华中大学筹备迁校事宜时，曾邀请文华图专一同迁校，但沈祖荣拒绝了这一建议，决定携文华图书馆专科学校及文华公书林部分图书一起迁往重庆。由于时间以及运输等原因，仅仅在文华图专保存的文华公书林藏书中选带了两千余册图书、档案运往重庆。1938 年武汉沦陷后，文华公书林未带走的四万余册书刊损失殆尽，馆舍建筑遭到严重破坏。抗战结束后，华中大学和文华图专相继返汉，二者分别建设自己的华中大学图书馆和韦棣华纪念图书馆，均不再沿用文华公书林之名。