Judul: Bakteriofaga Khusus Escherichia coli yang Diisolasi dari Berbagai Contoh Air di Bogor Tengah, Kota Bogor
Abstrak: Keberadaan jasad renik yang sudah tahan terhadap anti jasad renik (antimicrobial resistance, AMR) merupakan ancaman serius dalam dunia kesehatan. Escherichia coli diketahui telah tahan terhadap beberapa anti jasad renik seperti sefalosporin dan fluorokuinolon. Bakteri E. coli dapat menyebabkan masalah serius. Penggunaan faga dalam terapi penyakit yang disebabkan oleh bakteri patogen dinilai cukup menjanjikan karena memiliki kepekaan dan kekhususan yang bagus dibandingkan dengan antibiotika. Tujuan Penelitian adalah mengisolasi E. coli dan mendapatkan faga khusus E. coli serta mencirikan faga yang diperoleh dari beberapa sumber air di Bogor Tengah, Kota Bogor. Contoh air diambil dari tiga titik yang berbeda di Sungai Ciliwung, satu titik air minum hewan, satu titik air ikan hidup dan satu titik air celupan daging di Pasar Merdeka Kota Bogor. Bakteri inang diisolasi terlebih dahulu untuk mendapatkan biakan murni menciri E. coli. Kemudian dilakukan isolasi faga, uji plak, penyimpanan faga, uji bercak, mengukur kadar dan berat molekul protein faga. Bakteri yang diduga E. coli diperoleh dari enam contoh air yang diambil berdasarkan karakter pertumbuhan pada Eosine Methylene Blue Agar (EMBA), Mac Conkey Agar (MCA), pewarnaan Gram, dan Uji IMViC. Faga berhasil diperoleh dari satu isolat bakteri asal air celupan daging dari Pasar Merdeka Kota Bogor dengan kadar sebesar 9,1 x 108 pfu/ml dan tidak ditemukan pada contoh air lainnya. Hasil pemeriksaan menggunakan Analytical Profile Index 20 Enterobacteriaceae (API 20E) menunjukkan kemungkinan besar bakteri inangnnya adalah E. coli (89,5%, low discrimination). Namun demikian, uji lanjutan masih diperlukan untuk mempertegas identitas bakteri inang. Pengujian kisaran inang faga terisolasi menggunakan teknik uji bercak menunjukkan bahwa faga hanya mampu melisis sel bakteri inangnya saja, dan tidak menunjukkan aktivitas litik pada sel bakteri Salmonella, maupun pada lima isolat diduga E. coli yang diperoleh dari penelitian ini, serta pada satu isolat arsip yang menunjukkan persentase rendah sebagai E. coli (37,6%, low discrimination). Bahkan faga terisolasi juga tidak melisiskan bakteri isolat arsip yang telah terkonfirmasi sebagai E. coli dengan API 20E (95%, good identification). Selanjutnya, analisis protein faga dilakukan menggunakan teknik Bradford untuk menghitung kadar protein dan menggunakan teknik Sodium Dodecyl Sulphate–Polyacrylamide Gel Electrophoresis (SDS-PAGE) untuk menentukan berat molekul protein penyusunnya. Hasil menunjukkan faga terisolasi mempunyai kadar protein sebesar 11 µg/ml, namun pada pemeriksaan penentuan berat molekulnya belum membuahkan hasil yang meyakinkan. Pita protein yang diduga asal faga dengan kisaran berat molekul 45 kDa dan 60 kDa terlihat samar-samar, dan menjadi tidak muncul pada pengulangan kedua dan ketiga. Dapat disimpulkan bahwa faga terisolasi memiliki kisaran inang yang sempit, yaitu hanya mampu melisiskan bakteri inang yang diduga kuat adalah E. coli. Upaya pengayaan dan pemurnian stok faga sangat penting dilakukan untuk memiliki jumlah stok faga yang melimpah sehingga dapat digunakan pada berbagai pengujian untuk mengetahui karakteristik dan identitas faga terisolasi tersebut. Kata kunci: analisis protein, Escherichia coli, faga, kisaran inang, tahan terhadap anti jasad renik, The existence of antimicrobials resistant microorganisms is a serious problem in the world. Escherichia coli is known to be resistant to several antibiotics, such as cephalosporin and fluoroquinolones. One of the important bacteria is Escherichia coli. The use of phaga in the therapy of diseases caused by pathogenic bacteria is considered quite promising because
Keyword: antimicrobial resistance, Escherichia coli, host range, phage, protein analysis