На початку 2002 року вперше взяв участь у Золотому кубка КОНКАКАФ 2002 року у США, куди еквадорців запросили у статусі гостей. На турнірі він зіграв у матчах проти Канади та Гаїті. Того ж року Фернандес потрапив до заявки на чемпіонату світу 2002 року в Японії і Південній Кореї. На турнірі він був запасним і не зіграв жодної хвилини.