O período marcado pela Restauração Portuguesa, promovida por parte da nobreza lusitana e que deu fim à União Ibérica, também se configurou como um período de crise para o reino português. Entre os desafios trazidos com a restauração estavam a recuperação das possessões perdidas; o reconhecimento internacional da independência do reino; a defesa das fronteiras e a legitimidade da nova dinastia, sendo a instabilidade de D. João IV, por ter assumido o poder através de um golpe de Estado palaciano e não duma revolta da população. Vieira teve envolvimento nas discussões sobre a legitimidade real, elaborando teorias não apenas para legitimar o Duque de Bragança como Rei de Portugal, mas também para evidenciar a impossibilidade da retomada da coroa por Felipe IV.