Fille de l'infante Catalina-Micaela, et donc cousine du roi Philippe IV d'Espagne, aussi roi du Portugal, elle est nommée vice-reine du Portugal en 1635. En réalité, le pouvoir était entre les mains d'un ancien page de Gaspar de Guzmán, comte d'Olivares, Miguel de Vasconcelos. Celui-ci l'exerce en tant que secrétaire d'État de 1635 à 1640 pour la vice-reine. Le , la révolte initiant la guerre de Restauration, éclate. Le complot organisés par des fidalgos de la plus haute aristocratie portugaise, dite les "40 Conjurés", abouti à la prise du palais royal à Lisbonne et à l'emprisonnement de la vice-reine. Vasconcelos est retrouvé dans une armoire et est tué. La vice-reine est reconduite à la frontière.