1912年中华民国建立后，裁撤游美学务处，学堂改名为清华学校，分中等科四年、高等科四年共计八年学制。唐国安为第一任校长，周诒春为，在校生约500人，教员30余人，以“培植全材，增进国力”为宗旨培养“领袖人才”。1913年春，近春园、长春园东南隅、水磨村部分地段并入清华大学。1914年10月，美国建筑师墨菲与为学校规划校园，布置留美预备学校和综合大学。1916年至1920年，建成图书馆、体育馆、科学馆、大礼堂等早期建筑。此期间，经费充足、园林优美，学习环境十分理想。学校强调体育锻炼和强健体魄，设立体操课，午后“强迫运动”，开办童子军训练和军事训练（兵操）；参加菲律宾第一届远东运动会；清华、协和、汇文合办的“三角运动会”为北京最早校际大赛。各界名人学者也前来演讲，1914年11月5日，梁启超先生以“君子”为题发表演讲，引述易经中“天行健，君子以自强不息”及“地势坤，君子以厚德载物”，对清华学子给予厚望。后“自强不息、厚德载物”被定为校训。