Eva-Maria Wernicke startete in ihrer aktiven Zeit für den SC Traktor Oberwiesenthal. Sie galt als eine der Hoffnungen der DDR für die Olympischen Winterspiele 1972 in Sapporo, konnte sich jedoch für diese nicht gegen Ute Rührold, Margit Schumann und Altmeisterin Anna-Maria Müller qualifizieren. Doch gewann sie im selben Jahr den Titel bei der Junioren-Europameisterschaft. In den folgenden Jahren gehörte sie zur Rennrodelspitze der DDR und damit in der Welt. 1973 gewann sie hinter Schumann und Rührold in Königssee die Bronzemedaille bei der Europameisterschaft, ebenso bei der WM des Jahres in Oberhof. 1975 musste sie sich bei der EM in Olang nur Schumann geschlagen geben. 1976 konnte sich Wernicke schließlich für die Olympischen Winterspiele in Innsbruck qualifizieren, scheiterte dort jedoch einmal mehr an ihren Nerven. Nach dem ersten Durchgang auf Platz fünf liegend, verbesserte sie sich im zweiten Lauf auf den dritten Rang. Aufgrund von Fahrfehlern konnte sich im abschließenden dritten Lauf noch Elisabeth Demleitner auf den dritten Rang schieben und Wernicke auf den undankbaren vierten Rang verweisen.