Ab 25. März 1939 folgte er Admiral I. S. Jumaschew als Befehlshaber der Schwarzmeerflotte in Sewastopol nach. Am 21. Mai 1941 zum Vizeadmiral befördert, war er während des Großen Vaterländischen Krieges für den Seetransport militärischer Ausrüstung und Personals zu den von deutschen Truppen belagerten Küstenstädten verantwortlich. Zuerst stärkte er der Verteidigung der Küstenarmee (General Grigori Sofronow) bei der Verteidigung von Odessa gegen die rumänische 4. Armee. In der Endphase der Belagerung leitete er im Oktober 1941 die Evakuierung der zahlenmäßig unterlegenen Verteidigungstruppen. Als Kommandant der Schwarzmeerflotte war er auch für die Verteidigungszone des jetzt durch die deutsche 11. Armee bedrohten Kriegshafens von Sewastopol zuständig. Er war im Mai 1942 auch an der Evakuierung der Halbinsel Kertsch seitens der Küstenarmee des General Petrow beteiligt. Der sowjetische Historiker A. V. Nemenko warf ihn bei der Führung völlige Inkompetenz und Mangel an Voraussicht vor, die zu großen Verlusten bei der Evakuierung der Krim führte. Bei der Evakuierung der Halbinsel Kertsch soll er in seiner Panik die stürmischen Wetterbedingungen zur See nicht berücksichtigt haben, welche Tausende von Menschen den Tod durch Ertrinken brachten. Ein großer Teil der verlorenen Schiffe und Besatzungen wurden bei der planlos erfolgten Evakuierung Opfer eigener Minenfelder.