Cesare'nin kariyeri, Fransa'yla dostluk kuran babasının (Bu dostluk Cesare'nin, Navarra Kralı III. John'un kızkardeşi Charlot d'Albret ile evlenmesiyle güçlenecek) İtalya Savaşları'ndaki himayedârlıklarını bozma planlarına dayanıyordu. Gian Giacomo Trivulzio'nun Milano'yu Ludovico Sforza'nın elinden almasından sonra; 1499'da Fransa Kralı XII. Louis, Cesare yardımıyla Milano'ya girdi ve İtalya'ya birtakım istila seferleri başlattı.