胥龙之战后，韦弗跟随第2团缓慢进军密西西比州奥尔康县县城科林斯（），并在这里晋升为少校。面对邦联陆军来袭，韦弗表现英勇，对北军取得第二次科林斯之战胜利起到重要作用，为此他也在第二团司令官牺牲后晋升上校。此后，韦弗带领第二团驻守密西西比州。1863年夏，第二团被派往田纳西州和阿拉巴马州边境，负责驻防普瓦斯基周边地区。接下来该团参与了亚特兰大战役中的雷萨卡之战，然后在1864年继续跟随威廉·特库姆塞·舍曼少将经乔治亚州向大海进军。1864年5月，韦弗服役期满并返回爱荷华州的家。战争结束后，韦弗获加衔准将，军衔追溯至1865年3月13日，是多位战后获加衔以表彰其服务的北军军官之一。