Petković teve uma carreira afetada em diferentes momentos pelos conflitos decorrentes da desintegração da Iugoslávia. Ele não chegou a sentir-se mais pessoalmente afetado pela guerra civil na época, pois ""nunca aconteceu no território sérvio. Um pouco mais na Croácia e na Bósnia, foi o pior. Mas tudo é perto, são distâncias de 300 km. Era pertinho"", conforme declarou em 2009. Foi justamente quando esteve mais distante que sofreu mais: em meio à sua passagem pelo Vitória, ocorreu Guerra do Kosovo, em 1999. Seu país foi bombardeado pela OTAN enquanto os pais do jogador ainda moravam na capital Belgrado. "Eu me emociono todos os dias quando vejo as imagens dos ataques (...) É muito difícil estar longe neste momento", declarou. Chegou a participar, na Espanha, de um fórum de atletas e intelectuais iugoslavos, em protesto contra a ofensiva militar estrangeira, no que considerou um massacre contra seu povo.