메달리스트에 대한 시상식은 2020년 하계 올림픽 폐막식 행사 중 치러졌다. 이번 올림픽에서는 처음으로 여자 부문 시상식도 치러져, 여자 마라톤 부문 금메달리스트인 케냐의 페레스 등에 대한 시상식이 진행된 이후, 남자 마라톤 부문 시상식이 진행되었다. 이에 따라 도쿄 올림픽 스타디움에는 케냐의 국가가 두 차례 울려퍼졌다.