1806年10月14日、イエナ・アウエルシュタットの戦いを指揮していた時、フェルディナントはヘッセンハウゼン（現在のバート・ケーゼン）近郊でフランス元帥ルイ＝ニコラ・ダヴーと交戦、銃弾を浴びて重傷を負った。勝利したナポレオン率いるフランス軍から逃れるためフェルディナントは瀕死の状態で中立国家デンマークの領域に逃れ、11月10日にオッテンゼンにおいて、71歳で亡くなった。ブラウンシュヴァイク＝ヴォルフェンビュッテルは中立を宣言したが、フランスに占領され、翌1807年にはフランスの衛星国ヴェストファーレン王国に取り込まれた。