Durante las primeras etapas del bombardeo de Yugoslavia en 1999 por la Organización del Tratado del Atlántico Norte (OTAN), Blažić argumentó que la coalición dirigida por estadounidenses estaba apuntando a las instalaciones de la industria química "en un intento obvio de causar un desastre ambiental". Luego acusó a la OTAN de usar armas químicas y radiactivas contra Yugoslavia en violación de las convenciones internacionales, y agregó que el "bombardeo de alfombras" de la OTAN a Kosovo y Metohija planteó la cuestión de si la alianza militar realmente quería que los refugiados albaneses regresaran a la zona como afirmaba. En una conferencia de prensa, Blažić acusó a la OTAN de violar las convenciones internacionales relacionadas con la contaminación por petróleo, el envenenamiento por benzol, la prevención del riesgo de cáncer, la contaminación atmosférica transfronteriza, la protección de la capa de ozono, la protección de la flora y la fauna y la protección de los trabajadores contra los riesgos laborales. Tras la conclusión de la campaña de bombardeos, sugirió que el humo y los humos tóxicos causados por las acciones de la OTAN podrían haber contribuido a las fuertes tormentas de lluvia y otros malos climas que afectaron a Serbia en el verano de 1999.