Awal 1942, invasi terhadap Asia Pasifik Selatan pun dimulai. Januari, menginvasi Jawa. Lalu pada Maret, Nagatsuki mengawal konvoi ke sekitar Singapura, Penang dan Rangoon, hingga ia ditransfer ke Rabaul pada awal 1943 guna mengawal konvoi Jepang.