En 1641 va iniciar-se una guerra civil a Irlanda. A l'illa la situació era molt inestable. El pontífex va escoltar els consells del franciscà Luca Wadding. Va ser Wadding qui va suggerir a Innocenci X el nom del nou nunci apostòlic: Giovanni Battista Rinuccini. Rinuccini va arribar a l'illa el de novembre de 1645; mentrestant, des de Roma, va enviar armes i municions a les tropes de la Confederació de Kilkenny.