In der Zeit des Nationalsozialismus dezimierten Flucht, Deportation und Ermordung die jüdische Gemeinde Schwelms bis zu ihrer völligen Auslöschung zu Jahresende 1944. Der Friedhof wurde in dieser Zeit mehrfach Ziel von Vandalismus und Schändung, unter anderem in der „Reichskristallnacht“ von 1938, im Umfeld des Aufrufs zur „Reichsmetallspende“ von 1940, erneut 1942 und 1945. Dabei wurden Grabsteine beschmiert, beschädigt, umgestürzt und zerschlagen. Zeugen beschrieben 1943 und 1945 den Ort als „verwüstet“ und „völlig zerstört“, sämtliche Steine auf der Fläche seien umgeworfen gewesen.