Efter att Nazityskland invaderat Grekland i april 1940 flydde de återstående delarna av Greklands flygvapen till de av Storbritannien kontrollerade länderna Egypten och Palestina. De grekiska piloterna värvades av RAF och organiserades i tre divisioner; 13:e bombdivisionen (13 Μοίρα Ελαφρού Βομβαρδισμού), 335:e jaktdivisionen (335 Βασιλική Ελληνική Μοίρα Διώξεως) och 336:e jaktdivisionen (336 Βασιλική Ελληνική Μοίρα Διώξεως). De båda sistnämnda till en början utrustade med Hawker Hurricanes men uppgraderade till Spitfire Mk.V i december respektive oktober 1943. Båda divisionerna deltog i det italienska fälttåget och genomförde flera anfall över de av Tyskland ockuperade Albanien och Jugoslavien. I november 1944 kunde divisionerna flytta ”hem” till den nyligen befriade flygbasen Hellenikon nära Aten och 31 juli 1945 överfördes de officiellt från RAF till Greklands flygvapen. Nästan genast drogs flygvapnet in i Grekiska inbördeskriget och Greklands regering köpte därför in modernare Spitfire Mk.IX och Mk.XIV för att ersätta sina slitna Mk.V. De spelade en viktig roll i att understöda grekiska armén mot jugoslaviska, bulgariska och albanska partisaner.