Ибрагим Эдхем родился на острове Хиос в греческой православной семье. В 1822 году во время Хиосской резни его родители были убиты турецкими солдатами, а он сам продан в рабство. В Стамбуле его усыновил великий визирь Коджа Мехмед Хюсрев-паша, не имевший собственной семьи, дал ему имя «Ибрагим Эдхем» и помог получить хорошее образование — сначала в Османской империи, а затем в Париже, где Ибрагим Эдхем учился в Эколь де Мин вместе с Луи Пастером.