Judul: Efektivitas Ekstrak Paci-Paci Leucas lavandulaefolia Yang Diberikan Lewat Pakan Untuk Pencegahan Dan Pengobatan Infeksi Penyakit MAS Motile Aeromonas Septicemia Pada Ikan Lele Dumbo Clarias sp.
Abstrak: Ikan lele dumbo (Clarias sp.) merupakan ikan konsumsi air tawar yang cukup digemari masyarakat karena rasa dagingnya yang gurih, harganya terjangkau, dan memiliki protein yang cukup tinggi. ). Budidaya ikan lele dumbo saat ini berkembang menjadi budidaya intensif karena semakin tingginya permintaan di pasaran. Semakin berkembangnya sektor akuakultur maka permasalahan yang dihadapi pun menjadi semakin banyak pula. Salah satunya adalah permasalahan penanggulangan penyakit pada ikan. Di Indonesia, wabah penyakit bercak merah ikan yang disebabkan oleh bakteri Aeromonas ini dilaporkan pertama kali terjadi di suatu areal pembudidayaan ikan di Cibening, Kecamatan Cibungbulang, Kabupaten Bogor bersamaan dengan datangnya ikan mas yang baru diimpor dari Taiwan pada bulan September 1980 (Hardjosworo, et al., 1981). Banyak upaya yang telah dilakukan para ahli untuk menanggulanginya baik upaya-upaya pencegahan maupun pengobatan. Mulai dari pemberian berbagai jenis antibiotik dengan bermacam-macam dosis, pemberian vitamin, pemberian probiotik hingga penggunaan tanaman obat (fitofarmaka). Fitofarmaka atau tanaman obat adalah obat alamiah yang bahan bakunya disarikan dari tanaman untuk digunakan dalam pengobatan (Anonimus, 2004). Paci-paci (Leucas lavandulaefolia) adalah salah satu fitofarmaka yang efektif mengatasi penyakit Motile Aeromonas Septicemia pada ikan (Abdullah, 2008 dan Sopiana, 2005). Paci-paci mengandung berbagai senyawa aktif seperti: minyak atsiri, flavonoid, tannin, saponin, alkaloid dan methanol yang bersifat antimikroba, antiinflamasi, antioksidan serta bersifat sebagai detoksifikasi racun dan mampu meningkatkan sistem kekebalan tubuh terhadap penyakit. Pada penelitian ini dilakukan uji efektivitas paci-paci yang diberikan lewat pakan ikan komersil untuk pencegahan maupun pengobatan penyakit MAS. Adapun parameter-parameter uji meliputi kelangsungan hidup, patologi makro dan parameter hematologi ikan lele dumbo yang diuji tantang dengan A. hydrophila penyebab penyakit MAS. Penelitian ini terdiri dari 4 perlakuan dengan 3 kali ulangan sebagai berikut : 1. Kontrol negatif (KN) dimana ikan disuntik dengan PBS. 2. Kontrol positif (KP) dimana ikan diinfeksi bakteri A. hydrophila 105 cfu/ml. 3. Pencegahan (PC) dimana ikan diberi pakan yang telah dicampur dengan paci-paci dengan dosis 4 g/100 ml yang telah diseduh dan disaring. Ikan diberi pakan yang telah dicampur paci-paci selama 7 hari, kemudian diuji tantang dengan A. hydrophila 105 cfu/ml. 4. Pengobatan (PO) dimana terlebih dahulu ikan diinfeksi bakteri A.hydrophila 105 cfu/ml. Setelah terlihat gejala klinis, lalu ikan diberi pakan yang telah dicampur paci-paci dengan dosis 8 g/100 ml. Parameter yang diamati adalah patologi makro (gejala klinis dan respon nafsu makan), hematologi ikan (jumlah sel darah merah, jumlah sel darah putih, hematokrit, hemoglobin dan indeks fagositosis), mortalitas, pertambahan bobot dan kualitas air. Hasil penelitian menunjukkan bahwa dengan pemberian ekstrak paci-paci yang dicampurkan ke dalam pakan ikan memberikan respon tanggap kebal terhadap peningkatan daya tahan tubuh ikan lele dan mampu menekan tingkat kematian ikan lele setelah uji tantang dengan bakteri A.hydrophila yang patogen. Sedangkan tingkat kematian ikan setelah uji tantang untuk masing-masing perlakuan kontrol negatif, kontrol positif, pengobatan dan pencegahan secara berturut-turut adalah: 0 %, 72,22 %, 55,56 % dan 38,89 %. Hasil penelitian juga menunjukkan bahwa perlakuan pencegahan (ekstrak paci-paci 4 g/100 ml) merupakan perlakuan yang paling baik yaitu mampu meningkatkan kekebalan ikan terhadap serangan penyakit MAS, hal ini didukung oleh gejala klinis yang ringan, kelangsungan hidup dan gambaran darah. Berdasarkan hasil penelitian maka dapat diketahui bahwa pemberian ekstrak paci-paci yang
Keyword: 

Judul: Efektivitas Ekstrak Daun Paci-paci Leucas lavandulaefolia untuk Pencegahan dan Pengobatan Infeksi Penyakit MAS Motile Aeromonad Septicaemia Ditinjau dari Patologi Makro dan Hematologi Ikan Lele Dumbo Clarias sp.
