Berikutan penemuan benua Amerika oleh Christopher Columbus untuk Sepanyol, pihak Sepenyol banyak menurunkan ekspedisi ke rantau itu, dan memulakan penaklukan tanah-tanah Maya pada 1520-an. Pada tahun 1540, Sepanyol menubuhkan Jeneral Kapten Guatemala, yang terbentang dari selatan Mexico ke Costa Rica, maka melalui kebanyakan kawasan yang kini dikenali sebagai Amerika Tengah, kecuali British Honduras (kini Belize). Ini bertahan selama hampir tiga abad, sehingga bangkitnya pemberontakan (yang jelas menyusuli Perang Kemerdekaan Mexico) pada tahun 1821.