Quando altre repubbliche costituenti dell'Unione Sovietica avanzarono pretese di sovranità nel 1988 e 1989, la leadership turkmena iniziò a sua volta a criticare le politiche anche economiche di Mosca, tacciandole di sfruttamento del benessere e dell'orgoglio dei turkmeni. Con voto unanime del Soviet Supremo, il Turkmenistan dichiarò la propria sovranità nell'agosto 1990. Dopo il tentativo di colpo di stato dell'agosto 1991 contro il regime di Gorbačëv a Mosca, il leader comunista turkmeno Saparmyrat Nyýazow indisse un referendum popolare sull'indipendenza. Il risultato ufficiale fu del 94% a favore dell'indipendenza, pertanto il Soviet Supremo della repubblica non poté far altro che dichiarare l'indipendenza del Turkmenistan dall'Unione Sovietica e l'istituzione della Repubblica del Turkmenistan il 27 ottobre 1991. Il Turkmenistan ottenne l'indipendenza dall'Unione Sovietica il 26 dicembre 1991.