С июня 1941 года Чванов В. Т. участвовал в боях Великой Отечественной войны. Уже в первый день войны выполнил боевой вылет при обороне Лиепаи, где базировалась эскадрилья. Там же 25 июня при атаке танковой колонны уничтожил 2 танка, при этом тихоходный гидросамолёт получил множественные повреждения от зенитного огня. Начал войну лётчиком-наблюдателем на самолёте МБР-2, выполнил на нём 90 боевых вылетов. Участвовал в Прибалтийской стратегической оборонительной операции и в обороне Ленинграда. В первую военную зиму совершал по 4-5 боевых вылетов за ночь.