Несприяннятя окупації призвело до того, що під час Кримської війни османські війська легко зайняли Сухумі та значну частину Абхазії. Навіть по завершенню війни гірські абхази протягом 1857—1860 років намагалися захопити фортеці Управління Чорноморської берегової лінії. 1864 року після завершення Кавказької війни російський уряд прийняв рішення про ліквідацію князівства (було створено спеціальний Сухумський відділ) та депортацію роду Шервашидзе до внутрішніх районів Росії. 1866 року було придушено антиросійське повстання