Après s'être marié au cours de l'année 2003, il commence sa saison comme l'an passé en prenant la deuxième place des masters. En novembre, il prend la huitième place du Trophée Lalique de mi-novembre. Mais la semaine suivante, pour son onzième Grand-Prix, à la Coupe de Russie, les conseils d'Alexandre Jouline portent leurs fruits puisque Frédéric monte pour la première fois sur le podium d'un Grand-Prix en prenant la médaille de bronze derrière le russe Evgeni Plushenko et le chinois Chengjiang Li. Le mois suivant, aux championnats de France à Briançon, il retrouve la seconde place perdue la saison passée, derrière Brian Joubert. Aux championnats d'Europe de février 2004 à Budapest, il réalise son meilleur résultat européen en se classant au pied du podium, derrière son compatriote Brian Joubert (qui est sacré champion d'Europe pour la première fois), et les russes Evgeni Plushenko et Ilia Klimkin. Qualifié pour les championnats du monde de mars 2004 à Dortmund, contrairement à l'année passée, il se classe pour la première fois dans le Top-10 mondial à la neuvième place.