Terminada la guerra con España, hizo la campaña naval en el norte, durante la guerra con la Gran Colombia, formando parte de la dotación de la fragata "Presidente" siempre al mando de Guise. Se distinguió en los combates librados en la rada de Guayaquil hasta lograr la capitulación del puerto en 1829. Por sus méritos fue ascendido a alférez de fragata. En 1834 ascendió a teniente segundo.