Rebellen forderten auch weiterhin die Unabhängigkeit Belutschistans. 2004 brach der heftigste Konflikt aus. 2006 wurde der Rebellenführer Nawab Akbar Bugti von pakistanischen Sicherheitskräften getötet. Im Verlauf der Jahre reagierten die Separatisten immer brutaler. Es wurden nicht nur Gasleitungen gesprengt, sondern auch Entwicklungshelfer, Diplomaten und Journalisten entführt und getötet. Es werden zunehmend Übergriffe auf Zuwanderer aus anderen pakistanischen Provinzen gemeldet, die teilweise schon in vierter Generation hier leben. Grundsätzlich lässt sich sagen, die Zivilgesellschaft ist schwach ausgeprägt, staatliche Repressionen sind allgegenwärtig und Menschenrechtsverletzungen an der Tagesordnung.