Srníček nam met het Tsjechisch voetbalelftal deel aan Euro 1996 in Engeland. Hij was op dat toernooi slechts de doublure van eerste doelman Petr Kouba. Na dat toernooi werd Srníček eerste doelman en werd met Tsjechië derde op de FIFA Confederations Cup 1997. Srníček speelde alle groepswedstrijden van de Tsjechen op Euro 2000 in Nederland en België. Frank de Boer scoorde in de 89ste minuut het Nederlandse doelpunt tegen hem in de groepsfase (1–0).