Im Bürgerkrieg, der 49 v. Chr. ausbrach, scheint Galba Caesar weiter gedient zu haben, da er erwartete, ein Konsulat zu erhalten, was ihm der Diktator aber verweigerte. Er schloss sich darauf der Verschwörung gegen Caesar an. Im Jahr 43 v. Chr., nach der Ermordung Caesars, diente er als Legat im Heer des Senats, das vor Mutina (jetzt Modena) in Oberitalien gegen Caesars Anhänger Marcus Antonius kämpfte. Galba befehligte die kampferprobte Marslegion und war mit ihr an der Schlacht von Forum Gallorum beteiligt, in der Antonius am 14. oder 15. April 43 v. Chr. eine Niederlage erlitt. Ein Brief Galbas, in dem er diese Schlacht schildert, ist in der Korrespondenz Marcus Tullius Ciceros erhalten.