Lors de la CAN 2010, les "Super Eagles" atteignent les demi-finales où ils s'inclinent contre le Ghana, et terminent à la après une dernière victoire contre l'Algérie. Au terme de ce tournoi vu comme décevant, le Suédois Lars Lagerbäck est nommé à la tête de la sélection pour une durée de cinq mois, le temps de la mener à la Coupe du monde. Le Nigeria perd son premier match face à l'Argentine (1–0). Pour leur , face à la Grèce, les "Super Eagles" ouvrent le score grâce à Kalu Uche, mais après l'expulsion de Sani Kaita, laissent leurs adversaires prendre l'avantage et l'emporter (2–1). Pratiquement éliminés ils terminent le tournoi sur un match nul face à la Corée du Sud (2-2, buts de Uche et Yakubu). Furieux de cette élimination, le Président du Nigeria Goodluck Jonathan suspend la sélection de toute compétition internationale pour deux ans, au risque d'être bannie par la FIFA dont les statuts interdisent toute intervention politique. La décision est annulée par le gouvernement quelques jours plus tard mais la FIFA poursuit sa procédure. Le , la FIFA annonce que Nigeria est suspendu de toute compétition internationale jusqu'à nouvel ordre. La sanction est finalement levée quatre jours plus tard.