Natalie Moszkowska est née le à Varsovie. Ses parents sont Alexander Moszkowski et d'Eveline Juhwihler. Elle est membre du parti social-démocrate polonais. Autour de 1900, à la suite de persécutions de la part du gouvernement tsariste, elle émigre de l'Empire russe en Suisse où elle commence ses études à l’université de Zurich. Le , elle obtient le titre de docteur "oeconomiae publicae" de l'université de Zurich sous la direction de Heinrich Sieveking. Elle a rédigé sa thèse de doctorat sur les caisses d'épargne des travailleurs dans les industries du charbon et de l'acier en Pologne. Comme indiqué dans sa thèse, elle a travaillé sur la base de documents russes, auxquels elle aurait eu accès lors de son ultime séjour dans le Royaume de Pologne en 1911. Fin 1918, dans le contexte de la Révolution d'octobre de 1917 et de la « Révolution de novembre » 1918 alors en cours en Allemagne, les autorités helvétiques suspectent Natalie Moszkowska d’être une « agitatrice pour le compte du bolchevisme ». Comme Moszkowska et Leiba Chaim Kaplan sont restées plus longtemps que prévu à l'Alpenhotel de Weesen-Amden en Suisse, la police cantonale de Saint-Gall a été chargée de surveiller cette « paire de Russes », qui recevait « fréquemment du courrier postal recommandé ».