Peyer trat nach Ende des Zweiten Weltkriegs gegen die Zwangsvereinigung der ungarischen Arbeiterparteien auf und wurde im Jahr 1947 aus der MSZDP ausgeschlossen. Im ungarischen Parlament wechselte er zur Radikalen Partei (Magyar Radikális Párt). Peyer floh am 19. November 1947 nach Salzburg und ging dann mit Frau und Tochter 1948 in die USA, er wurde im nunmehr kommunistischen Ungarn in Abwesenheit zu einer achtjährigen Gefängnisstrafe verurteilt. Peyer starb während der Ereignisse des Ungarischen Volksaufstandes 1956, den er aus der Ferne verfolgte.