Button bestritt auch die Saison 2016 an der Seite von Alonso für McLaren. Beim Großen Preis von Österreich wurde er Sechster. Intern unterlag er Alonso mit 54 zu 21 Punkten und beendete die Saison auf dem 15. Gesamtrang. Im Rahmen des Großen Preises von Italien gab er sein Karriereende als Stammpilot zum Saisonende bekannt.