Judul: IPB (Bogor Agricultural University)
Abstrak: Bakteri asam laktat (BAL) merupakan kelompok bakteri yang paling umum ada pada produk fermentasi pangan. Secara luas BAL telah diaplikasikan pada fermentasi pangan di seluruh dunia dan diketahui bahwa BAL juga termasuk ke dalam mikroorganisme yang aman bagi manusia dengan status generally recognized as safe (GRAS). Selain berperan dalam pengawetan bahan yang difermentasi, BAL juga berperan sebagai probiotik dan menghasilkan komponen bioaktif yang berimplikasi terhadap peningkatan kesehatan manusia. Salah satu produk fermentasi laktat tradisional Indonesia adalah dadih, yaitu susu kerbau fermentasi dari Sumatera Barat. Sebagian besar proses fermentasi dadih berlangsung secara spontan, walaupun di beberapa daerah pengolahan dadih dilakukan dengan metode backslopping. Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari dinamika populasi dan keragaman BAL selama proses fermentasi dadih serta menganalisis kemampuannya sebagai penghasil peptida bioaktif angiotensin converting enzyme (ACE) inhibitor Untuk mempelajari dinamika dan keragaman BAL dadih digunakan pendekatan dengan metode kultivasi (culture-dependent) dan tanpa kultivasi (culture-independent) berbasis molekuler. Teknik terminal restriction fragment length polymorphism (T-RFLP) diaplikasikan pada pendekatan tanpa kultivasi untuk menganalisis dinamika dan keragam BAL dadih yang dibuat dengan metode fermentasi backslopping dan spontan. Sementara metode kultivasi dilakukan untuk mengisolasi, menyeleksi, dan mengidentifikasi sifat morfologi, genotip dan fenotip BAL dadih yang tumbuh pada medium MRSA + 0.5% CaCO3, sehingga diperoleh isolat BAL yang berpotensi menghasilkan peptida bioaktif ACE inhibitor. Bakteri asam laktat hasil isolasi kemudian dikarakterisasi profil protein dan aktivitas penghambatan ACE (persen penghambatan dan IC50). Metode tanpa kultivasi (teknik T-RFLP) menunjukkan bahwa dinamika dan keragaman BAL dadih dipengaruhi oleh metode fermentasi yang digunakan. Metode fermentasi bakslopping menghasilkan dinamika keragaman dan kelimpahan relatif BAL yang lebih besar dibandingkan dengan metode fermentasi spontan. Sementara metode kultivasi dengan pencawanan berhasil mengisolasi dua belas isolat BAL yang dengan aktivitas antibakteri dan proteolitik yang berpotensi sebagai penghasil peptida bioaktif ACE inhibitor. Berdasarkan sifat morfologi, genotip dan fenotipnya kedua belas isolat BAL hasil isolasi dikelompokkan ke dalam 3 genus yaitu Lactococcus, Lactobacillus, dan Pediococcus. Hasil identifikasi menunjukkan bahwa 41.6% (5 isolat) teridentifikasi sebagai Lactococcus lactis subsp. lactis, 25% (3 isolat), teridentifikasi sebagai Lactobacillus plantarum subsp. plantarum, 16.6% (2 isolat) teridentifikasi sebagai Lactococcus lactis subsp. cremoris, dan masing-masing 8.3% (1 isolat) teridentifikasi sebagai Pediococcus pentosaceus dan Lactobacillus pentosus. Isolat Lactococcus lactis subsp. lactis DK12 telah teruji memiliki persen penghambatan terhadap ACE yang cukup tinggi, yaitu 61.9 ± 7.5% dan nilai IC50 442.2 μg/ml. Profil protein susu yang difermentasi dengan isolat Lactococcus lactis subsp. lactis DK12 terdiri dari 6 pita protein berukuran 12 kDa-125 kDa. Hasil penelitian menunjukkan bahwa isolat Lactococcus lactis subsp. lactis DK12 dapat digunakan sebagai kultur starter pada industri pengolahan susu fermentasi dan berpotensi untuk dikembangkan lebih lanjut sebagai agen terapi atau suplemen untuk menurunkan tekanan darah atau sebagai antihipertensi dalam bentuk pangan fungsional asal hewan
Keyword: ACE inhibitor, bakteri asam laktat, dadih, fermentasi spontan dan backslopping.

