Nel 1978 Watkins incontrò Bernie Ecclestone, a quel tempo CEO della Formula One Constructors Association, che gli offrì di diventare medico ufficiale e delegato alla sicurezza delle corse di Formula 1. Il compenso pattuito era di 35.000 $ a stagione, con la clausola che Watkins doveva pagare di tasca sua biglietti aerei, conti d'albergo, noleggio auto e spese impreviste. Watkins accettò e debuttò al Gran Premio di Svezia 1978. Al di fuori delle corse, continuò ad operare come neurologo a Londra.