Durch den Fall des Eisernen Vorhangs gehörte Musil im Rahmen der Weltmeisterschaft 1991 erstmals wieder zum Kader der Tschechoslowaken. Beim Canada Cup 1991 führte er die Auswahl dann als Mannschaftskapitän ins Turnier. Seine letzte WM-Medaille war die Bronzemedaille im Rahmen der Weltmeisterschaft 1992, bei der er auch ins All-Star-Team gewählt wurde. Für die tschechische Nationalmannschaft trat er allein bei der Weltmeisterschaft 1994 aufs Eis.