Ein weiteres Arbeitsgebiet von Reid war die Seismologie. Er sammelte ab 1902 seismologische Daten für den US Geological Survey und veröffentlichte 1911 einen der ersten zusammenfassenden Berichte in den USA über die damals neue Wissenschaft. Mit Andrew Cowper Lawson, Professor in Berkeley und ehemaliger Doktorand (1888) der Johns Hopkins University, war er in der staatlichen Kommission zum Studium des Erdbebens von San Francisco 1906. Sie kamen zu dem Schluss, dass die Ursache der Aufbau massiver elastischer Spannungen längs der Verwerfung der St. Andreas Spalte war, die sich im großen Beben von 1906 entluden (Theorie des "elastic rebound" von Reid). Danach war er ein international anerkannter Experte für Erdbeben, der auch unter anderem 1926 eine internationale wissenschaftliche Konferenz dazu in Japan besuchte.