Pendant l'occupation, à la tête de Gnome et Rhône, il s'efforce de maintenir le personnel en France, d'éviter les départs en Allemagne des ouvriers spécialisés et du parc des machines, de n’assurer à ses usines qu’une production réduite. Fort de sa position, Louis Verdier aide son fils Jean-Gérard à monter en 1943 la Section motorisée du XVIe, agissant dans la Résistance, qui aida les Blindés de Leclerc à entrer dans Paris. Il lui fournit des vélomoteurs et des side-cars, soustraits clandestinement, pièce par pièce, à l’usine de Gennevilliers malgré la surveillance allemande, et remontés par les deux techniciens détachés de l’usine et mis à la disposition de la Section).