V květnu 2021 bylo nejprve oznámeno, že chybí v nominaci na nadcházející EURO, v nominaci ho nahradil Aleš Mandous. Těsně před vstupem do mistrovství z ní ale vypadl zraněný Jiří Pavlenka, kterého nahradil právě Koubek. K týmu se připojil až po zápase se Skotskem.