Když jeho strýc bojoval v britsko-americké válce, Johns převzal řízení obchodu. V roce 1819 ustavil se svými bratry firmu "Hopkins &amp; Brothers Wholesalers". Většina Hopkinsova bohatství nicméně pocházela z jeho investic do různých podniků, zejména do "Baltimore and Ohio Railroad", v němž se stal roku 1847 ředitelem. Zastával také funkci prezidenta "Merchants' Bank" a vedoucí pozici v dalších organizacích.