A finales de octubre, no obstante, fue puesto en libertad al no demostrarse los cargos, pasando a disposición de las autoridades civiles, en concreto del Delegado gubernativo de orden público de los sublevados, Luis Medina Montoro, destacado en todo el período de represión por su especial obsesión con los masones. Así, a pesar de la excarcelación, lo recluyó de nuevo en el convento de San Marcos, que entonces era utilizado como campo principal de prisioneros del complejo concentracionario de León (en la actualidad es el Parador de San Marcos), donde compartió celda con el propio catedrático Romero Flores y Victoriano Crémer.