V roce 1563 přenesl hlavní město svého vévodství ze Chambéry do Turína a ve státní správě a soudnictví zavedl jako úřední jazyk italštinu. Roku 1578 nechal ze Chambéry přenést slavné Ježíšovo plátno do katedrály sv. Jana Křtitele v Turíně. Emanuel Filibert se velice zasloužil o reorganizaci svého dominia a o zlepšení podmínek v zemědělství a manufakturách vypleněných cizími vojsky a dlouhodobě podporoval také bankovnictví. Tak se mu podařilo vytvořit základ pro sestavení nevelké, avšak disciplinované armády, která se opírala o systém domobrany organizovaný podle provincií. Stará feudální a žoldnéřská vojska zrušil. Jeho malé námořnictvo (&lt;a href="Nicesk%C3%A9%20hrabstv%C3%AD"&gt;Nizza/Nice&lt;/a&gt;) se účastnila bitvy u Lepanta.