Ян Вацлав Каливода родился 21 февраля 1801 года в городе Праге. В 1815 году был среди первых выпускников Пражской консерватории, ученик Фридриха Вильгельма Пиксиса. В 1816—1821 годах играл в оркестре пражского театра. С 1822 года был придворным композитором князей Фюрстенберг и жил преимущественно в их резиденции Донауэшингене (до революции 1848 года).