No obstant això, el clima polític present durant aquella època deteriora progressivament la seva amistat. El cop d'estat de l'11 de setembre de 1973, encapçalat pel general Augusto Pinochet per a enderrocar al govern Unitat Popular de Salvador Allende, interromp de sobte la relació d'aquests tres amics. La direcció del Saint Patrick passa a les mans de l'Exèrcit de Xile, amb el conseqüent acomiadament del Pare McEnroe, l'expulsió de diversos alumnes i la militarització del col·legi.