Nel 1808 Görres ritornò a Coblenza, rimanendo in disparte fino all'inizio della lotta nazionale contro Napoleone che lo spinse a fondare il giornale "Rheinischer Merkur" (Il Mercurio renano) il cui primo numero uscì il 23 gennaio 1814. Giudicato il più influente del tempo, il giornale ebbe una linea politica dapprima avversa a Napoleone e, dopo la caduta di quest'ultimo, avversa alla politica reazionaria degli stati tedeschi, in appoggio alla concessione di leggi costituzionali in Germania; il che portò alla sua soppressione (1816). Dopo la pubblicazione del pamphlet "Teutschland und die Revolution" ("La Germania e la Rivoluzione") nel 1819 fu costretto a fuggire a Strasburgo e poi in Svizzera, dove visse in povertà per molti anni. Nel 1824 ritornò formalmente alla fede cattolica. Nel 1827, su richiesta di Luigi I di Baviera, divenne professore di storia all'Università di Monaco di Baviera, dove formò un circolo di intellettuali cattolici liberali. Fu portavoce cattolico e vigoroso in molte controversie; per esempio, "Athanasius" (Atanasio, affari di Colonia nella traduzione in lingua italiana) è uno scritto di protesta contro l'arresto dell'arcivescovo di Colonia Clemens August Droste zu Vischering, ordinato dalle autorità prussiane durante la controversia fra Chiesa cattolica e Stato ("Kirchenstreit") del 1837. nel periodo 1836-42 scrisse la monumentale "Christliche Mystik" ("Misticismo cristiano") in 4 volumi.