На международно ниво Батистута е на второ място сред голмайсторите за отбора на  – има 56 гола в 78 мача с националната фланелка на Аржентина . Батистута играе за на три Световни първенства – Световно първенство 1994, Световно първенство 1998 и Световно първенство 2002, също така и на три издания на Копа Америка – през 1991, 1993 и 1995 г. Играе по-голямата част от кариерата си във Фиорентина и се нарежда десети в класацията по най-много вкарани голове в историята на Серия А със 184 гола в 318 мача.