Cluj est administrée par un maire () et un conseil municipal formé de 27 conseillers élus au suffrage universel tous les quatre ans. La ville est divisée en 23 quartiers, dont 8 construits (voire encore en construction) après la révolution de 1989. Afin de faciliter l'accès du citoyen aux structures de l'administration municipale, la mairie de Cluj-Napoca a établi des filiales (mairies de quartier) dans les plus grands quartiers de la ville. Dans l'avenir, chaque quartier disposera d'une telle mairie de quartier. Cluj a connu quatre maires depuis les premières élections municipales démocratiques en 1992.