El Grupo Alfa estuvo involucrado en la Primera Guerra Chechena de 1994-1996, luego de la declaración de independencia de los chechenos de la RSFS de Rusia y a continuación de la Unión Soviética en 1990-1991. Tropas Alfa sirvieron en "grupos antiterroristas móviles" ("mobilnye gruppy antiterrora"), además de proporcionar seguridad para el complejo del gobierno checheno pro-Moscú y la sede regional del FSB en Grozni, la capital chechena.