O centro foi fundado pela empresa Condutores Mexicanos (Condumex) com o fim de resgatar fundos bibliográficos e documentários de grande valor histórico que perder-se-iam por falta de conservação ou que seriam vendidos a bibliotecas e arquivos fora de México. Este primeiro centro foi inaugurado em 1965 a iniciativa de Ricardo García Sáinz, aconselhado pelo bibliófilo Luis Gutiérrez Cañedo. Sua primeira aquisição foi a colecção formada por este último, composta por 10 mil volumes principalmente do século XIX e proveniente de fundos como a Diócesis de Guadalajara e correspondência de personagens envolvidas na Independência de México. A partir da primeira colecção comprada inaugurou-se o Centro de Estudos de História de México o 19 de agosto de 1965 na sede da empresa na Industrial Vallejo, dividindo-se desde então entre arquivo e biblioteca.