Med två mål mot Japan i VM 2006 blev Ronaldo den tjugonde spelaren någonsin att göra mål i tre olika världsmästerskap (VM 1998, 2002 och 2006). Den 27 juni 2006 vann han VM-historiens skytteliga när han i åttondelsfinalen mot Ghana gjorde sitt femtonde VM-mål och slog tysken Gerd Müller, men blev senare slagen själv av Miroslav Klose under semifinalen mellan Tyskland och Brasilien den 8 juli 2014. Brasilien blev emellertid utslagna i kvartsfinalen mot Frankrike.