После начала армяно-татарской резни Сепух направляется в Закавказье, где принимает участие во многих точках конфликта, в частности, в Елизаветполе. В Закавказье Сепух действует до 1908 года, с перерывом на 4-й съезд партии Дашнакцутюн, проходивший в Вене.