La présence française est très mal vécue dans la région. Les habitants espèrent un éventuel débarquement britannique qui libérerait le pays. L'Église est la cible de la France révolutionnaire. Les églises sont fermées ; les béguinages, les cloîtres, les abbayes sont abandonnés ; les bâtiments vendus ou même parfois démolis. Lorsque, le 5 décembre 1798, une loi impose le service militaire à tout homme de 20 à 25 ans, les habitants prennent les armes et se révoltent. C'est ce que l'on appelle la guerre des paysans ou encore "Boerenkrijg" dans la région. Cette révolte ne durera que quelques mois et fut sévèrement réprimée (170 leaders furent exécutés).