Amnell aloitti opintonsa Turun akatemiassa vuonna 1711, Suuren Pohjan sodan aikana. Pohjalaisen osakunnan matrikkelissa hänestä käytetään lisämäärettä "Calajokiensis". Hän on mahdollisesti joutunut pakenemaan Ruotsin puolelle Isovihan aikana. Joka tapauksessa hänet vihittiin papiksi Turun hiippakunnassa 1. marraskuuta 1722. Samana vuonna hänestä tuli Turun ruotsalaisen seurakunnan kappalainen. 5. toukokuuta 1733 hänestä tuli kirkkoherra vauraaseen Tammelan pitäjään. Vuodesta 1736 alkaen hän toimi samalla myös lääninrovastina.