Von der ersten bis zur letzten Seeschlacht mit Ausnahme der Seeschlacht bei Kentish Knock diente die "Brederode" als Flaggschiff und nahm an allen Seeschlachten im Kanal und in der Nordsee teil. Luitnant-Admiraal Maarten Tromp fiel am Ende des Jahres 1652 vor den Staaten General in Ungnade und musste an Land bleiben. Den Flottenbefehl übernahm Vizeadmiral de With. Vor der Schlacht bei Kentish Knock wollte Vizeadmiral de With sein vorgesehenes Flaggschiff, dem angemieteten Ostindienfahrer "Prins Willem", gegen die "Brederode" tauschen. Aber deren Besatzung weigerte sich ihn an Bord zu nehmen und drohte sogar mit Kanonenschüsse auf sein Boot. Deshalb musste er zu dem umgerüsteten Handelssegler, der zwar größer und mit größerer Anzahl Geschütze versehen war, aber auch als schlechtester Segler in der Flotte galt, zurückgebracht werden. Nach diesem Gefecht wurde Tromp rehabilitiert und übernahm wieder den Flottenbefehl und die "Brederode".