Depuis 1991, Wieme s'efforce de soutenir les camps de réfugiés près de Kisaro avec la Croix-Rouge et plusieurs autres monastères. Il est nommé maire adjoint. Au déclenchement du génocide des Tutsi le , il doit retourner en Belgique à deux reprises temporairement. A partir de 1995, il reconstruit l'école agricole après que le centre ait été occupé par les insurgés. En 2014, il doit retourner en Belgique en raison d'une maladie en phase terminale où il meurt à l'hôpital universitaire de Gand. Le fut inauguré un monument commémoratif sur la colline Kisaro.