Pierwszym trenerem Hanyū był Shōichirō Tsuzuki, który w 1977 roku doprowadził Minoru Sano do brązowego medalu mistrzostw świata, będącego pierwszym medalem tych zawodów wywalczonym przez Japończyka. Po zamknięciu lodowiska w Sendai w 2004 roku Shōichirō Tsuzuki przeniósł swoją bazę treningową do Jokohamy, oddalonej od Sendai o ponad 400 kilometrów, co uniemożliwiło im dalszą współpracę. W tym okresie kolejnym trenerem Hanyū została Nanami Abe, która doprowadziło go między innymi do mistrzostwa świata juniorów, zwycięstwa w finale cyklu junior Grand Prix czy pierwszego medalu mistrzostw świata. Po zdobyciu właśnie tego medalu Hanyū zdecydował się na zmianę trenera na Briana Orsera i przeniesieniu swoje bazy treningowej do klubu Toronto Cricket, Skating and Curling Club w Kanadzie. Jako przyczynę podał chęć dalszego rozwoju i podniesienia poziomu zarówno w aspektach związanych ze stroną techniczna, jak i artystyczną.