Le traité d'Amiens, du , qui met fin à la période de guerres commencées en 1792, comporte une clause qui prévoit la restitution à l'ordre de son territoire de Malte ; mais elle ne va pas être respectée, du fait de la reprise en de la guerre entre la France et l'Angleterre. Le grand maître Tommassi installe les décombres de l'Ordre à Messine en Sicile, puis à Catane en Italie, en attendant la possibilité de se reconstituer à Malte.