I &lt;a href="Verdenscupen%20i%20langrenn%202009/10"&gt;sesongen 2009/10&lt;/a&gt; gikk Kowalczyk inn til seks verdenscupseire, blant annet vant hun Tour de Ski, og hun vant verdenscupen sammenlagt. I OL i 2010 i Vancouver gikk hun inn til sølv på klassisk sprint bak Marit Bjørgen. På den avsluttende 30 km klassisk kom det til et spurtoppgjør med den tredobbelte gullvinneren Marit Bjørgen som Kowalczyk avgjorde til sin fordel.