1870-luvulla britit perustivat Liittoutuneiden malaijivaltioiden valtioliiton. Johor ei liittynyt liittynyt siihen vaan pysyi liittoutumattomana. Johorissa on säilynyt edelleen vahva tunne itsenäisyydestä. Toisen maailmansodan aikana Japani valloitti 1942 Johoren Malaijan taistelun jälkeen. Japani piti Malakan niemimaata hallussaan vuoteen 1945 asti. Sodan jälkeen Johor liittyi Malaijan federaatioon, joka itsenäistyi Britanniasta vuonna 1957, ja Johorista muodostui Malaijan ja myöhemmin perustetun Malesian osavaltio.