Cuando era niño, durante el reinado del califa Úmar en 636, Ibn al-Zubayr pudo haber estado presente con su padre en la Batalla de Yarmuk contra los bizantinos en Siria. También estuvo presente con su padre en la campaña de Amr ibn al-As contra el Egipto bizantino en 640. En 647, Ibn al-Zubayr se distinguió en la conquista musulmana deIfriqiya (África del Norte) bajo el mando del comandante Abd Allah ibn Sa'd. Durante esa campaña, Ibn al-Zubayr descubrió un punto vulnerable en las líneas de batalla de los defensores bizantinos y mató a su patricio, Gregorio. Fue alabado por esto por el califa Uthmán y pronunció un discurso de victoria, bien conocido por su elocuencia, a su regreso a Medina. Más tarde, se unió a Sa'id ibn al-As en la ofensiva de este último en el norte de Irán en 650. Uthman nombró a Ibn al-Zubayr a la comisión encargada de la recopilación del Corán. Durante el sitio rebelde de la casa de Uthmán en junio de 656, el califa puso a Ibn al-Zubayr a cargo de su defensa y, según los informes, resultó herido en los combates. Tras el asesinato de Uthmán, Ibn al-Zubayr luchó junto a su padre y su tía A'isha contra los partidarios del sucesor de Uthmán, el califa Ali, en la Batalla del Camello en Basora en diciembre. Al-Zubayr, su padre, murió allí mientras que Ibn al-Zubayr resultó herido mientras luchaba con uno de los comandantes de Ali, Malik al-Ashtar. Ali salió victorioso e Ibn al-Zubayr regresó con A'isha a Medina, participando más tarde en el arbitraje para poner fin a la Primera Fitna (guerra civil musulmana) en Adhruh o Dumat al-Jandal. Durante las conversaciones, aconsejó a Abd Allah ibn Umar que pagara el apoyo de Amr ibn al-As. Ibn al-Zubayr heredó una fortuna significativa de su padre.