Жена Франтишека Мусила Андреа Голикова — дочь известного чешского хоккеиста и тренера Ярослава Голика. У них трое детей: дочь Дана и сыновья Давид и Адам. В 2011 году Адама на драфте НХЛ выбрал «Эдмонтон Ойлерз», а в 2015 году Давида — «Сент-Луис Блюз».