Die umstrittene Rolle der "Nederlandsche Unie" führte dazu, dass Linthorst Homan nicht wieder in seine alte Funktion als Königlicher Kommissar eingesetzt wurde. Im Oktober 1947 erhielt er aber zumindest eine rückwirkend auf den April 1945 datierte ehrenvolle Entlassung. Die ersten fünf Jahre nach seiner Entlassung war Linthorst Homan nicht in der Politik tätig, 1946 wurde er Vorsitzender des Königlich Niederländischen Molkereiverbandes, diese Funktion behielt er bis 1952. 1951 wurde er auch Vorsitzender des Nationalen Olympischen Komitees. In seine Zeit fällt der Beschluss, die Olympischen Sommerspiele von 1956 in Melbourne wegen des Einmarschs der Sowjetunion in Ungarn im Zuge des dortigen Volksaufstands zu boykottieren.