У 2003 годзе пасля ўварвання ЗША і іх саюзнікаў вярнуўся ў Ірак і стаў выконваць функцыі саветніка па бяспецы прэм'ер-міністра Ібрахіма аль-Джафара. У 2005 годзе быў абраны ў савет прадстаўнікоў Іраку прадстаўніком партыі Дава ад мухафазы Бабіль. У 2006 годзе афіцыйныя асобы ЗША звярнуліся да прэм'ер-міністра Ірака Нуры аль-Малікі з просьбай выдаць ім арганізатара тэрактаў у Кувейце ў 1983 годзе. Абу Махдзі аль-Мухандзісу прыйшлося бегчы ў Іран.