Realizó su pasantía de abogado en el estudio del licenciado Mariano Lasso de la Vega, quien trabajaba en la ciudad de Santiago de Querétaro desde finales de 1809 o principios de 1810. Este letrado era buen amigo del corregidor de esa ciudad, Don Miguel Domínguez, y de su esposa Doña Josefa Ortiz de Domínguez con quienes Mier y Altamirano empezó a asistir a unas supuestas juntas literarias donde se leían y se analizaban diversas obras, pero en las cuales pronto empezaron a discutirse ideas libertarias y a planearse un levantamiento para conseguir la independencia del país y a favor del rey Fernando VII, quien había sido derrocado por el ejército francés de Napoleón Bonaparte desde 1808. Mier y Altamirano pronto fue parte importante de este grupo de personalidades que se reunía en torno a lo que luego se llamó la Conspiración de Querétaro.