Fu signora attenta e sempre presente, sia nei momenti di assenza del marito sia in quelli di normale vita di corte. In varie occasioni si sostituì al duca per svolgerne le funzioni, ed in una di queste circostanze la sua azione fu determinante per salvare lo stato, quando, nel 1482, durante la guerra, i veneziani arrivarono a pochissima distanza dalle mura del castello e la città stava per capitolare. Il duca sembrava morente, affetto da una grave malattia e non in grado di guidare le forze nella difesa cittadina ed Eleonora in vari modi seppe infondere il necessario coraggio ai ferraresi. Del resto era sua abitudine dare in modo regolare udienza a tutti, senza differenze tra appartenenti alla nobiltà o al popolo, quindi conosceva perfettamente i suoi sudditi, che a loro volta, anche quando la criticavano, non potevano non riconoscerne le qualità.