O Clube Militar foi um importante apoiador do movimento que deu início a ditadura militar brasileira; em meio a acusações de um golpe comunista por parte de João Goulart que estava em viagem oficial à União Soviética e China no momento da renúncia de Jânio Quadros, o exército, com o apoio do Clube Militar, impediu Jango de voltar ao Brasil, e após um período de negociação, foi permitido seu retorno ao país. Logo depois, com as elites e a classe média conservadora temendo que um golpe comunista estava próximo, ocorreu no Rio de Janeiro a Marcha da Família com Deus pela Liberdade, manifestação que deu aos militares o aval popular para a deposição de João Goulart. Com o apoio da classe média e da Igreja Católica, em 15 de abril de 1964, ocorreu uma Eleição Presidencial indireta, na qual o Congresso elegeu Castello Branco entre 3 militares para assumir o cargo de Presidente do Brasil, que declarou que iria permanecer no poder até que o suposto risco comunista fosse cessado no Brasil, assim caracterizando o Golpe Militar de 1964.