Тем временем, возобновившаяся с франками и бургундами складывалась неудачно для вестготов. В 507 году в битве при Вуйе погиб Аларих II, а зимой того же года Арль осадили бургунды. Во время осады женский монастырь, к тому времени почти построенный, был разрушен, и монахинями пришлось искать убежище в Марселе. Сомнения в лояльности Цезария среди жителей города вновь обострились после того, как один из его родственников бежал к осаждающим. Начались беспорядки, которые житие приписывает евреям. Цезария поместили под арест в его собственном дворце и планировали переправить по Роне в другой город, оставшийся под контролем вестготов. Дальнейшие события, приведшие к освобождению Цезария, не вполне ясны, и также позднее использовались в анти-иудейской полемике. Город находился в осаде до конца 508 года, пока король остготов Теодорих Великий не прислал свою армию под командованием герцога Иббы. Бургунды были вынуждены отступить за Дюранс, вернувшись к прежним границам. Решением Теодориха была восстановлена преторианская префектура Галлии с центром в Арле. В 510 году главой префектуры был назначен патриций Либерий.