Im Juli 2013 wurde Lindgren für einen Langzeitaufenthalt an Bord der ISS nominiert. Er startete am 22. Juli 2015 zusammen mit dem russischen Kommandanten Oleg Kononenko und dem japanischen Astronauten Kimiya Yui im Raumschiff Sojus TMA-17M zur ISS. Dort arbeitete er bis zum 11. Dezember 2015 als Bordingenieur der ISS-Expeditionen 44 und 45.