Основан в 1830 году под названием . В условиях типичной для довоенного юга расовой и половой сегрегации, колледж был предназначен исключительно для обучения белых юношей. В ходе Гражданской Войны между севером и югом большинство из них было призвано в армию для участия в военных событиях. Многие погибли или же поменяли место жительства из-за крайнего разорения юга, а потому после окончания войны в округе практически не осталось белых мальчиков студенческого возраста. Поэтому в ходе так называемой реконструкции юга, правительство передало пять старинных зданий колледжа, возведённых неграми-рабами, а также ряд прилежащих земель чернокожей интеллигенции для образования института для чёрных в 1871 году; в том же году вуз был переименован в Государственный университет Алкорна (), в честь , губернатора штата . Приём белых студентов начался с 1960-х годов, хотя их количество по-прежнему незначительно. За 1998—2009 годы в университете обучалось в общей сложности около 70 студентов из России и стран СНГ. Ныне университет расположен вблизи невключённой территории Лормен, в юго-западной части штата Миссисипи недалеко от исторического пути Натчез Трейс в 5 километрах от реки Миссисипи и границы со штатом Луизиана.