У липні 2016 року було оголошено про те, що Вінгада буде новим головним тренером клубу «Норт-Іст Юнайтед» з Суперліги Індії, де працював до 15 травня 2017 року, оскільки йому запропонували нову роботу головного тренера у збірній Малайзії. 15 травня 2017 року Нелу Вінгада був офіційно оголошений новим головним тренером національної збірної Малайзії із важким завданням пожвавити малайзійський футбол. Його перший матч припав на відбір до Кубку Азії 2019 року проти Лівану, який закінчився поразкою 1:2. Загалом всі сім матчів, в яких командою керував португалець, закінчилися поразками, включаючи товариські матчі. В результаті 6 грудня 2017 року Нелу подав у відставку. У короткій заяві, опублікованій на сайті асоціації, 64-річний тренер пояснив, що рішення було прийнято після зустрічі з президентом ФАМ Тунку Ісмаїлом Султаном Ібрагімом.