После завоевания Никеи османами монастырь продолжал действовать, и, хотя источников о его османском периоде мало и дата его закрытия неизвестна, в 1830-х годах он ещё существовал. Церковь Успения действовала для местных христиан до 1922 года, когда после победы в войне с греками турецкая артиллерия уничтожила храм. От него остались руины оснований колонн, окружённые жилой застройкой Изника. Мозаики храма на рубеже XIX—XX веков были тщательно задокументированы, в том числе Русским археологическим институтом в Константинополе, и после уничтожения продолжают изучаться.