Zé Rui rejoint en 1987 le , club de deuxième division portugaise. Après trois ans dans cette équipe, Il signe à O Elvas puis rejoint en 1992 União Leiria. Après une saison comme titulaire avec ce club, il signe au CF Belenenses en I Divisão. Après deux saisons, il signe au Vitória Setúbal où il reste quatre saisons. Il dispute lors de cette saison deux rencontres avec la sélection du Cap-Vert comptant pour les qualifications de la Coupe d'Afrique des nations 2000.