В 1861—1867 годах Хуарес руководил борьбой мексиканского народа против англо-франко-испанской интервенции. В ответ на мирные инициативы мексиканского правительства испанцы и англичане в апреле 1862 года вывели из страны войска, ослабленные эпидемией жёлтой лихорадки. Однако французы под началом Эли Фредерика Форе продолжили вторжение. На первых порах мексиканские войска под командованием Игнасио Сарагосы одержали при Пуэбле существенную победу над французскими интервентами (позднее этот день стал отмечаться как мексиканский национальный праздник — Пятое мая), но те в ответ увеличили численность своего экспедиционного корпуса.