Von 2000 bis 2003 war Michael Jordan Mitbesitzer und Manager der Franchise und spielte auch selber noch für das Team. Der Erfolg blieb dennoch aus. Die Wizards erreichten während Jordans Spielzeit kein einziges Mal die Playoffs, obwohl man gute Spieler wie Jerry Stackhouse oder Larry Hughes im Team hatte. Vor allem wurde Jordans Führungsstil als Manager des Teams kritisiert. So wählte er beim NBA-Draft 2001, Kwame Brown an erster Stelle aus, ohne das dieser die Erwartungen je erfüllen konnte. Hoffnungsvolle Talente wie Richard Hamilton wurden unter Jordan verkauft.