Synagoga została zbudowana około 1900 roku, kiedy to gmina żydowska w Dżardżisie przekroczyła 1000 członków. W 1982 roku synagoga została podpalona przez lokalnych Arabów w reakcji na masakrę w Sabrze i Szatili. Wówczas doszczetnie zniszczono zwoje Tory znajdujące się w jej wnętrzu. Po tych wydarzeniach synagoga została gruntownie odnowiona i obecnie służy 100. osobowej gminie żydowskiej.