Die beiden Seitenaltäre sind im Stil des Hochaltares ausgeführt. Der Josefsaltar steht im rechten Teil des Querschiffes und der Marienaltar an der linken Seite. Sie wurden ebenso wie der Hochaltar von Schnitzer aus Buching und die Altarbilder malte Hotter. Im Bild des Josefsaltares werden das ehemalige Degussawerk, die hiesige Pfarrkirche und der Hof Böstering gezeigt, sie sollen die Gemeinde versinnbildlichen. Das Bild im Marienaltar zeigt in der Mitte den Petersdom und an den Seiten Fatima und Lourdes als Stätten der Marienverehrung.