La comunità si rigenerò nei secoli seguenti, distribuita tra il mellah, situato nella casba, e l'insediamento di Founti. Tra le principali antiche famiglie ebraiche di Agadir si citano gli Edery, i Zafrany, gli Abitbol, i Serraf, i Knafo, i Khalifa, gli Abisror, i Cohen, i Lévy, i Mazzaltarim e gli Abdelhaq. La comunità era costituita per lo più da artigiani, calzolai e piccoli negozianti. Il mellah disponeva di una piccola sinagoga, oltre ad essere sede della tomba di un marabutto. A partire dall'inizio del XX secolo, gli ebrei cominciarono ad abbandonare la casba per trasferirsi nei quartieri nuovi della città, in particolare a Talborjt. Negli anni 1950 gli ebrei avevano completamente abbandonato la casba. La comunità contava 503 membri nel 1936 e 1.500 nel 1951. In seguito al terremoto del 1960, dei 2.300 ebrei, centinaia rimasero vittime; in contemporanea, molte famiglie, parallelamente a quanto avveniva nel resto del Marocco, cominciarono ad emigrare. Molte famiglie ebraiche di Agadir si stabilirono principalmente in Canada, precisamente a Montréal e a Toronto; molti invece emigrarono verso Israele, Francia e Casablanca. Oggi rimangono in città alcune decine di famiglie ebraiche che gestiscono una sinagoga e un cimitero ebraico.