Judul: Analisis Ekspresi Gen CYP Ganoderma boninense yang Diinfeksikan pada Tanaman Kelapa Sawit In Vitro
Abstrak: Kelapa sawit merupakan salah satu komoditas perkebunan yang sangat penting di Indonesia, namun komoditas ini sering kali menghadapi penyakit busuk pangkal batang (BPB). Penyakit ini biasanya disebabkan oleh Ganoderma boninense. Salah satu pendekatan yang potensial untuk mempelajari terkait infeksi penyakit ini adalah melalui identifikasi gen cyclophilins (CYP) yang diketahui sebagai faktor virulensi Ganoderma boninense. Tujuan penelitian ini adalah menganalisis ekspresi gen cyclophilins (CYP) Ganoderma boninense yang diinfeksikan pada tanaman kelapa sawit secara in vitro (metode qPCR). Fragmen gen target diperoleh dengan mengamplifikasi cDNA Ganoderma boninense menggunakan primer GbCYP203 dan GbCYP205. Ekspresi gen target dianalisis menggunakan qPCR, dengan gen α-tubulin sebagai gen referensi dan kontrol negatif sebagai kalibrator. Gen target telah berhasil terekspresi pada semua isolat Ganoderma boninense yang digunakan. Gen GbCYP203 berperan pada tahap awal infeksi yaitu pada waktu 2 dan 4 minggu, sedangkan gen GbCYP205 berperan pada tahap akhir infeksi yaitu pada waktu 6 dan 8 minggu.
Keyword: cyclophilins (CYP), Ganoderma boninense, penyakit busuk pangkal batang, qPCR, tanaman kelapa sawit.

Judul: Ekspresi Protein Tanaman Kelapa Sawit (Elaeis Guineensis Jacq.) Yang Terinfeksi Ganoderma Boninense Pat. Pada Fase Pembibitan
Abstrak: Busuk pangkal batang (BPB) adalah penyakit pada tanaman kelapa sawit akibat terserang fungi patogen Ganoderma boninense dan merupakan penyakit paling penting pada perkebunan kelapa sawit di Asia Tenggara. BPB dapat membunuh lebih dari 80% tegakan tanaman kelapa sawit yang memiliki setengah masa hidup ekonominya. Sistem pertahanan tanaman terhadap serangan patogen dengan mengaktifkan respon pertahanan dari berbagai komponen. Respon tersebut termasuk induksi gen terkait pathogenesis-related (PR) proteins, seperti glukanase dan kitinase, produksi metabolit sekunder atau penguatan dinding sel. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan isolat G. boninense yang memiliki tingkat virulensi tertinggi secara in vitro berdasarkan aktivitas enzim ekstraseluler dan menetapkan respon tanaman kelapa sawit moderat tahan dan tidak tahan G. boninense berdasarkan aktivitas enzim peroksidase (PO), kitinase, β-1,3-glukanase, fenilalaninamonia liase (PAL), dan polifenol oksidase (PPO). Tahap pertama penelitian, yaitu karakterisasi setiap kultur G. boninesne, analisis aktivitas enzim ekstraseluler G boninense. Tahap kedua, yaitu penanaman tanaman kelapa sawit moderat tahan dan tidak tahan G. boninense, perlakuan tidak dan dengan infeksi G. boninense yang memiliki tingkat virulensi tertinggi, pengamatan gejala BPB, dan analisis aktivitas enzim tanaman kelapa sawit. Hasil penelitian menunjukkan bahwa setiap isolat G. boninense memiliki karakteristik kultur yang berbeda. Isolat G8 memiliki waktu fase eksponensial tercepat. Isolat G2 memiliki tingkat virulensi tertinggi berdasarkan aktivitas enzim ekstraseluler secara in vitro. Korelasi negatif ditunjukkan antara pertumbuhan dan virulensi pada isolat G2. Persentase serangan G. boninense terhadap tanaman kelapa sawit memiliki kecenderungan yang semakin tinggi seiring dengan lamanya waktu perlakuan. Progeni moderat tahan (R1 dan R2) memiliki persentase serangan yang lebih rendah dari progeni tidak tahan (S). Analisis aktivitas enzim pada tanaman kelapa sawit menunjukkan bahwa aktivitas PO dan PPO lebih tinggi pada progeni moderat tahan pada bulan ke-1 setelah perlakuan. Enzim kitinase dan β-1,3-glukanase memiliki aktivitas yang lebih tinggi pada progeni moderat tahan pada bulan ke-3 setelah perlakuan. Aktivitas enzim PAL pada progeni moderat tahan lebih tinggi pada setiap bulan pengamatan. Tanaman kelapa sawit moderat tahan memiliki sistem pertahanan yang lebih baik berdasarkan aktivitas enzim PO, PPO, PAL, kitinase dan β-1,3- glukanase. Enzim PPO dapat dijadikan sebagai kandidat penanda untuk membedakan antara progeni moderat tahan dan tidak tahan terhadap infeksi G. boninense berdasarkan analisis kelompok dan biplot. .
Keyword: busuk pangkal batang, enzim ekstraseluler, interaksi inang-penyakit, kelapa sawit

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: