arulpm/triplet_large huggingface dataset:
Judul: Analisis Produktivitas Kelapa Sawit dengan Indeks Vegetasi Satelit Landsat-8, Curah Hujan dan Manajemen Pemupukan
Abstrak: Taksasi merupakan salah satu metode estimasi produktivitas kelapa sawit yang penting digunakan dalam penentuan keputusan perkebunan di kemudian hari. Kesalahan pengambilan data yang digunakan dalam taksasi dapat menimbulkan masalah di dalam perencanaan kebutuhan tenaga kerja dan transportasi yang dibutuhkan sehingga akan meningkatkan biaya pengelolaan yang tinggi. Memanfaatkan penginderaan jauh dapat digunakan untuk menganalisis data perkebunan kelapa sawit yang memiliki luas perkebunan yang begitu luas menjadi lebih feasible dan reliable. Tujuan dari penelitian ini adalah menghitung nilai indeks vegetasi citra Landsat-8, menentukan persamaan regresi linear berganda untuk estimasi produktivitas kelapa sawit, mengetahui uji tingkat signifikansi (sig. F), uji akurasi dan uji determinasi (R2) model estimasi produktivitas dan menentukan model terbaik estimasi produktivitas kelapa sawit PT Socfin Indonesia. Estimasi dilakukan dengan menggunakan 1, 2 dan 3 variabel bebas. Dilakukan pergeseran beberapa bulan kebelakang pada masing-masing kombinasi variabel bebas. Pendugaan produktivitas menggunakan data pergeseran bulan kebelakang (M-3, M-6, M-12 untuk 6 bulan dan M-6, M-12, dan M-24 untuk 12 bulan). Model estimasi diberi skor pada masing-masing uji, pembobotan digunakan untuk memilih model terbaik. Kombinasi model dengan parameter curah hujan lapangan, pupuk dan indeks vegetasi EVI, pergeseran 6 bulan yang terpilih sebagai model terbaik., Estimation is one of the methods of forecasting oil palm productivity which is important to use in determining future plantation decisions. inaccurate data collection can cause problems in planning the required workforce and transportation requirements, and causing high management costs. Remote sensing can be used to analyze data on vast plantation oil palm plantations to be more feasible and reliable. The purpose of this study is to calculate the Landsat-8 image vegetation index, determine the multiple linear regression for estimating oil palm productivity, significance test (sig. F), accuracy test and determination test (R2) of the productivity estimation model and lastly determine the best model for PT Socfin Indonesia's estimated palm oil productivity. Estimation using 1, 2 and 3 combination independent variables. Estimation of productivity uses data months backwards (M-3, M-6, M-12 for 6 months and M-6, M-12, and M-24 for 12 months). Weight used on each to each test, to determine the best model. Models with parameters CHIRPS rainfall, fertilizer and EVI vegetation index, 6 months shift was chosen as the best model.
Keyword: estimasi produktivitas, indeks vegetasi, kelapa sawit, landsat-8, pengideraan jarak jauh
Judul: Characteristics of Mayonnaise with The Addition of Belly and Trimming Oil from By-Product of The Catfish (Pangasius hypopthalmus) Processing Industry
Abstrak: Mayones adalah saus berwarna kuning pucat dengan tekstur yang kental dan creamy. Mayones dapat dibagi menjadi 2 bagian utama tergantung pada jumlah minyak yang digunakan. Mayones umumnya terbuat dari minyak nabati seperti minyak kelapa sawit dan minyak kedelai. Alternatif lain yang dapat digunakan yaitu penambahan minyak ikan. Minyak ikan dapat diperoleh dari ikan-ikan yang mengandung lemak, misalnya ikan patin. Ikan patin berpotensi untuk diekstrak minyaknya. Biasanya ikan patin di Indonesia diolah atau disajikan dalam bentuk filet. Industri filet ikan patin menghasilkan by-product yang selama ini dimanfaatkan sebagai bahan baku pembuatan pakan dengan nilai jual yang rendah padahal keberadaan hasil samping tersebut sangat berlimpah. Berdasarkan penjelasan di