В 1944 году Канарёв окончил академические курсы офицерского состава ВВС и ПВО при Военно-морской академии имени К. Е. Ворошилова. С апреля того же года он командовал 2-й гвардейской минно-торпедной авиадивизией ВВС Черноморского флота. Дивизия под его командованием активно участвовала в Крымской и Ясско-Кишинёвской наступательных операциях (в последней произвела массированный авианалёт на главную румынскую военно-морскую базу Констанца в августе 1944 года). 5 ноября 1944 года гвардии полковнику В. П. Канарёву присвоено воинское звание генерал-майор авиации.