В 1808 году по приказу Александра I архитектор Карл Росси начал возводить новую Екатерининскую церковь на месте церкви святого Георгия. Строительство было прервано войной 1812 года, через пять лет её отделку закончил архитектор Алексей Бакарев. Храм в неоготическом стиле выходил на Спасскую улицу и занимал почти всю южную сторону монастыря. Фасад представлял собой ряд крупных трёхчетвертных колонн, треугольных фронтонов, стрельчатых оконных и дверных проёмов. Он был украшен характерными для готического стиля скульптурными и орнаментальными деталями. В нём устроили два придела — Рождества Иоанна Предтечи и Иконы Казанской Богоматери.