Il fut l'un des principaux acteurs dans le Comité Exécutif du Conseil de Sécurité Nationale (EXCOMM) pendant la crise des missiles cubains d'. Dans un télégramme du , il a insisté pour que la CIA reste vigilante sur l'acheminement d'armes soviétique vers Cuba, bien que dans le rapport de la National Intelligence Estimate du on eût conclu qu'il était peu probable que des missiles nucléaires fussent déjà situés sur l'île.