Il 23 marzo 1692, Ali Pascià fu nominato Gran Visir dell'Impero Ottomano. La sua prima azione come gran visir fu di recarsi sul campo di battaglia per osservare il corso della guerra in corso, la Guerra austro-turca. Ha preso accordi per riparare il bastione di Belgrado (nell'odierna Serbia). Al ritorno a Istanbul, la capitale, si è concentrato sul miglioramento dello stato delle finanze, che erano in deficit a causa della costosa guerra. Autorizzò Canibi Ahmet, il "defterdar" (ministro delle finanze), a lavorare su questo incarico. Tuttavia, sebbene il disavanzo fosse stato recuperato, Ali Pascià divenne presto il bersaglio di severe critiche e opposizione da parte dei rivali politici a causa della sua politica di austerità economica. Il sultano gli chiese di licenziare Canibi Ahmet, ma Çalık Ali Pascià cercò di difenderlo. Non riuscendo a convincere il sultano, si dimise il 17 marzo 1693 dopo un anno in carica.