正觉寺塔曾在清末咸丰、同治年间遭遇火烧，又经历地震等自然灾害以及人为拆取砖块等破坏，砖砌结构松动、拱顶毁坏，南侧形成一个大窟窿，塔身沿另一边也出现了3~5厘米宽裂缝；塔基西南须弥座下被拆进塔身1.15米，存在倒塌的危险。2008年汶川大地震后该塔进行修复，目前修复工作已经完成，并经四川省文物局验收合格。