Im selben Jahr gründete sich auf Anregung von Ernst Lohmann als Reaktion auf die Massaker an den Armeniern 1894–1896 der "Deutsche Hülfsbund für christliches Liebeswerk im Orient". Brockes übernahm im April 1897 die Leitung des vom Hilfsbund eingerichteten Waisenhauses im Istanbuler Vorort Bebek. Im Winter 1898/99 unternahm er zusammen mit Ernst Lohmann eine Inspektionsreise zu den anderen Einrichtungen deutscher Hilfswerke. Sie führte ihn zunächst per Schiff von Konstantinopel nach Smyrna (Izmir), dann über Land nach Mersin, Tarsus, Adana, Sis (Kozan (Adana)), Hadschin (Saimbeyli), Marasch (Kahramanmaraş) und Zeitun (Süleymanlı). Es folgten Aintab (Gaziantep) und Urfa; dann ging es nach Mesereh (Elazığ) und durch Kappadokien nach Sivas und von dort über Amasya zur Küste und zurück nach Konstantinopel. Bei einer Ansprache, die er in Zeitun hielt, verwendete er das Wort "erlösen", was von den anwesenden türkischen Polizisten als das türkisch gleichlautende "befreien" (der Armenier von türkischer Herrschaft) und damit als Anstiftung zum Aufruhr verstanden wurde. Es kam zu einer diplomatischen Intervention; die Hohe Pforte forderte von der deutschen Reichsregierung seine Abberufung, und Brockes wurde faktisch aus dem Osmanischen Reich ausgewiesen. Er veröffentlichte seine Reiseberichte in der konservativen Berliner Zeitung "Der Reichsbote" und 1900 in Buchform. Die Berichte und Abbildungen geben einen Einblick in die Welt der armenischen Bevölkerungsgruppe, die 1915 unterging.