L'opposition interne au roi a grandi au fil des années. Il est renversé le par son propre fils soutenu par la population madrilène. en appelle alors à , désormais empereur. Mais le , Madrid se soulève contre les troupes français installées depuis l'année précédente. Manuel Godoy, menacé de mort par ses compatriotes, est exfiltré par le général Murat. Le souverain français prend parti ni pour le père ni pour le fils. Il préfère les pousser tous deux à abdiquer, en sa faveur, le à Bayonne. En compensation, obtient des terres et des revenus en France, et la couronne de Ligurie. L'empereur a choisi de faire de l'Espagne un royaume vassal. Et il en confie le trône à son frère aîné Joseph Bonaparte, qui prend le nom de José – "premier et dernier" écrira plus tard dans ses mémoires le général Thiébault. Le , le nouveau monarque prête serment sur la constitution de Bayonne, la première qui ait été donnée à l'Espagne. Et le même jour, il reçoit le serment de fidélité des membres du Conseil espagnol. Car les classes supérieures libérales modérées acceptent ce changement de dynastie. On les appelle les "afrancesados".