Bei den Afrikaspielen 2011 gewann Thomson mit Nolan Hoffman, Reinardt Janse van Rensburg und Darren Lill das Mannschaftszeitfahren und belegte im Straßenrennen Rang zwei. 2012 gewann er eine Etappe der Volta a Portugal und errang erneut Silber im Straßenrennen und Bronze im Einzelzeitfahren bei den Afrikameisterschaften.