Nach dem Sturz Mussolinis am 25. Juli 1943 marschierten am 1. August deutsche Truppen nach Oberitalien. Aber erst nachdem am 8. September der Waffenstillstand der Regierung Badoglio mit den Alliierten bekannt gegeben wurde, spitzte sich die Lage zu. Die Verantwortlichen der Villa ahnten die Gefahr und sahen sich umgehend nach neuen Zufluchtsorten um. Mit Hilfe des Arztes Giuseppe Moreali und des Priesters Arrigo Beccari wurden die jüdischen Kinder innerhalb weniger Stunden zum Großteil im Priesterseminar der Abtei und in kleineren Teilen bei einheimischen Familien versteckt. Die zunächst eher gleichgültigen oder gar ablehnenden Einheimischen hatten ihre Haltung geändert. Etwa 35 Familien, darunter Bauern, Korbflechter und Ladeninhaber, waren an der Rettung der Kinder beteiligt. Jeder brauchbare Schutzraum wurde genutzt, so Heuböden, Kuhställe, Getreidespeicher, ein Lagerraum für Tabak und ein Weinkeller. Als am 9. September die deutsche Feldgendarmerie vom faschistischen Parteisekretär von Nonantola zur Villa geführt wurde, fanden sie jene leer vor.