Keisse maakte op 1 januari 2005 de overstap van Jong Vlaanderen 2016 naar Chocolade Jacques-T Interim. Samen met ploegmaat Matthew Gilmore won hij in het zesdaagse seizoen 2005-2006 vier wedstrijden Firenzuola, Grenoble, Gent en Hasselt. Daarnaast wonnen ze ook het Europees kampioenschap ploegkoers en werden ze derde op het wereldkampioenschap. In 2006 kroonde Keisse zich tot Europees kampioen achter de Derny, het daaropvolgende jaar werd hij tweede achter de Nederlander Matthé Pronk. Op het WK van 2007 werd Keisse tweede tijdens de puntenkoers. Hij verzamelde 21 punten minder dan winnaar Juan Llaneras uit Spanje. Nog een jaar later werd hij voor de tweede maal in zijn carrière Europees kampioen ploegkoers. Ditmaal in combinatie met Kenny De Ketele.