Po raz pierwszy na arenie międzynarodowej Juho Mikkonen pojawił się 14 grudnia 2007 roku w zawodach Pucharu Skandynawskiego w fińskiej miejscowości Vuokatti, gdzie zajął 146. miejsce w biegu na 15 km techniką klasyczną. W lutym 2009 roku wystąpił na mistrzostwach świata juniorów w Praz de Lys-Sommand, gdzie był między innymi siódmy w sztafecie i dziewiętnasty w sprincie klasykiem. Na rozgrywanych rok później mistrzostwach świata juniorów w Hinterzarten jego najlepszym wynikiem było czwarte miejsce w sprincie stylem dowolnym. Trzykrotnie startował na mistrzostwach świata młodzieżowców, najlepszy wynik osiągając podczas MŚ U-23 w Libercu w 2013 roku, gdzie zdobył srebrny medal w sprincie klasykiem, przegrywając tylko z Włochem Federico Pellegrino.