Judul: Ekspresi Gen FBPase/ClRan1 pada Tanaman Kentang (Solanum tuberosum L.) Kultivar Nooksack Transgenik Generasi G1.
Abstrak: Pemenuhan kebutuhan kentang industri dalam negeri masih terkendala oleh rendahnya kualitas dan produktivitas kultivar kentang. Nooksack merupakan kentang industri yang cocok untuk pembuatan french fries. Kentang ini memiliki daging umbi berwarna putih, kandungan pati tinggi, kandungan gula rendah, dan tahan terhadap penyakit layu bakteri, akan tetapi kentang ini memiliki produktivitas yang rendah. Perbaikan sifat kentang melalui cara konvensional masih terkendala oleh jumlah ploidi, sterilitas yang tinggi dan waktu, sehingga pendekatan rekayasa genetika dengan menyisipkan gen FBPase dan ClRan1 merupakan langkah cepat yang dapat dilakukan untuk mengatasi masalah produktivitas kentang. Fructose-1,6-bisphosphatase (FBPase) berperan penting dalam proses fotosintesis yang digunakan dalam sintesis fotosintat (pati dan sukrosa). Root activating number 1-GTPase (Ran1) berperan dalam pembelahan sel dan perkembangan akar pada saat kekeringan. Ekspresi berlebihan kedua gen tersebut diharapkan dapat meningkatkan fotosintesis dan memperbaiki perakaran untuk menyediakan kebutuhan fotosintesis sehingga dapat meningkatkan produktivitas umbi kentang. Kentang Nooksack telah berhasil ditransformasi dengan gen FBPase dan ClRan1, dan transformasi ini meningkatkan produksi umbi. Akan tetapi, integrasi dan ekspresi gen FBPase dan ClRan1 pada kentang transgenik generasi G1 belum dianalisis. Oleh sebab itu, penelitian ini bertujuan menganalisis integrasi dan ekspresi gen FBPase dan ClRan1 pada tanaman kentang Nooksack transgenik generasi G1. Penelitian ini menggunakan umbi kentang transgenik generasi G0 galur NKF1, NKF2, dan NT sebagai kontrol. Analisis fenotipe dilakukan pada tanaman yang berumur 6 dan 13 MST, dan analisis laju fotosintesis dilakukan pada umur 7 MST. Analisis ekspresi gen FBPase dan ClRan1 dilakukan dengan menggunakan qRT-PCR. Gen FBPase dan ClRan1 stabil terintegrasi pada genom kentang Nooksack transgenik generasi G1. Ekspresi gen FBPase dan ClRan1 pada galur transgenik lebih tinggi dari pada non-transgenik. Galur NKF1 memiliki ekspresi gen FBPase dan ClRan1 paling tinggi diantara galur yang lain berturut-turut yaitu 2.28 dan 6.69 kali lebih tinggi dibandingkan dengan non-transgenik. Galur NKF2 memiliki ekspresi FBPase dan ClRan1 berturut-turut yaitu 1.67 dan 3.59 kali lebih tinggi dibandingkan non-transgenik. Semakin tinggi ekspresi gen FBPase dan ClRan1 maka semakin baik fenotipe tanamannya dan produktivitas umbi kentang Nooksack semakin tinggi. Nooksack transgenik memiliki kualitas dan produktivitas yang tinggi, sehingga berpotensi digunakan untuk memproduksi kentang industri.
Keyword: ekspresi gen, gen FBPase, laju fotosintesis, produktivitas umbi, Ran1

Judul: Ekspresi Gen Hd3a pada Tanaman Kentang (Solanum tuberosum L.) Kultivar Nooksack Transgenik Generasi Klonal G1
Abstrak: Kentang (Solanum tuberosum L.) merupakan bahan pangan yang banyak dikonsumsi masyarakat Indonesia. Kebutuhan terbanyak terhadap kentang adalah pada bidang industri untuk pembuatan french-fries dan keripik kentang. Salah satu kultivar yang memiliki potensi sebagai bahan baku industri French-fries yaitu kultivar Nooksack. Namun, kelemahan dari kentang kultivar Nooksack adalah produktivitasnya yang rendah dan ukurannya yang tergolong kecil. Ekspresi berlebih pada gen Hd3a diharapkan dapat meningkatkan produksi umbi tanaman kentang kultivar Nooksack ini. Introduksi gen Hd3a ke dalam tanaman kentang kultivar Nooksack telah dilakukan sehingga menghasilkan tanaman kentang transgenik. Akan tetapi analisis ekspresi gen Hd3a di dalam tanaman transgenik tersebut belum pernah dilakukan. Analisis ekspresi diawali dengan penanaman tanaman kentang transgenik. Tanaman ditanam di media cocopeat dalam polybag dan ditempatkan di rumah kaca. Analisis fenotip menunjukkan bahwa tinggi tanaman, bobot kering tajuk, ukuran umbi, dan produksi umbi untuk tanaman transgenik NKH lebih tinggi daripada NK tanaman non-transgenik. Analisis ekspresi relatif dengan qRT-PCR menunjukkan bahwa tanaman transgenik NKH4 mengekspresikan gen Hd3a 6,53 kali lebih tinggi dan NKH5 3,46 kali lebih tinggi daripada tanaman non transgenik (NK). Hasil ini menunjukkan bahwa tingkat ekspresi gen Hd3a memiliki hubungan dengan pertumbuhan tanaman serta produktivitas umbi.
Keyword: ekspresi gen, gen Hd3a, kultivar Nooksack, transgenik

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: