Khar fikk flere fremtredende verv i løpet av Shaukat Azizs regjeringstid. Hun var statssekretær for "økonomiske anliggender og statistikk" fra 2003 til 2004, og minister for "økonomiske anliggender" fra 2004 til 2007. Etter jordskjelvet i Nord-Pakistan i 2005 samarbeidet hun med internasjonale hjelpefond og veldedige organiasjoner. Hun arbeidet også med forslag til den transafghanske rørledning.