紀元前67年から紀元前62年にかけて、カルプルニアヌスはポンペイウスの軍のレガトゥス（副司令官）を務めた。海賊討伐に際しては、ヘレスポントスとプロポンティスで艦隊を指揮し、後には第三次ミトリダテス戦争に参加した。紀元前63年にはエルサレム攻囲戦で神殿の丘を攻撃したポンペイウス隷下の部隊の一つを指揮した。