Gunta Stölzl war die Tochter des Lehrers und Schulrektors Franz Seraph Stölzl und der Kreszenz Stürzer. Ihr Vater war mit dem Reformpädagogen Georg Kerschensteiner befreundet. Ihr Bruder Erwin war Jurist. Nach Abschluss der Höheren Töchterschule in München trat Stölzl 1914 in die Königliche Kunstgewerbeschule München ein. 1917 bis 1918 diente sie als Rotkreuzschwester an der Isonzofront im heutigen Slowenien und an der Westfront in Frankreich.