Per un període curt entre 1478 i 1485, la ciutat fou administrada per l'Imperi Otomà. Després es convertia en un centre urbà important del Kanat de Crimea. El 1783, amb la totalitat Crimea, Kezlev era annexionada a l'Imperi Rus. El seu nom es convertia oficialment en Ievpatòria el 1784. La ciutat fou ocupada breument el 1854 per tropes britàniques, franceses i turques durant la Guerra de Crimea, quan fou el lloc de la Batalla d'Eupatòria. Adam Mickiewicz va visitar la ciutat el 1825 i va escriure un dels seus sonets crimeans a la ciutat; més tard fou traduït al rus per Mikhaïl Lérmontov.