Les deux universités francophones de la région bruxelloise siègent à Bruxelles. L'université Saint-Louis - Bruxelles est située dans le pentagone de la Ville de Bruxelles, et possède une seconde implantation dans le « Quartier européen ». L'Université libre de Bruxelles (ULB) siège aussi à Bruxelles, la majorité de son campus principal du Solbosch étant situé sur le territoire de la ville de Bruxelles (extension sud), sur des terrains offerts par la ville à l'université après l'Exposition universelle de 1910.