Ayant fait la connaissance de Juan Perón, et séduit par ses idées, il accepta en 1946 le portefeuille nouvellement créé de ministre de la Santé. À ce titre, il fut un promoteur des politiques de santé publique et de la médecine préventive. Il fit construire un grand nombre d’hôpitaux publics, mena des campagnes vigoureuses (et efficaces) contre les maladies endémiques, et réussit à améliorer plusieurs indicateurs de santé publique, tels que la mortalité infantile, le pronostic de la tuberculose, etc. Cependant, insatisfait de l’état d’esprit régnant dans l’administration péroniste, il préféra donner sa démission en 1954. Le putsch militaire de 1955, qui renversa Perón, le surprit au Brésil ; diffamé par le nouveau pouvoir, proscrit, dépouillé de ses biens, il succomba à l’âge de 50 ans, faute de soins adéquats, à la grave hypertension dont il souffrait depuis de longues années, mais non sans avoir encore rédigé plusieurs ouvrages d’anthropologie philosophique. Ses mérites seront dûment reconnus par les autorités argentines à partir de la décennie 2000.