Le origini del Comando del 3º Corpo d'armata risalgono al 1º aprile 1860 quando venne istituito a Parma il 3º Comando con funzioni prevalentemente territoriali, ma, in caso di guerra, in grado di trasformarsi in comando di corpo d'armata. Il 3º comando aveva il compito di difendere parte dei territori che il Regno di Sardegna aveva recentemente acquisito in seguito alla seconda guerra d'indipendenza in cui aveva sconfitto l'Impero austriaco, e la sua giurisdizione si estendeva sul territorio dell'Emilia delimitato dal corso dei fiumi Trebbia e Panaro.