Abstrak: Ikan lele dumbo Clarias sp. termasuk komoditas yang banyak dibudidayakan secara intensif. Budidaya ikan lele dombo ini dihadapkan pada kendala penyakit MAS (Motile Aeromonad Septicaemia) yang disebabkan oleh Aeromonas hydrophila. Penyakit ini sering timbul sebagai wabah di Asia Tenggara sampai sekarang dan menimbulkan kematian dengan derajat penularan yang tinggi pada ikan-ikan air tawar. Penggunaan antibiotik untuk penanggulangan penyakit bakterial secara terus menerus dan tidak terkontrol menyebabkan timbulnya resistensi bakteri. Karena itu, penanggulangan penyakit ikan sedang diarahkan pada penggunaan bahan-bahan alami yang terbukti efektif, murah, aman terhadap manusia dan ramah lingkungan. Paci-paci (Leucas lavandulaefolia) merupakan salah satu tanaman obat yang banyak digunakan untuk pengobatan tradisional pada manusia dan sekarang ini mulai dicobakan untuk pengendalian penyakit pada sistem budidaya ikan. Senyawa aktif yang terkandung dalam daun dan akar paci-paci yaitu minyak atsiri, flavonoid, tannin, saponin, alkaloid dan metanol diketahui bersifat sebagai antimikroba dan dapat meningkatkan sistem kekebalan tubuh ikan. Informasi mengenai potensi tanaman paci-paci sebagai imunostimulan untuk meningkatkan daya tahan tubuh ikan terhadap infeksi A. hydrophila masih kurang. Karena itu, dilakukan penelitian ini yang bertujuan untuk mengetahui efektivitas ekstrak daun paci-paci baik untuk pencegahan dan pengobatan infeksi penyakit MAS (Motile Aeromonad Septicaemia) yang disebabkan oleh A. hydrophila secara in vivo ditinjau dari patologi makro dan parameter hematologi ikan lele dumbo (Clarias sp.). Penelitian ini dilakukan bulan Maret sampai Oktober 2007. Tempat penelitian di Laboratorium Kesehatan Ikan dan Laboratorium Kaca 1, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, IPB. Penelitian ini terdiri dari 2 tahap yaitu uji LD-50 dan uji in vivo. Uji LD-50 dilakukan untuk mendapatkan konsentrasi bakteri yang akan diinfeksikan pada uji in vivo. Uji ini dilakukan dengan cara menyuntikkan bakteri A. hydrophila pada ikan lele dumbo dengan konsentrasi 104, 105, 106, 107 dan 108 cfu/ml sebanyak 0.1 ml/ekor. Jumlah ikan uji 10 ekor tiap perlakuan. Sedangkan uji in vivo dilakukan untuk melihat pengaruh ekstrak daun paci-paci lewat injeksi secara intramuskular terhadap daya tahan, patologi makro dan parameter hematologi ikan lele dumbo setelah diinfeksi A. hydrophila. Sehingga dari pengujian ini dapat dilihat potensi tanaman paci-paci sebagai imunostimulan. Penelitian ini terdiri atas 4 perlakuan yaitu pencegahan, pengobatan, kontrol positif dan kontrol negatif dan masing-masing perlakuan terdiri atas 3 ulangan. Jumlah ikan uji masing-masing 10 ekor tiap ulangan. Ikan uji perlakuan pencegahan diinjeksi ekstrak paci-paci dosis 4 g/100 ml sebanyak 0.1 ml/ekor dan tujuh hari kemudian diuji tantang dengan A. hydrophila 105 cfu/ml. Ikan uji perlakuan pengobatan dan kontrol positif diinfeksi A. hydrophila 105 cfu/ml sebanyak 0.1 ml/ekor sedangkan ikan uji perlakuan kontrol negatif diinjeksikan PBS sebanyak 0.1 ml/ekor. Setelah gejala klinis muncul pada jam ke 18 pasca infeksi, ikan uji perlakuan pengobatan diinjeksi ekstrak paci-paci dosis 8 g/100 ml sebanyak 0.1 ml/ekor.
Keyword: 

Judul: Penyusunan Overlap Graph menggunakan Suffix Tree pada DNA Sequence
Abstrak: The DNA sequence assembly is very important in genome analysis. This step aims to reconstruct contigous DNA fragment (contigs) from short fragment by concatenating fragments based on the overlap region among them. This method employs overlap graph for solving the problems. In this graph, nodes represent fragments and edges represent overlap. This research developed a software for constructing overlap graph using suffix tree. The evaluation was conducted by measuring the number of nodes, number of edges, and the execution time in many values of minimum overlap. The minimum overlap is defined as the minimum length of substring which is considered as the overlap region between two fragments. The evaluation results showed that the number of nodes, the number of edges, and the execution time were increased with the decreasing of the minimum overlap value.
Keyword: