За всю свою историю башня неоднократно получала повреждения. По мнению историков, Константино-Еленинская башня пострадала меньше других башен во время оккупации Москвы Наполеоном, потому что ворота были завалены. В 1917 году во время революционного артобстрела Кремля было повреждено семь башен, в их числе и Константино-Еленинская. Во время Великой Отечественной войны башня почти не пострадала от налётов немецкой авиации.