Der Trainer von Brasilien, Carlos Dunga nominierte André Santos für den Kader des FIFA-Konföderationen-Pokals 2009, wo er auch dort sein Debüt in der Nationalmannschaft gab am 15. Juni 2009 im ersten des Turniers gegen Ägypten. André Santos bestritt im Turnier alle Spiele und hatte maßgeblichen Anteil am Gewinn des Confed-Cups 2009.