Во время второй гражданской войны 1975—1990, еврейское кладбище находилось на границе между мусульманскими и христианскими районами, на христианской стороне Дамасского шоссе. Фалангисты частично заминировали кладбище в целях предотвращения возможности их противника пересечь кладбище по дороге в христианские районы города. В конце войны ливанская армия полностью очистила территорию кладбища от мин, но захоронениям был причинён существенный ущерб ракетами и бомбардировками. Однако, как отметил в своих исследованиях историк еврейской ливанской общины Наги Зейдан, кладбище никогда не подвергалось нападениям вандалов и ни разу не было осквернено.