Первым сражением в его карьере стало Второе сражение при Бул-Ране, где он принял участие в самом первом бою, известном как "бой у Браун-Фарм". Здесь под ним была убита лошадь и Мередит сломал несколько ребер. Однако, вскоре Мередит вернулся в строй и принял участие в Мерилендской кампании, в частности, в сражении у Южной горы. Сразу после сражения он сослался на последствия травмы и общее утомление и покинул полк, отправившись в Вашингтон, чтобы восстанавливать здоровье и добиваться повышения. В сражении при Энтитеме его полком командовал подполковник Элоис Бэчман, который погиб во время наступления на кукурузном поле. Джон Гиббон, командир железной бригады, расценил исчезновение Мередита накануне боя как дезертирство. Однако, в октябре 1862 Гиббон был повышен до командира дивизии и покинул бригаду, оставив Лизандера Катлера временным командиром. Мередит сразу начал добиваться этого места и добился рекомендации генерала Бернсайда (который был родом из Индианы), а также поддержки Джозефа Хукера, который хотел таким путём наладить отношения с губернатором Мортоном. В итоге, по словам Гиббона, «компетентный полковник [Катлер] был отстранен, и заменен некомпетентным бригадным генералом».