Тогда усташи разработали проект Хорватской православной церкви. Предполагалось привлечь в эту церковь не хорватов (с точки зрения усташей, истинный хорват может быть только католиком), а переживших геноцид сербов, которые нуждались в духовном окормлении. Из 577 довоенных представителей православного духовенства на территории Хорватии 219 были убиты, а большая часть оставшихся в живых изгнана в Сербию весной 1941 года, поэтому паства, оставшаяся без духовного пастыря, должна была, по расчётам усташей, потянуться в новую церковь в поисках поддержки. Так усташи надеялись посеять смуту среди сербов и расколоть их.