Han var søn af værtshusholder Johan Gottfried Krætzmer (ca. 1761-1839) og Marie Jensdatter (Lyngbye) (ca. 1765-senest 1834). I 1826 blev Krætzmer ansat som oboist i Kapellet, hvor han var til 1849, da han blev fyret på grund af dårlig opførsel. Siden var han organist ved Kastelskirken. Han døde under koleraepidemien.