Nella stagione 2016-2017, con alla guida il nuovo allenatore Vincenzo Montella, i rossoneri conducono un girone d'andata al di sopra delle aspettative, culminato a dicembre con la vittoria della Supercoppa italiana a Doha ai danni della Juventus ai tiri di rigore. Nel girone di ritorno la squadra non riesce a ripetere le buone prestazioni, ma ottiene comunque il sesto posto finale, valido per l'accesso al terzo turno preliminare di Europa League.