Sie wurde vom Internationalen Olympischen Komitee (IOC) ausgewählt, bei den Olympischen Sommerspielen 2016 in Rio de Janeiro, Brasilien, für die Olympiamannschaft der Flüchtlinge im 800-Meter-Lauf anzutreten. Das Refugee Olympic Team war das erste Flüchtlingsteam in der olympischen Geschichte. Lokonyen war eine von fünf Athleten im Team, die ursprünglich aus dem Südsudan stammen. Bei der Eröffnungsfeier war sie die Fahnenträgerin der Mannschaft. Nathinke wurde in der ersten Runde Siebte mit einer Zeit von 2:16,64. Sie schied dadurch aus. Sie trainiert zusammen mit Tegla Loroupe.