Van 2000-2004 was Vogts bondscoach van Schotland. Dit werd geen succes. Hij wist met de Schotten geen kwalificatie af te dwingen voor het WK 2002 en het EK 2004. In de play-off voor het EK 2004 verloor hij met Schotland van het Nederlands elftal: op de 1-0 overwinning op eigen veld volgde een 6-0 nederlaag in Amsterdam.