De partij werd verboden na de Amerikaanse invasie in Irak. Leden in hogere functies werden opgepakt en berecht of moesten onderduiken. De rest werd door het tijdelijk bestuur ontslagen. Deze brodeloos geworden ex-leden vonden snel een weg naar de Ba'athloyalistische verzetsgroepen in Irak waaronder onder meer de Naqshbandi. Uiteindelijk zou een deel van deze groep verder radicaliseren en opgaan in de Islamitische Staat in Irak en de Levant, deze groep van de nodige militaire en bestuurlijke ervaring voorziend. Een aantal ex-Ba'athleden zou uiteindelijk sleutelfuncties binnen ISIS gaan bekleden.