В 1454 году князь Рудольф Жаганьский принял участие в Тринадцатилетней войне на стороне Тевтонского ордена против Польского королевства. Собрав под своим началом около 1900 вооруженных пехотинцев и всадников, он прибыл в Свидвин. Он не был единственным силезским князем, воевавшим на стороне Ордена. Вместе с чешским военачальником Бернардом Шумборским Рудольф Жаганьский командовал 15-тысячным орденским войском в битве под Хойницами 18 сентября 1454 года, где польско-шляхетское ополчение понесло полное поражение. В сражении погибло около трех тысяч человек со стороны поляков, а около 300 рыцарей было взято в плен. В битве князь Рудольф не выжил — он погиб в начале сражения, после решительной атаки тяжелой польской кавалерии. Не известно, где он был похоронен.