В 1795 году Беловежская пуща оказывается в составе Российской Империи, что приводит к снижению числа животных из-за охоты. Полностью истребляются бобры и медведи, сокращается поголовье зубров, хотя их отстрел разрешён только по дозволению императора. Происходит передача участков пущи в собственность дворянам с последующим сведением лесов. Пожар 1812 года и нашествие Наполеона наносят пуще дополнительный урон. Только при Александре II она снова становится заповедной и начинается восстановление популяции животных, а том числе за счёт ввоза их из Германии.