Amelunxen stand 1799 zunächst in Kurmainzer und ab 1802 in preußischen Diensten. Er wurde 1805 zum Sekondeleutnant befördert und erlebte als solcher 1806 den Feldzug gegen Frankreich während des Vierten Koalitionskrieges. 1808 trat er als Unterleutnant in königlich westphälische Dienste und nahm 1809 im Fünften Koalitionskrieg am Feldzug gegen Österreich teil. 1810 wurde er zum Rittmeister befördert. Von 1812 bis 1813 diente er im westphälischen Garde-Chasseur-Regiment und kämpfte mit dieser Einheit im Feldzug gegen Russland, unter anderem in der Schlacht bei Borodino, wo er eine Verwundung erlitt, und an der Schlacht an der Beresina.