En 1832, pendant la Guerre des Libéraux, un incendie détruisit le cloître du Couvent de Saint François, épargnant l'église. En 1841, la Reine Marie fit don des ruines du couvent à l'association des commerçants de la ville, qui décida d'y construire le siège de leur association, le Palais de la Bourse ("Palácio da Bolsa"). Confié à l'architecte Joaquim da Costa Lima, sa construction débuta en 1842. Il imagina un imposant édifice rectangulaire combinant la rigueur d'un grand bâtiment dans le style anglais, doté d'une façade dans le style néo-classique à la mode au Portugal, depuis la fin .