W reprezentacji Belgii Johny Thio występował w latach 1965–1972. W 1972 uczestniczył w mistrzostwach Europy. W turnieju finałowym rozgrywanym w Belgii był rezerwowym i nie wystąpił żadnym meczu. Ogółem w reprezentacji Belgii rozegrał 18 spotkań i strzelił 6 bramek.