Teatterissa tapahtui 13. marraskuuta 2015 terrori-isku, joka kuului laajempaan samaan aikaan tehtyyn terrori-iskujen sarjaan. Iskussa surmattiin noin 100 ihmistä. Teatterissa soitti iskun alkaessa yhdysvaltalainen Eagles of Death Metal -yhtye, joka selviytyi vahingoittumattomana. Hyökkäys Bataclaniin oli pahin Pariisin marraskuun 2015 terrori-iskuista. Kolme aseistettua hyökkääjää iski Bataclanin 1500-paikkaiseen konserttisaliin, joka oli tuona iltana loppuunmyyty. Osa katsojista pääsi pakoon salin sivuovien kautta, ja kymmenet ihmiset onnistuivat kiipeämään turvaan rakennuksen katolle. Osa piiloutui, toiset taas näyttelivät kuollutta, jotta eivät olisi kiinnittäneet terroristien huomiota. Silminnäkijöiden mukaan hyökkääjät karjuivat “Allāhu akbar” (Jumala on suurin) ja syyttivät Hollandea Ranskan sotilaallisesta väliintulosta Syyriassa. Terroristit pitivät Bataclania hallussaan yli kaksi tuntia, ottivat panttivankeja ja tappoivat ihmisiä umpimähkään. Sitten Ranskan turvallisuusjoukot hyökkäsivät rakennukseen. Kaksi hyökkääjistä räjäytti räjähdevyönsä, ja kolmannen hyökkääjän vyö räjähti, kun siihen osui poliisin luoteja.