Freyberg ledde sitt förband i det misslyckade brittiska fälttåget i Grekland 1941 vilket slutade med evakuering till Kreta. När Tyskland anföll Kreta fick Freyberg befälet över de allierade trupperna där men lyckades inte stoppa tyskarna. Något han kritiserades för efteråt. Detta påverkade dock inte hans karriär utan han ledde den 2. nyzeeländska divisionen i slaget vid El Alamein och i den fortsatta framryckningen i Nordafrika.