Дебитовао је 1995. на званичним мечевима за репрезентацију Чешке. Током каријере у националном тиму, одиграо је само 7 мечева, пошто је углавном био резервни голман. У саставу националног тима учествовао је на Европском првенству 1996. године у Енглеској, где су Чеси стигли до финала, у којем су после продужетака изгубили од Немаца. На овом турниру први голман је био Петр Коуба, а Мајер је био резервни голман.