Det var oprindeligt placeret i Nihinbashi, et forretningsdistrikt i Tokyo, som blev ødelagt under det store jordskælv i 1923, Kantou-jordskælvet. Markedet blev 1935 flyttet til Tsukiji, hvor dele af det stadig ligger. Oktober 2018 flyttede fiskemarkedet i Tokio til et nyt sted i Toyosu.