با شروع جنگ تحمیلی در ۳۱ شهریور ۱۳۵۹ که همه دنیا کمر به نابودی ایران و انقلاب نوپای اسلامی ایران بسته بودند، همه مردم با غیرت ایران اسلامی از هر قشر و قومیتی به جبهه ها شتافتند. آیت‌الله طبرسی هم در کنار و همراه مردم بارها و بارها طی مراحل مختلف به جبهه و مناطق درگیر رفتند و گاهی در خطوط مقدم به سازماندهی و سرکشی پرداختند. ایشان مسئول پشتیبانی جنگ استان مازندران بودند و مردم را برای حضور در جبهه‌ها و مبارزه علیه رژیم متجاوز صدام ترغیب می کردند همچنین ایشان نقش بسزایی در تحکیم اراده مبارزان داشتند به طوری که متناوباً با حضور در جبهه به روحیه بخشی و ایجاد انگیزه در میان رزمندگان غیور مازندرانی حاضر در خط مقدم می‌پرداختند.