Au début de la Guerre de Bosnie-Herzégovine, Jajce est une ville de peuplement mêlé, à la jonction de secteurs majoritairement serbes au nord, bosniaques au sud-est et croates au sud-ouest. Entre fin avril et début mai 1992, la plus grande partie de la population serbe quitte la ville pour se réfugier sur les territoires contrôlés par la République serbe de Bosnie. L'église orthodoxe serbe est dynamitée dans la nuit du 10 au .