С началом Великой Отечественной войны в Сибирском ВО была спешно сформирована 24-я армия, которая уже в июле 1941 года прибыла под Вязьму и вошла в состав Фронта резервных армий (с 30.07.1941 — Резервный фронт). Полковник Моисеевский был назначен начальником отдела боевой подготовки этой армии. Участник Смоленского сражения, в том числе Ельнинской наступательной операции. С 11 сентября 1941 года — командир 303-й стрелковой дивизии этой армии. В начале немецкого генерального наступления на Москву (операция «Тайфун») попал в окружение в Вяземском котле 5 октября 1941 года, в ноябре создал из бойцов-«окруженцев» партизанский отряд, стал его командиром и действовал с ним в Можайском районе Московской области.