1801年，托马斯·杰斐逊当选美国总统。他拒绝进贡，并派遣美国海军舰队前往地中海，開啟了第一次巴巴里戰爭。舰队砲轟了当今利比亚、突尼斯和阿尔及利亚的各种设防海盗城市，最终从他们的统治者那里获得了公平通行的特许权。杰佛逊的继任者詹姆斯·麦迪逊，在对英国的1812年战争结束后不久，于1815年指挥了第二次战争的军队。