В 1997 году Coloni Motorsport вновь попробовала свои силы в чемпионате «Международной Формулы-3000». Самым успешным для команды стал сезон 2002 года, когда пилотами команды были Джорджо Пантано и Энрико Токачелло. Одержав три победы на двоих, гонщики завершили сезон на неплохих местах - Пантано в ранге вице-чемпиона, а Токачелло - на девятом месте. Ещё через год, в 2003, когда пилотами команды стали Рикардо Сперафико и Жолт Баумгатнер, они также добились успеха - Сперафико стал вице-чемпионом, а Баумгартнер дебютировал в Формуле-1 в команде Jordan Grand Prix на своём домашнем Гран-при Венгрии 2003 года.