Judul: Seleksi dan Identifikasi Aktinomiset sebagai Agens Hayati untuk Pengendalian Penyakit Kresek yang Diakibatkan oleh Xanthomonas oryzae pv. oryzae pada Padi
Abstrak: Padi merupakan tanaman yang sangat penting sebagai sumber bahan pangan utama di Indonesia. Salah satu penyakit yang sering menyerang padi adalah penyakit kresek oleh bakteri Xanthomonas oryzae pv. oryzae. Penelitian ini bertujuan mengisolasi dan mengidentifikasi isolat aktinomiset yang berpotensi untuk mengendalikan penyakit kresek pada padi oleh bakteri X. oryzae pv. oryzae. Lima belas isolat aktinomiset telah diisolasi dari tanah perakaran bambu, tanah sawah, dan tanah perakaran sawit di Bogor. Lima isolat, yaitu AB10, AB11, ATS6, ATS8 dan APS7, menunjukkan aktivitas penghambatan terhadap X. oryzae pv. oryzae. Empat isolat, yaitu AB10, AB11, ATS6, dan APS7 kembali diuji untuk perlakuan perendaman benih padi. Hasil pengujian menunjukkan bahwa perlakuan perendaman benih padi dengan aktinomiset tidak memberikan pengaruh nyata terhadap persen perkecambahan, tinggi tunas, panjang akar, dan bobot kecambah. Namun demikian, perlakuan dengan isolat ATS6 dan APS7 memberikan persen perkecambahan, tinggi tunas, panjang akar, dan bobot kecambah yang lebih baik dibandingkan perlakuan lainnya. Perlakuan perendaman benih padi dengan aktinomiset dapat mengurangi jumlah inokulum bakteri X. oryzae pv. oryzae terbawa benih. Isolat ATS6 merupakan isolat aktinomiset yang menunjukkan hasil terbaik dalam penekanan bakteri X. oryzae pv. oryzae dan pertumbuhan kecambah padi. Dua isolat yang paling berpotensi dipilih dan diidentifikasi. Berdasarkan hasil identifikasi dari sekuen parsial gen 16S rRNA, isolat ATS6 dan APS7 termasuk ke dalam genus Streptomyces. Isolat ATS6 memiliki kesamaan terdekat (98%) dengan S. katrae HQ607777.1, dan isolat APS7 memiliki kesamaan terdekat (99%) dengan Streptomyces sp. HE577953.1. Kedua isolat aktinomiset tersebut berpotensi untuk dikembangkan lebih lanjut sebagai agens hayati untuk pengendalian penyakit kresek…
Keyword: Aktinomiset, Penyakit kresek, Xanthomonas oryzae pv. oryzae, Agens hayati

Judul: Penapisan Aktinomiset Filosfer Padi Penghasil Senyawa Bioaktif Anti Xanthomonas oryzae pv. oryzae dan Pyricularia oryzae Penyebab Penyakit Pada Padi.
Abstrak: Padi merupakan salah satu komoditi pangan yang penting di dunia. Namun berbagai macam penyakit pada tanaman padi dapat menyebabkan penurunan produksi padi. Dua penyakit penting yang menyerang tanaman padi antara lain penyakit hawar daun bakteri (HDB) yang disebabkan oleh Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo) dan penyakit blas yang disebabkan oleh cendawan Pyricularia oryzae (Po). Salah satu alternatif yang dapat digunakan untuk mengendalikan penyakit-penyakit tersebut adalah menggunakan mikroba agens pengendali hayati, diantaranya dari jenis aktinomiset. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi aktinomiset dari filosfer padi yang menghasilkan senyawa bioaktif penghambat pertumbuhan Xoo dan Po. Sebanyak 33 isolat telah diisolasi dari filosfer padi varietas Ciherang. Uji antagonisme terhadap Xoo dan Po yang dilakukan menunjukkan semua isolat yang diperoleh mempunyai potensi dalam menghambat pertumbuhan Xoo, dan 28 isolat diantaranya mempunyai potensi menghambat pertumbuhan Po. Uji hipersensitivitas pada tanaman tembakau menunjukkan 27 isolat tidak menimbulkan reaksi hipersensitif pada daun tembakau, sedangkan uji patogenisitas terhadap tanaman padi varietas IR-64 yang dilakukan dengan teknik pengguntingan dan pencelupan daun menunjukkan 18 isolat tidak mengakibatkan gejala penyakit pada tanaman padi. Sebanyak 13 isolat yang memiliki sifat antagonis terhadap kedua patogen tersebut, non patogenik terhadap padi dan tembakau, berpotensi untuk dikembangkan sebagai agens biokontrol terhadap penyakit hawar daun bakteri dan blas. Identifikasi secara molekuler terhadap 4 isolat terbaik (H1.11, H1.8, AFSG 29, dan AFSG 15) menunjukkan bahwa isolat H1.11 memiliki kemiripan dengan Streptomyces sp. (99% dari 983 nukleotida, evalue 0.0, query cover 99%), isolat H1.8 memiliki kemiripan dengan Actinomadura sp. (100% dari 100 nukleotida, e-value 0.0, query cover 100%), dan dua isolat lainnya teridentifikasi sebagai Uncultured bacterium clone.
Keyword: Actinomycetes, Bacterial leaf blight, Phylloshere bacteria, Bioactive compounds

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: