Als im September 1326 die ins Exil geflüchtete Königin Isabelle zusammen mit Roger Mortimer und einem Heer in England landete, um Eduard II. zu stürzen, begleitete Baldock den König und Despenser auf ihrer Flucht nach Westengland und weiter nach Wales. Am 26. Oktober 1326 wurde Baldock als Kanzler für abgesetzt erklärt, und am 16. November 1326 wurden der König und Despenser mit den wenigen ihnen verbliebenen Gefolgsleuten, darunter Baldock, bei Llantrisant gefangen genommen. In Hereford beanspruchte Bischof Orleton, dass Baldock sich als Geistlicher nicht vor einem weltlichen, sondern vor einem geistlichen Gericht verantworten müsse. Orleton nahm ihn angeblich mit nach London. In "Monthalt", dem Londoner Stadthaus des Bischofs, wurde Baldock jedoch von einem aufgebrachten Mob ergriffen, der sich auf die Rechte der City of London berief. Baldock wurde in das Gefängnis im Newgate gebracht, wo er einige Monate später an den Folgen seiner Verletzungen und Misshandlungen starb. Er wurde auf dem Friedhof der Kanoniker der St Paul's Cathedral beigesetzt.