José de San Martín aveva incominciato a fare incursioni in Perù fin dal 1820. Nel 1821 aveva già liberato buona parte del territorio peruviano, ma le città principali restavano in mano realista. Il 26 e 27 luglio 1822 Bolívar e San Martín s'incontrarono alla conferenza di Guayaquil. Durante l'incontro si trovarono entrambi d'accordo che era necessario liberare al più presto anche il Perù e discussero i loro piani di campagna per completare l'operazione. San Martín, Bolívar e Sucre nei mesi seguenti conquistarono sempre più territorio e il 10 febbraio 1824 Bolívar ricevette l'incarico di Dittatore del Perù. Il "Libertador" si dedicò alla riforma completa della politica e dell'apparato militare del nuovo stato, conducendo personalmente, insieme con Sucre, l'esercito nella Battaglia di Junín il 6 agosto 1824. Sucre sconfisse l'esercito nemico anche nella Battaglia di Ayacucho il 9 dicembre. Al completamento dell'indipendenza di tutto il Sudamerica mancava solo l'Alto Perù (attuale Bolivia), Callao e Chiloé).