Kishi studerade först vid Tokyos kejserliga universitet och fick senare en post i handels- och industridepartementet 1920. 1935 blev han huvudansvarig för den industriella utvecklingen av den japanska lydstaten Manchukuo, då misstänkts för att ha använt kinesiskt tvångsarbete. 1941 utnämndes han till närings- och industriminister i Tojo Hidekis ministär och följande år valdes han in i Japans underhus. Efter Japans nederlag i andra världskriget arresterades han som misstänkt för krigsförbrytelser i "A-klassen", men släpptes 1948 och ställdes aldrig inför rätta vid Tokyoprocessen. Kishi återvände till den politiska arenan när USA:s ockupation av Japan upphörde 1952.