arulpm/triplet_large huggingface dataset:
Judul: Spatio Temporal Clustering Titik Panas Pada Lahan Gambut Di Sumatera Menggunakan Proses Pengelompokan Poisson
Abstrak: Kebakaran hutan dan lahan merupakan permasalahan serius dan memiliki dampak yang besar bagi keseimbangan lingkungan. Mengingat dampak dari kebakaran yang sangat merugikan dan faktor penyebab timbulnya kebakaran yang kompleks, maka penting untuk dikembangkan sistem peringatan sejak dini (early warning system) guna pencegahan kebakaran lahan gambut. Indikasi terjadinya kebakaran hutan dan lahan dapat diketahui melalui titik panas yang terdeteksi di suatu lokasi tertentu pada waktu tertentu. Dengan mengetahui pola persebaran penggerombolan titik panas maka dapat diketahui wilayah-wilayah yang memiliki kepadatan titik panas yang tinggi sehingga dapat membantu pihak yang berwenang untuk penguatan implementasi kebijakan dalam pencegahan kebakaran lahan gambut sejak dini. Salah satu pendekatan dalam data mining yang digunakan adalah clustering. Penelitian ini menerapkan pendekatan statistik untuk mengetahui pengelompokan sebaran titik panas secara spasial dan temporal. Dalam penelitian ini metode Kulldorff’s Spatial Scan Statistic (KSS) digunakan untuk clustering titik panas lahan gambut di wilayah Sumatera pada tahun 2001-2014. Data yang digunakan sebagai objek penelitian yaitu data sebaran titik panas dan data sebaran lahan gambut di Pulau Sumatera. Tahapan yang dilakukan dalam penelitian terdiri dari tujuh tahap yaitu studi literatur, pengumpulan dan analisis data, praproses data, implementasi metode KSS dengan model Poisson untuk menentukan likelihood, penentuan cluster titik panas dengan menggunakan metode KSS, validasi cluster, dan visualisasi clustering. Hasil pengujian menunjukkan bahwa cluster titik panas paling banyak terjadi pada Provinsi Riau dan Sumatera Selatan. Sebaran cluster titik panas di Sumatera berdasarkan tingkat kematangan gambut yaitu pada tahun 2001-2006 didominasi oleh tipe gambut “Hemists (100)” dengan kedalaman “sedang” dan “Hemists/Saprists (60/40)” dengan kedalaman “dalam”. Sedangkan, pada tahun 2007-2014 didominasi oleh “Hemists/Saprists (60/40)” dengan kedalaman “sangat dalam” dan “Hemists/Saprists (60/40)” dengan kedalaman “sedang”. Berdasarkan ketebalan gambut pada tahun 2001-2006 sebaran cluster titik panas di Sumatera didominasi oleh “Sedangμ 100-200 cm (D2)” dan Dalam/tebal (D3) (200-400 cm)”. Sedangkan, pada tahun 2007-2014 didominasi oleh “Dalam/tebal (D3) (200-400 cm)” dan “Sangat Dalam/Sangat Tebalμ >400cm (D4)”. Berdasarkan jenis tutupan lahan, secara umum sebaran cluster titik panas lahan gambut tahun di Sumatera pada tahun 2001–2014 didominasi oleh “hutan rawa” dan tingkat kematangan “hemik”.
Keyword: clustering, hotspot, lahan gambut, pemrosesan poisson, scan statistic
Judul: Mempelajari pengaruh penambahan onggok ampas tahu dan parutan papaya muda dalam pengolahan tempe
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk membuat tempe campuran dengan mengurangi jumlah kedelai dan mensubstitusinya dengan bahan lain yang lebih murah, namun masih menghasilkan tempe yang bermutu cukup baik. Didalam penelitian ini digunakan bahan baku utama kedelai dengan bahan substitusinya adalah ampas tapioka (ong gok), ampas tahu dan papaya muda. Perlakuan yang dipelajari adalah jumlah substitusi dan jenis pembungkus yaitu kantung plastik dan daun pisang. Jumlah substitusi dengan onggok dan parutan papaya muda masing-masing adalah sebanyak 0, 10, 30 dan 50 persen. Sedangkan substitusi dengan ampas tahu adalah sebanyak 0, 25, 50 dan 75 persen. Laru tempe yang digunakan adalah kultur campuran yang mengandung Rhizopus sp.. Pengolahan tempe yang dilakukan adalah cara tradisonal, dengan melakukan perebusan dua kali dan lama pemeraman 38 40 jam. Analisa tempe segar meliputi total protein, kadar air, nilai pH, VRS dan total asam serta uji organoleptik meliputi tekstur, sifat irisan, kelebatan pertumbuhan kapang dan bau. Hasil olahan dianalisa dengan uji organoleptik meliputi rasa dan bau.
