Han var søn af den pommerske adelsmand, oberstløjtnant i svensk tjeneste Carl Philip von Wackenitz (17. december 1697 - 3. december 1739) til Boltenhagen og Kisow og Charlotte Louise von Oertzen af huset Tornow (29. juli 1699 - 14. marts 1774). Han var født i Pommern 26. april 1726, kom 14 år gammel ind på Landkadetakademiet i København, blev 1744 fændrik, var så i hessisk krigstjeneste (i Brabant, Skotland og Holland), indtil han 1750 blev kaptajn i dansk tjeneste. 1758 blev han fløjadjudant hos kong Frederik V og major ved Delmenhorstske gevorbne Infanteriregiment, førte 1761-62 en grenaderbataljon i Holsten, forsattes til Prins Frederiks Regiment, men kom 1766 tilbage til Delmenhorstske Regiment, blev 1767 oberstløjtnant og beordret med sin bataljon til Trondhjem, 1772 forflyttet til Søndenfjeldske og 1773 til Holstenske Regiment, men samme år udnævnt til oberst og generalkrigskommissær i Norge samt 3. deputeret i det norske Generalitets- og Kommissariatskollegium. 1774 blev han kammerherre og naturaliseredes som dansk adelsmand 1777 tillige med broderen Philip Leopold von Wackenitz, der var kammerherre og generaltolddirektør i Trondhjem. 1783 blev han generalmajor og under felttoget 1788 1. medlem af Feltkommissariatet («Kommissariatskommissionen»). 1789 fratrådte han som generalkrigskommissær, da han blev 1. deputeret i det norske Generalitets- og Kommissariatskollegium, 1790 Ridder af Dannebrog, 1795 generalløjtnant og 1808 general. Han døde i Christiania 16. december samme år.