Miura w reprezentacji zadebiutował w 1999 r. W tym samym roku uczestniczył wraz z drużyną narodową w turnieju Copa America w Paragwaju, gdzie Japonia wystąpiła gościnnie. Już rok później święcił mistrzostwo Azji, wyczyn ten powtórzył w 2004 r. Atsuhiro dwukrotnie uczestniczył także w Pucharze Konfederacji – w 2001 i 2005 r.