Su debilidad quedó patente en la cuarta Cruzada, cuando los invasores penetraron en Blanquerna. En Blanquerna también se localizaba la Iglesia de Santa María de las Blanquernas, en honor a Theotokos (Madre de Dios), que se convirtió en la segunda iglesia en importancia de Constantinopla tras Santa Sofía, por la única razón de que la residencia del emperador estaba próxima. En 1347, Juan VI Cantacuzeno fue coronado allí en lugar de en Santa Sofía. En 1453 durante el asedio final de Constantinopla, los otomanos atacaron Blanquerna con su gran cañón, destruyendo completamente sus muros, fallando los bizantinos en bloquear la Kerkaporta, permitiendo así la entrada de los turcos en la ciudad.