Bald war die gesamte Insel von den Osmanen besetzt, und nur noch die stark befestigte Festung Candia hielt stand. Die Osmanen unter Gazi Hüseyin Pascha begannen mit der Belagerung von Candia am 1. Mai 1648. Die Festung wurde von einer kleinen venezianischen Besatzung unter Luigi Mocenigo gehalten. Schon in den ersten sechs Monaten verloren die Türken bei der Belagerung 20.000 Mann.