Apesar de ter ocupado lugares de chefia em organizações culturais do Estado Novo, surpreendentemente, no pós-25 de Abril de 1974, revelou-se um ardente comunista. Amigo de Vasco Gonçalves, entre 1974 e 1975 foi Director-Geral dos Assuntos Culturais e Secretário de Estado da Cultura e Educação Permanente. Em 1985 regressou ao Teatro Nacional de São Carlos como Administrador-Director Artístico e da Produção, e em 1987 foi-lhe atribuída a Medalha de Mérito da Secretaria de Estado da Cultura. Segundo Jorge Calado, do Instituto Superior Técnico, "João de Freitas Branco foi sem dúvida o grande educador musical dos portugueses".