El "Plasmodi falcipar" ha existit des de fa 50.000–100.000 anys, tot i que la mida de la seva població no va augmentar fins fa uns 10.000 anys, al mateix temps que es produïren els avenços en la difusió de l'agricultura i el desenvolupament d'assentaments humans. Els parents propers dels paràsits humans de la malària continuen sent comuns amb els ximpanzés. Algunes evidències suggereixen que la malària de "P. falcipar" pot haver-se originat en goril·les.