Но в период правления Екатерины II миссионерство сошло на нет. Β 1773 году вышел указ, устранявший архиереев от всяких дел об инородцах и ο строительстве их молитвенных домов, передавая все дела такого рода в ведение светской власти. В 1789 году было запрещено посылать проповедников к инородцам без особого дозволения губернатора, а в 1799 году должность проповедника и вовсе была упразднена. Такое изменение политики было связано с активным участием иноверцев в восстании Пугачёва, многочисленными волнениями среди них, а также с бегством калмыков из России в Китай. При Александре I на калмыцкий были переведены катехизис и Евангелие от Матфея, но очень неудачно и непонятно.