Ely do Amparo gab am 3. April 1949 beim Auftaktspiel zur Copa América 1949, einem 9:1-Erfolg gegen Ecuador, sein Länderspieldebüt in der brasilianischen Nationalmannschaft. Im weiteren Turnierverlauf kam er zumeist an der Seite von Danilo Alvim und Noronha zu vier weiteren Einsätzen, darunter im Entscheidungsspiel um den Titelgewinn, als durch ein 7:0 gegen Paraguay zum dritten Mal die Kontinentalmeisterschaft gewonnen wurde. Ein Jahr später gehörte Ely auch bei der Weltmeisterschaft im eigenen Land zum brasilianischen Aufgebot. Während des Turniers, in dem der Titel im letzten und entscheidenden Gruppenspiel, das als Maracanaço in die Geschichte einging, gegen Uruguay verloren wurde, kam Ely lediglich in der Vorrunde bei einem 4:0-Erfolg über die Mexikaner zum Einsatz. Einen Monat vor Turnierbeginn gehörte er noch zur Stammformation, als Uruguay im Rahmen der Copa Río Branco in drei Spielen bezwungen wurde.