Las principales potencias querían principalmente garantizar con este Protocolo la integridad territorial de Dinamarca y que el puerto estratégico de Kiel no cayera en manos prusianas. Once años más tarde, este tratado se convirtió en el desencadenante de la guerra germano-danesa de 1864. Prusia y Austria declararon que Dinamarca había violado el Protocolo al introducir la Constitución de noviembre, que Cristian IX de Dinamarca firmó el 18 de noviembre de 1863. Después de un período inicial de administración conjunta austro-prusiana, Kiel finalmente fue entregado a Prusia en 1867.