Khatzís va néixer a Ioànnina, al nord-oest de Grècia, quan la ciutat encara estava sota administració de l'Imperi Otomà. Es graduà a l'Escola Zosimaia de Ioànnina i, després, assistí a la Universitat d'Atenes per cursar Medicina. No obstant això, no va poder acabar els seus estudis per causa de dificultats econòmiques. Aleshores, s'entornà a Ioànnina i esdevingué professor a Vourbiani, Konitsa. L'any 1909, Khatzís fou escollit editor del periòdic "Epirus" (Ήπειρος), per l"Associació Política Hel·lènica de Ioànnina". A les columnes d"Epirus" recolzà els drets de la població grega de la regió contra la mala gestió i el mal govern de les autoritat otomanes d'aleshores. Per aquest tipus d'activitat fou sentenciat a mort pels otomans però, gràcies a les Guerres Balcàniques i la retirada de les tropes otomanes, va poder salvar la vida. Durant 1914-1915 participà en els esdeveniments que van succeïts a l'Epir Septentrional pels nadius grecs contra l'annexió al nou Principat d'Albània i recolzà les activitats del Govern provisional.