Das 16. Jahrhundert war für die Grafschaft Castell mit einem einschneidenden Ereignis verbunden. Die Grafen nahmen den lutherischen Glauben an und erhielten so größere Unabhängigkeit von den Würzburger Fürstbischöfen. Die folgenden Kriege des Jahrhunderts, der Bauernkrieg des Jahres 1525 und der Zweite Markgrafenkrieg zerstörten dann allerdings weite Teile der Grafschaft. In der Wende zum 17. Jahrhundert kam es sogar zur Linienspaltung des Hauses Castell: Alt-Castell-Rüdenhausen und Castell-Remlingen entstanden.