Nach der verlorenen Seeschlacht von Beachy Head war er am Sturz Herberts beteiligt. Er selbst übernahm als erster Admiral of the Fleet de facto das Oberkommando, ohne dass es ihm gelang, die Franzosen zur Schlacht zu zwingen. Er war an geheimen Verhandlungen mit dem im Exil lebenden König James II. beteiligt. Dabei ging es einerseits um die Gewinnung von Informationen, andererseits wollte sich Russell aber für den Fall einer Restauration absichern. Möglicherweise war er auch wegen dieser Verhandlungen einer Schlacht aus dem Weg gegangen. Die Gespräche brachten wenig Ergebnisse.