Jefferson joue dans l'équipe universitaire des Arizona Wildcats de l'université d'Arizona. Il est drafté en de la Draft 2001 de la NBA par les Rockets de Houston, mais est envoyé aux Nets du New Jersey, avec les droits de Jason Collins et de Brandon Armstrong contre Eddie Griffin. Le transfert est tout de suite favorable au Nets. En effet, Jefferson joue un rôle très important dans la conquête du titre de la Conférence Est, en 2002-2003. Jefferson fait également partie de l'équipe olympique américaine aux Jeux olympiques de 2004.