Budynek powstał w połowie XIII w. jako młyn wodny, tzw. Trzeposz (niem.Treposch) i był własnością Torunia. W 1259 roku rada miasta przekazała młyn Zakonowi Krzyżackiemu (jako władzy zwierzchniej). Po wojnie 13-letniej król polski Kazimierz Jagiellończyk w tzw. przywilejach kazimierzowskich zwrócił go miastu. Młyn przez kilka stuleci był przebudowywany. Warto dodać, że do dziś zachowane są fragmenty ul. Droga Trzeposka, która niegdyś prowadziła do młyna.