В 1501 году, когда французские войска Людовика XII вторглись в Неаполитанское королевство с севера, испанцы Фердинанда Католика оккупировали юг, положив начало войне 1501—04 годов. Фабрицио и его родственник Просперо Колонна поддержали неаполитанского короля Федериго I Арагонского. Фабрицио возглавлял силы, которые защищали Капую, и был разбит Беро Стюартом д’Обиньи и взят в плен, позже выкуплен королём неаполитанским за 2 тыс. дукатов.