Vid sidan av sin ämbetsmannakarriär utförde Möller ett flertal uppdrag. Han var byggnadschef vid Stockholmsutställningen 1897 (där den smakfulla och praktiska disponeringen av terrängen var hans verk) samt ledamot av dess centralkommitté, samma år medlem av förvaltningsutskottet i kommittén för Sveriges deltagande i världsutställningen i Paris 1900, 1898 ledamot av sanatoriebyggnadskommittén, 1901 ledamot av överstyrelsen för jubileumsfonden, 1906 ordförande i Tekniska skolans styrelse och 1911 ordförande i regaliekommittén. Han blev 1890 ledamot av Konstakademien och 1901 ledamot i dess förvaltningsnämnd samt 1914 hedersledamot av Vitterhets-, historie- och antikvitetsakademien.