Вторая генетическая линия связана с гаплогруппой R1b, которая, скорее всего, связана с населением Дешти-Кипчака, рекрутированного в Иранский поход Хулагу от восточного крыла улуса Джучи. Имеются данные о генетической линии, связанной с гаплогруппой J2. Согласной одной из выборок, к гаплогруппе C2 относится 33,3 % протестированных хазарейцев, к гаплогруппе J2 — 26,6 %.