Hij brak als student ook een lans voor Nederlandse homoseksuele militairen, nadat de Amerikaanse vijfsterren generaal en voormalig bevelhebber van de NAVO, generaal John J. Sheehan, had beweerd dat de Val van Srebrenica het gevolg was van de inzet homo's in het Nederlandse leger. Schouten trok met zijn stichting Pink Army ten strijde tegen de generaal en eiste diens excuses. Zijn initiatief kreeg steun van een meerderheid in de Tweede Kamer. De generaal bood op 29 maart 2010 publiekelijk zijn excuses aan.