Однако решение нового партийного лидера Кешара Джанга Райямаджхи поддержать королевский переворот 1960 года поставило партию на грань раскола. Члены партии во главе с Пушпой Лалом выступили резко против. К 1962 году и это радикальное крыло КПН раскололось — по вопросу китайско-индийской пограничной войны: Пушпа Лал поддержал Индию, Тулси Дал Амайтья — КНР. В итоге, КПН распалась на различные фракции, положив начало многочисленным конкурирующим компартиям в стране.