I 1925 ble bygget stengt inntil videre på grunn av skader fra byggearbeidene med Madrids metro. Myndighetene så på muligheten for å bygge om operahuset, men planene ble aldri gjennomført på grunn av økonomiske problemer og politiske omveltninger som den spanske borgerkrigen. I stedet ble Teatro Real restaurert og åpnet dørene som en konsertarena i 1966 – etter å ha vært stengt i 41 år. I de påfølgende årene var Teatro Real hjemmebane til Det spanske nasjonalorkesteret og RTVEs symfoniorkester. I 1969 ble den 14. utgaven av Eurovision Song Contest arrangert i operahuset, blant annet med en metallskulptur på scenen laget av Salvador Dalí. I perioden 1966–1988 var Teatro Real Madrids fremste konsertarena, men bygget stengte dørene på ny høsten 1988. I stedet ble Teatro Real bygget om for å møte det lokale ønsket og behovet for et skikkelig operahus. Ombyggingen startet 2. januar 1991, og 11. oktober 1997 åpnet operahuset dørene igjen. Åpningen ble foretatt av kong Juan Carlos og dronning Sofia, sammen med arkitektene Juan Manuel González og Francisco Rodríguez de Partearroyo. Åpningsforestillingen var Manuel de Fallas "El sombrero de tres picos" og "La vida breve" som ble etterfulgt av verdenspremieren på "Divinas Palabras," av den spanske komponisten Antón García Abril. I besetningen var blant andre Plácido Domingo.