В 2005 году Валоес вместе с национальной командой принял участие в Золотом кубке КОНКАКАФ. На турнире в матче против сборной Гондураса он дебютировал за сборную Колумбии. 9 мая 2007 года в товарищеском матче против сборной Панамы он забил совй первый гол за национальную команду. В том же году Сесар принял участие в Кубок Америки в Венесуэле. На турнире он сыграл в матче против сборной США.