С ноября 1920 по октябрь 1921 года — вновь слушатель академии, и в конце 1921 года окончил Военную академию РККА в числе трёх лучших выпускников. С октября 1921 по апрель 1922 года — помощник начальника оперативного управления Туркестанского фронта, временно исполняющий должность начальника оперативного отдела штаба Туркестанского фронта. С апреля 1922 — начальник штаба 2-й Туркестанской стрелковой дивизии и Ферганской группы войск. С мая 1924 года — командир 2-й Туркестанской стрелковой дивизии и командующий Ферганской группы войск. Принимал активное участие в боевых действиях против басмачей, где получил пулевое ранение в одном из боёв.