Rains est récompensé pour sa contribution à Cumberland Gap en étant promu et nommé brigadier général le . Lorsque le général Braxton Bragg concentre son armée à Murfreesboro, dans le Tennessee, au cours du même mois, la brigade de Rains constituée de troupes de Caroline du Nord, d'Alabama et du Tennessee part pour Murfreesboro et est affectée à la division du major général John P. McCown dans le corps de Hardee. Lors de la bataille de Stones River le , Rains est tué d'une balle dans le cœur et meurt instantanément tout en menant sa brigade en avant dans une attaque contre l'artillerie de l'Union. Ses derniers mots sont « "en avant mes braves gars, en avant !" ». Le sénat des États confédérés n'a pas confirmé la nomination de Rains en tant que brigadier général à la date de sa mort.