La falta de coordinación con las autoridades de Madrid fue otro importante problema. Por ejemplo, las milicias procedentes de Barcelona que actuaban en el Frente de Aragón, lo hicieron desde el primer momento sin ninguna coordinación con el Ministerio de la Guerra en Madrid, algo que también ocurrió durante el Desembarco de Mallorca. Cuando el Ministro de Marina y Aire, el socialista Indalecio Prieto, visitó a Díaz Sandino, este lo recibió "como si fuera ministro de una potencia extranjera".