W reprezentacji Brazylii Amauri zadebiutował 24 marca 1963 w przegranym 0-3 meczu z reprezentacją Argentyny w Copa América 1963, na której Brazylia zajęła czwarte miejsce. Amauri na turnieju wystąpił w dwóch meczach z Argentyną i Ekwadorem. Ostatni raz w reprezentacji Amauri wystąpił 19 grudnia 1968 w wygranym 3-2 towarzyskim meczu z reprezentacjąjugosławii. W 44 min. meczu Amauri strzelił swą jedyną bramkę w reprezentacji.