С 8 сентября 1919 по 18 января 1920 года Крапивянский возглавлял 60-ю стрелковую дивизию РККА. В феврале 1920 года был назначен начальником тыла 12-й армии РККА, одновременно в апреле-мае командовал 47-й стрелковой дивизией РККА, которая отличилась в боях с войсками Деникина за Черниговщину и Киев и против польских войск на мозырском, олевском и овручском направлениях.