27 мая 1999 года (во время конфликта в Косово) Милошевич был обвинён НАТО в военных преступлениях, нарушении Женевской конвенции и геноциде. Югославия была подвергнута бомбардировке авиацией НАТО. В результате бомбардировок авиацией НАТО 20 июня 1999 года югославская армия была выведена из Косова и Метохии.