Durant cette saison, Baptiste Serin participe au Tournoi des Six Nations des moins de 20 ans lors de l'édition 2013 où il participe aux cinq rencontres, quatre titularisations, et où il inscrit seize points, quatre pénalités et deux transformations. Plus tard, lors de la même année, il dispute le championnat du monde de cette catégorie d'âge, cette sixième édition se déroulant en France. Il dispute cinq rencontres, inscrivant un essai contre les "", lors du premier tour. Toutefois, avec deux défaites, contre ces derniers et les futurs champion du monde anglais, la France est éliminée de la course au titre, terminant finalement cinquième après des victoires face à l'Irlande et l'Argentine. Sur cette compétition, il est titulaire à deux reprises et inscrit .