In 2020 werd het seinzoen drastisch op zijn kop gezet door het COVID-19 virus, waardoor er vanwege strenge maatregelen diverse races werden afgelast en het kampioenschap flink werd ingekort en aangepast. Op 20 september 2020 won Van der Mark de Superpole Race op het circuit van Barcelona-Catalonië. In de eindstand van het algemeen klassement werd Van der Mark 5e met 1 overwinning en 8 podiumplaatsen. Ook werd vroegtijdig bekend dat Van der Mark in 2021 niet meer voor Yamaha uit zal komen maar voor het "BMW Motorrad WSBK Team".