老化細胞では、老化関連分泌表現型(SASP)遺伝子群の活性化などの転写制御を反映する特異的な3次元ゲノム構造が形成される。しかし、細胞老化に伴うゲノム構造の再編成の機序は未解決である。そこで、その機序を解明するためにヒト胎児肺由来のIMR-90細胞を用いて同調的に細胞老化を誘導できる培養細胞株を構築した。この細胞株とStable Isotope Labeling by Amino acids in Cell culture(SILAC)法を組み合わせて、老化細胞と増殖細胞において核に含まれるタンパク質を質量分析により定量的に比較した。その結果、約2000種類の核内タンパク質の細胞老化に伴う継的な変化が明らかになった。同時に行った、次世代シーケンサーを用いた3'-RNA-seq解析によるmRNAの定量解析との相関も含め、本発表では、細胞老化に伴うゲノム構造の再編成に関与するタンパク質とその作用機序の一端について議論する。

カテゴリ: 生物学
質問: ヒト胎児肺由来のIMR-90細胞を用いて、同調的に細胞老化を誘導できる培養細胞株とStable Isotope Labeling by Amino acids in Cell culture(SILAC)法を組み合わせて、老化細胞と増殖細胞において核に含まれるタンパク質を質量分析により定量的に比較した結果、細胞老化に伴う継時的な変化が明らかになった核内タンパク質の種類は幾つですか？
回答: ヒト胎児肺由来のIMR-90細胞を用いて、同調的に細胞老化を誘導できる培養細胞株とStable Isotope Labeling by Amino acids in Cell culture(SILAC)法を組み合わせて、老化細胞と増殖細胞において核に含まれるタンパク質を質量分析により定量的に比較した結果、細胞老化に伴う継時的な変化が明らかになった核内タンパク質の種類は、約2000種類です。