En la Roumanie, qui entretemps a remplacé son roi pro-Allié par le dictateur fasciste Ion Antonescu, efface la RSSM de la carte en participant à l'attaque allemande contre l'URSS et en reprenant pour quatre ans la Bessarabie. Ce n'est plus la Roumanie d'avant-guerre, une démocratie parlementaire pluraliste, mais un état militaire qui annexe aussi la Podolie ukrainienne entre le Dnister et le Buh (dite Transnistrie par les Roumains). juifs sur et Roms sur « disparaissent » de l'ancienne Bessarabie durant cette période. La moitié d'entre eux se sont enfuis derrière l'Armée rouge en déroute, mais ont été rattrapés en Ukraine et fusillés sur place, soit par les Allemands, soit par les Roumains, soit même par des retardataires Soviétiques: « ils encombraient les routes ». D'autres ont été enfermés par l'armée d'Antonescu dans des hangars ou silos qui furent incendiés ou dynamités. Une partie des juifs Bessarabiens et Bucoviniens a pu être sauvée grâce aux efforts conjugués de la société "Aliyah" dirigée par Eugène Meissner et Samuel Leibovici, du réseau maçonnique du SMR dirigé par le Iancou Grigorescu et N.G. Malioglu, de la Croix-Rouge roumaine et de quelques « justes » comme le pharmacien Beceanu de Jassy ou le maire de Cernăuți, Traian Popovici. Mais Juifs au moins ont été déportés de Bessarabie en Transnistrie où les autorités d'Antonescu les ont laissé mourir de froid, de malnutrition et de dysenterie. Une page très noire dans l'histoire de la Roumanie et de la Moldavie. Derrière le rideau de fer, les « justes » moldaves ou roumains n'ont pas eu connaissance de l'existence de Yad Vashem, et la plupart sont morts anonymement.