В 2001 году Агирре в первый раз возглавил сборную Мексики, на Кубке Америки 2001 сборная под его руководством выиграла серебряную медаль, уступив в финале Колумбии. На чемпионате мира 2002 Мексика выиграла свою группу, но на первом этапе плей-офф уступила сборной США.