В 1796 году 67-й полк был отправлен в Вест-Индию для участия в нескольких кампаниях, в том числе в Сан-Доминго во время гаитянской революции, и некоторое время был расквартирован на Ямайке. В том же году Хоутон был произведен в подполковники. В январе 1799 года Хоутон был переведён в 88-й пехотный полк, также известный как "Коннахтские рейнджеры", который был размещён в Индии. Хоутон присоединился к своему полку в Бомбее. По неизвестным причинам Хоутон не сопровождал его в Египет в 1801 году для окончательного разгрома французской армии, дислоцированной там, и вместо этого провел несколько лет в штабе лорда Морнингтона. В 1804 году он вернулся в Англию, привезя с собой несколько депеш.