21 maja 2009 trener Dunga powołał Santosa na Puchar Konfederacji w RPA. Pierwszy występ w kadrze zaliczył 15 czerwca 2009 w meczu przeciwko Egiptowi, wygranym 4:3. Podczas turnieju zagrał łącznie w 5 spotkaniach, w tym w finale turnieju z USA, zakończonym zwycięstwem 3:2.