Летом 1864 года Стюарт участвовал в Битве в Глуши, где от ран погиб его брат, лейтенант Уильям Джеймс Стюарт (1832—1864). Стюарт снова сражался в составе дивизии Джонсона, которая удерживала центр оборонительной линии корпуса генерала Юэлла. Стюарт водил свой северокаролинский пехотный полк в атаку на ньюйоркцев, нанеся им урон примерно в 600 человек.