Po roce 1212 začíná mít republika vážné finanční problémy a musí zavádět nové daně, mimo jiné i kvůli vedení nákladných válek s Benátkami a Pisou. Z důvodu Saladinova vítězství nad Jeruzalémským královstvím bylo vážně narušeno odbytiště ve svaté zemi a Byzantská říše přestala na několik desítek let existovat. Přesto se Janovu dařilo prosperovat, období vnějšího míru ale znovu umožnilo vzestup vnitřních problémů. Toto střídání vnějších a vnitřních rozporů je příznačné pro celou historii Janovské republiky. I proto byli v roce 1215 pro zajištění nestranné justice zaměstnáni profesionální zahraniční soudci. V roce 1216 byl navždy zrušen úřad konzulů, neboť boje o tyto úřady často způsobovaly rozbroje a byl dále posílen úřad "podestá". Mimo jiné i pro zajištění klidu v Ligurii se Janov následně připojuje k neúspěšné křížové výpravě do Egypta, krom toho se zaplétá do dalších válek s Benátkami a Pisou. V následné mírové dohodě Benátky mimo jiné slibují zajistit obnovení obchodních privilegií Janova v následnických státech Byzantské říše.