Во второй половине июля 1944 года армия была передислоцирована в район юго-западнее города Новогрудок. В ходе Белостокской операции, наряду с другими армиями, 49-я армия прорвала оборону противника на рубеже Гродно — Свислочь. 24 июля освободила польский город Соколка и к исходу 27 июля вышла в район севернее и западнее этого города. К 20 августа армия вышла на рубеж Церковщина — Зимцы. Возобновив 28 августа наступление, армия преодолела леса южнее Ельни, форсировала реки Десна и Сож, 28 сентября освободила Мстиславль. К 15 сентября армия вышла к реке Нарев в районе города Ломжа, где перешла к обороне.