Shaqaqi et Awda ont été expulsés d’Égypte en 1981 après la mort d’Anouar el-Sadate. Le JIP a poursuivi ses travaux dans la bande de Gaza, jusqu'à ce que ses fondateurs soient expulsés au Liban en 1987. Au Liban, le groupe a été en mesure de recevoir la formation du Hezbollah et de développer une relation étroite avec l'organisation libanaise. Il revendique ainsi, le , l'exécution de , chef de l'antenne de la CIA à Beyrouth, enlevé en 1984 par le Jihad islamique selon certaines versions, par le Hezbollah selon d'autres. Avant de mourir, il aurait livré une confession de 400 pages à ses ravisseurs. Quelques semaines après son enlèvement, l'administration Reagan initiait des négociations avec l'Iran (scandale Iran-Contra), qui auraient eu pour objectif, entre autres, d'obtenir la libération de Buckley.