В ходе Великой Отечественной войны с 2 июля 1941 до 1 февраля 1944 года посёлок был оккупирован немецкими войсками, в период оккупации в окрестностях райцентра действовали советские партизаны. Во время резни на Волыни, которую осуществляли украинские националисты, в Киверцы под защиту немецкой администрации прибывали польские беженцы из уничтоженных УПА окрестных деревень. 13 июня 1943 года отец Казимеж Батовский похоронил 150 поляков, убитых УПА, в соседних колониях в общей могиле на кладбище. В конце июля 1943 года венгерская служба безопасности и голландские коллаборационисты из железнодорожных войск вместе с немецким подкреплением из Луцка отразили нападение УПА на Киверцы. 30 националистов и сопровождающий их украинский православный священнослужитель были взяты в плен и расстреляны.