Son petit-fils, Georges Rallis, lui impute deux erreurs politiques. La première concerne la guerre gréco-turque de 1897. Theotókis se serait laissé entraîner par le climat va-t'en-guerre qui prévalait à cette époque, et il ne s'est pas opposé à l'envoi de troupes grecques en Crète, ce qui a conduit à la défaite. La seconde erreur a trait au désaccord existant entre le Prince Georges et Elefthérios Venizélos : Theotókis n'est pas intervenu dans leur différend, ce qui a entraîné le schisme national.