Louise Mushikiwabo sinh ngày 22 tháng 05 năm 1961 tại Kigali, thủ đô của Rwandan. Cha cô là Bitsindinkumi, một người Tutsi từ tộc Batsobe; Bitsindinkumi làm nông dân, quản lý các công việc nhỏ của gia đình cũng như làm kế toán cho một đồn điền cà phê thuộc địa. Mẹ cô là Nyiratulira, Cô trải qua thời thơ ấu ở Kigali. Cô là em út trong số 09 người con, anh chị em của cô bao gồm Lando Ndasingwa, người đã trở thành một doanh nhân và chính trị gia đáng chú ý ở Rwanda trước khi bị giết năm 1994 trong cuộc diệt chủng Rwandan, và Anne-Marie Kantengwa, người đã tiếp quản khách sạn Lando, ông Land Land sau khi ông qua đời và phục vụ tại Quốc hội Rwanda từ năm 2003 đến năm 2008