Cuando el mariscal Soult y el rey José I comenzaron con sus intrigas, Sebastiani rehusó participar en ellas, aunque no dejaron de circular rumores que le incluían en ellas. El 15 de julio de 1812, asedió Drissa y el 8 de agosto hizo lo mismo en Inkowo y en la retirada de Moscú. Bonaparte le puso a la cabeza de los restos de la caballería de la Grande Armée en los finales de la campaña de Rusia y tomó parte en todos los combates importantes de la final campaña de 1813.