Moret geriet 1986 in die öffentliche Kritik, weil nach einem Grossbrand im Sandoz-Werk Schweizerhalle der Rhein mit Chemikalien verseucht wurde. Er war Hauptarchitekt der Fusion von Sandoz mit der ebenfalls in Basel angesiedelten Ciba-Geigy AG zur Novartis AG, die 1996 verkündet wurde. Es handelte sich dabei um die bis zu diesem Zeitpunkt grösste Unternehmensfusion. Leiter der neuen Gesellschaft wurde Daniel Vasella, der Ehemann einer Nichte Morets.