В 1267 или 1268 году Михаил II умер, и его владения были разделены между двумя сыновьями: Никифору достался Эпир, а Иоанну — Фессалия. Византия не пыталась захватить Эпир, и Никифор I наследовал своему отцу. С этого момента правители Эпира больше не оспаривали императорский титул у Константинополя, довольствуясь титулом деспота. В 1270 году остров Корфу был захвачен королём Сицилии и Неаполя Карлом I Анжуйским, который готовился к крупномасштабному походу на Константинополь, намереваясь возродить Латинскую империю. В 1272 году он захватил Диррахий и большую часть Албании, провозгласив себя королём Албании. Никифор I Комнин Дука заключил с ним союз, согласившись стать его вассалом. В 1280 году армия Карла I захватила Бутринти и начала осаду Берата. Но осада окончилась неудачно, византийская армия в 1281 году смогла отбросить армию Карла, что дало императору Михаилу VIII Палеологу контроль за внутренней частью Албании и северным Эпиром. Прибрежные города остались у Карла Анжуйского. Более того, в 1282 году произошло восстание на Сицилии (Сицилийская вечерня), и Карл был вынужден отказаться от полномасштабной войны с Византией. Таким образом Албания была потеряна для Эпирского деспотата.