Michael Clauss superó el examen de acceso al Cuerpo superior del Servicio Exterior en 1990. Fue enviado en el equipo de crisis del Ministerio de Asuntos Exteriores alemán durante la Segunda Guerra del Golfo. En 1991 se trasladó a la embajada en Israel como asesor político. Después, entre 1994 y 1997, le fue asignada una comisión como oficial de personal para el servicio superior en el Ministerio de Asuntos Exteriores. En 1997, se convirtió en Consejero de la Representación Permanente de la República Federal de Alemania ante la Unión Europea (UE) en Bruselas. En 1999 fue nombrado asistente personal de un secretario de Estado en la sede del Ministerio de Asuntos Exteriores en Berlín .