De tweede helft van de dertiger jaren wordt bepaald door anti-Tsjechische propaganda door de Polen, wat resulteert in eisen van de Poolse omwonenden dat de Tsjechische scholen worden gesloten, het onteigenen van grond van Tsjechische boeren, negatieve bejegening van Tsjechische kolonisten op Poolse grond, en daarna ook in Český Malín zelf. Na invallen van de oostelijke Poolse regio's door Sovjettroepen, welke de regio bezetten op grond van een geheim aanhangsel van het Molotov-Ribbentroppact, valt Český Malín nu onder de Sovjet-Unie. Er wordt in deze periode een ziekenhuis gebouwd en in 1941 een kolchoz. Na gevechten tussen de Sovjet-Unie en het nazistische Duitsland wordt Český Malín bezet en valt nu onder het Derde Rijk.