Ein letztes Mal trat Zeuxis während des Römisch-Syrischen Krieges in Erscheinung. In der entscheidenden Schlacht bei Magnesia 190 v. Chr. hatte Zeuxis das Kommando über den rechten Flügel des Heeres. Unmittelbar nach der Niederlage gegen die Römer wurde Zeuxis als Unterhändler zu diesen geschickt. Er handelte auch ein Jahr später in Rom den Frieden von Apameia aus. Kleinasien fiel in dessen Folge an die Römer, woraufhin Zeuxis’ Funktion als Vizekönig nach mehr als zwanzig Jahren ihr Ende fand.