Il nome del partito fu cambiato nel 1991 dopo la legalizzazione dei partiti d'opposizione. L'ala giovanile del partito, l'Interahamwe, in seguito si sviluppò in gruppo paramilitare che gioco un ruolo fondamentale nel Genocidio del Ruanda. Dopo la morte di Habyarimana avvenuta nell'aprile del 1994; elementi della linea dura del partito furono accanto agli architetti del genocidio; la Coalizione per la Difesa della Repubblica (CDR), che gioco un ruolo fondamentale, era originariamente una fazione della linea dura del MRND che divenne un partito separato.