Sin embargo, las obras y políticas proyectadas para su administración se vieron interrumpidas por el Terremoto de Guatemala de 1976. Ponciano León tuvo que enfrentar la emergencia provocada por el desastre, así como la posterior reconstrucción de la ciudad. Para ello, trabajó en colaboración con el gobierno central, encabezado por el general Kjell Eugenio Laugerud García, a pesar de que eran rivales políticos. Aun cuando la red de distribución de agua sufrió graves daños, la Municipalidad pudo restablecer el servicio en 48 horas, y gracias al Plan de los Cien Días, se logró el descombramiento casi total de la ciudad antes de que comenzara la temporada de lluvias, lo que previno más desastres.