Милан Мартич получил наибольшее наказание — 35 лет тюрьмы, Милан Бабич был осуждён на 13 лет лишения свободы. Он выразил раскаяние за свою деятельность во время войны, прося «хорватских братьев простить его». В ходе разбирательств в МТБЮ было доказано, что значительное число хорватских гражданских лиц в больницах и приютах, отмеченных красным крестом, были мишенью для сербских сил. В 2007 году были осуждены два бывших офицера ЮНА за массовое убийство хорватов в Вуковаре. Веселин Шливанчанин был приговорён к 10 годам тюрьмы, а Миле Мркшич получил 20 лет лишения свободы. Прокуроры заявили, что после взятия Вуковара югославскими войсками несколько сотен хорватов были переданы сербским паравоенным силам, участвовавшим в штурме. Из них по крайней мере 264 (в том числе раненые солдаты, женщины, дети и пожилые люди) были убиты и похоронены в братских могилах на окраине Вуковара. Мэр Вуковара Славко Докманович был доставлен в Гаагу для судебного разбирательства, но покончил жизнь самоубийством в 1998 году прежде, чем разбирательство началось.