Gregory Cromwell war der einzige Sohn des englischen Staatsmanns Thomas Cromwell, 1. Earl of Essex und dessen Ehefrau Elizabeth Wykes. Er hatte zwei Schwestern, Anne und Grace, und eine Halbschwester, Jane (eine uneheliche Tochter seines Vaters). Seine Mutter und die beiden Schwestern starben wohl im Sommer 1528 in London an einer Englischer Schweiß genannten Epidemie.