Die Wurzeln der GUNT liegen in der Gemengelage, die der libysch-tschadische Grenzkrieg im Tschad hervorgebracht hatte. Nachdem sich 1978 Hissene Habre, Vorsitzender der anti-libyschen Gruppe FAN mit dem damaligen tschadischen Präsidenten Malloum verbündet hatte, kam es zu einer Offensive der pro-libyschen Rebellengruppe FAP unter Goukouni Oueddei, die von libyschen Streitkräften unterstützt wurde.&lt;ref name="zeit_1987/15"&gt;&lt;/ref&gt; 1978 zeigte die Koalition von Oueddei und dem libyschen Machthaber Gaddafi bereits Risse und es kam zu Gefechten zwischen rivalisierenden Gruppen. 1979 zerbrach auch das Bündnis von Habre und Malloum und es kam zu Straßenkämpfen zwischen Habres und Malloums Anhängern in der tschadischen Hauptstadt N'djamena. Die dadurch weiter eskalierende und unübersichtliche Lage im Tschad führte zu einer Internationalen Friedenskonferenz im nigerianischen Kano. Durch den Druck Nigerias und Frankreichs konnten die Rivalen Habre und Oueddei zur Teilung der Macht bewogen werden, in einer Regierung der Nationalen Einheit, der GUNT. Oueddei wurde in dieser Präsident, Habre Verteidigungsminister.&lt;ref name="zeit_1983/34"&gt;&lt;/ref&gt;