Em 5 de agosto de 2018, Agüero marcou dois gols na vitória por 2–0 sobre o em partida válida pela Supercopa da Inglaterra. Em 19 de agosto, alcançou um hat-trick na vitória por 6–1 sobre o Huddersfield Town válida pela segunda rodada da Premier League, gols após completar passes do goleiro Ederson, do lateral Benjamin Mendy e ao conferir falha de Ben Hamer. No dia 21 de setembro, o atacante argentino renovou seu contrato com o City até 2021.