Auch zivilgesellschaftliche Akteure aus Portugal sind im Tschad aktiv. So kam die portugiesische Hilfsorganisation Assistência Médica Internacional (AMI) erstmals 2004 in das Land, um Flüchtlinge aus Darfur zu betreuen. Seit April 2013 ist die Unterstützung des Krankenhauses von Dono Manga im südtschadischen Département Tandjilé Est (Region Tandjilé) das Hauptprojekt der AMI im Tschad, die dort medizinische Projekte durchführt und das Krankenhaus zu knapp der Hälfte auch finanziert. Auch über kirchliche Organisation wie dem Jesuiten-Flüchtlingsdienst JRS kommen weiter Helfer aus Portugal in den Tschad, vor allem zur Unterstützung der sudanesischen Flüchtlinge dort.