Bald nach dem Tod Philipps IV. konnte sich Watteville erneut öffentlich des Vertrauens des spanischen Königshauses erfreuen und wurde 1666 von der spanischen Regentin, der Königinwitwe Maria Anna von Habsburg, als außerordentlicher Botschafter nach Rom versetzt, wo er mit seinem Bruder, dem spanischen Botschafter in den Schweizer Kantonen, Jean de Watteville, bei der Vorbereitung eines Defensivbündnisses kooperierte, das die Sicherheit der Freigrafschaft Burgund garantieren sollte. Er nahm dann im Zuge des Restaurationskriegs an Verhandlungen zur Verteidigung der umstrittenen Freigrafschaft Burgund teil, die von den Franzosen beansprucht wurde (die zuvor Portugal, sogar mit Expeditionstruppen unter Marschall Friedrich von Schomberg aktiv gegen Spanien unterstützt hatten). Um 1668 wurde Watteville der neue spanische Botschafter in Portugal, wo er 1670 verstarb. Kurz vor seinem Tod war er von Maria Anna von Habsburg noch zum Ritter des Orden vom Goldenen Vlies ernannt worden.