Judul: The Potency of Endophytic Bacteria to Enhance The Resistance of Black Pepper (Piper nigrum L.) againts Phytophthora capsici Leon, the Causal Agent of  Basal Stem Rot Disease (BSR).
Abstrak: Penyakit Busuk Pangkal Batang (BPB) yang disebabkan oleh cendawan P. capsici merupakan penyakit paling penting pada tanaman lada. Penyakit tersebut sudah menyebar di berbagai daerah penanaman lada di Indonesia. Kerugian hasil yang ditimbulkan oleh adanya penyakit BPB pada tanaman lada dapat mencapai 40% setiap tahun. Sampai saat ini belum ada cara efektif untuk mengendalikan penyakit BPB. Indonesia memiliki keanekaragaman mikroba yang sangat tinggi dan banyak diantaranya berpotensi sebagai agens pengendali hayati salah satunya adalah kelompok bakteri endofit. Penelitian ini bertujuan untuk mengeksplorasi dan mengidentifikasi bakteri endofit dari beberapa varietas tanaman lada yang mampu menekan perkembangan penyakit BPB serta menguji daya penekanan bakteri endofit terhadap penyakit BPB secara in vitro dan in vivo pada bibit tanaman lada. Eksplorasi bakteri endofit diisolasi dari tanaman lada yang diambil dari tiga jenis varietas yaitu varietas Natar, Petaling, dan Jambi. Isolat cendawan P. capsici yang digunakan dalam penelitian ini berasal dari koleksi Laboratorium Balai Penelitian Tanaman Obat dan Aromatik Bogor. Isolat yang diperoleh diseleksi potensi antagonismenya terhadap cendawan P. capsici dengan metode biakan ganda pada media PDA. Bakteri endofit terpilih dibiakkan pada media cair Luria Berthani (LB) kemudian diinkubasi bergoyang dengan kecepatan 150 rpm pada suhu ruang selama 72 jam. Perlakuan yang digunakan pada pengujian ini meliputi: aplikasi bakteri endofit secara tunggal, kombinasi antar isolat, aplikasi fungisida, dan kontrol tanpa aplikasi bakteri dan fungisida dengan 4 ulangan dan 5 sub unit bibit tanaman lada pada setiap ulangan. Pengamatan dilakukan terhadap masa inkubasi, kejadian penyakit, penekanan penyakit, keparahan penyakit, dan perkembangan penyakit. Isolat bakteri endofit terpilih diidentifikasi secara molekuler berdasarkan gen 16S rRNA. Ekstraksi DNA bakteri dilakukan menggunakan kit GeneadTM. Amplikasi gen 16 rRNA menggunakan primer universal 27(F5’-AGAG TT TGATCCTGGCTCAG-3’) dan 1492R (5’-GGTTACCTTGTT ACGA CTT-3’). Isolat bakteri terpilih dilakukan karakterisasi secara morfologi bakteri endofit, uji Gram menggunakan KOH 3%, penambat nitrogen, dan reaksi hipersensitif pada tanaman tembakau., Phytophthora capsici as causal agent of basal stem rot (BSR) disease on pepper plants (Piper nigrum L) is a major pathogen of this plant. The objective of this research was to get some endophytic bacteria were able to suppress the growth of Phytophthora capsici by two methods: (1) explored and identified endophytic bacteria from several varieties of pepper plants were able to suppress the progression of the disease, (2) endophytic bacterial antagonism were tested toward Phytophthora capsici by in vitro and in vivo. The results showed that 134 endophytic bacteria from leaves and roots of black pepper have been successfully isolated and produced three isolates selected. The three endophytic bacteria were DJ4, AN21, and DJ8. The incubation period of endophytic bacteria treatment was longer than control treatment, 12-15 days after inoculation (dai) and 10 dai, respectively. The application of endophytic bacteria in suppressing disease progression ranged 51.95% to 95.63% in black pepper seed. Severity of illness ranged from 0%-29.35%. Molecular characterization based on the sequence partial of 16S rRNA showed that three isolates of endophytic bacteria (DJ4, AN21, and DJ8) identified as Agrococcus jenensis, Delfitia tsuruhatensis, and Bacillus licheniformis, three endophytic bacteria were not phytopathogenic.
Keyword: Black pepper, Endophytic bacteria, Phytophthora capsici, Sequencing

Judul: Utilization of Endophytic Bacterial as Biological Agenst of Fusarium solani and Meloidogyne spp. on Pepper Plants
Abstrak: Penyakit kuning lada merupakan salah satu penyakit penting pada tanaman lada yang dapat menurunkan produktivitas pada daerah sentra lada di Indonesia. Patogen yang berasosiasi dengan penyakit ini yaitu nematoda Meloidogyne incognita dan cendawan Fusarium solani. Sampai saat ini pengendalian penyakit kuning lada yang menggunakan agens hayati terutama bakteri endofit hanya berfokus untuk mengendalikan salah satu jenis patogen saja. Di samping itu, pemanfaatan campuran dan konsorsium bakteri endofit sebagai agens hayati penyakit kuning lada juga masih kurang dikembangkan. Berdasarkan hal tersebut tujuan dari penelitian ini yaitu untuk mengevaluasi keefektifan isolat tunggal, campuran, dan konsorsium bakteri endofit terhadap F. solani dan Meloidogyne spp. serta pengaruhnya terhadap pertumbuhan tanaman lada. Penelitian ini dilaksanakan di Laboratorium Nematologi Proteksi Tanaman IPB dan Rumah Kaca Cikabayan IPB dari bulan Agustus 2020 hingga Mei 2021. Penelitian ini mencangkup perbanyakan isolat tunggal dan konsorsium bakteri endofit, uji kompatibilitas bakteri endofit, isolasi F. solani dan Meloidogyne spp. dari tanaman lada yang bergejala penyakit kuning di Kalimantan Barat, uji dual kultur dan mortalitas nematoda secara in vitro, uji karakterisasi fisiologi bakteri endofit terbaik, dan pengujian keefektifan bakteri endofit sebagai agen biokontrol penyakit kuning lada dan agen pemacu pertumbuhan tanaman lada di rumah kaca. Data dianalisis menggunakan rancangan acak lengkap (RAL) dengan uji Tukey pada taraf 5%. Pada penelitian ini sebanyak 17 isolat tunggal dan dua isolat konsorsium diperbanyak dari isolat koleksi yang diisolasi dari tanaman Pteris ensiformis, Elaeis guineensis, Areca catechu, Avicennia sp., Piper collubrium, Cymbopogon nardus, P. nigrum, Imperata cylindrica dan Mimosa pudica. Hasil uji kompatibilitas didapatkan sebanyak delapan isolat campuran yang kompatibel dan sembilan isolat campuran tidak kompatibel. Adapun hasil identifikasi patogen yang diisolasi dari akar tanaman lada yaitu diperoleh cendawan F. solani dan nematoda Meloidogyne spp. Hasil pengujian in vitro diketahui bahwa sebanyak 17 isolat tunggal, delapan isolat campuran dan dua isolat konsorsium mampu menghambat pertumbuhan miselium F. solani dan meningkatkan persentase mortalitas Meloidogyne spp. Isolat tunggal APE35, EG113, isolat campuran EG26+Labt1 dan isolat konsorsium PTM3 memiliki persentase daya hambat lebih baik dibanding isolat lain dan mampu meningkatkan persentase mortalitas nematoda Meloidogyne spp. di atas 70% secara in vitro. Hasil uji karakterisasi fisiologi menunjukkan bahwa keempat isolat dapat memproduksi protease, selulase, fitohormon IAA, dan menghasilkan senyawa volatil. Adapun isolat campuran EG26+Labt1 dan konsorsium PTM3 menunjukkan aktivitas kitinolitik dan hanya isolat konsorsium PTM3 yang mampu melarutkan fosfat. Hal ini merupakan salah satu mekanisme yang dimiliki bakteri endofit sebagai agen biokontrol dan pemacu pertumbuhan tanaman lada baik pada pengujian in vitro ataupun di rumah kaca. Hasil pengujian di rumah kaca menunjukkan bahwa isolat tunggal APE35, EG113, isolat campuran EG26+Labt1 dan isolat konsorsium PTM3 mampu menekan kejadian penyakit kuning dan keparahan penyakit kuning. Perlakuan keempat bakteri endofit pada bibit tanaman lada juga dapat menurunkan jumlah puru dan populasi nematoda pada akar tanaman lada. Selain itu, perlakuan keempat isolat bakteri endofit berpengaruh nyata dalam meningkatkan pertumbuhan tanaman pada peubah tinggi tanaman, jumlah daun, jumlah buku, dan bobot basah tajuk tanaman lada. Perlakuan isolat campuran EG26+Labt1 pada bibit lada menunjukkan pertumbuhan yang lebih baik dibanding perlakuan isolat lain., Pepper yellow disease is one of the important diseases in pepper plants that can reduce productivity
Keyword: biokontrol, dual kultur, mortalitas, pemacu pertumbuhan

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: