Baatarjav osallistui paralympialaisiin ensimmäistä kertaa vuonna 2000. Tuolloin hän oli henkilökohtaisessa kilpailussa kuudes hävittyään puolivälierissä. Baatarjav sijoittui viidenneksi Ateenan kisoissa 2004 ja oli seitsemäs vammaisjousiammunnan MM-kisoissa 2007. Pekingin paralympialaisissa 2008 hän voitti kultaa peitottuaan finaalissa Ranskan Fabrice Meunierin pistein 94–90.