Najważniejsza kolekcja muzeum nawiązuje do II wojny światowej. Są ta różne panele fotograficzne, pokazujące życie na Malcie podczas wojny, zwłaszcza trudności codziennego życia ludności cywilnej oraz zniszczenia spowodowane bombardowaniami lotniczymi. Jednym z głównych elementów wystawy jest kadłub Gloster Sea Gladiator "N5520", jedyny ocalały z . W muzeum znajduje się też Willys Jeep 'Husky' używany przez Dwighta Eisenhowera przed aliancką inwazją na Sycylię, oraz przez Roosevelta, kiedy wizytował Maltę. "George Cross", którym Malta została odznaczona przez króla Jerzego VI w kwietniu 1942 roku, również jest wystawiany w muzeum. Placówka posiada też wrak rozbitego samolotu, zdobyczne niemieckie karabiny maszynowe, torpedę, lekki moździerz oraz inną broń.