Ainsi, jusqu'au , des épisodes majeurs de peste sont encore signalés régulièrement en Europe, comme à Toulouse en 1628–1633 et dans le Nord de l'Italie, la grande peste de Londres en 1665–1666, la peste de Marseille en 1720, Londres en 1764, Moscou en 1771. Des flambées de la maladie se sont également produites dans des territoires proches du continent, comme aux îles Canaries (à San Cristóbal de La Laguna en 1582). L'ensemble des mesures mises en place à partir du , d'abord municipales puis étatiques comme le au , conduit progressivement à l'élimination de cette pandémie.