Od 1. února 1805 byl jmenován prefektem departementu Moselle a zůstal jím až do roku 1814. Napoleon si cenil jeho práce a roku 1809 jej jmenoval důstojníkem Čestné legie a téhož roku jej obdaroval dědičným titulem baron císařství. Pak roku 1813 ho dokonce poctil titulem hrabě císařství. Téhož roku Vaublac při audienci u císaře v rozhovoru s ním ostře kritizoval samotný princip neúspěšné ruské kampaně. Sídlo úřadu Vaublanca byly Mety a zde v roce 1813 v důsledku koncentrace zraněných a nemocných vojáků vypukla epidemie skvrnitého tyfu, kterým onemocněl i Vaublanc a jen těsně unikl smrti. Roku 1814 otevřel brány Met spojencům.