В сентябре 1991 года после августовского путча и назначения нового руководства Центрального телевидения вернулся в программу «Время», также был ведущим программы «Панорама». До конца 1996 года работал на разных должностях в РГТРК «Останкино» (с 1995 года — ОРТ, в настоящее время — «Первый канал»). В 1992—1994 годах — собственный корреспондент РГТРК «Останкино» по Бенилюксу. В 1994—1996 годах был ведущим программы «Окно в Европу» на Первом канале Останкино, для создания которой Киселёв получил грант Еврокомиссии, направленный на поддержку демократических институтов в России.