Falk Balzer begann seine sportliche Laufbahn als Schwimmer im Alter von 7 Jahren in Dresden. 1986 beendete er diese Laufbahn und trainierte zweimal in der Woche bei der TU Dresden Leichtathletik. Eine Aufnahme an eine Kinder- und Jugendsportschule blieb ihm aufgrund einer Scheuermann-Krankheit im Lendenwirbel untersagt. Als seine Eltern 1987 nach Karl-Marx-Stadt versetzt wurden, wurde Falk Balzer unter der Auflage an die Kinder- und Jugendsportschule delegiert, dass er von seinem Vater Karl-Heinz Balzer trainiert wird. Bei der letzten Kinder – und Jugendspartakiade der DDR 1989 war Falk Balzer erstmals über 110 Meter Hürden erfolgreich und belegte den 3. Platz. 1992 qualifizierte er sich für die Juniorenweltmeisterschaften. Er musste jedoch aufgrund eines doppelten Bänderisses im Sprunggelenk verletzt abreisen.