Durant la Seconde Guerre mondiale les Lipovènes furent très nombreux à résister aux Allemands (ils ont coulé des patrouilleurs sur le Danube, abrité des Juifs en fuite, participé à la Résistance roumaine et aux partisans soviétiques), mais ils reprirent cette résistance après la guerre contre les régimes communistes soviétique et roumain, et plus de la moitié d'entre eux fut déportée (ceux d'Ukraine au Goulag, ceux de Roumanie dans la plaine du Bărăgan), soumis au même genre de travaux forcés.