Không chỉ gameshow, truyền hình thực tế, VTV3 còn sản xuất, hợp tác và thực hiện nhiều chương trình lớn và đặc sắc, có ý nghĩa quan trọng, như việc sản xuất tín hiệu, phát sóng các môn thi đấu trong kỳ Đại hội Thể thao Đông Nam Á 2003 mà Việt Nam là chủ nhà. Ngoài ra, bộ phận VTV3 còn tác nghiệp, đưa tin ở các giải đấu lớn (do phòng Thể thao thực hiện), thực hiện sản xuất cuộc thi Hoa hậu Việt Nam cùng Báo Tiền Phong, các chương trình đặc biệt như "Cầu truyền hình Việt - Lào" (2002), "Huyền thoại đường Trường Sơn" (2004) và các chương trình đặc biệt phối hợp cùng các đơn vị trong nước.