소련의 지하철 건설 속도는 인상적이였지만, 이 당시에는 소련의 붕괴를 정확히 알 수 없었으며 결국 경제적 의미로 니즈니노브고로드 지하철은 미래에 쉽게 유지하기 힘든 시스템이었다. 그래서, 1단계가 1989년 완공되었을 때 2단계 건설이 시작되었고 1990년에 고르키 지하철이라는 이름으로 개통했다. 소련의 해체는 소련 시민들의 경제와 생활에 파괴적인 영향을 끼쳤다. 초인플레이션으로 인해 지하철 건설 자금의 거의 대부분은 대도시에 몰리게 되었고 모스크바 지하철과 상트페테르부르크 지하철은 끊어지게 되었다. 1990년 개통한 구간은 거의 대부분 이미 완료되었고 파산한 기업과 노동자들을 보호하기 위해 노력했다. 1993년 말 소르몹스코 메슈체르스카야 선 선의 첫 2개 역이 개통되었다.