Guigou absolvierte von seinem Debüt am 1. Juli 1999 bis zu seinem letzten Einsatz am 1. Juni 2004 41 Länderspiele Nationalmannschaftskarriere für die uruguayische Fußballnationalmannschaft. Einen Treffer erzielte er nicht. Er gehörte sowohl dem Aufgebot bei der Copa América 1999 als auch demjenigen bei der Fußball-Weltmeisterschaft 2002 an. Bei der WM kam er in zwei Spielen zum Einsatz.