Il 21 gennaio 1941, la pubblicazione del giornale fu soppressa dal segretario interno nella coalizione di guerra, Herbert Morrison (deputato del Partito Laburista), per aver ripetutamente violato le linee guida sulla difesa militare, con una politica editoriale pacifista per fomentare l'opposizione al perseguimento del conflitto bellico. Più tardi, durante i bombardamenti di Londra, gli uffici a Cayton Street furono completamente distrutti in un incendio; la sede della redazione, nel 1942, fu temporaneamente spostata nei vecchi uffici della "Caledonian Press", a "Swinton Street" (nello stesso luogo dove, dal 1925 al 1929, era stato pubblicato il vecchio giornale del Partito, il "Sunday Worker"). Nuovi uffici furono acquistati solo nel 1945, in "Farrington Road", dove prima si trovava il magazzino di una fabbrica di spazzole. Quando l'Unione Sovietica fu invasa dalla Germania con l'Operazione Barbarossa, la linea del giornale mutò ancora: i comunisti britannici divennero ferventi sostenitori dell'entrata in guerra del Regno Unito. Per l'intera durata del conflitto, il "Daily Worker" si adoperò per sostenere lo sforzo bellico britannico, premendo per aprire un "secondo fronte" in Europa. La censura governativa sul giornale cessò, poi, nel settembre del 1942.