Die anfänglich guten diplomatischen Beziehungen zwischen der 1949 gegründeten Volksrepublik China, die 1950 Tibet besetzt hatte, und Indien verschlechterten sich zusehends, nachdem China bekannt gab, dass es eine Straße durch Aksai Chin, das nach indischer Lesart zu Indien gehörte, gebaut hatte, und nachdem Nehru 1959 dem Dalai Lama politisches Asyl in Indien gewährte. Im Jahr 1962 kam es zum Indisch-Chinesischen Grenzkrieg, mit einem chinesischen Überraschungsangriff auch auf dem Gebiet der NEFA. Die chinesische Volksbefreiungsarmee eroberte in Kürze nahezu das das gesamte Gebiet der NEFA, zog sich jedoch nach kurzer Zeit wieder hinter die MacMahon-Linie zurück.