Murphy gilt als zentristischer Demokrat, der in gesellschaftspolitischen Fragen wie Schwangerschaftsabbruch (Pro-Choice) und Gleichstellung Homosexueller liberal, in fiskalpolitischen Fragen aber restriktiv ist. Er weicht häufiger von der Parteilinie ab; so unterstützte er die Republikaner im Repräsentantenhaus bei einem Gesetzesvorschlag, den Präsidenten dazu zu verpflichten, innerhalb von zehn Jahren den Haushalt auszugleichen und stimmte als einer von 19 seiner Fraktion für den Bau der ökologisch umstrittenen Pipeline Keystone XL. Zudem gehörte er 2014 zu den sieben Kongressabgeordneten seiner Partei, die der Einsetzung eines Untersuchungsausschusses zum Verhalten der Regierung Obama beim Anschlag auf die US-Botschaft im libyschen Benghazi zustimmten.