Pour cette raison, elle était toujours à la prison de l'Abbaye lors des massacres de septembre, lorsque les tribunaux populaires ont jugé et exécuté sommairement les détenus des prisons de Paris. Le personnel pénitentiaire a cependant tenté de maîtriser au maximum la violence, notamment en ce qui concerne les détenues de la prison de l'Abbaye, dont seulement deux femmes sur 200 ont été exécutées. Dans le cas de la princesse, elle a été escortée au tribunal par le personnel pénitentiaire ayant l'intention de la protéger, et a été particulièrement assistée par un monsieur Chancy, qui lui a dit quoi dire afin de tourner la sentence du tribunal à son avantage. Elle a donc répondu qu'elle était emprisonnée depuis le 27 août, qu'elle a été interrogée et que son domicile a été perquisitionné depuis, mais qu'aucune preuve à charge n'a été présentée contre elle, et qu'elle a été séparée de son mari et ne savait pas où il se trouvait ni s'en souciait.