慶長5年（1600年）の関ヶ原の戦いでは、長重は西軍にくみしたことでいったん改易されるが、慶長8年（1603年）に徳川家康より常陸国古渡1万石を与えられて大名として復帰し、大坂の陣での武功により、元和5年（1619年）に常陸国江戸崎2万石、元和8年（1622年）には陸奥国棚倉5万石、寛永4年（1627年）白河10万700石と加増された。