Markos Botzaris (grekiska: Μάρκος Μπότσαρης, albanska: Marko Boçari), född ca 1788 i södra Epirus, död 21 augusti 1823, var Arvanit (albanska befolkning i nuvarende Grekland) med namnet Marko Boçari, senare ändrat av grekerna till Botzaris. Botzaris var en grekisk general omskriven som en hjälte i det Grekiska frihetskriget och kapten över sulioterna. Botzaris är en nationalhjälte i Grekland. Han tillhörde sulioterna, en kristen folkgrupp, och var son till Kitsos Botzaris, som i sin tur var son till Georg Botzaris.