초기 1966년 뉴욕에 사무공간을 대량 공급하기 위해 계획되었다. 1966년 뉴욕 항만청은 기존에 있던 건물들을 철거하면서, 1970년 착공하였다. 착공 4년 만인 1974년 완공 및 개장했다. 이후 1993년 2월 26일 폭탄 테러가 발생하여 1994년까지 폐장하였으며 1994년 재개장 하였다. 2001년 9월 11일 1 월드 트레이드 센터 건물이 붕괴되면서 그 잔해가 6 월드 트레이드 센터를 덮쳤다. 잔해가 덮치면서 내부에 대형 화재가 발생했고, 이로 인해 심한 구조적 충격을 받았다. 또한 건물 중앙에 대형 크레이터가 하나가, 남동쪽에 작은 크레이터 하나가 발생하였다.