W reprezentacji Albanii Kapllani zadebiutował 31 marca 2004 roku w wygranym 2:1 towarzyskim meczu z Islandią. 2 czerwca 2007 roku w wygranym 2:0 pojedynku eliminacji Mistrzostw Europy 2008 z Luksemburgiem strzelił pierwszego gola w kadrze.