Die erhaltenen Quellen liefern keinerlei Informationen über Scarpus’ Leben im folgenden Jahrzehnt. Sein Name taucht in den Berichten der antiken Autoren erst wieder anlässlich der entscheidenden Auseinandersetzung zwischen Antonius und Octavian um die Alleinherrschaft im Römischen Reich auf. Damals fungierte er als ein von Antonius eingesetzter Statthalter der Kyrenaika und Kommandeur von vier Legionen. Formell stand Kyrene zwar unter ptolemäischer Oberherrschaft, doch übten die Ägypter nur die zivile, Scarpus als römischer Vertreter aber die militärische Verwaltung aus. Er sollte mit seinen Legionen Ägypten vor einem Angriff Octavians schützen. Nach der Niederlage in der Schlacht bei Actium (2. September 31 v. Chr.) segelte Antonius mit der ägyptischen Königin Kleopatra VII. nach Nordafrika zurück. Antonius wollte nun die in der Kyrenaika stationierten Legionen zur Organisierung der Verteidigung Ägyptens übernehmen, doch Scarpus ließ Antonius’ Boten exekutieren und wechselte auf die Seite Octavians. Da nicht alle Offiziere den Übertritt mitvollziehen wollten, ließ er einige hinrichten und so die übrigen disziplinieren. Schließlich lieferte er seine Provinz und Legionen dem von Westen gegen Alexandria vorstoßenden Feldherrn Octavians, Gaius Cornelius Gallus, aus.