La Coppa Intercontinentale 2000 fu persa dai "blancos" a beneficio degli argentini del : a Tokyo non bastò un gran gol di Roberto Carlos a rimontare il doppio svantaggio, maturato nei primi cinque minuti di gioco a causa di una doppietta di Martín Palermo. Nello stesso mese di dicembre del 2000 il Real Madrid ricevette dalla FIFA il premio di migliore club del XX secolo. La votazione, condotta tra i lettori del magazine bimestrale della FIFA, vide il club della capitale spagnola ottenere una schiacciante maggioranza di voti (42,35 %).