Im Krieg gegen Österreich 1809 war das Regiment der 1. Infanterie-Brigade (1. Division Generalleutnant von Deroy) unterstellt. Nach dem Gefecht bei Offenstetten am 20. April 1809 erbeutete es zwölf Kanonen. Am 11. August 1809 erlitt das Regiment im Gefecht bei Schönberg zwanzig Tote und Verwundete, der Obristkommandant Oberst Johann Nepomuk Graf von Spaur geriet in Gefangenschaft. Im weiteren nahm es an den Gefechten auf dem Bergisel (13. August und 1. November 1809) teil. Am 5. Oktober 1809 besetzte das verstärkte I. Bataillon Berchtesgaden. Am 1. November 1809 erhielten die Schützen des II. Bataillons unter dem Kommando von Oberlieutenant Anton Heiligenstein von General Raglovich den Befehl, die Zillerhöfe zu nehmen, welches nach kurzem Feuergefecht gelang. Oberlieutenant Heiligenstein bemerkte auf dem rechten Zillerufer Verschanzungen der Tiroler, die bereits das Feuer auf die Zillerhöfe eröffneten. Er beschloss, diese Stellungen im Sturm zu nehmen, und rückte gegen die auf einer Anhöhe befindlichen Schanzen vor. Aus der Nähe erkannte er nun, dass er diese nicht ohne schwere eigene Verluste frontal einnehmen konnte. Er ließ ein Kleines Detachement im davor liegenden Wald zurück, das die Tiroler durch Störfeuer beschäftigen und ablenken sollte. Er selbst umging mit der Masse seiner Schützen die Stellungen der Tiroler links, griff mit heftigsten Feuer seiner neunzig Mann den Feind in seiner Flanke an und warf ca. 300 Tiroler aus ihren Verhauen und Verschanzungen. Eine zu Ambras besetzte tirolische Stellung war nun ebenfalls bedroht und musste geräumt werden. Diese Verschanzung wurde unverzüglich von bayerischen Truppen besetzt. Für seine umsichtige und kluge Disposition beim Kampf am Reiner- (auch Ziller-)Hof wurde er gemäß Armeebefehl vom 22. Oktober 1810 mit dem Ritterkreuz des Militär-Max-Joseph-Ordens ausgezeichnet. 1810 war die Garnisonsstadt des Regiments Salzburg.