В сборной Южной Кореи Чон дебютировал в 1980 году. 25 августа он забил свой первый гол в ворота Индонезии (3:0) в рамках Президентского кубка. В том же году он дошёл до финала Кубка Азии, где команда уступила Кувейту со счётом 3:0. В Кубке Азии 1988 года его сборная снова проиграла в финале, на этот раз Саудовской Аравии по пенальти со счётом 3:4. В 1988 году он также принял участие в летних Олимпийских играх. В 1990 году Чон со сборной отправился на чемпионат мира, где сыграл в матчах против Испании (1:3) и Уругвая (0:1). Южная Корея вылетела с турнира после группового этапа. В общей сложности в 1980—1990 годах Чон сыграл за Южную Корею 58 матчей и забил 21 гол.