Nelsen hizo su debut con la el 18 de junio de 1999 en un amistoso ante que terminó empatado 0-0. Ese mismo año fue convocado para disputar la Copa FIFA Confederaciones, en la que el defensor disputó desde el inicio los partidos ante y , ambos con derrota 2-0, mientras que ingresó desde el banco en el 2-1 favorable para los . Al año siguiente anotó su primer gol internacional en un partido ante que representó la final de un torneo amistoso en el que Nueva Zelanda fue el ganador.