В 2015 году Волков назвал состоявшийся в 2014 году референдум о статусе Крыма проведённым с нарушениями законодательства и настаивал на проведении повторного референдума под международным контролем с учётом волеизъявления жителей Крыма. В то же время, согласно словам председателя Меджлиса крымскотатарского народа Рефата Чубарова, Леонид Волков во время протестов в поддержку Алексея Навального 2021 года отказался исправлять интерактивную карту и удалять Крым с карты Российской Федерации, приведя некоторые аргументы, которые Чубаров отказался озвучивать.