Martin Pfurtscheller startete als Aktiver für den "Skiclub Neustift". Der ehemalige in Neustift lebende Sportsoldat begann 1986 mit dem Biathlonsport. Von der &lt;a href="Biathlon-Weltcup%201992/1993"&gt;Saison 1992/93&lt;/a&gt; bis 1996 war er im Biathlon-Weltcup aktiv. Bei seinem ersten Rennen, einem Einzel in Pokljuka, gewann er als 22. sofort Weltcuppunkte. Früh in der &lt;a href="Biathlon-Weltcup%201993/1994"&gt;Saison 1993/94&lt;/a&gt; erreichte er mit Platz 16 bei einem Einzel in Pokljuka das beste Einzelergebnis seiner Weltcup-Karriere. Erste internationale Meisterschaft und zugleich Höhepunkt der Karriere wurde die Teilnahme an den Olympischen Winterspielen 1994 in Lillehammer, bei denen Pfurtscheller in allen drei Rennen eingesetzt wurde. Im Sprint wurde er 43., im Einzel 57. und mit Alfred Eder, Ludwig Gredler und Franz Schuler als Schlussläufer der Staffel Österreichs Neunter. Letzter Einsatz bei einem Großereignis wurde der Sprint bei den Weltmeisterschaften 1996 in Ruhpolding, bei dem Pfurtscheller 76. wurde.