In der Saison 2016/17 erreichte Wattana bei den Indian Open die Hauptrunde und schied dort gegen Jamie Jones aus. Bei den World Open schied er in der Wildcardrunde gegen Xu Si aus. Zum fünften Mal in Folge verlor er nach überstandener Gruppenphase in der Runde der letzten 32 bei der 6-Red World Championship, diesmal mit 0:6 gegen Yuan Sijun. Bei den Shanghai Masters verlor er in der zweiten Qualifikationsrunde gegen Mark Joyce und bei den English Open in der zweiten Runde gegen Fraser Patrick. Völlig überraschend kam er beim International Championship bis ins Achtelfinale, wo er an Judd Trump scheiterte. Bis zu den Welsh Open gewann Wattana kein Spiel mehr, dort zog er durch ein 4:3 über Xiao Guodong in die Hauptrunde ein, wo er mit 3:4 gegen Kurt Maflin verlor. Nach zwei weiteren Auftaktniederlagen beendete er die Saison auf Weltranglistenplatz 88.