Bor là tâm điểm của Nội chiến Sudan lần thứ hai. Tiến sĩ John Garang de Mabior, một sĩ quan trong Quân đội Sudan đã lãnh đạo cuộc nổi dậy ở thành phố Bor vào tháng 5 năm 1983, dẫn đến sự ra đời của Phong trào Giải phóng Nhân dân Sudan và Quân Giải phóng Nhân dân Sudan (SPLM/SPLA). Bor cũng là hiện trường của vụ thảm sát năm 1991, nơi có khoảng 2.000 người thiệt mạng.