Pour cette nouvelle saison, Marco Verratti retrouve Leonardo qui l'avait fait signer dans la capitale et qui revient en tant que directeur sportif. Sur le terrain, il est régulièrement associé à Marquinhos et au nouvel arrivé Idrissa Gueye. En , il prolonge son contrat avec le PSG. Il est désormais lié au club parisien jusqu'en 2024. Le , après être entré en jeu contre Galatasaray en Ligue des champions, il rejoint Paul Le Guen comme joueur ayant disputé le plus de rencontres européennes sous les couleurs du PSG. Le au Borussia Dortmund, il devient seul détenteur du record. Récoltant un carton, il est suspendu pour le match retour. Il s'agit de sa septième suspension en coupe d'Europe. À la même période, on apprend que l'agent Donato Di Campli abandonne ses poursuites à l'encontre de Verratti. Le joueur avait décidé de rompre leur engagement à la suite de son transfert avorté au FC Barcelone en 2017, et avait rejoint Mino Raiola. La saison prend alors une tournure inédite, puisque toutes les compétitions sont suspendues à cause de la pandémie de Covid-19. Le championnat finit par être définitivement arrêté, sacrant le club parisien pour la neuvième fois (septième titre pour Verratti). Les finales de coupes nationales sont disputées en juillet et remportées toutes les deux par le club parisien. Concernant l'UEFA, le PSG dispute le "final 8" à Lisbonne. On apprend que le milieu italien est blessé à l’entraînement par son coéquipier Eric Choupo Moting. Il retrouve le terrain lors de la demi-finale face à Leipzig (victoire 0-3) et entre en cours de match lors de la finale face au Bayern Munich (défaite 1-0).