Los alemanes invadieron Francia en mayo de 1940, y el país firmó el armisticio del 22 de junio de 1940. Ese mismo día, Fried recibió las directrices detalladas del dirigente de la Comintern Gueorgui Dimitrov y de Thorez sobre las actividades que debían realizarse respecto de las fuerzas alemanas de ocupación. Inmediatamente después de la ocupación, algunos comunistas franceses intentaron obtener permiso de los alemanes para publicar legalmente su periódico, "L'Humanité". Fried no recibió orden de cesar todo contacto con las autoridades alemanas hasta comienzos de agosto de 1941. La dirección del Partido Comunista Francés en el periodo que comenzó con la ocupación de Francia y concluyó con la invasión alemana de la URSS el 22 de junio de 1941 se instaló en tres lugares: el secretario general Maurice Thorez estaba en Moscú con André Marty; en París el partido lo dirigía Benoît Frachon, con la ayuda de Arthur Dallidet; luego en Bruselas se escondían Jacques Duclos, que luego dirigió la formación y la resistencia comunista, así como Maurice Tréand y Eugen Fried.