En 1895 un incendio destruyó gran parte del edificio, siendo restaurado al año siguiente por Carlos Bunot con la colaboración de los arquitectos Doyère, Joannon y von Moltke. La reinauguración fue en 1901bajo el gobierno de Federico Errázuriz Echaurren. El terremoto producido en 1906 le causó severos daños al edificio, por lo que debió ser reacondicionado una vez más, en esta ocasión por el arquitecto chileno Alberto Cruz Montt. Desde esa fecha el Senado y la Cámara de Diputados funcionaron en el edificio hasta el golpe de estado de 1973, cuando a partir de dicho momento se utilizó para fines del Ministerio de Justicia.