In dieser Zeit wandte sich Léon de Laborde vornehmlich Archivstudien zu und publizierte zunächst das dreibändige Werk "Les ducs de Bourgogne" (1849–1852), das sich Kunst und Gewerbe Frankreichs und der Niederlande im 15. Jahrhundert widmete. Gleichzeitig entstanden die Bände zu "La renaissance des arts à la cour de France" (1851–1855). Weitere Werke, etwa "Athènes aux XVe, XVIe et XVIIe siècles" (1855), folgten. Zugleich war er Teil der zeitgenössischen Kunstszene und Jurymitglied der Great Exhibition in London 1851 sowie Präsident der Sektion für die Schönen Künste der Weltausstellung in Paris 1855, nachdem er bereits Jurymitglied der Französischen Industrieausstellung im Jahr 1844, zudem des Salon de Paris im Jahr 1852 gewesen war. Wegen nicht zu überbrückender Differenzen mit dem Direktor des Louvre, Alfred Émilien de Nieuwerkerke, gab er die Stelle als Konservator 1854 auf. Im Jahr 1857 wurde er Generaldirektor der Archives nationales. In dieser Position veranlasste er die Publikation zahlreicher großer Archivbestände, unter anderem der "Monuments historiques" 1866 und der "Actes du Parlement de Paris" 1867. Im Jahr 1864 wurde er Kommandeur der Ehrenlegion, 1868 Mitglied im Senat des Zweiten Kaiserreichs, erkrankte jedoch im Sommer schwer und wurde in den Ruhestand versetzt. Am 26. März 1869 verstarb er.