В 1809 г. Конгресът подновява търговските отношения с всички страни, освен с Великобритания и Франция, и така де факто отменя ембаргото. Това става три дни преди края на мандата на Джеферсън. Ембаргото сериозно влошава отношенията между САЩ и Великобритания и вероятно спомага за последвалата не след дълго Британско-американска война.