Nei giorni successivi alla Strage di piazza Fontana fu additato, con Giuseppe Pinelli (morto in circostanze non chiarite, precipitando dalla finestra della Questura), come colpevole in base alla testimonianza del tassista Cornelio Rolandi, successivamente scomparso per disturbi cardiaci, che dichiarò di avere portato col suo taxi in quella piazza un uomo molto somigliante al Valpreda. Lì Valpreda sarebbe sceso con una valigetta e sarebbe tornato sul taxi senza di essa. Furono arrestati anche altri cinque aderenti al "Circolo anarchico 22 marzo". Valpreda venne accusato anche dall'ex estremista di destra, poi avvicinatosi agli anarchici, Mario Merlino. L'alibi di Valpreda - era a casa di una prozia, poiché ammalato - non viene creduto.