1524年-1525年，夏爾三世率領德意志傭兵擊退法國對意大利的進攻，更於帕維亞戰役中俘獲弗朗索瓦一世。1526年雙方簽訂馬德里和約，釋放弗朗索瓦一世，而弗朗索瓦一世保證發還波旁家族的產業，但事後卻以在脅迫下簽署和約而拒絕踐約。查理五世其後任命夏爾三世為米蘭總督，但沒有為軍隊提供糧餉。1527年爆發兵變，夏爾三世被部下劫持，前往教宗國搶劫，於圍攻羅馬時被槍擊而死。波旁家族分支旺多姆伯爵系不准繼承，因此波旁公國亦從此併入法國皇室皇室領地。