Mit der Unabhängigkeit Mexikos 1821 brach die Nordgrenze vollkommen zusammen. Die Comanche fühlten sich nicht mehr an Vereinbarungen mit den Spaniern gebunden und unternahmen Raubzüge tief in den Norden Mexikos, teilweise 1000 km südlich der Comancheria. 1852 erreichten die Comanche-Raubzüge ihren Höhepunkt. Ab 1858 drangen die ersten US-amerikanischen Truppen in die Comancheria vor, um den ständigen Überfällen der Comanche, Kiowa und Kiowa-Apachen ein Ende zu bereiten – doch dies führte nur noch zur Eskalation der Gewalt. Durch die immer weiter vordringende Siedlungsgrenze wurden die Comanche immer weiter nach Westen und Norden abgedrängt (zuerst die "Penateka" und "Nokoni"), sowie durch die Büffeljäger vermehrt ihrer Nahrungsgrundlage beraubt. Letzte freie Gruppen der "Kwahadi"-Comanche suchten Zuflucht in ihrem alten Versteck, dem Palo Duro Canyon – mussten sich aber der Übermacht (1874–1875) beugen.