Die Handlung basiert auf dem Leben des FBI Supervisory Special Agent James R. Fitzgerald und seinem Buch "A Journey to the Center of the Mind, Book III: The “First Ten” FBI Years, 1987–1997." Der Showrunner, Produzent und Regisseur Greg Yaitanes äußerte sich in einem Interview zu der Entstehung. Ursprünglich sei "Manhunt: Unabomber" unter dem Arbeitstitel "Manifesto" eine Storyidee für eine abgeschlossene Miniserie gewesen. Discovery aber sah darin das Potential für eine Anthologie. Er führt weiter aus, dass die US-Generalstaatsanwältin Janet Reno das verbindende Glied zwischen den einzelnen Fällen sein könnte. In der vierten Episode "Publish or Parish" fährt die Kamera über ihren Schreibtisch und man sieht die Sammelmappen der verschiedenen Kriminalfälle wie Waco, Oklahoma City in 1993 oder der Bombenanschlag auf das World Trade Center im gleichen Jahr.