종교 개혁이 시작된 이후 위그노라고 불린 칼뱅주의 개신교의 세력이 확장하면서 프랑스에서도 종교 간의 갈등이 첨예화 되었다. 훗날 앙리 4세가 된 나바르의 앙리의 결혼식 기간에 일어난 성 바르톨로메오 축일의 학살은 가톨릭 교도들이 개신교도들을 무차별적으로 학살한 사건이었다. 이러한 갈등은 결국 내전의 양상을 띄게 되어 위그노 전쟁이 일어났다. 위그노에서 가톨릭으로 개종하여 왕위에 오른 앙리 4세는 낭트 칙령으로 종교의 자유를 보장하여 위그노 전쟁을 종식시켰다.