頭端式ホーム1面2線を有する地上駅（主に1番線使用）。駅舎とホームの間には18段の階段があったが、1960年（昭和35年）5月24日のチリ地震津波到来の際に水が達した段には、青いラインが引かれていた。階段横には、車椅子対応型のエレベーターが2011年（平成23年）3月17日使用開始に向けて設置中だった。2番線側には機回し線が敷設されており、2009年（平成21年）10月10日 - 12日の間に小牛田駅 - 当駅間で運行された「SLホエール号」のC11形蒸気機関車が機関車を付け替えるために使用された。