Los planes para realizar una nueva película de Godzilla fueron anunciados por Tōhō en diciembre de 2014. Anno y Higuchi fueron presenteados como directores del filme en marzo de 2015. La escenografía principal comenzó en septiembre y finalizó en octubre, mientras que los efectos especiales comenzaron en noviembre de ese mismo año. La inspiración para la película vino del accidente nuclear de Fukushima y el terremoto y tsunami de 2011.