Tonträgeraufnahmen hat Wedernikow vor allem mit dem russischen Staatslabel "Melodija" eingespielt. Besonders genannt seien hier drei zentrale Opernproduktionen, "Fürst Igor" von Alexander Borodin, "Snegurotschka" von Rimski-Korsakow und "Der steinerne Gast" von Alexander Dargomyschski. Alle drei Opern wurden auf Ariola-Eurodisc übernommen. Eine Gesamtaufnahme des "Boris Godunow" erschien auch bei Philipps. "Der geizige Ritter" von Rachmaninow erschien auch beim Label Harmonia Mundi.