Con l'avvento del programma Space Shuttle nei primi anni '80, la struttura originale delle piattaforme di lancio fu rimodellata per le esigenze dello Space Shuttle. Il pad 39A ha ospitato tutti i lanci dello Space Shuttle fino al gennaio 1986, quando lo Space Shuttle Challenger sarebbe diventato il primo a lanciarsi dal pad 39B durante la sfortunata missione STS-51-L, che si concluse con il disastro del "Challenger" e la morte dell'intero equipaggio della missione un minuto dopo l'inizio del volo.