Judul: Ovine Pregnancy-Associated Glycoprotein (ovPAG) as a marker of pregnancy on Garut Sheep
Abstrak: Pregnancy-associated glycoprotein (PAG) merupakan famili aspartik protease, terdapat di dalam sel trofektoderm plasenta ungulata. OvinePAG disintesa oleh sel mono- dan binukleat trofoblas sesaat menjelang implantasi pada hari ke 14-15. Oleh karena itu, PAG digunakan sebagai indikator penanda kebuntingan dini dan juga kesehatan fetus. Tujuan penelitia ini adalah ekstrasi dan isolasi ovPAG dalam kotiledon plasenta; memproduksi antibodi poliklonal (Rabbit anti-ovPAG); mendeterminasi ovPAG dalam urine domba bunting, dan pembuatan standar ovPAG. Kegiatan penelitian diawali dengan melakukan ekstraksi dan isolasi PAG dari plasenta domba garut yang dikoleksi pada saat melahirkan dan mengkarakterisasi PAG berdasarkan berat molekulnya. Pada saat melahirkan, kotiledon dikoleksi dari plasenta, disimpan pada -200C sampai seluruh induk domba (n=9 ekor) melahirkan. Selanjutnya kotiledon diekstrak dengan perlakuan presipitasi asam (H3PO41M, pH 4,5 ; sentrifus) dan garam (40% (NH4)SO4 dilanjutkan 80% (NH4)SO4, dan disentrifus). Berikutnya dilakukan isolasi protein melalui gel filtrasi (Sephadex G-75) dan kromatografi pertukaran anion (DEAE-cellulose). Fraksi yang ditampung diukur absorbansinya, fraksi yang memiliki absorbansi tinggi, diukur total proteinnya.
Keyword: 

Judul: Isolasi Pregnancy Associated Glycoprotein dari Plasenta Sapi Peranakan Ongole
Abstrak: Pregnancy associated glycoprotein (PAG) merupakan protein penanda kebuntingan anggota superfamili aspartat proteinase (AP) yang diekspresikan oleh sel-sel binukleat pada lapisan trophoblast plasenta mamalia terutama pada hewan ruminansia. Protein tersebut digunakan sebagai indikator kebuntingan ternak sapi mulai hari ke-26 pasca perkawinan. Penelitian ini bertujuan untuk memperoleh karakter dan isolat PAG dari plasenta sapi potong peranakan ongole (PO) sebagai substansi spesifik penanda kebuntingan. Jaringan plasenta sapi PO diperoleh dari rumah potong hewan lokal kemudian dilakukan proses pembersihan menggunakan NaCl 0.9% dan pengambilan placentom, selanjutnya disimpan pada suhu -85⁰C. Jaringan placentom dilakukan proses pembuatan sediaan histologi untuk identifikasi sel-sel penghasil PAG dan ekstraksi dengan perlakuan sentrifugasi serta presipitasi asam untuk memperoleh ekstrak placentom. Selanjutnya ekstrak dilakukan pemisahan protein menggunakan metode kolom terbuka Sephadex gel G-75 dan fraksi yang diperoleh dikarakterisasi dengan elektroforesis protein SDS PAGE. Fraksi kolom kemudian dianalisis menggunakan HPLC dan puncak protein yang terbentuk diisolasi serta diukur konsentrasinya menggunakan metode Lowry. Isolat protein yang diperoleh selanjutnya dilakukan konfirmasi menggunakan anti-bPAG-1 dengan metode ELISA. Hasil elektroforesis protein monogel SDS PAGE diperoleh pita protein dengan berat molekul 63.17-65.78 kDa yang tidak berbeda jauh dengan profil bPAG-1 pada berat molekul 48.69-70.03 kDa. Hasil kromatogram HPLC diperoleh 5 puncak protein dengan satu diantaranya (P2) mempunyai profil yang identik dengan bPAG-1 yaitu pada waktu retensi 6.464 menit. Hasil isolasi dari masing-masing puncak dan pengukuran total protein diperoleh protein dengan konsentrasi tertinggi yaitu pada puncak ke-2 (P2) 19.75±4.60 μg/ml serta puncak ke-3 (P3) 27.5±0.00 μg/ml. Induksi reaksi silang terhadap anti-bPAG-1 menunjukkan hasil positif untuk P2 dan P3, hal tersebut mengindikasikan bahwa isolat protein dari placentom sapi PO tersebut merupakan variasi dari PAG-1 karena memiliki kedekatan karakteristik dengan bPAG-1 sehingga berpotensi untuk digunakan sebagai substansi spesifik penanda kebuntingan untuk sapi PO.
Keyword: Pregnancy Associated Glycoprotein, sapi PO, indikator kebuntingan, substansi spesifik, substansi spesifik

Judul: Thermal Characteristics and Dynamics of Tropical Cyclone over Western North Pacific Ocean: A Case Study of Typhoon Songda (Chedeng) 2011
Abstrak: The frequent occasion of Tropical Cyclone (TC) over Western North Pacific (WNP) Ocean lies from 10˚N to 26˚N and 121˚E to 170˚E. Sources of TC development come from warm ocean temperature where latent heat is released during condensation processes and subsequently concentrated in the boundary layer. Relative humidity at 850-700 hPa is responsible to produce the most intense storm. Meanwhile, weak vertical wind shear between 850-200 hPa is one of the dynamical factors that lead to the development of TC. Pressure level of 850-200 hPa is chosen to minimize the thermodynamic effect in the lower troposphere. Typhoon Songda (Chedeng in the Philippines) or TSC lasted from May 18th to 30th, 2011 and strengthened into powerful Super Typhoon stage between May 24th and 27th. Long curving track and the exhibition of all sequences of TC life cycle, TSC is then considered as an ideal case of TC. The objective of the study with case of TSC is to investigate the role of thermal characteristics and dynamics on TC intensity. The research is carried out by using Advanced Research of Weather Research and Forecasting model (WRF ARW model) version 3.3. Two domains are employed in the model. The first domain situate from 02˚N to 40˚N and 118˚E to 149˚E and cover spatial resolution () of 33.1 km. The second domain situate from 09˚N to 27˚N and 119˚E to 132˚E with of 11 km. Timestep of the model () is 120 seconds. The model is supported by the following physical parameterization, i.e., Yonsei University Scheme (YSU) in the boundary layer, Kain-Fritsch scheme (KF) in the cumulus, and WRF Single-Moment 3-class scheme in the microphysics. Initial meteorological condition prior to the formation of the cyclone is generated using WRF ARW standard-release model. Sensitivity of the model output is obtained from a selected single-parameter change scenarios, namely, 10 % to 20 % decrease and increase of wind shear initial data at 850-200 hPa, and by 10 % to 20 % decrease of relative humidity initial data at 850-700 hPa. The result showed that the negative correlations between wind shear and intensity are found in wind shear scenarios. Wind shears of 10 ms-1 which lead to strengthening of the wind intensity in the early period of Typhoon development are found in wind shear scenarios. The effect of wind shear changes on wind intensity is statistically significant in the 20 % wind shear scenarios. During mature stage, weak wind intensity occurred when wind shear increase as given in the WRF standard-release and the 20 % decreasing scenario. Different situation is found in the 20 % increasing scenario where wind shear tend to weak and lead to strong wind intensity at this stage. Meanwhile, the reduction of moisture supply at 850-700 hPa resulting from 20 % decreasing relative humidity play a major role in the weakening of wind intensity and reduces mechanical energy of the cycle process as much as 300 J kg-1.
Keyword: