Dans les premiers jours de mars 1941, Đuro Strugar participa à l'organisation de plusieurs manifestations et il participa au comité provincial du parti communiste pour la Serbie qui se réunit le 29 mars à Čukarica. Après le bombardement de Belgrade par les nazis et la courte guerre d'avril, il se rendit au Monténégro puis, dès la fin du mois d'avril, revint à Belgrade. En tant que membre du parti communiste de Belgrade, il fut un des organisateurs de la lutte de libération nationale dans la capitale yougoslave. Il participa à la formation de groupes armés, à la collectes d'armes et de fournitures médicales ; il travailla aussi à maintenir le lien avec l'Unité de Partisans du mont Kosmaj (en serbe : ). En juin 1941, il prit part à la session du parti communiste pour la Serbie ; à partir de ce moment-là, il garda le contact avec Janko Janković, qui lui transmettait des informations sur les membres du parti arrêtés et sur les futures descentes de police.