En , alors qu’il est en permission, il est rappelé par Leclerc pour participer aux opérations de Libye. Il devient le médecin-chef de la colonne Leclerc. Le , le médecin-capitaine Laquintinie rejoint donc la «colonne» déjà en marche vers le nord depuis dix jours. Le , c'est le premier engagement contre la compagnie saharienne italienne qui couvre les abords de Koufra. Laquintinie soigne, opère, réconforte. Au soir du deuxième jour, les Italiens battent en retraite dans le désert et sont poursuivis sur 150 km. La cuvette de l'oasis, le terrain d'aviation et le village indigène sont occupés. Reste à conquérir El Taj, le point fort que défend un bataillon et où flotte toujours le drapeau italien. Pendant les dix jours du siège, le docteur Laquintinie demeure sans faiblir à la tâche. Pourtant, le paludisme dont il souffre et qu'il a toujours traité par le mépris l'a repris. De plus, en opérant dans ces conditions précaires, il s'est piqué à la main. Le lendemain, une septicémie se déclenche, la fièvre le tourmente, dans cette chaleur accablante qui écrase les combattants. Il refuse de se laisser évacuer. Le 25, le drapeau italien disparaît, le El Taj se rend. C'est alors que Leclerc, face à ses hommes figés au garde-à-vous, prononce le serment de Koufra. Laquintinie accepte maintenant d'être ramené au Cameroun. Trois jours plus tard, le , il est de retour à Yaoundé. Malgré une amputation du bras, il est trop tard : la fièvre qui terrasse le chirurgien de Koufra n'est pas due au seul paludisme, mais à la septicémie qu'il a contractée en opérant. Il meurt le .