Il continue de progresser et atteint les quarts de finale au Masters de Shanghai. Au championnat du monde de 2016, âgé de , McManus est l'invité surprise des demi-finales. Issu des qualifications, il élimine successivement Stephen Maguire (10-7), Ali Carter (13-11) et John Higgins (13-11), avant de s'incliner aux portes de la finale contre le Chinois Ding Junhui, par 17 manches à 11. Il s'assure ainsi un retour dans le top 20 ; le mieux qu'il ait fait depuis dix ans.