Po okupacji terytorium Litwy przez Armię Czerwoną (VI 1940) i aneksji Litwy przez ZSRR pozostał w Niemczech, gdzie skupił wokół siebie grono litewskich działaczy niepodległościowych. Po Ataku Niemiec na ZSRR w czerwcu 1941 wybrany szefem rządu niepodległej Litwy – władze niemieckie nie pozwoliły mu jednak przedostać się do Kowna.