Emilie Hovden bestritt 14 Länderspiele für die norwegische Jugendauswahl, in denen sie 28 Tore warf. Mit dieser Mannschaft nahm sie an der U-17-Europameisterschaft 2013 teil. Anschließend lief Hovden 16-mal für die norwegische Juniorinnenauswahl auf, in denen sie insgesamt 40-mal in das gegnerische Tor traf. Mit dieser Auswahlmannschaft nahm sie an der U-19-Europameisterschaft 2015 teil. Hovden bestritt im September 2019 zwei Partien für die norwegische B-Nationalmannschaft, in denen sie sieben Treffer erzielte.