Filip Lazarov steht im Aufgebot der Mazedonischen Nationalmannschaft. Bei der Weltmeisterschaft 2009 erreichte er Platz 11, bei der Europameisterschaft 2012 den fünften und bei der Weltmeisterschaft 2013 den 14. Rang. Bisher bestritt er 47 Länderspiele, in denen er 133 Tore erzielte. (Stand: 11. Dezember 2016)