Незадолго до прихода в город Красной армии, 1 июля 1944 года Хойзер выехал из Минска в составе команды СС. Пройдя через Августов и Ортельсбург, он достиг города Накельна в Восточной Пруссии, где в течение нескольких месяцев был учителем в полицейском институте. В августе 1944 года ему было присвоено звание гауптштурмфюрера СС и в конце того же месяца стал командиром айнзацкоманды 14, входящую в айнзацгруппу H. Подразделение было задействовано в подавлении национального восстания в Словакии. Совместно с так называемой Глинковой гвардией айнзацкоманда 14 уничтожила 2867 человек в Кремнице и , а в отчёте командования содержалось упоминание об аресте евреев в городе Топольчани и его окрестностях. В марте 1945 года руководил военной группой в Кремсе-ан-дер-Донау.