Cockburn ha escrito tres libros sobre Irak. El primero, " Out of the Ashes: La resurrección de Saddam Hussein ", fue escrito con su hermano Andrew Cockburn antes de la guerra en Irak. El mismo libro fue posteriormente republicado en Gran Bretaña con el título " Saddam Hussein: An American Obsession ". Dos más fueron escritos por Patrick, después de la invasión de Estados Unidos, a raíz de sus reportajes de Irak. " La Ocupación: Guerra y la Resistencia en Irak " (2006) mezcla relatos de primera mano con la presentación de informes. El libro de Cockburn es crítico de la invasión, así como la salafistas fundamentalistas que componen gran parte de la insurgencia. " La Ocupación " fue nominado para los National Book Critics Circle en 2006, en la categoría de no ficción. El segundo, " Muqtada: Muqtada al-Sadr, el Shia Revival, y la lucha por Irak ", fue publicado en 2008. " Muqtada " es un relato periodístico de la historia reciente de la Sadr religiosa y políticamente prominente familia Sadr, el regreso de Muqtada, y el desarrollo de los movimiento sadrista. También ha escrito "Isis. El retorno de la yihad" (2014), traducido a nueve idiomas, y " El ascenso de Estado Islámico: ISIS y la nueva revolución sunita" (2015). Ambos son acerca de cómo el grupo terrorista Estado Islámico de Irak y el Levante (ISIS, o EI) fue capaz de crear su propio estado en el norte de Irak y el este de Siria.