Le régime satisfait également les monarchiens qui espèrent profiter des élections au Directoire pour y placer leurs hommes, et favoriser ainsi à terme un retour de la monarchie en France. Sentant la menace, les Thermidoriens proclament le décret des deux tiers, rendant obligatoire la présence de deux tiers de conventionnels dans les nouveaux conseils législatifs. Le 23 septembre, la Constitution est approuvée par plus d'un million de contre moins de . L'acceptation du principe des deux tiers est, en revanche, beaucoup plus précaire, avec seulement contre , tandis que des fraudes ont eu lieu pour faire taire les opposants. Cette situation laisse donc attendre des troubles. Ceux-ci éclatent le an IV () lorsque sans plan bien défini marchent sur les Tuileries où siège la Convention. C'est à Paul Barras que revient la charge de commander les opérations de défense, tandis que le général Bonaparte dirige l'artillerie qui mitraille les insurgés jusqu'à leur dispersion. La répression reste cependant modérée en comparaison de celle qui a touché les insurrections précédentes. Le Directoire étant accepté, il reste à le mettre effectivement en place par le biais d'élections législatives (tenues en 1795).