Bölge ağırlıklı olarak Doğu Vijayan Dağları'nın hornblend - biyotit gnaysının altında yer almaktadır. Alçak rakımlı topraklarda kuru bölge iklimi hakimdir. Alanın ortalama bağıl nemi %80'dir. Millî park, üçünde tuz tavaları olan beş sığ lagün içerir. Bundala Lagünü , Embilikala Lagünü , Malala Lagünü , Koholankala Lagünü ve Mahalewaya alan kaplamaktadır. Koholankala ve Mahalewaya tuz üretimi için uygun koşulları sağladığı için bu bölgelerde gelişmiş tuz üretimi yapılmaktadır. İklim koşulları, yıllık ortalama sıcaklığın görüldüğü tropik Muson iklim özellikleri sergiler. Yıllık yağış miktarı arasında değişmektedir, kurak dönem Mayıs ayından Eylül ayına kadar devam eder. Parkın yüksekliği deniz seviyesinden yüksekliğe kadar değişmektedir. Park, 2004 Hint Okyanusu tsunamisinden etkilenmiştir. Kum tepelerinin koruyucu etkisi nedeniyle park çok az hasar almıştır.