EM2016-karsinnoissa Skotlanti arvottiin kovaan karsintalohkoon muun muassa Saksan ja Puolan kanssa. Skotlanti voitti Strachanin johdolla neljä karsintaottelua ja sijoittui lohkonsa neljänneksi. Karsinnat päättyivät 0-6 murskavoittoon Gibraltaria vastaan. Karsintojen jälkeen Strachan teki kaksivuotisen jatkosopimuksen. Skotlanti taisteli Slovakian kanssa lohkon kakkossijasta ja mahdollisuudesta selvitä jatkokarsintoihin. Skotlanti hävisi karsinnoissa vain kaksi ottelua, Slovakialle ja Englannille. Kolme tasapeliä oli kuitenkin liikaa ja Skotlanti jäi lohkonsa kolmanneksi. Karsintojen jälkeen Strachan jätti tehtävänsä.