Khi Chiến tranh Vệ quốc vĩ đại nổ ra ngày 22 tháng 6 năm 1941, ông giữ chức Tham mưu trưởng Phương diện quân Tây Bắc. Trong những ngày đầu tiên của cuộc chiến, phương diện quân bị thiệt hại nặng nề bởi những đợt xung kích của Cụm tập đoàn quân Bắc của Đức trong chiến dịch phòng thủ chiến lược Baltic. Ngày 1 tháng 7 năm 1941, ông bị cách chức, sau đó bị bắt ngày 11 tháng 7 năm 1941. Theo hồ sơ của NKVD Liên Xô, ""y đã bị bắt bởi lời khai của DYBENKO, KOCHERGIN và YEGOROV, với tư cách là thành viên của tổ chức Trotskyist, và y bị cáo buộc về các hoạt động phá hoại theo lời khai của các nhân chứng RUBTSOV, DEREVYANKO, KASHIRSKY và KORENOVSKY. Y thú nhận đã không hoạt động trong ban lãnh đạo quân khu.""