In der Periode der Terrorherrschaft, die von Anfang Juni 1793 bis Ende Juli 1794 dauerte, wurde Bernadotte mit Wirkung vom 18. Juli 1793 zum Capitaine gewählt. Bernadottes Regiment unterstützte die Nordarmee bei den Kämpfen am 8. September 1793 bei Hondschoote und am 15. und 16. Oktober 1793 bei Wattignies. Die französische Armee stand dabei unter der Führung des Generals Jean-Nicolas Houchard. Noch vor den beiden Schlachten wurde Bernadotte am 8. August 1793 zum Chef de bataillon befördert. Eine Bestätigung folgte am 8. Februar 1794, so dass er Kommandeur eines Bataillons wurde. Am 4. April 1794 übernahm Bernadotte als Chef de brigade die 71. Infanterie-Halbbrigade mit 3.000 Mann.