In de 16e en 17e eeuw was er in de Vendée een belangrijke protestantse minderheid. Hieronder waren ook relatief veel volgelingen van Calvijn, die enige tijd in de omgeving is geweest en daar gepreekt heeft. Veel hugenoten uit deze streken zijn ten gevolge van de vervolgingen onder Lodewijk XIV naar o.a Nederland gevlucht. Het departement was een van de 83 departementen die werden gecreëerd tijdens de Franse Revolutie, op 4 maart 1790 door uitvoering van de wet van 22 december 1789. De beroemde laatste roman "Quatre-vingt-treize" van Victor Hugo speelt zich af in 1793 in de Vendée, alwaar de contrarevolutionaire krachten van de Chouannerie lang standhielden en bloedig onderdrukt werden.