Judul: Endophytic Fungal Diversity of Local Rice and Their effects on Rice seedling Growth.
Abstrak: Cendawan endofit ialah cendawan yang hidup di dalam jaringan tanaman inang tanpa menyebabkan gejala penyakit. Cendawan endofit potensial sebagai pupuk hayati dan pengendali hayati tanaman, termasuk padi lokal, sehingga dapat digunakan untuk meningkatkan produktivitas tanaman tanaman padi lokal yang ramah lingkungan. Padi lokal merupakan salah satu andalan karena cocok dengan kondisi lingkungan setempat. Namun, produktivitas padi lokal umumnya belum maksimal karena terkendala oleh kesuburan tanah. Produksi padi termasuk padi lokal masih bergantung pada pupuk anorganik. Pupuk anorganik yang digunakan terus menerus dapat mengubah struktur fisik dan kimia tanah yang menyebabkan tanah menjadi tidak subur. Oleh karena itu, perlu diterapkan suatu teknik budi daya padi spesifik yang berwawasan lingkungan dan berkelanjutan. Penelitian ini bertujuan mengisolasi dan menganalisis keragaman cendawan endofit padi lokal kultivar Siam 11 Kalimantan dan potensinya dalam meningkatkan pertumbuhan bibit tanaman inangnya. Isolasi cendawan dilakukan pada seluruh bagian tanaman padi Siam 11 Kalimantan, yaitu akar, pelepah, daun, gabah, biji pecah kulit, sekam, kecambah dan bibit dengan metode sterilisasi permukaan menggunakan NaOCl 1% dan dikulturkan pada media Potato sucrose Agar (PSA) yang mengandung kloramfenikol 500 mg L-1. Identifikasi cendawan menggunakan gabungan karakteristik morfologi dan molekuler. Keragaman cendawan endofit dihitung melalui indeks keragaman Shanon-Wiener. Cendawan endofit di analisis molekuler menggunakan sekuen rDNA dengan primer ITS1 dan ITS4 yang dilanjutkan dengan analisis filogenetik. Cendawan selanjutnya di uji kemampuannya dalam meningkatkan pertumbuhan bibit padi menggunakan filtrat. Kultur pengaruh filtrat cendawan endofit terhadap pertumbuhan tanaman padi diuji pada perkecambahan dan pertumbuhan benih padi. Filtrat cendawan endofit dari satu isolat terbaik dianalisis senyawa bioaktifnya menggunakan Liquid Chromatography-Mass Spectrometry (LC-MS). Data pertumbuhan tanaman padi dianalisis melalui Analisis Variance (ANOVA) menggunakan SAS 9.4. Perbedaan antar perlakuan dilanjutkan dengan uji Tukey pada taraf kepercayaan 95% (p<0,05). Sebanyak 14 kelompok isolat cendawan endofit berhasil diisolasi. Berdasarkan pengamatan morfologi sebanyak 11 isolat memiliki konidia (bersporulasi), sedangkan 3 isolat lainnya tidak bersporulasi. Berdasarkan hasil identifikasi molekuler, keempat belas isolat tersebut terdiri atas tiga belas spesies yaitu Cladosporium oxysporum, C. coloradense, Fusarium keratoplasticum galur 1 dan 2, F. humuli, Penicillium brefeldianum, P. citrinum, Poaceascoma lochii, Pseudopestalotiopsis simitheae, Sarocladium oryzae, Simplicillium obclavatum, Talaromyces macrosporus, T. angelicus, dan T. pinophilus. Bagian tanaman dengan frekuensi kolonisasi cendawan endofit paling tinggi terdapat pada bagian daun, sebesar 11,67%, sedangkan frekuensi kolonisasinya paling rendah terdapat pada bagian sekam yaitu 2,78%. Cendawan Sarocladium oryzae paling sering ditemukan dengan frekuensi 6,39%, atau tingkat dominansi spesies paling tinggi (95,83 %), sedangkan cendawan F. keratoplasticum galur 1, F. humuli, dan T. pinophilus paling jarang ditemukan dengan frekuensi masing-masing sebesar 0,28 % atau dominansinya paling rendah (masing-masing 4,17 %). Keragaman cendawan endofit yang diperoleh berdasarkan analisis keragaman Shanon-Wiener termaksuk dalam kategori sedang yaitu 2,24. Hasil pengujian filtrat asal ke-13 medium kultur yang telah dipisahkan dari miselium terhadap pertumbuhan benih padi lokal umur 14 hari pada kondisi laboratorium, menunjukkan isolat F. keratoplasticum galur 1 memiliki potensi yang paling baik, yaitu menghasilkan nilai peningkatan tinggi tajuk 3,87 cm, panjang akar 3,14 cm, dan bobot kering akar 3,52 mg. Analisis melalui LC-MS dari ekstrak kasar asal filtrat tersebut menunjukkan terdapat lima senyawa yang diduga membantu meningkatkan pertumbuhan tanaman padi, yaitu 2-C-methylerythritol 4-phosphate, asam sitrat, asam sitrakonat, asam DL-malat,
Keyword: 5W+1H