Malgré son précédent avorté avec les "Blucerchiati" de la Sampdoria, ses débuts au sein de l'élite italienne se firent finalement avec le club de l'Empoli FC et un accord de copropriété entre ces derniers et le Milan. Ce fut donc au cours de la saison 2007-2008, que Ignazio Abate prit part à sa première expérience en Série A et également à 24 matchs de championnat. Saison qui le vit et qui fut pour lui, l'occasion d'ouvrir son compteur but avec une réalisation lors du match contre le Genoa CFC (0-1), l'autre club de la ville de Gênes, sur leur pelouse du Stade Luigi-Ferraris.