После Августовского путча 1991 года исполнительно-распорядительные органы Советов — исполкомы, были заменены администрациями, председателей исполкомов заменили главами администраций, причём главы областных администраций назначались на должность Президентом РСФСР. К концу 1991 года президиумы Советов были повсеместно упразднены, советы народных депутатов были разделены на малые и большие советы. Происходило усиление исполнительной ветви власти и повсеместное оттеснение Советов на второй план. Осенью 1993 года в ходе политического кризиса система Советов была ликвидирована президентом Б. Н. Ельциным, сначала разогнан Съезд народных депутатов и Верховный Совет, затем распущены Советы всех уровней.