Pendant la guerre de Sécession, il devient une partie intégrante de la défense de Washington D.C face aux Confédérés. Son commandant, Franklin Buchanan, démissionne afin de rejoindre la Confédération, laissant son poste à John A. Dahlgren. Le célèbre cuirassé de l'Union a été réparé sur le chantier après un engagement avec le CSS "Virginia".