Efter att Inbördeskriget i Sierra Leone tog slut i januari 2002 gick han under jorden. Med största sannolikhet tog han sig över gränsen till Liberia men därefter upphör spåren efter honom. Vid ett flertal gånger har han påståtts vara död men detta har aldrig kunnat bekräftas. Den 7 mars 2003 väcktes åtal mot Koroma vid Specialdomstolen för Sierra Leone för bland annat Brott mot mänskligheten. Han har sedan dess varit internationellt efterlyst men sökandet efter honom har än så länge varit resultatlöst. Redan den 1 juni 2003 förklarades han officiellt död i grannlandet Liberia under oklara omständigheter. Åtalet mot honom kvarstår.