Depois que a principal ofensiva militar da Segunda Guerra da Chechênia terminou e os separatistas mudaram de tática para a guerra de guerrilha, o comando geral das forças federais na Chechênia foi transferido do exército para o FSB em janeiro de 2001. Enquanto o exército carecia de meios técnicos para rastrear a guerrilha grupos, o FSB sofria de inteligência humana insuficiente devido à sua incapacidade de construir redes de agentes e informantes. No outono de 2002, os separatistas lançaram uma campanha massiva de terrorismo contra os civis russos, incluindo o ataque ao teatro Dubrovka. A incapacidade das forças federais de conduzir operações antiterroristas eficientes levou o governo a transferir a responsabilidade de "manter a ordem" na Chechênia do FSB para o Ministério de Assuntos Internos (MVD) em julho de 2003.