3 сентября 1939 года Великобритания вступила во Вторую мировую войну. На момент начала войны 1-й батальон был в Олдершоте в составе наравне с 1-м батальоном и 2-м батальоном Королевского Норфолкского полка 2-й пехотной дивизии. После мобилизации батальон отправился в составе Британских экспедиционных сил, разместившись в сентябре в , а в мае 1940 года перебазировался в Бельгию во время битвы за Францию. Сдержать натиск вермахта и войск СС британцы не смогли и отступили: 1-й батальон Королевских шотландцев 25 мая занял позиции у Ле-Парадиз около Бетуна, чтобы прикрыть эвакуацию войск из Франции. 27 мая после многочисленных атак 3-й танковой дивизии СС «Тотенкопф» батальон сложил оружие и сдался, однако его постигла печальная судьба, как и 2-й батальон Королевского Норфолкского полка, почти 100 человек которого попали в немецкий плен и тут же были расстреляны без суда и следствия: в 2007 году раскопки в Ле-Парадиз подтвердили, что эсэсовцами были схвачены и расстреляны не менее 21 солдата полка Королевских шотландцев. Те, кто избежал этой участи и успел эвакуироваться, собрались в июне в Брэдфорде и следующие два года несли охранную службу, готовясь отразить возможное вторжение немцев на Британские острова. 1-й батальон вместе со всей 2-й дивизией в апреле 1942 года отправился в Британскую Индию, где обучался ведению боя в джунглях.