Sua carreira de advogado foi interrompida pela guerra civil entre Pompeu e Júlio César. Fausto, representante da casa de Lúculo e genro de Pompeu, se juntou aos pompeianos. Ele estava na Batalha de Farsalos, em 48 a.C., e se juntou aos líderes pompeianos na África Velha depois da derrota para os cesarianos. Após a Batalha de Tapso, em 46 a.C., Fausto tentou escapar para o Reino da Mauritânia, mas foi capturado e morto por Públio Sítio, um aliado de César, no final do mesmo ano.