Judul: Simulasi Dinamika Molekul Protein 1GB1 Menggunakan Not Just Another Molecular Dynamcs Program (NAMD)
Abstrak: Protein 1GB1 helps Streptomyces griseus to avoid host defense by immunoglobulin binding site properties. The aim of this study are to learn the mechanism of unfolding and molecular dynamics of protein 1GB1 by temperature variance based on some parameters. Coordinate file of 1GB1 that given by NMR (Nuclear Magnetic Resonance) can be downloaded from Protein Data Bank, then it was processed by some steps such as minimization, heating, equilibration and production run using PBC (Periodic Boundary Condition) and PME (Particle Mesh Ewald) methods. Simulation running at 325K, 350K, 375K, 400K, 450K dan 500K. Except simulation 1 ns at 500K, all simulations running for 10 ns. Some parameters shown unfolding process of 1GB1 at 900 ps in 500 K simulation. Secondary structures that broke for the first time is alpha-helix that converted to turn and coil.
Keyword: 

Judul: Kestabilan Struktur 3D Lipase PPD2 terhadap Perubahan Konsentrasi Air Garam: Kajian Komputasi Dinamika Molekul.
Abstrak: Enzim Lipase memiliki peran dalam dunia industri. Enzim Lipase PPD2 merupakan enzim yang diisolasi dari mata air Papandayan. Pada penelitian kali ini Simulasi Dinamika Molekul dilakukan pada struktur 3D Enzim Lipase PPD2 dengan penambahan variasi garam dan suhu. Simulasi Dinamika Molekul memberikan informasi bahwa penambahan garam memiliki pengaruh untuk menstabilkan struktur 3D Enzim Lipase PPD2 terhadap pengaruh kenaikan suhu. Nilai RMSD , Jari-jari Girasi, RMSF, SASA, Interaksi Van der Waals, dan pasangan jembatan garam menunjukan simulasi dengan penambahan variasi garam menghasilkan nilai yang lebih stabil dibandingkan simulasi tanpa penambahan garam. Nilai RMSF memberikan informasi konsentrasi garam 1.5 M merupakan konsentrasi garam terbaik yang dapat menjaga kestabilan suhu sekaligus tetap dapat mempertahan fleksibelitas setiap residu asam amino yang terdapat pada sistem.
Keyword: enzim lipase PPD2, konsentrasi garam, simulasi dinamika molekul variasi suhu

Judul: Perempuan dan Resiliensi Nafkah Rumah Tangga Pedagang Pasar Terapung (Kasus : Pasar Terapung di Banjarmasin, Kalimantan Selatan)
Abstrak: Pasar terapung memiliki keunikan tersendiri dibandingkan dengan pasar lainnya, karena aktivitas jual-beli berlangsung di atas sungai menggunakan perahu. Perbedaan ukuran perahu yang dimiliki oleh pedagang laki-laki dan perempuan dapat menunjukkan kondisi perekonomian yang berbeda. Pemanfaatan modal nafkah rumah tangga dapat berbeda-beda sesuai dengan kemampuan masing-masing dalam memanfaatkannya. Berbagai sumber nafkah juga dimanfaatkan baik dari sektor perdagangan maupun non-perdagangan. Penelitian ini merupakan penelitian kuantitatif yang didukung dengan kualitatif. Teknik pengumpulan data melalui kuesioner untuk data kuantitatif dan wawancara mendalam untuk data kualitatif. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menganalisis struktur nafkah, mekanisme adaptasi nafkah, dan faktor-faktor yang mendukung tercapainya resiliensi nafkah rumah tangga pedagang pasar terapung laki-laki dan rumah tangga pedagang pasar terapung perempuan. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa pedagang pasar terapung perempuan menjadi pencari nafkah utama dalam rumah tangga. Selain itu, dengan segala keterbatasan yang perempuan miliki, kemampuan adaptasi mereka untuk mencapai resiliensi nafkah lebih baik dibandingkan pedagang laki-laki., Floating market is unique compared to other markets, because trading activity takes place on the river using boats. The difference in boat sizes owned by male and female traders can indicate different economic conditions. Utilization of household capital according to the ability of each to utilize it. Various sources of income are also utilized from both the trade and non-trade sectors. This research is a quantitative supported by qualitative method. Technique of collecting data is through questionnaires for quantitative and in-depth interviews for qualitative. The purpose of this study is to analyze the structure of income, livelihood adaptative mechanism, and the factors that support the achievement of household livelihood resilience of male and female floating market traders. The results of this study indicate that female floating market traders are the main breadwinners in the household. In addition, with all the limitations that women have, their adaptability to achieve livelihood resilience is better than that of male traders.
Keyword: household, livelihood resilience, traders