11 Mayıs 2011'de Eugene, 2009'da "Creating Destiny" dizisinin "başrol oyuncusu" Ki Tae-young ile evleneceğini duyurdu. Düğünleri 23 Temmuz 2011'de Anyang, Gyeonggi-do'daki Seul Merkez Kilisesi'nde düzenlendi. Ünlü çiftlerin günlük evli hayatlarını filme alan bir realite şovu olan "Super Couple Diary'de" yer alan ilk çift onlardı. Eugene, 12 Nisan 2015'te Lo-hee adında bir kızı olan ilk çocuklarını doğurdu. Ayrıca 18 Ağustos 2018'de başka bir kız çocuğu olan Lo-rin'i doğurdu. MV Sewol'un batışından sonra Eugene hayranları, Evanjelik Vaftiz'in Kurtuluş mezhebine olan inancından şüphe etmeye başladı. Evangelical Baptist Kilisesi'ne inanmadığını, 32 yıl önce Evanjelik Baptist Kilisesi'nden ayrılan Kore Hristiyanlığı Baptist Kilisesi'nde olduğunu söyledi.