В 1399 году в северной части Синьцзяна образовалось Ойратское ханство. В середине XVII века возникло Джунгарское ханство, которое в середине XVIII века было завоевано империей Цин. В 1760 году в составе Цинской империи было образовано наместничество, получившее название «Синьцзян».