El 25 de mayo del 2013, Pizarro se consagró campeón de la Champions League 2012-13 con el Bayern de Múnich, que vencieron en la final 2-1 al Borussia Dortmund con un gol a los 89 minutos. El ‘Bombardero’ es el segundo peruano en alzar la Liga de Campeones (Ex Copa de Europa) junto a Víctor Benítez. Bayern de Múnich derrotó a Borussia Dortmund en la cuarta final entre equipos de un mismo país. El escenario fue el mítico Estadio de Wembley con goles de Mario Mandžukić y Arjen Robben en los últimos minutos el Bayern de Múnich conquistó su Champions League número 5. Claudio Pizarro fue uno de los más felices tras salir campeón de la Champions League. El peruano llegó al Bayern de Múnich con esa misión y la cumplió. El Bombardero decidió volver esta temporada al Bayern de Múnich por una sola razón: salir campeón de la Bundesliga, Copa de Alemania y Champions League. El ‘Bombardero’ ya lo ganó todo jugando para clubes alemanes. Su primer título fue la Copa Intercontinental 2001. El soñado triplete. El primero ya lo logró hace algunas semanas y 25 de mayo se adjudicó la ‘Orejona’, luego de que los Bávaros vencieran 2-1 al Borussia Dortmund en la final.