Le , peu après l'invasion de l'Union soviétique par l'Allemagne, la ville de Lwów est envahie par les Allemands. Deux jours plus tard, Bartel est arrêté dans le cadre de l'Opération extraordinaire de pacification (AB-Aktion), un plan d'élimination systématique de la classe dirigeante polonaise. Emprisonné par la Gestapo, Bartel subit des interrogatoires musclés, menés par les hommes du SS-Brigadeführer Eberhard Schöngarth. Il est exécuté le sur ordre de Heinrich Himmler, peu après la fin du massacre de ses collègues.