Judul: Penyakit Busuk Bulir Bakteri (Burkholderia glumae) Terbawa Benih Padi Berbagai Varietas dan Konfirmasinya dengan PCR
Abstrak: Penyakit busuk bulir bakteri (Burkholderia glumae) statusnya menjadi penting dalam beberapa tahun terakhir di berbagai negara termasuk Indonesia. Peningkatan intensitas penyakit diduga akibat perubahan ketahanan tanaman dan ras patogen yang berkaitan dengan perubahan iklim global dan peningkatan aktivitas importasi benih padi. Informasi mengenai penyakit ini di Indonesia masih terbatas. Penelitian ini bertujuan mempelajari gejala dan infeksi B. glumae pada benih padi berbagai varietas dari Pulau Jawa dan konfirmasi dengan polymerase chain reaction (PCR). Sampel benih padi terdiri atas 25 varietas baik unggul, lokal, maupun hibrida impor diperoleh dari berbagai lokasi di Pulau Jawa. Sampel benih acak diambil untuk menentukan insidensi penyakit dan terpilih berdasarkan adanya gejala pada permukaan bulir. Umur benih, tingkat perkecambahan biji, dan insidensi penyakit berdasarkan gejala pada permukaan benih dari masing-masing varietas cukup bervariasi. Penurunan tingkat perkecambahan benih tidak dipengaruhi oleh tingginya insidensi penyakit maupun usia benih saat pengujian. B. glumae positif terdeteksi pada sebagian besar sampel benih padi varietas unggul dan lokal dengan PCR, tetapi tidak terdeteksi pada benih padi hibrida. Jenis-jenis gejala busuk pada permukaan bulir bervariasi dari ringan hingga berat. Hampir semua jenis gejala pada permukaan benih juga berasosiasi positif dengan B. glumae melalui konfirmasi PCR. Patogen juga terdeteksi dalam biji padi tanpa gejala dengan PCR. Biji bergejala busuk menyebabkan penurunan daya kecambah berkisar 1-55%, penurunan pertumbuhan bibit 3-41%, dan penghambatan panjang akar berkisar 5-63%. Benih tanpa gejala dapat menghasilkan tanaman bergejala dan tanpa gejala. Benih dan bibit tanpa gejala dan bergejala juga terbukti berasosiasi dengan B. glumae melalui konfirmasi PCR.
Keyword: Benih tidak bergejala, deteksi molekuler, padi hibrida impor, terbawa benih, varietas lokal, varietas unggul

Judul: Penyakit Busuk Bulir Bakteri pada Padi di Jawa: Studi Kasus, Sebaran, Karakteristik, Potensi Penurunan Hasil dan Pengendaliannya
Abstrak: KRESNAMURTI TRI KURNIASIH. Penyakit Busuk Bulir Bakteri pada Padi di Jawa: Studi Kasus Sebaran, Karakteristik, Potensi Penurunan Hasil dan Pengendaliannya. Dibimbing oleh GIYANTO, MEITY SURADJI SINAGA, KIKIN HAMZAH MUTAQIN, ENY WIDAJATI. Penyakit busuk bulir bakteri (BBB) merupakan emerging disease pada tanaman padi di Indonesia. Penyakit ini ditemukan pertama kali di Indonesia pada tahun 1987 di Jawa Barat. Akan tetapi setelah itu, tidak terdapat laporan mengenai penyakit ini, hingga kemunculan kembali penyakit ini sekitar tahun 2010 di berbagai daerah di Indonesia. Meskipun telah banyak ditemukan akan tetapi belum dilakukan usaha pengendalian karena keterbatasan informasi mengenai penyakit BBB. Penyakit ini dapat menurunkan produksi padi di lapangan, karena menyerang tanaman padi terutama pada fase generatif. Oleh karena itu perlu dilakukan penelitian untuk mendapatkan informasi ilmiah mengenai daerah sebar penyakit BBB terutama di Jawa, identitas patogen yang berasosiasi dengan penyakit BBB, keberadaan patogen di dalam benih padi dan metode deteksinya, penurunan hasil akibat serangan patogen serta teknik pengendaliannya yang efektif. Tahapan penelitian yang dilakukan berupa survei lapangan untuk mendapatkan tanaman padi yang bergejala, dilanjutkan dengan karakterisasi secara morfologi, fisiologi dan molekuler terhadap isolat bakteri yang berhasil diisolasi dari gejala yang ditemukan di lapangan. Analisis homologi, filogeni dan RFLP in silico dilakukan untuk melihat keragaman genetik antar isolat bakteri. Tahap selanjutnya adalah deteksi keberadaan patogen dan pengembangan metode deteksi dini patogen pada benih padi. Uji in planta pada tanaman padi dilakukan untuk melihat variasi gejala yang dihasilkan akibat infeksi patogen serta potensi penurunan hasil. Aplikasi perlakuan panas kering dan minyak cengkeh dilakukan untuk mengendalikan B. glumae yang terbawa pada benih padi. Gejala BBB yang ditemukan di lapangan berupa busuk bulir dan hawar malai yang disertai dengan hampa. Malai tanaman yang terserang tampak lebih tegak karena sebagian bijinya hampa. Penyakit BBB telah tersebar di 9 kabupaten di Jawa yaitu Karawang, Subang, Purwakarta, Indramayu, Majalengka, Cirebon, Temanggung, Kediri dan Blitar. Karakterisasi secara morfologi, fisiologi dan bioassay menunjukkan 22 isolat bakteri merupakan Burkholderia spp. yang bersifat patogen. Karakterisasi molekuler berdasarkan sikuen DNA gen pengode 16S rRNA dan ITS 16S-23S rRNA memperlihatkan bahwa 15 isolat bakteri teridentifikasi sebagai B. glumae dan 7 isolat bakteri teridentifikasi sebagai B. gladioli. B. glumae ditemukan berasosiasi dengan gejala BBB dari daerah Karawang, Subang, Purwakarta, Indramayu, Temanggung, Kediri dan Blitar. B. gladioli ditemukan berasosiasi dengan gejala BBB dari Karawang, Majalengka, Cirebon dan Blitar. Hasil analisis homologi, filogeni dan RFLP in silico sikuen DNA gen pengkode 16S rRNA menunjukkan bahwa B. glumae dan B. gladioli dari Jawa memiliki keragaman genetik. Analisis keberadaan bakteri menunjukkan bahwa B. glumae ditemukan berada di bagian sekam kelopak, sekam mahkota dan embrio benih padi. Populasi B. glumae paling banyak ditemukan di bagian sekam mahkota biji padi sebesar 1.82 x 107 CFU g-1 diikuti bagian sekam kelopak dan embrio masing-masing sebesar 6.57 x 106 dan 1.08 x 106 CFU g-1. B. gladioli ditemukan berada di bagian sekam kelopak, sekam mahkota, endosperma dan embrio benih padi. Populasi B. gladioli pada benih padi tertinggi ditemukan di sekam mahkota sebesar 2.42 x 103 CFU g-1. Populasi B. gladioli di sekam kelopak, embrio dan endosperma berturut-turut sebesar 1.29 x 103; 6.35 x 102; 6.5 x 101 CFU
Keyword: Burkholderia glumae, patogen terbawa benih, perlakuan benih, Burkholderia gladioli

Judul: Implementasi Space Time Composite (STC) Data Model Menggunakan Model Data Relasional
Abstrak: The data model is a concept that describes the data stored in the database and the relationship between the data to the user in logic. Development of data models is very important in the design of the database as the basis of the stage of database design to be made. This study aims to apply the concept of Space Time Composite (STC) on the Model Data storage vector data types that can store enough information and describes the process of drafting objects and objects spatiotemporal evolution over time. From the results of the test queries on the data model that have been created, queries in a system are acquired that can help display the information preparation of objects from time to time and know the history of the object polygon and arc that has undergone changes in topology.
Keyword: