In der &lt;a href="Snooker-Saison%201998/99"&gt;Saison 1998/99&lt;/a&gt; konnte Jones bei zehn Turnieren erneut nur drei Auftaktspiele gewinnen und scheiterte ebenfalls wieder in der nächsten Runde, wobei dies bei der UK Championship, bei den Irish Open und bei den Welsh Open der Fall war. Auf der Weltrangliste rutschte er aus den Top 100 und belegte in der folgenden Saison den 104. Platz.