О. Я. Либошиц был крещёным евреем, чьи предки происходили из Чехии. Он являлся сыном российского врача (1741—1827), имевшего широкую практику в Вильно. Либошиц-старший оставался иудеем, поэтому в Санкт-Петербурге работать не мог.