La temporada 2002–03 demostró ser otra temporada productiva para Henry, ya que marcó 32 goles en todas las competiciones y contribuyó con 23 asistencias, marcas notables para un delantero. Llevó al Arsenal a otro triunfo en la FA Cup (donde fue el MVP en la final), aunque el Arsenal no pudo retener su título de la Premier League. A lo largo de la temporada, compitió con Ruud van Nistelrooy del Manchester United por el puesto del máximo goleador de la liga, pero el neerlandés superó a Henry en la por un solo gol. No obstante, Henry fue nombrado Jugador del Año de los Jugadores de la PFA y Futbolista del Año de la FWA. Su creciente estatus como uno de los mejores futbolistas del mundo se afirmó cuando salió segundo para el premio al Jugador Mundial de la FIFA. Con 24 goles y 20 asistencias en la liga, Henry estableció un nuevo récord como la mayor cantidad de asistencias en una sola temporada de la Premier League, y también se convirtió en el primer jugador en el siglo XXI en registrar al menos 20 goles y 20 asistencias en una sola temporada en una de las cinco mejores ligas de Europa.