Dal 1982 al 1992 Izetbegović ha lavorato come consulente per lo studio "Konsalting" di Sarajevo. Dal 1991 al 2003 è stato direttore dell'ufficio per gli edifici pubblici per la città e poi il cantone di Sarajevo. Durante la guerra (1992-1995) ha fatto da segretario personale al padre, il presidente Alija Izetbegović.