Sepeninggal Marianna pada tahun 1890, surat-surat kabar di Prancis memberitakan bahwa ia telah memeluk agama Kristen sebelum menghembuskan nafas terakhir disaksikan oleh Edgardo. Edgardo menyangkal kebenaran berita ini. "Aku senantiasa mengharapkan ibuku memeluk agama Katolik," tulisnya dalam sepucuk surat kepada harian "Le Temps", "dan sudah berulang kali aku mencoba membujuknya untuk berbuat demikian. Sayangnya, tidak kunjung terlaksana". Setahun kemudian, Padri Pio Edgardo Mortara pulang ke Italia untuk pertama kalinya dalam dua dasawarsa untuk berkhotbah di Modena. Salah seorang saudari dan beberapa orang saudara kandungnya juga datang mendengarkan khotbahnya, dan sampai akhir hayatnya Edgardo selalu mengundang kaum kerabatnya bilamana sedang berada di Italia. Ketika singgah di Roma pada tahun 1919, Edgardo berkunjung ke Wisma Katekumen yang pernah ditinggalinya 61 tahun lampau. Kala itu ia sudah menjadi penghuni tetap biara paguyuban imam reguler di Bouhay, Liège, Belgia. Di Bouhay ada sebuah tempat ziarah untuk menghormati Bunda Maria Perawan Lourdes. Edgardo merasa memiliki ikatan khusus dengan Sang Perawan Lourdes, karena peristiwa penampakan Bunda Maria di Lourdes terjadi pada tahun 1858, yakni tahun ketika Edgardo memeluk agama Kristen. Padri Pio Edgardo Mortara tinggal di Bouhay sampai akhir hayatnya pada tanggal 11 Maret 1940, saat berumur 88 tahun.