Wegen der sofort mit der deutschen Invasion Österreichs beginnenden Judenverfolgung in Wien musste Mandler 1938 nach Prag in die Tschechoslowakei emigrieren. Mandler leitete dort das im März 1939 gegründete Transportbüro "Jüdische Emigrationshilfe" am Wenzelsplatz. Ab 1939/1940 arbeitete er im Auswanderungsamt als Verbindungsmann zur SS.