С 2010 года имеет статус национального исследовательского университета. В 2015 году вуз вошел в число университетов России, отобранных для участия в Проекте 5-100, целью которого является улучшение конкурентной позиции российских университетов. ЮУрГУ включает в себя 10 институтов и высших школ, 2 факультета (предвузовской подготовки и военного обучения), а также 4 филиала (Златоуст, Миасс, Сатка — в Челябинской области, Нижневартовск — в ХМАО).