В 1995 году Хабер перешёл в «Штутгарт», в составе которого стал обладателем кубка Германии в 1997 году. В 1995 году он сыграл свои единственные два матча за сборную Германии против сборной Бельгии (2:1) и ЮАР (0:0). 13 мая 1998 года Хабер играл в финале Кубка кубков против «Челси», в котором «Штутгарт» проиграл со счётом 0:1.