El 27 de febrero de 1844 se proclamó una segunda "Independencia de la República Dominicana" consumada por el líder político Juan Pablo Duarte, quien junto a otros liberales —autodenominados "los trinitarios"— terminó con el yugo haitiano que había sometido la parte oriental de la isla por veintidós años. Tras diecisiete años como una república independiente, la Corona Española volvió a tomar el control de Santo Domingo en 1861 debido a una anexión propiciada por la clase conservadora dominicana, liderada por el rico terrateniente y primer presidente de la recién proclamada nación Pedro Santana. Este tercer periodo español no prosperó, ya que Gregorio Luperón, un joven nacionalista que comulgaba con las ideas de Duarte, enfrentó a los conservadores en la Guerra de la Restauración, poniendo fin al dominio español de manera definitiva en 1865.