Der Park wurde nach Fort Stevenson benannt, einem Militärposten aus dem 19. Jahrhundert. Das Fort wurde 1867 errichtet und nach Thomas Greeley Stevenson, einem General der Unionsarmee benannt, der am 10. Mai 1864 in der Schlacht bei Spotsylvania Court House gefallen ist. Das Fort diente zur Sicherung der Schifffahrt auf dem Missouri, zum Schutz vor Indianern und als Stützpunkt verschiedener Postrouten. Außerdem diente es zur Versorgung des 200 Kilometer östlich gelegenen Forts Totten. Das Fort bestand aus zehn primitiven, aus Adobeziegeln und Pappelholz erbauten Baracken. Es wurde in keine direkten militärischen Aktionen verwickelt und wurde am 31. August 1883 aufgegeben. Die Gebäude dienten noch bis 1894 als Indianerschule. Das Gelände des ehemaligen Forts liegt heute etwa drei Kilometer südwestlich des Parks im Wasser des Lake Sakakawea.