Дебют за национальную сборную Франции состоялся 19 ноября 1988 года в матче квалификации на ЧМ 1990 против сборной Югославии, где Перес также отметился забитым голом. Был включен в состав сборной на чемпионат Европы 1992 в Швеции. Всего Перес провёл за сборную 22 матча и забил 2 гола.