Det folkliga missnöjet med PRN:s politik, som präglades av bedrägeri och korruption tog sig starka uttryck i presidentvalet 1948 då förre presidenten Calderón återigen ställde upp som presidentkandidat. Calderón tvingades dock låta en oberoende väljartribunal överse valet. Detta gjorde att väljartribunalen valde att utse Calderóns främste utmanare, Otilio Ulate, till segrare i presidentvalet. Calderón vägrade emellertid att erkänna sig besegrad och hävdade att valresultatet byggde på valfusk. Han lyckades få landets parlament, kongressen, att ogiltigförklara valresultatet och besluta att nyval skulle hållas. Detta ledde dock till att det s.k. Costaricanska inbördeskriget bröt ut den 12 mars 1948.