Pajol assiste donc au premier siège de Mayence. La place ayant capitulé le 21 du même mois, il continue de s'avancer en éclaireur jusqu'à Francfort, entre dans cette ville et concourt le au succès que le général Houchard obtient sur les Prussiens près de Limbourg. Il se distingue d'une manière non moins brillante le , à la bataille d'Hochheim, ainsi que le , pendant une sortie de la garnison de Mayence (second siège de Mayence). Quoiqu'il a le bras gauche fracturé dès le commencement de l'action, il continue son service.