Judul: Paralelisasi proses short reads alignment dengan algoritme burrows-wheeler transform menggunakan CUDA
Abstrak: Teknologi DNA sequencing dan DNA sequence assembly memiliki peran penting dalam bidang ilmu biologi molekuler, khususnya genomika. Teknologi ini berfungsi untuk membentuk fragmen DNA yang lebih panjang (contigs) dari penggabungan fragmen-fragmen pendek (reads). Salah satu metode untuk melakukan DNA sequencing adalah next-gen sequencing (NGS), yang menghasilkan reads pendek untuk kemudian dijajarkan kembali pada sebuah genom rujukan. Penelitian ini bertujuan untuk mengimplementasikan algoritme Burrows-Wheeler transform (BWT) untuk melakukan proses short reads alignment hasil NGS dan paralelisasi program sehingga dapat dieksekusi menggunakan graphic processing unit (GPU) dengan memanfaatkan library CUDA. Genom rujukan yang digunakan adalah kromosom 11 kacang kedelai (Glycine max) dan sampel reads yang digunakan memiliki variasi jumlah 1 000, 2 000, 5 000, 10 000, dan 20 000 reads. Besar speedup rata-rata yang dihasilkan adalah 1.335 dan nilai speedup tertinggi pada sampel berjumlah 20 000 read dengan nilai 1.393. Paralelisasi program menggunakan CUDA menghasilkan waktu eksekusi lebih baik dibandingkan dengan program sekuensial.
Keyword: Burrows-Wheeler transform, CUDA, next-gen sequencing, short reads

Judul: Penjajaran sekuen DNA paralel berbasis kolom menggunakan algoritme Needleman-Wunsch dan graphic processing unit (GPU)
Abstrak: Deoxyribo nucleid acid (DNA) merupakan salah satu biomolekul yang berperan penting dalam menyimpan instruksi genetika makhluk hidup. DNA sendiri terdiri atas jutaan nukleotida yang saling berpasangan yang membentuk susunan double helix. Untuk mendapatkan informasi pada dua pasang DNA salah satunya perlu dilakukan proses penjajaran secara lokal maupun global. Salah satu cara yang dapat digunakan adalah menggunakan metode penjajaran global sekuen dengan skema berbasi kolom dengan tujuan untuk mendapatkan kemiripan DNA. Untaian DNA yang dibangkitkan secara acak tersebut diolah menggunakan library yang dimiliki oleh sebuah graphic processing unit yang dinamakan dengan CUDA. CUDA merupakan sebuah platform komputasi yang disediakan oleh NVIDIA untuk memanfaatkan cores yang ada pada GPU untuk digunakan pada proses komputasi. Tujuan penggunaan CUDA pada proses penjajaran DNA adalah untuk mencapai speedup semaksimal mungkin dibandingkan dengan menggunakan CPU. Pada penelitian ini didapatkan hasil speedup menggunakan GPU dibandingkan dengan CPU adalah 7.9 kali.
Keyword: columnwise, graphics processing unit, speedup

Judul: Perilaku Remaja Terhadap Aspek Keamanan Makanan Jajanan
Abstrak: Tujuan umum penelitian ini untuk mengetahui perilaku remaja terhadap aspek keamanan makanan jajanan. Tujuan khususnya adalah: (1) Mengetahui pengetahuan, sikap, praktek, dan sumber informasi remaja tentang aspek keamanan makanan jajanan; (2) menganalisis hubungan antara karakteristik individu (jenis kelamin, uang jajan, dan prestasi belajar) dengan pengetahuan, sikap, dan praktek remaja terhadap aspek keamanan makanan jajanan; (3) menganalisis hubungan antara pengetahuan remaja terhadap aspek keamanan makanan jajanan dengan sikap dan praktek remaja terhadap aspek tersebut; (4) menganalisis hubungan antara sikap remaja terhadap aspek keamanan makanan jajanan dengan praktek remaja terhadap aspek tersebut.
Keyword: