Im Jahr darauf ereilte ihn bei den Leichtathletik-Hallenweltmeisterschaften 1999 in Maebashi über 400 m erneut das Aus in der ersten Runde. Bei den WM in Sevilla stellte die Schweizer 4-mal-400-Meter-Stafette in der Besetzung Clerc, Mathias Rusterholz, Alain Rohr und Marcel Schelbert im Vorlauf mit 3:02,46 min den aktuellen Schweizer Rekord auf, verpasste aber dennoch den Einzug ins Finale.