Po zakończeniu służby w armii wstąpił do Szabaku, gdzie m.in. uczył się języka arabskiego. W 1992 roku został szefem południowego sektora Szabaku. W tym czasie zlikwidowano głównego konstruktora bomb Hamasu, Jahję Ajjasza. W 1996 roku, po zabójstwie Icchaka Rabina, Dichter został szefem oddziału ochrony Szabaku, a w 1999 roku został mianowany zastępcą dowódcy Szabaku.