Po raz pierwszy na arenie międzynarodowej Tobias Kammerlander pojawił się 14 grudnia 2002 roku, kiedy wystartował w zawodach FIS Race w Klingenthal. Zajął wtedy 34. miejsce w konkursie rozgrywanym metodą Gundersena. W 2004 roku wystartował na mistrzostwach świata juniorów w Stryn zajmując 29. miejsce w sprincie. Startował także rok później, na mistrzostwach świata juniorów w Rovaniemi, ale uzyskiwał słabe wyniki. Największy sukces w kategorii juniorów osiągnął w 2007 roku, podczas mistrzostw świata juniorów w Tarvisio, gdzie wywalczył złoty medal w sztafecie. Indywidualnie jednak plasował się na początku trzeciej dziesiątki.