Les troupes françaises sont entrées à Milan en 1796 pour coïncider avec la première campagne d'Italie de Napoléon. Ici, ils ont réquisitionné le Codex Atlanticus et d'autres brouillons et écrits de Léonard de Vinci conservés à la Bibliothèque Ambrosienne de Milan à partir de 1673. Le corpus léonardien des écrits n'est revenu que partiellement, le Codex Atlanticus a été restitué non intact à la bibliothèque Ambrosienne. En fait, plusieurs feuilles du Codex sont conservées à Nantes et à Bâle, tandis que tous les autres cahiers et écritures dédicacées de Léonard de Vinci sont conservés à la Bibliothèque nationale de France à Paris.