In seguito all'instaurazione della dittatura di Ion Antonescu e all'inizio dell'Operazion Barbarossa ("vedasi Romania nella seconda guerra mondiale"), come allievo ufficiale combatté sul fronte orientale, in Bessarabia e in Transnistria, prima di essersi ferito al braccio durante la Battaglia di Odessa nel 1941. Dichiarò di aver abbandonato il suo interesse per l'estrema destra dopo un dialogo del 1943 con il collega diplomatico Victor Rădulescu-Pogoneanu, il quale convinse Djuvara a diventare "un sostenitore della democrazia parlamentare".