Von 1997 bis 1999 war Alves Mitglied des Distriktsparlaments (DPRD) und wurde 1998 zum Mitglied der indonesischen Kommission zur Eliminierung von Gewalt gegen Frauen ernannt. Als Vorsitzende der am 25. November 1998 ETWAVE organisierte Alves Demonstrationen gegen die Gewalt an Osttimoresinnen. Im Vorfeld des Unabhängigkeitsreferendums 1999 beteiligte sie sich an der Tür-zu-Tür-Kampagne für die Freiheit Osttimors. Als aber indonesische Zeitungen von ihrem Tod berichteten, floh sie während der Gewaltwelle im September über Jakarta nach Lissabon, wo sie zu einer der führenden Frauen in der Unabhängigkeitsbewegung wurde.