1071年以降、ヘルムス渓谷はセルジューク朝の侵入に苦しむようになったが、1118年にはフィロカレス将軍の活躍によりこの地域は取り戻され、コムネノス王朝による東ローマの中興とルーム・セルジューク朝の衰退によって、サルディスは東ローマ領に留まった。1204年、第4回十字軍がコンスタンティノポリスを陥落させ、サルディスはニカイア帝国の支配下に入った。1261年、ニカイア帝国がコンスタンティノポリスを奪回すると小アジア全体への支配がおろそかとなり、結局それらはムスリムの戦士集団であるガーズィー（）のアミールたちに奪われ、1306年に結ばれた条約でカイステル川（クチュク・メンデレス川）の渓谷とサルディスの砦は彼らに引き渡された。サルディスは、1402年にティムールの軍勢によって占領（そしておそらく破壊）されるまで、衰退しながらも存続した。