Após a invasão dos EUA ao Iraque em 2003, aterros e obras de drenagem foram danificados e abertos, e os pântanos começaram a alagar novamente. O Pântano Central mostrou pouca recuperação, ao longo de 2003, mas no início de 2004, uma colcha de retalhos de lagos tinha aparecido em áreas do norte; haviam inundações em áreas do sul, que tinham sido previamente secas desde o início da década de 1990. Tem ocorrido uma recolonização natural da vegetação do pântano e o retorno de algumas espécies de peixes e aves, embora a recuperação do Pântanos Centrais tem sido muito mais lento comparado ao Pântanos Huwaizah e Hammar; as seções das zonas húmidas mais severamente danificadas ainda não mostram quaisquer sinal de regeneração. Acredita-se que o rato banticota Bunn da cauda curta tenham sido extintos.