En 1988 su notoriedad aumenta, negándose a efectuar su período de reserva en los territorios ocupados. En 1988 fue a prisión por negarse a realizar su servicio militar en los territorios palestinos, concretamente en Nablús (Cisjordania) y es encarcelado durante 3 semanas. Es el número 39 de los "refusenik" israelíes. Ya había servido en 1982 en el momento de la guerra de Líbano y una primera vez en los territorios ocupados en 1986, pero la primera Intifada todavía no había comenzado en aquella época. A su salida de prisión y en respuesta a las reacciones con relación a su obra, inventa el término de Nuevos historiadores para denominar a los historiadores que están reescribiendo la historia de los orígenes de Israel como Avi Shlaim e Ilan Pappé. Todos son atacados con virulencia, acusados de antisionismo y sus métodos comparados con los negacionistas.