Il se reconvertit comme entraîneur, d'abord à la tête de la réserve du Real, baptisée alors "Plus Ultra CF", puis à la tête de l'équipe première : après quelques matchs d'interim en 1958 et 1959, il est nommé officiellement en , après les échecs en championnat de l'Argentin Luis Carniglia en 1958-1959 et du Paraguayen Manuel Fleitas Solich en 1959-1960. Il prend en charge l'équipe alors qu'elle doit affronter le FC Barcelone, champion d'Espagne en titre, en demi-finale de Coupe d'Europe des clubs champions : deux victoires (3-1) lui assurent la qualification pour la finale, remportée facilement sur l'Eintracht Francfort - c'est le premier titre du nouvel entraîneur. Quelques semaines plus tard, le Real Madrid affronte le CA Peñarol au cours de la première édition de la Coupe intercontinentale : après un match nul et vierge à Montevideo, les Madrilènes l'emportent largement au retour (5-1) et s'emparent du trophée.