约翰继续执行其父的分离主义政策，企图使勃艮第变成一个完全独立的公国，并致力于加强对尼德兰的控制。1408年，无畏的约翰率勃艮第军队镇压列日市民起义。他与奥尔良公爵路易一世进行残酷的夺权斗争（所谓阿馬尼亞克派與勃艮第派內戰的斗争），以争夺患精神病的法王查理六世的摄政权。1407年，无畏的约翰派人刺杀了路易，此后他成为法国的摄政（至1413年）。