Význam organizace postupně upadal a stávala se zastřešujícím termínem pro řadu různých uskupení. K faktickému rozpadu došlo na přelomu let 2017 a 2018, kdy se Turecko rozhodlo k invazi do Sýrie a vytvořilo novou skupinu s názvem Svobodná syrská armáda složené z některých uskupení původní Svobodné syrské armády při turecké hranici (které byly Tureckem dlouhodobě podporovány), dalších opozičních skupin, včetně islamistických a teroristických, a pravděpodobně také příslušníků turecké armády v přestrojení.