Anlässlich des Krieges gegen Frankreich wurde Jena für die Dauer des mobilen Verhältnisses zum Kommandeur des Brandenburgischen Jäger-Bataillons Nr. 3 ernannt. In der Schlacht bei Spichern wurde er durch einen Lungenschuss schwer verwundet und war nach seiner Gesundung erst im Mai 1871 wieder dienstfähig. Ausgezeichnet mit dem Eisernen Kreuz II. Klasse wurde Jena nach dem Friedensschluss zum Bataillonskommandeur ernannt und stieg in dieser Stellung bis September 1873 zum Oberst auf. Am 14. Februar 1874 beauftragte man ihn mit der Führung des Grenadier-Regiments „Prinz Carl von Preußen“ (2. Brandenburgisches) Nr. 12. Nach seiner Ernennung zum Regimentskommandeur wurde Jena am 24. Juni 1874 als Rechtsritter in den Johanniterorden aufgenommen. Mit der Beförderung zum Generalmajor wurde er am 3. Februar 1880 zum Kommandeur der 21. Infanterie-Brigade in Breslau ernannt. Am 14. Oktober 1884 versetzte man ihn zu den Offizieren von der Armee und kommandierte Jena vorübergehend zur Vertretung des Kommandeurs der 4. Division. In dieser Stellung wurde er am 1. April 1885 zum Generalleutnant befördert und am 15. April 1886 mit der gesetzlichen Pension unter Verleihung des Sterns zum Roten Adlerorden II. Klasse mit Eichenlaub und Schwertern zur Disposition gestellt.