A partir de mayo de 2003 pasó al Centro de Alto Rendimiento de Madrid para ser miembro del equipo nacional sénior, donde fue entrenada por Jesús "Fillo" Carballo, Lucía Guisado, Almudena San José y Eva Rueda, teniendo como coreógrafa a Fuensanta Ros. En el encuentro Gran Bretaña - España fue oro por equipos, mismo puesto que logró la selección en el encuentro España - Bélgica en Palma de Mallorca, donde Gener fue además 6ª en la general. En el Campeonato de España de Autonomías fue oro por equipos, mientras que en la Copa de España en Málaga logró el 8º puesto tanto en la general, como en salto y en suelo. En el España - Italia en Ponferrada fue oro por equipos, además de lograr el 5º puesto en la general. En julio disputó el Campeonato de España Individual en Alicante, logrando el 4º puesto en la general tras Elena Gómez (oro), Patricia Moreno (plata) y Lenika de Simone (bronce). Además, logró el 6º puesto en salto, el oro en barras asimétricas y el bronce en suelo. En el Campeonato de España de Clubes fue plata por equipos. En el encuentro Alemania - España - Bulgaria - Francia celebrado en Dresde a finales de julio, fue plata por equipos y obtuvo el 15º puesto en la general individual. En su primer Campeonato del Mundo, el Campeonato Mundial de Anaheim, logró el 5º puesto por equipos (lo que clasificó al combinado español para los JJ. OO. de Atenas 2004).