Loukaris studerede i Venedig og Padova, opholdt sig i længere tid i Nederlandene og i Schweiz, især i Geneve. Han blev patriark i Alexandria som "Kyrillos 3." i 1602 og patriark af Konstantinopel som "Kyrillos 1." i 1621. Han var det første betydningsfulde navn i den ortodokse kirke efter Konstantinopels fald i 1453 og havde som sådan stor indflydelse på dens historie i det 17. århundrede.