Det andet hovedpunkt i planen blev gennemført af unionshære under Henry W. Halleck, Ulysses S. Grant og Nathaniel P. Banks foruden flådeskibe under Andrew H. Foote, William D. Porter og David Farragut, som gradvis tog kontrol med Mississippi i 1862 og fuldførte opgaven med erobringen af Vicksburg og Port Hudson i juli 1863.