虽然哥倫布为欧洲开启了殖民及发展美洲的大门，但对當地的美洲原住民印地安人来讲则是受到歐洲殖民者侵略的开始，從此大量美洲的原住民人口大幅下降，歐洲殖民者佔據美洲土地,對於美洲這是一個悲哀的日子，因為他們的生活從此被徹底改變：疾病、失去土地、戰爭，不但令大量印第安人死亡，更令他們無法自給自足，成為美國社會的底層，甚至被當作不存在。所以每年到了這一天，不少印第安人都會舉行活動抗議殖民統治，並在哥伦布日的巡遊慶祝活動中抗議。近年因為反對種族主義和轉型正義的聲音高漲，很多美國城市不再紀念哥倫布日，改為慶祝原住民日，以紀念原住民對美洲的貢獻。乔治·弗洛伊德之死引发的拆除历史争议人物雕像浪潮之中，大大提高了這個爭議。