Bei der Schlacht um Berlin zum Ende des Zweiten Weltkriegs wurde das Gebäude aufgrund seiner unmittelbaren Nähe zum Reichstagsgebäude bombardiert und stark beschädigt. Dabei wurden das Archiv und die Bibliothek sowie fast das gesamte Vermögen des VDI vernichtet. Mit der wegen seiner Zugehörigkeit zum NS-Bund Deutscher Technik verfügten Vereinsauflösung des VDI vom 22. November 1945 durch den Alliierten Kontrollrat wurde das VDI-Haus mitsamt Grundstück auf Basis des Kontrollratsgesetzes Nr. 2 vom 10. Oktober 1945 beschlagnahmt. Nach den Planungen von Albert Speer zur Umgestaltung der Reichshauptstadt wäre das VDI-Haus abgerissen worden.