Anfang Januar 2012 wurde Kaisa Mäkäräinen als erste Biathletin überhaupt zum Finnlands Sportler des Jahres 2011 gewählt. 2016 wurde sie auf der Finnischen Sportgala mit dem Preis "aufregendster Moment im Sport" für den Empfang der Bronzemedaille bei den Heimweltmeisterschaften in Kontiolahti ausgezeichnet. 2018 erhielt sie die Holmenkollen-Medaille, die höchste norwegische Auszeichnung im Skisport. Im Februar 2021 wurde Mäkäräinen auf der Finnischen Sportgala als "Botschafterin des finnischen Sports" ausgezeichnet. Der Preis wurde von ihrem Patenkind überreicht und ihre Lieblingsband Apulanta würdigte sie mit einem Liveauftritt.