מיליגן השתתף עם נבחרת הנוער בגביע העולם בכדורגל לנוער בשנת . במאי נכלל בסגל הנבחרת הבוגרת לקראת מונדיאל 2006 והיה הצעיר מבין שחקני הנבחרת. ב-7 ביוני 2006 ערך את הופעת הבכורה שלו בנבחרת במשחק ידידות נגד . בפברואר היה שותף לעלייה של הנבחרת למשחקי אולימפיאדת בייג'ינג. ב-3 במרץ 2010 הבקיע את שער הבכורה שלו בנבחרת בניצחון 0-1 נגד . בינואר זכה עם הנבחרת בגביע אסיה בכדורגל 2015.