Nach dem Krieg kam es zu einer Militärkonvention zwischen Preußen und Sachsen-Altenburg. Am 25. September 1867 wechselte Etzdorff daher in die preußische Armee und kam als Kompaniechef in das 33. Infanterieregiment. Als solcher nahm er am Deutsch-Französischen Krieg teil. Vom 19. Oktober 1870 bis zum 30. September 1871 war er Kommandeur des I. Bataillons. In der Schlacht bei Gravelotte wurde er durch einen Schuss durch den rechten Oberarm und durch die Brust schwer verletzt. Dafür erhielt er am 18. August 1870 das Eiserne Kreuz 2. Klasse.