Baczko besuchte die Kadettenhäuser in Bensberg und Berlin. Anschließend wurde er am 1. April 1848 als Portepeefähnrich dem 18. Infanterie-Regiment der Preußischen Armee überwiesen, nahm im selben Jahr an der Niederschlagung des Aufstandes in Posen teil und avancierte Ende Mai 1848 zum Sekondeleutnant. Nach einer zweijährigen Kommandierung zum 5. kombinierten Reservebataillon war Baczko von Mitte Dezember 1854 bis Ende September 1858 Adjutant des II. Bataillons. Als Premierleutnant wurde er am 1. Juli 1860 in das neu formierte 3. Posensche Infanterie-Regiment Nr. 58 versetzt und steig Mitte November 1860 zum Regimentsadjutanten auf. Unter Beförderung zum Hauptmann wurde Baczko am 8. Dezember 1861 Kompaniechef. In dieser Eigenschaft nahm er 1866 während des Krieges gegen Österreich an den Kämpfen bei Nachod, Schweinschädel und Königgrätz teil, wurde bei Skalitz leicht verwundet und nach dem Friedensschluss mit dem Roten Adlerorden IV. Klasse mit Schwertern ausgezeichnet.