Una volta scoppiata la Guerra di successione spagnola, l'elettore Massimiliano II Emanuele di Baviera mise a ferro e fuoco Stockach. Nel corso delle Guerre rivoluzionarie francesi della Seconda Coalizione furono combattute due battaglie tra la Prima Repubblica francese e la monarchia asburgica nel 1799 e nel 1800. Nel 1810 Stockach venne definitivamente annessa al Granducato di Baden.