Judul: Karakteristik Massa Air Arlindo Di Pintasan Timor Pada Musim Barat Dan Musim Timur
Abstrak: Pintasan Timor merupakan jalur keluar dari Arlindo (Arus Lintas Indonesia), yaitu arus yang membawa massa air dari Samudera Pasifik melintasi perairan Indonesia menuju Samudera Hindia. Oleh karena itu, Pintasan ini memiliki peranan yang penting dalam sirkulasi massa air khususnya di lintang rendah. Penelitian ini dilaksanakan pada dua periode pengamatan yaitu Januari 2004 (5 stasiun) dan Juni 2005 (6 stasiun). Data yang digunakan adalah data suhu, salinitas, sigma-t, kedalaman, kecepatan dan arah arus. Pengolahan data dilakukan dengan menggunakan perangkat lunak Ocean Data View (ODV), Surfer, dan Matlab untuk memperoleh hasil berupa sebaran melintang dan menegak (suhu, salintas, dan σt), diagram T-S, dan arus Geostropik. Setiap parameter yang diamati memiliki pola pelapisan. Pelapisan ini mengalami perubahan kisaran nilai dan ketebalan pada dua musim yang diamati. Kisaran nilai suhu pada Musim Timur lebih rendah daripada Musim Barat, yaitu mencapai 28.01oC (Juni 2004) dan 29.60 oC (Januari 2005). Pada pelapisan suhu, lapisan homogen yang terbentuk pada Musim Timur lebih tebal daripada Musim Barat yaitu perbedaan ketebalannya mencapai 45 m, namun lapisan termoklin yang terbentuk pada Musim Barat lebih tebal (perbedaan ketebalan mencapai 103 m) daripada Musim Timur. Kisaran nilai salinitas permukaan pada Musim Timur lebih rendah daripada Musim Barat, yaitu mencapai 33.91 psu (Musim Timur) dan 34.33 psu (Musim Barat). Nilai sigma-t di permukaan pada Musim Timur lebih tinggi dari Musim Barat, yaitu berkisar antara 21.20-21.80 (Musim Timur) dan 20.08-21.70 (Musim Barat). Analisis dengan diagram T-S menunjukkan adanya dua jenis massa air, yaitu massa air dicirikan oleh salinitas minimum South Pacific Intermediate Water (SPIW) dan Antarctic Intermediate Water (AAIW). Pengamatan Musim Barat dan Musim Timur tidak ditemukan massa air kerkarakteristik salinitas maksimum baik yang berasal dari massa air Pasifik Utara maupun Pasifik Selatan. Perhitungan arus dengan menggunakan metode geostropik, diketahui bahwa arus di Pintasan Timor bergerak ke arah barat dan timur. Arah arus Geostropik di lapisan permukaan didominasi menuju arah barat baik pada Musim Barat maupun Musim Timur. Transpor massa air pada Musim Barat (Januari 2004) secara menyeluruh bergerak ke arah timur dengan transpor total massa air sebesar 4.61 Sv. Musim Timur (Juni 2005)memiliki transpor total massa air pada sebesar 1.85 Sv dengan total transpor massa air yang bergerak ke timur sebesar 38.92 % dan bergerak ke barat sebesar 61.08 %.
Keyword: 

Judul: Karakteristik massa air arlindo di Perairan Timur Indonesia pada musim timur
Abstrak: Sirkulasi massa air di perairan timur Indonesia yang dikenal secara internasional dengan istilah Indonesian Throughflow (Bray et al., 1996) atau Arus Lintas Indonesia (Arlindo) dalam Bahasa Indonesia (Ilahude dan Gordon, 1996) sangat menarik untuk diteliti. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis massa air Arlindo di perairan timur Indonesia pada musim timur, yang meliputi analisis jalur lintasan Arlindo dan karakteristik massa air yang terlibat di dalamnya. Karakteristik massa air di Samudera Hindia dan di wilayah ekuator bagian barat Samudera Pasifik dianalisis juga sebagai bahan perbandingan. Kegiatan penelitian adalah berupa pengolahan data sekunder yang diperoleh dari the National Oceanographic Data Center (NODC), NOAA, Amerika Serikat. Lintasan Arlindo dianalisis berdasarkan gambar kontur sebaran anomali kedalaman dinamik di lapisan permukaan 0 dbar relatif terhadap permukaan 1000 dbar. Karakteristik massa air dianalisis berdasarkan ciri-ciri core layer (King, 1963) yang terlihat dalam grafik suhu-salinitas (S-S) dan grafik suhu-oksigen (S-O₂). Sebaran nilai anomali kedalaman dinamik di lapisan permukaan 0 dbar relatif terhadap permukaan 1000 dbar menunjukkan nilai yang cukup tinggi di Laut Cina, Laut Sulu, Laut Sulawesi, dan sebagian Samudera Pasifik, yaitu antara 1,8 dyn m sampai 1,9 dyn m. Di sebelah timur Mindanao nilainya lebih kecil (1,5 dyn m sampai 1,7 dyn m), sedang di sebagian Laut Sulu nilainya lebih besar (2,0 dyn m sampai 2,1 dyn m).
Keyword: 

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA