In Cannes wurde Scorsese 1986 als bester Regisseur für "Die Zeit nach Mitternacht" ausgezeichnet und zurück ins Rampenlicht gerückt. Sein Billard-Drama "Die Farbe des Geldes" spielte weltweit 130 Mio. Dollar ein, "Die letzte Versuchung Christi" (1988) wurde trotz des Boykotts christlicher Gruppen ein Achtungserfolg. Mit dem Thriller-Remake "Kap der Angst" (1991) und dem Kostümfilm "Zeit der Unschuld" (1993) betrat Scorsese künstlerisches Neuland. 1995 beschloss er mit "Casino" seine Mafia-Trilogie, die er mit "Hexenkessel" und "Good Fellas – Drei Jahrzehnte in der Mafia" (1990) begonnen hatte. Auch die Verfilmung der Jugendjahre des Dalai Lama "(Kundun", 1997) und das New-York-Drama "Bringing Out the Dead" (1999) wurden von der Kritik gelobt. Den kommerziellen Höhepunkt seiner Karriere erreichte Scorsese aber mit "Gangs of New York" (2002), "Aviator" (2004) und "Departed – Unter Feinden" (2006), jeweils mit Leonardo DiCaprio in der Hauptrolle.