Nel 2002, ha pubblicato "L'Effroyable Imposture", un controverso volume sugli attacchi terroristici dell'undici settembre. Il libro, il cui titolo significa "La spaventosa impostura", in cui Meyssan sostiene che tali attacchi siano stati organizzati da una fazione di ciò che lui chiama "il complesso militare industriale degli Stati Uniti" per imporre un regime militare. Il libro, che immediatamente è diventato un best seller mondiale ed è stato tradotto in 27 lingue, è stato seguito da "Pentagate", in cui sostiene che l'attacco contro il Pentagono non sia stato effettuato usando un aereo di linea commerciale, ma un missile.