Поскольку Ногалесу было всё равно за кого воевать, он обратился к германской армии, где его приняли без отказа от гражданства и направили в январе 1915 года военным советником в армию Османской империи, где он вскоре получил титул бея. 12 февраля 1915 года Ногалес занял один из руководящих постов в 3-й армии и служил на Кавказском фронте. В апреле и мае 1915 года он служил при турецкой жандармерии на севере страны и тогда же попросил освободить его от этой службы в знак протеста, когда он стал свидетелем расправы турок над армянами после Ванского сражения. Он служил в османских войсках на протяжении всей Первой мировой войны, воевал на Кавказском фронте, в Месопотамии и Палестине, в 1917 году командовал 3-й кавалерийской дивизией, участвовавшей в обороне Иерусалима от англичан. Ногалес был награждён германским Железным крестом первого класса кайзером Вильгельмом II и получил несколько османских наград, а также звание генерал-майора османской армии.