আহমদ ১৯৬৬ সালে কামরুন নাহারকে বিয়ে করেন। তাদের এক কন্যা, রাশিদা এবং এক পুত্র রেজা ছিল। আহমদের ভাই, গিয়াসউদ্দিন আহমদ, ঢাকা বিশ্ববিদ্যালয়ের ইতিহাসের অধ্যাপক ছিলেন যিনি ১৯৭১ বাংলাদেশী বুদ্ধিজীবী হত্যাকাণ্ডের শিকার হয়েছিলেন।