Во время казацкого восстания 1648 года в Межириче останавливался Богдан Хмельницкий. Казаки почти дотла разрушила город: по описанию 1708 года здесь зафиксировано разрушение земляных валов, а от панской резиденции осталось только два камина. Но монастырь сохранился.