Apatzingán wurde von den Spaniern um das Jahr 1617 gegründet; Mönche des Franziskanerordens trieben die Christianisierung voran. Während des Mexikanischen Unabhängigkeitskampfes (1810–1821) wurde in Apatzingán im Jahr 1814 von Mitgliedern des Kongresses die erste Verfassung Mexikos, die Verfassung von Apatzingán, geschrieben – daher der Beiname der Stadt. Die Erhebung zur Stadt erfolgte im Jahr 1883.