費德勒與同胞的也就是最著名的斯坦·瓦林卡已經彼此對戰23次與費德勒以20勝3負領先。費德勒在大滿貫比賽中6-1領先，在硬地賽場上15-0，在草地上1-0，在紅土上得到4-3，決賽則以1-1打成平手。2014年蒙地卡羅大師賽的決賽，瓦林卡以三盤打敗費德勒贏得他的第一個大師賽 。 瓦林卡在2015年法国网球公开赛四分之一決賽直落三戰勝了費德勒，以贏得他的第一次法国网球公开赛冠軍，之後2015年美國網球公開賽費德勒在半決賽中直落三戰勝了瓦林卡。2017年澳洲網球公開賽半決賽中費德勒五盤再次擊敗瓦林卡。其他的比賽包括2012年上海大師賽和2013, 2017年印第安维尔斯大师赛，費德勒贏得了四次。2014年溫布頓網球錦標賽，費德勒以四盤贏得了比賽。2014年ATP世界巡迴賽總決賽，費德勒再以三盤擊敗瓦林卡。儘管他們在場上的對抗，但他們在場外是親密朋友，他們也常多次合作雙打，尤其是2008年北京奧運會和2014年台維斯盃都贏得冠軍。