Napoleons Ägyptenfeldzug (1798–1801) zielte langfristig auf die Eroberung der britischen und portugiesischen Besitzungen in Indien. Die Briten boten Portugal, mittlerweile unfähig, sein Weltreich allein zu verteidigen, ihren Schutz an und hielten Goa von 1799 bis 1813 besetzt. Auf ihren Druck hin schaffte man 1814 die Inquisition endgültig ab.