Efter andra världskriget, från omkring 1948, började han bygga upp en hemlig antikommunistisk så kallad stay behind-organisation, vilken - till skillnad från den stay behindorganisation som ibland har benämnts Arla gryning och stod under ledning av Alvar Lindencrona - inte var organiserad i samarbete med försvarsstaben eller var sanktionerad av centralt placerade statsråd inom regeringen. Otto Hallberg hade haft planer på sin organisation Räddningsrörelsen redan 1943 men startade arbetet på allvar efter Pragkuppen 1948. Räddningsrörelsen organiserades i ett cellsystem dit Hallberg knöt vänner som i sin tur organiserade nya celler. 1952, när organisationen avslöjades, beräknades antalet medlemmar till 1200. I Uppsala startade Hallberg ett utbildningsprogram för officerare och upprättade även informella kontakter med säkerhetspolisen där anhöriga till två av Hallbergs närmaste män arbetade. Bland de ledande medlemmarna i Räddningsrörelsen fanns Asea-direktören och doktorn Ragnar Liljeblad, skapare av "den svenska atombomben".