Vào tháng 6 năm 2017, khi Sampaoli được bổ nhiệm làm HLV đội tuyển quốc gia mới, Scaloni một lần nữa được bổ nhiệm làm trợ lý. Một năm sau, sau thất bại của đội tuyển quốc gia tại World Cup ở Nga, anh và Pablo Aimar được bổ nhiệm làm HLV tạm thời cho đến cuối năm; vào tháng 11 năm 2018, Scaloni đã được làm HLV chính thức cho đến tháng 6 năm 2019, khi Copa América 2019 sắp diễn ra.