В 1704 году, после поражения в Гохштедтском сражении, Максимилиан временно сделал жену регентом Баварии, но уже в следующем году Тереза Кунегунда уехала со своим исповедником к матери в Венецию, оставив детей в Мюнхене. В 1706 году четверо старших детей были перевезены в Клагенфурт, тогда как двое младших оставались в Мюнхене.