W latach 2009–2010 Jørgensen grał w reprezentacji Danii U-18 i reprezentacji Danii U-19. W 2010 roku zaczął występować w kadrze U-21. W 2011 roku zagrał z nią na Mistrzostwach Europy U-21, których Dania była gospodarzem. Na tym turnieju strzelił 1 gola, w grupowym meczu z Białorusią (2:0).