ЧОН участвовал в подавлении крестьянских волнений в период проводимой в РСФСР продразвёрстки и гражданской войны в России, а также в качестве силовой поддержки продотрядов, занимавшихся изъятием у крестьян хлеба и других продуктов. Нижегродский батальон особого назначения участвовал в подавлении Кронштадтского и Тамбовского восстаний в 1920-21 годах. Екатеринбургские части участвовали в подавлении сибирского восстания 1921 года.