Marcó su primer gol con la camiseta "biancoceleste" en el derbi romano del 11 de abril de 2009, que terminó con resultado de 3-1. El encuentro finalizó con victoria de la Lazio (4–2) y muchas amonestaciones. Lichtsteiner también fue amonestado por confrontar al defensor romano Christian Panucci luego de que este le cometiera una falta. Durante esa temporada, ya como titular indiscutible, formó parte de un poderoso ataque por las bandas junto al serbio Aleksandar Kolarov por izquierda.