El terrorismo derivó en matanzas en los extrarradios de Argel en 1997. En estos años, hacia el final de la guerra, la lucha armada islamista perdió la mayor parte del apoyo popular y su fracaso supuso también el fracaso y la frustración de las clases medias y bajas, incapaces de acceder a la política como lo había hecho el FIS a finales de los años 80 y principios de los años 90. Los grupúsculos armados como el GIA ya no constituían, a finales de la década de los 90, sujetos políticos relevantes. Esa falta de apoyos y la división del FIS permitió al Estado argelino controlar finalmente el islamismo y la situación política, y absorber a las clases medias religiosas y a la burguesía que estaban dispuestas a pactar la paz a cambio de no perder su estatus económico y de poner en marcha reformas económicas de corte liberal. Sin embargo, a pesar de la disolución del GIA en septiembre de 1997, y a pesar de la liberación de Abbasi Madani en julio de ese mismo año, la violencia y las matanzas continuaron durante el año siguiente con los grupúsculos que surgieron de esta disolución. Abdelkader Hachani, el líder del FIS que encabezaba las negociaciones con el régimen, fue asesinado el 22 de noviembre de 1999. El país fue recobrando progresivamente la estabilidad con el cambio de siglo, a pesar de la represión gubernamental y la continuación de la violencia después de 1999, si bien hoy en día continúan produciéndose pequeños conflictos de baja intensidad en algunas zonas y resulta difícil poner una fecha de final a la guerra civil argelina.