Judul: Produksi, Potensi, dan Karakterisasi Plantarisin dari Lactobacillus plantarum S34 secara in vivo pada mencit ddY.
Abstrak: Resistensi antibiotik merupakan permasalahan yang timbul akibat kesalahan penggunaan antibiotik yang tidak tepat sehingga mikroorganisme dapat menyesuaikan diri untuk bertahan hidup. Beberapa mikroorganisme dilaporkan memiliki resistensi terhadap lebih dari satu jenis antibiotk/multiple drug resistence (MDR). Di Indonesia, keberadaan bakteri yang telah memiliki resistensi terhadap antibiotik telah ditemukan, seperti pada golongan Staphylococcus, Pseudomonas, Proteus, Shigella, Klebsiella, Escherichia, dan Salmonella. Berbagai upaya dilakukan untuk menangani kasus yang disebabkan oleh bakteri MDR, seperti bakteriofag maupun ekstrak kasar plantarisinlorasi bahan berpotensi antimikrob, salah satunya adalah peptida antimikrob seperti plantarisin. Penelitian mengenai plantarisin yang berasal dari Lb. plantarum telah dilakukan sebelumnya dengan mengisolasi Lb. plantarum S34 dari bekasam. Aktivitas antimikrob plantarisin diketahui mampu menghambat pertumbuhan mikroorganisme, seperti Escherichia coli, Listeria innocua, Micrococcus luteus, Enterococcus casseliflavus, Lactococcus lactis lactis, dan Lactobacillus plantarum. Aktivitas antimikrob yang lebar ini menjadikan plantarisin sebagai kandidat senyawa antimikrob yang baru. Sebagai kandidat antimikrob baru, pengujian terhadap keamanan dan efektivitas antimikrob plantarisin S34 baik secara in vitro maupun in vivo harus dilakukan. Pada penelitian ini pengujian terhadap keamanan plantarisin dilakukan secara in vivo dengan pengamatan selama 48 jam dengan dosis 50, 100, 1000, dan 5000 mg/kgBB. Identifikasi berat molekul menggunakan SDS-PAGE menunjukkan adanya pita pada posisi 7.34 kDa dan 5.82 kDa. Protein dengan bobot <10 kDa ini diduga merupakan plantarisin tipe II. Dua buah pita yang muncul diduga sebagai plantarisin EF dan JK. Pita pada posisi 7.34 yang diduga sebagai plantarisin EF juga mirip dengan total bobot molekul dari plantarisin E yang sebesar 3.75 kDa dan plantarisin F sebesar 3.86 kDa. Sedangkan pita dengan ukuran 5.82 memiliki ukuran yang hampir sama dengan berat molekul plantarisin JK jika dihitung menggunakan rata-rata bobot molekul asam amino. Pengujian terhadap aktivitas ekstrak kasar plantarisin menunjukkan aktivitas yang kuat terhadap EPEC K1.1 dan S. aureus, aktivitas baik terhadap S.typhimurium dan Proteus, dan lemah terhadap S. typhosa Hasil pengujian terhadap toksisitas ekstrak kasar plantarisin S34 tidak menunjukkan adanya perubahan yang signifikan. Penurunan maupun kenaikan yang dialami mencit masih berada pada rentang normal mencit. Pengamatan terhadap kadar biokimia darah ureum dan kadar SGPT. Kenaikan kadar ureum dapat diakibatkan oleh pemecahan secara enzimatik ekstrak kasar plantarisin S34 oleh enzim proteolitik. Pemecahan protein ini menghasilkan urea maupun amoniak pada darah yang akan dibuang melalui feses maupu urin. Kadar SGPT meningkat dapat dikarenakan adanya aktivitas penguraian oleh enzim proteolitik yang dihasilkan oleh hati. Namun demikian, peningkatan kadar SGPT masih dalam taraf 5 normal sehingga tidak menunjukkan adanya kelainan pada fungsi organ hati. Pengamatan terhadap organ ginjal maupun hati tidak menunjukkan adanya kerusakan yang diakibatkan oleh pemberian ekstak kasar plantarisin S34. Pemberian ekstrak kasar plantarisin S34 menunjukkan tidak ada gejala toksisitas baik secara analisis hematologi maupun hstopatologi hingga dosis 5000 mg/kgBB.
