Sau vụ tấn công khủng bố ngày 11 tháng 9 năm 2001, Giuliani đã tin tưởng Nathan với việc phối hợp các nỗ lực của Trung tâm Hỗ trợ Gia đình tại Bến tàu 94, một yêu cầu tranh chấp của Giám đốc đầu tiên của Văn phòng Quản lý Tình trạng Khẩn cấp của Thành phố New York, Jerry Hauer, nhưng được hỗ trợ bởi những người khác nói rằng cô ấy đã đóng một vai trò có giá trị trong đó kéo dài bốn tháng. Rudy Giuliani đã viết về giai đoạn này trong cuốn sách Leadership năm 2002 của mình, giải thích rằng cô có khả năng phục vụ như một cố vấn thị trưởng vững chắc sau ngày 11 tháng 9 bởi vì cô "đã là một y tá trong nhiều năm, và sau đó là một giám đốc dược phẩm, cô đã quản lý một nhóm người và có nhiều kỹ năng tổ chức. Hơn nữa, cô có kiến thức khoa học và chuyên môn nghiên cứu sâu rộng." Ngoài ra, anh ta nói rằng anh ta "đưa cô ta đi làm giúp tôi tổ chức các bệnh viện" để hỗ trợ những người bị thương trong các vụ tấn công.