Os navios internados tiveram todas as suas armas desabilitadas. A frota permaneceu em cativeiro durante as negociações do Tratado de Versalhes. Ficou aparente para Reuter que os britânicos tinham a intenção de tomar as embarcações alemãs em 21 de junho de 1919, data limite para assinatura do acordo de paz. Ele decidiu deliberadamente afundar seu próprios navios com o objetivo de impedir que isso ocorresse. A força britânica de vigia deixou Scapa Flow na manhã do dia 21 a fim de realizar treinamentos, com Reuter emitindo a ordem de afundar às 11h20min. O "Bayern" afundou às 14h20min, porém marinheiros britânicos conseguiram encalhar o "Baden", sendo o único dos grandes navios que não afundou. Ele foi posteriormente reflutuado, minuciosamente examinado e testado pelos britânicos e depois afundado em 16 de agosto de 1921 como navio alvo em testes de artilharia. O "Bayern" foi recuperado em 1º de setembro de 1934 e desmontado no ano seguinte em