Da Jugoslawien bis Ende November 1918 große Teile Südkärntens besetzt hatte und die gerade erst konstituierte Staatsregierung in Wien diesen Entwicklungen nichts entgegensetzen konnte, wurde die Kärntner Landesversammlung eigenmächtig aktiv. In der Sitzung am 5. Dezember 1918 brachte Fritz Dörflinger, gemeinsam mit Florian Gröger (SDAP) und Konrad Walcher (CSP), einen Dringlichkeitsantrag auf Widerstand gegen die jugoslawischen Gebietsansprüche ein. Im folgenden sogenannten Kärntner Abwehrkampf und im Vorfeld der Kärntner Volksabstimmung engagierte er sich militärisch wie politisch in der Verteidigung des Landes; er war Kommandant der "Abwehr-Kompagnie Klagenfurt" und im Kärntner Heimatdienst aktiv.