Shinya Nakano est retenu avec l'équipe du Japon des moins de 17 ans pour participer à la coupe du monde des moins de 17 ans en 2019. Il est titulaire au poste d'arrière gauche et participe à l'intégralité des quatre matchs de son équipe. Les Japonais s'inclinent en huitièmes de finale contre le Mexique (0-2 score final).