Während der gesamten WM-Qualifikation erzielte er von den 15 Toren drei im Doppelpack sowie zwei Hattricks. Der erste Hattrick gelang ihm dabei am 2. September 2000 bei einem 5:0-Erfolg über El Salvador, den zweiten, mit dem er nicht nur im amerikanischen Raum an vermehrter Bekanntheit erlangte, erzielte er beim 3:1-Heimsieg über Mexiko am 20. Juni 2001. In die Zeit zwischen den WM-Qualifikationsspielen fielen auch drei Spiele des UNCAF Nations Cups 2001, wobei dem Honduraner beim 10:2-Sieg über Nicaragua ein Hattrick gelang. Obwohl die Mannschaft die mit Abstand meisten Tore erzielte, kam sie als Gruppendritter nicht über die erste Runde des Bewerbs hinaus. Am 2. Mai 2002 kam Pavón in einem 3:3-Remis gegen Japan im Kirin Cup, zum Einsatz und kam dabei gleich zwei Mal zum Torerfolg.