arulpm/triplet_large huggingface dataset:
Judul: Suplementasi Sericin pada Media Koleksi dan/atau Maturasi In Vitro untuk Meningkatkan Kualitas Oosit Sapi
Abstrak: Kualitas oosit menjadi salah satu faktor penting dalam produksi embrio secara in vitro (IVEP). Kualitas oosit yang dimatangkan secara in vitro dilaporkan tidak sebaik in vivo. Hal tersebut berhubungan dengan stres pada oosit yang terjadi selama proses IVEP. Ovarium yang dikoleksi dari rumah potong hewan sudah terhenti aliran darahnya, sehingga mengakibatkan kondisi iskemia. Dalam keadaan iskemia, reoksigenasi akan membentuk radikal oksigen yang bersifat toksik. Selain itu, oosit sangat sensitif terhadap perubahan lingkungan selama maturasi in vitro, terutama akibat perbedaan kadar oksigen. Perbedaan lingkungan tersebut juga mengakibatkan kejadian stres oksidatif. Kejadian stres oksidatif pada sel mengakibatkan gangguan pada sel dan berakhir pada kematian sel. Sericin merupakan kelompok protein globular larut air yang diproduksi oleh ulat sutera Bombyx mori bagian kepompong. Sericin banyak mengandung serin yang tergolong dalam kelompok asam amino hidroksil. Komponen tersebut memiliki aksi antioksidan. Aksi antioksidan dari kelompok tersebut dilakukan dengan cara mengkelat elemen logam seperti besi dan tembaga. Sericin sebagai antioksidan mampu menekan peroksidasi lipid dan menurunkan level H2O2 yang menginduksi kejadian stres oksidatif. Selain itu, sericin sebagai bahan substitusi dari BSA mampu meningkatkan hyaluronan dan mempercepat ekspresi CD44 mRNA pada oosit, sehingga dapat meningkatkan pematangan inti oosit. Penelitian ini bertujuan untuk mengkaji suplementasi sericin pada media koleksi dan/atau maturasi in vitro terhadap tingkat pematangan inti dan DNA fragmentasi oosit sapi. Penelitian ini dibagi menjadi dua tahapan, tahap pertama bertujuan untuk mengevaluasi tingkat pematangan inti oosit yang disuplementasi sericin pada medium koleksi dengan konsentrasi 0.1%, 0.5%, 1% dan kontrol (tanpa sericin). Penelitian berikutnya dilakukan untuk mengevaluasi tingkat pematangan inti dan fragmentasi DNA dari oosit yang dikoleksi dengan atau tanpa sericin 0.1% dan dimaturasi dengan atau tanpa sericin 0.1%. Oosit yang telah termaturasi kemudian diwarnai dengan terminal deoxynucleotidyl transferase (TdT) dUTP nick-end labeling (TUNEL) dan Hoechst 33342. Kemudian status inti dan tingkat fragmentasi DNA dievaluasi menggunakan Zeiss Confocal Laser Scanning Microscope 710. Hasil penelitian pertama menunjukkan bahwa persentasi oosit pada kelompok ser 0.1% mencapai tahap metafase II (MII) lebih tinggi secara signifikan jika dibandingkan dengan kontrol (P<0.05). Pada penelitian berikutnya, kelompok Ser 0.1%; +BSA+Ser 0.1% memiliki persentasi pematangan inti tertinggi jika dibandingkan kelompok kontrol (P<0.05). Tingkat fragmentasi DNA oosit sapi terlihat tidak berbeda secara signifikan pada semua perlakuan (P>0.05). Penelitian ini dapat disimpulkan bahwa suplementasi 0.1% sericin pada medium koleksi mampu meningkatkan pematangan inti oosit sapi, namun tidak berpengaruh terhadap tingkat fragmentasi DNA.
Keyword: in vitro, koleksi, maturasi, oosit, sapi, sericin
Judul: Application of Seedball Chitosan-AA-NPK-microfertilizers for the Growth of Sengon (Falcataria falcata L.) and Nyamplung (Calophyllum  inophyllum L.) on Tenjolaya Mineral Soil
Abstrak: Pemulihan lahan kritis dapat dilakukan melalui pemilihan jenis tanaman adaptif seperti sengon (Falcataria falcata) dan nyamplung (Calophyllum inophyllum), pemberian pupuk dari limbah kelapa sawit (LKS), dan teknik seedball. Tujuan penelitian ini adalah membuat formula pupuk kitosan (CS)-asam asetat (AA)-NPK-microfertilizers berbasis limbah kelapa sawit, serta menganalisis aplikasi seedball untuk pertumbuhan sengon dan nyamplung pada tanah mineral di Kecamatan Tenjolaya. Microfertilizers yang terdiri atas CS-AA-NPK-mikro lignoselulosa (ML), CS-AA-NPK-mikro-kristalin selulosa (MK), CS-AA-NPK-mikro-karbon teraktivasi (MT), CS-AA-NPK- mikro-karbon non teraktivasi (MNT), CS-AA-NPK, dan kontrol dengan taraf 1%, 3%, 5%, dan 7%. Rancangan percobaan pertumbuhan menggunakan Rancangan Acak Lengkap Faktorial dengan 3 faktor yaitu formula pupuk, taraf pupuk, dan jenis tanaman. Hasil penelitian menunjukkan jenis tanaman, interaksi formula dengan taraf pupuk, interaksi formula dengan jenis tanaman, dan interaksi ketiga faktor berpengaruh nyata pada semua variabel pertumbuhan, sedangkan faktor lain berpengaruh nyata pada sebagian variabel pertumbuhan. Hasil terbaik pada nyamplung adalah CS-AA-NPK-MNT1%, sedangkan pada sengon adalah CS-AA-NPK-ML3%., Restoration of critical land can be done through the selection of adaptive plant species such as sengon (Falcataria falcata) and nyamplung (Calophyllum inophyllum), fertilizers from palm oil waste (LKS), and seedball techniques. The purpose of this research is to make a chitosan (CS)-acetic acid (AA)-NPK-microfertilizers formula based on palm oil waste, and analyze the application of seedball for the growth of sengon and nyamplung on mineral soil in Tenjolaya District. Microfertilizers consisting of CS-AA-NPK-micro lignocellulose (ML), CS-AA-NPK-micro-crystalline cellulose (MK), CS-AA-NPK-micro-activated carbon (MT), CS-AA-NPK-non-activated micro-carbon (MNT), CS-AA-NPK, and control with levels of 1%, 3%, 5%, and 7%. The design of the growth experiment used a Factorial Completely Randomized Design with 3 factors, namely fertilizer formula, fertilizer level, and plant type. The results showed that the type of plant, the interaction of the formula with the level, the interaction of the formula with the type of plant, and the interaction of the three factors had a significant effect on all growth variables, while other factors had a significant effect on some growth variables. The best result on nyamplung is CS-AA-NPK-MNT1%, while on sengon is CS-AA-NPK-ML3%.
Keyword: critical land, rehabilitation, adaptive plants
Judul: Struktur Komunitas Moluska (Gastropoda dan Bivalvia) Serta Distribusinya Di Pulau Burung dan Pulau Tikus, Gugusan Pulau Pari,  Kepulauan Seribu
Abstrak: Laut yang mengelilingi pulau Burung dan pulau Tikus merupakan laut dangkal yang memiliki substrat bervariasi di antaranya adalah substrat lumpur, lumpur berpasir, pasir maupun batu karang. Terdapat juga berbagai jenis habitat, di antaranya mangrove, padang lamun dan terumbu karang. Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari struktur komunitas moluska serta distribusinya yang berada di perairan Pulau Burung dan Pulau Tikus. Penelitian dilaksanakan pada bulan Juni 2007. Pengamatan dilakukan pada 5 stasiun pengamatan. Pengambilan contoh moluska didapat dengan metode transek kuadrat yang dimulai dari tepi pantai ke arah tubir. Selama pengamatan berhasil ditemukan sebanyak 47 jenis yang terdiri dari 24 jenis Gastropoda dan 23 jenis Bivalvia. Nilai keanekaragaman jenis (H’) berkisar antara 1.454 – 3.606, nilai indeks keseragaman berkisar antara 0.641 – 0.921, nilai dominansi (C) berkisar antara 0.11 – 0.46. dan nilai kemiripan jenis berkisar antara 0 – 0.40.
Keyword:
Judul: Efek Pemberian Mikoriza dan Pembenah Tanah terhadap Produksi Leguminosa pada Media Tailing Liat Dari Pasca Penambangan Timah
Abstrak: Tailing adalah limbah ekstraksi bijih tambang yang menumpuk di lahan pasca penambangan yang memiliki sifat fisik, kimia, biologis dan nutrisi yang sangat rendah sehingga dapat menurunkan produktivitas lahan dan menghambat pertumbuhan tanaman. Hal tersebut perlu diatasi dengan melakukan usaha rehabilitasi agar dampaknya tidak berlanjut. Salah satu upaya tersebut adalah pemberian top soil (tanah lapisan atas) dan pembenah tanah berupa humega. Humega merupakan produk pembenah tanah konsentrat yeng mengandung bahan organik dan asam humik. Upaya lainnya adalah revegetasi dengan menanam vegetasi pionir yang dapat tumbuh pada kondisi marginal, menjaga kesuburan tanah dan merupakan tanaman penutup tanah yang dapat mengkonservasi tanah. Vegetasi yang cocok tersebut adalah dari famili leguminosa. Agar tanaman tumbuh cepat, sehat dan berproduksi lebih banyak maka usaha pemberian CMA (Cendawan Mikoriza Arbuskula) dirasakan perlu untuk hal tersebut karena mikoriza merupakan asosiasi simbiotik bersifat mutualistik antara cendawan dengan perakaran tanaman yang membantu tanaman dalam pengambilan unsur hara dan melindungi tanaman dari serangan patogen akar. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui interaksi faktor mikoriza dan faktor pembenah tanah terhadap produksi tanaman Pueraria javanica, Centrosema pubescens, dan Calopogonium mucunoides yang ditanam pada tailing liat dari pasca penambangan timah dan mencari alternatif pembenah tanah pengganti top soil. Penelitian dilakukan di rumah kaca Laboratorium Agrostologi, Departemen Ilmu Nutrisi dan Teknologi Pakan. Rancangan yang digunakan adalah Rancangan Acak Lengkap Faktorial (2x6) dengan empat ulangan, dan dua faktor yaitu faktor CMA dan faktor pembenah tanah. Faktor CMA terdiri atas Tanpa CMA (M0) dan Dengan CMA (M1), faktor pembenah tanah terdiri atas Kontrol (H0), Top soil (H1), Humega Cair (H2), Humega Bubuk (H3), Top soil ditambah Humega Cair (H4), dan Top soil ditambah humega Bubuk (H5). Peubah yang diamati adalah berat kering tajuk periode I dan II, persentase infeksi akar, jumlah spora dan identifikasi spora. Hasil yang diperoleh adalah interaksi antara mikoriza dan pembenah tanah nyata (p<0,05) meningkatkan bobot kering tajuk periode I pada tanaman P.javanica dengan hasil terbaik adalah pada pemberian humega bubuk saja tanpa CMA. interaksi tersebut juga nyata (p<0,05) meningkatkan bobot kering tajuk periode II pada tanaman C.pubescens dengan hasil terbaik pada perlakuan humega cair tanpa CMA. Secara umum interaksi antara faktor mikoriza dengan pembenah tanah sangat nyata (p<0,01) meningkatkan infeksi akar pada semua jenis tanaman. Alternatif pembenah tanah yang dapat menggantikan top soil adalah humega bubuk.
Keyword:
Judul: Formulation of Nori-Like from Green Seaweed Ulva lactuca with the Addition of  Boiled Water
Abstrak: Pembuatan produk nori-like dapat dilakukan menggunakan rumput laut Ulva lactuca, dengan menambahkan air rebusan pemindangan. Tujuan penelitian ini menentukan formula ¬nori-like terbaik, dari U. lactuca dengan penambahan air rebusan pemindangan, serta mengevaluasi karakteristik produk nori-like U. lactuca dengan penambahan air rebusan dari proses pemindangan. Pembuatan produk nori-like dilakukan dengan menambahkan konsentrat air rebusan pemindangan dengan jumlah yang berbeda dalam proses pengolahan. Formulasi terpilih, secara sensori, dalam pembuatan nori-like yaitu dengan menambahkan konsentrat air rebusan pemindangan sebanyak 3%. Produk nori-like yang dibuat pada penelitian ini memiliki nilai gizi yang lebih rendah dibandingkan nori yang telah komersil, akan tetapi hasil yang diperoleh telah menunjukkan bahwa penambahan 3% konsentrat air rebusan pemindangan dalam pembuatan nori-like dapat meningkatkan nilai gizi pada produk nori-like, dengan kadar air 12,77%, abu 14,53%, protein 17,02%, lemak 5,88%, dan serat pangan 25,77%. Asam amino yang mendominasi pada nori-like terpilih yaitu histidina, asam glutamat, dan glisina. Produk ini memiliki nilai aw 0,59 serta intensitas warna L,a,b berturut-turut 14,28, 0,76, dan 14,44., Nori-like products can be made using Ulva lactuca seaweed, with an additional boiled fish water. The purpose of this study was to determine the selected nori-like formula, made from U. lactuca with the addition of boiled fish water, and to evaluate the characteristics of nori-like from U. lactuca with the addition of boiled water from boiling process. The making of nori-like products was done by adding different amounts of boiled water concentrate during the process. The selected nori-like formula was made by adding 3% of the concentrated boiled water. The nori-like products made in this study contained a lower nutritional value than commercial nori, but the results obtained have shown that an additional 3% of the boiled water concentrate in the processing of nori-like can increase the nutritional value of nori-like, with 12.77% water content, 14.53% ash, 17.02% protein, 5.88% fat, and 25.77% dietary fiber. The dominant amino acids in the selected nori-like were histidine, glutamic acid, and glycine. This product has an aw value of 0.59 and L, a, b values of 14.28, 0.76, and 14.44, respectively.
Keyword: nori-like, Ulva lactuca, boiled water
Judul: Phosphorus  fertilization  optimization  for  caisin (brassica rapa l. cv. Caisin)  of Andisols
Abstrak: Penelitian ini dilakukan untuk memperoleh dosis optimum pemupukan fosfor tanah Andisol. Penelitian dilakukan di Kebun Percobaan Pasir Sarongge Cianjur dari April hingga Mei 2014. Percobaan ini menggunakan rancangan Split Plot design.Bedeng utama (main plot) adalah pengkondisian hara P tanah yang terdiri atas lima taraf, yaitu X (1856.3 kg per ha P 2O5 ), 3/4 X (1392.225 kg per ha P 2O5 ), 1/2 X (928.15 kg per ha P 2O5 ), 1/4 X (464.076 kg per ha P 2O5 ) dan 0 X (0 kg per ha P 2O5). Anak Bedeng (sub plot) adalah dosis pemupukan P yang terdiri atas lima taraf, yaitu X (1856.3 kg per ha P 2O5 ), 3/4 X (1392.225 kg per ha P 2O5 ), 1/2 X (928.15 kg per ha P 2O5), 1/4 X (464.076 kg per ha P 2O5 ) dan 0 X (0 kg per ha P 2O5). Dimana X = 1856.346 kg P2O5 per ha atau 5156 kg SP-36 per ha, yaitu P yang dibutuhkan untuk mencapai kadar P sangat tinggi pada tanah Andisol Pasir Sarongge. Dosis N dan K yang digunakan adalah 200 kg per ha Urea (45% N) dan 100 kg per ha KCL (60% K 2 O). Pengkondisian hara P tanah berpengaruh sangat nyata terhadap pertumbuhan dan hasil tanaman caisin. Perlakuan pemupukan P tidak memberikan pengaruh yang nyata terhadap pertumbuhan dan hasil tanaman caisin pada tingkat kesuburan tanah sedang pengekstrak Bray. Serangan penyakit akar gada dapat menjadi penyebab pemupukan tidak berpengaruh pada tanaman. Persentase jumlah tanaman yang terserang penyakit akar gada adalah 11.90%. Dosis rekomendasi pemupukan P di Kebun Percobaan Pasir Sarongge belum dapat ditentukan, This study was conducted to find out the optimum of phosphorus fertilization on andisol. The study was conducted at the Experimental Farm Pasir Sarongge Cianjur from April to May 2014. This study arranged in split plot design. The main plot is conditioning the soil of P consisting of five rates, namely X (1856.3 kg/ha P2O5), 3/4 X (1392.225 kg/ha P2O5), 1/2 X (928.15 kg/ha P2O5), 1/4 X (464.076 kg/ha P2O5) and 0 X (0 kg/ha P2O5). Subplot is a rate of fertilizer P which consists of five levels, namely X (1856.3 kg/ha P2O5), 3/4 X (1392.225 kg/ha P2O5), 1/2 X (928.15 kg/ha P2O5), 1/4 X (464.076 kg/ha P2O5) and 0 X (0 kg/ha P2O5). Where X = 1856.346 P2O5 kg/ha or SP-36 5156 kg/ha, ie P is needed to achieve very high levels of P in the soil Andisol Pasir Sarongge. Dose of N and K were used was 200 kg ha upper of urea (45% N) and 100 kg ha upper KCl (60% K2O). The results showed that the conditioning of the soil nutrient P is able to enhance the growth and yield of caisin, whereas P fertilization treatment did not give significant effect on the growth and yield of caisin. P fertilization treatment did not give a significant effect on the growth and yield of crops on soil fertility extracting Bray. Mace root disease may be the cause of fertilization had no effect on the plant. The percentage of plants affected mace root
Keyword: pupuk, P tanah, sayuran
Judul: Indeks Glikemik Gula Kelapa Cetak, Kristal, dan Cair.
Abstrak: Gula kelapa adalah gula yang dihasilkan dari nira pohon kelapa. Gula dari nira palma umumnya memiliki nilai indeks glikemik yang lebih rendah dibandingkan dari nira tebu. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui nilai indeks glikemik gula kelapa cetak, kristal, dan cair. Berdasarkan analisis proksimat gula kelapa cair memiliki kadar air tertinggi (24.61 %bb), sedangkan gula kelapa kristal memiliki kadar air terendah (3.78 %bb). Kadar karbohidrat gula kelapa kristal lebih tinggi yaitu 91.70 %bb dibandingkan gula kelapa cetak dan cair (88.55 %bb dan 71.69 %bb). Kadar glukosa dan sukrosa gula kelapa cair lebih tinggi dibandingkan gula kelapa cetak dan kristal, sedangkan kadar sukrosanya lebih rendah dibandingkan kedua jenis gula kelapa lainnya. Nilai indeks glikemik (IG) gula kelapa dihitung berdasarkan luas area dibawah kurva pada kurva respon glukosa darah 10 orang responden dengan metode IAUC. Nilai IG gula kelapa cetak tergolong kategori IG sedang (67), sementara gula kelapa kristal dan cair tergolong IG rendah (52 dan 54). Uji t-test menunjukkan bahwa tidak terdapat perbedaan yang signifikan (p > 0.05) antara indeks glikemik ketiga jenis gula kelapa. Berdasarkan hasil pembobotan uji organoleptik diketahui gula kelapa kristal merupakan gula yang paling diterima dengan total skor 13.93 dari skor maksimum 20.
Keyword: fruktosa, glukosa, gula kelapa, IG rendah, uji organoleptik
Judul: Weevil Elaeidobius kamerunicus Faust Population in Oil Palm (Elaeis guineensis Jacq) at PTPN VIII Kebun Sukamaju, Cikidang, Sukabumi
Abstrak: High productivity of oil palm is affected bypollination. Elaeidobius kamerunicus is weevil pollinator that can increase fruit set of oil palm. Weevil population was influenced by natality, mortality, and migration. The objective of this research were to study weevil E. kamerunicus population and environmental factors on oil palm estate at Sukamaju, Cikidang, Sukabumi. Weevil population were observed by stratified random sampling method in male flowers were located at three blocks of the estate on Juny, August, and October 2010. Sex ratio of female and male weevil was counted. Relationship between environmental factors and weevil population were analyzed by Pearson correlation. The highest population of weevil occured in August.Weevil population at Sukamaju was lower than the minimum weevil population for optimum pollination. Sex ratio of female and male weevil during observation was 3:1. Rainfall has the highest effect to weevil population among parameters measured.
Keyword:
Judul: Evaluasi Ventilator Terhadap Profil Paru-paru Anak Babi (Sus scrofa) Syok Hipovolemik dengan Resusitasi Cairan Kristaloid Hipervolemik.
Abstrak: Aplikasi ventilator mekanik terhadap pasien yang diduga mengalami cedera paru–paru dapat memperburuk kondisi pasien. Tujuan penelitian ini menilai kemanfaatan ventilator terhadap profil paru-paru syok hipovolemik sebelum dan setelah resusitasi cairan kristaloid hipervolemik. Penelitian ini menggunakan lima ekor anak babi jantan berumur 6-10 minggu sebagai hewan model syok, dan terdiri atas empat tahap perlakuan, stabilisasi, perdarahan, resusitasi normovolemik, dan resusitasi hipervolemik. Pengaturan ventilator mekanik dalam set PEEP 5, FiO2 0.5, dan rasio I:E adalah 1:2, diaplikasikan dari awal tahap. Pengupayaan syok dilakukan dengan mengeluarkan darah hingga mean arterial pressure (MAP) menurun 20% dari stabil. Resusitasi normovolemik dan hipervolemik menggunakan NaCl 0.9% sebagai kristaloid. Parameter yang diamati terdiri dari EVLWI dan PVPI pada PiCCO®, dan VTE, PIP, dan RR pada ventilator mekanik. EVLWI tidak mengindikasikan terjadinya edema paru. Penurunan VTE tanpa perubahan EVLWI, PIP dan RR yang nyata mengindikasikan paru paru sehat dengan pernafasan yang cepat dan dangkal. Parameter PVPI tidak dapat digunakan sebagai parameter terhadap permeabilitas kapiler dalam kondisi syok hipovolemik. Penggunaan set ventilator dimungkinkan mencegah peningkatan EVLWI, dan penggunaan ventilator mekanik tidak memperparah kondisi pasien syok selama resusitasi cairan kristaloid dilakukan.
