Am 17. Spieltag der Saison 2017 erzielte Ngakoue gegen die Tennessee Titans seinen ersten Touchdown in der NFL, als er einen eroberten Fumble 67 Yards weit in die gegnerische Endzone zurücktrug. Insgesamt erzwang er in der Saison sieben Fumbles, davon einen in den Play-offs, womit er die NFL in dieser Statistik anführte. Vier dieser Fumbles resultierten in einem Touchdown für die Jaguars, zudem erzielte Ngakoue 12,0 Sacks. Die Jaguars stellten in der Saison eine der besten Defenses der Liga, die oft mit dem Spitznamen „Sacksonville“ bezeichnet wurde. Das Team schaffte es bis ins AFC Championship Game und stand kurz vor der ersten Super-Bowl-Teilnahme, musste sich allerdings in einem knappen Spiel den New England Patriots geschlagen geben. Als Ersatz für seinen Mitspieler Calais Campbell wurde Ngakoue in den Pro Bowl 2018 berufen.