Judul: Evaluasi Penambatan Molekuler dan Analisis Sifat Fisikokimia Senyawa Aktif Tanaman Herbal Untuk Agen Antiepileptik
Abstrak: Epilepsi merupakan salah satu penyakit kronis yang menyerang otak manusia. Terdapat beragam cara untuk mengobati epilepsi, salah satunya dengan mengonsumsi obat antiepileptik. Akan tetapi, obat-obat antiepileptik ini memiliki efek samping yang berisiko tinggi sehingga penelitian ini dilakukan untuk mencari alternatif lain yang dapat berpotensi sebagai agen antiepileptik. Penelitian ini dilakukan dengan metode in silico berupa penambatan molekuler dan analisis sifat fisikokimia pada senyawa aktif yang terkandung dalam beberapa herbal yang terdapat di Indonesia dan dianalisis berdasarkan sudut pandang fisika molekuler. Xylopine lebih berpotensi karena secara fisikokimia xylopine memiliki sifat yang mirip dengan obat, mudah berikatan dengan sisi aktif reseptor, dan ikatannya dengan sisi aktif reseptor tidak mudah lepas. Hal ini menunjukkan bahwa tanaman herbal cukup bersaing dengan obat dalam hal menginhibisi reseptornya., Epilepsy is one of the chronic diseases which attacked human brain. There are various ways to treat epilepsy, one of them is by taking antiepileptic drugs. But, these antiepileptic drugs have high-risk side effect so that this research has been done to find another alternatives that can be potential as antiepileptic agent. This research was conducted using the in silico method in the form of molecular docking and physicochemical properties analysis of active compounds which is contained in several Indonesian herbs and analyzed based on molecular physics. Xylopine is more potential because physicochemically it has drug-like properties, easier to bind with the active sites of receptor, and it bonds with the active sites are strong. It indicates that herbs are quite competitive with the medicines in terms of inhibiting the receptor.
Keyword: Antiepileptic agent, epilepsy, herbal active compounds, molecular docking, physicochemical properties

Judul: In Silico Identification of Bay Leaf (Syzygium polyanthum Wight.) Metabolites As EGFR-Tyrosine Kinase Inhibitor
Abstrak: Syzygium polyanthum Wight. merupakan salah satu tanaman herbal yang telah diketahui memiliki berbagai aktivitas farmakologi termasuk potensi antikanker. Epidermal Growth Factor Receptor-Tyrosine Kinase (EGFR-TK) merupakan sasaran terapi yg menarik karena seringkali terlibat dalam banyak kanker. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi senyawa aktif pada S. polyanthum Wight. yang mempunyai aktivitas penghambatan EGFR-TK dan memprediksi mekanismenya secara in silico. Piranti lunak PLANTS digunakan untuk penambatan molekuler dalam rangka penapisan virtual, dan interaksi ligan secara bersama-sama (combined docking) yang sebelumnya dilakukan penentuan grid box. Untuk analisis interaksi ligan-reseptor dan visualisasi menggunakan Pymol, Ligplot+ dan YASARA. Sebanyak 238 senyawa metabolit dalam daun S. polyanthum Wight. dihasilkan dari studi literatur. Struktur 3 dimensi EGFR-TK (kode:1M17) diunduh dari PDB dengan ligan alami 4-anilinakuinazolina sebagai ko-kristal. Proses validasi reseptor menghasilkan rerata RMSD 1,70 Å yang artinya proses penambatan dapat dianggap valid. Hasil penambatan molekuler diperoleh 5 senyawa terbaik dengan skor penambatan sebagai berikut 1-heptatriakotanol (-108,97), Z-heptatriakonten-2-on (-106,50), 2,6,10,15,19,23-heksametil-1,6,10,14,18,22-tetrakosaheksaen-3-ol (-99,05), hentriakontana (-97,22), dan skualena (-95,78). Sebagai pembanding, 4-anilinokuinazolina dan Gefitinib (inhibitor tirosin kinase komersial) berturut-turut memiliki nilai skor penambatan -97,45 dan -97,97. Dengan demikian kelima senyawa tersebut relatif jauh lebih berpotensi daripada inhibitor komersial yang ada. Hasil analisis penambatan kombinasi menghasilkan nilai skor penambatan sebesar -116,3. Hal ini menunjukkan bahwa kombinasi 5 senyawa terbaik Syzygium polyanthum Wight. tersebut jauh lebih baik dibandingkan dengan senyawa tunggalnya. Dari lima senyawa terbaik 2,6,10,15,19,23-heksametil-1,6,10,14,18,22-tetrakosaheksaen-3-ol, hentriakontana, dan skualena memenuhi tiga dari empat aturan Lipinski sehingga dianggap mirip dengan senyawa obat. Dari prediksi Absorpsi, Distribusi, Metabolisme, Toksisitas (ADMET), beraneka senyawa potensial ini mampu terabsorpsi dan diekskresikan dengan baik serta relatif tidak toksik. 1-heptatriakotanol dan Z-heptatriakonten-2-on memiliki bioavalabilitas cukup rendah. Meskipun demikian senyawa terbaik dalam S. polyanthum Wight. itu memiliki atom dan gugus ciri senyawa obat (pharmacophore) yang terkonfirmasi dari potensi penghambatan EGFR-TK yang sangat baik secara in silico sehingga dapat dikembangkan menjadi senyawa obat.
Keyword: inhibitor EGFR-Tirosin Kinase, kanker, penambatan molekuler, Syzygium polyanthum Wight

Judul: Construction of Strongly Optimal Binary Linear Code with Minimum Distance 9 and 11
Abstrak: A binary linear code of length n over q F is a subspace of n q F . A code has three parameters that attached to it, namely length, dimension, and minimum distance. A code with length n, dimension k and minimum distance d is often called [n, k, d ]-code. Usually, when two parameters are given, then we want to find a code that has the best value for the last parameter. Based on Gilbert- Varshamov bound, if a [n, k, d ]-code exists and can not be expanded, we call it a strongly optimal code. In this paper, we construct strongly optimal code with minimum distance 9 and 11. In constructing the code, we created a theorem and algorithm based on Gilbert-Varshamov bound before we implement the algorithm to MAPLE programming language. Because of computational limitations, the program can only construct up to k = 10 for d = 9 and k = 12 for d = 11.
Keyword: