Sin embargo, la agenda social tuvo un progreso lento hasta 2003 debido a la agenda política. Los años 1999 y 2000 estuvieron marcados por la aprobación de la Constitución, múltiples elecciones y tensiones internas en el Gobierno. En los años 2001 y 2003 el Gobierno se centró en la aprobación de nuevas leyes, en especial un paquete de 49 leyes aprobadas por decreto mediante la Ley Habilitante que incluían la Ley de Tierras y Desarrollo Rural, la Ley de Hidrocarburos, la Ley de Pesca y Acuicultura, la Ley de Zonas Especiales de Desarrollo Sustentable. La aprobación de estas leyes produjo una fuerte confrontación política en el país, que llevó a un paro cívico nacional convocado por la patronal Fedecámaras, a un paro petrolero y al golpe de estado de 2002, que fue revertido tras 48 horas.