Für manche jüdische Israelis rückte die Moschee während der Phase massiver Mordanschläge gegen Israelis, auch gerade in Tel Aviv-Jaffa, (September 2000 bis Februar 2005, so genannte al-ʿAqṣā Intifaḍa) als Symbol der Mörder ins Rampenlicht. Am Freitag Abend, den 1. Juni 2001, mordete ein ausländischer arabischer muslimischer Suizidattentäter 21 meist jugendliche Nachtschwärmer vor der "Dolphi Disko" () im ehemaligen Dolphinarium und verwundete 120 weitere. Es verbreitete sich das Gerücht, der muslimische Mörder habe vor der Tat in der 120 Meter entfernten Hassan-Bek-Moschee Zuspruch gefunden.