После окончания гражданской войны летом 1997 года, Мухиддин Кабиров вернулся в Таджикистан, в Душанбе, став одним из помощников председателя оппозиционной Партии исламского возрождения Таджикистана Саида Абдулло Нури и его заместителя Ходжи Акбара Тураджонзода.