El 4 de noviembre de 2016, es nombrada de nuevo ministra por el presidente del Gobierno. A partir de esta fecha, se incorpora en la nomenclatura del Ministerio el término "Pesca" para pasarse a denominar Ministerio de Agricultura y Pesca, Alimentación y Medio Ambiente. El 1 de junio de 2018, debido a la moción de censura de Pedro Sánchez contra Mariano Rajoy pasó a ser ministra en funciones.