Во время событий 19-21 августа 1991 года Баранников был одним из главных организаторов обороны «Белого дома» и противодействия Государственному комитету по чрезвычайному положению (ГКЧП). Вечером 19 августа он разослал шифротелеграмму руководителям территориальных органов МВД РСФСР, которая требовала отказаться от участия в «антиконституционном перевороте», и отдал распоряжение о направлении для защиты российского руководства подразделений московского ОМОНа и курсантов милицейских школ.