Федералисты опасались и того, что политическая мощь штатов, расположенных на атлантическом побережье, приведёт к противостоянию западных фермеров с торговцами и банкирами Новой Англии. Также существовали опасения, что увеличение территорий рабовладельческих штатов приведёт к дальнейшему росту напряжения между Севером и Югом. Фракция федералистской партии под управлением сенатора от штата Массачусетс Тимоти Пикеринга дошла даже до того, что озвучила предложение о разделе Северной конфедерации. Возглавить новую страну было предложено вице-президенту Аарону Берру при условии, что он сможет убедить Нью-Йорк поддержать это решение. Отношения Аарона Берра с Александром Гамильтоном, который в своё время помог положить конец северному сепаратистскому движению, опустились на самую низкую отметку в этот период. Взаимная вражда между двумя политическими деятелями привела в 1804 году к дуэли, на которой Берр убил Гамильтона.