Am 21. Juli 1944 beendete Kitzinger seine Tätigkeit im Reichskommissariat Ukraine. Am 23. Juli 1944 ernannte Hitler ihn zum Militärbefehlshaber in Frankreich. Sein Vorgänger Carl-Heinrich von Stülpnagel war am Hitler-Attentat beteiligt gewesen. Kitzinger trat seine Stelle, so Peter Lieb, in der festen Absicht an, „die schwierige Lage durch Härte und Bekämpfung der Lethargie in den Stäben“ zu überwinden. Wenige Tage später forderte er, zu den Besprechungen des OB West mit den Oberbefehlshabern von Marine und Luftwaffe hinzugezogen zu werden; er selbst wolle nicht als „reiner Territorialverwalter“ angesehen werden. Sonst wolle er zurücktreten. Kitzinger übte das Amt des Militärbefehlshabers Frankreich nur bis zum 4. Oktober 1944 aus, Paris hatte schon am 25. August kapituliert.