Seule une petite partie du Château a survécu jusqu'à aujourd'hui, en raison des nombreuses destructions qu'il a subies au cours des siècles, dont la principale destruction lors d'une rébellion de la ville en 1454. La ville se rebella le . Quelques jours plus tard la faible garnison teutonique négocia une capitulation selon laquelle elle fut autorisée à quitter le Château ainsi que la ville. Très rapidement, le , le Château fut pillé et le Conseil de la ville de Toruń décida qu'il vallait mieux le détruire afin d'éviter que les chevaliers teutoniques occupent à nouveau le Château. Cet événement marqua alors le début de la Guerre de Treize Ans (1454-1466).