В апреле 2004 года Худорошкину уличили в применении допинга и дисквалифицировали на два года. В 2006 она вернулась в спорт и на чемпионате Европы стала 7-й. Через год на чемпионате Европы в помещении Ирина выиграла свою вторую серебряную медаль. На пекинской Олимпиаде Худорошкина показала скромный результат и стала лишь 25-й в квалификации.