In het &lt;a href="Bundesliga%202012/13"&gt;seizoen 2012/13&lt;/a&gt; haalde de ploeg de finale van de Champions League (op 25 mei 2013 in het Wembley Stadium). In de poule eindigde de ploeg als eerste, voor Real Madrid, Ajax en Manchester City, waarna in de knock-outfase achtereenvolgens werd afgerekend met Sjachtar Donetsk, Málaga en wederom Real Madrid. In de finale was landgenoot Bayern München echter met 2-1 te sterk door een goal van Arjen Robben in de 89e minuut. Ook in de Bundesliga eindigde Dortmund achter Bayern München op de tweede plaats.