In 2009 werd Lindgren geselecteerd als astronaut. Lindgren’s eerste en enige ruimtevlucht was Sojoez TMA-17M en vond plaats op 22 juli 2015. Deze vlucht bracht de bemanningsleden naar het ISS. Hij maakte deel uit van de bemanning van ISS-Expeditie 44 en 45. Tijdens zijn missie maakte hij twee ruimtewandelingen. Lindgren stond ook enige tijd reserve voor Crew Dragon-testvlucht SpX-DM2.