Durante la guerra de los ducados de 1864 fue "Kapitänleutnant" y primer oficial de la fragata prusiana . En la batalla naval de Jasmund (Isla de Rügen) el 17 de marzo de 1864, fue herido y condecorado con la Orden del águila Roja. En 1866, Prusia se convirtió en parte de la Confederación Alemana del Norte, la armada se convirtió oficialmente en la de la confederación y Livonius se unió a la nueva institución.