Uczelnia został założona w 1990 roku na podstawie decyzji Rady Ministrów ZSRR jako Homelski Państwowy Instytut Medyczny (Гомельский государственный медицинский институт). Ponieważ rejon Homla i Mohylewa był obszarem dotkniętym skutkami katastrofy w Czarnobylu, powołano tam instytut, którego głównym celem miało być zapewnienie lekarzy i innych specjalistów medycznych na tym terenie, a także prowadzeniem badań nad skutkami katastrofy i poszukiwanie sposobu na zapobieganie im. Pierwszym rektorem instytutu został Jurij Bandażewski, który kierował nim do 1999 roku.