Stefanidi satte verdensbestenotering i 12-årsklassen med 3,55 meter. Hun hoppet 3,90 meter i 2003, og passerte 4 meter i mai 2004, da hun hoppet 4,01 meter i Athen. Hun ble gresk U18-mester i stavsprang i 2004, med 4,15 meter, og vant igjen i 2005. Hun ble tatt ut til å delta i Ungdoms-VM i friidrett 2005, et mesterskap hun vant med 4,30 meter. I 2006 vant hun stavsprang under Gymnasiaden, der hun hoppet 3,95 meter, noe som var ny mesterskapsrekord.