Japonya’nın kayıtsız şartsız teslim olmasından sonra adaya çıkan ABD işgal kuvvetleri hapishaneyi devralarak siyasi mahkûmları serbest bırakmışlardır. Sugamo Hapishanesi bu dönemde Uzak Doğu Uluslararası Askerî Ceza Mahkemesinde yargılanmayı bekleyen savaş suçlusu sanıklarını misafir etti. Suçlu bulunan 7 savaş dönemi Japon liderin idamı da burada gerçekleşti. Hapishanenin denetimi için toplamda 2500 ABD askeri personeli görev yapacak ve 1945-1952 yılları arasında 2000 Japon savaş suçlusu burada kaldı