Le , la position stratégique de l'abbaye sur une colline dominant la route allant de Rome à Naples, lui vaut d'être le théâtre d'une bataille meurtrière, durant la deuxième phase de laquelle elle est une dernière fois détruite par un bombardement massif des forces alliées, qui y soupçonnaient à tort la présence de troupes allemandes. Le bombardement a commencé le matin du 15 février et 142 bombardiers lourds et 114 bombardiers moyens ont rasé l'abbaye. Au cours de cela, de nombreux civils ont été tués qui avaient cherché refuge à l'intérieur du bâtiment, tandis qu'à l'extérieur, plusieurs soldats allemands et même une quarantaine de soldats de la division indienne ont été tués par des bombes. Le soldat Walter M. Miller, futur écrivain, a participé au bombardement et il s'est inspiré de cette expérience pour son œuvre la plus importante, "Un cantique pour Leibowitz".