La quinta edizione della gara in linea femminile Junior dei campionati europei di ciclismo su strada si è svolta il 5 luglio 2009 nei dintorni di Hooglede in Belgio, su un percorso totale di 63,3 km. La medaglia d'oro è stata vinta dall'italiana Elena Cecchini con il tempo di 1h34'46" alla media di 40,07 km/h, argento all'olandese Laura van der Kamp e a completare il podio la francese Pauline Ferrand-Prévot.