Negli anni ottanta intraprende la carriera di allenatore, arrivando anche a guidare la selezione messicana alla Confederations Cup del 2001 dopo aver vinto più volte il campionato messicano con il Toluca. Nel 2006 si siede sulla panchina del Pachuca: vince la Coppa Sudamericana nel 2006, seguita immediatamente da 2 Champions Cup di fila (2007 e 2008).