退役後的施丹只間中以個人名義在慈善賽出現。其後，他先後擔任皇家馬德里的顧問、總監、助教及青訓營教練。對於會否出任一隊教練，施丹曾表示「未有打算，可是將來什麼也會發生」。2016年1月4日，皇家馬德里正式宣布由齐达内接替剛被辭退的貝尼特斯成為主帥，於2015/16球季的餘下聯賽賽事中敗於巴塞羅那僅居亞軍﹔歐洲聯賽冠軍盃決賽憑具爭議性的越位入球，在法定時間及加時1-1打和後，互射十二碼以5-3險勝馬德里體育會封王。至此，施丹分別曾經以球員、助教及領隊身份協助皇馬奪得歐洲冠軍，亦成為第七位於球員時代和執教生涯皆能取得歐冠盃的人。2016/17球季則帶領皇馬暌違五年重奪西甲冠軍及成為歐冠盃改制後首支能夠衛冕的球隊。2018年，施丹帶領皇馬連續三年贏得歐聯冠軍。