В 1852 году Иглесиас был избран в Конгресс, где он приобрел известность благодаря своим красноречию и знанию конституционного права. В 1856 году он был назначен главным чиновником министерства финансов при президенте Игнасио Комонфорте, а позже министром юстиции (с января по май 1857 г.). В последней должности он отвечал за разработку закона, который запретил церкви владеть земельной собственностью. С мая по сентябрь 1857 года Иглесиас был министром финансов. 16 сентября 1857 года он был избран путём всенародного голосования судьей Верховного суда. После захвата Пуэблы французами 17 мая 1863 года президент Бенито Хуарес был вынужден оставить Мехико — Иглесиас сопровождал его. В сентябре Хуарес назначил его министром юстиции, он занимал этот пост до возвращения республиканского правительства в столицу в 1867 году после изгнания императора Максимилиана. В этот период он сопровождал Хуареса и республиканское правительство, когда они переезжали с места на место, чтобы избежать захвата сторонниками императора. Часть этого времени он также занимал пост финансов.