Pela Seleção Argentina, Ortega estreou em 1993, em uma partida contra a Alemanha em Miami. Viria ainda a representar a "Albiceleste" em três Copas do Mundo. Conquistou a medalha de ouro nos Jogos Pan-Americanos de 1995, obteve a medalha de prata nos Jogos Olímpicos de 1996 e o vice-campeonato na Copa das Confederações de 1995. Disputou um total de 86 partidas e marcou 17 gols.