Nach seiner Laufbahn als Aktiver wurde Mark Hager Trainer. Zunächst betreute er die australischen Juniorinnen und war Assistenztrainer der australischen Damen. 2009 wurde er Chefcoach der "Black Sticks", der neuseeländischen Nationalmannschaft der Damen. Diese erreichten 2012 in London und 2016 in Rio de Janeiro jeweils den vierten Platz bei den Olympischen Spielen. Bei den Commonwealth Games gewannen sie Silber 2010 in Delhi, Bronze 2014 in Glasgow und schließlich Gold 2018 in Gold Coast. Anfang 2019 übernahm Mark Hager das Traineramt bei der englischen und der britischen Damen-Nationalmannschaft.