1252年開始連續三年糧食欠收，加劇民生艱難。1254年亨利與教宗諾森四世達成協議，為向西西里進兵而向貴族徵收軍費，無視歷年欠收情況而強徵貴族們的三分之一收入，惹起貴族集體不滿。於是在1258年4月由孟福尔伯爵帶領男爵們，武裝進逼亨利，要求其放棄強徵和更好遵守《大憲章》。亨利在武裝貴族們的壓力下，於1258年6月召開史稱「狂暴議會」的會議，會議上貴族們逼使亨利簽訂了《牛津条例》，亨利還被逼遣散外國顧問，改由显赫人士组成的“十五人议会”參與政務，被后世认为是英国议会的起源。后来，亨利三世故态复萌，贵族公然反叛，引发了第二次男爵战争（1264年－1267年）。1264年，孟福尔擒获亨利三世，成为国家的实际统治者。然而15个月后，重振旗鼓的保王党在爱德华王子率领下，在伊夫舍姆战役中击败孟福尔军队，叛乱逐渐被平息，亨利復位。亨利三世对美学富有热情，如西敏寺和约克大教堂采用哥特式建筑风格重建。