Durante la epidemia de fiebre amarilla que azotó Buenos Aires en 1871, del Castillo dirigió el lazareto en la ciudad. Dos años más tarde, durante la epidemia de cólera, fue director del lazareto establecido al norte de la ciudad. También actuó en la epidemia de cólera que tuvo lugar entre 1886 y 1887, desde la Dirección Nacional de Lazaretos que comprendía el Lazareto de Martín García, el Lazareto Flotante Patacho General Villegas y el Lazareto de la Boca del Riachuelo, promoviendo los postulados modernos para evitar el contagio e insistiendo que además del aislamiento debía practicarse la desinfección.