Ещё одной значимой темой для социологических исследований «КаИС-К» в начале 90-х годов был мониторинг социальных проблем, связанных с радиоэкологической обстановкой в России, а также исследования в рамках федеральной программы «Дети Чернобыля». Опросы проводились в районах России, Украины и Белоруссии, пострадавших от аварии на Чернобыльской АЭС, иных регионов имевших проблемы с радиологической обстановкой — на Урале, Алтае, в Томской области. Всего состоялось более 70 исследований по этой тематике, в том числе в сотрудничестве с американскими экологами.