O cessar-fogo terminou em 6 de abril de 1994, quando o avião do presidente Juvénal Habyarimana foi abatido perto do aeroporto de Kigali, matando-o e Cyprien Ntaryamira, presidente do Burundi. Ainda não se sabe quem lançou o ataque; o RPF culpou os extremistas hutus no governo de Ruanda, enquanto o governo alegou que o RPF era responsável pelo ataque. A derrubada do avião serviu como catalisador do genocídio de Ruanda, que começou em poucas horas. Ao longo de aproximadamente 100 dias, cerca de 1.000.000 de tutsis foram mortos, por ordem do governo interino. A RPF tutsi recomeçou sua ofensiva e assumiu o controle do país metodicamente cortando as rotas de suprimento do governo e aproveitando a deterioração da ordem social. Em 7 de junho, o arcebispo hutu de Kigali, Vincent Nsengiyumva, foi assassinado perto do centro da igreja de Kabgayi com dois bispos e treze padres por membros da RPF, que se acreditava que os prelados estavam envolvidos com a morte de suas famílias.