6 марта 1809 года назначен командующим маршевых кавалерийских полков 5-го военного округа, 4 апреля возглавил кавалерию 4-го корпуса Армии Германии (3-й, 14-й, 19-й и 23-й конно-егерские полки), с которой принял участие в Австрийской кампании. В ходе всей кампании захватил более 6000 пленных. Сражался 21-22 апреля при Ландсхуте, 24 апреля при Ноймаркте, 3 мая при Эбельсберге, 10 мая вступил в Вену. 22 мая 1809 года при Асперне дрался под началом Массена, затем получил приказ идти на помощь Ланну в Эсслинг, где и был ранен пулей в правое бедро, но не оставил руководство своей кавалерией, и под конец дня отвёл егерей на остров Лобау. 5 июля переправился через Дунай вслед за дивизией Лассаля, на следующий день при Ваграме участвовал в атаке вместе с силами Лассаля. После гибели полковника 8-го гусарского Лаборда, обращается к своим бывшим подчинённым: «Гусары 8-го, я командовал вами в течение тринадцати лет. Мое имя вам известно. Вот враг, я надеюсь, что вы покажите мне вашу былую отвагу». Воодушевлённые данной речью, гусары 8-го, а также последовавшие за ними другие полки яростно атаковали и изрубили австрийских улан, захватили 11 неприятельских орудий, однако сам Марюла в ходе этой атаки был тяжело ранен пулей в бедро. 12 июля 1809 года был произведён в дивизионные генералы, и заменил убитого Лассаля на посту командира дивизии, но новые и старые раны не позволили ему долго оставаться в данной должности. 24 сентября 1809 года он получил административную должность, и был назначен командующим 6-го военного округа.