Fu membro dell'associazione nazionale "Tatrín". Nel 1847, appena prima della rivoluzione, Daxner delineò un programma che raccoglieva le petizioni della nazione slovacca per le libertà culturali, politiche e sociali. Fu condannato a morte dalle autorità ungheresi nel 1848, ma fu liberato da Ján Francisci-Rimavský e dall'esercito austriaco (che combatteva a fianco degli slovacchi contro gli ungheresi) e divenne capitano delle truppe volontarie slovacche nelle campagne rivoluzionarie.