Durante tutte le ultime fasi della guerra, il Gruppo d'armate Sud fu costretto a subire altre sconfitte e a ripiegare sempre più verso nord. Dopo la caduta di Vienna, il Gruppo d'armate Sud fu rinominato in Gruppo d'armate Ostmark: i resti di quest'unità furono sconfitti e catturati nel corso dell'offensiva di Praga del maggio 1945.