В отборочном турнире к чемпионату Европы 2008 боснийской сборной в соперники достались: Греция, Турция, Норвегия, Молдавия, Венгрия и Мальта. Слишкович был очень доволен результатами жеребьёвки и заявил, что его команде вполне по силам пробиться на чемпионат Европы. Первая игра отборочного цикла завершилась разгромной победой боснийцев над аутсайдером группы сборной Мальты (5:2). Во втором матче подопечные Слишковича принимали дома сборную Венгрии. В первом тайме Саша Папац сфолил в своей штрафной площади, а Сабольч Хусти уверенно реализовал пенальти. На исходе первой половины встречи с поля был удалён защитник боснийцев Эмир Спахич. После этого венгры имели преимущество и забили ещё 2 гола, гол Мисимовича установил окончательный счёт — 3:1 в пользу венгров. После этого матча Слишкович подал в отставку. Тренер заявил, что намеревался в двух стартовых играх набрать 6 очков, что команде сделать не удалось. Также Блаж Слишкович добавил, что «это решение далось ему очень тяжело, но он не мог поступить иначе». Однако руководство Футбольного союза Боснии и Герцеговины не приняло отставку главного тренера. Слишкович согласился продолжить работу в сборной и на пресс-конференции перед третьим матчем с Молдавией отметил: