Mike Fountain spielte zunächst in kleineren Juniorenligen, bevor er 1990 in die Ontario Hockey League wechselte. Hier war er für die Sault Ste. Marie Greyhounds und Oshawa Generals aktiv. Beim NHL Entry Draft 1992 wurde der Torhüter von den Vancouver Canucks in der zweiten Runde an 45. Stelle ausgewählt. Anschließend war er für die kanadische Nationalmannschaft bei der Junioren-Weltmeisterschaft 1992 aktiv.