С начала войн за независимость Шотландии клан Мюррей поддерживал повстанцев, которые боролись за независимость Шотландии от короля Англии Эдуарда I Плантагенета. Клан присоединился к восстанию Уильяма Уоллеса. Сэр Эндрю Мюррей из Петти, соратник Уильяма Уоллеса, погиб после битвы на Стерлингском мосту в 1297 году. Его сыном был Эндрю Мюррей (1298—1338), 4-й лорд Ботвелл, который дважды занимал пост регента (хранителя) Шотландии в 1332—1333, 1335—1338 годах. Эндрю Мюррей был женат на Кристине Брюс, сестре короля Шотландии Роберта I Брюса. В 1333 году Эндрю Мюррей участвовал в битве при Халидон-Хилле.