Zum Einsatz kamen die Züge zum ersten Mal auf der Strecke von Bahnhof Euston nach Bahnhof Manchester Piccadilly am 23. Juli 2002, zur Eröffnung der Commonwealth Games in Manchester. In den folgenden Monaten übernahmen die Klasse-390-Züge den Verkehr nach Manchester vollständig und wurden auch nach Bahnhof Liverpool Lime Street, Bahnhof Birmingham New Street, Wolverhampton und Preston eingesetzt. Ende 2003 war auch die letzte Klasse 86-Lokomotive durch Pendolinos ersetzt worden.