Am 27. August 1886 kehrte Hoffmann nach zwei erfolgreichen Jahren in Afrika in der Heimat zurück. Zunächst wieder im Hydrographischen Amt der Marine und in der Admiralität als Leiter des Dezernates für Schiffe im Ausland, Taktik und Signalwesen tätig, wurde Hoffmann am 6. April 1888 vom Kaiser Friedrich III. zum Kommandanten der Panzerfregatte "Kaiser" ernannt. In dieser Funktion und mit seinem Schiff vertrat Hoffmann Deutschland im Mai 1888 an der Weltausstellung in Barcelona; er begleitete den neuen Kaiser Wilhelm II. im Sommer 1888, unmittelbar nach seiner Thronbesteigung, bei seinen Antrittsvisiten in St. Petersburg, Kopenhagen und Stockholm und Anfang August 1889 beim Antrittsbesuch bei seiner Großmutter Königin Victoria im Osborne House auf der Insel Wight. Es folgte eine Mittelmeerreise bis Ende April 1890 nach Piräus/Athen (Teilnahme an der Hochzeit der Kaiserschwester Sophie), Konstantinopel (Besuch bei Sultan Abdülhamid II.), Korfu (Besuch bei Kaiserin Elisabeth), Venedig, Triest (Besuch der Torpedowerft Whitehead), und zurück nach Wilhelmshaven. Während dieser Reise fuhr Kaiser Wilhelm II. meist auf Hoffmanns Schiff, was ihm in der Flotte den Ehrentitel »Kutscher des Kaisers« eintrug. Am 10. Oktober 1892 zum Kontreadmiral befördert – war Hoffmann Mitglied der Schiffsprüfungskommission, Lehrer an der Marineakademie und Vorstand der wissenschaftlichen Dienste der Marine (zur »Nautischen Abteilung« aufgewertet).