Judul: Penyakit Busuk Bulir Bakteri pada Padi di Jawa: Studi Kasus, Sebaran, Karakteristik, Potensi Penurunan Hasil dan Pengendaliannya
Abstrak: KRESNAMURTI TRI KURNIASIH. Penyakit Busuk Bulir Bakteri pada Padi di Jawa: Studi Kasus Sebaran, Karakteristik, Potensi Penurunan Hasil dan Pengendaliannya. Dibimbing oleh GIYANTO, MEITY SURADJI SINAGA, KIKIN HAMZAH MUTAQIN, ENY WIDAJATI. Penyakit busuk bulir bakteri (BBB) merupakan emerging disease pada tanaman padi di Indonesia. Penyakit ini ditemukan pertama kali di Indonesia pada tahun 1987 di Jawa Barat. Akan tetapi setelah itu, tidak terdapat laporan mengenai penyakit ini, hingga kemunculan kembali penyakit ini sekitar tahun 2010 di berbagai daerah di Indonesia. Meskipun telah banyak ditemukan akan tetapi belum dilakukan usaha pengendalian karena keterbatasan informasi mengenai penyakit BBB. Penyakit ini dapat menurunkan produksi padi di lapangan, karena menyerang tanaman padi terutama pada fase generatif. Oleh karena itu perlu dilakukan penelitian untuk mendapatkan informasi ilmiah mengenai daerah sebar penyakit BBB terutama di Jawa, identitas patogen yang berasosiasi dengan penyakit BBB, keberadaan patogen di dalam benih padi dan metode deteksinya, penurunan hasil akibat serangan patogen serta teknik pengendaliannya yang efektif. Tahapan penelitian yang dilakukan berupa survei lapangan untuk mendapatkan tanaman padi yang bergejala, dilanjutkan dengan karakterisasi secara morfologi, fisiologi dan molekuler terhadap isolat bakteri yang berhasil diisolasi dari gejala yang ditemukan di lapangan. Analisis homologi, filogeni dan RFLP in silico dilakukan untuk melihat keragaman genetik antar isolat bakteri. Tahap selanjutnya adalah deteksi keberadaan patogen dan pengembangan metode deteksi dini patogen pada benih padi. Uji in planta pada tanaman padi dilakukan untuk melihat variasi gejala yang dihasilkan akibat infeksi patogen serta potensi penurunan hasil. Aplikasi perlakuan panas kering dan minyak cengkeh dilakukan untuk mengendalikan B. glumae yang terbawa pada benih padi. Gejala BBB yang ditemukan di lapangan berupa busuk bulir dan hawar malai yang disertai dengan hampa. Malai tanaman yang terserang tampak lebih tegak karena sebagian bijinya hampa. Penyakit BBB telah tersebar di 9 kabupaten di Jawa yaitu Karawang, Subang, Purwakarta, Indramayu, Majalengka, Cirebon, Temanggung, Kediri dan Blitar. Karakterisasi secara morfologi, fisiologi dan bioassay menunjukkan 22 isolat bakteri merupakan Burkholderia spp. yang bersifat patogen. Karakterisasi molekuler berdasarkan sikuen DNA gen pengode 16S rRNA dan ITS 16S-23S rRNA memperlihatkan bahwa 15 isolat bakteri teridentifikasi sebagai B. glumae dan 7 isolat bakteri teridentifikasi sebagai B. gladioli. B. glumae ditemukan berasosiasi dengan gejala BBB dari daerah Karawang, Subang, Purwakarta, Indramayu, Temanggung, Kediri dan Blitar. B. gladioli ditemukan berasosiasi dengan gejala BBB dari Karawang, Majalengka, Cirebon dan Blitar. Hasil analisis homologi, filogeni dan RFLP in silico sikuen DNA gen pengkode 16S rRNA menunjukkan bahwa B. glumae dan B. gladioli dari Jawa memiliki keragaman genetik. Analisis keberadaan bakteri menunjukkan bahwa B. glumae ditemukan berada di bagian sekam kelopak, sekam mahkota dan embrio benih padi. Populasi B. glumae paling banyak ditemukan di bagian sekam mahkota biji padi sebesar 1.82 x 107 CFU g-1 diikuti bagian sekam kelopak dan embrio masing-masing sebesar 6.57 x 106 dan 1.08 x 106 CFU g-1. B. gladioli ditemukan berada di bagian sekam kelopak, sekam mahkota, endosperma dan embrio benih padi. Populasi B. gladioli pada benih padi tertinggi ditemukan di sekam mahkota sebesar 2.42 x 103 CFU g-1. Populasi B. gladioli di sekam kelopak, embrio dan endosperma berturut-turut sebesar 1.29 x 103; 6.35 x 102; 6.5 x 101 CFU
Keyword: Burkholderia glumae, patogen terbawa benih, perlakuan benih, Burkholderia gladioli