В составе ирландской сборной Джейсон Макатир принял участие в Чемпионатах мира 1994 и 2002 годов. Именно его гол в ворота голландцев 1 сентября 2001 года позволил ирландцам пробиться на первенство в Японии и Корее. Стоит отметить, что этот матч в Дублине хозяева заканчивали вдесятером. Перед самым началом турнира в сборной произошла ссора между главным тренером Миком Маккарти и капитаном команды Роем Кином, и в результате Кин был отчислен и отправлен обратно домой. Джейсон Макатир выступил в прессе с комментариями по этому поводу, что послужило причиной серьёзной ссоры между ним и экс-капитаном ирландской сборной, однако не помешало команде выйти из группы и пройти в 1/8 финала, где она уступила испанцам.