Анатолиј Вјачеславович Лебед је рођен 10. мај 1963. у граду Валга у Естонији. Његов отац Вјачеслав Андрејевич Лебед је учествовао у Стаљинградској бици, што је пресудно утицало да се и Анатолиј определи за војну каријеру. Војни рок је служио 1981. године у Литванији и Казашкој Совјетској Социјалистичкој Републици. Прошао је Војну ваздухопловно-техничку школу Ломоносов и постао дипломирани инжењер летења 1986. године.