Judul: Genetic Diversity of Sugar Palm (Arenga pinnata (Wurmb) Merr.) from Nine Regions in Indonesia Based on SSR Markers
Abstrak: Aren (Arenga pinnata (Wurmb) Merr.) adalah tanaman multiguna yang adaptif terhadap berbagai kondisi lahan dan potensial untuk dikembangkan secara luas karena memiliki nilai ekonomi dan fungsi konservasi. Produk tanaman aren telah dimanfaatkan untuk bahan baku industri. Nira aren selain untuk bahan pembuatan gula juga dimanfaatkan untuk bahan baku industri bioethanol. Ijuk aren sebagai bahan pembuatan biopolimer yang dapat diaplikasikan dalam industri otomotif dan industri kemasan. Pati dari bagian batang pohon aren yang sudah tua dijadikan bahan baku industri pembuatan tepung. Perakaran aren yang lebat memiliki kemampuan yang sangat baik dalam menahan air dan tanah. Dukungan inovasi teknologi sangat penting untuk mencapai keberhasilan dan keberlanjutan pengembangan aren melalui peningkatan produktivitas tanaman aren. Komponen teknologi yang diperlukan untuk meningkatkan produktivitas tanaman aren antara lain varietas, klon, dan pohon induk unggul yang dihasilkan dari program pemuliaan tanaman. Plasma nutfah sebagai sumber keragaman genetik sangat penting dalam program pemuliaan tanaman. Indonesia menyimpan potensi keragaman genetik tanaman aren yang tinggi, mengingat penyebaran tanaman aren cukup luas di kepulauan Indonesia yang memiliki kondisi geografi berbeda. Informasi keragaman genetik sangat penting dalam menentukan strategi pengelolaan dan pemanfaatan plasma nutfah untuk tujuan pemuliaan tanaman atau untuk program konservasi plasma nutfah itu sendiri. Penelitian ini bertujuan untuk memperoleh informasi keragaman genetik dan kekerabatan genetik aren yang berasal dari sembilan daerah di Indonesia berdasarkan marka SSR. Penelitian dilaksanakan pada bulan Agustus 2020 sampai dengan Maret 2021. Bahan genetik tanaman dalam penelitian ini terdiri atas 144 aksesi aren dari sembilan daerah, yaitu Bangka (10 aksesi), Lampung (16 aksesi), Lebak (16 aksesi), Bogor (11 aksesi), Tasikmalaya (10 aksesi), Brebes (26 aksesi), Gowa (13 aksesi), Bombana (13 aksesi), dan Muna (29 aksesi). Sampel yang diambil dari setiap aksesi berupa bagian daun tanaman aren. Seleksi terhadap 113 pasang (forward + reverse) primer SSR dilakukan untuk mendapatkan primer polimorfik. Primer SSR terpilih dari tahap seleksi primer digunakan untuk genotyping 144 aksesi aren menggunakan teknik PCR. Data hasil genotyping dianalisis untuk mengetahui jumlah alel (Na), jumlah alel efektif (Ne), heterozigositas observasi (Ho), dan heterozigositas harapan (He), persentase keragaman genetik dalam populasi dan antar populasi, jarak genetik antar populasi, nilai PIC (Polymorphism Information Content) dan pohon kekerabatan genetik antar aksesi aren. Hasil penelitian menunjukkan bahwa terdapat dua primer yang informatif untuk studi keragaman genetik aren. Keragaman genetik aren dalam populasi (79%) lebih tinggi dari keragaman genetik antar populasi (21%). Keragaman genetik aren paling tinggi ditunjukkan oleh populasi asal Bangka, sedangkan keragaman genetik paling rendah terdapat pada populasi asal Muna. Jarak genetik paling jauh antara populasi Lampung dan Muna (0,283), dan jarak genetik paling dekat antara populasi Bangka dengan Lebak (0.033). Aren dari sembilan populasi terbagi ke dalam tiga kelompok besar kekerabatan. Kelompok 1 terdiri atas aksesi populasi Bangka, Lampung, Bogor, Tasikmalaya, Brebes, Gowa, Bombana dan Muna. Kelompok 2 terdiri atas aksesi populasi Bangka, Lampung, Lebak, Bogor, Tasikmalaya, Brebes, dan Gowa. Kelompok 3 terdiri atas aksesi populasi Bangka, Lebak, Brebes, Tasikmalaya, dan Gowa. Seluruh aksesi populasi Muna berada dalam satu kelompok kekerabatan mengindikasikan bahwa gene flow sangat terbatas pada populasi Muna. Secara umum, pola pengelompokan aksesi aren pada penelitian ini tidak ditentukan oleh faktor geografis asal aksesi aren. Kata kunci:
Keyword: jarak genetik, kekerabatan genetik, polimorfik