Nach dem Ende des Krieges versuchte Sulkowski Napoleon zur Unterstützung der polnischen Sache zu bewegen. Er machte 1798 auch den Feldzug nach Ägypten mit. In der Schlacht bei den Pyramiden wurde er erneut verwundet. Er wurde Mitglied des Institut d’Égypte und mit verschiedenen Arbeiten beauftragt. Dazu zählte insbesondere die Erarbeitung eines französisch-arabischen Wörterbuchs. Sulkowski hat sich auch an der Erforschung der ägyptischen Altertümer beteiligt. Er selbst fand den Kopf einer Isis-Statue und einen Stein mit Hieroglypheninschriften, an deren Übersetzung er sich versucht hat.