第一次スーダン内戦後、1976年に赤道州は東西に分けられ、第二次スーダン内戦の一因ともなった。1991年にかつての赤道州が復活し2人の知事が治めていたが、1994年にスーダンの行政区が26のウィラーヤに再編され、東西赤道州と白ナイル上流部のアラブ語名に因むバハル・エル＝ジャバル州となった。バハル・エル＝ジャバル州は南部スーダン自治政府（現南スーダン政府）によって2005年に中赤道州に改名された。