В 1090 году город захватывают туркоманы Данишмендиды, переименовывают его в Сивас и провозглашают своей столицей. В 1172 году Себастию завоевывают турки-сельджуки, в 1400 году был захвачен и разграблен войсками Тамерлана. Позднее переходит под власть османских турок (1408) и эллинистическое влияние здесь заметно ослабевает. Несмотря на османское владычество, вплоть до Первой мировой войны и Геноцида армян большинство населения города и региона составляли армяне, из 166 крупных торговцев 141 был армянином, из 155 экспортеров — 125 армян, из 37 банкиров — 32 армянина, из 9 тыс. 800 ремесленников и мелких торговцев — 6 тыс. 800 и из 153 промышленных предприятий 130 принадлежали армянам.