Due anni dopo, la compagnia dei Moschettieri venne sciolta dal cardinale Giulio Mazzarino e, insieme con l'ufficiale Besmaux, divenne uno dei suoi uomini di fiducia, svolgendo diverse missioni presso i comandanti delle armate del Re nel periodo della Fronda. Il suo compito era quello di staffetta, portatore di messaggi e agente segreto. Quando nel 1651, durante queste pericolose insurrezioni, Mazzarino dovette lasciare la Corte e si rifugiò dall'arcivescovo di Colonia, d'Artagnan gli fece da messaggero galoppando da Brühl a Parigi. Fu agli ordini di Turenne nella campagna delle Fiandre. Nel 1655 o 1656 diventò capitano delle Guardie, poi capitano e custode della voliera delle Tuileries, incarico tanto futile quanto prestigioso, visto che lo ottenne a pagamento, disputandolo a Colbert. Nel 1657 la compagnia dei Moschettieri venne ricostituita e, l'anno seguente, ne assunse il comando, succedendo a Issac de Baas come sottotenente, sebbene titolare della carica rimanesse il duca di Nevers, nipote di Mazzarino. Nello stesso anno, partecipò all'assedio di Dunkerque.