Nach vorübergehender Deaktivierung übernahm Metternich am 19. November 1915 das Amt des deutschen Botschafters im Osmanischen Reich. Dort versuchte er erneut einen mäßigenden Einfluss auszuüben. Seinen Versuchen, die brutale Armenierpolitik der Pforte zu bremsen bzw. die deutsche Regierung durch seine Eingaben dazu zu veranlassen, ihren Einfluss auf die Regierung in Konstantinopel zu nutzen, um diese zu einer Mäßigung zu veranlassen, waren indes kein Erfolg beschieden. Nachdem der Reichskanzler ihm keine Unterstützung zuteilwerden ließ und die türkische Regierung sich zunehmend verstimmt über seine Interventionsversuche zeigte, wurde Metternich schließlich am 3. Oktober 1916 von seinem Posten abberufen.