Der Abschnitt des Treffurt-Wanfrieder Werratales beginnt südöstlich von Treffurt am Übergang zu den Muschelkalkhöhen des Thüringer Beckens und endet nordwestlich von Wanfried am Eintritt der Werra in das Eschweger Becken. Bei einer Länge des Tales von ungefähr 10 Kilometern querte die ehemalige Innerdeutsche Grenze mehrfach das Flussgebiet.