Dopo la salvezza del precedente torneo, per la stagione 2003-04 il Modena fu allenato da Malesani. Nelle prime giornate di campionato la squadra ottenne 3 vittorie consecutive, sorpassando addirittura l'Inter e trovandosi in zona Uefa. In seguito scese però di varie posizioni, finendo nella parte destra della classifica. Sostituito Malesani con Bellotto, gli emiliani mancarono la salvezza all'ultima giornata perdendo con la Lazio.