Im September 2012 absolvierte Jérémie Boga 2 Partien für die französische U16-Nationalmannschaft (1 Treffer). Von 2014 bis 2016 lief er für die U19-Auswahl auf und erzielte gleichfalls 1 Tor. In der Folge entschied sich Boga, künftig für die Nationalmannschaft der Elfenbeinküste aufzulaufen und debütierte am 10. Juni 2017 in Bouaké beim 2:3 im Qualifikationsspiel für den Afrika-Cup gegen Ghana.