"Whitehurst" được điều động sang thành phần dự bị từ ngày 6 tháng 12, 1958, nhưng tiếp tục phục vụ như một đơn vị thuộc Lực lượng Chống tàu ngầm Dự bị sang tận giữa thập niên 1960. Sau khi xảy ra các vụ Khủng hoảng Berlin và Khủng hoảng tên lửa Cuba vào năm 1961, con tàu được huy động trở lại phục vụ thường trực cùng Hạm đội Thái Bình Dương từ ngày 2 tháng 10 dưới quyền chỉ huy của hạm trưởng, Thiếu tá Hải quân Donald L. MacLane. Nó rời hai ngày sau đó để chuyển đến cảng nhà mới tại Trân Châu Cảng, và sau một giai đoạn thực hành huấn luyện tại khu vực Hawaii, nó lên đường vào ngày 10 tháng 2, 1962 để hướng sang khu vực Tây Thái Bình Dương.