Сезон 1998/99 начался с неожиданного проигрыша 0–9 в первом раунде Чемпионата Великобритании пробившемуся через квалификацию Маркусу Кэмпбеллу. Однако к концу сезона Хендри восстановил форму и выиграл Открытый чемпионат Шотландии и рекордный седьмой Чемпионат мира. В полуфинале он одолел Ронни О’Салливана 17–13, после чего в финале взял верх над Марком Уильямсом 18–11. Но это был его последний мировой титул.