Nel 2001 è tornato a Girona come direttore sportivo, e nel 2003 per un breve periodo ha allenato la squadra. Un anno dopo si è trasferito in Portogallo ed è diventato vice del suo amico Víctor Fernández, allenatore del . I due hanno vinto la Coppa Intercontinentale 2004 ma sono stati esonerati prima del termine della stagione. Narcís Julià ha continuato a lavorare con Fernández al Real Saragozza fino al 2008.