Ptolemaios XV. Kaisarion nebyl vůbec uveden v Caesarově závěti. Po smrti Kleopatřina druhého bratra Ptolemaia XIV. se stal spoluvládcem své matky Kleopatry VII. Pozdější milenec a manžel Kleopatry VII., Marcus Antonius, je roku 44 př. n. l. uznal za právoplatné a jediné vládce Egypta. Antonius svým třem dětem, které měl s Kleopatrou, věnoval rozsáhlá římská území, což se nelíbilo Římu a byl to jeden z mnoha důvodů započetí války s Octavianem. Po porážce Kleopatry a Antonia v bitvě u Actia a jejich následné smrti v Egyptě nechal Octavianus Ptolemaia XV. Kaisariona v roce 30 př. n. l. zavraždit. Kaisarionovi bylo tehdy zhruba 17 let. Jeho nevlastní sourozenci, dva synové a dcera Marka Antonia a Kleopatry, byli odvezeni do Říma a vychováni Octavií, Antoniovou římskou manželkou (a Octavianovou sestrou). Dcera Kleopatry Kleopatra Seléné se v dospělosti stala numidskou královnou.