Tuvo un papel relevante durante la guerra en el Norte. En el otoño de 1936 se integró en el Ejército de Euzkadi creado por el Gobierno provisional vasco para defenderse de los sublevados. Durante la batalla de Villarreal estuvo al frente de una de las columnas que atacó la localidad, a finales de 1936. Más adelante fue puesto al mando de una de las divisiones del I Cuerpo de Ejército de Euzkadi, participando en los combates en Vizcaya y en la batalla de Santander. Durante la campaña de Asturias mandó la 50.ª División, que agrupaba los restos de la 3.ª División vasca. Ibarrola tomó parte en la batalla de El Mazuco, antes de la caída de Asturias, de donde lograría escapar.