У 90-х роках Ходжа став прихильником Демократичної ліги Косова та її лідера Ібрагіма Ругови у боротьбі за незалежність Косова. У 1998 році він, разом з іншими членами Асоціації ветеранів Антифашистської Національно-визвольної війни, допомагав збройній боротьбі Армії визволення Косова (АВК). Він підтримав втручання НАТО під час війни в Косово.