Tussen 1993 en 2001 kwam hij 54 keer uit voor het nationale team van Roemenië. Prodan maakte deel uit van de Roemeense selectie tijdens het WK 1994 en het EK 1996. Zijn enige goal maakte hij op 12 november 1994 in de met 3-2 gewonnen EK-kwalificatie wedstrijd tegen Slowakije.