Judul: Potensi Antituberkulosis Tanaman Obat dari Indonesia terhadap Mycobacterium smegmatis JCM6386ᵀ
Abstrak: Tuberkulosis (TB) adalah masalah kesehatan serius yang tercatat sebagai penyakit pembunuh nomor dua di dunia. Berdasarkan data WHO, Indonesia berada diperingkat ke lima dengan kasus TB tertinggi di dunia. Kontrol TB tidak terdapat pembaharuan, kurang efektif dan tidak mudah diakses. Pengobatan TB masih sama sejak 40 tahun lalu. Di sisi lain, Indonesia memiliki kekayaan biodiversitas ke dua terbesar di dunia setelah Brazil. Beberapa tanaman dari Indonesia yang dapat dikembangkan untuk pengobatan TB diantaranya lempuyang wangi (Zingiber aromaticum), buah makasar (Brucea javanica), tabat barito (Ficus deltoidea), srigunggu (Clerodendrum serratum), sidaguri (Sida rhombifolia) dan cucur atap (Baeckea frutescens). Enam tanaman tersebut diharapkan memiliki senyawa yang berpotensi untuk pengobatan TB. Aktivitas antimikobakteri dari ekstrak tanaman ditentukan dengan metode turbiditi. Pengujian M. tuberculosis seharusnya dilakukan pada laboratorium dengan keamanan hayati level 3 (BSL-3) yang membutuhkan laboran terlatih dan alat khusus. Penelitian ini dilakukan dengan menggunakan Mycobacterium smegmatis JCM6386ᵀ. Bakteri M. smegmatis merupakan bakteri yang tidak patogen dan pertumbuhannya delapan kali lebih cepat dibandingkan M. tuberculosis. M. smegmatis digunakan untuk mempelajari sistim biologi M. tuberculosis, seperti kultur sel dan ekspresi gen. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menentukan aktivitas antimikobakteri dari lempuyang wangi (Zingiber aromaticum), buah makasar (Brucea javanica), tabat barito (Ficus deltoidea), srigunggu (Clerodendrum serratum), sidaguri (Sida rhombifolia) dan cucur atap (Baeckea frutescens). Isolasi dan identifikasi senyawa aktif dari tanaman obat Indonesia yang memiliki potensi sebagai antituberkulosis. Efek dari DMSO terhadap pertumbuhan M. smegmatis JCM6386T adalah faktor penting untuk ditentukan. Konsentrasi DMSO pada 0.5%, 1%, 2%, 3%, 4% dan 5% v/v tidak memiliki pengaruh yang berbeda nyata terhadap pertumbuhan M. smegmatis JCM6386ᵀ dengan 5% beda nilai terkecil. Sedangkan konsentrasi DMSO pada 8% dan 16% v/v memiliki pengaruh yang berbeda nyata pada pertumbuhan M. smegmatis JCM6386ᵀ dengan 5% beda nilai terkecil. Ekstrak metanol dalam 0.5% v/v DMSO pada umbi lempuyang wangi (Z. aromaticum), buah dari buah makasar (B. javanica), daun tabat barito (F. deltoidea), daun srigunggu (C. serratum), daun dan batang sidaguri (S. rhombifolia) memiliki aktivitas antimikobakteri pada 20 mg ekstrak eq./mL. Z. aromaticum memiliki aktivitas hambatan pertumbuhan M. smegmatis JCM6386ᵀ tertinggi diantara yang lain. Sebagai tanaman yang memiliki aktivitas antimikobakteri tertinggi diantara lima tanaman obat, pemisahan berdasarkan hasil uji aktivitas dari ekstrak metanol Z. aromaticum dilakukan. Hasil dari pemisahan Z. aromaticum menggunakan HPLC, analisis GC, GC-MS dan NMR, senyawa aktif pada Z. aromaticum sebagai antimikobakteri adalah (2E,6E,10E)-2,6,9,9-tetramethylcycloundeca- 2,6,10-trien-1-one (zerumbone). Nilai IC50 zerumbone adalah 38 