Tras la elección de Zulfikar Ali Bhutto, del partido izquierdista Partido Popular de Pakistán, las relaciones entre los países empeoraron, hasta que, gracias a la Operación Ciclón, en la década de 1980, dirigida contra la expansión soviética en Asia Central y Asia del Sur, su relación diplomática mejoró. En esta, el país americano financió y entrenó a los muyahidines musulmanes en Afganistán para combatir a la Unión Soviética. Las relaciones se agriaron una vez más después del Colapso de la Unión Soviética, cuando los Estados Unidos aprobaron sanciones contra Pakistán al aprobar la Enmienda de Pressler, que fue promulgada contra Pakistán por su programa de armas nucleares, que se inició después de la Guerra indo-pakistaní de 1971 y se aceleró después de que India detonó una bomba nuclear en 1974. Pakistán, una vez más asumió un papel importante en los intereses geopolíticos estadounidenses en la región tras los ataques del 11 de septiembre, y la posterior guerra contra el Terror. Las relaciones se fortalecieron cuando Estados Unidos nombró a Pakistán un aliado importante extra-OTAN en 2002, lo que permitió la liberación de más de US$25.000.000 en ayudas para Pakistán. Los esfuerzos de recuperación de Estados Unidos luego del Terremoto de Cachemira de 2005 fueron ampliamente apreciados por el público pakistaní.