Nach dem Ausbruch des polnischen Novemberaufstandes von 1830 schloss er sich demselben an, wurde von Józef Chłopicki zum Brigadegeneral ernannt und zeichnete sich in der Schlacht bei Grochów aus. Später drang er nach Litauen vor, unterstützte den dortigen Aufstand und unternahm gemeinschaftlich mit Giełgud an der Spitze von 5.000 Litauern einen Angriff auf Wilna. Die Angreifer wurden aber zurückgeschlagen und Chłapowski musste sich im Juli 1831 über die preußische Grenze zurückziehen. Hier streckte er die Waffen, erhielt eine längere Haftstrafe und wurde zur Bezahlung einer bedeutenden Strafsumme verurteilt.