Nach der Gründung des Staates Griechenland wurde das Gebiet nach ihr benannt und bildete nach 1830 zusammen mit Fokida zunächst eine Präfektur "Fthiotis und Fokis". Die damalige Präfektur Fthiotis und Fokis umfasste 1879 eine Fläche von 6.426 oder 6.084 km² (je nach Berechnungsweise) und hatte 128.440 Einwohner. Im türkisch-griechischen Krieg von 1897 fanden auch Kämpfe im Gebiet der heutigen Präfektur Fthiotida statt. Nach dem griechischen Angriff auf die damalige griechisch-türkische Grenze südlich des Olymp mussten sich die griechischen Streitkräfte schrittweise nach Süden zurückziehen. Am 5. Mai 1897 eroberten türkische Streitkräfte Farsala; die griechischen Einheiten zogen sich darauf geordnet nach Domokos in den Norden der späteren Präfektur Fthiotida zurück. Die Stellungen waren im weiteren Verlauf gegen die türkischen Angriffe nicht zu halten, so dass die griechische Armee sich schrittweise zunächst nach Almyros, dann zu den Thermopylen (20. Mai 1897) zurückziehen musste. Zu weiteren Kriegshandlungen kam es nach Intervention des russischen Zaren und nachfolgendem Waffenstillstand aber nicht mehr.