Trong khi phần lớn thạch anh kết tinh từ dung nham magma, thạch anh cũng kết tủa hóa học từ các mạch nước nóng như gangue, đôi khi cùng với các khoáng vật quặng như vàng, bạc và đồng. Các tinh thể thạch anh lớn được tìm thấy trong các pegmatite hỗn hợp magma. Các tinh thể hình thành tốt có thể dài đến vài mét và nặng hàng trăm kilogram.