В 1831 году Губарев принял участие в подавлении восстания в Польше. 30 июля 1831 года переведён в лейб-гвардии Павловский полк. 22 апреля 1834 года произведён в подполковники и переведён в Ряжский пехотный полк, однако к полку не прибыл, поскольку получил новое назначение в Образцовый пехотный полк. В 1835 году прикомандирован к лейб-гвардии Измайловскому полку, а 14 декабря 1836 года получил в командование Виленский егерский полк. С этим полком воевал против горцев на Северном Кавказе, прикрывал работы по постройке укреплений Черноморской береговой линии и неоднократно бывал в перестрелках с горцами.