El Kassam Tugayı militanları, İkinci İntifada esnasında hem İsrailli askerlere ve hem de sivillere karşı gerçekleştirilen hem askeri tarzdaki saldırılardan hem de bombalı intihar saldırılardan sorumlu silahlı gruplar arasındaydı. Bu Filistinli ayaklanma Birinci ayaklanmadan daha fazla şiddetliydi. Toplam ölü sayısı Filistin tarafında 55000 ve İsrail tarafında ise 11000 kişi idi ve ayrıca 64 yabancı da ölülere katıldı. İkinci İntifada esnasında kullanılan intihar bombalarının %40 ı bir çalışmaya göre El Kassam’dan geldi.