Du côté chouan, il signe, sans y croire, les accords de la Mabilais le . Mais plusieurs chefs ne les signent pas, les accords sont transgressés puis rompus au bout d’un mois. Hoche est prévenu d’un débarquement à Carnac. Il fait repousser les débarquements britanniques dont celui des émigrés dans la presqu'île de Quiberon, commandés par de Puisaye, d'Hervilly et de Sombreuil, du au , et il défait les Chouans. Il obtient alors le commandement de toutes les armées de l’Ouest.