Howe i el seu germà Richard, com a part de les seves instruccions, havien estat assignats com a comissaris de pau, amb una autoritat limitada per tractar amb els rebels. Després de Long Island, van perseguir un intent de reconciliació, enviant el general John Sullivan capturat a Filadèlfia amb una proposta per a una conferència de pau. La conferència resultant, conduïda per l'almirall Howe, no va tenir èxit. Els Howe havien rebut poders limitats, com els representants del Congrés, i aquests últims van insistir que els britànics reconeguessin la recentment declarada independència colonial. Això no estava dins dels poders dels Howe, per la qual cosa la conferència va fracassar i Howe va continuar la campanya. Primer va desembarcar tropes a Manhattan el 15 de setembre i va ocupar la ciutat de Nova York (que llavors només ocupava el baix Manhattan), tot i que el seu avanç cap al nord a Manhattan es va comprovar l'endemà a Harlem Heights. Després es va aturar, passant gairebé un mes consolidant el control de la ciutat de Nova York i esperant reforços. Durant aquest temps va ordenar l'execució de Nathan Hale per espionatge, i va haver de tractar els efectes d'un important incendi a la ciutat. Després va intentar un desembarcament a la part continental a Throgs Neck, amb la intenció de flanquejar la posició de Washington a Harlem Heights. No obstant això, l'estreta trajectòria entre la platja i la part continental estava ben defensada i va acabar retirant les tropes. A continuació, va fer un reeixit desembarcament de tropes a Pell's Point, al comtat de Westchester; Washington va aconseguir evitar ser flanquejat, retirant-se a White Plains. Howe va expulsar Washington de la zona de Nova York amb èxit a la Batalla de White Plains del 28 d'octubre i després va dirigir la seva atenció per consolidar la presa britànica de Manhattan. Al novembre va atacar la fortalesa restant de l'exèrcit continental a la batalla de Fort Washington, fent diversos milers de presoners.