Im Zuge des Abgasskandals musste Audi-Topmanager Ulrich Hackenberg im Dezember 2015 seinen Posten räumen. Sein Nachfolger Stefan Knirsch musste im September 2016 gehen. Mit Ulrich Weiß, dem entlassenen Chef der Audi-Motorenentwicklung, sowie den Ex-Führungskräften/leitenden Entwicklern Carsten N. und Zaccheo Giovanni Pamio mussten bereits zahlreiche Führungskräfte das Unternehmen verlassen. Ob Stadler von den Manipulationen Kenntnis hatte oder daran beteiligt war, ist (Stand Februar 2020) Gegenstand diverser Ermittlungen. Stadler wird allerdings von ehemaligen Managern teils erheblich belastet. Zudem gibt es zahlreiche Hinweise, dass der Abgasskandal des VW-Konzerns bei Audi seinen Ursprung hatte.