25 августа 1992 года, во время осады Сараево библиотека подверглась сильному обстрелу и сгорела. Попутно были украдены около 700 рукописей и инкунабул, а также уникальная коллекция боснийских изданий культурного возрождения XIX века. Перед атакой, в библиотеке насчитывалось 1,5 млн томов и более 155 тысяч редких книг и рукописей. Некоторые граждане и библиотекари пытались спасти часть книг, находясь под снайперским огнём, в результате по крайней мере, погиб один человек. Но большинство книг не смогли сохранить от пожара.