23 февраля 2012 года, вскоре после того, как Амальфитано помог «Олимпику» обыграть миланский «Интер» в Лиге чемпионов, тренер Лоран Блан впервые вызвал Моргана в национальную сборную Франции. Комментируя свой выбор, Блан заметил, что давно следит за игрой Амальфитано и интересовался им ещё в бытность тренером «Бордо». Говоря о достоинствах игрока, тренер отметил его техническое мастерство, умение принимать решения и делать навесы. В товарищеском матче со сборной Германии, который проходил 29 февраля в Бремене в рамках подготовки к чемпионату Европы 2012 года, состоялся дебют Амальфитано в составе сборной своей страны. Он вышел на поле на 67-й минуте, заменив Матьё Вальбуэну, и уже через две минуты сделал навес с правого фланга в штрафную, с которого Флоран Малуда забил немцам второй гол. Встреча завершилась победой французской сборной со счётом 2:1.