Jelačić ed i suoi sottoposti si unirono all'arciduca Giovanni nella sua ritirata verso l'Ungheria. Nella Battaglia di Raab, comandò 7.500 fanti. Con l'aiuto della riserva d'esercito, i suoi soldati riuscirono a respingere un attacco francese, ma l'azione si concluse comunque con la sconfitta degli austriaci. Comandò nuovamente la sua divisione nella Battaglia di Wagram ma l'armata dell'arciduca Giovanni giunse troppo tardi sul campo per sollevare la situazione. Morì il 4 febbraio 1810 a Zalaapáti, nell'attuale Ungheria.