В 1926 году начался Северный поход, Бай Чунси стал заместителем начальника штаба НРА. В начале 1927 года, командуя авангардом восточной колонны, он из провинции Цзянси вошёл в провинцию Чжэцзян. В апреле 1927 года Бай Чунси принял участие в устроенной Чан Кайши резне коммунистов в Шанхае. В ходе боевых действий в 1927 году Бай Чунси разгромил войска милитариста Сунь Чуаньфана, а также выступившего осенью 1927 года против Чан Кайши Тан Шэнчжи.