Leopold von Morgenstern war der Sohn des Justizamtmanns in Sandersleben Johann Andreas Morgenstern (* 1752; † 1809) und der Johanna Maria Bach (* 1766). Er strebte anfangs eine akademische Laufbahn an und nahm 1810 in Dessau eine Anstellung als Regierungsadvokat an. Dann jedoch nahm er als Auditeur und Quartiermeister beim anhaltischen Kontingent am russischen Feldzug teil, wurde 1814 zum Hauptmann befördert und kämpfte in den Befreiungskriegen in den Niederlanden gegen Frankreich.