第二次大戦が勃発し、シャールはアルザスの砲兵連隊に配属された。1940年5月にドイツ軍がフランスに侵攻。シャールはダンケルク撤退作戦（ダンケルクの戦い）のために、ロワレ県ジアン（サントル＝ヴァル・ド・ロワール地域圏）に向かい、民間船による撤退のためにロワール川のジアン橋の防御にあたった。6月14日、パリ陥落。6月22日、独仏休戦協定締結。復員したシャールは、南仏（ドイツ軍非占領地域）の故郷リル＝シュル＝ラ＝ソルグに戻ったが、12月に共産党員と疑われ、ヴォクリューズ県知事に通報された。知事は警察に家宅捜査を命じたが、捜査員の一人から逮捕される可能性があることを事前に知らされたため、急遽、（プロヴァンス＝アルプ＝コート・ダジュール地域圏、アルプ＝ド＝オート＝プロヴァンス県）に逃亡。翌1941年の初めに地元のレジスタンス運動家と連絡を取り、運動に参加した。