Nel giugno 2021 si mobilita nella vicenda di Marco Zennaro, amministratore unico di una piccola impresa veneziana, incarcerato da oltre 70 giorni in condizioni disumane in una prigione del Sudan, a Khartum, ostaggio di Abdallah Ahamed, fedelissimo del generale Mohamed Hamdan Dagalo, vice presidente del Consiglio Sovrano che guida il Paese dopo il colpo di Stato del 2019. Il patriarca aveva preso contatto con il nunzio apostolico in Sudan ed Eritrea, Luís Miguel Muñoz Cárdaba, chiedendo un interessamento «sul piano umanitario e per quanto possibile su quello diplomatico». Il patriarca si era detto «vicino alla famiglia di Marco Zennaro, già informata del suo interessamento e della disponibilità del rappresentante pontificio, e ha assicurato il costante ricordo nella preghiera mentre rimane aperto il contatto con il nunzio apostolico per seguire gli ulteriori sviluppi». Il 14 giugno 2021 viene annunciata la scarcerazione di Zennaro al quale sono stati concessi i domiciliari in un albergo, "dietro una forte pressione della Farnesina e anche del Patriarca di Venezia".