Il entre dans la première compagnie de Mousquetaires du roi, commandée par Charles de Batz de Castelmore, dit d'Artagnan ; en 1667-1668, il participe à la guerre de Dévolution, puis à la guerre de Hollande à partir de 1672 ; il est blessé lors du siège de Maastricht en à l'attaque de la porte de Tongres où d'Artagnan est tué. Quarré d'Aligny est nommé maréchal des logis avec une pension de 500 écus. En 1677, il participe à la prise de Valenciennes où il se fait remarquer en menant l'assaut à la tête de sa compagnie.