Judul: Karakterisasi Molekuler Gen Hemaglutinin Virus Avian Influenza Subtipe H9N2 yang Diisolasi dari Ayam Layer di Pulau Jawa.
Abstrak: Virus Avian Influenza (VAI) subtipe H9N2 merupakan ancaman bagi peternak layer di seluruh dunia. Infeksi VAI subtipe H9N2 dapat mengakibatkan kerugian ekonomi yang cukup besar bagi peternak layer, karena menyebabkan penurunan produksi telur hingga 70% apabila disertai oleh ko-infeksi bakteri atau virus lain. Pulau Jawa merupakan pulau dengan kepadatan ternak unggas yang paling tinggi di Indonesia. Wabah VAI H9N2 di Pulau Jawa belum pernah dilaporkan, namun mengingat besarnya kemungkinan telah terjadi penyebaran VAI subtipe H9N2 ke pulau Jawa, maka kegiatan surveilans terkait keberadaan virus ini perlu dilakukan, terutama pada peternakan layer yang mengalami penurunan produksi telur secara drastis. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk melakukan karakterisasi secara molekuler isolat VAI subtipe H9N2 yang diisolasi dari ayam layer yang mengalami penurunan produksi telur di Pulau Jawa, serta mempelajari hubungan filogenetiknya dengan VAI subtipe H9N2 yang diisolasi di negara lain yang mengalami wabah H9N2. Tiga puluh tiga isolat arsip suspek VAI H9N2 digunakan pada penelitian ini. Isolat virus di propagasi pada telur ayam berembrio spesific antibody negative (TAB-SAN), kemudian RNA virus diekstraksi dari cairan alantois TAB dan identifikasi virus dilakukan dengan metode reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) terhadap keberadaan gen H9 dan N2. Sekuensing nukleotida terhadap gen hemaglutinin (HA) dilakukan pada isolat virus yang menunjukkan hasil positif terhadap gen H9 dan N2. Karakteristik gen HA dianalisa berdasarkan motif cleavage site, receptor binding site, antigenic site serta ada tidaknya Potential N-Linked Glycosylation Site (PGS) di sekitar receptor binding site. Kedekatan filogenetik dianalisa dengan membandingkan isolat virus pada penelitian ini dengan isolat VAI subtipe H9N2 lainnya pada GenBank melalui pohon filogenetik. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa 13 dari 33 isolat virus merupakan VAI subtipe H9N2 dan masuk ke dalam lineage Y280, clade h9.4.2.5, serta memiliki kedekatan genetik dengan isolat Cina tahun 2013 dan Vietnam tahun 2014 dengan persentase homologi nukelotida sebesar 96.9%–98.8%. Pola susunan asam amino pada cleavage site gen HA dari 13 isolat VAI H9N2 adalah PSR(K)SSR↓GLF yang mengindikasikan bahwa virus pada penelitian ini memiliki patogenisitas yang rendah pada unggas (low pathogenic avian influenza/LPAI).
Keyword: VAI subtipe H9N2, layer, karakterisasi molekuler, gen HA

Judul: Identifikasi Subtipe, Patogenitas, Dan Filogenetik Virus Avian Influenza Isolat 2012–2013.
Abstrak: Penyakit Avian Influenza (AI) merupakan penyakit infeksius yang sangat penting pada unggas yang disebabkan oleh virus Avian Influenza. Penyakit ini pertama kali masuk ke Indonesia pada tahun 2003 dan telah menyebar secara luas menyebabkan kerugian ekonomi yang besar dan kematian yang tinggi pada peternakan-peternakan unggas. Dewasa ini wabah penyakit AI masih sering terjadi secara sporadis meskipun pada peternakan yang telah rutin divaksin AI. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menentukan subtipe dan patogenitas virus AI serta melakukan analisis filogenetik dan jarak kekerabatan gen hemaglutinin dari virus-virus AI yang diisolasi pada tahun 2012–2013 di daerah Jawa Barat, Jawa Tengah, dan Medan. Sampel diperoleh dari peternakan unggas yang mengalami wabah penyakit AI dan diinokulasikan serta dipropagasi dalam Telur Ayam Berembrio (TAB) specific pathogen free (SPF) berumur 10 hari.Cairan alantois yang dipanen 5 hari setelah inokulasi diuji hemaglutinasi (HA). Cairan alantois dengan HA positif diuji lebih lanjut untuk menentukan subtipe hemaglutinin dan neuraminidase menggunakan real-time reverse transcription polymerase chain reaction (RRT-PCR) dan dipersiapkan untuk proses pengurutan oligonukleotida menggunakan reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). Hasil proses pengurutan oligonukleotida dari gen hemaglutinin digunakan dalam analisis pola asam amino daerah pemotongan gen hemaglutinin dan hubungan kekerabatan antar virus-virus yang diisolasi. Hasil penelitian menunjukkan bahwa semua isolat tergolong ke dalam HPAI H5N1 dengan pola asam amino daerah pemotongan PQRESRRKKR/GLF dan PQRERRRKR/GLF. Isolat-isolat tersebut terbagi ke dalam klaster 2.1 dan klaster 2.3 dan masih memiliki hubungan kekerabatan yang dekat dengan jarak genetik kurang dari 0.3 antara virus yang satu dengan yang lainnya dan juga terhadap beberapa isolat virus AI yang menyebabkan wabah-wabah sebelumnya di Indonesia. Di masa mendatang isolat-isolat yang digunakan dalam penelitian ini dapat dimanfaatkan sebagai alternatif strain virus untuk produksi vaksin AI yang diharapkan dapat melindungi peternakan-peternakan unggas terhadap ancaman wabah AI.
Keyword: Avian Influenza, daerah pemotongan, hemaglutinin, patogenitas, filogenetik

Judul: Kruskal Coordinates in 4+1 Dimensional Schwarzschild  Spacetime Geometry
Abstrak: Koordinat Kruskal adalah hasil ekstensi maksimal dari koordinatSchwarzschild yang menimbulkan interpretasi baru tentang keberadaan wormhole. Secara teori, wormhole adalah struktur yang menghubungkan dua titik berbeda dalam ruangwaktu. Namun, ukuran wormhole terlalu kecil untuk dapat dilalui dan tidak stabil sehingga mudah runtuh. Penelitian ini bertujuan mendapatkan solusi koordinat Kruskal untuk geometri Scwarzschild pada dimensi yang lebih tinggi yang dapat berguna untuk menganalisis kestabilan wormhole. Penelitian ini dilakukan melalui penambahan dimensi ruang dari 3+1 dimensi menjadi 4+1 dimensi untuk mendapatkan geometri Schwarzschild, koordinat Eddington-Finkelstein, dan koordinat Kruskal dengan memanfaatkan gerak radial foton. Hasil akhirnya, solusi geometri ruangwaktu Schwarzschild dalam koordinat Kruskal dapat dibentuk dan diilustrasikan dalam diagram Kruskal. Diagram tersebut menunjukan sebuah black hole, white hole, dan dua alam semesta yang dihubungkan oleh wormhole., The Kruskal coordinates are the maximal extension of the Schwarzschild coordinates which give rise to new interpretations of the existence of wormholes. In theory, a wormhole is a structure that connects two different points in spacetime. However, the size of the wormhole is too small to pass through and is unstable so that it collapses easily. This study aims to obtain Kruskal coordinate solutions for the Scwarzschild geometry in higher dimensions which can be useful for analyzing wormhole stability. This research was carried out by adding space from 3+1 dimensions to 4+1 dimensions to obtain Schwarzschild geometry, Eddington Finkelstein coordinates, and Kruskal coordinates by utilizing the radial motion of photons. The final result, the solution of the Schwarzschild spacetime geometry in Kruskal coordinates can be formed and illustrated in a Kruskal diagram. The diagram shows a black hole, a white hole, and the two universes connected by a wormhole.
Keyword: Schwarzschild geometry, Eddington-Finkelstein coordinates, Kruskal coordinates, radial motion of photons, wormhole