Nel 2000, Ayalon fu sostituito da Avi Dichter, un ex commando Sayeret Matkal e un esperto agente Shin Bet, che rafforzò i rapporti di lavoro con le forze di difesa israeliane e la polizia israeliana. Dichter era al comando quando scoppiò l'Intifada di al-Aqsa e ha trasformato lo Shin Bet in un attore di spicco nella guerra al terrorismo dopo il crollo del Vertice di Camp David del 2000 .