Von März 1972 bis November 1973 trainierte er die portugiesische Nationalmannschaft wo er Nachfolger von José Gomes De Silva wurde, der die Qualifikation für Europameisterschaft 1972 in Belgien verfehlte. Unter José Augusto wurde Portugal bei der auch Mini-Copa genannten Taça Independência zur 150-jährigen Unabhängigkeit Brasiliens 1972 zweiter von 20 Teilnehmern, und unterlag dort erst in der letzten Spielminute des Finales den Gastgebern und amtierenden Weltmeistern mit 0:1.