Cuando Macdonald sucedió a Championnet y se ordenó la retirada, Rusca siguió el movimiento del ejército. Se encontró en la desafortunada Batalla de Trebia el 20 de Pradial (17-19 de junio de 1799)), donde mostró gran valor y donde recibió dos disparos en la pierna izquierda. Abandonado en Plasencia con otros generales heridos, permaneció prisionero de los austriacos durante 20 meses.