Trong màu áo đội tuyển Cộng hòa Séc, Jankulovski đã từng tham dự Euro 2000, Euro 2004, Euro 2008, và World Cup 2006. Anh đá khoác áo đội tuyển Cộng hòa Séc 77 lần, ghi 11 bàn thắng.