Después de la evasión frustrada del Rey y de su familia los días 20 y 21 de junio de 1791, intentó contener la agitación republicana que pedía el derrocamiento del rey; a petición de la Asamblea, proclamó la ley marcial el 17 de julio de 1791 y ordenó a la Guardia Nacional, bajo el mando de Lafayette, que cargara contra la muchedumbre amotinada en la explanada del Campo de Marte. Como alcalde de París, fue considerado responsable directo de la masacre. Bailly era un hombre acabado y lo sabía; su popularidad, hasta entonces intacta, cayó en picado.