Nach der WM kehrte er nach einer kurzen Pause wieder in die Nationalmannschaft zurück. Im EM-Qualifikationsspiel in Georgien wurde er jedoch vom neuen Trainer Roberto Donadoni auf die Tribüne verbannt, offiziell aus "taktischen Gründen". Die Kollegen der Nationalmannschaft stellten sich auf Del Pieros Seite, der bekundete, sich auch weiterhin dort behaupten zu wollen. Donadoni nominierte ihn jedoch nur noch selten. Nach Del Pieros starken Leistungen in der Rückrunde der Saison 2007/08 und dem Gewinn der Torjägerwertung berief ihn Donadoni dann schließlich doch in den Kader für die EM 2008 in Österreich und der Schweiz. Bei dem Turnier kam der Stürmer in drei der vier Partien zum Einsatz und scheiterte mit seinem Team im Viertelfinale knapp am späteren Europameister Spanien.