Micpe Ilan vznikl v červnu 2002 coby polovojenský opěrný bod typu nachal. V té době vrcholila Druhá intifáda, která se projevovala napětím i mezi izraelskými Araby žijícími v regionu vádí Ara. Zároveň došlo k opadnutí zájmu Židů o usidlování v tomto regionu (nezájem potkal zejména rozvíjející se obytný soubor Chariš 2 kilometry západně odtud). V reakci na tento trend se v Micpe Ilan v dubnu 2005 usadila skupina Židů. Civilní usídlení v Micpe Ilan organizovalo sdružení Or Mesimot. Komunita je pojmenována podle izraelského astronauta Ilana Ramona.