Несмотря на приверженность римско-католической вере, Фрэнсис Толбот поддерживал политику короля Генриха VIII Тюдора и после роспуска монастырей получил от него во владение ряд земель, в том числе . Хотя он мало участвовал во внутренней политике, граф Шрусбери был могущественной фигурой на севере королевства. Он принимал участие во вторжении в Шотландию, которое завершилось битвой при Пинки (10 сентября 1547). В 1549 году Фрэнсис Толбот был назначен председателем Совета Севера.