Nach dem kommunistischen Februarumsturz 1948 befasste sich das Statistikamt mit der Erfüllung der Fünfjahrespläne. Der Fall des Regimes durch die Samtene Revolution im Jahr 1989 machte eine unparteiische Statistik wieder möglich. Das Tschechische Statistikamt (ČSÚ) wurde mit der Teilung der Tschechoslowakei am 1. Januar 1993 als Nachfolgeorganisation des Staatlichen Statistikamts gegründet. Nachdem die Räumlichkeiten im Prager Stadtteil Karlín beim Hochwasser 2002 schwer beschädigt wurden, übersiedelte das ČSÚ 2004 in ein neues Gebäude im 10. Bezirk.