Ernesto Muyshondt naît à San Salvador le 30 août 1975. Son père, Ernesto Muyshondt Parker était l'un des principaux producteurs de coton du pays, a souffert pendant la guerre civile de plusieurs attaques de guerilleros contre ses propriétés telles que ses tracteurs, ses aéronefs de travail agricole, ainsi qu'une majeure partie de ses champs de coton ont été incendiés. Son père était également un ami du fondateur de l'ARENA, Roberto d'Aubuisson, qui l'a soutenu et aidé pendant la guerre. À l'âge de 21 ans, Ernesto a dû prendre en charge l'entreprise familiale après que son père ait été victime d'une attaque à main armée lui perforant le crâne, le laissant handicapé.