במלחמה נהרגו 714 מבני הקהילה היהודית בבולגריה, מתוכם 28 קצינים חלקם בכירים. אחוז הנופלים מבני הקהילה היה גדול מאחוז הנופלים בקרב כלל האוכלוסייה הבולגרית, ורבים מהם היו מעמודי התווך של הקהילה. הקהילה היהודית ככל בני העם הבולגרי יצאה מן המלחמה מוכה וחבולה. תקופת אי השקט שלאחר המלחמה הביאה על היהודים צרות נוספות. אחד מחברי מנגנון הטרור ששילח את המפגעים אשר ביצעו את הפיגוע בכנסיית סווטה נדליה באפריל 1925, בו נהרגו 160 בני אדם, היה חיים מרקו פרידמן בן הקהילה היהודית והעניין הוביל לפרץ אנטישמי שהתמקד בבירה סופיה. בתגובת הנגד של משטרו של אלכסנדר צאנקוב, נרצחו מאות אנשי שמאל, בהם גם יהודים. מבין הנרצחים ניתן לציין את העיתונאי יוסף הרבסט (בבולגרית: Йосиф Хербст; 1875 אדירנה, האימפריה העות'מאנית - 1925, סופיה, ממלכת בולגריה, שהיה אחיו של קרל הרבסט), אשר "נעלם" במהלך מעצרו וגופתו מעולם לא נמצאה.