Mit Angriffen einer Rebellenbewegung unter dem Namen "Mouvement Patriotique de Côte d’Ivoire" (MPCI) auf Korhogo und Bouaké begann im September 2002 der Bürgerkrieg gegen die Regierung des christlichen Südens unter Laurent Gbagbo. In einer ersten Reaktion flog die französische Armee 130 westliche Ausländer aus der Stadt. Im Mai 2003 wurde zwar ein Waffenstillstand vereinbart, aber bis zur Unterzeichnung des Friedensabkommens im Juli 2007 herrschte der Ausnahmezustand. In der Stadt übernahmen Rebellen das Kommando. Der Markt von Korhogo wurde zum Umschlagplatz für Schmuggelware. Als sich 2006 die Rebellen zurückzogen, nahm die kriminelle Gewalt zu. Die Sicherheitsaufgaben wurden nun von einer "Dozos" genannten traditionellen Jäger-Gruppe übernommen; einer Bruderschaft, die behauptet, über magische Fähigkeiten zu verfügen.