С 5 на 7 мая 1945 года его дивизия оказала помощь Пражскому восстанию, выступив на стороне восставших. Сдавшись в плен к американцам, 15 мая 1945 года Буняченко был передан американскими военными органам РККА. В 1946 году был осуждён вместе с генералом Андреем Власовым по обвинению в государственной измене, лишён воинских званий и государственных наград СССР и казнён.