Yokoyama debuteerde op 6 maart 2015 in het Japans vrouwenvoetbalelftal tijdens een wedstrijd om de Algarve Cup tegen Portugal. Yokoyama nam met het Japans elftal deel aan het Aziatisch kampioenschap 2018. De voetballer scoorde daarin vier doelpunten, waaronder de winnende 1-0 tegen Australië (finale) en Japan behaalde goud op het Aziatisch kampioenschap. Yokoyama heeft 40 interlands voor het Japanse elftal gespeeld en scoorde daarin 17 keer.