敌对行动中止后，库珀所在部队的占领区有约30万被纳粹带到德国充当奴隶的难民，库珀为这些希望返回家园的人们提供法律建议。根据雅尔塔会议达成的协议，所有俄罗斯籍难民应遣返回苏联，但苏方认为，这份协议只对俄罗斯籍难民适用，那些非俄罗斯籍的配偶和后代不能据此前往苏联。库珀的报告引起巴顿将军注意，后者因此下令第3集团军占领区内的难民无须遵从遣返令，库珀还因此获得第3集团军的军政府表彰。为了取缔所有纳粹官员的职务，德国巴伐利亚的239个法院都在库珀的监督下重组，为此他获得了一枚铜星勋章。在此期间上任的法官包括之后成为巴伐利亚总理的威廉·霍格纳（），以及之后当上德国总理的路德维希·艾哈德。