叙利亚内战开始后，扎伊通成为叙利亚政府负责应对和暴力镇压示威者的危机处理机构九人成员之一。在2012年7月大马士革炸弹袭击事件中，危机处理机构的四人死亡，巴沙尔总统遂对国家安全机构进行全面改组，扎伊通成为安全总局局长，而政治安全局局长之职由鲁斯图姆·加扎利继任。