Das Gebiet von Helike war schon in der frühen Bronzezeit (2600 bis 2300 v. Chr.) besiedelt. Im 4. Jahrhundert v. Chr. war diese Polis führende Stadt im Achaiischen Bund. Schutzgott der Stadt war Poseidon, der Tempel des Poseidon Helikonios war laut Pausanias das „heiligste Heiligtum der Ionier“. Im Winter des Jahres 373 v. Chr. erschütterte ein schweres Erdbeben Helike und ließ sämtliche Gebäude zusammenfallen. Kurz darauf überschwemmte eine riesige Flutwelle die Stadt sowie zehn Kriegsschiffe aus Sparta, die im Hafen vor Anker lagen. Dies war vermutlich eine der schwersten und opferreichsten Naturkatastrophen in der Ägäis seit der Minoischen Eruption auf der Vulkaninsel Thera in der späten Bronzezeit. Danach zog sich die Wasserflut nicht zurück, sondern es bildete sich für mehrere Jahrhunderte eine Art Lagune, die dann nach und nach versandete, wobei die Ruinen von Schlammablagerungen bedeckt und bis in unsere Zeit hinein unauffindbar blieben.