Desde a sua sagração a nova sé catedral tornou-se o centro da Igreja Católica Romana na então colónia portuguesa da Guiné, assim como depois da independência, em 1974. Na época dos grandes esforços de urbanização levados a cabo pelo poder colonial português entre as décadas de 1940 e 1960, a catedral constituiu-se como um poderoso símbolo da presença de Portugal, e da conversão de Bissau numa "capital digna do país". O Governador Colonial, Sarmento Rodrigues escreveu, por ocasião de uma celebração em 1949: "A cidade de S. José de Bissau tem hoje um apreciável conjunto de artérias e edificações. (...) Possui hotéis, hospitais, estádio, praças, monumentos, uma catedral, água canalizada, luz e todas as modernas conveniências". A partir dessa época, quando visitantes de alta categoria se encontravam em Bissau, era imperativa uma visita à catedral, quando não um serviço religioso.