Als gevolg van een zeebeving voor de kust op 11 maart 2011 ontstond een tsunami die de luchthaven overstroomde. De luchthaven werd gesloten omdat het hele terrein inclusief de landingsbanen, taxibanen en opstelplaatsen onder water kwam te staan en navigatiehulpmiddelen verloren gingen. Beelden van de overstroming werden getoond over de hele wereld. Na de vloedgolf was het gebouw omsloten door water en drijvend afval. Personen die zich in het gebouw bevonden ten tijde van de vloedgolf verzamelden zich op het dak.