В 1855 году он был в числе смелых охотников, атаковавших англичан близ Лабораторной балки 27 апреля и уничтоживших тех же англичан у Зелёной горы 30 апреля. 6 июля был произведён в штабс-капитаны, и с 8 июля состоял для особых поручений при начальнике штаба Севастопольского гарнизона генерал-майоре князе В. И. Васильчикове. При отражении неприятеля перед Малаховым курганом 22 августа 1855 года Мольский был ранен осколком бомбы в левую бровь, с обнажением кости и контужен в левую часть головы; в конце года он был произведён в капитаны со старшинством от даты своего ранения. 16 февраля 1856 года получил чин майора.