V květnu 1945 během Pražského povstání se přidal na stranu povstaleckých Čechů a pomáhal jim se svou jednotkou osvobodit Prahu. Před postupující Rudou armádou uprchl do amerického zajetí, byl však americkou hlídkou předán veliteli 25. sovětského tankového sboru spolu s náčelníkem štábu divize podplukovníkem Nikolajevem a náčelníkem kontrarozvědky kapitánem Olchovnikem . Stalo se to 15. května ve vesnici Dvorec (dnes část Nepomuka). Američané vinili Buňačenka za jeho boj u Saint-Lô, který je stál těžké ztráty na životech. I to bylo jedním z důvodů, proč ho vydali Sovětům.