Heydar Aliyev, o futuro presidente do Azerbaijão, voltou à sua terra natal do Naquichevão em 1990, depois de ser expulsado do seu cargo no Politburô por Mikhail Gorbachov em 1987. Pouco depois de voltar ao Naquichevão, Aliyev foi eleito ao Soviete Supremo por uma maioria esmagadora. Aliyev depois da tentativa de golpe de estado de Agosto de 1991, no final de 1991, Aliyev consolidou o seu poder na região do Naquichevão e consolidou uma independência quase total de Bacu.