Po wybuchu II wojny światowej batalion został aktywowany 1 listopada 1941 w Fort Riley. 15 lipca 1942 został zreorganizowany i przeprojektowany w 9th Armored Engineer Battalion i jednocześnie zwolniony z przydziału do 2 Dywizji Kawalerii i przydzielony do 9 Dywizji Pancernej. We wrześniu 1944 z tymczasowej bazy w Anglii batalion przeniesiony został do Francji, gdzie zabezpieczał przemieszczanie się 9 Dywizji na obszarze całego kraju. W rejonie Schoenfels-Wilwerdange-Bissen batalion nawiązał pierwszy kontakt z wrogiem. W grudniu 1944 wziął udział w bitwie o wybrzuszenie. "Kompania C" batalionu wyróżniła się podczas obrony Bastogne, za co została nagrodzona Distinguished Unit Citation.