シベリア出兵を機に、ロシア経由で反ユダヤ主義が日本にも流入し、第二次世界大戦にかけて広まった。日本は、ユダヤ人迫害を国策としたナチス・ドイツと防共協定（後に日独伊三国同盟）を結んだが、ホロコーストには加担しなかった。一時は満州国へのユダヤ人難民受け入れも検討した（河豚計画）。リトアニア駐在の日本人外交官・杉原千畝のように、在欧ユダヤ人の亡命に協力した日本人もいる。ドイツの迫害からソ連を通り極東地域の満州国国境まで逃げてきたユダヤ人難民をハルピン特務機関長だった樋口季一郎陸軍中将(当時は少将)がオトポールから満州国国内を通し上海租界まで脱出などを手伝ったオトポール事件(ヒグチ・ルート)などもある。