Große Teile Ostfrieslands waren durch die Kriegswirren der sächsischen Fehde und der geldrischen Fehde zerstört. Graf Enno II. hatte aus seiner Niederlage gelernt und blieb in der Folgezeit zurückhaltend. Balthasar aber begann siegestrunken ab 1537 einen Konflikt mit den Bremern, indem er Kaperbriefe ausstellte. Daraufhin erwirkten die Bremer die Verhängung der Reichsacht über Balthasar, welche am 21. Juni 1538 ausgesprochen wurde. Im Juli 1540 belagerten die Bremer Esens, wobei sie von Maria von Jever unterstützt wurden. Balthasar starb am 18. Oktober 1540, noch während der Belagerung, an einer Krankheit. Kurz darauf endeten die Kampfhandlungen und im Laufe des Jahres wurde unter Vermittlung des hessischen Landgrafen Philipp ein Friedensvertrag mit den Bremern geschlossen, in dem Balthasars Schwester als neue Regentin des Harlingerlandes unter der Lehnshoheit der Bremer eingesetzt wurde.