Später kam Hakkâri unter den Einfluss der persischen Safawiden. Diese wurden 1514 in der Schlacht bei Tschaldiran von den Osmanen vernichtend geschlagen und aus Anatolien verdrängt. Unter der Vermittlung von İdris-i Bitlisî schlossen die kurdischen Fürsten der Region ein Abkommen mit den Osmanen ab. Doch das Fürstentum Hakkâri wurde, da es nun an der Grenze zwischen Osmanen und Safawiden lag, von beiden Mächten umgarnt und wechselte dementsprechend oft die Seiten. Der südliche Teil Hakkâris fiel für Jahrhunderte an das Fürstentum Badinan. Der Hakkâri-Herrscher Zahid Bey teilte sein Reich unter seinen zwei Söhnen Seyyid Mehmed und Melik Bey auf. 1548 kam es zum Konflikt mit den Osmanen, als Melik Bey hingerichtet wurde. Dessen Sohn Zeynel lehnte sich auf, wurde aber wegen der strategischen Lage Hakkâris von den Osmanen als Herrscher eingesetzt. Doch sein Onkel Seyyid Mehmed, der mehr prosafawidisch war, erkannte ihn nicht an. Es kam zum Kampf, den Zeynel mit Hilfe der Osmanen gewann und so seinen Onkel tötete. Zeynel betrieb eine antisafawidische Politik und sein Nachfolger und Sohn Ibrahim Bey erhielt 1578 von den Osmanen den Rang eines Paschas. 1585 nahm Zeynel an einem Kriegszug der Osmanen gegen Täbris (Osmanisch-Safawidischer Krieg (1578–1590)) teil, wobei er in einem Kampf umkam. 1688 wurde der Status des Fürstentums von den Osmanen herabgesetzt: aus einem "Hükümet" (Regierung) wurde ein "Ocaklik" (Stammesgebiet). Anfang des 19. Jahrhunderts war das Fürstentum Teil des Eyâlet Van. Innerhalb dieser Provinz gab es noch das Fürstentum der Mahmudi (heute Saray) und die zwei Ocaklik von Kotuz und Müküs (heute Bahçesaray); der Rest wurde direkt vom osmanischen Gouverneur (Wali) verwaltet.