In der Schlussphase des Zweiten Weltkrieges lag Trebnitz im Kampfgebiet um die Seelower Höhen, der letzten deutschen Verteidigungslinie vor Berlin. Das Gut selbst überstand die Gefechte, wurde kurzzeitig als Lazarett der Wehrmacht und nach der Enteignung Harald von Brünnecks im April 1945 bis zum Ende der Kampfhandlungen in Europa als Kommandanturstelle der Roten Armee genutzt. Die Einrichtung und Ausstattung des Hauses gingen damals verloren.