Fils de cultivateur, Nicolas Pasquier s'enrôle dans l'armée à 19 ans comme simple soldat en . Sergent-major au d'infanterie de ligne, il est fait prisonnier de guerre à la bataille de Wissembourg le . Sous-lieutenant en 1875, porte-drapeau en 1879, lieutenant en 1881, capitaine d'habillement au d'infanterie en 1887, passé dans le 58e régiment d'infanterie en 1889, il y devient capitaine adjudant-major en 1899. Il sert d' à au sein du contingent français de la force expéditionnaire internationale envoyée en Chine pour venir à bout de la révolte des Boxers. Promu chef de bataillon en , il est placé hors cadre et nommé par le général Louis André au poste de commandant des prisons militaires de Paris en août 1901 après son retour en métropole. À ce titre, il a pour principale attribution les fonctions de directeur de la prison du Cherche-Midi, où il remplace Forzinetti. Chevalier de la Légion d'honneur depuis 1895, il est promu officier du même ordre en 1903.