Во время ирландской войны за независимость Койл жила в зоне Лонгфорда и Роскоммона. Она предоставляла наброски местного полицейского участка тамошней Ирландской республиканской армии (ИРА). Эния регулярно подвергалась преследованиям со стороны чёрно-пегих в Роскоммоне; её дом дважды разрушали члены организации. Она была арестована в канун нового 1921 года и приговорена к трём годам каторжных работ за помощь членам ИРА. Согласно уставам СИЖ, она отказалась признать вину во время суда. В своих записях Койл отмечала: «Я читала газету на протяжении всей этой комедии и только один раз подняла глаза, чтобы сказать председателю, что он тратит своё драгоценное время зря, поскольку я не признаю его фиктивный суд. Из-за того, что я говорила по-ирландски один из полицейских должен был перевести эти мои семь мудрых слов».