Po dymisji Władimira Alekny w 2012 roku Andriej Woronkow był jednym z kandydatów na trenera reprezentacji Rosji, którym został wybranym jednogłośnie przez Rosyjski Związek Piłki Siatkowej. Z reprezentacją zwyciężył w rozgrywanych w Polsce i Danii mistrzostwach Europy 2013 oraz zwyciężył w turnieju finałowym Ligi Światowej 2013 w Mar del Placie oraz zdobył srebrny medal Pucharu Wielkich Mistrzów 2013.