La escritura del "Shoku Nihongi", el primer sucesor de "Nihonshoki", comenzó alrededor del 760 por Fujiwara no Nakamaro, pero sufrió varios contratiempos antes de su publicación en el 797, como la muerte de Nakamaro en la Rebelión de Fujiwara no Nakamaro en el 764; los treinta volúmenes del borrador generaron críticas por concentrarse en hechos anecdóticos e ignorar algunos eventos importantes. El emperador Kōnin hizo revivir el proyecto, pero aún permaneció en forma de borrador. Los edictos en el 794 y el 797 hicieron posible completar el proyecto. Los cuarenta volúmenes del "Shoku Nihongi" cubren el período del 697 al 791. El trabajo final se destaca por el uso de nuevas fuentes, como los registros de templos budistas o los informes de ingresos fiscales. Al igual que el "Kojiki", está escrito en un lenguaje basado en el chino clásico y en un uso fonético de los caracteres chinos. El "Shoku Nihongi" también describe ciertos aspectos de la sociedad japonesa de la época, como las condiciones de los trabajadores en las obras de construcción en la capital, Heijō-kyō (la moderna Nara). En consonancia con los modelos chinos, el lugar de la poesía se reduce considerablemente.