Ignjovski kommt seit der U16 in den Juniorennationalmannschaften des FSS zum Einsatz, bisher spielte er 15-mal für Serbien und erzielte ein Tor. Mit der U17 nahm er 2008 an der Europameisterschaft in der Türkei teil, wo er mit seiner Mannschaft nach der Vorrunde ausschied. Mit der U19 konnte er sich für die Europameisterschaft 2009 in der Ukraine qualifizieren, wo die serbische Auswahl im Halbfinale am späteren Europameister Ukraine scheiterte. Am 28. Februar 2012 kam er in einem Test-Länderspiel gegen die Auswahl Armeniens zu seinem ersten A-Länderspieleinsatz für Serbien.