En 1816 tras proclamarse la independencia Argentina el general Martín Miguel de Güemes creó el departamento de La Puna (o de Atacama) incluido en Salta hasta las costas del océano Pacífico. Tras el asesinato que sufriera Güemes, el territorio de la Puna de Atacama (o "El Alto") recayó en poder de los realistas hasta que en 1825 aprovechando la momentánea debilidad (guerras civiles y preludios de la Guerra Argentino-brasileña), el estado boliviano se declaró dueño de toda la Puna de Atacama, quedando solo en poder de Salta la zona de la quebrada del Toro que tuvo como capital a San Antonio de los Cobres, aun así la quebrada del Toro fue atacada por las fuerzas de la confederación peruano-boliviana en 1835 aprovechando que la Confederación Argentina debía enviar tropas contra los "colorados" instalados -contra los nacionales uruguayos- en el Estado Oriental del Uruguay, los brasileños y los aliados de "colorados" y brasileños: los ingleses y franceses.