Zurückgekehrt nach Frankreich wechselte Bachelu nach einer weiteren Beförderung als Aide-de-camp zu General Charles Victor Emmanuel Leclerc und begleitete diesen 1802 auf dessen Strafexpedition nach Saint Domingue auf der Insel Hispaniola. Dort sollte der Aufstand (→Haitianische Revolution) unter Führung von Toussaint Louverture niedergeschlagen werden um die dortigen französischen Interessen zu wahren. Das französische Expeditionsheer wurde geschlagen und Leclerc kam dabei ums Leben. Bachelu, der zusammen mit dessen Witwe, Pauline Bonaparte, zurückreiste, erreichte am 13. Januar 1803 wieder Frankreich.