Sovyetler Birliği'nin dağılmasından ve Ukrayna'nın bağımsız bir devlet olarak kurulmasından sonra, Metalist 1992 yılında Ukrayna Premyer-Liha'nın açılış sezonuna katıldı. İlk sezonda iki grupta oynanan ligde kendi grubunda 3. sırada yer aldı. Kulüp 2006-07 sezonunda ligi 3. sırada tamamladı ve 2007-08 UEFA Kupası birinci turuna katılma hakkı kazandı. Kulüp 2001 yılından bu yana ligde en çok beşinci sırada yer aldı.