Andersen ble etter hvert fast på det norske U21-landslaget, ledet av senere A-landslagstrener Nils Johan Semb. A-landslagsdebuten kom i en privatlandskamp mot i mai 1999, og var med i den norske EM-troppen i 2000. Andersen fikk ikke spille noen kamper i EM-sluttspillet, men var stort sett fast på landslaget i hele resten av Semb-perioden.