Hubicki nahm mit dieser Division am Überfall auf Polen und den Feldzügen gegen Frankreich, auf dem Balkan und in Russland teil. Wegen das Wirken seiner Division auf dem Balkan wurde ihm am 20. April 1941 das Ritterkreuz des Eisernen Kreuzes verliehen. Am 15. April 1942 gab er sein Kommando ab, wurde in die Führerreserve versetzt und sieben Tage später mit dem Deutschen Kreuz in Gold ausgezeichnet. Im August 1942 übernahm er das "Generalkommando Schelde", später umgewandelt in das LXXXIX. Armeekorps. Als General der Panzertruppe wurde er im Juni 1943 Kommandierender General des Auffrischungsstabes Mitte, bevor er im Juli den Befehl über den Sonderstab II im OKH übernahm. Ende Juli 1944 wurde Hubicki Nachfolger Fritz Schliepers als Deutscher General beim Slowakischen Verteidigungsministerium und Chef der deutschen Heeresmission in der Slowakei. Nach der Auflösung dieser Dienststelle aufgrund des Slowakischen Nationalaufstands wurde er am 1. Oktober wiederum in die Führerreserve versetzt. Am 31. März 1945 erfolgte seine endgültige Verabschiedung aus dem Militärdienst.