7月に開催された第1回会合から間もなく、ベインはスコットランドの国民盟約（盟約派）から軍事的支援を求める議会の使節の長として派遣された。第一次イングランド内戦が始まる前から宗教問題で主教戦争（1639年 - 1640年）でチャールズ1世に対抗していた長老派主流のスコットランドは、イングランド議会がイングランドに教会政治の長老制拡大を認めるならば、進んで議会を支援する意向だった。ベインは長老派にも聖公会にも反対だったが、合意を形成する方法を見つけた。宗教と政治の話題を組み合わせた「厳粛な同盟と契約」と呼ぶ合意を提案し、「最良の改革された教会の例」に関する合意に掴みにくい言葉を入れた。この言葉はスコットランド人にとってはその考えが採用されるものと考えられ、一方でイングランド人はイングランドの（すなわち独立した）慣習を採用できることを意味すると解釈できた。厳粛な同盟と契約はスコットランド、イングランド、アイルランドの当局で承認され、スコットランドが戦争に加わる道を作った。