Des opérations militaires sont donc menées par le corps expéditionnaire français contre les dissidents tenant l'État d'Oaxaca afin de permettre la construction d'une route carrossable pour les convois. Le , après de rudes combats, Bazaine parvient à s'emparer d'Oaxaca, mais les chefs des guérillas se réfugient dans les montagnes, d'où il est presque impossible de les expulser. Le caractère incomplet de la prise de la province d'Oaxaca se reproduira presque partout au Mexique : dans les États de Michoacán, de Sinaloa et dans la Huasteca.