1860 war Baabda Schauplatz blutiger Auseinandersetzungen zwischen Drusen und Maroniten während des Bürgerkriegs im Libanongebirge. Baabda war einer der Hauptorte des osmanischen Mutesarriflik Libanonberg (1861–1916), das als autonome Provinz wiederum die Keimzelle des modernen Staates Libanon darstellt. In den Jahren bis 1956 wurde in Baabda der heutige libanesische Präsidentenpalast erbaut. Syrien und seine libanesischen Alliierten eroberten im Oktober 1990 den Palast in Baabda und drängten Michel Aoun ins Exil. Am 12. Dezember 2007 fiel der libanesische Brigadegeneral François al-Hadsch in Baabda einem Bombenattentat zum Opfer. Die Täter und die näheren Hintergründe der Tat sind bislang unbekannt.