Emmanuel Eseme begann vergleichsweise spät mit der Leichtathletik. Er trainiert am Sportkomplex der Universität Yaoundé in Kameruns Hauptstadt. 2018 nahm er bei den Afrikameisterschaften in Nigeria erstmals an internationalen Meisterschaften teil. Bei denen ging er über 100 Meter an den Start und konnte das Halbfinale erreichen, in dem er mit 10,64 s als 16. ausschied. 2019 verbesserte er sich direkt bei seinem ersten Wettkampf des Jahres über 100 Meter auf 10,41 s. Im August nahm er erstmals an den Kamerunischen Meisterschaften teil, bei denen er über 100 und über 200 Meter jeweils Gold gewinnen konnte. Während er über 100 Meter seine Bestzeit aus dem Januar bestätigte, verbesserte er sich über 200 Meter auf 20,31 s und egalisierte damit den Nationalrekord, den Joseph Batangdon seit dem Jahr 1999 alleinig innehatte. Ende August nahm er an den Afrikaspielen in Rabat teil. Während er im Vorlauf über 200 m nicht antreten konnte, ging er im Vorlauf als Teil der 4-mal-100-Meter-Staffel an den Start und war am Finaleinzug damit beteiligt. Wie über 200 Meter konnte er auch im Finale der Staffel nicht antreten, die auf dem siebten Platz ins Ziel kam. Ende September trat Eseme bei den Weltmeisterschaften in Doha über 200 Meter an, schied allerdings im Vorlauf aus. Einen weiteren Monat später nahm er über 200 Meter und mit der Staffel an den Militärweltspielen in Wuhan teil. Dabei belegte er im Sprint den fünften Platz und wurde zudem Siebter mit der Staffel.