В період з 1995 по 1998 рік Джексон захищав кольори національної збірної Шотландії, провів у її складі 28 матчів, забив чотири м'ячі. Учасник чемпіонату світу 1998 року. Також був у складі «тартанової армії» на європейській першості 1996, але не зіграв на турнірі жодного матчу.