Nach dem Verbot der KSČ und der deutschen Besetzung des Landes emigrierte Weikert 1939 in die Sowjetunion, wo er in Stalingrad eine Schlosserausbildung aufnahm und sich dem Nationalkomitee Freies Deutschland anschloss. Zwei Jahre später übersiedelte Weikert in die Kasachische SSR und arbeitete dort als Schlosser. Ab 1942 erhielt er Spezialausbildungen auf dem Gebiet der Nachrichtentechnik in Ufa und Moskau. Nach Ausbruch des Slowakischen Nationalaufstandes meldete sich Weikert Anfang September 1944 freiwillig in Kiew bei der Aufstellung von Partisaneneinheiten. Er wurde illegal nach Banská Bystrica in die Slowakei eingeflogen und wirkte dort als Funker des Partisanenhauptstabes.