В последующих боях Федотов вновь отличился в Житомирско-Бердичевской, Корсунь-Шевченковской, Ровно-Луцкой, Проскуровско-Черновицкой, Львовско-Сандомирской операциях. В конце сентября 1944 года его полк вёл тяжелые наступательные бои в ходе Восточно-Карпатской операции, выбивая противника с одного рубежа за другим. В бою 30 сентября на подходе к чехословацкой границе полковник В. Н. Федотов был тяжело ранен. На фронт больше не вернулся, пролечившись в госпиталях до весны 1945 года.