Durante la Guerra árabe-israelí de 1947-48, las tropas jordanas arrestaron a los judíos que vivían al este de la Línea Verde, incluidos los del Barrio Judío de la Ciudad Vieja. Casi todos los defensores de Kfar Etzion fueron masacrados, incluidos civiles, hasta un total de 129 fallecidos. Los prisioneros fueron devueltos a Israel una vez finalizada la guerra. El 8 de julio de 1948, el ejército israelí evacuó a los habitantes judíos de Kfar Darom y Naharayim ante la presión militar ejercida por Egipto y Jordania. También se retiraron civiles judíos de aldeas en la Alta Galilea libanesa, mientras que Siria se retiró de Mishmar HaYarden.