Военные действия происходили на Крите, в Эгейском море и в Далмации. Большая часть территории Крита была завоёвана османами в первые несколько лет войны, однако столица Крита, Кандия, продолжала сопротивляться ещё длительное время. Внутренние беспорядки в Османской империи и война в Европе не давали османам возможности одержать верх. Осада Кандии заставила обе стороны сосредоточить своё внимание на снабжении. Свою единственную надежду победить венецианцы возлагали на истощение османских запасов, поэтому значительная часть боевых действий происходила на море. На протяжении всей войны Венеция, на стороне которой воевали госпитальеры, Папское государство и Франция, сохраняла общее превосходство на море, однако она так и не смогла полностью перекрыть на Крит поток османских поставок и подкреплений. Затянувшийся конфликт негативно влиял на экономику Венеции, которая базировалась на торговле с Востоком через порты Османской империи.