В составе сборной Виктор Угарте становился участником 5 кубков Америки и чемпионата мира 1950 года в Бразилии, где сборной не удалось продвинуться дальше первого раунда. За 17 лет выступлений за сборную Боливии Виктор провёл в общей сложности 45 матчей и забил 16 мячей. Последние 2 гола, забитых Виктором в футболке национальной сборной, пришлись на финальный матч чемпионата Южной Америки 1963 против сборной Бразилии и позволили боливийцам выиграть первый в своей истории чемпионский титул.