Nach dem Prairialaufstand (20. bis 23. Mai 1795) entzog sich Thuriot der drohenden Verhaftung durch Flucht. Er wurde durch die Generalamnestie vom 26. Oktober 1795 begnadigt und Ende 1795 zum Kommissar des Direktoriums am Gerichtshof von Reims berufen. Seit April 1803 wirkte er als Richter am Kriminalgericht des Départements Seine und im Februar 1805 erfolgte seine Berufung zum Stellvertreter des Generalprokurators und zum Staatsanwalt am Kassationsgericht.