El 14 de junio de 1995 el líder checheno provocó una de sus más graves acciones insurgentes: la toma de rehenes de un hospital de Budiónnovsk. No logrando sus propósitos, que consistían en presionar a Rusia para que ordenase un alto al fuego en Chechenia, sus hombres se retiraron liberando a los secuestrados. Después de aquel episodio que, de todas formas, costó la vida a más de 150 personas y dejó más de 400 heridos, fue emitida la orden de búsqueda y captura por parte de la Fiscalía rusa contra Basáyev. Su estatus de guerrillero más o menos común evolucionó rápidamente hacia convertirse, según el Gobierno ruso, en el "terrorista número uno de la Federación".