После Октябрьской революции принимал участие в Гражданской войне на стороне Красной армии. В 1918 году — командир 1-го авиаотряда Сибири в армии Сергея Лазо в Забайкалье. После передислокации отряда в Спасск был вызван во Владивосток по делам, связанным с обеспечением отряда. Его приезд совпал с восстанием Чехословацкого корпуса во Владивостоке, в результате которого Сущинский оказался на территории, занятой белыми. Несколько месяцев он скрывался, но после объявления Колчаком всеобщей мобилизации был отправлен в Спасск инструктором авиашколы, находившейся в то время под контролем белых. В апреле 1920 года Спасск заняли японские интервенты, и он ушёл в сопки с красными партизанами, где находился до окончания боевых действий.