Judul: Identifikasi dan Analisis Ekspresi Gen Lisozim pada Ikan Lele Dumbo Clarias gariepinus yang Diinfeksi Aeromonas hydrophila
Abstrak: Lisozim adalah enzim anti-mikroba yang memiliki peran penting dalam sistem imun. Lisozim mengkatalis proses hidrolisis ikatan β-(1,4)-glycosidic yang merupakan bagian dari penyusun dinding sel bakteri. Sistem ini menjadi salah satu bentuk respons awal ikan terhadap serangan bakteri patogen. Secara umum, lisozim ditemukan dalam bentuk tipe-c dan tipe-g pada ikan. Namun, belum ada laporan mengenai sekuens gen dan analisis ekspresi dari lisozim tipe-c (CgLysC) dan tipe-g (CgLysG) pada ikan lele dumbo. Selain informasi sekuens gen, informasi terkait ekspresi gen juga penting untuk diketahui dan dievaluasi. Sebaran ekspresi gen pada berbagai jaringan akan membantu evaluasi fungsi dan distribusi gen pada spesies terkait. Respons imun juga dapat dievaluasi pascainfeksi bakteri dengan melihat pola ekspresi gen pada rentang waktu tertentu. Sebagai tambahan, informasi terkait studi ontogenetik pada perkembangan awal larva akan membantu peneliti untuk mengetahui perkembangan sistem imun ikan pada berbagai stadia ikan. Informasi-informasi tersebut menjadi penting untuk diketahui sebagai usaha manajemen penyakit pada ikan lele. Berdasarkan kepentingan tersebut, penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi sekuens CgLysC dan CgLysG, menganalisis ekspresi kedua gen lisozim tersebut di berbagai jaringan ikan dan pascauji tantang bakteri Aeromonas hydrophila, serta menganalisis profil ontogenetik gen pada berbagai stadia ikan. Identifikasi gen dilakukan dengan metode polymerase chain reaction (PCR) dilanjutkan dengan kloning gen dan sekuensing. Analisis ekspresi gen dilakukan dengan metode realtime-PCR (qPCR) pada berbagai jaringan ikan sehat, serta pascauji tantang bakteri A. hydrophila. Analisis ontogenetik dilakukan dari telur yang belum dibuahi hingga larva 10 hari pascatetas. Hasil penelitian berhasil mengidentifikasi sekuens CgLysC sepanjang 594 pasang basa yang terdiri dari 387 coding region yang mentranslasikan 129 asam amino dan CgLysG sepanjang 608 pasang basa yang terdiri dari 383 coding region dan mentranslasikan 119 asam amino. Struktur asam amino kedua gen memiliki homologi dan kedekatan evolusi yang tinggi dengan spesies ikan yang lain. Ekspresi CgLysC dan CgLysG terdistribusi diseluruh jaringan uji dengan ekspresi tertinggi pada jaringan imun seperti ginjal depan dan limpa. Pascauji tantang, ekspresi kedua gen termodulasi pada seluruh jaringan uji dengan peningkatan tertinggi berada 12 jam pascauji tantang, menunjukkan peranan penting lisozim bagi respons imun anti-bakteri pada ikan lele dumbo. Profil ontogenetik menunjukkan kedua gen bersifat maternal, ditransmisikan dari induk ke anak. Ekspresi mRNA lisozim pada larva meningkat mulai dari hari kelima pascatetas. Diduga gen lisozim ikan lele mulai stabil terekspresi dan siap memberikan perlindungan bagi ikan sebagai innate immunity mulai dari hari kelima hingga kesepuluh pascatetas.
Keyword: A. hydrophila, lele dumbo, lisozim, ontogenetic, respons imun

Judul: Pewarisan Marka SNP2 Gen Lys-C pada Ikan Lele Clarias gariepinus Generasi Pertama dan Daya Tahan Benih terhadap Infeksi Aeromonas hydrophila.
