W reprezentacji Austrii Patocka zadebiutował 30 maja 2007 roku w przegranym 0:1 towarzyskim meczu ze Szkocją. W 2008 roku został powołany przez selekcjonera Josefa Hickersbergera do kadry na Mistrzostwa Europy 2008. W kadrze narodowej rozegrał 5 meczów.