Яннис Зуганелис пишет музыку для театральных шоу, кино, телевидения, а также для балетных представлений. Его первой работой в дискографии была запись на "LYRA" в 1972 году в возрасте пятнадцати лет, в целом Зуганелис выпустил более 60 альбомов. Его дискография включает в себя широкий спектр музыкальных произведений: для детей, саундтреки, оркестровая музыка, авторская песня, рок-музыка, фолк-музыка, музыка, основанная на древнегреческой культуре. В 1996 году его работы были представлены на церемонии награждения лауреатов Нобелевской премии, альбом «Soul Strings» был создан по заказу Шведской академии. Альбом «The Light Of Flame» был написан в 2004 году по случаю Паралимпийских игр. Он написал музыку к нескольким кинофильмам (более 20), к более чем ста спектаклям, старинным и современным. Среди них — произведения Эсхила, Софокла, Еврипида, Аристофана, Менандра, Теренция, Шекспира, Мольера, Лопе де Вега, Лорка, Брехта. Его песни исполняют: Василис Папаконстантину, Айседора Сидерис, Сакис Булас, Йоргос Даларас, Элеонора Зуганели. Он является одним из немногих греческих композиторов инструментальной музыки, чьи произведения были выпущены во всем мире: а именно альбом «Όπου και να ταξιδέψω η Ελλάδα με πληγώνει» (1980) от "SONET MUSIC" и "CBS", «Ατρείδες» (1978) от "Deutsche Grammophon". С 2000 по 2004 год пять CD были изданы по всему миру от "VENOL". В 2002 году Зуганелис получил премию "D. SHARP" за продажу 500 000 его альбомов во всем мире.