2004年，車臣独立分子在别斯兰劫持了1,200名人质，阿爾法小組與另一特種部隊信號旗小組負責強攻體育館，行動中令兩支部隊至少有11名幹員陣亡。是次行動中俄羅斯軍方和聯邦安全局的強硬營救手段亦遭到外界批評。這些批評包括軍隊動用戰車、裝甲運兵車和武裝直升機參與營救行動，以及進行攻堅的特種部隊幹員在學校內使用火箭推進榴彈和火焰噴射器等高殺傷力武器。事件最後更以悲劇收場，其中超過300人死亡，最嚴重的是當中接近一半是小童。曾參與1980年伊朗大使館包圍戰的前英國陸軍第22特種空勤團隊員接受衛報訪問時指這是他聽過最糟糕的人質營救手段，其他受訪的前特種空勤團隊員則認為聯邦安全局的指揮方式以及地方政府的應對方法有著明顯缺陷，令特種部隊成員在欠缺指揮下只能作出臨時應變，甚至在進行攻堅前都沒有預先準備好，另外一名受訪的SAS隊員又對參與營救行動的俄羅斯特種部隊成員深表同情，認為不單是俄羅斯，其他國家也該是時候重新評估反恐策略。事後俄羅斯政府被外界質疑拒絕為事件進行深入調查，又不允許追究誤傷或誤殺人質的特種部隊人員。在2007年，447名事件中的生還者和家屬向歐洲人權法院入稟控告俄羅斯政府。