Pronto, Mahmoud Abbas pasó a encargarse de las finanzas de Fatah, alejándose de las actividades guerrilleras y políticas de sus compañeros. Abu Daoud, quien planeó la Masacre de Munich, el secuestro de miembros de la delegación olímpica israelí que terminó con la muerte de once atletas y entrenadores israelíes y un policía alemán, escribió que los fondos para la operación fueron provistos por Abbas, aunque este no supo para qué sería usado el dinero. Él fue uno de los primeros miembros de Fatah que promovió el diálogo con israelíes moderados, algo que comenzó a hacer en 1974. Cuando la OLP instaló sus bases en Líbano, Abbas se distanció de la línea beligerante de la organización y permaneció en Damasco. En una entrevista en 2012, Abbas recordaba: “como habíamos tomado las armas, estábamos en posición de deponerlas con credibilidad”. Entró en el Consejo Nacional Palestino en 1968 y fue elegido para la ejecutiva de la OLP en 1980. Tras el asesinato de Abu Yihad por parte de los servicios secretos israelíes, Mahmoud Abbas pasó a desarrollar sus funciones en los territorios palestinos ocupados por Israel, y en especial tareas de coordinación entre el liderazgo en Túnez, los millones de refugiados en el exilio y la propia población palestina ocupada.