22 апреля 1906 избран в Государственную думу I созыва от общего состава выборщиков Киевского губернского избирательного собрания. Входил в Трудовую группу, что полностью подтверждают и сами трудовики в своем издании «Работы Первой Государственной Думы». Активный член Украинской громады. Член Аграрной комиссии. Подписал законопроекты: «О гражданском равенстве», аграрный проект «33-х». 5(18) июня выступил по аграрному вопросу, в заключении пространной речи Зубченко сказал «Я, господа, утверждаю, что наше безземельное крестьянство в отчаянии, ему жить нельзя и оно не даст жить другим». Также выступил по поводу Белостокского погрома.