I 1863 indledte Iver Holger Rosenkrantz en kortvarig diplomatisk karriere. Han blev 21. juni udnævnt til chargé d'affaires og fra 18. november samme år ministerresident i Italien. Han blev imidlertid fjernet fra posten på grund af uheldige dispositioner, bl.a. et tvivlsomt projekt, hvor italienere ville støtte Danmark økonomisk i krigen 1864. Han fik sin afsked fra udenrigstjenesten i 1866. Fra 1868-1869 medlem af Folketinget, valgt i Skanderborg Amts 2. kreds. 1869 søgte han forgæves valg i Fakse, og igen i Skanderborg 1872, hvor han trådte tilbage inden valghandlingen.