12. ledna 2010 se Zilda Arns nacházela na Haiti, kde připravovala otevření pobočky "Pastoral da Criança". V okamžiku, kdy udeřilo zemětřesení, přednášela v Port-au-Prince adeptům misionářských řádů ve studijním centru pro řeholníky. V troskách budovy zahynula ona a dva posluchači. 15. ledna bylo její tělo letecky dopraveno do rodné Brazílie.