5 июля 1945 года генерал-майор Муратов был направлен в распоряжение Военного совета Приморской группы войск Дальневосточного фронта, где с 29 июля вступил в командование 342-й стрелковой дивизией 35-й армии. С началом Советско-японской войны дивизия под командованием Муратова в составе 87-го стрелкового корпуса находилась в резерве 1-го Дальневосточного фронта. В период проведения Южно-Сахалинской операции она подчинялась 16-й армии 2-го Дальневосточного фронта и со своими задачами успешно справилась.