Diese Strategie wurde zum Teil verursacht durch die Stellung, in der sich die tschechoslowakische Exilregierung in der zweiten Hälfte des Jahres 1941 befand. Die Repression des neuen stellvertretenden Reichsprotektors in Böhmen und Mähren, Reinhard Heydrich, führte zu einer deutlichen Schwächung des Widerstandes im Protektorat, unter anderem wurde die bis dahin stärkste Widerstandsgruppe Obrana národa fast aufgerieben und die Aktionen des Widerstandes kamen zum Erliegen. Weil die britische Regierung durchgehend die Ergebnisse der Widerstandsbewegungen in den besetzten Ländern auswertete und sich danach orientierte, geriet die tschechoslowakische Exilregierung unter Edvard Beneš in einen Zugzwang. Unter diesen Umständen fiel die bis heute umstrittene Entscheidung, einen spektakuläres Attentat auf Heydrich durchzuführen. Diese Aktion, die den Decknamen Operation Anthropoid erhielt, wurde durch die II. Abteilung vorbereitet, in die Pläne wurden außer dem Leiter Moravec nur fünf weitere Personen eingeweiht. Diese Aktion, die aus militärischer Sicht ein Erfolg war, führte jedoch zu einer noch stärkeren Repression im Protektorat.