In Portland nam Stefanidi deel aan de WK indoor van 2016. Op dit toernooi behaalde ze de bronzen medaille. Tijdens de EK in Amsterdam werd de Griekse Europees kampioene polsstokhoogspringen. Vervolgens zette Stefanidi kort daarna de kroon op haar carrière door op de Olympische Spelen in Rio de Janeiro de olympische gouden medaille in het polsstokhoogspringen te veroveren.