В 1793 году в 23 года во время Французской войны за независимость он вступил в 82-й пехотный полк в качестве капитана благодаря покупке звания. В 1794 году он перешёл в недолго просуществовавший 97-й Пехотный полк, а после его роспуска в 1795 году в 67-ой пехотный. Будучи в 97-м, Хоутон и его войска провели несколько месяцев с флотом Канала в качестве импровизированных морских пехотинцев. Его отец умер в том же году, и титулы, поместья и политические должности перешли к его старшему брату Генри Филиппу Хоутону.