Durante la seconda guerra mondiale, entrambe le organizzazioni hanno creato organizzazioni di resistenza sotterranea: ONR-ABC è stata trasformata in Grupa Szańca ("Rampart Group"), il cui braccio militare è diventato lo Związek Jaszczurczy ("Lizard Union"), mentre l'ONR-Falanga ha creato il Konfederacja Narodu ("Confederazione della Nazione"). Non sostenevano lo stato segreto polacco legato al Governo in esilio della Polonia. Durante l'occupazione tedesca della Polonia, molti degli ex attivisti dell'ONR appartenevano a gruppi di resistenza delle forze armate nazionali. Dopo la seconda guerra mondiale, l'esilio forzato di molti membri dell'ONR è stato reso permanente dalla Repubblica Popolare di Polonia di recente creazione, che li ha bollati come nemici dello stato.