Eynatten avancierte Mitte Januar 1868 zum Major und Kommandeur der I. Abteilung, die er 1870/71 im Krieg gegen Frankreich in den Schlachten bei Spichern, Colombey und Gravelotte sowie vor Metz, Montmédy und Mézières führte. Im November 1870 war er zugleich Kommandeur der Belagerungsartillerie vor Diedenhofen. Ausgezeichnet mit beiden Klassen des Eisernen Kreuzes wurde Eynatten nach dem Friedensschluss am 1. Juni 1871 zum Kommandeur der reitenden Abteilung ernannt. Unter Stellung à la suite seines Regiments erfolgte am 19. Dezember 1871 seine Ernennung zum Direktor der Artillerieschießschule in Berlin. Zugleich war er ab Februar 1872 auch als Mitglied der Prüfungskommission für außeretatmäßige Sekondeleutnante der Artillerie und des Ingenieurkorps tätig. Ende Oktober 1872 erhielt Eynatten den Rang und die Gebührnisse als Regimentskommandeur, wurde Ende März 1873 Oberstleutnant und am 2. Juli 1874 zunächst mit der Führung des Feldartillerie-Regiments Nr. 15 in Straßburg beauftragt. Am 15. September 1874 wurde er zum Regimentskommandeur ernannt und in dieser Eigenschaft am 22. März 1876 zum Oberst befördert. Unter Stellung à la suite seines Regiments beauftragte man Eynatten am 22. September 1877 mit der Führung der in Karlsruhe stationierten 14. Feldartillerie-Brigade. Am 13. November 1877 wurde er Kommandeur dieser Brigade und 1881 mit dem Kommandeurkreuz I. Klasse des Ordens vom Zähringer Löwen sowie des Schwertordens ausgezeichnet. Eynatten avancierte Ende März 1882 zum Generalmajor und erhielt im Januar 1885 anlässlich des Ordensfestes den Roten Adlerorden II. Klasse mit Eichenlaub. Am 11. Februar 1886 wurde er mit dem Charakter als Generalleutnant und der gesetzlichen Pension zur Disposition gestellt.