Pépé recebeu sua primeira convocação em novembro de 2016. Pépé representou o elenco da Seleção Marfinense no Campeonato Africano das Nações, de 2017. Em 24 de março de 2018, em um amistoso contra o Togo, na França, Pépé marcou seu primeiro gol na primeira metade de um empate 2-2. Ele seguiu três dias depois com outro gol na vitória por 2 a 1 sobre a Moldávia.