Daniels wurde mit fünf Emmys ausgezeichnet und elfmal nominiert. 1989 wurde er für "Saturday Night Live" ausgezeichnet. Die von Greg Daniels verfasste "Die Simpsons"-Folge Lisas Hochzeit wurde 1995 mit einem Emmy ausgezeichnet, 1999 die "King of the Hill"-Folge „And They Call It Bobby Love“. Zweimal wurden seine Drehbücher für "Das Büro" mit einem Emmy ausgezeichnet, bei der Primetime-Emmy-Verleihung 2007, zusammen mit Michael Schur, für die Folge "Gay Witch Hunt" und bei der Primetime-Emmy-Verleihung 2011 für "Goodbye, Michael".