После того как просьба Бейзилона о возвращении во флот была одобрена, он был назначен в роту «С» (Чарли) 1-го батальона 27-го полка 5-й дивизии морской пехоты во время высадки на Иводзиму. 19 февраля 1945 года Джон стал командиром пулемётного расчёта. Его подразделению было поручено высадиться на участке Red Beach II. Японцы встретили наступающих огнём сильно укреплённых огневых точек, построенных по всей территории острова. Так как его подразделение было сковано огнём противника, Бейзилон обошёл японские позиции, пока не оказался непосредственно на крыше японского ДОТа. Джон забросал японцев гранатами и в одиночку уничтожил целый опорный пункт и его гарнизон. Затем он пробился к Аэродрому № 1 и помог американскому танку, попавшему на минном поле под сильный миномётный и артиллерийский огонь. Бейзилон провёл тяжёлое транспортное средство по опасной местности, несмотря на сильный огонь японцев. Когда Джон двигался по краю аэродрома, он был убит осколком японского снаряда . Действия Бейзилона помогли морским пехотинцам преодолеть оборону японцев на месте высадки, где морпехи были прижаты к земле плотным огнём противника и могли в любой момент быть сброшены обратно в море. За доблесть в битве за Иводзиму, Джон Бейзилон был посмертно награждён второй по значимости наградой морской пехоты — Военно-морским крестом.