Під час Полтавської битви Бауер командуючи частиною драгунських полків в бою за редути, успішно відбив всі атаки шведів, захопив 14 прапорів та штандартів, потім очолював кавалерію правого крила армії. Після битви брав участь у переслідуванні залишків армії супротивника до Переволочни. За Полтавську битву Петро I подарував Бауеру свій портрет, прикрашений діамантами, та земельні володіння. З осені 1709 року Бауер командував кавалерією в армії Шереметєва. У жовтень 1709 — червні 1710 років брав участь в облозі Риги. З 1711 року вів бойові дії проти шведів у Польщі та Данії.