В 1994—1995 годах, ставших кульминацией конфликта, Греция ввела торговое эмбарго против Республики Македония. В 2008 году на саммите НАТО в Бухаресте Греция воспрепятствовала приглашению Республики Македонии в НАТО, ссылаясь на нерешённость проблемы с именованием государства, на что Республика Македония ответила иском в Международный суд в Гааге, на экономическом уровне спор не оказывал почти никакого влияния на отношения между странами. Греческие компании инвестировали в экономику Республики Македония больше средств, чем в любую другую страну, являясь её главным инвестором. Только в Скопье ими было создано порядка 5000 рабочих мест.