Dışişleri Bakanı olduğu dönemde Hollanda-Türkiye ilişkileri diplomatik olarak tamamen koptu (Şubat 2018). Bu kopmada onun bakan olmadığı dönemde yaşanan 2017 Hollanda-Türkiye diplomatik krizinin etkisi büyük oldu. Zijlstra Zeytin Dalı Harekâtı'nın başlamasından kısa bir süre sonra YPG ile PKK'nın bağlantılı olduğunu ifade etti.