Жеребьёвка группового этапа чемпионата Европы состоялась 1 июня 2008 года в Праге. В жеребьёвке принимали участие первый вице-председатель Комитета УЕФА по юношескому и любительскому футболу Джим Бойс, а также футболисты сборной Чехии, которым предстояло сыграть на взрослом первенстве Европы в Австрии и Швейцарии — вратарь Петр Чех и нападающий Мартин Фенин. Команды, которые выходили в полуфинал, автоматически попадали в финальную часть молодёжного чемпионата мира, которая должна была пройти в следующем году в Египте.