Ertl schied Ende Januar 1943 aus der Zentralbauleitung Auschwitz aus und absolvierte die SS-Pionierschule. Ab Mai 1943 war er beim Pionierbataillon der SS-Kavallerie-Division eingesetzt und gehörte dem Stab beim SS-Truppenübungsplatz Heidelager an. Als Stellvertreter Bischoffs folgte ihm Anfang April 1943 Werner Jothann nach. Als Beweggrund für seine Entscheidung, sich aus Auschwitz versetzen zu lassen, gab Ertl nach Kriegsende zu Protokoll: „Schon zu Ende 1942, als ich sah wie sich der Lagerbetrieb entwickelte, faßten ich und mehrere andere Kameraden den Entschluß, uns aus Auschwitz wegzumelden. Nach der Niederlage von Stalingrad bot sich hierzu eine günstige Gelegenheit. Alle wurden hinsichtlich ihrer Kriegsverwendungsfähigkeit untersucht. Wir ließen es gar nicht auf unsere Untersuchung ankommen und meldeten uns freiwillig. Daraufhin wurde ich am 3.2.1943 zum Ersatztruppenteil nach Dresden versetzt“.