En accord avec les parties concernées, la Fédération de la République tchèque de football hérite, dans la continuité, du siège de membre de la Fédération tchécoslovaque de football à la FIFA et à l'UEFA, tandis que la fédération slovaque de football doit formuler une demande d'affiliation. La sélection tchèque, héritière principale de la sélection tchécoslovaque, fait ainsi ses débuts en février 1994 et réalise sa première grande performance deux ans plus tard en atteignant la finale de l'Euro 1996. Elle sera encore demi-finaliste de l'Euro en 2004. La sélection slovaque, qui avait été de son côté recréée de façon informelle dès juin 1992 fait également officiellement ses débuts en . Elle participe pour la première fois à la Coupe du monde de football en 2010 en battant notamment son voisin tchèque.