Agendo ancora una volta contro le disposizioni ufficiali, Clinton decise di spostare il suo esercito a New York via terra anziché via mare. Egli concluse così una significativa marcia verso New York, scontrandosi con l'esercito di Washington a Monmouth Court House il 28 giugno. Clinton bruciò definitivamente la sua reputazione in patria stendendo un rapporto sui movimenti svolti che esagerava enormemente la grandezza dell'armata di Washington, minimizzando sull'altro fronte le perdite inglesi a Monmouth. Giunto a New York, Clinton e l'ammiraglio Howe dovettero scontrarsi con lo spettro di una flotta francese al di fuori del porto. Fortunatamente l'ammiraglio d'Estaing decise anziché di entrare nel porto, di salpare alla volta di Newport. Una volta che Clinton seppe della destinazione del nemico, egli decise di spostare le truppe a rinforzare le guarnigioni di Newport garrison mentre Lord Howe salpò per scontrarsi con d'Estaing. Entrambe le flotte vennero colpite da una tempesta ed il tentativo americano a Newport fallì prima che Clinton arrivasse. Clinton inviò delle forze di supporto al raid delle comunità vicine, mentre tornò a New York per organizzare le truppe che dovevano essere inviate a sud. Il distaccamento per rafforzare la Florida venne inviato invece in Georgia. Questa forza prese Savannah nel dicembre del 1778 e nel gennaio del 1779 conquistò per breve tempo Augusta. Egli inoltre predispose delle truppe per il servizio nelle Indie occidentali cercando di catturare l'isola di Saint Lucia; la spedizione ebbe successo e costrinse i francesi dell'area ad arrendersi.