Elie Hobeika terbunuh, bersama pemandunya, oleh bom kereta di Beirut, Lebanon pada 24 Januari 2002. 22 poun TNT diletakkan dalam kereta Sedan berdekatan yang diletupkan; empat tangki oksigen dalam kereta Hobeika menguatkan lagi letupan. Satu kumpulan yang tidak pernah dikenali mengenalkan dirinya sebagai "Lebanese for a Free and Independent Lebanon" menghantar fax mengaku bertanggung jawab, menuduh Hobeika sebagai "agen Syria"; kumpulan itu tidak kedengaran lagi selepas itu. Lebanese Interior Minister Elias Murr telah menuduh Israel sebagai bertanggung jawab, berdasarkan kesan lesen kereta sedan; yang dinafikan dengan kerasnya oleh menteri luar Israeli Shimon Peres. Elie Hobeika dijadualkan untuk memberi keterangan terhadap Ariel Sharon mengenai penglibatannya dalam penyembelihan dalam mahkamah Belgium kerana jenayah terhadap kemanusiaan.