Die Festung Charlemont erwies sich als von großer strategischer Bedeutung in den irischen Konföderationskriegen in den 1640er-Jahren, da es sich um eine der wenigen Festungen im damaligen Irland handelte. Sie wurde 1641 von den Truppen Felim O'Neills erobert und die Ulster-Armee der irischen Konföderierten hielten sie die gesamten 1640er-Jahre über. Schließlich wurde sie durch Charles Coote eingenommen, nachdem die Garnison Ende der 1650er-Jahre durch die New Model Army verstärkt worden war, aber Hunderte von Cootes Soldaten wurden bei diesem Angriff getötet. Am 14. Februar 1858 wurde das Fort als Garnison aufgegeben.