Im Februar 2018 lief Jannik Arbogast bei den Deutschen Leichtathletik-Hallenmeisterschaften in Dortmund über 3000 Meter auf den 7. Platz, im Juli 2018 belegte er bei den Deutschen Leichtathletik-Meisterschaften in Nürnberg im 5000-Meter-Lauf den 8. Platz, gefolgt von seinem bislang größtem Erfolg, dem trotz unregelmäßigen Lauftraining über den Sommer überraschenden Gewinn der Deutschen Meisterschaften im 10-km-Straßenlauf im September 2018 in Bremen. Dort konnte er sich ohne große Erwartungen im Vorfeld erst auf den letzten Metern aus einer vierköpfigen Spitzengruppe entscheidend absetzen. Bei den Crosslauf-Europameisterschaften 2018 in Tilburg musste Jannik Arbogast kurzfristig seinen Start wegen eines Infekts absagen.