Em seu primeiro ano na Europa, teve um ótimo desempenho, mas uma lesão o impediu de jogar a final da Recopa Europeia, troféu mais importante obtido pelo "Barça" na temporada 1996-97. Mas Ronaldo declarou que "ele merece a taça tanto quanto a gente. Giovanni marcou gols decisivos e deveria estar jogando". Ambos deram a volta olímpica abraçados. O clube, porém, interessou-se por Denílson, revelação do São Paulo, ofertando por ele alguns milhões mais o passe de Giovanni, que aceitara voltar ao Brasil, chegando até a assinar um contrato com o Tricolor. Mas a transferência dupla acabou não concretizada pela desistência do Barcelona em pagar o preço que oferecera. O seu treinador, Louis van Gaal, chegou a, inclusive, informar Giovanni do negócio, já que não contava com o jogador, mas, no final das contas, a transação não seria realizada. Giovanni vinha em baixa com a seleção após desempenhos ruins no Torneio da França e na Copa América de 1997, mas recuperou-se ao fim da temporada 1997-98: o campeonato espanhol, perdido na temporada de estreia, foi conquistado com Giovanni marcando sobre o Real Zaragoza o gol que garantiu o título e o meia se garantiu na Copa do Mundo FIFA de 1998.