Il se distingue au concile de Trente par son éloquence. Il prononce notamment un discours sur la bataille de Dreux (publié en 1563) remarqué pour la hardiesse de ses propos qui dénoncent les abus qui minent le catholicisme et enjoignent à l'Église d'entreprendre de profondes réformes. Il y soutient des positions gallicanes en affirmant que les évêques, investis par Dieu directement, ne peuvent pas être les simples délégués du pape. Il rédige le décret sur les mariages clandestins qui se trouve dans les actes du concile. Ce sujet avait été l'occasion d'intenses débats pendant le concile.