En 1799, Bellegarde comandaba un cuerpo al este de Suiza, conectando los ejércitos del Archiduque Carlos y Aleksandr Suvorov, y finalmente se unió a este último en el norte de Italia. Condujo el sitio de la ciudadela de Alessandria, y estuvo presente en la decisiva Batalla de Novi. Después de la derrota austriaca en la Batalla de Marengo (en la que su hermano Friedrich Bellegarde comandaba una brigada), el emperador Francisco II de Austria eligió a Bellegarde para comandar el ejército en Italia con el rango de General de Caballería. El 25 de diciembre, los franceses derrotaron a Bellegarde en la Batalla de Pozzolo.