بدأت هجرة اليونانيين من مصر قبل ثورة 1952 . مع إنشاء نظام جديد لسيادة جمال عبد الناصر وصعود القومية العربية وما تلاها من تأميم العديد من الصناعات في عامي 1961 و 1963 ، قرر الآلاف من الموظفين اليونانيين التخلي عن البلاد. هاجر العديد منهم إلى أستراليا والولايات المتحدة وكندا وجنوب إفريقيا وأوروبا الغربية واليونان. أغلقت العديد من المدارس والكنائس والمجتمعات والمؤسسات اليونانية اليونانية في وقت لاحق، لكن الكثير منها ما زال يعمل حتى يومنا هذا. شهد نظام ناصر هجرة كبيرة لليونانيين من مصر، لكن معظم الأقلية غادرت البلاد إما قبل أو بعد الفترة 1952-1970. ساهمت الحروب العربية الإسرائيلية في عامي 1956 و 1967 في اقتلاع الجالية اليونانية الكبيرة في مدن قناة السويس وخاصة بورسعيد.