El 19 de julio Cunill se presentó con sus hombres a los militares, pero el jefe dijo que era republicano y los despidió malamente. Al fracasar la sublevación en Barcelona, Cunill y otros requetés fueron fusilados a las afueras del cuartel de San Andrés por milicianos del Frente Popular, quienes los dieron a todos por muertos. Según una carta de Alfonso Carlos de Borbón, Cunill se había arrojado al suelo en el momento del fusilamiento, sin recibir ningún balazo. El oficial que mandaba el pelotón, le dio el tiro de gracia, pero solo le hirió ligeramente el cuello. Llegada la noche, volvió en sí. Pudo entrar en una casa, donde le curaron las heridas, y huyó a Navarra, actuando después en el frente de Aragón. Según José Bru Jardí, Cunill había sido uno de los primeros catalanes en pasar al bando nacional.