El 15 de marzo de 1870 fue destinado como cirujano al Hospital Militar de Buenos Aires, con nombramiento retroactividad al día 15 de febrero. En ese puesto lo halló la epidemia de fiebre amarilla que asoló la ciudad de Buenos Aires en 1871. Al caer víctima de la enfermedad el doctor Caupolicán Molina, Damianovich quedó al frente del Hospital y por los servicios prestados a la población mereció la medalla de oro acordada por la Municipalidad.