Boutsianis bermain empat kali untuk untuk Australia. Penampilan pertamanya datang pada Kualifikasi Piala Dunia 2002 pada pertandingan melawan Tonga, Australia menang 22-0, memecahkan rekor dunia untuk kemenangan terbesar dalam pertandingan internasional. Boutsianis datang sebagai pemain pengganti dan mencetak gol di pertandingan tersebut. Pada pertandingan berikutnya, melawan Samoa Amerika, ia mendapat kesempatan menjadi "starter" dan mencetak tiga gol Australia untuk memecahkan rekor mereka sendiri dengan kemenangan 31-0. Pertandingan terakhirnya untuk tim nasional Australia adalah pada Agustus 2001 dalam pertandingan menghadapi Jepang.