В 2011 году в Ливии началась Гражданская война, правительство Египта распорядилось закрыть границу между странами. После событий Арабской весны отношения между Египтом и Ливией вступили в неспокойную фазу, так как стали возникать споры, связанные с обеспечением безопасности и ростом террористической активности. Летом 2014 года на территории Ливии снова вспыхнула Гражданская война, многочисленные вооружённые группировки боролись за контроль над различными регионами государства. Эта ситуация негативно сказывалась на соседнем Египте. Ливийские исламисты были замечены в продаже оружия джихадистам, действующим на территории Синайского полуострова. В 2014 году правительство США обвинило власти Египта и ОАЭ в нанесении ракетных ударов по столице Ливии — Триполи, что было опровергнуто властями этих стран. В июне 2017 года президент Египта Абдул-Фаттах Халил Ас-Сиси распорядился нанести удар по вооружённым группам на территории Ливии в ответ на террористические акты против христиан на территории Египта.