2000-luvulla Yhdysvaltain joukkue on yhä enemmissä määrin kyennyt horjuttamaan Meksikon ylivaltaa Pohjois-Amerikan ykkösjoukkueena. Merkittävin Meksikon aseman horjuttaminen tapahtui vuoden 2002 MM-kisoissa, kun alkulohkonsa voittanut Meksiko hävisi neljännesvälierän USA:lle 2–0. Saksan kisoissa 2006 Meksiko pelasi samassa alkulohkossa Iranin, Angolan ja Portugalin kanssa. Joukkue voitti avauspelissään Iranin 3–1, mutta jäi sen jälkeen 0–0 -tasapeliin Angolaa vastaan. Lohkon päätöspelissä Meksiko kärsi tappion Portugalille, mutta eteni silti jatkoon lohkokakkosena. Meksikolaisten taival katkesi kuitenkin jälleen neljännesvälieriin, kun joukkue hävisi Argentiinalle jatkoajan jälkeen.