De nombreuses autres actions internationales suivent : en Albanie afin d'encourager le déroulement démocratique des élections de 1987, au Mozambique durant deux années entre 1990 et 1992, permettant le 4 octobre 1992 la signature du traité de paix mettant fin à la guerre. Le 13 janvier 1995 la « plate-forme de Sant'Egidio », permet de réunir des partis politiques de l’opposition algérienne afin de trouver une solution politique et pacifique à la guerre civile algérienne. Entre 1996 et 1998 l'organisation négocie avec le pouvoir serbe pour la réouverture des écoles et facultés kosovares, négociations entre la guérilla et le pouvoir au Guatemala, participation aux négociations ayant amené à la signature des accords d'Arusha au Burundi, etc.