Judul: Deteksi cucumber mosaic virus (CMV) penyebab penyakit kuning pada tanaman lada
Abstrak: Lada merupakan salah satu tanaman rempah yang memiliki manfaat cukup beragam baik sebagai rempah maupun sebagai obat untuk menyembuhkan berbagai macam penyakit pada manusia seperti sakit perut, demam, dan malaria. Indonesia tercatat sebagai salah satu negara produsen dan pengekspor lada terbesar di dunia. Namun dalam perkembangannya, ekspor lada Indonesia mengalami penurunan karena beberapa tahun terakhir ini banyak negara lain yang mempunyai potensi untuk bersaing menjadi negara produsen dan pengekspor lada. Selain itu, penurunan ini juga disebabkan rusaknya tanaman lada di sentra produksi akibat serangan hama dan penyakit. Salah satunya adalah penyakit kuning yang disebabkan oleh virus. Penelitian ini bertujuan untuk mendeteksi dan mengidentifikasi virus penyebab penyakit kuning pada tanaman lada. Pengamatan penyakit kuning telah dilakukan pada pertanaman lada di Instalasi Penelitian Balai Penelitian Tanaman Rempah dan Obat di Sukabumi. Tanaman yang sakit memperlihatkan gejala bercak klorotik pada daun muda, daun menjadi melengkung dan melepuh. Insiden penyakit kuning di kebun koleksi ini sangat tinggi, mencapai 95,71 % dari 350 tanaman yang diamati. Beberapa daun dari tanaman lada sakit digunakan sebagai bahan untuk deteksi dan identifikasi patogen yang berasosiasi dengan penyakit kuning. Pengujian melalui enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) memperlihatkan bahwa sebagian besar sampel tanaman lada (34 dari 37 tanaman sampel) positif bereaksi dengan serum anti-CMV. Hasil pengujian ini memberi arah deteksi/identifikasi patogen sasaran yang akan dilakukan. dsRNA yang diekstraksi dari tanaman lada sakit dengan metode Doodds et al. (1984) ditemukan terseparasi menjadi empat spesies dalam elektroforesis pada gel agarose. Ukuran keempat spesies dsRNA ini sama dengan ukuran dsRNA CMV yang diektraksi dari tanaman tembakau yang digunakan sebagai standar. Demikian juga reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) yang telah dilakukan dengan menggunakan primer yang didesain berdasarkan sikuen genom CMV-B2 (Suastika 1996) berhasil mengamplifikasi dsRNA yang digunakan sebagai cetakan. Hasil ini sudah sangai cukup untuk mengatakan bahwa penyakit kuning pada tanaman lada berasosiasi dengan CMV. Untuk lebih menyakinkan, virus pada tanaman lada ini telah dimurnikan dengan metode Francki et al. (1979). Pengamatan partikel virus dalam siapan murni dengan mikroskop elektron menemukan bahwa virus berbentuk bulat dan berukuran 28 nm, yang merupakan ciri dari Cucumovirus dimana CMV termasuk di dalamnya.
Keyword: 

Judul: Pengendalian cucumber mosaic virus pada tanaman tomat dengan satelit RNA
Abstrak: Cucumber mosaic virus (CMV) termasuk patogen utama pada tanaman tomat di Indonesia. Virus ini dapat menyebabkan mosaik, kekerdilan tanaman, malformasi dan nekrotik pada daun dan buah. Sampai saat ini belum didapatkan cara pengendalian yang efektif. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui potensi satelit RNA yang berasosiasi dengan CMV isolat lemah yaitu CMV-MP1 dan CMV-NI dalam melindungi tanaman tomat dari pengaruh infeksi CMV isolat ganas di lapang. Inokulasi vaksin dilakukan dengan membuat luka mikro dengan menaburi seluruh permukaan bibit tomat dengan cellite dan vaksin disemprotkan pada bibit tersebut. Setelah sekitar seminggu dipelihara dalam solipot, bibit tomat tersebut dipindah-tanam di petak-petak percobaan. Pengamatan dilakukan setiap minggu setelah tanam selama 9 minggu. Peubah yang diamati yaitu kejadian penyakit, berat dan jumlah buah yang sehat dan sakit, tinggi tanaman dan nilai brix. Data yang diperoleh dianalisis menggunakan program SAS. Berdasarkan hasil ELISA diketahui bahwa kejadian penyakit oleh CMV pada petak percobaan cukup tinggi yaitu sekitar 30%. Tingkat infeksi CMV ini diharapkan mempunyai kontribusi yang cukup dalam hal mempengaruhi produksi tanaman tomat. Pada percobaan ini, walaupun analisis statistik mengatakan bahwa tidak terdapat perbedaan nyata antara kuantitas (bobot dan jumlah) buah tanaman yang divaksin dengan tanaman yang tidak divaksin, tetapi terlihat kecenderungan bahwa tanaman yang divaksin MP1 atau N1 menghasilkan buah lebih banyak dari pada tanaman kontrol. Tanaman tomat yang diberi vaksin MP1 atau NI menghasilkan buah sehat yang nyata lebih tinggi dibandingkan tanaman yang tidak divaksin. Dapat juga dikatakan bahwa perlakuan vaksin MP1 dan N1 dapat mengurangi kuantitas (berat) buah sakit. Vaksin MPI dan N1 tidak berpengaruh buruk pada tanaman tomat yang diberi perlakuan terbukti dari pertumbuhan tanaman tidak memperlihatkan perbedaan dibandingkan dengan pertumbuhan tanaman yang tidak diberi vaksin. Nilai Brix menggambarkan jumlah gula terlarut dalam buah tersebut. Dalam percobaan ini, perlakuan vaksin ternyata tidak mempengaruhi nilai Brix dari buah tomat
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: