Von 1948 bis 1953 war er Lehrer an einer Hamburger Oberschule. Jochmann wurde 1953 Assistent des Zeithistorikers Fritz Fischer an der Universität Hamburg und befasste sich in den folgenden sieben Jahren intensiv mit der deutschen Geschichte im 20. Jahrhundert. 1960 vertraute ihm der Hamburger Senat den Aufbau der damaligen Forschungsstelle für die Geschichte des Nationalsozialismus in Hamburg an, die er 26 Jahre bis zu seiner Pensionierung 1986 leitete. In dieser Zeit entwickelte sich die Einrichtung zu einem im In- und Ausland bekannten Institut. Bei der Neugründung des Instituts setzte Jochmann durch, dass nicht nur die Zeit des Nationalsozialismus im engeren Sinn, sondern die Vorgeschichte seit der Reichsgründung von 1871 zu untersuchen sei. In seiner Ära erschien eine große Anzahl von Studien zur politischen Sozialgeschichte Hamburgs und Deutschlands vom Ende des 19. bis zur Mitte des 20. Jahrhunderts. Der Schwerpunkt war dabei die Frage nach den Ursachen für das Aufkommen des Nationalsozialismus, nach seinen Vorläufern und Wegbereitern.