Prema Masudu Banisadru, nakon invazije Iraka na Iran 1980. godine, MEK je nazvao Sadama Huseina „agresorom" i „diktatorom". Iako se MEK borio protiv Iraka u septembru 1980. godine, oni su pozvali na mir i potpisali mirovni sporazum sa Irakom 1983. godine" nazivajući nastavak rata nelegitimno". Prema Alirezi Jafarzadehin, MEK je uspeo da zaustavi iračke vazdušne napade na Iran u raznim prilikama.