2016 Yaz Olimpiyatları'nda erkekler bireysel yol yarışı kazandı ve 2017 Paris-Roubaix, Gent-Wevelgem ve E3 Harelbeke, 2016 GP de Montréal ve 2016, 2017 Omloop Het Nieuwsblad gibi bir günlük diğer yarışları kazandı. Büyük Turlar'da, Van Avermaet Tour de France'da iki bireysel etap galibiyeti aldı ve 2016 ve 2018 Turlarında on bir gün boyunca Sarı mayo giydi ve 2008 Vuelta a España'da bir etap galibiyetiyle birlikte Vuelta a España puan klasmanını kazandı. Van Avermaet ayrıca 2017 UCI Dünya Turu'nun genel galibi oldu.