En 1854 trasladó toda su actividad de trabajo a Siracusa, Nueva York, y comenzó a usar el proceso de colodión húmedo. En 1859, Barnard se unió a la firma de Edward Anthony. Al estallar la guerra, Barnard trabajaba para Mathew Brady en Washington DC y en la ciudad de Nueva York. Barnard, además de hacer retratos y fotografiar a las tropas alrededor de Washington DC, estuvo entre el primer grupo de fotógrafos de Brady, quienes fueron enviados al campo para fotografiar los campos de la Campaña del Norte de Virginia, y la Campaña Peninsular, incluyendo las batallas de Bull Run y Yorktown, así como la de Harpers Ferry.