1 января 1957 Роман Кольчиньский в звании подполковника был назначен комендантом гражданской милиции Гданьского воеводства. Занимал этот пост восемнадцать с половиной лет — до 1 июня 1975. Был повышен в звании до полковника MO. На этот период пришлись такие события, как студенческие волнения марта 1968 и рабочие протесты декабря 1970. В обоих случаях Кольчиньский выступал активным проводником репрессивного курса.