在第二次世界大战中当地的居民由于饥荒、处决、屠杀和强行迁徙受到巨大损失。与纳粹德国联盟的保加利亚占领军迫害当地希腊人，在他们占领的东马其顿和西色雷斯殖民，并将当地的所有犹太人运走。马其顿平民死亡总数估计超过40万，其中包括5.5万希腊犹太人。此后希腊内战中的战斗也影响到了当地居民，加上战后的贫困迫使许多农村的马其顿居民迁徙到城市或外国。即使今天马其顿许多地方依然人烟稀少。