С началом войны дивизия в составе Северо-Западного фронта принимала участие в приграничном сражении в Прибалтике. Её части под ударами превосходящих сил противника вынуждены были отходить от Таураге на Скаудвиле. По выходу в этот район утром 23 июня 1941 года она получила приказ совместно с 23-й танковой дивизией перейти в контратаку, однако противник к этому времени решительными действиями сорвал выдвижение танковой дивизии, и эта контратака не состоялась. В последующем остатки дивизии в условиях окружения пробивались к реке Западная Двина через Радвилишкис. К 30 июня они вышли к реке в районе Рембаты, но и на этом рубеже удержаться не смогли и вынуждены были отходить на Тарту. К 9 июля дивизия заняла оборону на левом берегу реки Эмма-Йыги от озера Выртс-Ярв до озера Псковское и держала её в течение 14 дней. В июле — августе её части вели бои в окружении в районе населённого пункта Тудалина. После выхода из окружения дивизия отошла в район город Ораниенбаум, где и заняла оборону. В августе — сентябре подполковник Синкевич временно командовал 125-й стрелковой дивизией, затем исполнял в ней должность начальника штаба. 18 сентября дивизия была переброшена под Ленинград и в составе 55-й армии Ленинградского фронта приняла участие в Синявинской наступательной операции, в ходе которой вела бои по прорыву сильно укреплённой обороны противника в направлении населённых пунктов Яж-Ижора, Красный Бор, Путролово. В последующем её части в составе 55-й и 42-й армии находились в обороне в районе Пулковских высот под Ленинградом.