El tema de Cefalonia aparece frecuentemente mencionado en contexto bélico en los siglos IX-XI. En 809, el "strategos" Pablo derrotó una flota veneciana frente a Dalmacia. En 880, el almirante Nasar derrotó en una batalla estratégica a una flota pirata árabe que saqueaba las islas del tema. Las tropas de Cefalonia posteriormente participaron en la ofensiva bizantina en Italia. Los mardaítas de Cefalonia son mencionados en la expedición fallida de 949 contra el Emirato de Creta. La última mención de un "strategos" de Cefalonia data de 1011, cuándo Kontoleon Tornikios fue enviado a Italia a suprimir una revuelta lombarda. Tras el derrumbe bizantino en Italia a mediados del siglo XI, el tema perdió importancia y quedó al mando de gobernadore civiles bajo el título de "krites" ("jueces").