Основан в 1796 году небольшой группой поселенцев. Город назван в честь капитана Джонатана Дейтона, участника войны за независимость. В городе было подписано Дейтонское соглашение, положившее конец Боснийской войне. 3 августа 2019 года, сразу после массового убийства в Эль-Пасо, в Дейтоне также была открыта стрельба.