Ordonné prêtre en 1869, il est d'abord Primat des Arméniens d'Égypte de 1886 à 1890. Revenu à Constantinople, l’archevêque Matthieu Izmirlian est élu Patriarche arménien de Constantinople en 1894. Il doit renoncer à son siège en 1896 lors des massacres de l’époque du sultan ottoman et il est remplacé par le prélat et historien Malachia Ormanian (1896-1908).