Im Sommer 2009 verließen schließlich die Torhüter Leo Franco und Grégory Coupet Atlético Madrid, sodass die "Colchoneros" aus der spanischen Hauptstadt die Rückkaufoption des Vertrages zogen und Roberto mit einem Dreijahresvertrag ausstatteten. Jedoch verblieb er weiter in der Reservistenrolle, zu dieser Zeit hinter dem spanischen Torhütertalent Sergio Asenjo. Nur als dieser zur U-20-WM 2009 nach Ägypten berufen wurde, kam Roberto zu ein paar wenigen Einsätzen. Kurze Zeit später drang in den Reihen Atléticos sogar ein weiteres Torwarttalent, David de Gea, vor und Roberto sah sich nun als dritte Wahl auf seiner Position. Mit dem Hauptstadtclub konnte er in der Saison &lt;a href="UEFA%20Europa%20League%202009/10"&gt;2009/10&lt;/a&gt; die unter diesem Namen erstmals stattfindende UEFA Europa League gewinnen.