Kaj Leo Johannesen er også en tidligere færøsk landsholdsspiller i fodbold. Han spillede 4 landskampe for Færøernes A-landshold i 1991 og 1992, heriblandt i kvalifikationerne til EM 1992 og VM 1994. Han var reservemålmand i 18 landskampe, også i den berømte EM-kvalifikationskamp i Landskrona, Sverige, da Færøerne slog Østrig 1-0.