雍正七年（1729年），大清宁远大将军岳钟琪征讨准噶尔时在巴尔库尔城西（今新疆哈密市巴里坤县境内）发现了裴岑碑并迁往将军府。但也有学者认为早在康熙五十四年（1715年），张寅的《西征纪略》之中“原上有碑，篆文甚古，只新全师三字可识，余悉漫漶”是对此碑的描述。石碑被发现后有言论表示石碑已于乾隆二十二年（1757年）被裘文达公移置敦煌，但有学者指出嘉庆十年（1805年），王昶的《金石萃编》以及1941年吕少卿的《重修敦煌县志》都表示石碑一直保存在城北门外的关帝庙的碑亭处，裘只是拓得拓本带回内地，从而天下皆知。纪昀曾在《阅微草堂笔记》中谈到：““其事不见后汉书，然文句古奥，字划浑朴，断非后人所依托。以僻在西域，无人拓摹，石碑锋棱犹完整。”可见当时石碑的完整程度，后因棰拓次数过多，石碑遭到了损伤并导致后来的拓片质量越来越差，以至于关于石碑内容出现了分歧。1931年，马仲英进军新疆，守城军烧毁关帝庙，该碑被烧裂。时任民众教育馆馆长张钧对石碑进行了简单修复后运往仙姑庙的月光楼。然而该年正逢大旱，有人认为是因为移走了石碑故又把石碑迁反原址，不料石碑在过程中破裂。现该碑藏于新疆维吾尔自治区博物馆内。清乾隆五十一年（1786年）申兆定摹刻了一块四面刻字的石碑，现藏于西安碑林博物馆。