À Boulikessi, les djihadistes livrent un violent combat contre le bataillon malien du G5 Sahel. Le camp, aussi appelé « Fort 11 », est tenu par près de 120 militaires du des commandos parachutistes, unité d'élite malienne. La région est isolée et sans réseau téléphonique. Surpris, les soldats maliens se replient dès le début de l'attaque, le camp est envahi en une heure, puis il est pillé et en partie détruit par les djihadistes. Selon un sous-officier affecté dans la zone, . Les affrontements dans cette localités se poursuivent cependant pendant deux jours. L'armée malienne dépêche des renforts et des forces spéciales maliennes sont déployées le matin du 30 septembre. Le bataillon du G5 Sahel lance alors une contre-attaque pour reprendre deux de ses positions tombées aux mains des djihadistes à Boulikessi. Les troupes maliennes bénéficient de l'appui de deux avions de chasse Mirage 2000 et de deux hélicoptères Tigre français de la force Barkhane, venus de Gao et le soutien de l'armée burkinabée. Les aéronefs n'effectuent pas de bombardements et se contentent de survoler la zone à basse altitude pour mettre en fuite les djihadistes. La force Barkhane n'engage pas d'appui au sol, mais des forces spéciales française auraient été déployées. Le matin du octobre, le camp de Mondoro est repris. Les combats se poursuivent toute la journée à Boulikessi, qui est repris à son tour dans la soirée par l'armée malienne.