O Egito estava praticamente controlado pelos Franceses, mas a situação não era segura porque, para além da guerra santa proclamada pelo Sultão, dois outros acontecimentos constituíram graves obstáculos aos planos de Napoleão: a destruição de parte importante da frota francesa na Batalha do Nilo e a notícia de que, na Síria, um exército estava a ser preparado para invadir o Egito e expulsar os Franceses. Este exército estava a ser organizado por , governador turco da Síria. Para que Napoleão pudesse prosseguir os seus planos e avançar para a Índia, era necessário, por um lado, destruir aquele exército turco e, por outro, obter o apoio de alguns povos da região, já que o domínio naval britânico não permitiria grandes (ou talvez nenhuns) apoios de França.