ОМОН города Санкт-Петербурга был создан в 25 ноября 1988 года на базе оперативного полка милиции ГУВД Леноблгорисполкома, созданного в 1948 году. Состоит из 5 батальонов общей численностью в 1150 бойцов (на 2003 год) и моторизованного батальона, включая моторизованную роту на катерах. В расположении отряда находятся бронированные внедорожники Т-98 Комбат, СПМ «Тигр», водометы, БТР, используются автомобили Hummer H2. Сотрудники подразделения обучаются технике рукопашного боя, стрельбе из различного вооружения . ОМОН Санкт-Петербурга принимал участие во Второй чеченской компании (например, в селении Старые Атаги в 2002 году), разгонах несанкционированных митингов. Некоторые правозащитники утверждали, а Европейский суд по правам человека в одном из своих своём решений заявил, что ОМОН Санкт-Петербурга осуществлял зачистку поселка Новые Алды 5 февраля 2000 года, когда были расстреляны мирные жители и сожжены дома. В октябре 2006 года пресс-служба ОМОН ГУВД Санкт-Петербурга и Ленинградской области заявила, что подозрения в отношении его сотрудников являются необоснованными. Некоторые журналисты обвиняют ОМОН Санкт-Петербурга в жестоком обращении с участниками акций протеста, в том числе и с депутатами.