21 ноября перебрался на Украину, где в марте 1918 года стал начальником штаба Чехословацкого корпуса, с которым он прошёл до Владивостока (в июне). Поддержал Александра Колчака, который назначил его 17 января 1919 года руководителем комиссии по расследованию убийства царской семьи (Дитерихс был активным монархистом), на должности которого он пребывал до 7 февраля того же года.