2010年（平成22年）に名古屋市熱田区の名古屋国際会議場において開催された第10回生物の多様性に関する条約締約国会議（COP10）に関連して、名古屋市として「なごやの生きものに関する情報を次世代へ伝えるために収集し、発信するとともに、なごやの身近な自然の調査・保全活動を推進する」ことを目的に設立した生物の多様性に関する施設である。2011年（平成23年）3月をもって廃止された名古屋市環境局天白中継所の建物を改装工事の上、2012年（平成24年）3月に「なごや生物多様性センター」として設置された。