En 1972 la Unión Internacional de Patinaje introdujo un nuevo segmento de la competición, el programa «corto», parecido al programa libre en que se realizaba con música, pero de menor longitud y con elementos de patinaje (saltos y piruetas ) predeterminados y obligatorios para todos los patinadores. El programa corto contribuía un 20 % a la puntuación final y el program libre y las figuras 40 % cada uno. Janet Lynn decidió competir en la temporada de 1973, pues este cambio en el reglamento supuestamente la beneficiaba. En el Campeonato del Mundo de Bratislava realizó las mejores figuras de su carrera y quedó en segundo puesto. Contra todos los pronósticos, tuvo dos caídas en sendos saltos del programa corto y terminó en el puesto 12.º en esta fase de la competición. Ganó el programa libre, lo cual le consiguió la medalla de plata. Esta competición marcó el final de su carrera amateur.