Succeduto al padre Suleymānshāh II, Qilij Arslan III ebbe un regno effimero di circa un anno, a cavallo dei grandi sconvolgimenti portati nelle terre dell'Impero bizantino ed in Anatolia dalla Quarta crociata e dalla nascita dell'Impero di Nicea e dell'Impero di Trebisonda. Fu spodestato dallo zio Kaykhusraw I, già spodestato dal fratello Suleymānshāh II e rifugiatosi a Costantinopoli presso il "basileus" Alessio III Angelo (1195), che avviò così il suo secondo regno e procedette alla riconquista di Iconio ai Crociati.