Дебютировал в сборной в 1998 году в отборочном матче ЕВРО 2000 против киприотов, которым испанцы уступили со счётом 2:3, и с тех пор регулярно привлекается в национальную команду. Сыграл четыре встречи в финальной стадии чемпионата Европы, но не поехал на чемпионат мира 2002 — форма Мичела Сальгадо не устроила Хосе Антонио Камачо. При Иньяки Саэсе вновь стал основным футболистом сборной Испании, и лишь только повреждение подколенного сухожилия не позволило Сальгадо защищать честь своей страны на ЕВРО 2004.