V decembri 2002 bol menovaný palubným inžinierom 6. návštevnej expedícii na Medzinárodnej vesmírnej stanici (ISS) s plánovaným štartom v októbri 2003. Po havárii Columbie a zrušení letov raketoplánov bol program letov radikálne zmenený. Kuipers sa stal náhradníkom Pedra Duqueho v 5. návštevnej expedícii (letela v októbri 2003) a sám sa od júla 2003 súčasne pripravoval na štart v apríli 2004 v 6. návštevnej expedícii. ESA let pomenovala DELTA ().