Las únicas condiciones para la creación del estado llevó al gobierno federal a veces a considerar a Virginia Occidental diferente de los otros estados fronterizos en la post-guerra y durante la reconstrucción. Los términos de la capitulación concedida al ejército confederado en Appomattox se aplicaban solo a los soldados de los 11 estados de la Confederación y a Virginia Occidental. Los soldados confederados que regresaban de los otros estados fronterizos necesitaban obtener un permiso especial del Departamento de Guerra. Del mismo modo, la ]]Comisión de Reclamaciones Meridional]] fue diseñada originalmente para aplicarse solamente a los 11 estados de la Confederación y Virginia Occidental, aunque las reclamaciones de los otros estados a veces fueron satisfechas.