Jugoslavian maajoukkueessa Govedarica pelasi 27 ottelua ja teki kaksi maalia vuosina 1994–2000. Hän oli mukana MM-kilpailuissa 1998 ja EM-kilpailuissa 2000. EM-kilpailuiden 2000 puolivälierässä Alankomaita vastaan Govedarica teki oman maalin Jugoslavian hävitessä 1–6.