Бизнес Ларреа продолжал успешно развиваться, и в 1808 году городской совет Буэнос-Айреса назначил его куратором военно-морского патруля, предназначенного для борьбы с контрабандой. Это дало Ларреа возможность продемонстрировать свои навыки и умения в области мореходства. Кроме этого Хуан Ларреа регулярно посещал встречи противников испанского владычества в Южной Америке и в 1809 году присоединился к . Восстание провалилось, однако революционно настроенные жители вице-королевства продолжали собираться с силами, и в 1810 году в ходе Майской революции вице-король Сантьяго де Линьерс был смещен со своего поста. Несмотря на то, что Ларреа не участвовал в открытых заседаниях городского совета Буэнос-Айреса, на которых определилось будущее вице-королевства, он был назначен членом Первой хунты — первого независимого правительства Аргентины.