Et af Nazi-Tysklands strategiske mål under invasionen af Sovjetunionen i juni 1941 var at opnå kontrol med oliefelterne i Kaukasus. De tyske invasionsstyrker nåede dog aldrig så langt syd som Georgien. Georgien stillede med 700.000 mand til Sovjetunionens røde hær, hvor omkring 350.000 omkom under krigen. Landet var en vigtig kilde til produktion af tekstiler og ammunition. Under krigen og kort efter beordrede Josef Stalin, der var etnisk georgier, forflyttelse af forskellige etniske befolkningsgrupper i Georgien, idet Stalin var af den opfattelse, at de havde samarbejdet med nazisterne. Tjetjenere, ingusjetere, karatjajere og balkarere, blev alle tvangsforflyttet til fjerntliggende områder i Centralasien og Sibirien. Folkeslagenes autonome republikker i området blev opløst og overtaget af Georgiske SSR.