Poté si jako reprezentační jednička zachytal na EURU 2000, kde čeští fotbalisté nepostoupili ze základní skupiny D (Nizozemsko, Francie, ČR, Dánsko). Pavel odchytal všechny tři zápasy českého týmu na šampionátu. Srniček odchytal v letech 1994–2001 v českém národním týmu celkem 49 utkání. Po neúspěšné baráži na MS 2002 v Japonsku a Jižní Koreji jej reprezentační trenéři přestali povolávat a příležitost dostal mladý Petr Čech.