W latach 2004–2014 prowadził reprezentację Austrii, która pod wodzą Pointnera stała się potegą w konkursach drużynowych: siedmiokrotne mistrzostwo świata (2005–2013), dwukrotne mistrzostwo olimpijskie (2006, 2010), trzykrotne mistrzostwo świata w lotach (2008, 2010, 2012) oraz 9-krotny triumf w Pucharze Narodów (2005–2012, 2014), a sukcesy indywidualne odnosili: Thomas Diethart, Martin Koch, Andreas Kofler, Wolfgang Loitzl, Thomas Morgenstern, Gregor Schlierenzauer, Andreas Widhölzl. Odszedł z reprezentacji Austrii po &lt;a href="Puchar%20%C5%9Awiata%20w%20skokach%20narciarskich%202013/2014"&gt;sezonie 2013/2014&lt;/a&gt; i został zastąpiony przez Heinza Kuttina.