Judul: Identifikasi Molekuler Tuna dengan Cytochrome Oxidase Subunit 1 (COI) dan Kualitasnya pada Suhu Penyimpanan yang Berbeda
Abstrak: Kasus penolakan produk ekspor tuna Indonesia diantaranya disebabkan oleh misbranding serta kandungan bakteri patogen dan toksin yang melebihi standar. Penggunaan primer gen COI mitokondria merupakan metode yang efektif untuk mengidentifikasi spesies ikan tuna. Kemunduran mutu ikan dapat diketahui dari kandungan amina biogenik yang terbentuk pada ikan. Kualitas ikan tuna perlu dipertahankan dan ditingkatkan untuk menghasilkan produk sesuai dengan standar mutu dan aman dikonsumsi. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi molekuler sampel ikan tuna dan menentukan pengaruh perbedaan kondisi penyimpanan terhadap kualitas ikan tuna melalui uji sensori, mioglobin, amina biogenik dan profil protein. Penelitian ini dilakukan melalui dua tahap, yaitu 1) preparasi bahan baku dan identifikasi molekuler, 2) penentuan kualitas ikan tuna pada penyimpanan yang berbeda yaitu suhu ruang, suhu dingin dan suhu beku selama 18 hari dengan pengamatan setiap hari untuk parameter uji sensori, sedangkan untuk mioglobin, amina biogenik, serta profil protein dilakukan pengamatan pada hari ke- 0, 1, 2, 3, 4, 8, 14 dan 18. Identifikasi ikan tuna melalui pendekatan molekuler melalui gen COI. Data sensori dan morfometrik dianalisis secara deskriptif; data mioglobin menggunakan rancangan acak lengkap faktorial (RALF) in time, sedangkan amina biogenik menggunakan rancangan acak lengkap (RAL) in time. Hasil penelitian menunjukkan bahwa kemurnian isolat DNA yaitu 1.99 dengan konsentrasi 93.8 ng/μL serta terindentifikasi spesies Thunnus tonggol dengan nilai homologi 99.69%. Panjang baku sampel ikan tuna yaitu 31.889±1.06 cm. Batas penerimaan sensori pada kondisi suhu ruang mencapai 1 hari, penyimpanan suhu dingin mencapai waktu penyimpanan 10 hari dengan nilai skor quality index method (QIM) 11 serta penyimpanan beku menunjukkan pengaruh perlakuan yang baik hingga hari ke-18. Konsentrasi mioglobin tertinggi terdapat pada daging gelap penyimpanan hari pertama yaitu 319.21±14.56 mg/100 g. Kandungan amina biogenik selama 18 hari mengalami kenaikan yang signifikan baik yang disimpan di suhu dingin maupun suhu beku. Kandungan histamin mencapai nilai yang melebihi standar Food and Drug Administration (FDA) (50 μg/g) yaitu pada suhu beku penyimpanan 18 hari dan suhu dingin penyimpanan mulai dari hari ke-8. Penyimpanan suhu beku untuk kandungan kadaverin menunjukkan nilai rata-rata lebih kecil dibandingkan perlakuan suhu dingin yaitu 5.98 μg/g. Putresin penyimpanan suhu beku hari ke-18 juga masih lebih rendah dibandingkan dengan penyimpanan suhu dingin di hari yang sama serta nilai keduanya juga masih tergolong rendah yaitu kurang dari 50 μg/g. Hasil analisis profil protein ikan tuna pada penyimpanan suhu ruang, suhu dingin dan beku memiliki berat molekul berkisar antara 10-100 kDa, serta bobot molekul mioglobin antara14-18 kDa.
