Angesichts der drohenden Invasion des Nachbars Indonesien rief die FRETILIN am 28. November die Unabhängigkeit der Demokratischen Republik Osttimor von Portugal aus. Nicolau Lobato wurde der erste Premierminister des Landes. Am 7. Dezember begann Indonesien mit dem Angriff auf die Hauptstadt Dili und die indonesischen Invasion. Nicolau Lobato floh in die Berge, während Isabel und ihr Sohn in Gefangenschaft gerieten. Isabel wurde von den Soldaten vergewaltigt. Sie konnte im letzten Moment José an ihre Schwester "Olímpia Barreto" geben, bevor Isabel zur Exekution gebracht wurde. Sie und Dutzende andere Zivilisten wurden von den indonesischen Soldaten auf dem Werftgelände hingerichtet. Die Leichen ließ man ins Wasser fallen.