1991년에 남과 북의 올림픽위원회는 한반도기에는 '한반도와 제주도를 상징적으로 그려넣고, 그 밖의 섬은 생략한다'고 합의하였으나, 경우에 따라서는 울릉도, 독도가 그려진 깃발을 쓰기도 해서 논란이 있다. 이러한 문제 때문에 남과 북의 이견이 엇갈리는 경우가 있어 2018년 동계 패럴림픽에서는 개막식에서의 공동 입장이 무산되기도 하였다.