Onder leiding van bondscoach Howard Wilkinson nam Murphy in 2000 met Engeland U21 deel aan het Europees kampioenschap in Slowakije. Murphy is negenvoudig international voor het Engelse nationale A-elftal en scoorde één keer. Hij zou deel uitmaken van het team op het WK van 2002, maar moest afhaken vanwege een blessure aan zijn middenvoetsbeen.