En 1702 dejó la Gobernación y Capitanía de Ceuta y fue nombrado Capitán General en Andalucía, estando en el cargo entre 1702 y 1710. Durante la Guerra de Sucesión Española su cuartel apoyó al rey Felipe V. En 1702, las tropas del archiduque Carlos compuestas por unos 14 000 hombres desembarcaron cerca de Cádiz apoyados por una flota anglo-holandesa al mando de Sir George Rooke, comprometiendo seriamente su región militar, aunque fueron contenidas exitosamente en la Batalla de Cádiz (1702). Sin embargo, la flota anglo-holandesa del Príncipe de Darmstadt y de Sir George Rooke conquistó Gibraltar en 1704.