La période qui suivit est mal connue car les autobiographies de Wiesenthal se contredisent sur de nombreux points et il a également dramatisé et romancé certains événements. L'une des versions est qu'il a ouvert un cabinet d'architecture avant d'être finalement admis à l'université de Lwów. Durant ses études, il dessina plusieurs bâtiments résidentiels ainsi qu'un sanatorium et fut un membre actif d'une association étudiante sioniste ; il écrivit également des articles dans "Omnibus", une revue étudiante satirique et fut diplômé en 1939. Le journaliste et écrivain Guy Walters note que dans sa première autobiographie, Wiesenthal ne fait aucune mention d'études à Lwów ; son nom n'apparait dans aucun document universitaire ni dans la liste des architectes de la période. Il cite par ailleurs un CV rédigé après la Seconde Guerre mondiale, dans lequel Wiesenthal indique qu'il avait travaillé comme contremaître dans une usine jusqu'en 1939 puis comme mécanicien dans une autre usine jusqu'à l'invasion allemande de l'Union soviétique en 1941. Dans son autobiographie de 1961 "" ("J'ai chassé Eichmann"), il rapporte avoir travaillé comme ingénieur à Odessa de 1940 à 1941.