亡命政府の帰国後にも共産党の勢力は拡大し、1948年のチェコスロバキア政変によってついに一党独裁体制が確立された。共産党の指導者クレメント・ゴットワルトが大統領となり、ソ連とその衛星国としての関係が続いた。しかし1968年にアレクサンデル・ドゥプチェクが第一書記となると、「人間の顔をした社会主義」とする改革が行われ始めた。この「プラハの春」と呼ばれる改革はソ連とワルシャワ条約機構軍の介入によって頓挫し、「正常化」が行われた。この際に導入された連邦制が、後のチェコとスロバキアの分離につながることになる。その後も改革の動きは水面下で続き、1989年には社会主義体制の変革を求める反政府運動が起こった。この際にソ連軍は介入することはなく、ビロード革命と呼ばれる無血革命が達成され、社会主義体制が崩壊した。