Il est également clair que Luxemburg, qui n'avait pas été condamnée mais pendant une bonne partie ou la totalité de cette période, était simplement détenue en « garde à vue » a pu recevoir des visiteurs et n'a pas été empêchée d'écrire copieusement pendant qu'elle était en prison. Jacob a réussi à faire sortir en contrebande plusieurs manuscrits importants de la prison, dont les « lettres de Spartacus » ("« bulletins d'information »") et le « pamphlet Junius », critique importante de Luxemburg sur la crise qui se déroule au Parti social-démocrate, à la suite de la décision de la direction du parti de convenir de ce qui équivalait à une trêve parlementaire (), notamment sur les questions de financement de la guerre. Cependant, bien que le pamphlet Junius soit devenu un document emblématique, à l'époque il s'est avéré impossible de trouver un éditeur avant la sortie (temporaire) de la prison de Luxemburg en 1916. À partir de 1917, Mathilde Jacobs travaille également intensivement avec Leo Jogiches, l'associé politique de Luxemburg. Leur collaboration a perduré tant dans la période révolutionnaire que pendant celle de la République de Weimar que l'Allemagne a connue juste après la guerre. Mathilde Jacobs était certainement présente au congrès de trois jours du parti qui a commencé le et qui a marqué la fondation du Parti communiste d'Allemagne. Il est probable qu'elle y ait participé activement.