По ходу политических перемен Роман Пашковский постепенно брал всё более реформаторский курс — прежде всего с позиций польского патриотизма. Он стал первым официальным деятелем ПНР, который поднял вопрос о памяти поляков, погибших в СССР. В 1987 Пашковский посетил Катынь, после чего публично заявил о необходимости оглашения исторической правды о Катынском расстреле и увековечивании памяти жертв. 5 апреля 1989 Пашковский поездку поляков в Катынь на место гибели родных, перенос земли из могил и закладку у Памятника неизвестному солдату в Варшаве. По инициативе Пашковского при Госсовете была создана Комиссия памяти жертв сталинизма во главе с заместителем председателя Госсовета Зеноном Комендером.