Dans le contexte des procès des attentats de janvier 2015 en France a lieu le 16 octobre 2020 l'assassinat du professeur Samuel Paty. Le 19 octobre, le journal "Le Point" publie un article du journaliste Clément Pétreault révélant que le rapporteur général de l'Observatoire de la laïcité, Nicolas Cadène, devrait être bientôt remplacé. Soutenu dans des tribunes par la Ligue de l'enseignement, la Ligue des droits de l'homme, la Fédération nationale de la libre pensée et des universitaires spécialistes renommés de la laïcité ou du fait religieux, il conserve finalement son poste. écrit "Libération" dans un retour sur l'affaire en décembre 2020. Le 25 novembre 2020, le même journaliste écrit dans "Le Point" un nouvel article à charge intitulé . L'enquête revient sur une intervention de la Secrétaire d'État chargée de la jeunesse Sarah El Haïry auprès d'élèves réunis par la Fédération des centres sociaux et socioculturels de France qui s'est mal passé. La présidente Radia Bakkouch était présente le même jour que Sarah El Haïry, à la restitution du débat, en tant qu'observatrice et sans intervenir. Laurent Grzybowski, journaliste et père du fondateur Samuel Grzybowski écrit un article dans "La Vie" restituant les échanges, qui déplait à la Secrétaire d’État. L'article du "Point" fait le lien avec les polémiques de 2016 suite à tribune "#NousSommesUnis," et cite longuement l'essayiste Fiammetta Venner, compagne de Caroline Fourest, et Jean-Pierre Sakoun, président de l'association Comité Laïcité République.