Nos Jogos do Sudeste Asiático de 2005, Phil Younghusband disputou 3 partidas pela Seleção Filipina sub-23, e outros 3 jogos pela equipe sub-21 em 2007. Um ano antes, em novembro de 2006, estreou pela equipe adulta com 4 gols, contra Timor Leste, pelas Eliminatórias da Copa da Ásia.