Im Februar 1941 wurde Blandy zum jüngsten Konteradmiral der Marine befördert und zum Chef des Bureau of Ordnance ernannt. Im Dezember 1943 erhielt er den Befehl über die Amphibious Group One, mit der er an der Invasion Kwajaleins Anfang 1944 teilnahm. Im November 1944 wurde Blandy Kommandant der Amphibious Support Force, sein Flaggschiff war die USS "Estes". Er war an der Schlacht um Iwojima sowie der Schlacht um Okinawa beteiligt, anschließend erhielt er den Oberbefehl über die Kreuzer- und Zerstörerflotten der US-Pazifikflotte.