13世紀時期，信仰異教或東正教的波羅的海人和芬蘭人成爲北方十字軍入侵的目標。在立窩尼亞十字軍入侵後，由寶劍騎士團所控制的十字軍國家（Terra Mariana）在今天的拉脫維亞及愛沙尼亞南部成立。後經歷蘇勤戰役，寶劍騎士團大受挫敗，殘黨則加入條頓騎士團或者其下自治的立窩尼亞騎士團。愛沙尼亞北部成爲丹麥的自治領，但在14世紀中期爲條頓騎士團所購。當地的十字軍和教士皆爲德國人，這亦使波羅的海德意志人在愛沙尼亞及拉脫維亞大部分能保持強勁影響力一直至20世紀上半葉。德國人成爲當地的貴族，同時德語亦被用作通用語。