С 1982 по 1986 год между странами были хорошие отношения при президенте Коста-Рики Луисом Альбертом Монхе Альваресе, но с приходом к власти его преемника Оскара Ариаса Санчеса у Коста-Рики с Панамой начали возникать проблемы. Так, на территории Коста-Рики было обнаружено изуродованное тело панамского оппозиционера. Затем, начались торговые споры, что негативно сказалось на товарообороте. В начале 1987 года страны подписали соглашение о регулировании торговли в приграничном регионе, но через несколько дней Панама закрыла границу, заявив, что Коста-Рика нарушает договоренности. Граница была вновь открыта через несколько дней, и в марте 1987 года президенты Эрик Артуро Дельвалье и Оскар Ариас Санчес подписали соглашение, с целью разрешить торговый спор и наладить сотрудничество в таких областях, как: здравоохранение и образование. Однако, правительство Коста-Рики в июне 1987 года раскритиковало методы Панамы по подавлению беспорядков внутри страны, что вновь привело к охлаждению отношений. В декабре 1987 года посол Панамы в Коста-Рике заявил, что официальные лица Соединённых Штатов Америки и Коста-Рики планируют организовать вторжение в Панаму и убить руководителя страны Мануэля Норьегу. Коста-Рика отвергла обвинения, по которым не было получено никаких вещественных доказательств. Хотя этот вопрос вскоре исчез с повестки дня, отношения между Коста-Рикой и Панамой в конце 1987 года были менее добрососедскими, чем в предыдущие годы.