Эвра начал сезон 2008/2009 участием в Суперкубке Англии, закончившемся победой «Манчестер Юнайтед» над «Портсмутом». Зимой Патрис пропустил несколько матчей Премьер-лиги сначала из-за дисквалификации, наложенной на него за драку с работником стадиона «Стэмфорд Бридж» (4 матча + штраф 15 000 фунтов), а затем из-за травмы стопы, которую он получил в поединке с «Челси» 11 января 2009 года. Тем не менее, он сыграл на клубном чемпионате мира в декабре 2008 года; «Юнайтед» завоевал трофей и официально оформил звание лучшего клуба на планете.