В Конгрессе были противоречия из-за просьбы Арнольда назначить более опытного офицера для ведения осады. Сперва выбор пал на генерал-майора Чарльза Ли, получившего серьёзный опыт во время службы в британской армии, который должен был вступить в новую должность в январе. Спустя неделю конгрессмены решили направить Ли в южные штаты для борьбы с возможным британским вторжением (Британская атака была отбита в июне 1776 года в бою у форта Салливана.). В итоге было решено назначить генерал Джона Томаса, участвовавшего в осаде Бостона.