Swoją karierę trenerską Becker rozpoczął od prowadzenia hiszpańskiego klubu RSD Alcalá. Następnie pracował w takich klubach jak: UD San Sebastián de los Reyes, CD Ciempozuelos, CF Fuenlabrada i CD San Fernando. W latach 2012-2015 prowadził reprezentację Gwinei Równikowej kobiet. W 2015 został selekcjonerem reprezentacji mężczyzn tego kraju. W 2015 poprowadził ją w Pucharze Narodów Afryki, na którym Gwinea Rówinkowa zajęła 4. miejsce.