Nachdem Estland 1940 aufgrund des deutsch-sowjetischen Nichtangriffspakts von der Sowjetunion annektiert wurde, arbeitete Palusalu zunächst weiter als Gefängniswärter im Zentralgefängnis in Tallinn, wurde dann aber "während des alten Regimes als Diener" entlassen und zog dann auf seinen Hof.