Эммануил Томбазис родился в 1784 году на острове Идра, в семье судовладельца Николаоса Томбазиса. Некоторые из кораблей Томбазисов запечатлел французский художник Антуан Ру () во время их заходов в Марсель перед Греческой революцией 1821 года.