Von 1308 bis 1309 begleitete sie ihn nach Irland. Ihr Großvater überließ ihr 1308 seine irischen Besitzungen. Nach einem Aufenthalt in England begleitete sie von 1310 bis 1312 erneut ihren Mann nach Irland, wo dieser sich um die irischen Güter kümmerte. Roger Mortimer stieg später zum Justiciar und zum King's Lieutenant von Irland auf. 1318 kehrte er nach England zurück, wo er rasch in die innenpolitischen Konflikte während der Herrschaft von Eduard II. verwickelt wurde. Im März 1321 gehörte er zu den Marcher Lords, die gegen den königlichen Günstling Hugh le Despenser rebellierten. Vermutlich sah Joan ihren Mann zuletzt im Sommer 1321, ehe dieser sich im Januar 1322 dem König ergeben musste. Mortimer wurde im Tower of London inhaftiert.