Yoshinobu s-a bucurat de relații bune cu Ishida Mitsunari și s-a alăturat Armatei de Vest în timpul bătăliei de la Sekigahara ; pentru aceasta a fost pedepsit de Ieyasu, care i-a redus feuda la doar 180.000 "koku" și l-a transferat în Domeniul Kubota, din provincia Dewa .