Die Befriedung der Sennar-Provinz war kurzlebig. Gegen Ende des Jahres 1882 begann Amirs Bruder, Ahmad al-Makaschif, im Auftrag von Muhammad Ahmad die Stadt Sennar zu bedrohen und die Bevölkerung aufzuwiegeln. In einer weiteren Expedition gelang es Abd al-Qadir Pascha zwar Ahmad aus der Umgebung von Sennar zu vertreiben, aber erst eine Expedition von William Hicks im April 1883 schaltete Ahmad endgültig aus. Nach der Eroberung von Khartum im Januar 1885 durch die Mahdisten, schickte Muhammad Ahmad seinen Onkel Muhammad bin Abd al-Karim zur Eroberung der Stadt Sennar aus. Dessen Belagerung und Sturmversuche scheiterten. Muhammad Ahmad entsandte darauf seine Hauptarmee mit seinen fähigsten Generälen, darunter Wad al-Najumi und Abu Qarja. Angesichts der hoffnungslosen Lage kapitulierte die ägyptische Garnison noch vor Ankunft der Kriegerhorde im August 1885 und Sennar wurde ein Teil des Mahdi-Reichs, das bis 1899 bestand.