Následující dlouhé období míru znamenalo oslabení námořnictva. V letech 1864–1866 se Chile zapojilo, po boku Peru, Ekvádoru a Bolívie do První tichomořské války vedené proti Španělsku. V bitvě u Papudo se 26. listopadu 1865 střetla chilská korveta "Esmeralda" se španělským škunerem "Virgen de Covadonga", který zajala. Spojenecká peruánsko-chilská eskadra navíc v únoru 1866 odrazila španělský útok v námořní bitvě u Abtaa. Oslabené španělské loďstvo se vzmohlo na březnové ostřelování a blokádu peruánských přístavů Valparaiso a Callao, v bitvě u Callao přitom utrpělo značné ztráty, které ho přinutily ke stažení z oblasti. Tím konflikt skončil.