Назначенный в чине подполковника 26 мая 1809 года командиром Невского пехотного полка, Шеле 30 августа 1811 года был произведён в полковники и, продолжая командовать Невским полком, участвовал во время Отечественной войны 1812 года во многих сражениях, в том числе в делах 19 октября, 1 и 2 ноября при боях под Чашниками и под Смоляны, за что был награждён орденом святой Анны II степени.