O triunfo de Napoleão em Marengo garantiu sua autoridade política e aumentou sua popularidade em casa, mas não levou a uma paz imediata. O irmão de Bonaparte, José, liderou as complexas negociações em Lunéville e relatou que a Áustria, encorajada pelo apoio britânico, não reconheceria o novo território que a França havia adquirido. À medida que as negociações se tornavam cada vez mais difíceis, Bonaparte deu ordens a seu general Moreau para atacar a Áustria mais uma vez. Moreau e os franceses varreram a Baviera e obtiveram uma vitória esmagadora em Hohenlinden em dezembro de 1800. Como resultado, os austríacos capitularam e assinaram o Tratado de Lunéville em fevereiro de 1801. O tratado reafirmou e expandiu os ganhos franceses anteriores em Campo Formio.