В листопаді-грудні «Ентерпрайз» прикривав десантну операцію на островах Гілберта, в січні 1944 року на Маршаллових островах та Східних Каролінських островах. 21 квітня він завдавав удару по ворожих об'єктах в Новій Гвінеї. В червні авіаносець забезпечував висадку на Маріанські острови та брав участь в битві у Філіппінському морі. У вересні-жовтні атакував японські бази на Західних Каролінських островах, Окінаві, Лусоні та Формозі. Брав участь в битві в затоці Лейте, в ході якої 24 жовтня авіагрупа «Ентерпрайза» атакувала лінкор «Мусасі».