С января по апрель 1945 года Шедле вместе с Гитлером постоянно находился в Фюрербункере и курировал его охрану. 28 апреля 1945 года Шедле был ранен в ногу осколками снаряда при обстреле советской артиллерией здания Рейхсканцелярии в ходе штурма Берлина и с тех пор передвигался опираясь на костыли. После самоубийства Адольфа Гитлера днем 30 апреля 1945 года отряд фактически прекратил свое существование. Вечером 1 мая 1945 года, Шедле отклонил предложение Вильгельма Монке присоединиться к его группе для попытки прорыва из Фюрербункера, ссылаясь на ранение. Поступившее несколькими часами позже аналогичное предложение Рохуса Миша было им также отклонено. Вскоре после часа ночи 2 мая 1945 года Франц Шедле застрелился из табельного пистолета в Фюрербункере, чтобы не попасть в плен к Красной армии.