1783 року українські козацькі полки було реорганізовано в регулярні полки на зразок російської армії. Під час війни 1812 року на Конотопщині створюються загони народних ополченців. Уже 20 серпня перший загін конотопських ополченців під командуванням штабс-капітана Черниша направився в Новозибків для з'єднання з російською армією. Для боротьби з інтервентами створювались і козацькі полки. Понад дві тисячі козаків і селян повіту брали участь у боротьбі проти французів.