Sebbene il temi principali di questo congresso fossero l'igiene, l'educazione e la storia in rapporto all'educazione fisica, il Comitato Olimpico Internazionale doveva rispondere alla volontà del popolo e delle istituzioni greche di ospitare in modo permanente i Giochi olimpici dell'era moderna, che ritenevano un'eredità di loro competenza e contestavano quindi la volontà del CIO di spostare la sede dei Giochi in una nazione diversa ogni quattro anni. Questa richiesta venne respinta, sia per favorire l'internazionalizzazione e lo sviluppo del movimento olimpico, sia per l'attacco militare dell'esercito greco alla Turchia nel febbraio 1897, che aveva dato il via alla guerra greco-turca, atteggiamento contrario agli ideali olimpici che perseguivano la pace e l'uguaglianza tra i popoli. Il CIO propose comunque al re di Grecia Giorgio I di organizzare un evento sportivo a metà di un Olimpiade, negli anni pari non olimpici, con la prima manifestazione nel 1906 per dar modo di organizzare al meglio i Giochi, offerta che il re accettò seppur con scarso entusiasmo.