Babak gugur Liga Eropa UEFA 2019–2020 dimulai dengan babak 32 besar pada 20 Februari dan berakhir dengan pertandingan final pada 21 Agustus 2020 di RheinEnergieStadion di kota Köln, Jerman, untuk menentukan juara Liga Eropa UEFA 2019–2020. Sebanyak 32 tim bersaing pada babak gugur.