Im Griechischen Unabhängigkeitskrieg waren die Inseln Basis für die Flotte der griechischen Aufständischen. Nach der Unabhängigkeit Griechenlands 1832 wurden Sapientza und die anderen Inousses-Inseln vom Königreich Griechenland als zu seinem Territorium zugehörig angesehen. Großbritannien hingegen sah die Inousses als Teil der Ionischen Inseln an, deren Kontrolle es 1815 übernommen hatte. Ab 1839 forcierte Großbritannien seinen Anspruch auf die Inousses-Inseln, vor allem von Sapientza und Elafonisos als Bestandteil Zakynthos’ für die Republik der Ionischen Inseln, was zu diplomatischen Konflikten zwischen Großbritannien und dem Griechenland führte. Im Februar 1849 flüchteten Gefangene von den Ionischen Inseln über Elafonisos nach Griechenland. Ende August 1849 kamen der britische Außenminister Lord Palmerston und der britische Statthalter auf den Ionischen Inseln, Earl Grey, überein, dass die britische Marine die Insel Elafonisos zurückerobern solle. Neben anderen Faktoren wie der Don-Pacifico-Affäre mündete der griechisch-britische Konflikt 1850 in einer Seeblockade der griechischen Häfen durch die britische Marine. Nach Reparationszahlungen Griechenlands für britische Verluste während des Unabhängigkeitskrieges wurde diese Gebietsforderung fallen gelassen. Griechenland musste über 180.000 Drachmen Entschädigungszahlungen leisten. Die griechische Wirtschaft, insbesondere der Handel, hatten unter der Seeblockade schwer gelitten. Alle Ionischen Inseln gelangten schließlich 1864 endgültig an Griechenland.