Будучи убежденным роялистом, маркиз просил у императора Педру II разрешения принять под своё командование имперский флот и арестовать повстанцев, провозгласивших Бразильскую республику. Педру II воздержался, предпочитая изгнание гражданской войне. В возрасте 82 лет старый адмирал всё ещё оставался рядом с императорской семьей, пока свергнутый император не отплыл в Португалию. В марте 1897 года Лисбон умер в Рио-де-Жанейро.