Judul: Penyakit Busuk Bulir Bakteri (Burkholderia glumae) Terbawa Benih Padi Berbagai Varietas dan Konfirmasinya dengan PCR
Abstrak: Penyakit busuk bulir bakteri (Burkholderia glumae) statusnya menjadi penting dalam beberapa tahun terakhir di berbagai negara termasuk Indonesia. Peningkatan intensitas penyakit diduga akibat perubahan ketahanan tanaman dan ras patogen yang berkaitan dengan perubahan iklim global dan peningkatan aktivitas importasi benih padi. Informasi mengenai penyakit ini di Indonesia masih terbatas. Penelitian ini bertujuan mempelajari gejala dan infeksi B. glumae pada benih padi berbagai varietas dari Pulau Jawa dan konfirmasi dengan polymerase chain reaction (PCR). Sampel benih padi terdiri atas 25 varietas baik unggul, lokal, maupun hibrida impor diperoleh dari berbagai lokasi di Pulau Jawa. Sampel benih acak diambil untuk menentukan insidensi penyakit dan terpilih berdasarkan adanya gejala pada permukaan bulir. Umur benih, tingkat perkecambahan biji, dan insidensi penyakit berdasarkan gejala pada permukaan benih dari masing-masing varietas cukup bervariasi. Penurunan tingkat perkecambahan benih tidak dipengaruhi oleh tingginya insidensi penyakit maupun usia benih saat pengujian. B. glumae positif terdeteksi pada sebagian besar sampel benih padi varietas unggul dan lokal dengan PCR, tetapi tidak terdeteksi pada benih padi hibrida. Jenis-jenis gejala busuk pada permukaan bulir bervariasi dari ringan hingga berat. Hampir semua jenis gejala pada permukaan benih juga berasosiasi positif dengan B. glumae melalui konfirmasi PCR. Patogen juga terdeteksi dalam biji padi tanpa gejala dengan PCR. Biji bergejala busuk menyebabkan penurunan daya kecambah berkisar 1-55%, penurunan pertumbuhan bibit 3-41%, dan penghambatan panjang akar berkisar 5-63%. Benih tanpa gejala dapat menghasilkan tanaman bergejala dan tanpa gejala. Benih dan bibit tanpa gejala dan bergejala juga terbukti berasosiasi dengan B. glumae melalui konfirmasi PCR.
Keyword: Benih tidak bergejala, deteksi molekuler, padi hibrida impor, terbawa benih, varietas lokal, varietas unggul

Judul: Deteksi dan Identifikasi Molekuler Bakteri Burkholderia glumae dalam Benih Padi Varietas Unggul, Lokal, dan Hibrida
Abstrak: Bakteri Burkholderia glumae adalah patogen terbawa benih yang menyebabkan penyakit busuk bulir padi. Bakteri ini menjadi penyebab dari penyakit yang baru meningkat kembali statusnya di beberapa negara penanam padi, termasuk Indonesia. Bakteri ini merupakan patogen yang terbawa benih padi, sehingga ketika benih terinfeksi ditanam, tanaman padi yang tumbuh telah mulai terinfeksi sejak masih sangat dini. Deteksi dan identifikasi B. glumae diperlukan dalam pengambilan keputusan untuk strategi pengendalian lebih awal dan tepat. Deteksi dan identifikasi secara molekuler perlu diaplikasikan untuk B. glumae dalam benih padi mengingat tingkat sensitifitas, akurasi dan efisiensinya yang tinggi. Penelitian ini bertujuan untuk melakukan deteksi dan identifikasi B. glumae secara molekuler dalam benih padi berbagai varietas baik unggul, lokal, dan hibrida yang diperoleh dari Pulau Jawa. Isolasi bakteri dari 25 varietas benih padi dilakukan pada media selektif untuk B. glumae, sucrose phosphate glutamate (S-PG). Sebanyak 15 isolat bakteri terduga B. glumae dari 15 varietas padi menunjukkan kemiripan morfologi dengan karakter spesifik koloni tipe A dari B. glumae pada media S-PG. Deteksi PCR dilakukan dengan primer 1418S dan 1418A yang spesifik mengamplifikasi wilayah sikuen insersi IS1418 dari B. glumae. Hasil PCR menunjukkan bahwa dari 15 isolat bakteri dengan ciri koloni spesifik B. glumae tipe A, 13 isolat terdeteksi positif sebagai bakteri B. glumae dengan terbentuknya ukuran pita DNA berukuran 572 pb. Analisis nukleotida gen 16S rRNA hasil sekuensing dari produk PCR menggunakan pasangan primer 27F dan 1429R dilakukan terhadap isolat-isolat positif B. glumae yaitu BCI11 asal varietas Pandan Wangi Cianjur, BKL14 asal varietas IR-64 Klaten, dan BGE24 asal varietas Hibrida 2 Gresik. Isolat BCI11, BKL14 dan BGE24 menunjukkan homologi berturut-turut sebesar 97%, 85%, dan 65% dengan isolat B. glumae yang tersedia dalam pangkalan data GenBank berdasarkan uji BLAST sikuen nukleotida gen 16S rRNA. Secara filogenetika, isolat BCI11 dan BKL11 berada di dalam kelompok yang sama dengan isolat B.glumae dari negara lain yaitu Thailand, Jepang, Cina, Timor Timur, Korea Selatan, India, Amerika Selatan, dan Panama.
Keyword: Analisis nukleotida, busuk bulir, filogenetika, patogen terbawa benih, PCR-sekuensing

Judul: Implementasi Space Time Composite (STC) Data Model Menggunakan Model Data Relasional
Abstrak: The data model is a concept that describes the data stored in the database and the relationship between the data to the user in logic. Development of data models is very important in the design of the database as the basis of the stage of database design to be made. This study aims to apply the concept of Space Time Composite (STC) on the Model Data storage vector data types that can store enough information and describes the process of drafting objects and objects spatiotemporal evolution over time. From the results of the test queries on the data model that have been created, queries in a system are acquired that can help display the information preparation of objects from time to time and know the history of the object polygon and arc that has undergone changes in topology.
Keyword: