Im Januar 1919 übernahm Ador zusätzlich das Amt des Bundespräsidenten. In dieser Funktion reiste er zweimal nach Paris, um an der Friedenskonferenz mit den Staats- und Regierungschefs der Entente zusammenzutreffen. Damals war es für einen Bundespräsidenten unüblich, ausländischen Boden zu betreten. Während seiner ersten Mission traf er sich mit Wilson, David Lloyd George, Georges Clemenceau und Edward Mandell House. Dank seines Engagements wurde Genf Hauptsitz des Völkerbundes. Er erreichte darüber hinaus die Anerkennung des besonderen Neutralitätsstatus der Schweiz und daraus resultierend den Beitritt der Schweiz zum Völkerbund. Im Sommer 1919 kündigte Ador seinen bevorstehenden Rücktritt an und begründete dies damit, er sei zu müde und zu alt, um sich der Wiederwahl zu stellen. Am 31. Dezember 1919 trat er zurück; er war der einzige Politiker der Liberalen Partei, der jemals dem Bundesrat angehörte.