Bibikov combatté nuovamente contro la Confederazione di Bar (1771–1774), venne promosso al rango di tenente generale nel 1771 e nel 1773 venne assegnato a reprimere la rivolta di Pugačëv. Durante questa campagna Bibikov si ammalò di colera e morì all'età di 44 anni. L'imperatrice Caterina II concesse alla sua famiglia una grande residenza per vivere.