Der Shorttrack-Weltcup 2008/09 ging vom 17. Oktober 2008 bis 15. Februar 2009 und wurde in sechs Ländern ausgetragen. Die Saisonhöhepunkte waren die Europameisterschaften 2009 in Turin, die Weltmeisterschaften 2009 in Wien und die Teamweltmeisterschaften 2009 in Heerenveen.