Первым директором нового вуза был назначен Александр Евгеньевич Лагорио, назначенный по уставу также деканом Горного отделения. На момент открытия университет имел три отделения: механическое, химическое и инженерно-строительное, к которым в 1903 году добавилось четвёртое — горное. Поляки составляли большинство среди студентов вплоть до 1905 года, когда их количество достигло 1100 человек. Однако в результате событий революции 1905—1907 годов количество слушателей резко уменьшилось и вновь достигло предреволюционного уровня лишь незадолго до начала первой мировой войны.