Mientras tanto, había recibido preocupantes informes de la inteligencia británica que decían que estaba en peligro de ser asesinado y que su país podría enfrentar un golpe de estado. Los miembros de su tribu estaban descontentos con la supuesta sumisión de Habibullah a los británicos, y su consejo y parientes hablaron abiertamente de sus sospechas por su inactividad. Habibullah comenzó a depurar su tribunal de funcionarios que se sabía eran cercanos a Nasrullah y Amanulá. Recordó a los emisarios que había enviado a Persia para conversar con Alemania y Turquía en busca de ayuda militar. Mientras tanto, la guerra empeoró para las Potencias Centrales. La Rebelión árabe contra Turquía y la pérdida de Erzurum ante los rusos acabaron con las esperanzas de enviar una división turca a Afganistán. La influencia alemana en Persia también disminuyó rápidamente, poniendo fin a las esperanzas de que Goltz Bajá pudiera liderar una división de voluntarios persas en Afganistán. La misión se dio cuenta de que el emir desconfiaba profundamente de ellos. Un nuevo intento de la inteligencia británica de proporcionar información falsa a la misión, supuestamente originada en Goltz Bajá, convenció a von Hentig de la falta de confianza del emir. Nasrullah hizo una última oferta en mayo de 1916 para sacar a Habibullah del poder y liderar las tribus fronterizas en una campaña contra la India británica. Sin embargo, von Hentig sabía que no llegaría a nada y los alemanes abandonaron Kabul el 21 de mayo de 1916. Niedermayer ordenó a Wagner que se quedara en Herat como oficial de enlace. Los miembros indios también se quedaron, persistiendo en sus intentos de alianza.