Im 14. und 15. Jahrhundert sank die Bevölkerungszahl von Nižný Klátov durch die angespannte wirtschaftliche Situation infolge der Türkenkriege, wegen religiösen Konflikten und häufig auftretenden Epidemien. Ab dem späten 16. Jahrhundert begann der verstärkte Zuzug von Slowaken. Im 16. Jahrhundert kamen auch die Ideen Luthers und Calvins in das Dorf. Sie fielen vorwiegend bei der deutschen Bevölkerung auf fruchtbaren Boden. Im späten 17. Jahrhundert griff die Gegenreformation im Osten der Slowakei (1752 waren alle Einwohner von Nižný Klátov wieder katholisch). Weitere einschneidende Ereignisse waren die Kämpfe während des Kuruzenaufstandes von Franz II. Rákóczi und eine Pestepidemie im Jahr 1710.