Като отговорни за управлението и поддържането на светилището, амфиктионите се задължават да го защитават дори и с война, ако интересите му са засегнати. За Делфийското светилище се водят няколко свещени войни – най-интересната за историята на Елада става третата срещу фокидците през 343 г. пр. Хр., в която се намесва Филип II Македонски, и с която намеса той (т.е. Древна Македония) става официален член на елинското семейство.