В своих научных работах Грэхам Т. Аллисон поднимает важные вопросы конца XX века, в том числе связанные с разрешением Кубинского ракетного кризиса, с угрозой получения террористами ядерного оружия и его применения, ставит проблему использования экстремистскими неправительственными организациями ядерного оружия, рассматривает комплекс мер, который должен быть принят как на национальном, так и на международном уровне для предотвращения ядерного терроризма, констатирует необходимость предотвращения ядерного терроризма, которое должно «стать абсолютным национальным приоритетом».