Nella prima fase della sua carriera nell'opposizione politica (1900-1908), cercò l'unità tra cristiani e musulmani e incontrò i capi dei rispettivi gruppi. Ricevette sostegno nella causa dei Giovani Turchi e durante questo periodo, incontrò Edmond Demolins, divenendo un seguace della scuola di scienze sociali. Sabahaddin sosteneva le politiche economiche liberali nella sua Società per l'iniziativa privata e il decentramento, che divenne una rivale del Comitato di Unione e Progresso (CUP) di Ahmet Rıza. Questa divisione afflisse il movimento dei Giovani Turchi prima del 1908 e avrebbe costituito la disputa centrale nel discorso politico più istituzionalizzato della Seconda era costituzionale. Dopo la Rivoluzione dei Giovani Turchi nel 1908 e la presa del potere da parte del Comitato di Unione e Progresso, Sabahaddin tornò nell'Impero ottomano.