Македонија је учествовала на 23. Европском првенству 2016. одржаном у Амстердаму, Холандија, од 6. до 19. јулa. Ово је било седмо европско првенство у атлетици на отвореном од кад је Македонија стекла своју независност. Репрезентацију Македоније представљала је једна атлетичарка која су се такмичила у трци 400 м са препонама.