Під час битви у Філіппінському морі за відсутності радарів саме літаки "E13A" використовувались для пошуку американських кораблів. Але через проблеми з технікою та помилки пілотів часто передавалась недостовірна інформація, внаслідок чого удари японських літаків здійснювались нескординовано, часто по другорядних цілях, а часом ударні групи японських літаків взагалі не знаходили американські кораблі. В результаті з 440 літаків, які були у японців до битви, в Японію повернулось тільки 35 ударних літаків. З 43 бортових гідролітаків уціліло лише 15, і з них лише два "E13A".