В мае 1899 г. был назначен министром иностранных дел. После начала филиппино-американской войны был назначен директором военного трибунала, ушел в отставку в июне 1899 г. 17 ноября 1899 г. был захвачен американцами. После пяти месяцев тюремного заключения в апреле 1900 г. был освобожден. В том же году он основал Федералистскую партию, которая стремилась к сотрудничеству с американцами и включению страны в качестве одного из штатов в состав США. В 1902 г. выступил одним из основателей Независимой филиппинской церкви. Как член организации масонов был мастером филиппинской ложи и секретарем Народной национальной партии.