Judul: Keragaman Gen SCD Serta Asosiasinya dengan Komposisi Asam Lemak dan Kadar Malonaldehida Ayam F2 Silangan Kampung dan Broiler.
Abstrak: Daging yang berkualitas merupakan prioritas utama bagi konsumen untuk lebih selektif dalam memilih daging ayam untuk dikonsumsi. Mengonsumsi daging seringkali dihubungkan dengan tingginya kadar kolesterol dalam darah. Tren konsumsi seperti ini mendorong diproduksinya daging ayam dengan kandungan asam lemak jenuh yang rendah dan kandungan asam lemak tidak jenuh yang tinggi. Gen stearoyl-CoA desaturase (SCD) diketahui sebagai gen yang mengkatalis perubahan asam lemak jenuh (saturated fatty acid/SFA) menjadi asam lemak tidak jenuh tunggal (monounsaturated fatty acid/MUFA). Sebelumnya gen SCD telah banyak diteliti secara ekstensif pada sapi, sedangkan pada ayam pernah dilakukan pada ayam broiler. Hasil penelitian menunjukkan bahwa gen SCD ini berhubungan dengan komposisi asam lemak pada sapi dan juga pada ayam. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis keragaman gen SCD pada populasi ayam F2 silangan kampung dan broiler serta memahami hubungan keragaman gen-gen tersebut dengan komposisi asam lemak dan kadar MDA. Penelitian terdiri atas dua tahap yaitu analisis keragaman gen SCD pada populasi ayam F2 persilangan kampung dan broiler (KBKB). Asosiasi keragaman gen tersebut diidentifikasi pada komposisi asam lemak dan kadar malonaldehida (MDA) pada ayam KBKB. Sampel yang digunakan sebanyak 53 sampel ayam KBKB. Ayam KBKB yang digunakan untuk asosiasi sebanyak 53 sampel paha atas untuk analisis asam lemak dan 51 sampel paha bawah untuk analisis MDA. 53 sampel darah ayam KBKB digunakan untuk analisis keragaman. Genotyping dilakukan menggunakan metode polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP). Analisis data yang dilakukan yaitu frekuensi genotipe, frekuensi alel, heterozigositas, keseimbangan Hardy-Weinberg dan asosiasi data genotipe dengan fenotipe menggunakan general linear model (GLM). Hasil menunjukkan bahwa gen SCD pada populasi ayam KBKB bersifat polimorfik. Gen SCD pada populasi ayam KBKB 12 minggu memiliki keragaman yang tinggi. Ditemukan asosiasi signifikan (P<0.05) gen SCD terhadap asam lemak, tetapi tidak signifikan terhadap kadar MDA.
Keyword: gen SCD, asam lemak, malonaldehida, ayam persilangan

Judul: Identifikasi Keragaman Gen Stearoyl-CoA Desaturase (SCD|HinfI) pada Ayam Silangan Kampung dan Broiler dengan Teknik PCR-RFLP
Abstrak: Gen Stearoyl-CoA Desaturase (SCD) merupakan salah satu gen pengode enzim yang terlibat dalam biosintesis asam lemak. Penelitian ini dilakukan untuk mengidentifikasi keragaman gen SCD pada generasi kedua persilangan kampung-broiler (KBKB) dengan menggunakan metode Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP). Sampel DNA yang digunakan untuk identifikasi keragaman sebanyak 100 sampel DNA ayam yang terdiri atas 62 sampel ayam KBKB, 20 sampel DNA ayam broiler dan 18 sampel DNA ayam kampung. Perhitungan genotip, frekuensi alel, nilai heterosigositas, dan keseimbangan Hardy-Weinberg pada penelitian ini dilakukan pada ayam persilangan kampung dan broiler. Gen diamplifikasi pada posisi c.17492542G>C dengan panjang sekuen 407 bp dan dipotong menggunakan enzim restriksi HinfI menghasilkan ; 373 dan 34 bp pada genotip GG; 407, 373 dan 34 bp pada genotip GC, serta 407 pada genotip CC. Frekuensi alel tertinggi ditemukan pada alel G. Genotip GG dan GC lebih banyak ditemukan dibandingkan genotip CC pada populasi ayam KBKB. Hasil identifikasi gen SCD|HinfI menunjukkan bahwa populasi ayam KBKB, ayam broiler dan ayam kampung yang digunakan bersifat polimorfik (beragam) dan berada pada keseimbangan Hardy-Weinberg. SCD merupakan gen kandidat yang potensial mengontrol biosintesis asam lemak ayam.
Keyword: heterosigositas, keragaman, PCR-RFLP, SCD

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: