År 1945 ställdes Raeder inför rätta vid Nürnbergprocessen. Han anklagades för en rad krigsförbrytelser, bland annat för att ha beordrat avrättning av skeppsbrutna allierade soldater. Han dömdes till livstids fängelse, men bad domstolen om att få bli avrättad, av "barmhärtighetsskäl". Ansökan avslogs, då tribunalen inte hade befogenhet att skärpa straffet. Raeder fördes, i likhet med de sex andra frihetsberövade männen, till Spandaufängelset i Berlin i juli 1947. Han kom dock att friges den 26 september 1955 av hälsoskäl.