Міграційна та митна правоохоронна служба була створена в 2002 році відповідно до Акту про національну безпеку після подій 11 вересня 2001 року . Зі створенням Міністерства національної безпеки США, функції та юрисдикція декількох прикордонних та митних органів були зосереджені в Міграційній та митній правоохоронній службі США.