Tšekin maajoukkueessa Srníček pelasi 49 A-maaottelua vuosina 1994–2001. Hän oli mukana saavuttamassa EM-hopeaa 1996 sekä Maanosaliittojen cup -pronssia 1997 ja kuului joukkueeseen myös EM-kilpailuissa 2000.