Ved Perfiction Indoor-stevnet i Gent satte han ny personlig rekord på 60 meter innendørs, med 6,80 sekunder. Borlée deltok ved Lag-EM i friidrett 2013 i Dublin, der Belgia igjen konkurrerte i First League. Denne gangen kom han på 2.-plass på 200 meter, bak Pavel Maslák, med tiden 21,31. Han deltok også på stafettlaget som kom på 2.-plass på 4 x 400 meter. I august 2013 deltok han ved VM i friidrett 2013. På 400 meter nådde han finalen, der han løp inn til 4.-plass. På 4 x 400 meter kom Belgia på 5.-plass. Ved Jeux de la Francophonie i september var han med på laget Vallonia-Brüssel, som kom på 3.-plass på 4 x 100 meter. På nasjonalt nivå ble han belgisk mester på 200 meter utendørs. Hans beste resultater fra Diamond League 2013 var 2.-plass ved Memorial Van Damme og bronse ved London Grand Prix, på 400 meter. Han deltok også ved Jeux de la Francophonie, der Frankrike kom på 3.-plass på 4 x 100 meter.