1 сентября 1939 года Германия вторглась в Польшу. Вермахт оттеснил польские войска за черту, согласованную с СССР по пакту Молотова-Риббентропа. Немцы взяли под свой контроль Люблинское воеводство и восточное Варшавское воеводство. 17 сентября правительство Польши покинуло страну, и Красная Армия выдвинулась на линию соприкосновения с германскими войсками, заняв Вильнюсский край, который в соответствии с советско-литовскими договорами 1920 и 1926 годов должен был принадлежать Литве. Добившись от немцев пересмотра секретных протоколов к пакту Молотова-Риббентропа, 28 сентября 1939 года СССР подписал с Германией Договор о дружбе и границе. В секретном приложении к нему было оговорено, что для компенсации Советскому Союзу оккупированных немцами польских территорий Германия передаст Литву, за исключением небольшой территории в Сувалке, в советскую сферу влияния. Обмен территориями также был мотивирован желанием СССР контролировать Литву, которая объявила Вильнюс своей столицей "де-юре". В секретных протоколах и Советский Союз, и Германия четко признавали литовский интерес к Вильнюсу.