Judul: Komposisi dan distribusi vertikal harian zooplankton pazda siang dan malam hari di perairan pantai Bojonegor. Laut banten
Abstrak: Perairan pantai Bojonegara terletak di bagian barat dari Teluk Banten. Perairan ini merupakan perairan dangkal dengan kedalaman maksimum ± 6,10 m. Parameter fisika-kimia yang diukur di perairan ini, secara vertikal relatif stabil dan tidak memperlihatkan pengaruh yang besar terhadap kehidupan zooplankton. Adapun parameter tersebut meliputi suhu air, salinitas, kece- rahan, arus, oksigen terlarut dan pH di berbagai stasiun pada siang dan malam hari. Komposisi zooplankton yang ditemui sejumlah 33 famili yang terdiri dari 45 genera. Komposisi ini didominasi oleh 4 kelompok yaitu ordo Dinoflagellida, Calanoida, Cyclopoida dan Harpacticoida. Kelimpahan zooplankton menyebar homogen di semua stasiun. Hal ini mungkin disebabkan oleh dangkalnya perairan pantai Bojonegara sehingga pencampuran massa air membantu meratakan penyebaran jenis zooplankton. Penyebaran zooplankton secara vertikal ditunjukkan oleh kelimpahannya di berbagai kedalaman. Uji statistik terha- dap kelimpahan zooplankton pada kedalaman yang berbeda tidak menunjukkan perbedaan yang nyata, kecuali pada stasiun II siang dan III malam. Sedangkan pada kelompok dominan, hanya ordo Dinoflagellida di siang hari yang menunjukkan adanya perbedaan kelimpahan yang nyata. Secara keseluruhan, kelimpahan zooplankton pada siang dan malam tidak menunjukkan perbedaan yang mencolok. Be gitu pula dengan kelompok dominan, kecuali ordo Harpacti coida yang memberikan perbedaan kelimpahan yang mencolok antara siang dan malam. Harpacticoida lebih besar dijum pai pada siang hari. Hubungan antara zooplankton dan phytoplankton merupakan proses yang penting dalam pemanfaatan dan pemindahan energi, terutama dalam rantai makanan…
Keyword: 

Judul: Komposisi Dan Distribusi Vertikal Harian Fitoplankton Pada Siang Dan Malam Hari Di Perairan Pantai Bojonegara, Teluk Banten
Abstrak: Perairan pantai Bojonegara merupakan bagian dari Te- luk Banten yang terletak di bagian baratnya. Kedalaman maksimum perairan ini adalah + 6,10 m. Parameter fisika-kimia yang diukur secara vertikal di perairan ini relatif stabil. Parameter yang diukur meliputi salinitas, suhu air, kecerahan, arus, pH, oksi- gen terlarut, nitrat dan phosphat. Komposisi fitoplankton yang ditemui di perairan ini adalah 18 famili yang terdiri dari 37 genera. Enam fami- li diantaranya merupakan kelompok dominan di semua stasi- un, yaitu: Fragilariaceae, Naviculaceae dan Nitzschiace- ae. Penyebaran kelimpahan fitoplankton hampir merata di semua stasiun. Diduga hal ini disebabkan perairan pan tainya relatif dangkal sehingga percampuran air membantu penyebaran jenis fitoplankton. Penyebaran fitoplankton secara vertikal ditunjukkan oleh kelompok fitoplankton di berbagai kedalaman. Uji statistik menunjukkan bahwa di se- mua stasiun tidak ada perbedaan kelimpahan yang nyata ter- hadap kedalaman yang berbeda, kecuali pada stasiun II malam menunjukkan perbedaan sangat nyata. Pada kelompok dominan tidak ada yang menunjukkan perbedaan kelimpahan yang nyata terhadap kedalaman yang berbeda. Secara keseluruhan, kelimpahan fitoplankton yang di temui tidak menunjukkan perbedaan terhadap siang dan malam hari. Uji statistik di semua stasiun memberikan nilai ti- dak signifikan, kecuali stasiun III kedalaman 0 m memberi- kan nilai signifikan. Pada kelompok dominan, hanya Rhizo- soleniaceae dan Chaetoceraceae memberikan nilai sangat sig- nifikan. Kelimpahan Rhizosoleniaceae dan Chaetoceraceae pada siang hari sangat tinggi. Hubungan antara fitoplank- ton dan zooplankton tidak terlepas dari proses pemanfaatan dan pemindahan energi, terutama fitoplankton sebagai sum ber energi bagi kehidupan organisme lain…
Keyword: 

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA