Möglicherweise wurde auf der Burg 1612 James Graham geboren, zumindest aber verbrachte er seine Jugendzeit dort. Zum Verhängnis wurde Kincardine Castle 1646 der schottische Bürgerkrieg. Zu diesem Zeitpunkt von 50 Mann unter Führung des Schwagers von Graham sowie dessen Cousin besetzt, wurde sie am 16. März nach zehntägiger Belagerung durch die weit überlegenen Truppen von General Middleton eingenommen und noch am selben Tage niedergebrannt. Sie wurde nicht wiederaufgebaut und verfiel daher in der Folgezeit zunehmend. Das Gelände blieb noch bis zum Beginn des 19. Jahrhunderts im Besitz der Familie Graham, ehe es veräußert wurde. Zu dem etwa 500 Meter nordöstlich gelegenen, zu dieser Zeit erbauten Herrenhaus Kincardine Castle besteht, außer der Namensgleichheit, kein Zusammenhang.