Alors que le Suprême Conseil appuyait le gouvernement de Benito Juarez contre l'intervention militaire française (1861-1867) et contre la monarchie de Maximilien (1864-1867), le , Manuel R. de Cunha Reis crée un Suprême Conseil dissident et émet des décrets pour déclarer que ce Suprême Conseil a l'unique autorité pour toute la nation et déclare le Rite National Mexicain illégitime et irrégulier.