Între 1418 și 1562, Estonia a fost parte a Confederației Livoniene. După Războiul Livonian, nordul Estoniei (partea nordică a Confederației Livoniene, care fusese parte a regatului danez între 1219 și 1346) devine parte a Regatului Suediei, partea sudică intră în componența Poloniei, iar insula Saaramaa revine danezilor.