Als in Folge des Putschversuchs 2016 im November desselben Jahres Professor Mehmed Özkan von der Regierung zum neuen Rektor ernannt wurde, kam es zu Protesten. Im März 2017 versammelten sich Professoren auf dem Campus der Universität, um gegen staatliche Eingriffe zu protestieren. An der Boğaziçi Üniversitesi wurden zwei Professoren entlassen: Professor Abbas Vali aus dem Sociology Department und Associate Professor Noemi Levy-Aksu aus dem History Department wurden ihrer Posten am 22. Februar 2017 durch den Türkischen Hochschulrat (YÖK) enthoben. Als Hintergrund wird gesehen, dass beide Anfang 2016 eine Petition der Initiative „Akademiker für den Frieden“ unterzeichnet hatten, woraufhin es zum Academics-for-Peace-Prozess kam.