Judul: Seleksi dan Optimasi Primer Spesifik Penyandi Gen Tripsin Inhibitor dan Aktin sebagai Marka Molekuler Ketahanan Hama pada Sengon (Falcataria moluccana).
Abstrak: Sengon (F. moluccana) merupakan salah satu pohon yang dikelompokan sebagai pohon yang memiki banyak fungsi, mudah ditanam, cepat tumbuh, serta bernilai ekonomis. Sifat-sifat tersebut menjadikan sengon banyak dibudidayakan di masyarakat. Namun, adanya serangan hama penggerek batang atau boktor (Xystrocera festiva) menyebabkan kerugian besar dalam pembudidayaannya. Penelitian ini bertujuan mendapatkan marka molekuler yang berbasis gen ketahanan dalam upaya pengendalian serangan boktor, yakni gen tripsin inhibitor (TI). Perancangan primer spesifik yang dilakukan menghasilkan lima kandidat primer TI dan empat kandidat primer aktin. DNA sengon berhasil diisolasi pada penelitian ini. Hasil amplifikasi menunjukkan hanya primer AcTI, TaACT, dan AcACT yang menghasilkan amplikon sesuai ukuran target. Analisis homologi pada ketiga amplikon tersebut memiliki tingkat kesamaan yang cukup tinggi terhadap gen penyandi TI dan aktin lainnya di database. Selain itu, ketiga sekuen amplikon tersebut juga menunjukkan adanya prediksi daerah conserved domain. Gen TI nantinya akan dideteksi ekspresinya dengan Real-Time PCR, menggunakan gen aktin sebagai kontrol.
Keyword: aktin, boktor, F. moluccana, primer spesifik, tripsin inhibitor

Judul: Optimasi Metode Deteksi dan Ekspresi Gen α-Amilase Inhibitor pada Sengon (Falcataria moluccana Miq.)
Abstrak: Salah satu permasalahan yang sering terjadi di hutan rakyat maupun hutan tanaman sengon (Falcataria moluccana Miq.) dengan pola penanamannya yang cenderung monokultur adalah serangan hama penggerek batang boktor (Xystrocera festiva Pascoe). Langkah awal pengembangan sengon yang tahan terhadap serangan hama boktor dapat dilakukan dengan cara pendeteksian gen ketahanan terhadap hama boktor dan mengetahui aktivitas gen melalui analisis ekspresi gen. Salah satu gen ketahanan hama boktor pada sengon yaitu α-amilase inhibitor. Penelitian ini bertujuan untuk optimasi metode deteksi dan analisis ekspresi gen α-amilase inhibitor pada sengon. Prosedur kerja dalam penelitian ini meliputi isolasi DNA dan RNA total, uji kualitatif dan kuantitatif DNA dan RNA total, sintesis cDNA, perancangan primer spesifik gen AAI (target) dan aktin (kontrol), optimasi suhu annealing primer gen AAI dan aktin menggunakan template DNA dan cDNA, sekuensing serta optimasi konsentrasi sampel cDNA pada Real Time PCR. Sekuen gen spesifik aktin berhasil diperoleh dari primer TAAct sebesar 121 bp dan menunjukkan kesamaan dengan gen aktin Sarocalamus faberi. Sekuen gen spesifik α-amilase inhibitor diperoleh dari primer GMAAI sebesar 195 bp dan menunjukkan kesamaan dengan gen LTP Rosa chinensis yang mempunyai fungsi dan struktur domain mirip dengan α-amilase inhibitor. Analisis ekspresi gen aktin dan AAI menggunakan primer TAAct dan GMAAI masih perlu dioptimasi lagi.
Keyword: α-amilase inhibitor, aktin, Falcataria moluccana, Real Time PCR

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: