Спочатку армії була відведена ділянка будівництва фортифікаційних споруд від Азовського моря до Сталінграду. Зводила донський оборонний рубіж по річках Аксай — Дон — Сіверський Донець, з лютого 1942 — Ворошиловградський і Ростовський оборонні обводи. З кінця липня 1942 вела на ТВД Північно-Кавказького і Закавказького фронтів будівництво Орджонікідзевського, Мінераловодського, Грозненського і Аксайського оборонних обводів, Терського, Сунженського і Гудермесського оборонних рубежів, загород в Ельхотовській ущелині і Дарьяльському дефіле. Саперні бригади залучалися до інженерного забезпечення бойових дій в ході Донбаської операції 1942 і оборони Кавказу.