Nel 1942 vi operò con lo Stuka soprattutto il 102º Gruppo Tuffatori, guidati dal leggendario Comandante Giuseppe Cenni, tra azioni diurne sul naviglio, alle difficilissime azioni notturne su Malta; a scorta dei Tuffatori spesso vi erano i Cacciatori del 51º Stormo, con i Macchi M.C.202, e operanti dalla stessa base. Durante l'estate del 1943 venne bombardato pesantemente e venne conquistato dalle truppe alleate sbarcate sulle vicine spiagge durante l'Sbarco in Sicilia. L'occupazione delle truppe americane durò fino al settembre del 1944 quando fu restituito alle autorità italiane.