À l'automne 1793, il est envoyé en mission dans les Pyrénées-Orientales en pleine Guerre du Roussillon. Il s'empare au cours de cette mission de grands pouvoirs, se mêlant de la stratégie militaire des généraux. Il n'hésite pas à participer aux combats et est même blessé avec son collègue Cassanyes. En septembre il nomme le général Dagobert commandant de l'armée des Pyrénées orientales. Mais celui-ci est vaincu à la Bataille de Trouillas par les Espagnols du général Antonio Ricardos.