29 сентября 1962 года, через год после распада Объединённой Арабской Республики президент Насер назначил министра по делам президентства Али Сабри Председателем Исполнительного Совета ОАР — главой правительства Египта. Одновременно Насер поручил ему возглавить работу по созданию правящей партии — Арабского Социалистического союза (АСС) и ввёл его в состав Высшего исполнительного комитета АСС. В качестве главы правительства Сабри активно участвовал в международных делах. В январе 1963 года он вместе с премьер-министром Цейлона Саримаво Бандаранаике и министром иностранных дел Ганы Уильямом Офори-Атта участвовал в переговорах Дели по урегулированию конфликта между Индией и Китаем.