Im Zeitraum zwischen 1854 und 1867 machte Boucard zwei Expeditionen in den Süden von Mexiko. Von 1854 bis 1856 begleitete er seinen Freund Auguste Sallé (1820–1896) und sammelte mit ihm im Municipio San Andrés Tuxtla im mexikanischen Bundesstaat Veracruz. Die Ausbeute wurde 1857 von Philip Lutley Sclater (1829–1913) in seinem Artikel "On a collection of birds received by M. Sallé from Southern Mexico" beschrieben. Es folgten viele weitere Sammlungen beispielsweise aus Oaxaca ("List of birds collected by M.A. Boucard in the state of Oaxaca in south-western Mexico, with descriptions of new species") oder der Umgebung von Orizaba ("Notes on a collection of birds from the vicinity of Orizaba and Neighbouring Parts of Southern Mexico"), die von Sclater, Osbert Salvin (1835–1898) oder George French Angas (1822–1886) bearbeitet wurden. Im Rahmen der französischen Intervention in Mexiko setzte Napoléon III. 1864 eine wissenschaftliche Kommission ein, die unter der Leitung des Zoologen Marie Firmin Bocourt (1819–1904) als "Mission scientifique au Mexique et dans l’Amérique Centrale" publizierte. Boucard trug als korrespondierendes Mitglied zum Erfolg des Unternehmens bei.