Na de Deense nederlaag in 1864 in de oorlog tegen Duitsland werd Tønder - net als de rest van Sleeswijk - Duits. De opkomst van industrie en de toegang tot een groot Duits afzetgebied zorgden voor groei. In 1867 kreeg de stad zijn eerste spoorwegverbinding. Aan het begin van de 20e eeuw verdiende Tønder aan het (Duitse) toerisme naar het eiland Sylt, aangezien de toeristen via Tønder moesten reizen.