« Buonaparte, général en chef de l'armée de l'intérieur, atteste que le général Malye a servi avec le plus grand zèle, qu'il s'est distingué au 13 Vendémiaire par son courage et son patriotisme ». Celui-ci a dû prendre une part active à la répression de l'insurrection royaliste du 13 vendémiaire à Paris, action qui sera le point de départ de la carrière du futur empereur. Entre-temps, le général a épousé, à Bitche, place forte de la Moselle, Marie-Thérèse Knoepfler, dont il aura sept enfants. Quatre survivront, trois filles (Marie Françoise Caroline, Marie Rose, Marguerite Henriette) et un garçon (Antoine Emile).