Henry Burghersh ne reste pas longtemps en faveur auprès d'Édouard II. En effet, Bartholomew de Badlesmere rejoint en la révolte baronniale dirigée par le comte de Lancastre contre le roi et son favori Hugues le Despenser. Malgré l'exil temporaire de Despenser en août, le conflit reprend dès le mois d'octobre et le roi parvient à écraser ses adversaires le lors de la bataille de Boroughbridge. Badlesmere s'enfuit du champ de bataille et tente, selon John Leland, de se cacher dans les domaines de son neveu mais est capturé par Donald II de Mar, un partisan d'Édouard II, et sommairement exécuté pour haute trahison à Canterbury le . Les temporalités d'Henry Burghersh sont saisies en représailles par le roi, qui demande sans succès au pape de le démettre de son titre : en effet, dès le , il écrit à Jean XXII pour lui dire qu'il a été trompé quant à la capacité et à l'aptitude d'Henry à son poste, et qu'il est désormais totalement convaincu qu'Henry ne peut demeurer évêque. Édouard II adresse également des lettres aux cardinaux présents à la cour pontificale pour leur demander de le soutenir.