La participación de Dupont en diferentes campañas militares y el éxito obtenido en ellas le hizo ser reconocido por Napoleón como uno de sus grandes generales, pero tras la derrota de Bailén, Dupont expió amargamente el desastre; culpado por Napoleón del desastre fue encarcelado a su llegada a Francia junto a otros generales vencidos y sus causas se sometieron al dictamen de una Comisión especial, nombrada al efecto. En virtud del dictamen de la Comisión Dupont fue privado de todos sus grados, títulos y condecoraciones; borrado su nombre del anuario de la Legión de Honor, prohibiéndosele el uso del uniforme militar y el empleo de su título de conde, se le confiscaron todas sus pensiones y se le recluyó en prisión.