Ο Ιγκονέ διορίστηκε Λοχαγός στις 4 Ιανουαρίου 1806 και έγινε Ιππότης της Λεγεώνας της Τιμής στις 14 Μαΐου 1806. Κατά τη διάρκεια της Μάχης του Auerstaedt (14 Οκτωβρίου 1806), ο Λοχαγός Ιγκονέ έδειξε δεξιοτεχνία και τόλμη, αλλά ο αδελφός του, ο Συνταγματάρχης Ιωσήφ Ιγκονέ, πέθανε εκεί (το όνομά του αργότερα θα χαραχθεί στην Αψίδα του Θριάμβου). Διακρίθηκε ακόμα στις 8 Φεβρουαρίου 1807 κατά τη διάρκεια της μάχης του Άιλαου"," όπου τραυματίστηκε και πάλι στο αριστερό πόδι και στην κάτω κοιλιακή χώρα. Το 1809, συμμετείχε στις μάχες του Eckmühl (21-22 Απριλίου 1809) και του Βαγκράμ (5-6 Ιουλίου 1809). Η ηρωική συμπεριφορά του ανταμείφτηκε στις 22 Ιουνίου 1809 με την τοποθέτησή του στο 1ο Σύνταγμα των Πεζικών Γρεναδιέρων στην διάσημη Αυτοκρατορική Φρουρά.