След битката при Йена, Луиза и съпругът ѝ се установяват в Кьонигсберг, а след битките при Йелауи и Фридланд, когато цяла Прусия се оказва окупирана от Франция, Луиза лично посещава Наполеон Бонапарт в щабквартирата му в Тилзит, за да договори условията за мир, но усилията ѝ остават напразни. В края на 1808 г. Луиза напуска Прусия и посещава Санкт Петербург и отново се завръща в Берлин в края на декември 1809 г.