No último jogo da temporada, no dia 22 de maio de 2011, sofreu uma nova lesão, desta vez no ombro, após sofrer falta do zagueiro Cristián Zapata, da Udinese. A lesão aconteceu às vésperas da Copa América, competição que viria a disputar logo em seguida, tendo tempo hábil para sua recuperação. Ao lado de Ibrahimović, Pato terminou a temporada como artilheiro do Milan no Campeonato Italiano; ambos marcaram 14 gols.