Dragan Gajič hat bisher 161 Länderspiele für die slowenische Nationalmannschaft bestritten. Mit 692 Toren ist er drittbester slowenischer Schütze hinter Aleš Pajovič (697) und Luka Žvižej (702). Bei der Handball-Weltmeisterschaft der Männer 2007 in Deutschland belegte er mit seinem Land den 10. Platz. Er nahm auch an den Europameisterschaften 2010, 2012 (Zweiter der Torschützenliste) und 2016 sowie der Weltmeisterschaft 2013 (4. Platz) teil. Bei der Weltmeisterschaft 2015 wurde er mit 71 Treffern Torschützenkönig und ins All-Star-Team gewählt. Auch bei der Weltmeisterschaft 2021 stand er im Aufgebot.