События 1917 г. негативно отразились на научной и педагогической работе Андрея Александровича. В 1919 г. в числе других сотрудников ХОС-ХОС он был направлен на «общественные работы», организованные новыми властями. Хотя эти работы носили принудительный характер, А. А. Потебня будучи руководителем отдела, имел возможность от них отказаться. Однако чувство солидарности с коллегами не позволило Андрею Александровичу остаться в стороне. Участвуя в работах, он заболел пневмонией, и умер в возрасте 49 лет, оставив незавершенными целый ряд фундаментальных исследований.