После этого генерал Сен-Сюзанна передал ему командование всеми опорными пунктами департамента Верхний Рейн. Затем он возглавлял авангард Гельветической армии, а в 1799 году снова находился в рядах Рейнской армии и принял участие в битве при Гогенлиндене (1800). Однако, измученный ранами и усталостью, генерал Жорди попросил о переводе в тыл, а затем и вовсе вышел в отставку, отказавшись от звания дивизионного генерала, которое, по его мнению, не заслужил.