3 августа 2019 года, во время протестов за регистрацию кандидатов в Мосгордуму, СК РФ возбудил уголовное дело по ч. 4 ст. 174 УК РФ (Легализация (отмывание) денежных средств или иного имущества, приобретённых другими лицами преступным путём). Следствие считает, что близкие к ФБК люди, а также сотрудники фонда, в 2016—2018 годах легализовали через счета организации около 1 миллиарда рублей, которые были получены ими от неустановленных лиц, получивших эти деньги преступным путём. Леонид Волков, комментируя эту информацию, заявил, что сотрудники правоохранительных органов хотят объявить «отмыванием денег» пожертвования в фонд, которые шли через его счета, и таким образом сделать невозможным финансирование региональных штабов Навального. 8 августа в качестве обеспечительной меры был наложен арест на счета ФБК и некоторых его сотрудников на 75 миллионов рублей; были также заблокированы банковские счета региональных штабов Навального (в целом арест был наложен более чем на 100 счетов). По словам Леонида Волкова, 75 миллионов рублей, которые якобы были отмыты, представляют собой выручку от продажи пожертвованных ФБК биткойнов, когда покупатели оплачивали покупку биткойнов, внося наличные на счёт через банкоматы. По мнению Волкова, это «простая, известная и совершенно законная операция», а цель уголовного дела — «разломать финансирование нашей структуры, чтобы мы не могли платить зарплату, налоги, аренду».