μg/mL. Ekstrak metanol dari B. frutescens menunjukkan hambatan pertumbuhan terhadap M. smegmatis JCM6386ᵀ sebesar 62.837% pada 20 mg eq./mL. Pemisahan menggunakan partisi cair-cair dilakukan dalam dua lapisan yaitu lapisan heksan dan air. Hasil pengujian menunjukkan bahwa lapisan heksan memiliki 70.767% hambatan pertumbuhan berdasarkan metode turbiditi tetapi hasil pengujian dengan media agar menunjukkan hasil yang berbeda dimana dalam media agar tidak terdapat koloni bakteri. Kondisi ini menunjukkan bahwa warna dari tumbuhan memiliki pengaruh terhadap penyerapan multiskan FC pada 595 nm. Pemisahan disertai pengujian daya hambat pertumbuhan terhadap M. smegmatis JCM6386ᵀ dilakukan. Hasil pemisahan menunjukkan terdapat empat senyawa aktif yang diberi kode Cd-1, Cd-2, Cd-3 dan Cd-4. Data LCMS menunjukkan berat molekul dari empat senyawa tersebut adalah 446, 506, 446 dan 460 g/mol, masing-masingnya.
Keyword: Tanaman obat Indonesia, Mycobacterium smegmatis JCM6386T, lempuyang wangi (Zingiber aromaticum), buah makasar (Brucea javanica), tabat barito (Ficus deltoidea), srigunggu (Clerodendrum serratum), sidaguri (Sida rhombifolia), cucur atap (Baeckea frutescens), aktivitas antimikobakteria, potensi antituberkulosis

Judul: Aktivitas Anti-Mycobacterium dari Fraksi Metabolit Sekunder Bakteri Endofit Bacillus velezensis strain DJ4 Asal Jengkol (Archidendron pauciflorum)
Abstrak: Penemuan dan pengembangan obat anti-tuberkulosis (TB) baru yang efektif terhadap strain Mycobacterium yang resisten antibiotik perlu dilakukan untuk menurunkan angka kematian akibat TB. Mycobacterium smegmatis umum digunakan dalam penelitian awal penapisan senyawa anti-TB. Penelitian ini bertujuan memfraksinasi metabolit sekunder yang dihasilkan oleh bakteri endofit Bacillus velezensis strain DJ4 asal jengkol (Archidendron pauciflorum), menganalisis aktivitas anti-Mycobacterium-nya terhadap M. smegmatis, dan mengidentifikasi profil metabolit fraksi aktifnya. Lima puluh enam fraksi telah berhasil diperoleh melalui teknik kromatografi lapis tipis (KLT) dan kromatografi kolom. Sepuluh fraksi diantaranya memiliki aktivitas antibakteri terhadap M. smegmatis dengan minimum inhibitory concentration (MIC) berkisar antara 85–1325 μg/ml. Fraksi F53 merupakan fraksi paling potensial dengan nilai MIC terendah yaitu 85 μg/ml. Pada konsentrasi 1× MIC dan ½× MIC, fraksi tersebut mampu menghambat pembentukan biofilm M. smegmatis berturut-turut sebesar 68,3% dan 52,1%. Pengamatan menggunakan scanning electron microscope (SEM) menunjukkan bahwa matriks biofilm M. smegmatis yang diberi perlakuan fraksi F53 lebih tipis, kurang kompak, serta terpisah-pisah dalam beberapa bagian dibandingkan kontrol media maupun metanol. Analisis Liquid Chromatography-Tandem Mass Spectrometry (LC-MS/MS) menunjukkan bahwa fraksi tersebut mengandung lima jenis senyawa, antara lain 2-(p-anisyl)-5-methyl- 1-hexene, nigakilactone H, tetratriacontanamine, dan dua senyawa lainnya yang belum teridentifikasi.
Keyword: antimycobacterial, Archidendron pauciflorum, fractionation, MIC, Mycobacterium smegmatis

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: