Anschließend übernahm Sallandrouze de Lamornaix am 1. April 1893 den Posten als Oberkommandierender des Marineausbildungsdivision mit dem Panzerschiff "Naïade" als Flaggschiff. Er nahm an der Krönung von Kaiser Nikolaus II. von Russland am 26. Mai 1896 teil, bei der es durch eine Massenpanik zu einer Katastrophe bei den Krönungsfeierlichkeiten mit 1389 Toten und weiteren 1300 Verletzten kam. Am 10. Juni 1896 wurde er zum Konteradmiral "(Vice-amiral)" befördert und übernahm am 15. Juni 1896 von Flottillenadmiral Charles Chauvin den Posten als Chef des Generalstabes der Marine "(Chef d’état-major de la Marine)". Diese Funktion bekleidete er bis zu seiner Ablösung durch Konteradmiral Jules de Cuverville am 8. Juli und war zugleich in Personalunion Kabinettschef von Marineminister Armand Besnard. Danach übernahm er am 1. Januar 1899 den Posten als Mitglied des Obersten Marinerates sowie zugleich als Oberkommandierender des Nord-Geschwaders mit der "Formidable" als Flaggschiff. Auf dieser verstarb er am 18. September 1899 vor Brest und wurde anschließend auf dem Pariser Friedhof "Père Lachaise" bestattet.