Tras el estallido de la Guerra Civil, pasó a ser miembro del Comité de Milicias Antifascistas de Cataluña. En septiembre de 1936 fue nombrado "conseller" de Seguridad Interior en el gobierno de la Generalidad de Cataluña. Durante los siguientes meses se vio impotente para controlar los "paseos" y asesinatos que llevaban a cabo los grupos incontrolados y las Patrullas de Control anarquistas. A partir de abril de 1937 dio orden de desmantelar y desarmar a todos los grupos paramilitares que actuaban en la retaguardia, lo que equivalía a acabar con el poder de la CNT-FAI. A comienzos de mayo autorizó al comisario general de Orden Público Eusebio Rodríguez Salas a que se hiciera con el control del edificio de la Telefónica en Barcelona, cuya centralita telefónica estaba controlada por un comité anarquista e incluso llegaba a intervenir las comunicaciones telefónicas oficiales. Esto provocó un enfrentamiento con la CNT-FAI y fue la chispa que hizo estallar los llamados sucesos de mayo de 1937.