En 2003, il est affecté comme chef du groupement opérations à bord du porte-avions "Charles de Gaulle" alors engagé dans la guerre d'Afghanistan. Promu capitaine de vaisseau le , il commande la frégate "La Fayette" l'année suivante qui est déployée dans le cadre de l'opération "Enduring Freedom". Il est auditeur de la session nationale de l'Institut des hautes études de défense nationale pendant l'année 2008-2009.