Он участвовал в Первом сражении при Булл-Ран, а с июля 1861 по апрель 1862 служил адъютантом при генерале Уильяме Бэрри. Во время кампании на Полуострове служил инспектором артиллерии и обратил на себя внимание хорошей организацией артиллерийского огня в сражении при Малверн-Хилл. Генерал Дэниэль Баттерфилд писал, что Уэбб спас федеральную армию от разгрома.