Κατά τη διάρκεια της εκστρατείας στα Βαλκάνια, ο Φογκτ ηγήθηκε του 2ο Λόχου του 2ου τάγματος αναγνώρισης των SS και κατά τη διάρκεια της γερμανικής εισβολής στη Σοβιετική Ένωση συμμετείχε με τη 2η SS μεραρχία Πάντσερ «Das Reich». Αρρώστησε βαριά με τύφο και μετά την ανάρρωσή του τον Οκτώβριο του 1941 έγινε δάσκαλος και εκπαιδευτής στη σχολή αξιωματικών των SS στο Μπαντ Τελτς και από τον Φεβρουάριο του 1942 στο Λάουενμπουργκ.