Judul: Correlation of HSP70 Expression, Post-Thawing Spermatozoa Quality, and Fertility of Bali Bulls by Age Group
Abstrak: Sapi Bali merupakan sapi asli Indonesia yang memiliki berbagai keunggulan, seperti performa yang baik, kualitas karkas yang bagus, mudah beradaptasi, mampu mencerna pakan berkualitas rendah, dan performa reproduksi yang baik. Strategi pemuliaan untuk meningkatkan populasinya salah satunya adalah melalui penerapan teknologi reproduksi berbantuan inseminasi buatan (IB) dengan menggunakan semen beku. Pemanfaatan semen beku dalam penerapan IB mempunyai beberarapa kendala, diantaranya adalah penurunan kualitas spermatozoa oleh pengaruh proses kriopreservasi dan pencairan kembali semen. Selain itu, penuaan merupakan salah satu faktor yang menyebabkan penurunan kualitas semen seperti hilangnya protein-protein (makromolekul) spermatozoa dan berimplikasi pada penurunan fertilitas. Makromolekul spermatozoa seperti heat shock protein 70 (HSP70) memiliki peran yang penting untuk menjaga homeostasis protein dari pengaruh perubahan suhu dan stres oksidatif. Kehadiran protein ini banyak dikaji hubungannya dengan fertilitas. Oleh karena itu, diperlukan kajian untuk mengidentifikasi ekspresi gen dan protein HSP70 serta hubungannya dengan kualitas spermatozoa post-thawing dan fertilitas lapangan sapi Bali. Penelitian ini menggunakan 6 ekor pejantan sapi Bali yang dikelompokkan berdasarkan umur (3 ekor berumur 9 tahun dan 3 ekor berumur 12 tahun). Computer-assisted semen analysis (CASA) digunakan untuk mengamati motilitas dan parameter kinetik spermatozoa. Abnormalitas morfologi spermatozoa dievaluasi menggunakan pewarnaan Diff-Quick. Pewarnaan fluorescence isothiocyanate-conjugated peanut agglutinin (FITC-PNA) digunakan untuk mengamati integritas akrosom spermatozoa dan pewarnaan acridine-orange (AO) untuk mengamati fragmentasi DNA. Identifikasi ekspresi gen HSP70 pada spermatozoa post-thawing dilakukan menggunakan qRT-PCR dan identifikasi protein HSP70 menggunakan ELISA. Tingkat fertilitas lapangan diperoleh dari nilai conception rate (CR) yang dihitung dari data layanan IB dan pemeriksaan kebuntingan tahun 2019-2021 provinsi Bali yang tersedia di data besar iSIKHNAS. Data dianalisis menggunakan Microsoft Excel 365 dan Microsoft Access 2013 untuk mengetahui tingkat fertilitas pejantan. Perbedaan kualitas spermatozoa post-thawing, ekspresi HSP70, dan fertilitas antar-kelompok umur (9 tahun dan 12 tahun) dianalisis menggunakan t-test independent. Hubungan ekspresi HSP70, kualitas spermatozoa post-thawing, dan fertilitas dianalisis menggunakan Pearson correlation. Data tersebut diolah menggunakan program SPSS versi 25.0. Hasil penelitian menunjukkan bahwa terdapat perbedaan kualitas spermatozoa post-thawing antara pejantan kelompok umur 9 tahun dan 12 tahun. Motilitas total (63,971,12% vs 57,232,01%), motilitas progresif (58,171,44% vs 51,712,34%), non-motile sperm (36,001,11% vs 42,781,99%), abnormalitas morfologi (kelainan bagian kepala: 0,490,09% vs 0,740,09; kelaian bagian leher dan midpiece: 0,780,15% vs 2,400,67%; kelainan bagian ekor: 7,950,36% vs 9,490,56%), dan integritas akrosom spermatozoa (86,680,72% vs 82,571,02%) dari pejantan umur 9 tahun secara signifikan terdapat perbedaan dengan pejantan umur 12 tahun, sedangkan pada parameter kinetik dan fragmentasi DNA tidak terdapat perbedaan yang signifikan antara kedua kelompok umur. Teridentifikasi ekspresi gen dan protein HSP70 pada spermatozoa post-thawing sapi jantan Bali, meskipun tidak berbeda signifikan (P>0,05) antara kedua kelompok umur. Tingkat fertilitas lapangan dari semua pejantan tergolong baik, namun kelompok pejantan umur 9 tahun (75,941,09%) dan kelompok pejantan 12 tahun (74,200,39%) tidak terdapat perbedaan yang signifikan (P>0,05). Secara statistik ekspresi gen HSP70 berkorelasi dengan hiperaktif spermatozoa (r = 0,815; P<0,05) dan integritas akrosom spermatozoa (r = 0,882; P<0,05), sedangkan protein HSP70 berkorelasi dengan integritas akrosom spermatozoa (r = 0,860; P<0,05). Selain itu, ekspresi gen HSP70 memiliki hubungan erat dengan fertilitas (r = 0,935; P<0,01). Hubungan yang erat juga terlihat antara hiperaktif (r = 0,927; P<0,01) dan integritas akrosom spermatozoa (r =
Keyword: HSP70, post-thawing, sapi Bali

Judul: IPB (Bogor Agricultural University)
