Após o 11 de setembro de 2001 ataques, nada menos do que oito F-14 esquadrões participaram na Operação Enduring Freedom, voando de longo alcance missões do Oceano Índico para os alvos em redor do Afeganistão e a realização de reconhecimento e de apoio em terra de missões. A partir do início da Operação Liberdade Duradoura para o fim da Operação Anaconda, F-14s do VF-14, VF-41, VF-102, VF-211, e VF-213 caiu mais de de material bélico em alvos.