Vuosina 2016–2018 Jalonen valmensi KHL-seura Jokereita. Vuonna 2018 hän palasi maajoukkueen valmentajaksi Lauri Marjamäen siirryttyä toiseen suuntaan Jokereihin. Jalonen valmensi Suomen maailmanmestariksi toistamiseen vuoden 2019 maailmanmestaruuskisoissa. Vuoden 2021 MM-kilpailuissa ”Leijonat” saavutti Jalosen johdolla hopeaa.