Летом 2011 года Роман Яковлев перешёл из московского «Динамо» в краснодарское и в новой команде был выбран капитаном. В октябре того же года впервые после чемпионата Европы-2003 получил вызов в сборную России, вошёл в заявку на Кубок мира и во второй раз за карьеру стал победителем этого турнира. В общей сложности провёл 142 матча за сборную России, набрал 1655 очков и 487 отыгранных подач.