Однако самый сильный удар по благосостоянию города нанесла последняя Русско-шведская война (1808—1809). Уже с марта 1809 года Торнио становится гарнизонным городом русской армии. В сентябре того же года война завершилась подписанием Фридрихсгамского мирного договора. В результате этой войны Российская империя присоединила Финляндию. Граница была проложена по самым глубоким фарватерам рек Торнио и Муонио, разделив Лапландию на две части и ударив по торговле. Торнио был оставлен на Российской стороне границы по специальному настоянию императора Александра I. Шведы основали деревню Хаапаранта (ныне Хапаранда) на своей стороне границы, чтобы сбалансировать потерю Торнио. Окончательное разграничение территорий было закреплено отдельным Актом разграничения, подписанном в Торнио 8 (20) ноября 1810 года.