Deux ans plus tard, Parme remporte une deuxième coupe de l'UEFA aux dépens de l'Olympique de Marseille (3-0), au Stade Loujniki de Moscou. En 1999 également, les Parmesans s'imposent une nouvelle fois en Coupe d'Italie contre la Fiorentina, performance réitérée en 2002 face à la Juventus. L'effectif est alors très cosmopolite avec des joueurs tels que Sebastien Frey, Roberto Sensini, Savo Milošević, Matías Almeyda, Sabri Lamouchi ou Hidetoshi Nakata. Le club connait deux autres passages en Ligue des champions lors des années 1999 et 2001 mais ne dépassera jamais le troisième tour de la compétition (éliminé successivement par les Glasgow Rangers, puis le LOSC).