Il 29 giugno 2009, a seguito della scomparsa di Jackson, l'album è tornato in testa alle classifiche di tutto il mondo; solo negli Stati Uniti ha venduto oltre 349.000 copie in una settimana. Secondo "Nielsen Soundscan", la compilation ha venduto oltre 2 milioni di copie solo negli Stati Uniti, nei primi mesi dopo la morte dell'artista, raggiungendo la posizione numero 1 della classifica Top Catalog Albums di "Billboard". A distanza di un paio di mesi dalla morte del cantante, la "RIAA" ha certificato "Number Ones" triplo disco di platino negli USA. Nel 2016 è stato certificato 8 volte disco di platino nel Regno Unito.