В начале Второй мировой войны, после 17 сентября 1939 года, советские бомбардировщики начали сбрасывать над городом листовки написанные на ломаном польском языке, объявляющие о скором освобождении "от гнета панов" и других угнетателей. Затем началось советское вторжение в Польшу, после которого многие жители региона были репрессированы, а регион подвергнут советизации. Новогрудок стал частью БССР, где в 1940 году стал районным центром Барановичской области.