Ο Μαρκίνιος πραγματοποίησε το ντεμπούτο του με την εθνική αντρών της Βραζιλίας το 2013 και έκτοτε έχει πραγματοποιήσει 47 συμμετοχές με το εθνόσημο. Ήταν μέλος της αποστολής στο Μουντιάλ 2018 και στα Κόπα Αμέρικα 2015, Σεντενάριο και 2019, κατακτώντας το τελευταίο, καθώς και της ολυμπιακής ομάδας που κατέκτησε το χρυσό το 2016.