厄尔利于1861年5月4日接到通知，纽约州国民警卫队第69步兵团将征用乔治城大学校园直到这个月24日。此后，纽约州第79步兵团又于7月3至4日征用校园。1862年8月29日，联邦军征用该校充当医院，为约翰·波普（）少将在第二次馬納沙斯之役中受伤的部下治疗。伤员众多之下，圣三一教堂也被征用，乔治城大学直到1863年2月3日才不再是军用医院。