Το 2006, ανέλαβε χρέη προπονητή στην εθνική Σερβίας στην θέση του Ομπράντοβιτς, οδηγώντας την ομάδα στο παγκόσμιο πρωτάθλημα της Ιαπωνίας. Οι Σέρβοι απέτυχαν να μπουν στην πρώτη οκτάδα, με τον Σάκοτα να παραιτείται στα τέλη Μαΐου του 2007.