Reto Berra wurde bisher mehrfach in Nachwuchs-Nationalmannschaften der Schweiz eingesetzt. Sein erstes grosses Turnier absolvierte er 2005 bei der U18-Weltmeisterschaft. Sowohl bei der Weltmeisterschaft 2006, als auch bei jener von 2007 war er Stammtorhüter der U20-Nationalmannschaft und trug massgeblich zum Verbleib der Schweiz in der A-Gruppe bei.