Dès l'annonce de la candidature de Le Drian, la question du cumul des fonctions de ministre de la Défense et président de Conseil régional se pose. Durant sa campagne présidentielle, François Hollande s'était engagé à ce que les ministres de son futur gouvernement ne cumulent pas leur portefeuille avec une fonction exécutive locale. Dans un premier temps, il est annoncé que Le Drian restera ministre le temps de la campagne. Les attentats du 13 novembre 2015 à Paris changent la donne, François Hollande ayant demandé à Jean-Yves Le Drian de demeurer ministre le temps nécessaire en raison notamment de l'état d'urgence et la guerre contre le groupe terroriste État islamique.