När Nelson den 1 augusti anlände till Abukir utanför Alexandria fann han att han kommit för sent och att vid den ankrade franska flottan låg tomma transportfartyg. Nelson såg dock sin chans att utdela ett hårt slag mot den franska flottan. Om britterna kunde segla upp tätt inpå de franska fartygen kunde de utnyttja sin överlägsenhet i artilleri för att nå ett avgörande, samtidigt som fransmännen avstängdes från möjligheten att fly. Slaget vid Nilen blev en förkrossande seger för britterna. Av 13 franska linjeskepp sänktes eller erövrades 11, utan att britterna förlorade ett enda fartyg. Därmed sattes punkt för Napoleons Egyptiska äventyr i och med att armén blev avskuren i Egypten. England fick samtidigt en nationalhjälte. Slaget öppnade för brittisk erövring av Malta och Minorca, och en återigen dominerande position för Royal Navy i Medelhavet.