Durant la Guerra Civil, Fredericksburg guanyà importància estratègica perquè es trobava a mig camí entre Washington DC i Richmond, les capitals dels bàndols contendents en la guerra. Durant la Batalla de Fredericksburg, que tingué lloc entre l'11 i el 15 de desembre de 1862, la vila suportà importants danys a causa dels bombardejos i saquejos per part de les forces de la Unió. Una Segona Batalla de Fredericksburg tingué lloc als voltants de la vila el 3 de maig de 1863, connectada amb la campanya de Chancelorsville (27 d'abril a 6 de maig de 1863). Les batalles de Wilderness i de Spotsylvania Court House tingueren lloc al maig de 1864.