Judul: Utilization of enhanced random amplified polymorphic DNA (E-RAPD) for geneticc variability analysis on plantlets of smooth cayenne pineapple, Ananas comosus L. Merr.
Abstrak: Recently, RAPD markers have been widely used in speeding up and assisting practical plant breeding, crop improvement or plant characterization. RAPD is known as in-expensive and simple technique with a number of advantages: (1) universal set of oligonucleotide primers can be used for all plant species, (2) a large number of samples may be easily and rapidly characterized, (3) automatically process. However, RAPD those commonly use 10-base oligonucleotides of primers amplify target DNA sequences randomly and have low reproducibility. In this research, 11-base oligonucleotides of primers have been utilized as enhanced-RAPD (e-RAPD). Utilization of this e-RAPD has been evaluated on Smooth Cayenne pineapple plantlets obtained from tissue culture as target DNA materials. The e-RAPD has been expected increase specificity of DNA amplified products than RAPD's, result in easier to analyze and more reproducible. Beside of those, it has been expected amplifiable on this DNA genome of Smooth Cayenne pineapple plantlets and can be used to evaluate genetic variability among the plantlets. The DNA sample materials from plantlets of 20 combination treatments were isolated base on CTAB methods with some of modifications, and precipitated by phenol chloroform isoamyl alcohol. Primer 11-mers as enhancer of RAPD markers were selected on four single primers (SOB-1, SOB-2, SOB-3, and SOB-4) and its six combinations. Total volume of each amplification reaction was 25 μl which consisted of buffer 2.5 µl, MgCl 2 ul, dNTP 1 ul, primer 2 ul, DNA sample 1.5 ul. Taq polymerase 0.2 µl, and sterilized deionized water 15.8 µl. The PCR selected profile programmed pre-denaturation at 94 °C; 1.5", 45 cyles with each denaturation 94 °C; 0.5", annnealing 37 °C; 1', and elongation 72°C; 2", then final elongation at 72°C; 4. In evaluating the e-RAPD's products, the data of DNA amplified products on five treatment samples obtained from RAPD reaction of primer 10-mers (OPE-7) has been compared in analysis process. The e-RAPD results using four selected primers (SOB-1, SOB-1-2, SOB-2-3, SOB-3-4) has successfully amplified DNA genome of Smooth Cayenne pineapple plantlets. However it is not optimal yet. The best results of e-RAPD's Cabe obtained by precisely optimization of PCR program and the optimal concentration of all reaction reagents, such as optimization on the annealing temperature, the amount of DNA samples, and concentrations of dNTP, MgCl2, and Tag polymerase. The e-RAPD produced 57 total fragments which all 100% showed as polymorphic DNA. The dendogram clustering perform the high variability among all treatments. Treatment of BA 13.32 µM combined with NAA 2 µM show the shortest genetic distance to control treatment without exogenous hormones. This variability which refers to somaclonal variations may occur after tissue culturing. It can be caused of some posible factors, such as the using of exogenous hormones, subculture frequency, explant type, micropropagation system, and other technical defects.
Keyword: 

Judul: Analisis keseragaman genetik tanaman teh (Camellia Sinensis (l) o. Kuntze) asal kultur jaringan, setek, dan biji dengan teknik RAPD
Abstrak: Kultur jaringan melalui induksi tunas aksiler dan penggandaan embrio somatik dikembangkan sebagai eara perbanyakan tanaman teh dalam jumlah yang banyak dengan waktu yang cepat dan tingkat keseragaman yang tinggi. Analisis terhadap variasi somaklonal yang terjadi pada tanaman kultur jaringan merupakan salah satu upaya konservasi tanaman. RAPD (random amplified polymorphic DNA) memanfaatkan kemampuan nukleotida dari suatu primer acak dengan nukleotida pada DNA cetakan yang mengandung basa komplemennya sering digunakan untuk menganalisis tingkat keseragaman genetik. RAPD menggunakan mesin peR (polymerase chain reaction), yaitu alat amplifikasi DNA yang dapat diatur suhunya untuk terjadinya proses sintesis DNA seperti denaturasi DNA, penempelan primer, dan pemanjangan primer. Dalam analisis ini digunakan 8 primer hasil seleksi. yaitu OPA 1. OPA 2. OPA 3. OPA 7, OPA 8, OPB I, OPB 3, dan OPB 7. Sctiap primer menghasilkan pola pita yang spesifik sehingga keseragaman tanaman dapat dilihat dari pola amplifikasi oleh primer tertentu. Primer OPA 8 dan OPB 3 memberikan pita polimorfik yang tinggi sehingga penentuan seragam tidaknya genetik suatu populasi dapat lebih mudah diamati Berdasarkan perbandingan pola pita amplifikasi, kesamaan genetik dihitung dengan menggunakan koefisien Dice. Hasil penelitian menunjukkan tingkat keseragaman genetik rata-rata taRaman teh asal embrio somatik paling tinggi, yaitu sebesar 890/0, diikuti tanaman asal setek dengan tingkat keseragaman genetik rata-rata sebesar 77%, sedangkan tingkat keseragaman genetik rata-rata tanaman teh asal biji sarna dengan tunas wiler sebesar 64%. Ketidakseragaman pada tanaman kultur jaringan khususnya tunas wiler ini dapat disebabkan oleh siklus pengkulturan yang panjang dan tidak teratur, mutasi karena penyerapan zat pengatur tumbuh tertentu pada
Keyword: 

Judul: Leukemia pada kucing
Abstrak: Leukemia pada kucing adalah suatu penyakit yang sangat patogen, disebabkan oleh sejenis virus. Virus ini dikenal sebagai Feline Leukemia Virus atau FeLV. FeLV ini oleh beberapa ahli dikatakan hanya bersifat ganas pada hewan kucing. Penularannya bisa secara horizontal maupun congenital. Kucing pada semua tingkat umur dapat terserang oleh FeLV ini. Khusus pada bentuk "thymic leukemia", virus ini hanya menyerang anak-anak kucing berumur diba- wah 1 tahun. Kucing-kucing liar atau yang tidak terpeli- hara jarang sekali terinfeksi FeLV. Selain dari serangan virus FeLV itu sendiri, maka penyakit leukemia ini bisa disebabkan oleh beberapa fak- tor yang sudah ada dalam tubuh hewan dan sangat menunjang perkembangan penyakit ini, yaitu antara lain tumor, agen toksik, cedera oleh kecelakaan dan gangguan hemopoiesis. FeLV menyerang sel-sel darah dalam tubuh hewan se- hingga pembentukan darah berjalan tidak normal. Terlihat sel-sel darah yang belum dewasa sudah beredar dalam sir- kulasi darah. Bentuk dan jumlahnya tidak lagi seimbang dalam tubuh hewan kucing tersebut. Gejala klinis antara lain kekurusan, ikterus, anemia, lemah, anoreksia, dyspnoe, sulit menelan, batuk, dan membran mukosa pucat. Selain itu kelenjar pertahanan tubuh juga membengkak, kemudian terjadi hepatomegali, spleenomegali dan pembengkakan pada ginjal. Terbentuk massa tumor pada beberapa tempat. Secara biopsy pada sumsum tulang akan terlihat be- berapa perubahan. Sumsum tulang berwarna merah tua atau abu-abu. Konsistensinya lunak dan terdapat banyak sekali memproduksi sel darah putih. Melalui gambaran darah leukemia ini lebih mudah didiagnosa. Jumlah retikulosit rendah sekali. PCV 8-15%, hemoglobin menurun, sel darah putih (WBC) meningkat, lim- fosit meningkat, Alfaglobulin juga ada peningkatan, dan banyak eosinofil yang belum dewasa beredar dalam darah…dst
Keyword: