Judul: Rekayasa Genetik Tanaman Kentang (Solanum tuberosum L.) Kultivar Jala Ipam dengan Gen MmPMA
Abstrak: Kentang merupakan salah satu bahan pangan utama di dunia setelah gandum, padi, dan jagung dan mendapatkan prioritas untuk pengembangannya di Indonesia. Peningkatan produksi merupakan prioritas utama dalam menjaga ketahanan pangan kentang. Salah satu faktor yang sangat penting dalam peningkatan produksi adalah bibit. Selain bibit, faktor lingkungan juga mempengaruhi produksi kentang. Beberapa lahan di dataran tinggi di Indonesia bersifat masam yang mengakibatkan produksi tanaman menurun. Perakitan tanaman transgenik melalui rekayasa genetika dilakukan untuk memperoleh tanaman yang memiliki kualitas dan kuantitas yang lebih baik dibandingkan dengan tanaman non-transgenik. H+-ATPase membran plasma memiliki peranan yang sangat penting dalam mengaktifkan transport sekunder pada tanaman seperti penyerapan mineral dari tanah, toleransi terhadap garam, dan pembukaan stomata. Tembakau (Nicotiana tabacum L.) transgenik yang mengandung gen MmPMA penyandi H+-ATPase membran plasma dari Melastoma malabathricum L. mempunyai jumlah cabang, bunga, buah, dan stomata yang membuka lebih banyak dibandingan dengan tanaman non-transgenik. Tembakau transgenik juga berbunga lebih awal. Penelitian ini bertujuan untuk melakukan rekayasa genetika tanaman kentang kultivar Jala Ipam dengan gen MmPMA penyandi ATPase membran plasma untuk mendapatkan tanaman kentang transgenik. Tanaman kentang transgenik ini diharapkan mempunyai produktivitas yang lebih tinggi dan lebih toleran terhadap lahan masam daripada tanaman non-transgenik. Transformasi genetik telah dilakukan dengan metode kokultivasi menggunakan Agrobacterium tumefaciens strain LBA4404 yang membawa pGWB502-MmPMA. Ruas batang dari kentang kultivar Jala Ipam digunakan sebagai eksplan untuk ditransformasi. Efisiensi transformasi genetik pada penelitian ini adalah sebesar 3.46%. Analisis integrasi transgen MmPMA dilakukan dengan PCR menggunakan sepasang primer 35S-F dan PMA-R1. Analisis PCR menunjukkan bahwa enam tanaman transgenik putatif yang resisten terhadap higromisin sebagai agen seleksi merupakan tanaman transgenik yang mengandung gen MmPMA dibawah kendali promoter 35S CaMV. Hasil ini menunjukkan bahwa rekayasa genetika tanaman kentang Jala Ipam dengan gen MmPMA telah berhasil dilakukan dengan mendapatkan tanaman transgenik. Tanaman transgenik mempunyai jumlah stomata membuka, lebar stomata membuka, tinggi tanaman dan toleransi tanaman terhadap pH rendah lebih tinggi daripada tanaman non-transgenik. Produktivitas umbi antara kentang transgenik dan non-transgenik relatif sama.
Keyword: plasma membran ATPase, kentang kultivar Jala Ipam, rekayasa genetika, Agrobacterium tumefaciens, transgenik

Judul: . Transformasi Genetik Tanaman Kentang (Solanum Tuberosum L.) Kultivar Jala Ipam Dengan Gen Hd3a.
Abstrak: Kentang merupakan salah satu bahan pangan yang dapat dimanfaatkan sebagai pangan tanpa diproses dan pangan olahan. Kentang French fries beku merupakan kentang olahan yang sangat penting. Produksi kentang untuk French fries beku masih sedikit, sehingga peningkatan produksi bibit dan perakitan kultivar baru menjadi penting untuk dilakukan. Jala Ipam merupakan kultivar kentang yang cocok untuk produksi French fries beku. Rekayasa genetik dengan gen Hd3a dapat memperbaiki produktivitas kultivar ini. Hd3a merupakan mobile florigen pada tanaman padi yang mempunyai homologi dengan FT (flowering locus T) dari Arabidopsis. Ekspresi berlebih gen Hd3a menginduksi pembungaan dan pengumbian pada kentang cv. Andigena transgenik. Penelitian ini bertujuan untuk melakukan transformasi genetik kentang Jala Ipam dengan gen Hd3a. Transformasi genetik dilakukan dengan perantara Agrobacterium tumefaciens strain LBA4404 yang membawa plasmid p2K1-Hd3a yang mengandung gen Hd3a di bawah kendali promoter rolC dan A. tumefaciens yang membawa plasmid pCambia1300-Hd3a yang mengandung gen Hd3a di bawah kendali promoter 35S CaMV. Ruas batang (internode) digunakan sebagai eksplan yang ditransformasi. Eksplan mulai membentuk kalus 2 minggu setelah kokultivasi. Efisiensi transformasi pada penelitian ini adalah sebesar 18% untuk tanaman yang ditransformasi dengan p2K1-Hd3a dan 7% untuk tanaman yang ditransformasi dengan pC1300-Hd3a. Analisis molekuler dengan PCR dilakukan untuk mengetahui integrasi gen Hd3a di dalam tanaman transgenik. PCR dilakukan dengan menggunakan pasangan primer rolC-F dan Hd3a-FP-R untuk tanaman transgenik putatif yang dihasilkan dari transformasi menggunakan plasmid p2K1-Hd3a dan pasangan primer 35S-F dan Hd-R untuk tanaman transgenik putatif yang dihasilkan dari transformasi menggunakan plasmid pC1300-Hd3a. Analisis PCR menunjukkan bahwa dua dari tiga tanaman transgenik putatif adalah tanaman transgenik yang mengandung gen Hd3a di bawah kendali promoter rolC dan keempat tanaman transgenik putatif semuanya adalah tanaman transgenik yang mengandung gen Hd3a di bawah kendali promoter 35S CaMV. Hasil ini menunjukkan bahwa proses transformasi genetik kentang kultivar Jala Ipam dengan gen Hd3a telah berhasil dengan baik.
Keyword: Kentang kultivar Jala Ipam, gen Hd3a, Agrobacterium tumefaciens, promoter rolC, promoter 35S CaMV

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: