২০০০ সালের রাষ্ট্রপতি নির্বাচনে প্রায় ৮০ শতাংশ মুসলিম আমেরিকান ডেমোক্র্যাটিক প্রার্থী আল গোরের চেয়ে রিপাবলিকান প্রার্থী জর্জ ডব্লিউ বুশকে সমর্থন করে। তবে বুশ প্রশাসনের অধীনে আফগানিস্তান ও ইরাক আক্রমণের কারণে, এবং কেউ কেউ যাকে ১১ সেপ্টেম্বরের হামলার পর রিপাবলিকান পার্টির বর্ধিত মুসলিম বিরোধী বক্তব্য বলে অভিহিত করে, আমেরিকান মুসলমানদের মধ্যে রিপাবলিকান পার্টির প্রতি সমর্থন দ্রুত হ্রাস পেয়েছে।