Le A6M2-N Rufe apparut pour la première fois sur le théâtre des opérations peu de temps après l'invasion des îles Aléoutiennes le . Le premier combat entre des A6M-2-N et les forces américaines fut l'interception d'un B-24, le . Le , trois B-17 et sept B-24 furent interceptés, les Japonais revendiquèrent un B-24 endommagé, même si, en fait, ils ont détruit un B-17. D' à , des affrontements se déroulèrent entre les "Rufe" basés sur les îles de Kiska, Attu et les avions américains basés à Dutch Harbor. Le pilote de l'aéronavale de Yoshiichi Sasaki apparaît comme l'un des pilotes japonais ayant le plus haut score lors de cette campagne, avec 4 victoires personnelles et 5 en coopération. Dans la campagne des Aléoutiennes, ces hydro-chasseurs furent engagés contre les chasseurs P-38 "Lightning" et les bombardiers B-17 et B-24. Cependant, ils furent décimés par les chasseurs terrestres américains. Les "Rufe" servirent alors pour l'entraînement des pilotes de N1K1 quoique rarement utilisés en opérations réelles depuis des lacs au Japon.