Judul: IPB (Bogor Agricultural University), Selection and Application of Probiotics in Tilapia (Oreochromis niloticus) through Approach One Health
Abstrak: Probiotik merupakan mikroorganisme hidup tidak patogen yang dapat memberikan keuntungan pada inang dan lingkungannya. Mikroorganisme yang banyak dimanfaatkan sebagai probiotik adalah dari golongan bakteri. Bakteri probiotik umum digunakan dalam budi daya ikan yang diberikan melalui pakan dan air budi daya. Pada penelitian ini bakteri probiotik diisolasi dari saluran cerna ikan nila. Seleksi kandidat bakteri probiotik dilakukan dengan cara menyeleksi bakteri sebagai penghasil enzim pencernaan dan penghasil antibakteri. Adanya masalah resistansi antibiotik pada bakteri menjadikan bakteri probiotik tidak aman untuk digunakan sebagai probiotik karena dapat berpotensi resistan terhadap antibiotik dan membawa gen resistan antibiotik. Penyebaran bakteri resistan dan gen resistan dari bakteri ke bakteri lainnya akan berakibat pada penyebarannya di lingkungan budi daya. Adanya peranan elemen genetik gerak, mobile genetic elements (MGEs) menjadikan bakteri dapat mentrasfer gen resistan antibiotik ke bakteri lainnya. Keberadaaan bakteri resistan antibiotik dapat menjadikan masalah pada berbagai sektor yang mencakup kesehatan hewan, lingkungan dan manusia (One health). Penyakit yang disebabkan oleh bakteri resistan sangat sukar untuk diobati dengan menggunakan antibiotik, sehingga akan berisiko tinggi terhadap kesehatan hewan, manusia dan lingkungan. Penggunaan probiotik yang mengandung bakteri resistan dan gen resistan antibiotik juga akan mempengaruhi terhadap kesehatan hasil produk perikanan. Produk hasil perikanan yang membawa bakteri resistan dan gen resistan dapat berpotensi mempengaruhi kesehatan manusia dan lingkungan. Tujuan umum penelitian ini adalah mendapatkan bakteri sebagai kandidat probiotik yang tidak bersifat resistan dan tidak membawa gen resistan antibiotik tertentu, serta evaluasi kinerjanya dengan cara in vivo menggunakan ikan nila. Penelitian pertama bertujuan untuk mendapatkan koleksi bakteri kandidat probiotik. Bakteri hasil koleksi dikarakterisasi sebagai penghasil enzim pencernaan protease, lipase, amilase dan selulase dengan menggunakan metode disk diffusion. Selain itu, bakteri sebagai kandidat probiotik dikarakterisasi sebagai penghasil antibakteri yang dapat menghambat pertumbuhan bakteri Streptococcus agalactiae, Streptococcus iniae dan Aeromonas hydrohila menggunakan metode disk diffusion pada media agar dan metode kultur bersama dalam media cair. Karakterisasi pola hemolitik menggunakan media agar darah. Hasil penelitian menunjukkan sebanyak 465 isolat bakteri diisolasi dari saluran cerna ikan nila dari beberapa daerah yaitu Sukabumi, Ciamis, Serang, Banjarnegara, Banyumas, Jayapura, Sorong, Manokwari Selatan, Takalar, Lampung, Batam dan Mandiangin. Hasil isolat bakteri sebagai kandidat probiotik dibagi menjadi dua kelompok berdasarkan bentuk sel bakteri. Sebanyak 459 koleksi isolat bakteri yang didapatkan dengan bentuk sel basil dan 6 isolat bakteri bentuk sel kokus. Sejumlah 29,84% (137/459) diidentifikasi dapat menghasilkan enzim pencernaan. Sampel 15,32% (21/137) isolat bakteri dapat menghasilkan enzim pencernaan dan dapat menghambat pertumbuhan bakteri Streptococcus agalactiae dan Streptococcus iniae. Isolat bakteri bentuk sel kokus diidentifikasi memiliki potensi dapat menghambat pertumbuhan bakteri Streptococcus agalactiae, Streptococcus iniae dan Aeromonas hydrophila. Bakteri sebagai kandidat probiotik yang memiliki pola hemolitik g diambil sebagai kandidat probiotik. Penelitian kedua bertujuan mengidentifikasi secara fenotipe dan genotipe isolat bakteri menggunakan primer 16S RNA, mengidentifikasi genom lengkap, mengidentifikasi komposisi sekuen G~C dan menganalisis sifat permukaan sel bakteri. Karakterisasi sifat hidrofobik permukaan sel bakteri menggunakan metode uji agregasi garam, uji spontan agregasi, uji otomatis agregasi, uji agregasi bakteri menggunakan n-hexadecane, serta uji kepatuhan bakteri terhadap bahan polistiren. Selain itu sifat permukaan sel bakteri juga dilakukan dengan metode uji pertumbuhan bakteri dalam media soft agar. sekuen dan memiliki pola pertumbuhan kompak dalam media
Keyword: antibiotik, gen resistan, ikan nila, one health, probiotik, antibiotic, gene resistance, one health, probiotic, tilapia