Уния не имела поддержки среди большинства духовенства и паствы. В 1696 году (впервые зафиксировано в письме от 5 сентября 1696 года) архиепископ Марамурешский (Мараморошский) Иосиф (Стойка) получает от несогласных с унией клириков титул экзарха «всей Угорской страны», хотя по другой версии он получил этот титул от Константинопольского патриарха ещё в 1693 году. По некоторым данным, в 1694 году владыка Иосиф заключил соглашение соглашение с кальвинистами (Трансильванской реформатской консисторией) о совместной борьбе экспансии католицизма. После отступничества митрополита Афанасия архиепископ Иосиф направляет ему обширное послание на румынском языке с обличением унии и папизма (текст не сохранился). Владыка Иосиф вёл активную антикатолическую деятельность, с его благословения проводятся антиуниатские церковные соборы. 5 марта 1705 года архиепископа Иосифа арестовывают и заключают при замке в Хусте. В конце 1706 года епископом Мараморошским был избран Иов (Цирка). Воспользовавшись Восстанием Ракоци, в начале 1707 года владыка Иов смог ненадолго восстановить митрополию в Алба-Юлии, а Афанасий (Ангел) был изгнан в Сибиу. По причине военных неудач венгров, в конце 1707 года Иов, заочно приговорённый австрийцами к смертной казни, бежал в Молдавское княжество. Иосиф (Стойка) продолжал нелегальную деятельность по окормлению православных общин до своей смерти в 1711 году.