Im Juli 1861 trat er im Rang eines Oberstleutnants in das 4. Texas-Kavallerie-Regiment ein. Während des New-Mexico-Feldzuges kommandierte er am 28. März 1862 die konföderierten Truppen bei der Schlacht am Glorieta-Pass. Er wurde noch am Tag der Schlacht zum Oberst befördert. Am 12. September 1862 wurde Scurry Brigadegeneral. Scurry war an der Rückeroberung Galvestons, Texas am 1. Januar 1863 beteiligt. Im Oktober 1863 wurde er zum Kommandeur der 3. Brigade von Walker’s Texas Division ernannt. Er kommandierte 1864 diese Brigade während der Schlachten bei Mansfield und Pleasant-Hill. Er wandte sich nach diesen Schlachten gegen das von Frederick Steele befehligte und in Arkansas operierende VII. US-Korps. Seine Truppe marschierte anschließend nach Nordost-Texas. Am 30. April 1864 wurde Scurry in der Schlacht bei Jenkins Ferry verletzt und erlag nach dem Ende des Gefechts seinen Verletzungen.