Judul: Kadar Kortisol, Triiodotironin (T3), dan Tiroksin (T4) Kerbau Lumpur (Bubalus bubalis) Selama Lima Belas Hari Pascatransportasi
Abstrak: Transportasi mempunyai peranan penting dalam pendistribusian kerbau. Transportasi ternak dapat menyebabkan suatu kondisi stres dan tekanan yang berdampak pada kesehatan ternak. Tingkat stres dapat dilihat dari beberapa parameter, diantaranya melalui perubahan kadar hormon kortisol dan hormon tiroid dalam darah. Penelitian ini bertujuan untuk mencari informasi mengenai pengaruh transportasi terhadap kadar kortisol, T3, dan T4 selama lima belas hari pascatransportasi. Empat ekor kerbau lumpur betina berusia 2 tahun digunakan dalam penelitian ini. Kerbau lumpur mengalami transportasi menggunakan truk bak terbuka selama 2 jam sejauh 15 kilometer. Selama masa aklimatisasi, ternak kerbau kemudian diberikan anti-cacing albendazol untuk menghindari telur cacing dan diberikan vitamin B kompleks. Setiap hari semua ternak diberi pakan rumput dan air minum ad libitum. Darah kemudian diambil pada saat setelah transportasi sampai hari ke-15 dan diukur menggunakan metode radio-immunoassay (RIA). Pengukuran kortisol dilakukan setiap hari, sedangkan pengukuran T3 dan T4 dilakukan setiap dua hari sekali. Hasil pengukuran kadar kortisol serum menunjukkan adanya pengaruh transportasi terhadap kerbau penelitian yang ditunjukkan melalui kadar kortisol yang meningkat dari kadar kortisol normal literatur. Kadar kortisol tertinggi terjadi pada hari pertama yaitu pada saat hewan baru saja mengalami transportasi dan mulai menurun sejak hari kedua pascatransportasi. Hasil pengukuran kadar triiodotironin (T3) pada serum kerbau menunjukkan hasil konsentrasi T3 yang fluktuatif yaitu meningkat sejak pengukuran pertama sampai pengukuran ke-2 pascatransportasi dan mulai menurun pada pengukuran hari ke-3 dan seterusnya. Hasil pengukuran T4 menunjukkan peningkatan pada hari pertama dan mulai terjadi penurunan kadar T4 sejak pengukuran kedua pascatransportasi. Penurunan T4 mengindikasikan adanya konversi dari T4 menjadiT3 dengan bentuk lebih aktifKondisi demikian disebabkan oleh stres akibat transportasi sehingga proses metabolisme mengalami perubahan.
Keyword: 

Judul: Physiological Responses and Productivity of Swamp Buffalo in Different Agroclimates
Abstrak: Kerbau merupakan ternak yang potensial sebagai penghasil daging, akan tetapi populasinya terus mengalami penurunan dari tahun ke tahun. Kerbau dikenal merupakan ternak yang rentan mengalami stres. Hal ini menyebabkan gangguan fisiologis yang berdampak pada gangguan metabolisme, gangguan sistem endokrin, dan penurunan produktivitas kerbau. Pemeliharaan kerbau selain itu, menyebar pada berbagai kondisi agroklimat menyebabkan variasi produktivitas antar-kondisi agroklimat. Kondisi agroklimat ditentukan oleh unsur iklim, seperti temperatur, kelembapan dan temperature-humidity index (THI) merupakan faktor yang sangat berpengaruh pada tingkat kenyamanan ternak yang kondisinya berbeda-beda di setiap daerah. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis respons fisiologis dan produktivitas kerbau lumpur pada kondisi agroklimat yang berbeda. Penelitian dilakukan dalam tiga tahapan. Penelitian tahap pertama dilakukan dengan metode survei dan mengumpulkan data melalui wawancara dengan peternak dan observasi ke kandang atau tempat penambatan kerbau. