Một Tòa án Tội ác Chiến tranh, tương tự như ở Nürnberg, được thành lập ở Tokyo. Vào ngày 3 tháng 5 năm 1946, khởi tố các nhà lãnh đạo quân sự Nhật Bản vì tội ác chiến tranh bắt đầu.Một số thành viên nổi bật của nội các Nhật Bản đã bị xử tử, đáng chú ý nhất là cựu Thủ tướng Tojo Hideki. Nhưng Hoàng đế không bị xét xử tại các phiên tòa ở Tokyo và cũng không bị truất ngôi, các thành viên trong hoàng tộc cũng vậy. Thay vào đó, theo Hiến pháp sau chiến tranh, Nhật hoàng đã bị thu hẹp thành một vị quân vương danh nghĩa đầu sỏ không có đặc điểm thần thánh và bị cấm tham gia chính trị.