Ketika pasukan Jerman Nazi melakukan invasi ke Uni Soviet pada tahun 1941, Sheng memutuskan untuk bergabung kembali dengan Kuomintang dan mengusir penasihat Soviet serta mengeksekusi para anggota Komunis. Chiang Kai-shek tidak bisa mempercayai Sheng lagi karena Sheng sudah mencoba untuk bernegosiasi kembali dengan Stalin, sehingga Chiang menggulingkannya dan mengendalikan pemerintahan provinsi itu secara langsung pada tahun 1944. Kemudian Pemerintahan KMT yang baru menghadapi suatu pemberontakan yang bergabung dengan Republik Turkestan Timur Kedua.