Os primeiros Rafale implantados numa zona de combate foram os da marinha francesa, durante a Operação Hércules, e a participação francesa na Operação Liberdade Duradoura. Voaram de Charles de Gaulle sobre o Afeganistão, logo em 2002, mas o padrão F1 não se adapta a missões do solo, não se tendo visto nenhuma ação do Rafale.