Bei der sowjetischen Besetzung der polnischen Ostgebiete im September 1939 wurde er freigelassen und nahm die ihm angebotene Stelle des Direktor der Kaliwerke Lemberg an. Im Juni 1940 wurde er jedoch festgenommen und nach Sibirien (Beregaiewo, Rajon Teguldet) deportiert. Ab 1941 arbeitete er unter Hausarrest als Chemiker und Apotheker in Tscheboksary, siedelte 1942 nach Moskau und, entsprechend dem Sikorski-Maiski-Abkommen freigelassen, trat dort im März 1943 dem Bund Polnischer Patrioten unter Wanda Wasilewska bei. Nach der Überschreitung der Bug-Linie durch die sowjetischen und polnischen Kampfverbände im Juli 1944 gehörte der zu Mitgründern der wiederhergestellten Inlands-PPS als deren Vorsitzender bzw. ab 1945 erster Stellvertretender Vorsitzender. Er wurde ferner am 22. Juli 1944 zum Amtsleiter (Minister) für Arbeit, Soziales und Gesundheit in der provisorischen Regierung PKWN unter seinem Parteikammeraden Edward Osóbka-Morawski berufen. Das Amt hatte er bis zum 31. Dezember 1944 inne.