In seguito alla retrocessione, determinata dallo spareggio perso contro la , nella stagione 2003-04 l'Atalanta torna in Serie B (l'ultima partecipazione al campionato cadetto era stata quella del 1999-2000, in cui gli orobici si erano classificati al secondo posto): per la prima volta, la seconda divisione conta 24 squadre (a seguito del blocco delle retrocessioni, innescato dal Caso Catania).