Als die Arbeit des Staatsrats scheiterte und der König 1261 die Herrschaft zurückgewann, akzeptierte Peter de Montfort diese Entwicklung. Für den minderjährigen George de Cantilupe wurde er zum Verwalter des walisischen Abergavenny Castle ernannt, das er im Februar 1263 erfolgreich gegen einen Angriff des walisischen Fürsten Llywelyn ap Gruffydd verteidigte. Als Earl Simon im April 1263 aus seinem französischen Exil nach England zurückkehrte, schloss sich Peter de Montfort ihm wieder an. Earl Simon forderte die erneute Anerkennung der Provisions of Oxford durch den König, was schließlich im Frühjahr 1264 zum offenen Krieg der Barone gegen den König führte. Dabei befehligte Peter de Montfort im März 1264 die Rebellen in Northampton, das am 5. April von den königlichen Truppen erobert wurde. Montfort geriet in Gefangenschaft, doch nach dem großen Sieg von Earl Simon in der Schlacht von Lewes am 14. Mai kam er wieder frei. Er gehörte dem neuen neunköpfigen Staatsrat an und spielte damit in der neuen Regierung der Barone eine wichtige Rolle. Im September 1264 gehörte er der Delegation an, die vergeblich eine Einigung mit dem französischen König und dem päpstlichen Legaten zu erreichen suchte, die beide weiter Heinrich III. unterstützten und die Provisions ablehnten. Als Lohn für seine Arbeit wurde ihm das Gut von Garthorpe in Leicestershire übergeben. Im Sommer 1265 nahm Peter de Montfort am letzten Feldzug von Earl Simon teil und fiel mit ihm in der Schlacht von Evesham, die zum entscheidenden Sieg der Anhänger des Königs wurde.