Після чемпіонату покинув команду і незабаром очолив іспанське «Атлетіко», проте в команді надовго не затримався і наступного року став тренером збірної Еквадору. Як тренер збірної був учасником розіграшу Кубка Америки 1995 року в Уругваї, де не зміг вивести з командою в раунд плей-оф, та розіграшу Кубка Америки 1997 року у Болівії, де еквадорці дійшли до чвертьфіналу. В кінці того ж року, після того як Матурана не зміг вивести збірну на чемпіонат світу 1998 року, колумбійський спеціаліст покинув збірну і повернувся на батьківщину, де недовго очолював «Мільйонаріос».