En la Guerra de Independencia (1895-1898) el territorio de Artemisa es nuevamente teatro de importantes combates, durante la invasión a occidente y la campaña en Pinar del Río de Antonio Maceo, Lugarteniente General del Ejército Mambí. Artemisa fue la sede de la comandancia general de la Trocha de Mariel a Majana, línea fortificada construida por los españoles, en la parte más estrecha de la isla (entre la bahía de Mariel al norte y la Ensenada de Majana, al sur) con el vano propósito de impedir la movilidad de las tropas de Maceo y embotellarlo en Pinar del Río. La Trocha fue burlada por los mambises en varias ocasiones. El General Maceo cayó en combate el 7 de diciembre de 1896 en la finca de San Pedro, actual municipio de Bauta, lugar donde se erige un monumento.