Na początku lat 90. Konczałowski powrócił do Rosji ("Kurka Riaba", 1994; "Dom wariatów", 2002), okazjonalnie realizuje również filmy historyczne dla amerykańskich stacji telewizyjnych (miniserial "Odyseja" 1997). Dwukrotnie otrzymał Srebrnego Lwa za najlepszą reżyserię na 71. i 73. MFF w Wenecji - odpowiednio za filmy "Białe noce listonosza Aleksieja Triapicyna" (2014) oraz za "Raj" (2016).