Jean Bouvier fu impegnato politicamente. Nel 1935 aderì alla "Jeunesses communistes" (Gioventù comunista) e prese parte al dibattito politico nel periodo del "Front Popolare". Militante del Partito Comunista Francese (PCF), nel 1953, l'anno della morte di Stalin, pubblicò con Jean Gacon un libro intitolato "La vérité sur 1939" in cui si sosteneva che l'Unione Sovietica non avesse mai sottoscritto il Patto Molotov-Ribbentrop. Più tardi riconobbe pubblicamente come errati interventi di questo tipo. Cominciò ad allontanarsi dal PCF in occasione della repressione della rivoluzione ungherese del 1956 e ruppe definitivamente col partito nel 1969, durante il Maggio francese. Alla fine della sua vita le sue posizioni politiche erano vicine a quelle dei socialisti riformisti.