Judul: Deteksi diferensial Tomato chlorosis virus (ToCV) dan Tomato infectious chlorosis virus (TICV) dengan reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR)
Abstrak: Tanaman tomat (Lycopersicon esculentum Mill.) merupakan salah satu komoditas hortikultura yang sangat potensial untuk dikembangkan. Namun, upaya peningkatan produksi dan mutu tomat untuk memenuhi kebutuhan nasional dan ekspor menghadapi banyak kendala, salah satunya adalah gangguan organisme pengganggu tumbuhan (OPT). Beberapa tahun terakhir ini terdapat penyakit baru yang menyerang tanaman tomat yang disebabkan oleh Tomato chlorosis virus (ToCV) dan Tomato infectious chlorosis virus (TICV). Penyakit yang diinduksi oleh ToCV maupun TICV tidak dapat dibedakan gejalanya. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan metode deteksi diferensial TICV dan ToCV melalui reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). Sampel tanaman tomat yang positif terinfeksi tunggal oleh ToCV maupun TICV, dan yang positif terinfeksi ganda oleh TICV dan ToCV diperoleh dari hasil penelitian terdahulu. Untuk menguji penerapan metode RT-PCR terhadap sampel dari lapangan, beberapa sampel juga diperoleh dari sentra produksi tomat di beberapa daerah seperti Cianjur, Cipanas, Lembang, dan Garut. Sampel daun yang diambil dari lapangan di ekstraksi dan dideteksi dengan metode RT-PCR dan PCR, kemudian hasil PCR dielektroforesis. Untuk dapat membedakan virus ToCV dan TICV yang menginfeksi tanaman tomat, deteksi dilakukan dengan menggunakan primer khusus, yaitu ToCV-CF (5’GTGTCAGGCCATTGTAAACCAAG-3’) ToCV-CR (5’CACAAAGCGTTTCTTTTCATAAGCAGG-3’), TICV-CF (5’AATCGGTAG TGACACGAGTAGCATC-3’) dan TICV-CR (5’-CTTCAAACATCCTCCATCT GCC-3’) yang dapat mengamplifikasi virus secara terpisah. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa pasangan primer ToCV dan TICV benar-benar spesifik hanya mendeteksi virusnya masing-masing. Panjang pita produk RT-PCR untuk ToCV diperoleh 360 bp, sedangkan untuk TICV adalah 417 bp. Kedua pasang primer untuk ToCV dan TICV yang dicampur dapat digunakan untuk mendeteksi kedua virus ini, baik yang menginfeksi tunggal maupun bersama-sama dalam jaringan tanaman tomat. Selain utuk mendeteksi virus, metode RT-PCR dengan kedua pasang primer ini juga dapat diterapkan untuk diagnosis.
Keyword: 

Judul: Uji Serologi Diferensial dan Simultan untuk Tomato chlorosis virus (ToCV) dan Tomato infectious chlorosis virus (TICV) pada Tanaman Tomat
Abstrak: Tomato clorosis virus (ToCV) dan Tomato infectious chlorosis virus (TICV) merupakan Criniviruses yang mengakibatkan gejala yang sama berupa klorosis pada tomat. Penyakit ini ditandai dengan klorosis pada jaringan antar tulang daun, daun menjadi lebih tebal dan rapuh, beberapa daun mengalami nekrotik, dan bagian daun berubah menjadi merah keunguan (bronzing). Kedua virus ini menyebabkan penurunan kuantitas dan kualitas produksi buah, sehingga menjadi masalah yang serius pada pertanaman tomat di Indonesia. Antiserum poliklonal yang diproduksi menggunakan protein selubung masing-masing virus yang diekspresikan pada Escherichia coli telah tersedia sebelumnya. Penelitian ini bertujuan menggunakan antiserum tersebut untuk menganalisa hubungan serologis kedua virus dan untuk pengembangan metode deteksi diferensial dan simultan. Tanaman tomat yang terinfeksi tunggal maupun ganda oleh ToCV dan TICV, yang telah dianalisis terlebih dahulu dengan diferensial reverse transcription-polymerase chain reaction, digunakan sebagai sumber virus. Analisis menggunakan gel agarose presipitation test (AGPT) dan dot immunobinding assay (DIBA), ditemukan bahwa tidak ada reaksi silang yang diamati antara antiserum ToCV dan TICV. Hal ini menunjukkan bahwa kedua virus tersebut tidak memiliki hubungan serologi. Sehingga berimplikasi bahwa kedua antiserum tersebut dapat digunakan dalam metode deteksi serologi diferensial untuk ToCV dan TICV. Selanjutnya, campuran antiserum ToCV dan TICV dalam AGPT dan DIBA dapat mendeteksi kedua virus dalam jaringan tanaman tomat yang terinfeksi ganda. Deteksi kedua virus secara simultan dalam uji serologi tunggal dapat menghemat waktu dan biaya. Metode serologi yang dikembangkan pada penelitian ini diharapkan menjadi cara terbaik untuk diagnosis kedua virus ini.
Keyword: agarose gel presipitation test, antiserum, Crinivirus, dot immunobinding assay

Judul: Kekonsistenan Hamiltonian pada Gerak Gelombang Interfacial
Abstrak: The interfacial wave is an internal wave that occurs at boundary of two layers fluid. It appears because there is difference of mass density between the two layers. The objective of this thesis is to formulate the motion of internal wave with flat base and flat as well as free upper bound surface. The motion equation obtained is a Hamiltonian system. The Hamiltonian in this system is expressed by variable of wave deviation and horizontal component of potential velocity. Under assumption that interfacial wave moves only in one direction, it can be shown that the Hamiltonian depends on the solution of the wave motion equation. The coefficients of the equation depend on the physical characteristics of the two layers of fluid, i.e. thickness and mass density. The numerical results show that Hamiltonian in the system is constant. It is consistent with Hamiltonian characteristic, which does not depend on time.
Keyword: