Lowe fait quatre présences, deux comme lanceur partant et deux comme releveur, dans les séries éliminatoires de 2004. Avec une victoire à sa fiche à chaque tour éliminatoire, il participe activement à la conquête de la Série mondiale 2004 par les Red Sox. Il est le lanceur partant des Sox dans les quatrième et septième matchs de la célèbre Série de championnat de la Ligue américaine entre Boston et les Yankees de New York. Ces deux parties se soldent par un triomphe des Red Sox, Lowe voyant la décision gagnante lui être attribuée dans l'ultime affrontement.