Retenu en sélection nationale pour la Coupe des confédérations en 2005, la Coupe du monde en 2006 et pour l'Euro en 2008, Thomas Hitzlsperger est néanmoins souvent remplaçant au sein de la Mannschaft. Il devient progressivement titulaire en sélection au cours de la campagne de qualifications pour le Mondial 2010, au détriment de Torsten Frings. Néanmoins, son faible temps de jeu à la Lazio Rome et ses nombreuses blessures, amènent Joachim Löw à ne pas le sélectionner.