Hieman ennen Yhdysvaltain vapaussodan syttymistä Trenton käsitti noin 100 taloa. Se oli yksi kolmesta ensimmäisestä Yhdysvaltain itsenäisyysjulistuksen julkilukupaikoista 8. heinäkuuta 1776. Kaikki kaupungin asukkaat eivät kuitenkaan kuuluneet itsenäisyyden kannattajiin. Britit valtasivat kaupungin marraskuussa 1776 ja monet sen rakennuksista poltettiin. 26. joulukuuta 1776 George Washington johti amerikkalaiuset jäätyneen Delawarejoen yli ja valtasi kaupungin yllätyshyökkäyksellä. Seitsemän päivää myöhemmin amerikkalaiset ottivat voiton Trentonin taistelussa. Taistelu oli sodan ensimmäinen amerikkalaisten suuri voitto. Sodan päätyttyä amerikkalaisten voittoon mannermaakongressi kokoontui Trentonissa kahden kuukauden ajan vuonna 1784. Kaupungista kaavailtiin jonkin aikaa Yhdysvaltojen uutta pääkaupunkia ja hankkeeseen hyväksyttiin jopa rahoitus. Lopulta Trentonista ei kuitenkaan pääkaupunkia tullut.