Judul: Studi tentang keadaan pasang surut dengan melakukan analisis harmonik menggunakan metoda admiralty di Perairan Teluk Pelabuhan Ratu Kabupaten Sukabumi Jawa Barat
Abstrak: Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui konstanta harmonik pasut dan jenis pasut di Teluk Pelabuhan Ratu, mengetahui pengaruh faktor-faktor astronomi terhadap pasut serta mengetahui penyimpangan antara data hasil pengamatan dengan hasil prediksi menggunakan metoda Admiralty. Penelitian ini dilakukan di 3 stasiun. Stasiun 1 di Desa Cibangban dan stasiun 2 di depan TPI Pelabuhan Ratu pengamatan dilakukan selama 29 hari. Sedangkan stasiun 3 di Desa Loji selama 15 hari. Alat yang digunakan adalah rambu pasut (palm staff). Data ketinggian air dianalisis berdasarkan teori harmonik dengan menggunakan metoda Admiralty. Teori harmonik untuk menganalisis pasut menggunakan anggapan bahwa kurva pasut mempunyai kecenderungan yang sama dengan kurva sinusoidal. Karena itu sebelum diolah dengan metoda Admiralty, data ketinggian air mengalami beberapa penyesuaian. Proses penyesuaian terhadap data. ketinggian air berpengaruh cukup besar terhadap fase komponen perairan dangkal (M4 dan MS4). Tetapi pengaruh tersebut relative ..dst
Keyword: 

Judul: Model dan simulasi pola arus perairan teluk Pelabuhan Ratu dengan metode beda hingga eksplisit
Abstrak: Studi mengenai model hidrodinamika dan simulasi pola arus di perairan Teluk Pelabuhan Ratu ini bertujuan untuk membangun model matematik numerik yang dapat memberikan informasi fisik dan dinamika perairan Teluk Pelabuhan Ratu, membuat simulasi pola arus, serta mendalami dan memahami pola arus di sekitar Teluk Pelabuhan Ratu. Parameter pokok yang digunakan pada studi ini adalah pasang surut, keadaan angin, serta batimetri perairan. Data pasang surut diperoleh dari hasil penelitian Palit (1992), dengan tiga stasiun pengamatan yaitu Stasiun Cibangban, TPI, dan Loji. Data angin diperoleh dari Badan Meteorologi dan Geofisika Jakarta dengan stasiun pengamatan di wilayah Cilacap, sedangkan data batimetri diperoleh dari Dishidros TNI-AL. Hasil simulasi disajikan secara visual dalam bentuk grafik verifikasi nilai elevasi serta dalam bentuk vektor arus. Persamaan model yang digunakan adalah persamaan gerak massa air dua dimensi dan persamaan kontinuitas (Bowden, 1983; McDowell and O'Connor, 1978). Metode beda hingga eksplisit digunakan untuk mendapatkan solusi numerik dari persamaan model. Langkah waktu simulasi harus memenuhi kriteria Courant Friedrich ...dst
Keyword: 

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA