Nella stagione successiva Franco Sensi decise di rifondare la squadra affidandola al boemo Zdeněk Zeman, il quale, nella sua prima stagione, terminò al quarto posto. Nel 1998-1999 la Roma prelevò il centrocampista russo Dmitrij Aleničev, che fu tuttavia affiancato da altri acquisti non di pari valore come Ivan Tomić, Gustavo Bartelt e Fábio Júnior (quest'ultimo pagato 30 miliardi di lire), i quali diminuirono di fatto la qualità generale della rosa a disposizione di Zeman, con conseguente quinto posto in Serie A ed eliminazione agli ottavi di Coppa Italia e ai quarti in Coppa UEFA.