L'armée de Rhin-et-Moselle poursuit son offensive sur Munich et bat de nouveau les autrichiens à Geissenfeld le septembre. Apprenant la nouvelle de la défaite de Jourdan lors de la bataille d'Amberg, Moreau ordonne la retraite. Suivi par Latour, il traverse la Forêt-Noire pour prendre de vitesse l'archiduc Charles qui cherche à l'encercler. Il parvient à regagner le Rhin à la mi-octobre.