On pourrait croire que cette ingérence de plus en plus insistante de la part de la Russie, mais aussi des puissances occidentales, dans les affaires ottomanes aurait dû améliorer le sort des minorités chrétiennes dans l'Empire turc. Elles ne firent en réalité qu'éveiller des tensions nouvelles. Déjà, la Guerre d'indépendance grecque de 1821-1830 avait redéfini les droits politiques et religieux des sujets grecs encore soumis à la Sublime Porte, tandis que les conflits récurrents entre la Russie orthodoxe et l'Empire ottoman faisaient envisager aux populations musulmanes de ce dernier État leurs compatriotes grecs non plus seulement comme des infidèles, mais surtout comme des alliés objectifs de leur ennemi du nord. Même avec la promulgation de l"'Hattı hümayun" qu'Abdülmecit avait été contraint d'accorder en 1856 et qui offrait divers droits et privilèges aux chrétiens, la situation continua à aller de mal en pis. L'Empire ottoman de la seconde moitié du fut ainsi marqué par un essor du nationalisme qui aboutit, en 1908, à la prise du pouvoir par le parti des Jeunes-Turcs et la déposition du sultan Abdülhamid II. Il s'agissait certes bien pour le nouveau gouvernement de Constantinople de promouvoir des réformes inspirées des idées libérales occidentales, mais ce mouvement avant tout patriotique, n'entendait s'adresser qu'aux Turcs ethniques, et allait mettre fin plusieurs siècles de cohabitation pacifique entre musulmans et autochtones. La Première Guerre mondiale et les difficultés des Turcs face à la Triple-Entente allaient achever de briser le "modus vivendi" qui unissait encore populations chrétiennes et musulmanes en Asie mineure. Ainsi, Grecs et Arméniens furent-ils rejetés des unités combattantes et cantonnés à des tâches de logistique, suscitant de part et d'autre rancœurs et haines.