Durant el seu virregnat a l'Índia, va tenir greus problemes amb la corrupció i atacs externs, amb grans pèrdues a Ceilan i Mombasa. De tornada a Europa, va ser nomenat membre del Consell de Portugal a Madrid. En aquesta posició, va argumentar que Portugal havia de ser un regne incorporat, després d'haver tingut greus disputes amb el comte-duc d'Olivares, que creia que tots els dominis de Dom Felip III havien de ser províncies espanyoles. Després de la Guerra de la Restauració, va continuar fidel a Felip III, acabant la seva vida a la capital espanyola.