Abstrak: Ikan lele Clarias gariepinus yang potensial tahan terhadap infeksi Aeromonas hydrophila sudah diidentifikasi menggunakan marka single nucleotide polymorphism (SNP2) pada gen lisozim tipe-C (LYSC). Namun, hasil dari penelitian tersebut belum dianalisis pada keturunan yang dihasilkan. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis pewarisan marka SNP2 gen Lys-C pada ikan lele Clarias gariepinus generasi pertama dan daya tahan benih terhadap infeksi Aeromonas hydrophila. Persilangan ikan lele berbeda genotipe yang dilakukan yaitu(♀TT×♂TT),(♀CC×♂TT),(♀TT×♂CC),dan(♀CT×♂CT).Analisis pewarisan genotipe dilakukan dengan metode polymerase chain reaction dan uji tantang dilakukan dengan menginfeksi ikan menggunakan A.hydrophila. Ikan uji yang digunakan berukuran 11 – 13 cm, bakteri A. hydrophila diinjeksikan secara intramuskular dengan dosis 1 mL per ekor, sebanyak 20 ekor per perlakuan 3 kali ulangan. Parameter yang diamati yaitu tingkat kelangsungan hidup, gambaran sel darah putih, aktivitas fagositik, dan respiratory burst. Persilangan TT><TT menghasilkan 100% keturunan TT dengan tingkat kelangsungan hidup pasca infeksi A. hydrophila tidak berbeda nyata dengan persilangan resiprokal TT dengan CC yaitu berkisar 68,33-78,33% lebih tinggi dibandingkan dengan persilangan heterozigot CT><CT sebesar 45%., The catfish Clarias gariepinus which is potentially resistant to Aeromonas hydrophila infection has been identified using a single nucleotide polymorphism (SNP2) marker in the C-type lysozyme gene (LYSC). However, the results of these studies have not been analyzed in the resulting offspring. This study aimed to analyze the inheritance of the SNP2 marker of the Lys-C gene in the first generation of catfish Clarias gariepinus and the resistance of the fry to Aeromonas hydrophila infection. Crosses of catfish with different genotypes were carried out, namely (♀ TT × ♂ TT), (♀ CC × ♂ TT), (♀ TT × ♂ CC), and (♀ CT × ♂ CT). The analysis of genotypic inheritance was carried out using the polymerase chain reaction method and the challenge test was carried out by infecting fish using A. hydrophila. The test fish used were 11-13 cm in size, A. hydrophila were injected intramuscularly at a dose of 1 mL-1 per fish, as many as 20 fish per treatment with 3 replications. Parameters observed were survival rate, white blood cell appearance, phagocytic activity, and respiratory burst. TT><TT crosses produced 100% of TT progeny with post-infection survival rate of A. hydrophila not significantly different from reciprocal TT crosses with CC, which was 68.33-78.33% higher than heterozygous crosses CT><CT which was 45%.
Keyword: Aeromonas hydrophila, Genotype, Lysozyme, Resistance, SNP

Judul: Struktur Kristal Film BaxSr1-xTiO3 dengan Variasi Fraksi Mol (x = 0,5 ; 0,6 ; 0,7 ; 0,8)
Abstrak: BaxSr1-xTiO (BST) film has been successfully made by growing BST on substrate surface Si (100) p-type with chemical solution deposition methode and spin coating technique at 3000 rpmrotational speed for 30 seconds. BST film made with mole fraction variation (x = 0,5 ; 0,6 ; 0,7 ; 0,8) and annealing process at a temperature of 850 °C for 22 hours. Characterization of BST samples obtained using X-ray diffractometer. The results of X-ray diffractometer characterization showed that the best crystal structure resulting in x = 0,5 mole fraction with the highest diffraction intensity and 25,55 nm crystal size, while the lowest diffraction intensity is owned by BST films with x = 0,8 mole fraction and the crystal size of 41,86 nm.
Keyword: Bogor Agricultural University (IPB), XRD., chemical solution depositon, BST, Annealing