Em 1900 expôs pela primeira vez fora de Portugal, apresentando quatro obras na Exposição Universal de Paris. Em 1901, foi criada a Sociedade Nacional de Belas-Artes de Portugal e Santos Braga imediatamente aderiu e expôs, ganhando prémios e recebendo críticas positivas. Nessa época, muitas de suas pinturas eram de nus femininos, retratos e representação de flores e figuras humanas. José Malhoa passou a realizar exposições individuais, incluindo também obras de alguns dos seus discípulos, incluindo os de Emília. Participava com regularidade nas exposições do Grémio Artístico e da Sociedade Nacional de Belas-Artes (1.ª medalha, 1901). A 3 de outubro de 1903 falece o seu marido António Ferreira Braga, ficando viúva, sem nunca ter tido filhos.