В августе — сентябре 1919 г. действовала в составе Туркестанского фронта, участвуя в разгроме колчаковской Южной армии и белоказаков. В ходе Актюбинской операции соединилась 13 сентября того же года с войсками Туркестанской советской республики у станции Мугоджарская. Часть войск 1-й армии продолжала вести бои против белоказаков в Уральской области до апреля 1920 года, другая часть войск в ноябре 1919 — марте 1920 заняла Закаспийскую область, участвовала в Хивинской и Бухарской операциях, устанавливая там советскую власть. Позже армия участвовала в борьбе с басмачами.