Method for the production of vector plasmids capable of transforming an Escherichia coli host bacterium and to promote and control the expression of heterologous DNA

Abstract: 1. A method of preparing vector plasmids capable of transforming a bacterial Escherichia coli host, of acting as a promoter and of controlling the expression of a heterologous DNA, characterized in that it consists of : a) a partly synthetic promoter with a sequence identical to that of the PL promoter of the lambda bacteriophage ; b) a sequence transcribed from the promoter in question, which is a leader sequence consisting of a ribosomal binding site, manifested by the compilation of natural binding sequences (consensus sequence), followed by a region rich in A and T bases whose length must lie between 3 and 15 bases up to the translation initiation ATG ; c) a recognition sequence of _K_p_n_l, _N_c_o_l and _B_a_mHI restriction enzymes straddling the site of the initiation of the translation.

Description: Procédé de préparation de plasmides capables de transformer un htte bactérien E.coli et d'y promouvoir et contrôler la synthèse d'un ADN hétérologue. La présente invention se rapporte S la préparation de plasmides portant une séquence d'ADN choisie en vue de pouvoir y insérer et en extraire aisément une séquence d'ADN hétérologue de façon a ce que cette dernière soit exprimée dans la bactérie hutte Escherichia coli du plasmide. Elle concerne également les plasmides vecteurs obtenus selon les procédés revendiqués. Elle comprend plus particulièrement la conception d'une séquence nucléotidique représentant une partie du promoteur PL du bactériophage lambda, une séquence représentant le leader de l'ARN messager transcrit a partir de ce promoteur, séquence choisie pour être optimale pour l'initiation de la traduction dudit ARN messager, enfin, une séquence de reconnaissance de différentes enzymes de restriction de façon à permettre l'insertion et l'excision d'ADN hétérologues en phase derrière le site d' initiation de la traduction. L'expression d'ADN hétérologues en vue d'y diriger la synthèse de polypeptides dans la bactérie hOte Escherichia coli nécessite l'utilisation de plasmides appelés "vecteurs d'expression". De nombreux vecteurs d'expression ont été décrits dans la littérature. Ils ont tous en commun les caractéristiques de porter un promoteur, soit d'origine bactérienne, soit d'orisine phagique, suivi d'un site de fixation des ribosomes et d'un site d'insertion d'un ADN hétérologue. L'ADN hétérologue a exprimer est introduit, soit avec son site propre d'initiation de la traduction, soit en phase derrière un site d'initiation de la traduction porte par le vecteur. La présente invention a pour objet la préparation de plasmides capables de transformer des bactéries E.coii, et portant un promoteur dont la séquence partiellement synthétique est celle d'un Promoteur P. du bactériophage lambda, transcrivant un messager dont le leader a une séquence choisie pour être optimale pour l'initiation de la traduction et possédant une séquence, chevauchant le site d'initiation de la traduction, telle que l'on puisse la cliver par différentes enzymes de restriction. Ce procédé de préparation de plasmides conçus pour permettre l'expression d'ADN hétérologues dans la bactérie E.coli selon la présente invention, est caractérisé en ce que le plasmide comprend a) un promoteur partiellement synthétique de séquence identique à celle du promoteur PL du bactériophage lambda. b) une séquence transcrite â partir du promoteur en question qui soit un leader considéré comme optimal pour l'expression d'un ADN hétérologue que l'on peut insérer en aval de ladite séquence leader. c) une séquence de reconnaissance des enzymes de restriction KPnI, NcoI et BamHI à cheval sur le site d'initiation de la traduction. De