Након пораза код Фарсале 48. године п. н. е. у Северну Африку су дошли водећи помпејанци као Катон Млађи и Метел Сципион, од којих је потоњи преузео комадну од Вара. Године 46. п. н. е. Вару је поверена команда над помпејанском флотом. Након битке код Тапса, Вар је поражен од цезаровске флоте Гаја Дидија и присиљен искрцати се у Хиспанији. Тамо се прикључио Титу Лабијену и с њим погинуо у бици код Мунде којом је окончан рат.