En 2013-2014, McManus se montre régulier et remonte par conséquent dans le classement mondial. Il est notamment quart de finaliste de l'Open mondial. En avril, au championnat du monde, il parvient comme l'année précédente à accéder au grand tableau. Il y retrouve un ami et un rival ; John Higgins. Il se réconcilie avec le public du Crucible Theatre, avec qui il n'a plus connu la joie d'une victoire depuis 2005, s'imposant par 10 manches à 7. Au second tour, dans un matchs de vétérans contre Ken Doherty, Alan s'impose sur le score de 13 à 8, atteignant les quarts de finale, comme en 2005. Il est cependant vaincu par le futur vainqueur : Mark Selby. Il retrouve ensuite sa place dans le top 32 du classement.