Judul: Kajian epidemiologi virus avian influenza pada distribusi anak ayam umur satu hari
Abstrak: Virus AI patogenitas tinggi atau Highly Pathogenic Avian Influenza (HPAI) saat ini telah menyebar dengan cepat hampir ke seluruh Wilayah Negara Republik Indonesia. Penanganan yang serius perlu segera dilakukan agar wabah AI tidak berkembang menjadi pandemi influenza. Jika dilihat dari jumlah kematian unggas, mulai Bulan Agustus 2003 hingga November 2005, kejadian AI cenderung mengalami penurunan tetapi wilayah yang terjangkit cenderung meluas. Penelitian ini diharapkan dapat mengungkap informasi tentang kemungkinan anak ayam umur satu hari (DOC) terinfeksi atau membawa virus AI. Tujuan penelitian ini adalah mendeteksi keberadaan virus AI pada DOC menggunakan Teknik Pewarnaan Imunohistokimia (IHK), melakukan identifikasi virus AI yang berasal dari DOC dengan Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reactions (RT-PCR) dan isolasi virus AI serta melakukan kajian epidemiologi adanya infeksi virus AI pada DOC. Sampel yang digunakan pada penelitian ini adalah DOC final stock (FS) pedaging dan petelur yang berasal dari perusahaan pembibitan di daerah Jawa Barat dan Banten yang akan didistribusikan ke luar Pulau Jawa melalui Bandar Udara Soekarno Hatta dengan metode detect disease. Pengambilan sampel dilakukan pada Bulan April sampai dengan September 2008 dengan jumlah sampel sebanyak 240 ekor DOC dan diketahui presentase jumlah sampel asal Kabupaten Subang (42.5%), Cianjur (22.5%), Tanggerang (22.5%), Bogor (7.5%), dan Sukabumi (5%). Jumlah sampel DOC pedaging sebanyak 156 ekor (65%) dan DOC petelur sebanyak 84 ekor (35%). Pengambilan sampel dengan metode detect disease ini digunakan untuk mendeteksi penyakit AI pada DOC, apabila ditemukan 1 ekor positif maka dapat dikatakan DOC tersebut telah terinfeksi penyakit AI. Setiap DOC diambil darahnya untuk melihat titer antibodi terhadap AI dengan uji hemaglutinasi inhibisi (HI). DOC tersebut kemudian dinekropsi dan diambil organ (trakea, paru-paru, usus, hati, ginjal) dan kuning telurnya untuk dideteksi keberadaan virus AI menggunakan teknik pewarnaan imunohistokimia (IHK) dan Reverse Transcriptase-Polymerase Chain Reaction (RT-PCR). Deteksi virus AI dengan metode IHK menggunakan antibodi monoklonal AI H5N1 dengan kromogen (AEC) yang akan memberi warna kemerahan pada virus AI. Hasil penelitian diketahui bahwa 158 sampel (65.8%) positif antigen AI H5N1 pada organ. Dari 158 sampel positif tersebut diketahui bahwa 104 sampel (65.8%) menunjukkan keberadaan antigen hanya pada trakea, paru-paru dan usus sedangkan 54 sampel (34.2%) ditemukan pada semua organ (trakea, paru-paru, usus, hati, ginjal) yang diteliti. Identifikasi menggunakan RT-PCR dengan primer matrik (FAI; RAI) serta primer H5 (FH5; RH5) (Lee et al. 2004) pada 40 kumpulan sampel dari 80 sampel organ trakea dan paru-paru hanya 3 kumpulan sampel yang positif Influenza A. Identifikasi pada 80 sampel kuning telur DOC menunjukkan 44 sampel (55%) kuning telur positif Influenza A dan dari sampel positif Influenza A tersebut 19 sampel (43.2%) menunjukkan positif virus AI subtipe H5 dan 25 sampel (56.8%) positif AI subtipe lainnya (Hx). Data epidemiologi diperoleh dengan cara wawancara dan kuesioner. Hasil pemeriksaan laboratorium serta hasil kuesioner kemudian dianalisis dengan analisis logistik untuk mengetahui signifikansi asosiasi antara kejadian AI dan faktor risiko di peternakan sedangkan analisis regresi linier dilakukan untuk menganalisis prevalensi AI. Prevalensi AI tertinggi pada distribusi DOC terdapat pada Kabupaten Bogor (91.7%) dan prevalensi terendah terdapat pada Kabupaten Sukabumi (77.6%). Kasus tertinggi terjadi pada DOC pedaging diawal musim penghujan. Penggunaan alat transportasi milik perusahaan akan mengurangi risiko DOC
Keyword: 

Judul: Identifikasi Subtipe, Patogenitas, Dan Filogenetik Virus Avian Influenza Isolat 2012–2013.
