Se caracterizou por uma pesada luta de guerrilha entre o governo comunista de Kabul e os mujahidins. Iniciou-se logo após a retirada das forças militares da União Soviética do país. A saída dos soviéticos do conflito deixou a responsabilidade de lutar contra os rebeldes islamitas apenas ao governo afegão. Depois de três anos de luta, o país já estava completamente sob controle dos mujahidins. Contudo, o conflito reiniciaria logo depois, prolongando a guerra civil por mais quatro anos, até que os extremistas do grupo radical Taliban prevaleceram e firmaram um novo regime fundamentalista no país.