1996年6月のロシア大統領選挙に立候補し第一回投票では、得票率14.52％を獲得し、第三位につける。第一回投票では過半数を獲得した候補者がいなかったため、一位のエリツィンと二位のゲンナジー・ジュガーノフの間で決選投票が行われることとなった。エリツィン陣営は、レーベジ票を取り込むために交渉し、レーベジは選挙直後、エリツィン支持を表明した。6月18日、レーベジは国家安全保障担当大統領顧問兼安全保障会議書記に任命される。