Durante la década de 1940, Fernández participó con la selección peruana en tres ediciones más del Campeonato Sudamericano. La primera de ellas en el Campeonato Sudamericano 1941 realizado en Chile, donde disputó cuatro encuentros y marcó tres anotaciones. La segunda en el Campeonato Sudamericano 1942 de Uruguay llegando a anotar dos goles en tres partidos. Y su última participación internacional con la selección se dio en el Campeonato Sudamericano 1947 de Ecuador, disputando tres encuentros y sin marcar goles. Su último partido lo disputó el 20 de diciembre de 1947 ante los locales con empate a cero.