Zum 24. November 1942 wurde Leslie Morshead als Generalleutnant "(Temporary Lieutenant-General)" für seine militärischen Verdienste im Mittleren Osten auch zum Knight Commander des Order of the Bath (KCB) geschlagen. Danach war er als Nachfolger von Generalleutnant Edmund Herring von 1943 bis zu seiner Ablösung durch Generalleutnant Frank Berryman 1944 Kommandierender General des II. Korps "(II Australian Corps)". Er selbst übernahm 1944 den Posten als Kommandierender General der aus australischen Soldaten und aus einheimischen Angehörigen aus dem Territorium Papua sowie Territorium Neuguinea bestehenden "New Guinea Force". Am 21. Januar 1944 löste er Generalleutnant Iven Mackay als Kommandierender General der Zweiten Armee "(2nd Australian Army)" ab und bekleidete diese Funktion bis zum 23. Juli 1944, woraufhin Generalmajor Herbert Lloyd seine Nachfolge antrat. Zuletzt übernahm er am 24. Juli 1944 von Generalleutnant Frank Berryman den Posten als Kommandierender General des I. Korps "(I Australian Corps)" und hatte diesen bis zur Auflösung des Korps zum Ende des Zweiten Weltkrieges 1945 inne. Zum Ende des Zweiten Weltkrieges nahm er auch an der "Operation Oboe" (1. Mai 1945 bis 15. August 1945) zur Befreiung Borneos von den Japanern teil. Für seine Verdienste im Westpazifik wurde er am 2. November 1946 erneut im Kriegsbericht erwähnt. Nach Kriegsende schied er aus dem aktiven Militärdienst aus.