Am 1. November 1943 wurde er in die Führerreserve des OKH versetzt, wo er vom 16. November bis 14. Dezember am 8. Divisionsführer-Lehrgang teilnahm. Am 18. Dezember 1943 wurde er zur Heeresgruppe Mitte versetzt, wo er am 5. Januar 1944 in den Stab der 291. Infanterie-Division wechselte und zehn Tage später als Nachfolger von Generalleutnant Werner Göritz die Führung dieser Division übernahm. Am 25. März 1944 wurde seine Division, Teil des LIX. Armeekorps (General der Infanterie Kurt von der Chevallerie), mit der gesamten 1. Panzerarmee unter General der Panzertruppe Hans-Valentin Hube bei Kamjanez-Podilskyj in der südwestlichen Ukraine von sowjetischen Truppen eingeschlossen. Hubes Armee konnte sich dann aber bis zum 6. April in der Kesselschlacht von Kamenez-Podolski mit etwa 200.000 Mann in einem wandernden Kessel aus der Umklammerung befreien. Während dieses Ausbruchskampfes wurde Eckholt am 1. April zum Generalmajor befördert und gleichzeitig zum Kommandeur der Division ernannt. Seine Division wurde dann nordöstlich von Lemberg wieder in die Abwehrfront eingegliedert. Am 12. Juli 1944 wurde Eckholt, unmittelbar vor dem Beginn der sowjetischen Lwiw-Sandomierz-Operation, bei Lopatyn so schwer verwundet, dass er den Rest des Krieges, in die Führerreserve versetzt, in verschiedenen Lazaretten verbrachte. Er kam im Mai 1945 im Lazarett in Heiligenstadt (Thüringen) in amerikanische Gefangenschaft, aus der er am 23. Mai 1947 entlassen wurde.