Jonathan Laugel fait ses débuts au judo au Ju-jitsu Club d'Enghien-les-Bains pendant quatre années, avant d'enchaîner avec deux ans de basket-ball, puis par le rugby à XV à l'OGEM (Montmorency) ou il y restera jusqu'à ses 15 ans. Repéré lors des sélections départementales, il intégrera simultanément le centre de formation du Racing Métro 92 et la section sport études du lycée Lakanal de Sceaux en 2006. Il rejoint ensuite le pôle France de Marcoussis pour la saison 2011-2012. Cela lui permet d'intégrer l'équipe de France de rugby à XV des moins de 20 ans, équipe avec laquelle il dispute le championnat du monde junior en Afrique du Sud, participant à quatre rencontres.