23 октября 1996 года в товарищеском матче против сборной Эквадора, Санчес дебютировал в сборной Мексики. В следующем году Хоэль в составе национальной команды занял третье место на Кубке Америки. 8 ноября в поединке против сборной Гватемалы защитник забил свой первый гол за сборную.