Ende der 1940er Jahre begann Zeiß gemeinsam mit Propst Ernst zur Nieden die Bedeutung der Sportseelsorge durch Vorträge zu propagieren. Er initiierte die noch heute stattfindenden Sporttagungen der Evangelischen Akademien. Den ersten evangelischen Gottesdienst anlässlich einer großen Sportveranstaltung überhaupt hielt Zeiß während des Motorradrennens auf dem Schottenring 1952. Aufgrund dieser Erfahrungen entsandte die Kirchenleitung mit Karl Zeiß erstmals einen Pfarrer für die Fußball-Weltmeisterschaft in Bern 1954. So fand das „Wunder von Bern“ unter seelsorglichem Beistand statt.