Nach diesen Ereignissen wurde die Partei als Untergrundbewegung weitergeführt. Die NDF arbeitete von diesem Zeitpunkt an mit dem von Abolhassan Banisadr gegründeten Nationalen Widerstandsrat Iran und den Volksmudschahedin zusammen, um die Regierung der Islamischen Republik Iran zu stürzen. Nach dem Ausbruch des Iran-Irak-Krieges wurde die Zusammenarbeit mit den Volksmudschahedin beendet, da diese sich auf die Seite Saddam Husseins begeben hatten.