Pierwszy sukces w karierze Shiho Kusunose osiągnęła w 2001 roku, kiedy zdobyła brązowy medal w wieloboju podczas mistrzostw świata juniorów w Seulu. W zawodach tych lepsze okazały się jedynie jej rodaczka Emi Tanaka oraz Claudia Pechstein z NRD. Nigdy nie zdobyła medalu w kategorii seniorek; jej najlepszym wynikiem było czwarte miejsce wywalczone podczas sprinterskich mistrzostw świata w Hamar. Walkę o podium przegrała tam z Amerykanką Chris Witty. W tym samym roku czwarte miejsce zajęła również w biegu na 1000 m podczas dystansowych mistrzostw świata w Warszawie. Tym razem w walce o medal lepsza była Niemka Franziska Schenk. Wielokrotnie stawała na podium zawodów Pucharu Świata, odnosząc przy tym pięć zwycięstw. Najlepsze wyniki osiągnęła w &lt;a href="Puchar%20%C5%9Awiata%20w%20%C5%82y%C5%BCwiarstwie%20szybkim%201994/1995"&gt;sezonie 1994/1995&lt;/a&gt;, kiedy zajęła drugie miejsce w klasyfikacji końcowej 1000 m. W tej samej klasyfikacji była też trzecia w &lt;a href="Puchar%20%C5%9Awiata%20w%20%C5%82y%C5%BCwiarstwie%20szybkim%201995/1996"&gt;sezonie 1995/1996&lt;/a&gt;. W 1994 roku wzięła udział w igrzyskach olimpijskich w Lillehammer, zajmując między innymi szóste miejsce w biegu na 1000 m. Na rozgrywanych cztery lata później igrzyskach w Nagano jej najlepszym wynikiem było jedenaste miejsce na tym samym dystansie. W 1998 roku zakończyła karierę.