2016 Avrupa Futbol Şampiyonası eleme aşaması, 2016 Avrupa Futbol Şampiyonasının gruplarını ilk 2 sırada tamamlayan 12 takım ve 3. sıradaki takımlardan en iyi 4 olmak üzere toplam 16 takımın katıldığı ve maçların tek maçlı eleme sistemi ile oynandığı bölümüdür. Gerektiğinde uzatma süresi ve penaltı vuruşlarıyla galip gelen takım belirlenir. Maçlar, 25 Haziran - 10 Temmuz 2016 tarihleri arasında oynanmıştır.