תחת מאמן הנבחרת החדש מורטן אולסן, הצליחה דנמרק להעפיל ממוקדמות מונדיאל 2002, ויורגנסן זומן על ידי אולסן לסגל דנמרק לטורניר הגמר. במשחק הראשון בו גברה דנמרק 2-1 על , עלה יורגנסן מהספסל בדקה השבעים. הוא עלה פעם נוספת מהספסל, הפעם לאחר חמישים דקות, במשחק השני בו נפרדה דנמרק בשוויון 1-1 עם . במשחק השלישי והאחרון, בו גברה דנמרק 2-0 על צרפת, פתח יורגנסן בהרכב הפותח אך הוחלף במחצית. דנמרק העפילה מהמקום הראשון לשמינית הגמר, שם הודחה עם הפסד 3-0 ל, בו יורגנסן לא נטל חלק.