В 1815 году, во время войны с Мюратом, он принял начальство над авангардом австрийских войск, и при всякой встрече разбивал неприятеля. 21 мая Нейпперг с двумя кавалерийскими полками вступил в Неаполь, пробыл здесь до 25 июня, в качестве военного губернатора, король Обеих Сицилий Фердинанд I наградил его большим крестом ордена св. Фердинанда и Заслуги, украшенным алмазами; в то же время ему за храбрость, оказанную в 1813 и 1814 годах, пожалован командорский крест ордена Марии Терезии.