Luego de la guerra, Emory mantuvo vaios puestos militares, comandante del "Ejército del Golfo" (que incluía a tropas federales de Luisiana, Arkansas, Mississippi)–a demandando peligrosas reconstrucciones. Por razones políticas, el General Sheridan remueve a Emory del comando, retirándose en 1876; y el "Departamento del Golfo prontamente se une a la gran "División dee Missouri", de Sheridan, que incluía a Texas.