El 28 de enero de 2019, inició su segunda etapa al frente del Bolonia FC. Logró sacar al equipo italiano de los puestos de descenso, terminando la Serie A en un solvente 10º puesto al sumar 30 puntos en 17 jornadas. El 8 de junio de 2019, tras haber obtenido esta cómoda permanencia en la élite, renovó su contrato con el club por 3 temporadas más. Un año después, con el equipo en 10ª posición en la Serie A, amplió su contrato por un año adicional.