L'8 settembre 1988 a Salamanca, Sotomayor stabilì il record del mondo, appartenente a Patrik Sjöberg, portandolo a 2,43, pochi giorni prima della cerimonia di apertura delle Olimpiadi di Seul, dove ancora una volta non sarà presente perché Cuba boicotta anche quei Giochi, in solidarietà con la Corea del Nord. Nel 1989, dopo aver saltato ai mondiali indoor di Budapest 2,43, stabilì un nuovo record del mondo saltando 2,44 ai Campionati centroamericani e caraibici di atletica leggera di Porto Rico.