Nel braccio di sinistra del transetto, a pavimento, si trova l'organo a canne Cavaillé-Coll "opus 250/229", costruito nel 1865 per la residenza privata del barone d'Erlanger e restaurato dallo stesso organaro nel 1899. Dopo la morte del committente, nel 1927 il figlio lo donò al comune di Parigi che lo fece collocare all'interno dell'università della Sorbona dalla ditta Cavaillé-Coll-Convers, che in tale occasione operò alcune modifiche. Gravemente danneggiato dall'incuria e dagli eventi del maggio 1968, per volontà del comune nel 1986 è stato portato nell'attuale collocazione e restaurato dall'organaro Jean Renaud.