Intorno al 1590, Toyotomi Hideyoshi pretese che il Regno delle Ryūkyū lo appoggiasse nella sua campagna per la conquista della Corea. In caso di successo, Hideyoshi si sarebbe mosso successivamente contro la Cina. Siccome il Regno delle Ryūkyū era uno stato tributario della dinastia Ming, la richiesta fu rifiutata. Lo shogunato Tokugawa che emerse dopo la caduta di Hideyoshi autorizzò la famiglia Shimazu — signori feudali del Dominio di Satsuma (attualmente Prefettura di Kagoshima) — ad inviare una forza di spedizione per conquistare le Ryūkyū. La successiva invasione ebbe luogo nel 1609. L'occupazione fu abbastanza rapida, incontrando un minimo di resistenza armata, ed il re Shō Nei fu portato prigioniero nel dominio di Satsuma e successivamente ad Edo (odierna Tokyo). Quando fu liberato due anni dopo, il Regno delle Ryūkyū ottenne una certa autonomia; Satsuma però mantenne il controllo di alcuni territori del Regno delle Ryūkyū, in particolare l'Arcipelago Amami-Ōshima, che furono incorporati nel dominio di Satsuma e rimangono ancora oggi parte della Prefettura di Kagoshima, anziché di Okinawa.