Desde el establecimiento de relaciones diplomáticas, el contacto entre las dos naciones aumentó a través del comercio y el comercio. En mayo de 1942, México declaró la guerra a las Potencias del Eje, que incluía a Japón, y se unió a la Segunda Guerra Mundial. El Escuadrón 201 fue un escuadrón mexicana de aviones de combate que lucharon contra pilotos japoneses en la Batalla de Luzón, en las Filipinas. Después de la guerra, las relaciones diplomáticas fueron restauradas y han continuado sin disminuir desde entonces.