L'armée byzantine sous les Comnènes est une force efficace et résiliente mais qui repose trop sur la direction d'un empereur compétent. Après la mort de Manuel en 1180, ce leadership efficace disparaît car Alexis II Comnène, le nouvel empereur, n'est encore qu'un enfant et l'usurpateur Andronic Ier Comnène tente ensuite de briser le pouvoir de l'aristocratie qui fournit les cadres de l'armée. Enfin, la dynastie des Anges ne s'avère pas en mesure de diriger l'Empire aussi efficacement que les Comnènes. Cette faiblesse du gouvernement de l'Empire entraîne l'effondrement du système issu des Comnènes, basé sur la famille impériale au sens large. Les intérêts régionaux d'une aristocratie puissante s'expriment de plus en plus au travers de rébellions armées et de sécessions. Une méfiance mutuelle apparaît entre l'aristocratie et la bureaucratie de la capitale et ces deux facteurs perturbent et affaiblissent l'Empire byzantin. Quand Constantinople tombe en 1204, au moment de la Quatrième Croisade, les États byzantins qui survivent sont le despotat d'Épire, l'Empire de Nicée et l'Empire de Trébizonde. Tous reprennent les structures militaires de la dynastie des Comnènes. Leurs succès, notamment ceux de l'Empire de Nicée qui reprend progressivement le terrain perdu (reconquête de Constantinople en 1261) peuvent être vus comme des exemples d'efficacité de ce modèle militaire. Toutefois, les armées byzantines qui se succèdent, notamment après 1261, sont suffisamment distinctes de celle existante sous la dynastie des Comnènes pour les traiter séparément.