ミクロ組織を踏まえた高深度空間トランスクリプトミクス
キーワード：トランスクリプトーム、空間トランスクリプトミクス、RNA-seq
組織や臓器は、時空間的に定められた遺伝子発現により厳密に制御されている。そのため、そのしくみを正確に理解するには、空間情報と遺伝子発現情報を紐付けた解析が必要である。そこで、我々は組織切片上の光照射した領域だけの遺伝子発現情報を網羅的に解析できる新たな空間トランスクリプトーム法、Photo-Isolation Chemistry (PIC)を開発した(Honda et al., 2021; Honda et al., 2022)。PIC は、マウス胚や成体マウス海馬などのマクロ領域から細胞内構造体などの1μm以下のミクロ領域と大小さまざまな領域を高感度に解析できる。さらに、未固定や固定凍結切片に加えパラフィン切片にも適応できるため、生物学的研究から病理診断などの臨床研究にまで幅広く応用されることが期待できる。ここでは、PIC の原理からPICを用いた様々な解析事例を紹介しつつ、他技術との比較やPICの今後の技術展開についても議論したい。

カテゴリ: 生物学
質問: 組織や臓器は何によって制御されていますか？
回答: 組織や臓器は時空間的に定められた遺伝子発現によって制御されています。