Al-Husseini a aidé la cause de l'Axe au Moyen-Orient en émettant une fatwa de guerre sainte contre la Grande-Bretagne en mai 1941. La proclamation du mufti contre la Grande-Bretagne a été déclarée en Irak, où il a joué un rôle déterminant dans le déclenchement de la guerre anglo-irakienne de 1941. Pendant la guerre, le mufti a demandé à plusieurs reprises au « gouvernement allemand de bombarder Tel-Aviv ».