Zum Auftakt der folgenden Saison machte Huber ihre ersten Rennen im Rahmen des Weltcups. Ihre erste Abfahrt in Lake Louise beendete sie als 31. und verpasste damit um einen Rang ihren ersten Punktgewinn. Die ersten Punkte gewann sie knapp zwei Wochen später als Zehntplatzierte der Abfahrt von St. Moritz. Dasselbe Resultat erreichte sie bei einer Kombination in Flachau im Januar 2001. Bei der Junioren-WM 2001 in Verbier verpasste sie als Vierte knapp eine Medaille in der Abfahrt. Bei den Deutschen Meisterschaften 2002 in Saalbach-Hinterglemm gewann Huber erneut Bronze in der Abfahrt. In Innerkrems musste sich Huber 2003 in der Abfahrt nur Steffi Stemmer geschlagen geben. Bei den gleichzeitigen deutschen Juniorenmeisterschaften gewann sie Bronze in der Abfahrt und im Super-G. Im Februar 2003 bestritt die Deutsche in St. Moritz ihr einziges Rennen im Rahmen einer Weltmeisterschaft und wurde Abfahrts-25.