La temporada &lt;a href="Primera%20Divisi%C3%B3n%20de%20Espa%C3%B1a%201999/2000"&gt;1999/2000&lt;/a&gt;, con Héctor Cúper como técnico, se inició con la conquista de otro título, la Supercopa de España frente al FC Barcelona, y con la llegada de otro veloz compañero, el Kily González, pero tuvo un mal comienzo con cuatro derrotas consecutivas. Aun así el equipo cosechó un magnífico debut en la Liga de Campeones de la UEFA y fue superando eliminatorias con Claudio López como máximo goleador del equipo en esta competición con 5 goles, más uno en la fase previa, y alcanzó en su primera participación disputar la final contra el Real Madrid el 24 de mayo de 2000, sin poder alzarse con el título pese a que el Valencia había demostrado un juego de mayor calidad y efectividad durante toda la competición. En la Liga el equipo remontó el vuelo y finalizó 3.º, nuevamente en puestos de Liga de Campeones, y con Claudio López como segundo máximo goleador del equipo en Liga con 11 goles, dos menos que Gaizka Mendieta. Se despidió de la afición valencianista en Mestalla el 19 de mayo de 2000 en el último partido de Liga contra el Real Zaragoza, con victoria valencianista por 2 a 1 y con el Piojo anotando el gol del triunfo. Fue despedido ovacionado por la afición mientras daba una vuelta al césped entre lágrimas, con una bandera valenciana y dando las gracias a la afición por todo su cariño, ya que se conocía ya su venta a la SS Lazio de Italia. Caló profundamente en el corazón de la afición valencianista.