Tras una poco inspirada primera mitad de la temporada 2005-2006, cambió la táctica del equipo en lugar de jugar a la defensiva. El 26 de febrero de 2006, la Roma consiguió un nuevo récord de triunfos consecutivos (11) en la Serie A con una victoria 2-0 sobre la SS Lazio. Sin embargo, a finales de la temporada, la Roma no llegó al 4º lugar, siendo 5ª, por lo que no se pudo clasificar para la Liga de Campeones. Spalletti también alcanzó la final de la Copa de Italia contra el Inter durante la temporada 2005-2006, pero la perdió. Sin embargo, finalmente los romanos se clasificaron para la Liga de Campeones de la UEFA 2006-07, ya que la Juventus fue descendida a la Serie B y la Fiorentina y el AC Milan recibieron sanciones al restarles puntos como consecuencia del escándalo "Moggigate".