Joulukuussa 2010 Michel allekirjoitti 13 kuukauden sopimuksen Päiväntasaajan Guinean maajoukkuevalmentajan tehtävistä. Ranskalaisen on tarkoitus luotsata toista isäntämaata Afrikan mestaruuskisoissa 2012. Michel sai kuitenkin erosi tehtävästään ennen lopputurnausta lokakuussa 2011. Pian eropäätöksensä jälkeen Michel kuitenkin kertoi, että hän saattaa jatkaa tehtävässä. Michelin mukaan liiton johto haluaa ranskalaisen jatkoa ja ehtona on, että liitto tekee hänen vaatimiaan muutoksia työskentelyolosuhteisiin. Lopulta Michel ilmoitti joulukuussa 2011, vain kuukausi ennen Afrikan mestaruuskisoja jättävänsä lopullisesti paikkansa Päiväntasaajan Guinean maajoukkuevalmentajana.