En-Nesyri blev uttagen i Marockos trupp till Afrikanska mästerskapet 2017 i Gabon, där han gjorde mål i den andra gruppspelsmatchen mot Togo (3–1-vinst). I juni 2018 blev han uttagen i Marockos trupp till fotbolls-VM 2018 i Ryssland, som ersättare till Badr Banoun. Han gjorde mål i den sista gruppspelsmatchen mot Spanien som slutade 2–2.