1959年，菲德爾·卡斯特羅在古巴革命中成功推翻巴蒂斯塔的執政，美国起初承认卡斯特罗建立的临时政府，兩國關係良好；但是，古巴政府其後進行改革，這些改革對美國在古巴的利益構成一定影響，而古巴政府在冷戰下傾向與蘇聯，令美國對古巴政府產生不滿。美國在1960年停止向古巴提供任何经济援助、取消古巴对美國的食糖出口份额、开始對古巴實施禁运，在1961年1月斷絕與古巴的外交關係；此後，美國和古巴之間先後爆發猪湾事件和古巴导弹危机。在1962年後的近半個世紀，美國與古巴的雙邊關係一直欠佳，兩國之間時有爭執；美國把古巴列為支持恐怖主義國家之一，而時任古巴共產黨第一書記的菲德爾·卡斯特羅亦被稱為「反美鬥士」。