Повернувшись на батьківщину, у грудні 2018 року прийняв керівництво командою «Дженоа». Під його керівництвом генуезці завершили сезон на 17-му місці чемпіонату, ледь врятувавшись від пониження у класі. По завершенні сезону Пранделлі команду залишив.