Nach der italienischen Annexion Albaniens 1939 kehrte Fundo nach Korça zurück und arbeitete bis zu seiner Entlassung 1940 als Gymnasiallehrer. In dieser Zeit war er im (nichtkommunistischen) Untergrundkampf gegen die Besatzungsmächte aktiv. 1941 wurde er verhaftet und auf die italienische Internierungslagerinsel Ventotene deportiert. Nach dem Zusammenbruch des italienischen Faschismus 1943 aus der Haft befreit, ging er zurück nach Albanien. Dort wurde er im September 1944 von kommunistischen Partisanen gefangen genommen und auf Befehl von Enver Hoxha, der eine Weisung des Komintern und Titos ausführte, als Trotzkist und Renegat vor den Augen von Angehörigen der britischen Militärmission zu Tode geprügelt.