Profondément conservateur, le jeune prince participa à la répression des mouvements révolutionnaires qui mirent à mal les monarchies de la Confédération Germanique. À la tête d'un escadron de hussards, il participa au rétablissement de l'ordre ancien dans le Grand-duché de Bade. Gravement blessé à la bataille de Wiesenthal, le prince fut promu promu major par son oncle, le roi de Prusse Frédéric-Guillaume IV. En 1852, il fut promu colonel; en 1854, général de division; en 1856 lieutenant général. En 1860, il publia un ouvrage militaire intitulé : "Eine militärische Denkschrift von P. F. K". Promu général de cavalerie, Le prince Frédéric-Charles de Prusse participa à la seconde guerre du Schleswig contre le Danemark en 1864 et occupa le poste de commandant des troupes prussiennes dans les forces expéditionnaires austro-prussiennes.