En 1552 les troupes du margrave Albert II Alcibiade de Brandebourg-Kulmbach incendient la collégiale au cours de Seconde guerre des Margraves. Les chanoines s'étaient enfuis avec la Croix sainte, d'abord dans l'église Saint-Ignace, puis ils avaient trouvé refuge jusqu'en 1573 dans l'église du Saint-Esprit sur la Rheinstraße, avant de réintégrer la collégiale enfin restaurée.