1991년에 시에라리온 내전이 시작된 후 CDC는 Segbwema에서 프로그램을 철수했다. 콘테와 그의 의료진은 Segbwema에서 Kenema Government Hospital (KGH)로 옮겨 세계에서 유일한 라싸열 격리 병동을 20년간 운영하였다. 콘테는 영국의 자선 단체인 Merlin과 협력하여 시에라리온에서 라싸열을 예방하기 위한 공중 보건 활동을 펼쳤다. 자금과 장비의 지원이 적었음에도 불구하고, 콘테는 라싸열의 치료에 관한 연구를 지속하여 치명률을 낮추고, 수많은 생명을 구했다. 하지만 그는 2004년 에 일어난 주사바늘 사고로 인해 라싸열에 걸려 숨졌다.