하지만 헌법 제정 문제로 국회 내부의 정쟁이 이어졌고 부원지쟁과 장훈복벽을 거쳐 중화민국 국회가 다시 전복되면서 호법전쟁 등 남북 내전이 이어졌고 북방에서는 북양정부의 권력을 쥐기 위해 안휘군벌의 돤치루이, 직예군벌의 펑궈장, 차오쿤, 오패부, 봉천군벌의 장쭤린, 산시군벌의 옌시산 등이 중국 각지에서 할거하였다. 이 군벌들이 중앙에서 대립하였고, 각 지방에서도 군벌들이 난립하여 중국 전역에서 군벌들이 서로 싸우는 상황이 1928년까지 이어진다. 이 시기에 1919년 외몽골 출병을 통해 다시 복속시킨 외몽골이 1921년 로만 폰 운게른슈테른베르크의 공격에 다시 빼앗기는 등 국가적 손실도 매우 심각하였다.