Şamahı Uyezd Transkafkasya bölgesinin yönetim kurumları" kanununa göre 10 Nisan 1840 tarihinde Şirvan eyaleti ve Salyan toprakları temel alınarak kuruldu. Bölge 1841-1846 yılları arasında Hazar bölgesinin bir parçasıydı. 1846 tarihinde yeni kurulan Shamakhi Valiliğine aynı adla katıldı. 1858 Şamahı depreminde Şamahı şehri ve Şamahı Uzeyd büyük hasar gördüğü için Şamahı Valiliğinin merkezi Şamahı şehrinden Bakü şehrine taşındı. Bundan sonra Şamahı Valiliğinin adı da Baku Valiliği olarak değiştirildi. Şamahı Rus Çarlığının yıkılışından sonra kısa bir süre Transkafkasya Demokratik Federatif Cumhuriyetinin bir parçası oldu. Azerbaycan Demokratik Cumhuriyeti bağımsızlığını ilan ettikten sonra Temmuz 1918'de Kafkas İslam Ordusu ve Azerbaycan kuvvetleri Şamahı'yı Bolşeviklerden kurtardı. 1920'de Kızıl Ordu'nun Azerbaycan'a müdahalesi sonucunda Azerbaycan Demokratik Cumhuriyeti sona erdi. Şamahı uyezd, 1929'da feshedilinceye kadar Azerbaycan Sovyet Sosyalist Cumhuriyeti'nin bir parçası oldu.