Deze tekortkomingen kwamen de Sovjet-Unie duur te staan toen de Duitsers aanvielen. De "Dekabrist"-klasse werd toen voor zover mogelijk gemoderniseerd en vervolgens gestationeerd in de Zwarte Zee en Oostzee. Van de nog vijf beschikbare duikboten overleefden slechts twee de gevechtshandelingen. "D-6" werd beschadigd door een luchtaanval en uiteindelijk door de Russen zelf tot zinken gebracht, de "D-3" liep voor de Noorse kust op een mijn en de "D-4" ontmoette zijn noodlot tijdens een treffen met de Duitse duikbootjagers "UJ-102" en "UJ-103".