В июле 1941 года подполковник Абдуллаев был направлен в распоряжение Военного совета Северо-Западного фронта, где вскоре был назначен на должность начальника 3-го отделения разведывательного отдела, затем — на должность помощника начальника разведывательного отдела по кадрам штаба фронта, в октябре — на должность начальника разведывательного отдела Новгородской армейской оперативной группы, а затем — на должность начальника оперативного отдела штаба 34-й армии, участвовавшей в Демянских наступательных операциях 1942 и 1943 годов. В марте и августе 1943 года армия предприняла две попытки наступления для разгрома старорусской группировки противника и овладения Старой Руссы. В боевой обстановке при овладении городом Абдуллаев не смог охватить объём работы возглавляемого им оперативного отдела армии по организации своевременного выполнения поставленных задач. В результате 23 июня 1943 года Абдуллаев был отстранён от должности и зачислен в распоряжение Военного совета фронта и 17 августа 1943 года был назначен на должность начальника штаба 96-го стрелкового корпуса, находившегося до октября в подчинении командующего войсками Северо-Западного фронта.