Il 21 febbraio 2006 subentra alla guida della prima squadra in sostituzione di Alberto Cavasin, che si trova ultima con 14 punti. A fine campionato i biancocelesti, non riuscendo ad ottenere la salvezza con 21 punti e con il 19º piazzamento nella classifica finale (non più ultimo - 20º - per lo scandalo "Calciopoli"), retrocedono. Il 31 maggio viene comunque riconfermato e firma un contratto biennale. Il 5 novembre, all'indomani del pareggio in trasferta per 2-2 con il Pescara, viene esonerato, dopo appena dieci partite ed aver totalizzato 10 punti all'attivo.