W latach 1940-1941 trzy dywizje piechoty i inne jednostki wchodzące w skład I Korpusu "Second Australian Imperial Force" (2ndAIF) zostały przetransportowane na Bliski Wschód, gdzie uczestniczyły w szeregu kampanii przeciw siłom Państw Osi: Niemiec, Włoch i Francji. Gdy wybuchła wojna na Pacyfiku dowództwo korpusu oraz dywizje 6. i 7. wróciły na początku 1942 roku do Australii, by wzmocnić obronność kraju; przerzucenie tych sił nosiło kryptonim "Operacja Stepsister". Rząd Australii przystał na prośbę Brytyjczyków i Amerykanów, by 9 Dywizja pozostała jeszcze jakiś czas na Bliskim Wschodzie, w zamian za skierowanie dodatkowych oddziałów United States Army do Australii i brytyjską pomocy w rozbudowie Royal Australian Air Force do 73 dywizjonów. W tym roku 9 Dywizja odegrała ważną rolę w I (lipiec 1942) i II bitwie pod El Alamein (23 października – 4 listopada). W tym drugim starciu dywizja poniosła tak znaczne straty, że nie mogła wziąć udziału w pościgu za uchodzącymi wojskami Osi.