CTUは、1993年の世界貿易センター爆破事件後、国内テロ攻撃の標的保護を担う政府機関として、CIA（中央情報局）内部に設立されたという設定である。CIAの中でも国内テロ対策部門を受け持ち、外国人テロリストによる破壊活動を防ぐことを任務としている。