W 2002 roku trener reprezentacji Arabii Saudyjskiej – Nasser Al-Johar powołał Al-Thagafiego do 23–osobowej kadry Mistrzostwa Świata w Korei Południowej i Japonii. Na mundialu Saudyjczycy nie zdobyli ani jednego punktu i odpadli w rundzie grupowej. Na mistrzostwach Al-Thagafi pełnił rolę rezerwowego i jako jeden z 5 piłkarzy w drużynie nie wystąpił w żadnym ze spotkań. Oficjalny debiut w reprezentacji swojego kraju piłkarz zanotował w 2004 roku. Łącznie dla zespołu narodowego zanotował 2 występy.