W reprezentacji Brazylii Júnior zadebiutował 18 grudnia 1996 roku w wygranym 1:0 meczu z Bośnią i Hercegowiną. W 2001 roku wziął udział w Copa América 2001, ale z Brazylią odpadł jeszcze w ćwierćfinale po porażce 0:2 z Hondurasem.