Bei der vorgezogenen Wahl zum bulgarischen Parlament im Oktober 2014 wurde Kunewa jedoch als Vertreterin des Reformblocks (der insgesamt auf 8,9 % kam) in die Nationalversammlung gewählt. In der anschließend gebildeten Koalitionsregierung aus GERB, Reformblock und ABW unter Führung des Ministerpräsidenten Bojko Borissow war Kunewa stellvertretende Ministerpräsidentin und Europaministerin. Nach dem Rücktritt des Bildungs- und Wissenschaftsministers Todor Tanew übernahm sie zusätzlich auch dessen Ressort. Bei der Parlamentswahl 2017 verfehlte der Reformblock und damit auch Kunewa den Wiedereinzug in die Nationalversammlung. Den Vorsitz der Bewegung „Bulgarien der Bürger“ gab sie an Dimitar Deltschew ab.