Большинство его родственников и друзей были лоялистами, однако Моррис, когда началась Американская революция, принял сторону патриотов. Он служил в ополчении, избирался в конгресс штата и Континентальный конгресс. После поражения на выборах в Палату представителей в 1779 году переехал в Филадельфию, где работал адвокатом. На Филадельфийском конвенте брал слово чаще любого другого. Отстаивал создание сильного федерального правительства, которым должна будет руководить состоятельная элита.