В войне с Швецией принимал деятельное участие, в феврале 1809 года он отправился в Або. Там некоторые генералы, ввиду приказа государя перенести театр войны на шведский берег, ссылались на разные затруднения. Много препятствий пришлось претерпеть русским войскам, но Аракчеев энергично действовал.