Во время русско-турецкий войны (Крымская или Севастопольская кампания), в которой Франция была союзником Турции, русское посольство покинуло Париж, однако Васильев и члены причта посольской церкви остались. Это дало возможность оказывать не только духовную помощь своим больным и немощным соотечественникам, остающимся в Париже, но и многостороннюю, в том числе материальную (Васильев лично собрал более 25000 франков), помощь русским военнопленным. Используя свои связи с влиятельными лицами во властных структурах, отец Иосиф получил аудиенцию у императора Наполеона III и добился ряда свобод для своих подопечных пленных.