ฟุตบอลในประเทศสโลวีเนียอยู่ภายใต้การดูแลของสมาคมฟุตบอลสโลวีเนีย () โดยมีทีมชาติเข้าร่วมแข่งขันในระดับนานาชาติมาตั้งแต่ ค.ศ. 1991 ซึ่งเป็นปีที่ยูโกสลาเวียล่มสลาย ฟุตบอลทีมชาติสโลวีเนียเคยเข้าร่วมแข่งขันรายการใหญ่ทั้งหมดสามครั้ง ได้แก่ ฟุตบอลชิงแชมป์แห่งชาติยุโรป 2000, ฟุตบอลโลก 2002 และ ฟุตบอลโลก 2010) ลีกฟุตบอลสูงสุดของสโลวีเนียคือปราวาลีกาหรือเฟิสต์ลีก รองลงมาคือเซคันด์ลีกและเทิร์ดลีก การแข่งขันฟุตบอลถ้วยในประเทศได้แก่สโลวีเนียนฟุตบอลคัพ สโมสรที่มีชื่อเสียงของประเทศคือ มารีบอร์ ซึ่งเคยเข้าร่วมแข่งขันในรอบแบ่งกลุ่มยูฟ่าแชมเปียนส์ลีก