Райнер Эрнст в период с 1981 по 1990 годы играл в составе сборной ГДР. В составе этой сборной он участвует квалификационных раундах чемпионатов Европы 1984 и 1988 годов, а также чемпионатов мира 1982, 1986 и 1990 годов.