Alexander Blomqvist studerade vid Borgå gymnasium och blev student 1815. Han promoverades till filosofie magister (ultimus) vid akademin i Åbo 1819 och blev år 1823 docent i grekisk litteratur. Från 1828 hade han tjänsten som vice bibliotekarie för universitetsbiblioteket och han utsågs från år 1845 till bibliotekets bibliotekarie. Vicebibliotekarietjänsten var förenad med en adjunktur i lärdomshistoria med föreläsningsskyldighet. År 1838 utsågs Blomqvist även till professor i lärdomshistoria. Då universitetet flyttade till Helsingfors efter Åbo brand (1827) flyttade även Blomqvist till Helsingfors.