Duarte membantu mendanai dan menyemangati para pejuang Dominika selama Perang Kemerdekaan Dominika. Pada akhirnya ia bangkrut akibat dana yang terus dikucurkannya. Duarte juga tidak bersepaham dengan kaum royalis dan pro-aneksasi, terutama dengan tokoh militer Pedro Santana yang ingin bergabung kembali dengan Imperium Spanyol. Pada akhirnya Santana-lah yang berhasil unggul sementara Duarte harus pergi ke pengasingan. Duarte wafat di Venezuela pada tahun 1876.