Он принимал участие в эскориальском заговоре, раскрытом 28 октября 1807 года. Его посадили в тюрьму и предали суду вместе с другими заговорщиками. Но поскольку они обратились к Наполеону, который не хотел, чтобы его имя было упомянуто, правительству пришлось замять дело, и заключённые были оправданы. После восстания в Аранхуэсе 17 марта 1808 года, в которой он принял участие, он стал одним из самых доверенных советников Фердинанда. Решение нового короля встретиться с Наполеоном в Байонне было во многом вдохновлено им. В 1814 году Эскоикис опубликовал в Мадриде свой труд «Честное представление причин, которые вдохновили короля Фердинанда VII на путешествие в Байонну» ().