Bayern telah terlibat usaha amal sejak dulu, membantu klub sepak bola lainnya dalam kekacauan keuangan serta masyarakat biasa dalam penderitaan. Setelah terjadinya tsunami pada tahun 2004 "FC Bayern - Hilfe eV" didirikan, sebuah yayasan yang berfokus pada kegiatan sosial klub. Pada awal berdirinya, yayasan ini didanai dengan €600.000, yang disumbangkan oleh pejabat dan pemain dari klub. Uang tersebut digunakan antara lain untuk membangun sebuah sekolah di Marathenkerny, Sri Lanka dan membangun kembali wilayah Trincomalee, Sri Lanka. Pada bulan April 2007, fokus dari yayasan beralih kepada masyarakat setempat yang lebih membutuhkan.