З 1934 по 1947 рік захищав кольори національної збірної Куби. Зіграв у 5-и (з 6-и) матчах кубинської збірної в кваліфікації до Чемпіонату світу 1934 року. Через чотири роки був викликаний головним тренером збірної Хосе Тапія для участі в чемпіонаті світу 1938 року у Франції. На французькому мундіалі зіграв один матч, проти Румуунії. Хуан пропустив м'яч від Штефана Добаї, проте партнери по команді зуміли забити два м'ячі у відповідь. Зрештою, кубинці перемогли з рахунком 2:1 та пройшли далі. Проте в 1/4 фіналу збірна Куби програла збірній Швеції та вибула з турніру.