Jacques Villeneuve juntou-se a Williams em 1996 e Clear tornou-se o seu engenheiro de corrida; O canadense venceu o Campeonato Mundial no ano seguinte sob a orientação de Clear. Quando Villeneuve se mudou para a British American Racing (BAR) para a temporada de , seu engenheiro seguiu o exemplo. A parceria continuou até o Grande Prêmio do Japão de 2003, quando Villeneuve saiu na véspera da corrida. com Takuma Sato ocupando o lugar vago na BAR e chegou na sexta posição em sua corrida de estreia com a equipe. Clear trabalhou com Sato novamente em 2004 e 2005.