Po zakończeniu kariery piłkarskiej Matošić został trenerem. W latach 1956–1958 oraz 1965 był szkoleniowcem Hajduka Split. W latach 1959–1961 oraz 1963–1964 prowadził inny zespół ze Splitu, RNK Split. W latach 1961–1963 pełnił funkcję selekcjonera reprezentacji Tunezji. W 1962 roku zajął z nią 3. miejsce w Pucharze Narodów Afryki 1962.