Judul: Tinjauan Kwalitatif Terhadap Cendawan Penyebab Mastitis Mikotik Di Kecamatn Pangalengan Jawa Barat
Abstrak: Secara umum mastitis disebabkan oleh keadaan sanitasi yang jelek, perlakuan pemerahan yang kurang memperhatikan kesehatan ambing, perawatan ambing yang kurang ketika kering kandang dan faktor-faktor lainnya. Kejadian mastitis mikotik muncul menyusul setelah terjadinya mastitis yang disebabkan oleh bakteri. Dugaan ke arah itu timbul setelah pengobatan terhadap mastitis bakterial gagal dan tidak mencapai kesembuhan. Untuk mendiagnosa mastitis mikotik, perlu ditemukan cendawan pada air susu ambing yang menderita mastitis. Di samping itu perlu dilakukan pemeriksaan patologik anatomi. Meskipun demikian, penemuan beberapa isolat cendawan belum berarti bahwa sapi-sapi tersebut menderita mastitis miko- tik, karena dalam air susu normal pun selalu dapat di- isolasi khamir dan kapang. Selain itu bakteri yang resis- ten terhadap antibiotik antibakteri dapat juga mengga- galkan pengobatan mastitis. Dalam penelitian ini, dari ambing yang sehat dapat diisolasi 34 isolat cendawan yang terdiri dari Aspergillus fumigatus sebanyak 15 isclat (44,12%), Cladosporium spp. sebanyak 10 isolat (29,41%), Penicillium spp. sebanyak tujuh isolat (20.59%), Paecilomyces sp. sebanyak satu iso- lat (2,94%) dan Rhodotorula sp. sebanyak satu isolat (2,94%). Sedangkan dari ambing yang sakit dapat diisolasi 43 isolat yang terdiri atas Aspergillus fumigatus sebanyak 10 isolat (23,26%), Cladosporium spp. sebanyak 10 isolat (23,26%), Candida albicans dan Penicillium spp. masing- masing enam isolat (13,95%), Candida stellatoidea dan Rhodotorula sp. masing-masing sebanyak lima isolat (11,63%) dan Paecilomyces sp. satu isolat (2,32%). Sementara itu diperoleh hasil bahwa khamir, khususnya Candida albicans lebih banyak ditemukan pada air susu yang berasal dari ambing yang sakit, yang dengan pengobatan an- tibiotik gagal disembuhkan. Untuk mengurangi kejadian ini disarankan agar sanita- si kandang dan kesehatan ternak serta peternaknya diting- katkan, teknik pemerahan dan pengelolaan lainnya diperbaiki dan penyuluhan ditingkatkan frekwensinya…
Keyword: 

Judul: Aktivitas gen TLRs dan CXCRs dalam Meningkatkan Ketahanan Sapi Perah terhadap Mastitis Subklinis
Abstrak: Peradangan kelenjar ambing berdampak pada penurunan kualitas dan kuantitas susu yang mengakibatkan kerugian ekonomi. Kondisi ini lazim disebut sebagai suatu penyakit mastitis. Mastitis dikelompokkan menjadi dua yaitu mastitis klinis dengan ciri ambing membengkak, terasa panas, susu memperlihatkan perubahan secara fisiologi menjadi lebih kental. Sementara mastitis subklinis, secara kasat mata ciri-ciri mastitis subklinis tidak dapat diketahui. Melalui pemeriksaan rutin kondisi mastitis subklinis dapat diketahui dengan cepat. Pemeriksaan yang dilakukan dengan mereaksikan susu sapi dengan reagen atau senyawa 3% Alkyl-Aryl-Sulfonate. Reaksi yang terbentuk merupakan reaksi ikatan kovalen antara reagen dengan sel somatik yang terdapat di dalam susu. Reaksi ini menghasilkan tingkat kekentalan susu yang menjadi tolak ukur pengamatan kualitatif kondisi mastitis subklinis. Secara kuantitatif mastitis subklinis dapat diketahui dengan cara menghitung keberadaan sel somatik yang terdapat di dalam susu. Peradangan ambing disebabkan karena adanya infeksi oleh mikroorganisme, umumnya bakteri. Jenis bakteri yang mengontami terbagi menjadi dua yaitu bakteri endogenus dan bakteri lingkungan. Bakteri endogenus umumnya bersifat Gram negatif dan bakteri yang di lingkungan memiliki sifat Gram positif. Bakteri masuk melalui lubang puting pada saat pemerahan baik pada proses manual ataupun dengan menggunakan mesin. Saat terjadi pemerahan pertahanan kelenjar ambing mengalami kondisi titik terendah. Hal ini disebabkan oleh karena sphincter masih terbuka beberapa saat setelah pemerahan, selain itu sel darah putih, antibodi serta enzim juga habis, ikut terperah. Kondisi ini dapat memperburuk kondisi ambing. Penelitian ini dibagi menjadi tiga kelompok dengan judul (i) Prevalensi dan jenis bakteri penyebab mastitis subklinis (ii) Pengaruh mastitis subklinis terhadap kualitas susu (iii) Respons kelenjar mammae (HC11) terhadap bakteri: proliferasi, dan ekspresi gen family Toll-like Receptor (TLRs) dan family chemokine Receptor CXCRs. Kegiatan pertama bertujuan menganalisis jumlah cemaran bakteri yang ada dalam susu yang dapat memengaruhi kualitas susu. Selain itu juga menganalisis kondisi infeksi mastitis serta mengidentifikasi jenis bakteri dominan penyebab mastitis di beberapa peternakan di wilayah Jawa Barat. Jumlah ternak yang dipergunakan 10 ekor pada masing-masing lokasi peternakan di Jawa Barat pada ketinggian tempat yang berbeda-beda yaitu di Kabupaten Bandung, Kabupaten Bandung Barat, Kabupaten Sumedang, Kabupaten Sukabumi, Kabupaten Subang, Kabupaten Tasikmalaya