Avec la création d'une armée permanente dans le dernier quart du en France, apparaît l'idée de créer un "service pharmaceutique"; mais il s'agit d'apothicaires de la personne et de la cour royales plutôt que d'apothicaires de l'armée et de la nation. En 1476, préparant la conquête de Toro, Isabelle la Catholique organise un hôpital de campagne dans six vastes tentes. Le nom de l'apothicaire ainsi que celui de son aide – Jaime Pascual et Esteban de Buenora – sont connus. C'est la première mention historique de pharmaciens militaires. Les sentiments humanitaires de la reine Isabelle, lui vaudront par la suite le titre de "mater castrorum". La même organisation trouvera place dans les campagnes pour la reconquête de Malaga en 1487 et la Prise de Grenade en 1492, et dans les campagnes de Charles-Quint puis de Philippe II, en Italie et aux Pays-Bas, en 1532 contre les Barbaresques, en 1582 aux Açores et même dans la marine au temps de l'Invincible Armada. L'événement le plus notable du est la création à Malines, en 1567, par Marguerite de Parme, d'un hôpital militaire à l'usage des Espagnols, formation de courte durée, mais qui préfigure l'installation en 1585, toujours à Malines, par Alexandre Farnèse, fils de Marguerite, d'un véritable « Hôpital royal de l'armée », dont le règlement, arrivé jusqu'à nous, est le plus ancien règlement d'hôpital militaire que l'on connaisse.