Während der indonesischen Invasion griffen im Juni 1976 indonesische Truppen Liquiça an. Ende 1979 gab es in Vila de Liquiçá ein sogenanntes "Transit Camp", in denen die Besatzer osttimoresische Zivilisten internierten. 1999 war Liquiçá Schauplatz zweier besonders schwerer Verbrechen während der Unruhen zur Zeit des Unabhängigkeitsreferendums.