En el momento de la Segunda Guerra Bóer, Sauer fue acusado de fomentar el sentimiento pro-bóer entre los holandeses del Cabo, aunque, de hecho, trató repetidamente de persuadir a sus electores para que se abstuvieran de la lucha en curso contra el dominio británico. Sin embargo, su hermano fue condenado por ser un rebelde por la causa bóer y encarcelado.