В октябре 1946 года спецлагерь № 3 был закрыт, а все содержавшиеся в нём были переведены в другие лагеря для интернированных. В здании кухни советскими оккупационными властями была организована центральная следственная тюрьма, получившая неофициальное название "«подводная лодка»" (), поскольку камеры её либо совсем не имели окон, либо те были наглухо закрыты жестяными листами, а внутри находились лишь деревянные нары и ведро. Среди заключённых были как подозреваемые нацисты, так и противники нового коммунистического режима в Восточной Германии, в том числе: художник-карикатурист Фриц Берендт () и политик Курт Мюллер (). Кроме того, в тюрьме содержались бывшие власовцы и эмигранты, покинувшие советскую Россию после событий октября 1917 года и гражданской войны. Порою на одного заключённого в камере приходился лишь 1 м площади, рацион же состоял из 300 граммов хлеба, жидкого супа и заменителя кофе. Спать приходилось на голых досках, душ разрешался не чаще одного раза в неделю, а вентиляция и отопление были смонтированы лишь в 1949 году. Сроки предварительного заключения составляли от нескольких недель до 28 месяцев, что зависело, в первую очередь, от того, как быстро удавалось получить признание от заключённых, для чего практиковались угрозы и пытки, наказания многочасовым стоянием, лишением сна, прогулок и еды. Признавших вменяемые им преступления ждал немного улучшенный рацион, шерстяные одеяла, сигареты, а затем военный трибунал.