Les biens de l'abbaye sont confisqués en 1527, et les bâtiments brûlés par les armées danoises en 1566 pendant la Guerre nordique de Sept Ans. Au milieu du , Magnus Gabriel De la Gardie reçoit l'abbaye en cadeau de la reine Christine. De la Gardie restaure l'église et y établit son mausolée familial, où il est inhumé en 1686 en compagnie de son épouse Maria Euphrosyne de Palatinat-Deux-Ponts († 1687), de leur fils Gustave-Adolphe († 1695) et de l'épouse de ce dernier Elisabeth Oxenstierna († 1726) tandis que les bâtiments abbatiaux subsistants sont laissés à l'abandon.