Margarete blieb weiterhin in engem Kontakt zu ihrer Familie. Als ihr Onkel Thomas von Savoyen 1255 in die Gefangenschaft der Stadt Asti geriet, drängte Margarete ihren Mann erfolgreich, dass im Gegenzug in Frankreich Kaufleute aus der Lombardei verhaftet wurden, um ihren Mann freizupressen. Der darauf folgende Handelsstreit wurde erst vor Juni 1270 beigelegt. Ab 1262 versuchte Margarete vergeblich im Konflikt des englischen Königs mit dessen Schwager Simon de Montfort über dessen Mitgift zu vermitteln. Ihre Bemühungen blieben aber erfolglos, und 1264 kam es in England zu einem offenen Krieg zwischen dem König und einer von Montfort geführten Adelsopposition.