plus a) le promoteur de séquence identique à celle du promoteur PL du bactériophage lambda est construit à partir d'un promoteur PR dont la partie comprise entre le site Hindi situé dans la région -35 et le site d'initiation de la transcription est remplacée par un fragment synthétique de séquence identique à la séquence naturelle du PL b) la séquence leader transcrite à partir du promoteur en question est longue de 23 bases suivies d'un codon ATG d'initiation de la traduction, elle comprend un site de liaison des ribosomes homologue à l'ARN 16S du ribosome sur 9 bases et situé 12 bases en amont de l'ATG. c) les séquences reconnues par les enzymes KpnI, NcoI et BamHI sont combinées en une séquence de longueur minimum qui est EMI3.1 De plus a) le promoteur PL et le leader transcrit à partir de ce promoteur sont construits à partir du promoteur PR du plasmide vecteur pCQV2 par remplacement d'un fragment HindII-BamHI de 56 paires de bases par un frgment de 60 paires. de bases synthétisé sous forme de 4 oligodesoxyribonucléotides. b) des bactéries hûtes E.coli sont transformées par le plasmide obtenu sous a), sélectionnées, et isolées par crible caractéristique., et les vecteurs portés sont caracterises par séquençage des régions relevantes. Enfin, la séquence leader inventée est la suivante EMI3.2 <tb> AT <SEP> G <SEP> T <SEP> A <SEP> C <SEP> T <SEP> A <SEP> A <SEP> G-GAG <SEP> GT <SEP> T <SEP> T <SEP> TG <SEP> G <SEP> T <SEP> A <SEP> C <SEP> C <SEP> A <SEP> T <SEP> G <tb> t <tb> initiation <SEP> de <SEP> la <SEP> initiation <SEP> de <tb> <SEP> transcription <SEP> la <SEP> traduction <tb> Le procédé faisant l'objet de la présente invention est plus particulièrement caractérisé par le choix des moyens suivants a) on conçoit de modifier le vecteur pCQV2 d'usage libre de façon à ce que le promoteur PR qu'il porte devienne un promoteur PL en utilisant le fait qu'il existe au sein de la région d'homologie -35 de ces deux promoteurs, un site de restriction HindII et que la région la plus éloignée du site d'initiation de la transcription par rapport au clivage HindII est identique pour les deux promoteurs. b) on conçoit une séquence optimale pour l'initiation de la traduction en prenant celle dont la complémentarité avec L'ARN 16S du ribosome est la plus grande dans les limites de la dimension permise de cette séquence et en faisant suivre cette séquence de 12 bases puis d'un ATG, codon d'initiation de la traduction. La distance de 12 bases entre le site de fixation du ribosome et le site d'initiation de la traduction étant considérée comme optimale. c) on découpe la séquence ainsi conçue en 4 fragments monobrins convenables pour titre synthétisés chimiquement et titre clones en deux étapes distinctes permettant un contrtle intermédiaire du bon fonctionnement du vecteur. d) on synthétise chimiquement les 4 fragments dont l'ensemble couvre la partie du promoteur PL comprise entre le site Hindi de la région d'homologie -35 et le site d'initiatior de la transcription ainsi que le leader de l'ARN messager et la région portant les sites d'insertion choisis. e) on insère les 4 fragments synthétiques dans le plasmide pCQV2 clivé par les enzymes Hindi et BamHI et débarrasse du fragment HindII et BamHI de 56 paires de bases à remplacer. f) on transforme des bacteries de la souche MM294 par l'ADN hybride obtenu dans la phase précédente. g) on sélectionne, par leur résistance à un antibiotique, les bactéries qui portent un plasmide. h) on isole de cette banque les clones porteurs de lADN inséré par hybridation avec un fragment constitutif de l'ADN inséré marqué au 32P i) on caractérise le vecteur par séquençage des régions relevantes par la méthode de Maxam & Gilbert, à partir d'un site de restriction proche de l'ADN inséré dans le plasmide. On obtient alors un premier vecteur. j) on