Då de allierade 8 november 1942 inledde invasionen av Nordafrika, Operation Torch, befann sig Darlan i Alger för att besöka sin son som drabbats av polio. Enligt order från Pétain skulle de franska trupperna ovillkorligt göra motstånd. De allierades befälhavare, generallöjtnant Dwight D. Eisenhower, tog emellertid genom sin ställföreträdare Mark Clark kontakt med Darlan och 11 november träffades en överenskommelse om vapenstillestånd. Den 13 november utnämndes Darlan med amerikanskt stöd till kommissarie ("Haut Commissaire") i Nordafrika. Härigenom irriterade amerikanerna Charles de Gaulle som i juni 1940 bildat organisationen Fria Frankrike.