En 2001, Jay Z habló en contra de Prodigy después de que asumiera un problema con una línea de Jay Z de "Money, Cash, Hoes" que él sentía eran insultos subliminales a Mobb Deep y referencias a la confrontación entre Mobb Deep con Tupac Shakur, Snoop Dogg, y Death Row Records. Más tarde Jay Z interpretó la canción "Takeover", en el Summer Jam 2001, que inicialmente atacaba a Prodigy y reveló fotos de Prodigy vestido como Michael Jackson. Una línea al final del "Takeover" hace referencia a Nas, quien lo criticó en "We Will Survive". Nas respondió con una pista de diss llamada "Ether", y casi al instante, Jay Z añadió un verso más a "Takeover", que insulta a Nas y se iniciaría una pelea entre los dos raperos. Jay Z más tarde lanzó su sexto álbum de estudio "The Blueprint" que más tarde fue considerado por muchos como uno de los álbumes más "clásicos" del hip hop, que recibe el codiciado 5 Mic Review de la revista "The Source". Publicado durante el velatorio de los ataques del 11 de septiembre, el álbum logró debutar en el número uno en el "Billboard 200", vendiendo más de 427.000 unidades en la primera semana de lanzamiento. El éxito del álbum fue eclipsado por el trágico suceso. "The Blueprint" ha sido certificado 2x Platino en Estados Unidos. "The Blueprint" fue aplaudido por su producción y el equilibrio de "mainstream" y el rap "hardcore", recibiendo el reconocimiento de ambos públicos. The Blueprint fue escrito en sólo dos días. Eminem fue el único rapero invitado en el álbum, produciendo y rapeando en la canción "Renegade". Cuatro de los trece temas del disco fueron producidos por Kanye West y representa uno de los primeros grandes saltos de West en la industria. The Blueprint incluye las canciones populares "Izzo (HOVA)", "Girls, Girls, Girls", "Jigga That Nigga" y "Song Cry".