W reprezentacji Urugwaju Lembo zadebiutował 17 czerwca 1999 roku w spotkaniu przeciwko Paragwajowi. W tym samym roku wystąpił w rozgrywkach Copa América i zdobył srebrny medal. W 2002 roku Víctor Púa powołał Lembo do kadry na mistrzostwa świata. Na mundialu tym „Charrúas” zajęli 3. miejsce w swojej grupie i odpadli z turnieju. Sam Urugwajczyk na boiskach Korei Południowej i Japonii zagrał w meczach z Francją oraz Senegalem. Łącznie dla drużyny narodowej zanotował 39 występów.