Judul: In Vitro Germination and Growth of Lime (Citrus aurantifolia) for Selection of Endophytic Bacteria to Control Huanglongbing Disease
Abstrak: Kendala yang sering dialami dalam pertanaman jeruk adalah tingginya serangan penyakit, salah satunya adalah penyakit Huanglongbing (HLB). Pengendalian HLB dapat dilakukan dengan memanfaatkan agen hayati berupa bakteri endofit. Teknik infeksi buatan serangan HLB secara in vitro telah berhasil dikembangkan sehingga seleksi bakteri endofit dapat dilakukan dengan lebih cepat. Jeruk nipis dipilih sebagai eksplan seleksi karena sangat peka terhadap serangan HLB. Penelitian ini bertujuan mendapatkan konsentrasi giberelin dan perlakuan skarifikasi terbaik untuk perkecambahan in vitro jeruk nipis, serta mengetahui isolat bakteri endofit terbaik dan lama perendaman optimal untuk pengendalian HLB. Pada tahap pertama penelitian, biji jeruk nipis dengan dan tanpa perlakuan skarifikasi dikecambahkan pada media dasar MS+VMW dengan tambahan giberelin 0 mgL −1 , 5 mgL −1 , 10 mgL −1 , dan 15 mgL −1 . Pada tahap kedua, tunas jeruk hasil perkecambahan direndam selama 1, 2, dan 3 hari dalam 7 suspensi isolat bakteri endofit yang berbeda lalu diinfeksi buatan secara in vitro dengan suspensi bakteri CLas, patogen HLB. Hasil penelitian menunjukkan bahwa konsentrasi giberelin optimal untuk menginduksi perkecambahan biji jeruk nipis adalah 5 ml −1 . Perlakuan skarifikasi secara nyata mampu mempercepat waktu berkecambah. Bakteri endofit Micrococcus endophyticus memberikan hasil lebih baik dalam mengurangi gejala infeksi HLB dibandingkan bakteri endofit Bacillus spp. Lama perendaman tunas jeruk dalam suspensi bakteri endofit optimal untuk mengurangi gejala infeksi Clas adalah 3 hari., The problem that is often experienced in citrus cultivation is the high incidence of diseases, one of which is Huanglongbing disease (HLB). HLB control can be done by utilizing biological agents in the form of endophyte bacteria. In vitro artificial infection techniques for HLB attacks have been developed so that selection of endophyte bacteria can be carried out more quickly. In vitro lime sprouts were chosen as the explants of selection because of its sensitivity to HLB attack. This study aims to obtain the best gibberellin concentration and scarification treatment for in vitro lime germination, as well as to determine the best endophyte bacterial isolates and optimal immersion time for HLB control. In the first stage of the research, seeds with and without scarification treatment were germinated on MS+VMW base medium with the addition of 0 mgL −1 , 5 mgL −1 , 10 mgL −1 , and 15 mgL −1 gibberellin. In the second stage, the shoots were cultured for 1, 2, and 3 days in 7 different endophyte bacterial suspensions and then infected with CLas bacteria, the pathogen of HLB. The results of this research indicate that the optimal concentration of gibberellin to induce lime germination is 5 mgL −1 . The scarification treatment significantly accelarated the germination time. Endophyte bacteria Micrococcus endophyticusshowed better results in reducing the symptoms of HLB infection than the endophyte bacteria Bacillus spp. The optimal duration of inoculation to reduce the symptoms of CLas infection was 3 days.
