С начала Отечественной войны 1812 года генерал от инфантерии Дохтуров был шефом Московского пехотного полка и командовал 6-м пехотным корпусом 1-й Западной армии, руководил обороной Смоленска, в Бородинском сражении командовал центром русской позиции и после смертельного ранения П. И. Багратиона возглавил 2-ю Западную армию. Затем руководил русскими войсками в уличных боях в Малоярославце. Во время Заграничных походов 1813—1814 годов командовал войсками в герцогстве Варшавском и корпусом Польской армии, руководил осадой Гамбурга.