Ha sido internacional con la Selección de fútbol de Italia en 22 ocasiones. Participó en el Mundial de 1998 y en la Eurocopa de 2000. Precisamente en la final de la competición europea de 2000, a pase de tacón de Totti, efectuó el pase que permitió a Delvecchio adelantar momentáneamente a los "azzurri". La final terminó en 2-1 para Francia, gracias al gol de oro marcado por Trezeguet, futuro compañero de equipo de Pessotto en la Juventus.