Em meados de 1942, as forças do Eixo derrotaram a força da Commonwealth na Líbia e avançaram para o noroeste do Egito. Em junho, o 8.º Exército Britânico se posicionou a pouco mais de 100 km a oeste de Alexandria, no ramal ferroviário de El Alamein, e a 9.ª Divisão foi levada adiante para reforçar essa posição. Os elementos principais da divisão chegaram à El Alamein em 6 de julho e a divisão foi designada a seção mais ao norte da linha defensiva da Commonwealth. A 9.ª Divisão desempenhou um papel significativo na Primeira Batalha de El Alamein, que interrompeu o avanço do Eixo, embora ao custo de pesadas baixas, incluindo todo o 2.°/28.° Batalhão de Infantaria, que foi forçado a se render em 27 de julho. Após esta batalha, a divisão permaneceu no extremo norte da linha de El Alamein e lançou ataques diversionistas durante a Batalha de Alam Halfa no início de setembro.