A seguito della Strage di via D'Amelio, nell'attentato sparisce l'agenda rossa del magistrato Borsellino, un taccuino personale sopra cui lo stesso Paolo Borsellino avrebbe annotato le più importanti considerazioni e fatti che riguardassero la mafia nell'ultimo periodo (tra cui anche i possibili sospettati della strage di Capaci). Ayala fu uno dei primi ad arrivare sul luogo della strage, ma rese in proposito testimonianze discordanti, motivate (secondo quanto da lui dichiarato) dalla situazione di grande turbamento emotivo in cui si trovava. Ecco le versioni: