После 1994 года положение клуба ухудшилось и по итогам &lt;a href="%D0%A7%D0%B5%D0%BC%D0%BF%D0%B8%D0%BE%D0%BD%D0%B0%D1%82%20%D0%93%D0%B5%D1%80%D0%BC%D0%B0%D0%BD%D0%B8%D0%B8%201995/1996"&gt;сезона 1995/1996&lt;/a&gt; «Айнтрахт» вылетел во Вторую Бундеслигу. Зато в том же году вратарь франкфуртцев Андреас Кёпке становится чемпионом Европы 1996 года. Спустя два года, в 1998 году, клуб вернулся обратно в Бундеслигу, но поборовшись три сезона за выживание, в 2001 году вновь выбывает во вторую лигу.