En rad kompositioner framkom under dessa år: 2:a och 3:e symfonin, uvertyrer, kammarmusik samt konsertkantaten "Comala". Kriget 1848 föranledde Gade att återvända till Köpenhamn, men några få år senare dirigerade han på nytt en rad Gewandhauskonserter. I Köpenhamn blev Gade Musikforeningens dirigent, varigenom denna blev centrum för det danska konsertlivet. Även för Musikforeningens konsertkantater, av vilka särskilt "Elverskrud" (1853) blev populär. Från samma tid härrör baletten "Et Folkesagn" (1854), som Gade skrev tillsammans med J. P. E. Hartmann. Denne och Gade ledde från 1867 tillsammans det nystiftade konservatoriet i Köpenhamn och Gade var därutöver organist vid Garnisonskirke och vid Holmens Kirke 1858-1890. 1879 blev han hedersdoktor vid Köpenhamns universitet.