Весной 1939 года Марсман в последний раз посещает Нидерланды, чтобы наградить юных поэтов. Война застала его в южной части Франции. После того, как немцы начали нападать на страны Западной Европы, многие нидерландцы уехали в Великобританию. Марсман погиб в 1940 году, спасаясь бегством в Великобританию, вскоре после нападения на Нидерланды нацистской Германии. До сих пор точно неизвестно, было ли судно было торпедировано немецкой подлодкой или потонуло по какой-либо другой причине. Восемь человек выжило после торпедирования судна, среди них была его жена.