Da er aber im Laufe der folgenden zwei Spielzeiten bei den Weltranglistenturnieren stets in der Qualifikation ausschied, verschlechterte er sich auf Rang 111. Den Negativtrend konnte Hughes danach aber mit einer Verbesserung auf Platz 108 unterbrechen, denn ihm gelang während der &lt;a href="Snooker-Saison%201988/89"&gt;Saison 1988/89&lt;/a&gt; eine Hauptrundenteilnahme beim Classic 1989. Die nächste Saison verlief aber weniger erfolgreich, sodass sich Hughes als Testspieler an den Professional Play-offs 1990 beteiligten musste, da er auf Platz 122 abgerutscht war. Anschließend zog sich Hughes in Teilen vom Profi-Snooker zurück und bestritt nicht mehr alle Turniere; die verbleibenden Spiele verlor er zumeist. 1994 zog er sich endgültig und vollständig zurück. Abgestützt auf Platz 525, verlor er 1996 seine Spielberechtigung auf der Profitour. Dies bedeutete das Ende seiner Profikarriere, auch wenn er 1997 ein Spiel auf der zweitklassigen UK Tour bestritt.