Sydneyn olympialaisissa vuonna 2000 Mutola ja Mosambikin valtio saivat vihdoin ensimmäisen olympialaisten kultamitalinsa. Kultainen menestyskulku jatkui 2001 Lissabonin MM-hallikisoissa, 2001 Edmontonin MM-kisoissa, 2002 Afrikan mestaruuskisoissa, 2002 maailmancupissa, 2003 Birminghamin MM-hallikisoissa, 2003 Pariisin ulkoratojen MM-kisoissa ja 2004 Budapestin hallimaailmanmestaruuskisoissa. Koko 1990-luvun jälkipuoliskon ja 2000-luvun alun Mutola oli yksi maailman ylivoimaisimmista urheilijoista dominoiden 800 metrin kilpailuja mielensä mukaan. Esimerkiksi vuoden 2003 Kultaisessa liigassa hän voitti kaikki osakilpailut.