Il rendimento di Frasnelli nella stagione 2006-2007 è stato inferiore a quello dell'anno precedente, con un 17º posto come miglior risultato nella sprint a tecnica libera di Rybinsk. Ai Mondiali di Sapporo, disputati nel mese di febbraio, ha partecipato alla prova sprint individuale in tecnica classica, che ha concluso in 23º posizione, migliore degli italiani.