CEN-SAD:s uttalade mål är att bilda en frihandelsregion i norra Afrika. Sedan 2001 ingår CEN-SAD som en av pelarna i Afrikanska ekonomiska gemenskapen, där regionen överlappar tre av de andra pelargemenskaperna: ECOWAS, ECCAS och COMESA. Under 2000-talet har organisationen varit delaktig i försöken att medla fred i Darfurkonflikten, samt stöttat TFG-regeringen i Somaliakonflikten.