In 1805 werden de bergen doorkruist door de Expeditie van Lewis en Clark. Deze bergen (en de Salmon River Mountains, ten zuiden van de Bitterroot Mountains) vormden een groot onverwacht obstakel voor hun expeditie naar het westen. Dit betekende eveneens het einde voor hun hoop op het vinden van een "noordwestelijke passage" tussen het stroomgebied van de Atlantische Oceaan (via de Missouri) en de Pacifische Oceaan.