Tot de Eerste Balkanoorlog in 1913 was Igoemenitsa in Turkse handen. Het was een klein, onbelangrijk vissersdorpje met hooguit 500 inwoners, tot het in 1936 (tot 2010) hoofdplaats van de nomos Thesprotía werd. In de nasleep van de Tweede Wereldoorlog werd het in 1944, tijdens de aftocht van de Duitse bezettingstroepen, met de grond gelijk gemaakt, waarna het volledig werd herbouwd als een moderne stad.