Джибути продолжает развивать тёплые отношения с Эфиопией, отражая фундаментальные экономические связи между странами и давнюю традицию торговли. Однако, военное участие Эфиопии в кампании в Сомали в 2007 году вызвали широкую критику среди большинства сомалийского населения Джибути. В 2007 году президент Джибути Исмаил Омар Гелле участвовал в саммите Африканского союза в Эфиопии и поддерживал миротворческую операцию в Сомали (АМИСОМ). Эфиопия является одним из основных торговых партнёров Джибути. Президент Исмаил Омар Гелле расширил сотрудничество Джибути с Эфиопией в области политической, экономической и социальной интеграции, обе страны обязались обеспечить мир и стабильность в регионе. Страны также сотрудничают в борьбе против движений, направленных на формирование суверенного государства афарцев, которые действуют в Эфиопии, Джибути и Эритрее.