Após a revolução iraniana de 1979, Najafi retornou ao Irã e tornou-se um membro do corpo docente da Universidade de Tecnologia de Isfahan em 1979, além disso foi presidente da universidade de 1980 a 1981. Foi membro do corpo docente do departamento de ciências matemáticas da Universidade Sharif de Tecnologia de 1984 até 1988, quando deixou o corpo docente e se mudou para o governo.