El 9 de diciembre siguiente resultó decisivo marcando el gol del definitivo 0-1 en casa del Palermo, servido por un taconazo de Mirko Vučinić. El 5 de mayo de 2013, exactamente a una vuelta de distancia, tras la victoria de la Juventus frente al equipo "palermitano" nuevamente por 1-0, ganó el segundo scudetto consecutivo. En el primer partido oficial de la temporada 2013-14, la Supercoppa que el 18 de agosto de 2013 lo vio enfrentarse a su exequipo la Lazio, Lichtsteiner fue uno de los protagonistas de la victoria bianconera realizando el tercer gol y dando dos asistencias a sus compañeros en el 4-0 con el que la Juventus venció a los "biancocelesti".