Bieg na dystansie 5000 metrów mężczyzn był jedną z konkurencji rozgrywanych podczas VIII Mistrzostw Europy w Budapeszcie. Biegi eliminacyjne zostały rozegrane 2 września, a bieg finałowy 4 września 1966 roku. Zwycięzcą tej konkurencji został reprezentant Francji Michel Jazy, który na tych mistrzostwach zdobył również srebrny medal w biegu na 1500 metrów. W rywalizacji wzięło udział trzydziestu dwóch zawodników z dziewiętnastu reprezentacji.