Judul: Ability of Xylocarpus granatum’s endophytic actinobacteria to inhibit the growth of Propionibacterium acnes
Abstrak: Propionibacterium acnes merupakan salah satu bakteri patogen penyebab jerawat pada manusia. Buah Xylocarpus granatum secara tradisional telah digunakan sebagai bedak anti jerawat oleh masyarakat di Luwu, Sulawesi Selatan. Keberadaan aktinobakteri endofit di dalam jaringan X. granatum dapat berpotensi menghasilkan metabolit sekunder sebagai antibakteri yang penting untuk pengobatan jerawat dengan bahan alami. Penelitian ini bertujuan mengkaji aktivitas supernatan dan ekstrak etil asetat aktinobakteri endofit X. granatum sebagai antibakteri P. acnes. Sebanyak 24 isolat aktinobakteri endofit X. granatum dari koleksi Laboratorium Mikrobiologi, Departemen Biologi, FMIPA, IPB diremajakan pada media International Streptomyces Project 4 (ISP4). Karakterisasi morfologi menunjukkan kelima isolat memiliki ciri-ciri genus Streptomyces dengan tipe rantai spora Rectus Flexibilis. Penapisan aktivitas antibakteri dari supernatan aktinobakteri dilakukan terhadap P. acnes. Aktivitas inhibisi pertumbuhan P. acnes diindikasikan dengan terbentuknya zona bening di sekeliling cakram kertas berdiameter 6 mm. Sebanyak 14 dari 24 supernatan isolat mampu menghasilkan zona bening dengan diameter berkisar antara 1,00-7,00 mm. Isolat XGS3, XGS4, XGS6, XGS7, dan XGS8 yang menghasilkan zona bening dengan diameter antara 6,50-7,00 mm selanjutnya diekstraksi dengan pelarut etil asetat, kemudian diuji kembali kemampuan inhibisinya terhadap P. acnes. Ekstrak etil asetat isolat XGS8 konsentrasi 1000 ppm memiliki diameter zona bening terbesar diantara kelima isolat terpilih, yaitu sebesar 7,50 mm. Konsentrasi Hambat Minimum (KHM) isolat XGS3, XGS4, dan XGS8 yaitu pada konsentrasi 500 ppm, sedangkan KHM isolat XGS6 dan XGS7 yaitu pada konsentrasi 750 ppm. Data tersebut menunjukkan bahwa isolat XGS3, XGS4, XGS6, XGS7, dan XGS8 dapat menghambat pertumbuhan P. acnes.
Keyword: acne vulgaris, actinobacteria, antibacterial, endophytes, Xylocarpus granatum

Judul: Xylocarpus granatum Endophytic Actinobacteria: Presence and Activity of Antioxidants
Abstrak: Xylocarpus granatum menghasilkan berbagai senyawa bioaktif dengan aktivitas biologis yang beragam, salah satunya sebagai antioksidan. Aktinobakteri endofit juga dapat menghasilkan senyawa bioaktif. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keberadaan aktinobakteri endofit X. granatum dan mengetahui aktivitas antioksidannya. Metode penelitian diawali dengan isolasi aktinobakteri endofit dari buah, biji, dan daun menggunakan media selektif Humic acid (HV). Selanjutnya dilakukan karakterisasi isolat yang diperoleh menggunakan empat media berbeda yaitu YSA, ISP2, ISP3, dan ISP4. Aktivitas antioksidan dari supernatant aktinobakteri dan ekstrak etil asetat aktinobakteri dilakukan menggunakan metode DPPH. Hasil penelitian menunjukkan bahwa dari X. granatum diperoleh 15 isolat aktinobakteri endofit dari buah, biji, dan daun. Isolat aktinobakteri endofit X. granatum menunjukkan perbedaan warna pada miselium aeria dan miselium substrat, serta perbedaan penataan rantai spora. Supernatan XGF11, XGF12, dan XGF4 menghasilkan aktivitas antioksidan tertinggi yaitu: 57.30%, 49.77%, dan 41.90% penghambatan. Kapasitas antioksidan ekstrak etil asetat XGF12 adalah 501.60 μg AEAC/mg ekstrak, 465.47 μg AEAC/mg ekstrak untuk ekstrak etil asetat XGF11, dan 455.53 μg AEAC/mg ekstrak untuk ekstrak etil asetat XGF4. Ekstraksi DNA aktinobakteri endofit dilakukan berdasarkan Presto Mini gDNA Bacteria Kit. Berdasarkan hasil analisis gen 16S rRNA, isolat XGF11 dan XGF12 menunjukkan kemiripan masing-masing 99.42% dan 99.16% dengan Streptomyces xylanilyticus SR2-123 dan XGF4 memiliki kemiripan 99.82% dengan Brevibacterium sediminis FXJ8.269., Xylocarpus granatum produces various bioactive compounds with diverse biological activities, one of them as an antioxidant. Endophytic actinobacteria can also produce bioactive compounds. This study aimed to explore the existence of the endophytic actinobacteria of X. granatum and determine its antioxidant activity. The research method begins with the isolation of endophytic actinobacteria from fruits, seeds, and leaves using selective media Humic Acid (HV). Furthermore, characterizing the obtained isolates using four different media, namely YSA, ISP2, ISP3, and ISP4. Measured antioxidant activity for actinobacterial supernatants and actinobacterial ethyl acetate extracts using the DPPH method. The results showed that from X. granatum, 15 isolates of endophytic actinobacteria were obtained from fruit, seeds, and leaves. Endophytic actinobacteria isolates from X. granatum showed different colors of aerial mycelium, substrate mycelium, and spore chain type. XGF11, XGF12, and XGF4 isolates produced high antioxidant activity of the supernatant; 57.30%, 49.77%, and 41.90% inhibition, respectively. The antioxidant capacity of XGF12 ethyl acetate extract was 501.60 μg AEAC/mg extract and 465.47 μg AEAC/mg extract for XGF11 ethyl acetate extract. DNA extraction and 16S rRNA amplification from endophytic actinobacteria X. granatum according to Presto Mini gDNA Bacteria Kit Protocol. Based on 16S rDNA gene analysis, isolates XGF12 and XGF11 showed 99.16% and 99.42% similarities with Streptomyces xylanilyticus, respectively. Meanwhile, XGF4 showed to have 99.82% similarities with Brevibacterium sediminis.
Keyword: Keragaman, DPPH, Endofit, Ekstrak etil asetat, 16S rRNA, Diversity, endophytes, ethyl acetate extract

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: