La cattedrale rischiò di essere danneggiata durante la Guerra sovietico-polacca del 1920.. Durante il periodo sovietico, la cattedrale riuscì a scampare alla demolizione ma non alla chiusura. Nel corso della seconda guerra mondiale divenne un museo della religione e dell'ateismo. Le reliquie di Santa Barbara, una martire del terzo secolo, vi furono traslate dal monastero dorato di San Michele prima che venisse distrutto nel 1934. Dopo la guerra la cattedrale venne riaperta, ed era uno dei pochi posti dell'URSS dove i turisti potevano visitare una chiesa ortodossa funzionante.