Judul: Potential of Bacterial Isolates from Peatlands as Controlling Agent for the Root Knot Nematodes Meloidogyne incognita
Abstrak: Lahan gambut Indonesia memiliki luas mencapai 14,9 juta hektar dan 35% diantaranya berada di Sumatera. Tanah gambut terbentuk dari adanya akumulasi bahan organik pada kondisi jenuh air dan atau kondisi anaerob. Tanah gambut memiliki kandungan bahan organik tinggi, derajat keasaman rendah, dan kandungan oksigen terlarut rendah yang menyebabkan laju dekomposisi pada lahan gambut menjadi lambat. Namun demikian, lahan gambut merupakan habitat dari berbagai jenis mikrob yang berperan penting dalam ekosistem, salah satunya adalah mikrob dari jenis bakteri. Bakteri merupakan kelompok mikroorganisme yang paling beragam dalam aspek fisiologi terutama terkait keragamannya pada berbagai tipe habitat. Keberadaan mikrob fungsional pada lahan gambut merupakan aspek penting yang perlu dilestarikan. Adanya konsep konservasi pada lahan gambut perlu memerhatikan peran bakteri. Bakteri pada lahan gambut mampu memanfaatkan bahan organik dalam aliran energi dan siklus unsur hara. Salah satu pemanfaatan bakteri gambut adalah dengan memanfaatkan kemampuannya dalam bidang pertanian seperti kemampuannya sebagai agens pengendali hayati penyakit tanaman. Salah satu parasit dari kelompok nematoda yang merupakan parasit penting pada tanaman budidaya dan memiliki kisaran inang yang luas yaitu nematoda puru akar (NPA). NPA merupakan sebutan lain untuk spesies nematoda Meloidogyne spp.. NPA tersebar luas di seluruh dunia dan menyebabkan kehilangan hasil baik di daerah tropis maupun subtropis. Kehilangan hasil yang disebabkan oleh nematoda ini dapat mencapai 5–20%. Potensi bakteri asal gambut sebagai agens pengendali nematoda belum banyak diteliti sehingga perlu dilakukan. Bakteri pada lahan gambut mampu memanfaatkan bahan organik dalam aliran energi dan siklus unsur hara. Adanya sifat dan karakter fisiologi khusus yang dimiliki oleh bakteri asal gambut dapat dimanfaatkan dalam bidang perlindungan tanaman. Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi potensi isolat bakteri asal gambut baik secara in vitro maupun in planta sebagai agens pengendalian M. incognita. Di samping itu, isolat bakteri yang potensial diidentifikasi secara molekuler dengan teknik PCR. Pengujian in vitro terhadap 50 individu juvenil (J2) M. incognita menggunakan 4,5 ml filtrat bakteri dilakukan pada suhu 27 oC. Pengamatan dilakukan terhadap persentase mortalitas nematoda pada 6, 12, 24 jam setelah perlakuan, dan 12 jam setelah pembilasan. Percobaan menggunakan rancangan acak lengkap (RAL) dengan 17 perlakuan dan 3 ulangan. Pengujian terhadap isolat bakteri meliputi: uji Gram dengan larutan KOH 3%, produksi senyawa HCN dengan cyanide detection solution (CDS), dan aktivitas kitinolitik pada media koloidal kitin. Isolat bakteri dengan aktivitas kitinolitik tertinggi kemudian diidentifikasi secara molekuler dengan teknik PCR untuk target 16S rRNA menggunakan primer forward 27 F dan primer reverse 1492 R dilanjutkan dengan perunutan DNA. Sebanyak 15 isolat bakteri asal gambut berhasil ditumbuhkan pada media Agar, 11 isolat bakteri merupakan bakteri Gram positif dan 4 isolat lainnya Gram negatif. Hasil penelitian menunjukkan bahwa 9 isolat bakteri yaitu: GA2 GAA1, GT1 GTA7, GT1 GTB3, GT1 GTB4, GT1 GTB6, GT1 GTB7, GT1 GTC2, GT1 GTC4, and STDHC4 memiliki kemampuan nematisidal in vitro dengan mortalitas mencapai 83–94% serta dapat meningkatkan pertumbuhan tanaman secara in planta hingga 32,23%. Isolat bakteri GT1 GTB4, GT1 GTB7, dan GT1 GTC2 memiliki kemampuan menghasilkan enzim kitinase dengan indeks lisis > 1 dan memiliki persentase keefektifan dalam menekan nematoda secara in planta sebesar 51,18–62,99%. Isolat bakteri GT1 GTB4 dan GT1 GTB7 memiliki homologi 99% dengan Serratia marcescens
Keyword: indeks lisis, kitinase, mortalitas, lysis index, chitinase, nematode mortality