Samferdselsministeriet ble opprettet i 1809 som jernbaneministeriet i det russiske Imperiet. Etter revolusjonen ble folkets Kommissariat for Jernbaner av SOVJET og deretter (etter 1946) - Departementet for Jernbaner. Senere utvidet ministeriet sin myndighet og ble Departementet for Transport innen Sovjetunionen. Etter sammenbruddet av Sovjetunionen ble ministeriet re-etablert som Departementet for Transport av den russiske Sovjetiske Sosialistiske Føderale Republikk (dette er etterfølgeren staten til Sovjetunionen). Når denne staten ble omdøpt til den russiske Føderasjonen den 25. desember 1991, ble navnet igjen endret til Departementet for Transport av den russiske Føderasjonen [Samferdselsministeriet ].