Le , la division rejoint Marienwerder en train. Eicke réunit ses officiers à plusieurs reprises . Dans les premiers jours de l'attaque, Eicke mène ses troupes, qui font très peu de prisonniers. Il est sévèrement blessé au pied lors de l'explosion de son véhicule sur une mine le , et soigne sa blessure au camp de concentration de Sachsenhausen. En , devant de nombreux gradés de la SS, dont le médecin du Reich Grawitz, il y fait la démonstration des techniques d'assassinat de masse expérimentées depuis deux semaines au camp : des prisonniers de guerre soviétiques qui croient subir un examen médical sont exécutés par un tir dans la nuque, dans une pièce spécialement meublée et organisée pour cette exécution. À partir de , ce sont ces techniques que Grawitz rend systématiques dans les camps d'Auschwitz, Buchenwald et Flossenbürg.