На Олимпийских играх 2004 года Джонс выступила на трёх дистанциях. 15 августа в полуфинале 100-метровки брассом Лизель установила новый олимпийский рекорд 1:06,78 с. На следующий день в финале соревнований Джонс была главной претенденткой на победу, но не смогла показать хороший результат и стала только третьей, уступив китаянке Ло Сюэцзюань и ещё одной австралийке Брук Хансон.