Embora não tenha oferecido apoio aos rebeldes, o governo queniano teria ficado desapontado com o fracasso da invasão. Consequentemente, continuou a dificultar as atividades dos exilados anti-Amin, mas os exilados continuaram a se organizar e conspirar contra o governo ugandense a partir do Quênia. Amin foi deposto durante a Guerra Uganda-Tanzânia de 1978-1979. Os exilados ugandenses, incluindo grupos baseados no Quênia, apoiaram os tanzanianos durante o conflito. O suposto apoiador do Movimento de Libertação de Uganda, John Ruhinda, juntou-se ao Exército de Libertação Nacional de Uganda pró-Tanzânia durante a Guerra Uganda-Tanzânia.