9 июля 2018 года Луис Энрике стал главным тренером сборной Испании по футболу, сменив на этом посту Фернандо Йерро. Контракт подписан на 2 года. С марта 2019 года Луис Энрике передал руководство сборной в трёх матчах своему ассистенту, Роберту Морено, поскольку отсутствовал, переживая за больную остеосаркомой 9-летнюю дочку (в итоге девочка скончалась в августе). 19 июня 2019 года он официально покинул пост главного тренера сборной «по личным причинам». Оправившись от семейной трагедии 19 ноября Энрике вернулся на пост главного тренера национальной сборной, которая под руководством Морено квалифицировалась на Евро 2020.