У вересні 1918 року Казань обложили червоноармійці. Ленін наказав вибити білочехів будь — якою ціною — «Місто не шкодувати», — писав Ленін, і місто не шкодували: більшовики стріляли прямою наводкою по кремлю з гармат, встановлених на пагорбі порохового заводу — всі п'ять куполів собору були зруйновані прямими влученнями снарядів. Зовнішній вигляд було відтворено лише в ході реставрації собору в 1973—1984 рр., незадовго до перебудови.