Joachim Löw, von 2004 bis 2006 Co-Trainer der Nationalmannschaft Deutschlands und seit 2006 hauptverantwortlicher Trainer der Nationalmannschaft, war als Spieler und Trainer u. a. auch in der Schweiz tätig (u. a. in Schaffhausen und in Winterthur). Dadurch hatte sich Löw ein Netzwerk in die Schweiz und auch ein gutes Verhältnis zu Siegenthaler aufgebaut; Löw holte Siegenthaler als Chefscout zum DFB. Siegenthaler übernahm die Aufgabe, die zunächst für Berti Vogts vorgesehen war. Seinen ersten Einsatz hatte Siegenthaler beim FIFA-Konföderationen-Pokal 2005 in Deutschland. In den deutschen Medien wurde die Berufung zunächst mit Skepsis gesehen.