Ο Μεσσηνιακός διοργανώνει κάθε χρόνο το μίτιγκ "Παπαφλέσσεια", το οποίο από το 1996 είναι διεθνές. Ο σύλλογος έχει αναδείξει πολλούς αθλητές. Σπουδαιότερος σύγχρονος αθλητής του Μεσσηνιακού είναι ο άλτης μήκους Λούης Τσάτουμας, με σημαντικές διεθνείς διακρίσεις. Το 2007 πήδηξε 8,66 μ. που ήταν η καλύτερη επίδοση στον κόσμο. Το 2010 κατέλαβε την 6η θέση στο Ευρωπαϊκό πρωτάθλημα στίβου, ενώ το 2014 κατέκτησε το ασημένιο μετάλλιο στο Ευρωπαϊκό Πρωτάθλημα Στίβου.