В начале XIX века Уотерфорд был признан уязвимым, после чего британское правительство установило три башни мартело, чтобы укрепить существующий форт в Дунканноне. В течение этого века в городе активно развивались и процветали такие промышленные отрасли, как производство стекла и судостроение. В 1846—1849 годах на жизни города серьёзно отразился Великий голод, но запасы риса позволили избежать худших последствий катастрофических перебоев в поставке продуктов.