Como já era previsto, Neymar esteve presente na lista dos convocados do técnico Felipão, para a disputa da Copa das Confederações de 2013. Durante toda a competição, Neymar esteve utilizando a camisa de número 10, antes utilizada por Oscar, ao invés da camisa 11. No jogo de estreia da Seleção na Copa das Confederações de 2013 diante do Japão, Neymar marcou o primeiro gol do Brasil na competição após pegar a bola e bater de primeira, o que lhe rendeu indicação ao Prémio Puskás do gol mais bonito do ano (mas Neymar acabou perdendo o prêmio para o atacante Ibrahimović). O jogo terminou 3-0 para o Brasil. Neymar voltou a ser protagonista novamente na partida contra o México em que deixou o seu gol e fazendo uma bela jogada para o segundo gol na vitória por 2-0, vitória que garantiu a classificação da seleção para a fase final da competição.