В период с 1995 по 1998 год Джексон защищал цвета национальной сборной Шотландии, провёл в её составе 28 матчей, забил четыре мяча. Участник чемпионата мира 1998 года. Также был в составе «тартановой армии» на европейском первенстве 1996, но не сыграл на турнире ни одного матча.