Später war Matošić mehrfach als Trainer sowohl von Hajduk als auch dem Lokalrivalen RNK Split tätig. 1960 stieg er mit RNK in die erste Liga auf. Zwischen 1961 und 1963 war er als Nachfolger seines Landsmanns Milan Kristić Auswahltrainer der tunesischen Nationalmannschaft, beim Afrika-Cup 1962 belegte die Mannschaft unter seiner Leitung den dritten Platz.