Зосередивши в своїх руках всю повноту цивільної та військової влади, отаман зберіг і представницькі органи влади — обласні та повітові земські збори, дозволив діяльність профспілок. Верховними органами влади були Народні збори і уряд Забайкальської республіки, сформовані колишнім отаманом Забайкальського козачого війська (згодом — Верховним Головнокомандувачем Східним фронтом Російської армії, Верховним Головнокомандувачем Далекосхідної армії) генерал-лейтенантом Григорієм Семеновим ще в період Сибірської республіки.