Po dobu umístění v přístavu v Kielu došlo v červnu 1941 k napadení Sovětského Svazu německou armádou, což bylo v oblasti Baltu podpořeno vytvořením dočasné Baltské flotily, která měla zabránit případnému průniku sovětské flotily z Leningradu. "Tirpitz" byl krátce ustanoven vlajkovou lodí této skupiny lodí, sestávající z kapesní bitevní lodi Admiral Scheer, lehkých křižníků "Köln", "Nürnberg", "Leipzig" a "Emden", torpédoborců a dvou skupin minolovek. Baltická flotila pod vedením admirála Otto Ciliaxe, strážila v období od 23. do 26. září 1941 okolí Alandských ostrovů, poté byla však rozpuštěna a "Tirpitz" pokračoval dále ve výcviku.