Va ser lliurat al Tribunal per als Judicis de Nuremberg sota l'acusació de conspirar per cometre crims de guerra, crims contra la pau i crims contra la humanitat, però va ser absolt per falta de proves. Més tard va ser arrestat i condemnat a nou anys de presó com a part d'un procés de desnazificació. No obstant això, va ser posat en llibertat en 1950, abans de complir la condemna, ja que va quedar clar per al tribunal que Fritzsche era innocent de les acusacions plantejades.