Nel 1092 la città venne strappata agli arabi da El Cid e nel 1238, ritornò nell'alveo della cristianità ad opera di Giacomo I d'Aragona. Nel Settecento e nell'Ottocento subì devastazioni durante la guerra di successione, la guerra d'indipendenza e le guerre carliste. Il XX secolo ha visto l'impulso offerto a Sagunto dall'industria pesante prima e poi dall'industria dei tessuti, rendendo la città un centro economico rilevante dell'area di Valencia.