28 Haziran 2009 günü Güney Afrika'yla oynanan 2009 FIFA Konfederasyonlar Kupası 3.lük maçında İspanya'yı ipten alan oyuncu oldu. 1-0 gerideyken 88. ve 89. dakikalarda attığı gollerle takımını 2-1 öne geçirdi. Uzatmalar sonunda İspanya millî futbol takımı, 2009 FIFA Konfederasyonlar Kupası 3.sü oldu. Daniel Güiza, 18 Kasım Çarşamba günü Avusturya'ya 1 gol daha atarak millî takımdaki gol sayısını 6 ya çıkarttı.