Le musée s'établit alors dans une période instable, à la fin de la république de Weimar et au début de l’émergence du parti nazi. L'objectif est de préserver l'autonomie de la gestion des musées. Le conseil d'administration dirigé par Oskar von Miller pensait que le musée allemand devait rester apolitique, ce qui, pendant les années 1920, a abouti à des attaques hostiles des nazis. Bismarck a représenté une partie importante dans la politique allemande mais malgré cela Von Miller refuse de mettre la statue de Bismarck dans le hall d'honneur du musée pour préserver l'aspect apolitique du musée. La politique de collection orientée à l'international est aussi critiquée par les nationalistes de droite. En 1934, une personnalité du NSDAP, Fritz Todt, arrive à la direction du musée. Entre et , l'exposition antisémite "Le Juif éternel" attire plus de visiteurs.