Beauregard was niet gelukkig met zijn opdracht. Hij vond zelf dat hij het bevel over een van de grote Zuidelijke legers verdiende. Desondanks voerde hij zijn taak boven alle verwachtingen goed uit. Hij voorkwam in 1863 de inname van Charleston door Noordelijke land- en amfibische aanvallen. Op 7 april 1863 werd een gepantserde kanonneerboot van schout-bij-nacht Samuel Francis Du Ponts Souht Altantic Blockading Squadron met succes verjaagd bij Fort Sumter door accuraat artillerievuur van Beauregards kustbatterijen. Van juli tot september 1863 probeerden Noordelijke eenheden onder leiding van brigadegeneraal Quincy Adams Gillmore Fort Wagner in te nemen, terwijl Schout-bij-nacht John A. Dahlgren Fort Sumter probeerde te vernietigen. Omdat de aanval op Fort Sumter mislukte, kon inname van Fort Wagner niet ten volle uitgebuit worden om Charleston te bedreigen.