16日、伊18は横須賀を出港し、呉に移動する。4月16日、第1潜水隊の僚艦、伊10、伊30と共に甲先遣隊を編成し、呉を出港。18日、ドーリットル空襲を受け、小笠原諸島北方沖にいる米機動部隊の迎撃のために北東へ向かったが、空振りに終わった。27日、ペナンに到着し、水上機母艦日進により運ばれてきた甲標的を搭載。30日、伊30を除いた部隊は特設巡洋艦報国丸（大阪商船、10,438トン）、愛国丸（大阪商船、10,437トン）と共にペナンを出港。5月5日、10日、15日に報国丸、愛国丸から給油を受けた後、2隻と別れた。17日、波浪により浸水し、左舷ディーゼル機関が故障。このため、甲標的の発進地点への到着が遅れ、30日のディエゴ・スアレス攻撃には参加できなかった。その後、インド洋で通商破壊を行う。6月8日0230、のモザンビーク海峡でノルウェー貨物船ウィルフォルド（Wilford、2,158トン）を砲撃により撃沈。9日、英客船エリシア（Elysia、6,757トン）を雷撃により撃沈。同日、搭載甲標的を投棄。17日、報国丸、愛国丸との会合点に到着し、燃料と食糧の補給を受けた。7月1日、のモザンビーク海峡で蘭貨物船デ・ヴェールト（De Weert、1,805トン）を砲撃。デ・ヴェールトは2日後に沈没した。2日、英貨客船テミス（Themis、7,406トン）を雷撃するも、魚雷は早爆してしまう。テミスは潜望鏡めがけて銃撃するも、命中することはなかった。6日、の南アフリカ南方のインド洋で、英貨客船ムンダラ（Mundra、7,341トン）を砲雷撃により撃沈した。20日、ロドリゲス島を偵察。31日、ディエゴガルシア島を偵察。8月2日、ペナン付近で英潜に雷撃を受けるも、被害はなかった。同日、ペナンに寄港し、23日に横須賀に到着して整備を受ける。