По словам историка Алексея Малиновского, при нашествии войск Наполеона в 1812 году башня была подорвана и разрушена до основания, после возврата Москвы на её месте была воздвигнута новая башня. Однако большинство исследователей считают, что изначальную башню не разрушали. После окончания Отечественной войны началось восстановление стен и башен Кремля. Планировали демонтировать все стены Китай-города, но ограничились только разборкой части стены, примыкающей к Беклемишевской башне. В 1849 году Москворецкой башне вернули её вид до переоборудования Петром I.