Vuonna 1792 Hoban voitti suunnittelukilpailun presidentin virka-asunnosta vastikään perustetussa pääkaupungissa. Hobanin alkuperäisen suunnitelman selkein esikuva oli Dublinin Leinster House, mutta lopullisen julkisivun mallina toimi eräs kuva englantilaisen James Gibbsin vuonna 1728 julkaisemasta kirjasta "Book of Architecture". Hoban määrättiin johtamaan suunnittelemansa talon rakennustöitä, mistä hän sai palkkioksi 500 dollaria ja tontin pääkaupungin alueelta. Valkoisen talon peruskivi muurattiin vuonna 1793, mutta talo valmistui vasta 1801. Hoban oli vuosina 1793–1802 myös yksi William Thorntonin suunnitteleman Washingtonin kongressitalon ("United States Capitol") rakentamisesta vastanneista arkkitehdeista, aluksi ylivalvojana ja vuodesta 1798 itse rakennustöiden johtajana. Kongressitalon alkuperäinen pohjoissiipi valmistui hänen valvonnassaan vuonna 1800, mutta muut arkkitehdit ovat myöhemmin huomattavasti muuttanet sitä. Muita Hobanin Washingtoniin suunnittelemia rakennuksia olivat Grand Hotel (1793–1795), Little Hotel (1795) ja sotaministeriön talo (1818), joista yksikään ei ole säilynyt. Valkoisen talon tuhouduttua pahoin vuoden 1812 sodassa Hoban valvoi sen vuosina 1814–1829 toteutettua uudelleenrakentamista.