Габриэль Ваханян родился в Марселе в семье беженцев от геноцида армян. Окончил лицей Валанса в 1945 году и протестантский богословский факультет в Париже. В Принстонской духовной семинарии получил степень магистра богословия в 1950 году и доктора философии в 1958 году за диссертацию «Протестантизм и искусство».