Durch den konzentrierten Angriff, der in den Rücken der feindlichen Armee zielte, gelang es Napoleon erneut, die lebensnotwendigen rückwärtigen Versorgungsstraßen des Gegners unmittelbar nach Ausbruch der Kämpfe zu bedrohen. Während der Kaiser Anfang Oktober seine gesamte disponible Armee bereits an der Grenze auf engem Raum zusammenzog, ließen seine Gegner, in erster Linie Preußen und Sachsen, mehr als die Hälfte ihrer Streitkräfte zu Hause in ihren Quartieren zurück. Ohne einheitliche Führung, ohne einheitliches Ziel, aufgeteilt in vier fast autonome „Armeen“, unter Herzog von Braunschweig, Fürst von Hohenlohe, Rüchel und Herzog von Württemberg (auch „"Reservekorps"“ genannt; es befand sich z. T. der Schlachten von Jena und Auerstädt etwa zwischen Magdeburg und Halle). Der junge König, Friedrich Wilhelm III., befand sich bei der Armee des Herzogs von Braunschweig. Die persönliche Anwesenheit des Königs steigerte die Autorität Braunschweigs als Oberbefehlshaber nicht, sondern hemmte sie eher. Dies wurde auch deutlich, als der Herzog von Braunschweig gleich zu Beginn der Schlacht von Auerstedt tödlich verwundet wurde und der König sich nicht in der Lage fühlte, entweder den Oberbefehl selbst zu übernehmen oder wenigstens vorübergehend einen anderen Oberbefehlshaber zu ernennen, so dass zeitweise niemand die Armee führte. Daher wurden bei den Alliierten alle wesentlichen Entscheidungen durch einen „Kriegsrat“ gefällt, an den sich dann aber nicht alle hielten. wurden nur wenige Tage nach Kriegsbeginn zwei der vier Teile der unsicher agierenden Alliierten westlich der Saale bei Jena und Auerstedt einzeln angegriffen und vernichtend geschlagen. Damit war der Krieg von 1806 fast schon entschieden.