В составе сборной Чехии Соботка принимал участие на Кубке мира 2016 года, а также на 3-х чемпионатах мира: 2014, 2015 и 2017 годов. На чемпионатах мира 2014 года в Минске и 2015 года в Праге, чешская сборная занимала 4 место, остановившись в шаге от медалей. Всего за сборную Соботка провёл 41 матч, набрал 18 очков (9 шайб + 9 передач).