Tras recuperarse plenamente de su lesión, Amar'e disputó los 82 partidos de temporada regular y jugó su segundo All-Star Game, donde anotó 29 puntos en 21 minutos. Fue uno de los tres jugadores de la NBA (junto con Carlos Boozer y Elton Brand) en aparecer entre los 20 primeros en puntos (20,4, 19º en la liga), rebotes (9,6, máxima en su carrera, 9º) y en porcentaje de tiros de campo (realizó su mejor año con un 57,5%, 5º). Al final de la temporada fue incluido en el Mejor Quinteto de la NBA con su compañero Nash, convirtiéndose en el primer dúo de los Suns en lograrlo.