Великий лондонский пожар начался в 1666 году на соседней улице Пудинг-лейн; огонь серьезно повредил старое здание церкви. После пожара приход Девы Марии был объединен с приходом храма Святого Андрея Хаббарда (St Andrew Hubbard), располагавшемся в том же квартале; церковь Святого Андрея не восстанавливалась после Великого пожара.