Jennifer Souza nahm mit der deutschen U-17-Nationalmannschaft an der U-17-Europameisterschaft 2015 in Mazedonien teil. Dort war sie im Spiel gegen Rumänien mit neun Treffern erfolgreichste deutsche Werferin und wurde nach der Partie zur besten Spielerin gewählt. 2018 spielte sie mit der U-20-Nationalmannschaft bei der U-20-Weltmeisterschaft in Ungarn.