С 1968 по 1971 год Ренни был заместителем Лоуренса Микельмора, генерального комиссара Ближневосточного агентства ООН для помощи палестинским беженцам и организации работ, убедившего генерального секретаря ООН У Тана назначить Ренни в качестве своего преемника. Джон Шоу Ренни занимал пост генерального комиссара Ближневосточного агентства ООН для помощи палестинским беженцам и организации работ с 1971 по 1977 год. Его штаб-квартира располагалась в Бейруте и на своём посту он застал войну судного дня 1973 года и гражданскую войну в Ливане.