В 1991—1994 годах эта конфронтация привела к масштабным военным действиям за контроль над Нагорным Карабахом и некоторыми прилегающими территориями. 5 мая 1994 года был подписан Бишкекский протокол о перемирии и прекращении огня между Арменией и непризнанной Нагорно-Карабахской Республикой с одной стороны и Азербайджаном с другой стороны. Тогда же было подписано соглашение о прекращении огня с 12 мая 1994 года. По итогам войны под контролем НКР оказались бо́льшая часть бывшей Нагорно-Карабахской автономной области Азербайджанской ССР и прилегающие районы, в том числе и обеспечивающие связь Нагорного Карабаха с Арменией.