Новый предолимпийский сезон американка начала в начале сентября в Бергамо на Кубке Ломбардии, где сумела завоевать бронзовую награду. Через две недели фигуристка выступала в Монреале на турнире Autumn Classic International, где заняла первое место и улучшила своё прежнее спортивное достижение в короткой программе. В конце октября Нагасу выступала на этапе Гран-при в Миссиссоге, где на Кубке федерации Канады заняла место в середине турнирной таблице. В конце ноября она выступала на заключительном этапе Гран-при в Саппоро, где заняла пятое место. В январе 2017 года на национальном чемпионате в Канзасе она не смогла составить конкуренции ведущим американским фигуристкам и финишировала только четвёртой. В феврале фигуристка выступала в Канныне на континентальном чемпионате, где выиграла бронзовую медаль. В произвольной программе и сумме были улучшены все прежние спортивные достижения.