Батько у 1547 році в ході Шмалькальденської війни потрапив у полон та кілька років перебував в ув'язненні в Іспанських Нідерландах. Матір і старший брат взяли на себе керування ландграфством. Крістіна пішла з життя навесні 1549 року. Барбарі на той час було 13 років. Деякий час вона провела в Амберзі у сестри Анни, яка була одружена із пфальцграфом Цвайбрюкену. У 1552 році батько повернувся з полону.