Zurück in Rom avancierte Strakosha durch die Verletzung von Marchetti und den Verkauf von Berisha an Atalanta Bergamo zum ersten Torhüter des Teams und gab am 20. September 2016 im Serie-A-Spiel gegen den AC Mailand sein Debüt für Lazio, wobei er trotz einer 2:0-Niederlage eine gute Leistung zeigte. Fünf Tage darauf spielte Strakosha erstmals zu Null gegen den FC Empoli. Der frühere italienische Nationaltorhüter Dino Zoff lobte den zu dem Zeitpunkt 21-jährigen Albaner für seine Leistungen in beiden Partien.