Во второй половине XIX—XX веке префектура Аомори играла роль военно-промышленного центра Японской империи. В городе Хиросаки квартировалась 8 дивизия Императорской Армии Японии, принимавшая участие в Русско-японской войне 1904—1905 гг. и интервенции в Сибирь 1918—1924 гг., а в порту Оминато размещалась база Императорского флота Японии. Из-за своего стратегического значения префектура потерпела сильные бомбардировки авиации США во время Второй мировой войны.