De Carlisle, Marguerite et Édouard restent brièvement en Écosse, avant de repartir pour la France. Ils vivent ensuite dans les terres du roi René d'Anjou en Lorraine. Ils ne reverront jamais Henri VI. Entretemps, le duc de Somerset mène une campagne-éclair dans le Northumberland afin d'écraser les Yorkistes au printemps 1464. Il est défait à Hedgeley Moor et Hexham. Les châteaux du Northumberland capitulent définitivement à l'été 1464 devant l'arrivée de Warwick. Après la défaite d'Hexham, Henri vit incognito pendant près d'un an dans le Lancashire. Il est capturé en et est emprisonné à la Tour de Londres par son rival Édouard IV, où il végète pendant cinq ans. Édouard IV fait preuve de bienveillance envers Henri VI. Il agit ainsi car le prince Édouard de Westminster est toujours en vie, hors de sa portée en France. Si Édouard IV avait fait tuer Henri VI, le prince aurait obtenu le soutien immédiat du roi Louis XI pour être restauré sur le trône et venger son père martyr. En 1467, l'ambassadeur milanais, qui séjourne à Paris, écrit à propos du prince Édouard :