In zijn eerste seizoen bij Real Madrid wist Isidro geen vaste plaats in het elftal te bemachtigen. De drie daaropvolgende seizoenen groeide hij evenwel uit tot de vaste rechtsback van de ploeg. Isiro werd met zijn club Real Madrid vier jaar achtereenvolgens kampioen (1961-1964) en won in zijn eerste seizoen de dubbel. Na het verlies van de Europacup I-finale tegen Internazionale in 1964 werd Isidro het slachtoffer. Hij kwam niet meer aan spelen toe en vertrok naar CE Sabadell.