Judul: Pengklonan gen VP28 Penyandi Viral Protein-28 dari virus white spot syndrome sebagai langkah awal produksi vaksin rekombinan udang penaeid
Abstrak: Usaha produksi udang dalam negeri saat ini sedang mengalami kendala akibat serangan penyakit white spot syndrome virus (WSSV) pada jenis udang windu (Penaeus monodon). WSSV yang termasuk virus DNA berukuran besar dapat menginfeksi udang dan berbagai jenis crustaceae lainnya. Virus ini merupakan patogen yang sangat ganas dan paling serius menyerang udang. Serangannya begitu cepat, sangat sulit dihentikan dan dapat mematikan 100% udang peliharaan dalam waktu 3-10 hari setelah munculnya gejala klinis. Serangan virus ini juga telah menghancurkan industri udang di berbagai negara. Infeksi WSSV ditandai dengan adanya bintik putih atau bercak putih pada eksoskeleton dan epidermis terutama pada bagian karapas udang. Hingga saat ini belum ada cara tradisionalyang efektif mencegah dan menanggulangi penyakit ini.
Keyword: 

Judul: Produksi dan Evaluasi Pemberian Rekombinan Viral Inhibitor Protein terhadap Resistansi Udang Vaname Pascainfeksi Virus WSSV
Abstrak: WSSV merupakan agen penyakit yang dapat menyebabkan penyakit bintik putih atau whitespot disease dan sifatnya yang sangat virulen menyebabkan penyebarannya menjadi sangat cepat. Jika tidak dicegah dan ditangani, infeksi WSSV mampu menyebabkan kematian massal hingga 100% pada udang setelah 3 hingga 10 hari terinfeksi. Salah satu upaya yang sering dilakukan adalah dengan meningkatkan respons imun udang. Hingga saat ini, metode yang umum dilakukan untuk meningkatkan respons imun udang adalah dengan aplikasi imunostimulan. Hanya saja aplikasi imunostimulan ini tidak menghambat virus WSSV secara langsung, melainkan bergantung pada kenaikan respons imunitas udang akibat pemberian bahan imunostimulan. Oleh karena itu, alternatif metode penghambatan infeksi WSSV secara langsung pada udang perlu dikembangkan lebih lanjut. Viral inhibitor protein (VIP) diketahui berperan dalam resistansi udang terhadap infeksi virus. Berdasarkan studi in silico, diduga terjadi pembentukan ikatan kompleks antara VIP dengan domain RING finger pada WSSV yang menginhibisi aktivitas WSSV secara langsung. Berdasarkan fakta tersebut, VIP dapat digunakan sebagai strategi baru untuk mengontrol infeksi WSSV pada budidaya udang. Salah satu teknologi yang dapat digunakan dengan memanfaatkan potensi tersebut adalah teknologi protein rekombinan. Protein VIP dapat diproduksi dengan menyisipkan vektor ekspresi VIP ke dalam bakteri sehingga VIP dapat diproduksi secara massal dan cepat, memanfaatkan tingkat replikasi bakteri yang tinggi. Oleh karena itu, pada studi ini dilakukan evaluasi terkait pemberian VIP pada udang vaname (Litopenaeus vannamei) dalam menghambat infeksi WSSV. Pada studi ini rekombinan VIP dapat diproduksi dengan konsentrasi total protein sebesar 2,51±0,10 mg mL-1. Pengujian secara in vivo dilakukan dengan menginjeksikan rekombinan VIP ke udang vaname. Udang dengan bobot 6,66±0,08 g diinjeksi rekombinan VIP dengan dua dosis berbeda (1 μg g-1 dan 10 μg g-1) dan diuji tantang dengan WSSV. Pada kontrol positif udang tidak diinjeksi rekombinan VIP dan diuji tantang dengan WSSV, sedangkan pada kontrol negatif udang tidak diinjeksi rekombinan VIP dan tidak diuji tantang dengan WSSV. Sebagai kontrol rekombinan, udang diinjeksi dengan protein rekombinan non-VIP dan tidak diuji tantang dengan WSSV. Hasil yang diperoleh pada kelangsungan hidup udang yang diinjeksi dengan rekombinan VIP mengalami peningkatan yang signifikan setelah diuji tantang dengan WSSV (P<0,05). Pemberian rekombinan VIP dengan dosis 10 μg g-1 mampu meningkatkan resistansi udang terhadap WSSV ditandai dengan kelangsungan hidup 82,22% setelah 14 hari terinfeksi. Respons imun udang yang diinjeksi dengan rekombinan VIP juga terlihat lebih tinggi daripada perlakuan kontrol positif pascainfeksi WSSV (P<0,05). Laju penurunan respons imun yang terjadi semakin rendah seiring dengan meningkatnya konsentrasi protein VIP yang diberikan. Hasil riset ini menunjukkan bahwa protein VIP sangat berpotensi digunakan untuk mengendalikan penyakit WSD akibat infeksi WSSV.
Keyword: Litopenaeus vannamei, rekombinan, viral inhibitor protein, white spot syndrome virus

Judul: Kajian Atmosfer Bawah Wilayah Tropis dan Subtropis
Abstrak: Planetary Boundary Layer is the lowest part of the atmosphere directly affected by the earth’s surface and responds to surface forcings within a time period of hourly to daily. The thickness of boundary layer varies over space and time, ranging from hundreds of meters to a few kilometers. The objective of this study consist of the analysis of Boundary Layer based on diurnal and nocturnal vertical profiles of meteorological properties and identification of characteristics pertaining to tropical atmosphere (represented by Soekarno-Hatta (6.110S, 106.650E), Polonia (3.560N, 98.680E), and Da Nang (16.030N, 108.200E) stations) and subtropical atmosphere (represented by Perth (31.930S, 115.960E), Nanjing (32.000N, 118.800E), and Hakasskaja (43.780N, 87.620E) stations). Virtual potential temperature, specific humidity, wind speed and direction, atmospheric stability, and Bulk-Richardson number are used to estimate the boundary layer thickness. Vertical profile of the virtual potential temperature and specific humidity are used to determine the Mixed Layer heights during the day and Residual Layer heights during the night. On the other hand, the mean value of Turbulent Flow Thickness is derived from the vertical profile of the Bulk-Richardson number (RiB). Analytical results of this study revealed that Mixed Layer height in the tropical atmosphere varies in a range from 260 m to 1410 m, Residual Layer height varies in a range from 267 m to 925 m, whereas the Turbulent Flow Thickness variation is confined between 0 m to 335 m. In subtropical atmosphere Mixed Layer height varies in a range from 101 m to 1483 m, Residual Layer height varies in a range from 121 m to 1276 m, whereas the Turbulent Flow Thickness variation is confined between 0 m to 769 m. This study also revealed that, except during summer, Mixed Layer Heights in the tropics are normally higher than in the subtropics.
Keyword: