arulpm/triplet_large huggingface dataset:
Judul: Studi kebiasaan makanan ikan belut (Monopterus albus) di Kecamatan Cibeber, Kabupaten Cianjur, Jawa Barat
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kebiasaan makanan ikan belut di areal persawahan Cisalak Kidul dan Babakan, Desa Cisalak, Kecamatan Cibeber, Kabupaten Cianjur, Jawa Barat. serta kelimpahan makanan alaminya di perairan yaitu zooplankton dan makrozoobenthos, dihubungkan dengan habitatnya yaitu kualitas air, bahan organik tanah, dan tekstur tanah yang mempengaruhi kehidupan ikan belut dan selera makannya. Kebiasaan makanan yang ingin diketahui meliputi komposisi makanan, waktu makan, dan tumpang tindih relung makanan. Penelitian ini dilakukan dua tahap, yaitu penelitian pendahuluan di areal persawahan Desa Cisalak dan areal persawahan Desa Cipetir untuk mengetahui waktu makan, dilanjutkan dengan penelitian utama di areal persawahan Cisalak Kidul (pengairan teknis, dataran rendah, dan jerami umumnya dibakar) dan areal persawahan Babakan (pengairan teknis dan sederhana, datarannya lebih tinggi dari Cisalak Kidul. dan jerami umumnya tidak dibakar) yang termasuk wilayah Desa Cisalak. Pengambilan contoh ikan belut dilakukan setelah padi dipanen, yaitu satu kali pada penelitian pendahuluan dan empat kali pada penelitian utama. Pengambilan' contoh-contoh zooplankton, makrozoobenthos, air, dan substrat dilakukan pada penelitian utama untuk mendukung kebiasaan makanan ikan belut tersebut. Dari penelitian pendahuluan didapatkan persentase tertinggi kepenuhan lambung ikan belut berdasarkan perbandingan volume makanan dengan volume lambungnya, diketahui perkiraan waktu makan ikan belut tersebut, yaitu dari jam 23.00-24.00 WIB di Desa Cisalak dan jam 21.00-22.00 WIB di Desa Cipetir. Dari analisis isi perut ikan belut pada penelitian utama diketahui bahwa, makanan ikan belut di Cisalak Kidul dan di Babakan secara umum terdiri dari Arthropoda (1 kelas), Annelida (2 kelas), Molluska (1 kelas), dan Chordata (1 kelas). Komposisi makanan ikan belut di kedua lokasi tersebut berbeda. Dari jenis-jenis makanan dan rasio panjang usus/panjang tubuh diketahui bahwa ikan belut merupakan ikan karnivor. ...
Keyword:
Judul: Gangguan Reproduksi Pada Sapi Perah Dan Hubungannya Dengan Kinerja lnseminasi Buatan Di Wilayah Jawa Barat, Jawa Tengah dan D.I Yogyakarta
Abstrak: Produktivitas ternak yang sebagian besar pada peternakan rakyat saat ini masih dihadapkan ,pada masalah rendahnya angka kelahiran, tingginya angka kematian masih ditemukannya gangguan reproduksi . Upaya peningkatan produktivitas ternak dapat dicapai melalui teknik inseminasi buatan. embrio transfer dan rekayasa genetik.
Keyword:
Judul: Pembuatan Film Stronsium Titanat Didadah Indium Oksida/Silikon (100) Melalui Metode Chemical Solution Deposition
Abstrak: Telah berhasil dibuat film stronsium titanat (SrTiO3) di atas substrat Si (100) tipe p dengan metode Chemical Solution Deposition (CSD) dengan larutan 1 M berbantuan spin coating dengan kecepatan putar 8000 rpm. Film ini di annealing dengan suhu 8500C ditahan selama 8 jam. Film stronsium titanat (SrTiO3) pada konsentrasi pendadah 0%, 2%, 4%, 6% indium oksida (In2O3) dikarakterisasi sifat optik dan struktur XRD dan diperoleh energi gap berturut-turut sebesar 2.75 eV, 2.3 eV, 2.17 eV, 2.42 eV. Struktur kristalnya berbentuk kubus dengan parameter kisi sebesar a = 3.8020 Å ; a = 3.8208 Å ; a = 3.8482 Å ; a = 3.8541 Å, dan rata-rata ukuran kristalnya sebesar 0.0702, 0.0828, 0.0679, 0.0622 dalam satuan μm.
Keyword: annealing, bandgap, SrTiO3, CSD, In2O3
Judul: Estimasi Nilai Ekonomi Air Irigasi pada Usahatani Padi Sawah di Desa Telarsari, Karawang, Jawa Barat.
Abstrak: Rice is strategic comodity for national economy in Asian countries, including Indonesia. Therefore, many farmers in Indonesia elaborate rice farming system. West Java is one of Indonesia provinces with high rice production and productivity. Karawang distric, West Java region, become the center of rice production. Rice production mainly depends on irrigation system. Irrigation system is divided into three, namely pimary, secondary, and tertiary irrigation system. Nowdays, the condition of irrigation system, especially tertiary system in Karawang distric has been damaged because of significant decrease of water supply, especially in dry season. Telarsari village is one of the villages in Karawang distric which has problem in tertiary irrigation system. The aims of this research were to estimate economic value of irrigation water in Telarsari Village, Karawang Distric, to estimate farmer’s Willingness to Pay (WTP) for recovering the tertiary irrigation system, and to analyze factors which affecting the value of farmer’s WTP of the tertiary irrigation system. The method of this research were water rent, Willingness to Pay (WTP), and multiple regresion analysis. The object for observation and interview in this research were farmers who get their irrigation water from Jatiluhur Reservoir. The result demonstrated the water rent or contribution of irrigation water was Rp 6.839.880/Ha/MT. Analysis of farmer’s willingness to pay for tertiary irrigation system recovery displayed that 100 percent of farmers respondents were agree to pay for the recovery of tertiary irrigation system. WTP’s average value of farmers respondents was Rp 143.125/Ha/MT and WTP’s total of farmer population in Telarsari village was Rp 25.171.904/MT. Other factors namely farmer’s age, the width of paddy field, and income levels significantly influenced againts farmer’s WTP value in Telarsari village.
Keyword: Willingness to Pay (WTP), water rent, irrigation system
Judul: Studi model struktur tegakan hutan alam hujan tropika dataran rendah di Bengkunat Propinsi DT I Lampung
Abstrak: Masalah pemilihan model dari beberapa famili sebaran peubah acak kontinu, merupakan materi utama yang dibahas dalam tesis ini. Famili sebaran terbaik berdasar- kan hasil pemilihan ini dipakai untuk menduga bentuk struktur tegakan hutan yang merupakan sebaran jumlah pohon per hektar (N) pada berbagai kelas diameternya (D), atau N = f (D), pada hutan alam hujan tropika dataran rendah. Sebagai contoh kasus dalam penelitian ini di ambil tegakan hutan alam pada tegakan hutan di Bengkunat, Propinsi Daerah Tingkat I Lampung dengan memakai famili sebaran eksponensial, gamma, lognormal dan bagai famili sebaran yang akan dipilih. Weibull Pemilihan semo-el famili sebaran terbaik diadakan dengan prosedur cara kemungkinan maksimum. Berdasarkan hasil penelitian diperoleh bahwa famili sebaran lognormal diduga merupakan model terbaik untuk model struktur tegakan kelompok semua jenis pohon, kelompok jenis pohon komersil dan jenis meluang, sedangkan jenis-jenis damar asam dan simpur diduga dapat didekati oleh famili sebaran gamma. Pemeriksaan lebih lanjut memberikan petunjuk adanya kesamaan hasil pendugaan terhadap beberapa macam dimensi tegakan, yaitu: kerapat- an pohon, luas bidang dasar tegakan dan volume yang diperoleh dengan memakai struktur tegakan dan dengan cara perhitungan seperti yang selama ini biasa dilakukan, yaitu dengan mencari rata-rata hitung. Demikian pula dengan hasil penilaian kelayakan penerapan sistem silvikultur Tebang Pilih Indonesia (TPI). Oleh karenanya kemungkinan penerapan pemakaian struktur tegakan dalam pendugaan dimensi-dimensi tegakan agaknya perlu ditinjau lebih lanjut, mengingat tingkat kepraktisannya yang lebih tinggi dalam pengambilan data di lapangan dibandingkan dengan cara yang selama ini dilakukan. ..
Keyword:
Judul: Pemanfaatan Fly Ash Batu Bara sebagai Adsorben dalam Penyisihan COD dari Limbah Cair Domestik UP Suralaya
Abstrak: Fly ash yang dihasilkan oleh PT Indonesia Power Unit Pembangkitan Suralaya (UP Suralaya) pada tahun 2010 sebesar ± 400000 ton per tahun. Menurut peraturan yang berlaku, fly ash tergolong limbah B3 dengan kode limbah B409. Oleh karena itu diperlukan suatu kegiatan pemanfaatan untuk mengurangi dampak negatif dari limbah tersebut. Salah satu alternatif pemanfaatan fly ash yaitu sebagai adsorben polutan limbah cair. Penelitian ini bertujuan menganalisis pengaruh bobot fly ash, kecepatan pengadukan, dan waktu kontak adsorben pada saat pengujian terhadap kadar/konsentrasi COD serta menentukan kapasitas adsorpsi dan removal efficiency terhadap limbah cair domestik. Pengujian dilakukan pada berbagai berat fly ash, waktu kontak dan kecepatan pengadukan. Penurunan konsentrasi COD paling efektif adalah dengan pemanfaatan fly ash sebanyak 0.5 gram dengan waktu kontak 90 menit dan kecepatan pengadukan 150 rpm. Kapasitas adsorpsi dan removal efficiency terbaik dalam penyisihan COD dengan variasi berat fly ash, waktu kontak dan kecepatan pengujian mencapai 0.0467 mg/g dan 68.7 %.
Keyword: kapasitas adsorpsi, kecepatan pengadukan, removal efficiency, waktu kontak
Judul: Analisis gen B11 pada Padi Mutan Hawara Bunar Sensitif Aluminium
Abstrak: Toleransi Aluminium (Al) pada tanaman dapat dikendalikan oleh satu atau beberapa gen. Gen B11 telah berhasil diisolasi dari padi cv Hawara Bunar yang toleran Al, tetapi perannya terhadap cekaman Al belum sepenuhnya dipahami. Mutan Hawara Bunar sensitif Al telah dihasilkan, namun penyebab respon sensitif terhadap Al belum diketahui. Oleh karena itu penelitian ini bertujuan menganalisis urutan nukleotida promotor dan gen B11 yang diisolasi dari padi mutan Hawara Bunar sensitif Al (M5) dan tipe liar Hawara Bunar (HB). Tahapan analisis promotor terdiri dari beberapa tahap, yaitu: seleksi Eschericia coli pembawa pENTR/D-TOPO rekombinan promotor gen B11, isolasi plasmid, verifikasi arah orientasi sisipan, dan perunutan nukleotida. Tahap analisis gen B11, terdiri dari: isolasi DNA padi M5, PCR gen B11, elusi hasil PCR, kloning gen B11 pada pGEM-T Easy, transformasi E. coli TOP10 dengan plasmid rekombinan, dan perunutan nukleotida. Analisis promotor menunjukkan bahwa tidak terdapat perbedaan urutan nukleotida pada daerah upstream 1132 pb dari situs awal transkripsi gen B11 antara padi M5 dengan tipe liarnya. Urutan nukleotida gen B11 antara padi M5 dan tipe liarnya sepanjang 2024 pb hanya memiliki perbedaan nukleotida pada posisi ke-409 dan 1368 yang merupakan daerah intron. Oleh karena itu, perbedaan toleransi Al antara padi M5 dengan tipe liarnya tidak disebabkan oleh perbedaan urutan nukleotida baik pada promotor maupun gen B11.
