Estuvo guerreando en Flandes hasta que, en 1600, el emperador Rodolfo II lo nombró maestre de Campo y gobernador de Hungría. Luchó en las tropas del Emperador, que también era rey de Hungría, contra los otomanos y sus vasallos protestantes (luteranos, calvinistas y unitaristas) durante la llamada “larga guerra turca”, o Guerra de los Trece Años (1593-1606).