8月24日、ガードフィッシュは6回目の哨戒でビスマルク諸島方面に向かった。9月21日にツラギ島に寄港し、9月28日までの間はブーゲンビル島に揚陸した部隊と連絡を取る特別任務に就く。10月7日夜、ガードフィッシュはピート ("USS Peto, SS-265") から輸送船団に関する情報を受け取り、捜索を行ったところ、翌10月8日未明に4隻の大型輸送船と2隻の護衛艦からなる輸送船団を発見する。ガードフィッシュはの地点で魚雷を6本発射し、うち2本が陸軍船加州丸（福洋汽船、5,460トン）に命中してこれを撃沈する。翌10月9日午後から10月10日未明にかけても、からの地点にかけて4,800トン級輸送船を追い掛け回し、10月9日の攻撃では発射した3本の魚雷は全て外れたが、10月10日の攻撃で発射した魚雷のうち1本が命中して、目標は沈没したと判定される。10月13日にもの地点で2隻の大型輸送船と護衛艦を発見し、魚雷を4本発射したが命中せず、375フィート（約114メートル）の深さまで投下された爆雷を避ける羽目となった。その後はブリスベンに針路を向け、2日間にわたってラバウル空襲に参加した爆撃機の援護任務に就いた。10月19日、ガードフィッシュはツラギ島に寄港してアメリカ海兵隊の探査部隊を乗艦させ、10月28日にブーゲンビル島のエンプレス・オーガスタ湾に部隊を上陸させた。この任務は、11月1日に行われた連合軍のブーゲンビル島タロキナへの上陸に少なからず貢献した。11月3日、ガードフィッシュは70日間の行動を終えてブリスベンに帰投した。