В 330 году до н.э. Агафон остался в Экбатанах в компании Пармениона, , и Ситалка. Вскоре он сыграл роль в устранении Пармениона. Однако в 325/324 году Агафон был обвинён вернувшимся из Индии Александром в плохом управлении. Вместе с Гераконом, Клеандром и Ситалком он встретил царя в Кармании, где был арестован и, видимо, казнён.