" Zanim opracujemy efektywny marker do badania tylko jednego , konkretnego enzymu , najpierw musimy poznać jego preferencje katalityczne - tzw . specyficzność substratową " - tłumaczy kierownik projektu dr hab . Marcin Drąg . Istniejące do tej pory narzędzia kompleksowego profilowania enzymów proteolitycznych opierały się na zastosowaniu jedynie naturalnych aminokwasów występujących w białkach . Aby uzyskać lepsze efekty , wrocławski zespół dr . Drąga sięgnął po aminokwasy nienaturalne , które nie są kodowane przez DNA i w większości powstały dzięki syntezie organicznej . Powstała hybrydowa ( zawierająca naturalne i nienaturalne aminokwasy ) biblioteka substratów fluorogenicznych ( HyCoSuL ) . " Dzięki temu narzędziu jesteśmy w stanie stworzyć nowe , bardziej czułe substraty i markery chemiczne dla bardzo dużej grupy enzymów proteolitycznych " – wyjaśnił dr Drąg .
"Before we develop an effective marker to study only one specific enzyme, we first need to know its catalytic preferences - the so-called substrate specificity," explains the project leader, Dr. Hab. Marcin Drąg. Existing tools for comprehensive profiling of proteolytic enzymes so far were based on the use of only natural amino acids found in proteins. To obtain better results, the Wrocław team of Dr. Drąga used unnatural amino acids, which are not encoded by DNA and were mostly created thanks to organic synthesis. A hybrid library (containing natural and unnatural amino acids) of fluorogenic substrates (HyCoSuL) was created. "Thanks to this tool, we are able to create new, more sensitive substrates and chemical markers for a very large group of proteolytic enzymes," explained Drąg.