Следующим пострадал младший из братьев — генерал-аншеф граф Валериан Зубов, находившийся в тот момент в Закавказье в качестве главнокомандующего в Русско-персидской войне. Император счёл результаты его похода ничтожными, а издержки — чрезмерными и в январе 1797 года разослал приказ о возвращении в Россию напрямую командирам отдельных частей его армии, минуя главнокомандующего и штаб. Такое явное нарушение принципа единоначалия неминуемо привело бы к дезорганизации войск и позорному поражению, однако генералу Зубову чудом удалось избежать катастрофы. 27 апреля 1797 года, во время обратного похода, он был отставлен от службы и отправился в ссылку в своё подмосковное имение.