Во время Американо-мексиканской войны Сеймур был призван в звании майора в пехоту Коннектикута (16 марта 1846 года), а затем принят в 9-й пехотный полк Армии США (9 апреля 1847 года). Благодаря своему мужеству и проявленным в битве при Чапультепеке лидерским качествам Сеймур был назначен подполковником в 12-й пехотный полк под командованием Милледжа Л. Бонема (12 августа 1847 года).