Ruggeri var i en årrække en nøglespiller på Argentinas landshold, og var med til at vinde guld ved VM i 1986 i Mexico. Han deltog også ved VM i 1990, hvor argentinerne vandt sølv, samt ved VM i 1994. Udover succesen ved VM repræsenterede han også argentinerne ved hele fire udgaver af Copa América. I 1991 og 1993 var han en del af det vindende hold. Han var også med til at vinde Confederations Cup 1992. I alt nåede han 97 landskampe, hvori han scorede syv mål.