Makarius war 49 Jahre lang Metropolit von Assiut, der Hauptstadt Oberägyptens. Er war eine führende Persönlichkeit in der Öffentlichkeit und führte die Kopten in ihren politischen Bewegungen, zunächst in der Konsolidierungsbewegung von 1910 und später in der nationalen Revolution in Ägypten von 1919.