Jakub Parzeński swoją karierę koszykarską rozpoczynał od występów w rezerwach Śląska Wrocław. W debiutanckim sezonie (2007/2008) wystąpił w barwach tej drużyny w 9 meczach II ligi, zdobywając w nich średnio po 4 punkty. Po wycofaniu się Śląska z rozgrywek Polskiej Ligi Koszykówki zaczął występować w pierwszej drużynie tego klubu, która zajęła miejsce dotychczasowych rezerw w II lidze. W sezonie 2008/2009 zagrał w 17 meczach, zdobywając średnio po 7 punktów, a w kolejnym sezonie (2009/2010) wystąpił w 19 spotkaniach, zdobywając w nich średnio po 13,5 punktów. Przed sezonem 2010/2011, w lipcu 2010 roku, podpisał kontrakt z włoskim klubem Virtus Bolonia. W zespole tym wystąpił w sumie w 5 meczach ligowych, zdobywając w nich średnio po 1,2 punktu. We wrześniu 2011 roku został wypożyczony z Virtusu Bolonia na sezon 2011/2012 do klubu PBG Basket Poznań. W klubie tym wystąpił w 38 meczach, zdobywając w nich średnio po 6,2 punktów i 3,4 zbiórki. W maju 2012 roku zgłosił się do udziału w drafcie do ligi NBA. Po zakończeniu rozgrywek ligowych w sezonie 2011/2012, w czerwcu 2012 roku, powrócił do Virtusu Bolonia. W sierpniu 2013 roku powrócił do Polski, gdzie obecnie reprezentował barwy Śląska Wrocław.