バークレー郡はウェストバージニア州で2番目に古い郡である。1772年2月にバージニア植民地議会により、フレデリック郡の北3分の1が分離して設立された。設立のときは現在のジェファーソン郡とモーガン郡も含んでいた。歴史家の多くは、郡名がバージニア植民地総督を1768年から1770年まで務めたボトトート男爵ノーボーン・バークレー（1718年-1770年）に因んだ命名と考えている。例えばウェストバージニア州のブルーブックでは、バークレー郡がノーボーン・バークレーに因む命名であると記している。ノーボーン・バークレーは1761年にイングランドのノースグロスターシャー民兵隊で大佐を務め、1764年に貴族に列せられるまで、同地域代表の庶民院議員を務めた。モーリス・ド・バークレー（ -1361年）とその妻でジョン・ボトトートの姉妹かつ共同相続人であるキャサリン・ド・ボトトートの直系子孫として、ボトトート男爵を称した。ジョン・ボトトートは、1309年から1315年に令状によって男爵となった初代ボトトート男爵ジョン・ド・ボトトート（ -1324年）の息子かつ相続人だった。モーリス・ド・バークレーは、モーリス・ド・バークレー（ -1347年、カレー包囲戦で戦死）の息子かつ相続人であり、この先代は第2代バークレー男爵モーリス・ド・バークレー（1271年-1326年）の次男であり、1337年にグロスターシャーストークギフォードの荘園を取得していた。ノーボーン・バークレーはギャンブルで大きな借金を背負い、政府に任官を懇願し、1768年7月にバージニア総督に任官された。1769年、イギリスの政府が歳入を増やす手段として新たな課税を要求したことと、犯罪の被告を裁判のために本国に送り返すよう要求したことに対し、植民地議会が反対する決議を採択したことで、バークレーは躊躇しながらも議会を解散した。議会との対立はあったものの、バークレーは植民地人に尊敬されており、特に本国議会に課税を撤廃するよう文書を送ったあとはなおさらだった。本国議会が課税の撤廃を拒否した時、バークレーはリコールを要求した。バークレーの尽力を感謝した植民地人はその記念碑を建立し、それが今もウィリアムズバーグに残っている。またバージニア州のボトトート郡とこのバークレー郡にその名前を残している。