in seguito alla fine della Guerra civile in Etiopia e la fine della Repubblica Popolare Democratica d'Etiopia, Fikre fu uno dei 46 ex leaders della Repubblica Popolare Democratica d'Etiopia ad essere processati di persona il 19 aprile 1996 con l'accusa di aver ucciso persone, genocidio e crimini contro l'umanità dalla Repubblica Federale Democratica d'Etiopia; 22 altre personalità, inclusi l'esiliato Menghistu, furono processati in assenza dallo stesso tribunale. Il processo si concluse il 26 maggio 2008, e Fikre Selassie fu condannato a morte. Nel dicembre 2010, il governo etiope commutò la sua sentenza di morte insieme ad altri 23 ufficiali del Derg. Il 4 ottobre 2011, Fikre Selassie fu liberato insieme ad altri suoi 16 colleghi, dopo vent'anni di carcere.