Dopo alcuni anni di buoni risultati nella seconda serie, con le "Rondinelle" guidate da Frisoni rispettivamente al sesto, al terzo e al quinto posto, e nonostante l'ombra della Seconda guerra mondiale si allungasse sempre di più sull'Italia, la squadra ritrovò la Serie A nella stagione 1942-1943 con il nuovo allenatore József Bánás, piazzandosi al secondo posto, distaccata di due soli punti dai vincitori del . In seguito agli eventi del 25 luglio e dell'8 settembre 1943 e al conseguente scoppio della guerra civile, i lombardi riuscirono comunque a disputare il campionato Alta Italia 1944, arrivando secondi dietro all', a pari merito con il ; lo spareggio fu però favorevole ai bianco-rossi, che si imposero per 1-0.