Efter 11. september 2001 omfatter luftovervågningen ikke kun militær flyvning, men også den civile lufttrafik med henblik på at afværge mulige terrorhandlinger. CAOC Finderup skal desuden i givet fald kunne stille trænet personel til rådighed i forbindelse med NATO-ledede luftoperationer overalt på kloden. I krise- og krigstid vil chefen for CAOC Finderup overtage kommandoen over de flystyrker, som landene tildeler NATO.