Наступним великим турніром для Алоїзі знову став Кубок конфедерацій 2001 в Японії і Південній Кореї, де австралійці стали третіми. Алоїзі провів на полі дві гри з п'яти, в обох виходив на заміну, голів не забивав. В матчі за 3-тє місце австралійці взяли реванш у бразильців (1:0, гол забив Шон Мерфі).