1805 ging Tirol im Zuge der Napoleonischen Kriege von Österreich an das neu errichtete Königreich Bayern über. Eisenstecken beteiligte sich 1809 an den Tiroler Freiheitskämpfen gegen die Bayern und deren französischen Schutzherren. Dabei stand er an vorderster Front und erwies sich als besonders tapfer und entschlossen. Auch der Oberkommandant der Tiroler, Andreas Hofer, hörte von seinen Taten und berief ihn an seine Seite. Eisenstecken hat wesentlich am Sieg der Tiroler Schützen bei der Zweiten Schlacht am Bergisel (25. und 29. Mai 1809) beigetragen.