Dopo aver annunciato il suo ritiro da allenatore al termine dell’esperienza bergamasca (in seguito aveva anche rifiutato la panchina dell’Udinese Calcio), il 17 aprile 2019 è nominato commissario tecnico della nazionale albanese fino al termine delle qualificazioni a Euro 2020. Nel 2020 ottiene la promozione in Nations League B con la vittoria per 3-2 contro la Bielorussia all'ultima giornata.