Konfederasyon, Birlik ile Doğu'da kanlı bir açmaza karşı savaşırken, Birlik ordusu Batı'da çok daha başarılıydı. Missouri'deki Konfederasyon isyanları, Springfield, Missouri yakınlarındaki Wilson's Creek'teki ilk Konfederasyon zaferine rağmen, federal hükümet tarafından 1863'te bastırıldı. Perryville Savaşı'ndan sonra, Konfederasyonlar da Kentucky'den sürüldü ve bu da büyük bir Birlik zaferiyle sonuçlandı. Lincoln bir keresinde Kentucky hakkında şöyle yazmıştı:"Bence Kentucky'yi kaybetmek tüm oyunu kaybetmekle neredeyse aynı." Vicksburg'un düşüşü Birliğe Mississippi Nehri'nin kontrolünü verdi ve Konfederasyonu ikiye böldü. Sherman'ın Chattanooga ve ardından Atlanta'daki başarıları, Georgia ve Carolinas'ı yok etmesine direnmek için birkaç Konfederasyon kuvveti bıraktı. Dakota Savaşı 1862'de Minnesota'da patlak verdi * Antietam ayrıca, Lincoln'a, ilk Kölelerin Azad Edilmesi Bildirisi'ni yayınlamak için aradığı fırsatı da yarattı. Bildiride, Birlik'e karşı isyan eden eyaletlerdeki tüm kölelerin 1 Ocak 1863'ten başlayarak özgür oldukları açıklanıyordu. Uygulamada Bildiri'nin ilk etkileri pek az oldu; çünkü, sadece Konfederasyon eyaletlerindeki kölelere özgürlük sağlıyor, sınır eyaletlerindeki köleliğe dokumuyordu. Siyasal açıdan ise, köleliğin kaldırılmasının da Birlik'in güvence altına alınmasının yanı sıra, bundan böyle, savaşın açıklanmış bir amacı olduğu anlamına geliyordu.