W 2002 roku Víctor Púa powołał Munúę na Mistrzostwa Świata w Korei Południowej i Japonii. Na mundialu tym "Charrúas" zajęli trzecie miejsce w swojej grupie i odpadli z turnieju. Sam Munúa na azjatyckich boiskach był rezerwowym dla Fabiána Cariniego i nie wystąpił w żadnym z meczów. Łącznie dla drużyny narodowej rozegrał 21 pojedynków.