В 1937 году Балабан был приговорён к шестимесячному тюремному заключению и штрафу по обвинению в выращивании марихуаны. Поскольку у него не было денег на выплату штрафа, тюремный срок был увеличен до трёх лет. В тюрьме Балабан чтобы заработать денег занимался стрижкой. Вскоре после освобождения из тюрьмы Балабан был осуждён повторно, на этот раз за убийство своего предполагаемого сообщника по первому делу, убитый также являлся соперником Балабана в борьбе за любовь его первой жены Фадиме. До 1947 года Балабан находился в тюрьме на острове Имралы. Затем он был переведён в тюрьму Бурсы. В 1950 году Ибрагим Балабан попал под амнистию и был освобождён. После переворота 1960 года полгода содержался в тюрьме за рисунки на политические темы.