Durante los primeros meses de guerra con los Estados Unidos después del ataque a Pearl Harbor, Japón planeó usar armas biológicas contra los estadounidenses. Durante la Campaña de Filipinas en marzo de 1942, los japoneses consideraron liberar 90 kg de pulgas portadoras de la peste —unos 150 millones de insectos— en cada uno de diez ataques separados, pero los estadounidenses se rindieron en Bataan antes de que se implementara el plan. En noviembre de 1944, Japón lanzó un total de 9.300 bombas incendiarias y antipersona transportadas por globos que fueron diseñados para elevarse a 10.000 metros, y dirigidos hacia el este por la corriente en chorro hacia los Estados Unidos continentales. Estos mataron a seis civiles estadounidenses cerca de Bly, Oregón, que se estrellaron contra una granja en Medford, Oregón, y causaron un cortocircuito en las líneas eléctricas que suministraban electricidad para las bombas de enfriamiento del reactor nuclear en las instalaciones de producción del Proyecto Manhattan en Hanford, Washington. El sistema de emergencia restauró la energía. Durante la batalla de Iwo Jima, se consideró otro ataque biológico contra los estadounidenses. El piloto Shoichi Matsumoto contó más tarde cómo se suponía que dos planeadores que transportaban patógenos serían remolcados sobre la batalla y liberados, pero los planeadores que se suponía que despegarían del Japón continental al aeródromo de Matsumoto en el distrito de Pingfang en preparación para el ataque nunca llegaron a su destino.