2009 erreichte Elisabeth Willeboordse das Halbfinale der Europameisterschaften in Tiflis. Nach Niederlagen gegen die Russin Vera Koval und Alice Schlesinger aus Israel belegte sie den fünften Platz. Bei den Judo-Weltmeisterschaften 2009 in Rotterdam besiegte sie die Israelin im Viertelfinale und gewann auch das Halbfinale gegen die Slowenin Urška Žolnir. Im Finale von Rotterdam unterlag sie der Japanerin Yoshie Ueno und erhielt die Silbermedaille. Bei den Judo-Europameisterschaften 2010 in Wien gewann sie ihren nach 2005 zweiten Titel durch einen Finalsieg über die Italienerin Edwige Gwend. Bei den Weltmeisterschaften 2010 in Tokio verlor sie im Viertelfinale gegen ihre Landsfrau Anicka van Emden und belegte den siebten Platz. Beide Niederländerinnen waren Mitglied der Mannschaft, die 2010 den Weltmeistertitel im Teamwettbewerb gewinnen konnte. Bei den Judo-Weltmeisterschaften 2011 in Paris verlor Willeboordse das Halbfinale gegen die Französin Gévrise Émane, den Kampf um die Bronzemedaille gewann Annicka van Emden. Zum Abschluss ihrer Karriere belegte Elisabeth Willeboordse den siebten Platz bei den Olympischen Spielen 2012 in London.