Sự đưa vào bất đồng chất nguyên tố ảnh hưởng mạnh mẽ đến khả năng xử lý và sử dụng thạch anh. Thạch anh tự nhiên với độ tinh khiết cực cao, cần thiết cho các lò và thiết bị khác dùng để nuôi cấy silicon đơn tinh thể trong ngành công nghiệp bán dẫn, là hiếm và đắt đỏ. Những thạch anh tinh khiết cao này được định nghĩa chứa ít hơn 50 ppm của các nguyên tố bất đồng chất. Một vị trí khai thác quan trọng cho thạch anh tinh khiết cao là Mỏ Gem Spruce Pine tại Spruce Pine, North Carolina, Hoa Kỳ. Thạch anh cũng có thể được tìm thấy tại Caldoveiro Peak, tại Asturias, Tây Ban Nha.