Die Bürger von Thorn schlossen sich der Hanse und 1440 dem Preußischen Bund an. Am 7. Februar 1454 versuchten sie die Burg zu stürmen. Der damalige Komtur Albrecht Kelb konnte den Sturm zunächst abwehren, daraufhin begann die Belagerung. Nach nur einem Tag ergab sich Kelb und öffnete die Tore. Der Stadtrat von Thorn billigte umgehend die Zerstörung der Burg aus strategischen Gründen, um eine erneute Stationierung auswärtiger Truppen zu vermeiden, seien es polnische oder solche des Deutschen Ordens. Die Zerstörung der Burg leitete den Dreizehnjährigen Krieg ein. Erhalten blieb die Vorburg, der sogenannte Dansker.