Op 2 november nam Lally-Tollendal ontslag uit de constituante, onder opgave van gezondheidsredenen maar later verwijzend naar de Mars op Versailles. Hij emigreerde het volgende jaar naar Lausanne, en keerde in 1792 terug naar Frankrijk. Op 10 augustus, dag van de bestorming van de Tuilerieën, werd hij gearresteerd tijdens een vergeefse poging om de koninklijke familie te evacueren. Opgesloten in de Prison de l'Abbaye, kwam hij kort voor de Septembermoorden miraculeus vrij. Hij ontkwam naar Engeland, van waaruit hij de Nationale Conventie aanschreef met de vraag te mogen deelnemen aan de verdediging van Lodewijk XVI in diens proces voor hoogverraad. Hij werd niet in het land toegelaten.