Op 8 augustus 1561 benoemde Pius IV Johannes Mahusius, gardiaan van het Minderbroedersklooster in Brussel, tot eerste bisschop van Deventer. Zijn benoeming was niet onomstreden en ontmoette veel kritiek en weerstand bij de lokale overheid. Mede hierdoor kon hij zijn zetel niet in bezit nemen. In 1568 verscheen de hertog van Alva, nadat hij zijn Groningse expeditie (met de veldslagen bij Heiligerlee en Jemmingen) had afgesloten, in persoon in Deventer om de komst van de bisschop af te dwingen. Deze was echter lichamelijk al zodanig verzwakt dat hij de reis naar Deventer niet meer kon ondernemen. Hij moest daarom nog in hetzelfde jaar zijn functie ter beschikking stellen.