Prahan kevään muutokset tukahdutettiin neuvostojoukoin elokuussa 1968. Turnovský päätti tällöin muuttaa Itävaltaan. Tämän jälkeen hän työskenteli Norjan kansallisoopperassa ja Bonnin oopperassa. Monet hänen levytyksistään kuitenkin tuhottiin Tšekkoslovakiassa poliittisista syistä. Vuoden 1989 jälkeen Turnovský palasi säännöllisesti esiintymään kotimaahansa, mutta hän myös opetti Grazin musiikin ja esittävien taiteiden yliopistossa. Vuosina 1992–1995 hän toimi Prahan sinfoniaorkesterin pääkapellimestarina.