Његово краљевско височанство Стефан Батори био је први моћни кнез независне Трансилваније, а као угарски католик, који је касније постао краљ под именом Стефан Батори од Пољске, обавезао се да ће задржати верску слободу коју је одобрио Тордски едикт, али је ову обавезу тумачио у све ограниченијем смислу. За време владавине последњег кнеза Трансилваније из династије Батори, Жигмунда, Трансилванија улази у Дуги рат на страни хришћанског савеза Светог римског царства Хабзбурговаца и Кнежевине Влашке под кнезом Михајом Храбрим, против Османског царства.