V ďalšej etape vojny vytlačili Francúzi ruské sily z Poľska a v niekoľkých prípadoch zamestnali mnohých poľských a nemeckých vojakov v niekoľkých obliehaniach v Sliezsku a Pomoransku, v druhom prípade za pomoci holandských a talianskych vojakov. Napoleon sa potom obrátil na sever, aby čelil zvyšku ruskej armády a pokúsil sa dobyť dočasné pruské hlavné mesto Kaliningrad. Taktická remíza v Eylau (7. - 8. februára 1807), po ktorej nasledovala kapitulácia v Danzigu (24. mája 1807) a bitka pri Heilsbergu (10. júna 1807), prinútila Rusov ustúpiť ďalej na sever. Napoleon jednoznačne spôsobom porazil ruskú armádu vo Friedlande (14. júna 1807), potom musel Alexander uzavrieť s Napoleonom Tylžský mier (7. júla 1807). V Nemecku a Poľsku vznikli nové napoleonské klientské štáty, ako je Vestfálske kráľovstvo, Varšavské vojvodstvo a Danzigská republika.