Un respiro vendría en la Copa América de 1995 con sede en Uruguay, ahora con el técnico Héctor Núñez. Francescoli levantó por última vez el trofeo en el Estadio Centenario, tras una final contra el recién tetracampeón del mundo, Brasil, al que vencieron en penales donde él acertó el primer cobro celeste. Este título igualó a Uruguay y Argentina como los mayores ganadores de la competicióne hizo que Enzo, con 34 años y un año sin trofeos con River Plate, fuera elegido nuevamente el mejor jugador de América del Sur, once años después de haber recibido el mismo reconocimiento. Durante esta competición, Enzo marcó su último gol como jugador del plantel charrúa.