Am 21. August 1999 kam es im Rahmen der Krise in Osttimor zu einer Schießerei in Uma Tolu, wenige Tage vor dem Unabhängigkeitsreferendum. Am 22. August umzingelten indonesische Soldaten mehrere Flüchtlinge im Gemeindehaus, nah am Fußballplatz. Ein Dorfbewohner wurde angeschossen, neun weitere ebenfalls verletzt. Mehrere Häuser wurden niedergebrannt, darunter auch das Haus des Schulleiters, der Jugendliche in einer Anti-Milizen-Wachtruppe organisiert hatte. 260 Menschen flohen aus den Ort. Milizen errichteten im Suco Straßensperren.