В мае 1811 года армия была реорганизована, и Попон был назначен командующим дивизии. Это стало началом крайне неудачного для него периода. В Саламанке в июле 1812 года его изолированное подразделение было разгромлено в результате атаки британской пехоты и кавалерии во главе с генерал-лейтенантом Степлтоном Коттоном (позже виконтом Комбермером). В июне 1813 года британцы застали врасплох его войска в Сан-Мильяне и Осме. Дивизия пропустила битву при Витории, но помогла отразить преследование союзников при Толосе. Его дивизия была разбита в Сорорене в конце июля 1813 года и возле Бидасоа в октябре. После этих поражений маршал Никола Сульт заменил его Жаном Франсуа Левалем. Отправленный в Италию, он потерпел поражение на реке Таро в апреле 1814 года. Имя Попона вписано под Триумфальной аркой в столбце 35.