Daniel quittierte den Dienst im Heer 1858 und übernahm die Leitung der Plantage seines Vaters in Louisiana. Im Oktober 1860 heiratete er Ellen Long aus dem Northampton County in North Carolina. Als sich Louisiana entschied, den Konföderierten Staaten von Amerika beizutreten, bot er diesen seine Dienste an und wurde am 3. Juni 1861 als Oberst Kommandeur des 14. Infanterie-Regiment. Sein Regiment war in seiner Zusammensetzung einzigartig: Ihm gehörten die Männer der repräsentativsten und honorigsten Familien des Staates an und er gab ihnen die bestmögliche Ausbildung für den Krieg. Nachdem er weitere Truppen North Carolinas organisiert und ausgebildet hatte, übernahm er eine Brigade, zusammengesetzt aus den 43., 45. und 50. Infanterie-Regimentern und einem Kavalleriebataillon, mit der er vom 25. Juni – 1. Juli 1862 an der Sieben-Tage-Schlacht in Virginia teilnahm. Am letzten Tag der Schlacht entkam er bei der Schlacht am Malvern Hill nur knapp, als er selbst verwundet und sein Pferd unter ihm erschossen wurde.