Il représente l'Équipe de Slovénie de hockey sur glace. Il a participé à deux championnats du monde moins de 18 ans en 2001 et 2002, et à deux championnats du monde junior en 2003 et 2004. En , il est appelé pour la première fois en sélection senior par le sélectionneur František Vyborny lors de la manche de l'Euro Ice Hockey Challenge se déroulant à Bled. Le , il marque son premier but en équipe nationale contre la Croatie. Lors des mondiaux 2006, il est surnuméraire lors du premier tour mais dispute un match contre l'Italie lors de la poule de relégation qui condamne l'équipe à la descente en division 1. En 2007, durant la préparation pour les mondiaux division 1, il est le dernier défenseur écarté par le sélectionneur Ted Sator. En 2008, le nouveau sélectionneur Mats Waltin l'aligne aux côtés de Miha Rebolj sur la troisième paire défensive des Lynx. Lors du tour préliminaire, l'équipe termine quatrième de son groupe et joue le barrage de relégation contre la Slovaquie. Elle s'incline 5-1 lors du premier match. Le lendemain, Jakob réalise une assistance sur le but de David Rodman puis grâce à une égalisation de Anže Kopitar en fin de troisième tiers, les deux équipes vont en prolongation. Le slovaque Ľubomír Višňovský donne la victoire à son équipe aux tirs au but. La Slovénie est reléguée en division 1 pour 2009.