Il 14 gennaio 1989 Mahrer ottenne il successo più prestigioso della sua carriera vincendo la discesa libera della Streif di Kitzbühel e il mese dopo ai Mondiali di Vail nella medesima specialità fu 4º. Il 5 gennaio 1991 vinse la sua prima discesa libera della Kandahar di Garmisch-Partenkirchen e ai successivi Mondiali di Saalbach-Hinterglemm conquistò, sempre in discesa libera, la sua unica medaglia iridata, il bronzo.