Als Napoleon 1801 seinen Schwager, General Charles Leclerc d’Ostin beauftragte, eine Strafexpedition gegen die Aufständischen unter Toussaint Louverture (→Haitianische Revolution) zu führen, meldete sich Boudet als einer der Ersten als Freiwilliger. Am 11. Dezember 1801 verließen sie unter dem Oberbefehl von Admiral Louis Thomas Villaret de Joyeuse Brest und segelten nach Saint-Domingue (Hispaniola). Am 5. Februar 1802 erreichten sie Port-au-Prince.