El 9 de diciembre ganó la Copa Intercontinental por 3-0 ante el Club Olimpia paraguayo. Dio dos balones al palo, pero sus rechaces fueron aprovechados para marcar gol por sus compañeros. En la liga fueron colíderes en la 19.ª jornada, pero a partir de ahí siempre estuvieron por detrás del Unione Calcio Sampdoria, que se adjudicó el título con 5 puntos de diferencia. A final de temporada van Basten tuvo una discusión con Sacchi, que no renovó su contrato con el equipo y se convirtió en el nuevo seleccionador italiano.