Pada tahun 1895, di bawah Perjanjian Shimonoseki yang mengakhiri Perang Tiongkok-Jepang Pertama, Taiwan berusaha melawan pendudukan Jepang, dan Republik Formosa yang berumur pendek dideklarasikan oleh gubernur Tiongkok, Tang Jingsong pada tanggal 25 Mei 1895. Tang menjadi presiden republik baru, dan Liu Yongfu diangkat menjadi brigadir jenderal dan diberi komando pasukan perlawanan di Taiwan selatan. Sepuluh hari setelah mendeklarasikan kemerdekaan, Tang Jingsong melarikan diri ke Tiongkok Daratan, dan Liu menggantikannya sebagai kepala pemerintahan (meskipun ia tidak, seperti yang sering diklaim, berhasil menjadi presiden). Pada akhir Mei 1895 pasukan Jepang mendarat di dekat Keelung, di pantai utara Taiwan, dan melanjutkan untuk menaklukkan pulau itu. Antara Juni dan Agustus Jepang mengalahkan pasukan Formosa di Taiwan utara dan tengah, dan pada bulan Oktober 1895 tiga kolom Jepang maju di Tainan, menyapu pasukan Liu. Pada tanggal 20 Oktober 1895, Liu melarikan diri ke daratan dengan menumpang kapal niaga berbendera Inggris SS Thales bersama kapal penjelajah Jepang "Yaeyama" di dekat pengejaran. "Yaeyama" menangkap "Thales" di perairan internasional di luar Amoy, tetapi partainya tidak dapat menangkap Liu, yang menyamar sebagai kuli. Insiden ini memicu protes diplomatik dari Inggris dan menghasilkan permintaan maaf resmi oleh pemerintah Jepang. Pada tanggal 21 Oktober Tainan menyerah kepada Jepang. Runtuhnya perlawanan Formosa meresmikan lima dekade pemerintahan Jepang di Taiwan.