L'arco interno o vulcanico si estende per 450 km da Methana, sulla costa orientale del Peloponneso a ovest, fino all'isola di Nisiro, al largo della costa egea della Turchia, a est. Consiste in una serie di isole vulcaniche dormienti o attive tra cui Santorini, il sito della catastrofica eruzione dell'era minoica. Sono presenti anche vulcani sottomarini, di cui il più famoso è il Kolumbo.