Beim Tod des Vaters, der 1597 im Türkenkrieg im ungarischen Raab den Tod fand, war Frebonie erst ein Jahr alt. Sie hatte noch die ältere Schwester Anna und eine jüngere Schwester Eva, die jedoch im Kindesalter starb. Erbe der väterlichen Besitzungen wurde ihr älterer Bruder Vratislav Eusebius. Da alle vier Geschwister noch klein waren, standen sie zunächst unter der Vormundschaft ihrer Mutter. Weil jedoch eine testamentarische Verfügung zur Vormundschaft nicht bestand, wurde diese 1603 gerichtlich an ihre Tante Polyxena übertragen, die eine verwitwete Schwester ihres Vaters war. Trotzdem standen die Kinder weiterhin unter der Obhut ihrer Mutter, die sich 1606 in zweiter Ehe mit Bruno von Mansfeld verheiratete. Danach lebten Frebonie und ihre Geschwister vermutlich in Wien.