Fallecería poco después, cuando se disponía a viajar a Madrid para formar parte de la discusión que allí se llevaría a cabo sobre el futuro de Portugal. Con la proclamación de Juan IV como rey de Portugal, su viuda fue atacada por los insurrectos portugueses, lo cual obligó a que las tropas leales a Madrid a intervenir para protegerla. Finalmente, ella, junto con su hijo, Lorenzo Pires de Castro, III Conde de Basto, leales a Felipe IV, se exiliaron en Madrid junto con el resto de aristócratas portugueses exiliados por la proclamación del Gobierno de la Casa de Braganza.