Otrzymała imię Selene (Księżyc), a jej bliźniaczy brat Aleksander – imię Helios (Słońce). W 37 p.n.e. Marek Antoniusz uznał oficjalnie ich oboje za swoje dzieci, decyzją tą wzbudzając oburzenie wielu Rzymian. Podczas tzw. "Donacji Aleksandryjskiej", specjalnie zorganizowanej uroczystości w Aleksandrii jesienią 34 p.n.e., Marek Antoniusz rozdzielił wschodnie królestwa, ogłaszając Kleopatrę królową Egiptu, Cypru, Afryki i Celesyrii współwładającą z synem Cezarionem (synem Cezara), Aleksandrowi Heliosowi oddał Armenię, Medię i podbite części Partii, Ptolemeuszowi – Fenicję, Syrię i Cylicję. Kleopatra Selene została ogłoszona przez ojca królową Cyrenajki i Libii. Po porażce w bitwie pod Akcjum i w jej konsekwencji samobójczych śmierci Antoniusza i Kleopatry i aneksji Egiptu przez Oktawiana w 30 p.n.e. Kleopatra Selene, razem z braćmi (Aleksandrem i Ptolemeuszem) została oddana pod opiekę Oktawii, siostry Augusta i byłej żony Marka Antoniusza. W 29 p.n.e. byli prowadzeni w pochodzie triumfalnym Oktawiana.