Plus tard, des Albanais du Kosovo commencèrent une insurrection contre Belgrade lors de la création de l'Armée de libération du Kosovo en 1996. Des affrontements armés entre les deux parties éclatèrent au début de 1998. Un cessez-le-feu facilité par l'OTAN fut signé le , mais les deux parties le rompirent deux mois plus tard et les combats reprirent. Lorsque le meurtre de 45 Albanais Kosovars lors du massacre de Račak fut signalé en , l'OTAN décida que le conflit ne pourrait être réglé qu'en introduisant une force militaire de maintien de la paix pour restreindre de force les deux parties. Après l'échec des accords de Rambouillet le avec le rejet par la Yougoslavie d'une force extérieure de maintien de la paix, l'OTAN se prépara à installer les soldats de la paix par la force. Le bombardement de l'OTAN en Yougoslavie suivit, une intervention contre les forces serbes avec une campagne de bombardement principalement, sous le commandement du général Wesley Clark. Les hostilités prirent fin deux mois et demi plus tard avec l'accord de Kumanovo. Le Kosovo fut placé sous le contrôle gouvernemental de la Mission d'administration intérimaire des Nations Unies au Kosovo et de la protection militaire de la Force pour le Kosovo (KFOR). La guerre de 15 mois fit des milliers de civils tués des deux côtés et plus d'un million de déplacés.