Nommé général de brigade le 3 nivôse an XIV, il obtient un commandement au de la Grande Armée le et fait la campagne de Prusse. Passé au commandement d'une brigade de la division de réserve des grenadiers d'Oudinot le suivant, il prend une part glorieuse aux combats d'Ostrołęka, Dantzig, Heilsberg ainsi qu'à la bataille de Friedland. L'Empereur nomme Conroux commandeur de la Légion d'honneur par décret du et le crée baron de l'Empire le sous le nom de "Pépinville". Employé à l'armée d'Allemagne en 1809, et après s'être distingué à la bataille de Wagram le , il est élevé au grade de général de division le 31 du même mois.