Foi novamente ocupada de 1577 a 1589, na sequência do desembarque de para a tentativa conquista de Marrocos que redundou na Batalha de Alcácer-Quibir de 1578. Em 1589 Filipe I de Portugal devolve Arzila ao sultão saadiano Almançor. Arzila é também o local de nascimento do guerreiro , que começando por combater os portugueses, depois entrou ao serviço deles na Índia e no Extremo Oriente.