En 1998, il fait paraître chez Flammarion "Géopolitique de Jérusalem", version remaniée de sa thèse de doctorat. L'année suivante, il rédige "Le Moyen-Orient entre guerre et paix : une géopolitique du Golan". En 2000, il publie "L’art de la guerre par l’exemple : stratèges et batailles". À la suite des Attentats du 11 septembre 2001, il rédige "Géopolitique de l’apocalypse : la démocratie à l’épreuve de l’islamisme" en 2002, ouvrage dans lequel il appelle notamment à ne pas confondre l'islam avec l'islamisme radical.