За вријеме Рата у Босни и Херцеговини дошло је до низа невоља у школству: због недостатка струје и гријања полугодишта су помијерана у љетне мјесеце, а била је и несташица наставних средстава, уџбеника, наставног кадра. Зграда гимназије је оштећена и у њој се није могла одвијати настава, све док 2009. године није обновљена. Од школске 1992/93. године, школа је носила назив Гимназија са техничким школама Дервента, да би школске 2014/15. добила назив ЈУ СШЦ „Михајло Пупин“ Дервента, који и данас носи.