Após a Copa da Ásia de 2007, Takeshi Okada era o novo técnico e Nakamura ganhou a Kirin Cup 2008 e 2009, e foi importante na classificação da seleção a Copa do Mundo FIFA de 2010 e era titular e um dos principais jogadores do time, mesmo jogando bem abaixo do que podia. Após o problema no Espanyol de Adaptação, passou por um mau momento e também teve uma Lesão e acabou sendo reserva na Copa 2010. Jogando somente contra a Holanda. Nakamura ficou muito triste e chegou a dizer que ele e a Copa do Mundo não se davam bem juntos, se referindo as Lesões em 2002 e 2006 e 2010 e com muita tristeza para ele e todos os fãs, anunciou sua aposentadoria da seleção após a Copa.