Il 14 agosto 2014, durante i Campionati europei a Zurigo, corre e vince la gara dei 3000 metri siepi, ma viene in seguito squalificato per aver corso gli ultimi metri di gara senza la maglietta, tolta prima dell'ultimo ostacolo e senza la quale corre gli ultimi 80 metri circa. Mekhissi-Benabbad è stato immediatamente ammonito dai giudici di gara per comportamento improprio, ma successivamente la Spagna ha presentato un ricorso, che è stato accolto. Il corridore è stato squalificato e ha perso così quella che per lui sarebbe stata la terza medaglia d'oro consecutiva agli Europei di atletica. Tre giorni dopo, in occasione dei 1500 metri piani, il corridore francese si impone nettamente grazie a un rabbioso ultimo giro di gara, vincendo così la sua terza medaglia d'oro agli Europei.