Im siebenjährigen Dreikronenkrieg stand Qualen zwischen 1563 und 1570 im Dienst des dänischen Königs Friedrich II. und führte dabei 1569 die Eroberung der Festung Varberg im schwedischen Halland herbei, bei deren Belagerung der Feldherr Daniel Rantzau gefallen war. Als Auszeichnung für die besonderen Verdienste wurde er zum Feldmarschall ernannt.