Deluso dalle condizioni sociali del suo popolo sotto la guida della Federazione Rivoluzionaria Armena o "Dashnak", Bagramjan partecipò ad una rivolta che venne sedata e subì l'arresto e la prigione per alcuni mesi, quando venne riabilitato nei ranghi dell'esercito per partecipare al conflitto turco-armeno. Il 29 novembre 1920 le truppe dell'Armata Rossa invasero il territorio armeno ponendo fine all'esperienza della Prima Repubblica di Armenia, e l'esercito nazionale armeno fu destituito, tuttavia Bagramjan decise di entrare nell'esercito sovietico e venne assegnato all'XI armata dove venne nominato comandante di un reggimento di cavalleria.