Наиль Мухамедьяров родился 8 ноября 1962 года в Ленинске в семье выходцев из Крыма, подвергшихся депортации в Узбекистан в ходе сталинских репрессий. Начал заниматься тяжёлой атлетикой в возрасте 14 лет у Валерия Кима. В 1979 году после поступления на факультет физического воспитания Андижанского государственного педагогического института продолжил тренироваться под руководством Александра Кима. В 1982 году был чемпионом Европы среди юниоров в среднем весе.