Le déclin des populations californiennes indigènes à la fin des a été étudié en détail par Cook. Cook a évalué l'importance relative des diverses sources du déclin, y compris les maladies épidémiques de l'Ancien Monde, la violence, les changements nutritionnels et le choc culturel. Les déclins avaient tendance à être les plus marqués dans les zones directement touchées par les missions et la ruée vers l'or. D'autres études ont abordé les changements survenus au sein de régions individuelles ou de groupes ethnolinguistiques.