2007 erreichte er mit der Mannschaft das Viertelfinale der Südamerikameisterschaft, das gegen die Auswahl Argentiniens mit 0:4 verloren wurde. 2011 gewann er mit der Mannschaft das Spiel um Platz 3 mit 4:1 gegen die Auswahl Venezuelas. Mit seinen Treffern zum 2:0, 3:1 und 4:1 gelangen ihm insgesamt fünf Turnier-Tore, womit er Torschützenkönig des Turniers wurde. 2015 wiederholte er mit der Mannschaft den Erfolg von 2011, als er mit dieser am 3. Juli mit 2:0 gegen die Auswahl Paraguays gewann und mit dem Treffer zum Endstand in der 89. Minute beitrug. Mit vier Toren in sechs Turnierspielen war er treffsicherster Torschütze, wobei ihm beim 3:1-Sieg im gegen die Auswahl Boliviens ein Hattrick gelang. Bei der vom 3. bis 26. Juni 2016 in den Vereinigten Staaten ausgetragenen Copa América Centenario 2016 – aus Anlass des 100-jährigen Bestehens der Copa América – avancierte Guerrero mit dem Treffer zum 1:0-Endstand im ersten Gruppenspiel gegen die Auswahl Haitis mit seinem 27. Länderspieltor zum alleinigen Rekordtorschützen seines Landes.