Педро Руис дебютировал в составе сборной Перу 22 июня 1975 года в товарищеском матче со сборной Эквадора, завершившимся поражением перуанцев со счётом 0:6. В том же году Руис принял участие в победном для его сборной Кубке Америки, на котором сыграл в двух матчах. Своё последнее выступление за сборную Руис провёл в товарищеском матче со сборной Колумбии 18 июля 1979 года, тот матч перуанцы проиграли со счётом 0:1. Всего же за сборную Педро Руис сыграл 7 официальных матчей.