Изначально «Альфа 66» сделала ставку на вооружённое свержение режима Кастро. Организация активно включилась в повстанческое движение Эскамбрая (в официальной кубинской терминологии — "bandidos"). 19 октября 1962 года было объявлено об объединении антикоммунистических военных усилий повстанческого Второго национального фронта и «Альфы 66».