Le truppe di Jackson bloccarono un feroce assalto dell'Unione a Fredericksburg, Virginia. Nella battaglia di Chancellorsville le forze di Jackson affrontarono l'esercito dell'Unione e, in un'intensa battaglia all'interno di un'intricata foresta, esse lo respinsero sulle proprie linee di partenza. L'oscurità pose fine all'assalto e nella penombra sfortunatamente Jackson e il suo stato maggiore furono per errore scambiati per forze di cavalleria dell'Unione e colpiti dal fuoco di truppe confederate. Jackson fu ferito da tre proiettili; il braccio sinistro fu amputato dal dottor Hunter McGuire ed egli morì sette giorni dopo di polmonite. Le ultime parole di Jackson furono: «lasciateci attraversare il fiume e riposare all'ombra degli alberi» (dalle sue ultime parole, Ernest Hemingway trasse il titolo di un suo famoso romanzo: "Di là dal fiume e tra gli alberi").