Бут сыграл за сборную Шотландии 22 матча и забил 6 голов. Благодаря его голам «кельты» попадают на Евро-96. Скотт забивает важные голы в тяжелейших поединках против сборных России (1-1) и Финляндии (1-0). Также Бут является членом команды на Чемпионате Мира 1998 года.