Aguirregaray spielte in der U-20-Nationalmannschaft Uruguays und feierte dort unter Trainer Diego Aguirre am 31. Juli 2008 beim Torneo Ciudad de Trinidad in der Partie gegen Paraguay. Insgesamt stand er 20-mal für diese Auswahl auf dem Platz und erzielte zwei Treffer. Er nahm mit der U-20 sowohl an der U-20-Fußball-Südamerikameisterschaft 2009 als auch an der U-20-Fußball-Weltmeisterschaft 2009 in Ägypten teil, wo er in den Gruppenspielen gegen Ghana und Usbekistan zum Einsatz kam.