Innenpolitisch musste Djohar in seinem zweiten Jahr eine massive Schwächung hinnehmen, da seine Regierungspartei durch den Austritt verschiedener Minister mit anschließender Parteineuhgründungen gespalten wurde. Aufgrund wechselnder Koalitionen waren unterjährig zudem verschiedene Regierungsumbildungen notwendig. Anfang Dezember 1991 brachten 24 von 42 Parlamentariern ein Misstrauensvotum ein, dessen Umsetzung „vom Parlamentssprecher manipulativ verhindert wurde“. Außenpolitisch stand der Präsident „unter massiven Pressionen Frankreichs, das eine Verfassungsreform fordert und gleichzeitig finanziellen Druck ausübte, um die Regierung zu einem Strukturanpassungsübereinkommen mit den beiden Bretton-Woods-Übereinkommen zu bewegen“. Um die Bindung an die islamische Welt zu stärken, entsandte er im Januar 1991 ein Truppenkontingent anlässlich des zweiten Golfkriegs nach Saudi-Arabien, zudem wurden die bilateralen Beziehungen zu Madagaskar weiter intensiviert. Staatsbesuche führten ihn u. a. nach Frankreich und Belgien. Die innenpolitischen Komplikationen, die Djohar zu bewältigen hatte, setzten sich auch in seinem dritten Jahr fort – so musste er im Mai und Juli gleich zweimal die Regierung umbilden. Zudem wurden am Jahresanfang diverse politische Streiks durchgeführt, da Djohars Regierung nicht mehr in der Lage war, die Gehälter der Staatsangestellten zu bezahlen. Im Februar 1992 gingen gar Schüler und Studenten in einen Hungerstreik. Außerdem wurde er im August 1991 vom Präsidenten des Obersten Gerichtshof aus dem Amt entlassen, ignorierte diese Maßnahme jedoch und verhaftete stattdessen sämtliche Mitgliedes des Obersten Gerichtshofs. Anschließend rief er den Notstand aus.