En 1937 se autorizaría la construcción de los acorazados clase "Yamato" —los más pesados y fuertemente armados jamás construidos— con motivo de la doctrina "Kantai Kessen", a los cuales Yamamoto se oponía ya que «ningún barco era insumergible». Sobre el tema dijo: «La serpiente más feroz puede ser vencida por un enjambre de hormigas». En palabras de Yamamoto, los aviones implementados en portaaviones serían el enjambre mortal de hormigas en la nueva guerra. A finales de año sucedió el incidente del USS "Panay"; Yamamoto lamentó los hechos y se disculpó con el embajador estadounidense Joseph Grew.