Спессотто разоблачал преступления со стороны правящей хунты, военных и ультраправых «эскадронов смерти», особенно после убийства иезуитского священника Рутилио Гранде. Из-за его оппозиции режиму он неоднократно получал угрозы расправы. Он также призывал к миру в условиях надвигавшейся гражданской войны в Сальвадоре. Когда партизаны как-то заняли церковь и захватили несколько священников в заложники, Спессотто провёл успешные переговоры об их освобождении.