當基輔及諾夫哥羅德的弗拉基米爾大公改宗正教會後，正教會就大幅的在斯拉夫語地區發展。基輔也成了早期俄羅斯地區基督宗教的中心，「基輔及全羅斯的都主教」成為俄羅斯地區教會的領袖，並從屬於君士坦丁宗主教的聖統。1238年受到蒙古人入侵的影響，大量人口流往莫斯科，導致政治中心的轉移，基輔都主教的教座也遷到了莫斯科，但是依然保留基輔這個頭銜。然而，1441年時以西鐸都主教因為支持了佛羅倫斯大公會議中對東西教會合併的決議而遭到俄羅斯驅逐，最後流亡羅馬並獲羅馬教宗的庇護。之後俄羅斯正教會在1448年改選了約拿主教擔任領袖，並改用「莫斯科都主教」這個頭銜。之後在1589年時獲得了君士坦丁普世牧首的同意後，成立了莫斯科牧首聖統。至於烏克蘭地區則一度被信奉羅馬天主教的波蘭占領，並在1596年簽下了《布列斯特合併宣言》使得原先的基輔都主教管轄區改宗天主教。直到1620年耶路撒冷牧首费奥凡到基輔祝聖了幾位東正教的主教，才重建了正教會的都主教教區，1686年由於烏克蘭地區併入俄羅斯帝國的情勢。基輔都主教區就此由君士坦丁宗主教聖統轉移到莫斯科宗主教的管轄下。