Некоторые операции с участием SAS получили скандальную известность. В 1988 году в Гибралтаре в ходе операции «Флавий» спецназовцами были расстреляны трое безоружных волонтёров ИРА: Майред Фаррелл, Дэниэл Маккен и Шон Сэвидж. Британский суд оправдал всех спецназовцев, заявив, что применение силы было неизбежно. В 1995 году британские оперативники SAS координировали действия авиации НАТО, которая была должна бомбить позиции Армии Республики Сербской, но также совершала бомбардировки населённых пунктов, запугивая гражданское население. Оперативники занимались и поимкой командиров Армии Республики Сербской. В 1999 году британцы оказывали помощь Армии освобождения Косово, и это вмешательство, согласно албанским источникам, привело к тому, что в одной из стычек с сербскими спецназовцами был убит сержант SAS.