Dopo il tentato colpo di stato del 15 luglio 2016 contro il regime di Recep Tayyip Erdoğan, il giornale è stato chiuso con decreto governativo e Altan arrestato, insieme al fratello Mehmet, con l'accusa di cospirazione e di far parte del movimento di Fethullah Gülen, in esilio negli Stati Uniti. È stato processato e condannato in un primo tempo, nel febbraio 2018, all'ergastolo, e successivamente liberato dal carcere il 14 aprile 2021 per annullamento delle condanne da parte della Corte Suprema turca.