Po několika převratech se v roce 1979 dostal k moci Saddám Husajn, který postupně nastolil diktaturu. Vlajku však nechal změnit a schválit parlamentem až 14. ledna 1991, těsně před odvetnou operací (Pouštní bouře) vojsk pod vlajkou OSN, která reagovala na anexi Kuvajtu Irákem 2. srpna 1990. Vlajka byla oproti předchozí doplněna o zelený nápis Allāhu Akbar, mezi hvězdami (psaný Husajnovým rukopisem). Husajn chtěl touto změnou ospravedlnit rozpoutanou válku náboženskou ideologií.