В сборной Джованни в основном играл на позиции левого атакующего полузащитника. В сборной Нидерландов на домашнем Евро-2000 Джо уступил свою позицию на левом фланге атаки Марку Овермарсу и Будвейну Зендену. Поэтому ван Бронкхорст занял место левого защитника, однако и здесь он уступал ветерану Артуру Нюмана, который завершил карьеру сразу после окончания европейского турнира. После чего все тренеры национальной команды постоянно вызывали ван Бронкхорста на матчи сборной.