Lịch sử 
Ngày 23 tháng 5 năm 1939, Giáo hoàng Piô XII bổ nhiệm Francis Spellman làm Tổng giám mục thứ sáu của Tổng giáo phận New York. Theo báo cáo, ngay từ lúc đó ông đã muốn xây dựng một khu tưởng niệm phù hợp và lâu dài cho vị tiền nhiệm của mình là cố Hồng y Patrick Joseph Hayes. Khu tưởng niệm ấy sau này chính là ngôi trường. Tổng giám mục Spellman đặt viên đá đầu tiên vào ngày 20 tháng 11 năm 1940, tức sinh nhật của Hồng y Hayes. Trường Hồng y Hayes được khánh thành và thánh hiến bởi tổng giám mục giáo phận vào ngày 8 tháng 9 năm 1941, đúng vào lễ kỷ niệm 49 năm thụ phong linh mục của vị cố hồng y.