2009-ben megkapta a Dinamo Zagreb vezetőedzői posztját és még ebben az évben megnyerte a horvát bajnokságot illetve a horvát kupát. 2010-ben ismét bajnoki címet ünnepelhetett. 2011-ben egy rövid ideig a Lokomotiva, majd ismét a Dinamo Zagreb edzője lett. A 2012-es Eb után segédedző volt a válogatottnál, de néhány hónap után ismét visszatért a Dinamohoz és 2012 novembere óta ő a vezetőedző. A 2012–13-as bajnoki idény végén ismét bajnoki címet szerzett.