A seguir Lumumba renunciou ao poder, em setembro, Kasongo chegou a um acordo em meados de dezembro para trabalhar sob a nova liderança de Joseph Iléo. No entanto, em janeiro, os comissários do governo de Coronel Joseph Mobutu foram-se se demitindo devido a problemas financeiros. Kasongo exigiu que Lumumba fosse restaurado para a segundona. As propostas que foram feitas para ter a disputa sobre a governança instalaram-se em uma mesa redonda, e Kasongo rejeitou a ideia de uma carta das Nações Unidas, o Secretário-Geral Dag Hammarskjöld, escrevendo: "Como se o povo Congolês, por eleger livremente o seu parlamento, não tinha o mesmo símbolo escolhido seus líderes [...] A crise do congo é basicamente uma crise de legalidade [...] A solução é restaurar os poderes constitucionais do parlamento." Em meados de fevereiro, as Nações Unidas estabeleceram um programa pelo qual os potenciais alvos políticos poderia buscar a proteção militar em instalações designadas. Kasongo foi a primeira pessoa a acomodar-se no serviço. o Vice-Primeiro-Ministro Jean Bolikango pessoalmente pediu-lhe para voltar para sua residência sob a proteção do governo, mas Kasongo, optou por permanecer com sua família em um estacionamento com guarda de instalações. Em agosto de 1961, Kasongo, foi reeleito presidente da Assembleia Nacional.