После вторжения армии Наполеона в пределы Российской империи Шкапский принял активное участие в Отечественной войне 1812 года, сражался со своим полком в ряде сражений этой войны и был за что награждён 20 марта 1813 года орденом Святого Георгия 3-го класса № 278