Em 1980, Ghiggia teve uma breve passagem como treinador do Peñarol. Foi em ano dos mais difíceis para o clube, que chegou a contratar um jogador de Gana e dois da África do Sul. A crise se refletiu especialmente no cargo de técnico: o brasileiro Dino Sani ficou até maio, quando se demitiu para trabalhar no México. Seu lugar foi ocupado por José Etchegoyen por apenas dois meses, sendo substituído interinamente por Luis Prais e pelo preparador físico Jorge Kistenmacher, até a chegada de Ghiggia. O ex-jogador renunciou pouco tempo depois, ao saber que o clube estava contratando o chileno Leonel Tuoni. Em contraste, o rival Nacional venceu o campeonato uruguaio, a Libertadores da América e o Mundial Interclubes daquele ano.