Après la Conquête de l'Algérie par la France en 1830, l'état Français en prit possession, et après avoir indemnisé les héritiers et en fait la première Mairie d'Alger. En 1860, la partie ouest du palais fût transormée à l'occasion de la visite de l'impératrice Eugénie de Montijo, à laquelle Aziza Bacri, la petite fille de Michel Cohen Bacri servit d'interprète. C'est sans doute à cette époque, que toute la partie ouest fut agrandie. Le Palais a connu plusieurs transformations et occupations jusqu'en 1939, date à laquelle il fut affecté au service de l'Artisanat. En 1961, il devient Musée des Arts Populaires. Par décret du , il est érigé en Musée National des Arts et traditions populaires.