Habrovany gehörte von 1341 bis 1383 zu den Besitzungen Thimo II. von Colditz auf Krupka. Später wurde das Dorf geteilt und gehörte größtenteils dem Benediktinerinnenkloster Teplice und nach dessen Untergang in den Hussitenkriegen zur Herrschaft Teplice. 1512 wurde das Dorf in der Besitzbestätigung Wladislaws II. Jagiello für Johann und Bernhard von Waldstein auf Teplice erwähnt. Ihnen folgte Adam Lev von Rosental, der seinem Besitz 1537 an Simon Třeštík von Hyršov verkaufte. 1561 bestand Habrovany aus einem Meierhof und sieben Wirtschaften. Unter Wolf von Vřesovice wurde die Herrschaft geteilt, dabei kam Habrovany zum Gut Malhostice. Diesen Anteil erwarb 1586 Kaspar d. Ä. von Nostitz und Bellwitz und schloss ihn an seine Herrschaft Dobkovice an. Der andere Teil von Habrovany gehörte ab 1592 Friedrich von Biela auf Tschochau, der als einer der Führer des Ständeaufstandes am 21. Juni 1621 auf dem Altstädter Ring in Prag hingerichtet wurde. 1610 kaufte Johann Nikolaus Hochhauser von Hochhausen auf Hliňany zusammen mit dem Dorf Suchá auch den Dobkovicer Anteil von Habrovany auf. 1622 kaufte Hochhauser aus dem konfiszierten Besitz Friedrich von Bielas auch den anderen Teil von Habrovany mit der Feste zu seiner Herrschaft Hliňany hinzu. Bis zur Aufhebung der Pfarre Žim im Jahre 1699 gehörte Habrovany zu deren Sprengel, danach wurde Tschochau zum Pfarrort. In der berní rula von 1654 sind für Habrovany 22 Anwesen ausgewiesen, von denen drei wüst lagen. Die Feste erlosch zum Ende des 17. Jahrhunderts und der herrschaftliche Hof wurde 1804 an 14 Siedler verkauft. Nach der Schlacht bei Kulm siedelten sich an der Peliken-Mühle Russen an.