Philip Allen genoss zunächst eine private Ausbildung und besuchte dann die "Taunton Academy" sowie die "Robert Rogers School" in Newport. Anschließend studierte er bis 1803 am "Rhode Island College", der heutigen Brown University. Danach wurde er Kaufmann in der Firma seines Vaters, die unter anderem im Außenhandel tätig war. Als dieser während des Britisch-Amerikanischen Kriegs von 1812 durch militärische Maßnahmen zum Erliegen kam, verlegte sich Allen auf die Herstellung von Bekleidungsartikeln aus Baumwolle.