La tarea inicial del escuadrón de Nueva Guinea fue apoyar a las fuerzas estadounidenses y australianas en la Batalla de Buna-Gona. Hasta el final de la guerra el escuadrón operó en el ejército con el papel de co-operación, proporcionando fuerzas de tierra con artillería de observación, reconocimiento y el Apoyo aéreo cercano. El 26 de diciembre de 1942, un Piloto oficial del Escuadrón No 4 Wirraway piloteado por John Archer derribó un A6M Zero. Esta fue la única presa lograda por un Wirraway durante la guerra y ganó la Silver Star Archer de los EE.UU., El 31 de enero de 1943, el escuadrón envió a uno de sus vuelos a Wau, donde participó en la Batalla de Wau.