Convocato per la Confederations Cup 2013, nella prima gara contro il del 16 giugno 2013, giocatasi al Maracanã, ha raggiunto le 100 presenze in nazionale e ha realizzato su punizione il gol del temporaneo 1-0; la partita è poi terminata col punteggio di 2-1 per l'Italia. A causa di una contrattura, Pirlo è costretto a saltare la partita finale del girone contro il . È tornato in campo nella semifinale con la , persa ai tiri di rigore.