Johanna was enkel titelvoerend gravin; de daadwerkelijke bevoegdheden die bij haar ambt hoorden werden uitgeoefend door haar moeder en haar tweede echtgenoot, koning Alfons III van Portugal. In 1248 trok haar man als lid van het gevolg van koning Lodewijk IX van Frankrijk op de Zevende Kruistocht naar Egypte, waar hij in 1250 sneuvelde. Haar huwelijk met Wouter van Châtillon was kinderloos gebleven.