Osttimor war von Indonesien von 1975 bis 1999 besetzt worden. Am 30. August 1999 organisierten die Vereinten Nationen ein Referendum, bei dem sich die Bevölkerung Osttimors sich deutlich für einen unabhängigen Staat entschieden. Indonesische Sicherheitskräfte und pro-indonesische Milizen (Wanra) überzogen nochmals das Land mit einer Gewaltwelle mit bis zu 3000 Toten, die Infrastruktur wurde zu 75 % zerstört. Die Einwohner wurden vertrieben oder von den Indonesiern zwangsevakuiert und nach Westtimor deportiert. Die Internationale Streitkräfte Osttimor (INTERFET) sorgte ab September wieder für Ruhe und Ordnung und die Indonesier zogen ab, zusammen mit osttimoresischen Unterstützern die nun Racheakte befürchteten. Drei Viertel der Bevölkerung war insgesamt auf der Flucht. Etwa 280.000 Osttimoresen wurden von Indonesien nach Westtimor zwangsdeportiert oder hatten dort Zuflucht gesucht. Viele dieser Osttimoresen blieben auch nach dem Abzug der Indonesier in den Flüchtlingslagern. Es waren die ehemaligen Befürworter des Anschlusses an Indonesien und auch solche, die während der Unruhen Verbrechen gegen ihre Nachbarn verübt hatten. Man befürchtete Repressalien bei einer Rückkehr in die Heimatdörfer.