Проєкт створення державної обсерваторії в Пруссії з'явився 1700 року, коли з ініціативи Лейбніца засновано Прусську академію наук, тим більше що в складі Академії був астроном (Готфрід Кірх). Але через мізерне фінансування академія довгий час була змушена використовувати невелику приватну обсерваторію в Берлінському передмісті. Тільки 1835 року почалося зведення спеціальної будівлі в районі Фрідріхштадт, за проєктом Карла Фрідріха Шинкеля. Першим директором нової обсерваторії став Йоганн Франц Енке (формально — від 1825 року). Він же керував випуском астрономічного журналу "«Berliner astronomisches Jahrbuch»."