Uma segunda onda de purgas começou no início de 1948. Foi dirigido principalmente contra os judeus na União Soviética, que foram denunciados como "cosmopolitas sem raízes". A campanha inicialmente levou à dissolução do Comitê Antifascista Judeu e à execução de intelectuais iídiche conhecidos como a Noite dos Poetas Assassinados. Culminou no chamado Complô dos médicos e terminou abruptamente com a morte de Stalin em março de 1953.