Erste internationale Meisterschaftserfahrungen sammelte Fatima Amarilla im Jahr 2011, als sie bei den Südamerikameisterschaften in Buenos Aires in 2:26,73 min den neunten Platz im 800-Meter-Lauf belegte. 2013 belegte sie bei den Juniorensüdamerikameisterschaften in Resistencia in 2:20,89 min den sechsten Platz über 800 Meter und schied mit 59,49 s in der Vorrunde im 400-Meter-Lauf aus. Im Jahr darauf schied sie auch beim Panamerikanischen Sportfestival in Mexiko-Stadt mit 58,95 s im Vorlauf über 400 Meter aus und anschließend belegte sie bei den U23-Südamerikameisterschaften in Montevideo in 2:19,83 min den achten Platz über 800 Meter und erreichte über 400 m Hürden nach 65,75 s Rang sechs. 2016 schied sie dann bei den Ibero-Amerikanischen Meisterschaften in Rio de Janeiro mit 57,84 s in der ersten Runde über 400 Meter aus und wurde über die Hürden in 63,85 s Fünfte. Anschließend belegte sie bei den U23-Südamerikameisterschaften in Lima in 59,03 s den sechsten Platz über 400 Meter, erreichte über 800 Meter in 2:17,66 min Rang sieben und wurde im Hürdenlauf nach 64,28 s Fünfte. 2017 schied sie bei den Südamerikameisterschaften in Luque mit 57,89 s im Vorlauf über 400 Meter aus und belegte in 2:14,14 min den neunten Platz über 800 Meter. Zudem klassierte sie sich mit 63,62 s auf dem achten Platz über die Hürden und erreichte mit der paraguayischen 4-mal-400-Meter-Staffel nach 4:09,14 min Rang sechs. Anschließend schied sie bei den Juegos Bolivarianos in Santa Marta mit 57,72 s in der Vorrunde aus und belegte über die Hürden in 62,04 s den achten Platz.