Güney Sudan bayrağı 9 Temmuz 2011 tarihinde İkinci Sudan İç Savaşı'nı sona erdiren Kapsamlı Barış Antlaşması'nın imzalanması ile kabul edilmiştir. Bayrak daha önce &lt;a href="Sudan%20Halk%C4%B1n%20%C3%96zg%C3%BCrl%C3%BCk%20Ordusu/Hareketi"&gt;Sudan Halkın Özgürlük Ordusu/Hareketi&lt;/a&gt; tarafından da kullanılmıştır.