Bei den Six Nations 2005 bildete er zusammen mit Gavin Henson ein überragendes Duo als Innendreiviertel und hatte so großen Anteil am Grand-Slam-Gewinn. Folglich wurde er auch für die British and Irish Lions nominiert. Er verletzte sich jedoch noch vor Beginn der Tour, so dass er nicht aktiv an den Spielen teilnehmen konnte. Er fiel infolge dieser Verletzung nahezu eine komplette Saison aus, so dass auch ein vorzeitiges Karriereende Shanklins nicht ausgeschlossen werden konnte. In der nächsten Saison war er aber wieder Teil des walisischen Kaders, jedoch folgten enttäuschende Six Nations und das Vorrundenaus bei der Weltmeisterschaft. Das Team schlug unter dem neuen Trainer Warren Gatland bei den Six Nations 2008 zurück und konnte sich erneut den Grand Slam sichern. Shanklin wurde dabei in allen Spielen eingesetzt. Mit den Blues gelang ihm 2009 der Gewinn des Anglo-Welsh Cup.