鄭成功攻臺之役中，鄭成功軍隊以澎湖群島為基地擊敗了荷蘭人。至清代（西元1727年）設立澎湖廳，隸屬福建省。清末因1895年4月甲午戰爭戰敗後，連同臺灣和遼東半島割讓予日本，惟澎湖早已於同年3月的澎湖之役中落入日軍之手。1920年，日本政府改澎湖郡併入高雄州，後復改回澎湖廳。1945年，第二次世界大戰日本戰敗後，由中華民國治理澎湖列島，設澎湖縣，劃入新設立的台灣省。