La chiesa non è stata danneggiata durante la guerra. Tuttavia, a causa degli anni trascorsi dalla costruzione, nel dopoguerra è stata effettuata una ristrutturazione esterna, grazie a una donazione della Grecia. Inoltre, negli anni del dopoguerra, la Chiesa ortodossa serba tentò di riprendere possesso dell'edificio della Facoltà di Economia di Sarajevo, uno spazio che fu acquistato insieme alla piazza per la costruzione della Cattedrale e del seminario ortodosso tra il 1859 e 1862. La controversia è ancora in corso.