แอฟริกาคัพออฟเนชันส์ 2019 รอบแพ้คัดออก เป็นการแข่งขันในรอบที่สองในการแข่งขันฟุตบอลแอฟริกาคัพออฟเนชันส์ต่อจากรอบแบ่งกลุ่ม โดยจะเริ่มแข่งขันในวันที่ 5 กรกฎาคมกับรอบ 16 ทีมสุดท้ายและสิ้นสุดในวันที่ 19 กรกฎาคมซึ่งเป็นวันแข่งขันรอบชิงชนะเลิศซึ่งจะจัดที่ สนามกีฬาแห่งชาติไคโร ใน ไคโร. ทั้งหมด 16 ทีม (สองทีมที่ดีที่สุดจากแต่ละกลุ่ม และสี่ทีมอันดับสามที่ดีที่สุด) จะได้ผ่านเข้าสู่รอบแพ้คัดออก.