Nel febbraio 2011 è ritornato in Egitto per partecipare alle manifestazioni di protesta contro Mubarak poi note come "Rivoluzione egiziana del 2011"; al suo arrivo all'Aeroporto Internazionale del Cairo ricevette un'accoglienza trionfale, con qualche migliaio di persone presenti, e diverse personalità eccellenti come ʿAlāʾ al-Aswānī. È diventato quindi, di fatto, il leader dell'ala laica che si opponeva a Mubarak ma che non voleva l'insediamento di un regime islamico.