Добровольцем ушёл на фронт во время Первой мировой войны. После её окончания вступил в роту князя Ливена и во время гражданской войны сражался против большевиков на территории Латвии, затем в Северо-западной армии генерала Юденича. «Мало известно, какие военные заслуги имелись у прапорщика Каллистратова. Позднее его политические противники распространяли листовки с описанием зверств белогвардейцев, в которых он якобы участвовал. Некоторые сослуживцы, действительно, отзывались о нем не слишком лестно, но ни одного документального подтверждения личного соучастия Мелетия в издевательствах над пленными красноармейцами, в расстрелах, грабежах населения никто не представил», — отмечает первый биограф Каллистратова С. Кузнецов.