Alus kuului toukokuussa jälleen Mariaaneille sijotettuun 2. laivastoon, ja osallistuttuaan kesäkuussa Mariaanien taisteluun, se liitettiin liikkuvan osaston etujoukkoihin. Lokakuussa alus osallistui Leytenlahden taisteluun lähdettyään 22. lokakuuta Bruneista Kuritan keskisen osaston mukana. "Kongō" selvisi Yhdysvaltain laivaston ilmavoimien iskuista Sibuyaninmerellä 24. lokakuuta ja seuraavana päivänä se kohtasi Samarin taistelussa Yhdysvaltain laivaston saattuetukialusosaston. "USS Gambier Bay" upposi ja kolme saattuetukialusta vaurioitui. Saattuetukialuksia suojannut hävittäjä "USS Hoel" hyökkäsi torpedoin, jolloin se joutui "Kongōn" tykistön maaliksi vaurioituen pahoin. "Kongō" oli myös mahdollisesti alus, joka osui kuudesti toiseen hyökänneeseen hävittäjä "USS Johnstoniin".