Après les Jeux olympiques d'été de 1996 à Atlanta, où la France ne gagne aucune médaille en natation, il décide de réorganiser la filière française, en rompant avec une culture de l'exception et en étant plus exigeant sur les résultats au long terme pour créer une filière d'excellence. Il oblige les nageurs souhaitant participer à une compétition internationale à gagner d'abord un titre national, ce qui le rend très impopulaire. Mais cette rigueur se révèle payante en 1998, aux Championnats du monde de Perth, quand Roxana Maracineanu emporte la médaille d'or sur le 200 mètres dos, puis emporte la médaille d'argent aux Jeux de Sydney dans la même discipline.