Le il est élu troisième député suppléant de Rhône-et-Loire, avec sur 795 votants. Le il est appelé à siéger en remplacement du girondin Chasset, décrété d'accusation. Noailly reste dans l'obscurité au cours de son mandat et reste siéger en l'an III malgré le rappel de Chasset. Membre du Comité des secours publics, il présente après le 13 vendémiaire un rapport en faveur des soldats républicains blessés par les rebelles royalistes.