Pelletier zählte zu den frühen Anhängern Napoleons und als dieser 1798 seinen Feldzug nach Ägypten plante, meldete er sich als Freiwilliger. Er nahm an der Belagerung von Akkon (März/Mai 1799) teil und konnte sich in den Kämpfen bei den Pyramiden (21. Juli 1799) und vor Abukir (25. Juli 1799) wiederum durch Tapferkeit auszeichnen. Nach der erfolgreichen Belagerung von Alexandria (August/September 1801) durch britische Truppen, konnte Pelletier wieder nach Frankreich zurückkehren.