Fundado por Milton Obote em 1960, o Congresso do Povo de Uganda governou o país entre 1962 e 1971, e novamente entre 1980 e 1985. Durante os governos de Obote, que foi presidente duas vezes sob a bandeira do Congresso do Povo de Uganda, numerosas violações dos direitos humanos foram cometidas, especialmente durante o período entre 1966 e 1971, quando o partido era o único legalizado. Em 1971, o ditador Idi Amin baniu o partido depois de executar um golpe de Estado bem sucedido contra Obote. Com a derrubada de Amin pelas Forças Armadas da Tanzânia em 1979, o partido retornaria ao poder após triunfar nas eleições posteriores a invasão tanzaniana. No entanto, as denuncias de fraude eleitoral levaram a uma guerra civil, durante a qual Obote foi novamente deposto pelas forças governamentais sob o comando de Tito Okello, em meados de 1985. A guerra terminou com a vitória do Movimento de Resistência Nacional, liderado por Yoweri Museveni, em 1986. O regime do Movimento proibiu todos os partidos políticos e estabeleceu um sistema não partidário, que terminou em 2005.