Judul: Karakteristik Massa Air Bersalinitas Rendah di Perairan Teluk Balikpapan
Abstrak: Perairan Teluk Balikpapan merupakan perairan yang dipengaruhi oleh masukan massa air dari Selat Makassar dan daratan Kalimantan Timur. Kondisi perairan yang relatif tertutup dan banyaknya daerah aliran sungai yang bermuara di sepanjang teluk menyebabkan perairan ini memiliki karakteristik massa air yang penting untuk dipelajari. Tujuan penelitian ini adalah untuk mendeskripsikan kondisi hidro-oseanografi dan melihat variasi Massa Air Bersalinitas Rendah (MABR) bulanan di Perairan Teluk Balikpapan pada setiap musimnya. Analisis yang digunakan pada penelitian ini yaitu analisis anomali salinitas ( ( )), fraksi air tawar ( ), dan volume transpor massa air tawar ( ). MABR di perairan Teluk Balikpapan bervariasi setiap musimnya. MABR pada Musim Barat memiliki jarak sebesar 157 km dengan Volume Transpor Massa Air tawar (VTMA) sebesar 71.87-185.18 m3s-1. Musim Peralihan 1 memiliki jarak MABR sebesar 157 km dengan VTMA sebesar 133.09-187.44 m3s-1. Musim Timur dan Musim Peralihan 2 umumnya memiliki jarak MABR yang bervariasi dari 29-157 km. VTMA pada Musim Timur berkisar 51.46-136.48 m3s-1, sedangkan VTMA pada Musim Peralihan 2 berkisar 4.03-51.46 m3s-1. Musim Barat sampai Musim Peralihan 1 cenderung tergolong dalam perairan yang terstratifikasi lemah (weakly stratified), sedangkan Musim Timur sampai Musim Peralihan 2 cenderung tergolong dalam perairan tercampur sempurna (well mixed). Perbedaan jarak MABR, VTMA, dan stratifikasi kolom perairan pada setiap musim ini disebabkan oleh adanya pengaruh gaya pasut, arus, topografi dasar laut, serta curah hujan yang berfluktuasi setiap musimnya.
Keyword: Massa air bersalinitas rendah, stratifikasi, Teluk Balikpapan, transpor air tawar

Judul: Intrusi Air Tawar ke Perairan Teluk Balikpapan dengan Metode Fraksi Air Tawar dan Box Model
Abstrak: Teluk Balikpapan merupakan daerah yang memiliki banyak muara sungai. Campuran antara air laut dan air tawar di wilayah perairan muara dipengaruhi oleh pasang surut. Tujuan penelitian ini yaitu mengestimasi besar intrusi air tawar pada saat menuju pasang dan menuju surut dengan menggunakan metode box model dan fraksi air tawar di Perairan Teluk Balikpapan. Data salinitas dari CTD digunakan untuk menganalisis metode fraksi air tawar dan box model. Data model COPERNICUS digunakan untuk menganalisis distribusi spasial arus. Budget air tawar sistem box model dihitung dengan data evaporasi dan curah hujan. Fraksi air tawar dan Volume Transpor Massa Air tawar (VTMA) pada saat menuju pasang di Perairan Teluk Balikpapan sebesar 16.92 – 36.26% dan 2.048 x 109 – 9.661 x 109 m3hari-1, sedangkan saat menuju surut sebesar 19.33 – 34.5% dengan VTMA sebesar 1.084 x 109 – 10.710 x 109 m3hari-1. Saat menuju pasang di mulut teluk, air laut mendorong massa air tawar menuju barat teluk dengan nilai budget salinitas permukaan sebesar -95.352 x 106 psu.m3hari-1, sedangkan saat menuju surut air tawar mengalir keluar ke arah timur teluk sebesar -135.512 x 106 psu.m3hari-1. Budget salinitas permukaan saat menuju pasang di Transek 5 sebesar -116.331 x 106 psu.m3hari-1 dan pada saat menuju surut sebesar -143.794 x 106 psu.m3hari-1 ke arah selatan teluk.
Keyword: air tawar, box model, fraksi air tawar, pasang surut, Teluk Balikpapan, VTMA

Judul: Penyusunan Overlap Graph menggunakan Suffix Tree pada DNA Sequence
Abstrak: The DNA sequence assembly is very important in genome analysis. This step aims to reconstruct contigous DNA fragment (contigs) from short fragment by concatenating fragments based on the overlap region among them. This method employs overlap graph for solving the problems. In this graph, nodes represent fragments and edges represent overlap. This research developed a software for constructing overlap graph using suffix tree. The evaluation was conducted by measuring the number of nodes, number of edges, and the execution time in many values of minimum overlap. The minimum overlap is defined as the minimum length of substring which is considered as the overlap region between two fragments. The evaluation results showed that the number of nodes, the number of edges, and the execution time were increased with the decreasing of the minimum overlap value.
Keyword: