С началом Великой Отечественной войны в действующей армии. Уже 22 июня 1941 года капитан Емельянов над Вильнюсом сбил самолёт противника. Но в воздушном бою он был ранен и три месяца лечился в госпитале. После выздоровления вернулся на фронт, в короткий срок овладел в совершенстве самолётом-штурмовиком.