Após a conclusão da sua educação ele continuou a ensinar filosofia e matemática no colégio jesuíta em Mogilev, onde também se dedicou ao trabalho pastoral. Ele então voltou para Polotsk, onde ensinou seminaristas jesuítas e alunos leigos no Colégio Jesuíta. Franciszek liderou uma fuga de alunos da invasão francesa de 1812 e, mais tarde, regressou à cidade para reassumir a sua posição como professor de teologia dogmática, apologética e homilética.