С 1994 года начальник 1-го (организационно-планового) управления — заместитель начальника Главного военно-медицинского управления Министерства обороны Российской Федерации. Участник Первой и Второй чеченских кампаний, где непосредственно занимался медицинским обеспечением Объединенной группировки войск (сил). Генерал-лейтенант медицинской службы (1997). Указом Президента Российской Федерации от 24 декабря 2004 года № 1585 назначен начальником Главного военно-медицинского управления Минобороны России — начальником медицинской службы Вооружённых Сил Российской Федерации. 6 июня 2005 года на XXXVI Всемирном конгрессе по военной медицине был избран президентом Международного комитета военной медицины (был им до 2007 года).