L'infanzia di Faysal coincise con la seconda guerra mondiale, il suo paese era formalmente alleato del Regno Unito. Nell'aprile del 1941, lo zio 'Abd al-Ilah fu brevemente deposto come reggente da un colpo di Stato militare che aveva lo scopo di allineare l'Iraq con le potenze dell'Asse. Questo fatto presto portò alla guerra anglo-irachena. I tedeschi promisero aiuti che non vennero mai e 'Abd al-Ilah venne restaurato al potere da una forza alleata combinata composta dalla Legione araba, dalla Royal Air Force e dalle altre unità britanniche. Dopo la sconfitta dei golpisti, il paese rientrò nell'alleanza britannica e, alla fine della guerra, si unì alla Nazioni Unite.