Церковь имела высокую колокольню, сады на склоне со стороны реки Вислы, а весь комплекс был окружен стеной. Помимо монахинь, монастырь принимал мирян, часто защищая их от наказания или публичной клеветы. Конгрегация бернардинцев в Варшаве также имела второй деревянный монастырь в Праге, который практически был ликвидирован после пражской резни в 1794 году.