Judul: Pengembangan Internet of Things Sistem Observasi Gelombang Pesisir
Abstrak: Gelombang permukaan laut merupakan pergerakan air naik dan turun tegak lurus terhadap permukaan laut. Gelombang yang terjadi di laut memiliki pergerakan yang acak, dinamis, dan kompleks, sehingga pengukuran tinggi dan periode gelombang sulit dirumuskan secara akurat. Dibutuhkan data tinggi gelombang yang real-time agar memudahkan masyarakat untuk dapat memantau kondisi tinggi gelombang dengan mudah. Tujuan penelitian ini yaitu (1) Menghasilkan instrumen wave buoy untuk observasi gelombang pesisir, (2) Menghasilkan website dan aplikasi mobile yang dapat menampilkan hasil pengukuran instrumen wave buoy, (3) Menganalisis data hasil pengukuran instrumen wave buoy. Penelitian dibagi ke dalam 3 tahapan, yaitu perancangan sistem observasi gelombang pesisir, integrasi serta uji lapang dan monitoring. Adapun perancangan sistem obeservasi gelombang terdiri dari 4 bagian yaitu perancangan wahana buoy, perancangan basis data, perancangan website dan perancangan aplikasi mobile. Perancangan wahana terdiri atas perancangan pelampung (buoy), perancangan sistem elektronik dan perancangan perangkat lunak. Perancangan basis data pada penelitian ini didasarkan pada format data hasil pengukuran. Basis data tersebut terdiri dari table sensor, tabel filter dan tabel tinggi gelombang. Perancangan website terdiri atas perancangan header, perancangan menu, perancangan body dan perancangan footer. Perancangan aplikasi mobile dalam penelitian ini dilakukan dengan menggunakan MIT App Inventor sebagai pembuat aplikasi. Perancangan aplikasi mobile dimulai dengan perancangan mockup. Hasil rancangan dari wahana wave buoy terdiri dua bagian yaitu pelampung dan pemberat. Pelampung digunakan untuk membarikan daya apung serta merupakan peletakan dari sistem elektronik. Sistem elektronik pada instrumen wave buoy dibagi ke dalam dua bagian, yaitu sistem elektronik pada instrumen dan sistem elektronik pada base station. ESP Lora32 TTGO versi 1 digunakan sebagai mikrokontroler (pengendali utama). Sensor yang digunakan yaitu sensor accelerometer MPU-6050. Data-data yang diperoleh dari sensor akan diproses oleh mikrokontroler pada buoy. Frekuensi sampling data yang digunakan yaitu 10 Hz dan jumlah data 128 data dengan perulangan setiap 10 menit. Data-data tersebut akan dikirim ke basis data melalui base station. Data yang masuk ke basis data akan diolah menjadi tinggi gelombang dan diteruskan ke ThingSpeak. Selanjutnya data tersebut ditampikan pada website dan aplikasi mobile. Adapun tabel basis data yang telah dibangun meliputi buoy, buoy_filter, dan buoy_h. Tahap selanjutnya adalah menampilkan informasi tinggi gelombang pada basis data ke dalam body website dalam bentuk tabel dan grafik menggunakan modul query. Halaman utama website yang dibuat dalam penelitian ini terdiri atas header, menu, body, dan footer. Header yang digunakan adalah ‘Monitoring Gelombang Pesisir’ pada bagian kiri. Body halaman utama pada website berisi peta lokasi penempatan instrumen, data realtime pengukuran tinggi gelombang, data tinggi gelombang hari sebelumnya, data tinggi gelombang pada bulan saat website diakses serta grafik real-time pengukuran tinggi gelombang. Pada body juga terdapat list dropdown berupa data lokasi penempatan buoy. Bagian footer ditampilkan logo fakultas perikanan dan ilmu kelautan sebagai identitas. Website yang dibangun dapat diakses oleh pengguna melalui alamat url http://laut-pulauseribu.net/buoy. Sedangkan aplikasi yang dibangun memiliki satu halaman utama yaitu halaman yang menampilkan data tinggi gelombang real-time dalam bentuk label dan grafik. Analisa hasil pengukuran lapangan menggunakan MATLAB dengan metode zero crossing analysis. Penempatan instrumen dan pengambilan data di perairan Kepulauan Seribu. Hasil analisis data selama 23 jam diperoleh tinggi gelombang signifikan yang terjadi di Perairan Gosong Semak
Keyword: wave buoy system, Internet of Things, website, aplikasi mobile, perairan Kepulauan Seribu

Judul: DEVELOPMENT AND FIELD TEST OF IOT-BASED DRIFTING BUOY INSTRUMENTS FOR COASTAL WATERS
