Judul: Interaksi Antara Cendawan Endofit Asal Jahe Merah dengan Beberapa Bakteri Patogen pada Manusia
Abstrak: Cendawan endofit hidup pada berbagai jaringan tanaman seperti akar, batang, daun, dan buah. Cendawan tersebut bersifat simbiosis mutualisme atau netral dengan tanaman inang serta berpotensi sebagai sumber penghasil senyawa bioaktif termasuk senyawa antibakteri. Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari interaksi antara cendawan endofit asal jahe merah dengan bakteri patogen manusia Bacillus cereus, Staphylococcus aureus, dan Salmonella typhii. Metode pengujian yang digunakan adalah metode co-culture serta metode oposisi langsung melalui cara gores dan lapis ganda. Terdapat tiga tipe mekanisme cendawan endofit dalam mengendalikan bakteri uji yaitu melalui kontak fisik, produksi senyawa antibakteri, dan kombinasi kedua mekanisme tersebut. Hasil penelitian menunjukkan bahwa cendawan endofit yang diuji yang memiliki mekanisme interaksi secara fisik terhadap B. cereus, S. aureus, dan S. typhii berturut-turut ialah satu, sembilan, dan enam strain. Jumlah cendawan yang memiliki mekanisme interaksi melalui produksi senyawa antibakteri adalah enam strain terhadap S. aureus, dan lima strain terhadap S. typhii, sedangkan cendawan yang memiliki kedua mekanisme ialah sebanyak tiga strain terhadap S. aureus dan dua strain terhadap S. typhii. Hampir seluruh cendawan endofit yang diuji menunjukkan perubahan morfologi hifa sebagai hasil interaksi dengan bakteri uji. Perubahan morfologi yang terjadi ialah perubahan diameter hifa, hifa terpuntir 180o dan 360o, dinding sel hifa berkeriput atau berkelok, pembentukan klamidospora, dan percabangan hifa lebih banyak.
Keyword: antibakteri, cendawan endofit, interaksi, perubahan morfologi hifa

Judul: Interaksi Cendawan Endofit Asal Jahe Merah (Zingiber Officinale Roscoe) Dengan Beberapa Bakteri Yang Merugikan
Abstrak: Cendawan endofit merupakan cendawan yang hidup pada jaringan tumbuhan yang sehat termasuk tanaman obat seperti jahe merah. Jahe merah umumnya digunakan sebagai obat tradisional termasuk pengobatan penyakit yang disebabkan oleh infeksi bakteri patogen. Tujuan penelitian ini ialah untuk mempelajari interaksi antara cendawan endofit asal jahe merah dengan bakteri Morganella morganii, Pseudomonas aeruginosa, dan Escherichia coli. Metode double layer digunakan untuk menguji kemampuan cendawan dalam menghambat bakteri uji, sedangkan metode oposisi langsung digunakan untuk pengamatan karakteristik morfologi cendawan ketika bertemu dengan ketiga bakteri tersebut. Hasil uji double layer menunjukkan bahwa 13 isolat yang diuji mempunyai aktivitas penghambatan yang bervariasi terhadap ketiga bakteri, dua isolat menghambat ketiga bakteri uji, satu isolat tidak menghambat ketiganya, sedangkan sepuluh isolat memiliki aktivitas penghambatan yang bervariasi. Aktivitas penghambatan cendawan terhadap masing-masing bakteri uji menunjukkan bahwa sepuluh isolat menghambat M. morganii, sembilan isolat menghambat P. aeruginosa, dan tiga isolat menghambat E. coli. Fusarium solani memiliki aktivitas penghambatan tertinggi terhadap M. morganii dan P. aeruginosa dengan diameter zona bening masing-masing sebesar 2.17 mm dan 1.75 mm, sedangkan Acremonium macrolavatum memiliki aktivitas penghambatan tertinggi terhadap E. coli dengan diameter zona bening sebesar 1.5 mm. Sebagian besar isolat cendawan menunjukkan perubahan morfologi hifa ketika bertemu dengan bakteri uji. Perubahan morfologi hifa tersebut ialah menjadi keriting, menggulung, dan kadang-kadang membentuk klamidospora.
Keyword: Antibakteri, daya hambat, modifikasi morfologi hifa, zona bening

Judul: The Construction of Greedy SVP LLL Algorithm
Abstrak: A lattice is a set of all integer linear combination of a set of linearly independent vectors in ℝ𝑛���. The independent vectors are called bases of lattice. Any lattice can be generated from many bases, and these bases have the same cardinality. In the lattice, the most fundamental and renowned problem is the Shortest Vector Problem (SVP). SVP is a tracking problem of the shortest nonzero vector in a lattice with equivalent bases. In two dimensions, SVP problem has resolved exactly by Gauss’ algorithm. When the lattice dimension is higher than two, A.K. Lenstra, H.W. Lenstra and L. Lovasz gave a LLL algorithm to compute approximation of nonzero shortest vector in the lattice. Reduced bases solution obtained from LLL algorithm still be an approximation and has polynomial running time of arbitrary dimension which large enough. In 1994, Schnoor and Euchner modified this LLL algorithm as a new variant which later was named deep insertion LLL algorithm. This algorithm is a modified version of the LLL algorithm to the terms of the exchange step to improve the accuracy of output of LLL reduced bases and applying it to the subset sum problem. The purpose of this research are: (1) Reconstruct the LLL algorithm and deep insertion LLL algorithm using a geometric approach. (2) Construct a greedy SVP LLL algorithm. (3) Implement the three algorithms in a symbolic programming language, and evaluate them experimentally. A bases ℬ=[𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑛���] in ℝ𝑚��� is called reduced LLL with parameter 𝛿��� if satisfies: (a) |𝜇���𝑗���𝑖���|≤12, for every integer 𝑖���,𝑗��� with 1≤𝑖���<𝑗���<𝑛���. (b)𝛿���‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���)‖2≤‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���+1)‖2, for 𝑗���=1,2,…,𝑛���−1,where 𝛿��� is a reduced parameter of real numbers with 14<𝛿���<1. The first requirement is the reduced basis 𝛿��� must “nearly orthogonal” and in its computation case, this requirement can be reached out by using the Gram-Schmidt’s orthogonalization. While the second requirement is called exchange step, or used to called as Lovasz condition. By using both of these requirements, then they establish the LLL algorithm. Then, Schnoor and Euchner modify the LLL algorithm based on the requirements of the exchange step called the deep insertion LLL algorithm, where the exchange step is based on the comparison of the projected vector in orthogonal complement [𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑘���−1]⊥ after j-th reduction. To construct greedy SVP LLL algorithm, the requirements of the exchange step is based on purely by comparing norm of lattice 𝐛���𝑗��� with norm lattice 𝐛���𝑖��� for 𝑖���=1,2,3…,𝑗���−1. The process of insertion reduced vector after the exchange step also has done greedily. Then, we calculate the number of arithmetic operation in greedy SVP LLL algorithm for further analysis. The result of our exprimentation for three algorithms on the certain matrix size shows that the running time of the three algorithms increases propotional to the size of the matrix. The result also shows that by using 𝛿���=34 for the LLL algorithm and the deep insertion LLL algorithm, and the greedy SVP LLL algorithm which is a new variant made by using no parameter of 𝛿���, outperform of the other of two previous algorithm in terms of speed with the same output.
Keyword: LLL algorithm, LLL deep insertion algorithm, greedy SVP LLL algorithm