Au printemps 1943, visé par le STO il décide de rejoindre la DB du général Leclerc, dont il avait appris, par Radio Londres la victoire à Koufra en mars 1941 . Avec quatre compagnons séminaristes il franchit la frontière franco-espagnole le 28 juillet 1943 près de Hendaye. Ils sont arrêtés et emprisonnés. Rapidement libérés après une intervention du délégué général de la Croix-Rouge en Espagne, Mgr Boyer-Mas, ils sont placés en résidence surveillée à Irun qu'ils peuvent quitter, grâce à une intervention de l'évêque de Vitoria, pour gagner Madrid et de là débarquer au Maroc où ils s'enrôlent. Durant cet épisode Maurice Cordier met par écrit les raisons de son évasion de France :