La base navale di Truk fu evacuata il 1º febbraio e la "Fusō", assieme a numerose altre navi, fece rotta verso Palau, dove arrivò il 4 febbraio. Durante l'evacuazione, il sommergibile statunitense "Permit" riuscì a tenersi a portata di tiro dalle navi giapponesi, ma fu impossibilitato ad attaccare. Il 23 febbraio il comando della "Fusō" passò al capitano di vascello Masami Ban. Il 30 maggio prese parte all'operazione Kon, con l'obiettivo di rafforzare la guarnigione di Biak sotto attacco dal 27 maggio. Nonostante sia stato più volte intercettato sia da navi che da aerei statunitensi, il convoglio non subì attacchi lungo la rotta. La sera del 3 giugno, mentre le navi erano ancora in rotta, il comandante della Flotta Combinata ammiraglio Soemu Toyoda annullò l'operazione. Il 4 giugno l'ordine fu però revocato, e la "Fusō", raggiunta assieme alle altre navi la base navale di Davao, lì rimase non prendendo più parte all'operazione. Durante battaglia del Mare delle Filippine, indicata dai giapponesi col nome in codice di "Operazione A-Go", la "Fusō" rimase in stato di allerta, ma non prese parte agli scontri. Deluso dalla sconfitta subita nel Mar delle Filippine, l'alto comando della Marina imperiale propose di inviare la "Fusō" e la "Yamashiro" ad attaccare la forza navale in appoggio alla Battaglia di Saipan. L'idea fu però rigettata da Toyoda, che la bollò come una missione suicida destinata a un sicuro fallimento.