Después de los atentados terroristas del 11 de septiembre de 2001, la mayoría de las compañías aéreas mexicanas, registraron una disminución en el flujo de pasajeros, a excepción de Aviacsa. De hecho, en 2003, de las 13 compañías de transporte aéreo registradas en México, Aviacsa fue la única en registrar ganancias. Ese año, la compañía reportó que controlaba alrededor del 13% del mercado en México, justo después de Aeroméxico y Mexicana de Aviación.