W 2009 roku po raz pierwszy sięgnął po medal rangi Mistrzostw Świat, które odbyły się w Miszkolcu, zajął wtedy drugie miejsce w biegu sprinterskim. Rok 2010 Fabian Hertner rozpoczął od zdobycia 3 medali na Mistrzostwach Europy w Biegu na Orientację w Primorsku, gdzie zajął pierwsze miejsce w sprincie, trzecie na dystansie długim oraz pierwsze w sztafecie. Z kolei na Mistrzostwach Świata w Biegu na Orientację 2010, które odbyły się w Trondheim, powtórzył wynik sprzed roku, zajmując drugie miejsce w sprincie.