In der JSPC wurde der R87E vorerst nur bei einem einzigen Lauf, dem 500-km-Rennen in Fuji, eingesetzt. Dies war die einzige Möglichkeit für das Team, um sich und das Fahrzeug unter Rennbedingungen für den Le-Mans-Einsatz vorzubereiten. Diese Trainingszeit wurde allerdings durch den Ausfall des Wagens wegen eines Motorschadens noch zusätzlich verkürzt. Trotz der geringen Erfahrung aus nur diesem einzigen Rennen ging das Nissan-Werksteam beim 24-Stunden-Rennen von Le Mans 1987 an den Start. Zwei R87E und ein privat eingesetzter Vorjahres-R86V nahmen daran teil, allerdings erreichte keiner der Boliden das Ziel. Der Wagen des Privatteams Italya Sports mit der Startnummer 29 musste nach sieben Stunden und 86 Runden wegen eines Unfalls aufgeben, während die beiden neuen Nissan mit technischen Problemen zu kämpfen hatten. Schließlich schieden beide R87E nach 16 Stunden Renndauer aus, #32 mit 117 gefahrenen Runden wegen Getriebe- und Elektronikproblemen und #23 mit 181 Runden aufgrund eines Motorendefektes. Nach diesem niederschmetternden Ergebnis wurde der R87E noch einige Male in Japan eingesetzt, wobei ein Zieleinlauf auf der 8. Position die beste zu verzeichnende Platzierung darstellte.