Durant ce mercato, l'effectif des Girondins est profondément remanié et connait ainsi une vague importante de départs. Prêtés la saison passée, Marco Caneira et Pascal Feindouno sont ainsi transférés définitivement, respectivement du côté du FC Valence et de l'AS St-Étienne. Une année après son arrivée, Michális Kapsís qui n'a pas convaincu en Gironde retourne en Grèce, le champion d'Europe 2004 s'engage avec l'Olympiakos le . Les Girondins essuieront également les départs d'Albert Riera qui n'a pas réellement convaincu pour l'Espanyol Barcelone le et de Camel Meriem qui s'engage avec l'AS Monaco le . D'une manière générale, les joueurs n'ayant pas convaincu à Bordeaux sont amenés à quitter le club. C'est le cas de Deivid qui ne s'est jamais imposé et qui est transféré au Sporting Lisbonne, de Cyril Rool qui s'engage avec l'OGC Nice une année après son arrivée ou encore de Kalu Uche dont l'option d'achat ne sera pas levée et qui retourne donc au Wisla Cracovie.