پیشینه این شهر تاریخی به قرن ۴ هجری بر می گردد. با هجوم مغولان شهرغلغله نیز مانند بسیاری از شهرهای آن‌زمان توسط چنگیزخان به آتش کشیده‌شد که بقایای ویرانی و آتش‌سوزی در آن هم‌اکنون نیز مشهود است. با این حال با توجه به شواهد باستان‌شناسی دوران تیموری در این محوطه تاریخی، به نظر می‌رسد که شهرغلغله در سده های بعد نیز به حیات خود ادامه داده است.