En 2018-2019, Thomas Tuchel devient l'entraîneur du Paris Saint-Germain. Au cours de la tournée estivale en Asie, Verratti est titulaire lors du Trophée des champions début-août (victoire 4-0 contre Monaco). Il retrouve alors Gianluigi Buffon, qui vient de rejoindre le club parisien. Toujours en délicatesse après sa reprise de la compétition, Verratti ne revient sur les terrains que mi-septembre face à Saint-Étienne contre qui il délivre une passe décisive sur l'ouverture du score de Julian Draxler (victoire 4-0). Avec la retraite de Thiago Motta, il est désormais associé à Adrien Rabiot dans l'entre-jeu parisien. Suspendu lors du déplacement à Anfield, Verratti retrouve la Ligue des champions le contre l'Étoile rouge de Belgrade (victoire 6-1). Il déclare au "Parisien" que l'équipe avait besoin d'un coach tel que Thomas Tuchel. Affirmant « ne pas mener la vie qu'on lui prête » concernant son hygiène de vie, même si fin octobre, il est contrôlé avec une alcoolémie de 0,49 mg/l, soit au-dessus des 0,20 mg/l autorisée pour un permis probatoire, il affirme début 2019 être désormais pleinement remis d'une pubalgie qui lui a valu deux opérations et l'a handicapé de 2016 à 2018.