Roeder entkam jedoch und er gelangte auf seiner Flucht zunächst nach Kolberg und da dieses schon eingeschlossen war, nach Rügen. Dort schloss er sich dem Freikorps „von Marwitz“ an. Nach dem Frieden von Tilsit kam er 1808 in Garnison nach Berlin, nahm aber für seine Denkart bezeichnend schon 1809 seinen Abschied, um im österreichischen Dienst von Neuem gegen Napoleon zu kämpfen. Aber das unerwartet rasche Ende des österreichischen Krieges verhinderte die Ausführung dieser Absicht. Da der Friede von Schönbrunn gleich darauf jede Aussicht auf eine preußische und deutsche Erhebung in weite Ferne zu rücken schien, widmete sich Roeder die nächsten Jahre seiner wissenschaftlichen Bildung auf den Universitäten zu Frankfurt an der Oder, Berlin und Heidelberg. Hier traf ihn der Aufruf von König Friedrich Wilhelm III. „An Mein Volk“. Er folgte dem Ruf, kehrte in die Heimat zurück und wurde als Premierleutnant und als Adjutant bei Generalleutnant von York wieder angestellt. Gleich in der Schlacht bei Großgörschen wurde Roeder so schwer verwundet, dass er in Folge hiervon sein rechtes Auge für immer verlor. Aber noch ehe er völlig geheilt war, trat er doch gleich bei dem Ablauf des Waffenstillstandes wieder in die Armee ein und kämpfte in den Schlachten an der Katzbach, bei Möckern, Ligny, und Belle Alliance. Für seinen Mut und militärische Umsicht erhielt er für die Schlacht an der Katzbach das Eiserne Kreuz II. Klasse sowie für Belle Alliance das Kreuz I. Klasse.