Pour atteindre l'objectif fixé par le , l'équipe d'intervention du Rosenberg (), avec l'aide de la Gestapo, pille les ouvrages des bibliothèques et des archives des loges maçonnique et des juifs d'Europe occupée, à la recherche de documents pertinents pour l'université, rassemblés dans l'« Institut de recherche sur la question juive » () ouvert en à Francfort-sur-le-Main, une des composantes de l'École. Plus de sont saisis et envoyés à Francfort en attendant la fin de la guerre et un transfert à Chiemsee en Bavière, qui devait être son lieu d'implantation. En 1943, l'Institut, qui compte plusieurs millions d'ouvrages, est transféré à Hungen à la suite des bombardements britanniques.