In Robert Bordens Regierung erhielt Sifton einen als wenig bedeutend empfundenen Ministerposten, jenen des Zollministers. Im Mai 1918 übernahm er zusätzlich die Leitung der Bundessteuerbehörde. Von September bis Dezember 1919 war er Minister für öffentliche Bauten. Im Jahr 1919 nahm Sifton außerdem als Delegierter an der Pariser Friedenskonferenz teil und unterzeichnete den Friedensvertrag von Versailles. Borden ernannte ihn am 31. Dezember 1919 zum Außenminister. Auch unter Arthur Meighen, der ab Juni 1920 die Regierung führte, blieb Sifton in diesem Amt. In diesem Jahr wurde er in den Privy Council aufgenommen. Sifton starb im Januar 1921 nach kurzer Krankheit im Alter von 62 Jahren. Er wurde auf dem Nationalfriedhof in Ottawa beigesetzt.