Verrà convocato come membro del Giappone Under-20 al mondiale in Nigeria del 1999 dove otterrà l'argento, nella fase a girone segnerà una rete contro gli Stati Uniti nella vittoria per 3-1, durante gli ottavi di finale il Giappone pareggia contro il Portogallo per 1-1 per poi vincere 5-4 ai rigori, Takahara segnerà uno dei rigori vincenti, infine segnerà un gol nella semifinale contro l'Uruguay vinta per 2-1.