5 березня 1945 року йому було доручено командування III (германським) танковим корпусом СС, основною ударною силою якого була його дивізія. Йоахім Циглер загинув 2 травня 1945 року під час оборони Берліна, поблизу вокзалу на Фрідріхштрассе.