Emre Belözoğlu on kotikaupunkinsa mahtiseuran Galatasarayn kasvatteja. Hän debytoi aikuisten joukkueessa jo 16-vuotiaana kaudella 1997–1998. Vuonna 2000 hän voitti seurassa UEFA Cupin, mutta siirtyi vuonna 2001 Serie A:n Internazionaleen. Hän kuului myös Turkin maajoukkueen runkopelaajiin 2002 MM-kisoissa, missä joukkue saavutti pronssia.