Летом 1812 года началась война с Англией. Она была непопулярна в Северной Каролине и только два сенатора из шести проголосовали за объявление войны в Конгрессе. В распоряжении штата было всего плохо обученных ополченцев и 5 кораблей для охраны побережья. В июне 1813 года британский флот адмирала Коберна вошёл в пролив Окрокок и захватил городок Портсмут. Он ушёл через четыре дня в поисках более серьёзной добычи, и больше в штате не происходило боевых действий, но нападение Коберна обеспокоило северокаролинцев, которые стали всё более склоняться к федерализму и запрашивать помощи в обороне штата. В годы войны примерно северокаролинцев служили в армии и флота. Особенно прославился капитан , который выиграл несколько морских боёв, но погиб в Атлантике, вероятно во время шторма. Армейский офицер прославился в сражениях на канадской границе.