С этого времени Беркли были союзниками могущественного рода Мортимеров, который возглавлял Роджер Мортимер, барон Вигмор. Этот союз был скреплён женитьбой Томаса на дочери Роджера Маргарет в мае 1319 года. Когда многие лорды Марки начали войну против королевских фаворитов Диспенсеров, создававших своё территориальное княжество в этом регионе, Беркли вслед за Мортимерами поддержали это начинание (1321 год). Сначала мятежники принудили Эдуарда II изгнать Диспенсеров, но уже осенью тот смог взять реванш. В феврале 1322 года Морис Беркли покорился; Томас же бежал на север Англии, где присоединился к Томасу Ланкастерскому. 16 марта в битве при Боробридже королевская армия одержала окончательную победу. Томас попал в плен и оказался в заключении в замке Певенси.