Bei der Zweiten Schlacht am Bull Run am 28. und 30. August 1862 attackierte er die Unionstruppen, durchbrach ihre Linien und zwang sie zum Ausweichen. Sechs Wochen später, bei der Schlacht am Antietam am 17. September 1862, wurde er am Oberschenkel verwundet. Die nächsten Schlachten, an denen er teilnahm, waren die Schlacht von Fredericksburg vom 11. – 15. Dezember 1862 und die Schlacht bei Chancellorsville vom 1. bis 4. Mai 1863. Bei der Schlacht von Gettysburg vom 1. – 3. Juli 1863 war die Division von Anderson an den Angriffen der Konföderierten am zweiten und dritten Kampftag beteiligt.