Han var sønn av juristen Nicolai Aagesen, og ble student i 1843. I 1848 deltok han som frivillig i den første slesvigske krigen. Året etter tok han juridisk embetseksamen og ble ansatt i Justisministeriet. Senere foretok han en lang utenlandsreise til Frankrike og England, og ble i 1855 ansatt som lektor ved Københavns Universitet, hvor han året etter ble professor. Han beholdt denne stillingen til sin død. Fra 1861 var han dessuten ekstraordinær assessor i Højesteret og var i mange år formann i styret for Nationalbanken. Det året han døde var han innvalgt som medlem av Landstinget.