Cependant, la situation vient à empirer gravement à la suite de la rébellion des portes Hamaguri en 1864, lorsque le domaine de Chōshū en est tenu pour responsable et subit les représailles du Shogunat. Si la première intervention des forces Shogunales se termine sans effusion de sang puisque les responsables de l'attaque sur le palais impérial sont remis au Shogunat en compensation, la deuxième expédition de Chōshū aboutit à une cinglante défaite des forces shogunales qui font face à une armée menée par Ōmura Masujirō. Le domaine d'Hamada est capturé, forçant Kawata et ses camarades à fuir vers Chōshū. Kawata rejoint ensuite le domaine de Tosa, où, s'alliant au pionnier Sakamoto Ryōma, il planifie la démolition de la république d'Ezo.