Si bé el grup no duia a terme atacs, encara cridava per la lluita armada contra Israel. En la Segona Intifada el FLA distribuïa a famílies de "chehadat" (màrtirs) diners en el nom del president Saddam Hussein de l'Iraq. En 2003, quan Estats Units va atacar l'Iraq i va deposar a Hussein, el FLA va perdre la seva font de finançament; des d'aquest any es va afeblir molt i gairebé va desaparèixer. El cap del FLA, Rakad Salem, va ser empresonat en 2001 per Israel per les seves activitats de distribució de diners iraquià a famílies de "chehadat".