En 1646, pendant les Guerres confédérées irlandaises, il négocia sans succès avec le commandant royaliste James Butler (1er duc d'Ormonde) pour la reddition de Dublin aux forces parlementaires. En 1647, pendant la Première révolution anglaise, il fut accusé d'avoir trahi la cause parlementaire, ainsi que de Détournement de fonds, à la suite de quoi il s'enfuit vers le continent, mais retourna au Parlement en . Le , il a été arrêté et est resté en prison (notamment au château de Wallingford) pendant près de trois ans. Ayant pris une part active dans la restauration de Charles II, il a été employé en Irlande pour organiser les affaires des soldats et autres aventuriers qui s'étaient installés en Irlande.