Во время обеих мировых войн Скагеррак был стратегически очень важен для Германии. Во время Первой мировой войны с 31 мая по 1 июня 1916 года здесь произошло одно из крупнейших морских сражений — Ютландская битва. Во время Второй мировой войны важность контроля над этим водным путём, единственным морским выходом к Балтике, послужила мотивом для немецкого вторжения в Данию и Норвегию и строительства северных частей Атлантического вала. Обе мировых войны привели к большому количеству кораблей и судов, потопленных в Скагерраке.