Die geplante Kanadische Konföderation stieß in New Brunswick jedoch auf heftigen Widerstand. Die neue Anti-Confederation Party gewann die Wahl im März 1865, während die Befürworter der Konföderation eine empfindliche Niederlage hinnehmen mussten; auch Tilley verlor seinen Sitz. Doch bereits ein Jahr später änderten sich die politischen Verhältnisse wieder grundlegend, da die Anti-Confederation Party auseinanderbrach. Im Mai 1866 kam es zu einer Neuwahl, die mit einem überwältigenden Sieg der Konföderationsbefürworter endeten. Tilley war im Dezember 1866 einer der Delegierten an der Londoner Konferenz, wo der British North America Act ausgehandelt wurde. Die Bezeichnung Dominion für den neuen Staat wird Tilley zugeschrieben, der vom Psalm 72:8 der King-James-Bibel inspiriert worden sein soll.