1830與1840年代盛行的浪漫民族主義令克羅地亞民族主義重新復甦，催生出高唱統一哈布斯堡帝國內南部斯拉夫民族的「伊利里亞運動」，並透過克羅地亞著作和文化的傳播，使克羅地亞語成為一種標準語言，用以對抗匈牙利语。1848年，帝國內匈牙利地區爆發革命，克羅地亞人選擇與奧地利站在同一陣線，並於1849年一同打敗了匈軍，隨後，克羅地亞進入了一段日耳曼化時期。1860年代，奧地利由於政治上的疲弱，被迫通過「1867年奧匈折衷方案」來與匈牙利王国成立「共主邦聯」的二元帝國——「奧匈帝國」，其中克羅地亞地區被劃給了匈牙利管理，地位根據1868年發布的《克羅地亞匈牙利妥協協議》制定，克羅地亞王國和斯拉沃尼亞再度統一，達爾馬提亞王國則實際上由奧地利控制，里耶卡則保持著的狀態。在奧匈帝國根據《柏林條約》吞併波赫兩省後，克國駐軍區也跟著被廢除，並於1881年根據《克羅地亞—匈牙利協議》回歸克羅地亞控制。奧匈帝國內部以法蘭茲·斐迪南大公為首推行將國家改為實質聯邦制的構想，克羅地亞也將成為其中一個聯邦單位，但這些努力隨著斐迪南大公遇刺身亡和第一次世界大戰爆發而終止。