Pendant la révolution américaine, il reprit du service et devint colonel d'un régiment de milice en 1775. Devenu général de brigade, il organisa la milice du New Jersey, et combattit à Trenton et Princeton. En 1777, St. Clair livra sans combat le fort Ticonderoga aux Britanniques supérieurs en nombre, ce qui lui valut un blâme et d'être relégué aux affaires mineures.