黄海海戦後の西京丸は修理の後、引き続き徴用船として活動。1895年5月8日以降の台湾平定にも参加した。最中の10月28日に台湾征討近衛師団長北白川宮能久親王が台南にて薨去。西京丸は能久親王の遺体を安平から日本に運搬した。この際、表向きには「（能久親王は）御病気ニテ御帰京遊バサル」ということになっていた。戦争終結後、西京丸は徴用を解除された。