Durante a Campanha de Maryland, a divisão do general Cadmus Wilcox foi adicionada ao comando de Anderson. Na Batalha de Antietam em setembro de 1862, ele estava no comando geral da posição conhecida como Sunken Road ("estrada afundada"), ou Bloody Lane ("Alameda Sangrenta"), no centro da defesa da Confederação. Foi ferido na coxa e deixou a batalha (o brigadeiro sênior, Roger Atkinson Pryor, assumiu seu posto) sem o qual sua divisão começou a perder força e, posteriormente, sucumbiu aos ataques pelos flancos da União que os expulsaram de sua posição. Na Batalha de Fredericksburg, naquele dezembro, a sua divisão não esteve seriamente envolvida.