Во время военного переворота 19 ноября 1968 года Хайдара находился в Томбукту, где был задержан военными и переправлен в тюрьму в Бамако. Через некоторое время он был освобождён, вернулся на родину в Тимбукту и больше не возвращался к политической деятельности.