Після революції в жовтні 1917 заняття в семінарії відбувалися зі значними перервами. Незабаром була реквізована велика частина семінарських приміщень і майна. Незабаром після початку «червоного терору» у вересні 1918, а разом з ним — масованої атаки на Церкву, Семінарія в Саратові була закрита.