Pada bulan Oktober 1948, Warlimont telah dibicarakan sebagai penjenayah perang di hadapan tribunal tentera Amerika Syarikat dalam Perbicaraan Pemerintah Tertinggi kerana beliau menyampaikan arahan Hitler supaya komando tentera Bersekutu perlu dihapuskan dan bukan ditahan sebagai tawanan perang, yang dipanggil sebagai Perintah Komando. Walaupun beliau berhujah bahawa beliau cuba untuk melemahkan arahan Hitler, beliau telah disabitkan kesalahan dan dihukum penjara seumur hidup. Walau bagaimanapun, pada tahun 1951 hukumannya dikurangkan kepada 18 tahun. Pada tahun 1957 terdapat pengampunan untuk banduan tertentu, dan beliau akhirnya dibebaskan daripada Penjara Landsberg. Selepas perang beliau terlibat dalam pelbagai penulisan kajian sejarah perang.