El 14 de octubre de 1918, Berzarín se alistó voluntario en el Ejército Rojo y luchó en el Frente Norte contra la Guardia Blanca y las tropas británicas. Luego sirvió en el área de combate de Petrogrado. En 1921 participó en la represión del levantamiento de Kronstadt y en el puesto de asistente del jefe del equipo de ametralladoras y del comandante de pelotón, en la derrota de los destacamentos rebeldes en la región de Amur, en Siberia (1924). En 1923 se graduó de los cursos de personal de comando de infantería de Petrogrado.