Em 15 de março de 1899, Bruce escreveu a "Sir" Clements Markham na RSG, oferecendo-se para fazer parte do grupo científico da Expedição Antártica Nacional, na altura em seus estágios iniciais de planejamento. A resposta de Markham limitou-se a uma linha, em que não se comprometia, e, durante um ano, Bruce não teve qualquer outro tipo de resposta. Aconselharam-no, então, a candidatar-se, indiretamente, a um cargo de assistente científico. Em 21 de março de 1900, Bruce voltou a lembrar a Markham que ele se tinha candidatado um ano antes, e expôs as suas intenções atuais: "Não tenho qualquer tipo de ilusão de ser capaz de juntar dinheiro suficiente para um segundo navio britânico". Nos dias que se seguiram, informou que o financiamento para um segundo navio já estava assegurado, fazendo suas primeiras referências explícitas a uma "Expedição escocesa" Isso alarmou Markham, que respondeu com um pouco de raiva: "Essa orientação será mais prejudicial para a Expedição [...] Um segundo navio não constitui o mínimo requisito [...] Não entendo o porquê essa rivalidade maliciosa foi despoletada". Bruce respondeu negando a rivalidade, e afirmando: "Se os meus amigos estão dispostos a me dar dinheiro para realizar meus planos, eu não vejo por que não deveria aceitá-lo [...] são várias as opiniões que afirmam que um segundo navio seria altamente desejável". Insatisfeito, Markham escreveu de volta: "Como eu estava fazendo o meu melhor para que você fosse escolhido [para a Expedição Antártica Nacional] eu tinha o direito de pensar que você não iria dar esse passo [...] sem ao menos me consultar". Ele continuou: "Você irá inviabilizar a expedição Nacional [...] ao organizar a sua própria expedição".