Su padre, José Manuel, falleció el 29 de octubre de 2005, cuando Christian tenía veintiún años y se encontraba concentrado con su club fuera del país. En su gol que celebró el 12 de diciembre de ese año sobre el Sydney de Australia, por el Mundial de Clubes, Bolaños miró al cielo y se lo dedicó a plenitud. El 9 de junio de 2007, su hermano José Pablo, también perdió la vida al sufrir un accidente de tránsito en el sector de Pavas, en donde se volcó su vehículo tras impactar contra dos muros de locales comerciales. Christian estaba con su selección en territorio estadounidense cuando ocurrió el incidente, por lo que pidió permiso al entrenador Hernán Medford para regresar a Costa Rica, perdiéndose el resto de la Copa de Oro de la Concacaf. Bolaños arribó en horas de la tarde desde Miami para presenciar las honras fúnebres.