Après la Quatrième croisade et le "Partitio terrarum imperii Romaniae" (« Partage des terres de l'Empire de Romanie »), Corfou devient vénitienne. En 1207 le doge Pietro Zani donne l'île en fief à dix nobles vénitiens. Corfou passe aux mains du despote d'Épire vers 1214, et est capturée en 1257 par Manfred de Sicile. Néanmoins, avec la défaite de Manfred à Bénévent et la signature du traité de Viterbe le , Corfou devient une possession du royaume angevin de Naples. Pendant ce temps, le reste des îles continue à faire partie du Comté palatin, qui, tout au long de son existence, fut gouverné par trois familles : les Orsini (dont la parenté avec la famille romaine Orsini n'est pas attestée), la Maison d'Anjou et la famille Tocco. La domination de la famille Tocco dura 122 ans, jusqu'en 1479, lorsque les Ottomans s'emparèrent de Céphalonie, Zante, Leucade et Ithaque.