В первый же день войны В. И. Залесский был вызван с дачи в военкомат. Ему отправили на зенитные установки, оборонявшие столицу. С 15 июля 1941 г. инженер-майор В. И. Залесский служил помощником командира противотанкового артиллерийского полка, затем помощником командира по технической части 36-й отдельной истребительно-противотанковой артиллерийской бригады на 1-м Прибалтийском фронте. В сентябре 1944 года участвовал в Шауляйской операции.