Стрімка кар'єра розпочалася у 1795 році. Під час повстання роялістів 13 вандем'єра (3-4 жовтня) він надав цінну послугу Наполеону Бонапарту, доставивши у потрібний момент у центр Парижа гармати. Після цього Мюрат стає капітаном та ад'ютантом Бонапарта. У 1796 році Йоахім Мюрат бере участь в Італійському поході французької армії. Тут він стає полковником. Після того як за дорученням Бонапарта Мюрат привіз у Францію захоплені у ворога прапори, він стає бригадним генералом. Після цього Йоахім Мюрат повертається в Італійську армію, де бере участь у битвах при Риволі та Фаворіте. У 1798 році Мюрат разом з Бонапартом бере участь у Єгипетському поході. Тут він очолює французьку кінноту. Нею він командував під час Битви біля пірамід. Особливо Мюрат відзначився при штурмі турецької фортеці Се-Жан-Д'акр.