У липні 1939 року Е. Пітчонка призначений командиром 2-го парашутного батальйону 2-го парашутного полку, на чолі якого 10 травня 1940 року десантувався в Голландії під час вторгнення німецького вермахту до Нижніх країн. У квітні 1941 року під час Грецької кампанії вів свій підрозділ у битву за Коринф. 26 березня 1941 року підвищений у майори. Брав участь у десантуванні та боях на грецькому Криті.