Дана 1. јула 2009. године Санадер је објавио своју оставку на месту председника Владе Хрватске и на месту председник ХДЗ-а, као и његово комплетано повлачење из активне политике, додајући да нема намеру да се врати. Оваква одлука Санадера дошла је као "велико изнанађење", док су хрватске медији видели Санадера као кандидата на предстојећим председничким изборима. Хрватски сабор је прихватио Санадерову оставку 2. јула 2009. године и о томе обавестио председника Републике. За своју наследницу на месту хрватској премијера и председника ХДЗ-а одредио је Јадранку Косор. Санадер је после изабран за почасног председника ХДЗ-а.