Louis Aleman começou a participar do Concílio da Basileia (1431-1449) em 1434 e, a partir de 1436, passou a desempenhar um papel importante. Tornou-se, na verdade, um membro influente desse encontro, onde junto com o cardeal Giuliano Cesarini, dirigiu o partido conciliarista, que apoiava o domínio da autoridade dos concílios sobre a do papa. Em 14 de fevereiro de 1438, o cardeal Louis Aleman foi o presidente do concílio, mas nos dias seguintes, o papa lançou um anátema contra todas as decisões tomadas.