Für die Werktätigen der im Rahmen der deutschen Aufrüstung geschaffenen Junkers Flugzeug- und Motorenwerke in Dessau wurde in Waldersee eine "Junkers-Siedlung" mit 512 Häusern errichtet. Während des Zweiten Weltkrieges fielen 130 Einwohner. In den letzten Kriegstagen kam es zum Einsatz des Volkssturmes. Auf Drängen der Bevölkerung wurden Verhandlungen mit den heranrückenden US-amerikanischen Truppen aufgenommen, die am 23. April 1945 zur Besetzung des Ortes führten. Entsprechend den alliierten Vereinbarungen von Jalta wurde der Ort nach Abzug der amerikanischen Streitkräfte am 4. Mai 1945 der Roten Armee übergeben.