Ibrahimović comenzó su tercera temporada en el Inter al ganar la Supercopa Italiana contra la Roma. Después de que el tiempo regular y el tiempo extra habían terminado en un empate, el partido fue a una tanda de penaltis donde convirtió con éxito su intento de penalti y obteniendo la victoria. Anotó el único gol de su equipo en el partido inaugural de la Serie A 2008-09 contra la Sampdoria, que terminó en empate 1-1. El 4 de octubre, durante el partido contra el Bolonia en el que el Inter ganó por 2-1, Ibrahimović marcó un gol sensacional, deslumbrando al portero Francesco Antonioli con un irresistible «golazo» de "Taco" con una asistencia de Adriano. El gol fue luego votado como el Gol del Año en la Serie A por lo que se le entregó un Oscar como premio.