Το 1920, το Καρς εκ νέου τέθηκε υπό τον έλεγχο της Τουρκίας, κατά τη διάρκεια του Τουρκοαρμενικού Πολέμου. Ο καθεδρικός ναός έπαυσε την λειτουργία του ως εκκλησία και μετατράπηκε, για σύντομο χρονικό διάστημα, σε τζαμί, «ωστόσο, ολίγον καιρό αργότερα, η κεμαλιστική κυβέρνηση τον διέθεσε προς πώληση. Ο Δήμος του Καρς προχώρησε στην αγορά του και σχεδίαζε την κατεδάφισή του και την ανέγερση στη θέση του ενός σχολείου, ωστόσο το συγκεκριμένο σχέδιο ουδέποτε υλοποιήθηκε. Κατά τη διάρκεια της δεκαετίας του 1950, η δημοτική αρχή της πόλης το χρησιμοποίησε ως χώρο αποθήκευσης πετρελαίου.»