Inoltre da ottobre 2011 anche il Kenya ha inviato delle forze coordinate con l'esercito somalo nell'operazione Linda nchi contro gli Al-Shabaab nel sud della Somalia, con una missione parallela ufficialmente guidata dall'esercito somalo, con le forze keniane con un ruolo di supporto. Il 12 novembre il governo keniano concordò di sottomettere le proprie forze al comando dell'AMISOM.