Am 9. März 1943 wurde Wells Brigadegeneral im Stab des II. Australischen Korps und verblieb in dieser Funktion bis zum 11. April 1944, wobei ihm am 28. April 1944 der vorübergehende Dienstgrad "(Temporary Rank)" eines Brigadegenerals verliehen wurde. Danach war er vom 12. April 1944 bis zum 16. September 1945 Brigadegeneral im Stab des I. Australischen Korps, mit dem er an der Schlacht um Neuguinea sowie der Operation Oboe (1. Mai 1945 bis 15. August 1945) teilnahm, der Befreiung des japanisch besetzten Borneo.