En diciembre de 1939, a petición de Hans Frank en Berlín, la "Ostbahndirektion" obtuvo la independencia financiera después de devolver 10 millones de "Reichsmarks" a la DRB. La remoción de todos los daños de las bombas se completó en 1940. La administración polaca fue ejecutada en acciones de tiroteo masivo (ver: "Intelligenzaktion" de 1939 y AB-Aktion alemán de 1940 en Polonia) o encarcelada en los campos de concentración nazis. Los puestos de gestión se ocuparon de funcionarios alemanes en una ola de unos 8.000 ascensos instantáneos. La nueva División Este de la DRB adquirió 7.192 kilómetros de nuevas líneas ferroviarias y 1.052 km de vía estrecha (en su mayoría industriales) en las áreas anexas.