Akers débute en universitaire avec l'équipe d'UCF Golden Knights de l'Université de Floride centrale. Elle intègre l'équipe des États-Unis de football féminin à sa création en 1985. Cadre de la sélection, Michelle participe au sacre américain lors de la première édition de la Coupe du monde féminine. Ses dix buts lui permettent de terminer meilleure buteuse de la compétition et seconde meilleure joueuse. Les Américaines terminent troisième du Mondial 1995 avant de remporte l'or à domicile lors des Jeux olympiques 1996. Trois ans plus tard, Akers remporte son second sacre mondial avec la Coupe du monde 1999.