1974 wurde Alexandrinos Bruder José Borromeu Duarte neuer Liurai, während Alexandrino Mitglied der APODETI wurde. Portugiesisch-Timor sollte auf die Unabhängigkeit vorbereitet werden und die APODETI forderte, unterstützt von Indonesien, den Anschluss an den großen Nachbarstaat. Nach den Wirren des Bürgerkriegs 1975 und der Unabhängigkeitserklärung durch die FRETILIN, besetzte Indonesien Osttimor in der Operation Seroja. Als Legitimation diente die sogenannte Balibo-Deklaration, in der osttimoresische Politiker angeblich Indonesien zu Hilfe riefen. Borromeo war, als ein Vertreter des APODETI-Präsidiums, einer der sechs Unterzeichner.