Además, Scaparrotti ha ocupado puestos clave de liderazgo a nivel táctico, operativo y estratégico en el Ejército de los Estados Unidos, incluyendo el de director de operaciones del Mando Central de los Estados Unidos y el de 69.º comandante de cadetes en la Academia Militar de los Estados Unidos. Ha comandado fuerzas durante las operaciones Libertad Iraquí (Irak), Libertad Duradera (Afganistán), Apoyo a la Esperanza (Zaire/Ruanda), Esfuerzo Conjunto (Bosnia y Herzegovina), y Respuesta Asegurada (Liberia).