У своїй діяльності НКРЗУ керується Конституцією України, актами Президента України і Кабінету Міністрів України, Концепцією радіаційного захисту населення України у зв’язку з Чорнобильською катастрофою, законами України, іншими нормативно-правовими актами та Положенням про НКРЗУ.