Auf See war er wie folgt eingesetzt: Auf "USS Albany" diente er als Talos-Geschützoffizier; Kampfsystem- und Materialoffizier im Stab des Kommandeurs der "Destroyer Squadron Thirty Six"; "USS Valley Forge" als "Recommissioning Engineer Officer"; "USS Belknap" als "Executive Officer" (XO) und später als Kommandierender Offizier (CO); "USS Port Royal" als Kommandierender Offizier. Während seiner Kommandos über die "USS Belknap" nahm er an den Operationen "Provide Comfort" und "Deny Flight" teil. An Land diente Moeller u. a. als Kommandeur der "Surface Warfare Officers School".