Berizzo 1996. október 9-én Venezuela ellen debütált az argentin válogatottban. Szerepelt az 1997-es és az 1999-es Copa Américán. Előbbi tornán egy mérkőzésen, a Peru elleni negyeddöntőben kapott lehetőséget, míg utóbbi tornán nem lépett pályára. 2002 februárjában eltörte a bokáját, így nem szerepelhetett a 2002-es világbajnokságon.