Tan temprano como 1807 ambas escuelas fueron dañadas cuando muchos profesores y el alumnado participaron en la invasión de Napoleón de Rusia, de la cual pocos habían regresado. En 1852 la escuela agrícola fue restablecida en Weihenstephan y en 1895 devino en una universidad agrícola, el cual formó el núcleo de la Universidad Técnica de campus de ciencias de vida de Múnich en Freising.