Em virtude de suas atuações, Alex foi convocado para a Seleção Brasileira, disputando a Copa América de 1999 onde sagrou-se campeão e também a Copa das Confederações de 1999, onde foi vice-campeão e vice-artilheiro. Em Dezembro, disputou o Mundial de Clubes de 1999 contra o Manchester United, em Tóquio e mesmo Alex tendo uma atuação destacada (teve um gol mal anulado na partida) e o Palmeiras sendo melhor que o adversário, os ingleses venceram por 1 a 0.