Les opérations militaires au Salvador se sont poursuivies de manière similaire jusqu'au début du XXe siècle. Pendant la Grande Dépression, les prix du café ont chuté, les salaires des travailleurs indigènes salvadoriens ont baissé et le chômage s'est généralisé. Pendant trois jours en 1932, les travailleurs indigènes se sont rebellés. Le général au pouvoir, Maximiliano Hernandez Martinez (1882-1966), a répondu avec brutalité. Sous son commandement, l'armée nationale a massacré jusqu'à 40 000 paysans (La Matanza).