En 1990, Boginskaya devint la troisième femme à écraser les championnats d'Europe de gymnastique (après la Tchécoslovaque Věra Čáslavská en 1965 et 1967 et la Soviétique Lyudmila Turishcheva en 1973), remportant la médaille d'or dans chaque épreuve individuelle. Ce faisant, elle défendait avec succès ses titres au concours général individuel avec 39,874 points, au sol avec la note maximale de 10,00 et au saut de cheval et y ajoutait les titres aux barres asymétriques et à la poutre encore avec la note maximale de 10,00. En 1991, lors d'une finale controversée, Boginskaya échouait dans la défense de son titre mondial au profit de l'Américaine Kim Zmeskal. Néanmoins, elle remportait les titres à la poutre et au concours général par équipes.