Aaltonen otti kaudella 2012–2013 ison askeleen eteenpäin SM-liigassa ja hän teki 15 ensimmäisessä ottelussaan kahdeksan maalia. Kaikkiaan Aaltonen teki kauden aikana 32 runkosarjaottelussa tehot 11+5=16, kunnes hänen kautensa todettiin päättyneeksi nilkkavamman takia alle 20-vuotiaiden MM-kilpailuissa joulukuussa 2012. Aaltonen kuitenkin kuntoutui toipui pelikuntoon juuri ennen A-nuorten kevään 2013 pudotuspelien alkua. Hän vahvisti loppukevään Bluesin A-nuoria, jotka voittivat kauden päätteeksi SM-hopeaa. Aaltonen teki lokakuussa 2012 kaksivuotisen jatkosopimuksen Bluesin kanssa. Huhtikuussa 2013 sitä jatkettiin vuodella kevääseen 2015 saakka.