В Отечественную войну 1812 года он был отправлен в 1-ю западную армию, сосредоточенную в то время в Дрисском лагере и был прикомандирован к отдельному корпусу графа Витгенштейна; принимая деятельное участие в саперных и инженерных работах, участвовал в сражениях при Клястицах, Сбольне, находился в авангарде генерала Властова при преследовании французов к Полоцку и, наконец, участвовал в штурме и взятии этого города. Во время штурма Шабельский под картечными выстрелами неприятелей навел два понтонных моста для наших войск, чем способствовал своевременному их прибытию к месту боя и взятию города. В качестве саперного офицера Шабельский исполнял неоднократно поручения начальника штаба генерала Довре, производя с летучими отрядами рекогносцировки и поиски в пределах неприятельского расположения. Замеченный, как храбрый и распорядительный офицер, Шабельский в течение кампании 1812 г. получил за отличие чины подпоручика и поручика и орден св. Владимира 4-й степени с бантом.