Judul: Studi parameter oseanografi dan struktur komunitas plankton di Perairan Teluk Pelabuhan Ratu
Abstrak: Fitoplankton dan zooplankton merupakan organisme yang sangat penting bagi kehidupan nekton di dalam perairan dan dapat dipakai sebagai indikator kualitas air terutama di Perairan Teluk Pelabuhan Ratu. Perairan ini merupakan pusat kegiatan penangkapan ikan sangat potensial sehingga dapat sebagai sumber pendapatan non-migas untuk meningkatkan perekonomian Indonesia. Penelitian dilaksanakan pada tanggal 22 Mei sampai 19 Juni 1994 di Perairan Teluk Pelabuhan Ratu. Pengambilan contoh air dilakukan pada 9 stasiun dan masing-masing stasiun terdapat tiga kali pengambilan contoh pada selang waktu dua minggu. Analisa yang dilakukan secara deskriptif yaitu penyajian data dalam bentuk tabel dan grafik, menggunakan indeks kesamaan Canberra Metric dan Bray-Curtis, menghitung kelimpahan fitoplankton dan zooplankton, indeks Keragaman, indeks keseragaman dan indeks dominansi serta analisa komponen utama (PCA). Hasil pengamatan menunjukkan beberapa parameter fisika yang terukur; nilai suhu perairan berkisar antara 26,1 29 °C, nilai kecerahan antara 3 14 meter, besar arus yang melewatinya berkisar antara 1,9 18 m/detik yang dipengaruhi oleh arus Samudera Hindia.
Keyword: 

Judul: Deskripsi distribusi horisontal zooplankton dan hubungannya dengan parameter fisika dan kimia perairan di Perairan Teluk Pelabuhan Ratu
Abstrak: Penelitian dilakukan di perairan Teluk Pelabuhan Ratu, Kabupaten Sukabumi, Propinsi Jawa Barat. Penelitian berlangsung pada bulan Mei-Juli 1994. Tujuan penelitian, pertama, untuk mengetahui struktur komunitas zooplankton yang meliputi kelimpahan, komposisi dan keanekaragaman zooplankton. Kedua, untuk mengetahui pola distribusi horisontal zooplankton dan hubungannya dengan beberapa parameter fisika dan kimia perairan di perairan tersebut. Hasil penelitian menunjukkan bahwa nilai kelimpahan zooplankton rendah, yaitu berkisar 12157-37500 ind/m³. Dari kelimpahan zooplankton yang diperoleh, organisme dari Kelas Chromonadea menduduki jumlah terbanyak, sebesar 73%; organisme Kelas Crustacea sebesar 18%; sisanya sebesar 1% (Kelas Urochordata, Kelas Sarcodina, Kelas Mollusca, Kelas Scyphomedusae, Kelas Polychaeta, Kelas Rhizopodea, Kelas Rotatoria, Kelas Bryozoa dan Kelas Saggitodea). Indeks struktur komunitas zooplankton menunjukkan bahwa indeks keanekaragaman zooplankton rendah, yaitu berkisar 1.317-2.345; nilai indeks keseragaman zooplankton berkisar 0.447-0.732; dan tidak adanya dominansi suatu jenis organisme zooplankton tertentu pada stasiun-stasiun pengamatan. Pola penyebaran horisontal zooplankton menunjukkan kecende- rungan menurunnya kelimpahan zooplankton ke arah menjauhi pantai ...dst
Keyword: 

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA