Là người con gái út trong bốn người con của bà Trần Lệ Xuân và Ngô Đình Nhu – em trai và cố vấn cho Tổng thống Việt Nam Ngô Đình Diệm. Vào năm 1963, chế độ Ngô Đình Diệm bị sụp đổ – trong đó cả hai người gồm cha của bà là Ngô Đình Nhu và bác Ngô Đình Diệm đã bị ám sát, Lệ Quyên bị buộc phải rời khỏi quê hương cùng gia đình của mình và cuối cùng xin tị nạn Rome.