Shibata begann ihre internationale Karriere im Jahr 2007, als sie für die U-15-Nationalmannschaft nominiert wurde. 2011 trug sie maßgeblich zum Gewinn der U-19-Asienmeisterschaft 2011 bei. Sie gehörte dem Kader der japanischen U-20-Nationalmannschaft an, der an der U-20-Weltmeisterschaft 2012 in Japan teilnahm. Sie wurde als zweitbeste Spielerin der U-20-Weltmeisterschaft 2012 mit dem silbernen Ball ausgezeichnet.