In Nicaragua i diplomatici statunitensi sostennero segretamente le forze ribelli di Juan J. Estrada contro il governo del presidente José Santos Zelaya, che voleva revocare le concessioni commerciali concesse alle compagnie statunitensi. Si dice che il segretario di Stato Knox fosse uno dei principali azionisti di una delle società che sarebbero state danneggiate da tale mossa. Il paese era indebitato con diverse potenze straniere e gli Stati Uniti non erano disposti a farlo cadere nelle mani degli europei, anche perché poteva essere la sede di un canale alternativo a quello di Panama. Zelaya e il suo successore eletto, José Madriz, non furono in grado di reprimere la ribellione e nell'agosto 1910 le forze di Estrada presero la capitale Managua. Gli Stati Uniti fecero accettare al Nicaragua un prestito e inviarono funzionari per assicurarsi che fosse rimborsato dalle entrate del governo. Il paese rimase instabile, e dopo un altro colpo di Stato nel 1911 e altri disordini nel 1912, Taft inviò truppe; la maggior parte fu ritirata presto, ma un contingente rimase fino al 1933.