22 czerwca 1941, w dniu ataku Niemiec na Związek Radziecki, kolej pracowała jeszcze według normalnego harmonogramu, ale następnego dnia została ona zamknięta. W trakcie wojny linię zniszczono – brakowało ponad 95% szyn, stacje oraz dach zajezdni spalono; zniszczono pierwszą lokomotywę i wywieziono drugą w nieznane miejsce. Wagony usunięto z torów, ale nie wywieziono ich daleko; po drobnych naprawach można było ich dalej używać. Po zakończeniu konfliktu władze przywiązywały znaczną wagę do przywrócenia funkcjonowania kolei, wydarzenie to miało bowiem świadczyć o powrocie do normalnego życia miasta.