Estland deltog i det allra första VM-slutspelet i innebandy, VM 1996 i Sverige, där man kom på näst sista platsen efter seger över Singapore i placeringsmatchen med 10-1. Efter det har Estland tillhört topplagen i B-divisionen och varit nära att gå upp många gånger, men inte förrän vid VM 2006 lyckades man att avancera. Vid Innebandy-VM 2008 besegrade Estland Danmark i gruppspelet och slapp att åter spela match om sista platsen. Vid VM 2010 spelade Estland i Grupp C tillsammans med Sverige, Tyskland och Australien och tog sig för första gången till ett slutspel där de möter Tjeckien i kvartsfinalen.