По-късно колекцията е разпръсната между няколко руски библиотеки. Части от колекцията на Залуски се връщат в Полша през 1842 г. и 1863 г. През 20-те години на XX век след полско-съветската война и по силата на Рижкия договор правителството на Руската съветска федеративна социалистическа република връща на Полша 50 000 единици от колекцията. Те са умишлено унищожени от германските войници по време на Планираното разрушаване на Варшава през октомври 1944 г., след потушаването на Варшавското въстание. Само 1800 ръкописа и 30 000 печатни материала от оригиналната библиотека оцеляват след войната.