Entre 1959 i 1964, Gašparovič va estudiar a la facultat de lleis de la Universitat de Comenius, a Bratislava, què és la universitat central del país. Aquell mateix any, es va casar amb Silvia Beníková, amb qui té dos fills. El 1968 va ingressar al Partit Comunista de Txecoslovàquia, presumptament per reforçar les reformes proposades per Alexander Dubček. El 1968 però, després de la invasió soviètica de Txecoslovàquia, en fou expulsat. Des de llavors, i fins a 1990, va exercir de professor a la Facultat de Dret a la Universitat Comenius de Bratislava.