В мае 1825 года Кютахья , чтобы обезопасить свой тыл при осаде Месолонгиона атаковал Галаксиди и вновь разрушил его. Масштабы этого разрушения были меньшими, поскольку город ещё не оправился от первого разрушения и, главное — немногочисленные корабли Галаксиди не находились в гавани. Значительно более тяжёлым было разрушение города египтянами Ибрагима в ноябре того же года. Ибрагиму удалось захватить корабли и сотни женщин и детей, которые были отправлены в рабство в Египет. После третьего разрушения, выжившие жители оставили город до конца войны и поселились на острове Идра в городах Коринф, Лутраки и др. С окончанием войны правительству удалось выкупить немногих жителей из египетского рабства.