En mars, Stanislas Wawrinka se rend en Californie pour participer aux Masters d'Indian Wells. Il se montre très solide avec des victoires sur Nikolay Davydenko, Marin Čilić et Tomáš Berdych, avant que Roger Federer ne le domine en deux sets (3-6, 4-6). D'ailleurs, c'est avec ce compatriote qu'il dispute le double du tournoi. Ils n'avaient pas joué ensemble depuis septembre 2008 en Coupe Davis, juste après leur victoire olympique à Pékin. Les deux Suisses écrasent la paire tête de série composée de Max Mirnyi et Daniel Nestor (6-1, 6-2) dès leur entrée en lice. Ils s'imposent ensuite face au duo français Benneteau/Gasquet, maîtrisent Mark Knowles et Michal Mertiňák pour finalement accéder à la finale après un succès face aux Espagnols tenants du titre, Marc López et Rafael Nadal. Néanmoins, ils s'inclinent contre Alexandr Dolgopolov et Xavier Malisse, sur le score de 4-6, 7-6 et 7-10 au super tie-break. Stanislas Wawrinka dispute par la suite le Masters de Miami, où une déception se forme dès son entrée en lice avec une défaite contre Marcel Granollers en trois sets, en encaissant un difficile 6-0.