Etwa 1860 zog er nach Salzburg, wo er zusammen mit Gregor Baldi das Unternehmen Baldi &amp; Würthle gründete. Baldi hatte zuvor dort eine Kunsthandlung mit Verlag betrieben und etliche Mappen zur Topographie der Umgebung herausgebracht, in denen Stiche von Würthle verwendet worden waren. Baldi &amp; Würthle wurden schnell bekannt, unter anderem durch ihre Landschafts- und Panoramaaufnahmen. Aus dem Vorort Riedenburg zogen sie 1866 mit ihrer Firma in die zentraler gelegene Schwarzstraße. 1873 wurde Friedrich Würthle, der auf der Wiener Weltausstellung seine topographischen Aufnahmen gezeigt hatte, mit der Fortschrittsmedaille ausgezeichnet. Außerdem verlieh ihm der Kaiser Franz Joseph I. das Goldene Verdienstkreuz mit der Krone.