Во время двух мировых войн музей был закрыт. Здание серьёзно пострадало от союзнических бомбардировок Берлина, начавшихся в 1943 году, и, в особенности, в ходе уличных боёв во время битвы за Берлин в апреле 1945 года. После войны здание оказалось в советском секторе оккупации Берлина, затем в Восточном Берлине. Часть музейных экспонатов, оказавшихся в разделённой Германии на территории ФРГ, была собрана во Франкфурте-на-Майне в отдельный музей, ныне Франкфуртский музей коммуникаций, открывшийся в 1958 году. Восстановленный музей на Лейпцигской улице под названием Музей почты с постоянной экспозицией, посвящённой истории почтового дела, телеграфа, телефонии, радио и телевидения, открылся в апреле 1960 года. В 1964 году в музее открылась постоянная экспозиция почтовых марок. В преддверии 750-летия Берлина в 1987 году в здании была запланирована полная реконструкция Музея почты ГДР, которая завершилась лишь в 1990 году, после падения Берлинской стены.