После отказа правительства предоставить Каталонии автономию Хуан Коморера, опасаясь репрессий, 2 июля 1919 года вместе с женой отправился в Аргентину. Прибыв в Буэнос-Айрес, Коморера вступил в Социалистическую партию Аргентины и стал редактором официального печатного органа партии — газеты La Vanguardia, c 1923 по 1930 год руководил еженедельником Nación Catalana. В 1926 году у него родилась дочь — Нурия. Был натурализован, однако после государственного переворота генерала Урибуру в ноябре 1930 года Коморера вынужден был покинуть Аргентину и перебраться в Монтевидео (Уругвай).