Les informations obtenues en France et en Belgique pointaient Strasbourg comme un objectif important car les physiciens Rudolf Fleischmann et Carl Friedrich von Weizsäcker travaillaient à l'université de la ville ; des recherches sur les torpilles et les moteurs à réaction y étaient également menées. Le , le d'armées américain informa la mission Alsos qu'il était sur le point de prendre la ville. Le laboratoire de recherche nucléaire fut découvert sur le site de l'hôpital de Strasbourg et les scientifiques qui y travaillaient tentèrent de s'échapper en se faisant passer pour des médecins. Weizsäcker parvint ainsi à s'enfuir mais Fleischmann fut arrêté. Selon des documents découverts, des recherches étaient menées à Stadtilm, Haigerloch, Hechingen et Gäufelden. Les informations obtenues indiquaient néanmoins que les Allemands n'étaient pas parvenus à développer un procédé d'enrichissement de l'uranium. Cela permit pour la première fois à la mission Alsos d'affirmer catégoriquement que les Allemands n'avaient pas d'armes nucléaires et ne seraient pas capables d'en fabriquer avant plusieurs années. L'incapacité des services de renseignement à prévoir l'attaque allemande dans les Ardennes en posa néanmoins des questions sur les affirmations de l'unité et elle dut confirmer que l'explosion particulièrement puissante d'une fusée V2 près d'Anvers n'était pas liée à une ogive nucléaire. Les rumeurs sur une bombe atomique allemande persistèrent jusqu'à la fin du mois de .