בזמן מלחמת קונגו הראשונה, רבים מתושבי מבוגיי מאיי עמדו בתחילה לצידו של השליט מובוטו ססה סקו כנגד כוחות המורדים בהנהגת לורן קבילה. בין אפריל 1997 לאוקטובר 1998 הייתה העיר תחת שלטונות המורדים.