Podczas kampanii wrześniowej Kozłów Biskupi był objęty walkami w ramach Bitwy nad Bzurą, toczonymi przez połączone armie „Poznań” (gen. Tadeusz Kutrzeba) i „Pomorze” (gen. Władysław Bortnowski). Była to największa bitwa wojny obronnej 1939. 14 września rozpoczęto działania prowadzące do otoczenia sił polskich. Pod koniec dnia gen. Bortnowski wydał niekonsultowany z gen. Kutrzebą, defensywny rozkaz odwrotu całości sił Armii „Pomorze” na lewy brzeg rzeki. 16 września przy wsparciu potężnego lotnictwa bojowego Niemcy rozpoczęli atak na okrążone armie polskie. 1 Dywizja Pancerna, ściągnięta spod Góry Kalwarii, przeprawiła się w Kozłowie przez Bzurę, uderzyła na 57 pp z 14 DP, rozbiła go i wdarła się w głąb ugrupowania i na tyły obu armii polskich. Doprowadziło to do klęski obrońców w toczącej się w dniach 13 – 16 września Bitwy o Sochaczew i otworzyło drogę niemieckim dywizjom do ataku na stolicę. W dniach 17–22 września garnizon warszawski został wzmocniony przez oddziały Armii „Poznań” i Armii „Pomorze”, które przez Puszczę Kampinoską, przedarły się do stolicy.