En revanche, le rattachement à l'URSS en 1940 par le pacte Hitler-Staline bouleverse ce mode de vie ancestral, en raison des persécutions notamment religieuses par le NKVD (1940-1941 et après 1944) et ethniques par le régime fasciste roumain (1941-1944), le premier accusant les Vylkoviens d'être archaïques et contre-révolutionnaires, le second d'avoir, en tant que Russes, soutenu l'URSS. La population diminue alors d'un tiers et une partie des constructions tombent en ruine. Ce n'est qu'avec la déstalinisation que les persécutions et les déportations cessent, à partir de 1956. Vylkove retrouve la liberté en 1991 avec l'indépendance de l'Ukraine lors de l'effondrement de la dictature. Il y a aujourd'hui en ville plusieurs auberges et estaminets, trois églises (deux lipovènes et une ukrainienne) et Vylkove, siège de la du Delta du Danube, est devenue une attractive destination pour le tourisme de nature, de pêche, de randonnée et d'aventure.