Intitolata al compositore polacco Fryderyk Chopin (anche noto con il nome francesizzato di Frédéric François Chopin e che studiò lì dal 1826 al 1829), l'Università risale alla Scuola di musica per cantanti e attori teatrali fondata nel 1810 da Wojciech Bogusławski. Nel 1820 fu trasformata dal successivo insegnante di Chopin, Józef Elsner, in una scuola di musica più generale, l'Istituto di musica e declamazione; fu poi affiliata all'Università di Varsavia e, insieme all'Università, fu sciolta dalle autorità imperiali russe durante le repressioni che seguirono la rivolta del novembre 1830. Nel 1861 fu ricreata come Istituto di Musica di Varsavia.