Lapisse wurde zur Grande Armée kommandiert und nahm an den Koalitionskriegen teil. Er wurde dem Stab von Marschall Charles Pierre François Augereau zugeteilt. Unter dessen Befehl nahm er an den Kämpfen bei Ulm (16./19. Oktober 1805) teil. Später kämpfte er neben Jacques Desjardin bei Jena (14. Oktober 1806), bei Czarnowo (23./24. Dezember 1806), bei Golymin (26. Dezember 1806) und Preußisch Eylau (7./9. Februar 1807).