Pour la Coupe du monde 2006, l’équipe d'Indonésie est battue au tour de la phase qualificative par l’Arabie Saoudite et le Turkménistan tout en étant devant le Sri Lanka. À la Coupe d'Asie des nations de football 2007, en tant que pays coorganisateur, elle est battue au , faisant une victoire contre Bahreïn (2-1, buts de Bambang Pamungkas et de Budi Sudarsono) et deux défaites contre l’Arabie Saoudite (1-2, but d’Elie Aiboy) et contre la Corée du Sud (0-1).