En Afrique, le typhus est signalé au Burundi dès 1933, et des cas sporadiques régulièrement rapportés depuis. Lors de la guerre civile du Burundi, une épidémie éclate en 1997, du fait du déplacement de populations (camps de réfugiés en région de haute altitude). Le nombre de personnes touchées est estimée à 24 000 pour la période janvier-mai, et au total à près de avec 15 % de décès.