В 1803 году Франсен выучился и получил приход в Пемаре. После Русско-шведской войны 1808—1809 Финляндия вошла в состав Российской империи. Франсен был вынужден выбирать: либо оставаться на родине, либо перебраться в Швецию. Летом 1811 года он эмигрировал и стал пастором в Кумле в лене Эребру. Имел в пасторат в Халльсберге. (Только в 1840 году Франсен ненадолго посетил Финляндию. После он изложил в стихотворной форме свои впечатления от перемен, произошедших с людьми и страной за время пребывания под российской властью). В 1818-м он стал доктором теологии, а в 1820-м — деканом. Франсен был представителем духовного сословия в риксдаге в 1823—1841 годах, с определёнными перерывами. На одном из своих первых заседаний в парламенте Франсен назвал себя финно-шведом. В те времена это слово обозначало всех жителей Великого княжества Финляндского — и этнических финнов, и этнических шведов. В 1824 он получил приход в Стокгольме. В 1831 году Франсен был избран епископом Хернёсанда. Начал исполнять свои новые обязанности не раньше 1834-го и делал это до самой смерти. За время его службы построен Хернёсандский кафедральный собор. Тогда Хернёсандская диецезия охватывала все территории Швеции к северу от Уппсальской диецезии.