Након победе Кубанске револуције, Фидел Кастро га је 1960. године позвао да дође живети на Кубу, што је Арбенз прихватио. Међутим, ћерка му је 1965. године починила самоубиство, а то га је психички сломило. Вратио се у Мексико да сахрани кћер, где је напослетку и умро 1971. године. Умро је у купатилу од утапања у кади или посклизнућа.