У Жана от брака с Марией Орлеанской было двое детей. Сын, Гастон де Фуа (1489—1512), в 1506 году обменял Этамп и Нарбонну королю на Немурское герцогство, став, таким образом, пэром Франции. Во время войны Камбрейской лиги Гастон проявил себя как талантливый полководец, одержав несколько побед в Италии, но в 1512 году погиб в битве при Равенне. Женат он не был, детей не оставил. Его сестра Жермена де Фуа (1488—1538) в 1505 году вышла замуж за короля Арагона Фердинанда II, овдовевшего после смерти Изабеллы I Кастильской. В 1512 году Фердинанд, прикрываясь её правами на наваррский трон, оккупировал большую часть Наварры.