A la batalla de Farsàlia Afrani va tenir el comandament d'un sector del camp. Després de la derrota, atès que no esperaven perdó, va fugir a Àfrica, on es va unir a l'exèrcit pompeià dirigit per Cató i Quint Cecili Metel Escipió, i després de la derrota final de Thapsus l'any 46 aC, va intentar fugir a Mauritània amb Faust Sul·la i mil cinc-cents cavallers, però va ser fet presoner per Publi Sitti, un aventurer aliat de Cèsar, i assassinat pocs dies després, segons uns per ordre de Cèsar mateix i segons altres durant un motí.