В 1659 году возглавлял гарнизон Конотопа, осаждённый царской армией князя Алексея Трубецкого. Гуляницкий умело организовал оборону, однако ситуация становилась всё критичнее. Голод, дезертирства и ропот почти привели к сдаче города, однако в последний момент подоспело войско крымского хана и Выговского. В Конотопской битве оно сумело одержать победу над конными отрядами русской армии и заставило Трубецкого снять осаду.