Na vier jaar gereden te hebben voor teams met een tekort aan financiële middelen, wilde Brundle een nieuwe uitdaging. In 1988 won hij de wereldtitel bij de sportauto's, maar reed ook nog voor Williams in de Grand Prix van België, nadat Nigel Mansell niet kon rijden omwille van waterpokken. In 1989 kwam hij terug in de Formule 1, bij Brabham. Ze behaalden echter niet meer het niveau van begin jaren tachtig en Brundle ging opnieuw in de sportwagens rijden in 1990. Hij won dat jaar de 24 uur van Le Mans, waarmee hij zijn racecarrière opnieuw lanceerde. In 1991 ging hij opnieuw naar Brabham, maar het team was helemaal teruggevallen op de grid.