Lakoba kembali ke Abkhazia pada tahun 1921. Abkhazia telah dikuasai oleh Bolshevik pada waktu itu sebagai hasil dari penaklukan Georgia. Bersama dengan Eshba dan Nikolai Akirtava, Lakoba merupakan salah satu penandatangan telegram untuk Vladimir Lenin yang mengumumkan pembentukan Republik Sosialis Soviet Abkhazia (RSS Abkhazia) yang awalnya diizinkan untuk berdiri sebagai negara bagian Uni Soviet yang seutuhnya. Komite Revolusi (Revkom) yang didirikan dan dipimpin oleh Eshba and Lakoba dalam rangka persiapan pendudukan Bolshevik kemudian berhasil menguasai Abkhazia. Revkom dibubarkan pada 17 Februari 1922. Lakoba kemudian terpilih sebagai Ketua Dewan Komisar Rakyat yang dibentuk pada hari yang sama, sehingga secara resmi menjadi pemimpin Abkhazia. Ia menduduki posisi tersebut hingga 17 April 1930 setelah dewan tersebut dibubarkan dan diganti oleh Presidium Komite Eksekutif Pusat, walau Lakoba tetap bertahan sebagai pemimpin. Meskipun ia dihormati oleh sesama pejuang revolusi, Lakoba tidak pernah mendapat peranan penting dalam Partai Komunis dan menolak untuk menghadiri berbagai pertemuan partai. Hal ini disebabkan Partai Komunis Abkhaz merupakan cabang dari Partai Komunis Georgia dan Lakoba ingin menghindari berurusan dengan pejabat partai di Georgia. Ia lebih memilih menggunakan koneksi dengan pejabat tinggi di pusat untuk mempertahankan pengaruhnya.