Han kämpade i boerkrigen, där han organiserade Irländska Transvaal Brigaden. Den blev känd som "MacBride's Brigad" efter grundaren, men då MacBride inte själv hade mycket militär erfarenhet rekommenderade han den Irlands-amerikanska översten John Blake till att bli befälhavare. Brigaden blev officiellt erkänd av boerregeringen, och MacBride fick graden major och statsborgarskap i Transvaal. Omkring 500 irländare och irlandsamerikaner kämpade i brigaden, vid ett flertal tillfällen mot irländska regiment ur brittiska armén såsom Dublin Fusiliers og Inniskillings. MacBride var involverad i slagen vid Ladysmith, Colenso och andra platser.