Авиакомпания регулярно участвует в операциях по оказанию помощи в районах, пострадавших от стихийных бедствий - Индонезия в 2004-2005 годах, Гаити в 2010, Непал в 2015.. Внутри России подобный рейс впервые был осуществлен в 2013 году в Благовещенск, на самолете Авиакон Цитотранс было отправлено оборудование для восстановления жилых домов и социальных объектов, пострадавших от наводнения.