2月13日から28日にかけては、マッカーサー元帥の「故地」コレヒドール島とバターン半島の奪還を支援する。ルソン島を確保した連合軍のうち、マッカーサー軍はフィリピンからインドネシア方面の掃討作戦をおこなう。一息入れた後、6月29日から7月7日まではボルネオの戦いの一つであるに先駆けて機雷除去作戦を支援した。この方面の日本軍の抵抗は大きく、機雷と防御砲火により11隻の掃海艇を撃沈または損傷させた。フェニックスは火力支援で防御砲火を沈黙させ、部隊を上陸させた。