Zur Ausgestaltung einer Reihe von Kirchenbauten trug Janssens durch Tafel- und Wandgemälde bei, etwa für die Jesuitenkirche von Löwen, das Beginenkloster in Gent, die Abtei Maredsous bei Namur, die Kirchen St. Joseph und St. Willibrord sowie die Liebfrauenkathedrale in Antwerpen (1903–1910). Außerdem schuf Janssens eine Reihe von Porträts von Geistlichen, so zum Beispiel Bildnisse der Päpste Leo XIII. und Pius X. (1904), des Mechelner Erzbischofs Désiré-Joseph Mercier, des Genter Bischofs Antoon Stillemans (1916) und dessen Bruders, des Priesters Petrus-Ludovicus Stillemans (1906). Auch den katholischen Politiker und Minister Joris Helleputte und den Kunstsammler Fritz Mayer van den Bergh (1901) porträtierte er. Janssens nahm an verschiedenen Ausstellungen in München teil, 1905 stellte er auf der Weltausstellung Lüttich aus. Während des Ersten Weltkriegs lebte Janssens als Flüchtling in Manchester, wo er sich als Porträtmaler über Wasser hielt. 1916 entstanden dort seine Bildnisse des Nuklearphysikers Ernest Rutherford und dessen Tochter Eileen.