Berger a făcut parte din echipa cehă care a participat la Euro 1996, fiind singurul jucător din echipă cu potențialul de a deveni „o vedetă internațională”. În ciuda acestui fapt, Martin Frýdek a fost preferat în locul lui Berger la începutul meciului pentru primul meci împotriva Germaniei. Berger a continuat să joace în toate meciurile echipei naționale din turneu, reușind să marcheze în finală din penalty reușind să-și aducă echipa în avantaj în fața Germaniei. Cehia a pierdut în cele din urmă din cauza regulii golului de aur în prelungiri.