La Deuxième guerre civile a lieu de 1648 à 1649. Tout membre de la Chambre des communes qui n'est pas du côté de la religion des "" ou du côté des "grandees" (les officiers supérieurs de la New Model Army) est exclu du Parlement. On exclut donc ceux qui sont assez courageux pour maintenir leur liberté d'opinion. Il ne reste plus au Parlement qu' : le Long Parlement devient le Parlement croupion. Le ,  est exécuté. Le , Cromwell proclame la "République", ou Commonwealth. Des bandes de doctrinaires en armes chassent les pasteurs nommés par les évêques anglicans.