Aldridge wurde im NBA-Draft 2006 an zweiter Stelle von den Chicago Bulls ausgewählt und kurz darauf im Austausch für Tyrus Thomas zu den Portland Trail Blazers transferiert. In seiner Debütsaison, die ihm die Wahl ins NBA All-Rookie First Team einbrachte, erhielt Aldridge vor allem nach der Verletzung von Center Joel Przybilla Spielzeit. 2007/08 konnte er sich, nachdem mit Greg Oden, Portlands Hoffnungsträger auf der Center-Position, bereits vor Beginn der Saison ausgefallen war, als Stammspieler und Leistungsträger etablieren.