Er war im Dienste des Fürstbischofs von Lüttich und des Heiligen Römischen Reiches auf der Seite Kaiser Karls V. Er befahl Truppen während des Achtzigjährigen Kriegs und des Truchsessischen Kriegs. Von Lynden war Inhaber wichtiger Positionen im Hochstift Lüttich, besetzte 1584 Bonn und war Gouverneur von Köln im Jahre 1592.