La stagione 1962-1963, apertasi con la doppia sconfitta in Coppa Intercontinentale contro il Santos di Pelé, vide l'exploit definitivo degli attaccanti Eusébio e José Torres che permise alla squadra di tornare alla vittoria del campionato e di raggiungere, per il terzo anno consecutivo, la finale di Coppa dei Campioni dove fu sconfitta in rimonta dai campioni d'Italia del Milan.