Tras la muerte de Jomeini en 1989, este fue sucedido por Alí Jamenei, actual jefe de estado, quedando la jefatura del gobierno abierta a unas elecciones cada cuatro años en las que se ha asistido a una pugna entre un sector reformista liderado por Muhammad Jatami y otro sector conservador. El 18 de julio de 1994 en Buenos Aires se produjo el Atentado a la AMIA, en la que se acusó a Irán de la masacre a la institución judía.