Также Мануэль - игрок юношеских сборных Испании различных возрастов. Является серебряным призёром Чемпионата Европы 2016 года среди юношей до 17 лет. На турнире провёл все шесть матчей будучи ключевым игроком сборной. В финале против юношей из Португалии не забил свой пенальти в серии одиннадцатиметровых, что принесло его команде поражение.