Pour le politologue et islamologue Gilles Kepel, les émeutes de 2005 . Il voit ainsi dans les émeutes de 2005 le point de départ du jihadisme de « troisième génération », répondant à l"Appel à la résistance islamique mondiale" de Abou Moussab al-Souri et qui donnera ses premiers résultats tangibles avec l'affaire Mohammed Merah en 2012. D'après le rapport de la DCRG, cependant, les autorités islamistes n'ont joué , tandis que l'extrême-gauche : en conclusion, la thèse du soulèvement organisé est écartée. Il en est de même pour le rapport du Conseil national des villes. Les enquêtes des Renseignements généraux ne montrent pas d'influence religieuse dans les violences. Au contraire, des représentants de l'Islam ont parfois tenté de s'imposer comme médiateurs : l'UOIF publie un texte recommandant aux musulmans de ne pas participer aux émeutes afin d'éviter les amalgames.