От Наполеона Пюто получил сперва также должность губернатора Кольмара. В 180 году он захватил Диршау, а затем принимал участие в осаде Данцига. В 1808 году отправился воевать в Испанию, где отличился в битве при Эспиносе и был повышен до дивизионного генерала. В 1809 году впервые принял командование дивизией, с которой участвовал в сражении при Ваграме, и которая стояла в тылу в Германии во время войны 1812 года.