Il 13 e 14 febbraio del 1945, le incursioni aeree su Dresda danneggiarono gravemente il complesso di edifici. Contrariamente alla maggior parte degli edifici circostanti, che sono crollati spesso insieme alle pareti esterne, l'Accademia d'arte è stata preservata, nelle strutture, nonostante gravi danni interni dovuti al fuoco. La ricostruzione è iniziata subito dopo la guerra. Già nel 1952, fu possibile riprendere l'insegnamento nell'edificio. Le ultime ali dell'edificio sono state restaurate nel 1965, e nel 1968 venne realizzata una nuova vetrata sullo "spremiagrumi". Tuttavia, una ristrutturazione fondamentale è avvenuta solo dopo l'unificazione tedesca. Lo stato della Sassonia ha sistematicamente rinnovato l'edificio dal 1991 al 2002. Fu solo in questo contesto che la galleria d'arte nell'edificio Lipsius, che era inutilizzabile nell'era della DDR, fu ricostruita e inaugurata nel 2005. Il design dell'edificio espositivo degli architetti Auere Weber, Stoccarda/Monaco di Baviera e Rolf Zimmermann, Dresda, hanno ricevuto il premio di architettura "Nike" nella categoria "Particolare perfezione" nel 2007.