In der Schlacht bei Cross Keys am 8. Juni 1862 wurde von Gilsa schwer verwundet. Während seines Genesungsurlaubs kämpfte das Regiment in der Brigade von Julius Stahel unter General Franz Sigel in der Zweiten Schlacht am Bull Run. Mit der Aufstellung des XI. Korps der Army of the Potomac unter Oliver Otis Howard im Herbst 1862 wurde das Regiment der 1. Brigade der 1. Division unter dem Kommando von Charles Devens unterstellt, und von Gilsa wurde zum Brigadekommandeur ernannt.