1893 wurde Komura Erster Sekretär der japanischen Gesandtschaft in Peking. Während des Sino-Japanischen Krieges war er Zivilverwalter der von Japan besetzten Territorien in der Mandschurei. Er spielte eine Schlüsselrolle bei den Friedensverhandlungen und bei der Formulierung des Vertrages von Shimonoseki 1895.