Churchill nomme le 17 juillet 1940 l’amiral Roger Keyes « Directeur des Opérations Combinées ». Âgé de 68 ans, ce marin est un ami de Churchill et un héros de 14-18. Le 22 avril 1918, il conduisit notamment le raid contre la base sous-marine allemande de Zeebruges. Celui-ci est ainsi à la tête d’un état-major interarmées ne dépendant plus du comité des chefs d’état-major, mais en faisant pleinement parti, et relevant directement du premier ministre lui-même. L’état-major mis en place initialement pour planifier les « "raidings operations" » se fond alors dans la nouvelle structure et le général Bourne devient l’adjoint de Keyes. La mission des « Opérations Combinées » concerne la planification et l’exécution des raids en territoire ennemi. De ce fait, il assure la coordination des moyens interarmées mis à sa disposition dans le cadre de ces opérations. Les unités commandos, dont il assure le recrutement et l’entrainement, lui sont directement rattachées. Enfin, il supervise le développement de matériels spécifiques et en assure la production.