Masséna viel hierdoor uit de gratie bij Napoleon en bleef in de daaropvolgende twee jaren afwezig. Na de Slag bij Leipzig in 1813 gaf Napoleon hem echter weer een bevel, als commandant van de 8e divisie bij Marseille. Masséna diende nog als commandant van de nationale garde in Parijs na Napoleons nederlaag in de Slag bij Waterloo.