Às vezes, conflitos mais recentes impossibilitaram a Comissão de cuidar de cemitérios em uma determinada região ou resultaram na destruição de locais. O cemitério indiano de Zehrensdorf, na Alemanha, foi desleixado após o final da Segunda Guerra Mundial e até a reunificação alemã, porque estava localizado em uma área ocupada por forças russas e não foi totalmente reconstruído até 2005. A Guerra dos Seis Dias e a Guerra de Atrito resultaram na destruição do Memorial Port Tewfik e do Memorial Aden e na morte de um jardineiro da Comissão no Cemitério do Memorial de Guerra de Suez. Durante a Guerra Civil Libanesa, dois cemitérios em Beirute foram destruídos e tiveram que ser reconstruídos. A manutenção de sepulturas e memoriais de guerra no Iraque continua difícil desde a Guerra do Irã-Iraque na década de 1980, sendo a manutenção regular impraticável desde a Guerra do Golfo.