Sau khi quay trở về quần đảo Hawaii cho một đợt nghỉ ngơi, "Waller" lại khởi hành từ Trân Châu Cảng để đi Saipan, quần đảo Mariana ngang qua Kwajalein, hộ tống cho Đội đặc nhiệm 51.18, một lực lượng viễn chinh dự bị hỗ trợ cho chiến dịch Mariana, sẵn sàng đổ bộ lên một trong những mục tiêu Saipan, Guam hay Tinian tùy tình hình đòi hỏi. Saipan sau đó được xác định là mục tiêu, và con tàu đã nả pháo lên các vị trí của quân Nhật trên đảo này. Đến chiều tối ngày 18 tháng 6, nó nhận mệnh lệnh hỗ trợ hỏa lực lên hai khu vực nhằm giúp binh lính Thủy quân Lục chiến chống trả đợt tấn công bằng xe tăng của đối phương; nó cùng "Pringle" tiến vào vịnh Magicienne lúc 17 giờ 55 phút.