No tal referendo nos inícios de 1963, o regime anuncia que 5.598 711 pessoas votaram pelas reformas e apenas 4.115 contra as reformas Se bem que os resultados aparentem uma grande popularidade, há uma enorme controvérsia em relação à sua exatidão e sucesso, terá havido inúmeras fraudes.Em junho de 1963, o ayatollah Ruhollah Khomeini, um dirigente de Qom foi preso depois de um discurso em que atacava direta e duramente o Xá (considerando-o um infiel); seguiram-se uma série de tumultos, os mais violentos desde a queda de Mossadegh uma década antes. Ruhollah Khomeini seria obrigado a exilar-se, primeiro na Turquia e mais tarde em França, de onde regressaria em 1979. O xá reprimiu com violência os tumultos e o governo aparentemente conseguiu derrotar os opositores, mas na clandestinidade o clero começou a preparar a oposição ao Xá e foi o fermento para a Revolução Iraniana de 1979. O que irritava o clero xiita foi a perda de influência na educação (tendia a ser secular e afastado dos princípios basilares do Islão), economia (perda de rendimentos) e das tradições milenares (os direitos das mulheres).