Ende 1944 war der größte Teil des Generalgouvernements von der Roten Armee besetzt, die Deutschen kontrollierten nur noch den Westen des Gebiets. Dennoch wurde das Generalgouvernement nicht aufgelöst, vielmehr blieben Frank und seine Verwaltung in Krakau, das nur noch wenige Kilometer von der Front entfernt lag. Der endgültige Zusammenbruch kam mit der Weichsel-Oder-Operation der Roten Armee im Januar 1945. Die deutsche Front konnte dem Ansturm nicht mehr standhalten und so gingen die besetzten polnischen Gebiete innerhalb weniger Tage verloren. Am 17. Januar wurde Warschau, am 19. Januar die Besatzungs-Hauptstadt Krakau erobert. Am Tag zuvor war bereits Generalgouverneur Frank nach Bayern geflohen. Damit war die Existenz des Generalgouvernements beendet.