Tammikuussa 2011 alkaneiden Egyptin mielenosoitusten aikana Al-Jazeera raportoi tapahtumista, ja sen toimintaa häirittiin. Muiden ulkomaisten toimittajien lisäksi erityisesti Al-Jazeeran toimittajia on kohdeltu kovakouraisesti ja heitä on pidätetty. Al-Jazeera on jo aiemmin samassa kuussa ollut tärkeä informaatiokanava Tunisian kansannousun yhteydessä ja sieltä ympäri arabimaailma levinneessä kapinamielialassa. Kanavan arabiankielisen toimituksen on väitetty tukevan islamisteja, esimerkiksi Hamasia. Se itse sanoo, että ”sen on pidettävä silmät auki, jotta havaitsemme tapahtumat, jotka saattavat johtaa arabidiktaattorin kaatumiseen”, vaikkakaan se ei katso tehtäväkseen vapauttaa arabimaita sorrosta. Ranskalainen politiikan tutkija Claire Gabrielle Talon katsoo kirjassaan "Al-Jazeera" (2011), että kanava oli liian sitoutunut kansanousuihin eikä siten noudattanut riittävästi objektiivisuutta verrattuna länsijournalismiin.