Bowe lief erstmals im November 2004 für Irland gegen die USA auf. Er fiel dann aufgrund einer Verletzung für die Six Nations 2005 aus. Weitere Verletzungen und Formschwankungen führten dazu, dass er nicht für den Kader Irlands zur Weltmeisterschaft 2007 berücksichtigt wurde. In den folgenden Spielzeiten wurde er jedoch zum fundamentalen Bestandteil der Nationalmannschaft und spielte so in allen fünf Spielen beim Grand Slam der Iren bei den Six Nations 2009.