Később a Załuski-gyűjtemény egyes részei különböző orosz könyvtárakba kerültek. Egy része 1842-ben és 1863 között visszakerült Lengyelországba. Az 1920-as években a lengyel-szovjet háború és azt befejező rigai béke következtében a szovjet hatóságok visszaadtak lengyeleknek kb. 50 000 könyvtári tételt, amelyet viszont 1944 októberében a német katonaság majdnem teljesen megsemmisített Varsó tervszerű pusztítása alatt, a varsói felkelés leverése után. Az eredeti állományból a háborút csak 1800 kézirat és 30 000 nyomtatvány élte túl.