All'inizio della guerra la "Home Fleet" subì due cocenti perdite. La prima fu quella della vecchia corazzata HMS "Royal Oak", all'ancora a Scapa Flow; dopo questa perdita la "Home Fleet" fu temporaneamente trasferita da Scapa Flow al Tail of the Bank di Firth of Clyde fino alla fine di lavori di messa in sicurezza degli accessi alla rada di Scapa Flow, da uno dei quali era riuscito a passare il sommergibile autore dell'affondamento. In seguito, nel 1941 la Home Fleet dovette patire la perdita più dolorosa, quella dell'orgoglio della Royal Navy, l'incrociatore da battaglia HMS "Hood" da parte della corazzata tedesca "Bismarck", affondata presso l'uscita del Canale di Danimarca tra l'Islanda e la Groenlandia durante un'operazione passata alla storia come "Caccia alla Bismarck".