こうして形成されたタジク国家は1990年に主権宣言を行い、1991年に国名をタジキスタン共和国に改めるとともに、ソ連解体にともなって独立を果たした。1991年11月大統領選挙でラフモン・ナビエフが当選し、共産党政権が復活する。1991年12月21日、独立国家共同体（CIS）に参加する。ロシアとは同盟関係にあり、国内にロシア軍が駐留している。