28 августа 1810 года Венегас прибыл в Веракрус, и 13 сентября официально вступил в должность в Мехико. Одним из первых своих указов он приостановил взимание налогов с индейцев и мулатов. Всего через пару дней Мигель Идальго и Костилья поднял в Мексике антииспанское восстание. Венегас сразу понял, что дело принимает серьёзный оборот, и тут же двинул на подавление восстания всю армию, включая столичный гарнизон. Он назвал повстанцев "инсургентами" (insurgentes), и это слово вошло в историю Мексики. К лету 1811 года Венегасу удалось разгромить основные силы повстанцев и схватить их лидеров, но вскоре восстания охватили всю Новую Испанию, выдвинув новых вождей.