Vettel va lluitar per mantenir el ritme del seu company d'equip, Vitantonio Liuzzi, en les carreres d'Hongria, Turquia, Itàlia i Bèlgica, sense arribar a superar als cotxes de la meitat inferior de la graella (Toyota, Honda, Super Aguri y el propio Toro Rosso). En el Gran Premi del Japó del 2007, Vettel va arribar a ésser tercer després de Lewis Hamilton i Mark Webber, de manera que per uns moments semblava que podria aconseguir el seu promer podi, que també hagués estat el primer de l'escuderia italiana. Tot i així, durant un període en què va sortir el cotxe de seguretat, Vettel va col·lidir amb Webber. El jove alemany va ser sancionat amb la pèrdua de deu posicions a la graella de sortida de cara a la següent cursa, però la penalització no va dur-se a efecte a causa de la publicació d'un video al youtube per part d'un espectador que havia filmat l'incident i l'havia penjat a la xarxa, fent que la investigació es tornés a reeobrir. Més endavant, Mark Webber va culpar a Hamilton de l'accident, declarant que el britànic havia fet "un pèssim treball" després que aparegués el cotxe de seguretat en pista, frenant bruscament i variant el seu traçat.