Di in anno più tardi è la convocazione nella nazionale maggiore dove debutta il 24 ottobre 2010 nell'incontro vinto per 3-0 sulle avversarie della nell'ambito della qualificazioni al Mondiale di Germania 2011. In quell'occasione la Grecia, inserita nel gruppo 3, si classifica terza nel girone fallendo la qualificazione alla fase finale. Negli anni seguenti Kongoulī diventa una presenza fissa in squadra, inserita in rosa sia per le qualificazioni agli europei di Svezia 2013 e Paesi Bassi 2017 che ai mondiali di Canada 2015, dove realizza la sua prima rete nella nazionale maggiore, l'unica segnata dalla Grecia nell'incontro del 26 ottobre 2013 perso 7-1 con il , e Francia 2019, fallendo sempre la qualificazione alla fase finale.