В сентябре 1990 года был избран членом ЦК Компартии РСФСР от Марксистской платформы. В том же году на XXVIII съезде КПСС А. В. Крючков был избран в программную комиссию. 15 мая 1992 года был избран председателем Политсовета ЦИК РПК. С осени 1991 года был одним из организаторов митингов с участием РПК. В июле 1993 года РПК вступила в Фронт национального спасения, а Крючков стал членом Политсовета ФНС. Во время октябрьских событий 1993 года был назначен начальником штаба ФНС по защите Дома Советов.