Para noviembre de 1811 llegaría a ser alcalde primero y corregidor de San Salvador. En la mañana del 5 de noviembre, debido a la inquietud que había en la ciudad por el encarcelamiento del presbítero Manuel Aguilar, del llamado para dirigirse a Guatemala del sacerdotes Nicolás Aguilar y las sospechas de un intento de asesinato contra el cura y vicario de la ciudad José Matías Delgado; ordenaría que todos los europeos (incluido el intendente Antonio Gutiérrez y Ulloa) fueron arrestados, desarmados y guardasen prisión en la cárcel del cabildo, para tal efecto nombraría a Miguel Delgado y León como juez de policía; iniciando de esa forma el primer movimiento independentista de San Salvador. Más adelante, debido a sugerencia hecha por el abogado Juan Miguel de Bustamante en la casa del presbítero José Matías Delgado, ordenaría que los europeos fuesen recluidos en los conventos en lugar de la cárcel.