Thomas Liese startete in seiner Zeit als Amateur für den SC DHfK Leipzig. Liese wurde mit der DDR-Auswahl 1985 Bahn-Juniorenweltmeister in der Mannschaftsverfolgung und gewann 1986 die Silbermedaille. Bei den UCI-Bahn-Weltmeisterschaften 1989 konnte er den Titel mit dem Bahnvierer der DDR im Elitebereich gewinnen. Bei den letzten DDR-Meisterschaften 1990 gewann er mit dem Vierer aus Leipzig den Titel in der Mannschaftsverfolgung.