До средине 1990-их, Запад га је сматрао једним од представника нове генерације афричких политичара. Међутим, поверење у њега пољуљано је његовим учешћем у инвазији на ДР Конго у Другом конгоанском рату 1998 – 2003. Пре одржања избора 2006. године, укинуо је временско ограничење трајања председничког мандата. Спољашњи посматрачи запазили су и Мусевенијево повремено гушење деловања демократске опозиције. Године 2011, започео је његов четврти председнички мандат.