V říjnu 1942 byla "Zuihó" přidělena k 1. divizi letadlových lodí (společně se "Šókaku" a "Zuikaku") a 25.-27. října se účastnila bitvy u ostrovů Santa Cruz. Na palubě nesla 20 A6M2 "Zero" a 9 B5N2 "Kate". Ráno 26. října byla zasažena dvěma 500lb (226,7 kg) pumami svrženými dvěma bombardéry SBD-3 "Dauntless" ranního průzkumu z letadlové lodi USS "Enterprise". Poškození znemožnila letový provoz na její palubě. Tím účast "Zuihó" v této bitvě skončila a spolu s o něco později poškozenou "Šókaku" byla v doprovodu torpédoborců "Hacukaze" a "Maikaze" odeslána na Truk.