Fischerin valmentajaura alkoi kaudella 2009–2010 HC Luganon U17-junioreiden valmennustiimissä. Kaudella 2010–2011 hän toimi sekä seuran NLA-joukkueen että A-nuorten apuvalmentajana. Kaudella 2011–2012 Fischer toimi Luganon NLA-joukkueen päävalmentajana kahden ottelun ajan tuurattua Barry Smithia. Kesken kauden 2012–2013 hän jätti joukkueen valmennustiimin siirryttyään Sveitsin alle 20-vuotiaiden maajoukkueen apuvalmentajaksi Sean Simpsonin valmennustiimiin. Fischer toimi syksyllä 2012 myös Colin Mullerin apuvalmentajana alle 19-vuotiaiden World Junior A Challengessa, joka päättyi pronssiin. Alle 20-vuotiaiden MM-kilpailut päättyivät puolestaan Sveitsin osalta kuudenteen sijaan. Keväällä 2013 hän toimi Simpsonin alaisuudessa myös Sveitsin miesten maajoukkueessa, jossa Fischer voitti hopeaa.