Флорида-Кіс час від часу загрожують тропічні бурі та урагани, що призводять до евакуації на материк. Ураган Жорж, знищивши значну частину житла та інфраструктури на багатьох островах Карибського басейну, завдав збитків та масштабних затоплень на Нижніх Кіс у 1998 році, перш ніж здійснив викід на Міссісіпі. У 2005 році урагани Катріна, Ріта та Вільма вплинули на Кіс (хоча жоден не зробив прямого удару), завдавши широкої шкоди та затоплення. Найсильнішим ураганом, що вдарив по району, був ураган Дня праці 1935 року, ураган категорії 5.