4月16日、ファラガットはアダック島に向かう。5月11日までアラスカ水域を行動したが、その2日後の5月13日、伊31からの魚雷が戦艦ペンシルベニア (USS "Pennsylvania", BB-38) に向けて発射される。ペンシルベニアを護衛していた米駆逐艦("USS Phelps, DD-360")が潜航中の潜水艦をソナー探知して爆雷2発を投下するも、伊31を撃沈できなかったばかりか伊31の反応も消えてしまった。上空を警戒していたPBY カタリナが伊31が潜航していると思しき位置に発煙筒を投下して目印とし、離れた場所にいたファラガットと (USS "Edwards", DD-619) を呼び寄せて伊31の討ち取りに差し向けた。やがてファラガットとエドワーズは爆雷攻撃を行い、その後浮上してきた伊31へ向けエドワーズが砲撃を行って伊31を撃沈した。6月も引き続き対潜哨戒任務に就いたあと、7月5日からはキスカ島の包囲に参加。8月15日のコテージ作戦開始までの間に艦砲射撃を繰り返し、9月4日までキスカ島への部隊上陸を支援ののち、輸送船団を護衛してサンフランシスコに向かい、そのままオーバーホールに入った。