১৯৯০ সালে, রাহমান তাজিক এসএসআরের সুপ্রিম সোভিয়েতের জনগণের সহকারী নির্বাচিত হন। ১৯৯২ সালের আগস্টে তাজিকিস্তানে গৃহযুদ্ধের প্রথম মাসগুলিতে রাষ্ট্রপতি রাহমান সোভিয়েত পদত্যাগ করতে বাধ্য হন। ভারপ্রাপ্ত রাষ্ট্রপতি হন সুপ্রিম সোভিয়েতের স্পিকার আকবর ইস্কান্দার । নাগরিক অস্থিরতা শেষ করার প্রয়াসে ইস্কান্দার ১৯৯২ সালের নভেম্বর মাসে পদত্যাগ করেছিলেন। একই মাসে, সুপ্রিম সোভিয়েত তার ১৬ তম অধিবেশনের জন্য খুজান্দে বৈঠক করে এবং তাজিকিস্তানকে একটি সংসদীয় প্রজাতন্ত্র হিসাবে ঘোষণা করে। রাহমান তখন সুপ্রিম সোভিয়েতের সদস্যদের দ্বারা চেয়ারম্যান হিসাবে নির্বাচিত হন - এটি রাষ্ট্রপতির সমতুল্য পদ - এবং সরকারপ্রধান।