Né le 24 novembre 1833 dans le village de Sainte-Rose (devenu le quartier Sainte-Rose de Laval en 1965), Antoine Labelle est le seul fils d'Angélique Maher et d'Antoine Labelle, un cordonnier. Il est un descendant direct d'Olivier Charbonneau, le premier habitant de l’Île Jésus. Issu d'un milieu populaire, son enfance est notamment marquée par la rébellion des Patriotes de 1837-1838. Alors qu'il effectue ses classes primaires à Sainte-Rose, il est pris en charge par le curé Pascal Brunet, qui voit en lui un potentiel pour la prêtrise.