Die nächsten beiden Turniere sollten enttäuschend verlaufen. Weder für die EM 1990 noch für die EM 1992 konnte man sich qualifizieren. Mit Frankreich als Gastgeber wurde 1994 das erste Mal eine Endrunde in einem einzigen Land ausgetragen. Die Franzosen konnten das Halbfinale erreichen, wo man dem späteren Titelträger Italien mit 3:5 nach Elfmeterschießen (0:0) unterlag. Im Spiel um Platz drei scheiterte das Team mit 1:2 gegen Spanien. Zur EM 1996 in Spanien scheiterte man erneut im Halbfinale gegen Italien. Allerdings konnte man sich durch einen 1:0-Erfolg gegen Schottland die Bronzemedaille sichern. Die Europameisterschaften 1998 und 2000 fanden ohne französische Beteiligung statt, da die Qualifikation nicht geschafft wurde. Erst 2002 wurde man wieder auf sie aufmerksam, nachdem das zweite Mal nach 1988 das Finale erreicht wurde. Dort musste man sich denkbar knapp mit 3:1 nach Elfmeterschießen (0:0) geschlagen geben. Damaliger Trainer der "Blau-Weiß-Roten" war der spätere A-Nationaltrainer Frankreichs Raymond Domenech. Wie auch schon beim Titelgewinn 1988 konnte sich die Mannschaft nicht für die folgende Europameisterschaft qualifizieren und enttäuschte somit seine Fans. In Portugal 2006 wurde der Halbfinalist in einer vorhergegangenen Gruppenphase ausgespielt. Hier konnte man sich gegen den Gastgeber Portugal sowie Deutschland und Serbien und Montenegro als Gruppensieger durchsetzen. Im Halbfinale wartete die niederländische Auswahl. Nach einem 0:2 zur Halbzeit, konnte das Blatt bis zum Abpfiff zu einem 2:2 gewendet werden. In der Verlängerung scheiterte man dann allerdings mit 3:2 gegen den kommenden Europameister.