Os soviéticos estabeleceram o GKO em 30 de junho de 1941 (uma semana após a Alemanha nazista invadir a União Soviética em 22 de junho de 1941) por uma decisão composta do Presidium do Soviete Supremo da URSS, do Conselho dos Comissários do Povo ("Sovnarkom"), e o Comitê Central do Partido Comunista da União Soviética. A situação de guerra nas linhas de frente exigia uma forma de governo mais centralizada. O Soviete Supremo, no entanto, continuou sem suspensão. Em 18 de junho de 1942, mais de 1 mil membros compareceram à 9ª sessão do Supremo Soviete em Moscou.