Le 17 ou , le kapétan Constantín Lachaná déclencha à Vathy l'insurrection contre les Ottomans. Lykoúrgos, qui avait quitté Smyrne le , débarqua sur Samos le 24 du même mois. Le , était créée l'« Organisation Militaire et Politique de l'Île de Samos » () et Lykoúrgos en devenait « Administrateur Universel et Général » (). En , la milice samiote repoussa la tentative ottomane de débarquement menée par le capitan pacha (amiral de la flotte ottomane), Kara-Ali. Lykoúrgos fut promu « Archigénéral de Samos » () par Dimítrios Ypsilántis.