Sirvió en las campañas de Flandes de 1793 como ayudante de campo de Sir Ralph Abercromby, y en Irlanda durante la Rebelión irlandesa de 1798, donde fue el segundo al mando en la Batalla de Castlebar, bajo las órdenes del General Lake. En 1799, durante las guerras napoleónicas, participó de la expedición a los Países Bajos, y fue segundo al mando en la expedición de 1801 a Egipto, comandada por Abercromby. Tras la muerte de Abercromby en marzo de 1801, luego de ser herido mortalmente en la Batalla de Alejandría, Hely-Hutchinson pasó al mando de la fuerza expedicionaria. En recompensa por sus éxitos en la campaña, el  Sultán otomano Selim III lo nombró Caballero de Primera Clase de la Orden de la Luna Creciente.