Джефф Айзексон народився у місті Вірджинія, що в Міннесоті. Займатися керлінгом почав у 1996 році завдяки батьку, що також брав участь у змаганнях з цього виду спорту. У 2005 році команда Джеффа посіла 4-те місце на чемпіонаті світу серед молоді, а самого Айзексона того ж року було включено до молодіжної «Команди усіх Зірок США». У 2007 році він разом з партнерами по збірній став переможцем зимової Універсіади 2007. Скіпом у тій команді був Джон Шустер, разом з яким Айзексон продовжив виступи і надалі, завдяки чому в 2009 році вперше став чемпіоном Сполучених Штатів.