Появление католицизма на территории современного Египта было связано с крестовыми походами и относится к началу XIII века. Во время Ферраро-Флорентийского собора была подписана уния с Коптской церковью. Однако уния осталась только на бумаге и настоящего единения между церквами не произошло. В последующее время Святой Престол предпринимал неоднократные попытки соединить коптов с Римом. В 1741 году коптский иерусалимский епископ Афанасий Амба с небольшой группой верующих перешёл в католицизм, положив начало Коптской католической церкви. 15 августа 1824 года Римский папа Лев XII издал буллу "Petrus Apostolorum", которой учредил Патриархат для верующих Коптской католической церкви, которым управляли апостольские викарии. Патриархат оставался без собственной иерархии до 15 марта 1895 года, когда Римский папа Лев XIII возвёл в должность апостольского викария Патриархата священника Георгия Макария, который принял имя Кирилл с титулом «епископ Кесарии Филипповой». До 1895 года копты-католики находились под юрисдикцией латинского апостольского викариата Аравии и Египта (сегодня — Апостольский викариат Александрии Египетской). Небольшая община Коптской католической церкви, насчитывающая в конце XVIII века несколько сот человек, сегодня состоит из семи епархий численностью около двухсот тысяч верующих.