Am 6. Dezember 1921 trat ein Friedensvertrag zwischen Irland und Großbritannien in Kraft, bei dem der Teilung der Insel zugestimmt wurde. Markiewicz stimmte damit nicht überein und verließ die Regierung im Januar 1922 gemeinsam mit Eamon de Valera und anderen. Sie ging für kurze Zeit in die USA, um für die vollständige Unabhängigkeit einzutreten und dafür Geld aufzutreiben. Während des Bürgerkriegs vom Mai 1922 bis Juni 1923 griff sie wieder zu den Waffen. Nach ihrer Wiederwahl in das Parlament 1923 trat sie der Partei Fianna Fáil anlässlich ihrer Gründung im Jahre 1926 bei.