1994年3月波士尼亞與赫塞哥維納境內的穆斯林和克羅埃西亞人雙方同意共组联邦，以共同对抗境內塞爾維亞人。1995年11月21日各方签署代顿和平协定，结束内战，并把波士尼亞與赫塞哥維納分为波黑联邦以及塞族共和国两个政治实体。在這次的内战中波士尼亞與赫塞哥維納境內共有20万人死亡，超过200万人流离失所。战争结束後，北约在波士尼亞與赫塞哥維納的境內继续驻扎维和部队，2004年底由欧盟所取代。