После подавления Польского восстания 1830—1831 годов монастырь был передан Русской православной церкви и преобразован в Пожайский Успенский мужской монастырь. Были убраны резные деревянные алтари в часовнях, некоторые фрески перекрашены, три фрески, изображавшие моменты из жизни Литвы и жизни Пацев, были закрашены. После 1863 года по указанию архиепископа Александра (Добрынина) с фасада церкви убраны четыре статуи из песчаника, изображавшие Симеона, Анну, Марию и Иосифа.