Der amerikanische Gelehrte Stephen Tankel beschrieb das ISI-CT als ein beim pakistanischen Sicherheitsinstitut als „extern gesponsertes Waisenkind“ wahrgenommenes Element, welches über ein nur begrenztes Mandat verfüge und vom leistungsstärkeren „S-Flügel“, welchem die Leitung von Geheimdienst- und Sicherheitsoperationen außerhalb Pakistans obliege, eingeschränkt und untergraben werden würde. Westliche Wissenschaftler, Forscher und Journalisten wie Robert Johnson, David Ignatius, Thomas E. Ricks, Siegfried O. Wolf, Shaun Gregory und Steve Coll befürworten die indische Behauptung, dass der Anschlag von Mumbai zumindest mit einem gewissen Grad an Vorkenntnis durch den ISI stattgefunden habe. Die Journalisten Cathy Scott-Clark und Adrian Levy schrieben in ihrem Buch "The Exile: The Stunning Inside Story of Osama Bin Laden and Al Qaeda in Flight" (ISBN 1-4088-5876-2), berufend auf zwei führende Mitglieder der LeT, dass Osama bin Laden 2008 nach Mansehra gereist war, um an einem außerordentlichen Treffen für die Operation in Mumbai am 26. November 2008 teilzunehmen. Dieses Treffen sei vom „S-Flügel“ des ISI beaufsichtigt und von al-Qaida gesponsert worden. Das Anwesen von Osama bin Laden in Abbottabad soll auf einem von der LeT erworbenen Grundstück errichtet worden sein. Darüber hinaus stellten Dokumente, die bei der Razzia des US-Kommandos beschlagnahmt wurden, bei der bin Laden getötet wurde (Operation Neptune Spear), fest, dass Hafiz Muhammad Saeed bis zu dessen Tod mit dem al-Qaida-Chef korrespondiert hatte.