Under Peninsula kampagnen i 1862 blev han igen forfremmet efter sin indsats i Slaget ved Williamsburg og som generalmajor var Hill en af de mest prominente og succesfulde hærchefer i Robert E. Lees Army of Northern Virginia. Hill's "Light Division" (som faktisk var en af de største i hæren) udmærkede sig i Syv dages slaget, Slaget ved Cedar Mountain, Andet slag ved Bull Run, slaget ved Antietam, og Slaget ved Fredericksburg. Hans division var en del af Stonewall Jacksons korps, og efter at Jackson blev dødeligt såret i slaget ved Chancellorsville in maj 1863, overtog Hill kortvarigt kommandoen over korpset og blev selv såret.