Петер почав свою кар'єру у 2000 році у складі юніорської команди Лангнау Тайгерс (елітна юніорська національна ліга А). У основному складі дебютував в сезоні &lt;a href="%D0%A7%D0%B5%D0%BC%D0%BF%D1%96%D0%BE%D0%BD%D0%B0%D1%82%20%D0%A8%D0%B2%D0%B5%D0%B9%D1%86%D0%B0%D1%80%D1%96%D1%97%20%D1%96%D0%B7%20%D1%85%D0%BE%D0%BA%D0%B5%D1%8E%202003"&gt;2002/03&lt;/a&gt; років (34 гри, 12 очок). Перед сезоном &lt;a href="%D0%A7%D0%B5%D0%BC%D0%BF%D1%96%D0%BE%D0%BD%D0%B0%D1%82%20%D0%A8%D0%B2%D0%B5%D0%B9%D1%86%D0%B0%D1%80%D1%96%D1%97%20%D1%96%D0%B7%20%D1%85%D0%BE%D0%BA%D0%B5%D1%8E%202004"&gt;2003/04&lt;/a&gt;, він перейшов до ХК «Давос». У своєму першому сезоні Петер провів 39 матчів, забив одинадцять голів та зробив вісім передач. У Драфті НХЛ 2004 року був обраний під 166 номером клубом «Вашингтон Кепіталс». У наступні роки, Гуггісберг став одним із лідерів клубу. Однак, у квітні 2006 року, він був визнаний винним у порушенні закону щодо обігу наркотиків та засуджений до п'яти днів в'язниці і штрафу у розмірі 3 500 франків. Його діючий контракт із клубом «Давос» призупинили до кінця 2006 року, через що він пропустив Кубок Шпенглера. У травні 2007 року суд наклав штраф у 30 600 франків, а також громадські роботи у лікарні Давосу. Незважаючи на цей інцидент з ним продовжили контракт на два роки. У січні 2014 року, він вирішив змінити клуб і уклав трирічний контракт з «Клотен Флаєрс».