Als Johann II. Kasimir 1648 zum neuen König Polens gewählt wurde, trat Krzysztof Opaliński der Opposition gegen diesen bei. Der König hatte nur wenige Unterstützer und Freunde in den Reihen der polnischen Szlachta, da er offen mit Österreich sympathisierte und der polnischen Kultur gegenüber ignorant und verachtend gegenübertrat. Daher hielten viele Adlige des Staates Johann II. Kasimir entweder für einen schwachen oder die Jesuiten unterstützenden König („Jesuitenkönig“) oder hatten andere Gründe dafür, ihn abzulehnen und stattdessen den Protestanten Karl X. Gustav von Schweden alsbald zu unterstützen, Ansprüche auf den polnischen Thron geltend zu machen. Während der folgenden schwedischen Invasion entschieden sich die mit der Verteidigung Großpolens betrauten Krzysztof Opaliński und Bogusław Leszczyński dazu, sich, aufgrund ihrer Unzufriedenheit mit Johann II. Kasimir, Karl Gustav gemeinsam mit ihrem Adelsaufgebot (pospolite ruszenie) am 25. Juli 1655 bei Ujście kampflos zu ergeben. Viele andere Wojewoden folgten daraufhin ihrem Beispiel, insbesondere Janusz Radziwiłł im Großfürstentum Litauen, obgleich Krzysztofs Bruder Łukasz Opaliński dem polnischen König loyal blieb. Große Teile des Landes wurden daraufhin von den Schweden eingenommen – bis zur Belagerung von Jasna Góra und der Konföderation von Tyszowce, welche den Krieg gegen die Schweden zu einem Wendepunkt brachten.