Les difficultés des temps ne permettant pas que le roi l’envoie à Rome, il décida de s’y rendre à ses frais, en 1695, mais, au bout de six mois, il fut admis au nombre des pensionnaires du roi. il dessina beaucoup, principalement d’après Raphaël. En 1700, il quitta Rome après avoir vu faire l’ouverture du grand jubilé séculaire et, de retour à Paris, l’Académie l’agréa le , en lui faisant la distinction de le dispenser de certifier par acte de son pays, comme y étaient tenus, suivant la délibération du , tous les candidats étrangers. Le 25 aout 1704, il fut reçu académicien avec, comme morceau de réception, un tableau sur l’Espagne offrant la couronne à Philippe de France, duc d’Anjou. Le choix de ce sujet ne devait rien au hasard car, durant son séjour à Rome, Favanne était devenu l’ami de Jean Bouteroue d’Aubigny, secrétaire de la princesse des Ursins. Cette dernière ayant juste été rappelée en Espagne, l’année suivante, Bouteroue fit venir son ami à la cour de Madrid où il réalisa divers ouvrages de marque. Ses dix années de séjour à Madrid ou à l’Escurial allaient donner à Favanne l’occasion d’être la victime des rivalités entre les tenants de l’ancienne dynastie Habsbourg et la nouvelle dynastie Bourbon instaurée en 1700 à l’issue de la guerre de Succession.