Après ce succès, Hindenburg et Ludendorff sont nommés sur le front de l'Est plus au sud à la tête de la armée. Le général von Schubert devient le nouveau commandant de la armée tandis que von François reste à la tête du corps d'armée en Prusse-Orientale et continue la guerre avec succès à la bataille des lacs de Mazurie. Lorsque von Schubert lui donne l'ordre de se retirer, von François refuse. Il envoie un télégramme au haut commandement de l'armée décrivant ses succès et affirmant que von Schubert est mal conseillé. Le télégramme impressionne tant l'Empereur que ce dernier relève von Schubert de ses fonctions et nomme von François commandement de la armée allemande le . Il ne garde cependant que peu de temps ce commandement. Lorsque Hindenburg et Ludendorff lancent leur contre-attaque de Thorn vers Lodz, von François doit les soutenir par l'envoi du corps d'armée. Ne voulant pas se séparer de ce corps d'armée d'active, il envoie à la place le composé de soldats mal entraînés et mal équipés. Début , von François est démis du commandement et est remplacé par Otto von Below.