Van Aegidius' geschriften, die bijna alle gebieden van de kennis uit die tijd bestreken, is weinig bewaard gebleven. Dit komt deels doordat hij maar weinig liet drukken en deels doordat een groot deel in 1527, tijdens de Plundering van Rome, werd vernietigd. Veel kunsthistorici gaan ervan uit dat het beeldprogramma van Rafaëls fresco's in de Stanza della Segnatura in Vaticaanstad door Aegidius geïnspireerd is.