Начиная с 2003 года вооружённые силы Республики Сербской начали входить в состав вооружённых сил Боснии и Герцеговины. В 2005 году части реформированной армии Боснии и Герцеговины, состоящие из боснийских, хорватских и сербских подразделений, были направлены в составе коалиционных сил в Ирак. 6 июня 2006 года вооружённые силы Республики Сербской окончательно перестали существовать, войдя в состав армии Боснии и Герцеговины.