W okresie Muromachi Izumo i Oki znajdowały się pod kontrolą klanu Kyōgoku. Jednak po zakończeniu wojny Ōnin klan Amago rozszerzył swoje wpływy poprzez zamek Gassan-Toda. W 1566 r. Motonari Mōri zdobył: Izumo, Iwami i Oki. Jednak po 30 latach wpływów w 1600 r. w wyniku bitwy pod Sekigaharą utracił je na rzecz Yoshiharu Horio. Zaraz po zwycięstwie Horio zadecydował o budowie zamku Matsue, który ukończono tuż po jego śmierci. W 1638 r. wnuk Ieyasu Tokugawy, Naomasa Matsudaira, przejął władzę w momencie, gdy klan Horio nie miał już przywódcy. Rodzina Matsudairy rządziła, aż do zniesienia systemu "hanów". W XVII wieku rozpoczęto wydobycie srebra w kopalni Iwami Ginzan, aktualnie znajdującej się na liście światowego dziedzictwa UNESCO.