В декабре 1917 года направлен на работу во Всероссийскую чрезвычайную комиссию по борьбе с контрреволюцией и саботажем при Совете народных комиссаров РСФСР (ВЧК), где занимал пост комиссара ВЧК по вопросам типографий. В 1918—1919 годы был сотрудником Отдела по борьбе с должностными преступлениями. В июле 1918 года во время восстания левых эсеров был арестован вместе с Ф. Э. Дзержинским. В 1921—1922 годы был членом коллегии ВЧК. В 1921—1922 годы был начальником спецотделения при Президиуме ВЧК (с марта 1922 по 1 октября 1928 года при Коллегии ГПУ-ОГПУ). Был ответственным за охрану высшего руководства СССР, в том числе В. И. Ленина. По рекомендации Беленького Дзержинскому Ф. Э. в Горки в 1922 году была набрана группа охраны В. И. Ленина, примерно из 20 человек. Старшим группы был П. П. Пакалн. В группу входили Аликин Сергей Николаевич, Бельмас Александр Васильевич, Соколов Семён Петрович, Пидюра Макарий Яковлевич, Балтрушайтис Франц Иванович, Иванов Георгий Петрович, Казак Тимофей Исидорович, Кулик, Проценко и др.&lt;br&gt;