В 1842 году он подал в отставку и вернулся в Венгрию, где стал членом Консервативной партии, поддерживавшей Габсбургов и не желавшей реформирования власти. 7 апреля 1848 года, во время революции в Венгрии Эстерхази стал министром иностранных дел в первом правительстве Венгрии, руководителем которого был граф Лайош Баттьяни. Выполнял роль посредника в переговорах между Веной и венгерским правительством. После того, как его намерения помирить обе стороны окончились неудачей, в сентябре 1848 года ушел в отставку. Позже Эстерхази поддерживал связи с венгерскими политиками в эмиграции, в частности, с Лайошем Кошутом.