Appelé en équipe de France une première fois en 1983, il ne participe pas à l'Euro 1984 victorieux mais réintègre les Bleus pour la Coupe du monde 1986. Cantonné à un rôle de remplaçant, il dispute la demi-finale contre la RFA en remplaçant en cours de matche Alain Giresse, mais dispute intégralement la « petite finale » victorieuse contre la Belgique. Alors âgé de 24 ans, il est présenté comme le successeur de Michel Platini, mais ne confirmera pas, notamment à cause de pépins physiques. Il compte également une sélection en équipe de France B obtenue en 1988. Lors de la saison 1990/91, Philippe, revenu à son meilleur niveau et alors titulaire indiscutable au poste de meneur de jeu de l'OM, est retenu par le sélectionneur Michel Platini en vue d'un match contre la Tchécoslovaquie le . Malheureusement, une légère blessure l'empêchera d'honorer cette sélection. Michel Platini ne lui redonna pas sa chance. Gérard Houllier, son successeur à la tête des Bleus, l'ignora complètement.