Kort nadat de Duitsers Denemarken bezetten in 1940, werd de luchthaven gebruikt voor de Operatie Weserübung en diende de luchthaven als belangrijke stop voor de Luftwaffe onderweg naar Noorwegen. Na de verovering van Noorwegen heeft de luchthaven ook als uitvalsbasis gediend voor Slag om Engeland. Naarmate de oorlog vorderde, werd de luchthaven tussen 1940 en 1941 steeds verder uitgebouwd en was het een van de meest versterkte luchthavens van het bezette Europa.