雖然埃米利奥·恩苏埃父為赤道幾內亞藉，但他本人多次拒絕赤道幾內亞國家隊的邀請，選擇代表西班牙青年國家隊。2012年，他為了入選西班牙u23參加2012年奧運，再次拒絕赤道幾內亞的邀請出席2012年非洲國家盃，可是事與願違，他最終亦並沒有入選。