Скирос стал частью Афинской морской державы. Остров имел важное стратегическое значение для Афин, служил стоянкой для афинского флота по пути в Геллеспонт. Несмотря на поражение Афинской державы в Пелопоннесской войне остров по её итогам и далее по условиям Анталкидова мира остался под прямым управлением Афин. В 322 году до н. э. по результатам Ламийской войны остров был завоеван Македонией. В 196 году до н. э. по результатам второй Македонской войны после полутора столетий македонского господства Скирос был возвращен афинянам, но вскоре, после утраты Афинами независимости, перешёл к римлянам. Римляне добывали на острове мрамор (каменоломни в Пурья, ). В III веке н. э., во времена правления императора Галлиена остров подвергся жестокому разграблению герулов. Во времена Византийской империи остров был местом ссылки.