В июне 1945 года генерал-полковник Иванов назначается начальником штаба Главного командования советских войск на Дальнем Востоке. За лето под его руководством была тщательно подготовлена операция по разгрому Квантунской армии. В ходе Маньчжурской операции умело руководил работой штаба, обеспечил непрерывное управление войсками, оперативно принимал решения по всем случаям изменения обстановки на фронтах.