Am 6. Oktober 2008 wurde McKiernan zusätzlich das Kommando über die neu aufgestellte "United States Forces Afghanistan (USFOR-A)" übertragen und die Operationen ISAF und OEF faktisch verschmolzen. Die US-Truppen, die nicht unter ISAF-Kommando standen, wurden bis dahin vom Regionalkommandeur Ost, einem Major General der US-Streitkräfte geführt.