A inicios de la siguiente temporada, su presencia en la Community Shield nuevamente causó asombro, dado que Ferguson lo había descartado debido a una lesión en el tendón de Aquiles. Carrick fue titular, no tuvo una buena actuación y fue sustituido en el medio tiempo, mientras que su equipo derrotó al Manchester City por 3-2. El 18 de diciembre, a mediados de temporada, le marcó un gol, el primero en setenta partidos con el Manchester United y el tercero en condición de visitante, al Queens Park Rangers en triunfo un por la liga. El 14 de enero de 2012, anotó su primer tanto en Old Trafford desde enero de 2010 en una goleada por 3-0 sobre el Bolton Wanderers, mediante un disparo a larga distancia en el minuto 83. El equipo ocupó la tercera plaza de su grupo en Liga de Campeones, por lo que accedió a Liga Europa de la UEFA, donde los eliminó el Athletic Club en octavos de final. En Premier League, sumaron 89 puntos y quedaron segundos, detrás del Manchester City. Durante la temporada, Carrick debió suplantar a Paul Scholes y jugar exclusivamente de pivote o defensa central, y registró buenos números de pases, intercepciones y entradas.