Il quitte Toulon en avec la flotte anglaise ou en , prend la route de l'Espagne et meurt - en émigration - à Carthagène vers 1796, à l'âge de 81 ans. Il est victime de l'épidémie de typhus qui emporte quantité d'émigrés dans la province de Gérone. Longtemps avant sa mort, Louis de Fabry portait le titre de marquis, qui lui avait été donné dans ses brevets signés par le Roi.