23 февраля 2011 года, за день до начала чемпионата мира 2011 года, объявил о завершении карьеры из-за проблем со здоровьем. В апреле 2011 года стало известно, что он подозревается в употреблении допинга. Допинг-проба «A» Веэрпалу оказалась положительной на наличие запрещённых веществ, предположительно гормон роста HGH, который используется для более быстрого восстановления и наращивания мышц. В августе 2011 года Андрус был дисквалифицирован за применение гормона роста на 3 года (до 23 февраля 2014-года — последнего дня Олимпийских игр в Сочи) вместо стандартных двух из-за того, что лыжник отказался сотрудничать с антидопинговым комитетом Международной федерации лыжного спорта (FIS) и задержал вскрытие пробы «В».