На Мондиал 2002 той вкарва 3 гола, но получава травма в мачът срещу Ирландия. След като Фернандо Йеро се отказва от националния отбор през 2002 г., Раул става капитан на Реал Мадрид и Испания. Последния си мач за Испания изиграва през септември 2006 г. Раул не попада в състава на „Ла Фурия“ за Евро 2008 г., след като е пренебрегнат от Луис Арагонес.