Jacob Thuesen studierte Film an der Staatlichen Filmhochschule in Kopenhagen. Das Studium schloss er 1991 ab und begann im Bereich Filmschnitt zu arbeiten. Als Editor arbeitete er u. a. für Lars von Trier, Susanne Bier und Annette K. Olesen. Als Regisseur drehte er zunächst einen Kurzfilm und einen Dokumentarfilm, bevor er 2005 seinen ersten Spielfilm vorstellte. Für "Angeklagt" wurde er 2005 mit dem Europäischen Filmpreis in der Kategorie Europäische Entdeckung des Jahres ausgezeichnet. Der Film lief außerdem im Wettbewerb der Berlinale 2005.