"Mika" speelde bij de Belgische nationale ploeg van 1993 tot 2001. Hij haalde slechts 18 selecties en 14 caps waarin hij een keer scoorde. Zijn debuut vond plaats op 13 februari 1993 tegen Cyprus (0-3 winst) waar hij na 87 minuten mocht invallen voor Enzo Scifo in de voorronde voor het WK van 1994. Zijn laatste cap dateerde van 7 oktober 2000 toen hij 2 minuten voor tijd mocht invallen voor Marc Wilmots in de met 0-4 gewonnen match tegen Letland tijdens de voorronde voor het WK van 2002. Hij werd nog een keer geselecteerd op 24 maart 2001 tegen Schotland (2-2), maar bleef de hele match op de bank. Goossens kende weinig geluk bij de nationale ploeg. Hij speelde in de voorronde van drie wereldkampioenschappen (1994, 1998 en 2002), maar zat telkens bij de afvallers uit de voorselectie. Ook voor EURO 2000 viel hij uit de boot wegens een blessure. Hij stond uiteindelijk slechts drie keer aan de aftrap, waaronder een vriendschappelijke wedstrijd tegen Duitsland in 1995, waarin hij zijn enige doelpunt scoorde voor de Duivels (1-2 verloren), overigens het eerste Belgische doelpunt in het nieuwe Koning Boudewijnstadion.