Afin de privilégier sa rééducation à la suite de son opération au genou, Tsonga ne participe pas aux Jeux olympiques à Pékin. Il fait son retour à l'US Open où il bat Santiago Ventura au premier tour, puis Carlos Moyà au second tour, avant de perdre face à Tommy Robredo (6-7, 2-6, 3-6). Après le "Heineken Stars 2008" sur le circuit challenger, qu'il remporte le 20 septembre au Viêt Nam face au Suédois Robin Söderling (7-6, 1-6, 6-4), il participe au tournoi de Bangkok où il s'impose en battant en demi-finale Gaël Monfils (6-0, 6-3), et le mondial Novak Djokovic en finale 7-6, 6-4. Il prend ainsi sa revanche sur la finale de Melbourne et remporte à cette occasion son premier tournoi en simple sur le circuit ATP. Durant le Masters de Madrid, Tsonga rencontre pour la première fois Roger Federer contre lequel il s'incline 4-6, 1-6 en huitièmes de finale. Une semaine plus tard, il atteint pour la seconde année consécutive les demi-finales du Tournoi de Lyon, où il bat notamment Marc Gicquel 7-5, 4-6, 6-3, Fabrice Santoro 6-2, 5-7, 6-3, et Juan Carlos Ferrero 7-6, 6-1. Il trébuche finalement contre Julien Benneteau, pour la seconde fois de la saison, 6-7, 5-7.