Zurück in New York City wurde sie 1995 Lokalreporterin der "New York Times". Anfang September 2001 wechselte sie als Inlandskorrespondentin der NYT beim Weißen Haus nach Washington, als die Terroranschläge am 11. September die Politik um 180 Grad drehten und die meisten journalistischen Fragen nun außenpolitischer Natur waren. Bumiller hielt sich als NYT-Korrespondentin stets in der Nähe des Präsidenten George W. Bush auf, sowohl auf dessen Privatsitz auf der Prairie Chapel Ranch als auch bei den Reisen nach St. Petersburg und in den Nahen Osten. Ab 2007 arbeitete sie als Korrespondentin der NYT beim Pentagon. Später wurde sie Redakteurin im Washingtoner Büro der "Times", das sie seit September 2015 leitet.