Vuonna 2003 Ndereba voitti Sapporon puolimaratonin ja MM-kisojen maratonin kultamitalin. Seuraavana vuonna hän voitti Bostonin maratonin ja sijoittui Ateenan olympialaisissa toiseksi. 2005 hän voitti jälleen Bostonin maratonin. Samalla hänestä tuli ensimmäinen nainen, joka on voittanut juoksun neljään kertaan. Helsingin MM-kisoissa hän sijoittui hopealle, ja voitti maailmanmestaruuden 2007.