После освобождения И. И. Волкотрубенко был назначен начальником Центральных артиллерийско-технических курсов усовершенствования офицерского состава (с 1956 года — Центральные артиллерийско-технические офицерские курсы). В августе 1958 года на базе курсов создаётся Пензенское высшее артиллерийское инженерное училище. И. И. Волкотрубенко руководил училищем до 1966 года, был делегатом XX (в 1956 году), XXII (в 1961 году) и XXIII (в 1966 году) съездов КПСС, членом бюро Пензенского обкома КПСС, депутатом Пензенского областного совета депутатов трудящихся.