Остров Юкон имеет максимальный размер по линии север—юг ок. 2,25 км, по линии восток—запад — 1,9 км, его площадь составляет примерно 2,5 км², максимальная высота — около 150 метров над уровнем моря (в 1964 году он опустился примерно на 60 сантиметров в результате мощного землетрясения). Минимальное расстояние до материка — около 1,3 км. Вокруг Юкона разбросаны несколько более мелких, также необитаемых, островов: Хескет (ок. 650 м к юго-западу), Коэн (ок. 900 м к северо-востоку). В 12 километрах к северу, через пролив, расположен весьма крупный по местным меркам город Хомер (ок. 5000 жителей). Оттуда до Юкона регулярно ходят морские такси, так как есть много желающих провести своё свободное время на каяках в окрестностях острова.