Bogataj startade i Skid-VM 2005 i Oberstdorf i Tyskland. Där deltog han i alla grenar och blev nummer 40 (normalbacken) och 28 individuellt. I lagtävlingarna blev slovenska laget Primož Peterka, Jure Bogataj, Jernej Damjan och Rok Benkovič nummer 4 i stora backen, 8,9 poäng från prispallen. I lagtävlingen i normalbacken lyckades samma slovenska lag vinna en bronsmedalj, efter Österrike och Tyskland.