Calero fue internacional con la Selección Colombia en 55 ocasiones, participando en el Mundial de 1998, y en varias Copas América, destacando principalmente la Copa América 2001 donde se consagró campeón, aunque fue suplente de Óscar Córdoba en la mayoría de los juegos, jugando solo uno. También participó en la Copa de Oro 2000 donde terminaría subcampeón. Miguel Calero es recordado como uno de los mejores porteros que ha visto su selección.