Sus subalternos Erwin Lahousen y Hans Bernd Gisevius, sobrevivieron a la guerra y testificaron en el Juicio de Núremberg sobre la oposición de Canaris contra Hitler. Lahousen informó sobre una conversación entre Canaris y el general Wilhelm Keitel donde le advertía que el Ejército alemán era responsable de las atrocidades en Polonia a lo que Keitel respondió que eran órdenes de Hitler. Keitel, uno de los firmantes de la rendición incondicional de Alemania, fue condenado a morir en la horca en Núremberg.