Für Kasachstan nahm Malgin im Juniorenbereich an der U20-Weltmeisterschaft der Division I 2007 teil, bei der er jedoch nicht eingesetzt wurde. Bei der Winter-Universiade 2013 im italienischen Trentino kam er zu einem Einsatz in der kasachischen Studentenauswahl, die hinter Kanada die Silbermedaille errang.