Takım 2008-09 sezonuna 2008 NBA Seçmeleri'nde 4. sıradan Russell Westbrook'u draft ederek başlamıştır. Birçok kişi bu seçimi çok ciddi biçimde eleştirip bu draftta kendisinden daha potansiyelli oyuncuların olduğunu söyleyip beğenmese de Westbrook gösterdiği performansla eleştirilerin haksız olduğunu göstermiştir. Ayrıca aynı drafttan 1. tur 24. sıradan Serge Ibaka draft edilse de 1 sezon daha Avrupa'da oynaması için çağrılmadı. Free agent'tan ise Sırp Pivot Nenad Krstić ile de anlaşılıp sözleşme imzalandı. Thunder 2008-09 sezonu başlamadan önce birçok hazırlık maçı yapmıştır. Hazırlık turnuvalarında görücüye ilk kez Minnesota Timberwolves'e 88-82 kaybettikleri maçta çıkmışlardır. Thunder takımı Ford Center'da ilk kez 14 Ekim'de Los Angeles Clippers'la oynadıkları hazırlık maçında oynamışlardır.