Бойчак был задрафтован в 2002 году клубом «Колорадо Эвеланш» под общим 61-м номером. До того, как быть задрафтованным, Джонни Бойчак играл за клуб Западной хоккейной лиги «Калгари Хитмен». Свой профессиональный дебют Бойчак сделал в клубе АХЛ «Херши Беарс» в сезоне 2004/05 во время локаута в НХЛ.