Am 21. Februar 1809 wurde er zur Reitenden Artillerie der Brandenburgischen Artillerie-Brigade versetzt. Während der Befreiungskriege kämpfte Protzen bei Großgörschen, erhielt für Bautzen das Eiserne Kreuz II. Klasse und für Kulm den Orden der Heiligen Anna III. Klasse. Außerdem nahm er an den Kämpfen bei Leipzig sowie Haynau teil und wurde für Mouty mit dem Orden des Heiligen Wladimir IV. Klasse mit Schleife ausgezeichnet. Am 1. Juni 1814 kam er zur Garde-Artillerie-Brigade, wo er bis Juli 1815 zum Kapitän aufstieg.