Po wybuchu II wojny światowej ewakuował się na Węgry, gdzie pracował w Czerwonym Krzyżu w Budapeszcie. Następnie trafił do Syrii, gdzie szkoliła się Samodzielna Brygada Strzelców Karpackich (walczył między innymi w bitwie o Tobruk). W nocy z 5 na 6 maja 1944 roku samolot z Jerzym Waletko i dwoma polskimi skoczkami poleciał z Włoch do Grecji. Jako cichociemny na greckiej ziemi przyjął nazwisko Edward George Bart i miał zajmować się zbieraniem informacji o ruchach wojsk niemieckich i werbowaniem Polaków do służby w Polskich Siłach Zbrojnych. Spędził tam pół roku współpracując z greckim ruchem oporu.