Од 1994. до 2006. године Кан је био део немачког националног тима, у којем је играо као стартер након повлачења Адреаса Кепкеа. На светском првенству 2002. године, његов тим је стигао до финала. Иако је Немачка више пута критикована због слабе партије, Кан је био одлучујући фактор тима све до финала, у коме је изгубила од Бразила, а Кан је направио грешку код првог гола Бразила. Проглашен је за најбољег играча турнира и примио Златну лопту.