Judul: Perbandingan DNA Genorn Bakteri Asarn Laktat Bentuk Kokus Asal Rurnen Domba dengan Elektroforesis Gel Medan Berpulsa (Pulsed-Field Gel Electrophoresis)
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mernbandingkan pola restriksi DNA genorn beberapa bakteri asarn laktat (BAL) bentuk kokus yang diisolasi dari rurnen domba dengan menggunakan teknik elektroforesis gel medan berpulsa (PFGE), serta mernperkirakan ukuran DNA genorn dan hubungan filogenetik dari isolat tersebut. Sidik jail DNA dilakukan terhadap 26 isolat BAL kokus asal rurnen dornba dan satu isolat referensi (Streptococcus bovis) dengan menggunakan enzirn restriksi endonuklease Nod, Nhel , Sfil, dan Srnal. DNA penanda yang digunakan PFGE marker I1 Saccharomyces cerevisiae YPH 755. Kondisi elektroforesis pada tegangan 6 Vlcrn, suhu 14°C selama 17 jam. Dilakukan dengan tiga waktu pulsa yang berbeda yaitu 40-80, 1-20, dan 1-5 detik sehingga dapat memisahkan potongan DNA berukuran masing-masing 200- 800 kpb, 50-240 kpb, dan 8-100 kpb.
Keyword: 

Judul: Isolasi DNA kedelai (Glycine Max (L.) Merrill) varietas orba dan pemotongannya dengan enzim restriksi
Abstrak: Usaha perbaikan genetik kedelai (Glycine Bax (L.) Merrill) sangat diperlukan guna memenuhi kebutuhan akan kedelai yang selalu meningkat. Salah satu langkah yang dapat digunakan untuk membantu perbaikan tanaman adalah teknik DNA rekombinan. Pada penelitian ini dilakukan isolasi DNA dari dua sunber jaringan yang berbeda yaitu daun dan biji kedelai varietas Orba, yang bertujuan untuk mempelajari teknik isolasi DNA yang cepat dan membandingkan hasilnya, serta mempelajari kondisi pemotongan DNA dengan enzin restriksi, yang merupakan bagian dari satu penelitian jangka panjang dalam usaha perbaikan gebetik kedelai melalui pembentukan DNA rekombinan. Penelitian ini dilaksanakan mulai bulan Juni sampai Desember 1991, bertempat di Laboratorium Genetika Terapan PAU Bioteknologi IPB, Darmaga, Bogor. Hasil penelitian menunjukkan bahwa DNA yang diperoleh dari daun kedelai memberikan hasil yang lebih murni di- bandingkan dengan hasil yang diperoleh DNA dari biji kedelai, sehingga untuk mengisolasi DNA dari biji diper- lukan langkah-langkah pemurnian lebih lanjut. Hal ini disebabkan tingginya kandungan protein dan pati pada biji yang dapat terekstrak bersama-sama dengan DNA. Hasil elektroforesis DNA dengan gel agarosa menunjuk- kan posisi pita yang sama pada bagian atas gel yang ber- arti memiliki jumlah pasangan basa yang tinggi. Pemotongan DNA genom kedelai dengan enzin restriksi baik dari daun maupun dari biji, menghasilkan pita kontinu yang pada gel tampak nengoles ("smear"), karena pemotongan pada DNA genom menghasilkan ratusan ribu fragmen yang berbeda yang masing-masing tidak mungkin tampak sebagai pita-pita pada gel…
Keyword: 

Judul: Thermal Characteristics and Dynamics of Tropical Cyclone over Western North Pacific Ocean: A Case Study of Typhoon Songda (Chedeng) 2011
Abstrak: The frequent occasion of Tropical Cyclone (TC) over Western North Pacific (WNP) Ocean lies from 10˚N to 26˚N and 121˚E to 170˚E. Sources of TC development come from warm ocean temperature where latent heat is released during condensation processes and subsequently concentrated in the boundary layer. Relative humidity at 850-700 hPa is responsible to produce the most intense storm. Meanwhile, weak vertical wind shear between 850-200 hPa is one of the dynamical factors that lead to the development of TC. Pressure level of 850-200 hPa is chosen to minimize the thermodynamic effect in the lower troposphere. Typhoon Songda (Chedeng in the Philippines) or TSC lasted from May 18th to 30th, 2011 and strengthened into powerful Super Typhoon stage between May 24th and 27th. Long curving track and the exhibition of all sequences of TC life cycle, TSC is then considered as an ideal case of TC. The objective of the study with case of TSC is to investigate the role of thermal characteristics and dynamics on TC intensity. The research is carried out by using Advanced Research of Weather Research and Forecasting model (WRF ARW model) version 3.3. Two domains are employed in the model. The first domain situate from 02˚N to 40˚N and 118˚E to 149˚E and cover spatial resolution () of 33.1 km. The second domain situate from 09˚N to 27˚N and 119˚E to 132˚E with of 11 km. Timestep of the model () is 120 seconds. The model is supported by the following physical parameterization, i.e., Yonsei University Scheme (YSU) in the boundary layer, Kain-Fritsch scheme (KF) in the cumulus, and WRF Single-Moment 3-class scheme in the microphysics. Initial meteorological condition prior to the formation of the cyclone is generated using WRF ARW standard-release model. Sensitivity of the model output is obtained from a selected single-parameter change scenarios, namely, 10 % to 20 % decrease and increase of wind shear initial data at 850-200 hPa, and by 10 % to 20 % decrease of relative humidity initial data at 850-700 hPa. The result showed that the negative correlations between wind shear and intensity are found in wind shear scenarios. Wind shears of 10 ms-1 which lead to strengthening of the wind intensity in the early period of Typhoon development are found in wind shear scenarios. The effect of wind shear changes on wind intensity is statistically significant in the 20 % wind shear scenarios. During mature stage, weak wind intensity occurred when wind shear increase as given in the WRF standard-release and the 20 % decreasing scenario. Different situation is found in the 20 % increasing scenario where wind shear tend to weak and lead to strong wind intensity at this stage. Meanwhile, the reduction of moisture supply at 850-700 hPa resulting from 20 % decreasing relative humidity play a major role in the weakening of wind intensity and reduces mechanical energy of the cycle process as much as 300 J kg-1.
Keyword: