arulpm/tripletsmall huggingface dataset:
Judul: Pendekatan Neodeskriptif pada Kasus Multikolinear dengan Menggunakan Regresi Sekuensial
Abstrak: Analisis regresi klasik menggunakan koefisian parsial untuk mengukur pengaruh beberapa peubah bebas (X) terhadap peubah tak bebas (Y).
Keyword: 

Judul: Analisis penerapan metode kuadrat terkecil dan regresi komponen utama dalam multikolinearitas
Abstrak: Masalah pendugaan parameter dalam analisis regresi linier berganda sering menjadi topik yang menarik dalam beberapa penelitian. Timbul masalah antara lain multikolinearitas diantara peubah-peubah bebas. Dengan MKT akan terlihat efeknya yaitu tingginya koefisien deterrninasi tidak diikuti dengan konsistensi hipotesis, tanda koefisien regresi setelah dimodelkan dan perubahan kesignifikan bila masing-masing dan bersama-sama dimasukkan dalam model. Keadaan ini akan mempengaruhi dalam penafsiran model regresi bila memerlukan kajian lebih lanjut. Berdasarkan kenyataan ini, dilakukan suatu kajian dengan berbagai jumlah data untuk mengetahui dan memberikan garnbaran kepada pengguna seberapa besar peluang perubahan tanda peubah bebas juga kesignifikan koefisien regresi sebagai efek dari penerapan MKT bila terjadi multikolinearitas diantara peubah bebas dan solusi penerapan regresi komponen utama. Kajian ini dilakukan dengan menggunakan data simulasi.
Keyword: 

Judul: Kajian Perlakuan Uap Panas Dan Suhu Penyimpanan Untuk Mempertahankan Mutu Buah Mangga Arumanis (Mangifera Indica L.).
Abstrak: Pengolahan Pangan dan Hasil Pertanian (TPPHP) IPB dan Laboratorium Vapor Heat Treatment Balai Besar Peramalan Organisme Pengganggu Tumbuhan (BBPOPT) Jatisari, Jawa Barat. Kajian mortalitas telur lalat buah secara in-vitro dilakukan dengan merendam telur ke dalam air panas pada suhu 46 oC selama 5, 10, 15, 20, 25 menit dan kontrol. Kajian mortalitas telur lalat buah secara in-vivo dilakukan dengan buah mangga yang terinfestasi B. papaye lalu diberi perlakuan VHT pada suhu 47 oC selama 10, 20, 30, 40 menit dan kontrol. Pengamatan mutu buah dilakukan dengan memberi perlakuan VHT pada suhu 47 oC selama 25, 30, 35 menit dan kontrol, dan kemudian disimpan pada suhu 13±2 oC dan suhu 28±2 oC. Pengamatan perubahan mutu selama penyimpanan dilakukan setiap 3 hari. Hasil pengamatan menunjukkan bahwa 100% mortalitas lalat buah B. papayae secara in-vitro pada suhu 46 oC adalah selama 10 menit. Sedangkan 100% mortalitas secara in-vivo pada suhu 47 oC adalah selama 20 menit. Lama VHT dan suhu penyimpanan serta interaksinya tidak berpengaruh signifikan terhadap susut bobot, total padatan terlarut, dan kekerasan, tetapi berpengaruh signifikan terhadap vitamin C. Perlakuan panas tidak menyebabkan kerusakan fisiologis dimana buah masih mengalami proses respirasi secara normal. Buah pada penyimpanan suhu 13±2 oC buah dapat bertahan selama 18 hari dan pada suhu 28±2 oC hanya bertahan selama 9 hari. VHT pada suhu 47 oC selama 25-30 menit efektif untuk membunuh lalat buah yang terinfestasi dalam mangga Arumanis dan VHT yang diikuti oleh penyimpanan suhu rendah (13±2 oC) dapat mempertahankan mutu buah selama penyimpanan.
Keyword: mangga, perlakuan uap panas, lalat buah, disinfestasi
Judul: Identifikasi Tanaman Durian Berdasarkan Citra Daun Menggunakan LVQ dan Ekstraksi Tekstur Discrete Wavelet Transform
Abstrak: Durian (Durio zibethinus Murray) adalah salah satu komoditas yang memiliki nilai ekonomi tinggi. Nilai ekonomi durian dipengaruhi oleh keunggulan yang dimiliki setiap varietasnya. Oleh sebab itu identifikasi tanaman durian merupakan hal yang sangat penting. Identifikasi dilakukan dengan menggunakan citra daun dari lima tanaman varietas durian, serta metode klasifikasi Learning Vector Quantization (LVQ) dan ekstraksi tekstur Discrete Wavelet Transform (DWT). Penelitian ini menghasilkan akurasi tertinggi sebesar 76% pada DWT famili Haar level 6.
Keyword: daun, Discrete Wavelet Transform, durian, identifikasi, Learning Vector Quantization

Judul: Identifikasi Varietas Durian Berdasarkan Tekstur Daun Menggunakan K-Nearest Neighbor Dengan Ciri Statistical Textures
Abstrak: Durian (Durio zibethinus Murray) adalah salah satu komoditas yang memiliki nilai ekonomi yang tinggi di Indonesia. Nilai ekonomi durian dipengaruhi oleh keunggulan yang dimiliki setiap varietasnya. Oleh sebab itu identifikasi tanaman durian merupakan hal yang sangat penting. Pada penelitian ini, identifikasi dilakukan berdasarkan citra daun dari empat varietas durian. Metode klasifikasi yang digunakan adalah K-Nearest Neighbor dengan ekstraksi ciri statistical textures. Penelitian ini menghasilkan akurasi tertinggi sebesar 67,5% menggunakan 6 ciri statistical textures. Pada penelitian ini paling sulit teridentifikasi varietas Sukun. Varietas Sukun mempunyai kemiripan ke varietas Bakul dan Matahari.
Keyword: daun, Statistical textures, durian, identifikasi, K-Nearest Neighbor

Judul: Enteric Collibacillosis Pada Anak Babi Baru Lahir: Patogenesa dan Perubahan-Perubahan Patologisnya
Abstrak: Diare disebabkan oleh infeksi bakteri Escherichia coli pada anak-anak babi baru lahir yang peka terhadap en terotoksin produk bakteri tersebut. Dikenal sebagai colibacillosis. Patogenesa dari colibacillosis anak babi baru lahir adalah (1) infeksi oleh E. coli patogen, (2) proliferasi E. coli di lumen usus halus, (3) produksi dan pelepasan enterotoksin, dan (4) aktifitas toksin pada usus halus. Dalam proses proliferasi, adanya antigen pili K88 sangat penting karena memungkinkan bakteri perlekatan dengan epitel mucosa usus halus. mengadakan Setelah ko lonisasi dan proliferasi segera toksin dilepaskan. Akti- fitas toksin menginduksi sekresi yang berlebihan dari u- sus sehingga banyak cairan yang dikeluarkan ke lumen usus. Hal ini mengakibatkan banyak cairan dan elektrolit hilang sehingga timbul diare, dehidrasi dan asidosis yang sering menyebabkan kematian. Perubahan-perubahan patologis yang umum adalah dis tensi usus halus, dilatasi lambung dan infark pada kurva- tura mayor. Perubahan-perubahan histologis yang terjadi adalah enteritis hemorrhagica acuta, oedem dan kongesti pembuluh darah di lamina propria, akumulassi leukosit inti polimorf, sel monosit, dan inti sel mengalami piknosis Thrombus pada vena dan degenerasi serta desquamasi sel epitel usus….
Keyword:
Judul: Makrozoobenthos Sebagai Bioindikator Kualitas Air Sungai Di Sub Das Ciliwung Hulu
Abstrak: Makrozoobenthos Memiliki Sifat Yang Relatif Menetap Dan Gerakan Yang Sangat Terbatas Yang Akan Terkena Dampak Langsung Dalam Hal Perubahan Kualitas Air, Karena Itu Makrozoobenthos Sering Digunakan Sebagai Bioindikator Kualitas Air. Penelitian Ini Dilakukan Pada Bulan Maret Sampai Juni 2015 Di Sub Das Ciseuseupan, Cisukabirus, Dan Cisuren Dengan Tujuan Menentukan Tingkat Kualitas Air Dan Pengaruh Penggunaan Lahan Terhadap Kualitas Air Dengan Menggunakan Makrozoobenthos. Indeks Biologis Yang Digunakan Untuk Menganalisis Makrozoobenthos Yaitu Fbi Dan Signal 2. Nilai Fbi Yang Diperoleh Di Sub Das Ciseuseupan Adalah 5.02 Dengan Kriteria Sedang, Di Sub Das Cisukabirus Adalah 3.96 Dengan Kriteria Sangat Baik, Dan Di Sub Das Cisuren Adalah 4.37 Dengan Kriteria Baik. Luas Penggunaan Lahan Hutan Yang Lebih Besar Daripada Penggunaan Lahan Permukiman Merupakan Faktor Utama Tingginya Kualitas Air Di Sub Das Cisukabirus.
Keyword: Kualitas Air, Makrozoobenthos, Penggunaan Lahan

Judul: Makrozoobenthos sebagai Bioindikator Kualitas Air Sungai Citarum Hulu (Sub DAS Cikeruh, Citarik, dan Cirasea)
Abstrak: Penggunaan lahan yang beragam pada DAS Citarum Hulu menghasilkan beban pencemar yang dapat menurunkan kualitas air. Hasil analisis indeks STORET berdasarkan parameter fisik-kimia menunjukkan kualitas perairan Sungai Cikeruh, Citarik, dan Cirasea mengalami cemar sedang hingga cemar berat. Identifikasi kualitas air juga dilakukan dengan menggunaakan makrozoobenthos sebagai biota sungai yang hidupnya menetap pada dasar sungai. Kondisi kualitas air berdasarkan Indeks Famili Biotik (HBI) makrozoobenthos menunjukkan bahwa kualitas air Sungai Cikeruh tergolong buruk, dan kualitas air Sungai Citarik dan Sungai Cirasea tergolong cukup, sedangkan identifikasi kondisi air sungai berdasarkan Indeks Keanekaragaman jenis makrozoobenthos menunjukkan bahwa Sungai Cikeruh, Citarik, dan Cirasea mengalami pencemaran berat. Kesesuaian status mutu air menggunakan makrozoobenthos dengan parameter fisik-kimia menunjukkan bahwa makrozoobentos dapat digunakan sebagai bioindikator untuk memantau kualitas air sungai.
Keyword: bioindicator, Citarum, macrozoobenthos

Judul: igenvalues and Eigenvectors of Tridiagonal Matrix with Non Constant and Recurrent Diagonal Entries.
Abstrak: Matriks tridiagonal adalah suatu matriks yang mempunyai entri-entri bernilai nol kecuali pada diagonal utama, di bawah diagonal utama (subdiagonal) dan di atas diagonal utama (superdiagonal). Entri pada diagonal utama tidak konstan dan berulang. Setiap entri pada matriks tridiagonal ini adalah bilangan kompleks. Dalam karya ilmiah ini, akan dibuktikan 3 teorema untuk menentukan nilai eigen dengan 2 kasus dan 1 teorema untuk menentukan vektor eigen. Teorema pertama menentukan polinomial karakteristik dari matriks tridiagonal. Polinomial karakteristik dari matriks tridiagonal tersebut digunakan untuk menentukan nilai eigen pada teorema kedua dan ketiga serta menentukan vektor eigen pada teorema keempat
Keyword:
Judul: Pendugaan Dan Pemetaan Produktivitas otensial Tanaman Gandum (Triticullestil) Dengan Menggunakan Model Lintul I di Pulau Jawa
Abstrak: Kcbutuhan gandum Indonesia selama ini dipcnuhi dengan cara mengill1por. Impor gandum membutuhkan biaya yang besar, sehingga tidak elisien apabiIa penanalllan di Indonesia dengan segaIa hasilnya dapat dilllllngkinkan untuk lllengganukan impor tersebut. Untuk itll periu peneIitian pcngembangan gandum eli Indonesia. Salah satunya adalah menduga produksi potensial tanaman gandum di suatu tempat dengall mcnggunakan model simulasi tana111an. Dalam penelitian ini hal tcrscbut Iclah dilakllkan yang sckaligtls lllclllclakallllya dcng:lI1 program komputcr untuk dacrah Puinu J:\wa
Keyword: 

Judul: Penentuan potensi pengembangan tanaman gandum (Triticum aestivum) di Indonesia menggunakan model simulasi tanaman
Abstrak: Gandum adalah bahan pangan yang banyak dibutuhkan dan sampai saat ini masih diimpor. Usaha pengembangan gandum dalam negeri harus menghadapi berbagai tantangan terutama dalam hal kesesuaian agroklimat dan waktu tanam yang optimum. Salah satu cara yang dapat digunakan untuk memperoleh daerah yang sesuai bagi tanaman gandum adalah dengan menggunakan model simulasi tanaman. Dalam penelitian ini digunakan model Shierary-wheat untuk mensimulasi perkiraan potensi hasil gandum di Indonesia Model ini menggunakan input cuaca harian yang dibangkitkan melalui model Shierary-weather. Selanjutnya model dijalankan untuk tiap grid yang berukuran 0.1 lintang x 0.1 bujur atau yang setara dengan 11.1 km x 11.1 km. Hasil simulasi model kemudian dipetakan untuk melihat perubahan potensi hasil pada berbagai waktu tanam. Berdasarkan model simulasi daerah yang potensial ditanami gandum terletak di kawasan timur Indonesia. Penanaman di Kepulauan Maluku dan Kepulauan Nusa Tenggara dapat memberikan hasil sekitar 2-4 ton/ha. Bila diklasifikasikan daerah ini termasuk kelas 1, 2, 3, dan 4, yang berarti bahwa tanaman dapat berproduksi >3 ton/ha dengan umur 140 hari. Namun penanaman di daerah ini harus memperhatikan faktor ketersediaan air, yang dapat diatasi dengan melakukan penanaman pada waktu tanam optimum.
Keyword: 

Judul: Gambaran Leukosit Anjing yang Terinfeksi Babesia sp. Kronis
Abstrak: The aim of this research was to obtain the profile of leukocyte of dogs which were chronically infected by Babesia sp. This research used thirteen dogs were positive of chronical infection by Babesia sp with parasitemic percentage less than 1% regardless of breed, age, and sex. The blood samples were taken through Cephalic antibachii vein used syringe and inserted to tube with anticoagulant K3 EDTA (Ethylene Diamine Tetraacetic Acid). The count of total leucocytes were analyzed by cell counter-blood analyzer Hemavet®. Blood smears were made for the differential leucocytes calculation. In conclusion, the dogs chronically infected with Babesia sp. generally showed no changes on white blood cells. Leukocyte profile on few dogs individually showed leukocytosis condition with changes on one or few types of leukocyte cell.
Keyword: leukocytosis., dogs, chronic, Babesia sp.
Judul: Aplikasi pemberian asam amino bebas untuk larva udang vaname Litopenaeus vannamei
Abstrak: Penelitian ini bertujuan mengetahui peranan asam amino bebas dari taurin atau glutamin untuk menunjang tingkat kelangsungan hidup dan perkembangan stadia larva udang vaname Litopenaeus vannamei. Penelitian ini dilaksanakan pada tanggal 6-16 Juni 2006 di PT. Central Pertiwi Bahari (CPB), Desa Suak, kecamatan Sidomulyo, kabupaten Kalianda-Lampung Selatan.
Keyword: 

Judul: Pengaruh rotifera yang diperkaya dengan taurin pada kadar yang berbeda terhadap kelangsungan hidup dan perkembangan stadia larva udang vaname Litopenaeus vannamei
Abstrak: penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kadar optimum taurin melalui pengkayaan pada rotifera terhadap tingkat kelangsungan hidup dan perkembangan stadia larva udang vaname.larva udang vaname stadia Nauplii 6 dipelihara dalam 12 tangki fiberglass volume 500L yang diisi air 400L dengan kepadatan 125 ind/l. Larva dipelihara selama 10 hari hingga sebagian besar mencapai stadia pasca larva (PL). Larva diberi pakan buatan CP Star 100, CP Spina, BP Eguchi, lanzy MPL dan Lanzy ZM dengan frekuensi pemberian pakan 7 kali sehari.
Keyword: 

Judul: Penggunaan Teorema Homeomorphy 2-Manifold dan Teorema Euler Poincare pada Torus 𝑇�� dan Simplicial Complex 𝐾��
Abstrak: Two dimensional topological spaces are said to be homeomorphic if they have the same topological invariant, where one of topological invariant used is an Euler characteristic. Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem and Euler Poincare’s Theorem are used to distinguish two topological spaces. Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem uses Euler characteristic to identify two dimensional topological spaces. Euler Poincare’s Theorem is an alternative way to find Euler characteristic with Betti number, which is topological invariant as well. The objective of this paper is to investigate the homeomorphism of torus 𝑇����� and simplicial complex 𝐾�����. Topological space torus and simplicial complex 𝐾����� have the same Euler characteristic, which is two. Based on Homeomorphy 2-Manifold’s Theorem topological space torus 𝑇����� and simplicial complex 𝐾����� is homeomorphic.
Keyword: simplicial, torus, Euler, homeomorphism, topology
Judul: Pengaruh Faktor Pengelolaan Piutang terhadap Likuiditas dan Profitabilitas Perusahaan Sektor Industri Dasar dan Kimia di BEI.
Abstrak: Basic and chemical industry is one of the sectors included in the branches of the manufacturing industry that produces raw materials for further processing into finished goods so it can stimulate the productivity of society. This sector has an important role in economic growth in 2012. Receivables management can effectively reduce liquidity risks and it can increase profitability. This research aims to (1) Analyze financial performance condition of basic and chemical industry sector companies at IDX based on receivable ratio, liquidity, and profitability of company (2) Analyze influence of Receivable Turn Over (RTO) and Average Collection Period (ACP) component to liquidity and profitability basic and chemical industry sector companies at IDX. This study use the data base of a company's from chemical industry sector in 2012 and analyze using SEM. RTO and ACP are factors that loading of the latent RVB. CR and QR are the factors that loading of the latent LIQUID. NPM, ROA, and ROE are factors that loading of the latent PROFIT. The results showed that receivable management factors do not significantly influence the liquidity but do not influence the profitability.
Keyword: receivable management, profitability, liquidity

Judul: Pengaruh Faktor Manajemen Piutang terhadap Likuiditas dan Profitabilitas Perusahaan Sub Sektor Properti dan Real Estate di Bei
Abstrak: Sektor properti dan real estate merupakan perusahaan yang bergerak dalam bidang penyediaan, penyewaan dan kepemilikan tanah dan bangunan bagi keperluan usaha-usaha sektor yang lain. Peningkatan piutang usaha selama lima tahun menuntut perusahaan untuk memiliki sistem pengelolaan piutang yang baik. Penelitian ini bertujuan : (1) Menganalisis faktor manajemen piutang, likuiditas dan profitabilitas perusahaan sub sektor properti dan real estate di BEI, (2) Menganalisis pengaruh faktor manajemen piutang terhadap likuiditas dan profitabilitas perusahaan. Data yang digunakan data sekunder periode 2010-2014. Untuk melihat besarnya pengaruh faktor manajemen piutang terhadap likuiditas dan profitabilitas, digunakan alat analisis SEM dengan peubah Receivable Turn Over, Average Collection Period, Current Ratio, Quick Ratio, Retun on Asset dan Return on Equity. Hasil analisis faktor manajemen piutang berpengaruh positif tidak nyata terhadap likuiditas dan berpengaruh negatif nyata terhadap profitabilitas.
Keyword: Likuiditas, Piutang, Profitabilitas, SEM

Judul: Ornithonyssus Bursa (Berlese, 1888) Famili Macronyssidae yang Menyerang Unggas Dan Penaggulangannnya
Abstrak: Ornithonyssus bursa adalah tungau penghisap darah pada unggas di daerah tropis dan subtropis. Tungau ini relatif kecil, dengan panjang tubuh antara 700-1000 mikron dan lebarnya 250-490 mikron. Tubuhnya bulat berwarna coklat kekuningan sebelum menghisap darh dan berwarna merah setelah menghisap darah dari induk semangnya.
Keyword:
Judul: Dampak Industri Pulp Terhadap Pembangunan Daerah ( Studi Kasus : Propinsi Riau)
Abstrak: Peranan industri pulp dalam perekonomian Indonesia senantiasa menunjukkan peningkatan baik kapasitas produksi, jumlah produksi, maupun ekspor. Pada tahun 1998 sumbangan industri ini dalam ekspor non migas Indonesia meneapai sekitar 689 juta US$ meningkat dari tahun sebelumnya sebesar 489 juta US$. Peningkatan kontr·ibusi tersebut berdampak positif terhadap penerirnaan negara dari segi ekspor non migas. Dalam pembangunan industri saat ini tidak sedikit menimbulkan kesenjangan - kesenjangan dibalik kemajuan yang telah dieapai. Walaupun pembangunannya berada di daerah - daerah atau di desa - desa kadang kala eenderung kurang memberikan dampak yang nyata terhadap tingkat kesejahteraan masyarakat setempat. Dari kondisi inilah timbul suatu permasalahan sejauh mana dampak industri pulp terhadap pembangunan daerah.
Keyword: 

Judul: Kajian pembangunan industri pulp berbasis hutan tanaman industri di Kabupaten Pelawan: kasus PT Riau Andalan Pulp and Paper
Abstrak: Industri pulp merupakan salah satu industri hasil hutan yang sangat penting, karena perannya dalam perolehan devisa dan ekonomi nasional. Upaya meningkatkan pertumbuhan ekonomi di sektor industri sebagai reinvestasi surplus dapat menimbulkan penambahan tenaga kerja yang berasal dari sektor pertanian.
Keyword: 

Judul: Mathematical model of Hematopoietic Stem Cell in Chronic Myelogenous Leukemia with and without Therapy
Abstrak: Leukemia or blood cancer is a diverse group of neoplastic disease, characterized by the multiplication of abnormal leukocytes or malignant transformation of blood-forming cells in bone marrow and lymphoid tissues. One of the most common types of leukemia is Chronic Myelogenous Leukemia (CML), which is usually diagnosed by the presence of certain chromosomal abnormalities, the so-called Philadelphia chromosome (Ph). One of the treatments of CML is Granulocyte Colony-Stimulating Factor (G-CSF). In this paper, we discuss two Hematopoietic Stem Cell (HSC) models, i.e. HSC without treatment and HSC with G-CSF treatment. The model of HSC without treatment included three equations representing the dynamics of HSC, leukocyte and platelet. Whereas, the model of HSC with G-CSF treatment includes the previous three equations and adds two more equations representing G-CSF injection and G-CSF circulation. The stability behavior of the system approaching the equilibrium points in the simulation study is carried out using Mathematica 7.0. The simulation results show that the G-CSF treatment can successfully decrease the number of HSC, which means reducing the CML.
Keyword:
Judul: Hubungan antara pemadatan tanah dengan slip roda
Abstrak: Tujuan dari penelitian ini adalah menentukan hubungan antara slip roda dengan pemadatan tanah pada jenis tanah tertentu, sehingga dapat ditentukan tingkat slip yang sesuai agar pemadatan yang terjadi sekecil mungkin. Faktor-faktor yang berpengaruh terhadap pemadatan tanah antara lain: beban traktor, kadar air tanah, tekanan inflasi dan slip roda, serta masih banyak lagi. Pada penelitian ini dapat dilihat kombinasi hubungan dari beban, kadar air, tekanan inflasi ban dan slip terhadap pemadatan tanah. Analisis data percobaan digunakan analisis ragam dengan taraf 0.05 atau peluang 95%. Jenis tanah pada lahan percobaan adalah tanah bertekstur lempung liat berdebu. Hasil uji protor pada contoh tanah dihasilkan kepadatan maksimum terjadi pada kadar air 39% dengan bulk density wet 1.6922 g/cm³. Pengaruh kadar air tanah terhadap kohesi dan adhesi tanah mengakibatkan perubahan slip pada roda. Selain itu, besarnya pemadatan yang terjadi juga dipengaruhi oleh kadar air. ...
Keyword: 

Judul: Mempelajari Pengaruh Berat pada Roda Penggerak Traktor terhadap Slip Roda pada Pengolahan Tanah dengan Bajak Piring
Abstrak: Slip berlebihan merupakan masalah yang dihadapi pada operasi pengolahan tanah utama untuk lahan berkadar liat tinggi . Faktor yang mempengaruhi besarnya slip yang terjadi selama pengolahan tanah antara lain adalah jenis dan kondisi tanah, alat traksi , kecepatan kerja , dan perpindahan distribusi berat pada as penggerak traktor selama operasi
Keyword: 

Judul: Mitochondrial DNA Gene Organization and Phylogenetic Relationship of Naja siamensis
Abstrak: Naja siamensis is one of Asiatic cobra in the Family of Elapidae, known as a cryptic snake. It has many morphological variations that lead to misidentification. Misidentification can cause the wrong concept in developing antivenom types due to high snakebite cases occur in Thailand. Thus, an accurate species identification using a molecular approach is crucially required. Mitochondrial DNA has been used widely in snake molecular studies. These studies were aimed to determine the arrangement of the N. siamensis partial mitochondrial genes using reptile-oriented primers and to reveal the phylogenetic relationship among other species of Asian cobra. DNA extraction was carried out based on the standard DNA salting-out protocol and was conducted by bioinformatics analysis using BLASTn and MEGA 6 software. Gene annotation was performed against N. kaouthia complete genome. A total of 3121 bp of N. siamensis mtDNA genes were sequenced consisting of partial of six regions: 16S rRNA, ND1, tRNA-Ile, CRII region, tRNA-Leu, tRNA-Gln, and COI genes. The mtDNA gene organization of N. siamensis was predicted to has a similar pattern with the common Elapidae mtDNA gene organization. This study showed that there is a monophyletic form in Naja genus and N. kaouthia is the closest species with N. siamensis based on partial 16S rRNA and ND1 gene.
Keyword: 16S rRNA, Elapidae, ND1, phylogenetic relationship