Après le débarquement anglo-russe en République batave en , Humphreys quitta la "Juno" pour le cinquante canons qui était alors le navire amiral du ' Andrew Mitchell au sein de la . Il suivit l'amiral à bord du , servant dans le Zuiderzee durant les opérations militaires en Hollande. Il fut à bord du assigné à l'escadron du ' Henry Inman de l' lorsqu'il engagea le combat contre des frégates françaises à l'ancre à Dunkerque le . Humphreys fut ensuite transféré sur le quatre-vingt dix canons en 1800. Il fut promu "" le sur ce même bâtiment.