La protection verticale était importante, comparable, en ceinture, à celle des cuirassés rapides de la , et la protection horizontale était renforcée, sur les machines et les magasins, mais toujours sans blindage du pont d'envol. L'intégration des réservoirs d'essence d'aviation dans la coque les rendait sensibles à l'ébranlement des coups qui manquaient le navire de peu, et ne garantissait pas l'étanchéité du bâtiment aux émanations de vapeur d'essence d'aviation des hangars, ce qui ne fut pas sans conséquences pour le destin du "Shokaku" en mer des Philippines. L'artillerie anti-aérienne de Type 89, comportait huit tourelles doubles au lieu de six, et 12 affûts triples de Type 96&lt;ref name="Navweaps Japan /60 Type 96"&gt;&lt;a href="http%3A//www.navweaps.com/Weapons/WNJAP_25mm-60_mg.htm"&gt;Navweaps Japan /60 Type 96&lt;/a&gt;&lt;/ref&gt;, et non plus 14 affûts doubles et 3 triples, comme sur les "Sôryû-Hiryū".