Després que Moçambic va aconseguir la independència el 1975 els xinesos van trobar els seus actius de negoci i fins i tot els edificis de les associacions de la comunitat xinesa expropiades pel nou govern comunista, el que porta a molts a pensar en abandonar el país. L'empenta per sortir es va consolidar el 1977 per l'inici de la Guerra Civil de Moçambic. Molts van emigrar a Portugal. La seva arribada va precedir l'ona principal de la migració xinesa allà, que consistia en treballadors de la part continental xinesa; els xinesos de Moçambic tendien a tenir molt millors resultats del mercat laboral a Portugal, a causa tant al seu coneixement fluid de l'idioma portuguès, com del seu alt nivell d'educació. Les seves feines habituals són caixers de banc, enginyers, metges i altres professionals. Altres marxaren a Macau, que encara era una colònia portuguesa. Al final de la guerra el 1992 la comunitat s'havia reduït a uns centenars. Els descendents dels antics colons xinesos van continuar sortint del país, fins i tot amb l'arribada de la pau; l'any 2006 només es mantenien un total de gairebé vint famílies, potser un centenar de persones a Maputo, mentre que a Beira tan sols hi quedaven dues persones. Tanmateix van ser reemplaçats pels nous expatriats de la República Popular de la Xina, que va arribar al país com a part de la creixent cooperació econòmica entre la Xina i Àfrica.