La legione rimase sempre fedele a Cesare durante la guerra civile contro la fazione senatoriale guidata da Gneo Pompeo Magno e fu sempre attiva durante l'intero conflitto, combattendo a fianco del suo generale, forse a Durazzo ed a Farsalo nel 48 a.C. La legione prese parte alla battaglia di Tapso del 46 a.C. e alla successiva di Munda del 45 a.C. Dopo quest'ultima battaglia, Cesare potrebbe averla sciolta, con l'assegnazione di terra in Italia (a Spello), oppure potrebbe essere rimasta ancora attiva nel decennio successivo.