In de Ierse Burgeroorlog (1922–1923) stond Gibney aan de kant van Éamon de Valera, Constance Markievicz en Frank Aiken en waren gekant tegen het Anglo-Iers Verdrag. Zij werd gevangengenomen door troepen van het leger van de Ierse Vrijstaat en is met veel mede-leden van Cumann na mBan gevangengezet in Kilmainham Gaol.