El desempeño durante el Campeonato del Mundo de 1999 en Nigeria no fue tan bueno. Argentina terminó tercero en el grupo, venciendo a Kazajistán 1-0 en el debut, pero con un partido perdido ante Ghana (1-0) y un empate 0-0 con Croacia. En los octavos de final, Argentina fue derrotada a manos de México por 4-1 y eliminada del torneo.