Después del establecimiento del Estado Eslovaco (1939) que tenía alrededor de 65.000 húngaros étnicos, el partido (bajo el nombre de "Szlovenskói Magyar Párt", Partido Húngaro de Eslovaquia) permaneció como uno de los pocos partidos políticos permitidos (los otros eran el Partido Popular Eslovaco de Hlinka y el "Deutsche Partei" de los alemanes étnicos). en Eslovaquia). Durante el Insurrección nacional eslovaca (1944), el partido fue prohibido en el área controlada por los insurgentes. La prohibición se volvió a confirmar después del final de la Segunda Guerra Mundial.