В 1714 году И. М. Головин уже на Балтике, где принял отряд из 9 скампавей — быстроходных судов русского галерного флота, командуя которыми внёс свой вклад в победе в сражении под Гангутом. В 1715 году он попал в плен к шведам. Однако в том же году И. М. Головина обменяли на пленных шведских офицеров, и он продолжил служить отечеству. В 1717 году Пётр назначает Головина «обер-сарваером».