Tanto el castillo como la villa cayeron en manos de los musulmanes (que nuevamente lo destruyeron durante la retirada, de esta forma, Zayyan, trataba de evitar que Jaime I de Aragón pudiera utilizarlo para conquistar Valencia), hasta que en el año 1237, las tropas de Jaime I de Aragón dominaron la población, llamándola El Puig de la Cebolla. Inmediatamente se volvió a reconstruir el castillo, al tiempo que el monarca conquistador, fundaba el monasterio mercedario que tanta relevancia tuvo en la historia valenciana y que sirvió de punto de partida para el crecimiento de la población. Por este motivo, el nombre de la población, cambia nuevamente, pasando a ser El Puig de Santa María. En 1240 el rey cedió parte de los territorios a Arnau de Cardona (uno de los caballeros que más se distinguieron en la conquista junto a Berenguer de Entenza). En 1349, tanto la población como el castillo, fueron donados por Pedro IV de Aragón, el Ceremonioso a Jérica, Finalmente, en 1365 Pedro IV de Aragón mandó destruirlo, dentro de los conflictos de la llamada Guerra castellano-aragonesa de 1356-1369, contra Pedro I de Castilla.