À la suite des attaques du World Trade Center en 2001, Gene Codes consacra une part importante de ses ressources pour permettre l'identification de ceux qui étaient portés disparus. Cet effort se finalisa par la conception du logiciel "Mass Fatality Identification SYStem", ou MFISYS (prononcé “emphasis”). Ce logiciel enregistre les profils ADN et recherche des correspondances parmi les profils spécimen. Ces profils sont générés en séquençant une série de marqueurs génétiques comme l'ADN mitochondrial (ADNmt), les répétitions en tandem courtes ("short tandem repeats", STR) et le Polymorphisme nucléotidique. Peu de temps après, ce programme fut utilisé pour aider à identifier les morts tués durant le séisme du 26 décembre 2004 dans l'océan Indien en Asie. Gene Codes travaille actuellement avec le Projet ADN de la Shoah (DNA Shoah Project)  dont le but est d'identifier les restes de ceux qui furent tués durant l'Holocauste.