Do dzieł Clarke'a należą: hymny „Lord is my Strength”, skomponowany, by uczcić angielską wiktorię pod Ramillies (1706) czy wcześniejszy „O tell the World” skomponowany dla uczczenia pokoju w Ryswick (1698), napisał też muzykę pogrzebową dla zmarłego w 1695 Henry’ego Purcella. Najbardziej znanym jednak jego utworem jest krótkie „Trumpet Voluntary” znane również jako „Marsz Króla Danii”. Jego uczniem był Maurice Greene.