Prese per l'ultima volta il via in Coppa del Mondo l'8 gennaio 2006 a Maribor in slalom speciale, senza completare la prova (non portò a termine nessuna delle 34 gare nel massimo circuito cui prese parte), e ai successivi XX Giochi olimpici invernali di , sua unica presenza olimpica, fu 25ª nello slalom gigante. Ai Mondiali di Åre 2007, sua ultima presenza iridata, non completò lo slalom gigante; si ritirò al termine di quella stessa stagione 2006-2007 e la sua ultima gara fu lo slalom speciale dei Campionati polacchi 2007, disputato il 25 marzo a Falcade e nel quale la Krzyżyńska vinse la medaglia di bronzo.