W reprezentacji Australii Hooker zadebiutował 9 września 1990 roku w przegranym 0:1 towarzyskim pojedynku z Koreą Południową. W 1996 roku znalazł się w drużynie na Puchar Narodów Oceanii. 1 listopada 1996 roku w wygranym 5:0 meczu tego turnieju z Tahiti strzelił pierwszego gola w kadrze narodowej. Australia została triumfatorem tamtego turnieju.