1969年に行われた総選挙でフィアナ・フォールが勝利すると、ヒラリーは外相に就任した。1972年1月30日、北アイルランドのデリーでイギリス軍のパラシュート連隊によって市民が銃撃され、このうち13人が死亡するという事件（「血の日曜日事件」と呼ばれる）が発生した。ヒラリーはこの直後、国際連合が平和維持に関与するよう求めるためニューヨークの国連本部を訪ね、世界的に知られるようになった。しかしこの訪米では、北アイルランド問題が悪化している状況について世界の注目を集めたほかは、得るものはほとんどなかった。この時期を通じてヒラリーは、内戦が勃発する可能性に対して平和的な手段を追求しようとするリンチの信頼できる盟友の一人であった。ヒラリーは温厚な政治家と考えられていたが、1971年の党大会で気概を見せた。リンチの北アイルランド政策に反対していたケビン・ボーランド元防衛相が、リンチのスピーチの直前になって演台の近くに突進し、公然と大きな声で党首を非難した。ボーランド派の党員もこれに呼応しボーランドを賛美し始めたが、ステージの横にいたヒラリーは近くにあったマイクを手にし、「"You can have Boland, but you can't have Fianna Fáil"」と大声をたててボーランドたちを鎮めた。