Judul: Analisis profil DNA genom beberapa galur Bacillus thuringiensis dengan elektroforensis gel medan berpulsa (PFGE)
Abstrak: Bacillus thuringiensis subspesies kurstaki HD-1 merupakan galur Bacillus thuringiensis yang telah banyak digunakan sebagai pestisida alami dan dapat diperoleh secara komersial untuk memberantas hama berupa larva dari jenis Lepidoptera (kupu-kupu) yang menyerang tanaman sayur-sayuran. Laboratorium Biologi Molekuler Mikroba, Puslitbang Bioteknologi, LIPI, Cibinong memiliki beberapa koleksi bakteri Bacillus thuringiensis yang memiliki fenotipe serta sasaran yang sama dengan Bacillus thuringiensis subspesies kurstaki HD-1, yang direncanakan akan digunakan untuk memproduksi pestisida alami baru. Untuk mengetahui bahwa koleksi bakteri tersebut tidak termasuk dalam galur Bacillus thuringiensis subspesies kurstaki HD-1 tetapi memiliki fenotipe serta sasaran yang sama maka dilakukan uji genotipe dengan menggunakan Elektroforesis Gel Medan Berpulsa (PFGE). Berdasarkan jumlah dan ukuran pita-pita DNA yang telah diperoleh dari hasil pemotongan oleh enzim restriksi Sma I pada analisis profil DNA genom dengan menggunakan PFGE, maka dapat diketahui jumlah pita-pita DNA berkisar antara 9-11 pita dan ukuran genom dari kesepuluh galur Bacillus thuringiensis dan satu galur Bacillus thuringiensis subspesies kurstaki HD-1 berkisar antara 4585-6730 Kb. Hasil analisis kekerabatan berdasarkan Schizotyping menunjukkan bahwa galur Bacillus thuringiensis 25F, 10S, 25S3, 50S15, 25S3, 50S 10, dan 50S, dapat dikatakan sebagai organisma yang memiliki spesies sama dengan Bacillus thuringiensis subspesies kurstaki HD-1 karena berkerabat dekat, sedangkan galur Bacillus thuringiensis 2EMs, 2EM2, dan 50S, merupakan organisma yang memiliki spesies yang berbeda dengan Bacillus thuringiensis subspesies kurstaki HD-1 karena tidak memiliki hubungan kekerabatan.
Keyword: DNA

Judul: Isolasi dan identifikasi bacillus thuringiensis Berl. dari lahan pertanian
Abstrak: Dari 22 contoh tanah lahan pertanian daerah Lampung yang diperiksa, telah berhasil diisolasi 1683 isolat yang menunjukkan ciri-ciri Bacillus. Akan tetapi, pada pengamatan lekapan basah di bawah mikroskop kontras fase, hanya ditemukan 12 isolat (0.7%) bakteri pembentuk kristal protein. Kedua belas isolat tersebut berasal dari sembilan. contoh tanah. Semua isolat bakteri pembentuk kristal (p.k.p.) yang diperiksa berbentuk batang ramping, protein dengan spora berbentuk oval dan letaknya subterminal. Ada tiga macam bentuk kristal protein yang dijumpai, yaitu bipira- mida, romboid dan bulat. Isolat-isolat bakteri p.k.p. yang diperoleh diidentifikasi bersama-sama dengan 30 isolat bakteri p.k.p. yang berasal dari Sulawesi Tengah (merupakan hasil penelitian. terdahulu) secara serologis berdasarkan antigen flagelum- nya. Dari 42 isolat yang diuji, 20 diantaranya tergolong serotipe 17. Serotipe 17 ini merupakan serotipe yang paling banyak dijumpai, diikuti serotipe 15 (15 isolat), serotipe 6 dan 9 (masing-masing 2 isolat), serotipe 3, 5 dan 23 (masing-masing 1 isolat). Tidak ada korelasi antara serotipe dan bentuk kristal….
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: