Während der Napoleonischen Kriege wurde auch Kneiting im Jahr 1809, nach der Schlacht bei Regensburg, in starke Mitleidenschaft gezogen. Auf diese Zeit geht der Verlust sämtlicher Pfarrbücher zurück. Sie waren im Katharinenspital in Regensburg eingelagert, dem Sitz der Pfarrei, und sind seit dem Brand im Jahr 1809 vermutlich verbrannt. Zur Feier der Befreiung von der Herrschaft Napoleons wurde 1815 auf dem Kneitinger Berg ein Freudenfeuer entzündet, was die Pfarrchronik ausdrücklich vermerkt.