Inspiriert von seinem Vater, der ebenfalls als Unparteiischer tätig war, begann Nijhuis im Alter von 15 Jahren, erste Spiele zu pfeifen, zunächst jedoch nur Jugendspiele. Am 12. März 2005 hatte er am 25. Spieltag beim Spiel zwischen dem SC Heerenveen gegen den RKC Waalwijk (1:2) sein Debüt in der höchsten niederländischen Spielklasse, der Eredivisie. International sammelte er zunächst nur als vierter Offizieller in den Gruppenphasen von der UEFA Champions League und dem UEFA-Pokal Erfahrung, 2007 wurde er zum FIFA-Schiedsrichter berufen. 2009 war Nijhuis einer von sechs Schiedsrichtern bei der U-19-Fußball-Europameisterschaft. In seiner bisherigen Laufbahn leitete er 170 Profi-Spiele und verteilte dabei 555 Gelbe, 32 Gelb-Rote und 18 Rote Karten.