Metsu regresó a Emiratos Árabes Unidos en 2006 para convertirse en su seleccionador nacional con un contrato que le vinculaba hasta 2010. Los emiratíes ganaron la Copa de Naciones del Golfo de 2007. Sin embargo, el país fue eliminado en la fase de grupos de la Copa Asiática 2007 y el técnico terminó presentando su dimisión el 22 de septiembre de 2008, tras dos derrotas en la fase de clasificación para el Mundial. Tres días después fue contratado como entrenador de Catar, un país que organizaba la Copa Asiática 2011 y que con él llegó hasta cuartos de final. A la conclusión, fue cesado del cargo.