Während des Russisch-Österreichischen Türkenkrieges begleitete er Generalfeldmarschall Burkhard Christoph von Münnich als Historiograf und verfasste nach Kriegsende mehrere Schriften zu dessen Feldzügen. Auf Bitte von Münnich wurde er nach Kriegsende Aufseher des Salzbergwerks und der Salzgewinnung in Bachmut. Um die Förderung, die Verarbeitung und den Handel von Salz in Russland zu verbessern, wurde Juncker im Herbst 1737 zu Studienzwecken nach Deutschland geschickt. Er blieb für etwa zwei Jahre dort und kam an der Bergakademie Freiberg in Kontakt mit Michail Lomonossow, der sich dort auf den Gebieten Mineralogie, Bergbau und Hüttenwesen weiterbildete und auch dichterisch aktiv war.