После Реставрации Мэйдзи Ито получил звание лейтенанта и служил на корвете «Ниссин». После создания Императорского флота Японии (1869) служил на различных кораблях. В 1882 году получил звание капитана, 15 июня 1886 года — контр-адмирала, 12 декабря 1892 года — вице-адмирала. С 20 мая 1893 года — Верховный главнокомандующий «Флота постоянной готовности» (часть японского флота, состоявшая из наиболее современных и боеспособных судов). После того, как в 1894 году «Флот постоянной готовности» был объединён с «Западным флотом» (состоял из устаревших судов), Ито Сукэюки стал первым верховным главнокомандующим «Объединённого флота» и выиграл борьбу на море во время Японо-китайской войны. 11 мая 1895 года Ито стал начальником Генерального штаба Императорского флота Японии. 5 августа 1898 года он был удостоен титула "сисяку" (виконта), а 28 сентября 1898 года получил звание адмирала.