Pada hari-hari awal pendudukan, muncul suatu gerakan partisan Soviet yang kuat dan semakin terkoordinasi dengan baik. Dengan bersembunyi di hutan dan rawa-rawa, para partisan menimbulkan kerusakan berat pada jalur pasokan dan komunikasi Jerman, mengganggu rel kereta api, jembatan, kabel telegraf, menyerang depot pasokan bahan bakar, dan transportasi, serta menyergap tentara-tentara Poros. Dalam sebuat tindakan sabotase partisan terbesar selama berlangsungnya Perang Dunia Kedua, yang disebut pengalihan Asipovichy pada 30 Juli 1943, empat kereta api Jerman yang membawa bahan persediaan dan tank Tiger dihancurkan. Untuk melawan para partisan, Jerman terpaksa menarik pasukan yang cukup besar di belakang garis depan mereka. Pada tanggal 22 Juni 1944, Soviet meluncurkan Serangan Strategis Operasi Bagration, sehingga akhirnya mendapatkan kembali semua wilayah Belarusia pada akhir Agustus.