В октябре 1919 года М.П. Строев был направлен представителем Главкома в Тульский укреплённый район. Там он оказал помощь в организации наземной обороны Тулы от рейда 4-го Донского корпуса генерала К. К. Мамонтова и других наступавших войск А. И. Деникина, одновременно занимался организацией воздушной обороны, был назначен начальником Авиационной группы особого назначения Южного фронта. В состав группы вошли 41-й и 51-й разведывательные и 8-й истребительный отряды, отряд воздушных кораблей «Илья Муромец» и отряд особого назначения из инструкторов Московской школы военных лётчиков. Командуя Группой, участвовал в сражениях с 4-м Донским корпусом и 3-м Кубанским казачьим корпусом А. Г. Шкуро в ходе Воронежско-Касторненской операции.