Aganzo nam met Spanje deel aan het WK onder 20 in 1999, dat door Spanje gewonnen werd. Aganzo speelde op dat toernooi drie wedstrijden: een groepswedstrijd tegen Honduras, de achtste finale tegen de Verenigde Staten en de finale tegen Japan – telkens als invaller. Onder andere Xavi Hernández en Iker Casillas maakten toen ook deel uit van de selectie.