В 1962 году «Уракан» стал членом Ассоциации футбола Уругвая и с тех пор выступал в различных лигах страны, как правило, в третьей или четвёртой (в частности, «Уракан» является победителем последнего сезона Примеры D, после чего АУФ оставила только три лиги). Первым матчем в карьере Эдгардо Кодесаля, будущего арбитра финала чемпионата мира по футболу 1990 года, стала игра «Серро» — «Уракан» в 1977 году.