Hueyapan fue incluido en el municipio de Tetela del Volcán desde su creación por decreto del 31 de enero de 1937, separándolo del municipio de Ocuituco. El 19 de septiembre de 2017 fue una de las localidades más afectadas por el terremoto registrado ese día en México, debido a su cercanía con el epicentro; el sismo dañó hasta un 90% de las viviendas de la localidad.