El cerro de San Juan volvió a ser testigo de los acontecimientos históricos de la ciudad en los años 1860, en el contexto del segundo conflicto franco-mexicano. Después de la derrota en la Batalla de Puebla, las fuerzas francesas se replegaron hacia Veracruz a fin de alistarse para una segunda incursión en territorio mexicano. A principios de marzo de 1863, conseguidos los refuerzos necesarios, las tropas comandadas por el general Frédéric Forey se encaminaron hacia Puebla, defendida por el general Jesús González Ortega, quien había asumido el mando del Ejército de Oriente tras la muerte de Ignacio Zaragoza.