Версія навмисного підриву потягу була досить популярна в місцевому суспільстві. Припускалося, що метою акції було заподіяння максимального збитку місту Арзамас. Версія будувалася на тому, що вибух стався в підозрілій близькості до міста. Знову підстави для подібних версій дала, Залізнична катастрофа під Уфою, що сталася рівно через рік, 4 червня 1989.