La Jordan EJ11 de 2001, désormais motorisée par un V10 Honda, semble un peu plus performante : Frentzen finit à trois reprises dans les points lors des quatre premiers Grand Prix. Ses performances périclitent par la suite, il se blesse à Monaco et doit manquer le Grand Prix du Canada. Après six courses hors des points, il est limogé par Jordan après le Grand Prix de Grande-Bretagne.