ב-1991 למאמן מונה קונסטנטין בסקוב והמועדון שיחק ליגת המשנה הסובייטית. עם זאת, בשל התפרקות ברית המועצות, אסמרל צורפה לליגת העל הרוסית. בבסוף העונה המועדון סיים במקום ה-7, הגבוה ביותר בתולדות המועדון. אלא שאז החלה ההידרדרות ביכולת הקבוצה, שהעיתונאים ייחסו לכישלון מימון הקבוצה עקב פשיטת רגל של היזם. אסמרל במשך מספר שנים השתתפה ליגה השנייה ולאחר מכן איבדה את מעמדה המקצועני ופורקה.