Avec l'arrivée de Luke Burgess après la Coupe du monde 2011, Jean-Marc Doussain est souvent relégué au cours de la saison sur le banc des remplaçants mais connaît néanmoins douze titularisations au poste de demi de mêlée et trois titularisations au poste de demi d'ouverture. Il porte notamment le lors de la demi-finale et de la finale du Top 14, pour un second titre national à seulement . N'étant pas titulaire indiscutable en club, il n'est pas retenu en équipe de France pour le Tournoi des Six Nations 2012 ni pour la tournée d'été 2012.