Mijlocașul a debutat pentru echipa națională reformată a Cehiei în iunie 1994, într-o victorie cu 3-1 împotriva Irlandei. Primul său turneu major a fost Euro 1996, unde a marcat primul său gol la naționala mare și și-a ajutat echipa să ajungă până în finală. El a făcut, de asemenea, parte din echipa cehă care a terminat pe locul treilea în Cupa Confederațiilor FIFA din 1997, învingând-o pe Uruguay în meciul pentru locul trei. Nedved a înscris două goluri în timpul turneului, ambele care au venit în timpul victoriei cu 6-1 din Cehia asupra Emiratelor Arabe Unite în ultimul meci din grupe, fiind învinsă în semifinale de câștigătoarea turneului, Brazilia.