1939 lernte Bussi im Nachgang zum schweren Erdbeben von Chillán den Arzt Salvador Allende kennen, der zu diesem Zeitpunkt Mitglied des chilenischen Abgeordnetenhauses war. Beide setzten sich zu dieser Zeit für die vielen durch das Erdbeben obdachlos gewordenen Chilenen ein. Am 17. März 1940 heirateten Hortensia Bussi und Salvador Allende, der zu diesem Zeitpunkt bereits zum Gesundheitsminister unter Präsident Pedro Aguirre Cerda ernannt worden war. Mit ihm hatte sie drei Töchter: Carmen Paz, Beatriz und Isabel, die später selbst als Politikerin aktiv wurde. In den folgenden Jahren begleitete sie ihren Ehemann bei dessen erfolglosen Präsidentschaftkandidaturen 1958 und 1964, blieb aber eher im Hintergrund aktiv.