Beliau bertanggungjawab mengarahkan askar-askar menembak ratusan penziarah Sikh yang menunjuk perasaan secara aman di Jallianwala Bagh, Amritsar, Punjab (kini di India). sehingga mengorbankan sekurang-kurangnya 379 jiwa dan mencederakan ribuan orang lain. Tindakannya diraikan sesetengah pihak dalam kerajaan Raj British namun kerajaan pusat di United Kingdom mengecam keras kekejaman tindakan tersebut sehingga Dyer dipecat dan disekat daripada mana-mana jawatan kerajaan dalam jajahan India. Ada juga sejarawan yang menyatakan ia sebagai kejadian pemutus penting yang membawa kepada berakhirnya pemerintahan British di India dengan sentimen nasionalisme yang semakin membuak tinggi akibat kejadian ini.