Während der Schlacht in der Wilderness führte er wieder eine Brigade in der Potomac-Armee, die 2. Brigade der 3. Division im VI. Korps. Seymour wurde dort von den Konföderierten gefangen genommen, wenig später aber ausgetauscht. Nun erhielt er das Kommando über die 3. Division im VI. Korps, die er in der Shenandoahkampagne, vor Petersburg und im Appomattox-Feldzug führte.