Nach seiner Genesung kämpfte Brooke im Überland-Feldzug mit der Schlacht bei Spotsylvania Court House und vielen anderen Schlachten. Am 12. Mai 1864 wurde er zum Brigadier der Freiwilligenarmee befördert. In der Schlacht von Cold Harbor im Juni verletzte er sich erneut schwer. Später stieg er zum Generalmajor der Freiwilligenarmee auf.