Nach der Niederlage in der Schlacht um die Krim kehrte Frauenfeld nach Wien zurück. Die Abwicklung der Behörde des Generalkommissars überließ er seinem Stab. Seine „Denkschrift über die Probleme der Verwaltung der besetzten Ostgebiete“, am 10. Februar 1944 verfasst, wurde während der Nürnberger Prozesse ab Herbst 1945 als Beweismittel verwendet.