Le 8 novembre 2019, Jokić inscrit le panier victorieux contre les 76ers de Philadelphie à 1,2 seconde de la fin du match, pour donner aux Nuggets une victoire de 98-97, après un déficit de 21 points dans le match. Le match suivant, il marque de nouveau le panier de la victoire, dans une victoire 100-98 en prolongation contre les Timberwolves du Minnesota. Le 6 janvier 2020, il inscrit 47 points contre les Hawks d'Atlanta à l’extérieur, dans une victoire 123-115, son nouveau record en carrière. Le 4 février, il enregistre 30 points, 21 rebonds et 10 passes décisives dans une victoire 98-95 sur le Jazz de l'Utah. Il s'agit du premier match en 30/20/10 d’un joueur NBA depuis quatre ans, et seulement le depuis Kareem Abdul-Jabbar en 1976. Le 30 janvier, Jokić est sélectionné pour son deuxième NBA All-Star Game. À la fin de la saison, dans la "Bulle d'Orlando", en raison de la suspension de la saison 2019-2020, il est élu dans la All-NBA Second Team.