Уили остался незадрафтованным на драфте 2017 года, однако в Летней лиге выступал за команду «Бруклин Нетс». Позднее он подписал контракт с «Бруклин Нетс», который позволяет игроку выступать как за основную команду, так и за клуб Лиги развития «Лонг-Айленд Нетс». 29 октября 2017 года в матче против «Денвер Наггетс» Джейкоб Уили сыграл свой первый матч за «Бруклин Нетс» в НБА. 15 января 2018 года «Бруклин Нетс» расторг с игроком двухсторонний контракт.