V roce 2007 byl do aktivní služby povolán rezervista námořnictva Mark Lippert, který působil jako zahraniční šéfporadce senátora Baracka Obamy z Illinois. Lippert jej před nasazením v Iráku oslovil, aby ho ve funkci nahradil. McDonough tak nastoupil na pozici senátorova zahraničního poradce, kde setrval až do Obamova vítězství v prezidentských volbách 2008.