In der gemeinsamen deutschen Nationalmannschaft spielte Waldemar Pappusch bei der Feldhandball-Weltmeisterschaft (WM) 1959 (Weltmeister) und der Hallenhandball-WM 1961 (4. Platz). Für die Nationalmannschaft der DDR spielte er bei der Feldhandball-Weltmeisterschaft (WM) 1963, bei der er mit der Mannschaft der DDR Weltmeister wurde, und bei der Hallenhandball-WM 1964. 1963 wurde ihm der Vaterländische Verdienstorden in Bronze verliehen.