Od konce 17. století začal opět růst počet obyvatel díky kolonistům z Makedonie a Thessálie a v 18 a 19. století se ostrov opět zapojil do středomořského námořního obchodu. Během Řecké války za nezávislost našli na ostrově útočiště utečenci z pevniny. Součástí nového řeckého státu se Skopelos stal roku 1832.