"Empty Walls" wurde die erste offizielle Single. Sie wurde am 10. September zuerst als Download und am 25. September als CD-Single veröffentlicht. Das Lied erreichte Platz drei in den "Hot Modern Rock Tracks" und Platz vier in den "Hot Mainstream Rock Tracks" der US-Billboard-Charts. Zudem hielt es sich eine Woche lang in den Billboard Hot 100 (Platz 97) auf. Das Musikvideo zu "Empty Walls", das von Tony Petrossian gedreht wurde, erschien passend zu seinem Thema am 11. September 2007. Es zeigt Kinder beim Spiel in einer Art Kindergarten. Ein Mädchen baut aus Klötzen zwei Türme, die das World Trade Center darstellen sollen. Ein Junge zerstört diese mit einem Spielzeugflugzeug, worauf zwischen allen Kindern ein „Krieg“ entbrennt. Dabei werden auch verschiedene Szenen aus dem Irakkrieg nachgestellt, wie die Schleifung einer Statue von Saddam Hussein, repräsentiert durch einen übergroßen Teddybär, oder auch die Folterungen im Abu-Ghuraib-Gefängnis. Zwischendurch wird immer wieder Serj Tankian als Uncle Sam gezeigt, der inmitten der Kinder eine singt.