1994年のルワンダ紛争を調査するルワンダ国際戦犯法廷で、専門家のアンドレ・ギシャワはブタレ県が政府に反乱した地域であったと述べた。ブタレ県はツチ人知事が政権を握る唯一の県であり、大量虐殺には積極的に反対していた。ルワンダ国内では少数派のツチがブタレ県内には多く住んでいるため、県政は強硬派民兵インテラハムウェを編制した開発国民革命運動 (MRND) ではなく、社会民主党 (PSD) が握っていた。1994年4月6日にフツ族のジュベナール・ハビャリマナ大統領が乗っていた飛行機が撃墜し、大統領が死亡したことをきっかけにフツによるツチの大量虐殺（ジェノサイド）が起きたとき、ブタレ県だけはその難を逃れた。多くのツチが虐殺から逃れるためブタレ県に逃げてきた。