1998 року Естемірова полишає педагогічну діяльність і переходить на телебачення. Працюючи журналістом вона збирає та документує факти порушення прав людини під час першої чеченської війни. Протягом 1998—1999 років відзняла та випустила в ефір 13 телепередач про жертв російської каральної системи, допомагала колишнім ув'язненим російських фільтраційних таборів у Чечні.