क्लार्क ने फिफ्थ लेबर सरकार का नेतृत्व किया, जिसने किवीबैंक , न्यूजीलैंड सुपरनेशन फंड , न्यूजीलैंड उत्सर्जन व्यापार योजना और किवीसावर सहित कई प्रमुख आर्थिक पहल को लागू किया। उनकी सरकार ने फोरेशोर और सीबेड एक्ट 2004 भी पेश किया, जिससे बड़ा विवाद हुआ । विदेशी मामलों में, क्लार्क ने अफगानिस्तान युद्ध में सैनिकों को भेजा, लेकिन इराक युद्ध में युद्ध सैनिकों का योगदान नहीं दिया। उसने कई तरह के मुक्त-व्यापार की वकालत की समझौतों पहले विकसित देश के साथ इस तरह के एक समझौते पर हस्ताक्षर करने के लिए होता जा रहा सहित प्रमुख व्यापारिक भागीदारों, के साथ चीन , और करने के लिए एक सैन्य तैनाती का आदेश दिया 2006 पूर्व संकट अंतरराष्ट्रीय भागीदारों के साथ काम किया। लगातार तीन चुनाव जीत के बाद, 2008 के चुनाव में उनकी सरकार हार गई; क्लार्क ने 19 नवंबर 2008 को प्रधान मंत्री और पार्टी नेता के रूप में इस्तीफा दे दिया। वह नेशनल पार्टी के जॉन की द्वारा प्रधान मंत्री के रूप में और फिल गोफ द्वारा लेबर पार्टी के नेता के रूप में सफल रहे।