Mathias Joggi vertrat sein Heimatland bisher zwei Junioren-Weltmeisterschaften. Bei der U18-Junioren-Weltmeisterschaft 2004, Division I schaffte er mit der U18-Auswahl den Aufstieg in die Top-Division der Weltmeisterschaft. Zwei Jahre später bei der U20-Junioren-Weltmeisterschaft 2006 belegte er mit seiner Mannschaft den siebten Platz. Zudem gehörte er mit sieben Scorerpunkten zu den zehn besten Scorern der U20-Welttitelkämpfe.