Гетто в Михалишках было ликвидировано в марте 1943 года. Часть евреев деревни расстреляли на месте, часть вывезли в Вильнюс и убили там — большей частью в Понарах. В Понарах погибли более 600 жителей Михалишек, а спастись удалось только одному — Евгению Крескину, который упал за секунду до выстрелов и ночью выбрался из-под груды тел и скрылся в лесу.