En septembre 2020, Doherty reçoit une invitation pour continuer d'évoluer sur le circuit principal, lui qui ne devait plus avoir sa place en raison de sa sortie du top 64 du classement mondial. Il s'inscrit alors au championnat de la ligue, nouveau tournoi classé de la saison 2020-2021. Il se sort d'abord de la première étape, après avoir notamment dominé Neil Robertson et Andrew Higginson. Il ne s'arrête pas là, et parvient ensuite à se qualifier pour la phase finale, après avoir évolué dans le groupe de Thepchaiya Un-Nooh et Xiao Guodong. En phase finale, il domine son vieux rival John Higgins (3-0) et rate de peu une qualification pour une première finale classée depuis 2006. En effet, dans son match qui l'oppose à Joe Perry, Doherty doit l'emporter pour pouvoir se qualifier pour la finale puisqu'il a réalisé un meilleur break que l'autre prétendant ; Kyren Wilson. Après deux premières manches très convaincantes, l'ancien champion du monde semble rattrapé par l'enjeu et finit par céder.