Judul: Studi Tentang Distribusi Spasial Dan Perubahan Musiman Kelimpahan Ikan Pelagis Di Perairan Teluk Ambon
Abstrak: Salah satu ciri khas ekosistem perikanan laut adalah adanya perubahan yang tidak pemah berhenti, maka pengetahuan tentang kelimpahan dan pola distribusi kelompok ikan di suatu perairan terutama dalam kaitannya dengan perubahan musim dan kondisi oseanografi perairan sangat penting untuk diketahui, sebab pendugaan dan pengkajian stok merupakan komponen dasar dalam pengelolaan sumberdaya perikanan. Untuk mengetahui pola distribusi spasial dan perubahan musiman kelimpahan ikan pelagis di perairan Teluk Ambon, telah dilakukan penelitian pada musim Barat, musim Peralihan I dan musim Timur tahun 1996, dengan menggunakan peralatan dan metode hidroakustik. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menduga kelimpahan dan distribusi spasial dari ikan pelagis kecil di perairan T eluk Ambon serta perubaha,711ya menurut musim, melihat pola distribusi beberapa parameter oseanografi pada musim Barat, musim Peralihan I dan musim Timur serta hubungan antara kelimpahan dan distribusi ikan pelagis kecil dengan kondisi oseanografi. Peralatan hidroakustik yang digunakan, terdiri dari "Portable Scientific Echosounder SIMRAD EY-M" yang dilengkapi sebuah transducer dengan setengah sudut bim efektif 11 °, "Digital &ho Integrator SIMRAD QD", Tape Recorder serta peralatan pendukung lainnya. Jalur survei hidroakustik dibuat berbentuk transek paralel sejajar dengan jarak antar transek yang satu dengan lainnya adalah 1 mil laut arah Teluk Arnbon bagian luar dengan dengan densitas yang tertinggi berada pada daerah yang berbatasan dengan Laut Banda. Pada musim Timur densitas ikan menyebar pada seluruh perairan, dengan densitas ikan tertinggi pada mus1m 1m ditemukan pada bagian luar teluk yang berbatasan dengan Laut Banda. dst ...
Keyword: 

Judul: Studi Tentang Pendugaan Kelimpahan Ikan Pelagis Di Selat Sunda Bagian Utara Dengan Menggunakan Sistem Akuistik BIM Ganda Dan Analisa Oseanografis
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk menduga kelimpahan ikan pelagis di Selat Sunda bagian Utara, menganalisis distribusi spatial dan menganalisis kelimpahan ikan pelagis berdasarkan tinjauan oseanografis. Penelitian ini dilaksanakan di Selat Sunda bagian Utara pada bulan April tahun 1996, dengan metode akustik dan pola trek adalah continous paralel. Penggunaan metode akustik ini didasarkan atas kelebihan-kelebihan yang dimiliki, diantaranya sedikit banyaknya dapat mengatasi kelemahan-kelemahan pada metode konvensional, mempunyai kecepatan tinggi, akurat dan relatif murah. Mekanisme dasar dari sistem akustik bim ganda untuk mendapatkan data kelimpahan dan penyebaran ikan adalah dengan mengkombinasikan pengintegrasian echo (echo integration) dan pemrosesan data bim ganda (dual beam processing). Sistem bim ganda ini memiliki transducer multi elemen yang menghasilkan bim sempit (narrow beam) yaitu 10° dan bim lebar (wide beam) yaitu 25°, sehingga faktor bim (beam pattern factor) dapat dihilangkan dalam pengukuran insitu target strength. Pengukuran insitu target strength dilakukan dengan dual beam processor, sedangkan nilai densitas relatif ikan diperoleh melalui echo integrator secara real time. Nilai target strength berkisar antara -64 dB sampai -34 dB dengan rata-rata -56 dB. Rata-rata target strength pada siang hari lebih tinggi dibandingkan dengan malam hari dan nilai target strength meningkat dengan bertambahnya kedalaman, kecuali pada siang hari. Pengambilan data pada siang hari sampai kedalaman 90 meter sedangkan malam hari hanya 80 meter…dst
Keyword: Ikan pelagis, Sistem Alkustik Bim Ganda, Analisa Oseanografis, Single Target Echo

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA