W reprezentacji Włoch Lodetti zadebiutował w 1964 roku. W 1966 wystąpił na mistrzostwach świata, na których Italia nie zdołała wyjść z grupy. W 1968 roku zagrał natomiast na mistrzostwach Europy, które zakończyły się zwycięstwem Włochów. Po tym sukcesie Giovanni skończył swoją przygodę z reprezentacją.