Blanco fit sa première sélection en équipe nationale contre l'Uruguay le février 1995 et a participé à trois Coupes du monde, France 1998 ainsi que Corée-Japon 2002 et Afrique du Sud 2010. Le Mexique a été sorti en huitièmes de finale dans ces trois compétitions. Il a également remporté la Coupe des confédérations disputée au Mexique en 1999 où il a été le meilleur buteur du tournoi et a attiré beaucoup d'attention à la fois des clubs espagnols et allemands. Il gagna aussi les Gold Cups 1996,1998 et 2009.