À la fin de la campagne de la vallée, la brigade se déplace pour renforcer le général Robert E. Lee, lors de la bataille des sept jours sur la péninsule de Virginie. lors de la bataille de Gaines' Mill, la brigade attaque la droite fédérale et permet à Lee d'obtenir une victoire. lors de la campagne de Virginie septentrionale, la brigade subit des pertes élevées lors de la bataille de Cedar Mountain et le général Winder est tué le . Jackson rallie personnellement son ancienne brigade et remporte la bataille. La brigade subira plus de pertes au cours de la seconde bataille de Bull Run. Le 30 août 1862, la brigade de Stonewall repousse l'attaque de la brigade de fer de l'Union et se rallie pour lancer une contre-attaque. Son commandant par intérim, le colonel William S. Baylor est tué. Le colonel Andrew J. Grigsby prend le commandement de la brigade lors de la campagne du Maryland et de la bataille d'Antietam. La brigade défend les bois de l'ouest, où les combats sont si âpres et l'attrition si importante que Grigsby a le commandant de la division (division de Jackson) à la fin de la journée.