太平天國起義，洪秀全領導太平天國起義，義軍在起義後的六年中犧牲4千餘人；然而內訌中的1856年，洪秀全利用韋昌輝殺害楊秀清及親信 6 千餘人，兩個月總共殺了文武官員2萬人。後來又利用石達開來天京靖難，凌遲處死韋昌輝，將其屍體寸磔，割成許多塊，每塊皆二寸，掛在各處醒目的柵欄處，標上「北奸肉，只准看不準取」的字樣。「洪楊之變」導致了十幾萬人被殺。1864年曾國藩率湘軍攻入天京後，纵火杀掠，太平天國強盛時，南京最多有100萬人，到了1875年光緒帝登基時，南京依然人口不足50万。太平天國爆發（1851年）前夕中國人口約4.3億，太平天國滅亡（1864年）後，人口約2.3億人。