Grenzschleusen befanden sich an unübersichtlichen Stellen, meist in dichten Wäldern, oder in der Nähe von Orten mit einer verdeckten Zufahrtstraße zum Grenzzaun. Der Grenzübertritt sowie die Übergabe von Akten fanden meistens nachts statt. Manche Grenzschleusen wurden nur in der schneefreien Zeit benutzt, andere mit Motorbooten über den Ratzeburger See. Es gab auch operative Schleusen über Flüsse, wie den Übergang „Weißwasser“ über die Werra. Die Grenzschleusen hatten Namensbezeichnungen; eine der ersten war die „Grenzstelle Waldmann“ in der Nähe des thüringischen Meiningen. Zu den letzten Schleusen gehörten „Wurzel“ und „Zwerg“ auf dem Großen Ehrenberg im Harz.