В 1995 году Картер поступил в Университет Северной Каролины в Чапел-Хилл, став игроком баскетбольной команды ВУЗа. Он выступал за «Тар Хилз» на протяжении трёх лет, с 1995 по 1998 годы. Его тренером был Дин Смит, а позднее Билл Гатридж. Картер помог команде дважды выйти в «Финал Четырёх» (1997, 1998), в обеих играх он был самым результативным игроком. В 1998 году Винс был признан лучшим защитным игроком NCAA, а также был лучшим в лиге по проценту реализации бросков с игры (59,1 %). В том же году его выбрали во вторую сборную всех звёзд NCAA. Вслед за своим партнёром по команде Антуаном Джеймисоном, Картер выставил свою кандидатуру на Драфт НБА 1998 года.