Judul: Virtual Screening of Flavonoid Compounds of Indonesian  Medicinal Plants as SARS-CoV-2 Spike Protein Inhibitors of Indonesian Patients
Abstrak: COVID-19 merupakan penyakit yang disebabkan oleh virus SARS-CoV-2. SARS-CoV-2 memiliki kemiripan dengan virus SARS-CoV dan MERS-CoV. Protein spike, terutama pada bagian receptor-binding domain (RBD) merupakan perantara utama pelekatan virus pada reseptor ACE2 sel inang. Senyawa flavonoid dari tanaman obat diduga berpotensi menghambat infeksi SARS-CoV-2. Penelitian ini bertujuan menapis 308 senyawa flavonoid tanaman obat dari data bank molekul virtual yang memiliki potensi terbaik dalam menginhibisi RBD-Spike (EPI_ISL_576383) menggunakan metode virtual screening melalui analisis energi pengikatan (∆G), konstanta inhibisi (Ki), dan interaksi yang terbentuk berdasarkan farmakokinetik dan toksisitas. Diperoleh 3 senyawa terbaik dalam menginhibisi RBD-Spike yang diprediksi dapat menjadi obat COVID-19. Sophoraisoflavone A, catechin 3-gallate, dan 6,8-diprenylgenistein dapat menghambat RBD-Spike dengan berikatan pada residu asam amino yang menjadi kunci residu RBD-Spike. Sophoraisoflavone A memiliki ∆G -6.8 kkal/mol dengan Ki 10.23 µM, 6,8- diprenylgenistein memiliki ∆G -6.7 kkal/mol dengan Ki 12.11 µM, serta catechin 3-gallate memiliki ∆G -6.6 kkal/mol dengan Ki 14.34 µM., COVID-19 is a disease that cause by SARS-CoV-2. SARS-CoV-2 has similatities with the SARS-CoV and MERS-CoV. Spike protein, especially in the receptor-binding domain (RBD) mediates virus entry into host cells by binding to ACE2. Flavonoid compounds from medicinal plants were predicted to have the potential to inhibit SARS-CoV-2 infection. This research aims to screen 308 flavonoid compounds of medicinal plants from virtual molecule data banks that have the best potency as RBD-Spike (EPI_ISL_576383) inhibitor using virtual screening method through analysis of binding energy (∆G), inhibition constant (Ki), and interaction formed on the basis of pharmacokinetics and toxicity. There were 3 best compounds to inhibit RBD-Spike which were predicted as COVID-19 drugs. Sophoraisoflavone A, catechin 3-gallate, and 6,8-diprenylgenistein had the ability to inhibit RBD-Spike by binding to amino acid residues that were key residues of RBD-Spike. Sophoraisoflavone A had ∆G -6.8 kcal/mol with Ki 10.23 µM, 6,8- diprenylgenistein had ∆G -6.7 kcal/mol with Ki 12.11 µM, and catechin 3-gallate had ∆G -6.6 kcal/mol with Ki 14.34 µM.
Keyword: flavonoid, protein spike, RBD-Spike, SARS-CoV-2, virtual screening

Judul: In Silico Analysis of Flavonoid Compounds of Bay Leaf (Syzygium polyanthum) in inhibiting 3C-Like Protease SARS-CoV-2
Abstrak: Daun salam (Syzygium polyanthum) diidentifikasi memiliki senyawa aktif flavonoid. Flavonoid dilaporkan memiliki aktivitas antivirus. SARS-CoV-2 merupakan virus dari penyakit COVID-19. Virus ini dapat ditularkan dari manusia ke manusia. SARS-CoV-2 memiliki beberapa komponen penting salah satunya yaitu 3C-Like Protease. 3C-Like Protease berperan penting terhadap replikasi coronavirus. Penelitian ini bertujuan mempelajari interaksi antara senyawa flavonoid Daun salam (Syzygium polyanthum) dalam menghambat 3C-like Protease SARS-CoV-2 melalui uji in silico menggunakan teknik penapisan virtual serta memprediksi kemampuannya untuk dijadikan sediaan obat oral dengan memprediksi sifat bioavailabilitas dan toksisitasnya. Potensi terbaik terlihat pada Quercitrin dan Myricitrin dengan masing-masing ΔG -8.926 kkal/mol dan -8.858 kkal/mol. Dua senyawa tersebut memiliki berbagai interaksi ikatan hidrogen dan hidrofobik terhadap asam amino pada reseptor, serta diprediksi memiliki bioavailabilitas yang cukup baik dan tidak bersifat toksik, sehingga dapat menjadi kandidat inhibitor potensial enzim 3C-like Protease SARS-CoV-2 untuk dijadikan sediaan obat oral dalam menangani pandemik COVID-19., Bay leaf (Syzygium polyanthum) has been identified to have active flavonoid compounds. Flavonoids are reported to have antiviral activity. SARSCoV-2 is a virus from the COVID-19 disease. This virus can be transmitted from human to human. SARS-CoV-2 has several important components, one of which is 3C-Like Protease. 3C-Like Protease plays an important role in coronavirus replication. This research aims to study the interaction of flavonoid compounds in bay leaf (Syzygium polyanthum) in inhibiting the 3C-like Protease SARS-CoV-2 through in silico analysis using virtual screening techniques and predicting its ability to be used as an oral drug candidate by predicting its bioavailability and toxicity. The best potency was found in Quercitrin and Myricitrin with ΔG value of -8,926 kcal/mol and -8,858 kcal/mol, respectively. The two compounds have various hydrogen bondings and hydrophobic interactions with the amino acid residues of the receptor and are predicted to have good bioavailability and non-toxic properties so that they become potential inhibitors of 3C-Like Protease of SARSCoV-2 as oral drug candidate in dealing with the COVID-19 pandemic
Keyword: bay leaf, 3C-Like Protease, flavonoid, SARS-CoV-2

Judul: Rancang Bangun Mekanisme Penggetar Untuk Bajak Subsoil Getar Dengan Dua Bilah Bajak
Abstrak: Bajak subsoil merupakan alat pengolahan tanah pertama yang sering digunakan sebelum pembajakan dengan bajak singkal atau bajak piring untuk memecah lapisan keras di lapisan bawah. Alat ini biasanya digunakan pada tanah yang telah mengalamli pemadatan akibat lalu lintas traktor. Alat ini memiliki tahanan tarik yang tinggi dan biasa ditarik traktor empat roda
Keyword: