旧ゴアの都市は、15世紀にビジャープル王国によりマンドウィー川の辺に港として作られた。この都市は、ここより数キロ南に横たわるカダンバ朝及びヴィジャヤナガル朝の王たちに港として使われたゴヴァプリ (Govapuri) を置き換えるために建設されたもので、この都市はビジャープル王国を支配したアーディル・シャーヒー朝の第二の首都となった。この都市とシャー（王の称号）の宮殿、モスク、寺院は堀で囲まれていた。1510年、ポルトガル王国に征服されたことによりポルトガル支配下となり、ポルトガル領インドの行政府が置かれた。これ以降、この都市はポルトガル領インドの経済の中心かつ、ポルトガルのアジアにおける拠点となったが、1759年には総督の公邸が 9 km 西にある将来の首都となるパナジに移された。