Вернувшись в зону боевых действий, «Миссисипи» помогал в высадке на Пелелиу американских войск 12 сентября. После этого он направился к Ману, где и оставался до 12 октября. Линкор участвовал в высадке на Филиппины и обстреле побережья Лейте 19 октября.