1916年、フォー・コーツはアイルランド人民族主義者の率いる部隊により占領された。このイースター蜂起におけるイギリス軍の砲撃では建物は無事であったが、1922年よりはじまったアイルランド内戦において大きな損傷を被った。英愛条約（1921年12月締結）に反対するグループが建物を占拠したのに対し、アイルランド暫定政府を率いるマイケル・コリンズは投降勧告ののち建物を砲撃した。占領グループは投降の際に公文書館に放火し、多くの貴重な資料が灰となってしまった。