Powołany był także na Copa América 1999, gdzie wystąpił w trzech spotkaniach fazy grupowej z Peru, Paragwajem i Boliwią. Podczas Pucharu Azji 2000 zagrał w 6 spotkaniach turnieju, w których zdobył 3 bramki (dwie przeciwko Irakowi i jedną przeciwko Arabii Saudyjskiej). Turniej ten zakończył się zwycięstwem Japonii. Po raz ostatni w reprezentacji Japonii zagrał 25 kwietnia 2001 w meczu przeciwko Hiszpanii, przegranym 0:1. Łącznie Hiroshi Nanami w latach 1995–2001 wystąpił w 67 spotkaniach, w których strzelił 9 bramek.