Nachdem im Jahr 1957 die Kontrolle von der RAF an die RAAF übertragen wurde, stationierte Australien zur Zeit des Kalten Krieges eine Reihe von Bomber- und Jagdstaffeln. Die mit CAC Sabre ausgerüsteten "3. Squadron" und "77. Squadron" kamen auch während der Konfrontasi, einem Konflikt zwischen Malaysia und Indonesien in den 1960er-Jahren, zum Einsatz. Ab August 1964 kam es zu Abfangeinsätzen gegen anfliegende indonesische MiG-21 Abfangjäger. Da es zu keinen Grenzüberflügen kam, konnte eine weitere Eskalation verhindert werden. Erwähnenswert ist noch die Stationierung von Dassault Mirage III der "75. Squadron" zwischen 1968 und 1983.