Дебют в основній команді припав на матч проти збірної Кот-д'Івуару, в якому Амелія замінив Крістіана Абб'яті. В статусі дублера Джанлуїджі Буффона Амелія був у складі збірної на переможному чемпіонаті світу 2006 року, а також на чемпіонаті Європи 2008 року та Кубку конфедерацій 2009 року. Всього за національну збірну провів 9 матчів, в яких пропустив 8 голів.