Etter den tyske invasjonen av Sovjetunionen ble Rostov liggende på frontlinjen fra november 1941 til sommeren 1942. Spielrein, hennes døtre (16 og 29 år gamle) og andre jøder ble drept av Einsatzgruppe D og dumpet i en massegrav utenfor byen, etter at tyske styrker inntok byen for andre gang 27. juli 1942. Koner og barn av hennes brødre overlevde krigen.