Agneta Berliner var 2002-2006 ledamot av Västerås kommunfullmäktige och då ansvarig för Folkpartiet Västerås skolpolitik. Hennes politiska huvudfrågor rör barn, skola, företagande och jämställdhet. Berliner är bland annat drivande för att göra Barnkonventionen till svensk lag. Hon är även engagerad i Västsaharas ansträngningar att åter bli självständigt och att de västsahariska fiskevattnen ska exkluderas ur EU:s fiskeavtal med ockupationsmakten Marocko. Berliner var aktiv för att få ett bättre integritetsskydd vid signalspaning enligt FRA-lagen. Hon röstade i Sveriges riksdag den 11 mars 2010 för ett erkännande av Armeniska folkmordet.