Во время восстания 1831 года Пеликану было поручено устройство военного госпиталя в Вильне для раненых. Занимал должность инспектора Министерства внутренних дел (1831—1837). Принимал участие в упразднении Виленского университета и в комиссии об учреждении Виленской медико-хирургической академии, образованной из медицинского факультета университета. Занимался также в комиссии для определения виновности мятежников (участников восстания 1831 года).