Zbiory biblioteki obejmują m.in. 200 średniowiecznych rękopisów (w tym autograf "Roczniki, czyli kroniki sławnego Królestwa Polskiego" Jana Długosza, oraz 80 iluminowanych rękopisów (w tym "Złoty kodeks pułtuski", "Kodeks wizygocki", "Księga turniejowa", "Pontyfikał Erazma Ciołka") a także autografy listów znanych postaci np. Mikołaja Kopernika, Ludwiga van Beethovena, Marcina Lutra, Adama Mickiewicza, Georga Byrona, pierwszych prezydentów USA, a ponadto akt hołdu pruskiego.