1941年12月24日任北高加索军区格罗兹尼等几所步兵学校组成的独立第16学员旅旅长，编入北高加索军区的第56集团军，参加了收复罗斯托夫的战役。1942年3月30日任北高加索军区第44集团军师长。1942年5月29日任师长。在斯大林格勒会战中，1942年10月指挥步兵第138师转隶给了瓦西里·伊万诺维奇·崔可夫的第62集团军，渡过伏尔加河进入斯大林格勒工厂区“街垒”工厂以北宽700米，深400米的废墟阵地，背靠伏尔加河岸，北、西、南三面受敌，坚持了100个日夜，直到43年1月25日发动反攻。这块阵地后来被称为柳德尼科夫岛。1943年2月15日步兵第138师改称近卫步兵第70师。柳德尼科夫中将从6月1日开始指挥步兵第15军，参加库尔斯克会战，9月22日在切尔诺贝利以北地域强渡第聂伯河并固守并拓展登陆场，为此于1943年10月16日苏联最高苏维埃主席团授予其苏联英雄称号（1892号）。1944年5月27日升任第39集团军司令，隶属于伊万·丹尼洛维奇·切尔尼亚霍夫斯基指挥的白俄罗斯第3方面军。1944年6月开始的在白俄罗斯会战中，率部与波罗的海第1方面军阿法纳西·帕夫兰季耶维奇·别洛博罗多夫上将指挥的第43集团军配合在维捷布斯克地域只花了3天围歼德国第三装甲集团军下属的5个师，此即维捷布斯克-奥尔沙进攻战役。随后，第39集团军临时配属波罗的海第1方面军参加了波罗的海进攻战役，任务是攻占陶格夫匹尔斯–帕布拉德一线，进一步攻取考那斯与希奥利艾。8月1日第39集团军进抵拉塞尼艾–苏瓦乌基一线，沿着尼曼河的东普鲁士边界。受命进攻陶拉格，以切断德军渡过尼曼河退往蒂尔西特的道路。10月9日攻入东普鲁士，占Augstogallen，在6天攻势中推进了150 km。东普鲁士战役，1944年10月17日第39集团军发起进攻庫迪爾科斯-瑙梅斯蒂斯、、，遇到顽强抵抗，一周仅前进了21km。1945年1月13日东普鲁士战役转入总攻，由于大雾阻碍了炮火准备，柳德尼科夫决定把所有坦克与自行火炮集中到以南的次要突破地域，指向蒂尔西特西北，以达成对德军因斯特堡集团的突然性，当天下午16时天气好转后，发起进攻，至22时突入了12–16 km。1月17日，近卫第5与第94军突破了贡宾嫩防线，攻入、。1月19日攻占蒂尔西特，抵达，用了几天摆渡过河，至此推进了18 km。第39集团军授命向海岸推进，切断德军南北联系，攻占铁路站，从而切断了柯尼斯堡与皮劳。