Al vroeg in 2016 liet Sandi Morris zien, dat zij in een uitstekende vorm verkeerde. Op 13 maart 2016 veroverde zij de Amerikaanse indoortitel met een sprong over 4,95, de op twee na beste indoorprestatie ooit. Zij liet hiermee Jennifer Suhr haar hielen zien, die tweede werd met 4,90. Die haalde een week later op de wereldindoorkampioenschappen in Portland haar gram door met opnieuw een sprong over 4,90 de titel te veroveren, terwijl Morris ditmaal op 4,85 bleef steken en dus met het zilver genoegen moest nemen.Op 6 mei 2016 boekte ze in Doha haar eerste overwinning bij de Qatar Athletic Super Grand Prix, een wedstrijd in het kader van de IAAF Diamond League competitie. Tijdens het hoogtepunt van dat jaar, de Olympische Spelen van 2016 in Rio de Janeiro, won ze vervolgens met 4,85 een zilveren medaille. De Griekse Ekaterini Stefanidi won de wedstrijd met dezelfde sprong over dezelfde hoogte, maar had hiervoor minder foutsprongen nodig. Morris eindigde het seizoen ten slotte door tijdens de Memorial Van Damme over 5,00 te springen. Hiermee werd zij na Jelena Isinbajeva de tweede atlete in de geschiedenis, die deze hoogte wist te overbruggen.