El 11 de abril de 2002 lidera una gran marcha de la oposición que termina en un enfrentamiento entre civiles y Guardia Nacional y golpe de estado al presidente Chávez. Esa tarde, Ortega se retira de la marcha al ser advertido de la existencia de francotiradores y se refugia en la cede de la CTV, donde se reúne con la periodista Marta Colomina. En la noche se reúne con Pedro Carmona en una entrevista en el canal de televisión Venevisión. Al día siguiente, después de reunirse con Carmona antes de su envestidura presidencial, viaja al estado Falcón a visitar a su madre, por lo cual no se presenta al juramento presidencial. Tras estos de hechos, prosiguió su lucha contra Chávez, secundó el paro petrolero de 2002-2003, promovido por el empresariado aglutinado en el mencionado Fedecámaras. Tras volver a fracasar sus objetivos del paro en presionar para hacer renunciar a Chávez, fue acusado de conspiración, traición, entre otros delitos.