В 2000 году Гюнеш неожиданно для многих становится главным тренером сборной Турции. Под его руководством команда закончила отборочный цикл на чемпионат мира 2002 года на втором месте в своей группе, после чего в стыковых матчах переиграла сборную Австрии. Турецкой команде удалось впервые за 48 лет попасть на чемпионат мира в Корее и Японии, на котором они сумели пробиться в полуфинал, где уступили со счётом 1:0 будущим победителям турнира бразильцам. В матче же за третье место турки победили одних из хозяев чемпионата команду Южной Кореи со счётом 3:2 и завоевали бронзовые медали. Этот успех принёс Гюнешу звание «Тренер 2002 года» по версии УЕФА.