En 1940 se casa con Michel Worms de Romilly, editor que trabajaba en la editorial "Les Belles Letres" -del que se divorciará en 1973-. La pareja sufre las consecuencias de las leyes de Vichy sobre el estatuto de las personas judías: "“Jeanne no era judía. Yo era solo la mitad (por mi padre). Me casé por la iglesia porque mi esposo era católico. Pero mi esposo, medio judío como yo, tenía demasiados abuelos judíos, él era tres cuartas partes judío, por lo tanto judío, y yo, a través de mi matrimonio con un judío, yo era judía ... "" En 1941 fue expulsada de la enseñanza y ella y su marido tuvieron que ocultarse en Aix-en-Provence cambiando con frecuencia de residencia. Jacqueline lo cuenta en el libro "Jeanne". Tras la liberación logra un puesto de profesora en el liceo femenino de Versalles, el Liceo La Bruyère y de 1946-1947 es asistente en la Sorbona. en 1947 defiende su tesis doctoral sobre Tucídides en La Sorbona con el título: "Thucydide et l’impérialisme athénien : la pensée de l’historien et la genèse de l’œuvre (Tucídides y el imperialismo ateniense: el pensamiento del historiador y la génesis de la obra."