Chapita debutó en las Clasificatorias Rusia 2018 en la doble fecha de septiembre de 2016 ante Paraguay y Bolivia, tras su buena participación en la Copa América Centenario. Debutó el 1 de septiembre en la derrota por 2-1 ante Paraguay, siendo titular por la fecha 7 y fue reemplazado al 55' por Edson Puch en un opaco partido de Fuenzalida. El 6 de septiembre, también fue titular en el empate 0-0 ante Bolivia en el Monumental, donde José Pedro fue titular y salió al minuto 70 por Mauricio Pinilla en otro bajo partido del extremo derecho, fallándose ocasiones claras de gol. El 10 de noviembre fue nuevamente titular, esta vez ante en Barranquilla tras la lesión de Alexis Sánchez. Sin embargo Fuenzalida volvió a tener un rendimiento regular al mandar buenos centros para asistir en el primer tiempo, sin embargo en el segundo tiempo se fue apagando, teniendo una oportunidad clara de gol en el minuto 79, tras una buena jugada de Eduardo Vargas. Chile empató 0-0 aquel partido. 5 días después volvió inexplicablemente a ser titular, pese a que Alexis Sánchez se había recuperado, ante el . En este encuentro, Fuenzalida jugó mejor y Chile ganó 3-1. Fue reemplazado en el minuto 73 por Enzo Roco.