Im Juniorenbereich spielte Björn Jakobsson für Island bei den U18-D-Europameisterschaften 1997 und 1998 und der U18-Weltmeisterschaft der Europa-Division 2 1999 sowie den U20-D-Weltmeisterschaften 1999 und 2000 und 2001 bei der Qualifikation zur Division III der U20-Weltmeisterschaft.