В июне 1799 года республиканцы сдались повстанцам-санфедистам и русскому десанту. Фердинанд смог вернуться в Неаполь. Невзирая на милостивые условия сдачи, зачинщики «бунта» были казнены. В государстве установился полицейский режим, продолжавшийся до сентября 1800 года, когда первый консул Франции Наполеон Бонапарт, после победы над австрийцами при Маренго, заставил короля прекратить репрессии против бывших республиканцев.