Keyword: Antimikrob, Keamanan, Lactobacillus plantarum, Plantaricin, Resistensi

Judul: Toksisitas dan Efektivitas Plantarisin E dan F Lactococcus lactis pada Mencit ddY yang diinfeksi EPEC K1.1.
Abstrak: Enterophatogenic Escherichia coli (EPEC) K1.1 merupakan salah satu bakteri gram negatif yang menyebabkan diare dan resisten terhadap beberapa jenis antibiotik. Salah satu solusi untuk mengatasi masalah tersebut adalah dengan mengembangkan bahan antimikrob baru yang memiliki kemampuan membunuh patogen tersebut. Peptida antimikrob/antimicrobial peptides (AMP) merupakan suatu produk metabolisme primer bakteri asam laktat, salah satunya adalah plantarisin, yang memiliki kemampuan membunuh patogen. Karakteristik plantarisin yang mudah didegradasi oleh enzim proteolitik dan tidak membahayakan mikroflora usus menjadikan plantarisin dapat digunakan sebagai kandidat bahan obat. Pada penelitian sebelumnya telah dilakukan seleksi bakteri yang mampu memproduksi plantarisin. Gen penyandi plantarisin E dan F pada bakteri terpilih diisolasi kemudian ditransformasikan pada E.coli BL21 untuk meningkatkan jumlah produksi dan kemurnian bahan tersebut. Selanjutnya gen plantarisin yang telah ditransformasikan ke E.coli BL21 dipindahkan ke vektor produksi Lactococcus lactis NZ3900 untuk memudahkan aplikasi dan produksi plantarisin. Uji aktivitas plantarisin E dan F rekombinan secara in vitro menunjukkan aktivitas antimikrob terhadap E. coli ATCC, Staphylococcus aureus, Listeria monocytogenes, Bacillus cereus, Coliform dan EPEC K1.1. Sebagai kandidat bahan obat, tahap selanjutnya yang harus dilakukan adalah pengujian terhadap keamanan dan efektivitas plantarisin secara in vivo. Uji keamanan atau toksisitas secara in vivo diperlukan untuk menilai keamanan suatu senyawa kimia maupun bahan obat. Uji efektivitas antimikrob secara in vivo diperlukan untuk mengetahui efektivitas plantarisin dalam melawan patogen dalam tubuh makhluk hidup. Oleh karena itu pada penelitian ini dilakukan pengujian untuk mengetahui keamanan dan efektivitas plantarisin E dan F rekombinan pada mencit yang diinfeksi EPEC K1.1 sebagai bakteri patogen. Uji keamanan dilakukan dengan memberikan plantarisin E dan F rekombinan dosis 50, 100, 1000, dan 5000 mg/KgBB secara peroral. Selanjutnya dilakukan pengamatan terhadap keadaan kulit dan bulu, mata, letargi (kelesuan), konvulsi (kejang), tremor (gemetar), diare, dan kematian selama 48 jam. Analisa hematologi, biokimia darah, dan histopatologi organ hati dan ginjal dilakukan pada akhir pengamatan. Uji efektivitas antimikrob dilakukan dengan menginfeksi mencit dengan EPEC K1.1 dosis 108 cfu/mL selama 7 hari. Selanjutnya mencit diberikan NaCl, antibiotik, maltodekstrin, plantarisin E dan F dosis 100, 250, dan 500 mg/KgBB selama 7 hari. Pengamatan gejala klinis seperti letargi (kelesuan), konvulsi (kejang), tremor (gemetar), diare, dan kematian dilakukan selama perlakuan. Analisa hematologi dilakukan pada saat sebelum perlakuan, setelah infeksi EPEC K1.1, dan di akhir perlakuan. Analisa kadar malondialdehid dan histopatologi organ usus halus dilakukan di akhir perlakuan. Hasil uji toksisitas akut menunjukkan bahwa pemberian plantarisin E dan F rekombinan hingga dosis 5000 mg/KgBB tidak mengakibatkan kematian pada 5 kelompok mencit uji. Pengamatan hematologi dan biokimia darah menunjukkan kadar leukosit, eritrosit, hematokrit, hemoglobin, trombosit, urea, kreatinin, SGOT dan SGPT yang normal. Pengamatan histopatologi menunjukkan gambaran sel hati dan ginjal yang normal. Hasil uji efektivitas antimikrob terhadap EPEC K1.1 menunjukkan perbaikan kadar leukosit, hematokrit, dan hemoglobin pada semua kelompok mencit yang diberikan plantarisin E dan F. Pengamatan histopatologi organ usus halus menunjukkan adanya infiltrasi sel radang mononuklear dalam jumlah sedikit (<25) pada kelompok mencit yang diberikan plantarisin E dosis 250 dan 500 mg/KgBB serta plantarisin F dosis 500 mg/KgBB. Plantarisin E dan F rekombinan diduga memiliki aktivitas antioksidan yang ditunjukkan dengan rendahnya kadar malondialdehyde (MDA). Dosis efektif plantarisin E dalam mengatasi diare yang disebabkan
