1979年，伊朗爆发伊斯兰革命，局势动荡，在阿拉伯诸国和美国等国的支持下，萨达姆于1980年9月17日宣布單方面废止《阿尔及尔协定》，收回全部阿拉伯河主权。1980年9月22日，伊拉克革命指揮委員會命令伊拉克武裝部隊攻擊伊朗，軍隊分多路向伊朗境內推進，最遠達80公里，伊拉克又出動飛機，襲擊伊朗十個空軍基地，致使两伊战争爆发，戰爭歷時八年。两伊战争之后，阿拉伯河的航道被大量沉船淤塞，至今未能恢复。