Сезон 2007/2008 Рупник начал в основной сборной, но после первого этапа в Контиолахти он был отправлен на континентальный кубок, где ему покорился наивысший результат в карьере - второе место в спринте в Банско с четырьмя штрафными кругами. В этом же сезоне Рупник стал постоянным членом словенской эстафеты. На чемпионате мира в Остерсунде лучшим личным результатом Рупника стало 59-е место в индивидуальной гонке, а словенская эстафете стала только 19-й, а Рупник, бежавший на последнем этапе, заработал 2 штрафных круга.