Volvió a mandar el ejército prusiano en 1806 durante la guerra de la Cuarta Coalición, pero fue derrotado por Louis Nicolas Davout, el mariscal de Napoleón Bonaparte, en la Batalla de Auerstädt (14 de octubre de 1806). Durante la batalla fue golpeado por un tiro de mosquete y perdió los dos ojos. Herido de muerte el duque huyó ante las fuerzas francesas que avanzaban y murió en Ottensen el 10 de noviembre de 1806. Su cuerpo fue enterrado provisionalmente en Christianskirche, antes de que pudiera ser trasladado a la Catedral de Brunswick el 6 de noviembre de 1819.