После Октябрьской революции 1917 — один из организаторов Комитета спасения Родины и Революции, один из руководителей Союза защиты Учредительного собрания, за что был заключён новой властью в Петропавловскую крепость. Как писал в своих воспоминаниях И. И. Манухин, Авксентьев был освобождён из больницы «Крестов» благодаря вмешательству наркома юстиции эсера Исаака Штейнберга.