Il 28 novembre 1998 Martin Schmitt ottenne la sua prima vittoria in Coppa del Mondo sul trampolino lungo Lysgårdsbakken di Lillehammer, in Norvegia: da allora e per i tre anni seguenti rimase costantemente al vertice della specialità. Nella stagione 1998-1999 Schmitt si aggiudicò la Coppa del Mondo con dieci vittorie. Ai Mondiali di Ramsau am Dachstein, in Austria, vinse l'oro individuale nel trampolino lungo e contribuì alla conquista dell'oro nella gara a squadre. Sempre nel 1999 stabilì il nuovo primato mondiale, con 214,5 m.