Per la sua seconda stagione in massima serie, nel 2017-2018, il Crotone conferma alla guida della squadra l'allenatore Nicola, mentre l'assetto societario cambia, con l'insediamento a nuovo presidente di Gianni Vrenna, in carica dal 23 marzo 2017, che rileva tutta la società, la promozione a direttore generale di Raffaele Vrenna jr. e la conferma del direttore sportivo Beppe Ursino, in carica da oltre 25 anni. Nel dicembre del 2017 l'allenatore Davide Nicola rassegna le proprie dimissioni. Gli subentra Walter Zenga, che ottiene la sua prima vittoria contro il Chievo Verona. A causa di alcuni risultati negativi nelle ultime giornate e anche di un calendario complicato, il Crotone, pur rimanendo in corsa sino all'ultima giornata, non riesce nella salvezza: il 20 maggio 2018, dopo la sconfitta per 2-1 al San Paolo contro il , retrocede in Serie B.