Als einer der wenigen in der polnischen Führung verstand er die Doktrin des neuen Krieges – des Blitzkrieges. Am Anfang des Zweiten Weltkriegs war Kutrzeba Befehlshaber der in Großpolen stationierten Armee "Armia Poznań", die aus vier Divisionen und zwei Brigaden bestand. Mit diesem Verband (zusammen mit den Kräften der Armee Pommern (´Armia Pomorze´)) war es ihm gelungen, zwischen dem 9. September und 18. September 1939 in der Region um Kutno eine Gegenoffensive (Schlacht an der Bzura) gegen die deutsche Wehrmacht durchzuführen, in der vor allem die Front der deutschen 30. Infanterie-Division schwer bedroht und die deutsche 8. Armee zur Reorganisation gezwungen wurde. Der Angriff wurde um einige Tage zu spät durchgeführt, da sich der polnische Generalstab – und in erster Linie der Oberbefehlshaber, Marschall Rydz Smigly – zuerst weigerte, den Plan der Offensive zu akzeptieren. Stattdessen wurde Kutrzebas Armee nach Warschau zurückgerufen und befand sich zwischen dem 2. und 8. September 1939 tagelang auf dem Rückzug. Unter anderem wegen dieser Verspätung und der Überlegenheit der Luftwaffe (die polnischen Luftkräfte waren zu diesem Zeitpunkt nur noch zur Hälfte einsatzbereit – ca. 200 Flugzeuge – und konnten somit gegen die deutsche Luftwaffe nichts mehr ausrichten), aber auch wegen der fehlenden Entlastung durch die Westalliierten (Frankreich und Großbritannien weigerten sich entgegen vertraglicher Zusicherung, dem umkämpften Land zur Seite zu stehen) trat die "Armia Poznań" den Rückzug nach Warschau an, um dort an der Verteidigung der polnischen Hauptstadt teilzunehmen.