1762 begann Kossakowski seinen Dienst beim Fürsten von Kurland, Karl von Sachsen, in Mitau, in dessen Diensten er gegen die russischen Truppen kämpfte. Während des Sejms von Repnin 1767/68 kritisierte er den König scharf wegen dessen prorussischer Haltung und zentralistischer Bestrebungen. In der Folge war er Mitglied der Sejmdelegation, die Katharina II. um eine Garantie für den Erhalt Polens bitten sollte. 1768 nahm er an der antirussischen Bewegung Konföderation von Bar teil und organisierte Kampfgruppen für den Aufstand in Litauen.