8 августа 1808 года фон Тройль был назначен губернатором Або-Бьёрнеборгского лена. Таким образом, во время войны в Финляндии он был одним из ведущих чиновников покоренной Финляндии и показал свою готовность сотрудничать с российскими властями. 5 мая 1808 года награждён орденом Святой Анны 1-й степени.