21 мая 1455 года в Лестере должен был состояться Великий совет, куда был вызван и Джон Невилл в качестве Западного райдинга Йоркшира. Герцог Йоркский, который опасался, что на совете ему будут предъявлены обвинения, отбыл на север, где вместе с графами Солсбери и Уориком собрал войска, после чего 22 мая они напали на сторонников короля около Сент-Олбанса, разбив их, в результате чего герцог Йоркский оказался фактическим правителем Англии. В феврале 1456 года Маргарита Анжуйская вернула себе контроль над правительством и призвала Джона Невилла возобновить соперничество с графом Солсбери, союзником Ричарда Йоркского. Когда 1457 году умер Роберт Невилл, епископ Дарема, брат графа Солсбери, королева добилась, чтобы вакантный престол занял её сторонник , на племяннице которого позже женился Ральф, сын Джона. Новый епископ сразу же стал избавляться от родственников графа Солсбери, занимавших разные административные должности в епархии, заменяя их на представителей старшей ветви Невиллов. Так Джон получил должность судьи ассизы и в результате возглавил судебную систему епархии. Также он получил часть конфискованного имущества покойного епископа.