El 24 de abril de 2012, Eduardo Guzmán fue internado en el Hospital Clínico de la Universidad Católica debido a un accidente cerebrovascular de carácter grave. Sus tres hijos, criados en Canadá desde su exilio en 1973, viajaron a Chile para estar con él. El día lunes 30 de abril, a las 4:30 horas, falleció producto de dicho accidente, pidiendo que su funeral se hiciera de manera íntima y tranquila.