John Biscoe se narodil v Enfieldu, v hrabství Middlesex v Anglii. Jeho otec se jmenoval Thomas Biscoe a matka Anne (rozená Tibbs). V 17 letech, v březnu roku 1812 se připojil k Britskému královskému námořnictvu a zúčastnil se Britsko-americké války v letech 1812 - 1815. Jako kapitán ve výslužbě se poté se plavil na různých obchodních lodích, zejména do jihovýchodní Asie a Karibiku.