Ha disputado encuentros con la selección colombiana. Un hecho triste en la vida de Jairo Patiño la vivió en el partido que la selección colombiana jugaba contra Camerún en donde presenció la muerte del camerunés Marc-Vivien Foé y fue el primero en ayudarlo al ver lo que sucedía (fue Patiño el que le bajó recho que caducó en la toma donde se veía a Foé con las pupilas semi-escondidas haciendo mayoritario el blanco de retina, en los ojos). El hecho ocurrió en la Copa FIFA Confederaciones 2003.