Hubungan Elisabeth dengan putra sulungnya Konradin tetap dipertahankan. Ketika Carlo dari Anjou mengalahkan Manfredi dari Sisilia di Pertempuran Benevento pada tahun 1266, saudaranya Ludwig dan suaminya Meinhard mendorong keputusan Konradin untuk pergi kampanye. Pada bulan Agustus 1267, ibu dan putra bertemu untuk terakhir kalinya di Puri Hohenschwangau sebelum Konradin berangkat ke Italia, bersama dengan pamanda dan ayah tirinya, yang betapapun meninggalkannya di Verona. Setelah Elisabeth mendengar kekalahan dan eksekusinya pada tahun 1268, ia memiliki Gereja Santa Maria del Carmine didirikan di Napoli untuk mengenangnya. Pada tahun 1272 ia mendirikan biara Sistersien Stams di Tirol, bersama dengan suaminya Meinhard, di mana ia juga dimakamkan.