1916 wurde Schabinger zum deutschen Konsul in Jaffa ernannt. Dieses Amt hatte er bis zum Ende des Ersten Weltkrieges inne. Als Cemal Pascha am 28. März 1917 wegen des Heranrückens der Briten die Evakuierung ausländischer Zivilisten aus Jaffa und Tel Aviv verfügte, erwies sich schnell, dass die Militärs im Wesentlichen nur Juden zur Räumung zwangen, Nichtjuden aber gewähren ließen. Das erzeugte Unruhe, da die seit 1915 laufenden Massaker an Armeniern auch mit Räumungsbefehlen begonnen hatten. Zudem hatte nach Beginn des Ersten Weltkriegs die Hohe Pforte am 7. September 1914 den Ausländern mit ständigem Aufenthalt im Osmanischen Reich ihre persönliche Exterritorialität und die Unterstellung unter die Gerichtsbarkeit ihrer jeweiligen Konsuln, wie in den Kapitulationen des Osmanischen Reiches festgelegt, de facto entzogen. Bedrängte Juden bestürmten darauf Schabinger, etwas dagegen zu unternehmen. Darum wurden Schabinger und sein österreich-ungarischer Kollege an zwei aufeinander folgenden Tagen beim örtlichen Mutasarrıf vorstellig.