L'éducation joue un rôle considérable dans la diffusion des esprits révolutionnaires. Les riches marchands grecs financent de nombreux étudiants grecs dans les universités italiennes et du Saint-Empire romain germanique. Parallèlement, de grands centres éducatifs se créent à la veille de la Guerre d'indépendance grecque : à Ioannina, Smyrne, Chios et Kydonies, qui sont en outre des centres économiques grecs prépondérants. Il s'agit pour les indépendantistes de construire le futur État de Grèce, et donc d'éduquer ses citoyens. C'est cette mission que se donne Ioánnis Kapodístrias, fin administrateur qui pose les bases de la future administration du pays. Il participe, avec le philhellène britannique Frederick North, à la fondation de l'Académie ionienne en 1824. L'Académie s'inspire fortement de l'École polytechnique de Paris qui sert volontairement de modèle. Dans les campagnes, le rôle de l'Église Orthodoxe est déterminant et contribue non seulement à l'enseignement des classes les plus pauvres mais, sur le long terme, à construire l'identité de la Grèce contemporaine sur l'orthodoxie. Les popes participent activement à diffuser les idées de la Révolution grecque.