Nykänen jäi tiedusteluosaston lakkauttamisen jälkeen asumaan Viroon ja otti Viron kansalaisuuden. Vuonna 1920 Puolan–Neuvosto-Venäjän sodan aikana hän johti Puolassa 80-henkistä tiedustelu- ja tuhotyöosastoa. Hän asui vuosina 1920–1926 Tallinnassa mutta muutti sitten Latviaan Riikaan. 1930-luvulla Nykänen palasi takaisin Tallinnaan ja meni naimisiin virolaisen naisen kanssa.