A finales del siglo XIX existía el vicariato patriarcal de Deir ez-Zor y el noreste de la actual Siria era parte de la archieparquía de Mardin. A principios del siglo XX, los armenios católicos del Imperio otomano sufrieron el mismo destino que el resto de la nación armenia con el genocidio perpetrado en el Estado turco desde 1915 a 1923. Los fieles armenios se dispersaron en áreas vecinas como Siria, en donde en parte se concentraron en la ciudad de Qamishli (fundada por asirios que huían del genocidio "circa" 1920). Como la archieparquía de Mardin (que incluía partes de Irak, Turquía y de Siria) quedó vacante y destruida por el genocidio, los archieparcas de Alepo administraron los territorios de la archieparquía en Siria hasta que el vicariato patriarcal de Qamishli fue creado en 1938. El vicariato fue confiado al obispo Guregh Zohrabian.