À la fin de la domination ottomane, les villes et villages des Rhodopes ont pris une part importante à l’insurrection d'avril 1876. La répression féroce qui s’abattit sur la région conduisit à de nombreux massacres, dont le massacre de Batak, perpétré par des bachi-bouzouks manifestement incontrôlés. Les Rhodopes septentrionales furent libérées de la domination ottomane lors de la guerre russo-turque de 1877-1878, mais les Rhodopes méridionales restèrent ottomanes, même si, en vertu du traité de San Stefano, leur partie occidentale devait passer sous souveraineté bulgare. Les Rhodopes bulgares firent partie de la province autonome de Roumélie orientale, jusqu’à son intégration en 1885 à la principauté de Bulgarie. Certaines localités pomaques s'efforcèrent cependant de rester indépendants dans le cadre de la République de Tămrăš, qui fut cependant rendue à l'Empire ottoman après l'unification de la principauté de Bulgarie et de la Roumélie orientale. Cette rétrocession fut sanctionnée par la signature en 1886 de la convention de Tophane. La partie méridionale du massif fut annexée par la Bulgarie lors de la Première Guerre balkanique (1912-1913), malgré une éphémère tentative de république (Gouvernement provisoire de Thrace occidentale d'août à ), mais la partie occidentale fut annexée par la Grèce après la Deuxième Guerre balkanique (1913).