Sommeren og høsten 2012 var Bø rammet av en bakterieinfeksjon, ifølge pressen var det TWAR. Først 1. november ble Bø friskmeldt og han tok tiden til hjelp for å bli trene seg opp igjen. Først i VM i skiskyting 2013 i Nové Město na Moravě havnet Bø på pallen, da han gikk på det norske laget som i tredje VM på rad tok gull på mix stafett. Der gikk han sammen med Tora Berger, Synnøve Solemdal og Emil Hegle Svendsen. På fellesstarten tok han gull foran Anton Sjipulin og Emil Hegle Svendsen etter å ha skutt feilfritt på alle fire skytinger.