La Guerra de la Tercera Coalición llegó demasiado pronto para Austria, que se movió contra Francia en septiembre de 1805. Derrotada en la batalla de Austerlitz el 2 de diciembre de 1805, Austria tuvo que aceptar los términos dictados por Napoleón en la Paz de Pressburg. Estos crearon ambigüedades deliberadas en la constitución imperial. A Baviera, Baden y Württemberg se les concedió la "plénitude de la souveraineté" (soberanía total) sin dejar de ser parte de la "Conféderation Germanique" (Confederación Germánica), un nombre novedoso para el Sacro Imperio Romano Germánico. Asimismo, no quedó deliberadamente claro si el Ducado de Cleves, el Ducado de Berg y el Condado de Mark —territorios imperiales transferidos a Joachim Murat— seguirían siendo feudos imperiales o pasarían a formar parte del Imperio francés. En marzo de 1806, Napoleón no estaba seguro de si debían permanecer nominalmente dentro del Imperio.