Allo scoppio della seconda guerra mondiale, in qualità di ufficiale di cavalleria, partecipa alla campagna di Jugoslavia, rientrando in Italia nel giugno del 1941 e acquartierandosi con i suoi cavalleggeri a Lonigo (Vicenza). Col grado di maggiore comanda il secondo gruppo squadroni del Savoia Cavalleria al comando del colonnello Guglielmo Barbò di Casalmorano. Il 12 luglio dello stesso anno viene mobilitato con tutto il reggimento per la partenza sul fronte russo. Raffaele Pindinelli viene impegnato con i suoi squadroni in numerosi combattimenti durante tutto l'inverno e fino a marzo 1942, data in cui viene rimpatriato a causa di una grave infezione polmonare.