Der 1654 ausgebrochene Russisch-Polnische Krieg war wechselhaft und bedeutete für die Kosaken faktisch eine Fortsetzung des Chmelnyzkyj-Aufstands. Bei der Versammlung in Perejaslaw am 18. Januar 1654 leistete der Großteil der Kosakenanführer in Anwesenheit des russischen Bojaren und Botschafters Wassili Buturlin den Treueid auf Zar Alexei Michailowitsch. Nach dem Tod von Hetman Bohdan Chmelnyzkyj wurde am 16. September 1658 der Vertrag von Hadjatsch zwischen Vertretern Polen-Litauens und der ukrainischen Sitsch der Saporoger Kosaken unter Hetman Iwan Wyhowskyj und Pawlo Teterja geschlossen, der die Rückkehr des Hetmanats unter die nominelle polnische Herrschaft brachte. Dies spaltete die Kosakenreihen und stürzte die Ukraine in einen Bürgerkrieg. Nach dem Frontwechsel eines Teils der Kosaken wurde das russische Heer von einer Koalition der Polen, Kosaken und den Krimtataren am 8. Juli 1659 in der Schlacht bei Konotop geschlagen, worauf der Hetman Wyhowskyj trotz des Siegs gestürzt wurde.