Η πλέον διάσημη υπηρεσία του Χάνκοκ ήταν ως νέος διοικητής σώματος στη Μάχη του Γκέττυσμπεργκ, μεταξύ 1ης Ιουλίου και 3ης Ιουλίου 1863. Μετά τον θάνατο του φίλου του, Υποστρατήγου Τσων Φ. Ρέυνολντς, νωρίς την 1η Ιουλίου, ο Υποστράτηγος Τζωρτζ Τζ. Μηντ, νέος διοικητής της Στρατιάς του Ποτόμακ, απέστειλε τον Χάνκοκ να αναλάβει τη διοίκηση των μονάδων στο πεδίο της μάχης και να εκτιμήσει την κατάσταση. Έτσι, ο Χάνκοκ ήταν σε προσωρινή διοίκηση της «αριστερής πτέρυγας» της στρατιάς, αποτελούμενης από τα I, II, III και XI Σώματα. Αυτό επιδείκνυε την υψηλή εμπιστοσύνη του Μηντ προς αυτόν, επειδή ο Χάνκοκ δεν ήταν ο ανώτερος τη τάξει αξιωματικός της Ένωσης στο Γκέττυσμπεργκ εκείνη τη στιγμή. Ο Χάνκοκ και ο ανώτερός του διοικητής του XI Σώματος, Υποστράτηγος Όλιβερ Ο. Χάουαρντ, ήρθαν επ' ολίγον σε αντιπαράθεση σχετικά με τον διακανονισμό αυτό για την ηγεσία του στρατεύματος, αλλά ο Χάνκοκ υπερίσχυσε και αυτός οργάνωσε τις αμυντικές θέσεις της Ένωσης στον Λόφο του Κοιμητηρίου, ενώ ανώτερες Συνομοσπονδιακές δυνάμεις ωθούσαν το I και το XI Σώμα σε υποχώρηση μέσω της πόλης. Διέθετε από τον Μηντ την εξουσιοδότηση να αποσύρει της δυνάμεις του, άρα αυτός ήταν υπεύθυνος για την απόφαση να σταθεί και να πολεμήσει στο Γκέττυσμπεργκ. Ο Μηντ κατέφθασε μετά τα μεσάνυχτα και η γενική διοίκηση επανήλθε σ' αυτόν.