Meddeb war stark an aktuellen zeitgeschichtlichen Ereignissen interessiert. Nach den Terroranschlägen am 11. September 2001 vertiefte er sich in Fragen des Multikulturalismus, der Integration und des Islamismus. Ausfluss dessen ist sein Buch "La maladie de l’Islam" (deutsch: „Die Krankheit des Islam“, 2002), für das er den Literaturpreis „François Mauriac“ erhielt und das innerhalb der islamischen Welt, aber auch in Europa heftige Debatten auslöste. 2007 wurde ihm der „Prix international de francophonie Benjamin Fondane“ für sein Buch „Contre-prêches“, „Zwischen Europa und Islam (115 Gegenpredigten)“ (2007) verliehen. Auf Deutsch erschienen seine Romane „Talismano“ (1993) und „Aya“ (1998).