2001 год компания встретила с огромным долгом, а произошедшие 11 сентября теракты, которые привели к резкому спаду воздушных перевозок, стали окончательным ударом. 3 декабря того же года TransBrasil столкнулась с тем, что у неё закончилось топливо для своих самолётов, а средств для его приобретения уже не было. В связи с этим компания в тот день прекратила свою деятельность и была закрыта.