Il 25 giugno 2013 viene ufficializzato come nuovo allenatore del Paris Saint-Germain, firmando un contratto biennale. Vince subito la Supercoppa francese e chiude il primo anno vincendo anche il campionato e la Coppa di Lega francese. Inizia la sua seconda stagione al club capitolino vincendo un'altra Supercoppa. L'11 aprile 2015 vince la sua terza Coppa di Lega battendo 4-2 il Marsiglia. Vince il campionato nazionale anche nel 2015 e nel 2016.