Decidió exiliarse a Alemania tras la caída de Otón I de Grecia. Sin embargo, fundó la firma Margaritis-Konstantinou con su discípulo Yanis Konstantinou, lo que le permitió trabajar en ocasiones en Grecia y participar con esas fotografías en la Exposición Universal de Londres de 1862. Murió en 1892 en Wurzburgo.