Zu Beginn des Sezessionskrieges wurde er am 18. September 1861 Oberst und Kommandeur des 8. Kavallerieregiments der Freiwilligentruppen von Illinois. Als solcher führte er diese Einheit während des Halbinsel-Feldzuges und in der Schlacht von Williamsburg am 5. Mai 1862. Danach war er Kommandeur des 17. Kavalleriebrigade der Army of the Potomac und wurde nach der Teilnahme am Feldzug um Maryland am 5. Dezember 1862 zum Brigadegeneral befördert. Aufgrund von Kriegsverletzungen schied er aus dem aktiven Militärdienst aus und kandidierte stattdessen erneut für den US-Kongress.