Villasante besuchte 1936 das Noviziat Zarautz, als er wegen des Bürgerkriegs nach Gernika zurückkehrte. Er vertrat seinen Halbbruder José Gonzalo, der in einem Bataillon der Unión General de Trabajadores mobilisiert wurde. Während der Bombardierung am 26. April 1937 erlebte Luis mit seinem Vater, wie ihr Haus zerstört wurde.