Under bomberaidene mot Dresden 13. februar 1945 oppholdt Rudolf Mauersberger seg i Dresden. Huset han oppholdt seg ble truffet av bomber, men Mauersberger ble uskadd, bortsett fra en lammelse i hånden. Kreuzkirche og det meste av korarkivet ødelagt. Mauersberger hadde prøvd å finne guttene i koret, Dresdner Kreuzchor i skolebygningen. Da også denne ble truffet av bomber forsvant guttene derifra i panikk. Elleve korgutter døde under angrepene.