1864年10月にヨハン・ベルンハルト・フォン・レヒベルク伯爵（）の後任として外務大臣に就任、翌1865年の6月から7月にかけて1カ月のあいだ宰相を兼任した。メンスドルフ＝プイリーは典型的な「皇帝の忠実な下僕（„treugehorsame Diener seines Kaisers“）」であり、1866年の第二次シュレースヴィヒ＝ホルシュタイン戦争には後任の宰相リヒャルト・ベルクレディ伯爵（）と一緒になって憲法を一時的に停止させた。1866年11月に外相を辞任した。その後、アグラム（現在のクロアチア領ザグレブ）駐屯軍の軍団長となり、さらにプラハ駐在の軍団長に転任した。