В 1992 году, когда в Боснии началась гражданская война, Вараич переехал из Сараева в Белград и продолжал работать в спортивных органах Союзной Югославии, а затем Сербии. Он возглавлял программный комитет НОК Югославии с 1996 по 2000 год и был спортивным директором олимпийской сборной Югославии на Олимпийских играх 2000 года в Сиднее. С 2000 по 2002 год Вараич был спортивным директором мужской баскетбольной сборной Югославии, с 2003 по 2006 год — президентом спортивного союза «Спорт для всей Сербии». Активно участвовал в организации взрослого и юношеского чемпионатов Европы 2005 года в Белграде и юношеского чемпионата мира 2007 года в Нови-Саде. Был директором баскетбольного турнира Европейского юношеского Олимпийского фестиваля 2007 года и баскетбольного турнира Универсиады 2009 года.