El palacio es famoso sobre todo, por el papel que jugó en el reinado del último zar, Nicolás II. Él y su esposa, Alejandra siempre mostraron una preferencia por el palacio. En 1896, poco después de su enlace, encargaron a su arquitecto de confianza y arquitecto de corte, Silvio Danini, la reforma del ala sur del palacio para acomodarlo a su gusto, incluyendo la construcción del famoso balcón que rodeaba el ángulo sur. Tras el Domingo sangriento que hizo peligroso el Palacio de Invierno Nicolás II y su esposa decidieron hacer de él su residencia permanente. Remodelaron el salón de baile de dos plantas, transformando el espacio en el Habitación de Arce y el Nuevo Estudio y añadieron habitaciones para sus hijos en la planta superior. Contrariamente al gusto imperante en la corte, Alejandra, y el arquitecto Roman Meltzer, eligieron un estilo de decoración entonces moderno, Jugendstil o Art Nouveau, considerado por la aristocracia más «de clase media» que «imperial». Otra de estas famosas habitaciones es la habitación malva de Alejandra.