In der Spielzeit 2000 feierte Thelin den bis dato größten Erfolg ihrer Karriere, als sie an der Seite von Tina Nordlund, Hanna Ljungberg und Malin Moström mit einem Punkt Vorsprung auf die Frauenmannschaft des Malmö FF erstmals in der Vereinsgeschichte den schwedischen Meistertitel holte. Während sie mit ihrem Klub auch in der folgenden Spielzeit erfolgreich war, saß sie bei der Europameisterschaft 2001 als Ersatztorhüterin hinter Caroline Jönsson erneut nur auf der Ersatzbank und wurde ohne Spielminute Vize-Europameisterin. Am Ende des Jahres beendete sie ihre Karriere, um sich ihrer Familie widmen zu können.