De regreso a su ciudad natal, Guatemala, ingresó al servicio público. Seguidor de la fe protestante, Serrano colaboró durante ese periodo con varias organizaciones religiosas para auxiliar a la población afectada por el terremoto de 1976 en su país. Publicó asimismo un ensayo donde describía las paupérrimas condiciones de vida que sobrellevaba la población indígena guatemalteca, lo cual le ganó múltiples amenazas que lo obligaron a exiliarse en los Estados Unidos. Retornó a Guatemala en 1982, trabajando en el gobierno del general Efraín Ríos Montt como presidente en el Consejo de Estado del gobierno; este ente sustituyó al Congreso de Guatemala durante el régimen de facto con la función de diseñar el proceso de retorno al sistema constitucional y durante su gestión creó el Tribunal Supremo Electoral y la nueva Ley de Partidos Políticos.