Après la reconquête ottomane, Navarin devient le centre d'une caza (division administrative) dans le sandjak (district) de Morée ottomane. Le 10 avril 1770, après un siège de six jours, la forteresse du "Néo-Navarino" se rend aux Russes lors de l'expédition d'Orloff. La garnison ottomane est autorisée à rejoindre la Crète, tandis que les Russes réparent la forteresse pour en faire leur base. Cependant, le juin les Russes quittent Navarin et les Ottomans rentrent dans la forteresse qu'ils incendient et démolissent partiellement. La population grecque s'enfuit alors dans l’île de Sphactérie, où les mercenaires albanais des Ottomans massacrent la plupart d'entre eux.