Houve ameaça de uma invasão do Exército Vermelho ao Turquestão chinês, mas o governador concordou em cooperar com os sovietes. A criação da República da China em 1911, e a turbulência em geral no país afetou suas participações na Ásia Central. O controle da região pelo Kuomintang era fraco e havia uma dupla ameaça, dos separatistas islâmicos e dos comunistas. Eventualmente a região tornou-se amplamente independente sob o controle do governador provincial. Ao invés de invadir, a União Soviética criou uma rede de consulados na região e enviou ajuda e assessores técnicos. Na década de 1930, o relacionamento do governador de Xinjiang com Moscou foi muito mais importante do que com Nanquim. A Guerra Civil Chinesa desestabilizou ainda mais a região e viu os nacionalistas turcos fazerem tentativas de independência. Em 1933, a Primeira República do Turquestão Oriental foi declarada, mas foi destruída logo após com a ajuda das tropas soviéticas. Após a invasão alemã da União Soviética em 1941, o governador de Xinjiang, Sheng Shicai, rendeu-se e quebrou suas ligações para com Moscou, passando a se aliar com o Kuomintang. Isso levou a uma guerra civil na região. Sheng foi forçado a fugir e os soviéticos apoiaram a Segunda República do Turquestão Oriental que foi formada. Este estado foi anexado pela República Popular da China em 1949.