Im August 1899 wurde Elliott Als Bataillonskommandeur unter Beförderung zum Oberstleutnant auf die Philippinen geschickt. Von Oktober 1899 bis Januar 1900 befehligte er dort die 1. Brigade der "Marines". Er nahm an der Schlacht von Noveleta teil. Für sein Verhalten in dieser Schlacht erhielt er eine persönliche Belobigung des Marineministers ("Secretary of the Navy"), John Davis Long.