Après la révolution de juillet 1830, il est rappelé par Louis-Philippe le 13 mai 1831, qui le nomme commandant en chef de la Brigade française d'occupation en Morée en Grèce. Il succède ainsi au maréchal Maison (1828-1829) et au général Schneider (1829-1831) à la tête de ce corps expéditionnaire qui fut chargé en 1828 de libérer le Péloponnèse des troupes d'occupation turco-égyptiennes d'Ibrahim Pacha lors des dernières années de la guerre d’indépendance grecque. À la tête de cette Brigade de , le général Guéhéneuc a pour mission de maintenir l'ordre dans le pays nouvellement libéré et indépendant, de conserver une influence française dans la région, ainsi que de participer à la reconstruction du pays. Les derniers régiments français quittent définitivement le pays en août 1833, peu après l’arrivée sur le trône de Grèce du roi Othon au mois de janvier 1833. Pour son service, le roi le fera plus tard Grand-commandeur de l' Ordre du Sauveur. À son retour en France, il est remis en disponibilité. Il est cependant nommé lieutenant-général le 22 novembre 1836.