Kundrátek pelasi myös alle 20-vuotiaiden MM-kilpailuissa vuosina 2008 ja 2009, joista jälkimmäisessä turnauksessa hän oli Tšekin paras syöttäjä kuudella syöttöpisteellään. Kundrátek pelasi myös alle 18-vuotiaiden MM-kilpailuissa vuonna 2007. Hänet palkittiin Ruotsia vastaan pelatun alkulohkon ottelun päätteeksi Tšekin ottelun parhaana pelaajana. Kundrátek pelasi myös alle 18-vuotiaiden Ivan Hlinkan muistoturnauksessa vuonna 2006. Hän pelasi myös World U-17 Hockey Challengessa vuonna 2006, jolloin Kundrátek voitti pronssia.