Перес был также членом уругвайской национальной сборной. В целом, начиная с дебютного матча 2 ноября 1921 года до последней игры 31 августа 1924 года, он надевал футболку сборной шесть раз. Не забил ни одного гола. Играл в составе сборной на чемпионатах Южной Америки 1921 и 1923 годов. На последнем турнире выиграл титул чемпиона Южной Америки, приняв участие в трёх матчах.