Han var søn af arkitekt Johannes Paulus Jacobi og Ida Kirstine Margrethe født Bagge, blev landkadet 1845 og udnævntes efter bestået officerseksamen 1849 til sekondløjtnant ved 5. reservebataljon med aldersorden fra 1848. Han deltog i kampen ved Helligbæk, slaget ved Isted og fægtningen ved Stenten Mølle og kom ved krigens slutning til 11. bataljon, men derefter tilbage til sin gamle afdeling og udførte forskellige opmålingsarbejder i den sydlige del af Slesvig. Efter bataljonens opløsning 1852 og indtil udnævnelsen til premierløjtnant 1859 gjorde Jacobi tjeneste ved flere forskellige afdelinger, men var fra 1860 ansat som adjudant ved 3. infanteribrigade i Rendsborg, indtil han 1863 blev pladskommandant og detachementskommandør i Glückstadt.