После разгрома Великой армии в войне 1812 года, когда русские армии вышли на прусскую границу, Шарнхорст одним из первых выступил за заключение Калишского договора и за вступление Пруссии в войну за освобождение Германии (война шестой коалиции). В феврале 1813 года Шарнхорст вернулся на военную службу, вступил в учреждённый прусским королём «Комитет для усиления армии», назначен генерал-квартирмейстером в штаб Силезской армии Блюхера. Вскоре он получил чин генерал-лейтенанта.