Nato a Tarcento, terzogenito di cinque fratelli, nel 1553 da Emilia Pancera ed Ortensio, studiò letteratura a Udine, poi filosofia a Bologna e diritto a Padova, dove si sarebbe laureato intorno al 1575. Nel 1569 il padre restò vittima di una faida; l'anno successivo compose un opuscolo in poesia assieme a Gianfrancesco Deciani, il "Psalmus ad implorandum divinum auxilium in bello" ("Salmo per invocare l'aiuto divino nella guerra"), dove con "guerra" bisogna intendere quella contro i Turchi. Noto sin da giovine in campo astrologico, pubblicò nel 1573 un "Discorso" intorno ad una stella apparsa l'anno precedente nella costellazione Cassiopea, opera però dal profilo prevalentemente letterario e che fu criticata dagli astrologi contemporanei, con particolare veemenza da Tycho Brahe; nel volume si profetizzavano la prossima morte d'un sovrano e l'ascesa al potere di un altro che avrebbe pacificato il mondo, sconfiggendo l'Impero ottomano e convertendo gli ebrei, eventi di cui si credette di vedere la realizzazione nel 1574 nelle figure di Carlo IX di Francia e del suo successore Enrico III, per il quale Frangipane nello stesso anno fu autore d'un oroscopo particolarmente favorevole e del "Proteo, pastor del mare", tragedia musicata da Claudio Merulo. Terminati gli studi, fuggì nel 1575 da Padova nella natale Tarcento, a causa d'una epidemia di peste che mieté vittime anche all'interno della sua famiglia, sulla qual pestilenza l'anno successivo scrisse un volume; salvatosi dal morbo, compose il "Carmen in aedem divi Rochi in lamina argentea excisum " ("Carme inciso su lamina argentea per la chiesa di San Rocco"), di ventotto esametri, per un ex voto, dopodiché la sua penna tacque per più di trent'anni, eccezion fatta per una composizione poetica di soli trentanove versi.