У цей час у Росії відкрився Казанський університет, і відчувалася гостра нестача викладачів. Степан Румовський, один з перших російських академіків, призначений попечителем Казанського університету, запросив Бартельса на кафедру математики. Спочатку Бартельс відхилив цю пропозицію, але 1806 року, після війни з Наполеоном, у німецьких князівствах почалася розруха, і залишившись без засобів для існування Бартельс прийняв пропозицію Румовського. З 1808 року починається руський період в його біографії. У Росії Бартельса іменували Мартін Федорович.