В Карачи Хаккани изучал традиционное исламское учение, а также получил современное образование в области международных отношений. Его карьера началась в журналистике с работы в качестве корреспондента "The Islamic World Review" (освещал события после иранской революции). В этот период он много писал про мусульман в Китае и Восточной Азии и про исламские политические движения. Позже, как пакистанский корреспондент "Far Eastern Economic Review", он освещал гражданскую войну в Афганистане и приобрёл глубокое понимание целей боевиков исламистских групп джихада.