Tasavalta perustettiin 19. syyskuuta vuonna 1967 Nigerian sisällissodan aikana Biafran nukkevaltioksi Biafran Nigerian keskilännen alueen miehityksen seurauksena. Se nimettiin pääkaupungin Benin Cityn mukaan, ja sen hallinnon johtaja oli Albert Nwazu Okonkwo.