В 1942 году была обвинена в связях с главарём повстанческой организации Майрбеком Шериповым и арестована, после чего доставлена в Москву. Однако Марьям удалось доказать свою невиновность и через семь месяцев она была освобождена. Спустя девять месяцев был санкционировал её новый арест. Следственное дело снова развалилось и Марьям удалось выйти на свободу. К этому времени все чеченцы уже были высланы в Казахстан.