Неоднократно переизбираясь, на этом посту он пробыл до 1994 года. На посту президента ИИХФ Гюнтер Сабетцки стремился установить более тесные контакты с профессиональными организациями в Северной Америке, в том числе между ИИХФ и НХЛ. Он сыграл важную роль в прекращении конфликта с североамериканскими хоккейными организациями. Благодаря усилиям Сабетцки на чемпионате мира 1977 года участвовала национальная сборная команда Канады — впервые после 8-летнего перерыва. Под руководством Гюнтера Сабетцки реализована широкая программа оказания помощи странам, где хоккей развит слабо, а также программа улучшения методики судейства и подготовки тренерских кадров. Доктор Сабетцки — один из организаторов розыгрышей Кубка Канады. За период его президентства число членов ИИХФ возросло с 31 до 50.