Dès le mois d'octobre 1991, Figo connaît sa première sélection en sélection A face au Luxembourg (1-1). Éliminé de la World Cup 1994 puis du Mondial 1998, il ne peut s'exprimer que lors de l'Euro 1996. Maître à jouer d'une sélection très technique, plaisante à regarder, il ne peut alors trouver devant lui un joueur capable de transformer ses passes en buts. Le Portugal atteint toutefois les quarts de finale de ce tournoi, éliminés par une surprenante équipe de république tchèque. Il atteint la demi-finale du Championnat d'Europe de football 2000 qu'il perd après prolongation contre l'équipe de France. Les lusitaniens se qualifient pour la coupe du monde 2002, compétition dont ils font partie des favoris au même titre que la France et l'Argentine. Mais a la surprise générale, aucune de ses trois formations ne passera le premier tour. Il participe aussi à la finale du Championnat d'Europe de football 2004 a domicile perdue 1-0 face à la surprise du tournoi, la Grèce. Figo passe pourtant tout près de l'égalisation en fin de match. À l'issue de ce match, Figo décide de prendre sa retraite internationale, tout comme Zidane et Pavel Nedved. Toutefois, a l'image des deux autres légendes du football, il revient sur sa décision environ un an plus tard pour disputer la coupe du monde 2006 en Allemagne, Il finit sa carrière internationale lors cette même Coupe du monde 2006, lors du match pour la troisième place contre le pays organisateur, après avoir perdu une nouvelle fois en demi finale contre la France, jusqu'alors véritable bête noire du Portugal.