Nel 2003 lo stormo schierò circa 550 militari e 14 B-52 in supporto dell'operazione Iraqi Freedom. Durante il conflitto, i suoi bombardieri hanno eseguito più di 120 missioni di combattimento per un totale di più di 1.600 ore di volo. Sganciarono più di 1,5 milioni di tonnellate di armi, compresi missili da crociera, bombe convenzionali e a guida laser. I membri dello stormo sono continuamente dispiegati in tutto il mondo per prendere parte alla Guerra globale al Terrorismo. I suoi B-52 sono schierati anche sulla base di Andersen, sull'isola di Guam, come forze di stabilizzazione nell'estremo oriente.