Tập đoàn quân 3 tham chiến lần đầu tiên vào tháng 9 năm 1939, trong chiến dịch tại Belarus và Ba Lan. Cuộc xâm lược được tiến hành theo các điều khoản của Hiệp ước Molotov-Ribbentrop, chia cắt Ba Lan cho Liên Xô và Đức Quốc xã và đảm bảo rằng không nước nào sẽ tấn công nước kia.