В XII — начале XIII веков Шарукань запустел. В 1223 году был разрушен монголами во время рейда корпуса под командованием Джэбэ и Субедея. Половцы бежали на запад, надеясь найти союзников в лице Руси. После битвы на Калке некоторое время население города сохранялось, но повторный приход монголов во главе с Батыем заставил половцев уйти навсегда (1237).