Эберле начал сезон 2007/08, занимая седьмое место среди игроков WHL в предварительных рейтингах Центрального скаутского бюро НХЛ. В середине сезона он занимал 24-е место среди всех игроков юношеских хоккейных лиг Северной Америки, но в окончательных рейтингах опустился на 33-е место. На драфте НХЛ 2008 года Эберле был выбран в 1-м раунде под общим 22-м номером командой «Эдмонтон Ойлерз». Джордан с детства был поклонником данной команды и в интервью после драфта сказал: «Если бы у меня было право выбора, я бы выбрал "Ойлерз"».