După război, a studiat jurnalismul la Universitatea Carolină din Praga și apoi a lucrat mai mulți ani la Radio Praga. Lucra ca jurnalist în Israel în timpul Războiului de Independență, atunci când a întâlnit-o pe viitoarea sa soție, care era, la momentul respectiv, voluntară în cadrul Haganah. El a fost unul dintre principalii critici ai regimului comunist, în iunie 1967, la cea de-a patra Conferință a Scriitorilor, și a renunțat la calitatea de membru al Partidului Comunist după Războiul din Orientul Mijlociu din același an, în semn de protest față de ruperea relațiilor Cehoslovaciei cu Israelul. Cu toate acestea, ca urmare a invaziei conduse de sovietici în 1968 care a pus capăt politicii reformatoare cunoscute sub denumirea de Primăvara de la Praga, el a părăsit țara, mai întâi în Iugoslavia, apoi în Israel și, mai târziu, în 1970 în Statele Unite ale Americii. A petrecut anul universitar 1970-1971 ca cercetător al la Universitatea din Iowa. După destrămarea regimurilor comuniste din Europa de Est în 1989, și-a împărțit timpul între Praga și Washington, D.C., unde a continuat să predea la . După retragerea sa de la American University în 2003, a locuit doar Praga. I s-a oferit un apartament în Cetatea din Praga de către președintele Václav Havel și a fost onorat pentru contribuția sa la cultura cehă în 2006, cu prilejul împlinirii a 80 de ani de viață. Lustig a fost cel de-al optulea laureat al Premiului Franz Kafka (2008) și al treilea laureat al Premiului Karel Čapek (1996).