Веббер залишається в Red Bull, на сезон 2013 р. котрий стане для нього останнім у команді. Напруженість між ним і напарником Феттелем зростає після того як німець обігнав Марка на заключній фазі перегонів у Малазії попри наказ команди кожному утримуватися на своїй позиції. Ще один подіум Веббер бере у Монако. 27 червня 2013 року Марк Веббер оголошує, що залишить Red Bull по закінченню сезону. На 2014 рік він підписує контракт з Porsche і виступатиме на новоствореному боліді LMP1 світовому чемпіонаті на витривалість включно з перегонами «24 години Ле-Ману».