Am 29. September 1941 begann die Besetzung der Krim durch Truppen der Wehrmacht. In der Schlacht um die Krim (8. April bis 12. Mai 1944) gelang der Roten Armee die vollständige Rückeroberung der Halbinsel. Im Anschluss erfolgte die „Säuberung“ der Krim: Gemeinsam mit anderen nichtslawischen Minderheiten (zumeist Krim-Tataren, Armenier und Krimdeutsche) wurden die Archipel-Griechen von Balaklawa – wie alle ihre Landsleute auf der Halbinsel – 1944 auf Befehl von Stalin deportiert; nur Russen, Weißrussen und Ukrainer wurden ermutigt, dort zu siedeln.