Mặc dù được dự báo tốt và theo dõi trong suốt thời gian tồn tại, Hiệu ứng của Typhoon Vera rất tai hại và lâu dài. Ngoài cường độ của cơn bão, thiệt hại nghiêm trọng và số người chết lớn là một phần do sự thiếu khẩn cấp từ truyền thông Nhật Bản trước khi đổ bộ của Vera. Mặc dù ước tính chi phí thiệt hại cho thấy tổng số vượt quá US $ 261   triệu (tương đương 2,24 tỷ đô la Mỹ ), các ước tính thiệt hại khác cho thấy chi phí thiệt hại lên tới 600 đô la Mỹ   triệu (tương đương 5,16 tỷ USD ). Số người chết vẫn chưa rõ ràng, nhưng các báo cáo thường chỉ ra rằng khoảng 5.000   người đã thiệt mạng, với hàng trăm người khác mất tích. Ngoài người chết gần 40.000   người bị thương, và thêm 1.6   Hàng triệu người bị vô gia cư. Toàn quốc khoảng 834.000   nhà cửa bị phá hủy và khoảng 210.000   ha (520.000   ac) của các lĩnh vực nông nghiệp đã bị hư hại. Thiệt hại do Vera gây ra đã khiến nó trở thành cơn bão nguy hiểm nhất trong lịch sử Nhật Bản, thành công sau cơn bão Muroto năm 1934. Vera cũng là thảm họa tự nhiên nguy hiểm thứ ba ở Nhật Bản trong thế kỷ 20, chỉ sau trận động đất lớn Hanshin năm 1995 và trận động đất vĩ đại Kantō năm 1923.