Maialen Chourraut ist mit ihrem Trainer Xabier Etxaniz verheiratet, 2013 wurde ihre Tochter geboren. 2014 kehrte sie aufs Wasser zurück. Bei den Europameisterschaften in Wien belegte sie den 18. Platz in der Einzelwertung, gewann aber Silber mit der Mannschaft. Im Jahr darauf gewann sie in Markkleeberg den Europameistertitel. Bei den Weltmeisterschaften 2015 in London erreichte sie den fünften Platz. 2016 belegte sie bei den Europameisterschaften den sechsten Platz. Bei den Olympischen Spielen 2016 in Rio de Janeiro erreichte sie als Elfte der Qualifikation das Semifinale. Dort belegte sie den dritten Platz hinter Corinna Kuhnle und der Britin Fiona Pennie. Im Finale siegte sie mit über drei Sekunden Vorsprung vor Luuka Jones aus Neuseeland und Jessica Fox aus Australien.