À la suite de la chute de l'Union soviétique, le Tekstilchtchik est directement intégré au sein de la nouvelle première division russe. Il y évolue pendant cinq saisons, durant lesquelles il termine notamment quatrième du championnat en 1993 et participe à la Coupe UEFA l'année suivante. Affecté par la suite par des problèmes de financement, le club est finalement relégué en 1996 et tombe rapidement jusqu'à la quatrième division en 1999, perdant son statut professionnel dans la foulée.