Летом 2013 года Абате включили в заявку сборной Италии для участия в командном чемпионате Европы. Абате стартовал во втором финале, где пришёл к финишу первым. По итогам соревнований Эмануэле занял 6-е место, принеся итальянской сборной 7 зачётных баллов. В 2016 году Абате выступил на чемпионате Европы. Итальянский барьерист уверенно преодолел предварительный раунд, но в полуфинале финишировал только 4-м, завершив борьбу за медали.