Até a Proclamação da República, Henrique realizou tarefas comuns no observatório. Em 1888, acompanhado de Julião de Oliveira Lacaille, determinou as posições geográficas das estações meteorológicas da Estrada de Ferro Pedro II, a atual Central do Brasil. Ao mesmo tempo que atuava como engenheiro cartográfico, Henrique trabalhava na redação de um texto, o “Esboço de Climatologia do Brasil”, que fez parte do volume que o Brasil preparou para a Exposição Universal em Paris, em 1889, em comemoração do centenário da Revolução Francesa.