De basis werd in augustus 1876 opgericht door kolonel Nelson A. Miles tijdens de nasleep van de Slag bij de Little Bighorn. Het doel van de basis was een nieuwe huisvesting voor de cavelerie te creëren en zo de Cheyenne en Sioux die betrokken waren bij de slag de weg naar Canada te versperren. Aanvankelijk stond de basis bekend als de Tongue River Cantonment, maar die naam werd veranderd naar Fort Keogh als eerbetoon aan kapitein Myles Keogh, die gestorven was in de slag bij de Little Bighorn. In 1877 werd het fort het hoofdkwartier van het militaire district Yellowstone. Miles werd in september dat jaar benoemd tot brigadier en kreeg het bevel over de basis.