mesure le caractère fonctionnel du plasmide en insérant en phase derrière l'ATG un ADN hétérologue et en mesurant au moyen d'un test ELISA le taux de synthèse de la protéine codée par l'ADN hétérologue. Suivant une variante du procédé faisant l'objet de la presente invention, a) on délète le vecteur obtenu d'un fragment HindIII-HindIII de 125 paires de bases situées dans le gène ci codant pour le répresseur des promoteurs PR et PL b) on transforme, on sélectionne et on caractérise le résultat comme décrit plus haut de f) a j). On obtient alors un second vecteur ; e vecteur ne portant plus de répresseur de son propre promoteur devra titre utilisé dans une souche lysogène pour un bactériophage A défectif porteur du gene cl, soit sous sa forme sauvage, soit sous forme d'un mutant thermosensible cI,7) Suivant une autre variante du procédé, a) on insère deux fragments synthétiques complémentaires de 34 bases dans le vecteur obtenu clivé par les enzymes BamHI et PvuII débarrassé du fragment BamHI-PvuII de 1692 paires de bases. La séquence de 34 paires de bases est choisie de façon a présenter un maximum de sites de restriction qui par ailleurs ne se retrouvent pas en une autre localisation dans le vecteur. Elle porte notamment les sites SaCII, Balai. Sali, XhoI, SacI et Pvull, et est la suivante : EMI5.1 b) on transforme, on sélectionne et on caractérise le résultat comme décrit plus haut de f) A j). On obtient alors un troisième vecteur. Le procédé de préparation de plasmides d'expression d'ADN hétérologue dans la bactérie E.coli est caractérisé par la combinaison et le choix d'un ensemble de moyens détaillés ci-après. La construction d'un vecteur d'expression performant peut être faite par exemple en modifiant un vecteur d'expression banal, par exemple pCQV2 décrit par Queen (Mol. Appui Genet.,2(1983)1-10), en vue d'optimaliser les differents éléments influant sur son efficacité. Ces eléments sont principalement le taux de transcription dépendant de la séquence du promoteur et plus particulièrement des régions -35 et -10; ainsi que l'efficacité de l'initiation de la traduction déterminée par la séquence du site de liaison du ribosome et la séquence et la distance entre celui-ci et l'ATG d'initiation. On trouvera dans Rosenberg et Court (Annual Rev.of Genet. 1979, pp.319-354) une comparaison de différentes séquences promotrices bactériennes et de bactériophages; dans Kastelein, R.A., Berkhout, B., Overbeek, G.P. et Van Duin, J.(Gene 23 (1983) 245-254), Joy, E., Seth, A.K., Romens, J., Sood, A. and Joy, G. (Nucleic Adics Res. 10(1982) 6319-6329), Gheysen, D., Iserentout, D., Derom, C. and Fiers, W.(Gene 17 (1982) 55-63), Joy, G., Khoury, G., Seth, A.K. and Joy, E. (Proc. Natl. Acad. Sci. USA 78 (1981) 5543-5548), Hui, A., Hoyplick, J., Dinkelspiel, K. and de Boer, H.A. (The EMBO J. 3 (1984) 623-629), l'état des connaissances quant aux facteurs influençant l'initiation de la traduction chez E.col i. On peut concevoir une séquence qui paraisse optimale au vu des différents critères tels qu'ils ressortent de la littérature citée; par exemple: a) la séquence promotrice sera celle du promoteur PL du bactériophage lambda b) le site de reconnaissance du ribosome sera complémentaire de L'ARN 16S du. ribosome sur 9 bases et la distance entre ce site et 1 'ATG d'initiation sera d'environ 10 paires de bases. En aval de l'ATG d'initiation, on peut concevoir une séquence telle que un maximum de sites de restriction apparaissent sur une distance minimale et que ces sites soient uniques dans le vecteur. Cette séquence peut par exemple être conçue pour commencer par 1' extrémité cohesive d'un site BamHI ét se terminer par une extrémité franche. c) on peut creer une telle séquence, par exemple en la découpant en fragments simple brin de façon optimale, compte tenu des possibilités de la synthèse chimique d'ADN que l'on peut trouver décrite dans Narang, S.A. (Tetrahedron 39 (1983). 