Arran de la guerra, els dakota foren severament castigats: un tribunal militar nord-americà va condemnar 303 homes per crims de guerra i els va condemnar a mort. Dels 303, l'Exèrcit va penjar 38 homes l'endemà Nadal, en la major execució en massa de la història dels Estats Units. Es van realitzar esforços per revocar els tractats, l'abolició de la reserva, i expulsar per complet els restants dakota de Minnesota. Es van donar recompenses de 25 dòlars per qualsevol dakota que es trobés dins dels límits, amb l'excepció de 208 famílies mdewakanton, que eren considerades "amigables". Poc després van esclatar els conflictes addicionals coneguts com a Guerres Índies al sud i a l'oest, acabant finalment amb la Massacre de Wounded Knee de 1890 i la derrota dels sioux.