Im Zuge der Unabhängigkeit Portugiesisch-Guineas 1974 verließ die portugiesische Kolonialmacht das Land. Der ehemalige Amtssitz des Gouverneurs wurde umgewidmet und ist seitdem Amtssitz des Staatspräsidenten von Guinea-Bissau. 1998, im Zuge des Bürgerkriegs 1998 in Guinea-Bissau (s. Konflikt des 7. Juni 1998), bombardierte die guinea-bissauische Armee den Präsidentenpalast, um den Staatspräsidenten João Bernardo Vieira zum Einlenken zu bewegen. Trotz eines Friedensabkommens stand der Präsidentenpalast für zahlreiche Jahre leer. Erst im Rahmen eines Kooperationsabkommens zwischen Guinea-Bissau und der Volksrepublik China wurde der Palast 2013 innerhalb von 18 Monaten renoviert. Seitdem ist der Palast wieder Sitz des Staatspräsidenten.