1975 yılında doğduğu şehrin takımı Montijo'dan Sporting CP altyapısına transfer olan Futre, 1983 yılında 17 yaşındayken profesyonel futbola adım attı. Burada geçirdiği bir sezonun ardından ücret artış talebi kabul edilmeyince Porto kulübüyle anlaştı. Burada başarılı bir dönem geçiren oyuncu 2 Portekiz Ligi şampiyonluğu ve 1986-87 sezonunda bir Şampiyon Kulüpler Kupası şampiyonluğu yaşadı. 1987 Şampiyon Kulüpler Kupası Finali'nda "Maçın Adamı" seçilen futbolcu sezon sonunda İspanyol kulübü Atlético Madrid'e satıldı ve burada yaşadığı, daha sonradan kronikleşen diz sakatlıkları yüzünden istikrar sağlamakta zorlanmaya başladı. Daha sonra başka bir Portekiz kulübü Benfica ile anlaşarak ülkesine dönen oyuncu burada bir de Taça de Portugal kazandı. Fakat sakatlığı nüksedince başarısı devamlı olamadı ve Avrupa'daki önemli takımlarda kısa dönemlerde oynadı. Son olarak J1 League ekibi Yokohama Flügels'de futbol kariyerine son noktayı koydu.