Nesta fez carreira na Lazio e no Milan, clubes pela qual conquistou três títulos do Campeonato Italiano, três títulos da Copa da Itália, dois títulos da Liga dos Campeões da UEFA e um Mundial de Clubes da FIFA. Foi também frequentemente convocado para a Seleção Italiana. Desde a sua estreia em 1996, atuou em 78 partidas. Pela "Azzurra", disputou as Olimpíadas de 1996, três Eurocopas e três Copas do Mundo. Esteve na Seleção Italiana que chegou a final da Euro 2000, e posteriormente se aposentou da Seleção após a conquista da Copa do Mundo de 2006.