После Исламской революции 1979 партия получила возможность легальной работы, принимала участие в президентских и парламентских выборах (одним из партийных кандидатов был не состоявший в НПИ и не имевший никакого отношения к коммунизму экс-председатель Исламского революционного суда Садек Хальхали). Однако сотрудничество НПИ с исламистским режимом закончилось в 1982, когда правящий режим начал чистку министерств от членов НПИ и закрыл партийную газету. За короткое время были арестованы свыше 5 тысяч членов и сторонников партии. В феврале 1983 лидеры НПИ были арестованы, а партия официально запрещена. За год с мая 1983 по май 1984 гг. высших руководителей НПИ заставили выступить по телевидению с заявлениями, восхваляющими ислам и критикующими марксизм-ленинизм. Хотя Туде, в отличие от леворадикальных организаций федаинов и моджахедов иранского народа, не принимала участия в вооружённой борьбе против исламистского режима, репрессии продолжали обрушиваться и на её членов: особенно крупная волна казней коммунистов и других левых пришлась на 1988.