Јамато је за време битке за залив Лејте, од 22. до 25. октобра 1944. године учествовао у борбеним операцијама као део флоте Центар, коју је предводио Такео Курита. Циљ ове флоте је био да заустави искрцавање америчких трупа на Филипине. Током ноћног пролаза кроз мореуз Сан Бернандино, Централна флота је била нападнута од стране две америчке помдорнице које у успеле да потопе 2 јапанске тешке крстарице и избаце још једну из борбе, што је знатно ослабило могућност флоте да се супротстави ваздушним нападима.