В мае 1918 года вступил в ряды РККА, после чего был назначен на должность командира сотни 5-го советского казачьего полка на Царицынском фронте, в октябре — на должность командира эскадрона 4-го крестьянского кавалерийского полка бригады под командованием Булатникова. С января 1919 года, находясь на должности помощника командира 22-го Воронежского кавалерийского полка (отдельная кавалерийская дивизия, с марта — 4-я кавалерийская дивизия) принимал участие в боевых действиях на Южном фронте под Царицыном и на территории Донской области, а также в Воронежско-Касторненской, Харьковской, Донбасской, Ростово-Новочеркасской и Северо-Кавказской операциях и Егорлыкском сражении. С мая 1920 года принимал участие в ходе советско-польской войны в составе Юго-Западного фронта, а также в боевых действиях на житомирском, новоград-волынском и львовском направлениях и в районе Замостья. С октября Никитин в составе Южного фронта принимал участие в боевых действиях на территории Северной Таврии и Крыма, а с ноября воевал против войск под командованием Н. И. Махно.