Déclenchée par l'Irak en septembre 1980, la Guerre Iran-Irak pose un cas de conscience à l'ensemble de l'extrême-gauche iranienne. L'UCC refuse toute forme de ralliement au régime, insistant au contraire sur l’armement indépendant de la classe ouvrière en vue de la résistance. Son modèle reste celui de la lutte armée sous direction communiste, citant l’Albanie, la Corée et le Viêt Nam pour modèle. Mansoor Hekmat, quelques jours après les premiers bombardements, propose une ligne de « défense de la révolution contre la guerre des capitalistes ». Cette ligne reste applicable aussi bien dans la zone soumise au régime islamique ou dans celle occupée par l’armée irakienne.