En 2005, le Kényan ne prend que la cinquième place des Championnats du monde de cross puis s'impose à plusieurs reprises lors des meetings européens estivaux, notamment sur à Doha et Hengelo, et sur au meeting Golden Gala de Rome. Figurant parmi les favoris du aux Championnats du monde d'Helsinki, en raison notamment des absences d'Hicham El Guerrouj, retraité des pistes depuis l'année précédente, et de Kenenisa Bekele, aligné uniquement sur , Eliud Kipchoge ne termine pourtant que quatrième de la finale, la victoire revenant à son compatriote Benjamin Limo. En fin de , le Kényan remporte le meeting de Bruxelles en signant en la deuxième meilleure performance mondiale de l'année derrière Bekele.