В 1721 году произведён в унтер-лейтенанты, 20 марта 1724 года — в секретари первого ранга и в следующем году назначен в Петербургскую корабельную команду под началом Н. П. Вильбоа. 15 декабря 1727 года получил чин лейтенанта флота. 18 марта 1733 года по новому штату переименован в лейтенанты флота майорского ранга, с 8 июля 1734 года командовал придворной яхтой «Принцесса Анна», затем фрегатом «Брильянт», а 7 июля 1735 года был переведён в Тавров. Во время Русско-турецкой войны 1735—1739 годов Щербачёв находился на Дону под командованием П. П. Бредаля и в июне 1737 года был послан им из Геничи в Азов с 90 порожними лодками.