El principal logro de la CMSN fue hacer las paces con el Frente Polisario del Sáhara Occidental, que había estado luchando contra Mauritania desde que el gobierno del Moktar Ould Daddah entró en la Guerra del Sáhara Occidental en 1975. La CMSN optó por la retirada total del conflicto, evacuando el sur del Río de Oro (que había sido anexado como Tiris al-Gharbiyya ) y reconociendo al Polisario como representante del pueblo saharaui ; Esto llevó a una crisis en las relaciones con Marruecos, que de manera similar se había anexado los dos tercios del norte del país, y también se enfrentaba a la resistencia saharaui.