У 1911 році Джемаль був призначений губернатором Багдада. Він, однак, майже відразу пішов у відставку, щоб взяти участь в Балканській війні. У жовтні 1912 йому присвоєно звання полковника. Наприкінці 1-й балканської війни він відігравав важливу роль в пропагандистській кампанії проти переговорів з європейськими країнами, яку розгорнули «младотурки». Він намагався вирішити проблеми, що виникли в Стамбулі після перевороту 1913 роки. Джемаль зіграв значну роль у Другій балканській війні, а після перевороту, вчиненого 23 січня 1913 року, він став начальником гарнізону Стамбула і був призначений міністром громадських робіт. У 1914 році він став міністром морського флоту.