Judul: Peningkatan Kerentanan Tanaman Kopi terhadap Penyakit Kanker Batang akibat Aplikasi Glifosat
Abstrak: Kopi (Coffea sp.) merupakan salah satu tanaman perkebunan yang memiliki nilai ekonomi tinggi. Produktivitas tanaman kopi dipengaruhi oleh banyak faktor salah satunya hama dan penyakit. Penyakit kanker batang yang disebabkan oleh Fusarium solani merupakan salah satu penyakit penting pada tanaman kopi. Survei lapangan yang telah dilakukan sebelumnya memperlihatkan bahwa terdapat kaitan antara penyakit kanker batang dengan aplikasi glifosat. Beberapa penelitian menunjukkan bahwa penggunaan herbisida glifosat dapat meningkatkan kerentanan penyakit tanaman, tetapi pengaruhnya terhadap patosistem kanker batang kopi belum diteliti. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh penggunaan herbisida glifosat terhadap penyakit kanker batang kopi dan mekanisme fisiologi yang mendasarinya. Penelitian dilaksanakan di Laboratorium Klinik Tanaman, Departemen Proteksi Tanaman, Rumah Kaca Departemen Proteksi Tanaman IPB, Laboratorium Biorin PAU IPB dan Laboratorium Pengujian Pusat Penelitian Bioteknologi dan Bioindustri Indonesia (LB-PPBBI) dari bulan Agustus 2017 sampai bulan November 2018. Penelitian dilakukan secara in vitro dan in planta dengan perlakuan glifosat (0 , 4, 8 dan 16 ml l-l). Aplikasi glifosat dilakukan dengan cara menyemprotkan glifosat di sekitar perakaran bibit tanaman kopi yang berumur 1 tahun. Tanaman kopi tersebut kemudian diinokulasi F. solani dengan teknik penempelan pada batang. Percobaan terpisah dilakukan pada tanaman tanpa inokulasi patogen dengan mengukur pigmen fotosintesis (klorofil dan karotenoid), laju fotosintesis, konduktansi stomata, konsentrasi CO2 intraseluler dan transpirasi. Untuk melihat respons tanaman kopi terhadap cekaman oksidatif dilakukan pengukuran terhadap peroksidasi lipid, aktivitas enzim askorbat peroksidase (APX) dan aktivitas enzim katalase (CAT). Percobaan in vitro dilakukan dengan mengukur pertumbuhan koloni cendawan F. solani dengan perlakuan glifosat. Kanker batang pada tanaman kopi yang diinokulasi diukur panjang, lebar dan kedalaman lukanya. Pengujian in vitro menunjukkan bahwa glifosat bersifat antifungal terhadap F.solani. Glifosat dengan konsentrasi 16 ml l-1 menghambat pertumbuhan F.solani sebesar 100%. Pengujian in planta menunjukkan glifosat mampu meningkatkan kerentanan tanaman kopi terhadap penyakit kanker batang, ditunjukkan oleh meningkatnya kedalaman luka kanker. Perlakuan glifosat menurunkan nilai total klorofil, klorofil a, klorofil b dan karoten pada 12 HSP. Perlakuan glifosat pada semua konsentrasi pengujian menurunkan laju fotosintesis dan menaikkan konsentrasi CO2 intraseluler, tetapi tidak berpengaruh nyata terhadap konduktansi stomata dan laju transpirasi tanaman. Perlakuan glifosat pada tanaman menyebabkan cekaman oksidatif yang ditunjukkan dengan peningkatan peroksidasi lipid membran sel tanaman. MDA merupakan produk dari peroksidasi lipid yang mengekspresikan tanaman dalam keadaan tercekam. Penelitian ini menunjukkan kandungan MDA tanaman kopi meningkat seiring dengan peningkatan konsentrasi glifosat. Respons tanaman kopi dalam pengilangan ROS (Reactive Oxygen Species) atau cekaman oksidatif adalah peningkatan aktivitas enzim APX dan CAT. Penelitian ini menunjukkan aktivitas enzim APX dan CAT mengalami peningkatan setelah aplikasi glifosat. Secara keseluruhan perlakuan glifosat membuat tanaman kopi lebih rentan terhadap infeksi patogen. Peningkatan kerentanan tanaman tersebut disebabkan penurunan laju fotosintesis, peningkatan konsentrasi CO2 intraseluler dan cekaman oksidatif.
