Quand la Mongolie déclara son indépendance de la Chine, lors de la chute de la dynastie Qing et la révolution chinoise de 1911, le pouvoir met en place une théocratie dirigée par le Bogdo Khan, Jebtsundamba Khutuktu (1869 — 1924) Bogdo Gegen, sous le nom de Mongolie autonome (ou Empire de Mongolie du Bogdo. . Toutefois, le Jebtsundamba suivant, Jampal Namdol Chokye Gyaltsen, identifié à l'âge de 4 ans, est né à Lhassa, au Tibet. En 1959, il s'est enfui en Inde à Dharamsala où il vit en exil. Le dalaï-lama l'a nommé représentant de la tradition Jonang.