Мата пропустил все предсезонные игры «Челси», поскольку он играл за сборную Испании на летних Олимпийских играх 2012 года в Лондоне, но он вернулся к матчу Суперкубка Англии против «Манчестер Сити» и был заменен на 74 минуте на Дэниеля Старриджа. Свой первый ассист в сезоне Мата сделал 22 сентября 2012 года в матче против «Сток Сити», отдав голевую передачу на Эшли Коула. Он забил свой первый гол в сезоне в третьем раунде &lt;a href="%D0%9A%D1%83%D0%B1%D0%BE%D0%BA%20%D0%A4%D1%83%D1%82%D0%B1%D0%BE%D0%BB%D1%8C%D0%BD%D0%BE%D0%B9%20%D0%BB%D0%B8%D0%B3%D0%B8%202012/2013"&gt;Кубка Футбольной Лиги 2012/13&lt;/a&gt; в матче против «Вулверхэмптона», закончившегося победой «синих» 6:0.