No Grande Prêmio da Europa de 2009, disputado em 23 de agosto de 2009 em Valência, na Espanha, Rubens conquista sua primeira vitória na temporada, a décima na carreira e a centésima de pilotos brasileiros na principal categoria do automobilismo mundial. Em 13 de setembro, Rubinho consegue a segunda vitória em 2009, no Grande Prêmio da Itália, disputado no autódromo de Monza. Já em 17 de outubro, consegue fazer a "pole position" em casa, no Grande Prêmio do Brasil. Com o feito, Rubens faz a sua primeira "pole" do ano e a primeira em cinco anos, desde o Grande Prêmio do Brasil de 2004.