Peter Bauditz var søn af generalmajor Carl Gustav Heinrich Bauditz. Skønt han havde en sjælden kunstnerisk begavelse, bestemtes han fra ungdommen til militærstanden og blev 1836 sekondløjtnant ved 1. jyske Infanteriregiment, 1842 premierløjtnant ved 8. bataljon, 1849 kaptajn og 1864 major. Han deltog i Krigen 1848, som bragte ham Ridderkorset, og i de følgende felttog; særlig udmærkede han sig under Slaget ved Isted, da han var adjudant ved Schleppegrells division; han skulle overbringe generalens ordre til 13. bataljon om at gå rask frem, nåede Dragondelingen, som under løjtnant J.P.S. Nellemann var sendt frem imod Øvre Stolk, og ledede dennes angreb der på, hvorved han såredes. 5. august meldte han sig atter til tjeneste og blev souschef ved 2. division.