У 1938 він вивчав медицину в Празі, але через його єврейське походження і через гоніння на Євреїв у Словаччині часів фашистської диктатури Тісо не зміг закінчити навчання. Його батьків було вивезено до Освенціма, а Юрай інтернований протягом двох років у збірному концентраційному таборі Новаки. Там вступив до підпільної антифашистської організації. Брав участь у Словацькому національному повстанні, був командиром партизанської єврейської одиниці. Після війни вивчав філософію і французьку мову в університеті імені Коменського в Братиславі.