Jogou uma partida pela Seleção da CEI, como a antiga Seleção Soviética subsistiu para as disputas da Eurocopa 1992. Foi em abril, em empate de 2-2 com a Inglaterra, ainda antes da competição. Karpin, entretanto, ficou de fora do torneio e aquela foi sua única exibição pela CEI. Naquela partida, Karpin começou entre os reservas, entrando no minuto 63 no lugar de Andrey Kanchelskis.