宗教战争期间，图卢兹城内的统治阶级和城外的封建领主及新教徒关系日益紧张，引发了。17世纪，连接地中海和大西洋的米迪运河开凿联通，图卢兹成为重要的内河水运码头，商业得到快速发展。法国大革命后，图卢兹成为上加龙省的省会，当地的保皇派曾多次讨伐改革派，并于1799年发生了，最终被镇压。18世纪时，连接图卢兹的铁路线相继建成，图卢兹成为一个铁路枢纽。普法战争和两次世界大战期间，图卢兹成为法国重要的大后方城市，法国北方的大批军工企业迁至这一地区。1890年，法国工程师克雷芒·阿德尔在图卢兹进行了世界上第一次飞行器实验并取得成功。二战后，图卢兹成为法国重要的科教城市，并在1968年成为五月风暴运动的主要发生地。20世纪70年代，连接巴黎和图卢兹之间的卡皮托勒号列车成为当时欧洲商业运行速度最快的列车。1993年，图卢兹地铁建成通车。