La saison 2019-2020 reste la plus belle saison du club en Ligue des champions, le club tombe contre l'OL, le Zénith et le Benfica et joue dans le Groupe G. Le club débute d'abord par une victoire 2-1 face au Benfica le , mais perd ensuite 2-0 à domicile contre Lyon, puis enchaîne deux victoires contre le Zénith Saint-Petersbourg (2-1 à l'aller, 2-0 au retour), et a failli perdre contre le Benfica lors de la journée, menés 2-0 à l'issue du temps réglementaire Emil Forsberg inscrivera deux buts dans les arrêts de jeu et qualifiera Leipzig pour les huitièmes de finales, le club finit ensuite par un nul contre Lyon 2-2, en huitièmes de finales le club parvient à éliminer Tottenham (victoire 1-0 à l'aller; 3-0 au retour) mais son rêve s'interrompt à cause de la pandémie de Covid-19, il reprend finalement le en championnat et finit permettant toutefois de se qualifier pour la prochaine Ligue des champions en phase de groupes, le club reprend finalement sa tournée européenne le face à l'Atlético Madrid (tombeur du tenant du titre Liverpool, 1-0 à l'aller; 3-2 au retour), Leipzig gagne 2-1. Le club s'incline cependant en demi-finales contre le Paris Saint-Germain sur le score de 3 à 0.