I sostenitori di Isabella non cambiarono idea, ritenendone legittima la successione, anche perché, nel 1474, Giovanna del Portogallo, per via delle relazioni extramatrimoniali (una di queste relazioni era con Pietro di Castiglia, discendente da Pietro I, al quale diede due figli illegittimi da cui discesero i signori di Guadalajara), era stata ripudiata da Enrico IV che dichiarò che il matrimonio non era mai stato valido; così si crearono le condizioni per una guerra civile tra i sostenitori di Isabella I e quelli di Giovanna la "Beltraneja", che puntualmente alla sua morte nel 1474, si verificò. La guerra si concluse nel 1479 con la vittoria dei seguaci di Isabella I di Castiglia.