Considera que Francia debe mantener tropas en el Sahel y que la operación militar debe mantenerse pero pide apoyo a Alemania y a otros países europeos. Su segundo viaje exterior tras asumir la presidencia del país, después de Alemania, fue para visitar las tropas francesas que se encuentran en Malí. Viajó con Sylvie Goulard, ministra de los Ejércitos, y con el ministro de Europa y de Asuntos Exteriores, Jean-Yves Le Drian impulsor, como ministro de Defensa en el gabinete anterior de Hollande, de la intervención militar en Mali que comenzó en enero de 2013 bajo el nombre de Operación Serval y que continúa, ampliada a la región del Sahel (Malí, Burkina-Faso, Mauritania, Níger y Chad) bajo el nombre de Operación Barkhane desde agosto de 2014. También viajó el director general de la Agencia francesa de Desarrollo, Rémy Rioux. Macron aseguró que la lucha militar contra el yihadismo va de la mano con el desarrollo.