修理後の1944年（昭和19年）6月、第二航空戦隊（隼鷹、飛鷹、龍鳳）はマリアナ沖海戦に参加。同海戦で飛鷹が撃沈され、隼鷹も損傷した。修理と共に対空火器を増設。10月下旬よりフィリピン方面輸送作戦に従事、レイテ沖海戦には参加していない。12月9日、長崎沖合でアメリカの潜水艦の雷撃で損傷し佐世保に帰投した。