В начале Великой Отечественной войны руководил обороной острова Ханко и крайне сложной обстановке сумел организовать эвакуацию его гарнизона. 16 сентября 1941 года присвоено звание генерал-лейтенанта береговой службы и награжден орденом Ленина. В декабре 1941 года назначен командующим войсками внутренней обороны Ленинграда и начальником гарнизона города. Возглавил работу по возведению оборонительных сооружений в черте города и дельте реки Нева.