Il 25 maggio, perciò, Jōjima fu trasferito a terra e prese il comando del 3º Distretto navale con quartier generale a Sasebo ma per un breve periodo, giacché il 15 giugno entrò come assistente nello stato maggiore della Flotta Combinata; appena cinque giorni più tardi fu ancora trasferito, questa volta alla testa dell'11ª Divisione navi appoggio idrovolanti, alla data impegnata nell'occupazione di Kiska nelle isole Aleutine. La divisione giunse in Giappone a fine giugno, Jōjima ne assunse ufficialmente il comando e, dopo rifornimento di mezzi e carburante, il 23 agosto fece rotta per il Pacifico meridionale, ancorandosi il 28 alla base delle isole Shortland, nelle Salomone settentrionali. Jōjima prese parte attivamente alla campagna di Guadalcanal. Nella notte tra l'11 e il 12 ottobre guidò l'11ª Divisione (, ) e sei cacciatorpediniere, convoglio che sbarcò indisturbato truppe ed equipaggiamenti a Guadalcanal mentre infuriava la battaglia di Capo Speranza. Continuò a dirigere i convogli di rinforzi fino all'abbandono dell'isola nel gennaio-febbraio 1943.