新加坡戰役中，学校的钟楼因为地势高，成为盟军捍卫者 的中部，后沦为日本皇军的官邸。期间，学校也沦为一个临时集中营，成为肃清的大屠杀的拘留所。 战争结束后，学校重新开放，继续提供中学教育。 1950年代和1960年代期民间动乱期间，许多学生、教师和校友参加或领导了一系列的反殖民骚乱。