Päämaja perustettiin ensikertaa syyskuussa 1985, ja lakkautettiin asevoimien syyskuun 11. päivän terroritekojen jälkeisessä uudelleenorganisoinnissa lokakuussa 2002, jolloin sen toiminnot yhdistettiin U.S. Strategic Commandin alaisuuteen. USSPACECOM perustettiin uudelleen erillisenä sotatoimialueen päämajana (COCOM) elokuussa 2019.