Nach seiner aktiven Zeit als Amateurfußballer von 1959 bis 1966 beim Verein VCS in Den Haag wurde John Blankenstein zuerst Schiedsrichter bei Amateurspielen, dann pfiff er von 1979 bis 1996 bei Profispielen. Er war von 1985 bis 1995 FIFA-Schiedsrichter und leitete in dieser Funktion 88 internationale Begegnungen, wobei die bedeutendsten Spiele der Einsatz bei der Fußball-Europameisterschaft 1992 und ein Jahr später beim UEFA-Cup-Finale zwischen Juventus Turin und Borussia Dortmund waren.