格里利起初支持约翰逊宽厚的重建政策，但总统只想快速建立州政府，无意保障解放奴隶的选举权，令格里利非常失望。1865年12月国会开幕并逐步主控南方重建，激进派共和党人积极保障不论肤色所有男子的选举权和公民权利，格里利整体认可国会政策。1866年格里利竞选联邦众议员遭遇惨败，1867年初竞选联邦参议员又输给罗斯科·康克林（）。