En 2001, l'objectif est de battre l'équipe Jordan Grand Prix qui est passée du moteur Mugen Motorsports au Honda officiel, comme BAR. Olivier Panis remplace Zonta. Le premier Grand Prix, en Australie, est marqué par l'accident de Villeneuve et la disqualification de Panis, quatrième à l'arrivée. Si Panis rate le podium au Brésil à cause d'un ravitaillement raté, Villeneuve obtient le premier podium de l'équipe en Espagne, en profitant des nombreux abandons. Il récidive en Allemagne, toujours en profitant des abandons, la 003 se montrant plutôt décevante. À l'issue d'une fin de saison ratée, l'équipe finit sixième du championnat, derrière Jordan. Le directeur technique Malcolm Oastler est remplacé par Geoff Willis en provenance de Williams. Peu après, Craig Pollock est remplacé par David Richards.