Bogut wurde im NBA-Draft 2005 an erster Stelle von den Milwaukee Bucks ausgewählt. Er wurde schnell zum Stammspieler und nach seiner ersten Saison ins NBA All-Rookie First Team gewählt. Auch erreichte er mit den Bucks die Play-offs, die er in der Folgesaison trotz Steigerung seiner persönlichen Statistiken verpasste. In der &lt;a href="NBA-Saison%202007/08"&gt;Saison 2007/08&lt;/a&gt; konnte er insbesondere seine Ausbeute im Shotblock steigern. Die Saison 2009/10 war in Bezug auf seine Punkteausbeute (15,9 Punkte/Spiel) seine beste in der NBA, des Weiteren erreichte 10,2 Rebounds und 2,5 Blocks je Begegnung. Er erhielt eine Berufung in das All-NBA Third Team.