18 лютого 2016 року було оголошено що Харьянто стане бойовим пілотом команди Manor Racing у 2016 році. Його дебют відбувся 18 березня 2016 року на Гран-прі Австралії. Першу практику він закінчив на 19 місці, а другу на 14-му. Під часу третьої практики він потрапив до аварії на піт-лейні зіткнувшись із Роменом Грожаном, у результаті його було покарано штрафом у три позиції на стартовій решітці, та двома штрафними очками. У дебютній гонці Харьянто зійшов на 18 колі.