К дате столетия основания монастыря в 1724 году на месте деревянного храма был построен каменный. Название святыни изменилось во второй половине XVIII века, когда костёл отстроили после пожара 1751 года. С того времени храм освящён во имя Архангела Михаила. Особое почитание Архангела Михаила в Новогрудке началось после войны Речи Посполитой с Московским царством 1654—67 годах годов, когда, по преданию, он спас город от уничтожения.