В ходе Семилетней войны во время берлинского рейда русских войск в конце сентября 1760 года дворец получил серьёзные повреждения от обстрелов. Королева Елизавета Кристина была вынуждена покинуть Шёнхаузен и спасалась в крепости Магдебурга. Дворец был сильно разграблен дошедшими до Берлина русскими казачьими и гусарскими войсками, а кастелян Петерс - жестоко избит розгами. В 1764 году король выделил средства на перестройку Шёнхаузена; именно в перестроенном виде дворец сохранился до настоящего времени. Оба боковых флигеля были надстроены в высоту до уровня основного здания, а двор был перекрыт широкой лестницей.