비사야 제도의 레이테 섬과 세부 섬, 네그로스 섬 등지에는 일본군이 만들어 둔 비행장이 있었다. 그러나 레이테 섬은 1944년 말에 연합군에 점령되어 루손 전투까지의 일련의 전투 결과 일본군의 항공 전력은 괴멸 상태에 빠져 있었다. 무력화된 각 거점에는 공군의 지상 요원 등이 남겨져 분산 배치된 제102사단(신페이 후쿠에 중장)이 방위를 맡고 있었다. 지휘해야 할 스즈키 소사쿠 중장의 제35군 사령부는 레이테 섬 전투의 전쟁 전선 지도에 들어간 후 세부로 복귀하였고, 민다나오 전투에서 심한 손실을 입어 효과적으로 전체를 지휘할 수 있는 상태가 아니었다.