Durante o século XX, haveria vários episódios de genocídio contra as minorias indígenas como parte das políticas de limpeza étnica. O Império Otomano cometeria genocídios contra as minorias armênias, assírias e gregas em seu território. Na Alemanha nazista, programas de extermínio seriam realizados contra judeus (Holocausto) e ciganos (Porajmos), os poloneses eram considerados racialmente inferiores, então uma campanha de destruição da identidade cultural polonesa foi iniciada, além de substituir a população indígena polonesa por colonizadores alemães. Na União Soviética, foi feita uma tentativa de destruir a população indígena ucraniana por meio do holodomor, termo polêmico até hoje, e foram estabelecidos programas de transferência populacional que afetaram as populações Vainakh (Operação Lentil, durante o qual nomes locais na Chechênia e na Ingushetia foram substituídos por outros russos; mesquitas e cemitérios foram destruídos, e uma campanha massiva queimou incontáveis ​​manuscritos, livros e patrimônio inestimável no estilo histórico de Nakh) e os povos bálticos (Operação Priboi)