В июле 1918 года принимал активное участие в подавлении левоэсеровского мятежа в Москве. Был делегатом 5-го Всероссийского и 6-го Чрезвычайного съездов Советов. В августе 1919 года Готовский-Быховец добровольно пошёл на службу в Рабоче-крестьянскую Красную Армию. Прошёл путь от командира батальона до командира бригады 17-й стрелковой дивизии. За боевые заслуги Карп Федотович Готовский-Быховец был награждён орденом Красного Знамени за номером 15794 (Приказ Революционного военного совета Республики № 82 в 1923 году).