Sieben Jahre später wurde Aguirre in einer ähnlichen Situation erneut als „Retter in der Not“ geholt. Wieder einmal drohte die mexikanische Nationalmannschaft in der Qualifikation zu scheitern und wieder einmal riss Aguirre – trotz einer 1:2-Einstandsniederlage in El Salvador am 6. Juni 2009 – das Ruder herum und führte die Mexikaner zur WM-Teilnahme 2010. Außerdem gewann Aguirre im Juli 2009, zu jener Zeit erst einen Monat im Amt, den in den USA ausgetragenen CONCACAF Gold Cup, in dem sein „Schicksalsgegner“ USA im Finale mit 5:0 bezwungen wurde. Mit den bei der WM 2010 erzielten Resultaten unzufrieden (Mexiko schied erneut im Achtelfinale aus), legte Aguirre sein Amt am 30. Juni 2010 nieder. Er begründete seinen Rücktritt mit den Worten: „Ich muss gehen, das ist das Ehrenwerteste, was ich machen kann. … Wir haben unser Ziel nicht erreicht. Ein Weitermachen war nicht tragbar.“