La branche se rallia au protestantisme durant les guerres de religions. Florent de Beyne, tué par méprise en 1585, fut l'un des chefs huguenots qui rejoint le village de Viane après le massacre de la Saint-Barthélémy, dans le but d'organiser une confédération protestante et d'élire un général des religionnaires du Languedoc. En 1628, Jean de Beyne résista dix jours aux catholiques durant le siège de Viane.