Nachdem Milič und Marko Tušek aus der Nationalmannschaft zurückgetreten waren und Boštjan Nachbar fehlte, war der international gereifte Jagodnik bei der EM-Endrunde 2007 auch wieder in der Nationalmannschaft gefragt. Bei seiner vierten Endrundenteilnahme kam Jagodnik im fortgeschrittenen Leistungssportler-Alter von 33 Jahren erstmals auf nennenswerte Spielanteile und Slowenien befand sich nach fünf Siegen zum Auftakt auf einem guten Weg zur erstmaligen Olympia-Qualifikation. Doch nach dem Kantersieg mit 77:47 über Deutschland mit Dirk Nowitzki verlor man die folgenden drei Partien, unter anderem das Viertelfinale gegen Griechenland mit einem Punkt Unterschied nach Elf-Punkt-Führung vor dem letzten Viertel und die Revanche in der Platzierungsrunde gegen Deutschland, so dass man nach dem abschließenden Sieg über Frankreich auf dem siebten Platz die direkte Qualifikation verpasst hatte. In der Folge spielte Jagodnik zwei Spielzeiten beim KK Hemofarm im serbischen Vršac, unterbrochen durch eine Saison beim tschechischen Serienmeister ČEZ Basketball aus Nymburk, mit dem er 2009 das Double in Tschechien gewann. Im &lt;a href="ULEB%20Cup%202007/08"&gt;ULEB Cup 2007/08&lt;/a&gt; hatte er mit KK Hemofarm das Achtelfinale gegen den späteren Finalisten Akasvayu Girona verloren, bevor er 2008 in der Vorrunde des Eurocups, wie der Wettbewerb mittlerweile hieß, mit Nymburk ausgerechnet an Hemofarm Vršac scheiterte. Ein Jahr später erging es ihm mit KK Hemofarm in der Vorrunde des &lt;a href="Eurocup%202009/10"&gt;Eurocup 2009/10&lt;/a&gt; nicht besser, als man gar als Gruppenletzter ausschied.