Nach dem Krieg kehrte Outrata in die Tschechoslowakei zurück. Dort übernahm er die Position des Generalsekretärs des Wirtschaftsrates des Regierungschefs, die er bis 1949 – also auch noch nach der Machtübernahme durch die Kommunisten im Jahr 1948 – innehatte. Zudem fungierte er von 1946 bis 1949 als stellvertretender Vorsitzender der zentralen Staatlichen Planungskommission. Anschließend amtierte er von 1949 bis 1951 als stellvertretender Vorsitzender des Staatlichen Planungsamtes.