Juan de Lacoizqueta había nacido en el año 1653, en el pueblo de Legasa del valle de Bértiz-Arana, dentro del Reino de Navarra que formaba parte de la Corona de España, luego de la conquista castellano-aragonesa de 1512, siendo hijo de Juan de Lacoizqueta y de María Ana de Hizu, de la Casa-Palacio de Elizondo.