Berkeley commande encore "Marlborough" lorsqu'elle combat sous les ordres de Richard Howe lors du Bataille du 13 prairial an II, au sein de la division van de l'amiral Thomas Pasley et lors de la campagne précédente de l'Atlantique de mai 1794. Le juin, le "Marlborough" est démâté au corps à corps avec plusieurs navires français et le Berkeley grièvement blessé à la tête et à la cuisse, devant se retirer pour arrêter l'hémorragie. Il a une longue convalescence après l'action mais figure parmi les capitaines sélectionnés pour la médaille d'or commémorative de l'action, décernée uniquement à ceux qui ont joué un rôle important dans la victoire .