La actividad militar más intensa en la base tuvo lugar a mediados de la década de 1970, por la crisis de la descolonización del Sahara Occidental y su ocupación por Marruecos. Otras crisis militares en África Occidental, como la intervención de Francia en Malí en 2013, hicieron de la Base Aérea de Gando la principal plataforma aérea para las operaciones de la OTAN en África Occidental. En 2006, España propuso la Base Aérea de Gando como sede del recién creado Mando África de Estados Unidos (AFRICOM), pero finalmente la sede del AFRICOM se situó en Stuttgart, Alemania.