Während des griechischen Unabhängigkeitskrieges geriet das Kloster, mit dem das Monument zu diesem Zeitpunkt noch immer baulich verbunden war, offenbar mehrmals unter Beschuss und fiel schließlich einem Brand zum Opfer. Das Lysikratesmonument selbst wurde 1831 notdürftig gereinigt und von Schutt befreit. Um 1840 fertigte Theophil Hansen Zeichnungen des Monuments an, Details des Denkmals verwendete er später in seinen Bauten.