Judul: Equivalence of Micro-Minerals and Anti-Nutritionals in Genetically Modified Rice Events Carrying cry1B::cry1Aa Fusion Genes
Abstrak: Padi pembawa fusi gen cry1B::cry1Aa yang mengekspresikan dua toksin dengan situs pengikatan berbeda dan memiliki keunggulan tahan terhadap hama penggerek batang padi kuning (Scirpophaga incertulas Wlk). sedang dikembangkan oleh Lembaga Ilmu Pengetahuan Indonesia (LIPI). Salah satu persyaratan pelepasan tanaman PRG (Produk Rekayasa Genetik) adalah pengujian keamanan pangan, diantaranya adalah uji kesepadanan substansial nutrisi dan anti nutrisi tanaman PRG terhadap tetuanya. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui konsentrasi Fe, Zn, asam fitat, dan aktivitas anti tripsin pada padi PRG Rojolele pembawa fusi gen cry1B::cry1Aa dan menilai kesepadanannya terhadap padi non PRG Rojolele tetuanya. Konfirmasi keberadaan dan kestabilan fusi gen cry1B::cry1Aa dilakukan menggunakan PCR terhadap 6 event padi PRG fusi gen cry1B::cry1Aa generasi ketujuh (T6) dan menunjukkan pita DNA berukuran 808 bp sesuai harapan. Penetapan konsentrasi mineral mikro Fe dan Zn dilakukan menggunakan metode energy-dispersive x-ray fluorescence spectrometry (ED-XRF) sebanyak tiga ulangan. Rata-rata konsentrasi mineral mikro Fe dan Zn pada beras dari 6 event padi PRG fusi gen cry1B::cry1Aa berturut-turut 20,1 mg/Kg – 21,7 mg/Kg dan 32,4 mg/Kg – 34,8 mg/Kg serta pada beras dari padi non PRG berturut-turut 20,0 mg/Kg dan 31,8 mg/Kg. Penetapan kadar asam fitat dilakukan menggunakan metode spektrofotometri sinar tampak sebanyak delapan ulangan. Panjang gelombang maksimum standar phytic acid diperoleh pada 494 nm. Persamaan regresi linier Y = -8,4171 X + 1,0124 dan koefisien determinasi 0,9997 diperoleh dari kurva kalibrasi standar phytic acid. Rata-rata konsentrasi asam fitat pada beras dari 6 event padi PRG 1,235 mg/g – 1,250 mg/g dan padi non PRG 1,244 mg/g. Penetapan aktivitas anti tripsin dilakukan menggunakan metode spektrofotometri sinar tampak sebanyak delapan ulangan. Persentase hambatan anti tripsin pada beras dari 6 event padi PRG dan padi non PRG 40% – 60%. Rata-rata aktivitas anti tripsin pada beras dari 6 event padi PRG 0,0025 TIU/mg – 0,0027 TIU/mg dan padi non PRG 0,0026 TIU/mg. Penilaian kesepadanan konsentrasi Fe, Zn, asam fitat, dan aktivitas anti tripsin diuji secara statistik menggunakan Independent sample t-test. Hasil pengujian menunjukkan nilai p > 0,05. Hasil ini mengindikasikan konsentrasi Fe, Zn, asam fitat, dan aktivitas anti tripsin pada beras dari 6 event padi PRG Rojolele fusi gen cry1B::cry1Aa setara dengan padi non PRG Rojolele tetuanya. Oleh sebab itu, dapat disimpulkan bahwa transgen tidak mempengaruhi kandungan mineral mikro Fe dan Zn serta anti nutrisi asam fitat dan aktivitas anti tripsin pada beras dari 6 event padi PRG Rojolele pembawa fusi gen cry1B::cry1Aa.
Keyword: anti tripsin, asam fitat, Fe, kesepadanan subtansial, Zn

Judul: Ekspresi gen katahanan Fusi Gen (Cry 1 B-cry 1 Aa) terhadap sciporphaga interculas WLK. pada oryza sativa L. Kultivar rojolele
Abstrak: Penggunaan varietas padi tahan hama melalui rekayasa genetika adalah salah satu alternatif potensial dalam menanggulangi hama penggerek batang padi (Sciporphaga interculas Wlk). Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan galur padi transgenik generasi ke-4 (T3) homozigot yang mengandung gen ketahanan terhadap serangga penggerek batang kuning (fusi gen (cry1B–cry1Aa)) berdasarkan analisis PCR dan bioasai pada skala rumah kaca (Biosafety Containment). Pola segregasi pada fusi gen cry1B-cry1Aa dan seleksi homozigot ditentukan berdasarkan hasil konfirmasi PCR. Uji ekspresi dilakukan pada semua galur padi transgenik kultivar Rojolele melalui bioasai pada fase vegetatif yang diinfeksi dengan 6 ekor larva serangga penggerek batang kuning per anakan. Hasil analisis PCR menggunakan ± 30 tanaman per galur menunjukan 4 dari 5 galur padi transgenik Rojolele generasi ke -4 mengandung fusi 2 gen cry (cryIB-cryIAa) (galur RFz 3.3.2 1-6; RFz 4.2.2 1-27; RFz 3.3.2.A 11-25; Rjl 04 2.2.4 25-22) bersegregasi 3 : 1 mengikuti ratio Mendel yaitu 3:1. Hanya 1 galur transgenik (galur RFz 4.2.3 28-15) yang diidentifikasi sebagai galur homozigot. Bioasai diamati selama 28 hari setelah infestasi terhadap 5 tanaman per galur transgenik positif gen cry. Gejala serangan (sundep) menunjukkan persentase serangan 0% dengan skala kerentanan 0 (sangat tahan). Sedangkan kontrol isogenik dan kontrol tahan menunjukkan serangan 20%- skala 5(agak rentan) dan 2.86%- skala 1(tahan). Sehingga dinyatakan terdapat korelasi positif antara hasil PCR dan bioasai. Disamping itu, gen fusi (cry1B–cry1Aa) dapat dinyatakan efektif untuk menurunkan serangan serangga penggerek batang kuning.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: