I början av fortsättningskriget, (se: "Hangöfronten") då Sovjetunionen arrenderade halva Hangö udd led både Lappvik järnvägsstation och stickspåret till hamnen mycket stora skador. En ny järnvägsstation uppfördes 1942, omkring ett år efter det att Sovjetunionen hade lämnat, i förtid sin flottbas på området. En bit från stationshuset uppfördes även en arbetarkasern åt järnvägsarbetarna och ett godsmagasin för inkommande och avgående gods. Stickspåret till den totalförstörda hamnen återuppbyggdes inte efter kriget. Två nya stickspår har sedermera byggts från Lappvik järnvägstrafikplats till de närbelägna industrierna.