1802–1810 diente das Gebäude als Residenz für den Fürstprimas Karl Theodor von Dalberg. Am 24. April 1809 Während der Schlacht bei Regensburg war Dalberg nicht vor Ort in Regensburg. Deshalb konnte das Residenzgebäude als Übernachtungsquartier für Napoleon genutzt werden. Die Wohnräume des ebenfalls im Haus wohnenden Domprobstes Graf Thurn waren vorher von französischen Soldaten geplündert worden, jedoch wurde er von Napoleon reichlich entschädigt. Auf einem Empfang der weltlichen und geistlichen Würdenträger der Stadt versprach Napoleon der Stadt eine Summe von 1 Million Gulden als Entschädigung für die von seinen Truppen verursachten Kriegsschäden. Das Geld wurde später zum Bau der Maximilianstraße genutzt.