I 2003 inngikk Arnett en avtale med NBC og National Geographic, og ble deretter sendt til Irak for å dekke den amerikanske angrepet invasjonen av landet. Her gav han et omstridt intervju på irakisk TV som gjorde at mange mente han hadde gjort seg til offer i propagandaspillet. Hjemme i USA ba han det amerikanske folk om unnskyldning på frokost-TV, men NBC og National Geographic valgte uansett å avslutte sitt forhold til ham.