Im Zweiten Weltkrieg traf es den Bahnhof insbesondere am 15. Februar 1944 schwer; bei einem alliierten Luftangriff durchschlug eine Fliegerbombe die Decke des Bahnhofs, sodass der Betrieb zeitweilig ausgesetzt werden musste. Aufgrund des nahenden „Endkampfes“ und der schlechten Energieversorgung stellte die BVG den Betrieb auf der Strecke Wittenbergplatz – Ruhleben zum 25. April 1945 ein. Im Gegensatz zu vielen anderen Strecken im Berliner U-Bahn-Netz hatte der Streckenast zwischen Ruhleben und "Knie" relativ geringe Schäden erlitten, sodass bereits zum 17. Mai 1945 erste Pendelverkehre aufgenommen werden konnten; die komplette Linie AI auf der Strecke Ruhleben – Pankow fuhr ab dem 15. September 1946 wieder.