Im Mai 1990 erfuhr der Arabische Kooperationsrat zwar noch eine Erweiterung durch die Vereinigung Nordjemens und Südjemens, zur endgültigen Spaltung kam es jedoch infolge der irakischen Besetzung Kuwaits im August 1990. Während Jordanien und Jemen Verständnis für das irakische Vorgehen zeigten, schlossen sich Ägypten und Syrien der antiirakischen Allianz an und beteiligten sich sowohl am Wirtschaftsembargo als auch im Januar 1991 am Krieg gegen den Irak. Als Resultat der umfassenden Kriegszerstörungen und des auch nach 1991 anhaltenden Wirtschaftsembargos war auch die Wirtschaftskraft Iraks zerstört. Um der Isolation zu entkommen, in die Jemen durch die Parteinahme zugunsten des Iraks gekommen war, regte Präsident Salih 1992 eine Wiederbelebung der Kooperation mit Ägypten und Jordanien an, ohne den Irak, stieß aber bei Mubarak zunächst auf Ablehnung. Jordanien bezog zwar weiterhin Öl aus dem Irak, und noch 1994 verhinderten irakische Truppen im Jemen eine von Saudi-Arabien unterstützte Wiederabspaltung Südjemens. Im selben Jahr (1994) jedoch kündigte Ägypten schließlich auch formal seine Mitgliedschaft im Arabischen Kooperationsrat auf, und unter ägyptisch-syrischer Vermittlung söhnte sich Jemen 1995 mit Saudi-Arabien und den USA aus.