Ha giocato come titolare in tutte e quattro le partite che il Giappone ha disputato nel Mondiale 2002. Continuerà a giochare per molti anni con lo Yokohama F Marinos, vincendo per ben due anni il campionato nelle edizioni 2003 e 2004. Il Giappone vincerà la Coppa d'Asia che si è tenuta in Cina, Matsuda ha giocato una sola partita nella vittoria ai quarti di finale per 4-3 contro la Giordania entrando in partita nel secondo tempo supplementare. La sua ultima partita in nazionale è stata nell'amichevole contro il Kazakistan per 4-0, ironicamente è stata l'unica partita dove ha segnato una rete nella sua carriera con la nazionale giapponese.