Fran Vázquez, der schon als Junior mit Spanien die Silbermedaille bei U20-Europameisterschaft 2002 gewann, feierte am 27. August 2005 sein Debüt in der A-Nationalmannschaft. Er war zudem Teil des Kaders bei der Basketball-Europameisterschaft 2005 sowie bei der Basketball-Weltmeisterschaft 2010. Vázquez kam auf 41 A-Länderspiele, bei den Ausscheidungsspielen für die WM 2019 war er Spielführer der spanischen Mannschaft.