Несколько лет Марк Порций сопровождал отца — в Сицилии, на Балканах, в Азии, Киренаике и Африке. В 46 году до н. э., когда помпеянцы понесли окончательное поражение при Тапсе, Катоны находились в Утике. Известно, что отец пытался уговорить Марка спастись бегством на корабле, но тот отверг эту возможность ради выполнения сыновнего долга. Решив покончить с собой, Катон-старший в своём последнем разговоре с сыном «запретил юноше касаться государственных дел: обстоятельства, сказал он, больше не позволяют заниматься этими делами так, как достойно Катона, заниматься же ими по-иному — позорно». Марк, догадываясь о намерениях отца, пытался помешать ему, но тот всё же совершил самоубийство.