Nel corso della sua militanza nella formazione di Bergamo si fece apprezzare per la dedizione alla causa, malgrado il ruolo fisso di secondo portiere alle spalle di Fabrizio Ferron. Riuscì a disputare come titolare solo la stagione 1996-1997, conquistandosi il posto a stagione in corso ai danni di Davide Micillo. Durante tale campionato Pinato fu in grado di mantenere inviolata la propria porta per 757 minuti consecutivi (record d'imbattibilità in Serie A dell'Atalanta, tuttora imbattuto).