Als die Weltgesundheitsorganisation (WHO) vor den Olympischen Sommerspielen in Rio de Janeiro 2016 aufgrund vermehrter Zikavirus-Infektionen in Brasilien den globalen Gesundheitsnotstand ausrief, bewertete Schmidt-Chanasit die Situation und sprach sich gegen eine Absage der Veranstaltung aus. Im Deutschlandfunk warnte er im Januar 2016 davor, dass es im Spätsommer durchaus denkbar sei, dass Reiserückkehrer das Virus nach Deutschland bringen könnten, jedoch werde es keinen großen Ausbruch geben wie in Südamerika.