La victoria en el campeonato francés le dio confianza para enfrentarse al Campeonato Europeo de 2011. A causa de una caída en el "lutz" triple quedó relegado a la séptima plaza en el programa corto, pero logró ganar el programa libre y ascender hasta el segundo puesto en la general, detrás de su compatriota Florent Amodio.Esta medalla de plata era su décima medalla consecutiva en el Campeonato Europeo. En 2001, el Campeonato Mundial, que se iba a celebrar en Tokio tuvo que suspenderse a causa del terremoto en la costa oriental de Japón. La competición tuvo lugar en Moscú al mes siguiente. Joubert acabó en octava posición, la primera vez que no lograba una medalla en esta competición desde 2006.