W wyborach 1992 uzyskał mandat deputowanego do parlamentu. W roku 1996 objął kierownictwo resortu spraw wewnętrznych, którym kierował w czasie tłumienia protestów opozycji w 1996, a także w czasie albańskiej rewolucji piramidowej. W czerwcu 1997 komisja parlamentarna badająca wydarzenia wiosny 1997 uznała, że sześć osób, w tym Shamata odpowiada za akty ludobójstwa w czasie próby tłumienia zamieszek. Shamata miał wydać rozkaz użycia fosgenu przeciwko tłumowi demonstrantów we Wlorze.