Pendant la Grande guerre turque, à la fin du 17e siècle, la mosquée a été convertie temporairement en église catholique. Un des plus importants écrivains albanais, Pjetër Bogdani, également dirigeant actif de la résistance face aux Ottomans, était enterré à cet endroit. Après la reconquête des Ottomans, en 1690, les ossements de Pjetër Bogdani ont été exhumés et jetés dans les rues par les soldats ottomans.