Накануне Первой мировой войны (1914—1918) МГШ состоял из трёх основных частей: оперативной, организационно-тактической, статистической, а также исторической и канцелярии. После революции 1917 года неоднократно реорганизовывался, его функции и полномочия непрерывно менялись. В августе 1921 года был расформирован, его функции перешли к Морскому штабу Республики, затем после ряда изменений с 1955 года — Главному штабу ВМФ.