Una serie di fattori, quali grandi opere finanziate all'inizio del XIX secolo (soprattutto il restauro nel 1809-1810 della chiesa bruciata del Santo Sepolcro), l'interruzione nella ricezione delle entrate dei beni del Patriarcato nei principati danubiani, una gestione finanziaria disordinata, e, cosa più importante, la persecuzione ottomana degli ortodossi dopo l'inizio della rivolta greca nel 1821, portò alla completa rovina del Patriarcato, incapace di sostenere un enorme debito.