Његов отац је био пуковник у пешадији који је служио у Навари и у Италијанским кампањама под Кордобом. Његова се мајка удала касно у животу и имала је сина Франциска Мартина де Алкантара, који је учествовао у освајању Перуа са својим полубратом. Преко оца, Франциско је био други рођак Ернана Кортеза.