Judul: Isolasi dan Purifikasi Parsial Peptida Antibakteri dari Kapang Endofit Isolat KT31 yang Diisolasi dari Makroalga Kappaphycus alvarezii
Abstrak: Salah satu mikroorganisme sumber utama metabolit sekunder adalah kapang endofit. Beberapa metabolit endofit menunjukkan aktivitas antibakteri, antifungi, insektisida, dan imunosupresan. Berbagai macam penyakit seperti meningitis, fare, demam tifoid, infeksi saluran pencernaan, dan lain-lain dapat disebabkan eh bakteri patogen. Beberapa bakteri patogen yang membahayakan kesehatan manusia antara lain Escherichia coli, Bacillus subtilis, Salmonella thypii, Pseudomonas aeruginosa, Listeria monocytogenes, Bacillus pumilus, Staphylococcus aureus, dan lain-lain. Oleh karena itu, perlu adanya antibakteri ang dapat mengatasi penyebaran penyakit yang disebabkan oleh bakteri patogen. Tujuan penelitian ini adalah mengisolasi dan memurnikan secara parsial peptida aktif yang ada dalam isolat kapang endofit isolat KT31 serta mengetahui aktivitas antibakteri sebagai informasi awal untuk penapisan obat baru. Metode penelitian ini terdiri dari beberapa tahap yaitu: 1) Kultivasi kapang endofit isolat KT31, 2) Isolasi protein kapang dengan metode pengendapan melalui penambahan bermacam konsentrasi amonium sulfat yaitu 60%, 70%, 80%, dan 90%, 3) Analisis aktivitas antibakteri ekstrak kasar hasil pengendapan pada tujuh bakteri patogen yaitu, Escherichia coli NBRC 14237, Bacillus subtilis BTCC 2530, Salmonella thypiii P2KIM Collection, Pseudomonas aeruginosa BTCC B675, Listeria monocytogenes BTCC B693, Bacillus pumilus BTCC B530, Staphylococcus aureus P2KIM Collection, 4) Kromatografi gel filtrasi menggunakan gel Sephadex G-50 dan eluen etanol 30%, 5) Karakterisasi protein antibakteri melalui penentuan bobot molekul protein menggunakan SDSPAGE, 6) Penentuan kadar protein menggunakan BCA kit. Hasil aktivitas antibakteri terbaik ditunjukkan oleh diameter zona hambat tertinggi pada Escherichia coli dan Bacillus pumilus sebesar 14 mm. Aktivitas antibakteri ini diperoleh dari pelet hasil proses pengendapan protein kapang menggunakan amonium sulfat 80%. Hasil fraksi terbaik dari 30 fraksi ditunjukkan dengan zona hambat tertinggi sebesar 12 mm. Analisis bobot molekul kapang endofit isolat KT31 dilakukan dengan menggunakan SDSPAGE dengan hasil bobot molekul sebesar 11, 2745 kDa. ...
Keyword: Purifikasi, Peptida, Antibakteri

Judul: Aktivitas Antibakteri Dan Isolasi Fraksi Aktif Kapang Endofit Makroalga Chlorophyta Dan Phaeophyta
Abstrak: Makroalga Chlorophyta dan Phaeophyta merupakan organisme laut yang berpotensi memproduksi senyawa antibakteri. Chlorophyta jenis Caulerpa sp. dan Halimeda sp. serta Phaeophyta jenis Sargassum sp. telah diteliti mampu menghasilkan senyawa antibakteri terhadap beberapa bakteri seperti Staphylococcus aureus, Escherichia coli dan Vibrio sp. Kemampuan untuk menghambat pertumbuhan bakteri dimiliki juga oleh kapang endofit yang hidup pada jaringan makroalga tersebut. Tujuan dari penelitian ini adalah mendapatkan isolat kapang simbion dari alga hijau (Chlorophyta) dan alga coklat (Phaeophyta), serta memperoleh fraksi aktif terbaik sebagai antibakeri. Isolat kapang yang berhasil diisolasi pada penelitian ini sebanyak 13 isolat diantaranya 6 isolat pada media PDA air tawar dan 7 isolat pada media PDA air laut menggunakan metode langsung (direct innoculation). Isolat kapang KHC003 dan KHC026 B dari rumput laut Halimeda sp. dan Sargassum sp. menjadi isolat terpilih berdasarkan hasil seleksi aktivitas antimikroba terhadap E.coli dan S.aureus berdasarkan hasil uji antagonis secara langsung antara kapang dengan bakteri uji. Uji aktivitas antibakteri dilakukan dengan metode difusi sumur agar. Aktivitas antibakteri terbaik pada kapang KHC003 dan KHC026 B yakni setelah dikultivasi selama 18 hari. Ekstrak kedua isolat kapang mampu menghambat S.aureus dan E.coli. Uji sitotoksisitas ekstrak kapang KHC003 dan KHC026 B dilakukan dengan menggunakan metode MTT. Ekstrak kasar kapang KHC003 dan KHC026 B tergolong tidak toksik terhadap sel Vero dengan nilai IC50 masing-masing adalah 569,58 μg/mL dan 828,45 