Hans strenge, autoritære regime mødte stadig større folkelig modstand, men han holdt sig på magten helt frem til januar 1968, da han blev tvunget til at trække sig og Alexander Dubček overtog som partisekretær. Statsminister Jozef Lenárt fungerede nogle få dage som præsident, før stillingen blev overtaget af Ludvík Svoboda. Dette udløste Foråret i Prag.