Nach der Machtübergabe an die Nationalsozialisten arbeitete er wieder als Techniker. Er leitete eine Widerstandsgruppe, die aus der Oppositionsgruppe um Merker hervorgegangen war. Unabhängig von der KPD hat Peuke illegale Betriebsgruppen aufgebaut. Wegen der ihm fälschlich angelasteten Beteiligung an der Ermordung des SA-Mannes Horst Wessel 1930 und der Polizeioffiziere Paul Anlauf und Franz Lenck im Jahr 1931 wurde er gesucht.