Durante o começo da Era da Reconstrução, Davis permaneceu em silêncio. Mas de forma privada, para pessoas próximas, ele afirmava que o domínio do governo federal sobre o sul era injustificado. Ele dizia que o governo dos "yankees e negros" na sua terra era opressivo. Davis acreditava piamente que a raça branca era superior a negra e afirmava que a ordem social do sul deveria ser mantida com o homem branco dominando as "castas inferiores". Em 1881, ele reassumiu o controle da sua plantação de Brierfield, no Mississippi.