Peruť byla obnovena 1. prosince 1959 jako jedna z 20 perutí "Royal Air Force" vybavených strategickými balistickými střelami v rámci projektu „Emily“, když se její výzbrojí staly balistické rakety středního doletu Thor, s nimiž byla jednotka uvedena do bojové pohotovosti během kubánské raketové krize. Po ukončení programu "Thor" ve Spojeném království byla peruť 24. května 1963 rozpuštěna.