Beal est le premier homme du comté d'Oxford à s'enrôler, et son unité de la milice devient la compagnie G du 1st Maine Infantry Regiment, une unité levée pour trois mois. Beal est nommé capitaine le . Pendant ces trois mois, il participe à la défense de Washington. Il quitte le service actif le . À la fin de son engagement, il s'engage à nouveau et est nommé colonel du 10th Maine Infantry le . L'unité est engagée pendant la campagne de la vallée de Stonewall Jackson en 1862, y compris lors de la bataille de Cedar Mountain. Beal est félicité pour la couverture réalisée par le 10th Maine de la retraite de l'armée de la Virginie de Nathaniel Banks, et plus tard, lors de la deuxième bataille de Bull Run, et celle d'Antietam, où un tireur d'élite abat blesse grièvement Beal et tue son cheval. La balle traverse la cuisse et se loge dans son pied gauche. Beal quitte le service actif avec son régiment le .