Руководство США использовало Теракт 11 сентября 2001 года как повод для вторжения в Афганистан. Целью операции стало свержение режима талибов, которые укрывали у себя террориста Усаму бин Ладена. 7 октября Афганистан подвергся массированным авиационным и ракетным ударам, которые ослабляли силы талибов и способствовали продвижению вооружённой оппозиции Северного альянса, засевшей в горах Бадахшана. 9 ноября силы вооружённой оппозиции вошли в Мазари-Шариф, а 13 ноября — в оставленный талибами Кабул. 7 декабря пал последний оплот талибов город Кандагар. Вмешательство международного сообщества не позволило Северному альянсу взять власть в свои руки. В декабре созывается Лойя Джирга — совет старейшин афганских племён, на котором председательствует пуштун Хамид Карзай (с 2004 — президент Афганистана). Тем временем НАТО оккупирует Афганистан. Талибы переходят к партизанской войне.