El poema se inicia con un himno a la diosa Venus generatriz como fuerza germinadora de la naturaleza mientras, que termina con una descripción de la destructora peste de Atenas, contraste que tal vez fue buscado por Cicerón cuando ordenó el texto en seis libros y editó el poema. El libro I del poema contiene, además del himno ya citado, elogios hacia Memio y Epicuro; y trata sobre una introducción sobre los átomos y del vacío. El libro II trata del movimiento y agrupaciones de los átomos. El libro II versa sobre el alma, que es mortal. El libro IV sobre la teoría de la sensación, el libro V diserta sobre el mundo y el libro VI sobre diversos fenómenos atmosféricos y las enfermedades, terminando con el ya citado sombrío panorama de los estragos de la peste en Atenas.