С 1802 по 1805 год Баратынский командовал второю гребною эскадрою, а затем, приняв начальство над кораблем «Св. Петр», из Кронштадта отплыл в Корфу, в 1806 и 1807 годах плавал в Адриатических водах, участвовал при взятии крепости Тенедос и в сражениях с турецким флотом при Дарданеллах и у Афонской горы, после чего из Архипелага перешёл в Бокка-ди-Каттаро. 15 января 1807 года произведён за кампанию 1806 года в капитан-командоры.