איסה זומן לסגל הנבחרת של טרוט מולוטו לגביע אפריקה לאומות 2000, הטורניר היבשתי הראשון של איסה בקריירה. איסה שותף בכל שבעת משחקיה של דרום אפריקה בטורניר, אותם סיימה הנבחרת במקום השלישי.