Per la stagione 1928-1929 la squadra è inclusa nel girone A. Il campionato, concluso al 16º posto e ultimo posto con 18 punti, determina la retrocessione del Legnano alla Serie B 1929-1930, primo torneo di seconda serie a girone unico. Il Legnano sarebbe dovuto retrocedere in Prima Divisione, da quell'anno declassata a terzo livello del calcio italiano: tuttavia, in estate, la FIGC allarga i tornei di Serie A e B della Divisione Nazionale a 18 squadre, consentendo il ripescaggio delle 4 retrocesse in Prima Divisione, tra cui il Legnano, che vengono riammesse in Serie B.