Nel frattempo la Honda aveva temporaneamente abbandonato le competizioni internazionali, rientrando solo per il Gran Premio d'Italia 1966; per quell'evento Ginther si ricongiunse al team nipponico e condusse la gara fino a quando la sua auto si schiantò contro un muretto di contenimento, causando al pilota la rottura della clavicola e creando i presupposti per il successivo, definitivo abbandono della F1. In quella stagione riuscì comunque ad ottenere un buon 4º posto all'ultimo appuntamento, ovvero il Gran Premio del Messico.