Lors de l'indépendance tadjike en 1991, une longue guerre civile (1992-1997), dans laquelle les communistes et les islamistes se sont affrontées, a empêché la prospérité économique. En 1993, afin de préserver la stabilité interne du pays et freiner le trafic de drogue depuis l'Afghanistan vers l'Europe, la Russie a signé un traité avec le Tadjikistan par lequel lui est confiée la surveillance des frontières de cette ancienne république soviétique. Après une relative période d'accalmie débutée en 1997, la décision du président Emomali Rakhmonov en de hâter le départ des gardes-frontières russes a été perçue comme un recul de l’influence de Moscou au Tadjikistan. Depuis, Douchanbé a accepté l’installation d’une base militaire russe ainsi que la location d'un centre de contrôle de l'espace cosmique de Nourek pour une durée indéterminée. La pérennisation de la présence militaire russe () au Tadjikistan permet à Moscou de peser un poids plus important dans la région en renforçant son influence militaire et politique. Outre ce potentiel militaire, la Russie dispose également d'une base aérienne à Ayni et de diverses installations militaires à Douchanbé, Qurghonteppa et Koulab.