Judul: Deteksi Dan Identifikasi Nematoda Parasit Pada Tanaman Wortel (Daucus Carota L.) Asal Dataran Tinggi Malino, Gowa, Sulawesi Selatan
Abstrak: Kabupaten Gowa merupakan salah satu sentra penghasil wortel di Sulawesi Selatan. Salah satu kendala produksi wortel di Indonesia termasuk yang dihadapi petani-petani di Kabupaten Gowa ialah penyakit umbi bercabang. Genus nematoda parasit utama yang dapat menyebabkan kerusakan pada tanaman wortel di daerah tropis, yaitu Meloidogyne, Pratylenchus, Rotylenchulus, Longidorus, dan Xiphinema. Beberapa penelitian terdahulu berhasil mengidentifikasi 4 spesies Meloidogyne yang menginfeksi tanaman wortel di beberapa sentra produksi wortel di Pulau Jawa yaitu M. incognita, M. hapla, M. javanica, dan M. arenaria. Gejala malformasi umbi berupa puru, umbi bercabang, dan lesio ditemukan pada umbi wortel di daerah Malino. Penyebab umbi bercabang pada tanaman wortel di dataran tinggi Malino di Kabupaten Gowa sampai saat ini belum diketahui. Oleh karena itu, perlu dilakukan kajian untuk mengidentifikasi penyebab penyakit umbi bercabang di dataran tinggi Malino. Penelitian ini bertujuan mengetahui beberapa genus nematoda parasit yang berasosiasi dengan tanaman wortel dengan tahapan: a) deteksi keberadaan nematoda pada jaringan akar, b) identifikasi morfologi berdasarkan karakter morfometrik dan karakter pola perennial masing-masing untuk mengetahui genus dan spesies nematoda utama yang berasosiasi dengan wortel di Malino, c) identifikasi molekuler untuk mempelajari tingkat kekerabatannya dengan isolat koleksi pada GenBank. Hasil penelitian menunjukkan bahwa (a) Meloidogyne spp. memperlihatkan stadia perkembangan mulai dari telur, juvenil 1, 2, 3, dan 4, sampai dewasa melalui teknik pewarnaan nematoda pada jaringan akar; (b) tiga genus nematoda parasit, yaitu Meloidogyne, Rotylenchulus, dan Pratylenchus berhasil diidentifikasi berdasarkan karakter morfometrik. Tiga spesies nematoda parasit utama dari genus Meloidogyne yaitu M. incognita, M. arenaria, dan M. javanica berhasil diidentifikasi berdasarkan karakter pola perineal; (c) identifikasi secara molekuler dengan teknik PCR menggunakan primer spesifik berhasil mengamplifikasi pita DNA M. incognita, M. arenaria, dan M. javanica dengan ukuran berturut-turut ± 999 pb, ± 420 pb, dan ± 450 pb sedangkan PCR dengan primer multipleks tidak berhasil mengamplifikasi pita DNA. Analisis runutan nukleotida menunjukkan isolat M. incognita asal Malino-Indonesia memiliki kekerabatan yang dekat dengan isolat asal Bangka-Indonesia, Cina, dan Malaysia dengan nilai homologi berkisar 99.2% - 100%. M. javanica memiliki hubungan yang sangat dekat isolat asal Cina, Brazil, India, Iran, Amerika, dan Spanyol dengan nilai homologi berkisar 98.1% - 99.2%. Runutan nukleotida M. arenaria asal Malino-Indonesia telah didaftarkan pada GenBank dengan nomor aksesi KP234264. Runutan ini menjadi data pertama yang tersedia di GenBank.
Keyword: Meloidogyne, Pratylenchus, Rotylenchulus, umbi bercabang

Judul: Identifikasi Spesies Meloidogyne spp. Penyebab Umbi Bercabang pada Tanaman Wortel (Daucus carota L.) di Jawa Timur
Abstrak: Umbi bercabang merupakan penyakit baru dalam budidaya tanaman wortel di Indonesia dan telah menimbulkan kerugian yang besar bagi petani. Pada tahun 2010, beberapa spesies nematoda puru akar (NPA), Meloidogyne spp., dilaporkan sebagai penyebab utama penyakit umbi bercabang pada wortel di wilayah Agropolitan - Cianjur, Jawa Barat. Kerugian yang ditimbulkan berkisar antara 15% - 95%. Gejala umbi bercabang juga telah dilaporkan pada salah satu sentra produksi sayuran di Jawa Timur, yaitu di wilayah Desa Sumber Brantas, Kecamatan Bumiaji, Kota Batu. Penelitian bertujuan mengidentifikasi spesies Meloidogyne spp. pada umbi wortel bercabang dan mengetahui prevalensi sebaran Meloidogyne spp. berdasarkan ketinggian tempat. Penelitian dilaksanakan pada pertanaman wortel di wilayah Kota Batu serta Laboratorium Nematologi Tumbuhan dan Laboratorium Virologi Tumbuhan, Institut Pertanian Bogor dari bulan Mei hingga November 2011. Penelitian terdiri dari dua kegiatan yaitu survei dan identifikasi. Survei dilakukan di Desa Sumber Brantas, Kecamatan Bumiaji, Kota Batu pada tiga ketinggian/elevasi, yaitu 1600 m, 1700 m, dan 1800 m di atas permukaan laut (dpl). Identifikasi dilakukan dengan pengamatan ciri morfologi pola perineal (sidik pantat) nematoda betina dan identifikasi PCR ITS r-DNA. Identifikasi sidik pantat nematoda dilakukan terhadap 150 ekor betina dewasa, 50 ekor mewakili setiap ketinggian. Identifikasi PCR ITS r-DNA menggunakan primer multipleks untuk mengidentifikasi campuran spesies M. hapla, M. fallax, dan M. chitwoodi, serta 3 primer spesifik untuk mengidentifikasi spesies M. arenaria, M. incognita, dan M. javanica. Berdasarkan identifikasi pola sidik pantat diketahui empat spesies Meloidogyne spp., antara lain M. arenaria, M. hapla, M. incognita, dan M. javanica. Data tersebut diperkuat dengan hasil identifikasi PCR ITS r-DNA. Data hasil PCR menunjukkan hasil yang positif terhadap keberadaan keempat spesies tersebut
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: