Durch den Prager Aufstand gegen die deutsche Besatzung, der am 5. Mai 1945 begann, wurde die Protektoratsregierung gestürzt. Der Aufstand war faktisch am 8. Mai beendet; am 9. Mai 1945 marschierte die Rote Armee in Prag ein. Im Zuge des Prager Aufstandes wurde Helmuth Gabriel als hochrangiger NS-Funktionär auf Grund einer Anordnung des NKWD festgenommen und von den Sowjets in ein Speziallager nach Bautzen gebracht. Dort starb er am 22. August 1945 im Alter von nur 53 Jahren infolge der schlechten Lebensbedingungen.