В течение следующих двух десятилетий Иокогама стала одним из крупнейших портов японских островов, и в 1889 году её численность достигла 122 тысяч жителей. Значительным успехом в развитии городской инфраструктуры стало строительство водопровода (1887) и электрификация города (1890). Одним из самых драматических событий за всю историю города было мощное землетрясение в 1923 году, во время которого погибли около 20 тысяч человек, лежало в руинах или сожжено 60 тысяч зданий. Три башни Иокогамы чудом уцелели. Благодаря большим усилиям властей и жителей город был восстановлен к концу 1929 года.