En el otoño de 1944, tras el inicio de la llamada Insurrección nacional eslovaca, los alemanes se hicieron con las riendas del país y el 5 de septiembre pusieron a Stefan Tiso al frente del gobierno colaboracionista eslovaco, en sustitución de Vojtech Tuka. Tiso autorizó y coordinó la represión nazi en Eslovaquia contra los insurgentes antinazis, así como la represión y el exterminio de los judíos eslovacos. Estuvo al frente del gobierno títere hasta la primavera de 1945, cuando Bratislava fue liberada por el Ejército soviético. Capturado tras la guerra, fue juzgado por las autoridades checoslavacas y condenado a cadena perpetua.