Peterhof su, poput Carskog sela, zauzele nemačke trupe 1941. godine i držale do 1944. U nekoliko meseci koji su protekli između nemačke invazije na Sovjetski Savez i pojave nemačke vojske, zaposleni su uspeli da spasu samo deo blaga palata i fontana. Pokušano je da se demontiraju i sahrane fontanske skulpture, ali tri četvrtine, uključujući sve najveće, ostale su na svom mestu.