Стоян Хаджиев е роден в ениджевардарското село Бозец, тогава в Османската империя. Присъединява се към ВМОРО и става помощник войвода на Апостол войвода. Ръководи центъра „Корчуфка“ от 16 четници в Ениджевардарското езеро, която се сражава с гръцките чети. След Младотурската революция от юли 1908 година се легализира.