Drogba speelde tevens in het nationaal elftal van Ivoorkust en de spits had een belangrijk aandeel in de kwalificatie van zijn land voor het wereldkampioenschap voetbal 2006. In januari 2006 behoorde Drogba tot de Ivoriaanse selectie voor de Afrika Cup. Ivoorkust haalde daar de finale, maar verloor die na strafschoppen van Egypte. Drogba mocht zich dit verlies aanrekenen, aangezien hij vlak voor tijd een bijna niet te missen kans over het doel schoot en bovendien zijn strafschop in de serie niet benutte.