Frane Matošić, deuxième entraîneur yougoslave de l'équipe, prend la tête de la sélection après que Kristić ait conduit la Tunisie à se qualifier pour les Jeux olympiques. En 1962, l'équipe participe pour la première fois aux éliminatoires de la coupe d'Afrique des nations et se qualifie pour le tournoi : elle y bat le Maroc et le Nigeria puis termine troisième après avoir battu l'Ouganda lors du match pour la troisième place. La Fédération tunisienne de football nomme l'entraîneur français André Gérard pour prendre la tête de l'équipe qui remporte la coupe arabe des nations 1963, son premier titre, après avoir battu la Syrie, la Jordanie, le Liban et le Koweït. La Tunisie se qualifie également pour la CAN 1963 malgré une sortie au premier tour. La Confédération africaine de football décide que la Tunisie accueillerait la CAN 1965, malgré le fait que seulement neuf ans se sont écoulés depuis l'indépendance du pays. Une nouvelle génération de joueurs, notamment Abdelmajid Chetali et Sadok Sassi, atteint la finale après avoir battu l'Éthiopie (4-0) lors du match d'ouverture au stade Chedly-Zouiten, mais s'incline contre le Ghana en prolongation de la finale (2-3).