Efter kriget i Bosnien och Hercegovina så hade man en hel del problem med att organisera en gemensam fotbollsliga som skulle inkludera klubbar från hela landet. Många av lagen har en stark etnisk prägel och under de första åren (1995-1996) så var, enligt det nationella förbundet, den officiella bosnisk-hercegovinska ligan egentligen bara en liga som omfattade bosniakiska lag. Kroatiska och serbiska lag från Bosnien och Hercegovina valde att spela i sina egna regionala ligor. Detta började sakta men säkert att förändras i säsongen 1997/1998 då bosniakiska och kroatiska klubbar gick samman och organiserade ett gemensamt slutspel, där de bästa klubbarna från de respektive ligorna spelade om mästerskapstiteln. Uefa gav slutspelet officiell status och redan 1998 deltog bosnisk-hercegoviska lag i europeiska cuper. Serberna valde dock att fortfarande stå utanför och spela sin egen liga.