Judul: In Silico Screening of Active Compounds from Fabaceae Family as Antidepressant with Exponential Consensus Ranking
Abstrak: Depresi sudah umum dalam istilah psikologis, namun masih sulit dimengerti dalam istilah molekuler. Secara molekuler, depresi disebabkan dengan meningkatnya aktivitas enzim monoamina oksidase A (MAO-A). Penemuan obat antidepresan baru dapat dicari dengan memanfaatkan tanaman obat yang tersedia secara konvensional. Tanaman keluarga Fabaceae, yaitu secang (Caesalpinia sappan), asam jawa (Tamarindus indica), putri malu (Mimosa pudica), dan kacang gude (Cajanus cajan) telah ditapis menggunakan metode in silico dengan pemeringkatan konsensus eksponensial (ECR). Pemeringkatan menggunakan ECR telah meningkatkan rasionalitas pemeringkatan dengan menggunakan lima piranti lunak dibanding penapisan maya dengan satu piranti lunak. Meskipun tidak semua piranti lunak memiliki performa yang baik untuk semua struktur dan ligan, ECR telah berhasil menyeleksi sembilan senyawa berpotensi aktif dengan nilai IC50 eksperimental yang juga diduga aktif sebagai inhibitor MAO-A. Penyebaran sembilan senyawa paling banyak terdapat pada tanaman asam jawa dan kacang gude. Tanaman tersebut diduga berpotensi sebagai antidepresan didukung dengan data rendemen penelitian sebelumnya., Depression is already common in psychological terms, but it’s kind of poorly understood in molecular terms. On a molecular level, depression is caused by increased activity of the enzyme monoamine oxidase A (MAO-A). Medicinal plants can be utilized as a conventional alternative for developing new antidepressant drugs. Plants that are from Fabaceae family such as secang (Caesalpinia sappan), asam jawa (Tamarindus indica), putri malu (Mimosa pudica), and kacang gude (Cajanus cajan) have been screened using in silico method with exponential consensus ranking. Exponential consensus ranking (ECR) has improved the rationality of the ranking by using five docking software compared to virtual screening using one docking software. Although not all docking software outperform all structures and ligands, ECR has successfully selected nine potentially active compounds with experimental IC50 values that are also suspected to be active as MAO-A inhibitor. The most abundant distribution of these nine compounds are found in asam jawa and kacang gude plants. These plants are suspected to have potential as antidepressants, supported by previous yield data.
Keyword: antidepresan, depresi, ECR, Fabaceae, MAO-A, antidepressant, depression

Judul: Selection of Lamiaceae Family Species as Antioxidant and Antidepressant: its Activities and Active Compound
Abstrak: Depresi adalah penyakit mental kronis yang dapat mengancam jiwa dengan meningkatkan risiko bunuh diri. Penggunaan obat antidepresan sintetis merupakan terapi yang banyak digunakan untuk mengatasi gejala depresi. Penggunaan jangka panjang obat tersebut dapat menimbulkan efek samping. Oleh karena itu, diperlukan pengobatan alternatif yang aman dan mudah didapat, contohnya memanfaatkan tanaman obat Famili Lamiaceae yang banyak digunakan dalam pengobatan tradisional di Indonesia. Tanaman dari famili ini diketahui memiliki bioaktivitas antioksidan dan antidepresan. Salah satu patofisiologi penyebab depresi adalah adanya stres oksidatif yang meningkat. Oleh karenanya, pada penelitian ini dilakukan uji antioksidan terlebih dahulu sebagai skrining awal. Tanaman Lamiaceae banyak mengandung senyawa, namun tidak semuanya berperan aktif sebagai antioksidan dan antidepresan. Maka dari itu, penting untuk mengetahui metabolit aktif yang berperan sebagai antioksidan dan antidepresan. Penelitian ini mengevaluasi kapasitas antioksidan dan antidepresan dari empat spesies Lamiaceae: Ocimum americanum L., Ocimum basilicum L., Leucas lavandulifolia Sm., dan Perilla frustescen (L.) Britton, serta mengetahui dugaan metabolit aktifnya. Keempat ekstrak spesies Lamiaceae dievaluasi kapasitas antioksidannya menggunakan 2,2-difenil-1-pikrilhidrazil (DPPH), ferric-reducing antioxidant power (FRAP), dan cupric-reducing antioxidant power (CUPRAC). Ekstrak dengan kapasitas antioksidan tertinggi dipartisi dengan n-heksana, etil asetat, dan etanol-air, dan hasilnya diuji kapasitas antioksidan. Fraksi teraktif difraksionasi menggunakan kromatografi kolom dan hasilnya diuji kapasitas antioksidan. Ekstrak teraktif, fraksi teraktif, dan fraksi hasil fraksionasi diuji aktivitas antidepresannya dan dianalisis metabolitnya menggunakan kromatografi cair-spektrometri massa (LC-MS/MS). Antidepresan dievaluasi menggunakan sel PC12 yang diinduksi kortikosteron. Hasil penelitian menunjukkan bahwa ekstrak etanol 50% daun O. americanum L. mempunyai kapasitas antioksidan tertinggi yaitu sebesar 0,439 (DPPH); 1,021 (FRAP); dan 1,517 (CUPRAC) mmol setara asam askorbat (AAE)/g ekstrak. Kapasitas antioksidan tertinggi dari hasil partisi dimiliki oleh fraksi etil asetat dengan nilai sebesar 1,109 (DPPH); 1,551 (FRAP); dan 1,540 (CUPRAC) mmol AAE/g fraksi. Fraksi F7 mempunyai kapasitas antioksidan tertinggi yaitu sekitar 1,223 mmol AAE/g subfraksi (DPPH) dan 2,665 mmol AAE/g subfraksi (CUPRAC). Hasil uji antidepresan menunjukkan F8 pada konsentrasi 100 µg/mL memiliki aktivitas antidepresan tertinggi dengan nilai viabilitas sel sebesar 165,96%. Analisis metabolit menggunakan LC-MS/MS berhasil mengidentifikasi 34 metabolit yang terdiri dari flavonoid, terpenoid, asam amino, asam fenolat, asam lemak, dan asam karboksilat lainnya. Luteolin sebagai salah satu senyawa major pada F8 memiliki aktivitas antidepresan dengan konsentrasi terbaik pada 50 µM., Depression is a chronic mental illness that can be life-threatening by increasing the risk of suicide. The use of synthetic antidepressant drugs is a therapy that is widely used to treat symptoms of depression. Long-term use of this drug can cause side effects. Therefore, alternative treatments are needed that are safe and easy to obtain, for example using medicinal plants from the Lamiaceae family which are widely used in traditional medicine in Indonesia. Plants from this family are known to have antioxidant and antidepressant bioactivity. One of the pathophysiological causes of depression is increased oxidative stress. Therefore, in this study, an antioxidant test was carried out first as an initial screening. Lamiaceae plants contain many compounds, but not all of them play an active role as antioxidants and antidepressants. Therefore, it is important to know the active metabolites that act as antioxidants and antidepressants. This study evaluated the antioxidant capacity and antidepressant activity
Keyword: Antidepressant, Leucas lavandulifolia, Ocimum americanum, Ocimum basilicum, Perilla frustescen

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: