Le 24 juillet 2019 Filipe Soares s'engage avec le Moreirense FC pour un contrat de cinq ans. Ce club lui permet de découvrir la Liga NOS, il joue son premier match dans la compétition dès la première journée de la saison 2019-2020, face au SC Braga, le 11 août 2019. Il entre en jeu lors de cette rencontre perdue par les siens (3-1). Le 2 février 2020, Soares inscrit ses deux premiers buts pour Moreirense, lors de la victoire de son équipe en championnat contre le Gil Vicente (1-5 score final). Il délivre également une passe décisive pour Pedro Nuno ce jour-là.