Рохас — воспитанник мадридского «Реала». 14 ноября 1998 года в матче против «Сельты» он дебютировал в Ла Лиге, заменив Кристиана Пануччи. В том же году Роберто стал обладателем Межконтинентального кубка в составе столичной команды. Из-за высокой конкуренции Рохас провёл за «Реал» всего 5 матчей, после чего решил сменить клуб.