Anton Lindskog spelade bara 2 juniorlandskamper med 4 mål gjorda. Han blev sedan ordinarie i ungdomslandslaget där han spelade 31 matcher med 61 gjorda mål. Han var med i truppen som vann U21-VM 2013. Debuten i A-landslaget kom också 2013, i landskamp mot Tjeckien. Lindskog blev egentligen uttagen till landslaget redan i december 2012, men en skada gjorde att debuten då inte blev av. Han har sedan dess bland annat varit med i VM 2021 i Egypten och tagit silvermedalj. Inför OS 2020 i Tokyo blev han uttagen som en av tre reserver. Reglerna ändrades sedan och man fick ta in en extra ordinarie spelare i truppen, vilket blev Lindskog. Han var inskriven i matchtruppen en gång men fick ingen speltid.