Margarita fue educada junto con su hermana, la princesa Isabel, por su institutriz, Marion Crawford. En 1936 su tío el rey Eduardo VIII abdicó al trono para casarse con Wallis Simpson, y su padre ascendió como Jorge VI. Desde ese momento, fue conocida como Su Alteza Real la princesa Margarita. Asistió a la coronación de sus padres en 1937, y fue segunda en la línea de sucesión al trono británico hasta el nacimiento de su sobrino, el príncipe Carlos, en 1948.