En 1571, après le long siège de Famagouste, Chypre fut perdue. Au cours de cette même année, en réaction, lors de la bataille de Lépante, la flotte chrétienne, commandée par Don Juan d'Autriche et composée de navires espagnols, vénitiens, génois, pontificaux et des chevaliers de Malte vainquit la flotte ottomane. En 1669, après la sanguinaire guerre de Candie, qui dura 20 ans et laissa Venise exsangue malgré le soutien de la France, les Turcs prirent Candie (en grec Héraklion), acquérant ainsi le contrôle complet de la Crète. Dans la période qui suivit (1683-1687) et sous le commandement de Francesco Morosini, les Vénitiens réussirent à conquérir la Morée (l'actuel Péloponnèse), au cours de la Guerre de Morée. Ils la reperdirent cependant en 1718.