В 1997 году был переизбран в Национальную ассамблею, назначен на должность председателя Приватизационной комиссии Пакистана со статусом министра во время второго правительства премьер-министра Наваза Шарифа. В 1999 году Хаваджа Асиф был отстранён от должности после военного переворота под руководством генерала Первеза Мушаррафа. Национальное бюро подотчётности взяло Асифа под стражу по обвинениям в коррупции, но позже он был освобождён из-за отсутствия улик. Хаваджа Асиф сотрудничал с Навазом Шарифом во время правления Мушаррафа для того, чтобы сохранить Пакистанскую мусульманскую лигу (Н).