После завоевания крестоносцами Константинополя и основания Латинской империи в 1204 году Скирос вошел в домен латинского императора, однако в 1207 году стал владением венецианского аристократа , брата Андреа Гизи, правившего на Тиносе и Миконосе. С середины XV века Скирос стал владением Венеции. Венецианцы построили на острове крепости Палиокастро (), Маркеси (), Кастро () и Каламица (). В 1538 году Скирос захватили турки. До 1821 года остров находится под управлением Османской империи. В 1821 году жители острова принимали активное участие в освободительной национально-освободительной революции (1821—1829). В 1829 году вместе с оставшейся частью Спорад остров был освобожден и стал частью Греции.