El Escuadrón II participó intensamente de las operaciones aéreas durante la guerra de las Malvinas. La unidad tenía dos Boeing 707 —TC-91 y TC-92— en servicio. Tras la Operación Rosario, uno de estos aviones trasladó al gobernador británico Rex Hunt y sus militares a Uruguay. Después, el escuadrón se incorporó al Grupo de Tareas 17, a las órdenes de la Jefatura de Inteligencia Naval, que asumió la conducción de las operaciones de inteligencia el 20 de abril de 1982. Los Boeing de la FAA integraron el Elemento de Tareas 17.1 incorporando en cada vuelo un oficial aviador naval y un militar fotógrafo proveniente de la jefatura. El objetivo era localizar y determinar la composición de la flota británica, que había zarpado de Gran Bretaña y se dirigía a las islas Malvinas. Para desempeñar tal tarea, los 707 solamente contaban con radares meteorológicos, por lo que debía confirmar visualmente los contactos con el riesgo que ello implicaba. Para planificar las navegaciones, los militares contaron con el asesoramiento de pilotos de Aerolíneas Argentinas.