Judul: Respon Fisiologi Tanaman Padi Transgenik B11 Terhadap Cekaman Aluminium.
Abstrak: Aluminium (Al) menjadi faktor pembatas di lahan pertanian tanah masam terutama pada tanaman padi. Tanaman padi memiliki tingkat toleransi yang berbeda pada genotipe maupun varietas terhadap cekaman Al. Toleransi terhadap cekaman Al pada tanaman dipengaruhi oleh banyak gen. Gen B11 merupakan salah satu gen yang berperan dalam mekanisme toleransi Al yang diisolasi dari tanaman padi toleran Al yaitu var. Hawara Bunar. Gen B11 diketahui dapat meningkatkan toleransi tanaman tembakau transgenik (Nicotiana tabacum L.) terhadap cekaman Al. Penelitian untuk membentuk tanaman padi transgenik overekspresi gen B11 yang berasal dari padi var. IR64 telah dilakukan, namun belum dilakukan analisis untuk mengetahui respon tanaman transgenik tersebut khususnya respon morfologi dan fisiologinya. Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari respon morfologi dan fisiologi tanaman padi transgenik overekspresi gen B11 terhadap cekaman Al. Bahan tanaman yang digunakan adalah lima genotipe tanaman padi dengan dua varietas (IR64 dan Hawara Bunar) dan tiga tanaman transgenik generasi T4 yaitu: T8-2-4, T8-12-5, dan T8-15-41. Semua tanaman ditanam pada larutan kultur hara minimum 0 ppm Al selama 24 jam (masa adaptasi), kemudian dilakukan cekaman 15 ppm Al selama 72 jam (masa cekaman), dan ditanam kembali dalam larutan kultur hara minimum 0 ppm Al selama 48 jam (masa pemulihan). Peubah yang diamati dalam penelitian ini adalah analisis pertumbuhan akar, analisis kandungan Al, analisis peroksida lipid membran sel akar, analisis sekresi asam sitrat, dan pengamatan struktur sel akar. Data yang diperoleh dianalisis secara statistik menggunakan analisis sidik ragam dan dilanjutkan uji DMRT jika berbeda nyata pada tingkat kepercayaan α = 0.05 (SPSS versi 16.0). Pengelompokkan tanaman padi berdasarkan tipe tingkat toleransinya terhadap cekaman Al menggunakan Principal Component Analysis (PCA) yang dilengkapi analisis klaster yang dilakukan melalui program PAST 3.06. Hasil penelitian menunjukkan bahwa terjadi penurunan panjang akar pada perlakuan Al dan perlakuan pH. Sementara, hanya var. Hawara Bunar yang memiliki akar utama paling panjang. Pengukuran karakter akar menunjukkan panjang akar dan jumlah akar yang sama pada semua tanaman transgenik. Semua karakter akar lebih tinggi dibandingkan dengan IR64 yang mengindikasikan bahwa tanaman transgenik lebih toleran dibandingkan tipe liarnya. Jika dibandingkan dengan var. Hawara Bunar, semua tanaman transgenik memiliki nilai yang lebih tinggi pada karakter jumlah akar namun memiliki nilai yang lebih rendah pada karakter panjang akar. Hasil perhitungan nilai PAR dan RGR dari tanaman transgenik T8-2-4 dan T8-12-5 menunjukkan nilai yang lebih tinggi dibandingkan dengan var. IR64, namun nilai PPA tanaman transgenik T8-2-4 dan T8-12-5 lebih rendah dibanding var. IR64. Nilai PAR, RGR, dan PPA pada tanaman transgenik T8-15-41 tidak berbeda nyata dengan var.IR64. Hasil analisis akumulasi Al dengan pewarnaan hematoksilin menunjukkan profil warna ungu yang sangat jelas pada ujung akar var. IR64 dan tanaman transgenik T8-15-41, namun profil warna ungu tersebut lebih terlihat tidak pekat pada ujung akar T8-2- 4 dan T8-12-5, bahkan tidak terlihat adanya profil warna ungu pada var. Hawara Bunar. Analisis akumulasi dengan AAS menunjukkan perbedaan kandungan Al antar tanaman, dimana kandungan Al terendah terdapat pada var. Hawara Bunar dan transgenik T8-12-5. Tiga tanaman lainnya, yaitu IR64, T8-15-41 danT8-2-4 menunjukkan akumulasi Al yang lebih tinggi di ujung akar. Hasil analisis peroksida lipid membran sel akar menunjukkan perbedaan intensitas warna merah muda antara perlakuan
Keyword: akar, aluminium, gen B11, overekspresi, padi transgenik, respon fisiologi, respon morfologi

Judul: Respon Fisiologi, Morfologi, dan Anatomi Akar Padi Hawara Bunar Transgenik yang Mengalami Pembungkaman Gen B11 terhadap Cekaman pH Rendah dan Aluminium
Abstrak: Padi var. Hawara Bunar merupakan padi yang toleran terhadap cekaman aluminium (Al). Sifat toleransi Al pada varietas tersebut salah satunya diduga disebabkan oleh ekspresi gen B11 yang telah diisolasi dari padi var. Hawara Bunar. Pembungkaman gen B11 dengan teknik RNAi pada var. Hawara Bunar menghasilkan padi transgenik yang diduga memiliki sifat sensitif terhadap cekaman Al. Penelitian bertujuan mempelajari respon fisiologi, morfologi, dan anatomi akar padi Hawara Bunar transgenik yang mengalami pembungkaman gen B11 terhadap cekaman pH rendah dan Al. Kecambah padi ditanam pada larutan hara selama 24 jam periode adaptasi, kemudian diikuti dengan 72 jam periode cekaman, dan 48 jam periode pemulihan. Konsentrasi Al yang digunakan dalam perlakuan adalah 15 ppm. Peubah yang diamati yaitu karakter pertumbuhan akar, akumulasi Al pada akar, morfologi ujung akar, penampang membujur zona pemanjangan pada akar, dan struktur sel ujung akar. Hasil percobaan menunjukkan bahwa padi transgenik mengalami penghambatan pertumbuhan akar dan mengakumulasi Al lebih banyak di ujung akar dibanding padi var. Hawara Bunar ketika kedua genotipe tersebut mengalami cekaman Al. Sel-sel epidermis ujung akar padi transgenik mengalami kerusakan ketika mendapat cekaman Al. Panjang sel-sel parenkim korteks pada zona pemanjangan akar padi Hawara Bunar transgenik lebih pendek dibanding var. Hawara Bunar tipe liar ketika dicekam dengan pH rendah dan Al. Hasil analisis TEM menunjukkan sel akar padi Hawara Bunar transgenik mengalami kerusakan dan muncul granula di dalam sel. Pembungkaman gen B11 pada var. Hawara Bunar menyebabkan padi var. Hawara Bunar yang toleran Al menjadi sensitif Al, sehingga dapat disimpulkan bahwa gen B11 berperan dalam mekanisme toleransi padi terhadap cekaman Al.
Keyword: aluminium, padi, pembungkaman gen

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: