Чемпионат мира 2005 года в Москве оказался неудачным для Жубера, так как ему не удалось войти даже в тройку призёров, однако уже в следующем сезоне, после столь же неудачного выступления на Олимпиаде в Турине, где он стал лишь шестым, Жубер реабилитируется на чемпионате мира в Калгари, где он выигрывает и короткую, и произвольную программы, но в итоге становится вторым, уступив Стефану Ламбьелю только из-за неудачного выступления в ходе квалификации.