La echipa națională de fotbal a Franței, Wiltord a adunat 92 de selecții și a marcat 26 de goluri. El a mai jucat la Olimpiada din 1996, la două Campionate Mondiale (2002, 2006) și la două Europene (2000, 2004). Wiltord a făcut parte din echipele Franței care a câștigat Euro 2000 și a ajuns în finala Campionatului Mondial de Fotbal 2006.