Nach dem Schulabschluss am Falk-Gymnasium in Berlin-Tiergarten leistete Erwin Marcusson von 1917 bis 1918 seinen Militärdienst als Sanitätsgefreiter in Rastatt. Während der Novemberrevolution 1918 war er Mitglied eines Arbeiter- und Soldatenrats und nahm im Januar 1919 am Spartakusaufstand teil. 1919 wurde er Mitglied der KPD. Von 1919 bis 1925 studierte Marcusson Medizin in Berlin, Würzburg, Freiburg, München und Heidelberg. 1925 wurde er an der Universität Heidelberg promoviert. Nach Abschluss seiner fachärztlichen Ausbildung war er 1927–1930 Stadtschularzt in Altenburg und wurde 1930 Gewerbemedizinalrat in Magdeburg. Von 1930 bis 1933 war als Assistenzarzt am Krankenhaus in Berlin-Britz und in einer Privatpraxis tätig.