Durante o clima de instabilidade que ditou o fim da Primeira República, com o aumento da repressão sobre o movimento político contestatário e a crescente censura sobre a imprensa, José de Magalhães e João de Castro reconciliaram-se em 1931, sendo o activista convidado para exercer o cargo de presidente honorário no Conselho Nacional do Movimento Nacionalista Africano (MNA), criado então por João de Castro como forma de unificar as várias associações negras existentes em Portugal, «"a favor da união dos africanos de Lisboa, de toda a África, de todos os portugueses e pela democracia»", passando a assumir uma postura menos crítica sobre as políticas coloniais, tornando-se mais próximo do nacionalismo. Integraram o movimento várias figuras conhecidas pela luta dos direitos dos afro-descentes e da causa independentista de Angola, Moçambique, Guiné-Bissau e Cabo Verde, como Mário Pinto de Andrade, Amílcar Cabral, Pedro Pires, Agostinho Neto, Alda Lara, Joaquim Pinto de Andrade, Luandino Vieira, Lúcio Lara, Pepetela, Alda Espírito Santo, Miguel Trovoada, Eduardo Mondlane, Joaquim Chissano, Marcelino dos Santos ou Noémia de Sousa.