23 февраля 2000 года в товарищеском матче против сборной Португалии Вальгарен дебютировал за сборную Бельгии. В 2000 году Йос принял участие в домашнем чемпионате Европы. На турнире он сыграл в поединках против сборных Швеции, Турции и Италии. Он принимал участие в квалификационных матчах чемпионата мира 2002, но на первенство мира он не поехал из-за травмы.