У 1998 році Якубець закінчив стратегічний факультет Академії Збройних Сил України з присвоєнням кваліфікації Магістра державного військового управління. Того ж року його було призначено на посаду командувача аеромобільними військами України, яку він обіймав протягом 7 років. Брав участь у бойових діях в Косово. Після закінчення служби у квітні 2006 року зарахований до Апарату Ради національної безпеки і оборони України, де працював на посаді державного експерта з питань аналізу діяльності ЗС України та інших військових формувань. Державний службовець п'ятого рангу.