Акбар Бугти был избран в качестве сенатора в Национальную ассамблею Пакистана в мае 1958 года. В 1960 году он был арестован и осужден военным трибуналом и впоследствии лишён права на занятие государственных должностей в Пакистане. При президенте Зульфикаре Али Бхутто Акбару Бугти было разрешено вновь заниматься политической деятельностью. 14 февраля 1973 года он был назначен губернатором провинции Белуджистан. 1 января 1974 года Акбар ушёл в отставку с должности, так как был несогласен с политикой Исламабада в Белуджистане. В провинции находилось 100 тысяч пакистанских солдат, которые с помощью иранских военно-воздушных сил сражались с белуджистанскими повстанцами. Мохаммед Реза Пехлеви, шах Ирана, направил истребители F-14 и вертолёты AH-1, чтобы помочь пакистанской армии бороться с мятежом в провинции. 4 000 белуджей погибли в ходе войны, Акбар Бугти негласно поддерживал ведение вооружённых действий против Исламабада.