Воспитанник клуба «Виллем II» из Тилбурга, в составе которого дебютировал 27 февраля 1999 года в матче с «Утрехтом». После шести сезонов в «Виллеме II» перешёл в клуб АЗ из Алкмара, откуда уже попал в национальную сборную (первый матч 17 ноября 2004 года против сборной Андорры). С лета 2006 года являлся основным игроком обороны немецкого «Гамбурга». Был одним из основных защитников сборной Нидерландов на чемпионате мира в ЮАР, где нидерландцы дошли до финала, но уступили в дополнительное время сборной Испании. Матейсен сыграл в 6 из 7 матчей сборной (пропустил четвертьфинал с Бразилией из-за повреждения) и получил 1 жёлтую карточку (на 117-й минуте финала). Участвовал также в чемпионате мира 2006 года в Германии (сыграл в 3 из 4 матчей сборной на турнире) и в чемпионате Европы 2008 года (3 из 4 матчей). На провальном для нидерландцев чемпионате Европы 2012 года сыграл в 2 из 3 матчей (пропустил стартовую игру против Дании из-за травмы). Тренер сборной Нидерландов Берт ван Марвейк после чемпионата Европы назвал Йориса в числе тех футболистов, с кем не намерен работать в сборной в дальнейшем. На следующий день стало известно об отставке самого ван Марвейка.