Во вторую чеченскую войну Доку Умаровым Гакаев был назначен командующим Шалинским сектором Восточного фронта ВС ЧРИ / ИК. Заместителем командующего Шалинским сектором ВФ являлся младший брат Хусейна — Муслим, позывной «Дунга».