Nach dem Mord an dem Lehrer Samuel Paty am 16. Oktober 2020 wurde Mediapart beschuldigt, den gewaltbereiten Islamismus in Frankreich verharmlost zu haben. Innenminister Gérald Darmanin warf der Internet-Zeitung unter anderem vor, nie über die in Frankreich stark beachtete „Affäre Mila“ berichtet zu haben; die Jugendliche Mila hatte sich im Januar 2020 auf Instagram abfällig über den Islam geäußert, erhielt daraufhin Mord- und Vergewaltigungsdrohungen und musste unter Polizeischutz gestellt werden. Zudem klagte Darmanin gegen Mediapart wegen Verleumdung der Polizei, nachdem auf der Homepage der Internet-Zeitung die Erschießung des Attentäters Ansorow als Beispiel für die „barbarische Gewalt“ der Polizei bezeichnet worden war.