La rupture définitive avec la monarchie de Juillet se produisit les 5 et , lors des funérailles du général Lamarque, qui se transformèrent en rébellion durement réprimée. Philipon venait juste de publier et signer le « Projet d’un monument expia-poire ». Craignant pour sa vie, il se cache dans Paris jusqu’à la fin de l’état de siège. Il retourne à Sainte-Pélagie le et sort définitivement de prison le .