Judul: Identifying SNP g.5112179A>G TGFBR2 Gene Related to Carcass Characteristic and Meat Quality
Abstrak: TGFBR2 diprediksi menjadi faktor dari pertumbuhan sel otot. Penelitian ini dilakukan untuk mengidentifikasi hubungan keragaman gen Transforming Growth Factor Beta Receptor 2 (TGFBR 2) dengan karakteristik karkas dan kualitas daging. Penelitian ini menggunakan 40 domba jantan dengan pola pemeliharaan yang sama. Identifikasi gen TGFBR2 dan asosiasinya pada karakteristik karkas dan kualitas daging dilakukan dengan menggunakan Polymaerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP). Penelitian ini mengamati karakteristik karkas dan kualitas daging seperti bobot hidup, karkas hangat, persentase karkas, panjang karkas, karkas dingin, keempukan, susuk masak dan water holding capacity. Hubungan antara gen TGFBR2 dengan karakteristik karkas dan kualitas daging dianalisis menggunakan General Linear Model. Hasil penelitian menunjukkan bahwa terdapat hubungan yang signifikan (P<0,05) antara gen TGBR2 dengan berat karkas hangat, berat karkas dingin, panjang karkas, dan keempukan. Kesimpulan dari penelitian ini, bahwasanya gen TGFBR2 SNP g.5112179A>G berpotensi untuk dijadikan sebagai penanda seleksi terhadap karakteristik karkas dan kualitas daging., TGFBR2 is suspected to be the factor of muscle cell growth. The study aimed to examine Gen Transforming Growth Factor Beta Receptor II (TGFBR2) and their association on carcass characteristics and meat quality. This study uses 40 samples of rams with the same treatment. The identification gen TGFBR2 association with meat quality were performed using Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP). This study observed carcass characteristics and meat quality, such as live weight, hot carcass, carcass percentage, length, cold carcass, tenderness, cooking loss, and water holding capacity. The association between TGFBR2 gene and carcass characteristics and meat quality were analyzed using general linear model (GLM). The results showed a significantly association (P<0.05) between gen TGBR2 with hot carcass weight, cold carcass weight, carcass length, and tenderness. This study concluded the TGFBR2 SNP gene g.5112179A>G potential to be used candidate gene for carcass characteristics and meat quality.
Keyword: carcass characteristics, meat quality, PCR-RFLP, sheep, TGFBR2

Judul: Investigation of the Genetic Polymorphism of the CYP2A6 and FABP4 gene on Nutritional Value, Meat Quality, and Carcass Characteristics in Sheep
Abstrak: Tingkat konsumsi daging domba di kalangan konsumen disebabkan beberapa faktor yang mempengaruhi, diantaranya nilai gizi yang terkandung dalam daging domba, kualitas daging domba, serta karakteristik karkas yang memperhatikan proporsi perdagingan domba. Diantara gen-gen potensial yang dapat digunakan sebagai penanda nilai gizi, kualitas daging, dan karakteristik karkas pada daging domba Indonesia, yaitu gen cytochrome P450, family 2, subfamily A, polypeptide 6 (CYP2A6) dan gen fatty acid binding protein 4 (FABP4). Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi polimorfisme gen CYP2A6 pada SNP g.49170107 G>T dan gen FABP4 pada SNP g.57536954 C>T, serta mengetahui hubungannya dengan nilai gizi, kualitas daging, dan karakteristik karkas pada domba Indonesia. Total sampel yang digunakan untuk keragaman sebanyak 243 ekor domba dengan sembilan jenis domba Indonesia, yaitu domba texel cross (DTC), domba Barbados cross (DBC), domba compass agrinak (DCA), domba ekor gemuk (DEG), domba ekor tipis (DET), domba garut (DG), domba komposit garut (DKG), domba lokal jambi (DLJ), dan domba jonggol (DJ). Investigasi gen dilakukan dengan identifikasi keragaman gen CYP2A6 dan FABP4 yang dianalisis menggunakan Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP), serta dilakukan asosiasi gen CYP2A6 dan gen FABP4 terhadap parameter yang diuji menggunakan General Linear Model (GLM). Hasil penelitian menunjukkan bahwa gen CYP2A6 bersifat polimorfik yang ditandai dengan adanya dua macam genotipe GG dan TT, sedangan gen FABP4 bersifat monomorfik dengan genotipe TT. Keragaman ditemukan pada DEG, DET, DLJ, dan DJ. Keragaman genotipe gen CYP2A6 berada dalam keseimbangan Hardy-Weinberg. Hasil menunjukkan bahwa gen CYP2A6 secara nyata berasosiasi (P<0,05) dengan nilai gizi diantaranya kolesterol dan mineral Fe. Kualitas daging seperti pH, keempukan, susut masak, dan daya mengikat air tidak memiliki asosiasi dengan gen CYP2A6. Hasil asosiasi gen CYP2A6 secara nyata berasosiasi (P<0,05) dengan karakteristik karkas, yaitu bobot hidup, karkas hangat, persentase karkas, karkas dingin, serta potongan komersial. Berdasarkan hasil asosiasi tersebut menunjukkan bahwa gen CYP2A6 dapat dijadikan sebagai kandidat marker dalam program seleksi domba untuk memperbaiki kualitas daging domba.
Keyword: CYP2A6 gene, FABP4 gene, GLM, PCR-RFLP, sheep

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: