Der neue Feldherr der Hugenotten, Coligny, belagerte ohne Erfolg Poitiers. Bei Moncontour traf seine Armee wieder auf Anjou. In der Niederlage bei Moncontour am 3. Oktober 1569 übten die katholischen Truppen, insbesondere die Schweizer Landsknechte, Vergeltung für La Roche-L’Abeille. Coligny, selbst verwundet, verlor ein Drittel seiner Armee und zog sich mit dem Rest Richtung Languedoc zurück. Anjou verzichtete darauf, ihn zu verfolgen, und begann stattdessen eine aufwändige Belagerung der Hugenottenfestung Saint-Jean-d’Angély bei Saintes, die er nach großen Verlusten abbrechen musste. Dadurch hatte Coligny Zeit gefunden, seine Truppen zu reorganisieren. Im Languedoc trafen rund 4000 neue Söldner als Verstärkung ein, die verschiedene protestantische Fürsten rekrutiert hatten. Mit dieser Armee zog Coligny die Rhone aufwärts Richtung Burgund. Am 27. Juni 1570 siegte Coligny bei Arnay-le-Duc über die königliche Armee. Dadurch verbesserte sich Colignys Position in den folgenden Friedensverhandlungen mit Katharina von Medici erheblich.