En 1967, son nom fut modifié en Federal Aviation Administration, comme agence du Department of Transportation (DOT). L'épidémie de détournements des années 1960 l'impliqua dans le domaine de la sécurité des vols civils. C'est dans ce cadre qu'elle avait, en 1963, autorisé les pilotes à disposer en cabine d'armes à feu, ce afin de contrecarrer les menaces de détournement d'avions en relation, à l'époque, avec la crise de Cuba, à la condition que les pilotes suivent une formation à l'usage des armes approuvée par l'Agence. Cette liberté ne fut pas utilisée pour la raison qu'aucune compagnie aérienne ne fit de demande pour former ses pilotes. En , la FAA supprima cette autorisation sans fournir de justification. Elle refusa de répondre aux pilotes qui en demandèrent la raison.