En 1811 participaría en el primer movimiento independentista. Posteriormente, en 1814, sería uno de los principales líderes de la segunda insurrección independentista. Al inicio de ese movimiento, según el testimonio del soldado voluntario Pedro Garay, luego que el alcalde segundo de San Salvador Pedro Pablo Castillo mandase a tocar las campanas del cabildo (en la tarde del 24 de enero de ese año) para que la gente se aglomerara, Aranzamendi se presentaría en la sacristía de la iglesia parroquial; donde junto con Castillo, el alcalde primero Juan Manuel Rodríguez, Manuel José Arce, Domingo Antonio de Lara, y Miguel Delgado y León, se reunirían en una junta en el cuarto de los sacristánes; de donde saldría brevemente para traer papel y tinta, con la cual Juan Isidro Hoyos escribiría lo que en esa junta se decía para después enviárselo a las demás poblaciones de la intendencia de San Salvador.