В 1893 году, во времена династии Цин в Китае, Комура был поверенным в делах японской дипломатической миссии в Пекине. На этой должности он сообщил китайскому правительству о намерении Японии отправить войска в Корею в соответствии с положениями Тяньцзиньского договора, чтобы подавить восстание Тонгхак, которое привело к Первой китайско-японской войне. Во время войны Комура был назначен губернатором территорий, захваченных Японией в Маньчжурии. Он также был ключевой фигурой в переговорах об окончании войны, кульминацией которых стал Симоносекский договор, который он помог разработать.