Η Εξέγερση του Χμελνίτσκι των Ζαπορίζιων Κοζάκων του 1648–1657 κατάκλυσε τις νοτιοανατολικές περιοχές του πολωνικού στέμματος, με τις μακροπρόθεσμες επιπτώσεις της να είναι καταστροφικές για την Κοινοπολιτεία. Το πρώτο "liberum veto" (μια κοινοβουλευτική διάταξη που επέτρεψε σε οποιοδήποτε μέλος του Σέιμ να διαλύσει αμέσως μια τρέχουσα σύνοδο) ασκήθηκε από έναν αναπληρωτή το 1652. Αυτή η πρακτική θα αποδυνάμωνε τελικά την κεντρική κυβέρνηση της Πολωνίας. Στη Συνθήκη του Περεϊάσλαβ (1654), οι Ουκρανοί αντάρτες δήλωσαν ότι ήταν υποκείμενοι του Τσάρου της Ρωσίας. Ο Δεύτερος Βόρειος Πόλεμος ξέσπασε στον πυρήνα των πολωνικών εδαφών το 1655-1660. Περιελάμβανε μια βάναυση και καταστροφική εισβολή στην Πολωνία που αναφέρεται ως Σουηδικός Καταιγισμός. Ο πόλεμος τελείωσε το 1660 με τη Συνθήκη της Ολίβα, που είχε ως αποτέλεσμα την απώλεια ορισμένων από τα βόρεια περιουσιακά στοιχεία της Πολωνίας. Το 1657, η Συνθήκη του Μπρόμπεργκ καθιέρωσε την ανεξαρτησία του Δουκάτου της Πρωσίας. Οι δυνάμεις της Κοινοπολιτείας τα πήγαν καλά στον Πόλεμο Πολωνίας-Ρωσίας (1654-1667), αλλά το τελικό αποτέλεσμα ήταν η μόνιμη διαίρεση της Ουκρανίας μεταξύ Πολωνίας και Ρωσίας, όπως συμφωνήθηκε στην Εκεχειρία του Αντρουσόβο (1667). Προς το τέλος του πολέμου, η Εξέγερση του Λουμπομίρσκι, μια μεγάλη εξέγερση των αρχόντων κατά του βασιλιά, αποσταθεροποίησε και αποδυνάμωσε τη χώρα. Οι μεγάλης κλίμακας επιδρομές σκλάβων των Τάταρων της Κριμαίας είχαν επίσης πολύ επιβλαβείς επιπτώσεις στην πολωνική οικονομία. Η "Merkuriusz Polski", η πρώτη πολωνική εφημερίδα, δημοσιεύθηκε το 1661.