Nell'agosto 2002, dopo l'attacco alle Torri Gemelle di New York, il Governo degli Stati Uniti rese noto di ritenere che il Nuovo Esercito Popolare fosse un'organizzazione terrorista legata a Bin Laden. José María Sison, uno dei fondatori del Partito e dell'Esercito, attende al momento l'espulsione dai Paesi Bassi dopo l'accettazione, da parte dell'Unione europea, della disposizione USA. L'accusa statunitense si deve probabilmente all'omicidio del colonnello Nick Rowe, inviato nelle Filippine per riorganizzare l'esercito governativo.