Judul: Analisis Perubahan Sekuen Nukleotida Gen Squalene Synthase pada Artemisia annua L. Turunan T1 Hasil Induksi Sistem CRISPR
Abstrak: Artemisinin yang terkandung dalam Artemisia annua L. dapat digunakan sebagai anti-malaria. Kadar artemisinin pada A. annua L. cukup rendah, yaitu berkisar 0.1% hingga 1%. Peningkatan kadar artemisinin dapat dilakukan dengan menghambat squalene synthase yang merupakan enzim kunci dalam biosintesis sterol menggunakan sistem Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR). Penelitian ini bertujuan untuk melakukan analisis perubahan sekuen nukleotida gen squalene synthase pada A. annua L. yang sudah diinduksi sistem CRISPR. Analisis Perubahan Sekuen Nukleotida Gen Squalene Synthase dilakukan melalui tahap seleksi benih, isolasi DNA menggunakan Tiangen Kit, amplifikasi DNA dengan PCR, dan sekuensing gen squalene synthase. Hasil penelitian menunjukkan dari 9 sampel tanaman A. annua L. hasil induksi sistem CRISPR tidak semua sampel mengalami perubahan basa nukleotida pada situs target. Perubahan sekuen pada situs target hanya terjadi pada sampel 5 yakni perubahan dari A (Adenin) menjadi T (Timin) dan G (Guanin) menjadi C (Sitosin) yang dapat disebut sebagai substitusi transversi. Sampel lainnya yang disejajarkan dengan nontransgenik menunjukkan perubahan sekuen di luar situs target.
Keyword: Artemisinin, Artemisia annua L, CRISPR/Cas9, gen squalene synthase

Judul: Identifikasi Populasi Mutan Artemisia annua L. Hasil Induksi Sistem CRISPR.
Abstrak: Artemisia annua L. (A annua) adalah tanaman yang mengandung artemisinin, senyawa yang efektif mengobati malaria. Walaupun demikian, kandungan artemisinin sangat kecil pada A annua. Dalam rangka meningkatkan kandungan artemisinin, dilakukan rekayasa jalur metabolik dengan sistem clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR). Tujuan penelitian ini adalah mengidentifikasi tanaman populasi A annua yang mengalami mutasi setelah diinduksi oleh sistem CRISPR. Penelitian ini dimulai dengan preparasi benih, sterilisasi benih, isolasi DNA tanaman, optimasi suhu annealing primer, amplifikasi DNA tanaman, dan analisis dengan elektroforesis. Identifikasi yang dilakukan menunjukkan bahwa terdapat 46 tanaman yang berhasil diamplifikasi dan sebanyak 24 tanaman lainnya tidak berhasil diamplifikasi. Ukuran amplikon artemisia adalah berkisar 700 bp sedangkan ukuran amplikon plasmid yang merupakan kontrol positif hanya berkisar 500 bp. Sebanyak 46 sampel DNA kembali diamplifikasi dan dianalisis dengan elektroforesis QIAxcel. Sebanyak 39 sampel ditemukan mengalami mutasi. Ukuran basa nukleotida bervariasi yaitu 465 bp, 466 bp, 467 bp, dan 468 bp sedangkan ukuran plasmid adalah 468 bp.
Keyword: Artemisia annua L., artemisinin, CRISPR/Cas9

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: