Francisco Higino Lopes Carneiro nahm neben João Maria de Sousa, Hélder Vieira Dias, Roberto Leal Monteiro und Kundi Paihama als Angehöriger der Streitkräfte zur Befreiung Angolas FAPLA "(Forças Armadas de Libertação de Angola)" am Bürgerkrieg teil. Nach der Unabhängigkeit Angolas von Portugal am 11. November 1975 absolvierte er ein Studium der Militärwissenschaften, das er mit einem Magister "(Mestre em Ciências Militares)" abschloss. Er fand daraufhin verschiedene Verwendungen als Offizier und war unter anderem zwischen 1991 und 1995 Koordinator der Bildungskommission der Streitkräfte sowie Vize-Vorsitzender der Gemeinsamen Politisch-Militärischen Kommission. In den Jahren 1996 bis 1999 war er als Vize-Minister ohne Geschäftsbereich "(Vice-Ministro sem Pastas)" zuständig für die Koordinierung des Friedensprozesses nach dem Bürgerkrieg. 1988 wurde er Mitglied des Zentralkomitees (ZK) der Movimento Popular de Libertação de Angola (MPLA), dem er auch heute noch angehört. Des Weiteren wurde er 1998 Vize-Minister für Territorialverwaltung "(Vice-Ministro da Administração do Território)".