arulpm/triplet_large huggingface dataset:
Judul: Deteksi Spesies Mamalia Menggunakan DNA Lingkungan dari Kubangan Garam Alami Adudu, Suaka Margasatwa Nantu, Gorontalo, Sulawesi.
Abstrak: Deteksi keberadaan spesies mamalia merupakan langkah penting dalam penilaian keanekaragaman hayati dan pengelolaan populasi satwaliar di habitat alami. Sejumlah penelitian terdahulu menunjukkan keberhasilan pendekatan metabarkoding eDNA dalam mendeteksi keberadaan spesies-spesies mamalia. Sebagian mamalia terestrial diketahui memanfaatkan kubangan garam alami sebagai sumber mineral di dalam diet dan meninggalkan material genetik yang dapat digunakan untuk mendeteksi keberadaan spesies mamalia. Penelitian ini bertujuan untuk menguji dan mengevaluasi keandalan metode metabarcoding eDNA menggunakan primer MiMammals dari penanda 12S rRNA dalam mendeteksi spesies mamalia endemik Sulawesi dari sampel air kubangan garam alami Adudu. Penelitian ini dilakukan di kubangan garam alami Adudu, Suaka Margasatwa Nantu, Gorontalo, Indonesia. Kerja lapangan dilakukan pada pertengahan September 2017. Prosedur metabarkoding eDNA telah dilakukan untuk mendeteksi keberadaan mamalia dari kubangan garam alami ini. Sampel air dari kubangan garam alami tersebut difilter dan kemudian DNA lingkungan diekstraksi menggunakan DNeasy Blood and Tissue kit. Kemudian pustaka amplikon disusun melalui amplifikasi PCR dan sekuensing menggunakan platform MiSeq Illumina. Pengolahan data sekuen dan penentuan taksonomi dilakukan menggunakan dua platform bioinformatika, PipeCraft-1.0 dan OBITools-1.2.13. Tiga sampel DNA berhasil diekstraksi dan digunakan untuk penyusunan pustaka amplikon. Proses penyaringan kualitas dan penggabungan R1 dan R2 menghasilkan 131.275 urutan basa dengan panjang minimum 161 pb, panjang maksimum 252 pb, dan panjang rata-rata 232 pb. Pemrosesan reads menghasilkan urutan basa yang akan dikelompokkan untuk menyusun tabel OTU, penentuan taksonomi mencari urutan basa yang sangat mirip di dalam database referensi untuk menentukan identitas mamalia Sulawesi hingga tingkat spesies. Dua spesies mamalia Sulawesi berhasil dideteksi, yaitu anoa dataran rendah (Bubalus depressicornis) dan babirusa (Babyrousa babyrussa). Reads yang teridentifikasi sebagai babirusa Buru (Babyrousa Babyrussa, Linnaeus, 1758) kemungkinan besar adalah false-positive, karena lokasi studi tidak termasuk ke dalam range distribusi alami dari spesies ini. Kemungkinan urutan basa tersebut seharusnya teridentifikasi sebagai babirusa Sulawesi Utara (Babyrousa celebensis, Deninger, 1910). Keakuratan identifikasi spesies mamalia menggunakan metabarcoding eDNA dipengaruhi oleh prosedur metabarkoding eDNA, ketersediaan database referensi, dan perilaku mamalia.
