У письмових джерелах Любушки вперше згадується в 1444 році під назвою Любусса (). Назва ж «Ljubuški» буквально означає «Любуський». Любушки впали перед турецькими завойовниками, ймовірно, в 1472 році невдовзі після падіння Почителя. Турки зміцнили і розширили фортецю, добудували мури з бійницями, а поблизу твердині звели мечеть. Любушки, які в османську добу мали статус «кале» (фортеці), належали до 1718 року до Імотського каділука, а після цього самі стали місцем перебування кадії. У ті часи на місто часто нападали гайдуки з Примор'я та Далматинської Загори. Після Берлінського конгресу в Любушки 2 серпня 1878 року вступила австро-угорська армія на чолі з генералом Йовановичем. Під австро-угорським правлінням Любушки пережили значний економічний злет.