Ничем не отличившись, старалась быть всегда в стороне от всех событий. Но после стрелецкого бунта 1698 года Пётр I подозревал её в сочувствии к младшей сестре Софье. Однако причастность Евдокии к мятежу доказана не была и Пётр её не тронул. Оставшуюся жизнь провела в стенах Новодевичьего монастыря, но пострига не принимала. Келейная икона этой царевны «Богоматерь Иверская Понтаитисса», написанная в XVII веке на Северных Балканах, и сейчас находится в Новодевичьем монастыре.