Toutefois, certains mouvements politiques de ces pays ont, à divers moments, cherché à s’émanciper de la domination économique, politique et culturelle des minorités russophones qui ont alors été, volontairement ou non selon les personnes, impliquées dans des conflits comme les guerres civiles de Géorgie (1991-1993), de Moldavie (1992), du Tadjikistan (1992-1997) et du sud-est ukrainien (2013-2014). Les russophones de ces pays qui, fuyant les conflits, ont choisi d’émigrer vers la Russie, y sont souvent devenus des réfugiés que l’État russe a, le plus souvent, « oublié » d’aider à se réinsérer dans la « mère patrie », et qui y ont vécu très difficilement, au point qu’à l’issue des conflits (issue jusqu’ici toujours favorable aux pro-russes) certains sont revenus soit dans les pays qu’ils avaient quitté, soit dans les portions de ces pays qui, ayant auto-proclamé leur indépendance (parfois reconnue par la Russie) ou même leur rattachement à la Russie, acceptent de les accueillir (Abkhazie, Crimée, Nouvelle-Russie, Ossétie du Sud-Alanie, Transnistrie). Malgré l’acceptation officielle par la Russie de la demande de l’Union européenne et du Conseil de l'Europe de « "rectifier les manières de faire de l’ère soviétique" », les minorités russophones des pays ex-soviétiques continuent à être des enjeux dans des conflits géopolitiques qui dépassent leurs intérêts immédiats et dont les conséquences vont souvent à l’encontre de leur qualité de vie et de leur sécurité.