Après avoir brièvement servi en tant que commandant confédéré du district de Floride, Anderson retourne sur le terrain en pendant la campagne d'Atlanta. Il dirige une division du corps de Leonidas Polk dans l'armée du Tennessee aux batailles de Ezra Church, Utoy Creek, et aux prémices de la bataille de Jonesboro avant d'être blessé sérieusement à la mâchoire dans la soirée du . Temporairement inapte pour le service, il est relevé de son commandement et renvoyé chez lui à Monticello.