Kurz nach dem Ausbruch des Zweiten Weltkriegs wurde Radunski zum Umsiedlungskommando der Volksdeutschen Mittelstelle notverpflichtet, womit er automatisch Mitglied der Waffen-SS wurde. Beim Umsiedlungskommando gehörte er als Stabsführer von Dr. Schmidt, dem Bevollmächtigten der Vomi für die Umsiedlung der Volksdeutschen in Stanislau in Galizien, einem der fünf Einzelkommandos an, die im Einvernehmen mit den Sowjets die im sowjetisch besetzten Gebiet Polens befindlichen deutschen Bevölkerungsgruppen ins deutsche Gebiet überführen sollten. 1940 nahm Radunski an Verhandlungen für ähnliche Umsiedlungsaktionen in Lettland und Estland teil, die eine deutsche Delegation in Moskau und Riga führte, und deren Durchführung er anschließend bis ins Frühjahr 1941 selbst leitete. Eine wichtige Rolle spielte er zu dieser Zeit insbesondere bei der Eingliederung der umgesiedelten „Volksdeutschen“ in die deutsche Kriegswirtschaft.