Daha sonra, İskoç ordusunda bir general olarak Claverhouse, 1688 Devrimi'nden sonra İskoçya Kralı VII. James'e sadık kaldı. Jacobite davasına sadık olan Highland klanlarını topladı ve savaşta hayatını kaybetmesine rağmen, onları Killiecrankie'de zafere götürdü. Bu ilk Jacobite ayaklanması başarısız oldu; ancak Claverhouse bir Jacobite kahramanı oldu ve ikinci takma adı olan "Bonnie Dundee"yi aldı.