Guadalajara joue un rôle important durant la Guerre d'indépendance du Mexique puisque le chef des insurgés Miguel Hidalgo y Costilla y proclame l'abolition de l'esclavage et que le célèbre journal "El Despertador americano" (Le réveil américain) y est publié. Le chef insurgé José Antonio Torres avait pris la ville le . C'est également près de Guadalajara, à la bataille du pont de Calderón, que les insurgés d'Hidalgo et d'Ignacio Allende sont vaincus le , entraînant la fin de la première phase de la Guerre d'indépendance.