Henri IV'ün başbakanı Sully'ye göre Paré bir Huguenot'du ve 24 Ağustos 1572'de, St. Bartholomew Katliamı günü, Kral Charles IX Paré'yi bir elbise dolabına kilitleyerek hayatını kurtardı. 20 Aralık 1590'da 80 yaşında doğal nedenlerden ötürü Paris'te öldü ve Saint André-des-Arts kilisesine gömüldü. Paré'nin Huguenot davasına sempati duyduğuna dair kanıtlar olsa da, tehlikeden kaçınmak için Katolik gibi görünmeye devam etti: iki kez evlendi, gömüldü ve çocuklarını Katolik inancına göre vaftiz ettirdi.