Pada tanggal 17 Agustus 1945, tak lama setelah bom atom Hiroshima dan Nagasaki serta terjadinya peristiwa kekalahan Jepang, Presiden Soekarno memproklamasikan kemerdekaan negara Indonesia. Selama berlangsungnya revolusi melawan kembali pasukan Belanda, orang Eropa ditahan (meskipun kepala pastor tetap orang Belanda). Penahanan ini memastikan bahwa jemaat akan terus didominasi oleh orang Jawa dan pribumi lainnya.