Im Mai 1915 meldete sich Jones als begeisterter Freiwilliger zur Australian Imperial Force und kämpfte in der Gallipoli-Kampagne. Die dortigen Erlebnisse traumatisierten ihn noch auf Jahre hinaus. Nach dem Ende des Einsatzes auf Gallipoli wurde er erst dem Kamel-Korps zugeteilt, dann 1916 dem Australian Flying Corps. Dafür musste er eine Degradierung seines Ranges in Kauf nehmen, die er aber schnell wieder ausglich. Zunächst war er als Flugzeugmechaniker tätig, durfte dann aber nach England reisen, um Flugtraining zu erhalten. Er erhielt seinen Flugschein am 22. November 1917 und nahm im Januar 1918 seinen Dienst auf. Er wurde im März 1918 bei einem Einsatz schwer verwundet und war drei Monate dienstunfähig. Mit sieben Luftsiegen und im Rang eines Captains beendete er seinen Dienst, blieb aber noch bis zum Juni 1919 als Teil der britischen Besatzungstruppen in Deutschland.