На фронтах Німецько-радянської війни з квітня 1943 року. У складі полку пройшла всю війну від Сталінграда до Балтійського моря. Літала в екіпажі М. М. Федутенко, теж Героя Радянського Союзу. До кінця війни Антоніна Зубкова здійснила понад 50-и бойових вильотів. Після боїв у Східній Пруссії представлена ​​до присвоєння звання Героя Радянського Союзу.