С 1635 по 1649 год на месте деревянной была построена кирпичная церковь Богоматери Ангельской и Святого Франциска. Храм был возведён в стиле люблинского ренессанса. Церковь была освящена епископом Николаем Оборским, краковским викарием. Сюда был перенесён чудотворный образ Богоматери. В 1689 году вокруг храма был возведён монастырский комплекс, также в стиле люблинского ренессанса. Монастырские здания строили на болотистой земле. По этой причине фундамент построек укрепляли дубовыми балками. Во время войны 1812—1813 годов французская армия устроила в храме военный склад. В 1817 году монастырь францисканцев в Люблине был упразднён российскими властями. В зданиях монастыря расположился военный госпиталь. Затем здесь находились ткацкая фабрика, мыловаренный и свечной заводы.