In den Jahren 2000 und 2001 war Kyōko Hamaguchi dann nicht mehr so erfolgreich. Sie kam bei der Weltmeisterschaft 2000 in Sofia hinter Christine Nordhagen aus Kanada und Edyta Witkowska aus Polen auf den 3. Platz und verfehlte bei der Weltmeisterschaft 2001 in Sofia mit einem 4. Platz gar die Medaillenränge. Dabei verlor sie u. a. auch gegen Nina Englich aus Deutschland.