Après avoir raté le podium au général en 2007, Neuner commence la saison 2007-2008 par une victoire en relais à Pokljuka en Slovénie en . Elle remporte sa huitième épreuve lors du départ groupé d'Oberhof en et une semaine plus tard le relais à Ruhpolding. Peu avant ses 21 ans, elle relève le défi de faire un rapide aller-retour sur le circuit junior et prendre part à ses quatrièmes et derniers mondiaux juniors qui se déroulent à domicile, à Ruhpolding en . Elle y remporte facilement le titre sur le sprint et sur la poursuite, les deux seules épreuves qu'elle avait prévu de disputer, afin de se réserver pour les prochains Championnats du monde seniors.