Tras el estallido de la Guerra de 1812, Jackson nombró a Benton su ayudante de campo, con una comisión como coronel teniente. Benton fue nombrado para representar los intereses de Jackson a oficiales militares en Washington; lo molestó la posición, porque le negó la experiencia de combate. En 1813, Benton participó en una escaramuza fronteriza en la que Jackson fue herido.