Ein weiterer Zusammenschluss fand 1998 statt, als die "AEF (Africa Evangelical Fellowship)" zur SIM stieß. Die Geschichte der AEF begann 1879 mit der Errichtung eines Soldatenheims in Kapstadt, Südafrika. Aus dieser Wurzel formierte sich eine Mission, die 1889 nach dem ersten Burenkrieg aktiv wurde und sich "South African General Mission" nannte. Ihre Mission erstreckte sich über ganz Südafrika, bis hin zu den Inseln des Indischen Ozeans. Als sich die AEF 1998 mit der SIM zusammenschloss, erstreckte sich ihre Arbeit auf die Länder Angola, Botswana, Eswatini, Gabun, Madagaskar, Mauritius, Réunion, Mosambik, Namibia, Tansania, Sambia und Simbabwe.