De retour à Paris, Bonaparte est nommé capitaine le , dans le contexte de la guerre, où l'on a besoin de soldats. De plus, il ne reste que dans son régiment, le d'artillerie. La guerre prend de l'ampleur à l'automne 1792 avec la constitution d'une coalition des monarchies européennes contre la toute nouvelle République française, coalition à laquelle participe le royaume de Sardaigne. C'est à son poste de commandant en second du bataillon Quenza-Bonaparte que ce dernier fait ses premières armes en , participant à la tête de l'artillerie à l'expédition de La Maddalena. Malgré l'efficacité et la détermination de Napoléon, l'opération commandée par Colonna Cesari, un proche de Paoli, est un échec cuisant. Cet événement et l’exécution du roi en attisent la division avec les paolistes, provoquant une révolte des indépendantistes.