Desde os primeiros dias da ocupação surgiu um movimento poderoso e cada vez mais bem coordenado de partisans soviéticos. Escondendo-se em bosques e pântanos, os partisans infligiram graves danos às linhas de abastecimento e comunicação alemãs, danificando ferrovias, ligações telegráficas, pontes, atacando depósitos de mantimentos, combustível e transportes e fazendo emboscadas a soldados do Eixo. Nem todos os partisans anti-alemães, no entanto, eram pró-soviéticos. Na maior ação de sabotagem cometida pelos partisans em toda a Segunda Guerra Mundial, a chamada 'distração de Asipovichy', de 30 de julho de 1943, quatro trens alemães com suprimentos e tanques Tiger foram destruídos. Para combater a atividade partisan, os alemães tiveram de recuar forças consideráveis para trás de sua linha de frente. Em 22 de junho de 1944, a imensa ofensiva soviética denominada Operação Bagration foi lançada, reconquistando finalmente todo o território bielorrusso ao fim de agosto.