Magnus 57 meccset játszott a válogatottban, ahol 1997 februárjában mutatkozott be.Már az 1994-es VB-n kerettag volt, ám ekkor még csak csere az akkori legjobb svéd kapus, Thomas Ravelli mögött.Mivel a csapat az 1998-as franciaországi VB-re nem jutott ki, így Magnusnak az első világversenyére 2000-ig kellett várni, amikor is végre kijutottak a 2000-es EB-re.Itt, majd a 2002-es VB-n is ő volt az első számú kapusa a válogatottnak.Még a 2004-es EB-n is kerettag volt, ám itt már csak csere, ugyanis a kezdő kapus Andreas Isaksson volt.