После поджога Рейхстага и захвата власти Гитлером, 5 марта 1933 года Эдгар Андре был арестован. В тюрьме он провёл 3,5 года, подвергался пыткам. После этого он мог передвигаться только на костылях и потерял слух. 4 мая 1936 года в Гамбурге начался суд над ним, Андре обвинялся в убийствах, попытках убийства, а также преступлениях против общества, однако прокурор не мог привести достаточных доказательств. Однако, несмотря на это, Андре был приговорен к смертной казни, на этом настаивал Гитлер. 10 июля 1936 года именно такой приговор и был вынесен.