Judul: Endophytic Fungal Diversity of Local Rice and Their effects on Rice seedling Growth.
Abstrak: Cendawan endofit ialah cendawan yang hidup di dalam jaringan tanaman inang tanpa menyebabkan gejala penyakit. Cendawan endofit potensial sebagai pupuk hayati dan pengendali hayati tanaman, termasuk padi lokal, sehingga dapat digunakan untuk meningkatkan produktivitas tanaman tanaman padi lokal yang ramah lingkungan. Padi lokal merupakan salah satu andalan karena cocok dengan kondisi lingkungan setempat. Namun, produktivitas padi lokal umumnya belum maksimal karena terkendala oleh kesuburan tanah. Produksi padi termasuk padi lokal masih bergantung pada pupuk anorganik. Pupuk anorganik yang digunakan terus menerus dapat mengubah struktur fisik dan kimia tanah yang menyebabkan tanah menjadi tidak subur. Oleh karena itu, perlu diterapkan suatu teknik budi daya padi spesifik yang berwawasan lingkungan dan berkelanjutan. Penelitian ini bertujuan mengisolasi dan menganalisis keragaman cendawan endofit padi lokal kultivar Siam 11 Kalimantan dan potensinya dalam meningkatkan pertumbuhan bibit tanaman inangnya. Isolasi cendawan dilakukan pada seluruh bagian tanaman padi Siam 11 Kalimantan, yaitu akar, pelepah, daun, gabah, biji pecah kulit, sekam, kecambah dan bibit dengan metode sterilisasi permukaan menggunakan NaOCl 1% dan dikulturkan pada media Potato sucrose Agar (PSA) yang mengandung kloramfenikol 500 mg L-1. Identifikasi cendawan menggunakan gabungan karakteristik morfologi dan molekuler. Keragaman cendawan endofit dihitung melalui indeks keragaman Shanon-Wiener. Cendawan endofit di analisis molekuler menggunakan sekuen rDNA dengan primer ITS1 dan ITS4 yang dilanjutkan dengan analisis filogenetik. Cendawan selanjutnya di uji kemampuannya dalam meningkatkan pertumbuhan bibit padi menggunakan filtrat. Kultur pengaruh filtrat cendawan endofit terhadap pertumbuhan tanaman padi diuji pada perkecambahan dan pertumbuhan benih padi. Filtrat cendawan endofit dari satu isolat terbaik dianalisis senyawa bioaktifnya menggunakan Liquid Chromatography-Mass Spectrometry (LC-MS). Data pertumbuhan tanaman padi dianalisis melalui Analisis Variance (ANOVA) menggunakan SAS 9.4. Perbedaan antar perlakuan dilanjutkan dengan uji Tukey pada taraf kepercayaan 95% (p<0,05). Sebanyak 14 kelompok isolat cendawan endofit berhasil diisolasi. Berdasarkan pengamatan morfologi sebanyak 11 isolat memiliki konidia (bersporulasi), sedangkan 3 isolat lainnya tidak bersporulasi. Berdasarkan hasil identifikasi molekuler, keempat belas isolat tersebut terdiri atas tiga belas spesies yaitu Cladosporium oxysporum, C. coloradense, Fusarium keratoplasticum galur 1 dan 2, F. humuli, Penicillium brefeldianum, P. citrinum, Poaceascoma lochii, Pseudopestalotiopsis simitheae, Sarocladium oryzae, Simplicillium obclavatum, Talaromyces macrosporus, T. angelicus, dan T. pinophilus. Bagian tanaman dengan frekuensi kolonisasi cendawan endofit paling tinggi terdapat pada bagian daun, sebesar 11,67%, sedangkan frekuensi kolonisasinya paling rendah terdapat pada bagian sekam yaitu 2,78%. Cendawan Sarocladium oryzae paling sering ditemukan dengan frekuensi 6,39%, atau tingkat dominansi spesies paling tinggi (95,83 %), sedangkan cendawan F. keratoplasticum galur 1, F. humuli, dan T. pinophilus paling jarang ditemukan dengan frekuensi masing-masing sebesar 0,28 % atau dominansinya paling rendah (masing-masing 4,17 %). Keragaman cendawan endofit yang diperoleh berdasarkan analisis keragaman Shanon-Wiener termaksuk dalam kategori sedang yaitu 2,24. Hasil pengujian filtrat asal ke-13 medium kultur yang telah dipisahkan dari miselium terhadap pertumbuhan benih padi lokal umur 14 hari pada kondisi laboratorium, menunjukkan isolat F. keratoplasticum galur 1 memiliki potensi yang paling baik, yaitu menghasilkan nilai peningkatan tinggi tajuk 3,87 cm, panjang akar 3,14 cm, dan bobot kering akar 3,52 mg. Analisis melalui LC-MS dari ekstrak kasar asal filtrat tersebut menunjukkan terdapat lima senyawa yang diduga membantu meningkatkan pertumbuhan tanaman padi, yaitu 2-C-methylerythritol 4-phosphate, asam sitrat, asam sitrakonat, asam DL-malat,
Keyword: 5W+1H

Judul: Dampak Penggunaan Fungisida Sintetik terhadap Kelimpahan Cendawan Endofit dan Perkembangan Penyakit Tanaman Padi
