Efter hans hemkomst uppdrog regeringen honom att ombesörja en kritisk utgåva av Nya Testamentet. Av detta verk utkom första delen 1788; men då nästan hela upplagan gick upp i lågor vid den stora eldsvådan 1795, tillsammans med Vajsenhuset, där Birch hade blivit präst 1789, förlorade han lusten att fullfölja det.