Im Krieg gegen Preußen war Schmidt 1866 zur Dienstleistung im Hauptquartier des VII. Bundeskorps kommandiert und nahm an den Kämpfen bei Dernbach, Kissingen sowie Roßbrunn teil. Nach dem Waffenstillstand wurde er am 30. Juli 1866 zum Kommandeur des 1. Jägerbataillons „König“ ernannt. In dieser Stellung erhielt Schmidt im Januar 1868 das Ritterkreuz I. Klasse des Verdienstordens vom Heiligen Michael und avancierte Ende Mai desselben Jahres zum Oberstleutnant.