Победив прусскую армию в битве при Йене и Ауэрштедте, Наполеон вошёл в 1806 году в Пруссию. 25 октября 1806 года французский император посетил гарнизонную церковь и признался своим генералам, что победа над Пруссией далась бы ему не так легко, если бы ему противостоял такой полководец как Фридрих Великий. В знак уважения к личности Фридриха II и признания его военных заслуг Наполеон предоставил гарнизонной церкви личную защиту. К королевским могилам в гарнизонной церкви приходили и Фридрих Вильгельм III со своей супругой Луизой вместе с императором Александром I, чтобы скрепить свой союз.