Kuijt főszerepet játszott a Chelsea elleni büntetőpárbajban a 2006–2007-es UEFA-bajnokok ligája elődöntőben, ő lőtte be a döntőt érő gól. A döntőben is gólt lőtt, de ez már csak a szépítésre volt elég, Filippo Inzaghi két góljával 2–1-re kikaptak.