Il 2018 lo vede ingaggiato da Ducati Corse in veste di collaudatore ufficiale per lo sviluppo della nuova Ducati Panigale V4R SBK e partecipa sempre al campionato italiano dove ottiene due vittorie e conclude la stagione al terzo posto. Nella gara di Vallelunga durante la qualifica stabilisce il nuovo primato assoluto per le motociclette appartenuto in precedenza da Troy Bayliss. Il 2019 vede Zanetti nuovamente impegnato nel CIV oltre a disputare, in qualità di wild card il Gran Premio di Imola nel mondiale Superbike con una Panigale V4 del team Motocorsa e il Gran Premio di Misano come pilota sostitutivo per il Team Go Eleven. Ottiene ventuno punti chiudendo al ventesimo posto in classifica piloti e al decimo nella graduatoria del trofeo Indipendenti.