Montenegro Airlines wurde 1994 gegründet, konnte aber aufgrund der wirtschaftlichen und politischen Lage in Jugoslawien erst am 7. Mai 1997 den Flugbetrieb aufnehmen. Die erste Verbindung führte mit einer Fokker F28 nach Bari in Italien. Im Jahr 1998 wurde dann bereits die zweite F28 angeschafft und die Ziele wurden ausgebaut. Jedoch wurde die Expansion durch die Sanktionen gegen Jugoslawien Anfang 1999 gestoppt. Erst im Herbst 1999 konnte Montenegro Airlines ihren Flugbetrieb wieder aufnehmen.