Sutono conserve deux de ses trois titres aux Jeux de l’Asie du Sud-Est de 1999 sur le et événements, mais perd son titre sur le au profit de la Malaisienne . Elle s’impose comme l’une des meilleures coureuses de fond du continent aux Championnats d’Asie 2000. Prenant l'avantage à Jakarta, elle gagne le et une médaille de bronze sur le . Elle devient alors la première médaillée d'or d'Indonésie aux championnats depuis ses débuts en 1973.