В первый день битвы при Геттисберге, бригада (без 5-го и 3-го алабамских) неудачно атаковала позиции федеральной бригады Генри Бакстера. В начале 1864 года его полк был отправлен обратно в Алабаму, чтобы пополнить свои ряды, а О’Нил был срочно вызван в Долтон, Джорджия, где принял командование бригадой армии Теннесси и руководил ею в битве за Атланту. После того, как генерал-лейтенант Джон Белл Худ возглавил армию Теннесси, О’Нил был освобождён от командования. 6 июня 1863 года О’Нил был произведён в бригадные генералы, но это повышение было придержано генералом Робертом Ли и отменено президентом КША Джефферсоном Дэвисом с формулировкой, что «он был произведён в бригадные генералы перед окончанием войны».