После того, как в результате выступления чехословаков советская власть в Сибири была свергнута, 11 июля 1918 года А. В. Эллерц-Усов вступил в должность командующего Иркутским военным округом (официально назначен приказом по военному ведомству Временного сибирского правительства от 31 июля 1918 года) и приступил к формированию воинских частей из жителей Иркутской губернии. Так как объявление призыва входило в компетенцию Временного Сибирского правительства, с формальной точки зрения А. В. Эллерц-Усов превысил свои полномочия, и уже 13 августа иркутский губернский комиссар эсер П. Д. Яковлев донёс о незаконных приказах командующего округом министру внутренних дел Временного Сибирского правительства В. М. Крутовскому. В ответ 23 августа 1918 года временно управляющий Военным министерством генерал М. К. Менде потребовал от иркутского военного прокурора привлечь А. В. Эллерц-Усова к ответственности. А. В. Эллерц-Усов был отстранён от должности, но к этому времени мобилизация уже завершилась, и новый командующий округом не нашёл возможным сразу распустить мобилизованных. Разбирательство дела об объявленной А. В. Эллерц-Усовым самовольной мобилизации было прекращено приказом А. В. Колчака летом 1919 года.