Medzi 21. a 25. septembrom 1944 sa "Fujuzuki" podrobil núteným opravám v jokosuckých dokoch. Dňa 11. októbra vyplával spolu so sesterským "Šimocuki" a ľahkým krížnikom "Ójodo" z Jokosuky. Cestou do Haširadžimy bol zväz okolo 21:00 dňa 12. októbra napadnutý ponorkou USS "Trepang". Cieľom šiestich vystrelených torpéd mal byť "Ójodo". Všetky torpéda svoj cieľ minuli, ale jedno z nich zasiahlo "Fujuzuki" na prove. Predná časť torpédoborca sa doslova roztrhla a zásah poškodil aj prednú delovú vežu. Nasledujúce opravy prebiehali od 14. októbra do 20. novembra v dokoch v Kure. Kvôli tomuto poškodeniu a následným opravám "Fujuzuki" zmeškal bitku pri Leyte.