当北约介入科索沃战争时，葡萄牙准备在1999年北约轰炸南斯拉夫时提供帮助。作为北约在科索沃维和行动的一部分，葡萄牙提供了军队。在敌对状态结束后，葡萄牙提出了一项稳定科索沃北部塞尔维普雷舍沃山的计划。2008年10月，葡萄牙承认科索沃从塞尔维亚独立。