Judul: Pengembangan Metode Deteksi Cepat Aspergillus flavus Link. dan Fusarium sp. pada Benih Padi Menggunakan Laser-Induced Flourescence
Abstrak: Padi merupakan tanaman pangan yang memiliki nilai ekonomi tinggi dan sebagai komoditas politik. Berbagai upaya dilakukan pemerintah untuk mencapai target produksi padi sehingga dapat mengimbangi kenaikan konsumsi beras sebesar 2% yang disebabkan oleh pertambahan jumlah penduduk dan peningkatan konsumsi beras per kapita. Benih merupakan salah satu komponen utama yang menjadi faktor pembatas dalam sistem produksi padi. Kualitas benih akan menentukan nilai ekonomi suatu produksi pertanian, sehingga benih merupakan komoditas yang bernilai ekonomi tinggi.
Keyword: 

Judul: Deteksi Cendawan Patogen Terbawa Benih Padi Menggunakan Spektroskopi Fluoresens Serat Optik
Abstrak: Penggunaan benih bermutu akan mendapatkan hasil produksi yang tinggi dan berkualitas. Cendawan patogen terbawa benih merupakan salah satu faktor pembatas ketersediaan benih bermutu dan peningkatan hasil produksi tanaman. Kelompok cendawan Fusarium sp., Aspergillus sp., dan Bipolaris sp. banyak ditemukan menginfeksi benih padi baik saat penyimpanan maupun di lapangan. Patogen terbawa benih dapat memengaruhi seluruh kriteria mutu benih, terutama kesehatan benih. Deteksi dan identifikasi merupakan kegiatan penting dalam pengelolaan penyakit tanaman untuk menekan resiko kerugian yang ditimbulkan cendawan patogen. Penelitian ini bertujuan untuk mengembangkan metode deteksi dan identifikasi alternatif yang lebih cepat, akurat dan sederhana untuk cendawan patogen terbawa benih menggunakan spektroskopi fluoresens serat optik berdasarkan metabolit sekunder yang dihasilkan. Penelitian dilaksanakan di Laboratorium Mikologi Tumbuhan Departemen Proteksi Tanaman, Laboratorium Spektroskopi Optik Departemen Fisika Institut Pertanian Bogor dari Oktober 2016 hingga Juni 2017. Penelitian ini terdiri atas beberapa tahap, yaitu (1) isolasi dan identifikasi untuk mendapatkan isolat murni Aspergillus flavus, Bipolaris oryzae, dan Fusarium semitectum; (2) kalibrasi spektroskopi fluoresens serat optik, meliputi pembuatan media alternatif pertumbuhan cendawan, pembuatan probe serat optik, analisis metabolit sekunder cendawan target menggunakan Py-GC-MS, pengukuran panjang gelombang metabolit yang dihasilkan masing-masing isolat cendawan target dan kalibrasi spektroskopi fluoresens serat optik sebagai metabolit cendawan standar; (3) deteksi A. flavus, B. oryzae, dan F. semitectum pada benih padi, meliputi pembuatan suspensi cendawan dan aplikasi spektroskopi fluoresens serat optik untuk deteksi cendawan target pada benih padi. Hasil penelitian menunjukkan bahwa senyawa utama dan penciri metabolit A. flavus adalah aflatoksin B1, sedangkan pada B. oryzae adalah ophiobolin A, dan senyawa beauvericin pada F. semitectum. Berdasarkan pengujian dengan spektroskopi fluoresens serat optik pada metabolit cendawan A. flavus dapat dideteksi pada panjang gelombang emisi 440 nm, sedangkan B. oryzae pada 534 nm, dan F. semitectum pada 510 nm. Sensitivitas spektroskopi fluoresens serat optik bergantung pada kandungan metabolit dan nutrisi media pertumbuhan cendawan. Tingkat pengenceran metabolit terendah yang mampu terdeteksi untuk B. oryzae dan F. semitectum yaitu 10-7, sedangkan A. flavus hingga 10-10. Media ekstrak padi yang digunakan sebagai media alternatif mampu menstimulasi produksi metabolit cendawan pada masa inkubasi 24 jam. Semakin rendah tingkat konsentrasi media akan semakin sedikit cendawan yang terdeteksi. Spektroskopi fluoresens serat optik dapat digunakan sebagai metode deteksi cendawan patogen terbawa benih yang akurat dan cepat.
Keyword: Aspergillus flavus, Bipolaris oryzae, Fusarium semitectum, metabolit sekunder, panjang gelombang

Judul: Posisi Filogenetik Kura-Kura Carettochelys Insculpta  (Reptillia: Testudinata)
Abstrak: Carettochelys insculpta is an endemic freshwater turtle of southern Papua and northern Australia. Phylogenetic position of this turtle is remain unresolved until now. Most of the research conducted show close relationships of C. insculpta and members of Trionychidae family. However, some of the research show distance between C. insculpta and members of Trionychidae family. This research is conducted to analyze phylogenetic relationship between C. insculpta and other members of Testudinata using 12S rRNA, 16S rRNA, and both gene as markers. DNA samples were obtained from three different organisms of C. insculpta. Two species used as outgroups were Alligator mississippiensis and Iguana iguana. Phylogenetic analysis was carried out using Neighbor-Joining method with Felsenstein 1981 (F81) modeltest. A polytomy tree of Testudinata was produced by using 12S rRNA gene. However, analysis using 16S rRNA and both genes as markers confirmed that C. insculpta was located between the Chelonidae and the Trionychidae family.
Keyword: