Без урахування фронтових випробувань восени 1944 року, за даними Управління самохідної артилерії, вперше СУ-100 були застосовані в бою в січні 1945 року в ході Будапештської операції. В умовах, коли радянські війська вели стратегічний наступ, СУ-100 нерідко застосовувалися при завершенні прориву тактичної глибини оборони противника в ролі штурмових гармат, як наприклад, в Східно-Прусської операції, де були задіяні 381-й і 1207-й самохідно-артилерійські полки. При цьому самохідно-артилерійські частини йшли в атаку або з ходу, або з підготовкою в стислі терміни.