"Maria voll der Gnade" war ein großer Kritikererfolg und wurde mit 30 internationalen Film- und Festivalpreisen ausgezeichnet. Marston erhielt unter anderem den Publikumspreis beim Sundance Film Festival, den Alfred-Bauer-Preis der Internationalen Filmfestspiele von Berlin 2004 und wurde vom New York Film Critics Circle, der Los Angeles Film Critics Association und bei den Independent Spirit Awards als bester Debütregisseur beziehungsweise -drehbuchautor ausgezeichnet. Hauptdarstellerin Catalina Sandino Moreno gewann einen Silbernen Bären als beste Darstellerin und errang eine Oscar-Nominierung. Der deutsche film-dienst lobte Marston als einen Regisseur in der Tradition der großen Neorealisten, der den Mut aufbringe, "„entscheidende Fragen über die Zukunft seiner Charaktere unbeantwortet und moralische Werturteile außen vor zu lassen“". Trotz all seines Realismus sei "Maria voll der Gnade" "„weder ein Dokumentarfilm noch ein politischer Thesenfilm“", sondern "„eine ganz persönliche, aus der Sicht der 17-jährigen Hauptfigur gefilmte Geschichte“".