A háború végén, a WJC erőfeszítéseket tett a zsidó közösségek újjáépítésére Európában, kártérítési és jóvátételi követeléseket kezdeményezett Németország ellen, segítséget nyújtott a lakóhelyüket elhagyni kényszerült személyeknek és a holokauszttúlélőinek, valamint a náci vezetők háborús bűnökért és emberiség elleni bűncselekményekért történő megbüntetését javasolta. A Zsidó Világkongresszus részt vett a Nürnbergi per szabályainak kialakításában és bizonyítékokat szolgáltatott a náci vezetőkkel szemben az amerikai ügyészeknek.