Judul: Alel Monomorfik Gen Osteopontin (OPN|BsrI) pada Sapi Bali dengan Metode PCR-RFLP
Abstrak: Bangsa sapi bali sebagai sumberdaya genetik ternak asli Indonesia memiliki keunggulan, salah satunya adalah daya reproduksi yang tinggi. Gen osteopontin (OPN) merupakan anggota dari alur POU class 1 homeobox 1 (POU1F1) yang berkaitan dengan sifat reproduksi. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi ada tidaknya polimorfisme gen osteopontin (OPN) sebagai pengontrol sifat reproduksi pada sapi bali di Pulau Bali dengan menggunakan metode PCR-RFLP. Sampel sapi bali sebanyak 100 sampel yang berasal dari BPTU sapi bali dideteksi keberadaan keragaman genetiknya pada gen OPN menggunakan enzim restriksi BsrI yang memotong sekuens basa ACTGG|N. Amplifikasi gen OPN menghasilkan fragmen dengan panjang 290 bp yang terletak pada intron 4 dengan suhu annealing 60 oC selama 20 detik. Hasil analisis PCR-RFLP menunjukkan sapi bali yang dianalisis memiliki alel monomorfik T adalah 100%. Hasil sekuens fragmen gen OPN intron 4 menunjukkan terdapat mutasi antara basa sitosin (C) dengan timin (T).
Keyword: 

Judul: Identifikasi Keragaman Fragmen Promotor Gen Myostatin (MSTN|MspI) pada Sapi Bali menggunakan Metode PCR-RFLP.
Abstrak: Sapi bali memiliki kemampuan produksi, reproduksi, dan persentase karkas yang tinggi serta mampu beradaptasi pada kondisi lingkungan di Indonesia. Perbaikan mutu genetik sangat diperlukan untuk meningkatkan potensi yang dimiliki sapi bali. Gen myostatin merupakan gen yang memiliki peranan dalam mengatur pertumbuhan otot dan kualitas daging sebagai regulator negatif pertumbuhan. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi keragaman gen myostatin dengan metode Polymerase Chain Reaction – Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP). Sekuen primer gen myostatin forward dan reverse yang digunakan pada penelitian ini daerah promotor. Fragmen promotor dipotong dengan enzim MspI. Sampel DNA sapi bali yang digunakan berjumlah 44 sampel yang berasal dari BPPTU-HPT Denpasar, Bali. Hasil penelitian didapatkan bahwa gen myostatin daerah promotor pada sapi bali bersifat monomorfik dengan genotipe CC dan frekuensi alel C adalah 1 dan alel T adalah 0.
Keyword: enzim MspI, gen myostatin, PCR-RFLP, sapi bali

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: