Siegfried (Seyfried) Ferdinand von Kollonitsch entstammte dem Adelsgeschlecht der Kollonitz von Kollograd. Er war der älteste Sohn von zehn Kindern des Barons Georg von Kollonitsch (* 1537, † 1599) und dessen Ehefrau Maria Helena von Fuchs zu Fuchsberg (* 1539, † 1603). Kaiser Maximilian II. war sein Taufpate. Während des 15-jährigen Türkenkrieges, an dem er auch seit 1593 selbst teilnahm, ließ sich Siegfried dauerhaft in Ungarn nieder. 1598 erhielt er das ungarische Indigenat und Heimatrecht.