この年は4月にAFC U-19女子選手権マレーシア2006（兼「FIFA U-20女子ワールドカップ ロシア2006」（8月開催）アジア予選）、7月に2006 AFC女子アジアカップ（兼2007 FIFA女子ワールドカップアジア地区予選）、8月になでしこリーグオールスター、11月に1部7位と2部2位との入れ替え戦、12月に第15回アジア競技大会（カタール・ドーハ）および第28回全日本女子サッカー選手権大会と多くの試合が予定されたため、ディビジョン1については日程の調整が難航。そのため前年に行った3回戦総当たりをやめ、2回戦総当たりの「レギュラーリーグ」と、その結果により上位と下位の各4チームずつ1回戦総当たりの「プレーオフ」に変更。またシーズン前には前年と同じく「なでしこスーパーカップ」を行った。ちなみに「なでしこリーグオールスター」は1996年の「第4回バレンタインサッカーフェスティバル　L・リーグオールスター戦」以来10年ぶりの開催である。