В конце апреля—июне 1920 года войска фронта успешно отразили наступление белогвардейцев и японских интервентов, имевших цель сорвать создание ДВР и образовать «чёрный буфер» от Читы до Приморья. В связи с подписанием Гонготского соглашения между правительством ДВР и японскими интервентами (17 июля 1920 года) военные действия НРА против японцев прекратились, и задача овладения Читой была возложена на Амурский фронт. 1—31 октября войска фронта провели 3-ю Читинскую операцию, в ходе которой разгромили белогвардейские войска атамана Семёнова и взяли Читу, а также всё Забайкалье. К 1 ноября 1920 года Амурский фронт включал: 38 000 человек, 60 орудий, 191 пулемёт, 6 бронепоездов, 10 танков. Приказом главкома НРА от 8 ноября 1920 года фронт был переформирован во 2-ю Амурскую армию.