В декабре 1496 года Мануэл I издал Декрет об изгнании евреев из Португалии и обязательном крещении всех детей. евреев покинули страну. Оставшиеся были подвергнуты насильственному крещению согласно декрету от 19 марта 1497 года. Эти меры были обусловлены женитьбой Мануэла на инфанте Изабелле Астурийской, дочери Фердинанда II Арагонского и Изабеллы I Кастильской и вдове наследника престола инфанта Афонсу. Фердинанд и Изабелла изгнали евреев в 1492 году и заявили, что не дадут согласия на брак инфанты с королём страны, где допускается присутствие евреев. В Лиссабоне в 1506 году произошел крупный еврейский погром; лидеры бунта были казнены по приказу короля.