Граница между Азербайджанской и Армянской ССР стала государственной границей в 1991 году после распада СССР и провозглашения независимости Арменией, Азербайджаном и Нагорным Карабахом в том же году. Азербайджан не признал независимость последнего, что привело к полномасштабной войне с Арменией. Она закончилась победой армянской стороны и прекращением огня в мае 1994 года. Под контролем Армении осталась большая часть Нагорного Карабаха, организованная как Нагорно-Карабахская Республика, и значительная часть собственно Азербайджана, включая стратегически важный Лачинский коридор. Осенью 2020 года в результате боевых действий Азербайджан восстановил контроль над оккупированными территориями и частью бывшей НКАО, а в Лачинском корридоре разместились российские миротворцы. Современная азербайджано-армянская граница в целом соответствует официальной границе советской эпохи. Отношения между двумя странами остаются крайне напряжёнными, и вдоль границы неоднократно вспыхивали боевые действия, наиболее крупные в 2008, 2010, 2012, 2014, 2016, 2018 и 2020 годах..