Zutphen, obsazený Španěly v roce 1587 zradou anglického velitele Rowlanda Yorka, dobyl v roce 1591 zpět Mořic Oranžský, a kromě dvou krátkých období (v roce 1672 a během francouzských revolučních válek) od té doby zůstal součástí Nizozemska. Jeho opevnění bylo v roce 1874 demontováno. Ve druhé světové válce bylo město několikrát bombardováno spojeneckými silami, protože most přes řeku IJssel byl životně důležitý pro podporu německých vojsk v Arnhemu pro operaci Market Garden. Město bylo osvobozeno 14. dubna 1945 po dvou týdnech bojů. Po válce byl zahájen program obnovy. V současnosti má Zutphen jedno z nejlépe dochovaných středověkých městských center severozápadní Evropy, včetně zbytků středověké městské zdi a několika stovek budov z 13., 14. a 15. století.