Les bassins de rétention des déchets métallurgiques stockent une partie (20 % environ) des boues issues du processus de fabrication (procédé Bayer). De 1966 à 2007, les boues ont été stockées dans une fosse marine ainsi que dans deux vallons à proximité de l'usine. À la suite de la catastrophe d'Ajka survenue dans une usine similaire en Hongrie à de Budapest le , la sécurité du stockage des boues a suscité l'inquiétude au regard du risque d'effondrement des digues, et de la pollution marine causée par les rejets dans la baie de Cassis.