En 1846 conoció al francés Philibert Perraud que le inició en el procedimiento del daguerrotipo. Dos años después el vicecónsul griego en Viena donó una cámara a la Escuela de Artes y Oficios con la que Margaritis comenzó a dar clases de daguerrotipia. En 1853 abrió un estudio fotográfico en la plaza de Menta 585 de Atenas y comenzó especializándose en fotografía de difuntos. En 1855 participó en la Exposición Universal de París.