Märjamaa heeft een aan Maria gewijde kerk ("Maarja kirik"), die uit de eerste helft van de 14de eeuw dateert en als weerkerk de sterkste van West-Estland was. De kerk werd in de Lijflandse Oorlog (1574) en in de Tweede Wereldoorlog (1941) zwaar beschadigd. De 19de-eeuwse torenspits, die in de naoorlogse decennia ontbrak, werd in 1990 teruggeplaatst. Rondom de kerk vormde zich een kern, die in de tweede helft van de 19e eeuw begon te groeien.