En , lors de la libération de Saint-Malo, face à la résistance de la garnison allemande, l'île fut intensément pilonnée pendant près d'un mois par l'artillerie terrestre américaine, par deux cuirassés britanniques et surtout par des bombardiers alliés, qui utilisèrent, outre des bombes classiques, des bombes au phosphore et massivement des bombes au napalm. Contrairement à ce qui est parfois affirmé, Cézembre ne fut pas le premier lieu où fut utilisé le napalm pendant la guerre. La première utilisation de cette nouvelle arme eut lieu quelques semaines auparavant, en , lors de la prise de l'île de Titian dans le Pacifique et l'armée américaine l'utilisera également ponctuellement dans le bocage normand lors de la bataille de Normandie. Près de bombes sont larguées sur Cézembre. L'île fut probablement le site le plus bombardé au kilomètre carré des zones de combats lors de la libération de l'Europe de l'occupation allemande. La garnison ne se rendit que le 2 septembre, deux semaines après la reddition du fort d'Aleth qui était alors dernier point de résistance continental allemand de la "Forteresse" Saint-Malo. Cette reddition fut autorisée par le commandement allemand à la suite d'une tentative manquée pour ravitailler l'île. Sans eau potable, comptant 90 % de blessés, il était devenu impossible à la garnison allemande-italienne de se défendre contre un assaut amphibie que les Américains s'apprêtaient à lancer. Les soldats allemands et italiens survivants ayant résisté dans cet intense bombardement furent salués militairement par les officiers américains prenant pied sur l'île.