五航戦が参加した主要作戦（海戦）は、真珠湾攻撃（昭和16年12月上旬）、ラバウル攻略作戦支援（昭和17年1月下旬）、日本本土周辺警戒（昭和17年2月～3月）、セイロン沖海戦（昭和17年4月上旬）、珊瑚海海戦（昭和17年5月上旬）など。珊瑚海海戦で「翔鶴」は大破する。健在の「瑞鶴」も航空隊の消耗甚大のためミッドウェー作戦には参加せず、内地で待機した。