由于割让利比亚让青年土耳其党人在奥斯曼帝国的威望也随之动摇，自由和睦党人于1912年7月趁机推翻了青年土耳其党人的政权，但是靠着恩维尔的军队威望保住了联合进步委员会。但在同年10月开始的第一次巴尔干战争中，奥斯曼帝国又惨遭失败，被迫割地求和。恩维尔在1913年1月再度发动血腥政变，也即突袭高门政变，恢复了青年土耳其党人的政权。第二次巴尔干战争期间恩维尔担任奥斯曼军的参谋总长，在德国将军奥托·冯·桑德斯的帮助下收复故都亚德里亚堡（今埃迪尔内）。恩维尔现在的地位及声望如日中天，担任军事大臣，兼总参谋长，军衔从上校晋升为将军（帕夏），称号从酋長正式改为帕夏（恩维尔帕夏）。