Попытка Ндайизейе разработать новую конституцию привела к очередному обострению отношений между хуту и тутси, бойкоту заседаний парламента со стороны депутатов-тутси и нападению боевиков-хуту на лагеря беженцев-тутси на территории соседней Демократической Республики Конго. Тем не менее, после включения разоружившихся боевиков обеих сторон конфликта в 2005 году по новой конституции удалось провести парламентские выборы, на которых «Фронт за демократию в Бурунди», декларировавший приверженность социалистическим ценностям, потерпел сокрушительное поражение от новой консервативной партии «Национальный совет в защиту демократии», в действительности представлявшей интересы радикальных полевых командиров хуту в завершившейся гражданской войне.