Morgenstern har seks gullmedaljer med det østerrikske hopplandslaget i lagkonkurransene i VM. Han var med på å vinne begge lagkonkurransene (liten og stor bakke) under VM 2005, storbakkerennet i VM 2007 og begge lagkonkurransene (liten og stor bakke) i VM 2011. Han har også et individuelt gull fra VM 2011 i Oslo.