Kilka lat później Hernández za sprawą pochodzenia ojca otrzymał gwatemalskie obywatelstwo i zdecydował się na zmianę barw narodowych. W reprezentacji Gwatemali zadebiutował za kadencji selekcjonera Ivána Franco Sopegno, 27 marca 2015 w przegranym 0:1 meczu towarzyskim z Kanadą. Cztery miesiące później znalazł się w składzie na Złoty Puchar CONCACAF. Wystąpił podczas niego w dwóch meczach, odpadając wraz z drużyną w fazie grupowej.