Наиболее важной польской организацией сопротивления в Литве, как и в оккупированной Польше, была Армия Крайова. Командование АК по Виленскому краю возглавлял Александр Кшижановский. Польские партизаны попытались взять власть при освобождении Вильнюса от немецких войск в 1944 году, однако это им не удалось.