В октябре 1943 года вернулся в состав Флота Метрополии. В июне 1944 года принял участие в операции «Оверлорд». 18 июня у побережья Нормандии подорвался на магнитной мине и был отправлен в США для ремонта. Ремонт производился в Филадельфии до января 1945 года и завершился в апреле 1945 года в Англии. В апреле 1945 года «Нельсон» ушёл в Индийский океан. Совместно с Ост-Индским флотом обстреливал в июле 1945 года береговые укрепления на острове Пхукет (операция «Лайвери»), принимал капитуляцию японских войск в августе в Пенанге (операция «Юрист») и в сентябре в Малайе (операция «Зиппер»).