Nach einem schweren Bombenangriff der Luftwaffe auf die "Bristol Aeroplane Company" (BAC) im September 1940 wurde RAF Filton in Folge Heimat einer Spitfire Staffel. Im folgenden Jahr wurde die Basis ausgebaut, es wurden unter anderem zwei Beton-Start- und Landebahnen errichtet. In Filton wurde im Verlauf des Krieges eine Reihe verschiedener Luftfahrzeugmuster der BAC gebaut. Im weiteren Kriegsverlauf wurden auch die Endmontage amerikanischer Flugzeugtypen vorgenommen, die zerlegt aus den USA verschifft wurden. Nach der alliierten Invasion in der Normandie diente Filton auch als Durchgangsstation für den Rücktransport verwundeter Soldaten nach Übersee.