Avec les attaques constantes des pirates et la destruction de Portobelo en 1739, l'utilisation des routes transisthmiques au Panama entre dans une phase de déclin, et avec la construction du chemin de fer du Panama en 1855, le Camino Real a été abandonné. Au fil du temps, la végétation de la jungle et le développement humain, dans les zones proches de Panama City, ont fait disparaître une partie de la route.