Abstrak: Sapi madura sebagai salah satu plasma nutfah sapi lokal Indonesia yang memiliki tiga kegunaan yaitu sebagai sapi karapan, sapi sonok dan sapi pedaging. Sapi madura mulai dikembangkan sebagai sapi pedaging untuk memenuhi kebutuhan daging nasional. Salah satu strategi yang diterapkan untuk meningkatkan populasi sapi madura yaitu melalui inseminasi buatan (IB) menggunakan semen beku. Seleksi sapi madura unggul dilakukan melalui metode breeding soundness examination (BSE) dengan kualitas semen yang baik dan berdasarkan standar nasional Indonesia (SNI). Pemeriksaan kualitas semen konvensional masih belum akurat untuk memprediksi fertilitas dengan persentase conception rate yang belum maksimal. Analisis berbasis omic dengan pemanfaatan biomarka banyak dikembangkan untuk mengidentifikasi faktor molekuler yang mempengaruhi fertilitas pejantan. Evaluasi kualitas spermatozoa dikombinasikan dengan penggunaan beberapa biomarka, dianggap dapat lebih akurat untuk seleksi fertilitas pejantan. Protein heat shock protein 70 member 2 (HSP70-2), protamin 1 (PRM1) dan ostepontin (OPN) merupakan 3 major protein yang terseleksi dan berkorelasi terhadap kualitas semen infertilitas, penurunan kualitas fungsional spermatozoa, hingga perkembangan awal embrio. Tujuan penelitian ini adalah mengkaji pemanfaatan HSP70-2, PRM1 dan OPN sebagai biomarka penanda fertilitas. Penelitian terdiri dari 4 bagian tujuan spesifik, diantaranya (1) menganalisis karakteristik spermatozoa post-thawing dengan perbedaan tingkat fertilitas di lapangan, (2) menganalisis ekspresi gen dan konsentrasi protein HSP70-2, PRM1 dan OPN spermatozoa serta korelasinya terhadap kualitas spermatozoa pada tingkat fertilitas berbeda, (3) mengidentifikasi karakteristik berat molekul protein HSP70-2, PRM1 dan OPN pada spermatozoa, dan (4) menganalisis pemanfaatan protein HSP70-2, PRM1 dan OPN untuk menilai fertilitas spermatozoa sapi Madura. Penelitian bagian pertama dengan tujuan menganalisis karakteristik spermatozoa post-thawing sapi madura dengan perbedaan tingkat fertilitas di lapangan. Sapi madura dikelompokkan ke dalam tingkat fertilitas berbeda berdasarkan pengolahan data %first service conception rate (%FSCR) menggunakan data iSIKHNAs tahun 2018-2020. Hasil pengelompokkan tingkat fertilitas sapi madura unggul menjadi 3 tingkat fertilitas yaitu high fertility (HF) (80,86%; n= 2 ekor), medium fertility (MF) (73,12%, n= 4 ekor) dan low fertility (LF) (69,92%; n= 2 ekor). Kualitas semen pada semua karakteristik spermatozoa post-thawing kecuali indeks fragmentasi DNA spermatozoa (DFI), signifikan lebih tinggi (P<0,05) pada sapi madura HF dibandingkan dengan MF dan LF. Indeks fragmentasi DNA spermatozoa pada sapi madura HF signifikan paling rendah (P<0,05) dibandingkan MF dan LF. Hasil evaluasi karakteristik spermatozoa yang diukur diketahui berkorelasi positif (P<0,01) terhadap tingkat fertilitas (TF), dengan parameter DFI berkorelasi negatif terhadap TF yang artinya semakin sedikit fragmentasi DNA yang ditemukan maka tingkat fertilitas tinggi. Hasil penelitian bagian dua dengan tujuan menganalisis ekspresi gen dan konsentrasi protein HSP70-2, PRM1 dan OPN spermatozoa post-thawing sapi Madura dan korelasinya terhadap kualitas spermatozoa pada tingkat fertilitas berbeda. qRT-PCR dengan PPIA sebagai gen housekeeping. Kelompok pejantan madura HF mengekspresikan mRNA HSP70-2 signifikan paling tinggi (P<0,01), dan menunjukkan adanya pengaruh kelimpahan ekspresi terhadap parameter kualitas spermatozoa, terutama motilitas, plasma membran utuh, dan akrosom spermatozoa (P<0,01). Tingkat transkrip PRM1 tidak berbeda secara signifikan antara kelompok MF dan LF. Namun, ekspresi PRM1 signifikan lebih tinggi pada kelompok sapi pejantan HF (P<0,05), serta menunjukkan pengaruh pada motilitas spermatozoa (P<0,01), akrosom utuh, dan DFI spermatozoa (P<0.05) pejantan HF. Ekspresi OPN tidak berbeda antar kelompok fertilitas dan tidak menunjukkan pengaruh yang signifikan dengan kualitas spermatozoa. Sementara, konsentrasi protein dengan ELISA dilakukan
Keyword: biomarka, fertilitas, spermatozoa, omic, sapi madura

Judul: Tinjauan Matematis pada Model Makroskopik dan Mikroskopik Arus Lalu-lintas
Abstrak: Traffic flow phenomenon can be described through mathematical model such as continuous dynamic model with an ordinary differential equation so that it can be solved with integral factors. In this paper three simple models of traffic flow are discussed, i.e, two macroscopic and one microscopic models. Macroscopic model formulates dynamics of the traffic flow that occurs on a large number of vehicles on a road. While the microscopic model explains drivers’ behavior in their interaction with other vehicles ahead, i.e, car-following model. This paper shows the existence of ordinary differential equation found in the traffic flow model and indicates some different representations in the context of the same model. It also reviews a simple model of traffic flow along a single link, which leads to some unexpected results, i.e, it can express the solution model in term of link outflows as well as trip time. In the microscopic model, simulation is done to illustrate the behavior of the drivers with a sensitivity coefficient as a benchmark parameter.
Keyword: