Rafina fue fundada en la década de 1920 por refugiados griegos procedentes de Anatolia tras el final de la guerra greco-turca en el emplazamiento de un pequeño pueblo arvanita. Muchos de esos refugiados eran originarios del pueblo de Triglia siendo Rafina un anagrama del nombre de una antigua ciudad griega situada en el mismo lugar que la ciudad turca. Hasta los años 60-70 la población rural era la mayoritaria sin embargo posteriormente vio aumentada su población debido a un importante desarrollo urbanístico.