El desarrollismo controlaba el diario "Clarín", principal periódico de Argentina, y los peronistas e izquierdistas tenían en sus manos algunos pequeños pero influyentes medios de prensa; Illia no tenía nada parecido: si bien era apoyado por el Canal 7 (estatal) y el Canal 9 (privado), la prensa escrita estaba enteramente en su contra: los diarios y revistas le criticaban su pretendida inacción y su debilidad, al mismo tiempo que anunciaban abiertamente el golpe de estado que se estaba preparando. Illia se apoyó en los generales «colorados» para limitar el poder del comandante en jefe del Ejército, Juan Carlos Onganía, un cursillista formado en la Escuela de las Américas, pero los cuadros inferiores fueron ocupados por jefes "azules". Cuando, en 1965, Onganía pasó a retiro todos los jefes militares le respondían personalmente, mientras la prensa lo mostraba como jefe del inminente golpe de estado.