Indépendamment de son but initial, l'Arkansas Project a non seulement accusé Clinton d'indélicatesses financières et sexuelles (certaines plus tard vérifiés, d'autres non), mais ont aussi donné racine à « l'hyperbolique théorie du complot » avec des allégations telles, que Bill Clinton aurait collaboré avec la CIA pour exécuter une opération de trafic de drogues à partir de la ville de Mena en Arkansas ou que le couple Clinton avait pris des dispositions pour le meurtre à la Maison-Blanche de son conseiller Vince Foster afin d'étouffer l'affaire du Whitewater. La possibilité que l'on aurait donné de l'argent du projet à l'ancien associé de Clinton, David Hale, un témoin dans l'enquête Whitewater, a mené à la nomination de Michael J. Shaheen comme enquêteur spécial. Shaheen cité par le rédacteur de Scaife, qui a témoigné devant un jury fédéral d'accusation sur cette question.