Localizado cerca de Washington D. C., el condado de Fairfax fue una importante región durante la Guerra Civil. La Batalla de Chantilly o "Ox Hill", durante la misma campaña que la Segunda batalla de Bull Run, se libró en el condado; Bull Run estaba en el frontera entre los condados de Fairfax y Prince William. La mayor parte de la Guerra Civil, las tropas de la Unión ocuparon el condado aunque la población permaneciera simpatizante con la Confederación.