В начале августа 1812 года, в ходе войны за независимость Мексики, революционер Бернардо Гутьеррес де Лара с рекрутами, называвшими себя Республиканской армией Севера, вторгся в Техас. В ноябре того же года мятежники захватили крепость. В течение четырёх последующих месяцев техасский губернатор Мануэль Мария де Сальседо осаждал форт. 19 февраля, не в состоянии сломить сопротивление защитников крепости, губернатор снял осаду и повернул к Сан-Антонио-де-Бехар. Мятежники контролировали пресидио до июля—августа 1813 года, после чего контроль над Техасом был восстановлен усилиями войск Хосе Хоакина де Арредондо. Член Республиканской армии Севера Генри Перри попытался вновь захватить крепость в 1817 году, однако защитники пресидио вместе с подкреплением из Сан-Антонио нанесли поражение мятежникам 18 июля около ручья Колето-Крик.