3-22), et de façon a pouvoir realiser le clonage de ces fragments en deux étapes, un premier groupe de 4 fragments se terminant par exemple par un site BamHI, les deux derniers fragments ayant un site BamHI a leur extrémité 5' sur la fibre codante et une site Pvuil a leur extrémité 3' sur la mEme fibre. d) la synthèse chimique des fragments d'ADN voulus peut se faire selon différentes methodes dont on trouvera la description dans Narang, S.A. (Tetrahedron 39 (1983) 3-22), Itakura, K. (Trends in Biochem.Sc. (1982) 442-445), Ohtruka, E., ikehara, M. and Soll, D. (Nucleic Acids Res. 10 (1982) 6553-6570). A titre d'exemple, on peut utiliser soit la méthode des phosphotriesters décrite par Brown, E.L., Belagage, R., Ryan, M.J. and Khorama, M.S. (Methods in Enzymology 68 (1979) 109), soit celle des phosphites triesters décrite par Letsinger, R.L. and Lusford, W.B. (J. Am. Chem. Soc. 98 (1976) 3655). Ces méthodes diffèrent par le degré d'oxydation de l'atome de phosphore dans les intermédiaires nucléotidiques mis en oeuvre lors de la réaction de couplage. e) L'hybridation et la ligation des fragments d'ADN synthétique entre eux peut se faire par différentes méthodes dont on trouvera la description dans Molecular Cloning (1982 - Maniatis, T., Fritsch, E.F. and Sambrook, J., CSH Publ.). Ces méthodes sont basées sur le principe de l'hybridation des séquences complémentaires d'ADN. Elles consistent à mélanger les fragments d'ADN dans des conditions de température et de force ionique adéquates à la formation des hybrides spécifiques. La ligation de ces fragments hybridés est le résultat de l'action d'une enzyme, par exemple la T4 DNA ligase. La formation in vitro de molécules hybrides entre l'ADN synthétique double brin à cloner et l'ADN de vecteurs plasmides s'effectue selon le procéde décrit dans Molecular Cloning (1982 - Maniatis, T., Fritsch, E.F. and Sambrook, J., CSH Publ.), qui consiste à mélanger les molécules dans des conditions de température et de force ionique appropriées. C'est ce protocole qui a été suivi dans la réalisation de l'invention. L'ADN vecteur employé dans la réaction de recircularisation in vitro peut provenir de différents plasmides. Dans la réalisation de cette invention, on choisit de préférence le plasmide pCQV2 (Queen, C., J. Mol. Applied Genet. 2 (1983) 1-10) dans lequel on clone entre les sites Hindi et BamHI d'une part, et BamHI et Pvuii d'autre part. f) La plupart des méthodes utilisées pour transformer des bactéries par de l'ADN exogène font appel à un traitement particulier des bactéries par du chlorure de calcium, et visent µ optimiser l'efficacité de transformation pour différentes souches de bactéries. Dans le cadre de l'invention, plusieurs types de bactéries peuvent servir d'sites aux vecteurs utilisés. On prendra de préférence la souche d'Escherichia coli MM294 pour les vecteurs portant leur propre répresseur, et N99 et N5151 pour les vecteurs dépourvus de leur propre répresseur. Leurs conditions de croissance sont particulièrement commodes. En outre, parmi les différents procédés de transformation, on choisit celui decrit dans Mandel, M. and Higa, A. (J. Mo1. Biol. 53 (1970) 154). g) En raison des marqueurs de résistance aux antibiotiques présents dans l'ADN du vecteur, il est simple d'isoler les bactéries transformées par l'ADN recombiné in vitro. Par exemple, si l'ADN du vecteur porte le gène TetR, toute bactérie portant un tel vecteur sera résistante A la tétracycline. En outre, si l'insertion de l'ADN. dans le vecteur a pour effet d'inactiver un gène de résistance A un antibiotique, on repérera les bactéries qui Portent le vecteur recombinant par leur sensibilite a cet antibiotique. De préférence on choisit comme marqueur de sélection le caractère AmpR des plasmides construits. h) Le crible de sélection des clones porteurs de l'ADN-synthétique peut se faire selon des méthodes mettant en oeuvre une sonde synthétique. Cette approche est détaillée dans Genetic Engineering, vol.1, Williamson, R. Ed., (1981) Academic Press, N.Y. Dans le cadre de la presente invention, on utilise de préférence l'un ou plusieurs des fragments constitutifs de l'ADN-synthétique marqué au 32 P comme sonde oligodésoxyribonucléotidique que l'on hybride avec les clones de la banque. i) La séquence d'ADN créée dans l'un ou plusieurs des clones obtenus peut ttre caractérisée par des méthodes de séquençage décrites dans Maxam, A. & Gilbert, W. (Methods in Enzymology .65 (1980) 497-559) et dans Sanger, F., Nicklen, S. & Coulson, A.R. (Proc. Natl. Àcad. Sci. USA 74 (1977) 5463). Dans le cadre de la présente invention, on choisira de préférence la méthode de Maxam & Gilbert. j) On peut alors tester la valeur des plasmides créés, par exemple en y insérant un ADN hétérologue dont l'expression peut titre mesurée par exemple par un test ELISA comme décrit dans Bollen, A., Herzog, A., Cravador, A., Horion, P., Chuchana, P., van der Straten, A-, Loriau, R., Jacobs, P. & Van Elsen, A. (DNA 2 (1983) 255-264). L'exemple non limitatif suivant qui s'applique a la construction de vecteurs d'expression a partir du plasmide pCQV2 permettra de mieux comprendre l'invention. A. Construction du plasmide vecteur désigné ci-aPrEs par PULB1219 et obtenu suivant les revendications 1 µ 4. 1. Modification du Promoteur P du vecteur PCQV2 en promoteur PL et optimalisation des séquences influencant l'initiation de la traduction. Dans le cadre de la présente invention, nous avons choisi de modifier le promoteur PR du vecteur pCQV2 pour en faire un promoteur PL Pour cela, nous avons inventé la séquence double brin suivante. 1 10 20 5'G A C A T A A A T A C C A C T G G C G G T G A T A C T 3'C T G T A T T T A T G G T G A C C G C C A C T A T G A 60 50 40 30 40 50 GAGCACAGCAGCTAAGGAGGTTTTGGT CTCGTGTAGTCGATTCCTCCAAAACCA 30 20 60 4 C C A T G 3' T G G T À C C T A G 5' 10 i Cette séquence est caractérisée en ce que a) son extrémité 5' (considérant la fibre identique au mRNA) est franche et correspond à la coupure par l'enzyme Hindi dans la région -35 homologue aux promoteurs PR et PL 1 en ce qu' elle est identique a la séquence naturel le du PL jusqu'au site d'initiation de la transcription (base 34 sur la fibre codante), b) les 26 bases suivantes sont choisies pour constituer un site de reconnaissance par les ribosomes qui soit optimal, pour que la séquence et la distance séparant ce site de reconnaissance du site d'initiation de la traduction (ATG, bases 58, 59, 60) soit optimale, et pour présenter devant cet ATG les sites de reconnaissances des enzymes KPnI et Nicol, c) son extrémité 3' se termine par la partie d'un site de restriction BamHI telle qu'elle apparat après clivage d'un ADN par cette enzyme. Dans le cadre de la présente invention, nous avons choisi de synthétiser cette séquence sous forme de 4 fragments simple brin allant des bases 1 9 27 et 28 d 60 sur la fibre codante et 1 à 30 et 31 à 64 sur la fibre complémentaire. 2. Préparation et ligation des fragments constitutifs Dans le cadre de la présente invention, on choisira de préférence de digérer le plasmide pCQV2 par les enzymes BamHI et Hindi et d'isoler par électrophorèse sur gel d'acrylamide et électroélution les fragments obtenus de 4302, 459 et 125 paires de bases. On choisira ensuite de digérer le fragment de 459 paires de bases par l'enzyme Hindili ce qui génère 2 fragments de 403 et 56 paires de bases qui sont séparées par électrophorèse; le fragment de 403 paires de bases est électroélué. Par ailleurs on choisit de ne phosphoryl er que les fragments de 33 et 34 bases de façon a éviter la formation de polymères lors de la ligation. On mélange alors 50 pmoles de chacun des 4 fragments synthétiques; le mélange est porté 2' a 90 C et refroidi lentement jusque 150C, on ajoute 10 en volume d'acétate de sodium 3M et 2,5 vol. d'éthanol, on refroidit 20' à -80 C et on centrifuge. Le culot est lavé a l'éthanol 75% dans veau, séché et resuspendu en tampon de ligation (50mM Tris HCl pH7.4, 10mM MgCl2. 