フィジー諸島での予行演習の後、サンフアンはウォッチタワー作戦に従事し、1942年（昭和17年）8月7日にフロリダ諸島ツラギ島への上陸部隊に対して砲撃支援を行った（フロリダ諸島の戦い）。これに対しラバウルを発進した日本海軍の一式陸上攻撃機と九九式艦上爆撃機が、揚陸作業中の連合軍輸送船団に空襲をおこなう。輸送船団と護衛艦艇は自分達の対空砲火と、フレッチャー提督の空母機動部隊から飛来したF4F ワイルドキャットで応戦した。駆逐艦が小破した。