В январе 1943 года был назначен на должность заместителя командующего войсками 21-й армии. За боевые отличия и высокое воинское мастерство личного состава 21-я армия в апреле была преобразована в 6-ю гвардейскую армию. С 31 июля по 8 августа Лагутин исполнял должность командира 23-го гвардейского стрелкового корпуса, который принимал участие в ходе боевых действий во время Белгородско-Харьковской наступательной операции. 3 ноября был ранен в бою и эвакуирован в госпиталь. После выздоровления в апреле 1944 года был вновь назначен на должность заместителя командующего 6-й гвардейской армией, которая принимала участие в Белорусской, Шяуляйской, Рижской и Мемельской наступательных операциях, а затем вела боевые действия на Курляндском полуострове. С 7 по 26 мая 1945 года исполнял должность командира 22-го гвардейского стрелкового корпуса.