Cuando Lenin volvió a publicar un periódico propio —nuevamente llamado "Proletarii"— a partir de agosto de 1906, Krúpskaya quedó nuevamente encargada de sus distribución desde Finlandia. Se encargó asimismo de coordinar el viaje de varios de los delegados al V Congreso del partido, que se celebró en Londres a finales de la primavera de 1907. A finales de año, restablecida la autoridad zarista en el país, Lenin y Krúpskaya decidieron volver a exiliarse. Mientras Lenin pasaba a Suecia, Krúpskaya quedó encargada de destruir los archivos principales, regresó a San Petersburgo para encontrar alojamiento para su madre, y partió luego también al exilio.