Po agresji ZSRR na Polskę 17 września 1939 dostał się do niewoli radzieckiej. Według stanu z kwietnia 1940 był jeńcem obozu w Kozielsku. Między 7 a 9 kwietnia 1940 przekazany do dyspozycji naczelnika smoleńskiego obwodu NKWD – lista wywózkowa 015/2 poz 62, nr akt 3763 z 5.04.1940. Został zamordowany między 9 a 11 kwietnia 1940 przez NKWD w lesie katyńskim. Został zidentyfikowany podczas ekshumacji prowadzonej przez Niemców w 1943 wpis w księdze czynności pod datą 24.04.1943. Figuruje liście AM-178-478 i Komisji Technicznej PCK GARF-478 (nazwisko zapisano jako Palczyński). Przy szczątkach w mundurze majora znaleziono legitymację oficerską, pamiętnik, łańcuszek z medalikiem, list z kopertą. Znajduje się na liście ofiar opublikowanej w Gońcu Krakowskim nr 101 i Nowym Kurierze Warszawskim nr 105.