Nach dem Krieg betätigte sich Ahlfen als Autor verschiedener Bücher. Bereits während seiner Zeit als Lehrer an der Kriegsakademie hatte er ein militärisches Lehrbuch "„Dienst bei den Pionieren“" (Verlag Detke, Leipzig 1937) verfasst. Nun veröffentlichte er ab den frühen 1950er Jahren weitere theoretische Schriften zum Pionierwesen. Außerhalb des militärischen Fachbereichs wurde von Ahlfen durch seine Schriften zu den Kämpfen um Breslau bekannt, erstmals mit dem 1956 erschienenen Aufsatz "„Der Kampf der Festung Breslau“" in der "Wehrwissenschaftliche Rundschau", ein Jahr später gefolgt vom Buch "„Der Kampf der Festung Breslau“" (Verlag Ernst Siegfried Mittler, 1957). In den nächsten Jahren beschäftigte er sich zusammen mit Hermann Niehoff, seinem Nachfolger als Festungskommandant von Breslau, weiterhin mit diesem Thema. Im Jahre 1959 veröffentlichten sie gemeinsam das Buch "„So kämpfte Breslau“" (Verlag Gräfe und Unzer, 1959), das ein großer kommerzieller Erfolg wurde, und dem ein Jahr später eine zweite erweiterte Auflage folgte. In dem nachfolgenden Band "„Kampf um Schlesien“" (Verlag Gräfe und Unzer, 1961) betrachtete Ahlfen noch einmal den größeren Kontext der Operationen 1945.