A partir de 1990, Rostropovich passou a ser novamente bem-vindo nos círculos oficiais da Federação Russa, chegando mesmo a participar de alguns momentos da atribulada conjuntura política do país. Em 1991, por exemplo, ao ser informado de que os tanques estavam nas ruas de Moscou, Rostropovich reagiu ao seu estilo: comprou uma passagem aérea para o Japão, num voo com escala na capital russa. Durante a parada, saiu do aeroporto e foi ao encontro de Boris Yeltsin, na esperança de ajudar a pacificar os ânimos. Em 1993, novamente apoiou Yeltsin e, no auge da crise constitucional, regeu a "National Symphony Orchestra" em plena Praça Vermelha. Ele também manteve um relacionamento amistoso com Vladimir Putin.