La stagione 1996-1997 iniziò il 25 agosto 1996 con la vittoria della Supercoppa italiana contro il Milan per 2-1 allo stadio Giuseppe Meazza, decisa dalla doppietta di Gabriel Batistuta, con rete di Dejan Savićević per i rossoneri. La formazione era composta da Toldo, Carnasciali, Firicano, Amoruso, Falcone, Schwarz, Piacentini, Cois, Rui Costa, Oliveira, Batistuta. Tra i volti nuovi della squadra gigliata, oltre a Luis Oliveira e Aldo Firicano, ci fu dal gennaio 1997 Andrej Kančelskis. I viola non riuscirono però a confermare le buone prestazioni dell'anno precedente, con Batistuta che segnò meno reti rispetto al passato, e conclusero il campionato al nono posto, restando fuori dalle competizioni europee. In Coppa Italia la squadra venne battuta agli ottavi dal Bologna, dopo aver superato il Cosenza nel turno precedente. In Coppa delle Coppe i gigliati ebbero un buon cammino, superando il Gloria Bistriţa al primo turno, lo Sparta Praga agli ottavi e il Benfica ai quarti, venendo battuti in semifinale dal Barcellona.