В 1664 году англичане в ходе второй англо-голландской войны захватили Новый Амстердам (будущий Нью-Йорк). В 1666 году флот принца Руперта Пфальцского был разбит голландцами в Четырёхдневном сражении, но через месяц голландцы потерпели поражение про Орфорднессе. В 1667 году голландцы под командованием талантливого адмирала де Рюйтера провели удачный рейд на Медуэй, ворвавшись в Чэтемские доки и уничтожив добрую часть английских кораблей, что стало самым тяжёлым поражением в истории британского флота — историки сравнивали это с разгромным поражением британских войск на холме Маджуба от буров и даже с падением Сингапура, захваченного в 1942 году японцами; ещё одно поражение потерпели англичане в Солбее в 1672 году. Англичане извлекли опыт из поражений и стали переходить к ведению крупномасштабных сражений. Для флота был разработан Воинский устав, который регулировал поведение офицеров и моряков, а Воинские инструкции определили правила ведения боя. Следуя этим документам, англичане стали одерживать больше и больше побед, заполучив славу самого сильного военно-морского флота мира. В 1689 году после Славной революции королём Англии и Шотландии стал Вильгельм III Оранский, который в 1692 году подписал указ о включении королевского флота Нидерландов в состав английского флота и его переподчинении британским адмиралам. Влияние и реформы Пипса, главного секретаря Адмиралтейства при Карле II и Якове II, сыграли важную роль в повышении уровня профессионализма военно-морских сил.