Giải bóng đá vô địch quốc gia Quần đảo Cook 2001 là mùa giải thứ 28 được ghi nhận của giải đấu bóng đá cao nhất ở Quần đảo Cook, với việc không rõ kết quả ở các mùa giải từ 1951 đến 1969, mùa giải 1986 và cả 1988–1990. Tupapa Maraerenga giành chức vô địch đầu tiên được ghi nhận. Avatiu là đội á quân.