עם תחילת מלחמות הבלקן הוחזר אנדראס לשירות בצבא היווני ואליס שימשה כאחות. תרומתה העיקרית הייתה בהקמת בתי חולים צבאיים בחזית, ועל תרומה זו קיבלה מהמלך ג'ורג' החמישי את "אות הצלב האדום". במהלך מלחמת העולם הראשונה הכריז אחיינה, המלך קונסטנטינוס על יוון כנייטרלית, למרות תמיכתה של הממשלה הנבחרת במדינות ההסכמה. בזמן הפצצת אתונה על ידי צרפת בשנת 1916, נאלצו אליס ומשפחתה לתפוס מחסה במרתפים של הארמון המלכותי. ביוני 1917, כאשר נאלץ המלך לוותר על המלוכה, נאלצו אליס וחברים אחרים רבים במשפחת המלוכה היוונית לעזוב את יוון ולצאת לגלות. את השנים הבאות בילתה רוב משפחת המלוכה בשווייץ.