Avec l'appui du PRIT, qui lui fournissent de nombreux combattants tadjiks, le groupe de Namangani établit petit à petit sa base d'opérations dans la vallée de Tavildara et combat durant la Guerre civile tadjike aux côtés de l'OTU (Opposition tadjike unie). Ils parviennent deux fois brièvement à occuper la ville de Tavildara.