De retour à Paris, il rompt avec le PCF et adhère à la Jeunesse communiste révolutionnaire (JCR), aux côtés d’Alain Krivine. Son frère Samuel Johsua est le confondateur du Mouvement du 11 mai à Marseille et a comme lui participé activement au soulèvement de mai-juin 1968, au cours duquel Isaac Johsua est emprisonné à la Santé pour « reconstitution de ligue dissoute ».