Plašil lukeutui pitkään Tšekin maajoukkueen vakiopelaajiin. Hän oli mukana Tšekin joukkueessa sekä EM-kilpailuissa 2004, 2008, 2012 ja 2016 että MM-kilpailuissa 2006. Hän on pelannut 103 maaottelua ja tehnyt niissä seitsemän maalia, ja hän ylitti sadan maaottelun rajan kaikkien aikojen neljäntenä tšekkipelaajana.