Au cours des , les échanges de chevaux entre l'Espagne et le Portugal sont réguliers, et des chevaux des élevages andalous sont utilisés pour améliorer la cavalerie portugaise. La victoire du Portugal contre l'Espagne lors de la Guerre de Restauration (1640-1668) est en partie axée sur des troupes montées sur des chevaux de guerre de sang espagnol. Avec le règne de Philip III de Portugal (Philippe IV d'Espagne), l'élevage de chevaux portugais atteint son point le plus bas. L'espagnol fait promulguer des lois pour interrompre la production de chevaux de cavalerie dans le pays. Quelques haras poursuivent leur activité en secret avec des chevaux de contrebande ou volés en Espagne. Ces fermes secrètes, cependant, ont fourni la base du Lusitanien moderne. En 1662, quand Charles II d'Angleterre épouse Catherine de Bragance du Portugal, la dot royale inclus les garnisons de Tanger et de Mumbai appartenant au Portugal. Ces garnisons possèdent une importante cavalerie portugaise, montée sur des chevaux ibériques.