Entre les , un village fortifié existait sur le site de Mikulcice-Valy à au sud-est du village actuel. Certains historiens ont situé l'ancienne forteresse de Vogastisburg dans ce village. Mikulcice était l'un des centres principaux de la Grande-Moravie et probablement sa capitale. Une partie des restes de la ville se trouve actuellement en Slovaquie dans le village de Kopcany. En particulier, la seule église grande-morave existant encore, l'église de Sainte-Marguerite d'Antioche se trouve sur le territoire de Kopcany. Sur le site de Valy, qui couvre de 30 à , les restes de douze églises, un palais et plus de tombes (dont trois africains) ont été retrouvés. Les bâtiments étaient construits sur plusieurs îles au milieu de la rivière et reliés par des ponts. Les rives étaient protégées par des palissades en bois. Les soldats, les serviteurs et les artisans habitaient autour de l'acropole. Au total, personnes vivaient à cet endroit. Ce site perdit de son importance après la chute des mojmirides en 906 et l'arrivée des Hongrois du duc Arpad ; il était désert dès le .