Le 6 janvier 2021, Trump incite ses partisans à « marcher sur le Capitole » pendant la réunion du Congrès présidé par Mike Pence pour le Sénat et Nancy Pelosi pour la Chambre. Dans son discours devant la foule de ses partisans qu'il a rassemblés devant la Maison-Blanche. Trump persiste à dire que « Si Mike fait la bonne chose, nous gagnons l'élection » Mais Pence publie parallèlement une lettre dans laquelle il explique qu'il ne fera pas objection à la victoire de Biden puisqu'il n'en a pas les pouvoirs. Avertis de la position du vice-président, une partie des émeutiers qui partent alors à l'assaut du Capitole, entrent en force dans le bâtiment en criant . Evacué de la salle du Sénat, Mike Pence échappe d'extrême justesse à la meute des émeutiers qui investissent le bâtiment. Durant l'assaut, Mike Pence tweete à : , alors que Trump affiche dans un premier temps son soutien aux émeutiers. Il ne reçoit aucun coup de fil du président Trump, semble agir pour faire intervenir la Garde nationale, et condamne fermement l'invasion du Capitole. L'ordre étant rétabli, il reprend la séance : « À ceux qui ont semé le trouble dans notre capitale, vous n'avez pas gagné, la violence ne gagne jamais, retournons au travail ». Il lit les résultats qui valent proclamation du nouveau président et dans les jours qui suivent, tout en se désolidarisant nettement de l'attitude de Donald Trump pendant l'émeute, il se refuse à faire appliquer le . Il accepte de participer à la transition de pouvoir au contraire du président Trump qu'il rencontre à nouveau le , et dont il reçoit pratiquement la délégation de toutes les affaires courantes.