En , un convoi de quatre cargos français en route vers Dakar est arraisonné par les Britanniques. En représailles, les Français envoient "Le Glorieux" et "Le Héros" attaquer le commerce britannique sur la côte sud-africaine. Le , "Le Glorieux" attaque sans succès un cargo devant Port Elizabeth. Deux jours plus tard, "Le Héros" coule le cargo "Thode Fagelund" () au large d'East London. Il se rend ensuite à Diego-Suarez, à Madagascar. À la fin décembre, il escorte un aviso parti ravitailler Djibouti, dont les Alliés font le blocus. Il effectue plusieurs patrouilles avec le "Vengeur" en janvier 1942 depuis Djibouti. Il rentre à Diego-Suarez en mars puis est placé en réparations à Nossi-Bé puis à Majunga. Craignant une attaque japonaise sur Madagascar, qui compromettrait la sécurité et le ravitaillement de l'Inde, les Britanniques mènent une action sur Diego-Suarez, à partir du . "Le Glorieux" appareille immédiatement pour le cap d'Ambre et s'approche, sans pouvoir l'attaquer, du porte-avions . Le , après le naufrage des trois tonnes "Bévéziers", "Le Héros" et "Monge", il évacue vers Androka, au sud de Madagascar, puis regagne Toulon, où il arrive le .