Prestasi Indonesia memburuk dibanding tahun 2003 di Hanoi, Vietnam. Pada SEA Games ini Indonesia hanya mengantongi 49 emas, 79 perak, dan 89 perunggu, dengan total 217 medali. Hasil ini hanya mengantarkan Indonesia pada posisi ke-5. Padahal, di Pesta Olahraga Asia Tenggara 2003 yang diselenggarakan di kota Hanoi dan kota Ho Chi Minh, Vietnam, Indonesia berada di posisi ke-3, dengan 55 emas, 68 perak, dan 98 perunggu.