Il 2 giugno segna nella semifinale di ritorno della Libertadores contro il Cerro Porteño finita 3-3 e il Santos conquista la finale dopo il successo dell'andata per 1-0. Il 22 giugno segna uno dei gol decisivi per la conquista della Libertadores. Il 28 luglio, dopo aver partecipato con il Brasile alla Copa América, Neymar torna in campo con la maglia del Santos e realizza una doppietta contro il Flamengo (4-5 per i rossoneri il risultato finale), partita valida per il campionato brasiliano: il primo dei suoi due gol vincerà poi il FIFA Puskás Award 2011 come miglior gol dell'anno.