Дэн Эллис был выбран во втором раунде драфта НХЛ 2000 года клубом «Даллас Старз». Первую игру в НХЛ Эллис провел 18 января 2004 года против «Лос-Анджелес Кингз», но затем три года играл за фарм-клубы — «Юта Гриззлис», «Гамильтон Бульдогз» и «Айова Старз» в АХЛ, «Айдахо Стилхэдз» в Хоккейной лиге Восточного побережья. Со «Стилхэдз» в 2004 году Дэн завоевал Кубок Келли.