18 мая 1806 года переведён штабс-лекарем в Кавалергардский полк, с которым принимал участие в Прусском походе 1807 года. 23 января 1808 года Цеэ по болезни был уволен от военной службы и в том же году удостоен Дерптским университетом звания доктора медицины и хирургии и определен к Алсуфьевским минеральным водам Тверской губернии.