Pereyra wurde mit der uruguayischen Juniorenauswahl bei der Junioren-Südamerikameisterschaft des Jahres 1975 in Peru Südamerikameister. Im Verlaufe des Turniers wurde von Trainer Walter Brienza fünfmal eingesetzt. Ein Tor erzielte er nicht. Pereyra war auch Mitglied der A-Nationalmannschaft Uruguays, für die er zwischen dem 25. Juni 1975 und dem 16. Juni 1986 32 Länderspiele absolvierte. Er erzielte fünf Länderspieltore. Pereyra gehörte dem uruguayischen Aufgebot bei der Copa América 1975 an. Er nahm mit Uruguay zudem an der Weltmeisterschaft 1986 teil. Bei der WM kam er sowohl im Gruppenspiel gegen Schottland als auch im Achtelfinale gegen Argentinien zum Einsatz.