W reprezentacji Finlandii Ylönen zadebiutował 15 listopada 1995 w przegranym 1:3 meczu eliminacji Mistrzostw Europy 1996 z Rosją. 16 lutego 1996 w przegranym 2:5 towarzyskim pojedynku z Tajlandią strzelił swojego jedynego gola w kadrze. W latach 1995–2002 w drużynie narodowej rozegrał 46 spotkań.