С начала Отечественной войны 1812 года капитан Сипягин числился в лейб-гвардии Семёновском полку, был флигель-адъютантом и состоял при великом князе Константине Павловиче, а затем при П. И. Багратионе. Был во многих главных сражениях кампании 1812 года, в бою под Красным командовал отдельным отрядом, за многочисленные боевые отличия был награждён орденом Св. Георгия 4-го класса и произведён в полковники. Во время Заграничного похода 1813 года исполнял дипломатические поручения и координировал взаимодействие с австрийскими войсками на территории Великого герцогства Варшавского, с мая был начальником штаба резервных войск, за отличие в сражениях под Дрезденом и Кульмом произведён в генерал-майоры. В кампании 1814 года во Франции командовал отдельным летучим отрядом и за боевые отличия награждён орденом Св. Георгия 3-го класса и назначен генерал-адъютантом.