Ferrara appoggia dagli anni novanta tutti gli interventi militari degli Stati Uniti d'America, a partire dalla prima guerra del Golfo. All'inizio del 2003, in un editoriale del "Foglio", appoggia le iniziative militari degli Stati Uniti d'America contro l'Iraq intraprese dal presidente George W. Bush, che culminano con l'invasione nonostante il parere contrario del segretario dell'ONU Kofi Annan e l'opposizione degli altri membri del Consiglio di sicurezza delle Nazioni Unite.