Son rôle comme officier de renseignement de la Wehrmacht dans la réussite de l'opération "Kozora" menée contre les partisans et la population au Monténégro et en Macédoine fait l'objet en 1985-1986 d'une controverse, l'« affaire Waldheim ». Un comité international d'historiens militaires conclut qu'il n'y et qu'.