Po rozpoczęciu się kampanii wrześniowej przedstawiciele władz polskich w Gdańsku oferowali Cieszyńskiemu sposób bezpiecznej ucieczki wraz z rodziną, jednak nie skorzystał z tej propozycji. Został aresztowany w pierwszych dniach okupacji. W ramach akcji wymierzonej przeciwko polskiej inteligencji został razem z innymi Polakami wywieziony do Piaśnicy i rozstrzelany dnia 17 listopada 1939 r. Jego grób symboliczny znajduje się na cmentarzu katolickim w Sopocie (kwatera D4-9-6).