Бавария на Максимилиан Йозеф влиза във войната срещу Франция на страната на Втората антифренска коалиция с нежелание и по принуда. Във Войната на Третата коалиция курфюрстът застава на страната на Франция. По време на управлението му територията и населението на Бавария се увеличават.