امیرالمؤمنین در واقع یک موقعیت دولتی نبود بلکه صرفاً یک عنوان مذهبی و افتخاری بود. پس از آنکه طالبان کابل را در سال ۱۹۹۶ تسخیر کردند، «"شورای عالی افغانستان"» تشکیل شد و عمر به عنوان رئیس شورا در ۲۷ سپتامبر ۱۹۹۶ اعلام شد؛ در این ظرفیت، عمر عملاً به عنوان رئیس کشور منصوب شد. پس از حمله ایالات متحده به افغانستان که در ۲۰۰۱, عمر عزل شد و دفتر رئیس "شورای عالی" توسط ریاست جمهوری جایگزین شد. با این اوصاف، همه رهبران طالبان تاکنون این عنوان را استفاده کرده‌اند.