Zgodnie z przyjętą w 2000 r. przez Niemcy polityką dot. energii atomowej, blok 1 elektrowni Isar powinien był zostać wyłączony z eksploatacji do 2011 r. Operator elektrowni, spółka E.ON, zainwestował jednak 800 mln euro w prace modernizacyjne na rzecz zwiększenia bezpieczeństwa, w związku z czym w październiku 2010 r. przedłużono jednak okres działalności reaktora o kolejnych 8 lat do 2019 r. Po katastrofie w elektrowni jądrowej Fukushima Daiichi w marcu 2011 r. zadecydowano o tymczasowym wyłączeniu bloku 1 ze względów bezpieczeństwa. Następnego dnia poinformowano, że moc bloku zostanie zmniejszona do 15%, jednak 17 marca ministerstwo środowiska Bawarii nakazało wyłączenie reaktora, co stało się tego samego dnia. Od tego czasu reaktor pozostaje wyłączony na stałe.