それ以降に行われたAFCアジアカップ1996や1998年フランス大会アジア予選などの公式試合を含めて1993年から1997年まで一切の国際試合には参加せず（1998年バンコクアジア大会から復帰）、2006年ドイツ大会アジア予選の参加まで国際試合の数は以前と比べて激減した。国際試合に参加しなかった理由は一般的には国内の飢饉や自然災害、金日成主席の死去などとされてきたが、中国サッカー専門誌で元北朝鮮代表チームの関係者「日韓への敗戦に激怒した金正日総書記が対外試合の禁止を命じたからだ」と証言した。最近では経済的要因（苦難の行軍）がその理由とされてきている。脱北者のサッカー関係者と親しい韓国のサッカーライター金起徳によれば、競技力の低下から国際試合を禁じたというのは2次的な理由であり、実際には経済的要因が大きかったという。また、協会副会長のリ・ガンホンはその理由について「国家財政危機で強化費が限られてしまったので、協会内での議論の結果、その強化費の多くをユースに回したから」と述べている。結果的にユース育成は成功し、2004年から各年代のアジアユース大会で優勝や準優勝といった好成績を残すようになった。選手の実力があがったことで、海外のクラブで活躍する選手も出てきた。