Atak Niemiec na ZSRR (22 czerwca 1941) zastał 161 DS w czasie przemarszu do Mińska. Od 26 czerwca toczyła boje z przeważającymi siłami najeźdźców, broniła się pod Gżatskiem i na brzegu Dniepru, przemieszczając się w kierunku Jelnii. We wrześniu wycofana do miasta Kalinin w celu uzupełnienia strat.