Bieg na dystansie 5000 metrów mężczyzn był jedną z konkurencji rozgrywanych podczas XII mistrzostw Europy w Pradze. Biegi eliminacyjne zostały rozegrane 31 sierpnia, a bieg finałowy 2 września 1978 roku. Zwycięzcą tej konkurencji został reprezentant Włoch Venanzio Ortis. Przyznano dwa srebrne medale, ponieważ Aleksandr Fiedotkin ze Związku Radzieckiego i Markus Ryffel ze Szwajcarii wbiegli na metę w tym samym momencie i fotokomórka nie była w stanie ustalić, który z nich był pierwszy. W rywalizacji wzięło udział trzydziestu dwóch zawodników z dwudziestu jeden reprezentacji.