Es gibt Hinweise auf eine keltiberische Siedlung mit Namen "Virovias". Aus römischer Zeit stammen drei Grabstelen, die sich heute im Museum von Numantia befinden; in dieser Zeit lag der Ort an einer Straße, die "Numantia" (bei Garray) mit "Bilbilis" (Calatayud) und "Caesaraugusta" (Saragossa) verband. Nach der arabisch-maurischen Eroberung entvölkerten sich weite Gebiete im Norden der Iberischen Halbinsel. Im 10. Jahrhundert begann unter dem kastilischen Grafen Gonzalo Téllez die in der ersten Hälfte des 12. Jahrhunderts unter Alfons I. von Aragón vollendete Rückeroberung "(reconquista)" Altkastiliens. In dieser Zeit wurde Borobia von Siedlern aus dem christlichen Norden neu- oder wiederbesiedelt "(repoblación)". Im 14. Jahrhundert hatte der Ort unter dem kastilisch-aragonesischen „Krieg der beiden Peter“ zu leiden. Die örtliche Burg diente zur Sicherung der einstmals umkämpften Grenze – eine Situation, die jedoch durch die Eheschließung zwischen Isabella von Kastilien und Ferdinand von Aragón im Jahr 1469 hinfällig wurde.