Im Juniorenbereich stand Müller bei zahlreichen Turnieren für die Schweizer Nachwuchsnationalmannschaften auf dem Eis. So bestritt er das Eishockeyturnier des Europäischen Olympischen Winter-Jugendfestivals 2011, bei dem er die Bronzemedaille gewann, sowie das Ivan Hlinka Memorial Tournament 2011, die U18-Junioren-Weltmeisterschaft 2013 und die U20-Junioren-Weltmeisterschaften in den Jahren 2013, 2014 und 2015.