Initialement pendant la guerre, la Grèce suit une politique de neutralité, bien que le Premier ministre Elefthérios Venizélos privilégie la Triple-Entente mais le roi Constantin Ier de Grèce fait savoir à l'Allemagne son choix de la neutralité. Ce différend conduit à un conflit politique profond, appelé le schisme national. En , afin de faire pression sur le gouvernement royal à Athènes, les Français confisquent les navires grecs. Ceux-ci continuent leurs missions avec des équipages français, principalement pour assurer des escortes de convois et patrouilles en mer Égée, jusqu'à l'entrée en guerre de la Grèce aux côtés des Alliés en : les bâtiments de la marine sont rendus à la Grèce. Par la suite, la marine grecque prend part aux opérations alliées de la mer Égée, dans l'expédition alliée à l'appui du général Dénikine des armées blanches en Ukraine mais aussi dans les opérations de guerre gréco-turque (1919-1922) en Asie Mineure.