1959年3月10日，拉萨骚乱发生，中央认定西藏发生武装叛乱。3月28日，国务院命令解散原西藏政府，由西藏自治区筹备委员会行使西藏政府职权。1961年7月9日，国务院同意班禅堪布会议厅的报告，决定结束班禅堪布会议厅委员会。至此，新旧政法机构并存的局面才最终结束。