В это время Бубник активно привлекался в состав национальной сборной Чехословакии по хоккею. Так, в 1948 году он удостоился права защищать честь страны на зимних Олимпийских играх в Санкт-Морице — чехословаки одержали здесь победу над всеми соперниками кроме Канады, с которой сыграли вничью, и заняли второе место, уступив канадцам только по разнице заброшенных и пропущенных шайб. Тем самым Бубник получил серебряную олимпийскую медаль, а также золотую медаль разыгрывавшегося здесь первенства Европы. В 1949 году он со своей командой победил на чемпионате мира (и Европы) в Швеции.