Македонија је учествовала на 16. Светском првенству у атлетици у дворани 2016. одржаном у Портланду (САД) од 17. до 20. марта. Репрезентацију Македоније на њеном петом учествовању на светским првенствима у дворани представљао је један атлетичар који се такмичио у трци на 400 метара.