Patrick Pemberton maakte zijn debuut in het Costa Ricaans voetbalelftal op 5 september 2010 in een vriendschappelijke wedstrijd tegen Jamaica (0–1). Hij speelde mee in twee wedstrijden in de laatste ronde van het kwalificatietoernooi voor het wereldkampioenschap 2014. Hij won met Costa Rica de Copa Centroamericana 2013 door in de finale Honduras met 1–0 te verslaan. Nadien werd Pemberton door de UNCAF uitgeroepen tot zowel doelman als speler van het toernooi.