Obwohl verschiedenen Ethnien des Landes generell friedlich zusammen leben, kommt es dennoch auch zu ethnisch basierten Konflikten. Der Biafra-Krieg Ende der 1960er Jahre beruhte auf dem Versuch der Abspaltung der südöstlichen Regionen des Landes, die mehrheitlich von den Igbo besiedelt werden. Der derzeitige Konflikt im Nigerdelta geht vor allem von den Ijaw und Ogoni aus und hat als Hintergründe die ungerechte Verteilung der Öleinnahmen und ökologische Schäden. Der Scharia-Konflikt in Nigeria erreicht seine höchste Intensität im Stammesgebiet der Kanuri.