Op 18 februari 2016 werd bekend dat Haryanto in 2016 zijn debuut maakt voor het Manor F1 Team in de Formule 1. Hij rijdt hier naast de eveneens debuterende Pascal Wehrlein. Hij is de eerste coureur uit Indonesië die in de Formule 1 uitkomt. Vanwege een gebrek aan sponsorgeld was echter lange tijd de vraag of hij het seizoen wel af zou kunnen maken. Tijdens de Grand Prix van Duitsland reed hij zijn laatste race voor het team, waarna hij werd vervangen door Esteban Ocon.