Hizo su debut profesional con el primer equipo en la Copa Italia el 8 de junio de 1977, en una victoria por 1-0 sobre la Juventus durante la temporada &lt;a href="Serie%20A%20%28Italia%29%201976-77"&gt;76/77&lt;/a&gt;, e hizo su debut en la Serie A la temporada siguiente. Tiempo después en el "Nerazzurri" llegó a ser capitán entre 1988 y 1992, jugó 392 partidos en Serie A marcando 10 goles, 73 partidos en la Liga de Campeones (1 gol) y 94 partidos en la Copa de Italia (2 goles). Con el Inter ganó dos "Scudettos", dos Copas de Italia y una Supercopa de Italia, además una Copa de la UEFA. Baresi es considerado una de las más grandes leyendas del Inter.