Nach zwei Open-Turnieren im Jahr 2006 trennten sich die langjährigen Partnerinnen. Bei der Europameisterschaft 2007 unterlag Nováková mit ihrer neuen Mitspielerin Petra Novotná den deutschen Duos Goller/Ludwig und Holtwick/Semmler. Zwei Jahre später verloren Nováková und Lenka Háječková bei der Weltmeisterschaft in Stavanger das Achtelfinale gegen die österreichischen Schwester Doris und Stefanie Schwaiger. Seit 2010 bildet Nováková ein Duo mit Tereza Tobiášová, die bereits 2008 an ihrer Seite war. Bei der Weltmeisterschaft 2011 schieden Nováková/Tobiášová in der ersten Hauptrunde gegen die Brasilianerinnen Talita/Antonelli aus.