Judul: Keragaman Genetik Varietas Lokal Kacang Tunggak (Vigna unguiculata (L.) Walp.) untuk Perakitan Varietas sebagai Alternatif Bahan Pangan.
Abstrak: Kacang tunggak (Vigna unguiculata (L.) Walp) tergolong tanaman pangan kelompok leguminosa yang dapat digunakan sebagai produk pangan maupun pakan. Beberapa karakter unik kacang tunggak adalah morfologi yang beragam, mampu tumbuh pada kondisi tanah yang miskin unsur hara, tahan kekeringan, dan memiliki kadar nutrisi yang tinggi. Salah satu daerah di kepulauan Maluku yang memiliki spesies ini adalah Maluku Barat Daya (MBD) dengan kondisi ketersediaan air yang terbatas. Studi secara komprehensif tentang morfologi, fisiologi, biokimia, dan genetik dari kacang tunggak di daerah ini belum dilakukan dalam upaya pengembangan dan pemanfaatan baik dari segi pemuliaan, konservasi, maupun ekonomis. Secara umum, tujuan penelitian ini adalah untuk memperoleh varietas lokal kacang tunggak yang memiliki produktivitas tinggi, toleran terhadap kekeringan, dan mengandung kadar asam folat tinggi. Beberapa tujuan khusus dari penelitian ini adalah (1) menganalisis keragaman genetik varietas lokal kacang tunggak MBD berdasarkan karakter morfologi pada lokasi berbeda; (2) mengarakterisasi morfofisiologi varietas lokal kacang tunggak MBD terhadap cekaman kekeringan serta mengidentifikasi varietas yang toleran kekeringan; (3) menganalisis kadar asam folat varietas lokal kacang tunggak MBD dan korelasinya dengan karakter fisik sehingga dapat dijadikan penciri tanaman kacang tunggak berpotensi kadar asam folat tinggi; (4) mengidentifikasi sekuen gen dihidrofolat reduktase (DHFR) yang terlibat dalam jalur sintesis folat untuk perakitan varietas dalam pemanfaatan sebagai alternatif bahan pangan. Penelitian ini diharapkan dapat memberikan manfaat dalam menyediakan basis data untuk perakitan varietas unggul dengan produksi tinggi, toleran terhadap cekaman kekeringan, dan potensi kadar asam folat tinggi. Tahapan dalam penelitian terdiri atas analisis keragaman morfologi pada lokasi berbeda, respon morfofisiologi dan identifikasi varietas toleran terhadap cekaman kekeringan pada fase vegetatif dan generatif, kadar asam folat dan identifikasi sekuen gen DHFR yang terlibat dalam jalur sintesisnya. Keragaman morfologi dilakukan pada dua lokasi (Ambon dan Bogor) berdasarkan perbedaan kondisi lingkungan dan menggunakan 40 karakter mengikuti deskriptor dari International Board Plant Genetic Resources (IBPGR 1983). Perlakuan cekaman kekeringan berupa periode pemberian air yang menggambarkan kondisi keterbatasan air pada Kabupaten MBD. Perlakuan dilakukan di rumah kaca untuk pengukuran pada fase vegetatif dan generatif. Analisis kadar asam folat mengikuti serangkaian modifikasi metode yang dimulai dari maserasi, partisi, KLT, HPLC, dan LC-MS. Identifikasi gen DHFR dilakukan dengan amplifikasi PCR menggunakan primer spesifik DHFR dilanjutkan dengan sekuensing. Semua tahapan penelitian menggunakan tujuh varietas lokal yang terdiri atas KM1, KM3, KM4, KM6, KM7, KM8, KM9 dan tiga kultivar dari Balitkabi-Malang (KT1, KT2, KT7) sebagai pembanding. Hasil penelitian menunjukkan bahwa tiap varietas memiliki karakter morfologi yang berbeda. Sebagian besar karakter yang diamati dengan nilai tertinggi dimiliki oleh varietas KM3, KM4, dan KM6. Hasil analisis komponen utama menunjukkan terdapat tiga klaster pada tiap lokasi. Varietas KM3 lebih adaptif, stabil, dan konsisten dari varietas lokal lainnya. Untuk perlakuan cekaman kekeringan pada fase vegetatif dan generatif menunjukkan bahwa periode pemberian air 10 hari sekali menurunkan semua karakter morfologi dan fisiologi kecuali kadar prolin dan panjang akar mengalami peningkatan. Terdapat hubungan yang signifikan antara panjang tajuk dengan kadar air relatif, laju transpirasi, jumlah dan bobot biji serta panjang akar dan kadar prolin. Berdasarkan nilai indeks sensitivitas dan analisis komponen utama diperoleh varietas KM7 tergolong toleran terhadap cekaman kekeringan. Selain perbedaan lokasi dan cekaman kekeringan, hasil analisis kadar
Keyword: cowpea, DHFR gene, different locations, drought stress, folic acid

