La sfârșitul celui de-al Doilea Război Mondial, Pecerski s-a intors la Rostov-pe-Don, unde a locuit înainte de război, și a lucrat ca administrator al unui teatru de operetă. Asasinarea în masă a evreilor în lagărul de exterminare de la Sobibor a făcut parte dintre acuzațiile aduse împotriva liderilor naziști la Procesele de la Nürnberg. Tribunalul Internațional de la Nürnberg a vrut să-l cheme ca martor pe Aleksandr Pecerski, dar guvernul sovietic nu i-a permis să călătorească în Germania pentru a depune mărturie.