Après des études à l'Athénée royal de Verviers, André Joris entame, en pleine Seconde Guerre mondiale, des études d'Histoire à l'Université de Liège. Il y suit notamment les enseignements de Félix Rousseau et de Fernand Vercauteren, qui orientent son intérêt vers la période médiévale. En 1944, l'Offensive Von Rundstedt, le contraint à quitter Liège et à terminer ses études à l'Université libre de Bruxelles.