Z młodzieżową reprezentacją Burkina Faso Kouakou Koffi zdobył srebrny medal igrzysk afrykańskich 2015. W pierwszej reprezentacji Burkiny Faso zadebiutował 26 marca 2016 w wygranym 1:0 meczu z Ugandą. Kouakou Koffi został powołany na Puchar Narodów Afryki 2017. Wystąpił w całym zremisowanym 1:1 pierwszym meczu fazy grupowej z Kamerunem. Zagrał także w pozostałych meczach Burkińczyków w turnieju. W półfinale "Ogiery" zremisowały z Egiptem, ale odpadły po serii rzutów karnych. Jedną z „jedenastek” zmarnował Koffi, którego strzał obronił Essam El-Hadary. Ostatecznie Burkina Faso zajęła trzecie miejsce.