למרות מתיחויות אלו, שתי המדינות מקיימות שיתופי פעולה כלכליים וביטחוניים- במיוחד בנושאי הגירה והמלחמה בטרור. מרוקו סייעה בחקירת פיגועי 11 במרץ 2004 במדריד.