Poco después de la muerte de Ellen Amman en noviembre de 1932, Godin publicó su biografía, que fue inmediatamente incluida en la lista negra de los nacionalsocialistas, ya que Ammann había ayudado a frustrar el golpe de Estado de Hitler en 1923. Esta vigilancia de su trabajo venía motivada por su amistad con Ellen Ammann, pero también por ser tataranieta del judío Aron Elias Seligmann y prima de Michael Freiherr von Godin, quien, como jefe de policía, había jugado un papel clave para frustrar el golpe de Hitler. Michael von Godin huyó a Suiza después de ser liberado del campo de concentración de Dachau. Marie Amelie von Godin no negó su ascendencia judía y, como católica acérrima, también ayudó a conocidos judíos. En su probablemente último viaje a Albania en 1939, acompañó a una mujer judía al país seguro de los Balcanes. Dado que, según las leyes de Nuremberg, había sido clasificada como "Judía Mischling en segundo grado", necesitaba un permiso especial para convertirse en miembro del Reichsschrifttumskammer (Sociedad de escritores) y seguir activa como escritora. En estos años, sin embargo, solo publicó novelas sobre la patria, que fueron bien recibidas. Por otro lado, se le prohibió publicar sobre temas albaneses: se sospechaba que estaba apoyando a los combatientes de la resistencia albaneses y en adelante se la supervisó duramente.