Zimą 1945 zabrał 25 skrzyń z obrazami i wyjechał z rodziną do Aschbach, gdzie kilka miesięcy później aresztowali go amerykańscy żołnierze. Po trzech dniach przesłuchań został jednak zwolniony z braku dowodów na nielegalne posiadanie tych dzieł. Gurlitt twierdził po wojnie, że reszta jego kolekcji została zniszczona podczas bombardowań Drezna. Zarekwirowane w 1945 dzieła sztuki oddano mu dopiero w 1950. Po wojnie dalej handlował sztuką i działał w nadreńskim stowarzyszeniu artystów.