Václav Klaus rovněž vyjádřil pochybnosti o invazi do Iráku v roce 2003, kdy se vyjádřil, že zbraně hromadného ničení se v Iráku nenajdou, což vzbudilo negativní reakce administrativy prezidenta Bushe i Klausových kritiků. Jiří Pehe nazval Klausův postoj v této věci "čeháčkovstvím". Později se ukázalo, že Klausova predikce byla oprávněná a zbraně hromadného ničení se v Iráku nenašly.