Το 1881, ο Μεσενικόλας έγινε τμήμα της Ελλάδας και ορίστηκε έδρα του δήμου Νευροπόλεως. Κατά τη διάρκεια του ελληνοτουρκικού πολέμου του 1897, κατά τη διάρκεια του οποίου ο τουρκικός στρατός κατέλαβε την πεδινή Θεσσαλία, στον Μεσενικόλα εγκαταστάθηκαν οι ελληνικές πολιτικές και στρατιωτικές αρχές της πόλης της Καρδίτσας και η μεραρχία Τρικάλων του Ελληνικού Στρατού. Τον Ιούνιο του 1943, κατά τη διάρκεια της Κατοχής, οι Ιτάλοι σκότωσαν στο χωριό 12 άτομα και έξι μήνες αργότερα οι Γερμανοί δολοφόνησαν δεκατρεις κατοίκους του χωριού και έκαψαν το χωριό.