Бакали возглавлял коммунистов Косова в конце 70-х и начала 80-х, но ушёл в отставку в 1981 году после разгона полицией протестов этнических албанцев. Он провел два года под домашним арестом, прежде чем был исключен из партии. После этого, ему было разрешено работать в провинциальной научной ассоциации до выхода на пенсию, но он был вынужден уволиться, когда Слободан Милошевич увеличил сербский контроль над Косово в конце 80-х годов.