W 1939 roku został zmobilizowany do 5 Szpitala Okręgowego w Krakowie. W czasie kampanii wrześniowej wraz z chorymi został ewakuowany na Lubelszczyznę, a następnie po agresji ZSRR na Polskę wzięty do niewoli przez żołnierzy Armii Czerwonej. Jest notowany jako jeniec obozu NKWD w Starobielsku. Wraz z dr Maciągiem do obozu dostał się również jego syn Adam, podchorąży 5 Dywizjonu Artylerii Konnej. Obaj zostali rozstrzelani przez NKWD w Charkowie w 1940 roku w ramach Zbrodni Katyńskiej. Rodzina Maciągów należała do naukowej i kulturalnej elity Krakowa. Adam senior i junior byli często portretowani przez M. Ładę-Maciągową. Ich portrety znajdują się w Muzeum Regionalnym w Siedlcach. W tej kolekcji znajduje się także obraz „Katyń”, autorstwa Małgorzaty Łady Maciągowej.