В 2012 году из-за операции на плече О’Дрисколл пропустил Кубок шести наций, и его подменял на позиции центрового в паре с Гордоном Д’Арси. К ирландец восстановился и снова ринулся догонять южноафриканца Джона Смита по числу матчей в должности капитана сборной, проведя свою 83-ю встречу. Однако уже на Чемпионате регби 2013 года новозеландец Ричи Маккоу догнал и О’Дрисколла, и Смита, побив их рекорд 2 ноября 2013 года матчем против Японии. Перед Кубком шести наций 2013 года О’Дрисколл был лишён звания капитана, которое перешло к Джейми Хислипу по решению тренера сборной, Деклана Кидни, чем О’Дрисколл был крайне недоволен, но в составе он остался. О’Дрисколл провёл все пять игр, выйдя в стартовом составе сборной Ирландии, однако успел отметиться с отрицательной стороны на турнире, когда в игре против Италии ударил правой ногой в грудь и был удалён с поля на 10 минут, а после турнира был ещё на три недели отстранён от права выступать за сборную или за клуб.