Agli ordini del comandante Ceva di Noceto, la nave partecipò poi alla prima guerra d’indipendenza: nel maggio del 1848 salpò da Genova insieme alla pirocorvetta a ruote "Tripoli" ed alle corvette a vela "Aquila" ed "Aurora" ed il 17 maggio giunse ad Ancona, insieme ad "Aquila" e "Tripoli". Dopo l'arrivo ad Ancona la pirocorvetta, dovendosi rifornire di carbone, non venne immediatamente fatta proseguire alla volta di Venezia, e la scarsezza di navi a vapore fu causa del fallimento dell'inseguimento tentato, al largo di Sacca di Piave, il 22 maggio 1848, da parte della squadra sardo-napoletana nei confronti di alcune unità austro-ungariche, in quanto le navi italiane, più numerose e potenti, persero tempo per far rimorchiare le unità a vela sarde dalle pirofregate borboniche. Una volta raggiunta la squadra navale già presente nelle acque dell'Alto Adriatico, la "Malfatano" partecipò alle operazioni di blocco al porto di Trieste, a favore di Venezia insorta, ed incrociò tra le foci del Piave e del Tagliamento alla ricerca di navi austro-ungariche.