Vuonna 2001 rakennus vaurioitui pahoin Syyskuun 11. päivän iskuissa. Kaksoistornien etelätornin romahtaessa, Deutsche Bank Buildingin 24. kerroksien julkisivun osat ja sisäosat tuhoutuivat. Rakennuksen julkisivu peitettiin verkolla rakennuksen romahtamisen estämiseksi. Rakennuksessa aloitettiin korjaustyöt, mutta niistä luovuttiin rakennuksen laajan tuhoutumisen seurauksena ja todettiin käyttökelvottomaksi terveydelle vaarallisten myrkyllisten mineraalipölyjen kuten asbestin ja lyijyn takia. Vuoden 2005 syyskuussa rakennuksen katolta löydettiin ihmisten jäänteitä. Maaliskuussa 2006 rakennuksessa vaarallisen jätteiden puhdistustyötä tehneet rakennustyöntekijät löysivät rakennuksesta useita luunpalasia.