3 ноября 2016 года Феликс Крисанто дебютировал в составе сборной Гондураса, выйдя в основном составе в домашней товарищеской игре против команды Белиза. Он также выступал за национальную сборную в матчах Центральноамериканского кубка 2017, Золотого кубка КОНКАКАФ 2017 и отборочного турнира чемпионата мира 2018.