Während des Arabischen Aufstandes 1936–39 spielte es eine wichtige Rolle. Am 15. Mai 1936 rief es dazu auf, keine Steuern an die Briten zu zahlen, in Generalstreik zu treten, sowie die jüdische Einwanderung zu beenden. Im September 1937 wurde das Komitee von der britischen Mandatsmacht verboten, nachdem Lewis Yelland Andrews, der für Galiläa zuständige Mandatsbeamte, von Anhängern von al-Qassam ermordet worden war. Am 18. Mai 1939 formulierte das Hohe Komitee in einer schriftlichen Erklärung seine Zurückweisung des britischen Weißbuchs von 1939, in dem die Anzahl jüdischer Einwanderer nach Palästina festgelegt wurde.