Nach dem Besuch der Jacobschule in Danzig sowie der Gymnasien in Marienwerder und Oppeln trat Pannwitz am 1. April 1838 als Musketier in das 22. Infanterie-Regiment der Preußischen Armee ein. Mit der Beförderung zum Sekondeleutnant erfolgte am 8. Juni 1841 seine Versetzung in das 38. Infanterie-Regiment (6. Reserve-Regiment) nach Glatz. Ab April 1845 war er für ein Jahr zum 6. kombinierten Reserve-Bataillon kommandiert. Während der Septemberrevolution nahm Pannwitz 1848 an den Barrikadenkämpfen in Frankfurt am Main teil und erhielt dafür den Roten Adlerorden IV. Klasse mit Schwertern. Von Januar bis Mitte Juni 1849 war er zu Ausbildungszwecken zur Gewehrfabrik nach Saarn kommandiert und nahm im Anschluss während der Niederschlagung der Badischen Revolution bei der 1. Kompanie am Gefecht bei Sinsheim teil. Er wurde dabei schwer verwundet und mit dem Ritterkreuz des Ordens vom Zähringer Löwen ausgezeichnet. Nach einem Lazarettaufenthalt in Heidelberg nahm Pannwitz am Krieg gegen Dänemark teil.