Als überregionaler Handelsplatz hatte der Ort Apen ab 1738 ausgedient, da man seit dieser Zeit eine vor dem Wasser sichere Wege- und Postverbindung von Oldenburg über Westerstede – Moorburg installierte. Über das Lengenermoor nach Remels und Ostfriesland baute man einen neuen Postweg und so verlor Apen und seine Wehranlage an Bedeutung. 1764 wurden die Reste der Anlagen verkauft und geschleift. Der dänische König ließ nach Drängen aus den Vogteien Apen und Westerstede die Aufgabe der Wehranlage auch formell zu. Die Baustoffe und Ländereien wurden verkauft und es blieb lediglich ein Wassergraben mit einer Anhöhe übrig, die als Viehweide genutzt wurde. In den späteren Jahren kam Apen dann zu Westerstede und die Neuzeit mit der Neuordnung nach den Befreiungskriegen von Napoleon (1815) besiegelte endgültig die Aufgaben des übergeordneten Verwaltungssitzes Apen. Lediglich die Vogtei in den Grenzen der jetzigen politischen Gemeinde Apen blieb bestehen und wurde mit anderen Ammerländer Kirchspielen dem Amte Neuenburg (später Westerstede) und heute dem Landkreis Ammerland zugeordnet. Der Bau der Eisenbahnlinie Oldenburg-Leer 1869 über einen Teil des Geländes hatte dessen Zerstörung zufolge.