Sob Napoleão I, uma ala norte paralela à Grande Galerie foi iniciada e a coleção cresceu através de campanhas militares bem-sucedidas. Após a Campanha do Egito, entre 1798 e 1801, Napoleão nomeou o primeiro diretor do museu, Dominique Vivant Denon. Em homenagem, o museu recebeu o nome de "Museu Napoleão" em 1803 e foram feitas aquisições de obras espanholas, austríacas, holandesas e italianas, como despojos ou através de tratados, como o Tratado de Tolentino.