Na de bevrijding van Tsjecho-Slowakije door het Rode Leger (1945) keerde de regering in ballingschap naar Praag terug en kwam er een regering van het Nationaal Front (Národní fronta / Narodný front) tot stand. Binnen deze regering participeerden naast de Communistische Partij van Tsjecho-Slowakije (KSČ) nog vijf ander partijen, waaronder de ČSNS. Later werd de samenstelling van het Nationaal Front ten gunste van steeds machtiger wordende communistische partij: een aantal partijen werden uit het Front verwijderd (de Slowaakse Democratische Partij en de sociaal-democraten) en na de communistische coup van februari 1948 werden de overige partijen, waartoe de ČSNS behoorde, gelijkgeschakeld. Partijleider Petr Zenkl (1884-1975), vice-premier sinds 1946, en een tegenstander van de groeiende communistische invloed, nam ontslag uit de regering en wist naar het buitenland te ontkomen. Zenkl bleef tot zijn dood leider van de ČSNS in ballingschap en had een belangrijk aandeel in de totstandkoming van de Raad van Vrij Tsjecho-Slowakije dat gevestigd was in Washington, D.C. en waarvan hij de leiding had tot 1972.