Wendel spielte von der U-15 bis zur U-20 für alle Auswahlmannschaften Brasiliens. 2001 gehörte Wendel zum brasilianischen Aufgebot beim Gewinn des Campeonato Sudamericano Sub-17 und war auch bei der anschließenden U-17-Weltmeisterschaft Stammspieler. 2003 belegte er Rang 2 bei der Campeonato Sudamericano Sub-20, beim Gewinn der U-20-Weltmeisterschaft 2003 stand er allerdings nicht im Aufgebot.