В июне 2003 года Гамкрелидзе сменил Гачечиладзе на посту лидера «Новых правых». Как отмечали наблюдатели, в ноябре 2003 года под руководством Гамкрелидзе «Новые правые» не поддержали «революцию роз» — бескровный государственный переворот, приведший к отстранению от власти Шеварднадзе. Это стало поводом для разногласий между Гамкрелидзе и симпатизировавшим революции Гачечиладзе. В итоге последний вскоре покинул объединение. Несмотря на это, «Новые правые» поддержали действия нового президента Михаила Саакашвили по свержению Аслана Абашидзе в Аджарии. На парламентских выборах в марте 2004 года «Новые правые» вместе с движением «Промышленность спасёт Грузию» набрали 7,96 процента голосов. В парламенте Гамкрелидзе возглавил фракцию «Правая оппозиция» и стал членом комитета по обороне и безопасности.