Pasqualigo a pris part apparemment à la Bataille de Lépante en 1571. Il avait été nommé capitaine du galion espagnol "Idra" (Hydra) de Naples, qui se tenait sur le flanc gauche de la flotte chrétienne. Il s'agit peut-être d'une autre personne s'appelant également « Luigi Pasqualigo », mais aucune preuve ne permet de douter qu'il s'agisse du même homme.