В сентябре 1967 года Фунамото был вызван в национальную сборную Японии на матчи квалификации на Летние Олимпийские игры 1968 года. Его дебют состоялся 27 сентября во встрече с Филиппинами. Он делил ворота с олимпийцем Кэндзо Ёкоямой в команде с 1967 по 1975 год. Фунамото провел 19 матчей, 17 — в стартовом составе и 2 — выйдя на замену, блокируя соперников пять раз. Он пропустил 25 голов, в то время как Японии выиграла 9 встреч, 8 — проиграла и две — сыграла вничью. Он участвовал в турнире Pestabola Merdeka (1970, 1972, 1975), Азиатских играх (1970), отборочных матчах Кубка Азии (1975), квалификации на Летние Олимпийские игры 1968 и отборочных матчах на чемпионат мира по футболу (1970, 1974) за время своей карьеры в национальной команде.