南苏丹的铁路运输没有广泛的铁路系统。现有的铁路基础设施建于1959年至1962年之间，由苏丹政府遗留下来的設施年久失修。南蘇丹鐵路有 窄轨 （1067毫米）單線路線，連接蘇丹的巴巴努沙與与南苏丹的瓦屋市。 在第二次苏丹内战之后，该线路被地雷破壞，状况不佳，而後使用联合国的资金修复了这条路线。