Face à l'ignorance des aspirations indonésiennes, quatre années de lutte seront nécessaires pour que les deux rivaux finissent par s'entendre. Durant ces années, divers accords, batailles et opérations vont être menées: la Bataille de Surabaya, l'accord de Linggarjati, l'Opération Product, l'accord du Renville et l'Opération Corbeau et Serangan Umum.