Kurz vor der Eroberung Berlins durch die Rote Armee verließ Kritzinger die Stadt am 23. April 1945, nachdem er vom 20. April 1945 an mit der Leitung der Evakuierung der verbliebenen Minister und Ministerialbeamten beauftragt gewesen war. Nachdem er noch im Mai 1945 Staatssekretär in der Regierung Dönitz im Sonderbereich Mürwik geworden war, wurde er dort schließlich am 23. Mai von den Briten verhaftet.