Nach dem Tod seines Mentors im Jahr 1909 nahm Chubb die Aufgabe vor, sich mit südamerikanischen Vogelarten zu beschäftigen. Dieses Forschungsgebiet fesselte ihn den Rest seines Lebens. Sein erster selbständiger Artikel handelte über die Vögel Paraguays, die William T. Foster (1867–1915) für das Museum gesammelt hatte. Bald darauf lernte er William Knatchbull-Hugessen, 3. Baron Brabourne (1885–1915) kennen, mit dem er ein längeres generelles Werk über die Vogelwelt Südamerikas plante. Der erste Band, der 1912 erschien, enthielt eine Liste aller bis dahin bekannten Arten und wurde damals als Standardwerk betrachtet. Als der Baron 1915 in der Schlacht von Neuve-Chapelle verstarb, war es Chubb leider nicht mehr möglich, das Projekt weiter fortzuführen. Als 1916 von Cubb mit Hilfe der Sammlung von Frederick Vavasour McConnell (1868–1914) "The birds of British Guiana" erschien, würdigte dessen Frau Helen McConnell geb. Mackenzie im Vorwort ihren verstorbenen Mann. Ein zweiter Band von Chubb erschien schließlich im Jahr 1921. Er war bis dahin das vollständigste Werk über die Avifauna Britisch-Guayanas. 1919 begann er in der Fachzeitschrift "The Ibis" einen längeren Artikel mit dem Titel "Notes on Collections of Birds in the British Museum, from Ecuador, Peru, Bolivia, and Argentinia", welches sich hauptsächlich auf Sammlungen von Perry Oveitt Simons (1869–1901), Walter Goodfellow (1866–1953) und Baron Brabourne stützte und nie vollendet wurde. Dazu publizierte er viele kleinere Artikel in "Bulletin of the British Ornithologists' Club" und "Annals and magazine of natural history". Für seine langen treuen Dienste für das Museum wurde er mit der "Imperial Service Medaille" ausgezeichnet.