Hun er aktiv pasifist og protesterte mot den amerikanske krigføringen i Vietnam. Baez ble fengslet etter å ha støttet motstand mot vernepliktstjeneste i Vietnam. Hun besøkte Hanoi julen 1972 og opplevde den amerikanske bombingen av byen under Operasjon Linebacker II. Sammen med Baez var Telford Taylor (general og jussprofessor), presten Michael Allen og vietnamveteranen Barry Romo. De søkte tilflukt i hotellets bomberom mens amerikanske fly bombet byen. Opptak fra turen utgjør den ene siden av albumet "Where Are You Now, My Son?" utgitt i 1973. Baez har spilt inn materiale av Jackson Browne.