Eric Wynalda gjorde debut för 2 februari 1990 i en match mot Costa Rica. 14 mars samma år skrev Wynalda på ett kontrkat med United States Soccer Federation vilket gjorde honom landslagsspelare på heltid. Han spelade även VM 1990 där han bland annat fick rött kort i mötet med Tjeckoslovakien. Han deltog även i VM 1994 och Copa América 1995, där han kom med i turneringens lag efter mål mot både Chile och Argentina.