En calidad de diputado se encontraba en Madrid, el 18 de julio de 1936, lo que sin duda le salvó la vida, ya que, tras el triunfo del levantamiento militar, fueron represaliados la mayoría de los miembros de su familia. La guerra civil española representó para Labín una tremenda tragedia familiar ya que, apenas iniciada, fueron ejecutados dos de sus hijos y el futuro marido de una de sus hijas, todos ellos militantes socialistas.