Après l'attaque allemande contre l'URSS (1941), la communauté juive est déportée par le régime fasciste roumain (1940-1944) en Transnistrie où la majorité périt par assassinats ou privations. En 1944 c'est le tour des roumanophones de subir la déportation, cette fois vers le Kazakhstan soviétique. En 1945 Taroutyne est dépeuplée et en ruines ; après la guerre, elle sera repeuplée principalement de Russes et rattachée à l'oblast d'Akkerman-Izmaïl qui est inclus en 1954 dans l'oblast d'Odessa. Depuis la dislocation de l'URSS en 1991, Taroutyne est une ville de l'Ukraine indépendante.