После сезона, на Драфте НХЛ 2003 года, он был выбран в 1 раунде под общим 5-м номером клубом «Баффало Сейбрз». Такой высокий номер на драфте является рекордом для хоккеистов Австрии. Второй сезон за «Миннесоту» не принёс столько наград, сколько дебютный. Вместе с командой Ванек вновь выиграл лишь чемпионат WCHA. Как и в прошлом году он вошёл во вторую Сборную всех звёзд лиги. Результативность также немного снизилась: 51 (26+25) очко в 38 играх. Ванек занял пятое место среди бомбардиров лиги.