En 1801 marchó al mando del ejército de la India enviado a cooperar con Ralph Abercromby en la expulsión de los franceses de Egipto. Arthur Wellesley fue nombrado segundo en el mando, pero debido a problemas de salud no acompañó a la expedición siendo reemplazado por Samuel Auchmuty. Baird desembarcó en Kosseir en junio, condujo su ejército a través del desierto hasta Kena, sobre el Nilo, y luego a El Cairo. Llegó a Alejandría y se unió a las fuerzas sel general Hutchinson, quien había sucedido a Abercromby, a tiempo de participar de las operaciones finales de la campaña.