סבסטיאן באייר (בגרמנית: Sebastian Bayer; נולד ב-11 ביוני 1986) הוא אתלט גרמני. הוא אלוף אירופה בקפיצה לרוחק (הלסינקי 2012). הוא מחזיק בתוצאה השנייה בטיבה בהיסטוריה בקפיצה לרוחק באולם.