С 1807 года Михал Цихоцкий служил в войске Великого герцогства Варшавского. В 1809 году он был комендантом плаца в Люблине, затем командиром 9-го пехотного полка Варшавского герцогства. Он участвовал во французской интервенции в Испанию. Вместе с дивизией Варшавского герцогства он вернулся из Испании и принял участие во вторжении Наполеона в Россию в 1812 году. 28 ноября 1812 года был ранен в боях на реке Березина. В 1813 году Михал Цихоцкий оборонял Шпандау (район Берлина) во время весенней кампании.