Действующая церковь Святого Иоанна Крестителя была построена в 1710 году на месте, где когда-то находилась другая средневековая церковь, основанная в 670 году и разрушенная землетрясением в 1679 году. Средства на строительство церкви выделил богатый ереванец по имени Мелик Агамал (семейство Мелик-Агамалянов). Как и другие средневековые церкви, эта церковь является трёхнефной базиликой с молельным залом, главным алтарём на восточной стороне и двумя ризницами по обеим сторонам (наподобие Церкви Святой Богородицы Зоравор и Церкви Святой Богородицы Катогике).