Нападението е извършено в контекста на Ирано-иракската война от 1980 – 1988 г. и на операция Анфал, проведена от режима на Саддам Хюсеин срещу кюрдски бунтовници. Халабджа е в зоната на активните бойни действия между иракската и иранската армия и е едно от средищата на кюрдската съпротива срещу Саддам през 1980-те години.