Zu den Bundestagswahlen 2009, 2013 und 2017 wurde Burkhard Lischka von der SPD als Direktkandidat im Bundestagswahlkreis 69 Magdeburg nominiert und zog jeweils über die Landesliste in den Deutschen Bundestag ein, bei den Bundestagswahlen 2013 und 2017 zudem als Spitzenkandidat. Im Bundestag war Burkhard Lischka seit Oktober 2009 Mitglied des Ausschusses für Recht und Verbraucherschutz sowie des Unterausschusses Europarecht und vom 24. Mai 2011 bis 23. September 2014 Rechtspolitischer Sprecher der SPD-Bundestagsfraktion. Danach wurde er Mitglied des Innenausschusses und Innenpolitischer Sprecher seiner Fraktion. Darüber hinaus war Lischka seit Januar 2014 Mitglied des Parlamentarischen Kontrollgremiums. Er war zudem stellvertretendes Mitglied des NSA-Untersuchungsausschusses. Seit dem 25. Oktober 2011 war Lischka zudem Mitglied des Vorstandes der SPD-Bundestagsfraktion. Seit 2013 war Lischka Mitglied der PKGr und Obmann der SPD-Fraktion.