Au début de la Guerre de Bosnie-Herzégovine, l'aéroport a cessé progressivement toute activité. En juin 1992, l'aéroport est investi par les militaires français de la Force de protection des Nations unies, il sert alors principalement à l’acheminement de l'aide humanitaire et au soutien logistique des forces onusiennes. Durant la guerre plus d'une centaine de tirs d'obus visèrent la plateforme. Rouvert au trafic aérien civil le 16 août 1996, l'aéroport a été rénové grâce à des donations néerlandaises.