Quando scoppiò la guerra in Bosnia nel 1992, Ljujić-Mijatović respinse la politica nazionalista serba, rimase a Sarajevo durante l'assedio della città da parte dell'esercito serbo bosniaco e sostenne la preservazione di una Bosnia ed Erzegovina multietnica. Quando Nenad Kecmanović rassegnò le dimissioni da membro serbo della presidenza della Bosnia ed Erzegovina nel luglio 1992, Ljujić-Mijatović era la delegata serba con il maggior numero di voti alleelezioni del 1990 che risiedeva ancora nel territorio controllato dal governo, dopo le dimissioni di Biljana Plavšić e Nikola Koljević e l'espatrio di altri due delegati.