После возвращения к представительному правлению и окончания гражданской войны Риос Монтт пытался избраться на президентский пост. В 1990 его кандидатуру отклонил Конституционный суд. В 1994 Эфраин Риос Монтт был избран в парламент от FRG. В 2000—2004 годах он являлся председателем парламента. Наибольшей поддержкой Риос Монтт и его партия пользовались в сельских индейских районах, где в 1982—1983 шли самые ожесточённые бои и «патрулерос» развивали максимальную активность.