W 2001 roku Bolaños został powołany przez szkoleniowca Ricardo Armendáriza do reprezentacji Ekwadoru U-17 na Młodzieżowe Mistrzostwa Ameryki Południowej. Tam jego drużyna zanotowała bilans zwycięstwa, remisu i dwóch porażek, zajmując ostatnie miejsce w pierwszej rundzie i nie kwalifikując się na Mistrzostwa Świata U-17 w Trynidadzie i Tobago. Dwa lata później znalazł się w składzie reprezentacji Ekwadoru U-20 na kolejne Młodzieżowe Mistrzostwa Ameryki Południowej. Na urugwajskich boiskach pełnił rolę jednego z ważniejszych graczy swojej kadry, rozgrywając pięć z ośmiu spotkań i zdobywając bramkę z rzutu karnego w spotkaniu z Paragwajem (2:3), natomiast Ekwadorczycy zdołali awansować do rundy finałowej, lecz uplasowali się w niej na ostatniej pozycji i nie zdołali awansować na Mistrzostwa Świata U-20 w Zjednoczonych Emiratach Arabskich. W 2005 roku, reprezentując barwy tej samej kategorii wiekowej, wziął udział w swoich trzecich Młodzieżowych Mistrzostwach Ameryki Południowej, gdzie miał niepodważalne miejsce w wyjściowym składzie i wystąpił we wszystkich czterech meczach od pierwszej minuty, a jego zespół przegrał swój komplet spotkań i odpadł z kontynentalnego turnieju w pierwszej rundzie, przez co nie dostał się na Mistrzostwa Świata U-20 w Holandii.