לקראת עונת &lt;a href="%D7%A2%D7%95%D7%A0%D7%AA%202015/2016%20%D7%91%D7%9C%D7%99%D7%92%D7%AA%20%D7%94%D7%A2%D7%9C%20%D7%91%D7%9B%D7%93%D7%95%D7%A8%D7%92%D7%9C"&gt;2015/2016&lt;/a&gt; מונה בשנית למאמנה של מכבי חיפה לאחר שחתם על חוזה לשלוש עונות. ב-7 בדצמבר 2015 שבר לוי את שיא המשחקים כמאמן מכבי חיפה עם הופעתו ה-185 לאחר שעקף בדירוג את שלמה שרף. בליגה הציגה חיפה יכולת חלשה וסיימה במקום הרביעי, ולוי ספג ביקורת רבה מצד האוהדים. בסוף העונה זכה רוני לוי עם הקבוצה בגביע המדינה, לאחר ניצחון 1–0 במשחק הגמר על מכבי תל אביב. לוי המשיך לאמן את חיפה גם בפתיחת עונת &lt;a href="%D7%A2%D7%95%D7%A0%D7%AA%202016/2017%20%D7%91%D7%9C%D7%99%D7%92%D7%AA%20%D7%94%D7%A2%D7%9C%20%D7%91%D7%9B%D7%93%D7%95%D7%A8%D7%92%D7%9C"&gt;2016/2017&lt;/a&gt; אך לאחר שקבוצתו הודחה מול נומה קאליו האסטונית, סיים לוי את תפקידו ביולי 2016.