Второе формирование состоялось перед началом русско-японской войны. Со 2 февраля 1904 года по 9 декабря 1905 года армия под руководством генерала Куроки, первая высадившаяся в Корее, принимала участие в большинстве сражений войны, в том числе в боях у Цзиньчжоу, Вафангоу, на Янзелинском перевале, Дашицяо, в сражении на реке Шахе, при Ляояне, Сандепу, в Мукденском сражение.