La stagione 2015-2016 fu anche l'ultima con Ventura in panchina (scelto come nuovo CT della Nazionale di calcio dell'Italia). Darmian passò al Manchester United mentre El Kaddouri andò al Napoli. Arrivarono in particolare Davide Zappacosta e Daniele Baselli dall'Atalanta mentre Andrea Belotti fu prelevato dal Palermo per 7,5 milioni di euro. Il Toro concluse una stagione contraddistinta più da bassi che da alti al dodicesimo posto. In questa stagione venne posta inoltre la prima pietra (davanti a 10.000 persone) per la ricostruzione dello Stadio Filadelfia, che fungerà da centro sportivo e sede della società e del museo.