Ende 1939 wurde Opitz zur Einwandererzentrale Posen versetzt. 1941 übernahm er ein „fliegendes Kommando“ des RSHA zur Grenzüberwachung. 1943 kehrte er als Referent für die Grenzpolizei ins Reichssicherheitshauptamt nach Berlin zurück (Referat IV F 1). Nach dem Attentat auf Hitler am 20. Juli 1944 gehörte Opitz der zur Aufklärung dieser Tat eingesetzten Sonderkommission der Geheimen Staatspolizei an.