In dieser Zeit wurde das heute nicht mehr erhaltene südliche Querschiff als Kirche notdürftig hergerichtet. Während der Hungersnot gerieten die Brüder in finanzielle Schwierigkeiten, als sie sich bemühten, die notleidende Bevölkerung mit Nahrung zu versorgen. Henry Hughes, der Bischof von Gibraltar ließ daraufhin im Jahr 1847 der Gemeinschaft 100 Pfund zukommen. Im Jahr 1852 wurde Meelick wurde den Franziskanern endgültig aufgegeben, wonach eine Nutzung der Gebäudereste als Gemeindekirche begann. Erst durch umfangreiche Restaurierungen in den Jahren 1984 und 1985 gewann Meelick die heutige Form, wobei das südliche Querschiff abgerissen und das Hauptschiff mitsamt dem Chorbereich wieder eingedeckt wurde.