Después del exilio final de su padre, durante la guerra de los Nueve Años, Fitz-James sirvió en el ejército francés, dirigido por el mariscal de Luxemburgo, contra las fuerzas aliadas al mando de Guillermo de Orange. Fitz-James participó en las batallas de Steenkerque y de Landen, en esta última, el 29 de julio de 1693, fue hecho prisionero, pero intercambiado con el duque de Ormonde.