In quello stesso anno Bruce si era anche candidato per la partecipazione alla "British National Antarctic Expedition" guidata da Scott, la sua candidatura venne accettata nel marzo del 1900 ma rinunciò alla partecipazione, perché erano iniziati i preparativi per una spedizione scozzese. Il rifiuto di prendere parte alla spedizione britannica e l'organizzazione di un'iniziativa scozzese suscitarono l'ira di Clements Markham (Presidente della "Royal Geographical Society" e organizzatore della spedizione Discovery), che temeva che venissero distolti fondi e attenzione dalla "British National Antarctic Expedition".