Toljan participó con la selección de fútbol sub-17 de Alemania en el Campeonato Europeo Sub-17 de la UEFA 2012, en la cual llegó a la final contra , pero el conjunto alemán terminó siendo subcampeón. Luego jugó varios partidos en la selección sub-19. Además, Toljan también tiene la ciudadanía croata y por lo tanto también podía jugar para el equipo nacional de Croacia. El 26 de mayo de 2015 fue convocado a la selección sub-21 de en el plantel preliminar para jugar la Eurocopa Sub-21 de 2015 en República Checa.