Im Jahre 1449 löste das Generalkapitel in Citeaux das von den Schwestern verlassene Kloster auf. 1450 übertrug Erzbischof Dietrich von Moers mit Hinweis auf seine landesherrlichen Rechte den Besitz des aufgehobenen Klosters dem Birgittenkloster Marienforst bei Godesberg. Nachdem im truchsessischen Krieg Hofgebäude und Dachstuhl der Klosterkirche abgebrannt waren, wurden die Hofgebäude wieder aufgebaut und die Kirche auf Initiative der Familie Wolff-Metternich wieder restauriert, so dass sie wie bisher für Gottesdienste genutzt werden konnte. Die Kirche war eine Wallfahrtsstätte, an der eine „mirakulöse steinerne Madonna“ verehrt wurde. Der Hof, der durch einen Halfen bewirtschaftet wurde, blieb bis 1802 im Besitz des Klosters Marienforst. Infolge der Säkularisation wurde der Frauenthaler Hof mit der Marienkapelle enteignet und verkauft.