В правление короля Лондон постигли две катастрофы: Эпидемия чумы, унесшая жизни более 100 000 человек. Король с семьёй покинул Лондон и уехал в Оксфордшир, когда чума спала двор вернулся в феврале 1666 года, а Великий лондонский пожар в сентябре 1666 года уничтожил большую часть города, король с братом помогали в тушении пожара, но при этом пожар уничтожил чумных крыс и блох. Король способствовал восстановлению города и помощи погорельцам, была осуществлена раздача продовольствия.