Durante la Guerra de los Ducados en 1864, participó en acciones navales contra la flota austrohúngara en la batalla de Heligoland del 9 de mayo de 1864. La “Jylland” junto a la “Niels Juel” y la “Heimdall” batió a otras dos fragatas de hélice austriacas y tres cañoneros prusianos, pero fueron incapaces de mantener el bloqueo sobre los puertos prusianos del mar del Norte. La “Jylland” recibió daños considerables durante el combate.