С 1824 года он был членом Южного общества. Через 2 дня после событий на Сенатской площади, 27 декабря 1825 года, был подписан приказ об его аресте. В. К. Тизенгаузен был арестован в ночь на 5 января 1826 года, 10 января был доставлен в Петербург на главную гауптвахту, а на следующий день переведён в Трубецкой бастион Петропавловской крепости (камера № 3). Осуждён по VII разряду и по конфирмации 10.7.1826 приговорён к 2 годам каторжных работ, через месяц срок был сокращён до 1 года. С 7 октября по 30 ноября 1826 находился в Военно-сухопутном госпитале и только 10 февраля 1827 года был отправлен в Сибирь; через два месяца (9 апреля) доставлен в Читинский острог. В апреле 1828 года, по отбытии срока, отправлен на поселение в Сургут Тобольской губернии, откуда в 1829 году переведён в Ялуторовск (по дороге пробыл в Тобольске с 4 апреля по 27 мая по болезни). Получаемое от казны пособие (57 руб. 14 коп.) по представлению генерал-губернатора Западной Сибири с 1846 было увеличено вдвое. В. К. Тизенгаузен завез в Сибирь и начал культивировать яблони, которые отлично прижились.