1998 yılında Newell's Old Boys takımında profesyonel olan Bernardi, burada 75 maça çıktı ve üç gol attı. 2000 yılında Fransız takım Olympique de Marseille'ye transfer olan Bernardi, Marseille forması altındaki ilk maçına 3 Şubat 2001 tarihinde 1-0 kaybettikleri Auxerre maçında çıktı. Bernardi, Marseille formasını sadece sekiz kez giyebildi ve 2001 yılında Monaco'ya transfer oldu. Bernardi, Monaco forması altındaki ilk maçına 28 Temmuz 2001 tarihinde 1-0 kaybettikleri maçta Sochaux karşısında çıkarken; ilk golünü ise 29 Kasım 2003 tarihinde Nantes karşısında maçın tek golünü attı. 2002-03 sezonunda takımıyla Coupe de la Ligue'i kazandı. 2003-04 sezonunda ise UEFA Şampiyonlar Ligi'nde Ludovic Giuly, Fernando Morientes, Jérôme Rothen ve takımdaki diğer futbolcularla iyi maçlar çıkarttılar ve Monaco, Şampiyonlar Ligi'nde finale yükseldi. Ancak Monaco, finalde Porto'ya 3-0 kaybetti ve ikinci oldu. 2008 yılına kadar Monaco'da top koşturan Bernardi, 2008 yılında eski takımı Newell's Old Boys'a geri döndü.