白玉山塔高66.8米，18个窗口。塔身设计为炮弹形，以炫耀军威。也有人说这是在表彰日军的炮兵部队。还有说法称塔身为蜡烛形，日军为祭悼亡灵作此设计。塔内有24层铁质螺旋楼梯，台阶273级，是自美国訂制的。 塔顶北侧有铜质铭文，为东乡平八郎与乃木希典合撰，简述了旅順會戰的过程。塔顶的观光台的铁质围栏为太阳旗的放射图案。此外，日军还在白玉山北峰（今旅顺海军兵器馆舰桥下）建有一座“纳骨祠”，葬有日俄战争中死亡的22723名日军士兵的骨灰。