El seu pare, Malachy McCourt (1901-1985), falsament va afirmar haver estat en l'IRA durant la Guerra d'Independència d'Irlanda, i la mare, Angela Sheehan (1908-1981), catòlica irlandesa, era nascusa a Limerick. Frank McCourt va viure a Nova York amb els seus pares i quatre germans menors: Malachy, nascut el 1931; els bessons Oliver i Eugene, nascuts el 1932; i una germana menor, Margaret, que va morir només set setmanes després del naixement, el 1934.