I greci a Creta continuarono a portare avanti delle rivolte popolari e nel 1897, il governo greco guidato da Theodoros Deligiannis, su pressione della popolazione, dichiarò guerra agli ottomani. Ne conseguì la guerra greco-turca del 1897 dove l'esercito greco, male armato ed equipaggiato, venne sconfitto dagli ottomani. Ad ogni modo, l'intervento ancora una volta delle Grandi Potenze portò ad una disfatta poco dolorosa, con la perdita unica dei territori greci al confine con la Turchia, mentre Creta venne istituita come Stato autonomo con commissario il principe Giorgio di Grecia.