Lincoln fue atacado el 14 de abril, y falleció al día siguiente. Davis lamentó su muerte; más tarde afirmó que creía que el difunto hubiese sido más exorable con el sur de lo que lo fue su sucesor en el cargo presidencial, Andrew Johnson. Tras el magnicidio, Johnson ofreció una recompensa de cien mil dólares por el apresamiento de Davis, al que acusó de colusión en la muerte de Lincoln. En las unidades confederadas cundía el desorden, y las unionistas redoblaron los esfuerzos por capturar a Davis.