В начале 1920-х годов поддерживал тесные контакты с англичанами, касавшиеся в первую очередь помощи в свержении советской власти в Гиляне. Принял активное участие в государственном перевороте в феврале 1921 года, когда силами Персидской казачьей бригады было свергнуто правительство Фатулла-хана Акбара. 22 февраля 1921 года был назначен премьер-министром страны. После вступления в должность инициировал начало массовых арестов в провинциях, не поддержавших смену власти. Программа Табатабаи предусматривала серьёзную модернизацию экономической, земельной и правовой системы Персии по европейским стандартам, в том числе планировалось изъятие большого количества земли у помещиков с последующей передачей фермерам. Против планируемых реформ Табатабаи выступило большое количество политиков и дворян, и в итоге уже 23 мая Ахмад Шах отправил его в отставку. В тот же день Табатабаи покинул Тегеран (а вскоре и страну), а спустя сутки все арестованные по его приказу деятели были освобождены.