Judul: Stabilitas Transgen Dan Ekspressi Gen B11 Pada Tanaman Tembakau Transgenik Generasi T3.
Abstrak: Ion aluminium (Al3+) mendominasi tanah masam yang memiliki pH<5 dan toksik bagi akar tanaman karena selain dapat mengkelat unsur hara, Al3+ dapat merusak sistem perakaran sehingga menyebabkan tanaman mengalami defisiensi usunr hara dan menurunkan produksi tanaman. Beberapa varietas tanaman memiliki mekanisme toleransi terhadap cekaman Al. Tanaman pertanian seperti gandum memiliki mekanisme toleransi terhadap cekaman Al dengan melibatkan pelepasan asam organik seperti asam malat dan asam sitrat dari akar. Asam organik yang dilepaskan akan mengkelat dan mendetoksifikasi Al di zona rhizosfer. Padi merupakan tanaman serealia yang toleran terhadap cekaman Al. Roslim (2011) telah mempelajari dan mengidentifikasi bahwa padi lokal Indonesia var. Hawara Bunar berpotensi sebagai sumber gen toleran Al. Gen penyandi toleransi terhadap cekaman Al, yakni gen B11, telah berhasil diisolasi dari tanaman padi var. Hawara Bunar dan telah berhasil diintroduksikan ke dalam tanaman tembakau di bawah promotor 35S CaMV yang kemudian menghasilkan tanaman tembakau transgenik pembawa gen B11. Uji stabilitas tanaman tembakau transgenik pembawa gen B11 menunjukkan bahwa tanaman tembakau transgenik generasi pertama (T1) membawa copy gen B11 dan analisis fungsi gen B11 pada tembakau transgenik T1 menunjukkan gen B11 dapat meningkatkan toleransi tanaman tembakau terhadap cekaman Al. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk memperoleh tanaman tembakau transgenik yang memiliki transgen B11 yang stabil pada generasi T2 dan T3 serta menganalisis ekspresi gen B11 dan gen-gen lain (STOP1, ALMT1, MATE) yang terkait dengan toleransi terhadap cekaman Al. Biji tanaman tembakau transgenik diseleksi pada media MS yang mengandung higromisin selama 28 hari. Tanaman yang toleran selanjutnya di cek stabilitasnya dengan PCR menggunakan primer gen B11 dan hpt. Ekspresi relatif dari gen B11 dan gen-gen lain (STOP1, ALMT1, MATE) yang terkait dengan toleransi Al dianalisis dengan teknik qPCR. Hasil penelitian menunjukkan bahwa 24 dari 26 nomor tanaman transgenik terpilih yang diseleksi mampu tumbuh pada medium selektif dengan rasio 3:1 untuk toleran:sensitif terhadap hygromicin. Di antara semua nomor yang diuji, terdapat dua nomor T3 secara konsisten menunjukkan 100% tumbuh pada media selektif. Hal ini menunjukkan bahwa kedua nomor tersebut telah homozigot untuk gen hpt. Karena gen hpt terletak dekat dengan left border downstream gen B11, maka hal ini mengindikasikan bahwa gen B11 juga telah homozigot untuk kedua nomor tersebut. Analisis stabilitas genetik tanaman tembakau transgenik menunjukkan bahwa tanaman tembakau transgenik telah membawa gen B11 sampai generasi T3. Analisis ekspresi menunjukkan bahwa peningkatan ekspresi gen B11 diikuti oleh peningkatan ekspresi dari gen STOP1, ALMT1 dan MATE, mengindikasikan adanya hubungan regulasi di antara gen-gen tersebut dalam merespon cekaman Al.
Keyword: Aluminium, gen toletan Al, stabilitas gen, tanaman transgenik

Judul: Pertumbuhan Tembakau Transgenik Toleran Aluminium Pada Berbagai Konsentrasi Hara Media Tumbuh
Abstrak: Gen B11 telah diintroduksikan pada tanaman tembakau yang merupakan tanaman model. Gen ini diduga tidak hanya menyebabkan tembakau toleran terhadap cekaman aluminium (Al), tetapi juga berperan dalam efisiensi absorpsi unsur hara. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan mempelajari pertumbuhan tanaman tembakau transgenik toleran Al dan kemampuannya dalam absorpsi unsur hara nitrogen (N), fosfor (P), dan kalium (K) pada berbagai konsentrasi unsur hara media tumbuh. Penelitian ini merupakan percobaan faktorial menggunakan rancangan acak lengkap dengan 3 ulangan. Faktor pertama adalah genotipe tembakau yaitu tembakau transgenik dan tipe liarnya, dan faktor kedua adalah konsentrasi unsur hara media tumbuh, yaitu media Murashige-Skoog (MS) 1/3, 2/3, dan 1 x konsentrasi penuh. Peubah yang diamati meliputi tinggi tanaman, panjang akar, jumlah daun, luas daun, bobot basah dan kering biomassa, kandungan klorofil daun, dan kandungan unsur N, P, K dalam jaringan tanaman. Hasil penelitian menunjukkan bahwa pemberian perlakuan media tumbuh Murashige-Skoog (MS) dengan tiga taraf konsentrasi berpengaruh terhadap peubah panjang akar dan bobot kering biomassa yang dihasilkan pada kedua genotipe tembakau. Tembakau transgenik toleran Al memiliki pertumbuhan yang relatif lebih baik dibanding tembakau tipe liar. Hal ini terutama terlihat pada peubah bobot basah 21 HSP (hari setelah perlakuan) dan luas daun 7 dan 21 HSP, sedangkan peubah lainnya menunjukkan respon yang tidak berbeda nyata antara kedua tipe tembakau. Hal ini membuktikan bahwa gen B11 tidak berperan dalam efisiensi absorpsi unsur hara dan hanya bersifat spesifik mengendalikan toleransi tanaman terhadap cekaman Al.
Keyword: absorpsi hara, tembakau, transgenik, toleran Al

Judul: Hamiltonian formulation for linear waves motion in two layers fluid
Abstrak: The surface wave could be considered as a wave that separates two fluids, namely water and air. Based on this assumption, it is introduced the interfacial wave, a wave between two layers of fluid with different density. The formulation of interfacial waves motion begins with deriving the base equation of irrotational ideal fluid. Furthermore, according to irrotational fluid assumption, the base equation can be stated in velocity potential. In this derivation, the fluids domain is assumed to be restricted by rigid lid boundary conditions, both at the upper and lower limit. Therefore, the interfacial waves motion can be explained in a hamiltonian formulation. In the hamiltonian formulation, total energy is defined as the sum of kinetic and potential energy. The hamiltonian system is obtained from reduction of kinetic energy by using the Dirichlet Neumann Operator. The resulted kinetic energy equation is nonlinear. Therefore, this form is linearized by first part of the Taylor expansion. This linearization gives a dispersion relation of linear wave. Based on this dispersion relation, the phase speed of the linear wave depends on the density ratio of the two layers fluid.
Keyword: