Nel 2005 arriva anche la convocazione nella nazionale maggiore da parte del selezionatore Ignacio Quereda. Da allora Boquete viene più volte convocata per rappresentare la Spagna a livello internazionale condividendo con le compagne il percorso che la vedono approdare alla fase finale del campionato europeo di Svezia 2013, raggiungendo i quarti di finale, e il Mondiale di Canada 2015, dove le "Rojas" vengono eliminate alla fase a gironi.