Боборыкин поступил на военную службу в 1814 году. С 1814 по 1815 года он участвовал в войне шестой коалиции . С 1828 по1831 год командовал 25-й артиллерийской бригадой, во главе которой принимал участие в польской кампании (1830—1831). В 1836 году назначен командиром Астраханского артиллерийского гарнизона. В 1839 году был награждён орденом Св. Владимира 4-й степени. С 1841 года служил помощником начальника артиллерийского гарнизона Кавказского округа. В 1844 году был уволен в отставку с производством в генерал-майоры.