Сложные процессы, происходившие в СССР в конце 1980-х годов, а также после его распада, вызвали значительные изменения в НПИ. Несмотря на это в 1989 году в нём был создан радиотехнический факультет, а в 1992 году — финансово-экономический и на базе машиностроительного — отдельный факультет по переподготовке специалистов с высшим образованием, вскоре преобразованный в Институт повышения квалификации при НПИ.