Sikandar Lodi morì per cause naturali nel 1517 e il suo secondo figlio Ibrahim Lodi salì al trono. Questi non godeva del sostegno dei nobili afghani e persiani o dei capi regionali, tanto che dovette subito preoccuparsi di eliminare nemici interni quale suo fratello maggiore Jalal Khan, insediato come governatore di Jaunpur da suo padre che era forte dell'apprezzamento degli amiri e dei capi. Ibrahim Lodi non riuscì a consolidare il suo potere e, dopo la morte di Jalal Khan, il governatore del Punjab Daulat Khan Lodi si rivolse a Babur, discendente diretto di Tamerlano e fondatore della dinastia Moghul, spronandolo ad attaccare il Sultanato di Delhi. Babur sconfisse e uccise Ibrahim Lodi nella battaglia di Panipat nel 1526, evento che segna la fine del Sultanato di Delhi e l'insediamento nella regione dell'Impero Moghul.