Comincia la stagione 2008 ancora al meeting di Doha, stavolta vincendo in 1'44"36; successivamente prende parte ai Campionati africani di Addis Abeba (Etiopia), vincendo le batterie in 1'52"93, la semifinale in 1'48"82 e infine la finale in 1'44"20, davanti al sudanese Ismail Ahmed Ismail (1'45"41) e al connazionale Asbel Kiprop (1'46"02). Il 6 giugno al meeting di Oslo segna il suo primato personale con 1'43"72, dietro al sudanese Abubaker Kaki che con 1'42"69 fa registrare il primato stagionale assoluto; a fine stagione Rudisha risulterà settimo nella classifica dei migliori tempi stagionali sugli 800 m.