El barco escoltó a un convoy desde Kwajalein hasta la base naval de Truk en enero de 1942, donde se le instaló una barbeta con dos ametralladoras antiaéreas Tipo 93 de 13,2 mm (0.5 pulgadas) delante del puente de mando. Ese mismo mes, el Yayoi escoltó un convoy de tropas desde Truk a Guam, y luego se unió a la invasión de las Islas Salomón, cubriendo los desembarcos de las fuerzas japonesas durante la Operación R (la invasión de Rabaul, Nueva Irlanda y Nueva Bretaña) y durante la Operación SR (la invasión de Lae y Salamaua en Nueva Guinea) en enero-marzo. Del 28 de marzo al 1 de abril, participó en la ocupación inicial de las Islas Shortland y Bougainville en las Islas Salomón. Más tarde de ese mes, el barco apoyó la ocupación de las islas Almirantazgo.