Γεννήθηκε στη Τσαγκαράδα της Θεσσαλίας το 1807. Οι γονείς του πέθαναν όταν ήταν ήδη μικρός και ο θείος του Κωνστάντιος που τον υιοθέτησε κατά το ξέσπασμα της ελληνικής επανάστασης του 1821, τον πήρε μαζί του στο Κάιρο καθώς και στο Μοναστήρι της Αγίας Αικατερίνης στο Όρος Σινά. Μετά την διαμονή στην Αίγυπτο, ο Ευαγγελινός Αποστολίδης έγινε μαθητής του Ανθίμου Γαζή το 1828 στη Σύρο όπου είχε μεταφερθεί ο λόγιος των Μηλαιών μετά την έναρξη της επανάστασης. Καλούμενος ο "μικρός Σοφοκλής" από τον Μάγνητα δασκαλό του, θα μεταναστεύσει στις ΗΠΑ το 1829 όπου και θα αρχίσει τις σπουδές του με την οικονομική βοήθεια του ιεραποστόλου Μπριούερ. Το 1842 διορίστηκε υφηγητής της ελληνικής γλώσσας στο Πανεπιστήμιο Χάρβαρντ και το 1860 ανέλαβε καθηγητής της έδρας στο αυτό πανεπιστήμιο στο οποίο και δίδαξε μέχρι τον θάνατό του το 1883.