Хиос был опустошен печально известной резней на Хиосе в 1822 году, когда османские войска отбили остров, который присоединился к Греческому восстанию против Порты, и вырезали или продали в рабство около половины его 80 000 жителей. Тем не менее, остров восстановил хотя бы часть своего былого процветания и сохранил обширную автономию после окончания Греческой войны за независимость, пока османские административные реформы 1866 года не превратили его в более регулярную провинцию в пределах вилайета Архипелаг. В 1880—1887 годах Хиос даже служил столицей вилайета Архипелаг.