Коли загальне становище погіршилося з падінням Месолонгіона, грецький уряд вирішив призначити Караїскакіса в червні 1826 р. головнокомандувачем на материку. Йому вдалося перешкодити відступу Мустабея після його перемоги при Аталанті, а перемога Караїскакіса при Арахові в ніч на 6 грудня 1826 р. належить до числа найблискучіших успіхів грецької війни за незалежність.