Nach der durch den NSDStB erzwungenen Auflösung des Corps im Wintersemester 1935/36 pflegte Germania einen Teil ihrer Traditionen gemeinsam mit dem Corps Vitruvia, mit dem ja seit langer Zeit besonders enge Beziehungen bestanden hatten, in der "Kameradschaft" "Andreas Hofer" so gut es eben ging weiter, eine Wiedererrichtung des Corps in seiner alten Form lag zu dieser Zeit außerhalb der denkbaren Möglichkeiten. Mensuren beispielsweise wurden in dieser Zeit – unter anderem wegen der damit verbundenen Gefahr des Verlustes der Fähigkeit zur Verbeamtung der Beteiligten – nur noch sehr selten und unter strikter Geheimhaltung gefochten, die Nationalsozialisten hatten auch vor dieser für die Corps essentiellen Frage nicht halt gemacht. In diese Zeit fällt auch der Verlust von 21 Corpsbrüdern an allen Kriegsfronten des Zweiten Weltkrieges. Allein in der Schlacht von Stalingrad fielen drei Germanen.