希土两国对爱琴海的部分领土、领海的主权存在争议。1913年，第一次巴尔干战争后，希腊获得了爱琴海除Imbros岛、Tenedos岛之外所有的岛屿。两国曾就爱琴海部分岛屿主权问题发生过数次冲突。