Werner Möller war der Sohn eines Schuhmachers. Er war als Klempner tätig, engagierte sich früh in der Sozialdemokratie und veröffentlichte erste literarische Arbeiten in sozialdemokratischen Zeitungen (z. B. "Freie Presse", Barmen). Ab 1914 gehörte er als entschiedener Kriegsgegner zu den Anhängern des linksradikalen SPD-Politikers Julian Borchardt. 1916 wurde Möller wegen Verteilens von Antikriegs-Flugblättern zu neun Monaten Gefängnishaft verurteilt. Nachdem er führendes Mitglied der linken Gruppierung Internationale Kommunisten Deutschlands in Berlin gewesen war, für deren Organ "Arbeiterpolitik" er Beiträge geliefert hatte, nahm er 1918 an der Novemberrevolution und als Berliner Delegierter der Internationalen Kommunisten Deutschlands am Gründungsparteritag der KPD teil. Möller gehörte Anfang Januar 1919 zu den führenden Köpfen bei der Besetzung des Verlagsgebäudes des "Vorwärts. Berliner Volksblatt. Organ der revolutionären Arbeiterschaft Groß-Berlins" während des Januaraufstandes; er fungierte während dieser Zeit als Schriftleiter des Blattes. Er wurde gemeinsam mit weiteren sechs Parlamentären, darunter auch Wolfgang Fernbach, von Angehörigen der Freikorpseinheit Regiment Potsdam auf Befehl von Gustav Noske ermordet. Seine Frau Klara Möller berichtete in einem Brief an "Die Republik. Tageszeitung für die deutschen Arbeiterräte":