Erste internationale Erfahrungen sammelte Mercyline Chelangat bei den Crosslauf-Weltmeisterschaften 2015 in Guiyang, bei denen sie in der Juniorinnenklasse den 26. Platz belegte. Im Jahr darauf wurde sie bei den U20-Weltmeisterschaften in Bydgoszcz in 15:34,09 min Vierte im 5000-Meter-Lauf. Bei den Crosslauf-Weltmeisterschaften 2017 im heimischen Kampala wurde sie in der allgemeinen Wertung 12. und qualifizierte sich auch für die Weltmeisterschaften in London. Dort schied sie über 5000 Meter mit 15:16,75 min in der ersten Runde aus, während sie im 10.000-Meter-Lauf in 31:40,48 min auf Rang 13 einlief. Im Jahr darauf nahm sie erstmals an den Commonwealth Games im australischen Gold Coast teil und gewann dort in 31:48,31 min die Bronzemedaille über 10.000 Meter hinter ihrer Landsfrau Stella Chesang und Stacey Chepkemboi Ndiwa aus Kenia. Zudem wurde sie im 5000-Meter-Bewerb in 15:50,01 min Elfte. In den folgenden drei Jahren bestritt sie aufgrund einer Schwangerschaft keine Rennen, qualifizierte sich dann aber 2021 über 10.000 m für die Olympischen Sommerspiele in Tokio, bei denen sie nach 33:10,90 min auf Rang 24 gelangte.