1801 schiffte er sich zur Bekämpfung der französischen Expeditionstruppen nach Ägypten ein und übernahm dort nach der Verwundung des Generals Abercromby in der Schlacht bei Alexandria am 21. März den Oberbefehl über die britische Armee. Er eroberte Damiette und Ramanieh, schloss Kairo ein und zwang den französischen General Belliard am 27. Juni mit 14.000 Mann zur Kapitulation. Dann wandte er sich nach Alexandria und schlug alle Ausfälle Menous zurück und nötigte auch ihn am 31. August mit seiner gesamten 10.000 Mann umfassenden Streitmacht zur Aufgabe.