К началу Отечественной войны 1812 года генерал-майор Лаптев находился в отставке и вступил в Московское ополчение, где командовал 8-м пешим казачьим полком. По прибытии к Главной армии возглавил 2-ю бригаду 11-й пехотной дивизии, отличился в Бородинском сражении, где был ранен. Далее он командовал 23-й пехотной дивизией. Во время Заграничных походов 1813 и 1814 годов командовал 21-й и 24-й пехотными дивизиями, за отличие в Битве народов под Лейпцигом был произведён в генерал-лейтенанты. В 1814 году участвовал в боях во Франции, в сражении при Краоне был тяжело ранен.