Merlin был основан в 1993 году д-ром Кристофером Бессом (), Николасом Меллором () и Марком Далтоном () отправить британские благотворительные медицинские бригады в зоны бедствия, а затем, чтобы предотвратить болезни и помочь работе местных служб здравоохранения. Первая миссия — отправка в Боснию основных продуктов питания и медикаментов на сумму 1 миллион фунтов стерлингов. С тех пор организация специализируется на благотворительности, направленной на реагирование на стихийные бедствия и чрезвычайные гуманитарные ситуации. На 2013 год Merlin работала в более чем 40 странах и ответила на некоторые из самых серьёзных гуманитарных чрезвычайных ситуаций последнего времени: цунами в Азии, циклон в Бирме, землетрясение 2010 года в Гаити и наводнение в Пакистане.