Tot în această perioadă, teritoriul Statelor Papale au fost teatrul de operațiuni între această țară, pe de-o parte, și romano-germani și spanioli, pe de altă parte, pentru controlul anumitor zone însemnate (Parma, Modena, Ferrara, Urbino, Rimini, Piacenza). Înainte ca Sfântul Imperiu să declare război protestanților, oștenii lui Carol Quintul au devastat și jefuit cetatea Romei și împrejurimile ei în 1527. Cu aceeași împrejurare, împăratul romano-german l-a prins și l-a întemnițat pe Papa Clement al VII-lea. Câțiva ani mai târziu, Filip al II-lea al Spaniei l-a înfrânt în luptă pe papa Paul al IV-lea.