Die Mauern des Langhauses sind im unteren Bereich romanisch. 1220 wurde erstmals eine Pfarre in Gutenstein urkundlich erwähnt. Der spätgotische Chor wurde 1487 erbaut. In den Jahren 1670 und 1679 wurde das Langhaus barock umgebaut. Im Zuge der Barockisierung wurde es erhöht und neu eingewölbt. Zusätzlich erfolgte der Einbau der seitlichen Kapellennischen. Der Umbau erfolgte durch Baumeister Peter Baron. Zwischen 1679 und 2000 war die Kirche dem Servitenkloster auf dem Mariahilfberg inkorporiert. In den Jahren 1857 und 1858 erfolgte ein Umbau im neugotischen Stil unter Ernst Karl von Hoyos-Sprinzenstein. Dabei wurden die Maßwerkfenster eingefügt, die nördliche Portalvorhallen an das Langhaus angebaut, das Herrschaftsoratorium am Chor geschaffen und der Westturm errichtet. Der Sakristeianbau erfolgte 1907.