Verrà convocato per partecipare alla FIFA Confederations Cup 2001 segnando su punizione il gol del 1-0 contro il Canada nella partita che i giapponesi vinceranno 3-0. Nel 2004 viene convocato come fuori quota nella nazionale olimpica alle Olimpiadi in Grecia, dove il Giappone sarà eliminato come ultima squadra del suo girone, Ono segnerà due rigori nella partita persa contro il Paraguay per 4-3.