С конца июня его солдаты безуспешно пытались подавить восстание братьев Палафокс, которые заперлись в Сарагосе и отказывались сложить оружие. Это вынудило Вердье начать осаду города (15 июля 1808 года). Байленская капитуляция генерала Дюпона не дала ему возможности расправиться с повстанцами, и, опасаясь окружения, Вердье снял блокаду со столицы Арагона. 8 ноября 1808 года он должен был получить в распоряжение 1-ю дивизию в корпусе маршала Сульта, но уже через неделю генералу нашли иное применение — его сделали командующим в провинции Бильбао.