Fregatten "Jylland" kom til at stå sin prøve under 2. Slesvigske Krig. Den danske flåde fik her blandt andet til opgave at hindre østrigske skibe i at komme de preussiske og østrigske landtropper til hjælp, og 9. maj 1864 fik "Niels Juel", "Jylland" og korvetten ”Heimdal” fjenden i sigte i farvandet ud for Helgoland. Der var tale om de østrigske fregatter "Schwarzenberg" og "Radetzky", de preussiske kanonbåde "Basilisk" og "Blitz" samt hjuldamperen "Adler".