Nishikata tävlade i Skid-VM 1993 i Falun. Där blev han nummer 58 i stora backen og nummer 7 i normalbacken, en tävling som vanns av landsmannen Masahiko Harada. Under VM 1995, i Thunder Bay i Kanada, blev Nishikata nummer 24 i stora backen och nummer 7 i normalbacken där landsmännen Takanobu Okabe och Hiroya Saitō säkrade en japansk dubbelseger. I lagtävlingen vann japanska laget (Takanobu Okabe, Jin’ya Nishikata, Hiroya Saitō, Naoki Yasuzaki) en bronsmedalj efter sägrande Finland och Tyskland.