В 1918 году, будучи доцентом анатомии Львовского университета, Панчишин, воспитанный в полонизированной семье, во время Польско-украинской войны сделал выбор в пользу украинцев, за что был уволен из университета. По национальной же причине Панчишин отказался переехать в Варшаву, куда его приглашал давний покровитель, профессор Антоний Глюзинский.