Hong participó en los Juegos Asiáticos de 1994 después de la Copa del Mundo, pero se lesionó la rodilla durante el partido de cuartos de final contra . Corea del Sur perdió ante en las semifinales después de que abandonara el torneo. Cuando Park Jong-hwan dirigía la selección de Corea del Sur, Hong entró en conflicto con Park, quien tenía una disposición autoritaria, y fue criticado por formar su facción dentro del equipo nacional. También se especulaba si había jugado el partido con pereza, después de que Corea del Sur perdiera 6-2 ante en los cuartos de final de la Copa Asiática 1996. En la Copa Mundial de la FIFA 1998 en Francia, Corea del Sur fue eliminada en la primera ronda con un empate y dos derrotas. Hong no pudo evitar la derrota del equipo por 5-0 en el segundo juego contra . Fue convocado como jugador mayor de edad para la selección sub-23 de Corea del Sur para los Juegos Olímpicos de 2000, pero se lesionó justo antes del torneo y fue reemplazado por Kang Chul. En la Copa Asiática 2000, Corea del Sur no pudo ganar el torneo al terminar en tercer lugar, pero Hong fue seleccionado para el All-Star Team.