Am 28. November 1962 löste Brigadegeneral "(Brigadir Jenderal)" Amir Machmud Oberst M. Jusi als Kommandeur des Regionalen Militärkommandos KODAM X in Kalimantan Selatan und verblieb in dieser Funktion bis zu seiner Ablösung durch Oberst Sutopo Juwono am 15. November 1965 ab. In diese Zeit fiel der Putschversuch der Bewegung 30. September "(Gerakan September Tiga Puluh)", der die Massaker in Indonesien 1965–1966 auslöste. Er selbst wurde daraufhin Nachfolger von Brigadegeneral Umar Wirahadikusumah Kommandeur des Regionalen Militärkommandos KODAM V in Jakarta und verblieb in dieser Verwendung bis zu seiner Ablösung durch Brigadegeneral Makmun Murod 1969. In dieser Funktion war er maßgeblich an der Umsetzung des Supersemar-Dekrets "(Surat Perintah Sebelas Maret)" vom 11. März 1966 von Staatspräsident Sukarno beteiligt, das Generalleutnant Suharto die Ermächtigung gab, alle Maßnahmen zu ergreifen, um nach dem gescheiterten Putschversuch vom 30. September 1965 für Ordnung zu sorgen.