11世紀初期、東ローマ帝国の行政区域のシルミウム・テマの一部となりこの時期、バシレイオス2世(976年 - 1025年)治世下であった。また、コンスタンティノープル総主教区管轄のオフリド大主教区を形作った。それまではニシュ大主教区であった。1182年から1183年にかけてピロトはセルビアとハンガリーの連合軍が支配し、ステファン・ネマニャとフリードリヒ1世がピロトを通ったが市民からは熱狂的な歓迎を受けた。その直ぐ後の1190年代にアセンとペタルの蜂起が起こる。14世紀に入るとセルビア人公爵であるモムチロ()によりピロト要塞()が築かれた。その後はオスマン帝国の支配下となり以後、19世紀に入るまで続くこととなり、1831年4月7日にはオスマンの支配に対する反発からボスニア人の反乱が起こった。