atas maka perlu dilakukan inovasi pemanfaatan minyak ikan yang dihasilkan dari by-product industri pengolahan untuk selanjutnya diolah menjadi produk pangan yang bernilai tambah salah satunya adalah mayones. Bahan utama yang digunakan untuk pembuatan mayones yaitu minyak yang diekstraksi dari bagian belly dan dari daging sisa trimming ikan patin yang merupakan hasil samping pengolahan yang diperoleh dari perusahaan pengolahan ikan yaitu PT. Adib Global Food Supplies, Karawang. Bahan lain yang digunakan yaitu kuning telur ayam, air perasan jeruk nipis, gula, garam, air hangat, lada, mustard, gom, dan natrium benzoat. Pembuatan mayones dilakukan dengan mencampurkan minyak ikan dan minyak jagung dengan perlakuan yang diberikan yaitu konsentrasi minyak ikan dan minyak jagung yang berbeda. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan formulasi terbaik yang dibuat dengan penambahan minyak ikan belly dan trimming berdasarkan uji stabilitas emulsi, viskositas, pH, warna, proksimat, organoleptik, dan mikrobiologi. Penelitian ini menggunakan desain eksperimental di laboratorium. menggunakan metode Rancangan Acak Lengkap (RAL) Faktorial yang terdiri atas 2 faktor yaitu minyak ikan yang diekstrak dari sumber yang berbeda (belly dan trimming) dan perbedaan konsentrasi rasio minyak ikan yang ditambahkan (45%; 40%; 35%; dan 30%). Apabila terdapat beda nyata, dilakukan uji lanjut Duncan. Data organoleptik sebagai data nonparametrik dianalisis menggunakan uji Kruskal Wallis dan apabila berpengaruh nyata dilanjutkan dengan uji lanjut Mann¬¬-Whitney U test. Hasil penelitian menunjukkan bahwa mayones formulasi terbaik yaitu mayones F2c yang terdiri dari 40% minyak trimming:60% minyak jagung, kemudian mayones F1d yang terdiri atas 45% minyak belly:55% minyak jagung.
Keyword: by-product, mayones, minyak ikan, Pangasius hypopthalmus
Judul: Telaah Sistem Informasi Program Pemberdayaan Daerah dalam Mengatasi Dampak Krisis Ekonomi
Abstrak: Dalam rangka penanggulangan akibat krisis ekonomi. Pemerintah mencanangkan program Perluasan Jaring Pengaman sosial (pJPS) meliputi enam belas program. Salah satu program diantaranya adalah program "Pemberdayaan Daerah dalam Mengatasi Dampak Krisis Ekonomi", (PDM-DKE) yang ditujukan untuk menanggulangi pengangguran dan kemiskinan akibat krisis ekonomi. Pada karya ilmiah ini penulis melakukan analisis secara teoritis terhadap sistem informasi program PDM-DKE dalam menghasilkan informasi untuk mendukung pemberian bantuan, pemantauan pelaksanaan, penilaian keberhasilan pelaksanaan program, dan men perbaikan formulir input program PDM-DKE.
Keyword:
Judul: Estimasi Volume dan Analisis Nilai Tambah Distribusi Daging Babi di DKI Jakarta.
Abstrak: Daging babi merupakan sumber protein hewani yang harganya murah dan tersedia di pasaran. Daging babi didistribusikan oleh berbagai pelaku usaha yang terlibat dalam rantai pasok daging babi. Efisiensi dalam proses distribusi akan sangat berpengaruh pada harga pembelian oleh konsumen. Tujuan dari penelitian ini adalah menduga volume daging babi yang didistribusikan di DKI Jakarta dan melakukan analisis terkait dengan adanya nilai tambah yang dihasilkan dalam jaringan distribusi rantai pasok daging babi. Metode yang digunakan adalah analisis finansial dan analisis deskriptif. Hasil dari penelitian ini menunjukan bahwa estimasi volume penjualan harian daging babi di DKI Jakarta sebesar 14 577.43 kg per hari dengan estimasi penjualan setiap pedagang sebesar 133.74 kg setiap hari. Setiap pelaku usaha dalam rantai menciptakan nilai tambah yang berbeda-beda. Nilai profitabilitas dan nilai tambah setiap pelaku usaha dalam distribusi daging babi di DKI Jakarta dipengaruhi berbagai hal seperti biaya total dan penerimaan total, tenaga kerja, jumlah produksi, dan nilai input-output produksi.
Keyword: daging babi, distribusi, estimasi volume, efisiensi, nilai tambah
Judul: Mempelajari pengaruh waktu fermentasi dalam pembuatan brem padat biji nangka(Artocarpus heterophillus)
Abstrak: Penelitian ini merupakan salah satu usaha mencari bahan baku pembuatan brem padat selain beras ketan dan merupakan langkah awal pemanfaatan biji nangka yang selama ini masih dianggap sebagai limbah. Proses pembuatan brem padat biji nangka meliputi fermentasi biji nangka, penghancuran tape biji nangka, pemerasan, pemasakan sari tape biji nangka, pengadukan, pencetakan dan pengeringan. Untuk membuat brem padat dari biji nangka diperlukan beberapa bahan tambahan, yaitu glukosa, dekstrin dan putih telur. Hasil penelitian menunjukan bahwa untuk memperoleh brem padat biji nangka dengan sifat-sifat yang mirip brem padat beras ketan diperlukan penambahan glukosa dan dekstrin sebesar 70 persen dengan perbandingan glukosa dekstrin= 71 dan putih telur sebesar 2 persen sebagai whipping agent. Dalam penelitian ini dipelajari pengaruh lama fermen- tasi (2,3,4,5 hari) dan suhu pemasakan (60°C, 70°C, 80°C) terhadap sifat-sifat brem padat biji nangka yang dihasilkan. ...
Keyword:
Judul: Chemosystematics of Genus Alpinia Subsection Cenolophon through Metabolomics Appoarch
Abstrak: Alpinia merupakan salah satu genus dari Zingiberaceae yang banyak ditemukan di kawasan tropis termasuk Indonesia. Beberapa anggota Alpinia telah mengalami pengelompokan ke dalam subseksi, salah satunya adalah subseksi Cenolophon. Pendekatan morfologi telah dilakukan untuk mengelompokkan anggota subseksi tetapi perlu ada pendekatan lain untuk mempertegas pengelompokan tersebut, salah satunya adalah kemosistematik. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis senyawa metabolit tak tertarget pada genus Alpinia subseksi Cenolophon sebagai dasar perbedaan antar spesies dengan penanda kimia. Metode yang dilakukan berupa identifikasi morfologi, ekstraksi rimpang, analisis metabolomik dan analisis data. Identifikasi morfologi menunjukkan spesies Alpinia pusilla memiliki pangkal daun berbeda dengan spesies subseksi lainnya. Senyawa Valganciclovir, 2-hydroxyisobutyric, 8-Chlro-1-tetrahydronorharmanone, 3-FUROIC ACID, 4-Vinylphenol merupakan kandidat penanda kimia pada spesies subseksi Cenolophon. Spesies A. pusilla memiliki jarak perbedaan paling besar terhadap spesies lainnya., Alpinia is one of the genera of Zingiberaceae that is commonly found in tropical areas including Indonesia. Several members of Alpinia are grouped into subsection categories, one of which is the Cenololphon subsection. Clustering the member of the subsection based on morphological characters has been carried out but another appoarch is needed to emphasize the grouping, one of them is chemosystematics. The study aimed to analyze untargeted metabolites of the genera Alpinia subsection Cenolophon as the chemical marker basis for differentiation among species. The methods used are morphology identification, rhizome extraction, metabolomics analysis and data analysis. Morphological identification shows that Alpinia pusilla has a different leaf base from other subsection species. Valganciclovir, 2-hydroxyisobutyric, 8-Chlro-1-tetrahydronorharmanone, 3-FUROIC ACID, 4-Vinylphenol compound are candidate chemical markers in subsection Cenolophon species. Species A. pusilla has the greatest distance different from other species.
Keyword: Untargeted metabolite, Chemical markers, Morphology, Rhizome
Judul: Analisis Dinamika Model Hubungan Romantis pada Kasus Pasangan Komplementer
Abstrak: Dalam penelitian ini dianalisis perilaku dinamik model hubungan romantis pasangan komplementer Romeo dan Juliet dengan Romeo yang memiliki kepribadian narsistik (individu yang selalu menginginkan lebih banyak cinta) dan Juliet yang memiliki kepribadian waspada (menanggapi perasaan cinta dengan positif). Model ini memiliki dua titik tetap, dengan salah satu titik tetapnya bersifat sadel. Dinamika model dibagi menjadi dua kasus yaitu parameter tingkat perubahan perasaan Romeo akibat perasaannya sendiri (a) dan parameter tingkat perubahan perasaan Juliet akibat interaksinya dengan Romeo (d). Pada kondisi a<d, hubungan romantis Romeo dan Juliet semakin lama akan semakin menghilang. Saat kondisi a=d, maka hubungan romantis Romeo dan Juliet akan terus berubah dari cinta ke benci dan sebaliknya hingga akhirnya hilang dalam waktu yang lama. Sedangkan saat kondisi a>d, perasaan Romeo dan Juliet akan terus berubah dari cinta ke benci dan sebaliknya sampai waktu yang tidak dapat ditentukan. Jadi agar pasangan ini selalu memiliki hubungan romantis, maka nilai perasaan Juliet akibat interaksinya dengan Romeo harus lebih kecil dibandingan perasaan Romeo., This study analyzed the dynamic behavior of the romantic relationship model of the complementary couple Romeo and Juliet with Romeo who has a narcissistic personality (an individual who always wants more love) and Juliet who has a wary personality (responds to love feelings positively). This model has two fixed points, with one of the fixed points being a saddle. The dynamics of the model is divided into two cases, namely the parameter of the level of change in Romeo's feelings due to his own feelings (a) and the parameter of the level of change in Juliet's feelings due to her interaction with Romeo (d). In condition a<d, Romeo and Juliet's romantic relationship will gradually disappear. When condition a = d, Romeo and Juliet's romantic relationship will continue to change from love to hate and vice versa until it finally disappears for a long time. Meanwhile, during the a>d condition, Romeo and Juliet's feelings will continue to change from love to hate and vice versa for an undetermined time. So in order for this couple to always have a romantic relationship, the value of Juliet's feelings due to her interaction with Romeo must be smaller than Romeo's feelings.
