Prijedor este menționat pentru prima dată ca un mic fort din lemn în lista locurilor din Imperiul Otoman care au fost devastate de trupele croate între 1693 și 1696. Aceste regiuni au fost sub stăpânire otomană până în 1878. Cu aproximativ 200 de ani în urmă, în această parte a Bosniei, au fost construite un număr mare de fortificații pentru a proteja granițele deseori contestate cu Austria. Mai târziu, multe fortificații au fost distruse în timpul războiului dintre Liga Sfântă și Imperiul Otoman în timp ce granițele au fost mutate spre est și spre sud în favoarea Austriei. Prima mențiune a orașului, care se referă la acesta ca „Palanka Praedor” într-un raport scris în limba latină a unui mareșal austriac despre așezările fortificate, apare între 1693 și 1696. Termenul "„Palanka”" indică o fortificație din lemn construită pe o insulă creată artificial pe râul Sana. Nu este clar cum a primit numele Prijedor, dar există două teorii. Una dintre ele se referă la termenul "„prodor”" care în limba locală însemnând revărsare și se referea la râul Sana care deseori inunda întreaga zonă. A doua teorie face referire la o întrecere dintre un bărbat și un cal (un cal este cunoscut în mod obișnuit în regiune ca "„Doro”"). Omul a câștigat și se spune că a ajuns la linia de sosire înaintea calului, ceea ce în limba locală se exprimă ca "„Prije Dore”" .