У складі національної команди дебютував 17 квітня 1974 року. На виїзді радянські футболісти здобули перемогу над командою Югославії з мінімальним рахунком 1:0 (гол забив Давид Кіпіані). У листопаді-грудні 1976 року брав участь у турне по Південній Америці. Радянська команда провела три офіційних матча: проти збірних Бразилії (2:2), Аргентини (1:1) й Уругвая (3:1). Манучар Мачаїдзе виходив на поле у перших двох поєдинках. Четвертий матч за збірну СРСР провів 19 травня 1979 року — нічия у кваліфікації на Євро-80 проти команди Угорщини (2:2).