13 czerwca 2019 roku znalazł się w kadrze zawodników powołanych na Puchar Narodów Afryki 2019. Senegal w turnieju dotarł aż do finału w którym uległ 1:0 Algierii. Ndiaye był podstawowym zawodnikiem drużyny występując we wszystkich siedmiu spotkaniach reprezentacji Senegalu na tym turnieju.