Fukumoto absolvierte ihr erstes Länderspiel für die japanische Nationalmannschaft am 4. Oktober 2002 gegen Vietnam. Sie spielte bei der 5. Frauenweltmeisterschaft 2007 noch bei allen drei Spielen, bei der 6. Frauenweltmeisterschaft 2011 in Deutschland war Fukumoto im Kader, sie wurde aber nicht eingesetzt. Bei den Olympischen Sommerspielen 2008 in Peking absolvierte sie alle sechs Spiele Japans, unterlag im Spiel um die Bronzemedaille aber der deutschen Mannschaft.