Quando i lahar raggiungono le aree popolate, possono causare danni difficilmente quantificabili alle persone. I flussi piroclastici potrebbero avere un effetto non trascurabile sui ghiacciai che circondano il vulcano: non si deve infatti dimenticare il triste avvenimento passato alla storia come tragedia di Armero del 1985 in Colombia, causata da una piccola eruzione sotto la calotta glaciale sommitale del Nevado del Ruiz. Le colate di fango del Glacier Peak rappresentano una minaccia simile per le piccole comunità di Darrington e Concrete e una minaccia minore per le città più grandi e in rapida crescita di Mount Vernon e Burlington, così come altre comunità lungo il corso inferiore dello Skagit e del Stillaguamish. Uno studio del 2005 condotto dallo United States Geological Survey ha identificato nove vulcani delle Cascate, incluso il Glacier Peak, come "vulcani ad altissima minaccia che necessitano un monitoraggio inadeguato". Al momento dello studio, sul Glacier Peak era installato un solo sismometro che non "funzionava da due anni".