В &lt;a href="%D0%A7%D0%B5%D0%BC%D0%BF%D0%B8%D0%BE%D0%BD%D0%B0%D1%82%20%D0%90%D0%BD%D0%B3%D0%BB%D0%B8%D0%B8%20%D0%BF%D0%BE%20%D1%84%D1%83%D1%82%D0%B1%D0%BE%D0%BB%D1%83%202008/2009"&gt;сезоне 2008/09&lt;/a&gt; Эванс влился в основной состав «Юнайтед», заменяя при необходимости двух основных центральных защитников клуба, Рио Фердинанда или Неманью Видича. 17 сентября 2008 года Джонни сыграл в матче Лиги чемпионов против «Вильярреала», завершившегося безголевой ничьей, а четыре дня спустя дебютировал за «Манчестер Юнайтед» в Премьер-лиге в матче против «Челси», заменив в центре обороны дисквалифицированного Неманью Видича. Встреча закончилась со счётом 1:1. В декабре 2008 года Эванс выходил на замену в двух матчах на клубном чемпионате мира, включая финальный матч, в котором Видич был удалён в начале второго тайма.