Cuando la policía se personó en su domicilio para hacer cumplir la orden de ingreso en prisión, Fernández de Landa se hallaba ausente y en paradero desconocido, motivo por el cual se dictó una orden de busca y captura contra él y también contra Miguel Ángel Hurtado López, otro de los condenados durante el mismo proceso y que había eludido del mismo modo su ingreso en prisión. El 21 de julio de 1983 ambos condenados se presentaron voluntariamente ante La Audiencia Nacional, cuya sección Tercera decretó su inmediato ingreso en prisión, siendo internado en un primer momento en la cárcel de Alcalá Meco y, posteriormente, en la prisión provincial de Zamora, en la que se convertiría, junto con Ricardo Sáenz de Ynestrillas, en el lugarteniente de José Fernández Cerrá, uno de los autores de la matanza de Atocha.