Nel 2000 si classificò seconda con la sua band "Six Chix" al concerto per le classificazioni della canzone che avrebbe rappresentato il Regno Unito all'Eurovision Song Contest 2000 e nello stesso anno si unì alla compagnia della produzione londinese del musical "The Lion King" al Lyceum Theatre, in cui rimase per due anni del ruolo di Rafiki: ricoprendo la parte della babbuina sciamana, a Clarke fu affidata la canzone più celebre dello show, "Circle of Life". Nel 2002 lasciò "Il re leone" per unirsi al cast della prima del musical dei Queen "We Will Rock You", in cui interpretava Killer Queen, un ruolo che le valse una seconda candidatura ai Laurence Olivier Award alla miglior performance in un ruolo non protagonista in un musical. Nel 2004 si unì al cast del longevo revival londinese di "Chicago" all'Adelphi Theatre e cominciò ad interpretare l'infermiera Lola Griffin nella soap opera "Holby City", in cui apparve per oltre cento episodi tra il 2005 e il 2019. Nel 2010 si unì alla produzione londinese di "Hairspray", mentre nel 2011 ottenne un nuovo successo interpretando Oda Mae Brown (il ruolo per cui Whoopi Goldberg vinse l'Oscar) nell'adattamento musicale di "Ghost", a scena a Manchester e poi al Piccadilly Theatre del West End londinese; per la sua interpretazione ottenne la sua terza nomination al Laurence Olivier Award alla miglior performance in un ruolo non protagonista in un musical.