Хельт дебютировал в составе сборной Дании 1 сентября 1982 года в товарищеском матче против Румынии (0:1). В 1988 году тренер Зепп Пионтек вызвал его в сборную на чемпионат Европы. На этом турнире Йон принял участие в одном матче против Испании (2:3). С 1982 по 1990 год он сыграл 39 матчей за национальную сборную.