В началото на неговото управление Пердика II е съюзник на Атина. След отпадането на Потидея от Атинския морски съюз по времето на Пелопонеската война Атина се съюзява с противниците на Пердика, неговия брат Филип и с Дердас от Елимия. Затова той подпомага на Потидея и на другите халкидийски градове. През 432 г. пр. Хр. Атина изпраща генерал Архестрат в Македония. Той тръгва заедно с Филип и братята на Дердас против Пердика в битката при Потидея. Те завладяват Терме и когато обсаждат Пидна, Пердика слкючва с тях съюз. Когато Архестрат тръгва да завладява Потидея, македоните отпадат и помагат на Аристей и Потидея.