Nach dem Frieden von Lunéville freigekommen, nahm er seine Tätigkeit wieder auf und kommandierte als Feldmarschallleutnant im Dritten Koalitionskrieg die österreichische Feldarmee mit einer Truppenstärke von 5.500 Mann. In der Schlacht bei Wertingen am 8. Oktober 1805 traf er auf die französischen Truppen unter Marschall Joachim Murat, wurde geschlagen und musste kapitulieren. Aufgrund der schwerwiegenden Niederlage, die den weiteren Verlauf des Dritten Koalitionskriegs vorausbestimmte, wurde er nach einem Verfahren vor dem Kriegsgericht 1805 auf die Liste der Inaktiven gesetzt und schließlich 1807 aus der Armee entlassen.