2006 erschien mit "En Soap" ihr erster abendfüllender Film. Mit ihm nahm sie am Wettbewerb der Berliner Filmfestspiele 2006 teil und konnte den Silbernen Bären gewinnen. Weitere Auszeichnungen erhielt der Film beim Filmfestival von San Sebastián und wurde 2007 mit dem Bodil als bester dänischer Film ausgezeichnet. 2008 eröffnete Fischer Christensen mit dem Spielfilm "Der Tanz" die fünfzigste Auflage der Nordischen Filmtage Lübeck, in dem sie die weibliche Hauptrolle erneut Trine Dyrholm anvertraute.