Godart war stellvertretender Direktor (Sous-Directeur) des Collège Louis-le-Grand in Paris, an dem er auch studiert hatte, und kam nach der Besetzung des Rheinlandes (→Erster Koalitionskrieg) durch die Franzosen als Provisor (Proviseur) an das Lyzeum in Bonn. Nach Ende der französischen Besatzung machte er sich mit 300 französischen Schülern auf Befehl von General Sebastian durch die feindlichen Linien auf Schleichwegen auf den Weg nach Frankreich und kam nach 25 Tagen mit ihnen in Douai (Département Nord) an. Zur Belohnung wurde er Zensor und Provisor am Lyzeum in Nancy. Während Napoleons Herrschaft der Hundert Tage stellte er sich auf die Seite des Kaisers und wurde deshalb nach Rückkehr der Bourbonen zwangsweise in den Ruhestand geschickt. Seine Schmetterlingssammlung, die er in 20 Jahren aufgebaut hatte, musste er einem Naturforscher in Bonn zu einem geringen Preis überlassen, er nahm jedoch seine Aufzeichnungen mit, die die Basis seiner späteren Werke waren.