Von 1945 bis 1949 und in den Jahren der jungen Bundesrepublik erlebte Bergedorf weitere beträchtliche Veränderungen. So baute Kurt A. Körber 1945/46 in Bergedorf die weltweit exportierende Maschinenfabrik Hauni auf. Die „Durchbruchstraße II“ "(Bergedorfer Straße/B5)" sorgte für einen städtebaulichen Wandel; denn für die neue Straße mussten unter Protest vieler Bürger alte Fachwerkhäuser weichen. Im Jahr 1962 wurde der Westen Bergedorfs durch die Sturmflut stark beschädigt. Insbesondere die Stadtteile Moorfleet, wo der Deich gebrochen war, Billwerder und Allermöhe. Die Großwohnsiedlung Bergedorf-West entstand Ende der 1960er Jahre in einer für die damalige Zeit typischen Art und Ausprägung. Die 1971 eingerichtete Fußgängerzone "Sachsentor/Alte Holstenstraße" sorgte hingegen für eine weitere Erhöhung der Attraktivität der inneren Bergedorfer Altstadt. Das erste kleinere Einkaufszentrum "CCB" ("City-Center Bergedorf") entstand 1973.