Von 1953 bis 1998 schuf Khouri als Regisseur 26 Spielfilme, für die meisten davon schrieb er auch das Drehbuch. Mit "Noite Vazia" (deutscher Titel "Spiele der Nacht") nahm er an den Internationalen Filmfestspielen von Cannes 1965, mit "O Palácio dos Anjos" an den Internationalen Filmfestspielen von Cannes 1970 teil. Mehrfach ausgezeichnet wurde er von der Associação Paulista dos Críticos de Arte (APCA), so 1974 für "O Último Êxtase" (bestes Buch), 1975 für "O Anjo da Noite" (bester Film), 1982 für "Eros, O Deus do Amor" (bester Film, beste Regie) und 1994 für "Per sempre" (beste Regie). Beim Festival de Gramado 1975 erhielt sein Werk "O Anjo da Noite" den Hauptpreis als bester Film. Khouris erotischer Film "Amor Estranho Amor" von 1982 (unter anderem mit Vera Fischer und Xuxa Meneghel) löste kontroverse Diskussionen aus.