Anfang der 1600er-Jahre hatte England mit Frankreich und Spanien Frieden geschlossen und die Küstenfestungen wurden nur noch wenig gepflegt. Im englischen Bürgerkrieg der 1640er-Jahre wurde Calshot Castle von den Roundheads gegen die Truppen König Karls I. gehalten und war mit einer 15 Mann starken Garnison zu jährlichen Kosten von £ 107 belegt. Das Parlament hielt die Festung für wichtig und versorgte sie weiterhin mit Munition. Anders als etliche andere Forts in der Gegend hielt das Parlament Calshot Castle einsatzbereit, vermutlich wegen seiner wichtigen Rolle beim Schutz von Southampton Water. Während des spanischen Erbfolgekrieges Anfang des 18. Jahrhunderts war es mit 25 Kanonen ausgestattet.