Согласно официальным результатам на выборах 5 апреля 2009 года ПКРМ победила в третий раз, набрав 49,48 % голосов (60 мест в парламенте), удержав, тем самым, большинство мест, но потеряв возможность избрания президента. В крупнейших городах Молдавии состоялись протесты населения против фальсификации парламентских выборов, оспаривавшие их легитимность, которые переросли в акции гражданского неповиновения и беспорядки, массовые задержания протестующих и аресты журналистов. Коммунистической партии не хватало голосов, а оппозиционные партии отказались голосовать за кандидатов, предложенных коммунистами на пост президента, что привело к досрочным парламентским выборам, которые состоялись 29 июля 2009 года. Партия коммунистов набрала 44,69 % голосов и получила 48 мандатов из 101. Остальные 4 партии, прошедшие в Парламент: Либеральная партия (15 мандатов), Демократическая партия Молдовы (13 мандатов), Либерал-демократическая партия Молдовы (18 мандатов) и Альянс «Наша Молдова» (7 мандатов), объединились в Альянс за европейскую интеграцию и сформировали парламентское большинство (53 голоса из 101). Партия коммунистов Республики Молдова, во главе с Владимиром Ворониным, перешла в оппозицию к новому правительству страны, не сумев найти союзников для формирования большинства. 11 сентября 2009 года Владимир Воронин сложил с себя полномочия президента.