O comodoro Allan Walters assumiu o Comando do Norte de Lukis em fevereiro de 1945. Walters dirigiu operações na Nova Guiné, Nova Bretanha e Bougainville até ao fim das hostilidades, e o capitão de grupo Val Hancock assumiu o comando da Asa N.º 71 em abril. Para maximizar o apoio às tropas terrestres australianas na preparação para o ataque final a Wewak, os três esquadrões Beaufort da asa foram acompanhados por mais dois, os esquadrões N.º 6 e N.º 15. Aproximadamente sessenta aviões Beaufort e Boomerang atacaram posições japonesas atrás da Baía Dove antes de desembarques anfíbios no dia 11 de maio para impedir a retirada das tropas inimigas. Durante todo o mês a asa lançou mais de 1200 toneladas de bombas e voou mais de 1400 missões; por outro lado, a asa sofreu com escassez de combustível e munições, e a certa altura os seus esquadrões tiveram de carregar os seus bombardeiros com bombas capturadas dos japoneses. A Asa N.º 84, comandada pelo capitão de grupo Bill Hely e que tinha sob a sua alçada o Esquadrão N.º 5 que voava principalmente aeronaves Boomerang, juntamente com outras duas unidades de reconhecimento e transporte, também sofria com a escassez de equipamentos e de pilotos. Reforçada por um destacamento do Esquadrão N.º 36, que operava aviões C-47 Dakota, as suas aeronaves realizaram mais de 4000 missões durante a campanha de Bougainville até ao final de junho de 1945. Naquele mês o Comando do Norte foi encarregado de actuar na reserva para a Operação Oboe Six, a invasão de Labuan. Em julho o Grupo N.º 11 foi formado como um "comando estático" com sede em Morotai, nas Índias Orientais Holandesas, usando elementos do Comando do Norte e da Primeira Força Aérea Táctica; isso libertou esta última de deveres de guarnição enquanto as suas unidades de combate avançavam em direcção a Bornéu.