Il fait ensuite partie des volontaires français qui s'enrôlent au service des Confédérés Polonais. En effet, la France a soutenu les Confédérés dans leur lutte contre les Russes par une aide financière de francs par mois et par l'envoi de troupes, sous la direction de Dumouriez puis sous celle du baron de Vioménil. Recruté avec le grade de lieutenant-colonel le , Belcourt est chargé de former un régiment au château de Cracovie. Ayant constitué un détachement de 400 hommes et deux pièces de canon, il doit évacuer la place de Cracovie en novembre en raison de l'avance des troupes russes. Il est fait prisonnier et dépouillé lors d'un accrochage avec les Cosaques au village de Royana le . La colonne de prisonniers à laquelle il appartient est envoyée en Sibérie et parvient à son lieu d'internement à Tobolsk en octobre 1770 après un périple de plusieurs mois.