Au moment de la Révolution égyptienne de 2011, il adopte une stratégie prudente et payante pour réaliser le but historique de la Confrérie : l'accession au pouvoir. Le mouvement ne participe pas aux manifestations de janvier mais, une fois Hosni Moubarak renversé, insiste pour la tenue d'élections législatives libres, tout en multipliant les rencontres et les déclarations rassurantes, avec l'ambassadeur américain le , ou les Coptes. Dans le même temps, il refuse fermement la rédaction d'une constitution avant les élections, appelle à la patience et ne condamne pas les bavures du pouvoir militaire afin de ne pas retarder la transition civile.