2013年2月，金基正与金沙朗出战德國羽毛球黃金大獎賽，在男双準决赛以1比2（21-15、19-21、13-21）不敌赛会6号种子、中国的柴飚/洪炜。同年4月，他参加中華民國臺北举办的亞洲羽毛球錦標賽，他与搭档的金沙朗被列为赛会3号种子在首圈以2比0（21-19、21-12）击败了新加坡的丹尼·巴瓦·克里斯南塔/刘意；在次圈，奋战三局以2比1（21-13、23-25、21-11）力克中华台北强档的陳宏麟/呂佳彬；八强中，鏖战三局以2比1（21-16、21-23、21-17）击退了泰国强档的玛尼蓬·宗集/尼迪蓬·潘普佩克；四强中，再次陷入苦战以2比1（19-21、21-13、21-14）逆转了赛会2号种子、日本强档的遠藤大由/早川賢一；决赛中，直落两局以0比2（13-21、20-22）不敌世界第一、队友的高成炫/李龍大，未能卫冕。同期4月，他与金沙朗出战印度羽毛球超級賽，在男双準决赛以0比2（11-21、13-21）不敌赛会3号种子、队友的高成炫/李龍大。同年7月，他代表韓國参加俄羅斯喀山舉行的世界大學生運動會，助韩国队赢得混合團體金牌；此外，还与两位搭档的洪智勳以及金昭映分别赢得男子雙打铜牌和混合雙打金牌，亦是本届世大运双冠王得主。同年8月，他參加中國廣州舉行的世界羽毛球錦標賽，分別與鄭景銀和金沙朗出戰混合雙打及男子雙打項目。在混合雙打方面，他與鄭景銀首圈以2比0輕取德國組合，第二圈再以2比0（21-18、21-19）力克5號種子、馬來西亞的陳炳順/吳柳螢晉級；但在第三圈就以1比2（16-21、21-11、11-21）不敵日本的早川賢一/松友美佐紀，16強止步。至於男雙方面，他與金沙朗被列為5號種子，故在首圈輪空；第二圈以2比0輕取中華台北的陳宏麟/呂佳彬後，第三圈又以2-1反勝隊友、12號種子的申白喆/柳延星晉級。及至半準決賽，他們面對2號種子、馬來西亞的古健傑/陳文宏，以2比0獲勝；但在準決賽與3號種子、丹麥組合玛蒂亚斯·鲍伊/卡斯腾·摩根森的對戰中，卻在領先一局下以1比2（23-21、18-21、18-21）被逆转，僅得季軍。同年9月，他分别与金沙朗以及金昭映出战中華台北羽毛球黃金大獎賽，在男双决赛以2比0（21-11、21-11）击败了赛会4号种子、中华台北强档的李勝木/蔡佳欣，赢得黃金大獎賽男双冠军；而混双準决赛以0比2（18-21、18-21）不敌赛会3号种子、队友的申白喆/張藝娜。同年11月，他分别与金沙朗以及金昭映出战韓國羽毛球黃金大獎賽，在男双决赛以2比1（21-15、18-21、25-23）击败了赛会5号种子、队友的高成炫/申白喆，赢得黃金大獎賽男双冠军；而混双準决赛以1比2（14-21、21-19、14-21）不敌队友的姜志旭/崔惠仁。同期11月，他与金昭映出战中國羽毛球首要超級賽，在混双準决赛以0比2（9-21、11-21）不敌赛会2号种子、印尼强档的通托维·艾哈迈德/利利亚纳·纳西尔。同样11月，他与金沙朗出战香港羽毛球超級賽，在男双决赛以1比2（21-12、15-21、18-21）不敌队友的李龍大/柳延星，赢得亚军。