arulpm/triplet_large huggingface dataset:
Judul: Evaluation of several Preservatives for Storage of Mexicana Grass Cuttings (Euchlaena mexicana Schrad)
Abstrak: Rumput Meksiko (Euchlaena mexicana Schrad) tidak dapat dibudidayakan dengan biji. Oleh sebab itu perlu dilakukan pengawetan pada stek, agar dapat di distribusikan ke tempat yang lebih jauh. Permasalahan yang sering terjadi pada pengiriman stek adalah terjadinya kerusakan secara fisik maupun rusak karena faktor lain seperti mikroba dan fungi, oleh karena itu perlu ada metode pengawetan stek. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui bahan dan alat yang tepat digunakan sebagai pengawet dan menentukan lama masa simpan yang terbaik untuk stek rumput Meksiko (Euchlaena mexicana Schrad). Rancangan percobaan yang digunakan adalah Rancangan Acak Lengkap (RAL) pola faktorial dengan pengulangan 5 kali. Faktor A adalah perlakuan berupa 4 jenis bahan atau alat pengawet: cairan gula 2%, cairan lilin, silica gel dan mesin pendingin (refrigerator) dan faktor B berupa 5 jenis lama penyimpanan: 3, 6, 9, 12 dan 15 hari. Bahan yang digunakan adalah stek rumput Meksiko (Euchlaena mexicana Schrad) sebanyak 625 potong stek. Peubah yang diukur adalah: keadaan umum stek, awal pertumbuhan setelah tanam, daya tumbuh, penyusutan bobot stek dan tinggi vertikal. Hasil penelitian menunjukkan bahwa pada perhitungan penyusutan bobot stek terlihat adanya interaksi antara perlakuan bahan pengawet dengan lama penyimpanan (P<0,05), dimana semakin lama penyimpanan maka penyusutan bobot semakin besar. Terdapat interaksi yang nyata antara daya tumbuh dan tinggi vertikal dengan lama penyimpanan (P<0,05), semakin lama penyimpanan maka daya tumbuh dan tinggi vertikal semakin menurun. Kesimpulan dari penelitian ini adalah stek rumput Meksiko (Euchlaena mexicana Schrad) dapat disimpan dengan kualitas yang baik selama 15 hari dengan menggunakan pengawet/alat refrigerator.
Keyword:
Judul: Karakterisasi Rat Embryonic Fibroblast (REF) Pasca-Kriopreservasi Lambat pada Tingkat Pasase yang Berbeda
Abstrak: Rat embryonic fibroblast (REF) merupakan sel fibroblas yang berasal dari fetus tikus. Sel ini banyak digunakan sebagai objek dalam berbagai penelitian seperti imunologi, farmakologi dan toksikologi, serta sel punca. Produksi sel REF primer yang sudah banyak dilakukan adalah menggunakan proses enzimatis. Proses ini membutuhkan optimasi yang lama serta menyebabkan mikrofili dan reseptor permukaan sel yang berperan dalam penempelan pada substrat kultur mengalami kerusakan. Metode lain yang dapat dilakukan adalah kultur eksplan primer. Kriopreservasi merupakan bioteknologi yang banyak dimanfaatkan untuk menyimpan sel. Teknik tersebut memiliki kekurangan, yaitu adanya efek toksik yang ditimbulkan oleh krioprotektan yang digunakan. Belum ada laporan yang menyatakan efek toksik krioprotektan dimethyl sulfoxide (DMSO) dan ethylene glycol (EG) jika digunakan secara tunggal pada sel REF. Tujuan penelitian ini adalah untuk memproduksi sel REF yang berasal dari jaringan otot fetus tikus dengan metode kultur primer eksplan. Tujuan kedua adalah membandingkan viabilitas, karakteristik proliferasi, morfologi, dan morfometri sel REF pre- dan pasca-kriopreservasi lambat menggunakan dua krioprotektan yang berbeda pada tingkat pasase yang berbeda. Eksplan diperoleh dari karkas fetus yang berasal dari tikus betina dengan usia kebuntingan 15–17 hari. Eksplan dikultur pada cawan menggunakan medium kultur Dulbecco’s modified eagle’s medium-high glucose (DMEM-high glucose). Pasase dilakukan pada saat sel REF memenuhi dasar cawan. Kriopreservasi sel REF menggunakan dua krioprotektan tunggal yang berbeda yaitu dimethyl sulfoxide (DMSO) dan ethylene glycol (EG). Morfologi dan morfometri sel REF diamati dengan cara mewarnainya menggunakan Giemsa. Data kuantitatif diolah menggunakan analysis of variance (ANOVA). Parameter yang diamati dari penelitian ini adalah kecepatan proliferasi sel REF, viabilitas, kecepatan proliferasi, morfologi, dan morfometri sel REF pre- dan pasca-kriopreservasi pada tingkat pasase yang berbeda. Hasil penelitian menunjukkan bahwa sistem kultur eksplan dapat dilakukan pada sel REF. Sel REF pada pasase 6 memiliki tingkat proliferasi yang berbeda nyata (p < 0.05) dibandingkan sel REF pada pasase 2 dan 4. Nilai viabilitas sel REF pasca-kriopreservasi menggunakan DMSO tidak berbeda nyata (p > 0.05) dengan sel REF pre-kriopreservasi dan berbeda nyata dengan sel REF pasca-kriopreservasi menggunakan EG. Sel REF pasca-kriopreservasi menggunakan DMSO mampu berproliferasi dengan baik meskipun lebih lambat secara nyata (p < 0.05) dibandingkan pre-kriopreservasi. Dimethyl sulfoxide (DMSO) adalah krioprotektan yang dapat mempertahankan viabilitas dan proliferasi sel REF dengan baik. Kriopreservasi menyebabkan morfologi sel berubah dengan ukuran sel yang tidak berubah.
Keyword: rat embryonic fibroblast, kriopreservasi, viabilitas, proliferasi, morfologi
Judul: Evaluasi Penerapan Good Farming Practice pada Peternakan  Rakyat Sapi Potong di Situ Bolang Indramayu
Abstrak: Produktivitas ternak sapi potong domestik belum cukup untuk memenuhi kebutuhan dalam negeri. Sebanyak 90% peternakan sapi di Indonesia dikelola secara tradisional. Penelitian bertujuan mengevaluasi pengelolaan peternakan sapi potong di Peternakan Situ Bolang sesuai Peraturan Menteri Pertanian Republik Indonesia Nomor 46/Permentan/PK.210/8/2015 tentang Good Farming Practice untuk Sapi Potong. Penelitian menggunakan analisis deskriptif kualitatif wawancara kepada 33 responden menggunakan kuesioner dan pengamatan secara langsung. Hasil penelitian dapat dilihat dari nilai aspek Good Farming Practice yaitu pembibitan dan reproduksi, manajemen pakan, tata laksana pemeliharaan, perkandangan, dan kesejahteraan ternak. Penerapan GFP oleh peternak rakyat di Situbolang Indramayu mendapatkan nilai 2,05 tergolong dalam kategori sangat kurang., Domestic beef cattle productivity is not sufficient to meet domestic demand. As many as 90% of cattle farms in Indonesia are managed traditionally. The study aimed to evaluate the management of beef cattle farming in Situ Bolang Farm according to the Regulation of the Minister of Agriculture of the Republic of Indonesia Number 46/Permentan/PK.210/8/2015 about Good Farming Practice for Beef Cattle. The study used descriptive qualitative analysis of interviews with 33 respondents using questionnaires and direct observation. The results of the study can be seen from the value of aspects of breeding and reproduction, feed management, rearing procedures, cowshed, and animal welfare. Implementation of GFP by smallholder farmers in Situbolang Indramayu received a score of 2.05, which is classified as very lacking.
Keyword: beef catle, community farm, good farming practice
Judul: Pendugaan stok ikan biji nangka (upeneus sulphureus cuvier) dengan menggunakan metode swept area di Perairan Teluk Lampung
Abstrak: Pembangunan nasional khususnya sub sektor perikanan bidang kelautan mempunyai nilai yang strategis dan potensial untuk dikembangkan. Keterbatasan akan sumberdaya yang ada untuk pembangunan dan meningkatnya kebutuhan pangan, semakin mendorong kepada pemanfaatan surnberdaya hayati laut, khususnya ikan. Salah satu jenis ikan ekonomis penting adalah biji nangka atau kuniran. Metode yang terbaik untuk pendugaan stok sumberdaya ikan demersal adalah metode swept area. Prinsip yang digunakan dari metode ini adalah penyapuan dasar perairan dengan trawl dasar dan ikan yang tertangkap merupakan sumber data penelitian. Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Februari 1996 dengan mengikuti Cruise Ratu-Sebesi dengan KM. Stella Maris di perairan Teluk Lampung. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menduga padat sediaan, biomassa dan potensi lestari serta mengetahui hubungan panjang dan berat biji nangka (Upeneus sulphureus Cuvier) di perairan Teluk Lampung.
Keyword:
Judul: Studi In vivo Implan Tantalum Porous Lapis Hidroksiapatit pada Tikus Sprague Dawley: Gambaran Darah dan Pencitraan Radiografi
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui persembuhan luka, gambaran darah dan densitas radiografi implan tantalum porous lapis hidroksiapatit secara in-vivo pada tikus melalui pengamatan kondisi klinis, pemeriksaan pada respon darah tepi dan pencitraan radiografi. Sebanyak 12 ekor tikus Sprague Dawley jantan berumur ±3 bulan dibagi dalam tiga kelompok perlakukan: kelompok kontrol tanpa pemasangan implan, kelompok tantalum porous dan kelompok tantalum porous lapis hidroksiapatit. Implan berukuran 5 x 2 x 0.5 mm3 disisipkan pada tulang femur bagian medio lateral yang telah dikikis menggunakan bor tulang. Sampel darah diambil melalui vena ekor pada hari ke-0 sebelum operasi pemasangan implan, hari ke-14, 30 dan 60 setelah implantasi. Parameter yang diamati yaitu persembuhan luka, pemeriksaan darah lengkap dan pencitraan radiografi. Pengamatan persembuhan luka dilakukan pada hari ke-3, 7, dan 14 setelah implantasi. Pemeriksaan darah lengkap dilakukan pada hari ke-0 sebelum implantasi, hari ke-7, 14, 30, dan 60 setelah implantasi. Pencitraan radiografi dengan posisi lateral recumbency menggunakan radiografi diagnostik dilakukan pada hari-0, 7, 14, 30 dan 60 setelah implantasi. Selanjutnya densitas implan para radiogram dianalisis dengan menggunakan piranti lunak ImageJ®. Hasil pengamatan persembuhan luka, panjang luka dan pertumbuhan rambut tidak menunjukkan perbedaan yang nyata pada masing-masing kelompok perlakuan. Hasil perhitungan sel darah merah, hemoglobin, hematokrit, sel darah putih dan diferesial sel darah putih juga menunjukkan perbedaan yang tidak nyata pada masing-masing kelompok perlakuan. Hasil analisis densitas radiografi menunjukkan rata-rata densitas radiografi tantalum porous berlapis hidroksiapatit lebih rendah dibandingkan tantalum porous tanpa lapis hidroksiapatit. Kesimpulan, implantasi tantalum porous berlapis maupun tanpa lapis hidrokisiapatit tidak menunjukkan perbedaan yang nyata pada pengukuran parameter darah merah, darah putih dan densitas radiografi implan tantalum porous lapis hidroksiapatit lebih rendah dibandingkan tantalum tanpa lapis hidroksiapatit.
Keyword: Densitas radiografi, hidroksiapatit, implan biomaterial, in-vivo, parameter darah, tantalum porous.
Judul: Pengaruh Orientasi Sudut Lamina Terhadap Sifat Fisis dan Mekanis Papan Cross Laminated Bamboo (CLB) Lima Lapis
Abstrak: Cross laminated bamboo (CLB) merupakan pengembangan dari teknologi kayu lapis dengan lapisan laminasi silang dari vinir yang diketaui memiliki sifat-sifat yang unggul karena adanya penataan lapisan yang saling bersilangan. CLB dibuat dari bambu betung dengan ketebalan 4 cm (lima lapis) dari bilah yang berukuran 15 cm x 2 cm x 0.8 cm dan dengan orientasi sudut bilah (0o, 45o, dan 90o). Adapun perekat yang digunakan adalah perekat isosianat dengan berat labur 280 g/m2. Pengujian yang dilakukan meliputi sifat fisis (kerapatan, kadar air, kembang susut dan delaminasi), Sifat mekanis (MOE, MOR dan keteguhan geser rekat) dan pengujian kemampuan peredaman bunyi. Adanya variasi orientasi sudut bilah bambu diharapkan dapat meningkatkan kekuatan mekanis dan menurunkan kembang susut CLB. Hasil pengujian MOE, MOR dan keteguhan rekat CLB semakin menurun seiring dengan peningkatan sudut orientasi bilah-bilah bambu.
Keyword: Cross Laminated Bamboo, bambu betung, perekat isosianat, arah orientasi sudut bilah bambu
Judul: Diversity of Local Forage for Goats in Pidoli Lombang and Aek Banir Village, Panyabungan Subdistrict, Mandailing Natal Regency, North Sumatera
Abstrak: Bentuk topografi dan dinamika sosial yang berbeda di antara Desa Pidoli Lombang dan Aek Banir mempengaruhi sistem beternak yang diterapkan masyarakat. Desa Pidoli Lombang yang memiliki topografi datar dan lebih dekat dengan ibukota kecamatan menerapkan sistem pemeliharaan ternak kambing secara intensif. Sementara Desa Aek Banir yang memiliki tofografi berbukit dan terletak jauh dari ibukota kecamatan menerapkan sistem pemeliharaan ternak kambing secara semi intensif. Penelitian dilaksanakan di peternakan kambing rakyat Desa Pidoli Lombang dan Aek Banir. Metode yang digunakan adalah observasi langsung difokuskan pada pengamatan kandang kambing, memprediksi komposisi botani di kandang ternak, menimbang hijauan pakan yang diberikan pada ternak, menimbang ternak dewasa, wawancara dengan peternak dan pemotretan untuk dokumentasi. Pengamatan pemberian hijauan per hari hanya di lakukan di Desa Pidoli Lombang dengan sistem pemeliharaan intensif dengan menggunakan sampel 40 ekor kambing dari 4 orang peternak. Desa Pidoli Lombang memiliki 3 jenis kambing yaitu kambing Benggala, kambing Peranakan Benggala-Lokal dan kambing Kacang Lokal. Hijauan pakan diberikan peternak terbagi atas 3, yaitu kacangan (5 jenis), rumput (3 jenis) dan ramban (6 jenis). Spesies jenis kacangan yaitu Gliricidia sepium Jacq. Kunth ex. Walp, Leucaena leucocephala LAMK, Centrosema pubescens Benth, Pueraria javanica Benth. dan Calopogonium mucunoides Desv. Jenis rumput yaitu Brachiaria mutica Forssk, Panicum maximum Jacq var. Gatton dan Chloris barbata Swartz. Jenis ramban yaitu Manihot utillissima POHL, Ipomoea batata (L). Lam, Artocarpus heterophylus LAMK, Mikania micrantha HBK, Mangifera indica L. dan Ipomoea aquatic Forssk. Desa Aek Banir memiliki satu jenis kambing yaitu kambing Kacang Lokal. Jenis hijauan pakan diberikan peternak terbagi atas 3 yaitu kacangan (5 jenis), rumput (2 jenis) dan ramban (5 jenis). Jenis kacangan yaitu Gliricidia sepium Jacq. Kunth ex. Walp, Leucaena leucocephala LAMK, Centrosema pubescens Benth, Calliandra calothyrsus Meissn dan Calopogonium mucunoides Desv. Spesies jenis rumput yaitu Brachiaria mutica Forssk dan Cynodon dactylon L. PERS. Spesies jenis ramban yaitu Manihot utillissima POHL, Mikania micrantha HBK, Arenga pinnata (Wurmb) Merr, Lantana camara LINN dan Eugenia aquena BURM.f.
Keyword:
Judul: Identifikasi Infraspesies Fusarium oxysporum Asal Bukan Pisang dan Kemampuan Pindah Inangnya ke Tanaman Pisang.
Abstrak: Fusarium oxysporum memiliki beragam cara hidup yaitu saprob, endofit dan patogen. Fusarium oxysporum penyebab penyakit tanaman seringkali dinyatakan memiliki inang yang spesifik, misalnya penyebab penyakit layu Panama pada pisang adalah F. oxysporum fsp. cubense (Foc). Foc dikelompokan menjadi 4 ras berdasarkan kisaran kultivar pisang inangnya. Saat ini ras juga dapat diidentifikasi dengan primer spesifik ras. Institut Pertanian Bogor Culture Collection memiliki banyak koleksi F. oxysporum dari berbagai sumber bukan tanaman pisang yang belum diketahui identitas infraspesiesnya serta kemampuan pindah inangnya ke tanaman pisang. Oleh sebab itu identitas ras dari strain-strain F. oxysporum ini dan kemampuan pindah inang dari F. oxysporum ke tanaman pisang perlu diketahui sebagai dasar pertimbangan dalam pemilihan cara pengendaliannya. Identifikasi ke dalam ras 4 dan ras TR (Tropical Race) 4 dilakukan secara molekuler menggunakan tiga primer spesifik yaitu, TR4 F/R, TR4 F2/R1, dan Foc Sc 1/2. Kemampuan pindah inang dianalisis dengan cara uji patogenisitas terhadap tanaman pisang ambon dan tanduk. Identifikasi molekuler menunjukkan bahwa 11 (IPBCC 88.012, IPBCC 07.328, IPBCC 07.540, IPBCC 08.561, IPBCC 08.562, IPBCC 08.568, IPBCC 10.674, IPBCC 14.1236, IPBCC 14.1237, IPBCC 14.1238 dan IPBCC 14.1239) dari 15 strain yang diteliti adalah Foc TR4 dan dua strain lainnya (IPBCC 07.338 dan IPBCC 14.1242) termasuk Foc ras 4. Uji patogenisitas Foc IPBCC 88.012, 07.328, 08.561, 10.674 dan 14.1236 yang berturut-turut berasal mentimun, tanah, gubal gaharu, sarang serangga dan endofit pohon kina menunjukkan bahwa strain-strain ini mampu pindah inang ke tanaman pisang. Hal ini menunjukkan bahwa Foc tidak bersifat spesifik inang.
Keyword: Fusarium oxysporum, ras, patogenisitas, inang
Judul: Analisis Efisiensi dengan Pendekatan Data Envelopment Analysis (DEA) dan Pendapatan Usahatani Talas di Kecamatan Cijeruk, Kabupaten Bogor
Abstrak: Desa Tajur Halang dan Desa Cipelang merupakan sentra produksi talas di Kecamatan Cijeruk. Penggunaan input-input produksi yang tepat berperan penting dalam produksi yang berkualitas. Penggunaan input-input produksi yang berlebih dapat menurunkan kualitas produksi yang optimal. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menganalisis tingkat efisiensi usahatani talas dan menganalisis pendapatan usahatani talas di Desa Tajur Halang dan Desa Cipelang, Kecamatan Cijeruk, Kabupaten Bogor. Tingkat efisiensi usahatani talas dianalisis dengan Data Envelopment Analysis (DEA). Pendapatan usahatani talas dianalisis dengan analisis R/C rasio. Hasil analisis tingkat efisiensi usahatani talas menunjukkan bahwa terdapat 1 orang petani yang tidak efisien dalam menggunakan input-input produksi talas di Desa Tajur Halang, sedangkan di Desa Cipelang terdapat 6 orang petani yang tidak efisien dalam menggunakan input-input produksi talas. Pendapatan usahatani talas bagi petani yang tidak efisien memiliki pendapatan lebih rendah dibandingkan petani yang efisien di kedua desa yaitu Desa Tajur Halang dan Desa Cipelang. Besarnya pendapatan petani yang tidak efisien di Desa Tajur Halang sebesar Rp.(939.000) per m2, sedangkan di Desa Cipelang sebesar Rp 6 976 584 per m2. Dilihat dari status kepemilikan lahan, pada Desa Tajur Halang dan Desa Cipelang, pendapatan usahatani yang memiliki lahan sendiri lebih rendah daripada petani menggarap lahan garapan. Besarnya pendapatan usahatani yang memiliki lahan sendiri di Desa Tajur Halang sebesar Rp.(1.359.478) per m2, sedangkan pendapatan usahatani yang menggarap lahan garapan sebesar Rp 4.296.613 per m2. Lain halnya dengan Desa Tajur Halang, besarnya pendapatan usahatani yang memiliki lahan sendiri di Desa Cipelang sebesar Rp 5 619 186.63, sedangkan pendapatan usahatani yang menggarap lahan garapan sebesar Rp 9 363 100.87. Hal ini terjadi karena petani yang menggarap lahan Perhutani di Desa Cipelang tidak mengeluarkan biaya sewa atau biaya pajak tanah. Berdasarkan luas lahan yang digunakan, pendapatan usahatani di Desa Tajur Halang pada luas lahan lebih dari 1.633 m2 memiliki nilai paling tinggi dibanding luas lahan lainnya, yaitu sebesar Rp.8.018.627. Di Desa Cipelang, pendapatan usahatani pada luas lahan lebih dari 3.377 m2 memiliki nilai paling tinggi dibanding luas lahan lainnya, yaitu sebesar Rp 14.474.742.44..
Keyword: Data Envelopment Analysis (DEA), efisiensi, pendapatan usahatani, talas.
Judul: Analisis Strategi Pemasaran Dalam Membantu Penjualan UMKM Kerajinan Kerang Hijau Binaan PT PJB UP Muara Karang Jakarta
Abstrak: Perkembangan zaman menuntut semua masyarakat untuk terus berinovasi. Salah satunya adalah dalam bidang pemasaran, terutama pada sektor UMKM. Para pelaku usaha harus jeli dan mampu memanfaatkan perkembangan teknologi serta internet, karena dapat memudahkan dalam segi pemasaran serta mampu mengefisienkan dan mengefektifkan biaya dalam penjualan dan pelayanan pelanggan. Penelitian ini bertujuan menetapkan strategi pemasaran dalam membantu penjualan UMKM Kerajinan Kerang Hijau. Jenis data yang digunakan pada penelitian ini adalah data primer dan data sekunder, data primer di peroleh dari hasil observasi dan wawancara dengan pemilik UMKM Kerajinan Kerang Hijau binaan PT PJB UP Muara Karang, Dinas UMKM, Konsultan IT, Pemerintah Daerah serta data sekunder diperoleh dari studi literatur, internet, instansi terkait. Pengolahan data penelitian ini menggunakan Analisis SWOT dan dipilih strategi Pemasaran yang terbaik menggunakan Analisis Hierarki Proses (AHP). Hasil dari penelitian ini berupa alternatif strategi yang bisa diterapkan yaitu penetrasi pasar.
Keyword: pemasaran, promosi, UMKM
Judul: Prediksi Fryer dengan Penggemukan Kelinci Muda
Abstrak: Pakan merupakan faktor utama untuk pertumbuhan ternak, termasuk kelinci, mempelajari pengaruh pakan yang berbeda terhadap produksi fryer, maka dilakukan penelitian mengenai produksi fryer dengan penggemukan kelinci muda berdasarkan pengaruh perlakuan pemberian pakan yang berbeda.
