W 1311 Fryderyk III Piękny rozpoczął rokowania z Jakubem II Sprawiedliwym w sprawie małżeństwa z jego córką. Dwa lata później w Barcelonie Izabela poślubiła per procura Fryderyka Pięknego. W styczniu 1314 narzeczona wraz z dużym wianem przybyła do Austrii. Wesele odbyło się 31 stycznia 1314 w Judenburgu. Po ślubie Izabela używała imienia Elżbieta. W październiku 1314 Fryderyk Piękny został wybrany królem niemieckim w opozycji do Ludwika Bawarskiego. W Zielone Święta 1315 Elżbieta została koronowana w Bazylei na królową. Jej małżeństwo okazało się harmonijne, ale przez cały czas małżonkowie borykali się z problemami finansowymi. Elżbieta musiała kilkakrotnie ratować finanse poprzez sprzedaż swoich kosztowności. Okres uwięzienia męża po bitwie pod Mühldorfem i spory z Ottonem Wesołym, bratem męża, przyczyniły się do pogorszenia jej stanu zdrowia. Przeżyła męża o pół roku.