Являлся временным президентом Панамы с 1 сентября по 20 декабря 1989 года, до вторжения американских войск в Панаму. После этого генерал Мануэль Антонио Норьега Морено, правивший страной «де-факто», был свергнут и арестован, а Франсиско Родригес уступил свой пост Гильермо Эндаре как победителю ранее аннулированных выборов.