En 1987 Carlsson recibió lo que sería su último nombramiento. Fue nombrado por las Naciones Unidas (ONU) Comisionado Especial para Namibia. Era el comisionado No7 en ese cargo. Le tocó adelantar las negociaciones de paz entre todos los participantes en el conflicto bélico de África del Sudoeste. Carlsson participó representando a la ONU en las negociaciones lideradas por Chester A. Crocker (mediador de los Estados Unidos) en 1988, velando por el cumplimiento de la resolución No 435 del Consejo de Seguridad.