Hancock obtint finalement un commandement de combat en janvier 1945, lorsqu'il priend la tête du 100 Squadron RAAF, pilotant des bombardiers légers Bristol Beaufort au cours de la campagne Aitape-Wewak de Nouvelle-Guinée. Ce mois-là, l'unité attaque les positions japonaises à Maprik, en contrebas des rangs du Prince Alexander, et à Cape Moem, près de Wewak. Le 1er avril, Hancock prend le contrôle du No. 71 Wing RAAF, placée sous le contrôle général du Commandement du Nord de la RAAF et dont les numéros nominaux étaient les suivants. No. 7 Squadron RAAF, No. 8 Squadron RAAF et le 100 Beaufort Squadrons, ainsi qu'une unité de chasseurs-bombardiers CAC Boomerang du No. 4 Squadron RAAF. Il est bientôt complété par deux autres unités Beaufort, No. 6 Squadron RAAF et No. 15 Squadron RAAF. Offrant un appui aérien rapproché aux troupes terrestres australiennes avant l'assaut final sur Wewak, l'escadre a effectué plus de 1 400 sorties et largué plus de 1 200 tonnes de bombes rien qu'en mai. Au milieu de l'année, les forces d'Hancock manquaient cruellement de carburant et de munitions, au point que ses escadrons ont dû armer leurs Beauforts de bombes japonaises capturées. En juillet, suffisamment de ravitaillement arrive pour permettre au wing de continuer à fonctionner normalement. Le No. 71 est actif jusqu'au tout dernier jour de la guerre du Pacifique, accomplissant sa dernière mission de combat impliquant 30 Beauforts seulement quelques heures avant l'arrivée des nouvelles de la victoire, le 15 août 1945. Le "distinguished flying on operations in Northern Command" de Hancock lui vaut la Distinguished Flying Cross; la récompense est annoncée dans le "London Gazette" le 22 février 1946.