Ciò nonostante con l'arrivo di Ronald Koeman quale nuovo selezionatore, datato 2018, De Ligt diviene, al fianco del capitano Van Dijk, un punto fermo della difesa olandese. Il 24 marzo 2019 segna la sua prima rete in nazionale, nella sconfitta interna per 3-2 contro la , valevole per le qualificazioni al . Nel successivo giugno prende parte con gli "oranje" alla fase finale della neonata Nations League: va in gol nella vittoriosa semifinale contro l' (3-1) che porta i Paesi Bassi in finale, dove tuttavia dovranno soccombere dinanzi ai padroni di casa del (0-1).