2002 року Футбольна федерація Тунісу запросила Роже до роботи зі збірною Тунісу. Лемер привів команду до перемоги в Кубку африканських націй 2004 року та вивів її до фінальної частини чемпіонату світу 2006 року. У лютому 2008 року його було звільнено після програшу збірній Камеруну в чвертьфіналі Кубка африканських націй 2008 .