Од краја 11. века Јонска острва почињу нападати прво Сарацени, а потом и Нормани и Млечани. 1185. године сва острва осим Крфа прелазе у руке Нормана са Сицилије. Млечани освајају Крф и Китеру у Четвртом крсташком рату 1204. године. Млечани су проширили власт и на остала острва до краја краја 15. века, учинивши их својим испостава за трговину са Истоком. Тако су Јонска острва остала једини део грчког света који је остао изван османске власти, па су одиграла важну улогу у касније развоју грчке народне свести.