Para 2009 el conjunto se renovó casi por completo, permaneciendo, de las gimnastas que habían estado en Pekín 2008, únicamente Ana María Pelaz. Algunas gimnastas como Bet Salom decidieron abandonar la selección debido a la decisión de Angelova de aumentar el número de horas de entrenamientos, lo que los hacía incompatibles con sus estudios. Alejandra fue este año gimnasta titular en los dos ejercicios de la temporada. En abril, con el conjunto ya entrenado por la seleccionadora Efrossina Angelova junto a Sara Bayón (que tras dejar el equipo en mayo sería sustituida por Noelia Fernández), logró dos medallas de plata (en el concurso general y en 3 cintas y 2 cuerdas) en la prueba de la Copa del Mundo celebrada en Portimão (Portugal), además del 6º puesto en 5 aros. En septiembre, en el Campeonato Mundial de Mie, el conjunto obtuvo el 6º puesto tanto en el concurso general como en la final de 5 aros, y el 7º en 3 cintas y 2 cuerdas. El conjunto titular lo formaron ese año Alejandra, Loreto Achaerandio, Sandra Aguilar, Ana María Pelaz (capitana) y Lidia Redondo, además de Nuria Artigues y Sara Garvín como suplentes al principio y al final de la temporada respectivamente.