その後オスマン帝国に併合されてから500年間、オスマン帝国領であり続けた。19世紀の終わりにマケドニア抗争が始まると、この地域のギリシア人とブルガリア人の間で衝突が起こった。その後1912年の第一次バルカン戦争で、現在のキルキス県東部はブルガリア領となった。しかし、1913年に起きた第二次バルカン戦争では、ギリシャ王国がこの地域を占領し、ギリシャ王国に併合された。この時北部マケドニア地方（現在のマケドニア共和国）のギリシア人がこの地域に移住した。また、ヌイイ条約の結果、北トラキア地方のギリシア人がこの地域に移り住み、逆にこの地域に住むブルガリア人はブルガリアへ移住した。その結果この地域のギリシャ語話者は多数派となった。さらに、1922年の希土戦争の後に結ばれたローザンヌ条約で、小アジアからのギリシア人も移住した。