SMA Kolese de Britto didirikan pada tanggal 19 Agustus 1948, oleh para rohaniwan dari Serikat Jesus dan para suster Carolus Borromeus dengan nama SMA Kanisius. Waktu itu masih menempati ruang atas SMP Bruderan Kidul Loji. Karena Agresi Militer II Belanda, sekolah kemudian terpaksa ditutup pada 18 Desember 1948.