En 1979, la Guerra civil de El Salvador comenzó. Desde 1982, Secretario General de las Naciones Unidas, Javier Pérez de Cuéllar (originario de Perú), desempeñó un papel importante en la mediación durante la guerra. Como resultado, el Presidente peruano Alan García recibió a funcionarios del gobierno salvadoreño y rebeldes FMLN en Perú para discusiones de paz. En 1989, el Secretario General Javier Pérez de Cuéllar nombró a un diplomático peruano, Álvaro de Soto, como representante Personal para el Proceso de Paz Centroamericano, y Soto dirigió las negociaciones que pusieron fin a la guerra civil en El Salvador. En enero de 1992, el gobierno salvadoreño y el FMLN firmaron un acuerdo de paz en la Ciudad de México conocido como los Acuerdos de Paz de Chapultepec, que puso al fin a la guerra civil.