In seguito, Carlo si trasferì all'Università di Pavia che però venne chiusa allo scoppio della seconda guerra d'indipendenza, nel 1859. Tornato ad Iseo, fu tra i membri della deputazione che accolse Giuseppe Zanardelli, proveniente da Sarnico. A luglio, si recò a Brescia per accompagnare con la carrozza di famiglia Giuseppe Garibaldi, intenzionato a raggiungere la città per parlare con il generale Alfonso Lamarmora.