Nachdem er bereits zweimal im Provinziallandtag der Grenzmark Posen-Westpreußen gesessen und diese Provinz von 1926 bis 1929 im Reichsrat vertreten hatte, zog Warnke 1928 als Abgeordneter für die Zentrumspartei in den Reichstag in Berlin ein, dem er bis 1933 angehörte. Im März 1933 stimmte er zusammen mit den übrigen Zentrumsabgeordneten für das Ermächtigungsgesetz, was indessen nicht verhinderte, dass er einige Monate später aus dem Reichstag entfernt wurde. Während der Zeit des Nationalsozialismus war er beruflichen Benachteiligungen und politischer Verfolgung ausgesetzt. Nach dem Attentat vom 20. Juli 1944 wurde er im August 1944 von der Gestapo in Haft genommen und nach seiner Haftentlassung im Oktober 1944 unter Polizeiaufsicht gestellt.