Ocak 1943'te İkinci Dünya Savaşı'nın Doğu Cepshesi'nin Çeçen-İnguş sınırlarına yaklaşması nedeniyle kütüphane geçici olarak çalışmalarını durdurdu. Kütüphane aynı yılın Eylül ayında yeniden açıldı. Çeçenlerin ve İnguşların sürgün edildiği yıllarda çalışanlar kütüphanede saklandılar ve yıkıma maruz kalan Çeçen ve İnguş dillerinde büyük miktarda edebî birikimi korumayı başardılar.