Отец умер рано. Для того, чтобы избежать опекунства при ведении хозяйства, юноша обратился к королю Станиславу Августу Понятовскому с ходатайством о признании его совершеннолетним. В 16 лет Ян был избран гражданско-военным комиссаром Ошмянского уезда. На Гродненском сейме 1794 года Ян Ходзько был признан совершеннолетним. В 1795 году стал работать асессором суда в Поставах, потом там же стал работать подсудком.