Он был назначен командующим армией и потерпел серьезное поражение в битве при Геборе, после чего был отстранен от командования. Совершенно униженный, Мендисабаль просил отправить его служить простым рядовым; его просьба была удовлетворена. После того, как он отличился в битве при Альбуэре в мае 1811 года, он был восстановлен судом в звании командующего 7-й армией ("Séptimo Exército"), с которой он отправился на север Испании, на территорию баскских провинций (Бискайя) - Наварра, Риоха, Бургос и Сантандер. Он сражался в этом горном регионе, используя партизанскую тактику.