Durante la Seconda intifada (Intifada di al-Aqsa), cominciata nel settembre del 2000, la Jihad Islamica palestinese ha perpetrato numerosi attacchi suicidi contro gli israeliani. Vari attacchi nel 2001 e nel 2002 sono partiti dalla città cisgiordana di Jenin, in cui il responsabile della Jihad Islamica era Mahmud Tawalbe, Ali Sefuri e Tabeth Mardawi. I quartier generali della Jihad Islamica palestinese a Jenin e in Cisgiordania sono stati pesantemente attaccati e smantellati durante l'Operazione Scudo Difensivo: Tawalbe è stato ucciso da un bulldozer blindato IDF Caterpillar D9, mentre Sefuri e Mardawi sono stati incarcerati dalle forze di sicurezza israeliane.