Peu après l'invasion allemande de la Belgique, il fut membre, en septembre 1940 du "", un conseil consultatif de la Ligue nationale flamande (VNV). Durant l'été 1941, il s'engagea dans la Légion flamande (l'unité de volontaires flamands) pour y diriger un hôpital de campagne sur le front de l'est. Se rendant compte que la Légion Flamande combattait comme unité de la Waffen-SS, Daels se retira et devint critique envers le VNV. En 1942, il démissionne du "Raad van Leiding" et en 1943 rend sa carte de membre.. À la libération de la Belgique en 1944, il fuit avec l'aide de différentes instances ecclésiastiques en Suisse. En 1946, il fut condamné par contumace à la peine de mort pour sa collaboration. Les biens de sa famille furent saisis, y compris un terrain et une villa à Knokke. En 1959, Daels fut autorisé à revenir en Belgique.