Judul: Isolasi dan Konstruksi Novel Strain Khamir untuk Peningkatan Performa Produksi Etanol Menggunakan Hidrolisat Lignoselulosa
Abstrak: Mikrob yang mampu memfermentasi xilosa masih sedikit dan menjadi salah satu kendala produksi bioetanol generasi kedua. Saccharomyces cerevisiae yang umum digunakan dalam produksi etanol secara alami tidak memiliki kemampuan memfermentasi xilosa, sehingga mengakibatkan konsentrasi etanol dari fermentasi lignoselulosa menjadi relatif rendah. Di samping itu, organisme yang mampu memproduksi etanol dari glukosa atau xilosa masih memiliki viabilitas rendah terhadap inhibitor yang dihasilkan dari hidrolisis lignoselulosa. Oleh karena itu, tujuan penelitian ini yaitu melakukan isolasi, skrining, identifikasi molekuler, dan rekayasa genetik khamir penghasil bioetanol dengan teknik genome shuffling untuk meningkatkan performa produksi etanol menggunakan hidrolisat lignoselulosa. Isolasi khamir dilakukan dengan metode sebar di media Yeast Potato Xylose Agar (YPXA) dan Yeast Potato Glucose Agar (YPGA). Khamir yang tumbuh dievaluasi kemampuannya memproduksi etanol menggunakan YPX dan YPG cair. Substrat dan produk fermentasi dianalisis menggunakan HPLC dengan kolom Hi-plex H for carbohydrate dan detektor Refraction Index Detector. Identifikasi molekuler khamir terpilih dilakukan dengan menganalisis daerah ITS1-ITS4. Kemampuan penggunaan jenis gula isolat khamir terpilih juga diidentifikasi dengan mengevaluasi secara kualitatif pertumbuhanya pada media padat yang mengandung glukosa, xilosa, fruktosa, sukrosa dan CMC. Toleransi isolat khamir terpilih terhadap inhibitor furfural-HMF dievaluasi menggunakan metode fermentasi sedangkan toleransi terhadap etanol dievaluasi dengan metode spot assay. Konstruksi novel strain dilakukan melalui metode genome shuffling antara isolat yang berkemampuan baik memfermentasi xilosa (KBKTI 10-5.1) dan isolat yang berkemampuan baik memfermentasi glukosa serta toleran terhadap senyawa furfural dan HMF (DBY1). Mutan diseleksi berdasarkan kemampuan tumbuhnya pada media glukosa dan xilosa secara terpisah dan dilanjutkan dengan analisis RAPD untuk membedakan secara gentik antar mutan. Kemampuan produksi etanol pada media YPXG maupun hidrolisat lignoselulosa oleh tetua dan mutan diuji menggunakan fermentasi sistem batch. Diperoleh 24 isolat murni dari media YPXA dan 22 isolat murni dari media YPGA. Isolat terpilih identik dengan Candida tropicalis, Cyberlindnera jadini, Wickerhamomyces anomalus, Pichia anomala, dan S. cerevisiae. Etanol yang diproduksi oleh mutan Fcs1 dan Fcs4 pada hidrolisat asam rumput gajah mengalami peningkatan 26,58% dan 24,17% dari tetua DBY1 serta 14,94% dan 21,84% dari tetua KBKTI 10-5.1. Berbeda dengan produksi etanol pada hidrolisat basa rumput gajah, mutan Fcs1 dan Fcs4 hanya mengalami peningkatan produksi etanol sebesar 1,35% dari tetua KBKTI 10-5.1. Produktivitas etanol oleh mutan Fcs1 dan Fcs4 pada hidrolisat asam rumput gajah mencapai 0,042 g/L/h dan 0,044 g/L/h. Rekombinasi genom antara spesies khamir menghasilkan novel strain khamir yang mampu meningkatkan produktivitas etanol pada hidrolisat asam
Keyword: Biofuels, fermentation, genetic engineering, lignocellulosic

Judul: Seleksi Khamir Penghasil Bioetanol dan Analisis Filogenetik Berdasarkan Sekuen Daerah Internal Transcribed Spacer
Abstrak: Kebutuhan bahan bakar yang semakin bertambah perlu diiringi upaya untuk mencari sumber energi alternatif seperti bioetanol. Khamir umum digunakan untuk fermentasi bioetanol. Penelitian ini bertujuan melakukan seleksi khamir penghasil bioetanol dengan konsentrasi tinggi menggunakan high-performance liquid chromatography (HPLC) dan mengidentifikasi keragaman genetik atau analisis filogenetik dengan mengamplifikasi daerah internal transcribed spacer (ITS). Hasil penelitian ini menunjukkan khamir mampu hidup dalam konsentrasi glukosa dan xilosa tinggi, tetapi tidak mampu mengonsumsi selulosa. Isolat khamir yang berpotensi menghasilkan kadar etanol tinggi adalah RAGI NKL 10.5.2.3 dan TKH (BGR) 10.5.2.1 yakni sebesar 2.61 g/L. Amplifikasi pada daerah ITS berhasil dilakukan dengan ukuran amplikon 400-900 pb. Amplikon pada domain D1/D2 26s rDNA sebesar 250 pb. Amplifikasi dengan primer spesifik ScerF2 dan ScerR2 berhasil dilakukan dan membuktikkan terdapat dua isolat yang bukan golongan Saccharomyces cerevisiae. Analisis keragaman genetik khamir menunjukkan 13 isolat khamir tergolong Saccharomyces cerevisiae dan sisanya masuk ke dalam genus Clavispora, Candida, dan Kodamaea (Pichia).
Keyword: Amplifikasi, bioetanol, fermentasi, identifikasi, khamir

Judul: Perdagangan reptilia sebagai binatang peliharaan di DKI Jakarta
Abstrak: DKI Jakarta in the world of wildlife trade is often referred as yellow dots, a city vulnerable to illegal trade. Wildlife trade in DKI Jakarta consists not only on ornamental fish, mammals and birds, but even reptiles. This study aims to describe trade locations, identify species of trade and analyze preferences of pet reptiles. The study was conducted in five traditional markets and 35 pet shops in DKI Jakarta, using interviews and investigative methods. I also carried out survey on cyber-market trade and interviews to pet reptile owners. The study was carried out from August 20th to November 20th, 2010. A total of 52 species (26 species of turtles, 23 snakes and three lizards) were traded on traditional markets, and 46 species (21 species of turtles, 19 species of snakes and six species of lizards) at the pet store. In traditional markets the common species sold are local species, but not on pet stores where most are imported species. In total, survey found five species of protected reptiles according to PP No. 7 of 1999, four species of Appendix I CITES’s reptiles and six species listed as critically endangered by IUCN Red List. Three forums in internet carried out cyber markets of pet reptiles. The most favorite pet reptiles were snakes, especially the ball python (Python regius).
Keyword: