Pero pronto se desvelaron también algunos de los problemas fundamentales de esta tecnología: los residuos radiactivos, que mantienen su peligrosidad durante decenas y hasta centenares de miles de años, y las enormes cantidades de plutonio que produce la industria atómica, que podían contribuir (y de hecho lo hicieron) a la proliferación nuclear. Otros problemas no menos graves se hicieron patentes más adelante (entre ellos el peligro de accidentes como el de Chernóbil).