Im Krieg 1848–50 zwischen dem Deutschen Bund und Dänemark, die beide das Herzogtum Schleswig beanspruchten, nahm Schlobach offenbar als Freiwilliger teil. Letztlich diente er als Pionierleutnant sowie Kompanieführer im 14. Schleswig-Holsteinischen Infanterie-Bataillon und erhielt mehrere Auszeichnungen.