Kallisperis Eltern waren Nicholas und Marigo Kallisperi geboren. Ihr Vater stammte von der Insel Kalymnos und war Offizier im Griechischen Freiheitskampf gewesen. Danach wurde er Schulinspektor, war 1844 Richter in Athen und 1855 Präfekt von Messenien. Das Ehepaar hatte drei Kinder und förderte deren Ausbildung. Kallisperi besuchte eine private Mädchenschule, die "Hill School" in Athen.