Lee Min-seong lief von 1995 bis 2004 für die Südkoreanische Fußballnationalmannschaft insgesamt 67-mal auf. In dieser Zeit konnte er mit der Nationalmannschaft bei der Fußball-Asienmeisterschaft 2000 den 3. Platz sowie bei der heimischen Fußball-Weltmeisterschaft 2002 den 4. Platz feiern.