Область Омахеке є батьківщиною народу гереро. Під час повстання гереро проти німецьких колоніальної влади в 1904, після розгрому основних сил повсталих в Битві при Ватербергу, вцілілі гереро тікали через територію Омахеке в британський Бечуаналенд, розраховуючи знайти там притулок. Так як німецькі війська не підпускали гереро до джерел води, величезна їх кількість загинуло по дорозі від спраги. Багатьма вченими ці події розглядаються як перший геноцид в історії ХХ століття.