Джексон также не проявлял интереса к административной деятельности: он избегал необходимости улаживать личную вражду между юристами или недоразумения в работе. «Междоусобные войны между могущественными баронами» были регулярным явлением среди американских прокуроров. Автор ключевого меморандума, определившего ход процесса — полковник Бернайс — покинул прокурорскую команду в середине августа: после того как осознал, что на него будет возложена только техническая работа. В декабре примеру Бернайса последовал глава OSS Донован.