השינוי בעמדת המאמן והגעתו של הארגנטינאי ריקרדו לה וולפה, סימנה עבור פארדו את הדרך חזרה לנבחרת. הוא זכה עם מקסיקו בתואר בפעם השלישית בגביע הזהב 2003. הוא חזר ליטול חלק משמעותי בטורניריה השונים של מקסיקו, וכך ייצג אותה בקופה אמריקה 2004, ושנה אחר כך בגביע הקונפדרציות 2005.