Первая лига СР Югославии по футболу 1998/1999 () — 7-й сезон чемпионата Югославии по футболу с момента начала распада Югославии. Он начался 7 августа 1998 года и был прерван 20 марта 1999 года из-за бомбардировок Югославии. 12 июня 1999 года «Партизан» был объявлен чемпионом Югославии в сезоне 1998/99.