Margarita Pellegrin studierte von 1958 bis 1961 an der ABF der HfBK Dresden, wo sie ihren späteren Mann, den chilenischen Maler Hernando León, kennenlernte. Im Jahre 1963 folgte sie ihm nach Chile. Von 1964 bis 1969 arbeitete sie als Assistentin für Grafik und von 1969 bis 1974 als Dozentin für Gestaltungslehre an der Universidad de Chile in Antofagasta. Nach dem Militärputsch im September 1973 kehrte sie 1974 mit ihrem Mann und den drei Kindern in die DDR zurück. Seitdem lebte und arbeitete sie in Dresden als freiberufliche Künstlerin u. a. in den Bereichen Textilgestaltung (bis Ende 80er Jahre), Malerei, Grafik, Installationen und Grafikdesign (ab 90er Jahre). 2003 übernahm sie Buch, Regie, Produktion und Gestaltung im Animationsfilm „Der Fall“.