В 1889—1891 годах реставрировал по собственным проектам Преображенский собор и часовню Иоанна Грозного в Переяславле-Залесском и собор Мирожского монастыря во Пскове, а в 1893—1900 годы был занят реставрацией новгородского Софийского собора, при чём обнаружил части древней росписи этого храма, мозаичные полы, первоначальный престол и множество архитектурных форм, замаскированных или искаженных переделками собора. Практическая архитектурная деятельность Суслова выразилась в сооружении каменной церкви близ Переяславля-Залесского, усыпальницы павших русских воинов в Сан-Стефано, кустарного павильона на Нижегородской выставке, церкви Преподобного Серафима Саровского в подмосковном селе Федино (Воскресенский район) и нескольких частных дач.