Во время Второй мировой войны 17 августа 1941 года была оккупирована германскими войсками. Освобождена в ходе Нарвской операции. Во время войны Старый город был сильно разрушен в ходе действий советской авиации, а также при отступлении немцев их специальными сапёрными командами. После войны Нарва, как и Таллин, входила в число 32 городов, взятых на учёт Госкомитетом по делам архитектуры СССР. Несмотря на планы по восстановлению старого города, разрушенные здания не были законсервированы и в начале 1950-х началась расчистка территории под строительство типовых домов. Часть зданий впоследствии всё же была восстановлена: Ратуша (в которой располагался Дворец пионеров, а на третьем этаже находился фотокружок), Ливонский замок с башней Германа (сейчас там расположен Нарвский музей), дом Офицерского собрания и другие. Всего сейчас сохранилось 16 зданий Старого города, в том числе и большая часть здания Владимирской церкви (сейчас там отделение детской стоматологии), некоторые из этих зданий находятся под защитой государства.