Das Gebiet von Namakkal stand im Laufe seiner Geschichte unter der Herrschaft wechselnder Dynastien. Wohl im frühen 17. Jahrhundert entstand unter der Ägide von Ramachandra Nayaka, einem Statthalter der Nayaks von Madurai, eine Festung in Namakkal. Die Festung wurde in der Folgezeit von den muslimischen Sultanen von Bijapur und Golkonda, den Königen von Mysore sowie den Marathen beherrscht. Die Briten eroberten Namakkal 1768 im Ersten Mysore-Krieg, verloren die Stadt aber kurz darauf wieder an Hyder Ali. Am Ende des Dritten Mysore-Krieges musste Tipu Sultan von Mysore 1792 die Gegend von Namakkal aber an Britisch-Indien abtreten. Die Briten gliederten das Gebiet als Teil des Distrikts Salem in die Provinz Madras ein. Nach der indischen Unabhängigkeit 1947 kam das Gebiet zum Bundesstaat Madras, der 1956 nach den Sprachgrenzen des Tamil neu formiert und 1969 in Tamil Nadu umbenannt wurde. Als eigenständiger Distrikt entstand der Distrikt Namakkal 1997 durch Abspaltung vom Distrikt Salem.