改装なって4月12日、報国丸は愛国丸とともに呉を出発、同25日にペナン島に到着した。ペナン出撃は4月30日で、その10日後の5月9日に早くもこの作戦の最初の戦果となるオランダのタンカー、ヘノタ（約15,000総トン）を拿捕する。ヘノタは後に特設給油艦大瀬となった。およそ一月後の6月5日、モザンビーク海峡南方でイギリスの商船エリシア（6,757総トン）を発見し、撃沈。6月17日には、第八潜水戦隊甲先遣隊に補給を行った。なお、甲先遣隊の内の何隻かは数週間前に特殊潜航艇をもってマダガスカルの戦いに参加したものである。これからまた一月ほど経った7月12日、ニュージーランドの貨物船ハウラキ（7,113総トン）を拿捕（ハウラキは後に伯耆丸と改名され海軍が徴用）、その後に作戦を終了しペナンに帰投した。作戦中、明記した以外にも報国丸と愛国丸の両船は何度か潜水艦に補給を行っている。