En la Rebelión jacobita de 1745, conocida como la Cuarenta y cinco, Fort William fue sitiado por dos semanas por los Jacobitas. desde el 20 de marzo al 3 de abril de 1746. Sin embargo, aunque los Jacobitas habían capturado dos de los fuertes en la cadena de las tres fortificaciones Great Glen (Fort Augustus y el original Fort George, fallaron al intentar tomar Fort William.