Bubník spilte 127 landskamper for Tsjekkoslovakias herrelandslag i ishockey og scoret 121 mål. Han spilte også fotball på landslagsnivå, elleve kamper for Tsjekkoslovakias herrelandslag i fotball og fire mål. Han scoret ett mål mot under bronsefinalen i Europacupen i fotball for landslag 1960, som vant 2–0.