Črna smrt je v Basel prišla leta 1348. Za to so krivili Jude, približno 50 do 70 Judov je bilo usmrčenih na grmadi 16. januarja 1349 v tako imenovanem pokolu v Baslu. Potres v Baslu leta 1356 je uničil večino mesta skupaj s številnimi gradovi v bližini.