Macedonię na Letnich Igrzyskach Paraolimpijskich 2016 w Rio de Janeiro reprezentowało dwoje strzelców. Był to szósty występ reprezentacji Macedonii na letnich igrzyskach paraolimpijskich (poprzednie miały miejsce w latach:1996, 2000, 2004, 2008 i 2012). Chorążym reprezentacji podczas ceremonii otwarcia igrzysk była Oliwera Nakowska-Bikowa.