Ekim Devrimi ile birlikte iktidarı alan Bolşeviklere karşı ayaklanma çıkartmaya çalışır ve başarısız olunca Mançurya’ya kaçar. Ağustos 1918’de bölgeye gelen Çekoslovak Lejyonu sayesinde bazı bölgelerde egemenlik kurar. Bölgede her türlü hırsızlık, yağma, soygun ve katliam düzenleyerek kötü bir şöhrete ulaşmıştır. Sibirya’da genel olarak iktidarı ele alan Beyaz Ordu komutanı Amiral Aleksandr Kolçak istemeyerek de olsa Semyonov’u Chita Garnizon komutanı atar. 1919 yılı başlarında Semyonov kendisini Baykal Kazaklarının Atamanı ilan eder. Semyonov Sibirya Müdahalesi olarak adlandırılan İtilaf Devletlerinin Rus İç Savaşına Beyazlar lehine müdahalesine katılan ve kendi bölgesel amaçları için işgal politikası güden Japonya Ordularının desteğini arkasına alır. Ataman Semyonov’un egemenliğindeki bölge Japonların da desteğiyle genişler.