En 1953 fue elegido para ser colaborador del británico William Cook durante el Sudamericano celebrado en tierras incaicas. Pero a falta de tres fechas Cook fue expulsado en un partido por indisciplina, siendo relegado por la Federación Peruana a un segundo plano, nombrando a Fernández Roca entrenador principal; consiguió una resonante victoria ante Brasil el 19 de marzo, por 1-0 con gol de Luis Navarrete, en la que fue la primera victoria peruana ante el Scratch y la única conseguida en Lima hasta la fecha. Ese mismo año obtuvo con el equipo incaico la primera edición de la Copa del Pacífico, al superar a Chile.