El desarrollo de la marina puesto en marcha por el inglés Sir John Acton, Secretario de Estado de Fernando IV de Nápoles, llevó a Caracciolo a lo más alto de la marina. En 1782 se volvió teniente de navío; el año siguiente, fue nombrado capitán de fragata y luchó contra los piratas berberiscos en el Mar Mediterráneo. En 1793 comandó los cuatro navíos napolitanos que lucharon contra los franceses bajo el mando del almirante Samuel Hood, participando también en el sitio de Tolón. El 14 de marzo de 1795, estando al mando del navío de 74 cañones "Tancredi", formó parte de la flota anglo-napolitana dirigida por el almirante William Hotham que luchó en la batalla de Génova (1795), impidiendo a la flota de la Francia revolucionaria desembarcar en Córcega. En esa ocasión estuvo con Horatio Nelson quien, al mando del navío de 64 cañones "HMS Agamemnon", recibió su bautismo de fuego atacando y capturando el navío de 80 cañones "Ça Ira".