En 1578, il prit Limbourg et le château de Dalhem. En juin 1579, Maastricht est enlevée par les troupes d'Alexandre Farnèse après 4 mois de siège au cours duquel Mondragón a joué un rôle décisif pour obtenir cette victoire qui a permis à l'Espagne de récupérer le sud des Pays-Bas espagnols. Mondragón est allé en Espagne pour rendre compte à Philippe II de la situation générale dans les Pays-Bas espagnols.