Judul: Kloning dan Ekspresi Gen Tripsin dari Streptomyces albulus pada Escherichia coli BL21(DE3).
Abstrak: Tripsin adalah salah satu enzim protease dari organ pankreas yang digunakan untuk terapi pengganti enzim pada pasien pancreatic insufficiency. Hampir seluruh tripsin yang digunakan saat ini berasal dari hewan mamalia seperti babi dan sapi. Hal ini dikhawatirkan menjadi sumber transmisi penyakit hewan ternak selain adanya potensi alergenisitas hewan mamalia serta adanya resistensi penganut agama tertentu (Islam, Yahudi) berkaitan dengan tripsin dari organ pankreas babi. Dengan demikian dibutuhkan sumber-sumber tripsin yang baru sebagai alternatif. Sejalan dengan perkembangan bioteknologi, tripsin dari mikroba terutama berupa produk rekombinan lebih menjanjikan sebagai tripsin pengganti. Pada penelitian ini kami mengidentifikasi gen tripsin dari S. albulus yang disebut S. albulus Trypsin (SAT) berukuran 804 pb dan mengkode 267 asam amino. Gen SAT belum pernah diteliti ataupun diekspresikan sebelumnya baik secara konvensional maupun secara rekayasa genetika. Gen SAT berhasil diisolasi dari S. albulus 14147 dan diklon pada vektor pGEMT-easy dengan inang Escherichia coli DH5α. Subkloning ke vektor pET21b pada inang E.coli DH5α dilakukan dengan metode heatshock. Transformasi vektor pET-SAT ke inang E.coli BL21(DE3) telah berhasil dilakukan dan dilanjutkan dengan ekspresi pada media Luria Bertani (LB). Hasil SDS PAGE memperkirakan ukuran berat molekul protein SAT pada 23 kDa. Uji aktivitas spesifik enzim tripsin dilakukan menggunakan substrat sintetik tripsin N- α-benzoyl-DL-arginine-p-nitroanilide (BAPNA) dengan aktivitas sebesar 0.2 U/mL. Aplikasi aktivitas enzim SAT terhadap susu skim 0.2% diteliti secara in vitro. Degradasi kasein dan protein lain pada susu skim menunjukkan adanya aktivitas proteolitik tripsin. Berdasarkan data yang diperoleh, kloning dan ekspresi gen tripsin dari S. albulus (SAT) telah berhasil dilakukan, enzim SAT bersifat aktif dan dapat menghidrolisis senyawa peptida (susu skim). Berdasarkan data sekuensing dan ekspresi protein dapat dikonfirmasi bahwa molekul hypothetical protein dari S. albulus strain ZPM (NZ_CP006871.1), strain CCRC 11814 (NZ_AROY02000075.1) dan strain PD-1 (NZ_AXDB02000024.1) adalah molekul serin protease tripsin.
