Der Entwurf eines ersten Siegels wurde durch die Verwaltung des Montana-Territoriums in Auftrag gegeben und durch Francis McGee Thompson, einen Abgeordneten in der ersten Legislativversammlung des Territoriums in Bannack, der Hauptstadt des Territoriums, entworfen. Thompsons Entwurf wurde am 9. Februar 1865 durch die Legislativversammlung gebilligt und am selben Tag durch den Territorialgouverneur Sidney Edgerton per Unterschrift in Kraft gesetzt. Das Siegel wies den Wahlspruch "Oro y Plata" (spanisch für „Gold und Silber“) auf und enthielt als Bildelemente einen Spaten, einen Pflug und einen Spitzhacke, die zusammen die landwirtschaftlichen Ressourcen und den mineralischen Reichtum des Territoriums symbolisieren sollten. Als Naturelemente waren die Berge, nach denen das Territorium seinen Namen erhalten hatte und die Großen Wasserfälle ("Great Falls") des Missouri River, die Lewis und Clark auf ihrer damaligen Expedition stark beeindruckt hatten, dargestellt. Das erste Siegel enthielt auch die Darstellung eines Bisons und anderer Tiere. Diese wurden in den folgenden Jahren wieder entfernt, da das Siegel als zu voll empfunden wurde.