Následný převrat v roce 1948 však znamenal nová obvinění. Opět byl obviněn z kolaborace a později také z toho, že peníze, které vlastnila Čsl. strana lidová, které byl předsedou, nepředal Národní frontě, ale rozdal je všem členům podle výše jejich příspěvků. Vše bylo víceméně vykonstruované a tehdejší státní moc se ho tímto chtěla zbavit jako mnoha dalších lidí a odstranit ho ze společenského a politického života Turnovska. Krom penežitého trestu, který mu byl na tehdejší dobu uložen v horentní výši, strávil pak léta 1953–1957 ve vězení ve Valdicích. Po návratu z vězení se vrátil do Koberov, kde žil u svého bratra Ludvíka Plíhala, jelikož všechen majetek v Turnově včetně bytu mu byl znárodněn.