En mai 1994, un mois après le début du génocide au Rwanda, alors que Kouchner n'est plus ministre, il se rend dans le pays avec Renaud Girard, alors grand reporter au "Figaro" dans le but d'évacuer des orphelins tutsis retenus à l'hôtel des mille-collines de Kigali. Sur place, le général Dallaire, commandant de la force de l'ONU, la Minuar qui contrôle l'hôtel des mille-collines, est hostile à ce projet « d'exporter des enfants rwandais… pour que quelques Français bien-pensants se sentent un peu moins coupables du génocide ». Kouchner obtient cependant l'accord de toutes les parties le , mais rentre à Paris le avant la réalisation du projet. L'évacuation commence le .