Sezon 2005 gracze NSÍ Runavík zakończyli na miejscu czwartym w ligowej tabeli. Christian Høgni Jacobsen zapisał się wówczas jako pierwszy król strzelców w historii klubu. Będąc finalistą Pucharu Wysp Owczych, z uwagi na to, że HB Tórshavn został wówczas także mistrzem archipelagu, NSÍ zagrał w &lt;a href="Puchar%20UEFA%20%282005/2006%29%23I%20runda%20kwalifikacyjna"&gt;pierwszej rundzie kwalifikacyjnej Pucharu UEFA 2005/06&lt;/a&gt;, gdzie przegrał oba mecze przeciwko Liepājas Metalurgs 0:3 i 0:3. W kolejnym sezonie NSÍ zajął miejsce piąte, wygrywając dwanaście i remisując sześć z dwudziestu siedmiu spotkań. Jacobsen ponownie został wówczas królem strzelców. Sezon 2007 zapisał się w kartach historii klubu, jako jedyny, podczas którego wywalczył on Mistrzostwo Wysp Owczych. Z 29 spotkań NSÍ przegrał jedynie cztery, przy dziewiętnastu wygranych. Na miejscu lidera znalazł się w 23. kolejce i do końca nie oddał już prowadzenia. W kolejnym sezonie ponownie znalazł się na czwartym miejscu w tabeli, jednak wystąpił jedyny do tej pory raz w swojej historii w pierwszej rundzie kwalifikacyjnej Ligi Mistrzów. Pierwsze spotkanie z Dinamo Tbilisi przegrał 0:3, drugie zaś zwyciężył 1:0, jednak stosunek bramek (1:3) wyeliminował go z dalszej rywalizacji w turnieju. Zdobywcą honorowej bramki był Milan Pejcić. Sezon 2009 klub zakończył ponownie na pozycji czwartej w pierwszoligowej tabeli. Wystąpił też w &lt;a href="Liga%20Europy%20UEFA%20%282009/2010%29%23Faza%20kwalifikacyjna"&gt;pierwszej rundzie kwalifikacyjnej Ligi Europy 2009/10&lt;/a&gt;, gdzie przegrał 1:3 i 0:3 z klubem Rosenborg BK. Jedyną bramkę dla NSÍ w meczu wyjazdowym zdobył Károly Potemkin w szóstej minucie.