Schändungen des Friedhofes während der Regierungszeit des NS-Regimes blieben aus. Die Hagenower Synagoge blieb hingegen nicht verschont. Sie wurde in der Pogromnacht vom 9. November 1938 im Inneren geschändet und im Außenbereich in Brand gesetzt. Anwohner der Synagoge konnten das Feuer jedoch löschen. Auch das Eigentum des jüdischen Händlers Hermann Meinungen und des jüdischen Arztes Hans Sommerfeld wurde in dieser Nacht gezielt angegriffen.