Айдер Зейтуллаєв народився в Середній Азії в сім'ї насильно переселених туди кримських татар. Розпочав займатися футболом у ДЮСШ міста Фергана. Дебютував у команді майстрів у 1977 році в складі команди «Нафтовик» з Фергани, яка грала в другій лізі СРСР. Уже в 1979 році Зейтуллаєв став одним із кращих бомбардирів команди, відзначившись 10 забитими м'ячами. У наступні роки виступів за ферганську команду нападник відзначався щонайменше 9 забитими м'ячами за сезон. У 1983—1984 роках Зейтуллаєв грав у армійській команді «Зірка» з Джиззака, яка на той час виступала в першій лізі СРСР.