Am 15. September 1866 folgte seine Ernennung zum Kommandanten von Torgau und am 31. Dezember 1866 erhielt Blanckensee den Charakter als Generalmajor. Im Krieg gegen Frankreich befehligte er eine kombinierte Infanterie-Brigade der 3. Reserve-Division, die er bei der Einschließung von Metz führte. Für seine Leistungen in der Schlacht von Noisseville wurde Blanckensee mit dem Eisernen Kreuz II. Klasse ausgezeichnet. Während der Belagerung von Péronne erkrankte er an Gehirntyphus, wurde nach Amiens gebracht und verstarb dort.