Ducournau schloss im Jahr 2008 ihr Studium an der Pariser Filmhochschule "La Fémis" ab. Sie arbeitete bei ihren Filmproduktionen als Story Editor und Script Consultant. Im Jahre 2011 drehte sie ihren ersten Kurzfilm "Junior". Für diesen arbeitete sie mit der Schauspielerin Garance Marillier zusammen. "Junior" wurde bei den Internationalen Kurzfilmtagen Oberhausen 2012 mit dem Preis der Jugendjury ausgezeichnet. Ihr Horrorfilm "Raw", erneut mit Garance Marillier in der Hauptrolle, feierte seine Premiere bei den Filmfestspielen von Cannes 2016.