Tras volver a Berlín después de las Guerras Napoléonicas (después de 1815), estudió por su cuenta y logró pasar los exámenes para ingresar a la Universidad de Berlín. Sin embargo, se le negó la admisión por su membresía en la "Berliner Burschenschaft", opositora a la monarquía prusiana. Se mudó a Jena, donde ingresó a la Universidad de Jena en 1820, y dentro de cuatro meses terminó de redactar una disertación en el campo de las matemáticas. Cuando las autoridades prusianas lo alcanzaron, Lieber dejó Jena y se marchó a Dresde, para estudiar topografía. Tan pronto como estalló la revolución griega de 1821, Lieber ofreció voluntariamente sus servicios