然而舍恩随即于1968年欧洲足球锦标赛预选赛上遭到挫折。在1967年4月6日开局主场以6比0战胜阿尔巴尼亚的一个月后，西德队又于5月3日客场以0比1不敌南斯拉夫，批评者们立刻如期而至，他们认为球队应该更注重防守。同年10月7日，西德队完成复仇，在主场以3比1战胜南斯拉夫。于是他们在12月17日在客场对阵阿尔巴尼亚的比赛中只需战胜对手便可晋级。然而，西德队却令人意外的以0比0完赛，无缘欧锦赛决赛圈。舍恩在随后遭到了广泛的批评。带着这段惨痛的经历，西德队又参加了1970年世界杯预选赛。在面对分组赛对手奥地利、苏格兰和塞浦路斯的两回合主客场制比赛中，舍恩率队以5胜1平的不败战绩晋级世界杯决赛圈。其中的最后一场比赛是1969年10月22日于汉堡以3比2战胜苏格兰：在现场72,000名观众面前，莱因哈德·利布达于第79分钟通过个人表演射入制胜球，是舍恩团队顺利晋级的决定性因素。