De geschiedenis begon met de stichting van de parochie in 1849 tijdens de Californische goldrush. De eerste kleine kapel werd gebouwd in 1849 en een indrukwekkende derde kerk werd vernietigd door het vuur dat volgde op de aardbeving in 1906. De welgestelde bankier William Henry Crocker schonk zijn in ruïnes liggende eigendom op Nob Hill aan het bisdom om er een kathedraal te bouwen. De nieuwe kathedraal nam de congregatie en de naam van de nabijgelegen parochie over.