В сборной Габона Мубамба дебютировал в 1998 году. В 1999 году выиграл с командой Кубок УНИФФАК. В 2000 году он был запасным в сборной на Кубке африканских наций 2000 года и сыграл одну игру против ДР Конго (0:0). На Кубке африканских наций 2010 он сыграл одну игру группового этапа против Камеруна (1:0). Он также попал в заявку сборной Габона на домашний Кубок африканских наций 2012, где сыграл три матча против сборных Нигера, Марокко и Мали. За сборную в общей сложности провёл 86 матчей и забил три мяча, участвовал в розыгрышах Кубка КЕМАК 2003, 2005 и 2007.