Sebagai seorang manajer, Deschamps memulai kariernya dengan AS Monaco, dan membantu klub untuk memenangkan Coupe de la Ligue pada tahun 2003, dan mencapai Final Liga Champions UEFA 2004, dinobatkan sebagai Ligue 1 Manager of the Year pada tahun 2004. Selama 2006-07 musim, ia membantu mantan klubnya Juventus memenangkan gelar Serie B dan kembali ke Serie A setelah terdegradasi karena keterlibatan mereka dalam Skandal Calciopoli 2006 musim sebelumnya. Dia kemudian mengelola salah satu dari mantan klubnya, Marseille, di mana dia memenangkan gelar Ligue 1 2009-2010, serta tiga gelar Coupe de la Ligue berturut-turut antara 2010 dan 2012, dan gelar Trophée des Champions berturut-turut pada 2010 dan 2011. Pada 8 Juli 2012, Deschamps diangkat sebagai manajer baru tim nasional Prancis , memimpin tim ke perempat final Piala Dunia FIFA 2014, Final Kejuaran Eropa UEFA 2016, dan ia memenangkan Final Piala Dunia FIFA 2018 mengalahkan Kroasia dengan skor 4–2. Setelah kemenangan Prancis di Piala Dunia FIFA 2018 , Deschamps menjadi orang ketiga yang memenangkan Piala Dunia sebagai pemain dan sekaligus manajer bersama Mário Zagallo dan Franz Beckenbauer, Mengikuti Beckenbauer sebagai yang kedua sebagai kapten.