Bunse wurde 1940 Soldat, vor Leningrad verwundet, kämpfte in der Schlacht am Wolchow, wurde im Winter 1942/1943 wieder verwundet und kam in ein Lazarettlager in Ostpreußen. Von dort schrieb er einen Brief direkt an Adolf Hitler, in dem er ihn aufforderte, die Gräueltaten an der russischen Bevölkerung und vor allem an der orthodoxen Kirche zu verbieten. Er wurde in die psychiatrische Abteilung des Lazaretts Königsberg eingewiesen, dort von seiner Mutter abgeholt und im April 1943 in Dortmund ausgemustert. In Verfolgung der Absicht, in ein Schweizer Kloster einzutreten, wurde er an der Grenze festgenommen und nach Durchgang durch ein Gefängnis in die psychiatrische Klinik in Freiburg im Breisgau eingewiesen. Da er dort wegen der menschenunwürdigen Verhältnisse schließlich die Nahrungsaufnahme verweigerte (und zwangsernährt wurde), wurde wieder seine Mutter verständigt, die anreiste und die Verlegung zu den Alexianern nach Münster erreichte.