В начале 90-х годов Али Фатхи вернулся на родину. По возвращении в Чечню шейх Али Фатхи аш-Шишани поселился в Урус-Мартане, откуда родом братья Ахмадовы, Магомед Цагараев, Абдул-Малик Межидов и другие известные ичкерийские командиры салафитского толка. До первой чеченской войны Урус-Мартан был центром антидудаевской оппозиции, а в межвоенный период в Ичкерии, благодаря Али Фатхи, этот регион стал центром салафизма, так называемого ваххабизма.