De retour de prêt, il joue le rôle de doublure de Carlos Kameni. Après l'hiver 2006 et le retour de la CAN de celui-ci, la concurrence s'installe et les deux joueurs partage le temps de jeu. Gorka Iraizoz joue plus particulièrement les matchs de Coupe d'Espagne qu'il remporte et de la Coupe UEFA. Il prend part à trente-deux rencontres dont vingt-et-une en championnat.