Pilgeriä on arvosteltu Venäjän ja Kiinan suurvaltapoliittisten intressien kritiikittömästä puolustamisesta ja salaliittoteorioiden levittämisestä. Sergei ja Julija Skripalin myrkytystapauksen Pilger väitti olevan länsimaisten tiedustelupalvelujen juoni Venäjään kohdistuvien hyökkäysten oikeuttamiseksi. Vuonna 2016 Pilger julkaisi elokuvan "The Coming War on China" jossa Pilger kuvaa Kiinan sotilaallisen levittäytymisen Aasiassa oikeutetuksi puolustustaisteluksi amerikkalaista imperialismia vastaan. Koronaviruspandemian hillitsemiseksi länsimaissa käyttöönotettujen rajoitustoimien Pilger väitti olevan salajuoni kansalaisoikeuksien rajoittamiseksi ja hyökkäykseksi Kiinaa vastaan.