Si ce scandale n'a pu manquer d'avoir un impact sur l'orgueilleuse Isabelle, d'autres sujets de préoccupations habitent la jeune femme en Angleterre. Au nord, la situation tourne au pire lorsqu'en , Édouard tente de repousser les Écossais dans une nouvelle campagne, qui s'achève par la catastrophique bataille de Bannockburn. Les barons rejettent la responsabilité de l'échec sur le roi et le contraignent dès le mois de à accepter de gouverner avec l'aide du comte de Lancastre. Isabelle reste loyale envers son époux et freine l'influence de Lancastre à la cour en approfondissant ses liens avec ses ennemis, les Beaumont. Lancastre, fort de son nouveau pouvoir, se retourne immédiatement contre sa nièce et son entourage, réduisant le train de sa maison, qu'il harcèle. Parallèlement, la « Grande Famine » s'abat sur l'Angleterre entre 1315 et 1317, provoquant une importante mortalité et accroissant les problèmes financiers. Malgré la naissance de son second fils Jean d'Eltham, le , puis de sa fille Aliénor de Woodstock, le , la situation d'Édouard reste précaire. Dès , l'habileté d'Isabelle est de nouveau requise quand, avec l'aide du comte de Hereford, elle aide à la conclusion d'une paix provisoire entre Édouard et son oncle Thomas de Lancastre. En , elle participe également aux négociations du traité de Leake.