Когда наступил 1812 год, он хотел ехать на место самых серьёзных военных действий, но получил Высочайшее повеление провести новую границу и устроить военную линию по реке Илек, где через несколько лет, благодаря заботам и трудам Струкова, было устроено до 20 казачьих станиц, пришедших впоследствии в цветущее состояние. В том же 1812 году Струков много содействовал предотвращению готового подняться в крае башкирского бунта. Около этого же времени он устроил новый солевозный путь для доставки илецкой каменной соли от места её разработки прямо до Самары.