印度尼西亞政府協助其他國家逮捕及起訴與爆炸案相關的激進伊斯兰主义及基地組織成員。於2002年在巴厘岛庫塔發生傷亡最慘重的爆炸案。因爆炸案而受他國發布旅遊警示則重創了印度尼西亞的旅遊業及外商投資前景。