I bavaresi sono tuttavia ancora in corsa per vincere la Coppa dei Campioni, dove sono anche campioni in carica: saltato il primo turno eliminano negli ottavi i "cugini" del Magdeburgo (tra l'altro le due squadre si sarebbero dovute anche incontrare nella Supercoppa UEFA, ma il confronto non viene disputato), e approdano in seguito alla finale. A Parigi, in una partita ricordata anche per le violenze degli hooligan inglesi trovano il Leeds United, che viene battuto 2-0 grazie ai gol di Franz Roth e Gerd Müller, capocannoniere della manifestazione. Però Björn Andersson deve abbandonare il campo nei primi minuti a causa di un duro contrasto mentre Uli Hoeneß subisce un grave incidente al ginocchio che condizionerà il resto della sua carriera; gli inglesi dal canto loro si lamentano invece per alcune decisioni arbitrali a loro sfavore. Intanto la squadra aveva deciso di non partecipare alla Coppa Intercontinentale.