In der Eredivisie stand Bajrami zu Saisonbeginn neben Bryan Ruiz, Wout Brama, Luuk de Jong und Theo Janssen als Stammspieler auf dem Platz. Im September geriet er jedoch im Training mit seinem Landsmann Rasmus Bengtsson aneinander, der ihn bei einem Tackling verletzte. Anschließend fiel er bis nach der Winterpause aus. In der Rückrunde kehrte er auf den Fußballplatz zurück, kam aber kaum über die Rolle des Ergänzungsspielers hinaus und war hauptsächlich Einwechselspieler. Im Endspiel um den KNVB-Pokal gegen Ajax Amsterdam kurz vor Saisonende wechselte ihn Trainer Michel Preud’homme beim Stand von 2:2-Unentschieden in der Verlängerung ein, durch ein Tor des ebenfalls eingewechselten Marc Janko holte er seinen ersten Titel im Ausland. Auch im direkten Duell um den Meistertitel gegen denselben Gegner am letzten Spieltag eine Woche später wurde er eingewechselt, das Spiel ging jedoch mit einer 1:3-Niederlage verloren und somit verpasste der Klub als Vizemeister das Double. Wenngleich er auf Vereinsseite nicht zum Stamm gehörte, hatte er sich im Nationalmannschaftskader etabliert und spielte in einer Gruppe mit der Auswahl seiner niederländischen Wahlheimat um die Qualifikation zur Europameisterschaftsendrunde 2012.