1946 року, після повернення французів до влади в Лаосі, Пхумі вирушив до північного Таїланду, де впродовж наступних трьох років був активним діячем Лао Іссара. Наприкінці 1949 року він став одним з небагатьох лаосців, хто приєднався до Суфанувонга у північному В'єтнамі. Там він узяв участь в установчих зборах Фронту вільного Лаосу, за результатами якого Пхумі Вонґвікіта обрали генеральним секретарем Фронту, а також призначили на посаду міністра внутрішніх справ і віцепрем'єр-міністра уряду, який було створено на противагу королівському урядові у В'єнтьяні. Той уряд не отримав міжнародного визнання, втім Пхумі номінально зберігав свої посади до того моменту, поки Женевські угоди 1954 року не завершили Першу індокитайську війну.