В декабре 1961 года в воинском звании полковника переведен в Группу советских войск в Германии командиром 94-й гвардейской мотострелковой дивизии в город Шверин, которой командовал в течение пяти лет. В этот период Главнокомандующими ГСВГ были Маршалы Советского Союза И. С. Конев, И. И. Якубовский, П. К. Кошевой, а Сухопутных войск — В. И. Чуйков, которые проверяли боевую готовность и боевую подготовку дивизии, участвовали в проведении учений, смотров и отмечали высокие результаты. Дивизия приводилась в высшие степени боевой готовности во время Карибского кризиса и строительства Берлинской стены. Командиру дивизии В. К. Мерецкову было присвоено воинское звание генерал-майор. При убытии В. К. Мерецкова к новому месту службы, учитывая его высокие достижения и умелое командование дивизией, Главнокомандующий ГСВГ П. К. Кошевой провёл специальный церемониал с построением всей дивизии и награждением командира.