В сборной Бразилии Валдир Перес дебютировал 4 октября 1975 года в матче Кубка Америки 1975 года со сборной Перу, завершившимся со счётом 2:0. В составе сборной Валдир Перес принял участие в трёх чемпионатах мира 1974, 1978 и 1982 годов и Кубке Америки 1975 года. Причём в 1978 году Валдир Перес в составе сборной стал бронзовым призёром чемпионата мира. Своё последнее выступление за сборную Валдир Перес провёл в матче чемпионата мира 1982 года против сборной Италии 5 июля 1982 года, тот матч завершился поражением бразильцев со счётом 2:3. Всего же за сборную Валдир Перес сыграл 27 официальных матчей, в которых пропустил 17 голов, причём 12 матчей Валдир Перес отстоял «на ноль». Также Валдир Перес сыграл за сборную 4 неофициальных матча, в которых пропустил 4 гола.