1990년부터 1997년까지 고향팀인 클루브 올림피아의 유소년팀에서 활동하다가 1997년 성인팀 입단으로 프로에 정식 데뷔를 알렸다. 이후 현재까지 고국인 파라과이를 비롯해 독일, 잉글랜드, 스페인, 멕시코의 8개 프로팀에서 활동하며 통산 514경기 147골을 기록하고 있으며 특히 클루브 올림피아에서 1997년부터 1999년까지 뛰었다가 17년만인 2016년에 다시 복귀하여 현재까지 133경기에서 58골을 터뜨리며 팀의 2번의 리그 3연패에 공헌했고 바이에른 뮌헨 시절에는 155경기에서 31골을 기록하며 분데스리가 5회 우승, DFB-포칼 4회 우승, DFL-리가포칼 2회 우승, 2000-01년 UEFA 챔피언스리그 우승, 2001년 인터콘티넨털컵 우승에도 크게 기여했다. 또한 블랙번 로버스 소속으로 잉글랜드 프리미어리그 2007-08 시즌 팀내 최고의 선수에 선정됐고 1999년과 2018년 파라과이 올해의 선수에도 선정되었으며 2007년 12월에는 프리미어리그 이달의 선수에도 선정되는 영예를 안았다.