Con la Selección de fútbol de Bélgica, disputó 57 partidos internacionales y anotó solo 9 goles. Incluso participó con la selección belga, en 2 ediciones de la Copa Mundial. La primera participación de Van Moer en un mundial, fue en la edición de México 1970. donde su selección quedó eliminado, en la primera fase de la cita de México y la segunda, fue en la edición de España 1982. donde su selección quedó eliminado, en la segunda fase de la cita de España. También participó en una sola edición de la Eurocopa y fue en la edición de Italia 1980, cuando su selección perdió la Final de Roma, ante su similar de Alemania.