Вскоре на территорию Словакии стали совершаться авианалёты. 26 июня 1944 несколько американских бомбардировщиков совершили вылет на территорию Словакии, и бой с ними завершился плачевными последствиями: погибли три пилота, один получил тяжёлое ранение, а шесть самолётов были сбиты в ходе стычки. Тогда Кришко по болезни не мог нести службу. 29 августа 1944 грянуло Словацкое национальное восстание, и Владимир с сотником Иваном Галузицким перебрался в Банску-Бистрицу, перейдя на сторону восставших и возглавив 13 октября 1944 Объединённую эскадру. В конце октября он перебрался с небольшой технической группой и двумя бипланами к Доновалам. Генералы Виест и Голян были готовы перелететь в СССР, однако совершить перелёт не удалось, и Кришко велел уничтожить самолёты. Спустя две недели восстание было подавлено, а Кришко бежал в горы.