En du fait de l'absence de mesures d'hygiène et d'aide médicale, les dangers d'épidémie se développèrent. La méthode de lutte des nazis contre cette menace consistait uniquement dans l'extermination des populations. Alfred Filberg, commandant des Einsatzgruppen-9 et principal bourreau du ghetto de Vitebsk signa un arrêté d'extermination étalée de tous les juifs. L'arrêté fut justifié par le danger de développement d'épidémies. Les documents à ce sujet contiennent des données contradictoires à propos des dates de liquidation du ghetto et le nombre des victimes. Dans le rapport des Einsatzgruppen « B » on parle de deux massacres par fusillades en octobre pour victimes et de victimes en décembre. Selon les documents du procès qui s'est tenu à Berlin-ouest en , il est question de trois fusillades en octobre : une de 250 victimes sous la direction de Grayfenberg, une de 750 dirigée par Filbert, et une de 800 dirigée par Shtrouk. Toutes les victimes étant juives. Selon les documents du Ts.G.K. (commission gouvernementale extraordinaire pour l'établissement et la poursuite des crimes des fascistes allemands) Commission extraordinaire de l'État, personnes furent fusillées. Selon d'autres sources encore ou Juifs.