De nouveau commandant le génie de l'Armée d'Italie sous Masséna en 1805, il est nommé commandant en chef le génie de la Grande Armée le . Il sert à Golymin le 26 décembre, à Eylau le , élève des têtes de pont revêtues de bois, pouvant servir de camps retranchés à Praga, Serock et Modlin. Les glaces enlevant sans cesse les ponts de bateaux, il fait construire trois ponts sur pilotis sur des rivières plus larges que le Rhin. Pendant le repos de l'armée, il se rend au siège de Kołobrzeg, puis va prendre le commandement de celui de Dantzig, mémorable par les difficultés rencontrées par les assiégeants et par le peu de moyens mis à leur disposition. Ce n'est qu'après 51 jours de tranchée ouverte que la place capitule. Il termine cette campagne en juillet 1807 par le siège de Stralsund, que les Suédois finissent par évacuer. Avant de rentrer en France, il fait fortifier Thorn, Marienbourg et Magdebourg.