Во время французской интервенции в Мексику, Сонора была захвачена французскими войсками в качестве части военных усилий для воцарения ставленника Франции императора Максимилиана I в качестве монарха Мексики. Порт Гуаймас был атакован войсками под командованием А. Кастаньи (Armando Castagny), заставив мексиканские войска под командованием Пескейры и генерала Патони отступить к северу от города. Французские войска снова напали на мексиканские в местечке Ла Пасьон (La Pasión), и снова одержали победу. Французы были непобедимы в штате, пока в битве у Льянос де Урес в 1866 не были разбиты Пескейрой, Хесусом Г. Моралесом (Jesús García Morales) и Анжелом Мартинесом (Ángel Martínez). Вскоре после этого действующая конституция штата была написана в 1871, а столица была перенесена в Эрмосильо.