Med krimsko vojno (1853–1856) so leta 1855 osmanske sile z Omarjem pašo na čelu zasedle Zugdidi. Konec leta 1855 in v začetku leta 1856 je mesto osvobodila mingrelijska milica, ki ji je poveljeval generalmajor knez Grigol Dadiani. Po ukazu Iskender paše so Osmani oropali, požgali in uničili celotno mesto, zlasti palače in botanični vrt . Mnoge stavbe so bile močno poškodovane tudi med gruzijsko državljansko vojno 1992-1993.