Entgegen ersten Planungen gab die CAF am 19. Juli 2010 bekannt, dass die Mannschaften, die sich für 2012 qualifizieren, "nicht" automatisch auch für den Afrika-Cup 2013 qualifiziert sind. Vielmehr gab der Verband im September 2010 einen Qualifikationsmodus bekannt, der separat von der Qualifikation zur Fußball-Weltmeisterschaft 2014 stattfinden wird.