Im Oktober 1944 entstand aus dem MGK West das Marineoberkommando West. Der Befehlsbereich französische Südküste entfiel im Spätsommer 1944 wegen der Besetzung Südfrankreichs durch die Alliierten. Der Befehlsbereich Kanalküste wurde im September 1944 nach der Landung der Alliierten in der Normandie aufgegeben, und die eingeschlossenen Stellungen und Festungen in Frankreich wurden direkt dem MOK West unterstellt. Das Kommando des "Kommandierenden Admirals Atlantikküste" blieb als "Festungskommandant La Rochelle" bis zum Kriegsende bestehen. Dem MOK West unterstanden neben den Marinekräften die Atlantikbefestigungen und alle in den Festungsgebieten eingeschlossenen Verbände des Heeres und der Luftwaffe.