Sein medizinisches Pflichtjahr verbrachte Nowa Omoigui 1983 im National Youth Service Corps beim nigerianischen Militär. Nach dem Militärputsch von 1985 verließ er Nigeria und übersiedelte in die USA. Nach medizinischen Weiterbildungen in Rochester und an der University of Illinois in Chicago arbeitete Nowa Omoigui als Herzspezialist an der Stanford University sowie an der Cleveland Clinic. Während des Kuwait-Krieges beriet er US-Militärs medizinisch. Als erster Afrikaner übernahm er 1994 die Leitung des Herzzentrums an der University of South Carolina in Columbia.