기원전 4세기에 포키스는 이웃 보이오티아에 의해 끊임없는 위험에 노출되었다. 코린토스 전쟁에서 스파르타의 보이오티아 침공을 지원한 후(기원전 395년 – 기원전 394년), 포키스는 수세적인 입장에 놓였다. 기원전 380년에 스파르타의 도움을 받았지만, 국력을 신장한 테바이에 순종을 강요받았다. 포키스 군은 에파메이논다스의 펠로폰네소스 반도 침략에 참여했다. 그러나 만티네이아에서의 마지막 전투(기원전 370년 – 기원전 362년)를 제외하고, 그곳에 군대를 파병하기를 거부했다. 그 보복으로 테바이는 종교적인 논쟁을 끈질기게 부추겨, 기원전 356년 암피크티오니아 동맹 회의에서 포키스가 불이익을 당하는 형벌 판결을 받게 했다. 궁지에 몰린 쥐가 고양이를 물듯이 포키스는 필로멜로스와 동생 오노마르코스와 같은 유능한 장군이 병력을 이끌고 델포이를 점거하여 약탈한 재산으로 용병군을 고용했다. 포키스 동맹군의 도움으로 포키스는 먼저 보이오티아와 테살리아까지 쳐들어 갔지만, 마케도니아 왕국의 필리포스 2세에 의해 테살리아에서 추방되었다. 그러나 국가 자체는 신전의 보물 고갈과 지도자들의 배신이 필리포스의 자비에 맡겨지기까지 10년 동안 유지되었다. 필리포스 2세는 신전의 재산 반환과 울타리 없는 마을에 인구를 분산하라는 조건을 의무적으로 내세웠지만, 그것은 곧 무시되었다. 기원전 339년, 포키스는 도시를 재건하기 시작했다. 이듬해 기원전 338년에는 카이로네이아 전투에서 아테나이-테바이 연합군으로 필리포스 2세와 싸웠지만, 마케도니아 왕국의 압도적인 승리로 끝나고, 마케도니아 왕국의 영향력 하에 들어갔다.