In 2001 kwam Kootwijkerbroek landelijk in het nieuws, in verband met het verzet van bewoners tegen de massale ruiming van rundvee na de ontdekking van mond-en-klauwzeer (zie MKZ-crisis (2001)). Door inzet van de Mobiele Eenheid konden enkele medewerkers van de RVV worden ontzet. Tientallen dorpelingen werden gearresteerd. Hierna is het nog wekenlang onrustig geweest in het dorp. In 2011 bleek dat het tweede onderzoek, waar de boeren destijds vergeefs om vroegen, wel was gedaan. Het toonde geen MKZ aan.