Em 2002, iniciou-se a construção de uma segunda ponte, ao lado do primeiro segmento original (o segmento entre o continente---da cidade de Oakland---à "Yerba Buena Island"). Este novo trecho, que os habitantes locais apelidaram de "New Bay Brigde", substitui um importante trecho destruído durante o terremoto de Loma Prieta, em 17 de outubro de 1989, quando uma seção de 30 metros da pista superior desabou. O novo trecho conta com apenas um andar para tráfego, com pistas de mão opostas correndo paralelamente. A construção foi concluída em 2 de setembro de 2013, com custo total de 6.5 bilhões de dólares.