Parallèlement en Égypte, Abdel Fatah Al Sissi exerce une forte répression contre l'organisation des frères musulmans dont est issu son prédécesseur Mohamed Morsi. Cette hostilité envers le mouvement islamiste fait de l'Égypte une alliée objective du maréchal Khalifa Haftar (surnommée le « Sissi libyen »), en lutte pour le pouvoir contre son rival Fayez el-Sarraj, chef d'État reconnu par la communauté internationale, mais dont le contrôle du territoire se limite à Tripoli et ses environs.L’Égypte, qui au même moment connaît une insurrection islamiste dans le Sinaï, fournit des armes et des équipements au général Khalifa Haftar, qu’elle perçoit comme le rempart le plus sûr contre les islamistes. Le Caire appelle l’ONU à exempter l’Armée nationale libyenne commandée par Haftar de l’embargo sur les armes en Libye afin de faciliter l’envoi d’armes au général. En 2014, l'Égypte est aussi accusée par Washington d’avoir mené des raids contre des milices islamistes en Libye combattues par Khalifa Haftar.