Ali Haidar wurde als Angehöriger der alawitischen Minderheit im Dorf Hallet Ara im Gouvernement Latakia geboren. Er gilt als Kindheitsfreund des späteren Diktators Hafiz al-Assad. Er absolvierte seine militärische Ausbildung an der Militärakademie in Homs. Bereits als Jugendlicher war Ali Haidar der Baathpartei beigetreten. Nach der Revolution des 8. März wurde er zum Chef der Spezialeinheiten der syrischen Armee berufen. Während der Machtübernahme durch Assad im Rahmen der Korrekturbewegung leistete Haidar den Putschisten militärische Hilfe. Seine Truppen nahmen eine zentrale Rolle im "Tiefen Staat" der alawitisch dominierten Baath-Partei ein. Seine Spezialeinheiten waren um Tartus und Damaskus gruppiert, um das Regime gegen innere und äußere Bedrohungen zu schützen. Ebenso waren sie im Libanesischen Bürgerkrieg an Gefechten mit der Israelischen Armee beteiligt. Als Hafiz al-Assads Bruder Rifaat den von Krankheit geschlagenen Diktator absetzen wollte, gehörte Haidar zu den Loyalisten, die es Hafiz al-Assad ermöglichten, den Putsch niederzuschlagen.