ゲルダは1940年7月28日に、デンマーク・で亡くなった（）。ゲルダの死は、第二次世界大戦が開戦し、ナチス・ドイツがデンマークに侵攻した数か月後のことだった（デンマーク侵攻は1940年4月の出来事である）。彼女の小さな地所はオークションで売却され、地元紙に小さな追悼記事が掲載されただけだった。遺体はソールビェア公園共同墓地（）にひっそりと埋葬されている。彼女がレズビアンだったかどうかに関しては議論の余地が残されている。アイナーとゲルダは互いに同性愛者だったが、当時仕事を得るために、この事実を隠しておく方が得策だと判断したとする論文もいくつか存在する。