Профессиональную карьеру Джемайли начал в возрасте 17-ти лет в клубе «Цюрих», где в год дебюта он становится игроком «основы» клуба и проводит 30 матчей и забивает 2 мяча, в следующем сезоне — 26 игр и 1 мяч, в сезоне 2005/06 32 матча и 3 мяча, а в последний год в команде 23 матча и 3 гола. Уже тогда Джемайли обратил на себя внимание европейских клубов, включая итальянских грандов, «Милана», «Ювентуса». Сам же Джемайли предпочёл уехать в Англию, в клуб «Болтон Уондерерс». Но сразу по приезде в Англию у Джемайли случилось несчастье, он получил травму колена, очень долго восстанавливался и так ни разу и не вышел на поле, к тому же у «Болтона» сменился тренер, который не доверял молодому игроку, из-за этой травмы игрок, к тому же, не поехал на чемпионат Европы-2008. 31 августа 2008 года Джемайли перешёл в клуб «Торино» на правах аренды, с последующей возможностью клуба, при желании, выкупить игрока у «Болтона» за 2 миллиона евро. 24 сентября Джемайли дебютировал в серии А в матче с «Кьево». Несмотря на вылет «Торино» в Серию Б в 2009 году итальянская команда оформила переход Джемайли из «Болтона» на постоянной основе. 31 августа 2009 года он был отправлен в аренду в «Парму». 1 июля 2011 года перешёл в «Наполи».