Během salvadorské občanské války působil hlavně jako televizní reportér a později pokračoval v žurnalistické kariéře, přičemž se stal úspěšným moderátorem vícero publicistických pořadů a byl známým kritikem salvadorské pravicové vlády. Později se stal více aktivní v místní politice a v roce 2007 jej Národní osvobozenecká fronta Farabunda Martího nominovala do prezidentských voleb v březnu 2009. Ty vyhrál se ziskem 51,32 % hlasů a stal se prvním levicově orientovaným prezidentem v novodobé historii země. Úřadu se ujal 1. června 2009. V zahraniční politice udržuje dobré vztahy se Spojenými státy a navázal diplomatické vztahy s Kubou, které jeho země přerušila po Kubánské revoluci. Zavedl též řadu sociálních reforem. Do prezidentského křesla usedl po Funesovi 1. června 2014 Salvador Sánchez Cerén ze stejné politické strany.