Newton revient au manoir entre 1665 et 1667, à la suite de la fermeture de l’Université de Cambridge des suites de la grande peste de Londres. Inspiré entre autres par les Platoniciens de Cambridge de l'époque, il y mène d'importantes études scientifiques révolutionnaires pour son époque, d'observations, d'expérimentations, et de découvertes, durant deux ans d'isolement obsessionnelle autodidacte quasi total, sur la Philosophie naturelle, l'algèbre, la mécanique, l'optique..., ou il formule entre autres ses travaux de Formule du binôme de Newton, d'Identités de Newton, de lumière, et d’optique... L' est considérée comme "« année de merveilles »" ou "« année des miracles »", en latin, à la suite de ses importantes découvertes de la Révolution scientifique.