그러나 테일러 정권은 주변국의 반인도적인 반군을 지원하거나 부정한 인력착취와 밀수를 행하며 이익을 챙겼고, 결국 국제적으로 테러지원국가로 여겨지며 고립되기 시작했다. 계속되는 혼란 속에 1999년 북서부에서 테일러 정권에 반대하는 LURD가 봉기하면서 제2차 라이베리아 내전이 시작되었고, 2003년에는 동남부에서 또다른 반란군 MODEL이 일어났다. 결국 동년 6월에 아크라에서 세력간 회담이 열렸고 곧 테일러는 축출되어 이후 인도에 반하는 죄 혐의에 대한 유죄를 선고받았다.