Auch für die WM in den USA konnten sich die Kolumbianer unter ihrer Leitung qualifizieren. Dort mussten sie aber nach der Vorrunde obwohl von Pelé als Geheimfavorit eingestuft die Segel streichen. Als Maturana nach der WM aufhörte wurde Gómez sein Nachfolger. Ihm gelang es die Kolumbianer zur WM nach Frankreich zu führen, wo ihnen aber nur ein Sieg gegen Tunesien gelang. Die beiden anderen Gruppenspiele gegen Rumänien und England wurden verloren. Damit schied Kolumbien als Gruppendritter aus. Gómez wechselte daraufhin nach Ecuador und übernahm die ecuadorianische Nationalmannschaft, die sich noch nie für eine WM-Endrunde qualifiziert hatte. In der Qualifikation belegten die Ecuadorianer unter seiner Führung den zweiten Platz und ließen dabei den späteren Weltmeister Brasilien hinter sich, wogegen sich Kolumbien nach zuvor drei erfolgreichen Qualifikationen als Sechster nicht qualifizieren konnte. Bei der Endrunde verloren sie ihr erstes Spiel gegen Italien durch zwei Tore von Christian Vieri mit 0:2 und auch das zweite Spiel gegen Mexiko ging trotz früher Führung mit 1:2 verloren. Im letzten für sie selber bedeutungslosen Spiel gegen Kroatien gelang dann der erste Sieg, womit sie den Kroaten den Weg ins Achtelfinale verbauten. Gómez blieb zunächst im Amt, trat aber nach der Copa América 2004 zurück, bei der Ecuador in der Gruppenphase dreimal verloren hatte.