最初のミシシッピ軍は、ジョン・ポープ少将を司令官として1862年2月29日に創立された。創立時は2個歩兵師団で構成されており、ミシシッピ川沿いを作戦地域とした。ポープがミズーリ州ニューマドリッドに向かって進軍を開始した際、近隣の小軍管区（military district）から部隊が追加され、5個師団編成となった。各師団長は、デービッド・スタンレレー（）、シュイラー・ハミルトン（）、ジョン・パーマー（）、イレーザー・パイン（）およびジョセフ・プラマー（）であった。さらにゴードン・グレインジャー（）が2個連隊からなる騎兵旅団を率い、ナポレオン・ビュフォード（）の船艇旅団も加わった。この兵力を持って、ミシシッピ軍はアイランドNo.10の戦いに参戦した。