"Mercy" ditempatkan di San Diego, California dan umumnya bertugas di Samudra Pasifik dan Hindia. Misi pertamanya adalah bantuan kemanusiaan ke Filipina dan Pasifik Selatan pada 1987. Misi militer pertamanya terjadi dalam Perang Teluk I (1990-1991), melayani tentara koalisi. Kapal ini juga dikirim setelah tsunami 2004 yang berpusat di lepas pantai Sumatra. Pada 2013, kapal ini membantu Filipina dan negara-negara lain yang terkena Taifun Haiyan.