La Banovina fue sometida junto con el resto de Yugoslavia en la veloz invasión del Eje. Considerado por los alemanes como perfecto caudillo títere de un nuevo estado, Maček recibió la oferta de convertirse en primer ministro del nuevo país. Dos veces la rechazó, convencido como pocos políticos croatas del momento de que el Eje acabaría perdiendo la guerra. Evitar en lo posible las penalidades de la guerra a los croatas se convirtió en su objetivo. A la vez que solicitaba a sus partidarios que colaborasen con el nuevo régimen de Ante Pavelić, enviaba un delegado (Juraj Krnjević) al Gobierno yugoslavo en el exilio en Gran Bretaña. Mientras, el ala más derechista del partido se pasó a los ustachas. El mismo día que las tropas alemanas entraban en Zagreb, el representante alemán, Veesenmayer había logrado su beneplácito para que el representante local de los ustachas, Slavko Kvaternik, tomase el poder en la ciudad, ya abandonada por las autoridades yugoslavas ante el avance alemán. Poco después Kvaternik, acompañado de Veesenmayer, proclamaba por radio el establecimiento del nuevo Estado Independiente de Croacia.