Przedostał się nielegalnie na terytorium Państwa Słowackiego, gdzie związał się z partyzantką. Organizował struktury partyzanckie w centralnej i zachodniej Słowacji. Jesienią i zimą 1944 r. uczestniczył w słowackim powstaniu narodowym. W pierwszych dniach walk na czele oddziału partyzanckiego przeszedł do ruin Zamku Sklabinia, gdzie jego podkomendni weszli w skład zgrupowania wojskowego, stanowiącego zarodek przyszłej 1 Czechosłowackiej Brygady Jana Žižky. Walczył na zachodniej Słowacji w rejonie miejscowości Strečno, Vrútky, Priekopa, Štiavnik, a następnie przedostał się w Góry Jaworniki na granicy Moraw i Słowacji. Został w stopniu kapitana szefem sztabu brygady. Po upadku powstania na przełomie 1944 i 1945 r., organizował na Morawach oddziały partyzanckie, działające do końca okupacji. Doszedł do stopnia majora.