La entrada de Suecia en la Tercera Coalición de 1805 contra Napoleón supuso la ocupación de la Pomerania Sueca por las tropas francesas de 1807 a 1810 y de nuevo de enero de 1812 a marzo de 1813. En octubre, cuando los franceses se habían ya marchado de Pomerania, el ejército sueco derrotó a Napoleón en la batalla de Leipzig junto con las tropas de Rusia, Prusia y Austria. Suecia también atacó a Dinamarca y, por el Tratado de Kiel de 14 de enero de 1814, ésta cedió Pomerania a los daneses a cambio de Noruega. No obstante, el destino de la Pomerania Sueca se selló durante el Congreso de Viena a través de los tratados entre Prusia y Dinamarca de 4 de junio y con Suecia de 7 de junio de 1815. En estas maniobras Prusia obtuvo la Pomerania Sueca a cambio de Lauenburgo que fue cedida a Dinamarca, la cual recibió además 2,6 millones de táleros por parte de Prusia y 3,5 millones de táleros por parte de Suecia en concepto de indemnización por daños de guerra. La Pomerania Sueca fue incorporada a Prusia como "Nueva Pomerania Superior" ("Neuvorpommern") dentro de la provincia prusiana de Pomerania.