Den 7 april 2016 offentliggjordes det att Janne Andersson skulle ta över tränarrollen i Sveriges herrlandslag efter Erik Hamrén efter sommarens EM-slutspel. Andersson fortsatte att träna IFK Norrköping till och med juli, och tillträdde därefter planenligt som förbundskapten. Fram till januari 2017 var Lars Lagerbäck rådgivare till Janne Andersson. Den 13 november 2017 förde Andersson Sverige till VM 2018 i Ryssland, efter att laget slutat tvåa i kvalgruppen och slagit ut Italien i playoff. I Ryssland-VM ledde Andersson landslaget till kvartsfinal mot England, efter att ha slagit Schweiz i åttondelsfinal med 1-0.