Mais, les résurgences nationalistes qui apparaissent à la fin des années 1980 touchent de plein fouet Banja Luka : les nationalistes serbes détruisent les seize mosquées de la ville et l'une des deux églises catholiques. Dès lors, Zlatko et sa famille «n'ont eu que quelques heures pour fuir la ville, car sinon les Serbes leur coupaient la tête». Né d'un père musulman et d'une mère croate, il se tourne alors vers une « autre patrie », la Croatie : il évolue ainsi pendant trois saisons au RK Agram Medveščak Zagreb, puis, après la dislocation de la Yougoslavie, c'est le maillot de l’équipe nationale de Croatie qu'il revêt. Devenu capitaine de la sélection à damier, il devient ainsi vice-champion du monde en 1995 et surtout champion olympique en 1996 avec quatre autres anciens joueurs du RK Borac Banja Luka : Irfan Smajlagić, Patrik Ćavar et Iztok Puc.