Надалі всі зусилля частин 11-ї армії були направлені на захоплення Криму і Севастополя. До кінця жовтня 1941 року була окупована велика частина Кримського півострова. Спроби захоплення головної бази Чорноморського флоту з ходу не увінчалися успіхом. Становище армії було ускладнене висадкою великого морського десанту на Керченському півострові. У травні 1942 року в ході наступальної операції були розгромлені війська Червоної Армії в районі Керчі, а на початку липня 1942 року в результаті штурму був узятий Севастополь.