Stéphanie Mugneret-Béghé hat zwischen April 1992 (6:1-Sieg gegen die ivorischen Frauen) und Juni 2005 (0:3 gegen Deutschland) in 115 offiziellen Partien den blauen Dress der französischen A-Nationalelf getragen und dabei auch 14 Treffer erzielt. Mit den "Bleues" nahm sie an einer Welt- (2003, drei Einsätze) und drei Europameisterschaftsendrunden (1997, 2001, 2005, zusammen zehn Einsätze) teil. Ihr 100. Länderspiel bestritt sie im März 2004 im gegen Italien nach Elfmeterschießen gewonnenen Spiel um Rang Drei des Algarve-Cups.