Posteriormente, asistió a la Universidad Estatal de Misisipi donde jugó con los Mississippi State Bulldogs desde 2013 a 2015. Jones apareció en los 13 juegos e hizo tres aperturas como estudiante de primer año en 2013. Tuvo 32 tacleadas y tres capturas (sacks). Como estudiante de segundo año, apareció en los 13 juegos y tuvo 26 tacleadas y tres capturas. Como júnior, comenzó los 13 juegos, registrando 44 tacleadas y 2.5 capturas. Tras la conclusión de su tercer año, Jones tomó la decisión de renunciar a su último año universitario y entrar en el Draft de la NFL de 2016.