Judul: Penelusuran Efek Interaksi Lokasi dan Galur Pada Model Tetap dan Campuran
Abstrak: Analisis AMMI (Additive Main Effects and Multiplicative Interaction) adalah analisis multilokasi untuk mengetahui kestabiIan suatu galur pada berbagai kondisi lokasi. Pada analisis AMMI, faktor galur dan lokasi yang dicobakan diasumsikan sebagai faktor tetap. Namun terkadang pada dasarnya faktor lokasi merupakan faklor acak yang dipilih dari banyak lokasi yang ada di Indonesia. Sehingga perlu dilihat apakah terdapat perbedaan kesimpulan antara faktor lokasi yang diasumsikan sebagai faletor tetap dan faktor acak. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh interaksi antara lokasi dan galur pada model tetap dan model campuran, serta membandingkan pengaruh lokasi dan galur pada model tetap dan model campuran. Hasil pada penelitian ini menunjukkan bahwa terdapat interaksi antara lokasi dan galur pada kedua model. Perbandingan pola interaksi antara model tetap dan model campuran yang dilihat dari biplot AMMI2 pada model tetap dan biplot interaksi pada model campuran memiliki perbedaan dan persamaan. Perbedaan terlihat pada galur yang stabi!, pada model tetap galur yang stabi! adalah galur 1, 3, 4, 7, 8, dan 12. Sedangkan pada biplot model campuran terlihat bahwa hampir seluruh galur yang stabil kecuali galur 2, 6, 8, 9, dan 11. Untuk galur yang spesifik, kedua model memiliki galur spesifik yang hampir sarna. Pada model tetap respon tertinggi di lokasi D adalah galur 11, di lokasi C adalah galur 2, di lokasi A adalah galur 5, sedangkan di lokasi F adalah galur 6 dan 10. Pada model campuran respon tertinggi di lokasi A dan D adalah galur II, di lokasi C adalah galur 2, sedangkan di lokasi F adalab galur 6.
Keyword: 

Judul: Penerapan model ammi campuran pada interaksi genotipe-lingkungan spasial
Abstrak: Analisis AMMI (Additive Main Effect and Multiplicative Interactions) digunakan untuk analisis kestabilan dan kespesifikkan dalam percobaan multilokasi. Asumsi yang digunakan dalam suatu analisis statistika menjadi sesuatu yang penting dan harus ada. Akan tetapi, data yang berasal dari percobaan lapang sering mempunyai pola spasial yang dapat digambarkan dalam suatu fungsi, sehingga asumsi kebebasan ragam sisaan mungkin saja tidak terpenuhi. Oleh sebab itu diperlukan suatu cara yang dapat mengakomodir keragaman spasial sehingga asumsi kebebasan dapat terpenuhi. Dalam penelitian ini genotipe diasumsikan sebagai faktor tetap sedangkan lokasi diasumsikan sebagai faktor acak. Lokasi yang digunakan ada 12, sedangkan genotipe yang digunakan ada 14 genotipe. Sebagian besar lokasi tidak menunjukkan adanya pola spasial, kecuali daerah Ngawi1 (AR1xAR1), Deli Serdang1 (IDxAR1), dan Lebak2 (IDxAR1). Keragaman biplot AMMI2 yang mampu digambarkan oleh pengaruh interaksi genotipe dan lingkungan setelah mengakomodir pengaruh spasial lahan adalah sebesar 58.56%. Poligon dalam Biplot AMMI2 membagi lokasi-lokasi yang ada menjadi empat kelompok. Berdasarkan biplot tersebut genotipe yang spesifik adalah BP1932-3E-7-2-1, IPB97-F-13-1-1, IPB97-F-15-1-1, dan Padi Ciherang. Kemudian berdasarkan ellips yang terbentuk pada biplot AMMI2 ini genotipe yang stabil adalah BP3692-2E-8-2, B10531E-KN-15-2-0-LR-B378-2, OBS 1720/PSJ, BIO-110-BC-Pir 4, IPB98-F- 5-1-1, IPB102-F-46-2-1, dan Padi Gilirang.
Keyword: AMMI, interaksi genotipe x lingkungan (IGL), spasial, model campuran, uji multilokasi

Judul: Mitochondrial DNA Gene Organization and Phylogenetic Relationship of Naja siamensis
Abstrak: Naja siamensis is one of Asiatic cobra in the Family of Elapidae, known as a cryptic snake. It has many morphological variations that lead to misidentification. Misidentification can cause the wrong concept in developing antivenom types due to high snakebite cases occur in Thailand. Thus, an accurate species identification using a molecular approach is crucially required. Mitochondrial DNA has been used widely in snake molecular studies. These studies were aimed to determine the arrangement of the N. siamensis partial mitochondrial genes using reptile-oriented primers and to reveal the phylogenetic relationship among other species of Asian cobra. DNA extraction was carried out based on the standard DNA salting-out protocol and was conducted by bioinformatics analysis using BLASTn and MEGA 6 software. Gene annotation was performed against N. kaouthia complete genome. A total of 3121 bp of N. siamensis mtDNA genes were sequenced consisting of partial of six regions: 16S rRNA, ND1, tRNA-Ile, CRII region, tRNA-Leu, tRNA-Gln, and COI genes. The mtDNA gene organization of N. siamensis was predicted to has a similar pattern with the common Elapidae mtDNA gene organization. This study showed that there is a monophyletic form in Naja genus and N. kaouthia is the closest species with N. siamensis based on partial 16S rRNA and ND1 gene.
Keyword: 16S rRNA, Elapidae, ND1, phylogenetic relationship