Judul: IPB (Bogor Agricultural University)
Abstrak: Resistansi bakteri terhadap antimikrob merupakan ancaman yang nyata terhadap kehidupan manusia dan hewan. Kegagalan pengobatan akibat infeksi mikrob patogen resistan diperkirakan pada tahun 2050 akan menyebabkan kematian hingga 10 juta manusia pertahun dengan kerugian ekonomi hingga 100 triliun USD. Penggunaan antimikrob pada hewan produksi dan lingkungan pemeliharaannya merupakan salah satu penyebab meningkatnya jumlah bakteri resistan antimikrob. Indonesia merupakan salah satu dari lima teratas negaranegara yang diperkirakan akan mengalami peningkatan penggunaan antimikrob di hewan produksi pada tahun 2030. Oleh sebab itu, Indonesia memegang peranan penting dalam pengendalian resistansi antimikrob di hewan produksi. Penggunaan kolistin sulfat di hewan produksi yang merupakan last drug choicedalam pengobatan infeksi bakteri gram negatif multiresistan di manusia saat ini menjadi kajian yang sangat menarik di dunia. Terutama sejak ditemukannya genmobilized colistin resistance-1 (mcr-1) yang dapat dipindahkan melalui plasmid. Perpindahan gen ini yang sangat mudah ke bakteri lain menyebabkan berbagai negara mulai mengurangi penggunaan kolistin sulfat di hewan produksi. Meskipun demikian, pelarangan penggunaan suatu antimikrob harus melalui kajian ilmiah agar hasilnya valid, yaitu dengan penilaian risiko. Tujuan penelitian ini adalah melakukan penilaian risiko secara kualitatif dan kajian mutant prevention concentration (MPC) kolistin sulfat terhadap timbulnya resistansi kolistin pada E. coli pada broiler. Penelitian dilaksanakan dari November 2016 sampai dengan November 2018. Penelitian dilakukan dengan membuat data primer dan menggunakan data sekunder. Data primer dilakukan dengan melakukan percobaan modelling rantai suplai broiler di laboratorium, pengambilan sampel di rantai suplai broiler dari kandang hingga produk jadi untuk mendapatkan prevalensi E. coli resistan kolistin serta gen mcr-1 dan mcr-2, uji serotipe E. coli O157:H7, kuisioner, wawancara ahli, transfer gen mcr-1 ke S. Enteritidis, sekuensing gen mcr-1, dan penelitian MPC. Pengumpulan data sekunder melalui kajian publikasi ilmiah, data yang tidak dipublikasikan, dan melalui wawancara ahli. Penilaian risiko dibuat dengan menggunakan data tersebut diatas dengan menggunakan penilaian risiko kualitatif. Hasil penelitian didapatkan bahwa E. coli resistan kolistin ditemukan di rantai suplai broiler dengan prevalensi sedang, yaitu 11.76% (CI 95%; CL 9.21- 14.91%), prevalensi gen mcr-1 10.55% (CI 95%; CL 8.13-13.57%), tidak ditemukannya gen mcr-2, dan prevalensi E. coli O157:H7 resistan kolistin adalah 0.41% (sangat rendah). Berdasarkan evaluasi MPC E. coli patogen, didapatkan rentang mutant selection window kolistin sulfat yang lebar. Hal ini menunjukkan bahwa pemberian kolistin sulfat dengan dosis yang direkomendasikan pada broiler dapat memacu adanya single step mutasi E. coli menjadi resistan terhadap kolistin. Transfer gen mcr-1 melalui konjugasi berhasil dilakukan dari donor E. coli resistan kolistin kode DI15ke resipien S.EnteritidisATCC 13076. Hasil kajian penilaian risiko penggunaan kolistin sulfat terhadap resistansi E. coli terhadap manusia terdiri atas empat alur kemungkinan pendedahan. Alur pertama adalah di kandang broiler dengan hasil penilaian risiko sedang dengan ketidakpastian rendah. Alur kedua adalah di rumah potong unggas skala kecil dengan keseluruhan hasil penilaian risiko rendah dengan ketidakpastian rendah. Alur ketiga adalah di pasar tradisional melalui daging broiler segar dengan hasil penilaian risiko sedang dengan ketidakpastian rendah. Alur terakhir melalui produk daging matang broiler dengan hasil penilaian risiko rendah dan ketidakpastian rendah. Secara keseluruhan apabila hasil penilaian risiko semua alur digabung maka didapatkan penilaian risiko tinggi dengan ketidakpastian rendah. Mengingat pentingnya kolistin sulfat pada manusia maka pengurangan penggunaan kolistin sulfat
