阿弗拉克在巴黎接受了心脏手术后，于1989年6月23日在当地逝世。萨达姆宣称阿弗拉克临终前皈依了伊斯兰教，但之后阿弗拉克的家人对此表示质疑。尽管如此，萨达姆还是为阿弗拉克举行了伊斯兰式的葬礼。阿弗拉克家人认为萨达姆所谓的阿弗拉克改宗伊斯兰教的宣称只是他用来划清复兴党与基督教界限的工具。阿弗拉克的陵墓由萨达姆下令建造，在2003年美军入侵伊拉克后被驻扎在绿区的美国大兵作为军营使用。根据阿弗拉克家人的说法，阿弗拉克陵墓在美军入侵期间受损严重。