Serna ainda participou da Copa de 1998, jogando as 3 partidas da seleção, que novamente amargou a eliminação na primeira fase. Ele nunca jogou a Copa América em toda sua trajetória internacional, sendo preterido por Francisco Maturana na edição de 2001, sediada e vencida justamente pelos colombianos. Seu último jogo pelos "Cafeteros" foi em novembro do mesmo ano, e Serna deixou o futebol internacional após 51 jogos e 2 gols.