Peu de temps avant le déclenchement de la Deuxième guerre civile anglaise en 1648, son compatriote écossais, , partisan de Charles et le mari de sa parente, Catherine Bruce, nomment Bruce comme fiduciaire principal de Ham House pour agir au nom de sa femme, Catherine, et leurs filles. Cette décision réussit à protéger la propriété de Murray de la séquestration par les parlementaires.