Zwischen 1979 und 1983 war Chisec so stark vom Guatemaltekischen Bürgerkrieg betroffen, dass fast die gesamte Bevölkerung des Municipios floh, größtenteils ins nahe Mexiko. Auf der "Finca Xamán" in der Comunidad "La Aurora 8 de Octubre" wurde am 5. Oktober 1995 ein Massaker verübt (Massaker von Xamán).