Výbor vyvíjel činnost také po listopadu 1989, kdy se s minimálním úspěchem snažil o očištění justice. Mezi členy Výboru narůstaly rozpory a v červnu 1996 členové rozhodli o pozastavení činnosti VONS. V současné době se o obdobnou činnost snaží Amnesty International a spolek Šalamoun.