John Fitzgerald Byers est né le , soit le jour de l'assassinat de son homonyme John Fitzgerald Kennedy (initialement, ses parents avaient choisi le même prénom que son père, Bertram), et est originaire de Sterling en Virginie. Il est l'homme qui dirige ce petit groupe de génies qui tombent toujours à point pour aider l'agent Mulder dans ses enquêtes. Byers est le visualisateur, l'idéologiste, l'expert en manipulation des informations et des complots. Il a de profondes connaissances en science et en génétique.