Menurut berbagai sumber yang dapat dipercaya seperti riwayat dalam Shahih Bukhari, dan kitab "Ath-Thabaqat al-Kubra" karangan Ibnu Sa'ad, Uqbah terbunuh di Perang Badar dan termasuk di antara para pemimpin Quraisy yang mayatnya dilempar ke dalam lubang. Namun, menurut biografi Ibnu Ishaq, Uqbah menjadi tawanan Perang Badar dan kemudian ia dihukum mati oleh Ashim bin Tsabit atas perintah Muhammad. Menurut sarjana Muslim Safiur Rahman al-Mubarakpuri, setelah Perang Badar dua tawanan – Nadhr bin Harits dan Uqbah bin Abi Mu'aith dipenggal oleh Ali. Mubarakpuri menyebutkan bahwa peristiwa tentang pemenggalan ini juga disebutkan dalam Sunan Abu Dawud no 2686 dan Anwal Ma'bud 3/12.