Il 9 maggio 2017, a seguito dell'esonero dello stesso Pioli, viene richiamato per condurre la squadra nelle ultime tre partite di campionato. Al suo secondo esordio sulla panchina nerazzurra perde per 2-1 contro il ; vince poi contro la per 1-3 e contro l' per 5-2 chiudendo il campionato al 7º posto.