Kurz danach verließ sie ihr Mann in Richtung Portugal, um in den Krieg gegen seinen Bruder Michael zu ziehen. Dieser hatte den portugiesischen Thron usurpiert, und Pedro schickte sich an, im sogenannten Miguelistenkrieg diesen für die rechtmäßige Herrscherin, seine Tochter Maria da Glória, zurückzuerobern, was ihm auch gelang. Amélie folgte ihrem Mann im September 1833 nach Portugal, wo das Paar den Palácio Nacional de Queluz in der Nähe von Lissabon bezog. Schwer von Tuberkulose gekennzeichnet, starb Pedro dort am 24. September 1834 und ließ Amélie als 22-jährige Witwe mit einer kleinen Tochter zurück.