Bell wurde im Jahr 1963 von den von Minnesota Vikings in der zweiten Runde an 16. Stelle der NFL Draft ausgewählt. Auch die Kansas City Chiefs zeigten an einer Verpflichtung von Bell Interesse und wählten ihn in der siebten Runde an 57. Stelle der AFL Draft aus. Bobby Bell entschloss sich einen Profivertrag bei den Chiefs zu unterschreiben und wurde von deren Head Coach Hank Stram in seinen ersten beiden Profijahren als Defensive End eingesetzt. Nach der Saison 1964 wechselte Bell auf die Position eines Linebackers. Im Jahr 1966 konnte Bell mit den Chiefs, die in der Regular Season elf von 14 Spielen gewonnen hatten, seinen ersten Meistertitel gewinnen. Im AFL Endspiel schlug seine Mannschaft das Team der Buffalo Bills mit 31:7, wobei Bell einen Sack zum Sieg seiner Mannschaft beitragen konnte. Die Chiefs unterlagen danach im "AFL-NFL World Championship Game" (später umbenannt in Super Bowl I) den von Vince Lombardi betreuten Green Bay Packers mit 35:10. Auch in diesem Spiel war Bell an einem Sack gegen den gegnerischen Quarterback Bart Starr beteiligt, konnte die Niederlage seiner Mannschaft damit aber nicht verhindern.