С ноября 1944 года генерал Козырь был заместителем командира 50-го стрелкового корпуса. В ходе Дебреценской наступательной операции корпус захватил город Сату-Маре, в ходе Будапештской наступательной операции успешно форсировал реку Тиса южнее Чопа, в Банска-Быстрицкой операции освобождён город Банска-Бистрица, в Братиславско-Брновской операции им освобождены города Кремница, Прьевидза (Чехословакия). 21 апреля 1945 года при выезде в войска машина генерала Козыря попала в расположение немецких войск, все находившиеся в ней были убиты пулемётным огнём в городе Райград в 12 километрах от Брно.