Гільдебранд знову змушений був тікати, коли Гітлер анексував Австрію в 1938 році. Він провів одинадцять місяців у Швейцарії, поблизу Фрібурга. Потім він переїхав до Фіак у Франції, поблизу Тулузи, де викладав у католицькому університеті Тулузи. Коли гітлерівці вторглись у Францію у 1940 р., він переховувався; після багатьох негараздів та героїчної допомоги французів, серед яких Едмонд Мішелет та американський журналіст Варіан Фрай, він зміг втекти до Португалії зі своєю дружиною, їхнім сином Францом та невісткою. Звідти вони поїхали на кораблі до Бразилії, а потім до Нью-Йорка, прибувши в 1940 році. Там він викладав філософію в університеті єзуїтів Фордхем на Роуз-Хілл в Бронксі, де потім став наставником відомої католицької письменниці та професорки філософії Ронди Червін.