藩当局の容れるところとなり、急ぎ東京（7月に江戸から改称）へ向かう。その頃、米沢藩には内外から箱館戦争への従軍を求められていたが、宮島はこれに反対し、静岡藩（江戸開城交渉により徳川家は江戸から静岡へ減封となっていた）の関口・勝らとも交渉して、これを回避。12月4日に「奥羽有罪在一身」との建白書を新政府弁事局に提出した。その結果、12月7日に米沢藩は18万石から14万石の減封、藩主・斉憲の隠居と嫡子・茂憲の家督相続が認められるという、庄内藩と並ぶ比較的寛大な処置がなされた。版籍奉還後は、米沢藩の藩政改革に尽力した。