Ensimmäisen lipun samankaltaisuus Yhdysvaltain lipun kanssa johti monesti sekaannuksiin, koska ne oli vaikea erottaa toisistaan taistelukentällä. Se aiheutti suuria ongelmia etenkin Bull Rushin taistelussa, kun sotilaat ampuivat omiaan luullessaan niitä viholliseksi. Lippu korvattiin taistelukentillä Etelän ristiksi ( kutsutulla lipulla, Siinä on punaisella taustalla valkoisilla ääriviivoilla tummansininen vinoristi, jossa on kolmetoista valkoista konfederaation osavaltioita kuvaavaa tähteä.