Durante la Guerra Civil (1936-1939) el aeropuerto de La Albericia, así como el cercano aeródromo de Pontejos o Rubayo (de reciente creación), vieron actividad militar de ambos contendientes. En La Albericia estuvo situado el Mando Aéreo Republicano del Norte. Con la toma de Santander por los sublevados, ambos aeródromos serían utilizados como bases por la Legión Cóndor alemana a partir de 1937. Al finalizar el conflicto armado el aeropuerto de La Albericia recibe tráfico aéreo civil y también militar al quedar instalada una base aérea.