Kowalczuk absolvierte ein Studium an der Universität Danzig und in Warschau. Anschließend arbeitete er mehr als zwölf Jahre als Lehrer, unter anderem als Erzieher von behinderten Kindern. Im Jahr 2010 wurde er Leiter der Abteilung für soziale Kommunikation im Danziger Rathaus. Kowalczuk gehörte zu dem Team, das die Fußball-Europameisterschaft 2012 vorbereitete. Drei Jahre später wurde er stellvertretender Direktor der Abteilung Bildung der Stadt. Im April 2014 übernahm er die neu geschaffenen Abteilung für soziale Entwicklung.