Mit dem Ausbruch des Ersten Balkankrieges wollte sich Eyer in der bulgarischen Armee als Freiwilliger einschreiben. Da er jedoch Ausländer war, konnte er bei den regulären Truppen nicht mitkämpfen. Noch am Tag der Mobilisierung bildete er in Russe den "Junak-Legion" mit dem er sich den Makedonien-Adrianopel-Freiwilligen-Korps anschloss. Im Zweiten Balkankrieg führte er die "1. Kompanie" des "Zwölften Losengrad Bataillons" des Korps, das zuvor in Burgas aus ostthrakischen Flüchtlingen gebildet wurde, an. Er kämpfte in Makedonien in den größeren Schlachten bei "Sultan tepe" und bei "Dram teke".