Entre su trabajo docente se puede mencionar que en 1803 estuvo de profesor artístico de los príncipes y princesas y en 1806 impartió clases de diseño en Oporto. También participó en los presentes que dieron a William Carr Beresford y el duque de Wellington por su participación en la guerra contra Napoleón, sin embargo, Sequeira estuvo inicialmente de parte de las tropas francesas dedicando un cuadro al general Junot. También se puso de parte de los liberales realizando en 1821 retratos a 33 diputados participantes en la Revolución liberal de Oporto, con motivo de sus ideas tuvo que exilarse a Francia al triunfar los absolutistas en Vilafrancada. Durante su estancia en Francia expuso en el Museo del Louvre y recibió un premio por un cuadro titula Muerte de Camoens que se encuentra desaparecido y se considera la primera obra romántica portuguesa, pero especialmente pudo relecionarse con los románticos franceses y entabló amistad con Eugène Delacroix.