Mobilisé à la déclaration de guerre en , il est affecté à Vannes au sein du bataillon de chars de combat. Ce dernier prend l'appellation de compagnie autonome de chars de combat et est intégrée au corps expéditionnaire qui part pour la Norvège en . Après avoir participé à la bataille de Narvik, Alfred de Schamphelaëre et son équipage de char sont envoyés avec douze autres en Angleterre où il s'engage le dans les forces françaises libres et est affecté à la compagnie autonome de chars de combat. Celle-ci part en Afrique en participe à la bataille de Dakar puis séjourne en Sierra Leone, au Cameroun et au Congo avant d'embarquer pour Port-Saïd, dernière étape avant la Palestine où elle prend part à la campagne de Syrie en 1941. Promu maréchal des logis le , il devient chef de char et part en Libye où il participe à la guerre du désert et à la seconde bataille d'El Alamein où sa compagnie est déployée en appui de la 13e demi-brigade de Légion étrangère. Après avoir participé aux combats en Tripolitaine puis à la fin de la campagne de Tunisie, il est promu maréchal des logis-chef en .