Начало Мадагаскарской операции — 5 мая 1942 года вновь застигло "Bévéziers" врасплох в процессе пополнения припасов и дозаправки. В течение шести часов субмарина с 2/3 команды на борту пыталась прорваться из гавани в открытое море, однако получила попадание глубинной бомбой с торпедоносца Swordfish авиакрыла "HMS Illustrious" и легла в дрейф. Пережив еще две атаки, в 6:10 субмарина дала течь. Командир приказал команде покинуть тонущее судно. Развернувшись, торпедоносцы вновь атаковали субмарину, в результате чего двое моряков пропало без вести, и еще четверо было ранено, после чего субмарина окончательно затонула в точке с координатами . В следующем году она была поднята силами антигитлеровской коалиции и поставлена в резерв, а в 1946 году разрезана на металл.