Nel 1499 Pietro fu costretto dal padre a rientrare a Venezia, a causa dei cambiamenti della politica internazionale sconvolta dall'inizio delle guerre d'Italia contro francesi e spagnoli. Durante la permanenza in patria, Bembo curò nel 1501 l'edizione de "Le cose volgari" (ossia dei "Rerum Vulgarium Fragmenta" e dei "Triumphi") di Petrarca e nel 1502 l'edizione de "Le terze rime" (ossia della "Divina Commedia") di Dante: per la prima volta due autori in lingua volgare divennero oggetto di studi filologici, fino ad allora riservati esclusivamente ai classici antichi. Entrambe le edizioni, stampate da Aldo Manuzio, costituirono le basi di tutte le edizioni successive per almeno tre secoli. Nell'ottobre 1502 il giovane Bembo poté tornare nell'amata Ferrara, dove conobbe Lucrezia Borgia, all'epoca moglie del principe ereditario Alfonso d'Este, con la quale ebbe presumibilmente una relazione. Il ritorno nella città estense però non fu di lunga durata: nell'aprile 1505 (un mese dopo la pubblicazione de "Gli Asolani") Bembo seguì il padre a Roma in ambasceria per conto della Serenissima, ma, anziché rientrare nella città lagunare, si fermò alla corte di Urbino.