Bonzi Wells est choisi en de la Draft 1998 de la NBA par les Pistons de Détroit. Le 21 janvier 1999, il signe pour les Trail Blazers de Portland. Il y devient titulaire après un moment puis le second joueur majeur de l'équipe après Rasheed Wallace. Sa moyenne de points par matchs progresse pour atteindre 17,0 points par match en 2001-2002 puis 15,2 en 2003.