El 6 d'abril de 1994, el president de Ruanda Juvénal Habyarimana va morir quan el seu avió va ser derrocat i aquest gry va precedir immediatament el que seria conegut com el Genocidi de Ruanda en el qual s'estima que es van morir entre 800.000 i 1.000.000 persones. Mujawamariya era un objectiu a Kigali, on Radio Télévision Libre des Mille Collines la va titllar de "mala patriota que mereixia morir." Ella estava en comunicació amb Alison Des Forges cada 30 minuts a causa d'aquesta amenaça i el derrocament. Des Forges era membre de Human Rights Watch i li va dir que cuidés dels seus fills si moria. Així les coses, Mujawamariya va sobreviure.