Maria Kaczyńska wurde 1942 (anderen Angaben zufolge 1943) als "Maria Mackiewicz" geboren. Ihr Vater Czesław Mackiewicz arbeitete als Förster in Nowa Brda und machte sie mit der Natur vertraut. Ihre Mutter Lidia stammte aus Sankt Petersburg und war Lehrerin an einer Schule in der Nähe von Złotów. Sie hatte einen Bruder namens Konrad. Ihre Familie stammte ursprünglich aus der Region um Wilna. Sie kehrten als Repatrianten nach dem Zweiten Weltkrieg nach Polen zurück. Ihr Vater hatte als Mitglied der Polnischen Heimatarmee in der litauischen Stadt gegen deutsche Wehrmachtssoldaten gekämpft. Auch zwei ihrer Onkel väterlicherseits waren Kriegsteilnehmer: der eine nahm als Mitglied des 2. Polnischen Korps an der Schlacht um Monte Cassino (1944) teil, der andere kam als Offizier beim Massaker von Katyn (1940) ums Leben.