42 v. Chr. kämpfte Norbanus Flaccus auf Seite der Triumvirn Marcus Antonius und Octavian (der spätere Kaiser Augustus) gegen die Caesarmörder Marcus Iunius Brutus und Gaius Cassius Longinus. Trotz der Überlegenheit der Republikaner zur See gelang es Norbanus Flaccus und Lucius Decidius Saxa, etwa Mitte 42 v. Chr. mit einer militärischen Vorhut von acht Legionen durch das Ionische Meer nach Makedonien zu segeln. Sie landeten an der dortigen unbewachten Küste, marschierten auf der Via Egnatia ostwärts über Thessalonike und Philippi bis zum Fluss Nestos in Thrakien und besetzten die dortigen Küstenpässe. Da stießen sie aber auf die ihnen entgegenziehenden, numerisch viel stärkeren Truppen von Brutus und Cassius. Während der ein Geschwader kommandierende Caesarmörder Lucius Tillius Cimber im Süden der Stellung von Norbanus Flaccus und Decidius Saxa ein Landungsmanöver unternahm, wurden diese vom überlegenen Landheer der Republikaner im Norden auf Gebirgspfaden umgangen. Rechtzeitig konnten die Unterfeldherren der Triumvirn nach Amphipolis zurückweichen und diese Position behaupten, bis dort Antonius mit den Hauptstreitkräften ankam. Nachdem Brutus und Cassius in den beiden Schlachten bei Philippi von den Triumvirn geschlagen worden waren und Selbstmord verübt hatten (Oktober/November 42 v. Chr.), wurde Norbanus Flaccus an Stelle des erkrankten Octavian der Oberbefehlshaber von dessen Truppen.