В мае 1863 года Гриффин командовал своей дивизией в сражении при Чанселорсвилле, но серьезных боев на его участке не произошло. Тем не менее после сражения (15 мая) он взял отпуск по состоянию здоровья, передав дивизию Джеймсу Барнсу. Из-за этого он пропустил геттисбергскую кампанию и вернулся к дивизии только 3 июля, в последние часы сражения при Гетисберге.