Город также был особенно важным центром для Вооружённых сил Литвы. В январе 1919 года во время литовских войн за независимость была создана Каунасская военная школа, которая начала готовить солдат. В мае 1919 года в районе Фрэда был основан Литовский государственный авиационный завод, чтобы отремонтировать и снабжевать армию военными самолётами. В Каунасе начали изготавливать литовский военный самолёт АНБО.