Beltrán de la Cueva no va prendre partit per la seva suposada filla durant la Guerra de Successió castellana entre 1474 i 1479, després de la mort d'Enric IV. Al contrari, va combatre en les files isabelines durant diversos anys, tant a la guerra successòria com al setge de Granada de 1491. Va morir el dia de Tots els Sants de 1492 al seu castell de Cuéllar.