Años más tarde, como consecuencia de las invasiones inglesas al Río de la Plata, la familia se radicó en Córdoba. Una vez allí, la familia lo anotó en el Colegio de Monserrat y posteriormente se inscribió en la Universidad de esa ciudad. Lafinur obtuvo diplomas de bachiller, licenciado y maestro de artes, pero fue expulsado de la Universidad en 1814 por su mal carácter y por su oposición a la política de la Logia Lautaro. Logró cursar tres grados: bachiller, licenciado y maestro de artes (filosofía) y le quedaron pendientes los cursos de teología.