Шаджар играла важную роль во время Седьмого крестового похода против Египта (1249—1250) после смерти своего первого мужа. Она возвела на престол своего пасынка, Туран-шаха. После того, как Туран-шах был свергнут, мамлюки выбрали Шаджар султаном Египта (2 мая 1250 года). Это ознаменовало окончание правления Айюбидов и начало эпохи мамлюков. Однако сирийские Айюбиды не признали султаном женщину, их поддержал аббасидский халиф аль-Мустасим, бывший высшим авторитетом для мусульман. По решению мамлюков Салихия (служивших султану ас-Салиху Айюбу) Шаджар ад-Дурр стала женой мамлюкского эмира Айбека. Конфликт с мужем из-за его первой жены, усугубившийся желанием Шаджар править за спиной мужа окончился убийством Айбека. Шаджар ад-Дурр была арестована. Через несколько дней её тело обнаружилось во рву под стенами цитадели Каира. Шаджар аль-Дурр похоронена в мавзолее, ранее построенном ею в Каире.