Zu Beginn des osmanischen Völkermords an den Armeniern 1915 waren Murat und seine Kameraden in Sivas. Als die Deportationen angeordnet wurden, wurden Gendarmen ausgesandt, um Murat zu fassen. Osmanische Behörden versprachen den ansässigen Armeniern, dass sie von den Deportationen verschont blieben, falls sie Murat auslieferten. Viele Armenier, vor allem ältere, welche ihr Eigentum und Heim nicht aufgeben wollten, begannen, osmanische Autoritäten über seine Unterkunft zu informieren. Murad verteidigte sich mit seinen Landsmännern für eineinhalb Jahre. 1916 zog er nach Samsun und reiste mit einem Segelboot zum russischen Hafen von Batumi. Er leitete Freiwilligenverbände in der Schlacht von Erzincan. Am 4. August 1918 starb er bei Kämpfen in der Schlacht um Baku.