Medina 2003-ban debütált a mexikói válogatottban. Eleinte csak barátságos meccseken számítottak rá. Első komoly tornája a 2005-ös konföderációs kupa volt, ahol harmadik számú csatár volt Jared Borgetti és Ramón Morales mögött. A 2006-os világbajnokságon nem volt ott, de a 2010-es tornára már kapott behívót.