Giese fühlte sich humanistischem Gedankengut verpflichtet und handelte nach der Überzeugung, dass es kein Gesetz gebe, das die Behandlung von jüdischen Patienten verbiete. In der Pogromnacht im November 1938 rettete er einen frisch operierten Patienten vor der Verschleppung in das Konzentrationslager Buchenwald, indem er ihn für transportunfähig erklärte. Giese sei „daraufhin telefonisch anonym bedroht und als ‚Judendoktor‘ bezeichnet worden“. Laut Akten des Universitätsarchivs Jena hatte der Pathologe Werner Gerlach, Dekan der Medizinischen Fakultät war und Mitglied des persönlichen Stabes von Heinrich Himmler, Giese beim Thüringer Ärzteführer Richard Rohde als Reaktion auf diese Vorgänge denunziert. Giese hielt den Repressionen stand, und es zeichnete ihn aus, dass er sich auch nach 1945 nicht mit seinen Erlebnissen brüstete.