Durante el ministerio de Georges Clemenceau, en 1917, fue cada vez más marginado de los asuntos políticos: creía que el armisticio había llegado demasiado pronto y que el ejército francés debería haberse adentrado aún más en Alemania. En la Conferencia de Paz de París y en las negociaciones del Tratado de Versalles quería que la zona alemana de Renania fuese puesta bajo control militar aliado. Poincaré escribió un memorándum a la conferencia, diciendo que durante la guerra franco-prusiana Alemania había ocupado militarmente varias provincias francesas, las cuales no evacuó hasta que recibió la totalidad de las indemnizaciones, en tanto que Francia reclamaba reparaciones por el daño causado.