Su departamento gestionó también la restitución democrática de los ayuntamientos, una vez disueltas las respectivas Juntas Locales de Defensa, la creación de comisiones gestoras de las diputaciones o la revisión de incautaciones. Monzón impulsó asimismo desde su departamento la supervisión de los daños causados por los bombardeos de la aviación franquista y organizó la defensa del país. Fue uno de los testigos de los daños causados por el Bombardeo de Guernica en 1937. Una vez ocupada Euskadi por los franquistas, huyó junto con José Antonio Aguirre desde Santander el 23 de agosto de 1937 a Francia.