Syméon se retire dans un monastère pendant 7 ans jusqu'en avril 1482 lorsqu'il est appelé une troisième fois à siéger. Au cours de ce troisième patriarcat, il convoque au monastère de Pammakaristos un synode qui condamne définitivement l'Union de Florence. Syméon renonce à sa charge à l'automne 1486 et meurt en un lieu et à une date inconnue.