En 1099, los ejércitos cruzados capturaron Jerusalén, incluyendo Beit Hanina, masacrando a la población civil musulmana y empujando a huir a los supervivientes. Posteriormente volvieron para cultivar sus huertas y campos. Menos de un siglo después, en 1187, la ciudad fue recuperada por las fuerzas ayubíes de Saladino. Para asegurar una mayoría musulmana y proteger a la ciudad de otra futura cruzada, Saladino trajo poderosas tribus beduinas del desierto del Néguev y del norte del Hiyaz que se establecieron en la zona.