Ele ainda participou dos Jogos Paralímpicos de Verão de 2020 em Tóquio, onde, após prova com ultrapassagem na última curva, conquistou a medalha de ouro ao se consagrar campeão na corrida de metros na classe T11, estabelecendo novo recorde continental (15min13s76), ganhando sua primeira medalha nos Jogos Paralímpicos e a primeira do Brasil no Atletismo em Tóquio 2020. No Japão, Yeltsin Jacques conquistou sua segunda medalha de ouro e ajudou o Brasil a chegar à marca de 100 (cem) medalhas de ouro na história dos Jogos Paralímpicos, ainda quebrando o recorde mundial dos 1 500 metros da classe T11, marcando 3 minutos, 56 segundos e 60 centésimos.