Watkins začal znovu s cyklem "Nové série", který zahrnoval různé předměty a formáty, které se většinou vztahovaly ke Kalifornii. Nicméně zůstal i nadále chudým a jeho rodina žila pro čas v opuštěném železničním dobytčáku. Jeho zrak začal selhávat. Zemětřesení v San Franciscu v roce 1906 a následný oheň zničili Watkinsonovo studio a negativy. V roce 1910 byl Watkins hospitalizován ve státní nemocnici pro duševně nemocné, kde umřel o šest let později.