Колониалната епоха започва с пристигането на колонизатори от три страни – Франция, Великобритания и Италия, които според Берлинската конференция трябва да си поделят Африканския рог. Французите окупират най-северните райони и създават владението Френска Сомалия (Джибути), получило своята независимост през 1977 г. Великобритания завзема териториите на югоизток от Джибути, формирайки Британска Сомалия (Сомалиленд), а Италия окупира най-южните части, създавайки Италианска Сомалия през 1892 г. Едва 6 години след окупацията започва антиколониалната съпротива, оглавявана от сомалийския поет, учител и политик Мохамед Абдула Хасан. Съпротивата приключва с поражение за сомалийските бунтовници и много жертви от страна на местното население.