Le Nigeria est le seul pays à avoir boycotté deux fois les Jeux. Il boycotte seul les Jeux de 1978 pour protester contre la participation de la Nouvelle-Zélande, qui maintient des relations sportives avec l'Afrique du Sud, où sévit alors le régime de l'apartheid. Et il est, avec le Ghana, l'instigateur d'un large boycott des Jeux de 1986, pour protester contre le refus du gouvernement britannique de Margaret Thatcher d'appliquer des sanctions à l'encontre de l'Afrique du Sud. Absent par ailleurs aux Jeux de 1962, le Nigeria est le premier pays à être suspendu du Commonwealth, de 1995 à 1999, pour l'exécution de Ken Saro-Wiwa et d'autres activistes par le régime militaire du dictateur Sani Abacha. Le Nigeria est ainsi interdit de participation aux Jeux de 1998.