Ljungberg vierde de grootste successen als speler van Malmö FF. Met die club won hij vier keer de landstitel en vijfmaal de Zweedse beker. Hij speelde mee in de Europa-Cupfinale op 30 mei 1979, toen Malmö met 1-0 verloor van Nottingham Forest door een doelpunt van Trevor Francis. Ljungberg beëindigde zijn loopbaan in 1982 bij Örebro SK.