Raïdou Boina Bacar réalise ses débuts avec l'équipe nationale des Comores lors d'un match de qualification pour le Championnat d'Afrique des nations de football 2016 contre le Zimbabwe le 21 juin 2015 (défaite 2-0). Il dispute les qualifications pour le Championnat d'Afrique des nations de football 2018, marquant un but contre le Lesotho le 23 juillet 2017 (victoire 2-0). Il dispute la Coupe COSAFA 2019 qui voit les Comoriens éliminés en quarts de finale ; il marque un but en phase de groupes contre l'Eswatini. Il joue également les Jeux des îles de l'océan Indien 2019.