Жёсткую критику Марио Сандоваля Аларкона вызвала позиция США при свержении диктаторского режима Анастасио Сомосы в Никарагуа в июле 1979 года. Сандоваль Аларкон решительно поддерживал Сомосу. Когда гватемальское правительство под влиянием администрации Картера попыталось запретить посадку самолёта Сомосы, Сандоваль Аларкон с отрядом боевиков прибыл в аэропорт, добился разрешения на посадку и на несколько дней принял Сомосу в своём доме.