В 1984 году Нэппер вернулся в посольство США в Москве, два года заведовал международными делами в политическом отделе. В 1986—1988 годах он занимал должность заместителя директора отдела Южной Африки в Государственном департаменте. Пройдя шестимесячные курсы румынского языка, Нэппер в 1989 году был назначен поверенным в делах в посольстве США в Румынии. Он был отмечен получил почётной премией Государственного департамента за руководство посольством США во время Румынской революции 1989 года.