17世紀後半から18世紀にかけてロシアに対しドン・コサックは、ラージンの乱（1670年 - 1671年）、、プガチョフの乱（1773年 - 1775年）などを起こしたが、いずれもロシア軍によって鎮圧された結果、ドン・コサックは完全にロシアの体制に取り込まれた。一方、ザポロージャ・コサックは大北方戦争の際にロシアに反発したり、コサック国家の近代化によって自国存続を強く意識したりしていたので、18世紀末に「分離主義者」としてロシア帝国によって滅亡させられた。