Sur mer, les opérations tournent rapidement à l'avantage des Coalisés. Depuis 1792, la flotte britannique parasite la circulation des convois de commerce à destination de la France. Pendant le siège de Toulon, les troupes britanniques, autrichiennes, espagnoles, piémontaises et françaises royalistes tenant la ville sont évacuées par la "Royal Navy" en prévision de la chute imminente de la place. En abandonnant la ville, le commodore William Sidney Smith détruit une grande partie de l'arsenal et des navires français ancrés à Toulon, portant un coup sévère à la marine française. Dans l'Atlantique, Anglais et Français se livrent à l'arraisonnement de navires de commerce et à des petites escarmouches pendant le printemps 1794. Puis à l'été, la flotte de la Manche britannique commandée par l'amiral Richard Howe inflige une sévère défaite tactique à la flotte française menée par le vice-amiral Louis Thomas Villaret de Joyeuse lors de la bataille du 13 prairial an II, du au .