Избранный членом национального конвента, он примкнул к монтаньярам и голосовал за смерть короля, хотя и держался в стороне от клуба якобинцев. После 9 термидора Тибодо стал одним из предводителей умеренной партии и настоял на возвращении удалённых депутатов, на отмене законов о подозрительных, о максимуме и др. В 1795 г. он был избран в президенты Конвента, затем в члены Комитета общественного спасения. 1 прериаля он высказался против крайних мер по отношению к виновникам, но тем энергичнее восставал против 13 вандемьера. Будучи одним из главных редакторов конституции III года, Тибодо был избран в Совет пятисот сразу 32 департаментами и был сначала секретарём, а затем президентом Совета (1796).