Marcelo Bielsa, surnommé "El loco" reprend les rênes de la sélection pour quatre ans, avec la même mission de remporter un mondial. Lors de la Copa América 1999, sa sélection "bis" s'incline en quart de finale contre le Brésil. Auparavant, elle avait perdu lourdement contre la Colombie (3-0), lors d'un match marqué par les trois penaltys manqués par Martín Palermo. En 2001, la Copa América a lieu en Colombie et face au contexte terroriste, l'Argentine décide de ne pas y participer.