Uusi lääketieteellinen yliopisto perustettiin vuonna 1990 (aluksi Homelin lääketieteellinen instituutti), koska maan kaakkoisosassa oli läheisen, edellisvuoden Tšernobylin ydinvoimalaonnettomuuden seurauksena kasvanut tarve lääketieteelliseen tutkimustiedon keräämiseksi ja alan ammattilaisien kouluttamiseksi. Vuonna 2000 avattiin kansainvälisten opiskelijoiden osasto.