Ginter debytoi Saksan maajoukkueessa 5. maaliskuuta 2014 ystävyysottelussa Chileä vastaan tullessaan vaihdosta kentälle Mesut Özilin tilalle. Hänestä tuli samalla 900. Saksan maajoukkueessa pelannut pelaaja. 2. kesäkuuta 2014 Joachim Löw valitsi Ginterin kokoonpanoon vuoden 2014 MM-kilpailuihin. Hän ei kuitenkaan päässyt maailmanmestaruuden voittaneen Saksan yhdessäkään ottelussa kentälle. Hän pelasi neljä ottelua Saksan voittaessa Maanosaliittojen cupin 2017. Hän kuului Saksan MM-kisajoukkueeseen jälleen 2018, muttei tälläkään kertaa päässyt pelaamaan. Ensimmäisen maaottelumaalinsa hän viimeisteli EM-karsintaottelussa Valko-Venäjää vastaan marraskuussa 2019 ja toisen Kansojen liigan ottelussa Ukrainaa vastaan lokakuussa 2020. Hän on pelannut kesäkuun 28. päivään 2021 mennessä 43 A-maaottelua.