Après son retour en Allemagne, le "Köln" participa à diverses opérations en Baltique jusqu'en 1942, reçut quelques modifications, puis resta au mouillage en Norvège en attendant un éventuel raid vers les convois pour la Russie. En 1944 il devint navire d'entraînement pour les cadets en Baltique, servant d'escorteur pour les cargos de ravitaillement. En 1945 il subit une petite refonte à Wilhemshaven et fut bombardé à quai par la RAF, chavirant totalement, quille en l'air. En avril il fut rayé, mais remis à flot et utilisé comme batterie flottante avant d'être démoli en 1946.