En la temporada siguiente, no obstante un inicio poco favorable en el curso del cual solo conseguiría un punto en los primeros dos partidos de la fase de grupos incluyendo una derrota 1-3 contra el Real Madrid, desde entonces no volvería a perder en la Liga de Campeones de la UEFA 2003-04, eliminando al Olympique de Marsella en dicha fase (quien luego llegaría a la final de la Copa UEFA de ese mismo año) y sucesivamente, y ya en la fase de eliminación directa, al Manchester United (en Old Trafford y en el minuto de reposición); al Olympique de Lyon; y al Deportivo de la Coruña; antes de derrotar por 3-0 en la Final al AS Mónaco de Didier Deschamps, la otra sorpresa de la competición y consiguiendo de esta forma su segunda Liga de Campeones, igualando lo conseguido por las "Águilas". En ese mismo año conseguía la Liga y la Supercopa de su país, y la Copa Intercontinental. en la que sería su última versión antes de la creación del Mundial de Clubes como reemplazante permanente de la anterior. Desde entonces, el Porto conseguiría otras 7 Ligas, 4 Copas, 6 Supercopas y la Liga Europa en 2011, el último título internacional conseguido a la fecha por el fútbol portugués.