Nach mehreren Umbenennungen wurde die Akademie von 1308 bis 1358 und erneut ab 1362 "Songgyungwan" genannt. Die Gebäude des Komplexes wurden während des Imjin-Kriegs (1592–1598) zerstört. Die heute noch stehenden Gebäude wurden zwischen 1602 und 1610 im Stil der Goreyo-Zeit rekonstruiert. Zur Unterscheidung von der nach der Verlegung der Hauptstadt nach Hanyang (Seoul) 1398 dort gegründeten Bildungseinrichtung, die ebenfalls "Songgyungwan" genannt wurde und aus der später die Sungkyunkwan-Universität hervorging, wird der Gebäudekomplex in Kaesŏng als "Koryo Songgyungwan" bezeichnet.