L'any 1937, sota el lideratge del secretari general del SCI, Rodolfo Olgiati, es va crear l'Ajuda Suïssa, una plataforma d'ONGs suïsses que va realitzar importants tasques d'ajuda humanitària durant la guerra d'Espanya, amb diverses seus a Madrid, Burjassot i Barcelona, on van treballar de forma conjunta amb els quàquers. Hi van participar, entre d'altres, Elisabeth Eidenbenz i Ruth von Wild, membres del SCI. L'Ajuda Suïssa va continuar treballant amb la població refugiada espanyola al sud de França i, en esclatar la Segona Guerra Mundial, va mantenir els mateixos sistemes d'ajut a la població més vulnerable. El SCI va ser present també en el decurs de la Guerra d'Algèria, en el context de la descolonització i de l'antimilitarisme.