In seguito all'addio del "Trap", la squadra visse un periodo altalenante. Il secondo posto nella Serie A 1992-1993 e la conquista della Coppa UEFA 1993-1994 fecero da contraltare a stagioni anonime o negative: ottava classificata nel campionato 1991-1992, nel 1994 l'Inter rischiò di retrocedere malgrado la concomitante affermazione europea, guadagnandosi la permanenza in Serie A solo alla penultima giornata. Soggetta a forti critiche — che coinvolsero anche Bergomi, nel frattempo divenuto capitano a tutti gli effetti —, la retroguardia dell'Inter fu rivoluzionata nell'estate del 1994 dalle cessioni di Riccardo Ferri e Walter Zenga, che passarono alla nell'ambito della trattativa che portò in nerazzurro Gianluca Pagliuca.