Judul: Karakteristik Marka Genetik DNA Mitokondria Sebagai Acuan Konservasi Genetik Harimau Sumatera
Abstrak: Harimau Sumatera merupakan satu-satunya subspesies harimau yang masih bertahan hidup di Indonesia dan saat ini keberadaannya terancam punah. Dengan mengetahui status genetik dan keragaman genetik suatu populasi dapat dirancang suatu program konservasi untuk menghindari kepunahan dan membantu pengembangan rencana pengelolaan kelangsungan hidupnya (Damayanti 2007). Pengkajian keragaman genetik melalui penandaan molekuler menggunakan Deoxyribonucleic Acid (DNA), baik dari DNA inti dan DNA mitokondria (mtDNA) akan mengungkapkan perbedaan dengan lebih teliti dalam membedakan intra dan interspesies yang menyangkut tentang struktur, komposisi, dan organisasi genom pada tingkat DNA (Duryadi 1994). Cytochrome b (Cyt. b) merupakan fragmen di dalam genom yang biasa digunakan untuk mengetahui hubungan spesies dari genus atau famili yang sama. Sedangkan daerah Displacement loop (D-loop) biasa digunakan untuk mengetahui hubungan kekerabatan sampai tingkatan intraspesies karena dua domainnya yaitu HVS-I (Hypervariable Segments I) dan HVS-II memiliki mutasi yang tinggi (Widayanti 2006). Penelitian ini bertujuan (1) Untuk menganalisis keragaman genetik berdasarkan marka genetik daerah Cyt. b parsial dan daerah D-loop bagian HVS-I pada Harimau Sumatera; dan (2) Untuk mengetahui hubungan kekerabatan antar individu Harimau Sumatera dan antar subspesies Harimau Sumatera dengan subspesies harimau lainnya di dunia.
Keyword: 

Judul: Analisis keragaman genetik harimau Sumatera (Panthera tigris sumatrae Pocock, 1929) asal Aceh berdasarkan gen Cytochrome B
Abstrak: Harimau Sumatera (Panthera tigris sumatrae Pocock, 1929) adalah salah satu dari subspesies yang diketahui berada di Indonesia. Di Sumatra diperkirakan populasinya sekitar 400-500 ekor, sementara di Aceh terdapat 110-140 ekor. IUCN (International Union for Conservation of Nature and Natural Resources) mengkategorikan sebagai spesies yang kritis keberadaannya dan terancam punah. Tujuan dari penelitian ini adalah menganalisis keragaman genetik harimau Sumatera asal Aceh dan mengetahui kekerabatannya. Bahan yang digunakan berupa darah awetan sebagai sumber materi DNA yang merupakan koleksi dari Laboratorium Biologi Molekuler, Departemen Biologi FMIPA IPB. Hasil isolasi dan purifikasi DNA kemudian diamplifikasi dengan PCR memakai primer spesifik forward UF-06 5’-AGCAGCAGTCCACCTCCTA- TTCCTT-3’ dan reverse UF-07 5’-GCTTTGGGTGCTGATGGTGGGGCTA-3’. Produk PCR disekuensing dan dianalisis pohon filogeninya. Basa-basa nukleotida yang berbeda antara harimau Sumatera asal Aceh (A1, A2, A3, A4) dan EF551003 (Panthera tigris amoyensis) adalah 16 basa nukleleotida. Hubungan kekerabatan antara keempat harimau Aceh adalah bahwa A2 lebih dekat dengan A3 dan keduanya lebih dekat dengan A4 daripada A1. Hasil Analisis setelah memasukkan outgroup harimau Amoy (Panthera tigris amoyensis), harimau Aceh tidak berubah dan tetap dalam satu cluster. Berdasarkan hasil analisis keragaman genetik di daerah Cyt. B pada harimau Aceh A1, A2, A3, dan A4 didapatkan dua buah situs basa nukleotida spesifik yang mencirikan harimau Sumatera, yaitu basa nukleotida ke 108 (Guanin) dan basa nukleotida ke 121 (Timin).
Keyword: Genetic diversity, Panthera tigris balica, Deoxyribonucleic Acid

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: