Judul: Vaksin Polivalen Edwardsiella ictaluri Untuk Pencegahan Penyakit Enteric Septicemia of Catfish Pada Ikan Patin (Pangasianodon hypophthalmus).
Abstrak: Kasus kematian akibat penyakit Enteric Septicemia of Catfish (ESC) yang disebabkan oleh bakteri Edwardsiella ictaluri menjadi kendala utama pada budidaya ikan patin di Indonesia. Perbedaan kondisi geografis antar wilayah diduga menjadi faktor penyebab variasi fenotipe dan genotipe isolat E. ictaluri. Karakteristik spesifik isolat dapat menjadi dasar pertimbangan dalam pengembangan riset vaksin polivalen E. ictaluri yang mampu memproteksi terhadap variasi antigen heterolog dan meningkatkan nilai relative percent survival (RPS). Penelitian ini bertujuan untuk mengembangkan vaksin polivalen E. ictaluri untuk pencegahan penyakit ESC pada ikan patin, dengan lima tahap penelitian yaitu 1) karakterisasi fenotipe dan genotipe E. ictaluri, 2) identifikasi gen virulen dan evaluasi korelasi terhadap patogenisitas E. ictaluri, 3) profil protein dan toksisitas protein bakteri E. ictaluri pada ikan patin, 4) efikasi berbagai sediaan vaksin inaktif sel utuh E. ictaluri pada ikan patin didukung kajian uji kualitas dan keamanan vaksin, dan 5) efikasi dan proteksi vaksin inaktif polivalen sel utuh E. ictaluri dengan dan tanpa booster pada ikan patin. Penelitian tahap pertama bertujuan mengidentifikasi isolat E. ictaluri secara fenotipe dan genotipe. Karakteristik terhadap tujuhbelas isolat bakteri yang berasal dari wilayah berbeda yaitu tujuh isolat dari Jawa Barat (PCjG, PJlG), PSb5G, PSb3G, PSb1G, PSmH, P), satu isolat dari Jawa Timur (PTaH), dua isolat dari Riau (PR1G, BRSH), tiga isolat dari Sumatera Selatan (B1, B2, A2), satu isolat dari Jambi (PJbH), satu isolat dari Lampung (S.935G), dan dua isolat dari Kalimantan Selatan (PBm1G, PBm2G) secara biokimia dan API 20E teridentifikasi sebagai E. ictaluri. Seluruh isolat termasuk β-hemolitik namun zona paling terang terlihat pada isolat PSb1G, PJbH, A2, P, dan PBm1G. Aktivitas enzim dan profil antibiotik homolog pada semua isolat. Analisis PCR semua isolat dengan primer spesifik E. ictaluri terdeteksi pada 129 bp. Isolat E. ictaluri asal Indonesia menunjukkan variasi genotipe. Semua isolat memiliki kemiripan 99.56-100% dengan strain E. ictaluri 93-146 complete genome. Penelitian tahap kedua bertujuan mengidentifikasi gen virulen dan menganalisis korelasi gen virulen dan patogenisitas dalam menentukan komposisi penyusun vaksin polivalen E. ictaluri. Identifikasi gen virulen menunjukkan hasil variatif dan secara umum pada semua isolat E. ictaluri memiliki gen T6SS (evpC) dan urease. Kematian ikan patin akibat infeksi E. ictaluri tertinggi sebesar 96.67- 100% terjadi pada ikan yang dinfeksi dengan E. ictaluri PSb1G, PJbH, A2, P, dan PBm1G dengan rerata waktu kematian 3.73-4.58 hari pascainfeksi. Mortalitas ikan patin akibat infeksi ESC tidak dipengaruhi oleh jumlah gen virulen yang dimiliki bakteri E. ictaluri. Infeksi E. ictaluri menyebabkan perubahan abnormalitas patologi klinik, gambaran darah, dan kerusakan jaringan. Penelitian tahap ketiga bertujuan menganalisis profil protein, toksisitas sel utuh, dan extracellular product (ECP) serta korelasinya terhadap patogenisitas. Karakterisasi protein sel utuh dan ECP E. ictaluri menggunakan SDS-PAGE ditunjukkan dengan hasil pengukuran berat molekul (BM) pada masing- masing sediaan. Profil protein sel utuh pada isolat PJbH menunjukkan 14 pita protein pada kisaran 11.18-140 kDa, sedangkan pada isolat P dan PBm1G menunjukkan 10 pita protein pada kisaran 11.18-71.06 kDa. Profil protein ECP terdeteksi hanya ditemukan 2 pita, yaitu 11.18 dan 14.30 kDa. Mortalitas tertinggi terjadi pada perlakuan sel utuh P dan PBm1G sebesar 97.78% dan 100% sedangkan pada PJbH menunjukkan kematian rendah sebesar 15.56%. Toksisitas sel utuh menyebabkan gejala klinis,
Keyword: E. ictaluri, genotype, phenotype, polyvalent, relative percent survival