Bereits im Juni 1689, noch bevor die Nachricht über die im Dezember 1688 erfolgte Glorious Revolution Boston erreichte, gab es erste Tendenzen zu einem Aufstand gegen Andros. Nachdem Wilhelm III. gemeinsam mit Maria II. den englischen Thron bestiegen hatte, reichten die in London tätigen Repräsentanten für Massachusetts Increase Mather und Sir William Phips eine Petition bei den Königen und dem Board of Trade ein, in der sie die Wiedereinsetzung der Charta von Massachusetts forderten. Mather konnte zudem die Verzögerung der Nachricht an Andros über die Revolution bewirken. Er hatte bereits einen vor der Revolution vorbereiteten Brief an Bradstreet abgesendet, in dem er diesen darüber informierte, dass die Charta illegalerweise annulliert worden war und dass die Kolonisten . Gerüchte über die Revolution erreichten die Kolonie jedoch bereits vor den offiziellen Nachrichten, und Bradstreet wird als einer der möglichen Organisatoren des darauf folgenden Aufstands in Boston angesehen. Er schrieb an diesem Tag einen offenen Brief an Andros, in dem er ihn zum Rücktritt aufforderte, um den Mob zu beruhigen. Der zwischenzeitlich nach Castle Island geflohene Andros ergab sich und wurde nach mehreren Monaten Gefangenschaft nach England gebracht, um ihn vor Gericht zu stellen.