В ноябре 1917 года одним из первых вступил в Добровольческую армию. Участвовал в обороне Ростова. В феврале 1918 года был тяжело ранен, заменяя пулеметчика в бронепоезде в бою у Новочеркасска. Скрывался во время 1-го Кубанского похода. Во время 2-го Кубанского похода — командир отряда, а затем полка кавказских горцев. По представлению генерала Врангеля — полковник в Сводно-горской дивизии. После неудачного штурма Царицына в первых числах июня 1919 года Кавказской армией генерала Врангеля, во время которого Сводно-горская дивизия понесла большие потери в командном составе, генерал Врангель назначил его командующим этой дивизией. 23 августа 1919 года полковник Шинкаренко, командуя Сводно-горской дивизией, по своей инициативе атаковал уже вступающую в Царицын 28-ю дивизию и нанес ей тяжелые потери. 29 августа 1919 года в бою с бригадой 4-й дивизии О. И. Городовикова Сводно-горская дивизия полковника Шинкаренко совместно с 4-й Кубанской дивизией разгромила Орловскую группу 10-й армии РККА и отбросила её за Дубовку, таким образом ликвидировав нависшую над Царицыным угрозу. В Крыму, реорганизуя Вооруженные Силы Юга России, генерал Врангель произвел полковника Шинкаренко в генерал-майоры и назначил его командиром отдельной конной бригады. Бригада генерала Шинкаренко особенно отличилась в боях 12—17 августа 1920 года у Серагоз в Северной Таврии. Награждён орденом Святителя Николая Чудотворца и назначен командиром Туземной горской дивизии. После эвакуации Крыма в ноябре 1920 года проживал сначала в Сербии, недолго в Германии и, наконец, с конца 1920-х годов во Франции, в Ницце, где занимался литературным трудом.