2007-2008 sezonu ara transfer döneminde Galatasaray’a katılmıştır. Rigobert Song gibi bir dünya yıldızının 2008 Afrika Uluslar Kupası’nda bulunduğu sırada forma şansı bulan Emre, Galatasaray defansına çok çabuk uyum sağlamıştır. 2009-2010 sezonunda ise fazla forma şansı bulamamıştır.