В апреле 2020 года раввин Бакши-Дорон, страдавший на протяжении нескольких лет от проблем со здоровьем, заразился коронавирусом COVID-19 и через 5 дней скончался в медицинском центре «Шаарей-Цедек» в Иерусалиме. Похоронен на иерусалимском кладбище «Хар ха-Менухот».