1885年柏林条约签订后，不列颠东非公司被威廉·麦金农接管。与此同时，在英国政府的大力支持下，公司的殖民活动逐步在东非开展。蒙巴萨及其港口成为了公司的根据地，公司的行政办公室也就位于希莫尼以南约五十英里的地方，公司在1888年4月18日在伦敦正式注册成立，并于1888年8月6日获取维多利亚女王授予的皇家特许证。