In maart 1918 werd door communistische sympathisanten - merendeels van Russische afkomst - deze ASSR uitgeroepen. Pjotr Kobozev, een etnische Rus, werd voorzitter van het Centraal Uitvoerende Comité, en daarmee in feite regeringsleider van de autonome republiek. Kobozev was tevens tijdelijk minister-president (voorzitter van de Raad van Volkscommissarissen). Turkestan lag tijdens de Russische Burgeroorlog midden in de vuurlinie. Uiteindelijk lukte het het Rode Leger om Turkestan voor de communisten te behouden en de Basmatsjiopstand neer te slaan.