Auch nach der indonesischen Unabhängigkeitserklärung wurde der Ort weiterhin als Gefängnisinsel benutzt. Während der Herrschaft von Präsident Suharto wurden Hunderte von politischen Dissidenten zu Haftstrafen auf der Insel verurteilt. Die meisten von ihnen waren Mitglieder der verbotenen Kommunistischen Partei Indonesiens, aber auch der Dichter Pramoedya Ananta Toer.