L'année suivante, il réalise le temps de 8 min 06 s 46 sur 3 000 m steeple à l'occasion du meeting de Zurich, et ce après avoir été victime d'une chute dans le dernier tour. Vainqueur des sélections du Kenya devant les grands spécialistes mondiaux de la discipline que sont Patrick Sang, Peter Koech ou Julius Kariuki, il se qualifie pour ses premiers Championnats du monde. Le , à Tokyo, Moses Kiptanui s'adjuge le titre mondial du 3 000 m steeple en 8 min 12 s 59, devançant de près d'une seconde son compatriote Patrick Sang et de près de trois secondes l'Algérien Azzedine Brahmi. Blessé au genou au début de la saison 1992, il ne termine que quatrième des sélections olympiques kényanes et n'obtient pas son billet pour les Jeux de Barcelone où trois de ses compatriotes réalisent un triplé historique. Il s'illustre néanmoins lors des meetings suivants an battant le record du monde du 3 000 mètres en 7 min 28 s 96, le à Cologne, puis celui du 3 000 m steeple en 8 min 02 s 08 trois jours plus tard à Zurich, améliorant de plus de trois secondes l'ancienne meilleure marque mondiale de Peter Koech établie en 1989.