A partir do início da invasão da União Soviética em Junho de 1941, os "Einsatzgruppen" seguiram o exército para as áreas conquistadas e reuniram os judeus, oficiais do Comintern e membros mais destacados do Partido Comunista, e executaram-nos. Eichmann foi um dos oficiais que recebiam relatórios detalhados das suas actividades. A 31 de Julho, Göring deu autorização por escrito a Heydrich para preparar e submeter um plano para uma "solução total para a questão judaica" em todos os territórios sob controlo alemão, e coordenar a participação de todas as organizações do governo envolvidas. O"Generalplan Ost" (Plano Geral para o Leste) estabelecia a deportação da população dos territórios ocupados na Europa de Leste e da União Soviética para a Sibéria, para servirem de escravos ou para serem mortos.