В первые годы войны высокая боеготовность флота сыграла огромную роль. Особое место в его боевых действиях занимают оборона Одессы, Севастополя, Керченско-Феодосийская десантная операция, оборона Кавказа, освобождение Новороссийска. Флот провёл 24 десантные операции, было потоплено 835 кораблей и судов противника, 539 повреждено.