באליפות העולם בשחייה שנערכה בברצלונה בשנת 2003 כבר בשלב חצי הגמר קבעה ג'ונס שיא עולם חדש במשחה ל-100 מטר חזה בתוצאה של 1:06.37 דקות, שיפור לשיאה של היינס (1:06.52 דקות). למחרת היא לא הצליחה לשחזר את יכולתה וזכתה רק במדליית ארד (1:07.47 דקות) אחרי קסיוג'ואן (1:06.80 דקות) ואמנדה בירד מארצות הברית (1:07.42 דקות). במשחה ל-200 מטר חזה היא זכתה במדליית כסף בתוצאה של 2:24.83 דקות, אחרי בירד שהשוותה את שיא העולם 2:22.99 דקות ולפני הוי קווי מסין (2:25.78 דקות). במשחה שליחות 4x100 מטר מעורב היא זכתה במדליית ארד נוספת בתוצאה של 4:01.37 דקות, אחרי סין (3:59.89 דקות) וארצות הברית (4:00.83 דקות).