Kurz nach dem Sumatra-Andamanen-Beben im Indischen Ozean am 26. Dezember 2004 verbannten einige Radiostationen das Lied vorübergehend aus ihrer Rotation. Schätzungsweise starben durch das Beben und seine Folgen etwa 230.000 Menschen, davon allein in Indonesien rund 165.000. Über 110.000 Menschen wurden verletzt, über 1,7 Millionen Küstenbewohner rund um den Indischen Ozean wurden obdachlos. Neben "Die Flut" wurden auch Titel wie "Perfekte Welle" von Juli oder auch "Land unter" von Herbert Grönemeyer vorübergehend aus dem Programm genommen. Der SWR3-Sprecher Frank Bischoff erklärte beispielsweise, dass es nicht passen würde, wenn solche Titel jetzt gespielt würden.