Nachdem sein Vertrag anschließend auslief, gab es erneut Differenzen bei der Übereinkunft mit den Devils einen neuen Kontrakt betreffend, wodurch Niedermayer abermals den Saisonstart verpasste. Schlussendlich kam man überein, einen Vierjahresvertrag mit einem Durchschnittsgehalt von 4 Millionen Dollar abzuschließen. In der &lt;a href="NHL%202000/01"&gt;Spielzeit 2000/01&lt;/a&gt; markierte der Linksschütze in 57 Spielen insgesamt 35 Scorerpunkte und nahm ein weiteres Mal am All-Star Game 2001 teil. In den Play-offs war er erneut in einen Zwischenfall involviert als er in einem Spiel der Viertelfinal-Serie gegen die Toronto Maple Leafs durch einen Elbogencheck seines Gegenspielers Tie Domi das Bewusstsein verlor. Niedermayer unterstellte Domi daraufhin Absicht bei dieser Aktion, da dieser ihm zuvor aufgrund eines vorausgegangenen Checks mit einer Revancheaktion gedroht hatte. Domi entschuldigte sich für den Vorfall und wurde anschließend von der Liga für den Rest der Play-offs gesperrt. Niedermayer hingegen erreichte später mit den Devils erneut das Stanley Cup Finale, wo man jedoch den Colorado Avalanche unterlag.