1700年11月1日，卡洛斯二世去世，终年38岁，驗屍報告描述他「全身無一滴血，心臟細如黑胡椒，肺遭腐蝕，腸爛而長壞疽，只有一個睾丸且黑如煤，頭裝滿水」，可見他長期被因近親繁殖而造成的身體缺陷折磨至死。西班牙哈布斯堡王朝终结。法国的安茹公爵腓力即位成为国王费利佩五世，他是延续至今的西班牙波旁王朝的第一位君主。由于奥地利对西班牙王位的要求，以及英国、荷兰在法国对西班牙关系上的不满，爆发了一场欧洲大部分国家和邦国的西班牙王位繼承戰爭。