Hình thành 
Các sinh vật sống bao gồm các hợp chất hữu cơ. Trong cuộc sống, chúng tiết ra hoặc bài tiết các vật liệu hữu cơ vào môi trường của chúng, thải bỏ các bộ phận cơ thể như lá và rễ và sau khi sinh vật chết đi, cơ thể chúng bị phân hủy do tác động của vi khuẩn và nấm. Các phân tử lớn hơn của chất hữu cơ có thể được hình thành từ sự trùng hợp của các phần khác nhau của vật chất đã bị phá vỡ. Thành phần của chất hữu cơ tự nhiên phụ thuộc vào nguồn gốc, chế độ biến đổi, tuổi và môi trường hiện có của nó, do đó chức năng hóa lý sinh học của nó thay đổi theo các môi trường khác nhau.