I starten af 1314 blev Margrete angiveligt afsløret i utroskab i Tour de Nesle Affæren. Hendes svigerinde Isabella af Frankrig vidnede mod hende, og Margrete blev fundet skyldig og fængslet i de sidste to år af sit liv sammen med sin svigerinde Blanka af Burgund. Margrete blev holdt indspærret på Château Gaillard og døde efter hård behandling i april 1315. Meget passende slap Ludvig 10. nu for skilsmisse, og 5 måneder senere blev han gift med Klementine af Ungarn.