Главный алтарь храма украшен картиной Карела Шкреты «Мадонна, благословляющая рыцарей мальтийского ордена на битву при Лепанто» (ок. 1640—1651), написанной в стиле барокко, на которой изображён, помимо прочего, великий магистр ордена Жан Паризо де ла Валетт. Картина помещена в массивную раму, в насадке которой сделана лепка сидящей в лучах Девы Марии. Две статуи ангелов охраняют алтарь с обеих сторон, свисая со стен.