Представитель польского шляхетского рода Бегановских герба «Гржимала». Сын хорунжего калишского Станислава Бегановского. Участник войн Речи Посполитой против Швеции (1625—1629), крымских татар и украинских казаков. В 1630 году он участвовал в подавлении казацко-крестьянского восстания на Украине под руководством гетмана Тараса Трясило. В 1633 году Н. Бегановский принимал участие в битве с татарами под Каменецем в Подолии. В 1637 году участвовал в битве против восставших казаков под Кумейками. В следующем 1638 году Николай Бегановский принимал участие в подавлении казацко-крестьянского восстания под руководством Якова Острянина и Дмитрия Гуни. В битве с казаками под Голтвой он носил звание обозного и командовал полком немецкой пехоты.