Datzelfde jaar vertrok Redouté met de Expeditie van Napoleon naar Egypte. Hij maakte er afbeeldingen van de vissen in de Nijl en werkte mee aan de "Description de l'Égypte", waarvoor hij elf platen en honderd figuren leverde. Op 17 november 1801 ontscheepte hij in Marseille. Hij keerde terug naar Parijs en bracht er de rest van zijn leven door.