Die Staniza wurde 1862, gegen Ende des Kaukasuskrieges 1817–1864 an Stelle einer russischen Verteidigungsanlage („Redoute“) bei einer gleichnamigen Übergangsstelle über den Kuban gegründet. Sie gehörte zunächst zur Abteilung "(otdel)" Temrjukski, später Tamanski der Oblast Kuban. Von 1940 bis 1953 war Warenikowskaja Verwaltungssitz eines nach ihr benannten Rajons.