Laget spilte sin første landskamp borte mot den 16. november 1956, i en kamp de tapte 1–2. Sudan var ett av tre land som deltok i det første Afrikamesterskapet i 1957. Landslaget oppnådde flere gode resultater i mesterskapene frem til midten av 1970-tallet, med flere andreplasser og gruppespill samt mesterskapseier i 1970 som høydepunkt. Etter dette lyktes ikke Sudan å kvalifisere seg før i 2008, og i 2012 spilte Sudan seg frem til en kvartfinale.