Juan VI se enfrentó a una crisis política cuando algunos grupos en Portugal intentaron revertir la metropolitanización de su antigua colonia. Con el final de las Guerras Napoleónicas llegaron los llamados para que John regresara a Lisboa y para que Brasil volviera a su condición colonial anterior. A finales de 1821 la situación se estaba volviendo insoportable y Juan VI y la familia real regresaron a Portugal.