Tras la derrota de Lavalle, emigró al Uruguay, donde fue partidario de Fructuoso Rivera. Prestó servicios como Comandante General de Armas de la capital uruguaya durante el sitio de Montevideo y segundo jefe del general José María Paz. Presidió la Academia de Instrucción de Infantería para Jefes. En 1845 fue Jefe del Estado Mayor General del Ejército uruguayo, ahora creado como dependencia del Ministerio de Guerra y Marina. Al año siguiente integró la Asamblea de Notables que ofició junto al Consejo de Estado como Poder Legislativo. Fue ascendido al rango de general en junio de 1847, y poco después ejerció brevemente el cargo de Ministro de Guerra.