В период с ноября 1941 года по февраль 1943 года А. В. Забояркин находился на территории, оккупированной немецко-фашистскими войсками. После освобождения Красной Армией Большесолдатского района Александр Васильевич добровольно явился в штаб 240-й стрелковой дивизии 38-й армии, освобождавшей район, и 6 марта 1943 года был зачислен сапёром в 368-й отдельный сапёрный батальон. Боевое крещение принял на Воронежском фронте в ходе Харьковской оборонительной операции. С конца марта по август 1943 года участвовал в оборонительных боях на южном фасе Курской дуги восточнее города Сумы. В августе-сентябре 1943 года красноармеец А. В. Забояркин сражался за освобождение Левобережной Украины в ходе Сумско-Прилукской операции Битвы за Днепр. Особо отличился при форсировании Днепра.