После Октябрьской революции был назначен комиссаром по продовольствию Александро-Невского района Петрограда. В декабре 1917 года по направлению Народного комиссариата продовольствия был направлен в Западную Сибирь с чрезвычайными полномочиями по заготовке хлеба для Москвы и Петрограда. В Омске Ильмера выбрали в состав Западно-Сибирского Областного совета, назначили комиссаром продовольствия Акмолинской области. После восстания чехословацкого корпуса участник обороны Омска. После ликвидации советской власти в городе ушёл в подполье. Осенью 1918 г. получил задание восстановить разгромленные большевистские организации в Томске и Омске. С 1919 г. член Томского комитета РКП(б), один из руководителей готовившегося восстания против Российского правительства. 4 марта 1919 г. вместе с другими членами подпольного комитета РКП(б) (И. Григорьев, Ян Бредис) арестован, 14 марта — умер от пыток в тюрьме.