1809年1月16日，法國元帥蘇爾特率軍追上英軍，爆發。黑衛士在戰役中部署在英軍中央，並與一同死守法軍首輪攻勢，遭到法軍重創。英軍雖然在戰役中擊退法軍，但包括摩爾在內的多名將軍卻因傷陣亡，部隊亦因疾病而承受嚴重損失。1月18日英軍倉猝從海路撤出西班牙，棄下大量武器裝備。拉科魯尼亞戰役後，黑衛士第一營返回英國，然後隨軍遠征瓦爾赫倫島的法國船塢。然而英國遠征軍飽受瘧疾及斑疹傷寒感染，造成大量士兵死亡，行動亦告失敗。當黑衛士第一營在1809年9月返抵英國時，軍團原先的758人只有204人仍可作戰。這場瘟疫在當時亦被稱為「瓦爾赫倫熱」（Walcheren Fever）。