Сборная Киргизии не участвовала в отборочном турнире к Кубку Азии 2007 из-за слишком низкого рейтинга ФИФА, наряду с остальными 15 слабейшими сборными Азии. В январе 2007 года главным тренером сборной снова был назначен Нематджан Закиров. В 2007 году сборная принимала участие в международном турнире Кубок АлмаТВ в Казахстане, где проиграла все три матча против сборных Казахстана, Узбекистана и Азербайджана. В том году сборная также принимала участие в , где также не смогла выйти из группы, заняв третье место из пяти. Соперниками по группе были Сирия, Индия, Бангладеш и Камбоджа. В том году сборная также участвовала в отборочном турнире к чемпионату мира 2010 в ЮАР, остановившись уже в первом предварительном раунде, где ее соперником являлась сборная Иордании. Итого в 2007 году сборная сыграла 9 игр. 3 победы и 6 поражений.