El maig de 2015, va ser un dels alts executius de la FIFA acusats de diversos delictes de corrupció en el marc de les investigacions dirigides pel Departament de Justícia dels Estats Units en el conegut com a Cas Fifagate. Warner es va lliurar a les autoritats judicials de Trinitat i Tobago i va quedar en llibertat sota fiança de 2,5 milions de dòlars. A finals de 2019 segueix pendent de la resolució de recursos la seva extradició als Estats Units.