Ngày 16 tháng 12 năm 2013, hơn 20 quầy hàng tại khu D chợ Nhà Xanh đã bị cháy rụi hoàn toàn và 10 quầy hàng bị ảnh hưởng một phần. Một nhân chứng kể lại đám cháy xuất phát từ tiếng nổ nhỏ phát ra ở đoạn đầu khu D của chợ, sau đó nhiều tiếng nổ khác liên tiếp phát ra rồi lửa bùng lên. Đám cháy đã được huy động 9 xe chữa cháy và 200 lính cứu hoả và được dập tắt sau khoảng 3 giờ. Theo đó ước tính thiệt hại từ vụ việc này có thể lên đến hàng chục tỷ đồng.
 Liên quan tới vấn nạn "chặt chém" và chửi khách hàng, một clip vụ việc cô gái trẻ bị đánh, chửi tại một cửa hàng quần áo ở chợ Nhà Xanh đã được tung ra. Theo đó, vì mặc cả giá, cô gái này đã bị chửi mắng, tát liên tục vào mặt. Công an quận Cầu Giấy đã phải vào cuộc, điều tra và xác minh làm rõ sự việc với người bán hàng. Cô gái bị tát trong đoạn clip chưa thể liên lạc được.