14 октября 1861 года Эчолс получил звание полковника. Весной 1862 года его полк числился в составе знаменитой «Бригады каменной стены» и участвовал в кампании в долине Шенандоа. 23 марта 1862 года он сражался в первом сражении при Кернстауне, где его полк выдержал атаку пяти федеральных полков Эрастуса Тайлера, но Эчолс был ранен в плечо пулей Минье. Он выбыл из строя на несколько недель.