अप्रैल 2015 में नेपाल में आए भूकंप ने बौधनाथ स्तूप को बुरी तरह से क्षतिग्रस्त कर दिया था, और उसका शिखर गंभीर रूप से टूट गया था। नतीजतन, गुंबद के ऊपर की पूरी संरचना, और इसमें मौजूद धार्मिक अवशेष को हटाना पड़ा, जो अक्टूबर 2015 के अन्त तक पूरा हो गया। पुनर्निर्माण कार्य 3 नवंबर 2015 को स्तूप के लिए गुंबद के शीर्ष पर एक नए केन्द्रीय ध्रुव या "जीवन वृक्ष" का निर्माण एक अनुष्ठान के साथ शुरू हुआ।