Der erste Erfolg einer burkinischen Jugendnationalmannschaft gelang, als sich die U-17-Junioren ("Étalons cadets") für die WM 1999 in Neuseeland qualifizieren konnten. Das Team kam aber nicht über die Gruppenphase hinaus. Beim nächsten Turnier 2001 in Trinidad und Tobago gelang allerdings ein großer Erfolg, als Argentinien im Spiel um den 3. Platz besiegt werden konnte. Herausragende Spieler waren dabei Wilfried Sanou und Madi Panandétiguiri. Die U-20-Nationalmannschaft ("Étalons juniors") konnte sich zwei Jahre später für die WM 2003 in den Vereinigten Arabischen Emiraten qualifizieren und dort ins Achtelfinale einziehen. Der größte Erfolg einer Jugendauswahl Burkina Fasos gelang unter Trainer Rui Vieira mit dem Titelgewinn bei der U-17-Afrikameisterschaft 2011 in Ruanda.