В самой Шотландии в 1644 развернулась гражданская война между ковенантерами и роялистами. Несмотря на победу к 1646 году ковенантеров положение осложнилось событиями в Англии: король Карл I был казнен (1649). Шотландцы, верные династии Стюартов, признали новым королём его сына Карла II, утвердившего в Бредском договоре (1650) Национальный ковенант. Но в 1651—1652 Шотландия была завоевана войсками Оливера Кромвеля и присоединена к Англии.