Šindelin isä Jaromír on entinen jääkiekkomaalivahti ja maailmanmestari (vuodelta 1985), joka on pelannut myös SM-liigassa. Näin ollen myös Jakub pelasi varhain juniorina Suomessa Kiekko-Reippaassa ja Tapparassa. Jaromír on sittemmin toiminut päävalmentajan ja urheilujohtajan tehtävissä Extraligassa asti. Jakub Šindelin setä Roman pelasi omalla urallaan puolustajana HC Třinecin Extraliga-joukkueessa.