Hij speelde bijna zijn hele carrière voor Estudiantes, waarmee hij grote successen behaalde. Na een landstitel in de Metropolitano-titel van 1967 won de club drie keer op rij de Copa Libertadores, won het de Copa Interamericana in 1969 en de Intercontinentale beker tegen Manchester United in 1968. In 1969 en 1970 verloren ze de Intercontinentale beker tegen respectievelijk AC Milan en Feyenoord Rotterdam. De wedstrijd tegen Milan was extreem gewelddadig en de Argentijnse president Juan Carlos Onganía liet zelfs het hele team van Estudiantes arresteren. Manera sloeg de Milanees Pierino Prati al na drie minuten bewusteloos en dat was niet het enige geweld tijdens deze wedstrijd. Samen met Ramón Aguirre Suárez en Alberto Poletti vloog hij zelfs een maand in de gevangenis en werd voor 20 wedstrijden geschorst en mocht nooit meer internationale wedstrijden spelen.