16강에서는 지역예선에서 공방전을 벌인 바 있는 우루과이를 만났다. 콜롬비아에게 우루과이는 지역예선에서는 꽤 어려운 상대였으나 16강에서 만났을 때는 우루과이의 루이스 알베르토 수아레스가 이탈리아를 상대로 조르조 키엘리니의 어깨를 깨무는 행위를 하여 FIFA로부터 중징계를 받고 팀에서 이탈했기 때문에 전력은 훨씬 약화된 상태였다. 그렇게 약해진 우루과이를 상대로 손쉽게 승리를 거두고 사상 첫 8강에 진출했다. 하지만 8강 상대가 개최국인 브라질이었고 양팀은 시종일관 반칙으로 일관하며 매우 거친 경기를 진행했다. 이러한 흐름으로 이어지다가 결국 후안 카밀로 수니가와 네이마르가 공을 놓고 경합을 벌이는 과정에서 수니가가 네이마르의 허리를 골절시키고 말았다. 이 경기에서 콜롬비아는 브라질에게 패하여 4강 진출에는 실패했지만 승리한 브라질 역시 네이마르를 부상으로 잃고 4강에서 독일에게 기록적인 대패를 당하였고 그 후유증으로 3·4위전에서 네덜란드에게 또다시 대패를 당하였다.