Во время Первой мировой войны Франц Йозеф служил в императорском военно-морском флоте в чине второго торпедного офицера на бронепалубном крейсере SMS Emden в бою у Кокосовых островов (9 ноября 1914). Крейсер SMS Emden смог захватить и потопить большое количество английских судов. В награду германское правительство разрешило морским офицерам, служившим на этом крейсере, добавить название судна к окончанию своей фамилии. Поскольку в Веймарской республике дворянские титулы были преобразованы в фамилии, то в 1919 году Франц Йозеф принял фамилию «Принц фон Гогенцоллерн-Эмден».