En , l'Union soviétique et l'Allemagne nazie signent le pacte germano-soviétique de non-agression et son protocole additionnel secret, divisant l'Europe centrale et orientale en sphères d'influence. La Lituanie est initialement affectée à la sphère allemande, probablement en raison de sa dépendance économique vis-à-vis du commerce allemand. Après l'ultimatum de mars 1939 concernant la région de Klaipėda, l'Allemagne représente 75 % des exportations lituaniennes et 86 % de ses importations. Pour renforcer son influence, l'Allemagne suggéra une alliance militaire germano-lituanienne contre la Pologne en promettant de restituer la région de Vilnius, mais la Lituanie respecta sa politique de stricte neutralité. Lorsque l'Allemagne envahit la Pologne en , la Wehrmacht prend le contrôle de la voïvodie de Lublin et de la voïvodie de Varsovie orientale, alors situées dans la sphère d'influence soviétique. Pour compenser cette perte pour l'Union soviétique, un codicille secret du Traité de frontière et d'amitié germano-soviétique transfère la Lituanie dans la sphère d'influence soviétique, ce qui sert de justification permettant aux Soviétiques d'occuper la Lituanie le , afin d'établir la RSS de Lituanie.