Im Jahre 1863 schließlich bekam Roches den Posten als französischer Generalkonsul in Edo, Japan. Er befürwortete das Bombardement von Shimonoseki. Nach der Meiji-Restauration half Roches bei der Modernisierung des Shogunwesens und organisiere eine französisch-japanische Schule. Im Jahre 1868 erreichte er gemeinsam mit dem niederländischen Diplomaten Dirk de Graeff van Polsbroek als einer der ersten europäischen Gesandten eine persönliche Audienz bei Kaiser Meiji. Kurz danach wurde Roches durch Charles Descantons de Montblanc abgelöst.