Abstrak: Penyakit Avian Influenza (AI) merupakan penyakit infeksius yang sangat penting pada unggas yang disebabkan oleh virus Avian Influenza. Penyakit ini pertama kali masuk ke Indonesia pada tahun 2003 dan telah menyebar secara luas menyebabkan kerugian ekonomi yang besar dan kematian yang tinggi pada peternakan-peternakan unggas. Dewasa ini wabah penyakit AI masih sering terjadi secara sporadis meskipun pada peternakan yang telah rutin divaksin AI. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menentukan subtipe dan patogenitas virus AI serta melakukan analisis filogenetik dan jarak kekerabatan gen hemaglutinin dari virus-virus AI yang diisolasi pada tahun 2012–2013 di daerah Jawa Barat, Jawa Tengah, dan Medan. Sampel diperoleh dari peternakan unggas yang mengalami wabah penyakit AI dan diinokulasikan serta dipropagasi dalam Telur Ayam Berembrio (TAB) specific pathogen free (SPF) berumur 10 hari.Cairan alantois yang dipanen 5 hari setelah inokulasi diuji hemaglutinasi (HA). Cairan alantois dengan HA positif diuji lebih lanjut untuk menentukan subtipe hemaglutinin dan neuraminidase menggunakan real-time reverse transcription polymerase chain reaction (RRT-PCR) dan dipersiapkan untuk proses pengurutan oligonukleotida menggunakan reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). Hasil proses pengurutan oligonukleotida dari gen hemaglutinin digunakan dalam analisis pola asam amino daerah pemotongan gen hemaglutinin dan hubungan kekerabatan antar virus-virus yang diisolasi. Hasil penelitian menunjukkan bahwa semua isolat tergolong ke dalam HPAI H5N1 dengan pola asam amino daerah pemotongan PQRESRRKKR/GLF dan PQRERRRKR/GLF. Isolat-isolat tersebut terbagi ke dalam klaster 2.1 dan klaster 2.3 dan masih memiliki hubungan kekerabatan yang dekat dengan jarak genetik kurang dari 0.3 antara virus yang satu dengan yang lainnya dan juga terhadap beberapa isolat virus AI yang menyebabkan wabah-wabah sebelumnya di Indonesia. Di masa mendatang isolat-isolat yang digunakan dalam penelitian ini dapat dimanfaatkan sebagai alternatif strain virus untuk produksi vaksin AI yang diharapkan dapat melindungi peternakan-peternakan unggas terhadap ancaman wabah AI.
Keyword: Avian Influenza, daerah pemotongan, hemaglutinin, patogenitas, filogenetik

Judul: Penggunaan Teorema Homeomorphy 2-Manifold dan Teorema Euler Poincare pada Torus 𝑇�� dan Simplicial Complex 𝐾��
Abstrak: Two dimensional topological spaces are said to be homeomorphic if they have the same topological invariant, where one of topological invariant used is an Euler characteristic. Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem and Euler Poincare’s Theorem are used to distinguish two topological spaces. Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem uses Euler characteristic to identify two dimensional topological spaces. Euler Poincare’s Theorem is an alternative way to find Euler characteristic with Betti number, which is topological invariant as well. The objective of this paper is to investigate the homeomorphism of torus 𝑇����� and simplicial complex 𝐾�����. Topological space torus and simplicial complex 𝐾����� have the same Euler characteristic, which is two. Based on Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem topological space torus 𝑇����� and simplicial complex 𝐾����� is homeomorphic.
Keyword: simplicial, torus, Euler, homeomorphism, topology