Im November 1937 ordnete Präsident Lin Sen an, die chinesische Hauptstadt von Nanjing nach Chongqing zu verlegen. Als die japanischen Truppen am 1. Dezember 1937 Nanjing angriffen, floh die Regierung zunächst nach Wuhan, Anfang 1938 kamen die Beamten in Chongqing an. Daraufhin führten japanische Kampfflugzeuge am 18. Februar 1938 erstmals einen Luftangriff auf die Stadt durch. Die Luftangriffe auf Chongqing wurden bis zum 23. August 1943 fortgesetzt. Während dieser Zeit wurde regulär Unterricht abgehalten; bei Fliegeralarm begaben sich die Studenten in Luftschutzbunker, wo die Veranstaltungen nahtlos weiterliefen. Die Professoren der Fakultät für Ingenieurwissenschaften bauten einen Ersatz für den am 24. August 1937 bei einem japanischen Luftangriff auf Nanjing zerstörten, englischsprachigen Kurzwellensender „Voice of China“, der am 6. Februar 1939, nun bekannt als „Frosch von Chongqing“ (重庆之蛙), seinen Betrieb aufnahm.