Quizás debido a las turbulencias internas que vivía Bolivia con la Guerra Federal, su conflicto con Paraguay en la Guerra del Chaco, a la separación de Panamá de Colombia, a la Guerra de los Mil Días y al conflicto que Colombia vivía con Perú, las relaciones entre Bolivia y Colombia se vieron estancadas. A lo anterior se suma el hecho de los guerras mundiales; para la primera ambos países se mantuvieron en la neutralidad, mientras que para la segunda, debido al acercamiento entre estos y los Estados Unidos, ambos decidieron declarar la guerra a Alemania. Después de estos conflicto, tanto Bolivia como Colombia fueron fundadoras de la recién creada Organización de las Naciones Unidas en 1945, y para 1948 de la Organización de Estados Americanos.