Judul: Isolasi Pregnancy Associated Glycoprotein dari Plasenta Sapi Peranakan Ongole
Abstrak: Pregnancy associated glycoprotein (PAG) merupakan protein penanda kebuntingan anggota superfamili aspartat proteinase (AP) yang diekspresikan oleh sel-sel binukleat pada lapisan trophoblast plasenta mamalia terutama pada hewan ruminansia. Protein tersebut digunakan sebagai indikator kebuntingan ternak sapi mulai hari ke-26 pasca perkawinan. Penelitian ini bertujuan untuk memperoleh karakter dan isolat PAG dari plasenta sapi potong peranakan ongole (PO) sebagai substansi spesifik penanda kebuntingan. Jaringan plasenta sapi PO diperoleh dari rumah potong hewan lokal kemudian dilakukan proses pembersihan menggunakan NaCl 0.9% dan pengambilan placentom, selanjutnya disimpan pada suhu -85⁰C. Jaringan placentom dilakukan proses pembuatan sediaan histologi untuk identifikasi sel-sel penghasil PAG dan ekstraksi dengan perlakuan sentrifugasi serta presipitasi asam untuk memperoleh ekstrak placentom. Selanjutnya ekstrak dilakukan pemisahan protein menggunakan metode kolom terbuka Sephadex gel G-75 dan fraksi yang diperoleh dikarakterisasi dengan elektroforesis protein SDS PAGE. Fraksi kolom kemudian dianalisis menggunakan HPLC dan puncak protein yang terbentuk diisolasi serta diukur konsentrasinya menggunakan metode Lowry. Isolat protein yang diperoleh selanjutnya dilakukan konfirmasi menggunakan anti-bPAG-1 dengan metode ELISA. Hasil elektroforesis protein monogel SDS PAGE diperoleh pita protein dengan berat molekul 63.17-65.78 kDa yang tidak berbeda jauh dengan profil bPAG-1 pada berat molekul 48.69-70.03 kDa. Hasil kromatogram HPLC diperoleh 5 puncak protein dengan satu diantaranya (P2) mempunyai profil yang identik dengan bPAG-1 yaitu pada waktu retensi 6.464 menit. Hasil isolasi dari masing-masing puncak dan pengukuran total protein diperoleh protein dengan konsentrasi tertinggi yaitu pada puncak ke-2 (P2) 19.75±4.60 μg/ml serta puncak ke-3 (P3) 27.5±0.00 μg/ml. Induksi reaksi silang terhadap anti-bPAG-1 menunjukkan hasil positif untuk P2 dan P3, hal tersebut mengindikasikan bahwa isolat protein dari placentom sapi PO tersebut merupakan variasi dari PAG-1 karena memiliki kedekatan karakteristik dengan bPAG-1 sehingga berpotensi untuk digunakan sebagai substansi spesifik penanda kebuntingan untuk sapi PO.
Keyword: Pregnancy Associated Glycoprotein, sapi PO, indikator kebuntingan, substansi spesifik, substansi spesifik

Judul: Identifikasi Single Nucleotide Polymorphism Ekson 2.2 Gen PLAG1 pada Sapi Bali, Peranakan Ongole dan Limousin
Abstrak: PLAG1 merupakan gen yang berada di kromosom 14 pada sapi yang diduga memiliki hubungan dengan sifat pertumbuhan dan penambahan bobot badan. Tujuan dari penelitian ini adalah mengidentifikasi Single Nucleotide Polymorphism (SNP) ekson 2.2 Gen Pleomorphic Adenoma 1 (PLAG1) pada Sapi bali, PO, dan limousin. Penelitian ini menggunakan teknik direct sequencing pada 15 sampel darah sapi bali jantan, 15 sampel darah sapi bali betina, 8 sampel darah sapi PO, dan 8 sampel darah sapi limousin. Hasil sequencing kemudian dianalisis menggunakan program BLAST dari NCBI, Finch TV, BioEdit dan Popgene. Identifikasi keragaman SNP dianalisis dengan menggunakan pendekatan ClustalW menggunakan program MEGA10. Hasil amplifikasi ekson 2.2 gen PLAG1 pada 3 bangsa sapi berbeda diperoleh 11 SNP bersifat polimorfik dan frekuensi alelnya memenuhi kriteria keseimbangan Hardy-Weinberg. SNP yang ditemukan pada sapi bali berjumlah 6 yaitu c.1654 A>C, c.1660 G>A, c.1720 C>T, c.1753 A>G, c.1759 G>A dan c.1870 G>A, pada sapi PO ditemukan 2 SNP c.1822 A>T dan c.2050 A>G, dan pada sapi limousin ditemukan 3 SNP c.1779 T>C, c.1792 C>T dan c.1818 C>G.
Keyword: gen PLAG1, sapi, sequencing, SNP

Judul: Tinjauan Matematis pada Model Makroskopik dan Mikroskopik Arus Lalu-lintas
Abstrak: Traffic flow phenomenon can be described through mathematical model such as continuous dynamic model with an ordinary differential equation so that it can be solved with integral factors. In this paper three simple models of traffic flow are discussed, i.e, two macroscopic and one microscopic models. Macroscopic model formulates dynamics of the traffic flow that occurs on a large number of vehicles on a road. While the microscopic model explains drivers’ behavior in their interaction with other vehicles ahead, i.e, car-following model. This paper shows the existence of ordinary differential equation found in the traffic flow model and indicates some different representations in the context of the same model. It also reviews a simple model of traffic flow along a single link, which leads to some unexpected results, i.e, it can express the solution model in term of link outflows as well as trip time. In the microscopic model, simulation is done to illustrate the behavior of the drivers with a sensitivity coefficient as a benchmark parameter.
Keyword: