La continuité urbaine après la chute de l'Empire romain reste incertaine : on sait que se développe au un pèlerinage autour du tombeau de sainte Afre, martyre qui incarne la christianisation de la ville, à au sud de la ville romaine, mais le sort de cette dernière est mal connu. Certains historiens ont situé l'ancienne forteresse de Vogastisburg, citée au , à Augsbourg.