جودت حاجی‌اف برای مدت کوتاهی بین سالهای ۱۹۴۷ تا ۱۹۴۸ کارگردانی هنری در ارکستر فیلارمونیک باکو را بر عهده داشت و سپس در آکادمی موسیقی باکو استخدام شد. در سال ۱۹۴۷ به ریاست این آکادمی رسید که تا سال ۱۹۶۹ در این سمت ابقاء شد. در سال ۱۹۶۳ به عنوان استاد آهنگسازی تعیین شد. در این آکادمی به مدت حدود ۴ دهه تدریس کرد. آخرین اثر سمفونیک او با عنوان «۲۰ ژانویه» بود که در سال ۱۹۹۱ به نثار احترام به یاد قربانیان ژانویه سیاه (۱۹۹۰) که نظامیان و تانکهای شوروی در آن روز تعداد زیاد غیرنظامیان آذربایجانی را در باکو قتل‌عام کرده بودند، اختصاص یافت.