В конце сентября 1961 года, чтобы отличать руандийский от идентичного по цветам гвинейского, на флаг была добавлена буква "R", которая дополнительно символизировала название страны, революцию и проведённый референдум. Этот флаг остался неизменным и после объявления независимости страны 1 января 1962 года, под ним же был проведён геноцид в 1994 году и под ним же было свергнуто правительство хуту после его проведения.