Най-голямото предизвикателство за проекта е разположението на протока в една от най-земетръсните зони в света. Суматра често е удряна от опустошителни трусове; повече от 230 000 души загиват при земетресението в Индийския океан от 26 декември 2006 г. В региона са разположени голям брой активни вулкани, включително и Кракатау, който е едва на 40 km от проектирания мост и е известен с опустошителното си изригване през 1883 г., когато загиват 10-ки хиляди хора.