Nel XVII secolo la "Rivoluzione scientifica" investì anche la chirurgia. L'utilizzo del microscopio, inventato in Olanda e perfezionato da Galileo, portò nel corso del secolo a numerose scoperte anatomiche da parte di medici come Marcello Malpighi (che identificò i capillari sanguigni e osservò i globuli rossi), Giovanni Maria Lancisi e altri: il microscopio venne usato anche in ambito clinico, ad esempio per effettuare autopsie.