Début 2005, Carlos Alberto Parreira ne convoque plus le milieu de terrain d'Arsenal qu'il prend finalement dans son groupe pour la Coupe des confédérations 2005. Edu rentre en jeu lors du dernier match de poule face au Japon (2-2) qui est sa dernière sélection en équipe du Brésil de football. Le groupe remporte la compétition pour deux victoires en deux tournois internationaux pour Edu.