Charles Andrew Willoughby (* 8. marec 1892, Heidelberg, Nemecké cisárstvo – † 25. október 1972, Naples, Florida, USA) bol americký dôstojník v hodnosti generálmajor, ktorý bol počas obsadenia Japonska a počas Kórejskej vojny šéfom tajnej služby pre "Supreme Commander for the Allied Powers (SCAP)" generála MacArthura. Otvorene prejavoval fašistické sklony. Pomohol japonským vojnovým zločincom predísť trestným stíhaniam, tým že mnohých naverboval do služieb USA. Po odchode do dôchodku bol poradcom generála Francisca Franca.