По итогам первичного голосования, Симоненко, чей рейтинг на протяжении кампании составлял 12—16%, вышел во второй тур вместе с Леонидом Кучмой, получив 22,2% голосов. Менее чем за неделю до повторного голосования левые силы во главе с КПУ провели в Киеве митинг, на который собралось около 4500 человек. Перед вторым туром Евгений Марчук назвал лидера компартии ставленником Кучмы, по его версии в случае совместного выхода во второй тур, лидер коммунистов пропустит главу государства в президенты, а потом сторонники Кучмы в парламенте поддержат Симоненко при баллотировке в спикеры Верховной рады. По итогам второго тура Симоненко проиграл, набрав 37,8%. В дальнейшем он участвовал в выборах 2004, 2010 и 2014 годов, однако уже не добивался таких результатов.