En 2016, Harrie Lavreysen fait ses débuts internationaux sur piste à l'occasion des championnats d'Europe. En l'absence des meilleurs Néerlandais, de retour des Jeux olympiques, il est aligné en vitesse individuelle et par équipe. Il ne passe pas les qualifications et est classé et . En fin d'année, aux championnats des Pays-Bas, il est deuxième de la vitesse derrière Jeffrey Hoogland et troisième du keirin derrière Jeffrey Hoogland et Hugo Haak.