Во время Четырёхлетнего сейма (1788—1792) Николай Чапский принадлежал к патриотической партии, выступал за заключения союза Речи Посполитой с Пруссией, который мог защитить республику от агрессии со стороны России. Занимался увеличение комплектации своего полка, приобретением средств на обмундирование и снаряжение. В сентябре 1789 года Николай Чапский председательствовал в военном суде по делу офицеров, допустивших побег из темницы бывшего подскарбия великого коронного Адама Понинского.