Classificou o país na Eurocopa 2000, com um empate em 2 x 2 com os concorrentes diretos e arquirrivais da Croácia, que terminaram eliminados com o resultado, na própria casa. Boškov saiu do cargo após a Euro e voltou brevemente em 2001, quando a Seleção foi comandada por três treinadores conjuntamente: ele, Ivan Ćurković e Dejan Savićević, mas a classificação para a Copa do Mundo de 2002 não veio.