2003年美国入侵伊拉克的时候，他在一个清真寺当阿訇。根据美国国防部记录，巴格达迪在美国入侵伊拉克期间于2004年2月被美军以的身分扣留拘押在；2004年12月初因为没有审查出他有犯罪前科被关押的记录，他被“无条件释放”。