Tras el inicio del Levantamiento Nacional Eslovaco en 1944, el SNR se hizo cargo de las áreas liberadas por la resistencia. En febrero de 1945, sus representantes se establecieron en Košice para tomar el control total de Eslovaquia. Su membresía creció de 41 a 100 inicialmente, divididos equitativamente entre comunistas y no comunistas, con una Junta de Comisionados para actuar como su cuerpo ejecutivo. Sus poderes fueron gradualmente restringidos bajo los Acuerdos de Praga de 1945-1946 y luego del golpe de Estado checoslovaco de 1948, cuando los comunistas tomaron el poder, el SNR se convirtió en un instrumento del régimen comunista. Más adelante, con la federalización de Checoslovaquia en 1968, el SNR fue el parlamento de la República Socialista Eslovaca.