1540년 파리에서 세상을 떠날 당시 뷔데는 한밤중에 화장해 달라는 유언을 남겼다. 그런데 당시 그의 미망인이 제노바에서 개신교 공개 활동을 했던 것으로 알려지면서 (남편이 죽자 활동 중단), 유언과 함께 미루어 볼 때 뷔데가 사실은 칼뱅주의 성향이 아니었나 하는 추측이 있다. 성 바르톨로메오 축일의 학살이 벌어지자 뷔데의 가족들은 프랑스를 떠날 수밖에 없었으며 그 중 일부는 스위스로 피난해 가문의 전통을 굳게 지켰고, 나머지는 포메라니아에 정착해 뷔데 / 부도이스 (Budde / Buddeus)로 개명하여 살았다고 전해진다 (요한 프란츠 부도이스 참고). 아들 뷔데에 의하면 그가 처음에 칼빈의 시편강의를 들으면서 자신의 필요에 의해서 다른 친구들과 함께 필기를 했다. 그런데 그 강의의 내용이 너무나도 은혜롭고 감동이 되어 자기들만 그런 명강의를 듣고 다른 사람들이 듣지 못하는 것을 못내 아쉽게 생각해서 필기한 친구들이 서로 노트를 비교하고 보충하여 칼빈에게 보이고 내용확인과 수정을 가한 후에 출판하도록 했다고 한다. 칼빈은 그의 주석에서 화폐와 도량에 관하여 기욤뷔데의 견해에 전적으로 동의와 존경을 표했다.