В 1873 году во время Хивинского похода часть Аральской флотилии была направлена в устье Амударьи. Однако эта экспедиция не принесла ожидавшейся от неё пользы. Этим ограничилась роль флотилии в военных действиях в Средней Азии. Не более успешна была и другая отрасль деятельности Аральской флотилии — перевозка военных грузов и людей. Благодаря глубокой осадке пароходов и слабым паровым машинам, мелководью и изменчивости фарватера Сырдарьи, рейсы пароходов носили случайный характер, требовали много времени и обходились дорого. Перевозки эти производились между Казалинском и Чиназом, а с 1873 года — между Казалинском и Петро-Александровском. Путь на пароходе от Чиназа до форта Перовского в среднем занимал 8—14 дней, обратно около 12—20 дней, при этом движение проходило только днём. От форта Перовского до Казалинска вниз — 4—6 дней, а вверх — 6—12 дней.