Die darauf folgende Weltcupsaison 1988/89 war für Schneider die mit Abstand erfolgreichste. Sie entschied sämtliche sieben Slaloms sowie sechs von sieben Riesenslaloms für sich; hinzu kam ihr einziger Sieg in einer Weltcup-Kombination. Schneider übertraf die bisherige Bestmarke des Schweden Ingemar Stenmark aus der Saison 1979/80, als ihm 13 Siege gelungen waren. Auch blieb sie elf Rennen in Folge ungeschlagen. Überlegen gewann sie die Weltcup-Gesamtwertung. Die einzige Niederlage dieser Saison im Slalom musste sie bei der Weltmeisterschaft 1989 in Vail hinnehmen, als sie hinter Mateja Svet Zweite wurde; sie war bekannt dafür, aus hinteren Positionen noch zum Sieg zu fahren, aber an diesem 11. Februar 1989 lag sie auf der "Piste International" nach dem ersten Lauf nur auf Rang 8, so dass die Aufholjagd nicht mehr ganz klappte. Vier Tage später revanchierte sie sich mit dem zweiten Riesenslalom-Weltmeistertitel.