Insbesondere gesellschaftspolitisch gilt Manchin als konservativ. So setzte er sich bis zuletzt gegen die Anerkennung der gleichgeschlechtlicher Ehe ein und stimmte gegen die Aufhebung der Richtlinie Don’t ask, don’t tell für die US Army. Er hat sich entgegen der Parteilinie stets gegen Schwangerschaftsabbruch eingesetzt (Pro-Life). 2010 erhielt Manchin die Unterstützung der üblicherweise republikanisch geneigten United States Chamber of Commerce. Bei den Wahlen 2010 und 2012 wurde Manchin auch vom Waffenlobby-Verband National Rifle Association (NRA) unterstützt; sie gab ihm die Bestnote A. Nach dem Massaker an der Sandy-Hook-Grundschule brachte Manchin gemeinsam mit dem republikanischen Senator Pat Toomey Anfang 2013 eine Gesetzesinitiative ein, die eine Persönlichkeitsüberprüfung bei Waffenkäufen („background checks“) forderte. Die NRA attackierte ihn in Werbefilmen und versuchte ihn so einzuschüchtern. Der Gesetzesvorschlag scheiterte. Daraufhin beendete die NRA ihre finanzielle Unterstützung für Manchin. Im Senatswahlkampf 2018 hat die NRA offengelassen, ob sie eine Empfehlung für ihn ausspricht.