Als Angehöriger der Familie van Lynden, dem Dienstadel des Herzogtums Geldern zugehörig, führte ihn seine Militärlaufbahn an wechselnde Kriegsschauplätze: zunächst in den Diensten Karls V. gegen das Frankreich Heinrichs II. in das Artois und nach Italien (Italienische Kriege), dann in den Diensten der Republik Genua gegen das Osmanische Reich und die Barbareskenstaaten in das Mittelmeer (Türkenkriege im Mittelmeer). Später ging er in die Spanischen Niederlande, wo er Hauptmann und Superintendent von Culemborg (1568–1574) und Düren wurde. Im Auftrag des Fürstbischofs von Lüttich wurde er danach Gouverneur von Charlemont und Franchimont in den Ardennen, anschließend Oberhofmeister und Artilleriegeneral des Kölner Erzbischofs Ernst von Bayern im Truchsessischen Krieg, später noch Gesandter am Hofe Philipps II. von Spanien. Lynden war Ritter des Santiagoordens und benannte sich nach der von ihm erworbenen Herrschaft "Seigneur de Stoumont", ferner erhielt er das Baronat für sein dortiges "Schloss Froidcourt".