Nach dem Putschversuchs 2016 wurden weitere 6 Mitarbeiter entlassen. Auch zwei Dekane wurden ihres Amtes enthoben. Rektor Akkanat kritisierte die deutschen Partner und eine einseitige Kritisierung der Einschränkung von Wissenschaftsfreiheit. Wissenschaftler, die sich anonym besorgt über die Lage in ihrer Heimat äußerten, würden die Türkei nur schlechtmachen wollen. Die Soziologin Dr. Aslı Vatansever bemängelte, wenn die deutsche Seite keinen Einfluss darauf habe, wer dort entlassen würde, gehöre die Zusammenarbeit beendet.