Registaram-se alguns combates entre tropas francesas e austríacas, em geral com vantagem para os franceses. Os austríacos iam recuando em direção a Alexandria. Bonaparte pensou que o general Melas se encontrava ainda em Turim, que queria evitar o combate com o exército francês e que o seu objetivo era retirar em direção à única saída que lhe restava, o porto de Génova. Assim, Napoleão passou a maior parte das suas tropas para sul do rio Pó e avançou em direção a Alexandria. No dia 14 de junho, inesperadamente, Bonaparte viu-se confrontado com forças mais numerosas em Marengo, 4 km a leste de Alexandria. A Batalha de Marengo foi a mais sangrenta batalha desta campanha. Perante o sucesso inicial das tropas austríacas, os franceses conseguiram reunir mais forças, reagir e transformar a derrota em vitória. Depois desta batalha, os austríacos não ofereceram mais resistência ao avanço francês. Melas negociou a capitulação. Esta vitória francesa destruiu a vontade dos austríacos em continuarem a guerra e deu a Napoleão Bonaparte o peso político que ele necessitava para regressar a Paris e confirmar a sua posição como líder dos Franceses.