O Exército Continental, ainda mais reduzido pelo término dos alistamentos que possuíam um curto prazo de duração, e em janeiro de 1776 reduzido pela metade para 9.600 homens, teve que ser complementado com milícias, e Knox juntou-se com artilharia pesada capturada do Forte Ticonderoga. Quando o Rio Charles congelou, Washington estava ansioso para cruzá-lo e invadir Boston, mas o general Gates e outros se opuseram a milícias não treinadas atacando fortificações bem guarnecidas. Washington concordou relutantemente em proteger a Fortificação de Dorchester Heights, trinta metros acima de Boston, em uma tentativa de forçar os britânicos a saírem da cidade. Em 9 de março, sob a escuridão, as tropas de Washington trouxeram grandes armas de Knox e bombardearam navios britânicos no porto de Boston. Em 17 de março, nove mil soldados britânicos e legalistas começaram uma caótica evacuação de Boston, que durou dez dias. Logo depois, Washington entrou na cidade com quinhentos homens, com ordens explícitas de não saquear a cidade. Ordenou a vacinação contra a varíola que teve um grande efeito, como fez mais tarde em Morristown, Nova Jersey. Se absteve de exercer autoridade militar em Boston, deixando os assuntos civis nas mãos das autoridades locais.