Die Familie Tronchin suchte zum Zeitpunkt der Bartholomäusnacht (vom 23. zum 24. August 1572) Zuflucht in Genf. Der Vater von Théodore Tronchin, Jean-Robert Tronchin (1670–1730), war einer der reichsten Bankiers in Genf und Lyon, auch war er Mitglied im Rat der Zweihundert von Genf, "Membre du Conseil des Deux-Cents". Seine Mutter war Angélique Calandrini (1692–1715), aus Italien stammend, und jung verstorben. Ein Cousin von Tronchin war der Genfer Advokat, Mäzen und Autor François Tronchin (1704–1798).