Вместе с троюродной тёткой Маргаритой Бургундской и сестрой Бланкой Бургундской была замешана в знаменитом деле Нельской башни в 1314 году. Однако на суде, в отличие от сестёр, не был доказан факт супружеской неверности. Жанну обвинили в пособничестве и заключили в замок Дурдан, откуда она была выпущена в 1315 году по ходатайству своего мужа Филиппа Пуатье. Её сестре и троюродной тётке повезло меньше, они были заточены в суровый замок Шато-Гайар, где Маргарита через год встретила свою смерть, а Бланка, помутившаяся рассудком, провела почти всю оставшуюся жизнь.