Il 10 giugno 2000, Arakawa è convocata nella Nazionale maggiore in occasione di una partita contro Canada. Arakawa ha disputato anche il Mondiale 2003, Mondiale 2007, torneo olimpico 2004 e torneo olimpico 2008. In tutto, Arakawa ha giocato 72 partite con la Nazionale nipponica riuscendo a segnare 20 gol.