Il se convertit à l’Islam et adopte le prénom Yahya. De 1995 à 1998, il préside le Conseil supérieur des musulmans de Belgique. En 1998, suite à une polémique concernant un écrit qu'il a publié sous le pseudonyme "Nasreddin Lebatelier" , dans lequel il met en parallèle un texte d'Ibn Taymiyya et l'assassinat des moines de Tibéhirine survenu deux ans auparavant en Algérie, il négocie un départ à l’amiable avec l’UCLouvain et part enseigner au Centre d’études islamiques de l’Université d’Oxford, puis au "Hartford seminary" (Connecticut)"," jusqu’à son éméritat en .