В 2001 году Арриага дебютировал за сборную Колумбии. В том же году он в составе национальной команды поехал на Кубок Америки. На турнире Эудалио принял участие в матчах против сборных Венесуэлы, Эквадора, Гондураса и Чили. В поединке против чилийцев он забил свой первый и единственный гол за сборную страны. Эудалио выиграл Кубок Америки в составе сборной Колумбии.