En la Guerra de la Segunda Coalición, como comandante de la 1° División del Ejército del Danubio, Ferino dirigió la división a través del río Rin en Hüningen, pasó por el Ducado de Baden y marchó hacia Schaffhausen. Estaba familiarizado con este territorio desde la campaña de 1796. Su división aseguró el flanco derecho de la fuerza principal de Jourdan para la batalla de Ostrach el 21 de marzo de 1799. A pesar de que sus tropas permanecieron fuera de la zona donde se daba la batalla principal, durante la retirada, una parte de su columna fue cortada por el ejército del Archiduque Carlos y capturada.