В мае 1918 года стал одним из руководителей антибольшевистского выступления Чехословацкого корпуса, организатором восстания в городе Ново-Николаевске (позднее г. Новосибирск). Летом 1918 года — командующий чехословацкими войсками восточнее Омска. Вместе с группой генерала Войцеховского выбил из Екатеринбурга (при СССР - г. Свердловск) большевиков.