Défenseur du dialogue interreligieux, Marek Halter est, en 2017, l'un des organisateurs de la Marche des musulmans contre le terrorisme. Celle-ci, composée d'une trentaine d'imams du monde entier, fait escale dans plusieurs villes d'Europe frappées par le terrorisme djihadiste (Berlin, Bruxelles, Paris, Toulouse, Nice...) pour y apporter un message de tolérance. Le , ils se rendent à l'église de Saint-Étienne-du-Rouvray (Seine-Maritime) dans laquelle fut assassiné le Père Jacques Hamel le .