Върховният съд на Северна Осетия обвинява Масхадов в съпричастност към терористична дейност – терористичния акт в театъра на метростанция „Дубровка“ в Москва през 2002 г., което той отрича според радио BBC. Убит е на 8 март 2005 г. в резултат от спецоперация на Федералната служба за сигурност (ФСБ) на Русия.