En Argentinos Juniors, club que lo vio nacer, fue figura en el plantel que obtuvo la Copa Libertadores en el año 1985, obteniendo el derecho de jugar la Copa Intercontinental en Japón contra la Juventus, que contaba entre sus filas con Michael Laudrup y Michel Platini, entre otros. En esa final Claudio Borghi fue la gran figura del partido, a pesar de que el equipo argentino caería derrotado en la tanda de penales.