Travis Diener üniversite kariyeri boyunca Marquette üniversitesinde Golden Eagles takımında Steve Novak ve Dwayne Wade ile birlikte 4 sene boyunca oynadı. 2003 yılında takımıyla birlikte NCAA Turnuvasında Final Four oynama başarısı gösterdi. Diener 2005 yılında üniversite kariyerine son noktayı koyup 2005 NBA Seçmeleri'ne katılacağını açıklamıştır.