1828年から1834年まで続いたポルトガル内戦（ペドロ4世とミゲル1世の間で争われた）では、劇場は閉鎖せざるを得なかった。1850年、内部の照明が当時最新のガス照明に切り替えられた。その少し後、ポルトガル政府が個人投資家からサン・カルルシュ劇場を買い上げた。数回の試みが失敗した後、電気照明となったのは1887年である。1935年から1940年、劇場は改修のため閉められた。1974年、劇場常設のオペラ・カンパニーが立ち上げられた。1993年、ポルトガル交響楽団（Orquestra Sinfónica Portuguesa）が創設された。