Judul: Analisis Keragaman Genetik Jati Asal Sulawesi Selatan Berdasarkan Marker SSR.
Abstrak: Hasil penelitian menunjukkan bahwa total alel yang terdeteksi pada lima lokus SSR ada 19 alel, jumlah alel tiap lokus minimum 2 alel dan maksimum 5 alel dengan rata-rata 3.8 per lokus. Nilai Polimorphic Information Content (PIC) tertinggi pada lokus ATC02 (0.70) dengan rata-rata 0.52. Rata-rata keragaman genetik tertinggi pada populasi pohon asal Massepe (0.663) untuk semua lokus, kemudian populasi pohon asal Ceddie dan populasi bibit asal Massepe. Nilai indeks fiksasi dalam populasi menunjukkan ekses heterosigositas kecuali pada populasi bibit asal Massepe terjadi defisit heterosigositas yang ditunjukkan dengan nilai Fis yang positif. Lokus AGT10 nyata menyimpang dari hukum Hardy-Weinberg untuk semua populasi yang dianalisis. Koefisien diferensiasi genetik relatif rendah (Gst = 0.022) atau sekitar 2.2 % variasi SSR diantara populasi. Analisis AMOV A menunjukkan komponen dan persentase ragam terbesar terdapat di dalam populasi baik populasi pohon maupun populasi bibit, dibanding antar populasi dalam grup dan antar grup itu sendiri. Persentase ragam untuk populasi pohon dan bibit adalah 93.75 % dan 92.74%. Analisis pengelompokan individu untuk semua populasi dengan metode UPGMA, menunjukkan lima kelompok utama pada koefisien jarak genetik 0.50. lndividu dari empat lokasi mengelompok secara acak dengan jarak genetik yang bervariasi. Penyebaran biji tanaman jati asal Sulawesi Selatan tidak cenderung selalu berdekatan dengan tetuanya.
Keyword: tanaman jati, keragaman genetik, isolasi DNA, Amplifikasi DNA, PCR

Judul: Genetic Diversity of Sengon Population (Paraserianthes falcataria (L.) Nielsen) in Community Forest in Java based on RAPD Marker
Abstrak: Paraserianthes falcataria (L) Nielsen yang dikenal dengan nama lokal sengon banyak ditanam pada hutan rakyat di Jawa, karena tergolong pohon yang cepat tumbuh dan multiguna, baik dari daun, batang, dan sistem perakaran. Kebanyakan sengon ditanam secara monokultur sehingga pertanaman ini mempunyai masalah yaitu, mudah terserang hama dan penyakit seperti hama penggerek batang Xystrocera festiva, damping off, dan karat puru. Untuk itu diperlukan sengon unggul yang tahan hama dan penyakit, yang dihasilkan dari program pemuliaan. Untuk melaksanakan program pemuliaan, maka diperlukan keragaman genetik yang tinggi. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui keragaman genetik di antara populasi tanaman sengon pada beberapa hutan rakyat di Jawa. Sampel tanaman sengon diambil dari 9 populasi yaitu, Cianjur, Sukabumi, Garut, Kuningan, Subang, Tasikmalaya dari Jawa Barat, Wonosobo dari Jawa Tengah, Kediri dan Lumajang dari Jawa Timur, dengan jumlah 25 sampel perpopulasi. DNA Sengon diekstraksi dengan menggunakan metode CTAB dan GenElute Plant Genomic DNA miniprep Kit dari SIGMA. Pada proses PCR, DNA tersebut diamplifikasi menggunakan primer OPA-2, OPA-3, OPB-10, OPY-5, dan OPU-5. Analisis data dilakukan dengan program POPGENE, NTSYS, dan GenAlex. Parameter yang diukur adalah heterozigositas harapan (He), Presentase Lokus Polimorfik (PLP), jumlah alel yang diamati (na), jumlah alel efektif (ne), dan jarak genetik. Nilai dugaan heterozigositas harapan (He) seluruh populasi adalah 0,2349, menunjukkan bahwa populasi sengon di Jawa memiliki keragaman genetik yang tinggi. Sebagian besar variasi genetik tersimpan di dalam populasi yaitu sebesar 82%, sedangkan perbedaan antar populasi hanya sebesar 18%. Populasi Garut dan Kediri memiliki jarak genetik terjauh (0,0857) sementara jarak genetik terdekat (0,0123) terdapat pada populasi Tasikmalaya dan Lumajang. Dendrogram jarak genetik menunjukkan bahwa pola penyebaran sengon di Jawa terjadi secara acak, karena populasi yang terdapat pada satu daerah yang sama (Jawa Barat) ternyata memiliki jarak yang dekat dengan provinsi lain.
Keyword: 

Judul: Numerical modeling of the hydrodynamics of standing wave and scouring in front of impermeable breakwater with different steepnesses
Abstrak: The aim of this paper is to numerically study the effects of breakwater steepness on the hydrodynamics of standing wave and scouring process in front of impermeable breakwaters. A two-dimensional hydrodynamics model based on the Reynolds Averaged Navier–Stokes (RANS) equations and the Volume of Fluid (VOF) method was developed and then combined with an empirical sediment transport model. Comparisons with an analytical solution and experimental data showed the present model is very accurate in predicting the near bottom velocity and capable of simulating the scour/deposition patterns consistent with experimental data. It was found that the additional terms of bottom shear stress in the momentum equations are necessary to produce a physical scouring pattern. Different breakwater steepnesses produce different characteristics of standing wave, the steady streaming system, and scouring pattern in front of the breakwaters, which also affects the correlations between them. An additional analysis of the turbulence field parameters and the sediment transport rate was also performed. All these important information will be presented in details in this paper and can be worthwhile for designing the breakwater in coastal areas.
Keyword: The RANS–VOF model Standingwave Steadystreamingsystem Scouring pattern Breakwatersteepness