Aunque su creación institucional surgió con la declaración de la Constitución en 1837, su establecimiento "de facto" dató desde 1836 —con el término de la Guerra entre Salaverry y Santa Cruz— hasta 1839 —con su disolución proclamada por el general Agustín Gamarra, presidente restaurador peruano quien, junto a los peruanos contrarios al proyecto de Santa Cruz y los gobiernos de Chile y de la Confederación Argentina, declaró la guerra a la Confederación. El Ejército Unido Restaurador, formado por el Ejército de Chile y tropas restauradoras peruanas bajo los mandos del general chileno Manuel Bulnes y del mariscal Agustín Gamarra, derrotó al Ejército de la Confederación, formado por el Ejército de Bolivia y tropas confederadas peruanas, en la batalla de Yungay el 20 de enero de 1839.