Keyword:
Judul: Evaluasi Penerapan Sanitasi, Sistem Pemotongan, Sistem Jaminan Halal dan Keamanan Daging Sapi di RPH Kota Pekanbaru
Abstrak: Penyediaan bahan pangan dengan nilai gizi tinggi merupakan masalah penting sebagai upaya meningkatkan kesehatan dan kecerdasan masyarakat. Salah satu bahan pangan yang mengandung nilai gizi tinggi adalah daging sapi. Pemenuhan kebutuhan masyarakat akan daging perlu dilakukan dengan cara meningkatkan produksi dan kualitas hasil ternak secara optimal serta menjamin mutu daging yang aman sampai ke konsumen. Peningkatan permintaan daging tidak selalu diikuti dengan perbaikan sarana rumah potong hewan (RPH) yang memadai, sehingga keamanan dan kehalalan daging menjadi suatu permasalahan yang belum terselesaikan. Kualitas dan keamanan daging yang dihasilkan salah satunya ditentukan oleh pelaksanaan penyediaan daging di rumah potong hewan (RPH). Proses penanganan ternak dan daging di RPH yang kurang baik dan tidak memperhatikan faktor-faktor sanitasi dan higienis, akan berdampak pada mutu, kehalalan dan keamanan daging yang dihasilkan. Selain itu, diperlukan penetapan aturan atau standar operasional maupun teknis sebagai dasar untuk menyelenggarakan fungsi RPH sebagai tempat pelaksanaan pemotongan ternak guna menghasilkan daging yang ASUH (aman, sehat, utuh dan halal). Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi penerapan standard sanitation operational procedure (SSOP), good slaughtering practices (GSP) dan sistem jaminan halal (SJH) serta nilai kontrol veteriner (NKV) terhadap rumah potong hewan (RPH) Kota Pekanbaru. Selain itu, penelitian ini bertujuan mengevaluasi keamanan daging asal RPH Kota Pekanbaru ditinjau dari kualitas daging yang meliputi mutu fisik, tingkat cemaran mikroba, cemaran residu logam berat (Pb, Cd, Hg) serta cemaran residu pestisida golongan organofosfat. Pengambilan sampel dilakukan secara acak sederhana (simple random sample) terhadap sejumlah pemilik ternak yang melakukan pemotongan di RPH Kota Pekanbaru. Sejumlah pemilik ternak, diambil lima pemilik ternak yang melaksanakan pemotongan di RPH sebagai sampel pengamatan SSOP, GSP, SJH dan NKV. Tiga ekor ternak diambil dari masing-masing pemilik ternak untuk dianalisis mutu fisik daging (pH, warna, persentase air bebas), cemaran mikroba (Salmonella, Eschericia coli, Coliform dan total plate count/TPC), cemaran residu logam (Pb, Cd dan Hg) serta cemaran residu pestisida organofosfat. Sampel yang dianalisis berupa sampel daging sapi bagian otot Bicep femoris (BF) dan Longissimus dorsi et lumbarum (LD), organ hati dan ginjal...dst
Keyword: keamanan daging, jaminan halal, residu logam berat, residu pestisida, rumah potong hewan
Judul: Penampilan Reproduksi Sapi Brahman Cross (Studi Kasus Di Wilayah Transmigrasi Sebamban Kalimantan Selatan)
Abstrak: Hadirnya kasus yang menyerupai AIDS ·didalam populasi Monyet dan Kera (Primata) yang awalnya digunakan untuk keperluan penelitian di Pusat Pusat atau Lembaga-Lembaga Penelitian kini menimbulkan masalah dan harapan-harapan bagi para ahli. Kelompok Retrovirus yang menyebabkan hewan terjangkit dan sakit ternyata sama dengan yang menyerang pada Manusia. Meskipun tampaknya virus penyebab AIDS termasuk dalam sub famili Lentivirus dan memiliki sedikit perbedaan inti rantai protein pembengun struktur RNA dengan virus penyebab Simian-AIDS, tetapi sifat antigenik protein envelop virion. virulensi serta patogenesa hampir sama terhadap spesies ysng terinfeksi.
Keyword:
Judul: Pengaruh jenis kemasan dan lama penyimpanan pada suhu ruang terhadap mutu tepung terasi
Abstrak: Terasi merupakan penyedap masakan yang berperanan penting dalam hidangan. Indonesia. Cara-cara pemasakan te- rasi (pengukusan, pemanggangan, penyangraian atau panggo rengan) sebelum terasi digunakan cukup merepotkan dan ku- rang praktis. Di samping itu, terasi mentah mempunyai penampakan yang kotor dan juga mudah rusak. Dengan demi- kian, perlu dilakukan upaya pembuatan terasi yang lebih awet, lebih menarik, mudah disimpan dan dikemas serta praktis dalam penggunaannya. Salah satu alternatif yang dapat dilakukan adalah pembuatan tepung terasi matang. Tujuan penelitian ini adalah untuk mempelajari penga- ruh jenis terasi, jenis kemasan, dan lana penyimpanan pada suhu ruang terhadap nutu tepung terasi.
Keyword:
Judul: Pemanfaatan Alat Pengusangan Cepat Menggunakan Etanol untuk Pendugaan Vigor Daya Simpan Benih Jagung (Zea mays L.).
Abstrak: Pengusangan cepat adalah pengujian vigor daya simpan benih setelah mendapatkan pengusangan fisik maupun kimia yang dapat memberikan simulasi lingkungan suboptimum yang dapat menyebabkan kemunduran benih mirip seperti kondisi sebenarnya. Penelitian ini menggunakan metode pengusangan cepat kimia pada benih jagung dengan memanfaatkan alat pengusangan cepat tipe IPB 77-1 MM. Alat pengusangan cepat (APC IPB 77-1 MM) diharapkan merupakan mesin yang akan dapat mempercepat kemunduran benih dengan memanfaat uap etanol 96%. Fungsi dari alat pengusangan cepat IPB 77-1 MM dimaksudkan agar dapat melihat kemunduran benih secara cepat yang bisa menggambarkan kemunduran mutu yang terjadi pada penyimpanan alami yang dalam penelitian ini ditunjukkan dengan menggunakan metode penyimpanan terkontrol. Penelitian ini menggunakan lima lot benih jagung dengan tingkat vigor yang berbeda hasil dari deteriorasi terkontrol pada suhu 40 °C dan RH 98%. Hasil dari pembuatan lot benih dari vigor tinggi hingga rendah: P1 (94.5% berkecambah normal), P2 (92.5% berkecambah normal), P3 (70% berkecambah normal), P4 (38% berkecambah normal), dan P5 (17% berkecambah normal). Penelitian ini terdiri dari dua percobaan, percobaan pertama adalah pengusangan cepat kimia yang terdiri atas 5 taraf waktu pengusangan yaitu 0, 25 (1x25’), 50 (2x25’), 75 (3x25’), dan 100 (4x25’) menit. Percobaan kedua adalah penyimpanan terkontrol pada kondisi suhu kamar (30-34 °C) dan RH tinggi (85-99%) yang didapatkan dari larutan garam jenuh Na2SO4 dan terdiri dari 5 taraf waktu penyimpanan yaitu 0, 10, 20, 25, dan 30 hari.. Penelitian ini bertujuan untuk menguji pemanfaatan APC IPB 77-1 MM untuk pendugaan vigor daya simpan benih jagung dengan menggunakan pengusangan kimia. Hasil percobaan menunjukkan alat pengusangan cepat IPB 77-1 MM dapat digunakan untuk menduga penurunan vigor pada benih jagung. Hasil percobaan juga menunjukkan alat pengusangan cepat IPB 77-1 MM dapat menduga nilai vigor daya simpan yang sama dengan percobaan penyimpanan pada tolok ukur daya berkecambah dan potensi tumbuh maksimum sedangkan untuk tolok ukur indeks vigor dan kecepatan tumbuh belum menunjukkan konsistensi penurunan vigor.
Keyword: APC IPB 77-1 MM, jagung, pengusangan cepat kimia, penyimpanan terkontrol
Judul: Penggunaan biomassa onggok, limbah pengalengan nenas dan limbah asam sitrat dalam ransum dan pengaruhnya terhadap penampilan produksi ayam broiler
Abstrak: Tujuan penelitian adalah untuk mempelajari pengaruh fermentasi Onggok, Limbah Pengalengan Nenas dan Limbah Asam Sitrat terhadap perubahan nutrisi bahan dan pemanfaatannya untuk pakan ayam broiler. Penelitian dimulai dengan pembuatan biomassa Onggok (BIOMO), biomassa Limbah Pengalengan Nenas (BLPN) dan biomassa Limbah Asam Sitrat (BLAS) , melalui fermentasi media padat dengan menggunakan kapang Aspergillus niger dan lama fermentasi enam hari. Selanjutnya biomassa ini digunakan sebagai komponen pakan ayam broiler sebanyak 15 % dan dibandingkan dengan bahan yang tidak di fermentasi dan ransum komersial. Dalam penelitian ini digunakan 400 ekor ayam broiler strain Shaver Starbro yang terbagi secara acak dalam 40 unit kandang. Penelitian dilakukan dengan menggunakan Rancangan Acak lengkap (RAL) dengan sembilan perlakuan ransum + satu kontrol (ransum komersial). Setiap perlakuan terdiri atas empat ulangan. Parameter yang diukur adalah konsumsi ransum, pertambahan bobot badan, konversi ransum, bobot dan persentase karkas , bobot dan persentase lemak abdominal dan analisis ekonomi. Hasil penelitian menunjukkan bahwa perlakuan pengukusan + mineral dan fermentasi Onggok, Limbah Pengalengan Nenas dan Limbah Asam Sitrat menunjukkan peningkatan kandungan protein (N x 6,25) dan penurunan kandungan serat kasar. Penggunaan bahan baku Onggok (Pl/Onggok), Limbah Pengalengan Nenas (P4/LPN) dan Limbah Asam Sitrat (P7 /LAS) ; penggunaan Limbah yang dikukus + mineral (P2/OM, P5/LPNM, P8/LASM) serta limbah yang difermentasi (P3/BIOMO, P6/BLPN, P9/BLAS) pada taraf 15 % dalam ransum ayam broiler, memberikan respon yang sama dengan ransum komersial (PO/kontrol) terhadap konsumsi ransum, pertambahan bobot badan dan konversi ransum, kecuali : Pl (Onggok), konsumsi ransum periode starter sangat nyata (P<0,01) dan PS (LASM) nyata (P<0,05) lebih rendah dari PO/kontrol. Pertambahan bobot badan pe­riode starter dari perlakuan P3 (BIOMO) dan P7 (LAS) sangat nyata (P<0,01) lebih kecil dan P5 (LPNM), P9 (BLAS) nyata (P<0,05) lebih kecil dari PO/kontrol. Sedangkan konversi ransum Pl(Onggok) sangat nyata (P<0,01) lebih kecil dan PS (LASM) nyata (P<0,05) lebih besar dari PO/kontrol. Penggunaan Onggok (Pl/Onggok) dan Limbah Pengalengan Nenas (P4/LPN) dalam ransum, memberikan persentase lemak abdominal yang paling rendah, yaitu 1,85 dan 1,46.
Keyword: Biomassa onggok
Judul: Pertumbuhan dan perkembangan ukuran-ukuran tubuh relatif terhadap bobot potong itik alabio
Abstrak: Penelitian dilakukan di Fakultas Peternakan, Institut Pertanian Bogor dari awal September hingga akhir Oktober 1990. Materi yang digunakan adalah 30 ekor itik Alabio (15 ekor jantan dan 15 ekor betina) yang diamati perkembangan ukuran tubuhnya. Pengamatan pertambahan bobot badan dilakukan terhadap lima ekor itik jantan dan empat ekor betina dengan kisaran bobot awal 34.67 ± 4.39 gram. Pertumbuhan awal dipelajari dengan rumus Wt Wo ekt Bobot dewasa dan bobot pertumbuhan diperlambat dipelajari dengan rumus WtA Be-kt. Pengaruh jenis kelamin terhadap parameter yang diamati dipelajari dengan analisis kovarian (sidik peragam). Analisis statistik mengikuti fungsi pertumbuhan dengan model Ya Xb. Titik infleksi Alabio jantan dan betina tercapai pada minggu keempat dengan bobot badan masing-masing 514 dan 344 gram. Koefisien pertumbuhan (b) dari semua ukuran tubuh mempunyai nilai b<1.0 (masak dini). Pengaruh jenis kelamin tidak nyata pada koefisien pertumbuhan ukuran linier relatif terhadap bobot potong. Jenis kelamin berpengaruh sangat nyata (P<0.01) terhadap nilai intersep (a) untuk lingkar dada, panjang paha atas, panjang paha bawah, panjang shank dan panjang tulang shank, sedangkan terhadap panjang leher, panjang dada, lingkar shank, lingkar tulang shank dan bobot tulang shank tidak nyata. Pada bobot badan yang sama (1052.05 gram), jantan memiliki lingkar dada 21.01 cm, panjang paha atas 6.45 cm, panjang paha bawah 11.14 cm dan panjang shank 5.67 cm, yang nyata berbeda dengan betina yang memiliki lingkar dada 21.87 cm, panjang paha atas 6.21 cm, panjang paha bawah 10.89 cm dan panjang shank 5.52 cm. Nilai r terbesar terdapat pada ukuran lingkar dada terhadap bobot potong, yaitu sebesar 0.99. Gelombang pertumbuhan itik jantan dan betina dimulai dari arah kaki (shank), panjang paha bawah, panjang paha atas, dada dan dari arah lain dimulai dari leher ke dada…dst
Keyword:
Judul: Pemanfaatan ganggang mikro sebagai bioindikator perairan yang tercemar
Abstrak: This study aimed to determine the sensitivity of some freshwater microalgae from Indonesia to the heavy metal contaminants (Hg, Cd, As and Pb) and pesticides. Result of the selection of ten isolates of microalgae grown in BG 11 medium obtained three strains which have the fastest growth rate: ICBB 9111, ICBB ICBB 9113 and 9114. Third is selected microalgae strains were identified as: Synechoccus sp. ICBB 9111 (originally there in Mt Salak, Bogor), Chlamydomonas sp. ICBB 9113 (paddy field of Ciomas - Bogor) and Chlorella vulgaris ICBB 9114 (origin Telaga Warna, Puncak, Bogor). To test the sensitivity of microalgae to heavy metals, three selected bacteria are grown in a medium containing heavy metals Cd, Hg, As and Pb at a concentration of 1.25 ppm, 2.50 ppm, 5.00 ppm and 10.00 ppm. Observation of the optical density (OD) performed on the first 30 minutes up to 96 hours. Based on visual observations obtained during this period that two strains of micro-algae growth stalled. Both strains of microalgae are Synechococcus sp. ICBB 9111 and Chlamydomonas sp. ICBB 9113. In contrast to Chlorella vulgaris ICBB 9114 still survive, especially in the medium containing metal ions Cd and Pb, whereas in medium containing Hg and As these strains are not able to survive. The next stage of research is the analysis of metal content, which is not absorbed by the micro algae biomass. From the analysis found that Hg and As are almost entirely absorbed by algae and micro-media content in each of the remaining <0.001 ppm and <0,002 ppm. Whereas for Cd and Pb only a small portion is absorbed by microalgae. Based on the results of the durability of each micro algae in media containing different heavy metals. ICBB Chlorella vulgaris strain 9114 has the durability and adaptability to heavy metals higher than the strain Chlamydomonas sp. ICBB 9113. While Synechococcus sp. ICBB 9111 had the highest sensitivity of all four metals tested. In addition to heavy metals tested, three strains were also tested sensitivity to the herbicide; isoprophylamine glyphosate and paraquat dichloride and insecticide ; buthylphenylmethylcarbamate (BPMC) and deltamethrin with variations of the following concentrations: 5ppm, 10ppm, 20ppm and 40ppm. Microalgae growth observations showed that all three strains are able to survive up to 24 hours in media containing pesticides tested. After 24 hours, the three began to show signs of decline. At the 96-hour observation of all micro algae die. The amount of pesticide concentrations ranged from 10-20ppm concentration which is critical to the durability and adaptability of microalgae. Of the overall treatment and observation can be drawn a conclusion that some micro algae have tolerance to pollutants (heavy metals or pesticides) that enter the aquatic environment. Adsorption capacity and adaptation of micro algae can be used as bio-indicators in monitoring and evaluation of marine environmental impacts of the heavy metal pollutants and pesticides.
