С ноября 1918 года на Украине началась межусобная война. После того, как войска Антонова-Овсеенко 19 марта захватили Жмеринку, Восточный фронт, Запорожский корпус атамана Волоха, Южная группа атамана Янова и «Запорожская сечь» атамана Божко оказались отрезанными от остальной армии УНР. По приказу Симона Петлюры, эти подразделения, под общим командованием Фёдора Колодия, должны были отступить на юг, поддерживая связь с французскими частями. Однако, в результате захвата Бара и Могилёв-Подольского, связь между штабом Колодия в селе Вапнярка и Действующей армией была прервана. В это время состоялась попытка мятежа атаманов Волоха, и Волощенко (бывший куренной командир 3-го гайдамацкого полка). Участие Фёдора Колодия в этих событиях противоречивая. По данным Ярослава Тинченко, Колодий участвовал в мятеже и был провозглашён членом Революционного совета в Вапнярке. По утверждениям Исаака Мазепы, Колодий выступил против мятежа и вместе с полковником был отстранён мятежниками от командования.