Zeller foi selecionado com a quarta escolha geral no Draft de 2013 pelo Charlotte Bobcats. Em 31 de março de 2014, ele marcou 15 pontos, a melhor marca da temporada, contra o Washington Wizards. Em 5 de abril de 2014, ele registrou seu primeiro duplo-duplo da carreira com 12 pontos e 11 rebotes contra o Cleveland Cavaliers.