После Второй мировой войны носила название "Научной библиотеки Вильнюсского государственного университета имени В. Капсукаса". В то время библиотека прилагала много усилий для возвращения старых фондов, которые были рассеяны вследствие закрытия Вильнюсского университета после восстания 1831 года. По инициативе университета, при поддержке ЦК Компартии Литвы было получено согласие учреждений, имевших книги библиотеки Вильнюсского университета, вернуть их. Первый комплект книг числом 4000 библиотека получила от Библиотеки АН СССР в Ленинграде в 1956 году, затем от нее было получено 1100 томов в 1958 году и 4300 томов в 1959 году. В числе этих книг были сочинения А. Снядецкого и Я. Снядецкого, И. Лелевеля, «Постилла» М. Даукши. В 1958 году было получено более 7500 томов из Библиотеки АН УССР, в том числе сочинения Аристотеля, Геродота, Плутарха, Канта, Лессинга, Эйлера, Руссо, Вольтера, Монтескье, социалистов-утопистов Оуэна и Мора, профессоров Вильнюсского университета Снядецких, С. Юндзиласа, Почобута, Данилавичюса, бывшего директора библиотеки Гродека. В 1959 году было получено 700 томов из библиотеки Харьковского университета, в том числе много изданий XV века. Всего к 1966 году было возвращено более 15000 томов.