Puerto Darwin se originó en 1859 como un centro de cría de ovejas, actividad que continuó hasta 1922 cuando la granja fue transferida a Prado del Ganso. Su nombre se debe a Charles Darwin, quien estuvo en las islas dos veces, en marzo de 1833 y en el mismo mes de 1834, donde realizó un examen zoológico de las islas Malvinas durante su viaje alrededor del mundo en el barco "HMS Beagle".