En 1929, elle retourne à l'Université de Chicago, à la demande de Charles Edward Merriam pour superviser les travaux sur le projet "l'Histoire de Chicago". Pour le Siècle de Progrès, exposition universelle de 1933, elle écrit "As Others See Chicago: Impressions of Visitors, 1673-1933." Elle entame ensuite son travail le plus notable, "A History of Chicago "dont lLes deux premiers volumes seront publiés en 1937 et 1940. En 1955, elle décroche la Bourse Guggenheim et termine le troisième volume en 1957, trois ans après sa retraite avant de devenir professeur émérite. Pierce débutera un quatrième volume, qui devait couvrir les années 1894 à 1915, mais ne le terminera jamais.