С 1961 по 1965 год Бёрк был начальником отдела геологии в Университете Вест-Индии в Кингстоне, Ямайка; после чего занимал должность начальника отдела геологии в Университете Ибадана в Нигерии с 1965 по 1972 год. В 1967 году учёный важное значение тогдашней новой теории тектоники плит для понимании поведения и истории нашей планеты. Несмотря на социальные волнения в Нигерии, вызванные Гражданской войной (1967–1970 годы), он нашел время для множества других исследований: формирование тропических почв (он показал доминирующую роль дождевых червей в их формировании), катастрофические явления эрозии в тропическом климате и новые методы седиментологии, опубликовав карту гравитационных аномалий Бугера в Нигерии.