Capito oficialmente começou seu novo cargo dentro da McLaren em 1 de setembro de 2016. Seu primeiro fim de semana de corrida com sua nova equipe foi o Grande Prêmio da Itália. Porém, em 19 de dezembro de 2016, foi anunciado que Capito deixaria seu cargo de diretor executivo na equipe. Em 7 de fevereiro do ano seguinte, a saída de Jost Capito foi confirmada oficialmente pela McLaren.