Во время Второй англо-бурской войны (1899—1902) дивизия началась под командованием генерала Уильяма Гатакре ("William Forbes Gatacre"). В 1902 году армия была переформирована, и 3-я пехотная дивизия стала постоянно действующей в Бордоне в составе 1-го армейского корпуса, в составе которой находились 5-я и 6-я пехотные бригады.