Генрих Вильгельм фон Вертер — сын генерал-лейтенанта Филиппа Августа Вильгельма фон Вертера (1729—1802) и его второй супруги Софии Альбертины Елизаветы фон Корфф (1744—1795). В 1787 году Генрих Вильгельм также поступил на службу в прусскую армию. Отец умер в 1802 году, Вертер в звании ротмистра драгунского полка отца принял участие в походе 1807 года. После заключения Тильзитского мира в связи с сокращением войск Вертер уволился в звании капитана и стал камергером Фридриха III.