Zu Diskussionen führten zwischenzeitlich im Inneren der Kirche angebrachte Wandmosaike, welche Wladimir Putin und Josef Stalin darstellen sollten. Putin wurde in Zusammenhang mit der Annexion der Krim und Stalin in Verbindung mit der Moskauer Siegesparade von 1945 vor der Basiliuskathedrale dargestellt. Aufgrund wachsender Kritik wurden die Mosaike noch vor der Einweihung der Kirche entfernt.