Nach Flechtheims Tod wurde in der NS-Propaganda Ausstellung „Entartete Kunst“ im Jahr 1938 in Düsseldorf ein großes Foto des Galeristen gezeigt, das ihn und die von ihm vertretene Kunst mit dem Kommentar „Der Jude, der Großmanager dieser Kunst“ diffamierte. Weitere postume Diffamierungen waren unter anderem in Wolfgang Willrichs Publikation „Säuberung des Kunsttempels. Eine kunstpolitische Kampfschrift zur Gesundung deutscher Kunst im Geiste norddeutscher Art“ (1937) zu lesen. Auch in der Wanderausstellung Der ewige Jude (ab November 1937) wurde „Der Kunsthändler Alfr. Flechtheim“ in einer großflächigen Fotomontage in herabwürdigender Absicht präsentiert.