Amir stred i 1948 års arabisk-israeliska krig, och deltog 1952 i den statskupp som avsatte kung Faruq I och införde republik i Egypten. Han var försvarsminister och stabschef i egyptiska armén 1956–1967 samt vice premiärminister 1958–1967 under Gamal Abdel Nasser. Amir förde befälet över egyptiska armén under Suezkrisen 1956, inbördeskriget i Nordjemen 1962–1967 och sexdagarskriget 1967.