En 2003, le Gallois dispute quelques meetings en salle en vue de préparer la dernière compétition officielle de sa carrière, à savoir les Championnats du monde en salle. Il s'impose lors des meetings en salle d'Erfurt et de Glasgow et prend la deuxième place de celui de Dortmund. Le , devant son public de Birmingham, Colin Jackson tire un trait définitif sur sa carrière sportive en ne prenant que la cinquième place d'une finale du haies très relevée remportée par Allen Johnson devant Anier García et Liu Xiang. Membre de l'Ordre de l'Empire britannique depuis 1990 et Officier en 2000, Jackson est fait Commandeur en 2003.