Zheng Chenggong ("Coxinga"), che era stato adottato dall'imperatore Longwu nel 1646 e nobilitato da Yongli nel 1655, continuò anche a difendere la causa dei Ming meridionali. Nel 1659, proprio mentre Shunzhi si preparava a tenere un esame speciale per celebrare le glorie del suo regno e il successo delle campagne sudoccidentali, Zheng risalì il Fiume Azzurro con una flotta ben armata, prese diverse città ai Qing, e andò così lontano da minacciare Nanchino. Quando l'imperatore venne a sapere di questo improvviso attacco, si dice che abbia squarciato il suo trono con una spada in preda alla rabbia. Ma l'assedio di Nanchino fu rimosso e Zheng Chenggong respinse, Zheng costringendolo a rifugiarsi nella provincia costiera sud-orientale del Fujian. Spinto dalle flotte Qing, Zheng fuggì a Taiwan nell'aprile 1661 e sconfisse gli olandesi nell'Assedio di Forte Zeelandia, espellendoli da Taiwan e fondando il Regno di Tungning. Zheng morì nel 1662. I suoi discendenti resistettero al dominio dei Qing fino al 1683, quando suo nipote Zheng Keshuang consegnò Taiwan all'Imperatore Kangxi dopo la battaglia di Penghu. I principi della dinastia Ming che accompagnarono Coxinga a Taiwan furono il principe di Ningjing, Zhu Shugui, e il principe Zhu Hónghuán 朱弘桓, figlio di Zhu Yihai.