Kaféet är inrymt i en träpaviljong som uppfördes till Stockholmsutställningen 1897 som försäljningsbod för Loka mineralvatten. Byggnaden flyttades till sin nya plats vid Saltsjöns strand 1911. Byggnaden och köket renoverades 2007 och sortimentet utökades med tillagad mat vilket var förutsättningen för att Ekorren skulle få alkoholtillstånd.