A lo largo de su historia, el IDHC ha denunciado vulneraciones en materia de derechos humanos en España, en aspectos como los recortes de derechos sociales, las vulneraciones de la libertad de expresión, la libertad de reunión y el derecho a la participación política y violaciones de derechos de personas inmigrantes. La entidad se ha mostrado crítica ante las actuaciones policiales del referéndum del 1 de octubre y los procesos judiciales posteriores, así como ante el encarcelamiento de políticos y miembros de la sociedad civil catalana.