Insatisfeito com a direção que seu país tomou durante a Primeira República da Nigéria sob o primeiro-ministro Abubakar Tafawa Balewa, Ifeajuna tornou-se um conspirador em uma tentativa de derrubar o governo. Dados seus estudos, Ifeajuna foi considerado um dos motivadores intelectuais da conspiração e ele escreveu um manuscrito não publicado sobre o raciocínio da tentativa de golpe de Estado nigeriano de 1966. Ele desprezou a corrupção e a anarquia que resultaram da má administração do governo.