Hernández mencetak tiga gol di Piala Konfederasi FIFA 2013 melawan Italia dan Jepang, selain berjuang untuk mencetak skor dalam pertandingan persahabatan dan kualifikasi Piala Dunia pada masa berikutnya. Ia tak terpilih untuk memulainya di Piala Dunia FIFA 2014, namun mencetak satu gol sebagai pemain cadangan melawan Kroasia untuk membantu Meksiko masuk kualifikasi untuk putaran knockout. Pada musim semi berikutnya, Hernández mencetak gol-gol pada beberapa pertandingan persahabatan, namun keluar dari CONCACAF Gold Cup 2015 karena cedera pundak. Ia kembali ke tim nasional untuk CONCACAF Cup 2015, sebuah turnamen satu pertandingan khusus melawan Amerika Serikat untuk masuk kualifikasi untuk Piala Konfederasi FIFA 2017; Meksiko memenangkan pertandingan tersebut dengan skor 3–2, dengan Hernández mencetak gol pertama dari pertandingan tersebut dan pertandingan pertamanya melawan Amerika Serikat.