All'inizio della stagione 2012-2013 ha vinto la Supercoppa di Francia 2012 contro il (2-2 nei tempi regolamentari e 4-2 ai rigori); Gourcuff nel corso della gara ha realizzato l'assist per il gol dell'1-1 segnato da Bafétimbi Gomis ed è stato nominato miglior giocatore della partita.