Genádio permaneceu na África como mestre dos soldados por um longo tempo (até o início da década de 590) e foi ele quem se tornou o primeiro exarca da África quando o imperador fundou o exarcado no final da década de 580, unindo as autoridades civil e militar em suas mãos. O exarcado se estendia por todo o norte da África, pelas possessões imperiais na Espanha, as ilhas Baleares, Sardenha e Córsega. Ele prosperou enormemente e, sob Heráclio , as forças africanas conseguiram derrubar o tirano Focas em 610. O exarcado era praticamente uma entidade autônoma a partir de 640 e sobreviveu até a queda de Cartago para os omíadas em 698.