Für Slowenien nahm Pretnar im Juniorenbereich an den U18-Junioren-C-Europameisterschaften 1995 und 1996 sowie den U20-Junioren-C-Weltmeisterschaften 1995, 1996 und 1997 teil. Des Weiteren stand er im Aufgebot seines Landes bei den B-Weltmeisterschaften 2004 und 2007 sowie bei den A-Weltmeisterschaften 2003, 2005 und 2008.