Министерство в данном виде просуществовало до прекращения существования СССР в декабре 1991 года (постановлением Правительства РСФСР № 50 от 18 декабря 1991 года материальная база МВЭС СССР на территории России и за рубежом передана в ведение Комитета внешнеэкономических связей РСФСР).