Em 2003, Jones bateu o recorde australiano nos 200 m medley individual no início do ano, em um evento experimental. Mais tarde no Campeonato Mundial, em Barcelona, Espanha, estabeleceu um recorde mundial nas semifinais dos 100 m peito (1m06s37). No entanto, ela sucumbiu aos nervos na final e ficou em terceiro lugar, prova vencida pela chinesa Luo Xuejuan. Conseguiu uma medalha de prata nos 200 m peito, atrás de Amanda Beard (2m24s33).