Le 3 février 2018, lors du meeting des Millrose Games, à New York, Emmanuel Korir établit un nouveau record d'Afrique en salle du 800 mètres en , la quatrième meilleure performance de tous les temps. Fin juin 2018, il remporte son premier titre de champion du Kenya, sur la distance du 400 m, en établissant un record personnel à . Le 22 juillet 2018, lors du meeting de Londres, qu'il remporte, il porte son record personnel sur à , réalisant le meilleur temps sur la distance depuis 2012, mais devenant surtout le sixième meilleur performeur de l'histoire. Le 3 août 2018, aux championnats d'Afrique d'Asaba au Nigeria il devient vice-champion d'Afrique du 800 m derrière le Botswanais Nijel Amos. Deux jours plus tard, il remporte l'épreuve du 4 × 400 m en compagnie de Aron Koech, Alphas Kishoyian et Jared Momanyi. En fin de saison 2018, il remporte pour l'équipe d'Afrique le de la Coupe continentale à Ostrava.