Después de perder el campeonato por solo un punto ante el AC Milan en la temporada 1998-99, de la mano de Mihajlović, Alessandro Nesta, Marcelo Salas y Nedvěd, logró ganar su segundo scudetto en la temporada 1999-2000, así como la Copa Italia de la temporada 1999-2000, derrotando en la final al Inter con Sven-Göran Eriksson como entrenador.