Butt, der zu Beginn seiner Laufbahn sieben Mal für die englische U-21-Auswahl aufgelaufen war und diese im November 1996 erstmals als Kapitän angeführt hatte, absolvierte am 29. März 1997 sein erstes A-Länderspiel gegen Mexiko. Der erste Auftritt von Beginn an folgte rund ein Jahr später, als er am 11. Februar 1998 im Rahmen seines fünften England-Einsatzes Chile im heimischen Wembley-Stadion mit 0:2 unterlag. Obwohl er sich stetig in die Mannschaft spielte, sorgten eine Hüftverletzung dafür, dass ihn Trainer Glenn Hoddle im englischen Kader für die WM 1998 in Frankreich nicht berücksichtigte. Nach dem Turnier selbst kam Butt dann nur noch sporadisch zum Zuge und Hoddles Nachfolger Kevin Keegan verzichtete auf seine Nominierung für die Europameisterschaft 2000 in Belgien und den Niederlanden – zwischen den beiden Endrunden war Butt zu nur zwei Länderspiele gekommen.