La guerra que precedió al reinado de Juan I y el mismo estado de abandono al que este rey había abocado la región, llevó la plaza a la ruina y a la despoblación durante más de un siglo. Fue deber de Manuel I renovar la atención real al lugar y dar un nuevo impulso al municipio. A principios de 1508 el monarca decidió restaurar la fortaleza y el 25 de junio del mismo año le concedió una nueva carta foral, donando la ciudad a su hijo, el infante Duarte. Esto abrió un nuevo ciclo de progreso en la historia del municipio que siglo y medio después se rompería con la Guerra de Restauración.