Liga Champions UEFA 1998-99 adalah musim ke–44 dari Liga Champions UEFA, turnamen klub utama sepak bola UEFA, dan musim ketujuh dalam format Liga Champions UEFA. Kompetisi ini dimenangkan oleh Manchester United, mengalahkan Bayern München dengan skor 2-1 di final. Teddy Sheringham dan Ole Gunnar Solskjær mencetak gol bagi United. Mereka adalah klub asal Inggris pertama yang mencapai final Liga Champions sejak tragedi Heysel .