Армин Молер родился в Базеле в 1920 году. Поступил на учёбу в Базельский университет и некоторое время поддерживал коммунистов. Был призван в швейцарскую армию в возрасте 20 лет, но после прочтения работ Освальда Шпенглера и нападения Германии на Советский Союз в июне 1941 года проникся симпатиями к нацистской Германии и в 1942 году дезертировал из армии, чтобы вступить в ряды ваффен-СС. Однако не сумел завоевать достаточного доверия и на службу принят не был. Несмотря на это, остался в Берлине ещё на один год, прежде чем возвратиться в Швейцарию, где был заключён в тюрьму за дезертирство.