Пековић је члан репрезентације Црне Горе. За репрезентацију је наступао на Евробаскету 2011. у Литванији где је Црна Гора завршила на 21-ом месту од 24 тима. Пековић је на том такмичењу имао 13 поена и 6,4 скока по утакмици.