После развала СССР общая деградация образования сказалась и на системе ССМШ, хотя большинство из них продолжают функционировать и ныне. С 1990-х годов некоторые ССМШ обрели статус музыкального колледжа (правда это не соответствует трактовке понятия «колледж» в США).