La situazione per Dante III peggiorò in occasione delle Guerre d'Italia, allorché Verona fu occupata dalle truppe di Massimiliano I d'Asburgo e Dante fu costretto a riparare nella Mantova dei Gonzaga per sfuggire anche alla pestilenza che devastava la città natale. Raggiunto dal fratello Jacopo, il 22 settembre 1509 fece testamento, disponendo di essere sepolto nel chiostro del convento di Sant'Anastasia a Verona e di nominare eredi universali i tre figli maschi avuti dalla moglie Lucia Franchini, sposata nel 1491. Morì a Mantova tra il 1513 e il 1514, per risultare sicuramente deceduto entro il mese di novembre del 1515, come si evince dal testamento della figlia Ginevra.