Judul: Analisis  Filogenetik, Sifat Fisikokimia, dan Struktur Enzim Fitase Sepuluh Spesies Aspergillus In Silico
Abstrak: Asam fitat merupakan senyawa kimia yang terdiri atas inositol dan asam fosfat serta merupakan senyawa antinutrien yang selalu terdapat pada bahan pakan unggas monogastrik berbahan tanaman serealia. Fitase (myo-inositol heksakisfosfat fosfohidrolase) adalah enzim yang dapat menghidrolisis ikatan fosfoester pada asam fitat, menghasilkan fosfat anorganik dan ester fosfat. Aspergillus merupakan genus kapang yang dapat menghasilkan enzim fitase dan telah banyak digunakan dalam produksi enzim fitase karena mudah dikulturkan. Penelitian ini bertujuan melakukan perbandingan struktur, karakteristik fisikokimia dan hubungan kekerabatan filogenetik enzim fitase dari beberapa spesies Aspergillus sp. secara in silico sebagai langkah penapisan awal dalam memperoleh enzim fitase yang paling cocok diaplikasikan pada pakan unggas. Hasil penelitian menunjukkan fitase 1QFX asal A. niger, P34755 asal A. awamori dan D5HQ11 asal A. ficuum memiliki kekerabatan yang sangat tinggi ditinjau dari filogenetik, urutan sekuen asam amino, sifat fisikokimia, serta struktur kristalnya. Ketiga sekuen asam amino enzim tersebut memiliki titik isoelektrik pada kisaran 4 sehingga merupakan enzim acid phytase. Nilai hidrofobisitas maksimum ketiga sekuen lebih besar dari 3 sehingga termostabilitasnya cukup tinggi. Simpulan dari penelitian ini adalah fitase 1QFX asal A. niger, P34755 asal A. awamori dan D5HQ11 asal A. ficuum merupakan fitase yang paling cocok untuk diaplikasikan pada pakan unggas.
Keyword: Aspergillus, Enzyme, Phytase, Phytic acid

Judul: In Silico and In Vitro Characterization and Production Optimization of Phytase Enzyme from Aspergillus niger IPB CC 93 0265
Abstrak: Asam fitat merupakan senyawa kimia yang terdiri dari inositol dan asam fosfat dan merupakan senyawa antinutrien yang terdapat pada bahan pakan unggas monogastrik yang terbuat dari tanaman serealia. Fitase merupakan enzim yang dapat menghidrolisis ikatan fosfoester pada asam fitat sehingga menghasilkan fosfat anorganik dan ester fosfat. Aspergillus merupakan salah satu genus kapang yang dapat menghasilkan fitase dan telah banyak digunakan dalam produksi fitase karena mudah dibudidayakan. A. niger, A. awamori dan A. ficuum merupakan tiga spesies Aspergillus yang menghasilkan fitase dengan struktur dan sifat fisikokimia yang paling sesuai untuk diaplikasikan pada pakan unggas serta memiliki tingkat homologi yang cukup tinggi. Penelitian terdahulu telah membuktikan bahwa kapang A. niger, A. ficuum dan A. awamori merupakan tiga spesies Aspergillus yang menghasilkan fitase dengan karakteristik fisikokimia serta struktur yang homolog dan cocok untuk diaplikasikan pada pakan secara in silico. Namun, belum dilakukan penelitian mengenai perbandingan penambatan molekuler enzim fitase dari ketiga kapang untuk menentukan spesies Aspergillus yang paling cocok. Tujuan dari penelitian ini adalah melakukan simulasi penambatan molekuler pada enzim fitase dari tiga spesies Aspergillus dengan kemiripan tertinggi serta mengoptimalkan kondisi produksi dan karakterisasi sederhana enzim fitase dari spesies Aspergillus yang mempunyai karakteristik terbaik hasil dari molekuler docking sebagai langkah pertama dalam produksi enzim fitase skala besar untuk diterapkan pada pakan unggas. Metode yang digunakan adalah pemodelan struktur dan penambatan molekuler in silico yang dikombinasikan dengan optimasi kondisi produksi secara in vitro meliputi pH, waktu inkubasi dan konsentrasi penginduksi fitase A. niger IPB CC 93 0265. Hasil docking ketiga struktur fitase menggunakan YASARA menunjukkan bahwa fitase 1QFX memiliki skor ΔG paling negatif dan skor Kd terkecil yang menunjukkan afinitas tertinggi terhadap substrat asam fitat. Fitase A. niger IPB CC 93 0265 mempunyai aktivitas spesifik tertinggi setelah produksi 4 hari dengan medium pH 7 dan induser fitat 0,5%. Kemurnian tertinggi diraih dari fraksi dialisis dengan aktivitas spesifik sebesar 0.18 U/µg, persentase yield sebesar 49.61% dan kemurnian meningkat sebesar 4.01 kali lipat dibandingkan ekstrak kasar. Nilai Km terukur 6.583 µmol serta vmaks sebesar 0.139 µmol/menit. Fitase A. niger IPB CC 93 0265 memiliki bobot molekul di rentang 25 – 37 KDa. Kesimpulan dari penelitian ini adalah diantara 3 struktur fitase yang telah dibandingkan dan di-docking dengan asam fitat, fitase 1QFX dari A. niger merupakan fitase yang paling sesuai untuk diaplikasikan pada pakan unggas setelah 4 hari produksi enzim dalam medium pH 7 dan konsentrasi fitat 0,5%., Phytic acid is a chemical compound consisting of inositol and phosphoric acid and is an antinutrient compound found in monogastric poultry feed ingredients made from cereal crops. Phytase is an enzyme that can hydrolyze phosphoester bonds in phytic acid, resulting in inorganic phosphate and phosphate esters. Aspergillus is a genus of mold that can produce phytase and has been widely used in the production of phytase because it is easily cultured. A. niger, A. awamori and A. ficuum are three Aspergillus species that produce phytase with the most suitable structure and physicochemical properties for application in poultry feed and have a fairly high level of homology. Previous research has proven that A. niger, A. ficuum and A. awamori are three Aspergillus
