La temporada 1990-91 comenzó de buena forma tras ganar la Supercopa de Italia al vencer 5-1 a la Juventus. La liga sin embargo, fue algo decepcionante, el equipo terminó 7° luego de haber sido campeones de la última temporada. No pudo ganarle a sus rivales del norte (Juventus, Inter y Milán) y tampoco al AS Roma, con quien disputa el "derby del sole". El 17 de marzo de 1991, por la fecha 25ª, el Napoli le ganó por 1:0 al Bari con gol de Gianfranco Zola. Tras el partido Maradona fue elegido para el control antidopaje, que finalmente daría positivo por cocaína. La Federación italiana le impuso una sanción que lo alejaría de los estadios durante quince meses, sanción que fue ratificada por el Comité de Apelación. En 1991, después de lo ocurrido, Maradona se fue de Napoli, y el equipo entró en una lenta pero constante decadencia.