Infolgedessen zerfiel die kleine Kirche über die Jahrhunderte vollends und wurde offenbar geplündert. Bereits Urkunden aus dem Jahr 1625 bezeichnen sie als „Ruine“ und „ehemaligen“ Wallfahrtsort. Die Ruinen wurden 1789 an ein kleines Gehöft angefügt, das bis 1880 die Zugänge zu den Alaunwerken enthielt. Preußische Landkarten, die zwischen 1820 und 1878 durch die Geodäten Jean Joseph Tranchot und Karl von Müffling angefertigt worden waren, belegen, dass der heutige Ortsteil „Kreuzkirch“ in dieser Form noch gar nicht existierte, eingetragen sind lediglich die Alaunhütten sowie die Kreuzkirche (hier als „Ruine Kreutzkirche“ eingetragen). Sowohl während der Befreiungskriege 1813 als auch während des Ersten und Zweiten Weltkrieges wurden die Ruine der Kreuzkirche wie auch Melsbach schwer beschädigt. Heute steht die Kreuzkirche nach dem Denkmalschutzgesetz des Landes Rheinland-Pfalz (DSchG) unter Denkmalschutz.