De Beaupuy nahm 1793 an der Belagerung von Mainz teil und wurde danach am 31. August 1793 zum Général de brigade befördert. In die Armée des côtes de Brest zur Bekämpfung der königstreuen Aufständischen in die Vendée abgestellt, kämpfte er dann im Feldzug des Virée de Galerne. Eine Verwundung erlitt er in der Schlacht bei La Tremblaye und nahm trotz seiner Verwundung an der Abwehr der Belagerung von Angers teil. Eine weitere Verwundung erlitt er am 26. Oktober 1793 in der Schlacht bei Entrammes. Während des Feldzuges in der Vendée kämpfte er außerdem: