Після чемпіонату Європи 2008 року, що пройшов у Києві, відбувся допінг-скандал. Андреа Бальдіні не зміг успішно пройти перевірку на допінг: результат допінг-проби показав присутність забороненого препарату — фуросеміду. Після відкриття допінг-проби «В», яка також стала позитивною, стало зрозуміло, що італієць не зможе взяти участь у Оліміпійських іграх (замість нього на ігри поїхав Андреа Кассара), він також був виключений з протоколу особистих змагань чемпіонату Європи і разом з товаришами по команді позбавлений золотих нагород чемпіонів Європи у командній першості. Чемпіонами стали рапіристи Польщі. Пізніше, у квітні 2009 року, на засіданні антидопінгової комісії FIE, що проходило у Белфасті, було вирішено дискваліфікувати Бальдіні на 6 місяців, починаючи з 3 вересня 2008 року, це означало, що на момент засідання час дискваліфікації вже сплинув. Сам Бальдіні не визнав факту вживання забороненого препарату.