Споры по поводу принадлежности Нагорного Карабаха в конечном итоге переросли в крупномасштабный военный конфликт, в ходе которого армянские силы взяли под контроль большую часть бывшей НКАО и семь прилегающих районов. По данным HRW, систематические нарушения прав человека совершались местными армянскими силами Карабаха и правительствами Азербайджана и Армении. Прекращение огня было достигнуто в 1994 году и до сих пор остается в силе, поскольку Нагорно-Карабахская Республика "де-факто" независима, а "де-юре находится" внутри границ Азербайджана. Неразрешенный конфликт с Арменией из-за Нагорного Карабаха, а также присутствие в Азербайджане до 880 000 беженцев и вынужденных переселенцев значительно способствовали ухудшению экономической, социальной и политической ситуации в Азербайджане, где около 14 % территории страны оккупированы Армянскими силами.