Участник советско-японской войны 1945 года. Во время Курильской десантной операции капитан 1 ранга Д. Г. Пономарев в короткие сроки подготовил и в сложных погодных условиях осуществил переход морем, произвел высадку десанта на сильно укреплённые противником острова Шумшу и Парамушир, организовал подавление вражеских опорных пунктов и огневых точек. За успешное проведение этой операции приказом от 14 сентября 1945 года Д. Г. Пономареву было присвоено звание Героя Советского Союза.