Peter Guggisberg a fait ses débuts en Ligue Nationale A en 2002 avec le SC Langnau Tigers. Il a ensuite été transféré au HC Davos, où il a été sacré champion de Suisse en 2005, 2007 et 2009. Il a également été repêché en 2004 en au total par les Capitals de Washington de la Ligue nationale de hockey. Bien qu'il soit l'un des meilleurs joueurs de son équipe, il est également connu pour ses frasques ; en effet, il a été suspendu par son club en décembre 2006 après avoir été pris avec un taux de d'alcool dans le sang et a été condamné en 2007 à 90 jours de travaux d'intérêt général et à une amende de francs suisses.