Marega pelasi Malin maajoukkueessa ensimmäisen maaottelunsa kesäkuussa 2015 Etelä-Sudania vastaan. Hän on pelannut kaikkiaan 20 maaottelua ja tehnyt niissä kolme maalia. Hän on pelannut Afrikan-mestaruuskilpailuissa vuosina 2017 ja 2019.