Durante a invasão alemã da União Soviética, Malsagov serviu no 5º Regimento de Aviação de Bombardeiros de Curto Alcance no Distrito Militar de Odessa. O regimento, originalmente equipado com SBs Tupolev, logo recebeu os modernos bombardeiros de mergulho Petlyakov Pe-2 logo após a invasão. Como tenente, ele rapidamente dominou a pilotagem da nova aeronave e começou a fazer missões na Frente Sul em junho de 1941, bombardeando uma base naval romena, tanques inimigos e tropas em avanço. Em 20 de setembro de 1941, ele havia feito 65 missões, e no inverno seguinte, ele se destacou após fazer 20 missões de bombardeio no espaço de vários dias, pelas quais recebeu a Ordem da Bandeira Vermelha em 7 de janeiro de 1942. Devido à precisão de seus ataques a bomba, ele foi capaz de destruir dez tanques, cinco canhões antiaéreos, 27 carros e matar mais de 100 soldados de infantaria inimigos. Em 14 de janeiro de 1942 ele foi morto em ação durante uma missão de bombardeio e seu funeral foi realizado em 24 de janeiro. Ele foi indicado ao título de Herói da União Soviética duas vezes, mas devido ao Aardakh, ele não recebeu o título desde que o povo Ingush, incluindo veteranos de guerra, foi coletivamente marcado como traidor e considerado inelegível para o título. Após o colapso da União Soviética, ele foi declarado Herói da Federação Russa em 1995.