1213 und 1215 diente John als Sheriff von Norfolk und Suffolk. Durch seine Besitzungen hatte er sowohl Kontakte zu den nordenglischen Baronen um Eustace de Vesci und William de Mowbray wie auch zu den ostenglischen Baronen, die sich nach 1212 zur Adelsopposition gegen König Johann Ohneland zusammenschlossen. Angesichts der langjährigen Verbundenheit seiner Familie mit den angevinischen Königen schloss sich FitzRobert jedoch erst spät dieser Adelsopposition an. Wegen seiner umfangreichen Ländereien und seiner Stellung wurde er nach der Anerkennung der Magna Carta durch den König im Juni 1215 zu einem der 25 Barone gewählt, die die Einhaltung der Bestimmungen der Magna Carta durch den König überwachen sollten. Als der König seine Anerkennung widerrief, kam es ab September 1215 zum offenen Krieg der Barone gegen den König. FitzRobert stand zunächst weiter auf der Seite der Rebellen, bis er sich nach der verlorenen Schlacht von Lincoln im Mai 1217 als einer der ersten Barone dem Regentschaftsrat unterwarf, der für den minderjährigen König Heinrich III. die Regierung übernommen hatte. Später diente er von 1224 bis 1227 als Sheriff von Northumberland.