8月10日、乗客を乗せずに横浜から出航、神戸でスイス外交官を乗船。上海でイギリス領事館関係者や民間抑留者ら敵性外国人903名を収容、シンガポール（当時の日本側呼称は昭南）でもイギリス人3名を乗船させた。ただし、大内健二によれば乗船者総数は910名である。航海は順調で、9月8日（大内によれば8月28日）に交換地である当時中立国であったポルトガル領東アフリカの交換地ロレンソ・マルケスに到着、乗客を下船させた。同地で待機していたイギリス側の客船「シティ・オブ・カンタベリー」から新任領事館員等と日本人合計867名、タイ王国人4名、ドイツ外交官2名、捕虜援助物資および特殊潜航艇によるシドニー港攻撃で戦死した日本兵の遺骨を引き取ると、9月11日（大内によれば9月2日）に帰途に就いた。特殊潜航艇（甲標的）隊員の遺骨四柱は、鎌倉丸乗組員が制作した骨箱に収められた。シンガポールで日本人450名とタイ人4名が下船、香港で捕虜援助物資約1,000トンを陸揚げした後、10月8日（大内によれば9月27日）に横浜へ無事に到着した。