Chevalier-Bouchet gab zu einem späteren Zeitpunkt an, sie sei nach der Olympiateilnahme so motiviert gewesen, ihre Leistung zu steigern, dass sie zu schnell ins Training eingestiegen sei und „zu hart trainiert“ habe. Die dadurch im Sommer 2014 entstandenen Rückenprobleme führten dazu, dass sie – trotz eines Weltcupsieges mit der Mixed-Staffel um Martin Fourcade als Schlussläufer beim Auftakt in Östersund – die Saison frühzeitig für mehrere Wochen unterbrach, um ihren Körper zu schonen. Sie verlor dadurch ihren Platz im Weltcupteam und trat 2015 wieder im IBU-Cup an, wo sie mehrere Top-Ten-Ergebnisse erzielte. Nach einem zweiten Rang im Sprint von Ridnaun berücksichtigten sie die Trainer ab Dezember 2015 wieder für die höchste Wettkampfserie. Bei ihrem Comebackrennen im Sprint von Pokljuka (bei dem ihre Schwester Chloé ihr Weltcupdebüt gab) wurde Chevalier-Bouchet 35., im weiteren Saisonverlauf erreichte sie mehrmals die vorderen 20 Ränge im Einzel und wurde wieder zur Stammläuferin in der Staffel. Zusammen mit Justine Braisaz, Bescond und Dorin-Habert gewann sie die Silbermedaille bei den Weltmeisterschaften von Oslo.