Migchelsen war als Trainerin verschiedener Vereinsmannschaften und Co-Trainerin der niederländischen U-19-Nationalmannschaft tätig. Während der Fußball-Europameisterschaft 2012 der Männer in Polen und der Ukraine fungierte sie als Scout des Russischen Fußballverbandes im Stab um Cheftrainer Dick Advocaat. Zur Saison 2013/14 ersetzte Migchelsen die ehemalige tschechische Nationalspielerin Jitka Klimková als Trainerin des australischen Erstligisten Canberra United FC.