Després de la captura de la flota francesa durant la Batalla del Nil, l'1 d'agost de 1798, la Royal Navy va iniciar un bloqueig sobre l'illa, assistida per una rebel·lió de la població local. Obligats a replegar-se a Valletta, els francesos van patir malalties amb gran escassetat de provisions, fets que van afectar greument la seva moral. Tot i que van resistir 2 anys, a principis del 1800 es produïren diversos combats entre els francesos, intentant trencar el bloqueig que mantenien els britànics, amb l'esquadra liderada per l'almirall Horatio Nelson, ajudats pels maltesos que es van alçar contra els francesos el 2 de setembre, finalment el bloqueig va acabar amb la rendició a Nelson el 4 setembre de 1800.