У 1810 році Ігнацій Ледуховський вступив до армії Варшавського Великого герцогства в ранзі лейтенанта, служив у кінній артилерії. У вересні 1811 року став інженером військового гарнізону Гданська. Перед кампанією 1812 року повернувся на службу в артилерію. Під час російської кампанії Наполеона служив у ранзі капітана в X-у корпусі маршала Макдональда. Під час відступу французької армії з Росії 3 січня 1813 року був важко поранений у ногу, яку згодом ампутували. У червні 1813 року під час оборони Гданська нагороджений Хрестом Почесного легіону. У Кенігсберзі потрапив у полон до росіян.