Quiroga commence sa carrière à Newell's Old Boys en championnat d'Argentine en 1997. L'année suivante, il est transféré au Sporting Clube de Portugal, où il joue six saisons, entrecoupées par un prêt au SSC Naples en 2000-2001. Il remporte avec le club de Lisbonne le championnat en 2000, au côté de son compatriote Aldo Duscher. Il gagne à nouveau le championnat en 2002. En Italie, il connaît avec le club napolitain une relégation en Serie B.