A recém-separada República Eslovaca, liderada por Jozef Tiso, foi estabelecida na Eslováquia. Parte do sul da Eslováquia e toda a Rutênia (o antigo extremo leste da Checoslováquia) foi anexada pela Hungria. Zaolzie foi anexada pela Polônia, e anexada pelos alemães 11 meses depois, e retornada à Checoslováquia em 1945 pela União Soviética. A Revolta Nacional Eslovaca, iniciada em agosto de 1944, foi suprimida pelas forças alemãs no final de outubro; partidários, no entanto, continuaram lutando nas montanhas até o fim da guerra. Em abril de 1945, o Exército Vermelho derrotou os alemães e derrubou o governo de Tiso, anexando a Rutênia dos Cárpatos à União Soviética.