ב-14 באפריל 1865 נרצח לינקולן על ידי אוהד הקונפדרציה ג'ון וילקס בות'. שותפו למעשה של בות', לואיס פאוול, פצע קשות את מזכיר המדינה ויליאם סיוארד סגן הנשיא ג'ונסון גם הוא היה יעד להתנקשות. ב-26 באפריל נלכד בות' אך הוא נהרג על ידי בוסטון קורבט, חייל שהפר הוראות.