Après la révolution de décembre 1989, il entre dans l'arène politique aux côtés d'Ion Iliescu et de Petre Roman, et devient ministre des Transports dans les gouvernements Roman et Stolojan entre 1991 et 1992. Lorsque le Front de salut national (FSN) se divise entre une aile conservatrice incarnée par Iliescu et une aile réformatrice incarnée par Roman, Băsescu reste au FSN aux côtés de Roman, lorsque, en 1993, le parti prend le nom de Front de salut national-Parti démocrate (FSN-PD). Il devient député de ce parti, de 1992 à 1996.