Pendant l'Occupation, les Allemands ne commettent aucune exaction sur la commune de Guiscriff, ce qui ne sera pas le cas pour les communes voisines. Parmi les français qui perdent la vie à Mers el Kebir lors de l'attaque de la marine française par la Royal Navy, figurent les noms de trois guiscrivites : François Jamet, André Le Scouarnec et Gabriel Le Ster. Neuf guiscrivites meurent en captivité en Allemagne. Quatre autres décèdent des suites des séquelles de leur captivité en Allemagne. Enfin François Gleyen, prisonnier en Allemagne, est tué par un soldat américain sur le chemin du retour après être descendu d'un train pour aller chercher de l'eau et être entré dans une zone interdite. Plusieurs guiscrivites entrent dans la Résistance au sein des FFI et des FTP. Dix d'entre eux y perdront la vie, soit fusillés par les Allemands, soit tués au cours des combats de la Libération. En effet, environ 80 maquisards guiscrivites, sous les ordres de Gérard de Carville, prendront part aux combats de libération de la ville de Rosporden. Enfin deux guiscrivites meurent en déportation dans les camps d'extermination en Allemagne : René Nicolas Hamon et Louis Marie Guillemot.