W reprezentacji Argentyny Zárate zadebiutował 15 lutego 1956 w przegranym 0:1 meczu z Urugwajem w Mistrzostwach Ameryki Południowej. Na turnieju w Urugwaju Argentyna zajęła drugie miejsce a Zárate wystąpiłtylko w tym meczu. W 1963 po raz drugi wystąpił w Mistrzostwach Ameryki Południowej, na którym Argentyna zajęła trzecie miejsce. Na turnieju wystąpił we wszystkich sześciu meczach z Kolumbią, Peru, Ekwadorem, Brazylią, Boliwią i Paragwajem, którym był jego ostatnim meczem w reprezentacji.