Переносились также грибы, такие как гриб, вызывающий голландскую болезнь вяза, убивающую американские вязы в лесах и городах Северной Америки, многие из которых были посажены как уличные деревья. Некоторые из инвазивных видов превратились в серьёзные экосистемные и экономические проблемы после распространения в Новом Свете. Полезным, хотя, вероятно, непреднамеренным случаем интродукции является "Saccharomyces eubayanus", дрожжи, используемые для приготовления светлого пива, которое, как теперь считается, возникло в Патагонии. Другие виды пересекли через Атлантику в Европу и изменили ход истории. В 1840-х годах "Phytophthora infestans" пересекла океаны, нанеся урон урожаю картофеля в нескольких европейских странах. В Ирландии урожай картофеля был полностью уничтожен; Ирландский картофельный голод привёл к тому, что миллионы людей умерли от недоедания или эмигрировали.