کشتار زندانیان توسط کمیساریای خلق در امور داخلی رویدادی است که توسط پلیس مخفی شوروی در ایالت‌های غربی این کشور در روزهای ابتدایی تهاجم نظامی آلمان به شوروی رخ داد. تخمین زده شده که نزدیک به صد هزار زندانی در این کشتار کشته شده‌اند.