En la Revolución Francesa, fue elegido coronel general de la Guardia Nacional de Francia del sur de Piève antes de retirarse. Luego se convirtió en mariscal de campo el 1 de marzo de 1791 a la cabeza de los guardias de los dos cantones corsos, donde luchó contra las amenazas de los géneros a la independencia de Córcega. Derrotado en las elecciones a la Convención Nacional en 1793, permaneció en Córcega y con los representantes enviados por la Convención organizó la resistencia a los intentos británicos de retomar Córcega convocados por Pasquale Paoli. Después de su derrota en el asedio de Toulon por Napoleón Bonaparte, otro corso, los británicos capturaron Saint-Florent en febrero de 1794, y luego sitiaron a Bastia en mayo. Abbatucci participó en la Defensa de Calvi contra los británicos, negociando la rendición de la fortaleza con honores militares en agosto y siendo repatriada a Toulon por los británicos.