W reprezentacji Kolumbii Morantes zadebiutował w 1997 roku. W tym samym roku znalazł się w drużynie na Copa América. Na tamtym turnieju, zakończonym przez Kolumbię na ćwierćfinale, wystąpił w spotkaniach z Meksykiem (1:2), Kostaryką (4:1, 2 gole), Brazylią (0:2) oraz Boliwią (1:2).