La forte opposition à Balmaceda se concrétise quand le congrès n’approuve pas la loi du budget de l’année 1891. Balmaceda déclare, le janvier, qu’on prolongerait le budget de l’année précédente et que le Congrès ne se réunirait pas avant le mois de mars. Le même jour, le Congrès considère illégale l’attitude du président et déclare sa destitution. La marine se range aux côtés des parlementaires, tandis que l’armée déclare sa loyauté au président. Cette période marque le début de la guerre civile de 1891.