本列车採用由北京和利時系統工程（HollySys）生產的國產CTCS-300H型CBTC，是香港首次有列車採用中國內地製造的訊號系統（該公司生產之另一款CTCS-300S訊號系統於國內其他高鐵廣泛使用，但往績不佳，曾涉2011年甬台温铁路列车追尾事故）。