Jugó con la selección española absoluta, el 10 de junio de 2006, en un amistoso con victoria ante Alemania (30–31). La primera fase final que disputó, fue el Campeonato de Europa de 2008. También fue preconvocado para los Juegos Olímpicos de Pekín 2008, aunque finalmente el seleccionador en ese momento, Juan Carlos Pastor, decidió descartarlo para la cita olímpica. Julen participó posteriormente en el Mundial de 2009, en la que el combinado nacional acabó en un decepcionante 13º puesto. en el Europeo de 2010, concluyendo en sexto puesto y en el Mundial de 2011, en el que consiguieron la medalla de bronce.