Пробыв полгода в опале, Себастьяни перед началом кампании в России вернулся в строй и получил в командование кирасирскую дивизию корпуса Монбрена. Приняв с отличием участие в сражении под Смоленском (на подступах к которому имел неоднократные авангардные стычки с казаками Платова), Себастьяни после Бородинской битвы во главе 2-го кавалерийского корпуса среди первых вошёл в Москву. При отступлении из России Себастьяни командовал остатками французской кавалерии и возглавлял авангард.