Machsom Watch wurde 2001 von Ronnee Jaeger, einer Menschenrechtsaktivistin, Adi Kuntsman und Yehudit Keshet gegründet. Nach eigenen Angaben war dies eine Reaktion auf Menschenrechtsverletzungen gegenüber Palästinensern an israelischen Checkpoints. Die Gruppe zeigte Besorgnis über „die ausufernde israelische Reaktion auf die Zweite Intifada und die Abriegelung ganzer Dörfer und Städte im Westjordanland“.