Il giovane Alfonso, entusiasta del successo dell'impresa, dopo aver licenziato i soldati ungheresi rientrò finalmente a Napoli, dove venne acclamato dal popolo e dove trovò i soccorsi che erano venuti dal Portogallo e dalla Spagna, che fece rimandare indietro. Nella guerra morirono numerosi celebri uomini d'arme come: Matteo di Capua, Conte di Palena, Giulio Acquaviva Conte di Conversano, Don Diego Cavaniglia e Marino Caracciolo. Le ossa degli eroici Martiri di Otranto vennero poi fatte seppellire da Alfonso con tutti gli onori, alcune delle quali nella Chiesa di Santa Maria Maddalena, trasferite poi nella Chiesa di Santa Caterina a Formiello, dove si venerano come reliquie di Martiri.