Краузе продовжив службу в крігсмаріне, учасник Норвезької кампанії. Згодом корабель, на якому він служив, потопили, але Краузе вижив. Після цього Гітлер реабілітував його і призначив ад'ютантом від СС в рейхсканцелярії. В грудні 1943 року Краузе продовжив воювати, цього разу у військах СС. Учасник боїв на радянсько-німецькому фронті.