Aalst cambió de manos varias veces durante la guerra de los Ochenta Años (1568-1648). El 3 de noviembre de 1583 fue tomada por las tropas españolas, pasando a formar parte de los Países Bajos. Tiempo después fue conquistada por Francia en la Guerra de Devolución de 1667, devuelta por el tratado de Aquisgran. En 1714 pasó a ser posesión de Austria. Fue ocupada por Francia en el verano de 1794, hasta que las tropas prusianas toman la villa el 14 de diciembre de 1813. La economía basada en la industria textil prosperó con los franceses. El congreso de Viena la incluyó en el Reino Unido de los Países Bajos. El siglo XIX estuvo marcado por la crisis social causada por la Revolución Industrial, con el padre Adolf Daens a la cabeza de la defensa de los derechos del trabajador. Durante el siglo XX, Aalst fue ocupada por los alemanes durante las dos guerras mundiales.