En el parlamento ruso, Nemtsov estaba en el comité legislativo que trabaja en la reforma agrícola y la liberalización del comercio exterior. Fue en este cargo que Nemtsov conoció a Borís Yeltsin, quien quedó impresionado con el trabajo del joven. Durante el intento de golpe de Estado contra el gobierno de Yeltsin en 1991, Nemtsov fue partidario vehemente del presidente, y estuvo a su lado durante todo el enfrentamiento. Después de los acontecimientos de octubre de 1991, la lealtad de Nemtsov fue recompensada con el cargo de representante presidencial en su región natal de Nizhni Nóvgorod.