21 октября Ньюком Макги отплыла на военном транспорте «» из Нагасаки в Сан-Франциско, где была назначена при американской миссии в Токио, и 7 декабря прибыла обратно в Японию, будучи прикреплённой к штабу 2-й армии под командованием генерала Ясукаты Оку. Она стала очевидцем сражения на реке Шахе и в Мукдене. Японский военный министр присвоил доктору Ньюком Макги титул «начальника медсестёр», наделив её званием, равным рангу офицера японской армии. В Японии она пробыла до окончания войны в сентябре 1905 года.