Erwin Jaenecke wurde am 1. April 1934 zum Oberstleutnant befördert und im Oktober 1934 erhielt er das Kommando über das sich im Aufbau befindliche Pionier-Bataillon 31 in Höxter an der Weser. Am 1. März 1936 erfolgte die Beförderung zum Oberst. Am 26. April 1937 war Jaenecke in der Legion Condor beim Luftangriff auf Guernica in Spanien als Chef des Stabes des Sonderstabes W, beteiligt.