1943年（昭和18年）2月1日、「巻波」は外南洋部隊増援部隊旗艦としてガダルカナル島撤収作戦に参加するが、空襲で損傷する。第三水雷戦隊旗艦を駆逐艦「白雪」に引き継ぎ、駆逐艦「文月」に曳航されて避退した。