В 1805 году Перрен принимал участие в Австрийской кампании, находился в сражении при Аустерлице. Переведённый 23 августа 1806 года в 6-ю артиллерийскую бригаду, Перрен в составе её, а затем — Санкт-Петербургской резервной артиллерийской бригады принял участие в кампании против французов в Восточной Пруссии, отличился в сражениях при Чарново (где заслужил орден св. Владимира 4-й степени с бантом), Новосильске и при Пултуске. 7 ноября 1807 года за отличие был переведён в гвардейскую артиллерию.