Le elezioni imperiali e incoronazioni di Carlo VII (1742) e Francesco I (1745), lo rimisero in gioco come ambasciatore, giocando un ruolo importante soprattutto nell'ultima delle due elezioni. Dal 1753 divenne responsabile statale delle finanze e nel 1757 promosse largamente un'intesa di stato in vista della Guerra dei Sette anni con Federico II di Prussia per proteggere l'Hannover dalle ingerenze di Francia e Austria e con la speranza di annettere territorialmente le diocesi di Hildesheim, Osnabrück e Paderborn. Durante l'occupazione francese che fece seguito alla Battaglia di Hastenbeck, fu l'unico ministro a non abbandonare la sua posizione ed a cercare invece di trattare con gli invasori per alleviare lo sfruttamento economico della regione. Nel 1765 Munchausen venne nominato da re Giorgio III suo primo ministro nell'Hannover.