В июле 2015 года Самир Качаев отправился служить в ряды Вооружённых сил Азербайджанской Республики. Проходил службу на линии фронта в Тертерском районе. В ночь на 2 апреля 2016 года на линии соприкосновения армяно-азербайджанских сил в Нагорном Карабахе начались интенсивные боевые действия. Соглашение о прекращении огня было заключено только 5 апреля. Как вспоминает один из участников того сражения рядовой Вугар Алыев, командир подразделения Самир Качаев в первых же боях в тертерском направлении сражался справа от него, а некоторое время спустя получил ранение, но не отступил и продвинулся вперёд. В одном из боёв в окрестностях города Тертер Самир Качаев погиб. Он должен был демобилизоваться через три месяца, в июле.