En 1523, la Reforma protestante penetró en la región y, en el curso de la Guerra de Esmalcalda (1546-47), Joachimsthal fue ocupada por el ejército de Sajonia. Sin embargo, con el avance de la Contrarreforma en 1621 y con la subsiguiente recatolicización de la zona, la mayoría de los ciudadanos luteranos y de los mineros de las montañas huyeron hacia el vecino ducado de Sajonia.