El 11 de mayo de 2011, Lorca sufrió dos terremotos de 4,7 y 5,1 grados en la escala de Richter. La estación quedó dañada, sobre todo en la parte superior. El tejado, paredes y ventanas cayeron por la fuerza del seísmo y pocos días después todo el piso superior de la estación fue demolido por seguridad. A pesar de los daños se siguió prestando servicio de viajeros en la zona anexa al edificio histórico. Aunque en un principio se rumoreaba la demolición, técnicos de Adif evaluaron la estación y optaron por la restauración del edificio. Tras varios años de trabajos el edificio principal fue reabierto al servicio en 2014.