L'unità rimase nella Francia orientale come truppa d'occupazione fino al 21 dicembre 1940, quando iniziò a trasferirsi ad Anversa in vista della mai attuata operazione Leone marino. Dopo un altro periodo di permanenza in Francia, la 29ª motorizzata, comandata dal generale von Boltenstern, si stabilì nel febbraio 1941 in Germania da dove, a maggio, passò al fronte orientale iniziando l'operazione Barbarossa (giugno 1941) inquadrata nel XXXXVII Armeekorps (mot.) del Panzergruppe 2 (HG Mitte) del generale Heinz Guderian, con cui avanzò dal settore ad ovest di Brest-Litowsk contribuendo alla chiusura della sacca di Minsk-Białystok, la prima grande battaglia d'accerchiamento dell'operazione Barbarossa. Dal 28 giugno l'unità, attestata a sud della città di Minsk in attesa delle più lente divisioni di fanteria della 4. Armee, dovette affrontare duri combattimenti contro i reparti dell'Armata Rossa che, rimasti bloccati all'interno della sacca, cercavano di aprirsi un varco. Furono in particolare elementi dell'Infanterie-Regiment (mot.) 15, dell'Infanterie-Regiment (mot.) 71 e del Pionier-Bataillon 29, concentrati nel "kampfgruppe" Thomas, che combatterono aspramente nel settore della foresta di Zelvianca, riuscendo a controllare la situazione nonostante alcuni momenti di difficoltà