1948年11月12日，远东国际军事法庭对畑俊六判处无期徒刑。在巢鸭监狱中服刑不到10年後，他在1954年假释出狱了。清晨，畑俊六乘坐监狱提供的汽车上路，中途他的弟弟驾驶汽车前来迎接。回到阔别了七年的旧居后，畑俊六进门的第一件事就是到神像前跪拜。出狱后不久，畑俊六就担任了陆军军官亲善团体偕行社的会长，到全国各地去慰问战亡者家属。