1989年ソ連人民代議員大会代議員選挙にベラルーシ人民戦線派から立候補し当選した。デメンティ最高会議議長の下で第一副議長。1990年にベラルーシ最高会議は主権宣言を採択し同時に非核地帯であることも宣言された。1991年ソ連8月クーデターで共産党を離党し、クーデターを支持したデメンティ最高会議議長の後任として、9月18日ベラルーシ共和国最高会議議長（国家元首）に選出された。シュシケヴィチは、ベラルーシのベロヴェーシの森でロシアのエリツィン大統領、ウクライナのレオニード・クラフチュク大統領とともに会談を持ち、ソ連の解体、独立国家共同体（CIS）の結成を決定した（ベロヴェーシ合意）。