Judul: Sifat-sifat Tanah pada Suatu Transek di Kebun Percobaan Fakultas Pertanian IPB, Darmaga
Abstrak: Tujuan penelitian ini adalah untuk melihat sifat-sifat kimia, fisik dan morfologi tanah dalan suatu transek lereng dan mengklasifikasikannya sampai kategori famili. Bahan yang diteliti adalah contoh tanah dari empat pedon yang berada pada suatu transek di Kebun Percobaan Fakultas Pertanian, IPB Darmaga. Transek tersebut berada pada suatu wilayah yang landai sampai berombak. Transek tersebut terbagi menjadi 3 posisi lereng yaitu lereng bawah, lereng tengah dan lereng atas. Pada masing-masing bagian lereng dibuat pedon-pedon : Pedon P1 di lereng bawah, Pedon P2 di lereng tengah sedangkan Pedon P3 dan P4 di lereng atas. Masing-masing pedon dideskripsi dan diambil contoh tanahnya untuk dianalisis sifat fisik dan kimia tanahnya di Laboratorium Jurusan Tanah, Fakultas Pertanian, IPB.
Keyword: 

Judul: Sifat-sifat tanah pada suatu transek lereng di kebun percobaan IPB Darmaga
Abstrak: Sifat-sifat tanah berubah dari satu tempat ke tempat lain yang secara relatif mencerminkan bekerjanya berbagai faktor pembentuk tanah. Penelitian ini dilakukan untuk melihat perubahan sifat-sifat tanah pada suatu transek lereng berkaitan dengan posisi relatifnya secara topografis. Penelitian ini bertujuan untuk melakukan karakterisasi sifat morfologi, sifat fisik dan kimia tanah pada suatu transek lereng berjarak pendek di Kebun Percobaan IPB Darmaga dan mengklasifikasikan tanahnya berdasarkan sistem Taksonomi Tanah (Soil Survey Staff, 1998). Penelitian diawali dengan pengumpulan data dan informasi yang menunjang pelaksanaan penelitian lapang, kemudian dilanjutkan dengan pembuatan sketsa transek. Pada transek tersebut dibuat 4 buah profil. Jika ditinjau secara mikro (jarak pengukuran 5 m), Profil P1, P2, P3 dan P4 masing-masing terletak pada lereng mikro sebesar 5%, 9%, 5%, dan 0%. Untuk menentukan lokasi profii pewakil dari transek tersebut dilakukan pengeboran pada setiap jarak 5 meter. Analisis ketagaman jenis tanah untuk penetapan lokasi profil didasarkan pada kenampakan visual keragaman tanah hasil bor yang disusun pada pedokomparator. Setelah itu dilakukan pembuatan profil pewakil, deskripsi profil, dan pengambilan contoh tanah dari setiap horison pada profil-profil tersebut. Tekstur tanah pada keempat pedon didominasi oleh liat. Translokasi liat lebih bersifat vertikal dan lokal pedon dari pada lateral. Warna tanah pada keempat pedon berkisar dari coklat gelap (7.5 YR3/4) sampai merah kekuningan (5 YR 4/6). Keempat pedon mempunyai struktur tanah yang relatif seragam, dan didominasi oleh struktur gumpal Umembulat dengan tingkat perkembangan struktur sedang serta ukuran sedang. Konsistensi tanah tidak memperlihatkan perbedaan yang nyata antar pedon, keempat ..dst
Keyword: 

Judul: Development of DNA Vaccine Encoding Glycoprotein of Koi Herpes Virus Using Local Isolate.
Abstrak: The aim of this research was to develop DNA vaccine of Koi Herpesvirus in carp. Glycoprotein gene originated from ORF 25 KHV virus that is 1.8 kbp in size, is a potential gene in DNA vaccine construction. The sequencing and similarity analysis of the gene using BLAST software showed that this gene is a GP25 gene and was found to be very similar (99%) to GP25 of KHV virus from the USA and Israel. When this GP25 gene was ligated with pGEMT Easy (pT, 3 kbp in size) vector, plasmid size was increasing up to 5 kb. Following this, a digestion of pT-GP25 plasmid using Sal I enzyme was applied resulted in a GP25 fragment (1.8 kbp). Subsequently, pAct-D6 with a size of 8.5 kbp was also cut using the same enzyme to eleminate a D6 gene with a size of 1.6 kbp. GP25 gene was then ligated with pAct resulted a pAct-GP25 plasmid with a size of 8.8 kbp. As there was only one restriction site applied, ligation can be occurred in two different directions. Thus, in order to determine the plasmid with the desired direction PCR analysis was carried out, and plasmid with the right direction was the one that sized approximately 2.1 kbp (no. 6, 17 and 20). High level of GFP gene expression was detected in all tissues analyzed, i.e. kidney, gil, spleen, and muscle 24 hours after injection which indicated that β-actin promoter of Japanese medaka could be active in common carp. Although not as high as on 24 hours, expression was still detected until day 7 and disappeared after day 28 post injection indicating that pAct-GFP can be remained and β-actin promoter of Japanese medaka can be active in muscle, gills and kidney at least a week after injection. The result of RT-PCR analysis on pAct-GP25 injected common carp showed that GP25 gene expression can be detected 14 days after injection in all tissues observed. The expression level differences between GFP and GP25 genes possibly related to the primer sensitivity on annealing process to cDNA template and the size of PCR targeted DNA fragment, as smaller PCR targeted product will be easier to be amplified than a bigger one. The length of PCR targeted DNA with GP25 primer was 1.8 kbp whereas GFP gene was 0.6 kbp.The challenge test on common carp results showed that all unvaccinated and negative control (not infected with KHV) was alive until the end of the experiment. Whereas, the survival of fish vaccinated with a dose of 12.5 was ranged from 60.9 and 96.7%. In relation to the activity of β-actin promoter that was used in this DNA vaccine, gene expression was occured 24 hours after vaccination and remained until 2 weeks. The control fish that was not injected by GP25 showed no GP25 expression either in the observed tissues or organs and resulted in a lower survival, i.e. 23.3%. The challenge test results has indicated that the fish vaccinated with GP25 at doses of 7.5 and 12.5 μg/100μL were able to produce KHV glycoprotein in their body which would be
Keyword: