À partir de jusqu’à , le bâtiment s’est trouvé dans le ghetto de Varsovie. Il a logé consécutivement : l’Entraide sociale juive (pol. Żydowska Samopomoc Społeczna), le point de rassemblement pour les Juifs déportés d’Allemagne et l’entrepôt des meubles volés aux habitants du ghetto. Quoique endommagé, le bâtiment a survécu au soulèvement dans le ghetto de Varsovie et l’insurrection de Varsovie. Les collections de la bibliothèque ont été dérobées par les Allemands, mais après la guerre on a récupéré une partie d’elles (selon une autre source, la bibliothèque a perdu toutes les collections, c’est-à-dire 40 mille objets) .