Mit dem Ende der Sowjetunion begann Butkevičius' politische Laufbahn, als er in den Rajonrat von Vilkaviškis gewählt wurde. 1991 trat er in die wiedergegründete LSDP ein, nachdem er in der Sowjetunion bereits kurze Zeit Mitglied der Kommunistischen Partei gewesen war (1985–1988).