Nach dem Krieg wurde Wasserfuhr 1816 zum Pensionärchirurgus des Invalidenhauses Berlin ernannt. Er absolvierte die medizinisch-chirurgische Staatsprüfung und wurde 1817 zum Dr. med. promoviert. Als Regimentsarzt war er in Thionville und Koblenz tätig. Im Jahre 1820 wurde er schließlich General-Divisionsarzt beim II. Armee-Korps in Stettin. Dort sollte er bis zu seinem Tode wohnen. 1848 nahm er am schleswig-holsteinischen Feldzug im Hauptquartier von General Friedrich von Wrangel teil, wo er das gesamte Medizinalwesen der unterstellten Truppen leitete. Dafür wurde Wasserfuhr der Rote Adlerorden II. Klasse mit Eichenlaub sowie das Komturkreuz des Oldenburgischen Haus- und Verdienstorden des Herzogs Peter Friedrich Ludwig verliehen.