Наряду с наукой, Мурат Айтхожин также принимал участие в партийной жизни страны. Мурат Айтхожин был депутатом Верховного Совета СССР 11 созыва (Совет Союза) от Чапаевского избирательного округа Уральской области и делегатом XXVII съезда КПСС.