К началу Великой Отечественной войны в составе ВМФ СССР имелась одна бригада морской пехоты на Балтийском флоте и 6-я отдельная рота морской пехоты на Пинской военной флотилии. О существовании последней не упоминает практически ни одна публикация по истории морской пехоты, несмотря на то, что бойцы 6 ормп активно принимали участие в боях лета 1941 г. вместе с Припятским отрядом речных кораблей ПВФ. С началом войны началось формирование и обучение отрядов, батальонов и бригад. В ходе войны численность морских пехотинцев, принявших участие в сражениях, составило порядка 100 тыс. человек. Военная обстановка потребовала отправку большого количества морской пехоты на сухопутные фронты. В ходе войны пехотинцы проявили себя в обороне Москвы, Ленинграда, Одессы, Севастополя, Мурманска, Сталинграда, Новороссийска, Керчи. За боевые заслуги 5 бригад и два батальона морской пехоты преобразованы в гвардейские, 9 бригад и 6 батальонов награждены орденами, многим присвоены почётные наименования. 122 морских пехотинца удостоены звания Героя Советского Союза. Единственная женщина-командир взвода морской пехоты в годы Великой Отечественной войны — гвардии лейтенант Е. Н. Завалий.