В течение второго правления Мариано Игнасио Прадо война с Испанией продолжилась. В 1867 году принял новую конституцию, которая впоследствии была отменена при Педро Диасе Кансеко. В результате противостояния с Конгрессом Перу был вынужден подать в отставку 7 января 1868 года.