Keyword: eDNA, mamalia Sulawesi, metabarkoding, 12S rRNA, kubangan garam alami
Judul: Karakterisasi Berbagai Aksesi Sagu (Metroxylon spp.) di Distrik Aimas Kabupaten Sorong, Papua Barat
Abstrak: Potensi pati yang tinggi pada sagu dapat dimanfaatkan sebagai salah satu sumber tanaman penghasil karbohidrat. Dibandingkan tanaman penghasil karbohidrat lainnya, sagu merupakan penghasil karbohidrat tertinggi yaitu 20-40 ton ha-1.Setiap tanaman sagu mampu memproduksi pati sagu sekitar 200-400 kg pati. Produksi sagu yang dikelola dengan baik dapat mencapai 25 ton pati kering/hektar/tahun setara dengan tebu dan lebih tinggi dibandingkan dengan ubi kayu dan kentang (10-15 ton/hektar/tahun). Penelitian bertujuan untuk mengetahui perbedaan keragaan pertumbuhan dan produktivitas aksesi sagu lokal yang memliki potensi pati tinggi yang dibedakan berdasarkan informasi masyarakat lokal dan keragaman morfologi serta keragaman genetik. Penelitian ini dilaksanakan dari bulan Agustus 2016 hingga bulan Desember 2016 di Distrik Aimas, Kabupaten Sorong, Papua Barat. Analisis genetik dilakukan di Laboratorium Bioteknologi dan Molekular Tanaman Departemen Agronomi dan Hortikultura IPB. Analisis kandungan pati dilakukan di Laboratorium Departemen Ilmu dan Teknologi Pangan Fakultas Teknologi Pertanian IPB. Bahan yang digunakan dalam penelitian yaitu 8 aksesi sagu lokal hasil eksplorasi. Data hasil morfologi secara keseluruhan dianalisis secara deskriptif, selanjutnya diolah menggunakan aplikasi STAR untuk menghasilkan dendrogram. Data karakter genetik dianalisis berdasarkan jumlah pita polimorfik yang terbentuk, selanjutnya diolah menggunakan program NTSYS-pc versi 2.02. Berdasarkan karakterisasi sagu, terdapat perbedaan karakter morfologi dari delapan aksesi sagu, seperti warna kuncup daun muda anakan, bentuk tajuk, jumlah daun, tinggi batang, keberadaan duri, kandungan pati, serta warna empulur dan pati. Aksesi Wasulagi merupakan satu-satunya aksesi yang tidak berduri. Berdasarkan hasil analisis RAPD ternyata berbagai aksesi sagu tersebut memiliki hubungan kekerabatan yang dekat yaitu aksesi Wafabala dan Wagelik sebesar 90%. Sebagian besar aksesi sagu tersebut merupakan aksesi unggul yang berpotensi untuk lebih dikembangkan karena memiliki kandungan pati lebih dari 200 kg batang-1. Aksesi Wasenan merupakan aksesi sagu yang memiliki potensi hasil tertinggi yaitu 361.51 kg batang-1. Berdasarkan perhitungan jumlah pohon masak tebang per hektar di hutan sagu alami Distrik Aimas, Kabupaten Sorong, didapatkan pati kering sebanyak 28.86 ton ha-1 tahun-1.
Keyword: potensi produksi, genetik, pati, keragaman
Judul: Karakteristik Fisik dan Organoleptik Dendeng Ayam Fermentasi dengan Penambahan Starter Streptococcus thermophilus dan Lactobacillus delbrückii subsp. Bulgaricus
Abstrak: Dendeng merupakan salah satu bentuk awetan daging tradisional. Suhu pengeringan yang digunakan dalam pembuatan dendeng cukup tinggi. Suhu yang tinggi dapat mengakibatkan terjadinya denaturasi protein sehingga produk menjadi keras dan warnanya terlihat gelap. Teknologi pengolahan daging sudah banyak perkembangan, begitu pula pengolahan dendeng saat ini mulai dikembangkan. Penelitian ini mencoba membuat dendeng daging ayam fermentasi dengan penambahan starter Streptococcus thermophilus dan Lactobacillus delbrückii subsp. bulgaricus. Bakteri Streptococcus thermophilus dan Lactobacillus delbrückii subsp. bulgaricus menghasilkan enzim proteolitik sehingga dapat membantu mendegradasi protein menjadi senyawa yang lebih sederhana sehingga produk menjadi lebih empuk. Proses fermentasi kedua bakteri tersebut akan menghasilkan sifat yang khas diantaranya adalah memiliki rasa dan aroma yang khas sehingga akan meningkatkan palatabilitas dendeng ayam. Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari dan mengetahui karakteristik fisik dan organoleptik dendeng ayam fermentasi dengan penambahan bakteri Streptococcus thermophilus dan Lactobacillus delbrückii subsp. bulgaricus. Rancangan percobaan yang akan digunakan adalah Rancangan Acak Kelompok (RAK) dengan empat kelompok, periode pembuatan sebagai kelompok. Perlakuan yang diberikan yakni penambahan starter Streptococcus thermophilus dan Lactobacillus delbrückii subsp. bulgaricus dengan taraf 0%, 0,25%, dan 0,5% dari berat daging (b/v). Parameter yang diamati meliputi sifat fisik dan organoleptik. Sifat fisik yang akan diuji adalah nilai pH, aktivitas air (a), nilai rendemen, penilaian warna, dan kekerasan. Bila prosedur sidik ragam menunjukkan perbedaan yang nyata (P<0.05), maka dilanjutkan dengan uji Duncan. Sifat organoleptik yang diuji adalah uji hedonik panelis terhadap warna, aroma, kekerasan, rasa dan penampakan umum produk. Pengaruh perlakuan ini diuji dengan uji Kruskall Wallis dan jika berbeda. nyata akan dilanjutkan dengan uji Gibbons. Hasil penelitian menunjukkan bahwa penambahan starter Streptococcus thermophilus dan Lactobacillus delbruckii subsp. bulgaricus tidak mempengaruhi (P>0,05) sifat fisik dan organoleptik produk dendeng ayam fermentasi tetapi penambahan starter Streptococcus thermophilus dan Lactobacillus delbrückii subsp, bulgaricus dapat menurunkan nilai pH, aw dan kekerasan, serta meningkatkan nilai rendemen dan memperbaiki warna produk dendeng ayam. Berdasarkan hasil uji hedonik penambahan starter Streptococcus thermophilus dan Lactobacillus delbruckii subsp. bulgaricus dapat meningkatkan penerimaan terhadap atribut warna, tetapi panelis tidak menyukai rasa dari produk dendeng ayam fermentasi. Hal ini terjadi karena panelis umumnya tidak menyukai makanan asam, tetapi panelis masih dapat menerima secara penampakan umum produk dendeng ayam fermentasi.
Keyword: Streptococcus thermophilus, Lactobacillus delbriickii subsp, daging ayam, Dendeng ayam fermentasi
Judul: Keawetan alami kayu ulin (Eusideroxsylon zwageri T. et B) asal Jambi
Abstrak: Keawetan alami kayu adalah suatu ketahanan kayu secara alamiah terhadap serangan jamur dan serangga dalam lingkungan yang serasi bagi kehidupan organisme bersangkutan (Duljapar, 1996). Keawetan kayu berarti ditentukan oleh daya tahannya terhadap berbagai organisme perusak kayu terutama jamur dan serangga (termasuk rayap). Keawetan alami kayu sangat dipengaruhi oleh konsentrasi zat ekstraktif yang beracun terhadap organisme perusak kayu (Syafii, 1996). Keawetan alami kayu bervariasi sesuai dengan jumlah serta jenis zat ekstraktifnya. Salah satu jenis kayu indonesia yang memiliki keawetan alami yang tinggi adalah kayu ulin (Eusideroxylon zwagerii T. et. B). Kayu ulin termasuk dalam kelas awet I dan berdasarkan percobaan kuburan pun jenis kayu ini masuk kelas awet tersebut. Daya tahan terhadap rayap kayu kering termasuk kelas awet II, tetapi terhadap jamur pelapuk kayu termasuk kelas awet I (Martawijaya dkk, 1989). Di hutan alam Senami (Jambi) sesuai dengan nama lokalnya dikenal empat nama kayu ulin yaitu bulian sirap, bulian tanduk, bulian kapur dan bulian daging Belum ada informasi tentang keawetan alami ke empat kayu tersebut (Irawan, 2001). Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keawetan alami atau daya tahan kayu Ulin bagian gubal dan teras dari Propinsi Jambi terhadap serangan rayap tanah (Coptotermes curvignathus Holmgren) melalui pengujian secara laboratorium. Pengujian kehilangan berat menggunakan standard "Modified Wood Block Test" (MWBT-Test). Pengujian kandungan zat ektraktif kayu ulin dalam pelarut air dingin menggunakan standar TAPPIT 307 pm-88. Pengujian kelarutan zat ekstraktif kayu ulin dalam pelarut air panas menggunakan standar TAPPI T 207 om-88. Pengujian kandungan zat ekstraktif dalam pelarut alkohol benzena menggunakan standar TAPPI T 204 om-88. Rancangan percobaan yang digunakan dalam pengujian secara laboratorium yang berupa kehilangan berat adalah dengan metode Rancangan Acak Lengkap (RAL).
Keyword: Eusideroxsylon zwageri, Ironwood, natural durability
Judul: Pengembangan Model Prediksi Risiko Kebakaran Hutan dan Lahan di Kalimantan Barat menggunakan Data Satelit
Abstrak: The frequency and intensity of forest and land fires in recent decades tend to increase, despite the prevention efforts have been made. In most cases, the prevention efforts were not effectice since the available early warning systems is on a daily basis or the longest is on weekly basis. The available time for the prevention is very short. This study aimed to develop seasonal fire early warning system, a system that can provide warning information with lead time of at least 1 to 3 month. With this system, it is expected that the preventive actions can be implemented more effectively. The method used was to build a hotspots prediction model based on information of sea surface temperature anomaly in the Pacific Ocean (NIÑO 3.4 region) and monthly and seasonally rainfall. Hotspots are used as an indicator to indicate the level of fire threat. Models that relate hotspot and sea surface temperature anomaly/seasonal rainfall were developed for seven land use/cover categories in two soil types, i.e. peat lands and minerals. The level of fire risk is determined based on the probability of having number of hotspot above threshold values under different condition of the sea surface temperature in the NIÑO 3.4. The threshold value is the same as the monthly average of hotspot number. The fire risk model was developed only for West Kalimantan province using hotspot data from 2001-2013 from Terra and Aqua satellites Modis. The results of the analysis suggested that the highest density of hotspots generally occured around August for non-forest land cover types of peat lands. Variability of hotspot density from July to October in this area was significantly correlated with the variability of SST anomalies in NIÑO 3.4 region with time lag of zero to two months. Based on risk matrix, it was found that the probability of having hotspot above the threshold value will be more than 50% if the the SST anomaly in NINO3.4 region was more than 0.5 oC. The probability to have hotspot number more than threshold value when the SST anomaly at lag 0, 1 and 2 month were 63%, 54% and 50% respectively. For the future research, it is suggested that the the development of hotspot forecasting model should use twophase regression techniques.
Keyword: Bogor Agricultural University (IPB), Risk Matrix, MODIS, Land Cover, Hotspot, Forest Fire
Judul: Produksi Bioetanol dari Limbah Biomassa Lignoselulosa Sorgum (Sorghum bicolor L.) melalui Fermentasi Saccharomyces cerevisiae.
Abstrak: Batang sorgum manis termasuk bahan lignoselulosa yang mengandung lignin, selulosa dan hemiselulosa sehingga dapat dimanfaatkan dalam pembuatan etanol. Penelitian ini bertujuan untuk produksi etanol dari limbah lignoselulosa batang sorgum manis. Tahapan penelitian terdiri atas persiapan limbah batang sorgum manis, pengeringan dan pencacahan, hidrolisis dengan asam-basa kuat encer (H2SO4 0.5 % dan NaOH 1%) serta fermentasi oleh S. cerevisiae. Parameter yang dianalisis meliputi kadar glukosa dan xilosa hasil hidrolisis lignoselulosa, kadar etanol dan kadar produk samping berupa asam asetat, asam laktat, dan gliserol. Berdasarkan data yang diperoleh kadar glukosa dari hasil hidrolisis asam lebih besar daripada hidrolisis basa yaitu 5,39 g/L dan xilosa sebesar 12,05 g/L. Kadar etanol paling tinggi selama fermentasi oleh Saccharomyces cerevisiae TKPK 10.5.1 yang diinkubasi selama 2 hari adalah 2,76 g/L. Hasil penelitian menunjukan bahwa limbah lignoselulosa batang sorgum manis dapat dijadikan sebagai bahan baku dalam pembuatan bioetanol.
Keyword: Bioetanol, fermentasi, hidrolisis, lignoselulosa, Saccharomyces cerevisiae
Judul: Analisis Biaya dan Kelayakan Usaha Penggilingan Padi di Kelurahan Situ Gede, Kecamatan Bogor Barat.
Abstrak: One important aspect of post-harvest handling of rice is rice milling. Although many rice milling unit, but deployment and their feasibility has not so optimal.This situation requires an evaluation and needs analysis to assess the optimum level making it feasible to operate profitably. The research objective is to create a cost analysis and feasibility of rice mills and to make sensitivity analysis on several conditions. The study was conducted for 3 months, from May 2010 until July 2010. Using Mr Kardi’s rice milling unit as an objects for the research where located at Situ Gede Village in West Bogor. Based on the calculation of the cost analysis, obtained total cost rice mill for a year is Rp. 37,033,093.194. Main cost produced per kilogram of rice at Rp. 283.8. Breakeven point values obtained for rice mills is 139.19hours / year or 35,342.784 kg of paddy / year. In addition, based on sensitivity analysis, obtained value net present value (NPV) is Rp. 168,628,529.933, the internal rate of return (IRR) is 40.11, and the gross value of B / C ratio is 1.50. Based on that results, we can conclude Kardi’s rice mill unit is feasible to run. After that, a sensitivity analysis was performed on several conditions that may occur. The selected conditions is rising diesel fuel prices, rising labor wage, and decrease the amount of annual milled. After calculating the sensitivity analysis, obtained some conditions which may cause the rice mill is not feasible to run.
Keyword:
Judul: Metode Prediksi Tak Bias Linier Terbaik Empiris Spasial pada Area Kecil untuk Pendugaan Pengeluaran Perkapita (Studi Kasus : Kabupaten Jember Provinsi Jawa Timur)
Abstrak: Poverty of an area can be measured by their per capita expenditure. Direct estimation of expenditure per capita based on small area data may cause a large variance of estimates. Spatial Empirical Best Linear Unbiased Prediction (SEBLUP) is one of the small area estimation methods to solve the problems. The method is developed from EBLUP allowing correlation among area. Susenas Data was used to compare SEBLUP, direct estimation and EBLUP. The result showed that the standard error of SEBLUP was smaller than those of direct estimation and EBLUP
Keyword:
