В 1801 году придворная церковь стала приходским храмом, а в ходе секуляризации 1802 года была закрыта. Братство и орден в тот период продолжали существовать. В 1913 году город Берг-ам-Лайм был включен в состав Мюнхена; к тому моменту Орден Святого Михаила был преобразован в Орден Заслуги — он был окончательно упразднен посли Ноябрьской революции 1918 года. Братство Святого Михаила существует существовать и в XXI веке.