Der Algerische Bürgerkrieg und die anhaltenden innenpolitischen Spannungen in Algerien verhinderten eine weitere Intensivierung der bilateralen Zusammenarbeit, die erst in den 2000er Jahren wieder zunahm. Am 1. August 2005 unterzeichneten beide Staaten in Algier ein Freundschaft-, Nachbarschafts- und Kooperationsabkommen.