Der Ort entstand in der Nachfolge des Kalifornischen Goldrausches zunächst als Endstation der ersten Eisenbahn in Kalifornien, die ab Februar 1856 die kalifornische Hauptstadt Sacramento mit den Goldfeldern am American River verband. Im "Folsom Powerhouse State Historic Park" befindet sich ein historisches Wasserkraftwerk, das 1896 erbaut wurde, Energie aus dem American River gewann und so Sacramento mit Elektrizität versorgte. Diese Anlage ist heute eine National Historic Landmark. Der Fluss ist oberhalb der Stadt durch den Folsom Dam zum Folsom Lake aufgestaut.