Bij de aanslagen op 11 september 2001 was het 90 Church Street mee onderhevig aan de instorting van 7 World Trade Center in de late namiddag (23:20 uur Nederlands-Belgische tijd), het aanpalende gebouw ten westen van het postgebouw. De schade aan het gebouw bleef echter minimaal. Dit staat in een vaak schril contrast met enkele andere beroemde gebouwen in de omgeving zoals het Verizon Building, wat ongeveer een tijdgenoot is van het 90 Church Street.