Juan Rodríguez Ballesteros blieb auch nach dem Sturz seines Nachfolgers und der Wahl einer Regierungsjunta ein Unterstützer der royalistischen Sache in Chile. Die Verfechter der Unabhängigkeit sahen in ihm und der "Real Audiencia" wesentliche Stützpfeiler der spanischen Macht. Als im April 1810 Tomás de Figueroa einen royalistischen Putsch unternahm und scheiterte, löste die Junta unter Fernando Márquez de la Plata die "Real Audiencia" als obersten Gerichtshof Chiles ab. Als Grund wurde die vermeintliche Unterstützung der Verschwörer angegeben – ungeachtet möglicher Sympathien hatten die Richter der "Real Audiencia" allerdings nur zugesagt, die Forderungen der Figueroa-Putschisten bei der Junta vorzutragen.