Méhée de La Touche poi divenne segretario di Jean-Lambert Tallien, e nel novembre 1795 è stato nominato primo segretario al Ministero della Guerra del Direttorio francese. Poco dopo ha ricoperto la stessa funzione presso il Dipartimento degli esteri sotto Charles-François Delacroix. Si è dimesso nell'aprile 1796, e divenne direttore del "Journal des Hommes Libres". Nel 1797, dopo il Colpo di Stato del 18 fruttidoro, viene condannato all'esilio in Caienna, insieme a Jean-Charles Pichegru, François-Marie, marchese di Barthélemy e tredici altri.