Во время смоленского похода Русско-польской войны царя Алексея Михайловича был приглашён в Москву, куда и переехал в 1655—1656 годах. В 1662 году Спиридон Потёмкин стал архимандритом Покровского монастыря Русской православной церкви в городе Москве.