Zur &lt;a href="Primera%20Divisi%C3%B3n%202014/15"&gt;Saison 2014/15&lt;/a&gt; kehrte Saúl zu Atlético Madrid zurück. Im August 2014 gewann er mit dem Verein durch ein 2:1 nach Hin- und Rückspiel gegen Real Madrid den spanischen Superpokal. Am 16. September 2014 debütierte er bei der 2:3-Niederlage im Gruppenspiel gegen Olympiakos Piräus in der Champions League. Anfang Mai 2015 verlängerte Saúl seinen Vertrag bis zum 30. Juni 2020. Sein erstes Tor in der Champions League erzielte er am 21. Oktober 2015 beim 4:0-Heimsieg im Gruppenspiel gegen den FK Astana. Nachdem sich Tiago Ende November 2015 das Schienbein gebrochen hatte, erkämpfte sich Saúl einen Stammplatz in Atléticos Mittelfeld. Er kam in der Champions League in allen 13 Spielen seiner Mannschaft zum Einsatz und trug u. a. mit einem Tor im Halbfinale gegen den FC Bayern München dazu bei, dass das Finale gegen Real Madrid erreicht wurde. In der Liga kam er zu 31 Einsätzen, in denen er vier Tore erzielte und belegte mit der Mannschaft den dritten Tabellenplatz. Mitte Mai 2016 wurde sein Vertrag um ein weiteres Jahr bis 2021 verlängert. Im Juli 2017 verlängerte er seinen Vertrag bis zum 30. Juni 2026. In der &lt;a href="UEFA%20Europa%20League%202017/18"&gt;Spielzeit 2017/18&lt;/a&gt; gewann Saúl mit Atlético erneut die Europa League und Mitte August 2018 erstmals den UEFA Super Cup. In der &lt;a href="Primera%20Divisi%C3%B3n%202020/21"&gt;Saison 2020/21&lt;/a&gt; wurde er mit Atlético erstmals spanischer Meister.