Cependant, Paoli finit par se séparer du mouvement révolutionnaire sur la question de l'Exécution de Louis XVI et se rapprocha du parti royaliste. Accusé de trahison par la Convention nationale, il convoqua en 1793 une « "consulta" » à Corte, avec lui-même comme président, assemblée au cours de laquelle la sécession formelle de la Corse de la France fut déclarée. Il demanda la protection du gouvernement britannique, alors en guerre contre la France révolutionnaire, et suggèra le Royaume d'Irlande comme un modèle pour un royaume autonome corse sous le monarque britannique. Pour le Royaume-Uni, c'est l'occasion de sécuriser une base en Méditerranée.