Hier verblieb er über den Beginn des Zweiten Weltkriegs hinaus bis zum 20. Juni 1940. Für knapp sechs Monate fungierte er als Hafen- und Seekommandant Brest, war dann Kommandant der "Seeverteidigung Bretagne" und wurde als solcher am 1. September 1941 zum Konteradmiral befördert. Am 15. Juni 1942 wurde er von seinem Posten abgelöst und kurze Zeit darauf am 23. Juni 1942 zum "Küstenbefehlshaber Deutsche Bucht" ernannt. Seine letzte Dienststellung war die des Kommandierenden Admirals Schwarzes Meer ab 7. Februar 1943. Als solcher wurde er am 1. März 1943 zum Vizeadmiral befördert und am 20. Oktober 1943 mit dem Deutschen Kreuz in Gold ausgezeichnet. Bei einem sowjetischen Luftangriff im Zuge der Kertsch-Eltigener Operation kam Kieseritzky bei Kamysch-Burun ums Leben. Postum wurde ihm am 20. November 1943 das Ritterkreuz des Eisernen Kreuzes verliehen. Auf dem Kieler Nordfriedhof sind sein Name, sowie sein Geburts- und Sterbedatum auf dem Grabstein seiner Frau verewigt.