Als die türkische Armee 1683 Wien bedrohte, schloss sich Ferdinand Wilhelm dem Heer unter Herzog Karl von Lothringen an und kämpfte in der Schlacht am Kahlenberg, mit der Wien entsetzt wurde. Auch danach kämpfte er weiter im Türkenkrieg mit. Vor der Festung Neuhäusel wurde er 1685 durch einen Schuss in die Stirn schwer verwundet. Ferdinand Wilhelm überlebte die Verletzung dank seiner guten Konstitution, sollte aber 16 Jahre danach ihren Spätfolgen erliegen.