Am 2. Mai 1807 avancierte Wilhelm von Metzen zum Kommandeur des 5. Bayerischen Linien-Infanterie-Regiments "von Preysing". Als Verbündeter Frankreichs nahm er 1809 am Feldzug der Bayern in Tirol teil, zunächst als Oberstleutnant, zuletzt als Oberst. Er kämpfte mit seinem Regiment u. a. im August 1809, in der 3. Bergisel-Schlacht und musste sich nach deren unglücklichen Ausgang mit den Franzosen durch das Unterinntal zurückziehen. Nach dem Frieden von Schönbrunn kehrten im Oktober 1809 Franzosen und Bayern als Besatzungsmacht nach Tirol zurück; Wilhelm von Metzen war dort wieder ab 25. Oktober 1809. Kritik an der Tapferkeit seiner Truppe bzw. an seinen persönlichen Fähigkeiten, seitens des französischen Oberkommandierenden Marschall François-Joseph Lefebvre und des Generals Jean-Baptiste Drouet d’Erlon, führten zum tragischen Ende Metzens. In seiner Ehre tief gekränkt schoss er sich in Rattenberg, im Gasthof „Zum Goldenen Adler“ (wo Andreas Hofer am 1. Juni 1809 einen wichtigen Kriegsrat gehalten hatte), am 15. Dezember 1809, um 1 Uhr nachmittags, eine Kugel in den Kopf. Am 17. des Monats wurde Oberst Wilhelm von Metzen dort unter militärischen Ehren bestattet. Sein Schädel mit dem Kugelloch in der Stirn und der Aufschrift "„Kgl. bayer. Oberst v. Metzen“" befand sich später, als Relikt aus der Franzosenzeit, am sogenannten Ölberg vor der Sakristei der Pfarrkirche Rattenberg. Touristen wurde auf Verlangen auch das Zimmer gezeigt, wo sich der Offizier erschossen hatte. Laut Mitteilung des kath. Pfarramtes Rattenberg (31. August 2012) war unter dem Ölberg vor der Sakristei ein Ossuarium; die hier gelagerten Gebeine – darunter vermutlich auch die Oberst von Metzens, samt Schädel – wurden 1978 dort entfernt und auf dem örtlichen Friedhof beigesetzt.