1963年，杨文明发动1963年南越政变，殺害了南越第一任总统吴廷琰并成立軍人革命委員會，由阮玉書擔任总理。阮玉書任内的南越政府由于军政府的所谓“军事革命委员会”与文人内阁之间争权夺利，导致政局混乱，政府势弱。在杨文明的军政府于1964年被阮庆将军發動的政变推翻后，阮玉寿从此淡出政坛。