Durante gli anni 1930 l'Esercito Popolare Mongolo fu variamente impegnato durante il periodo di purghe interne che portò all'istituzione in Mongolia di un regime di stampo stalinista capitanato da Čojbalsan. L'introduzione della collettivizzazione in Mongolia e l'eliminazione delle tradizionali caste nobiliari e monacali mongole portò a svariate rivolte interne, culminate nell'aprile 1932 dall'ammutinamento di circa 3.000 soldati dell'Esercito stesso; i reparti fedeli a Čojbalsan, sostenuti da unità dell'Armata Rossa, repressero rapidamente queste rivolte entro la metà degli anni 1930. L'ammutinamento del 1932 portò a un periodo di ristrutturazione interna dell'Esercito Popolare Mongolo, chiamato ben presto a difendere le frontiere nazionali dalle mire espansionistiche dell'Impero giapponese, giunto al confine mongolo dopo l'invasione della Manciuria del 1931-1932.