Con el cambio de sistema de Marcelo Bielsa, en el que el esquema pasó del 4-4-2 al 4-3-3, perdió su puesto de titular. A pesar de ello, disputó 56 partidos de los 63 posibles, en los que marcó cinco goles. El 12 de enero de 2012, consiguió anotar un gol de tacón ante el Albacete.No pudo ganar ninguna de las dos finales disputadas, ni la de UEFA Europa League ni la de la Copa, en las que participó saliendo desde el banquillo.En la segunda temporada de Marcelo Bielsa, solo jugó 600 minutos repartidos en 22 partidos. El 30 de agosto de 2012 anotó su primer gol en competición europea ante el HJK Helsinki. El 28 de noviembre de 2012, consiguió anotar su primer gol en la fase de grupos de la UEFA Europa League ante el Hapoel Kiryat Shmona.Con la llegada de Ernesto Valverde en 2013 su rol en el equipo no cambió demasiado, disputó 670 minutos repartidos en 21 partidos. En el verano de 2014 el Athletic llegó a un acuerdo de cesión con la SD Eibar, pero el jugador prefirió quedarse.El 30 de septiembre de 2014 debutó en Champions League en la derrota ante el BATE Borisov por 2-1. Su último partido como jugador del Athletic lo disputó el 7 de marzo de 2015, en la victoria obtenida por 1-0 ante el Real Madrid.Durante la temporada 2014-15 solo jugó cinco partidos sumando un total de 50 minutos y tampoco fue convocado para la final de Copa de Rey de 2015.