Le FK36(r) et le PaK 36(r) ont vu le combat sur le Front de l'est et en Afrique du Nord. Le premier emploi du FK 36(r) a été noté dès le mois de à Bir Hacheim en Libye ; et, en , 117 sont référencés dans les effectifs de l'Afrika Korps. Le canon sera utilisé jusqu'à la fin de la guerre dans le rôle d'antichar et de pièce d'artillerie de campagne : en , la Wehrmacht possédait encore 165 Pak 36(r) et Pak 39(r).