Неолит отмечен в Нижнем Египте существованием культур Фаюм А (её носители, вероятно, прибыли из стран Плодородного полумесяца, неся с собою достижения Неолитической революции), Меримде (5000—4200 до н. э.), Эль-Омари (5 тыс. до н. э.), Маади-Буто (4000—3400 до н. э.). Верхнеегипетский неолит представлен культурами: тасийской → бадарийской → амратской → герзейской → Нулевой династией.