Bu olaydan sonra Kurt Schuschnigg Avusturya'nın ilhakı sırasında Almanya tarafından tutuklandı. 12 Mart 1938 günü ev hapsine alındı. 28 Mayıs'a kadar evinde hapis tutuldu ve Gestapo tarafından uykusuz bırakıldı. SS mensupları tarafından üzerinde fiziki ve psikolojik işkence uygulandı. Ev hapsinden sonra Viyana'da Hotel Metropol'de bulunan Gestapo karargahına götürüldü. 17 ay boyunca 5. katta küçük bir odada kapalı kaldı. Burada SS mensuplarının odaları, lavaboları, bulaşık kapları ve tuvaletleri kendi havlusuyla ona temizlettirildi; Gestapo tarafından çeşitli ayak işleri yaptırıldı. Başbakanlıktan düşüşünün 1. yıl dönümünde, 11 Mart 1939'da 30 kilo kaybetmiş olduğu halde, bir SS doktoru sağlık durumunun çok iyi olduğuna dair rapor verdi. Schuschnigg'in tutuklanmasından az sonra, eski Kontes Vera Czernin'le vekâletname vererek evlenmesine izin verilmişti.