Además de proporcionar una crónica de primera mano de la Restauración, el diario de Pepys es notable por sus relatos detallados de varios otros eventos importantes de la década de 1660, junto con el menos conocido Diario de John Evelyn. En particular, como ya se ha señalado, es una valiosísima fuente para el estudio de la Segunda Guerra anglo-neerlandesa de 1665-7, la Gran Peste de 1665, y el Gran Incendio de Londres en 1666. En relación con la peste y el fuego, Robert Latham (el compilador de la edición definitiva del diario), comentó que: ""Sus descripciones de ambos hechos —agónicamente vívidos— logra su efecto por ser algo más que la presentación de informes superlativos; ... que se escriben con compasión. Como siempre con Pepys, son las personas, no los efectos literarios, la cuestión principal"."