Für das Jahr 1937/1938 erhielt er ein Stipendium, das ihm einen Aufenthalt an der Friedrich-Wilhelms-Universität Berlin ermöglichte. Während dieser Zeit veröffentlichte er einen größeren Aufsatz (in deutscher Sprache) in der Zeitschrift "Philologus" und heiratete am 19. August 1938 in Rottweil die Klassische Philologin Margarete Hohenadel (1911–?). Zum Jahresende kehrte Szantyr nach Wilna zurück und trat dort zum 31. Dezember 1938 eine Stelle an der Universität an. Nachdem im Zweiten Weltkrieg die Rote Armee Wilna besetzt hatte, verlor Szantyr diese Stelle und unterrichtete vom 1. September 1940 bis zum 1. März 1941 erneut am Adam-Mickiewicz-Gymnasium. Der damals noch gültige deutsch-sowjetische Nichtangriffspakt ermöglichte es ihm, mit seiner Familie (mit der 1939 geborenen Tochter Krystyna) in das Deutsche Reich überzusiedeln. Zum 5. März 1941, drei Monate vor dem deutschen Überfall auf die Sowjetunion, zog Szantyr mit seiner Familie nach Linz an der Donau und unterrichtete dort ab dem 9. Oktober 1941 am Staatsgymnasium.