Laëtitia Hubert change d'entraîneur et de lieu d'entraînement. Elle signe au Paris Olympique Club à Champigny-sur-Marne sous la houlette d'Annick Gailhaguet. Elle se présente au Trophée Lalique en novembre, mais doit abandonner après le programme court. C'est alors qu'elle doit subir une nouvelle opération chirurgicale, cette fois-ci sur le péroné. Cette opération la condamne toute la saison. Elle ne peut donc pas défendre son titre national aux championnats de France de Courchevel. Elle reprend l'entraînement au début de l'année 2000, mais ne peut participer ni aux championnats d'Europe de à Vienne ni aux championnats du monde de mars 2000 organisés en France à Nice.