Киргистан је учествовао на Светском првенству у атлетици у дворани 2016. одржаном у Портланду од 17. до 20. марта тринаести пут, односно учествовао је под данашњим именом на свим првенствима од 1993. до данас. Репрезентацију Киргистана представљао је један атлетичар, који се такмичио у трци на 3.000 метара.