Pérez war Mitglied der A-Nationalmannschaft Uruguays, für die er von seinem Debüt am 14. Dezember 1933 bei der 0:1-Niederlage gegen Argentinien bis zu seinem letzten Einsatz am 27. Januar 1935 drei Länderspiele absolvierte. Ein Länderspieltor erzielte er nicht. Er gehörte dem Aufgebot Uruguays bei der Südamerikameisterschaft 1935 an, bei der Uruguay den Titel gewann. Dort kam er in den Begegnungen mit Chile und Argentinien zum Einsatz.