dan Kabupaten Bogor yang berasal dari beberapa peternakan kecil dan menengah, perusahan dan instansi. Pengambilan sampel dengan menggunakan metode survai secara purposive random sampling dengan kondisi sapi periode laktasi ke 2-3 serta bulan laktasi ke 2-4. Analisis bakteri susu dengan menggunakan metoda California Mastitis Test (CMT) dengan skala 1 sampai 4 (P1-P4) sebagai mastitis subklinis. Analisis jumlah cemaran bakteri dengan menggunakan metoda Total Plate Count (TPC) dengan pengenceran susu pada konsentrasi 10-1, 10-2, 10-3, 10-4, 10-5, dan 10-6 menggunakan 0.9% NaCl Fis, Analisis jenis morfologi bakteri dilakukan dengan menggunakan metoda pewarnaan Gram.dan analisis sekuensing dilakukan dengan mengisolasi DNA bakteri dengan primer universal 16S rRNA. Hasil yang didapat pada kegiatan pertama ini memperlihatkan bahwa lokasi yang memiliki kondisi ambing yang sehat terbanyak pada wilayah Pangalengan. Kondisi sapi perah yang dikelompokkan terinfeksi mastitis subklinis pada peternakan rakyat berada pada tingkat cemaran bakteri P1, sedangkan pada peternakan komersil dan instansi pemerintah pada tingkat P2. Susu sapi mastitis yang terinfeksi oleh bakteri didominasi dari jenis Gram positif dan memiliki morfologi basil (batang). Bakteri dominan tersebut terdeteksi sebagai Basillus sp berdasarkan hasil sekuensing.
Keyword: bakteri patogen, ekspresi gen, kualitas susu, mastitis subklinis

Judul: The Construction of Greedy SVP LLL Algorithm
Abstrak: A lattice is a set of all integer linear combination of a set of linearly independent vectors in ℝ𝑛���. The independent vectors are called bases of lattice. Any lattice can be generated from many bases, and these bases have the same cardinality. In the lattice, the most fundamental and renowned problem is the Shortest Vector Problem (SVP). SVP is a tracking problem of the shortest nonzero vector in a lattice with equivalent bases. In two dimensions, SVP problem has resolved exactly by Gauss’ algorithm. When the lattice dimension is higher than two, A.K. Lenstra, H.W. Lenstra and L. Lovasz gave a LLL algorithm to compute approximation of nonzero shortest vector in the lattice. Reduced bases solution obtained from LLL algorithm still be an approximation and has polynomial running time of arbitrary dimension which large enough. In 1994, Schnoor and Euchner modified this LLL algorithm as a new variant which later was named deep insertion LLL algorithm. This algorithm is a modified version of the LLL algorithm to the terms of the exchange step to improve the accuracy of output of LLL reduced bases and applying it to the subset sum problem. The purpose of this research are: (1) Reconstruct the LLL algorithm and deep insertion LLL algorithm using a geometric approach. (2) Construct a greedy SVP LLL algorithm. (3) Implement the three algorithms in a symbolic programming language, and evaluate them experimentally. A bases ℬ=[𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑛���] in ℝ𝑚��� is called reduced LLL with parameter 𝛿��� if satisfies: (a) |𝜇���𝑗���𝑖���|≤12, for every integer 𝑖���,𝑗��� with 1≤𝑖���<𝑗���<𝑛���. (b)𝛿���‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���)‖2≤‖𝜋���𝑗���(𝐛���𝑗���+1)‖2, for 𝑗���=1,2,…,𝑛���−1,where 𝛿��� is a reduced parameter of real numbers with 14<𝛿���<1. The first requirement is the reduced basis 𝛿��� must “nearly orthogonal” and in its computation case, this requirement can be reached out by using the Gram-Schmidt’s orthogonalization. While the second requirement is called exchange step, or used to called as Lovasz condition. By using both of these requirements, then they establish the LLL algorithm. Then, Schnoor and Euchner modify the LLL algorithm based on the requirements of the exchange step called the deep insertion LLL algorithm, where the exchange step is based on the comparison of the projected vector in orthogonal complement [𝐛���1,𝐛���2,…,𝐛���𝑘���−1]⊥ after j-th reduction. To construct greedy SVP LLL algorithm, the requirements of the exchange step is based on purely by comparing norm of lattice 𝐛���𝑗��� with norm lattice 𝐛���𝑖��� for 𝑖���=1,2,3…,𝑗���−1. The process of insertion reduced vector after the exchange step also has done greedily. Then, we calculate the number of arithmetic operation in greedy SVP LLL algorithm for further analysis. The result of our exprimentation for three algorithms on the certain matrix size shows that the running time of the three algorithms increases propotional to the size of the matrix. The result also shows that by using 𝛿���=34 for the LLL algorithm and the deep insertion LLL algorithm, and the greedy SVP LLL algorithm which is a new variant made by using no parameter of 𝛿���, outperform of the other of two previous algorithm in terms of speed with the same output.
Keyword: LLL algorithm, LLL deep insertion algorithm, greedy SVP LLL algorithm