Nouguier besuchte die École polytechnique und schloss sie 1861 ab. 1862 besuchte er die Bergbau-Hochschule École nationale supérieure des mines de Paris und schloss sie 1865 als Bergbauingenieur ab. Nach seinem Studium arbeitete er bei "Ernest Goüin et Cie." und war in der Konstruktion am Ausstellungspavillon der Weltausstellung 1867 beteiligt sowie an der Straßenbrücke auf der Rue Brémontier in Paris, der Rybinsk-Brücke über die Wolga und der Margaretenbrücke in Budapest. Im Jahr 1867 wechselte er zur "Eiffel et Cie.", der späteren "Compagnie des Establissments Eiffel", dem Ingenieurbüro von Gustave Eiffel.