В 1798 году был произведён в контр-адмиралы. В сражении при Абукире Декрес командовал с борта корабля «Вильгельм Телль» обсервационной эскадрой; прославился руководством сопротивления при в 1798 году, несмотря на то, что в конце концов был вынужден сдаться англичанам.