Am 16. September 1943 verlegten sechs Zerstörer der 8. britischen Zerstörer-Flottille ("Faulknor, Echo, Intrepid, Eclipse, Raider" und die griechische "Vasilissa Olga") als Begleiter der internierten italienischen Schiffe nach Alexandria und wurden zur Unterstützung des britischen Feldzugs im Dodekanes eingeteilt, durch den die Briten die Inseln des seit 1912 italienischen Dodekanes übernehmen wollten. Zeitweise konnten die Inseln Kos, Kalymnos, Samos, Leros, Symi und Astypalea besetzt werden. Die Deutschen versuchten gleichzeitig, die bisher italienischen oder von den Italienern besetzten Gebieten zu gewinnen. Am 17./18. September griffen "Faulknor", "Eclipse" und "Vasilissa Olga" erstmals einen deutschen Konvoi an und versenkten zwei Frachter. Am 7. Oktober entdeckte das britische U-Boot Unruly einen deutschen Konvoi. Es erzielte Artillerietreffer auf zwei Schiffen und meldete die Position des Geleits. Das Geleit wurde wenig später von den Kreuzern "Penelope" und "Sirius" und den Zerstörern "Faulknor" und "Fury" an der Nordostspitze von Stampalia gestellt und zusammengeschossen. Der ablaufende britische Verband wurde in der Scarpanto-Straße von "Ju 87" der II./StG.3 und "Ju 88" des LG.1 und der II./KG.51 angegriffen und "Penelope" durch Bombentreffer beschädigt. Am 15./16. Oktober scheiterte der Versuch des Kreuzers "Phoebe" mit "Faulknor" und "Fury" einen weiteren Konvoi zu stellen an deutschen Luftangriffen. In der Nacht vom 10./11. November beschoss "Faulknor" deutsche Stellungen aus Kos. In den Nächten vom 12./13. und 13./14.11. suchten "Faulknor" zusammen mit den Geleitzerstörern "Beaufort" und der griechischen "Pindos" ohne Erfolg deutsche Transportschiffe. Die Gruppe beschoss zweimal Ziele auf Leros und musste dann wegen Kraftstoffmangel ablaufen. Ab dem 15. war die "Faulknor" dann im Einsatz bei der Evakuierung der letzten alliierten Truppen im Dodekanes.