De 1801 a 1817, o Rei Maximiliano I José da Baviera assumiu o comando total do Exército da Baviera. Em 1817, o General von Triva era o verdadeiro chefe do Ministério, mas a administração da justiça e economia dos militares foi parte do "Oberadministrativkollegium" e o "Generallazarettinspektion". Em 1822, Maximiliano I atribuído o General von Wrede como comandante-em-chefe do exército, e o "Staatsministerium der Armee" também se tornou responsável pela administração da justiça e economia. Depois de 1829, as tarefas e as responsabilidades do comando supremo do exército ("Oberkommando", existente a partir de 1822 a 1829) foram transferidos para o Ministro da Guerra, de modo que ele foi além disso comandante-em-chefe do exército. Depois de adquirir o comando do exército da Baviera, o ministro da guerra tinha muito mais responsabilidades do que seus análogos de outros países, como o Ministro Prussiano da Guerra. Após o colapso do reino da Baviera, em 1918, o Kriegsministerium foi substituído pelo "Ministerium für militärische Angelegenheiten" (ministério de assuntos militares).