Bij zijn wereldbekerdebuut, in januari 2003 in Innichen, scoorde Perathoner direct wereldbekerpunten. In december 2004 behaalde hij in Hermagor-Pressegger See zijn eerste toptienklassering in een wereldbekerwedstrijd. Op de FIS wereldkampioenschappen snowboarden 2011 in La Molina eindigde de Italiaan als zeventiende op de snowboardcross. In januari 2012 stond Perathoner in Veysonnaz voor de eerste maal in zijn carrière op het podium van een wereldbekerwedstrijd. In Stoneham nam hij deel aan de FIS wereldkampioenschappen snowboarden 2013. Op dit toernooi eindigde hij als negentiende op het onderdeel snowboardcross. De Italiaan was geselecteerd voor de Olympische Winterspelen 2014 in Sotsji, aldaar ging hij echter niet van start.