Axel Lillie wurde 1619 Page von Gustav II. Adolf. Er machte schnell Karriere und wurde innerhalb von vier Jahren vom Leutnant zum Oberst befördert. 1630 kam er nach Deutschland und wurde Kommandant von Spandau. Er nahm an der Belagerung von Würzburg und Mainz teil. Allerdings wurde er bei Mainz in den linken Schenkel geschossen, so dass dieser amputiert werden musste. Er soll ihn in der Kirche von Schweinfurt einmauern lassen haben. Nachdem Gustav II. Adolf bei Lützen gefallen war, befürchtete die schwedische, dass Polen in den Krieg eingreifen werde, so wurde Lillie zur Armee nach Preußen geschickt. Er kehrte aber bald mit Torstensson zurück. 1635 wurde er Generalmajor und 1638 Generalfeldmarschall Baner als Assistenzrat zugeordnet. Als der Generalgouverneur von Schwedisch-Pommern Sten Svantesson Bielke verstarb, wurde er zu dessen Nachfolger ernannt. Dort wurde er dann auch militärisch tätig und besetzte 1639 Demin und fiel 1640 in die Mark ein, wo er Havelberg, Ratenau und das Haveland besetzte. Lillie nahm 1642 an der Schlacht bei Breitenfeld teil und leistete einen wertvollen Beitrag zu Lennart Torstenssons Sieg. Nach der Schlacht wurde er Kommandant von Leipzig und Gouverneur der Markgrafschaft Meißen. Er blieb hier die nächsten Jahre und verhandelte den 1645 Waffenstillstand von Kötzschenbroda und den folgenden Friede von Eilenburg von 1646.