Os efeitos combinados das enchentes anteriores e Eline deixaram cerca de 463.000 pessoas deslocadas ou desabrigadas, incluindo 46.000 crianças de cinco anos ou menos. No geral, as enchentes anteriores e Eline causaram cerca de 700 mortes, metade em Chokwe. com danos estimados em $ 500 milhões (2000 USD). O ciclone e as cheias interromperam grande parte do progresso económico que Moçambique tinha feito na década de 1990, desde o fim da guerra civil.