Nach der US-amerikanischen Landung auf Guadalcanal verließ die "Yamato" zusammen mit einem Geleitträger und mehreren Zerstörern Japan und machte sich auf den Weg nach Truk, um dort als schwimmende Kommandozentrale für die anlaufenden japanischen Gegenoperationen zu dienen. Auf dem Weg dorthin wurde sie erneut von einem US-U-Boot angegriffen, doch die Torpedos verfehlten wieder ihr Ziel. Am 28. August erreichte der Verband ohne weitere Zwischenfälle seinen Liegeplatz. Im Oktober 1942 gab die "Yamato" 4.500 t Öl an einen Tanker ab, der die bei Guadalcanal eingesetzten japanischen Schiffe versorgen sollte – ein deutliches Zeichen der Treibstoffknappheit der Kaiserlichen Flotte bereits in dieser frühen Phase des Krieges. Nach der Schlacht bei den Santa-Cruz-Inseln fand auf ihr ein großes Bankett zur Feier des dort vermeintlich errungenen Sieges statt.