Bis 2011 fiel die Einwohnerzahl rapide auf 90.178. Dies ist ein Rückgang von 43.456 Personen oder rund 32,5 %. Während die albanische Bevölkerungsgruppe ihren Anteil auf 97,45 % (87.814 Personen) erhöhen konnte, ging die Zahl der serbischen Bevölkerungsgruppe auf nur 624 Personen zurück, was noch 0,7 % der Gesamtbevölkerung ausmachte. Der Anteil der Roma war mit 0,4 % (361 Personen) ebenfalls stark gesunken. Nach Schätzungen der Organisation für Sicherheit und Zusammenarbeit in Europa lebten vor dem Kosovokrieg rund 25.000 Serben und 6000 Roma in der Gemeinde. Der starke Bevölkerungsrückgang der nicht-albanischen Bevölkerung ist auf deren Flucht und Vertreibung zurückzuführen, vor allem während der 2004 landesweiten pogromartigen März-Ausschreitungen gegen die serbische oder nicht-albanische Bevölkerung von Seiten extremistischer Albaner sind die noch in Gjilan verbliebenen Serben mit Gewalt vertrieben worden oder sind in nahe gelegene Dörfer geflüchtet.