Yalón considera a Irán la fuente principal de inestabilidad y terrorismo en la región. En enero de 2008, durante un debate en el "IDC Herzliya", Yaalón dijo que «Es imposible estabilizar la situación mundial y especialmente la situación en Oriente Medio sin enfrentarse antes a Irán». En una entrevista con "The Sydney Morning Herald" Yaalón declaró: «Tenemos que enfrentarnos a la revolución iraní inmediatamente. No hay forma de estabilizar Oriente Medio hoy en día sin derrotar el régimen iraní. El programa nuclear de Irán debe ser detenido». Para derrotar a Irán añadió que «Deben ser consideradas todas las opciones y herramientas». Cuando se le preguntó acerca de si esto incluía deponer militarmente a Ahmadineyad y el resto del liderazgo iraní, Yaalón dijo que «Tenemos que plantearnos asesinarle.» También dijo que los Estados Unidos, en lugar de llevar a cabo la Invasión de Irak de 2003, deberían haber atacado a Irán en ese mismo año.