Nel 1638 vari rappresentanti della società scozzese riunitisi a Edimburgo sottoscrissero un patto (National Covenant) con il quale si impegnarono ad opporsi all'introduzione nella Chiesa presbiteriana della nuova liturgia e della gerarchia episcopale imposte dal re Carlo I. Nel 1639 e 1640 due conflitti armati, le cosiddette Guerre dei Vescovi, che videro opporsi le truppe del re e quelle dei Covenanti, terminarono con la vittoria di questi ultimi. Durante la guerra civile (1642-1651), i Covenanti strinsero un'alleanza con il Parlamento inglese (1643) nel conflitto contro Carlo I, e il loro supporto militare fu determinante nella vittoria sull'esercito realista. Nel 1647 furono però esclusi dai negoziati dal Parlamento inglese vittorioso e disperarono che le promesse loro fatte venissero mantenute. In Scozia cambiarono gli equilibri di potere, e un nuovo accordo fu raggiunto con la Corona: una parte dei Covenanti, detti "Engagers", offrirono il loro sostegno militare a Carlo I in cambio dell'impegno di questi di sostenere il presbiterianesimo nei tre Regni per un periodo di tre anni.