Ses activités à la présidence de la Banque centrale étaient controversées : il était par exemple accusé d'avoir illégalement versé de l'argent aux forces anti-réforme du Soviet suprême pendant la crise constitutionnelle russe de 1993. Gerachtchenko est également accusé d'être en grande partie responsable du "mardi noir" russe d', lorsque le rouble s'est effondré à 24 % en un jour. En 1995, l'ancien économiste de Harvard, Jeffrey Sachs, qualifie Gerachtchenko de "pire banquier central au monde".