были введены федеральные войска и началась Первая чеченская война, Исаев в составе своего отряда был направлен туда. Принял активное участие в штурме Грозного, развернувшегося в конце декабря 1994 года — начале января 1995 года, и сопровождавшегося тяжелейшими боями. Вместе со своими товарищами Исаев многократно участвовал в проведении специальных мероприятий в чеченской столице. 1 января 1995 года при возвращении с очередного задания колонна, где находились краснодарские оперативники, попала в засаду сепаратистов. Произошло это на углу улиц Первомайской и Патриса Лумумбы. В разгар боя снаряд гранатомёта попал в бронетранспортёр, за рулём которого находился Исаев. Получивший тяжёлые ранения старший лейтенант сумел вместе со своими товарищами выбраться из боевой машины, но получил при этом ещё несколько ранений.