El 24 de abril de 1812, se corrió el rumor de que las fuerzas de la hacienda Tlahuelilpan, venían en auxilio de la ciudad, del saqueo fueron objeto diversas casas, y se obtuvieron cerca de trescientas piezas con valor de mil pesos cada una, cincuenta tejos de oro, más de seiscientos fusiles y otros muchos útiles pertenecientes a la tropa. El 10 de mayo de 1813, el comandante realista, Domingo Claverino, a quien se habían unido las fuerzas de Rafael Casasola, entra en Pachuca, donde no encontró oposición y restablece la normalidad en el trabajo de las minas. El resto de la guerra de Independencia de México, ocurrió con tranquilidad en la ciudad, hasta el 9 de junio de 1821; cuando Nicolás Bravo y Guadalupe Victoria, entran en la ciudad proclamando el Plan de Iguala.