En vísperas del campeonato 2016-2017, la entidad decidió simplificar el nombre por el de Venezia Football Club y decidió confiar el puesto de entrenador a Filippo Inzaghi. Encuadrado en el Grupo B de la Lega Pro, se formó un grupo fuerte los jugadores de experiencia en categorías superiores como Alexandre Geijo, Maurizio Domizzi, Simone Bentivoglio y Agostino Garofalo, el equipo se presentó desde los primeros días como candidato para la promoción: tras conseguir la primera posición al final de la primera vuelta, el Venezia logró gradualmente separarse de sus perseguidores (Parma, Padova y Pordenone) y, finalmente, asegurar matemáticamente la victoria de su grupo con tres partidos por disputar para el final de la temporada regular, gracias al empate casa para 1-1 obtenido el 15 de abril de 2017 contra el Fano. El Venezia, por lo tanto, reconquistó la Serie B después de 12 años de ausencia. El equipo cerró la temporada con la mejor defensa del grupo (solo 29 goles encajados) y el segundo mejor ataque, llegando a marcar hasta 16 jugadores; los mejores anotadores de temporada para los lagunari fueron Stefano Moreo y Alexandre Geijo, quienes cierran la temporada ambos con 10 goles. Tras 4 temporadas en segunda división, el equipo ascendió en el play-off de la serie B tras ganar por un global de 2-1 al Associazione Sportiva Cittadella y jugará la Serie A donde estuvo por última vez en la temporada 2001-02.