Po ataku Niemiec na ZSRR nadal pełnił funkcję komendanta Odeskiej Bazy Morskiej i jednocześnie był dowódcą garnizonu Odessy. W sierpniu 1941 roku, gdy Odessa została okrążona przez wojska rumuńskie i niemieckie w dniu 19 sierpnia został utworzony Odeski Rejon Obronny, którego został dowódcą dowodząc od tego momentu obroną Odessy do momentu ewakuacji z niej wojsk w dniu 16 października 1941 roku.