Während der Belagerung von Rapperwil im Ersten Villmergerkrieg wurden 1656 drei grosse und eine kleine Glocke von den Zürchern abgeführt, später aber wieder zurückgegeben, darunter wohl zwei 1606 von Peter Füssli in Zürich gegossene. 1718 schlug ein Blitz in den Turm ein und brachte alle Glocken zum Schmelzen. Als Bürgerin Zürichs erhielt die Äbtissin Klara Helbling vom Rat der Stadt 100 Pfund an den Schaden sowie den Erlass einer Schuld. Das heutige Geläut besteht aus drei Glocken.