Столь же критически эксперты Института Катона оценивают происходящее в последние годы, как они считают, ущемление гражданских свобод американцев. Они резко осудили проведенную в 1993 г. по приказу тогдашнего министра юстиции Джанет Рино (Janet Reno) операцию против последователей Ветви Давидовой в Уэйко (штат Техас). Позднее они критиковали принятый в США Закон о борьбе с терроризмом (Patriot Act), содержание под стражей участников так называемых неприятельских незаконных вооруженных формирований вроде Хосе Падильи (José Padilla) в тюрьме Гуантанамо и энергичное отстаивание администрацией Буша-младшего прав исполнительной власти на односторонние действия.