En agosto presidió un concilio en Benevento en el que excomulgó a Clemente III, prohibió la la investidura por laicos y promovió la cruzada de Mahdía, una acción armada contra los musulmanes del norte de África, un precedente de lo que serían luego las Cruzadas. Cayó enfermo durante el desarrollo del concilio y se retiró por última vez a la abadía de Montecasino, donde murió el 16 de septiembre de 1087.