En la primavera de 1862, las fuerzas confederadas empujaron hacia el norte a lo largo del Río Grande desde El Paso, Texas, a través del Territorio de Nuevo México, pero fueron detenidas en la Batalla de Glorieta Pass (26-28 de marzo de 1862). En 1863, el General Edmund Kirby Smith tomó el mando del Departamento Confederado Trans-Mississippi, e intentó sin éxito aliviar el asedio de Vicksburg por el Teniente General Ulysses S. Grant en las riberas orientales opuestas del río Misisipi en el estado de Misisipi. Como resultado de la larga campaña / asedio y rendición en julio de 1863 por el General John C. Pemberton, la Unión ganó el control de todo el río Misisipi, dividiendo la Confederación. Esto dejó al Departamento de Trans-Mississippi casi completamente aislado del resto de los estados confederados al este. Llegó a ser apodado y conocido como "Kirby Smithdom", lo que pone de relieve la falta de control directo del Gobierno de la Confederación sobre la región.