En 1915, les autorités russes suppriment le "numerus clausus" qui limitait le nombre d'étudiants juifs, ce qui entraîne une multiplication du nombre de cellules locales de "HeHaver". Fisher participe au congrès illégal des sionistes russes qui se tient à Moscou cette même année, les participants votent la neutralité du mouvement dans la Première Guerre mondiale. Peu de temps après, Fisher est arrêté lors d'une réunion à Odessa où il devait faire un compte-rendu du congrès. Emprisonné, il est ensuite condamné à l'exil dans le gouvernement d'Irkoutsk en Sibérie centrale, à Nijneoudinsk, petite localité située sur le parcours du transsibérien. Après un an et demi en Sibérie, il est libéré à l'occasion de la révolution de Février 1917 qui marque la fin de l'Empire russe.