В июне-июле 1940 г. дивизия принимала участие в присоединении к СССР Бессарабии, входившей в состав Румынии. После окончания похода в Бессарабию 9-я кд осталась в Южной Бессарабии для охраны государственной границы. С 7 июля дивизия вошла в состав Одесского военного округа (далее ОдВО)