Le "Makigumo" est attaché avec le "Kazagumo" et "Yugumo" à la division de destroyer de la escadre de la Kidō Butai ( flotte aéronavale) en . En , il escorte les porte-avions du vice-amiral Chūichi Nagumo lors de la bataille de Midway. En , la division est assignée à la flotte impériale et participe en août à la bataille des Salomon orientales. Au mois d'octobre, il effectue plusieurs allers et retours afin d'escorter des transports de troupes vers Guadalcanal. Le , lors de la bataille des îles Santa Cruz, il participe avec l’"" au torpillage de l' qui finit par sombrer dans la nuit du à 1h35. Lors de la bataille navale de Guadalcanal, les 13 et , il assiste la force de l'amiral Shōji Nishimura et avec l'aide du "Kazagumo", il recueil les rescapés du croiseur "Kinugasa" coulé par l'aviation américaine. Le , il quitte les Îles Truk pour le Japon qu'il atteint le afin d'entreprendre des réparations. Après les travaux, il quitte le Japon, le , rejoint les îles Truk, puis Rabaul et atteint les Îles Shortland le . Le février, il participe à l'évacuation de Guadalcanal des troupes japonaises à la fin de la bataille de Guadalcanal. Il est touché par une mine en voulant éviter l'attaque d'un PT boat et sombre au large de l'île Savo. Les 237 survivants du naufrage sont recueillis par le "Yugumo".