С 15 по 16 июля 2016 года в Турции часть турецких военных совершила попытку государственного переворота, который окончился неудачей. В организации переворота Эрдоган обвинил живущего в США проповедника Гюлена. В ходе переворота Эрдоган едва избежал гибели от рук путчистов в Мармарисе, откуда он успел незадолго до штурма отеля вылететь в Стамбул, погибли двое его охранников. Всего в ходе мятежа погибли 238 человек, ещё 3 тыс. получили ранения. Спустя полмесяца после мятежа общее число задержанных по обвинениям к его причастности в Турции достигло 26 тыс. человек, в тюрьме находились 2839 военнослужащих, 29 полковников были отстранены от службы, в их числе 5 генералов. Аннулированы паспорта у 75 тыс. человек. После подавления путча Эрдоган стал настаивать на восстановлении в Турции смертной казни, что вызвало конфликт с Евросоюзом, утрату перспектив членства в ЕС, а также отмены безвизового режима между ЕС и Турцией.