Im Vorfeld der Unterzeichnung des Konkordates mit Frankreich war er Sekretär der Legation in Frankreich unter Kardinal Giovanni Battista Caprara. Am 5. September 1801 verließ er Rom und erreichte Paris am 4. Oktober desselben Jahres. Dort blieb er drei Jahre lang bis zur Ankunft des Papstes im Dezember 1804. Giuseppe Antonio Sala wandte sich mehrmals gegen die Zugeständnisse, die der schwache Kardinallegat Bonaparte gegenüber machte, und zog damit den Zorn des Letzteren auf sich. Am 2. Dezember 1804 assistierte er bei der Kaiserkrönung Napoleons.