L’église Saint-Philippe garde sa fonction de cathédrale de la ville d’Alger jusqu’à l'indépendance de l'Algérie en 1962 où elle est reconvertie en mosquée. Le ministère algérien des habous et l'archevêque d'Alger annoncent le transfert, par une déclaration publique commune, comme un . La première prière solennelle du vendredi y est célébrée le ; elle se déroule au-dessus d'une crypte qui abrite encore les tombeaux des évêques.