Im Dezember 2001 verunglückte der Tour-Van der Band auf eisglatter Straße. Gitarrist Brian Patton brach sich beide Beine und Bassist Scott Williams erlitt so schwere Schulterverletzungen, dass er als Musiker aufhören musste. Die für Anfang 2002 geplanten Tourtermine mit Gwar und God Forbid mussten aus diesem Grund abgesagt werden. Nachdem Gitarrist Patton genesen war, stieß Soilent Green zur laufenden Gwar-Tournee hinzu, als Tourbassist wurde Jonny Modell verpflichtet. Bei einem weiteren Tourbus-Unfall im April 2002 wurden Sänger Falgoust und Bassist Modell schwer verletzt und die Band musste erneut pausieren. Während dieser Auszeit erschienen eine auf 2.000 Stück limitierte Split-EP mit EyeHateGod sowie ein auf 1.000 Stück limitierter Re-Release des 2001er Studioalbums als LP im Klappcover, die heute zu gesuchten Sammlerstücken geworden sind. Im April 2003 wurde die Band mit dem neuen zweiten Gitarristen Tony White und Bassist Scott Crochet reaktiviert und ging im Sommer 2003 mit The Black Dahlia Murder auf Tournee. Am 26. April 2004 wurde der ehemalige Bassist Scott Williams in seiner Wohnung in Gretna tot aufgefunden, nach offiziellen Angaben soll ein Bekannter von Williams ihn erschossen und danach Selbstmord begangen haben. 2004 und 2005 folgten weitere Touren mit Behemoth und Suffocation. Ebenfalls 2005 stieg Tommy Buckley bei Crowbar ein und im Juni nahm Soilent Green das vierte Studioalbum "Confrontation" auf, das wenig später veröffentlicht wurde. Ex-Sänger Glenn Rambo gehörte im August 2005 zu den Opfern des Hurrikans Katrina.