Efter Asturienrevolutionen i oktober 1934 arresterades Rubial och dömdes till fängelse. Han släpptes fri efter folkfrontens valseger i mars 1936. Vid Spanska inbördeskrigets utbrott senare samma år anslöt han sig till de republikanska styrkorna. Han tillfångatogs i februari 1937 och dömdes 1940 till 14 år i fängelse. Under tiden i fängelse fortsatte han att organisera medfångar i det numera underjordiska PSOE. Efter frigivningen 1956 valde han att stanna kvar i Spanien och arbetade för PSOE under kodnamnet "Pablo".