Вооружённые силы Буркина-Фасо были задействованы в Агашерскай войне 1985 года, где они потерпели поражение. После этого президент Томас Санкара начал проводить реформы в вооруженных силах. Однако они не были завершены из-за очередного переворота и гибели Санкары.