Chortkiv fue ocupado por el Ejército Rojo el 17 de septiembre de 1939 durante la invasión soviética de Polonia, luego por la Alemania nazi en junio de 1941. El 26 de agosto de 1942, dos mil judíos del gueto de Chortkiv fueron deportados al campo de exterminio de Belzec por la Schutzpolizei alemana, mientras que otros quinientos, enfermos o demasiado jóvenes, fueron asesinados en el mismo lugar. En 1944, el Ejército Rojo liberó la ciudad, que pasó a formar parte de la Ucrania soviética, hasta la disolución de la URSS en 1991.