連邦制を採り、遊牧民の多い南スーダンでは土地や家畜をめぐる争いはしばし起こり、行政区画が槍玉に上がることがある。一例を挙げると、2014年に設置されたピボール行政区（GPAA、ジョングレイ州内）は、民族の自治区の設立のため武装蜂起した反政府勢力と南スーダン政府の和平協定によって生まれたものである。2013年のクーデター未遂事件から始まったサルバ・キール・マヤルディ大統領（ディンカ族出身）とリエック・マチャル元副大統領（ヌエル族出身）の内戦では、お互いが出身民族を優遇するかのような行政区画へ変更を宣言する事態になった（両者の行政区画はキール政権とマチャル派の項をそれぞれ参照）。