A la fin de l’année 1993, le parti se trouve profondément divisé entre deux courants, l'un conduit par Faustin Twagiramungu et Agathe Uwilingiyimana, favorables à une coalition avec le Front patriotique rwandais, l'autre mené par Jean Kambanda est proche du mouvement radical Hutu Power. En , ce dernier sera le Premier ministre du gouvernement intérimaire responsable du génocide des Tutsi rwandais.