Aus dem Zeitraum von der mittelminoischen Phase MM III B bis in die spätminoische Phase SM I B stammen die meisten Gebäudereste in Roussolakkos. Sie bestehen aus lokalem "Sideropetra" (kristallinem Kalkstein) und Konglomerat sowie Sandstein für Türpfosten und Quadermauerwerk. Zur Pflasterung der Straßen und der Böden in den Häusern wurden purpurner und blaugrüner Schiefer verwendet. Das Gebäude 1 ganz im Norden der Ausgrabungsstätte war in SM I A das erste, dessen vier Außenwände als Quadermauerwerk errichtet wurden. Gegen Ende von SM I A um 1500 v. Chr. bedeckte eine sieben Zentimeter starke vulkanische Ascheschicht des Thera-Ausbruchs die Region und ein oder mehrere mindestens neun Meter hohe Tsunamis überschwemmten die Ebene von Palekastro. Die Gebäude von Roussolakkos wurden dabei fast bis auf die Grundmauern zerstört.