Sempre nel 1999 il Centro Operativo gestisce l'operazione DINAK nell'ambito dell'Operazione Allied Force, nel 2001 il potenziamento della Difesa Aerea del G8 di Genova, nel 2002 del Summit NATO-Russia, svoltosi a Pratica di Mare e del Vertice mondiale della FAO svolto a Roma, nel 2003 della riunione interministeriale dell’Unione Europea svolta a Roma e nel 2004 della firma della Costituzione europea di Roma.