1813 gab Nathan die Werkstatt auf, meldete sich als Freiwilliger für das "4. Churmärkische Landwehr-Infanterie-Regiment" und nahm an den Kämpfen gegen die napoleonischen Truppen teil. Noch während der Militärzeit wurde er zur Inspektion thüringischer Gewehrfabriken und Büchsenmacherbetriebe abkommandiert. Wegen der damit verbundenen Verdienste wurde er nach seinem Ausscheiden aus dem Militärdienst 1814 in den Staatsdienst übernommen und in der königlichen Gewehrfabrik in Neisse/Schlesien eingesetzt. Nachdem die Fabrik 1821 privatisiert worden war, konnte er nicht weiter beschäftigt werden, erhielt jedoch bis zur Wiederanstellung 1829 ein „Inactivitätsgehalt“.