Judul: Deteksi dan Identifikasi Aphelenchoides besseyi Christie pada Lima Varietas Padi dengan Polymerase Chain Reaction (PCR)
Abstrak: Aphelenchoides besseyi Christie merupakan nematoda parasit tumbuhan penting pada padi dan menyebabkan kehilangan hasil hingga 54%. A. besseyi dapat bertahan selama delapan bulan hingga tiga tahun setelah panen dan dapat ditularkan melalui benih. Informasi mengenai nematoda A. besseyi di Indonesia masih sangat terbatas. Penelitian ini bertujuan mengetahui tingkat infeksi nematoda A. besseyi pada benih padi dari lima varietas, yaitu Pak Tiwi 1, IR64, Ciherang, IPB 3S, dan SL 8 SHS dan mengidentifikasi A. besseyi secara morfologi dan molekuler dengan teknik Polymerase Chain Reaction (PCR). Lima gram benih dari setiap varietas diekstraksi dengan menggunakan metode Baermann yang telah dimodifikasi. Identifikasi secara morfologi dilakukan dengan pengamatan preparat semipermanen nematoda dewasa. Identifikasi molekuler dengan PCR terdiri dari beberapa tahap, yaitu ekstraksi, amplifikasi, dan elektroforesis DNA. Amplifikasi DNA menggunakan pasangan primer spesifik untuk mengamplifikasi ITS 1 dan 2. Hasil pengamatan menunjukkan bahwa A. besseyi didapatkan pada lima varietas dengan jumlah individu nematoda yang berbeda-beda. Jumlah nematoda tertinggi didapatkan pada varietas Pak Tiwi 1 dan jumlah terendah didapatkan pada IR64. A. besseyi memiliki ciri khas yang dapat dibedakan dengan nematoda lain, seperti mukro. Amplifikasi DNA nematoda menunjukkan hasil positif dengan ukuran fragmen DNA sekitar 830 bp. Hasil tersebut membuktikan bahwa nematoda yang didapatkan pada kelima varietas adalah A. besseyi.
Keyword: amplifikasi, DNA, ekstraksi, elektroforesis, morfologi

Judul: Karakterisasi Morfologi dan Morfometri Nematoda Aphelenchoides besseyi Christie pada Beberapa Varietas Padi.
Abstrak: Aphelenchoides besseyi merupakan nematoda parasit terbawa benih yang menyebabkan penyakit pucuk putih pada padi. Identifikasi A. besseyi secara morfologi dan morfometri pada beberapa varietas padi di Jawa Tengah dan Daerah Istimewa Yogyakarta (DIY) belum pernah dilaporkan, sehingga penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keberadaan A. besseyi pada beberapa varietas padi di Jawa Tengah dan DIY serta menelaah karakter morfologi dan morfometrinya. Sampel benih diperoleh dari kios pertanian di Kecamatan Weru (Sukoharjo), Cawas (Klaten), Banguntapan (Bantul), Wonosari (Gunung Kidul), dan hasil perbanyakan petani di Cilacap Selatan (Cilacap). Metode yang dilakukan antara lain: pengambilan sampel benih, ekstraksi nematoda, penghitungan populasi, identifikasi morfologi dan morfometri. A. besseyi ditemukan berasosiasi dengan varietas Pandan wangi, Sintanur, Pepe, Inpari 33, Prima, dan Sembada 168 dengan populasi berkisar 1.4 sampai 27.2 ekor per 5 g benih padi. Ciri khas A. besseyi yang ditemukan bibir set off dengan stomatostilet, bulbus median berukuran besar dan berbentuk oval, star shaped mucro pada ujung ekor. Vulva pada nematoda betina terletak pada 60-75% panjang tubuh, dan spikula pada nematoda jantan berbentuk seperti duri mawar (rose thorn shaped spicule). Hasil pengukuran morfometri dengan karakteristik panjang tubuh (L) (0.55-0.84 μm), panjang stilet (S) (10.81- 12.92 mm), diameter tubuh maksimum (W) (14.09-22.87 mm), panjang ekor (T) (36.93 – 53.51 mm), panjang esofagus (ES) (58.17 – 86.51 mm). Persentase posisi dari katub esofagus dari anterior tubuh sampai setengah dari katub (bulb) dibagi dengan total panjang esofagus dari dasar kelenjar esofagus (MB) (100.11 – 146.52%). Persentase jarak vulva dari anterior dibagi dengan panjang tubuh (V) (55.35-85.67%), a (L/W) (29.58-52.04), b (L/MB) (8.12-14.97), dan c (L/T) (11.94- 19.92).
Keyword: benih, ekstraksi, identifikasi, kios, pengukuran

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: