Durante la Guerra de Independencia, Mizque envió un diputado al Congreso de Tucumán, Pedro Ignacio Rivera (previamente había hecho lo propio ante el Congreso General Constituyente de 1813), que declaró la Independencia de las Provincias Unidas en 1816. También, como parte de Cochabamba, tuvo un representante en la Asamblea General de Diputados de las Provincias del Alto Perú, que declaró la Independencia de Bolivia en 1825.