Bruno Stojić nació en una familia de etnia croata el 8 de abril de 1955 en la aldea de Hamzići, del municipio de Čitluk, República Socialista de Bosnia y Herzegovina, en el marco de la Yugoslavia socialista. En 1990 fue nombrado viceministro de Interior del gobierno autónomo bosnio, y en 1992, ya comenzada la guerra, responsable del Consejo Croata de Defensa (HVO), la rama militar de la autoproclamada República croata de Bosnia por el presidente Mate Boban. En 1993 fue nombrado responsable de la Oficina de Producción y Venta de armas y equipos militares.