Als Erster aus der Gruppe wurde Eduard Klinik am 21. September 1940 an seiner Arbeitsstelle unter dem Vorwurf verhaftet, er plane einen Staatsstreich. Zusammen mit seinen Freunden Czesław Jóźwiak, Edward Kaźmierski, Franciszek Kęsy und Jarogniew Wojciechowski kam er zunächst auf das berüchtigte Fort VII in Posen und wurde am 16. November 1940 in ein Gefängnis in Wronki eingeliefert. Im April 1941 wurde die Gruppe nach Berlin und im Mai 1942 nach Zwickau verlegt. Dort wurden die Angeklagten wegen Vorbereitung zum Hochverrat zum Tode verurteilt. Der Strafsenat des Oberlandesgerichts Posen tagte dazu am 31. Juli 1942 in der Untersuchungsanstalt Zwickau. Edward und seine Freunde wurden mit anderen Verurteilten aus dem polnischen Widerstand beschuldigt, Mitglieder der polnischen Nationalpartei SN gewesen zu sein. Sie gehören zu den Opfern der mit äußerster Härte betriebenen Germanisierungspolitik des nationalsozialistischen Deutschlands im sogenannten Warthegau, die sich nicht selten gerade auch gegen kirchliche Gruppen und Intellektuelle wandte. Bei der Verurteilung, für die die katholischen Überzeugungen der Jungen keine Rolle spielten, wandte das Gericht rückwirkend die sogenannte Polenstrafrechtsverordnung vom 4. Dezember 1941 an, die auch für geringste Vergehen besonders drakonische Strafen ermöglichte. Die Verhängung der Todesstrafe wurde mit der nach Ausbruch des Deutsch-Sowjetischen Krieges gebotenen Abschreckungswirkung begründet.