Under det tyske angrepet på Norge 9. april 1940 ble skipet rekvirert av de allierte styrkene i Norge, og ble satt inn som transportskip i Nord-Norge. DS «Erling Jarl» kom uskadet fra krigshandlingene i Nord-Norge, og i juli 1940 var hun tilbake i hurtigrutetrafikk. 28. januar 1941 på nordgående grunnstøtte skipet og sank ved Brønnøysund. 1 person mistet livet i forliset.