Vytautas Bulvičius, ministro della difesa, fu arrestato dalle truppe sovietiche il 2 giugno. Il suo posto fu quindi assunto dal generale Stasys Raštikis. Il 21 giugno 1941 (appena un giorno prima che la Germania dichiarasse guerra all'Unione Sovietica e che scoppiasse la rivolta di giugno), quattro membri del governo pianificato furono arrestati dai sovietici: si trattava di Vladas Nasevičius, Vytautas Statkus, Jonas Masiliūnas e Jonas Vainauskas, i quali furono incarcerati nella prigione di Gorkij a Mosca. Il tribunale russo incaricato di giudicarli cominciò le udienze il 26 novembre 1941 (dopo la fine della rivolta e mentre la Lituania era stata già occupata dalla Germania). Le sentenze furono emesse due giorni dopo: Bulvičius fu giustiziato, mentre Masiliūnas, Nasevičius e Statkus furono esiliati in Siberia, insieme ad altre persone arrestate nello stesso periodo.