В начале Польского восстания 1830—1831 годов Томаш Лубенский находился на стороне скептически настроенных генералов. Благодаря поддержке Франциска Ксаверия Друцкого-Любецкого Томаш Лубенский стал вице-президентом Варшавы. Его главной задачей на этом посту было проведение разоружения гражданского населения и сдерживание революционных выступлений. 7 декабря диктатор Юзеф Хлопицкий назначил Лубенского начальником Дирекции Почт и Полиции. 21 декабря Лубенский вошел в польское правительство как заместитель министра внутренних дел, но на этом кончилась его гражданская карьера в повстанческом лагере. Уже 7 января 1831 года он был уволен в атмосфере скандала. Причиной была дело бегство из тюремной больницы обвиненного в государственной измене Матеуша Любовидского, связанные экономическими интересами с Лубенскими и своим братом, Юзефом Любовидским, председателем польского банка. Правда, непосредственное участие в событии принимал Генрик Лубенский, но Томаш знал об этом и как заместитель министра внутренних дел пытался замять дело. В качестве сенатора Царства Польского Томаш Лубенский подписал 25 января 1831 года акт о низложении Николая I Романова. На следующий день после низложения Николая I, то есть 26 января, Томаш Лубенский сообщил в поправке к протоколу заседаний сената о том, что лишение царя польского престола состоялось по инициативе депутатской палаты, и сенаторы были вынуждены последовать за ним.