Efter den tyske invasion i juni 1941 blev Kommuna flyttet til Kronstadt, hvor den, på trods af de omfattende bombardementer, forrettede tjeneste igennem belejringen af Leningrad. I marts 1942 bjærgede Kommuna fire KV kampvogne, to traktorer og 31 andre køretøjer der var faldet igennem isvejen "Livets Vej" på Ladoga-søen, som var Leningrads eneste forsyningsrute under den tyske belejring. Samme år reparerede besætningen på Kommuna også seks M-klasse ubåde, hævede undervandsbåden 411 (Shchuka-klassen), slæbebåden Austra, skonnerterne "Trud" og "Vodoley-2" samt flere andre fartøjer. I februar 1943 blev Kommuna sendt til Volga hvor man hævede slæbebåden "Ivan" og et Iljusjin Il-2 fly. I 1944 hævede Kommuna i alt 14 vrag på i alt 11.767 ton, og reparerede i alt 34 andre skibe.