Произведённый в 1808 году в офицеры, Шебеко неоднократно отличался в Отечественную войну 1812 года и последующих Заграничных походах 1813—1814 годов: за Тарутино награждён орденом св. Владимира 4-й степени, за Кацбах — орденом св. Анны 3-й степени, за Битву народов под Лейпцигом — орденом св. Анны 2-й степени, а за Шатобриенн, где ранен пулей в руку, чином штабс-капитана.