Grazie alla sua interpretazione in "Questione di chimica", Bryan Cranston vinse il Premio Emmy nel 2008 come "Miglior attore protagonista in una serie drammatica". Vince Gilligan fu nominato agli Emmy come miglior regista e vinse il DGA Award nella categoria "Miglior sceneggiatura per una serie drammatica". Lynne Willingham si aggiudicò il premio Emmy al miglior montaggio per l'episodio.