Реорганизация исполнительной власти РСФСР, проведенная в начале ноября 1991 года, привела в тому, что для проведения экономической реформы было сформировано Правительство РСФСР под непосредственным руководством президента РСФСР. Это изменение было закреплено указом Президента РСФСР № 172 от 6 ноября 1991 года. Фактическим руководителем работы Правительства РСФСР становился первый заместитель председателя Правительства, которым стал госсекретарь Г. Э. Бурбулис, что ещё больше увеличило значение его роли. Тот же указ отменял действие указа о создании Государственного совета при президенте РСФСР, тем самым его упраздняя. Это преобразование сократило название должности, которое стало звучать просто "Государственный секретарь РСФСР" (с 25 декабря 1991 года — "Государственный секретарь Российской Федерации"). О значении государственного секретаря РСФСР в это период свидетельствует то, что 8 декабря 1991 года именно он вместе с Б. Н. Ельциным подписал Беловежские соглашения, фактически положившее конец существованию СССР.