Après la chute de l'Union soviétique et la réorganisation du football russe, Tioumen est intégré directement au sein de la nouvelle première division russe pour la saison 1992. Il ne s'y éternise cependant pas, finissant vingtième et largement dernier à l'issue de la compétition. Le club se relève rapidement et parvient à remporter le groupe Est de la deuxième division dès la saison suivante et à être promu au terme des barrages de promotion.