Boruyerdí recibió instrucción primaria y secundaria en la escuela Alaví de los iraníes de Nayaf (Iraq), a donde se había desplazado su familia para realizar estudios su padre en los seminarios islámicos de la ciudad. En 1970, con veinte años, regresó a Irán e inició estudios en la Universidad de Tabriz. Siendo estudiante, se implicó en el activismo político que desembocaría en la Revolución Islámica de 1979, por lo que resultó detenido por la SAVAK y encarcelado. En 1975 se licenció en como técnico de laboratorio de diagnóstico clínico y se empleó en los laboratorios Mehrab Jan de Mashhad y, posteriormente, de la Media Luna Roja en Dubái. En Dubái prosiguió su militancia política como organizador de la diáspora iraní en el emirato y fue por ello sometido a interrogatorios policiales a petición de la SAVAK.