С вторжением гитлеровской Германии в Грецию в 1941 году, Гипарис поспешил на Крит и принял участие в бою за Крит против парашютистов вермахта (см. Критская операция). После того как Крит был оккупирован немцами, Гипарис выбрался в Египет, где возглавил военную полицию греческих гарнизонов городов Александрия и Каир.