År 2013 dömdes Praljak av Internationella krigsförbrytartribunalen för det forna Jugoslavien (ICTY) till 20 års fängelse för krigsförbrytelser begångna mot bosniaker i Bosnienkriget (1992–1995). Efter överklagande fastställdes straffet i andra instans år 2017. Under den pågående rättegången den 29 november 2017 drack Praljak kaliumcyanid, ett gift, och avled kort därefter på sjukhuset Haaglanden Medisch Centrum.