11 февраля 1977 года в городе Мостар был основан университет. Он получил имя Джемала Биедича, югославского боснийского государственного деятеля, погибшего в 1977 году в авиакатастрофе. Во время Боснийской войны в 1992 году активы университета были присвоены хорватскими активистами. Он был переименован в "Университет Мостара", а в качестве официального языка обучения был принят хорватский. Профессора-мусульмане покинули университет и в мае 1993 года основали новое учебное заведение со старым названием "Университет Джемала Биедича". Университет расположился в бывших югославских военных казармах.