O uso público do termo suscitou uma resposta crítica também de vários grupos muçulmanos. No rescaldo do 11 de Setembro, George W.Bush descreve as políticas como a sua batalha contra "fascistas islâmicos... [que] vai usar todos os meios para destruir aqueles, porque nós amamos a liberdade." O Conselho para as Relações Americano-Islâmicas (CAIR) escreveu a ele para reclamar, dizendo que o uso do termo "alimenta a percepção de que a guerra ao terror é na verdade uma guerra contra o Islã". Ingrid Mattson da Sociedade Islâmica da América do Norte também queixou-se desse discurso, alegando que adicionado a um mal-entendido do Islã. Mattson reconhece, no entanto, que alguns grupos terroristas também abusam dos "conceitos islâmicos e condições para justificar sua violência".