El Ejército Continental, bajo el comando de Gates y Benedict Arnold, finalmente logró detener la avanzada británica en la Batalla de Saratoga. Esta victoria, la primera derrota significativa de los británicos, marcó un punto de inflexión en la revolución, ya que fue el evento que convenció a los franceses de unirse a la guerra y apoyar a las colonias. Cuando Schuyler demandó una corte marcial para responder a los cargos de Gates, fue reivindicado, pero decidió renunciar al ejército el 19 de abril de 1779. En 1779 y 1780, participó en dos sesiones más del Congreso Continental.