Во время Первой Шлезвигской войны (1848—1851) Вильгельмина Мария приняла сторону супруга, выступавшего против Дании. Такая позиция привела к разрыву отношений между ней и датской королевской семьей. В то время она жила в Дрездене. В 1852 году, после примирения, вместе с мужем вернулась на родину, где они поселились в замке Лаузенлунд. Любовь соотечественников к её родителям способствовала восстановлению былой популярности принцессы у датского народа.