Ban đầu là một giáo viên nghiên cứu tôn giáo, Bafaqih bắt đầu sự nghiệp báo chí của mình bằng cách dịch các bài báo tiếng Ả Rập sang tiếng Mã Lai cho nhật báo "Pemandangan". Ông cũng trở thành một nhà văn tự do cho cả "Pemandangan" và tạp chí hàng tuần "Pandji". Sau khi "Pemandangan" bị chính quyền Hà Lan phạt, Bafaqih chuyển đến hãng thông tấn Dōmei của Nhật Bản để làm biên tập viên. Ông vẫn là một biên tập viên vào thời điểm Indonesia tuyên bố độc lập. Vài giờ trước khi sự kiện diễn ra, nhà báo đồng nghiệp Adam Malik đã liên lạc với Bafaqih để đưa ra một văn bản tuyên bố, và Bafaqih đã chuyển nó cho một đồng nghiệp khác để truyền đi khắp quần đảo mà không bị các nhà kiểm duyệt Nhật Bản phát hiện. Sau khi Indonesia độc lập, chi nhánh Dōmei trở thành Antara, và Bafaqih làm việc ở đó với tư cách là tổng biên tập. Ông điều hành văn phòng Jakarta của cơ quan này khi trụ sở chính của nó chuyển đến Yogyakarta vào năm 1946, cùng với Mochtar Lubis. Ít lâu sau Antara bị đóng cửa sau Chiến dịch Kraai năm 1948, trong thời gian đó Bafaqih làm việc tại tờ báo dân tộc chủ nghĩa "Merdeka".