Con la Rivoluzione francese i rapporti tra lo Stato Pontificio e la Francia si deteriorarono notevolmente. Durante la Campagna d'Italia del 1796 i territori della Chiesa furono invasi e la città di Roma fu occupata; dichiarata la Repubblica Romana, papa Pio VI fu deportato dapprima in Toscana e poi in Francia. Il nuovo pontefice, Pio VII, poté rientrare a Roma quando le forze della coalizione prevalsero su quelle francesi.