В 2011 году Карлос принял участие в Кубке Америки в Аргентине. На турнире он сыграл в матчах против сборных Колумбии, Мексики, Венесуэлы, Чили, и дважды Уругвая. В поединке против колумбийцев Лобатон забил свой первый гол за национальную команду. По итогам соревнований Карлос завоевал бронзовую медаль.