La Commune de Paris en fait la prison de la famille royale dont elle s’était assuré la garde, après la journée insurrectionnelle du 10 août 1792. La famille royale est d'abord transférée au couvent des Feuillants puis le emprisonnée au Temple au terme d'un dîner servi dans le palais du Grand Prieur, devant tout le quartier en liesse. L'aménagement de la tour demandant un certain délai, le roi et les siens sont d'abord logés dans l'appartement du bibliothécaire-archiviste Barthélémy. Les deuxième et troisième étages de la grosse tour sont partagés en plusieurs pièces dont les fenêtres sont équipées d'abat-jour pour empêcher les prisonniers de communiquer avec l'extérieur.