Nach Kriegsende fungierte Klüfer kurzzeitig als Kommandeur eines nach ihm benannten Detachement. Er wurde dann zunächst noch in die Vorläufige Reichswehr übernommen, schied aber am 31. Dezember 1920 unter Verleihung des Charakters als Oberstleutnant aus dem aktiven Dienst und trat in den Polizeidienst ein. Klüfer war als Kommandeur der Sicherheitspolizeigruppe Gelsenkirchen an der Niederschlagung des Ruhraufstandes beteiligt. Im Anschluss daran wurde er 1921 mit der Gesamtführung der Polizeitruppen anlässlich der Märzkämpfe in Mitteldeutschland beauftragt. Sie endeten mit der Erstürmung der Leuna-Werke.