Wiosną 2009 Benítez za sumę dwóch milionów dolarów przeszedł do meksykańskiego zespołu CF Pachuca. Tam od razu został podstawowym zawodnikiem pierwszego składu i w meksykańskiej Primera División zadebiutował 18 stycznia 2009 w wygranym 4:1 meczu z Tigres UANL, w którym zdobył także premierową bramkę w tamtejszej lidze. W tym samym, wiosennym sezonie Clausura 2009 zdobył ze swoją ekipą wicemistrzostwo Meksyku, a także zajął drugie miejsce w rozgrywkach kwalifikacyjnych do Copa Libertadores – InterLidze, z czterema bramkami zostając najskuteczniejszym piłkarzem tych rozgrywek. W 2010 roku triumfował natomiast z Pachucą w najbardziej prestiżowych rozgrywkach północnoamerykańskiego kontynentu – Lidze Mistrzów CONCACAF, w finałowym pojedynku z Cruz Azul (1:0) w doliczonym czasie strzelając decydującego o zwycięstwie gola. Kilka miesięcy później wziął udział w Klubowych Mistrzostwach Świata, gdzie jednak Pachuca odpadła już w ćwierćfinale, zajmując piąte miejsce w turnieju.