При этом к режиму Второй империи он относился критично, и помня о революционных событиях 1830 и 1848 годов, в которых самому довелось участвовать, ничего хорошего не ожидал. Особенно его раздражал всплеск клерикализма и показного благочестия во Франции 1860-х годов, когда завзятые безбожники, желая подольститься к императору, гурьбой ринулись в церковь. Моду на демонстративную религиозность Мериме, будучи атеистом, считал чем-то вроде умственного помрачения, и посвятил этому немало едких строк в письмах к Женни.