10mM DTT, lmM spermidine, lmM ATP; 0,1 mgXml BSA). Les trois fragments de pCQV2 de taille 4302, 403 et 125 également en solution en tampon de ligation, sont ajoutés à raison de 40 pmoles de chaque. Le mélange est incubé 16h a 15 C en présence de 5 unites de l'enzyme T4 DNA ligase. 3. Transformation des bactéries huttes MM294 On procède alors à la transformation de la souche MM294 ("Molecular Cloning", Maniatis, J, Fritsch, E.F., Sambrook, J., CSH Ed. 1982) dont le système de restriction est modifié de façon a tolérer la présence d'un ADN étranger selon la méthode décrite dans "Molecular Cloning" (Maniatis, J., Fritsch, E.F. and Sambrook, J., CSH Ed. 1982). 4. Obtention de la banque de clones En raison du caractère AmpR du plasmide, on peut sélectionner les bactéries transformées par simple croissance sur milieu contenant de l'ampicilline. L'ensemble des manipulations décrites ci-dessus a conduit µ l'obtention d'une banque de 100 clones dont une grande partie doit contenir un plasmide de séquence voulue. 5. isolement des clones de séquence voulue On a recherché les clones porteurs d'un plasmide ayant la séquence voulue au moyen du fragment de 34 bases utilise comme sonde. Après avoir marqué cette sonde au 32P par une réaction enzymatique (kination en 5' de la sonde), nous l'avons utilisée pour cribler la banque de clones. Pratiquement, on fixe l'ADN de chaque clone sur feuille de nitrocellulose, suivant la technique de Grunstein, ri. et Hogness, D. (Proc. Natl. Acad. Sci. USA 78 (1975) 3961) et on l'hybride avec la sonde synthétique marquée au 32P dans des conditions ioniques et de température appropriées (0,9 NaCl et 55 C), la sonde radioactive va reconnattre spécifiquement l'ADN des clones portant une séquence homologue, c'est-a-dire une séquence nucléotidique typique du promoteur PL . On visualise les clones positifs par autoradiographie. Les clones positifs sont alors analyses par restriction par les enzymes Hindll, BamHI, Ncol, KPnI, HindIII; à cette etape, un clone ayant toutes les propriétés voulues a été retenu, pULB1219. 6. Séquencage du clone PULB1219 On caractérise le plasmide du clone pULB1219 par l'établissement de la séquence nucléotidique de la région modifiée et des jonctions avec les régions non modifiées. A cet effet, l'ADN du plasmide recombinant est préparé et clivé au site de restriction BamHi unique dans le plasmide recombinant. Les extrémités du plasmide linéarisé sont alors marquées au 32p, On coupe ensuite le plasmide par l'enzyme EcoRI générant deux fragments dont l'un porte à son extrémité marquée la séquence synthétique. Le fragment marqué est alors soumis à une serie de réactions chimiques conduisanta la production d'oligonucléotides marqués, de tailles différentes, dont l'analyse sur gel de polyacrylamide conduit a l'établissement de la séquence en bases suivant la technique de Maxam,A.M. & Gilbert,N. (Proc. Natl. Acad. Sci. USA 74 (1977) 560 > . On voit que la séquence obtenue est parfaitement conforme a celle définie en 1., et jointe aux fragments de pCQV2 de la façon choisie. B. Construction du plasmide vecteur désigné ci-après par PULB122 et obtenu suivant la revendication 5. 1. L'ADN du plasmide pULB1219 est clivé par l'enzyme de restriction Hindili générant deux fragments. Ceux-ci sont séparés sur gel de polyacrylamide et le plus grand est électroélué. 2. Ce fragment est alors religué sur lui-mEme générant le plasmide vecteur pULB1220. 