1757 kehrte er nach Québec zurück. 1758 beteiligte er sich an einer Expedition ins Gebiet der Mohawk. Nachdem die Mitglieder der Familie Vérendrye aus politischen Gründen durch den Intendanten François Bigot aus wichtigen Posten im westlichen Teil der französischen Kolonien entfernt wurden, begann Louis-Joseph wieder als Pelzhändler zu arbeiten. Im Zuge des Siebenjährigen Kriegs transportierte Louis-Joseph im Jahr 1759 Indianer vom Fort Michilimackinac nach Montreal um sie gegen die Briten und deren Verbündete beim Lake Champlain kämpfen zu lassen. Am 15. Oktober 1761 begab er sich auf eine Reise nach Frankreich. Am 15. November wurde sein Schiff bei einem Sturm in der Nähe der Kap-Breton-Insel zerstört. Louis-Joseph und seine Besatzung sind seitdem verschollen.