Promu en première division russe en 1992 après la disparition de l'Union soviétique, le Chinnik retombe rapidement en deuxième division mais effectue par la suite plusieurs fois l'ascenseur au cours des années 1990 et 2000, participant même par deux fois à la Coupe Intertoto en 1998 et 2004. Il connaît sa dernière relégation à l'issue de la saison 2008 et évolue depuis au sein de la deuxième division russe.