В начале Великой Отечественной войны, в июле 1941 года, полковник Глаголев назначен командиром 42-й кавалерийской дивизии, которая начала формирование в Краснодаре. на Северном Кавказе. В августе 1941 года дивизия была переброшена в Крым, передана 51-й отдельной армии. Дивизия участвовала в Крымской оборонительной операции в составе кавалерийской группы армии, которая действовала очень неудачно и все кавалерийские дивизии в её составе понесли большие потери. Остатки дивизии отошли в Севастополь, где в ноябре дивизия была расформирована. Полковник В. В. Глаголев был вывезен на Северный Кавказ, где с декабря формировал 242-ю стрелковую дивизию, с января 1942 года — 115-ю кавалерийскую дивизию, с февраля — 73-ю стрелковую дивизию. В апреле 1942 года дивизия была передана в 24-ю армию Южного фронта. В июне—июле 1942 года участвовал в тяжёлых оборонительных боях Воронежско-Ворошиловградской операции, в которой в июле дивизия попала в окружение под Миллерово и фактически была разбита, в августе Глаголев вышел из окружения с остатками дивизии, которую в сентябре расформировали. После короткого пребывания в распоряжении Военного совета Закавказского фронта и в должности заместителя командира 11-го гвардейского стрелкового корпуса, в октябре 1942 года назначен командиром 176-й стрелковой дивизии на Закавказском фронте. Во главе дивизии вёл успешные боевые действия на оборонительном этапе битвы за Кавказ, отличился в контрударах под Моздоком и Орджоникидзе. Тогда дивизия была награждена орденом Красного Знамени (награждение воинских частей за отличия в оборонительных операциях было очень редким случаем).