Judul: Microbiome Structure Analysis of Elaeidobius kamerunicus Faust as Pollinator of Oil Palm
Abstrak: Kelapa Sawit merupakan salah satu tanaman potensial di Indonesia karena menjadi sumber daya utama penghasil minyak nabati, menjadi sumber pendapatan daerah dan nasional, serta komoditas ekspor. Permintaan kelapa sawit terus meningkat setiap tahunnya baik di dalam dan di luar negeri. Untuk mengimbangi kondisi tersebut, diperlukan peningkatan produksi buah kelapa sawit. Nilai produktivitas hasil kelapa sawit dinyatakan dalam persentase fruit set (FS) yaitu perbandingan buah hasil penyerbukan dengan total buah dalam satu tandan kelapa sawit. Oleh karena itu, peningkatan frekuensi penyerbukan akan meningkatkan nilai FS kelapa sawit. Proses penyerbukan pada kelapa sawit membutuhkan bantuan polinator karena bunga jantan dan betinanya terpisah serta mekar pada waktu yang berbeda. Salah satu serangga polinator kelapa sawit adalah kumbang Elaeidobius kamerunicus (E. kamerunicus) (Coleoptera, Curculionidae). Serangga ini telah dibuktikan dapat meningkatkan nilai FS di beberapa negara. Populasi E. kamerunicus yang tinggi akan meningkatkan frekuensi penyerbukan kelapa sawit. Selain itu, E. kamerunicus harus aktif dan bugar untuk mentransfer polen dari bunga kelapa sawit jantan ke betina. Aktivitas dan kebugaran serangga polinator dapat dipengaruhi oleh interaksi dengan mikrobiom pada tubuhnya. Beberapa penelitian telah melaporkan bahwa mikrobiom dalam tubuh serangga berperan penting terhadap kebugaran dan aktivitas serangga. Penelitian tentang E. kamerunicus yang ditinjau dari aspek mikrobiom masih sangat terbatas. Belum ada penelitian yang melaporkan tentang struktur mikrobiom E. kamerunicus pada fase serangga dewasa. Oleh karena itu, penelitian ini dilakukan untuk membandingkan dan mengidentifikasi struktur mikrobiom pada E. kamerunicus dari dua wilayah perkebunan kelapa sawit dengan nilai FS tinggi dan rendah sehingga diharapkan dapat menjelaskan pengaruh keberadaan bakteri-bakteri terhadap aktivitas dan kebugaran E. kamerunicus dalam melakukan polinasi dan pembentukan nilai FS kelapa sawit. Penelitian ini dilaksanakan di Laboratorium Divisi Research and Development (R&D) PT Wilmar Benih Indonesia, Cikarang, Jawa Barat. Serangga E. kamerunicus didapatkan dari dua lokasi perkebunan kelapa sawit milik Perkebunan Wilmar Grup Indonesia di provinsi Sumatra Barat. Serangga yang berasal dari daerah dengan nilai FS tinggi (80,69%) dikoleksi dari perkebunan kelapa sawit PT Agro Masang Perkasa Plantation (AMP) di Kabupaten Agam, sedangkan serangga yang berasal dari daerah dengan nilai FS rendah (50%) dikoleksi dari perkebunan kelapa sawit dari PT Gersindo Minang Plantation (GMP) di Kabupaten Pasaman Barat. Pengkulturan bakteri pada E. kamerunicus dilakukan pada dua jenis media pengkulturan bakteri yaitu media Plate Count Agar (PCA) untuk total bakteri dan media De Man Rogosa Agar (MRSA) untuk bakteri asam laktat. Hasil pengkulturan kemudian dikarakterisasi dan diseleksi setelah itu diidentifikasi dengan gen penyandi 16S rRNA menggunakan primer universal 27f dan 1387r. Selain itu juga dilakukan analisis Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism (T-RFLP) yang dilakukan dengan mengesktraksi DNA dari sampel E. kamerunicus hasil penggerusan kemudian diamplifikasi dengan gen penyandi 16S rRNA menggunakan primer 27f yang telah dilabeli dengan fluorescein FAM dan primer 1387r yang telah dilabeli dengan fluorescein HEX. Hasil amplifikasi kemudian dipotong dengan enzim restriksi MspI dan HhaI sehingga menjadi beberapa Terminal Restriction Fragment (T-RF). Fragmen-fragmen tersebut dianalisis untuk menentukan perbedaan struktur mikrobiom pada E. kamerunicus dari dua kebun kelapa sawit dengan nilai FS berbeda. Selain itu, dilakukan perhitungan indeks-indeks yaitu indeks keanekaragaman, dominansi, dan kemiripan (Sorensen’s dan Jaccard). Hasil pengkulturan bakteri menunjukkan bahwa terdapat bakteri yang ditemukan pada E. kamerunicus
Keyword: fruit set, microbiome, T-RFLP