Durant la Première Guerre mondiale, les Alliés utilisent l'île comme base arrière pour essayer de prendre les détroits des Dardanelles, à quelque 50 kilomètres de là. Ces opérations sont effectuées en 1915 principalement par les troupes britanniques, et le port de Moudros est placé sous le contrôle de l'amiral Rosslyn Wemyss, qui le fait agrandir pour accueillir les navires de guerre britanniques, mais l'île manque des infrastructures nécessaires aux soldats, et les troupes qui sont envoyées à Gallipoli doivent s'entraîner en Égypte. Cette campagne échoue à la fin de l'année 1915 et l'importance de Moudros décroît, mais le port reste une base alliée pendant la guerre pour bloquer les Dardanelles. Les Français l'utilisent comme base arrière pour la flotte de Méditerranée, comme lieu d'hospitalisation et comme base aérienne : le général Baumann en est le commandant français. À la fin du mois d'octobre 1918, l'armistice entre les Alliés et l'Empire ottoman est signé à Moudros.