Lorsque la Wehrmacht allemande envahit les Pays-Bas le 10 mai 1940, le sous-marin "O 26" n'était pas encore complètement terminé dans le chantier naval. Bien que le personnel du chantier naval ait tenté de couler le bateau, qui était encore dans la forme, l'occupation allemande étonnamment rapide de la rive sud de la Meuse le a contrecarré cette tentative. Deux sous-marins jumeaux, le "O 25" et le "O 27", toujours en construction, sont également devenus des butins allemands. Tous trois ont ensuite été complétés et mis en service par la Kriegsmarine sous les numéros "U-D3" (ex "O 25"), "U-D4" (ex "O 26") et "U-D5" (ex "O 27"). Avec ces sous-marins, la Kriegsmarine a également capturé le Schnorchel, qui avait déjà été installé dans la marine néerlandaise sur les sous-marins "O 19" et "O 20".