Das Estnische Rote Kreuz wurde am 24. Februar 1919, ein Jahr nach Erlangung der staatlichen Unabhängigkeit Estlands, gegründet. Am selben Tag erfolgte die Bestätigung der Satzung durch die estnische Regierung. Die Hauptaufgabe des Estnischen Roten Kreuzes bei seiner Gründung bestand zunächst im humanitären Einsatz während des Estnischen Freiheitskrieges (1918–1920). In der Zwischenkriegszeit erhielt das Estnische Rote Kreuz vor allem aus den Vereinigten Staaten Aufbauhilfe. Es leistete selbst Unterstützung zur Linderung der Hungersnot Anfang der 1920er Jahre in Sowjetrussland.