Le , il fut retenu pour servir comme lieutenant dans le cadre du Military Peace Establishment Act. Il servit alors en Méditerranée jusqu'en 1804. Le , il fut convoqué à Baltimore pour transférer ses meilleurs hommes sur les frégates , et . Il prit ensuite le commandement du qui fut engagé lors de la bataille de Derna. Capitaine du le , il regagna les États-Unis en 1806. Il fut promu au grade de "master commandant" ("commander") le . En permission de 1806 à 1808 dans le cadre d'une mission de marine marchande, il reprit son service au sein de l'armée en mars 1808 lorsqu'il reçut l'ordre de superviser la construction de canonnières.