Piala Champions Eropa 1968-69 dimenangkan oleh Milan, yang mengalahkan Ajax 4-1 di babak final, memberikan Milan gelar Piala Champions Eropa kedua mereka. Sejumlah klub Eropa Timur mengundurkan diri dari putaran pertama ketika UEFA memasangkan klub-klub Eropa Timur berhadapan satu sama lain.