Рост населения в середине 1980-х годов резко прекратился, когда начала стремительно падать цена на нефть из-за кризиса перепроизводства нефти и ухудшаться ситуация в городской экономике. В 1986 году взорвался космический шаттл «Челленджер», это трагическое происшествие также отрицательно сказалось на аэрокосмической отрасли. Население города за это десятилетие выросло всего на 2,3 %. C конца в 1980-х годов в результате рецессии Хьюстон прилагает усилия по диверсификации своей экономики, сосредоточив внимание на развитии аэрокосмической промышленности, здравоохранения, биотехнологий и сокращении зависимости от нефтяной индустрии.