Mit Ende des Mittelalters gerät die klösterliche Siedlung aus dem Blick. Das Kloster wurde im 17. Jahrhundert wieder besiedelt, 1695 erneuert durch den Wardapet Daniel von Tigranakert (heute Silvan in der Provinz Diyarbakır) und 1788 durch Bischof Hovhannes von Schamb (in Sjunik). Von 1800 bis 1807 fanden hier die Mönche von Etschmiadsin Zuflucht. Bauarbeiten ließen 1852 Vardan von Odzun 1852 und 1868–1871 der Wardapet Grigor durchführen. In der russischen Zeit entstand beim Kloster ein Dorf und Horomos wurde Sitz des armenischen Bischofs von Kars. Das Kloster blieb aktiv bis zur Wiederangliederung des östlichen Gebietes der Demokratischen Republik Armenien an die Türkei (1920).