El 23 d'abril de 1954 (i fins al 17 de juny) el senador McCarthy passà a presidir una Comissió encarregada de l'eliminació dels simpatitzants comunistes de l'Exèrcit. El 1953 envià al tinent general John W. "Iron Mike" O'Daniel a Vietnam perquè estudiés i "assessorés" les forces franceses allà destinades. No obstant això, acceptà el consell del Cap de l'Estat Major Matthew Ridgway i rebutjà donar suport a França a la Guerra d'Indoxina que mantenia amb el Viet Minh, guerra que finalitzà amb la derrota francesa després Dien Bien Phu amb la Conferència de Ginebra, per la que França abandonava Indoxina i s'acceptava la separació del país en dues meitats (tal com ja havia passat a Corea): Vietnam del Nord i Vietnam del Sud. El 1954, oferí suport militar i econòmic al Vietnam del Sud; i en els anys posteriors, s'incrementaren el nombre de conseller militars americans en aquell país davant el suport del Vietnam del Nord als "alçaments" del sud i davant la possibilitat que el país caigués.