За национальную сборную Эмерсон провёл 73 матча и забил 6 мячей. Принимал участие в чемпионатах мира 1998 и 2006 годов, а победный для бразильцев турнир 2002 года пропустил из-за травмы, полученной за несколько дней до его начала&lt;ref name="ОСНОВНОЙ СОСТАВ / ЭМЕРСОН"&gt;&lt;a href="http%3A//acmilanfan.ru/season/squad/EMERSON/"&gt;ОСНОВНОЙ СОСТАВ / ЭМЕРСОН&lt;/a&gt;&lt;/ref&gt;.