Che l'UAR avesse raccolto e poi occultato degli elementi che potevano consentire di far luce su attentati terroristici, lo dimostra il fatto che l'archivio di via Appia era conservato una parte dell'ordigno che alle 1.50 della notte del 9 agosto del 1969, era esploso sul treno in sosta alla stazione di Pescara. Il ritrovamento che lascia diverse perplessità, visto che è stato ormai giudiziariamente accertato che tale bomba l'aveva messa quel nucleo padovano di estrema destra ritenuto colpevole della strage di piazza Fontana (Freda e Ventura), responsabile di una lunga scia di attentati commessi durante tutto il 1969. Si è scoperto che l'UAR, dopo la strage di piazza Fontana del 12 dicembre del 1969, cercò di coinvolgere il ferroviere Giuseppe Pinelli proprio negli attentati sui treni dell'agosto del 69. Pinelli venne fermato la sera del 12 dicembre dal commissario calabresi e portato in questura da dove non sarebbe uscito vivo (precipitò da una finestra al quarto piano per ragioni mai pienamente accertate). Tura del suo libretto ferroviario, risultava che proprio la sera dell'8 agosto e gli aveva preso un treno alla stazione di Milano diretto a Roma. La concomitanza di quel viaggio con gli attentati avvenuti proprio nella notte fra 8 e 9 agosto, fornì evidentemente all'UAR, l'occasione per cercare di coinvolgere in essi Pinelli. Infatti in un documento del 18 dicembre dello stesso anno, scritto da Russomanno e indirizzato a D'Amato, si sosteneva che la sera dell'8 agosto, Pinelli avrebbe avuto tutto il tempo di piazzare il pacchetto regalo sul treno in arrivo da Venezia e sull'altro in partenza per Venezia. La sera dell'8 agosto un ordigno era stato infatti ritrovato da una passeggera proprio la stazione di Milano sul treno giunto in stazione alle 22.44 e un altro era esploso alle 2.11 alla stazione di Chiari sul treno straordinario notturno Milano-Venezia. Ancora più esplicito è il successivo documento nel quale Russomanno affermava che il suicida Giuseppe Pinelli, aveva dichiarato che era partito da Milano per Roma alle 23. 30 del giorno 8 agosto. A Roma incontrò Ivo Della Savia e successivamente Valpreda e altri giovani. È anche possibile, non probabile, che a Roma intanto operasse Valpreda con o senza Ivo, collocando altre quattro bombe identiche sui treni per Bologna, Pescara e Bari. I l 17 gennaio del 1970, il questore di Milano Marcello Guida, inviò una relazione al Viminale e all'UAR nel quale tirava in ballo Pinelli anche sulla strage di piazza Fontana, sostenendo che la sua decisione di sottrarsi col suicidio ad ogni altro interrogatorio, non poteva che confermare che egli fosse stato indotto a tale disperato gesto dalla preoccupazione di essere ormai smascherato e di andare incontro a vicende giudiziarie di estrema gravità. Tre giorni dopo all'ufficio politico milanese Antonino Allegra, stilò un rapporto per il Viminale dal quale in primo luogo si apprende che dal 22 agosto al 6 settembre del 1969 il telefono di Pinelli era stato posto sotto intercettazione in relazione a un suo presunto coinvolgimento negli attentati ai treni: non era emerso nulla a suo carico. Sosteneva che egli stesso aveva posto in essere atti che per loro natura o per la loro concomitanza con determinati eventi delittuosi facevano fondamenta ritenere che non fosse estraneo a siffatte azioni terroristiche perché Pinelli, come risulta confermato dal suo libretto ferroviario, quella sera si recò a Roma ove si trattenne due giorni. Costruzione del tutto fallace, perché sul treno Trieste-Venezia-Milano-Parigi, la scatola di legno contenente l'ordigno era stata scoperta casualmente da una giovane, Elvira Mazzali, in uno scompartimento di seconda classe. Essa disse di essere salita sul treno a Milano assieme ad altri tre amici subito dopo l'arrivo del convoglio in stazione e di non aver notato nessun altro salire con loro. I tre amici danno una versione analoga e confermano i fatti. Una volta consegnata la scatola al ferroviere, gli artificieri procedettero al disinnesco dell'esplosivo. Visto che essi riferirono di essere saliti sul treno subito dopo la sua fermata, appare logisticamente impossibile che l'ordigno possa essere stato portato la Pinelli su quel treno dopo che esso era arrivato alla stazione centrale. L'ipotesi è che la bomba fosse stata portata su quel treno o a Trieste o a Venezia da un ignoto passeggero che la nascose nel vagone poco prima dell'arrivo alla stazione di Milano dove egli con probabilità sarebbe sceso. In un libro pubblicato nel novembre del 2019, il magistrato Salvini ha riportato una testimonianza personale risalito all'ex neofascista padovano Gianni Casalini, il quale ammesso di essere stato assieme al suo camerata Ivano Toniolo, uno dei responsabili materiali della collocazione degli ordigni quella sera di agosto alla stazione di Milano.