Il club, che ha principalmente giocato nei campionati di Serie C, ha ottenuto una storica promozione in Serie B (dopo averla sfiorata più volte sotto le presidenze Bassi in vari campionati di terza serie tra la fine degli anni cinquanta e i primi anni sessanta, Bulgarella nel campionato 1994-1995 e Morace nel campionato 2011-2012) nell'anno sportivo 2012-2013. In B ha sfiorato la promozione in Serie A nei play-off per l'accesso diretto al campionato 2016-2017, nella stagione 2015-2016, giungendo terza (record assoluto) e perdendo la finale contro il Pescara. In quella stagione il Trapani fece registrare il record di vittorie consecutive nel campionato cadetto (8), record tuttora detenuto insieme alla Juventus 2006/2007 e al Verona 2011/2012.