Pendant que Martínez est à Durango, la Guerre d'indépendance du Mexique éclate et le Nouveau-Mexique devient une partie du Mexique indépendant. Sous l'administration espagnole, le commerce avec les États-Unis était limité. En 1821, sous l'administration mexicaine, la Piste de Santa Fe est ouverte et le commerce encouragé. Des commerçants d'origine anglo-américaine, comme Kit Carson et William Becknell, se pressent au Nouveau-Mexique.