การเรียนการสอนดำเนินการมาเรื่อย ๆ จนมาถึงสมัยของ บาทหลวงยาโกเบแจง เกิดสว่าง ได้เกิดสงครามอินโดจีนขึ้นทำให้โรงเรียนต้องปิดตัวลงนักเรียนบางส่วนไม่ได้รับการศึกษาต่อ และนักเรียนบางส่วนได้คุณพ่อจากพนัสนิคมชักชวนไปเรียนต่อที่บ้านเณรศรีราชา จนเมื่อวันที่ 1 พฤษภาคม พ.ศ. 2488 ได้มีการอนุญาตให้โรงเรียนกลับมาเปิดการเรียนการสอนอีกครั้งโดยให้ชื่อโรงเรียนว่า โรงเรียนประชาสงเคราะห์ หัวไผ่ โดยมีการแยกฝั่งของโรงเรียนเช่นเดิมคือ ฝั่งประถม มีมาสเซอร์เกษร ทองเหลือง เป็นครูใหญ่ และฝั่งมัธยม มีมาสเซอร์เพิ่ม ศรีวิจารณ์ เป็นครูใหญ่ มีบาทหลวงสนิท วรศิลป์ เป็นผู้จัดการของโรงเรียน และมี ฯพณฯ ยาโกเบ แจง เกิดสว่าง เป็นเจ้าของโรงเรียน มีการเก็บค่าเล่าเรียนฝั่งประถมปีการศึกษาละ 15 บาท ฝั่งมัธยมปีการศึกษาละ 30 บาท ต่อมาในปี พ.ศ. 2495 บาทหลวงสนิท วรศิลป์ ได้ทำการรวมทั้ง 2 โรงเรียเข้าด้วยกัน โดยมีนายเจริญ ยุ่นประยงค์ เป็นครูใหญ่