In 1990 zou Manchester United de FA Cup winnen over twee wedstrijden (na het spelen van een replay) tegen Crystal Palace. Leighton speelde de eerste wedstrijd, maar moest zich drie maal omdraaien – waarvan twee keer voor Ian Wright resulterend in een 3–2 achterstand. De Welshman Mark Hughes verhinderde dat Palace de beker won door de 3–3 te scoren in de 113e minuut. Les Sealey begon aan de replay, wat bij toenmalig eerste doelman Leighton in het verkeerde keelgat was geschoten. Daarbovenop zat hij niet op de bank voor de replay. Leighton was woedend. Manchester United won met 0–1 na een doelpunt van verdediger Lee Martin in de 59ste minuut. Aangezien hij in de eerste wedstrijd meespeelde had Leighton recht op een medaille, maar hij weigerde deze ostentatief en zou de medaille kurkdroog in de handen van Les Sealey hebben gestopt. Hij kon daarna nog door één deur met Sealey, maar zijn fantastische relatie met Ferguson was voorgoed naar de filistijnen. Leighton verliet Manchester United nadat de club in 1991 de Europacup II won. In 1991 stond concurrent Sealey wederom tussen de palen in de finale van de Europacup II van 1991 tegen het FC Barcelona van trainer Johan Cruijff. Het 'Dream Team' van Cruijff, met Ronald Koeman tussen de lijnen, werd met 2–1 verslagen. Mark Hughes scoorde twee maal. Leighton speelde niet mee omdat hij door Ferguson werd uitgeleend aan Arsenal (en daarna aan Reading).