Keyword:
Judul: Hubungan suhu dan salinitas terhadap hasil tangkapan bubu Buton di Teluk Belebuh, Lampung Selatan
Abstrak: Penelitian dilakukan di Perairan Teluk Belebuh, Lampung Selatan dari bulan Juli sampai dengan Oktober 1996. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh suhu dan salinitas terhadap hasil tangkapan serta mengetahui jenis dan komposisi hasil tangkapan dari alat tangkap bubu kawat tipe buton. Metode yang digunakan adalah experimental fishing, dimana penelitian tersebut langsung dilakukan di lapangan. Data yang diperoleh di analisis dengan Regresi Linear Berganda. Metode tersebut digunakan untuk menduga seberapa besar pengaruh suhu dan salinitas terhadap hasil tangkapan. Uji-f digunakan untuk mengetahui pengaruh bersama-sama faktor yang digunakan, sedangkan Uji-t digunakan untuk melihat pengaruhnya secara parsial terhadap hasil tangkapan. Nilai suhu di Pantai Pulau Sekepal yang tertinggi saat hauling pagi yaitu 30.0°C dan nilai suhu terendah yaitu 26.0°C dengan nilai rata-rata 28.6°C, sedangkan pada saat hauling sore, nilai suhu tertinggi sebesar 31.5°C dan nilai suhu terendahnya yaitu 28.0°C dengan nilai rata-rata 30.2°C. Hasil pengukuran salinitas di Pantai Pulau Sekepal saat hauling pagi menunjukan nilai tertinggi sebesar 35% dan terendah 29.0%, serta mempunyai rata-rata 31.7%0 sedangkan salinitas saat hauling sore mempunyai nilai tertinggi sebesar 34.2%, dan nilai terendah pada 27.5%%% dengan rata-rata 30.700. Hasil tangkapan yang diperoleh terdiri dari 10 famili dengan 96 ekor saat hauling pagi dan 11 famili dengan 155 ekor saat hauling sore. Jenis ikan yang dominan tertangkap saat hauling pagi dan sore adalah famili Labridae. ...
Keyword:
Judul: Perbandingan Struktur 3D PfHT pada Sistem Air dan n-Hexane dengan Metode Pendekatan Simulasi Dinamika Molekul
Abstrak: Plasmodium falciparum Hexose Transporter (PfHT) adalah protein pembawa di bagian dalam membran fosfolipid bersifat hidrofobik yang memediasi glukosa ke dalam tubuh parasit. Penelitian ini bertujuan membandingkan struktur 3D PfHT dalam dua sistem berbeda dengan sistem n-Hexane sebagai pelarut nonpolar dan sistem air sebagai pelarut pembanding. Sebanyak 2 struktur tiga dimensi dari PfHT didapatkan dari hasil simulasi dinamika molekul selama 50 ns dan dianalisis dengan sembilan parameter: RMSD, RMSF, energi, jumlah ikatan hidrogen, struktur sekunder, SASA, visualisasi, plot Ramachandran, dan interaksi ionik. Hasil penelitian menunjukkan PfHT dalam sistem n-Hexane yang dibandingkan dengan sistem air, yaitu terdapat perubahan sebagian struktur α-helix serta muncul kemungkinan bahwa struktur tidak sepenuhnya hidrofobik, struktur dinilai baik dari segi energinya yang rendah, kualitas struktur didapatkan kurang sesuai sebagai pelarut tunggal karena ada kemungkinan bahwa sebagian struktur PfHT terletak pada bagian luar membran fosfolipid bilayer yang bersifat hidrofilik., Plasmodium falciparum Hexose Transporter (PfHT) is a carrier protein inside the hydrophobic phospholipid membrane that mediates glucose into the parasite body. This study aims to compare the 3D structure of PfHT in two different systems with the n-Hexane system as a nonpolar solvent and the water system as the comparative solvent. A total of 2 three-dimensional structures from PfHT were obtained from the molecular dynamics simulations for 50 ns and analyzed using nine parameters: RMSD, RMSF, energy, number of hydrogen bonds, secondary structure, SASA, visualization, Ramachandran plot, and ionic interactions. The results showed PfHT in the n-Hexane system compared to the water system, namely that there was a change in part of the α-helix structure, the possibility also arose that the structure was not entirely hydrophobic, the structure was considered acceptable in terms of its low energy, and the quality of the structure was found to be less suitable as a single solvent, mainly because there is a possibility that some parts of the PfHT structure actually lie on the outside of the hydrophilic phospholipid bilayer membrane.
Keyword: molecular dynamics simulation, PfHT, Plasmodium falciparum