En mayo de 1811, el ejército se reorganizó y Maucune fue ascendido para liderar una división. Esto inició un período de notable mala suerte. En Arapiles, en julio de 1812, su aislada división fue destruida por una combinación de ataques de infantería y caballería dirigidos por el teniente general Stapleton Cotton (más tarde vizconde de Combermere). En junio de 1813, los británicos sorprendieron a sus tropas en San Millán de la Cogolla. La división se perdió la batalla de Vitoria, pero ayudó a combatir la persecución aliada en Tolosa. Su división se dispersó en Sorauren a finales de julio de 1813 y en el Bidassoa en octubre. Después de estas derrotas, el mariscal Soult lo reemplazó por Jean François Leval. Enviado a Italia, fue derrotado en el río Taro en abril de 1814 mientras defendía contra probabilidades de tres a uno. Maucune es uno de los nombres inscritos bajo el Arco de Triunfo en la Columna 35.