Avec la guerre entre le roi de France et la Bourgogne, la ville est sollicitée par les deux partis pour prendre position. Jusqu'en 1417, elle reste autant que possible dans la plus stricte neutralité ; puis, les consuls prennent résolument le parti du roi de France. Cette fidélité n'est pas entièrement partagée par la population ; toutefois, aucun soulèvement pro-bourguignon n'a lieu. Dans les années 1410 et 1420, une surveillance particulière a lieu envers les habitants récemment arrivés de la Bresse ou du Mâconnais. Mais rien ne vient étayer des rumeurs qui courent périodiquement, affirmant que des personnes préparent un soulèvement.