Judul: Analysis of Tetracycline Resistance Genes in Escherichia coli from Pig Farms, Pig Slaughter Places, and its Environment in Banten
Abstrak: Kemunculan dan penyebaran resistansi antibiotik akibat penyalahgunaan antibiotik yang berlebihan di industri peternakan telah menjadi ancaman serius bagi kesehatan masyarakat di tingkat global. Peternakan babi, tempat pemotongan babi, dan limbah yang dihasilkan dapat menjadi reservoir dan berperan penting terhadap penyebaran gen resistan antibiotik ke lingkungan sehingga berpotensi mengancam kesehatan masyarakat. Antibiotik golongan tetrasiklin merupakan salah satu antibiotik yang banyak digunakan pada peternakan babi dan masih digunakan untuk mengobati pasien di Puskesmas dan rumah sakit. Beberapa studi telah menunjukkan bahwa antibiotik golongan tetrasiklin telah resistan terhadap Escherichia coli. Sekitar 70% strain E. coli yang diisolasi dari babi di Denmark dari tahun 2004 sampai 2017 menunjukkan resistansi terhadap tetrasiklin. Escherichia coli umumnya digunakan sebagai biomarker untuk memantau resistansi antibiotik karena kemampuannya dalam mentransfer gen resistan ke bakteri lain secara horizontal melalui mobile genetic element (MGE) serta dijadikan indikator dari kualitas mikrobiologi air dan lingkungan. Provinsi Banten memiliki sejumlah peternakan babi dan tempat pemotongan babi untuk memenuhi kebutuhan daging babi di masyarakat. Saat ini, belum tersedia data komprehensif terkait E. coli yang resistan terhadap antibiotik golongan tetrasiklin secara fenotipe dan genotipe dari peternakan babi, tempat pemotongan babi, dan lingkungan di Indonesia sehingga perlu dilakukan penelitian terkait hal tersebut. Tujuan dari penelitian ini adalah: (1) mengkarakteristikkan fenotipe resistansi antibiotik golongan tetrasiklin pada E. coli yang diisolasi dari sampel peternakan babi, tempat pemotongan babi, dan lingkungan; (2) mendeteksi keberadaan, keragaman dan pola gen resistan tetrasiklin pada E. coli yang diisolasi dari sampel peternakan babi, tempat pemotongan babi, dan lingkungan; (3) menganalisis kesesuaian gen resistan tetrasiklin pada E. coli yang diisolasi dari peternakan babi, tempat pemotongan babi, dan lingkungan; (4) menganalisis kesesuaian antara hasil pengujian resistansi antibiotik golongan tetrasiklin secara fenotipe dan genotipe pada E. coli yang diisolasi dari tempat pemotongan babi dan lingkungan di Provinsi Banten. Penelitian ini menggunakan sampel yang diambil dari peternakan babi, tempat pemotongan babi, dan Sungai Cisadane yang dialiri limbah tempat pemotongan babi di Provinsi Banten. Jenis sampel yang diambil dari peternakan babi yaitu feses dan limbah cair (effluent). Jenis sampel dari tempat pemotongan babi yaitu swab lantai dan effluent. Total peternakan babi dan tempat pemotongan babi di Provinsi Banten masing-masing sebanyak 44 peternakan dan 10 tempat pemotongan babi. Pengambilan sampel pada penelitian ini dilakukan di semua peternakan babi dan tempat pemotongan babi yang ada di Provinsi Banten. Sampel feses diambil dari kumpulan feses segar dari babi pada setiap flock yang ada di peternakan babi. Sampel effluent diambil dari limbah cair yang dialirkan langsung ke lingkungan. Sampel sungai diambil pada titik yang dialiri limbah tempat pemotongan babi. Terdapat 2 titik sungai yang dialiri limbah tempat pemotongan babi yang masing-masing diambil bagian upstream dan downsream. Pengambilan sampel effluent dan air sungai mengacu pada Standar Nasional Indonesia (SNI) 6989.59-2008 tentang Metoda Pengambilan Contoh Air Limbah dan International Organization for Standardization (ISO) 19458:2006 tentang Water Quality – Sampling for Microbiological Analysis. Isolasi dan identifikasi E. coli mengacu pada Global Tricycle Surveillance Extended Spectrum Beta-Lactamase (ESBL) E. coli dari World Health Organization (WHO 2021). Uji kepekaan terhadap dua jenis antibiotik golongan tetrasiklin (tetrasiklin dan oksitetrasiklin) menggunakan metode difusi cakram (disk diffusion) Kirby-Bauer mengacu pada Clinical and Laboratory
Keyword: Escherichia coli, limbah, peternakan babi, resistansi tetrasiklin, tempat pemotongan babi