2008年6月2日，國際米蘭宣布簽下穆里尼奥做爲主教練，成爲球隊歷史上的一大轉折點。在他領導之下的2008-09賽季，國際米蘭提前三輪比賽，連續第四次獲得意甲聯賽冠軍，同時也獲得了該季意大利超級盃的冠軍。然而球隊在歐冠1/8決賽中總比分0:2被曼聯淘汰。