Judul: Kontribusi maternal kuda Arab (Equus ferus caballus) pada populasi poni Sulawesi Utara berdasarkan D-loop mitokondria parsial.
Abstrak: Poni Sulawesi Utara diklasifikasikan ke dalam empat subpopulasi, yaitu poni Minahasa, Minahasa Selatan, Manado dan Tomohon. Keempat populasi poni tersebut memiliki karakteristik warna rambut dan ukuran tubuh yang berbeda dengan lebar pinggul sebagai pembeda anatar subpopulasi poni lokal Sulawesi Utara. Keempat poni diperkirakan berasal dari introgesi kuda Thoroughbred dan kuda Arab. Sebagian data yang menunjukkan struktur genetik dan hubungan asal-usul populasi poni Sulawesi Utara telah dikaji melalui morfometrik, warna tubuh dan keragaman protein darah. Tujuan penelitian ini untuk menganalisis asal-usul tetua betina pada poni Sulawesi Utara melalui DNA mitokondria. Bagian dari mtDNA D-loop parsial, Hyper Variable Segments 1 (HVS1), digunakan untuk mengetahui tetua betina kuda Arab (Equus ferus caballus) yang ditemukan pada sebelas poni Sulawesi Utara (Tomohon, Amurang, Kawangkoan) dan dilakukan melalui metode “sequencing” D-loop mitochondrial DNA parsial. Produk isolasi DNA diamplifikasi pada daerah D-loop parsial mitokondria dengan metode PCR, primer forward EA 177 5’ AGCTCCACCATCAACACCCAA-3’ dan primer reverse EA 178 5’-CCATGGACTGAATAACACCTTATGGTTG-3’, pada kondisi predenaturasi 95°C selama tiga menit, denaturasi 95°C selama satu menit, penempelan primer pada suhu 57°C selama satu menit, tahap pemanjangan ruas DNA pada suhu 72°C selama 2 menit, tahap pemanjangan akhir ruas DNA pada suhu 72°C selama 5 menit sebanyak 30 siklus, dan diakhiri dengan tahapan pendinginan pada suhu 15°C selama 15 menit. Sepanjang 368 pasang basa dari daerah HVS1 dianalisis (HVS-1: posisi nukleotida 15.469-15.834) terhadap daerah kontrol mitokondria (d-loop: pasang nukleotida 15.469-16.660). Analisis terhadap ruas HVS1 menggunakan metode Neighbour Joining dan p-distance dengan pengulangan 1000x. Keragaman haplotipe melalui sekuen D-loop HVS 1 dapat digunakan untuk membedakan Equus caballus (no. Acc X79547.1) terhadap intraspesies poni lokal Sulawesi Utara. Analisis filogenetik menunjukkan bahwa sebelas poni Sulawesi Utara merupakan anggota spesies Equus caballus. Enam poni asal Sulawesi Utara diduga memiliki hubungan kekerabatan maternal dengan kuda USA-Egyptian, diantaranya poni Kawangkoan (no. 1, 2, 3, 4) dan poni Amurang (no. 2 dan 5) dengan jarak genetik antara 0 hingga 6,5%. Karakter haplotipe yang sama pada poni Kawangkoan no. 4 ditemukan pada USA-Egyptian (no. Acc KC840716.1) dengan jarak genetik 0%. Poni ini memiliki hubungan kekerabatan maternal dengan kuda USA-Egyptian. Poni Amurang (no. 1, 3, 4), poni Kawangkoan (no. 5) dan poni Tomohon tidak ditemukan karakter haplotipe kuda Arab. Poni Amurang (no. 1, 4, 3), poni Kawangkoan (no. 5) dan poni Tomohon tidak memiliki hubungan kekerabatan maternal dengan kuda Arab.
Keyword: Equus caballus, partial mtDNA D-loop sequencing, phylogenetic, USA-Egyptian horse, Arabian horses

Judul: Analysis of Local Horse Pedicab Coat Color Pattern in North Sulawesi
Abstrak: Horse has been domesticated since ancient times. The horse coat color is the expression of genotype and categorize as qualitative traits. Information on the characteristic of Indonesian, especially in North Sulawesi horse coat color is very limited. The aim of this study is to determine the phenotype and genotype of coat color of horse in the North Sulawesi. The study was conducted in four different areas in North Sulawesi, Tomohon, Manado, Minahasa and Amurang. Genetic distance analyses based on coat color was performed. The most coat color in the four areas was bay, chestnut, bay-cream, chestnut-cream, roan, black, white and spotted. The dominant coat color was bay and chestnut. Genetic distance analyses result indicate that the horse from Manado, Minahasa and Amurang are clustered in one group and separated to Tomohon population with the genetic distance between the two cluster was 0.002244. The genetic distance of the horse from Manado and from Minahasa was 0.000164. On the other hand, the genetic distance of the horse from Manado and Minahasa group and Amurang was 0.001006. The smallest genetic indicates the closeness genetic between the two population.
Keyword: 

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: