幕府にとって運の悪い事に、この時期は火器の飛躍的発展期と重なったため、1862年発足の幕府陸軍とこれを参考とした諸藩が導入した従来のマスケット銃（日本ではゲベール銃と呼ばれた）主体の戦列歩兵方式による密集隊形での歩兵運用は、発足の時点で既に時代遅れの存在となっており、第二次長州征伐に参戦した幕府陸軍と諸藩兵は、下関戦争での惨敗から大村益次郎指導下で独自の軍制改革を実行し、長射程・高命中精度のミニエー銃(長州藩は薩長同盟により薩摩藩を経由して英国のグラバー商会からエンフィールド銃を購入していた)を装備し、散兵中心の歩兵運用をオランダ・フランス軍制の文献分析を通じて構築していた長州諸隊に惨敗を喫した。