Joni Ortio vertrat Finnland erstmals bei der World U-17 Hockey Challenge 2008 und verhalf der Mannschaft als Stammtorhüter im folgenden Jahr bei der U18-Junioren-Weltmeisterschaft zum Gewinn der Bronzemedaille. Bei den U20-Junioren-Weltmeisterschaften 2010 und 2011 stand er ebenfalls im Tor der finnische Auswahl und schloss das Turnier 2011 mit einer Fangquote von 93,1 Prozent als zweitbester Torwart hinter Jack Campbell ab.