În 1816 a ajuns în Varșovia, la invitația lui Stanisław Zamoyski, care l-a însărcinat cu executarea decorului sculptural pentru refacerea Palatului albastru (Plavi Dvorac). În 1817 a fost numit profesor de sculptură la Universitatea din Varșovia. El a deținut această funcție până la desființarea Departamentului de Arte Plastice după sfârșitul revoltei din noiembrie. Între anii 1820-1822 el a câștigat o bursă guvernamentală în Italia, unde a lucrat sub îndrumarea lui Bertel Thorvaldsen. Malinski a fost profesor pentru Konstanty Hegel (tatăl lui Wladimir Hegel), Władysław Oleszczyński și Jakub Tatarkiewicz.