La entrada de las tropas papales-imperiales en la ciudad estuvo acompañada de represiones masivas, ejecuciones y la expulsión de los republicanos. En 1531, su nuevo gobernante, Alejandro de Médici, nieto de Lorenzo el Magnífico, llegó a Florencia. La constitución democrática fue abolida, y en 1532 Alejandro fue proclamado duque de Florencia. Esto significó el fin de la República Florentina y su transformación en una monarquía hereditaria bajo el gobierno de la casa de Médici. Después de la anexión de Siena aliada francesa en la Guerra italiana en 1557, el nuevo estado recibió el nombre del Gran Ducado de Toscana desde 1569.