Родился в Джанкшн-сити (штат Канзас) в семье также известного генерал-лейтенанта Армии США Эдны Чаффи Старшего. В 1906 году закончил Военную академию в Вест-Пойнте и стал лейтенантом кавалерии. Во время Первой мировой войны попал в пехоту, в звании майора участвовал в составе IV корпуса в Сен-Миельской операции, затем был произведён в полковники и в составе III корпуса участвовал в Мёз-Аргоннском наступлении.