Efter studentkravallerna i maj 1968 delades universitetet upp i två universitet: "Université d'Aix-Marseille I" och "Université d'Aix-Marseille II". Efter en omorganisation bildades 1973 också "Université d'Aix-Marseille III"'. Alla dessa tre sammanslogs 2012 till "Université d'Aix-Marseille".