Later nam Pálffy ook deel aan de Oostenrijks-Turkse Oorlog en de Russisch-Turkse Oorlog. Na de dood van keizer Karel VI in 1740 werd hij beschermheer van de jonger keizerin Maria Theresia en dier raadsman, vooral in Hongaarse aangelegenheden. Hij werd benoemd tot ridder in de Orde van het Gulden Vlies en tot Palatijn van Hongarije. Hij bleef voor de rest van zijn leven een vertrouweling van Maria Theresia.