Rüdiger valittiin vuoden 2016 EM-kisoihin Saksan joukkueeseen, mutta joutui jättämään kisat väliin polvivamman vuoksi. Hän oli voittamassa Maanosaliittojen cupia 2017. MM-kisoissa 2018 hän pelasi Saksan joukkueessa ottelun Ruotsia vastaan. Kesäkuun 28. päivään 2021 mennessä hän on pelannut 44 maaottelua ja tehnyt niissä yhden maalin.