No início da Revolta Dungan, Huiyuan Cheng foi o último lugar do Vale do Rio Ili a ser tomado pelos rebeldes, no final de novembro de 1864. Em resposta à instalação de um sultanato naquela região, o Império Russo ocupou o Vale do Rio Ili em 1871, ocupação que durou até 1881, quando a região foi devolvida à China nos termos do Tratado de São Petersburgo.