7 августа 2016 года Лингард забил гол после сольного прохода по центру в матче за Суперкубок Англии против «Лестер Сити». Игра завершилась победой «Юнайтед» со счётом 2:1. 26 февраля 2017 года забил важный гол в матче с «Саутгемптоном» в финале Кубка Футбольной лиги, в котором «Манчестер Юнайтед» одержал победу со счётом 3:2. 6 апреля 2017 года подписал новый контракт с «Манчестер Юнайтед» до 2021 года с возможностью автоматического продления ещё на один сезон.