Ботанические сборы Акинфиева вошли в гербарий русской флоры Ботанического института Академии наук СССР, Тифлисский музей и Тифлисский ботанический сад. Гербарий Акинфиева, отображающий флору Екатеринославской губернии, хранится в Днепропетровском государственном университете. В 1900 году гербарий флоры Екатеринославской губернии демонстрировалсяв Париже на Всемирной выставке. Гербарий Акинфиева по Кавказу был приобретён Санкт-Петербургским ботаническим садом в 1899 году за 700 рублей.