Владимир Кесада входил в состав сборной Коста-Рики на чемпионате мира 1990 года в Италии, но остался в числе шести игроков команды, так и не вышедших на поле в этом турнире. Защитник провёл за национальную сборную 31 матч и играл на Кубке наций Центральной Америки 1991 и Золотом кубке КОНКАКАФ 1991.