1994 wurde Domingas von indonesischen Soldaten verhaftet und bedroht. Nach ihrer Freilassung gründete sie die Frauenrechtsorganisation Fokupers und warb für die Unabhängigkeit im Vorfeld des Unabhängigkeitsreferendums in Osttimor 1999. Als pro-indonesische Milizen und das Militär eine letzte Gewaltwelle gegen die Unabhängigkeitsbefürworter auslösten, musste Domingas mit ihrer Familie in die Berge fliehen. Nachdem die internationale Eingreiftruppe INTERFET wieder für Ruhe und Ordnung gesorgt hatte und die Vereinten Nationen die Verwaltung Osttimors übernahm, kehrte Domingas mit den anderen Flüchtlingen in die verwüstete Landeshauptstadt Dili zurück.