Nel 1944, la Germania nazista stava iniziando a perdere rovinosamente terreno sul fronte orientale a scapito della Russia sovietica. Nel luglio del 1944, l'Armata Rossa raggiunse i confini lituani nell'ambito dell'Operazione Bagration. Gran parte del territorio lituano fu conquistato durante l'offensiva del Baltico. L'ultima battaglia di Memel terminò nel gennaio del 1945. Anticipando il ritorno del terrore sovietico, circa 70 000-80 000 lituani si ritirarono in Germania prima dell'avanzata dell'Armata Rossa. In genere si trattava di attivisti politici e culturali, artisti e scienziati. Trascorrendo i primi anni del dopoguerra come sfollati, alla fine si stabilirono in altri paesi, il più delle volte negli Stati Uniti. Coloro che rimasero in Lituania furono arruolati nell'esercito (circa 80 000 soldati). I coscritti sfuggirono al progetto unendosi ai partigiani lituani, un gruppo di resistenza antisovietica. Questi gruppi di guerriglieri scatenarono diversi casi di disobbedienza civile e politica, a cui i sovietici risposero effettuando azioni repressive di vario genere.