2007 márciusában Naldo meghívást kapott Dungától, a brazil labdarúgó-válogatott szövetségi kapitányától a válogatott keretébe. Annak ellenére, hogy a keret tagja, a Copa Américán nem kapott játéklehetőséget. A csapat 3–0-ra legyőzte Argentínát a döntőben. Naldo 2007. június 1-jén debütált a Wembley Stadionban Anglia ellen, a mérkőzés 1–1-es döntetlennel végződött.