Alisson nastupoval za Brazílii na různých mládežnických úrovních předtím, než v roce 2015 debutoval v reprezentačním áčku. Za to odehrál Copu América Centenario v roce 2016, Mistrovství světa v roce 2018 v Rusku a Copu América v roce 2019, kterou s týmem vyhrál a dokonce byl vyhlášen jako nejlepší gólman soužete.