Der "Portus Pisanus" wurde wohl von den Etruskern als Handels- und Militärhafen angelegt. Als solchen nutzten ihn auch die Römer und dann im Mittelalter insbesondere die Seerepublik Pisa. Letztere befestigte ihn im 12. Jahrhundert wegen andauernder Kriege mit der Seerepublik Genua. Es entstanden mehrere Wehrtürme, darunter zwei an der Hafeneinfahrt, die diese unter anderem mit einer schweren Hafenkette sicherten. Weil die Pisaner nach der verlorenen Seeschlacht bei Meloria die Friedensbedingungen nicht einhielten, wurde der Hafen von den Genuesern 1289 weitgehend zerstört oder unbrauchbar gemacht und die Hafenkette als Trophäe nach Genua gebracht, wo einzelne Teile jahrhundertelang in Kirchen oder an öffentlichen Gebäuden hingen. Die Kettenteile wurden erst 1861 im Zug der Einigung Italiens zurückgegeben und befinden sich heute auf dem "Camposanto Monumentale" in Pisa.