Baselski potres leta 1356 je povzročil veliko škodo na cerkvenem obzidju, obokih in stolpu. Popravila so potekala počasi. Kor je bil obnovljen leta 1359, streha pa v letih 1378–80. V zgodnjih fazah gradnje Münstra je bila ta cerkev še vedno v uporabi. Ladja je bila dokončno porušena med letoma 1449–51 in stolp je ostal do leta 1493.