Caso aparte es el destino de los caquetíos. Aportaron grandes contingentes a los ejércitos realistas, especialmente a Juan Manuel Cagigal y Mac Swing. Después de Carabobo en 1821 quedaron muy debilitados y acabaron culpándose y enfrentándose entre sí. El cacique Martín López de la Chica en Moruy murió poco después, y el de Santa Ana, Juan Alberto Núñez, tuvo que huir de patriotas y rivales locales. Muchos indios fueron muertos por los patriotas o se suicidaron y por ella no participaron de la campaña de Occidente. En 1800 eran 8.000 pero en 1821 apenas 1.800 por la guerra, la emigración y el hambre. Poco después desaparecieron como pueblo.