У 1856 році Вудрафф став церковним істориком і пропрацював на цій посаді протягом тридцяти трьох років. Будучи президентом храму в місті Сент-Джордж він під керівництвом Бриґама Янґа стандартизував храмові церемонії. Він був хрещений за померлих підписантів Декларації незалежності США та інших американських батьків-засновників, так як стверджував, що вони відвідали його у видіннях.