В начале Пиренейской войны Брёнье был назначен в армию Жана Андоша Жюно для вторжения в Португалию в 1807 году. Во время битвы при Вимейру 20 августа 1808 года бригада Брёнье застала врасплох и отбила атаку двух британских батальонов, но вскоре всё-таки была разбита. Раненный и захваченный англичанами, он вернулся во Францию из плена в 1809 году.