ハンス・イェションネク参謀長の自殺後、1943年9月に空軍指導部改造が行われた際、コラーは空軍統帥（作戦）部長に任命され中将に進級した。ギュンター・コルテン参謀総長が1944年7月にクラウス・フォン・シュタウフェンベルク大佐によるヒトラー暗殺未遂事件で死亡すると、当然コラーが後任になると見られていたが、空軍総司令官ヘルマン・ゲーリングは自分の意のままになると考えた空軍教育総監ヴェルナー・クライペ（）を後任に据えた。しかしクライペには荷が重すぎたため、11月にゲーリングはコラーを後任の空軍参謀総長にせざるを得なくなった。同時にコラーは航空兵大将に進級した。