Um grande número de oficiais do exército encontraram-se em 9 de novembro de 1889 e planejaram um golpe de estado. O marechal Deodoro da Fonseca assumiu o comando de seiscentos homens no dia 14 e tomou o quartel general do exército, exigindo a substituição do gabinete liderado por Afonso Celso de Assis Figueiredo, Visconde de Ouro Preto. No dia seguinte, , Deodoro proclamou a república e depôs Pedro em um golpe de estado republicano. O imperador recusou quaisquer sugestões dadas por políticos e líderes militares leais para subjugar a rebelião, simplesmente comentando que "Se assim é, será minha aposentadoria. Trabalhei demais e estou cansado. Agora vou descansar". Pelos dois dias seguintes a família imperial ficou confinada ao Paço Imperial no Rio de Janeiro, onde receberam a notícia de que tinham sido banidos do Brasil. Na madrugada de 17 de novembro a família embarcou no navio "Alagoas" e partiu para Portugal. Algum tempo depois de ser exilada, Isabel publicou uma declaração que dizia: