Logan Stanley stammt aus Waterloo in der Provinz Ontario und spielte in seiner Jugend bei den "Waterloo Wolves" und den "Waterloo Siskins". Bei der "OHL Priority Draft 2014" wurde Stanley als zwölfter Spieler von den Windsor Spitfires gezogen und kam am 9. Mai 2014 zu seinem ersten Einsatz in der Ontario Hockey League (OHL). Im Jahr 2016 wurde Stanley beim NHL Entry Draft in der ersten Runde als 18. Spieler von den Winnipeg Jets ausgewählt. Am 7. Dezember 2016 unterschrieb er bei den Jets einen für drei Jahre gültigen Einstiegsvertrag.