Efter kejsardömets fall 1911 inleddes en administrativ reform och Chongqing avskaffades som prefektur 1913, under Republiken Kina. 1929 fick Chongqing en modern stadsförvaltning och stora delar av stadsmurarna revs. Den ursprungliga stadskärnan utgjordes av de gamla häradena Ba och Jiangbei.