Вслед за тем Панкратьев был также в делах под Измаилом и Бендерами. В том же 1791 году он находился при заключении с верховным визирем Юсуф-пашой мирных «прелиминарных» пунктов, а в 1793 году был послан фельдмаршалом графом Н. И. Салтыковым на Дон для прекращения беспорядков между казаками.