В 1849 году Шипшев в составе полка, входившего в русский экспедиционный корпус под командованием генерал-фельдмаршала И. Ф. Паскевича, участвовал в подавлении Венгерского восстания (Революция 1848—1849 годов в Венгрии), которое Венгерское королевство подняло против владычества австрийской династии Габсбургов (в войну русские войска вступили по просьбе австрийского двора). (4 ноября) следующего года Шипшев был произведён в поручики, а (24) декабря 1853 года ― в штабс-ротмистры.