Ωστόσο, το 1939, η Εσθονία θεωρήθηκε ότι ήταν στη σφαίρα επιρροής της Σοβιετικής Ένωσης, μετά την υπογραφή του Συμφώνου Μολότοφ-Ριμπεντρόπ . Και το 1940 η Εσθονία καταλήφθηκε πλήρως από τη Σοβιετική Ένωση. Ο Τόνισον προσπάθησε να επηρεάσει τον Πρόεδρο Κονσταντίν Πατς στην αντίσταση στη σοβιετική κατοχή, τουλάχιστον συμβολικά, αλλά ο Πατς είχε ήδη αποφασίσει να παραδοθεί χωρίς αντίσταση.