', premier jeu de la trilogie débutant la série nommée ' ou simplement ', connait donc deux suites directes réalisées par Retro Studios. Le premier jeu est ', sorti en sur , dans lequel Samus voyage vers la planète Ether et découvre qu'une météorite de phazon a créé un univers parallèle. L'ennemi principal de Samus est son double malveillant appelé Samus Sombre, qui se nourrit de l'énergie du phazon. Le troisième et dernier volet de la trilogie est ', sorti en sur la Wii. Samus est contaminé par le phazon après avoir été attaquée par Samus Sombre, qui a pris le commandement d'un groupe de Pirates de l'espace pour envoyer des graines de phazon (appelées Léviathans) pour corrompre des planètes. Le jeu marque des changements dans le ' en introduisant notamment le tir libre grâce à la Wiimote, qui remplace le verrouillage de cible, et un système de mises à jour d'armement, qui succède aux rayons interchangeables. Un quatrième épisode intitulé "4" est annoncé lors de l'E3 2017.