Los portaaviones también proporcionan ayuda después de los desastres naturales; en el año 2005, el "Lincoln" realizó operaciones en apoyo de la Operación Unified Assistance en Indonesia después del tsunami de diciembre de 2004, y el "Truman" proporcionó ayuda después de ocurrido el Huracán Katrina en el año 2005. El Grupo de Ataque de Portaaviones del "Reagan" llevó a cabo operaciones de asistencia humanitaria y de mitigación de desastre en Filipinas en junio de 2008 tras el paso del Tifón Fengshen, el cual mató a centenares de personas que vivían en las regiones de la isla central y en la isla principal de Luzón. En enero de 2010 el "Vinson" operó en las costas de Haití, proporcionando ayuda y agua potable a los supervivientes del Terremoto de Haití de 2010 como parte de la Operación Unified Response encabezada por Estados Unidos, junto con otras grandes naves de guerra y el barco hospital "Comfort".