El 14 d'agost va començar la ofensiva franquista a Santander, que al cap de pocs dies s'havia convertit en un desastre per a les tropes republicanes, encara que les tropes basques del sector oriental van mantenir les seves posicions. Però davant l'enfonsament de la rereguarda del XIV Cos d'Exèrcit, Prada va rebre ordres de retirar-se cap a Astúries però es va trobar amb la insubordinació dels batallons nacionalistes bascos, que es van retirar pel seu compte cap a la localitat de Santoña. Allí es va produir l'anomenat Pacte de Santoña, pel qual aquestes tropes basques es rendien a les tropes italianes del CTV amb la intenció d'aconseguir certs privilegis, encara que després no fou respectat i van caure en mans de Franco. Així, una bona part de les unitats del XIV Cos van ser baixa i van deixar a la formació en una situació crítica, havent de retirar-se cap a Astúries amb les poques unitats que encara li quedaven, com per exemple el Batalló Isaac Puente. Enmig de la retirada, Prada va ser nomenat cap suprem de l'Exèrcit republicà del Nord i el va substituir en el seu lloc el Tinent Coronel Francisco Galán Rodríguez, un altre militar de provada eficàcia.