Fabrice Gobert fait des études de commerce à l'École des hautes études commerciales du Nord (EDHEC, promotion 1997) et y intègre l'association étudiante audiovisuelle ETNA. Il poursuit sa formation dans le cinéma à l'université Paris III de 1994 à 1998 avant de devenir assistant réalisateur. Son premier film, "Simon Werner a disparu...", en partie inspiré de sa propre expérience de ses années de lycée, est sélectionné lors du Festival de Cannes 2010 dans la sélection Un certain regard. Le , il est nommé pour le César du meilleur premier film pour la  des César du cinéma.