Gli ultimi monaci vennero dispersi e gran parte del monastero venne distrutto dagli ottomani durante la conquista di Costantinopoli nel 1453: la basilica, risalente al V secolo, venne trasformata da Bayezid II nella moschea dell'Imrahor ("İmrahor Camii" in Turco, dove "Imrahor" era lo stalliere capo del palazzo imperiale).