В 1854 году Баков принял участие в походе в Придунайские княжества, отличился при осаде Силистрии. С 16 апреля 1855 года находился в рядах защитников Севастополя, где находился до самого последнего дня обороны. За отличие при обороне Севастополя он был произведён в подпоручики и награждён орденом св. Станислава 3-й степени с мечами и бантом.