Jens Jørn scorede i 1979 i Cadiz mod Spanien (3-1). Hans andet mål faldt i 1986, hvor Jens Jørn blev matchvinder i Idrætsparken mod Finland (1-0) i Danmarks første EM 1988 -kvalifikationskamp. Han spillede sin sidste landskamp som 35-årig i Cardiff mod Wales (0-1) i 1987. Selvom Jens Jørn var med i 24 kampe, hvor Danmark ikke scorede, er der plus på kontoudskriften, der siger: 32 sejre – 12 uafgjorte – 25 nederlag. Målscore: 97-77. Jens Jørn Bertelsen opnåede desuden fem kampe på vort U-landshold i 1975.