Mikkel Hansen, Danimarka millî takımıyla Rio de Janeiro'daki 2016 Yaz Olimpiyatları'nda Olimpiyat, kendi ülkesi ve Almanya'nın ortaklaşa ev sahipliğinde gerçekleştirilen 2019 Dünya Erkekler Hentbol Şampiyonası'nda dünya ve Sırbistan'da düzenlenen 2012 Avrupa Erkekler Hentbol Şampiyonası'nda ise Avrupa şampiyonluğu kazandı. Ayrıca turnuvanın All-Star ekibine en iyi sol oyun kurucu olarak seçildi. 2011'de İsveç'teki Dünya Şampiyonası'nda ikinci olan Danimarka takımının kadrosunda yer aldı. Turnuvanın genel olarak en iyi golcüsü oldu.