30 мая, в связи с высадкой американцев на остров Биак, 5-я дивизия вместе с линкором «Фусо» и шесть эсминцами покинула базу, имея целью прикрытие конвоя до места высадки (операция «КОН»). 31 мая соединение прибыло в Давао и 2 июня направилось с конвоем в Биак. Однако в связи с обнаружением конвоя подлодками и воздушной разведкой операция «КОН» 3 июня была отменена, и 5 июня корабли вернулись в Давао. 7 июня 5-я дивизия вместе с эсминцами «Асагумо» и «Кадзагумо» покинула Давао для прикрытия нового конвоя до Биака (операция «КОН» № 3) и 11-го прибыла на остров Бачан; на переходе «Мёко» 8 июня дозаправился с танкера «Нитиэй-мару». Выход конвоя был намечен на 15 июня, однако более приоритетным оказалось осуществление операции «А-Го» в связи с началом американской операции по захвату Марианских островов. 13 июня 5-я дивизия покинула Бачан и вместе с 1-й дивизией («Ямато» и «Мусаси») присоединилась к Первому мобильному соединению; 16 и 17 июня корабли дозаправились в море. В ходе сражения в Филиппинском море 19—20 июня 5-я дивизия была частью тактической группы «А» вице-адмирала Одзава вместе с 1-й дивизией авианосцев («Тайхо», «Дзуйкаку», «Сёкаку») и 10-й эскадры эсминцев, входя в ордер ПВО авианосцев. После сражения не получившие повреждений крейсера 22 июня прибыли на Окинаву, а 23—24 июня перешли в Курэ для ремонта. В ходе ремонта, продолжавшегося до 29 июня, «Мёко» прошёл третью военную модернизацию: установлены ещё 16 одиночных и 4 строенных 25-мм автомата (общее число стволов — 52), увеличен боекомплект 25-мм снарядов до 2200 на ствол, на фок-мачте размещён дополнительная РЛС обнаружения воздушных целей № 13, в верхней части носовой надстройки — РЛС обнаружения надводных целей № 22 модель 4.