Bei den Nordischen Junioren-Skiweltmeisterschaften 2004 in Stryn erreichte Malts im Einzelspringen den 45. Platz im Einzelspringen von der Normalschanze. Mit der Mannschaft kam er auf den 15. Platz. Im August 2004 startete er erstmals im Skisprung-Continental-Cup. Jedoch gelang es ihm in der Folge in seiner gesamten Karriere nicht, sich in dieser Serie durchzusetzen. Er blieb in allen Wettbewerben ohne Punktegewinn. Bei den Estnischen Meisterschaften 2004 in Otepää gewann er gemeinsam mit Jaan Jüris und Kristjan Eljand seinen zweiten nationalen Meistertitel.