El 1998 va debutar com a directora de teatre amb la seva versió de "La gavina" d'Anton Txèkhov, protagonitzada per Fernanda Montenegro i ajudada per Luiz Päetow. El 2007, novament amb Salles, Thomas va dirigir "Linha de Passe", pel·lícula que li va valer a Sandra Corveloni el premi a la millor actriu al 61è Festival Internacional de Cinema de Canes.