Negli anni a seguire lo Stormo è stato impiegato in varie operazioni nella ex Jugoslavia, partecipando oltre che all'operazione Sharp Guard, successivamente tra il 1996 e il 1999 alla Operazione Joint Guardian, Joint Forge, Decisive Endeavour e Allied Force, dopo che il 28 febbraio 1998 era stato preso in consegna il primo esemplare di Tornado ECR.