从美洲土著居民首先开始在这一地区狩猎和捕鱼开始，黄石公园的人类活动历史至少已经有1万1千年。1950年代蒙大拿州邮局建设期间，人们找到了一个约1万1千年前克洛维斯的黑曜石投矛尖。其後，人们在公园内发现了大量克洛维斯古印第安人制作的黑曜石刀具和武器。而用黄石黑曜石所制作的箭头也在密西西比谷发现，这说明当时的本地部落和远在东部的一些部落间已经有了固定的黑曜石交易活动。等到白人探险家们于1805年的刘易斯与克拉克远征中首度进入这一地区时，他们遇到了内兹佩尔塞人、克罗印第安人和肖松尼人的部落。虽然远征队成员们在通过如今的蒙大拿州时被告知了黄石的南部地区，但是他们并没有对之进行调查。