Isezaki arbeitete als Entwicklungshelfer in Sierra Leone, kurz vor dem Ausbruch des Bürgerkrieges 1991, und blieb insgesamt zehn Jahre in dieser Funktion in Afrika. Von März 2000 bis Juni 2001 war er für die Vereinten Nationen in Osttimor. Danach kehrte er für die UNAMSIL nach Sierra Leone zurück und arbeitete in der Koordinierungsabteilung für DDR (disarmament, demobilization, and reintegration). Ebenfalls im Bereich DDR war Isezaki dann in Afghanistan tätig, als Sondergesandter der japanischen Regierung. Inzwischen ist er Professor für Friedens- und Konfliktforschung an der Diplomschule für Globale Studien der Tokyo University for Foreign Studies (TUFS) Isezaki Kenji und verfasste mehrere Bücher. Außerdem ist Isezaki Vizepräsident der Association of Aid and Relief Japan, der ältesten internationalen Nichtregierungsorganisation Japans.