Сын Бенджамина М. Эмануэля и Марши (Смулевиц) Эмануэль. Два младших брата — бывший мэр Чикаго Рам Эмануэль и известный голливудский агент по подбору актеров Ари Эмануэль. Дядя Иезекииля (брат отца), Эмануэль, был убит во время арабского восстания в подмандатной Палестине, после чего семья изменила свою фамилию с Ауэрбах на Эмануэль.