Judul: Proteomic and phenotypic studies of Balitbangtan Superior Kampung Chicken (KUB) on fresh and frozen semen quality
Abstrak: Fenotip adalah karakteristik (struktural, biokimiawi, fisiologis, dan perilaku) yang dapat diamati dari suatu organisme yang diatur oleh genotipe dan lingkungan serta interaksi keduanya. Fenotip pada ayam seperti jengger dan warna bulu telah dilaporkan dapat menggambarkan kualitas semen. Fenotip ini diduga berhubungan dengan konsentrasi hormon testosteron yang berhubungan juga dengan spermatogenesis. Kualitas semen berhubungan dengan kandungan protein pada plasma semen maupun sperma. Analisis protein pada semen dapat dilakukan menggunakan liquid chromatography tandem mass spectrophotometry (LC-MS/MS). Alat tersebut dapat mengidentifikasi protein berdasarkan sifat kimia dan rasio massa/muatan (m/z) protein. Penelitian ini bertujuan untuk mengkarakterisasi semen segar dan hubungannya dengan konsentrasi testosteron, kualitas semen beku, dan kandungan protein semen (plasma semen dan sperma) pada ayam KUB dengan fenotip berbeda. Penelitian ini terdiri atas 1) Karakterisasi kualitas semen ayam KUB berdasarkan perbedaan fenotip dan korelasinya dengan testosteron, 2) Analisis kualitas semen beku ayam KUB berdasarkan perbedaan fenotip, 3) Identifikasi profil protein semen ayam KUB dan fungsinya berdasarkan perbedaan tipe jengger menggunakan SDS-Page dan LC-MS/MS. Sampel semen dan plasma darah yang digunakan pada tahap satu dan dua berasal dari empat kelompok ayam yaitu jengger tunggal bulu penutup merah (JTBM), jenggger tunggal bulu penutup putih (JTBP), jengger pea bulu penutup merah (JPBM), dan jengger pea bulu penutup putih (JPBP). Sampel semen yang digunakan pada tahap tiga dibedakan berdasarkan tipe jengger. Penelitian tahap pertama adalah karakterisasi kualitas semen ayam KUB berdasarkan perbedaan fenotip dan korelasinya dengan testosteron. Hasil penelitian menunjukkan pejantan dengan fenotip JPBM memiliki volume semen paling tinggi dan JTBM adalah yang paling rendah (P<0,05). Pejantan JTBM juga memiliki motilitas dan konsentrasi sperma paling rendah dibandingkan dengan fenotip lainnya.. Diameter taji tidak berbeda nyata pada setiap kelompok (P>0,05), sedangkan panjang taji pada kelompok jengger pea lebih tinggi dari kelompok JTBP (P<0,05), tetapi tidak berbeda nyata dengan kelompok JTBM. Konsentrasi sperma dan testosteron pada kelompok JPBM tidak berbeda dengan kelompok JPBP dan lebih tinggi dibandingkan dengan kelompok JTBP (P<0.05). Diameter dan panjang taji berkorelasi positif dengan konsentrasi testosteron dengan nilai “r” masing-masing 0,57 dan 0,41. Kesimpulan tahap I bahwa kelompok JPBM memiliki kualitas semen paling baik. Penelitian tahap kedua yaitu pembekuan semen menggunakan pengencer ringer laktat kuning telur (RLKT), ringer laktat kuning telur+fruktosa (RLKTF), dan ringer laktat kuning telur+glukosa (RLKTG) yang berasal dari kelompok JTBM, JTBP, JPBM, dan JPBP. Motilitas dan viabilitas sperma post-thawing ayam KUB paling tinggi ditunjukkan pengencer RLKTG (P<0,05). Abnormalitas sperma post-thawing JTBM dalam pengencer RLKTG paling rendah dibandingkan dengan kelompok lainnya. Kesimpulannya kelompok JTBM menunjukkan hasil PTM yang paling baik. Pengencer terbaik dalam mempertahankan kualitas semen post-thawing adalah RLKTG. Penelitian tahap ketiga menggunakan semen (plasma semen dan sperma) dari kelompok jengger tunggal dan jengger pea. Kelompok penelitian menjadi plasma semen jengger tunggal (PSJT), plasma semen jengger pea (PSJP), sperma jengger tunggal (SJT), dan sperma jengger pea (SJP). Sampel dianalisis menggunakan SDS-Page dengan pewarnaan Comassie Brilliant Blue yang dilanjutkan dengan analisis LC-MS/MS. Hasil penelitian menunjukkan bahwa terdapat 10 pita protein yang terbentuk pada kelompok PSJT dan PSJP dengan berat molekul ~5-10 kDa, sampai 101-140 kDa dan dua pita yang tidak terbentuk pada kelompok SJT dan SJP dengan berat molekul ~5-10 kDa dan 21-25 kDa. Hasil dari
Keyword: characteristics of fresh semen, KUB chicken, frozen semen, phenotype, proteomics