În Bombardarea Iugoslaviei de către NATO din 1999 nu a împiedicat desfășurarea maratonului în acel an, cursa ținându-se pe 17 aprilie. Aproximativ 40 de alergatori din nouă țări au trecut linia de sosire în 3 ore, 15 minute și 16 secunde. Alergătorii din țările NATO au fost Seine Brenson din Statele Unite ale Americii, și Michael Turzynski și Heinz Lorber din Germania. Ultimii doi sunt și membri fondatori ai echipei germane de maraton „100 Maraton Club”.