Il 18 dicembre 1742 venne promosso a pieno titolo al rango di colonnello del Royal Regiment of Ireland, che venne inviato nel 1744 per proteggere i Paesi Bassi contro l'invasione francese. Ad ogni modo, egli venne richiamato in patria nel novembre del 1745 per schiacciare la Rivolta giacobita del 1745, al termine della quale Mordaunt venne promosso brigadiere generale. Egli fu presente a quella campagna in diversi scontri tra cui la Battaglia di Falkirk. Comandò una delle due divisioni dell'esercito e lasciò Edimburgo al comando del principe Guglielmo Augusto, duca di Cumberland. Egli comandò personalmente la terza linea (riserva) alla Battaglia di Culloden e dopo lo scontro seguì gli Highlanders. Il Duca di Cumberland, in segno di riconoscenza, gli donò la carrozza di Carlo Edoardo Stuart.