Bulgaria utilizó su alianza con la Alemania Nazi para retomar el control del Este de Tracia durante la Segunda Guerra Mundial. Alejandrópolis permaneció bajo control búlgaro desde mayo de 1941 hasta 1944. La ciudad sufrió el destrozo de sus edificios y la pérdida de población durante la guerra pero salió mucho mejor parada de la Guerra Civil Griega. Las fuerzas del ejército comunista eran muy pocas y pobremente organizadas por lo que la mayor parte de las batallas se produjeron fuera de la zona.