Lors de la conférence «Beijing +5» de l'Assemblée générale des Nations unies en 2000 (une conférence de suivi de la Quatrième conférence mondiale sur les femmes à Pékin de 1995), Franziska Brantner remplit la fonction de coprésidente du "Youth Caucus" de la Commission des Nations unies sur la condition de la femme. Pour le Fonds de développement des Nations unies pour la femme (UNIFEM), l'organisation de l'ONU pour les droits de la femme, elle travaille en tant que conseillère et coordonne avec la Présidence française du Conseil de l'Union européenne en 2008 un projet concernant l'élaboration du cadre européen pour la Résolution 1325: les femmes, la paix et la sécurité du Conseil de sécurité des Nations unies. Elle est coauteur d'une étude du Conseil européen des relations étrangères sur la politique européenne des droits de l'homme au sein des Nations unies. À la Fondation Bertelsmann à Bruxelles, elle travaille sur la Politique étrangère et de sécurité commune et sur les réponses européennes à la crise financière.