Quan va ser visitat per Herbert Feigl el 1935, Schlick va expressar la seva consternació pels esdeveniments a Alemanya. El 22 de juny del 1936, quan Schlick pujava les escales de la universitat per a anar a classes, un exalumne, Johann Nelböck, va desenfundar una pistola i li va disparar en el pit. Schlick va morir poc després. Nelböck va ser jutjat i sentenciat però es va convertir en una "cause célèbre" per al creixent sentiment antisemita de la ciutat (el fet que Schlick no fóra jueu va ser passat per alt). Nelböck va ser alliberat sota jurament poc després i es va afiliar al partit nazi austríac després de l'Anschluss.