Po raz pierwszy na arenie międzynarodowej Masako Ishida pojawiła się 26 grudnia 1997 roku w japońskiej miejscowości Otoineppu, zajmując 31. miejsce w biegu na 5 km techniką klasyczną w zawodach FIS Race. W 2000 roku wystartowała na mistrzostwach świata juniorów w Štrbskim Plesie, gdzie jej najlepszym wynikiem było 13. miejsce na dystansie 15 km stylem klasycznym. W Pucharze Świata zadebiutowała 7 marca 2001 roku w Oslo, zajmując 54. miejsce w sprincie klasykiem. Pierwsze punkty wywalczyła ponad dwa lata później - 28 listopada 2003 roku w Ruce, gdzie zajęła 29. pozycję w biegu na 10 km. Parę miesięcy wcześniej brała udział w mistrzostwach świata w Val di Fiemme, gdzie indywidualnie plasowała się w czwartej dziesiątce, a wspólnie z koleżankami z reprezentacji była jedenasta w sztafecie. Najbliżej medalu na imprezach tej rangi była podczas rozgrywanych w 2009 roku mistrzostw świata w Libercu, gdzie razem z Madoką Natsumi zajęła czwarte miejsce w sprincie drużynowym. Kilkanaście dni później Japonka po raz pierwszy w karierze stanęła na podium zawodów Pucharu Świata: 14 marca 2009 roku w Trondheim była trzecia na dystansie 30 km stylem klasycznym. W zawodach tych wyprzedziły ją jedynie Petra Majdič ze Słowenii i Polka Justyna Kowalczyk. W klasyfikacji generalnej &lt;a href="Puchar%20%C5%9Awiata%20w%20biegach%20narciarskich%202008/2009"&gt;sezonu 2008/2009&lt;/a&gt; zajęła ostatecznie 33. miejsce. Najlepsze wyniki w Pucharze Świata osiągnęła w &lt;a href="Puchar%20%C5%9Awiata%20w%20biegach%20narciarskich%202012/2013"&gt;sezonie 2012/2013&lt;/a&gt;, kiedy rywalizację ukończyła na siedemnastej pozycji. W 2006 roku wystąpiła na igrzyskach olimpijskich w Turynie, ale indywidualnie ani razu nie zmieściła się w czołowej trzydziestce, a w sztafecie Japonki zajęły 12. miejsce. Na rozgrywanych cztery lata później igrzyskach olimpijskich w Vancouver, gdzie była między innymi piąta w biegu na 30 km techniką klasyczną i ósma w sztafecie.