En 1809, al estallar la guerra en Austria, Dahlmann, junto con el poeta Heinrich von Kleist, a quien había conocido en Dresde, fue a Bohemia, y luego estuvo con el ejército imperial, hasta la Batalla de Aspern, con el vago objeto de tratar de convertir la guerra austriaca en alemana. Esta esperanza fue destrozada por la derrota de Wagram.