С 1936 года у Гиммлера секретарём служила Хедвиг Поттхаст. Девушка стала его любовницей в 1939 году. Два года спустя она ушла с работы, и Гиммлер предоставил ей жильё — сначала в Мекленбурге, затем — в Берхтесгадене. Она родила ему двух детей: сына Хельге (род. 15 февраля 1942 года) и дочь Нанетту Доротею (род. 20 июля 1944 года в Берхтесгадене). Маргарет, жившая тогда с дочерью в Гмунде, узнала о романе мужа в 1941 году. Уже тогда супруги не были близки, и Маргарет решила сохранить брак ради дочери. В годы войны она работала медсестрой в Германском Красном Кресте и была назначена инспектором 3-го военного округа (Берлин-Бранденбург). Гиммлер поддерживал тесную связь с Гудрун, которую ласково называл «Пюппи» («куколка»). Он звонил дочери раз в несколько дней и приезжал к ней при любой возможности.