Kristo Siimer startete erstmals 2015 im IBU-Junior-Cup. Zwei Jahre später nahm er an den Biathlon-Juniorenweltmeisterschaften 2017 in Brezno teil. Er erreichte den 26. Platz im Sprint und verbesserte sich in der anschließenden Verfolgung auf den 18. Platz. Bei der nächsten Ausgabe der Jugendweltmeisterschaften erreichte er den 20. Platz im Sprint und den 8. Platz in der Verfolgung. Bei den Biathlon-Juniorenweltmeisterschaften 2019 war Siimers bestes Ergebnis der 39. Platz im Sprint. In der darauffolgenden &lt;a href="Biathlon-Weltcup%202019/20"&gt;Saison 2019/20&lt;/a&gt; gab Kristo Siimer sowohl sein Weltcup-Debüt als auch sein Weltmeisterschafts-Debüt. Ebenso ging er bei den Biathlon-Juniorenweltmeisterschaften 2020 an den Start und erreichte dort mit dem 14. Rank im Sprint sein bestes Ergebnis. Die &lt;a href="Biathlon-Weltcup%202020/21"&gt;Saison 2020/21&lt;/a&gt; verbrachte Siimer hauptsächlich im Weltcup, mit Abstechern in den IBU-Cup und zu den Biathlon-Juniorenweltmeisterschaften 2021. Siimers erreichte in dieser Saison sein bis dato bestes Weltcup-Ergebnis, den 71. Platz im Sprint von Nové Město na Moravě. Ebenfalls nahm Siimer regelmäßig an estnischen Herren-Staffeln und Mixed-Staffeln teil. Im Quartett war das beste Ergebnis mit seiner Beteiligung der 13. Platz im Rennen in Oberhof in der Saison 2019/20.