À partir des années 1990 avec l'arrivée de Alex Ferguson en 1987 le club étoffe son palmarès avec 2 nouvelle Ligue des champions en 1999 et en 2008, une coupe des coupes en 1991 et une supercoupe de l'UEFA en 1991 et le club atteint souvent la finale lors des supercoupes de l'UEFA en 1999 et en 2008 et 2 finales de ligues des champions en 2009 et en 2011.