En 2010, a los 17 años, Aedo fue convocada a la Selección nacional de su país para participar en la Copa América femenina a disputarse en Ecuador, donde anotó el primer gol en la victoria de Chile por 3-1 sobre Perú. En la Copa América femenina de 2018, Aedo marcó tres goles (1 contra Paraguay y 2 contra Perú) para ayudar a Chile a clasificar para una Copa Mundial Femenina de la FIFA por primera vez en su historia. Ha sido reconocida como una de las "goleadoras" de la selección.