이때부터 안티오키아 후국은 외부적으로는 십자군 전쟁에서 중요한 역할을 하지 못하고 내부적으로는 후국의 지배권을 놓고 내분에 휩싸였다. 1187년 살라흐 앗 딘의 예루살렘 공격 당시 안티오키아는 이탈리아 도시국가들의 연합함대의 도움으로 무사했지만 이어 벌어진 제3차 십자군 전쟁 때는 아무런 역할을 하지 못했다. 레몽과 콩스탕스의 아들인 보에몽 3세가 후국을 지배했고 그의 아들 보에몽 4세는 하틴 전투 이후 트리폴리 백국의 섭정이 되었다. 1201년 보에몽 3세가 죽자 보에몽 4세와 형제 레몽 뤼펭은 후국의 지배권을 놓고 다투었다. 그사이 보에몽 5세와 보에몽 6세를 거치는 동안 제5차 십자군, 신성로마제국의 프리드리히 2세의 제6차 십자군, 프랑스의 루이 9세의 제7차 십자군 전쟁이 일어났지만 안티오키아 후국은 아무런 역할을 하지 못했다.