La possibilité que Henry Stafford, duc de Buckingham et soutien à l'usurpation de Richard III en , soit un suspect dans l'affaire dépend de la survie ou non des princes de la Tour au moment où Stafford est exécuté le , après avoir conduit une insurrection infructueuse afin de renverser Richard et de placer Henri Tudor sur le trône. Les partisans de la théorie impliquant Buckingham dans le meurtre des fils d'Édouard IV arguent que celui-ci avait plusieurs motifs de tuer les princes de la Tour. En tant que descendant du roi Édouard III, tant du côté paternel via Jean de Gand, duc de Lancastre, et Thomas de Woodstock, duc de Gloucester, respectivement les troisième et cinquième fils d'Édouard III, que du côté maternel via Jean Beaufort, comte de Somerset, aîné des enfants légitimés de Jean de Gand, Henry Stafford pourrait espérer, en assassinant les princes, avancer sa propre revendication au trône d'Angleterre. Alternativement, il aurait pu agir pour le compte d'un tiers.