Pierluigi Casiraghi fait ses débuts en équipe d'Italie le contre la Belgique en match amical et inscrit son premier but l'année suivante contre Saint-Marin. Très apprécié par le sélectionneur Arrigo Sacchi il participe à la Coupe du monde 1994 dont il est finaliste et à l'Euro 96. Après sept ans en équipes d'Italie où il est appelé de manière très régulière, il n'est pas retenu pour la Coupe du monde 1998. Le changement de sélectionneur en 1996 et sa piètre entente à Rome avec son entraineur Erikson y sont sans doute pour quelque chose. Il avait pourtant marqué un but décisif lors des barrages face à la Russie en . Il connait sa et dernière sélection le contre le Paraguay en amical.