Blatche asistió al Instituto South Kent en South Kent, Connecticut, y dio el salto a la NBA directamente desde el instituto, siendo seleccionado por Washington Wizards en el Draft de la NBA de 2005 en la 49.ª posición de la segunda ronda, aunque todas las predicciones apuntaban a que sería elegido en primera ronda. Antes de asistir a South Kent, Blatche pasó cuatro años en el Instituto Henninger en Syracuse, New York, donde promedió 25 puntos, 18 rebotes y 8 tapones, liderando a su equipo a un balance de 25-0. En South Kent sus números fueron de 27.5 puntos, 16 rebotes y 6 tapones en los cinco años que estuvo allí, y guió al conjunto a un récord de 32-9.