Lowes gick Roadracing-VM 2017 upp i kungaklassen MotoGP som fabriksförare för Aprilia med Aleix Espargaró som stallkamrat. Lowes hade svårt att hålla sig på hjulen och tog endast 5 poäng vilket räckte till 25:e plats i VM. Trots ett tvåårigt kontrakt med Aprilia fick inte Lowes fortsatt förtroende utan återvände till Moto2-klassen säsongen 2018. Han kör en KTM för stallet Swiss Innovative Investors.