Erst seit dem Zusammenbruch der Sowjetunion und der Wiederherstellung der litauischen Unabhängigkeit 1990 beginnt eine landesweite Diskussion über die Aufarbeitung des Holocaust. Im Vordergrund der Wahrnehmung steht jedoch die eigene Opferrolle während der „Russenjahre“ 1940–1941 und 1944–1989. Litauen war der erste Teil der ehemaligen Sowjetunion, der nach der Unabhängigkeit den Schutz von Stätten des Holocaust in ihre Verfassung schrieb. 1995 sprach der litauische Präsident Algirdas Brazauskas vor dem israelischen Parlament eine offizielle Entschuldigung an das jüdische Volk wegen der litauischen Beteiligung am Holocaust aus. Das Simon Wiesenthal Center kritisierte die schleppende Aufarbeitung und warf den litauischen Behörden vor, Kriegsverbrecher nicht vor Gericht zu bringen.