El veritable significat de la divisió va ocórrer entre els desembarcats que estaven preparats per comprometre's amb els "Realistes" sempre que es garantissin les seves terres i drets civils, i aquells, tal com Owen Roe O'Neill, que volia anul·lar completament la presència britànica a l'illa. Els nadius demandaven una Irlanda catòlica i independent i la permanent expulsió dels colons anglesos. La majoria dels militants estaven conscienciats a recuperar terres ancestrals de les seves famílies que havien perdut durant la colonització. Després de lluitar amb els "Confederats", O'Neill es va retirar amb els seus homes cap a l'Ulster i no es va tornar a unir als seus antics camarades fins a la reconquesta de Cromwell en 1649. La lluita interna, va obstaculitzar fatalment els preparatius de la "Confederació de lleials a la Corona", aliança per repel·lir la invasió del parlamentari Nou Exèrcit Model.