El sistema natural de Moncul está formado por la microcuenca del río Moncul y por la laguna de Trovolhue. Esta microcuenca tiene una extensión de 48.800 ha aproximadamente y se origina a partir de una serie de riachuelos que drenan desde cerros de la cordillera de Nahuelbuta, principalmente desde el norte y el este hasta su lecho, el cual tributa en el río Imperial. En este sector, producto del hundimiento de la cordillera por efectos del terremoto y posterior maremoto de 1960 se forma una extensa planicie litoral, que dada su profundidad unos 10 km. antes de desembocar en el río Imperial, forma la laguna de Trovolhue de aproximadamente 280 ha.