至 1939 年，青年衛士在全球拥有 70,000 名成员，大部份成員來自东欧。随着第二次世界大战和納粹大屠殺的到来，青年衛士的成员将注意力集中在抵抗纳粹上。 莫德哈伊·阿涅萊維奇是青年衛士华沙分會的领导人，同時成为犹太战斗组织的负责人，華沙猶太區起義的發起人之一。青年衛士其他成员在匈牙利、立陶宛和斯洛伐克参与了犹太人的抵抗和救援活動。罗马尼亚青年衛士的领导人因反法西斯活动被捕并遭到处决。