Iwabuchi befehligte die Verteidigung der Stadt Manila im Februar 1945. 14.000 Marinesoldaten und rund 10.000 Armeesoldaten blieben in Manila zurück, während die 14. Regionalarmee, die Luzon gegen die Amerikaner verteidigte, sich nach Baguio zurückzog. Am 2. Februar erreichte die 1. US-Kavalleriedivision die Stadt. Etwa 8.000 amerikanische Fallschirmjäger der 11. US-Luftlandedivision waren inzwischen in den Tagaytay-Hügeln gelandet und marschierten schnell in Richtung Manila. Die 1. Kavalleriedivision war am 3. Februar über die letzte intakte Brücke über den Pasig gekommen, und nach heftigem Widerstand waren es am 19. Februar vermutlich nur noch etwa 2.000 Mann, die gegen die GIs kämpften. Am 26. Februar beging Iwabuchi in seinem Gefechtsstand Suizid, wahrscheinlich indem er sich mit einer Handgranate in die Luft sprengte, und wurde postum zum Admiral befördert.