"Juanpi", son surnom en Argentine, commence sa carrière en jouant dans les divisions inférieures du championnat d'Argentine avec l'équipe de jeunes d'Argentinos Juniors, un club de football de Buenos Aires. Il gagne sa place dans l'équipe première à partir de 1994, et après avoir été capitaine de l'équipe d'Argentine des moins de 20 ans qui remporte la Coupe du monde des moins de 20 ans 1995 au Qatar, il est acheté par la Juventus de Turin, mais il n'entre pas dans les plans de l'équipe préétablis et revient rapidement en Argentine.