През юни 1944 г. „Ямато“ взема участие в сражението във Филипинско море, като съединение, включващо също „Мусаши“ и ред други тежки кораби, действа пред своите самолетоносачи. На 19 юни „Ямато“ за първи път открива огън в бойна обстановка, но по-късно става ясно, че линкорът обстрелва собствената си авиация – за щастие, неефективно.