Am 27. Juli 1365 brach eine Kreuzfahrerflotte unter Führung Peters I. von Venedig über Rhodos zum Kreuzzug gegen Alexandria auf und Peter Thomas ermahnte die Teilnehmer zu religiöser Begeisterung. Am 9. Oktober eroberten, plünderten und zerstörten die Kreuzfahrer Alexandria. Wenige Tage danach zogen sie sich, gegen den Rat von Peter Thomas und anderen, vor dem mamlukischen Gegenangriff mit der Beute nach Zypern zurück. Peter Thomas berichtete davon in zwei leidenschaftlichen Briefen an Papst Urban V. und Kaiser Karl IV.