Nach dem Ausbruch der Deutschen Revolution von 1848 beteiligte sich Böckel aktiv am politischen Leben. Mit seinem Kollegen Wilhelm von Freeden hatte er ab 1848 die linksliberal-demokratische Zeitung "Freie Blätter für das freie Volk" heraus, die bis 1851 in Jever erschienen. Von 1848 bis 1858 gehörte Böckel außerdem dem Oldenburgischen Landtags an, in dem er sich rasch als Wortführer der linken Opposition profilierte. Durch seine rhetorische Begabung, seine fundierten Sachkenntnisse und die präzise Logik seiner Argumentation wurde er zu einem der besten Debattenredner des Parlaments. Allerdings vertrat er meist unpopuläre und kontroverse Standpunkte. So lehnte er aufgrund seiner politischen Überzeugungen 1849 den Bündnisvertrag Oldenburgs mit dem reaktionären Preußen ab, trat für die freiheitliche Verfassung ein und organisierte den Protest gegen die Wahlrechtsänderungen, mit deren Hilfe die linken Kräfte ausgeschaltet werden sollten. Seit Ende 1848 versuchte die Regierung erfolglos, den unbequemen Oppositionspolitiker durch Druck und beamtenrechtliche Disziplinierungsmaßnahmen in seiner Tätigkeit zu behindern. Schließlich wurde er ab dem 14. Juni 1851 zur Disposition gestellt und auf Wartegeld gesetzt. Als im folgenden Jahr Böckel die Schulleiterstelle einer privaten höheren Lehranstalt in Idar in der zu Oldenburg gehörenden Exklave Birkenfeld angeboten wurde, verweigerte das Ministerium aus politischen Gründen die erforderliche Zustimmung. Um das karge Wartegeld aufzubessern, erteilte Böckel in der Folge Privatunterricht und betätigte sich von 1853 bis 1858 als Verleger für die "Volkszeitung für Oldenburg".