In den Wirren des Zweiten Weltkrieges konnte er mit seinem Bruder aus seinem Exil in den Iran fliehen, wo er sich der Republik Mahabad anschloss. 1947 ergab er sich der irakischen Regierung und wurde zum Tode verurteilt. Das Todesurteil wurde dann in lebenslange Haft umgewandelt. Nach dem Militärputsch und Sturz der Monarchie im Juli 1958 durch General Abd al-Karim Qasim kam er frei. Seinen Platz hatte inzwischen sein Bruder Mustafa Barzani, der jahrelang in der Sowjetunion lebte, eingenommen. Ahmed Barzani verstarb in den 1960ern.