Em 2013, em paralelo com a Seleção Feminina, Becker assumiu o cargo de diretor-técnico da equipe masculina, função que exerceu até janeiro de 2015, quando foi contratado para treinar a "Nzalang", substituindo o ex-zagueiro espanhol Andoni Goikoetxea. A Seleção Guinéu-Equatoriana ficou em quarto lugar na Copa Africana de Nações, em sua melhor campanha na competição.