Podczas okupacji Ankierman został zamknięty w getcie warszawskim, gdzie w 1942 roku był jednym z założycieli PPR i bliskim współpracownikiem Józefa Lewartowskiego. Członek Komitetu Dzielnicowego (KD) PPR. Brał udział w organizowaniu ruchu oporu, był członkiem sztabu ŻOB i uczestniczył w przygotowywaniu powstania w kwietniu 1943. Wraz z Mordechajem Anielewiczem i innymi bojownikami ŻOB popełnił samobójstwo w bunkrze sztabu przy ul. Miłej 18.