Une nouvelle guerre entre la France et l'Autriche se déclenche en 1809, conduisant le prince de Reuss à prendre la tête d'une division du "Armeekorps" commandé par l'archiduc Louis. Les troupes sous ses ordres comprennent 12 bataillons répartis en deux brigades sous les généraux Frédéric Bianchi et Franz Schulz von Rothacker. Dans la première phase de la campagne, qui culmine à la bataille d'Eckmühl le , il se signale successivement à Abensberg et Landshut. Le , il dirige une colonne d'attaque lors du combat de Neumarkt-Sankt Veit qui s'achève sur une victoire autrichienne, avant de prendre part à la bataille d'Ebersberg le suivant.