Etter sisteplassen holdt landet seg borte fra konkurransen, men returnerte i 1999 med Aistė og låten «Strazdas». Hun framførte bidraget på samogitisk, en litauisk dialekt. Hun ble bare nummer 20 av 23, og dermed måtte Litauen stå over konkurransen i 2000. Et middels resultat fulgte i 2001, og landet kom nest sist i 2002 og måtte dermed stå over konkurransen i 2003.