В составе сборной России Эмиль Гарипов принимал участие в юниорском чемпионате мира 2009 года, на котором он вместе с командой стал серебряным призёром, проведя 1 матч, и пропустив одну шайбу. В 2011 году Эмиль Гарипов в составе уже молодежной сборной России завоевал звание чемпиона мира. Так же Эмиль Гарипов является двукратным чемпионом Универсиады 2009 и 2011 в составе студенческой сборной России.