Instruit du débarquement des Anglais en Zélande, l’Empereur confie au général Reille l’un des trois corps formés de l’armée de Bernadotte. De la Zélande il retourne en Espagne comme gouverneur de la Navarre le , bat Francisco Espoz y Mina au Carascal, à Serin, et détruit, avec deux compagnies de hussards, trois bataillons espagnols. Le maréchal Suchet n’ayant pas assez de forces pour le siège de Valence, Reille s’y porte avec la division de son nom, la division Severoli, et concourt à la prise de cette place. Reille commande en chef, en Aragon, le corps de l’Èbre le jusqu’au , époque où il reçoit le commandement de l’armée de Portugal, forte de hommes. Le roi Joseph Bonaparte ayant pris la résolution de concentrer toutes ses forces en avant de l’Èbre, le général Reille évacue les provinces qu’il occupe et se dirige vers les hauteurs de Pancorbo, en soutenant le choc des ennemis et en conservant ses positions. Les armées du Centre et du Portugal s’étant rassemblées à Pancorbo, on tient un conseil de guerre pour décider quelle position on prendrait. Le général Reille propose de réunir toutes les troupes disponibles, montant à hommes, et de prendre la ligne d’opérations par Logroño et la Navarre ; mais on juge à propos de ne point quitter la route de France, et Wellington ayant prévenu le rassemblement des troupes françaises qui ne sont que de combattants, quand il en a , les Français sont attaqués et battus. Reille se défend avec hommes contre près de , et ne se retire que par ordre. Dans ces dernières opérations contre les Anglais, les Espagnols et les Portugais coalisés, il commande l’aile droite française le , combat sur la Bidassoa, en Navarre, à Orthez et à Toulouse.