Kibbuz Amir war die letzte Siedlung, die während der Zeit des Arabischen Aufstands als so genannte Turm-und-Palisaden-Siedlung gegründet wurde. Die Gründer Amirs hatten zunächst einige Jahre in Chadera gelebt, ehe sie am 29. Oktober 1939 innerhalb eines Tages Turm, Gebäude und Befestigung des Kibbuz errichteten. Die Siedlung wurde mehrfach angegriffen; in der Anfangszeit hatten die Siedler durch die Lage am Rande der Hulesümpfe außerdem mit der Malaria zu kämpfen.