Durant la Guerre franco-allemande de 1870, il participe aux combats autour de Metz. Fait prisonnier à Metz, il est conduit dans un camp d' internement en Allemagne d'où Il s'évade et, grâce à son allemand parfait, regagne la France via le Palatinat, le duché de Bade et la Suisse. Il rejoint Gambetta qui le nomme général de brigade. Il prend la tête de la Division d’Infanterie du Corps d’Armée. En , le général Crémer combat à Bligny-sur-Ouche, puis à Nuits-Saint-Georges, près de Dijon. Il prend une part active aux combats de l'armée de l'Est, mais ne passera pas en Suisse lors de la retraite, préférant à l'instar du contre amiral Penhoat et du général Billot, rejoindre Lyon en passant par les Hauts plateaux du Jura début février 1871.