La reconquista prit fin le avec la victoire de l'Armée des Andes à la Bataille de Chacabuco. Durant cette bataille, les troupes patriotiques combattirent avec le colonel et avec le drapeau de l'armée des Andes, inspiré du Drapeau de l'Argentine. Il n'y a pas de sources pour savoir si le drapeau bleu-blanc-jaune fut utilisé. Dans son récit sur la bataille, Bartolomé Mitre omit ce détail.