25 серпня 1992 року сербські обстріли під час облоги Сараєво призвели до повного знищення бібліотеки; серед втрат було близько 700 рукописів та інкунабул та унікальна колекція боснійських серійних видань, деякі з середини XIX століття боснійського культурного відродження. До нападу бібліотека зберігала 1,5 мільйона томів та понад 155 000 рідкісних книг та рукописів. Деякі громадяни та бібліотекарі намагалися врятувати книги під обстрілом снайперів, принаймні одна людина загинула.