"Paperino e le Giovani Marmotte" fu nominato per l'Oscar al miglior cortometraggio d'animazione ai Premi Oscar 1939, ma perse a favore de "Il toro Ferdinando", anch'esso della Disney. Quell'anno ricevettero una nomination anche i cortometraggi Disney "L'eroico ammazzasette" e "Tra le stelle di Hollywood", stabilendo il record di maggior numero di nomination nella categoria per lo stesso studio. "Paperino e le Giovani Marmotte" fu la prima candidatura all'Oscar della serie "Donald Duck".