Entrò a far parte dell'esercito e combatté nelle guerra di Granada. Dopo che la conquista di Granada fu completata nel 1492, Mendoza avanzò di grado e prestò servizio nella seconda guerra italiana, dove si distinse al servizio di Gonzalo Fernández de Córdoba, ""el Gran Capitán"." Giocò un ruolo importante nella battaglia di Ruvo e nella presa di Melito nel regno di Napoli, per il quale fu nominato nel 1506.