John Marino wurde in North Easton im US-Bundesstaat Massachusetts geboren und spielte in seiner Jugend unter anderem für die "South Shore Kings" im nahegelegenen Foxborough. Ohne in einer namhaften Juniorenliga zu spielen wurde er bereits im NHL Entry Draft 2015 an 154. Position von den Edmonton Oilers berücksichtigt, ehe er zur Saison 2015/16 in die United States Hockey League (USHL) wechselte. In der ranghöchsten Nachwuchsspielklasse der Vereinigten Staaten verbrachte er ein Jahr bei den "Tri-City Storm" und gewann mit diesen prompt die USHL-Playoffs um den Clark Cup. Anschließend schrieb er sich an der Harvard University ein und lief fortan für deren Eishockeyteam, die Harvard Crimson, in der ECAC auf, einer Liga im Spielbetrieb der National Collegiate Athletic Association (NCAA). Auch mit den Crimson feierte der Abwehrspieler am Ende seiner ersten Spielzeit den Gewinn der Meisterschaft, bevor er sein Team im Folgejahr mit einer &lt;a href="Plus/Minus"&gt;Plus/Minus&lt;/a&gt;-Wertung von +21 anführte und sich innerhalb der ECAC unter den Top 10 platzierte.