Берриган по-прежнему придерживался своих активистских корней на протяжении всей своей жизни. Он продолжал выступать против вмешательства США за рубежом, от Центральной Америки в 1980-х годах через Войну в Персидском заливе в 1991 году, Косовскую войну в 1999 году, вторжение США в Афганистан в 2001 году и вторжение в Ирак в 2003 году. Он также был решительным противником смертной казни, одним из редакторов журнала "Sojourners" и сторонником движения Occupy. По его мнению, «злодеяния капитализма так же очевидны, как злодеяния милитаризма и злодеяния расизма».