La saison de l'an 2000 est la dernière saison pour Fatima Yusuf et son ambition est intacte, elle commence donc par prendre une troisième place aux championnats d'Afrique sur le 200 m, en 23 s 27. Sélectionnée pour les Jeux olympiques de Sydney, elle est éliminée en quart de finale (23 s 21) et met un terme à sa carrière, à 29 ans.