Napoléon le fait le grand aigle de la Légion d'honneur et le nomme sénateur avec une pension annuelle de le . Ayant brièvement quitté sa division de cuirassiers en août — son rôle de parlementaire étant incompatible avec l'exercice d'un commandement au sein de l'armée d'active —, le général d'Hautpoul est réintégré à son poste dès le mois de septembre avec le déclenchement de la guerre contre la Prusse. Il sert à Iéna le et à la prise de Lübeck le . Il est employé avec sa division au de cavalerie de Bessières le , puis sous Murat de nouveau le . À la bataille d'Eylau, après avoir exécuté deux charges à la tête de sa division de cuirassiers, il est blessé lors d'une troisième, atteint d'un biscaïen. Refusant d'être amputé d'une jambe, contre l'avis du chirurgien Larrey, il meurt cinq jours après le de septicémie.