Зворник це єдине боснійське місто, яке лежить прямо на кордоні з Сербією. У цьому його відмітна риса, але в цьому і його біда. На початку сербської агресії проти Боснії і Герцеговини міського голову Зворника від мусульманської Партії демократичної дії представники Сербської демократичної партії Радована Караджича змусили роззброїти місцеву поліцію. А вже 8 квітня 1992 р. місто зазнало військового нападу з боку Сербії. При цьому місто було піддано обстрілу дислокованою на сербському березі Дрини артилерією. 19 травня 1992 р. об'єднані сили ЮНА, напіввійськових формувань та «Тигрів» Аркана загарбали Зворник і за час окупації з 1992 по 1995 роки вбили приблизно 700—900 боснійців, піддаючи етнічним чисткам 40 000 осіб у Зворнику та околицях. Протягом війни сербські війська зруйнували мечеті в місті та довкола нього.