Lampard rate l'Euro 2012 à cause d'une blessure à la cuisse mais joue tous les matchs de pré-saison avec Chelsea. La saison 2012-2013 débute avec une défaite face à Manchester City en Community Shield. Du fait de la suspension de John Terry, il est capitaine de Chelsea pendant le match de la Supercoupe d'Europe où son équipe s'incline (1-4) face à l'Atlético Madrid. Il célèbre le de Premier League de sa carrière en marquant lors de la victoire 8 à 0 face à Aston Villa, le . Le , Steve Kutner, l'agent de Lampard, annonce que le contrat de Frank Lampard, qui se termine en , ne sera pas renouvelé. Il marque son pour Chelsea dans une victoire 4-0 face à Brentford en FA Cup, faisant de lui le meilleur buteur de l'histoire de Chelsea dans la compétition avec 26 buts. Le de Lampard pour Chelsea est marqué le 17 mars face à West Ham United, son ancien club. Le 11 mai, Lampard devient le meilleur buteur de l'histoire de Chelsea en marquant deux buts lors d'une victoire 2-1 face à Aston Villa. En finale de la Ligue Europa 2012-2013, Lampard est capitaine du club londonien pour une victoire 2-1 contre Benfica, soulevant ainsi le onzième trophée majeur de l'ère Roman Abramovich. Le 16 mai, Lampard signe une extension de un an à son contrat avec Chelsea, déclarant : .