En 2001, durante la fase de clasificación para la Copa Mundial de 2002, Iván Kaviedes anotó el gol gracias a una perfecta asistencia de Aguinaga, y así Ecuador calificó para la Copa del Mundo por primera vez en su historia. En 2003, después de casi quince años en el Necaxa, Alex firmó un contrato con el Cruz Azul, donde jugó media temporada antes de regresar a Ecuador para cumplir con un contrato final con Liga de Quito al Clausura 2005 donde ganó su primer campeonato en Ecuador.