V roce 1810 se oženil s Anne Cochrane, dcerou admirála Sira Alexandra Cochrana ze skotského rodu hrabat z Dundonaldu. Měli spolu čtyři děti, dědicem titulu baroneta byl syn Sir Thomas Troubridge, 3. baronet (1815–1867), který sloužil v armádě a v krymské válce přišel o nohu. V další generaci dosáhl vysokých hodností u námořnictva vnuk Sir Ernest Troubridge (1862–1926).