В 2010 году Кранчар возглавил сборную Черногории. Но после хорошего старта национальной команды в квалификации на выход в чемпионат Европы, когда за два матча до конца отборочного цикла Черногория занимала второе место в группе, 8 сентября 2011 года он был уволен. Деян Савичевич, президент Федерации футбола Черногории, сказал на это: «У Кранчара была проблема, которую мы тщательно пытались скрывать. Эта проблема связана с алкоголем». Сам Кранчар опроверг слова Деяна.