În Jagodina au trăit mai mulți soldați spahii și otomani și mai puțin sârbi creștini. A avut o școală turcească. Cu statutul de "palanka" (oraș mic), Jagodina a fost menționată în 1620, ca o mică oprire pe drumul către Istanbul. În anul 1660, un călător pe nume Evliya Çelebi a afirmat că orașul a avut 1500 de case și că întreaga populație este formată din creștini care au fost convertiți la islam. La mijlocul secolului al XVII-lea, Jagodina a avut un bazar acoperit (bezistan). După războiul austro-turc (1716-1718), Jagodina a devenit capitala districtului Jagodina. Conform registrului austriac din 1721, Jagodina a avut 162 de familii care locuiau în localitate. După noul război austro-turc (1737-1739), Serbia a ajuns din nou sub stăpânirea otomană.