В марте 1864 года Потомакская армия была реорганизована, количество корпусов было сокращено, и в итоге Эйрс стал командовать 4-й бригадой 1-й дивизии V корпуса. В этом звании он участвовал в Оверлендской кампании Гранта, а во время осады Петерсберга стал командиром новой 2-й дивизии V корпуса. 1 августа 1864 года он получил временное звание генерал-майора добровольческой армии. В этом звании он участвовал в Аппоматтоксской кампании.