Під час кубинської ракетної кризи у жовтні 1962 року "McCoy AFB" стала тимчасовою оперативною базою для понад 120 винищувачів F-100 Super Sabre та F-105 Thunderchief та первинною базою для розвідувальних літаків U-2, що літали над Кубою. Один з цих U-2 був збитий радянськими ракетами С-75 "поверхня-повітря" поблизу Банеса на Кубі. Його пілот, майор Рудольф Андерсон молодший був лише одним вбитим за Кубинської кризи.