Протягом багатьох років грецька частина району озер Преспа була малозаселеною, напіввійськової зоною, для проїзду в яку потрібно було отримувати спеціальний дозвіл. Під час громадянської війни у Греції тут відбувалися запеклі бої і більша частина населення згодом поїхала звідти, щоб уникнути злидні і політичні чвари. До 1970-х, район мало освоювався, пізніше Греція стала залучати в район туристів. Через достаток рідкісної фауни і флори 2000 року район було оголошено транснаціональним парком.