Poco dopo la Caduta di Costantinopoli nel 1453, Hayrettin Effendi, "Sancaktar" (alfiere) del Sultano Mehmed II, trasformò l'edificio in una "Mescit" (oratorio) e venne sepolto qui. Gli statuti della Waqf (Fondazione) corrispondente non sono però giunti sino a noi. Il grande terremoto del 1894, che ebbe il suo epicentro sotto il Mar di Marmara, distrusse parzialmente la moschea, che è stata ripristinata solo tra il 1973 e il 1976.