Kvalifikácia na Majstrovstvá Európy v basketbale mužov 1999 bola kontinentálna kvalifikácia pre účasť na Majstrovstvách Európy 1999 v basketbale mužov, organizovaná Európskou basketbalovou federáciou (FIBA Europe). Zúčastnilo sa jej 47 európskych družstiev, ktoré súťažili o 14 miest na záverečný turnaj v štyroch predkvalifikačných a piatich kvalifikačných skupinách. Prebiehala od 21. mája 1997 do 27. februára 1999.