W swojej karierze piłkarskiej Hrgota grał w reprezentacji Szwecji U-19 i reprezentacji Szwecji U-21. Z tą drugą wywalczył mistrzostwo Europy na Mistrzostwach Europy 2015. W dorosłej reprezentacji zadebiutował 4 września 2014 w wygranym 2:0 towarzyskim meczu z Estonią, rozegranym w Solnie.