Le fleuve charrie une quantité importante de limon, en particulier lors de la fonte des neiges au printemps. La concentration de limon à l'embouchure de la rivière forme des bancs de sable qui constituent un obstacle à la navigation. Cette difficulté de navigation est la raison pour laquelle aucune ville importante n'a été édifiée à son embouchure. Son estuaire est répertorié comme l'un des zones humides d'importance internationale par la Convention de Ramsar sur les zones humides. Le Connecticut est également classé dans l'American Heritage Rivers par l'Agence de protection de l'environnement des États-Unis