L'obra de Samuel Pepys és una font historiogràfica important gràcies a haver confeccionat un detallat diari privat, molt sincer, escrit amb un sistema de taquigrafia que abasta el període 1660–1669 i que no va poder ser desxifrat fins al 1825. El diari a més de la vida privada documenta les activitats científiques polítiques i econòmiques d'Anglaterra. Recull moltes dades sobre la Gran pesta de 1665 i també sobre l'incendi de la ciutat de Londres de 1666.