Lokajski wurde Soldat im Zweiten Weltkrieg und geriet als Zugführer im 35. Infanterieregiment beim polnischen Brest in sowjetische Kriegsgefangenschaft. Er konnte im Dezember 1939 fliehen und entging damit dem Schicksal der anderen Offiziere, die im Mai 1940 von den Sowjets im Massaker von Katyn ermordet wurden. Neben seiner Tätigkeit am Mikołaj-Rej führte er ein kleines Fotogeschäft. Lokajski war auch Lehrer in den Untergrundschulen des polnischen Widerstands, da die deutschen Okkupanten polnische Sportwettkämpfe verboten hatten. Sein Bruder Józef Lokajski kam 1943 als Widerstandskämpfer in Warschau um und Eugeniusz Lokajski wurde im Januar 1944 unter dem Decknamen „Brok“ in der Armia Krajowa vereidigt.