Несмотря на официальную роль в правительстве ПНА, Хусейни одновременно позволял себе выступать в качестве критика действий палестинского руководства, вместе с Ханан Ашрауи учредив Палестинский информационный центр по правам человека. Он поддерживал идеи конституционной демократии и свободного рынка на территории будущего палестинского государства. В отношении еврейских кварталов в восточной части Иерусалима (официально палестинским руководством расцениваемых как незаконные) и права палестинцев на возвращение его позиции были более гибкими, чем у других палестинских лидеров. Хусейни часто выступал на израильском телевидении, излагая палестинскую точку зрения на спорные вопросы. После начала Интифады Аль-Аксы его позиция стала более жёсткой, и он стал резче выступать против израильских поселений на оккупированных территориях.