El 13 de febrero de 1860 el banco cambió su nombre a "Banco de Valparaíso". En aquel entonces su sede se ubicaba en la Plaza de la Intendencia (actual Plaza Sotomayor). El 31 de marzo de 1866 la casa matriz del Banco de Valparaíso resultó dañada producto del bombardeo a la ciudad que formó parte de la Guerra hispano-sudamericana.