Im Jahr 2001 wurden Birendra und ein Großteil seiner Familie im Rahmen eines Massenmordes getötet. Die Tat soll von seinem Sohn, Thronfolger Dipendra, begangen worden sein. Diese Version des Tatherganges wird jedoch von vielen Bürgern in Nepal bezweifelt. Dipendra wurde nach Birendras Tod zum König ausgerufen. Da er jedoch durch die Schussverletzungen, die er sich im Laufe der Vorfälle im Königspalast mutmaßlich selbst zugefügt hatte, im Koma lag, wurde der Bruder Birendras, Prinz Gyanendra, zum Regenten erklärt. Gyanendra trat, nachdem Dipendra drei Tage später verstorben war, die offizielle Nachfolge als König von Nepal an.