Efter stadsbranden i Umeå 1888 anställdes han som stadsarkitekt för att leda återuppbyggnaden av staden. I den nye stadsarkitektens uppgifter ingick att upprätta förslag till stadsplan och att granska ritningar. Vidare hörde till uppdraget att gestalta stadens offentliga byggnader. Arbetsbördan blev för stor för Lindström och efter några år flyttade han med familjen tillbaka till Stockholm.