La carriera di Yūsuke Ishijima inizia nei tornei scolastici giapponesi e prosegue in seguito nella University of Tsukuba. Fa il suo esordio da professionista in V. League con la maglia dei Sakai Blazers nella stagione 2005-06, aggiudicandosi subito lo scudetto ai danni dei Suntory Sunbirds, ricevendo anche il premio di miglior esordiente; nel 2006 viene convocato per la prima volta nella nazionale giapponese, partecipando alla World League ed al campionato mondiale. Nella stagione successiva gioca per la prima volta all'estero, ingaggiato dallo Sport Club Ulbra nella Superliga brasiliana; con la nazionale vince la medaglia d'argento al campionato asiatico e oceaniano 2007.