Al termine della stagione fa ritorno al Palermo, squadra nel quale è convinto di restare fin quando il 27 agosto 2004 ritorna all'Atalanta in prestito con diritto di opzione sulla compartecipazione. Vari infortuni e seguenti ricadute ne condizionano il rendimento nel campionato di Serie A, nel quale segna 5 reti in 28 partite. A fine stagione l'Atalanta esercita il diritto di riscatto della comproprietà, e nella stagione 2005-2006, anche questa costellata da infortuni, colleziona 8 presenze in campionato senza reti.