1945年7月1日、インディペンデンスはアーサー・W・ラドフォード少将指揮下の第38.4任務群に加わり、日本本土に対する最終攻撃のため出撃した。第38任務部隊は8月まで日本各地を攻撃し、インディペンデンスの艦載機は空中哨戒を行う一方、谷田部、浦河、室蘭などを攻撃し、7月24日と28日の呉軍港空襲では軽巡洋艦大淀と重巡洋艦利根、戦艦榛名に損害を与えたと判定された。