La Crónica de Ayutthaya cuenta que la construcción del Mahathat Chedi comenzó en 1374 durante el reinado de Boromma Ratchathirat I y se completó bajo el reinado del rey Ramesuan. Las fundaciones de la pagoda se derrumbaron durante el reinado del rey Boromma Ratcha I (o Song Tham), pero fueron posteriormente reconstruidas en 1633 bajo el reinado del rey Prasat Thong. Finalmente, el templo fue destruido y quemado durante la invasión birmana en 1767 y desde entonces ha quedado en ruinas.