1798年，拿破仑率法国军队逐出骑士团，馬爾他騎士團於是成為總部位於羅馬的特殊政治實體。1800年英国占领马耳他，1814年正式成为大英帝國殖民地。二戰時期受義大利空軍多次的轟炸和圍攻，並曾擬定了作戰計劃入侵，代號大力士作戰，但島上居民頑強抵抗令義大利王國並未佔領馬耳他。