Małachowski est préfet de la région de Sandomierz, et en 1782 il reçoit du roi Stanislas l'Ordre de l'Aigle blanc. Élu Maréchal de la Diète de l'association polonais-lituanien en 1788, il préside les travaux de la Grande Diète et travaille en étroite collaboration avec d'autres dirigeants du Parti patriotique, comme Ignacy Potocki et Hugo Kołłątaj, À l'écoute des espérances du peuple pour élargir les droits politiques, en 1791 il adopte la citoyenneté de la ville de Varsovie et sera l'un des artisans de la Constitution polonaise du 3 mai 1791.