В 1994 Симон Стефани, вместе с группой высших партийно-государственных руководителей во главе с Алией, был привлечён к судебной ответственности, обвинён в злоупотреблении властью и приговорён к 8 годам тюремного заключения. В 1996 было возбуждено новое уголовное дело — по факту преступлений против человечности. Однако после политического кризиса и массовых беспорядков 1997 Стефани был освобождён по амнистии. Три года спустя Симон Стефани скончался.