En 1942, la corvette a d'abord escorter les convois au large de la côte sud-est de l'Australie et se trouvait dans le port de Sydney pendant l' attaque du sous-marin de poche japonais du 31 mai 1942. 12 jours plus tard, Whyalla escortait un convoi en direction du sud lorsque le cargo "Guatemala" a été torpillé et coulé par le sous-marin japonais "I-21", le seul navire à être perdu dans un convoi escorté par Whyalla.