Während der Tschetschenienkriege ab 1994 war Wedeno als eine der größten relativ weit im gebirgigen Teil der Republik gelegenen Ortschaften erneut wiederholt umkämpft. Im Ersten Tschetschenienkrieg wurde Wedeno von russischen Truppen am 3. Juni 1995 eingenommen, im Zweiten Tschetschenienkrieg nach zweimonatigen, verlustreichen Kämpfen am 11. Januar 2000. Im August 2001 kam es zu einem Angriff der Separatisten auf die russische Kommandantur im Ort, im März 2006 zu Kämpfen zwischen OMON-Kräften und Separatisteneinheiten unter – dem im nahen Dyschne-Wedeno geborenen – Schamil Bassajew und Doku Umarow in der Umgebung.