Judul: Identifikasi Forma Specialis Fusarium oxysporum Asal Bibit Kelapa Sawit dan Seleksi Agens Biokontrol
Abstrak: Penyakit layu fusarium pada tanaman kelapa sawit yang disebabkan oleh F. oysporum f.sp. elaeidis (Foe) merupakan salah satu penyakit penting pada kelapa sawit di berbagai negara produsen kelapa sawit. Di Indonesia, Foe termasuk Organisme Pengganggu Tanaman Karantina Golongan A1 (OPT KA1) atau belum pernah dilaporkan ada di Indonesia. Hasil penelitian terbaru menunjukkan Fusarium spp. berasosiasi dengan berbagai gejala pada kelapa sawit, salah satunya F. oxysporum. Meskipun belum ada laporan yang relevan tentang kehilangan hasil kelapa sawit yang disebabkan oleh penyakit fusarium, eksplorasi agens biokontrol sebagai upaya mencari pengendalian berbasis biokontrol untuk mengantisipasi adanya introduksi patogen tersebut. Penelitian ini bertujuan mengetahui forma specialis F. oxysporum asal bibit kelapa sawit berdasarkan karakter morfologi dan teknik molekuler, serta memperoleh cendawan agens biokontrol yang efektif dalam mengendalikan F. oxysporum pada bibit kelapa sawit in vitro dan in planta. Identifikasi morfologi tiga isolat cendawan F. oxysporum dilakukan pada media PDA dan BLA, identifikasi karakter molekuler dengan teknik PCR dan sikuensing menggunakan primer EF 1 5' -A TGGGT AAGGA(A/G) GACAAGAC-3’ dan EF 2 reverse 5'GGA(G/A)GTACCAGT(G/C)ATCATGTT- 3'. Pengujian cendawan rizosfer calon agens biokontrol dilakukan dengan uji patogenisitas pada tiga benih uji (kacang tanah, mentimun dan cabai). Cendawan yang dinyatakan berpotensi sebagai agens biokontrol selanjutnya diuji kemampuan antagonisme untuk mengetahui potensi dan mekanisme biokontrolnya. Isolat cendawan rizosfer yang berpotensi sebagai agens biokontrol dan empat isolat agens biokontrol koleksi Lab. Mikologi, IPB diidentifikasi berdasarkan karakter morfologi pada media PDA dan WA. Uji antagonisme agens biokontrol dilakukan dengan uji kultur ganda dan pembentukan senyawa volatil in vitro. Pengujian keefektifan tujuh agens biokontrol terhadap tiga isolat F. oxysporum patogenik pada kelapa sawit dilakukan di rumah kaca kebun percobaan Cikabayan, IPB. Berdasarkan karakter morfologi ketiga isolat cendawan patogen diidentifikasi sebagai F. oxysporum. Hasil analisis kekerabatan melalui konstruksi pohon filogenetik menunjukkan F. oxysporum isolat Cikabayan B memiliki kedekatan dengan F. oxysporum f.sp. elaeidis NRLL 22543 asal Suriname. Sementara F. oxysporum isolat Cikabayan A dan isolat Papua tidak berkerabat dekat dengan F. oxysporum f.sp. elaeidis NRLL 22543 asal Suriname, akan tetapi tetap menjadi satu clade monofilotik dengan F. oxysporum f.sp. elaeidis NRLL 22543 asal Suriname. Ketiga isolat F. oxysporum asal bibit kelapa sawit juga memiliki homologi yang tinggi dengan F. oxysporum f.sp. elaeidis NRLL 22543 asal Suriname kecuali isolat Papua. Analisis pairwise distance dengan F. oxysporum f.sp. elaeidis NRLL 22543 asal Suriname menunjukkan bahwa F. oxysporum isolat Cikabayan B, Cikabayan A, dan Papua memiliki jarak genetik 2 yang bervariasi, berturut-turut adalah 0.004, 0.006, dan 0.042. Inokulasi buatan ketiga isolat F. oxysporum pada bibit kelapa sawit in planta menunjukkan bahwa ketiga isolat tersebut bersifat patogenik terhadap bibit kelapa sawit. Hasil uji patogenisitas beberapa cendawan rizosfer di peroleh tiga isolat cendawan rizosfer yang berpotensi sebagai agens biokontrol dan empat isolat agens biokontrol koleksi Laboratorium Mikologi Tumbuhan. Berdasarkan hasil identifikasi morfologi tujuh isolat agens biokontrol, empat isolat termasuk dalam genus Trichoderma, yaitu T. harzianum isolat Gadingrejo 1, T. harzianum isolat Gadingrejo 2, dan T. harzianum isolat Jambi; T. virens isolat Jambi; dan T. inhamatum isolat Jambi, sedangkan dua isolat lainya adalah Gliocladium fimbriatum isolat KLMT 1 dan G. fimbriatum isolat KLMT 2. Hasil uji antagonisme menujukkan tujuh isolat agens
Keyword: Fusarium oxysporum f.sp. nekrotik akar, elaeidis, translation elongation factor -1α, senyawa volatil, Trichoderma inhamatum