Il 27 marzo 2002 disputerà una partita amichevole contro la Polonia dove segnerà il gol del 2-0 che sancirà la vittoria della nazionale giapponese. Viene convocato per partecipare alla FIFA Confederations Cup 2003 dove il Giappone verrà eliminato nella fase a girone, Takahara giocherà tutte e tre le partite. Il 20 agosto 2003 segnerà una doppietta nella vittoria per 3-0 nell'amichevole contro la Nigeria, mentre il 7 settembre 2005 segnerà un gol in un'amichevole molto combattuta contro l'Honduras vinta per 5-4. Il 30 maggio 2006 metterà a segno una doppietta nell'amichevole che finirà con un prestigioso pareggio contro la Germania.