За повідомленнями засобів масової інформації, карфентаніл у суміші з іншим похідним фентанілу реміфентанілом застосовувався під час штурму театру на Дубровці під час захоплення заручників чеченськими бойовиками. Цю інформацію частково підтвердив у інтерв'ю тодішній міністр охорони здоров'я Росії Юрій Шевченко, непрямо про це може свідчити цей факт, що під час штурму бригадам швидкої допомоги, які прибували до місця захоплення заручників, хоча й з деяким запізненням, дано вказівку мати при собі запас препарату налоксон, який застосовується при отруєнні або передозуванні опіоїдними наркотиками. Проте неможливість контролювати дозу введеного препарату, також і у зв'язку із його інгаляційним застосуванням, призвела до загибелі не тільки терористів, а й більш ніж 120 заручників.