安平砲擊事件反映出中國官員與外國談判，不諳國際法，處處先考量諭旨、國內法治為先，以道德詮釋條約，導致爆發原可避免的軍事衝突。也衍生出十九世紀萬國公法應用在臺灣時，國際法與國內法的衝突，此事件中美國駐厦門領事李仙得對臺灣主權產生的看法，影響日後牡丹社事件的走向。