С 1918 по 1940 год служил в эстонской армии. Участвовал в Эстонской освободительной войне. Позже служил военным представителем Эстонии за рубежом и дипломатом (в Литве (1919), Варшаве (Польша, 1919—1923), Париже (Франция, 1924—1925), Бельгии (1925—1929)). С 1929 по 1934 годы дважды служил офицером для поручений штаба армии и дважды — командиром отдельного пехотного батальона. В 1934—1939 годах служил комендантом города Таллин и одновременно командовал (), который занимался караульной службой таллинского гарнизона. В 1939—1940 гг. Юнкур командовал , продолжая быть комендантом города Таллин. В июле 1940 года оставил как должность командующего округа Харью, так и должность коменданта города Таллин.