En septembre 2012, "The Atlantic" rapporte que Terry Jones fut impliqué dans la promotion d'un film dénigrant l'islam : "L'Innocence des musulmans". Le film a suscité des protestations en Égypte et en Libye. Au Caire, les manifestants ont attaqué l'ambassade américaine et brûlé le drapeau américain. Le consulat américain de Benghazi, en Libye, a été en grande partie incendié et pillé. L'ambassadeur J. Christopher Stevens et trois autres citoyens américains furent tués le .