Im Juni 1215 bezeugte Pandulf zu Runnymede die Anerkennung der Magna Carta durch König Johann. Seine Rolle in den folgenden Verhandlungen zwischen den rebellischen Baronen und dem König ist umstritten. Mindestens ein zeitgenössischer Chronist gibt ihm und Nikolaus von Tusculum eine Mitschuld, dass der Konflikt zwischen der Adelsopposition und dem König zum Krieg der Barone eskalierte. Vor allem die finanziellen Forderungen von Pandulf sowie seine Bevorzugung von königlichen Kandidaten bei der Besetzung von vakanten Bistümern und Abteien hätten zum Scheitern der Verhandlungen mit dem König geführt. Am 15. Juli 1215 wurde Pandulf zu Verhandlungen mit den Baronen nach Oxford gesandt. Wenig später, am 25. Juli, wurde er durch Intervention des Papstes zum neuen Bischof von Norwich gewählt. Anscheinend war Pandulf bei der Wahl nicht anwesend. Auch in den nächsten Jahren nahm er sein Amt nicht wahr, vermutlich besuchte er vor 1222 nur einmal kurz das Gebiet seines Bistums. Höchstwahrscheinlich verzögerte er bewusst seine Weihe, damit er als Beauftragter des Papstes unabhängig vom Erzbischof von Canterbury blieb. Norwich gehörte nämlich zur Kirchenprovinz Canterbury, und der damalige Erzbischof Stephen Langton gehörte zu den wichtigsten Unterstützern der Barone gegen den König. Zusammen mit Peter des Roches, Bischof von Winchester, verkündete Pandulf im September die Exkommunikation der rebellischen Barone durch den Papst. Wenig später enthob Pandulf im Auftrag des Papstes Erzbischof Langton seines Amtes. Anschließend reiste er nach Rom, wo er als Vertreter von König Johann am Vierten Laterankonzil teilnahm.