Na de reformatie bleef de kerk een religieus bouwwerk, al liet het in onderhoud te wensen over. Tijdens de Zweedse aanval op de stad in de Driekronenoorlog werd de domkerk verwoest. Het bisdom Hamar werd bij het bisdom Oslo gevoegd en pas in 1864 weer van Oslo gescheiden. Het herstel van het bisdom leidde tot de bouw van een nieuwe domkerk van Hamar.