Kewell was de jongste speler ooit die zijn debuut maakte voor het Australisch nationaal elftal, toen hij op 24 april 1996 aantrad in het vriendschappelijke duel tegen Chili. Hij was op dat moment 17 jaar en zeven maanden oud. In november 1997 speelde Kewell met "The Socceroos" mee in het kwalificatieduel tegen Iran voor een plaats op het WK 1998. Hij scoorde de openingstreffer in de heenwedstrijd, maar Iran ging naar het WK op basis van gemaakte uitdoelpunten (1-1 en 2-2). In 1997 was hij met de "Socceroos" verliezend finalist op de Confederations Cup. Kewell scoorde destijds in de halve finale het enige doelpunt tegen Uruguay. In 2000 nam Kewell met het Australisch elftal deel aan de Olympische Spelen van Sydney. In 2005 had hij een aandeel in de plaatsing van Australië voor het Wereldkampioenschap voetbal 2006. Nadat Kewell als invaller in het veld kwam in de play-off tegen Uruguay, gingen de "Socceroos" meer druk zetten. Marco Bresciano scoorde vervolgens vanuit een afgeweken schot van Kewell de winnende treffer. Op het WK maakte Kewell in de laatste groepswedstrijd een doelpunt. Zijn goal in de slotfase tegen Kroatië zorgde ervoor dat de "Socceroos" zich voor het eerst plaatsten voor de achtste finales van een WK. Hierin was Italië met 1-0 te sterk. Kewell behoorde tot de selectie voor de Azië Cup 2007, het eerste Aziatische toernooi waaraan Australië deelnam na de overstap van de OFC naar de AFC in januari 2007.