Ο διάδοχός του δούκας Ιωάννης ο Άφοβος, είχε πολύ λιγότερη επιρροή στη βασίλισσα Ιζαμπώ από τον πατέρα του. Όταν ο Λουδοβίκος της Ορλεάνης εκδίωξε τους Βουργουνδούς από το Συμβούλιο αντιβασιλείας το 1407 αλλά και για προσωπικούς λόγους, ο Ιωάννης ο Άφοβος απαλλάχθηκε από τον αντίπαλό του, δολοφονώντας τον. Αυτή η πράξη βύθισε τη χώρα σε έναν εμφύλιο πόλεμο (1407-1435) μεταξύ των Βουργουνδών και των υποστηρικτών του Λουδοβίκου της Ορλεάνης υπό τον Αρμανιάκ, και οι δύο ουσιαστικά διεκδικητές του θρόνου.