A Guiné Equatorial, representada pelo Comitê Olímpico Nacional da Guiné Equatorial, compete nos Jogos Olímpicos de Verão de 2016 no Rio de Janeiro entre os dias 5 e 21 de agosto de 2016. O país conta com participação de um total de dois atletas, um homem e uma mulher, que participam no atletismo. Reïna-Flor Okori, três vezes em Olimpíadas com a França, foi o porta-bandeira da Guiné Equatorial na cerimónia de abertura.