Con il terremoto del 1688 la chiesa crollò. Il cardinale Orsini la riedificò con il titolo di S. Spirito e permise che vi officiasse la confraternita di S. Maria di Costantinopoli. Tuttavia qui officiava anche la confraternita dei calzolai, istituita all'altare dei santi Crispino e Crispiniano. Ciò comportava litigi e discordie, tanto che l'amministrazione della confraternita di S. Maria di Costantinopoli eresse, attigua alla chiesa di S.Spirito, una propria chiesa, il cui altare fu consacrato il 26 dicembre 1740 dal Vicario Apostolico "Domenico Antonio Manfredi", vescovo di Boiano (come ricorda una lapide), che vi tenne pure ordinazione in "minoribus"