En 2012 se descubrió que las ruinas también habían sido afectadas por la Segunda Batalla de El Alamein. El equipo encontró varias bombas sin explotar, así como restos carbonizados de italianos y soldados de Nueva Zelanda dentro de sus túneles. En 2013, la excavación se detuvo pero Martínez logró más tarde permiso para continuar su trabajo en el lugar.