2009'da Baerbock, partisinin federal seçimler için olan seçim listesine seçilemedi. 2013'te "Potsdam - Potsdam-Mittelmark II - Teltow-Fläming II" seçim bölgesinde Yeşil Partinin adayı oldu ve partinin Brandenburg eyaleti için olan seçim listesindeki lider konumunu güvence altına aldı. Seçim listesi aracılığıyla Federal Meclis'e üye oldu.