Bis in die 1930er Jahre nahm die Anzahl der Gemeindeglieder kontinuierlich ab, sodass sie bei der Machtergreifung durch die NSDAP 1933 auf 63 Personen gesunken war. Die jüdische Bevölkerung war zu dieser Zeit noch vollständig ins Dorfleben integriert. Im Gemeinderat befand sich ein jüdisches Mitglied, im Bürgerausschuss waren sechs jüdische Mitglieder aktiv. Mit den bald folgenden Boykottaufrufen wurde das jüdische Leben in Neidenstein zerstört. Ab 1935 wurden mehr und mehr jüdische Häuser und Geschäfte aufgegeben und verkauft. Der größte Teil der Neidensteiner Juden emigrierte. Bei den Novemberpogromen 1938 wurde von der Eschelbronner SA unter Leitung des Obersturmbannführers und Waibstadter Bürgermeisters Eugen Laule am 10. November die Inneneinrichtung der Synagoge zerstört und die letzten 19 jüdischen Einwohner wurden während der Wagner-Bürckel-Aktion im Oktober 1940 nach Camp de Gurs deportiert.