Fransa ile ittifak yanlısı olarak Almanların 1939 yılında Polonya'yı işgalinden sonra Fransa'da kurulan Polonya kuvvetlerinin komutasını üstlendi. Önce Angers'ye, sonra da Londra'ya sığınan sürgündeki hükûmetin başkanı oldu. Müttefik devletlerin liderleriyle iyi ilişkiler kurdu. Josef Stalin sonradan, onun Rusların elinde bulunan binlerce Polonyalı esirin Katyn'de öldürülmesi olayının incelenmesi için Nisan 1943'te Uluslararası Kızılhaç Örgütü'ne başvurmasını gerekçe göstererek Sovyetlerin Polonya ile olan diplomatik ilişkilerini kesti.