Мог быть избран снова в 1938, однако, сославшись на американскую традицию ограничения в два президентских срока, заявил: «Я добровольно, против желаний моего народа, отказываюсь от переизбрания на этот высокий пост». Несмотря на это, в середине 1937 была запущена широкая избирательная кампания, прекратить которую заставил международный резонанс, вызванный резнёй гаитян, Трухильо заявил об «уходе на покой». Вместо него баллотировался и в 1938 одержал победу, оставаясь единственной кандидатурой в бюллетене, выбранный им в преемники 71-летний вице-президент Пейнадо, на пост вице-президента была предложена кандидатура . В действительности Трухильо сохранил всю власть в собственных руках, оставшись главнокомандующим и лидером партии. Пейнадо, в частности, приказав увеличить размер знака «Бог и Трухильо», скончался 7 марта 1940, и пост занял Тронкосо. С 1942 после избрания Рузвельта на третий президентский срок в 1940 Трухильо был дважды переизбран, увеличив срок пребывания на посту до пяти лет, и в 1952 под давлением Организации американских государств передал его своему брату Эктору. Несмотря на то, что Трухильо формально уже не был главой государства, в 1955 широко отмечалось 25-летие его правления, в честь чего были отчеканены золотые и серебряные памятные монеты с его изображением.