На уровне национальной сборной Маркиньос дебютировал в 2013 году, в это же время принимая участие в матчах команды до 17 и 20 лет. Представлял команду Бразилии на Кубке Америки 2015, 2016, 2019 и 2021 годов, а также чемпионате мира 2018 года.