Лопухин был масоном и состоял великим мастером ложи «Трёх добродетелей»; также являлся членом тайных декабристских организаций «Союза спасения» (с 1817 г.), «Союза благоденствия» (участвовал в составлении его устава — «Зеленой книги») и «Северного общества» (в которое вступил по предложению П. И. Пестеля, затем, по несогласию с делами общества, выбыл из него в 1822 году). В декабре 1825 года, после событий на Сенатской площади, был допрошен генерал-адъютантом В. В. Левашёвым и затем отдельным повелением императора Николая I освобождён без последствий.