La danzatrice fu protagonista alla Scala anche nel 1847 e nel 1848, rispettivamente con "Caterina, la figlia del bandito" (balletto di Jules Perrot con musica di Cesare Pugni) e con il "Faust", sempre di Perrot. Nella prima occasione la ballerina austriaca riscosse un successo straordinario presso un pubblico entusiasta, ma l'anno successivo fu vittima innocente della mutata situazione politica. In città fervevano i sentimenti anti-austriaci, e il debutto del "Faust" era previsto per il 22 febbraio (mancava meno di un mese all'inizio delle Cinque giornate di Milano). Fu allora diffuso un volantino che chiedeva ai milanesi di non andare alla rappresentazione a causa delle origini austriache della Elssler. La popolazione accolse l'invito e i più agguerriti si recarono addirittura a fischiarla in teatro, facendola svenire.