Dandolo trug den Titel eines separaten Herrn, weit weg von Venedig, und so passt es ins Bild, dass er nach seinem Tod am 1. Juni 1205 in der Hagia Sophia beigesetzt wurde, nachdem er noch kurz zuvor an einer erfolglosen Expedition gegen die Bulgaren teilgenommen hatte. Nach Venedig gelangte alles Erdenkliche: Marmor und Porphyr, exotische Tiere, Kunstwerke und vor allem zahllose Reliquien. Aber die Urne Dandolos blieb in Konstantinopel. Seine Asche soll von Mehmed II., dessen Armee Konstantinopel 1453 eroberte, verstreut worden sein. Die Grabinschrift ließ er möglicherweise bestehen.