De keizer verving Pál Kray die van mei tot juli 1800 nederlagen geleden had tegen Jean Victor Marie Moreau door de achttienjarige aartshertog Johan van Oostenrijk en Lauer als tweede in bevel. Lauer pleitte bij de keizer voor een verlenging van de wapenstilstand. Op 12 november brak opnieuw oorlog uit. Franz von Weyrother, de stafchef van aartshertog Johan, overtuigde Jan en Lauer tot een offensieve strategie. De Oostenrijkers wonnen de slag bij Ampfing op 1 december 1800. Op 3 december marcheerden de Oostenrijkers in vier colonnes door ruw terrein naar de Slag bij Hohenlinden. Moreau lokte de Oostenrijkers in een hinderlaag en omsingelde de linkerflank en het Oostenrijks leger leed een zware nederlaag. Lauer kreeg de schuld en verliet in 1801 het leger en stierf twee jaar later.