Morgan behoorde in 2008 tot de Amerikaanse selectie van het gewonnen WK onder 20. In maart 2010 debuteerde ze in een wedstrijd tegen Mexico in het nationaal elftal. In oktober 2010 maakte de aanvalster tegen China haar eerste interlanddoelpunt. In 2011 nam Morgan deel aan het WK. In de finale werd verloren van Japan. In 2012 won ze goud op de Olympische Spelen van Londen. Morgan scoorde twee keer in de eerste wedstrijd tegen Frankrijk en in de halve finale tegen Canada maakte ze in de verlengingen het winnende doelpunt. In de finale werd met 2–1 gewonnen van Japan. In 2015 werd Morgan met haar land wereldkampioen door in de finale met 5–2 te winnen van Japan, het land waar ze in 2011 de finale van verloren. In 2014 (6–0 winst tegen Costa Rica) en 2018 (2–0 winst tegen Canada) werd de CONCACAF Gold Cup gewonnen. Tevens was ze met vijf doelpunten medeverantwoordelijk voor de grootste overwinning op een WK voor vrouwen ooit, doordat de Verenigde Staten de eerste wedstrijd in de groepsfase van het WK van 2019 met maar liefst 13–0 wonnen van Thailand. De finale van deze editie werd met 2–0 gewonnen van Nederland.