С началом арабского восстания в 1936 году Агранат мобилизовался в Хагану и патрулировал в Хайфе между Адар ха-Кармелем (еврейским районом) и нижним городом, где жили арабы. Став судьёй, не прерывал связь с Хаганой несмотря на то, что в какой-то период организация вынуждена была уйти в подполье.