Pochi mesi dopo la conquista dello scudetto giunse anche l'esordio in Nazionale (30 settembre, contro la in Coppa FIRA, proprio a Rovigo). Fu la prima di 84 presenze in 14 anni in maglia azzurra, con la quale Checchinato disputò le Coppe del Mondo del 1991 in Inghilterra, 1995 in Sudafrica, 1999 in Galles e 2003 in Australia.