Judul: Karakterisasi Genetik Karang Genus Favites (Faviidae: Scleractinia) di Perairan Kepulauan Spermonde, Sulawesi Selatan
Abstrak: Karang memiliki keanekaragaman spesies yang kaya, meskipun hanya menutupi sebagian kecil lautan, namun di dalamnya menjadi tempat hidup berbagai organisme. Karakter morfologi sebagai pembeda antar taksa pada karang umumnya menggunakan parameter yang didasarkan pada bentuk koloni, struktur dan bentuk rangka seperti koralit, septa, paliform lobe, septocostae, kolumella, dan duri septa. Akan tetapi, karakter morfologi tersebut sering mengalami variasi akibat faktor lingkungan, yang disebut dengan plastisitas fenotifik. Plastisitas fenotifik yang dipengaruhi oleh kondisi lingkungan telah menyebabkan perubahan karakter morfologi (penotifik) walaupun spesiesnya tetap sama. Oleh karena itu pendekatan identifikasi yang handal berdasarkan karakter mofologi dan molekuler dalam bentuk aplikasi DNA barcoding sangat dibutuhkan. Penggunaan penanda genetik Cytochrome c Oxidase subunit I (COI) dalam DNA barcoding telah umum digunakan sebagai pemilah penentuan spesies organisme pada berbagai taksa. Namun demikian, penanda genetik ini ternyata tidak konsisten membedakan antar spesies jika diaplikasikan pada karang ordo Scleractinia. Hal ini terjadi karena ketidak konsistenan dalam pengelompokan (clustering), yaitu suatu spesies masuk ke dalam kelompok tertentu dan kadangkala masuk ke dalam kelompok yang lain. Pada penelitian ini menggunakan pendekatan secara paralel antara karakter morfologi dan molekuler. Model yang digunakan adalah beberapa spesies karang Genus Favites yang dikoleksi dari perairan Kepulauan Spermonde. Data molekulernya juga dikombinasikan dengan beberapa data molekuler karang Favites dari berbagai belahan dunia, yang diperoleh dari Bank Gen (NCBI). Ini bertujuan untuk melihat posisi karang Favites yang berasal dari Perairan Kepulauan Spermonde dengan karang dari lokasi lainnya secara genetik. Karakter morfologi baik deskriptif dan morfometrik seperti diameter koralit, tipe sudut koralit, ada tidaknya paliform lobe, bentuk permukaan koloni, dan duri septa merupakan karakter kunci dalam penentuan spesies pada karang Favites. Akan tetapi karakter ini seringkali dipengaruhi oleh faktor lingkungan. Pada penelitian ini mencoba menyusun pohon filogeni 6 spesies pada karang genus Favites (Favites abdita, F. benattae, F. chinensis, F. flexuosa, F. halicora, dan F. paraflexuosa) yang dikoleksi dari Perairan Kepulauan Spermonde. Pohon filogeni disusun berdasarkan karakter morfologi (deskriptif dan morfometrik) menggunakan metode UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean) pada program PAUP 4.0. Hasil pada penelitian ini memperlihatkan pengelompokan taksa berdasarkan masing-masing spesies. Akan tetapi, jika hanya menggunakan karakter morfometrik dalam menyusun pengelompokannya, tidak memperlihatkan perbedaan yang jelas antar spesies. Hal ini membuktikan bahwa karakter morfometrik sangat plastis dan dipengaruhi oleh faktor lingkungan, bila dibandingkan dengan karakter deskriptif. vi Pada penelitian ini, kami mencoba menggunakan penanda genetik Internal Transcribed Spacer (ITS), yang merupakan fragmen dari gen ribosom dengan panjang sekitar 750 bp. Gen ITS ini diamplifikasi menggunakan mesin PCR dengan primer universal untuk karang. Produk PCR-nya kemudian disekuensing, lalu diolah dengan menggunakan program MEGA 5. