Operacja była porażką Brytyjczyków, gdyż na skutek przeciwdziałania włoskiej floty i lotnictwa Osi, z 6 statków konwoju na Maltę doszły jedynie dwa, a pozostałe zatopiono. Zatonęły też dwa niszczyciele, w tym jeden polski, a szereg okrętów odniosło uszkodzenia. Jedynie dwa statki i stawiacz min "Welshman" dostarczyły na Maltę ładunek – ok. 25 tysięcy ton zaopatrzenia, który jednak pomógł przetrwać wyspie przez najbliższe miesiące. Wobec porażki operacji "Harpoon" i prowadzonej równolegle operacji "Vigorous", z której żaden statek nie dotarł na Maltę, powstała konieczność przeprowadzenia w sierpniu kolejnej, silniejszej operacji zaopatrzeniowej, "Pedestal".