Erste internationale Erfahrungen sammelte Miyuki Fukumoto im Jahr 2000, als sie bei den Asienmeisterschaften in Jakarta mit übersprungenen 1,75 m den sechsten Platz belegte. 2003 gewann sie bei den Asienmeisterschaften in Manila mit 1,84 m die Silbermedaille hinter der Vietnamesin Bùi Thị Nhung und im Jahr darauf siegte sie bei den erstmals ausgetragenen Hallenasienmeisterschaften in Teheran mit einer Höhe von 1,83 m. 2005 belegte sie bei den Asienmeisterschaften in Incheon mit 1,80 m den neunten Platz und im Jahr darauf wurde sie bei den Hallenasienmeisterschaften in Pattaya mit 1,85 m Vierte. Im Dezember nahm sie erstmals an den Asienspielen in Doha teil und erreichte dort mit einem Sprung über 1,84 m Rang fünf. 2007 wurde sie bei den Asienmeisterschaften in Amman mit 1,88 m Vierte und schied anschließend bei den Weltmeisterschaften in Osaka mit 1,84 m in der Qualifikation aus.