Mais c'est avec le Bayern Munich qu'il va inscrire les plus belles lignes à son palmarès. Durant l'année 2013, l'équipe remporte tout : la Ligue des Champions, la Coupe du monde des clubs, la Supercoupe de l'UEFA, et la Bundesliga. C'est la première équipe allemande à réussir cet exploit. Il sera aussi champion d'Allemagne en 2014 et 2015, remportera deux Coupes d'Allemagne, en 2013 et 2014, ainsi que la Supercoupe d'Allemagne en 2012.