Dopo che Joe Biden ha vinto le elezioni presidenziali del 2020 e Trump si è rifiutato di concedere la vittoria pronunciando frasi di frode elettorale, Stefanik ha aiutato Trump negli sforzi per ribaltare i risultati delle votazioni. Ha detto tra l'altro che "più di 140.000 voti provenivano da elettori minorenni, deceduti e altrimenti non autorizzati" nella contea di Fulton, in Georgia. Ha anche espresso "preoccupazioni" riguardo a Dominion Voting Systems, oggetto di numerose false teorie cospirative di destra. Nel dicembre 2020, Stefanik ha sostenuto la causa Texas contro Pennsylvania, un tentativo di invertire la sconfitta di Trump presentando una petizione alla Corte Suprema degli Stati Uniti per respingere i risultati certificati in Michigan, Pennsylvania, Wisconsin e Georgia. Dopo che una folla di sostenitori pro-Trump ha preso d'assalto il Campidoglio degli Stati Uniti il 6 gennaio 2021, Stefanik ha condannato la violenza ma ha respinto l'idea che Trump fosse responsabile di quel progetto. Ha promosso teorie considerate cospirative su una "elezione rubata", e poche ore dopo l'invasione del Campidoglio, ha votato contro l'accettazione dei voti elettorali della Pennsylvania alle elezioni del 2020. Più tardi, a gennaio, ha espresso opposizione all'impeachment di Trump sul suo ruolo nell'incitare all'assalto del Campidoglio.