New Orleans' statsadvokat Jim Garrison tok ut tiltalen mot Clay Shaw på grunnlag av at Shaw og en gruppe aktivister, inkludert David Ferrie og Guy Banister, var involvert i en konspirasjon mot hemmelige agenter fra Central Intelligence Agency (CIA) i forbindelse med mordet på John F. Kennedy Garrison arresterte Shaw 1. mars 1967. Garrison mente at Clay Shaw var mannen som var navngitt som «Clay Bertrand» i Warren-Kommisjonens rapport. Garrison sa at Shaw har brukt pseudonymet «Clay Bertrand» i New Orleans' homofile kretser.