حصل على التأهيل للأستاذية عام 1993 - من لجنة برئاسة البروفيسور رينيه ريمون، رئيس معهد الدراسات السياسية بباريس، بما في ذلك الأساتذة إرنست جيلنر، وريمي ليفو، وآلان تورين، وأندريه ميكيل. تمت ترقيته إلى مدير الأبحاث في المركز الوطني الفرنسي للأبحاث عام 1995، وقضى العام الدراسي 1995-1996 في الولايات المتحدة كأستاذ كونسورتيوم في نيويورك (منصب مشترك في جامعتي كولومبيا ونيويورك والمدرسة الجديدة للبحوث الاجتماعية). استخدم مرافق المكتبة في جامعة نيويورك وكولومبيا لاستكشاف المصادر العلمية لكتابه الأكثر مبيعًا "الجهاد: توسع وانحسار الإسلاموية" استنادًا إلى عامين من العمل الميداني في العالم الإسلامي من إندونيسيا إلى إفريقيا، والذي صدر باللغة الإنجليزية في عام 2001 تحت عنون "الجهاد:في صميم الإسلام السياسي" ، وتُرجم إلى اثنتي عشرة لغة. على الرغم من الترحيب بالكتاب نظرًا لنطاقه ومنظوره، فقد تم انتقاده بعد 11 سبتمبر لأنه وثق فشل التعبئة الإسلامية السياسية في أواخر التسعينيات. أجاب كيبيل على منتقديه من خلال كتابه ""وقائع حرب شرقية" ، الذي نُشر بالإنجليزية بعنوان "ظهور قمر سيئ"" عام 2003. ثم قام بتحليل ذلك الفشل باعتباره نهاية لمرحلة أولى مما وصفه لاحقًا بـ"جدليات الجهادية"، التي لخصت الصراع ضد "العدو القريب"، تلتها مرحلة ثانية (القاعدة) تعلمت دروس هذا الفشل وركزت على "العدو البعيد"، الذي فشل بدوره في حشد جماهير المسلمين تحت راية من الجهاديين. وأعقب ذلك في النهاية مرحلة ثالثة تتكون من خلايا جهادية شبكية في أوروبا والشرق الأوسط وشمال إفريقيا، وهي تلك الخاصة بداعش. ثام كيبيل بتطوير ثلاثية الجهاد هذه بشكل أكبر في كتابيه "" "،" المنشور بالإنجليزية تحت عنوان "الحرب لكسب عقول المسلمين" عام 2004، و"الإرهاب والاستشهاد" عام 2008. شارك كيبل مع طلابه أيضًا في تحرير "القاعدة في نصوصها" عام 2006 - وهي ترجمة وتحليل لنصوص مختارة من قبل لمنظري الجهادية عبد الله عزام وأسامة بن لادن وأيمن الظواهري وأبو مصعب الزرقاوي.