Insbesondere im Dom sieht man an den Pfeilern der Gewölbe, dass die Planung während des Baues geändert wurde und der Chor dann doch wesentlich höher ausgeführt wurde als zunächst geplant. Bezogen auf die Grundfläche nimmt er fast die Hälfte der Fläche ein. Durch die Zerstörungen aufgrund des Luftangriffs auf Lübeck am 29. März 1942 wurde der Chor erst relativ spät nach dem Krieg wieder eingedeckt. Er ist heute durch eine große Glaswand vom Hauptschiff getrennt und dient der Gemeindearbeit. Bischof Heinrich liegt in der Mitte seines Chors unter einer Bronzegrabplatte, die seine Statue als Vollbild mit einem Modell des von ihm vollendeten Domchors schmückt, begraben. Der Stil der Grabplatte ist von ähnlichen Arbeiten in Flandern beeinflusst. Sie stammt aus der Werkstatt des Lübecker Rotgießers Jan Apengeter, der auch die Bronzetaufe der Lübecker Marienkirche (1337) gegossen hatte.