Erste internationale Erfahrungen sammelte Anna Bongiorni beim Europäischen Olympischen Jugendfestival (EYOF) in Tampere 2009. Dort belegte sie über 200 Meter den fünften Platz und den siebten Platz mit der italienischen Staffel. Bei den Jugendweltmeisterschaften in Brixen gelangte sie über 100 Meter in das Halbfinale und schied mit der Sprintstaffel in der Vorrunde aus. 2010 gewann sie bei den erstmals ausgetragenen Olympischen Jugendspielen in Singapur die Bronzemedaille in mit einer Mixed-Staffel und belegte über 200 Meter den siebten Platz. Bei den U20-Europameisterschaften in Tallinn 2011 gewann sie mit der italienischen Stafette die Silbermedaille und schied im 200-Meter-Lauf in der Vorrunde aus. 2012 erfolgte die Teilnahme mit der Staffel an den Juniorenweltmeisterschaften in Barcelona, bei denen sie bereits in der ersten Runde ausschied.