Judul: Kajian Habitat dan Populasi Badak sumatera di Kapi, Kawasan Ekosistem Leuser Propinsi Aceh
Abstrak: Badak sumatera mengalami penurunan populasi lebih dari 50% dalam dua dekade belakangan ini dengan populasi tersisa hanya kurang dari 200 individu di seluruh dunia. Perburuan, perubahan fungsi habitat menjadi bukan hutan serta gangguan aktivitas manusia merupakan faktor yang mempengaruhi penurunan populasi tersebut. Tujuan penelitian ini untuk mengetahui ukuran populasi Badak sumatera yang ada di Kappi, kualitas habitat serta faktor-faktor yang mempengaruhi populasi di lokasi penelitian. Penelitian ini dilaksanakan di dataran tinggi Kapi yang berada di dalam Kawasan Ekosistem Leuser di Kabupaten Gayo Lues Propinsi Aceh selama satu tahun sejak bulan Agustus 2012 sampai bulan Agustus 2013. Metode yang digunakan dalam pengambilan data berupa observasi langsung dengan Patch Occupancy dan identifikasi jejak serta wawancara dengan masyarakat. Lokasi penelitian dibagi ke dalam 72 grid berukuran 4 x 4 km atau seluas 1600 hektar yang dijelajahi sejauh 8 Km setiap gridnya dan mengumpulkan setiap temuan badak sumatera serta temuan lainnya yang relevan berupa kondisi fisik dan biologis dan gangguan manusia. Wawancara dilakukan kepada orang-orang yang pernah melakukan perburuan Badak sumatera di Kapi. Penelitian ini berhasil mendapatkan 23 temuan badak sumatera yang terdiri dari 14 jejak, 4 kubangan, 2 gesekan cula, 1 kaisan kaki dan 2 sisa pakan. Temuan Badak sumatera menyebar di 14 dari 72 grid yang disurvey atau nilai naive occupancy sebesar 0,194 atau badak menyebar di 19,4% wilayah survey. Dari hasil penelitian ini diperkirakan badak di Kapi berkisar 8 – 14 individu. Kapi juga merupakan habitat yang ideal bagi Badak sumatera karena habitat yang kaya baik sumber pakan, air, mineral serta didukung oleh topografi, kelerengan dan ketinggian yang sesuai. Diduga pembangunan jalan, aktivitas manusia dan perburuan telah menyebabkan populasi Badak sumatera berkurang drastis. Sejak tahun 1964 hingga tahun 1993, paling sedikit 50 individu badak telah diburu di Kapi.
Keyword: Badak sumatera Populasi, Kawasan Ekosistem Leuser

Judul: Studi potensi habitat badak sumatera (Dicerorhinus sumatrensis Fischer 1814) di areal pengembangan Suaka Rhino Sumatera Taman Nasional Way Kambas, Lampung
Abstrak: Indonesia memiliki 2 dari 5 spesies badak yang ada di dunia, salah satunya adalah badak sumatera (Dicerorhinus sumatrensis), Diperkirakan jumlah badak sumatera sekitar 500 ekor pada 10 tahun yang lalu, namun saat ini populasinya diduga berkurang sampai setengahnya. Hal lain yang memprihatinkan adalah koleksi badak sumatera di kebun binatang sama sekali tidak bereproduksi. Hal yang lebih memperihatinkan lagi adalah sampai saat ini 72,2% koleksi beberapa kebun binatang seperti kebun binatang Ragunan, kebun binatang Surabaya, Taman Safari, serta kebun binatang di Amerika dan Inggris mati karena beberapa sebab, di antaranya karena faktor gangguan pencernaan (44%) dan gangguan ginjal (11%) (Mitra Rhino, 2001). Di Taman Nasional Way Kambas yang semula diduga keberadaan badak sumatera telah punah, namun sekitar tahun 1993 dapat dipastikan melalui jejak yang ditemukan bahwa badak sumatera masih ada. Diperkirakan populasinya di Taman Nasional Way Kambas sekitar 15-24 ekor (STP 1998 dalam Sadjudin 1999). Oleh karena populasi tersebut tergolong kecil, untuk menyelamatkan keberadaan badak sumatera diperlukan upaya konservasi yang menyeluruh. Salah satu kegiatan dari konservasi badak sumatera adalah pembinaan habitat badak dengan pengumpulan data tentang potensi habitat sebagai langkah awalnya Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui potensi habitat badak sumatera dan peranan komponen-komponen habitat seperti komposisi dan struktur vegetasi, sumber-sumber air serta kubangan bagi badak sumatera di areal pengembangan Suaka Rhino Way Kambas. Hasil penelitian ini diharapkan dapat digunakan sebagai bahan pertimbangan dalam konservasi badak sumatera khususnya dalam pengelolaan habitat badak sumatera. Hipotesis dari penelitian ini adalah areal pengembangan Suaka Rhino Sumatera merupakan habitat badak sumatera dan saat ini masih dapat digunakan sebagai habitat badak sumatera berdasarkan pembandingan dengan habitat badak sumatera di daerah lainnya. Lokasi penelitian di areal pengembangan Suaka Rhino Sumatera Way Kambas termasuk ke dalam wilayah kabupaten Lampung Timur dan merupakan areal hutan hujan tropis dataran rendah dengan komposisi tumbuhan yang heterogen. Dalam areal penelitian juga terdapat beberapa rawa rawa yang berhubungan melalui aliran air dan menurut Sukotjo (1999) kawasan ini memiliki ketinggian 0-60 mdpl. Suhu rata-rata perbulan berkisar