31 августа 1903 года острова Чагос, выйдя из состава колонии Сейшельские острова, вошли в состав колонии Маврикий. В феврале 1942 года Великобритания ввела на остров Диего-Гарсия войска, которые дислоцировались там вплоть до сентября 1945 года. 8 ноября 1965 года острова, ранее входившие в состав колоний Сейшельские острова и Маврикий, образовали Британскую Территорию в Индийском Океане. 17 июля 1966 года началась продолжавшаяся до 1973 года эвакуация местного населения (потомков африканских рабов и индийцев, работавших на плантациях) по выбору — на Сейшельские острова или Маврикий, бо́льшая часть островитян предпочла последний. Незначительная их часть эмигрировала в Великобританию. 30 декабря 1966 года, согласно лизинговому соглашению между Великобританией и США, на острове Диего-Гарсия была основана база. 3 апреля 1967 года все плантации на островах были приобретены Великобританией. 24 марта 1971 года американские моряки начали постройку на Диего-Гарсии станции радиосвязи, которая была закончена к 20 марта 1973 года. 29 июня 1976 года острова Альдабра, Фаркуар и Дерош вошли в состав получившего независимость государства Сейшельские острова. 1 октября 1977 года на Диего-Гарсии открылась база МТО ВМС США. Увеличение числа военных сооружений в конце 1970-х — 1980-х годах было воспринято враждебно соседними государствами, которые считали базу демилитаризованной зоной Индийского океана. Во время войны в Персидском заливе 1990—1991 годов, вторжения США в Афганистан в 2001 году и начального этапа войны в Ираке (2003 год) с Диего-Гарсии было совершено несколько вылетов.