Der griechischen Mannschaft wurde traditionell der Platz an vorderster Stelle gewährt, ein Sonderstatus, der aus der Ausrichtung der antiken und ersten Spiele der Moderne in Griechenland herrührt. Als Gastgebernation lief die japanische Delegation zuletzt ein. Vor Japan liefen erstmals die Nationen ein, die als nächstes Gastgeber der Olympischen Sommerspiele sein werden. In diesem Fall Frankreich (Gastgeber mit Paris bei den Spielen 2024) und die Vereinigten Staaten (Gastgeber mit Los Angeles bei den Spielen 2028). Das Flüchtlingsteam, welches bei den Spielen 2016 in Rio de Janeiro noch als vorletzte Mannschaft das Stadion betrat, marschierte in Tokio an zweiter Stelle direkt hinter Griechenland ein. Die anderen Länder betreten das Stadion in alphabetischer Reihenfolge in der Sprache der Gastgebernation, in diesem Fall also Japanisch. Diese Reihenfolge entspricht sowohl der Tradition als auch den Statuten des Internationalen Olympischen Komitees (IOK).