במוקדמות מונדיאל 2006 הייתה יכולה הנבחרת האוזבקית לעלות למשחקי ההצלבה, אך נפלה כתוצה מהפרש שערים עדיף לטובת נבחרת בחריין. התוצאה הייתה שנויה במחלוקת מכיוון שהנבחרת שיחקה שלושה משחקים. במשחק הראשון, שנערך באוזבקיסטן, ניצחה הנבחרת האוזבקית 0:1 אך לאחר שבפיפ"א נמצאו טעויות שיפוט של השופט היפני ששפט במשחק, המשחק נפסל ובמשחק החוזר שנערך הסתיים המשחק בתיקו 1:1 על אדמת אוזבקיסטן. משחק הגומלין בבחריין הסתיים בתיקו 0:0 ולכן, בגלל עדיפות שערי חוץ, עלתה בחריין שלב במוקדמות המונדיאל האסייתים ונבחרת אוזבקיסטן נשרה. בגביע אסיה 2007 הגיעה אוזבקיסטן לשלב רבע הגמר בו הודחה על ידי לאחר הפסד בתוצאה 1-2.