Το 2007 πολλά δημοσιεύματα τον ήθελαν να φεύγει για την Γερμανία όμως παρέμεινε στο Λονδίνο. Ο τραυματισμός του εκείνη την χρονιά του στέρησε την συμμετοχή στο Champions League για όλη την σεζόν ακόμα και όταν ήταν υγιής. Συνέχισε την σεζόν κυρίως ως αλλαγή. Το 2008 έγινε ο τρίτος στην σειρά αρχηγός της ομάδας, σκόραρε αρκετά γκολ και βοήθησε πολύ την ομάδα του με αποκορύφωμα την νίκη επί της Μάντσεστερ Γιουνάιτεντ στις 26 Απριλίου 2008 όπου σκόραρε δύο φορές. Παρόλα αυτά το πρωτάθλημα δεν το κατέκτησε η Τσέλσι. Η επόμενη χρονιά ξεκίνησε πολύ καλά για τον ίδιο και την ομάδα. Όμως ένας ακόμη τραυματισμός τον κράτησε έξω σε μια περίοδο όπου το πρόγραμμα είχε πολύ δύσκολα παιχνίδια. Η σεζόν συνεχίστηκε χωρίς να είναι βασικό μέλος της ομάδας ο Μπάλακ. Στο τέλος της σεζόν υπέγραψε ανανέωση συμβολαίου για έναν χρόνο. Το 2009-2010 ξεκίνησε ακόμη μια φορά με πολύ φόρα και γκολ συνεχίζοντας έτσι και στο τέλος της σεζόν πανηγύρισε τον πρώτο του τίτλο στο νησί, την κατάκτηση του πρωταθλήματος για το 2010. Παράλληλα κέρδισε και το κύπελλο όπου στον Τελικό του 2010 αγωνίστηκε βασικός μέχρι το 44΄. Όμως ακόμη ένας τραυματισμός του στέρησε την θέση στην Εθνική Γερμανίας για το μουντιάλ ενώ το καλοκαίρι ανακοινώθηκε ότι δεν θα γίνει ανανέωση του συμβολαίου του.