Το καλοκαίρι του 1974, τα τουρκικά στρατεύματα κατέλαβαν τη Μόρφου, γεγονός που κατέστησε το σωματείο προσφυγικό. Η ΑΕΜ επαναδραστηριοποιήθηκε στη Λεμεσό και παρόλο που αντιμετώπιζε πολλές δυσκολίες, εντούτοις δήλωσε συμμετοχή στο προαιρετικό Ειδικό μικτό πρωτάθλημα Β΄ - Γ΄ κατηγορίας που διοργάνωσε η ΚΟΠ για τις ομάδες Β΄ και Γ΄ κατηγορίας. Τις επόμενες περιόδους της δεκαετίας του '70 η ομάδα κινδύνεψε με υποβιβασμό αλλά κατάφερνε να παραμένει στη Β΄ κατηγορία.