После начала войны руководил командой СД в штабе айнзацгруппы 1, в Польше. С марта 1940 года был начальником абшнита СД в Бремене. После окончания курса офицерской школы в Шарлоттенбурге и итальянской полицейской школе в Тиволи, с июля 1942 года служил в айнзацкоманде Тунис, возглавляемой Вальтером Рауффом, где занимался разведывательной службой. В ноябре 1943 года переведён во Францию, где стал командиром полиции безопасности и СД в Нанси. Потом Хот возглавил одну из команд, приданной айнзацгруппе H в Словакии, а во время Арденнского наступления руководил специальной командой, входившей в состав айнзацгруппы L. С апреля 1945 года по окончании войны занимал пост командира полиции безопасности и СД в Ставангере.