Nach Custers Niederlage am Little Big Horn 1874, wurde MacKenzie als Kommandeur des Wehrbezirks Black Hills und von Camp Robinson eingesetzt. Unter der Leitung von General George Crook, dem Befehlshaber des Wehrbereichs Platte, partizipierte Mackenzie als maßgeblicher Feldkommandeur an einer Winterkampagne gegen die Northern Cheyenne, deren Lager er am 25. November 1876 am Red Fork des Powder River in Wyoming überfiel und verwüstete.