Летом 1942 года Алексей Булахов был направлен на прохождение обучения и в начале 1943 года окончил ускоренный курс Военной академии имени М. В. Фрунзе. Летом того же года гвардии майор Булахов был назначен командующим 97-м гвардейским стрелковым полком в составе 31-й гвардейской стрелковой дивизии, где прослужил до конца войны. Полк под его командованием успешно участвовал в боях за освобождение Белоруссии и Литвы.