Поселение Биргу существовало ещё со времён финикийцев, но нынешний город был построен в раннем средневековье. Биргу был выбран столицей Мальты вместо Мдины по прибытии на эти территории госпитальеров (1530 год). После вторжения на остров Гоцо (1551) Орденом Святого Иоанна на полуострове, известном как Л’Изола, был построен город Сенглеа. Форт Сант-Анджело в Биргу был построен на месте древнего поселения Каструм Марис, а форт Сант-Майкл был построен на острове Гоцо, на берегу Средиземного моря и рядом с городом Сенглеа.