Se ha debatido si el Ejército Gubernamental puede considerarse una fuerza colaboracionista, o simplemente el ejército sumiso de un estado derrotado. Su oficial al mando, Jaroslav Eminger, fue juzgado y absuelto por cargos de colaboración después de la Segunda Guerra Mundial, algunos miembros de la fuerza participaron en operaciones de resistencia activa simultáneas con su servicio en el ejército y, en los últimos días del conflicto, elementos del ejército se unieron al levantamiento de Praga.