Распад СССР и возникший между двумя закавказскими республиками Азербайджаном и Арменией острый территориальный конфликт вокруг Нагорного Карабаха вызвали очередные массовые этнические миграции населения. По данным Госкомстата Азербайджана к началу февраля 1990 года из Армении в Азербайджан бежало 3,5 тыс. русских, подавляющая часть которых позже перебралась в Россию. Экономический кризис, события Чёрного января в Баку, внутриполитическая нестабильность, ограничение сферы применения русского языка, возрастание психологического дискомфорта, вывод с территории Азербайджана советских войск (лишь по некоторым оценкам их общая численность, вместе членами семей, достигала 70—80 тысяч человек) и т.д., всё это обусловило значительный отток русского населения из республики и привело к тому, что в первые годы независимости Азербайджана русские в значительной степени оказались отчуждены от политической жизни страны. Самый большой отток русских из Азербайджана в Россию был отмечен после событий Чёрного января 1990 года, а также в 1992 году, после чего он заметно сократился.