A França, el perill d'un cisma dels hugonots s'acostava. Per derrotar-los, Pius IV va recolzar la lluita del rei de França contra ells en oferir tropes i diners. El pontífex va queixar-se a la reina d'Anglaterra Isabel I per a la discriminació contra els catòlics anglesos. Per contra, va concedir la rosa daurada a Maria Stuart, la reina catòlica d'Escòcia. Ana de Bohèmia i Hongria, muller de Ferran I d'Habsburg, també va rebre la Rosa d'Or. Per defensar els cristians del nord d'Àfrica, va organitzar una expedició militar a Gerba