З лютого 1942 зводила для військ Брянського фронту оборонні рубежі і переправи через Дон, обвід Воронежу, Воронезький оборонний рубіж і тилові оборонні рубежі 40-ї і 60-ї армій; саперні бригади залучалися до інженерного забезпечення Воронезько-Ворошиловградської операції (28 червня — 24 липня). У квітні 1942 була розформована 16-та бригада; у жовтні управління армії перетворене на "35-те управління оборонного будівництва", 18-та і 19-та бригади — підпорядковані безпосередньо фронту, а 17-та бригада — переформована на спеціалізовану бригаду.