Nissen kandidierte bei den Bundestagswahlen 2005, 2009, 2013 und 2017 im Wahlkreis Frankfurt am Main II für das Direktmandat, unterlag jedoch stets den Kandidatinnen der CDU, Erika Steinbach (2005, 2009, 2013) bzw. Bettina Wiesmann (2017). Zur Bundestagswahl 2021 wurde Nissen von ihrer Partei nicht aufgestellt. Sie kandidierte auch nicht wieder für die Landesliste der SPD-Hessen.