Bei der Weltmeisterschaft 2016 schied er in der ersten Qualifikationsrunde mit 4:10 gegen Gary Wilson aus. Er spielte dabei das erste Foul des Turniers. Wegen auffälliger Wetten darauf leitete der Weltverband WPBSA Untersuchungen gegen Fernandez ein. Bis zum Ende dieser wurde er vorläufig gesperrt, wodurch er an den ersten drei Turnieren seiner elften Profisaison nicht teilnehmen konnte. Am 5. Juli 2016, seinem 40. Geburtstag, wurde er vom Weltverband für 15 Monate gesperrt. Die Sperre gilt rückwirkend ab dem 27. Mai 2016, dem Beginn seiner vorläufigen Sperre und damit bis zum 27. August 2017. Zudem wurde eine Strafzahlung von 2.000 £ gegen Fernandez verhängt und dieser dazu verpflichtet, sich künftig in der Antikorruptionsarbeit der WPBSA zu engagieren. Nach seiner Rückkehr machte er zwar noch einmal durch einen 6:5-Sieg über den Weltranglistendritten Ding Junhui bei der UK Championship auf sich aufmerksam, sonst gelangen ihm aber keine weiteren Siege mehr. Als Nummer 126 der Rangliste verlor er wieder seinen Profistatus und konnte sich ihn anschließend auch in der Q School nicht mehr zurückholen.