Dari 1798 hingga 1801, Godebski bertugas di Legiun Polandia. Bersama dengan Ksawery Kossecki dari 1803 hingga 1806, mereka menjadi penerbit dan editor almanak "Zabawy Przyjemne i Pozyteczne". Sejak 1805 ia menjadi anggota Friends of Science Society. Pada 1806, Godebski bergabung dengan Pasukan Darat Polandia cabang Kadipaten Warsawa; dia kecewa dengan kebijakan Napoleon terhadap Polandia. Godebski meninggal dalam Pertempuran Raszyn pada tahun 1809.