Keyword: Promoter, B11 gene, Rice, Aluminum sensitive mutan, Hawara Bunar, Seleksi E.coli pembawa, Seleksi koloni pembawa, Isolasi DNA, Kloning gen BII, Analisis promotor Gen BII, Analisis Bioinformatika Ge BII
Judul: Evaluasi energi ransum berkomponen dasar jerami padi dengan berbagai kadar protein pada kerbau
Abstrak: Penelitian ini dilakukan di Jurusan Ilmu Nutrisi dan Makanan Ternak, Fakultas Peternakan, Institut Pertanian Bogor, mulai bulan Oktober sampai dengan bulan Desember, 1984. Tujuannya adalah mengevaluasi energi ransum yang berkomponen dasar jerami padi dengan berbagai kadar protein pada kerbau lumpur (Bubalus bubalis). Pada penelitian ini digunakan 4 ekor kerbau lumpur be- tina dengan bobot badan rata-rata 264.5 ± 34.85 kg dengan menggunakan rancangan percobaan Bujur Sangkar Latin (BSL) 4 x 4. Bahan yang digunakan untuk menyusun ransum terdiri atas jerami padi, rumput lapang, pupuk urea, lemak hewan, bungkil kedele, lamtoro, dedak padi, onggok, garam, premix, dikalsiumfosfat dan sulfur. Kansum diberikan dalam bentuk mash dengan kadar protein 5.96, 12.12, 17.05 dan 22.79 per- sen dan isokalori. Parameter yang diukur adalah Konsumsi energi, energi feses, energi tercerna, energi urine, energi gas methan, energi tercerna, TDN dan perkiraan energi termetabolisme dari nilai energi tercerna. Uji Sidik Ragam digunakan untuk melihat pengaruh per- lakuan, sedangkan uji Ortogonal digunakan untuk melihat hubungan antara perlakuan dengan parameter yang diukur, serta uji Jarak Duncan untuk melihat perbedaan antara per- lakuan. Hasil penelitian menunjukkan bahwa kadar protein ran- sum berpengaruh nyata (F<0.01) terhadap konsumsi energi ransum dengan persamaan Y-89.5 64.4679X 1.9125X (г = 0.9963). Kadar protein juga mempengaruhi energi yang keluar melalui feses (P <0.01) dengan persamaan Y-32.1457 + 25.9121X - 0.7712X (r = 0.9854). Kadar protein juga mempengaruhi energi tercerna (P<0.01) dan energi termeta- turut: Y-57.3798 38.5579X1.1414X (r 0.9684) dan Y-49.7982 32.8937X 0.9796X(r = 0.9589). Energi bolisme (P<0.01) dengan persamaan masing-masing berturut- urine dipengaruhi (P<0.05) oleh kadar protein dalam ran- sum secara linear dengan persamaan Y 1.0521 + 0.2543X (r=0.9867). Energi gas methan juga secara nyata (P<0.01) dipengaruhi oleh kadar protein dalam ransum, dengan per- samaan Y-7.1629 5.1555X 0.1529X (r = 0.9956). TDN dipengaruhi oleh kadar protein secara nyata (P<0.01) dengan persamaan Y 56.1839 + 1.8249X - 0.0548X(r = 0.984)....
Keyword:
Judul: Penentuan Faktor-Faktor yang Memengaruhi Penyebaran Malaria di Indonesia dengan Spasial Regime
Abstrak: Malaria merupakan penyakit menular yang disebabkan oleh parasit Plasmodium dan ditularkan melalui nyamuk Anopheles betina infektif. Morbiditas malaria pada suatu wilayah ditentukan dengan Annual Parasite Incidence (API) per tahun. Indonesia merupakan salah satu negara dengan jumlah kasus malaria tertinggi. Suatu wilayah dengan kasus malaria tinggi akan menyebarkan malaria ke wilayah lainnya. Hal ini mengindikasikan adanya unsur spasial dalam penyebaran malaria di berbagai daerah. Model regresi terboboti geografis (RTG) dapat digunakan untuk memodelkan keragaman spasial. Koefisien RTG bersifat lokal yaitu setiap kota/kabupaten mempunyai koefisien yang berbeda-beda. Peringkasan koefisien RTG dapat dilakukan dengan penggerombolan nilai koefisien atau taraf nyata uji (nilai-p). Metode ini dikenal dengan spasial regime. Pada setiap regime akan ditentukan model regresinya. Tujuan dari penelitian ini adalah menentukan model spasial regime dengan metode analisis gerombol dan menentukan faktorfaktor yang berpengaruh terhadap penyebaran malaria di Indonesia pada tahun 2017 untuk setiap regime. Data yang digunakan dalam penelitian ini adalah data hasil Passive Case Detection (PCD) malaria dari Puskesmas di seluruh Indonesia sepanjang tahun 2017. Hasil dari penelitian ini menunjukkan bahwa slide positivity rate dan annual blood examination adalah peubah yang memengaruhi angka API di seluruh kota/kabupaten di Indonesia. Selain itu, wilayah dengan angka API rendah juga dipengaruhi oleh seluruh peubah yang digunakan pada penelitian ini. Wilayah dengan API tinggi dipengaruhi juga oleh peubah jumlah kasus positif pada anak usia 2-14 tahun.
Keyword: malaria, Annual Parasite Incidence, spatial regimes
Judul: Sifat-sifat dasar sortimen A II kayu jati (Tectona grandis Linn.f) di Perum Perhutani Unit III Jawa Barat
Abstrak: Kayu jati tergolong kayu mewah. Kayu ini merupakan salah satu jenis kayu yang banyak diminati oleh konsumen. Golongan kayu jati dari Jawa Barat yang banyak dikonsumsi oleh masyarakat adalah golongan sortimen A II, yaitu kayu bulat kecil jati yang berdiameter 20-29 cm (Lap. Biro Pemasaran Perum Perhutani Unit III Jawa Barat, 1993). Sifat dan kualitas kayu dipengaruhi juga oleh kualitas tempat tumbuh dan iklim (Poerwokoesoemo, 1956). Hal ini juga berlaku untuk kayu jati. Ada kemungkinan kualitas dan sifat kayu jati Jawa Barat berbeda dibanding jati dari daerah Jawa Tengah atau Jawa Timur, karena daerah Jawa Barat relatif lebih subur dengan curah hujan dan kelemba- ban yang lebih tinggi. Sehingga pada umur 40 tahun diameter tegakan jati Jawa Barat sudah menyamai besar diameter tegakan jati Jawa Tengah dan Jawa Timur yang umumnya berkisar 60-80 tahun (Anonymous, 1976). Akibat perbedaan tersebut maka tegakan jati di Jawa Barat tumbuh lebih cepat. Menurut Haygreen dan Bowyer (1989) dan Widarmana (1990) bahwa pertumbuhan yang cepat akan merubah komponen kimia, sifat anatomi, fisis dan mekanis yang dihasilkan. Untuk penggunaan tertentu perubahan sifat kayu ini dapat menguntungkan. Adanya perubahan sifat kayu akibat pertumbuhan yang lebih cepat perlu diketahui agar diperoleh keterangan yang berguna dalam penggunannya, yang pada akhirnya diharapkan dapat meningkatkan nilai ekonomisnya. PB Unive Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui karakteristik sortimen A II kayu jati Jawa Barat meliputi karakteristik makroskopis, sifat anatomi, fisis dan mekanis. Sifat makroskopis yang diteliti adalah persentase kayu gubal dan kayu teras, bentuk, ukuran dan jumlah mata kayu, taper serta lebar riap tumbuh. Sifat anatomi untuk mengetahui dimensi sel serabut dan sel pembuluh. Sifat fisis yang diteliti adalah berat jenis, kadar air dan penyusutan. Sifat mekanis yang diteliti adalah keteguhan lentur statis, keteguhan tekan sejajar serat, keteguhan tarik sejajar serat, keteguhan tarik tegak lurus serat dan kekerasan sisi. Bahan yang digunakan dalam penelitian ini adalah sortimen A II kayu jati yang berasal dari tebangan penjarangan dan tebangan akhir dari tiga KPH, yaitu KPH Cian- jur, KPH Ciamis dan KPH Indramayu. Pengujian sifat anatomi dengan sediaan maserasi dan sediaan mikrotom. Pengujian sifat fisis dan mekanis dengan metode British Standar 373:1957. Analisis data yang digunakan adalah Pemban- dingan Dua Nilai Tengah dengan kriteria Uji F.
Keyword:
Judul: Evaluation of green city concept implementation in Surabaya
Abstrak: Pertumbuhan suatu kota diiringi oleh perkembangan ekonomi, sosial, dan ekologi. Perlu adanya keseimbangan terhadap pertumbuhan antar aspek demi menciptakan perkembangan kota yang modern, ramah lingkungan, dan berkelanjutan. Kota Surabaya merupakan kota terbesar kedua di Indonesia, dan berhasil meraih banyak penghargaan yang bertemakan lingkungan seperti diantaranya penghargaan Adipura, Adiwiyata, Taman Kota Terbaik, dan lain sebagainya. Permasalahan umum yang dihadapi oleh kota Surabaya diantaranya sampah, krisis energi, degradasi lingkungan dan pemukiman kumuh. Tujuan dalam penelitian ini adalah memberi penilaian terhadap kinerja Kota Surabaya atas usahanya menerapkan konsep Kota Hijau dengan melihat peran pemerintah, pihak swasta, dan masyarakat. Penelitian ini menggunkan metode Asian Green City Index, yang memiliki delapan kategori evaluasi kinerja kota dalam menerapkan konsep Kota Hijau yaitu Energy and CO2, Land use and Buildings, Transport, Waste, Water, Sanitation, Air Quality, dan Environmental Governance. Hasil evaluasi menunjukan bahwa Kota Surabaya dalam menerapkan konsep Kota Hijau masuk kedalam kategori performa rata-rata dengan nilai rata-rata persentase sebesar 65.5% dan tingkat Index of Happiness masyarakat kota 70% sangat bahagia, 25% bahagia, dan 5% kurang bahagia., The growth of a city is accompanied by development of economy, social, and ecology. A balanced between the growth of urban development aspects is needed in creating a modern, environmental friendly, and sustainable city. Surabaya is the second largest city in Indonesia, and has won many awards with enviromental concept such as Adipura, Adiwiyata, Taman Kota Terbaik etc. The common problems of large cities such as waste, energy crisis, environmental degradation, and urban sprawl. The purpose of this study is to assess the performance of Surabaya City for its efforts to implement the Green City concept by looking at the role of the government, private sector, and community. This research was using the Asian Green City Index as the method which has eight categories of performance evaluation of the city in applying the concept of Green City: Energy and CO2, Land use and Buildings, Transport, Waste, Water, Sanitation, Water Quality, and Environmental Governance. The evaluation results show that in applying the concept of the Green City, Surabaya City is in above average rank, based on the category performance with an average persentase 65.5%, moreover the level Surabaya’s society happiness based on the Index of Happiness is 70% very happy, 25% happy, and 5% less happy.
Keyword: asian green city, berkelanjutan, evaluasi, index of happiness, kota hijau, modern
Judul: Success Rate of Artificial Insemination in Sentul Chicken at Warso Unggul Gemilang Breeding Farm
Abstrak: Peningkatan permintaan hasil produksi ayam kampung (daging dan telur) tidak sebanding dengan ketersediaannya di pasar. Ayam sentul adalah jenis ayam lokal yang dapat manfaatkan sebagai sumber daging maupun telur. Warso Unggul Gemilang adalah pelaku usaha peternakan yang mengembangkan bibit ternak ayam sentul dengan menerapkan sistem inseminasi buatan (IB). IB memiliki tingkat keberhasilan yang lebih tinggi bila dibandingkan dengan perkawinan alami. Penerapan IB dapat meningkatkan fertilitas pada telur yang dihasilkan, sehingga kemungkinan jumlah anak ayam atau DOC (day-old chicken) pun semakin meningkat. IB juga memungkinkan adanya seleksi dan persilangan antar-induk yang unggul secara genetik, sehingga peternakan dapat memperoleh hasil anak ayam yang unggul. Sebagai peternakan yang cukup besar dan dikembangkan dengan sistem intensif, Warso Unggul Gemilang dapat menjadi percontohan peternakan ayam lokal yang sukses dengan program IB-nya. Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari tingkat keberhasilan IB yang dilakukan pada ayam lokal jenis sentul di peternakan Warso Unggul Gemilang. Penelitian ini merupakan penelitian noneksperimental. Data diperoleh dari survei peternakan dan dari pihak pengelola peternakan berupa data candling (penerawangan) telur tetas pada tahun 2019. Data yang diamati pada dasarnya meliputi kondisi umum peternakan, proses pelaksanaan IB, dan tingkat fertilitas. Fertilitas telur yang dihasilkan pada peternakan Warso Unggul Gemilang yaitu 87,11%, dengan pendugaan paramater rata-rata sebesar 86,73 ≤ µ ≤ 87,49.
