V roce 2003 byl Babickij svědkem obhajoby v extradičním řízení Achmeda Zakajeva. Popřel svou známost se Zakajevem, v čem byl nařčen generální prokuraturou. 1. září 2004, okamžitě po zprávách o útoku na školu v Beslanu, Babickij odletěl do Osetie, aby zprostředkoval jejich propuštění, ale byl zadržen na letišti Vnukovo „za chuligánství“.