Після вибуху ІІ світової війни у 1939 р., вересневої кампанії та нападу СРСР на Польщу потрапив у полон до радянських військ. Перебував в ув'язненні у Москві, а 11 квітня 1940 р. потрапив до табору полонених у Козельську. Шимон Федоронько був убитий у 1940 р. у Катині. У 1943 р. його тіло було ідентифіковане під номером 2713 під час ексгумацій, що проводилися під керівництвом німців (буквально визначений як Шимон Фезазонко; біля тіла знайдено документ, виданий у таборі, що посвідчує особу), де його поховали на території теперішнього Польського військового кладовища у Катині.