Smrkovský a contribué au mouvement de réforme de 1968 d'une manière particulière. Il n'a pas seulement soutenu la démission d'Antonín Novotný de son poste de leader du parti communiste, mais le discours de Smrkovský fin a montré le réel impact de l'élection d'Alexander Dubček comme Premier secrétaire. Smrkovský est désigné à la tête du Parlement en , et en orateur talentueux il devient (avec Dubček) l'un des politiciens les plus populaires de l'époque. Il prend position en faveur des réformes démocratiques tout en maintenant une idéologie communiste, et supporte le rôle prééminent du KSČ à la tête du pays.