Il commence la saison 2012-2013 par un carton rouge à la suite d'un tacle dangereux, lors du Community Shield, opposant les Blues à Manchester City (défaite 3-2). Une semaine plus tard, la Premier League commence. Chelsea se rend à Wigan. Dès la de jeu, Ivanovic ouvre le score à la suite d'un superbe enchaînement d'Eden Hazard. Chelsea remporte finalement ce match 2-0.