Em novembro de 1940, Priller foi transferido para a Jagdgeschwader 26 "Schlageter" (JG 26) e recebeu o comando do 1.º Esquadrão. Em junho e julho de 1941, ele contabilizou mais 20 vitórias, ganhando-lhe a Cruz de Cavaleiro da Cruz de Ferro com Folhas de Carvalho em 19 de outubro de 1941. Priller foi nomeado "Gruppenkommandeur" (comandante do grupo) do III. "Gruppe" do JG 26 "Schlageter" em 6 de dezembro de 1941. Ele reivindicou sua 70.ª vitória em 5 de maio de 1942. Priller tornou-se "Geschwaderkommodore" (comandante de ala) do JG 26 "Schlageter" em 11 de janeiro de 1943. Durante a Invasão Aliada da Normandia em 6 de junho de 1944, ele voou em uma das poucas missões da Luftwaffe contra a cabeça de praia Aliada naquele dia. Priller conquistou sua 100.ª vitória em 15 de junho de 1944. Por essa conquista, ele foi condecorado com a Cruz de Cavaleiro da Cruz de Ferro com Folhas de Carvalho e Espadas. Durante a Operação Bodenplatte em 1 de janeiro de 1945, Priller liderou um ataque aos campos de aviação Aliados em Bruxelas-Evere e Bruxelas-Grimbergen. Em 31 de janeiro de 1945, Priller foi nomeado "Inspekteur der Jagdflieger West" (Inspetor de Pilotos de Caça do Oeste) e deixou de fazer voos operacionais. Ele ocupou esse cargo até o final da guerra em maio de 1945.