В апреле 1981 года коммандером флота Великобритании и НАТО, а также командующим ВМС Восточной Атлантики и получил повышение до звания полного адмирала 23 июля 1981 года. В апреле 1982 года произошло вторжение аргентинских вооружённых сил на Фолклендские острова и Джон Филдхаус был назначен командующим тактической группой ВМС Великобритании, которой было поручено осуществить возврат контроля над островами. Джон Филдхаус руководил действиями британских войск из командного центра в Нортвуде и в июне 1982 года Фолклендская война окончилась капитуляцией аргентинских войск. После окончания войны ему были вручены орден Бани и орден Британской империи.