Mientras el acorazado estaba destinado en Kiel Alemania invadió la Unión Soviética, por lo que se creó una Flota Báltica temporal para impedir la fuga de la flota soviética fondeada en Leningrado. El "Tirpitz" actuó brevemente como buque insignia de la escuadra, compuesto por el crucero pesado "Admiral Scheer", los cruceros ligeros "Köln", "Nürnberg", "Leipzig" y "Emden", varios destructores y dos flotillas de dragaminas. La Flota Báltica, bajo mando de Otto Ciliax, patrulló frente a las islas de Åland desde el 23 al 26 de septiembre de 1941, tras lo que la unidad fue disuelta y el "Tirpitz" retornó a sus entrenamientos. Durante este período de adiestramiento, el "Tirpitz" probó sus cañones principales y secundarios sobre el viejo acorazado "pre-dreadnought" "Hessen", que había sido convertido en un buque objetivo radiocontrolado. La Real Fuerza Aérea británica continuó lanzando incursiones de bombardeos aéreos sobre el acorazado mientras estaba estacionado en Kiel, aunque ninguna tuvo éxito.