Depuis, il s'est surtout distingué comme sélectionneur de l'équipe cubaine de football avec laquelle il a remporté la Coupe caribéenne des nations 2012 et atteint les quarts-de-finale de la Gold Cup 2013. Remplacé par Raúl González Triana, Benítez devient son adjoint et dirige le premier match de Cuba à la Gold Cup 2015, contre le Mexique, en raison d'un problème de visa du premier qui l'empêche de voyager aux États-Unis.