Дворяни гнобили народ, що викликало в північно-західній Фінляндії (Естерботнії, нині — Пог'янмаа) повстання селян. Обурені утисками і, головним чином, військовим постоєм, особливо обтяжливим під час шведсько-російської війни (що закінчилася Тявзинським миром в 1595 році), естерботнійці взялися за зброю. Існує думка, що вони зверталися зі скаргою до герцога Карла, але отримали від нього пораду розправитися з гнобителями власними силами. Цей епізод з історії фінського селянства відомий під назвою «Дубинна війна» (1596—1597). Флемінг жорстоко придушив повстання, його керівники на чолі з Яакко Ілккою були страчені, сам же Флемінг став могутніше, ніж будь-коли раніше, проте незабаром несподівано помер.