Magnus Landin debuterte på Danmarks herrelandslag i håndball den 10. juni 2015 mot Litauen, hvor han scoret fire mål, derav ett på kontring med hjelp fra storebror Niklas. Han spiller med trøye nr. 4 på den danske A-Landslag. Han deltok i VM 2017, EM 2018 og VM 2019. I VM 2019 tok Danmark gull.