В 1979 году, с формированием консервативного кабинета Джо Кларка, был вновь поставлен вопрос о переносе посольства Канады в Иерусалим, но крайне негативная реакция арабских стран заставила канадское правительство не только отказаться от этого плана, но и обратить более пристальное внимание на палестинскую точку зрения на конфликт. Канадское общество и правительство занимали более критическую позицию по отношению к Израилю в ходе Ливанской войны и первой интифады, хотя изменение этой позиции было более медленным, чем в других западных странах. В качестве одной из возможных причин неохотной поддержки канадским руководством права палестинцев на самоопределение называют опасения, что такая поддержка усилит позиции квебекских сепаратистов. Кроме того, по мнению некоторых сотрудников канадского дипломатического корпуса, на ближневосточную политику их страны оказывало непропорциональное влияние еврейское лобби. Созданный после Шестидневной войны Канадско-израильский комитет, в частности, вынудил членов правительства объясняться после одного из выступлений, осуждавших нарушения прав человека на палестинских территориях. Тем не менее в 1986 году в речи, произнесённой во время визита в Израиль, Джо Кларк, на тот момент министр в кабинете Малруни, отметил поддержку его страной прав палестинцев на государство на Западном берегу Иордана и в секторе Газа. В эти же годы Канада отказалась поддержать предложение премьер-министра Израиля Переса по созданию «Плана Маршалла для Ближнего Востока» и регулярно поддерживала в ООН резолюции, осуждающие строительство израильских поселений на Западном берегу реки Иордан и в секторе Газа и нарушения прав человека в контролируемом Израилем Южном Ливане. Канадское дипломатическое представительство в Палестинской национальной администрации открылось в 1999 году в Рамалле.