Niklas Zender startet seit Beginn des Jahres 2011 für die LG Eintracht Frankfurt, zuvor war er für die LG ovag Friedberg-Fauerbach aktiv. Der Medizinstudent wird von Volker Beck und Nick Dakin trainiert. Er tritt seit 2007 international an. Bei den 5. U18-Weltmeisterschaften des Jahres in Ostrava wurde er Sechster, ein Jahr später bei den 12. U20-Weltmeisterschaften in Bydgoszcz Fünfter über 400 Meter und Bronzemedaillengewinner mit der 4-mal-400-Meter-Staffel. Bei den U20-Europameisterschaften 2009 in Novi Sad verbesserte er sich jeweils um einen Rang. Bei der Team-Europameisterschaft 2010 in Bergen, seiner ersten internationalen Meisterschaft bei den Männern, gewann Zender mit der 4-mal-400-Meter-Staffel als Drittplatzierter die Bronzemedaille. 2011 startete er bei den U23-Europameisterschaften und kam mit der Staffel auf den fünften Platz. Bei den Europameisterschaften 2012 in Helsinki wurde er mit der deutschen 4-mal-400-Meter-Staffel Dritter, wurde aber nur im Vorlauf eingesetzt. Im Finale nahm Eric Krüger seinen Platz ein.