Après la Première Guerre mondiale, Papanastasíou prend part à plusieurs gouvernements de Venizélos, avec les postes de Ministre des transports, ministre de la santé et ministre de l'intérieur. Après la défaite de Venizélos aux législatives de 1920, il reste en Grèce et critique le gouvernement en place pour sa gestion de la Guerre gréco-turque.