12-30 сентября линкор бомбардировал береговые укрепления японцев, помогая подготовиться к вторжению на остров Лейте. После этого корабль отбыл с Филиппин и 23 октября прибыл в Вашингтон. На военно-морской верфи в Бремертоне линкор прошёл модернизацию, в результате которой было установлено дополнительное зенитное вооружение. По этой причине «Индиана» не приняла участие в главном Сражении в Заливе Лейте. После завершения модернизации «Индиана» направилась в Перл-Харбор.