktivitas antimikroba ditunjukkan dengan adanya zona hambat pada ketiga mikrob uji tersebut. Hasil penelitian menunjukkan bahwa fraksi aktif memiliki
Keyword: aktinomiset, C. albicans, Gram-positif, pigmen

Judul: Thermal Characteristics and Dynamics of Tropical Cyclone over Western North Pacific Ocean: A Case Study of Typhoon Songda (Chedeng) 2011
Abstrak: The frequent occasion of Tropical Cyclone (TC) over Western North Pacific (WNP) Ocean lies from 10˚N to 26˚N and 121˚E to 170˚E. Sources of TC development come from warm ocean temperature where latent heat is released during condensation processes and subsequently concentrated in the boundary layer. Relative humidity at 850-700 hPa is responsible to produce the most intense storm. Meanwhile, weak vertical wind shear between 850-200 hPa is one of the dynamical factors that lead to the development of TC. Pressure level of 850-200 hPa is chosen to minimize the thermodynamic effect in the lower troposphere. Typhoon Songda (Chedeng in the Philippines) or TSC lasted from May 18th to 30th, 2011 and strengthened into powerful Super Typhoon stage between May 24th and 27th. Long curving track and the exhibition of all sequences of TC life cycle, TSC is then considered as an ideal case of TC. The objective of the study with case of TSC is to investigate the role of thermal characteristics and dynamics on TC intensity. The research is carried out by using Advanced Research of Weather Research and Forecasting model (WRF ARW model) version 3.3. Two domains are employed in the model. The first domain situate from 02˚N to 40˚N and 118˚E to 149˚E and cover spatial resolution () of 33.1 km. The second domain situate from 09˚N to 27˚N and 119˚E to 132˚E with of 11 km. Timestep of the model () is 120 seconds. The model is supported by the following physical parameterization, i.e., Yonsei University Scheme (YSU) in the boundary layer, Kain-Fritsch scheme (KF) in the cumulus, and WRF Single-Moment 3-class scheme in the microphysics. Initial meteorological condition prior to the formation of the cyclone is generated using WRF ARW standard-release model. Sensitivity of the model output is obtained from a selected single-parameter change scenarios, namely, 10 % to 20 % decrease and increase of wind shear initial data at 850-200 hPa, and by 10 % to 20 % decrease of relative humidity initial data at 850-700 hPa. The result showed that the negative correlations between wind shear and intensity are found in wind shear scenarios. Wind shears of 10 ms-1 which lead to strengthening of the wind intensity in the early period of Typhoon development are found in wind shear scenarios. The effect of wind shear changes on wind intensity is statistically significant in the 20 % wind shear scenarios. During mature stage, weak wind intensity occurred when wind shear increase as given in the WRF standard-release and the 20 % decreasing scenario. Different situation is found in the 20 % increasing scenario where wind shear tend to weak and lead to strong wind intensity at this stage. Meanwhile, the reduction of moisture supply at 850-700 hPa resulting from 20 % decreasing relative humidity play a major role in the weakening of wind intensity and reduces mechanical energy of the cycle process as much as 300 J kg-1.
Keyword: