Nach dieser schweren Verletzung erreichte Owen nie wieder sein früheres Niveau. Er konnte an den ersten sechs Qualifikationsspielen für die Euro 2008 nicht teilnehmen. Im Anschluss an einen Testeinsatz für die englische B-Nationalmannschaft gegen Albanien nominierte ihn der neue Trainer Steve McClaren wieder für die anstehenden Partien gegen Brasilien und Estland. Seine beiden Tore gegen Russland (3:0) am 12. September 2007 waren Owens letzte für die „Three Lions“. England verpasste die Euro 2008 und McClarens Nachfolger Fabio Capello ließ ihn nur noch im März 2008 zu einem Kurzeinsatz im Freundschaftsspiel gegen Frankreich kommen.