Bassem Youssef est le fils d'un juge et d'une professeur d'université ; il grandit dans le quartier de Zamalek, "cocon de la vieille bourgeoisie cairote". Il y vit aujourd'hui avec sa femme Hala et sa fille, Nadia. Le 2 février 2011, il assiste en tant que volontaire plusieurs jeunes révolutionnaires blessés sur la place Tahrir lors de l'attaque des "baltageya". Entre deux saisons de l'émission "El Bernameg", il continue d’exercer la profession de cardiologue.