Bald nach dem Frieden von Teschen wurde Wurmser kommandierender General in Galizien und 1787 zum General der Kavallerie befördert. Beim Ausbruch des französischen Revolutionskriegs (Koalitionskriege) erhielt er im Frühjahr 1793 den Oberbefehl über das österreichische Heer am Oberrhein. Er kommandierte siegreich Kämpfe bei Rohrbach (29. Juni), Germersheim (5. Juli) und Essingen (27. Juli) und vereitelte dadurch die Versuche der Franzosen als Entsatztruppe nach Mainz durchzubrechen. Er vertrieb sie dann aus dem Bienwald (23. August) und eroberte am 13. Oktober, unterstützt vom Karl Wilhelm Ferdinand, Herzog zu Braunschweig, die Lauterburger und Weißenburger Linien. Nach mehreren nachteiligen Gefechten und der verlorenen Zweiten Schlacht bei Weißenburg sah er sich genötigt, mit einem stark geschwächten Heer Ende Dezember über den Rhein zurückzugehen. Er wurde im Januar 1794 abberufen.