З початок Другої світової війни віце-адмірал Дж. Саомервілль був знову викликаний на службу і виконував спеціальні завдання на замовлення Британського адміралтейства, зокрема особисто брав участь у розробці нового радару для потреб флоту. У травні 1940 року, коли британська армія опинилась на грані нищівного розгрому на полях Франції, активно діяв під проводом адмірала сера Б.Рамсея, організовуючи евакуацію Британського експедиційного корпусу з Дюнкерка.