Dans la deuxième moitié du les mouvements indépendantistes philippins prirent de l'importance grâce à José Rizal mais les Espagnols réussirent à garder le contrôle jusqu'en 1898 et la Guerre hispano-américaine. Lors du traité de Paris du 10 décembre 1898, Guam fut donnée aux Américains et les Philippines leur furent vendues malgré la déclaration d'indépendance de l'archipel le 12 juin de la même année (ce qui amena à la Guerre américano-philippine). Palau fut quant à elle vendue en 1899 aux Allemands.