Un nuovo infortunio, stavolta al piede, rischia di precluderne la convocazione per il campionato mondiale del 2006. Il commissario tecnico Eriksson lo seleziona ugualmente. I britannici sono ancora sconfitti dai lusitani ai quarti di finale. Durante la partita Rooney viene espulso per aver dato un calcio ai testicoli a Ricardo Carvalho mentre questi era a terra. La nazionale inglese manca poi l'accesso al campionato europeo del 2008, mentre al campionato del mondo del 2010, sotto la guida di Fabio Capello, si arrende contro la Germania agli ottavi di finale.