Из-за недостатка артиллерийских офицеров, Багговут в январе 1831 года был назначен командиром дивизиона гренадерской батарейной № 4 роты литовской артиллерийской бригады, с которой участвовал в кампании против польских мятежников. Участвуя в сражениях этой войны, Багговут отличился в кровопролитной битве 7 февраля у корчмы Вавр, вызвавшей отступление польских войск к Варшаве, и в сражении под Гроховым, 13 февраля, выполняя поручение — поддержать выстрелами своих орудий полки, атаковавшие Ольховую рощу. В последнем бою Багговут, контуженный ядром в локоть левой руки и раненый картечью в левую ногу, сделал сам себе делать перевязку, но как только окончил её, был ранен пулей в голову. Главнокомандующий, граф Дибич, и начальник штаба армии, граф Толь, организовали его лечение. За отличие под Гроховом Багговут, по особому представлению графа Дибича, был произведён в штабс-капитаны с переводом в лейб-гвардии 2-ю артиллерийскую бригаду и получил орден св. Анны 2 степени.