Peu à l'aise dans ces fonctions, il demanda ensuite au premier consul la permission d'accompagner, en qualité de préfet colonial, le général Leclerc, qui commandait l'expédition dirigée contre Saint-Domingue. Parti avec sa famille, dans l'espoir de faire valoir les droits qu'il tenait de son beau-père sur de grandes propriétés situées dans cette colonie, il y mourut en 1802, peu après son arrivée, de la fièvre jaune.