Nell'aprile 1796, quando lo Stato sardo fu sconfitto dalla Francia di Napoleone Bonaparte durante la Campagna d'Italia delle guerre rivoluzionarie francesi, Maria Teresa e sua sorella Maria Giuseppina lasciarono Torino per Novara, in parallelo con la partenza del marito di Maria Giuseppina da Verona. Maria Giuseppina andò in Austria, mentre Maria Teresa accettò l'invito del padre a tornare a Torino dopo la pace tra Francia e Savoia nel mese di maggio.