Judul: Analisis kinerja algoretme shift-or, knuth-morris-pratt dan boyer-moore pada pelacakan string eksak
Abstrak: Meski data dapat disimpan dalam berbagai bentuk, tetapi bentuk teks mendominasi dalam pertukaran informasi. Pelacakan string merupakan subyek penting pada pemrosesan teks. Proses pelacakan string pada suatu file teks adalah aplikasi umum yang telah diterapkan mulai dari editor teks, basis data, aplikasi biologi molekuler, temu kembali bibliografi, dan manipulasi simbol. Data akan meningkat pesat seiring dengan berjalannya waktu. Meski kapasitas penyimpanan dan kecepatan komputer turut meningkat, perlu didesain algoritme pelacakan string yang efektif dan efisien. Terdapat banyak algoritme yang digunakan pada pelacakan string eksak, di antaranya adalah algoritme Knuth-Morris-Pratt (KMP) dan algoritme Boyer-Moore (BM). KMP bekerja dengan cara menyepadankan karakter pola dengan teks mulai dari kiri ke kanan. Ketika terjadi ketidaksepadanan maka pola akan digeser sejauh tagged border. BM menyepadankan karakter pola dengan teks mulai dari kanan ke kiri. Ketika terjadi ketidaksepadanan, pola akan digeser ke kanan berdasarkan dua pendekatan yaitu: good- suffix dan bad-character. Terdapat pendekatan berbeda pada pelacakan string eksak yaitu algoritme Shift- OR (SO). Perbedaan tersebut terletak pada representasi pelacakan sebagai state bit berukuran panjang pola (m) dan menggunakan operasi bitwise left-shift dan operasi logika OR. Kelemahan algoritme ini adalah keterbatasan panjang pola yang dapat dilacak pada memory-word size machine (register). Hasil percobaan pelacakan pola pada suatu file teks menunjukkan bahwa 40.9%-45.7% waktu temu SO lebih cepat dari waktu temu KMP untuk seluruh m (2-32 karakter), dan 4.7%-63.8% lebih cepat dari waktu temu BM untuk m≤6 karakter. Waktu temu SO dan KMP dipengaruhi ukuran file (n) dan tidak dipengaruhi m, sedangkan waktu temu BM dipengaruhi oleh kombinasi m dan n. Ketiga algoritme tersebut dapat menemukan keberadaan string atau substring pada teks yang sesuai pola dengan baik. Penerapan ketiga algoritme pada pelacakan file teks menghasilkan waktu temu SO lebih cepat dari waktu temu KMP untuk semua m (2 - 32 karakter) dan lebih cepat dari waktu temu BM untuk m ≤ 3 karakter. Ketiga algoritme mampu melacak dan menampilkan file teks lebih baik dari segi jumlah temu file bila dibandingkan dengan pelacakan menggunakan fasilitas Search yang dimiliki Windows XP.
Keyword: 

Judul: Analisis kinerja algoritma pelacakan string dengan toleransi kesalahan
Abstrak: Pelacakan string banyak diperlukan pada pemrosesan string misalriya untuk pengeditan teks. Terkadang pelacakan string tidak berhasil dilakukan, salah satu penyebabnya adalah adanya kesalahan ejaan. Untuk itu perlu dilakukan pelacakan string yang tidak eksak atau pelacakan dengan toleransi kesalahan. Agar pelacakan string memiliki kinerja yang baik maka diperlukan metode yang tepat untuk digunakan dengan mempertimbangkan keefektifan algoritma dalam menemukan perkiraan kata yang cukup baik dan waktu proses yang cepat dalam menampilkan perkiraari kata tersebut. Dalam penelitian ini dilakukan perbandingan dua jenis algoritma pelacakan string dengan toleransi kesalahan, yaitu algoritma Wu-Manber (selanjutnya disebut algoritma WM) dan algoritma Pemrograman Dinamis (selanjutnya disebut algoritma DP). Perbandingan dilakukan untuk melihat efisiensi kedua jenis algoritma ditinjau dari keefektifannya dalam menampilkan perkiraan kata dan waktu proses yang diperiukan dalam menampilkan perkiraan kata. Pengujian dilakukan dengan menggunakan 3720 kata yang dijadikan kamus referensi dan direpresentasikan menggunakan struktur data trie. Proses yang dilakukan adalah membandingkan kata- kata pada file yang diperiksa dengan kata-kata yang terdapat pada struktur data trie. Jika kata terdapat pada kamus referensi struktur data trie, maka kata tersebut mempunyai ejaan yang benar. Jika tidak, maka dilakukan pencarian kata perkiraan pada kamus referensi struktur data trie dengan melakukan perhitungan jarak edit antara kata yang diperiksa terhadap kata yang terdapat pada struktur data trie menggunakan algoritma WM dan DP. Jarak edit yang dimaksud adalah jumlah minimal perbedaan antara dua string yang diakibatkan oleh operasi perubahan penggantian, penghapusan, penyisipan atau gabungan dari ketiganya. Hasil dari penelitian ini diperoleh bahwa algoritma WM dan DP keduanya memberikan kinerja yang sama bagusnya yaitu 100% terkoreksi untuk semua jenis kesalahan dan waktu proses algoritma WM kurang lebih 3 kali lebih cepat dibandingkan waktu proses algoritma DP.
Keyword: 

Judul: Evaluation of Influenza Antibody Titers in Serum and Egg Yolk of Layers Vaccinated with Influenza Vaccines.
Abstrak: Influenza belongs to the Orthomyxoviridae family which causes upper and lower respiratory tract infection. The aim of this study was to evaluate influenza-A specific antibody titers from serum and egg yolk of hens vaccinated with quadrivalent influenza vaccines. Three Hy-line Brown layers were vaccinated with quadrivalent influenza type A and B inactivated vaccines. Vaccination was carried out three times at a dose of 0.25 ml/chicken via the intramuscular route. The first vaccination was carried out at 24 weeks of age, then boosters were performed at 28 and 32 weeks of age. Serum and egg yolk were collected every week for 20 weeks since the first vaccination. Influenza A H3N2 and H1N1 antibody titers were determined using hemagglutination-inhibition (HI) test and agar-gel-precipitation (AGP) test. Influenza-A H3N2 and H1N1 specific antibodies were detected in both serum and egg yolk from the first to twenty weeks after the initial vaccination. Highest HI geometric mean titer (GMT) of H1N1 antibody reached 26.67 HIU at nine weeks post first vaccination (p.f.v), while H3N2 antibody reached 26 HIU at six weeks p.f.v. Our result showed that influenza antibodies can be produced in layers using quadrivalent vaccines and layer chickens are able to produce equivalent antibody levels for each influenza subtype.
Keyword: antibody, egg yolk, influenza, layer chickens, serum