2016年、国民投票でEU離脱が決まった結果、首相辞任を表明したデイヴィッド・キャメロンの後任として就任したテリーザ・メイ新首相により設置された。内閣府の欧州部門、外務・英連邦省欧州局、出身の職員が統合されて組織された。また、必要に応じて他の行政機関からも職員を受け入れることとされた。