Seperti anggota lain dari bekas pemerintah Jepang, Kishi diadakan di Penjara Sugamo sebagai "Kelas A" kejahatan perang menduga dengan urutan Panglima Tertinggi Sekutu. Tidak seperti Tojo (dan beberapa anggota kabinet lainnya), namun, Kishi dirilis pada tahun 1948 dan tidak pernah didakwa atau diadili oleh Pengadilan Militer Internasional untuk Timur Jauh. Namun, ia tetap secara hukum dilarang memasuki urusan publik karena pembersihan Sekutu pendudukan terhadap anggota rezim lama.