在1959年拉萨骚乱中，中国人民解放军毁灭了这座医学院及其供奉有用珊瑚缀成的无量寿佛、绿松石缀成的绿度母、海螺缀成的观世音等佛像的寺庙，因为藏人涉嫌在此处放置大炮。后来，药王山被无线电发射台占用。