In dieser Stellung nahm Thile 1866 während des Krieges gegen Österreich an den Kämpfen bei Münchengrätz und Königgrätz teil. Nach dem Friedensschluss in den Generalstab der 19. Division versetzt, wurde Thile am 22. März 1868 Oberstleutnant und am 18. Juni 1869 mit der Führung der Geschäfte des Chefs des Generalstabes des IV. Armee-Korps beauftragt. In dieser Stellung am 21. Oktober 1869 bestätigt sowie am 26. Juli 1870 zum Oberst befördert, nahm Thile 1870/71 während Krieges gegen Frankreich an den Kämpfen bei Beaumont und Sedan sowie der Belagerung von Paris und der Beschießung von Toul teil. Für seine Leistungen mit beiden Klassen des Eisernen Kreuzes sowie dem Komtur II. Klasse des Albrechts-Ordens ausgezeichnet, wurde Thile schließlich am 4. Juli 1872 zum Kommandeur des 3. Garde-Regiments zu Fuß ernannt. Unter Stellung à la suite dieses Regiments wurde Thile am 14. Oktober 1874 von diesem Kommando entbunden und mit der Führung der 4. Garde-Infanterie-Brigade beauftragt. Mit der Beförderung zum Generalmajor zum Kommandeur ernannt, folgte bereits am 28. Oktober 1875 seine Ernennung zum Inspekteur der Jäger und Schützen. Gleichzeitig beauftragte man ihn mit der Wahrnehmung der Geschäfte des Kommandeurs des Reitenden Feldjägerkorps. Seit dem 18. November 1880 im Rang eines Divisionskommandeurs, wurde Thile am 12. März 1881 zum Kommandeur der 20. Division in Hannover ernannt. Aufgrund seiner angeschlagenen Gesundheit wurde Thile am 7. Juli 1883 zu den Offizieren von der Armee versetzt, nachdem er bereits vorher zur Gesundung einen Urlaub von drei Monaten erhalten hatte. Da keine Besserung seines Zustandes zu erwarten war, wurde Thile am 12. Juli 1884 mit Pension unter Verleihung des Kronenordens I. Klasse mit Schwertern am Ringe zur Disposition gestellt.