Сражение в Филиппинском море состоялось 13 июня 1944 года. "Яхаги" находился в составе «Группы A» адмирала Дзисабуро Одзавы, которая противостояла американскому 5-му флоту в «решающем сражении» у Сайпана, в качестве флагмана эсминцев 10-го дивизиона "Асагумо", 17-го дивизиона "Уракадзэ", "Исокадзэ" и "Таникадзэ", 61-го дивизиона "Вакацуки", "Хацудзуки", "Акидзуки" и "Симоцуки", которые прикрывали авианосцы. 19 июня 1944 года японское авианосное соединение атаковало соединение TF 58 ВМС США, но потеряло большую часть самолётов в «Большой марианской охоте на индюков». "Яхаги" и "Уракадзэ" спасли 570 членов экипажа авианосца "Сёкаку" после того, как тот был торпедирован подводной лодкой "Кавалла".