Samuel Atlee wurde privat unterrichtet. Im Jahr 1745 kam er mit seiner Mutter nach Lancaster in Pennsylvania. Er begann ein Jurastudium, das er aber abbrach, um am Siebenjährigen Krieg (1756–1763) teilzunehmen. Dabei stieg er bis zum Hauptmann der Miliz von Lancaster auf. Er nahm an mehreren Feldzügen und Schlachten teil. Ob er dann sein Jurastudium fortsetzte und als Jurist arbeitete, ist nicht überliefert.