A Igreja AME não ignorou o status de escravizado e vulnerável de seus muitos paroquianos. Várias congregações serviram como escolas, como estações para a Underground Railroad e como fóruns para condenar a escravidão negra e a violência contra aqueles que eram supostamente livres. Em seus esforços, fundaram a Igreja Episcopal Metodista Britânica em 1856 em solo livre do Canadá, compraram a Wilberforce University em 1863 e participaram ativamente na Guerra Civil Americana: o clero alistado como capelães e os membros como soldados do Exército da União. A evangelização dos ex-escravos no Sul, após a Guerra Civil, resultou em crescimento sem precedentes. Em 1870-1871, o ministro da AME Hiram R. Revels foi o primeiro afro-americano a servir no Senado dos Estados Unidos, representando o Mississipi, durante o período conhecido como Reconstrução dos Estados Unidos. Em 1880, a Igreja AME possuía 400 mil membros e várias escolas e faculdades. Depois, começa a expansão da AME para a África Ocidental (1891) e a África do Sul (1896). Em um antigo prédio da AME em Los Angeles, tem início em 1906 o Reavivamento da Rua Azusa.