С 3 марта 1994 по 30 июня 1995 — директор Федеральной службы контрразведки (c апреля 1995 — Федеральной службы безопасности) РФ. Указом Президента РФ освобожден от занимаемой должности по собственной просьбе после теракта в Будённовске.