Anderson vocht in de Slag bij Devil's Den en de Slag bij Gettysburg, waar hij gewond raakte. Hij herstelde te Charleston (South Carolina) en vocht opnieuw in het Beleg van Knoxville. Hij vocht in de Slag in de Wildernis, de Slag bij Spotsylvania Court House, de Slag bij Cold Harbor, het Beleg van Petersburg. Hij gaf zich in april 1865 samen met Robert E. Lee over bij Appomattox Court House.