Durante los años 20, la red ferroviaria griega se dividió entre varias empresas -privadas y públicas-, siendo las más importantes la SPAP (Ferrocarriles Atenas-Pireo-Peloponeso) y la SEK (Ferrocarriles Estatales Helénicos). Finalmente, el SPAP integró la mayoría de los ferrocarriles del sur de Grecia y el SEK los del norte. Debido a la inmensa presión financiera y social del periodo de entreguerras, no se construyeron muchos ferrocarriles. Entre los proyectos de construcción más importantes de las décadas de 1920 y 1930 se encuentran la ampliación del ferrocarril El Pireo-Thissio hacia el centro de Atenas a través de un largo túnel, el intento de ampliación del ferrocarril Palaiofarsalos - Kalampaka hacia Grevena y Kozani y la construcción de la línea ferroviaria Leukothea - Anfípolis. Gran parte de la infraestructura ferroviaria fue destruida durante la Segunda Guerra Mundial y la posterior Guerra Civil, por lo que gran parte de la posguerra se dedicó a su reconstrucción. La única ampliación digna de mención entre 1940 y 1971 fue la construcción de una nueva línea ferroviaria que conectaba Larissa con Volos y la ampliación de la línea ferroviaria Tesalónica - Florina hasta Ptolemaida y Kozani. También fue significativa la ampliación de EIS hacia Kifisia mediante la absorción de una antigua línea de ferrocarril del Ática.