В 1942 Східний фронт все ще залишався основним районом бойових дій для "Ju 88". 2-й корпус розміщувався в Африці, ще дві авіагрупи "KGr 106" і "KGr 506" діяли над Атлантикою, а всі інші або були на східному фронті, або переозброювались в Німеччині. До весни 1942 більшість з останніх повернулась до активної служби. 4-й повітряний флот діяв в Криму, підтримував війська біля Харкова. В Євпаторії розміщувалась група "III/LG 1", яка діяла проти морських цілей на Чорному морі. В Норвегії ескадра "KG 30" завдавала ударів по морських конвоях союзників. З серпня основним районом дій став Сталінград, але до кінця року більшість авіагруп довелось вивести для переформування і підтримки військ на Середземномор'ї, тому в найбільш активних боях під Сталінградом брали участь тільки дві авіагрупи "Ju 88".