Becker kam 1933 als Sohn des Regisseurs Jacques Becker und von Geneviève Boyard in Paris zur Welt. Sein Bruder Étienne Becker war als Kameramann ebenfalls im Filmgeschäft tätig. Jean Becker begann seine Karriere 1953 als Regieassistent bei seinem Vater. Als solcher arbeitete er auch mit Julien Duvivier und Henri Verneuil zusammen. Von 1961 bis 1966 realisierte er drei eigenständige Regiearbeiten mit Jean-Paul Belmondo in der Hauptrolle; der letzte dieser Filme war "Geliebter Schuft". Von Mitte der 1960er bis Anfang der 1970er Jahre drehte er die Fernsehserie "Eine französische Ehe". Es folgte eine mehrjährige Regiepause. Erst 1983 meldete er sich mit "Ein mörderischer Sommer" als Regisseur zurück. Der Film über eine junge Frau, gespielt von Isabelle Adjani, die sich an den Vergewaltigern ihrer Mutter rächen will, lief 1983 im Wettbewerb um die Goldene Palme bei den 36. Internationalen Filmfestspielen von Cannes und erhielt insgesamt neun César-Nominierungen, die das Filmdrama in vier Preise umsetzen konnte.