С августа 1941 года — на фронтах Великой Отечественной войны. Командовал сначала миномётным дивизионом, затем был заместителем командира и командиром самоходно-артиллерийского полка. Принимал участие в боях на Северо-Западном, Южном, Центральном, Белорусском, 1-м, 2-м и 3-м Украинском фронтах. В годы войны дважды был ранен. Участвовал в боях в районе Демянского выступа, освобождении Старой Руссы, боях на Северском Донце, Курской битве, битве за Днепр, Мозырской, Корсунь-Шевченковской, Уманско-Ботошанской, Ясско-Кишинёвской операциях, освобождении Ясс, Васлуя, Рымника, Плоешти, Дебреценской операции, освобождении Будапешта, Вены и Праги. К августу 1944 года гвардии майор Акакий Букия был заместителем командира 745-го самоходного артиллерийского полка 5-го механизированного корпуса 6-й танковой армии 2-го Украинского фронта. Отличился во время Ясско-Кишинёвской операции.