En 65, Épaphrodite a appris qu'un groupe dirigé par le sénateur Pison organisait une conspiration. Les conjurés avaient convenu de poignarder Néron le lorsqu’il se rendrait au Circus Maximus pour les jeux de Cérès, tandis que Pison serait présenté au camp des prétoriens par Faenius Rufus. Épaphrodite l'a immédiatement rapporté à l'empereur et Pison et les autres ont été arrêtés. Après l'exécution des conspirateurs, Épaphrodite reçut les honneurs militaires. C'était désormais un homme riche qui possédait de grands jardins sur l'Esquilin, à l'est de la "Domus Aurea" («Maison d'Or»), que Néron avait commencé à construire après le Grand incendie de Rome en 64.