В январе 1921 года был делегирован в Верхнюю Силезию в качестве кавалерийского полковника. Первоначально — заместитель командующего, а с апреля 1921 года — командир секретной военной организации "Командование защиты плебисцита". В начале Третьего Силезского восстания организация была преобразована в Верховное командование повстанческих сил, и Мацей Мельжиньский возглавил Третье Силезское восстание.