Μετά την Τέταρτη Σταυροφορία, με τον Λατίνο αυτοκράτορα υπό την επιρροή των Βενετών που εγκαταστάθηκε στην Κωνσταντινούπολη, ο Βενετός Μάρκος Σανούδος κατέκτησε το νησί και σύντομα κατέλαβε τα υπόλοιπα νησιά των Κυκλάδων, καθιερώνοντας τον εαυτό του ως Δούκα της Νάξιας ή Δούκα του Αρχιπελάγους. Είκοσι ένα δούκες σε δύο δυναστείες κυβερνούσαν το Αρχιπέλαγος, μέχρι το 1566. Η Ενετοκρατία συνεχίστηκε στα διάσπαρτα νησιά του Αιγαίου μέχρι το 1714.