9 серпня 1819 року Боготи дістались звістки про розгром місцевих військ у битві при Бояці. Самано втік до Картахени, яка, втім, відмовилась визнавати його владу (режим репресій зробив його дуже непопулярним). Він відплив на Ямайку, однак потім повернувся до Панами, що в той час входила до складу Нової Гранади, де, не маючи ані військової, ані адміністративної влади, помер, очікуючи на дозвіл повернутись до Іспанії.