Первая попытка курфюрста создать свой собственный флот во время Северной войны ограничилась маленькой флотилией Балтийского моря, собранной в 1657 году в Пиллау и Мемеле, — 3 корабля, 34 пушки и 140 человек в команде — под командованием артиллерийского полковника . Началом флотилии послужил шведский корабль "Förgyllda Lejonet", севший на мель у берегов Пруссии в 1655 году. В следующем году он был снят, отремонтирован, переименован в "Clevescher Lindenbaum" и принят во флот в ранге фрегата с 10 пушками. Ещё через год к нему прибавился купленный в Кёнигсберге 7-пушечный флейт "Kurfurst von Brandenburg". В 1659—1660 годах бранденбургский флаг несли два курляндских корабля: 30-пушечный "Pax" и 12-пушечный "Clementia", формально нанятые курфюрстом в Копенгагене для избежания их захвата шведами. Со временем флотилия была увеличена до семи крупных кораблей, трёх канонерских шлюпов и двадцати вооружённых лодок, которые успешно использовались против шведских кораблей и укреплений в заливе Фришез-Хафф со стороны Речи Посполитой. После войны флот был сокращён из за отсутствия денег, и уже в 1662 году в его составе было всего восемь единиц. Есть упоминание, что между 1661 и 1664 годах существовал корабль "Kurprinz" (или "Churprinz"), но не указано ни типа, ни размеров, ни судьбы. Позднее флот из-за уменьшения расходов на него продолжал сокращаться. Примерно до 1670 года флот состоял только из одного корабля — "Leibjacht des Kurfürsten". Для увеличения своих доходов, курфюрст участвовал в международной морской торговле, для чего он построил в Нидерландах два корабля: "Herzogtum Cleve" и "Grafschaft Mark", но они были конфискованы Англией.