Nacque a Genova nel 1683. Frammentarie e pressoché scarne sono le notizie biografiche sulla vita di Stefano Lomellini, e gli unici fatti salienti che vengono riportati negli annali genovesi sono riferiti ad un suo massimo impegno durante l'assedio di Genova nelle fasi concitate della guerra di successione austriaca del 1746-1747. Assieme ad altri patrizi genovesi si distinse nella difesa della città lungo la linea difensiva della val Bisagno, supportando l'opera di assalto contro l'invasore austriaco perpetrato dal comandante delle truppe franco-spagnole, il marchese di Roquepine.