В кампанию 1805 г. Чаплиц командовал передовым деташементом в корпусе Багратиона, участвовал во многих делах и сражениях, в особенности же отличился под Лембахом, Шенграбеном, Цнаймом, где в течение трёх дней удерживал неприятеля и тем дал возможность армии и корпусу кн. Багратиона ранее неприятеля захватить дорогу, идущую от Вены; в сражении под Аустерлицем он спас отрезанный неприятелем Псковский пехотный полк, а после этого сражения прикрывал отступление армии.