Hanlon spilte ved ujevne mellomrom i løpet av 2009–2010-sesongen, og han deltok bare når en av de faste forsvarsspillerne var utilgjengelige på grunn av skade eller suspensjon. En slik periode var da Sol Bamba deltok med landslaget til Elfenbenskysten i Afrikamesterskapet i fotball 2010, og manager John Hughes beskrev avgjørelsen om å sette Bamba inn på førstelaget igjen på Hanlons bekostning som et av de tøffeste valgene han noen sinne hadde gjort i denne jobben. På slutten av sesongen sa Hughes at Hanlon var en "stor" fotballspiller, men at han trengte å bli tøffere og vise mer lidenskap i spillet.