Nel 1809 lo stesso governatore García Carrasco fu implicato in un caso di corruzione che distrusse la poca autorità che gli restava. Da questo momento iniziò a montare la pressione per le sue dimissioni. Nel giugno del 1810 arrivarono notizie da Buenos Aires, secondo cui le forze di Napoleone avevano conquistato l'Andalusia assediando Cadice, ultima resistenza spagnola all'avanzata francese. Inoltre la Suprema Junta Centrale, che aveva governato l'impero negli ultimi due anni, si sciolse lasciando il posto al Consiglio di Reggenza. García Carrasco, sostenitore dei "carlottisti", riuscì ad ingigantire i problemi politici prendendo estreme contromisure, quali l'arresto e la deportazione a Lima senza processo di rispettabili cittadini, solo avendo sospetti sulla loro aderenza alle idee della "junta". Tra gli arrestati ci furono José Antonio de Rojas, Juan Antonio Ovalle e Bernardo de Vera y Pintado.