Afin d'échapper à l'invasion, le gouvernement du Kuomintang déménage alors à Wuhan, avant de s'installer à Chongqing, au moment de la bataille de Wuhan. À la suite de la chute de Nankin, un massacre de grande ampleur mené par l'envahisseur nippon a lieu en décembre dans la capitale. Les estimations, sujettes à de houleuses controverses négationnistes, varient en fonction des sources. Le tribunal de Nankin estime que périrent alors que selon d'autres sources, comme le tribunal de Tokyo, le nombre se situe autour de .