Judul: Kajian Senyawa Antimikroba Bakteri Asam Laktat Homofermentatif Isolat ASI
Abstrak: Bakteri Asam Laktat (BAL) termasuk mikroorganisme yang aman jika ditambahkan dalam pangan karena sifatnya tidak toksik dan tidak menghasilkan toksin, maka disebut food grade microorganism atau dikenal sebagai mikroorganisme yang Generally Recognized As Safe (GRAS) yaitu mikroorganisme yang tidak beresiko terhadap kesehatan. Bakteri asam laktat telah dikenal pemanfaatannya sejak lama yaitu sebagai biopreservatif dalam proses fermentasi berbagai produk pangan. Hal ini dimungkinkan karena BAL dapat menghasilkan produk metabolit yang bersifat antimikroba seperti asam organik, hidrogen peroksida (H2O2), karbondioksida (CO2), diasetil, dan bakteriosin. Bakteriosin yang dihasilkan BAL, mendapat perhatian utama karena bermanfaat sebagai biopreservatif menggantikan bahan preservatif kimia. Kekhawatiran akan efek negatif bahan kimia bagi kesehatan membuat penggunaan pengawet semakin banyak beralih dari pengawet kimia ke pengawet yang lebih alami. Bakteriosin yang telah diisolasi hingga saat ini diketahui memiliki sifat sebagai protein, efek bakterisidal dengan spektrum penghambatan yang relatif terpusat pada spesies penghasil (kedekatan filogenetik), dan mempunyai reseptor spesifik pada sel sasaran. Oleh karena itu, tujuan penelitian ini adalah untuk mengkaji senyawa antimikroba yang dihasilkan BAL dan mengkaji potensinya sebagai penghasil bakteriosin. BAL yang digunakan pada penelitian ini adalah Lactobacillus homofermentatif (A3, A36, A38, R11), Streptococcus homofermentatif (A4), Lactobacillus rhamnosus (R12, R14), Lactobacillus fermentum (R17), Lactobacillus plantarum (B6) yang diisolasi dari air susu ibu (ASI). Pada penelitian sebelumnya, isolat-isolat ini diketahui berpotensi sebagai kandidat probiotik karena memiliki ketahanan terhadap asam dan garam empedu (bile salt). Selain itu, isolat BAL tersebut juga memiliki aktivitas antimikroba terhadap beberapa bakteri patogen seperti Bacillus cereus, Staphylococcus aureus, Salmonella sp., dan Escherichia coli. Penelitian ini terdiri dari dua tahap, yaitu (1) Pengujian aktivitas antimikroba BAL terhadap bakteri patogen (2) Pengujian aktivitas antimikroba sebagai seleksi untuk memperoleh isolat BAL yang berpotensi menghasilkan bakteriosin dan terbagi lagi menjadi empat tahap yaitu (a) Pengaruh netralisasi senyawa antimikroba terhadap bakteri uji sensitif dengan metode kontak, (b) Penentuan waktu inkubasi berdasarkan kurva pertumbuhan, (c) Pengaruh waktu inkubasi terhadap aktivitas antimikroba, (d) Konfirmasi pengujian bakteriosin Pada tahap pertama yaitu pengujian aktivitas antimikroba BAL diperoleh hasil keseluruhan isolat menunjukkan sifat antagonistik yang besar terhadap Listeria monocytogenes dengan rata-rata penghambatan sebesar 10.6 mm. Terdapat 12 isolat dengan penghambatan terhadap L. monocytogenes di atas 10 mm yaitu R11, R12, R13, R15, R18, R20, R30, R32, R36, A4, A38, dan A36 yang kemudian dilanjutkan ke tahap seleksi untuk memperoleh isolat yang berpotensi menghasilkan bakteriosin yaitu melalui pengaruh netralisasi terhadap supernatan. Pada tahap tersebut supernatan yang dinetralisasi dari 7 isolat yaitu R12, R13, R15, R20, R32, A4, dan A38 mampu menahan kenaikan pertumbuhan bakteri uji yaitu L. monocytogenes dengan nilai yang berbeda nyata dengan kontrol berdasarkan pengujian statistik dengan ANOVA yang dilanjutkan dengan uji Duncan. Hasil tersebut menunjukkan kemungkinan terdapatnya senyawa antimikroba selain asam organik yang dapat menahan kenaikan pertumbuhan bakteri uji. Isolat-isolat tersebut kemudian diuji lebih lanjut untuk mengkonfirmasi keberadaan bakteriosin. Waktu inkubasi yang digunakan untuk produksi bakteriosin berdasarkan waktu yang diperlukan untuk mencapai awal fase stasioner yang diperkirakan pada saat tersebut terjadi sintesis yang optimum dari bakteriosin. Isolat R13 mencapai awal fase stasioner pada jam ke-11, isolat R12, A4, dan A38 pada jam ke-13. Isolat R32 pada jam ke-15, Isolat R15 pada jam ke- 19 dan R20
