Seppänen palasi kaudeksi 2006–2007 vuoden mittaisella Mestis-sopimuksella Kajaanin Hokkiin. Hän ja Petri Koivisto lähtivät kauteen niin ikään Joni Myllykosken haastajina. Seppänen jäi lopulta joukkueen kolmosmaalivahdiksi ja hän sai pelasi alkukaudella vain yhden ottelun. Seppänen haki pelituntumaa myös kahden ottelun verran Hokin A-nuorista, kunnes tammikuussa 2007 seura lainasi hänet loppukaudeksi toiseen Mestis-joukkueeseen, Jokipoikiin kuukauden loppuun asti kestävällä sopimuksella. Joukkue tarvitsi ensisijaisesti paikkaajaa talviuniversiadeihin lähteneelle Pekka Sorsalle. Lopulta Seppänen syrjäytti Sorsan Jokipoikien kakkosmaalivahtina ja jatkoi joukkueessa kauden loppuun pääasiassa Alexander Salákin aisaparina pelaten seitsemän runkosarja- ja yhden playoff-ottelun. Toukokuussa 2007 Seppänen teki Jokipoikien kanssa vuoden mittaisen jatkosopimuksen. Hän lähti kauteen 2007–2008 kanadalaisen Jocelyn Guimondin aisaparina. Kaksikko jakoi torjuntavastuun alkukaudella varsin tasaisesti, mutta Guimond ei kuitenkaan sopeutunut kilpailuasetelmaan ja siirtyi joulukuussa 2007 Vaasan Sportiin. Seppänen jatkoi loppukaudella Jokipoikien selkeänä ykkösmaalivahtina aisaparinaan A-nuorista nostettu Jasu Salminen.