そのような流れの1944年（昭和19年）6月19日、マリアナ沖海戦で日本海軍は主力空母大鳳と翔鶴を潜水艦の雷撃で喪失した。7月5日、サイパン島地上戦はアメリカ軍の勝利で終わり、サイパン島に取り残されていた第六艦隊司令部（司令長官：高木武雄中将）、第三水雷戦隊司令部（司令官：中川浩少将）、第二海上護衛隊司令部（司令官：辻村武久少将）の三司令部は日本軍守備隊（中部太平洋方面艦隊・第31軍など）と共に玉砕した。第三水雷戦隊は7月18日付で中部太平洋方面艦隊から除かれて連合艦隊付属となった。