В следующей отборочной кампании сборная Чехии играла значительно хуже и заняла в группе лишь второе место, пропустив вперед недавно побежденных датчан. В стыковых матчах чешская сборная проиграла команде Бельгии и не попала в финальную часть чемпионата мира 2002 года. После этой неудачи Хованец подал в отставку.