В декабре 1854 года Врангель был произведён в генерал-лейтенанты и назначен начальником 2-й гвардейской пехотной дивизией; 30 августа 1857 года был пожалован в генерал-адъютанты и назначен кутаисским военным губернатором, но не вступил в должность; с 1858 года — начальник 21-й пехотной дивизии, командующий войсками и управляющий гражданской частью в Прикаспийском крае. В 1859 году, командуя Дагестанским отрядом, участвовал в наступлении князя А. И. Барятинского в долину Андийского Койсу — против Шамиля. 17—18 июля совершил замечательнейшую переправу через Андийское Койсу у аула Согратль. Энергично и неустанно преследуя Шамиля, отряд под командованием Врангеля вытеснил его из Аваристана и заставил укрыться в Гунибе. Вся операция, кончившаяся штурмом аула и пленением Шамиля, всецело принадлежала Врангелю и его славному отряду, за что 10 августа 1859 года генерал-лейтенант А. Е. Врангель был награждён орденом Св. Георгия 3-й степени.