1937年七七事變，日本全面侵華，翌年攻占廣州，1941年太平洋戰爭中佔領香港。葡萄牙薩拉查政府在歐洲親近納粹德國为首的軸心國，日本亦是軸心國成員，因此不敢得罪親近軸心國的葡萄牙。葡萄牙在二戰表面上保持中立，所以澳葡政府亦宣稱中立，日本因此沒有入侵澳門。但日軍基本上已經封鎖澳門經濟，沒有佔領的必要；並於1940年在幾無日僑的澳門新開設領事館，視澳門為對華情報基地，澳門因此避過戰乱。同屬葡萄牙殖民的東帝汶，在1941年因向350名荷蘭及澳大利亞士兵提供登陸場所，使得日軍以之爲藉口在1942年佔領葡屬東帝汶。