2 июня крейсер прибыл на Парамушир, и после заправки с танкера «Ниссан-Мару» 3 июня вышел в море для участия в операции «AL». До возвращения в Оминато 23-го он прикрывал высадку войск на Атту, патрулируя океан южнее острова. 28 июня-14 июля «Нати» совершил второй поход в этот район, затем с 24 по 30 прошёл докование в Йокосуке. С 14-го июля он передан в состав 21-й дивизии крейсеров («Тама» и «Кисо»), оставаясь при этом флагманом Пятого флота. 2 августа «Нати» вышел из Йокосуки и вплоть до двадцатых чисел марта 1943 года курсировал по маршруту Парамушир-Оминато. 30 сентября 1942 года из-за ошибочного сообщения о появлении американских кораблей он выдвигался на их перехват, в феврале прошёл ремонт в Сасэбо (с установкой ветрозащитных козырьков).