Fue elegido como un n.º 14 de comienzo para el Seis Naciones de 2009 contra Escocia, el 8 de febrero, y de nuevo el 14 de febrero contra Inglaterra. Marcó un ensayo en cada partido y lanzó un penalti contra Inglaterra. Sus puntos supusieron la diferencia entre los dos equipos. Luego jugó contra Francia en un partido que Gales perdió 21–16 en Saint-Denis. Warren Gatland luego quitó a Halfpenny en la victoria 20–15 contra Italia, pues Warren Gatland experimentó con el ala Mark Jones.