1992년 부트로스갈리는 평화를 위한 과제를 제출하고 유엔이 폭력적인 충돌에 어떻게 대응해야 하는가를 제시했다. 그러나 그는 1994년 르완다 집단살해가 일어나 100만여 명이 죽는 동안 유엔이 적절하게 대응하지 못했다는 비판을 받았으며, 앙골라 내전에서도 유엔의 개입 지지를 끌어모으는 데 실패했다. 그의 첫 번째 임기동안 유고슬라비아의 해체로 유고슬라비아 전쟁이 벌어지기도 했다. 그의 평판은 유엔의 실효성과 유엔에서의 미국의 역할 등에 관한 논쟁으로 꼬였다.