Dal 31 gennaio 1944 prese parte alla Campagna delle isole Marshall, bombardando Kwajalein. Il 20 febbraio effettuò bombardamenti su Taroa mentre il giorno successivo colpì Wotje. Il 15 marzo si spostò in Papua Nuova Guinea, bombardando Kavieng. Trascorse i mesi estivi nei cantieri di Navy Puget Sound per essere sottoposta ad una revisione, durante la quale i cannoni da 127 mm furono portati da 8 a 14. Tornata in combattimento, il 12 settembre la "Mississippi" fornì supporto durante lo sbarco su Peleliu, nelle Isole Palau. Dopo una settimana di operazioni fece rotta verso Manus, dove rimase fino al 12 ottobre. Ripartita da Manus, il 19 ottobre assistette alla liberazione delle Filippine, bombardando la costa orientale di Leyte. La "Mississippi" era parte della flotta, comprendente le corazzate "Pennsylvania", "West Virginia", "Maryland", "Tennessee" e "California" e gli incrociatori "Portland", "Minneapolis", "Columbia", "Denver", "Louisville", "Phoenix", "Boise" e "Shropshire", che ai comandi del retroammiraglio Jesse Oldendorf prese parte alla battaglia dello Stretto di Surigao, preludio della battaglia del Golfo di Leyte.