Door zijn successen bij het nationale belofteneftal maakte hij in 2010 promotie. Batista werd door de Argentijnse voetbalbond aangesteld als opvolger van bondscoach Diego Maradona, maar na een teleurstellende CONMEBOL Copa América werd hij in juli 2011 aan de kant gezet. In 2012 ging hij aan de slag bij het Chinese Shanghai Shenhua. Alejandro Sabella werd zijn opvolger bij de Argentijnen.