Le , la France reconnaît Jean IV, roi du Portugal, au début de la guerre de Restauration du Portugal. En 1642, le roi le choisit pour servir comme maréchal de camp sous les ordres du roi du Portugal mais il perdit complètement la vue dans un accident à Paris ce qui l'empêcha de servir davantage. Devenu aveugle, ce fut la fin de la carrière militaire du comte de Pagan.