После нападения на Всемирный торговый центр 11 сентября 2001 г. секретарь HHS Томми Г. Томпсон попросил Хендерсона взять на себя ответственность за Управление готовности общественного здравоохранения (позднее — Управление помощника секретаря по готовности и реагированию). На эти цели Конгресс выделил 3 миллиарда долларов.