El Golpe de Estado en Chile del 11 de septiembre de 1973 marcó trágicamente la vida de la familia Allende. Durante el asalto y bombardeo de las Fuerzas Armadas al Palacio de La Moneda, el presidente derrocado, Salvador Allende Gossens, obligó a su hija, confidente y consejera política Beatriz Allende, quien se encontraba embarazada de Alejandro, a que abandonara el palacio en llamas. Posteriormente, cuando el palacio ya estaba tomado, optó por suicidarse. Su residencia presidencial de la calle Tomás Moro, donde se encontraba su esposa, Hortensia Bussi, fue también bombardeada, pero consiguió sobrevivir al ataque.