Il empoche sa première victoire individuelle sur la mass start de Canmore le . Il est aussi deux fois dans le top plus tard aux Championnats du monde à Holmenkollen, avec une cinquième place et une quatrième place. En 2016-2017, Windisch devient un peu plus régulier, enregistrant son meilleur classement général dans la Coupe du monde avec le quatorzième rang et deux podiums sur le site d'Oberhof.