С августа служил помощником командира эскадрона в составе 23-го партизанского отряда, который в декабре 1918 года вошёл в состав 1-го советского полка, уже в котором М. Э. Москалик служил красноармейцем и командиром взвода, а также принимал участие в боевых действиях на Южном фронте против войск под командованием А. И. Деникина. В первой половине 1919 года полк находился в группе Кочергина, а в период с августа по декабрь — в составе войск под командованием войск под командованием Н. И. Махно и вёл боевые действия в районе Екатеринослава и Никополя. 15 декабря 1919 года полк включён в состав 45-й стрелковой дивизии, а Москалик назначен на должность командира взвода конной разведки в составе 405-го стрелкового полка этой же дивизии. Принимал участие в Одесской операции и взятии Одессы, затем, во время советско-польской войны, в боевых действиях на киевском, белоцерковском и львовском направлениях, а с ноября 1920 года — в боях против войск под командованием С. В. Петлюры и П. Н. Врангеля.