1942年5月、東洋艦隊はマダガスカル侵攻作戦（「アイアンクラッド作戦」）の支援を行った。これは、日本の船がヴィシー・フランス支配下地域の海軍基地を使う如何なる試みをも妨害することを目的とする作戦だった。作戦の間、東洋艦隊は、フランス海軍の艦船（2隻の特設巡洋艦、2隻のスループ、5隻の潜水艦）および日本帝国海軍の潜水艦群（「伊10」、「伊16」、「伊18」、「伊20」および「伊16」・「伊20」搭載の特殊潜航艇）と戦った。