Nel ritiro di maggio 2012 propedeutico all'Europeo in Ucraina e Polonia, il selezionatore della Spagna Vicente del Bosque lo convoca per le amichevoli contro Serbia e Cina (quest'ultima disputata proprio presso l"'Estadio Olimpico de la Isla Cartuja" di Siviglia), mandandolo in campo per metà partita nella sfida contro gli slavi e tenendolo in panchina nella seconda occasione. Il tecnico, però, non lo inserisce tra i convocati al successivo torneo continentale, preferendogli Javi Martínez. Beñat rientra nel giro della Nazionale dopo l'Europeo, collezionando altre presenze.