Anfang 1851 übergab er das II. Korps an Generalleutnant von Gumpenberg und übernahm selbst bis 1855 das Kommando über das I. Armee-Korps. Obwohl bereits kränklich wurde der Siebzigjährige beim Ausbruch des Deutschen Krieges im Juni 1866 mit einem Kommando im Verband des VII. Bundeskorps unter Prinz Karl von Bayern ernannt. Während der Schlacht bei Kissingen befehligte er 3.900 Bayern mit 13 Geschützen im Abschnitt bei Hammelburg. Es gelang ihm die angreifende preußische Division von Beyer (11.000 Mann mit 30 Geschütze) fünf Stunden lang aufzuhalten, bevor er seine Truppen nach dem Zusammenbruch der Division Zoller bei Kissingen zurückziehen musste. Danach vom Dienst verabschiedet, verstarb Karl Theodor 1868 in München, wo er auch beigesetzt wurde.