До осени 1991 года штат воссозданного Комитета составлял несколько человек, однако по мере ликвидации КГБ СССР, его полномочия и численность начали расти. В результате реорганизации КГБ СССР, начатой в августе 1991 года после провала выступления ГКЧП, в ведение КГБ РСФСР были переданы отдельные подразделения союзного КГБ, в частности: