В 1916 году адмирал Покровский был снова назначен на пост начальника штаба командующего Черноморским флотом. В вице-адмиральский чин адмирал Покровский был произведен 4 апреля 1916 года, за успешную организацию и проведение морских десантных операций и штурмов Трапезунда и Ризе, что имело важнейшее значение для хода войны на турецком фронте. До конца мая в захваченные турецкие порты было доставлено 34 тыс. человек, 6500 лошадей, более 100 тысяч пудов разного военного материала.