Nykyinen kaupunki on saanut alkunsa varsinaisesti vasta 1800-luvulla, jolloin sen asuttivat Jordanjoen laakson paimentolaiset ja maanviljelijät. Asukkaita tuli myös aina Saudi-Arabiata, Jordaniasta ja Syyriata saakka. Vuosien 1936–1939 arabikapinan aikana Tubas oli yksi tärkeistä kapinallisten keskuksista. Israelin asevoimat miehittivät sen kuuden päivän sodan aikana 7. kesäkuuta 1967.