Depois da contusão, reencontrou o caminho do gol no dia 27 de fevereiro. Em partida válida pela 25ª rodada do Campeonato Italiano, o Milan enfrentou o Catania fora de casa. Aos dez minutos da etapa final, Pato arriscou um chute de longe, que entrou no canto esquerdo do goleiro. Porém, o time mandante empatou e a partida terminou em 1 a 1. Na briga por uma vaga na Liga dos Campeões da UEFA, depois de empatar com a Lazio, o Milan venceu o Empoli por 3 a 1, com um gol de Pato, e partiu para enfrentar a vice-líder Roma, no dia 15 de março, jogo no qual foi derrotado por 2 a 1. No domingo seguinte, Pato dá a vitória por 1 a 0 para sua equipe com um gol contra o Torino. Após altos e baixos de seu time e uma derrota no clássico contra a Juventus, volta a marcar no dia 20 de abril, na goleada de 5 a 1 sobre a Reggina.