Højlund lief anfangs für die dänische Jugend- und Juniorinnennationalmannschaft auf. Mit diesen Auswahlmannschaften nahm sie an der U-18-Weltmeisterschaft 2014, an der U-19-Europameisterschaft 2015 und an der U-20-Weltmeisterschaft 2016 teil. Sie gewann mit Dänemark die Bronzemedaille bei der U-18-WM 2014, die Goldmedaille bei der U-19-EM 2015 sowie die Goldmedaille bei der U-20-WM 2016. Am 7. Oktober 2016 gab sie ihr Debüt für die dänische Nationalmannschaft. Højlund nahm an der Europameisterschaft 2018 in Frankreich teil. Bei der Europameisterschaft 2020 belegte sie mit Dänemark den vierten Platz. Im Turnierverlauf erzielte sie 15 Treffer.