在柏林戰役的最後，恩斯特曾兩度短暫與希特勒會面，第一次是希特勒希望對恩斯特、溫納·哈瑟醫師和護士在醫護站的服務；另一次則是在希特勒與爱娃·勃劳恩的婚宴上。1945年5月1日，申克在蘇聯紅軍攻破柏林後遭到俘虜。在投降之後，恩斯特與威廉·蒙克等其他德軍高階將領，在蘇聯中將瓦西里·伊萬諾維奇·崔可夫的允許下，和參謀長一同用餐。當日晚上十點半，在蘇聯軍隊戒護之下，所有德國將領被送往另一個房間。5月3日晚間，恩斯特和其他的德國將領們被帶往了蘇聯內務人民委員部。恩斯特一直在蘇聯被囚禁到1953年才獲釋並返回西德。