En marzo de 1991 los Agonauts fueron desplegados al Golfo Pérsico para apoyar el retiro de las tropas durante la Operación Desert Storm. Los Argonauts se convirtieron en el primer escuadrón operacional de FA-18 de la Armada en emplear los contenedores de Navegación Infrarroja de Mirada Delantera (en inglés: Navigational Forward Looking Infra-Red, NAV FLIR) y anteojos de visión nocturna.