Youri Djorkaeff egy Izrael elleni mérkőzésen mutatkozott be a francia nemzeti csapatban 1993-ban. Djorkaeff 2002-ig összesen 82-szer ölthette magára a francia válogatott mezét, s ez idő alatt 28-szor volt eredményes. A válogatottal mindent megnyert, amelyről egy labdarúgó valaha is álmodhat. 1998-ban megnyerte a nemzeti csapattal a franciaországi világbajnokságot, 2000-ben az Európa-bajnokságot és a 2001-es Konföderációs kupát is.