1943 februárjában Guadalcanal kiürítésénél segédkezett. Májusban az Aleut-szigetekhez rendelték, de a Attu-szigeti szövetséges győzelem után a küldetését felfüggesztették. 1944. június 19-én a Filippínó-tengeri csatában a "Taihót" és a "Sókakut" tengeralattjárók elsüllyesztették, így a "Zuikakunak" kellett elszállítania a megmaradt repülőgépeiket. A csata után már csak a "Zuikaku" maradt meg abból a hat repülőgép-hordozóból, amelyek Pearl Harbornál harcoltak.