Cartago siguió siendo una sede importante de la Iglesia latina hasta la conquista árabe de la ciudad tras la batalla de Cartago en 698. La ciudad fue saqueada y destruida por las fuerzas omeyas para evitar que fuera reconquistada por el Imperio bizantino. El nuevo centro regional musulmán se estableció en la inmediata ciudad de Túnez. Tras la conquista árabe, la diócesis de Cartago sufrió un declive, que puede asumirse con bastante lentitud, a partir de documentos que trazan una presencia cristiana desde el siglo VIII al XII y dan los nombres de dos obispos del siglo XI. Dos cartas del papa León IX de 27 de diciembre de 1053 muestran que la diócesis de Cartago todavía era una sede residencial. En cada una de las dos cartas, el papa León declaró que, después del obispo de Roma, el primer arzobispo y metropolitano principal de toda África era el obispo de Cartago ("Primus archiepiscopus et totius Africae maximus metropolitanus est Carthaginiensis episcopus"). El papa León agregó otra declaración sobre la posición del obispo de Cartago: "... y él no puede, por el bien de ningún obispo en toda África, perder el privilegio que recibido una vez por todas de la Santa Sede Romana y Apostólica, pero lo mantendrá hasta el fin del mundo, mientras se invoque allí el nombre de nuestro Señor Jesucristo, ya sea que Cartago esté desolada o que algún día resucite en gloria" ("nec pro aliquo episcopo in tota Africa potest perdere privilegium semel susceptum a sancta Romana et apostolica sede: sed obtinebit illud usque in finem saeculi").