Nach der Eroberung 1453 soll Mehmed II. Fatih den Großen Palast aufgesucht haben und angesichts der Ruinen folgende Zeilen aus einem persischen Gedicht von Saadi zitiert haben: „Die Spinne webt die Vorhänge im Palast der Cäsaren, die Eule ruft von Afrasiabs Türmen die Stunde aus.“ Nach der Eroberung wurde die Nea Basilika geplündert und ebenfalls dem Verfall preisgegeben.