Fowler, der sich auch für das Institute of Physics engagierte, untersuchte die radioaktiven Auswirkungen der Explosion des Kernkraftwerks Tschernobyl am 26. April 1986 in der Ukraine. Nach dem Bombenanschlag auf ein Verkehrsflugzeug vom Typ Boeing 747-121 über Lockerbie am 21. Dezember 1988 entwickelte er eine auf thermischen Neutronen basierende Methode zur Überprüfung des Passagiergepäcks. Im Ruhestand war er ferner privater Berater der Anwendung der Physik in der Industrie.