Название своё станция получила от городского района Боэдо и одноимённой улицы Авенида Боэдо, на перекрёстке которой с Авенидой Сан-Хуан она и расположена. Район же и улица получили своё название в честь аргентинского политика начала XIX века Мариано Боэдо, подписавшего в числе прочих Декларацию независимости Аргентины 9 июля 1816 года. В 1997 году станция была включена в число Национальных исторических памятников.