Keyword: system dynamics, love dynamics model, stability
Judul: Physical chemical Properties and Organoleptic Test of Gelato with Additional Carrot (Daucus carota L.) Extract
Abstrak: Sifat Fisik Kimia dan Organoleptik Gelato dengan Penambahan Ekstrak Wortel (Daucus carota L.). Dibimbing oleh MOCH SRIDURESTA SOENARNO dan MUHAMAD ARIFIN Susu adalah makanan dengan nilai kandungan gizi lengkap dan seimbang seperti protein, karbohidrat, lemak, mineral, dan vitamin. Es krim memiliki kandungan gizi yang cukup lengkap meliputi lemak, protein, karbohidrat, vitamin, fosfor, kalsium, dan mineral lainnya. Fosfor dan kalsium Penelitian ini bertujuan menganalisis karakteristik fisik, kimia dan uji organoleptik gelato dengan penambahan ekstrak wortel. Penelitian menggunakan Rancangan Acak Lengkap (RAL) tiga kali ulangan dengan perlakuan penambahan ekstrak sebanyak 0%,7%, 14%. Data yang diperoleh dianalisis menggunakan analysis of variance (ANOVA) dengan selang kepercayaan 95%. Data hasil uji organoleptik dianalisis menggunakan uji non parametrik Kruskal-Wallis. Hasil penelitian menunjukan tidak berpengaruh nyata (P>0,05) terhadap daya leleh, kadar protein, sifat hedonik warna, aroma, rasa dan tekstur. Penambahan ekstrak wortel berpengaruh nyata (P<0,05) terhadap pH dan overrun, uji hedonik intensitas rasa, uji mutu hedonik rasa, aroma, warna dan tekstur, dan formulasi gelato dengan penambahan ekstrak wortel sebanyak 7% menjadi formulasi terbaik yang disukai panelis berdasarkan uji hedonik dan uji mutu hedonik., Physical chemical Properties and Organoleptic Test of Gelato with Additional Carrot (Daucus carota L.) Extract. Supervised by MOCH SRIDURESTA SOENARNO dan MUHAMAD ARIFIN Milk is a food with complete and balanced nutritional value such as proteins, carbohydrates, fats, minerals, and vitamins. Ice cream has a fairly complete nutritional content including fat, protein, carbohydrates, vitamins, phosphorus, calcium, and other minerals. This study aimed to analyze the physical, chemical and organoleptic characteristics of gelato with the addition of carrot extract. The study used a complete randomized design (RAL) with three repetation with the addition of 0%, 7%, 14% extract treatment. The data obtained has analyzed by analysis of variance (ANOVA) with a 95% confidence interval. The organoleptic test result data were analyzed using the Kruskal-Wallis non-parametric test. The results showed no significant effect (P>0.05) on melting power, protein content, hedonic properties of color, aroma, taste and texture. The addition of carrot extract has a significant effect (P<0.05) on pH and overrun, hedonic test of taste intensity, and hedonic quality test of taste, aroma, color and texture, and gelato formulation with the addition of carrot extract as much as 7% became the best formulation preferred by panelists based on hedonic tests and hedonic quality tests.
Keyword: Carrot Extract, Chemical Properties, Gelato, Organoleptic Test, Physical Properties
Judul: Analisis pemindahan lokasi ibukota kabupaten (Studi kasus kabupaten DT II Agam, Provinsi DT I Sumatera Barat)
Abstrak: Untuk mengurangi ketimpangan dalam pembangunan maka setiap pembanqunan atau perubahan menqhendaki adanya penetapan lokasi. Persoalan lokasi merupakan persoalan pemilihan tempat yang sesuai dalam arti dapat memberikan efisiensi bagi suatu kegiatan tertentu, dilihat dari kegiatan itu sendiri maupun dari kaitannya dengan keqiatan di tempat-tempat lain.
Keyword:
Judul: Potensi Plantarisin F Rekombinan Dengan Penambahan Edta Dalam Menghambat Salmonella Sp. 38
Abstrak: Salmonella sp. 38 tergolong dalam bakteri gram negatif, yang diisolasi dari feses anak-anak penderita diare. Penggunaan antibiotik untuk pengobatan diare dapat menimbulkan resistensi bakteri, sehingga diperlukan alternatif pengobatan lain. Plantarisin F rekombinan yang dihasilkan Lactococcus lactis pNZ8148 Pln F dapat menjadi alternatif antibakteri alami. Aktivitas antibakteri plantarisin F terhadap bakteri gram negatif dapat ditingkatkan dengan penambahan EDTA. Penelitian ini bertujuan menguji potensi antibakteri plantarisin F rekombinan dengan penambahan EDTA terhadap Salmonella sp. 38. Metode awal adalah memproduksi plantarisin dengan menumbuhkan L. lactis pNZ8148 rekombinan F pada media M17 glukosa. Uji aktivitas antimikroba plantarisin dilakukan secara kualitatif menggunakan metode difusi agar. Purifikasi plantarisin menggunakan amonium sulfat 80% dan kolom filtrasi Sephadex G50. Sampel hasil purifikasi diukur bobot molekul proteinnya menggunakan elektroforesis SDS-PAGE. Plantarisin hasil produksi dan purifikasi diukur konsentrasi proteinnya menggunakan BCA kit. Sampel hasil purifikasi ditambahkan EDTA dengan konsentrasi 1 mM, 5 mM 10 mM dan 20 mM. Hasil produksi diperoleh 200 mL supernatan bebas sel. Hasil purifikasi dengan amonium sulfat 80% menunjukkan aktivitas plantarisin sebesar 14,78 AU/mg dengan kandungan protein sebanyak 13,54 mg. Hasil purifikasi dengan kolom filtrasi Sephadex G-50 menunjukkan aktivitas plantarisin sebesar 22,01 Au/mg dengan kandungan protein sebanyak 5,77 mg. Hasil pengukuran menggunakan elektroforesis SDS-PAGE 16% menunjukan bobot molekul plantarisin F adalah 3,85 kDa. Penambahan 20 mM EDTA pada plantarisin F rekombinan memperlihatkan peningkatan aktivitas antibakteri paling tinggi.
Keyword: EDTA, Lactococcus lactis, Plantarisin F rekombinan, Salmonella sp. 38
Judul: Analisis finansial perubahan kebun campuran kayu manis, Cinnamomum burmanii BI. menjadi kebun campuran kakao, Theobroma cacao L. : studi kasus di Nagari Guguak VIII Koto, Kecamatan Guguak, Kabupaten Lima Puluh Kota, Propinsi Sumatera Barat
Abstrak: Untuk mendukung pembangunan masa depan pertanian dan ekonomi Indonesia yang bertumpu pada hutan dikembangkanlah suatu konsep pertanian di lahan hutan atau agroforestri. Penggunaan konsep ini sebenarnya sudah lama dilakukan oleh masyarakat tradisional sebagai suatu tradisi. Salah satu contohnya di daerah Sumatera Barat dikenal istilah parak yaitu suatu sistem agroforestri kebun campuran yang memiliki ciri-ciri keanekaragaman spesies dan kerapatan hutan yang tinggi, serta struktur vertikal yang kompleks dan bertingkat-tingkat yang keberadaannya sangat penting bagi kehidupan masyarakat. Salah satu jenis tanaman utama yang diusahakan petani pada lahan kebun campuran adalah kayu manis (Cinnamomum burmanii Bl.). Namun, saat ini seiring dengan banyaknya permasalahan yang melanda kayu manis, seperti harga kayu manis yang murah di pasaran, waktu panen yang lama dan hasil yang tidak kontinyu menyebabkan sebagian petani beralih tanam kepada tanaman kakao (Theobroma cacao L.) yang diperkirakan mampu memberikan pendapatan yang lebih terjamin bagi petani serta memiliki hasil yang berkesinambungan.
