После провала попытки революции и государственного переворота в Бухаре, Усман Ходжа фактически покинул ряды младобухарцев эмирата, и переехал в Ташкент. Там он начал общаться с левыми эсерами, и в апреле 1918 года организовал левоэсеровское крыло младобухарцев. В сентябре 1918 года принимал участие в работе в Коммунистической партии Бухары, которая была создана в апреле того же года. В феврале 1920 года Усман Ходжа стал членом Центрального Туркестанского бюро партии младобухарцев-революционеров. Тогда происходила последняя фаза Бухарской революции, и в сентябре 1920 года завершилась так называемая Бухарская операция по свержению монархии в эмирате. Эмир Сеид Алим-хан и часть его приближенных бежали в Эмират Афганистан, и в Бухаре монархия была полностью упразднена.