קרואטיה הגיעה למקום הרביעי בפעם השנייה ב-1999 כאשר דוריס דרגוביץ' הופיעה עם השיר "Marija Magdalena" שסיים את גמר התחרות עם 118 נקודות. הופעתה של קרואטיה ב-1999 משכה התנגדויות מצד המשלחת הנורווגית משום שבליווי המוקלט הופיעו קולות אנושיים, דבר המנוגד לתקנון התחרות. בתגובה, איגוד השידור האירופי החליט לצמצם את הניקוד של קרואטיה בשליש לצורך חישוב לקביעת נטילתה העתידית של קרואטיה בתחרות, אולם הוחלט כי הדבר לא ישפיע על הניקוד של קרואטיה בתחרות הנוכחית. התחרות ב-1999 הייתה הפעם השנייה בה דרגוביץ' הופיעה בתחרות לאחר שנשלחה כנציגת הרפובליקה הפדרלית הסוציאליסטית של יוגוסלביה ב-1986.