Judul: Variasi Susunan "Immature RNA" yang Akan Ditranslasi Menjadi Polipeptida
Abstrak: Saat ini, informasi mengenai sekuen DNA dapat diperoleh dengan cepat, mudah dan murah melalui media internet. Informasi tersebut perlu diorganisasikan dan dianalisis sehingga data-data tersebut menjadi sebuah informasi yang lebih bermakna. Tujuan penelitian ini untuk mengetahui variasi susunan "immature RNA" yang akan ditranslasi menjadi polipeptida. Penelitian ini memanfaatkan media internet sebagai sumber pengambilan data yang dilaksanakan pada bulan 1 Juni 2003 sampai Januari 2004. Materi yang digunakan adalah 50 data sekuen DNA lengkap dari ternak ayam.
Keyword: 

Judul: Ragam struktur "Immature RNA" 49 gen sapi yang akan ditranslasikan menjadi protein
Abstrak: Bioteknologi dikenal sebagai salah satu revolusi teknologi yang sangat enjanjikan. Pentingnya bioteknologi secara strategis dan potensinya untuk konstribusi dalam bidang pertanian, pangan, kesehatan, sumber daya alam dan ingkungan mulai menjadi kenyataan yang semakin berkembang. Dengan ditemukannya DNA sebagai material genetik yang berstruktur double helix oleh Watson dan Crick tahun 1953 dan enzim untuk berbagai modifikasi dan manipulasi DNA melahirkan genetika molekuler. Informasi sekuen DNA dapat diakses melalui media internet yang terhimpun di dalam NCBI database yang berpusat di USA, EMBL (Eropa) dan DDBJ di Jepang. Penelitian ini memanfaatkan informasi tersebut untuk mendeskripsikan bentuk struktur "immature RNA" pada 49 gen sapi (Bos taurus) dan ada tidaknya variasi pola bentuknya. Pencarian sekuen DNA complete dilakukan selama bulan Maret hingga April 2004 dengan menggunakan fasilitas internet. Data berupa 49 gen yang telah disekuen dengan lengkap kemudian dianalisis secara deskriptif, diidentifikasi pola atau bentuknya kemudian masing-masing dibandingkan untuk mengetahui ada tidaknya variasi bentuk struktur gen. Hasil penelitian menunjukkan terdapat 12 variasi bentuk struktur gen yaitu EC1, EC00, EC21, EC22, EC01, EC10, EC12, EC13, EC20, ECs2, ECss dan IC11. Bentuk struktur gen yang paling banyak yaitu EC11 sebesar 42,86% terdiri atas 21 gen. Posisi kedua ECoo sebesar 16,33% terdiri atas delapan gen. Posisi ketiga EC21 sebesar 14,3% dengan tujuh gen. Posisi keempat EC22 sebesar 6,12% dengan tiga gen. Posisi kelima ECoi dan EC10 sebesar 4,08% dengan dua gen. Posisi keenam EC12, EC13, EC20, ECs2, ECss dan IC₁₁ masing-masing sebesar 2,04% dengan satu gen. Adanya variasi pada struktur gen disebabkan oleh pola susunan bagian penyusun gen, penyebaran dari kodon awal (initiation codon), kodon akhir (stop codon) dan ada tidaknya UTR (untranslated regions) yang meliputi 5'UTR dan 3'UTR. Sapi merupakan organisme eukariot, pada struktur gennya terdapat bagian intron yang menyelingi ekson sehingga bentuk struktur gen minimal tersusun atas dua ekson dan satu intron.
Keyword: bioteknologi, ragam struktur "Immature RNA", gen sapi, database

Judul: Thermal Characteristics and Dynamics of Tropical Cyclone over Western North Pacific Ocean: A Case Study of Typhoon Songda (Chedeng) 2011
Abstrak: The frequent occasion of Tropical Cyclone (TC) over Western North Pacific (WNP) Ocean lies from 10˚N to 26˚N and 121˚E to 170˚E. Sources of TC development come from warm ocean temperature where latent heat is released during condensation processes and subsequently concentrated in the boundary layer. Relative humidity at 850-700 hPa is responsible to produce the most intense storm. Meanwhile, weak vertical wind shear between 850-200 hPa is one of the dynamical factors that lead to the development of TC. Pressure level of 850-200 hPa is chosen to minimize the thermodynamic effect in the lower troposphere. Typhoon Songda (Chedeng in the Philippines) or TSC lasted from May 18th to 30th, 2011 and strengthened into powerful Super Typhoon stage between May 24th and 27th. Long curving track and the exhibition of all sequences of TC life cycle, TSC is then considered as an ideal case of TC. The objective of the study with case of TSC is to investigate the role of thermal characteristics and dynamics on TC intensity. The research is carried out by using Advanced Research of Weather Research and Forecasting model (WRF ARW model) version 3.3. Two domains are employed in the model. The first domain situate from 02˚N to 40˚N and 118˚E to 149˚E and cover spatial resolution () of 33.1 km. The second domain situate from 09˚N to 27˚N and 119˚E to 132˚E with of 11 km. Timestep of the model () is 120 seconds. The model is supported by the following physical parameterization, i.e., Yonsei University Scheme (YSU) in the boundary layer, Kain-Fritsch scheme (KF) in the cumulus, and WRF Single-Moment 3-class scheme in the microphysics. Initial meteorological condition prior to the formation of the cyclone is generated using WRF ARW standard-release model. Sensitivity of the model output is obtained from a selected single-parameter change scenarios, namely, 10 % to 20 % decrease and increase of wind shear initial data at 850-200 hPa, and by 10 % to 20 % decrease of relative humidity initial data at 850-700 hPa. The result showed that the negative correlations between wind shear and intensity are found in wind shear scenarios. Wind shears of 10 ms-1 which lead to strengthening of the wind intensity in the early period of Typhoon development are found in wind shear scenarios. The effect of wind shear changes on wind intensity is statistically significant in the 20 % wind shear scenarios. During mature stage, weak wind intensity occurred when wind shear increase as given in the WRF standard-release and the 20 % decreasing scenario. Different situation is found in the 20 % increasing scenario where wind shear tend to weak and lead to strong wind intensity at this stage. Meanwhile, the reduction of moisture supply at 850-700 hPa resulting from 20 % decreasing relative humidity play a major role in the weakening of wind intensity and reduces mechanical energy of the cycle process as much as 300 J kg-1.
Keyword: