Masterton vote pour rester dans l'UE lors du référendum de l'UE de 2016 et a été un ardent partisan de l'obtention d'un accord de retrait de l'Union européenne, mais il vote contre le projet de loi pour empêcher le Royaume-Uni de quitter l'UE sans accord . Fin 2017, Masterton est répertorié par le Daily Telegraph comme l'un des quinze «mutins du Brexit» conservateurs .