Die Bewohner von Vakıflı sind die Nachkommen jener Armenier, die dem Völkermord 1915 entkamen und am nahegelegenen Musa Dağı Zuflucht fanden. Sie wehrten 53 Tage lang die Angriffe der türkischen Truppen ab, bis die französischen Seefahrer eine Fahne mit der Aufschrift „Christen in Not: Retten“ sahen. Die armenischen Flüchtlinge wurden von den Franzosen in die ägyptische Hafenstadt Port Said evakuiert. Nach der französischen Besetzung der Türkei 1918 kehrten die armenischen Flüchtlinge wieder in ihre sieben Dörfer in die Provinz Hatay zurück. Nach dem Friedensvertrag zwischen der Türkei und Frankreich am 29. Juni 1939 wurde der Staat Hatay an die Türkei angegliedert und sechs der sieben Dörfer wurden entvölkert. Die Hälfte der Bewohner von Vakıflı verließ das Dorf. Die Dorfbewohner immigrierten vor allem in den Libanon und ließen sich überwiegend in Anjar nieder. Das moderne Anjar wurde 1939 mit Unterstützung der französischen Kolonialmacht von mehreren tausend armenischen Flüchtlingen vom Musa Dağı gegründet. Die sechs Ortsteile sind nach den sechs Dörfern (Haji Hababli, Kabusia, Vakif, Khodr Bek, Yoghun Oluk und Bitias) des Musa Dağı benannt. 2011 lebte in Vakıflı noch der 97-jährige Avedis Demirci, der als Baby den Widerstand vom „Mosesberg“ miterlebte.