Dicha guerra terminó, oficialmente, el 10 de febrero de 1878, con el Pacto del Zanjón. Por esa época, Bonne ya era Capitán de la escolta del Coronel José Maceo. Tras el fin de la guerra, se preparó una nueva, para continuar la lucha por la independencia. La Guerra Chiquita (1879-1880), también terminó en fracaso para los cubanos, y el ya Comandante Bonne depuso las armas, el 1 de junio de 1880.