Dopo l'avvio dell'invasione tedesca dell'Unione Sovietica il 22 giugno 1941, il "Komintern" fu impegnato insieme agli incrociatori "Krasnyj Kavkaz" e "Červona Ukraina" e a vari cacciatorpediniere a stendere campi minati difensivi a protezione della base sovietica di Sebastopoli. L'8 agosto il "Komintern" e i cacciatorpediniere "Nezamozhinsk" e "Shaumyan" furono inviati in appoggio alle forze sovietiche assediate a Odessa, venendo impiegati per gran parte del mese in numerosi bombardamenti costieri delle posizioni nemiche e scortando vari convogli da e per la città assediata. Dopo l'evacuazione di Odessa nell'ottobre 1941, l'incrociatore fu impegnato nel corso della campagna di Crimea, trasportando rifornimenti per la 44ª Armata sovietica a Feodosia il 1º gennaio 1942 nonché nei mesi seguenti truppe di rincalzo e vettovaglie per la guarnigione di Sebastopoli assediata dai tedeschi.