Am 12. Juli 1821 heiratete er Ludowika Górska (* 18. Mai 1797; † 16. Juni 1833). Nach der Umwandlung des Herzogtums Warschau in das, von Russland geführte, Kongresspolen wurde er 1828 Oberst und Kommandant des Warschauer Arsenals. Wie sein Vater setzte sich Ignacy Hilary Ledóchowski für die Unabhängigkeit Polens ein. So nahm er am Polnischen Novemberaufstand im Jahre 1830 teil und übernahm mit seiner langjährigen militärischen Erfahrung, als Brigadegeneral und Kommandant die Verteidigung der Festung Modlin. Erst am 9. Oktober 1831 musste sie, als eine der letzten polnischen Bollwerke, angesichts der russischen Überlegenheit kapitulieren.