В 1287 царство, отказавшись платить дань, было занято монголами в результате того, как империя Юань совершила несколько вторжений в Паган. Недавние исследования показывают, что монгольские армии, возможно, не достигли самого Пагана, и что даже если бы они это сделали, нанесенный ими ущерб был, вероятно, минимальным. Тем не менее, ущерб уже был нанесен. Город, в котором когда-то проживали от 50 000 до 200 000 человек, превратился в маленький городок. Город формально перестал быть столицей Мьянмы в декабре 1297 года, когда королевство Мьинсайн стало править в Верхней Бирме.