In het seizoen 2009/10 leende Genoa hem voor een jaar uit aan Portsmouth FC. Bij de Engelse club werd hij een ploegmaat van onder meer Papa Bouba Diop, Kevin-Prince Boateng en oud-ploeggenoot Aruna Dindane. De club verkeerde in financiële moeilijkheden en speelde een slecht seizoen. Portsmouth belandde op de tweede speeldag op de laatste plaats en raakte die positie niet meer kwijt. Vanden Borre zelf speelde regelmatig. In totaal kwam hij 19 competitiewedstrijden in actie voor "The Blue Army". Op de 33ste speeldag werd hij tegen Blackburn Rovers na een uur uitgesloten. Met Portsmouth stond hij (als bankzitter) op 15 mei 2010 in de finale van de strijd om de FA Cup. Daarin verloor de ploeg van trainer-coach Avram Grant met 1-0 van Chelsea door een treffer in de 59ste minuut van Didier Drogba.