Partecipa, insieme alla selezione spagnola, al Campionato europeo di calcio Under-19 2012 in Estonia. Jesé esordisce, da titolare, nella prima partita, della fase a gironi, contro la , al 30º minuto apre le marcature e 7 minuti più tardi viene ammonito, al 52º minuto viene sostituito sul 2-0, la partita viene poi vinta per 2-1. Nella seconda giornata contro il mette a segno una tripletta, la parita però viene pareggiata 3-3. La Spagna dopo aver superato la fase a gironi e aver battuto la ai calci di rigore in semifinale, batte nuovamente, in finale, la Grecia proprio con un gol di Jesé che si laurea, oltre al titolo europeo, capocannoniere della competizione con 5 reti.