С вводом новых правил в 2009 году стиль Евгении Канаевой значительно изменился. В начале сезона спортсменку мучали травмы и усталость. Тем не менее, она продолжала выигрывать все соревнования в абсолютном первенстве, и только некоторые финалы в отдельных видах программы она уступала Вере Сесиной или Анне Бессоновой. В мае на чемпионате Европы в Баку (Азербайджан) Канаева выиграла золото во всех четырёх видах программы. В июле она выиграла все золотые медали (в общем количестве 9 штук) на Универсиаде в Белграде и Всемирных играх в Тайване. Пять золотых медалей, завоеванных ею на Всемирных играх, позволили России выйти в лидеры общего зачёта. Президент РФ Дмитрий Медведев поблагодарил Евгению Канаеву за вклад в достижение победы. Канаевой присвоили титул «Героини Игр» на официальном сайте Универсиады в Белграде 2009 года.