20 мая 1942 года назначен архиепископом Харьковским и Ахтырским, экзархом Патриархии «в областях Украины, освобождаемых от фашистской оккупации». Однако Харьковская военная операция того года провалилась, и по ходатайству депутации горьковской православной общины 13 июля 1942 года он был восстановлен на Горьковской кафедре.