O triunfo da Banóvina da Croácia foi curto, uma vez que a Banóvina entrou em colapso juntamente com a Iugoslávia após a Invasão da Iugoslávia pelo Eixo, ocorrida em abril de 1941. Visto pela Alemanha como o líder ideal para o novo fantoche do Eixo - o Estado Independente da Croácia - foi oferecida a Maček a oportunidade de tornar-se primeiro-ministro do novo Estado, oferta, aliás, recusada por Maček duas vezes, sendo ele um dos poucos políticos croatas (e europeus) a crer que as forças do Eixo perderiam a guerra. Seu objetivo principal era preservar o povo croata da guerra e do sofrimento desnecessário. Ele pediu aos apoiadores do HSS a colaboração e a cooperação com o regime de Ante Pavelić, tendo, ao mesmo tempo, delegado a Juraj Krnjević a responsabilidade de representar o povo croata no governo iugoslavo no exílio.