Во время Гражданской войны Корнифиций сражался на стороне Юлия Цезаря против Помпея. Получил должность иллирийского "quaestor pro praetore" в 48 г. до н.э., он защитил эту провинцию от нападения флота Помпея. В 46 году до н.э. он был отправлен на Сицилию, возможно в качестве "legatus pro praetore", а затем в Сирию, где он участвовал в войне против сторонника Помпея полководца Квитна Цецилия Басса. В следующем году он получил должность претора. Летом 44 г. до н.э.,после убийства Цезаря, сенат назначил его управителем провинции Африка.