1846 wurde er zweiter Herausgeber des "Oregon Spectator", der ersten Zeitschrift in der Region. Er ersetzte William G. T'Vault und blieb für weiter 9 Ausgaben Herausgeber bevor George Law Curry diese Position übernahm. Nachdem der Krieg gegen die Indianer (Cayuse-Krieg) beendet war, wurde Lee 1848 zum Superintendent für Indianische Angelegenheiten von Gouverneur George Abernethy ernannt. 1849 suchte er sein Glück im California-Goldrausch. Er war dort erfolgreich und konnte so, als er nach Oregon City zurückkehrte, 1850 eine Firma gründen. In diesem Jahr schiffte er sich auch nach New York, um dort diverses Inventar für seinen Laden zu besorgen, starb jedoch am Panamafieber bei seiner Rückkehr nach Oregon 1851.