В 1788-1792 годах — посол на Четырёхлетнем сейме. Был инициатором проведения первой переписи на территории Речи Посполитой. В 1792 году присоединился к Тарговицкой конфедерации и стал консуляром генеральной коронной конфедерации. В 1793 года на гродненском сейме после добровольной отставки Михаила Ежи Мнишека Фредерик Юзеф Мошинский был назначен последним маршалком великим коронным. На этом сейме вошёл в состав гродненской конфедерации, которая признала Второй раздел Речи Посполитой между Россией и Пруссией. В 1793 году вошел в состав нового Постоянного Совета, где возглавил полицию и экономическую комиссию.