Judul: Prediksi Redaman Gelombang Menggunakan Rancangan Drag Tekanan Green Belt Mangrove (GBM) pada Persamaan Air Dangkal (PAD)-Dasar Laut Rata (DLR) dengan Pendekatan Numerik
Abstrak: Berbagai fenomena alam yang banyak terkait dengan gelombang, di antaranya adalah bunyi, cahaya, pergerakan air laut, aliran sungai, riak pada air kolam, dan contoh-contoh lain yang banyak terjadi dalam kehidupan sehari-hari. Salah satu jenis gelombang yang banyak dikaji adalah gelombang tsunami, yang mana gelombang tsunami ini memiliki periode gelombang yang sangat besar dan gelombangnya tidak mudah hilang ataupun tereduksi. Gelombang tsunami dapat menghantam pantai dengan energi yang sangat besar sehingga mengakibatkan area sekitar pantai mengalami kerusakan yang sangat luas. Salah satu upaya untuk meredam gelombang adalah dengan adanya keberadaan hutan mangrove yang berfungsi meminimalisir kerusakan pantai. Dalam penelitian ini, upaya untuk memprediksi redaman gelombang dilakukan dengan merancang drag tekanan Green Belt Mangrove (GBM) pada Persamaan Air Dangkal (PAD) untuk kasus Dasar Laut Rata (DLR). Persamaan yang merepresentasikan gelombang diterapkan melalui PAD untuk kasus DLR (PAD-DLR), sedangkan redaman gelombang dibangun melalui PAD-DLR dengan menerapkan drag tekanan fluida pada GBM yang tergantung pada koefisien drag dan luas GBM, dinamakan PAD-GBM-DLR. Solusi numerik PAD-DLR dan PAD-GBM-DLR diselesaikan dengan menggunakan Metode Beda Hingga. Adapun simulasi yang dilakukan guna menggambarkan perilaku gelombang dari solusi numerik PAD-DLR dan PAD-GBM-DLR. Pada penelitian ini telah diperoleh hasil prediksi redaman gelombang terhadap GBM melalui simulasi PAD-GBM-DLR. Berdasarkan hasil analisis pada simulasi yang telah dilakukan, Redaman Amplitudo Gelombang (RAG) dan Redaman Kecepatan Gelombang (RKG) terbesar diberikan pada kondisi IV yang memiliki nilai luas GBM dan koefisien drag GBM yaitu dan . Oleh sebab itu, semakin banyak dan besar nilai luasan GBM ( ) serta semakin kecil nilai koefisen drag GBM ( ) yang diberikan, maka redaman gelombang semakin membesar, begitupun sebaliknya.
Keyword: green belt mangrove, metode beda hingga, persamaan air dangkal, simulasi
Judul: Analisis Keragaman Genetik Kedelai Transgenik Turunan Keempat (T4) dan Varietas Unggul Nasional Berbasis Marka SSR
Abstrak: Tanaman kedelai transgenik dapat menambah koleksi plasma nutfah tanaman kedelai dan meningkatkan keberagaman kedelai. Keberagaman pada kedelai membutuhkan karakterisasi secara molekuler untuk mengetahui jarak kekerabatan antar varietas kedelai. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasijarak kekerabatan genetik kedelai transgenik turunan keempat (T4) dan beberapa kedelai varietas unggul nasional menggunakan marka SSR. Tahapan analisis keragaman genetik tersebut diawali dengan isolasi sampel DNA kedelai menggunakan metode Doyle dan Doyle termodifikasi, amplifikasi DNA menggunakan PCR dan selanjutnya analisis polimorfisme dan filogeni.Lima belas sampel DNA kedelai yang diukur memiliki konsentrasi DNA yang berkisar dari 6.4 – 516.4 ng/μl. Hasil amplifikasi sampel DNA kedelai menunjukkan ukuran produk hasil amplifikasi berkisar pada 100-200 pasang basa (bp). Rerata nilai PIC (Polymorphic Information Content) yang diperoleh sebesar 0,36. Hasil dendogram mengelompokkan 15 sampel tanaman kedelai menjadi 2 kelompok utama pada koefisien kemiripan 0,47. Kedelai dengan jarak genetik tertinggi dapat digunakan sebagai tetua dalam persilangan.
