فاور در ۲۲ می ۲۰۱۸ با قراردادی دو ساله تا پایان ژوئن ۲۰۲۰ به عنوان سرمربی بروسیا دورتموند انتخاب شد. در اولین فصل حضورش در این تیم به اولین سرمربی دورتموند تبدیل شد که در ۱۵ بازی اول خود در بوندس‌لیگا شکست‌‌ناپذیر بوده است. این بازی‌ها شامل پیروزی ۴-۱ مقابل لایپزیگ، پیروزی ۷-۰ مقابل نورنبرگ و همچنین پیروزی ۴-۰ برابر اتلتیکو مادرید می‌شود. فاور با بروسیا دورتموند توانست در ۳ آگوست ۲۰۱۹ پیروز سوپر جام فوتبال آلمان ۲۰۱۹ شود. در ژوئن ۲۰۱۹، قرارداد فاور با این تیم به مدت یک فصل دیگر تا پایان ژوئن ۲۰۲۱ تمدید شد. وی در ۱۳ دسامبر ۲۰۲۰، پس از کسب نتایج ضعیف و در نهایت شکست خانگی ۵-۱ برابر تیم اشتوتگارت برکنار شد.