Com a saída do então capitão Andrés Iniesta em maio de 2018, Messi foi nomeado o novo capitão da equipe na temporada seguinte. Em 12 de agosto de 2018, ele conquistou seu primeiro título como capitão do Barcelona, ​​a Supercopa de Espanha de 2018, após uma vitória por 2–1 sobre o ; com seu 33º título para o clube, ele também se tornou o jogador com mais títulos da história do time. Em 19 de agosto de 2018, Messi balançou as redes duas vezes na vitória por 3–0 sobre o em seu primeiro jogo pela La Liga da temporada. Messi voltou a marcar na terceira rodada da La Liga, na goleada contra o por 8–2, onde o atacante fez dois gols. Ele também marcou contra o Girona, pelo Campeonato Espanhol, no empate de 2–2. Já no dia 7 de outubro, em jogo realizado no Estádio de Mestalla, "La Pulga" ainda marcou contra o Valencia e o Barça empatou em 1–1.