Касательно правления Афендулиева на Крите были высказаны разные и противоречивые взгляды. С одной стороны утверждается, что до Крита Михаил принял участие в сражениях на Пелопоннесе (осада Монемвасии и Осада Триполицы), что он проявил активность в ведении военных операций на Крите и организации военных лагерей и что он был уважаем жителями острова. Утверждается, что Михаил располагал военными и административными способностями, может быть не теми что требовались для Крита и того времени, но что ему было трудно приспособиться и стать эффективным в незнакомом ему крае и в тяжёлые времена. Другая сторона оценивает, что его поведение по отношению к местным жителям характеризовали чрезмерное самомнение, авторитаризм, а также очевидная неэффективность.