Regionen er under kontrol af den centrale regering i Khartoum, og fredsaftalen om afslutningen af borgerkrigen i Sudan, Naivashaaftalen, gav ikke Nuba-Bjergene ret til at deltage i Folkeafstemningen om uafhængighed i Sydsudan i 2011. I stedet er beboerne i Nuba-Bjergene er forpligtet til at afholde dårligt definerede "folkelige konsultationer" for at bestemme deres fremtid.