Decyzja o jej utworzeniu została zawarta w Rezolucji Rady Bezpieczeństwa ONZ nr 1590 z dnia 24 marca 2005. Zadaniem misji był przede wszystkim nadzór nad przestrzeganiem porozumienia pokojowego zawartego w Nairobi 9 stycznia 2005. Kończyło ono wieloletnią wojnę domową między zdominowanym przez muzułmanów arabskiego pochodzenia rządem Sudanu a rebeliantami z zamieszkanego przez czarnych chrześcijan południa kraju. Mandat misji nie odnosił się natomiast do drugiego konfliktu trwającego wówczas na terytorium Sudanu, a dokładniej w Darfurze.