Noch 1990 trug die tschechoslowakische Nationalmannschaft ihr erstes Länderspiel aus, Gegner war Italien. An der Qualifikation zur Weltmeisterschaft 1992 nahm die Auswahl ohne Erfolg teil. Die erste Qualifikation für ein großes Turnier – die Futsal-Europameisterschaft – gelang der tschechischen Mannschaft erst 2001. In den 2004, 2008 und 2012 nahm die tschechische Nationalmannschaft an der Futsal-Weltmeisterschaft teil. Bisher größte Erfolge waren der Gewinn der Bronzemedaille bei der Europameisterschaft 2003 in Italien sowie bei der Europameisterschaft 2010 in Ungarn. Bei der Europameisterschaft 2005 im eigenen Land schieden die Tschechen bereits nach der Gruppenphase aus.