Après la guerre, il devient commandant de compagnie dans les corps francs de Franz von Epp puis intègre la Reichswehr. Avec son unité de soldats, il rencontre dans une brasserie le jusqu'alors inconnu Adolf Hitler à Jüterbog. Il quitte l'armée à l'automne 1923. En tant que membre de l'organisation "Reichskriegsflagge", Hühnlein participe en novembre 1923, au Putsch de la Brasserie et est emprisonné six mois dans la prison de Landsberg.