В Тридцатилетней войне Магдебург был в мае 1631 года взят штурмом армией Тилли и Паппенхайма, и почти полностью разрушен, при этом здание собора стало последним убежищем для нескольких тысяч жителей города. И уже 25 мая здесь снова была проведена католическая церковная служба.