Після призначення командувачем Об'єднаного корпусу швидкого реагування "(ARRC)" НАТО, Джексон у січні 1997 року отримав тимчасовий чин генерал-лейтенанта, а у квітні 1997 року його затвердили у цьому званні. У ланцюзі командування НАТО Джексон підпорядковувався Верховному головнокомандувачу ОЗС НАТО в Європі — американському чотиризірковому генералу Веслі Кларку. Під командуванням Джексона сили "ARRC" у березні 1999 року були розгорнені у Боснії і Герцеговині, де Джексон відслужив своє друге відрядження на Балканах, командуючи "KFOR" — багатонаціональними силами НАТО з підтримки миру, створеними наприкінці війни у Косово.