19 листопада 1989 року адвокат Рожер Уенен був обраний президентом клубу. Бажаючи професіоналізувати клуб він запрсив Філіпа Труссьє, який тренував команду з 1989 по 1992 рік. Це був період, коли АСЕК повернув втрачені позиції, й у період з 1990 по 1995 рік шість разів поспіль вигравав Лігу 1. Гравці АСЕКу також складали кістяк і національної збірної, яка тріумфувала в Кубку африканських націй 1992 року, зокрема ключовими гравцями тієї збірної були Бен Баді, Дональд-Олів'є Сьє та Базіль Ака Куме. Після 5-и виходів до півфіналу, в 1998 році АСЕК зрештою виграв Лігу чемпіонів КАФ. Для деяких гравців команди з'явилася можливість перейти до європейських клубів, зокрема капітан АСЕКа Тчірессу Гуель згодом перейшов до марсельського «Олімпіку». Декілька років по тому команда перевершила власний рекорд, у період з 2000 по 2006 років вона виграла національний чемпіонат сім разів поспіль.