Пьер Александр Жозеф Аллан родился 9 августа 1772 года в Сент-Омере (современный департамент Па-де-Кале). С началом Французской революции, 19-летний Аллан записался канониром-добровольцем в полк волонтёров Па-де-Кале и участвовал в бомбардировке Лилля в октябре 1792 года. Лазар Карно, организатор новой французской армии, заметил способности Аллана, вызвал его в Париж в топографический кабинет и дал ему ряд важных поручений. Наполеон назначил его секретарём военного комитета, ответственного за рассмотрение планов национальной обороны. С самого начала Аллан входил в Объединенный комитет по общественным работам и являлся его членом в течение тридцати лет.