I 1855 grundlagde Louis Lot sit eget værksted i Paris (fra hvilket Theobald Böhm senere selv kom til at bestille dele fra, for eksempel færdigborede trærør, da han ikke kunne kapere at lave det antal selv, der blev bestilt). Da Louis Dorus i 1860 efterfulgte Jean-Louis Tulou (modstander af Böhmfløjten) som fløjteprofessor ved Conservatoire de Paris, blev konservatoriet regelmæssig kunde hos Louis Lot. Vinderen af konservatoriets årlige konkurrence (først i denne række var Paul Taffanel) fik sidenhen en Lot-fløjte. Til verdensudstillingen i Paris i 1867 udstillede Lot en ny fløjtemodel med tykkere vægge, større tonehuller og blæsehul såvel som en mere stabil mekanik med modificerede gis-klap; denne form kendes stadig som den "franske model" af tværfløjter. Den eneste guldfløjte af Louis Lot blev lavet i 1869 til fløjtenisten Jean Rémusat (i 1948 videregik den til Jean-Pierre Rampals ejerskab). I 1875 gik Lot, som havde fremstillet omkring 2150 fløjter (heraf 870 af metal) og piccoloer, på pension.