Осенью 1944 года вдовствующая герцогиня де Гиз объявила детям, что больше не может содержать их семьи и они должны покинуть дом. Франсуаза с сыном уехали в Малагу, в Испанию, где жили в отеле Мирамар. Режим диктатора Франко не был лёгким периодом в жизни принцессы, но она получила деньги от продажи собственности мужа в Риме и Палермо. В 1948 году она решила уехать из города. В Грецию путь ей был закрыт из-за гражданской войны, а британское правительство отказало принцессе в убежище. Франсуаза и её сын Михаил уехали в Париж, где жили в доме принцессы Изабеллы и её второго мужа принца Пьера Мюрата. В их резиденции Франсуаза не желала никого видеть, редко покидала свои комнаты. В конце концов у неё началась депрессия. Она умерла 25 февраля 1953 года.