En la Primera batalla de Bull Run, Alexander hizo historia cuando fue la primera persona en usar las banderas de señales durante el combate a larga distancia. Sobre la "Colima de Señales" en Manassas, Alexander vio a tropas estadounidenses y señaló a la brigada bajo el mando del coronel Nathan Evans que prestara atención a su izquierda. Se enviaron refuerzos para cambiar la situación de la batalla a favor de los confederados.