Regresó a Portugal a mediados de 1910, y fue entonces destinado a la segunda División Militar (Viseu). Poco tiempo después, en el 5 de octubre de 1910, se produjo la proclamación de la República Portuguesa. Norton de Matos se ofreció para servir al nuevo régimen, habiéndose adherido al Partido Democrático de Afonso Costa. Fue ascendido al rango militar de Mayor y llegó, más tarde, a Jefe del Estado Mayor de la 5.ª División Militar. El 17 de mayo de 1912 se inicia como masón en la Logia Patria y Libertad, Nº 332, Lisboa (Rito Escocés Antiguo y Aceptado), bajo los auspicios del Gran Oriente Lusitano Unido, con el nombre simbólico de "Danton".