Le nouvel entraîneur de l'Italie Antonio Conte ne l'a convoqué qu'à une seule reprise, en pour des matchs face à la Croatie (Éliminatoires Euro 2016) et face à l'Albanie (amical), mais Balotelli blessé au muscle ischio-jambier, n'a pas pu répondre présent. Après une saison médiocre à Milan, tant d'un point de vue individuel ( et 1 passe décisive en ) que collectif (le club termine du calcio et échoue à se qualifier pour une compétition européenne pour la deuxième saison d'affilée), Conte ne le retient pas dans sa liste des  qui disputeront l'Euro 2016 en France.