Allerdings wurde er am 7. September 1947 erneut Ministerpräsident und bildete als solcher eine Koalitionsregierung zwischen seiner Liberalen Partei und der Volkspartei. Der Griechische Bürgerkrieg fiel großteils in seine Amtszeit. Während des Krieges überzeugte er auch Alexandros Papagos zur Rückkehr als Armeegeneral. Er starb am 24. Juni 1949 im Amt, wenige Monate vor dem Ende des Bürgerkrieges am 9. Oktober 1949.