アフラニウスはタプススの戦いに加わるが、ポンペイウス派は再び敗北した（紀元前46年4月）。その後、彼はファウストゥス・コルネリウス・スッラとともに、マウレタニアを通ってヒスパニアに向かい、そこで古い支持者を集めることを決意した。しかし、彼の2,500人の分遣隊は、カエサル派のプブリウス・シッティウスの待ち伏せに遭い、ほぼ全滅した。アフラニウスは捕らえられた。数日後、兵士の反乱が起こり、アフラニウスはスッラと共に殺された。スエトニウスとフロルスは、これはカエサルの命令によって行われた処刑であったと主張している 。