З червня 1941 року Семен Кривошеїн учасник Німецько-радянської війни. Брав участь у Курській битві, Вісло-Одерській, Берлінській операціях. Командував 3-м механізованим корпусом (23 жовтня 1943 року перейменований у 8-й гвардійський механізований корпус).