Am 8. Juni 1991 debütierte Mäkinen in der finnischen Nationalmannschaft in einem Spiel gegen die Sowjetunion. Sie nahm mit der Nationalmannschaft an der Europameisterschaft 2005 in England teil, bei der Finnland das Halbfinale erreichte. In 115 Länderspielen erzielte sie 16 Tore. Bis zum 9. März 2009 war sie mit 113 Länderspielen finnische Rekordnationalspielerin, wurde dann aber von Sanna Valkonen übertroffen, die es mittlerweile auf 119 Länderspiele gebracht hat.