קנדה ופרו כוננו יחסים דיפלומטיים ב-21 באוקטובר 1944. בתחילה התקיימו היחסים בין שני העמים בארגונים רב-צדדיים. במאי 1970 הגיעו הכוחות הקנדיים לפרו זמן קצר לאחר רעידת האדמה באנקאש להגיש סיוע הומניטרי למשך חודשיים בתגובה לבקשת הנשיא חואן ולסקו אלברדו.