En 1947, participaran en la guerra civil, a lado del Partido Liberal, Partido Comunista Paraguayo y Militares Institucionalistas, contra el Partido Colorado. Finalmente, los colorados ganaron la guerra e impusieron un régimen unipartidario, penas, asesinatos y persecuciones por lo que la mayoría de los conjurados tuvieron que exiliarse, nuevamente.