1998年にカビラの元同盟者であったウガンダとルワンダが彼に敵対して、新たな反政府勢力コンゴ民主連合 (RCD) を支援するようになった。カビラは南部アフリカ開発共同体に軍事介入を要請し、ジンバブエ、ナミビア、アンゴラとともに第二次コンゴ戦争を戦い、南部と西部を維持した（北部はウガンダ、東部はルワンダに支配された）。