Kamerunin joukkueessa Eto’osta tuli 17 vuoden ja kolmen kuukauden ikäisenä nuorin 1998 MM-kilpailuissa Ranskassa mukana ollut pelaaja. Hän oli myös ainoa pelaaja, joka oli syntynyt 1980-luvulla Ranskan MM-kilpailuissa. Vuoden 2002 MM-kilpailuissa hän pelasi Kamerunin kaikki kolme ottelua alusta loppuun ja teki Saudi-Arbaiaa vastaan ottelun ainoan maalin.