"Theseus" принял участие в бою на баскском рейде в апреле 1809 года. 11 апреля Томас Кокрейн организовал дерзкое нападение флотилии брандеров, с целью вызвать хаос среди стоящей на якоре французской эскадры. Большинство французских кораблей в страхе перед огнём обрубили якоря, но, неуправляемые без парусов, оказались на мели. 12 апреля Кокрейн организовал атаку на сидящие на мели французские корабли, в которой в числе прочих принимал участие и "Theseus". В результате атаки были захвачены или уничтожены 4 линейных корабля и фрегат.