Mysterio fece il suo ritorno ufficiale nella puntata speciale "SmackDown 1000" del 16 ottobre dove sconfisse lo United States Champion Shinsuke Nakamura in un match non titolato, qualificandosi per il torneo per la WWE World Cup a "Crown Jewel". Il 2 novembre, a "Crown Jewel", Mysterio sconfisse Randy Orton nei quarti di finale della WWE World Cup ma poi perse contro The Miz in semifinale. Il 18 novembre, a "Survivor Series", Mysterio prese parte al 5-on-5 Traditional Survivor Series Elimination match contro il "Team Raw" ma venne eliminato da Braun Strowman. Il 16 dicembre, a "", Mysterio sconfisse Randy Orton in un Chairs match. Nella puntata di "SmackDown" del 1º gennaio 2019 Mysterio partecipò ad un Fatal 5-Way match per determinare il contendente n°1 al WWE Championship che comprendeva anche AJ Styles, Mustafa Ali, Randy Orton e Samoa Joe ma il match venne vinto da Styles. Nella puntata di "SmackDown" del 22 gennaio Mysterio ha sconfitto Andrade in un 2-out-of-3 Falls match per 2-1, chiudendo la faida iniziata pochi mesi prima. Il 27 gennaio, alla "Royal Rumble", Mysterio partecipò al match omonimo entrando col numero 25 ma venne eliminato da Randy Orton. Nella puntata di "SmackDown" del 26 febbraio Mysterio partecipò ad un Triple Threat match per lo United States Championship che includeva anche il campione R-Truth e Andrade ma il match venne vinto dal campione. Nella puntata di "SmackDown" del 5 marzo Mysterio partecipò ad un Fatal 4-Way match per lo United States Championship che comprendeva anche il campione R-Truth, Andrade e Samoa Joe ma il match venne vinto da quest'ultimo. Il 10 marzo, a "Fastlane", la scena si ripeté nuovamente con Joe che riuscì a trionfare su Mysterio, Andrade e R-Truth mantenendo la cintura statunitense. Il 7 aprile, a "WrestleMania 35", Mysterio affrontò poi singolarmente Samoa Joe per lo United States Championship ma venne sconfitto dopo appena un minuto.