12 мая 1780 года, вместе с генералом Корнуоллисом, взял Чарльстон, но затем вернулся в Нью-Йорк, оставив Корнуоллиса одного, что стало причиной его поражения при Йорктауне (1781 год). В мае 1782 года снят с должности главнокомандующего. Для объяснения своих действий в Америке Клинтон опубликовал в 1783 году «Narrative», чем вызвал едкий ответ Корнуоллиса.