9月21日，在萨拉曼卡的会议中，佛朗哥被选为西班牙国民军总指挥。9月27日，托莱多攻城结束，国民军获胜。国民军很快对马德里形成了南北夹击的形势。由于共和军的拼命抵抗，国民军进展缓慢，迟迟无法进攻马德里。双方进入胶着状态。11月20日，长枪党创始人德里维拉在狱中被共和派官员下令处决。1937年4月，德国秃鹰军团发起格尔尼卡大轰炸，小镇格尔尼卡在3小时的密集轰炸后被彻底摧毁。1937年末，巴斯克、阿拉贡等地区陷落。国民军在12月末发起特鲁尔战役，至1938年2月结束，共和军蒙受巨大损失。3月国民军发动阿拉贡攻势，粉碎了共和军的大部分军事力量。