Während des Nationalsozialismus litt der Villa-Romana-Verein unter dem Einfluss des Regimes: Dem Reichserziehungs- sowie dem Propagandaministerium mussten Sitze im Vorstand eingeräumt und alle Juden bzw. missliebige Kunstfreunde aus dem Verein ausgeschlossen werden. Trotz der bedrohlichen Einwirkung des Nazismus auf die Verwaltung der Villa Romana gelang es, 1935 den Maler Hans Purrmann als deren neuen Leiter zu benennen. Dank der Unterstützung des damaligen Chefsyndikus der Deutschen Bank Hans-Alfons Simon, der die Übergriffe der Nationalsozialisten verhindern konnte, wurde das Florentiner Künstlerhaus zu einem unangetasteten – wenngleich mehrfach bedrohten – Refugium bzw. „Zentrum der Halbemigration“ für deutsche Künstler. Purrmann selbst musste 1937 erfahren, dass eines seiner Bilder in der propagandistischen Schandausstellung „Entartete Kunst“ gezeigt wurde. Andere diffamierte deutsche Künstler – u. a. die 1936 nominierte Preisträgerin Emy Roeder – konnten in Florenz einen Zufluchtsort finden. Offiziell musste sich allerdings die Auswahl der Stipendiaten in den Jahren der Diktatur an den stilistischen Richtlinien des Regimes orientieren: So wurden kompromisslose Avantgardisten wie Florenz Robert Schabbon abgelehnt, zugunsten gemäßigter moderner Künstler wie der roh-archaisierende Toni Stadler 1937, Verfechter der NS-Ideologie.