2016年2月，马库斯·埃利斯与克里斯·兰格瑞奇出戰奧地利羽毛球公開賽，在男双决赛以2比0（21-14、21-16）击败了日本的三橋健也/渡邊勇大，赢得冠军。同年4月，他参加法国永河畔拉罗什举办的歐洲羽毛球錦標賽，在男双準决赛以0比2（19-21、14-21）不敌赛会2号种子、丹麦的马德斯·康拉德-彼德森/马德斯·皮勒尔·科尔丁，赢的男子双打季军。同年8月，他与克里斯·兰格瑞奇代表英格兰出戰巴西里約熱內盧舉行的奥林匹克运动会羽毛球比賽男子雙打項目，在小组赛中曾击败了过韩国的金基正/金沙朗，但最终只能以第二出线；在八强中以2比0（21-19、21-17）击退了日本的遠藤大由/早川賢一，后者则在后面的比赛不敌对手，同时在銅牌賽取胜为英格兰赢得了一枚奥运铜牌。