Ernst bestritt bisher etwa 50 Spiele für die deutsche Jugend- und Juniorennationalmannschaft. 2012 gewann er mit dem Team die U-18-Handball-Europameisterschaft und wurde zum besten Spielmacher des Turniers gewählt. 2013 und 2015 nahm er an der U-21-Handball-Weltmeisterschaft teil. 2015 holte er mit der U-21-Mannschaft die Bronze-Medaille und wurde in das All-Star-Team als bester Rückraum Links gewählt.