Nabil prende parte attivamente alla rivoluzione egiziana. Viene arrestato e torturato il 4 febbraio dalla polizia militare, poi rilasciato 27 ore dopo. Viene arrestato nella sua casa a Ain Shams, quartiere del Cairo, alle 17 del 28 marzo 2011 da parte dell'intelligence militare. Ha potuto solo chiamare il fratello il giorno seguente per informarlo del suo arresto. Nabil fu condannato a tre anni di carcere per “offese all'esercito” per il suo slogan “l'esercito e il popolo non saranno mai una mano sola” da parte della corte 10 Ramadan a Nasr City al Cairo il 10 aprile. Prima di questo, fu imprigionato nel carcere di massima sicurezza a El Marg, che non permette di far filtrare la luce del sole. Inoltre, fu messo in carcere con altri detenuti che lo minacciavano. Gli è stato negato cibo e acqua ed è stato costretto a dormire in brande infestate da insetti. Questo gli portò diverse allergie. Nabil soffre di problemi cardiaci e di sbalzi di pressione sanguigna, pertanto chiese ai medici di essere sottoposto a controlli di routine. Iniziò lo sciopero della fame il 23 agosto 2011. Durante lo sciopero della fame, entrò in coma due volte e rischiò la vita numerose altre volte. Il 14 dicembre 2011, la Corte d'Appello militare egiziana ridusse la sua condanna a due anni di arresto, nonostante la difesa chiedesse la scarcerazione. In 29 dicembre a Piazza Tahrir, ci fu una manifestazione di protesta in solidarietà di Maikel Nabil per la sua scarcerazione. Il 23 gennaio 2012, Nabil viene rilasciato.