Нихон Киин основана в 1924 году на конференции профессиональных игроков из Токио, Нагойи, Кобэ, Осаки, Киото. Появление организации связано с последствиями землетрясения Канто, в результате которого многочисленные го-организации Токио оказались в плачевном финансовом положении и для выживания вынуждены были объединиться.