En 2006, âgé de 16 ans seulement, Yohan Blake remporte deux médailles lors des Championnats du monde juniors disputés à Pékin : le bronze sur 100 m dans le temps de 10 s 42, derrière le Britannique Harry Aikines-Aryeetey et le Canadien Justyn Warner et l'or au titre du relais 4 × 100 m avec ses coéquipiers de l'équipe de Jamaïque. Il se distingue dès l'année suivante lors des Jeux de la Carifta disputés dans les Îles Turques-et-Caïques en établissant un nouveau record national junior sur en 10 s 11 (+1,2 m/s). Il participe, toujours en 2007, aux Championnats panaméricains juniors de São Paulo où il obtient la médaille d'argent sur et la médaille de bronze au titre du relais 4 × 400 m. En 2008, Blake se classe quatrième du et deuxième du 4 × 100 m des Championnats du monde juniors de Bydgoszcz, en Pologne.