Václav Pilař debuterede 4. juni 2011 for Tjekkiets fodboldlandshold i en venskabskamp mod , hvor han fik 44 minutters spilletid. Tre dage efter fik han seks minutter mod . Det første landskampsmål scorede han 11. november 2011 i en kamp mod . I maj 2012 han af landstræner Michal Bílek blev udtaget til Europamesterskabet i fodbold, der skulle spilles i Ukraine og Polen. I Tjekkiets åbningskamp mod scorede Pilař tjekkernes enlige mål i 1-4 nederlaget. I næste kamp mod scorede han kampens andet mål, og var med til at sikre den hurtigste 2-0 føring i EMs historie.