Dopo aver assunto l'incarico corse a Brest per prendere personalmente il comando della flotta che stava per salpare per l'Egitto nel tentativo di liberare l'esercito francese bloccato là fin dall'invasione del 1798. Con l'aiuto di vento e nebbia riuscì ad eludere l'embargo britannico e salpò verso sud con 25 vascelli. Prevedendo un possibile sbarco in Irlanda, ancora non colonizzata nel timore della rivolta irlandese del 1798, la flotta assediante si diresse a nordovest, dando a Bruix un considerevole vantaggio prima che si sapesse la sua vera direzione. Al largo di Cadice Bruix incontrò una flotta britannica composta da 15 vascelli capitanati da Lord Keith. Nonostante la superiorità numerica e la presenza di 28 vascelli spagnoli a Cadice, Bruix rinunciò alla possibilità di attaccare e proseguì nel Mediterraneo.