扎拉级采用类似后日德兰无畏舰的集中防御布局，主炮塔、弹药库、锅炉室、轮机室等要害部门全部布置在装甲厚重的防御区内。侧舷装甲为特爾尼钢铁厂生产，经克虏伯渗碳工艺表面硬化处理的铬镍合金钢。意大利生产的这种钢材是当时世界最优良的渗碳钢之一：拥有首屈一指的硬度，同时又保持足够的韧度，对大小口径的穿甲弹均具有上佳的防御力。主装甲带在水线处最厚，达，至装甲带边缘处逐渐减薄至。主甲板装甲采用钼钒合金钢，厚。水线装甲带、甲板与前后两块装甲隔壁组成牢固的箱形防御区，装甲隔壁上半厚，下半厚。在主甲板上方另有一层的上层甲板，用来提前引爆来袭的穿甲弹。上层甲板和主装甲带间以一层的上层装甲带相连。四座主炮塔的装甲板均为，炮塔基座也是同样厚度。舰桥司令塔由一圈的表面硬化钢板防护，天盖也有厚。为了抵消厚重装甲带来的头重脚轻问题，扎拉级将前烟囱以后的甲板抬高一级，顺便改善了适海性。