Memasuki tahun 1993, ketika krisis mendera maskapai Gulf Air, pemerintah Oman yang tidak ingin ikut ke dalam pusaran krisis yang diakibatkan oleh Perang Teluk I membuat pemerintah akhirnya meresmikan pendirian dari Oman Air. Operasional pertama maskapai ini dimulai pada bulan Maret dengan pesawat Boeing 737-300 dari Ansett World Airways Services yang terbang dari Muskat ke Salalah. Pada bulan Juli tahun yang sama, penerbangan internasional pertama maskapai dioperasikan ke Dubai, dengan menggunakan pesawat yang sama. Pada bulan-bulan berikutnya, Penerbangan ke tujuan lain diluncurkan ke Trivandrum mulai November, Kuwait dan Karachi pada bulan Januari 1994, dan Kolombo pada bulan Oktober. Pada tahun 1995, dua Airbus A320 yang disewa dari Region Air Singapura didatangkan untuk menggantikan armada sebelumnya. Sepanjang tahun 1995 hingga 1997, berbagai layanan diluncurkan ke Mumbai, Dhaka, Abu Dhabi dan Doha serta Chennai. Pada bulan Oktober 1998, Oman Air bergabung dengan organisasi avasi terbesar dunia, Internasional Air Transport Association (IATA). Pada akhir tahun, Gwader, Peshawar, Jeddah dan Al-Ain dimasukkan dalam jaringan rute.