Au début de la Révolution française, Montaigu fut parmi les premières localités du Bas-Poitou à féliciter l’Assemblée nationale pour les décrets de la nuit du 4 Août. Mais avec la constitution civile du clergé en 1791 et surtout la levée en masse de , l’insurrection vendéenne éclata début mars de cette même année, et arriva à Montaigu le 13 sous la forme d’une troupe d’habitants des communes environnantes qui prit la ville et exécuta de nombreux républicains. (Pendant les guerres de Vendée, la division de Montaigu est commandée par le général Pierre Rezeau, un des lieutenants de Charette.) La ville fut reprise le par les républicains qui la pillèrent après avoir tué des centaines de vendéens, puis reconquise le 21 par les vendéens qui perpétrèrent aussi pillage et massacres. La ville fut définitivement reprise le 30 par Kléber. Des religieux, dont les chanoines de la collégiale Saint-Maurice, furent exécutés, et l’amiral Duchaffault arrêté et emprisonné à Nantes où il mourut. Charette continua le combat, notamment aux environs de Montaigu, jusqu’en , où à la suite de sa capture près du bois de la Chabotterie, il est conduit, par Montaigu, à Nantes pour être exécuté. En , Suzannet, successeur de Charette, tenta, avec Henri-Charles de La Roche Saint-André, de s'emparer de la ville de Montaigu mais ils furent repoussés, ce qui mit fin aux actions militaires dans la région.