Током касније фазе Кавкаског похода из Првог светског рата, после Октобарске револуције и руског грађанског рата, руске трупе су масовно напустиле Кавказ. У априлу 1918. Турци су заузели Карс и црква је поново претворена у џамију. Према примирју из Мудроса, од Турака се захтевало да се повуку до предратне границе. Република Јерменија је стекла надзор над градом 1919. године и црква је преуређена назад у јерменску цркву.