У 1996 році Ірина Бекешкіна стала заступником директора Фонду «Демократичні ініціативи», а у 2001 році — його науковим керівником. Вона була науковим редактором бюлетеню «Політичний портрет України» фонду «Демократичні ініціативи». Фонд одним з перших почав проводив екзит-поли в України, а екзит-пол під час виборів Президента України 2004 року, який зафіксував масштабні фальсифікації і став одним з каталізаторів Помаранчевої революції.