Durant la Première Guerre mondiale, le service est drastiquement réduit, avec un unique convoi mixte quotidien. En 1916, au vu de la proximité du front de la Somme, les autorités établissent un vaste faisceau de garage militaire en gare de Breteuil-Embranchement, ce qui vaut à la ligne d'être bombardée le lors de la dernière offensive alliée.