In den Wirren der Revolution verließ Lostanges 1791 den Dienst und emigrierte 1793. In der Emigration wurde er, nach einer vorausgegangenen Audienz seiner Familie 1792 mit König Friedrich Wilhelm II. (Preußen) am Hofe des Kurfürsten in Koblenz, wohl kurzzeitig preußischer Kammerherr. Nach seiner Rückkehr nach Frankreich um 1801 wurde Lostanges dann Capitaine de Frégate 1803 im Stab (État-Major) des Étienne Eustache Bruix und war an der Vorbereitung der Invasion Englands beteiligt. Vom Kaiser Napoléon Bonaparte wurde er dabei in am 14. Juni 1804 zum Ritter der Ehrenlegion ernannt. Lostanges bewährte sich später bei Einsätzen auf der Donau (so in der Schlacht bei Dürnstein im Vorfeld der Schlacht bei Austerlitz) und bei Venedig. Am 6. Juli 1806 erhielt er die Genehmigung zum Übertritt in die Dienste des Königs von Neapel, der ihm die Organisation der neapolitanischen Marine anvertraute. 1810 wurde Lostanges zum Ritter des Ordens beider Sizilien ernannt und am 26. April 1812 zum Konteradmiral befördert. Er war Befehlshaber des Schiffes, das Pauline Bonaparte nach Elba brachte. Am 20. Januar 1815 wurde er als neapolitanischer "Citoyen" naturalisiert, aber am 6. März gleichen Jahres kehrte Lostanges, mit Unterwerfung an den König Ludwig XVIII., nach Frankreich zurück.