В том же году Перси был назначен командиром крейсера «» и, идя на Восток, был задержан в Африке из-за начавшейся войны с бурами. Здесь он вновь отличился доставив осажденному Ледисмиту морскую 120-миллимировую пушку, для которой Перси самостоятельно разработал специальный лафет. Орудие это успешно боролось с известной пушкой буров прозванную «"Длинный Том"», что существенно помогло освободить Ледисмита. В награду за эту услугу военное и морское министерства Британской империи наградили Скотта Перси почетными званиями.