En 1702, Shovell rapporte en Angleterre le butin pris à Vigo sur la flotte franco-espagnole après leur capture par l'Amiral Rooke, et en il est nommé Rear-Admiral of England. Toujours en 1704, il sert sous les ordres de l'amiral Rooke en Méditerranée et participe à la prise de Gibraltar. Le Shovell devient Admiral of the Fleet et le mai il reçoit le commandement du corps expéditionnaire en Méditerranée, conjointement avec Charles Mordaunt, de Peterborough, avec lequel il assiège et prend Barcelone. En sa carrière militaire est à son apogée lorsqu'il est nommé Commandant en chef des flottes britanniques alors qu'il et à Lisbonne. À l'été 1707, il commande la composante navale de assiège Toulon. Pendant la guerre de Succession d'Espagne, une force combinée anglaise, autrichienne et hollandaise placée sous le commandement du Prince Eugène assiège et tente de prendre le port français de Toulon. Pendant cette campagne, qui dure du au , la Grande-Bretagne déploie une flotte en soutien aux unités terrestres. Conduite par Shovell, les vaisseaux anglais croisent en Méditerranée, attaquent Toulon et infligent des dégâts à la flotte du Levant basée dans le port. Cette campagne est un échec et l'alliance est défaite par les armées franco-espagnoles. La flotte anglaise reçoit alors l'ordre de se retirer, à Gibraltar puis à Portsmouth à la fin octobre.