Tijdens de winter van 1801 bracht de "USS Boston" minister Livingston naar Frankrijk en deelde met de Amerikaanse Middellandse Zeevloot mee in de strijd bij Tripoli in de Eerste Barbarijse Oorlog. Hij vocht in een strijd tegen zes of zeven Tripolitaanse kanonneerboten op 16 mei 1802. De "USS Boston" keerde terug naar Boston in oktober 1802. Daarna vertrok hij naar Washington D.C. waar hij werd opgelegd.