הרפובליקה הצ'כית השתתפה לראשונה במשחקים הפאראלימפיים באולימפיאדת הנכים לילהאמר (1994), אולימפיאדת החורף הראשונה שהתקיימה לאחר פירוק צ'כוסלובקיה. מאז, משתתפת צ'כיה במשחקי הקיץ ובמשחקי החורף כבדרך קבע.