Pjanić 13 Haziran 2016'da, €32 milyon bonservis bedeli karşılığında Juventus ile beş yıllık bir sözleşme imzaladı ve beş yıllık Roma kariyeri sona erdi. Yeni sezonda beş numaralı formayı aldı. 10 Eylül'de, takımının iç sahada 3-1 kazandığı Sassuolo karşılaşmasında, Juventus formasıyla ilk golünü attı. İlk sezonunda, takımı Coppa Italia ve Serie A'yı kazanırken, Şampiyonlar Ligi Finali'nde Real Madrid'e kaybederek sezonu üç kupayla tamamlama şansını kaçırdı.