El 1992, Marić empatà als llocs 4t-5è al Torneig de Candidates de Xangai, Xina. El 1994, empatà als llocs 4t-5è al Torneig de Candidates de Tilburg, Països Baixos. El 1997, empatà als llocs 4t-5è al Torneig de Candidates de Groningen, Països Baixos. A partir del 2000, el campionat del món de la FIDE es basa en un sistema eliminatori. A Nova Delhi, Índia, el 2000, Alisa Marić va jugar el matx semifinal contra la xinesa Qin Kanying. A Moscou, Rússia, el 2001, va arribar a la tercera ronda, en què va perdre contra la xinesa Zhu Chen, qui acabaria sent la campiona del món en aquella edició.