In 1426, nadat Niccolo III zijn vrouw terechtgesteld liet worden omwille van overspel, verliet Catharina zijn hof en voegde zich bij een lekengemeenschap van begijnen die de ideologie van Augustinus volgden. Ze waren echter aanvankelijk verdeeld of ze dan al wel of niet de ideologie van Franciscus moesten volgen, wat uiteindelijk ook gebeurde. In 1431 werd het Begijnenhuis omgevormd in het Clarissenconvent van Corpus Domini, dat uitgroeide van 12 vrouwen in 1431 tot 144 tegen het einde van de eeuw. Zuster Catharina leefde het grootste deel van haar leven in dit convent, tussen 1431 en 1456, en diende als meesteres van de novicen. Ze was een model van vroomheid en ervoer meerdere mirakels en visies van Christus, de Maagd Maria, Thomas Becket, Sint Josef en toekomstige gebeurtenissen zoals de Val van Constantinopel in 1453.