В апреле 2012 года Чан выступил на командном чемпионате мира. В короткой программе он занял второе место с высокой суммой 89,81 балла, но уступил Дайсукэ Такахаси, который побил мировой рекорд, принадлежавший Патрику, на 98 сотых балла. В произвольной программе канадец упал с недокрученного четверного тулупа, исполнил каскад «четверной тулуп + тройной тулуп» с помаркой, но остальные элементы были выполнены безупречно. За свою программу Патрик получил 170,65 балла, но проиграл победителю, Такахаси, 16 баллов. Этот турнир стал единственным, который Чан не смог выиграть в завершающемся сезоне.