ב-25 ביוני 1826 קיסר רוסיה ניקולאי הראשון חתם על צו להקמת מפקד הז'נדרמים ובראשו העמיד את הגנרל-אדיוטאנט והרוזן אלכסנדר בנקנדורף שהוטל עליו לפקד על הז'נדרמריה הרוסית, לאחר שבנקנדורף ניסה להזהיר את אלכסנדר הראשון מפרוץ מרד הדקבריסטים לכן ניקולאי הראשון ראה בו מפקד מעולה שיוכל לנהל את המשטרה החשאית. בצו קיסרי מיולי 1826 הלשכה המיוחדת במשרד הפנים הרוסי שהוקמה על ידי אלכסנדר הראשון, הפכה לגוף עצמאי בשם "המחלקה השלישית בלשכת הוד מעלת הקיסר (Третьего Отделения Собственной Е. И. В. канцелярии), כך המשטרה החשאית ויחידות הז'נדרמים הפכו לגוף אחד עד שנת 1829. בנקנדורף ניהל את המחלקה עד למותו בספטמבר 1844, במקומו מונה אלכסיי פיודורוביץ' אורלוב שניהל את המחלקה מספטמבר 1844 עד אפריל 1856.