Andretti maakte zijn debuut in de Formule 1 in 1993 bij McLaren, naast Ayrton Senna. Zijn doortocht in Europa was echter geen succes. Hij kreeg de technisch complexe Formule 1-wagen nooit onder de knie. Zaken als tractiecontrole en actieve ophanging werden in de CART niet gebruikt. Verder bleef hij pendelen tussen de Verenigde Staten en Europa, wat ook bijdroeg aan het gebrek aan succes dat Andretti in de Formule 1 behaalde. Hij reed driemaal in de punten, met als hoogtepunt een derde plaats in de Grand Prix van Italië, maar het contract met het team werd na onderling overleg wel ontbonden.