Abstrak: Aplikasi fungisida umum digunakan dalam pengendalian penyakit-penyakit padi. Penggunaan fungisida dianggap memiliki pengaruh negatif terhadap organisme non-target termasuk cendawan endofit. Cendawan endofit pada padi telah berhasil diisolasi dan di antaranya mampu meningkatkan pertumbuhan serta ketahanan tanaman inang dari cekaman biotik dan abiotik. Keberadaan cendawan endofit di dalam jaringan tanaman tidak terlepas dari pengaruh keadaan lingkungan sekitarnya, salah satunya adalah pengaruh penggunaan fungisida sintetik. Namun, pengetahuan tentang dampak fungisida terhadap cendawan endofit belum banyak diketahui. Tujuan penelitian ini adalah: (1) mendapatkan informasi mengenai keanekaragaman dan kelimpahan cendawan endofit tanaman padi akibat penggunaan fungisida sintetik; dan (2) mengetahui hubungan antara perubahan keanekaragaman dan kelimpahan cendawan endofit dengan perkembangan penyakit pada tanaman padi karena penggunaan fungisida. Penelitian dilakukan dari bulan Juni 2018 hingga Maret 2019 di Balai Besar Peramalan Organisme Pengganggu Tanaman Jatisari Karawang dan di Laboratorium Mikologi Tumbuhan Departemen Proteksi Tanaman IPB. Tahapan penelitian dimulai dari persiapan lahan, penanaman padi, isolasi cendawan endofit, dan aplikasi fungisida. Percobaan di lapangan terdiri atas dua taraf faktor yaitu fungisida kontak (mankozeb), fungisida sistemik (difenokonazol), dan kontrol sebagai pembanding. Isolasi cendawan endofit dan aplikasi fungisida dilakukan setiap minggu, dimulai saat tanaman berumur 3 hingga 10 minggu setelah tanam (mst). Variabel yang diamati dan dihitung adalah total segmen daun dan batang padi yang dikolonisasi cendawan endofit, jenis dan jumlah spesies cendawan endofit, serta frekuensi kolonisasi cendawan endofit. Selanjutnya dihitung indeks keanekaragaman Shanon-Wiener, indeks kemerataan, dan indeks kesamaan Sorensen cendawan endofit dari setiap perlakuan. Lima isolat cendawan endofit dengan frekuensi kolonisasi tertinggi diuji antagonis terhadap penyebab penyakit busuk pelepah (Sarocladium oryzae) dan juga diuji patogenisitas terhadap benih padi. Tingkat keparahan dan kejadian penyakit tanaman padi juga diamati dalam uji coba lapangan. Hubungan antara cedawan endofit dan keparahan dan kejadian penyakit tanaman padi dianalisis dengan korelasi Pearson. Hasil penelitian menunjukkan bahwa ada peningkatan kolonisasi cendawan endofit dengan pertambahan umur tanaman padi. Terdapat 37 morfospesies cendawan endofit yang berhasil diisolasi dari daun dan batang tanaman padi. Berdasarkan analisis indeks keanekaragaman Shanon-Wiener dan indeks kemerataan, cendawan endofit pada batang lebih beragam daripada daun padi. Berdasarkan analisis indeks kesamaan Sorensen, cendawan endofit antara berbagai perlakuan memiliki kesamaan spesies yang tinggi. Genus dominan cendawan endofit yang mengolonisasi daun dan batang padi yaitu Acremonium, Curvularia, Fusarium, Helminthosporium, Nigrospora, Penicillium, dan Mucor. Pengaruh fungisida terhadap cendawan endofit daun dan batang padi tidak menunjukkan perbedaan yang nyata. Namun, pada batang, frekuensi kolonisasi cendawan endofit menurun selama fase pertumbuhan muda tanaman dengan perlakuan mankozeb dan difenokonazol. Frekuensi kolonisasi genus Nigrospora dan Fusarium juga menurun pada batang dengan perlakuan difenokonazol selama fase pertumbuhan muda tanaman. Mankozeb dan difenokonazol berpengaruh secara nyata mengurangi keparahan penyakit bercak cokelat sempit (Cercospora oryzae) pada 9 dan 10 mst, tetapi tidak memengaruhi keparahan penyakit hawar daun bakteri (Xanthomonas oryzae pv oryzae). Sementara itu, mankozeb dan difenokonazol meningkatkan kejadian penyakit busuk pelepah pada 8 mst. Berdasarkan analisis korelasi Pearson, hubungan antara indeks keanekaragaman cendawan endofit (H’) dengan tingkat keparahan dan kejadian penyakit tidak konsisten di setiap minggu. Dengan perlakuan difenokonazol, indeks keanekaragaman (H’) cendawan endofit pada batang konsisten berkorelasi positif terhadap keparahan penyakit bercak cokelat sempit setiap minggu. Analisis korelasi Pearson antara frekuensi kolonisasi genus dominan
Keyword: difenokonazol, keanekaragaman, kolonisasi, komunitas, mankozeb

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: