A l'inici de la contesa, va formar part de l'aparell d'instrucció del Cinquè Regiment. En 1937 va ser nomenat comissari de l'Exèrcit del Centre, a les ordres del general Miaja. Quan a mitjan aquest any, el ministre de Defensa Nacional, Indalecio Prieto, va decretar que els comissaris polítics havien d'incorporar-se al capdavant, Antón va passar a ser ajudant del general Rojo. En finalitzar la guerra es va exiliar a França, i va continuar treballant per a la direcció del PCE a França. Després de l'abandó del país per part dels dirigents més importants del PCE, Antón va quedar com a responsable del partit a França. No obstant això, després de la signatura del Pacte Mólotov-Ribbentrop, els partits comunistes van ser il·legalitzats a França i Antón detingut i enviat al camp d'internament de Vernet d'Arièja. Va poder sortir d'allí gràcies a les gestions de les autoritats soviètiques i enviat a la Unió Soviètica a través de l'Alemanya nazi.