В связи с ростом смертности в период между 1940 и 1942 годами в лагере был построен крематорий. В том же году гражданские корпорации «Мессап» и «Ястрем» открыли на территории лагеря оружейные заводы и использовали в качестве рабочей силы заключенных концлагерей. После того, как война перенеслась в Сталинград, нацисты заключили миллионы советских заключенных в систему концлагерей, а советские военнопленные стали крупнейшей группой заключенных в лагере Нойенгамме и подверглись жестокому обращению со стороны эсэсовских охранников. К концу 1942 года уровень смертности вырос до 10 % в месяц.