Johnston ordonna à Pemberton de réunir son armée à la sienne pour combattre Grant même si Vicksburg devait être laissée sans défense. Ces ordres contradictoires augmentèrent l'inertie de l'armée de Pemberton. Lorsqu'elle se mit en marche (tout en gardant le contact avec Vicksburg), Grant avait déjà gagné beaucoup de terrain et vaincu Johnston à Jackson. L'armée de Pemberton se heurta à celle de Grant à Champion Hill à une trentaine de kilomètres de Vicksburg et y subit une grosse défaite qui amena au siège de Vicksburg.