Nel 2016 cominciò la gestione di Pep Guardiola, che aprì la stagione 2016-2017 con dieci vittorie consecutive in tutte le competizioni, di cui sei in Premier League, dove raggiunse il primo posto della graduatoria. Un calo di rendimento fece scivolare al terzo posto finale la compagine di Manchester, che nelle coppe non ebbe migliore fortuna. Nel 2017-2018 il tecnico spagnolo riuscì a vincere il titolo, con ben cinque giornate d'anticipo, com'era successo solo tre volte nella storia della competizione, e la Coppa di Lega. Nel 2018-2019 il City fu protagonista di una memorabile annata, in cui mise in bacheca Supercoppa d'Inghilterra, Coppa di Lega (ai tiri di rigore), titolo nazionale, il secondo di fila (evento che non accadeva in Premier dal 2009) e FA Cup, centrando "treble" domestico senza precedenti nella storia del calcio inglese. Nel 2020-2021 i "Citizens" si aggiudicarono la Coppa di Lega per la quarta volta consecutiva, agganciando il Liverpool nella graduatoria di successi nella competizione, e raggiunsero per la prima volta la finale della UEFA Champions League, persa contro i connazionali del .