Командовал отрядом красногвардейцев и матросов под Пулковом против войск Керенского — Краснова. В ноябре 1917 года был послан во главе Северного летучего отряда на Украину, участвовал в боях на Донбассе в составе Южного революционного фронта по борьбе с контрреволюцией. «Социалистическая армия» под командованием Сиверса заняла 10 февраля 1918 года Таганрог, 23 февраля — Ростов-на-Дону. После изгнания красных с Дона (см. ниже ) командовал 5-й советской армией (март—апрель 1918 года) против немецких войск на Украине, а с лета 1918 года — Особой бригадой (с сентября — 1-я Особая украинская бригада) в составе 9-й армии Южного фронта в боях против Донской армии. Был тяжело ранен 15 ноября 1918 года в бою под деревней Желновка и от полученных ранений скончался 8 декабря.