Palmer fue liberado en un intercambio de prisioneros por un destacado ciudadano de Richmond. Se recuperó en dos semanas y se reincorporó a su regimiento en febrero de 1863. Durante su período de encarcelamiento, el regimiento se había amotinado por no haberse designado oficiales y no haberse satisfecho otros incentivos de alistamiento. 212 soldados se enfrentaron a una corte marcial y a la posibilidad de presentarse ante un pelotón de fusilamiento por negarse a luchar en la batalla del Río Stone. Palmer reorganizó el regimiento, nombró personalmente a oficiales en cuyas habilidades confiaba mucho, y retiró los cargos contra los soldados confinados con la condición de que se comportaran adecuadamente en el futuro. El grupo de hombres hasta entonces considerablemente desmoralizados, se unió y se distinguió durante la Campaña de Tullahoma de 1863, la Batalla de Chickamauga, la captura del general de brigada de caballería de asalto Robert B. Vance, la captura de 28 vagones de un tren de alimentos en enero de 1864, y la Campaña de Franklin-Nashville.