El ejército de la Confederación Germánica (en alemán: "Bundesheer") era una fuerza militar alemana constituida por soldados de los diferentes Estados miembros de la confederación cuyo objetivo principal era la defensa de sus miembros contra enemigos exteriores. Concretamente, estaba dirigida contra Francia que en el pasado había invadido en repetidas ocasiones el antiguo Sacro Imperio Romano Germánico. Rusia también era una amenaza, por sus posturas paneslavistas que ponían en peligro el dominio austríaco sobre ciertas naciones eslavas de su imperio. Las leyes fundacionales de este ejército no previeron el caso de guerra entre estados miembros, como en la guerra de los ducados, donde el rey de Dinamarca era igualmente miembro de la confederación por su título de Duque de Holstein. La guerra austro-prusiana de 1866, presenció el enfrentamiento de dos estados miembros por el dominio sobre la confederación. La derrota austríaca llevó a la disolución del ejército federal.