En septembre 2014, il est nommé entraîneur du RK Zagreb, club croate de nouveau ambitieux après l'arrivée d'un nouveau sponsor. Rassuré sur l'ambition des dirigeants croates, son contrat a été prolongé jusqu'en 2018. Puis fin mai 2015, il est nommé sélectionneur de l'équipe nationale de Slovénie à compter du . Sous ses ordres lors du tournoi de qualifications, les Slovènes créent la surprise en gagnant leur billet pour la phase finale du tournoi olympique en écartant notamment l'Espagne, championne du monde 2013 et finaliste de l'Euro quelques mois plus tôt. Si le tournoi olympique est plutôt d'une belle facture -- défaite en quarts de finale face au Danemark, future champion --, le mauvais début de saison du RK Zagreb en Ligue SEHA et en Ligue des champions conduit à le club à remercier Vujović.