Judul: Antibacterial activity test of lactobacillus plantarum isolated from tropical fruits and relation to gene expression plantaricin.
Abstrak: Bakteriosin dari strain Lactobacillus plantarum yaitu plantaricin, memiliki kemampuan untuk menghambat pertumbuhan bakteri patogen. Penelitian ini bertujuan menguji aktivitas antibakteri dari isolat L. plantarum yang berasal dari buah-buahan tropis serta mengkorelasikan antara tingkat ekspresi gen pln A dan plnF dengan tingkat aktivitas penghambatan patogen. Isolat L. plantarum dari buah-buahan tropis terlebih dahulu di uji aktivitasnya dengan bakteri patogen Staphylococcus aureus, Salmonella thypimurium, Escherichia coli, Pseudomonas floresense dan Bacillus cereus kemudian diuji analisis ekspresi gen pln dengan RT-PCR. Hasil dari uji aktivitas antibakteri adalah isolat L. plantarum tersebut mampu menghambat pertumbuhan kelima bakteri uji dengan penghambatan relatif tertinggi 1.60 cm untuk E. coli. Pengujian dengan RT-PCR memberikan hasil yang positif untuk ekspresi gen plnA dan plnF dengan ukuran produk ±70 pb. Ekspresi relatif gen plnA terbaik berasal dari isolat TB(P) sebesar 47.123 AU dan ekspresi relatif gen plnF terbaik berasal dari isolat Mar A2 sebesar 215.560 AU. Korelasi antara tingkat ekspresi gen plnF terhadap tingkat penghambatan patogen bernilai positif terhadap bakteri E. coli dan P. floresense dengan nilai masing-masing y = 13.71x + 13.44 dan y = 2.209x + 32.24, sedangkan untuk gen plnA hanya berkorelasi positif untuk E.coli dengan nilai y = 1.998x + 8.816. Simpulan dari penelitian ini isolat L. plantarum memiliki korelasi antara aktivitas antibakteri dengan ekpresi gen plnA dan plnF yang positif terhadap E.coli sehingga dapat dijadikan alternatif pengganti antibiotik untuk mencegah penyakit saluran pencernaan seperti diare.
Keyword: 

Judul: Minimum Inhibitory Concentration (MIC) of Plantaricin from Four Strains of Lactobacillus plantarum Against Gram Negative Pathogenic Bacteria
Abstrak: Bakteri Asam Laktat (BAL) menghasilkan bakteriosin yang merupakan substrat antimikrob berupa protein, namun tidak semua BAL dapat memproduksi bakteriosin. Lactobacillus plantarum termasuk spesies BAL yang memproduksi bakteriosin. Bakteriosin asal L. plantarum ini dikenal dengan nama plantarisin. Plantarisin dapat dimanfaatkan sebagai pengawet alami pada produk pangan dan pakan. Tujuan dari penelitian ini untuk mengetahui aktivitas antimikrob plantarisin yang dihasilkan oleh empat galur L.plantarum yaitu 1A5, 1B1, 2B2, dan 2C12. Plantarisin diproduksi menggunakan metode purifikasi protein. Purifikasi protein yaitu pemurnian protein yang terdiri dari tiga tahap : purifikasi parsial dengan amonium sulfat, dialisis dan purifikasi menggunakan kromatographi pertukaran kation. Aktivitas penghambatan awal dilihat sebelum tahap purifikasi parsial dengan amonium sulfat. Penghambatan awal ini berupa zona hambat yang dihasilkan oleh supernatan bebas sel netral. Data zona hambat supernatan bebas sel netral diolah menggunakan rancangan faktorial RAL. Plantarisin diukur aktivitas penghambatannya terhadap tiga bakteri patogen Gram negatif, Escerichia coli ATCC 25922, Salmonella typhimurium ATCC 14028 dan Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853. Aktifitas penghambatan plantarisin diketahui melalui nilai penghambatan terkecil atau Minimum Inhibitory Concentration (MIC) yaitu konsentrasi terendah plantarisin yang dapat menghambat bakteri indikator. Nilai MIC yang diharapkan adalah serendah mungkin karena berarti pada konsentrasi rendah plantarisin sudah mampu menghambat bakteri indikator. Nilai MIC ditentukan melalui metode kontak. Data MIC diolah menggunakan rancangan RAL dan dianalisis secara deskriptif. Hasil penelitian menunjukkan bahwa nilai MIC terendah dihasilkan oleh plantarisin 1A5 yaitu sebesar 90% terhadap E. coli ATCC 25922, sebesar 90% terhadap S. typhimurium ATCC 14028 dan sebesar 80% terhadap P. aeruginosa ATCC 27853. Plantarisin 1B1 memiliki nilai MIC sebesar 90% terhadap E. coli ATCC 25922, sebesar 95% terhadap S. typhimurium ATCC 14028 dan sebesar 97% terhadap P. aeruginosa ATCC 27853. Nilai MIC plantarisin 2B2 yaitu sebesar 97% terhadap E. coli ATCC 25922 dan S. typhimurium ATCC 14028, serta sebesar 95% terhadap P. aeruginosa ATCC 27853. Nilai MIC plantarisin 2C12 terhadap E. coli ATCC 25922 yaitu sebesar 95%, sebesar 90 % terhadap S. typhimurium ATCC 14028 dan P. aeruginosa ATCC 27853. Kemampuan antimikroba plantarisin dipengaruhi oleh konsentrasi protein plantarisin dan sensitivitas bakteri indikator. Hasil penelitian ini menunjukkan plantarisin 1A5 memiliki konsentrasi protein tertinggi yaitu sebesar 122,40 mg/ml dan penghambatannya terhadap bakteri indikator juga paling tinggi dibandingkan iii dengan plantarisin dari galur L. plantarum yang lain. Berdasarkan nilai MIC yang dihasilkan oleh keempat jenis plantarisin dapat disimpulkan bahwa nilai MIC plantarisin yang diproduksi empat galur L. plantarum yaitu 1A5, 1B1, 2B2 dan 2C12 tidak selalu sama untuk setiap jenis bakteri indikator (patogen) Gram negatif.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: