Im August 1941 wurde er zum stellvertretenden Kommandeur der Logistik an der Zentralfront ernannt und im Dezember 1941 bei der Jelezer Operation verwundet. Er war schon als Befehlshaber der Truppen des Nordkaukasischen Militärbezirks bestellt, konnte die Position aber nicht annehmen, weil er ins Lazarett musste. Seit Februar 1942 war er stellvertretender Kommandeur für neu Formationen der Westfront. Ab März 1942 befehligte er die 20. Armee der Westfront, die an der Rschew-Sytschewkaer Operation teilnahm. Bei dieser Operation erzielten seine Truppen anfangs Erfolge, indem sie die deutsche Verteidigung durchbrach und bis zu 40 Kilometer tief vordrang. Im September 1942 wurde Reiter zum Kommandeur der Brjansker Front ernannt. Er zeichnete sich im Frühjahr 1943 bei der Woronesch-Kastornoje-Operation aus, bei der seine Truppen die deutsche 2. Armee und die ungarische 2. Armee weit nach Westen zurückdrängten. Für diesen Erfolg erhielt er nicht nur den Suworow-Orden 1. Klasse, sondern erhielt am 30. Januar 1943auch den Rang des Generalobersten. Am 12. März 1943 wurde die Brjansk-Front aufgelöst und Rejter wurde zum Befehlshaber der neuen Reservefront ernannt, die am 23. März in Kursker Front umbenannt wurde. Schon am 28. März 1943 wurde die Brjansker Front wieder unbenannt und Reiter blieb Kommandeur. Seit Juni 1943 war er Befehlshaber der Truppen des Steppen-Militärbezirks und bereitete die Truppen auf die bevorstehende Schlacht im Kursker Bogen vor. Von Juli bis September 1943 war er stellvertretender Befehlshaber der Woroneschfront, mit deren Truppen er an der Belgorod-Charkower Operation beteiligt war. Aus unklaren Gründen wurde er im September 1943 von seiner Position abberufen, in Führerreserve versetzt und als Befehlshaber des Militärbezirk Südural aus dem aktiven Kommando abberufen.