V roku 1960 bol odsúdený v skupine jezuitov na čele s tajným biskupom Jánom Korcom za tajné štúdium teológie na tri a pol roka väzenia. Podmienečne bol prepustený 9. mája 1962. Štátny súhlas na verejné pôsobenie ako kňaz však dostal až po svojej právnej rehabilitácii v roku 1969. 15. septembra 1969 zložil v Beckove slávnostné rehoľné sľuby. Pôsobil v Trnave, v kostole Najsvätejšej Trojice. V prvej polovici 70. rokov mu bol opätovne odňatý súhlas na verejné pôsobenie a tak vykonával prácu organistu. Od roku 1969 viedol tajný Teologický inštitút Spoločnosti Ježišovej na Slovensku, ktorý zabezpečoval štúdium filozofie a teológie záujemcom, ktorí tajne vstúpili do rehole jezuitov. Po roku 1989 sa tento inštitút pretransformoval na Teologický inštitút sv. Alojza v Bratislave na ktorého čele stál až do roku 1997. V tomto roku sa Inštitút úspešne pretransformoval na Teologickú fakultu Trnavskej univerzity.