После распада СССР полк оказался на территории независимого Таджикистана, где в мае 1992 года разгорелась гражданская война. Военнослужащие 201-й дивизии, в которую входил 92-й мотострелковый полк, смогли пресечь все попытки захвата вооружения дивизии противоборствующими сторонами конфликта.