12 февраля 2013 года в игре против Флориды, Ноэль порвал связки левого колена, после блокировки лей-апа игрока противоположной команды и выбыл на оставшуюся часть сезона. До своей травмы он считался потенциальным первым номером драфта 2013 года. Несмотря на свою травму, 15 апреля 2013 года Нереленс объявил о том, что выставляет свою кандидатуру на предстоящий драфт. По итогам сезона Ноэль был выбран в сборную новичков, также туда вошли Энтони Беннетт из университета Невады, Шабазз Мухаммад из УКЛА, Маркус Смарт из университета Оклахомы и игрок Канзасса Бен Маклемор.