Летом 1939 года во время боёв на Халхин-Голе принц Хигасикуни командовал первой батареей 1-й тяжелой полевой артиллерии полка Квантунской армии. Во время контрнаступления советских войск принц Хигасикуни Морихиро бежал с поля боя. 2 августа 1939 года принц был переведён обратно в Японию. Этот поступок принца замалчивался японской военной цензурой. Несмотря на явное пятно в своём послужном списке, принц был назначен капитаном артиллерии в марте 1941 года. Морихиро учился в Высшей военной академии Императорской армии Японии с декабря 1942 по декабрь 1943 года, после окончания которой он получил звание майора и был переведён в резерв.