Er plante den Mord an drei Bürgerrechtlern (Mississippi-Bürgerrechtsaktivistenmord) in Neshoba, Mississippi im Jahre 1964 und er plante 1966 die Ermordung Vernon Dahmers in Hattiesburg, Mississippi. Da sich der Staat Mississippi weigerte, Bowers wegen Mordes anzuklagen, konnte er nur vor einem Bundesgericht wegen Verletzung der Bürgerrechte angeklagt werden. Diese Vorgehensweise war in den Südstaaten üblich, so dass Weiße für Morde an Schwarzen deutlich geringere Strafen bekommen konnten, als Schwarze für Morde an Weißen. Bowers bekam für die Planung des ersten Anschlags sechs Jahre Haft. Für das Mordkomplott gegen Dahmer wurde er in den 1960er Jahren zwar angeklagt, aber nicht verurteilt. Erst in den 1990er Jahren wurde er deswegen zu lebenslanger Haft verurteilt. Er starb nach acht Jahren Gefängnis 82-jährig in Haft. Die größte Zeit seines Lebens hatte er in Freiheit verbracht.