En 1898, Henri Lechat prend la direction du musée des moulages dans les locaux de la Faculté des Lettres, au 15 quai claude bernard, à la suite de Maurice Holleaux et l'enrichit considérablement. Il en publie le catalogue raisonné en 1903, mis à jour par la suite en 1911 et 1923. C'est sous sa direction que le musée reçoit en 1900 une médaille d'or dans la catégorie « meilleur musée de province » à l'Exposition Universelle de Paris. En 1903, le musée des moulages de l'université de Lyon passe pour . A cette époque, le musée occupe dix pièces qui abritent plus de 800 moulages remis dans leur contexte par des photographies, des aquarelles et des cartes.