La seconda stagione sulla panchina "biancoceleste" si apre con la vittoria del suo primo titolo da allenatore; la Lazio, nella partita valida per l'assegnazione della Supercoppa italiana, supera i campioni d'Italia della Juventus con il risultato di 2-3. Tale risultato lo porta a essere l'unico, nella storia del club romano, ad avere vinto il trofeo sia sul campo sia in panchina. Il 14 settembre 2017 fa il suo esordio anche in Europa League, battendo gli olandesi del per 2-3. Il 18 aprile 2018, in occasione della trasferta vinta, per 3-4, contro la , siede per la centesima volta sulla panchina della Lazio. Conclude la stagione al quinto posto, mancando "in extremis" la qualificazione alla Champions League: all'ultima giornata di campionato, con Lazio e Inter rispettivamente in quarta e quinta posizione con tre punti di differenza, i "biancocelesti" ospitano in casa proprio i "nerazzurri", che si impongono per 2-3 e, in virtù degli scontri diretti, scavalcano il club romano, che deve accontentarsi dell'accesso all'Europa League.