Op het wereldkampioenschap voetbal onder 20 dat in juni en juli 2005 in Nederland werd gehouden, won Ustari met Argentinië de wereldtitel. Hij maakte deel uit van de Argentijnse selectie voor het wereldkampioenschap voetbal 2006. Op 22 augustus 2007 maakte de doelverdediger zijn debuut in het Argentijnse elftal in het vriendschappelijke duel tegen Noorwegen (2–1 verlies).