Sotto ritsuryō, l'attuale area cittadina era parte della Provincia di Hizen. Nel 1591, venne costruito il castello Nagoya nella costa nord. L'anno successivo, il castello divenne il luogo dal quale venne iniziate la guerra Imjin da Toyotomi Hideyoshi. Durante il 1593 Terasawa Hirotaka creò il dominio Karatsu. nel 1602 per rimpiazzare il Castello di Nagoya, fu costruito il castello di Karatsu in quello che ora è il centro di Karatsu. La torred nel castello di Karatsu fu costruito nel 1966.