Il 23 giugno 2016 venne selezionato al Draft NBA dai Los Angeles Lakers come seconda scelta del secondo giro, risultando essere la 32ª scelta assoluta. Fece il proprio debutto in NBA il 3 novembre 2016 nella partita vinta per 123-116 in trasferta contro gli Atlanta Hawks, in cui lui partì titolare a sorpresa al posto dell'infortunato Timofej Mozgov. La mossa fu sorprendente in quanto la riserva designata di Mozgov è Tarik Black, che in quella gara venne relegato al ruolo di subentrante. Zubac comunque giocò 18 minuti mettendo a segno 6 punti. Durante il mese di novembre venne spedito in D-League ai Los Angeles D-Fenders, squadra affiliata agli stessi Lakers. Il 18 gennaio 2017 mise a referto 11 punti e 13 rimbalzi nella sconfitta in casa per 127-121 contro i Denver Nuggets, realizzando la prima doppia doppia della sua carriera. Il 26 gennaio 2017 segnò 12 punti nella gara persa 105-98 in trasferta contro i Portland Trail Blazers. Nella partita successiva persa per 96-88 in casa degli Utah Jazz Zubac segnò 16 punti in 26 minuti partendo dalla panchina. Il 1º febbraio 2017, sempre partendo dalla panchina, segnò 17 punti nella gara vinta in casa per 120-116 contro i Denver Nuggets. Dal mese di marzo, con Mozgov fuori causa per infortunio, Zubac ha disputato buona parte delle restanti partite della stagione dei gialloviola da titolare.