Kadipaten ini pada akhirnya jatuh ke tangan Austria Habsburg dengan ditandatanganinya Traktat Baden (1714) yang mengakhiri Perang Penerus Spanyol. Kadipaten Milan tetap berada di bawah kekuasaan Austria hingga tahun 1796, ketika tentara Prancis di bawah pimpinan Napoleon Bonaparte menaklukannya. Kadipaten ini dibubarkan setahun kemudian setelah ditandatanganinya Traktat Campo Formio; dalam traktat tersebut, Austria menyerahkan Kadipaten Milan kepada Republik Cisalpina yang merupakan negara boneka Prancis.