À la mort de sa mère en 1847, il quitte la Saône-et-Loire et est placé chez sa tante, Judith Dufraine, sœur à l'hôpital de la Charité de Lyon qui l'envoie en apprentissage chez Jean Perrot (né en 1802), sculpteur marbrier sur le quai de l'Hôpital. Il suit parallèlement les cours du soir de l’École de dessin de Lyon. La Révolution de 1848 perturbe ses études, mais plus tard. Il entre alors en apprentissage chez Pierre Prost (1776-1855) aux Brotteaux en tant que praticien. Prost travaillait surtout pour le domaine funéraire en particulier avec l’atelier de Guillaume Bonnet, dans lequel fut ensuite introduit Dufraine. De là date l'éclosion de son talent et le début de sa carrière de praticien. Son apprentissage avec Bonnet est suivi d'une collaboration qui dure jusqu'à la fin de sa vie. Ainsi, il participe à la décoration de plusieurs ouvrages lyonnais tels que le palais du Commerce, le palais de justice ainsi que la statue de la "Ville de Lyon" pour la fontaine de l’ancienne place Louis XVI (aujourd’hui place du Maréchal Lyautey).