Die große neugotische Orgel auf der Empore wurde von Joseph Merklin (Merklin-Schütze) erbaut und von Anton Bruckner eingeweiht. Diese Orgel wurde 1867 auf der Weltausstellung in Paris mit einer Goldmedaille ausgezeichnet, wo sie von den meisten großen Pariser Organisten gespielt wurde. Joseph Merklin erhielt hiernach den Titel eines Ritters der Ehren Legion.