Karadžić didakwa ICTY melakukan kejahatan perang berupa genosida semasa Perang Bosnia-Herzegovina tahun 1992-1995. Selain itu, Karadžić terlibat pula dalam aksi pengepungan kota Sarajevo selama 43 bulan (dari 5 April 1992 hingga 29 Februari 1996) yang menewaskan sekitar 12.000 orang serta dalam pembantaian lebih dari 8.000 pria dewasa dan anak-anak warga Muslim di Srebrenica pada Juli 1995.