3 января 2011 года было сообщено, что для участия в голосовании зарегистрировалось 4 млн человек, из которых 95 % проживают в Южном Судане, а оставшиеся 5 % живут либо за границей, либо в северной части Судана. В частности, в граничащем с Югом конфликтном для Судана западном регионе Дарфуре для участия в данном референдуме было зарегистрировано около 23 000 человек, для волеизъявления которых было создано 20 участков по проведению референдума. По данным ООН, всего на конец декабря было зарегистрировано 3,7 миллиона участников голосования непосредственно в Южном Судане, 116 311 в северной части Судана и 60 243 за границей, для волеизъявления которых были созданы участки по проведению референдума в 8 странах: Австралии, Великобритании, Египте, Канаде, Кении, США, Уганде и Эфиопии. 52 % зарегистрированных участников составили женщины.