μg/mL. Senyawa aktif yang terkandung dalam ekstrak kapang KHC003 adalah adalah alkaloid, flavonoid, terpenoid dan steroid; sedangkan pada ekstrak kapang KHC026 B adalah alkaloid, flavonoid, fenol hidrokuinon dan terpenoid. Ekstrak kasar kapang KHC003 dan KHC026 B kemudian difraksinasi dengan metode KLT. Kombinasi eluen yang digunakan untuk fraksinasi ekstrak kapang KHC003 dan KHC026 B masing-nasing adalah etil asetat:dikrolometana:n-heksana=4:2:2 dan etil asetat:dikrolometana:n-heksana=4:1:2. Fraksinasi dengan KLT dan biautografi dengan metode overlay menunjukkan adanya zona hambat pada nilai Rf 0,86 dan 0,58 pada kapang KHC003 dan Rf 0,525 pada kapang KHC026 B. Fraksi yang menghasilkan zona bening dari KHC003 terdeteksi merupakan senyawa flavonoid dan steroid, sedangkan fraksi dari KHC026 B terdeteksi sebagai senyawa fenol. Fraksi 2 dari KHC003 menghasilkan zona hambat tertinggi terhadap bakteri S.aureus dan E.coli masing-masing 14,25 mm dan 11,25 mm.
Keyword: antibakteri, chlorophyta, fraksi, makroalga, phaeophyta

Judul: Thermal Characteristics and Dynamics of Tropical Cyclone over Western North Pacific Ocean: A Case Study of Typhoon Songda (Chedeng) 2011
Abstrak: The frequent occasion of Tropical Cyclone (TC) over Western North Pacific (WNP) Ocean lies from 10˚N to 26˚N and 121˚E to 170˚E. Sources of TC development come from warm ocean temperature where latent heat is released during condensation processes and subsequently concentrated in the boundary layer. Relative humidity at 850-700 hPa is responsible to produce the most intense storm. Meanwhile, weak vertical wind shear between 850-200 hPa is one of the dynamical factors that lead to the development of TC. Pressure level of 850-200 hPa is chosen to minimize the thermodynamic effect in the lower troposphere. Typhoon Songda (Chedeng in the Philippines) or TSC lasted from May 18th to 30th, 2011 and strengthened into powerful Super Typhoon stage between May 24th and 27th. Long curving track and the exhibition of all sequences of TC life cycle, TSC is then considered as an ideal case of TC. The objective of the study with case of TSC is to investigate the role of thermal characteristics and dynamics on TC intensity. The research is carried out by using Advanced Research of Weather Research and Forecasting model (WRF ARW model) version 3.3. Two domains are employed in the model. The first domain situate from 02˚N to 40˚N and 118˚E to 149˚E and cover spatial resolution () of 33.1 km. The second domain situate from 09˚N to 27˚N and 119˚E to 132˚E with of 11 km. Timestep of the model () is 120 seconds. The model is supported by the following physical parameterization, i.e., Yonsei University Scheme (YSU) in the boundary layer, Kain-Fritsch scheme (KF) in the cumulus, and WRF Single-Moment 3-class scheme in the microphysics. Initial meteorological condition prior to the formation of the cyclone is generated using WRF ARW standard-release model. Sensitivity of the model output is obtained from a selected single-parameter change scenarios, namely, 10 % to 20 % decrease and increase of wind shear initial data at 850-200 hPa, and by 10 % to 20 % decrease of relative humidity initial data at 850-700 hPa. The result showed that the negative correlations between wind shear and intensity are found in wind shear scenarios. Wind shears of 10 ms-1 which lead to strengthening of the wind intensity in the early period of Typhoon development are found in wind shear scenarios. The effect of wind shear changes on wind intensity is statistically significant in the 20 % wind shear scenarios. During mature stage, weak wind intensity occurred when wind shear increase as given in the WRF standard-release and the 20 % decreasing scenario. Different situation is found in the 20 % increasing scenario where wind shear tend to weak and lead to strong wind intensity at this stage. Meanwhile, the reduction of moisture supply at 850-700 hPa resulting from 20 % decreasing relative humidity play a major role in the weakening of wind intensity and reduces mechanical energy of the cycle process as much as 300 J kg-1.
Keyword: