Durant la guerre de Succession d'Autriche (1740-1748), Daun mène l'avant-garde de l'armée de Ludwig Andreas Graf Khevenhüller durant la campagne victorieuse de celui-ci sur le Danube en 1743. Ses supérieurs lui confièrent des commandements importants et il atteint le grade de lieutenant-général en 1745 après avoir participé aux batailles de Hohenfriedberg et Soor. Il prend également part à la bataille de Lauffeld et, après la guerre, l'impératrice Marie-Thérèse le fait chevalier de l'ordre de la Toison d'or. Il s'emploie à réorganiser l'armée impériale entre la guerre de Succession d'Autriche et la guerre de Sept Ans et est élevé au rang de feld-maréchal en 1754.