À la fin de la Première Guerre mondiale, Bischoff s'engage dans les corps francs qui luttent pour la défense du Baltikum. Il commande la Brigade de fer, qui devient bientôt Division de fer et combat pour asseoir le pouvoir du Duché balte uni. Les combats sont très violents, et Bischoff lutte jusqu'au bout pour la défense de cette terre de colonisation allemande contre les aspirations indépendantistes des peuples baltes. Joignant ses forces à l'armée occidentale des volontaires de Bermondt-Avalov, il quitte toutefois le pays avant même l'armistice et les dernières défaites fin 1919.