Несмотря на собственные сомнения и возражения лидеров партии, Линкольн решил выдвинуть свою кандидатуру на второй срок, хотя за последние четыре года он нажил себе немало врагов, его часто критиковали газеты и ненавидели многие люди. Демократическая партия объявила своим лозунгом окончание войны и ведение переговоров. Её кандидатом стал генерал Дж. Б. Макклеллан, уволенный Линкольном с поста главнокомандующего в 1862 году. В Республиканской партии одним из претендентов пытался стать министр финансов Салмон Чейз, но Линкольн был выдвинут единственным кандидатом. Взятие 2 сентября 1864 года Шерманом Атланты — житницы конфедерации, позволило Линкольну победить на президентских выборах своего соперника, сторонника мира — Макклеллана и набрать 212 из 233 голосов выборщиков. По настоянию Линкольна конгресс 31 января 1865 года принял XIII поправку к Конституции США, запрещавшую рабство на территории страны. В начале 1865 года победа северян уже была предрешена. В своей второй инаугурационной речи Линкольн призывал отказаться от мщения, поставил задачи реконструкции Юга, построения гармоничного Союза: