Após o colapso da monarquia francesa, André Michaux, que era um botânico real, perdeu sua fonte de renda. Ele ativamente pressionou a American Philosophical Society para apoiar sua próxima exploração. Seus esforços foram recompensados ​​e, no início de 1793, Thomas Jefferson pediu-lhe para empreender uma expedição de exploração para o oeste, semelhante à Expedição Lewis e Clark, conduzida por Meriwether Lewis e William Clark uma década depois. Na época da expedição planejada de Michaux, Lewis era um protegido de Jefferson, de 18 anos, que pediu para ser incluído na expedição e foi recusado por Jefferson.