Anna Lagerquist debuterade i svenska A-landslaget i en match mot Norge i Baltiska hallen inför VM 2011. Ungdomslandslaget hade träningsläger tillsammans med A-landslaget och Lagerquist fick spela några minuter i träningsmatchen. Sedan dess har hon hållits utanför landslaget med den motiveringen att hon är för kort (173 cm) för att spela i mittförsvaret. Inför hemma-EM 2016 var hon med på ett landslagsläger och imponerade på förbundskaptenen Henrik Signell och landslagsspelarna. Hon blev därefter sensationellt uttagen till EM-truppen 2016 och fick sitt internationella genombrott under turneringen. Hon övertygade med sitt försvarsspel i landslaget och var en av de bättre försvarsspelarna i turneringen. Hon bidrog också i anfall, även om det var av mindre betydelse.