La Junta de Gobierno Revolucionario se declaró a sí misma como una "junta reformista" que aprobaría reformas políticas y económicas. En realidad, continuó reprimiendo a la oposición política, especialmente después del surgimiento de varios grupos militantes de izquierda a principios de la década de 1980. El golpe es comúnmente citado como el comienzo de la Guerra civil de El Salvador que duró doce años de 1979 hasta 1992.