2009年3月22日，在2008-09赛季西甲联赛第28轮，巴塞罗那在主场迎战马拉加。哈维在这场比赛里打入1球并3次助攻队友，巴塞罗那以6比0大胜马拉加。2009年5月2日，在2008-09赛季西甲联赛第34轮，皇家马德里和巴塞罗那的国家德比中，哈维4次助攻队友，帮助巴萨以6比2客场战胜皇家马德里。2009年5月28日，哈维在欧洲冠军联赛决赛中助攻梅西，最终巴塞罗那以2比0战胜曼联，完成“三冠王”伟业。赛后，哈维被欧足联评为全场最佳。哈维也成为本届欧洲冠军联赛的助攻王。