В сентябре 1939 года 26-летний Васовский запустил сигнал повреждённого радиопередатчика «"Warszawa II"», что позволило информировать жителей страны во время нападения немецких войск. Во время оккупации Польши Ежи начал сочинять первые песни и ставить ревю. В то же время занимался преподаванием музыки и рисования, которое он очень любил. Занимался театральной деятельностью, при которой познакомился с актрисой Марией Добжиньской, ставшей позже женой Васовского. В эти тяжёлые годы Васовский работал преподавателем, обучал будущих звукорежиссёров.