Au siècle suivant, les descendants du capitaine Guglielmo Boccanegra, le corsaire génois Gilles Boccanegra et son fils Ambrosio Boccanegra se battent au services des royaumes de France contre les Anglais lors de la guerre de Cent Ans, et de Castille lors de la Reconquista. Le père Gilles Boccanegra participe à la première bataille navale de la guerre de Cent Ans, la bataille de L'Écluse en 1340 au sein d'une coalition franco-génoise, opposée à une coalition anglo-flamande. Vaincu, il parvient à s'échapper avec la moitié des mercenaires Génois sous ses ordres, et participe deux ans plus tard au siège d'Algésiras, étape clé de la Reconquista, en assurant avec succès le blocus maritime de cette ville portuaire tenue par les Maures.