Эксперты нередко называли Управление конституционной безопасности преемником Пятого управления КГБ СССР, занимавшегося борьбой против инакомыслия и «идеологических диверсий», которое позже было преобразовано в Управление по защите советского конституционного строя (управление «З»), но прекратило существование после событий августа 1991 года. По мнению исследователя истории советских спецслужб Никиты Петрова, это была лишь «легкая реструктуризация и изменение названия», поскольку ни структура, ни штатная численность сотрудников управления не изменилась. Сам Зотов говорил, что подобные структуры по защите государственной безопасности существуют в каждой стране, но деятельность Пятого управления КГБ СССР нельзя рассматривать в отрыве от советской государственной системы, а Управление конституционной безопасности в своей деятельности руководствуется только законом, а не политической целесообразностью. По мнению Андрея Солдатова, до образования вышеозначенного департамента Федеральная служба безопасности занималась только борьбой против шпионажа и терроризма; в дальнейшем она стала заниматься и борьбой против угроз политической стабильности (т.е. политическим сыском).