Pesawat MiG-29 India telah terlibat dalam Perang Kargil di Kashmir pada tahun 1999. Tentera Udara India telah menggunakan pesawat MiG-29 secara luas untuk mengiringi pesawat Mirage 2000 yang digunakan untuk menjatuhkan bom panduan laser ke atas sasaran-sasaran musuh. Berdasarkan sumber-sumber dari India, dua buah pesawat MiG-29 dari Skuadron No. 47 (Pemanah Hitam) berjaya mengunci dua buah pesawat F-16 Fighting Falcon Tentera Udara Pakistan yang berada hampir dengan ruang udara India. Disebabkan India dan Pakistan tidak berperang pada masa itu, pesawat MiG telah diarahkan oleh pusat arahan Tentera Udara India untuk menghentikan tindakannya. Selepas kejadian ini, Tentera Udara Pakistan telah mengarahkan pesawatnya untuk berada dalam ruang udara Pakistan. Bagaimanapun, dakwaan ini telah disangkal oleh Tentera Udara Pakistan dan tidak terdapat bukti untuk menyokong dakwaan Tentera Udara India. Semasa konflik ini, pesawat MiG-29 Fulcrum telah dipersenjatai dengan peluru berpandu RVV-AE dengan keupayaan BVR membolehkannya untuk menguasai ruang udara.