La ciudad fue un asentamiento del pueblo otomí, en 1117 el poblado es conquistado por grupos chichimecas, y pasó a depender de Acolhuacan en 1120. Fue conquistados por los tepanecas de Azcapotzalco a finales del . La conquista mexica se realizó en 1427 durante el reinado de Itzcóatl. Después de la Conquista de México se establece una encomienda en Actopan. Según el "Diccionario universal de historia y de geografía", la ciudad fue fundada el 16 de julio de 1546; aunque la fecha en que se celebra el aniversario de la fundación de la localidad corresponde al 8 de julio. En 1575 Actopan fue elevado a la categoría de pueblo.