Keyword: artificial insemination, fertility rate, sentul chicken
Judul: Prediction of Anti-inflammatory Compounds in Okra Pods (Abelmoschus esculentus L.) in Inhibition of Cyclooxygenase-2
Abstrak: Siklooksigenase-2 (COX-2) mengkatalisis pengubahan asam arakidonat menjadi senyawa mediator inflamasi, seperti prostaglandin (PG). Buah okra memiliki aktivitas antiinflamasi berdasarkan studi in vitro dan in vivo, namun belum diketahui senyawanya yang dapat menginhibisi COX-2. Penelitian ini bertujuan memprediksi aktivitas antiinflamasi senyawa aktif buah okra yang dapat menghambat COX-2 berdasarkan interaksinya dengan residu asam amino sisi aktif, katalitik dan selektif. Perangkat lunak YASARA Structure digunakan untuk penambatan molekuler, sementara Discovery Studio Visualizer dan Pymol digunakan untuk analisis interaksi ligan-reseptor. Penambatan dilakukan pada ukuran gridbox 2,0 Å. Penapisan virtual menghasilkan 16 senyawa aktif buah okra hasil studi pustaka menghambat COX-2 dengan nilai energi bebas pengikatan (ΔG) di atas -6,0 kkal/mol. Hasil ini masih lebih rendah dari asam mefenamat sebagai ligan eksperimental. Kuersetin dan α-cubebene paling potensial menghambat COX-2, dengan nilai ΔG -7,887 dan -7,502 kkal/mol serta Ki 1,63 dan 3,13 μM, namun kelimpahannya rendah di buah okra. Senyawa yang paling melimpah adalah kuersetin-3-O-glukosida (-6,668 kkal/mol), berinteraksi selektif dengan His90, Val523 dan Arg513, sama halnya dengan celecoxib sebagai ligan pembanding., Cyclooxygenase-2 (COX-2) catalyzes the conversion of arachidonic acid into inflammatory mediator compounds, such as prostaglandins (PG). Okra pods has anti-inflammatory activity based on in vitro and in vivo studies, but the compounds that can inhibit COX-2 is not yet known. This study aimed to predict the anti-inflammatory activity of the active compounds of okra pods as COX-2 inhibitor based on their interactions with amino acid residues on the active, catalytic and selective sites. YASARA Structure software was used for molecular docking, while Discovery Studio Visualizer and Pymol were used for ligand-receptor interaction analysis. Molecular docking is done on a gridbox size of 2.0 Å. Virtual screening resulted in 16 active compounds of okra pods from literature study inhibiting COX-2 with binding free energy (ΔG) values above -6.0 kcal/mol. These values is still lower than mefenamic acid as an experimental ligand. Quercetin and α-cubebene were the most potent to inhibit COX-2, with ΔG -7.887 and -7.502 kcal/mol and Ki 1.63 and 3.13 μM, however their abundance was low in okra. The most abundant compound was quercetin-3-O-glucoside (-6,668 kcal/mol) and selectively bind to His90, Val523 and Arg513, similar to celecoxib as a reference ligand.
Keyword: anti-inflammation, COX-2, molecular docking, okra pods, selective