В 1789 году, во время войны со Швецией, Болотников находился на гребном флоте и участвовал в десантах; особенно он отличился в Роченсальмской битве, где отдельная часть канонерских лодок, состоявшая под его непосредственной командой, наиболее способствовала одержанию полной победы над шведами. За эту битву Болотников 22 августа 1789 г. был пожалован золотой шпагой с надписью «За храбрость» и орденом св. Георгия 4-й степени (№ 330 по кавалерскому списку Судравского и № 645 по списку Григоровича — Степанова)