Tussen 1977 en 1984 werd Baecke 32 maal geselecteerd voor het Belgisch voetbalelftal. Hij speelde vijftien wedstrijden waaronder vier wedstrijden op het Wereldkampioenschap voetbal 1982 in Spanje. Baecke was eveneens aanwezig op het Europees kampioenschap voetbal 1984 in Frankrijk en zat er bij drie wedstrijden op de bank.