Zur Spielzeit &lt;a href="Fu%C3%9Fball-Bundesliga%202012/13"&gt;2012/13&lt;/a&gt; wechselte Dante zum FC Bayern München, bei dem er einen bis zum 30. Juni 2016 gültigen Vertrag unterschrieb. Sein erstes Tor für den FC Bayern München erzielte er am 24. November 2012 (13. Spieltag) beim 5:0-Sieg im Heimspiel gegen Hannover 96 mit dem Treffer zum 4:0 in der 63. Minute. Am 28. Spieltag sicherte sich Dante mit dem FC Bayern München seine erste deutsche Meisterschaft. Beim 2:1-Sieg der Münchener im UEFA-Champions-League-Finale 2013 verursachte er einen Strafstoß, durch den Borussia Dortmund zum 1:1 ausglich. Das Finale des DFB-Pokals gegen den VfB Stuttgart am 1. Juni 2013 verpasste Dante wegen einer Abstellung für die brasilianische Nationalmannschaft. Dennoch gewann er nach seiner ersten Saison mit dem FC Bayern München das Triple. Im März 2014 verlängerte er seinen Vertrag bis 2017. 2014 gewann er mit dem FC Bayern München das Double, 2015 erneut die deutsche Meisterschaft.