Ewerthon oli mukana alle 20-vuotiaiden Etelä-Amerikan mestaruuskilpailut voittaneessa joukkueessa vuoden 2001 kisoissa, joissa hän voitti myös jaetun maalikuninkuuden yhdessä Adrianon kanssa. Brasilian A-maajoukkueessa Ewerthon pelasi kolme ottelua vuonna 2001 ja toiset kolme ottelua vuonna 2003. Hän oli mukana Brasilian joukkueessa Copa Américassa 2001.