С наступлением нового века Нил Янг, несмотря на довольно почтенный возраст, не сбавил темпов выпуска нового материала. Вышел новый сольный альбом "Silver &amp; Gold", посвящённый жертвам террористических актов 11 сентября, в частности рейсу 93 United Airlines. После — мягкий и светлый "Are You Passionate?", посвящённый любимой жене Нила Пеги Янг. В 2003 году увидел свет новый плод сотрудничества с Crazy Horse — концептуальный "Greendale", рассказывающий об убийстве полицейского в небольшом городе в Калифорнии и его влиянии на местных жителей. Этот альбом музыкант сопроводил рок-оперой с таким же названием. В первую половину 2000-х Янг также давал много концертов в Европе, Америке, Японии и Австралии, на которых исполнял новый материал как сольно, так и совместно с Crazy Horse. Его растущее экологическое беспокойство привело к тому, что на этих гастролях для питания автомобилей было использовано биотопливо.