1987年，在中共十三届一中全会上，姚依林当选中共中央政治局常委（排名第五）。后升任排名第一的国务院副总理，负责常务工作。六四天安门事件时任中共中央政治局常委兼国务院副总理，坚决支持总理李鹏，对学生运动采取军事镇压，并是唯一一位没有与学生对话的政治局常委。同年6月24日，姚依林的党内排名在中共十三届四中全会赵紫阳和胡启立被罢免后从第五上升为第四。