1801 stellte das Osmanische Reich eine Armee zusammen, um das von Napoléon 1798 eroberte Ägypten (→Ägyptische Expedition) zu befreien. Kavala stellte dazu ein Kontingent von ca. 300 Mann ab. Zum Kommandeur wurde sein Schwager und Cousin Ali Agha ernannt, Muhammad Ali wurde dessen Stellvertreter. Das Kontingent wurde einem Korps albanischer Baschi-Bosuks zugeteilt. Zusammen mit britischen und regulären osmanischen Truppen segelte die Armee Richtung Ägypten. Während der Fahrt kehrte Ali Agha nach Kavala zurück und übertrug das Kommando des Kontingents aus Kavala an Muhammad Ali. Die Truppen landeten am 8. März 1801 bei Abukir. Vereint mit der osmanischen Armee, die über den Landweg durch Syrien nach Ägypten eindrang, wurde am 27. Juni Kairo erobert und die Franzosen konnten zum Abzug bewogen werden.