22 червня 1941 року нацистська Німеччина вторглася в СРСР і за тиждень взяла під контроль всю Литву. Спочатку німців зустрічали як визволителів від гнітючого радянського режиму. Литовці сподівались, що німці відновлять свою незалежність або принаймні дозволять певний ступінь автономії (подібно до Словацької Республіки ). Організований Литовським активістським фронтом (ЛАФ), литовці піднялися в рамках антирадянського та пронацистського червневого повстання, створили короткочасний Тимчасовий уряд і проголосили незалежність. Однак німці не визнали Тимчасовий уряд і створили власну цивільну адміністрацію - Рейхскомісаріат Остланд. Коли Червона Армія відновила контроль над Литвою влітку 1944 - січні 1945 року, литовські партизани розпочали збройну боротьбу проти другої радянської окупації. За оцінками, під час партизанської війни між 1944 і 1953 роками було вбито 30 000 партизанів та прихильників партизанів