Tra febbraio e aprile 1942 le due formazioni furono trasportate nella colonia italiana di Libia per combattere nei ranghi del DAK che affiancava le meno mobili formazioni del Regio Esercito schierate sul fronte nordafricano. A causa dell'affrettata messa a punto e del particolare ambiente desertico tutti i mezzi registrarono frequenti guasti meccanici e dunque pochi erano pienamente operativi, spesso mantenuti tali cannibalizzando i componenti necessari dalle unità troppo danneggiate. Gli Sturmpanzer II parteciparono alla battaglia di Ain el-Gazala tra maggio e giugno, conclusasi con la vittoria delle forze dell'Asse, e anche alle battaglie attorno El Alamein (la prima del luglio 1942 e quella di Alam Halfa del 31 agosto-5 settembre) dove l'avanzata del generale Erwin Rommel si era arrestata. Dopo la fine della seconda battaglia di El Alamein ed entro il 2 dicembre otto veicoli erano stati distrutti e i restanti quattro continuarono a essere usati fino alla primavera del 1943, quando l'ultimo fu abbandonato. Sembra però che le truppe dell'8ª Armata britannica trovarono sei Strumpanzer avariati in una officina non evacuata dai tedeschi in ritirata; uno fu poi passato all'esercito del Regno d'Egitto che lo utilizzò contro gli israeliani nella guerra arabo-israeliana del 1948.