С начала Отечественной войны 1812 года полковник Протасов числился в лейб-гвардии Конном полку и командовал сводным кирасирским полком в 1-м пехотном корпусе П. Х. Витгенштейна; отличился и в первом, и во втором сражениях под Полоцком. С начала 1813 года возглавлял лейб-гвардии Конный полк, с которым принял участие в Заграничном походе 1813 года, за отличие в Кульмском бою был произведён в генерал-майоры. Далее Протасов командовал Малороссийским кирасирским полком и блестяще проявил себя в Битве народов под Лейпцигом, где был ранен. Завершил своё участие в Наполеоновских войнах при взятии Парижа в 1814 году.