Отец — Марцелий Новодворский, участник восстания в Польше, выслан из Польши в Россию. Окончил в 1906 году гимназию Петербурга, изучал биологию в Санкт-Петербургском университете, в 1907—1912 годах учился в Военно-медицинской академии Санкт-Петербурга. Окончил её в 1912 году с дипломом военного врача и получил офицерское звание в русской армии. Ординатор клиники при Военно-медицинской академии. 22 июля 1914 года мобилизован в качестве младшего полкового врача и отправлен на фронт Первой мировой войны. С августа 1915 года — врач госпиталя и эвакуационного пункта в Петрограде. Служил в Русской императорской армии до 1917 года.