Sein Sohn mit Anna von Rabenhaupt ("Robenhaupt von Sucha/Robmhap ze Suché") war der noch in Mähren geborene Sebastian Schaffalitzky von Muckadell (1551–1624). Er kam zu Herzog Ludwig von Württemberg, diente zunächst auf spanischer Seite in den Niederlanden und nahm an dem Krieg zwischen Spanien und Portugal teil. Darauf kam er wieder nach Württemberg und wurde zum Obervogt des Zabergaus mit Sitz in Brackenheim ernannt, später auch zum Inspektor aller Festungen in Württemberg. Durch Kauf wurde er 1590 Gutsherr auf Freudental bei Besigheim.