Seine bis zum 4. Januar 1926 dauernde Amtszeit war durch tiefe innere Unruhen und Streitigkeiten mit der Bulgarischen Kommunistischen Partei (BKP) geprägt, die Zankow gnadenlos unterdrückte. Dies begann schon wenige Monate nach dem Putsch gegen Stambolijski mit einem Septemberaufstand, der blutig niedergeschlagen wurde. Schlussendlich verhängte Zankow nach einem Attentat auf Zar Boris III. und dem Bombenanschlag auf die Sweta-Nedelja-Kathedrale in Sofia 1925 das Kriegsrecht und erließ ein Verbot gegen die Kommunistische Partei.