В 1811 году Дохтуров переведён в лейб-гвардии Семёновский полк и назначен адъютантом к инспектору внутренней стражи, генерал-адъютанту графу Комаровскому, причём в Отечественную войну 1812 года, находясь в походе, был в сражении под Смоленском и за отличие произведён в поручики. Затем участвовал в сражении при Бородино, за что награждён орденом св. Владимира 4-й степени с бантом. Далее был в сражениях при Тарутине и под Малоярославцем (за что 15 февраля 1813 года пожалован золотой шпагой с надписью «За храбрость»), а оттуда — при преследовании неприятеля до границ и за отличие в сражениях произведён в штабс-капитаны.