С октября 1942 года по февраль 1943 года находился на курсах «Выстрел», затем был назначен заместителем командира 179-й стрелковой дивизии. В составе 43-й армии Калининского (с 20.10.1943-1-го Прибалтийского) фронта участвовал в оборонительных боях в районе г. Демидов, в Духовщино-Демидовской наступательной операции и наступлении на витебском направлении. С 13 по 29 ноября подполковник Клепиков временно командовал 204-й стрелковой дивизией, затем возвратился в 179-ю стрелковую дивизию на прежнюю должность. 27 февраля 1944 допущен к командованию 5-й мотострелковой бригадой 5-го танкового корпуса. Летом и осенью 1944 года бригада вместе с корпусом в составе войск 2-го Прибалтийского фронта участвовала в Режицко-Двинской, Шяуляйской и Рижской наступательных операциях, в освобождении города Крустпилс. За отличия в боях при освобождении города Двинск корпус был удостоен наименования «Двинский». После завершения боев на рижском направлении бригада вместе с корпусом была выведена на пополнение и до конца войны находилась в Белорусско-Литовском ВО.