Niclas Ekberg har det tredje bäst målsnittet i Sveriges herrlandslag genom tiderna, 4,10 mål per match. Från VM 2017 till 2019 var Ekberg lagkapten för Sveriges landslag. Hans företrädare var Jonas Källman, som under en kort period var lagkapten efter att försvarsspecialisten Tobias Karlsson avslutat sin landslagskarriär i september 2016. I maj 2019 aviserade Ekberg att han tog en paus tills vidare från landslaget, på grund av familjeskäl. Han återkom till landslaget 2021 i och med uttagningen till årets OS- och EM-kval.