Er war der Sohn eines Krempelmaschinenfabrikanten. Nach dem Besuch des Fürstenschule Grimma vom 21. September 1814 – 14. September 1819 studierte er an der Universität Leipzig und in Dresden Theologie. 1824 wurde er Diakon in Mittweida. Am 1. Juli 1843 wurde er Hauptpfarrer in Zschopau. Daneben wirkte er als Schriftsteller. In der Revolution 1848/49 übernahm er den Vorsitz im politischen Volksverein in Zschopau, der sich dem revolutionären Vaterlandsverein anschloss. Am 4. Mai 1849 im Zusammenhang mit der Reichsverfassungskampagne hielt Würkert eine flammende Rede auf einer Volksversammlung in Zschopau, in deren Anschluss die Sturmglocken von Kirche und Rathaus läuteten. Danach rückten 94 Männer nach Dresden aus, um die dortige "Provisorische Regierung" im Dresdner Maiaufstand zu unterstützen.