1944年8月に発生した反ナチス派によるスロバキア国民蜂起（SNP, Slovenské národné povstanie）に動揺したドイツは1944年9月からスロバキアを占領し、スロバキア共和国政府は主権のほとんどを失った。まもなくドイツ軍は東から殺到してきた赤軍、ルーマニア軍、チェコ軍によって撤退し、解放された地域は再びチェコスロバキアの一部となった。