Après avoir participé aux multiples actions dans lesquelles fut engagée la légère aux Armées du Nord, de Sambre-et-Meuse, du Rhin, d'Angleterre, du Danube et d'Allemagne, puis dans les Pouilles, Pierre Lejeune est fait prisonnier en juillet 1806 alors qu'il se trouve en Calabre. Livré aux Anglais, il est envoyé en captivité à Malte et n'est libéré qu'en , à la suite de l'intervention du Roi de Naples, qui obtient un échange de prisonniers.