В январе — феврале 1990 года Группа «А» была направлена в Баку, где произошли трагические события, закончившиеся гибелью нескольких сотен гражданских лиц (по мнению сослуживцев, часть мирных граждан могла быть убита провокаторами). Службу продолжал в Нагорном Карабахе и в Армении. Серьёзным ударом для Александра стала гибель его сослуживца лейтенанта Виктора Шатских, застреленного протестующими в Вильнюсе.