פנדו ערך את הופעת הבכורה שלו בנבחרת פנמה ביוני בניצחון 0-1 נגד . פנדו השתתף עם הנבחרת 6 פעמים בגביע הזהב ופעם אחת בקופה אמריקה 2016. בגביע הזהב 2003 וגביע הזהב 2015 נבחר לשוער הזהב.