Tornato ad allenare il Biarritz in difficoltà di classifica, alla fine del 2011 è stato contattato dalla Federazione francese per affiancare il neo commissario tecnico Philippe Saint-André; l'accordo con il Biarritz prevede che, pur entrando dal dicembre 2011 nello staff tecnico federale e collaborando al Sei Nazioni 2012, Lagisquet rimane in carica come tecnico del club fino alla fine del campionato.