Rafferty esiintyi ensimmäisen kerran Englannin naisten maajoukkueessa maaliskuussa 2010. MM-kilpailuissa 2011 hän pääsi vaihtopelaajana puolivälieräotteluun Ranskaa vastaan ja epäonnistui rangaistuspotkukilpailussa, jonka Englanti hävisi. MM-kilpailuissa 2015 hän pelasi viidessä Englannin seitsemästä ottelusta, muun muassa täyden peliajan neljännesvälierässä, puolivälierässä ja välierässä.