Susanne giftet seg 11. september 1653 med Preben Brahe. Ekteparet bodde først på Engelsholm i Jylland, i svenskekrigenes tid bodde de sammen med Anne Gøye på Næsbyholm ved Sorø og senere på Hvedholm på Fyn. Hun ligger begravet i Horne kirke, og omtales som en gudfryktig kvinne og hjelpsom overfor de fattige.