До 1944 року нацистська Німеччина відступала вздовж Східного фронту, а радянські війська досягли території Литви до середини 1944 року. У жовтні 1944 р. Радянські чиновники, в тому числі Сергій Круглов, який мав досвід депортації чеченців та інгушів, розпочали циркулювати ідеї щодо депортації сімей "бандитів" - чоловіків, які уникали призову до Червоної Армії та приєдналися до литовських партизанів. Однак такі заходи не були практичними на час війни. Натомість проводилась підготовка до депортації будь-яких литовських німців, їх сімей та більш далеких родичів. Потяг з 1000 людей виїхав з Каунаса 3 травня і прибув до пункту призначення лише в червні. Депортовані безкоштовно надавали робочу силу плантаціям бавовни в долині річки Вахш. Через особливо погані умови життя за перші два роки загинуло близько 580 депортованих.