Als Reaktion auf Grigorjans Verhaftung nahm das Außenministerium von Aserbaidschan Stellung und warf Grigorjan Kriegsverbrechen, Plünderung von Eigentum aserbaidschanischer Bevölkerung während der Besetzung der Städte Füzuli und Dschebrajil in Bergkarabach Anfang der 1990er Jahre sowie die Beteiligung am Massaker von Chodschali vor. Die aserbaidschanische Seite bezog sich außerdem auf ein Interview von Grigorjan mit Radio Free Europe aus dem Jahr 2014, in dem er behauptete, mit Hunderten von aserbaidschanischen Kriegsgefangenen aus dem Karabachkrieg nach Armenien zurückgekehrt zu sein. Später soll er sie als Zwangsarbeiter beschäftigt haben.