После Аншлюса Австрии в 1938 году создал в Зальцбурге полицию безопасности и возглавил местное гестапо в звании штурмбаннфюрера СС. Во время Польской кампании возглавлял айнзацкоманду 2, входившую в состав айнзацгруппы 2. Это подразделение было создано в августе 1939 года, следовало за 10-й армией вермахта и действовало в Ополе, Радомско и Коньске. 20 ноября 1939 года подразделение было расформировано. Служащие его айнзацкоманды были переданы в ведомство командира полиции безопасности и СД в Люблине. Впоследствии Рукс основал отделение гестапо в Бромберге (ныне Быдгощ), а также стал командиром полиции безопасности. Ему были подчинены отделения СД в Торне, и других городах. В 1942 году ему было присвоено звание оберштурмбаннфюрера СС, а в следующем году Рукс получил должность руководителя гестапо в Грауденце.