Unfähig, die türkischen Truppen in der Schlacht um Baku zu stoppen, ließ Dunsterville die Stadt nach sechs Wochen Belagerung am 14. September räumen, um sich in den Iran zurückziehen. Ein Großteil der armenischen Bevölkerung floh mit den britischen Truppen. Die osmanische Armee des Islams und ihre aserbaidschanischen Alliierten, geführt von Nuri Pasch, betrat am 15. September Baku und tötete als Revanche für die März-Tage zwischen 10.000 und 20.000 Armenier. Die Hauptstadt der ADR zog dann endgültig von Gəncə nach Baku. Doch nach dem Waffenstillstand von Mudros zwischen Großbritannien und der Türkei vom 30. Oktober, wurden die türkischen Truppen durch Alliierte ersetzt. Angeführt von General William Montgomery Thomson, der sich zum Militärgouverneur Bakus erklärte, kamen am 7. November 5000 Soldaten des Commonwealths in Baku an. Auf Thomsons Befehl wurde das Kriegsrecht in Baku verhängt.