Diese französischen Bürgerkriege fanden 1562–1563, 1567–1568, 1568–1570 und nach dem Massaker der Bartholomäusnacht 1572–1573, 1574–1576, 1576–1577 und 1579–1580 statt, waren außer in der Zeit 1572–1573 aber eher politische als militärische Manöver, kleinere Gefechte, keine wirkliche Einmischung des Auslands. Katharina von Medici waren diese Kriege ein Gräuel, so führte sie für ihre minderjährigen oder nur sporadisch aktiven Söhne Karl IX. und Heinrich III. (Frankreich) in zähen Verhandlungen politische Kompromisse herbei. Dies misslang ihr jedoch im Jahr 1572, als der hugenottische Adel in Paris zur Hochzeit ihrer Tochter Margarete von Valois mit dem jungen hugenottischen Prinzen Heinrich von Navarra eingeladen war, dann aber in der sogenannten Bartholomäusnacht massakriert wurde. Im folgenden vierten Hugenottenkrieg 1572–1573 wurden die führerlosen Hugenotten durch die vereinigten katholischen und königlichen Truppen nahezu vernichtet. Letztendlich wurden den Hugenotten in den jeweiligen Friedensschlüssen eine beschränkte Toleranz und einige wenige Sicherheitsplätze zugestanden. Ab 1576 stieg Heinrich von Navarra zum unumstrittenen Führer der Hugenotten auf. Die Hugenotten machten damals etwa 10 % der französischen Bevölkerung aus. Sie wurden in den Hugenottenkriegen im Wesentlichen in den Süden Frankreichs abgedrängt.