Après trois mois d'absence dus à la crise du coronavirus, Tottenham fait son retour à la compétition face à Manchester United en Premier League. Hugo Lloris revient à son meilleur niveau en étant plusieurs fois décisif, l'un de ses dégagements étant à l'origine de l'action menant à l'ouverture du score de Steven Bergwijn. Il réalise plusieurs arrêts de grande classe, notamment en effectuant une envolée impressionnante sur une frappe d'Anthony Martial. Cependant, Lloris finit par s'incliner sur un penalty de Bruno Fernandes en fin de match (1-1). Hugo Lloris enchaîne les performances de hautes volées lors de la fin de saison, réalisant une intervention cruciale dans le temps additionnel de la rencontre face à Bournemouth en sortant dans les pieds de Harry Wilson (0-0) et en se montrant décisif lors du "North London Derby" face à Arsenal en détournant à l'horizontale une reprise de volée de Pierre-Emerick Aubameyang (victoire 2-1). Le 19 juillet 2020, Hugo Lloris réalise un match de très haut niveau, effectuant un total de six arrêts décisifs face à Leicester City (victoire 3-0), notamment en effectuant une parade réflexe à l'horizontale sur une reprise de volée de Ayoze Pérez.