1866 nahm Gilsa am Feldzug gegen Bayern teil. Am 30. Oktober 1866 wurde er zum Kommandeur des 6. Westfälischen Infanterie-Regiments Nr. 55 und am 30. September 1866 zum Oberst ernannt. Nach drei Jahren und sieben Tagen Dienstzeit wurde er am 7. November 1869 in gleicher Eigenschaft in das 1. Oberschlesische Infanterieregiment Nr. 22 versetzt. Mit Beginn des Krieges gegen Frankreich wurde Gilsa Kommandeur der mobilen Posener Landwehr-Brigade bei der 3. Reserve-Division unter Generalleutnant Kummer. In dieser Stellung nahm er an den Belagerungen von Metz und Longwy, der Schlacht von Noisseville sowie den Kämpfen bei Rupigny teil. Dafür wurde Gilsa mit dem Eisernen Kreuz II. Klasse ausgezeichnet.