2009年10月，已在拜仁一线队展露头角的穆勒引起了德国国家足球队主教练约阿希姆·勒夫的注意，后者公开表示会考虑将其召入国家队，尽管这遭到了拜仁董事会的反对，但在一个月后，穆勒还是被列入了德国对阵科特迪瓦友谊赛的参赛名单，但没有出场。随后，由于德国队主力守门员罗伯特·恩克自杀身亡，原本在同一周内进行的另外一场对阵智利的比赛被迫取消。由于尝试新球员的比赛机会不足，以及21岁以下国家队正面临参加关键的2011年歐洲U-21足球錦標賽外围赛，勒夫及21岁以下国家队主教练均认为穆勒需要在21岁以下国家队作赛，于是穆勒被召回这一级别国家队。