Im Zuge der Polnischen Operation des NKWD innerhalb des Großen Terrors der Jahre 1937/38 wurden beinahe alle ZK- und Politbüromitglieder der KPP (30 von 37 ZK-Mitgliedern) festgenommen und ermordet, darunter Adolf Warski, Maria Koszutska und Bruno Jasieński. Viele weitere Mitglieder waren Repressalien ausgesetzt. Die Partei wurde von der Komintern auf Geheiß Stalins 1938 aufgelöst. Als eines der Motive für die Auflösung der KPP kann der Umstand angesehen werden, dass man ihren Mitgliedern unterstellte, in eine antisowjetische Spionage- und Sabotageorganisation verwickelt zu sein. Andererseits bildeten polnische Spanienkämpfer als auch andere ehemalige Mitglieder und Funktionäre der KPP den personellen Grundstock für die später mit Hilfe der UdSSR gegründete Polnische Arbeiterpartei, ohne dass es ein erneutes Vorgehen gegen die polnischen Kommunisten in ähnlicher Form gab.