Eine Fliegerbombe traf am 11. April 1944 das Kaiserbad und zerstörte seine südliche Gebäudeflanke. Da es aber noch bewohnbar war, ging der Badebetrieb weiter. Im Oktober des gleichen Jahres wurde die Stadt von amerikanischen Streitkräften in der Schlacht um Aachen belagert und schließlich eingenommen. Kurz vor der Kapitulation Aachens legten Zerstörungskommandos noch Feuer im Kaiserbad, das dadurch fast vollständig ausbrannte. Lediglich die "Fürstenbad" genannte Prunkbadezelle blieb unzerstört. Nach Kriegsende war lange ungeklärt, was mit der Ruine passieren sollte, bis sie 1959 abgerissen wurde. Zunächst sollte an ihrer Stelle ein großes neues Badehotel errichtet werden, für das Grundstückszukäufe bis zur Ursulinenstraße vorgesehen waren. Da die in Frage kommenden Nachbargrundstücke aber an den Eschweiler Bergwerks-Verein verkauft wurden, zerschlugen sich die Pläne. Schließlich fällte der Stadtrat in einer Sitzung am 13. Oktober 1960 den Beschluss, an der Stelle der Kaiserbadruine ein neues, modernes Kur- und Heilbad ohne Hotelbetrieb zu errichten. Die Planungen sahen vor, das noch erhaltene "Fürstenbad" in den Neubau zu integrieren, deshalb wurde die Badezelle zunächst abgebaut und auf dem städtischen Bauhof gelagert. Baubeginn für das neue Kaiserbad war im August 1961. Die Kosten für das am 8. Juni 1963 eingeweihte Bad inklusive einer Sanierung der Quellfassung betrugen rund 3,75 Millionen DM. Es bot Kapazitäten für 400 Wannenbäder pro Tag und eine etwa gleich hohe Anzahl an Anwendungen von Bewegungstherapie, Fango, Trockenmassagen und Reiztherapie. Entgegen dem anfänglichen Vorhaben wurde das "Fürstenbad" nicht in den Neubau integriert, sondern im Sommer 1963 in die im Bau befindlichen Burtscheider Kurparkterrassen eingebaut.