Po raz pierwszy na arenie międzynarodowej Bernhard Gruber pojawił się 27 stycznia 2000 roku, kiedy wystartował na mistrzostwach świata juniorów w Štrbskim Plesie. Wraz z kolegami z reprezentacji zdobył tam brązowy medal w konkursie drużynowym. Kilka dni później, 5 lutego 2000 roku w Andelsbuch zadebiutował w Pucharze Świata B, zajmując od razu trzecie miejsce w konkursie rozgrywanym metodą Gundersena. Dwa lata później, na mistrzostwach świata juniorów w Schonach był siódmy w sztafecie, a zawodów w Gundersenie nie ukończył.