В январе 1995 года в Кобе произошло крупнейшее землетрясение. В июне Нагасима перешел в клуб «Виссел Кобе», чтобы поддержать город и население, переживших бедствие. С его помощью в 1996 году клуб занял 2-е место в японской футбольной лиге и вышел в Джей-лигу. Нагасима провел за клуб 138 матчей, забил 67 мячей и закончил игровую карьеру в 2000 году.