しかし13世紀末、ヴェネツィア共和国が勢力を伸ばす事により、イストリア半島やアドリア海沿岸部は1727年までヴェネツィアが支配することとなった。そしてローマ教皇の計画により、アクイレイア総司教座()がザルツブルク司教座へ圧力をかけたことによりカリンティア、スティリア、カルニオラら三公国はボヘミア王オットカル2世が支配する事となった。こうしてスロベニアはオットカル2世のプシュミスル家とハプスブルク家が支配することとなるが、オットカル2世は1278年、マルヒフェルトの戦いにおいてハプスブルク家のルドルフ1世に敗北、三公国はハプスブルク家支配下となる。