U-17 je bila po sprejetju v aktivno službo dodeljena 1. podmorniški flotilji, katera je bila stacionirana v Kielu. Med novembrom 1939 in julijem 1940 so jo uporabljali kot šolsko podmornico. Med januarjem 1940 in aprilom 1940 so jo med operacijo Weserübung ponovno reaktivirali kot bojno podmornico. Od 1. maja 1940 pa do konca vojne pa je bila zopet v uporabi kot šolska podmornica.