В марте 1943 года полковник Якушин назначается командиром 215-й истребительной авиационной дивизии, входившей в состав 2-го истребительного авиакорпуса 3-й воздушной армии Калининского фронта. В апреле, после Ржевско-Вяземской операции, дивизия в составе корпуса была выведена в резерв Ставки ВГК, затем подчинена 1-й воздушной армии Западного фронта. С июня 1943 года и до конца войны она входила в 8-й истребительный авиакорпус, который вел боевые действия в составе 1-, 16- и 4-й воздушных армий, действовал на Калининском, Западном, Степном, 1-м и 2-м Белорусских фронтах. Части дивизии успешно действовали в Спас-Деменской, Смоленской, Белорусской, Восточно-Померанской и Берлинской наступательных операциях. Они выполняли задачи по завоеванию господства в воздухе, вели борьбу с авиацией противника, осуществляли сопровождение штурмовой и бомбардировочной авиации, штурмовку вражеских аэродромов, войск и резервов. 29 июня 1944 года был легко ранен в кисть левой руки и голень левой ноги. Всего за время войны части дивизии произвели 9413 боевых самолето-вылетов. В проведенных 297 воздушных боях было сбито 386 самолетов противника, а также 2 самолета-снаряда. За успешное выполнение заданий командования в боях с немецко-фашистскими войсками ей было присвоено почетное наименование «Танненбергская », и она была награждена орденом Красного Знамени. Лично полковник Якушин имел на своем счету к концу войны 13 успешных боевых вылетов.