Многочисленные критики работ наркома позже отмечали, что в «Новом курсе» Троцкий говорил лишь о бюрократизации, «инфицировавшей» партию, а не о бюрократии, правящей страной (как революционер стал говорить позднее). Кроме того, Троцкий отмечал что всё более распространённой становилась практика назначения губернских секретарей из Москвы (а не избрание их местными партийцами), после чего аппаратчики начинали принимать решения по вопросам, лежавшим либо вне, либо на границе их компетенции (данная тенденция была отмечена наркомом ещё на XI съезде).