Im Juni 1989 wurden die Neubauten der Botschaft durch Michail Gorbatschow eingeweiht, 1990 waren die letzten fertiggestellt. Nach der Auflösung der Sowjetunion im Dezember 1991 wurde die Botschaft in die diplomatische Vertretung der Russischen Föderation in Deutschland umgewandelt. Übergangsweise war auf der Viktorshöhe auch die Botschaft der Ukraine, die vor ihrer Unabhängigkeit (1991) innerhalb der Sowjetunion eine Unionsrepublik bildete, ansässig. Am 8. Mai 1999 trafen dort der UN-Sonderbeauftragte Carl Bildt und der russische Sonderbeauftragte für Jugoslawien Wiktor Stepanowitsch Tschernomyrdin zu Gesprächen über die Beilegung des Kosovo-Konflikts zusammen. Im Zuge der Verlegung des Regierungssitzes zog die russische Botschaft im August 1999 nach Berlin um (→ Russische Botschaft in Berlin). Auf der Viktorshöhe wurde daraufhin ein russisches Generalkonsulat eingerichtet, das im November 1999 in Betrieb genommen wurde und zunächst für Baden-Württemberg, Hessen, Nordrhein-Westfalen, Rheinland-Pfalz und das Saarland mit 200.000 Staatsangehörigen zuständig war. Nach der Einrichtung eines weiteren Generalkonsulats in Frankfurt am Main umfasst der Konsularbezirk seit dem 8. Oktober 2007 die Länder Nordrhein-Westfalen, Rheinland-Pfalz und Saarland. Mindestens bis 2008 bestand hier außerdem noch eine Außenstelle der russischen Botschaft, die zuletzt mit einem stellvertretenden Marineattaché besetzt war. Am 30. November 2012 wurde über einen externen Dienstleister ein neues russisches Visazentrum in Bonn eröffnet, das sich nach dem Wechsel des Partnerunternehmens seit Dezember 2016 im Godesberger Zentrum (Burgstraße 54) befindet. Im Generalkonsulat sind derzeit 25 Diplomaten und etwa 100 weitere Angestellte – ausschließlich russische Staatsbürger – beschäftigt (Stand: 2013); es handelt sich um die weltweit größte berufskonsularische Vertretung Russlands. Das Generalkonsulat beheimatet auch ein Museum der diplomatischen Präsenz Russlands am Rhein.