В 1709 же году он участвовал с своим полком на «Полтавской баталии» и был послан Петром Великим к крымскому хану и запорожцам с известием о выборе нового гетмана. Заехав из Крыма в Кош, Чарныш был там арестован атаманом Гордеенком и передан шведам, которые выдали его, вместе с прочими пленниками, Меншикову под Переволочной. Получив полковничество, Чарныш стал всевластно распоряжаться в своем полку, тесня полчан и скупая от них насильно «"грунты"». За время его полковничества сохранилось множество жалоб, поданных на него гетману от полчан. Но он, пользуясь покровительством гетманши, умел оправдывать себя перед гетманом, и жалобы оставались без результата.