В 1654 году гетман Хмельницкий говорил царю о Феодосии: «Той архимандрит зело потребен есть церкви святой, искусен муж и премудр и на вся дела веры нашей благочестивой благопотребен, и тебе, великому государю нашему, верен и всякого добра прямо желает». В том же году, после начала войны России с Речью Посполитой, кратко высказался за включение Киевской митрополии в состав Московского Патриархата и был автором нескольких челобитных писем царю Алексею Ивановичу. Однако уже в 1655 году Феодосий сменил позицию и высказался за сохранение прежней юрисдикции киевской митрополии. Возмущенный царь потребовал от патриарха московского и всея Руси Никона предать архимандрита анафеме, но тот отказался, объяснив, что не имеет права вмешиваться в чужую юрисдикцию. Несмотря на это, из-за давления российских властей Феодосий Василевич вынужден был отказаться от должности в пользу пророссийского священника Феодосия Сафоновича.