1862年夏，加菲尔德患上黄疸，体重大幅减轻。被迫回家后，他在夫人照顾下恢复健康。朋友们为他争取共和党的国会议员提名，但加菲尔德不愿向党大会代表拜票。同年秋季他返回部队，前往哥伦比亚特区等待下一道指令。在此期间出现江湖传闻，声称加菲尔德发生婚外情，他的婚姻出现裂痕，直到卢克丽霞决定忽视。加菲尔德一再接到临时指令，但很快又撤销，令他颇感不耐。在此期间，费兹·约翰·波特（）少将因未及时投身第二次馬納沙斯之役面临军事法庭审判。参与审判的加菲尔德认为波特罪名成立，与投票结果一致。庭审从1862年11月开始，1863年1月审判，持续近两个月，结束时加菲尔德终于接到命令，担任威廉·罗斯克兰斯（）少将的参谋长。