Fortan blieb er Stammtorhüter der dänischen Auswahl und nach dem knappen Scheitern in der WM-Qualifikation an Rumänien im entscheidenden letzten Spiel Mitte November 1989 in Bukarest (1:3) wurde auch die anschließende Europameisterschaft 1992 sportlich verpasst. Als Zweitplatzierter hinter der Auswahl Jugoslawiens rückte Dänemark jedoch nach dem Ausschluss Jugoslawiens in Folge des Kriegsausbruchs auf dem Balkan ins Teilnehmerfeld nach und das nun von Richard Møller Nielsen trainierte Team sorgte mit dem überraschenden Titelgewinn für den größten Erfolg in Schmeichels Nationalmannschaftskarriere. Dabei galt seine Torhüterleistung beim 2:0 im Finale gegen den amtierenden Weltmeister aus Deutschland als herausragend. Zuvor hatte er im Halbfinale die dänische Auswahl mit seinen Paraden gegen den Favoriten aus den Niederlanden ins Elfmeterschießen gerettet und dort den entscheidenden Schuss von Marco van Basten pariert.