Historien gjentok seg: Igjen ble El Guerrouj verdensmester på 1500 meter to ganger, i 2001 i Edmonton og i 2003 i Paris. Dermed er han den eneste som har greid å forsvare verdensmestertittelen tre ganger på rad. I VM 2003 tok han også sølvmedalje på 5000 meter.