蔡依林一直積極參加慈善活動，每逢周邊國家發生災害都會通過捐款等方式提供援助。1999年9月，臺灣遭遇921大地震，蔡依林將專輯《1019》的簽唱會的收入捐出用於賑災，而專輯中的歌曲《和世界做鄰居》MV記錄震後救援工作並藉此感謝社會各界的援助。2003年5月，全球爆發嚴重急性呼吸系統綜合症疫情，蔡依林和其他85名藝人共同演唱公益歌曲《手牽手》。同月，蔡依林代表演唱歌曲《手牽手》的86名藝人前往行政院衛生署疾病管制局向醫護人員表示慰問，並向醫院人員捐贈10萬張單曲《手牽手》。2004年12月，蔡依林通過匿名的方式私下向數個慈善機構捐款用於2004年印度洋大地震賑災。2005年1月，蔡依林參加由臺灣東風衛視舉辦的「送愛到南亞賑災晚會」，她也在當日再次捐款。2008年5月，蔡依林和朋友共同捐款人民幣100萬元用於汶川大地震賑災。同月，蔡依林參加由臺灣中視舉辦的「把愛傳出去四川賑災募款晚會」。同年7月，蔡依林受邀世界展望會代言「飢餓三十人道救援行動」，她也前往中國四川省廣元市元壩區元壩鎮、朝天區羊木鎮、青川縣馬鹿鄉等地表示慰問。2009年8月，臺灣遭遇八八水災，蔡依林和朋友共同捐款新臺幣300萬元。2010年4月，蔡依林參加在中國北京市工人體育場舉辦的「博愛中國·仁愛傳遞演唱會」呼籲幫助2010年玉樹地震災區教育重建，該演唱會的收入全部捐給中國紅十字基金會用於玉樹和汶川兩地災區的助學計畫。2011年3月，蔡依林和經紀公司共同捐款美金5萬元用於2011年日本東北地方太平洋近海地震賑災。2013年4月，蔡依林捐款人民幣100萬用於2013年蘆山地震賑災。同年7月，蔡依林通過四川省慈善總會捐款人民幣15萬元用於蘆山地震災區小學重建。2014年8月，蔡依林捐款新臺幣200萬元用於援助2014年高雄氣爆事故，其中100萬元用於警員和消防員的救援工作，另外100萬元用於幫助受到事故影響的民眾。2018年2月，蔡依林捐款新臺幣100萬元用於2018年花蓮地震賑災。2020年1月，中國爆發2019冠狀病毒病疫情，蔡依林捐款人民幣100萬元。同年4月，全球爆發2019冠狀病毒病疫情，蔡依林受邀中國大陸雲南廣播電視台和歌手陳奕迅共同演唱公益歌曲《Fight as One》。