Dopo la vittoria ai Mondiali decide di tornare in Russia, questa volta però per giocare nella Dinamo Mosca. Durante la stagione 2006-07 vince nuovamente il campionato russo e arriva in finale di Champions League, sconfitta dal Volley Bergamo. In estate otterrà il terzo posto agli Europei 2007. Nella stagione 2007-08 la Dinamo Mosca delude sia in patria che nelle competizioni europee, pertanto Elena non vince nessuna competizione. Nell'estate seguente partecipa alle Olimpiadi di Pechino 2008, ma la Russia sarà una delle maggiori delusioni. Al termine di questa competizione, Elena decide di lasciare la propria nazionale. Nella stagione 2008-09 vince nuovamente il campionato russo, ma, come due anni prima, esce nuovamente sconfitta in finale di Champions League sempre ad opera del Volley Bergamo. Nella stagione 2009-10 la Dinamo Mosca vince la Coppa di Russia, ma perde la finale di campionato. Prima dell'inizio della stagione stagione 2011-2012 annuncia il suo ritiro dall'attività agonistica.