Efter jordskælvet i Haiti den 12. januar 2010, var Hédi Annabi rapporteret savnet, i Christopher Hotel som var FN's hovedkvarter i Haiti. Selv om at Haitis præsident René Préval, tidligere havde bekræftet at Hédi Annabi var død, var han dog meldt savnet indtil den 16. januar 2010, hvor man officielt erklærede ham for død, efter at man havde fundet hans lig i ruinerne af bygninger i Port-au-Prince. Da jordskælvet skete, var han til møde med en kinesisk delegation.