En 1955, un sanglant coup d'État militaire, la Révolution Libératrice, renversa Perón et interdit l'activité du syndicalisme majoritaire péroniste. La CGT entame alors une longue phase de résistance, se réorganise clandestinement, et travaille à forcer l'annulation de la proscription du péronisme, et le retour de Perón dans lepays. Au cours des années 1960, certains de ses dirigeants (Vandor) ont tenté sans succès de développer un péronisme sans Perón.