Mentre sul continente si prepara la guerra d'indipendenza, non sembra che i membri della Filikì Eterìa abbiano pianificato o fossero in grado di organizzare una vera attività rivoluzionaria in questa regione, lontana dal resto della Grecia e priva delle condizioni favorevoli ad un sollevamento. Solo dopo i primi mesi dell’insurrezione e a seguito del sostegno di autorevoli personaggi locali L’Etairia diventa attiva sul territorio cretese.