У 2000 році, незважаючи на смерть президента клубу Луїджі Монтаньяні, у «Модени» почався вдалий період з двох вражаючих сезонів поспіль: спочатку клуб вийшов до Серії В, а у наступному сезоні пробився до Серії А вперше за 38 років. Сезон «Модена» почала з принизливої поразки 0-3 від «Мілана», проте невдовзі героїчно перемогла «Рому» з рахунком 2-1. Залишитися в першому дивізіоні команді традиційно вдалося лише в останній день змагань. Проте пониження у класі було неминучим і наступний сезон "жовто-сині" завершили на третьому з кінця турнірної таблиці місці.