Однак у 1915 році вірмени зазнали великих труднощів під молодотурською адміністрацією через прагнення уряду Туреччини, щоб її народи були релігійно однорідними (тобто мусульманськими), мотивовані, можливо, уявною загрозою вірмен від російських впливів, з якими Туреччина на війні. Відповідно вірменська громада Туреччини в 1915 році була знищена масовими депортаціями та вбивствами. Події навколо цієї етнічної чистки вірмен від Туреччини стали відомими як Геноцид вірмен. Неможливість Туреччини визнати ці події викликала серйозний гнів серед вірмен у всьому світі протягом останніх ста років. До 1915 року в Туреччині проживало майже два мільйони вірмен; сьогодні (2015) там проживає менше 100 000.