След разпадането на СССР, в периода през 1993 – 1997 г. летището не работи. През 1997 г. получава международен статут. През 2001 г. става собственост на местния съвет на град Измаил. Местната власт отделя много средства за ремонт на помещенията и погасяване на дългове на неизплатени заплати. През този период летището приема полети от Киев, Истанбул и Варна.