Zur Zeit des Nationalsozialismus ermöglichte Wilhelm Graf zu Lynar, ein Nachfahre des ansässigen Adelsgeschlechtes, den Beteiligten an der Verschwörung gegen Hitler vom 20. Juli 1944 geheime Treffen im Schloss Seese. Er wurde daraufhin verhaftet und am 29. September 1944 hingerichtet. Die Familie zu Lynar wurde daraufhin enteignet. Nach dem Ende des Zweiten Weltkrieges ging das Schloss Seese in der Sowjetischen Besatzungszone durch die Bodenreform in Volkseigentum über und wurde zunächst für die Unterbringung von Umsiedlerfamilien genutzt. Zwischen 1952 und 1957 befand sich in dem Gebäude eine Fachschule für Landwirtschaft.