Nach diesem, aus Sicht der Täter zufriedenstellenden Ergebnis sowie den Erfahrungen, die das SS-Sonderkommando Lange im Herbst 1939 mit der Vergasung von polnischen Psychiatriepatienten in einer ersten Gaskammer im Fort VII in Posen gesammelt hatte, wurde die Tötung der T4-Opfer mit CO-Gas allgemein festgelegt. Becker wurde mit der Instruierung der Ärzte beauftragt, die in den insgesamt sechs NS-Tötungsanstalten die Vergasung vornehmen sollten. Als erstes wurde Grafeneck in Betrieb genommen. Über seinen dortigen Einsatz sagte Becker 1960 aus, dass er nach einem erfolglosen Versuch von Dr. Schumann „persönlich etwa 20 Menschen durch Gas getötet habe“.