Lefebvre osallistui vuonna 1808 Napoleonin Espanjan-sotaretkeen IV armeijakunnan komentajana. Hän voitti useita taisteluja ja valtasi Bilbaon, mutta strategisten erimielisyyksien vuoksi Napoleon lähetti hänet pois tammikuussa 1809. Maaliskuussa 1809 hänet nimitettiin Baijeriin sijoitetun VII armeijakunnan komentajaksi, ja viidennen liittokunnan sodan puhjettua myöhemmin samana vuonna hän torjui Itävallan hyökkäyksen Baijeriin. Hän löi itävaltalaiset Arnhofenissa ja osallistui Napoleonin rinnalla Abensbergin, Eckmühlin ja Wagramin taisteluihin, mutta kärsi tappion Tirolin kapinallisille. Vuoden 1812 Napoleonin Venäjän-sotaretkellä Lefebvre komensi vanhan kaartin jalkaväkeä ja osallistui Borodinon taisteluun.