Данная епархиальная территория начала осваиваться православными христианами (в основном сибирскими казаками) после присоединения к Русскому государству в XVII веке, тогда территория Забайкалья была включена в состав единственной на всю Сибирь — Сибирско-Тобольской митрополии, учреждённой в сентябре 1620 года.