Espanjan maajoukkueessa Engonga pelasi 14 ottelua vuosina 1998–2000. Engonga oli mukana EM-kilpailuissa 2000 pelaten yhdessä ottelussa. Hän tuli vaihdosta kentälle 89. minuutilla Juan Carlos Valerónin tilalle ottelussa Sloveniaa vastaan alkulohkovaiheen toisella kierroksella 18. kesäkuuta.