Adams reprend le service au début de 1863 et conduit sa brigade lors du siège de Jackson, Mississippi, sous les ordres du général Joseph E. Johnston. Sous le commandement du général Braxton Bragg, la brigade d'Adams combat à Chickamauga. Le brigade d'Adams perce les lignes de l'Union, le deuxième jour de la bataille, mais est repoussée par les renforts de l'armée de l'Union. Adams est de nouveau blessé, au bras gauche, et est capturé.