Im September 1939 wurde ganz Ostpolen, und damit auch Nowomalyn, wie im Geheimen Zusatzprotokoll des Hitler-Stalin-Pakts mit Deutschland vereinbart, von der Sowjetunion besetzt. Nach dem deutschen Überfall auf die Sowjetunion war die Ortschaft während des Deutsch-Sowjetischen Krieges vom Sommer 1941 bis Anfang 1944 von Deutschland okkupiert und in das Reichskommissariat Ukraine eingegliedert.