El papel de la Cadena SER en las horas siguientes a los Atentados del 11 de marzo de 2004 en Madrid dio lugar también a innumerables polémicas e hizo correr ríos de tinta entre defensores a ultranza de rol de la emisora como adalid de la verdad que el Gobierno de José María Aznar pretendía ocultar a los ciudadanos y aquellos que opinan que la SER manipuló deliberadamente la información, con especial referencia a la existencia de un terrorista suicida propagada desde las ondas de la SER como información contrastada, y que más tarde resultó no existir. Desde el momento después del atentado, la Cadena SER mantuvo abierta la información de forma permanente para informar de todos los aspectos que incidieron en el mismo.