Presentó ante el Ministerio de Instrucción Pública un proyecto de exploración arqueológica en América del Sur, y se le aprobó una misión científica a Perú y Bolivia el 9 de julio de 1875. Después de haber llegado a Brasil, el emperador Pedro II lo autorizó a acompañar a un equipo científico para explorar la isla de Santa Catarina para buscar "sambaquís" o conchales, luego va a Perú y desembarca en Callao en febrero de 1876 por encargo del Ministerio de Instrucción Pública de Francia, con motivo de la Gran exposición universal de París de 1878.