Князь Андрей Иванович Хованский под командованием своего отца князя Ивана Андреевича участвовал в русско-польской войне 1654—1667 годов. В битве при Полонке в июне 1660 года он был ранен. Ратные люди, недовольные главным воеводой и его сыном, жаловались на их притеснения и развратный образ жизни. В июле 1675 года Андрей Иванович был назначен товарищем (заместителем) к своему отцу, находившемуся на воеводстве в Пскове.