Toktogasijew ist Mitglied der sozialistisch ausgerichteten Partei Ata Meken. Im Jahr 2019 wurde er mit Unterstützung der Partei Bir Bol als neuer Landwirtschaftsminister im Kabinett von Premierminister Muchammedkaly Abylgasijew vorgeschlagen, blieb jedoch bei der Besetzung des Amtes unberücksichtigt. Bei der Parlamentswahl in Kirgisistan 2020 kandidierte Toktogasijew für Ata Meken auf Listenplatz zwei für einen Sitz im kirgisischen Parlament, dem Dschogorku Kengesch. Das vorläufige Ergebnis der Parlamentswahl bedeutete ein Scheitern von Ata Meken an der 7-Prozent-Hürde, wurde jedoch im Rahmen der anschließenden Proteste in Kirgisistan annulliert. Nach der Wahl und dem Rücktritt der Regierung kam es zu chaotischen Szenen in Bischkek, verschiedene Interessengruppe protestierten in der Hauptstadt und es kam immer wieder zu gewaltsamen Zusammenstößen. Darüber hinaus war zu diesem Zeitpunkt unklar, wie eine neue Regierung gebildet werden würde, da das Parlament nicht mehr zusammenkam, sondern in verschiedene Interessengruppen zerfallen war.