ב-11 באוקטובר 1941 הוחלט להקים את הארמייה מחדש. היא השתתפה בקרבות מגננה של הקרב על מוסקבה. בתחילת 1942 היא השתתפה במתקפת נגד הסובייטית. במהלך שנת 1943 הארמייה החמישית השתתפה קרבות במרחב רז'ב וסמולנסק. בהמשך היא השתתפה במבצע בגרטיון ומבצע פרוסיה המזרחית.