Самюэль Умтити с 16 лет вызывался в сборные Франции всех возрастов, начиная с категории «до 17». В 2013 году был основным центральным защитником сборной на чемпионате мира среди молодёжных команд, проходившем в Турции. Защитник принял участие во всех играх группового этапа, но из-за перебора карточек был дисквалифицирован на матч 1/8 финала против команды-хозяйки чемпионата. Был возвращён в состав главным тренером Пьером Манковски на четвертьфинальную и полуфинальную игры, однако в последней получил «красную карточку» и вынужден был пропустить финальный матч. Франция стала чемпионом мира в возрастной категории до 20 лет, Умтити получил «золотую» медаль первенства. В декабре 2013 года Камерунская федерация футбола выразила заинтересованность в приглашении Умтити в состав национальной сборной.