1 ноября 1994 года состоялся второй в истории съезд НДПУ, в ходе которого были рассмотрены организационные вопросы, решение об участии первых в истории независимого Узбекистана &lt;a href="%D0%9F%D0%B0%D1%80%D0%BB%D0%B0%D0%BC%D0%B5%D0%BD%D1%82%D1%81%D0%BA%D0%B8%D0%B5%20%D0%B2%D1%8B%D0%B1%D0%BE%D1%80%D1%8B%20%D0%B2%20%D0%A3%D0%B7%D0%B1%D0%B5%D0%BA%D0%B8%D1%81%D1%82%D0%B0%D0%BD%D0%B5%20%281994%E2%80%941995%29"&gt;парламентских выборах 1994/1995&lt;/a&gt; на однопалатный Олий Мажлис Республики Узбекистан, а также программа партии на предстоящие выборы. Новым лидером партии был избран Абдулхафиз Марахимович Джалалов. По итогам парламентских выборов, НДПУ как и ожидалось заняла большинство мест и сохранила статус правящей партии в Узбекистане. В период гражданской войны в Таджикистане, Народно-демократическая партия Узбекистана поддерживала Народно-демократическую партию Таджикистана.