Після початку Першої світової війни виступав проти призначення принца Генріха командувачем Балтійським флотом, вважаючи, що той не має досвіду керівництва великих з'єднань кораблів. У 1917 року погодився з рішенням про початок необмеженої підводної війни. Після краху монархії в листопаді 1918 року Мюллер був звільнений у відставку.