Buku harian pribadi yang ditulis oleh Pepys selama periode 1660 sampai 1669 pertama kali diterbitkan pada abad ke-19, dan merupakan salah satu sumber utama yang paling penting dalam proses Restorasi Inggris. Buku harian tersebut menjadi sumber utama yang penting dan saksi sejarah atas peristiwa-peristiwa besar yang terjadi di Inggris, seperti Wabah Besar London, Perang Inggris-Belanda Kedua dan Kebakaran Besar London.