El primer Código Electoral se emitió durante la presidencia de Teodoro Picado Michalski (1944-1948) y aplicó por primera vez en las elecciones de 1948, donde tuvo poco efecto para calmar los ánimos de los opositores por lo que no se evitó el estallido de la guerra civil al ser anuladas las elecciones por acusaciones de fraude electoral. A partir de promulgada la Constitución de 1949 se creó el actual Código en el período 1949-1953 bajo el gobierno de Otilio Ulate. Al mismo se le han hecho varias reformas.