Nach dem Beginn des Ersten Weltkriegs wurde Seekirchner als z. D.-Offizier wiederverwendet und war ab dem 22. September 1914 zunächst Landsturminspekteur der Armeeabteilung Falkenhausen. Unter Beibehaltung in dieser Stellung war er vom 5. Oktober bis zum 27. Dezember 1914 Etappeninspekteur der Armeeabteilung und wurde anschließend zum Kommandeur der 8. Reserve-Feldartillerie-Brigade ernannt. Seekirchner nahm bis Mitte Mai 1915 an den Stellungskämpfen im Oberelsaß teil, verlegte an die Ostfront und war dort in die Kämpfe um Lubaczów und Lemberg eingebunden. Seine Brigade verlegt Ende Juni 1915 wieder an die Westfront, wo ihm König Ludwig III. am 8. Juli 1915 den Charakter als Generalleutnant verlieh. Nach Kämpfen im Oberelsaß und in der Schlacht an der Somme kam Seekirchner ab Oktober 1916 auf dem Rumänischen Kriegsschauplatz zum Einsatz. Am 7. Januar 1917 wurde er zum Kommandeur der übergeordneten 8. Reserve-Division ernannt und in dieser Eigenschaft erhielt er Ende des Monats das Patent zu seinem Dienstgrad.