La guerre va pourtant contrarier rapidement sa vocation d’artiste. Dès octobre 1942, Pierre Bichet est convoqué par le régime de Vichy, dans le cadre de la conscription obligatoire, afin de partir travailler en Allemagne. De retour à Pontarlier, il tente avec des camarades d’organiser un réseau d’aide aux réfractaires et, à l’issue d’une réunion clandestine, se fait arrêter par la Gestapo. Incarcéré à la prison de Pontarlier en mars 1943, il s’échappe grâce à l’intervention du Procureur de la République Paul Armand, alors membre d’un réseau de résistance. Il gagne la zone libre et trouve refuge comme bûcheron dans le Vercors où s’installent les premiers maquis. Pierre Bichet rejoint rapidement l’un d’eux, dans le cirque de Malleval. En janvier 1944, Pierre Bichet et son ami Paul Bulle de Pontarlier, sont parmi les rares rescapés de l’anéantissement de ce maquis et du massacre de Malleval sous le feu des Allemands. Il est ensuite recueilli par le maquis de Massif de la Chartreuse, puis gagne le Grésivaudan et rejoint ses montagnes jurassiennes pour participer à la libération du Haut-Doubs. Après la libération de Pontarlier, il se porte volontaire au Bataillon de chasseurs alpins et termine la guerre sur le front des Alpes en France et en Italie.