En 1809 Baviera fue otra vez a la guerra con Austria en el lado de Francia. Los Tiroleses se sublevaron contra la autoridad bávara y tuvieron éxito tres veces derrotando a las tropas bávaras y francesas que intentan volver a tomar la región. Austria perdió la guerra de la Quinta Coalición contra Francia y tuvo que firmar el tratado de Schönbrunn en 1809. Glorificado a menudo como ejecutaron al héroe nacional de Tirol, Andreas Hofer, el líder de la sublevación, en 1810 en Mantua, perdiendo una tercera y final batalla contra las fuerzas francesas y bávaras. Por el tratado firmado en París el 28 de febrero de 1810 el Tirol del Sur fue cedido por Baviera al Reino de Italia conformando el Departamento de Alto Adige y algunos pequeños distritos a Württemberg, recibiendo como compensación Salzburgo, el Innviertel, la mitad norte del Hausruck y los principados de Bayreuth y Ratisbona. La política de Montgelas había sido hasta ahora brillantemente acertada; pero la estrella de Napoleón ahora había alcanzado su cenit y el oportunista astuto había observado ya las muestras del cambio que venía.