Im Ersten Anglo-Birmanischen Krieg (1824–26) wurde ihr Ehemann aufgrund des Verdachts, ein englischer Spion zu sein, gefangengehalten. Ann zog dabei in eine Hütte außerhalb des Gefängnisses, um ihren Mann zu unterstützen. Sie setzte sich monatelang erfolglos dafür ein, die Behörden zur Freilassung ihres Mannes und seiner Mitinsassen zu bewegen. Sie schickte den Gefängnisinsassen auch Nahrung und Schlafmatten. Während dieser Zeit schrieb Ann Geschichten über das Leben als Missionarin und die Probleme der Einheimischen. Unter anderem schrieb sie über Kinderheirat, die Tötung weiblicher Kinder und die Strapazen der burmesischen Frauen, die keine Rechte außer denen hatten, die ihnen ihre Männer einräumten. Anns Gesundheit verschlechterte sich währenddessen; vermutlich aufgrund der anstrengenden Reisen und schwierigen Lebensbedingungen, die sie ertragen musste. Gleichzeitig hatte sie sich auch um ihr neugeborenes Kind zu kümmern. Nach der Freilassung ihres Mannes blieben beide in Burma, um ihre Arbeit fortzuführen. Ann starb 1826 in Kyaikkami, Niederburma, an den Pocken. Ihre letzten Worte soll sie in burmesischer Sprache gesagt haben.