McConnell liet zich lange tijd niet uit over wie de presidentsverkiezingen van 2020 had gewonnen. Pas nadat het Kiescollege op 15 december Joe Biden had gekozen sprak hij zijn felicitaties uit. In aanloop naar de bevestiging van de uitslag door het Congres waarschuwde hij zijn partijgenoten voor de "ondermijning van de republiek" wanneer de uitslag werd omgekeerd. Zijn echtgenote Elaine Chao was minister van Transport en stapte na de bestorming van het Capitool in januari 2021 op uit protest tegen het beleid van president Donald Trump. McConnell zelf zei dat Trump de bestorming van het Capitool had uitgelokt.