El sueño de dominación del duque de Borgoña lo empujó al crimen. El 20 de noviembre de 1407, Juan y Luis juraron una reconciliación solemne frente a la corte de Francia, pero solo tres días después, el 23 de noviembre , Luis fue brutalmente asesinado en las calles de la ciudad de París, cuando fue atacado por hombres armados, bajo las órdenes de Juan, mientras montaba su caballo y literalmente le amputaron los brazos, dejándolo indefenso. El asesinato desencadenó la guerra civil conocida como la guerra entre armañacs y borgoñones que dividió a Francia en dos campos, donde Juan sin Miedo se presentaba como el defensor de la paz y buscó ganarse la simpatía de la gente del pueblo. Para dominar París, se convirtió en el hombre de los cabochianos, pero se dejó desbordar. En 1415, Enrique V de Inglaterra intervinó en el conflicto. Juan sin Miedo, sin ánimo, trató en secreto con los ingleses que ganaron el 25 de octubre de 1415 la victoria de Azincourt, en la que no participó, pero donde perdió a sus dos hermanos menores, Felipe II de Nevers y Antonio de Brabante, quienes murieron en combate. Todavía fue en secreto cuando reconoció, por un acto de mayo de 1417, a Enrique V de Inglaterra y sus descendientes como herederos del trono de Francia. Francia se vio sumida en una crisis de las más graves y los ejércitos ingleses se mostraban cada vez más amenazantes. En julio de 1419, Juan sin Miedo entabló conversaciones con el Delfín. Arreglan su próxima entrevista en Montereau-Fault-Yonne. El duque va allí el 10 de septiembre de 1419. Fue en el puente donde Juan sin Miedo murió, asesinado con un hacha, en presencia del Delfín y probablemente víctima de la venganza de sus consejeros.