W reprezentacji Wybrzeża Kości Słoniowej Gérard Gnanhouan rozegrał do tej pory 6 meczów. Występował w eliminacjach do Mistrzostw Świata 2006, jednak stracił miejsce w składzie na rzecz Jeana-Jacques'a Tizié po porażce 2:3 z Kamerunem we wrześniu 2005. W 2006 był rezerwowym bramkarzem na Pucharze Narodów Afryki (2. miejsce) oraz Mistrzostwach Świata w Niemczech, z których jego drużyna odpadła po fazie grupowej.