Guðrún durchlief ab 2011 die isländischen Juniorinnenmannschaften. Mit der U-17 nahm sie im April 2011 an der zweiten Qualifikationsrunde zur UEFA U-17 EM teil und wurde beim 4:1-Sieg gegen Schweden eingesetzt. Da ihre Mannschaft auch gegen England und Polen gewann, waren sie für die Endrunde in der Schweiz qualifiziert. Hier verlor sie mit der Mannschaft im Halbfinale mit 0:4 gegen den späteren Europameister Spanien und dann auch das Spiel um Platz 3 gegen Rekordeuropameister Deutschland mit 2:8. Im Oktober unternahmen sie einen neuen Anlauf und konnten sich bei einem Turnier in Österreich mit Siegen gegen die Gastgeberinnen und Kasachstan sowie einem Remis gegen Schottland für die zweite Runde qualifizieren. Bei dieser konnten sie im April 2012 in Belgien zwar die Gastgeberinnen und England besiegen, durch eine Niederlage gegen die Schweiz verpassten sie aber die Endrunde. Sechs Monate später nahm sie mit der U-19-Mannschaft an der ersten Qualifikationsrunde und im April 2013 an der anschließenden Eliterunde der U-19-EM 2013 teil, bei der die isländische U-19-Mannschaft ausschied. Ebenso verlief die Qualifikation für die U-19-EM 2014, womit ihre Zeit in den U-Mannschaften endete.