Judul: Studi tentang kelimpahan dan distribusi vertikal harian zooplankton di Teluk Palabuhan Ratu pada musim timur 1992
Abstrak: Penelitian ini dilakukan di Teluk Palabuhan Ratu yang merupakan daerah penangkapan ikan yang cukup potensial. Perairan ini merupakan perairan teluk yang cukup luas dan berhubungan langsung dengan Lautan Hindia, sehingga karakteristik dan proses dinamika laut yang terjadi (fisika, kimia dan biologi) banyak dipengaruhi oleh Lautan Hindia. Tiga buah. sungai bermuara di teluk ini yaitu Sungai Citepus, Sungai Cimandiri dan Sungai Cipalabuhan. Plankton mempunyai peranan sangat penting, karena merupakan mata rantai dari rantai makanan di laut. Selain itu keberadaan dan sebar- an plankton dapat memberikan petunjuk tentang kesuburan perairan. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pola sebaran zooplankton di perairan Teluk Palabuhan Ratu pada musim timur 1992 dan gambaran tentang pola sebaran dan migrasi vertikal pada lapisan 075 m. Aspek yang diteliti meliputi kelimpahan, komposisi, keragaman dan dominansi zooplankton. Hasil pengukuran suhu permukaan di perairan Teluk Palabuhan Ratu pada pengambilan I berkisar 28,5029,00 °C. Pengambilan II berkisar 27,00 27,50 °C. Sedangkan pada pengambilan III berkisar 27.00- 28,00 °C. Salinitas permukaan pada pengambilan I berkisar 30,00 33,00°/00. Pengambilan II berkisar 30,00-33,00°/0o. Sedangkan pengambilan III berkisar 30,00 34,00°/00. Hasil pencacahan zooplankton per meter kubik air laut pada pengambilan I berkisar 1344 619 individu/m³ dengan rata-rata 949 individu/m³. Pada pengambilan II berkisar 966-503 individu /m³ dengan rata-rata 742 individu/m³. Sedangkan pada pengambilan III berkisar 936-294 individu/m³ dengan rata-rata 534 individu/m³. ...
Keyword: 

Judul: Kelimpahan, komposisi jenis, penyebaran dan perkembangan suksesi zooplankton di Perairan Teluk Pelabuhan Ratu Jawa Barat
Abstrak: Penelitian dilakukan mulai tanggal 2 April hingga tanggal 31 Mei 1994 di daerah Perairan Teluk Pelabuhan Ratu, Sukabumi Jawa Barat. Pengambilan contoh dilakukan setiap dua minggu sekali. Secara geografis daerah ini terletak antara 6°57' -7°07' Lintang Selatan dan 106°22' 106°33' Bujur Timur. Teluk ini dikeli- lingi oleh pegunungan terjal yang berkelanjutan ke bawah laut, sehingga tidak jauh dari pantai teluk ini mempunyai kedalaman lebih dari 200 m. Teluk Pelabuhan Ratu merupakan tempat bermuaranya Sungai Cimandiri, Cisolok, Cimaja, Cipanyairan, Cibareno, Cipalabuhan dan sungai Citepus. Sungai Cimandiri merupakan sungai terbesar yang alirannya dapat mencapai 200 m ke dalam teluk. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui kelimpahan, komposisi jenis, penyebaran, keragaman, keseragaman, dominansi dan perkembangan suksesi serta berbagai jenis zooplankton di daerah Perairan Teluk Pelabuhan Ratu. Di lokasi penelitian ditetapkan 10 buah stasiun pengambilan contoh dida- sarkan pada perbedaan isodepth dan adanya pengaruh yang berasal dari daratan baik pelabuhan ataupun aliran sungai dan setiap stasiun dibedakan kembali berdasarkan kedalaman. Di perairan Teluk Pelabuhan Ratu kelimpahan zooplankton berkisar antara 15 1749 ind/1, dengan rata-rata kelimpahan 563 ind/1. Berdasarkan perbedaan zonasi, stasiun Cimandiri memiliki kelimpahan tertinggi 666 ind/1. ...
Keyword: 

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA