ジュノーは、コート＝ドール県ビュシー・ル・グランで生まれた。父親はミシェル・ジュノー（1739年–1814年）、母はその妻のマリー・アントワネット・ビエネーメ（1735年–1806年）である。フランス革命が始まったときにはパリで法律を学んでいたが、義勇兵大隊に従軍、二度の戦傷を経て軍曹となった。1793年のトゥーロン攻囲戦でナポレオンと出会い、その副官となった。