Im Rahmen des Zweiten Burenkriegs wurden die "Habicht" und die "Hyäne" zur Kapkolonie entsandt, da Spannungen zwischen dem Reich und Großbritannien wegen der Durchsuchung von deutschen Schiffen aufgetreten waren. Da Kapstadt momentan nicht mehr für Wartungen zur Verfügung stand, sollten Leckagen in Kamerun beseitigt werden, was extrem aufwändig war. 1901 wurden daher die sonst in Kapstadt durchgeführten Arbeiten in Luanda in Portugiesisch-Westafrika (Angola) vorgenommen. 1902/03 besuchte die "Habicht" eine Reihe von westafrikanischen Häfen.