Torna dall'Europeo Under-19 con la sua Spagna per la stagione 2009-10 e viene convocato per la Emirates Cup 2009. Sostituisce Aaron Ramsey al 67' della partita contro l'Atletico Madrid e parte titolare confezionando l'assist per Eduardo contro i . Vincendo poi la partita 3-0, l'Arsenal vince la coppa. Viene poi incluso in prima squadra e debutta nella nuova stagione col numero 46 sulla schiena al 70' della seconda partita della stagione, contro il Portsmouth. Più tardi gli viene data la maglia numero 32, precedentemente indossata da Theo Walcott. Dato che il contratto di Mérida scade nel giugno 2010, interrogato sulla questione, il giocatore risponde che sta discutendo con il club per trovare un accordo e spera di arrivare ad un compromesso; il 5 novembre l'Arsenal conferma di aver trovato l'accordo verbale col giocatore, e che il contratto vero e proprio doveva ancora essere firmato. Mérida gioca contro il West Ham in FA Cup nel 2-1 vittorioso per i "Gunners". Il 17 gennaio 2010 subentra al 62' per Craig Eastmond e segna al 77' del 2-0 al Bolton il suo primo gol in Premier con la maglia dell'Arsenal.