Keyword: Fusarium solani, herbisida, perubahan fisiologi, cekaman oksidatif

Judul: Potensi Bakteri Endofit Asal Tanaman Kopi Untuk Pengendalian Nematoda Luka Akar Pratylenchus Coffeae (Zimmermann) Filipjev & Schuurmans Stekhoven Dan Pemacu Pertumbuhan Tanaman
Abstrak: Kopi merupakan tanaman perkebunan yang memiliki potensi ekspor yang cukup tinggi. Sebelum abad 19, Indonesia merupakan negara penghasil kopi terbesar di dunia setelah Brazil, namun saat ini produksi terus menurun dan telah tergeser oleh negara lain. Salah satu faktor penyebabnya adalah serangan nematoda luka akar Pratylenchus coffeae. Penurunan produksi akibat nematoda tersebut mencapai 28.7-78.4% pada kopi Robusta dan pada kopi Arabika, tanaman hanya dapat bertahan selama dua tahun. Upaya pengendalian terhadap P. coffeae telah dilakukan di antaranya secara kultur teknis, penggunaan bahan tanam tahan, kimiawi dan pengendalian biologis. Salah satu teknik pengendalian biologi adalah dengan pemanfaatan bakteri endofit. Penelitian mengenai eksplorasi dan penggunaan bakteri endofit pada tanaman kopi sebagai agens pengendali nematoda P. coffeae belum banyak dilakukan. Penelitian bertujuan memperoleh isolat tunggal maupun konsorsium bakteri endofit asal tanaman kopi yang efektif untuk mengendalikan nematoda luka akar P. coffeae dan memacu pertumbuhan tanaman. Ruang lingkup penelitian meliputi: 1) isolasi bakteri endofit dari bagian akar, batang dan daun sehat tanaman kopi untuk memperoleh isolat tunggal dan konsorsium; 2) penapisan bakteri endofit melalui uji hipersensitif dan hemolisis; 3) pengelompokan isolat tunggal bakteri endofit menurut golongan pseudomonad fluoresen, Bacillus, Aktinomiset dan bukan ketiganya; 4) penyiapan inokulum P. coffeae; 5) uji in vitro bakteri endofit terhadap mortalitas P. coffeae dan pemacuan pertumbuhan tanaman; 6) karakterisasi bakteri endofit mencakup pengujian aktivitas hidrolisis (kitinolitik, proteolitik, dan lipolitik), produksi HCN, kemampuan pelarutan fosfat (P), penambatan nitrogen (N2); 7) uji potensi bakteri endofit dalam menekan populasi P. coffeae dan memacu pertumbuhan tanaman di rumah kaca; dan 8) identifikasi secara molekuler dengan sekuensing gen 16S rRNA terhadap 2 isolat tunggal terbaik di rumah kaca. Hasil isolasi diperoleh 264 isolat tunggal dan 27 konsorsium bakteri endofit. Hasil seleksi melalui uji hipersensitif dan hemolisis, diperoleh 78 isolat tunggal dan 9 konsorsium bakteri endofit yang tidak bersifat patogen terhadap tumbuhan dan mammalia. Pengujian in vitro menunjukkan bahwa sebanyak 77 dari 78 isolat tunggal dan 9 konsorsium dapat menekan nematoda P. coffeae dengan persentase mortalitas nematoda antara 6.7-100%, dan 16.7-65.8%. Hasil uji pemacuan pertumbuhan diperoleh sebanyak 16 isolat tunggal (19.5%) yang memacu pertumbuhan batang dan 13 isolat tunggal (16.9%) mampu memacu pertumbuhan akar. Konsorsium bakteri endofit yang dapat memacu pertumbuhan batang sebanyak 6 konsorsium (60%) dan memacu pertumbuhan akar sebanyak satu konsorsium (10%). Berdasarkan seleksi awal tersebut dipilih 23 isolat tunggal dan 4 konsorsium bakteri endofit untuk karakterisasi fisiologis. Dua puluh tiga isolat tersebut terdiri atas 9 isolat yang mampu menekan P. coffeae saja, 10 isolat memacu pertumbuhan batang dan/atau akar, dan 4 isolat dapat menekan P. coffeae serta memacu pertumbuhan tanaman. Bakteri endofit konsorsium terseleksi sebanyak 4 konsorsium, terdiri atas satu konsorsium yang mampu menekan populasi P. coffeae saja, satu konsorsium dapat memacu pertumbuhan saja, serta 2 konsorsium yang mampu menekan P. coffeae dan memacu pertumbuhan tanaman. Berdasarkan karakterisasi fisiologis, diperoleh: 1) isolat tunggal bakteri endofit C939A31 memiliki kemampuan aktivitas proteolitik, kitinolitik, lipolitik, dan fiksasi N2, serta kemampuan menekan P. coffeae 66.7%; C939A32 memiliki kemampuan aktivitas lipolitik, pelarutan P dan fiksasi N2, serta kemampuan menekan P. coffeae 100%; I308A32 memiliki kemampuan aktivitas proteolitik, lipolitik, pelarutan P dan fiksasi N2, serta kemampuan menekan P. coffeae 77.9%;
Keyword: isolat tunggal, konsorsium, karakterisasi fisiologis, mortalitas

Judul: Asymptotic Distribution of Estimator for the Intensity Function of a Doubly Periodic Poisson Process
Abstrak: In this manuscript, estimation of the intensity function of a doubly periodic Poisson process is discussed. It is assumed that only a single realization of the Poisson process is observed in a bounded window [0,n]. It is also assumed that the period of the intensity function is known. The rate of consistency and asymptotic normality of the estimator are formulated. Finally, a confidence interval for the local intensity function is also formulated.
Keyword: