Isu hak asasi manusia (HAM) juga tidak kalah populer dibahas dalam konferensi, ketua Komisi Eropa, Jean-Claude Juncker adalah yang memulai pembahasan isu tersebut. Baginya beberapa negara Arab memiliki masalah dalam penegakkan HAM. Salah satu hal yang disorot oleh Uni Eropa adalah kasus pembunuhan terhadap jurnalis asal Arab Saudi, Jamal Khashoggi. Selain kasus tersebut, kasus pelanggaran HAM di Sudan selama Perang Saudara Sudan Selatan juga menjadi konsentrasi pembahasan. Isu ini bahkan dianggap menjadi ganjalan bagi pemantapan hubungan kerja sama Uni Eropa dengan Liga Arab.