בחצר המלוכה האוסטרית פנו אליה בתואר "הוד מעלתה הקיסרית והמלכותית". הנישואים היו מוצלחים בתחילה, אולם עד מהרה התגלעו חיכוכים בין רודולף וסטפני. אמו של רודולף, הקיסרית סיסי, לא עזרה לשיפור יחסיהם כאשר זלזלה בסטפני במופגן. ב-1883 נולדה בתם היחידה אליזבת מריה, ארכידוכסית אוסטריה. עם לידתה, נפרדו בני הזוג, התאמצו להשיג אישור מהקיסר להתגרש, והחלו לנהל פרשיות אהבים. ב-1889 נמצא רודולף מת יחד עם פילגשו האחרונה מרי וטסרה, בנסיבות שנותרו לא ברורות לחלוטין עד ימינו.