Le , un incendie éclate dans le quartier arménien. Il s’étend rapidement à tout le "konak", alors que de nombreux biens se trouvaient toujours abandonnés sur place. En une semaine, il détruit presque tout le "konak" et y fait près de . L’origine de ce désastre est fortement disputée : les Grecs et les Arméniens en imputent la responsabilité aux pillards turcs, tandis que les Turcs accusent les chrétiens de s’être livrés à une politique de terre brûlée pour empêcher que leurs biens n’échoient aux musulmans. Mais les témoignages, notamment celui de George Horton, affirment que le quartier arménien était gardé par les troupes turques qui y interdisaient la libre circulation.