Nach der Unabhängigkeitserklärung Osttimors 1975 begann Indonesien mit einer großangelegten Invasion in das Nachbarland. Im Januar 1976 wurde Maubisse erobert, dann erbrannte ein Kampf um den wichtigen Fleixa-Pass. Erst am 23. Februar erreichten die Indonesier die Stadt Ainaro, wo sie sich mit Truppen vereinigten, die in Betano angelandet waren. Ainaro wurde am 23. Februar 1975 von den Indonesiern erobert. Bis Oktober 1976 waren auch die Orte Ainaro, Maubisse, Hato-Udo und Zumalai, sowie die wichtigsten Überlandstraßen unter indonesischer Kontrolle. Im Bergland blieb die Bevölkerung zunächst noch von den Invasoren verschont, während aus den großen Ortschaften die Bevölkerung in "bases de apoio" flohen, wie "Catrailete", nah dem Tatamailau in Ermera, in Mape-Zumalai oder den Nachbarregionen. Im Ort Ainaro wurde eine große indonesische Militärbasis errichtet, von wo aus man gegen die in den Bergen Ainaros operierende FALINTIL vorging. Ab September 1977 begann die indonesische Armee mit der flächenmäßigen Besetzung der Region, was im Februar 1978 abgeschlossen war. Die Widerstandsbasen wurden zerstört, die Bewohner auseinandergetrieben oder gefangen genommen.