У жовтні 1943 року повернувся до складу Флоту Метрополії. У червні 1944 року взяв участь в операції «Оверлорд». 18 червня біля узбережжя Нормандії підірвався на магнітній міні і був відправлений у США для ремонту. Ремонт проводився в Філадельфії до січня 1945 року і завершився у квітні 1945 року в Англії. У квітні 1945 року «Нельсон» пішов в Індійський океан де зі Східно-Індійським флотом обстрілював у липні 1945 року берегові укріплення на острові Пхукет (операція «Лайвер»), приймав капітуляцію японських військ у серпні на Пінанзі (операція «Юрист») і у вересні в Малайї (операція «Зіппер»).