Krogius war auch im Bereich der Sportadministration sehr aktiv. Er war einer der Gründer des Suomen Olympiakomitea und war von 1919 bis 1929 auch dessen Präsident. Von 1906 bis 1917 war er zudem Präsident des finnischen Segelverbandes und war 1907 bei der Gründung des Weltverbandes beteiligt, der International Yacht Racing Union. Auch beim finnischen Turnverband war Krogius zeitweise als Präsident im Amt. Im Bewerbungsverfahren für die Olympischen Spiele 1940 war Krogius Vizepräsident des finnischen Organisationskomitees mit der Bewerberstadt Helsinki. Im März 1920 wurde er Mitglied im IOC und behielt diese Position bis August 1948. Nach seinem Rücktritt wurde er als eine der ersten Personen zum Ehrenmitglied des IOC ernannt.