Judul: Deteksi Frekuensi Gelombang Permukaan Laut Menggunakan Wavebuoy
Abstrak: Pemantauan gelombang di laut perlu dilakukan karena memiliki pengaruh terhadap dinamika yang terjadi di pantai dan dapat membantu kegiatan perencanaan pembangunan pesisir, pelabuhan, alur pelayaran dan lalu lintas. Wahana terapung seperti wavebuoy dengan sensor 10 DOF MEMS IMU (accelerometer, gyroscope, magnetometer dan tekanan) dapat digunakan untuk mendeteksi gelombang permukaan laut. Pada perairan kawasan konservasi lamun Pulau Bintan, wavebuoy yang dipasang dapat mendeteksi pergerakan gelombang permukaan laut. Data hasil perekaman berupa pergerakan wavebouy pada sumbu X, Y, Z pada frekuensi 1Hz-15Hz dari pergerakan gelombang permukaan. Pergerakan gelombang permukaan di perairan ini dominan mempengaruhi gerak wavebuoy kearah sumbu Z dan kurang mempengaruhi pada sumbu X, sumbu Y., Wave monitoring at sea needs to be done because it has an influence on the dynamics that occur on the coast and can help planning coastal development activities, ports, shipping lines and traffic. A floating vehicle such as a wavebuoy with a 10 DOF MEMS IMU sensor (accelerometer, gyroscope, magnetometer and pressure) can be used to measure sea level waves. In the waters of the seagrass conservation area of ​​Bintan Island, the installed wavebuoy can detect the movement of sea surface waves. The recorded data is in the form of wavebouy movements on the X, Y, Z axis at a frequency of 1Hz-15Hz from the movement of surface waves. The movement of surface waves in these waters dominantly affects wavebuoy motion towards
Keyword: Buoy, Sensor, Gelombang, Pesisir, Frekuensi

Judul: Pengembangan Internet of Things Sistem Observasi Gelombang Pesisir
Abstrak: Gelombang permukaan laut merupakan pergerakan air naik dan turun tegak lurus terhadap permukaan laut. Gelombang yang terjadi di laut memiliki pergerakan yang acak, dinamis, dan kompleks, sehingga pengukuran tinggi dan periode gelombang sulit dirumuskan secara akurat. Dibutuhkan data tinggi gelombang yang real-time agar memudahkan masyarakat untuk dapat memantau kondisi tinggi gelombang dengan mudah. Tujuan penelitian ini yaitu (1) Menghasilkan instrumen wave buoy untuk observasi gelombang pesisir, (2) Menghasilkan website dan aplikasi mobile yang dapat menampilkan hasil pengukuran instrumen wave buoy, (3) Menganalisis data hasil pengukuran instrumen wave buoy. Penelitian dibagi ke dalam 3 tahapan, yaitu perancangan sistem observasi gelombang pesisir, integrasi serta uji lapang dan monitoring. Adapun perancangan sistem obeservasi gelombang terdiri dari 4 bagian yaitu perancangan wahana buoy, perancangan basis data, perancangan website dan perancangan aplikasi mobile. Perancangan wahana terdiri atas perancangan pelampung (buoy), perancangan sistem elektronik dan perancangan perangkat lunak. Perancangan basis data pada penelitian ini didasarkan pada format data hasil pengukuran. Basis data tersebut terdiri dari table sensor, tabel filter dan tabel tinggi gelombang. Perancangan website terdiri atas perancangan header, perancangan menu, perancangan body dan perancangan footer. Perancangan aplikasi mobile dalam penelitian ini dilakukan dengan menggunakan MIT App Inventor sebagai pembuat aplikasi. Perancangan aplikasi mobile dimulai dengan perancangan mockup. Hasil rancangan dari wahana wave buoy terdiri dua bagian yaitu pelampung dan pemberat. Pelampung digunakan untuk membarikan daya apung serta merupakan peletakan dari sistem elektronik. Sistem elektronik pada instrumen wave buoy dibagi ke dalam dua bagian, yaitu sistem elektronik pada instrumen dan sistem elektronik pada base station. ESP Lora32 TTGO versi 1 digunakan sebagai mikrokontroler (pengendali utama). Sensor yang digunakan yaitu sensor accelerometer MPU-6050. Data-data yang diperoleh dari sensor akan diproses oleh mikrokontroler pada buoy. Frekuensi sampling data yang digunakan yaitu 10 Hz dan jumlah data 128 data dengan perulangan setiap 10 menit. Data-data tersebut akan dikirim ke basis data melalui base station. Data yang masuk ke basis data akan diolah menjadi tinggi gelombang dan diteruskan ke ThingSpeak. Selanjutnya data tersebut ditampikan pada website dan aplikasi mobile. Adapun tabel basis data yang telah dibangun meliputi buoy, buoy_filter, dan buoy_h. Tahap selanjutnya adalah menampilkan informasi tinggi gelombang pada basis data ke dalam body website dalam bentuk tabel dan grafik menggunakan modul query. Halaman utama website yang dibuat dalam penelitian ini terdiri atas header, menu, body, dan footer. Header yang digunakan adalah ‘Monitoring Gelombang Pesisir’ pada bagian kiri. Body halaman utama pada website berisi peta lokasi penempatan instrumen, data realtime pengukuran tinggi gelombang, data tinggi gelombang hari sebelumnya, data tinggi gelombang pada bulan saat website diakses serta grafik real-time pengukuran tinggi gelombang. Pada body juga terdapat list dropdown berupa data lokasi penempatan buoy. Bagian footer ditampilkan logo fakultas perikanan dan ilmu kelautan sebagai identitas. Website yang dibangun dapat diakses oleh pengguna melalui alamat url http://laut-pulauseribu.net/buoy. Sedangkan aplikasi yang dibangun memiliki satu halaman utama yaitu halaman yang menampilkan data tinggi gelombang real-time dalam bentuk label dan grafik. Analisa hasil pengukuran lapangan menggunakan MATLAB dengan metode zero crossing analysis. Penempatan instrumen dan pengambilan data di perairan Kepulauan Seribu. Hasil analisis data selama 23 jam diperoleh tinggi gelombang signifikan yang terjadi di Perairan Gosong Semak
Keyword: wave buoy system, Internet of Things, website, aplikasi mobile, perairan Kepulauan Seribu

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA