Nach seiner Rückkehr von der Weltausstellung in Paris 1867 übertrug Ismail Pascha Mubarak die Leitung des Ministeriums für öffentliche Bauten. In dieser Position leitete Mubarak die Modernisierung des Straßenbaus in Kairo nach europäischem Vorbild in die Wege. Da allerdings einige Stadtteile Kairos nicht modernisiert wurden, führte dies seit der Wende zum 20. Jahrhundert zu einer Zweiteilung. Die modernen Stadtteile lagen im Norden und Westen und waren sozial und wirtschaftlich wesentlich besser gestellt als die Altstadt. Von 1888 bis 1891 war Mubarak Erziehungsminister. Bereits 1870 gründete er das "Dār al-ʿulūm", das „Haus der Wissenschaften“, eine pädagogische Hochschule nach dem Vorbild der französischen École normale supérieure. Zudem änderte er den Lehrplan der traditionellen religiös orientierten Schulen, legte den Schwerpunkt auf Fremdsprachen und Naturwissenschaften und förderte die Übersetzung und Herausgabe von technischen Lehrbüchern.