1763年12月にヨット「キャサリン」の艦長に任命された一方、ソーンダースの後任として1766年9月23日からはグリニッジ病院の収入役という陸のポストも得た。アメリカ独立戦争中の1777年に3等艦「ロバスト」へ移り、オーガスタス・ケッペル大将の下で第一次ウェサン島の海戦（1778年7月27日）を戦った。この戦いは艦隊司令ケッペルの不適切な戦闘指揮と戦隊司令サー・中将の命令不服従によって大きな戦果が挙げられず政争に発展、責任の所在を巡って軍法会議が開かれる事態になった。フッドはパリサー指揮する後衛戦隊に所属していたが、ケッペルの軍法会議に証拠として改竄した航海日誌を提出していたことが明らかになり大きな批判を受けた。軍法会議後にフッドは「ロバスト」艦長を辞任し、「キャサリン」へ戻った。