Via zijn grootouders kon Lonergan voor Ierland uitkomen. Hij speelde eenmaal voor Ierland onder 16. Hierna koos hij voor Engelse jeugdteams. Hij speelde voor Engeland onder 20 waarmee hij deelnam aan het Wereldkampioenschap voetbal onder 20 - 2003. Bij Engeland onder 21 was hij reservedoelman.