В 1996 году был назначен главным тренером национальной сборной Узбекистана. Под его руководством команда с трудом преодолела отборочный раунд Кубка Азии 1996, а также крайне неудачно выступила в финальном раунде Кубка Азии 1996. После этого Ибрагимов был снят с должности главного тренера сборной Узбекистана.