Во время австро-прусской войны 1866 года Вердер, командуя (с 1865) 3-й пехотной дивизией, находился в составе II армейского корпуса в армии принца Фридриха-Карла, и участвовал в боях при Гичине и Кениггреце. За отличие был награждён орденом «Pour le Mérite» (20 сентября 1866).