Al iniciar la guerra, recibió el mando de la Fuerza Expedicionaria Británica en Francia, arribando al país el 19 de septiembre de 1939. Después de la Guerra en broma, inició la batalla de Francia en junio de 1940, y la FEB se preparó para ocupar Bélgica, hasta entonces neutral, para hacerle frente a la fuerza invasora alemana. Adivinando la estrategia aliada, los alemanes enviaron la mayor parte de sus tropas por las Árdenas, atrapando a la mayor parte del ejército francés y al FEB en Bélgica. Lord Gort ignoró las órdenes francesas de contraatacar al sur, para romper el cerco alemán, y decidió retirarse con la FEB y parte de las tropas francesas atrapadas al norte, donde solicitó la evacuación de sus tropas al Reino Unido (Operación Dinamo). La decisión de Gort salvó a la mayoría de los soldados británicos, aunque la mayor parte de las tropas francesas se perdió, no obstante, las tropas dejadas atrás cubrieron la retirada británica en la batalla de Dunkerque.