De Abraham Lincoln lag voor haven in Hongkong toen Zuidoost-Azië getroffen werd door een zware zeebeving. Het vliegdekschip ging humanitaire hulp verlenen in het zwaar getroffen eiland Sumatra. Half januari 2005 vertrok het schip weer nadat de Indonesische overheid de gevechtsvliegtuigen van het vliegdekschip verbood te vliegen. De piloten van hun kant zijn wettelijk verplicht minstens één maal om de twee weken te vliegen. Vanuit internationale wateren werden de hulpoperaties vanaf het schip voortgezet tot 4 februari. In die periode had het schip zo'n 2,6 miljoen ton hulpgoederen afgeleverd.