2001年，日本大阪舉行的世界乒乓球錦標賽成了林菱乒乓球生涯的轉捩點。在國家隊內部的選拔賽中，林菱憑藉出色的表現拿得第一名。可是，国家队的教练卻沒有安排她出戰單打比賽，只讓她參加混合雙打項目；後來，在國家隊友孙晋退出比賽的情況下，始復得單打比賽的資格。林菱沒有錯過這個失而復得的機會，在比賽接連擊敗各國的對手，成功躋身決賽；惜最終以1-3（21-14,12-21,12-21,19-21）負於隊友王楠，屈居亞軍。