In 1848 werd haar echtgenoot hertog van Saksen-Altenburg, nadat diens broer Jozef wegens de onrust tijdens de Duitse Revolutie van 1848-1849 was afgetreden. Vervolgens vestigde het echtpaar zich in Altenburg, alwaar ze een vrouwenvereniging, arbeidsschool en een evangelisch-luthers missiemaatschappij stichtte. Na de dood van haar echtgenoot in 1853 bleef Marie in Altenburg wonen. Ze stierf in oktober 1862 op 59-jarige leeftijd in Meiningen.