Date le premesse, il periodo della prima dominazione persiana si avviava a essere, per l'Egitto, un momento di profonda prosperità e ordine, ma le vicende internazionali -specie nell'area mediterranea- portarono ad altre conseguenze. Nel 490 a.C. i greci sconfissero l'esercito persiano nella Battaglia di Maratona e Dario fu perciò costretto a concentrare la propria attenzione su un altro fronte; ne approfittò il delta nilotico che si ribellò nel 486 a.C.. Essendo nel frattempo morto Dario, gli succedette sul trono di Persia e d'Egitto Serse (Xšaya-ṛšā) che intervenne stroncando duramente la rivolta e ponendo a capo della satrapia il proprio fratello Achemene il quale amministrò il paese con tale durezza che ancora secoli dopo il nome di Serse verrà ricordato nei testi egizi con appellativi di riprovazione. Nel 480 a.C. Achemene comandò, per conto del fratello, la flotta egizia, forte di circa 200 navi, nella Battaglia di Salamina che si concluse con la disfatta persiana cui seguì, nel 465 a.C., l'assassinio di Serse cui succedette, solo per alcuni mesi, Artabano a sua volta ucciso e sostituito, nello stesso 465 a.C., da Artaserse I.