Κατά τη διάρκεια της Τευτονικής κυριαρχίας, η περιοχή γνώρισε μια διαδικασία αστικοποίησης και οικονομικής ώθησης λόγω της επέκτασης της Χανσεατικής Ένωσης στην περιοχή. Το Τάγμα αργότερα επιτέθηκε στην πρώην σύμμαχό του, Βασίλειο της Πολωνίας και κατέκτησε την περιοχή της Πομερέλιας και εισήλθε έτσι σε μια μακροχρόνια σύγκρουση με την Πολωνία, η οποία στη συνέχεια μπήκε σε συμμαχία με το Μεγάλο Δουκάτο της Λιθουανίας. Στη Μαζουρία, οι Πολωνοί και οι Λιθουανοί νίκησαν το Τάγμα στη Μάχη του Γκρούνβαλντ. Οι πόλεμοι οδήγησαν τελικά σε εξέγερση του αστικού πληθυσμού των Πομερέλιας και της Βαρμίας, οι οποίοι επηρεάστηκαν από τους πολλούς πολέμους των Τευτώνων. Μετά από αίτημά τους, η περιοχή ενσωματώθηκε στην Πολωνία από τον βασιλιά Καζίμιρ Δ΄ της Πολωνίας και μετά τον Δεκατριετή Πόλεμο παρέμεινε υπό πολωνική κυριαρχία, αλλά χωρίστηκε σε δύο μέρη: το Έλμπλονγκ και το Πριγκιπικό Επισκοπάτο της Βαρμίας ενσωματώθηκαν απευθείας στο Βασίλειο της Πολωνίας και η Μαζουρία έγινε πολωνικό φέουδο υπό τον έλεγχο του Τευτονικού Τάγματος.