Вспышка вооружённых конфликтов на территории бывшей Югославии привела к прекращению деятельности факультета в апреле 1992 года. После начала в 1992 году гражданской войны на территории Боснии и Герцеговины решение Народной скупщины Республики Сербской об отделении высших учебных заведений от центра в Сараево создало правовую основу для организации высших учебных заведений в Республике Сербской; решение вступило в силу 10 ноября 1992 года. После вступления в силу Закона «О высшем образовании Республики Сербской», принятого Народной скупщиной, решение от 10 ноября 1992 года было отменено.