แอฟริกาใต้เป็นหนึ่งในสิบเก้าประเทศที่แข่งขันในพาราลิมปิกฤดูร้อน 1964 ซึ่งจัดขึ้นที่กรุงโตเกียวประเทศญี่ปุ่นระหว่างวันที่ 3 - 12 พฤศจิกายน 1964 ทีมนี้ได้อันดับที่ 5 ในตารางเหรียญ ประกอบด้วยทั้งหมด 19 เหรียญ 8 เหรียญทอง 8 เหรียญเงิน และ 3 เหรียญทองแดง ทีมแอฟริกาใต้ประกอบด้วยนักกีฬา 9 คน