Im Zuge der Allgemeinen Mobilmachung vor dem Überfall auf Polen wurde Deboi am 26. August 1939 zum Kommandeur des Infanterie-Regiments 199 der 57. Infanterie-Division ernannt, die in diesem Feldzug bei der Heeresgruppe Süd zum Einsatz kam. Im Frühjahr 1940 führte Deboi sein Regiment im Westfeldzug. Nach Beendigung der Kampfhandlungen blieb das Regiment zusammen mit der Division zu Besatzungsaufgaben in Frankreich eingesetzt. Mit Beginn des Unternehmens Barbarossa zog Debois Regiment im Rahmen der Division im Bereich der Heeresgruppe Süd bis in den Raum Belgorod. Hier gab Deboi Ende Januar 1942 das Kommando des Regiments ab und wurde am 31. Januar 1942 mit der Führung der 44. Infanterie-Division beauftragt, zu deren Kommandeur er Anfang Mai 1942 nach seiner Beförderung zum Generalmajor ernannt wurde. Als Teil der 6. Armee nahm die Division unter Debois Führung am Unternehmen Blau teil und stieß Richtung Stalingrad vor. Dort wurde der Großteil von Debois Division bei der dortigen Schlacht um Stalingrad bis Januar 1943 vernichtet. Am 28. Januar 1943 geriet Deboi dort in sowjetische Kriegsgefangenschaft, die er in verschiedenen Kriegsgefangenenlagern verbrachte. Am 20. Januar 1955 verstarb er im Lazarett des Lagers Tschernzy an einer Urämie infolge chronischer Nephritis und Arteriosklerose. Seine letzte Ruhestätte fand er auf dem Kriegsgefangenenfriedhof Tschernzy (Reihe 3, Grab 5/6).