До літа підводний човен проходив планові ремонті роботи, екіпаж відпочивав та готувався до нового походу. 3 червня, коли в Західній Європі щосили точилися битви, армія Франції була практично розтрощена, а союзники з превеликими труднощами проводили евакуацію експедиційних та французьких військ з плацдарму в Дюнкерку, U-47 вийшов з Кіля в океан. Подолавши Північне море, субмарина обігнула Британські острови та вийшла у південну частину Ірландії.