In 1798 verkreeg Castlereagh van William Pitt de positie van gouverneur-generaal (Chief Secretary) van Ierland. Vanuit deze functie speelde hij een actieve rol in het neerslaan van de Ierse opstand van dat jaar. Vervolgens was hij ook een drijvende kracht achter de "Act of Union". Hiervoor werd hij in brede kring beschimpt. Zo noemde Lord Byron hem een wrede despoot.