Erstmals in eine australische Auswahlmannschaft wurde Duncan im Oktober 2011 anlässlich der Qualifikation zur U-19-Asienmeisterschaft 2012 berufen. Auch bei der Endrunde, als sich das Team durch den Halbfinaleinzug für die U-20-Weltmeisterschaft 2013 in der Türkei qualifizierte, gehörte er zum Aufgebot, blieb hinter Paul Izzo aber ohne Einsatz. Für die Endrunde der U-20-WM wurde Duncan ebenfalls nominiert, blieb beim dortigen Vorrundenaus hinter Izzo aber erneut ohne Einsatz. Im Januar 2014 nahm Duncan mit der australischen U-23-Auswahl an der U-22-Asienmeiterschaft teil, bei der die Mannschaft im Viertelfinale an Saudi-Arabien scheiterte. Duncan wechselte sich auf der Torhüterposition mit John Hall und Aaron Lennox ab und kam bei der 0:4-Niederlage im letzten Gruppenspiel gegen Japan zum Einsatz, als der Gruppensieg bereits feststand. Im Januar 2016 war Duncan Stammtorhüter bei der U-23-Asienmeisterschaft, die zugleich als Qualifikationsturnier für das Olympische Fußballturnier 2016 diente. Das australische Team scheiterte hierbei bereits in der Vorrunde, Duncan hatte dabei in den drei Vorrundenpartien nur einen Gegentreffer kassiert.