Na zijn vrijlating in 1939 trok Pijade naar zijn geboortestad Belgrado, maar werd in 1941 opnieuw gearresteerd. Na de inval van de Asmogendheden in april 1941 werd hij vrijgelaten en voegde zich bij het partizanenleger van Tito. In juli 1941 was hij een van de leiders van de opstand in Montenegro tegen de Italiaanse bezetter. Pijade viel echter vooral op vanwege het geweld tegen alle landgenoten die weigerden zich bij Communistische Partij te voegen. Hij trad zeer gewelddadig tegen hen op en dreef sommige richting de Četniks, die later in de oorlog samenwerkten met de Duitsers en Italianen. Pijades handelswijze was de reden voor Tito om hem terug te roepen.