Na początku lat 90. zakładał wraz z Antunem Vujiciem partię Socjaldemokraci Chorwacji. Wkrótce jednak przeszedł do ugrupowania swojego ojca, Chorwackiej Wspólnoty Demokratycznej (HDZ), jednak nie angażował się politycznie przez kilka lat. W 2001 organizował niezależną listę wyborczą w wyborach lokalnych w Zagrzebiu, uzyskał mandat radnego chorwackiej stolicy, po czym współtworzył nową partię o nazwie Hrvatski istinski preporod, która jednak nie odniosła żadnych sukcesów wyborczych. Miroslav Tuđman zdecydował się wystartować jako kandydat niezależny w wyborach prezydenckich w 2009, w pierwszej turze głosowania otrzymał 4,09% głosów.