12 февраля 2015 года Карлос Альфредо Санчес дебютировал в составе сборной Гондураса, выйдя на замену в середине второго тайма гостевого товарищеского матча против команды Венесуэлы. Он также принял участие в трёх матчах Золотого кубка КОНКАКАФ 2017.