Pour ses débuts, Nakajima est titularisé par Sérgio Conceição au poste d'attaquant le en phase qualificative de la Ligue des champions contre le FK Krasnodar. Porto perd la rencontre 2-3 et se fait éliminer de la compétition, une première pour le club depuis 2010. Le , il entre en jeu en Liga NOS face au Vitória Setúbal (victoire 4-0).