Der Innenraum ist – von den untergeordneten Seitenschiffen abgesehen – ein einheitlicher Saal, der von einem Tonnengewölbe mit Kassetten überspannt ist. Im Inneren kann man wiederum die Säulen als romanisch betrachten, während das kassettierte Tonnengewölbe eine Verbindung zur Renaissance herstellt. Zwischen den Arkaden und den großen Rundfenstern des Obergadens sind Relieffriese mit Szenen aus dem Markusevangelium eingefügt. Der Jugendstileinfluss ist in erster Linie in der Ausstattung und Ornamentierung vorhanden, angefangen bei dem Christuskopf über dem Hauptportal und den Schmuckformen der Portaleinfassungen, weiter dann durch die Türbeschläge, das farbige Glas der Türfüllungen, die teilweise noch vorhandenen ursprünglichen Lampen, die Treppengeländer, und die Möbel in der Sakristei. Von der Innenausstattung sind die Kanzelintarsien von Rudolf Yelin d. Ä. und der Altarschmuck in kunstgewerblichem Leder mit Holzintarsien beachtenswert. Der Prospekt der Orgel ist der einzige in Stein gefertigte nördlich der Alpen. Die Position der Orgel und der Sängerempore hinter dem Altar ist außergewöhnlich.