Acredita-se que o nome "Babaeski" tenha se originado na seguinte história: o sultão otomano Maomé, o Conquistador, teria parado na cidade seguindo em direção a Constantinopla antes do cerco final à cidade. Ali, ele teria conhecido um velho em frente a uma velha mesquita - atualmente conhecida como "Pequena Mesquita" (Küçük Cami) - e perguntou-lhe quando a cidade fora fundada. O velho respondeu ""Eskidir, eski...", que significa "É velha, velha...". Quando o sultão perguntou a idade do velho, ele teria respondido "Baba... eski", que significa "o ancião [padre] é velho...". Daí em diante, o nome Babaeski teria sido utilizado para designar o local.