Judul: Implementasi Breadth-First Search Paralel untuk Memprediksi Drug-Target Interaction dalam Graf Tanaman-Penyakit
Abstrak: Pengembangan obat baru untuk penyakit degeneratif membutuhkan biaya yang besar. Obat yang dikembangkan memiliki resiko yang dapat menimbulkan efek samping sehingga membutuhkan waktu yang lama untuk menjamin keamanannya. Strategi drug repurposing dapat digunakan untuk meminimalkan biaya, efek samping, dan waktu yang dibutuhkan dalam pengembangan obat. Salah satu pendekatan dari drug repurposing adalah pendekatan berbasis target yang dapat digunakan untuk mencari kemiripan senyawa-protein dan memprediksi drug-target interaction (DTI). Penelitian ini menggunakan algoritme breadth-first search (BFS) untuk menelusuri graf tanaman-penyakit dan memprediksi kemungkinan DTI. BFS diimplementasikan secara sekuensial dan paralel. Implementasi dari algoritme paralel menghasilkan waktu eksekusi sebesar 46.299 detik dengan speed-up sebesar 51.33 kali ketika menggunakan parameter thread size 4.
Keyword: breadth-first search, degeneratif, drug repurposing, drug-target interaction, jamu, paralel, penyakit, tanaman

Judul: Optimasi Penelusuran Bipartite Graph Tanaman-Protein untuk Memprediksi Formula Jamu dengan Algoritme Branch and Bound
Abstrak: Jamu adalah ramuan herbal asal Indonesia yang telah digunakan selama bertahun-tahun. Jamu terbuat dari komposisi berbagai macam tanaman obat, seperti akar, daun, dan batang. Penyakit yang dipercaya dapat diatasi oleh jamu sangat beragam, salah satunya adalah penyakit Diabetes mellitus. Penelitian terkait prediksi formula jamu untuk penyakit Diabetes mellitus tipe 2 sudah pernah dilakukan, namun terkendala dalam pencarian kombinasi formula jamu karena memiliki waktu komputasi yang tinggi. Penelitian ini bertujuan melakukan prediksi kombinasi formula jamu dengan mengoptimasi penelusuran pada bipartite graph tanaman-protein menggunakan algoritme branch and bound. Data yang digunakan pada penelitian ini adalah data protein yang berasosiasi dengan penyakit Diabetes mellitus tipe 2 dan data tanaman yang menarget protein tersebut. Penelusuran bipartite graph dengan algoritme branch and bound mereduksi waktu komputasi sampai 40 kali lebih cepat dibandingkan dengan strategi complete search pada penelitian sebelumnya untuk pencarian kombinasi 4 tanaman. Strategi pencarian breadth first search menjadi opsi terbaik pada penelitian ini.
Keyword: bipartite graph, branch and bound, jamu, Diabetes mellitus, obat tradisional

Judul: Purifikasi Dan Karakterisasi Imunoglobulin Y (IgY) Pada Telur Ayam Kampung
Abstrak: The objective of this research was to purified and characterized yolk immunoglobulin (IgY) from Indonesian native chicken eggs. Fourty eggs were collected from Cibanteng, Ciampea, Cinangneng, and Darmaga. IgY from egg yolk were puri$ed with Water Soluble Fraction (WSF) method combinated by 12% PEG 6000 and 40% Amonium sulpha methodt. IgY molecular weight was established by SDS-PAGE and the concentration was determinated by UV specfrophotometer. The result show that average IgY concentration from native chicken eggs was 7.86 mngml. Molecular weight of native chicken IgY was 180 and I70 kDa..
Keyword: