Beim Hochwasser in Mitteleuropa 2002 trat im August auch die Weißeritz über ihre Ufer. Sie floss erstmals seit ihrer Verlegung Ende des 19. Jahrhunderts wieder etwa entlang ihres einstigen Flussbetts auch über die Könneritzstraße und richtete dabei in sämtlichen anliegenden Häusern enormen Schaden an. Die Reparaturen erfolgten in den folgenden Jahren mit Finanzmitteln aus der staatlichen Hochwasserhilfe. Nach siebenmonatiger Bauzeit ersetzte im Dezember 2005 die behindertengerechte Straßenbahnhaltestelle „Kongresszentrum (Haus der Presse)“ die alten Stationen vorm Gebäudekomplex Penck-Hotel. Im Jahr 2007 wurde der zwischen Ehrlich- und Schweriner Straße gelegene Abschnitt der Könneritzstraße als letztes linkselbisches Teilstück des 26er Rings saniert. Verkehrszählungen im Jahr 2009 ergaben für die fertig ausgebaute Könneritzstraße im Bereich Bahnhof Dresden Mitte eine Belastung von 20.100 Kraftfahrzeugen in 24 Stunden. Nach dem 2006 erfolgten Abriss des markanten Kesselhauses des Kraftwerks Mitte laufen seit 2011 umfangreiche Umbauten auf dem Gelände. Ende 2019 beschloss der städtische Bauausschuss die Aufstellung eines Bebauungsplans für eine 0,87 Hektar große, aktuell (Stand: 2020) als Pkw-Parkplatz genutzte Fläche an der Ecke Könneritz-/Ehrlichstraße, um dort ein modernes Büro- und Geschäftshaus, das auch ein bis zu 55 Meter hohes Hochhaus enthält, zu errichten.