Po wybuchu II wojny światowej Perlikowski wraz z grupą komunistów zbiegł do Związku Radzieckiego, licząc na azyl ze strony tamtejszych komunistów. 17 września ZSRR dokonało jednak agresji na Polskę. Komuniści, którzy przedostali się do ZSRR, w tym Perlikowski, zostali przez nich zamordowani.