В 1995 году Шолль стал игроком национальной команды, а на следующий год выиграл чемпионат Европы в Англии. До этого выступал в составе молодёжной сборной Германии до 21 года (5 матчей и 3 гола). В финальном противостоянии ЧЕ-1996 против Чехии провёл на поле 69 минут, после чего был заменён на Оливера Бирхоффа, который впоследствии стал автором золотого гола. Чемпионат мира 1998 года во Франции полузащитник пропустил из-за конфликта с главным тренером Берти Фогтсом. Несмотря на хорошие показатели в чемпионате, Шолль не попал в заявку на мундиаль. Принимал участие в чемпионате Европы 2000 года в Бельгии и Нидерландах, где забил единственный гол сборной Германии в матче группового этапа против Румынии.