Namun, insiden terbesar di musim 1988 terjadi di Grand Prix Italia di Monza. Dengan dua lap tersisa Senna memimpin lima detik atas duet Ferrari Gerhard Berger dan Michele Alboreto yang perlahan tapi pasti mendekati McLaren di akhir lomba (Prost tersingkir dari lomba dengan mesin yang bermasalah). Saat berada di Rettifilo Chicane, Senna mendekati Williams yang dikemudikan Jean-Louis Schlesser (yang menggantikan Nigel Mansell yang tidak sehat). Schlesser membelok lebar dan berusaha memberi Senna ruang untuk overlap namun kemudian ia kehilangan kendali dan mencoba memperbaiki arah sebelum kemudian bertabrakan dengan Senna. Dua Ferrari lantas menyalip Senna dan finis 1-2, yang pertama di Grand Prix Italia sejak kematian pendiri tim Enzo Ferrari. Lomba ini menjadi satu-satunya lomba yang tidak dimenangkan McLaren pada tahun 1988.