Judul: Analisis Keragaman Genetik Kunyit (Curcuma longa Linn.) Dan Temulawak (Curcuma xanthorrhiza Roxb.) Budidaya Tanah Jawa Berdasarkan Penanda Molekuler RAPD
Abstrak: Penanda molekuler RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) merupakan salah satu teknik yang digunakan dalam analisis keragaman genetik tanaman. Kunyit (Curcuma longa Linn.) dan temulawak (Curcuma xanthorrhiza Roxb.) sebagai tanaman obat herbal potensial memiliki distribusi luas di wilayah Indonesia yang dapat berpengaruh terhadap pola keragaman genetiknya. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pola keragaman genetik dari 12 sampel genus Curcuma yang berasal dari berbagai daerah di Pulau Jawa. Penelitian diawali dengan optimasi isolasi DNA dan amplifikasi DNA, hingga analisis lokus dan konstruksi pohon filogenetik menggunakan metode UPGMA (Unweighted Pair Group Method Arithmatic Mean) dari software NTSYS. Modifikasi protokol isolasi DNA dengan penambahan Proteinase K setelah proses inkubasi dan RNAse setelah proses pencucian menunjukkan hasil paling baik. DNA yang diisolasi memiliki ukuran berkisar pada 9000 bp dengan kualitas pita yang cukup baik. Amplifikasi DNA dengan 20 primer acak terpilih pada 7 sampel kunyit menghasilkan 278 pita DNA dari 177 lokus, dan pada 5 sampel temulawak menghasilkan 184 pita DNA dari 143 lokus yang seluruhnya merupakan pita polimorfik. Analisis kemiripan genetik 7 varietas Curcuma longa Linn. menunjukkan nilai koefisien kemiripan genetik sebesar 42.37% - 94.35% dan 19.58% - 85.31% pada 5 varietas Curcuma xanthorrhhiza Roxb. Hasil pengelompokan pada nilai koefisien kemiripan genetik 51.65% dan 33.17% menunjukkan bahwa 7 varietas kunyit dan 5 varietas temulawak yang diteliti berasal dari dua kelompok besar.
Keyword: 

Judul: Analisis Polimorfisme DNA Tanaman Kunyit (Curcuma longa L.) dan Temulawak (Curcuma xanthorrhiza Roxb) Lokal Menggunakan Marka RAPD
Abstrak: Tanaman kunyit (Curcuma longa L.) dan temulawak (Curcuma xanthorrhiza Roxb) lokal Indonesia yang tersebar dan mudah ditemukan di wilayah Indonesia banyak digunakan sebagai obat tradisional. Kandungan kurkumin pada kedua tanaman tersebut memiliki banyak khasiat kesehatan, yaitu sebagai obat antiproliferatif dan antiinflamasi. Adanya polimorfisme DNA pada kedua tanaman tersebut di beberapa lokasi Pulau Jawa belum diidentifikasi. Oleh karena itu, perlu dilakukan analisis genetik untuk menentukan keragaman kedua tanaman tersebut. Salah satu teknik yang biasa digunakan untuk analisis keragaman genetik adalah PCR RAPD. Tujuan penelitian ini mengisolasi DNA tanaman kunyit dan temulawak dan menentukan pola genetik tanaman tersebut dengan PCR RAPD. PCR dilakukan dengan menggunakan 20 primer acak OPA, OPB, OPC, dan OPD (1-5). Ekstraksi DNA menggunakan metode modifikasi Zheng et al. 1995 pada 13 sampel daun temulawak dan kunyit. Hasil menunjukkan bahwa primer yang dapat mengamplifikasi DNA sampel, yaitu: primer OPA-1, OPA-3, OPA-4, OPC-1, OPC-2, OPC-4, dan OPD-4. Selain itu, hanya tiga sampel yang dapat teramplifikasi, yaitu: temulawak Wonogiri, temulawak Karang Anyar, dan kunyit Wonogiri. Sampel yang teramplifikasi memiliki pola genetik yang berbeda yang dihasilkan oleh setiap primer acak sehingga kedua puluh primer acak dapat digunakan sebagai marka untuk analisis fingerprint.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: