En 1642 se fue a Irlanda, como segundo al mando deAlexander Leslie, pero jefe de hecho del ejército escocés enviado para sofocar la rebelión de los católicos irlandese que habían masacrado a los colonos escoceses asentados en el Úlster durante la Rebelión irlandesa de 1641.[25] La campaña de Monro en Irlanda se desarrolló principalmente en la provincia del Úlster. Después de tomar y saquear Newry en abril de 1642, y de intentar sin éxito someter a Sir Phelim O'Neill, Monro consiguió hacer prisionero al Conde de Antrim, Randal MacDonnell en el Castillo de Dunluce.