Строительство базы было завершено в 1942 году. 28 марта 1942 года британские коммандос осуществили рейд на порт Сен-Назера, в результате которого был разрушен сухой док , который был единственным сухим доком на побережье Атлантики, способным принимать самый мощный корабль в составе Кригсмарине — линкор «Тирпиц». В 1942—1943 гг. году союзники подвергли Сен-Назер сильнейшим бомбардировкам, в ходе которых большая часть города была разрушена. Город пережил более 50 авианалётов, в ходе которых погибло 479 мирных жителей. Однако бомбардировки не смогли нанести существенного ущерба базе подводных лодок. Ни одна немецкая субмарина не пострадала в ходе этих налетов.