W reprezentacji Egiptu Shobair zadebiutował w 1987 roku. W 1990 roku został powołany przez selekcjonera Mahmouda El-Gohary'ego do kadry na Mistrzostwa Świata we Włoszech. Tam był podstawowym bramkarzem Egiptu i rozegrał 3 spotkania grupowe: z Holandią (1:1), z Irlandią (0:0) i z Anglią (0:1). W swojej karierze grał także w Pucharze Narodów Afryki 1992 i Pucharze Narodów Afryki 1994. Od 1987 do 1996 roku rozegrał w kadrze narodowej 59 spotkań.