В дальнейшем Харрис провёл шесть сезонов как помощник главного тренера в клубе НБА «Даллас Маверикс», а затем ещё по одному сезону в «Чикаго Буллз» и «Нью-Джерси Нетс». Согласно сайту НБА, в эти годы он был самым высокооплачиваемым помощником главного тренера в лиге. В общей сложности он проработал помощником главного тренера в НБА 18 лет, в последние 11 из которых его клубы одерживали в среднем по 55 побед за сезон. В начале 2004 года Харриса пригласили тренировать сборную КНР, перед этим занявшую 12-е место на чемпионате мира. Американский тренер вывел китайскую команду, где играл центровой НБА Яо Мин, в Олимпийский турнир в Афинах, где она сумела пробиться в плей-офф. С 2009 года Харрис 11 сезонов работал с фарм-клубом «Даллас Маверикс» «Техас Лэджендс», играющим в Лиге развития НБА, за это время побывав его тренером и вице-президентом. В 2011-2012 годах занимал должность помощника главного тренера сборной Доминиканской Республики, за это время завоевав с Джоном Калипари бронзовые медали чемпионата Америки и выиграв Центробаскет.