Daito Takahashi nella prima parte della sua carriera si dedicò alla combinata nordica, ottenendo il suo primo risultato di rilievo in Coppa del Mondo il 9 dicembre 1999 a Vuokatti, in Finlandia, giungendo 38º in una gara individuale. Tre anni dopo partecipò ai XIX Giochi olimpici invernali di , negli Stati Uniti, piazzandosi sesto nella gara sprint individuale. Nel 2003 fu presente ai Mondiali della Val di Fiemme, in Italia, dove ottenne il sesto nella gara a squadre.