Mit seiner Division eilte Delaborde anschließend an den Rhein (Armée de Mayence), wo er den Breisgau besetzte, während Moreau nach Bayern vorrückte. Nach dem Frieden von Lunéville (1801) übernahm Delaborde die 13. Militär-Territorialdivision. Im Jahr 1807 rückte seine Division unter General Junot in Portugal und wurde im Dezember diese Jahres als Gouverneur von Lissabon eingesetzt. Im folgenden Jahr 1808 kämpfte Delaborde gegen die Briten unter Wellesley bei Roliça (17. August) und in der Schlacht bei Vimeiro (21. August), wo er verwundet wurde. Er befehligte sine Division auch weiterhin und kämpfte im Januar 1809 in der Schlacht bei La Coruña. Zwei Monate später kämpfte er bei Carvalho, bevor er im Mai 1809 erneut in Porto kämpfte. Im September befehligte er das II. Korps der Hauptarmee in Spanien. Er kehrte nach Frankreich zurück und wurde von Kaiser Napoleon in den Grafenstand erhoben.