Bei den Präsidentschaftswahlen 2012 trat Araújo wieder an und erhielt 17,30 % der Stimmen. Bei den Parlamentswahlen 2012 wurde Araújo erneut zum Abgeordneten gewählt, nahm den Sitz aber nicht ein, da er in der neuen Regierung den Posten des stellvertretenden Premierministers und des Koordinators für soziale Angelegenheiten übernahm. Seinen Posten als Parlamentspräsident gab er am 30. Juli 2012 an seinen Nachfolger Vicente da Silva Guterres ab.