В апреле 1936 года во время второй итало-эфиопской войны Гульельмо Наси командовал левой колонной Южного фронта (командующий фронтом — Родольфо Грациани). После начала Второй мировой войны Наси возглавил в 1940 году итальянское завоевание Британского Сомалиленда, вынудив британские силы эвакуироваться морем в Аден. В 1941 году в результате британского контрнаступления Наси был вынужден отступить в укреплённый Гондэр. После того, как 6 июля капитулировали Амадей Савойский и Пьетро Гадзера, гарнизон под командованием Наси остался последней итальянской частью в Восточной Африке, продолжающей боевые действия, а он сам — вице-королём и генерал-губернатором Итальянской Восточной Африки. Гульельмо Наси сдался в Гондэре лишь 28 ноября 1941 года, и был отправлен в лагерь для военнопленных в Кению.