1 лютого 1997 року дебютував в офіційних іграх у складі національної збірної Китаю в товариському матчі проти США (1:1). У підсумку він став основним гравцем китайської збірної і брав участь з нею в декількох невдалих відбіркових етапах до чемпіонатів світу. Його найбільшим досягненням було срібло на домашньому Кубку Азії 2004. Лі був ключовим гравцем команди, яка дійшла до фіналу і поступилася там Японії з рахунком 3:1.