Zglinitzki wurde am 27. März 1858 als zweiter Kommandeur des I. Bataillons in das 1. Garde-Landwehr-Regiment nach Königsberg versetzt. Daran schloss sich ab dem 15. März 1859 eine Verwendung als Kommandeur des Füsilier-Bataillons im 30. Infanterie-Regiment sowie am 18. Oktober 1861 die Beförderung zum Oberstleutnant an. Am 13. August 1864 beauftragte man ihn zunächst mit der Führung des 2. Schlesischen Grenadier-Regiments Nr. 11 und ernannte ihn am 21. November 1864 zum Regimentskommandeur. In dieser Eigenschaft avancierte er am 18. Juni 1865 zum Oberst und erhielt am 11. November 1865 das Kommandeurkreuz II. Klasse des Hausordens vom Goldenen Löwen. Während des Deutschen Krieges nahm Zglinitzki bei der Mainarmee an den Kämpfen bei Langensalza, Üttingen, Roßbrunn sowie Würzburg teil und erhielt für sein Wirken am 20. September 1866 den Roten Adlerorden III. Klasse mit Schwertern.