Pe 31 august 2001 Dudek a semnat cu Liverpool F.C., care l-a ales ca înlocuitor al portarului olandez Sander Westerveld. După stressul suferit la Campionatul Mondial de Fotbal 2002, Dudek nu s-a mai regăsit, și, după evoluții slabe și gafe precum în meciul cu Manchester United (de pe 1 decembrie 2002), a fost ținut pe banca de rezerve, până ce o accidentare a lui Chris Kirkland i-a permis să revină între buturi. Achiziționarea portarului spaniol "Pepe" Reina în iulie 2005, însă, a însemnat scoaterea definitivă a lui Dudek din planurile antrenorului.