En un principio, la línea editorial del diario La Tercera se ligó al Partido Radical, pero en 1965 se desvinculó del partido, convirtiéndose en un diario independiente de todo partido político, régimen de gobierno o confesión religiosa. En 1968 se trasladó a la que sería su sede durante más de tres décadas, en Av. Vicuña Mackenna 1870, y fue el segundo periódico chileno en adoptar el sistema ófset. En 1970, el diario fue uno de los más acérrimos opositores al gobierno de Salvador Allende y en 1973 apoyó el Golpe de Estado del 11 de septiembre, siendo "La Tercera de La Hora" uno de los diarios partidarios de la dictadura militar de Augusto Pinochet, junto a "El Mercurio" y "La Nación".