Pablo Orbaiz begann seine Karriere beim größten Verein seiner Heimatstadt Pamplona, dem CA Osasuna. Nach vier Jahren in der ersten Mannschaft des Teams aus der inoffiziellen baskischen Hauptstadt ging es 2000 für Orbaiz zum renommierten Athletic Bilbao – ein Jahr nachdem er mit der spanischen U20-Nationalmannschaft die U-20-WM gewinnen konnte. In elf Jahren bei Athletic kam er auf 264 Ligaspiele und zehn Tore.