En 1993, accompagné de son ami Joao Silva, il se rend au Soudan pour montrer l'horreur de la guerre civile soudanaise et de la famine qui frappent le pays. Certains des clichés de Carter feront le tour du monde, notamment la célèbre image prise à Ayod au Soudan en 1993, dite « La fillette et le vautour » (qui était en réalité un garçon), et qui montre un enfant soudanais affamé, observé non loin par un vautour. La photo lui vaudra le prix Pulitzer, mais également une controverse très virulente sur les conditions dans lesquelles elle a été prise.