Judul: Autentikasi Kerupuk Udang Dengan Metode DNA Barcoding
Abstrak: Kerupuk udang merupakan makanan ringan yang berbahan dasar tepung tapioka dengan tambahan udang dan bumbu-bumbu lain. Autentikasi kerupuk udang dapat menjadi quality control yang tepat seiring dengan pemberlakuan Masyarakat Ekonomi ASEAN (MEA). Tujuan penelitian ini adalah mendesain primer spesifik untuk udang, autentikasi produk kerupuk udang, dan menentukan spesies udang yang digunakan sebagai bahan baku pada produk kerupuk udang. Primer COI yang telah didesain memiliki persentase GC 50%, suhu lebur 57 °C, dan panjang gen target 613 pb. Ekstrak DNA memiliki konsentrasi 0,3-3,9 ng/μL. Elektroforegram menunjukkan sembilan sampel berhasil teramplifikasi pada 500-750 pb. Analisis BLAST menunjukkan sampel teridentifikasi sebagai Litopenaeus vannamei, Metapenaeus ensis, Fenneropenaeus merguiensis, dan Sphyraena flavicauda dengan tingkat homologi 95% sampai 100%. Komposisi nukleotida yang didapatkan memiliki basa pirimidin yang lebih banyak dari basa purin, dengan basa terbanyak timin (33,0%) dan basa tersedikit guanin (17,8%). Analisis filogenetik menunjukkan L. vannamei memiliki kekerabatan yang lebih dekat dengan F. Merguiensis dibanding M. ensis.
Keyword: COI, jarak genetik, PCR, pohon filogeni

Judul: Autentikasi dan Ketertelusuran Puffer Fish (Lagocephalus lunaris) pada Produk Olahan Ikan Berbasis Surimi
Abstrak: Produk olahan ikan berbasis surimi berpotensi tinggi dalam kesalahan pelabelan bahan baku, dan berpotensi menggunakan bahan tidak sesuai dan toksisitas tinggi. Penelitian bertujuan melakukan autentikasi untuk menentukan bahan baku digunakan pada produk olahan surimi menggunakan DNA barcode. Amplifikasi DNA dilakukan dengan primer target fish universal F1R1/F2R2, mini-barcode, serta primer spesies spesifik Lagocephalus lunaris. Amplifikasi optimum primer F1R1/F2R2 berada pada suhu 54 °C, sedangkan primer mini barcode pada suhu 62 °C dengan 35 siklus. Produk PCR di sekuensing, dan diketahui urutan basa nukleotida DNA sampel. Analisis menunjukkan sampel S1 adalah Coryphaena hippurus atau ikan mahi-mahi dengan homologi 96.32%, S2 dan S3 Nemipterus bathybius atau ikan kurisi dengan homologi 93.54% dan 94.77% dan CS adalah spesies Evynnis cardinalis atau Ikan kuro dengan homologi 97.80%. Amplifikasi sampel dengan primer spesies spesifik ikan buntal Lagocephalus lunaris dengan suhu 54 °C, 57 °C, dan 60 °C menunjukkan tidak terdapatnya pita DNA pada enam sampel yang dianalisis.
Keyword: DNA barcode, primer, produk surimi

Judul: Mathematical model of Hematopoietic Stem Cell in Chronic Myelogenous Leukemia with and without Therapy
Abstrak: Leukemia or blood cancer is a diverse group of neoplastic disease, characterized by the multiplication of abnormal leukocytes or malignant transformation of blood-forming cells in bone marrow and lymphoid tissues. One of the most common types of leukemia is Chronic Myelogenous Leukemia (CML), which is usually diagnosed by the presence of certain chromosomal abnormalities, the so-called Philadelphia chromosome (Ph). One of the treatments of CML is Granulocyte Colony-Stimulating Factor (G-CSF). In this paper, we discuss two Hematopoietic Stem Cell (HSC) models, i.e. HSC without treatment and HSC with G-CSF treatment. The model of HSC without treatment included three equations representing the dynamics of HSC, leukocyte and platelet. Whereas, the model of HSC with G-CSF treatment includes the previous three equations and adds two more equations representing G-CSF injection and G-CSF circulation. The stability behavior of the system approaching the equilibrium points in the simulation study is carried out using Mathematica 7.0. The simulation results show that the G-CSF treatment can successfully decrease the number of HSC, which means reducing the CML.
Keyword: