עם כיבוש מוסול נמלטו ממנה כל הנוצרים. ב-16 ביוני 2014 השמיד הארגון את כל הכנסיות בעיר. ב-26 ביולי דווח על הריסת "כנסיית סנט מרי" במוסול, באמצעות מטעני צד. ב-21 בספטמבר פוצצו חמושים את "כנסיית הזיכרון לרצח העם הארמני" בדיר א-זור. שלושה ימים לאחר מכן פוצצה בעזרת חומרי נפץ מאולתרים כנסייה אשורית עתיקה בתיכרית, שנודעה בשם "הכנסייה הירוקה".