Im Zweiten Markgrafenkrieg (Bundesständischer Krieg) kam es am 9. Juni 1553 zu Plünderungen und einer verheerenden Niederbrennung des Ende Januar durch Albrecht Alcibiades mit Ritterschaft und Streitkräften aufgerüsteten Neustadt, wobei wohl vor allem bürgerliche Gebäude betroffen waren. Beteiligt waren dabei Truppen aus Nürnberg und Windsheim, nach einer "Brandenburger Chronik" auch Braunschweiger und nach der "Würzburger Chronik" auch Truppen des Würzburger Fürstbischofs Melchior von Zobel. Hierbei wurden die meisten Urkunden, Privilegien, Protokolle und Ratsbücher der Stadt vernichtet (Abschriften, die Inhalte der verbrannten Dokumente enthalten, wurden in Bad Windsheim und Ansbach gefunden).