Na de oorlog was hij o.a. luitenant-ter-zee en marine-instructeur. Aan het begin van de Burgeroorlog van 1891 schaarde hij zich als commandant van de "Cachapoal" aan de zijde van de rebellen en landde op 17 februari 1891 in de haven van Iquique. Twee dagen later wist hij met een beperkt aantal mannen Iquique te behouden tijdens een aanval van het regeringsleger. Aan het einde van de burgeroorlog voerde hij bevel over de fregat "Lynch".