В Вооружённых силах Грузии с 1992 года: начальник оперативного управления — первый заместитель начальника штаба Главного управления Национальной гвардии Грузии, с июля 1993 года — начальник штаба — первый заместитель командующего 1-го армейского корпуса Министерства обороны Грузии.Участвовал в боевых действиях в Абхазии и Самачабло (Цхинвальский регион). Под руководством Б. Григолашвили были спланированы и успешно проведены многие боевые операции. Был был смертельно ранен и геройски погиб в боях в абхазской войне. За выдающийся вклад на благо родины и нации, стойкость и самопожертвование, проявленную храбрость и героизм в борьбе за защиту родины и её территориальной целостности, за умелое руководство, осуществление мероприятий по обороне, разработку и проведение военных операций генерал-майор Борис Григолашвили был посмертно награжден Орденом Вахтанга Горгасали I степени (1993).