Op de wereldkampioenschappen zwemmen 2009 in Rome strandde Joensen in de series van de 400, 800 en 1500 meter vrije slag. Tijdens de Europese kampioenschappen kortebaanzwemmen 2009 eindigde de Faeröerder als zevende op de 1500 meter vrije slag, hij kwalificeerde zich voor de finale op de 400 meter vrije slag maar meldde zich hier voor af en hij werd uitgeschakeld in de series van de 200 meter vrije slag.