1862年7月25日、スローカムは志願兵の少将に指名され（7月4日付け）、陸軍でこの階級になった者として2番目に若い記録だった。第二次ブルランの戦いの後に、その第1師団を率いてジョン・ポープ少将の退却を援護した。サウス山の戦いでは、クランプトン峡谷で、その優柔不断な軍団指揮官ウィリアム・B・フランクリン少将を無視し、スローカムとその部下の士官達が石壁の背後にいる敵前線を攻撃し潰走させた。1862年10月20日、アンティータムの戦いで戦死したジョセフ・K・マンスフィールド少将の後を継いで第12軍団の指揮を執った。この戦いではスローカムの師団は予備隊とされていた。スローカムはこの軍団を率いてフレデリックスバーグの戦い（戦場に到着するのが遅れ北軍にとって大惨事となった戦闘には加われなかった）と、チャンセラーズヴィルの戦いに参戦した。チャンセラーズヴィルではその軍団とジョージ・ミードとオリバー・O・ハワード各少将の軍団を含む右翼全軍46,000名を指揮した。スローカムはうまく立ち回ってロバート・E・リー軍の背後に回ったが、ポトマック軍指揮官ジョセフ・フッカー少将から時期尚早とチャンセラーズヴィルで止められてしまった。この戦いの後でスローカムはフッカーを公然と批判し、フッカーを指揮官から排除しようとした将軍達の「徒党」の一人となった。