1551年，昂热成为的管辖中心，这一职能相当于行省首府，并延续到了法国大革命结束。宗教战争时期，昂热主教收留了大批新教徒，1555年，昂热出现了第一个卡尔文教堂，此后昂热成为了新教徒运动的中心城市之一，1572年，圣巴多罗买大屠杀波及昂热，当地的新教徒和天主教徒之间产生了巨大的矛盾，其中新教徒在镇压下伤亡惨重，被杀的新教徒的尸体被扔进曼恩河，最终在当地市政官员蒙索罗伯爵的制止下，战乱才得以平息。