No ano seguinte, foi convocado para disputar a Copa das Confederações de 2005, entretanto, após sofrer uma lesão atuando pelo Fenerbahçe, foi cortado da Seleção, indo no seu lugar o meia Edu. Alex fez sua última partida pela Seleção Brasileira na vitória por 3 a 0 sobre a Seleção da Venezuela pela última rodada das Eliminatórias para a Copa de 2006 (Novamente, mesmo participando das eliminatórias, não foi convocado para a Copa do Mundo de 2006).