Sobrino de Fernando de Ávalos, Alfonso sucedió a su tío en el mando de las tropas del emperador Carlos. En 1532 combatió en Austria contra las tropas de Solimán el Magnífico durante la Pequeña Guerra en Hungría. Participó en las distintas expediciones de Carlos V, como en la Jornada de Túnez. Combatió en la Batalla de Pavía y mandó el ejército español e imperial de Carlos V en la Guerra italiana de 1542-1546. En 1543 consiguió levantar el sitio que Jeireddín Barbarroja y Francisco de Borbón, conde de Enghien, habían puesto a Niza. En la Batalla de Cerisoles en abril 1544, fue derrotado por las tropas francesas a las órdenes del mismo Francisco de Borbón, aunque en junio conseguiría una importante victoria en la Batalla de Serravalle.