Навесні 1944 року 1-й механізований корпус у складі 1-го Білоруського фронту брав участь в операції «Багратіон». Корпус разом з 4-м гвардійським кінним корпусом увійшов до складу рухомої кінно-механізованої групи під командуванням генерала І. О. Плієва. Підполковник Я. С. Задорожний в цій операції виконував обов'язки начальника оперативного відділу корпусу, і його відділ безпосередньо планував наступ корпусу в складі КМГ. В результаті частинам і з'єднанням корпусу вдалося успішно виконати поставлені завдання, звільнивши більше 1200 населених пунктів, зокрема, міста Слуцьк, Слонім і Брест. Підполковник Я. С. Задорожний був нагороджений орденом Червоного Прапора.