Aparicio ha debuttato con la Nazionale di calcio a 5 della Spagna il 22 ottobre 2001 nel corso dell'amichevole vinta per 3-2 contro il . Con le furie rosse ha preso parte a due Coppe del Mondo, concluse entrambe al secondo posto, e vinto tre edizioni del campionato europeo. Nel complesso, ha giocato 118 partite mettendo a segno 45 reti. Al termine del campionato europeo 2012 annuncia il suo ritiro dalla Nazionale.