Сильный ущерб городу причинила немецкая оккупация, длившаяся с 4 ноября 1941 по 15 апреля 1944. В окрестных горах и лесах Крымского заповедника сражался Алуштинский партизанский отряд Южного соединения партизан Крыма, почти весь его первоначальный состав погиб в боях. Более 500 жителей Алушты погибло от рук оккупантов, 231 человек был угнан на работы в Германию. Ещё больше город обезлюдел после депортации крымских татар 18 мая 1944 года. В Алуште имеются памятники, посвящённые военным событиям.