В изменившихся условиях лица, управляющие Баварией, пришли к выводу, что её будущее лежит в союзе с Францией. В соответствии с договором, подписанным с Наполеоном, при дальнейшем расширении Французской Империи Бавария должна была получить компенсации за утерянные территории на левом берегу Рейна. В 1803 году в ходе германской медиатизации Бавария поглотила епископства Вюрцбургское, Бамбергское, Аугсбургское и Фрайзингенское, часть Пассауского епископства, территорию двадцати аббатств и семнадцати городов и деревень; образовавшаяся компактная территория являлась более чем достаточной компенсацией за утерянные анклавы на противоположном берегу Рейна. В войне третьей коалиции Бавария выступила уже как союзник Франции и по Пресбургскому миру получила Тироль с Бриксеном и Трентом, Форарльберг, правобережье Инна, Бургау и Линдау, а также Пассау и Айхштет, отторгнутые от Зальцбургского курфюршества (правда, в обмен на Тироль пришлось выделить бывшему зальцбургскому курфюрсту Великое герцогство Вюрцбург), а титул правителя Баварии был повышен с «курфюрста» до «короля». За это Максимилиану пришлось выдать дочь Августу замуж за наполеоновского пасынка Евгения Богарне.