Nach der Machtübernahme verlor der Ehemann alle seine Ämter und Stellungen. Die Nazis durchsuchten mehrfach das Haus der Familie und Hanna Gerig und ihr Mann wurden wiederholt verhört. Sie konnte für eine Bremer Firma als Vertreterin im Verkauf für Kaffee arbeiten, schrieb vereinzelt kleine honorierte Beiträge für die Kirchenzeitung und gab nebenbei noch Klavierunterricht um den finanziellen Notstand zu überbrücken. Der Versuch, in Deutz mit einem Feinkostladen wieder finanziell Fuß zu fassen, wurde durch einen von der NSDAP organisierten Boykott vereitelt. Heimlich hielten beide weiterhin Kontakt zu politischen Bekannten, so auch zum Kölner Kreis. Nach dem Attentat auf Hitler wurde ihr Mann bei der Aktion „Gitter“ mit anderen ehemaligen Reichstagsabgeordneten und Politikern demokratischer Parteien (u. a. Konrad Adenauer, Josef Baumhoff, Peter Schlack, Joseph Roth und Hubert Peffeköver) verhaftet und in das Arbeitserziehungslager in den Messehallen in Köln-Deutz überführt. Hanna Gerig kämpfte mit allen Mitteln um ihren Mann und um seine Mitgefangenen, doch am 16. September 1944 wurde Otto Gerig zusammen mit Baumhoff, Schlack, Roth und Peffeköver ins KZ Buchenwald überführt. Dennoch engagierte sie sich weiterhin so sehr für die Gefangenen in Deutz, dass die Lagerleitung ihr damit drohte, sie und ihre Kinder ebenfalls zu inhaftieren. Das brachte ihr unter den Gefangenen den Namen "Engel der Messehallen" ein. Nachdem sie nach längerer Zeit erfahren hatte, dass ihr Mann im KZ umgekommen war, und ihr erneut mit KZ-Haft gedroht wurde, versteckte sie sich mit ihren Kindern außerhalb von Köln bei Johann Peffeköver, dessen Bruder Hubert ein Mitgefangener aus dem Lager Deutz und dem KZ-Buchenwald war.