Nach Ausbruch des Zweiten Weltkriegs schloss sich Blühová der Widerstandsbewegung an. 1942 wurde sie von einem nationalsozialistischen Spion enttarnt. Blühová tauchte daraufhin unter dem Pseudonym "Elena Fischerová" bis Kriegsende unter. 1944 beteiligte sie sich am slowakischen Nationalaufstand. Ihr Vater und viele Familienmitglieder wurden im Holocaust ermordet.