После сокрушительного поражения Ордена в битве при Дурбе в 1260 г, пруссы снова восстали. Большой Прусский мятеж продолжался четырнадцать лет. Вармийцы выбрали вождём Глаппо и присоединились к восстанию. В начале восстания Глаппо удалось взять Бранево, но попытка взять Балгу обернулась неудачей. В 1266 г. правители Бранденбурга прибыли в Пруссию и построили замок на границе Вармии и земель натангов между Балгой и Кёнигсбергом. Замок, названный Бранденбург Brandenburg (теперь Ушаково), успешно сопротивлялся прусским атакам. Глаппо был взят в плен и повешен, когда пытался взять крепость в 1273 г.. Спустя год мятеж был окончательно подавлен, и это было последним восстанием вармийцев. Впоследствии они были постепенно ассимилированы немцами и поляками. Большое количество польских поселенцев прибыло после Второго Торуньского мира, передав Вармийское архиепископство польской короне в качестве части провинции Королевская Пруссия.