Trasferito per due anni nella fortezza di Ziegenhain, nel corso della Guerra di Smalcalda, 65 delle oltre 850 pietre originarie risultavano scomparse quando il Reliquiario fu restituito a Marburgo nel 1548. Negli anni del trasferimento a Kassel, sotto il regno di Girolamo Bonaparte (1810-1814), andarono perdute 117 pietre, il crocifisso dal frontone nord e parti delle figure, come attestato dal professor Johann Christoph Ullmann. Ulteriori danni furono causati da un furto con scasso nel 1920.