В конце концов, эритрейский флаг был заменен на эфиопский, а правительство Эритреи было переименовано в администрацию Эритреи. Протесты эритрейцев в ООН не рассматривались. Под давлением императора Эфиопии Хайле Селассие I на парламент Эритреи 15 ноября 1962 года федерация была официально распущена, Эритрея вошла в состав Эфиопии на правах обычной провинции. В 1958—1962 гг. существовало эритрейское освободительное движение, патриотическая организация, которая объединила студентов, интеллектуалов и городских рабочих. ЕВР пыталась бороться с режимом, но была раскрыта и разгромлена. Последовательное уничтожение Эфиопией эритрейской государственности спровоцировало вооруженное восстание, с 1961 года в Эритрее началась война за независимость, которая завершилась через 30 лет обретением Эритреей независимости.