Als in Yokosuka stationiertes Schiff fuhr die "Cowpens" regelmäßig Einsätze mit dem dort beheimateten Flugzeugträger "Kitty Hawk". Mit dem Träger nahm der Kreuzer unter anderem an der Übung "Valiant Shield" 2006 und 2007 teil. 2009 verlegte die "Cowpens" erstmals an der Seite der "USS George Washington (CVN-73)" in den Pazifik, nachdem die "Washington" die "Kitty Hawk" in Yokosuka abgelöst hatte. Nach dem Bombardement von Yeonpyeong fuhr der Kreuzer an der Seite der "Washington" ins Gelbe Meer.