ב&lt;a href="%D7%A2%D7%95%D7%A0%D7%AA%202016/2017%20%D7%91%D7%A1%D7%A8%D7%99%D7%99%D7%94%20%D7%90%27"&gt;עונת 2016/2017&lt;/a&gt;, אף על פי שכבש שער עצמי בהפסד החוץ 1–3 לגנואה בחודש נובמבר, המשיך סנדרו ביכולתו הטובה מהעונה הקודמת. מספר תצוגות מרשימות הביאו להדחתו של פטריס אברה מההרכב הפותח, ולתפיסת מקום זה על ידי סנדרו. באותה עונה הופיע סנדרו ב-43 משחקים, ובכך היה לשחקן ששיחק את מספר המשחקים הרב ביותר ביובנטוס באותה עונה. הוא כבש שלושה שערים, שיחק תפקיד מפתח בדאבל נוסף ואף סייע לקבוצתו להגיע לגמר ליגת האלופות, בו הפסידה 1–4 לריאל מדריד. סנדרו נבחר לקבוצת השנה בליגה האיטלקית הבכירה לעונה זו.