Op 24 augustus 2014 werd Ondoa opgeroepen voor het Kameroens voetbalelftal voor de wedstrijden tegen Congo-Kinshasa en Ivoorkust. Op 6 september maakte hij in de met 2–0 gewonnen wedstrijd tegen Congo-Kinshasa zijn debuut, en werd geprezen door bondscoach Volker Finke. Ondoa was basisspeler in alle groepswedstrijden van Kameroen op het Afrikaans kampioenschap voetbal 2015 en was eerste doelman op het volgende kampioenschap in 2017, waarin in de finale werd gewonnen van Egypte (2–1). Hij nam met Kameroen als regerend Afrikaans kampioen deel aan de FIFA Confederations Cup 2017, waar in de groepsfase werd verloren van regerend wereldkampioen Duitsland, regerend Zuid-Amerikaans kampioen Chili en werd gelijkgespeeld tegen de kampioen van Azië, Australië.