São Tomé e Príncipe ha partecipato ai Giochi della XXXI Olimpiade, che si sono svolti a Rio de Janeiro, Brasile, dal 5 al 21 agosto 2016, con una delegazione di tre atleti impegnati in due discipline: atletica leggera e canoa. Portabandiera alla cerimonia di apertura è stato il canoista Buly Triste.