Официальная причина закрытия Международного туркмено-турецкого университета не называлась. Однако, по некоторым источникам, его упразднение связано с патронажем движением «Хизмет» Фетхуллаха Гюлена. В то же время после попытки военного переворота в Турции в июле 2016 года власти этой страны призвали международное сообщество к закрытию образовательных учреждений, связанных Фетхуллахом Гюленом.