Im Mai 1945 wurde er von den Japanern interniert. Am 10. September 1945 geriet er in US-amerikanische Internierung und war zunächst zusammen mit japanischen Politikern und Militärs im Sugamo-Gefängnis inhaftiert. Stahmer wurde unter anderem zum Zustandekommen des Drei-Mächte-Paktes von den Amerikanern verhört. Bei den Tokioter Prozessen musste er als Zeuge vor Gericht aussagen. Im September 1947 traten er und seine Frau auf einem Truppentransportschiff zusammen mit anderen Ausgewiesenen die Rückreise nach Deutschland an. In Deutschland war er noch bis Ende September 1948 interniert.