Parti en mission de liaison en Angleterre en , il est envoyé par les Princes en Vendée, rejoint l'armée vendéenne au passage de la Loire le . Il est blessé à la Bataille de Savenay, (Loire-Atlantique), en protégeant la retraite, se réfugie dans la forêt du Gâvre où il se rétablit. De 1794 à 1795, il commande la division royaliste de La Guerche de Bretagne, composée de 500 hommes et participe à toutes les batailles. En 1799, il est courrier des Princes dans les départements insurgés : il est fait prisonnier par les "bleus", mais il parvient à s'évader de la tour de Lébat qui servait de prison dans la ville-Neuve à Rennes. Il tente de rejoindre l'Espagne à bord du corsaire malouin « "Le Furet" », commandé par Pierre François Etienne Bouvet de Maisonneuve. Mais le vaisseau est intercepté le par les Anglais qui le font prisonnier à leur tour. Il est échangé après six mois de captivité sur les pontons d'Angleterre, sur l'intervention d'Henri de Saint-Hilaire, son oncle, lieutenant-général en Espagne. Après avoir servi en Espagne sous les ordres du général de Saint-Hilaire, il se retire définitivement en 1801 dans son château de La Haye Saint-Hilaire. Il épouse en 1816 Gillette-Marie Le Bouc. Elle lui donne un fils, Louis-Hyacinthe-François-Xavier, né le , qui sera le futur représentant du « comte de Chambord » en Ille-et-Vilaine. Louis de La Haye-Saint-Hilaire meurt le .