Keyword: 

Judul: Thermal Characteristics and Dynamics of Tropical Cyclone over Western North Pacific Ocean: A Case Study of Typhoon Songda (Chedeng) 2011
Abstrak: The frequent occasion of Tropical Cyclone (TC) over Western North Pacific (WNP) Ocean lies from 10˚N to 26˚N and 121˚E to 170˚E. Sources of TC development come from warm ocean temperature where latent heat is released during condensation processes and subsequently concentrated in the boundary layer. Relative humidity at 850-700 hPa is responsible to produce the most intense storm. Meanwhile, weak vertical wind shear between 850-200 hPa is one of the dynamical factors that lead to the development of TC. Pressure level of 850-200 hPa is chosen to minimize the thermodynamic effect in the lower troposphere. Typhoon Songda (Chedeng in the Philippines) or TSC lasted from May 18th to 30th, 2011 and strengthened into powerful Super Typhoon stage between May 24th and 27th. Long curving track and the exhibition of all sequences of TC life cycle, TSC is then considered as an ideal case of TC. The objective of the study with case of TSC is to investigate the role of thermal characteristics and dynamics on TC intensity. The research is carried out by using Advanced Research of Weather Research and Forecasting model (WRF ARW model) version 3.3. Two domains are employed in the model. The first domain situate from 02˚N to 40˚N and 118˚E to 149˚E and cover spatial resolution () of 33.1 km. The second domain situate from 09˚N to 27˚N and 119˚E to 132˚E with of 11 km. Timestep of the model () is 120 seconds. The model is supported by the following physical parameterization, i.e., Yonsei University Scheme (YSU) in the boundary layer, Kain-Fritsch scheme (KF) in the cumulus, and WRF Single-Moment 3-class scheme in the microphysics. Initial meteorological condition prior to the formation of the cyclone is generated using WRF ARW standard-release model. Sensitivity of the model output is obtained from a selected single-parameter change scenarios, namely, 10 % to 20 % decrease and increase of wind shear initial data at 850-200 hPa, and by 10 % to 20 % decrease of relative humidity initial data at 850-700 hPa. The result showed that the negative correlations between wind shear and intensity are found in wind shear scenarios. Wind shears of 10 ms-1 which lead to strengthening of the wind intensity in the early period of Typhoon development are found in wind shear scenarios. The effect of wind shear changes on wind intensity is statistically significant in the 20 % wind shear scenarios. During mature stage, weak wind intensity occurred when wind shear increase as given in the WRF standard-release and the 20 % decreasing scenario. Different situation is found in the 20 % increasing scenario where wind shear tend to weak and lead to strong wind intensity at this stage. Meanwhile, the reduction of moisture supply at 850-700 hPa resulting from 20 % decreasing relative humidity play a major role in the weakening of wind intensity and reduces mechanical energy of the cycle process as much as 300 J kg-1.
Keyword: