Im Oktober/November 1944 nahm Kiliani an einem Divisionsführer-Lehrgang teil. Mitte November 1944, nachdem Kiliani im Oktober 1944 kurz die 3. Panzergrenadier-Division geführt hatte, übernahm er in Vertretung für Generalmajor Gustav Hundt die 1. Skijäger-Division und blieb bis Anfang Dezember 1944 deren Kommandeur. Anschließend übernahm Kiliani, ebenfalls in Vertretung, bis Ende Dezember 1944 für Generalleutnant Carl Becker das Kommando über die 253. Infanterie-Division. Von Mitte Januar 1945 bis Mitte Februar war er, nachdem der Divisionskommandeur Generalmajor Otto Obenaus an der Ostfront verschwunden war, Führer der 545. Volksgrenadier-Division. Unter seiner Führung war die Division bei der Niederschlesische Operation eingebunden. Vom 19. Februar 1945 bis Kriegsende war er dann Kommandeur der 320. Infanterie-Division und wurde in dieser Position am 20. April 1945 zum Generalmajor befördert. Die Division kam im mährischen Deutsch-Brod in sowjetische Gefangenschaft. Kiliani befand sich vom 10. Mai 1945 bis 6. Oktober 1955 in russischer Kriegsgefangenschaft.