Keane est également l'un des seuls joueurs à avoir été retenu pour une Coupe du monde, mais à ne pas l'avoir disputé, en raison d'un clash avec son sélectionneur en 2002. À la suite de son départ de l'équipe d'Irlande, il insulte publiquement son sélectionneur, ce qui lui vaut d'être écarté pendant plusieurs mois de l'équipe nationale. Il a été souvent surnommé de fou à cause de ses tacles et blessures volontaires.