Nghiên cứu đã chỉ ra rằng ngựa Caspi và ngựa Turkoman chiếm vị trí trong phân tích phát sinh loài đã được tăng lên đến một giả thuyết cho rằng chúng có thể là tổ tiên của tất cả các giống loại phương Đông khác được nghiên cứu cho đến nay. Tuy nhiên, nghiên cứu gần gũi của ngựa Caspi và bộ xương các loài họ ngựa equid khác bởi Firouz và những người khác tìm thấy một số bất thường duy nhất cho các con ngựa Caspi.