Au fil des décennies, porté par les témoignages les plus divers, et par les écrits prophétiques de Gonçalo Anes Bandarra, le sébastianisme prend des caractéristiques messianiques propres à la métropole portugaise et à la culture du Nord du Brésil ("cultura nordestina"). Il est associé à des miracles. D'un point de vue politique, il est considéré comme l'expression double d'un mal-être de la population et d'un espoir. Le mythe sébastianiste de la restauration de la grandeur du Portugal à travers la venue d'un homme providentiel est utilisé à plusieurs reprises. Il est l'un des conditionnants du rapport du peuple portugais à la politique. Lors de la guerre de Restauration de 1640-1668 menée par le roi Jean IV de Portugal contre la Monarchie Catholique espagnole, il est mis au service de la Maison de Bragance. Le jésuite Antonio Vieira est l'un des principaux artisans de cette construction prophétique nouvelle, à laquelle il consacre l'essentiel de son œuvre dans ses dernières années, même après la fin de la guerre contre l'Espagne, écrivant, entre autres, "Clavis Prophetarum" et l"História do Futuro". Assimilé par la suite à une forme de patriotisme, le sébastianisme est mis à contribution de façon plus ou moins directe pendant les grandes guerres menées par le Portugal et dans plusieurs mouvement de régénération nationale. Il perdure dans l'inconscient collectif jusqu'à la période contemporaine.