Le , le lieutenant-général et son « groupe Shimbu », un détachement indépendant, est chargé de la défense du sud de Luçon, autour de la capitale Manille. Le groupe est officiellement renommé «  » le . Yokoyama commande les forces japonaises défendant Manille contre les  et  armées américaines et les troupes de l'armée philippine et de la dont font partie plusieurs groupes de guérilla. Après la bataille de Manille, Yokoyama fait reculer ses forces restantes dans les montagnes du sud de Luçon pour commencer une campagne de guérilla et harceler les Alliés. Au moment de la reddition du Japon, la ne compte plus que hommes.