Judul: Reproductive biology, food habits, and population connectivity of horseshoe crab (Xiphosura: Limulidae) in Sunda Shelf area
Abstrak: Mimi adalah hewan purba yang mampu bertahan hampir 450 juta tahun dengan bentuk morfologi yang cenderung stabil. Terdapat empat jenis mimi di dunia dan tiga diantaranya dapat ditemukan di perairan Indonesia, yaitu Carcinoscorpius rotundicauda Latreille, 1802, Tachypleus gigas Müller, 1785, dan Tachypleus tridentatus Leach, 1819. Keberadaan ketiga jenis mimi di Indonesia tidak diikuti dengan ketersediaan data yang mencukupi. Informasi dasar tentang biologi mimi di Indonesia belum banyak terungkap. Status konservasi mimi berdasarkan IUCN Red List of Threatened Species adalah terancam punah untuk T. tridentatus, sedangkan dua lainnya C. rotundicauda dan T. gigas berstatus data deficient atau kurang data. Beberapa negara menyatakan mimi mengalami penurunan populasi dan berpotensi untuk menghadapi risiko kepunahan secara global. Akan tetapi, hingga saat ini data dan informasi biologi mimi di Indonesia masih terbatas. Tujuan dari penelitian ini adalah menganalisis karakteristik habitat pemijahan mimi serta beberapa aspek reproduksinya untuk jenis T. gigas di Subang, Jawa Barat, menganalisis jenis makanan mimi serta menguraikan persaingan makanannya berdasarkan DNA-metabarcoding, menganalisis konektivitas populasi yang terdapat di Indonesia untuk jenis T. gigas berdasarkan marka molekuler DNA-mitokondria pada bagian AT-rich untuk mengetahui keterkaitan populasi satu dengan yang lainnya. Metode yang digunakan dalam analisis karakteristik habitat pemijahan adalah pengamatan secara langsung pada bulan penuh dan bulan baru untuk mengetahui keberadaan T. gigas yang sedang memijah dan telur yang telah didepositkan. Pengamatan parameter lingkungan di daerah pemijahan juga diukur untuk mengetahui karakteristik habitatnya. Selanjutnya analisis kebiasaan makanan C. rotundicauda dan T. gigas dilakukan berdasarkan DNA-metabarcoding. Analisis DNA yang berasal dari isi lambung diperoleh dengan tahapan ekstraksi, amplifikasi, elektroforesis, sekuensing DNA, dan pengolahan data bioinformatik. Selain itu, metode serupa juga dilakukan untuk mengetahui konektivitas populasi T. gigas di daerah Paparan Sunda berdasarkan DNA mitokondria bagian AT-rich. Proses analisis data dilakukan dengan menggunakan beberapa perangkat lunak seperti Obitools, RStudio, MEGAX dan DNAsp. Daerah pemijahan mimi yang ditemukan pada penelitian ini terdapat di Subang, Jawa Barat khususnya di Pulau Burung dan Segara Menyan. Indikasi penentuan daerah pemijahan tersebut berdasarkan penemuan sepasang mimi yang sedang melakukan pemijahan, sarang dan telurnnya. Jumlah sarang yang ditemukan pada pengamatan bulan penuh sebanyak 50 sarang dengan total fekunditas 12.422 telur, sedangkan pada bulan baru sebanyak 27 dengan total fekunditas 5.841 telur. Karakteristik habitat yang dijadikan sebagai tempat pemijahan dan peneluran mimi cenderung spesifik, berada di gundukan pasir sekitar genangan air bekas tambak dan di sekitar tanaman mangrove. Rhizophora sp. Jenis substrat dominan pasir halus dan kasar. Sarang mimi yang telah ditemukan sebagian besar terletak di daerah tenang, terlindung dari gangguan gelombang ataupun ombak dan berada di tempat yang cenderung teduh dengan kelembaban yang cukup. Peranan penting mimi dalam sistem ekologi salah satunya sebagai pengendali struktur komunitas bentos. Hasil analisis komposisi jenis makanan berdasarkan DNA-metabarcoding menjelaskan bahwa C. rotundicauda dan T. gigas termasuk kelompok hewan karnivora. Jenis makanan C. rotundicauda dan T. gigas di Balikpapan didominasi oleh polychaeta (Clhoeia parva, Ancistrosyllis groenlandica, Mediosmastus sp.) dan scyphozoa (Lychnorhiza sp., dan Catostylus sp.). Jenis makanan C. rotundicauda di Demak sebagian besar gastropoda (Philine aperta dan Perinella cingulata), sedangkan pada T. gigas sebagian besar palaeonemertea (Callinera sp. dan Tubulanus sp.). Jenis makanan C. rotundicauda di Sumenep yang banyak ditemukan
Keyword: Habitat pemijahan, mimi/belangkas, jenis makanan, single stock, sarang telur, Food habit, horseshoe crab, nest placement, single stock, spawning ground