Године 1938., након што је Хитлер окупирао Аустрију, Шредингер је имао проблема јер је 1933. побегао из Трећег рајха и јер је био отворен противник нацизма. Касније је порекао све ово, али убрзо је повукао изјаву и лично се извинио Ајнштајну. То није смирило страсти па је Шредингер отпуштен са универзитета под изговором политичке невјеродостојности. Био је малтретиран и саветовано му је да не напушта земљу. Он и његова супруга побегли су у Италију. Из Италије је путовао на универзитет у Оксфорду и Генту.