Bonin trat am 1. April 1908 als Seekadett in die Kaiserliche Marine ein und absolvierte seine Grund- und Seeausbildung auf dem Großen Kreuzer "Hertha". Nach dem Besuch der Marineschule kam er Anfang Oktober 1910 an Bord des Linienschiffes "Braunschweig" und avancierte Ende September 1911 zum Leutnant zur See. Von August 1912 bis September 1913 diente Bonin als 2. Torpedooffizier auf dem Linienschiff "Kaiser". Daran schloss sich eine Verwendung als Kompanie- und Wachoffizier bei der II. Torpedodivision in Wilhelmshaven sowie der VI. Torpedobootflottille an. Nach dem Beginn des Ersten Weltkriegs stieg Bonin Mitte September 1914 zum Oberleutnant zur See auf und war im Juli/August 1916 in Vertretung Flaggleutnant der II. Aufklärungsgruppe der Hochseeflotte. Im April 1917 wurde Bonin bei der VI. Torpedobootflottille Kommandant des Torpedobootes "S 44". Im weiteren Kriegsverlauf übernahm er das Torpedoboot "S 131", wurde Ende April 1918 Kapitänleutnant und wirkte als Chef der XI. Halbflottille. In dieser Eigenschaft überführte er sein Boot nach Kriegsende gemäß der Waffenstillstandsbedingungen nach Scapa Flow und befand sich nach der Selbstversenkung der Flotte ab dem 21. Juni 1919 in britischer Kriegsgefangenschaft.