Po raz pierwszy utwory z albumu został zaprezentowane na wyspie Ellis w Nowym Jorku. Sponsorem koncertu była stacja radiowa WXRK, która nadała występowi tytuł "Pep Rally". Zespół zagrał osiem utworów z "By the Way" oraz hity z "Californication" i "Blood Sugar Sex Magik". "New York Post" nazwał występ "jednym z najlepszych koncertów roku". Miejsce koncertu zostało wybrane z zamierzeniem przywrócenia Nowemu Jorkowi miana "Stolicy Kultury" po atakach z 11 września. Cały dochód z biletów został przekazany na cele charytatywne. Niebawem Red Hot Chili Peppers wyruszył na ogólnoświatową trasę koncertową promującą album. Trasę rozpoczęto w Europie; w jej ramach zespół wystąpił m.in. na Coachella Valley Music and Arts Festival i Fuji Rock Festival. Grupa zakońćzyłą europejski etap trasy wioną 2003, by 1 maja rozpocząć etap amerykański. Formacja zagrała 3 czerwca 2003 koncert w Madison Square Garden w Nowym Jorku; sprzedano wszystkie bilety, a zespół otrzymał pozytywne oceny od krytyków. Kelefa Sanneh z "The New York Times" napisała: "we wtorkową noc Red Hot Chili Peppers zawitali do Madison Square Garden, by dać niezwykły dwugodzinny koncert...w trakcie "Don't Forget Me" Flea pomylił akordy, a Frusciante dał boską partię solową, która syczała i bulgotała jak reakcja chemiczna". Amerykański etap trasy zakończył się 21 czerwca; działalność zespołu została zawieszona na kilka tygodni do występu w Slane Castle 23 sierpnia dla 80-tysięcznej publiczności. 17 listopada 2003 wydano w formacie DVD zapis tego koncertu – "Live at Slane Castle", który został drugim DVD w historii grupy, po "Off the Map".