Im Fünften Koalitionskrieg, in der Schlacht von Regensburg am 23. April 1809, brannte das Kloster vor dem Schwarzen Burgtor (heute Dachauplatz) durch die Beschießung Napoleons nieder, nachdem französische Soldaten das Kloster geplündert hatten. Die damalige Äbtissin, Maria Aloysia Kerschensteiner, schilderte dieses Ereignis: