В 1808 году переведён в Финляндию. Сперва под его начальством был образован особый Сердобольский отряд, задачей которого было удержать волнение, вспыхнувшее в Карелии при занятии Саволакской области шведским генералом Сандельсом, так как восстание в дальнейшем могло угрожать коммуникациям русской армии. Дойдя с отрядом до реки Пиелис, Алексеев, под влиянием слухов, что Сандельс отправил в Карелию одного из лучших своих офицеров отважного партизана Мальма, и что к Карелии направляются главные силы шведов, боясь быть отрезанным от своих сообщений и запасов, отступил к Кеми, допустив этим Мальма свободно вступить в Карелию, где его появление было сигналом к общему восстанию. Отступление Алексеева давало неприятелю возможность зайти в тыл нашей армии, действовавшей против Сандельса. Недовольный его действиями, император Александр I поручил командование Сердобольским отрядом князю М. П. Долгорукову, который прибыв в Сердоболь и осмотревшись, в донесении своем поспешил оправдать Алексеева и, в свою очередь, потребовал усиления отряда пехотой и артиллерией. В августе вчетверо усиленный отряд, авангардом которого командовал Алексеев, выступил из Сердоболя и вошел снова в Карелию, 17 сентября соединился с войсками Тучкова и вскоре нанес неприятелю поражение при Иденсальме, где князь Долгоруков был убит. За успешные действия в качестве начальника авангарда в этом движении Алексеев был награждён был орденом Святой Анны 1-й степени.