En , Bonaparte charge Sérurier d’effectuer une démonstration devant Valenza avec sa division pendant que le gros des troupes franchit le Pô près de Piacenza. Après la bataille de Lodi, Bonaparte modifie l’organisation de l’armée d’Italie qui compte à présent une réserve de cavalerie et quatre divisions d’infanterie, dont une sous les ordres de Sérurier. Au cours de la bataille de Borghetto, le , ses soldats font diversion sur le cours supérieur du Mincio pendant que l’attaque principale se déroule à Valeggio contre l’armée impériale de Beaulieu. Le , la division Sérurier, forte de hommes, prend position au nord de la forteresse de Mantoue. Le , Sérurier, accompagné du général d’artillerie Lespinasse et du colonel du génie Chasseloup-Laubat, effectue une reconnaissance aux abords de la forteresse. Deux jours plus tard, Bonaparte investit officiellement Sérurier du siège de Mantoue avec environ soldats. Le général en chef écrit peu après au Directoire : . L’arrivée des troupes autrichiennes du général Wurmser contraint cependant les Français à lever le siège le après avoir enterré leurs canons, et la division Sérurier se replie derrière l’Oglio. Sérurier contracte la malaria et doit rentrer en France pour se soigner. Les généraux Fiorella et Gardanne dirigent la division en son absence à la bataille de Castiglione. Le , Bonaparte adresse au Directoire une note confidentielle dans laquelle il évalue les capacités de ses généraux. À propos de Sérurier, il écrit : .