Родился в 1780 году в Ла-Рошели. Очень рано начал карьеру: уже в 1798—1801 годах был финансовым контролёром двух провинций в Верхнем Египете, когда в результате Египетского похода Наполеона эти земли временно оказались под контролем Франции. В 1802 году отправился в Сан-Доминго, где стал генеральным секретарём в администрации генерала , управлявшей восточной частью острова, которая перешла под юрисдикцию Франции по Базельскому мирному договору. После вторжения Наполеона в Испанию восточная часть острова вернулась под власть Испании, и Бенуа Шассерио оказался пленником. Он смог бежать, но возможности вернуться во Францию не было, так как на море господствовал британский флот, и поэтому он скитался по Антильским островам и континентальной части Испанской Америки.