پس از انقلاب فوریه ۱۹۱۷، او و خانواده‌اش به تبعید داخلی در توبولسک، سیبری فرستاده شدند. به زودی پس از انقلاب اکتبر و به قدرت رسیدن بلشویکها، در طی جنگ داخلی روسیه او به همراه پدر و مادرش، چهار خواهر و سه مستخدم به دستور دولت بلشویکها اعدام شدند، هرچند شایعاتی مبنی بر زنده ماندن وی تا کشف ۲۰۰۷ و کشف یکی از خواهرانش همچنان ادامه داشت. در ۱۷ ژوئیه سال ۱۹۹۸، در هجدهمین سالگرد اعدام او و والدین و سه خواهرش به همراه مستخدمان وفادارشان به‌طور رسمی در کلیسای جامع سنت پیتر و پُل مدح شدند. الکسی و خواهرش ماریا هنوز دفن نشده‌اند. این خانواده در سال ۲۰۰۰ توسط کلیسای ارتدکس روسی در زمره قدیسان شمرده شدند.