La Misión de San Francisco Solano fue la 21.ª y última misión construida en Alta California, y la localizada más al norte de esa provincia. Fue la única misión construida en Alta California después de que México se independizó de España. La dificultad de su comienzo demuestra la confusión resultante de ese cambio de gobernanza. El gobernador de California quería una fuerte presencia mexicana al norte de la bahía de San Francisco para evitar que los rusos que habían establecido Fort Ross en la costa del Pacífico se movieran hacia el interior. Un fraile franciscano joven de la Misión de San Francisco de Asís quería ir a un lugar con un mejor clima y con acceso a un mayor número de conversos potenciales.