In 1978 nam Musyoki namens Kenia deel aan de Gemenebestspelen in het Canadese Edmonton. Hij eindigde als tweede op de 5000 m achter zijn landgenoot Henry Rono. Dat jaar won hij tevens zilver op de 5000 m en 10.000 m bij de Afrikaanse Spelen. Ook werd hij dat jaar door de Kenianse atletiekbond gesommeerd met onmiddellijke ingang terug te keren naar eigen land, omdat hij ongeoorloofd deelgenomen zou hebben aan de Weltklasse Zürich. Bij deze meeting eindigde hij ondanks een persoonlijk record van 13.24,89 op een teleurstellende vijfde plaats op de 5000 m.