Zum Ende des Dreißigjährigen Krieges war Philipp Ludwig Obrist in kaiserlichen Kriegsdiensten. Im Dezember 1642 wurde er zum Stadtkommandanten von Lemgo ernannt, wo er im nächsten Jahr Katharina, die Witwe des Grafen Simon Ludwig von Lippe, heiratete. Im März 1644 wurde er auf dem Weg nach Höxter, wo er das Kommando übernehmen sollte, von hessen-kasselschen Truppen überfallen und als Gefangener nach Kassel gebracht. Bei einem Gefangenenaustausch einige Monate später scheint er wieder freigekommen zu sein. Er blieb in Höxter stationiert, zog 1645 aber unter dem westfälischen Oberbefehlshaber Gottfried Huyn von Geleen zur Unterstützung Franz von Mercys gegen die Franzosen nach Bayern. In der Schlacht bei Alerheim geriet Philipp Ludwig ein zweites Mal in Gefangenschaft.