Im September 2016 wurde er verhaftet, weil man auf seinem Handy eine App gefunden hatte, die zur Kommunikation auch von Beteiligten des Putsches genutzt worden war. Seine Immunität wurde nicht anerkannt, da die Anklage nicht in Verbindung mit seinen diplomatischen Tätigkeiten stünde und er wurde zu 7,5 Jahren Haft verurteilt. Akay wurde der versuchte Umsturz der verfassungsmäßigen Ordnung, Totschlag und die Mitgliedschaft in der angeblichen "Fethullahistischen Terrororganisation (FETÖ)" vorgeworfen. Er erhielt ein Ausreiseverbot und wurde aus der Haft entlassen. Der Fall wird vor dem Kassationshof verhandelt werden.