1959年拉萨骚乱后，第五世吉仓活佛吉仓·古成额巴（Keutshang sku phreng lnga pa）被监禁了一段时间，随后于1980年代流亡印度。吉仓日追则被毁灭。1980年代，吉仓日追仍为一片废墟。1991年，一位该寺原来的僧人开始修复该寺，1992年完工。如今，吉仓日追正常开展宗教活动。