Judul: Identifikasi Keragaman Genetik, Tingkat Outcrossing, dan Korelasi Genotipe Kulit Buah terhadap Genotipe Progeni pada Kopi Arabika
Abstrak: Kabupaten Garut, provinsi Jawa Barat merupakan salah satu daerah penghasil kopi Arabika di Indonesia. Salah satu varietas kopi Arabika yang mulai banyak dibudidayakan oleh petani di kabupaten Garut adalah Ahernt GRT KN. Kopi Arabika Ahernt GRT KN memiliki keunikan kulit buah berwarna kuning ketika masak, berbeda dengan kebanyakan kopi lain yang berwarna merah ketika masak. Kopi Arabika var. Ahernt GRT KN memiliki citarasa spesialty dan biji buah besar (31,55 gram/100 biji) sehingga memiliki harga tinggi. Petani di Garut menanam kopi Arabika var. Ahernt GRT KN bersama dengan kopi Arabika varietas lain yang memiliki kulit buah merah di lahan yang sama. Petani kemudian mengambil biji kopi Arabika var. Ahernt GRT KN dari lahan campuran tersebut untuk ditanam kembali atau dijual ke petani lain untuk dijadikan benih. Penanaman dari biji memungkinkan terjadinya pengambilan benih dengan kualitas berbeda-beda sehingga adanya kemungkinan keragaman genetik antar sesama kopi var. Ahernt GRT KN. Selain itu, petani menganggap bahwa kopi dengan kulit buah kuning akan menghasilkan progeni yang true to type ke induknya meskipun berasal dari lahan campuran. Padahal, ada kemungkinan persilangan dengan kopi varietas lain yang dapat merubah genetik progeni kopi Arabika var. Ahernt GRT KN, akan tetapi tidak disadari petani. Selama ini tidak ada kopi Arabika var. Ahernt GRT KN yang memiliki kulit buah kuning ketika ditanam di lahan campuran, yang mengindikasikan persilangan tidak merubah fenotipe dan genotipe kulit buah. Tujuan dari penelitian ini antara lain : 1) mengetahui keragaman genetik kopi Arabika dalam populasi, 2) mengetahui tingkat outcrossing kopi Arabika var. Ahernt GRT KN di lahan campuran, 3) mengetahui pengaruh persilangan terhadap genetik dan fenotipe kulit buah kopi Arabika. Percobaan pertama mempelajari keragaman genetik 95 kopi Arabika yang terdiri dari 39 kopi Arabika var. Ahernt GRT KN, 47 kopi Arabika var. Sigararutang, dan 9 kopi Arabika var. S795. Analisis keragaman dilakukan menggunakan 6 pasang primer SSR yang berasal dari hasil seleksi 20 pasang primer SSR. Analisis ringkasan statistik dilakukan menggunakan perangkat lunak PowerMaker 3.25. Analisis klaster dilakukan menggunakan perangkat lunak Darwin 6.0.21 dengan metode pengklasteran Sattah dan Tversky. Hasil analisis statistik menunjukkan bahwa nilai heterozigositas harapan (He) jauh lebih tinggi dibandingkan dengan nilai heterozigositas teramati (Ho). Nilai He yaitu 0,43, sedangkan nilai Ho yaitu 0,07. Hal tersebut mengindikasikan populasi yang diuji mengalami inbreeding dan memiliki tingkat kawin silang yang rendah. Analisis keragaman genetik masing-masing varietas menunjukkan bahwa kopi Arabika var. Ahernt GRT KN dan var. Sigararutang memiliki keragaman genetik di dua primer, yaitu primer M24 dan Ca052. Sebaliknya, kopi Arabika var. S795 memiliki keragaman genetik di seluruh primer, meskipun dengan tingkat yang berbeda-beda. Analisis Ho masing-masing primer menunjukkan kopi Arabika var. Ahernt GRT KN memiliki residu heterozigositas di dua primer, sedangkan kopi Arabika var. Sigararutang dan S795 sudah cenderung homozigot. Analisis klaster menunjukkan bahwa masing-masing varietas kopi Arabika mengelompok berdasarkan varietas. Kopi Arabika var. Sigararutang dan Ahernt GRT KN membentuk empat tipe, sedangkan kopi Arabika var. S795 membentuk enam tipe. Hal tersebut mengindikasikan bahwa keragaman genetik kopi Arabika var. Sigararutang dan Ahernt GRT KN relatif rendah, sedangkan keragaman genetik kopi Arabika var. S795 relatif tinggi. Percobaan kedua yaitu mempelajari tingkat outcrossing kopi Arabika di lahan campuran
Keyword: heterozigositas, keragaman genetik, kopi Arabika, tingkat persilangan