2013-14 sezonu kulübün tarihindeki 83. futbol sezonu oldu. Atlético, ligde son maçta Barcelona ile karşılaştı ve 1-1 berabere kalarak La Liga'da şampiyonluğa ulaştı. 24 Mayıs 2014 tarihinde Lizbon'daki Işık Stadyumu'nda Real Madrid'e karşı oynanan 2014 UEFA Şampiyonlar Ligi Finali'ni ise uzatmalar sonucunda 4-1 kaybederek ikinci oldu.