Als Generalarzt diente Middeldorpf im Deutsch-Dänischen Krieg und im Deutschen Krieg. Die Methode der Unterbindung der Arterien durch perkutane Umstechung, Wege zur Heilung von Magenbauchwandfisteln durch plastische Operation und die Operation von Speiseröhrenpolypen zählen ebenso zu seinen besonderen medizinischen Leistungen.