O primeiro confronto entre o Partido Baath e a Irmandade Islâmica na Síria ocorreu logo após o golpe de Estado baathista de 1963, em que o Partido Ba'ath obteve o poder no país. Desde o início, grupos políticos islâmicos, em que a Irmandade obteve grande destaque, representou a mais forte oposição ao novo regime. A proibição da Irmandade em 1964 resultou em sua radicalização. Entre 1964 e 1965, greves e grandes manifestações se espalharam nas principais cidades da Síria, especialmente em Hama, e foram esmagadas pelo exército. A cidade de Hama, em particular, era uma "fortaleza de desembarque do conservadorismo e dos Irmãos Muçulmanos", e "foi durante muito tempo um adversário temível do estado baathista."