Yanagita wurde 1997 in den Kader der japanischen Nationalmannschaft berufen und kam bei der Asienmeisterschaft der Frauen 1997 zum Einsatz. Sie wurde in den Kader der Weltmeisterschaft der Frauen 1999, 2003 und 2007 und Olympischen Sommerspiele 2004 und 2008 berufen. Insgesamt bestritt sie 91 Länderspiele für Japan.