3. Le plasmide vecteur p.ULB1220 est utilisB pour transformer la souche de E.coli N99 lysogène pour un A défectif portant le gène cI sauvase. Ceci conduit a l'obtention d'une banque de clones caractérisés par simple restriction. C. Construction du plasmide vecteur désigné ci-aPrès par PULB1221 et obtenu suivant les revendications 6 a 8. 1. Conception d'une séquence d'insertion/excision d'ADN hétérologue On choisit, pour l'insérer entre les sites BamHI et Pvuil du fragment obtenu, la séquence suivante. 1 10 5' G A T C C C C G C G G T G G C C A 3' G G G C G C C À C C G G T 30 20 20 30 G T C G À C C T C G A G C T C A G 3' C À G C T G G À G C T C G A G T C 5' 10 1 pressentant notamment les sites de restriction Sacil, Ball, AccI, Sali. Aval, XhoI, HsiAI, SacI. De plus, l'insertion de cette séquence dans pULB1220 régénère les sites BamHI et PvuII. 2. L'ADN du plasmide vecteur pULB1220 est clivé par les enzymes de restriction BamHI et PvuII. Cette digestion génère deux fragments, qui sont séparés sur gel de polyacrylamide. Le plus grand est purifié par electroélution. 3. La séquence choisie est synthétisée sous forme de 2 fragments monobrins complémentaires comme décrit plus haut. 4. Les 2 fragments monobrins sont hybridés et ligués comme décrit plus haut. 5. Le plasmide vecteur obtenu est utilisé pour transformer la souche N99 comme décrit. 6. La banque de clones obtenue est caractérisée par hybridation avec le fragment de 34 bases utilise comme sonde, comme décrit. Les clones positifs sont alors testés pour la présence des sites de restriction portés par le fragment synthétique. Le clone pULB1221 est retenu. 7. L'ADN du plasmide vecteur pULB1221 est isolé et clivé par l'enzyme Nicol. Le plasmide linéarisé est marqué au 32P comme décrit, recoupé par l'enzyme EcoRI et séquence comme décrit. La séquence est exactement celle choisie. D. Test de l'efficacité des Plasmides vecteurs pULB1219. PULB1220 et pULB12211. 1. Afin de tester l'efficacité des plasmides vecteurs pULB1219, pULB1220 et pULB1221, un cDNA codant pour 1'&alpha;1-antitrypsine humaine (&alpha;-AT) a été inséré en phase au site BamHI de chacun d'eux ainsi qu'au site BamHI du plasmide vecteur pCQV2 ; pour cela, un fragment de cDNA de l'v-AT portant un site BamHI a son extrémité NH2 terminale et une extrémité franche après le stop, a été ligué comme décrit, avec les plasmides pCQV2, PULB1219, PULB1220, clivés par BamHI et PvuII, et pULB1221 clivé par BamHi et Ball. Les plasmides recombinants obtenus ont été utilisés pour transformer les souches MM294 dans les cas de pCQV2 et pULBî2î9, et N99 dans les cas de pULB1220 et pULB1221. Les transformants ont été caractérisés par extraction à petite échelle de leur ADN plasmidique et restrictions appropriées. Dans le cas des plasmides pULB1220 et pULB1221, l'ÀDN plasmidique de clones jugés corrects est utilisé pour retransformer la souche N5151 lysogène pour un A défectif porteur d'un gène ci muté thermosensible (cIaa57). Les souches ainsi construites, pCQV2 &alpha;1,-AT dans MM294, pULB1219 &alpha;1-AT dans MM294, pULB1220 a-AT dans N5151 et pULB1221 &alpha;-A1 dans N5151, sont alors cultivées µ 32 C jusqu'à une densité optique de 0,5 E 660 nm. La culture est alors divisée en deux parts dont l'une reste a 32 C et l'autre est portée rapidement a 42 C. Après lh30, les cellules sont récoltées par centrifugation puis extraites au !ysozyme et Triton X100. L'&alpha;1-antitrypsine et les protéines totales sont alors mesurées, la première par un test ELISA au moyen d'anticorps de chèvre et d'anticorps de souris couplés a la peroxydase, tous deux dressés contre l'&alpha;1-antitrypsine humaine, les secondes par la méthode du folin. Le résultat montre que les vecteurs pULB1219, pULB1220 et pULB1221 sont 5 a 10 fois supérieurs au parent pCQV2.

