В начале Отечественной войны 1812 года полковник Эммануэль был шефом Киевского драгунского полка и командовал 2-й бригадой (по другим данным 13-й бригадой) 4-й кавалерийской дивизии 4-го резервного кавалерийского корпуса, состоял в арьергарде 2-й Западной армии и был во множестве сражений с французами при отступлении к Москве, в бою на Шевардинском редуте был ранен. Далее он отличился в сражениях при Малоярославце и под Вязьмой, за что был произведён в генерал-майоры. Во время Заграничных походов 1813 и 1814 годов также был во множестве сражений и за отличие при взятии Парижа получил чин генерал-лейтенанта.