Cuộc xâm lược Panama của Hoa Kỳ năm 1989 đã lật đổ ông khỏi quyền lực; ông bị bắt giữ, bị giam như một tù binh chiến tranh, và bị giải về Mỹ. Noriega bị xét xử vì tám cáo buộc buôn lậu thuốc phiện, gian lận, và rửa tiền vào tháng 4 năm 1992. Án tù của Noriega tại Mỹ chấm dứt tháng 9 năm 2007; với sự tạm treo các yêu cầu dẫn độ của cả Panama và Pháp. Pháp đã được thực hiện yêu cầu dẫn độ vào tháng 4 năm 2010.