Pendant la Seconde Guerre mondiale, en , la Bessarabie est réoccupée par la Roumanie devenue fasciste dans le cadre de l'invasion des forces de l'Axe en Union soviétique. La même année, le territoire soviétique compris entre le Dniestr et le Boug forme le « gouvernorat » roumain de Transnistrie, avec Odessa pour capitale (voir ). En 1942, ce « gouvernorat » de Transnistrie compte 1,2 million d'habitants (dont 23 % de roumanophones), sur . Il est divisé en 13 districts. Les roumanophones sont nombreux surtout à l'ouest, dans le bassin du Dniestr. Le régime du maréchal Antonescu, en fait une sorte de « Sibérie roumaine » où il déporte résistants, Juifs et Roms qu'on laisse mourir de froid et de dysenterie, quand ce n'est pas l'armée elle-même qui les fusille lorsqu'ils tentent de résister ; d'autres sont enfermés dans des hangars que l'on arrose de carburant avant d'y mettre le feu.