Durante Segunda Guerra Mundial vivió en Polonia, donde fue miembro de la Żegota. Más tarde cruzó la Frontera interalemana y huyó a Francia en 1945, donde vivió el resto de su vida. Por un tiempo, Czapska ayudó a Tygodnik Powszechny, y ya en París trabajó para la revista "Kultura". También fue miembro de la Sociedad polaca de Ciencias y Artes en el Extranjero. Durante su exilio, sus obras fueron objeto de censura en Polonia. Cuando el escritor Tomasz Strzyżewski huyó a Suecia, el nombre de Maria Czapska salió a relucir. En París, se centró en su obra literariaa, publicando algunas obras de importancia: "Dwugłos wspomnień", "Europa w rodzinie" o "Czas odmieniony". En 2014, dos de sus libros, "Una familia de Europa Central" y "A través de la tormenta", fueron publicados en inglés.