Dodo zu Innhausen und Knyphausen werd geboren in Lütetsburg in Oost-Friesland. Hij begon zijn militaire loopbaan onder Maurits van Oranje en tijdens de Dertigjarige Oorlog sloot hij zich aan bij de protestantse strijdkrachten. Hij vocht mee in de Slag bij Höchst, Stadtlohn en Dessau. Daarnaast deed Knyphausen oorlogservaring op in het westen. Zo hielp hij de Engelsen in 1628 in hun poging om La Rochelle te ontzetten.