Во время крымской русско-турецкой войны 1853—1855 гг. Ганчар помогал Чайковскому в формировании отряда султанских казаков. Когда русские войска заняли Добруджу, ему пришлось удалиться в Константинополь. Генерал Ушаков, командовавший войсками в Добрудже, арестовал двух старообрядческих епископов и одного священника; они были сосланы в Спасо-Евфимьевский монастырь в Суздале. Ганчар усиленно хлопотал о их возвращении перед правительствами турецким и французским, но безуспешно. По окончании войны он возвратился в Добруджу и продолжал агитацию в пользу своих единоверцев.