В 2009 году вышла картина «Коко Шанель и Игорь Стравинский», в которой Миккельсен исполнил главную мужскую роль, русского композитора Игоря Стравинского. Фильм закрывал 62-й Каннский фестиваль. В 2011 году Миккельсена можно было увидеть в роли Графа Рошфора в приключенческом боевике Пола Андерсона «Мушкетёры», вольной интерпретации одноимённого романа Александра Дюма.