Pierwszą dużą imprezą na której miał szansę zagrać były Mistrzostwa Świata U-20 w Piłce Nożnej 2009. Reprezentacja ZEA doszła tam do ćwierćfinału, a Mabkhout w dwóch meczach grał od początku, a w dwóch wchodził na boisko z ławki rezerwowych, nie udało mu się jednak zdobyć bramki na tym turnieju. W 2010 roku zadebiutował w pierwszej reprezentacji swojego kraju w meczu towarzyskim z Czechami. Dwa lata później udało mu się dostać do kadry U-23, która miała reprezentować kraj podczas Igrzysk Olimpijskich w Londynie. Ten turniej nie był już tak udany dla ZEA, które zakończyło turniej już w fazie grupowej oraz dla samego Mabkhouta, który zaliczył zaledwie jeden występ przeciwko Senegalowi kiedy jego reprezentacja była już bez szans na awans. W tym samym roku udało mu się jednak zaliczyć pierwsze trafienie w barwach narodowych w meczu towarzyskim z Estonią, a niewiele ponad miesiąc później „ustrzelił” hat-tricka w wygranym aż 6:2 meczu z Bahrajnem. Rok 2013 okazał się być przełomowym dla reprezentacyjnej kariery Aliego. Selekcjoner Mahdi Ali powołał go na turniej o Puchar Zatoki, który reprezentacja ZEA wygrała, a Mabkhout był jej ważnym ogniwem zdobywając dwie bramki. Rok później podczas turnieju rozgrywanego w Arabii Saudyjskiej, Mabkhout został najlepszym strzelcem turnieju - zdobywając 5 bramek, jednak jego drużynie nie udało się obronić tytułu zdobytego przed rokiem. W 2015 roku znalazł się w kadrze na Puchar Azji. Podczas turnieju kadra ZEA zajęła trzecie miejsce. Nie udało im się awansować do Mistrzostw Świata w Rosji, natomiast zapewnili sobie awans na Puchar Azji. Mabkhout został powołany na ten turniej.