В следующем сезоне результативность Гомеса по прежнему оставалась на высоком уровне. Так, например 10 сентября 2011 года в чемпионате Германии против «Фрайбурга» он отметился покером, а его «Бавария» разгромила соперника со счётом 7:0, 13 марта 2012 года в Лиги чемпионов против швейцарского «Базеля» Гомес вновь отметился покером, 16 апреля 2013 года в Кубке Германии против «Вольфсбурга» футболист появился на поле на 77-й минуте, заменив Марио Манджукича, и поразил ворота соперника трижды. Голы Гомеса помогли команде добраться до финала Лиги чемпионов, где мюнхенцы в серии пенальти уступили «Челси» (сам Марио свой удар реализовал).