Spaignart stammte aus einer kursächsischen Theologenfamilie. Christian studierte ab 1604 an der Universität Wittenberg, wo er sich 1606 den akademischen Grad eines Magisters der Philosophie erwarb. 1609 wurde er an der Wittenberger Stadtkirche ordiniert und begann seinen Pfarrerdienst in österreichischen Enns, als Hofprediger im Schloss Hagenberg. Später wurde er Pfarrer in Enns und promovierte 1617 zum Doktor der Theologie in Wittenberg. In seinen Schriften von 1617 nennt er sich "ecclesiae Anasinae in Austria superiore pastor". 1618 übernahm er die Stelle eines Hofpredigers in Hofprediger Steyregg. Die in dieser Zeit mit aller Macht durchgeführte Rekatholisierung Oberösterreichs zwang ihn 1620 zur Auswanderung in sein Geburtsland Sachsen. Er zog zuerst nach Wittenberg, wo er sich am Disputationsbetrieb der dortigen Hochschule beteiligte. Im selben Jahr wurde er an der St. Ulrichskirche in Magdeburg Pfarrer. Dort wurde er frühzeitig zu einer Person des öffentlichen Lebens, der stadtgeschichtliche Bedeutung durch das Verfassen einer Vielzahl an Streitschriften erlangte. In den Wirren des Dreißigjährigen Krieges wurde er im Zuge der Eroberung Magdeburgs 1631 verschleppt und gegen eine Summe von 400 Goldgulden freigelassen. Danach zog er nach Erfurt, wo er sein Leben beschloss.