Keyword: pancreatic insufficiency, peptidase SI, serine protease, Streptomyces albulus, trypsin

Judul: engklonan Gen Protease Serupa Subtilisin dari Bacillus pumilus YI ke dalam Escherichia coli DH5a,
Abstrak: Studi pelacakan dengan menggunakan gen kimotripsin dari fragmen BamHl plasmid pJB, diperoleh hasil bahwa tidak satupun Bacillus sp. yang diisolasi dari Indonesia, termasuk Bacillus pumilus YI, memiliki gen penyandi serupa kimotripsin. Ristiarini (1996) telah melokalisir gen penyandi enzim protease serupa subtilisin pada Bacillus pumilus YI dengan menggunakan metode hibridisasi southern. Gen serupa subtilisin tersebut terdapat pada fragmen DNA genom hasil digesti EcoRI yang berukuran 3 kb. Pada penelitian ini dilakukan pengklonan gen penyandi enzim serupa subtilisin ke dalam Escherichia coli DH5a dengan menggunakan vektor pUC 19. Dari hasil pengklonan diperoleh beberapa koloni putih., yang setelah direplika pada media yang mengandung skim (skim milk agar ) diperoleh empat koloni putih yang menghasilkan halo yang tipis setelah diinkubasi selama 4 hari pada suhu 37°C. Hasil verifikasi plasmid diperoleh adanya beberapa DNA sisipan (insert) dengan ukuran yang berbeda, yaitu 0.3 kb, 0,9 kb, 1,5 kb, 2.4 kb, 2,6 kb, 2, 7 kb, dan 3,0 kb. Plasmid-plasmid rekombinan ini dilµbridisasi dengan menggunakan pelacak gen subtilisin dari fragmen .&oRI plasmid pPT30. Dua dari plasmid rekombinan ini menghasilkan signal positif dengan ukuran 2.4 kb, 2.6 kb, dan dua plasmid rekombinan lainnya berukuran hampir sama yaitu 3 kb. Dengan demikian gen penyandi enzim protease serupa subtilisin dari Bacillus pumi/us YI telah terklon dan plasmid rekombinannya berturut-turut disebut : pBNI, pBN2, pBN3, dan pBN4. Selama pertumbuhan pada Luria broth pada suhu 37°C, E. coli rekombinan rnenghasilkan aktivitas protease tertinggi yaitu 0.2307 U/ml setelah 15 jam fermentasi, dan secara umum protease yang dihasilkan bersifat sensitif terhadap PMSF.
Keyword: 

Judul: Characteristic of Overshooting Top (OT) Based on  Himawari  8  Satellite  as  a  Convective  Cloud  Feature  that  Generates  Extreme Weather in the Java Island Region
Abstrak: Overshooting Top (OT) is a feature at the top of a convective cloud that is associated with extreme weather. Research on OT in tropical Indonesia is still very limited. The existence of geostationary satellites with wide area coverage and fast frequency observations is useful for observing the fast dynamics of the OT life cycle. Therefore, this study intends to analyze the relationship between OT and extreme weather, updraft and thermodynamic conditions of OT when extreme weather occurs, the best objective method for detecting OT in the day time and night time, and the spatiotemporal distribution of OT in the tropical region of Java Island during the 2018-2021 period. Based on visual analysis using visible channel and Himawari 8 sandwich products, 87% of extreme weather events in Java were accompanied by the appearance of OT. It indicates that the presence of the OT pattern is a convection cloud pattern or feature that is closely related to extreme weather events for the Java Island region. The existence of a time lag between the appearance of OT and extreme weather events on Java Island indicates that the OT of convection cloud can be used as a precursor or nowcasting for the appearance of extreme weather. Most of the convective cloud OT features during extreme weather events on Java Island have altitude that were only able to exceed the altitude of the equilibrium level and few were able to exceed the tropopause level of 9 km – 16 km. The difference in atmospheric conditions during extreme weather events on Java Island, which is in the tropics and subtropics, is a strong and unstable convective energy condition characterized by a larger CAPE, as well as unstable KI, LI, SI and TTI values. It is offset by kinematic factors in the form of a weak vertical wind shear (bulk wind shear 0-6 km) and a higher freezing point height. The difference between extreme weather events in the Java Island region and other tropical regions compared to subtropical regions is the strong updraft speed of convection clouds. The IRW Texture COMB algorithm based on the IRW-Texture Gradient modification and the COMB algorithm shows a significant increase in quality for detecting OT and non-OT pixels in Java. Rainy days with rainfall > 50 mm/day are very common in areas with an altitude of > 500 m. On the other hand, the level of convection activity which is indicated by the presence of OT and lightning is significantly reduced in this area. OT of convective clouds appear more frequently during the DJF season and less frequently during the JJA season. OT often appears during the day time and rarely at night time. Most OTs appear in the central part, away from the south and north coasts of Java Island during the day, while OTs that appear near the south and north coasts of Java Island can appear in the morning or afternoon.
Keyword: convective clouds, extreme weather, Overshooting Tops, Himawari 8 Satellite