গুনাওয়ান প্রাক্তন রাষ্ট্রপতি মেঘবতী সুকার্নোপুত্রীর সহকারী হিসেবে কাজ করেছে যে মেঘবতী ইন্দোনেশিয়ার ডেমোক্রেটিক পার্টি অফ স্ট্রাগল (পিডিআইপি) নামক দলের নেত্রী আর এই দলটি রাষ্ট্রপতি নির্বাচনে জোকোউইএর প্রার্থীতা সমর্থন করেছিল