Keyword:
Judul: Pengendalian penyakit akar gada (Plasmodiophora brassicare Wor.) pada caisin dengan bakteri kitinolitik
Abstrak: Salah satu masalah penting bagi petani sayuran kubis-kubisan khususnya caisin (Brassica campestris L.var. chinensis (Rupr.) Olson) adalah penyakit akar gada yang disebabkan oleh cendawan Plasmodiophora brassicae Wor. Serangan patogen ini sering kali mempengaruhi tingkat produksi tanaman caisin karena kehilangan hasil yang disebabkan penyakit ini dapat sangat berat (50-100%). Pada tanaman yang terserang menunjukkan gejala akar tanaman membengkak, sehingga mengganggu translokasi unsur hara dan air. Keadaan demikian menyebabkan pertumbuhan tanaman terhambat, tanaman menjadi kerdil, pada siang hari daun-daunnya berwarna hijau kelabu, lebih cepat layu, dan mengering hingga akhirnya mati. Penanggulangan penyakit yang sering dilakukan di lapang adalah penggunaan varietas tahan, penggunaan fungisida dan pengapuran, Sementara pengendalian hayati yang pernah dilakukan antara lain perendaman lahan, ekstrak bawang putih, penggunaan mulsa, penggunaan bakteri antagonis dan solarisasi tanah. Pengendalian alternatif terhadap P. brassicae adalah dengan mengembangkan teknik pengendalian hayati. Dengan pendekatan konsep pengendalian hayati ini, maka dalam penelitian ini digunakan agen antagonis, yaitu dengan menggunakan bakteri kitinolitik yang diharapkan tidak menyebabkan dampak pencemaran dan juga dapat berkembang secara alami. Penelitian ini bertujuan untuk mencari isolat bakteri kitinolitik yang efektif dalam mengendalikan penyakit akar gada (P. brassicae) pada tanaman caisin di dalam rumah kaca. ...
Keyword:
Judul: Trancriptomic Analysis of Kamper (Dryobalanops aromatica) Grown in Peat Media and Mineral Soil
Abstrak: Dryobalanops aromatica is a highly economic value resin-producing tree. It has been known as an essential international trade commodity widely used in the perfume, cosmetics, medicine, and wood industries. In natural habitats, this adaptive species has been found to grow well on peatland and mineral soils. The information regarding adaptive genes in Indonesian native trees to abiotic stress is still very limited. The research was conducted to analyse the differential gene expression (DGEs) that can elucidate the role of several up-regulated and down-regulated genes under peat media and mineral soil treatments. DGE analysis was carried out using R software, Bioconductor package 'edgeR'. Using the Benjamini and Hochberg approach to control FDR (false discovery rate) with the value of FDR is 0.05), with a log2FC (log2 fold change) with minimal value 2 and p-value of 0.05, showed 320 contigs were up-regulated, and 439 contigs were down-regulated, while 58129 contigs were not significantly expressed. Furthermore, this study also presents an overview of the genes involved in different pathways, such as photosynthesis, carbon and energy metabolism, phytohormone-related genes, nitrogen metabolism, reactive oxygen species, and transcription factor. This information will be helpful in understanding D. aromatica molecular responses to stress conditions that may be useful for selecting genotypes in the breeding programs or peatlands restoration. We found that genes involved in plant stress phytohormone biosynthesis, such as JA (jasmonic acid), ET (ethylene), GB (gibberellic acid), were up-regulated. In contrast, genes involved in ABA and IAA showed down-regulated on peat media treatment. Further, genes encode biological functions of the cell wall, and molecular functions as metal ion binding were up-regulated. Genes that function as antibiotics and ROS scavengers such as Peroxidase and Superoxide dismutase [Fe]2, chloroplastic were also found up-regulated. The transcription factors MYB26, NAC43, and NAC73 are thought to be transcription factors involved in the defense responses to D. aromatica in peat stress treatment. Molecular phylogeny analysis was carried out on the sequences of genes related to the adaptability of D. aromatica to the peat media stress to determine the evolutionary history, kinship relationships, and related gene functions. Homologous genes show different expression up-/down-regulations patterns. However, the alignment and phylogenetic analysis results showed an identity matrix and a distance matrix showing differences between up-regulated and down-regulated homologous genes. The differences between these genes are thought to be due to differences in the specific motifs of their constituent bases.
Keyword: adaptation, Dryobalanops, phylogenetic, Transcriptome, RNA-seq