En 2010, il est nommé par le maire de Paris Bertrand Delanoë président de l’Institut des cultures d'Islam avec pour projet de « dépolitiser l'islam ». En , lors de la Révolution tunisienne, il est contraint de démissionner à la suite de la révélation par "Mediapart" de deux « notes techniques » adressées à l'ex-dictateur tunisien Ben Ali pour une sortie de crise de la révolution en cours.