Poiché gli Asburgo non avevano ancora occupato le Azzorre, egli salpò verso le isole con una flotta di avventurieri francesi, guidati da Filippo Strozzi, un esiliato fiorentino al servizio della Francia, ma venne sconfitto due volte da Álvaro de Bazán, I marchese di Santa Cruz, il 26 luglio 1582 al largo dell'isola di São Miguel (Battaglia di Ponta Delgada o delle Azzorre). L'anno successivo i suoi alleati e sostenitori furono nuovamente sconfitti, il 27 luglio nella cosiddetta battaglia di Terceira. Egli tornò quindi in Francia ove visse per un certo tempo spostando continuamente la propria residenza nel timore di venir assassinato da sicari al soldo di Filippo II finché si risolse a trasferirsi in Inghilterra. Qui la regina Elisabetta lo appoggiò per gli stessi motivi che avevano spinto Caterina de' Medici a fare altrettanto. Nel 1589, un anno dopo il disastro della Invincibile Armata, egli accompagnò una spedizione inglese, al commando di Francis Drake e Sir John Norreys presso le coste portoghesi. La flotta della spedizione era composta in parte di navi della corona inglese ed in parte di navi corsare in cerca di bottino. Antonio, con tutta la credulità dell'esiliato, credette che la sua presenza avrebbe provocato una rivolta generale contro Filippo II ma non successe nulla e la spedizione si concluse con un fallimento.