A Universidade de Washington esperava abrir a temporada de 2016-17 com Dejounte Murray e Marquese Chriss; no entanto, ambos os calouros foram selecionados na primeira rodada do Draft da NBA de 2016. Fultz disse sobre o cenário previsto se eles tivessem ficado: "Acho que seríamos o número 1 no país. Teríamos ido ao Torneio da NCAA e vencido". Sem nenhum talento comprovado, Fultz assumiu como líder da equipe e artilheiro principal. Como armador titular, ele estreou em uma derrota por 98-90 em casa para Yale, no qual ele marcou 30 pontos.