Dans les mois qui suivent, un camp de concentration est créé à proximité de Dantzig, au Stutthof. Rapidement, les détenus sont employés pour les besoins de l'économie allemande, dans les industries contrôlées par la SS, dans des fermes situées à proximité, voire dans une usine d'aviation de la firme Focke-Wulf. À partir de l'été 1944, y sont notamment déportés les Juifs internés dans les camps de concentration de l'Ostland, Kaiserwald, et Vaivara et du Gouvernement général de Pologne, menacés par les succès soviétiques de l'été 1944, comme les Juives du ghetto de Kovno et les habitants de Shavli en .