Cependant, ces ordres sont révoqués plus tard le même jour ; et le "Varuna" est affecté au nouvel escadron du blocus du golf de l'ouest. En cours de route vers le sud fin février, le "Varuna" fait escale à Port-Royal, en Caroline du Sud, pour des réparations, où le navire du capitaine de frégate Charles S. Boggs, assume temporairement le commandement du port, le , au cours de l'absence de Samuel F. Du Pont. La canonnière rejoint finalement l'escadron du blocus du golfe de l'ouest du contre-amiral David G. Farragut, le .