В первой же игре своего второго сезона в «Террапинс», 9 ноября 2012 года он выступал против действующего национального чемпиона Кентуккийскийского университета, во главе с потенциальным первым номером драфта 2013 года Нерленсом Ноэлем. Игра проходила в недавно открытом Барклайс-центре в Бруклине, Нью-Йорк. Лень оказывал давление на Ноэля на протяжении всего матча, набрав в итоге 23 очка + 12 подборов + 4 блок-шота, против 4 очков, 9 подборов и 3 блоков у Нерленса, хотя Кентукки и выиграли ту игру со счетом 72:69. 16 января 2013 года в матче против Университета Северной Каролины Алексей набрал 6 подборов и 10 очков, в том числе и совершил победный бросок за 0,9 секунды до конца матча. 16 февраля 2013 года Лень опять сыграл важнейшую роль в победе над Дьюкским университетом — 83:81. В той игре он набрал 19 очков + 9 подборов + 3 блок-шота, весь матч сдерживая звезду Дьюка Мэйсона Пламли, ограничив его результативность до 4 очков. Свой второй сезон в Мэриленде Алексей закончил уже с куда более яркой статистикой: 11,9 очка 7,8 подбора 2,0 блок-шота за матч. Реализация бросков Алексея со средней и ближней дистанции составила 53,4 %.