L’histoire des religions aux Philippines prend un tournant décisif avec la colonisation espagnole au , car la conversion des peuples au catholicisme est un aspect crucial de la politique coloniale du royaume d’Espagne. En près de trois siècles de présence espagnole, le catholicisme se répand sur la quasi-totalité de l’archipel à l’exception des parties musulmanes au sud. Le clergé joue un rôle prépondérant dans les affaires de l’archipel, administrant de fait les provinces et y maintenant l’ordre colonial jusqu'à la Révolution philippine. Avec le passage des Philippines aux mains des États-Unis, le protestantisme et d’autres églises chrétiennes non catholiques apparaissent, sans toutefois supplanter l’Église catholique.