Bizimungu został nominowany na stanowisko prezydenta Rwandy po ludobójstwie dokonanym w 1994 roku na przedstawicielach grupy etnicznej Tutsi, w momencie, gdy partią rządzącą w kraju był bliski Tutsim Rwandyjski Front Patriotyczny. Stał się on symbolem rekonsyliacji między dwiema grupami etnicznymi; jego żona, Serafina, jest Tutsi.