Jonathan Papelbon joue en séries éliminatoires en 2005, 2007, 2008 et 2009. Le dans le match de la Série de championnat de la Ligue américaine face aux Rays de Tampa Bay, et malgré la défaite des Red Sox, Papelbon établit le record des majeures pour le plus grand nombre de manches éliminatoires lancées sans accorder de point en début de carrière, dépassant les 20 de Joe Niekro de 1980 à 1987. Il amène le record jusqu'à 26 manches sans accorder de point, avant de finalement céder un point aux Angels de Los Angeles un an plus tard, le , dans le match de la Série de divisions, qui marque d'ailleurs son dernier match éliminatoire joué avec Boston.