Jesus memulai kariernya di Palmeiras. Ia terpilih sebagai pendatang baru terbaik pada Campeonato Brasileiro Série A 2015, tahun di mana ia juga membantu timnya memenangkan Copa do Brasil. Tahun berikutnya ia dinobatkan sebagai pemain terbaik saat Palmeiras memenangkan gelar liga nasional pertama mereka dalam 22 tahun terakhir. Ia bergabung dengan Manchester City pada Januari 2017 dengan biaya transfer sebesar €32 juta, bersama City ia telah memenangkan Liga Utama Inggris pada 2018, 2019 dan 2021, Piala EFL pada 2018, 2020 dan 2021, serta Piala FA pada 2019.