しかし、軍を率いたことがなく最初から無理のある任命だったため、1642年にスウェーデンの将軍レンナート・トルステンソンにブライテンフェルトの戦いに敗れオーストリアを危機に晒した。1641年からドイツ騎士団総長を務めたが、1644年にトルステンソン戦争でデンマーク救援に差し向けた軍勢が敗北したため司令官を辞任、1647年にスペイン領ネーデルラント総督に就任してフランス侵攻の準備を進めていたが、翌1648年にコンデ公ルイ2世率いるフランス軍と遭遇して大敗（ランスの戦い）、スペインからオーストリアへの支援が失われたことで兄がドイツ諸侯と妥協してヴェストファーレン条約の締結につながった。