Se cree que la ciudad surgió en torno a una abadía fundada en 792. En 1610, casi 150 años después de la fundación del monasterio franciscano, Omagh fue fundada como ciudad. Sirvió como refugio para los fugitivos del este de Tyrone durante la rebelión de 1641. En 1689, año en que tuvo lugar la batalla del Boyne, James II llegó a Omagh, en el camino a Derry. Los partidarios de Guillermo III, príncipe de Orange, quemaron la ciudad.