La saison suivante, Luis Scola apporte en moyenne 14,62 points et 4,67 rebonds à son équipe lors de la saison régulière de la Liga ACB et il est même nommé meilleur joueur de la pour une évaluation de 52. Vitoria dispute de nouveau les playoffs, éliminant Pamesia Valencia (trois victoires à une), puis Barcelone en demi-finale sur le score de trois victoires à une. Vitoria remporte son premier titre de champion en battant Unicaja Málaga trois victoires à zéro. Vitoria remporte également la Coupe du Roi en battant Barcelone 85 à 83. En Euroligue, Vitoria n'est éliminé au niveau du qu'à la différence particulière face au Maccabi Tel-Aviv. Ses performances en Espagne et en Europe (15,9 points et 4,6 rebonds) attirent rapidement les regards, en particulier ceux de la NBA et des Spurs de San Antonio qui le choisissent en lors de la Draft 2002 de la NBA. Scola reste tout de même en Espagne afin de se perfectionner.