Po sametové revoluci Soňa Hermochová vykonávala v letech 1991–1997 funkci vedoucí katedry psychologie FF UK. V letech 1994 až 2000 byla proděkankou filozofické fakulty Univerzity Karlovy pro zahraniční vztahy. Od roku 2009 je členkou pedagogického sboru Vysoké školy aplikované psychologie v Terezíně.