På hemmaplan i Finland under Skid-VM 1989 i Lahtis vann Puikkonen öppningstävlineg i stora backen, 6,0 poäng före Weissflog och 13,5 poäng före Matti Nykänen. I lagtävlingen vann Puikkonen igen guld med Finland, med god marginal till Norge och Tjeckoslovakien. Han lyckades inte i normalbacken och slutade på 13:e plats.