Unter Julen Lopetegui kam der damals 19-Jährige im Frühjahr 2011 in die spanische U-20-Nationalmannschaft mit der er, nach dem Absolvieren von zwei freundschaftlichen Länderspielen, von Juli bis August 2011 an der U-20-Weltmeisterschaft in Kolumbien teilnahm. Dort wurde er in drei der fünf Länderspiele Spaniens eingesetzt und unterlag mit dem Team im Viertelfinale im Elfmeterschießen gegen die Alterskollegen aus Brasilien. Ebenfalls 2011 schaffte der junge Innenverteidiger den Sprung in die U-21-Auswahl seines Heimatlandes, wurde jedoch nicht für die Europameisterschaften 2011 in Dänemark und 2013 in Israel berücksichtigt, kam aber dennoch in den Jahren 2011 bis 2014 auf 15 Länderspieleinsätze für Spanien U-21 und war an zwei EM-Qualifikationen beteiligt. Sein letztes U-21-Länderspiel war ein 1:1-Remis gegen Österreich am 9. September 2014. Weiters wurde Amat, nachdem er sämtliche spanischen Nachwuchsnationalmannschaften durchlaufen hatte, von Johan Cruyff in die Katalanische Fußballauswahl berufen. In dieser gab er am 30. Dezember 2011 sein Debüt, als er beim 0:0-Remis gegen Tunesien in der zweiten Spielhälfte nach der Halbzeitpause für Sergio Busquets auf den Rasen kam. Rund ein Jahr später kam er beim nächsten Länderspiel der Katalanen, einem 1:1-Remis gegen Nigeria, abermals über eine Halbzeit zum Einsatz.