18 марта 1810 года Ушаков был назначен командиром Черниговского пехотного полка. С самого начала Отечественной войны 1812 года Ушаков находился в сражениях с французами, отличился в арьергардных боях под Витебском, за что был произведён в полковник. В Бородинской битве он был ранен пулей в рот с повреждением челюсти, а ядром ему раздробило левую ногу. Впоследствии она была ампутирована ниже колена. 23 декабря 1812 года он был награждён орденом св. Георгия 4-го класса (№ 1122 по кавалерскому списку Судравского и № 2489 по списку Григоровича — Степанова)