Com o Golpe de 1964 e a promulgação do AI-1, que permitia punições extralegais de adversários do novo regime, foi destituído do cargo e preso durante alguns dias no Forte de Copacabana, tendo seus direitos políticos cassados. Sofreu longo processo, acusado de haver autorizado a paralisação da refinaria de Cubatão (SP), em 1 de abril de 1964.