Judul: Potency of Water Extract Compounds of Papaya Leaves (Carica papaya L.) and Pulai Leaves (Alstonia scholaris L.) as HMG-CoA Reductase Inhibitors In silico.
Abstrak: Ekstrak tunggal air daun pepaya dan pulai diketahui memiliki aktivitas inhibisi HMG-KoA reduktase (in vitro) yang secara in vivo mampu menurunkan kolesterol darah. Kombinasi kedua ekstrak memberi efek sinergis setara lovastatin, tetapi belum diketahui senyawa aktif serta interaksi yang terjadi dengan enzim tersebut. Penelitian bertujuan mengidentifikasi senyawa aktif pada kedua ekstrak tunggal tersebut menggunakan LC-MS/MS, serta prediksi potensi sebagai inhibitor HMG-KoA reduktase melalui studi in silico. Ekstraksi dilakukan menggunakan metode dekokta, ekstrak kemudian dianalisis menggunakan LC-MS/MS, dan diprediksi potensinya sebagai inhibitor HMG-KoA reduktase melalui studi in silico. Terdeteksi masing-masing 28 senyawa aktif pada kedua ekstrak tunggal. Prediksi toksisitas, bioavailabilitas, dan penambatan molekuler menghasilkan 2 senyawa daun pepaya dan 6 senyawa daun pulai potensial. Simpulan penelitian ini adalah senyawa terbaik daun pepaya (2,4-diaminoptiridine glyoxal) dan daun pulai (xenocoumacin 1) serta senyawa potensial lain memiliki interaksi dengan residu katalitik HMG-KoA reduktase pada Ser684, Asp690, Lys691, dan Lys692., Water extract of papaya and pulai leaves is known to have HMG-CoA reductase inhibitory activity (in vitro) which in vivo can lower blood cholesterol. The combination of the two extracts has a synergistic effect equivalent to lovastatin, but the active compound and the interactions that occur with the enzyme are unknown. The aim of the study was to identify the active compounds in both single extracts using LC-MS/MS, as well as to predict their potential as HMG-CoA reductase inhibitors through in silico studies. Extraction was carried out using the decoctal method, the extract was then analyzed using LC-MS/MS, and its potential as an HMG-CoA reductase inhibitor was predicted through in silico studies. Each of the 28 active compounds was detected in both single extracts. Two papaya leaf compounds and 6 pulai leaf compounds were obtained which had the potential to pass the prediction of toxicity, bioavailability, and molecular anchoring. The conclusion of this study was the best compounds from papaya leaves (2,4-diaminoptiridine glyoxal) and pulai leaves (xenocoumacin 1) as well as other potential compounds have interactions with HMG-CoA reductase catalytic residues on Ser684, Asp690, Lys691, and Lys692.
Keyword: Alstonia scholaris L., Carica papaya L., HMG-CoA reductase, in silico

Judul: In Silico and In Vitro Study of Piper crocatum Ruiz & Pav as HMG-CoA Reductase Inhibitor and Inhibition of Malondialdehyde Formation
Abstrak: Penimbunan plak kolesterol dalam dinding pembuluh darah terjadi akibat molekul LDL (Low Density Lipoprotein) teroksidasi oleh radikal bebas, yang merupakan salah satu faktor resiko terjadinya penyakit jantung koroner. Enzim yang berperan dalam pembentukan kolesterol adalah enzim hidroksil metilglutaril-KoA reduktase (HMG-KoA reduktase). Enzim ini berperan mereduksi HMG-CoA menjadi mevalonat yang selanjutnya diubah menjadi kolesterol. Dalam kondisi hiperlipidemia, terjadi peningkatan reactive oxygen species (ROS), sehingga menimbulkan peroksidasi lipid di dalam tubuh dan menghasilkan produk oksidasi yaitu malondialdehida (MDA). Keberadaan ROS dapat dinetralisir dengan senyawa yang berpotensi sebagai antioksidan. Pemanfaatan tanaman herbal menjadi alternatif dalam mengobati berbagai penyakit. Sirih merah mengandung senyawa aktif yang berpotensi sebagai inhibitor HMG-KoA reduktase dan antioksidan, seperti flavonoid, alkaloid, polifenol, fenolik, tanin, dan minyak atsiri. Penelitian sebelumnya telah banyak dilakukan penghambatan HMG-KoA reduktase secara in vivo. Penemuan obat dapat dipermudah dan dipercepat dengan prediksi pengikatan molekul ligan pada protein secara komputasi. Penelitian sebelumnya telah berhasil melakukan