Antes y durante la invasión de Israel al Líbano de 1982, al-Wazir planificó varios ataques al interior de Israel contra objetivos civiles y militares. Preparó la defensa de Beirut frente a las fuerzas israelíes invasoras; sin embargo, Israel prevaleció y al-Wazir fue exiliado del Líbano junto con el resto de los dirigentes de Fatah. Al-Wazir se asentó en Ammán por un período de dos años y, luego, fue exiliado a Túnez en 1986. Desde su base allí, comenzó a organizar los comités juveniles en los Territorios Palestinos; estos se convirtieron finalmente en la espina dorsal de las fuerzas palestinas en la Primera Intifada; sin embargo, no vivió para comandar el levantamiento: el 16 de abril de 1988, fue asesinado en su casa en Túnez, aparentemente, por un comando israelí del Sayeret Matkal en operación conjunta con el Mossad. Israel nunca ha reconocido la acción.