"Fusō" menjabat sebagai kapal bendera oleh Laksamana Madya Sukeuji Hosoya, Divisi ketujuh, Squadron ketiga, selama perang Russo-Jepang dan direncakan untuk disiapkan di selatan Pulau Tsushima selama Pertempuran Tsushima bila pertempuran mengarah dijalan yang dilayarinya. Pada tanggal 7 September 1904, meriam 15-centimeter miliknya dicopot penggunaannya di Pengepungan Pangkalan Arthur. Mereka menggantinya dengan meriam-meriam yang dikirim dari kapal yang rusak pada Maizuru Naval Arsenal ditanggal 28 Desember. Dia dikasifikasi ulang sebagai kapal pertahanan pesisir dibulan Desember 1905, dan coret pada tanggal 1 April 1908. Degradasi dari statusnya sebagai "kapal teladan", dia ditempatkan ke Pemilik pelabuhan Yokosuka sampai dia diperintahkan untuk dijual tanggal 15 Februari 1909. Yokosuka melaporkan penjualan dirinya tanggal 30 November, tetapi tidak membuktikan informasi dari tanggal penjualan atau nama dari pemenang lelangnya.