Mysegaes est d'abord entraîné par son père Wilfried Mysegaes. À 16 ans, Horst Karsten devient son entraîneur. En 1985, il remporte la médaille de bronze des Championnats d'Europe junior puis le titre en 1987. Au championnat d'Allemagne 1992, il finit deuxième derrière Matthias Baumann et se qualifie pour les Jeux olympiques d'été de 1992. Il est à l'issue de l'épreuve individuelle puis remporte la médaille de bronze par équipe en compagnie de Matthias Baumann, Herbert Blöcker et Ralf Ehrenbrink. En 1994, Mysegaes est champion d'Allemagne. Aux Jeux équestres mondiaux de 1994, il gagne la médaille de bronze par équipe en compagnie de Ralf Ehrenbrink, Bettina Overesch et Peter Thomsen. En 1996, Mysegaes met fin à sa carrière à la suite d'une blessure.