Em 1997, o então presidente nigeriano, Sani Abacha, sugeriu o nome de Bonfrere para reassumir o comando da Nigéria, mas o sérvio Bora Milutinović acabou sendo o escolhido para a função (Philippe Troussier e Monday Sinclair haviam passado no comando, sem sucesso), a contragosto do general, que viria a falecer três dias antes da Copa de 1998. Bonfrere regressaria às "Super Águias", entre 1999 e 2001, mas acabou não permanecendo para a Copa Africana de Nações (foi substituído por Shaibu Amodu, que havia sucedido o holandês em 1995).