Jakobs absolvierte nach dem Abitur 1984 zunächst eine Ausbildung im gehobenen Auswärtigen Dienst am Fachbereich Auswärtige Angelegenheiten der Fachhochschule für Öffentliche Verwaltung, die er 1987 als Diplom-Verwaltungswirt abschloss. Im Anschluss war er von 1987 bis 1989 in der Personalabteilung des Auswärtigen Amtes in Bonn sowie zwischen 1989 und 1994 als Vize-Konsul an der Botschaft in Argentinien tätig. Nach seiner Rückkehr fand er von 1994 bis 1998 Verwendung in der Protokollabteilung im Auswärtigen Amt in Berlin sowie danach zwischen 1998 und 1999 als Leiter Technik im Organisationsstab für den G8-Gipfel in Köln 1999 und die EU-Ratspräsidentschaft 1999.