Anschließend wechselte Pacthod in die Armée d'Italie und zeichnete sich bei Raab (14. Juni 1809) und Wagram (5./6. Juli 1809) aus. Weitere Höhepunkte seines militärischen Lebens waren die Kämpfe bei Bautzen (20./21. Mai 1813) und Hoyerswerda (27. Mai 1813); ein Tiefpunkt war die Niederlage in der Schlacht an der Katzbach (26. August 1813), als seine Division sich zur Flucht auflöste und deren Reste gefangen genommen wurden. In der Völkerschlacht bei Leipzig kommandierte er die 10. Infanteriedivision im 5. Corps von Général de Lauriston. In der Schlacht bei Fère-Champenoise (25. März 1814) wurde er zusammen mit General François Pierre Amey gefangen genommen.