1680年、62歳で死去した。晩年はフランスの統合政策（後に再統合戦争に発展）によるフランスの介入に悩まされ、1677年にマリー・ルイーゼに先立たれる、シャルロッテから離婚を拒否され続けるなど不幸続きだった。息子のカール2世が選帝侯位を継いだが、1685年に嗣子なくして死去、プファルツ＝ジンメルン家が断絶すると遠縁のプファルツ＝ノイブルク公フィリップ・ヴィルヘルムが継承、ルイ14世は義妹の権利を主張して大同盟戦争（プファルツ継承戦争）を起こすことになった。プファルツは戦争で荒廃し宗教的寛容も失われたが、1720年にマンハイムで復活している。