La saison 2002-2003 est la plus prolifique en termes de podiums pour Akhatova, puisqu'elle remporte sa première course en Coupe du monde à l'occasion de la mass start d'Antholz, puis ajoute deux podiums à son palmarès avant les Championnats du monde à Khanty-Mansiïsk en Russie, où elle remporte le titre mondial du relais, puis le dernier jour le titre sur la mass start. Elle est la dauphine de Martina Glagow au classement général de la Coupe du monde.