Vanaf 1798 nam hij deel aan de Expeditie van Napoleon naar Egypte. Na zijn terugkeer in Frankrijk in 1803 besteedde hij een groot deel van zijn leven aan het publiceren van de wetenschappelijke resultaten van de campagne. Hij was een van de belangrijkste redacteuren van de "Description de l'Égypte", de 26-delige uitgave met uitgebreide wetenschappelijke beschrijvingen van het antieke en moderne Egypte, die door de Franse staat werd uitgegeven tussen 1809 en 1828.