Creta divenne uno stato parlamentare semi-indipendente all'interno dell'Impero Ottomano. Governatori cristiani amministrarono l'isola negli anni 1880, presiedendo un parlamento in cui liberali e conservatori si contendevano il potere. Le controversie tra questi portarono a un'ulteriore insurrezione nel 1889 e al crollo degli accordi del Patto di Halepa. Le potenze occidentali permisero alle autorità ottomane di inviare truppe sull'isola per ristabilire l'ordine, ma il sultano Abdul Hamid II colse l'occasione per applicare nell'isola la legge marziale. Questa azione favorì la simpatia internazionale per la causa dei cristiani cretesi. Un'insurrezione scoppiata nel 1897 portò alla guerra greco-turca del 1897. In seguito ad un violento scontro tra i musulmani e i cristiani cretesi, i britannici costrinsero gli ottomani ad abbandonare l'isola; le ultime forze ottomane furono evacuate il 6 novembre 1898. Lo stesso anno fu stabilito lo Stato cretese, sebbene ancora sottoposto alla sovranità formale del sultano ottomano.