Στις 16 Ιουνίου 1972 διορίστηκε Υπουργός Δικαιοσύνης στην Κυβέρνηση Αρχιεπισκόπου Μακαρίου Γ΄ 1968, θέση στην οποία παρέμεινε και στην Κυβέρνηση Αρχιεπισκόπου Μακαρίου Γ΄ 1973 έως τις 15 Ιουλίου 1974, ημέρα του πραξικοπήματος. Κατά τη διάρκεια της θητείας του απήχθη από την ΕΟΚΑ Β΄ και κρατήθηκε ως όμηρος για ένα σχεδόν μήνα. Ο Γεώργιος Γρίβας μέσω φυλλαδίου έθεσε πέντε όρους στον Αρχιεπίσκοπο Μακάριο Γ΄ για απελευθέρωση του, ένας εκ των οποίων ήταν να επιλέξει ο Μακάριος μεταξύ αρχιεπισκοπικού θρόνου και προεδρίας της δημοκρατίας. Ο Μακάριος δεν υπέκυψε στον εκβιασμό και ο Χρίστος Βάκης αφέθηκε ελεύθερος ένα μήνα μετά.