Im März 1966 übernahm er als Général d’armée das Oberkommando über die französischen Truppen in Deutschland (FFA) mit Hauptquartier in Baden-Baden. Während der Mai-Unruhen flog de Gaulle am 29. Mai 1968 unter größtmöglicher Geheimhaltung zu einem kurzen Besuch zu Massu nach Baden-Baden, der Spekulationen darüber auslöste, ob de Gaulle an einen Einsatz der Armee zur Beendigung der Unruhen gedacht habe und sich nur Massus unbedingter Loyalität für einen solchen Eingriff sicher sein wollte. Dass de Gaulle auch seine Familie und seine Wertsachen bei sich gehabt hatte, gab Spekulationen über eine eventuelle Flucht des Präsidenten Raum. Den Inhalt des Vier-Augen-Gespräches, das er mit de Gaulle eineinhalb Stunden geführt hatte, gab Massu in seinem 1983 in Paris erschienenen Buch „Baden 68“ wieder. Zuvor hatten die 1982 erschienenen Memoiren von Georges Pompidou den Schleier, der über dieser Begegnung lag, gelüftet.