Wie auch die übrigen Alpen war der Gurnwandkopf während des Pleistozäns mehrfach stark vereist. Insbesondere die Vereisungsspuren der Riß- und der Würm-Kaltzeit lassen sich nachweisen, wobei die Riß-Kaltzeit die Würm-Kaltzeit an Intensität noch übertraf. Das Dreiseengebiet wurde damals von einem Abzweig des Tiroler-Achen-Gletschers durchflossen, der am Seekopf die Wettersteinbarriere durchbrach und dann als Seetraun-Gletscher in den Ruhpoldinger Talkessel einströmte. Der Tiroler-Achen-Gletscher entsandte ferner einen Abzweig durchs Große Wappbachtal, der sich im Tal der Röthelmoosalm mit einem nördlich der Hochscharten herüberziehenden Seitenast vereinigte und sodann als Urschlauer-Achen-Gletscher ebenfalls gen Ruhpolding vorstoss. Die maximalen Ferneisstände der Riß-Kaltzeit betrugen gemäß Klaus Doben (1970) mehr als 1200 Meter über N. N., sowohl im Dreiseengebiet als auch im Großen Wappachtal. Der Gurnwandkopf trug sogar einen kleinen Lokalgletscher, der unterhalb der Wände des Westsporns nach Nordwesten zum Südende der Röthelmoosalm hin abfloss. Der Gipfel ragte damals knapp 500 Meter aus den ihn umgebenden Ferneismassen.