В 356 году до нашей эры фокейцы под командованием Филомела захватили и разграбили Дельфы, что привело к Третьей Священной войне (356–346 годы до нашей эры), которая закончилась поражением фокейцев и возвышением Македонии при Филиппе II. Это привело к Четвертой Священной войне (339 год до н. э.), кульминацией которой стала битва при Херонее (338 до н. э.) и установление македонского владычества над Грецией. В Дельфах македонское правление было заменено этолийским в 279 году до нашей эры, когда галльское вторжение было отбито, а после этолийцев римлянами в 191 году до нашей эры. Это место было разграблено Луцием Корнелием Суллой в 86 году до нашей эры, во время Митридатских войн, и Нероном в 66 году нашей эры. Хотя последующие римские императоры династии Флавиев внесли свой вклад в восстановление этого места, оно постепенно утратило своё значение.