Durante l'Intifada di al-Aqsa, Israele ha lanciato l'Operazione Scudo Protettivo con l'obiettivo dichiarato di smantellare le infrastrutture terroristiche in modo da contenere gli attentati suicidi e altre attività di guerriglia. L'esercito circondò ed entrò in sei grandi centri palestinesi in Cisgiordania, tra cui Jenin. Durante la battaglia di Jenin nell'aprile 2002 furono uccisi 23 soldati israeliani e 52 palestinesi, tra cui civili. Human Rights Watch riferì che il campo profughi, il principale campo di battaglia, subì gravi danni. Secondo testimoni, persone disarmate sono state colpite e sono morte dopo che gli sono state negate le cure mediche.Human Rights Watch ha ritenuto illegali molti omicidi, tra cui la morte di un uomo di 57 anni (Kemal Zughayer) che è stato colpito e investito da un carro armato nonostante avesse attaccato una bandiera bianca sulla sua sedia a rotelle. Un uomo di 37 anni (Jamal Rashid), paralizzato, è stato schiacciato sotto le macerie della sua casa, e alla sua famiglia è stato negato il permesso di rimuovere il suo corpo. Un ragazzo di 14 anni è stato ucciso mentre si spostava per acquistare generi alimentari durante la sospensione temporanea del coprifuoco imposto dall'esercito. Il personale medico è stato colpito (e un'infermiera uccisa) mentre cercava di raggiungere i feriti, benché fosse chiaramente in uniforme con il simbolo della mezzaluna rossa. Ci sono state anche notizie di soldati israeliani che hanno usato palestinesi come scudi umani, e un padre ha descritto come un soldato ha appoggiato il fucile sulla spalla di suo figlio di 14 anni mentre sparava. Israele ha negato l'ingresso di squadre di soccorso e giornalisti a Jenin anche dopo il loro ritiro. Negli anni seguenti, Jenin fu soggetto a estesi coprifuoco e omicidi mirati israeliani.