Ia memperkuat tim internasional selama sembilan tahun, Ceni mengumpulkan 16 caps. Ia terpilih untuk regu yang memenangkan Piala Konfederasi FIFA 1997 dan Piala Dunia FIFA 2002 (dan Piala Dunia FIFA 2006, masih belum sepenuhnya pulih dari operasi lutut), tetapi hanya muncul dalam dua game di tahap akhir, 3–2 menang melawan Meksiko di turnamen pertama dan kemenangan 4–1 atas Jepang di ketiga.