In der italienischen Nationalmannschaft debütierte Chiesa unter Arrigo Sacchi am 29. Mai 1996 beim 2:2 gegen Belgien. Mit Italien nahm er an der EM 1996 in England und der WM 1998 in Frankreich teil. Für die Nationalmannschaft kam er 17 Mal zum Einsatz und erzielte sieben Tore. Sein letztes Länderspiel bestritt er 2001 gegen Südafrika.