Filippikos, Bizans topraklarında sığınan yakın tarihte tahttan indirilen Pers hükümdarı II. Hüsrev () için 590 yılındaki diplomatik misyon dışında birkaç yıl sahneden kaybolur kaybolur. 598'de kısa süre Balkanlar'da sürmekte olan savaşta general olarak görevlendirildi ve bazı kaynaklarda Trakya'da Avarlara karşı zafer kazandığı bildirilmesine rağmen, büyük olasılıkla general Priscus'la olan karışıklıktır.