联合国调查其原委，一些以伊朗及也門为首的外国渔船趁索马里内乱进入其海域大肆非法捕捞，并且有一些與意大利黑手党有关的欧洲企业，趁乱在此海域倾倒包括核废料在内的各种有毒废料，使得当地渔业经济遭受破坏。而索马里由于连年内战，海岸警卫力量严重缺失，无法抵抗外国船只。2004年发生的印度洋海啸则彻底摧毁了索马里沿海地区本已虚弱的经济。作为回应，部分渔民开始组织对当地渔业进行武装保护，最终演变成为海盗。根据2009年Wardheer新闻的一份调查显示，索马里70%的沿海居民强烈认同，海盗作为一种国防形式保护了当地水域。由一些海盗组织的名称（如“国家志愿海岸警卫队”）也可以看出，海盗的前身实际上为渔民自发组织的民兵。然而在发现了抢劫的巨额利润后，当地武装部队的主要动机则发生了改变。