W 2000 roku został na sezon wypożyczony z Interu do SSC Napoli, z którym spadł do Serie B. W sezonie 2001-2002 grał w Bologna FC. Był to najlepszy sezon w karierze Fresiego, gdyż wystąpił w 25 meczach i strzelił 8 bramek, co zaowocowało transferem do ówczesnego mistrza Włoch Juventusu. Z Juventusem zdobył mistrzostwo Włoch 2003, choć Fresi występował sporadycznie w meczach "bianconerrich". Problemy z miejsce w podstawowym składzie spowodowały transfer w połowie sezonu 2003-2004 do AC Perugia. Z Perugią spadł do Serie B po przegranych barażach Fiorentiną.