Oliver North est ensuite assigné au Conseil de sécurité nationale, en tant que directeur des affaires politiques et militaires. Il y reçoit sa dernière promotion, celle de lieutenant-colonel. À ce poste, il s’occupe notamment de la recherche des responsables des attentats de 1983 à Beyrouth, aide à l’invasion de la Grenade, au minage des ports du Nicaragua en 1983 pour asphyxier l’économie du pays et contribue à planifier les bombardements contre la Libye en 1986.