Anfang des 16. Jahrhunderts aber hatte das Weserufer vor der Stephanistadt teilweise eine Mauer bekommen und vor den landseitigen Mauern hatte man einen Wall zum Schutz gegen die stärker gewordenen Kanonen angelegt. Als im Schmalkaldischer Krieg im März 1547 ein kaiserliches Heer gegen Bremen marschierte, machte man sich in aller Eile an weitere Modernisierungen: Schöne aber unnütze Mauer- und Tortürme wurden gekappt, das Schwanengatt zugedeicht und in seiner Nähe eine Brücke über die Kleine Balge gebaut. Vier Jahre später, also 1551, brach man die innere Mauer zwischen der Natel und der äußeren Mauer ganz ab. Aber den Torbau der Natel und die Mauer zwischen ihr und dem Fangturm an der Weser ließen man stehen. So ist das Tor auch auf den ersten Stichen von Bremen abgebildet, bei Weigel mit einer welschen Haube, bei den übrigen mit einem Satteldach, was heute für die korrektere Darstellung gehalten wird. 1590 wichen der Fangturm und der südliche Teil der inneren Mauer dem Neuen Kornhaus, aber erst kurz vor 1660 wurde der Torbau der Natel abgerissen. Noch im Stadtplan von 1796 heißt die nordwestliche Fortsetzung der Langenstraße zwischen Letzter Schlachtpforte und der Straße "Fangturm" (Überbauung der Kleinen Balge) "Die Natel".