През априлските дни на 1925 г. е задържан в Дирекцията на полицията. За да не издаде съмишлениците си, Емил Марков се хвърля от IV етаж на Дирекцията. По една случайност остава жив. Осъден по ЗЗД и след четири и половина години затвор е освободен.