共产党拒绝与波兰流亡政府交涉，同样拒绝与地下国交涉；波兰“解放区”境内的地下国领导人和军人遭遇迫害。地下国的一些著名领导人——包括政府代表和家乡军末任总司令——决定现身，并应苏联的邀请开始与共产党当局公开谈判；然而他们在1945年3月被苏联人逮捕，于当年6月在臭名昭著的莫斯科十六人公审中获刑。1945年6月27日，民族团结委员会举行了最后一届会议，会上发表了12项声明，要求苏联军队离开波兰，停止镇压非共产主义政党。政府代表办公室在其领导被捕后重组，由任末任代表。6月28日，（Tymczasowy RządJedności Narodowej，TRJN）在莫斯科宣告成立；波兰政府代表办公室随后于7月1日宣布解散，标志地下国的终结。