Το 1999, κατά τη διάρκεια του πολέμου του Κοσσυφοπεδίου, ο Μπάιντεν υποστήριξε τον βομβαρδισμό του ΝΑΤΟ το 1999 στην Ομοσπονδιακή Δημοκρατία της Γιουγκοσλαβίας. Συνυπέγραψε με τον Τζον Μακέιν, το ψήφισμα McCain-Biden του Κοσσυφοπεδίου, το οποίο κάλεσε τον Πρόεδρο Κλίντον να χρησιμοποιήσει όλες τις απαραίτητες δυνάμεις, συμπεριλαμβανομένων των στρατιωτικών δυνάμεων, για να αντιμετωπίσει τον Σλόμπονταν Μιλόσεβιτς, για τις γιουγκοσλαβικές ενέργειες έναντι Αλβανών στο Κοσσυφοπέδιο.