Veel van de kerkelijke schatten gingen verloren tijdens de bezetting van Moskou door de legers van de Pools-Litouwse alliantie in 1612. De kerk werd eveneens beschadigd door de Drievuldigheidsbrand, een grote brand in het Kremlin in 1737. De daaropvolgende restauraties werden vervolgens door de Franse bezetting van Moskou in 1812 weer tenietgedaan toen de Franse troepen de kathedraal plunderden en het godshuis als legerbarak gebruikten. Opnieuw volgde een restauratie in de jaren 1815-1820.