Через три тижні після призначення головним тренером Маєлі Когана, він вступив в запеклу суперечку з головним тренером «Естеґлала» Аміром Галеноєм. Через це ФФІРІ відправила у відставку Маєлі Когана. Наступного тижня Афшин Готбі погодився замінити Маєлі Когана на посаді головного тренера збірної Ірану. Після цієї зустрічі Готбі сказав в інтерв'ю «Життєва мрія, давня амбіція та подорож, записана зірками, ось-ось здійсниться. Я повинен подякувати всім людям у всьому світі, які підбадьорили, підтримали й надихнули мене на цю можливість». Під керівництвом Афшина збірна Ірану не змогла потрапити на чемпіонат світу 2010 року в ПАР, проте його контракт з командою було продовжено. На кубку Азії 2011 року з 4-х матчів виграв 3 поєдинки, проте в 2-у турі іранці поступилися вдома Йорданії, яка набрала 13 очок та очолила групу. Продемонстрував хороші результати в товариських матчах (зокрема, перемога над Боснією і Герцеговиною, Китаєм та Південною Кореєю), проте отримав порцію критики не лише від журналістів, в й від деяких працівників тренерів ФФІРІ, оскільки не змогли стерпіти успішну діяльність американського іранця на посаді головного тренера збірної та вимагали заміну на іранського тренера. Однак через декілька днів йому дозволили працювати й надалі, а Іранська федерація вирішила зберегти Афшана на посаді головного тренера як мінімум до завершення Кубка Азії 2011 року. У 2010 році збірна виграла 8 матчів поспіль, завдяки чому Готбі заручився довірою федерації. На чемпіонаті Федерації футболу Західної Азії 2010 року команда Меллі фінішувала другою. Також іран вийшов до 1/4 фіналу кубку Азії 2011 року, де іранці поступилися Південної Кореї через голу Юн Біт Гарам в додатковий час. Після цієї поразки Афшина було звільнено з займаної посади.