Proprio nel 2004 viene ceduto all' dove rimane per due stagioni: sotto la guida di Roberto Mancini vince uno scudetto (nel 2006, assegnato a tavolino ai nerazzurri dopo le vicende di Calciopoli), due Coppe Italia (2005 e 2006) e una Supercoppa italiana (2005). Il 17 aprile 2005 segna il suo unico gol in 49 apparizioni con l'Inter (di cui 30 in Serie A), nell'incontro vinto 2-0 sul .