Durante l'assedio di Genova del 1747, come molte chiese dell'entroterra genovese subì danni e saccheggi da parte delle truppe austriache, ma non esistono rapporti dettagliati sull'entità di questi danni. Tuttavia una nuova importante ristrutturazione, quasi una ricostruzione, fu eseguita tra il 1760 e il 1771; tra il 1830 e il 1840, grazie anche alla collaborazione dei ricchi villeggianti che nel frattempo avevano iniziato a frequentare Geminiano, fu costruito il campanile.