4 квітня 2016 був призначений головним тренером «Челсі», який приступив до своїх обов'язків відразу після закінчення Чемпіонату Європи-2016. У в Англії італієць зумів привести «аристократів» до перемоги у Прем'єр-лізі. Утім команде не лише не захистила чемпіонський титул, але, посівши лише п'яте місце, опинилася поза зоною Ліги чемпіонів. Тож, попри здобуття кубка Англії того сезону, влітку 2018 року Конте був відправлений у відставку керівництвом «Челсі».