Tentera laut juga terlibat dalam kesemua rampasan kuasa tentera di Argentina sepanjang kurun ke-20. Semasa kediktatoran 1976 hingga 1983, anggota tentera laut telah terlibat dalam Perang Kotor di mana beribu-ribu orang telah diculik, didera dan dibunuh oleh pasukan junta tentera. The Sekolah Mekanik Tentera Laut yang dikenali sebagai ESMA, menjadi sebuah pusat deraan kejam. Antara mangsa mereka yang dikenali ramai adalah remaja Sweden, Dagmar Hagelin, dan rahib wanita Perancis Alice Domon dan Léonie Duquet (pada Oktober 2007, Tentera Laut Argentina menyerahkan sekolah ini kepada kumpulan hak asasi manusia untuk dijadikan sebuah muzium peringatan).