In seguito al ritorno in Serie A, il Siena saluta Conte che si accasa alla Juventus: per la stagione 2011-12 i toscani sono allenati da Sannino. In campionato la squadra si rende protagonista di buone prestazioni, raggiungendo una tranquilla salvezza: con 44 punti in classifica, viene eguagliato il primato in Campionato stabilito nel 2007-08.