Tatăl, Jan Długosz din Niedzielska, care s-a distins în Bătălia de la Grunwald, a avut 12 copii cu două soții, dintre care trei fii au purtat numele de Jan. Cel care se va înscrie mai târziu în istorie ca un "părinte al istoriografiei poloneze" și-a început studiile în școala parohială din Nowy Korczyn, unde tatăl său a fost staroste din 1421. Apoi, timp de trei ani a studiat la Universitatea din Cracovia.