Vận dụng lợi thế so sánh để phát triển đất nước (Nhà xuất bản Khoa học Xã hội, 1998)
 Hiến dâng (tiểu thuyết, Nhà xuất bản Quân đội Nhân dân, 2000, Nhà xuất bản Lao động tái bản, 2002). VTV3 dựng thành phim Truyền hình 5 tập mang tên Hồi sinh, 2001.
 Dòng đời (Bộ tiểu thuyết 4 tập, Nhà xuất bản Văn nghệ, 2006)
 Lũ (bộ tiểu thuyết thứ hai, tiếp theo bộ Dòng đời, 2 tập, Nhà xuất bản Tre Xanh - USA)
 Sách tham khảo: Nguyên Nguyên - Việt Nam định hướng xã hội chủ nghĩa trong thế giới toàn cầu hóa, Nhà xuất bản Trẻ, TPHCM,2001
 Hồi ký: Tôi làm "chính trị" 
 Hồi Ký, final version (4th Draft) Phần một, Phần hai, Phần ba, Phần bốn – Phục lục 
 Tham khảo thêm các bài viết hàng năm, đăng tải trên viet-studies.net của Trần Hữu Dũng
 3 bài liên quan đến Đại hội XIII của ĐCSVN
 Nguyễn Trung, "Kiến nghị về Đại hội XIII" 
 Nguyễn Trung, "Hãy xây dựng một Việt Nam của một dân tộc trưởng thành và dấn thân!" (Suy nghĩ về sự lựa chọn của Đại hội XIII cho đất nước)
 Nguyễn Trung, "Vài suy nghĩ về 3 nhiệm vụ lớn gian khổ phía trước của nước ta" 
 Kiến nghị về Đại hội XIII của ĐCSVN