Gunther wurde 1896 als Tochter des aus Deutschland eingewanderten Juweliers Casper Gunther und dessen Ehefrau Susannah Ehren geboren. Sie erwarb 1919 an Columbia University einen Bachelor of Arts in Anthropologie bei Franz Boas und 1920 einen Master of Arts. Nach ihrer Promotion ging sie mit ihrem Ehemann Leslie Spier 1921 an die University of Washington mach Seattle. Nach einer kurzen Auszeit setzte sie ihre Lehrtätigkeit 1929 fort. Nach ihrer Scheidung im Jahr 1930 und dem Wegzug von Spier blieb Gunther an der Universität. Sie wurde Dekanin des Fachbereichs Anthropologie und 1930 Leiterin des Washington State Museum (heute Burke Museum). 1962 war sie für die Ausstellung indianischer Kunst des Nordwestens bei der Weltausstellung in Seattle verantwortlich. Im Jahr 1966 wechselte sie auf den Lehrstuhl für Anthropologie an der University of Alaska Fairbanks. Doch bereits nach drei Jahren ging sie zurück nach Seattle an die University of Washington.