Svoji klubovou kariéru započal v roce 1988 v Realu Madrid, pouze však v B týmu a tak se postupně přes Castillu, Elche, Méridu UD a Celtu Vigo dostal r. 1994 zpět do Realu, kde však do roku 1998 odehrál pouze 41 zápasů a proto přestoupil do Valencie, kde nahradil odcházejícího Andoni Zubizarretu a kde se nastálo usadil na postu jedničky klubu a v letech 1998–2002 i španělské reprezentace, za kterou odchytal EURO 2000. Cañizares se jako jednička dvakrát za sebou dostal s Valencií do finále Ligy mistrů, v obou případech byla Valencia poražena (v sezóně &lt;a href="Liga%20mistr%C5%AF%20UEFA%201999/00"&gt;1999/00&lt;/a&gt; porážka 0:3 s Realem Madrid a v sezóně &lt;a href="Liga%20mistr%C5%AF%20UEFA%202000/01"&gt;2000/01&lt;/a&gt; porážka s Bayernem Mnichov na penalty). Největší smůlu si však vybral v roce 2002, kdy měl jet jako španělská reprezentační jednička na Mistrovství světa, avšak před šampionátem si zranil v koupelně nohu, když na ni upustil lahvičku s vodou po holení.