Margaret Levyns wurde zunächst zuhause durch ihre Mutter unterrichtet, später besuchte sie die "Ellerslie Girls' School". Sie erhielt eine bevorzugte Studienempfehlung und bekam zwei Stipendien zugesprochen. 1908 schrieb sie sich am "South African College", der heutigen Universität Kapstadt, für ein Mathematik-, Geologie- und Chemiestudium ein und wählte Botanik für ihr Abschlussjahr. Sie erhielt zwei weitere Stipendien, das "Queen Victoria Scholarship" und das 1851 Exhibition Memorial Scholarship, und verbrachte 1912 bis 1914 am Newnham College in Cambridge. Kurz nach ihrer Rückkehr nach Südafrika wurde sie mit einem weitern Stipendium für das John Innes Institute in Norwich ausgezeichnet. Nach ihrer erneuten Rückkehr übernahm sie eine Dozentenstelle am Botanischen Institut des South African College. Sie promovierte 1932 als erste Frau als D.Sc. an der Kapstadtuniversität mit dem Thema ‘A taxonomic study of "Lobostemon" and "Echiostachys"‘ (jeweils Gattungen aus der Familie der Raublattgewächse). Sie veröffentlichte 1929 einen Führer zur Flora der Kap-Halbinsel und schrieb wesentliche Abschnitte in dem von Adamson &amp; Salter 1950 veröffentlichten Standardwerk "Flora of the Cape Peninsula".