Judul: Detection of Methicillin- Resistant Staphylococcus aureus Isolated from Animals, Humans, and The Environment at IPB Educational Animal Hospital: The Concept of One Health
Abstrak: Staphylococcus aureus merupakan salah satu bakteri penyebab infeksi yang paling umum di dunia. S. aureus merupakan flora normal pada kulit, saluran pernafasan, dan saluran pencernaan pada manusia serta hewan dan dapat juga ditemukan di udara dan lingkungan. Penggunaan antibiotik yang meluas menyebabkan munculnya Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) yaitu S. aureus yang resistan terhadap antibiotik methicillin. Penelitian ini bertujuan mendeteksi keberadaan bakteri Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus pada hewan, manusia, dan lingkungan di Rumah Sakit Hewan Pendidikan Institut Pertanian Bogor dengan konsep one health. Sampel diambil dari usap kulit manusia berjumlah 15, usap kulit hewan berjumlah 15 dan permukaan benda berjumlah 15. Metode yang digunakan untuk mengidentifikasi adalah isolasi bakteri pada media selektif, pewarnaan Gram dan uji biokimiawi yang terdiri dari uji katalase dan uji fermentasi glukosa. Uji resistansi antibiotik dilakukan dengan metode Kirby-Bauer dengan antibiotik berupa cefoxitin. Hasil uji resistansi dibandingkan dengan standar kepekaan antibiotik dari Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Berdasarkan hasil identifikasi, terdapat MRSA sebanyak 20% dari total sampel yang diambil di RSHP IPB., Staphylococcus aureus is one of the most common infection-causing bacteria in the world. S. aureus is normal flora of the skin, respiratory tract, and gastrointestinal tract in humans and animals and can also be detected in the air and environment. The widespread use of antibiotics has led to the emergence of Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus (MRSA), which is S. aureus resistant to methicillin antibiotics. This study aims to detect the presence of Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus bacteria in animals, humans, and the environment at the IPB University Teaching Animal Hospital with the concept of one health. Samples were taken from 15 human skin swabs, 15 animal skin swabs and 15 object surfaces. The methods used to identify are bacterial isolation on selective media, Gram staining and biochemical tests consisting of catalase test and glucose fermentation test. Antibiotic resistance test were conducted by Kirby-Bauer method with antibiotic in the form of cefoxitin. The results of the resistance test were compared with the antibiotic sensitivity standards of the Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Based on the identification results, there were MRSA as much as 20% of the total samples taken at RSHPIPB.
Keyword: identifikasi bakteri, resistansi, Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus, one health

Judul: One Health Approach: Study of Antibiotic Resistance of Staphylococcus aureus Isolated in Dairy Cattle Farms in South Sulawesi.
Abstrak: Staphylococcus aureus (S. aureus) merupakan bakteri yang dapat menyebabkan penyakit menular dan mengganggu kesehatan manusia dan hewan. Staphylococcus aureus menghasilkan beragam faktor virulensi yang berkontribusi pada jenis dan tingkat keparahan infeksi. Pengobatan S. aureus dengan antibiotik secara terus menerus dan tidak sesuai aturan penggunaan dapat menyebabkan resistansi antibiotik. Perkembangan resistansi antibiotik dipicu oleh penggunaan terapi antibiotik yang ekstensif atau penggunaannya sebagai pemacu pertumbuhan dalam produksi pakan ternak dan penyalahgunaan antibiotik di sektor manusia, hewan, dan lingkungan. Mengingat pentingnya masalah resistansi antibiotik dan keterkaitan antara manusia, hewan, dan lingkungan, oleh karena itu diperlukan pendekatan one health untuk menangani masalah resistansi antibiotik ini. Tujuan umum penelitian adalah mengidentifikasi, mengkarakterisasi, dan membuat pemodelan data spasial resistansi antibiotik isolat S. aureus dari peternakan sapi perah di Provinsi Sulawesi Selatan. Terdapat empat rangkaian penelitian yang dilakukan untuk mencapai tujuan tersebut. Penelitian pertama bertujuan untuk mengidentifikasi S. aureus secara fenotipik dan genotipik serta mengetahui hubungan genetik diantara isolat S. aureus berdasarkan gen nuc. Jumlah sampel sebanyak 142 sampel. Identifikasi S. aureus secara fenotipik meliputi metode kultur, dilanjutkan dengan pewarnaan Gram, uji katalase, dan uji koagulase. Metode genotipik meliputi Polymerase Chain Reaction (PCR) konvensional dan sekuensing. Metode fenotipik menunjukkan bahwa 56/142 (39,4%) sampel yang berasal dari hewan, manusia, dan dangke tumbuh pada media baired-parker agar (BPA). Metode genotipik menunjukkan 32/56 (57,1%) sampel memiliki gen nuc. Analisis filogenetik dari 12 isolat S. aureus menunjukkan hubungan kekerabatan yang dekat dan berada dalam clades yang sama. Hal ini menunjukkan bahwa kemungkinan besar isolat S. aureus dari hewan (SQ1) merupakan galur yang sama dengan isolat asal manusia (MA1, MH1, MD1, MF1). Penularan S. aureus dari manusia ke hewan diperkirakan akibat oleh proses adaptasi setelah hubungan jangka panjang dengan manusia. Kontak dekat antara manusia dan hewan dapat memfasilitasi terjadinya perpindahan inang. Kemampuan beberapa patogen untuk berpindah dari satu spesies inang ke spesies inang lainnya menimbulkan bahaya yang signifikan bagi kesehatan masyarakat dan keamanan pangan. Penelitian kedua bertujuan untuk mengetahui profil resistansi antibiotik, gen penyandi resistansi antibiotik, dan integron kelas 1 dari isolat S. aureus. Sebanyak 32 isolat S. aureus diuji sensitivitasnya terhadap 9 jenis antibiotik dengan metode difusi cakram Kirby-Bauer. Deteksi gen penyandi resistansi antibiotik menggunakan metode PCR konvensional, sedangkan deteksi gen integron kelas 1 menggunakan metode multiplex PCR. Hasil penelitian menunjukkan isolat asal manusia menunjukkan resistansi antibiotik penisilin G, ampisilin, oxacillin, cefoxitin, tetrasiklin, dan siprofloksasin. Isolat asal hewan menunjukkan resistansi antibiotik penisilin G, ampisilin, tetrasiklin dan eritromisin, sedangkan isolat asal dangke menunjukkan resistansi antibiotik penisilin G dan ampisilin. Gen penyandi resistansi antibiotik yang terdeteksi dari isolat asal manusia adalah blaTEM, tetA, dan mecA, untuk isolat asal hewan yaitu blaTEM dan tetA, sedangkan untuk isolat asal dangke yaitu blaTEM. Keberadaan gen integron kelas 1 sebesar 30% (3/10) pada isolat asal hewan dan 16,7% (1/6) pada isolat asal manusia. Penggunaan secara tidak tepat dan penyalahgunaan antibiotik, kontaminasi bakteri resistan dari hewan dan lingkungan berkontribusi terhadap kejadian resistansi antibiotik pada manusia, hewan, dan lingkungan. Penelitian ketiga bertujuan untuk mengetahui faktor virulensi dan mengetahui hubungan antara faktor virulensi dan resistansi antibiotik dari isolat S. aureus. Sebanyak 20 isolat S. aureus termasuk dalam kelompok resistan terhadap antibiotik dideteksi
Keyword: Faktor virulensi, One health, resistansi antibiotik, Staphylococcus aureus, sistem informasi geografis

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: