شاركت تونس في كأس الأمم الأفريقية لأول مرة عام 1962. في تلك السنة احتلت تونس المركز الثالث بفوزها على أوغندا في مباراة المركز الثالث بنتيجة 3–0. ومع ذلك، شارك في هذه النسخة 4 دول فقط. في عام 1965، سُمح لتونس بتنظيم كأس الأمم الأفريقية ووصلت إلى النهائي وخسرت اللقب أمام غانا بنتيجة 2–3 بعد الوقت الإضافي. عندها فقط وصلت إلى النهائي مرة أخرى في عام 1996، ومرة أخرى هذه المرة فقدت اللقب أمام الدولة المنظمة جنوب أفريقيا بنتيجة 0–2. وجاءت أفضل مشاركة في هذه البطولة بعد 8 سنوات عندما وصلت تونس على أرضها إلى النهائي للمرة الثالثة وفازت هذه المرة بعد الفوز على المغرب في النهائي بنتيجة 2–1. سجل كل من فرانسيلودو سانتوس سيلفا وزياد الجزيري هدفي تونس. إجماليا شاركت تونس في كأس الأمم الأفريقية 19 مرة لعبت 75 مباراة حققت الفوز في 23 مباراة حسم التعادل 29 مباراة وخسروا 23 منها سجلت 94 هدف وقبلت 91 هدف جاء أكبر فوز لتونس ضد زامبيا في 22 يناير 2006 بنتيجة 4–1 أما أكبر هزيمة كانت 3–0 ضد كل من الكاميرون في 10 فبراير 2000، غينيا يوم 30 يناير 2006 وساحل العاج يوم 26 يناير 2013. في 17 نوفمبر 2020، بعد ضمان التأهل لبطولة كأس الأمم الأفريقية 2021، أصبح المنتخب التونسي أكثر منتخب أفريقي صاحب مشاركات متتالية في تاريخ كأس الأمم الأفريقية بـ15 مشاركة متتالية من 1994 حتى 2021، محطما بذلك رقم المنتخب المصري وهو 14 مشاركة متتالية.