طبق گفته مخالفان، در ۴ آوریل ۲۰۱۷، این شهر با استفاده از سلاح‌های شیمیایی مورد حمله هوایی قرار گرفت. در جریان حمله شیمیایی، ۹۲ نفر کشته و چند صد نفر زخمی شدند. ایالات متحده آمریکا و دیگر کشورهای اروپایی، دولت سوریه را مسئول حمله شیمیایی دانستند. اما دولت سوریه حمله شیمیایی به خان شیخون را رد کرد و آن را ساختگی دانست. پس از چند ماه آرامش نسبی، این شهر در سپتامبر ۲۰۱۷ دوباره توسط جنگنده‌های سوریه و روسیه بمباران شد.