Supersport-VM 2016 arrangerades av Internationella motorcykelförbundet. Världsmästerskapet avgjordes över 12 omgångar. Säsongen inleddes den 27 februari i Australien och avslutades den 30 oktober i Qatar. Supersport körs vid samma tävlingshelger som Superbike-VM 2016 utom i USA då Supersport inte deltar. Den regerande världsmästaren, den turkiske Kawasakiföraren Kenan Sofuoğlu, försvarade sin titel. Han vann därmed sin femte VM-titel. Kawasaki vann också VM-titeln för konstruktörer.