Clan Na Gael controlaba las Convenciones de la Raza irlandesa desde 1916, y su grupo afiliado los Amigos de Libertad irlandesa. La Guerra irlandesa de Independencia provocó una ruptura en Clan na Gael que se precipitó en junio de 1920 cuando Éamon de Valera, como presidente de la República irlandesa, se implicó en una disputa con Devoy y el Juez Cohalan sobre la presión a los Candidatos a la presidencia de EE.UU. por el reconocimiento americano de la República irlandesa. Para castigar a Woodrow Wilson por su aparente falta de apoyo, el Clan respaldó a Harding en las Elecciones presidenciales de 1920. En octubre de 1920, Harry Boland declaró que la IRB en Irlanda había cortado conexiones con el Clan mientras que este no actuara según la voluntad del Dáil Éireann. Devoy y Cohalan rechazaron aceptar esto pero McGarrity discrepó, creyendo que sin el apoyo de la IRB, el Clan no tenía legitimidad, lo que provocó la ruptura. McGarrity, cuya facción fue rebautizada como Clan na Gael reorganizado, apoyó a las fuerzas Anti-Tratado durante la Guerra Civil mientras Devoy y Cohalan apoyaban al Estado Libre. Después de 1924, cuando la IRB y el Clan na Gael de Devoy-Cohalan decidieron disolverse, la facción de McGarrity pasó a ser el único Clan na Gael. En 1926, Clan na Gael se asoció formalmente con el reorganizado Ejército Republicano irlandés del mismo modo que antes lo había estado con la IRB.