В 1999 году он впервые выступал на Кубке Америки в Парагвае. В матче против сборной Колумбии Педро забил два гола. В 2000 году Рейес принял участие в Олимпийских играх в Сиднее и помог национальной команде завоевать бронзовые медали. В 2001 году он второй раз принял участие в розыгрыше Кубка Америки. На турнире он сыграл в матчах против сборных Эквадора, Венесуэлы, Колумбии и Мексики.