W reprezentacji Grecji Batista zadebiutował 12 października 1994 roku w wygranym 4:0 meczu eliminacji Mistrzostw Europy 1996 z Finlandią, w którym strzelił także gola. W latach 1994-1996 w drużynie narodowej rozegrał 14 spotkań i zdobył dwie bramki. Był pierwszym w historii czarnoskórym piłkarzem grającym w reprezentacji Grecji.