Trotz des höheren Status behielt Podol-Pachra bis zur zweiten Hälfte des 19. Jahrhunderts den Charakter einer Straßensiedlung, und nicht jenen einer Kaufmanns- und Manufakturenstadt. Trotzdem führte der neue Status zur Herausbildung von Verwaltungsorganen und einer neuen, gebildeten Schicht. Die Verbreitung von Bildung wurde durch die Gründung der Volksschule gefördert, einem der ersten öffentlichen Gebäude der Stadt, das nach einem Erlass von Katharina II. gebaut wurde. Im Jahre 1796 wurde Podol auf Erlass von Kaiser Paul I. zur kreisfreien Stadt, während die Poststation in den Ort Molodi verlegt wurde. Erst 1801 bekam die Stadt wieder eine Poststation und 1802 wurde sie infolge eines Erlasses von Alexander I. wiederum Sitz eines Ujesd. Während des Vaterländischen Krieges bzw. Napoleons Feldzug nach Russland lagerte die russische Armee von Feldmarschall Kutusow vom 6. bis 7. September 1812 in Podolsk, im heutigen Stadtbezirk Kutusowo. Kurz darauf wurde die Stadt von französischen Truppen eingenommen, wobei sie schwer beschädigt wurde. In Erinnerung an den Sieg im vaterländischen Krieg des Jahres 1812 wurde von 1819 bis 1832 die Dreifaltigkeitskathedrale erbaut, die sich im heutigen Stadtzentrum gegenüber dem Karl-Marx-Kulturpalast befindet.