1877 annektierten die Briten die Südafrikanische Republik, einschließlich des Gebiets der Bapedi, unter anderem weil Sekhukhune eine Gefahr für die Südafrikanische Republik und damit für die Stabilität der Region darstellte. Eine weitere Mission zur Befriedung Sekhukhunes im Jahr 1878 schlug erneut fehl. Erst 1879 besiegte ihn eine große Streitmacht aus Briten, Buren und rund 10.000 Swazi. Er wurde in Pretoria inhaftiert. Merensky erhielt von den Buren Land als Belohnung. Als Folge des Ersten Burenkrieges wurde die Pretoria Convention geschlossen. Artikel 23 dieses Friedensvertrages verfügte die Freilassung Sekhukhunes. Er konnte jedoch nicht mehr nach Thaba Mosega zurückkehren, sondern musste sich in der Nähe des Berges ansiedeln. Bereits 1882 wurde er von seinem Halbbruder Mampuru ermordet.