Wöhlert absolvierte sein Abitur an der Goethe Oberschule Schwerin und studierte anschließend Iranistik an der Humboldt-Universität zu Berlin. Dort wurde er im Jahr 1990 mit einer Arbeit über die sozio-ökonomische und politische Entwicklung der Irans während des ersten Golfkrieges promoviert. Anschließend arbeitete er bis zu dessen Abwicklung am Institut für Friedens- und Konfliktforschung der Humboldt-Universität zu Berlin und war sodann als außenpolitischer Berater des Bundestagsabgeordneten Manfred Müller tätig.