Rincón spillede desuden, mellem 1990 og 2001, hele 84 kampe for det colombianske landshold, hvori han scorede 17 mål. Hans første landskamp for colombianerne var en venskabskamp mod Uruguay 2. februar 1990, mens hans sidste optræden i landsholdstrøjen var en VM-kvalifikationskamp på udebane mod Argentina 3. juni 2001.