Работы на Цитадели вызвали значительный резонанс и неоспоримым подтверждением преступления войска Петра І 1708 г. стали выявленные останки жертв со следами насильственной смерти, мощный слой пепла от уничтоженной огнём застройки столицы показали масштабы трагедии, а её олицетворением стала обожжённая «Батуринская Богоматерь» — икона на металле конца XVII в., найденная археологами в 1995 г. на скелете убитой женщины. Параллельно обследовались загородная резиденция Ивана Мазепы на Гончаровке, территория Батурина и его окрестности.