Революция 1848—1849 годов в Германии увлекла и Филиппсона, стоявшего всегда на стороне либеральных реформ; он принимал деятельное участие в общественной жизни, будучи видным членом и руководителем умеренной партии. Филиппсон был избран в члены магдебургского муниципалитета; он особенно усердно занимался здесь педагогическими вопросами. В то же время он выступал и в защиту полного равенства евреев, и когда, с наступлением реакции, прусское правительство намеревалось, ввиду «"христианской основы современного государства"», ввести старые ограничения, Филиппсон организовал широкое движение среди евреев, и 300 общин примкнули к составленной им в 1856 году петиции в парламент с целью не только сохранения уже приобретенных прав, но и иx расширения. Удачный исход петиции побудил Филиппсона продолжать начатую борьбу в пользу эмансипации, и благодаря его энергии были отменены некоторые особые законы о евреях (еврейская присяга, клятва еврейских солдат и т. п.). В разгаре общественной борьбы из-под пера Филиппсона вышел ряд книг, носивших не столько еврейский, сколько общий характер и вызывавших к себе внимание всей Германии.