À la suite de l'accession au trône de Jacques, l’"Ark Royal" est renommé "Anne Royal", d'après la reine consort, Anne de Danemark. Il est entièrement reconstruit aux chantiers navals de Woolwich Dockyard en 1608 par Phineas Pett I en tant que vaisseau royal et est réduit à 42 canons. Sous ce nouveau nom, il sert de navire amiral à Lord Wimbledon lors de son raid sur Cadix en 1625 qui échoue en raison d'une préparation insuffisante.