Коначно је манастир потпуно срушен 15. фебруара 1944. у Другом светском рату за време Битке за Монте Касино. Након рата је манастир поново изграђен. Пре велике битке у којој је манастир уништен спашено је 1400 вредних руком писаних књига, које су премештене у Ватикан.