Per il 2016 Menghi si trasferisce nel campionato mondiale Superbike in sella ad una Ducati Panigale del team VFT Racing. È costretto a saltare i primi sette appuntamenti del campionato a causa di un grave infortunio subito nei test pre-stagionali sul circuito di Phillip Island. Il suo posto nel team VFT Racing viene preso dai connazionali Matteo Baiocco nelle prime gare e Luca Scassa nelle successive. Menghi partecipa di fatto al solo Gran Premio d'Italia a Misano chiudendo entrambe le gare fuori dalla zona punti.