29 kwietnia 1992 zadebiutował w reprezentacji Ukrainy w spotkaniu towarzyskim z Węgrami przegranym 1:3. Został zmieniony w 59 minucie. To był jego jedyny mecz w reprezentacji Ukrainy. Później zmienił obywatelstwo ukraińskie na rosyjskie i od 1993 występował w reprezentacji Rosji. Znany był przede wszystkim z tego, że ustanowił na mistrzostwach świata w 1994 roku rekord liczby goli strzelonych w jednym meczu, zdobywając pięć bramek dla Rosji w wygranym 6-1 meczu z Kamerunem. Wcześniejszy rekord należał do reprezentanta Polski Ernesta Wilimowskiego z 1938 roku. Salenko zdobył również bramkę w przegranym 1-3 meczu ze Szwecją i z dorobkiem 6 goli wspólnie z Christo Stoiczkowem został Królem strzelców Mistrzostw świata 1994 (jest jedynym królem strzelców w historii mundialu którego drużyna odpadła już po pierwszej rundzie). Jednak pomimo tego po mistrzostwach nie wystąpił już ani razu w reprezentacji Rosji.