В XVI веке здесь была создана социнианская школа. События 1636-1650 гг. отражены в местной летописи. Население города принимало участие в восстании Северина Наливайко 1594—1596 гг., восстании Павлюка 1637 года и восстании Хмельницкого 1648—1654 гг.. В 1659 году в битве под Хмельником русско-казацкое войско окончательно победило сторонников низложенного гетмана Ивана Выговского, сделавшего Хмельник на короткий период своей резиденцией.