Teluk San Francisco Bay menyalirkan air dari approximately 40 peratus California. Air dari sungai-sungai Sacramento dan San Joaquin, dan dari gunung-ganang Sierra Nevada, mengalir ke Teluk Suisun, yang kemudian mengalir melalui Selat Carquinez bertemu dengan Sungai Napa di tempat masuk Teluk San Pablo, yang bersambung di hujung selatannya ke Teluk San Francisco. Ia kemduian bersambung dengan Lautan Pasifik melalui selat Golden Gate. Walau bagaimanapun, kumpulan keseluruhan teluk saling bersambung ini kerap dipanggil "Teluk San Francisco" ("San Francisco Bay"). Teluk ini dinamakan Tanah Lembap Ramsar Kepentingan Antarabangsa pada 2 Februari 2012.