Keyword: hipovolemia, kristaloid, profil paru-paru, resusitasi cairan, ventilator
Judul: Soil Macrofauna Abundance and Site Characteristics in Limestone Post-Mining Land (PT. Solusi Bangun Indonesia)
Abstrak: Penambangan batu kapur berpotensi menghilangkan fauna tanah dan menurunkan kualitas tanah lahan pascatambangnya. Revegetasi merupakan upaya memulihkan ekosistem dan biodiversitasnya dengan penanaman pohon. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis kelimpahan makrofauna tanah, karakteristik tapak, dan hubungan karakteristik tapak dengan kelimpahan makrofauna tanah di lahan pascatambang kapur PT. Solusi Bangun Indonesia, Narogong, Jawa Barat. Makrofauna tanah dianalisis kelimpahan jenis dan beberapa indeks biodiversitas, sedangkan sampel tanah dianalisis sifat fisik, kimia, dan biologi tanahnya. Analisis data dilakuka dengan uji Beda Nyata Terkecil (BNT) untuk melihat perbedaan kelimpahan makrofauna tanah dan uji korelasi Pearson untuk mengetahui hubungan antara karakteristik tapak dengan kelimpahan makrofauna tanah. Kelimpahan makrofauna tanah pada keempat lokasi penelitian berbeda nyata kecuali pada lahan pascatambang terbuka yang dipengaruhi oleh kondisi klimatis dan edafisnya. Karakteristik tapak dari keempat lokasi penelitian menunjukkan perbedaan yang disebabkan oleh pengelolaan dan revegetasi lahan pascatambang, tahun revegetasi, dan karakteristik vegetasi yang tumbuh.
Keyword: post-lime mining, revegetation, site characteristics, soil macrofauna
Judul: Analysis of Long-read Sequences with MinION Technology on Kapur (Dryobalanops aromatica C.F Gaertn).
Abstrak: Salah satu spesies penting dari famili Dipterokarpa adalah kayu kapur (D. aromatica C.F Gaertn) dengan status konservasi rentan (vulnerable). Status tersebut mencerminkan perlunya upaya konservasi genetik berbasis sains yang didukung dengan teknologi baru, salah satunya adalah Oxford Nanopore Technology (ONT) MinION yang mampu menyajikan analisis long-read DNA sequences yang terjangkau. Saat ini penggunaan ONT masih jarang dilakukan pada pohon hutan asli Indonesia. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan data sekuens whole genome liputan rendah (low coverage) dan memanfaatkannya untuk menganalisis kekerabatan D. aromatica. Prosedur penelitian mencakup tahapan isolasi dan sekuensing DNA hingga analisis bioinformatika. Hasil menunjukkan bahwa sekuensing DNA D. aromatica dengan pembacaan urutan basa DNA long-read 1,55 Gb dengan genom parsial kloroplas D. aromatica 148.856 bp. Analisis kekerabatan menunjukan D. aromatica berkerabat dekat dengan D. rappa dengan marka kombinasi gen (matK dan rbcL) lebih direkomendasikan untuk digunakan dalam analisis lanjutan D. aromatica., One important species of the dipterocarps is kapur (D. aromatica C.F. Gaertn) with a vulnerable conservation status. This status indicates the need for science based conservation through new technology, among other Oxford Nanopore Technoloy (ONT) MinION, that is able to provide affordable analysis for long-read DNA sequences. Nowadayas, the use of ONT is still rare being applied to native Indonesian forest trees. The objective of this study was to generate long- read sequence data of the whole genome with low coverage and use it to analyze genetic relationship D. aromatica. The research procedure included DNA isolation and sequencing to bioinformatics analysis. The results showed that DNA sequencing of D. aromatica resulted in 1,55 Gb of DNA base long read sequences in which a partial chloroplast genome length was constructed with a total of 148.856 bp. The genetic relationship analysis showed that D. aromatica was closely related to D. rappa with a combined marker of matK and rbcL are recommended for future use of phylogenetic analysis of D. aromatica.
Keyword: Dryobalanops aromatica, genome, markers, MinION, sequencing