Il 7 dicembre 2008, nel corso della partita contro il Catania, si è infortunato ma è rimasto comunque in campo per tutti i 90' di gioco: l'esito della risonanza magnetica fatta due giorni dopo ha evidenziato una lesione al legamento crociato anteriore del ginocchio destro. Il 15 dicembre 2008 è stato operato ad Anversa per la ricostruzione del legamento crociato, con tempi di recupero stimati intorno ai sei mesi, periodo che gli avrebbe dovuto far chiudere anticipatamente la stagione 2008-2009 dove, fino a quel momento, era stato determinante per i risultati positivi dei rossoneri; torna invece a disposizione per la "classica" contro la Juventus del 10 maggio 2009, a poco più di cinque mesi dall'infortunio, nella quale è rimasto in panchina, mentre torna a giocare in amichevole due giorni più tardi a Tirana contro la Nazionale albanese. Ha disputato la prima partita ufficiale dopo il ritorno dall'infortunio il 31 maggio 2009, a distanza di cinque mesi e mezzo dall'operazione, nell'ultima giornata di Serie A 2008-2009 contro la Fiorentina, subentrando all'81' a Beckham.