В Стамбуле, готовясь к поездке на Берлинский конгресс, Мак-Гахан заразился брюшным тифом и умер 9 июня 1878 года в возрасте 33 лет. Он похоронен на греческом кладбище в присутствии дипломатов, военных корреспондентов и генерала Скобелева.