À partir des bouches du Sénégal, de Gorée, du golfe de Guinée et des comptoirs portugais, la traite négrière transatlantique prit de plus en plus d'ampleur tandis que la traite orientale perdait de l'influence. Le nombre d'ouvriers agricoles ou autres asservis (mais non esclaves) augmentait à l'Ouest, dans les colonies européennes, tandis que le nombre d'esclaves diminuait à l'Est. Les Européens combattirent, parfois par les armes, l'influence musulmane, convertissant au christianisme les adeptes des religions traditionnelles africaines et bloquant ainsi l'expansion de l'islam. En formant ces nouveaux chrétiens de manière à en faire des acteurs de l'économie et de la culture coloniale, l'Europe contrebalança ainsi la domination commerciale et intellectuelle musulmane. À Zanzibar, l'esclavage fut aboli en 1897, sous le sultan Hamoud ibn Mohammed : dès lors, le reste de l'Afrique n'eut plus de contacts directs avec les marchands musulmans et le modèle civilisationnel occidental s'ajouta au modèle oriental, marginalisant de plus en plus le modèle autochtone africain, appréhendé de manière condescendante par les deux autres.