Bei der Qualifikation zur Weltmeisterschaft 2014 in Brasilien schwächelte Mexiko stark und gewann von den ersten sechs Spielen in der vierten Qualifikationsrunde nur ein einziges Spiel. Im Juni nahm er mit "El Tri" am FIFA-Konföderationen-Pokal 2013 in Brasilien teil, wo die Auswahl in der Gruppenphase ausschied. Am CONCACAF Gold Cup 2013 nahm er nicht teil, in dem Mexiko im Halbfinale an Panama scheiterte. Obwohl man in den verbleibenden vier Qualifikationsspielen nur einen Sieg schaffte, qualifizierte man sich für die interkontinentalen Play-offs gegen Neuseeland. Cheftrainer de la Torre wurde während dieser Schwächephase entlassen und sein Nachfolger Víctor Manuel Vucetich wurde nach dem letzten Qualifikationsspiel gefeuert. In Abwesenheit Guardados schlug Mexiko Neuseeland zwei Mal deutlich und qualifizierte sich mit einem Gesamt-Score von 9:3 für die Endrunde der Weltmeisterschaft in Brasilien. Am 6. März 2014 bestritt Andrés Guardado beim 0:0-Unentschieden gegen Nigeria sein 100. Länderspiel für Mexiko.