В марте 2005 года в российском «ближнем зарубежье» происходит очередная «цветная революция» — в Киргизии свергают президента Аскара Акаева, правившего страной с 1990 года. В результате «тюльпановой революции» на смену ему приходит Курманбек Бакиев. В мае массовые беспорядки вспыхнули в узбекском Андижане. Власти Узбекистана заявили, что мятеж был организован радикальными исламистами. Жестокое подавление мятежа привело к сотням жертв. США призвали к независимому расследованию событий. В ответ президент Узбекистана Ислам Каримов потребовал прекращения американского присутствия на базе Карши-Ханабад. Уже в ноябре базу покинул последний американский самолёт, а в 2006 году туда пришли российские военные. Уход американцев с базы Манас в Киргизии затянулся на более долгий срок — окончательно они покинули базу лишь в 2014 году.