М. Н. Чистяков участвовал в подготовке и проведении операций на Сталинградском, Донском, Южном, Воронежском, Степном, 3-м Украинском и 4-м Украинском, 3-м Белорусском, 1-м, 2-м и 3-м Прибалтийских фронтах. Участник Смоленского оборонительного сражения 1941 года, Сталинградской битвы, Курской битвы, Донбасской наступательной операции 1943 года, Крымской, Белорусской, Прибалтийской наступательных операций. С июня 1945 года — командующий артиллерией советских войск на Дальнем Востоке, участник разгрома японской Квантунской армии во время советско-японской войны.