Sayyid Hamad bin Thuwaini Al-Busaid alifariki ghafla tarehe 25 Agusti 1896 saa tano na dakika arobaini asubuhi, mara baada ya kupewa sumu na binamu yake Khalid bin Barghash ambaye alijitangaza kuwa sultani mpya baada ya kifo cha Sayyid Hamad na alishikilia kiti hicho kwa siku tatu tu kabla ya kuondolewa na majeshi ya Waingereza baada ya vita vya Uingereza dhidi ya Zanzibar.