El 10 de junio de 1798, Mdina fue capturada por las fuerzas francesas sin mucha resistencia durante la invasión francesa de Malta. Una guarnición francesa permaneció en la ciudad, pero el 2 de septiembre de ese año estalló un levantamiento maltés. Al día siguiente, los rebeldes entraron en la ciudad a través de un puerto de salida en el bastión de Despuig y masacraron a la guarnición de 65 hombres. Estos eventos marcaron el comienzo de un levantamiento y bloqueo de dos años, que terminó en 1800 con la conversión de Malta en un protectorado británico.