Circa 59.018 esecuzioni vennero attribuite a Blobel dal Tribunale militare di Norimberga nel Processo agli Einsatzgruppen nel 1947. Blobel rilascerà, il 18 giugno 1947, anche un affidavit in cui parla dei suoi crimini e dell'ordine ricevuto di far sparire tutte le prove, terminando con la dichiarazione che recita «ho fatto questa disposizione di mia spontanea volontà, senza alcun tipo di promessa di ricompensa, e non sono stato sottoposto ad alcuna forma di costrizione o minaccia».