W ZSRR początkowo działała w miarę normalnie. Proboszczem był wtedy kapłan obrządku wschodniego o. Makary Karoweć OSBM, który był również duszpasterzem łacinników. W 1929 został on wydalony do Polski. Pozbawiona kapłana parafia przetrwała do operacji polskiej NKWD w 1937, kiedy to jej aktyw został aresztowany i wymordowany, a kościół wysadzony w powietrze. Parafia zaczęła się odradzać po śmierci Stalina. Do Mohylowa okresowo potajemnie przyjeżdżali kapłani. W latach 80. msza święta była już odprawiona regularnie w prywatnym mieszkaniu. Później parafia została oficjalnie zarejestrowana. Od 1991 posługują w niej marianie.