Aralık ayında yapılan 2008-2009 Grand Prix Finalinda kısa programı altıncı, serbesti dörüncü bitirip genel toplamda beşinci sırada yer aldılar. İkili 24-28 Aralıkta yapılan 2009 Rusya Artistik Patinaj Şampiyonasında altın madalyayı alıp Avrupa şampiyonasına katıldı. Kısa programda yaptıkları üçlü burgudan eksi GOE (uygulama puanı) aldı. Bunun yanında bazı teknik elemanları en üst seviye olan dört değil üç üzerinden değerlendirildi. 35.54 teknik /29.84 sunum puanı alan çift kısa programı üçüncü sırada bitirdi. Serbest programa çift yan yana üçlü toe lopp serisi ile başladı ve Kawaguchi ikinci atlayışı tam tur dönmediği için bu atlayış ikili sayıldı. Fırlatmalı dörtlü salchowda ise Kawaguchi iki ayak üzerine indi. Programın geri kalanını temiz kayan çift 58.59 teknik/58.80 sunum puanı elde etti ve serbest programı ikinci bitirdi. Genel toplamda ise gümüş madalyayı aldı.