В июне 1919 года в Риге Томсон вступил в Латвийскую армию. Служил заместителем командира Авиационной группы Латвийской армии Алфредса Валлейки. С июля 1919 — начальник авиационного отдела при Техническом управлении Латвийской армии. Участвовал в Освободительной войне в Латвии. С сентября 1919 года — командир Авиационного парка Латвийской армии. В 1919 году латвийским правительством ему было присвоено воинское звание старшего лейтенанта. В мае 1920 году уволен из армии «по состоянию здоровья». В сентябре 1920 года эмигрировал в США. Причиной эмиграции стали нападки на Томсона из-за службы в РККА.