Jusqu'à l'attentat du 6 avril 1994 contre le président Juvénal Habyarimana, Augustin Bizimungu était colonel des Forces armées rwandaises et commandant de la région militaire de Ruhengeri. Il y avait alors acquis une grande estime et une grande popularité au sein des Forces armées rwandaises et de la population rwandaise en mettant en échec certaines offensives menées par les rebelles du Front patriotique rwandais pendant la guerre civile, comme en à Ruhengeri.