Algunos de los MacShane supervivientes recibieron considerables extensiones de tierra tras la fuga de los condes. Esto dispersó al clan por la provincia y debilitó su influencia. Brian, hijo de Hugh, Jefe del McShane O'Neill dirigió al clan en el 1642 durante la rebelión de 1641 y las guerras confederadas, y luchó contra Oliver Cromwell en el período de la muerte de su primo Owen Roe O'Neill en 1649 y hasta la victoria de Cromwell en 1653. Dos décadas más tarde, su hijo, Brian Og dirigió al clan en apoyo de Jacobo II. Después de la derrota de las fuerzas Jacobitas, la familia fue "attainted" como rebeldes irlandeses en 1693, y Brian Og se exilió a Francia con Jaime II. Su heredero, Owen McHugh O'Neill, abandonó el apellido O'Neill nombre, y tomó sólo McShane como se establecía en lasLeyes Penales irlandesas, en un intento de conservar las propiedades de su padre.