Il 20 gennaio 1943 l"Atago" lasciò Kure e arrivò il 25 a Truk. Da qui salpò il 31 gennaio con il resto della 4ª Divisione, più la 5ª Divisione incrociatori, e si portò a nord delle Salomone, dove operò durante la settimana successiva per coprire a distanza l'evacuazione di Guadalcanal; una volta conclusa, il 9 tutte le unità rientrarono a Truk. L'incrociatore rimase nei paraggi della rada sino a buona parte di luglio. Il 21 del mese salpò con il "Takao" e il 26 arrivò a Yokosuka, dove due giorni dopo fu messo in bacino di carenaggio. La nave fu revisionata e l'armamento contraereo fu potenziato con due impianti trinati di cannoni Type 96 da 25 mm e un radar Type 13. Rimesso in acqua, dopo aver caricato truppe e rifornimenti, partì il 16 assieme alle corazzate , e , alla portaerei di scorta "Taiyo", al "Takao" e cinque cacciatorpediniere (unità più o meno stipate di personale e attrezzature): questo convoglio arrivò incolume il 23 a Truk e i due incrociatori pesanti proseguirono sino a Rabaul in Nuova Britannia, dove il 27 agosto sbarcarono soldati e aviatori. Subito rientrato a Truk, l "Atago" partecipò il 18 settembre a una massiccia puntata offensiva della 2ª e 3ª Flotta verso l'atollo di Eniwetok, in risposta all'incursione lanciata dalle portaerei della Quinta Flotta statunitense sulle isole Gilbert: questo tentativo di aggancio, così come quello successivo del 17 ottobre (nel quale l"Atago" fu seguito dal resto della 4ª Divisione incrociatori), rimase comunque senza esito.