Laget spilte sin første offisielle landskamp borte mot den 23. mai 1975, en kamp de tapte 6–2. Ekvatorial-Guinea har ikke kvalifisert seg til sluttspillet i et Verdensmesterskap, men deltok for første gang i Afrikamesterskapet i 2012. Laget regnes tradisjonelt for å være et av Afrikas svakere lag i henhold til FIFAs verdensranking.