ソ連崩壊後、ノギンスク市電はコロムナに本社を置くモスクワ州の国家統一企業であるモソブルエレクトロトランス（Мособлэлектротранс）による運営が行われ、2000年代までは線路や施設の修繕が進められていたが、以降は整備が行われず施設の老朽化が進行し、運用コストが増大した他列車の速度も低下した。車両についても整備が進まず運用から離脱する車両が続出し、予算の削減もあって2011年以降は僅か3両のみが運用に就く状態となり列車本数も大幅に減少した。更に2006年からは並行してミニバスの営業運転が始まり、利便性において不利であったノギンスク市電の利用客は大幅に減少した。