Keller nahm an den Fußballweltmeisterschaften 1990, 1998, 2002 und 2006 teil, kam jedoch nur 1998 und 2006 zum Einsatz. In den Jahren 1997, 1999 und 2005 wurde er zum Fußballer des Jahres in den USA gewählt. Beim Fußballturnier bei den Olympischen Sommerspielen 1996 war Keller als einer der drei zulässigen älteren Spieler Stammtorhüter der Olympiamannschaft der Vereinigten Staaten.