Après l'exécution de Jamal Pacha et un certain nombre de dirigeants de la communauté syrienne dans les rues des martyrs à Beyrouth et à Damas le 6 mai 1916, Raouf Al-Ayoubi fait défection à l'Empire ottoman. Il s'enfuit de Hama et se dirige vers le désert arabe pour rejoindre les forces du chef de la Grande révolte arabe contre l'Empire ottoman, Sharif Hussein bin Ali. Après la défaite de l'armée ottomane et le retrait de Damas, fin septembre 1918, il revient dans sa ville natale avec le prince Faisal bin Al-Hussein et les forces alliées et il y est nommé inspecteur pour les départements du gouvernement syrien, puis gouverneur de la brigade de Karak, qui comprend la plupart des régions de l'est de la Jordanie.