Nach der Übernahme einer Lehramtsstelle am Deutschen Gymnasium in Trient wurde Junger 1914 im Zug der Generalmobilmachung zum österreichischen Heer eingezogen und erlitt in einer der ersten Isonzoschlachten eine schwere Beinverwundung, in deren Folge er an das Wiener Kriegsarchiv abgezogen wurde.