1943. november 10-én Liebehenschelt kinevezték az auschwitzi megsemmisítő tábor parancsnokának. 1944. május 19-én a majdaneki megsemmisítő tábor parancsnoka lett. A háború után amerikai hadifogságba került és Lengyelországba szállították. Az Auschwitz-perben Krakkóban elítélték és 1948. január 28-án kivégezték.