El conflicto latente de Pepelyayev con Kolchak llegó a un punto crítico a mediados de diciembre de 1919 cuando emitió amenazas de arrestar al almirante blanco. Fueron reconciliados por Viktor Pepelyayev antes que Anatoly fuera discapacitado por tifus y transferido por convalecencia a Harbin. Los restos de su ejército se unieron al de Vladimir Kappel y cruzaron el congelado lago Baikal durante la Gran Marcha Helada Siberiana.