Am 14. August 2009 erfolgte die Gründung mit der Ernennung von drei Kommissaren durch die Regierung: Libório Pereira, dem designierten Präsidenten, Maria Olandina Isabel Caeiro Alves und Abel Ximenes. Jesuína Maria Ferreira Gomes und Alexandre Gentil Corte-Real de Araújo wurden vom Parlament am 13. Oktober 2009 zu Kommissaren ernannt. 2011 wurde Alves Osttimors erste Generalkonsulin auf Bali. Als Kommissarin wurde sie durch die Regierung von Isabel da Costa Ferreira ersetzt. Ximenes trat im Februar 2012 zurück, um bei den Präsidentschaftswahlen für den Kandidaten José Luís Guterres (Frenti-Mudança) arbeiten zu können. Als Nachfolger von Ximenes als Kommissar wurde von der Regierung am 30. April 2012 Abel dos Santos Fátima ernannt, der seit der Gründung des CFP der Generaldirektor des Sekretariats war. Sieger der Wahl wurde aber Taur Matan Ruak, der Ehemann von Costa Ferreira, die als First Lady als Kommissarin ausschied.