Während des Krieges gegen Österreich stand er seit März 1866 an die Spitze des im Generalstab ansässigen neugegründeten Nachrichtendienstes. Ein letzter persönlicher Versuch das Königreich Hannover vom Krieg gegen Preußen abzuhalten, scheiterte. Er traf am 26. Juni mit König Georg V. in Langensalza zusammen, ohne etwas zu erreichen. Über seine kurze Audienz bei Georg V. berichtet Doering später: "„Ich leitete die Unterredung mit der Aeußerung meines schmerzlichen Bedauerns ein, daß Seine Majestät, wie ich bereits durch den Lieutenant v. Broesigke erfahren habe, zu keinem Arrangement geneigt seien, welches dazu geeignet sei, Blutvergießen vorzubeugen, daß ich mich aber, trotz der geringen Aussicht auf Erfolg, verpflichtet erachte, auch meinerseits den Versuch zu machen, Seine Majestät zur Annahme der von mir überbrachten Vorschläge zu bewegen. Auf die Frage des Königs; ‚Von wem haben Sie Ihren Auftrag?‘ erwiderte ich: ‚Von Seiner Majestät dem König von Preußen‘ und auf die Frage: ‚Vom König selbst?‘ - ‚durch den Minister-Präsidenten Grafen v. Bismarck.‘ Hierauf fragte der König: ‚Was will der Mensch?‘, was mich zu der Aeußerung veranlaßte: ‚Ich muß vor allen Dingen unterthänigst bitten, daß Eure Majestät in Betracht ziehen, daß Sie von einem preußischen Minister sprechen, und darnach Ihre Ausdrücke wählen!‘ Der König sagte hierauf: ‚Nun, wir sind alle Menschen‘, und forderte mich auf, meinen Auftrag mitzutheilen.“" Während des Vormarsches in Böhmen gehörte er als Sektionschef im Generalstab zum Großen Hauptquartier Moltkes und wohnte am 3. Juli 1866 der Schlacht von Königgrätz bei. Nach dem Friedensschluss erfolgte seine Ernennung zum Kommandeur des 3. Garde-Grenadier-Regiments Königin Elisabeth in Dresden, zu dessen preußischer Besatzung es damals gehörte, und führte es im Mai 1867 in seine Friedensgarnison Breslau zurück.