Po zakończeniu kariery piłkarskiej Dussuyer został trenerem. W latach 1996–2002 był asystentem w AS Cannes, a w latach 2002–2004 był selekcjonerem reprezentacji Gwinei, która pod jego wodzą wystąpiła w Pucharze Narodów Afryki 2004. W latach 2006–2007 samodzielnie prowadził AS Cannes, a w 2008 roku został selekcjonerem reprezentacji Beninu, który poprowadził w Pucharze Narodów Afryki 2010.