1999 року Матурана очолив збірну Коста-Рика, проте пропрацювавши лише кілька місяців, змінив місце роботи, ставши тренером збірної Перу, з якою став півфіналістом розіграшу Золотого кубка КОНКАКАФ 2000 року у США. Але незабаром покинув перуанців, аби втретє очолити рідну збірну Колумбії перед домашнім розіграшем Кубка Америки 2001 року, в якому Матурана привів Колумбію до першого континентального чемпіонства в історії країни. Щоправда, один з континентальних грандів Аргентина відмовилася тоді від участі в змаганнях, а іншого, Бразилію, сенсаційно здолав на стадії 1/4 фіналу Гондурас. Тому у вирішальному поєдинку за титул Колумбія зіграла з «запрошеною» збірною Мексикою, яку господарі обіграли 1:0.