Ассоциация воинствующего духовенства была одной из немногих активных республиканских групп во время Ирано-иракской войны. «Свободная политическая атмосфера» не была обеспечена в Иране из-за особых условий военного времени, и Ассоциация воинствующего духовенства стала единственной активной политической организацией после роспуска в 1987 году Исламской республиканской партии (при этом все священнослужители-члены партии были членами Ассоциация, но не все члены Ассоциация входили партию). В связи с усилением разногласий между фракциями в правительстве Мир-Хосейна Мусави, организация раскололась и была создана реформистски настроенная Ассоциация боевого духовенства.