Пока Салазар был дееспособен, этот вопрос не стоял. Более того, в апреле 1961 года Томаш сыграл определённую роль в срыве попытки военного переворота, предпринятой министром обороны Жулиу Ботелью Монишем. Однако болезнь премьера в 1968 году сделала невозможным его дальнейшее пребывание у власти. 27 сентября 1968 года президент Томаш вынужден был издать указ об отстранении Антониу Салазара с поста главы правительства и назначении премьер-министром Марселу Каэтану. Этот шаг был основан на сложном компромиссе и обставлен рядом условий, главное из которых состояло в продолжении правительством войны в Африке ради сохранения колониальной империи.