Створення Хорватської Республіки Герцег-Боснія було предметом суперечок для бошняків. Хорвати звинуватили боснійців в ісламізації країни та спробах створити панування боснійців у всіх областях. Тож вони відкликали представників етнічних хорватів з парламенту, уряду та президентства. Через вигнання боснійських сербів боснійці переїхали в інші райони, що порушило територію хорватів та змінило їх довоєнне співвідношення. Політичні суперечки та незначні інциденти в центральній та північній Боснії, а також у північній та центральній Герцеговині призвели до хорватсько-боснійської війни в листопаді 1992 року.