華沙東站首次開始運營於1866年，作為新建的終點站，1933年，該站被重建為一個直通車站；第二次世界大戰期間，車站大樓被毀，在戰後的幾十年裡，臨時的臨時建築被用來為乘客提供服務。目前的車站大樓於1969年開放，曾經是華沙最現代化的大型車站，但後因未受重視而逐漸失修。直到2012年欧洲足球锦标赛舉辦期間，東站再度進行了大規模整修。