Erste internationale Erfahrungen sammelte Sunette Viljoen bei den Weltmeisterschaften 2003 in Paris, bei denen sie mit einer Weite von 56,78 m in der Qualifikation ausschied. Anschließend gewann sie bei den Afrikaspielen in Abuja mit 51,68 m die Bronzemedaille hinter der Tunesierin Aïda Sellam und Lindy Leveau von den Seychellen. Es folgte der Sieg bei den Afro-Asiatischen Spielen in Hyderabad mit 55,49 m. Im Jahr darauf siegte sie mit neuem Meisterschaftsrekord von 60,13 m bei den Afrikameisterschaften in Brazzaville und qualifizierte sich mit nur 20 Jahren erstmals für die Olympischen Spiele in Athen, kam dort aber mit 54,45 m über einen 35. Platz in der Qualifikationsrunde nicht hinaus. 2005 nahm sie an der Sommer-Universiade in Izmir teil und erreichte dort mit einer Weite von 51,09 m Rang zwölf. 2006 siegte sie bei den Commonwealth Games in Melbourne mit neuem Spielerekord von 60,72 m und musste sich bei den Afrikameisterschaften in Bambous mit 55,64 m nur ihrer Landsfrau Justine Robbeson geschlagen geben. Im Jahr darauf gewann sie bei den Afrikaspielen in Algier mit 54,46 m erneut die Bronzemedaill hinter Robbeson und Leveau. Anschließend wurde sie bei den Studentenweltspielen in Bangkok mit 58,39 m Fünfte.