El 2 de febrero de 2018, Thauvin marcó otro triplete en la victoria en casa por 6-3 contra el Metz. Ganó otros dos premios de Jugador del Mes en noviembre y febrero, y terminó la temporada 2017-18 de la Ligue 1 con 22 goles, sólo por detrás de Edinson Cavani, del PSG, como máximo goleador. Era uno de los cuatro candidatos al premio al mejor jugador de la temporada, que finalmente fue para el parisino Neymar. En la Europa League de la temporada, aportó cuatro goles en catorce partidos para el equipo, que perdió la final contra el Atlético de Madrid en Lyon.