С 1995 по 2004 год Энсисо был одним из лидеров сборной Парагвая. В её составе он трижды принимал участие в Кубке Америки (1995, 1999, 2001), а также в чемпионате мира 1998 года, где парагвайцы дошли до 1/8 финала. В 2004 году Энсисо был включён в олимпийскую сборную в качестве одного из трёх игроков старше 23 лет. Парагвайская команда дошла до финала турнира, где уступила Аргентине.