W reprezentacji Gabonu Moubamba zadebiutował w 1998 roku. W 2000 roku był rezerwowym drużyny Gabonu w Pucharze Narodów Afryki 2000. W 2010 roku został powołany przez selekcjonera Alaina Giresse’a do kadry na Puchar Narodów Afryki 2010. Tam rozegrał jedno spotkanie: z Kamerunem (1:0).