В 1903 году Евгений Юлианович был переведён с Черноморского флота в Тихоокеанскую эскадру. И 15 декабря 1903 года временно назначен командовать миноносцем «Сильный». 30 января 1904 года получил назначение на бронепалубный крейсер 1-го ранга «Диана», а уже 2 февраля был переведён на должность артиллерийского офицера канонерской лодки «Бобр». 18 июля 1904 года переведён в должность старшего артиллерийского офицера бронепалубного крейсера «Паллада». После потопления корабля японцами 8 декабря 1904 года присоединился к защитникам Порт-Артура. После сдачи крепости попал в плен.