Im November 1914 wurde Flower in die British Army zurückberufen, wo er die Egyptian Camel Transport Corps an der Palästinafront kommandierte. Während der Ägyptischen Revolution von 1919 war Flower als Inspektor des Innern und als politischer Offizier in Gizeh tätig. Für seine Rolle in diesem Konflikt wurde er zum Officer des Order of the British Empire ernannt.