フランス革命戦争の初期、「キャプテン」は地中海艦隊に属しており、ナポレオン・ボナパルトが名を上げた1793年のトゥーロン攻囲戦（トゥーロンをフランス王党派が占領し、後に革命軍によって奪還された戦い）に占領部隊の1隻として参加した。1796年6月、ジョン・ジャーヴィス提督の命でホレーショ・ネルソン艦長が「アガメムノン」から転属した。ネルソンは、ナポレオンの北イタリア侵攻に対してリヴォルノ沖に配備された最初の戦隊の指揮を執った。また、9月にはコルシカからのイギリス部隊の撤退を統括した。