1792 kam es zur Vertreibung der Nonnen durch die Französische Revolution. Thérèse lebte anfänglich ihr Ordensleben im Verborgenen weiter, wurde jedoch 1794 festgenommen und war für die Guillotine bestimmt, kam aber durch den Tod Robespierres Ende Juli frei. Wieder tauchte sie unter, diesmal im Hinterland von Tarare (Rhône). 1795 stieß sie zu einer Gruppe von ehemaligen Ordensfrauen, die der Priester Jean-François Magdinier (1750–1805) zwecks Einrichtung einer Mädchenschule in seinem Pfarrhaus in Sainte-Agathe-en-Donzy versammelt hatte. Als Folge des Staatsstreichs des 18. Fructidor V waren die Schwestern von Februar bis Mai 1798 in Gefängnissen in Roanne und Montbrison, konnten dann aber nach Sainte-Agathe zurückkehren.