Leimer proseguì in questa serie per il 2009, compagno di Pål Varhaug, il campione in carica del Campionato Italiano di Formula Renault 2.0. Tra le prime sei gare della stagione, vinse a Pau, Valencia, Brno, Brands Hatch e Spa-Francorchamps, giorno in cui la Formula Masters fu categoria di contorno per il Gran Premio del Belgio di Formula 1. Leimer poi vinse il titolo al settimo evento tenutosi a Oschersleben.