2019 року Меса утретє став чемпіоном Мексики, а наступного виграв і Лігу чемпіонів КОНКАКАФ. Це дозволило футболісту з командою поїхати на клубний чемпіонат світу в Катарі, де Франсіско зіграв у двох матчах і став з мексиканцями віце-чемпіоном світу. Станом на 12 лютого 2021 року відіграв за монтеррейську команду 68 матчів в національному чемпіонаті.