Згодом данська збірна не зуміла зберегти форму й високий рівень гри, і двома роками пізніше на чемпіонаті Європи 2000 в Бельгії і Нідерландах виступила невдало, програвши всі групові матчі і не потрапивши до плей-оф. Під час турніру Юганссон оголосив про свій намір не продовжувати свій контракт зі збірною Данії по закінченні чемпіонату. Всього з данською збірною Юганссон провів 40 матчів, у яких було 17 виграшів, 9 нічиїх і 14 поразок.