Judul: Identification and Molecular Characterization of Simian Endogenous Retrovirus in Macaca fascicularis and Macaca nemestrina in Captive Facilities in Bogor
Abstrak: Macaca fascicularis (monyet ekor panjang, MEP) dan M. nemestrina (beruk) merupakan satwa primata endemik Indonesia yang digunakan sebagai hewan model dalam penelitian biomedis untuk menunjang kesehatan manusia, salah satunya pada penelitian pengembangan vaksin Human immunodeficiency virus (HIV). Vaksin konvensional HIV yang telah dikembangkan saat ini tidak efektif akibat tingginya keragaman retrovirus eksogen. Studi terbaru telah dilakukan pendekatan pengembangan jenis vaksin HIV dengan memanfaatkan Human endogenous retrovirus (HERV). HERV juga diketahui menginduksi respon kekebalan, sehingga memungkinkan untuk dilakukan pengembangan terapi terhadap HERV untuk pencegahan kanker. Retrovirus endogen juga ditemukan pada satwa primata salah satunya yaitu Simian endogenous retrovirus (SERV), sehingga retrovirus endogen pada satwa primata ini diharapkan dapat mendukung dalam penelitian vaksin HIV maupun terapi anti-kanker pada manusia. Penelitian dasar berupa identifikasi dan karakterisasi molekuler terhadap retrovirus endogen pada satwa primata Indonesia yang terdeteksi pada sampel MEP dan beruk perlu dilakukan. Penelitian memanfaatkan 131 sampel darah utuh asal MEP dan 58 sampel asal beruk dikoleksi dari Fasilitas Penangkaran Wanara Satwa Loka (WSL) dan PSSP-LPPM IPB di Bogor. Amplifikasi PCR pada sampel DNA dilakukan dengan teknik real-time PCR SYBR Green menggunakan primer spesifik SRV1-5 7585U19 dan SRV1-5 7695L21. Analisis hasil amplifikasi didasarkan pada profil nilai cycle threshold (Ct) <24,0 dan nilai kurva leleh (melt curve) pada suhu kisaran 80,0-82,0ºC. Runutan nukleotida genom utuh dilakukan dengan teknik sekuensing asam nukleat menggunakan metode primer walking dan dianalisis dengan metode bioinformatik yaitu 4peaks, clustalW dan BLAST (NCBI). Pohon filogenetik dikonstruksi dengan metode neighbor-joining menggunakan program MEGA X. Berdasarkan uji tapis dengan teknik real-time PCR SYBR Green, diperoleh dua sampel yang memiliki karakeristik SERV yaitu Mn B1 dan Mn B140910 dengan nilai Tm 82,0ºC dan nilai Ct 22,37-22,54. Analisis runutan genom utuh terhadap dua sampel SERV tersebut diperoleh hasil yang identik dengan total 7991 nukelotida yang disusun atas domain LTR, gag, prt, pol, dan env. Kedua sampel ini memiliki kemiripan (identity) nukleotida 99-100% dengan isolat sampel beruk Mn 92227 asal Indonesia yang berada di Pusat Primata Nasional Universitas Washington (NaPRC UW) sejak tahun 1998 yang terkonfirmasi sebagai novel SERV. Gambaran hasil pohon filogenetik menunjukkan sampel Mn B1 dan Mn B140910 pada genom utuh nukleotida dan asam amino env mengelompok bersama SRV-2 dengan identitas nilai 82% dan 79%, sementara itu asam amino Gag, Prt, dan Pol mengelompok bersama SRV-1, -3, -4, -5, dan -8 dengan identitas 82-88%. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa kedua sampel yang diperoleh merupakan novel SERV asal beruk. Data genetik SERV pada beruk asal Indonesia ini dapat menjadi penelitian dasar dan pertimbangan penggunaan satwa primata sebagai model in vivo yang dapat menunjang perkembangan vaksin HIV dan terapi anti-kanker pada manusia., Macaca fascicularis (long-tailed macaque, MEP) and M. nemestrina (pig-tailed macaque, beruk) are non-human primates commonly used as laboratory animals in biomedical research to support the human health, among others are the in vivo testing for the development of HIV-1 vaccine. Recent studies have explored approaches to HIV vaccine by utilizing Human endogenous retrovirus (HERV) due to the hypervariability of exogenous retroviruses which causes conventional vaccines to be ineffective. HERV is also known induces an immune response, so it is possible to develop therapies against HERV for
Keyword: HIV, M. fascicularis, M. nemestrina, retrovirus, SERV

Judul: Isolasi dan Karakterisasi Gen pol Simian Retrovirus (SRV) asal Macaca fascicularis dan Macaca nemestrina Isolat Indonesia.