Abstrak: Data spasial arus pesisir umumnya diperoleh dari satelit altimetri. Namun data yang diperoleh masih memiliki kekurangan yaitu rendahnya tingkat resolusi dan perlunya validasi lapangan (ground truth). Electronic drift buoy (GPS- GPRS) adalah instrumen akuisisi data oseanografi yang menggunakan sistem Internet of Things (IoT) dan bergerak mengikuti pergerakan air di sekitar instrumen. Penerapan sistem IoT pada pelampung elektronik akan memudahkan akuisisi data dari pelampung hanyut karena data akan langsung masuk ke database, dikirimkan melalui sistem GPRS sehingga dapat dipantau secara real-time melalui website. Tujuan penelitian ini yaitu: (1) Menghasilkan prototipe instrumen pelampung hanyut pesisir dengan menggunakan sistem IoT; (2) Menganalisis data suhu dan konsentrasi fitoplankton di lokasi uji coba pelampung hanyut (perairan pulau Panggang Kepulauan Seribu). Perancangan instrument berbasis mikrokontroler ESP32 ini dilengkapi dengan modul GPS untuk akuisisi data lokasi dan modul GPRS untuk transmisi data ke database. Hasil rancang bangun instrument terdiri dari tiga bagian yaitu bagian pelampung apung memiliki dimensi tinggi 52 cm dan lebar 30 cm, bagian perangkap arus memiliki dimensi tinggi 25 cm dan lebar 25 cm untuk setiap sayap yang terbuat dari besi, serta bagian wahana sensor memiliki dimensi 20 cm dengan lebar 8.3 cm terbuat dari PVC dan diikatkan pada perangkap arus menggunakan tali. Uji lapang dilakukan di Perairan Kepulauan Seribu dengan melepas 3 buah pelampung buoy secara bersamaan. Data hasil pengambilan data oleh instrument kemudian dikirim ke database untuk bisa ditampilkan dalam bentuk ploting data pada website. Website yang dibangun digunakan untuk melihat hasil pengambian data instrument pelampung hanyut secara real-time. Website yang dibangun terdiri dari tiga halaman yaitu halaman beranda, halaman plot data drifter dan halaman setting waktu. Setiap halaman website terdiri dari tiga bagian utama yaitu header, content dan footer. Berdasarkan hasil uji lapang, didapatkan kecepatan arus berkisar 0,038 m/s hingga 0,35 m/s dan kecepatan arus rata-rata 0,19 m/s, sedangkan suhu permukaan berkisar 26,37 hingga 27,83 °C dengan nilai rata-rata 26,75 °C. Adapun konsentrasi fitoplankton di lokasi uji lapang berkisar antara 673.299 ind/l sampai 1,024.456 ind/l dengan nilai rata-rata sebesar 836.312 ind/l. Berdasarkan hasil uji coba ini dapat disimpulkan bahwa alat pelampung drifter telah berfungsi sesuai dengan tujuan pengembangannya.
Keyword: arus, GPS-GPRS, IoT, pelampung hanyut, suhu permukaan laut, konsentrasi fitoplankton

Judul: Gene Editing  of Two Cyanide Synthesis-related Genes in Cassava using CRISPR/Cas9
Abstrak: Cassava (Manihot esculenta) contain toxic quantities of cyanogenic glucoside. Reducing the potentially toxic cyanogenic glucoside levels in cassava could be achieved by gene editing through Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats – CRISPR associated protein 9 (CRISPR/Cas9), a high- precision genome editing technique in plants. Two cassava UDP- glucosyltransferase (UGT) paralogs, UGT85K4 and UGT85K5, are the genes catalyzing the synthesis of cyanogenic glucosides in plants. The study aimed to construct the CRISPR/Cas9 recombinant vector carrying single guide RNA (sgRNA) to edit UGT85K4 and UGT85K5 genes, and transform sgRNA CRISPR/Cas9 construct into KU50 cassava calli. Five sgRNAs were designed, considering the on/off target efficiency score and GC content. Those sgRNAs were ligated into pRGEB32 plasmid and introduced to competent Escherichia coli DH5a. The PCR colony and DNA sequencing were performed to verify the sgRNA insert. The amplicons showed the expected band size of recombinant vector (180 bp). Based on sequencing results, only one sgRNA was successfully ligated into the plasmid that will be used to edit the UGT85K5 gene. The sgRNA CRISPR/Cas9 construct in pRGEB32 plasmid was successfully transformed into Agrobacterium tumefaciens and introduced into KU50 cassava calli through co-cultivation. The overgrowth of Agrobacterium occurred after the co-cultivation phase.
Keyword: CRISPR/Cas9, Cyanogenic glucoside, Gene editing, sgRNA