İki nakliyat şirketi "Compagnie Générale Transatlantique" ve "Compagnie de Navigation Mixte", Cezayir 1962'de bağımsızlığını kazanana kadar Air Algérie'nin çoğunluk hissesine sahipti (%98). Bağımsızlıktan sonra Cezayir'deki "Délégation Générale" ve Air France çoğunluk hisselerini devraldı. Mart 1963'te finansal yapı değişti. Nakliyat şirketleri ve Air France hisselerinin %31'ini bıraktı ve Cezayir devleti şirketin %51 hissesini alınca hava yolu bayrak taşıma statüsüne çıktı. Nisan 1964'te devlet hisselerini %57'ye çıkardı. Aynı ay Cezayir-Moskova arasında çalışması planlanan iki İlyuşin İl-18 alınması için anlaşma imzalandı. Anlaşma sonradan iptal edildiği için Air Algérie bu uçaklardan sadece birini alabildi. Filodaki tek İlyuşin devlet tarafından kullanıldı. Nisan 1968'e gelindiğinde hava yolunun filosunda sekiz DC-4 vardı. Aynı yıl Lufthansa'ya ait dört Convair 440 alındı ve 640 versiyonuna değiştirildi. Bu uçaklar yaşlanan DC-4'lerin yerine geçecekti. Charter uçuşlar hava yolu şirketinin faaliyetlerinin %20'sini oluşturuyordu.