Voltaria ao Albacete em 1999, jogando 23 partidas e balançando as redes 6 vezes. Em 2000 foi para o Alavés, ajudando o clube a ficar em décimo lugar em "La Liga". No entanto, Geli foi lembrado por ter feito um gol contra na decisão da Copa da UEFA de 2000–01 que deu o título ao Liverpool, faltando apenas 3 minutos para o término da prorrogação. Após 100 jogos e 5 gols, o zagueiro deixou o Alavés em 2003 e voltaria ao Girona, onde encerrou a carreira em 2005. Dez anos depois de sua aposentadoria, foi eleito presidente dos "Blanquivermells", que na época jogavam a Segunda Divisão espanhola