Lo cierto es que su etapa de gobierno no estuvo ausente de problemas: Desde el primer momento hubo de hacer frente a la grave crisis económica que se abatía sobre el país desde principios de los 90, con una importante deflación y un creciente desempleo. Lejos de lograr contrarrestar sus efectos, tiempo después, el 17 de enero de 1995 tuvo lugar el Gran terremoto de Hanshin-Awaji. El cataclismo causó graves daños en la Prefectura de Hyōgo (especialmente la ciudad de Kobe), lo que conllevó un hundimiento de la ya dañada economía japonesa. Por su parte, el gobierno recibió numerosas críticas acusado de una mala coordinación en la ayuda a las víctimas. Dos meses después, el 20 de marzo, la secta Aum Shinrikyo llevó a cabo un atentado en el Metro de Tokio utilizando Gas sarín, con un gran impacto en la sociedad.