À la suite du coup d’État du général Pervez Musharraf le , une nouvelle faction est créée en 2002 par scission de la PML(N) pour soutenir le nouveau dirigeant : la Ligue musulmane du Pakistan (Q). Celle-ci remporte les élections législatives de 2002, mais sera de nouveau dépassée par la Ligue musulmane du Pakistan (N) dès les élections législatives de 2008. Chacune d'entre elles revendique l'héritage historique de la Ligue musulmane, ainsi le « Q » de la Ligue de 2002 fait référence au « Quaid e Azam » ("Commandant suprême"), le surnom du fondateur du pays, Muhammad Ali Jinnah. Nawaz Sharif a également revendiqué cet héritage.