1914 yılında Akdeniz'de ilk Müttefik Deniz Kuvvetleri Komutanı oldu. Müttefiklerin Akdeniz Kuvvetleri Komutanı olmasına rağmen Birleşik Krallık'ın savaş gemileri yönetimi altında değildi. 1914'te komutası altında 2 dreadnought, altı yarı dreadnought, tüm zırhlı savaş gemileri ile yirmi dört kruvazör bulunmaktaydı. Savaşın başında ticaret rotalarının ve Kuzey Afrika'ya ulaşım yollarının güvenliğine önem vermiştir. De Lapeyrère 1914'te Alman savaş kruvazörü "Goeben" ve hafif kruvazörü "Breslau"'nun Akdeniz'den Osmanlı karasularına kaçışı yüzünden de ağır eleştirilere uğramıştır. Önemli başarılara rağmen, yönetimi altındaki Fransız donanması, Avusturya-Macarisan ve İtalyan kuvvetleri ile standart denizcilik talimlerine hazırken, Alman u-bot'larına karşı girişilecek bir savaş için yetersizdi. Nitekim bir Alman denizaltısı tarafından torpillenen zırhlı kruvazör Léon Gambetta'nın ardından 10 Ekim 1915'te istifa etti.