Keyword: rekombinan, plantarisin, EPEC K1.1, mencit ddY

Judul: Thermal Characteristics and Dynamics of Tropical Cyclone over Western North Pacific Ocean: A Case Study of Typhoon Songda (Chedeng) 2011
Abstrak: The frequent occasion of Tropical Cyclone (TC) over Western North Pacific (WNP) Ocean lies from 10˚N to 26˚N and 121˚E to 170˚E. Sources of TC development come from warm ocean temperature where latent heat is released during condensation processes and subsequently concentrated in the boundary layer. Relative humidity at 850-700 hPa is responsible to produce the most intense storm. Meanwhile, weak vertical wind shear between 850-200 hPa is one of the dynamical factors that lead to the development of TC. Pressure level of 850-200 hPa is chosen to minimize the thermodynamic effect in the lower troposphere. Typhoon Songda (Chedeng in the Philippines) or TSC lasted from May 18th to 30th, 2011 and strengthened into powerful Super Typhoon stage between May 24th and 27th. Long curving track and the exhibition of all sequences of TC life cycle, TSC is then considered as an ideal case of TC. The objective of the study with case of TSC is to investigate the role of thermal characteristics and dynamics on TC intensity. The research is carried out by using Advanced Research of Weather Research and Forecasting model (WRF ARW model) version 3.3. Two domains are employed in the model. The first domain situate from 02˚N to 40˚N and 118˚E to 149˚E and cover spatial resolution () of 33.1 km. The second domain situate from 09˚N to 27˚N and 119˚E to 132˚E with of 11 km. Timestep of the model () is 120 seconds. The model is supported by the following physical parameterization, i.e., Yonsei University Scheme (YSU) in the boundary layer, Kain-Fritsch scheme (KF) in the cumulus, and WRF Single-Moment 3-class scheme in the microphysics. Initial meteorological condition prior to the formation of the cyclone is generated using WRF ARW standard-release model. Sensitivity of the model output is obtained from a selected single-parameter change scenarios, namely, 10 % to 20 % decrease and increase of wind shear initial data at 850-200 hPa, and by 10 % to 20 % decrease of relative humidity initial data at 850-700 hPa. The result showed that the negative correlations between wind shear and intensity are found in wind shear scenarios. Wind shears of 10 ms-1 which lead to strengthening of the wind intensity in the early period of Typhoon development are found in wind shear scenarios. The effect of wind shear changes on wind intensity is statistically significant in the 20 % wind shear scenarios. During mature stage, weak wind intensity occurred when wind shear increase as given in the WRF standard-release and the 20 % decreasing scenario. Different situation is found in the 20 % increasing scenario where wind shear tend to weak and lead to strong wind intensity at this stage. Meanwhile, the reduction of moisture supply at 850-700 hPa resulting from 20 % decreasing relative humidity play a major role in the weakening of wind intensity and reduces mechanical energy of the cycle process as much as 300 J kg-1.
Keyword: