Os baathistas tomaram o poder no Iraque pela primeira vez em 1963, mas foram depostos vários meses depois. Este que governou o país entre 1968 e 2003, nos primeiros anos em aliança com o partido comunista, aliança essa que seria quebrada posteriormente. Teve como liderança por muitos anos Saddam Hussein, sendo apoiado na ascensão pelos estadunidenses. O Partido Baath foi proibido em 2003 pela Autoridade Provisória da Coalizão após a invasão do Iraque. Hoje muitos ex-membros do partido fazem parte da insurgência iraquiana. Alguns autores atribuem a queda do partido a causa dos distúrbios no Oriente Médio no século XXI.