C 1979 по 1992 год в Сальвадоре бушевала гражданская война, а Испания играла активную посредническую роль для мирного решения конфликта между правительством и Фронтом национального освобождения имени Фарабундо Марти (ФНОФМ). В ноябре 1989 года пять испанских священников были убиты сальвадорскими солдатами в Центральноамериканском университете. В 1992 году представители правительства Сальвадора и ФНОФМ подписали Чапультепекские мирные соглашения в Мехико при участии членов испанского правительства.