Екельські походили з Королівської Пруссії. На початку XVIII століття оселились у Кракові. Дід Адам Екельський (1760—1841) був синдиком міста Казімеж, пізніше адвокат у Кракові, засідатель сенату Вільного міста. Був одружений з Ядвігою з Лексицьких. Мав трьох синів: Євстахія (1804—1870), Александра (1806—1858) і Наполеона (1810—1891). Євстахій брав участь у листопадовому повстанні, а Наполеон — у краківському 1848 року. Обидвоє перебували в еміграції.