Scettico sul futuro dell'animazione giapponese, nel 2015 annuncia di aver iniziato i lavori, in coppia con Shinji Higuchi, per dirigere un nuovo film dal vivo di Godzilla. La pellicola, intitolata "Shin Gojira", è stata distribuita in Giappone il 29 luglio del 2016 venendo acclamata dalla critica e diventando il miglior incasso live-action dell'anno in patria. Oltre a costituire un reboot delle origini del celebre kaijū, il film trae ispirazione dal terremoto e maremoto del Tōhoku del 2011 e dal successivo disastro nucleare di Fukushima, oltre ad essere una satira della società giapponese contemporanea.