El molino alberga orígenes andalusíes, siendo adquirido por el Diócesis de Córdoba a partir de 1272, tras la conquista cristiana de la ciudad, por diversas donaciones. En el siglo XV este tipo de azañas harineras fueron convertidas en batanes, y en el siglo XVII se adaptaron para albergas molinos con nuevas técnicas de regadío, existiendo el denominado molino de Tripas, que posteriormente desapareció.