Bernardo Baloyes tritt seit 2010 in Sprintwettkämpfen an. 2011 wurde er Kolumbianischer U18-Meister über 200 und 400 Meter. In diesen Disziplinen trat er im Juli auch bei den U18-Weltmeisterschaften in Lille an. Während er über 400 Meter nach dem Vorlauf disqualifiziert wurde, zog er über 200 Meter in das Halbfinale ein, in dem er als Fünfter seines Laufes ausschied. Einen Monat später trat er bei den U20-Südamerikameisterschaften in seiner kolumbianischen Heimat an. Dabei gewann er über 400 Meter und mit den 4-mal-100- und der 4-mal-400-Meter-Staffel jeweils die Silbermedaille. Im Oktober steigerte er seines Bestzeit über 200 Meter auf 21,17 s. 2012 gewann Baloyes bei den Kolumbianischen U23-Meisterschaften über 200 und 400 Meter jeweils eine Goldmedaille, wobei er seine 200-Meter-Bestzeit bis auf 20,48 s verbesserte. Über 200 Meter und mit der 4-mal-100-Meter-Staffel ging er im September bei den U23-Südamerikameisterschaften in São Paulo an den Start, bei denen er in beiden Disziplinen jeweils Silber gewann. 2013 siegte er erstmals bei den Kolumbianischen Meisterschaften der Erwachsenen. Im Juli nahm er erstmals an den Südamerikameisterschaften der Erwachsenen teil, bei denen er über 200 Meter die Silbermedaille gewinnen konnte. Nachdem er sich im Juni auf 20,46 s steigerte, qualifizierte er sich für die im August stattfindenden Weltmeisterschaften in Moskau. Dort schied er mit weit abgeschlagen nach dem Vorlauf aus.