25 марта 2016 года в отборочном матче чемпионата мира 2018 против сборной Чили Меркадо забил первый мяч за национальную команду. Летом того же года Габриэль стал серебряным призёром Кубка Америки в США. На турнире он сыграл в матчах против команд Панамы, США, Венесуэлы и дважды Чили.