29 ноября 2012 года был вновь назначен главным тренером сборной Бразилии вместо уволенного Мано Менезеса. В июне 2013 года бразильцы под руководством Сколари, обыграв сборную Испании в финале 3:0, выиграли Кубок конфедераций. На домашнем чемпионате мира 2014 сборная Бразилии заняла 4-е место, провалив два своих последних матча с Германией (1:7) и Нидерландами (0:3); после этого Сколари покинул свой пост.