Во время гражданской войны 69 года I Вспомогательный легион встал на сторону Отона. Боевое крещение это подразделение получило в первом сражении у Бедриака в апреле 69 года. Его солдаты, как сообщает Тацит, "«яростно рвались в бой, дабы стяжать себе первые лавры»", но были разбиты, хотя и сумели захватить орла XXI Стремительного легиона. Новый император Вителлий передислоцировал легион в Испанию, "«дабы он успокоился, живя на отдыхе, вдали от военных столкновений»". Однако, как только представилась возможность, легион перешёл на сторону Веспасиана и увлек за собой два других испанских легиона, VI Победоносный и X Парный. В 70 году подразделение принимало участие в подавлении Батавского восстания под руководством Квинта Петиллия Цериала. После этого легион стал лагерем в Могонциаке, разделив его вместе с XIV Парным. Многие плитки и кирпичи свидетельствуют о бурной строительной деятельности, развернутой солдатами данных легионов. Ими были построены акведук, а также поселение и бани с суточной мощностью 6500 м³ воды. Необходимый стройматериал изготовлялся легионерами в городе Таберны. В Аквах Маттиаков солдаты I Вспомогательного, XIV Парного, XXI Стремительного и XXII Первородного участвовали в возведении терм. По другой версии, вплоть до 88 года I Вспомогательный легион не покидал пределов Испании.