В мае 1793 года Анрио активно участвует в борьбе против жирондистской части Конвента. Один из составителей обращения секции Санкюлотов к Конвенту. В отсутствие Сантера, который был послан в Вандею на подавление контрреволюционного восстания, назначается временным главнокомандующим национальной гвардии Парижа, что говорит о его известности в секциях и доверии к нему лидеров восстания. Из записок Шометта о событиях 31 мая - 2 июня: — «Революционный Генеральный Совет назначает гражданина Анрио, командующего силами секции Санкюлотов, временным главнокомандующим. Мгновенно создается новый штаб, который приносит революционную присягу. Каждый офицер на своем посту ожидает приказов командующего, и все граждане готовы выступить по первому сигналу». Первой заботой Анрио было установление контроля над ключевыми позициями столицы — Арсенал (), Пале-Рояль и мост Пон-Нёф. Он приказывает закрыть городские заставы и арестовать подозрительных.