По поводу дальнейшей судьбы Яна Фаустина Лубы существуют 3 версии. По одной из них, он погиб 23 сентября 1648 года в битве с татарами под Пилявцами во время восстания Богдана Хмельницкого. По другой, он уцелел в сражении, вернулся в Польшу и прожил остаток жизни, кормясь по панским домам. По третьей версии, он нарушил запрет сейма и уехал в Швецию, где был похищен русскими, вывезен в Москву и казнён.