太平洋战争爆发时三水战隶属于第一舰队，职责与一水战近似。1943年4月1日，编入负责东南方向（所罗门群岛一带海域）的第八艦隊内。1944年（昭和19年）7月上旬，盟军攻占塞班岛，三水战司令部全灭。联合舰队打算重建三水战，作为反潜部队使用。8月20日，以三水战残存部队为基础，建立了。