Siirtomaa-ajalla Princeton oli pysähdyspaikka matkalla New Yorkista Philadelphiaan. Vuonna 1756 tuolloinen College of New Jersey eli nykyinen Princetonin yliopisto siirrettiin Princetoniin Newarkista. Oppilaitoksen myötä paikkakunnasta alkoi muodostua kulttuurin ja hallinnon keskus. Yhdysvaltain vapaussodan aikana vuonna 1777 Princetonissa käytiin Princetonin taistelu ja kesällä 1778 kesäkuusta marraskuuhun 1783 Princeton oli "de facto" Yhdysvaltojen pääkaupunki. Yhdysvaltain kongressi kokoontui Kingston Hallin tiloissa palkanmaksujen takia kapinoivien sotilaiden uhkaaman Philadephian sijaan.