1961 wurde Rogers, der Mitglied der Demokratischen Partei war, zunächst Sonderberater und dann stellvertretender Koordinator der USA in der Alliance for Progress, ein Abkommen zur ökonomischen Zusammenarbeit zwischen Nord- und Südamerika, das 1961 vom damaligen US-Präsidenten John F. Kennedy initiiert wurde. Ziel der Vereinbarung war es, vor dem Hintergrund der Kubanischen Revolution eine Zusammenarbeit weiterer Länder Latein- und Südamerikas mit der Sowjetunion zu verhindern. Aus Protest gegen die Entscheidung von Präsident Lyndon B. Johnson zur Invasion in die Dominikanische Republik und den Vietnam trat er 1965 von dieser Funktion zurück. Im Anschluss war er wieder als Rechtsanwalt in der Anwaltskanzlei "Arnold, Fortas &amp; Porter" tätig.