In zijn politieke loopbaan was Kikkert van 4 juni 1946 tot 7 december 1972 lid van de Tweede Kamer der Staten-Generaal en daarnaast in de periode 1946-1950 lid van de Drentse Provinciale Staten. Kikkert behoorde tot de sociale vleugel van de CHU en steunde in 1949 als enige van zijn fractie de wet die de publiekrechtelijke bedrijfsorganisatie in het leven riep. Hij maakte in 1949 tevens deel uit van de minderheid van de CHU-fractie die vóór de soevereiniteitsoverdracht aan Indonesië stemde. Hij hield zich als Kamerlid bezig met landbouw, maatschappelijk werk, sociale zaken, defensie en economische zaken en was tevens woordvoerder bij zaken die het noorden van het land betroffen. Hij maakte eind jaren zestig naam met twee plannen op defensiegebied: een plan voor de vorming van een beroepsleger, en het Plan Kikkert voor de aanleg van een militair oefenterrein bij Ter Apel. De Groningse CPN-voorman Fré Meis was van dat laatste een fel tegenstander.