Na de vlucht van de koninklijke familie naar Varennes-en-Argonne, waar Montmorin niets mee te maken had, werd hij gedwongen ontslag te nemen. Hij bleef wel een adviseur van Lodewijk XVI. In juni 1792 werden zijn papieren op het ministerie in beslag genomen en onderzocht. Er werd echter niets bezwarends gevonden, maar toch werd hij in juli 1792 beschuldigd en na 10 augustus van dat jaar ook vogelvrij verklaard. Na even op de vlucht te zijn geweest werd hij opgepakt en opgesloten in de Abbaye, waar hij tijdens de Septembermoorden werd vermoord.