Брак Марии с Иоанном длился 12 лет, но у них не было детей. Сфрандзи пишет, что она умерла в отсутствие мужа, когда тот был в Италии на Ферраро-Флорентийском соборе; Стивен Рансиман назвал причиной её смерти бубонную чуму. Она была похоронена в церкви монастыря Пантократора в Константинополе. Иоанн Эугеникос, брат Марка Эугеникоса Эфесского сочинил плач о её смерти.