Die Gründung des Staates Israel wurde von ihm freudig begrüßt. Noch im selben Jahr, als Stalin seine ursprüngliche Unterstützung für Israel revidierte, wurde David Hofstein, gemeinsam mit Kwitko, Markisch und anderen Mitgliedern des Jüdischen Antifaschistischen Komitees, verhaftet, zunächst nach Moskau, dann nach Sibirien deportiert, um dann 1952, wie viele weitere hervorragende Exponenten der jiddischen Kunst und Kultur, ein Opfer der stalinistischen Säuberungen zu werden. Er wurde in der „Nacht der ermordeten Dichter“ vom 12. auf den 13. August 1952 in der Lubjanka in Moskau exekutiert.