La victoire décisive à la bataille de Palerme, le , est obtenue grâce au génie de Tourville, alors que Duquesne à bord du "Saint-Esprit" tire un bord au large et ne participe pas à la confrontation. Le navire amiral espagnol "Nuestra Señora del Pilar" est détruite par un brûlot français et l'amiral don Francisco de la Cerda tué, tout comme l'amiral hollandais Jan den Haen. Finalement, la flotte alliée perd douze vaisseaux et près de . Durant l’été, Duquesne se révèle incapable de poursuivre et de détruire le reste des forces hollandaises pourtant mal en point. Duquesne obtient alors l'autorisation du duc de Vivonne de quitter le "Saint-Esprit", très malmené par la campagne, et passe sur le "Royal-Louis", « un des plus beaux bâtiments de la flotte de guerre française, avec ses cent vingt canons. »