بر اساس نوشته‌های هرودوت، مگاباتس به دلیل مشارکت مشترک در محاصره ناکام ناکسوس در ۴٩٩ پیش از میلاد مشهور است. او با آریستاگوراس و دارا بودن ٢٠٠ کشتی توسط داریوش بزرگ اعزام شد تا جزیره کوچک اژه را به شاهنشاهی پارس متصل کند.