Un cop finalitzades la Guerra d'Independència de Cuba i la Guerra hispanoestatunidenca, aquesta última culminada amb el tractat de París de 1898 i pel qual Espanya abandonava la seva demanda sobre Cuba, Betancourt va iniciar els tràmits de retorn al seu país natal. Durant els preparatius, però, va contreure una broncopneumònia fulminant i va morir el 7 de febrer de 1901 a Madrid.