Kastil ini tidak lagi penting dari segi militer setelah meletusnya Pertempuran Grunwald karena musuh besar Lituania berhasil dikalahkan oleh pasukan gabungan Lituania-Polandia. Kastil ini lalu dialihfungsikan menjadi tempat tinggal dan bagian dalamnya mulai didekorasi. Namun, selama perang melawan Keharyapatihan Moskwa pada abad ke-17, kastil ini mengalami kerusakan dan tidak dibangun kembali. Perlahan-lahan kastil ini berubah menjadi reruntuhan. Pada abad ke-19, rencana pembangunan kembali kastil Trakai mulai disusun. Pada tahun 1905, pemerintah Kekaisaran Rusia memutuskan untuk merestorasi sebagian reruntuhan kastil. Namun, proyek rekonstruksi besar-besaran baru dilakukan pada tahun 1946 setelah berakhirnya Perang Dunia II. Proyek ini diselesaikan pada tahun 1961 dan mengikuti rancangan Kastil Trakai pada abad ke-15. Kastil Pulau Trakai kini merupakan tujuan wisata yang populer.