1959年骚乱之后，在色拉寺的所有属寺中，扎西曲林日追的命运最为糟糕。在超过30年的时间里，该寺被完全忽视，濒临完全毁灭。1990年代初，帕绷喀仁波切的一位学僧，开始修复扎西曲林日追。到21世纪初，两位高僧留在该寺管理，他们也获得达旦日追（Takten Hermitage）的尼姑的协助， 这些尼姑住在山上更高处。