Bowe hizo su debut con la selección absoluta contra los Estados Unidos durante los internacionales de otoño en 2004; ocurrió en Lansdowne Road el 20 de noviembre de 2004. Se convirtió en el primer jugador del condado de Monaghan que ganó una cap con Irlanda desde los años 1920, marcando su presentación con un ensayo en el segundo tiempo. Bowe jugó partidos con Irlanda en su gira por Japón y sus internacionales de otoño en 2005. Jugó en el Seis Naciones 2006 y marcó un ensayo en el partido contra Italia.