Alla fine della prima guerra mondiale, Noske si distinse per i suoi attacchi contro i bolscevichi e l'ala sinistra del suo partito. Nel 1919, nominato Ministro della Difesa, non esitò a incoraggiare l'azione di gruppi paramilitari ultranazionalisti (in particolare i "Freikorps") per contrastare il diffondersi del bolscevismo nella Repubblica di Weimar. In effetti nel gennaio 1919 i "Freikorps", assieme alle truppe della Reichswehr guidate dal generale Walther von Lüttwitz, repressero nel sangue la rivolta della Lega Spartachista.