La investigación de Hoffmann se centra en el desarrollo social y político América Latina y el Caribe. Es experto en Cuba y ha publicado numerosos artículos y libros que analizan la. transformación política, social y económica del país desde 1989. Hoffmann interpreta la sucesión de Fidel Castro a Raúl Castro en 2006 como la transición del "socialismo carismático" al "socialismo burocrático", que promete una reforma económica gradual y una mayor eficiencia administrativa que en el anterior modelo de liderazgo personalizado.Un reciente proyecto de investigación examinó el surgimiento de nuevas desigualdades sociales y raciales en la isla. Basándose en una encuesta realizada a más de 1000 entrevistados en todas las provincias, el proyecto encontró diferencias notables con respecto a los ingresos, la participación en el pequeño sector privado de la economía, los viajes, el acceso a Internet y otros indicadores de la isla que, en muchos aspectos, hacen eco de las jerarquías socioeconómicas de la Cuba prerrevolucionaria. Si bien después de la Revolución de 1959 el sector estatal de la economía había sido el motor de la movilidad social, la depresión de los salarios estatales le ha dado la vuelta a este proceso. La investigación encontró que el acceso a las remesas de los emigrantes como capital inicial para los negocios privados y la posibilidad de obtener una ciudadanía extranjera son activos cruciales, que están altamente sesgados hacia los cubanos "blancos", en detrimento de los afrodescendientes.