Pada awal Tahun 1990-an, Kesatuan Soviet mengalami pergolakan politik besar-besaran, yang memuncak pada pembubaran Negara. Bekas Negara-Negara di semua bahagian Kesatuan Republik Sosialis Soviet menyatakan kemerdekaan mereka selama Januari 1990 - Disember 1991, mengakibatkan penubuhan beberapa negara merdeka, bersama dengan lima belas republik dan Komanwel Negara-Negara Merdeka (CIS). Sehingga masa itu, Syarikat Penerbangan Aeroflot ialah satu-satunya pertubuhan yang menyediakan perkhidmatan udara di seluruh Kesatuan Soviet, tetapi dengan perpecahannya, cawangan Aeroflot dari negara-negara ini memulakan perkhidmatan mereka sendiri, dan syarikat penerbangan itu sendiri dikendalikan oleh Rusia, republik terbesar CIS, dan dinamakan semula sebagai "AeroflotSyarikat Penerbangan Antarabangsa Rusia   (ARIA)". Pada tahun 1992 Aeroflot dibahagikan kepada beberapa syarikat penerbangan serantau, dimana Laluan Antarabangsa telah dioperasikan oleh ARIA. Syarikat penerbangan serantau yang lebih kecil yang muncul dari Syarikat Penerbangan Aeroflot lama kadangkala disebut sebagai "Babyflot"; Bashkirian Airlines, Krasnoyarsk Airlines, Moscow Airways dan Tatarstan Airlines ialah antara syarikat penerbangan yang dibentuk dari bekas direktorat Aeroflot.