Questi dati cambiarono drammaticamente nel settembre 2005, dopo il passaggio dell'Uragano Katrina. L'ufficio del sindaco ha stimato in gli abitanti della "parish" di Baton Rouge prima dell'uragano. Due settimane dopo, la popolazione era salita a -1 milione di persone. Secondo la Camera di Commercio di Baton Rouge, la città ha accolto circa sfollati dalla zona di New Orleans, dei quali hanno trovato rifugio in case private da parenti e amici, hanno affittato un'abitazione, si sono sistemati negli alberghi, nei rifugi per sfollati e in case sfitte o non ancora vendute, nei dormitori dei college e in altre strutture.