A differenza degli altri stati tedeschi, i Liberi Elettori della Baviera partecipano anche alle elezioni statali dal 1998. Nelle elezioni statali della Baviera nel 2008 i FW ottennero il 10,2% dei voti ed i primi 20 seggi nel Landtag. I FW potrebbero essere stati aiutati dalla presenza nella loro lista di Gabriele Pauli, ex membro dell'Unione Cristiano-Sociale in Baviera. Altri hanno suggerito che la causa e l'effetto potrebbero essere invertiti. Alle elezioni statali del 2013 i FW ripeterono il loro successo, ottenendo il 9,0% dei voti e 19 seggi. Cinque anni dopo, i Liberi Elettori ottengono l'11.6%, ottenendo 27 seggi.