Il 20 giugno 2018 la SPAL comunica alla Lega di aver esercitato il diritto di riscatto sul calciatore. Nonostante l'acquisizione in prestito di Vanja Milinković-Savić dal Torino, Gomis inizia il campionato 2018-2019 da titolare, per poi perdere il posto nella seconda parte di stagione in favore di Emiliano Viviano.