同年5月10日，就在第四舰队增强实力后不久，德軍开始挥师西进，发动荷蘭戰役。5月13日荷兰政府流亡英国，5月15日荷兰本土向德军投降。。因应情势突变，大本营决定防备德国海军在南洋群岛进行布雷，同时显示武力。11日军令部发出指示，要求第四舰队以帛琉（帕劳）为基地，开始做出战准备。第四舰队各队接令，15-25日间以远洋航海的名义陆续出动。随后日本政府与国联、德国达成共识，维持荷属东印度现状，没有发生武装冲突，因此各单位在9月间陆续返回日本。