לוקבנץ ערך את הופעת הבכורה שלו בנבחרת צ'כיה בשנת 1995, אך לא נכלל בסגל ליורו 1996. הטורניר הראשון בו לוקבנץ נטל חלק היה גביע הקונפדרציות 1997, בו זכה עם צ'כיה במקום השלישי. לוקבנץ השתתף גם ביורו 2000 בו הודחה נבחרתו בשלב הבתים, כשהוא נכנס כמחליף בכל שלושת המשחקים. גם ביורו 2004 נטל לוקבנץ חלק, ושותף במשחק אחד בלבד בשלב הבתים, לאחר שצ'כיה כבר הבטיחה את עלייתה, בניצחון 2-1 על נבחרת גרמניה. במשחק זה הוחלף לוקבנץ על ידי מילאן בארוש, שהבקיע את שער הניצחון, ולא שב לשחק יותר בטורניר זה. במונדיאל 2006 לוקבנץ נכנס במחצית כמחליף ליאן קולר הפצוע במשחק בשלב הבתים מול נבחרת ארצות הברית, בו ניצחה צ'כיה בתוצאה 3-0. לוקבנץ פתח במשחק מול נבחרת גאנה בו הפסידה צ'כיה בתוצאה 2-0. במשחק ההפסד של צ'כיה לנבחרת איטליה, לוקבנץ לא שותף, וצ'כיה הודחה בשלב הבתים. לאחר טורניר זה, לוקבנץ פרש מהנבחרת לאחר 11 שנים, בהן לבש 74 פעמים את המדים הלאומיים והבקיע 14 שערים.