После завершения карьеры футболиста Баттё стал тренером «Реймса», клуба в котором провёл всю свою карьеру как игрок. С «Реймсом» он пять раз побеждал в чемпионате и завоевал национальный кубок, а также дважды выходил в финал Кубка чемпионов. Одновременно с работой в «Реймсе» Баттё руководил сборной Франции, вместе с которой стал бронзовым призёром чемпионата мира 1958 года и дошёл до полуфинала чемпионата Европы 1960 года. После тринадцати лет в «Реймсе» он четыре года возглавлял «Гренобль», а затем стал главным тренером «Сент-Этьена», за пять лет работы с которым он четырежды приводил его к званию чемпиона Франции и завоевал два Кубка Франции. Дальнейшая тренерская карьера Баттё была менее успешна и титулов со своими командами он не завоёвывал. Завершил карьеру в 1981 году в клубе «Марсель».