En el episodio del 4 de enero de 2016 de Raw, Jericho hizo su regreso a la compañía a tiempo completo y confrontó a The New Day antes de anunciar su participación en el Royal Rumble match. En Royal Rumble, Jericho ingresó como el sexto participante, con una duración de más de 50 minutos, antes de ser eliminado por Dean Ambrose. En el episodio del 25 de enero de Raw, Jericho se enfrentó al recién debutante AJ Styles, siendo derrotado por este. Después del combate, y luego de una vacilación inicial de Jericho, ambos se dieron la mano en señal de respeto. En el episodio del 11 de febrero de SmackDown, Jericho derrotó a Styles. En Fastlane, Styles salió victorioso en un tercer combate entre los dos. En el episodio del 22 de febrero de Raw, Jericho y Styles decidieron formar equipo, apodándose Y2AJ. Después de ser derrotados por The New Day en una lucha por los Campeonatos en Parejas de WWE, Jericho atacó a Styles, terminando su alianza y alegando que estaba harto de que los fanáticos corearan el nombre de Styles en lugar del suyo, convirtiéndose en "" por primera vez desde 2012. El feudo culminó en WrestleMania 32, donde Jericho derrotó a Styles. Sin embargo, en el episodio del 4 de abril de Raw, Jericho compitió en un Fatal 4-Way match contra Styles, Kevin Owens y Cesaro para determinar al contendiente #1 al Campeonato Mundial Peso Pesado de WWE, pero no logró ganar después de ser derrotado por Styles.