2008 was een teleurstellend jaar voor Bakoelin. Bij de wereldbeker snelwandelen werd hij gediskwalificeerd, doordat hij met twee benen van de grond loskwam. Deze diskwalificatie ontnam hem bovendien zijn mogelijkheid zich te kwalificeren voor de Olympische Spelen van 2008.&lt;br&gt;Het daaropvolgende jaar besloot Sergej Bakoelin zich in het vervolg te richten op de langere snelwandelafstanden, zoals de 50 km snelwandelen, omdat hij dacht daar meer kans te maken door een zwakkere concurrentie. Deze keuze bleek een juiste te zijn; hij steeg in de klasseringen bij de nationale kampioenschappen, in 2010 bereikte hij het podium bij de Europese kampioenschappen en in 2011 wist hij de jongste wereldkampioen op de 50 km snelwandelen te worden. Hij wist op de WK de nummer twee, zijn landgenoot Denis Nizjegorodov, meer dan een minuut achter zich te laten.