En 2017, le nouveau président français Emmanuel Macron poursuit ce rapprochement en rencontrant à de multiples reprises sont homologue égyptien au Caire et à Paris, ainsi qu'à Biarritz et New York. En 2019, l'armée égyptienne qui contrôle la majeure partie de l'économie, et la RATP signent un contrat d'un milliard de dollars pour l'équipement du métro du Caire. Les deux chef d'État ont des positions convergentes sur la guerre en Libye (soutenant tous deux le général Haftar), l'exploitation des ressources gazières en Méditerranée orientale, et la guerre contre l'État islamique. En janvier 2019, des critiques d’Emmanuel Macron indiquant que la stabilité du pays ne saurait se faire aux dépens des libertés mettent un froid entre les deux pays, et valent à la France l’annulation de juteux contrats. Mais ces tensons s'estompent lors du déplacement d'Abdel Fattah al-Sissi à Paris en décembre 2020 dans un contexte de manifestations contre la France dans plusieurs pays musulmans après l'assassinat du professeur Samuel Paty qui avait montré à ses élève des caricatures de Charlie Hebdo représentant le prophète Mahomet. Tout en réaffirmant la liberté de caricature comme faisant partie de la liberté d'expression, Emmanuel Macron remercie son homologue égyptien pour son soutien contre une , et lui remet la légion d'honneur.