Før og under Kosovokrigen (1998-99), hadde den etnisk albanske separatistgruppen Kosovos frigjøringshær (KLA) en sterk grad av innflytelse og under krigen kontrollerte store deler av kommunen. Drenica, inkludert kommunen Gllogoc, fikk dermed store negative følger. Under krigen var det forekomster av massakrer utført av jugoslaviske styrker. Massegraver ble senere gravd opp i et forsøk på å skjule forbrytelser.