Alistou-se no exército revolucionário francês em 1792. Servindo nas primeiras campanhas das guerras revolucionárias francesas, em 1800, ele foi promovido ao posto de coronel. Promovido a general de brigada em 1805, no estabelecimento efetivo do Império Francês, e major-general em 1807, Lobau distinguiu-se nas batalhas de Jena e Aspern-Essling. Em 1810 foi criado conde de Lobau, em reconhecimento do seu papel na batalha de Aspern.