En octobre 2019, la CONAIE participe aux mobilisations contre le gouvernement de Lenín Moreno à la suite de la décision de celui-ci d'augmenter de 125 % les prix du carburant sur du Fonds monétaire international (FMI). Les manifestants demandent aussi la fin des concessions minières ou encore la défense de l’agriculture familiale. « Cette explosion sociale est liée à la déflation des produits agricoles ces deux dernières années. La baisse des prix des aliments affecte les conditions de vie des communautés indigènes, surtout dans la Sierra centrale, qui sont des producteurs pour le marché interne », explique Pablo Iturralde, chercheur au Centre des droits économiques et sociaux (CDES). Le pouvoir déclare l'état d'urgence pour une durée d'au moins trente jours, ce qui implique une interdiction de manifester ; huit manifestants sont tués (dont un dirigeant indigène), plusieurs centaines blessés, et plus de . Le gouvernement décide après douze jours de mobilisation de suspendre le décret controversé.