Miyahira deltog i sitt första Skid-VM i Ramsau am Dachstein i Österrike 1999. Han lyckades vinna medalj i alla tävlingarna. I första tävlingen, laghoppningen, vann han en silvermedalj tillsammans med lagkompisarna Noriaki Kasai, Masahiko Harada och Kazuyoshi Funaki. Japan var endast 1,9 poäng efter segrarna från Tyskland och 81,5 poäng före Österrike. I tävlingen i stora backen vann Miyahira an bronsmedalj efter två tyska hoppare. Han var 3,0 poäng efter guldvinnaren Martin Schmitt och 1,5 poäng efter Sven Hannawald. I sista tävlingen, i normalbacken vann Miyahira en ny silvermedalj, denna gången endast 1,5 poäng efter guldvinnaren, landsmannen Kazuyoshi Funaki och 1,5 poäng före bronsvinnaren Masahiko Harada som säkrade en trippel för Japan.