Находившийся в самом центре региона, оспариваемого соседними державами, Бюлли неоднократно становился жертвой военных конфликтов. Так, в 1537 году он был сожжен войсками Людовика XII, то же самое повторилось во время военной кампании 1556—1557 годов. К этому времени Бюлли был настолько разорен, что французы даже не обложили уцелевших жителей города налогом. В 1709—1712 годах во время Войны за испанское наследство через город несколько раз проходили армии воюющих сторон, подвергая его разграблению. Также в 1796 года половина города выгорела после сильного пожара.