Сезон &lt;a href="%D0%A7%D0%B5%D0%BC%D0%BF%D0%B8%D0%BE%D0%BD%D0%B0%D1%82%20%D0%A0%D0%BE%D1%81%D1%81%D0%B8%D0%B8%20%D0%BF%D0%BE%20%D1%84%D1%83%D1%82%D0%B1%D0%BE%D0%BB%D1%83%202016/2017"&gt;2016/17&lt;/a&gt; стал неудачным для Дзагоева. Из-за четырёх травм, полученных в течение сезона, он сыграл лишь 15 из 30 матчей в чемпионате России. Но несмотря на такое количество повреждений, сумел отличиться в играх Лиги чемпионов, забив голы во встречах с «Байером» и «Тоттенхэм Хотспур». Перед 30-м туром главный тренер ЦСКА Виктор Гончаренко заявил, что Дзагоев пропустит матч. Позднее стало ясно, что он также не сможет принять участие в Кубке конфедераций.