Malgré la défaite, les esclavagistes continuent de dominer la vie politique de la Louisiane. Plusieurs anciens combattants sécessionnistes simulent la conversion et se présentent à des postes de pouvoir (gouverneur, juge, maire, shérif, etc.). Ils s'emploient ainsi à maintenir en vigueur un certain code noir ségrégationniste malgré l'affranchissement des noirs. À la suite de l'l'assassinat du président Abraham Lincoln le 14 avril 1865, le vice-président Andrew Johnson lui succède. Malgré sa défense préalable de l'Union et de l'égalité des droits en tant que gouverneur du Tennessee, la gouvernance présidentielle de Johnson permet aux esclavagistes de la Louisiane de consolider leur influence, ce qui déçoit fortement Dostie. Il adopte une loi sur la reconstruction des États du Sud réintégrés dans l'Union qui accorde l'amnistie à presque tous les anciens dirigeants des États confédérés et il approuve la composition des États locaux ayant adopté des codes noirs qui maintiennent dans les faits des conditions d'esclavage sans le nommer. De plus, en février 1866, il oppose son véto à la loi garantissant l’élargissement des droits civiques des esclaves émancipés (Civil Rights Act) et à l’élargissement du mandat du Bureau des affranchis afin de répondre aux codes noirs répressifs, véto que le Congrès renverse en juillet de la même année.