1807'de, Çin'in ilk Protestan misyoneri Rahip Dr. Robert Morrison Makao'ya indi. Morrison'un asıl amacı Guangzhou'da yaşayan Çinlilere ulaşmaktı ve oradaki misyonerlik çalışmalarına hemen başladı. Ancak daha sonra Makao'da bir Çin Protestan kilisesi kurdu. 1842 Afyon Savaşı'nın ardından, Çing Hanedanı Hong Kong'u Birleşik Krallık'a verdi ve Makao'da yaşayan Protestan misyonerlerin çoğu ve İngilizler Hong Kong'a taşındı. İngilizlerin çoğu Protestan olduğundan, Makao Protestan nüfusu uzun süre sadece bir avuç dolusu yaşama indirildi. 20. yüzyılda bazı Çinli Protestanlar insanların evlerinde toplandılar. Evlerini toplantıya açan en ünlü Çinli Hristiyanlar Bay Lui De Shan ve Dr. Yu Mei De idi. Hong Kong'daki kiliselerin desteğiyle Ji Dou Kilisesi kuruldu. Bu Makao'daki ilk Çin Protestan kilisesiydi (orijinalı adı Ji Dou Salonu'ydu). 1905 yılında Portekiz sömürge hükûmetine kayıtlı ve kilise binası Hei Sha Huan'da inşa edildi. Makao'daki ikinci Çin Protestan kilisesi olan Makao Baptist Kilisesi, bundan kısa bir süre sonra inşa edildi ve ardından bir dizi Çin Protestan kiliseleri kuruldu.