Judul: Keragaman Genetik Tiliqua Scincoides (Squmata:Scincidae) berdasarkan Gen COI DNA Mitokondria
Abstrak: Kadal lidah biru (Scincidae: Tiliqua: Tiliqua scincoides) merupakan kadal diurnal, soliter, omnivora dan memiliki lidah berwarna biru. Distribusi alami kadal lidah biru terdapat di wilayah Indonesia bagian Timur, Australia dan Papua Nugini. Studi keragaman genetik dilakukan untuk mengetahui besarnya variasi genetik sebagai kunci konservasi dan pemanfaatannya. Ruas gen yang diamati adalah sekuen COI dari DNA mitokondria. Sampel buccal cells dijadikan sebagai sumber molekul DNA. Amplifikasi PCR sekuen COI genom mitokondria dengan primer AF645F dan AF646R kemudian runutan nukleotidanya disekuensing. Sekuen DNA gen COI hasil penyejajaran adalah 741 pasang basa yang terkonfirmasi sebagai spesies Tiliqua scincoides. Enam belas haplotipe berhasil teridentifikasi dari 93 situs polimorfik. Visualisasi haplotipe network yang terbentuk menjadi 16 haplotipe dengan 2 haplogroup yang dapat membedakan antar lokasi sampel. Jarak genetik menunjukkan kisaran antara 0.000-0.114. Nilai keragaman nukleotida (π) sebesar 0.052±0,007 dan keragaman haplotipe (hd) sebesar 0.971±0.027 menggambarkan keragaman genetik yang tinggi. Analisis pohon filogeografi membentuk 2 clade utama yang membedakan antar lokasi pada sampel kadal lidah biru.
Keyword: buccal cells, COI, kadal lidah biru, Tiliqua scincoides

Judul: Variasi gen cytochrome oxidase i (coi) pada lebah trigona di desa batu kucing dan desa bungku, jambi
Abstrak: Lebah trigona merupakan salah satu serangga polinator yang berperan dalam ekosistem. Pendataan keanekaragaman trigona secara morfologi telah dilakukan di indonesia, namun pendataan secara molekular dengan variasi gen cytochrome oxidase i (coi) belum dilakukan. Penelitian ini bertujuan menganalisis kekerabatan antar tiga spesies trigona dan mempelajari variasi gen cytochrome oxidase i (coi) pada lebah trigona di desa batu kucing dan desa bungku, jambi. Jumlah sampel yang dianalisis sebanyak dua individu pada t. Fuscobalteata, t. Laeviceps asal desa batu kucing dan desa bungku, jambi. Primer gen coi di disain berdasarkan melipona bicolor dari genbank. Hasil sekuen gen coi trigona secara parsial menghasilkan panjang nukleotida t. Fuscobalteata dan t. Laeviceps berturut-turut sebesar 724 dan 908 pb dengan komposisi at yang tinggi. Alignment sekuen asam amino t. Fuscobalteata, t. Laeviceps dan t. Chanchamayoensis dengan outgroup melipona bicolor menunjukkan daerah yang conserve sebanyak 161 pb dan variasi ditemukan pada 19 pb. Analisis jarak genetik tertinggi diperoleh antara m. Bicolor dengan t. Laeviceps sebesar 0.023. Konstruksi filogeni dilakukan menggunakan metode maximum parsimony (mp) dan neighbour joining (nj). Hasil kedua konstruksi filogeni menunjukkan kesamaan t. Laeviceps memiliki kekerabatan yang dekat dengan t. Fuscobalteata dibandingkan t. Chanchamayoensis.
Keyword: gen coi, dna mitokondria, trigona

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: