Judul: Genetic variability studies on avocado (Persea americana L.) using inter-simple sequences repeat (ISSR) analysis
Abstrak: Avocado (Persea americana Mill) is an evergreen tree native to Mesoamerica. Open pollination reproduction mode and mutations are the main source of the high genetic diversity in avocado. Differences in climate and soil conditions in Indonesia by region of origin also makes the avocado has a high diversity. Evaluation of avocado characterization is usually based on morphological descriptions of plants. However, this method requires a long time because the avocado plant is an annual plant. Therefore, other ways to characterize the avocado is needed. Inter-simple sequence repeat (ISSR) markers were used to study genetic diversity relationships among 23 avocado accessions. Morphological traits were used to assess levels of polymorphism across 23 accessions. Thirty-four morphological traits were scored and were scattered into 121 different loci. The twenty-third accessions grouped into three groups at 0.44 similarity degree. A total of 37 different amplification fragments were detected ranging from 2 to 7 per primer with an average of 5.2 fragments per primer. A dendrogram was generated using UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Averages). This dendrogram classified most of the genotypes analyzed into three major groups. The UPGMA cluster constructed from combination data of morphological traits and ISSR marker analysis separated the 23 accessions into three major groups at similarity value of 0.51. The most different accession is Lam1. The rest of the accessions in the dendrogram could be divided into two main clusters with accessions of different origin intermixed. The correlation coefficient between the morphological and ISSR matrices was 0.60076. It means that the matrices obtained from the molecular genomic markers and the morphological trait had significant positive correlations.
Keyword: 

Judul: Grouping of Plant Oil Palm (Elaeis guineensis Jacq) Origin of West Java by Simple Sequence Repeats (SSR) Markers
Abstrak: Permasalahan utama yang dihadapi di perkebunan kelapa sawit Indonesia adalah masih rendahnya produktivitas dan kualitas kelapa sawit. Adanya populasi kelapa sawit (Elaeis guineensis Jacq) yang belum diketahui identitasnya dan masih bertahan sejak zaman penjajahan Belanda diduga memiliki ketahanan terhadap serangan Ganoderma sp sehingga dapat digunakan sebagai indukan baru dalam pemuliaan tanaman untuk peningkatan produktivitas. Seleksi kelapa sawit melalui perakitan varietas unggul secara konvensional memerlukan waktu yang sangat lama. Teknik molekuler merupakan solusi yang tepat, cepat, dan akurat. Simple Sequence Repeat (SSR) marker digunakan untuk memperoleh informasi genetik pada penelitian yang bertujuan untuk mengelompokkan 58 pohon kelapa sawit yang belum teridentifikasi sebagai informasi awal untuk mencari indukan baru yang berkualitas. Tahapan penelitian dimulai dari isolasi DNA, uji kuantitatif dan kualitatif DNA, penentuan suhu annealing, amplifikasi DNA, hingga konstruksi pohon filogenetik menggunakan metode UPGMA (Unweighted Pair Group Method Arithmatic mean) dengan software NTSYS. DNA hasil isolasi berukuran 12000 bp dengan kualitas pita yang jelas dan terang. Amplifikasi DNA menghasilkan 859 alel dari 6 lokus. Keseluruhan alel menunjukkan polimorfisme yang cukup tinggi yaitu 93% dengan alel heterozigot lebih mendominasi daripada alel homozigot. Antara individu dalam populasi mempunyai nilai koefisien kemiripan bervariasi antara 42%-98%. Seluruh individu dalam populasi kelapa sawit dapat dikelompokkan menjadi dua kelompok besar pada nilai koefisien kemiripan sebesar 65%. Semakin tinggi nilai koefisien kemiripannya maka semakin spesifik pengelompokkan yang terjadi.
Keyword: 

Judul: Cycle Hamilton pada Graf Lengkap, Graf Regular, dan Graf 2-Connected 4-Regular Berorder Kurang dari Sepuluh
Abstrak: Suatu graf disebut graf Hamilton apabila graf tersebut memuat cycle Hamilton, yaitu cycle yang melewati setiap vertex tepat satu kali. Menentukan keberadaan cycle Hamilton pada suatu graf dapat menggunakan syarat cukup yang berupa teorema-teorema yang telah diperkenalkan sejak tahun 1950-an. Beberapa syarat cukup yang dibahas dalam karya ilmiah ini adalah syarat cukup yang berhubungan dengan graf lengkap dan graf regular. Suatu graf lengkap berorder 𝑛������ ≥ 3 dan graf r-regular berorder 𝑛������ ≤ 2𝑟������ + 1 merupakan graf Hamilton, Karena kedua graf tersebut memuat cycle Hamilton. Selanjutnya, syarat cukup tersebut digunakan untuk menentukan keberadaan cycle Hamilton pada graf 2-connected 4- regular berorder kurang dari 10.
Keyword: graf Hamilton, graf regular, graf lengkap, graf 2-connected 4-regular