Lors de la saison 2009, Carlo Janka semble avoir franchi un palier. Il débute l'année avec une neuvième place au géant de Sölden puis crée la surprise en montant sur son premier podium en coupe du monde dans la descente de Lake Louise le avec pourtant le dossard 65, devancé seulement par Peter Fill. Il intègre un nouveau top-10 à l'occasion du géant de Beaver Creek et du super-combiné de Val d'Isère où il a réalisé le meilleur temps de la manche de super G. Ces grandes performances sont confirmées par une première victoire en Coupe du monde le lors du géant de Val d'Isère où avec le dossard 22 il s'impose devant Massimiliano Blardone et Gauthier de Tessières. Cette première victoire est suivie d'une autre victoire en super-combiné cette fois-ci dans la station helvétique de Wengen devant Fill et son compatriote Silvan Zurbriggen. Enfin à Kitzbühel, il est tout près de faire un podium avec une quatrième place au combiné. Il symbolise avec Lara Gut chez les femmes la nouvelle génération du ski alpin suisse avant les mondiaux de Val d'Isère qui se déroulent en février 2009, il est classé avant le début de cette compétition au sixième rang du général.