El 27 de noviembre, Boca regresaba a competir en Tokio la final de la Copa Intercontinental. Esta vez, enfrente estaba el Bayern Múnich de Oliver Kahn. En un partido en que se destacaron las constantes faltas del conjunto alemán, y la expulsión del Chelo Delgado, el Bayern logró llevarse la ventaja en un confuso gol de Samuel Kuffour, y Bianchi no pudo repetir la hazaña. Culpa de las decepcionantes campañas del equipo a nivel local, y a la venta de varias piezas claves del equipo, varios rumoreaban que Bianchi no iba a continuar en Boca ya que su contrato acababa a fin de año. El punto de inflexión de este caso fue cuando el entrenador estaba dando una habitual conferencia de prensa post-partido, cuando el presidente del club, Mauricio Macri, apareció en la habitación y se sentó para conversar con el entrenador frente a los periodistas que estaban presentes. Luego de varios intercambios en el que Macri le insistía que le de explicaciones de porque había tomado esa decisión, Bianchi abandonó la habitación sin más y se despidió de los periodistas, claramente frustrado por la actitud del presidente. Al finalizar el Clausura, Bianchi no continuó a cargo del club y fue sustituido por Óscar Tabárez."“Gra­cias por ha­ber­me da­do tan­tas ale­grías en es­tos tres años y me­dio co­mo téc­ni­co de Bo­ca Ju­niors, en los cua­les ga­na­mos tres tí­tu­los na­cio­na­les y tres in­ter­na­cio­nales. Ven­drá otro téc­ni­co, pe­ro us­ted es irrem­pla­za­ble. Y es­toy se­gu­ra que en 2003 es­ta­rá otra vez pi­san­do el cés­ped de es­ta que­ri­da Bom­bo­ne­ra.”"