Per il campionato successivo la società cerca di rinnovare la rosa con l'obiettivo di ottenere una salvezza meno sofferta: i rinforzi principali sono Bonifazi, Missiroli, Fares e Andrea Petagna, acquistato dall' per una cifra complessiva di 15 milioni di euro. I biancazzurri iniziano la stagione con tre successi nelle prime quattro partite, a spese di , e : quest'ultima viene battuta proprio grazie a una doppietta dell'ex Petagna, che otterrà un bottino totale di 16 reti in campionato. Dopo quattro sconfitte, il 20 ottobre la SPAL espugna il campo della . Tuttavia, a tale buona partenza si contrappone una fase centrale del torneo difficile: dopo il successo ottenuto all'Olimpico cade a domicilio contro il e nei successivi scontri diretti casalinghi ottiene una serie di pareggi. Terminato il girone di andata con una sconfitta a San Siro contro il la squadra ferrarese si colloca a quota 17 punti, mantenendosi costantemente al di fuori della zona retrocessione ma palesando meno brillantezza rispetto alle fasi iniziali. Nel mercato invernale vengono ingaggiati il portiere Viviano e il centrocampista Murgia. La SPAL torna alla vittoria il 27 gennaio in casa del rimontando da 2-0 a 2-3, successivamente il margine sul terzultimo posto si assottiglia a causa di sei partite senza successi. In primavera gli estensi entrano in un periodo di forma ottimale, ottenendo sei vittorie in otto partite: al Paolo Mazza battono , e ; fuori casa superano , e : quest'ultima affermazione consente ai biancazzurri di salvarsi con tre giornate di anticipo, per poi concludere il torneo in tredicesima posizione a quota 42 punti. Nella stagione seguente, anche a causa di cessioni importanti come quella dell'esterno Manuel Lazzari, la squadra ferrarese non riesce ad ottenere la terza salvezza consecutiva, retrocedendo in Serie B con quattro turni d'anticipo.