2013年1月26日、ベアボックはポツダム＝ミッテルマルク郡小選挙区の同盟90/緑の党小選挙区候補者に選出された。同年3月2日に開催された同盟90/緑の党ブランデンブルク州代議員会議でベアボックは87.9 %の支持票を得て2013年ドイツ連邦議会選挙党代表候補者に選出された。この決定によって、ベアボックはドイツ連邦議会選挙に際して同盟90/緑の党政党名簿(比例代表リスト)の筆頭候補者になった。2013年9月22日におこなわれた2013年ドイツ連邦議会選挙で、ベアボックはポツダム＝ミッテルマルク郡小選挙区では7.2％の獲得で第5位に過ぎなかったが、政党名簿記載トップであったため比例区当選(復活当選)を果たした。