Après la compétition à Londres, Amrabat voit son sélectionneur Éric Gerets limogé par la fédération après une campagne éliminatoire à la Coupe du monde 2014 totalement ratée à la suite de deux matchs nuls face à la Gambie et la Côte d'Ivoire en 2012. Dans la même année, Rachid Taoussi est nommé nouveau sélectionneur. Le joueur joue plusieurs matchs amicaux avant d'être sélectionné pour prendre part à la CAN 2013. Lors de cette Coupe d'Afrique, il participe seulement à deux matchs qui se soldent sur un match nul face à l'Angola et le Cap-Vert avant de voir sa sélection à nouveau être éliminé de la compétition au premier tour. Son sélectionneur Rachid Taoussi sera le prochain sur la liste à être viré par la fédération marocaine de football. Avec une sélection marocaine en pleine crise, loin des années lumières ayant vu les jours lors de la Coupe du monde 1998 ou la Coupe d'Afrique 2004, le Maroc sombre et reste pendant une courte période sans entraîneur au début de 2014 jusqu'en mai où Badou Zaki devient le nouveau sélectionneur de l'équipe du Maroc. Sélectionneur connaissant très bien Nordin Amrabat, il intègre Nordin Amrabat dans son onze de base en le titularisant cinq fois dans des différents matchs amicaux au Maroc. Quelques mois plus tard, l'entraîneur mise de peu en peu sur le néerlando-marocain (trois sélections en 2015), préférant laisser place à Omar El Kaddouri, à ce moment joueur titulaire au SSC Naples. Lors des éliminatoires à la Coupe du monde 2018, Badou Zaki prive Nordin Amrabat des premiers matchs qualificatifs qui prendront une tournure négative, perdant 1-0 face à la Guinée équatoriale à Bata. Le sélectionneur, ayant eu deux années le temps de ramener une nouvelle air à la sélection marocaine, sera limogé.