Roy est drafté à la sixième place lors de la Draft 2006 de la NBA par les Timberwolves du Minnesota qui l'échangent contre le septième choix Randy Foye, choisi par les Trail Blazers de Portland. Dès la "", Roy marque 19 points par match en moyenne à 65 %, avec un pic à 35 points contre les Suns de Phoenix le 12 juillet 2006.