Durante la rivolta di Praga avvenuta tra il 5 e l'8 maggio 1945, Moravec tentò di recarsi in una stazione radio sotto il controllo tedesco nella speranza di poter lanciare un appello alla calma. Quando il veicolo su cui viaggiava finì il carburante, Moravec scese dalla vettura e si sparò alla testa con una pistola, presumibilmente per evitare la cattura. Morì proprio il 5 maggio, quattro giorni prima della liberazione di Praga.