Anche la stagione successiva vedrà il Genoa lottare per la salvezza. La stagione inizia con la conferma di De Canio. De Canio verrà sollevato dall'incarico il 22 ottobre dello stesso anno dopo la partita Genoa-Roma persa dal Genoa 2 a 4, dopo che la Roma ha segnato 4 gol a partire dal ventisettesimo minuto, e sostituito da Luigi Delneri. Dopo la sconfitta casalinga con il Catania per 0-2 il 20 gennaio 2013, Luigi Delneri è stato esonerato dal presidente Preziosi e sostituito da Davide Ballardini, già allenatore del Grifone nel 2010/11. Ballardini conduce i rossoblù a una sofferta salvezza.. Ritornato Gasperini sulla panchina del Genoa al posto di Liverani dopo le prime giornate della stagione di Serie A 2013-2014 il Genoa ottiene una salvezza tranquilla con buoni risultati e con 44 punti finali in classifica.