Het Verdrag van Zsitvatorok maakte een einde aan de Lange Oorlog met de Ottomanen. Opstanden her en der in het Rijk leidden tot spanningen tussen Matthias en zijn broer, Keizer Rudolf. Met het Verdrag van Libeň in 1608 werd Rudolf gedwongen verschillende bevoegdheden af te staan. Vanaf dan was Matthias koning van Hongarije, aartshertog van Oostenrijk en markgraaf van Moravië.