W reprezentacji Republiki Południowej Afryki Khomane zadebiutował w 1998 roku. W 2000 roku podczas Pucharu Narodów Afryki 2000 wystąpił w 2 meczach: z Algierią (1:1) i o 3. miejsce z Tunezją (4:3). W kadrze narodowej od 1998 do 2000 roku rozegrał 9 meczów.