忠親の子・本堂茂親は、関ヶ原の戦いで徳川方につき、六郷政乗と協力して、仙北境で小野寺義道と戦った。戦後、常陸国新治郡（現在の茨城県かすみがうら市）8,500石に移封。茂親の子・本堂栄親は、弟の本堂親澄に500石を分知し、知行は8000石となった（本堂親澄の家は子の代で無嗣断絶）。栄親の子・本堂玄親のときに初めて知行地に赴く暇が与えられる（参勤交代の開始）。以後、子孫は江戸幕府の旗本（交代寄合）として存続した。