Im Massaker von Andijon 2005 schossen die Einheiten des UNB wahllos auf Demonstranten, die gegen das Regime protestiert hatten. Offizielle Angaben sprachen von 187 Getöteten, wogegen inoffizielle Quellen die Zahl der Todesopfer auf 1500 bezifferten. Als Reaktion darauf belegte die Europäische Union Inoyatov und weitere hochrangige usbekische Funktionäre mit Einreiseverbot. Von der schwarzen Liste wurde Inoyatov allerdings 2008 gestrichen und konnte wenige Wochen später nach Deutschland reisen.