同年6月袁世凱去世，段祺瑞勢力大增。段祺瑞罷免了馮玉祥的旅長職務，任命其部下第1團團長楊桂堂繼任旅長。此後，鹿鍾麟歷任軍械官、砲兵營長等職。1917年（民国6年）7月張勳挾天子以令諸侯，擁立前清皇帝溥儀，實行復辟，第16混成旅的鹿钟麟、邱斌、张之江、李鸣钟等要求旅长杨桂堂出兵讨伐張勳，杨桂堂反而到北京拜谒張勳。鹿钟麟等遂推舉薛笃弼迎请冯玉祥回該旅。冯玉祥到廊坊后率該旅全体官兵通电讨伐張勳。