Ved oprørets udbrud i 1848 var han i Christian Høegh-Guldbergs fraværelse midlertidig kommanderende general for Nørrejylland og Fyn og havde i denne egenskab fra stabskvarteret i Odense at træffe de første foranstaltninger til sikring af Nordslesvig, men blev derpå af A.F. Tscherning sendt til Jylland for at organisere hestfolket af den folkevæbning, som da påtænktes rejst. Castenschiold kom dog ikke i virksomhed, thi regeringen fastholdt kun i kort tid tanken om en sådan rejsning, og i begyndelsen af det følgende år tog han sin afsked fra krigstjenesten.