Jovanović wurde sowohl für die U-19-Fußball-Europameisterschaft 2017 in Georgien als auch für die U-21-Fußball-Europameisterschaft 2019 in Italien und San Marino nominiert und bei beiden Turnieren mit der Leitung des Endspiels betraut. Zudem leitete er drei Spiele bei der U-17-Fußball-Weltmeisterschaft 2019 in Brasilien.