Ōfunaton kaupunki perustettiin vuonna 1952 liittämällä yhteen Ōfunaton ja Sakarin maaseutukaupungit sekä viisi kyläkuntaa. 1950-luvulta lähtien kaupungin satama-alueelle on sijoittunut puu-, sementti- ja elintarviketeollisuutta. Tärkeitä elinkeinoja ovat myös kalastus sekä kalkkikiven ja serpentiniitin louhinta. Kaupunki laajeni huomattavasti vuonna 2001, kun siihen yhdistettiin Sanrikun maaseutukaupunki. Vuonna 2011 Ōfunato kärsi pahoin Tōhokun maanjäristyksestä, kun sen aiheuttama yli kahdeksan metriä korkea tsunami surmasi 422 ihmistä ja tuhosi 2 791 asuinrakennusta kokonaan.