À la suite du coup d'État communiste de 1948, la prison de Pankrác est devenue le lieu d'exécution de la plupart des 234 prisonniers politiques exécutés en Tchécoslovaquie, y compris l'ancienne députée et dissidente anticommuniste Milada Horáková. À la suite d'une lutte de pouvoir au sein du parti, Rudolf Slánský, ancien chef du parti communiste tchécoslovaque et l'un des créateurs et organisateurs du coup d'État de 1948 y a également été tué.