Durante a Segunda Guerra Mundial serviu no Exército Britânico. Foi comissionado no Corpo Médico do Exército Real como tenente em 12 de abril de 1940. Recebeu o service number 128673. Recebeu a Cruz Militar durante a Batalha de Singapura, tornando-se prisioneiro de guerra. Serviu durante grande parte de seu cativeiro como trabalhador escravo na Ferrovia da Birmânia. Quando foi libertado no final da guerra, Pantridge estava emaciado e contraíra beribéri; sofreu de problemas de saúde relacionados à doença pelo resto da vida.