Дана 3. јуна 2013. сврстан је у Италијанску репрезентацију за Куп конфедерација 2013. У првом мечу Италије 16. јуна, Балотели је постигао победоносни гол у касном делу меча против Мексика за коначни резултат од 2-1 У следећем групном мечу са Јапаном, Балотели постиже гол из пенала за 3-2, после резултата од 2-0 у првом полувремену. Италија добија меч са 4-3, чиме омогућава себи да учествује у полуфиналу Купа Конфедерација по први пут у својој историји. У последњем мечу Италије у против домаћина и евентуалних шампиона Бразила, Балотели асистира Емануелеу Ђакеринију за изједначење петом, иако је касније Италија изгубила тај меч са 4-2. Раније у полуфиналу, Балотели је повредио бутину, што га је спречило да игра остатак турнира. Италија завршава турнир као трећепласирана након што је победила Уругвај у доигравању.