Na haar actieve hockeycarrière ging Boomgaardt verder als coach. Tot 2011 was ze zes jaar lang bondscoach van Nederlands meisjes A. Daarnaast was ze tot 2013 coach van de dames van Oranje Zwart, waarmee in 2009 promotie naar de hoofdklasse werd afgedwongen. Als bondscoach op de Jeugd Olympische Spelen pakte ze goud in 2010 en zilver in de zomer van 2014. Van 2012 tot 2014 was ze assistent-bondscoach van het Nederlandse dameselftal, dat in 2014 wereldkampioen werd. In 2015 ging ze aan de slag als coach van de dames van Laren. Boomgaardt was van juni 2016 tot en met maart 2017 bondscoach van de Belgische nationale damesploeg.