2003-ban Alonso jobban szerepelt Trullinál: az ifjú spanyol Malajziában megszerezte pályafutása első pole-pozícióját (Trulli második volt mögötte), majd a Hungaroringen első futamgyőzelmét is. Trulli legjobb eredménye hockenheimi harmadik helye volt. Az olasz 33 ponttal a világbajnokság nyolcadik helyén végzett, míg Alonso 55 ponttal a hatodikon.