Barrow palasi vuonna 1804 Afrikasta Englantiin, ja pääministeri varakreivi Melbourne nimitti hänet amiraliteetin alivaltiosihteeriksi. Nimitys tapahtui Napoleonin sotien aikaan, ja Barrow hyvänä organisoijana oli tärkeässä roolissa Yhdistyneen kuningaskunnan merimahdin kasvattamisessa. Hän oli myös mahdollisesti ensimmäinen, joka ehdotti St. Helenan saarta Napoleonin sijoituspaikaksi Waterloon taistelun jälkeen.