Починаючи з 2000 року у Дворжака дуже часто стали виникати проблеми зі здоров'ям, через які Томашу доводилося пропускати багато міжнародних стартів. Однак це не завадило Дворжаку виграти свій третій поспіль чемпіонат світу 2001.