Le , Gomes signe un contrat de cinq saisons avec l'Everton FC. Le Portugais prend part à neuf matchs en début de saison 2019-2020, avant de se blesser gravement à la cheville lors d'un match de Premier League contre Tottenham Hotspur le . Victime d'une fracture et d'une luxation de la cheville droite, il est opéré dès le lendemain. Le Portugais fait son retour sur les pelouses de Premier League en entrant à l'heure de jeu contre Arsenal le (défaite 3-2).