Abstrak: Jumlah penderita HIV AIDS di Indonesia meningkat dari tahun ke tahun. Penelitian pengembangan obat antiviral mutlak diperlukan. Untuk itu, perlu dikembangkan model virus yang memiliki karakteristik mirip dengan HIV mengingat penggunaan virus HIV sebagai virus model memiliki resiko keamanan yang lebih tinggi. Penelitian ini merupakan langkah awal untuk pengembangan virus model HIV dari Simian retrovirus (SRV) isolat Indonesia berdasarkan karakter-karakter spesifiknya. Tujuan penelitian ini adalah melakukan isolasi dan identifikasi gen pol Simian Retrovirus (SRV) isolat Indonesia asal Macaca fascicularis dan Macaca nemestrina yang selanjutnya dapat dikarakterisasi urutan nukleotidanya, dianalisis kekerabatannya, urutan asam aminonya, conserve domainnya, dan pemodelan struktur tiga dimensinya menggunakan analisis bioinformatika. Isolasi dilakukan dengan teknik PCR menggunakan sepasang primer 3284U dan 4925L. Amplifikasi gen pol dengan teknik PCR menghasilkan pita spesifik yang masing-masing berukuran sekitar 1600 bp. Hasil analisis sekuens DNA menunjukkan bahwa virus yang terdapat di dalam sampel Macaca fascicularis adalah SRV 2 sedangkan virus yang terdapat di dalam sampel Macaca nemestrina adalah Simian endogenous retrovirus. Oleh karena itu, virus SRV asal Macaca nemestrina tidak bisa dilakukan pemodelan struktur tiga dimensinya. Hasil isolasi dan permodelan struktur protein gen penyandi reverse transkriptase dan RNase-H SRV 2 asal Macaca fascicularis Indonesia telah berhasil dilakukan. Sisi aktif dari kedua enzim tersebut juga telah berhasil diidentifikasi dan ditentukan urutan asam aminonya. Sisi aktif dari RNase-H terdiri atas tiga asam amino dan reverse transkriptase terdiri atas 27 asam amino. Hubungan kekerabatan enzim dari SRV-2 isolat Indonesia menunjukkan bahwa enzim reverse transkriptase dan RNase-H isolat Indonesia dapat digunakan sebagai model untuk mempelajari enzim dari retrovirus lainnya.
Keyword: 

Judul: Pembuatan dan Karakterisasi Lapisan Tipis Copper oxide (CuO) Sebagai Sensor Gas
Abstrak: Lapisan tipis Copper Oxide (CuO) adalah bahan scmikonduktor yang memiliki sirat sangat scnsitif tcrhadap gas. mcngingat bahan tcrscbut sangat mud-ah mcngabsorpsi gas. DCllgan absorpsi gas ini akan l11crubah resistivitas lapisan tipis tersebut. Dalmn pcmbuatan.lapisan (ipis ini, lllclodc yang digunakan adalah metodc Dcposisi Fasa Cair (Liquid Phase Deposition) yaitu dengan mencmnpurkan 100 ml larutan Copper Sulphal (CuSO, 1I2H,O) 1M dengan 50 ml ammonium 25 %, Kemudian dicuplik 6ml dan dimasukkan ke dalam wadall yang telah terisi aquades 60 ml dan substrat pada dindingnya, kemudian diaduk dengan slirier dan dipanasi pada suhu 75°C selama 1 jam, Pendeposisian ini dilakukan sebanyak 4 kali. Hasil karakterisasi XRD memperlihatkan puncak-puncak CuO yaitu berada pada 28 = 35,306; 38,502; 61.475; 65,538 dengan masing-masing d = 2,5400: 2,3362: 1.5071; 1.4231.
Keyword: