調査ジャーナリストのによると、ブトロス＝ガーリは外務大臣だった1990年に、ルワンダ政府への2600万ドルの武器売却を秘密裏に承認していたという。この武器は、フツ族政権がその後の大虐殺のために公然と長期的に準備していたものの一部として備蓄されていた。その4年後にルワンダ虐殺が起きた時、ブトロス＝ガーリは国連事務総長を務めていた。