Als Prager Polizeichef wurde Bienert 1939 von der Gestapo verhaftet, auf Initiative Präsident Háchas aber wieder freigelassen. Bienert war seit Anfang 1942 Innenminister der tschechischen Protektoratsregierung, wurde als Nachfolger Jaroslav Krejčís von Januar bis Mai 1945 letzter Regierungschef des Protektorats Böhmen und Mähren. Da das Protektorat knapp außer Reichweite alliierter Bomber lag, lieferte dessen Wirtschaft bis zum Kriegsende beinahe ungestört wichtige Kriegsgüter. Bienert wurde am 5. Mai 1945 auf seinem Weg zum Rundfunk verhaftet, wo er offiziell das Ende des Protektorats verkünden wollte. Nach Kriegsende wurde er zu 3 Jahren Haft verurteilt. Im Mai 1947 wurde er aus der Haft entlassen, er starb im Februar 1949.