Во время первой русской революции дом пострадал от снарядов в ходе артиллерийского обстрела Пресни. В 1922 году Софийская больница получила имя бывшего главврача Нила Филатова. В годы Великой Отечественной войны на её территории размещался эвакогоспиталь № 5006. Дом Протковой продолжал находиться в составе больницы.