Kurz zuvor hatte Flüggen bereits seinen ersten Auftritt mit Alexander Walkenhorst, als die beiden neuen Partner das Satellite-Turnier in Lausanne gewannen. Anschließend wurden sie beim CEV-Masters in Novi Sad und beim Open-Turnier der FIVB World Tour in Anapa jeweils erst im Finale geschlagen. Bei der EM in Klagenfurt gewannen sie ihre Vorrundengruppe und das Achtelfinale, bevor sie gegen die neuen Europameister Gavira/Herrera ausschieden und das Turnier auf dem fünften Rang beendeten. Ebenfalls Fünfter wurden sie beim Grand Slam in Moskau. Nach einer Finalniederlage gegen Markus Böckermann und Mischa Urbatzka wurden sie deutscher Vizemeister. Danach trennte sich das Duo. Die letzten beiden Grand Slams des Jahres 2013 in São Paulo und Xiamen spielte Flüggen bereits mit seinem neuen Partner Sebastian Dollinger und erreichte dabei die Plätze neun und siebzehn. Die EM 2014 in Quartu Sant’Elena absolvierte er hingegen mit Sebastian Fuchs, wobei die vorübergehenden Partner bis ins Viertelfinale gegen die späteren Finalisten Samoilovs/Šmēdiņš kamen. Auf der World Tour kamen Flüggen/Dollinger zunächst nicht über 17. Plätze hinaus. Nach dem fünften Rang beim CEV-Masters in &lt;a href="Biel/Bienne"&gt;Biel/Bienne&lt;/a&gt; wurden sie Neunte beim Grand Slam in Stare Jabłonki. Bei der deutschen Meisterschaft kamen sie über die Verliererrunde ins Halbfinale und gewannen das Spiel um den dritten Platz gegen Armin Dollinger und Clemens Wickler.