В 1755 году Кашгар очутился в подданстве Цинской империи. В 1862 году мусульманское население Кашгарии восстало против цинского владычества, а Магомет Якуб бек Бадаулет разместил здесь столицу своих владений, государства Йеттишар. После его смерти оазис вернулся под руку богдыхана. До 1918 года в Кашгаре располагалось почтовое отделение Российской империи (Русская почта в Китае).