Après le débarquement des Alliés en Afrique du Nord, et d'autant plus à partir du (à la suite du défilé), la répression s'intensifie dans la région : les Allemands mènent de brutales offensives sous forme de représailles, d'exécutions et de rafles. La première rafle a lieu à Nantua le . 400 soldats sont déployés dans la ville. Le docteur Émile Mercier, dénoncé comme étant le chef de secteur de la Résistance, est arrêté puis exécuté sur la route de Maillat. 150 hommes âgés de 18 à 50 ans sont déportés pour combler les vides créés par l'augmentation du nombre de réfractaires au . Les soldats allemands se rendent ensuite à Oyonnax pour réaffirmer leur puissance sur une population impressionnée par le défilé du . Ils arrêtent et exécutent le maire de la ville, Paul Maréchal, et son adjoint, Auguste Sonthonnax, avant de rejoindre Arbent pour y exécuter le maire François Rochaix.