A Batalha de Saipan começou em 15 de junho de 1944. Sem a possibilidade de receber mais suprimentos ou reforços, a situação dos defensores era precária mas Saito estava determinado a lutar até o último homem, já que ele tinha conhecimento que a captura de Saipan pelos americanos colocaria as ilhas principais do Arquipélago japonês dentro do alcance dos aviões bombardeiros dos Aliados. Os japoneses usaram várias cavernas vulcânicas da ilha como local para atacar e atrasar o avanço americano defendendo ferozmente suas posições durante o dia e atacando de forma furtiva durante a noite. Os norte-americanos rapidamente desenvolveram tecnicas para limpar as cavernas usando lança-chamas apoiados por artilharia e metralhadoras. Em 7 de julho, os japoneses já não tinham mais para onde recuar e a derrota parecia iminente. Apesar das objeções do Almirante Nagumo, Saito fez planos para um último ataque banzai suicida. Para os últimos civis na ilha, Saitō teria dito: "Já não há mais distinção entre civis e combatentes. Seria melhor para eles se juntarem ao ataque com lanças de bambu do que ser capturados com vida." Mas às 16:15h de 9 de julho, o comandante americano, Almirante Turner, anunciou que Saipan havia sido conquistada por completo. Saitō, ferido por um tiro de artilharia, cometeu suicídio ritual em uma caverna no amanhecer do dia 10 de julho.