Toutefois, en dépit de ces réformes, de la rigueur de gestionnaires comme Petiet ou Daru et des interventions personnelles de Napoléon dans l'organisation de ses tâches et missions et de la mobilisation de toutes les ressources économiques disponibles, l'intendance des armées napoléoniennes continue à connaître de sérieuses déficiences qui sont peu ou prou à l'origine de graves revers militaires. Le désastre de 1812 en est certainement l'illustration la plus édifiante : conscient des problèmes logistiques qu'allait poser la campagne de Russie, . En 1814, des gardes nationaux assurant la défense de Paris sont armés de simples piques.