In 1570 werden op uitnodiging van toenmalig Bisschop Adam Konarski, de Jezuïeten naar Poznań / Posen gehaald en kregen toestemming in de voormalige kerk van Sint-Stanislaus te gaan resideren. In 1651 begon men met de bouw van een nieuwe kerk, waarvoor de plannen uit Rome kwamen. Het werk begon echt aan te vangen onder de hand van architect Tomansz Poncino. De Zweedse Zondvloed zorgde echter voor vertraging en veel werk werd uitgesteld. In 1705 was de kerk nog steeds niet volledig voltooid, toch werd de kerk in datzelfde jaar ingewijd. In de periode tussen 1727 en 1732 herontwierp architect Pompeo Ferrari de hoofdfaçade en een deel van het interieur van de kerk, onder andere het hoofdaltaar. Onder zijn leiding werd de kerk voltooid.