30 августа 1862 года (на второй день второго сражения при Булл-Ран) полк Хейса участвовал в наступлении дивизии Керни на позиции генерала Томаса Джексона. Во время этой атаки Хейс был тяжело ранен в ногу, из-за чего выбыл из строя на месяц и пропустил Мерилендскую кампанию. 29 сентября он вернулся в строй, но до лета 1863 года его полк простоял в укреплениях Вашингтона. В феврале Хейс стал бригадным командиром и ему поручили бригаду, сформированную из полков, попавших в плен в сражении при Харперс-Ферри и отпущенных по обмену. Это были четыре нью-йоркских полка: