В качестве игрока юниорской сборной США Джон Гибсон участвовал в чемпионате мира среди юношей в возрасте до 17 лет 2010 года, показав на нём лучший результат по пропущенным шайбам за игру (1,33). Выиграв с американскими юниорами также чемпионат мира 2011 года (в возрастной категории до 18 лет) и став его лучшим вратарём, в следующие два года Гибсон защищал ворота молодёжной сборной США на чемпионатах мира в возрасте до 20 лет. На молодёжном чемпионате 2013 года Гибсон отразил 95,5 % бросков, завоевал с американской командой золотые медали и был признан лучшим вратарём первенства и его самым полезным игроком.