Mit dem Befreiungskrieg erhielt Wobeser am 1. Juni 1813 das Patent zu seinem Dienstgrad und außerdem wurde er zum Führer einer Landwehrdivision diesseits der Weichsel ernannt. Am 15. Juli 1813 erhielt er ein Korps der Westpreußischen Landwehr, bestehend aus acht Bataillonen, drei Eskadrons und einer Batterie. Trotz der beeindruckenden Zahlen war das Korps schlecht bewaffnet und ausgebildet. Wobeser kam damit zum Korps des Generals von Tauentzien. Während des Feldzuges von 1813/14 kämpfte er in den Schlachten bei Großbeeren, ohne auf das rechten Oderufer in Feindkontakt geraten zu sein, bei Dennewitz, wo er zunächst bei Luckau stand und dann am 7. September im Gefecht bei Dahme zahlreiche Gefangene machte sowie der Blockade und dem Sturm auf Wittenberg, den Gefechten Luckau und Lindow sowie der Belagerung von Torgau. Bei Torgau hielt das Korps ab dem 30. September alleine die Belagerung, die Stadt ergab sich am 12. Januar 1814.