Judul: The Detection of Antibiotic Resistance of Escherichia coli from The  Pig Farm in Badung District Bali Province Through One Health Approach
Abstrak: Resistansi antimikrob atau Antimicrobial Resistance (AMR) saat ini menjadi masalah kesehatan global. Penggunaan antibiotik yang tidak tepat memicu keberadaan bakteri resistan, yang dapat menyebabkan penurunan kemampuan pengobatan antibiotik pada kejadian infeksi bakteri hingga kegagalan pengobatan. Bakteri Escherichia coli (E. coli) adalah bakteri Gram negatif yang bersifat komensal maupun patogen dan telah diketahui resistan pada beberapa jenis antibiotik. Resistansi antibiotik pada E. coli mengindikasikan adanya bakteri resistan di lingkungan dengan potensi penyebarannya. Disain penelitian ini merupakan penelitian eksploratif untuk mengidentifikasi pola resistansi dan gen penyandi resistansi antibiotik pada E. coli dari peternakan babi di Kabupaten Badung, Provinsi Bali, serta menganalisis hubungan kekerabatan bakteri E. coli resistan yang berasal dari hewan, manusia dan lingkungan. Pengambilan sampel dilakukan di 12 peternakan babi, terdiri dari 24 sampel feses babi, 24 sampel swab tangan pekerja kandang dan 12 sampel air limbah. Analisis laboratorium terdiri dari isolasi-identifikasi E. coli menggunakan media McConkey Agar dan uji biokimia IMViC, serta konfirmasi E. coli secara molekuler dengan Polymerase-Chain Reaction (PCR) deteksi gen uspA. Hasil E. coli positif selanjutnya diuji resistansi dengan metode Disk Diffusion Kirby-Bauer terhadap amoksisilin (AML), ampisilin (AMP), sefalotin (KF), seftriakson (CRO), sefotaksim (CTX), seftazidim (CAZ), siprofloksasin (CIP), kolistin sulfat (CT), eritromisin (E), streptomisin (S), tetrasiklin (TE), dan trimethoprim sulfametoksazol (SXT). Isolat E. coli resistan kemudian diuji deteksi E. coli penghasil ESBL dengan Modified Double Disk Sinergy Test (MDDST), diuji gen penyandi resistansi antibiotik dengan PCR, serta analisis kekerabatan isolat yang berasal dari hewan, manusia, dan lingkungan dengan sekuensing metode Sanger dan pohon filogenetik. Jumlah positif E. coli dari sampel feses 100% (24/24), air muara limbah 100% (12/12) dan swab tangan pekerja kandang 16,7% (4/24). Pola resistansi antibiotik menunjukkan pada semua isolat, resistansi tertinggi pada eritromisin, diikuti oleh amoksisillin dan ampisilin, tetrasiklin, streptomisin, trimethoprim sulfametoksazol Berdasarkan pola resistansi, sejumlah 14 isolat dikategorikan sebagai Multi Drug Resistance (MDR), yaitu resistan terhadap tiga atau lebih golongan antibiotik. Gen resistansi yang terdeteksi dari isolat E. coli resistan yaitu gen blaTEM, ampC, tetA, strA dan sul1, sedangkan ermB tidak terdeteksi. Escherichia coli penghasil ESBL tidak terdeteksi. Hasil analisis kekerabatan E. coli resistan asal manusia dan hewan, serta antar isolat hewan yang berasal dari peternakan yang sama memiliki memiliki hubungan kekerabatan yang dekat. Kolaborasi multisektoral yang melibatkan sektor kesehatan manusia, kesehatan hewan dan lingkungan hidup dipandang perlu dalam upaya pengendalian resistansi antibiotik secara nasional dan global., Antimicrobial resistance (AMR) is currently a global health problem. Inappropriate use of antibiotics triggers the existence of resistant bacteria, which can cause a decrease in the ability of antibiotic treatment in the event of bacterial infections and even treatment failure. Escherichia coli (E. coli) are Gram-negative bacteria which are both commensal and pathogenic, also are known to be resistant to several types of antibiotics. Antibiotic resistance in E. coli indicates the presence of resistant bacteria in the environment with the potential to spread. The design of this research was an exploratory study to identify resistance patterns and genes encoding antibiotic resistance in E. coli from the pig farms in Badung Regency, Bali Province, as well as analyzing the relationship between resistant E. coli bacteria originating from animals, human
Keyword: babi, Escherichia coli, gen resistansi, pola resistansi