Müffling war ab 1755 zunächst Junker beim Leibregiment in Gotha. Am 3. März 1758 trat er in preußische Dienste über und wurde im Infanterieregiment Nr. 3 angestellt. Mit dem Regiment nahm Müffling während des &lt;a href="Siebenj%C3%A4hriger%20Krieg"&gt;Feldzuges 1758/63&lt;/a&gt; an den Schlachten bei Kay, Liegnitz, den Gefechten bei Adelsbach und Leutmannsdorf sowie den Belagerungen von Dresden und Schweidnitz teil. Zwischenzeitlich war er am 10. Mai 1761 Sekondeleutnant geworden. In den Nachkriegsjahren stieg er bis 2. Februar 1776 zum Kapitän und Kompaniechef in seinem Regiment auf und wurde am 8. Dezember 1786 schließlich Major. Als solcher nahm er im Jahr darauf am Feldzug in Holland teil. Hier kommandierte er das Füsilierbataillon „von Langelair“ Nr. 17 und wurde für das Gefecht bei Amstelveen am 1. Oktober 1787 mit dem Orden Pour le Mérite ausgezeichnet. Am 20. Januar 1789 wurde Müffling Chef des Füsilierbataillons „von Wilhelmi“ Nr. 18, mit dem er im &lt;a href="Erster%20Koalitionskrieg"&gt;Feldzug 1792/95&lt;/a&gt; gegen das revolutionäre Frankreich kämpfte. Er kam bei der Kanonade von Valmy, der Schlacht bei Kaiserslautern sowie den Gefechten bei Waldalgesheim, Weidenthal, Edinghofen, Pallenberg und La Lune zum Einsatz. Während des Feldzuges wurde ihm als Oberstleutnant, am 12. September 1794, anlässlich der Erstürmung des Battenberges, das Kommando über das Infanterieregiment „von Kleist“ Nr. 12 übertragen. Ein Jahr nach seiner Beförderung zum Oberst übernahm er am 4. Januar 1796 das Infanterieregiment „von Thadden“ Nr. 3, in dem er seinerzeit seinen Dienst in der Preußischen Armee begonnen hatte.