En avril et mai 1992, au cours de la Guerre de Bosnie-Herzégovine, Kozarac est encerclée par les troupes de l'Armée populaire yougoslave (JNA) et des unités de la République serbe de Bosnie qui entrent dans la ville le ; beaucoup d'infrastructures sont détruites et une partie de la population est déportée dans les camps d'Omarska, Keraterm et Trnopolje. En tout, personnes ont disparu ou ont été tuées dans la localité. Depuis 1998, on assiste à un retour massif des populations déplacées, avec la construction de maisons et la reconstruction des infrastructures.