De 2009 à 2012, il entame une carrière d'entraîneur à l'Espanyol, qu'il hisse en milieu de classement trois années de suite. Lors de l'exercice 2013-2014, il conduit le club anglais de Southampton à la place de la Premier League, son meilleur classement depuis 1990. Dès 2014, Pochettino rejoint le club londonien de Tottenham Hotspur qu'il qualifie quatre années consécutives en coupe d'Europe et mène à sa première finale de Ligue des champions en 2019. Il est remercié le après un début de saison décevant. Le , il fait son retour au Paris Saint-Germain, en tant qu’entraîneur.