Im Zweiten Koalitionskrieg war die Gegend von Schindellegi erneut Schauplatz von Kämpfen: Als der französische Oberbefehlshaber André Masséna nach der Ersten Schlacht um Zürich seine Front verkürzen musste, besetzte der kaiserlich-königliche General Franz Jelačić am 12. Juni 1799 mit seiner Division den Etzel und verlegte Detachemente nach Richterswil, Wollerau und Schindellegi. Vor der Zweiten Schlacht um Zürich liess der französische General Joseph Chabran am 14. August einen Teil seiner Division gegen den oberen Zürichsee vorstossen. Jelačić vermochte unter Einsatz seiner Reserven die Franzosen bei Wollerau, Hütten und Schindellegi aufzuhalten, wurde dann aber von anderen Einheiten über das Wägital umgangen und am 15. August auf dem Etzel geschlagen, worauf sich seine Truppen in Unordnung über die Brücke von Grynau auf das rechte Ufer der Linth zurückzogen.