Selon une tradition rapportée par le seul Hérodote , en 545 av. J.-C. Pisistrate débarque à Marathon, marche sur Athènes et met en place pour la deuxième fois une tyrannie. Mais le dème est davantage connu pour être le site de la bataille de Marathon, se déroulant en 490 av. J.-C. pendant la Première guerre médique sur la plaine du dème. Dans cette confrontation les hoplites athéniens et platéens remportent la victoire sur un débarquement perse. C'est à l'issue de cette bataille que se forge l'histoire de Philippidès, soldat athénien dont le parcours serait à l'origine du marathon moderne, en allant annoncer la victoire de l'armée athénienne aux Athéniens. Cependant, cette construction antique tient de la légende.