Freyburg entwickelte sich westlich neben einem Suburbium der Neuenburg (mit der Kirche St. Kilian) um das Jahr 1200 zu einer Stadt mit eigenem Pfarrer und der Stadtkirche St. Marien. Im Jahr 1229 wird dieses "Vriburc" als "oppidum" erwähnt und spätestens 1292 "civitas" genannt. Vermutlich ausreichend geschützt durch die östlich über der Stadt thronende Burg sowie die Unstrut im Süden und die Talhänge im Norden lassen sich kaum Aktivitäten bezüglich der Stadtmauer nachweisen. Allerdings haben auch zahlreiche Stadtbrände wichtige Unterlagen zerstört. Ähnlich wie in den Nachbarstädten Laucha (Obertor) und Naumburg (Marientor) wurde aber die bereits bestehende Stadtmauer in der Mitte des 15. Jahrhunderts im Zuge des Sächsischen Bruderkrieges deutlich ausgebaut. Sie erhielt 1437 bis 1455 Wälle und Gräben und die Stadttore wurden mit Barbakanen verstärkt. Im Jahr 1447 bewährte sie sich umgehend, als sie der zweiwöchigen Belagerung durch den sächsischen Kurfürsten Friedrich II. standhielt.