Bàn thắng quốc tế đầu tiên của Éder đến trong trận đấu thứ 18 của anh, bàn thắng duy nhất trong chiến thắng ở trận đấu giao hữu trước Ý tại Stade de Genève vào ngày 16 tháng 6 năm 2015. Anh được lựa chọn bởi Fernando Santos vào đội hình dự UEFA Euro 2016 và là người ghi bàn thắng duy nhất trong trận chung kết để đánh bại chủ nhà Pháp trong hiệp phụ. Trước trận chung kết, Éder chỉ được thi đấu 6 phút trong trận gặp Iceland và 7 phút trong trận gặp Áo (đều tại vòng bảng) với tổng cộng 7 lần chạm bóng.