Основой должности генерал-кригскомиссара явилась должность "генерал-комиссара". Первым генерал-комиссаром был Ф. А. Головин во время Азовских походов (1695—1696). Указом Петра I от года о создании «особого Приказа» боярина Якова Фёдоровича Долгорукова предписывалось «писать его боярина во всяких письмах, которые о полковых делах, "генерал-комиссаром"».