Nato a Bucarest, discendeva da una famiglia aristocratica arumena. Suo padre Marcel, laureato all'Università Tecnica di Berlino e capitano nel corpo di ingegneri dell'esercito romeno, morì di influenza spagnola nel 1918; sua madre Tinca, fu l'ultima discendente della famiglia Gradişteanu di origini boiarde (secondo Djuvara, aveva parentele con tutte le famiglie boiarde in Valacchia). Gli zii di Djuvara, Trandafir e Alexandru Djuvara, erano personaggi pubblici di rilievo. Djuvara nacque durante la prima guerra mondiale; da bambino fu portato in rifugio dalla sua famiglia a Iași dopo l'occupazione della Romania meridionale da parte degli imperi centrali e poi, attraverso l'Impero Russo, in Belgio (dove Trandafir Djuvara era Ministro plenipotenziario).