За два роки повернувся в Тегеран, де став учителем богослов'я й імамом мечеті Джалілі. 1970 року за антиурядову діяльність був знову заарештований і зазнав тортур з боку членів САВАК, після чого був засуджений до чотирьох років ув'язнення, але звільнений за два завдяки старанням Хомейні. 1977 року Махдаві Кані став засновником і лідером Асоціації кліриків-борців, що ставила собі за мету повалення шаха, а пізніше — захист досягнень революції. Після перемоги ісламської революції 1979 року Хомейні призначив його до складу Ради Ісламської революції.