車站是一座地面車站，設有1面2線的島式月台，在月台近大分一方設有車站大樓，月台與車站大樓之間設有跨線橋。在車站大樓開業時只有車站北邊一邊出口，在2002年國際足協世界盃舉行時把車站大樓遷移重建。車站大樓以大分球場作為參考設計，在屋頂上設有足球物體。車站大樓內設有多用途廁所（可使用輪椅）。