La saison 2002-2003 est marquée par deux matchs contre l'ancien club d'Eto'o, le Real Madrid. Majorque gagne 5-1 contre le club de la capitale en championnat avec un but et deux passes décisives d'Eto'o. En Coupe du Roi, Majorque obtient une autre large victoire (4-0) en quart de finale retour avec un doublé d'Eto'o en cinq minutes. Ses bonnes performances lui permettent d'être élu Joueur africain de l'année en 2003 pour la première fois de sa carrière. Le RCD Majorque termine au milieu de tableau du championnat, à la neuvième position. Parti disputer la Coupe des confédérations avec sa sélection, le buteur reçoit l'autorisation de repartir en Espagne, en pleine compétition, pour y disputer la finale de Coupe du Roi, remportée contre le Recreativo Huelva grâce à un doublé d'Eto'o (3-0).