A partire dal 1614 Bonaventura Secusio stabilì la sede del seminario nel palazzo che fronteggiava la Loggia Senatoria. L'edificio comprendeva Porta Uzeda e fu parzialmente realizzato sulle mura di Carlo V presso l’antica chiesa di San Martino dei Bianchi. Nel 1693 il palazzo fu totalmente distrutto dal terremoto del Val di Noto, per poi essere ricostruito sotto l’episcopato di mons. Andrea Riggio dall'architetto Alonzo di Benedetto e ingrandito nel 1757 da Francesco Battaglia.