Khởi hành từ Trân Châu Cảng vào ngày 6 tháng 2, 1945 trong thành phần Đơn vị Đặc nhiệm 51.6.2, "William C. Miller" tham gia vào cuộc đổ bộ lên Iwo Jima từ ngày 23 tháng 2 đến ngày 16 tháng 3. Sau khi kết thúc chiến dịch, nó đi ngang qua Guam và Eniwetok để quay trở về Trân Châu Cảng vào đầu tháng 4. Con tàu tiếp tục quay về vùng bờ Tây và ở lại San Francisco, sau đó là San Diego, cho đến ngày 13 tháng 6, khi nó cùng tàu khu trục hộ tống lên đường đi sang quần đảo Hawaii. Sau khi đi đến Trân Châu Cảng vào ngày 19 tháng 6, nó hộ tống một đoàn tàu vận tải đi Eniwetok, đến nơi vào ngày 6 tháng 7. Nó lại ra khơi hộ tống các đơn vị thuộc Đệ Tam hạm đội trong các chiến dịch không kích xuống các đảo chính quốc Nhật Bản, và tiếp tục vai trò này cho đến ngày 15 tháng 8, khi Nhật Bản chấp nhận đầu hàng chấm dứt cuộc chiến tranh.