До прихода испанцев население, проживавшее на территории современного города, было представлено индейцами Арауканы и Теуэльче. В XIX веке аргентинское правительство истребило арауканское население и заняло их территорию. В первых декадах XX века в Неукен прибыли иммигранты из Европы (преимущественно из Испании и Италии), Сирии и Ливана. Во второй половине XX века в Неукен прибыло множество мигрантов из различных аргентинских провинций, а также из Чили. С начала 2000-х годов Неукен стал привлекательным местом для иммигрантов из Боливии. На фоне кризиса в Венесуэле прибыло большое количество мигрантов оттуда в 2010-х годы, ищущих работу главным образом в местной нефтяной отрасли, а также другие специалисты, такие как врачи, биохимики и переводчики. С 2015 года наблюдается приток китайских мигрантов, прибывшие из других городов Аргентины, желающих работать в торговой отрасли.