Blackton visse con larghezza di mezzi fino al Martedì nero del 1929, che bruciò i suoi averi. Spese i suoi ultimi anni in viaggio, mostrando i suoi vecchi film in conferenze sui giorni del cinema muto. Sua figlia, Violet Virginia Blackton (1910-1965) sposò lo scrittore Cornell Woolrich nel 1930, ma il loro matrimonio fu annullato nel 1933. Blackton era sposato con l'attrice Evangeline Wood quando rimase ucciso in un incidente stradale nel 1941. Cremato, le sue ceneri furono poste nel colombario del cimitero Forest Lawn Memorial Park di Glendale (California).