Auf der Westseite des Rathausgebäudes befindet sich das 1976 vom Gemeinderat beschlossene und im Dezember 1989 eröffnete "Otto König von Griechenland-Museum". Schwerpunkt der von der Gemeinde Ottobrunn getragenen Einrichtung ist, neben den Ursprüngen der Gemeinde, vor allem das Wirken des Ottobrunner Namenspatrons, Prinz Otto von Wittelsbach, in seinem Königreich Griechenland (siehe Abschnitt „19. Jahrhundert“). Die Sammlung umfasst mehr als 200 Objekte zu den Themenbereichen Philhellenismus, Griechischer Freiheitskampf und Entwicklung des befreiten Griechenland unter Otto. Darunter befinden sich historische Ansichten der Hauptstädte Nauplia und Athen sowie Kunst- und Gebrauchsgegenstände vom Hof Ottos I., z. B. Silber und Porzellan von der königlichen Tafel in Athen sowie Uhren und Schmuck aus Ottos persönlichem Besitz. Besonders hervorzuheben ist die Galerie des Museums mit Ölgemälden, Aquarellen und Grafiken von Klenze, Gärtner, Hess, Heideck, Perlberg, Schinkel, Rottmann und anderen. Nach dem Auszug einer benachbarten Sparkassen-Filiale aus dem Rathausgebäude wurde die ursprünglich "König-Otto-von-Griechenland-Museum" genannte Einrichtung von 80 auf 174 Quadratmeter vergrößert und im November 2000 wiedereröffnet.