拜占庭帝国崩毀於15世纪，1430年，新兴的伊斯兰教向此地扩张，穆斯林建立的奥斯曼帝国接管了阿索斯山。他们向修道院征收重税，并長期地任由他們自生自滅。在16世纪，修士的人数和财富衰减，但在19世紀左右，又因捐獻以及來自其他东正教国家（诸如俄罗斯、保加利亚、罗马尼亚和塞尔维亚）的新血注入而漸漸回復舊貌，每個国家在個別修道院滲入他們的影響力。在1912年，第一次巴尔干战争期間，土耳其人被希臘海軍逐出，在希腊和俄国在短暫的主權衝突後，第一次世界大战后此半岛才正式地歸属于希腊。