Zwischen 1996 und 1998 bestritt Doğan, der 1992 die deutsche Staatsbürgerschaft angenommen hatte, 19 Spiele mit der deutschen U-21-Auswahl. Bei der EM-Endrunde 1998 in Rumänien belegte die DFB-Nachwuchself um Michael Ballack und Lars Ricken nach ihrer 0:1-Auftaktniederlage gegen Griechenland mit zwei anschließenden Siegen den 5. Platz.