После вступления французских войск на польские земли, входившие в состав Прусского королевства, в 1806 году Станислав Бреза возглавил администрацию в Познани. В 1807 году он стал директором казначейства и внутренних дел Великого герцогства Варшавского, затем министром иностранных дел Великого герцогства Варшавского (1807—1815). В 1815 году Станислав Бреза возглавил депутацию, отправленную от граждан Великого княжества Познанского к королю Пруссии Фридриху Вильгельму III.