Prima della stagione 2003 lo sponsor principale abbandonò la scuderia e, con un budget inferiore a 80 milioni, si resero necessari molti tagli di spesa anche per quanto riguarda il personale tecnico, che si ridusse notevolmente: la stagione si presentò quindi difficile e impegnativa. I piloti erano Fisichella e Ralph Firman. In una stagione molto difficile, sia per la scarsa competitività della vettura che per i tanti ritiri, nonostante tutto la Jordan conquistò la sua ultima vittoria in Formula 1, seppure in una situazione molto particolare. Infatti al Gran Premio del Brasile la gara venne interrotta per la pioggia battente che aveva già causato numerosi incidenti. La vittoria, inizialmente attribuita a Kimi Räikkönen su McLaren, venne successivamente assegnata a Fisichella, unica soddisfazione per la Jordan in un anno concluso al nono e penultimo posto in classifica costruttori.