Rodrigo Fabri za sobą występy w reprezentacji Brazylii, w której zadebiutował 18 grudnia 1996 w towarzyskim meczu z reprezentacją Bośni i Hercegowiny. W 1997 roku wygrał z "canarinhos" Puchar Konfederacji, chociaż na turnieju był rezerwowym i nie zagrał w żadnym meczu. Ostatni mecz w reprezentacji Rodrigo Fabri zagrał 7 grudnia 1997 w towarzyskim meczu z reprezentacją RPA. Ogółem w latach 1996-1997 wystąpił w barwach "canarinhos" w 3 meczach i strzelił 1 bramkę.