10 февраля 2002 года Китинг стал Командиром Пятого флота ВМС США и в Манаме (Бахрейн). В марте 2003 года он побывал на «USS "Kitty Hawk"», прибывший для участия в операции «Иракская свобода», назвав его «домом вдалеке от дома», а в апреле — на , поблагодарив моряков за вклад в освобождение Ирака. 18 апреля во время недельного визита в зону командования, присвоил Китингу почётное звание . 25 августа он посетил «USS "Nimitz"», на котором прослужил больше чем на любом другом корабле за всю свою жизнь. 7 октября Китинг ушёл с должности командира флота и командования, внеся большой вклад в освобождение Ирака.