Các vắc-xin này nói chung là an toàn. Sốt xảy ra trong năm đến mười phần trăm trẻ em được tiêm chủng. Đau cơ tạm thời hoặc cảm giác mệt mỏi cũng có thể xảy ra. Trong một số năm nhất định, vắc-xin có liên quan đến sự gia tăng Hội chứng Guillain-Barré ở những người lớn tuổi với tỷ lệ khoảng một trường hợp trên một triệu liều. Không nên dùng cho những người bị dị ứng nặng với các phiên bản trước của vắc-xin. Mặc dù hầu hết các vắc-xin cúm được sản xuất bằng kỹ thuật dựa trên trứng, tuy nhiên vắc-xin cúm vẫn được khuyến nghị cho những người bị dị ứng trứng, ngay cả khi nghiêm trọng. Các vắc-xin có cả hai dạng virus bất hoạt động và suy yếu. Phiên bản không hoạt động nên được sử dụng cho những người đang mang thai. Chúng có dạng được tiêm bắp, phun vào mũi hoặc tiêm vào lớp giữa của da.