המשלחת הצפונית הביאה לאיחוד רוב סין תחת הממשלה הלאומית אך לא עבר זמן רב וסכסוך פנימי בתוך המפלגה הוביל לטבח שאנגחאי בו הפלג הימני במפלגה טבח בפלג השמאלי הקומוניסטי. תומכי האידאולוגיה הקומוניסטית אשר ברחו מהטבח הכריזו על פירוק המפלגה הקומוניסטית של סין ממפלגת הקוומינטנג ובכך החלה מלחמת האזרחים הסינית בין הקומוניסטים ללאומיים. בשנת 1936 לאחר תקרית שיאן שני הצדדים הסכימו ליצירת חזית מאוחדת נגד יפן.