Inför VM 2011 ändrades kvalsystemet i Europa och alla lagen fick chansen att kvala in till VM. Estland hamnade i grupp A tillsammans med Frankrike, Island, Nordirland, Serbien och Kroatien. Efter segrar mot Nordirland, Serbien och Kroatien slutade Estland på fjärde plats i gruppen och tog sig inte till VM.