У 1648 столиця була перенесена назад в Делі, у зв'язку з чим Червоний форт втратив своє значення. Після захоплення влади в 1658 році, імператор Аурангзеб помістив свого батька Шах Джахана в Червоному форті під домашнім арештом, де той і помер в 1666 році. У 1803 році форт був захоплений військами Ост-Індської компанії. Під час Повстання сипаїв 1857 року форт був місцем збройних зіткнень.