Si bien durante las primeras semanas los alféreces estaban lógicamente tutelados durante sus servicios o misiones de más responsabilidad (por ejemplo, los servicios de guardia de seguridad con armamento y munición real), después sus responsabilidades y tareas no tenían diferencia con las de cualquier otro oficial profesional de su misma categoría (alféreces, tenientes o capitanes). Algunos alféreces SEFOCUMA han participado, siempre voluntariamente (al igual que ha sucedido en el pasado con soldados de reemplazo), en varias de las misiones internacionales de paz llevadas a cabo por las tropas españolas a finales de los años 90 del siglo XX, principalmente en los conflictos de Bosnia y Kosovo.