À la suite du congrès de Vienne, Cracovie acquiert le statut de ville libre indépendante. C'est pendant cette période que furent abattus, en 1822, les murs du quartier juif, ce qui permit aux Juifs de s'établir progressivement dans le quartier chrétien. Après l’échec de l'insurrection polonaise de 1830, Cracovie perdit son autonomie et de 1836 à 1841, est fut occupée par l’armée autrichienne. En 1846, Cracovie se souleva contre cette occupation, mais la révolte fut matée et l’Autriche annexa définitivement le territoire de Cracovie le . À partir de 1860, l'Autriche mit fin aux discriminations contre les Juifs et l'interdiction faite aux Juifs d'habiter ailleurs que dans le quartier juif fut officiellement levée. Les Juifs les plus pauvres et les plus religieux demeurèrent à Kazimierz. Les plus émancipés construisirent, dans la , leur synagogue réformée, la .