第二段作戦から北方に転戦し、北方部隊（指揮官は第五艦隊司令長官細萱戊子郎中将）の指揮下でアリューシャン列島の作戦に従事した（アリューシャン方面の戦い、アッツ島増援作戦、アッツ島沖海戦など）。ただしミッドウェー作戦時の第27駆逐隊と第24駆逐隊は、連合艦隊旗艦大和を基幹とする主力部隊に所属していた。また一水戦所属だった第17駆逐隊が新編の第十戦隊へ転出し、一方で第十戦隊の第7駆逐隊（潮、漣、曙）が北方部隊に編入されてアリューシャン作戦に参加した。大規模な水上戦闘はアッツ島沖海戦が生起したのみで、北方部隊麾下の駆逐艦は空襲や敵潜水艦により損耗した。