Nach dem Tibetaufstand 1959 wurde Pelden Gyatsho von den chinesischen Behörden verhaftet. Die folgenden 33 Jahre verbrachte er in verschiedenen chinesischen Gefängnissen und Arbeitslagern. Er wurde gezwungen, an Umerziehungskursen teilzunehmen, und wurde dabei gefoltert, was irreversible körperliche Schäden zur Folge hatte. Er folgte jedoch weiterhin dem Dharma.