La llegada al poder de Adolf Hitler y el NSDAP a comienzos de 1933 significó el fin de la República de Weimar y la democracia alemana. El 6 de julio Schumacher fue arrestado y permaneció los siguientes diez años prisionero en los campos de concentración de Kuhberg, Flossenbürg y Dachau. En 1943 fue puesto en libertad debido a su pésimo estado de salud, pero tras el atentado contra Hitler del 20 de julio de 1944 volvió a ser detenido a pesar de que no tenía ninguna conexión con el mismo. Se encontraba en el campo de concentración de Neuengamme cuando las tropas británicas lo liberaron en abril de 1945.