Il 26 novembre 1804, per i suoi 25 anni di servizio come ufficiale dell'esercito imperiale russo, Baggovut ricevette l'Ordine di San Giorgio (4ª classe). Durante la guerra della quarta coalizione fu noto come uno dei più coraggiosi generali russi. Il 26 dicembre 1806, durante la battaglia di Pułtusk, protesse il fiume Narew. Per la sua condotta eroica gli fu concesso l'Ordine di San Giorgio di 3ª classe. Nella battaglia di Eylau del 1807, Karl ricevette l'ordine di bloccare l'avanzata nemica per permettere alle truppe russo-prussiane di prendere possesso delle fortificazioni. Nel corso del combattimento fu gravemente ferito al torace. Si distinse nella battaglia di Heilsberg ed in quella di Friedland. In questa seconda fu ferito di nuovo e subì una grave commozione cerebrale, a causa della quale fu costretto ad abbandonare il campo di battaglia prima della fine. Durante questa campagna miliare fu promosso tenente generale.