À la suite de divers démêlés avec différents acteurs du projet, Gisborne se désintéressa de la télégraphie et réorienta sa carrière vers le secteur des mines. Il revint habiter en Angleterre un temps avant de revenir au Canada où on le nomma, en 1862, commissaire de Terre-Neuve à l’Exposition industrielle de Londres et, cinq ans plus tard, commissaire des mines du gouvernement terre-neuvien à l’Exposition universelle de Paris. Il supervisa plusieurs travaux en Nouvelle-Écosse dont la construction de plusieurs tronçons de chemin de fer et l’amélioration des installations portuaires de Sydney et de Louisbourg. Il revint finalement à ses premières occupations alors que le gouvernement fédéral canadien le nomma officiellement le surintendant du service de télégraphie et de signalisation du pays. Durant cette période, il réorganisa le réseau télégraphique de la Colombie-Britannique et supervisa personnellement l’installation d'autres lignes télégraphiques en Alberta (de Dunmore à Fort Macleod) et en Saskatchewan (de Moose Jaw à Wood Mountain). Il entreprit de même la remise en état de la ligne Edmonton-Calgary. En 1882, il reçut le titre de membre fondateur de la Société royale du Canada.