В 1906 избран от Тифлиса в 1-ю Государственную Думу, лидер социал-демократической фракции. V съезд РСДРП (1907) избрал Жордания в ЦК, членом которого он был до 1912 года. За подписание Выборгского воззвания Жордания в декабре 1907 года был осуждён на 3 месяца тюрьмы.