19. heinäkuuta 2014 Gourcuff siirtyi Algerian maajoukkueen päävalmentajaksi nelivuotisen sopimuksella. Gourcuffin johdolla Algeria eteni Afrikan mestaruuskisoissa 2015 puolivälieriin, joissa Norsunluurannikko pudotti sen 3–1 voitolla. MM2016-karsinnoissa Algeria voitti Gourcuffin johdolla kolme lohkovaiheen ensimmäistä otteluaan ja varmisti paikkansa seuraavalle kierrokselle. Maaliskuun lopulla 2016 Gourcuff kertoi yllättäen haluavansa jättää maajoukkuevalmentajan tehtävät. Huhtikuun alussa vahvistettiin, että Gourcuff on purkanut vuoteen 2018 ulottuneen sopimuksena Algerian liiton kanssa.