Погром у Каунасу је био масакр над Јеврејима који су живели у Каунасу у Литванији, који се догодио од 25. до 29. јуна 1941 − у првим данима операције Барбароса и нацистичке окупације Литваније. Најозлоглашенији догађај ње одиграо у гаражи Лијетукис, где је неколико десетина јеврејских мушкараца јавно мучено и убијено 27. јуна. Након јуна, систематска убијања су вршена у разним тврђавама Каунаске тврђаве, посебно у Седмој и Деветој тврђави.