En 1848, après les Cinq journées de Milan, le palais est temporairement utilisé comme siège du nouveau gouvernement de Lombardie. Finalement, il devient le siège de la municipalité de Milan le . L'acquisition du palais par l'administration de la ville a marqué le début d'une nouvelle restauration du bâtiment et des alentours. La partie qui occupait la Piazza della Scala a été démolie pour créer la place. La façade du Palazzo Marino face à la place a été refaite pour devenir la façade principale du palais d'après un dessin de Luca Beltrami. La façade a été achevée en 1892.