Ha preso possesso della sua carica, giurando sulla Costituzione all'Assembleia da República il 9 marzo 2006, in una cerimonia cui hanno preso parte gli ex-Presidenti Ramalho Eanes e Mário Soares, il Principe delle Asturie, l'ex Presidente degli Stati Uniti, George H. W. Bush, il Presidente di Timor Est, Xanana Gusmão e altre personalità portoghesi e straniere. Va sottolineato il fatto che Cavaco Silva è il primo presidente di destra dal ritorno della Democrazia nel 1974.