Moussa Ag Acharatoumane est alors désigné comme le représentant du MNLA à l'étranger. Il participe en France à des conférences universitaires et à des débats télévisés. Sur le terrain, le MNLA est battu par des djihadistes en 2012, avant de reprendre pied dans la région de Kidal en 2013, lors de l'Opération Serval. En 2014, il forme avec d'autres groupes la Coordination des mouvements de l'Azawad (CMA), puis signe en 2015 un accord de paix à Alger avec l'État malien. Cependant la CMA entre en conflit avec des groupes armés pro-gouvernementaux rassemblés au sein de la Plateforme des mouvements du 14 juin 2014 d'Alger, et en particulier avec le Groupe autodéfense touareg Imghad et alliés (GATIA).