К удивлению многих, Клэнси выступил в защиту ислама сразу после теракта 11 сентября 2001 года, во время интервью CNN позже в этот день. Тесно связан с генералом Энтони Зинни (), критиковавшим войну в Ираке. Они вместе работали над двумя книгами.