Potom si ako reprezentačná jednotka zachytal na EURO 2000, kde českí futbalisti nepostúpili zo základnej skupiny D (Holandsko, Francúzsko, Česko, Dánsko). Pavel odchytal všetky tri zápasy českého tímu na šampionáte. Srníček odchytal v rokoch 19942001 v českom národnom tíme celkom 49 zápasov. Po neúspešnej baráži na MS 2002 v Japonsku a Južnej Kórei ho reprezentačný tréneri prestali povolávať a príležitosť dostal mladý Petr Čech.