戦後、再度の元軍の侵入に備えて陳国峻は兵士の訓練に励み、武器と艦船の増産を指示した。一方の元も過去の戦争で食料確保に苦しんだ失敗を踏まえ、艦船による食糧の輸送体勢を整える。1287年12月より元軍は大越に侵入し、元軍は長期戦に備えて万劫（ヴァンキュプ、現在のハイズオン省）に城砦を築いた。仁宗は昇龍を脱出し、紅河デルタで元軍が築いた拠点を巡っての大越軍と元軍の戦闘が展開される。戦況が変化するのは、雲屯（ヴァンドン、現在のクアンニン省ハロン市）で聖宗の養子（チャン・カイン・ズ）の率いる部隊が物資を搭載した元の補給艦隊を破った時であった。食料の確保と拠点の防衛に支障をきたした元軍は陸路と海路の二手に分かれて撤退を開始するが、陳国峻は将軍・范五老を諒山（ランソン）に派遣し、范五老の率いる伏兵によって陸からの退路を絶った。1288年3月にベトナム軍はを下ろうとする元軍に勝利し（白藤江の戦い (1288年)）、さらに諒山で待ち伏せていた范五老の軍が退却中のトゴンの軍に打撃を与える。