Il s'investit alors dans des mandats au sein des instances de la FIFA et dans des activités hippiques en étant propriétaire de l'écurie Al Badr Stud. Chiboub est par ailleurs nommé commissaire de la finale de la coupe du monde 2006. Le , il est élu président du Comité national olympique tunisien dont il était jusque-là le vice-président, avant d'être remplacé par Younes Chetali après sa fuite à l'étranger, au moment des événements de la révolution tunisienne de 2011 qui ont conduit à la chute du régime Ben Ali.