После убийства Авраама Линкольна братом Джуниуса Джоном сам Джуниус на короткое время оказался в тюрьме в Вашингтоне. Во время убийства он был занят в ангажементе в Цинциннати, штат Огайо. Тем не менее, его арестовали и доставили на поезде в тюрьму Олд-Кэпитол.