Keyword: Enzyme Activity, Fractionation, Hydrolysis, Phytic acid

Judul: Land Cover / Use, Spatial Patterns, and Regional Development in the Border Area of Bogor Regency and City
Abstrak: Rencana Tata Ruang Wilayah (RTRW) merupakan arahan kebijakan dan strategi pemanfaatan ruang wilayah yang dijadikan acuan oleh Pemerintah Pusat maupun Daerah. RTRW Kabupaten Bogor ditetapkan melalui Peraturan Daerah (Perda) No 11 Tahun 2016, sedangkan RTRW Kota Bogor ditetapkan melalui Perda No 8 Tahun 2011. Ketidakselarasan sering terjadi antara pemanfaatan ruang (tutupan/penggunaan lahan) dengan perencanaan tata ruang (pola ruang), selain itu ada dinamika ketidakselarasan antara pemanfaatan ruang dan perencanaan tata ruang di kedua wilayah yang berbatasan langsung. Untuk melihat ketidakselarasan di perbatasan tersebut dilihat dari keselarasan penggunaan lahan sejenis terhadap pola ruangnya. Secara kebijakan memang tidak ada larangan, karena berlaku pada wilayah administrasi yang berbeda namun dapat menginformasikan kecenderungan kebijakan pemerintah daerah maupun dinamika ruang di kedua wilayah. Objek dan lokus penelitian ini adalah tutupan/penggunaan lahan sejenis pada desa/kelurahan di perbatasan kedua wilayah. Kabupaten dan Kota Bogor merupakan wilayah dengan jumlah total penduduk mencapai 6 juta jiwa. Hal ini menyebabkan pemanfaatan lahan untuk permukiman semakin dibutuhkan serta adanya kecenderungan alih fungsi lahan pertanian menjadi kawasan permukiman (lahan terbangun). Bertambahnya penduduk merupakan salah satu penyebabnya. Tujuan penelitian ini adalah 1). Mengidentifikasi tutupan/penggunaan lahan dan perubahannya di daerah perbatasan Kabupaten dan Kota Bogor tahun 2010-2020, 2). Menganalisis tutupan/penggunaan lahan sejenis serta keselarasannya dengan pola ruang RTRW dan 3). Menganalisis perkembangan wilayah dan mendeskripsikan keselarasan tata ruang dan penggunaan lahan dengan perkembangan desa. Analisis yang digunakan dalam penelitian ini adalah analisis tabulasi matriks logis, sistem informasi geografi (SIG) dan skalogram. Berdasarkan hasil analisis, terdapat perubahan luas tutupan/penggunaan lahan dan ketidakselarasan tutupan/penggunaan lahan sejenis dengan rencana pola ruang Kabupaten dan Kota Bogor. Hasil interpretasi tutupan/penggunaan lahan desa-desa di perbatasan (62 desa) menunjukkan bahwa permukiman memiliki luas dominan di sepanjang perbatasan dan luasnya meningkat dari 3.987 ha (26%) tahun 2010 menjadi 6.184 ha (40%) tahun 2020. Total luas tutupan/penggunaan lahan sejenis di perbatasan seluas 1.560 ha tahun 2010 dan 2.981 ha tahun 2020. Tutupan/penggunaan lahan sejenis yang paling luas adalah permukiman yaitu masing-masing seluas 621 ha (40%) tahun 2010 dan 2.152 ha (72%) tahun 2020. Ketidakselarasan tutupan/penggunaan lahan sejenis dengan pola ruang Kabupaten Bogor dan pola ruang Kota Bogor sebesar 18%. Perkembangan wilayah (desa) di daerah perbatasan menunjukkan bahwa desa dengan angka perbandingan dengan predikat IPD bertambah sebanyak 55%, predikat IPD berkurang sebanyak 39%, dan predikat IPD tetap sebanyak 6% dari jumlah luas wilayah perbatasan. Hasil keselarasan tutupan/penggunaan lahan dengan perkembangan wilayah menghasilkan 9 kombinasi yang mendeskripsikan perkembangan desa terhadap keselarasan penggunaan lahan dengan pola ruangnya. Penggunaan lahan sejenis berdasarkan pola ruang di dominasi lahan yang selaras dengan perbandingan IPD yang bertambah sebanyak 49%., The Spatial Planning (RTRW) is a policy direction and strategy for the use of regional space which is used as a reference by both the Central and Regional Governments. The RTRW of Bogor Regency is stipulated through Regional Regulation (Perda) No 11/2016, while the RTRW for Bogor City is stipulated through Perda No. 8 of 2011. Un-conformity often occur between spatial use (land cover/use) and spatial planning (spatial patterns). There is also a dynamic un-conformity between spatial use and spatial planning in the two areas that are directly adjacent. To see the un-conformity at
Keyword: conformity; similar land use; border; spatial plan