Нагаминэ была включена в состав сборной Японии решением национального Олимпийского комитета для участия в летних Олимпийских играх 2016 в Рио-де-Жанейро. Она получила право участвовать и в индивидуальных, и в командных турнирах. В предварительном раунде Нагаминэ набрала 621 очко, заняв в рейтинге 39-е место. Сумма трёх японских девушек составила 1862 в рейтинговом раунде, принеся сборной Японии девятый посев в командном турнире.