Champion ble født i 1882 i Norfolkøya (som er nå australsk territorium, men var da en britisk koloni). Han flyttet til New Zealand som ungdom. Hans mor, Sarah Clara Quintal, nedstammet fra mytteren Mathew Quintal fra Mytteriet på Bounty. Hans far Captain William Nhill Champion var en sjøkaptein som handlet rundt om i Stillehavet. Malcolm jobbet på faren sin sitt skip og på slutten av det 19. århundret bosatte han seg i Auckland. Han døde på 26.juni 1939 i Auckland, New Zealand.