На драфте Паттон был выбран командой Чикаго Буллз под 16-м общим номером. Сразу же после драфте права на игрока были переданы клубу Миннесота Тимбервулвз по двустороннему соглашению между клубами и обмену Джимми Батлера на Зака Лавина, Криса Данна и право драфта Лаури Макканена. 4 июля 2017 года Пэттон заключил договор с «Тимбервулвз». Паттон должен был участвовать в летней лиге НБА 2017, но получил травму во время тренировки (перелом левой ноги) и был немедленно прооперирован, после чего временно отстранен на неопределённый срок. Дебютировал Джастин 1 апреля 2018 года против Юта Джаз. Его команда проигрывала 27 очков, и оставалось играть 3 минуты 44 секунды в четвёртой четверти. Паттон забил 2 очка, сделал перехват. 18 апреля 2018 года Джастин перенес еще одну операцию на левой ноге, чтобы ускорить восстановление после травмы, произошедшей прошлым летом. Команда объявила о том, что Пэттон на неопределенно время отстранен от игр за клуб. Большую часть дебютного сезона баскетболист провел в команде Айова Вулвз, где 28 раз выходил в стартовом составе. Средние показатели за игру составили 12,7 очков и 5,4 подбора за 23,2 минуты.