Der Beginn des Burenkriegs 1899 brachte Cook direkt in Konflikt mit dem "Little-England" Flügel der Liberalen Partei. Als David Lloyd George 1901 ein Konsortium liberaler Geschäftsleute organisierte, um die Daily News zu kaufen, erklärte er, dass die Zeitung in Bezug auf den Krieg eine neutrale Haltung einnehmen würde. Cook, ein starker Imperialist, konnte unter diesen Umständen nicht bleiben und wurde durch R. C. Lehmann ersetzt.