En juin, les Prussiens décident d'apporter un soutien effectif aux Russes. Le , Kościuszko est attaqué par les forces coalisées à Szczekociny, où il est battu, ce qui entraîne la chute de Cracovie. Ayant réussi à se replier à Varsovie, il défend la ville pendant plusieurs semaines. Le siège est levé le , lorsque les forces prussiennes se retirent afin de réprimer un .