antara 23° C. Penelitian dilakukan dalam bulan Juli dan Agustus 2001. Pengumpulan data vegetasi dilakukan dengan metode jalur berpetak, sedangkan pengumpulan data tentang kubangan dan sumber air dilakukan dengan cara survey ke daerah rawa-rawa. Berdasarkan hasil analisis vegetasi yang dilakukan dalam 48 plot pengamatan, ditemukan sebanyak 115 jenis tumbuhan yang tergabung dalam 29 famili, yaitu 83 jenis tumbuhan berkayu dan 32 jenis tumbuhan bawah. Tumbuhan berkayu dari tingkat semai mempunyai jumlah jenis paling banyak, yaitu 58 jenis (645 pohon), diikuti dengan pancang 56 jenis (612 pohon), pohon 50 jenis (384 pohon) dan tiang 38 jenis (125 pohon). Famili yang paling dominan adalah Euphorbiaceae (12 jenis) dan yang paling jarang antara lain adalah Fabaceae, Liliaceae, Lythraceae, Theaceae, Verbenaceae, Zingiberaceae serta Elaeocarpaceae masing-masing ditemukan 1 jenis. Pohon yang ditemukan mendominasi pada areal ini (nilai INP di atas 10%) berjumlah 8 jenis (16%), antara lain adalah puyung (Shorea parvifolia) dengan nilai Indeks Nilai Penting sebesar 42.40 %, diikuti dengan meranti (Shorea sp., INP 32.74%). Kedua jenis tersebut tersebar merata di seluruh areal dan kerapatannya cukup tinggi. Indeks Keanekaragaman Shannon untuk tingkat pohon adalah sebesar 3.27, artinya untuk tingkat pohon di lokasi penelitian tingkat
Keyword: 

Judul: Kloning dan Ekspresi Human Interferon-alfa2a pada Yeast Metilotropik Pichia pastoris
Abstrak: Interferon (IFN) is a group of proteins that are secreted by body cells as a result of exposure to biological vertebrates such as: viruses, bacteria, protozoa and other compounds. There are three types of interferon, namely: alpha (α), beta (β) and gamma (γ) IFN. Interferon-α2a belongs to the type I interferon. This protein has a molecular weight of 21.550 kDa and consists of 188 amino acids (23 amino acid of signal peptide and 166 amino acids of mature protein). Interferon-α2a is also known to be used for the treatment of hepatitis C and as anti-tumor and antivirus agents. Regulator gene for IFN production under normal conditions, is in the off position to IFN is not produced. But when there are external stimuli, both viral and bacterial infections, a regulator gene switches on, and IFN production system running. At the time of an attack from a variety of disease agents actually the body will produce IFN, but generally the amount produced is not sufficient to fight the disease agents that multiply very quickly. Therefore IFN intake from outside is needed. This is the beginning of the use of IFN as a drug. Genetic engineering is an activity to manipulate the genes to get new products by creating recombinant DNA through gene insertion. Recombinant DNA technology has been used to produce IFN. Yeast such as Pichia pastoris can be an alternative as the host (system) to express human interferon genes and as a producer of IFN protein. Expression system P. pastoris offers several advantages for the production of recombinant proteins, such as: the high level expression of recombinant proteins, ease of scaling-up fermenter, low cost and ease of transformation techniques and selection of transformed cells such as bacteria . The existence of inducible AOX1 promoter is very strong, easily control the expression of recombinant proteins by induction. AOX1 is a promoter that controls gene expression of alcohol oxidase to metabolize methanol as carbon source of P. pastoris. Therefore,this study aimed to clone human interefron-α2a (hifnα2a) gene in E. coli and express it in metylotrophic yeast P. pastoris. Vector used in this study is pPICZαB (Invitrogen). Ligation process between insert (hifn-α2a gene) and vector (pPICZαB) performed by using T4 DNA ligase, which functions synthesize the formation of phosphodiester bonds linking the nucleotides with nucleotide insert plasmid vectors to produce recombinant (pPICZαB-hifnα2a). This recombinant plasmid transformed into XL1 blue cells (E. coli) by Heat shock method. The results of sequencing analysis (clone 6) using 5'AOX and 3'AOX primers indicate that DNA base sequence of human IFN-α2a genes has been subclone into pPICZαB vector (in frame). Recombinant plasmid (clone 6) linearized using BstX1 enzyme before transformed into X33 yeast cell. Transformation into cell was done by Electroporation. The X33 cell P. pastoris strain was used to express human interferon-α2a. X33 is strains with the phenotype Mut+ (methanol utilization plus) and can be used for positive transformants selection using zeocin. Phase protein production work using Mut+ strain occurred in two phases. The first phase is the use of glycerol to obtain a certain amount of biomass (high cell
Keyword: