Водно-болотні угіддя в дельті Німана знаходяться під охороною Рамсарської конвенції . З метою захисту дикої природи та сприяння науковим дослідженням в 1992 році був створений регіональний парк Дельта Німана . Він займає 239,5 км² і складається з 14 заповідників, а також одніє водойми. Близько 20 % поверхні парку вкриті водою. З 1999 року, щороку у жовтні, Литовською асоціацією орнітологів та адміністрацією регіонального парку організовується спостереження за птахами. Щороку дельта затоплюється, але найбільшою загрозою для неї є забруднення, розвиток сільського господарства, рибальства і туризму.