В начале 1921 года направлен на учёбу в Петроградскую Объединённую военную школу. В марте был зачислен во 2-й полк отдельной сводной бригады курсантов, в составе которого участвовал и вторично отличился во время подавления Кронштадтского восстания. Приказом Революционного Военного Совета Республики № 44 в 1922 году Матвей Попов вторично был награждён орденом Красного Знамени РСФСР.