В составе отрядов служилых людей или совместно с яицкими казаками башкиры принимали участие в Ливонской войне в 1558—1581 гг., в отражении набегов сибирских татар и калмыков на Уфимский уезд (в XVI—XVII вв.), в освобождении России от польских интервентов (первая четверть XVII века), в Калмыцком походе в 1643—1644 гг., в Крымских походах в 1687 и 1689 годах, в Азовских походах в 1695 и 1696 годах. В 1771 году башкирам обязывалось возвратить бежавших в Джунгарию, российских поданных — калмыков.