Max Emanuel tenía pasión por el ejército. En 1865 se convirtió en teniente segundo en el 2º Regimiento Bávaro de Ulanos "Rey", y en 1866 participó en la guerra contra Prusia. Maximiliano Manuel partició en las batallas de Hünfeld y Hammelburg zum Einsatz. Desde 1867 sirvió en el 3er Regimiento de Cavallería "Duque Carlos Teodoro". Luchó con este regimiento durante la Guerra Franco-Prusiana en las batallas de batalla de Wörth, Beaumont, Orleans y el asedio de París. De 1873 a 1874, Maximiliano Manuel fue enviado a la Academia de Guerra de Baviera. Sin embargo, solo completó el primer curso y luego abandonó la Academia. Fue transferido al 1er Regimiento de Ulanos y promovido a "Rittmeister" (capitán de caballería) en 1875. Al año siguiente se convirtió en jefe de escuadrón en el 1er Regimiento de Caballería "Zar Nicolás de Rusia". Maximiliano Manuel fue liberado de esta función por razones de salud en 1877 y enviado à la suite del regimiento. Sin embargo, en los años siguientes fue promovido continuamente y finalmente nombrado general de división en 1887 para dirigir la institución de equitación en el cuartel Maximiliano II en Munich. Desde 1889 fue teniente general.