2004 kehrte er nach Russland zurück und erhielt einen Vertrag bei "Dynamo" aus der Oblast Moskau, die im Moskauer Vorort Ljuberzy beheimatet sind. Mit diesem Verein erreichte er dreimal die Play-offs um die russische Meisterschaft, in denen man jeweils in der ersten Runde ausschied. 2007 wurde der Verein in "Triumph" umbenannt und Morgunows noch laufender Vertrag aufgelöst. Nach dem Gewinn der Basketball-Europameisterschaft 2007 mit der russischen Nationalmannschaft unterschrieb er einen Vertrag bei einem weiteren Moskauer Vorortverein aus Chimki. Mit BK Chimki erreichte er die Finalserie um die russische Meisterschaft, die erneut zugunsten von ZSKA Moskau ausging. Im russischen Pokalwettbewerb 2008 blieb man im Finale gegen ZSKA jedoch siegreich. Bei Chimki kam Morgunow nicht wie gewünscht zum Zuge, wurde aber trotzdem für das Olympiateam 2008 nominiert und wechselte für die Saison 2008/09 nach zum Verein Lokomotive aus Rostow. In der Play-off-Viertelfinalserie 2008/09, in der Lokomotive gegen Morgunows vorherigen Verein Chimki verlor, zog er sich einen Kreuzbandriss zu und fiel monatelang aus. Der Verein selbst wurde als Lokomotive Kuban nach Krasnodar transferiert.