Κατά τη διάρκεια της τούρκικης εισβολής το 1974, το Ελένειον λόγω και της κεντρικής θέσης του θα μετατραπεί σε κέντρο επιχειρήσεων του Γ.Ε.Ε.Φ. Το 1974 -75 οι μαθητές του Ελενείου θα αυξηθούν δραματικά αφού εδώ θα φοιτήσουν, μετά την τουρκική εισβολή, αρκετά παιδιά προσφύγων.