Judul: Specific Protein Analysis as an kopyor indicator in Cocos nucifera
Abstrak: Tanaman kelapa kopyor yang menghasilkan kurang lebih 100% buah kopyor telah berhasil dirakit oleh Unit Penelitian Bioteknologi Perkebunan. Namun sifat kopyornya baru diketahui setelah tanaman berbuah (4-6 tahun setelah tanam). Untuk mempersingkat waktu penulian diperlukan teknik untuk menyeleksi sifat kopyor secara dini, yaitu dengan membandingkan embrio kelapa kopyor dengan embrio kelapa dalam. Tujuan penelitian ini adalah untuk menetapkan kandungan protein embrio kelapa kopyor dan untuk mengetahui penanda sifat kopyor pada kelapa dengan menggunakan metode analisis protein, yaitu elektroforesis SDS-PAGE. Penelitian terdiri atas dua kegiatan, yaitu menentukan kandungan protein embrio kelapa kopyor dan kelapa dalam dengan metode Bradford dan Lowry dan melakukan analisis protein dengan elektroforesis SDS-PAGE. Sampel berupa embrio kelapa kopyor dan embrio kelapa dalam yang terdiri dari 9 genotipe kelapa kopyor yang berasal dari Tangerang dan 6 genotipe kelapa dalam yang berasal dari Unit Penelitian Bioteknologi Perkebunan. Hasil penelitian menunjukkan bahwa kandungan protein embrio kelapa kopyor lebih rendah dari protein embrio kelapa dalam, yaitu sebesar (8,118,19) µg untuk protein embrio kelapa kopyor dan sebesar (11,53 11,16) µg untuk protein embrio kelapa dalam. Selain itu terdapat perbedaan pita-pita protein dari embrio kelapa kopyor dan kelapa dalam yang sekaligus dapat mencirikan sifat kopyor dari kelapa, yaitu pita protein dengan nilai BM 64, 43, 32, dan 25 kDa tidak terdapat pada embrio kelapa dalam; pita protein embrio kelapa kopyor dengan nilai BM 55 kDa mempunyai konsentrasi atau ketebalan pita yang lebih besar dari kelapa dalam dan pita protein dengan BM 36 kDa yang terdapat pada embrio kelapa dalam tidak terdapat pada pita protein embrio kelapa kopyor.
Keyword: 

Judul: Pollen Dispersal Analysis among Pati Dwarf and Kalianda Tall Kopyor Coconut (Cocos nucifera L.) Based on SSR and SNAP Marker to Support Coconut Breeding Program
Abstrak: Kelapa kopyor merupakan kelapa mutan alami asli Indonesia yang harus dilestarikan dan dikembangkan lebih lanjut agar sumberdaya genetik asli Indonesia tersebut dapat dimanfaatkan sepenuhnya untuk kesejahteraan rakyat Indonesia. Abnormalitas fenotipe endosperma kelapa Kopyor diduga sebagai akibat dari defisiensi enzim penting tertentu selama dalam proses perkembangan endospermanya. Namun demikian, identitas enzim yang defisien dari endosperma kelapa Kopyor sampai saat ini masih belum diketahui. Karakteristik mutan pada kelapa Kopyor juga dapat diturunkan secara genetik dari tetua ke progeninya. Salah satu permasalahan yang dihadapi oleh petani kopyor adalah rendahnya kuantitas hasil buah kopyor yang dipanen. Akibatnya produksi buah kelapa kopyor masih belum dapat memenuhi kebutuhan konsumen.Adanya kelapa normal di antara pertanaman kelapa kopyor diduga mempengaruhi produktivitas buah kopyor.Keberadaan pohon dewasa kelapa Dalam berbuah normal diduga berpengaruh negatif terhadap produksi buah kopyor. Pohon tersebut dapat menyebarkan serbuk sari pembawa sifat normal pada bunga betina pohon kelapa kopyor, akibatnya buah yang terbentuk dari penyerbukan akan menjadi buah normal. Keberhasilan penyerbukan pada tanaman juga memerlukan bantuan polinator untuk penyebaran serbuk sari tanaman kelapa maupun pada tanaman lainnya. Studi penyebaran serbuk sari dipelajari dengan menggunakan marka molekular yaitu marka SSR (Single Sequence Repeat) yang mempunyai keunggulan yaitu bersifat kodominan, polimorfismenya tinggi, lokus tersebar di dalam genom dalam jumlah banyak dan sampel DNA yang dibutuhkan sedikit karena dalam melakukan deteksi menggunakan PCR (Polymerase chain reaction) yang