W sierpniu 2011 roku zawodnik Sharks otrzymał powołanie do reprezentacji na rozgrywany w Nowej Zelandii puchar świata. Podczas turnieju grał jednak naprzemiennie z Gurthrö Steenkampem, a w decydującym ćwierćfinale z Australią nie znalazł się w składzie. W listopadzie 2012 roku Mtawarira musiał opuścić zgrupowanie reprezentacji przed meczem z Irlandią w Dublinie na skutek nasilenia się pojawiających się od około dwóch lat objawów kołatania serca. Ustabilizowanie stanu zdrowia zawodnika wymagało interwencji chirurgicznej, jednak dzięki temu udało się wyeliminować przyczynę mogącą przedwcześnie zakończyć jego karierę.