Les premiers exemplaires de série entrèrent en service en octobre 1944. Rapidement le Frances se tailla une réputation auprès des marins américains qui le considéraient comme un des avions japonais les plus dangereux. Toutefois la marine nippone connaissait une grave pénurie en matière d'équipages, ce qui affecta grandement le rendement opérationnel du P1Y. Néanmoins ils participèrent à la bataille de la mer des Philippines, celle de Shikoku, et celle de Saipan.