Quan l'exèrcit anglès va abandonar al rei, aquest va fugir a França, acompanyat de Patrick. En 1689 tots dos van tornar a Irlanda per iniciar la resistència davant Guillem d'Orange. Durant la Guerra Guillemita d'Irlanda, Sarsfield es va encarregar de mantenir Connacht en mans jacobites. El rei, que el va descriure com un tipus valent, però sense cap, aviat el va ascendir a General de Brigada i, més tard, encara que amb reserves, a General Major.