Упадок испанских галерных флотилий начался во время войны с Англией, за тридцать лет которой они многократно терпели поражение. Так, 19 апреля 1587 года Фрэнсис Дрейк с четырьмя галеонами наголову разгромил флотилию из десяти испанских галер у Кадиса. Серьёзные поражения ждали испанские галеры и на Средиземном море, несмотря на то, что на их службе находились такие признанные мастера галерной тактики, как генуэзец Андреа Дориа, триумфант Лепанто. В результате вооружённые артиллерией парусники окончательно заняли место в ядре испанского флота, а галеры хотя и применялись, но на вторых ролях, в основном — для десантных операций и перевозки войск.