Bei den Biathlon-Weltmeisterschaften 1997 in Osrblie gewann Favre mit der italienischen Staffel die Bronzemedaille. Zwei Jahre später gewann er bei den Biathlon-Weltmeisterschaften 1999 in Kontiolahti die Silbermedaille im Sprint. In der Saison 1994/95 wurde er hinter Jon Åge Tyldum Zweiter des Gesamtweltcups. Patrick Favre nahm 1994 und 1998 an den Olympischen Winterspielen teil. Im Jahr 2001 beendete er seine Laufbahn als Biathlet. Favre war Mitglied der Sportfördergruppe der italienischen Alpini.