、F1活動へのアドバイスをきっかけにフォードの全面的支援を得て、息子ポール・スチュワートの率いる国際F3000チーム「ポール・スチュワート・レーシング」と共にF1へとカムバック。フォードワークスの「スチュワート・グランプリ」を設立して参戦した。そのマシンはかつてのヘルメットと同じタータン・チェックを纏った。1999年のヨーロッパGPではジョニー・ハーバートがチームに初優勝をもたらす。