Før 2003-sesongen ble Button byttet ut med Fernando Alonso hos Renault og fikk etter dette kontrakt med BAR. Han ble nå lagkamerat med tidligere verdensmester Jacques Villeneuve. Gjennom sesongen var Button generelt raskere enn Villeneuve, noe som førte til at det var mye ordkrig mellom disse to i pressen. Button krasjet stygt på treningen før Monacos Grand Prix og måtte stå over dette løpet, men endte sesongen på en 9.-plass sammenlagt.