バレー戦役の終結後、ジャクソン軍はリーの指揮下に入り、北バージニア軍の第2軍団に位置づけられた。以後、優秀な部下に別働隊を与えて行動させるリーの作戦指揮において、ジャクソンは不可欠の存在となる。ジャクソン軍団は直ちにリッチモンド防衛のために呼び戻され、ビーバーダム・クリークの戦い（6月26日）に駆けつける。マクレランはこれを南軍の新手の到着と誤認し、南軍の総兵力を過大評価して半島戦役の幕引きを決断する。このマクレランの撤退は南北戦争の終結を3年先延ばししたとも言われる。