Evans trat dem konföderierten Heer bei, wo er den Dienstgrad eines Obersten erhielt und zum Brigadekommandeur einer kleinen Brigade ernannt wurde. Mit der Brigade nahm er am 21. Juli 1861 an der ersten Schlacht am Bull Run teil. Anschließend erhielt er das Kommando über eine andere Brigade, mit der er die Furten des oberen Potomacs überwachte. Am 21. Oktober 1861 vertrieb er Unionstruppen im Gefecht bei Balls Bluff vom Virginiaufer in der Nähe von Leesburg, Virginia.