Po ponownej próbie pogodzenia się z cesarzem wstąpił na służbę króla Danii Chrystiana IV, który wówczas rozpoczął swój udział w wojnie trzydziestoletniej. Jan Ernest otrzymał stopień generalski. Na początku 1626 zaatakował Westfalię i zajął Osnabrück. Następnie wraz z Mansfeldem ruszył na Śląsk, którego większą część opanował. Ponieważ jednak król Chrystian IV został pokonany w bitwie pod Lutter am Barenberge, a Mansfeld zmarł, Jan Ernest ponownie zaczął szukać zgody z cesarzem. Odrzucił jednak jej warunki i na czele swoich wojsk uderzył na Węgry. Tam w grudniu tego roku zmarł.