Dari tahun 1490 hingga 1523 dan dari 1544 hingga 1773, wilayah kadipaten ini dibagi-bagi oleh beberapa anggota Wangsa Oldenburg, terutama oleh Adipati Holstein-Glückstadt (yang juga Raja Denmark) dan Adipati Holstein-Gottorp. Kadipaten ini dianeksasi oleh Kerajaan Prusia pada tahun 1866 setelah Perang Schleswig Kedua.