2000-01 sezonunda futbolu bıraktığı Borussia Dortmund'a teknik direktör olarak döndü. Futbolculuk dönemindeki başarısını teknik adam olarak da sürdürdü. 2001-02 sezonunda Dortmund'u 6 yıl aradan sonra şampiyon yapmayı başardı. Aynı sezonda Dortmund'la UEFA Kupasında finale çıktı. Fakat finalde Feyenoord'a 3-2 kaybetti. 2004 sonunda takımdan ayrıldı.