На монастырском кладбище были похоронены многие известные калужане. Здесь находилась часовня на могиле Ермила Юродивого, усыпальница князей Оболенских, надгробные памятники и плиты героев Отечественной войны 1812 года: генерал-лейтенанта К. Ф. Багговута, смертельно раненого в Тарутинском сражении, тело которого было доставлено в Калугу, умерших в калужском военном госпитале генерал-лейтенанта Н. П. Лебедева и генерал-майора А. М. Всеволожского (ныне покойным иеромонахом Пафнутием в течение ряда лет принимались меры к исследованию и восстановлению монастырского некрополя у южной стены Богородице-Рождественского собора; в частности, была изготовлена и установлена точная копия гранитной могильной плиты К. Ф. Багговута).