1996年中华人民共和国政府認為中華民國總統直選是“台獨”行為，因而舉行大規模軍事演習嚇阻台灣。台灣海峽發生繼1954年金門“九三砲戰”和1958年“八二三砲戰”以來的第三次“台海危機”，此事件被泛稱為臺灣海峽飛彈危機。劉連昆在演習開始前三個月將演習計畫提供給中華民國。這份計畫顯示，整個演習的預算約為40多億人民幣，一旦1996年3月中華民國總統大選出現“最壞的結果”，演習隨時可以轉變成真正的軍事行動，即“準戰爭行為”，所有部隊全部在福建沿海部署完成。劉連昆不僅預先報告了這次演習的主要項目，而且說明這次演習的底線是“實彈射擊、越過海峽中線、動用潛艇、攻占外島”。當時時任中華民國總統的李登輝暗中派中華民國國家安全會議秘書長丁懋時兩次赴美求救。美國在證實台灣情報的準確性之後，派出原本派駐在菲律賓的獨立號航空母艦戰鬥群調派到台灣東部區域以及在波斯灣的尼米茲號航空母艦戰鬥群調派到台灣海峽區域，兩艘航空母艦戰鬥群圍繞台灣海峽，向北京政府施加壓力，這是美國首次在台灣海峽區域同時部署兩艘航空母艦戰鬥群。