1926年（民国15年）3月、李宗仁率いる軍は国民革命軍第7軍に改組され、李が軍長、黄紹竑は同軍党代表となった。同年夏、国民政府の下での制度改正に伴い、黄は広西省政府主席に任ぜられた。翌年4月の上海クーデターでは、蔣介石の意を受けて、黄紹竑も部下の黄旭初に中国共産党粛清を命じた。また、南昌起義の鎮圧、張発奎・黄琪翔率いる反蔣粤軍の撃破の指揮もとった。