2003 yılında beri Kamerun millî takımına davet edilen Webó, millî takım forması altında özellıkle Fildişi Sahili millî futbol takımına karşı oynanan 2006 FIFA Dünya Kupası elemelerinde dikkat çekmiştir. Bu karşılaşmada hat-trick yapmayı başarmıştır. Millî takımda Eto'o'nun partneri olarak görev yapmaktadır. Webó, 2014 FIFA Dünya Kupası Elemeleri'nde Tunus karşısında gol atmayı başarmıştır ve Kamerun 2014 Dünya Kupası'na gıtmeye hak kazanmıştır. Webó, millî takımı bıraktığını 31 Ağustos 2014 tarihinde açıkladı. 2015 Afrika Uluslar Kupası nedeniyle takımdan bir süre ayrı kalacak dönemin forvetleri Emmanuel Emenike ve Moussa Sow'dan sonra takımı yalnız bırakmamak için millî takımı bırakıp yalnızca Fenerbahçe'nin başarısına odaklanacağını belirtti.