Nel 1944, la Germania nazista si stava ritirando lungo il fronte orientale e le forze sovietiche raggiunsero il territorio della Lituania entro la metà del 1944. Nell'ottobre dello stesso anno, alcuni funzionari sovietici, tra cui Sergei Kruglov che avevano contribuito alle deportazioni dei ceceni e degli ingusci, cominciarono a ventilare l'ipotesi di deportare le famiglie dei "banditi" - uomini che evitavano la coscrizione nell'Armata Rossa e si univano ai partigiani lituani. Tuttavia, tali misure non avvennero nel corso della guerra. Furono invece subito eseguiti preparativi per espellere i tedeschi lituani, le loro famiglie e anche i parenti meno affini. Il treno con le 1 000 persone caricate a bordo lasciò Kaunas il 3 maggio e giunse a destinazione solo a giugno. I deportati fornirono manodopera gratuita alle piantagioni di cotone nella valle del fiume Vahš. A causa delle condizioni di vita particolarmente dure, circa 580 deportati morirono nei primi due anni.