Il a par la suite été transféré au Régiment de fantassins avant qu'il devienne colonel militaires dans l'armée le , avant de se rendre au Canada en 1773. Pendant la descente sur Montréal par les Américains en 1775, le Colonel Prescott, qui avait le grade de brigadier brigadier-général, a essayé de descendre à Québec avec les troupes britanniques et les magasins militaires, mais a été obligé de céder aux Américains le . En , il a été échangé pour John Sullivan. En novembre, il est devenu colonel de son régiment, et en décembre, il est troisième dans le commandement de l'expédition contre le Rhode Island, où il reste à la tête des forces britanniques avant la Bataille de Rhode Island.