L'attuale presidente eletto è Maryam Rajavi, la quale, nella sua prima elezione nel 1993, è stata considerata dal movimento il futuro capo di Stato dell'Iran. Massoud Rajavi, suo marito, è ufficialmente il presidente e portavoce dell'organizzazione, ma non si mostra in pubblico dall'invasione dell'Iraq del 2003. Fonti arabe di informazione hanno affermato che Massoud Rajavi sia scomparso o morto, che sia stato arrestato dalle nuove autorità irachene. Nel 2009 è stato diffuso un comunicato che afferma che Rajavi è in clandestinità per timore di essere assassinato, ma che il "grande architetto e leader della Resistenza" è tuttora in vita e in buona salute e ha rivolto una lettera agli ayatollah e agli oppositori interni. Nel 2016 è stato detto che Rajavi sia deceduto di malattia (complicazioni dell'AIDS) lo stesso anno. Tra gli altri fondatori vi fu Abolhassan Banisadr, primo Presidente della Repubblica Islamica dell'Iran, destituito e costretto all'esilio da Khomeini nel 1981 in quanto considerato troppo moderato.