Il padre di Nyýazow, Atamurat (1912-1943), morì combattendo contro la Germania nazista nel Caucaso, durante la Seconda guerra mondiale. Il resto della famiglia, la madre Gurbansoltan Eje (1913-1948) e i fratelli Niýazmurat (1938-1948) e Muhammetmurat (1942-1948) morirono nel Terremoto di Aşgabat del 1948. Nyýazow passò il resto dell'infanzia in un orfanotrofio prima di essere adottato.