В 1945 году Гюнтер Блобел стал свидетелем пожара в Дрездене ("см". Бомбардировка Дрездена). В 1990-х он основал благотворительную организацию «Друзья Дрездена» с целью восстановления частей города и важных культурных объектов в других частях Германии, пожертвовав на это все деньги, полученные на Нобелевскую премию.