Ben Kersten gewann 1998 bei den Junioren-Bahn-Weltmeisterschaften in Havanna die Goldmedaille im 1000-Meter-Zeitfahren und Silber im Teamsprint. Im Jahr darauf verteidigte er seinen Weltmeistertitel und gewann Gold im Teamsprint sowie Bronze im Sprint. 2003 wurde er erstmals australischer Meister im Zeitfahren und 2004 im Keirin. Außerdem gewann er bei den "Oceania Games 2004" dreimal Gold und einmal Silber. Im Jahr 2005 wurde Kersten im Zeitfahren erneut australischer Meister, und er gewann in dieser Disziplin den Lauf des Bahnrad-Weltcups in Sydney. 2006 gewann er den Weltcup in Los Angeles, wurde vierfacher nationaler Meister, gewann im Zeitfahren die Goldmedaille bei den Commonwealth Games und Silber bei den Weltmeisterschaften. Im nächsten Jahr wurde er australischer Meister im Zeitfahren sowie im Omnium, und bei der Ozeanienmeisterschaft holte er Bronze im Teamsprint.