En , Bouniatchenko accepta de collaborer avec les Allemands contre l'Union soviétique. En , peu avant de la fin de la guerre, il changea encore de camp et participa au soulèvement de Prague aux côtés de la résistance tchèque. Bouniatchenko a été capturé à au sud-est de Plzeň par des soldats de la 31e armée, puis pendu pour haute trahison avec les autres dirigeants de l'armée Vlassov.