"A hiányzó láncszem" elnyerte a legjobb animációs játékfilmnek járó Golden Globe-díját, valamint ez az első nem számítógépes animációs film, ami nyert a kategóriában, és az első nem CGI-s film, amely Golden-Globe-ot nyert a Libanoni keringő (2008) óta. Jelölést kapott a 92. Oscar-gálán, mint a legjobb animációs játékfilm, de elvesztette a Toy Story 4. ellen.