Однако периодически между США и Турцией возникали конфликтные ситуации и недопонимание. В 1974 году начался самый сложный период их отношений после вторжения Турции на Северный Кипр. В ответ на вмешательство Турции в конфликт на Кипре Соединённые Штаты приостановили поставки оружия в эту страну. Анкара же запретила осуществлять вооружённым силам США деятельность на своей территории, которая не были связана с миссиями НАТО. Кипрская проблема продолжала отравлять отношения США и Турции в течение нескольких лет. Даже после того, как Конгресс США снял эмбарго на поставки оружия Турции в 1978 году, прошло два года, прежде чем двустороннее сотрудничество в области обороны было восстановлено до уровня 1974 года.