Công ty được thành lập vào năm 1984 bởi nhà xuất bản Michael B. Morgan và William Kaufmann và nhà khoa học máy tính Nils Nilsson. Nó được tổ chức riêng tư cho đến năm 1998, khi nó được Harcourt General mua lại và trở thành một chi nhánh của Nhà xuất bản Học thuật, một công ty con của Harcourt. Harcourt đã được mua lại bởi Reed Elsevier vào năm 2001; Morgan Kaufmann hiện là một chi nhánh của bộ phận Khoa học và Công nghệ của Elsevier.