Mit dem Beginn des Portugiesischen Kolonialkriegs in Angola, Mosambik und Guinea-Bissau reagierte die portugiesische Geheimpolizei PIDE mit Verhaftungen und Verboten. Margarido wurde von der Polizei festgenommen und ins PIDE-Gefängnis in Caxias gebracht. Nachdem sie wieder frei kam, ging sie ins Exil nach Paris, wo sie ein Studium der Religionswissenschaften auf Diplom an der École Pratique des Hautes Études absolvierte. Zudem studierte sie Geisteswissenschaften und Filmwissenschaften. Margarido arbeitete zudem als Bibliothekarin und Sekretärin am Institut für luso-brasilianische Studien an der Sorbonne. Auch engagierte sie sich fürs Theater und schrieb für die portugiesische Zeitschrift „"Estudos Ultramarinos"“.