25 ноября 2018 года «Яны Капу», а также военные катера «Бердянск» и «Никополь» стали участниками вооружённого столкновения с силами Береговой охраны и ВМФ России. В этот день, около 7:00 по московскому времени, данные корабли, руководствуясь приказом президента Украины Петра Порошенко о переходе этих военных судов в Азовское море, при подходе к Керченскому проливу были блокированы пограничными кораблями и катерами Береговой охраны при попытке пройти через пролив, так как, по мнению российской стороны, корабли ВМС Украины нарушили правила прохождения Керчь-Еникальского канала (не поставили их в известность о проходе в установленный российскими правилами срок) и незаконно пересекли государственную границу Российской Федерации. Вытесняя украинские корабли из 12-мильной зоны, российский пограничный сторожевой корабль «Дон» совершил навал (бортовое столкновение с минимальными последствиями) на остановившийся буксир «Яны Капу». Все три украинских судна захвачены спецназом РФ. «Дон» в итоге получил повреждения. По сообщению Пресс-центра командования ВМС Украины, был повреждён один из двух главных двигателей, обшивка и леерное ограждение буксира, потерян спасательный плотик.