Keyword: kedelai transgenik, keragaman genetik, SSR, polimorfik, PIC
Judul: Profil Hematologi dan Kimia Darah pada Lutung Hitam (Trachypithecus auratus) di Taman Safari Indonesia Cisarua Bogor
Abstrak: Lutung hitam (Trachypithecus auratus) merupakan salah satu primata dari famili Cercopithecidae yang telah digunakan sebagai hewan penelitian secara luas. Penilitian ini bertujuan mendapatkan informasi mengenai nilai hematologi dan kimia darah pada T. auratus yang terdapat di Taman Safari Indonesia Cisarua Bogor. Data berasal dari empat individu T. auratus yang kemudian dibandingkan dengan lutung hanuman (Presbytis entellus) dan lutung kelabu (Presbytis cristatus) dari famili yang sama. Hasil menunjukkan bahwa nilai hematologi pada T. auratus jantan lebih tinggi daripada T. auratus betina. Total eritrosit, hemoglobin, hematokrit, platelet, dan mean corpuscular haemoglobin concentration pada T. auratus juga memiliki nilai yang lebih tinggi jika dibandingkan dengan P. entellus, sedangkan mean corpuscular volume dan mean corpuscular haemoglobin memiliki nilai yang lebih rendah. Jenis leukosit yang paling banyak ditemukan pada sel darah T. auratus adalah limfosit. Hasil pemeriksaan kimia darah pada T. auratus menunjukan hasil yang jauh berbeda jika dibandingkan dengan P. entellus dan P. cristatus, namun total protein pada masing-masing spesies tersebut memiliki nilai yang tidak jauh berbeda.
Keyword: hematologi, kimia darah, lutung hitam
Judul: IPB (Bogor Agricultural University)
Abstrak: KHV has made mass mortality in koi and common carp, and spread out to many countries. In Indonesia, KHV has caused outbreaks of mass mortality in many provinces, and cause economic losses and significant social matter. The aim of this research are to recognize and to analyze genetic variation of KHV that infects Cyprinus-carpio and to recognize its biogeographic distribution in Indonesia as well as to recognize and to analyze tissues pathological changes which infected by KHV. In this research, the fish that have been used are koi and common carp which suspected infected by KHV according to the clinical symptoms derived from 20 provinces in Indonesia. In every fish sample was taken its gill to PCR examination and then was done sequencing DNA (for KHV positive samples), for histopathology and immunohistochemistry examination, the organs that were taken: gill, kidney, spleen, intestine or digestive tract, liver, heart, and brain. Based on the results of sequencing DNA KHV and phylogenetic tree construction that has been made, there are 17 variants from 18 samples KHV positive was found. Those variants can be grouped into two clusters the main branch which consisted of group 1 includes variants KHV from South Kalimantan, Lampung, West Papua, West Kalimantan, West Java, Bali, East Nusa Tenggara. Then group II consists of KHV variants from North Sumatra, West Kalimantan, West Nusa Tenggara, Riau, East Kalimantan, and DKI Jakarta. Related to the infections of KHV variants on koi and common carp, pathological changes were found in such organs (gill, spleen, kidney, intestine and digestive tract, liver, heart, and brain). Pathological changes in gill organ was found proliferation of epithelial cells and fusion of secondary lamella, hypertrophy epithelial cells of gill lamella, telangiectasis, the inclusion body, edema, proliferation of hyaline layer and fibrosis at the base of the gills. Spleen pathological change was found infiltration of inflammatory cells or lymphocytes, appeared MMC, hemorrhage, congestion, and edema. Kidney pathological change was found hemorrhage, proliferation of cells in the interstitial, MMC, thickening of the tubule, inflammation of the glomerulus, the inclusion body, congestion, edema, fibrosis, necrosis of the glomerular. Intestine and digestive tract was found hemorrhage, enteritis, proliferation, goblet cells, fusion of the villi, deposit enterolit on gastric, congestion, edema, and necrosis in krypta. Liver pathological change was found hydropic degeneration, perivascular cuffing, congestion, and fibrosis. Heart pathological change was found infiltration of inflammatory cells or lymphocytes in the endocardium, hemorrhage, epicarditis, pericarditis, myocarditis, vacuolization, congestion, edema, fibrosis, and necrosis.
Keyword: