Johannes VI. verlieh Nikephoros spätestens 1351 die hohe Hofwürde eines "Sebastokrators" und übertrug ihm die Statthalterschaft über Adrianopel, dessen Zitadelle er im erneuten Bürgerkrieg 1352 zusammen mit Matthaios Asanes Kantakuzenos gegen die Truppen Johannes’ V. verteidigte. Nach der Absetzung Johannes’ VI. im Dezember 1354 sicherte er Adrianopel für dessen Sohn Matthaios, der von Thrakien aus den Kampf um den Kaiserthron gegen Johannes V. fortsetzte.