Nadat hij een overwinning had behaald tegen de Atheense admiraal Conon moest Callicratidas het opnemen tegen een grote vloot die gezonden was om Conon te helpen. Het kwam tot een treffen bij Arginusae in 406 v.Chr. Zijn vloot kreeg zware verliezen te verduren, verloor de slag en Callicratidas zelf werd gedood. Na zijn dood keerde Lysander terug uit Sparta om zijn positie als navarch weer in te nemen.