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi performa reproduksi kerbau betina yang dipelihara pada kondisi agroklimat berbeda di dataran rendah, dataran sedang, dan dataran tinggi. Parameter yang diidentifikasi adalah umur pertama kawin (age at first mating), umur pertama beranak (age at first calving), selang beranak (calving interval), body condition score (BCS), dan service per conception (S/C). Data dikumpulkan dari 235 ekor kerbau yang terdiri atas 91 ekor di dataran rendah, 66 ekor di dataran sedang, dan 78 ekor di dataran tinggi. Wawancara dilakukan kepada 227 peternak pemilik kerbau yang dijadikan sampel. Data performa reproduksi, data teknis pemeliharaan kerbau juga dikumpulkan dan diberi skor berdasarkan Pedoman Identifikasi Faktor Penentu Teknis Petenakan (DITJENNAK 1992). Hasil penelitian menunjukkan bahwa performa reproduksi kerbau di ketiga lokasi penelitian belum optimal dilihat dari umur beranak pertama yang masih lambat dan selang beranak yang panjang di ketiga lokasi. Nilai BCS di ketiga lokasi termasuk sedang yaitu 3,0 sampai dengan 3,20. Service per Conception di ketiga lokasi dan umur pertama kawin pada kerbau di dataran sedang dan dataran tinggi masih dalam rentang optimal. Performa reproduksi kerbau betina yang belum optimal di ketiga lokasi penelitian disebabkan oleh sistem pemeliharaan kerbau yang masih kurang baik. Hal ini terlihat dari skor penerapan aspek teknis pemeliharaan kerbau yang masih rendah di ketiga lokasi. Skor penerapan aspek teknis di dataran rendah, dataran sedang, dan dataran tinggi masing-masing 34,1; 39,9; dan 43,5% dari standar yang ditetapkan oleh DITJENNAK (1992). Rata-rata skor penerapan aspek teknis di dataran tinggi lebih baik dibandingkan dengan dataran rendah dan dataran sedang. Hal ini menggambarkan bahwa sistem pemeliharaan kerbau di daerah dataran tinggi lebih baik dibandingkan dengan kedua daerah lainnya, meskipun masih termasuk kategori “rendah”. Penelitian tahap kedua bertujuan untuk menganalisis profil hormon tiroksin, kortisol, dan testosteron pada serum kerbau yang hidup di daerah dengan kondisi agroklimat berbeda di dataran rendah, dataran sedang, dan dataran tinggi. Serum dikoleksi dari 18 ekor kerbau jantan dewasa dan 20 ekor kerbau dara. Analisis hormon dilakukan dengan metode Enzyme-Linked Immunosorbent Assay (ELISA). Konsentrasi hormon tiroksin, kortisol, dan testosteron cenderung tinggi pada kerbau jantan dan kerbau dara di dataran tinggi. Konsentrasi ketiga hormon cenderung rendah pada serum kerbau jantan dan betina di dataran rendah, kecuali hormon kortisol pada jantan terrendah terdapat pada kerbau di dataran sedang. Hal ini menggambarkan bahwa kondisi agroklimat memengaruhi konsentrasi ketiga hormon tersebut. Penelitian tahap ketiga dilakukan
Keyword: heat stress, hormone, reproductive performance, thermoregulatory, THI

Judul: Penyusunan Overlap Graph menggunakan Suffix Tree pada DNA Sequence
Abstrak: The DNA sequence assembly is very important in genome analysis. This step aims to reconstruct contigous DNA fragment (contigs) from short fragment by concatenating fragments based on the overlap region among them. This method employs overlap graph for solving the problems. In this graph, nodes represent fragments and edges represent overlap. This research developed a software for constructing overlap graph using suffix tree. The evaluation was conducted by measuring the number of nodes, number of edges, and the execution time in many values of minimum overlap. The minimum overlap is defined as the minimum length of substring which is considered as the overlap region between two fragments. The evaluation results showed that the number of nodes, the number of edges, and the execution time were increased with the decreasing of the minimum overlap value.
Keyword: