Le commandant militaire allemand en Serbie nomma deux gouvernements fantoches civils serbes pour effectuer des tâches administratives conformément à la direction et à la supervision allemandes. Le premier d'entre eux fut l'éphémère gouvernement de commissaires qui fut établi le . Le gouvernement de commissaire était un instrument de base du régime d'occupation, dépourvu de tout pouvoir. Fin , un soulèvement éclata dans le territoire occupé, qui submergea rapidement la gendarmerie serbe, l'appareil de police et de sécurité allemand, et même la force d'infanterie de la zone arrière. Pour aider à réprimer la rébellion, qui impliquait initialement à la fois les partisans yougoslaves dirigés par les communistes et les Tchetniks monarchistes, un deuxième gouvernement fantoche fut établi. Le gouvernement de salut national de Milan Nedić remplaça le gouvernement des commissaires le . Bien qu'ayant bénéficié d'un certain soutien le régime était impopulaire auprès de la majorité des Serbes. Cependant, cela n'a pas réussi à inverser la tendance et les Allemands ont été contraints de faire venir des divisions de première ligne de France, de Grèce et même du front de l'Est pour réprimer la révolte. À partir de la fin , l'opération "Uzice" expulsa les partisans du territoire occupé et, en décembre, l'opération "Mihailovic" dispersa les Tchetniks. La résistance se poursuivit à un faible niveau jusqu'en 1944, accompagnée de fréquentes tueries de représailles, qui impliquèrent pendant un certain temps l'exécution de 100 otages pour chaque Allemand tué.