Depois do golpe de estado, que levou ao poder Augusto Pinochet em 1973, o MIR foi proscrito e duramente reprimido, centenas de seus dirigentes e militantes foram mortos e torturados, e até o dia de hoje muitos deles permanecem como presos políticos desaparecidos. O secretario geral, Miguel Enríquez, foi assassinado em um cerco efetuado pelas forças de segurança da ditadura, em 5 de outubro de 1974 e a direção do partido ficou a cargo de Andrés Pascal Allende.