En octubre de 1860, bombas fétidas fueron arrojadas en el Gran Teatro de Varsovia, donde se encontraban presentes el zar Alejandro II y el emperador Francisco José I. El 27 de febrero de 1861, una muchedumbre polaca que protestaba contra la administración zarista fue aplacada por las tropas rusas, muriendo cinco personas. En 1863 se inició el Levantamiento de Enero, cuya derrota trajo como consecuencia inmediata la disolución del Congreso de Polonia y la anexión oficial al Imperio ruso. Se intensificó la rusificación de Polonia, quedando la administración pública y los colegios bajo control ruso.