En 2013, en catégorie juniors, lors des championnats d'Allemagne sur route, elle se classe troisième du contre-la-montre et deuxième de la course en ligne. Elle participe aux championnats d'Europe sur piste. Avec Doreen Heinze, elle finit deuxième de la vitesse par équipes. Toujours en 2013, elle devient championne d'Allemagne élite du scratch et troisième de l'omnium. En 2014, elle obtient le titre national juniors en contre-la-montre. Elle devient également vice-championne d'Europe de la course aux points. Deux semaines plus tard, elle termine deuxième des championnats du monde en poursuite cette fois. Sur l'omnium, elle est quatrième avant l'ultime épreuve qu'est la course aux points. Elle chute cependant durant la course, se casse la clavicule et est donc contrainte à l'abandon. Aux championnats du monde sur route juniors, Lisa Klein finit cinquième.