В январе 1919 года добровольно вступил в РККА и был зачислен в 7-й отдельный военно-рабочий батальон 8-й армии, в составе которого служил красноармейцем, отделенным командиром и квартирмейстером и воевал против деникинских войск под Новохоперском, Борисоглебском и Балашовом. В январе 1920 года батальон переформирован во 2-й отдельный батальон ВОСО, а Сидорин был назначен в нём зав. оружием и командиром взвода. В составе 5-й отдельной бригады ВОСО 12-й армии батальон участвовал в боях с белополяками. После окончания Советско-польской войны в ноябре 1920 года батальон переформирован в 8-й отдельный батальон ВОСО, а Сидорин назначен в нём помощником заведующего хозяйством. В феврале 1921 года батальон влился в 7-й Донецкий стрелковый полк, а Сидорин становится квартирмейстером этого полка. В декабре 1921 года он откомандирован в распоряжение ЦК ВКП(б) Украины, а оттуда направлен в 51-й кавалерийский полк 51-й Перекопской стрелковой дивизии. В марте 1922 года он там же окончил полковые пулеметные курсы и продолжил службу начальником пулемета и политруком. Участвовал в ликвидации бандитизма в районах Балта, Ананьев и Саврань. В декабре 1922 года полк переформирован в отдельный кавалерийский эскадрон, в котором Сидорин служил казначеем-квартирмейстером и командиром взвода.