La stagione 2002-2003 fu l'ultima stagione agonistica di Von Grünigen, nella quale, oltre a sei podi con tre vittorie, riuscì ad aggiudicarsi la sua quarta e ultima Coppa di slalom gigante con 117 punti di vantaggio su Bode Miller; la sua ultima vittoria in Coppa del Mondo fu quella ottenuta nello slalom gigante di Yongpyong del 1º marzo e l'ultimo podio quello, sempre in slalom gigante, di Lillehammer Hafjell del 15 marzo. Inoltre partecipò ancora ai Mondiali di Sankt Moritz, classificandosi 7º nello slalom gigante, e si congedò dalla Coppa del Mondo nell'ultima gara della stagione, lo slalom speciale di Lillehammer Hafjell del 16 marzo, che non completò. La sua ultima gara in carriera fu lo slalom gigante dei Campionati svizzeri del 2003, il 29 marzo a Verbier, nei quali si aggiudicò la medaglia d'argento.