1870年（明治3年）～1871年（明治4年）築地海軍兵学校教官。1872年（明治5年）工部省に転じ1873年（明治6年）ウィーン万国博覧会開催に際し、出品目録諸著書編集係として同地へ派遣された。欧州諸国を巡り、帰国後、キリスト教に傾倒して洗礼を受ける。津田仙の経営する学農社にてジュリアス・ソーパーの説教にあずかっていた。1874年（明治7年）明六社に加入。キリスト教の博愛精神から、当時、日本に多かった目の不自由な人の教育施設の必要性を説き、1875年（明治8年）津田仙らと共に楽善舎を組織、盲聾唖者の教育を発起し中村敬宇、岸田吟香、山尾庸三、ヘンリー・フォールズらと日本最初の盲学校といわれる東京盲亞学校（現筑波大学附属視覚特別支援学校）の前身・訓盲院を創設した。これが日本の特別支援教育の始まりである。また1875年（明治8年）私学錦裔塾を開き、のち耕教学舎と改称、これは現在の青山学院大学の源流の一つとなっている。2008年に慶應義塾が刊行した『慶應義塾史事典』の「古川正雄」の項目には、「明治8年3月、神田錦町に錦裔塾（弘道学舎、耕教学舎を経て、現青山学院の源流の一つとなる）を設立し、英語教師として宣教師ジュリアス・ソーパーを招いた」と書かれている。ところが青山学院大学の五十年史では「耕教学舎はジュリアス・ソーパーが設立した」（3頁）、「耕教学舎はジュリアス・ソーパーらが設立した」（707頁）と書かれており、青山学院大学の公式ホームページの沿革（青山学院の歩み）でも「ソーパーを中心に築地に開校された耕教学舎」、「ソーパーのいた説教所に古川正雄の一族が入信してきて、津田一家と彼らの協力によって耕教学舎が設立された」などと書かれている。古川が設立しソーパーを招いた塾の後身学校に「古川正雄の一族が入信してきた」という記述は妙に思える。