Er war seit 1575 Ritter des Hosenbandordens. Am 8. Juli 1585 wurde Howard zum Lord High Admiral ernannt. Ein Jahr später war er am Prozess gegen Maria Stuart beteiligt. 1587 wurde er zum Commander-in-Chief der englischen Flotte, die gegen die spanische Armada aufgeboten wurde, ernannt, obwohl er dann nicht direkt am Kampf gegen die Spanische Armada (Seeschlacht von Gravelines) beteiligt war. Sein Flaggschiff war die "Ark Royal". 1596 befehligte er zusammen mit Robert Devereux, 2. Earl of Essex, die Expedition, die Cádiz plünderte. Im Juli 1597 wurde er Oberrichter ("Chief Justice") in Eyre südlich des Trents. Am 22. Oktober 1597 wurde er in Anerkennung seiner Verdienste zum Earl of Nottingham erhoben. 1601 war er verantwortlich für die Niederschlagung der Essex-Rebellion. 1624 starb Howard im Alter von 88 Jahren.