2013 errang Casper Pedersen bei den Bahnweltmeisterschafte der Junioren in Glasgow die Bronzemedaille im Omnium. Im Jahr darauf wurde er bei den folgenden Junioren-Weltmeisterschaften im südkoreanischen Gwangmyeong, einem Vorort von Seoul, Weltmeister im Omnium. Ebenfalls 2014 belegte er beim Pavé de Roubaix, der Junioren-Austragung von Paris–Roubaix, Rang zwei.