Spalletti venne confermato alla guida, segnalandosi per una partenza promettente anche nel torneo 2018-19; in seguito all'eliminazione nel primo turno di Champions League, i meneghini caddero tuttavia in una spirale negativa. Con l'ambiente scosso peraltro dalle polemiche nate tra Icardi e la dirigenza, l'obiettivo stagionale divenne nuovamente l'ingresso alla massima manifestazione europea. Il tecnico toscano raggiunse ancora il quarto posto, sempre all'ultima giornata. Nella stessa stagione, il 26 ottobre 2018 Thohir lasciò la carica di presidente a Steven Zhang, figlio del "patron" Zhang Jindong, mentre il 25 gennaio 2019 uscì definitivamente dal club.