До конфлікту лісові райони і савана були населені лісовими слонами, буйволами, жирафами, окапі, бородавочниками, шимпанзе, різними антилопами. На березі озера Едвард мешкають гіпопотами, їх популяція скоротилася на більш ніж 95 % в 2006 році). Водні угіддя парку охороняються в рамках Рамсарської конвенції, сюди на зимівлю прилітають птахи з Сибіру. Колонії птахів включають бакланів, марабу та інші види.