Через 70 лет после Реформации Шотландия в целом одобрила преобразования и перешла к собственной пресвитерианской вере, отличавшейся впрочем от англиканской традиции, к примеру у шотландцев не было епископов. Всё большие расхождения беспокоили англичан и в 1630-х годах английский король Карл I решил навязать шотландцам новую церковную книгу о совместной молитве. В Шотландии нововведения понимания не нашли и по всей стране поднялось восстание которое привело к подписанию Национального ковентанта и созданию ковентантского движения. Нововведения оказались трагическими для Карла I, вскоре начались войны известные как епископские, которые в свою очередь привели в гражданской войне в ходе которой английский король потерпел поражение от парламента и был казнён. Клир собора Святого Махара, обладавший значительным влиянием на паству, был против подписания Национального ковентанта, что имело решающее значение для собора. Пережив Реформацию собор не смог прийти к согласию во время религиозных преобразований XVII века.