Tháng 1 năm 1996, Đào Bá Quân được bổ nhiệm giữ chức vụ Phó Bí thư Đảng ủy Quân khu, Tư lệnh Quân khu Quảng Châu và giữ cương vị này đến khi nghỉ hưu vào tháng 1 năm 2002. Ông qua đời lúc 18:37 ngày 18 tháng 1 năm 2009 ở Quảng Châu, hưởng thọ 72 tuổi.