Avec la redéfinition des frontières et les mouvements forcés de populations qui suivent les conflits interethniques des années 90 dans l'ex-Yougoslavie, les Balkans occidentaux sont fortement divisés et des tensions profondes subsistent. Les accords de Dayton mettent un terme à la guerre en Bosnie (1995) en séparant le pays en deux régions distinctes et en créant un gouvernement fédéral géré par une présidence collective tripartite et supervisée par un Haut représentant international. Les accords prévoient également l'intervention d'une force d'interposition de l'OTAN (l'IFOR) qui sera remplacée par la force de l’Union européenne Althea à partir de 2004. Le Kosovo devient indépendant en 2008 au prix d'un exode massif des populations albanaises et serbes et là aussi, une force otanienne est mise en place (la KFOR) et appuyée par une mission d'administration remplacée par la mission civile de l'Union européenne EULEX Kosovo.