Under sista krigsåret 1790 kommenderade Danckwardt på nytt en avdelning skärgårdsfartyg inom roddflottan. Med denna deltog han i det framgångsrika anfallet på Fredrikshamn 15 maj, där den av honom ledda styrkan bildade vänstra flygel. Då skärgårdsflottan under sin fortsatta offensiv österut anlänt till Pittkäpassi, blev Danckwardt på grund av sin kännedom om vattnen avdelat att vid behov med de mindre roddfartygen tag sig fram närmare kusten till Björkösund, något som dock aldrig behövdes. Under Viborgska gatloppet utsågs han även genom sin kännedom av vattnen att vara honom följaktig som andre flaggadjutant. Troligen var det Danckwardt betydelse som lots som gjorde att han nu inte återfick befälet över sin kanonslupsdivision, och därför inte kom att delta i Slaget vid Svensksund.