Die Friedensverhandlungen zogen sich in die Länge, weil die Kriegspartei weiter einflussreich blieb. Auch hoffte man auf ein Landungsunternehmen der Briten in den Niederlanden. Die Walcheren-Expedition scheiterte jedoch. Daher kam es am 14. Oktober zum Frieden von Schönbrunn. Die Friedensbedingungen waren für Österreich hart. Es verlor Salzburg, Berchtesgaden und das Innviertel an Bayern. Westgalizien kam zum Herzogtum Warschau. Russland bekam ein Gebiet in Ostgalizien. Das Land verlor auch die dalmatinische Küste und Triest, die als illyrische Provinzen an Frankreich gingen. Damit hatte Österreich keinen direkten Zugang mehr zum Meer. Außerdem hatte es erhebliche Kontributionen zu zahlen und musste die Unterstützung für die Aufständischen in Tirol einstellen. Dem Militär wurden Beschränkungen auferlegt; die Armee durfte nur noch 150.000 Mann umfassen.