עם תום חוזהו, לקראת עונת , עבר אויפלושי בהעברה חופשית לאתלטיקו מדריד הספרדית. בספרד חזר לשחק בעיקר כמגן ימני. בעונתו הראשונה בקבוצה סייע לה לסיים במקום הרביעי, כמו בעונה הקודמת, ולהעפיל לליגת האלופות. עונה אחר כך, למרות שסיימה רק במקום התשיעי בליגה, זכתה הקבוצה בטורניר הליגה האירופית הראשון בהיסטוריה, לאחר שהחליף את גביע אופ"א. אויפלושי פתח בהרכב אתלטיקו למשחק הגמר, בו ניצחה את פולהאם בתוצאה 2-1. עם פתיחת עונת , השלימה הקבוצה את הזכייה במשחק הסופר קאפ האירופי, כשניצחה את אלופת אירופה אינטר מילאן בתוצאה 2-0. אויפלושי פתח בהרכב קבוצתו במשחק. ב-19 בספטמבר 2010, בזמן הפציעות של הפסדה של אתלטיקו לברצלונה, הורחק אויפלושי בכרטיס אדום ישיר לאחר עבירה על ליונל מסי, שפצעה אותו בקרסול הימני. בעקבות ההרחקה הושעה אויפלושי על ידי ועדת המשמעת של הליגה לשני משחקים נוספים.