Il se marie en 1781 avec la riche Françoise Vockestaert et acquiert la propriété de Pasgeld, près de Delft. Il devient un des meneurs des patriotes bataves, soutenant publiquement la municipalité d'Alkmaar qui avait pris une résolution limitant le pouvoir du stathouder. Le 7 avril 1785, il devient procureur à l'amirauté de la Meuse, à Rotterdam. Il travaille notamment à la réorganisation de la flotte, après la Quatrième guerre anglo-néerlandaise. Le 6 février 1788, après la répression prussienne de la Révolution batave, il est banni par les États généraux des Provinces-Unies pour ses activités patriotes, à l'instigation du grand pensionnaire de Hollande Laurens Pieter van de Spiegel, qui reconnaîtra avoir été injuste avec Paulus.