Le pays a vécu des conflits frontaliers avec l'Indonésie et des mouvements sécessionnistes, tel celui de l'île de Bougainville (1989-2001) où la guérilla aurait fait près de et où, en novembre 2019, un référendum sur l'indépendance a eu lieu. ont voté en faveur de l’indépendance, soit plus de 98 % des suffrages exprimés.