Kriegel retornà a Txecoslovàquia el novembre de 1945 i, mentre continuava treballant com a metge, es va implicar en la tasca política del Partit Comunista. Fou membre del Comitè Regional del KSČ a Praga i treballà com a secretari a les milícies populars de Lidové quan el KSČ prengué el control del país el febrer de 1948. Va ser nomenat sotscretari del Ministeri de Sanitat el 1949. Durant les purgues polítiques del Partit dels anys 1950, Kriegel va haver de deixar el Ministeri i treballar com a metge per a l'empresa Tatra. Reprengué la seva carrera mèdica el 1957 i esdevingué el director mèdic a l'hospital Vinohrady de Praga. El 1960, va anar a Cuba com a assessor del govern de Fidel Castro en l'organització del sistema sanitari, i va coincidir per tant amb Crisi dels míssils de Cuba. En tornar a Txecoslovàquia, Kriegel va rebutjar un càrrec en l'organització de Partit però es presentà com a membre de l'Assemblea Nacional i va ser-ne elegit el 1964. Finalment, el 1966 fou escollit membre del Comitè Central del KSČ, encara que s'oposà al corrent conservador neoestalinista del Partit. Quan Alexander Batejaček va ser elegit el primer secretari del Comitè Central del KSČ el gener de 1968, Kriegel era un del principal proponents de l'ala democràtica del Partit. Durant aquest període, no va deixar la seva carrera mèdica; va treballar com el cap mèdic primer a l'Institut de Recerca de Malalties Reumàtiques (1963–65) i després a l'hospital Thomayer de Praga (1965–69).