Пребывание в должности начальника Генштаба привело к совершению военных преступлений — резни в г. Нанкин и применение химического оружия. Приказы о применении химоружия были отданы маршалом Котохито летом и осенью 1937 г. во время взятия Шанхая, а также весной 1938 г. во время боёв во Внутренней Монголии. Способствовал смещению генерала С. Хаты с поста министра Сухопутных войск, что привело к падению кабинета Ёнаи летом 1940 г. После формирования кабинета Коноэ стал членом "Совещания Ставки и Кабинета " и поддержал подписание «Тройственного пакта». Осенью 1940 г. ушёл с поста начальника Генерального штаба, но остался членом Высшего военного совета и советником Императора по военным вопросам. Скончался от болезни в летней резиденции дома Канъин в Одаваре весной 1945 г.. Удостоен государственных похорон.