Les FAS tiennent en permanence depuis le la posture de dissuasion, afin d'être en mesure de répondre 24 heures sur 24 aux ordres présidentiels selon les délais, les moyens et les plans préétablis. Les FAS sont duales : par la polyvalence d'emploi des Rafale, les FAS participent aussi aux missions assurées par l'Armée de l'air, de protection du ciel français et d'intervention extérieure comme Barkhane ou Chammal.