苏联解体后，阿塞拜疆独立。两国於1992年4月2日建交，中方同年8月设立中国驻阿塞拜疆大使馆。1994年3月7日至10日，阿塞拜疆总统盖达尔·阿利耶夫访华，双方签署了《中阿友好关系基础的联合声明》等八个文件，期间阿利耶夫总统和中华人民共和国主席江泽民、中华人民共和国国务院总理李鹏进行了会谈，就双边政治经贸关系、纳卡冲突及其他重大的国际问题交换了意见。