Mit dem Überfall der Wehrmacht auf die Sowjetunion zog Abdullayev in den Krieg. Er nahm zunächst an der Nordkaukasischen Operation teil, wurde anschließend auf die Halbinsel Krim verlegt. Bei einem der Gefechte wurde er verwundet und in ein Lazarett gebracht. Nach der Behandlung kehrte er wieder an die Front zurück.