Il 23 novembre del 1980, un forte terremoto scosse la Campania e la Basilicata e anche la chiesa dell'Ave Gratia Plena (in particolar modo la cupola) rimase notevolmente danneggiata. L'edificio, ritenuto non agibile, venne chiuso al pubblico. In questo periodo di chiusura diversi furono i furti, tra i più gravi è da ricordare quello di una grande collezione di pastori napoletani del XVIII secolo e di un ostensorio d'argento settecentesco. A seguito di un complessivo e discutibile restauro dell'edificio, la chiesa venne riaperta al pubblico solo il 1º aprile del 2001, giorno in cui venne consacrata la nuova mensa eucaristica dal Cardinale Michele Giordano.