Schon im Frühmittelalter existierten in Mutschau eine Kirche und ein Rittergut. Frühen Heimatforschern zufolge wurde der Ort um das Jahr 1080 gegründet. In der Umgebung vorhanden gewesene Schanzen entstanden wahrscheinlich während des Investiturstreits, speziell der Kämpfe zwischen Heinrich IV. und Rudolf von Rheinfelden. Zur Parochie Mutschau zählte die Kirche in Wildschütz. Das Patronatsrecht übte das Rittergut zu Mutschau bis zur Mitte des 19. Jahrhunderts aus. Am 24. Juni 1774 brach im Ort ein Feuer aus, bei welchem innerhalb nur einer halben Stunde 21 Gehöfte und die Kirche niederbrannten. Im Jahr 1813 lagerten nach der Schlacht von Lützen 30.000 Soldaten in Mutschau. Dabei wurde das Dorf geplündert, den Einwohnern jedoch rechtzeitig eine Flucht nach Zeitz gewährt.