У складі збірної був учасником чемпіонату Європи 1996 року в Англії, де чехи сягнули фіналу, в якому у додатковий час поступилися німцям, ставши таким чином лише віце-чемпіонами континенту. На цьому тріумфальному турнірі їх ворота незмінно захищав Петр Коуба, а Маєр залишався лише одним з його дублерів.