Como jefe del OKH, Guderian se enfrentó a los problemas urgentes de que el trabajo del personal se viera afectado por los arrestos, que entre el personal del OKH y sus familias finalmente llegaron a cientos. Guderian tuvo que llenar vacíos serios, como el creado por el suicidio del general Eduard Wagner, el intendente general, en julio. Incluso con el llenado de vacantes, seguía existiendo un problema clave: demasiados miembros del personal eran nuevos en sus funciones y carecían de conocimientos institucionales, incluido el propio Guderian. Guderian confiaba mucho en el coronel Johann von Kielmansegg, que era el oficial de estado mayor con experiencia en el OKH, pero fue arrestado en agosto. La situación no mejoró por el enfrentamiento de Guderian contra el Estado Mayor, al que culpó por haberse opuesto supuestamente a sus intentos de introducir la doctrina blindada moderna en el ejército en la década de 1930.Los últimos meses de 1944 estuvieron marcados por la lucha cada vez mayor entre el OKH y el OKW (Oberkommando der Wehrmacht) mientras las dos organizaciones competían por los recursos, especialmente en el período previo a la Batalla de las Ardenas. Después de la guerra, Guderian culpó a Hitler de malgastar las últimas reservas alemanas en la operación; no obstante, la situación estratégica de Alemania era tal que ni siquiera veinte o treinta divisiones más hubieran ayudado.