Se unió al ejército austríaco en 1821, como teniente en el Regimiento de Caballería Ligera N.º 1. Desde 1824 fue teniente en el Regimiento de Lanceros N.º 3, y en 1825 Capitán en el Regimiento Uhlan N.º 2. Desde 1828 hasta 1830 prestó servicio como comandante de escuadrones, de nuevo en el Regimiento Uhlan N.º 3. En 1832 estuvo de servicio en varios regimientos de húsares y ascendió en 1836 a coronel. En el año revolucionario de 1848 el príncipe Francisco de Paula tomó el como de brigada en la reserva del Cuerpo de Welden en las operaciones en Italia. En octubre de 1848 se incorporó al ejército del príncipe Alfredo I de Windisch-Grätz, y participó como mariscal de campo-teniente y comandante general de la represión de la revuelta en Hungría en 1849. A partir de julio de 1849 el príncipe Francisco de Paula fue comandante del Cuerpo de Reserva y el 16 de octubre de 1849 entró a formar parte del 13º Cuerpo del Ejército en Hungría. También en 1849 se convirtió en el coronel propietario (Inhaber) de los Húsares N.º 9. En 1859, el príncipe Francisco de Paula fue nombrado general de la Caballería y entre los años 1860-1866 fue inspector general de Caballería. De 1860 a 1861 dirigió en Hungría el Comando General de la República. En 1868 se jubiló. Desde 1861 el príncipe Francisco tenía un asiento en el Consejo Imperial Austríaco. Y desde en 1871, ya como miembro vitalicio.