Pomimo uszkodzeń i wysadzenia przez niemieckich saperów dzwonnicy, kościół przetrwał oblężenie Wrocławia w 1945. Od 1947 był użytkowany przez parafię starokatolicką we Wrocławiu. W latach 1947–1950 proboszczem tej parafii był zwierzchnik Polskiego Kościoła Starokatolickiego, Zygmunt Szypold.