Após o retorno de Napoleão de Elba, em 1815, Murat, depois de alguma hesitação, colocou-se no lado do imperador e empreendeu uma guerra contra os austríacos, com a participação de Pepe. Depois de muita luta, os napolitanos foram forçados a retirarem-se depois da Batalha de Tolentino (da qual Pepe participou), e, consequentemente, assinaram o Tratado de Casalanza, pelo qual Murat deveria abandonar o reino. Os oficiais, no entanto, conservaram suas patentes sob Fernando IV, que reassumiu o trono.