Moins de quatre mois après sa démission, le , Pompée ouvre une école professionnelle libre, organisée sur le modèle de l'école Turgot mais dotée d'un internat. Il l'installe aux portes de Paris, à Ivry, dans un ancien château appartenant à la veuve de l'industriel Saget et situé rue de Seine (actuelle rue Lénine). Le succès de ce nouvel établissement, signalé au public par Charles Sauvestre dans "L'Opinion nationale", vaut à son directeur les palmes d'officier de l'Instruction publique en 1865, après une visite du ministre de l'Instruction publique, Victor Duruy. En 1867, Pompée est promu officier dans l'ordre de la Légion d'honneur en récompense de ses fonctions de commissaire et de juré de la section d'enseignement de l'Exposition universelle.