analisis senyawa aktif yang terkandung dalam ekstrak dan fraksi sirih merah. Penelitian mengenai penghambatan HMG-KoA reduktase secara in silico dan in vitro oleh sirih merah belum dilakukan. Penelitian ini menguji potensi senyawa ekstrak etanol, fraksi air, fraksi etil asetat, dan fraksi n-heksan sirih merah sebagai inhibitor HMG-KoA reduktase secara in silico dan in vitro serta penghambatan pembentukan malondialdehida. Senyawa sirih merah dilakukan virtual screening menggunakan PyRx dan dilanjutkan analisis kelarutan dan toksisitas ligan. Penambatan molekul senyawa uji dilakukan menggunakan autodock vina terhadap ligan dengan energi afinitas tertinggi terhadap HMG-KoA reduktase (kode PDB: 1HWK) berdasarkan virtual screening. Ekstraksi sirih merah dilakukan dengan metode maserasi menggunakan etanol 70%, kemudian difraksinasi bertingkat menggunakan pelarut n-heksan, etil asetat, dan air. Penghambatan HMG-KoA reduktase in silico, kemudian dibuktikan secara in vitro dengan konsentrasi akhir sampel 50 ppm, 100 ppm dan 200 ppm. Atorvastatin digunakan sebagai kontrol positif. Pengahmbatan pembentukakan malondialdehida dilakukan dengan metode tiobarbituric acid (TBA) untuk melihat potensi aktivitas antioksidan sampel.Hasil virtual screening menunjukkan ligan terpilih yaitu glabrescione, galokatekin, schisandrin B, 4-(4-methoxy-phenylamino)-2,3-dihydro-1H-4a,9-diaza- cyclopenta[b]fluorene-10-carbonitrile, 4-({4,6-Bis[(3R,5S)-3,5-diamino-1-piperidinyl]- 1,3,5-triazin-2-yl}amino)benzenesulfonamide, dan 1,1'-(1,4-Butanediyl)bis{2,6-dimethyl- 4-[(3-methyl-1,3-benzothiazol-2(3H)-ylidene)methyl]pyridinium} dan senyawa dengan energi afinitas tertinggi yaitu 4-({4,6-Bis[(3R,5S)-3,5-diamino-1-piperidinyl]-1,3,5- triazin-2-yl}amino)benzenesulfonamide sebesar -8.3 kkal/mol, berinteraksi dengan residu asam amino Ser684, Asp690, Lys691, Lys692, Lys735. Penghambatan terbesar HMG- KoA reduktase secara in vitro terdapat pada fraksi etil asetat 200 ppm yaitu sebesar 94% dan aktivitas tertinggi penghambatan pembentukan malondialdehida pada fraksi etil asetat serta terendah pada semua konsentrasi adalah fraksi air., The buildup of Cholesterol plaque in artery walls occurs due to oxidation of LDL (Low Density Lipoprotein) molecules by free radicals, which is a risk factor for coronary heart disease. The enzyme that plays a role in the formation of cholesterol is the hydroxyl methylglutaril-CoA reductase (HMG-CoA reductase) enzyme. In hyperlipidemic conditions, there is an increase in reactive oxygen species (ROS), causing lipid peroxidation in the body and producing oxidation products, malondialdehyde (MDA). The presence of ROS can be neutralized with compounds that may act as antioxidants. Utilization of herbal plants is an alternative in treating various diseases. Red betel contains active compounds that have the potential to act as HMG-CoA reductase inhibitors, such as flavonoids, alkaloids, polyphenols, phenolics, tannins, and essential oils. Previous studies have carried out the inhibition of HMG-CoA
Keyword: Bioactive compounds, HMG-CoA reductase, red betel

Judul: Implementation of Spatio-Temporal Change Query in Relational Database.
Abstrak: Geographic object changes in various views. Object changes are recorded using a model of static storage. No historical connection between old version data and new version data has been built. For that, a storage model of spatio-temporal queries that can analyze spatio-temporal changes has been developed. The object changes the geometry are grouped according to the taxonomy of Spatio-Temporal Pattern Change. This research has been able to apply the query patterns change including born, expand, merge, contract, split, normal and die. This query based on geometric (area) changes. The implementation of spatio-temporal change queries represents an object changes continuously with easy, change detection is done by comparing two versions of data. Keyword: spatio-temporal change query, spatio-temporal change pattern.
Keyword: