После начала Великой Отечественной войны, к немецким оккупационным войскам примкнули отряды украинских националистов, принимавшие участие в карательных акциях против еврейского и польского населения, таких как, вероятно, и убийство львовских профессоров. В 1943—1944 годах, Украинская повстанческая армия приступила к массовому уничтожению этнически польского гражданского населения, что вошло в историю под названием Волынская резня. Её жертвами стали до 80 тысяч человек. В то же время, Армия Крайова жестоко расправлялась с жителями украинских деревень (Резня в Сахрыни, Павлокомская резня, резня в Горайце и другие). Взаимные этнические чистки поляков и украинцев, предшествовавшие наступлению Красной Армии, являются сегодня одним из наиболее спорных моментов польско-украинских отношений.