Pendant le mois de juin, la cinquième flotte participe à l'assaut sur les îles Mariannes. À partir du 11, des raids sont lancés sur Saipan depuis des porte-avions, suivis par des bombardements à partir du 13, durant lesquels l"Indianapolis" joue un rôle majeur. Le , jour du débarquement, l'amiral Spruance est averti qu'une grande flotte ennemie, composée de cuirassés, de porte-avions, de croiseurs et de destroyers, est en route afin de soutenir les garnisons basées dans les Mariannes. L'amiral ne pouvant pas dégarnir sa force de débarquement à Saipan de ses grosses unités, c'est une force de porte-avions rapides qui est envoyée à la rencontre de cette menace. Dans le même temps, un autre détachement est envoyé pour empêcher d'éventuelles attaques aériennes japonaises depuis les bases d'Iwo Jima et de Chichi.