9 октября 5-я дивизия была придана Флоту юго-западного района и через два дня в сопровождении эсминцев «Наганами» и «Судзукадзэ» покинула Трук, сопровождая конвой. 13 октября крейсера прибыли в Рабаул и до конца месяца находились там в готовности. В связи с высадкой американцев на Бугенвиле 5-я дивизия 1 ноября в 15:20 вышла в море в составе соединения контр-адмирала Омори, включавшего также крейсера «Сэндай», «Агано» и 6 эсминцев (на 4 из которых находилось 1100 солдат). В ходе ночного боя в заливе Императрицы Августы 2 ноября «Мёко» был повреждён при столкновении с эсминцем «Хацукадзэ» (помят форштевень и левый борт на уровне средней палубы, снесено два торпедных аппарата), непосредственно боевых повреждений при этом не получив. Утром того же дня «Мёко» и «Хагуро» вернулись в Рабаул и попали под налёт B-25 ВВС армии США, но не пострадали. С 4-го по 7 ноября они перешли на Трук, избежав последующих налётов, а с 12-го по 17 ноября совершили переход с сопровождении эсминцев «Сигурэ» и «Сирацую» в Сасэбо, где встали на ремонт. Почти весь период ремонта, с 18 ноября по 13 декабря, «Мёко» провёл в сухом доке Арсенала Сасэбо, пройдя вторую военную модернизацию: установлены 8 одиночных 25-мм автоматов (число стволов достигло 24), радиолокатор обнаружения надводных целей № 22 4-й модификации (дальность обнаружения эсминца — , крейсера — 20, линкора — 35), для улучшения герметичности корпуса все иллюминаторы на нижней палубе и часть на средней заделывались путём приваривания на их место круглых стальных заглушек. В период ремонта 25 ноября контр-адмирала Омори на должности командующего 5-й дивизией сменил контр-адмирал Сэнтаро Хасимото.