Judul: Strukur Prediksi dan Identifikasi Substrat Spesifik Lakase Isolat Lokal Neurospora crassa inaCC F226
Abstrak: Sekuen gen lakase dari isolat lokal Neurospora crassa InaCC F226 telah diidentifikasi bahwa terdapat tiga motif sekuen H-X-H, yang merupakan sekuen khas lakase diantaranya adalah HWH, HSH, dan HXXH. Ketiga motif sekuen tersebut menunjukkan terlibat dalam situs pengikatan atom tembaga. Terdapat tiga copper-binding loop yang mengandung motif sekuen, dengan beberapa residu asam amino lestari. Residu asam amino lestari pada copper-binding loop tersebut diantaranya 274(HWH)G---DG---T-CP pada CBL-1, 314GT-WY(HSH)FS-QYGG--- pada CBL-2, dan 607HPIHL pada CBL-3. Lakase isolat lokal Neurospora crassa (InaCC F226) merupakan enzim multisubunit yang terdiri atas tiga domain fungsional dengan motif struktur greek-key betta barrel yang merupakan struktur khas lakase. Lakase memiliki empat atom tembaga yang memiliki peran penting dalam aktivitas katalitik. Perbaikan struktur prediksi LAC inaCC melalui simulasi dinamika molekuler menunjukkan peningkatan kualitas struktur. Peningkatan persentase daerah disukai pada ramachandran plot (78.8%) dan persentil classchore serta nilai molprobity (99th dan 89th) menunjukkan bahwa struktur lakase menuju perubahan konformasi menjadi konformasi yang lebih stabil dengan resolusi yang lebih baik dibandingkan struktur prediksi awal. Metode MMPBSA diketahui merupakan metode yang lebih akurat dan sensitif dalam perhitungan energi bebas Gibbs ikatan substrat terhadap LAC inaCC. Senyawa aflatoxin dan ABTS merupakan substrat spesifik untuk lakase dari fungi isolat lokal Neurospora crassa inaCC F226.
Keyword: Lakase, Neurospora crassa, Prediksi Struktur, Simulasi Dinamika Molekul, Substrat Spesifik

Judul: Amplifikasi dan Karakterisasi Gen Penyandi Lakase LaccI16 Neurospora crassa InaCC F226
Abstrak: Lakase adalah salah satu oksidoreduktase yang sangat bermanfaat dalam berbagai industri diantaranya industri kertas, minuman beralkohol, dan sel bahan bakar biologis. Neurospora crassa InaCC F226 yang merupakan salah satu kapang ligninolitik penghasil lakase digunakan pada penelitian ini. Penelitian ini bertujuan melakukan amplifikasi, pemotongan, serta sekuensing gen penyandi lakase LaccI16 sehingga pada penelitian selanjutnya dapat dilakukan ekspresi berlebih menggunakan gen penyandi lakase tersebut. DNA genom N. crassa InaCC F226 berhasil diisolasi pada penelitian ini. Hasil amplifikasi menunjukkan bahwa gen penyandi lakase LaccI16 berukuran sekitar 1900 bp serta mempunyai dua situs restriksi KpnI dan satu situs restriksi PstI. Gen penyandi lakase LaccI16 juga memiliki tingkat kesesuaian yang tinggi dengan gen penyandi lakase lainnya yang terdapat pada bank data.
Keyword: KpnI, LaccI16, lakase, N. crassa, PstI

Judul: Estimasi Nilai Pajak Emisi Kendaraan Bermotor Roda Dua di Kota Bogor.
Abstrak: Sepeda motor merupakan kendaraan dengan proporsi jumlah tertinggi jika dibandingkan dengan total jumlah kendaraan bermotor di Kota Bogor yaitu sebesar 79 persen. Pada tahun 2011-2015, sepeda motor mengalami rata-rata peningkatan sebesar 9,7 persen per tahun. Kondisi tersebut berpotensi menyebabkan pencemaran udara dan menimbulkan dampak negatif bagi masyarakat. Penelitian ini dilakukan untuk mengestimasi nilai kerugian ekonomi akibat emisi kendaraan bermotor roda dua di Kota Bogor dengan menggunakan metode cost of illness, mengestimasi nilai pajak emisi per zat pencemar kendaraan bermotor roda dua dengan menggunakan pendekatan matematis, dan menganalisis persepsi masyarakat terhadap pajak emisi kendaraan bermotor roda dua dengan skala likert. Hasil estimasi nilai kerugian ekonomi akibat emisi kendaraan bermotor roda dua di Kota Bogor adalah sebesar Rp 28.938.637.351/tahun Berdasarkan total kerugian ekonomi tersebut, didapatkan nilai pajak emisi untuk zat pencemar HC sebesar Rp 356/kg, CO sebesar Rp 192/kg, dan PM10 sebesar Rp 29.032/kg. Dengan tarif pajak tersebut, pemilik sepeda motor harus membayar pajak emisi sebesar Rp 87.148/tahun. Berdasarkan analisis persepsi, masyarakat setuju apabila pemerintah menetapkan pajak emisi kendaraan bermotor roda dua di Kota Bogor sebagai salah satu upaya mengatasi pencemaran udara di Kota Bogor.
Keyword: cost of illness, emisi kendaraan bermotor, kerugian ekonomi, pencemaran udara, pendekatan matematis