Judul: Pengaruh frekuensi akustik terhadap penetrasi sub bottom profile dengan penerapan acoustic filtering
Abstrak: Kebutuhan data geofisika kelautan memperlihatkan kecenderungan yang meningkat akibat semakin maraknya kegiatan eksplorasi sumberdaya mineral dan energi di laut. Salah satu metode yang cukup handal untuk memenuhi kebutuhan tersebut adalah metode seismik refleksi, karena memiliki keakuratan yang tinggi untuk mengetahui karakteristik dasar laut, seperti ketebalan dan volume endapan sedimen permukaan laut, struktur dasar laut, dan kedalaman suatu perairan. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui pengaruh frekuensi akustik terhadap penetrasi metoda seismik refleksi ke bawah permukaan batuan dengan penerapan analisis spektrum data digital dan Acoustic Filtering. Akuisisi data lapangan dilaksanakan pada tanggal 23 Juli – 21 Agustus 2010 di daerah Pastenoster, Doang, dan Spermonde yang terletak di antara Selat Makassar dan Laut Flores pada koordinat 05°00’00’ – 07°00’00” LS dan 117°00’00”–120°00’00” BT. Pengolahan data dilakukan di Laboratorium Akustik Kelautan, Departemen Ilmu dan Teknologi Kelautan, Institut Pertanian Bogor dan di Pusat Penelitian dan Pengembangan Geologi Laut (PPPGL) di Bandung. Dalam pengolahan data seismik untuk penelitian ini software Promax dan Matlab digunakan untuk mengevaluasi dan menganalisis data serta Seisee digunakan untuk melihat tampilan digital data seismik dan mengekstraknya dalam Microsoft Exel. Analisis dilakukan terhadap spektrum frekuensi dari trace-trace seismik yang diolah. Berdasarkan hasil analisis FFT gelombang seismik dari lima trace pada line 14 dan line 15 Terdapat perubahan amplitudo gelombang seismik sejak merambat dari daerah permukaan, dasar laut, dan dibawah dasar laut terhadap respon frekuensinya. Hal ini disebabkan bahwa semakin dalam gelombang seismik merambat ke dasar sedimen maka semakin lemah frekuensi tingginya. Faktor lain yang mempengaruhi amplitudo gelombang akustik yang dipantulkan adalah sudut datang gelombang akustik pada bidang pantul, pengurangan (attenuation) dari gelombang akustik oleh sedimen, kehilangan energi akustik yang disebabkan oleh penyebarannya ke segala arah, serta kehilangan energi akustik yang disebabkan karena penyebarannya oleh bidang-bidang reflektor yang permukaannya tidak teratur. Berdasarkan hasil filtering menggunakan software Seisee, penggunaan frekuensi rendah akan mendapatkan penetrasi batuan yang lebih tinggi dibandingkan dengan frekuensi tinggi.
Keyword: 

Judul: Pengukuran dan Analisis Sinyal Sub-Bottom Profiler untuk Ekstraksi Nilai Koefisien Refleksi Sedimen Selat Lembeh
Abstrak: Pemetaan dasar laut yang akurat sangat dibutuhkan terkait dengan peningkatan aktivitas di bidang kelautan, seperti pengerukan, eksplorasi migas, dan penelitian geologi serta morfologi kelautan. Metode pemetaan dasar laut terdiri dari 2 metode, yaitu metode langsung (direct) dan metode tidak langsung (indirect). Metode langsung terdiri dari pengukuran lapang dan pengukuran di laboratorium. Faktor efisiensi yang rendah dan biaya yang tinggi menyebabkan metode langsung tidak efektif digunakan untuk memetakan dasar laut pada wilayah perairan yang luas. Pemrosesan sinyal dibutuhkan dalam menganalisis data akustik karena raw data akustik akan tercampur dengan noise atau derau dari lingkungan maupun dari instrumen akustik itu sendiri. Pemrosesan sinyal ditujukan untuk menghilangkan noise tersebut sehingga hanya sinyal utama yang dianalisis dan hasil klasifikasi tipe dasar perairan yang didapatkan juga akan jauh lebih akurat. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan menganalisis sinyal akustik (penapisan, dekonvolusi, penguatan sinyal) dari sub-bottom profiler untuk menggambarkan penampang melintang dari lapisan sedimen permukaan dasar laut, serta memperoleh nilai koefisien refleksi dari dasar perairan. Penelitian mengambil data di perairan Selat Lembeh, Sulawesi Utara. Nilai tersebut kemudian digunakan untuk mengklasifikasi lapisan sedimen permukaan dasar laut. Pengambilan data sub-bottom profiler (SBP) dilakukan di perairan Selat Lembeh pada bulan April 2016. Track pengambilan data dilakukan secara zigzag untuk mencakup seluruh wilayah selat. Data SBP diakuisisi menggunakan SBP tipe Syqwest Stratabox yang dipasang pada bagian badan kapal. Sampel sedimen diambil menggunakan grab sampler pada lintasan ke-37. Setelah data diakusisi, dilakukan pemrosesan data yang meliputi analisis spektrum dan filtering, serta tahapan dekonvolusi spike dan automatic gain control (AGC). Analisis fast fourier transform (FFT) dan band pass filter diaplikasikan pada penelitian ini untuk menghilangkan derau pada sinyal akustik. Nilai koefisien refleksi yang didapatkan dari lokasi pengambilan sampel pada trace ke-780 berkisar antara 0.1168 hingga 0.7938. Nilai maksimum koefisien refleksi di daerah ini disebabkan karena jenis sedimen yang dikandung pada wilayah tersebut lebih banyak mengandung besi pada sedimen pasir sehingga menyebabkan impedansi sedimen pun bertambah, sehingga nilai koefisien refleksi pada wilayah tersebut pun akan semakin besar.
Keyword: bandpass filter, FFT, Selat Lembeh, sub-bottom profiler

Judul: Characterization and Expression of Tomato infectious chlorosis virus Coat Protein Gene in Escherichia coli
Abstrak: Tomato infectious chlorosis virus (TICV) is a member of Crinivirus genus. TICV infects tomato crop in Garut and Cipanas, West Java Indonesia. Tomato initially showed bright interveinal yellowing symptoms. The coat protein gene (CP-TICV) was amplified by RT-PCR from total RNA extracted from infected tomato leaves and the amplified fragment was cloned and completely sequenced. The fragment was subsequently subcloned into the pET-21b expression vector. The recombinant plasmid was transformed to Escherichia coli strain BL21(DE3)pLysS to express the coat protein. The coat protein fused to a 6xhistag, was purified by affinity chromatography using a NiNTA spin column. The identity of the purified protein was confirmed by SDS-PAGE. In this experiment, 792 bp of CP-TICV gene of TICV virus has been successfully cloned, sequenced, and expressed in E. coli. Based on nucleotide sequences alignment analysis, TICV-Indonesia strain showed 100% identity to TICV –Spain strain and 99% identity to North America, France, and California strains and based on amino acid sequences alignment analysis, TICV-Indonesia strain showed 100% identity to TICV –Spain, North America, France strains and 99.2% identity to California strain. CP-TICV showed over expressed in E. coli when it is induced with 1 mM IPTG and incubated at 37oC. Purified CP-TICV-Histag recombinants protein sized 29 kDa based on SDSPAGE analysis.
Keyword: