1797 débute avec la victoire de Rivoli le 14 janvier puis la prise de Mantoue le 2 février. Marmont est ensuite de nouveau envoyé contre les armées du Pape, sous le commandement du général Victor. La paix est rapidement faite et Marmont est envoyé à Rome auprès du pape Pie VI pour s'assurer de la bonne exécution de la paix (qui consistait principalement au versement de sommes astronomiques à la République). Il tombe malade et ne peut rejoindre l'armée que le 20 mars 1797. Le 3 avril, il sert d'intermédiaire lors des négociations d'armistice avec l'archiduc Charles. L'armistice est signé le 7 avril puis les préliminaires de paix de Leoben le 17 avril. Marmont est ensuite détaché auprès du général Baraguey-d'Hillers pour réprimer les massacres commis par les Vénitiens. Il contribue ainsi à la chute de la république de Venise avant de rejoindre Bonaparte à Milan. Marmont participe, en tant que commissaire français du congrès de Reggio, à la création, voulue et dirigée par Bonaparte, de la République cisalpine le 20 juin 1797. Il est ensuite chargé d'accompagner Joséphine Bonaparte dans son voyage de quatre jours à Venise. C'est aussi à cette époque que Marmont présente le général Desaix à Bonaparte. Puis Marmont suit le général Bonaparte et participe brièvement au congrès de Rastadt avant de rentrer à Paris aux côtés du général victorieux.