Stijkel tenía una buena amistad con el baron J. A. Schorer, que era la fuerza impulsora detrás del Comité Científico Humanitario neerlandés, la primera organización holandesa comprometida con la igualdad de derechos para los homosexuales. El 10 de mayo de 1940, el mismo día del comienzo de la invasión de los Países Bajos por las tropas nazis, Stijkel, junto con Henri François, ayudó a Jhr. Schorer a destruir los archivos y las listas de afiliación del Comité Científico Humanitario holandés para que no cayesen en manos de los nazis.