Argaña volvió a candidatarse en las internas coloradas de 1997, donde se enfrentó a otro peso pesado de la política paraguaya: Lino Oviedo, un militar que participó en el Golpe de la caída de la dictadura de Stroessner y recientemente había protagonizado un fallido intento de golpe de Estado en 1996. Argaña y Oviedo protagonizaron lo que fue descrito por "Última Hora" como «la campaña electoral más enérgica y exaltada de la ANR». Argaña tuvo el apoyo del entonces presidente Wasmosy, pero aun así no logró derrotar a Oviedo; quedando como la dupla ganadora la conformada por Oviedo y Cubas, candidato a presidente y vicepresidente por el Partido Colorado para las elecciones generales de 1998, respectivamente.,