В составе главной национальной сборной Коста-Рики выступает с 2009 года. В 2011 году стал в составе сборной финалистом Центральноамериканского кубка, где принял участие в том числе и в решающем матче турнира, в котором забил единственный гол своей команды на 73-й минуте встречи. Что, однако, костариканцам не помогло, поскольку в итоге они уступили Гондурасу со счётом 1:2. Кроме того, Маркос с 3 мячами стал лучшим бомбардиром и обладателем «золотой бутсы» турнира (вместе с Рафаэлем Бургосом из Сальвадора). Примечательно, что эти голы стали для Уреньи первыми в составе сборной. 10 февраля 2011 года в товарищеском матче с Венесуэлой (2:2) Маркос забил свой 4-й мяч за сборную.