Während der Zeit der Deutschen Demokratischen Republik lag der See in der unmittelbaren Sperrzone der Innerdeutschen Grenze und war nur für die Grenztruppen der DDR zugänglich. Einzig einem Fischer aus Klocksdorf war es erlaubt, den See zweimal im Jahr zu befischen, ein Boot der Grenztruppen überwachte ihn. Die Grenze zur Bundesrepublik Deutschland verlief direkt am südwestlichen Ufer, die Grenzsperranlagen und der Grenzzaun lagen auf einer Anhöhe am nordöstlichen Ufer und waren von westlicher Seite nur schwer einzusehen. Trotzdem gelang es mehreren Personen, die Sperranlagen zu überwinden, durch den See zu schwimmen und in die Bundesrepublik zu flüchten. Obwohl der See heute von einem dichten Baumbestand umgeben ist, war er zur Zeit der Deutschen Teilung völlig baumfrei gewesen. Nach dem Fall der Mauer wurde am 31. Dezember 1989 zwischen Wietingsbek und Schlagbrügge die Grenze auch am Mechower See feierlich eröffnet.