Дальнейшие войны Селима III находились в тесной связи с действиями французской политики. Поход Бонапарта в Египет без предварительного соглашения с Турцией дал возможность России и Англии натравить Турцию на старого союзника, которому она объявила войну (1798). Война прошла без крупных дел. Успехи Бонапарта в Сирии до неудачной осады Сен-Жан-д’Акры, поражение им Мустафы-паши у Абукира (1799) — важнейшие дела этой кампании. Али-паша вёл войну с французскими войсками в прежних владениях Венеции, которыми овладели в 1797 году французы, без особого успеха, но турецкий флот в соединении с русской эскадрой Ушакова отняли у французов Ионические острова (1798—1799). Когда же Клебер, разбив 80 тысяч турок с 10 тысяч человек при Гелиополисе, погиб от руки фанатика, турецкие и английские войска так стеснили французов, что командовавший ими генерал Мену заключил в 1801 году договор, в силу которого французские войска очистили Египет.