Иван Карнилин являлся другом и соратником Бориса Немцова, бывшего нижегородского губернатора (в 1991—1997 годах) и оппозиционера. После гибели того в 2015 году, Иван Карнилин принял участие в «Марше памяти Бориса Немцова», проходившем под лозунгом «Против политических убийств и репрессий, за свободную Россию». Также Иван Карнилин поддержал предложение инициативной группы нижегородцев увековечить память о Борисе Немцове, предложивших установить мемориальную доску на доме, где жил убитый политик.