Keyword: kayu manis, finansial
Judul: Analisis Relasi Sosial antara Warga Masyarakat dengan Para Pemangku Kepentingan Taman Nasional Gunung Halimun Salak Terkait Akses Sumberdaya Hutan Lokapurna
Abstrak: The objectives of this research is, firstly, to analyze the history and dynamics of the access of local community over Lokapurna’s forest area. Secondly, to analyze the effect of changing social relations between local community and the stakeholders of Lokapurna’s forest of the Gunung Halimun Salak National Park. A survey method supported with qualitative data is applied. The results show that, first, up to present, the governance regime and property right of Lokapurna’s forest has been changing three times. Initially, the Lokapurna’s forest classified as protection forest of common pool state property, then changes to production forest of common pool private property, and lastly became conservation forest or national park of common pool state property. Second, the social relations between local community and their stakeholders are classified as “marginal”. The local community viewed the opportunity of cooperation and threat from their stakeholder as medium level
Keyword:
Judul: Deteksi perubahan penutupan lahan menggunakan citra satelit landsat ETM+ di Daerah Aliran Sungai (DAS) Juwana, Jawa Tengah
Abstrak: Daerah Aliran Sungai (DAS) Juwana yang memiliki Daerah Tangkapan Air yang cukup luas yang tersebar antara Perbukitan Kendeng Utara, Perbukitan Pati Ayam dan Gunung Muria, memiliki peranan yang penting bagi masyarakat sekitar. Namun kondisi sekarang ini diperkirakan telah terjadi perubahan lahan yang cukup besar baik itu pada sektor kehutanan, pertanian maupun sektor lainnya. Saat ini di kawasan DAS Juwana terdapat lahan kritis yang cukup luas akibat pengelolaan lahan yang salah atau tidak sesuai dengan kaidah konservasi. Perubahan yang terjadi ini perlu dimonitor guna menentukan kebijakan yang tepat.
Keyword:
Judul: Prediction of T-Cell Epitope Candidate Targeting Conserved-KRAS for Cancer Vaccine using Reverse Vaccinology Approach
Abstrak: Kanker merupakan penyebab kematian kedua terbesar di dunia. Sebanyak 9.6 juta kematian manusia di dunia disebabkan oleh kanker. Kurang lebih sepertiga penderita kanker mengalami mutasi gen KRAS. Mutasi gen KRAS banyak terjadi pada kanker pankreas (90%), kanker kolon (30-40%), dan kanker paru (15-25%). Pendekatan reverse vaccinology dapat mempermudah pengembangan vaksin penyakit yang sebelumnya sulit dan tidak mungkin diproduksi. Penelitian ini bertujuan untuk merancang kandidat epitop sel-T dengan target conserved-KRAS sebagai imunoterapi kanker. KSFEDIHHY merupakan kandidat epitop terbaik yang dihasilkan dari rangkaian penelitian yang dilakukan. Kandidat epitop ini memiliki skor imunogenisitas yang baik, diprediksi dapat berikatan dengan banyak supertipe HLA, bersifat non-alergen dan non-toksik. KSFEDIHHY dapat berikatan dengan HLA B*57:01 dengan affinitas -7.8 kkal/mol. Prediksi ikatan antara peptida dan HLA yang telah dilakukan baik berdasarkan sekuens maupun berdasarkan struktur ini menunjukkan KSFEDIHHY potensial untuk dikembangkan sebagai kandidat epitop untuk vaksin kanker., Cancer is the second cause of death in the world. There are 9.6 million deaths caused by cancer. Approximately one third of cancer patients have the KRAS gene mutation. KRAS gene mutations occur mostly in pancreatic cancer (90%), colon cancer (30-40%), and lung cancer (15-25%). The reverse vaccinology approach can ease the difficulties and impossiblities to produce vaccine. This study aims to design T-cell epitopes candidate targeting the conserved-KRAS as cancer immunotherapy. KSFEDIHHY is the best epitope candidate from a series of assays conducted. This candidate epitope has a good immunogenicity score, predicted to be able to bind with many HLA supertypes, non-allergenic and non-toxic. KSFEDIHHY can make a complex with HLA B*57:01 with binding affinity -7.8 kcal/mol. Prediction analysis for both sequence-based and structure-based shows that KSFEDIHHY has the potential to be developed as an epitope candidate for cancer vaccines.
Keyword: reverse vaccinology, HLA class I, T-cell epitope