Na počátku 90. let produkce prakticky všech plodin poklesla v důsledku války v Náhorním Karabachu. Konflikt v Náhorním Karabachu, kde se nachází asi třetina ázerbájdžánských orných půd, podstatně snížil zemědělskou produkci v Ázerbájdžánu. K recesi v zemědělské oblasti opět došlo v roce 2020, kdy se konflikt v Náhorním Karabachu opakoval. V roce 1990 přerušení práce a protisovětské demonstrace také přispěly k poklesu zemědělské produkce.