Après la capitulation japonaise du 2 septembre 1945, les Pays-Bas reprirent le contrôle de l'île. En décembre 1946, Buru, comme le reste des Moluques, Célèbes et les Petites îles de la Sonde, fut intégré dans l'État de l'Indonésie orientale ("Negara Indonesia Timur" en indonésien) créé par le gouvernement néerlandais pour transformer graduellement leurs anciennes possessions coloniales des Indes orientales en état associé. En décembre 1949, l'Indonésie orientale rejoignit la République des États-Unis d'Indonésie ("Republik Indonesia Serikat", ou RIS) crée lors de la Conférence de la Table Ronde de La Haye (23 août-2 novembre 1949).