L'UFR est fondée en 2009 à la fin de la guerre civile tchadienne de 2005-2010. Cette nouvelle alliance subit cependant rapidement une défaite décisive à la bataille d'Am Dam. Des accords de paix sont ensuite conclus et Omar el-Béchir, le président du Soudan, décide de se réconcilier avec Idriss Déby et cesse de soutenir les groupes rebelles tchadiens.