Da Sonia Madejsker akzentfrei Polnisch sprach, war sie, getarnt als katholische Polin, viel außerhalb des Ghettos unterwegs, unterhielt Kontakte zum Widerstand in Polen, Litauen und in den Ghettos und organisierte Verstecke für FPO-Mitglieder. Bei einer Kurierfahrt gemeinsam mit ihrer Genossin Cesia Rozenberg, die sie durch die Frontlinien zur Roten Armee führen wollte, wurden die beiden dreimal verhaftet, ohne dass sie als Jüdinnen erkannt wurden, und entkamen jedes Mal. Die Flucht zur Roten Armee scheiterte, doch kehrten die beiden Frauen sicher ins Ghetto zurück. Als das Wilnaer Ghetto im September 1943 liquidiert wurde, spielte Sonia Madejsker eine entscheidende Rolle bei der Unterbringung der aus dem Ghetto durch die Kanalisation Flüchtenden in vorbereiteten Verstecken. Einige dieser Verstecke waren im Heereskraftfahrpark mit Duldung durch dessen Kommandeur, den Wehrmachtsoffizier Major Karl Plagge, eingerichtet worden. Dieser beschäftigte dort mehrere hundert Zwangsarbeiter samt ihren Familien und verhinderte so deren Liquidierung. Weitere von Sonia Madejsker und Vitka Kempner organisierte Unterkünfte halfen mehreren hundert FPO-Mitgliedern, in die Wälder in der Umgebung der Stadt zu entkommen. Sonia Madejskers Eltern wurden jedoch bereits 1942 in der Massenhinrichtungsstätte im Wald von Ponary erschossen. Im März 1944 spürte die Gestapo Sonia Madejskers Versteck auf und umstellte es. Sonia Madejsker eröffnete das Feuer und traf drei Gestapo-Beamte tödlich, doch kam sie gegen die Übermacht nicht an. Sie versuchte, sich das Leben zu nehmen, wurde schwer verwundet und im Łukiszki-Gefängnis in Wilna viele Tage schwer gefoltert, ohne dass die Gestapo brauchbare Informationen herauspressen konnte. Sonia Madejsker starb kurz darauf im Gefängnis.