Nach dem Friedensschluss kehrte Fischer zunächst in seine Stellung als Adjutant beim Gouvernement Mainz zurück und trat in gleicher Funktion am 5. März 1867 zum Generalkommando des IX. Armee-Korps über. Unter Belassung in dieser Stellung wurde er am 25. September 1867 in das 6. Ostpreußische Infanterie-Regiment Nr. 43 versetzt. Daran schlossen sich ab 16. Februar 1869 Generalstabsverwendungen beim IX. Armee-Korps und ab 7. November 1869 bei der 17. Division an. Als Major nahm Fischer in dieser Funktion während des Krieges gegen Frankreich 1870/71 an den Belagerungen von Tool, Metz und Paris, den Schlachten bei Loigny und Poupry, Orléans, Beaugency sowie Le Mans teil. Seine Leistungen wurde dabei durch die Verleihung beider Klassen des Eisernen Kreuzes gewürdigt.