In Japan war erst Reichseiniger Oda Nobunaga in der Lage, die Piraterie zu beenden. Für den Kampf gegen rivalisierende Fürsten und Piraten hatte er 1576 große, möglicherweise eisenbewehrte Küstenschutzschiffe (Atakebune) bauen lassen, für die er die letzten Piraten rekrutierte. Sein Nachfolger, der Regent Toyotomi Hideyoshi wollte die nach der Reichseinigung nun arbeitslosen Samurai und Berufskrieger mit einem Feldzug gegen China ablenken. Da Korea den Japanern den Durchmarsch nach China verweigerte, begann Hideyoshi 1592 den Imjin-Krieg gegen Korea. Von Kyūshū aus setzte Hideyoshi mit hunderten Transportschiffen über. Den bis zu 200.000 gelandeten kriegserfahrenen Japanern hatte die koreanische Heeresmacht nichts entgegenzusetzen, die koreanische Kriegsmarine war der Flotte Hideyoshis jedoch überlegen und schlug sie bereits 1592 in der Seeschlacht von Okpo. Die koreanische Flotte war zwar kleiner als die japanische, die koreanische Seeleute aber waren erfahrener und kampferprobt, ihre Schildkrötenschiffe waren stärker als die zahlenmäßig überlegenen japanischen Transportschiffe. Daran änderte auch 1597 der vorübergehende japanische Seesieg von Chilcheonryang nichts. Während der koreanische Admiral Yi Sun-sin 1598 die japanische Transportflotte bei Myongnyang schlug und so den Nachschub unterband, gelang es den Koreanern mit Hilfe chinesischer Truppen, die Japaner auch an Land zurückzuschlagen.