Au début de la Seconde Guerre mondiale, le , la Bucovine est partagée en deux par le pacte Hitler-Staline : l’Armée rouge, le NKVD au Nord, la Wehrmacht et l’armée roumaine devenue fasciste au Sud, écument le pays, mettant définitivement fin à la « Douce Bucovine ». Au sud l’antisémitisme est attisé par les partisans du maréchal Antonescu. Au nord l’anti-roumanisme de certains membres d’autres communautés est exploité par les agents du NKVD stalinien. Les déportations se succèdent. Au nord devenu soviétique les Allemands, bien que tous nés sur place, sont « rapatriés » de force vers le Troisième Reich dans des trains et bus qui ne seront jamais rendus ; les Roumains pour leur part sont envoyés vers l’Asie centrale et la Sibérie et parfois massacrés ; puis, à partir de 1941, les Juifs de toute la Bucovine sont déportés vers la Transnistrie par l’armée roumaine sous l’accusation d’avoir soutenu l’invasion soviétique ; les Ukrainiens qui ont évité de contrarier les divers maîtres du territoire sont relativement épargnés, sauf les prêtres gréco-catholiques que le NKVD déporte comme « laquais du féodalisme » et « pourvoyeurs de l'opium du peuple ».