Peréz começou a praticar a marcha ao 12 anos em sua cidade natal, localizada a 2 600 m acima do nível do mar nas montanhas equatorianas, inspirado pelas vitórias de seu compatriota Rolando Vera na Corrida de São Silvestre, no Brasil, também um natural de Cuenca, e ganhou todos os títulos juvenis sul-americanos desta modalidade ainda na adolescência. Em 1989, com apenas 14 anos, no mesmo ano em que perdeu o pai, foi campeão sul-americano juvenil da marcha de 10 km em Montevidéu, Uruguai. Em 1990, aos 16, chamou pela primeira vez a atenção da comunidade internacional com um terceiro lugar e um recorde mundial para a sua idade nos 10 km do Campeonato Mundial Júnior de Atletismo em Plovdiv, Bulgária. Em 1992, em Seul, tornou-se campeão mundial júnior da prova. Uma fratura na clavícula o afastou dos treinamentos por algum tempo mas retornou vencendo, já como adulto, os 20 km nos Jogos Pan-americanos de Mar del Plata, em 1995, a primeira vez que o Equador ganhou uma medalha de ouro em Jogos Pan-americanos.