La nueva organización exigió nuevas levas de llamamiento de reservistas para cubrir las pérdidas ocurridas durante la retirada de Aragón, la llamada «Quinta del Biberón». Como estaba previsto, el mando de la nueva agrupación recayó en Modesto, que formó su nuevo cuartel general con veteranos del V Cuerpo de Ejército. Su jefe de Estado Mayor seguía siendo el mayor de ingenieros José Sánchez Rodríguez, mientras que el cargo de Comisario lo ostentaba Luis Delage García. El nuevo XV Cuerpo de Ejército recibió las divisiones 35.ª, 3.ª y 42.ª (antes denominada División «C»), mientras que los cuerpos V y XII también recibieron fuertes refuerzos en hombres y material —la frontera francesa había vuelto a abrirse—. No obstante, XVIII quedó encuadrado dentro del Ejército del Este. La Agrupación autónoma del Ebro participó en una ofensiva sobre Balaguer (aunque fuera el Ejército del Este quien llevase el peso de las operaciones) que acabó en fracaso. No obstante, dicha operación constituía una prueba de fuego de las fuerzas republicanas de Cataluña que se habían reorganizado en una unidad más grande, el Grupo de Ejércitos de la Región Oriental (GERO). Las fuerzas de la zona fueron reorganizadas y, ya de forma oficial, el 29 de mayo fue creado el Ejército del Ebro heredando las unidades de la antigua Agrupación del Ebro.