1944年9月17日にカリフォルニアはマヌス島へ向かい、フィリピン攻略戦のための準備を行った。10月17日から11月20日までレイテ島攻略戦においてカリフォルニアは重要な役割を果たした。10月25日にはスリガオ海峡海戦に参加した。1945年の元日、パラオを出航しルソン島上陸作戦に参加、艦砲射撃により上陸部隊を支援した。1月6日、リンガエン湾にて艦砲射撃中に特攻機の突入を受け、カリフォルニアの乗組員の44名が死亡、155名が負傷した。応急修理の後艦砲射撃は継続され、1月23日にピュージェット・サウンド海軍工廠に向けて出航、2月15日に到着し本格的な修理を受けた。