En 1999, après le retrait de Porsche et l'arrivée de Audi, Toyota s'affiche comme le grand favori de l'édition 1999. Après un nouveau duel en début de course face aux Mercedes CLR, les meilleurs Toyota aux avants postes connaîtront des ennuis mécaniques. Après le retrait des Mercedes, le duel se concentre entre la Toyota , et les deux BMW V12 LMR et 17. Après une remontée fantastique, et l'abandon de la BMW , Toyota continue de se rapprocher de la BMW V12 LMR . Mais une crevaison en fin de course va sceller le sort de la GT-One, qui termine sur la deuxième marche du podium.