Dalam Operasi "Barbarossa" tahun 1941, Hoth memerintah Kumpulan Panzer Ketiga yang berjaya menawan Minsk dan Vitebsk. Pada Oktober beliau mengantikan Jeneral Carl-Heinrich von Stülpnagel sebagai Panglima Tentera Darat Ketujuhbelas di Ukraine. Selaku panglima formasi itu, beliau menyeru askar-askarnya memahami keperluan untuk "menghukum keras bangsa Yahudi". Ketumbukannya telah dihalau balik oleh penyerangan Rusia pada awal tahun 1942 (lihat Pertempuran Kharkov Kedua).