Emmanuel Emenike, Sierra Leone takımı ile dostluk maçına çağrıldı. Daha sonra 23 kişilik 2013 Afrika Uluslar Kupası'na çağrıldı. İlk maçını 21 Ocak 2013'te Burkina Faso'ya karşı oynadı, maç 1-1 sonuçlandı. Fildişi Sahili ile yapılan çeyrek final maçında ülkesi için ilk golünü attı. 3 Şubat'ta karşılaşılan Fildişi Sahili ile yapılan maçta Emenike 30 metrelik serbest vuruştan topu ağlarla buluşturup maçın 2-1 galibiyetle bitmesini sağlamıştı.