После принятия года в Республике Новая Гранада , открывшей путь к федерализации государства, Панама первой года заявила о создании в границах Перешейка Федерального штата Панама (). года был создан федеральный штат , года — . Опасаясь развала страны, Конгресс года принял закон о создании федеральных штатов , , , и , а года провозгласил создание Гранадской конфедерации и принял , по которой страна становилась союзом суверенных штатов, — в их числе и Суверенного штата Панама (), — а политическая и военная власть центрального правительства были сведены к минимуму. Попытка президента Мариано Оспина Родригеса вернуть центру полномочия смещать и назначать губернаторов штатов и контролировать расходные статьи их бюджетов привела к гражданской войне, начавшейся с объявления года о выходе штата Каука из юрисдикции центрального правительства и его объединения с примкнувшими штатами (включая Панаму) в Соединённые штаты Новой Гранады (); года повстанческая армия взяла Боготу, президент был арестован, однако сопротивление сторонников централизации не прекращалось до начала 1863 года. года в Рионегро состоялась ассамблея, принявшая , преобразовавшую конфедерацию в Соединённые Штаты Колумбии () во главе с "Президентом союза" (). Ограничения политической и военной власти центрального правительства способствовали тому, что в последующие годы в стране произошло порядка 40 гражданских войн местного характера и одна общенациональная (в 1876—1877 годах). года консервативные круги добились принятия , по которой государство становилось унитарной Республикой Колумбия ().