La carriera internazionale di Lee comincia nelle file della nazionale coreana Under-20 nel campionato mondiale di categoria nel 2007. Nonostante la Corea abbia dato prova di grande abilità contro avversari come Stati Uniti, Polonia e Brasile (guidato dall'allora giovanissimo Pato), la formazione asiatica non riesce a centrare la qualificazione. Le sue prestazioni individuali, comunque, catturano l'attenzione dei più scettici, e cominciano a diffondersi voci riguardo all'interesse per Lee da parte di alcuni club europei.