En junio de 2016 se disputó la Copa del Mundo de Guadalajara, la primera competición internacional oficial de gimnasia rítmica que se celebró en España desde la Final de la Copa del Mundo en Benidorm (2008). El evento se desarrolló del 3 al 5 de junio en el Palacio Multiusos de Guadalajara con la asistencia de unas 8.000 personas en las dos últimas jornadas. Natalia obtuvo en Guadalajara el 12º puesto en la general y el 8º puesto en la final de cinta. Ese mismo mes participó en el Campeonato de Europa de Jolón, donde obtuvo el 19º puesto en el concurso general. El 25 de junio volvió a ser subcampeona de España en la general de la categoría de honor en el Campeonato de España Individual de Guadalajara. Fue además oro en cinta y plata en mazas, pelota y aro.