En , la Fédération écossaisse annonce que le contrat de Vern Cotter ne sera pas reconduit au-delà de , le rôle de sélectionneur étant confié à Gregor Townsend. En septembre de la même année, le club de Montpellier officialise l'arrivée de Vern Cotter à partir de la saison 2017-2018, en remplacement de Jake White. Lors des tests de novembre, la sélection écossaise est proche de la victoire face à l'Australie, défaite , avant deux victoires face à l'Argentine et la Géorgie. Lors de la dernière compétition disputée avec Vern Cotter à sa tête, l'Écosse termine à la quatrième place du tournoi 2017, avec le même nombre de points que l'Irlande deuxième et la France troisième : trois victoires à domicile contre l'Irlande, le pays de Galles et l'Italie et deux défaites contre la France et l'Angleterre. Au terme de son contrat, il présente un bilan de en , soit 53 % de victoires. Celui-ci est le plus élevé depuis le début de l'ère professionnelle pour un sélectionneur écossais. C'est également le meilleur bilan depuis Ian McGeechan durant sa période de 1988 à 1993.