Галлиполи стал главным перевалочным пунктом для османских армий, двигавшихся между Европой и Азией, защищенный османским флотом, который имел свою главную базу в городе. Султан Баязид I (1389—1402) укрепил Галлиполи и укрепил его стены и оборону гавани, но первоначально слабый османский флот оставался неспособным полностью контролировать проход через Дарданеллы, особенно когда ему противостояли венецианцы. В результате во время Турецко-венецианской войны (1463—1479) оборона пролива была усилена двумя новыми крепостями, а в Стамбуле был создан Османский имперский арсенал. Галлиполи оставался главной базой османского флота вплоть до 1515 года, когда его перенесли в Стамбул. После этого она начала терять свое военное значение, но оставалась крупным торговым центром как важнейший пункт пересечения Азии и Европы.