В клубе стал основным вратарём. Во многом благодаря ему «Днепр» в сезонах 2014/15 и 2015/16 стал бронзовым призёром чемпионата Украины. В сезоне 2014/15 Бойко вместе со своей командой дошёл до финала Лиги Европы, где «Днепр» в упорной борьбе уступил «Севилье» со счётом 2:3. Вошёл в символическую сборную турнира. В чемпионате «днепряне» заняли 3-е место не дотянувшись до второго, лигочемпионского места, во многом благодаря сложной концовке календаря (в 23-ем, 24-ом и 25-ом турах «Днепр» играл соответственно с «Зарёй», киевским «Динамо» и «Шахтёром»).