После разгрома Юго-Западного фронта в Киевском сражении 26 сентября 1941 года возглавил Харьковский военный округ. В ноябре назначен командующим 58-й резервной армией, формирующейся в Сибирском военном округе. Неизвестно, командовал ли он непосредственно этой армией, поскольку, по воспоминаниям его сына, полковника Кузнецова, генерал Кузнецов лежал в это время в госпитале.