В годы перестройки А. В. Каган стал инициатором организации в ДГБ № 1 хозрасчётного (платного) амбулаторного отделения. Возможно, именно организационные успехи на этом поприще сыграли решающую роль при назначении его в 1991 году на должность начмеда больницы. Это произошло в мае, а в сентябре того же года, вскоре после августовского путча мэром Ленинграда А. А. Собчаком он был назначен главным врачом ДГБ. № 1. Эту должность с небольшим перерывом (2000—2003 гг.) Анатолий Владимирович занимает по настоящее время.