มีร์ซาเยฟเคยเป็นตัวแทนของอุซเบกิสถานในทีมชาติรุ่นอายุไม่เกิน 20, 21 และ 23 ปี เขาถูกเรียกติดทีมชาติรุ่นอายุไม่เกิน 20 ปี สำหรับการแข่งขันฟุตบอลโลกเยาวชน 2009 ที่ประเทศอียิปต์ ซึ่งในรายการนั้น อุซเบกิสถานจบอันดับที่สามของกลุ่ม รองจากกานาและอุรุกวัย และมีอันดับเหนือกว่าอังกฤษเพราะผลต่างประตูได้เสีย ต่อมาเขาถูกเรียกติดทีมชาติรุ่นอายุไม่เกิน 23 ปี สำหรับการแข่งขันฟุตบอลเอเชียเยาวชน 2013 ซึ่งในรายการนั้น อุซเบกิสถานจบเพียงอันดับที่ 3 ของกลุ่ม ไม่สามารถผ่านเข้าสู่รอบแพ้คัดออกได้