En los últimos meses de 1938 estuvo colaborando con Vicente Rojo como encargado de la planificación y organización del Plan P, una proyectada ofensiva republicana sobre los frentes de Extremadura y Andalucía que contaría con un desembarco señuelo en Motril. Matallana, que al principio colaboró plenamente en su planificación, terminó oponiéndose abiertamente. Después de efectuar numerosas protestas y negativas, el Plan se suspendió finalmente junto a la también nula colaboración del General Miaja. El fracasado Plan P fue sustituido por una ofensiva menor en el Frente de Extremadura, comenzada en 5 de enero de 1939, pero a pesar de los avances y el territorio conquistado el resultado fue decepcionante y a principios de febrero las tropas republicanas habían vuelto a su punto de partida. La deficiente actuación del Ejército Popular controlado por los estalinistas en esta ofensiva volvió a plantear numerosas dudas sobre Matallana, cuyo cuartel general había emitido numerosas órdenes contradictorias prohibiendo nuevas ofensivas y ralentizando el avance. Matallana, por otra parte, mantenía cada vez una actitud más realista, en especial después de la derrota republicana en la Batalla del Ebro y la Campaña de Cataluña. Lo cierto es que desde comienzos de año la quinta columna madrileña venía tanteando la lealtad de Matallana y otros oficiales, y Matallana empezaba a contactar con agentes del servicio secreto franquista.