На следующий год Пекгарт, как игрок сборной до 19 лет, получил право сыграть на молодёжном первенстве мира в Канаде. В составе сборной Томаш провёл 7 матчей, однако голы не забивал. В серии пенальти 1/8 финала против Японии он не реализовал свой 11-метровый, что не помешало Чехии выйти в следующий круг. В 1/4 финала в матче с Испанией в серии пенальти Пекгарт на этот раз реализовал свою попытку, что помогло Чехии выйти дальше. Славянская сборная дошла до финала, где проиграла Аргентине 1:2, пропустив второй мяч за 4 минуты до конца второго тайма.