Дуглас Фримен писал, что 12 месяцев, которые Роберт Эдвард Ли провёл при штабе Скотта, стали самыми ценными в его карьере военного. Извлечённый из них опыт он потом постоянно применял в годы Гражданской войны. Во время кампании Ли близко познакомился с армией во всех её состояниях, кроме отступления, но так как Скотт мало использовал кавалерию, то Ли не оценил её пользы и тоже слабо использовал её в кампаниях 1862 года. Как офицер штаба, Ли присутствовал при всех совещаниях Скотта и при обсуждении всех стратегических решений. Фримен выделяет семь основных уроков, которые Ли вынес из этой кампании и которые повлияли на его стратегию в годы Гражданской войны: 1) наблюдая, как небольшая, но профессиональная армия сражается с большой, но плохо обученной, он научился уверенности и решительности в планировании операций; 2) наблюдая за Скоттом, Ли пришёл к мнению, что задача главнокомандующего — разработать план сражения, привести войска на позицию, но не командовать войсками на поле боя; 3) Скотт очень тщательно разрабатывал свои планы и полагался на профессиональных штабистов, и Ли точно так же привык рассчитывать на грамотных штабных офицеров, каковых у него впоследствии не оказалось; 4) Ли оценил ценность тщательной разведки и хорошего знания поля боя, и разведка стала его «второй натурой»; 5) Ли оценил важность фланговых манёвров, Второй Манассас был подражанием Серро-Гордо, а фланговый марш при Контрерас стал прообразом флангового марша в сражении при Чанселорсвилле; 6) Ли убедился в возможности наступления без коммуникаций и точно так же действовал во время Мэрилендской и Геттисбергской кампаний; 7) Ли оценил пользу укреплений: на полях сражений он мог наблюдать укрепления, построенные мексиканскими инженерами, обычно довольно профессиональными, и заключить, что они могли бы быть серьёзным препятствием, если бы их должным образом обороняли.