vooruitgang gaf binnen de veiligheid van de sport. Hij was ook een van de sleutelmensen die aanstuurde voor een overgang naar normaal geaspireerde motoren in 1989, wat onder andere te maken zou hebben met veiligheidsaspecten. Balestre is echter ook beschuldigd met het misbruiken van zijn macht, met als grootste voorbeeld de titelstrijd tussen Alain Prost en Ayrton Senna in de Formule 1 in 1989. Na afloop van de aanrijding tussen Prost en Senna in Suzuka, kwamen er implicaties in "Autosport Magazine" dat Balestre de titelstrijd in Prost zijn voordeel heeft weten te manipuleren doordat Senna werd gediskwalificeerd, beboet en een opschorting kreeg. Dit was de directe aanleiding voor Max Mosley om zichzelf aan te stellen voor het presidentschap binnen de FISA. Echter, toen Senna op controversiële wijze in aanrijding kwam met Prost tijdens dezelfde Grand Prix een jaar later, toonde Balestre geen bemoeienis en kwam ook niet tot sancties tegen Senna.