Команда создана в 1987 году. Своё название получила от своего первого учредителя — гостиницы «Жемчужина». Представляла также администрацию города Сочи и одноимённый футбольно-спортивный клуб. В 1988-м выступала в городском чемпионате. В чемпионате СССР — во второй низшей лиге и в кубке РСФСР в 1991. В кубке СССР не играла. С 1992 в чемпионате России. В первом дивизионе — в сезонах 1992 и 2000. С 2001 по 2003 и с 2008 — во втором дивизионе. С 1993 по 1999 — в высшем дивизионе. Высшее достижение — 9 место в 1994. Основных успехов команда достигла под руководством Арсена Юдильевича Найдёнова.