Poté, co srbské vojsko porazilo většinu tureckých jednotek u Kumanova, obsadilo Skopje. Po vypuknutí první světové války sem byly přesunuty některé srbské státní instituce, které byly vystaveny rakousko-uherskému útoku ze severu. Jen o rok později však město obsadilo Bulharsko, které si území vardarské Makedonie dlouhodobě nárokovalo. Bulharská armáda zde zřídila centrum pro Vojensko-inspekční oblast Makedonie. Po balkánských válkách (1912–1913) bylo město spolu s vardarskou Makedonií připojeno k Srbsku.