Durante la Crisi dei missili di Cuba del 1962, lo squadrone fu tenuto alla massima prontezza, con i missili puntati sugli obiettivi strategici nell'Unione Sovietica. La risoluzione della crisi missilistica includeva la disattivazione degli IRBM dei Thor e dei PGM-19 Jupiter nel Regno Unito, in Italia ed in Turchia. Lo squadrone fu sciolto con la fine del Project Emily nel 1963.