El cuartel general del 3er Frente Báltico se formó a partir del cuartel general del disuelto 20º Ejército, y los ejércitos de campaña subordinados al frente se tomaron del ala izquierda (sur) del Frente de Leningrado. Las operaciones en las que participó el 3er Frente Báltico incluyen la Ofensiva de Tartu y la Ofensiva de Riga (14 de septiembre al 24 de octubre de 1944), ambas parte integral de la Ofensiva del Báltico. Tras la captura de Riga, el 13 de octubre, el alto mando soviético disolvió el 3er Frente Báltico como unidad de combate y reasignó sus ejércitos a otros frentes.