Começou carreira política sendo eleito deputado estadual em outubro de 1962, pelo Partido Social Democrático (PSD), assumindo o cargo em 31 de janeiro de 1963, posto ocupado por pouco tempo tendo em vista que com o Golpe de 1964 (a instauração do Ato Institucional  nº 1, AI-1; e a perseguição de adversários do regime), seu mandato acabou por ser cassado assim como seus direitos políticos sendo suspensos por dez anos. Mais tarde, já com o processo de reabertura ocorrendo e depois a promulgação da Lei de Anistia em agosto de 1979, Amilcar Moreira conseguiu reingressar na política, agora filiado ao Movimento Democrático Brasileiro (MDB), que se opunha ao regime militar. Em novembro do mesmo ano o bipartidarismo é extinto, com isso Moreira, no ano que segue, se filia ao Partido do Movimento Democrático Brasileiro (PMDB).