L'ancienne église Saint-Nicolas fut le premier grand bâtiment public à être détruit dans le grand incendie qui ravagea Hambourg entre le 5 et le 8 . Les chroniqueurs décrivent la destruction de Saint-Nicolas comme un grand moment d'émotion pour les Hambourgeois. Premier grand bâtiment à être partiellement ravagé par les flammes, il fut une indication sur la violence qu'allait connaître cet incendie. Le , l'office de midi, tenu par le pasteur Wendt pour le pasteur Carl Moenckeberg, dut être écourté, et s'acheva sur une prière pour la sauvegarde de l'église. L'église ne fut pas totalement détruite cependant, ainsi la plupart des œuvres d'art qui s'y trouvaient ont résisté au feu.