Por sus orígenes, en términos prácticos, la SNSPA puede considerarse una continuación de la Academia Ştefan Gheorghiu, que proporcionó formación de cuadros del Partido Comunista Rumano antes de la Revolución rumana de 1989. El exsecretario del partido de la Academia Ştefan Gheorghiu, Vasile Secares, crea en enero de 1990 la Escuela de Altos Estudios Políticos. Más tarde, en la primavera de ese año, funda la Facultad de Altos Estudios Políticos de la Universidad de Bucarest, que en 1991 se transforma en la actual Escuela Nacional de Estudios Políticos y Administrativos. Vasile Secares será el rector de la institución desde su creación en 1991 hasta 2004.