Bei der Weltausstellung von 1851 in London zeigte Lafaye Bleiglasfenster seiner Werkstatt. Im gleichen Jahr hatte er Annette und Sophie Coppée angestellt, die für seine Werkstatt Kartons zeichneten. Am 20. April 1852 heiratete er die jüngere der Schwestern, Sophie Coppée. Da in der Mitte des 19. Jahrhunderts die Qualität der Kirchenfenster wiederentdeckt wurde, erhielten die Pariser Glasmaler viele Aufträge zur Restaurierung dieser Fenster bzw. zur Neuherstellung. Neben den oben genannten Kirchen erhielt die Werkstatt von Lafaye Aufträge zur Restaurierung weiterer Fenster in den Pariser Kirchen von St-Germain-l’Auxerrois, St-Gervais-St-Protais, Saint-Séverin, St-Paul-St-Louis und Saint-Sulpice. Eigene Fenster schuf Prosper Lafaye für die Pariser Kirchen Sainte-Clotilde, St-Leu-St-Gilles und für die Rosette von St-Augustin. Sein einziger Auftrag für eine Kirche außerhalb von Paris war in Blanzy-les-Mines (heute Montceau-les-Mines) im Jahr 1860. 1863 stiftete Prosper Lafaye für die Kirche seines Geburtsortes Mont-Saint-Sulpice ein Fenster mit der Darstellung seiner verstorbenen Familienmitglieder.