Amey fue puesto al mando del departamento de las Ardenas, en la 2ª División Militar, hasta 1806. Al comienzo de la guerra de la Cuarta Coalición, en septiembre de 1806, fue puesto al mando de una brigada de infantería dentro de la 2ª División que dirigía Étienne Heudelet de Bierre, en el VII Cuerpo al mando de Pierre François Charles Augereau. La brigada estaba formada por tres batallones del 7º Regimiento de Infantería Ligera. que participaron en la batalla de Jena el 14 de octubre de 1806. Luchó también en las contiendas de Golymin el 26 de diciembre de 1806 y en Eylau, del 7 al 8 de febrero de 1807, donde fue herido. En esta última, el VII Cuerpo sufrió pérdidas tan grandes que fue disuelto y sus supervivientes distribuidos a otros cuerpos. Amey se convirtió en gobernador de Elbing y más tarde tomó el mando de una brigada de la División de Claude Carra Saint-Cyr, dentro del IV Cuerpo del mariscal Jean-de-Dieu Soult.