С момента образования города и до окончания войны Севера и Юга ключевым вопросом политической жизни Канзас-Сити был конфликт южан и северян. Горожане приняли активное участие (по обе стороны фронта) как в кровавых событиях в Канзасе, так и в последовавшей Гражданской войне. В окрестностях города произошло множество ожесточённых боёв.