Nel 1987 il tedesco passò alla di Dino Viola, che se lo aggiudicò per 5,5 miliardi di lire. La prima stagione in Italia, con Nils Liedholm in panchina, non fu molto positiva per l'attaccante a causa di vari infortuni che ne frenarono il rendimento sottorete, fino a costringerlo all'operazione; inoltre, pur venendo difeso dal presidente, fu vittima di varie critiche da parte dell'ambiente. Le cose cominciarono a cambiare dall'annata successiva, che seppure non globalmente positiva per la squadra, vide l'attaccante chiudere a quota 10 reti, compresa quella della vittoria per 1-0 nel derby di andata contro la . Nella stagione 1989-1990, con l'arrivo in panchina di Luigi Radice, Völler toccò quota 14 gol in campionato, contribuendo al raggiungimento della semifinale di Coppa Italia.