Samtidig med arbejdet som fotograf drev Møller en omfattende dyrlægevirksomhed. Efter at have taget veterinær eksamen deltog han kort tid efter i felttoget 1864, hvor han fik rig lejlighed til behandling af heste, hvad der da også blev hans specialitet siden. Møller var en velset gæst på Veterinærskolen, og han var censor ved eksaminerne der.