Футбольный клуб «Крупа» был основан в 1983 году, и с тех пор неизменно выступал в региональных лигах чемпионата Югославии. После распада Югославии клуб принимал участие в турнирах высшей лиги Республики Сербской. Во время гражданской войны в Боснии клуб временно прекратил существование, но с 1996 года возродился и продолжил выступление в региональных лигах.