বাথ পার্টি ইরাকে ক্ষমতা গ্রহণ করলে নতুন সরকার কুর্দি বিদ্রোহের অবসান ঘটাতে কুর্দিদের তাদের নিজস্ব সীমিত স্বায়ত্তশাসন প্রদান করে। তবে, ১৯৮০-এর দশকে ইরান-ইরাক যুদ্ধের সময় কিছু কুর্দিদের ইরানপন্থী সহানুভূতি সহ বিভিন্ন কারণে, এই শাসন ব্যবস্থাটি কুর্দি-বিরোধী নীতি বাস্তবায়িত করে এবং একটি গৃহযুদ্ধ শুরু হয়। ১৯৮৭ সালের ২৯ শে মার্চ থেকে ১৯৮৯ সালে ২৩ শে এপ্রিল পর্যন্ত কুখ্যাত আল-আনফাল অভিযানটি শুরু হয়, ইরাকের কুর্দি জনগণের উপর সুসম্বদ্ধ গণহত্যা চলে। এর জন্য আন্তর্জাতিক সম্প্রদায় দ্বারা ইরাককে ব্যাপকভাবে নিন্দা জানায়, কিন্তু কুর্দিদের বিরুদ্ধে রাসায়নিক অস্ত্র ব্যবহার সহ অত্যাচারমূলক পদক্ষেপের জন্য কখনও গুরুতর শাস্তি দেওয়া হয়নি, যার ফলে হাজার হাজার মানুষ মারা যায়।