Накануне вторжения в СССР Гитлер одобрил восстановление айнзацгрупп СС. В марте 1941 года он обратился к своим генералам, выразив намерение сокрушить Советский Союз и уничтожить его интеллектуальную и политическую элиту. Его «Указания в особых сферах» к Директиве № 21 сообщают о неких задачах, которые рейхсфюрер СС должен выполнить на территории СССР, и о наделении Гиммлера полной свободой в рамках выполнения этих приказов. Тем самым Гитлер пытался предотвратить внутренние столкновения наподобие тех, которые возникли в ходе польской кампании: некоторые генералы пытались привлечь командиров айнзацгрупп к ответственности за военные преступления.