Op 1 december 1925 werd hij gepromoveerd tot kapitein-luitenant-ter-zee. Inoue bleef enkele jaren in staffuncties, en was militair attaché in Italië van 1927 tot 1929, waarna hij gepromoveerd werd tot kapitein-ter-zee. Op 15 november 1933 kreeg Inoue het bevel over de "Hiei". Wegens zijn organisatietalent werd hij na anderhalf jaar weer in een functie aan wal benoemd. Inoue was een beschermeling van admiraal Isoroku Yamamoto, en was sterk gekant tegen het Driemogendhedenpact met het fascistische Italië en nazi-Duitsland. Inoue was een leider van de 'linkse kliek' binnen het Japanse leger, die zich verzette tegen de toenemende neiging van Japan naar fascisme en overzees expansionisme.