Portugal foi envolvido no conflito em 1801, na chamada Guerra das Laranjas, ao ser invadido por forças espanholas. Na realidade, existia um estado de guerra entre Portugal e a França desde 1793, quando teve início a participação portuguesa na Campanha do Rossilhão, no âmbito da Guerra da Primeira Coligação. Sendo uma potência aliada da Inglaterra, Portugal garantia, com esta aliança, as comunicações com os seus territórios ultramarinos. Atacar Portugal e ameaçar ocupar o seu território era, para Napoleão, uma forma de ganhar uma posição mais favorável nas negociações com a Inglaterra quando chegasse o fim da guerra. Neste sentido, o governo espanhol foi pressionado para organizar, com o apoio francês, um exército para invadir Portugal. Assim, o estado de guerra que perdurava desde 1793 materializou-se novamente em ações militares, agora no território português, que foi parcialmente ocupado. A ameaça de anexar todo o território apressou as negociações de paz entre a França e a Grã-Bretanha.