Pope focht im Mexikanisch-Amerikanischen Krieg unter Zachary Taylor in den Schlachten von Monterrey und Buena Vista. Für seine Leistungen während des Krieges erhielt er die Brevet-Beförderungen zum Oberleutnant und später zum Hauptmann. Den Dienstgrad Oberleutnant der regulären Armee erlangte Pope am 3. März 1853, den des Hauptmanns am 1. Juli 1856.