Pálffy vedl důvěrnou korespondenci s princem Evženem Savojským o Rákócziho povstání v roce 1704. Pálffy byl od roku 1680 ženatý s Alžbětou, rozenou svobodnou paní Weichsovou, s níž založil tzv. starší Mikulášovu linii Pálffyů.