16世纪初，受到意大利战争的影响，萨伏伊公国的政权受到冲击。1523年，萨伏伊公爵投诚神圣罗马帝国皇帝查理五世，并帮助其在次年的帕维亚之战中击退了法军。1538年，法兰西国王弗朗索瓦一世与神圣罗马帝国国王查理五世签署《》，法兰西获得布雷斯和比热，而米兰则归属于哈布斯堡王朝，尼斯及萨伏伊却没有明确的归属。1543年，萨伏伊公国联合神圣罗马帝国及热那亚共和国军队，赶走了驻扎于此的法军及阿尔及利亚盟军。17世纪初，萨伏伊公爵修建了，扩大了尼斯港口的贸易腹地，尼斯城市人口数量迅速上升，17世纪末九年战争期间，卡提纳被法王路易十四派任为驻意大利的法军司令，于中击溃奥地利和萨伏依公爵的联军，最终征服了包括尼斯在内的整个萨伏伊。18世纪初的西班牙王位继承战争期间，法兰西军队再次与哈布斯堡军队发生战争，1705年的使得法兰西加强了对的统治。