În 1968, după asasinarea lui Robert F. Kennedy, Jackie își ia copiii din Statele Unite, zicând: "Dacă se omoară membrii familiei Kennedy, atunci copiii mei sunt ținte...Vreau să părăsesc această țară." În același an, se căsătorește cu magnatul grec Aristotel Onassis, care îi va lua să trăiască pe insula lui privată, Skorpios. Căsnicia lui Jackie cu Onassis durează până în 1975, la moartea acestuia.