Erst 1989 gewann Lupino wieder den französischen Meistertitel im Schwergewicht. Bei den Europameisterschaften verlor sie gegen Beata Maksymow, im Kampf um Bronze bezwang sie Maria Teresa Motta. Fünf Monate später bei den Weltmeisterschaften in Belgrad unterlag sie im Schwergewichtshalbfinale der Deutschen Regina Sigmund, im Kampf um Bronze besiegte sie die Kubanerin Estela Rodríguez. In der offenen Klasse schied Lupino gegen Ingrid Berghmans und die Japanerin Yōko Tanabe aus. Bei den Europameisterschaften 1990 startete Lupino nur in der offenen Klasse, im Finale unterlag sie der Britin Sharon Lee. Ein Jahr später unterlag sie frühzeitig der Niederländerin Monique van der Lee, im Kampf um Bronze gewann sie gegen Sharon Lee. Bei den Weltmeisterschaften 1991 in Barcelona verlor sie in der offenen Klasse frühzeitig gegen die Deutsche Claudia Weber, kämpfte sich dann aber bis zur Bronzemedaille durch. Bei den Europameisterschaften 1992 erhielt sie ebenfalls Bronze in der offenen Klasse. Bei der olympischen Premiere des Frauen-Judo 1992 in Barcelona gab es sieben Gewichtsklassen, aber keine offene Klasse. Lupino gewann im Schwergewicht drei Wettkämpfe, bis sie im Halbfinale gegen die Kubanerin Estela Rodríguez verlor, im Kampf um Bronze gewann Lupino gegen Claudia Weber. Bei den Europameisterschaften unterlag Nathalie Lupino gegen zwei Niederländerinnen: Im Schwergewicht verlor sie im Halbfinale gegen Monique van der Lee, gewann aber eine Bronzemedaille. In der offenen Klasse erreichte Lupino das Finale, das sie gegen Angelique Seriese verlor.