El 30 de abril de 2007, Kewell hizo su regreso después de casi un año de no tener actividad con su club. Entró de cambio al minuto 55 en un partido de las reservas del Liverpool frente a las reservas del Everton. El 5 de mayo de 2007, entró de cambio al segundo tiempo en un partido frente al Fulham FC en Craven Cottage, esto luego de haber estado fuera de actividad con el primer equipo desde la final de la FA Cup un año antes. El 13 de mayo de 2007, Kewell entró de cambio al segundo tiempo contra el Charlton Athletic en el último partido de la temporada, en donde marcó su último gol para el club. Las especulaciones sobre si Kewell iba a ser seleccionado o no para jugar la final de la Liga de Campeones se volvieron positivas luego de su gran desempeño contra el Charlton. Kewell mandó un pase cruzado a Dirk Kuyt quien a su vez asistió a Xabi Alonso para que éste marcara el gol y también marcó un penal al minuto 90. Kewell pudo jugar la final de la Liga de Campeones, entrando de cambio al segundo tiempo por Boudewijn Zenden, aunque el Liverpool fue derrotado 2-1 por el Milan.