Yüzler Denizler Filosu komutanı Amiral Reinhard Scheer'in yerine 1918 yılına kadar bu görevini yürütmüştür. Özellikle I. Dünya Savaşı sırasında, 31 Mayıs-1 Haziran 1916 tarihlerindeki Jutland Muharebesi'nde, I. Keşif Grubu'na komuta eden en ünlü amiraldir. Hipper, savaş sırasında Alman savaş gemisi komutanı olarak İngiliz basınında "bebek katili" şeklinde nitelendirilmiştir. Hipper'in Filosu, Ocak 1915'te Dogger Bank Muharebesi esnasında zırhlı kruvazör SMS Blücher'i kaybetti. Dogger Bank Muharebesi'nde İngiliz savaş gemisi filosu ile çatışmaya girdi. Hipper'in gemileri üç İngiliz savaş gemisini batırmayı başarmasına rağmen Jutland Savaşı'nda, Hipper'in amiral gemisi SMS Lützow batırılmıştır.