11 mars 2011 drabbades Miyako av en tsunami efter en jordbävning vid Tohoku. Tsunamivågen, som beräknades vara 37,8 meter hög, svämmade över den skyddsvall som fanns vid hamnen och vattnet nådde därmed in i staden. Stora delar av Miyakos byggnader och fiskeflotta förstördes. Mer än 600 människor rapporterades ha dött.