Haar zoon Eduard zette de strijd van het huis York door tegen de Lancasters. Cecily Neville had inmiddels haar intrek genomen in Baynard's Castle in Londen dat uitgroeide tot het hoofdkwartier van de Yorkisten. Toen Eduard in de Slag bij Towton de Lancasters wist te verslaan en vervolgens op 28 juni 1461 werd gekroond, werd Cecily Neville als koningin-moeder geëerd. Toen in 1469 Richard Neville samen met Cecily's zoon George in opstand kwam tegen de nieuwe koning, reisde Cecily naar Sandwich om de partijen met elkaar te verzoenen.