この後も、アメリカ軍は統合軍編制を随時見直しており、1987年にはアメリカ特殊作戦軍とアメリカ輸送軍が新たに編成された。1992年にはアメリカ戦略軍が編成、核攻撃作戦系統も整理された。1999年には冷戦後の状況を踏まえ、大西洋軍を改編し、アメリカ統合戦力軍が設置された。同時多発テロ事件後の2002年にはアメリカ合衆国本土防衛のため、アメリカ北方軍が置かれている。その後、アメリカアフリカ軍が2008年より実働を開始している。このように、近年は新たな統合軍の新設や改編が続いていたが、2011年には統合戦力軍が、国防費削減策の一環として設置から10年あまりで廃止されている。また、2011年4月の地域割り当ての改正では、特に北極エリアの割り当てが見直されている。北極点及びその周辺は、各統合軍の境界であったものが、北方軍の担当エリアとされた。