В годы Великой Отечественной войны — офицер Минно-торпедного управления ВМФ, по служебным делам находился на Белом, Балтийском, Чёрном, Каспийском морях, Тихом океане. На подводной лодке ходил в Турку и Хельсинки. Дважды корабли, на которых служил Логвинович, получали прямые попадания бомб и один раз перенесли торпедную атаку. Участник операций «Северный конвой» по проводке англо-американских караванов морских судов в Архангельск. Участвовал в разработке плавающих фугасов для подрыва речных переправ противника. Войну закончил в Севастополе.