Morgan telah tampil bersama dengan timnas AS di tiga Piala Dunia. Ia menjadi pemain termuda di skuad timnas AS pada Piala Dunia 2011 dan mencetak gol Piala Dunia pertamanya pada babak semifinal melawan Prancis. Pada Piala Dunia 2015, ia mencetak satu gol pada babak putaran kedua melawan Kolombia. Sebagai salah satu kapten tim pada Piala Dunia 2019, Morgan berhasil mencetak enam gol untuk AS, lima di antaranya adalah pada pertandingan babak penyisihan antara AS melawan Thailand.