Con el paso a la clandestinidad de la Juventud Peronista identificada con los Montoneros, en el clima de época de los años setenta, incluso el núcleo más izquierdista de la Juventud Radical sostuvo la validez de la política dentro de los cauces de la legalidad y por vía electoral. Durante el terrorismo de Estado iniciado desde los grupos paramilitares de la Triple A que respondían a José López Rega, Ministro de Bienestar Social de Héctor Campora, Perón y María Estela Martínez de Perón y proseguido e intensificado por el dictadura militar instalada el 24 de marzo de 1976, caracterizada por ejecutar una guerra sucia en la línea del terrorismo de estado, la Juventud Radical, mantuvo una posición de enfrentamiento al régimen y denuncia de las violaciones de derechos humanos. Uno de sus dirigentes históricos, Sergio Karakachoff fue secuestrado, torturado y asesinado en ese momento. En 1982 la Juventud Radical fue uno de los pocos sectores políticos del país que mantuvo una posición crítica frente a la Guerra de Malvinas contra Gran Bretaña, sosteniendo que una victoria fortalecería la dictadura.