W reprezentacji Hondurasu Pavón zadebiutował w 1993. Pierwszego gola dla drużyny narodowej zdobył 29 listopada 1995 w pojedynku z Panamą (2:0). 2 września 2000 strzelił hat-tricka podczas spotkania z Salwadorem (5:0), a 3 trafienia uzyskał również 23 maja 2001 w meczu z Nikaraguą (10:2) i 20 czerwca 2001 podczas pojedynku z Meksykiem (3:1). 13 czerwca 2007 strzelił 4 gole w spotkaniu przeciwko Kubie (5:0). Podczas gry w reprezentacji Pavón występował w wielu turniejach. W 1993, 2000 i 2007 uczestniczył w Złotym Pucharze CONCACAF, a w 2008 wziął udział w Igrzyskach Olimpijskich w Pekinie. W maju 2010 Reinaldo Rueda powołał go do kadry na Mistrzostwa Świata w RPA.