Wolfgang von Haffners Vater war der spätere Generalleutnant Johan Wolfgang Reinhold von Haffner (1770–1829), seine Mutter dessen Gattin Anna Margrethe, geb. Kaasbøll (1789–1849). Mit fünfzehn Jahren wurde er Sekondeleutnant à la suite im Leibregiment der Kürassiere. 1847 wurde er Kammerjunker. Am Ersten Schleswigschen Krieg nahm er freiwillig teil. 1871 wurde er General à la suite.