Judul: Identifikasi Keragaman Single Nucleotide Polymorphism (SNP) Ekson 2.1 Gen PLAG1 pada Sapi Pedaging
Abstrak: Gen Pleomorphic Adenoma Gene 1 (PLAG1) adalah salah satu gen yang mengendalikan sifat-sifat pertumbuhan pada sapi. Penelitian ini dilakukan untuk menganalisis keragaman Single-Nucleotide Polymorphism (SNP) daerah ekson 2.1 gen Pleomorphic Adenoma Gene 1 (PLAG1) pada sapi bali, sapi peranakan ongol (PO) dan sapi limosin dengan metode direct-sequencing. Sampel darah yang digunakan yaitu 46 sampel yang terdiri atas 29 sampel sapi bali, 9 sampel sapi PO dan 8 sampel sapi limosin. Analisis data yang dilakukan yaitu perhitungan frekuensi genotipe dan alel, nilai heterosigositas, dan keseimbangan Hardy-Weinberg (uji chi-square). SNP c.1186 C>T dan c.1420 G>A pada sapi PO dan semua SNP pada sapi bali bersifat polimorfik dengan keragaman yang rendah sedangkan SNP c.1033 C>G, c.1036 A>G, c.1067 G>A dan c.1492 A>G sapi PO dan semua SNP sapi limosin yang diteliti bersifat monomorfik. SNP yang ditemukan dalam penelitian ini mengubah susunan asam amino SNP c.1033 C>G his>gln dan SNP c.1067 G>A glu>lys. Keseimbangan Hardy-Weinberg gen PLAG1 dalam kadaan seimbang pada SNP c.1420 G>A sapi bali dan PO serta SNP c.1033 C>G dan c.1067 G>A pada sapi bali. SNP c.1186 C>T sapi bali dan sapi PO serta SNP c.1036 A>G, c.1186 C>T dan c.1492 A>G pada sapi bali tidak dalam keseimbangan Hardy-Weinberg.
Keyword: gen PLAG1, keragaman, sapi pedaging, SNP, teknik sekuensing

Judul: Identifikasi Single Nucleotide Polymorphism Ekson 2.2 Gen PLAG1 pada Sapi Bali, Peranakan Ongole dan Limousin
Abstrak: PLAG1 merupakan gen yang berada di kromosom 14 pada sapi yang diduga memiliki hubungan dengan sifat pertumbuhan dan penambahan bobot badan. Tujuan dari penelitian ini adalah mengidentifikasi Single Nucleotide Polymorphism (SNP) ekson 2.2 Gen Pleomorphic Adenoma 1 (PLAG1) pada Sapi bali, PO, dan limousin. Penelitian ini menggunakan teknik direct sequencing pada 15 sampel darah sapi bali jantan, 15 sampel darah sapi bali betina, 8 sampel darah sapi PO, dan 8 sampel darah sapi limousin. Hasil sequencing kemudian dianalisis menggunakan program BLAST dari NCBI, Finch TV, BioEdit dan Popgene. Identifikasi keragaman SNP dianalisis dengan menggunakan pendekatan ClustalW menggunakan program MEGA10. Hasil amplifikasi ekson 2.2 gen PLAG1 pada 3 bangsa sapi berbeda diperoleh 11 SNP bersifat polimorfik dan frekuensi alelnya memenuhi kriteria keseimbangan Hardy-Weinberg. SNP yang ditemukan pada sapi bali berjumlah 6 yaitu c.1654 A>C, c.1660 G>A, c.1720 C>T, c.1753 A>G, c.1759 G>A dan c.1870 G>A, pada sapi PO ditemukan 2 SNP c.1822 A>T dan c.2050 A>G, dan pada sapi limousin ditemukan 3 SNP c.1779 T>C, c.1792 C>T dan c.1818 C>G.
Keyword: gen PLAG1, sapi, sequencing, SNP

Judul: Analysis of NaTFSA Electrolytes on Sodium Ion  Batteries Using the DC-DFTB-MD Method
Abstrak: Pelarut air digunakan dalam sistem elektrolit NaTFSA pada baterai ion natrium karena sifatnya yang relatif aman. Namun, menghasilkan tegangan yang cukup rendah sehingga memiliki keterbatasan dalam pengaplikasiannya. Untuk mengatasi hal tersebut dikembangkan elektrolit berkonsentrasi tinggi. Pada penelitian ini, pengaruh konsentrasi elektrolit NaTFSA terhadap sifat struktur, dinamika, dan elektronik dianalisis menggunakan metode dinamika molekul pada level mekanika kuantum. Analisis mikroskopik struktur dan dinamika elektrolit NaTFSA menunjukkan bahwa seiring kenaikan konsentrasi, koefisien difusi air menurun sedangkan konduktivitas elektrolit cenderung meningkat sebanding dengan mobilitas ion-ion., The aqueous solvent is used in the NaTFSA electrolyte system in sodium ion batteries because it is relatively safer. However, the voltage window of the sodium ion battery is narrower than that of the lithium ion battery, thus it still limits its practical implementation. To overcome this problem, a high concentration of electrolyte was developed. In this present work, the salt concentration effect on structural, dynamic and electronic properties were analyzed using molecular dynamics methods at the quantum mechanical level. Microscopic analysis of the structural and dynamical properties of the NaTFSA electrolyte showed that as the concentration increased, the water diffusion coefficient decreased while the electrolyte conductivity tended to increase.
Keyword: Conductivity, DC-DFTB, Diffusion constants, NaTFSA electrolytes, Sodium ion batteries