パーカーはネルソンに艦隊の中でも喫水の浅い、小型の戦列艦12隻を委ねた。そして自らは残りの艦とともに戦場の北東にとどまって外部の干渉からネルソンを護り、北の防御陣地と交戦するためにコペンハーゲン方面に進出した（「バウンティ号の反乱」で有名なウィリアム・ブライ艦長がこのときネルソン艦隊の1隻、戦列艦「グラットン」を指揮していた。）。ネルソンの計画では、イギリス艦隊はまずデンマークの防御の比較的手薄な南側から、敵戦列に沿って進入する、というものだった。まず先頭の艦がデンマーク艦の舷側に接近し、その位置に投錨したうえで交戦する。他の船はその外側を通過し、次の艦が次のデンマーク艦と交戦する。以下同様に各艦が戦闘に突入するという計画である。またフリゲート「デジレー」は小型ブリッグを伴ってデンマーク戦列を南側から掃射し、フリゲート「アマゾン」のリュー艦長が指揮するフリゲート戦隊は北側から攻撃することになっていた。そしてひとたび艦隊がデンマーク艦隊を制圧したならば、陸上部隊がトロクレナ要塞を襲撃する手はずだった。イギリス艦隊の外側には砲艦が位置し、戦列越しにデンマーク部隊を砲撃する予定になっていた。イギリス艦隊がより強力な北側の防衛陣地を征圧できないときは、南側の船を排除して砲艦が市街地に接近し、市街地を砲撃するという脅しのもとに交渉を強要することになっていた。