Under första Balkankriget 1912-1913 förklarade Grekland krig mot Ottomanska riket och invaderade Thessaloniki. Det påföljande kriget mellan Grekland och det nybildade Turkiet 1919 till 1922 ledde till stora etniska omvälvningar i staden, då etniska greker från det tidigare Ottomanska riket flyttades till Thessaloniki, samtidigt som stadens muslimska befolkning, inklusive grekiska muslimer, deporterades till Turkiet.