またシベリアはロシア帝国時代から流刑地であったが、ソ連もこれを踏襲し数多くのグラグ（強制収容所）をシベリアに作って多くの政治犯を送り込み、鉱山労働や森林伐採などをさせた。第二次世界大戦では独ソ戦（大祖国戦争）の前線となったヨーロッパ・ロシアやウクライナから多数の工場がシベリアへと疎開し、以後シベリアの人口は急速に拡大した。また、独ソ戦においてソ連が攻勢に転じるとドイツ軍など枢軸国軍の捕虜がシベリアの捕虜収容所に送られ、ソビエト参戦後に赤軍に捕らえられた日本兵も同じくシベリア抑留された。戦後の冷戦期もシベリアの大都市は軍需産業を中心にして大きくなっていった。