С апреля 1792 года, с первых же дней войны против первой антифранцузской коалиции, Мортье находился на фронте, где сражался против интервентов в рядах Северной армии. Боевая обстановка, природные дарования и блестящее образование способствовали быстрому приобретению необходимого армейского опыта и освоению военного дела. Уже в первых боях с интервентами Мортье зарекомендовал себя не только бесстрашным воином, но и способным командиром.