В 1994 году озеро Чаны включено в список водно-болотных угодий международного значения (Рамсарская конвенция). В северной части озера на территории Чановского и Барабинского районов в 1958 году создан Кирзинский заказник площадью 1198 км², на его территории установлены ограничения охоты на куликов, на выпас скота и сенокошение, действует запрет на проведение осушительных мероприятий. Помощь в проведении экологических исследований оказывает голландский Центр по пресноводным водоемам и комплексному управлению в области водопользования ("Institute for Inland Water, Management and Waste Water Treatment, RIZA").