9 червня 2017 року спеціаліста було призначено головним тренером міланського «Інтернаціонале», з яким він уклав дворічну тренерську угоду. Свій перший сезон під керівництвом Спаллетті «Інтер» завершив на четвертому місці Серії A, уперша за попередні шість років кваліфікувавшись до Ліги чемпіонів. Тож у серпні 2018 року контракт тренера було подовжено ще на два роки, до 2021 року.