1864年には、キューパーは四カ国連合艦隊17隻の司令官として、再びユーライアスに将旗を掲げて長州藩を攻撃した。その際の通訳はアーネスト・サトウであった。この時の功績により、1864年2月25日にバス勲章（KCB：ナイト・コマンダー）を授与され、正式に中将に昇進した。