Les gouvernements de ces pays reprochent à la plateforme aux d'utilisateurs de ne pas leur fournir les clés de déchiffrement nécessaires à l’identification des usagers. Pour accéder à cette demande, les gouvernements prétextent que cette plateforme est un lieu de repère pour l’organisation d’activités illégales. Plus grave, certains pays comme l’Indonésie, soumis à plusieurs attaques de l’État Islamique en 2018, avance que ce réseau est un lieu d’éducation et d’organisation pour les terroristes en vue de commettre des attentats. Ce n’est pas la première fois que des pays avancent que ce réseau joue un rôle important dans l'orchestration d'attentats. La France et la Russie, après les attentats respectifs du 11 novembre 2015 et du métro de Saint-Pétersbourg, ont suspecté le réseau d’héberger de potentiels terroristes. Telegram Messenger a également été reconnu comme un outil de communication fréquemment utilisé par l'organisation terroriste État Islamique pour émettre des menaces, comme celles émises à l’encontre de l’Iran en septembre 2018.