Der Florentinische Codex beschreibt die Eroberung Mexikos und die anschließende Missionierung, die Sozialstruktur der aztekischen Gesellschaft sowie mesoamerikanische Götter und Moralvorstellungen. Darüber hinaus von Bedeutung sind die Beschreibungen und Abbildungen heilkräftiger Pflanzen sowie der Tierwelt Mexikos.