Јован је остао у Епиру до смрти цара Андроника III Палеолога (јун 1341). Тада је напустио Арту и кренуо ка Димотици да се састане са Кантакузином. Узео је учешћа у грађанском рату два Јована подржавајући Кантакузиново проглашење за цара 26. октобра 1341. године. Пратио је Кантакузина у нападу на Солун и приликом састанка са Стефаном Душаном (1331-1355). Исте године су тесалски племићи пришли Кантакузину нудећи му помоћ у рату. Кантакузин је након успешних преговора именовао Јована Анђела пинкерном и доживотним намесником Тесалије. Касније је Анђел напредовао до севастократорске титуле. Анђел је успешно владао Тесалијом. Користећи се падом Каталинаца у Атинском војводству, Анђел је проширио своју државу над читавим Епиром и Акарнанијом. Ана Палеолог је заробљена и утамничена. Почетком 1343. године Анђел је на челу тесалског контингента у Кантакузиновом нападу на Солун.