Придя к власти, Деби попытался примерить между собой и со своим правительством повстанческие группировки ради чего была вновь введена многопартийная система. На референдуме была одобрена новая конституция, и в 1996 году состоялись первые со времён колониального правительства конкурентные выборы, на которых Деби одержал победу. Через пять лет он одержал вторую победу и пошёл на второй, согласно конституции, срок. В 2003 году в Чаде началась разработка нефтяных месторождений. Однако вместо принесения процветания, этот фактор лишь усилил внутреннеполитические и межнациональные разногласия и началась новая гражданская война. Тогда же Деби без референдума и согласования с парламентом в одностороннем порядке изменил конституцию страны, отменив ограничение президентских сроков. Данный шаг вызвал волну негодования как в обществе, так и среди оппозиции.