Keyword: amina biogenik, QIM, suhu

Judul: Penelusuran Keaslian Ikan Tuna (Thunnus Sp.) Dan Produk Olahannya Melalui Teknik Molekuler Dna Barcoding
Abstrak: Kasus mislabeling atau ketidaksesuaian dengan label pada produk perikanan telah banyak dilaporkan di beberapa negara, namun di Indonesia belum banyak dilaporkan. Pengujian keaslian ikan atau autentikasi diperlukan untuk meyakinkan konsumen tentang keakuratan pelabelan. DNA barcoding merupakan urutan pendek DNA dari wilayah standar pada genom yang digunakan untuk identifikasi spesies. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi keaslian ikan tuna dan olahannya melalui teknik molekuler DNA barcoding menggunakan DNA mitokondria cyt b dan COI (cytochrome c oxidase subunit I) sehingga dapat digunakan untuk mencegah adanya pemalsuan/ketidaksesuaian label dan economic fraud. Tahapan penelitian terdiri atas identifikasi morfologi, pengukuran proporsi tuna segar utuh, pengukuran komposisi proksimat, identifikasi berbasis protein, dan identifikasi molekuler. Sampel terdiri atas 5 sampel tuna segar utuh dan 22 sampel olahan tuna berupa tuna steak, sushi tuna, bakso tuna, abon tuna dan tuna kaleng. Identifikasi secara morfologi menunjukkan ke lima sampel tuna segar utuh teridentifikasi sebagai tuna sirip kuning (Thunnus albacares). Komposisi rendemen daging merah ikan tuna 15,88%, daging putih 32,90%, sedangkan rendemen jeroan, kepala, tulang dan kulit masing-masing berkisar 8,19%; 22,87%; 16,03%; dan 4,14%. Komposisi protein tuna segar utuh 25,57%, tuna steak 22,37% dan tuna kaleng dalam minyak 14,91%. Identifikasi berbasis protein menunjukkan profil pola protein tuna segar utuh dan tuna steak terlihat lebih tebal dan jelas, untuk sushi tuna walaupun tidak tebal, namun pola proteinnya sama dengan tuna segar utuh dan tuna steak, sedangkan pola protein olahan bakso tuna, abon tuna dan tuna kaleng terlihat namun tipis. Hasil desain primer dengan gen cyt b menghasilkan urutan basa nukleotida untuk foward 5’GGAATAGGGAGAAGTAGAGGACG3’ dan reverse 5’CTYCTATCCGCAGTCCCATATGTYGG3’ dengan panjang fragmen 620 bp, sedangkan menggunakan gen COI dihasilkan primer dengan urutan basa nukleotida untuk foward dan reverse masing-masing 5’GTGCATGAGCTGGAATAGTTG3’ dan 5’CAGGGTCGAAGAAGGTTG3’ dengan panjang fragmen 583 bp. Hasil isolasi DNA diukur konsentrasi dan kemurnian DNA. Konsentrasi DNA berkisar antara 2 ng/μL sampai 444 ng/μL, kecuali untuk olahan tuna kaleng (Ka1, Ka2 dan Ka4), bola tuna (BoTu) dan sushi tourch tuna (SuTm) konsentrasi DNA yang diperoleh rendah. Kemurnian DNA berkisar antara 0,77 sampai 3,72. Hasil elektroforegram PCR dengan primer cyt b dan COI menunjukkan bahwa semua sampel tuna segar utuh, tuna steak, sushi tuna, bakso tuna, abon tuna dan tuna kaleng berhasil teramplifikasi pada rentang antara 500 bp sampai 750 bp, hal ini sesuai dengan DNA target yaitu 620 bp untuk cyt b dan 583 bp untuk COI, kecuali untuk sampel tuna kaleng dalam minyak (Ka3) tidak teramplifikasi yang ditandai dengan tidak adanya pita target, hal ini diduga bahwa sampel tuna kaleng dalam minyak (Ka3) tidak berisi ikan tuna. Identifikasi spesies berdasarkan analisis BLAST menunjukkan bahwa tuna segar (Ts1) baik menggunakan primer cyt b dan COI teridentifikasi sebagai tuna mata besar (Thunnus obesus) dengan tingkat homologi sebesar 99%, namun secara morfologi teridentifikasi sebagai T. albacares, hal ini disebabkan oleh ukuran yang masih kecil, yaitu panjang cagak (fork length) antara Ts1 dan Ts2 kurang dari 40 cm, sehingga sering terjadi kesalahan identifikasi. Semua olahan tuna baik menggunakan gen cyt b maupun COI teridentifikasi sebagai T. albacares dengan homologi berkisar 98-100%, kecuali untuk tuna steak (St5) teridentifikasi sebagai T. obesus dengan homologi 99%. Konstruksi pohon filogenetik dengan primer cyt b menunjukkan
Keyword: COI, cyt b, desain primer, DNA barcoding, pohon filogenetik tuna

Judul: Dynamics Model for Rural and Urban Economic Growth
Abstrak: Lewis theory of structural change has focused on mechanisms that allow countries to transform their domestic economic structure to a more modern economy. The proposed model deals with the mechanism of interaction between rural and urban Economic. This model is concerned with the process of labor transfer from rural to urban areas. This study aims to model the dynamics of economic growth in rural and urban areas, including determining the equilibrium solution and to carry out simulation of the model. The simulation results show that the transfer of labor from rural to urban areas will increase the rate of change of capital so that structural changes can be realized. In addition, increased propensity to save in rural areas will also accelerate structural change
Keyword: