В 1986 году парагвайцы, ведомые Хулио Сесаром Ромеро, впервые в своей истории вошли в число 16 лучших команд мира. Турниры 1990 и 1994 гг. Парагвай пропустил, а начиная с 1998 года сборная этой страны стала относиться к числу постоянных участников «мундиаля». Главной звездой в 1998 году был вратарь-бомбардир Хосе Луис Чилаверт, признанный лучшим голкипером турнира (наряду с Фабьеном Бартезом). В 1999 году страна впервые провела Кубок Америки, однако дальше 1/4 финала «полосатым» продвинуться не удалось. В 2002 году Парагвай во второй раз подряд вышел в 1/8 финала ЧМ, чего не смог повторить в 2006.