ב-18 באוגוסט 2017 החתימה אמפולי את קאפוטו על חוזה לארבע שנים תמורת 2.8 מיליון יורו בתוספת בונוסים. באמפולי המשיך קאפוטו את ההתקדמות שלו, כשסייע למועדון לזכות באליפות הסרייה ב' ולהעפיל לסרייה א', תוך שהוא כובש 26 שערים ב-41 משחקים ומסיים כמלך השערים של הסרייה ב'. גם בעונת החזרה שלו לסרייה א' הצליח להרשים קאפוטו, הוא סיים כמלך שערי הקבוצה כשכבש 16 שערים ב-38 הופעות, אולם אלה לא סייעו לאמפולי להישאר בליגה כשסיימה במקום ה-18 מתוך 20 קבוצות המוביל לסרייה ב'. אך כישרונו של קאפוטו לא נעלם מעיניהן של קבוצות הסרייה א'.