Der Ort wurde im Jahr 1708 von dem Spanier Pedro de la Cruz gegründet, der in der Umgebung einen Claim beantragt hatte. Um 1780 hatte die Gemeinde ca. 50.000 Einwohner, die alle dem „Lockruf des Silbers“ gefolgt waren. Mit dem Niedergang der Silberexporte nach Spanien im Verlauf des Mexikanischen Unabhängigkeitskriegs (1810–1821) ging die Bevölkerung bis auf etwa 10 Familien zurück. Danach erlebte das Minenwesen unter der Führung einiger US-Amerikaner einen erneuten Aufschwung – so betrug die Silberförderung im Jahr 1883 ungefähr 1,25 Millionen Pfund. Im Jahr 1887 wurden unter dem Namen "Batopilas Consolidated Mining Company" mehrere Minen der Region zusammengeschlossen, doch im frühen 20. Jahrhundert wurden sie allesamt aufgegeben.