その後、ドキュメンタリー映画の監督として活動を始めたパニュは、1989年に第1作『サイト2：国境周辺にて』を発表。翌1990年には11年ぶりにカンボジアに帰国した。その後もパリを拠点に作品を製作し続け、1994年に発表した初の劇映画『"Neak sre" （ネアック・スラエ）』は第47回カンヌ国際映画祭のコンペティション部門に出品され、1998年の劇映画2作目『戦争の後の美しい夕べ』も第51回カンヌ国際映画祭のある視点部門で上映された。