Po skončení války se Prchal s rodinou vrátil do vlasti a po odchodu do zálohy nastoupil na počátku roku 1946 k Československým aeroliniím. Zde vykonával funkce šéfpilota, zkušebního pilota a instruktora. Po převratu v únoru 1948 začal uvažovat o emigraci. Spolu se svými kolegy a bývalými spolubojovníky z 310. perutě Josefem Řechkou a Janem Kauckým naplánoval útěk letadlem. Vhodná příležitost nastala 30. září 1950. Zkušební komisař Kaucký obešel bezpečnostní předpisy a odstartoval sám k plánovanému zkušebnímu letu s dopravním letounem ČSA Douglas DC-3 imatrikulace OK-WAA. Přistál na polním letišti u Mělníka, kde rychle nastoupili tam již čekající Prchal a Řechka s rodinami, celkem 8 lidí. Prchal poté přebral řízení letounu a podařilo se mu přeletět přes hranice a východní Německo až do Anglie.