В 1943 році Іл-2 масово з'являється і в флотській авіації: 1 липня в Чорноморському флоті було 75 Іл-2, в Балтійському — 61, ще 28 в Північному. В флоті Іл-2 використовувались проти малих суден і конвоїв, зокрема Іл-2 Чорноморського флоту перешкоджали постачанням в Кубань, а в листопаді підтримували десант в ході Керченсько-Ельгинської операції.