Вторая мировая война для политрука В. С. Припутнева началась участием в совместной англо-советской операции «Согласие», в ходе которой был свергнут иранский шах Реза Пехлеви, а территория Ирана была частично оккупирована войсками союзников. В боях с немецко-фашистскими захватчиками Василий Степанович с января 1942 года на Крымском фронте в должности военного комиссара батареи 655-го стрелкового полка 404-й стрелковой дивизии. После поражения советских войск в Крыму был эвакуирован на Таманский полуостров. С мая 1942 года — комиссар 3-й артиллерийской батареи 212-го отдельного истребительно-противотанкового дивизиона 157-й стрелковой дивизии 44-й армии Северо-Кавказского фронта. После доукомплектования дивизия в составе 51-й армии была переброшена под Сталинград. С июля 1942 года на Юго-Восточном и Сталинградском фронтах политрук В. С. Припутнев участвовал в Сталинградской битве. Дивизион, в котором служил Василий Степанович, держал оборону в межозёрном дефиле Сарпа — Цаца, затем юго-западнее Сталинграда на рубеже Горная Поляна — Елхи. После упразднения института военных комиссаров в октябре 1942 года В. С. Припутнев получил воинское звание старшего лейтенанта и был назначен на должность заместителя командира артиллерийской батареи 76-миллиметровых пушек 384-го стрелкового полка по политической части. На заключительном этапе Сталинградской битвы на Донском фронте Василий Степанович принимал участие в операции «Кольцо». В период наступления с 10 по 27 января 1943 года старший лейтенант Припутнев, находясь непосредственно в боевых порядках батареи, оказывал помощь командиру батареи в организации взаимодействия подразделения с наступающей пехотой. Осуществляя огневую поддержку стрелковых частей 384-го стрелкового полка, батарея, в которой служил В. С. Припутнев, уничтожила 6 артиллерийских орудий противника, 6 пулемётов, 4 автомашины с боеприпасами и до роты вражеских солдат и офицеров.