Jusqu'à la fin 1796, il continua à la tête d'une escadre française patrouillant dans la Manche. En décembre de la même année, on lui confia, en remplacement de Vence, une division de la flotte qui fut envoyée à Brest pour tenter d'emmener le général Hoche avec un corps expéditionnaire dans le sud de Irlande. La tempête frappe de plein fouet la flotte français dès qu'elle quitte Brest. Bouvet, qui se retrouve au matin du 17 décembre séparé avec neuf autres bateaux du reste de la flotte, ouvre ses ordres secrets, et découvre qu'il devait se rendre à Mizen Head. Il fait un détour pour éviter les patrouilles britanniques. Le il arrive à à l'entrée de Bantry Bay. Le , il mouille près de Bear Island avec une partie de sa flotte. Le mauvais temps autour de Bantry Bay l'empêchant de faire débarquer ses troupes sur la terre ferme. Le soir du la tempête augmente encore d'intensité à tel point que la frégate "Immortalité" dans laquelle Bouvet avait stocké son drapeau, est emportée au large. Le vent diminua le , mais Bouvet, convaincu qu'aucun des bateaux de son escadre ne pourraient garder le mouillage dans la baie, décide de rentrer à Brest qu'il atteint le .