Защитники выдержали. 21 ноября 1918 года Нильский был ранен в третий раз. Но не прервал своей штабной работы. После освобождения города немедленно выехал в Варшаву. В виелкопольской команде ввёл военный порядок и четкую организацию. Повстанческие отделы перестроил в регулярное войско. Был также приближенным офицером Юзефа Пилсудского. В начале боёв на восточных границах возрождённого польского государства принял командование над 15 дивизией. В апреле 1919 года был уже на Виленском фронте. Исполнял там обязанности офицера в штабе Главнокомандующего.