Judul: Deteksi Endobakteri dan Uji Patogenisitas Fusarium oxysporum fsp. cubense terhadap Tanaman Pisang.
Abstrak: Fusarium oxysporum fsp. cubense (Foc) merupakan cendawan penyebab penyakit layu Panama pada tanaman pisang. Keberadaan endobakteri pada Foc koleksi IPBCC belum diketahui. Padahal bakteri endosimbion cendawan dapat mengubah morfologi dan gaya hidup inangnya. Patogenisitas Foc pembawa endobakteri terhadap pisang juga belum diketahui. Oleh sebab itu penelitian ini bertujuan mendeteksi endobakteri pada Foc dan mempelajari patogenisitasnya terhadap pisang ambon dan pisang tanduk. Sebanyak 17 strain Foc dideteksi keberadaan endobakterinya secara molekuler berdasarkan daerah 16S rDNA dengan primer 63F dan 1387R. Keberadaannya dikonfirmasi dengan pewarnaan BacLight yang sediaannya diamati menggunakan mikroskop fluorescence. Beberapa strain Foc pembawa endobakteri diuji dengan cara penyuntikan filtrat pada tulang daun tanaman pisang ambon dan tanduk yang berumur 5 bulan. Hasil penelitian secara molekuler menunjukkan bahwa 41.2% strain Foc membawa endobakteri, yaitu Foc 08, Foc 12, Foc 18, Foc 32A, Foc 33, Foc 37, dan Foc 44. Keberadaanya dikonfirmasi dengan pewarnaan BacLight. Namun, semua strain Foc yang diteliti terdeteksi membawa endobakteri yang ditandai dengan adanya sel bakteri hidup berpendar hijau setelah diwarnai dengan BacLight. Endobakteri banyak ditemukan pada struktur konidia dan hifa bagian tengah. Endobakteri juga ditemukan pada ujung-ujung hifa. Uji patogenisitas beberapa strain Foc pembawa endobakteri pada pisang ambon dan tanduk menunjukkan bahwa filtrat Foc mampu menginduksi terbentuknya gejala sakit pada kedua kultivar pisang tersebut. Uji patogenisitas ini juga menunjukkan bahwa strain-strain Foc yang diuji tergolong ras 4.
Keyword: bakteri, endosimbion, Fusarium oxysporum, pisang, virulen

Judul: Identifikasi Endobakteri Simbion Fusarium oxysporum f.sp. cubense dan Evaluasi Patogenisitas Simbiosisnya Terhadap Pisang Secara in vitro
Abstrak: Fusarium oxysporum f.sp. cubense (Foc) adalah cendawan penyebab layu pada tanaman pisang yang dilaporkan membawa endobakteri simbion. Namun, identitas dan pengaruh simbiosis endobakteri-Foc terhadap inangnya belum diketahui. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi endobakteri pada 7 strain Foc dan mempelajari pengaruh endobakteri terhadap patogenisitas Foc pada dua kultivar pisang, yaitu Ambon Kuning dan Tanduk. Identifikasi endobakteri dilakukan melalui analisis filogenetik pada daerah 16S rDNA dengan primer 27F dan 1492R . Patogenisitas dua strain Foc (Foc08 dan Foc12) diukur dengan uji in vitro filtrat kasar dan biomassa Foc terhadap plantling tanaman pisang yang siap diaklimatisasi. Filtrat kasar dan biomassa diperoleh dari kultur Foc pada Potato Dextrose Broth (PDB) (Foc-) dan PDB dengan penambahan antibiotik (Foc+) selama 21 hari dalam kondisi statis. Patogenisitas diukur dengan indeks serangan pada daun dan pangkal batang. Hasil penelitian menunjukkan 7 strain Foc memiliki endobakteri dan hanya endobakteri pada Foc12 yang berhasil diidentifikasi, yaitu Izhakiella australiensis. Endobakteri simbion Foc12 berpengaruh tidak nyata terhadap virulensi Foc12 pada kedua kultivar pisang. Endobakteri simbion Foc08 berpengaruh nyata terhadap virulensi Foc08 pada pisang Tanduk melalui pembentukan efektor. Interaksi endobakteri-Foc08 dengan pisang Ambon Kuning perlu dikaji lebih lanjut. Pemberian antibiotik belum mampu membunuh endobakteri secara menyeluruh.
Keyword: 16S rDNA, endosimbiosis, Izhakiella, layu panama, virulensi

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: