Ahmed Hassan maakte deel uit van de Egyptische selectie tijdens het gewonnen Afrikaans kampioenschap voetbal 2006, dat in zijn thuisland Egypte werd gehouden. In de openingswedstrijd, die door Egypte met 3–0 werd gewonnen tegen Libië, maakte Hassan het derde doelpunt, nadat zijn landgenoot Mido een strafschop had gemist. Ahmed Hassan scoorde in de rebound toen de bal via de doelman voor zijn voeten terechtkwam. Ahmed Hassan scoorde in de kwartfinale tegen Congo-Kinshasa zowel de 1–0 en als 4–1.