Før 2006-sesongen signerte Liuzzi med det nyetablerte juniorlaget til Red Bull, tidligere Minardi, med navn Scuderia Toro Rosso. Poeng var utenfor rekkevidde da bilen utover sesongen ble langt svakere enn konkurrentene grunnet bruk av en nedtrimmet V10 i stedet for den nye V8-motoren som ble brukt av alle de andre lagene. Høydepunktet var under løpet i USA hvor han tok en 8.-plass.