Aurélien Raphaël commence la natation à l'âge de 5 ans, l’athlétisme deux ans plus tard, puis s'entraîne au triathlon dès l'âge de 10 ans. Son autre passion qu'il partage avec sa sœur est la pâtisserie, profession pour laquelle il suit une formation de quatre ans à l’école hôtelière d’Étiolles où il obtient un bac pro hôtellerie restauration option pâtisserie. En triathlon, il devient champion d'Europe juniors en 2006 et champion du monde juniors en 2007 avant d'intégrer l'École interarmées sports de Fontainebleau en février 2008.