Elle fait ses débuts sur la scène internationale en 2003 à l'occasion des championnats du monde cadets de Sherbrooke au Québec. Elle y obtient la médaille de bronze en franchissant la hauteur de . Elle quitte ensuite sa ville natale de Iartsevo pour rejoindre le centre d'entrainement olympique de Moscou sous la conduite de Galina Filatova, ancienne sauteuse en hauteur soviétique ayant participé aux Jeux olympiques d'été de 1976. L'année suivante, Svetlana Shkolina se classe deuxième des championnats du monde juniors 2004 se déroulant à Grosseto en Italie, devancée par l'ukrainienne Iryna Kovalenko. Quatrième des Universiades d'été de 2005, elle remporte son premier succès international à l'occasion des championnats d'Europe juniors de Kaunas, avec un saut à .