O general Bonaparte e sua expedição escaparam às buscas pela Marinha Real e desembarcaram em Alexandria em 1º de julho. Ele travou a Batalha de Shubra Khit contra os mamelucos, a casta militar dominante do Egito. Isso ajudou os franceses a praticar sua tática defensiva para a Batalha das Pirâmides, travada em 21 de julho, por volta de 24 km das pirâmides. As forças do general Bonaparte, de 25 mil, eram aproximadas às da cavalaria egípcia dos mamelucos. Vinte e nove franceses e aproximadamente dois mil egípcios foram mortos. A vitória impulsionou o moral do exército francês.