Kolme neljäsosaa Międzyrzec Podlaskin asukkaista (noin 12 000) oli juutalaisia 1930-luvun lopussa. Neuvostoarmeija valtasi kaupungin syyskuun lopussa 1939. Neuvostojoukot antoivat kaupungin kuitenkin Saksalle, mikä oli osa Molotov–Ribbentrop-sopimusta. Antautumisen jälkeen noin 2 000 juutalaista jätti kaupungin ja muutti neuvostoliittolaisten hallinoimalle alueelle. Międzyrzec Podlaskiin nousi pian getto, jossa oli parhaimmillaan jopa 20 000 vankia. Getto tuhottiin 17. heinäkuuta 1943. Kun viimeiset 160–200 asukasta ammuttiin, kaupunki julistettiin virallisesti vapaaksi juutalaisista. Alle 1 % juutalaisasutuksesta selviytyi saksalaisvaltauksesta.