Чехословачка влада подржала је ционизам, инсистирајући на томе да се Јевреји асимилирају у чехословачку културу или емигрирају у Палестину. Јеврејима који су се на предратном попису становништва изјаснили за немачко или мађарско држављанство одузето је држављанство, губећи свако право на реституцију и претила им је депортација. Већина Јевреја у Словачкој емигрирала је у Израел или друге земље у годинама након рата. Исељавање се убрзало 1948. године након државног удара и национализације многих предузећа након рата. Број јеврејских заједница смањио се са послератних 126 на 25, док се број становника смањио за 80 процената. До краја 1949. године остало је само неколико хиљада Јевреја. Многи од оних који су одлучили да остану променили су презиме и напустили верску праксу како би се уклопили у словачку средњу класу. У 2019. години процењено је јеврејско становништво на 2.000 до 3.000.