Nachází se zde chrám Dionýsa a Dia. Během Řecko-perských válek poslal Afytos vlastní flotilu. Další zpráva o městě je až ze 14. století, následně z turecké doby. Město stále obývali Řekové a přetrvalo antické pojmenování. V této době byly postaveny dnešní budovy v tradiční řecké kamenné architektuře. Afytos se aktivně zapojil do Řecké války za nezávislost od Turků v roce 1821. Pocházeli odsud významní generálové např. Triandafyllos Garufallu.