המלחמה קטעה את מה שהיה אמור להיות שיא הקריירה של באסטין. הוא שוחרר מהשירות הצבאי כיוון שסבל מלקות שמיעה חמורה מדי. במקום זאת באסטין שירת בזמן המלחמה במסגרת ה-ARP (ארגון שעסק בהתגוננות מפני הפצצות אוויריות), והוצב על הגג של אצטדיון הייבורי ביחד עם טום ויטאקר. הוא שיחק בליגת המיוחדת שהופעלה בזמן המלחמה על מנת לשפר את מצב הרוח הציבורי. ב-1941 שודרה ידיעת תעמולה ברדיו רומא של איטליה הפשיסטית שלפיה באסטין נשבה בקרב כרתים, וכי הוא מוחזק על אדמת איטליה; האיטלקים לא היו מודעים לכך שבאסטין סובל מחירשות ולא משרת כלל בצבא.