El protector y máxima autoridad presidencial fue Andrés de Santa Cruz, electo Supremo Protector de la Confederación Perú-Boliviana por los Congresos de Tapacarí, Huaura y Sicuani el 28 de octubre de 1836, asimismo de manera simultánea asumió la presidencia del Estado Boliviano. Sin embargo Mariano Enrique Calvo, asumió la presidencia interina en reemplazo del presidente, al hallarse Santa Cruz en territorio peruano en el proceso de formación del protectorado de la Confederación Perú-Boliviana. En toda esa gestión, Santa Cruz estuvo más pendiente en asuntos militares que administrativos, como la guerra por el establecimiento de la Confederación Perú-Boliviana, la guerra contra la Confederación Argentina y la guerra contra Chile y el Ejército Restaurador. Por lo que Calvo llegó a estar más tiempo en el cargo presidencial que Santa Cruz, incluso sería a Calvo a quien José Miguel de Velasco terminaría derrocando, para terminar de esa manera por declarar la secesión de Bolivia de la Confederación Perú-Boliviana. Calvo ejerció el interinato por más de dos años y medio, sumadas todas las ausencias de Santa Cruz.