Más recientemente, los Marines han servido de forma destacada en la Guerra de Irak. La I Fuerza Expedicionaria de Marines, junto con la 3.ª División de Infantería estadounidense, encabezó en el 2003 la invasión de Irak. Los marines salieron de Irak en el verano de 2003, pero regresaron para el servicio de ocupación al inicio de 2004. Se les dio la responsabilidad de la provincia de Al Anbar, la región del gran desierto al oeste de Bagdad. Durante la ocupación, los marines encabezaron los ataques contra la ciudad de Faluya en abril (Operación Vigilant Resolve) y noviembre de 2004 (Operación Phantom Fury), y participaron en intensos combates en lugares como Ramadi, Al-Qa'im y Hit. Su estancia en Irak también ha generado controversia con la matanza de Haditha y el incidente de Hamdania. El 1 de marzo de 2009, el presidente Barack Obama en un discurso pronunciado en Camp Lejeune, Carolina del Norte prometió que todas las tropas se retirarían de Irak en agosto de 2010. El Cuerpo de Marines terminó oficialmente su papel en Irak el 23 de enero de 2010, cuando se transfirió la responsabilidad de la provincia de Al Anbar al Ejército de los Estados Unidos.