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa penentuan spesies sampel yang didasarkan pada karakter morfologi yang digunakan kurang konsisten terhadap data genetik (molekuler) dalam membedakan antar karang jenis Favites di Kepulaun Spermonde. Terdapat beberapa spesimen yang telah teridentifikasi dengan konsisten, yakni baik secara morfologi maupun molekuler sebagai F. abdita. Namun demikian pada beberapa sampel, ada yang secara morfologi adalah F. abdita, akan tetapi berbeda secara molekuler. Ada pula yang secara morfologi adalah F. chinensis, F. flexuosa, dan F. halicora akan tetapi secara molekuler 99% mirip dengan F. abdita. Serta ada yang memang bukan
Keyword: Karang Favites, variasi morfologi, Kepulauan Spermonde, Internal Transcribed Spacer (ITS), penanda genetik

Judul: Relationship between Symbiodiniaceae and Coral Reef Characteristics Based on Environmental DNA in Lombok Island Waters
Abstrak: Symbiodiniaceae merupakan biota asosiasi karang penting dan berkontribusi dalam kesehatan ekosistem terumbu karang. Sebagai endosimbion karang, Symbiodiniaceae menyediakan energi, menyerap sisa metabolit, dan membantu pertumbuhan karang. Hingga saat ini, dikenali 11 genera resmi dalam famili Symbiodiniaceae dan masih terdapat lima klade mewakili genera yang belum terdeskripsi secara formal. Karena itu, memahami keragaman Symbiodiniaceae dalam ekosistem karang menjadi penting dan diduga, Symbiodinaiaceae dapat menjadi indikator kondisi terumbu karang. Namun, informasi Keragaman Symbiodiniaceae di Indonesia masih sedikit. Lagipula, identifikasi Symbiodiniaceae tidak mudah, terlebih bila memerlukan pengambilan dan pengisolasian dari banyak lokasi dan inang. DNA lingkungan (eDNA) adalah materi genetika yang terlepas ke lingkungan, dapat digunakan untuk menilai potensi keragaman Symbiodiniaceae secara non destruktif, cepat, relatif luas, efisien, dan efektif. Melalui pendekatan survei eDNA, penelitian mengkaji keragaman hayati dan karakteristik komunitas Symbiodiniaceae, menelaah hubungan antara keragaman Symbiodiniaceae dan karakteristik terumbu karang dan menganalisa nilai indikator dan preferensi komunitas Symbiodiniaceae pada pengelompokan karateristik terumbu karang lokasi tertentu di Perairan Lombok. Pengambilan sampel eDNA dan pengamatan kondisi bentik karang dilakukan di zona inti, di luar zona inti, dan luar kawasan konservasi Perairan Lombok Barat, Utara, dan Timur. Materi eDNA dalam sampel air laut dan sedimen yang tersaring di kertas saring pada fraksi ukuran pori-pori 12 µm (fraksi >12 µm) dan 0,4 µm (fraksi 0,4-12 µm), diekstraksi dan diamplifikasi DNA-nya dengan primer gen V9-SSU 18S rRNA, kemudian disekuensing melalui platform MiSeq-Ilumina. Analisis bioinformatika melalui platform Qiime2 dilakukan untuk memperoleh amplicon sequence variants (ASV), identifikasi Symbiodiniaceae setelah mengindentifikasi eukaryota laut terlebih dahulu, dan analisis filogenetika. Pengamatan kondisi bentik karang dilakukan dengan metode point intercept transect (PIT) untuk menentukan kondisi tutupan kategori bentik, tingkat rugositas karang, tingkat tutupan bentuk karang hidup, indeks kematian karang (IKK), genera karang, dan keterwakilan genera karang. Dilakukan analisis statistik untuk analisis perbandingan sebaran dan komposisi kelimpahan, keragaman alfa dan beta, kluster, indikator dan preferensi komunitas