Tras rescindir contrato con el Athletic Club, firmó por dos temporadas con el Deportivo Alavés en Segunda División. En su primera temporada como jugador babazorro disputó 41 partidos y marcó nueve goles. Además, consiguió el ascenso a Primera División. El 8 de enero de 2017 regresó a San Mamés con el equipo vitoriano. El público local le brindó una fuerte ovación tras ser sustituido.El 8 de febrero consiguió clasificarse para la final de Copa del Rey al eliminar al Celta de Vigo, siendo uno de los jugadores destacados del partido. No participó en la final de la Copa del Rey ante el FC Barcelona.