Esteban Rodríguez entró en la convocatoria de Alfaro para efectuar la Copa Mundial Sub-20 de 2007 en Canadá. El 1 de julio fue suplente en la derrota 1-0 contra Nigeria. El 4 de julio debutó en la competencia como titular, pero su escuadra nuevamente perdió 1-0, esta vez frente a Japón. La última fecha se dio el 7 de julio, la cual culminó en victoria 1-2 sobre Escocia. Rodríguez participó en esta ocasión por 74' minutos. Su país quedó en el tercer lugar del grupo F, pero no le alcanzó para clasificar a la siguiente ronda.