Judul: Klasifikasi Enzim Protein Menggunakan Metode K-Nearest Neighbor Dan Analisis Komponen Utama
Abstrak: Enzim adalah suatu protein yang berfungsi sebagai biokatalisator dan mempunyai bentuk globular. Enzim merupakan biokatalisator yang aktif, sebab hanya dengan jumlah yang sedikit pada kondisi yang tepat, dapat mengatur jalannya reaksi kimia tertentu. Tujuan penelitian ini adalah untuk melakukan klasifikasi enzim berdasarkan 6 kelas yang ditentukan oleh Enzyme Commission. Data fasta sekuen protein enzim akan dilakukan ekstraksi fitur. Fitur yang digunakan adalah 470 fitur yang digunakan pada penelitian Rao et al (2009). Data yang digunakan adalah data fasta yang berjumlah 3000 data, masing-masing 500 data untuk 6 kelas. Metode yang digunakan dalam penelitian ini adalah K-Nearest Neighbor sebagai metode klasifikasi pada enzim dan Principal Component Analysis digunakan untuk mereduksi dimensi fitur. Penelitian ini menunjukkan sensitivitas rata-rata tertinggi sebesar 0.79 pada K-NN dengan PCA 85% dan PCA 90%.
Keyword: enzim, K-NN, PCA, protein

Judul: Identifikasi Protein Signifikan Penyakit Kanker Payudara dengan Menggunakan Principal Component Analysis dan ClusterONE
Abstrak: Penyakit kanker payudara adalah salah satu penyakit degeneratif yang memiliki tingkat jumlah kasus baru setiap tahunnya yang tinggi di Indonesia. Penyakit kanker payudara dapat diatasi dengan terapi yang menarget proteinprotein signifikan yang berpengaruh terhadap penyakit tersebut. Identifikasi protein signifikan dapat dilakukan dengan pendekatan topologi dan clustering. Untuk mengidentifikasi protein signifikan penyakit kanker payudara, penelitian ini menggunakan data centrality interaksi protein-protein yang dianalisis dengan principal component analysis (PCA) dan clustering dengan ClusterONE. PCA digunakan untuk mencari nilai overall centrality dari nilai-nilai centrality yang digunakan dan dilakukan clustering untuk membentuk kompleks protein yang berupa cluster berisi protein signifikan penyakit kanker payudara. Analisis cluster dilakukan dengan perbandingan kualitas tiap cluster yang terbentuk dan terhadap penelitian sebelumnya. Didapatkan sebanyak 27 protein merupakan protein yang berpengaruh terhadap penyakit kanker payudara dari 32 protein cluster terbaik
Keyword: ClusterONE, significant protein, breast cancer, principal component analysis

Judul: Dampak Banjir Pasang terhadap Strategi Bertahan Hidup dan Pengeluaran Rumahtangga Kampung Ujung Laut Semarang
Abstrak: Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi berbagai macam strategi bertahan hidup rumahtangga yang mengalami bencana banjir pasang di Kampung Ujung Laut Kelurahan Bandarharjo, Kota Semarang. Strategi bertahan hidup dilihat dalam dua kondisi, yaitu sebelum banjir dan sesudah banjir. Pengumpulan data pada penelitian ini menggunakan metode kuantitatif dengan instrumen kuesioner berstruktur, yang dikombinasikan dengan pendekatan kualitatif berupa metode wawancara mendalam. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa, pertama, bencana banjir menimbulkan dampak pada bidang ekonomi, kesehatan, dan lingkungan. Kedua, banjir mempengaruhi strategi bertahan hidup rumahtangga yang terkena bencana. Adapun strategi yang digunakan oleh rumahtangga responden dalam menghadapi banjir adalah dengan mengaplikasikan secara simultan strategi jaringan sosial, strategi berhutang, strategi menggadaikan barang, strategi arisan, strategi nafkah ganda, migrasi, dan alokasi tenaga kerja rumahtangga. Selain itu juga dijumpai perbedaan strategi bertahan hidup menurut tingkat pengeluaran rumahtangga, dalam kondisi banjir dan tidak banjir.
Keyword: Bogor Agricultural University, Institut Pertanian Bogor, IPB, Tidal floods impact, Expenditure, Survival strategies, Human ecology, Household survival strategies, Livelihood strategy, Monthly gathering, Pawning strategy, Household labors