En el contexto de la Guerra de Gaza de 2008-2009, tres jóvenes del campamento de Jan Yunis murieron abatidos por el ejército israelíː Hassan Rateb Muhammad Sem'aan, de 18 años, y Muhammad 'Abd a-Razeq al-Hileh, de 21, ambos miembros de la rama militar de Hamás, así como Salem Hamid Salem Abu Musa, de 23 años, que acompañaba al primero de ellos en un desplazamiento. Un año después de la conclusión de la guerra, Israel admitió haber usado bombas de fósforo blanco en zonas densamente pobladas de la Franja de Gaza, entre ellas el campamento de refugiados de Jan Yunis. El uso de fósforo blanco, que ocasiona horribles quemaduras químicas en la piel de sus víctimas, solo está permitido como cortina de humo y nunca en zonas habitadas por población civil, por lo que el ataque israelí constituyó una clara violación del derecho internacional.