En 1987 firmaron por el club los jóvenes Dragiša Binić y Robert Prosinečki, a los que posteriormente se unieron Refik Šabanadžović, Darko Pančev, Dejan Savićević, Miodrag Belodedici y Siniša Mihajlović. Por su parte, los futbolistas Stevan Stojanović y Vladimir Jugović llegaron al primer equipo desde las categorías inferiores del Estrella Roja. En el comienzo de la década de los noventa, el equipo rojiblanco, impulsado por los goles de Pančev, no encontró oposición en el campeonato doméstico, mientras que en Europa se situó entre los mejores. Ganaron la Copa de Europa de 1991 en Bari sin perder ningún partido y en 1991 se hicieron con la Copa Intercontinental en Tokio. La inminente guerra de los Balcanes, la desintegración de Yugoslavia y las sanciones impuestas por la ONU en todos los países de la ex Yugoslavia, aceleró el proceso de desmantelación del gran equipo campeón y tan solo trece meses después de la victoria en Bari, prácticamente toda la generación de campeones del Estrella Roja emigró a clubes de Europa Occidental.