W dwóch pierwszych konkursach &lt;a href="Puchar%20%C5%9Awiata%20w%20skokach%20narciarskich%202016/2017"&gt;Pucharu Świata 2016/2017&lt;/a&gt; zajmował kolejno 5. i 8. miejsce. 3 grudnia w Klingenthal reprezentacja Polski z Kotem w składzie odniosła pierwsze w historii zwycięstwo w konkursie drużynowym Pucharu Świata, a on sam uzyskał najlepszy indywidualny wynik zawodów. Po dwóch kolejnych startach zakończonych zajęciem 5. pozycji, 11 grudnia w Lillehammer zajął 2. miejsce, tym samym po raz pierwszy w karierze stając na podium konkursu indywidualnego Pucharu Świata. Wyprzedzony został jedynie przez Kamila Stocha. Trzy spośród konkursów 65. Turnieju Czterech Skoczni ukończył w pierwszej dziesiątce, a w klasyfikacji generalnej zajął 4. miejsce.