Après la restauration de l'autocéphalie de l'église géorgienne en 1916, le protopresbytre Mikheïl Makhatadzé (1851-1951) a servi à la tête de l'église. À la suite de l'invasion soviétique de 1921, le gouvernement communiste l'a expulsé et ses 14 enfants de l'église, a confisqué son appartement et l'a relogé. En 1925, le gouvernement soviétique de Mikheil Kakhiani a établi une usine de tricotage de chaussettes dans le bâtiment et en 1927-1929, il a été transformé en bain public. Les archives de 1928 révèlent l'enlèvement des cadavres du cimetière de l'église sous la direction de K.M. Sikharoulidzé, qui a ordonné que le transfert des corps ait lieu la nuit pour empêcher les rassemblements publics.