Manizja werd in 1991 geboren in Doesjanbe, de hoofdstad van de toenmalige Tadzjiekse Socialistische Sovjetrepubliek, een deelstaat van de Sovjet-Unie. Haar vader was een arts, haar moeder een psycholoog en couturier. Haar ouders scheidden op jonge leeftijd, en haar vader verzette zich tegen een muzikale carrière voor zijn dochter, daar hij meende dat dit niet strookte met de islam. Later besloot ze haar geboortenaam Chamrajeva te veranderen in Sangin, naar haar grootmoeder die haar steunde in haar keuze voor muziek. In 1994 vluchtte ze met haar familie naar de Russische hoofdstad Moskou vanwege het uitbreken van de Tadzjiekse Burgeroorlog. Daar studeerde ze uiteindelijk ook af als psycholoog aan de Russische Staatsuniversiteit voor Humane Wetenschappen.