L'Università Sun Yat-sen iniziò ufficialmente le sue lezioni il 7 novembre 1925, l'ottavo anniversario della rivoluzione d'ottobre. L'università fu istituita dividendo il dipartimento cinese dall'Università Comunista dei Lavoratori dell'Est, alla quale erano iscritti circa 100 studenti cinesi. Prese il nome da Sun per rispetto al suo contributo alla rivoluzione cinese.