Fino al 2005 Severin Blindenbacher giocò per i Kloten Flyers, prima di passare al club della sua città natale, gli ZSC Lions. A Kloten giocò nelle giovanili, per fare il debutto nella massima lega nella stagione 2000-01. Mentre giocava con il Kloten, venne scelto in 273ª posizione dai Phoenix Coyotes nell'NHL Entry Draft 2001. Passato allo ZSC Lions, vinse nel 2008 il campionato svizzero e la Champions Hockey League nel 2009. A partire dall'estate del 2009 si trasferì ai campioni svedesi in carica, i Färjestad BK, nella Elitserien.