Keyword: kolistin sulfat, resistansi, Escherichia coli, penilaian risiko, broiler

Judul: Kajian Resistensi Antibiotik dan Gen Penyandinya pada Escherichia coli Asal Peternakan di Bandung dan Purwakarta
Abstrak: Kasus infeksi oleh bakteri yang resisten terhadap antibiotika, menjadi masalah serius di dunia kesehatan, penggunaan antibiotika tidak dapat dilakukan untuk pengobatan penyakit. Penggunaan antibiotika di industri peternakan untuk terapi, penggunaan dosis sub terapi, dan growth promotor secara rutin tanpa memperhatikan aturan pemakaian berperan dalam perkembangan resistensi bakteri komensal dan patogen terhadap antibiotika. Tahun 2050, beberapa ahli memperkirakan infeksi akibat bakteri resisten terhadap antibiotika menyebabkan kematian hingga 10 juta jiwa per tahun dan biaya penanganan mencapai US$ 100 triliun. Sebagian besar kematian tersebut diakibatkan infeksi E. coli, Mycobacterium tuberculosis yang telah resisten terhadap antibiotika, dan malaria. Tujuan penelitian ini adalah mengisolasi dan mengidentifikasi E. coli, menguji resistensi antibiotika, dan mendeteksi gen penyandi resistensi bakteri E. coli asal peternakan ayam di Bandung dan Purwakarta. Sebanyak 57 sampel swab kloaka, litter, dan air minum dikoleksi secara acak dari 4 peternakan ayam layer dan breeder di Bandung dan Purwakarta. Penelitian dilakukan selama bulan Juni 2018 sampai Februari 2019. Isolasi dan identifikasi bakteri E. coli dengan menumbuhkan isolat E. coli ke media eosin metylen blue agar (EMBA), dilanjutkan dengan pewarnaan Gram, dan uji IMVIC, dan dikonfirmasi dengan identifikasi E. coli menggunakan polymerase chain reaction (PCR). Delapan belas biakan murni bakteri E. coli yang positif diuji sensitivitasnya menggunakan media agar Mueller-Hinton, metode disk diffusion menurut Kirby- Bouer. Disk antibiotika ampisilin, oksitetrasiklin, tetrasiklin, asam nalidiksid, gentamisin, dan kloramfenikol diposisikan di permukaan kultur bakteri, diinkubasi selama 24 jam pada suhu 35°C. Diameter zona terang disekeliling disk antibiotika yang terbentuk, diukur dalam satuan millimeter dan diinterpretasikan berdasarkan Clinical and Laboratory standards Institute guidelines (CLSI 2018). Isolat yang dikategorikan resisten dan intermediate terhadap antibiotika tersebut selanjutnya dideteksi gen penyandi resistensinya menggunakan polymerase chain reaction (PCR). Sebanyak 57 sampel yang diuji menunjukkan hasil positif 18 isolat E. coli. Hasil uji kepekaan antibiotik 18 isolat E. coli menunjukkan resistensi total 100% terhadap ampisilin, dan tingkat resistensi yang tingggi terhadap asam nalidiksit (94.4%), oksitetrasiklin (88.9%), tetrasiklin (88.9%), sedangkan resistensi terhadap gentamisin dan kloramfenikol masing-masing (22.2%), dan (11.1%). Sebagin besar isolat resisten terhadap 3-4 antibiotika dan hanya satu isolat resisten terhadap satu antibiotika. Frekuensi empat gen resisten pada penelitian ini diantaranya qnr(B) (94.4%), tet(A) (94.4%), ampC (77.8%), dan tet(B) (55.6%). Semua isolat E. coli mengandung 2-4 gen resistensi. Penelitian ini melaporkan resistensi antibiotik yang signifikan pada E. coli dari peternakan ayam di Bandung dan Purwakarta. Penelitian ini menggaris bawahi pentingnya pemantauan penggunaan antibiotik dan pengawasan ruitn resistensi antibiotik.
Keyword: antibiotika, ayam, E. coli, gen, multidrug resiste

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: