Sebbene il numero delle panchine sia alto, Galli sa pazientare in attesa dei momenti propizi. Nel 1990 contribuisce con un minutaggio maggiore alle vittorie del Milan in Coppa Intercontinentale e in Supercoppa UEFA 1990, ma è nel 1994 che Galli si consacra tra i migliori difensori della storia rossonera. Il 18 maggio il Milan è in finale di Champions League contro il favoritissimo Barcellona di Johan Cruijff, ma si appresta ad affrontare l'impegno in piena emergenza per le contemporanee squalifiche dei due centrali difensivi titolari Baresi e Costacurta. L'allenatore Fabio Capello è indeciso su come sistemare la squadra, ma a scanso di equivoci preferisce andare sul sicuro e opta proprio per Galli, al centro della difesa. È una scelta indovinata: il Milan vince la finale battendo gli spagnoli per 4 a 0 e Galli offre un'ottima prestazione, fermando sia il bulgaro Stoičkov che il brasiliano Romário.