スケジュールについては、1stステージ分が2015年12月15日に、それ以外については2016年1月13日に 発表された。Jリーグ発足後初となる「2月開幕」になる とともに、リーグ最終節が11月3日に終わるという前倒し日程となった。これについてJリーグでは「リーグ戦最終節の開催日時を（ACL2016に影響されず）揃えることを前提とした」「ステージ間の中断期間を無くし、平日開催を減らすことで全体的な過密日程を緩和し、（Jリーグ王者が出場する）FIFAクラブワールドカップ開催前にJリーグ年間王者を決定させること」が理由であると述べている。