Isasi występował w reprezentacji Paragwaju w latach 1977–1981. W 1979 uczestniczył w turnieju Copa América, który zakończył się tryumfem "Guaranich". W tuenieju Isasi wystąpił w sześciu meczach z Ekwadorem, Urugwajem, dwóch meczach półfinałowych z Brazylii oraz dwóch meczach finałowych z Chile.