Nino Niederreiter a effectué toute sa carrière de junior avec le HC Davos, disputant ses premiers matchs avec la deuxième équipe du club à l'âge de 15 ans. Il dispute avec l'équipe de Suisse le championnat du monde moins de 18 ans en 2008, à 16 ans. Lors de la saison 2008-2009, il est le plus jeune joueur de son équipe de Juniors Élites A et inscrit 34 points en 30 matchs. Il dispute même trois matchs de séries éliminatoires en LNA et est sacré champion de Suisse 2009. À la fin de la saison, il dispute le championnat du monde moins de 18 ans 2009.