Judul: Karakteristik Morfometrik, Pola Warna dan Molekular Ikan Kerapu (Serranidae) dari Perairan Raja Ampat
Abstrak: Serranidae merupakan famili dari ikan kerapu yang hidup soliter pada ekosistem terumbu karang. Ikan kerapu memiliki peran penting sebagai predator teratas di lingkungan laut. Selain itu ikan kerapu merupakan organisme yang sulit di identifikasi karena memiliki kemiripan pola warna dan morfometrik. Penelitian ini dilakukan untuk menganalisis karakteristik morfometrik, pola warna, dan struktur genetik kerapu yang diambil dari perairan Raja Ampat. Sebanyak 41 sampel ikan digunakan untuk analisis morfometrik dan pola warna, dan 52 urutan digunakan untuk barcoding DNA, yang berhasil dikumpulkan selama ekspedisi Raja Ampat pada Januari 2018. Analisis koresponden dan Bray-Curtis simmilarity digunakan untuk menganalisis karakteristik morfometrik. Program I3S Pattern + (Interactive Individual Identification System) digunakan untuk melihat kesamaan pola warna di antara kerapu. Analisis data molekuler menggunakan program MEGA 6.06 dengan metode filogenetik Neighbor Joining (NJ) dari model evolusi 2-Parameter Kimura dengan 1000 bootstraps. Kedekatan yang sama secara morfometrik diamati antara Epinephelus coioides, Epinephelus malabaricus, Epinephelus ongus, Cephalopholis cyanostigma, dan Cephalopholis miniata. Kesamaan pola warna yang diamati Anyperodon leucogrammicus memiliki kemiripan paling dekat dengan Epinephelus areolatus dengan nilai 31,26 dan paling banyak 90,28 dengan Plectropomus leopardus. Pohon filogeni merekonstruksi sebelas clades yang terbentuk dengan jarak genetik terdekat antara Epinephelus malabaricus dan Epinephelus coioides sebesar (4,2%), sedangkan jarak genetik terjauh adalah Epinephelus ongus dan Variola albimarginata sebesar (24%). Perbandingan kekerabatan kerapu menggunakan barcode DNA menunjukkan bahwa analisis morfologis lebih dekat daripada morfometrik. Karakteristik morfometrik tidak memiliki kontribusi besar pada beberapa spesies kerapu. Kombinasi antara morfometrik, pola warna dan kode DNA kerapu dapat membantu memisahkan antara spesies kompleks.
Keyword: DNA Barcoding, Ikan Kerapu, Morfometrik, Pola Warna

Judul: Analisis Filogenetik Beberapa Kerapu Subfamili Epinephelinae (Serranidae) Indo-Pasifik Barat Dari Perairan Indonesia.
Abstrak: Kelompok ikan serranid dari subfamili Epinephelinae terdiri atas sekitar 159 spesies yang termasuk dalam 15 genera, umumnya dikenal sebagai ikan kerapu, rockcods, hinds, dan seabasses. Ikan komersial penting ini merupakan ikan penghuni dasar perairan yang dapat ditemukan di daerah perairan tropis maupun subtropis. Sebagian besar spesies ikan ini menghuni habitat terumbu karang, sedangkan sebagian lainnya hidup di muara atau karang berbatu. Kerapu memiliki nilai ekonomi tinggi, namun kalsifikasi dan hubungan evolusi mereka seringkali terkendala oleh jumlah spesies yang luar biasa banyak, distribusi yang luas, serta kurangnya keahlian dalam identifikasi morfologi. Hal ini menyebabkan apapun jenis ikan yang tertangkap di lapangan dari anggota subfamili Epinephelinae seluruhnya disebut sebagai kerapu. Wilayah Indo-Pasifik memiliki jenis ikan kerapu yang paling beragam daripada daerah lain seperti di Atlantik Barat, Atlantik Timur, dan Pasifik Timur. Oleh karena itu perairan Indo-Pasifik menjadi wilayah yang sangat menarik untuk memahami hubungan filogenetik ikan kerapu khususnya di wilayah perairan Indonesia. Dalam penelitian ini, digunakan ruas gen sitokrom oksidase c subunit 1 (CO1) sebagai penanda molekuler untuk menganalisis hubungan antara beberapa jenis kerapu dari wilayah perairan Indonesia. Spesimen diperoleh dari berbagai macam sumber termasuk hasil pancing tradisional, pasar ikan, dan tempat pelelangan ikan dari beberapa titik sampling yaitu Banda Aceh (Sumatera), Luwuk (Sulawesi), Kupang (East Nusa Tenggara), Pangandaran (West Java), Raja Ampat (Papua), Sinjai, and Selayar Island (South Sulawesi). Jaringan yang digunakan sebagai sumber DNA berasal dari otot dorsal, insang, serta sirip. Seluruh sampel jaringan untuk