Bulgar ordusunun 13 Kasım 1912'de Çatalca önlerine varıp, 17-18 Kasım'da İstanbul üzerine taarruza geçmesi ve sonrasında İstanbul'un sürekli tehdit altında olması sportif müsabakaları imkânsız kılarken, önce 3 Mart, sonrasında da nihai olarak 16 Mart 1913'te yürürlüğe giren ateşkesin ardından sportif faaliyetler yeniden canlandı. Başta takım kaptanlarından Galip Kulaksızoğlu ve Şehit Arif Emirzade olmak üzere, Fenerbahçe'nin birçok oyuncusu, Balkan Savaşları'na katıldıkları için bu sezonda Fenerbahçe, çok az sayıda maç oynamıştır. Bu nedenle Fenerbahçe futbol takımı bu sezon, koşulların sportif faaliyetlere izin verdiği dönemlerde yaptığı özel karşılaşmalarla yetindi.