Der 2,15 m große und 114 kg schwere Centerspieler ging nach seiner Schulzeit zum Studium in die Vereinigten Staaten. Während seines ersten Studienjahrs war er am "Santa Fe College" in Gainesville (Florida), das zuvor auch sein vergleichbar großer Landsmann Arne Alig besucht hatte. Wie Alig konnte sich Malbeck insbesondere als Shotblocker in der Basketball-Hochschulmannschaft "Saints" auszeichnen, die in der "National Junior College Athletic Association" (NJCAA) spielen. Anschließend bekam er die Möglichkeit, an die Hawaiʻi Pacific University (HPU) zu wechseln, wo er für die "Sea Warriors" in der Hochschulliga NAIA spielte. In dieser gegenüber der NCAA kleineren und weniger bedeutenden Liga konnte sich Malbeck besonders auszeichnen und wurde 1996 sowie 1997 in das All-American-Team der landesweit besten Spieler dieser Liga gewählt. In der Saison 1996/97 war er sogar der Spieler des Jahres der NAIA. Er erzielte für die Hochschulmannschaft 1456 Punkte und lag damit in der ewigen Korbjägerliste der Hawai'i Pacific University auf dem zweiten Platz, als er diese 1997 verließ. Mit 649 Rebounds sicherte er sich den dritten Rang in der Bestenliste der Hochschulmannschaft, rutschte später aber ab, als sein Wert übertroffen wurde. Ende 2011 wurde Malbeck für seine sportlichen Leistungen an der HPU, die ihm 1997 ein Probetraining bei den Phoenix Suns in der am höchsten dotierten Profiliga NBA ermöglichten, in die „Athletics Hall of Fame“ () der Hochschule aufgenommen und seine Rückennummer 51 fortan innerhalb der Basketballmannschaft von einer weiteren Vergabe zurückgezogen. In seiner Zeit an der HPU wurde er auch erstmals in die deutsche Basketballnationalmannschaft berufen und nahm an der Endrunde der Basketball-Europameisterschaft 1997 teil (4 Spiele: 0,2 Punkte/Spiel).