Persianlajhden sodan alkaessa vuonna 1991 Karpinski lähetettiin Saudi-Arabiaan. Komennus kesti vain lyhyen aikaa, mutta hän jäi sen jälkeen kouluttamaan reserviläisiä ja toimien neuvonantajana Yhdistyneissä arabiemiirikunnissa naisten kouluttamiseksi asevoimien tarpeisiin. Vuonna 1997 hän palasi jälleen reserviin ja alkoi työskennellä siviilielämässä.