Von April 1921 bis Mai 1923 befehligte Cowan das Schlachtkreuzergeschwader der britischen Atlantikflotte, als sein Flaggschiff fungierte dabei die damals gerade in Dienst gestellte HMS Hood. Cowan wurde 1927 zum Admiral ernannt und ging 1931 in den Ruhestand. Im Zweiten Weltkrieg wurde er reaktiviert und war bei den britischen Kommandos im Einsatz. In der Schlacht von Gazala wurde er von Truppen der Achsenmächte gefangen genommen, später aber wieder ausgetauscht.