Na de mislukte aanslag op Adolf Hitler op 20 juli 1944 zag de situatie er voor Bonhoeffer een stuk slechter uit. Hij had in contact gestaan met de mensen die achter de aanslag een daarop volgende staatsgreep zaten. Verschillende familieleden van Bonhoeffer, waaronder zijn broer Klaus en zwager Rudigër Schleicher, werden gearresteerd. Een andere zwager, Hans von Dohnányi, zat al sinds april 1943 vast. Ook voor Bethge, die zich op het moment van de aanslag als soldaat in Italië bevond, volgde arrestatie. In tegenstelling tot Dietrich en Klaus Bonhoeffer, Schleicher en Von Dohnányi, overleefde Bethge zijn gevangenschap wel. Hij werd aan het einde bevrijd door de Russen.