Tras disputar la Copa Mundial de Fútbol Sub-20 de 2013 con Colombia, viajó a Inglaterra para probarse en el Arsenal F. C., el 10 de agosto de 2013 debutó con los "Gunners" en el amistoso que terminó con la victoria del Arsenal por 3-1 sobre el Manchester City F. C.; entrando en el minuto 67 al campo en reemplazo de Mikel Arteta. A pesar de que el técnico Arsène Wenger pidió a los directivos su fichaje luego del mes que estuvo con Pérez, se canceló el traspaso al Arsenal de Inglaterra, el técnico Juan Carlos Osorio, inició de a poco a volver a darle minutos en los partidos al punto de jugar los noventa minutos en los partidos contra el Envigado F. C. y también jugando los noventa minutos en el clásico frente a Millonarios, teniendo en ambos partidos destacadas actuaciones. Anotó su primer gol como profesional en el empate 1-1 ante Jaguares en la ciudad de Montería, días más tarde anotó su segundo gol en el clásico ante el DIM, ambos partidos correspondientes a la Copa Colombia 2013 torneo del quedaría campeón, ganando la final frente al Millonarios.