Восстание 1906 года, в отличие от Кронштадтского восстания 1905 года, носило не стихийный характер, а было заранее подготовлено организациями большевиков и эсерами. Поражение Декабрьского вооружённого восстания и начавшееся ослабление революционного движения, с одной стороны, и первые вооружённые выступления и брожения в армии и на флоте (Восстание на броненосце «Потёмкин», Севастопольское восстание, Кронштадтское восстание 1905 года, первое Владивостокское восстание, восстания и вооружённые выступления солдат 1905 года в Баку, Киеве, Курске, Самарканде, Ташкенте), с другой стороны, обратили внимание революционных партий на усиление революционной работы среди солдат и матросов. В. И. Ленин требовал от руководства большевиков: «В момент восстания нужна также и физическая борьба за войско. … все партийные работники в ходе революции и борьбы за армию должны руководствоваться мыслью о необходимости смелого наступления и нападения с оружием в руках, о необходимости истребления при этом начальствующих лиц и самой энергичной борьбы за колеблющееся войско» Особенно активно и успешно в этом направлении работал Петербургский комитет РСДРП, который через своих членов и агитаторов вёл активную пропаганду в десятках воинских частей, а к лету 1906 года в 27 воинских и флотских частях создавший свои постоянные военные комитеты.