Während der Ursprung der "Clodt" ungesichert ist, teils in Westfalen teils im Niederdeutschen vermutet wird, beginnt die urkundlich greifbare Geschichte der Familie im 16. Jahrhundert in Reval. "Rolof Clodt" soll sich nach Reval begeben haben und früh verstorben sein. Von seinen Söhnen war "Heinrich" 1571–1578 Ratsherr in Reval, 1574 war er Unterhändler der Stadt um einen Waffenstillstand im livländischen Krieg mit den Russen auszuhandeln. Der andere Sohn "Jost" (* 1517; † 1572) war zunächst Syndikus in Reval sowie Rat des letzten Landmeisters des Deutschen Ordens Gotthard Kettler. Als späterer Kanzler Kettlers und Oberrat im Herzogtum Kurland und Semgallen, wurde ihm von diesem am 22. März 1561 das Ordensschloss Jürgensburg, nach dem das Geschlecht fortan seinen Namen führt, verliehen. Am 1. August 1566 erging für ihn ein polnisches Adelsdiplom.