Na twee seizoenen op een hoog niveau te hebben gespeeld onder leiding van de Ierse trainer Joe Kinnear – Wimbledon, met clubtopschutter Dean Holdsworth in de rangen, eindigde als zesde in Scales' laatste seizoen &lt;a href="Engels%20voetbalkampioenschap%201993/94"&gt;1993/1994&lt;/a&gt; – verkaste Scales naar Liverpool voor een som van £ 3.500.000. Scales was een vaste waarde bij "The Reds". Volgens hem miste de ploeg de nodige discipline om kampioen te spelen, waarmee hij doelde op "moeilijke" jongens als Robbie Fowler en Stan Collymore. Meer dan twintig jaar na zijn afscheid van de club zei Scales dat hij Liverpool eigenlijk niet wilde verlaten en dat hij zijn vertrek heeft beklaagd. Hij speelde mee in de verloren FA Cup-finale van 1996, waarin Liverpool met 0-1 ten onder ging tegen aartsrivaal Manchester United na een late treffer van Éric Cantona vijf minuten voor tijd.