Панагюриште возникло в Средневековье (название — от греческого «праздник», «торжество», ср. панегирик), стало заметным поселением после захвата турками Велико-Тырново в 1349, когда туда переселились многие уцелевшие жители древней столицы. Один из главных центров Апрельского восстания 1876 года. Родина основателя Болгарской академии наук, видного общественного деятеля и историка Марина Дринова. В 1949 году в Панагюриште найден крупный фракийский клад золотых предметов.