Judul: Keragaman Genetik, Pertumbuhan Tanaman dan Produksi Benih Kacang Bambara (Vigna subterranea (L.) Verdc.) pada Musim Tanam Berbeda
Abstrak: Bambara adalah tanaman legum yang biasa ditanam oleh petani subsisten di wilayah kering sub-Sahara Afrika. Tanaman kacang bambara hingga saat ini termasuk tanaman underultilized crop, yaitu tanaman yang kurang diperhatikan oleh pemerintah, peneliti dan perusahaan. Tidak tersedianya varietas menjadi kendala bagi peneliti untuk mengembangkan varietas unggul kacang bambara. Pemurnian galur dan karakterisasi beberapa lanras Indonesia penting dalam pengembangan kacang bambara di Indonesia. Kacang bambara memiliki banyak keragaman, baik dari warna testa, bentuk benih, bentuk polong, bentuk daun, tinggi tanaman, lebar kanopi dan lain-lain. Karakterisasi beberapa genotipe kacang bambara lanras lokal maupun luar negeri sangat penting dilakukan. Karakterisasi berdasarkan morfo-agronomi bertujuan untuk menggali informasi tentang sifat-sifat penting yang menguntungkan dan dapat dikembangkan. Analisis molekuler juga merupakan salah satu analisis penting guna memastikan bahwa terdapat perbedaan secara genetik dari setiap individu. Kacang bambara dikenal dapat beradaptasi dengan baik pada kondisi gersang. Beberapa wilayah di Indonesia memiliki curah hujan yang cukup rendah yaitu Maluku, NTT, NTB, dan Sulawesi Selatan. Sejumlah daerah di Indonesia dilaporkan memiliki tingkat kekeringan atau curah hujan yang rendah sehingga cocok untuk pengembangan kacang bambara. Kondisi kekeringan pada tanah dapat diukur dengan Normalized Difference Vegetation Index (NDVI). Pengukuran NDVI digunakan untuk mengukur kadar N pada berbagai tanaman seperti jagung dan tebu. Pengukuran NDVI diharapkan mampu memprediksi tanaman yang toleran terhadap cekaman kekeringan. Penelitian ini bertujuan untuk: (1) mengevaluasi keragaman genetik kacang bambara lanras Indonesia dan respon pertumbuhan tanaman pada dua metode budidaya, (2) mendeskripsikan karakter pertumbuhan tanaman, karakter hasil dan mutu benih kacang bambara lanras Indonesia dan galur murni koleksi CFF, (3) mengevaluasi respon pertumbuhan tanaman dan produksi benih kacang bambara lanras Indonesia pada dua musim tanam. Penelitian ini dilaksanakan di Desa Mekarmulya, Kecamatan Situraja, Kabupaten Sumedang, pada 1 Agustus hingga 29 Desember 2017. Percobaan kedua dilaksanakan di tempat yang sama pada 24 Maret hingga Juli 2018. Analisis molekuler dilaksanakan di Molecular Laboratory, Crops For the Future (CFF), Jalan Broga, Semenyih, Malaysia dari 7 Agustus hingga 22 Agustus 2019. Percobaan pertama terdiri atas dua faktor yang disusun split plot dengan faktor metode budidaya sebagai petak utama, dan faktor genotipe sebagai anak petak. Faktor metode budidaya terdiri atas dua taraf, yaitu metode budidaya petani lokal dan metode standar yang digunakan oleh CFF. Faktor genotipe terdiri atas delapan lanras lokal Indonesia yaitu Sumedang krem, Sumedang cokelat, Sumedang hitam, Gresik hitam, Gresik cokelat, Madura hitam, Tasikmalaya hitam, Sukabumi hitam. Pengamatan karakter kuantitatif dan kualitatif mengikuti deskriptor kacang bambara yang kemudian dianalisis dengan analisis cluster. Analisis cluster dilakukan berdasarkan marka morfologi, kemudian dibandingkan dengan analisis molekuler menggunakan 3 primer. Amplifikasi PCR menggunakan label M13 pada tiga primer, produk PCR selanjutnya di-running menggunakan gel agarose dan DNA fragment analysis Applied Biosystem atau dinamakan elektroforesis kapiler. Percobaan kedua terdiri atas dua faktor yang disusun split plot dengan faktor metode budidaya sebagai petak utama, dan faktor genotipe sebagai anak petak. Faktor metode budidaya terdiri atas dua taraf, yaitu metode budidaya petani lokal dan metode standar yang digunakan oleh CFF. Faktor genotipe terdiri atas 16 taraf, delapan lanras lokal (Sumedang krem, Sumedang cokelat, Sumedang hitam, Gresik hitam, Gresik cokelat gelap, Madura hitam, Tasikmalaya hitam, Sukabumi hitam) dan delapan genotipe core
Keyword: capillary electrophoresis, landrace, leaf shape, NDVI, SSR marker, testa

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: