העיר הוקמה ב-1775 על ידי מתיישבים ספרדים. לאחר מלחמת העצמאות של מקסיקו (1821) עברה העיר לחזקתה. ב-1853 עברה טוסון והאזור שמסביבה לארצות הברית כחלק מרכישת גדסדן. בשנים 1867 - 1877 הייתה טוסון בירת אריזונה.