Scott Wilson wurde in Oakville geboren und spielte in seiner Jugend für die "Georgetown Raiders" im benachbarten Georgetown. Ohne in der Ontario Hockey League, der höchsten Juniorenliga seiner Heimat, berücksichtigt worden zu sein, wählten ihn die Pittsburgh Penguins im NHL Entry Draft 2011 an 209. und somit drittletzter Position aus. Im Anschluss schrieb sich der Angreifer im Herbst 2011 an der University of Massachusetts Lowell ein. Dort lief er fortan parallel zu seinem Studium für die "UMass Lowell River Hawks" in der Hockey East auf, eine Hochschul-Liga im Spielbetrieb der National Collegiate Athletic Association (NCAA). Als Freshman erreichte Wilson einen Punkteschnitt von über 1,0 (38 in 37 Spielen) und wurde in der Folge als Rookie des Jahres der Hockey East ausgezeichnet sowie ins All-Rookie Team der Liga gewählt. Im Jahr darauf gewann der Kanadier mit den River Hawks die Playoffs der Hockey East und erreichte in der Folge die "Frozen Four", das Finale der Hochschul-Meisterschaft der USA, wo man allerdings im Halbfinale der Yale University unterlag. Nach einer weiteren Saison in Massachusetts unterzeichnete Wilson im April 2014 einen Entry Level Contract bei den Pittsburgh Penguins, die ihn wenig später bei ihrem Farmteam, den &lt;a href="Wilkes-Barre/Scranton%20Penguins"&gt;Wilkes-Barre/Scranton Penguins&lt;/a&gt;, in der American Hockey League (AHL) debütieren ließen.