4月12日、上海クーデターが発生すると、李は蔣介石を支持して中国共産党粛清に従事した。武漢と上海の国民政府の分裂（寧漢分裂）でも上海国民政府を支持している。1928年、武漢政治分会主席を兼ね、さらに第4集団軍総司令に昇進した。北伐勝利後の10月、国民政府委員兼軍事参議院院長に任じられている。