El-Gindy guanyà el Campionat d'Àfrica de 2003 i obtingué una plaça pel Campionat del món de 2004 de la FIDE, on perdé a la primera ronda contra Aleksei Aleksàndrov per 1½-½. Es va classificar per la Copa del Món quatre cops per mitjà dels campionats d'Àfrica. La tercera posició en el desempat el 2007 li va assegurar un lloc a la Copa del Món de 2007 on va estar a punt de guanyar a la primera ronda contra l'excampió del Món de la FIDE i quart eventual-finalista Ruslan Ponomariov, però va perdre el matx després del desempat de ràpides per 2½-1½. La seva quarta posició el 2009 li va valdre la classificació per la Copa del Món de 2009, eliminat a la primera ronda per Ponomariov. El segon lloc el 2011 li va valdre classificar-se per a la Copa del Món de 2011, eliminat a la primera ronda a Zoltán Almási per 2-0.