Claims: REVENDICATIONS 1. Procédé de préparation de plasmides vecteurs capables de transformer un hotte bactérien Escherichia coli et d'y promouvoir et contrssler l'expression d'un ADN hétérologue, caractérisé en ce que le plasmide comprend: a) un promoteur Partiellement synthétique de séquence identique a celle du promoteur PL du bactériophage lambda. b) une séquence transcrite a partir du promoteur en question qui soit un leader considéré comme optimal pour l'expression d'un ADN hétérologue que l'on peut insérer en aval de ladite séquence leader. c) une séquence de reconnaissance des enzymes de restriction KpnI, Ncoi et BamHi a cheval sur le site d'initiation de la traduction. 2. Procédé de préparation de plasmides vecteurs selon la revendication 1, caractérisé en ce que a) le promoteur de séquence identique à celle du promoteur PL du bactériophage lambda est construit a partir d'un promoteur PR oont la partie comprise entre le site Hindi situé dans la région -35 et le site d'initiation de la transcription est remplacée par un fragment synthétique de séquence identique a la séquence naturelle du PL b) la séquence leader transcrite à partir du promoteur en question est longue de 23 bases suivies d'un codon ATG d'initiation de la traduction, elle comprend un site de liaison des ribosomes homologue a l'ARN 16S du ribosome sur 9 bases et situé 12 bases en amont de l'ATG. c) les séquences reconnues par les enzymes Kpni, Ncoi et BamHi sont combinées en une séquence de longueur minimum qui est: EMI18.1 3. Procédé de préparation de plasmides vecteurs selon les revendications 1 et 2 caractérisé en ce que: a) le promoteur PL et le leader transcrit a partir de ce promoteur sont construits a partir du promoteur PR du plasmide vecteur pCQV2 par emplacement d'un fragment HindII-BamHI de 56 paires de bases par un fragment de 60 paires de bases synthétisé sous forme de 4 oligodésoxyribonucléotides. b) des bactéries huttes E.coli sont transformées par le plasmide obtenu sous a), sélectionnées, et isolées par crible caractéristique et les vecteurs portés sont caractérisés par séquençage des régions relevantes. 4. Procédé de préparation de plasmides vecteurs selon les revendications 1 à 3 caractérisé en ce que la séquence leader Inventée est la suivante: EMI18.2 <tb> ATGTÀCTAAGGÀGGTTTTGGTÀCCATG <tb> t <tb> initiation <SEP> de <SEP> la <SEP> initiation <SEP> de <tb> transcription <SEP> la <SEP> traduction <tb> 5. Procédé de préparation de plasmides vecteurs selon les revendications 1 à 4 caractérisé en ce que le plasmide vecteur obtenu est modifié par la délétion d'un fragment Hindili-Hindili de 125 paires de bases dans le gène cI857. 6. Procédé de préparation de plasmides vecteurs selon la revendication 5 caractérisé en ce que le plasmide vecteur obtenu est modifié par l'insertion immédiatement en aval du site d'initiation de la traduction, d'une séquence qui porte un maximum de sites de restriction uniques dans le plasmide sur une distance minimum en vue de l'insertion et de l'excision d'un aDr het erologue. 7. Procede de préparation de plasmides vecteurs srlon les revendications 5 et 6 caractérisé en ce que la sequence est insérée au site BamHI du plasmide et porte notamment les séquences de reconnaissance des enymes Sacil, BalI, Sali, Xhol, SacI et PvuII uniques dans le vecteur et répartis sur une distance de 34 paires de bases. 8. Procédé de préparation de plasmides vecteurs selon les revendications 5 a 7 caractérisé en ce que la séquence insérée est la suivante: EMI19.1 9. Plasmides vecteurs capables de transformer un hôte bactérien Escherichia coli et d'y promouvoir et contrÏ- ler l'expression d'un ADN hétérologue, caractérisés en ce qu'ils sont obtenus selon les revendications 1 à 8.

Inventors: BOLLEN ALEX, JACOBS PAUL, MORAIS GRAVADOR ALFREDO JAIME, BOLLEN, ALEX, JACOBS, PAUL, MORAIS GRAVADOR, ALFREDO JAIME
Applicants: WALLONE REGION, REGION WALLONNE REPRESENTEE PAR L'EXECUTIF REGIONAL WALLON
Application year: 1985
Main classification: C12N15
IPC codes: C12N15, C07K14