צ'ופו-מוטינג שיחק בנבחרות הצעירות של גרמניה, והשתתף עם נבחרת גרמניה בכדורגל עד גיל 21 באליפות אירופה בכדורגל עד גיל 21 - 2011. עם זאת, כבר בשנת 2010 הצהיר צ'ופו-מוטינג שהוא מעוניין לשחק בנבחרת קמרון, על אף שנולד בגרמניה. עניין זה עורר מאוחר יותר תרעומת גדולה בהתאחדות הכדורגל התוניסאית, שנבחרתה, נבחרת תוניסיה, שהתחרתה עם קמרון במוקדמות מונדיאל 2014 והפסידה לה בפלייאוף העלייה, טענה שהדבר אסור על פי חוקי פיפ"א, ששחקן שנולד וייצג מדינה אחרת עד גיל 21, יוכל להחליף את נבחרתו. פיפ"א דחתה את עתירת ההתאחדות התוניסאית, מאחר שצ'ופו-מוטינג סיים את מחויבויותיו בכל העניינים הביורוקרטיים לפני שהחל לשחק בנבחרת קמרון, ועל כן המעבר הוא חוקי. צ'ופו-מוטינג נכלל בסגל קמרון למונדיאל 2010, בו פתח בשני משחקים בשלב הבתים, ולמונדיאל 2014, בו פתח בשלושה משחקים. בשני המונדיאלים הודחה קמרון בשלב הבתים עם אפס נקודות. צ'ופו-מוטינג השתתף עם נבחרת קמרון גם בגביע אפריקה לאומות 2015, שגם בו הודחה קמרון בשלב הבתים, לאחר שצברה שתי נקודות. לגביע אפריקה לאומות 2017, בו זכתה קמרון, צ'ופו-מוטינג לא זומן. בהמשך, צ'ופו-מוטינג וקמרון לא הצליחו להעפיל למונדיאל 2018, אך כן העפילו לגביע אפריקה לאומות 2019, שם הודחו בשמינית הגמר לאחר הפסד 2–3 לניגריה.