З червня 1943 по березень 1944 року навчався у Вищій військовій академії імені К. Є. Ворошилова. З березня 1944 року генерал-майор Г. Н. Перекрестов — командир 65-го стрілецького корпусу. По закінченні бойових дії у Східній Пруссії корпус був перекинутий на Далекий Схід. Учасник радянсько-японської війни. 8 вересня 1945 року присвоєно військове звання «генерал-лейтенант».