Koalisyon hükümeti, Çin İç Savaşı'nın bitiminde, muzaffer Çinli Komünistlerin 1949'da Sincan'a girmesiyle sona erdi. İkinci DTC'nin liderliği, Sovyetler Birliği tarafından Çinli Komünistlerle müzakere etmeye ikna edildi. Bu liderlerin çoğu, Ağustos ayı sonlarında Pekin'deki bir barış konferansına giderken bir uçak kazasında öldü. Saifuddin Azizi liderliğindeki kalan liderlik, yeni kurulan Çin Halk Cumhuriyeti'ne katılmayı kabul etti. Sincan'daki Milliyetçi askeri komutanlar, Tao Zhiyue ve eyalet valisi Burhan Şehidi Eylül ayında Halk Kurtuluş Ordusu'na (HKO) teslim oldu. Osman Batur yönetimindeki Kazak milisleri, 1950'lerin başlarına kadar HKO'ya direndi. ÇHC'nin Sincan Uygur Özerk Bölgesi, Sincan Eyaleti'nin yerini alarak 1 Ekim 1955'te kuruldu.