在約翰·亞當斯奔走下，諾克斯在1776年初正式獲得上尉軍銜，專門負責炮兵事宜。隨著波士頓圍城戰結束，諾克斯被派往紐約市佈防，期間與亞歷山大·漢密爾頓及班傑明·林肯等人結交。稍後諾克斯參與紐約及新澤西戰役多場重要戰事，包括在特倫頓戰役中負責補給。這些戰功使他在1777年初獲陞為准將。費城戰役後諾克斯開設了美軍第一所炮兵訓練學校，成為美國軍事學院的前身。約克鎮戰役時諾克斯亦隨軍南征，並且負責督導炮兵。