Fue entregado al Tribunal para los Juicios de Núremberg bajo la acusación de conspirar para cometer crímenes de guerra, crímenes contra la paz y crímenes contra la humanidad, pero fue absuelto por falta de pruebas. Más tarde fue arrestado y condenado a nueve años de prisión como parte de un proceso de desnazificación. Sin embargo, fue puesto en libertad en 1950, antes de cumplir la condena, ya que estuvo claro para el tribunal que Fritzsche era inocente de las acusaciones.