Nach einer weiteren vertretungsweisen Verwendung als Kommandierender General des stellvertretenden IX. Armeekorps in Kassel (zugleich Befehlshaber im Wehrkreis IX) von Januar bis April 1944 wurde Kleffel Befehlshaber des "Sonderstabes I" im OKH und im Juli 1944 Kommandierender General des XVI. Armeekorps an der Ostfront. Am 20. Oktober wurde er Befehlshaber der "Armeeabteilung Kleffel" (vormals "Armeeabteilung Grasser bzw. "Armeeabteilung Narva"), die aus dem LIV. Armeekorps hervorgegangen war. Anfang November kehrte er dann noch einmal zum XVI. Armeekorps zurück, ehe er Mitte Dezember in die besetzten Niederlande berufen wurde, um hier das wieder aufgestellte XXX. Armeekorps zu übernehmen. Vom 28. März bis zum 7. April 1945 war er hier zugleich stellvertretender Führer der 25. Armee. Bei Kriegsende geriet Kleffel in britische Kriegsgefangenschaft, aus der er am 20. Oktober 1947 entlassen wurde.