Fabinho jogou 3 partidas pela Seleção Togolesa, em 2003, estreando em julho do mesmo ano, contra a Mauritânia, pelas eliminatórias do Copa das Nações Africanas de 2004, sendo o único jogo oficial dele com o selecionado. Ele ainda disputaria 2 amistosos pelas "Águias", cujo técnico era o brasileiro Antônio Dumas.