Nel 2000, Mika Brzezinski lasciò per un breve periodo la CBS, e lavorò allo show pomeridiano "HomePage", con co-conduttori Gina Gaston e Ashleigh Banfield, della rivale MSNBC. Nel settembre 2001 ritornò come corrispondente alla CBS, che la portò a essere una dei principali corrispondenti da Ground Zero degli attentati terroristici dell'11 settembre. Mika Brzezinski era infatti in diretta quando la Torre Sud crollò (per coincidenza, il suo vecchio co-conduttore Ashleigh Banfield alla MSNBC si trovava a Ground Zero come corrispondente della MSNBC).