Han besegrades i kriget mot Sardinien 1859 och mot Preussen 1866. Dessa båda förluster resulterade i 1867 års författningsreform ("Ausgleich"), vilket bland annat innebar att det ungerska kungadömet återupprättades, i union med Österrike. Med 68 år på tronen är Franz Joseph den monark som regerat tredjen längst tid som myndig i världshistorien, efter Bhumibol Adulyadej och Elizabeth II.