Với màn trình diễn xuất sắc ở mùa giải 2013, HLV Hoàng Văn Phúc quyết định triệu tập thủ môn Nguyên Mạnh vào đội tuyển U23 Việt Nam đi tập huấn nước ngoài và dự SEA Games 27. Mặc dù thể hiện khá tốt trong những trận được bắt chính, tuy nhiên, Mạnh vẫn chỉ là sự lựa chọn thứ 2 trong khung gỗ của đội tuyển U23 Việt Nam sau người đàn em Trần Bửu Ngọc. Đáng tiếc hơn, ở SEA Games 27, Nguyên Mạnh không được bắt chính một trận nào và đội tuyển U23 Việt Nam đã phải về nước sớm.