1982 verlieh man ihm den Staatspreis der UdSSR. 1986 wurde er Sekretär im Schriftstellerverband der UdSSR und Ende des Jahres Chefredakteur der reformfreundlichen Literatur- und Kunstzeitschrift "Snamja" (: Знамя, „Banner“), ferner ein aktiver Kämpfer für die demokratischen Ideale der Perestroika. Aufgrund dieser Aufgaben kam er nicht mehr zum eigenen Schreiben. Ihm zu verdanken ist eine Auflagensteigerung bis 1989 von 220.000 auf 980.000 Exemplare. Bis 1993 war er auch Chefredakteur der Literaturzeitschrift "Zwesda" („Der Stern“), in der viele bis dahin verbotenen Werke (Bulgakows "Hundeherz", Wladimows "Der treue Ruslan" u. a.) veröffentlicht wurden. In diesen Jahren, die als „Perestroika“ in die Geschichte eingingen, bekannte Baklanow: „Eine solche Zeit wie heute hat es für die Literatur während meines ganzen Lebens nicht gegeben.“ Im Frühjahr 1988 trafen er und andere Repräsentanten der Sowjetliteratur in Dänemark die Emigranten Andrei Sinjawski und Lew Kopelew. Außerdem engagierte er sich in der im Frühjahr 1989 gegründeten kritischen Gruppe „Aprel“ („April“) innerhalb des Schriftstellerverbandes (nun der Russischen Sozialistischen Föderativen Sowjetrepublik, kurz: RSFSR), die beispielsweise demokratische Verfahren im Verband anmahnte. So wie er 1979 als Weltkriegsveteran den von der Sowjetarmee geführten Krieg in Afghanistan scharf kritisiert hatte, verurteilte er 1994 und 1999 die beiden Kriege in Tschetschenien. 1997 erhielt er den Staatspreis der Russischen Föderation.