В 1862 году был назначен командиром Киевского гренадерского полка, с которым в 1863 году участвовал в подавлении польского восстания; под его командованием были разбиты отряды Жиглинского и Баера при деревнях Ясен-Бернища и Студзянка, и 1 октября 1863 года Дохтуров был награждён орденом Св. Анны 2-й степени с мечами (в 1864 году получил императорскую корону к этому ордену). В 1869 году получил майорат в Царстве Польском.