抗战胜利后，麦蕴瑜任省政府顾问。1946年冬，时任广东省政府主席张发奎任命麦蕴瑜为南沙群岛接收专员，随南京政府军舰及相关人员前往南沙群岛进行调研、测量、竖立碑石等接收工作。1947年至1949年间，麦蕴瑜任广州市工务局局长，修筑了广州沦陷时期被破坏的基建设施。