Στις 17 Οκτωβρίου 1987 ο Πάπας Ιωάννης Παύλος Β΄ τον ονόμασε Τιτουλάριο Αρχιεπίσκοπος της Ουρμπς Σάλβια (Urbs Salvia) και τον διόρισε Αποστολικό Νούντσιο στην Γκάνα, το Τόγκο και το Μπενίν . Απεστάλη στις 28 Νοεμβρίου από τον Καρδινάλιο Αγκοστίνο Καζαρόλι, με τους επισκόπους Αλμπίνο Μένσα και Λουίτζι Μπετάτσι ως τους κύριους συνεργάτες. Στις 12 Ιανουαρίου 1990 μεταφέρθηκε στη Ρουάντα, όπου υποστήριξε τις οργανώσεις ανθρωπίνων δικαιωμάτων και ενθάρρυνε τους Καθολικούς επισκόπους να ενωθούν ως ισχυροί υποστηρικτές για τον τερματισμό του εμφυλίου πολέμου . Έμεινε στη θέση του και ταξίδεψε σε επικίνδυνες περιοχές και έγινε μάρτυρας της γενοκτονίας των Τούτσι το 1994. Τον Μάρτιο του 1995, ο Ιωάννης Παύλος Β΄ τον διόρισε μόνιμο παρατηρητή της Αγίας Έδρας στα Ηνωμένα Έθνη στη Γενεύη από το 1997, με τον ίδιο ρόλο στον Παγκόσμιο Οργανισμό Εμπορίου . Μετά το διορισμό του, ο Μπερτέλο διαπραγματεύτηκε το καθεστώς της Αγίας Έδρας ως μονίμου παρατηρητή στον Παγκόσμιο Οργανισμό Εμπορίου, καθιστώντας τον πρώτο εκπρόσωπό του εκείνο το έτος.