1996 року став головним тренером збірної Перу. Облітасу не вдалось вивести команду на чемпіонат світу 1998 року, проте він залишився на чолі рідної збірної, якою керував на Кубку Америки 1999 року у Парагваї. На цьому турнірі перуанці вилетіли у чвертьфіналі, після чого Хуан Карлос покинув посаду.