В Военно-Морском Флоте с 1941 года. Сражался с врагом на Черноморском флоте. В 17-летнем возрасте участвовал в обороне Одессы и Керчи. В феврале 1943 года Кипенко участвовал в Новороссийской десантной операции. На «Малой земле» был ранен.