Joaquín Walker studeerde rechten aan de Universiteit van Chili. Na zij studie vestigde hij zich in Valparaíso waar hij zich ontwikkelde tot een vooraanstaand zakenman. Hij was lid van de Kamer van Afgevaardigden (1885-1888; 1894-1897; 1903-1906; 1896-1897 voorzitter) en van de Senaat (1906-1915). Walker behoorde tot de "Partido Conservador" (Conservatieve Partij) en gold als een geharnast tegenstander van de liberale regeringen. Tijdens de Chileense Burgeroorlog (1891) koos hij de kant van het parlement tegen president Balmaceda. Van 13 april tot 3 september 1891 was hij minister van Oorlog en Marine in de revolutionaire tegenregering in Iquique. Na de overwinning van de revolutionairen werd hij minister van Financiën en later van Justitie (1891).