През 1999 преминава в Канзас Сити Уизардс. В първия си сезон за „магьосниците“ е често преследван от контузии, но през 2000 г. подобрява рекорданата си „суха“ серия, не допускайки попадение в 16 поредни мача. Меола печели редовния сезон и плейофите в МЛС, избран е за вратар и футболист на годината в САЩ. Успява да се завърне и в националния отбор, където е трети вратар на Световното първенство в Япония и Република Корея през 2002 г. Играе за Уизардс до 2004, след което се завръща в Метростарс, носещ вече името Ню Йорк Ред Булс.