В кампании 1866 года на Фогеля были возложены военные операции против союзных войск. Командуя Майнской армией, он быстро занял королевство Ганновер, принудил ганноверскую армию, после битвы при Лангензальце, сдаться на капитуляцию и двинулся к Фульде. Встретившись с баварцами при Дермбахе и Гюнфельде, Фогель перешёл Рёнские горы и 10 июля одержал победу при Гамельбурге, Киссингене и Вальдашахе, a 16-го занял Франкфурт-на-Майне. Несмотря на эти успехи, главная прусская квартира была недовольна действиями Фогеля, так как часто они не отвечали полученным указаниям и не были достаточно энергичны. Поэтому 19 июля его отозвали из Майнской армии и дали назначение генерал-губернатором в Богемию.