Будучи солдатом в 1940 году, Бразийак был захвачен немцами и провёл в плену несколько месяцев после падения Франции. На судебном процессе против публициста сторона обвинения утверждала, что его освобождение было обусловлено тем фактом, что он писал прогерманские статьи, находясь в плену. Бразийак был освобождён в начале 1941 года и вернулся к своей работе редактора "Je suis partout". Он также писал в угоду режиму Виши, но затем занял ещё более германофильские позиции и начал критиковать вишистский режим. В составе группы прогерманских французских писателей и художников принял участие в Веймарском собрании поэтов 1941 г., где было основана коллаборационистская «Европейская ассоциация писателей». В ноябре 1942 года Бразийак поддержал милитаризацию неоккупированной зоны под руководством правительства Виши, заявляя, что она «воссоединила Францию». Он побывал на месте Катынского расстрела, объездил весь Восточный фронт, встречался с французскими добровольцами и написал, по возвращении во Францию, что он ушёл от «рационального» коллаборационизма и пришёл к коллаборационизму «сердца» («"De collaborationiste de raison, je suis devenu collaborationiste de coeur"»). Он предлагал казнить левых политиков и летом 1944 года подписал петицию, где призывал к расстрелу всех членов французского Сопротивления. Бразийак считал себя «умеренным» антисемитом, и поэтому был смещён на посту главного редактора "Je suis partout" в 1943 году Пьером-Антуаном Кусто, который придерживался более радикальных взглядов. Писатель также был членом Коллаборационной группы "(Groupe Collaboration)", общественного объединения, которое занималось налаживанием тесных культурных связей между Францией и Германией. Он продолжал работать в различных журналах, включая "Révolution nationale" и "le Petit Parisien". После освобождения Парижа Бразийак прятался на чердаке, шутя по этому поводу в своём дневнике: «"евреи живут в шкафах уже в течение четырёх лет, почему бы не начать подражать им?"»