Invitado al Concilio de Florencia, el catolicós Constantino VI envió una delegación con plenos poderes encabezada por el obispo de Alepo, que aceptó las doctrinas y disciplinas latinas -igual que lo habían hecho los griegos- el 22 de noviembre de 1439, lo que fue promulgado por el papa Eugenio IV mediante el decreto "Exultate Deo". La oposición a la unión se produjo entre los monjes de Armenia oriental y en 1441 un sínodo de 17 obispos opuestos al catolicós Gregorio IX creó el catolicosado de Echmiadzin designando al monje Kirakos como catolicós y recibió la adhesión de otros 12. La Iglesia armenia tenía entonces 4 jurisdicciones eclesiásticas distintas y con frecuencia conflictivas: 3 catolicosados: en Sis (desde 1293), isla Akdamar (desde 1113 en el reino de Vaspurakan) y en Echmiadzin (desde 1441); y el patriarcado armenio de Jerusalén (desde 1311). Los catolicós de Sis mantuvieron sus relaciones con el papa y la unión solo tuvo efecto en pocos lugares. Luego de la toma de Constantinopla por los otomanos en 1453, el sultán Mehmed II creó el patriarcado armenio de Constantinopla en 1461 para liderar a toda la comunidad armenia en el Imperio otomano.