Během série bitev u Leyte byla nejprve během bitvy v Sibuyanském moři potopena bitevní loď "Musaši", kterou vedle pum zasáhlo 11 až 19 torpéd Mark 13. Během bitvy u mysu Engaño byly torpédy zasaženy letadlové lodě "Zuikaku" (16 torpéd a pumy), "Čitose" (až tři torpéda), a "Zuihó" (dvě torpéda a pumy). Nakonec během bitvy u ostrova Samar torpédům Mark 13 Avengerů z eskortních letadlových lodí padl za oběť těžký křižník "Čikuma". I nadále se torpéda Mark 13 uplatňovala při likvidaci císařského námořnictva během bojů o Filipíny, mimo jiné při potopení těžkých křižníků "Nači" a "Kumano".