Il conflitto bellico sovvertì le gerarchie nel calcio romano, i tornei ripresero nel 1919. La società seguì un approccio professionistico e lottò per le prime posizioni con l'Alba. Nella stagione 1921-22 la squadra vinse il campionato di Lega Sud, accedendo quindi alla finalissima, venendo però sconfitta dalla Pro Vercelli in entrambe le finali (0-3 all'andata e 2-5 al ritorno). Seguono tre stagioni nelle quali la squadra termina stabilmente in terza posizione nel girone eliminatorio laziale. Nella stagione 1925-26 i rossoblù giungono secondi nel girone eliminatorio laziale e secondi nel girone di semifinale di Lega Sud. Il 1º agosto 1926 la Carta di Viareggio, previa fusione rafforzativa con la Pro Roma, ammise la Fortitudo in Divisione Nazionale, torneo di massima serie finalmente unificato tra Nord e Sud, insieme a Alba e Napoli. Il torneo 1926-27 fu però disastroso: la Fortitudo Pro Roma chiuse ultima nel girone B di Divisione Nazionale, totalizzando solo cinque punti in diciotto partite e retrocedendo in Prima Divisione. l'unica impresa della stagione fu l'inaspettata vittoria per 4-2 in casa contro il Torino, squadra che in quella stagione avrebbe poi vinto lo scudetto (anche se le fu revocato per il Caso Allemandi). Nel 1927 Alba Audace, Fortitudo Pro Roma e Roman si fusero fondando l'Associazione Sportiva Roma. Dalla stagione successiva la lupa capitolina verrà usata come simbolo dall', che riuscì ad ottenere nel suo primo anno una difficile salvezza, e nel secondo un terzo posto nel girone A. Risultati più che buoni se rapportati a quelli ottenuti dalle altre compagini della ex Lega Sud.