Lee ist seit dem Jahr 2014 Mitglied der Nationalmannschaft und vertrat ihr Land bei der Fußball-Weltmeisterschaft der Frauen 2019, wo sie im Eröffnungsspiel gegen Frankreich für 69 Minuten zum Einsatz kam. Darüber hinaus war sie Bestandteil der südkoreanischen Kader für die Fußball-Asienmeisterschaften der Frauen 2014 und 2018.