В 1690 году, во время австрийской оккупации сербских земель, когда османская армия перешла в наступление, патриарх Арсений III Черноевич с десятками тысяч сербов, с дозволения австрийских властей, ушёл на север и осел на австрийской территории в Карловице. Дипломом императора Леопольда от 21 августа 1690 года сербы во всех землях империи, включая Венгрию, Славонию и Хорватию, получали покровительство императора и привилегии, в частности право избирать собственного церковного главу (то есть иметь автономную церковную иерархию), свободного исповедания по обычаю восточной церкви греческого обряда, строительства храмов, функционирования церковного суда. После кончины патриарха Арсения в Вене в 1706 году, император Иосиф I 24 мая 1708 года утвердил избрание епископа Исаийи Джаковича «архиепископом иллирийского или сербского народа греческого обряда». Первоначально автономная митрополия в юрисдикции Печской патриархии именовалась Крушедольской (по месту нахождения кафедры в Крушедолском монастыре), с 1713 года, когда резиденция митрополита была перенесена в Карловиц — Карловацкой митрополией. 18(29) мая 1710 года автономия митрополии в габсбургской империи, включавшей 6 епархий, была признана патриархом Печским Каллиником I, который был поставлен Константинополем на печский престол в 1691 году.