С 10 марта 1943 года полковник Д. Т. Никишин — командир 6-го гвардейского бомбардировочного авиационного корпуса 2-й воздушной армии 2-го Украинского фронта, который участвовал в Верхнесилезской, Берлинской и Пражской наступательных операциях. За образцовое выполнение заданий командования при взятии Берлина и проявленные при этом доблесть и мужество корпус и Д. Т. Никишин были награждены орденом Суворова 2-й степени.