Während des Dreißigjährigen Krieges drangen die schwedischen Truppen nach Süddeutschland vor und besetzten im Jahre 1631 das katholische Hochstift Würzburg. Dies war für die Schweinfurter, die sich der Reformation angeschlossen hatten, die Gelegenheit, sich an den Bewohnern des angrenzenden Würzburger Amtes Mainburg zu rächen, die im Jahre 1554 im Brandenburgischen oder markgräflichen Kriege Gewalttaten gegen die Schweinfurter ausgeübt hatten. Johann Erhard Heberer wusste sich die Gunst der Stunde zu nutzen. Es gelang ihm, wahrscheinlich auf Vermittlung durch seinen Bruder Marcus Heberer, dem Stadtschreiber von Schweinfurt, der die Verhandlungen mit den Schweden bei der kampflosen Übergabe der Stadt Schweinfurt geführt hatte und deshalb bei den Schweden großes Ansehen genoss, von der schwedischen Oberverwaltung zum Administrator (Vogt) eingesetzt zu werden. Er bezog das fürstliche Schloss zu Mainburg und soll die fürstliche Kasse geleert und den Vorrat an Wein und Getreide sowie Schafe und Schweine nach Schweinfurt gebracht haben. Er ließ es weiterhin zu, dass von ihm angeworbene Soldaten aus Schweinfurt das Amt Mainburg plünderten.