Hundseid był zszokowany, gdy jego stary oponent Quisling ogłosił się premierem rządu w związku z atakiem Niemiec na Norwegię w 1940 roku, i obawiał się represji ze strony Quislinga. Hundseid uciekł ze stolicy do wiejskiego hotelu, gdzie przebywał pod fałszywym nazwiskiem. Poprosił również lekarza o dostarczenie mu szybko działającej trucizny, którą mógłby zażyć w razie spotkania z wysłannikami Quislinga. Latem 1940 roku Gustav Richert, szef departamentu ds. żywienia i rolnictwa Komisji Rzeszy, rozpoczął pracę nad reorganizacją norweskich organizacji rolniczych według modelu korporacyjnego. Odbył podróż po kraju, by spotkać się z władzami ruchu chłopskiego, a w czerwcu przybył do Hundseida, ówczesnego gubernatora okręgu Buskerud, z propozycją objęcia stanowiska prezesa nowego chłopskiego "Norges Bondesamband" utworzonego w miejscu starego "Norges Bondelag". Hundseid odmówił objęcia stanowiska i jednocześnie jasno stwierdził, że nie był entuzjastycznie nastawiony do pracy z Quislingiem. W tym samym roku do Hundseida zwrócił się komisarz Sverre Riisnæs (1897–1988), który wkrótce przedłożył mu do podpisu oświadczenie z przeprosinami Quislinga, deklaracją gotowości zapisania się do partii Nasjonal Samling (NS) i deklaracją pozytywnych wypowiedzi o partii dla prasy. Hundseid zapisał się do NS, a po wojnie określił swoje postępowanie jako tchórzliwe. W 1943 roku przyjął stanowisko w komitecie NS i poparł plany znacznego zredukowanego samorządu lokalnego i wzmocnienia kontroli państwa.