Im Zweiten Markgrafenkrieg fielen die Truppen des Albrecht Alcibiades in Iphofen ein. Dabei wurde die Mühle im Jahr 1553 niedergebrannt. Im 17. Jahrhundert war sie wieder aufgebaut und Johann Grön bewirtschaftete sie als „SpittelMuller“. Gegen 1770 war die „Spittel-Mühl“ Teil der Pfarrei Iphofen. Im Jahr 1835 wurde die Spitalmühle als Mahl- und Gerbmühle am Wehrbach beschrieben. Die Mühlengebäude sind als Baudenkmal eingeordnet.