Hancock led af effekten af hans sår ved Gettysburg i resten af krigen. Efter at være kommet sig i Norristown, udførte han hverveopgaver hen over vinteren og vendte i foråret tilbage til posten som chef for II Korps i generalløjtnant Ulysses S. Grant's Overland-kampagne i forsommeren 1864, men han genvandt aldrig sin fulde mobilitet og ungdommelige energi. Ikke desto mindre gjorde han det godt I Slaget ved the Wilderness og ledede et afgørende gennembrudsangreb på Muldyrs skoen (Mule Shoe) ved det blodige hjørne (Bloody Angle) i Slaget ved Spotsylvania Court House der ødelagde Sydstaternes Stonewall Division. Hans korps led enorme tab i et nyttesløst angreb, som Grant beordrede i Slaget ved Cold Harbor.