Тримблу ампутировали ногу и из-за опасения инфекции его не стали забирать с собой, а оставили в Геттисберге. Он пролежал в федеральном госпитале до августа. Геттисберг стал концом его военной карьеры. Полтора года он провёл в плену на острове Джонсона и форте Уоррен. Его предлагали амнистировать сразу после плена, но военный секретарь Симон Кэмерон предложил этого не делать, ввиду того, что Тримбл слишком хорошо знал северные железные дороги. В марте 1865 года Улисс Грант отправил Тримбла в Сити-Пойнт для обмена военнопленными, но война уже подходила к концу. Тримбл был амнистирован в Линчберге 16 апреля 1865 вскоре после капитуляции генерала Ли под Аппоматоксом.