Kolejna wojna prusko-duńska 1864 roku spowodowała kolejną blokadę żeglugi przez Danię i tym razem doprowadziła Grunaua do ogłoszenia upadłości. W 1866 Ignatz Grunau zawarł ugodę z wierzycielami i dalej zarządzał braniewskim młynem. Jednak podeszły wiek i choroby zmusiły go do przekazania (wydzierżawienia) tej ostatniej nieruchomości swojemu synowi Georgowi. Ignatz powraca do rodziny w Elblągu i po dwóch miesiącach zmagania się z rakiem żołądka umiera 8 marca 1868 roku. Pochowany został 13 marca na cmentarzu św. Mikołaja.