Однако летом 1918 года турецкие войска были уже под стенами Баку. В условиях отсутствия помощи со стороны Советской России и усилившегося английского влияния Бакинский Совет был распущен, а власть в Баку взял Центрокаспий. Шаумян и бакинские комиссары предприняли неудачную попытку эвакуироваться, но были переправлены на пароходе «Туркмен» в Красноводск, арестованы и расстреляны.