Во Фрунзе в 1950 году Франкль начинает работать заведующим кафедрой теоретической физики в Киргизском государственном педагогическом институте (с 24.05.1951 Киргизский государственный университет (КГУ)). Профессор Франкль, как и все спецпереселенцы должен был каждый день приходить в спецкомендатуру расписываться. В 1956 году, после XX съезда КПСС Франкль реабилитирован и восстановлен в КПСС. Менее, чем за 8 лет работы в КГУ Франкль подготовил более 20 кандидатов наук.