Heiser studierte nach dem Abitur in Lingen (Ems) 1901–06 Bauingenieurwesen an der TH Berlin. Dann arbeitete er beim Wasserbauamt Emden und als Staatsbeauftragter bei der "Gesellschaft zur Förderung der Wasserwirtschaft" im Harz in Braunschweig. 1913 reiste er zu Wasserkraftanlagen nach Schweden und Norwegen. Nach der Teilnahme im Ersten Weltkrieg als Pionieroffizier ging er nach Magdeburg und leistete Vorarbeiten für die Saaletalsperren in Saalfeld (1919 als Regierungsbaurat). Seit 1921 arbeitete er für das Preußische Ministerium für Landwirtschaft, Domänen und Forsten und wurde 1924 auf den ordentlichen Lehrstuhl für Wasserwirtschaft, Wasserbau und Kulturtechnik an der TH Dresden als Nachfolger von Hubert Engels berufen. Heiser floh nach der Ausbombung 1945 nach Bremen, später ging er nach Hamburg und arbeitete 1946–49 als Dozent an der Staatsbauschule Hamburg bis zum Ruhestand. 1958 lehrte er wieder an der TH Braunschweig.