Bieber on osallistunut useisiin hyväntekeväisyystempauksiin. Hän on kampanjoinut PETA:n eli eläinten oikeuksia puolustavan järjestön puolesta, jotta ihmiset adoptoisivat lemmikkejä eläinsuojista eivätkä kasvattajilta tai eläinkaupoista. Hän tuki Haitin vuoden 2010 maanjäristyksen uhreja osallistumalla Michael Jacksonin ”We Are the World” -hyväntekeväisyyssinglen uudelleenlevytykseen. Hän lauloi kappaleen ensimmäisen rivin, jonka Lionel Richie esittää alkuperäisessä versiossa. Lisäksi Bieber tukee Pencils of Promise -hyväntekeväisyysorganisaatiota. Voittoa tavoittelematon järjestö rakentaa kouluja, ja se keskittyy kehitysmaihin. Organisaation tarkoituksena on taata koulutusta kaikille. Organisaation perustaja on Adam Braun, joka on Bieberin managerin Scooter Braunin veli.