Als A-Jugendlicher wurde Ngando im März 2011 für die französische U-18-Auswahl berücksichtigt und debütierte bei einem 2:3 gegen Deutschland. Er bestritt drei weitere Partien und rückte nach der Sommerpause 2011 in die U-19 auf. Für diese kam er elfmal zum Einsatz, bis er zur U-19-EM 2012 eingeladen wurde. Dort lief er in allen vier Partien für sein Team, das das Halbfinale erreichte, auf. Im Anschluss daran wurde er in die U-20-Mannschaft aufgenommen. Mit dieser nahm er an der U-20-WM 2013 teil, erreichte das Finale und stand auf dem Platz, als sich Frankreich im Finale gegen Uruguay nach einem 0:0 durch den Sieg im Elfmeterschießen den Titel sicherte. Im November desselben Jahres rückte er in die U-21 auf.