Однако Родс не имел прямой политической власти над независимой бурской республикой Трансвааль. Он часто не соглашался с политикой правительства Трансвааля, которую считал несовместимой с интересами владельцев шахт. В 1895 году, полагая, что он сможет использовать свое влияние для свержения бурского правительства, Родс поддержал рейд Джеймсона, неудачную попытку поднять восстание в Трансваале, получившую молчаливое одобрение государственного секретаря по делам колоний Джозефа Чемберлена. Рейд закончился катастрофическим провалом. Сесил Родс был вынужден уйти в отставку с поста премьер-министра Капской колонии, отправил своего старшего брата полковника Фрэнка Родса в тюрьму в Трансваале. Фрэнка признали виновным в государственной измене, это способствовал началу второй англо-бурской войны.