Von 2009 bis 2011 war sie Politische Direktorin des Auswärtigen Amtes und in dieser Funktion unter anderem deutsche Verhandlungsführerin in den EU-3+3-Verhandlungen über das iranische Atomprogramm. Sie soll Außenminister Guido Westerwelle vergebens geraten haben, der Resolution 1973 des UN-Sicherheitsrates zuzustimmen. Haber wurde am 2. Juli 2011 gemeinsam mit Harald Braun zur beamteten Staatssekretärin im Auswärtigen Amt ernannt. Sie löste Wolf-Ruthart Born ab und war unter anderem für die Europapolitik zuständig. Vom 13. Januar 2014 bis zum 14. März 2018 war Haber Staatssekretärin im Bundesministerium des Innern und dort für die Themenkomplexe Sicherheit, Migration und Integration zuständig, ihre Kompetenzen als Staatssekretärin wurden im Oktober 2015 stark ausgeweitet. Insofern steht ihre Aussage vor dem Innenausschuss des Deutschen Bundestages in der BAMF-Affäre noch aus. Seit dem 22. Juni 2018 leitet sie als erste Frau die deutsche Botschaft in Washington, D.C. Am 23. Februar 2019 wurde durch Recherchen des Nachrichtenmagazins "Focus" bekannt, dass Haber im Januar 2017 als damalige Staatssekretärin offenbar in einer Vertuschungsaffäre der deutschen Bundesregierung zum Anschlag auf den Berliner Weihnachtsmarkt an der Gedächtniskirche verstrickt war.