Nach der Bundestagswahl 2013 wurde Hubig von Bundesminister Heiko Maas (SPD) am 8. Januar 2014 zur beamteten Staatssekretärin und Amtschefin im Bundesministerium der Justiz und für Verbraucherschutz berufen. Sie übernahm die Verantwortung für die Bereiche Justiz, Rechtspolitik und Verwaltung. In ihrer Amtszeit war sie unter anderem mit der Verschärfung des Sexualstrafrechts befasst.