Става президент, наследявайки Бабрак Кармал. Води курс на помирение с въоръжената опозиция на муджахидините. Тези мерки имат определен успех, но след разпадането на СССР ислямистите си връщат влиянието. Горбачов спира военната помощ, а Елцин после спира икономическата. Това влияе още по-зле на управлението му.