Nachtwey a fost și el rănit în timpul muncii sale, în timpul invadaziei Irakului din 2003. La fel ca și Nachtwey, corespondentul revistei Time Michael Weisskopf a fost prezent în spatele mașinii Humvee a armatei Statelor Unite. În acel moment, un insurgent a aruncat o grenadă în mașina în care aceștia se aflau, iar Weisskopf a vrut să o arunce înapoi, dar nu a mai apucat să o facă, aceasta explodându-i în mână. În această explozie au fost răniți doi soldați, iar alți doi jurnaliști de la revista Time au murit. Nachtwey a reușit să facă mai multe fotografii, când fostul său coleg Weisskopf, primea îngrijiri medicale de la doctorul Billie Grimes înainte de a muri. Ambii jurnaliști au fost duși de urgență la un spital din Statele Unite. Nachtwey s-a refăcut după acest incident, astfel încât a reușit să fie prezent la tsunamiul din Sud-Estul Asiei, din 26 decembrie 2004.