Алексей Мерзляков родился года в небогатой купеческой семье в селе Николаевском Исетской провинции Оренбургской губернии, в 1781 году с. Николаевское преобразовано в г. Далматов. Ныне город Далматово — административный центр Далматовского района Курганской области. Алексея крестили в Николаевской церкви, сохранилась запись об этом событии. Предком Мерзляковых в Далматово был монастырский служитель Василий Михайлов сын Мерзляков (род. ок. 1687) с Вологодского уезда, упомянутый в переписной книге дьяка Ивана Баутина 1709 года. У него сыновья Кузьма (род. ок. 1723), Алексей (род. ок. 1727) и Андрей (род. ок. 1734). Кузьма Мерзляков — активный участник крестьянского бунта «Дубинщина» в 1763 году. Алексей Мерзляков — участник обороны Далматовского монастыря от Пугачевцев, впоследствии, был письмоводителем при допросах бунтовщиков в присутствии обер-аудитора Михаила Федорова, за что удостоился похвалы. У подъячего Алексея Мерзлякова два сына: Алексей Алексеевич, впоследствии правитель канцелярии при генерал-губернаторе Пермской и Тобольской губернии А. А. Волкове, и Фёдор — с 1791 года купец 3-й гильдии. В ревизской сказке 1782 года у Фёдора указана жена Ирина Никоновна, дочь крестьянина Никона Вяткина из города Далматова.