En 1918, il rejoint la nouvelle armée polonaise et prend part à la guerre soviéto-polonaise. Il commande initialement la brigade d'infanterie avant d'être promu commandant de la prestigieuse d'infanterie de légions polonaises. Après la guerre, il est envoyé à Paris, où il sort diplômé de l'École spéciale militaire de Saint-Cyr. À son retour, il est promu au grade de général. Żymierski sert alors à Varsovie en tant que chef adjoint de l'administration de l'armée polonaise. Pendant le coup d'État de 1926, il combat du côté de l'armée loyale au gouvernement qui sera déchu. En 1927, il est traduit en cour martiale et condamné sur des accusations de corruption et de détournement de fonds controversés, et est rétrogradé au grade soldat de première classe, expulsé de l'armée et condamné à 5 ans de prison.