El nuevo gobierno en 2004 recupera este órgano directivo bajo la denominación de Dirección General de Asuntos Internacionales de Terrorismo, Naciones Unidas y Organismos Multilaterales, órgano que asumía las competencias que originalmente tenía la dirección general pero con competencias sobre la promoción y protección de los derechos humanos a través de una Oficina de Derechos Humanos. Tras los ataques terroristas de 2004, el gobierno modifica la estructura del Ministerio creando la Dirección General de Asuntos Internacionales de Terrorismo, No Proliferación y Desarme y renombrado esta dirección general a Dirección General de Naciones Unidas, Derechos Humanos y Organismos Multilaterales.