Cuando Austria fue anexada por Alemania en , Innitzer y otros obispos católicos emitieron un comunicado el 18 de marzo pidiendo a sus feligreses aceptar y apoyar el "Anschluss". Tal declaración había sido aconsejada por el Gauleiter nazi Josef Bürckel, siendo que el texto concluía con la firma de Innitzer y los obispos al lado de la frase «Heil Hitler!». El gobierno nazi difundió este comunicado como una muestra de la adhesión de la jerarquía católica austriaca al "Anschluss", lo cual causó molestia en la Santa Sede, al punto que Pío XI requirió una aclaración al cardenal Innitzer.