En 1913, le Côme FCB rejoint la Prima Categoria, première division à l'époque où il n'existait pas de championnat national. Il y reste jusqu'en 1922, quand, après une défaite 2-1 contre Plaisance en barrages, le club est rétrogradé. En 1927, il fusionne avec l'autre équipe majeure de la ville, l'Esperia Football Club, pour former l"'Associazione Calcio Comense". Cette union est couronnée de succès puisque la même année, la neuve "AC Comense" remporte la Coupe Volta en battant notamment l'Inter et le Genoa.