Další zastavení stavby proběhlo po rozpadu SSSR v roce 1991. V 90. letech se stavba opět rozbíhá a zastavuje ještě několikrát a po roce 2000 téměř úplně stojí. Nový termín spuštění byl stanoven na rok 2004-2005 a proto probíhají dokončovací práce, jako je například dokončení střechy reaktorové budovy a některé části turbínové haly. Do roku 2008 bylo dokončeno ještě druhé, menší jezero pro chlazení a dále vodní pumpy pro přečerpávací nádrže. V roce 2009 bylo shledáno, že dostavba reaktoru RBMK by stála více, než postavit nový reaktor VVER. Posledním hřebíčkem do rakve k nedokončení reaktorů byla Fukušimská havárie a ekonomická krize roku 2008.