В 1440—1444 годах Софья отошла от активной политической деятельности. Она жила в Санокском замке, интересовалась, преимущественно, ведением хозяйства и внимательно следила за информацией, поступающей из Венгрии. Благодаря своей активной деятельности в борьбе с османами её старший сын Владислав прославился в Европе. В декабре 1444 года Софьи стали достигать слухи о его трагической гибели в битве при Варне. Однако, так как тела никто не видел, Софью не покидала надежда, что Владислав жив и попал в плен к туркам. Время шло — известий о судьбе Владислава не поступало. В этих условиях Софья направила все усилия на обеспечение польского трона своему младшему сыну.