Марк Катон участва в битката при Тапс в Африка. През 46 г. пр.н.е. баща му Катон Млади, разбирайки че по-нанатъшна борба с Цезар в Африка е безсмислена, се самоубива. Юлий Цезар прощава на младия му син и го пуска да си отиде.