1937年抗日战争全面爆发后，柴意新先后参加过淞沪抗战、南京保卫战、武漢會戰、鄂西会战；1942年任陆军第七十四军第五十七师第一六九团上校团长。1943年升任第七十四军第五十八师少将参谋长兼第五十七师第一六九团团长。