2008年11月9日にはバリ島爆弾テロ事件 (2002年) の実行犯3名が銃殺刑に処された。その後、2009年から2012年の間は死刑執行が一時停止されたのちに2013年に再開された。再開後の2013年から2021年6月時点で最後の年となる2016年まで23人が死刑執行されていた。この期間に執行された者の大半は麻薬の密輸に関わった外国人であり、銃殺刑に処されている。また2013年には執行再開に対して、執行停止を求めていたブラジル及びオランダ政府が駐インドネシア大使を召還して抗議を行い、2015年にはオーストラリア政府が死刑囚2人(ヘロイン密輸組織、通称「バリ・ナイン（）」の幹部)の執行停止を求めるなど各国と対立を深めた。この対立の影響か定かではないが、2016年7月29日に薬物関連の罪による4人の執行（内3人はナイジェリア国籍2人とセネガル国籍1人の外国人）を最後に死刑執行はされていない。