Accedió a la importante cartera de Comercio e Industria en el nuevo gabinete de Charles de Freycinet formado en enero de 1885, y se mantuvo en el cargo durante el gobierno de René Goblet (1886-1887). Durante su mandato organizó los primeros preparativos para la exposición de París de 1889. Desde el ministerio, Lockroy apoyó decididamente la construcción de la Torre Eiffel, publicando una carta llena de "mordacidad" en contra de la opinión del "París artístico" que se oponía al proyecto.