탈레반이 지배 세력을 확장하면서 2001년까지 북부동맹을 후퇴시키고 같은 해 9월 9일에는 북부동맹의 아흐마드 샤 마수드를 암살했다. 그러나 9.11 테러 사건 발발 직후 9.11 테러 사건의 배후로 지목된 오사마 빈라덴과 알카에다의 신병 인도를 거부하면서 미국을 비롯한 다국적군의 공격을 받게 되었다. 결국 2001년 북부동맹에 밀려 소멸하였으나 2021년 탈레반 공세로 인해 20년만에 부활하였다.