Sein Debüt bei der griechischen Nationalmannschaft gab Pedoulakis am 6. Mai 1986 bei einem Freundschaftsspiel gegen die Tschechoslowakei. Beim 113-93 Sieg erzielte er 7 Punkte. Mit Griechenland nahm Pedoulakis an der Basketball-Weltmeisterschaft 1986 in Spanien teil. Sein letztes von insgesamt 17 Länderspielen gab er am 20. Mai 1987 als er mit Griechenland beim Akropolis-Turnier den zweiten Platz erreichen konnte.