Подготовка к референдуму осложнилась тем, что, как и до этого в Крыму, Центральная избирательная комиссия Украины под руководством Андрея Магеры заблокировала электронные базы данных по избирателям в Донецком и Луганском регионах. Поэтому для референдума на местах были использованы несколько устаревшие данные украинского ЦИК по состоянию на 9 апреля 2012 года: тогда в Донецкой области было зарегистрировано 3 млн 412 тыс. избирателей (для сравнения, в Луганской области — 1 млн. 830 тыс.). На местах составлялись дополнительные списки, куда вносились паспортные данные новых избирателей или сменивших место постоянной регистрации.