2003 schuf Pen-Ek in Zusammenarbeit mit dem Schriftsteller Prabda Yoon und dem Kameramann Christopher Doyle die thailändisch-japanische Koproduktion "Last Life in the Universe", in der ein depressiver japanischer Bibliothekar (gespielt von Tadanobu Asano) kurz vor einem Suizidversuch den Tod eines Mädchens beobachtet und schließlich eine Beziehung mit deren älteren Schwester eingeht. Eine zweite Zusammenarbeit mit Asano und eine erneute Koproduktion, diesmal mit Hongkong, den Niederlanden und Südkorea, entstand 2006 mit "Insible Waves". Dieser Film, der von einem japanischen Koch eines thailändischen Restaurants in Macau handelt, lief im Wettbewerb der Internationalen Filmfestspiele Berlin 2006.