С распространением веб-комиксов стали появляться и профессиональные награды. В 2000 году на конкурсе Eagle Awards появилась категория «Любимый веб-комикс», а в 2001 году состоялось первое вручение премии Web Cartoonists' Choice Awards. В 2001 году Ignatz Awards также добавили номинацию «Лучший онлайн-комикс», но мероприятие было отменено из-за трагедии 11 сентября, впервые награждение состоялось лишь в 2002 году. В 2005 году категория «Лучший цифровой комикс» наконец появилась и на Eisner Awards, самой престижной премии в индустрии комиксов.