Армянское население Айоц-дзора особенно пострадало во время июньских погромов 1896 года, когда погибло более 900 человек и было ограблено около 1300 домов. После погромов приток курдов усилился и армяне были вытеснены примерно из 10 сёл. Тем не менее, накануне резни 1915 года, 12 тыс. армян Айоц-дзора составляли более 80 % населения. Они проживали в 30 из 38 сёл нахис. Во время геноцида 1915 года большая часть армян, благодаря вооружённой самообороне, избежала гибели. Айоц-дзорцы приняли участие в Ванской самообороне и Шатахской самообороне. После отхода русских войск в июле 1915, армяне Айоц-дзора перешли в Восточную Армению. Позднее, часть их (более 1200 человек) вернулась в Айоц-дзор, но в 1918 году, во время наступления турецких войск, вновь была вынуждена покинуть свои родные края.