En 2005 fou cridat a declarar en un tribunal gacaca sobre el seu possible paper en els assassinats de tutsis de 1994. En 2009 fou força criticat perquè va obstaculitzar l'exhibició en una església d'un documental sobre el Genocidi de Ruanda, on insinuava que en podria haver pres part. El 2 d'octubre de 2015, seixanta dos dies després de l'apertura del segon Sínode de la família, va obrir oficialment la causa per la canonització de Cyprien i Daphrose Rugamba, que foren assassinats durant el genocidi. En 2017 va celebrar el seu jubileu.