В период Второй интифады популярность Дахлана несколько упала в результате его антитеррористической позиции и умеренных взглядов. Дахлан критиковал Арафата и партийную руководство ФАТХа за коррумпированность, и в начале интифады активно противодействовал организации терактов на территории Израиля. Он всегда подчёркивал, что борьба с евреями допустима только в пределах границ 1967 года, и должна быть «народной».