Sin embargo, la larga crisis de la Heimwehr comenzó poco después, cuando en junio de 1921 la organización bávara hermana fue disuelta y cesó la ayuda financiera húngara a causa de la disputa por el control del Burgenland. La pérdida de la colaboración bávara desbarató los avances en la coordinación de las fuerzas en la capital y en la Baja Austria. Aunque la influencia bávara en los círculos paramilitares austriacos continuó hasta el fracaso del golpe de Múnich de noviembre de 1923, la marcha de Kanzler en agosto de 1921 supuso el comienzo de un periodo de competencia entre las distintas organizaciones alemanas decididas a dominar la situación en Austria. La intromisión de las organizaciones alemanas estorbó la cooperación entre las distintas formaciones austriacas. A estos acontecimientos se unió el fracaso de los dos intentos de recuperar el trono del exemperador Carlos, que reavivaron las disensiones entre legitimistas y nacionalistas alemanes y debilitaron todavía más a la Heimwehr.