Judul: Effect of Vitamin C and Vitamin B Complex on Glut-4 Translocation through PTEN and Tnf-Alfa Pathways in Silico
Abstrak: Diabetes Melitus (DM) terus menjadi isu kesehatan yang serius, hal ini dikarenakan prevalensi DM telah meningkat secara drastis selama dua dekade terakhir. Terdapat 177 juta kasus diabetes melitus, 90% diantaranya merupakan diabetes melitus tipe2 (T2DM). Banyak faktor yang mempengaruhi terjadiya T2DM, seperti obesitas, tingginya supresor GLUT-4 dan tingginya radikal bebas pada tubuh. Tnf-Alfa dan PTEN merupakan salah beberapa faktor yang dapat menghambat tertranslokasinya GLUT-4. Vitamin C dan B kompleks (B1,B2,B3,B12) terbukti dapat meningkatkan translokasi GLUT-4, tetapi mekanismenya masih belum diketahui. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui efek dari vitamin C dan vitamin B kompleks terhadap masuknya glukosa kedalam sel melalui jalur transpot GLUT-4 melalui mekanisme penghambatan PTEN dan Tnf-Alfa. Metode yang digunakan pada penelitian ini adalah penambatan molekular secara in sillico melalui analisis energi afinitas dan situs ikat (binding site). Interaksi antara ligan uji menunjukan interaksi yang sangat baik terhadap reseptor PTEN dan kurang baik pada reseptor Tnf-Alfa. Ligan dengan interaksi terbaik pada reseptor PTEN adalah asam folat. Ligan dengan interaksi terbaik pada reseptor Tnf-Alfa adalah riboflavin., Diabetes mellitus (DM) continues to be a serious health issue, this is because the prevalence of DM has increased dramatically over the past two decades. There are 177 million cases of diabetes mellitus, 90% of which are type 2 diabetes mellitus (T2DM). Many factors affect the occurrence of T2DM such as obesity, high GLUT-4 suppressor and high free radicals in the body. Tnf-Alfa and PTEN are one of the factors that can inhibit GLUT-4 translocation. Vitamin C and B complex (B1, B2, B3, B12) are proven to increase GLUT-4 translocation but the mechanism is still unknown. This study aims to determine the effect of vitamin C and vitamin B complex on the entry of glucose into cells through the GLUT-4 transport pathway through the inhibiting mechanism of PTEN and Tnf-Alfa. The method used in this research is molecular docking in sillico through energy affinity and binding site analysis. The interaction between the test ligands showed a very good interaction with the PTEN receptor and less good on the Tnf-Alfa receptor. Ligands with the best interactions on PTEN receptors are folic acid.Ligands with the best interactions on Tnf-Alfa receptors are riboflavin.
