После революции 1820 года Португалия превратилась в конституционную монархию, а Церковь потеряла свои привилегии. В 1822 году Бразилия стала независимой. В 1834 году антиклерикальное правительство закрыло множество монастырей и выслало апостольского нунция. Дипломатические отношения со Святым Престолом были восстановлены в 1841 году. В конце XIX века в стране был создан ряд католических ассоциаций мирян.