Период с февраля 1917 по осень 1918 года в биографии Багирова остаётся наиболее неясным. После февральской революции его назначили комиссаром второй (еврейской) части города Кубы. Ясно, что в 1917 году он стал заместителем Кубинского уездного комиссара, крупного помещика, капитана А. Зизикского, проработав на этой должности, по словам самого Багирова, до сентября месяца. Согласно показаниям цензора Главлита, пенсионера МГБ Садыха Кафарлы, который занимался разоблачением Багирова и за это был репрессирован, "«…во время первой империалистической войны Багиров служил в царской армии, в дикой дивизии…»".