В мае 1511 года кади Бурсы направил ему письмо с просьбой о помощи в связи с восстанием Шахкулу. 1 сентября 1511 года Юнус стал визирем Дивана и бейлербеем Анатолии вместо Синана-паши. 12 января 1512 года, когда Синан-паша стал третьим визирем, Юнус был назначен бейлербеем Румелии. После восхождения на трон Селима Юнус сопровождал отрёкшегося (или свергнутого) Баязида в Диметоку. Однако после смерти свергнутого султана Юнус был снят с поста бейлербея Румелии, возможно, это было следствием того, что, что Юнус был на стороне Баязида в битве при Урашраде, и Селим не доверял ему полностью. Долгое время он оставался в должности бейлербея Боснии, во время битвы при Чалдыране он оставался в Румелии для обеспечения безопасности границ. 25 сентября 1515 года он захватил замок Клис. 26 апреля 1516 года Юнус был назначен визирем вместо Хадым Синана-паши, ставшего великим визирем.