В начале января 1945 года генерал-майор Эрнест Жанович Седулин был направлен в госпиталь по болезни и после выздоровления с февраля вновь командовал 90-м стрелковым корпусом, который принимал участие в ходе Кёнигсбергской наступательной операции. За умелое руководство корпусом в этой операции генерал-майор Э. Ж. Седулин был награждён орденом Суворова 2 степени.