Trois ans et demi plus tard après avoir été élu de Paris aux États généraux, il accepta de participer à la défense de Louis XVI, lors de son procès devant la Convention nationale, en décembre 1792 et janvier 1793, à la suite duquel il cessa ses consultations pendant quelques mois et dut peut-être se cacher. En effet, François Denis Tronchet qui est sorti de l'arène politique à la séparation de la Constituante en septembre 1791 est, à partir de 1792, redevenu avocat, ou, pour reprendre l'expression de cette époque . Il recommença à donner des consultations, et à renouer des contacts avec ses anciens confrères. Sa participation au procès du roi Louis XVI contribua à sa légende. Car il fut, sous la Restauration, décrit comme un héros, avec également ses confrères Malesherbes et de Sèze. Par la suite, sous le second Empire, il devint l'une des figures les plus encensées par les magistrats dans leurs discours de rentrée des juridictions d'appel ou de cassation. Ces deux conceptions de ce personnage a pu brouiller la compréhension de la façon dont il a agit au moment du procès du roi[./François_Denis_Tronchet#cite_note-Tessier2016197-17 [17]].