În primăvara anului 1992, a început războiul în Bosnia și Herțegovina, iar armata croată și unitățile de voluntari s-au deplasat activ în Bosnia. Forțele croate au fost amplasate în teritorii cu un procent semnificativ de croați și au avut un rol important în ostilități împotriva sârbilor bosniaci și a armatei iugoslave, cel mai faimos exemplu fiind participarea în bătăliile din Posavina și în Bosnia și Herțegovina de Vest (Kupres). Statul Major al Croației a ajutat în mod activ pe croații bosniaci să își creeze structurile armate. Potrivit cercetătorului rus Ionov Alexeevici, Statul Major General al armatei croate bosniace pur și simplu a devenit "sucursala" Statului Major al Croației.