Vòng đấu loại trực tiếp UEFA Europa League 2016–17 bắt đầu vào ngày 16 tháng 2 và sẽ kết thúc vào ngày 24 tháng 5 năm 2017 với trận chung kết tại Friends Arena ở Solna, Thuỵ điển, để quyết định nhà vô địch của mùa UEFA Europa League 2016-17. Tổng cộng có 32 đội tranh tài trong giai đoạn knockout.