Allegri volvió a dirigir a la Juventus en la temporada 2016-17, logrando ganar la Copa Italia por tercer año consecutivo (algo que nunca había logrado ningún equipo antes) y su tercer título de la Serie A, el sexto consecutivo del club (un logro también inédito en la historia del fútbol italiano). Por último, disputó otra final de la Liga de Campeones dos años después, volviendo a perderla y quedándose de nuevo a las puertas del triplete.