Im Jahr 1542 wurde im Lande zum ersten Mal die Reformation eingeführt. Als fünf Jahre später Karl des V. über die Schmalkaldischen Truppen siegte und Herzog Heinrich der Jüngere so in sein Herzogtum zurückkehren konnte, ordnete dieser wieder die Rückkehr zum katholischen Glauben an. Erst sein Sohn Herzog Julius führte 1568 die Reformation endgültig ein. Nach dem Vorbild von 1542 gehörte das Gebiet des heutigen Salzgitter zu den drei Generalsuperintendenturen Bockenem, Gandersheim und Wolfenbüttel. Niederfreden gehörte zu Bockenem und wurde Sitz einer Spezialsuperintendentur, zu dieser zählten insgesamt 21 Orte, darunter die benachbarten Kirchen von Oberfreden, Osterlinde, Lesse und Reppner.