Дебют Альфредо Рота на международных соревнованиях состоялся в 1994 году на чемпионате мира среди юниоров, проходившем в Мексике. Итогом выступления стало 6 место в соревновании шпажистов. На взрослом уровне первым крупным соревнованием для итальянца стал чемпионат мира 1997 года. В личных соревнованиях Рота стал девятнадцатым, а в командных в составе сборной Италии стал бронзовым призёром чемпионата мира. Через два года европейское первенство проходило в Италии. Родные стены помогли молодому итальянцу. В индивидуальных соревнованиях Рота стал серебряным призёром, уступив французу Рэми Деломмэ, а в командных стал чемпионом Европы.