בעקבות הצלחותיו במצרים, במאי 1916 מונה פייטון למזכירו הצבאי של סר דאגלס הייג, ושרת עמו בפלנדריה עד מרץ 1918. בשנת 1917 קיבל תואר אבירות, מידיו של המלך ג'ורג' החמישי שערך ביקור אצל הכוחות בשטח. באפריל 1918 מונה למפקד הארמייה החמישית, במקומו של יוברט גוף שפוטר לאחר מבצע מיכאל. הארמייה שלו הוצבה בכוחות העתודה, ולא לקחה חלק בקרבות. ב-23 במאי הועבר הפיקוד על הארמייה לוויליאם בירדווד (שפיקד עליה עד סוף המלחמה), ופייטון הועלה לדרגת לוטננט גנרל באופן זמני. הוא קיבל פיקוד על הקורפוס ה-10, ופיקד עליו במשך שישה שבועות עד יוני, בלי להשתתף בקרבות. ב-3 ביולי הוא מונה למפקד הדיוויזיה ה-40, והוביל אותה בקרבות בפלנדריה במהלך מתקפת מאה הימים. הוא פיקד על הדיוויזיה עד מרץ 1919.