Em 19 de fevereiro de 1868, seis encouraçados brasileiros, incluindo "Tamandaré", passaram por Humaitá à noite. Três monitores de rio da classe Pará, "Rio Grande", "Alagoas" e "Pará", foram amarrados aos encouraçados maiores caso algum motor ficasse inoperacional pelos canhões paraguaios. O encouraçado "Barroso" liderou juntamente com "Rio Grande", seguido por "Bahia" com "Alagoas" e "Tamandaré" com "Pará". Tanto "Tamandaré", que havia sofrido cerca de 120 tiros, quanto o "Pará" tiveram que ser encalhados após passar pela fortaleza para evitar que afundassem. "Tamandaré" esteve em reparos em São José do Cerrito até meados de março. Em 25 de novembro, o navio bombardeou a capital paraguaia de Assunção. No dia 23 de março de 1869, "Tamandaré" e "Alagoas" destruíram as baterias de artilharia de Timbó. Após a guerra, o navio foi destinado à Flotilha do Mato Grosso, com sede em Ladário. "Tamandaré" foi desativado a 18 de abril de 1879 e posteriormente demolido.