À Park City, sur la piste qui l'avait sacrée championne olympique de slalom géant, Janica Kostelić remporte le premier slalom de la saison 2002-2003, la douzième victoire de sa carrière dans cette discipline. Elle est devancée la semaine suivante par la Suédoise Anja Pärson à Aspen. Le , à Lenzerheide, elle monte à nouveau sur la première marche du podium en slalom. Grâce à sa acquise la veille en descente, elle remporte également l'épreuve de combiné. La semaine suivante, à Semmering, elle est devancée par l'Italienne Karen Putzer en slalom géant, puis s'impose en slalom avec plus d'une seconde sur Christel Pascal, affirmant encore un peu plus sa domination sur le classement général de la Coupe du monde. Dans le slalom de Bormio, elle relègue sa première rivale, Elisabeth Görgl, à plus de deux secondes. Au cours du mois de janvier, elle obtient deux nouveaux podiums, l'un en slalom géant à Cortina d'Ampezzo, l'autre à Maribor, battue à deux reprises par Anja Pärson, et se présente en favorite avant les Mondiaux de Saint-Moritz. Lors de la première épreuve, le super-G, elle ne se classe que , handicapée par une douleur au ménisque de son genou droit, qui la contraint de renoncer à prendre le départ de la descente. Malgré la douleur physique, elle s'aligne sur le combiné. Elle réalise un bon temps dans la descente puis met à profit ses qualités de slalomeuse pour devancer l'Autrichienne Nicole Hosp de seulement six centièmes de seconde. Elle obtient ainsi son premier titre mondial. Seulement du slalom géant, Janica Kostelić dispute sa dernière épreuve, le slalom, le . Elle domine la première manche, puis distance à nouveau ses concurrentes autrichiennes Marlies Schild et Nicole Hosp dans la seconde manche. Elle remporte sa deuxième médaille d'or et son premier titre mondial en slalom, une performance que réalise également son frère Ivica Kostelić le lendemain, en s'adjugeant le slalom messieurs.