Nel caos che seguì il grande terremoto del Kantō del 16 settembre 1923, secondo la scrittrice e attivista Harumi Setouchi, Itō, Ōsugi e il suo nipotino di 6 anni vennero arrestati, percossi a morte e gettati in un mulino abbandonato da uno squadrone della polizia militare guidato dal generale Masahiko Amakasu. Secondo la studiosa di letteratura Patricia Morley, Itō e Ōsugi vennero strangolati nelle loro celle. Noe Itō aveva 28 anni. L'uccisione di due anarchici di così alto profilo e di un bambino piccolo divenne conosciuta come l'incidente di Amakasu e suscitò sorpresa e rabbia in tutto il Giappone. Il regista Kijū Yoshida diresse nel 1969 "Eros Plus Massacre", una pellicola sulla vita di Sakae Ōsugi in cui anche Itō appare spesso.