1885年（明治18年）7月、参謀本部第1局第1課長に就任。1886年（明治19年）5月、歩兵第19連隊長に転じ、1887年（明治20年）11月、歩兵大佐に昇進。1889年（明治22年）9月、歩兵第1連隊長となり、1892年（明治25年）9月、第4師団参謀長に異動したが、同年11月に休職。日清戦争末の1895年（明治28年）1月27日、後備歩兵第1連隊長として復帰し、同月31日、台湾混成支隊司令官に発令され、台湾に出征し澎湖諸島を占領（乙未戦争）。同年8月、陸軍少将に進級し台湾兵站監に就任。