Alla vigilia della Prima guerra mondiale, tornò a San Pietroburgo, e fu immediatamente esiliato a Tobol'sk in Siberia perché ritenuto una potenziale minaccia per il governo zarista che mantenne l'ortodossia russa come religione di Stato. Mentre era in esilio, iniziò a soffrire di reumatismi, ma si tenne in contatto con i cattolici russi e spedì loro delle lettere. Dopo la Rivoluzione di febbraio, il governo provvisorio ordinò il rilascio di tutti i prigionieri politici, e di conseguenza anche di Leonid. Venne convocato un Sinodo di tre giorni, dal 29 al 31 maggio 1917, della Chiesa greco-cattolica russa aperto in San Pietroburgo sotto la direzione del metropolita Andrej Szeptycki, e in questa occasione, lo ieromonaco venne nominato esarca dell'esarcato apostolico di Russia. Andrej Szeptycki volle concedergli la consacrazione episcopale, ma lo ieromonaco rifiutò la proposta. Il 1º marzo 1921, la sua nomina venne approvata da papa Benedetto XV.