Ab den 1950er wurden Außenstellen des Museums errichtet. 1959 wurde der Panzerkreuzer Aurora das erste Museumsschiff der Sowjetunion. 1972 folgte die Straße des Lebens am Ufer des Ladogasees. 1977 kam die Tschesmensker Kirche hinzu, die zu Ehren gefallener russischer Seeleute errichtet wurde, die bei der Seeschlacht von Çeşme den entscheidenden Sieg im 5. Russischen Türkenkrieg errangen. 1980 kamen die Festung Kronstadt mit der Nikolaus-Marine-Kathedrale, das Artillerie-Gelände und die Gedenkausstellung für Alexander Stepanowitsch Popow hinzu. Zunächst wurde nur die Galerie der Kathedrale als Ausstellungsfläche genutzt, bis man 2006 beschloss, das gesamte Gebäude unter die Obhut des Museums zu stellen. Ende der 1980er Jahre begann der Umbau des U-Boots D-2 "Narodovolets" der D-Klasse (Dekabrist) zum ersten Museums-U-Boot Russlands, dessen Eröffnung 1994 stattfand.