Mussaphia konnte später erneut die Münze in Tönning pachten. Er kooperierte viele Jahre mit Magnus von Wedderkop, der sich zu einem seiner größten Unterstützer entwickelte. Im Jahr 1698 betraute er seinen Sohn Joseph mit der Führung der meisten Geschäfte. Als 1700 die Belagerung von Tönning begann, hielt er sich vermutlich aufgrund von Münzgeschäften in der dortigen Festung auf und konnte diese nur unter Schwierigkeiten verlassen. Dem Bericht eines Korrespondenten, der im Oktober 1700 nach Hannover berichtete, ist zu entnehmen, dass Mussaphia „altershalben gantz unvernehmlich und fast kindisch“ geworden sei. Wenig später starb er.