A comienzos del año de 1800 sería asignado a Santa Lucía Zacatecoluca como coadjutor de su tío el presbítero y prócer Manuel Aguilar; donde se haría cargo casi por completo de las labores de esa parroquia hasta el año de 1810. Más tarde, en enero de 1811, sería designado cura de Olocuilta; desde donde animaría y apoyaría el primer movimiento indepedentista acontecido el 5 de noviembre de ese año.