In 295 v.Chr. kwam Croton in handen van een andere Syracusaanse tiran, Agathocles. Toen Pyrrhus in de jaren (280-278, 275 v.Chr) zijn invasie in Italië uitvoerde, was Croton nog steeds een aanzienlijke stad, maar na de Pyrrhische Oorlog, was de helft van de stad verlaten. De resterende bevolking gaf zich in 277 v.Chr. over aan Rome. In 216 v.Chr. na de Slag bij Cannae, ten tijde van de Tweede Punische Oorlog, kwam Croton in opstand tegen Rome. Drie jaar lang diende de stad als winterkwartier voor de Carthaagse leider Hannibal Barkas. Pas in 205 of 204 v.Chr. viel de stad opnieuw onder Romeins gezag. In 194 v.Chr. werd een Romeinse kolonie gesticht. Gedurende de rest van de Romeinse Republiek en ook het Romeinse Keizerrijk wordt verder weinig meer van Croton vernomen. Wel speelt een belangrijk deel van een overgebleven fragment van de Satyricon van Petronius in Croton.