dapat menggandakan DNA. Penanda DNA berbasis SNAP adalah satu-satunya penanda DNA yang memiliki sifat bi–alel dan kodominan, sehingga penanda SNAP mampu membedakan alel homozigot dari heterozigot yang efisien. Serangkaian penelitian telah dilakukan dengan tujuan untuk memberikan informasi mengenai tipe penyebaran serbuk sari dan besarnya persentase penyerbukan silang ataupun penyerbukan sendiri pada pertanaman kelapa, efek keberadaan pohon kelapa berbuah normal di dalam pertanaman kelapa berbuah kopyor, efek polinator terhadap produksi buah kopyor sehingga diharapkan produktivitas buah kelapa kopyor dapat ditingkatkan, selain itu juga memberikan informasi dasar genomik dan molekuler yang akan sangat berguna dalam mendukung program pemuliaan kelapa kopyor di masa yang akan datang. Oleh karena itu, penelitian penyebaran serbuk sari kelapa kopyor ini diperlukan untuk menjawab potensi permasalahan budidaya kelapa kopyor di masa depan. Analisis parental digunakan untuk mengevaluasi penyebaran serbuk sari pada kelapa kopyor dengan menggunakan CERVUS version 2.0 software. Keberadaan penyerbukan silang antara kelapa genjah dengan kelapa genjah, kelapa dalam dengan kelapa genjah dan kelapa hibrida dengan kelapa genjah diobservasi di pertanaman populasi kelapa kopyor Genjah Pati. Serbuk sari yang didonasikan dapat berasal dari serbuk sari donor yang berada dalam kisaran jarak tempuh 0-58 meter dari tetua betina yang dievaluasi. Oleh karena itu, selain dengan adanya keberadaan angin, polinator serangga juga dapat berperan penting dalam polinasi kelapa Kopyor. Pola pembungaan dan pembuahan pada tanaman kelapa kopyor tipe Dalam Kalianda menyebabkan rendahnya peluang terbentuknya buah kopyor pada tanaman kelapa berbuah kopyor yang dikelilingi tanaman kelapa normal. Penyerbukan kelapa kopyor oleh kelapa normal dengan jarak penyebaran serbuk sari rata-rata 14,7 m dengan penyebaran terjauh pada jarak 80 m dan penyebaran terdekat pada jarak 0 m. Pohon kelapa Dalam Kalianda menunjukkan rate of selfing sebesar 8,25% dan rate of outcrossing sebesar 91,75% di populasi kelapa Dalam Kalianda. Pertanaman kelapa Dalam Dukuh Seti Pati menunjukkan persebaran
Keyword: kelapa kopyor, endosperma abnormal, analisis parental, pergerakan serbuk sari, penyerbukan silang, penyerbukan sendiri, Marka SSR (mikrosatelit), Marka SNAP

Judul: A Continuous Vaccination Strategy in the SVIR Epidemic Model
Abstrak: Vaccination is conducted to minimize the spread of a disease. The vaccination is usually done several times within a fixed time interval. In the SVIR model, it is assumed that individuals do not get immediate immunity following a vaccination program. So according to process of vaccination on SVIR model, there are two strategies, i.e. the continuous vaccination strategy (CVS) and the pulse vaccination strategy (PVS). In this study, only the CVS strategy in epidemic model SVIR is considered. Results of the study indicate that dynamics of the CVS system depends on the basic reproductive number. If the basic reproductive number is less than one, then the disease-free fixed point is asymptotically stable. It means that the disease will eventually disappear from the population. Conversely, if the basic reproductive number is greater than one, then the endemic fixed point is asymptotically stable, which means that the disease will remain exist in the population. Simulation result shows that the vaccination would minimize the spread of disease by reducing the basic reproductive number. If the time for the vaccinated recipients to obtain the immunity, as well as a possibility of vaccinated recipients to be infected are neglected, then the disease will be eradicated. This condition is called an over-evaluating effect of vaccination.
Keyword: