Dopo la conclusione del conflitto la divisione di Oudinot fu sciolta e il generale fu inviato a condurre una delicata missione diplomatica, l'occupazione del Principato di Neuchâtel da parte della Francia; Oudinot gestì l'operazione senza spargimenti di sangue, e fu per questo nominato cittadino onorario di Neuchâtel. Dopo lo scoppio della guerra della quarta coalizione Oudinot comandò una divisione di dragoni appiedati, un incarico di basso prestigio, anche se nel novembre 1806 Napoleone autorizzò la ricostruzione della sua "divisione granatieri" sempre in forza al V Corpo d'armata di Lannes. Nel corso della seguente campagna in Polonia, la divisione di Oudinot fu impegnata nella battaglia di Ostrołęka il 16 febbraio 1807 per poi partecipare all'assedio di Danzica dal marzo al maggio seguente; il 14 giugno 1807 i granatieri di Oudinot furono al centro degli scontri della battaglia di Friedland, conclusasi con una decisiva vittoria di Napoleone.