В апреле 1793 года Марсо был послан в Вандею. Там он рассорился с якобинским депутатом конвента и народным представителем при Западной армии Пьером Бурботтом, который велел его арестовать. Марсо был, однако, выпущен на свободу перед битвой при Сомюре, где так отличился, что Бурботт сам хлопотал о его производстве в бригадные генералы — когда в том бою пала лошадь депутата, Марсо отдал ему свою со словами: «Садитесь скорее. Я предпочитаю быть убитым или взятым в плен, чем видеть представителя народа в руках этих разбойников».