28 października 1942 roku został awansowany tymczasowo do stopnia "Squadron Leadera" i mianowany dowódcą 450 dywizjonu, który w trakcie II bitwy pod El Alamein otrzymał nowe zadanie: atakowanie celów naziemnych na terytorium zajętym przez Niemców. 31 października, w trakcie ostrzeliwania konwoju ciężarówek w rejonie Buq Buq Williams przypadkowo przeciął linię strzału swojego bocznego, sierżanta M. C. Harrisona. Jego Kittyhawk został poważnie uszkodzony, co zmusiło go do awaryjnego lądowania na terenie wroga. 1 listopada został schwytany i odesłany do Stalag Luft III w pobliżu Żagania (niem. Sagan).