Con l'arrivo del presidente John F. Kennedy si vide l'abbandono di questa dottrina durante la crisi dei missili cubani a favore di una risposta flessibile . Le MRBM nucleari sovietiche a Cuba avevano un tempo di volo molto breve per i loro obiettivi statunitensi e avrebbero potuto paralizzare le basi dei bombardieri SAC e impedire una risposta statunitense. Sotto l'amministrazione Kennedy, gli Stati Uniti adottarono una politica più flessibile nel tentativo di evitare la guerra nucleare nel caso i sovietici non avessero cooperato e accolto le richieste statunitensi. Se solo gli Stati Uniti avessero annunciato una reazione militare a qualsiasi incursione sovietica (non importa quanto piccola) e la dottrina della rappresaglia massiccia non venisse attuata, allora i sovietici avrebbero pensato che gli Stati Uniti non avrebbero mai attaccato. Ciò avrebbe reso l'Unione sovietica molto più audace nelle sue iniziative militari contro gli alleati degli Stati Uniti e ciò avrebbe probabilmente condotto le due potenze verso una guerra nucleare..Se gli avvertimenti non fossero stati adeguatamente considerati dall'Unione Sovietica e le minacce non li avessero intimiditi in modo da rimuovere i missili da Cuba, allora l'Unione Sovietica avrebbe semplicemente creduto che le politiche statunitensi non sarebbero mai state attuate. Attraverso la nuova dottrina flessibile, gli Stati Uniti avrebbero avuto un modo migliore per rispondere alle minacce e provocazioni sovietiche evitando di rimetterci la faccia.