Lors de l'exercice 1948-1949, 56 % des exportations et 32 % des importations pakistanaises étaient liées à son voisin, qui est alors son premier partenaire commercial. Aussi, les deux pays ont signé 14 accords commerciaux sur la période de 1947 à 1974. Le Pakistan a gardé une balance commerciale positive jusqu'à l'exercice 1956-1957. L'importance des deux pays dans l'économie de leur voisin a, au fil des années, diminué avec des conflits ouverts et des prises de positions internes provoquant des boycotts tels le "Evacuee Property Ordinance" ou encore les tensions au Bengale. La coupure entre le Pakistan occidental et oriental crée des difficultés de livraisons entre les deux parties de la République Islamique, impliquant des condamnations envers les libertés de transits à travers l'Inde. Les guerres de 1965 puis de 1971 ont complètement rompu les circulations entre les deux pays (matériellement et diplomatiquement avec la destruction du Thar Express ou encore la suspension d'échanges commerciaux) jusqu'en 1974.