Während der Hochzeitsfeier warben Vertreter des Preußischen Bundes um Hilfe gegen den Deutschen Orden. Der König versprach Hilfe und die Preußen rebellierten. Polnische Feldtruppen erlitten in der Schlacht von Konitz eine Niederlage und griffen danach kaum aktiv in den Krieg zwischen dem Preußischen Bund und dem Deutschen Orden ein. Der Krieg endete 1466 zugunsten des Bundes und somit auch des Königs mit dem Zweiten Frieden von Thorn. Der Orden verlor den westlichen Teil seines Herrschaftsgebiets, der sich als autonomes Preußen Königlichen Anteils der Oberhoheit der polnische Krone unterstellte. Für den ihm verbleibenden östlichen Teil Preußens musste der Hochmeister dem polnischen König Heeresfolge leisten. Kaiser und Papst erkannten den Friedensvertrag nicht an.