Стал широко известен в 1992 году, после упразднения в стране должности президента, когда на заре гражданской войны (1992—1997) стал председателем Верховного Совета Таджикистана в качестве компромиссной кандидатуры между коммунистами и неокоммунистами с одной стороны, и исламскими, националистическими и либерально-демократическими силами (Объединённая таджикская оппозиция) с другой. Является противоречивой фигурой. Сторонники считают его личностью, которая путём компромиссов и переговоров с Объединённой таджикской оппозицией сумела остановить семилетнюю гражданскую войну и сохраняет стабильность и мир в стране, противники обвиняют в авторитарном правлении, устранении или изгнании из страны своих политических конкурентов и реальной оппозиции, насаждении культа личности, нарушениях прав и свобод человека, в доведении страны до тяжёлой социально-экономической ситуации, в способствовании расцвету безработицы, коррупции и политическо-экономического непотизма в стране.