V roce 1996 byly vozy Sauber velmi nespolehlivé, což vedlo k mnoha odstoupením ze závodu. Frentzen byl ale jedním z pouhých 4 závodníků, kteří dokončili chaotickou a deštivou Grand Prix Monaka, ve které zvítězil Olivier Panis. Stejně jako ve své debutové sezóně vybojobal na konci sezóny 7 bodů.