В 2013 году Минобрнауки на конкурсной основе отобрало 15 наиболее перспективных российских высших учебных заведений для участия в Проекте 5-100. В 2015 году в список вошло ещё шесть вузов. Цель программы «5-100»: к 2020 году хотя бы пять российских вузов из списка должны попасть в первую сотню трёх наиболее авторитетных мировых рейтингов университетов: "Academic Ranking of World Universities" (ARWU, также называемый Шанхайским рейтингом), "QS World University Rankings" и "", которые ежегодно составляют рейтинговые агентства ShanghaiRanking Consultancy, и Times Higher Education соответственно. Участники проекта разрабатывают «дорожные карты» развития, где в том числе ставят задачи по достижению определённых показателей в мировых рейтингах. Совет проекта рассматривает эти планы развития и даёт рекомендации Минобрнауки, а министерство распределяет финансирование между участниками. Университет ИТМО ежегодно входит в число лидеров проекта, субсидирование ведущих вузов достигает 1 млрд рублей.