La marine, peu de temps avant les guerres balkaniques, est composée d'une flotte de destroyers et de cuirassés. Sa mission est principalement offensive, visant à capturer les îles ottomanes de la mer Égée orientale et à établir la suprématie navale dans la région. À cette fin, son commandant en chef, le contre-amiral Pavlos Kountouriotis , établit une base avancée dans la baie de Moudros à Lemnos, directement en face du détroit des Dardanelles. Ayant repoussé les deux tentatives de sortie turques à partir du détroit, à Elli (décembre 1912) et Lemnos (janvier 1913), la flotte grecque obtient la maîtrise de la mer Égée.