Auch beim Konföderationen-Pokal 2005 in Deutschland triumphierte er. Am 29. Juni wurde die Nationalmannschaft Argentiniens im Endspiel mit 4:1 bezwungen. Bei der WM 2006 stellte Lúcio eine Bestmarke in diesem Wettbewerb auf, als er erst im Viertelfinale gegen die Nationalmannschaft Frankreichs nach 386 Minuten wieder ein Foul beging.