In seguito alla battaglia di Melegnano del 1515, dopo cui gli Svizzeri si ritirarono a Chiasso determinando il confine fra il Ducato di Milano e il Canton Ticino lungo il torrente Breggia, Quarcino e la sua chiesa vennero inseriti nei Corpi Santi di Como, nella cui circoscrizione censuaria rimasero sino al primo catasto italiano del 1873.