Nach dem Besuch des Gymnasiums in Münster studierte Ferdinand Werne seit 1819 an der Universität Bonn Rechtswissenschaften. 1820 wurde er Mitglied des Corps Guestphalia Bonn. Von 1822 bis 1823 beteiligte er sich am griechischen Freiheitskampf gegen die Osmanen. Er trat in den diplomatischen Dienst Preußens ein. Während der großen Pest von 1836/37 verweilte er in Konstantinopel. Danach wurde er Kanzler bzw. Vizekonsul des preußischen Konsulats in Alexandria.