Gisin se blesse à nouveau le 28 février 2007 : elle tombe lors du premier entraînement pour la descente de Tarvisio et se déchire les ligaments du genou gauche. Elle subit ensuite sa septième opération du genou. Son meilleur résultat est une neuvième place pendant la saison 2007-2008. Le 18 janvier 2009, elle remporte sa première course de coupe du monde, à égalité avec Anja Pärson, lors de la descente d'Altenmarkt-Zauchensee. Six jours plus tard, elle remporte la descente de Cortina d'Ampezzo. Elle ne termine pas la descente des championnats du monde 2009 à Val-d'Isère.