Императорская ставка была полностью независима от правительства Японии, и даже от премьер-министра. Если во время японо-китайской войны 1894—1895 годов премьер-министру Ито Хиробуми императором Мэйдзи было дано прямое разрешение посещать её заседания, то в годы русско-японской войны премьер-министру Кацуре Таро, несмотря на его военное прошлое, этого дозволено не было.