1942年7月，日本海军重新编制以航空母舰为主的第三艦隊。此时海军内部已经有不少声音，要求以航空兵力为主要作战力量，希望能让第三舰队和以战列舰为主的第二艦隊合起来编组一支新的舰队，这样就能让机动部队和前卫部队直接归属于统一的指挥机构下作战，从而精简指挥层级。同年10月聖克魯斯群島戰役爆发，在随后的研究会上，时任第三舰队参谋长提出了“有必要让机动部队指挥官统一指挥所在部队。由第二舰队司令长官来指挥的话，并不适合作战”的意见。1943年8月海军解决了相关问题，1944年3月正式组建第一机动舰队。