Естонија је учествовала на Светском првенству у атлетици у дворани 2008. одржаном у Валенсији од 7. до 9. марта. Ово је било девето учешће Естоније на светским првенствима у дворани, односно учествовала је под данашњим именом на свим првенствима од 1993. до данас. Репрезентацију Естоније представљало је троје атлетичара 2 мушкарца и 1 жена, који су се такмичиле у три дисциплине.