Dopo la Liberazione di Parigi non sfugge al clima di sospetto dell’epoca e viene accusato di collaborazionismo dal Comité national des écrivains (CNE) nel 1944-1945; sarà scagionato da ogni accusa grazie a una lettera Georges Duhamel. Inoltre il comitato, con le medesime motivazioni, fa dimettere dal proprio incarico l’editore Robert Denoël e Barjavel dirigerà di fatto la casa editrice fino all’assassinio di Denoël, avvenuto il 2 dicembre 1945.