Несмотря на то, что Румынская православная церковь стремилась закрепить своё влияние в регионе, церкви всё равно разрушались германскими войсками. Так, созванная в СССР Чрезвычайная государственная комиссия, в обязанности которой входил подсчёт ущерба от военных действий против Германии, насчитала в Молдавии разрушенными и повреждёнными 66 церквей и 2 часовни.