Hon har sedan 2001 spelat i det svenska landslaget. Nilla Fischer gjorde VM-debut i Kina, fredagen den 14 september 2007, i matchen mot . Hon kunde inte medverka i premiärmatchen mot Nigeria då hon varit magsjuk tidigare. Matchen mot USA slutade 2–0 till USA. I OS i Peking 2008 gjorde hon det avgörande 1–0-målet i gruppspelsmatchen mot Argentina.