Den 21 juli 2008 rapporterade regeringskällor att Karadžić arresterats i Serbien och förts till Belgrads krigsförbrytardomstol. Karadžić har sedan år 1995 varit anklagad för krigsförbrytelser och var fram till gripandet efterlyst av den Internationella krigsförbrytartribunalen för det forna Jugoslavien i Haag. USA utfärdade en belöning på 5 miljoner dollar för Karadžics och Ratko Mladićs gripande. Den 24 mars 2016 dömdes han till 40 års fängelse för folkmord i Srebrenica, krigsbrott samt brott mot mänskligheten av krigsförbrytartribunalen i Haag.