Le , il livre son premier compte-rendu de l'expédition aux membres de la société philotechnique. Après avoir composé pour ses amis un drame poétique intitulé "L'Entrée des Français au Caire", il met en ordre ses papiers afin de publier le compte-rendu de son voyage et de ses relevés : "Relation de l'expédition d’Égypte, suivie de la description de plusieurs des monumens de cette contrée, et ornée de figures", Paris, An VII (1799). Cet ouvrage, traduit en anglais dès 1800, contient une première partie historique retraçant le début de l'expédition, avec une carte de la Basse-Égypte et un plan de la bataille navale d'Aboukir, puis une seconde partie descriptive présentant plus particulièrement trois monuments alexandrins : la colonne de Pompée, la « cuve » (un sarcophage antique, identifié plus tard comme celui de Nectanebo II, transformé en bassin aux ablutions) de la mosquée Saint-Athanase et l'obélisque de Cléopâtre.