戦後、1947年（昭和22年）に北白川宮能久親王を合祀。能久親王は1895年（明治28年）に近衛師団長として台湾征討に参加し、薨去。その後、台湾神宮に祀られた（戦後は廃社となる）。生前、1883年（明治16年）に当地の浅間牧場の開設に携わった縁から、能久親王の功績を後世に伝えるものとして当社に祀り、これを機に社名を「牧宮神社」とした。