У мирний час Берегова охорона знаходиться під керівництвом Міністерства національної безпеки. У воєнний час, або за окремим рішенням Президента США Берегова охорона передається під командування ВМС або під керівництво об'єднаних командувань (приклад: Корейська війна 1950—1953, війна у В'єтнамі 1965—1973, війна в Іраку та в Афганістані 2003—2009).