1866 nahm Hanstein zu Beginn des Deutschen Krieges mit zwei Bataillonen seines Regiments unter General von Flies an der Schlacht bei Langensalza teil und war während des Mainfeldzuges Führer einer kombinierten Brigade, die er in den Gefechten bei Waldaschach, Oerlenbach, Neukirchen, Roßbrunn und Uettingen sowie bei der Beschießung von Würzburg kommandierte. Ausgezeichnet mit dem Kronenorden II. Klasse mit Schwertern, wurde Hanstein nach dem Friedensschluss unter Stellung à la suite seines Regiments mit der Führung der 28. Infanterie-Brigade in Wesel beauftragt. Mit einem Patent vom 30. Oktober 1866 erfolgte am 31. Dezember 1866 die Beförderung zum Generalmajor sowie seine Ernennung zum Brigadekommandeur. In gleicher Eigenschaft war Hanstein ab dem 18. Mai 1867 in Kassel bei der 44. Infanterie-Brigade tätig, bis er am 22. Mai 1869 mit Pension zur Disposition gestellt wurde. Nach seiner Verabschiedung erhielt er Mitte Juni 1869 das Kommandeurkreuz I. Klasse des Hausordens vom Weißen Falken.