Le , profitant de la négociation du consul de Suède Raoul Nordling avec le général von Choltitz, elle entre avec Raoul Nordling au camp de Drancy et signifie à son commandant, qui n'est autre qu'Alois Brunner, qu'elle le remplace à la tête du camp. Le capitaine SS, conscient de la tournure catastrophique des événements, en profite pour disparaître dans la nature. Du jeudi 17 au dimanche 19 août, alors que Paris n'est pas encore libérée (elle le sera le 25 août), Annette Monod organise la sortie des internés, remettant à chaque interné le minimum vital : des cartes d'alimentation et des papiers. Elle est secondée dans ce travail par une équipe de volontaires, par les chefs d'escalier et par les gendarmes. Elle emporte ensuite les archives subsistantes du camp jusqu'au siège de la Croix-Rouge, rue Vavin, traversant un Paris en pleins combats de la libération.