Alexandra Popp ha giocato per rappresentative nazionali tedesche sin dal 2006 quando aveva 15 anni. A livello giovanile ha fatto parte della nazionale Under-15, della nazionale Under-17, della nazionale Under-19 e della nazionale Under-20. Ha vinto il campionato europeo Under-17 nel 2008, segnando la seconda rete nella finale vinta per 3-0 sulla Francia, mentre è arrivata al terzo posto al campionato mondiale Under-21 nel 2008.