Nach Kriegsende wurde Obernitz 1919 aus dem Militärdienst verabschiedet. Danach beteiligte er sich an den Spartakistenkämpfen in Berlin. In den ersten Nachkriegsjahren absolvierte Obernitz ein Studium der Landwirtschaft an der Universität Bonn, der TH Darmstadt und der TH München, um seinen Lebensunterhalt anschließend als Gutspächter und -inspektor zu bestreiten. Von September 1922 bis Mai 1924 war er MG-Kompanieführer bei der Marine-Brigade Ehrhardt. Von 1924 bis 1926 war er Reichsgeschäftsführer des Bund Wiking. Obernitz ehelichte in Dessau 1923 Waldtraut von Beulwitz; das Paar bekam mehrere Kinder. Diese Ehe wurde 1934 in Nürnberg geschieden.