Ha sido internacional en seleccionados juveniles. En 1998 jugó el Mundialito sub-20 en Maldonado "Copa Álvaro Fabián Perea"; estuvo presente en los cuatro partidos de su selección y marcó además el gol (de tiro libre) de la victoria 3-2 ante Brasil que le confirió el título. Ese mismo año se alzó también con el Torneo Esperanzas de Toulon en Francia. Germán fue titular en los cinco partidos del torneo del cual salió campeón al vencer al seleccionado local por 2-0. En 1999 se coronó campeón del Campeonato Sudamericano Sub-20 de 1999, disputado en Argentina, convirtiendo dos goles de tiro libre ante Perú, y ese mismo año jugó el Mundial Sub-20 que se llevó a cabo en Nigeria.