31. lokakuuta 2016 Turkin poliisi pidätti Sabuncun ja 12 muuta Cumhuriyetin toimitukseen tai johtoon kuuluvaa ihmistä sekä tutki lehden toimittajien ja johdon koteja. Cumhuriyet on Turkin viimeisiä riippumattomia lehtiä. Syyttäjän mukaan pidätettyjen epäiltiin tehneen rikoksia kurdisissien ja "gülenistisen terrorijärjestön" puolesta, jota pääministeri Erdoğan syyttää heinäkuun 2016 vallankaappausyrityksestä. Syyttäjänviraston mukaan Cumhuriyertin johtoa ryhdyttiin tutkimaan elokuussa, koska epäiltiin, että lehti oikeuttaa vallankaappausyrityksen jutuissaan. Turkin johto on julistanut Fethullah Gülenin kannattajat yhteiskunnan vihollisiksi ja terroristeiksi. Sabuncu on ollut pidätettynä lokakuusta asti. Hän sai kuulla syytteensä viiden kuukauden pidätettynä olon jälkeen. Syytteet nostettiin 8 kuukauden kuluttua pidätyksen alkamisesta.