Judul: Analisis komunitas bakteri selam tahapan perkembangan larva udang putih (Litopenaeus vannamei)
Abstrak: Sampel untuk analisis diperoleh dari satu siklus produksi di hatchery berupa telur, nauplii, zoea, mysis, dan post larva. T-RFLP dan ARDRA menggunakan marker yang sama, yaitu gen 16S rRNA, tetapi untuk T-RFLP amplifikasi dilakukan dengan primer forward yang dilabel pada ujung 5’ sedangkan untuk ARDRA menggunakan primer yang tidak dilabel. Baik T-RFLP maupun ARDRA menunjukkan bahwa tiap tahapan perkembangan larva memiliki pola sidik ragam komunitas bakteri yang unik. Komunitas bakteri berubah secara dinamis mengikuti perkembangan larva, kecuali pada tahapan yang lebih akhir, di mana sistem imunitas dan pencernaan larva sudah berkembang lebih sempurna. Proses molting menyebabkan komunitas bakteri selalu berubah karena lapisan kitin saluran pencernaan ikut mengelupas dan lapisan yang baru bebas dari bakteri. Berdasarkan analisis keragaman, komunitas bakteri pada mysis atau post larva memiliki tingkat keragaman dan distribusi jenis yang paling tinggi dan merata, sementara komunitas bakteri pada zoea adalah yang terendah keragamannya dan tidak merata. Filotipe yang dominan pada masing-masing tahapan berbeda. Demikian juga terdapat perbedaan antara komunitas bakteri yang berasosiasi dengan larva dan komunitas bakteri di air pemeliharaannya. Jenis yang dominan pada air pemeliharaannya bukan merupakan jenis yang dominan berasosiasi dengan larva. Akan tetapi, beberapa filotipe dapat ditemukan pada keduanya, dan secara bersama-sama filotipe-filotipe ini dalam komunitas memiliki kemelimpahan relatif yang besar dan dominan. Selain air, kemungkinan pakan juga mempengaruhi komposisi komunitas bakteri yang berasosiasi dengan larva.
Keyword: microbial community, bacterial community, fingerprint pattern, Proteobacteria for egg, Bacteroidetes for nauplii

Judul: Identification of Bacterial Community in Vannamei Shrimp (Litopenaeus vannamei) from Two Different Market Locations Using Metagenomic Technology
Abstrak: Udang merupakan komoditas hasil perairan yang mudah mengalami proses kemunduran mutu, salah satunya disebabkan oleh aktivitas bakteri. Penggunaan media kultur dalam proses identifikasi komunitas bakteri menjadi kurang optimal, karena proses kultivasi tidak dapat menumbuhkan semua jenis bakteri. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi komunitas bakteri yang terdapat pada komoditas udang segar dengan teknik metagenomik. Proses identifikasi bakteri dilakukan melalui tahap pengusapan permukaan udang, kemudian isolasi DNA bakteri menggunakan Wizard Genomic DNA Purification Kit dan amplifikasi menggunakan primer universal 16S rRNA dengan wilayah V3-V4. Proses sekuensing dilakukan menggunakan teknik Next Generation Sequencing. Komunitas bakteri yang teridentifikasi didominasi oleh filum Bacteroidota, Patescibacteria, Firmicutes, Fusobacteriota, Campilobacteriota, Actinobacteriota, dan Proteobacteria. Potensi kelompok bakteri patogen dan pembusuk pada udang teridentifikasi berasal dari genus Myroides, Flavobacterium, Pseudomonas, Aeromonas, Escherichia, Shigella dan Shewanella, Shrimp is an aquatic product that is prone to deterioration in quality, one of which is caused by bacterial activity. The use of culture media in the identification process of bacterial communities is less than optimal because the cultivation process cannot grow all types of bacteria. This study aims to identify the bacterial community found in fresh shrimp commodities with a metagenomic approach. The bacterial identification process was carried out by swabbing the surface of the shrimp, then isolating bacterial DNA using the Wizard Genomic DNA Purification Kit and amplification using a universal 16S rRNA primer with a V3-V4 region. The sequencing process was carried out using Next Generation Sequencing. The identified bacterial community was dominated by the phyla Bacteroidota, Patescibacteria, Firmicutes, Fusobacteriota, Campilobacteriota, Actinobacteriota, and Proteobacteria. Potential groups of pathogenic and spoilage bacteria in shrimp were identified from the genera Myroides, Flavobacterium, Pseudomonas, Aeromonas, Escherichia, Shigella, and Shewanella
Keyword: amplicon sequence variants, bakteri, DNA, udang

Judul: Pengaruh ukuran billboard terhadap kualitas estetika lanskap kota Bogor
Abstrak: Salah satu permasalahan kota yang dialami saat ini antara lain adalah permintaan billboard. Penataan dan pemasangan billboard yang salah dapat menurunkan kualitas estetika lanskap kota. Ukuran billboard relatif besar, mendominasi pandangan sehingga menutupi good view yang berada di belakangnya.
Keyword: