Dès sa première saison, il réalise le triplé Ligue des champions, coupe d'Espagne et championnat (en plus d'une Supercoupe d'Europe et de la Coupe du monde des clubs). Emmené par le trio d'attaque « MSN » (Messi-Suárez-Neymar), Luis Enrique remporte de nouveau la Coupe et le championnat en 2015-16. Sa troisième année s'achève avec uniquement la victoire en Coupe, étant également marquée par la remontée historique contre le Paris Saint-Germain (victoire 6-1 après avoir perdu 0-4 à l'aller) en huitième de finale de la Ligue des Champions. Il quitte le Barça à l'issue de la saison 2016-17.