Habert est nommé général de brigade le 18 février 1808 et est envoyé en Espagne. Du 15 juin au 14 août, les Français entreprennent le premier siège de Saragosse qui se solde par un échec. Au début des opérations, Habert dirige une brigade indépendante forte de hommes composée des et bataillons polonais de la légion de la Vistule ( hommes), du régiment supplémentaire de la légion de réserve ( hommes), du bataillon du régiment d'infanterie de ligne (411 hommes) et du bataillon du régiment d'infanterie de ligne (420 hommes). Au décembre 1808, Habert est à la tête de la brigade de la division du général Grandjean appartenant au corps. Il a sous ses ordres quatre bataillons du de ligne et un bataillon du de ligne.