Sem o apoio civil em massa e em menor número, bem como desarmados, os rebeldes foram derrotados sobretudo pelos partidários de Amin em poucas horas. A maioria dos insurgentes foi morta ou capturada, enquanto o restante fugiu em desordem de volta para a Tanzânia. Reforçadas por tropas aliadas da Líbia e da Organização para a Libertação da Palestina (OLP), as forças de segurança de Uganda lançaram operações para perseguir e destruir os rebeldes errantes, enquanto iniciavam expurgos políticos contra supostos apoiadores de Obote. Ao mesmo tempo, Amin ordenou que sua força aérea retaliasse bombardeando a Tanzânia, levando esta última a mobilizar seu exército ao longo da fronteira. Antes que o conflito pudesse se transformar em uma guerra total entre Uganda e Tanzânia, os dois países concordaram em um cessar-fogo sob mediação somali e, subsequentemente, ratificaram um tratado em Mogadíscio para acalmar as tensões. Apesar disso, o conflito piorou muito as relações já precárias entre Uganda e Tanzânia e, em última análise, contribuiu para a Guerra Uganda-Tanzânia.