2016 folgte die Veröffentlichung von François Ozons Kinofilm "Frantz", der eine Einladung in den Wettbewerb der 73. Internationalen Filmfestspiele von Venedig erhielt und Beer den Marcello-Mastroianni-Preis als beste Nachwuchsschauspielerin einbrachte. In dem größtenteils in Schwarzweißbildern konzipierten Melodram ist Beer als Verlobte eines im Ersten Weltkrieg an der französischen Front gefallenen deutschen Soldaten zu sehen, die im Jahr 1919 in Quedlinburg einem mysteriösen französischen Ex-Soldaten (dargestellt von Pierre Niney) begegnet. Beer hatte nach ihrer Verpflichtung für "Frantz" sechs Wochen Zeit gehabt, den Part der Anna auf Deutsch und Französisch einzustudieren. Beim Dreh unterstützten sich Beer und Spielpartner Niney gegenseitig bei Problemen in der jeweils fremden Sprache. Ozon bemerkte an Beer, die im Film zwischen deutscher und französischer Sprache hin- und herwechselt, etwas Schelmisches und sehr Melancholisches. Er lobte ihr schauspielerisches Spektrum, ihre Glaubwürdigkeit und Fotogenität: „Sie war erst zwanzig Jahre alt, aber ihr Spiel zeugte von großer Reife. Sie konnte sowohl die Unschuld eines Mädchens verkörpern, als auch die Kraft einer Frau“, so Ozon über Beer. Der Film zog Vergleiche mit der jungen Romy Schneider nach sich, und nach den Dreharbeiten an "Frantz" verbrachte Beer einen Monat in Marseille, um weiter ihr Französisch zu verbessern.