1949年5月中华民国国军撤离杭州之时，扣留并破坏了轮渡所的大量船只，轮渡一度歇业至6月，7月中华民国空军袭击钱塘江大桥、闸口电厂和轮渡，3名船工不幸遇难，轮渡再度停运。中华人民共和国成立之后，浙江第一码头仍是省内最大的内河码头。1950年代中期，由于码头前沿沙滩延伸，船只难以停靠码头，因而客货班船都移至中河海月桥货运码头。1957年冬，浙江省省属钱江航运公司新建木栈桥近百米，浙江第一码头恢复使用。1960年，木栈桥改为钢筋混凝土新桥，并新建钢引桥两座。1979年后，钱塘江轮渡再次兴起，浙江第一码头除两岸渡运外，还运营绍兴、临浦、诸暨、富阳、桐庐、建德、兰溪、金华等地的长途客船，由此成为了全省重要的交通枢纽。1979年春，新引入客运、渡运泵船两艘。1985年8月，浙江省交通厅批准在江滩陆地处新建候船厅和综合楼。1980年代，浙江第一码头年输送旅客可达4000多万，每天凌晨3时北岸的第一码头开出当天第一班渡轮，南岸萧山就有百米长队伍在等待，船票也水涨船高由5分涨到5角。随着钱塘江过江交通越发便捷，钱江轮渡开始走下坡路，至1998年1月8日浙江第一码头最终宣告停渡。