С началом Военной операции России в Сирии в сентябре 2015 года, сотрудники Главного управления обеспечивают успешную работу Воздушно-космических сил в ходе данной операции. Президентом России Владимиром Путиным особо отмечена огромная роль военной разведки в «уничтожении главарей бандитов, баз и инфраструктуры боевиков» и в «точечных, разящих ударах нашей авиации и флота».