Eliminacje zostały podzielone na dwie rundy. 9 drużyn automatycznie weszło do drugiej rundy (5 reprezentacji, które zakwalifikowały się do mistrzostw świata w 2002 roku i 4 reprezentacje, które zajmują najwyższe miejsca w rankingu FIFA z 25 czerwca 2003 r.). Pozostałe 42 zespoły zostały rozlosowane parami. Rozgrywały po 2 mecze (dom i rewanż). Zwycięzca dwumeczu awansował dalej.