С февраля 1942 года состоял в распоряжении ГУК НКО, затем в марте был направлен в САВО на формирование 412-й стрелковой дивизии. В апреле ее формирование было отменено, а полковник Бородкин в мае назначен командиром 11-й мотострелковой бригады этого же округа. В июле 1942 года бригада убыла на Западный фронт, где была включена в 10-й танковый корпус. В августе в его составе участвовала в отражении ударов противника на левом фланге 16-й армии. С января 1943 года бригада вместе с корпусом вела бои на Юго-Западном фронте, в составе подвижной группы генерала М. М. Попова участвовала в Ворошиловградской наступательной операции. С марта по июль 1943 года бригада в составе корпуса находилась в резерве Ставки ВГК, затем убыла на Воронежский фронт. В составе 47-й и 40-й армий участвовала в Курской битве, Белгородско-Харьковской наступательной операции, в освобождении города Тростянец. С 23 октября по 28 ноября 1943 года Бородкин находился на лечении в санатории «Архангельское», затем состоял в распоряжении ГУК НКО.