Während des Krieges nutzte die Luftwaffe der Wehrmacht nach dem Ende des Westfeldzuges den Platz ab Juni 1940. Während der folgenden zwölf Monate, in der insbesondere die Luftschlacht um England stattfand, diente Villacoublay als Bomberstützpunkt von &lt;a href="Heinkel%20He%20111"&gt;Heinkel He 111P/H&lt;/a&gt; des Kampfgeschwaders 55 (KG 55), im Juni/Juli zunächst auch noch einige Wochen solchen des Kampfgeschwaders 27 (KG 27). Zwischen November 1940 und Mai 1941 nutzten den Platz ebenfalls Junkers Ju 88 der Aufklärungsgruppe 14 (AFG 14). Nach dem deutschen Überfall auf die Sowjetunion im Juni 1941 diente Villacoublay bis Februar 1943 der mit Messerschmitt Bf 109 ausgerüsteten Jagdfliegerschule 5 (JFS 5). Aufgrund der Verstärkung der alliierten Bomberoffensive gegen das Reich wurde die Basis jedoch wieder Stützpunkt von Kampfverbänden. Villacoublay wurde Heimathorst von Tagjägern zur Abwehr einfliegender Bomberverbände der Eighth Air Force der United States Army Air Forces (USAAF), bis August 1943 Bf-109 des Jagdschulgeschwaders 105 (JG 105) und nach einer einjährigen Unterbrechung kam es als unmittelbare Folge der alliierten Invasion in der Normandie ab Juni 1944 zu einer Nutzung durch Focke-Wulf Fw 190 des Jagdgeschwaders 54 (JG 54). Bis zur Eroberung des Flugplatzes durch die Westalliierten Ende August wurde der Platz regelmäßig durch leichte (Jagd-)Bomber der Ninth Air Force der USAAF – meist synchronisiert mit Angriffen der Schweren Bomber der 8. US-Luftflotte – attackiert.