De macht in Danzig lag "de facto" echter bij de Franse gouverneur Jean Rapp die er Franse soldaten liet inkwartieren en de stad buitensporige sommen geld deed opbrengen. Het Continentaal stelsel verstoorde de handel met Engeland. Na Napoleons mislukte Russische veldtocht belegerden Russische troepen de stad voor een periode van 11 maanden in 1813. Uiteindelijk gaven de Fransen zich op 17 november over. Het Franse garnizoen werd in opdracht van tsaar Alexander I naar Rusland afgevoerd.