Tijdens de Russisch-Japanse Oorlog was de Mikasa het vlaggenschip van admiraal Heihachiro Togo. Het schip nam actief deel aan de strijd en nam deel aan de Slag bij Tsushima in 1905. Kort na de oorlog kwam door een ongeluk een munitiekamer tot ontploffing en zonk. Het duurde twee jaar voor het schip gerepareerd was. Het deed daarna vooral dienst bij de kustverdediging tijdens de Eerste Wereldoorlog en nam deel aan de Japanse expeditie in Siberië tijdens de Russische Burgeroorlog.