Томас был выбран на драфте НБА 1999 года в первом раунде под общим 22 номером клубом «Хьюстон Рокетс». Уже в своём дебютном сезоне он стал лидером команды по подборам. В последующие годы он продолжал быть одним из лучших игроков команды по подборам, но во время &lt;a href="%D0%9D%D0%91%D0%90%20%D0%B2%20%D1%81%D0%B5%D0%B7%D0%BE%D0%BD%D0%B5%202002/2003"&gt;сезона 2002/03 годов&lt;/a&gt; его обменяли в «Филадельфию 76». В &lt;a href="%D0%9D%D0%91%D0%90%20%D0%B2%20%D1%81%D0%B5%D0%B7%D0%BE%D0%BD%D0%B5%202003/2004"&gt;сезоне 2003/04 годах&lt;/a&gt; он был одним из 11 баскетболистов, которые в сезоне среднем за игру делали дабл-дабл.