Am Morgen des 31. Mai 1916 lief die "Duke of Edinburgh" zusammen mit den anderen Schiffen des 1. Kreuzergeschwaders sowie dem 2. Kreuzergeschwader aus Invergordon aus und bildete etwa 18 Seemeilen vor der britischen Hauptmacht die mit der Aufklärung betraute Vorhut. Dabei verlor die "Black Prince" allerdings den Kontakt zu den übrigen Panzerkreuzern. Die Seeschlacht im Skagerrak sah etwa gegen 15:45 Uhr ihren Beginn in einem Gefecht zwischen britischen und deutschen Schlachtkreuzern. Das 1. Kreuzergeschwader stieß gegen 18:10 Uhr auf Teile der deutschen Schlachtflotte und erlitt schwere Verluste, unter anderem sank das Geschwader-Flaggschiff "Defence" um 18:20 Uhr mit Konteradmiral Arbuthnot und der gesamten Besatzung. Die HMS "Warrior" sank auf dem Rückmarsch nach schweren Beschädigungen und die vom Hauptverband abgekommene "Black Prince" wurde gegen 00:12 Uhr von den deutschen Schlachtschiffen "Thüringen", SMS "Ostfriesland" und SMS "Friedrich der Große" versenkt. Die "Duke of Edinburgh" blieb dagegen als einziges Schiff des 1. Kreuzergeschwaders weitgehend unbeschädigt, sie hatte dem Angriff von Konteradmiral Arbuthnot auf die deutsche Flotte nicht folgen können.