Zwei Jahre später nahm Piontek mit Dänemark zum zweiten Mal an einer Europameisterschaft teil. Bei der EM 1988 in der Bundesrepublik Deutschland mussten die Dänen, die in einer Gruppe mit Spanien, dem Gastgeber und Italien spielten, bereits nach der Gruppenphase die Heimreise antreten. 1990 wurde er, nachdem er ein Jahr zuvor die Qualifikation zur WM 1990 verpasst hatte, entlassen. Im selben Jahr wurde er Nationaltrainer der Türkei und trainierte diese bis 1993. Der Co-Trainer von Sepp Piontek war der spätere türkische Nationaltrainer Fatih Terim, da dieser die türkische Sprache beherrscht und so halbstündige taktische Ansprachen abgehalten werden konnten. Während der Amtszeit von Piontek hatte dieser gemeinsam mit dem ehemaligen Bundestrainer Jupp Derwall, der zuvor Galatasaray Istanbul trainierte, „viele Trainer ausgebildet“ und suchte nach „Spielertypen, die ein bisschen anders waren“. Parallel trainierte er 1993 für eine kurze Zeit den türkischen Erstligisten Bursaspor.