Em 1971 foi para Timor para ocupar o cargo de vice-reitor do seminário da diocese de Díli. Foi professor de língua portuguesa no Externato de São José, onde ensinou muitos intelectuais timorenses atuais, como Rui Maria de Araújo. Após a invasão indonésia de 1975 decidiu permanecer em Timor, sendo vigiado pelas autoridades indonésias.