Родилась в состоятельной семье. До шестнадцати лет училась в школе-интернате для девочек. В возрасте 30 лет вышла замуж за адвоката Фелипе Агонсильо. Её муж был сторонником независимости Филиппин, революционером и будущим первым филиппинским дипломатом, который за критику испанского колониального режима в 1895 году был вынужден покинуть страну. Сначала он отправился в Японию, затем поселился в Гонконге с другими филиппинскими изгнанниками. Марсела со своими детьми последовала за мужем. Когда её муж был в Гонконге во время вспышки Филиппинской революции, Марсела Мариньо Агонсильо и остальные члены семьи присоединились к нему и временно проживали там, чтобы избежать анти филиппинских военных действий оккупирующей Испании.