В сентябре 1939 года Белосток был оккупирован вермахтом, однако менее чем через месяц уступлен Советскому Союзу. В 1940 году Эстер переезжает в Москву, поступает в МИФЛИ, работает в журнале «Советская литература». За несколько дней до нападения Германии на СССР, отец был арестован, а мать сослана в колхоз на территории Алтайского края, где месяц спустя приговорена к 10 годам ИТУ по оговору за «религиозную пропаганду». После захвата Белостока немцами, отец оказался в гетто, где и погиб. Мать в ноябре 1941 года освобождена из-под стражи в связи с амнистией.