Idea sebuah markas operasi khas bersepadu Amerika tercetus selepas Operasi Cakar Helang, iaitu cubaan gagal menyelamatkan tebusan di kedutaan Amerika di Iran pada tahun 1980. Siasatan seterusnya, dipengerusikan oleh Laksamana bersara James L. Holloway III, iaitu mantan Ketua Operasi Tentera Laut AS, menyatakan kurangnya perintah dan kawal serta penyelarasan antara perkhidmatan sebagai faktor penting kegagalan misi. Sejak pengaktifannya pada 16 April 1987, Markas Operasi Khas A.S. telah terlibat dalam banyak operasi, dari pencerobohan Panama 1989 hingga ke Perang Global terhadap Keganasan yang sedang berlangsung.