Im Oktober 1805 befehligte Davout das 3. Korps der Armee in Österreich und führte in der Schlacht bei Austerlitz den rechten Flügel. Im Oktober 1806 operierte er mit dem rechten Flügel der Grande Armée selbständig und schlug das preußische Hauptheer am 14. Oktober in der Schlacht bei Auerstedt. Deshalb zum Herzog von Auerstedt erhoben, nahm er noch an den Schlachten bei Eylau, Heilsberg und Friedland in Ostpreußen teil und wurde zum Generalgouverneur des Herzogtums Warschau ernannt.