Quelque temps après, parce que le champion d'Europe en titre, le Bayern, a refusé de jouer la Coupe Intercontinentale 1974, l'Atlético est venu en tant que représentant du continent pour affronter le champion de la Copa Libertadores de América 1974 : le CA Independiente. Le match aller, déjà avec Luis Aragonés comme entraîneur du rojiblanco, s'est joué à Buenos Aires et fut remporté 1-0 par l'Independiente. Le , le match retour a été joué à Madrid, où l'Atlético a gagné 2-0, avec un but de Rubén Ayala à quatre minutes de la fin du match. Ainsi, le club matelassier a remporté la Coupe Intercontinentale, et a obtenu le deuxième titre international de son histoire, devenant ainsi le seul club au monde parvenant à remporter la Coupe Intercontinentale sans avoir remporté auparavant sa compétition continentale maximale et à être l'un des rares clubs reconnu par la FIFA comme champion du monde. L'année suivante, l'Atlético atteint un autre finale de Coupe, cette fois-ci la coupe nationale, où il sera battu douloureusement lors des tirs au but par le Real Madrid lors de la finale disputée à Vicente Calderón, connu pour un arbitrage controversé au détriment des rojiblancos.