Thế chiến thứ 2 bùng nổ, trong tình hình mới Xứ ủy Bắc kỳ quyết định cho Đảng bộ Thái Bình tổ chức Đại hội Đại biểu Đảng bộ tỉnh. Đại hội Đại biểu Đảng bộ tỉnh được tổ chức từ ngày 21-23/12/1940, Đại hội đã bầu ra Tỉnh ủy mới với nhiệm vụ cách mạng mới. Trong giai đoạn 1940-1945 Tỉnh ủy nhiều lần bị giải tán rồi lại tiếp tục tái lập lãnh đạo phong trào cách mạng địa phương. Sau cách mạng tháng 8 và trước khi Pháp tấn công Thái Bình (2/1950), tỉnh ủy vừa tích cực ổn định phát triển địa phương vừa chuẩn bị lực lượng vũ trang chống quân đội Pháp tấn công.