V březnu 2014 se spolu s poslanci Stanislavem Berkovcem a Milanem Šarapatkou zúčastnil jako pozorovatel kontroverzního referenda o odtržení Krymu od Ukrajiny a jeho připojení k Rusku. Zprávu o jejich návštěvě ve volební místnosti ve městě Sudaku, ve které chválili průběh referenda, vydala agentura Krymskij vektor, sám Soušek do agenturní kamery řekl, že hlasovat „lidé chodí v klidu, jsou rádi a všechno je dobré“. Jejich cestu financovala organizace Euroasijská pozorovatelna demokracie a voleb. Dodatečně vyšlo najevo, že za ní stojí belgický pravicový aktivista Luc Michel a že se zabývá nabízením monitoringu voleb nedemokratickým režimům. Žádný z českých účastníků si detailů financování nebyl údajně předem vědom, detaily o organizaci si prý nedohledal ani Soušek, který oslovil s nabídkou účasti i oba poslance. Proti účasti Souška při referendu a proti tomu, že jméno města Vysoké Mýto je spojováno s legitimizací referenda, se ve veřejném prohlášení vymezili někteří vysokomýtští zastupitelé, mj. poslanec Jiří Junek a radní Jiřina Šafrová. Ve městě následně vznikla i petice za jeho odstoupení. Soušek své jednání obhajoval na jednání zastupitelstva, kde ale k hlasování o jeho dalším působení ve funkci nedošlo a ke schválení usnesení, kterým by se zastupitelstvo od jeho cesty distancovalo, chyběl jeden hlas.