После разгрома немецких войск в Крыму 4-я воздушная армия была передана в состав 2-го Белорусского фронта. В его составе гвардии старший лейтенант С. В. Яцковский принимал участие в освобождении Белоруссии. В ходе Белорусской операции по заданию командования 2-го Белорусского фронта Серафим Вадимович вскрыл оборону противника на реке Проня на участке протяжённостью свыше 170 километров и глубиной 60 километров. Звено Яцковского принимало участие в обнаружении мест дислокации авиации противника. В начале января 1945 года С. В. Яцковский был произведён в капитаны. Он одним из первых в полку освоил новую технику фотографирования на малых высотах. Много времени Серафим Вадимович уделял обучению лётчиков своего звена. За отличие в ходе Восточно-Прусской операции гвардии капитан С. В. Яцковский получил свой третий орден Красного Знамени и был назначен на должность заместителя командира эскадрильи.