Die Geschichte der Statuette geht bis auf das Jahr 1593 zurück, als der damalige Gouverneur General Luis Perez Dasmarinas den Kapitän Hernando de los Rios beauftragte, eine Heiligenfigur anfertigen zu lassen. Sie sollte der religiöse Ausdruck für seine Herrschaft auf den Philippinen werden. Die Skulptur wurde der Maria vom Siege in Anlehnung der Verehrung der allerseligsten Jungfrau Maria vom Rosenkranz gewidmet, mit der Papst Pius V. seinen Dank für den Sieg der christlichen Flotte in der Seeschlacht von Lepanto 1571 ausdrücken wollte. Der Name La Naval de Manila spielt dabei auf die spanische Seefahrertradition an und deutet auf den Standort der Statuette. Die Statuette wurde mehrfach im Laufe der Geschichte beschädigt, konnte jedoch immer wieder restauriert werden. So wurde der alte Schrein, die alte Santo-Domingo-Kirche, während der Britischen Invasion der Philippinen 1762 sowie beim Bombardment Manilas Anfang 1942 zerstört und die Figur beschädigt.