В начале 1990-х годов основал независимую телекомпанию (НТК) «600». Участвовал в ряде локальных вооружённых конфликтов. Снял два фильма о Первой чеченской войне: «Ад» (документальный, 1995) и «Чистилище» (художественный, 1997). Демонстрация по Первому каналу телефильма «Ад» о штурме российскими войсками Грозного вызвала негативную реакцию представителей либеральной общественности, обвинивших создателя картины в предвзятости к чеченцам. В дальнейшем оценивал этот конфликт как «ненужную войну», в которой власть использовала патриотизм «самым бесстыжим и преступным образом». В 1995—1999 годах был ведущим телепередач «Дикое поле» и «Дни». Также в 2000 году на ОРТ готовилась выйти в эфир аналитическая программа «Невзоров», которая не вышла в эфир из-за назначения на должность председателя ВГТРК Олега Добродеева и переориентирования политических и финансовых ресурсов на РТР.