Em 14 de Setembro, na sede da Falange Libanesa, quando fazia seu último discurso como chefe das Forças Libanesas, as 16h10 uma bomba explodiu, causando a morte de Bachir e outros 26 falangistas. No começo acreditava-se que Bachir apenas tinha tido uns ferimentos, até sendo noticiado assim, mas na manhã seguinte foi confirmada sua morte. Habib Shartouni, um cristão maronita do Partido Social Nacionalista Sírio, foi preso pelo assassinato. Ele havia colocado a bomba um dia antes e a explodiu assim que sua irmã estivesse segura, sendo preso quando voltou pra conferir se ela estava bem. Mais tarde confessou, dizendo que "Bashir estava vendendo o país para Israel". Após a morte de Bashir, falangistas irados invadiram os campos de concentração palestinos e com conivência de Israel cometeram um massacre contra os palestinos lá presentes, no que ficou conhecido como Massacre de Sabra e Chatila.