באווירה הפכפכה זו, נכשלו מאמציה המתקדמים של המדינה להקים ממשלה יציבה. במרץ 1919 הוקמה ממשלה קומוניסטים, שהשתלטה מתוך קואליציה סוציאל-דמוקרטית-קומוניסטית. הוקמה הרפובליקה הסובייטית ההונגרית. למפלגת הקומוניסטים של הונגריה בראשות בלה קון, הייתה ההשפעה הרבה ביותר ברפובליקה, אם כי לכאורה נשלטה הממשלה על ידי הקואליציה הסוציאל-דמוקרטית-קומוניסטית. ממשלתו של קון נמשכה פחות מארבעה חודשים, ובסופו של דבר הסתיימה בפלישה צבא רומני. במהלך תקופה זו של הרפובליקה, מתח פוליטי מוגבר ודיכוי הובילו למעצרים והוצאות להורג במה שנקרא הטרור אדום. הדבר הוביל לירידה בתמיכה העם בממשלה. הונגריה ניסתה לשמור על סלובקיה וטרנסילבניה, אך כוחות רומנים פלשו להונגריה כאמור והפלישה התפתחה למלחמה ההונגרית-הרומנית. בסופו של דבר כוחות אלה הגיעו לבודפשט באוגוסט 1919. עם כיבוש זה, רוב הקומוניסטים ההונגרים, כולל קון, יצאו לגלות.