Hawaweeny wurde in Beirut (heute Libanon) geboren. Seine Eltern waren damaszener Syrer, die nach einem Massaker im Bürgerkrieg im Libanongebirge nach Beirut geflohen waren. Er begann seine Ausbildung an der "Patriarchalen Schule in Damascus", damals der führenden griechisch-orthodoxen Institution für höhere Bildung in der Levante unter der Leitung von Joseph von Damascus (1793–1860), und setzte seine Studien am Seminar von Chalki des Ökumenischen Patriarchats von Konstantinopel im damaligen Osmanischen Reich und danach an der Geistlichen Akademie Kiew im damaligen Russischen Kaiserreich fort.