Symbiodiniaceae terhadap kondisi terumbu karang di Perairan Lombok. Penelitian memperoleh 2.737.734 sekuens yang terdiri atas 20.478 ASV sebagai wakil individu. Identifikasi eukaryota laut mengungkap lima kingdom dengan komposisi Chromista (35%), Animalia (32%), Fungi (3%), Plantae (2%), dan Protozoa (2%), dengan 43,34 % total ASV tidak terindentifikasi sama sekali. Keragaman alfa (Shannon H’) eukaryota berkisar {minimum-maksimum (median)} antara 4,90-9,59 (7,63). Faktor alam terkait media habitat lebih mempengaruhi keragaman alfa eukaryota daripada faktor geografi skala lokal dan zonasi konservasi perairan. Aspek teknis terkait media sumber dan pembagian fraksi sampel menentukan perolehan eDNA eukaryota. Keragaman beta (Bray-Curtis) komunitas eukaryota berkisar {minimum-maksimum (median)} antara 0,72-0,99 (0,92). Terdapat perbedaan signifikans antar lokasi, media dan fraksi namun faktor manajemen terkait penetapan zonasi konservasi tidak mempengaruhi variasi heterogenitas komunitas eukaryota. Penelitian berhasil mendeteksi dan mengidentifikasi 16 wakil individu Symbiodiniaceae yang terdiri atas enam genera (subklade): Symbiodinium (A.sym21), Breviolum (B.sym18), Cladocopium (C.sym1, C.sym5, C.sym7, C.sym8, C.sym10, C.sym15, C.sym16, and C.sym17), Durusdinium (D1.sym2, D1.sym6, D1.sym19, and D1.sym22), Klade G Foraminifera (G2.sym4), dan Halluxium (H.Sym12). Komposisi dominan pada Cladocopium (71%), disusul Durusdinium (18,2%), dan Klade G Foraminifera (8,4%). Komunitas Symbiodiniaceae mencirikan keragaman alfa rendah dan keragaman beta tinggi, namun tidak memperlihatkan perbedaan secara nyata antar lokasi, zona, media, maupun fraksi. Sejauh diketahui, studi eDNA Symbiodiniaceae belum pernah dilakukan di kawasan
Keyword: Bioindikator, DNA lingkungan, Ekosistem terumbu karang, Keragaman hayati laut, Symbiodiniaceae, Endosimbion, Eukaryota, Filogenetika, Metabarkoding

Judul: Elektrodeposisi Film Tipis Semikonduktor Cu2ZnSnS4 (CZTS) pada Substrat Kaca ITO
Abstrak: Semiconductor Cu2ZnSnS4 (CZTS) thin film that can be used as absorber layers on solar cell module was made via electrodeposition method. CZTS thin film was electrodeposited on the surface of a silicate glass coated with a thin layer of indium tin oxide (ITO). Deposition process was done using potentiostatic mode at room temperature with a potential of 1.05 V for 30, 45, and 60 minutes, followed with annealing the film at 2 different temperatures, 500 ºC using furnace and 180 ºC using hot plate, both treatments for 45 minutes in N2/H2S atmosphere. The X-ray difractograms were analyzed using Match 2 program and showed that the CZTS thin films had kesterit crystalline structure, with a low percentage of CZTS phase. The thin film also contained secondary phases such as Cu2S, ZnS, and SnS. The obtained CZTS thin films had a thickness between 1.039 and 1.676 μm. Absorption study showed that the band gap energy of CZTS thin films which was annealed using furnace ranged from 1.50 to 1.52 eV, whereas that annealed using the hot plate was not observed. The band gap energy value showed that CZTS thin films can be used as sunlight absorber layers on solar cell. The formation of CZTS crystal film on this investigation was effectively performed using furnace annealing process at a temperature of 500 ºC with deposition time of 45 minutes.
Keyword: Thin film, Electrodeposition, Cu2ZnSnS4