Com a guanyador del Campionat del món Júnior, Shaked fou convidat a participar en el supertorneig de Grans Mestres a Tilburg, Països Baixos, amb una nòmina de participants que incloïa el campió del món Garri Kaspàrov, el futur campió mundial Vladímir Kràmnik, i els super GMs Piotr Svidler, Péter Lékó, Aleksei Xírov, Michael Adams, i Judit Polgár. A les darreries de 1997, Shaked competí en el Campionat del món de la FIDE de 1998, i guanyà el seu matx de primera ronda (contra Ivan Morovic), abans de ser eliminat en la segona ronda (per Serguei Rublevski). El 1998, Shaked avançà fins a les semifinals del Campionat dels Estats Units, derrotant Borís Gulko, abans de perdre amb el futur campió Nick de Firmian. Havent ingressat a la Universitat de Maryland amb una beca d'escacs el 1998, ajudà l'equip de la Universitat a guanyar el Campionat Panamericà Intercol·legial per equips, com a primer tauler del seu equip. Posteriorment, es canvià a la Universitat d'Arizona on es graduà en Informàtica.