Pendant l'été 1999, Laurent Blanc tente une troisième fois une expérience à l'étranger. L'Inter Milan accepte de miser vingt millions de francs (environ 3 millions €) sur le « Président » pour renforcer sa défense centrale. L'ancien du MHSC s'impose comme un titulaire indiscutable au sein du onze intériste en ne ratant aucune journée du Calcio tout en marquant trois buts. L'Inter effectue une bonne année 1999-2000 en arrachant une quatrième place en championnat avec une qualification pour le tour préliminaire de la Ligue des champions suivante à la clé, sans oublier la finale de Coupe d'Italie perdue 2-1 score cumulé contre la Lazio de Rome, auteur d'un doublé coupe-championnat.