В составе сборной ЮАР Мнгуни дебютировал 3 июня 2001 года в матче с Либерией, который завершился со счётом (1:1). В 2002 году он, в составе сборной, поехал на чемпионат мира, однако на турнире Мнгуни не провёл ни одной игры. Кроме того, игрок принимал участие в Кубке африканских наций 2002 в Мали и Кубка африканских наций 2004 в Тунисе. Последний матч за сборную Мнгуни провёл 30 марта 2004 года против Австралии, проигранном южноафриканцами 0:1. Всего за национальную команду Мнгуни провёл 12 игр.