I slutten av november 2020 ble han smittet av COVID-19 sammen med Philipp Aschenwald og hovedtrener Andreas Widhölzl i etterkant av rennene i Wisła, og hele laget ble satt i karantene da de ankom Kuusamo. Som følge av dette sendte det østerrikske skiforbundet seks utøvere fra deres B-landslag, hvor bl.a. Manuel Fettner stilte. Mot alle odds rakk han å bli frisk før VM i skiflyging 2020.