Польське повстання 1830—1831 років призвело до серйозного повороту в освітній політиці Російської імперії. Багато студентів і навіть викладачі Віленського університету були причетні до повстанського руху. За цих обставин учбова округа зазнала подальшої реорганізації. Указом від 12 січня 1831 року навчальні заклади Мінської губернії були передані до Білоруської учбової округи, а Волинської та Подільської губерній — до Харківської учбової округи. 1 травня 1832 року Віленський університет було закрито і разом з ним розформовано Віленську учбову округу. Навчальні заклади, що належали до Віленської учбової округи були включені до Білорусьої учбової округи, центр якої ще деякий час був у Вітебську, а у 1836 році був перенесений у Вільно.