I dubbel nåddes hans bästa placering, en 90:e plats, i början av november 2006. I OS 2008 i Peking vann Wawrinka guldet i herrdubbel tillsammans med Roger Federer. De tappade bara ett set under hela turneringen. Setförlusten kom i finalen mot det svenska paret Simon Aspelin / Thomas Johansson, där schweizarna vann med setsiffrorna 6-3, 6-4, 6-7(4), 6-3.