La communauté carmélite parvint à échapper aux affres révolutionnaires françaises, put se maintenir à Courtrai à partir de 1802 malgré un épisode de dix ans pendant lequel le monastère fit office de grange agricole et de prison. Des sœurs furent même envoyées rétablir leur congrégation à Louvain. En 1873 et en 1894, le monastère fut de nouveau agrandi. Hélas, il fut endommagé par les bombardements de 1918 mais obtint les réparations nécessaires en 1920.