W 1708 roku udał się do Barcelony w imieniu Karola VI, do jego oblubienicy Elżbietą Christine von Braunschweig. Następnie u boku księcia Marlborough brał udział w wojnie o sukcesję hiszpańską. W 1712 został mianowany szambelanem cesarskim, a w 1713 reprezentował cesarza Karola VI w Parlamencie Morawskim. Oznaką dużego zaufania do księcia ze strony Wiednia było powołanie go w 1723 roku do Tajnej Rady Cesarskiej. 11 października 1721 roku zmarł Antoni Florian. Po objęciu władzy nad Domem Książęcym Józef Jan wycofał się nieco z życia politycznego i angażował się głównie w wewnętrzne sprawy rodziny. Udało mu się naprawić sytuację finansową rodziny oraz ostatecznie zażegnać konflikty wśród krewnych powstałe po sporze między Antonim Florianem a Janem Adamem I.