Ağustos 1944'ten itibaren Führer Refakat Tugayı'nın komutanlığını yaptı. 15 Kasım 1944'e kadar Rastenburg'da, daha sonra Ocak 1945'e kadar Ardenler Taarruzu sırasında bir saha birimi olan Führerbegleitbrigade'ye (FBB) komuta etti. 30 Ocak 1945'te Tümgeneralliğe terfi ettirildi. Panzer tümenine genişletilen Führer Muhafız Birliği'nin komutanı oldu. 1945'te Tuğgeneralliğe terfi ettirildi ve komutan olarak atandı. Remer, başarılı bir tümen komutanı olarak görülmedi. Mart 1945'te Silezya'ya taşındı. Remer, tekrar komutanlık yeteneği olmadığı için eleştirildi. Sonunda Amerikan askerleri tarafından ele geçirildi ve 1947 yılına kadar savaş esiri olarak kaldı. 1947'de serbest bırakıldı.