Liverpool begon het seizoen 2019/20 met de Community Shield tegen Manchester City. In de strafschoppenreeks hield Alisson geen penalty tegen en Manchester City ging er met de prijs vandoor. In de eerste Premier League-wedstrijd van het seizoen, tegen Norwich City, raakte Alisson geblesseerd, waardoor hij twee maanden niet mee kon doen. Daardoor miste hij de UEFA Super Cup, die Liverpool na strafschoppen won van Chelsea. Op 30 november 2019 kreeg Alisson een rode kaart tegen Brighton &amp; Hove Albion nadat hij de bal met zijn handen aanraakte buiten het 16 meter-gebied. Op 21 december 2019 won Liverpool voor het eerst in haar historie het WK voor clubs. De finale werd na verlenging gewonnen van Flamengo. Alisson hield de nul. Alisson eindigde op de zevende plek voor de Ballon d'Or van 2019 en won op dezelfde avond de Yashin Trophy voor beste doelman van de wereld.