Malcolm H. Wiener, James P. Allen und andere vermuten, dass die Unwetterstele Auswirkungen des Ausbruchs des Vulkans von Santorin auf Ägypten beschreibt. Diese sogenannte Minoische Eruption hätte demnach auch große Teile Ägyptens verwüstet. Als Indizien führen sie die Beschreibungen in der Inschrift von ungewöhnlichem Lärm während des Unwetters sowie die – ihrer Meinung nach – ebenfalls untypische Finsternis während des Unwetters an. Der beschriebene „Lärm“ sei demnach das Dröhnen der Erde gewesen, ausgelöst durch den Vulkanausbruch; die Aschewolke wäre für die Dunkelheit verantwortlich. Außerdem sei die beschriebene Flut für einen einfachen Monsunregen als zu zerstörungsreich dargestellt. Es gilt als gesichert, dass die Santorin-Eruption einen oder mehrere Tsunamis auslöste. Die Tsunamis haben auch das tiefliegende Nildelta überflutet, was die verheerenden Zerstörungen erklären könnte. Auf der Arabischen Halbinsel existieren bis heute aktive Vulkane, und es ist möglich, dass diese durch die extreme Santorin-Eruption ebenfalls ausbrachen. Starkregen begleiten viele Vulkanausbrüche, lokale Starkregen entstehen durch die Eruptionsgewitter. Andererseits sind in Ägypten keinerlei Ablagerungen vulkanischer Asche gefunden worden, die in die Herrschaftszeit des Ahmose fallen.