В Хрустальную ночь 9 ноября 1938 года его отец был арестован и помещен в концлагерь Заксенхаузен, но через 4 месяца освобождён. Весной 1939 года, во время операции «Киндертранспорт», Пол Кон был отправлен в Великобританию, своих родителей он больше не видел. В течение двух лет он работал на ферме, а затем — токарем на фабрике. В 1944 сдал вступительные экзамены в Тринити-колледж Кембриджского университета (для этого он, в частности, самостоятельно выучил латинский язык), в 1948 году получил степень бакалавра. Там же, в 1951 году защитил диссертацию на степень Ph.D..