В начале войны корпус под командованием генерал-майора Комиссарова принимал участие в оборонительных боевых действиях в Прибалтике, а затем на холмском направлении. В августе 1941 года управление корпуса было расформировано, а Комиссаров был назначен на должность начальника управления тыла 34-й армии, а в ноябре того же года — на должность командира 183-й стрелковой дивизии, после чего принимал участие в ходе Калининской оборонительной и наступательной операций. В январе 1942 года дивизия была окружена юго-западнее Ржева, из которого вышла в конце февраля в районе позиций 30-й и 39-й армий, однако командир дивизии генерал-майор Константин Васильевич Комиссаров при выходе из него 2 марта 1942 года погиб. Похоронен в деревне Лобзено (, Тверская область). Затем перезахоронен в Кокошкино.