Judul: Kuantitas dan kualitas DNA organ dalam sapi bali
Abstrak: Sapi Bali merupakan plasma nutfah asli Indonesia yang perlu ditingkatkan produktivitas dan dijaga kelestariannya. Bioteknologi Rekayasa DNA menyediakan pendekatan baru dalam kedua upaya tersebut. Sampel DNA dengan kualitas yang bagus dan kuantitas yang cukup merupakan prasyarat utama yang diperlukan dalam penelitian di atas. Penelitian yang dilaksanakan di Laboratorium Biak Sel dan Jaringan Hewan, Pusat Penelitian dan Pengembangan Bioteknologi, LIPI dan Laboratorium Bioteknologi Hewan dan Biomedis, Pusat Antar Universitas Bioteknologi IPB dari bulan Maret sampai Juli 1999 ini bertujuan untuk mempelajari karakteristik (kuantitas dan kualitas) DNA organ dalam Sapi Bali. DNA diisolasi dari organ dalam (limpa, hati, ginjal, jantung dan paru-paru) dari tiga ekor sapi Bali untuk menentukan organ mana yang paling sesuai digunakan sebagai sumber DNA, berdasarkan tujuan yang diinginkan. Perbedaan kuantitas DNA antar organ dianalisis dengan analisis sidik ragam untuk RAL pola searah yang dilanjutkan dengan uji Tukey. Limpa menghasilkan DNA murni dengan konsentrasi paling tinggi yaitu 3,3 µg/mg sampel jaringan dan disusul oleh hati, paru-paru, jantung dan ginjal yang masing-masing 1,8; 1,5; 0,7 dan 0,5 µg/mg sampel jaringan dengan rasio A260/A280 berkisar antara 1,2 sampai 1,4. RNase cukup efektif untuk menghilangkan kontaminasi RNA dari DNA, tetapi dapat menurunkan tingkat kemurnian DNA terhadap protein (rasio A260/A280 menurun). Dari hasil analisis PCR, didapatkan bahwa semua sampel yang diisolasi menghasilkan DNA dengan kualitas yang baik. Hasil PCR juga menunjukkan adanya variasi genetik antar individu sapi Bali yang mungkin disebabkan oleh mutasi.
Keyword: 

Judul: Keragaman DNA mikrosatelit lokus HEL9 ILSTS6 dan INRA35 pada Sapi Bali di Pulau Bali dan Nusa Penida
Abstrak: Sapi bali (Bos javanicus) adalah salah satu bangsa sapi asal Indonesia yang merupakan domestikasi dari banteng. Tujuan penelitian ini adalah mengidentifikasi keragaman DNA mikrosatelit pada sapi bali yang berada di Pulau Bali dan Nusa Penida dengan menggunakan lokus (HEL9, ILSTS6, dan INRA35). Sampel yang digunakan sebanyak 95 sampel DNA sapi bali yang diambil dari 48 ekor sapi bali di pulau Bali dan 47 ekor sapi bali di pulau Nusa Penida. Tiga penciri mikrosatelit (HEL9, ILSTS6 dan INRA35) digunakan untuk mengidentifikasi keragaman sapi bali. PCR menggunakan aplikasiGenAlex versi 6.501. Data yang dianalisis berupa jumlah alel (na), alel efektif (ne), frekuensi alel, heterosigositas observasi (Ho), heterosigositas harapan (He), polymorphism information content (PIC), dan uji Amova. Hasil penelitian menunjukkan bahwa rata-rata heterosigositas pada sapi bali yang ada di Pulau Bali lebih tinggi dibandingkan Nusa Penida. Jumlah PIC sapi bali berkisar 0.190-0.666. Ketiga lokus yang diuji terhadap sapi bali di pulau Bali dan Nusa Penida berbeda dari marker, frekuensi alel dan tingkat kekerabatan dengan nilai keragaman sebesar 9%...
Keyword: Bali cattle, Microsatellites, Polymorphism, Polymerase chain reaction, DNA markets, Alel number, Effective allel, Ale, Ho, He, PIC

Judul: Tinjauan Matematis pada Model Makroskopik dan Mikroskopik Arus Lalu-lintas
Abstrak: Traffic flow phenomenon can be described through mathematical model such as continuous dynamic model with an ordinary differential equation so that it can be solved with integral factors. In this paper three simple models of traffic flow are discussed, i.e, two macroscopic and one microscopic models. Macroscopic model formulates dynamics of the traffic flow that occurs on a large number of vehicles on a road. While the microscopic model explains drivers’ behavior in their interaction with other vehicles ahead, i.e, car-following model. This paper shows the existence of ordinary differential equation found in the traffic flow model and indicates some different representations in the context of the same model. It also reviews a simple model of traffic flow along a single link, which leads to some unexpected results, i.e, it can express the solution model in term of link outflows as well as trip time. In the microscopic model, simulation is done to illustrate the behavior of the drivers with a sensitivity coefficient as a benchmark parameter.
Keyword: