Lo scoppio della guerra civile libica ha visto Mutassim, colonnello dell'esercito libico, impegnato al fronte contro le forze insurrezionali del Consiglio nazionale di transizione. In particolare, è stato il responsabile delle operazioni militari delle forze lealiste nel corso del lungo assedio di Sirte, la cui tenace resistenza ha stupito anche rappresentanti delle forze Nato. Il 20 ottobre 2011, alla caduta della città, tenta insieme al padre Muʿammar Gheddafi di guadagnare il deserto per continuare la lotta ma entrambi vengono catturati dal CNT: Muʿammar Gheddafi viene linciato sul posto mentre Mutassim viene sommariamente liquidato poco dopo. I loro corpi, nei giorni successivi, vengono mostrati al pubblico nella città di Misurata e poi sepolti in un luogo segreto.