Au cours des siécles, il y a eu de nombreux cas d'affrontements violents entre différentes sectes Hui. Les combats entre les sectes Hui ont conduit à la révolte des Jahriyya dans les années 1780 et a deux révoltes des Dounganes en 1862 et en 1895. Après une interruption lors de l'arrivée au pouvoir des communistes, les combats entre les différentes sectes reprennent au Ningxia, dans les années 1990. Plusieurs sectes refusent les mariages avec les membres d'autres sectes. Une secte soufie fait même circuler un pamphlet anti-salafiste rédigé en arabe. Le mouvement salafiste, qui se développe en Chine grâce au financement de l'Arabie saoudite, du Qatar, du Koweït et des Émirats arabes unis, a facilité la construction de plusieurs mosquées salafistes chinoises. Certains salafistes Hui ont rejoint les rangs de Daech.