Dirigé par Cesare Prandelli à partir mai 2002, Parme s'incline en Supercoupe d'Italie face à la Juventus (2-1), lors d'une finale disputée en Libye au stade du 11 Juin. En 2003, un scandale financier frappe Parmalat et affecte le fonctionnement du club. Le club termine une nouvelle fois cinquième du championnat d'Italie en 2004, mais doit faire face à de graves difficultés économiques. Tout proche de la relégation en 2005, l'équipe ne doit son maintien qu'à une victoire en barrage face à Bologne. Le club change d'identité cette année-là et redevient le "Parma Football Club", son nom originel. Un an après ce maintien, les Parmesans se qualifient pour la Coupe UEFA 2005-2006, à la suite de l'affaire des matches truqués du Calcio et au reclassement du club à la septième place.