在最初天主教占主导的情况下，英属马里兰省在英属北美殖民地中也具有“信教自由的先驱”的地位。但天主教地位不稳，与境内英国国教会、清教徒、贵格会之间的宗教斗争频繁发生，叛乱的清教徒甚至一度取得了对該省的支配权。英国光荣革命之后，站在议会军阵营的省内清教徒从巴尔的摩男爵家族手中夺取了英属马里兰省的统治权。这次事件被称为“清教徒革命”。然而，鉴于新建立的政府无法服众，英国国王威廉三世准备以皇室的名义任命叛军首领为总督。经过权衡,各方都可以接受的莱昂内尔·科普利成为皇家总督，直至1693年死于任上。此后弗朗西斯·尼科尔森继承了总督的职位。最终，巴尔的摩男爵五世查尔斯·卡尔弗特以宣誓自己是清教徒为代价，实现了巴尔的摩男爵家族在权力舞台上的的回归。