keperluan analisis molekuler disimpan dalam alkohol 95%. Sebanyak 26 urutan sekuen DNA dari 14 spesies kerapu dari wilayah perairan Indonesia yang termasuk ke dalam 5 genera (Anyperodon, Cephalopholis, Epinephelus, Plectropomus, dan Variola) berhasil diperoleh dan dipelajari hubungan kekerabatannya dalam penelitian ini. Beberapa sekuen juga telah didepositkan ke GenBank. Sebuah pohon filogeni yang dibangun menggunakan metode Neighbor-Joining (NJ) (Kimura 2-parameter) berhasil diperoleh berdasarkan runutan parsial gen CO1 dengan menggunakan Haemulon scuderii sebagai outgroup. Kemunculan Anyperodon dalam kelompok Epinephelus menyebabkan kelompok ini menjadi tidak monofiletik. Genus Cephalopholis lebih primitif dibandingkan genus Epinephelus. Plectropomus dan Variola menempati posisi basal dalam pohon filogeni, hal ini memungkinkan keduanya merupakan kelompok yang yang primitif diantara kelompok subfamili Epinephelinae yang lain. Hingga saat ini identifikasi fenotipik terhadap kelompok ikan serranid dilakukan berdasarkan perbedaan pola warna dan beberapa karakter morfologi, seperti jumlah jari-jari keras dan lunak, serta bentuk sirip ekor. Namun identifikasi berdasarkan pola warna dan beberapa karakter morfologi tersebut seringkali terkendala oleh adanya variasi intraspesifik serta perbedaan morfologi yang sangat mencolok pada satu spesies yang sama antara individu yang masih juvenil dengan individu yang telah dewasa sehingga menimbulkan kebingungan dalam penentuan spesies kelompok ikan serranid. Berkaitan dengan hal tersebut, salah satu contoh kasus yang diungkap dalam penelitian ini adalah penentuan spesies dari individu yang masih juvenile pada genus Epinephelus (Epinephelus erythtrurus). Analisis dilakukan dengan mengombinasikan identifikasi secara morfologi dan secara molekuler (CO1). Hasil penelitian ini diharapkan dapat berguna untuk dunia taksonomi dalam memahami analisis hubungan filogenetik antara beberapa jenis kerapu Indo Pasifik Barat di perairan Indonesia.
Keyword: CO1, Epinephelinae, Filogenetik, Indo Pasifik Barat, Kerapu

Judul: Pengembangan distribusi ILOS multimedia (ILOSmedia)
Abstrak: The development of open source softwares is still going rapidly nowadays, including open source operating systems for desktop computer, netbook, tablet PC, and smartphone. The open source operating systems have considerable contribution to open source software. Linux is an open source operating system that continues to grow since 1991. The characteristics in general Linux are free, can be distributed freely, and free to make changes in it. Linux in its development is divided into several distributions. Each distribution is made as a specific goal so that the operating system can focus on running the desired functions, such as multimedia, networking, education, etc. The objective of of this research is to develop and evaluate the ILOS distribution for multimedia by providing multimedia of open source packages. ILOSmedia uses Ubuntu10.10 and Remastersys as a tool to remaster. ILOSmedia is developed by installing multimedia packages that have been obtained based on the results of questionnaires from 30 respondents from three communities, which are KPLI Bogor, Linux.com forums, and Kaskus.us forums. ILOSmedia also uses the Realtime kernel as kernal Mutimedia. ILOSmedia testing is performed by 11 students of Computer Science who are members of FOKERZ community. The testing process is performed by executing ILOSmedia via live-cd and filled in a questionnaire. The test result shows that ILOSmedia has hardware compatibility on notebook and PC with good performance. As much as 72.727% of respondents believe that the size of the installer ILOSmedia of 1.34 GB and a minimum 10GB hard drive is normal. ILOSmedia has multimedia packages complete with the percentage completeness according to respondents is 45.455% are very complete and 54.545% are complete. Boot speed ILOSmedia have an average of 28.87 seconds and 90.91% of respondents consider that ILOSmedia have a desktop environment that is easy navigation
Keyword: