Als Sitz eines der wichtigsten Erzbistümer der Katholischen Kirche auf dem südamerikanischen Kontinent wurde die Kirche mehrmals von Päpsten besucht. Zum 25. Jubiläum des lateinamerikanischen Bischofsrates besuchte Papst Johannes Paul II. die Kathedrale am 2. Juli 1980 und leitete einen Gedenkgottesdienst zu dem Anlass. Zum zweiten Weltfamilientreffen des Papstes besuchte Papst Johannes Paul II. die Kathedrale am 4. Oktober 1987. Zum Weltjugendtag 2013 besuchte Papst Franziskus die Kathedrale auf seiner ersten Auslandsreise am 27. Juli 2013.