С началом Великой Отечественной войны назначен заместителем командира 347-й стрелковой дивизии. 27 февраля 1942 года назначен командовать 223-й стрелковой дивизией. 10 ноября 1942 года В. П. Зюванову было присвоено воинское звание генерал-майора. 30 мая 1943 года назначен заместителем командира 416-й стрелковой дивизии. С 19 по 28 мая 1944 года — временно командовал 203-й стрелковой дивизией. 24 августа 1944 года назначен комендантом Кишинёва. 20 апреля 1945 года назначен командиром 1373-го стрелкового полка 416-й стрелковой дивизии, заменив убитого командира полка подполковника З. Сеидбаталова. Особо отличился в ходе Берлинской наступательной операции. Подразделения 1373-го стрелкового полка штурмовали и захватили дворец кайзера Вильгельма, здание бывшего советского посольства, водрузили победное Красное знамя над Бранденбургскими воротами. Вскоре после этого, у Бранденбургских ворот был проведён митинг. Из воспоминаний члена Военного Совета 5-й ударной армии генерал-лейтенанта Ф. Е. Бокова: