Paratriathlonissa kilpaillaan Tokion paralympialaisissa 2020 2. kertaa. Kilpailut pidetään Odaiba Marine Parkissa. Kilpailut käydään 29. ja 30. elokuuta 2020. Kilpailuja on kahdeksan, joista neljä on miehille ja neljä naisille. Kaikki kilpailut ovat yksilökilpailuja. Yhteensä urheilijoita paratriathloniin osallistuu 80.