26 января 2005 года Багуи дебютировал в составе национальной сборной Эквадора в товарищеском матче против Панамы. В составе сборной был участником розыгрыша Кубка Америки 2007 в Венесуэле. Эквадор покинул турнир, проиграв все три матча группового раунда. На данный момент провёл в форме главной команды страны более 20 матчей.