В течение первых дней войны за независимость Хосе де ла Мар воевал на стороне роялистов сохраняя верность испанской короне. Война застала Хосе де ла Мара губернатором крепости короля Филиппа в Кальяо которую он успешно защищал. Когда 6 июня 1821 года вице-король Хосе де ла Серна вынужден был покинуть столицу город Лима, он приказал не оставлять крепость и ждать помощи, что Хосе де ла Мар с успехом и делал в течение 4 месяцев, но из-за недостаточного подкрепления по приказу вице-короля он был вынужден сдать крепость 19 сентября.