Оставшийся без умелого полководца, афинский флот был разбит и блокирован в гавани Митилены на Лесбосе. В Афинах были обращены в деньги все драгоценные посвящения, хранившиеся в храмах на Акрополе; на эти деньги был оснащён новый флот в 110 триер, на которые за нехваткой граждан посадили также метеков и освобождённых рабов. В 406 года до н. э. афиняне в ходе ожесточённого сражения при Аргинусских островах, близ Лесбоса нанесли поражение пелопоннесскому флоту. Из 140 спартанских кораблей было потоплено 70. В бою пал и новый наварх пелопоннесского флота Калликратид. Победа была решительная, однако истерически настроенная афинская масса обвинила стратегов в том, что они после битвы не подобрали моряков с собственных повреждённых и тонувших кораблей. Хотя обвиняемые ссылались, в своё оправдание, на разыгравшийся шторм, всех явившихся на суд в Афины стратегов приговорили к смертной казни.