Nel 1812 la Costituzione borbonica abolì il feudalesimo in Sicilia, sotto la spinta dei sentimenti della Rivoluzione Francese che si erano diffusi in tutta Europa repentinamente; il re borbonico Ferdinando I delle Due Sicilie, modificò dunque la suddivisione amministrativa della Sicilia: essa venne suddivisa in sette "Valli" e nel 1824 Saponara divenne un comune con a capo un Sindaco. A tale evento importante si aggiunse il processo di unificazione dell'Italia nella seconda metà dell'Ottocento con la celebre Spedizione dei Mille guidata da Giuseppe Garibaldi, durante la quale, i saponaresi, con il plebisicito del 1860 votarono positivamente all'annessione al Regno d'Italia. Nel 1864, un'alluvione e la piena del torrente crearono gravi danni al nucleo abitativo e soltanto attraverso opere come argini si riuscì a fermare la violenza degli straripamenti.