En 1994, le conflit entre le FLEC et l'Angola éclate à l'occasion d'une insurrection dont la répression fait de civiles et militaires. Par la suite, il y eut au Cabinda une résistance plutôt politique que militaire. En 2006, un cessez-le-feu est signé entre certains éléments du FLEC et l'Angola. À cette date, les séparatistes du FLEC affirment contrôler 85 % de l'enclave du Cabinda, ce qui était en contradiction manifeste avec les réalités. Le conflit armé se manifeste à nouveau au printemps 2010, lorsque des guérilleros attaquent un convoi de soldats angolais escortant un bus de footballeurs Togolais en route pour la Coupe d'Afrique des nations. L'attaque fit un mort parmi l'encadrement de l'équipe togolaise et les leaders du FLEC ne revendiquèrent pas cette action. S'ensuivit une répression dure de la part de l'Angola, et depuis 2006, il y a des actions militaires sporadiques de la part du FLEC, tandis qu'une résistance politique persiste. Malgré les démentis des autorités angolaises, qui cherchent à nier l'existence du conflit, la « guerre de libération » continue toujours au Cabinda.