Nach der 1932 in Anhalt erfolgten politischen Machtübernahme der NSDAP waren die Ankäufe moderner Kunst ein Grund für politischen Druck auf Grote, der sich daraufhin aus seinem Amt zurückzog. Die Galerie sollte nun im Sinne der nationalsozialistischen Kulturpolitik ein „Spiegelbild der Vielfältigkeit und des Reichtums des germanischen Geistes“ vermitteln. Die altdeutschen Meister Albrecht Dürer und Lucas Cranach d. Ä. bekamen den prominentesten Platz in der Dauerausstellung. 1937 fand eine Ausstellung zur ‚Entarteten Kunst‘ statt. Danach wurde die Kunst der Bauhausmeister beschlagnahmt, zerstört oder verkauft. 1939 begann angesichts des Kriegseintritts und bevorstehender Luftangriffe die Evakuierung der Kunstwerke an diverse Standorte, wie z. B. den Bergwerksstollen des Salzbergwerks Solvayhall bei Bernburg. Im Palais Reina verbliebene und in das Zerbster Schloss ausgelagerte Werke wurden bei Luftangriffen zerstört. Sie sind Teil der mehr als 200 Gemälde umfassenden Kriegsverluste.