Kemudian di Brazil, di mana Michael Schumacher menjalani balapan F1 terakhirnya, Jenson kembali meraih podium dengan finis di P3. Ia pun mendapat konfirmasi bahwa ia akan tetap bertahan di Honda untuk 2007. Posisi Button di klasemen akhir musim 2006 adalah di P6 dengan 56 poin. Namun catatan luar biasa Button di paruh musim kedua sangatlah mengagumkan, di mana ia mampu meraih 35 poin dalam sisa enam balapan, saat para pembalap lain tidak bisa menyamai prestasi dirinya.