В 1990 году началась военная операция международной коалиции против Ирака, что поставило власти Судана в неудобное положение. Официально Хартум объявил о своём нейтралитете, однако продолжил симпатизировать иракским властям в знак многолетней дружбы. Отказ Судана вступить в антииракскую коалицию возмутил власти Саудовской Аравии, которые в ответ заморозили программы экономической помощи этой стране, а также негативно отреагировал Египет, который стал оказывать помощь противникам режима Омара аль-Башира. После того, как Совет революционного командования по национальному спасению Судана направил заместителя лидера Национального исламского фронта на конференцию в Багдад, которую в январе 1991 года организовал президент Ирака Саддам Хусейн, Египет отозвал своего посла из Хартума. Усилия Совета революционного командования по национальному спасению Судана по поддержанию тесных отношений с Ираком привели к региональной изоляции Судана.