En 1441, Ezkio figure déjà comme un village uni à la ville de Segura. Au début du , Ezkio est séparé de Segura et est uni à la mairie d'Areria, à laquelle elle appartiendra jusqu'au de 1661. Elle aura l'indépendance par privilège royal. Pendant la Guerre de la Convention des habitants d'Ezkio ont largement participé aux luttes contre les envahisseurs français.