Nel 1906 fu nominato Ministro dell'Istruzione, suo primo incarico di Governo, ricoperto fino al 1908. Fu nuovamente ministro nel 1911-12 per il Commercio e l'Agricoltura e nel 1913-14 per gli Affari Esteri. Nello stesso periodo entrò a far parte del Consiglio privato dell'Imperatore. Nel 1919 prese parte alla Conferenza di pace di Parigi, incaricata di elaborare i Trattati di pace che avrebbero posto termine alla Prima guerra mondiale, come plenipotenziario dell'Impero giapponese. In questa occasione, Nobuaki propose una dichiarazione sull'uguaglianza razziale, che però fu respinta dalla Conferenza, e fece parte della Commissione che stilò la Convenzione della Società delle Nazioni.