Tonga ile oynanan ve ülkesinin rekor bir şekilde 22-0 kazandığı 2002 FIFA Dünya Kupası elemesi maçında ilk kez Avustralya millî takımı formasını giydi. Bu maçta sonradan oyuna dahil olan Boutsianis bir gol atmayı başardı. 11 Nisan 2001'deki Amerikan Samoası maçında da forma şansı bulup, üç gol kaydederken; takımının aldığı 31-0'lık galibiyette pay sahibi oldu. Bu maçla birlikte Avustralya, uluslararası bir futbol maçında en farklı galibiyet elde eden takım olmuş oldu. Bu iki maçın dışında iki kez daha millî formayı giyen Boutsianis, oynadığı dört maçta toplamda dört gol attı.