Nach einer insgesamt unbefriedigenden Saison bei den Bayern wechselte Effenberg im Sommer 1992 in die Serie A zum AC Florenz. Wiederum erzielte er in seinem ersten Punktspiel sein erstes Tor für den neuen Verein mit dem Treffer zum 1:0 im Spiel gegen den FC Genua 1893 (Endstand 1:1). Trotz eines hochkarätig besetzten Kaders – u. a. spielten Brian Laudrup, Francesco Baiano und der Argentinier Gabriel Batistuta in der Mannschaft – fand sich der Verein am Ende der Saison auf dem 16. Tabellenplatz wieder und musste absteigen. In der nächsten Saison (1993/94) wurde Effenberg in der Serie B von Claudio Ranieri trainiert und stieg mit der Mannschaft direkt wieder auf.