После смерти отца 3 февраля 1458 года Томас унаследовал все его владения и титулы. В 1460 году йоркисты разбили королевскую армию при Нортгемптоне, фактически взяли короля в плен и особым парламентским актом объявили Ричарда Йоркского наследником престола. Ланкастеры с этим не смирились. Жена Генриха VI Маргарита Анжуйская приказала преданным ей лордам собирать войска и идти в Йоркшир; такой приказ получил и Куртене, который в декабре 1460 года уже находился на севере. 30 декабря в битве при Уэйкфилде йоркисты были наголову разгромлены, причём, помимо Ричарда Йоркского, в схватке погибли двое Бонвиллов — сын и внук барона Уильяма. Одержав эту победу, ланкастерские лорды, включая Девона, двинулись на Лондон. Во второй битве при Сент-Олбансе 17 февраля 1461 года они разбили йоркиста Ричарда Невилла, 16-го графа Уорик. В этом сражении попал в плен барон Бонвилл, уже на следующий день осуждённый за измену и обезглавленный. Предположительно именно Куртене добился казни барона: король, при Сент-Олбансе снова попавший в руки ланкастерской партии, был готов помиловать пленника.