Zum Start in die &lt;a href="Snooker-Saison%202002/03"&gt;Saison 2002/03&lt;/a&gt; erreichte Wilkinson die Runde der letzten 48 beim LG Cup, wo er mit 3:5 gegen Tony Drago verlor. Anschließend kam er bis zu den Welsh Open 2003 nicht über die Runde der letzten 64 heraus, dort schaffte er es immerhin eine Runde weiter. Nach zwei weiteren Auftaktniederlagen stand die Qualifikation für die Snookerweltmeisterschaft an. In der Runde der letzten 64 traf er auf Dave Finbow, den er mit 10:7 besiegte. In der nächsten Runde traf er auf Fergal O’Brien, mit dem er sich ein enges Match lieferte. Doch Wilkinson gewann mit 10:8 und zog so zum neunten Mal in die Hauptrunde ein. Er verlor mit 7:10 gegen Stephen Hendry in der ersten Hauptrunde. Es sollte das letzte Mal sein, dass er eine WM-Hauptrunde erreichte.