Године 1975, када је почео рат у Либану, Богословски институт је био пресељен у Солун. У току рата манастир је постао уточиште за многобројне избјеглице. Године 1978. именована је специјална Синодска комисија за надзор института. Институт је остао у иностранству до 1979. године, после чега је поново враћен у своју земљу.