Sin embargo, cuando el Imperio perdió la guerra de 1683-1697 con Austria y cedió Eslavonia y Hungría a Austria en el Tratado de Karlowitz, las fronteras norte y oeste de Bosnia se convirtieron en la frontera entre los imperios austriaco y otomano. En 1716, Austria ocupó el norte de Bosnia y el norte de Serbia, pero esto solo duró hasta 1739, cuando fueron cedidos al Imperio otomano en el Tratado de Belgrado. Las fronteras establecidas entonces permanecieron en su lugar durante otro siglo y medio, aunque las guerras fronterizas continuaron.