El escándalo producido por el Proyecto Camelot, la Guerra de Vietnam y otros sucesos similares marcaron el desencuentro entre la Sociedad Americana de Antropología y los gobiernos de EE. UU. Este desencuentro se materializó en la interrupción de cualquier forma de colaboración de Antropología Operativa en favor de los intereses de Estados Unidos. Pero ya en el siglo XXI primero con la Invasión de Irak de 2003, después en la Guerra de Afganistán y más tardes con su continuación desde 2015, la Antropología Operativa ha conocido un gran desarrollo. El motivo de este desarrollo ha sido que los estudios antropológicos sobre los grupos humanos de Irak y Afganistán han permitido reducir el número de bajas de soldados, pertenecientes a la Coalición Internacional, producidas por artefactos explosivos improvisados. En el año 2005 se inició de nuevo la colaboración entre el Ministerio de Defensa de EE. UU. y la Antropología Operativa. Desde entonces el Enfoque Cultural aplicado a las operaciones militares ha tenido gran desarrollo. En 2009 con la llegada del general McChrystal a Afganistán, se ha decidido dar un cambio de timón en los planteamientos básicos de la estrategia, que tenga en cuenta el “entorno humano”.