Der Putsch gegen Salvador Allende 1973 in Chile beeinflusste das Wachstum des Genres stark, da die ganze musikalische Bewegung in den Untergrund gehen musste. Während der Tage des Putsches wurde der bekannte Sänger und Liedermacher Víctor Jara vom neuen Regime unter Augusto Pinochet gefoltert und ermordet. Gruppen wie Inti-Illimani, Quilapayún und Tiempo Nuevo fanden außerhalb des Landes Zuflucht. Die Militärregierung unter Pinochet war bis 1989 an der Macht und verbot traditionelle andine Musikinstrumente, um die "Nueva-Canción"-Bewegung zu unterdrücken. Nach dem Abgang Pinochets wurde das Stadion, in dem Victor Jara umgebracht worden war, in Estadio Víctor Jara umbenannt.