키르기스스탄의 첫 자연보호지역은 1948년에 이식쿨 호에 사는 물새들과 자연 환경을 보호하기 위해 지정되었다. 1975년에는 람사르 장소로 인정을 받았으며, 2000년에 유네스코의 세계 생물권 보전지역망의 이식쿨 생물권 보전지역은 이식쿨 주의 관리 경계 내에 속하게 되었다.