Con la maglia della riunificata partecipò poi, nel corso degli anni 1990, al in Svezia che vide i tedeschi finalisti, al Mondiale di chiusosi per i teutonici ai quarti di finale, e al in Inghilterra culminato con la terza affermazione continentale della Germania, trionfatrice in finale al golden gol sulla ; Kohler, partito titolare nella spedizione oltremanica, si infortunò tuttavia al 14' della partita d'esordio dei tedeschi nel torneo, il 9 giugno ancora contro i cechi, cosa che lo costrinse ad assistere da spettatore al resto della competizione.