El «Toro» Wilmar Cabrera inició su carrera en el Club Nacional de Football de Montevideo, donde formó parte del histórico equipo conocido como el Rey de Copas que ganó la Liga uruguaya, la Copa Libertadores y la Copa Intercontinental en 1980. En 1981, fue subcampeón de la Copa Interamericana, a pesar de los dos goles que marcó en el partido de vuelta de la final ante el Club Universidad Nacional de México. En 1983, sumó un nuevo título de Liga, con el que cerró su primera etapa en el Nacional.