Em 1570 William Cecil, na época o principal conselheiro da rainha, escolheu Walsingham para negociar e representar os huguenotes nas negociações com Carlos IX, quando se estipulava o tratado de Blois. Em seguida sucedeu "sir" Henry Norris como o embaixador da Inglaterra na França. Após o Massacre da noite de São Bartolomeu, sua casa em Paris tornou-se um santuário provisório de refugiados protestantes. Retornou à Inglaterra em abril de 1573.