У квалификацијама за Европско првенство 2004. у Португалији репрезентација се сусрела са сменом генерација, али и селектора што није донело жељене резултате. Квалификације је почела у Напуљу ремијем са Италијом 1:1. У другом колу, головима Дарка Ковачевића и Пеђе Мијатовића побеђена је Финска у Београду. У нову 2003. годину репрезентација улази са новим именом државе: Србија и Црна Гора. Први меч под новим именом репрезентација је одиграла 12. фебруара 2003. године у Подгорици против Азербејџана. Први гол за репрезентацију државне заједнице Србије и Црне Горе, постигао је у 33. минуту из једанаестерца Предраг Мијатовић. Голом Николе Лазетића деловало је да је питање победника решено, али је Гурбан Гурбанов уз два поготка шокирао све на стадиону „Под Горицом” и донео својој земљи тек други нерешен резултат у историји. У четвртом колу квалификација Финска је нанела тежак пораз „плавима” од 3:0 и свела шансе за пласман на Европско првенство на минимум. У наредном сусрету Србије и Црне Горе и Азербејџана, 11. јуна 2003. године, Азербејџан је у Бакуу дошао и до прве победе у својој историји. Поново је селекција Србије и Црне Горе водила и то до 88. минута са 1:0, али су онда Гурбан Гурбанов и Исмаилов преокренули резултат. Након овог пораза репрезентација Србије и Црне Горе изгубила је све шансе да се домогне макар другог места на табели квалификационе групе. У преостала три кола са најјачим ривалима, репрезентација није доживела ниједан пораз. Оба пута је савладан Велс са 1:0 у Београду и 3:2 у Кардифу. Други меч са Италијом завршен је као и први, нерешеним резултатом 1:1.