Con l'invasione dell'Unione Sovietica da parte della Germania nazista, nel 1941, Sheng decise di ricongiungersi al Kuomintang ed espulse i consiglieri sovietici ed uccise comunisti. Chiang Kai-shek non poteva fidarsi di Sheng, che tentò di rinegoziare con Iosif Stalin, così lo depose e installò il governo diretto nel 1944. La nuova amministrazione del Kuomintang affrontò quindi una ribellione che andò ad aggiungersi a quella della Seconda Repubblica del Turkestan orientale.