在经过持久自由军事行动推翻塔利班政权之后，阿里亚纳航空自2001年12月开始恢复其业务。大约一个月之后，联合国的相关国际制裁取消，阿富汗的航空公司被允许可以重新运营国际航线。2002年时，印度政府将印度航空的三架空客A300飞机作为礼物捐赠给阿里亚纳航空。阿里亚纳航空自1999年之后的第一个国际航班于2002年1月降落于印度德里的英迪拉·甘地国际机场，此后分别于同年6月和10月分别恢复了至巴基斯坦和德国的国际航线。2005年时，印度签署了一份与阿富汗的航空合作协议，印度航空负责为阿里亚纳航空培训50名工作人员。