Stationshuset byggdes 1893 och inköptes 1897. Huset byggdes i trä i en nationalromantisk stil, liknande Gällivare station och Jörns station. Tillbyggnader 1917 och 1925 ritades i jugendinspirerad stil av Folke Zettervall tillsammans med arkitekt Adolf W. Edelsvärd. Huset är en kulturbyggnad och märkt som byggnadsminne. Den mest kände resenär som bytt tåg i Boden är förmodligen Lenin. Efter Februarirevolutionen 1917 reste han från sin exil till Ryssland via den då (på grund av kriget) enda öppna vägen, via Haparanda.