W styczniu 2014 Aguilar został ściągnięty przez Antonio Mohameda – swojego byłego trenera z Colónu i Tijuany – do zespołu Club América ze stołecznego miasta Meksyk. Z miejsca wywalczył sobie niepodważalne miejsce w składzie, a w jesiennym sezonie Apertura 2014 zdobył ze swoją ekipą drugie w karierze mistrzostwo Meksyku, tworząc duet środkowych obrońców z Paolo Goltzem. W międzyczasie otrzymał meksykańskie obywatelstwo, w wyniku wieloletniego zamieszkiwania w tym kraju. W 2015 roku zajął z Américą drugie miejsce w krajowym superpucharze – Campeón de Campeones, a także triumfował w najbardziej prestiżowych rozgrywkach północnoamerykańskiego kontynentu – Lidze Mistrzów CONCACAF. Dzięki temu wziął udział w Klubowych Mistrzostwach Świata, na których uplasował się z Américą na piątej lokacie. W 2016 roku po raz drugi z rzędu wygrał natomiast północnoamerykańską Ligę Mistrzów.