Babak gugur Piala Negara-Negara Afrika 2019 adalah babak kedua dan terakhir putaran final Piala Negara-Negara Afrika 2019, setelah sebelumnya 16 tim peserta melaju dari babak grup. Babak ini menggunakan sistem gugur dengan terdiri atas babak 16 besar, perempat final, semifinal, perebutan tempat ketiga, dan pertandingan final. menjuarai turnamen setelah mengalahkan pada pertandingan final, sementara meraih juara ketiga setelah mengalahkan pada pertandingan perebutan tempat ketiga.