Judul: Identification of Pig DNA Fragments in Meat Bone Meal Samples Using Real Time Polymerase Chain Reaction
Abstrak: Meat Bone Meal (MBM) adalah bahan pakan yang memiliki sumber protein, energi, dan mineral yang baik untuk hewan. Pakan MBM diperoleh dari olahan produk samping hewan ternak yang mudah untuk dicampur dengan bahan yang berasal dari produk babi. Importir atau produsen lokal yang curang dapat mencampurkan produk babi ke dalam MBM karena produk babi memiliki harga yang relatif murah dan dapat ditemukan di beberapa negara. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi fragmen DNA babi pada sampel MBM menggunakan metode Real Time Polymerase Chain Reaction (qPCR). Proses identifikasi fragmen DNA babi pada sampel MBM dimulai dari ekstraksi DNA, kuantifikasi DNA (nilai konsentrasi dan kemurnian) dengan spektrofotometer 2000c, dan amplifikasi DNA dengan qPCR berbasis probe. Proses identifikasi DNA babi pada sampel MBM dideteksi menggunakan kit komersial Mericon Pig Kit dengan primer dan probenya sudah termasuk di dalam master mix spesifik. Hasil penelitian menunjukkan bahwa 81 sampel dari 198 sampel MBM teridentifikasi mengandung DNA babi. Sampel DNA babi yang positif dapat diketahui dengan nilai cycle threshold (Ct<45) pada hasil amplifikasi qPCR. Real time PCR dapat dijadikan sebagai metode pengujian untuk mengidentifikasi keberadaan fragmen DNA babi pada sampel MBM., Meat and bone meal (MBM) is a valuable source of protein, energy, and minerals in animal feed production. The MBM feed is obtained from livestock by-products that are easily mixed with pig products. Fraudulent importers or local producers can mix pig products into MBM because they are relatively inexpensive and can be found in several countries. This research aim was to identify pig DNA fragment in MBM samples using Real Time Polymerase Chain Reaction (qPCR). The process of identifying porcine DNA fragments in MBM samples was started from DNA extraction, DNA quantification (concentration and purity values) with spectrofotometer 2000c, and DNA amplification with qPCR based on probes. The process of detection porcine DNA in MBM samples was used a commercial Mericon Pig kit which the primer and probe were inserted into a specific master mix. The results showed that 81 samples were positive for porcine DNA from 198 samples of MBM. Positive samples of porcine DNA can be identified by cycle threshold value (Ct<45) on the result of amplification qPCR. Real time PCR methods can be used to identify the presence of porcine DNA in MBM samples.
Keyword: DNA, MBM, pork, qPCR

Judul: Analisis Enzim Pemotong pada Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP) untuk Mendeteksi Campuran Daging Babi dan Sapi
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis beberapa jenis enzim pemotong dalam metode PCR-RFLP untuk mendeteksi pencampuran daging babi dan sapi dalam berbagai konsentrasi. Sampel daging sapi dan babi diperoleh dari pasar di Kota Bogor dan DNA diekstraksi menggunakan metode presipitasi amonium asetat. Primer universal sitokrom b digunakan untuk mengamplifikasi mtDNA menggunakan polymerase chain reaction. Amplikon dipotong menggunakan enzim pemotong Hinf I, Alu I, Hae III, dan Taq I. Hasil memperlihatkan bahwa Hinf I memotong amplikon sapi namun tidak memotong amplikon babi, Alu I memotong amplikon sapi dan babi, Hae III memotong amplikon sapi dan babi, dan Taq I memotong amplikon sapi namun tidak memotong amplikon babi. Enzim Hae III merupakan enzim yang lebih spesifik untuk memperlihatkan hasil pemotongan pada campuran daging babi dan sapi pada konsentrasi rendah daging babi dan konsentrasi rendah daging sapi
Keyword: restriction enzymes, PCR-RFLP, cytochrome b, mtDNA

Judul: Ongkos irregularitas sebuah graf
Abstrak: Tulisan ini mengkaji bagaimana cara mcngubah sualu graf menjadi graf yang irregular, yaitu dengan menambahkan beberapa edge pacta graf asal. Untuk sebuah graf G, didefinisikan ongkos irregularitas ic(G) yaitu jumlah minimum tambahan edge sedemikian sehingga menjadi Multigraf H yang merupakan multigraf G irregular. Akan ditentukan ongkos irregularitas dari graf regular, graf mendekati regular, dan graf mendekati irregular.
Keyword: