Родился в знатной дворянской семье. Потомственный военный. Луиш да Силва Моузинью де Албукерке — дед Жуакина Аугушту Моузинью — был крупным политиком и военным, занимал министерские посты, участвовал в гражданской войне на стороне либералов. Жозе Диогу Машсареньяш Моузинью де Албукерке — отец Жуакина Аугушту Моузинью — был известным военным инженером. Жуакин Аугушту воспитывался в духе монархизма и традиций военной аристократии.