По возвращении из Парижа, Мэтьюс преподавал в школах Сан-Франциско — "San Francisco Art Students League" и "California School of Design", директором последней став в 1890 году. В 1894 году он женился на своей студентке. Преподаванием занимался вплоть до Великого землетрясения 1906 года в Сан-Франциско. После землетрясения он с женой открыл мебельный магазин, где Мэтьюс проявил свои способности дизайнера, ремесленника и художника. Они создали также компанию "Philopolis Press" и публиковали ежемесячный журнал, где пропагандировали Движение искусств и ремёсел в эстетике восстанавливаемого города. Среди многочисленных заказов Мэтьюса в этот период была серия фресок из двенадцати панелей для здания Капитолия в Сакраменто.