Il 25 novembre 2001 ad Aspen conquistò il suo miglior piazzamento in Coppa del Mondo (10º) e nella stessa stagione partecipò ai XIX Giochi olimpici invernali di , senza completare la prova. L'8 marzo 2004 ottenne a Sierra Nevada l'ultimo podio in Coppa Europa (2º) e il 27 febbraio 2005 prese per l'ultima volta il via in Coppa del Mondo, a Kranjska Gora senza qualificarsi per la seconda manche. Si ritirò all'inizio della stagione 2005-2006 e la sua ultima gara fu lo slalom speciale di Coppa Europa disputato il 15 dicembre a Obereggen, non completato da Perathoner.