Au début de l'Occupation, alors que la Martinique est administrée par l'amiral Robert, Victor Sévère s'oppose farouchement à ce dernier et au régime de Vichy. En 1941, il est écarté de la mairie de la capitale et l'amiral Robert nomme à sa place Jean de Laguarigue. Son appartenance à la franc-maçonnerie n'est pas étrangère à cette mesure. En 1942 il participe à la Résistance et se fait particulièrement remarquer après le débarquement en Afrique du Nord. En 1943, il contribue à la formation du Comité de libération nationale qui assure le ralliement des Antilles aux Forces françaises libres. Nommé à l'Assemblée consultative provisoire en , il en démissionne en , pour raison de santé.