Осенью 1805 вошел в эскадру контр-адмирала Луиса под Кадисом (в составе флота Нельсона), стерегшую франко-испанский флот адмирала Вильнева. 2 октября Нельсон приказал эскадре Луиса (5 линейных и "Endymion") идти в Гибралтар на пополнение припасов. В результате при Трафальгаре "Endymion" не был.