Beim Rückzug der Franzosen aus Spanien musste Abbé Navarra verlassen und kehrte nach dem entscheidenden Sieg der Alliierten in der Schlacht bei Vitoria (21. Juni 1813) nach Frankreich zurück. Er kommandierte die dritte Division unter dem Oberbefehl des Marschalls Nicolas Jean-de-Dieu Soult und zeichnete sich u. a. in den vom 9.–13. Dezember 1813 gegen englische, spanische und portugiesische Truppen geschlagenen Schlachten an der Nive nahe Bayonne aus. Er verstärkte dann mit seiner Division die Verteidigung des von den Engländern blockierten Bayonne. Auf Anweisung des Oberkommandierenden, Pierre Thouvenot, beteiligte er sich am 14. April 1814 an einem für die Engländer verlustreichen Ausfall aus der Stadt.