Zur Saison 2013 erhielt Button mit Sergio Pérez einen neuen Teamkollegen bei McLaren. Beim zweiten Rennen in Malaysia hatte Button aufgrund einer anderen Strategie, die einen Stopp einsparen sollte, gute Chancen auf eine vordere Platzierung. Bei seinem letzten Boxenstopp wurde aber ein Reifen nicht richtig befestigt, sodass er eine Runde zurückfiel. Er gab das Rennen kurz vor Schluss auf. Ein Rennen später in China sparte er abermals einen Stopp ein. Er kam auf dem fünften Platz ins Ziel. Beim letzten Saisonrennen in Brasilien erzielte er mit einem vierten Platz sein bestes Resultat in der Saison. Er wurde mit 73 Punkten Neunter in der Weltmeisterschaft und setzte sich damit gegen Pérez, der 49 Punkte erzielt hatte, durch. Button blieb 2013 zum ersten Mal seit 2008 ohne Sieg und Podest-Platzierung.