Au cours des années 1450, alors que la situation politique de l'Angleterre devenait de plus en plus confuse à cause des tensions entre les partis de Lancastre et d'York, le comte d’Oxford ménagea les deux camps, quoiqu'il fût membre du Conseil du Roi et que le duc d’York exerçât la charge de Lord Protector pendant la crise mentale du roi Henri, à l'hiver 1453–54. Le , avec six autres pairs et son frère, Robert Vere, il prit en mains la surveillance des côtes. Au mois de , il rallia trop tard l'armée pour prendre part à la bataille de St Albans, et ce n'est qu'en 1459 qu'il prit enfin le parti de la reine Marguerite contre le duc d’York. Au mois de , puis au mois d'avril suivant, il fut chargé de lever des troupes en Essex contre les Yorkistes, et au mois de mai, son fils Aubrey de Vere, récemment marié à Anne, la fille du duc de Buckingham, est cité comme « favori de la reine. »