Krótko po zamachu z 11 września prezydent Karimov zgodził się pomóc Stanom Zjednoczonym w „wojnie przeciw terroryzmowi” i zdecydował, że kraj będzie służył jako baza do przeprowadzania operacji w trakcie wojny w Afganistanie. Uzbeckie instalacje wojskowe, jak np. baza powietrzna K2 w Dżanabadzie, były wykorzystywane przez koalicję. Dzięki tej pomocy, władze uzbeckie mogły liczyć na współpracę gospodarczą i wojskową ze Stanami Zjednoczonymi, co pomogłoby rozwiązać problemy gospodarcze i polityczne.