Efter at Steve Gerrard stoppede sin landsholdskarriere efter EM 2014 blev Rooney udnævnt til ny anfører på landsholdet. 15. november 2014 spillede han sin landskamp nummer 100 og scorede et mål i en kvalifikationskamp til VM i fodbold 2016 mod , og 8. september 2015 satte han i en kvalifikationskamp til EM 2016 ny scoringsrekord for landsholdet med sit mål nummer 50, hvorved han overhalede Sir Bobby Charlton