Boisen var børnenes og de fattiges præst, og han holdt i mange år søndagsskole i København, efter at denne virksomhed, støttet af prinsesse Caroline Amalies levende interesse for sagen, midt i trediverne først var begyndt af de teologiske kandidater Gustav Schaarup, Peter Rørdam og J.H. Paulli. For det navnlig i fyrrerne blomstrende "Danske Samfund" var Boisen – ikke mindst ved sin sang – i en række år en hovedstøtte, og da den første slesvigske krig så mægtigt greb og løftede sindene, bragte hans levende fædrelandsfølelse ham til at samle og udgive "Nye og gamle Viser af og for danske Folk" (1849), der vandt en vid udbredelse og oplevede mange oplag. Også de af ham samlede "Bibelske og kirkehistoriske Salmer og Sange for Skole" (1853) blev modtaget med bifald.