30 сентября 1944 года был назначен на должность командира 120-го стрелкового корпуса, который успешно действовал в ходе Сандомирско-Силезской и Нижнесилезской наступательных операций. С февраля 1945 года командовал 197-й стрелковой дивизией, участвовавшей в Берлинской и Пражской наступательных операциях. За отличия в боях дивизия была награждена орденом Кутузова 2-й степени, а Ф. С. Даниловский — орденом Красного Знамени. С 10 марта по 3 апреля 1945 года генерал-майор Ф. С. Даниловский временно исполнял должность командира 21-го стрелкового корпуса, занимавшего оборону в районе города Губен и реки Нейсе.