In Folge der Terroranschläge am 11. September 2001 intervenierten die USA in Afghanistan und stürzten an der Seite der Nordallianz die Taliban-Regierung. Nach dem Fall von Kabul am 12. November 2001 zog sich Bin Laden wenige Tage später mit seinem Gefolge nach Tora Bora zurück. Eine Einheit von rund 70 US-amerikanischen und britischen Spezialkräften, verstärkt durch die Truppen dreier lokaler Warlords, griffen das Höhlensystem in der Schlacht um Tora Bora an. In deren Verlauf warfen US-amerikanische Bomber etwa 325.000 Kilogramm Bomben auf den Komplex ab. Bin Laden konnte aus Tora Bora entkommen und verbrachte die Zeit bis wahrscheinlich 2003 in einem abgelegenen Dorf in der afghanischen Provinz Kunar.