Keyword: Gibberellin, infection, inoculation, scarification

Judul: Citrus Plant Assembly Through Editing Genome as an Effort to Improve Huanglongbing Disease Resistance
Abstrak: DIAN PUJI RAHAYU. Perakitan Tanaman Jeruk Melalui Pengeditan Genom Sebagai Upaya Peningkatan Ketahanan Penyakit Huanglongbing. Dibimbing oleh AGUS PURWITO dan MIA KOSMIATIN Jeruk merupakan salah satu komoditi nasional yang memiliki potensi dan daya saing tinggi hal ini dikarenakan adanya kesadaran masyarakat akan kebutuhan jeruk sebagai sumber gizi. Upaya dalam peningkatan produksi jeruk memiliki berbagai kendala salah satunya yaitu ketidaktahanan tanaman jeruk terhadap serangan penyakit huanglongbing. Huanglongbing merupakan penyakit pada tanaman jeruk yang disebabkan oleh aktivitas bakteri Candidatus Liberibacter asiaticus (CLas) yang dibawa oleh serangga vektor berupa kutu loncat atau Asian Citrus Psyllid (ACP) yaitu Diaphorina citri Kuwayama. Adanya aktivitas bakteri Candidatus Liberibacter asiaticus (CLas) yang menginfeksi tanaman jeruk pada jaringan floem mengakibatkan akumulasi senyawa callose sehingga mengganggu perkembangan tanaman karena proses translokasi nutrisi ke bagian lain tanaman menjadi terganggu yang kemudian menimbulkan gejala penyakit huanglongbing seperti pucuk daun berbercak kuning, daun mengeras dan berukuran kecil. Hingga saat ini berbagai upaya untuk menanggulangi penyakit Huanglongbing masih belum efektif. Cara yang efektif untuk menanggulangi penyakit huanglongbing adalah menggunakan varietas yang tahan. Salah satu cara untuk mendapatkan tanaman yang tahan terhadap penyakit Huanglongbing yaitu dengan pendekatan bioteknologi melalui pengeditan genom. Pengeditan genom yang saat ini banyak digunakan yaitu dengan sistem CRISPR. CRISPR merupakan teknologi modern untuk pengeditan genom yang terdiri dari sekuens atau urutan nukleotida dengan repitisi pendek. Tujuan dari penelitian ini yaitu untuk memodifikasi gen callose synthase sehingga tidak terjadi akumulasi callose yang dihasilkan dari aktivitas bakteri Candidatus Liberibacter asiaticus (CLas) penyebab penyakit Huanglongbing melalui teknik transformasi gen CRISPR/Cas9-gRNA-CsCS ke dalam genom tanaman jeruk dengan bantuan bakteri Agrobacterium tumefaciens. Transformasi gen dilakukan pada 3 jenis eksplan yaitu embiro zigotik, embrio nuselar dan buku kotiledon yang berasal dari 4 jenis jeruk yang terdiri dari jeruk mandarin Ponkan, keprok Terigas, siam Banyuwangi dan fS89. Transformasi dilakukan pada konsentrasi Optical Density (OD600) sebesar 0,2 dan 0,02 dengan perendaman eksplan pada suspensi bakteri Agrobaterium tumefaciens yang telah membawa gen CRISPR/Cas9-gRNA-CsCS selama 20 menit kemudian dikokultivasi selama 3 hari pada kondisi ruang gelap lalu dilakukan seleksi pada media yang mengandung higromisin selanjutnya diregenerasikan pada beberapa komposisi media tanam untuk meregenerasikan eksplan. Eksplan yang beregenerasi kemudian dilakukan Shoot Tip Grafting dan diinokulasi bakteri Candidatus Liberibacter asiaticus (CLas) secara buatan. Hasil yang diperoleh dari penelitian ini yaitu optimasi pada konsentrasi vektor Agrobacterium tumefaciens pada Optical Density (OD600) 0,02 memiliki hasil tertinggi pada semua karakter pengamatan pada semua eksplan pada beberapa jenis jeruk sedangkan optimasi pada Optical Density (OD600) 0,2 memiliki nilai yang lebih rendah. Percepatan pertumbuhan putatif transforman asal eksplan buku kotiledon yang dilakukan pada 6 jenis media tanam (VMW, MT, MS+K0, MS+K1, MS+K2, MS+K3) menunjukkan bahwa tinggi tanaman dan jumlah daun tertinggi pada eksplan embrio nuselar diperoleh pada komposisi media tanam MS yang dikombinasikan dengan kinetin 3 mg/L. Nilai rata-rata tinggi tanaman dan jumlah daun tertinggi pada eksplan embrio zigotik terdapat pada komposisi media MT dan hasil rata-rata tinggi tanaman dan jumlah daun tertinggi pada eksplan buku kotiledon terdapat pada komposisi media tanam MS yang dikombinasikan dengan kinetin 2 dan 3 mg/L. Efisiensi transformasi tertinggi didapatkan pada jenis eksplan embrio nuselar sebesar 14,29%. Efisiensi regenerasi tertinggi terdapat pada jenis eksplan
Keyword: Transformasi, citrus, huanglongbing, in vitro

Judul: Pembangunan Perumahan Pada Wilayah Desakota Kaitannya Dengan Sistem Sosial Masyaraka t Asli
Abstrak: Faktor utama yang banyak mempengaruhi meningkatnya jumlah perumahan dan pemukiman pacta wilayah desakota adalah adanya tekanan populasi sebagai akibat dari migrasi besar-besaran menuju daerah desakota. Dengan kata lain, lokasi perumahan atau pemukiman menjadi tak memiliki banyak pilihan lagi, kota telah sesak dan sasaran selanjutnya para pengais materi di daerab kota adalab wilayah desakota. Masyarakat asli yang sejak lama tinggal di wilayah desakota merupakan bagian dari masyarakat desakota yang perlu diperhatikan. Baik disadari maupun tidak disadari, perubaban pada masyarakat asli desakota akan terjadi karena masyarakat selalu dalam keadaan dinamis. Selain itu perubahanjuga akan terjadi dikarenakan masyarakat adalah sistem yang terdiri dari bagian-bagian yang berhubungan serta berintegrasi secara fungsional, sehingga perubaban pada satu fungsi dari masyarakat akan mempengaruhi fungsi lainnya.
Keyword: