成立経緯から距離を取っていたとはいえ、国内外のファシスト勢力を基盤とするMSIはしばしばそれらの事件との関与を指摘された。1980年には戦後イタリア最悪の爆破テロ事件とも言われるボローニャ駅爆破テロ事件が発生、ネオ・ファシスト系テロ組織NAR（）やSISMI（イタリア政府諜報機関）の高官が逮捕されたが、この事件にMSI幹部でかつ非合法組織の「ロッジP2」の代表を務めていたリーチオ・ジェッリが含まれていた事に世間に大きな批判を寄せた。