Bernaert werd in 1987 voor het eerst Belgisch kampioen op de 800 m. Hij nam dat jaar ook deel aan de wereldkampioenschappen in Rome. Hij sneuvelde in de kwartfinales. In de volgende vijf jaren veroverde hij nog drie Belgische titels. In 1993 werd hij vierde op de wereldindoorkampioenschappen in Toronto. In 2000 veroverde hij ook een Belgische titel op de 1500 m.