En 1988, le premier vol d'un appareil de série est prévu pour fin 1995 avec une livraison à partir de 1996. En 1990, la formation du escadron de l'Armée de l'air est repoussée de 1996 à 1999. En 1992, elle est reportée à 2000. Le , la flottille 12F de l'Aviation navale, basée sur la base d'aéronautique navale (BAN) de Landivisiau, est la première unité équipée de Rafale, mais elle demeure en phase d'expérimentation ; l'unité n'est opérationnelle que le après avoir participé à l'opération internationale Enduring Freedom.