Cook enchaîne deux très bonnes saisons dans l'enclos de relève des Athletics. En 71 sorties au monticule en 2012, sa moyenne de points mérités n'est que de 2,09 avec 80 retraits sur des prises en 73 manches et un tiers lancées. Il remporte de plus 6 victoires contre deux défaites et, utilisé un temps comme stoppeur, il réalise 14 sauvetage. Le contre les Orioles de Baltimore, Ryan Cook réussit 4 retraits sur des prises en une seule manche : après avoir éliminé J. J. Hardy, Nick Markakis et Adam Jones, son dernier lancer est une troisième prise non attrapée par son receveur Kurt Suzuki. Cook enregistre son au bâton de la manche aux dépens de Matt Wieters. Invité au match des étoiles 2012, Cook lance une parfaite contre les étoiles de la Ligue nationale.