Sia la "Hiyo" che la "Junyo" vennero danneggiate da un siluro nel 1943, trascorsero circa tre successivi mesi in riparazione. Sfruttarono il tempo a disposizione, addestrando e trasportando gli aeri prima di ritornare nel campo di battaglia. La Hiyo venne affondata da un'esplosione causata da un siluro americano durante la Battaglia del Mare delle Filippine del 1944, mentre la Junyo nonostante subì diverse bombe, continuò a resistere. A causa del numero insufficiente di aeroplani, venne utilizzata come mezzo di trasporto verso la fine del 1944, subì inoltre un duro colpo da un siluro nel Dicembre dello stesso anno. Durante il corso della guerra, la nave rimase ferma a causa delle sue innumerevoli danni strutturali. Dopo la resa da parte del Giappone, gli americani ritennero che la nave non valesse tutti quei costi per la riparazione, di fatto venne smantellata nel 1946–1947.