Dopo che la riforma Renzi-Boschi è stata bocciata al referendum costituzionale del 4 dicembre 2016, la Puppato ha affermato su Twitter che il fenomeno della fuga dei cervelli dall'Italia sarebbe confermato dall'esito della consultazione referendaria, poiché la riforma è stata respinta dalla maggior parte dei cittadini residenti ma accolta con più favore dagli italiani all'estero. La dichiarazione è stata interpretata come un insulto alla supposta minore intelligenza di chi ha respinto la riforma, suscitando alcune polemiche.