Judul: Characterization of Sorghum Germplasm Resistance to Disease
Abstrak: Sorgum (Sorghum bicolor L. Moench) merupakan salah satu sumber karbohidrat alternatif di Indonesia. Tanaman sorgum memiliki keunggulan dalam daya adaptasi yang luas dan tahan cekaman kekeringan. Biji sorgum mengandung gizi yang tinggi dengan kandungan unsur pangan fungsional seperti antioksidan, zat besi dan vitamin B sehingga sorgum baik dijadikan sebagai sumber karbohidrat sehat untuk diversifikasi bahan pangan. Penyakit merupakan kendala dalam budidaya sorgum dan ketahanan terhadap penyakit karat merupakan syarat pelepasan varietas sorgum. Skrining plasma nutfah terhadap penyakit penting diperhatikan untuk pengembangan varietas sorgum yang tahan penyakit. Penelitian ini terdiri atas dua percobaan. Percobaan pertama bertujuan untuk memperoleh informasi mengenai karakter morfologi, agronomi dan tingkat ketahanan terhadap penyakit bercak ter, antraknosa dan karat daun. Percobaan kedua bertujuan untuk memperoleh informasi mengenai gen ketahan terhadap karat daun menggunakan primer spesifik. Percobaan pertama dan kedua menggunakan 48 genotipe koleksi Bank Gen Pertanian Indonesia di Balai Besar Penelitian dan Pengembangan Bioteknologi dan Sumber Daya Genetik Pertanian (BB Biogen) Kementerian Pertanian dan tujuh pembanding yang terdiri atas empat varietas nasional dan tiga genotipe hasil pemuliaan IPB. Penelitian dilaksanakan dari Januari hingga Agustus 2021. Percobaan pertama dilaksanakan di Kebun Percobaan Departemen Agronomi dan Hortikultura (AGH) IPB, identifikasi patogen karat daun di Klinik Tanaman Departemen Proteksi Tanaman (PTN) IPB, dan perhitungan stomata di laboratorium Mikroteknik AGH IPB. Percobaan disusun dalam Rancangan Perbesaran (Augmented). Penelitian ini menggunakan Spreader Row (SR) sebagai sumber inokulum alami penyakit karat daun, antraknosa dan bercak ter. Hasil penelitian menunjukkan karakter tinggi tanaman, jumlah daun dan panjang malai berkorelasi positif secara nyata terhadap tingkat keparahan penyakit. Genotipe sorgum rentan terhadap bercak ter dan moderat terhadap antraknosa serta tahan terhadap karat daun. Percobaan kedua dilakukan di Laboratorium Biologi Molekuler BB Biogen. Penelitian diawali dengan penelusuran gen ketahanan karat daun. Kandidat gen yang diidentifikasi adalah gen Rp1D yang berasal dari jagung dan gen Lr34 dari gandum. Primer untuk mengidentifikasi gen Rp1D adalah primer yang studi pustaka. Identifikasi gen Lr34 menggunakan primer yang dirancang menggunakan informasi dari NCBI. Total primer yang digunakan ada tiga yaitu Rp1D, Lr34 like 2 dan Lr34 like 2. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa genotipe sorgum menunjukkan satu pita yang sama (monomorfik) di setiap primer yang digunakan., Sorghum (Sorghum bicolor L. Moench) is one of the alternative sources of carbohydrates found in Indonesia. The sorghum plant has wide adaptability and drought resistance advantages. Sorghum grains contain high nutrients, with antioxidants, iron, and vitamin B that makes sorghum a healthy source of carbohydrates in food diversification. Plant disease is a constraint in sorghum cultivation, and resistance to rust disease is a requirement for the release of sorghum varieties. Therefore, germplasm screening for disease resistance is important for the development of disease resistant varieties of sorghum. This study consisted of two experiments. The first study aimed to obtain information on morphological and agronomic characters and resistance to tar spot, anthracnose. The second study aimed to obtain information on the gene for resistance to leaf rust using specific primers. Both studies used 48 genotypes from the Indonesian Agriculture Gene Bank collection at the Center for Research and Development of Biotechnology and Agricultural Genetic Resources, Ministry of Agriculture (ICABIOGRAD)
Keyword: antraknosa, bercak ter, karat daun, rancangan augmented, spreader row

Judul: Performance of Characters from Local Varieties, National Varieties, and Breeding Lines of Sorghum
Abstrak: Sorgum merupakan tanaman serealia dengan daya adaptasi yang luas dan memiliki banyak manfaat. Benih unggul yang masih sulit diperoleh dan terbatas menjadi salah satu masalah dalam pengembangan sorgum di Indonesia. Terdapat beberapa jenis sorgum varietas lokal, varietas nasional, dan galur-galur hasil pemuliaan yang perlu dilakukan uji keragaan karakter agronomi, hasil, dan ketahanan penyakit untuk memperoleh varietas dan galur sorgum yang berpotensi dikembangkan dalam program pemuliaan tanaman dan dilepas sebagai varietas baru. Penelitian dilaksanakan pada bulan Februari-Juli 2021 di Kebun Percobaan Leuwikopo dan Laboratorium Pemuliaan Tanaman, Departemen Agronomi dan Hortikultura, IPB University. Rancangan percobaan yang digunakan adalah rancangan kelompok lengkap teracak satu faktor yaitu genotipe dengan tiga ulangan. Berdasarkan analisis ragam semua genotipe memiliki keragaman karakter agronomi dan hasil yang diamati, juga keragaman karakter pada keparahan penyakit kecuali karat daun saat 60 dan 70 hari setelah tanam (HST), serta busuk batang. Genotipe A-125-1-6-1-6 berpotensi dikembangkan sebagai bahan pangan dan pakan ternak. Genotipe C-375-17-1-5 berpotensi dikembangkan sebagai bahan pangan dengan tinggi tanaman sedang. Genotipe Pulut 5 berpotensi dijadikan tetua untuk menghasilkan sorgum berumur genjah. Genotipe dari galur hasil pemuliaan menunjukkan respon sangat tahan terhadap penyakit antraknosa dan karat daun, kecuali Soraya 3. Varietas lokal memiliki respon ketahanan penyakit tahan dan agak tahan., Sorghum is categorized as a cereal crop with a wide range of adaptability and numerous advantages. Superior seeds are still difficult to obtain and limited supplay is one of the challenges in Indonesia sorghum development. There are several types of sorghum local varieties, national varieties, and breeding lines that need to be tested for the performance of agronomic characters, yield, and disease resistance in order to obtain sorghum varieties and lines with the potential to be developed in plant breeding programs and released as new varieties. The experiment was conducted from February-July 2021 at Leuwikopo Experimental Field and Plant Breeding Laboratory, Department of Agronomy and Horticulture, IPB University. The experimental design used was a randomized complete block design with one genotype treatment factor, in three replications. The result of the analysis of variance, showed that all genotypes had variability in agronomic characters and yield, as well as variability in disease severity, with the exception of leaf rust at 60 and 70 days after planting (DAP), and stem rot. Genotype A-125-1-6-1-6 has the potential to be developed as food and animal feed ingredient. Genotype C-375-17-1-5 has the potential to be developed as food plant with a medium plant height. The pulut 5 genotype has the potential to be used as parents in the production of early-aged sorghum. The breeding lines showed a very resistant response to anthracnose and leaf rust, except for the Soraya 3. Disease resistance reponses in local varieties are resistant and moderately resistant.
Keyword: analisis ragam, genotipe, karakter, keragaman, ketahanan penyakit

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: