Während der Palaiologen-Dynastie schützte Kaiser Michael VIII. das Hafenbecken mit einer Steinmauer und einer Kette. Sein Nachfolger Andronikos II. Palaiologos vertiefte den Hafen und schützte den Eingang mit eisernen Toren. In einem "Enkomium" von Kaiser Johannes VIII. wurde der Hafen im Jahr 1427 erwähnt. Das Dokument berichtet von Reparaturarbeiten am Hafen, die von Johannes VIII. angeordnet worden waren, und einem erneuten Ausbaggern. Beschäftigt waren hier bezahlte Arbeiter (darunter Priester und Mönche) und keine öffentlich Bediensteten. Danach konnten 300 Galeeren in dem Hafen anlegen. In einigen Versionen der Karte des Florentiner Reisenden Cristoforo Buondelmonti, der Konstantinopel im Jahr 1421 besuchte, sieht man das Hafenbecken flankiert von einem Arsenal, und aus den Berichten des spanischen Reisenden Pero Tafur aus dem Jahr 1437 lässt sich schließen, dass der Hafen zu diesem Zeitpunkt noch genutzt wurde. Dies blieb so bis zur Eroberung Konstantinopels durch die Osmanen im Jahr 1453.