此时，第一次鸦片战争爆发了。1842年6月13日，砵甸乍沿长江进攻，巴夏礼在远征中作为砵甸乍的随从。在7月21日，镇江被英军攻占。8月29日，在英军战舰康沃利斯號，中英双方签署了《南京条约》。根据条约，广州、厦门、福州、宁波和上海五个港口开放为通商口岸。