На початку німецько-радянської війни за рішенням партійних органів був залишений в тилу ворога для підпільної роботи. Але на початок вересня 1941 р. займав посаду начальника штаба київського бронепотягу «Літер А». Брав участь у невдалих спробах 37-ї армії (командувач генерал-майор А. А. Власов) в районі Баришівка — Березань — Яготин прорватися із київського оточення. Коли бронепотяг вийшов із строю, та коли війська в цілому втратили управління й розпалися на окремі бойові групи, Ареф'єв пристав до зведеної групи під керівництвом командувача армії Власова. Він згадує, що Власов намагався до останнього тримати дисципліну серед бійців та збирати кожен день поради командирів в своєму бойовому загоні, який в останні дні вересня перебував у болотах на р. Трубіж приблизно між селами Гланишів-Пристроми. На початку жовтня загін вирушив на схід з метою виходу з оточення.