Сразу после отделения Алабамы от Союза Лоу поступил в алабамское ополчение в звании капитана. В апреле 1861 году он перевёлся в Армию Конфедерации, в 4-й Алабамский пехотный полк, который набирался из учеников его школы. 4-й Алабамский также известен как «Алабамские зуавы». В первом сражении при Булл-Ран он сражался в бригаде Бернарда Би и был ранен в руку. Лоу выжил, но его левая рука более не действовала. Он вернулся в полк. 28 октября 1861 он был повышен до полковника, а в мае 1862 получил соединение, впоследствии известное как «Алабамская бригада». Бригада была частью Северовирджинской Армии и подчинялась генералу Лонгстриту. В июне бригада Лоу состояла из 4-х пехотных полков: