Mezi 21. a 25. zářím 1944 se "Fujuzuki" podrobil nutným opravám v jokosuckých docích. Dne 11. října vyplul spolu se sesterským "Šimocuki" a lehkým křižníkem "Ójodo" z Jokosuky. Cestou do Haširadžimy byl svaz kolem 21:00 dne 12. října napaden ponorkou USS "Trepang". Cílem šesti vystřelených torpéd měl být "Ójodo". Všechna torpéda svůj cíl minula, ale jedno z nich zasáhlo "Fujuzuki" na přídi. Příď torpédoborce se zbortila a zásah poškodil i přední dělovou věž. Následující opravy probíhaly od 14. října do 20. listopadu v docích v Kure. Kvůli tomuto poškození a následným opravám "Fujuzuki" zmeškal bitvu u Leyte.