D'autre part, le Pakistan soutient l'Azerbaïdjan dans le conflit au Haut-Karabagh. En raison de ses relations étroites avec les adversaires de l'Arménie, la Turquie et l’Azerbaïdjan, le Pakistan considère le massacre de Khojaly comme un génocide. Le Pakistan a été le troisième pays après la Turquie et la Roumanie à reconnaître l’indépendance de l'Azerbaïdjan, avec qui elle entretient des relations étroites depuis. L'Azerbaïdjan soutient la position du Pakistan sur le conflit au Cachemire. Ainsi, en raison de la politique pakistanaise perçue en faveur de l'Azerbaïdjan et de la Turquie, l'Arménie a développé des relations amicales avec l'Inde et soutient la position indienne sur le conflit au Cachemire.