En 1992, Kulikov se convirtió en el Comandante de las Tropas del Interior. Por ello, fue uno de los comandantes de las fuerzas del gobierno durante la crisis constitucional de 1993 en Moscú y la Primera Guerra Chechena. A inicios de 1995 Kulikov fue nombrado comandante del Grupo de Fuerzas Federales Unidas en Chechenia y comandó las fuerzas rusas durante la infame masacre de Samashki.