Дмитрий Ватикиоти происходил из большого рода Ватикиотисов, ведущего своё начало из Ватика в Лаконии. После неудачного Пелопоннеского восстания 1770 года Ватикиотисы, как и многие другие его участники, нашли убежище на близлежащих островах Порос, Идра и Спеце.