O Conselho do Comissariado do Povo se autointitulou chefe supremo do Exército Vermelho, delegando o comando e a administração do exército ao Comissariado para os Assuntos Militares e ao Colégio Especial de Todas as Russias dentro desse comissariado. Nikolai Krylenko era o comandante-chefe supremo, com Alexander Miasnikian como vice. Nikolai Podvoisky se tornou o comissário da guerra, Pavel Dybenko, comissário da frota. Proshyan, Samoisky, Steinberg também foram especificados como comissários do povo, bem como Vladimir Bonch-Bruyevich do Bureau de Comissários. Em uma reunião conjunta de bolcheviques e socialistas-revolucionários de esquerda, realizada em 22 de fevereiro de 1918, Krylenko observou: "Não temos exército. Os soldados desmoralizados fogem, em pânico, assim que veem um capacete alemão aparecer no horizonte, abandonando sua artilharia, comboios e todo o material de guerra ao inimigo que avança triunfantemente. As unidades da Guarda Vermelha são afastadas como moscas. Não temos poder para combater o inimigo; apenas uma assinatura imediata do tratado de paz nos salvará da destruição".