Anfang 2015 wurde er neuer Cheftrainer von Burkina Faso. Im Dezember 2015 erklärte Rohr seinen Rücktritt vom Traineramt in Burkina Faso. Als Grund gab er nicht sportliche Aspekte, sondern die „schwierige politische Lage“ im Land an. 2016 übernahm er den Cheftrainerposten der nigerianischen Fußballnationalmannschaft, mit der er beim Afrika-Cup 2019 den dritten Platz erreichte.