Im Februar 1942 zog die III. Gruppe von der Ostfront ab und wurde neu mit der Heinkel He 111 H6 ausgerüstet. Anschließend wurde sie nach Grosseto verlegt, wo die Ausbildung zum Lufttorpedogeschwader erfolgte. Die I./KG 26 griff dann ab März 1942 von Bardufoss () in Nordnorwegen alliierte Nordmeergeleitzüge an. Ab Juni 1942 griff auch die III./KG 26 von Banak () aus in diese Kämpfe mit ein. Dabei griffen Flugzeuge der I. Gruppe, am 2. Mai 1942 den Geleitzug PQ 15 mit Lufttorpedos an und versenkten die Frachter "Botavon" und "Cape Corso" und beschädigten die "Jutland", die am 3. Mai von "U 251" versenkt wurde. Beim folgenden Geleitzug PQ 16 versenkten Flugzeuge der I./KG 26 den Frachter "Lowther Castle". Am 5. Juli 1942 führte die I. Gruppe, mit 25 Heinkel He 111, einen Torpedoangriff gegen den Geleitzug PQ 17 durch. Bei Verlust von drei Flugzeugen versenkte sie den Frachter "Navarino" und beschädigte weitere, die später von U-Booten versenkt wurden. Der größte Angriff dieser Art erfolgte beim Angriff auf den Geleitzug PQ 18 im September 1942. Am 13. September griffen die I. und III. Gruppe, zusammen mit Flugzeugen des Kampfgeschwaders 30 mehrfach an und versenkten die Frachtschiffe "Wacosta" (), "Oregonian" (), "Macbeth", "Africander", "Empire Stevenson" (), "Empire Beaumont", "John Penn" () und den sowjetischen Frachter "Sukhona". Zum Schutz des Geleitzuges vor Luftangriffen fuhr der Flugzeugträger "Avenger" mit Jagdflugzeugen vom Typ Sea Hurricanes ihm Geleit mit. Dadurch erlitten beide Gruppen des Geschwaders bei mehreren Angriffen schwere Verluste. Bei der I./KG 26 gingen insgesamt zwölf Flugzeuge und sieben Besatzungen, bei der III./KG 26 acht Flugzeuge und sieben Besatzungen verloren.