En 1992, à la suite de la chute de l'Union soviétique, c'est la Fédération de Russie qui prend le contrôle de la majeure partie des VVS (environ 50 % des aéronefs et 65 % du personnel). Depuis, elles ont pris part à la Première guerre de Tchétchénie (1994-1996), à la Seconde guerre de Tchétchénie (1999-2002), à la Deuxième Guerre d'Ossétie du Sud (2008) et à la guerre de Syrie (2015).