Søren Rasmussen fik debut på det danske A-landshold den 10. marts 2000. Han stod dog i mange år i skyggen af Kasper Hvidt og andre målmænd, der var ældre end Rasmussen. Med Hvidts landsholdsstop var vejen banet for Rasmussen, og i december 2010 blev han af landstræner Ulrik Wilbek forhåndsudtaget til den spillertrup, der skulle repræsentere Danmark ved verdensmesterskaberne 2011 i Sverige. 14 dage før turneringsstart havde han i alt spillet 21 kampe for nationalmandskabet, og han fik sin slutrundedebut i Sverige.