Entre 1999 e 2002 Carla Sacramento não voltou a conquistar qualquer resultado relevante em grandes competições internacionais. No entanto, esteve bem perto por algumas ocasiões de voltar a subir ao pódio. Nos Mundiais de Sevilha de 1999, conseguiu um 5º lugar e não conseguiu defender o seu título. A portuguesa partiu para a frente bem cedo na corrida e acabou por pagar caro esse esforço inicial. As forças faltaram-lhe à entrada para a curva final, quando ainda ia em 1.º lugar, acabando por ser ultrapassada por 4 atletas, num final algo penoso para a campeã. Foi uma derrota difícil de digerir e uma lesão impediu-a de participar nos Europeus de pista, de 2000.