В 1858 г. довольно незначительный сам по себе спор привел к войне с Перу. Так как Роблес отверг предъявленные правительством Перу требования, то в ноябре 1858 г. гавани Эквадора, в особенности Гуаякиль, были блокированы перуанской эскадрой. В то же время начались волнения внутри страны: консервативная пария поднялась против Роблеса; однако ему скоро удалось подавить восстание и в союзе с Урбиной установить диктаторскую власть. Между тем Гуаякиль вследствие недостатка в съестных припасах оказался в чрезвычайно затруднительном положении, и комендант, генерал Франко, заключил с адмиралом перуанской эскадры конвенцию, в силу которой блокада была снята. Роблес, не желавший признавать этой конвенции, видел, что всюду кругом разгорается восстание и войска от него отпадают, а потому решился бежать в Чили.