Entre finals de 1942 i inicis de 1943, Cunningham serví sota el General Eisenhower, que el va fer Comandant Suprem de la Força Expedicionària Aliada. En aquest paper comandà la gran flota que cobrí els desembarcaments aliats al Nord d'Àfrica (Operació Torxa). El General Eisenhower escrigué d'ell al seu diari: