De South Tower werd net als de North Tower verwoest bij de aanslagen op 11 september 2001. Het Two World Trade Center werd als laatste getroffen door een gekaapt passagiersvliegtuig – namelijk door United Airlines-vlucht 175 – om 9:03 uur lokale tijd, maar was het eerste die na minder dan een uur uitbranden instortte om 9:59 uur (15:59 uur Midden-Europese Tijd). De aanslag op de South Tower was rechtstreeks te zien op televisie.