Après l'attaque allemande contre l'Union soviétique en , il a été nommé , « chef de la police et de la SS ») en Russie du Sud. Il commande à ses subordonnés d'assassiner en masse la population juive de l'Ukraine occidentale. Ces mesures auront pour nom les "Auskämmungsaktionen" (« mesures de ratissage »). Lors de la création du Commissariat du Reich pour l'Ukraine s'est déroulé, près de la ville de Kamianets-Podilskyï, l'un des massacres de masse de Juifs les plus importants de la Seconde Guerre mondiale. On dénombre assassinés par ses unités entre le dont quelque avaient déjà été déportées depuis la Hongrie, les autres étant de la région.