Keyword: Vitamin C, Vitamin B complex, GLUT-4, PTEN, Tnf-Alfa

Judul: Penambatan Molekul Kuersetin dan Turunan Katekin sebagai Inhibitor TNF Alpha secara In Silico
Abstrak: Diabetes Melitus (DM) terbagi menjadi dua jenis yaitu diabetes tipe 1 dan tipe 2. DM tipe 2 dapat terjadi karena adanya sel-sel tubuh resisten terhadap insulin. Senyawa antioksidan dapat menetralisir radikal bebas sehingga dapat mencegah penyakit degeneratif DM. Kuersetin dan katekin merupakan salah satu contoh senyawa antioksidan yang dapat memberikan efek antidiabetik. Senyawa tersebut sebagai ligan dan TNF-α sebagai reseptor. TNF-α merupakan mediator yang secara kritis terlibat dalam pengembangan resistensi insulin dan patogenesis DM tipe 2. Penelitian ini bertujuan mempelajari interaksi molekuler dengan teknik penambatan molekul serta menguji senyawa katekin dan kuersetin dalam menginhibisi TNF-α untuk memperbaiki sensitivitas membran sel terhadap insulin. Ligan uji yang digunakan epikatekin galat, epigalokatekin, katekin, epikatekin, epigalokatekin, dan kuersetin. Penelitian ini menggunakan perangkat lunak seperti AutoDock Vina, MarvinView, Ligplot+, PROCHECK, dan Discovery Studio Visualizer. Hasil terbaik yang diperoleh yaitu senyawa epikatekin galat memiliki energi afinitas sebesar -7.9 kkal/mol dan nilai konstanta inhibisi sebesar 1.595 μM. Residu asam amino yang berperan dalam sisi pengikatan ligan terhadap reseptor yaitu Tyr119 dan Tyr151. Simpulan dari penelitian ini senyawa turunan katekin dan kuersetin memiliki potensi yang baik dalam menurunkan aktivitas TNF-α yang menyebabkan peningkatan pemasukan glukosa ke dalam sel melalui mekanisme inhibisi reseptor TNF-α., Diabetes Melitus (DM) is divided into two types DM type 1 and type 2. T2DM can occur due to the presence of body cells resistant to insulin. Antioxidant compounds can neutralize free radicals to prevent degenerative diseases of DM. Quercetin and catechins are one example of antioxidant compounds that can give an antidiabetic effect. These compounds are as ligands and TNF-α as receptors. TNF-α is a mediator that is critically involved in the development of insulin resistance and pathogenesis T2DM. This study aims to study molecular interactions with molecular docking techniques and to examine catechins and quercetin compounds in inhibiting TNF-α to improve cell membrane sensitivity to insulin. The test ligands used were epicatechin gallate, epigalocatekin, catechin, epicatechin, epigalocatekin, and quercetin. This research uses software such as AutoDock Vina, MarvinView, Ligplot +, PROCHECK, and Discovery Studio Visualizer. The best results obtained were that the epicatechin gallate compound had an energy affinity of -7.9 kcal / mol and inhibition constant value of 1.595 μM. The amino acid residue that plays a role in the binding of ligands to the receptor is Tyr119 and Tyr151. The conclusion of this study that catechin and quercetin derivatives have good potential in reducing TNF-α activity which causes an increase in glucose entry into cells through the mechanism of receptor inhibition.
Keyword: DM type 2, in silico, quercetin, receptor TNF Alpha, catechin derrivates

Judul: Studi Taksonomi Katak Subgenus Papurana (Lesson, 1831) dari Halmahera (Anura, Ranidae, Hylarana), Studi Taksonomi Katak Subgenus Papurana (Lesson, 1831) dari Halmahera (Anura, Ranidae, Hylarana
Abstrak: I reevaluated taxonomic of subgenus Papurana position from Halmahera based on morphological and molecular analyses. My results show that two separate species occur on the Halmahera Island, each nested within two distinct clades (hereafter papua clade and celebensis clade), one of which corresponds to H. moluccana (celebensis clade) and the other to an unidentified species (papua clade). By p-distance ranging from 6.9 to 11.5% on the 16S rRNA gene, the unidentified species (Hylarana sp.) is genetically different from all congeners of the papua clade. The Hylarana sp. can be distinguished from all congeners by following combination of charactes: vomer teeth in two oblique rows with narrow inter-vomer distance; snout rounded dorsally; dorsum with few scattered cone-shaped tubercles that are black with white tips; distinct skin folds (ridges) on the dorsal side of the thigh coinciding with dark brown cross bars; a marbled pattern on the ventral side of the thigh and yellowish groin. I also present new data for H. daemeli, H. volkerjane, and H. arfaki from the western region of Papua. Furthermore, I found that H. celebensis has numerous mtDNA lineages, indicating cryptic diversity within the celebensis clade. The discovery of two separate species on Halmahera necessitates more research into the biogeographic history of Hylarana in Northern Moluccas.
Keyword: frog, Halmahera, Hylarana, morphology, Papurana, phylogenetic