Shirley war vergleichsweise beliebt, weil er sich geschickt aus den Affären seiner Vorgänger heraushielt. Mit Beginn des Siebenjährigen Kriegs in Nordamerika wurde er erneut militärisch gefordert, da er nach dem Tod von General Edward Braddock 1755 das höchste koloniale militärische Amt innehatte. Mit dieser Aufgabe war er jedoch überfordert und wurde 1757 abberufen. Sein Nachfolger Thomas Pownall sorgte für die koloniale Unterstützung der Kriegstruppen bis zum Ende des Konflikts 1760.