Innocenci només admetia la solució militar, i especialment volia que fos el rei de França qui intervingués, tot i que aquest estava més amoïnat amb la contenció dels anglesos i el control de Flandes. El 1207 fracassà el col·loqui entre ambdues faccions i el comte de Tolosa va ser excomunicat. Després que el gener de 1208 el legat papal fos assassinat, Innocenci III proclamà la croada contra el comte de Tolosa el 10 de març de 1208. Després del fracàs de la Tercera i la Quarta Croada, aquesta croada prometia els mateixos beneficis espirituals, sense haver de desplaçar-se tan lluny. El mateix Papa assumí la conducció de l'exèrcit, delegant-ho en el radical cistersenc Arnau Amalric, tot i que seria Simó de Montfort qui dirigí la croada.