Ондоа со своей сборной успешно квалифицировался на Кубок африканских наций 2015, проходивший в Экваториальной Гвинее. Фабрис играл все девяносто минут в трёх матчах группового этапа против Мали (1:1), Гвинеи (1:1) и Кот-д’Ивуара (0:1), пропустив в каждой из этих встреч. Сборная заняла последнее место, набрав два очка и потеряв все шансы на выход плей-офф.