Seit 2005 steht Manju im Kader der indischen Fußballnationalmannschaft seit der Tour der Nationalmannschaft in Pakistan. Er gewann mit seinem Nationalteam den Nehru Cup 2007. Nach einer Verletzung an der Achillessehne im South-Asian-Football-Federation-Cup konnte er nicht am AFC Challenge Cup 2008 teilnehmen, den Indien für sich entschied und sich somit für die Fußball-Asienmeisterschaft 2011 qualifizierte.