Nach dem Tod Präsident Habyarimanas am 6. April 1994 wirkte er als Vertreter der MDR an der Installierung der Übergangsregierung mit. Auf der Sitzung des militärischen Krisenkomitees schlug er seinen Parteikollegen Jean Kambanda für das Amt des Premierministers vor. Während des Völkermords an den Tutsi von April bis Juli 1994 forderte er im Radiosender RTLM die Ermordung von Tutsi. Er soll auch persönlich Morde an Tutsi begangen haben, darunter Mitgliedern seiner eigenen Familie.