Kaudella 2006–2007 Kofler sijoittui Keski-Euroopan mäkiviikon yhteistuloksissa 12:nneksi. Sapporon MM-kilpailuissa hän voitti kultaa joukkuemäessä sekä sijoittui normaalimäessä kuudenneksi ja suurmäessä kahdeksanneksi ollen molemmissa toiseksi paras itävaltalainen.