За сражением последовало недолгое перемирие, но 7 сентября оно было прекращено и Скотт атаковал позиции противника у «Королевских мельниц» (Молино-дель-Рей). В сражении при Молино-дель-Рей бригада Кларка потеряла треть рядовых и половину офицеров. Хэнкок получил ранение, когда командовал всей своей ротой. Ранение осложнилось лихорадкой, из-за чего Хэнкок не смог участвовать в штурме замка Чапультепек. Его сил хватило только на то, чтобы наблюдать за ходом сражения с крыши соседнего с лагерем дома. Он написал брату, что всегда будет жалеть о том, что не смог участвовать в штурме. Хэнкок вернулся в строй уже через несколько дней, когда американская армия вступала в Мехико. Боевые действия на этом прекратились.