Aux élections générales de 1892, l'adversaire de Brunner n'est pas un unioniste libéral, mais un conservateur, George Whiteley, qui est un fabricant de coton de Blackburn. Brunner est réélu avec une majorité accrue de 1 255 voix . Aux élections de 1895, il bat Thomas Ward, un autre conservateur, par 1 638 voix . Les élections générales de 1900 ont lieu pendant la guerre des Boers, à laquelle Brunner s'oppose. Il conserve son siège, mais avec une majorité réduite de 699 voix . Aux élections générales de 1906, l'adversaire de Brunner est le colonel conservateur BN North qui a combattu pendant la guerre des Boers. Brunner augmente sa majorité à 1792 voix . Il continue à être député de Northwich jusqu'aux élections générales de , lorsqu'il décide de ne pas se représenter, en partie pour des raisons de santé et aussi parce qu'il s'inquiète pour la santé de sa femme . Par la suite, il s'installe dans le Surrey, mais continue à jouer un rôle politique lorsqu'il est élu à la circonscription de Chertsey du conseil du comté de Surrey .