中共執政初期，华中大学与新政府的关系相当融洽，宗教事务也正常进行，但到了1950年，形势急转直下。一方面，中国人民志愿军参与抗美援朝战争后，美国宣布冻结新政府在美国的全部资产，中国大陆也做出了对等的回应，其中一个部分就是教会大学的国有化；另一方面，由于韦卓民在与美国的信中赞扬了解放军军纪良好、讲道理、有礼貌，遭到美方反华人士质疑，甚至怀疑韦卓民受到了共产党的收买或者胁迫，他们认为共产党统治后会破坏一切，尽管有联合董事会执行秘书麦默伦等人的努力弥合，但华中大学与教会的关系变得不如从前。我们和解放军人员有过接触，……，他们良好的纪律及礼貌给我们很好的印象。这是在旧政府下兵士中没有见到过的现象。在和新政府人员的接触中，他们是十分诚实而讲道理的，他们的态度是令人敬佩的。生活在这样的时代很有趣，每件事都是那么新奇，那么富有挑战性，每个人都有着这样混合着一些焦急的期望，但这同样是有趣的，它使人又变得年轻了。——韦卓民致麦默伦的信在国内外形势变化下，华中大学主动与政府接洽，申请改制为公立大学。华中大学的改制方向是一所师范大学，以适应中南地区教育师资的需要。1952年7月，成立了以中原大学校长、中南军政委员会教育部部长潘梓年为主任委员，韦卓民校长和中原大学教育学院王自申院长为副主任委员的改制委员会，随着中原大学、中华大学及其他高校部分科系的并入，华中大学逐步改制为华中高等师范学校。