Emilia Podoska pochodziła z Małopolski, gdzie się urodziła na dworku w Grajowie, w szlacheckiej, wielodzietnej rodzinie (miała czternaścioro rodzeństwa) jako córka Jakuba Józefa Podoskiego herbu Junosza i Marii z domu Kołodziejskiej. Została ochrzczona w kościele Wszystkich Świętych w Ptaszkowej jako Emilia Aurelia, a rodzicami chrzestnymi byli, jej brat Konstanty Podoski i Sydonia Siemek. Lata dziecięce spędziła w religijnej atmosferze rodzinnego dworku Ptaszkowa pod opieką troskliwej matki. Z patriotycznego domu rodzinnego wyniosła ponadto miłość do ojczyzny, bowiem ojciec jej brał udział w powstaniu listopadowym, zaś jej bracia w powstaniu styczniowym. Podoscy wspierali powstania również finansowo, sprzedając majątek Grajów, a pieniądze przeznaczyli na umundurowanie, utrzymanie i uzbrojenie powstańców. W zamian za przekazany majątek na potrzeby powstania styczniowego, otrzymali bransoletkę z brązu z symbolem niezapominajki (pamiątka przechowywana w rodzinie).