Durante la guerra de restauración la defensa de Elvas, ciudad fronteriza de importancia estratégica, se ha convertido en un imperativo. La ubicación del acueducto se convirtió en un obstáculo para la construcción de un nuevo conjunto de fortificaciones por lo que los ingenieros militares propusieron derruir el acueducto, con el respaldo de Juan IV de Portugal. La ciudad de Elvas se opuso a esta medida, y el conde de San Lorenzo, gobernador de la plaza-fuerte de Elvas, gestionó una petición a la Corona que el monarca respaldó.