Nel corso del mese di aprile del 1941 le potenze dell'Asse diedero l'avvio all'invasione della Jugoslavia e tra le forze aeree a supporto dell'operazione vi furono proprio i due "Kampfgeschwader" nelle cui file operavano ancora i Do 17 impiegati, come primo compito in quello specifico teatro, nel bombardamento di Belgrado. Nei giorni successivi le operazioni proseguirono con l'invasione della Grecia e quella dell'isola di Creta durante le quali, ancora una volta, i reparti operanti con il Do 17 ebbero parte nella fase iniziale di "ammorbidimento" delle difese avversarie.