Quando scoppiò la prima guerra mondiale, l'unità di stanza a Cracovia fu reintegrata a Vienna, nella base aerea di Aspern. Il 1º ottobre 1914, si recò sul fronte serbo all'aeroporto di Kovin e poi a Vinkovci, in Croazia. Dai Balcani al fronte orientale, andò a Pidhajci nella Galizia e quindi tornò a Cracovia. Nel luglio 1917, l'aeronautica fu riorganizzata, la squadriglia ricevette compiti da caccia ed il suo nome cambiò in Jagdfleiger-Kompanie 9 (Flik 9J). Dopo il Trattato di Brest-Litovsk, nell'aprile 1918 fu diretta in Italia, a Borgo Valsugana ed Ospedaletto. La squadriglia fu inquadrata nell'undicesima armata di Viktor von Scheuchenstuel nella Battaglia del solstizio del giugno 1918, che si concluse con il ritiro delle forze austro-ungariche.