Op 31 augustus 2016 vertrekt hij op huurbasis naar Stoke City. Ook in Stoke-on-Trent kan hij geen indruk maken. Na zeven wedstrijden stond hij nog steeds op nul doelpunten. In januari 2017 liet Bony Engeland achter zich om voor Ivoorkust uit te komen op de Afrika Cup, maar na het eindtoernooi speelde Bony geen enkele wedstrijd meer voor Stoke City.