Полоцьке Євангеліє було вкрадене з Полоцька після захоплення Іваном Грозним у ході Лівонської війни в 1563 р. Інформація про те, де надалі знаходилася книга — дуже скупа. Відомо лише, що у 19 ст. основна частина фоліанту була в історика М. Погодіна, а два аркуші — у збирача давнини В. Ундольського. У 1852 р. разом із архівом М. Погодіна Полоцьке Євангеліє передане було до Імператорської публічної бібліотеки в Санкт-Петербурзі.