Martin Bommas étudie l'égyptologie à l'université de Heidelberg et à l'université de Leiden. Après avoir travaillé sur la route du Karakorum dans les régions du nord du Pakistan et sur l'Hindou Kouch en 1989, il commence des fouilles en Égypte la même année. À 23 ans et au cours de la première guerre de Koweït, il est nommé directeur de la mission de l'Institut archéologique allemand sur l'île Éléphantine à Assouan. Dans sa thèse de doctorat, il reconstruit le temple de Khnoum de la à Éléphantine. Parmi les autres projets d'envergure avant 2009, citons à la fois la reconstruction de la porte monumentale d' et de , qui se trouvait autrefois dans le mur sud du téménos du temple de Satet, ainsi que la découverte d'un premier établissement humain au nord du sanctuaire de Heqaib. Depuis 2015, il dirige à Assouan le projet de recherche « Qubbet el-Hawa » (QHRP) de l'université de Birmingham. En 2016, il remporte le Top 10 Discoveries Award du "Louxor Times" après que le QHRP eut découvert la chaussée de .