当1866年中期的普奥战争爆发时，阿米尼乌斯号与阿达尔贝特亲王号作为普鲁士仅有的两艘铁甲舰被动员起来。它们原本驻泊在基尔，但在战争初期，阿米尼乌斯号曾于100小时内、经由卡特加特海峡和斯卡格拉克海峡开赴距离约的汉堡，这对于早期的铁甲舰而言是一个了不起的壮举。因此，在没有来自奥地利的海上威胁的情况下，普鲁士海军得以集中力量对付汉诺威王国。在战争的余下时间里，阿米尼乌斯号于舰长、海军少校的率领下，主要在外围行动，而只要该舰一出现，汉诺威的几个海岸炮台便告投降。6月15日，阿米尼乌斯号与两艘炮舰和负责掩护将军及大约13500名士兵渡过易北河，攻击汉诺威市。至月底，普鲁士军队在克尼格雷茨战略性击败奥地利人，从而结束了战争。