Für Kroatien nahm Kopajtić im Juniorenbereich an der U20-Junioren-D-Weltmeisterschaft 2000 sowie den U20-Junioren-C-Weltmeisterschaften 1999 und 2001 teil. Im Seniorenbereich stand er im Aufgebot seines Landes bei den C-Weltmeisterschaften 2004 und 2007 sowie bei den B-Weltmeisterschaften 2001, 2002, 2003, 2006 und 2009. Darüber hinaus vertrat er Kroatien bei den Qualifikationsturnieren für die Olympischen Winterspiele 2006 und 2010.