В послевоенный период отношения двух стран складывались враждебно, в частности вследствие помощи Москвы греческим коммунистам в начавшейся гражданской войне, хотя помощь была сравнительно незначительной и осторожной, так как Сталин оставался верен Соглашению о процентах 1944 года, согласно которому Греция отходила в сферу британского влияния. Например, 23 ноября 1945 года Политбюро ЦК ВКП(б) выделило Компартии Греции 100 тыс. долларов, а согласно распоряжению советского правительства от 24 апреля 1946 года КПГ были отправлены ротационная машина и 200 тонн газетной бумаги. Москва не признала прошедший в 1946 году в Греции референдум, по итогам которого было решено сохранить монархию. Ещё до проведения этого референдума советский посол контр-адмирал Родионов в августе 1946 года был отозван и вернулся в Грецию только в январе следующего года.