Дебют за сборную Греции состоялся 3 февраля 1999 года в матче Интернационального кубка Кипра против сборной Финляндии (1-2). Несмотря на хороший результат за «Монако» в 2004 году главный тренер сборной Отто Рехагель не включил Акиса в состав на Чемпионат Европы 2004. Всего за сборную Зикос провёл 18 матчей. Последним был товарищеский против сборной Кипра 14 ноября 2011 года (1:2).