Over zijn werk zijn weinig gegevens verzameld. In 1909 maakte hij een kopie van “Teun de Eierboer”, een beeld uit 1683 vermoedelijk van de Antwerpse beeldhouwer Pieter Scheemaeckers, dat vroeger op de Eiermarkt in Antwerpen een openbare pomp bekroonde. De kopie van Kerckx staat nu tegen de noordelijke gevel van het warenhuis “Grand Bazar” en werd in 1938 als monument beschermd. Jan Baptist Kerckx werkte mee aan het boerenkrijgmonument in Herentals en tekende het ontwerp voor de twee monumentale lantaarnpalen aan het Centraal Station in Antwerpen. Hij werkte mee aan het ontwerp van de wijk “Oud Antwerpen” op de Wereldtentoonstelling van 1894 (Antwerpen) en in 1909 was hij betrokken bij de inrichting van de Vlaamse Opera, waar hij de ornamenten maakt voor de gelagzaal op de begane grond.