弗拉奥维奇在國家隊也是常客。他早於1992年入選，共為國家隊上陣51場入15球。1998年世界杯他在對賽德國中上場，取得了一個入球勝出，晉身四強。他在所有克罗地亚球员中，国家队进球数曾排在第二位，仅次于达沃·苏克，这一成绩直到2008年欧洲足球锦标赛才被达里奥·斯尔纳追平。