Durante la guerra civil las JSUC jugaron un importante papel, tanto en las labores de la retaguardia como en el reclutamiento de voluntarios para el Ejército Popular de la República. Por ejemplo, el secretario de las JSUC, Francisco Graells, falleció en Barcelona durante los combates que se desarrollaron en julio de 1936 contra los militares de la guarnición que se habían sublevado.