Als Karl I. das Staatswesen reformierte und Hernán Cortés die überseeischen Besitzungen mit der Eroberung Mexikos nochmals enorm vergrößerte, wurde im Jahre 1524 der "Consejo de Indias" in eine eigenständige Institution umgewandelt, die nun die offizielle Bezeichnung "Real y Supremo Consejo de Indias" trägt.