Het schip werd het vlaggenschip van de Zweedse vloot. Tijdens de Zevenjarige Oorlog betwistten Zweden en Denemarken elkaar de hegemonie over de handel in de Oostzee. Tijdens de slag bij het eiland Öland einde mei 1564 bleek dat de Mars in vuurkracht moest onderdoen voor de tegenpartij. Op de tweede dag werd het schip bestookt met vuurkogels door Duitse huurlingen, die daarna het schip enterden. Het vuur bereikte de kruitvoorraad van het schip, waarna het ontplofte en zonk. Achthonderd Zweedse en Duitse opvarenden zouden hierbij om het leven zijn gekomen.