En algún momento posterior a 809, probablemente alrededor de 811, Qenneshre fue saqueada y quemada por un grupo árabe, probablemente bajo la dirección de Naṣr ibn Shabath al-ʿUqaylī. Alrededor de 820, el Patriarca Dionisios de Tel Maḥre, un exmonje de Qenneshre, consiguió que se le concediera permiso para reconstruir el monasterio por parte de ʿUthmān, hijo de Thumāma ibn al-Walīd, que había sucedido a su padre como el líder local de facto en medio de la guerra civil que siguió a la muerte del Califa Harún al-Rashid en 809. Qenneshre, sin embargo, nunca volvió a recuperar el nivel anterior.