Durant la guerra de restauració la defensa d'Elvas, ciutat fronterera amb Espanya i de gran importància estratègica, va esdevenir imperativa. La ubicació de l'aqüeducte es va convertir en un obstacle per a la construcció d'un nou conjunt de fortificacions, així doncs els enginyers militars van proposar derruir-lo, amb el suport de Joan IV de Portugal. La ciutat d'Elvas es va oposar a aquesta mesura, i el comte de Sant Lorenzo, governador de la plaça forta d'Elvas, va gestionar una petició a la Corona, que el monarca va recolzar.