Вскоре после начала Первой конголезской войны Кенго возглавил антикризисный центр, целью которого была координация борьбы с повстанцами Лорана-Дезире Кабилы. Из-за того, что повстанцы Кабилы были тесно связаны с тутси Руанды и Бурунди, позиции Кенго, чья мать была тутси, сильно пошатнулись. В марте 1997 года он подал в отставку. Мобуту удовлетворил его просьбу в апреле того же года, за месяц до собственного свержения.