Andrópov desempeñó el papel dominante en la decisión de invadir Afganistán en 1979. Insistió en la invasión, aunque esperaba que la comunidad internacional le echara la culpa a la URSS por esta acción; la decisión condujo a la invasión soviética de Afganistán (1979-1988). Fue el cerebro de la Operación Tormenta-333 que tuvo por objetivo el derrocamiento del presidente de la República Democrática de Afganistán Hafizullah Amín.