Utomhussäsongen 2016 inledde Susanna Kallur vid Bauhaus-galan på Stockholms Stadion den 16 juni. Här kom hon i hård konkurrens femma på tiden 13,00. Detta följde hon upp den 25 juni i en gala där hon visserligen tog stryk av finländskan Nooralotta Neziri men kom tvåa på tiden 12,91, vilket gav en tiondeplats på säsongens europalista. I början på juli ställde Kallur så upp vid EM i Amsterdam där hon gick vidare från försöken genom att vinna sitt heat på 13,01, men sedan slogs hon ut i semifinal med tiden 12,96. Den 27 juli sprang Kallur 100 meter häck vid Folksams GP i Karlstad och tog där sin första vinst sedan 2010, tid 13,06. Vid de Olympiska spelen i Rio de Janeiro ställde Kallur så upp i försöken på 100 meter häck den 16 augusti men blev endast femma i sitt heat och då inte heller tiden 13,04 räckte för avancemang slogs hon ut från fortsatt tävlande. I slutet av augusti sprang Kallur 100 meter slätt på SM. Där tog hon silver efter överraskningen Khaddi Sagnia.