Eduardo là thủ môn thứ 3 trong đội hình Bồ Đào Nha vô địch EURO 2016. Ngày 1 tháng 9 năm 2016, anh có trận đấu quốc tế cuối cùng khi giữ sạch lưới trong chiến thắng 5–0 trước Gibraltar.