Als Juniorenfahrer machte Bissegger international auf sich aufmerksam, als er bei "Le Pavé de Roubaix", der Junioren-Austragung von Paris–Roubaix, den achten Platz belegte. Im selben Jahr errang er gemeinsam mit Gino Mäder, Robin Froidevaux und Reto Müller bei den Bahnweltmeisterschaften der Junioren die Silbermedaille in der Mannschaftsverfolgung. Im Jahr 2016 wurde er im schweizerischen Aigle mit der neuen Weltrekordzeit von 3:12,416 Minuten Junioren-Weltmeister in der Einerverfolgung. Im selben Jahr nahm Bissegger als Juniorenfahrer als Mitglied des Schweizer Männervierers am ersten Lauf des &lt;a href="Bahnrad-Weltcup%202016/17"&gt;Bahnrad-Weltcups 2016/17&lt;/a&gt; in Glasgow teil, der in der Mannschaftsverfolgung Platz vier belegte.