Первый католический храм в Манаоаге был построен монахами-августинцами в 1600 году на месте местного кладбища. Первым священником этого храма стал доминиканец Хуан-де-Сан-Хасинто, который доставил из Испании почитаемую в храме статую Девы Марии. С 1608 года в храме действовала доминиканская миссия Мангалдан, которая в 1610 года была переименована в миссию Манаоаг. В 1701 году доминиканцы из постоянных нападок местных аборигенов из племени игорот начали строить современный храм на высоком холме на средства состоятельной семьи Гаспара де Гамбоа из Манилы. В 1882 году храм был расширен и в 1892 году пострадал во время землетрясения. Во время филиппинской революции храм был захвачен повстанцами, которые подожгли его. Во время этого события статуя Пресвятой Девы Марии Манаоаг сохранилась, после чего была перевезена в город Дагупан, где хранилась до октября 1898 года. Доминиканцы возвратились в Манаоаг в 1901 году и начали восстановление сожженного храма, которое завершилось в 1911 году. Был отреставрирован главный барочный алтарь XVIII века. В 1925 году храм был передан в бессрочное управление ордену доминиканцев. Полная реставрация церкви завершилась в 1931 году.