Sur ordre du gouvernement, il prend la tête d'un ensemble d'unités de la Reichswehr et de Freikorps et se dirige le dans la Ruhr, afin d'y mater le soulevement bolchevique qui s'y déroule. Après une répression sanglante et plus d'un millier d'exécutions perpétrées à l'encontre des insurgés, von Watter publie un ordre selon lequel, à compter du , tout serait puni de mort ; cet ordre intervient neuf jours après que le Président du Reich Friedrich Ebert a interdit les tribunaux sommaires. Sur son initiative, on fera ériger en 1934 un mémorial au sud du à Essen, rendant hommage aux combattants des corps francs tombés lors de la répression de l'insurrection.