Con el reinado de Carlos IX de Francia y la firma del Edicto de Saint-Germain, en el contexto de rivalidades religiosas y de dinastías (Guisa y Borbones), participa con las fuerzas reales en la primera guerra de religión contra los hugonotes de 1562, obteniendo la victoria en Dreux, pero nuevamente cae prisionero hasta 1563. Ese mismo año lidera una expedición militar que expulsa el 29 de julio a las tropas inglesas que habían tomado la ciudad de El Havre por el Tratado de Hampton Court.