Дэниел Маллен выступал за сборную Австралии в разных возрастных категориях. Дебют Маллена за взрослую команду состоялся в квалификационном матче Кубка Азии 2011 года в марте 2009 года — он вышел на поле в игре против сборной Кувейта.