V Kongu probíhá již celá desetiletí genocida pygmejských kmenů Mbuti, Lese a Ituri. Během druhé války v Kongu (1998–2003) byli Pygmejové loveni a někdy také pojídáni jedinci z obou stran konfliktu, kteří věřili, že jim toto jednání dodá magické síly. Na východě země byla během války vyhlášena operace s názvem Effacer le tableau, která měla za cíl masové vyvraždění pygmejů v tamní oblasti. Během této operace zemřelo mezi 60 000 a 70 000 Pygmeji.