Выдающиеся успехи Поупа на Миссисипи принесли ему повышение до генерал-майора от 21 марта 1862 года. Во время осады Коринфа он командовал левым крылом армии Халлека, но вскоре был вызван на восток Линкольном. После неудачного завершения Джорджем Макклеланом Кампании на полуострове Поуп был назначен командовать Вирджинской армией, собранной из разрозненных сил в долине Шенандоа и Северной Вирджинии. Это назначение разъярило Фримонта (который был старше Поупа по званию), который подал в отставку.