Judul: Deteksi dan pembandingan fitoplasma asal rumput bermuda (Cynodon dactyton (L.) Pers.) dan inang lainnya menggunakan teknik PCR-RFLP Serta Penularannya dengan Serangga
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk medeteksi fitoplasma pada rumput Bermuda yang bergejala penyakit daun putih dan wereng daun menggunakan teknik PCR, mengetahui adanya perbedaan fitoplasma rumput Bermuda dengan fitoplasma yang berasa dari tanaman-tanaman lain menggunakan teknik PCR RFLP serta melakukan uji penularanfitoplasma rumput Bermuda denagn wereng daun. Teknik PCR Menggunakan primer P1/P7 dilakukan terhadap DNA total hasil ekstraksi dari rumput bermuda sakit dan tanaman sakit lainnya serta wereng daun yang telah diberi perlakuan akuisisi dan periode laten.
Keyword: 

Judul: Penularan Fitoplasma pada Tanaman Kacang Tanah oleh Serangga Vektor Orosius argentatus dan Deteksi Molekuler dengan Teknik PCR.
Abstrak: Tanaman kacang tanah (Arachis hypogea L.) merupakan tanaman pangan yang menjadi sumber protein bagi masyarakat Indonesia. Tanaman ini memiliki nilai ekonomi yang tinggi sehingga banyak dibudidayakan. Permasalahan yang muncul dalam kegiatan budidaya kacang tanah salah satunya adalah serangan patogen. Fitoplasma penyebab penyakit sapu merupakan salah satu patogen yang memiliki potensi untuk menyebabkan kehilangan hasil yang tinggi pada pertanaman kacang tanah. Agens penular fitoplasma yang paling utama di lapangan adalah serangga vektor. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui sifat penularan fitoplasma pada kacang tanah oleh serangga vektor (wereng daun Orosius argentatus) dan serangga pembanding (wereng daun Empoasca sp.) menggunakan teknik uji hayati, pakan artifisial, dan Polymerase Chain Reaction (PCR). Metode yang digunakan dalam penelitian ini meliputi uji hayati penularan fitoplasma masing-masing oleh wereng daun O. argentatus dan Empoasca sp. dalam jumlah berbeda dari tanaman kacang tanah sakit bergejala sapu ke tanaman sehat, uji inokulasi serangga-serangga viruliferous tersebut ke pakan artifisial berupa medium makan larutan Sukrosa-TE dalam kantong parafilm (feeding sachet), dan deteksi fitoplasma dengan teknik PCR terhadap sampel tanaman uji, tubuh wereng daun uji, dan air liur wereng daun uji dalam pakan artifisial. Hasil yang diperoleh dari uji penularan fitoplasma dengan wereng daun menunjukkan bahwa O. argentatus merupakan serangga vektor yang efektif dalam menularkan fitoplasma penyebab penyakit sapu, sedangkan serangga pembanding Empoasca sp. bukan merupakan vektor. O. argentatus memiliki kemampuan mentransmisikan fitoplasma ke dalam jaringan tanaman kacang tanah dengan jumlah minimum satu ekor per tanaman. Namun, jumlah O. argentatus yang dapat menularkan fitoplasma dan menyebabkan gejala yang berat adalah 7 ekor per tanaman dibandingkan jumlah 1, 3 dan 5 ekor per tanaman. Masa inkubasi fitoplasma pada tanaman inang semakin pendek dengan semakin banyaknya jumlah O. argentatus yang diberikan. Infeksi fitoplasma yang berat pada tanaman kacang tanah menyebabkan peningkatan jumlah daun dan cabang secara drastis, menurunkan kuantitas dan kualitas hasil panen, dan memperpanjang umur tanaman dari kondisi normal. Fitoplasma berhasil terdeteksi dengan teknik PCR menggunakan pasangan primer P1 dan P7 pada tanaman kacang tanah yang menimbulkan gejala penyakit sapu dan pada tubuh wereng yang menularkannya, namun tidak terdeteksi pada medium makan artifisial sukrosa-TE.
Keyword: 

Judul: The Construction of Greedy SVP LLL Algorithm
Abstrak: A lattice is a set of all integer linear combination of a set of linearly independent vectors in ℝ𝑛���. The independent vectors are called bases of lattice. Any lattice can be generated from many bases, and these bases have the same cardinality. In the lattice, the most fundamental and renowned problem is the Shortest Vector Problem (SVP). SVP is a tracking problem of the shortest nonzero vector in a lattice with equivalent bases. In two dimensions, SVP problem has resolved exactly by Gauss’ algorithm. When the lattice dimension is higher than two, A.K. Lenstra, H.W. Lenstra and L. Lovasz gave a LLL algorithm to compute approximation of nonzero shortest vector in the lattice. Reduced bases solution obtained from LLL algorithm still be an approximation and has polynomial running time of arbitrary dimension which large enough. In 1994, Schnoor and Euchner modified this LLL algorithm as a new variant which later was named deep insertion LLL algorithm. This algorithm is a modified version of the LLL algorithm to the terms of the exchange step to improve the accuracy of output of LLL reduced bases and applying it to the subset sum problem. The purpose of this research are: (1) Reconstruct the LLL algorithm and deep insertion LLL algorithm using a geometric approach. (2) Construct a greedy SVP LLL algorithm. (3) Implement the three algorithms in a symbolic programming language, and evaluate them experimentally. A bases ℬ=[𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑛���] in ℝ𝑚��� is called reduced LLL with parameter 𝛿��� if satisfies: (a) |𝜇���𝑗���𝑖���|≤12, for every integer 𝑖���,𝑗��� with 1≤𝑖���<𝑗���<𝑛���. (b)𝛿���‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���)‖2≤‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���+1)‖2, for 𝑗���=1,2,…,𝑛���−1,where 𝛿��� is a reduced parameter of real numbers with 14<𝛿���<1. The first requirement is the reduced basis 𝛿��� must “nearly orthogonal” and in its computation case, this requirement can be reached out by using the Gram-Schmidt’s orthogonalization. While the second requirement is called exchange step, or used to called as Lovasz condition. By using both of these requirements, then they establish the LLL algorithm. Then, Schnoor and Euchner modify the LLL algorithm based on the requirements of the exchange step called the deep insertion LLL algorithm, where the exchange step is based on the comparison of the projected vector in orthogonal complement [𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑘���−1]⊥ after j-th reduction. To construct greedy SVP LLL algorithm, the requirements of the exchange step is based on purely by comparing norm of lattice 𝐛���𝑗��� with norm lattice 𝐛���𝑖��� for 𝑖���=1,2,3…,𝑗���−1. The process of insertion reduced vector after the exchange step also has done greedily. Then, we calculate the number of arithmetic operation in greedy SVP LLL algorithm for further analysis. The result of our exprimentation for three algorithms on the certain matrix size shows that the running time of the three algorithms increases propotional to the size of the matrix. The result also shows that by using 𝛿���=34 for the LLL algorithm and the deep insertion LLL algorithm, and the greedy SVP LLL algorithm which is a new variant made by using no parameter of 𝛿���, outperform of the other of two previous algorithm in terms of speed with the same output.
Keyword: LLL algorithm, LLL deep insertion algorithm, greedy SVP LLL algorithm