Феодалы страны выступили против реформ, проводимых Турцией. В 1821 году в Сребренице, Мостаре и других городах Боснии вспыхнули восстания, результатом которых стала казнь 300 феодалов-повстанцев. В последующие годы неповиновение продолжилось: во время восстания 1831 года во главе с Хусейном Градашчевичем боснийское войско одержало победу над турками на Косовом поле. Чтобы ослабить боснийскую оппозицию, турецкое правительство в 1833 году отделило от Боснии Герцеговину. Власть Турции была установлена только в 1851 году. В первой половине XIX века в стране получило развитие национально-освободительное движение, зародившееся в среде католического духовенства. Его итогом стало Боснийско-герцеговинское восстание 1875—1878 годов. В 1878 году "Босния и Герцеговина" получила автономию по Сан-Стефанскому миру, заключённому между Россией и Османской империей после окончания Русско-турецкой войны 1877—1878 годов. Однако вскоре по Берлинскому трактату того же года Австро-Венгрия в период с июля по октябрь 1878 года оккупировала Боснию и Герцеговину.