Die Jugendjahre von Homer D. Call waren von der Wirtschaftskrise von 1837 und dem folgenden Mexikanisch-Amerikanischen Krieg überschattet. Während des Bürgerkrieges verpflichtete er sich am 1. Oktober 1861 in Cortland (New York) als Corporal im 76. Infanterieregiment von New York. Am 13. Dezember 1862 wurde er bei der Schlacht von Fredericksburg verwundet. Im Juli 1863 wurde er zum Second Lieutenant befördert und im Februar 1864 zum "First Lieutenant." Call wurde am 5. Mai 1864 während der Schlacht in der Wilderness gefangen genommen und später auf Ehrenwort entlassen. Er trat im Februar 1865 aus der Armee aus.