Sebelum Perang Lubnan pada 2 Januari 1982, di mana orang anggota tentera Ghana yang berkawal di kedudukan UNIFIL telah diserang oleh orang yang tidak dikenali. Seorang anggota tentera Ghana telah ditembak dan kemudiannya meninggal dunia. Semasa Perang Lubnan, kedudukan-kedudukan PBB telah diambil alih oleh pasukan-pasukan "de facto" di bawah Saad Haddad. Pasukan-pasukan ini merupakan pasukan tempatan Lubnan yang disokong oleh IDF. Semasa pendudukan ini, fungsi utama UNIFIL adalah bagi menyediakan bantuan kemanusian. Bermula pada tahun 1985, Israel telah mengambil balik kedudukan-kedudukan tetap di Lubnan, walau bagaimanapun proses ini diselang seli dengan serangan dan pengeboman singkat, sepertimana dalam Operasi Ketelusan pada tahun 1993 dan Operasi Anggur Amarah pada tahun 1996. Pada tahun 1999, Israel berundur, yang mana berakhir pada tahun 2000 dan membolehkan UNIFIL menyambung kembali tugas-tugas ketenteraannya. Kerajaan Lubnan mendakwa kawasan ladang-ladang Shebaa adalah termasuk di dalam wilayah Lubnan, walau bagimanapun PBB menganggap Garisan Biru merupakan wilayah Syria di bawah pendudukan tentera Israel. Mereka berhujah bahawa pertikaian ini memberi sekatan sah berterusan kepada kumpulan penentang bersenjata Israel di Lubnan (bagaimanapun PBB secara rasminya mengesahkan Israel telah berundur sepenuhnya daripada semua kawasanyang diduduki selepas tahun 1973).