A Pamplona Shojaei vi rimane per 5 anni: dopo aver trovato molto spazio i primi due (33 partite disputato il primo anno e 36 il secondo), nei 3 successivi ne trova molto meno a causa di molti infortuni (tra cui uno che gli ha fatto saltare tutta la stagione 2011-2012) ha giocato molto meno, cosa avvenuta soprattutto dopo la Coppa d'Asia 2011.