Những vi khuẩn axít khác, được cho là có tác dụng probiotic, cũng có thể được tìm thấy trong kombucha. Đồ uống này chứa vi khuẩn Gluconacetobacter xylinus. Ngoài ra, nó còn chứa vi khuẩn Zygosaccharomyces sp., Acetobacter pasteurianus, Acetobacter aceti, và Gluconobacter oxydans.