2013 nahm Hernanes mit der "Seleção" am Konföderationen-Pokal in seinem Heimatland teil. In dem Turnier, das von Brasilien gewonnen werden konnte, stand Hernanes in allen fünf Spielen seiner Mannschaft auf dem Platz, wobei er allerdings viermal nur als Einwechselspieler zum Einsatz kam.