С 1995 по 1998 год Джексон защищал цвета национальной сборной Шотландии. Его дебют в составе «тартановой армии» состоялся 29 марта 1995 года, когда «горцы» в рамках отборочного турнира к чемпионату Европы 1996 в гостевом матче встречались с командой России. С того поединка Даррен пробился в основной состав сборной, проведя все игры квалификационного цикла, по итогам которого шотландцы смогли пробиться на континентальное первенство. Главный тренер национальной команды Крейг Браун включил нападающего в заявку на этот турнир, однако так и не выпустил его на поле в поединках чемпионата. 5 октября следующего года Джексон открыл счёт своим голам за «тартановую армию», поразив в отборочной встрече чемпионата мира 1998 ворота Латвии. В 1998 году Даррен в составе сборной поехал на «мундиаль», проходивший во Франции. На турнире Джексон принял участие в двух матчах — против команд Бразилии и Норвегии. Свою последнюю встречу за «горцев» нападающий провёл 10 октября того же года — в тот день шотландцы на эдинбургском стадионе «Тайнкасл» принимали эстонцев.