Manfredi terbunuh di Pertempuran Benevento pada tanggal 26 Februari 1266 ketika bertempur melawan saingan dan penggantinya Carlo I dari Sisilia. Carlo menangkap Eleni dan memenjarakannya. Dia hidup lima tahun kemudian di penangkaran ke kastel Nocera Inferiore di mana dia meninggal pada tahun 1271.