En las negociaciones para formar una "Gran Coalición" de los demócrata-cristianos y los Demócratas Sociales (SPD) tras las elecciones federales de 2013, Söder formó parte de la delegación de CDU/CSU en los grupos de trabajo de política financiera y presupuesto nacional, dirigido por Wolfgang Schäuble y Olaf Scholz, y sobre la regulación bancaria y la Eurozona, dirigido por Herbert Reul y Martin Schulz.