В районе Капувара найдены следы поселений иллирийцев, римлян и аваров. После прихода венгров Капувар стал западными воротами Королевства Венгрия. Название места связано с терминами «ворота» и «замок» ("vár"). Первое письменное упоминание датировано 1162 годом. Король Сигизмунд в 1387 году пожаловал это местечко роду Канисаи в благодарность за поддержку. В 1532 году Капувар перешёл к роду Надашди. В 1558 году посёлок получил право рыночной торговли, крепость была усилена из-за турецкой угрозы. Но несмотря на это, в 1594 году крепость ненадолго была захвачена Османской империей.