Después de los sucesos del 11 de septiembre de 2001, la República de Azerbaiyán se unió a las medidas antiterroristas de la ONU. La República de Azerbaiyán ha trabajado en estrecha colaboración con el comité de la onu sobre la lucha contra el terrorismo y el comité de sancciones de Afganistán. El octubre de 2001 Azerbaiyán participó en las operaciones antiterroristas en Afganistán y envió militar para colaborar con las fuerzas armadas internacionales sobre protección de la seguridad en Afganistán.