Le les étudiants manifestent à Budapest et déclenchent les évènements révolutionnaires. Le lendemain le le jour de l'entrée des chars russes à Budapest il est démis de ses fonctions et remplacé par Imre Nagy puis il s'envole pour l'URSS avec Ernő Gerő premier secrétaire du parti communiste hongrois. Hegedüs à la demande expresse de Iouri Andropov signe le une demande d'intervention des forces russes en Hongriepour selon ses mots abattre une « contre-révolution fasciste », demande antidatée au et transmise par télégramme crypté le par Andropov. Il revient en Hongrie en 1962. Il abandonne la politique et crée en 1968 à l'Académie des sciences de Hongrie des groupes de recherche en sociologie. Il dirige la revue "Valóság" (réalité). Il s'est opposé vivement à l'intervention des forces du Pacte de Varsovie en Tchécoslovaquie.