Il 18 agosto 2013 viene battuta dalla Juventus per 4-0 nella Supercoppa italiana. Petković, a campionato in corso, si era già accordato con la Nazionale svizzera, ritrovandosi così a essere contemporaneamente allenatore della Lazio e commissario tecnico della Svizzera, ma la situazione andrà avanti solo per poche settimane alla luce dei risultati poco soddisfacenti e di profonde incomprensioni con la dirigenza che porteranno anche alle vie legali. Il 4 gennaio 2014, il presidente Lotito decide così di sostituirlo con Edy Reja, già suo predecessore.