Die "Task Force 38" der 3. US-Flotte unter Halseys Kommando geriet am 18. Dezember 1944 etwa 200 Seemeilen östlich der Philippinen in den schweren Taifun Cobra, drei Zerstörer kenterten, neun Schiffe wurden schwer beschädigt, und 790 Seeleute kamen ums Leben. Die Flotte war dann noch unter Halseys Kommando an einigen weiteren Schlachten, unter anderem bei Angriffen auf Landziele im Südchinesischen Meer und Mitte des Jahres bei den Angriffen auf die japanischen Inseln im Einsatz. Am 29. August führte Halsey an Bord seines Flaggschiffs USS Missouri die Flotte in die Bucht von Tokio, wo am 2. September die Kapitulation Japans unterzeichnet wurde.