Период исполнения Финкельштейном полномочий Главного военного прокурора был ознаменован событиями «Интифады Аль-Аксы», поставившими перед Военной прокуратурой Армии обороны Израиля новые вызовы в области международного гуманитарного права, в частности в вопросах применения антитеррористических мер, ведения боевых действий в густонаселённых районах Сектора Газа и Западного берега реки Иордан и пр.