Murat Akça durchlief über die Jahre türkische U-15, Türkei U-16, Türkei U-17, Türkei U-18, Türkei U-19 und U-21 Juniorennationalmannschaften. 2009 nahm er mit der türkischen U-19 an der U-19-Fußball-Europameisterschaft 2009 teil. Hier schied man bereits in der Gruppenphase aus dem Turnier aus.