En 1998, Masterkova remporte le titre continental du 1 500 m à l'occasion des Championnats d'Europe d'athlétisme de Budapest, devançant la Portugaise Carla Sacramento et la Suissesse Anita Weyermann. En fin de saison, elle remporte la Finale du Grand Prix à Moscou et la Coupe du monde des nations de Johannesburg. En 1999, elle établit la meilleure performance de sa carrière sur 800 m en réalisant 1 min 55 s 87 lors du meeting de Moscou. Alignée sur deux épreuves lors des Championnats du monde d'athlétisme de Séville, elle se classe tout d'abord troisième du 800 m dominé par la Tchèque Ludmila Formanová, avant de remporter cinq jours plus tard la finale du 1 500 m en 3 min 59 s 53 devant l'Américaine Regina Jacobs.