Estudió primero nociones de cirugía, antes de entrar en el Ejército con 23 años, el 14 de septiembre de 1791, como teniente en el 3.º  de voluntarios de Var durante la formación de este cuerpo. Sirvió en un primer momento al ejército de Alpes después a aquella de Italia de 1791 a 1797. Ascendido a Adjunto al general el 21 de marzo de 1795, fue nombrado capitán al 16 de octubre siguiente. Embarcado con el ejército de Oriente para la campaña de Egipto de 1798 a 1801, fue herido en la nariz y en la pierna durante el Asedio de Acre el 15 de marzo de 1799. Obtiene poco después del grade de jefe de bataillon sobre el campo de batalla de Aboukir, el 1 de agosto del mismo año. Después de su regreso a Francia en 1801, participa en las campañas napoleónicas y obtiene los galones de mayor del 51.º de línea lo 22 de diciembre de 1803. El 27 de diciembre de 1805, después de la batalla de Austerlitz donde se ha distinguido, resulta coronel del mismo régiment. Se distingue durante la batalla de Auerstaedt, al seno de la brigada Debilly que pertenece a la división Morand. Baille toma igualmente marcha a la campaña en Polonia en el 3.º  del maréchal Davout. Está herido de un golpe de fuego a mano izquierdo durante la batalla de Golymin el 26 de diciembre de 1806. Restablecido, combate a Eylau el 7 de febrero de 1807, a los lados de la división Friant. A la salida de esta jornada, el coronel Baille lamenta al seno de su régiment 500 hombres matados, heridos o prisioneros.