Bei Beginn des Überfalls auf Polen wurde die "Schwerin" von der Kriegsmarine requiriert und als Truppentransporter eingesetzt, kehrte aber schon bald wieder zu ihrem Fährdienst zurück. Bei der Besetzung Dänemarks durch die Wehrmacht am 9. April 1940 brachten die "Schwerin" und die "Mecklenburg" deutsche Invasionstruppen in den frühen Morgenstunden nach Gedser, wo man die routinemäßige Ankunft der Fähren, nicht aber von Truppentransportern erwartete. Danach brachten die beiden Schiffe und die beiden in Gedser beschlagnahmten dänischen Fährschiffe "Danmark" und "Prins Christian" im Pendelverkehr weitere Truppen von Warnemünde nach Gedser.