Pendant la Seconde Guerre mondiale, des ateliers de réparation de chars de la Waffen SS ont été installés dans l'Arsenal. Plusieurs bâtiments ont été gravement endommagés par les bombes au cours des deux dernières années de la guerre. Pendant la bataille de Vienne, du 7 au 9 avril 1945, la Division SS "Totenkopf" a défendu le site, combats par lesquels l'Armée rouge a subi de lourdes pertes avant sa victoire .