Kristinusko tuli Kreikkaan pian varhaiskristillisellä ajalla apostoli Paavalin toiminnan kautta. Idän ja lännen kirkkojen erottua toisistaan Kreikka muodostui osaksi ortodoksisen kirkon aluetta. Katolilaisuus saapui Kreikkaan lännestä pysyvämmin neljännen ristiretken myötä vuonna 1204. Tuon jälkeen monet frankkivallan alla olleilla alueilla asuneet kreikkalaiset olivat virallisestikin jonkun aikaa katolisen arkkipiispan alaisuudessa, mutta kirkko säilytti itäisen luonteensa. Osmanivallan aikana turkkilaiset hallitsivat kreikkalaisia ortodoksisen papiston välityksellä. Katolinen suuntaus on säilynyt nykyaikaankin venetsialaisvallan alla pidempään olleilla alueilla. Kreikan vapaussodan ainakin symbolisena alkuna pidetään sitä, kun ortodoksinen piispa Germanos nosti itsenäisyystaistelun lipun vuonna 1821. Vapaussota sai paljon tukea luostareilta.