Щепихин С. А. внёс заметный вклад в военно-географическое изучение Синьцзяна, Алтая и Западной Монголии. Летом 1912 года совершил рекогносцировочную поездку в Тарбагатайский округ Синьцзянской провинции, с целью сбора сведений о китайских вооружённых силах в приграничной с Россией полосе, о военно-политической обстановке в Синьцзяне, в связи с событиями Синьхайской революции 1911 г., о положении национальных меньшинств в Синьцзянском округе — казахов, монголов, Сибо,уйгуров и др., а также для описания маршрутов и путей, ведущих из русского Семиречья в Западный Китай.