Весной 1943 года пережил первый инфаркт. После возвращения в строй в июне 1943 года назначен заместителем командующего Военно-Воздушных сил РККА. В феврале-апреле 1944 года находился в госпитале из-за второго инфаркта, но сразу после выхода из госпитале вылетел на фронт. С апреля 1945 года — вновь начальник штаба — заместитель командующего Военно-Воздушных сил РККА. На этих должностях значительную часть времени провёл в действующей армии, координируя действия участвовавших в наиболее крупных операциях нескольких воздушных армий. В таком качестве участвовал в Донбасской операции (1943), в освобождении Южной Украины, в Крымской операции 1944 года, в Белорусской, Прибалтийской, Восточно-Прусской операциях. За годы войны трижды повышен в воинских званиях.