Dopo la prima stagione nel 2005, "Dr. House" ha ricevuto cinque nomination per gli Emmy Award, di cui tre sono Creative Arts Emmy. Non ha vinto l'Emmy come "migliore serie drammatica", ma ha vinto il premio come "migliore sceneggiatura di una serie drammatica". L'anno successivo la serie è stata nominata per quattro Emmy Award, tra cui quello per la "migliore serie drammatica", tuttavia "Dr. House" non ha vinto nessun Emmy quell'anno, in quanto il premio per la migliore serie drammatica fu vinto da "24". Nel 2007 la serie ha ricevuto quattro nomination e ha vinto un Creative Arts Emmy per il trucco. L'anno successivo, al sessantesimo Primetime Emmy Award, la serie ha ricevuto nuovamente quattro nomination. Queste nomination comprendevano i riconoscimenti per la "migliore serie drammatica" per l'episodio "Gelo". Katie Jacobs e David Shore inizialmente volevano segnalare "La testa di House", ma in seguito scelsero "Gelo" perché, come ha spiegato Katie Jacobs, "La testa di House" era un "pezzo divertente di TV" per gli spettatori, ma ella e David Shore pensavano che non fosse adatto per l'Academy. La serie quell'anno ha vinto un solo Primetime Emmy per Greg Yaitanes, come "migliore regia in una serie drammatica" nella direzione dell'episodio "La testa di House". Hugh Laurie, che recita come attore principale, è stato nominato come "migliore attore di una serie drammatica" tre volte (nel 2005, nel 2007 e nel 2008), ma non ha mai vinto nessun Premio Emmy.