I 2012 blev han dømt for doping, da han deltog ved VM i kortbanesvømning 2012. Han mistede i første omgang to medaljer, som han vandt ved europamesterskabet på kortbane, men han ankede dommen, og senere, i februar 2014, vandt han apelsagen og dommen blev omstødt, således at han fik guldmedaljen tilbage som han vandt i 1500 meter fri ved VM i kortbanesvømning 2012, dommen var baseret på, at da han blev testet efter at han havde svømmet finalen i 1500 meter fri, så fandt man ikke noget. Dommen holdt dog fast ved, at han mistede den bronze-medalje som han vandt i 400 meter fri ved EM 2012 på kortbane. Årsagen til, at han blev testet positiv i doping, skyldtes i følge Glæsner selv, at han ved en fejltagelse kom til at anvende en amerikansk Vicks-inhalator, som indeholder et forbudt stof og derfor er forbudt at bruge i sportskonkurrencer, mens en dansk variant af den samme slags Vicks inhalator ikke er forbudt, da indholdet er forskelligt. Inhalatoren bruges mod forstoppelse i næsen. Der er ikke tale om en spray, man lugter til inhalatoren ved stoppet næse. Udover at miste bronzemedaljen, fik han også karantæne i tre måneder.