Da Tyskland vendte sig mod øst og invaderede Sovjetunionen i 1941, resulterede hærens manglende erobring af Moskva i Hitlers fjendskab. Tingene gik yderligere ned ad bakke for Brauchitsch, da han fik et alvorligt hjertetilfælde, og Hitler afskedigede ham den 19. december. Brauchitsch tilbragte de sidste tre år af krigen i Tři Trubky jagthytten i Brdy bjergene sydvest for Prag.