A finals de 2015 va ser acusat de corrupció pel Departament de Justícia dels Estats Units en el conegut com a Cas Fifagate. Va ser detingut i autoritzada la seva extradició als EUA, extradició que va quedar congelada en estar pendent de diversos processos judicials al Salvador. Va ser inhabilitat per la Confederació del Nord, Centreamèrica i el Carib de Futbol Associació (CONCACAF) i, a 2019, seguia pendent de judici pel Cas Fifagate.