Im Spätsommer 1944 kehrte McCain zum pazifischen Kriegsschauplatz zurück und übernahm von Admiral Marc Mitscher das Kommando über die "2nd Fast Carrier Task Force" und die "Task Group 38.1". Drei Monate später übernahm er auch "Halsey’s cavalry", die "Task Force 38" von Admiral William F. Halsey. Bis zum Kriegsende kämpften seine Trägerflugzeuge über Peleliu, Leyte, der Philippinensee, Mindoro, Luzon, Formosa, Okinawa und dem japanischen Festland.