Kipchoge, 2003 yılında IAAF Dünya Cross Country Şampiyonasında gençler kategorisindeki yarışı kazanarak ve 5000 m'de dünya gençler rekorunu kırarak ilk bireysel dünya şampiyonluğunu kazanmıştır. On sekiz yaşındayken 5000 m'de kıdemli oldu. 2003 Dünya Atletizm Şampiyonası'nda dünya şampiyonu olan Kipchoge, daha sonra 2004'te Kenya için Olimpiyat'larda ve 2006 Dünya Salon Atletizm Şampiyonasında bronz madalya kazandı. Beş kez Dünya Şampiyonası 5000 m finalisti olmuş Kipchoge, 2007 Dünya Şampiyonası, 2008 Yaz Olimpiyatları ve 2010 İngiliz Milletler Topluluğu Oyunları'nda gümüş madalyalar almıştır.