Livonija je postala del Velike litovske kneževine leta 1561, ko je bil z Vilenskim sporazumom sekulariziran Livonski red in med livonsko vojno razpuščena Livonska konfederacija. Na delu Livonije je bila ustanovljena Vojvodina Kurlandija in Semigalija, medtem ko sta jugozahodni del sedanje Estonije in severovzhod sedanje Latvije pripadla Veliki litovski kneževini.