V roce 1787 se Mifflin zúčastnil jako delegát United States Constitutional Convention. Byl signatářem Continental Association a podepsal ústavu Spojených států. V letech 1785 až 1788 byl členem Pennsylvania General Assembly (valné shromáždění). Byl také členem Supreme Executive Council of the Commonwealth of Pennsylvania (Nejvyšší výkonné rady Pensylvánského společenství ) a 5. listopadu 1788 byl zvolen předsedou tohoto orgánu a nahradil tak Benjamina Franklina. Dne 11. listopadu 1789 byl v této funkci jednomyslně potvrzen. Předsedal výboru, který sepsal pensylvánskou ústavu z roku 1790. Tento dokument odstranil Výkonnou radu a nahradil jej osobou guvernéra.