Таунгу возник ещё в 1280 году в качестве укреплённого поселения на вершине холма на берегу Ситауна. Когда Паганское царство было разгромлено монголами — сюда стали стекаться беженцы из Пагана, спасавшиеся сначала от монгольских, а затем от шанских набегов. Укрепление власти его правителей, мьянманцев по происхождению, ознаменовалось принятием в 1347 году царского титула Тхинкабой (правил в 1347—1368) и сооружением дворца в традиционном мьянманском стиле. Таунгу и позже оставался убежищем для мьянманских жителей всех рангов, спасавшихся от феодальных войн и усобиц, постепенно расширяясь в сторону долины Чаусхе, где можно было снимать по три урожая риса в год. Однако прочной власти в Таунгу в это время не было, она в значительной степени зависела от политической борьбы между мьянманцами (из другого их центра — Авы) и монами. В 1377 году Таунгу потерял независимость, войдя в состав Авского государства.