Mit seinem Verband nahm er mit dem Beginn des Zweiten Weltkriegs am Polen-, West- und Balkanfeldzug teil. Ab 1941 diente Lübbe als Kommandeur der 2. Schützen-Brigade im Deutsch-Sowjetischen Krieg. Am 5. September 1942 wurde er zunächst mit der Führung der 2. Panzer-Division beauftragt, am 1. Oktober zum Generalmajor befördert und schließlich am 20. Oktober 1942 zum Divisionskommandeur ernannt. Vom 1. Februar bis 5. April 1944 befand sich Lübbe in der Führerreserve und wurde im Anschluss Kommandeur der 81. Infanterie-Division bis 1. Juli 1944. Krankheitsbedingt kam er dann ein weiteres Mal in die Führerreserve, um ab 9. Oktober 1944 die "462. Volksgrenadier-Division" und ab November die 49. Infanterie-Division zu kommandieren. Ab Ende Dezember übernahm Lübbe das Kommando über die 433. Infanterie-Division. Er wurde im Februar 1945 an der Oderfront verwundet und geriet bei Kriescht in sowjetische Kriegsgefangenschaft.