Хрватска је учествовала на 11. Светском првенству у атлетици у дворани 2006. одржаном у Москви од 10. до 12. марта. О свом осмом учешћу на светским првенствима у дворани репрезентацију Хрватске представљале су две атлетичарке, које су се такмичиле у две дисциплине.