Durante la Segunda guerra mundial, la mina fue utilizada por las fuerzas de ocupación alemanas como almacén de guerra y fábrica subterráneas. Los nazis trasladaron a miles de judíos desde los campos de concentración de Plaszow y Mielec hasta la mina de Wieliczka para trabajar en la fábrica de armamento subterránea entre marzo y abril de 1944. El campo de concentración de la mina se estableció en el parque de Santa Kinga y albergó a unos 1700 prisioneros. Sin embargo, la producción nunca se llevó a cabo debido al avance soviético en las cercanías. Algunas máquinas y equipamiento fueron desmantelados, incluyendo una grúa eléctrica que fue transportada a Liebenau en la cordillera de los Sudetes. Otra parte del material fue devuelto tras la guerra en otoño de 1945 y los judíos se contrataron en fábricas de Litoměřice (Chequia) y Linz (Austria).