Fabré-Palaprat se révèle un médecin novateur, un officier de santé dévoué. Il est directeur général de la Société médico-philanthropique. En 1813, il est chargé de la surveillance des maladies contagieuses. Il intervient à ce titre mais aussi en soldat face aux forces européennes alliées contre l'Empire de Napoléon pendant la Bataille de Paris de 1814 (ce qui lui vaut la légion d’honneur). Il lutte aussi contre l’épidémie de choléra-morbus de février-octobre 1832.