Es folgten sechs weitere Transatlantiküberquerungen. Bei der ersten davon waren 800 britische Kinder an Bord, die nach Kanada evakuiert wurden. Am 15. November 1940 wurde die "Duchess of Atholl" erneut eingezogen und hauptsächlich für Truppenfahrten vom Clyde in den Mittleren Osten via Kapstadt genutzt. Im Mai 1942 nahm sie an der alliierten Eroberung von Madagaskar teil.