Pada tahun 2013, Prlić dijatuhi vonis penjara 25 tahun oleh Pengadilan Pidana Internasional untuk Bekas Yugoslavia (ICTY) dalam kasus Prlić et al., karena dinilai telah melakukan kejahatan perang dan kejahatan kemanusiaan terhadap populasi Muslim Bosnia selama berlangsungnya Perang Kroasia-Bosnia antara tahun 1992-1995. Atas putusan tersebut, Prlić mengajukan banding. Pada tahun 2017, sidang banding kasus Prlić dilaksanakan di Den Haag, Belanda.