С началом Отечественной войны 1812 года получил назначение на пост начальника инженеров и офицеров путей сообщения в 1-м пехотном (отделённом) корпусе графа Петра Витгенштейна, принимал участие во всех битвах этого корпуса: под Клястицами, на реке Свольне, в первом сражении под Полоцком 17 августа и втором 18 октября, отвечая в первую очередь за техническое обеспечение войск. Одновременно руководил всеми военно-инженерными работами. Во многом благодаря его усилиям были оперативно построены пути и мосты для дальнейшего перемещения русской армии через Нищу, под Полоцком и через Двину. За свои труды был награждён орденами Св. Анны 2-й степени с алмазными знаками и Св. Владимира 3-й степени. 3 января 1813 года ему было присвоено звание генерал-майора. С 17 февраля того же года Сиверс возглавил Сапёрный полк.