Samaan aikaan maajoukkuepestinsä ohella Minasjan toimi FC Pyunikin apuvalmentajana. Kesäkuussa 2008 hän nousi seuran päävalmentajaksi. Jan B. Poulsen sai potkut maajoukkueesta maaliskuun lopussa 2009, ja Minasjan nousi jälleen päävalmentajaksi. Helmikuussa 2010 hän teki EM2012-karsinnat kattavan sopimuksen maajoukkueen kanssa.