Мэнни Фернандес был выбран на драфте НХЛ в 1992 году клубом «Квебек Нордикс» в третьем раунде под общим 52 номером. Спустя два года, 13 февраля 1994 года, «Нордикс» обменяли Фернандеса в «Даллас Старз» на шведского защитника Томми Шёдина и выбор в третьем раунде драфта-1994 («Нордикс» выбрали нападающего Криса Друри). До этого обмена Фернандес выступал в юниорской лиге Квебека за «Лаваль Титан», а после стал играть за фарм-клуб «Старз» в Международной хоккейной лиге «Каламазу Уингз».