W 1945, kiedy Harbin został zajęty przez Armię Czerwoną, Matkowski zdecydował się na współpracę z radzieckimi organami bezpieczeństwa. W 1946 zeznawał jako świadek w procesie tokijskim, w którym sądzono japońskich zbrodniarzy wojennych. W tym samym roku stanął przed sądem radzieckim i został skazany na 25 lat więzienia. W 1958 został zwolniony i zrehabilitowany. Zamieszkał w Chabarowsku, gdzie kontynuował współpracę z organami bezpieczeństwa. Pod koniec życia zamieszkał we wsi Mago, gdzie pracował w firmie Eksportles.