1932 kehrte er nach München zurück und arbeitete an der Privatklinik Dr. Haas. Als dieser 1933 emigrieren musste, wurde Kraske unter der Bedingung des Eintritts in die NSDAP die Nachfolge angetragen. Er lehnte ab und ging wieder nach Freiburg, wo er an der Ludwigstraße eine Praxis als Allgemeinarzt sowie eine Orthopädiewerkstatt aufbaute. Im benachbarten Elternhaus hatte er gemeinsam mit seinen Geschwistern nach dem Tod des Vaters ein Sanatorium eingerichtet. Bei Beginn des Zweiten Weltkriegs wurde das Sanatorium beschlagnahmt und Hans Kraske zum Dienst im Reservelazarett Tübingen eingezogen. Ab 1941 war er wieder in Freiburg und setzte seine Arbeit als Allgemeinarzt fort. Bei der Operation Tigerfish im Februar 1944 wurden Praxis und Sanatorium zerstört.