Hugo von François verließ Deutsch-Südwestafrika im Jahr 1894, trat 1898 offiziell aus dem Militär aus und kehrte 1901 zu seiner Farm nach Otjihase in Deutsch-Südwestafrika zurück. Beim Ausbruch des Hereroaufstandes im Jahre 1904 floh er am 12. Januar 1904 nach Windhoek und trat der Schutztruppe bei. Als Militärkommandant organisierte er den Widerstand der Stadt und deren Abwehr. Am 13. März 1904 fiel er in einem Gefecht bei der Wasserstelle Ovikokoreroim Kampf gegen die Ovaherero.