Nach der Machtübernahme von Laurent-Désiré Kabila in der DR Kongo entsandte Déby 2000 Soldaten in die DRK, um der Regierung Beistand im Zweiten Kongokrieg gegen die von Ruanda und Uganda unterstützten Rebellen zu gewähren. Im Jahr 2003 unterstützten tschadische Soldaten den Putsch von François Bozizé in der benachbarten Zentralafrikanischen Republik. Déby, der als glänzender Stratege galt, behauptete sich in einem politischen Balanceakt zwischen der Volksrepublik China und den Vereinigten Staaten sowie zwischen Sudan und Libyen.