У дорослому футболі дебютував 1966 року виступами за мюнхенську «Баварію», у складі якої на наступні 12 сезонів став ключовою фігурою у півзахисті. Протягом цього періоду мюнхенська команда була серед лідерів не лише німецького, але й європейського футболу — граючи у її формі Рот здобув три Кубки чемпіонів УЄФА, Міжконтинентальний кубок та Кубок володарів Кубків, чотири рази вигравав чемпіонат Німеччини і тричі національний Кубок. У Бундеслізі став автором 72 забитих м'ячів, провівши заголом 322 гри у цьому змаганні. Неодноразово його голи ставали вирішальними, зокрема завдяки його влучним пострілам мюнхенці здобували Кубок чемпіонів у 1975 і 1976 роках.