Домингуш Пасиенсия стал вызываться в сборную Португалии в 1989 году. Свой первый гол он провёл 19 декабря 1990 года в товарищеской игре против сборной США. Принял участие в отборочных турнирах к чемпионатам Европы и мира. Участвовал в чемпионате Европы по футболу 1996 года, где провёл 3 игры и забил один гол. Всего Пасиенсия провёл за сборную Португалии 35 матчей, в которых забил 9 голов.