Leta 1499 so med italijanskimi vojnami francoske čete napadle vojvodstvo Milano. Kralj Ludvik XII. Francoski se je dogovoril, da bodo Bellinzono prepustili konfederaciji, da bi si zagotovili podporo svojih plačanih kontingentov. Po koncu kampanje pa ni izpolnil obljube in je utrdbe zasedel s 1000 možmi. Naslednjo zimo je izbruhnil upor v vojvodstvu Milano, v Bellinzoni se je prebivalstvo dvignilo proti kralju in pregnalo francoske okupatorje. Po zajetju vojvode Ludovica Sforze (izdaja Novare) so se prebivalci bali maščevanja Francozov in se 14. aprila 1500 podredili vladavini konfederalcev. Po miru v Aroni leta 1503 sta Francija in Milano kantone Uri, Schwyz in Nidwalden potrdila kot nove vladarje Bellinzone.