1683 wurde Colston in die „Society of Merchant Venturers“ in Bristol aufgenommen und zu diesem Zeitpunkt als „Westindischer Kaufmann“ beschrieben. Die 1680er Jahre waren seine lukrativsten Jahre, einem Bericht zufolge soll er über 40 Schiffe besessen haben. Bereits 1682 verwendete er die Gewinne aus dem Sklavenhandel für Geldverleihgeschäfte. Nach dem Tod seines Bruders Thomas im Jahr 1684 führte er einige Jahre lang das Handelsgeschäft seines Vaters in Bristol, obwohl er weiterhin in London wohnte. Er erbte das Handelsgeschäft seines Bruders und wurde Teilhaber einer Zuckerraffinerie in St. Peter’s Churchyard, die Roh-Rohrzucker, welcher von Sklaven auf den Plantagen der Karibikinsel St. Kitts produziert wurde, verschiffte und verarbeitete. Colston begrüßte die Revolution von 1688 und etablierte sich schnell bei der neuen Regierung, indem er erstens der neuen Regierung mehrere Darlehen vorstreckte und zweitens Wilhelm von Oranien, der sich wegen seines militärischen Erfolgs als König von England, Schottland und Irland in Personalunion betrachtete, Aktien der RAC im Wert von 1000 Pfund verkaufte. 1692 zog sich Colston aus der RAC zurück, setzte aber den Sklavenhandel privat fort. 1710 wurde Colston, der politisch Tory war, für den damaligen Wahlbezirk Bristol in das House of Commons gewählt, er hatte sich aus Altersgründen geweigert, bei den Wahlen zu kandidieren, da er zu diesem Zeitpunkt bereits 74 Jahre alt war, wurde aber in Abwesenheit aufgestellt. Colston war nicht sonderlich aktiv und kandidierte 1713 nicht erneut.