Lee recebeu a Cruz da Marinha por sua ações na batalha e algum tempo depois foi nomeado o comandante de toda a frota de couraçados da Frota do Pacífico. Na Campanha nas Ilhas Gilbert e Marshall, ele comandou uma força tarefa que atacou Nauru. Em seguida, comandou seus navios em diversas operações de ataque e bombardeio em posições japonesas no Pacífico. Também participou dos primeiros estágios da Batalha do Mar das Filipinas em junho de 1944, quando suas embarcações foram atacadas por diversas aeronaves japonesas. Por suas ações nesta batalha, recebeu a Legião do Mérito e a Medalha de Serviço Distinto.