En 1545 durante la Guerra italiana de 1542-1546, fue herido gravemente en el Segundo Sitio de Boulogne contra los ingleses, pero se recuperó. Fue golpeado con una lanza a través de los barrotes de su casco. La punta de acero le perforó ambas mejillas. Se mantuvo firme en la silla del caballo y regresó sin ayuda a su tienda. El cirujano pensó que se moriría de dolor cuando le extrajesen el hierro, pero actuó como si solamente le hubieran arrancado un pelo de su cabeza. Francisco de Lorena tuvo siempre las cicatrices de esa herida.