Im Zweiten Weltkrieg drangen die japanischen Truppen einige Stunden vor dem Überfall auf Pearl Harbour in Malaysia ein und besetzten es. Von 1943 an unterstützten die Briten die Widerstandsgruppe der Malayan Peoples’ Anti-Japanese Army (MPAJA), die gegen die Japaner kämpfte. 1945 eroberten alliierte Truppen Teile von Kalimantan von der japanischen Armee zurück, während Malaya bis Kriegsende unter japanischer Herrschaft blieb.