У 1986 році, перебуваючи на чолі Державної ветеринарної служби України, П. П. Достоєвський з перших днів брав активну участь у ліквідації наслідків аварії на Чорнобильській АЕС, організував і провів евакуацію худоби, налагодив дослідження тваринницької продукції в уражених областях на вміст радіонуклідів, очолив групу вчених з розробки рекомендацій щодо ведення тваринництва на забруднених територіях.