平成28年（2016年）熊本地震を引き起こした断層帯の一つである日奈久断層帯は、熊本県八代市付近で臼杵-八代構造線を切っていると考えられている。地震調査研究推進本部の長期評価において、日奈久断層帯は3区間に分けられているが、そのうちの日奈久区間（熊本県宇城市豊野町山崎から同芦北町の御立岬付近までの長さ約40km）付近に八代市がある。2015年の日本地質学会学術大会において、日奈久区間の八代市付近以南が臼杵-八代構造線の延長であって、臼杵-八代構造線が鹿児島県川内市の沖にまで延びている可能性がある旨が報告されている。