Den nær jevnaldrende Shakespeare var meget påvirket av Marlowe i sine tekster, noe som kan bli sett i gjenbruken av Marlowes tema i "Antonius og Kleopatra", "Kjøpmannen i Venedig", "Kong Richard II" og "Macbeth" fra henholdsvis "Dido", "Jøden fra Malta", "Edward den andre" og "Doktor Faustus". I "Hamlet", etter møtet med de reisende skuespillerne, anmoder Hamlet skuespilleren om å framføre en tale om Trojakrigen som i 2.2.429-432 har et ekko av Marlowes "Dido, dronningen av Kartago". I "Kjært besvær forgjeves" fører Shakespeare fram karakteren «Marcade» (tre stavelser) i en bevisst anerkjennelse av Marlowes figur «Mercury», også til stede i Kongen av Navarra i "Massakren i Paris". Betydningen for de blant Shakespeares publikum som hadde lest "Hero and Leander," var Marlowes identifikasjon av seg selv med guden Mercury (Merkur).