Pauer hat als Tochter der österreichischen Philosophieprofessorin Herlinde Pauer-Studer und eines Deutschen zwei Staatsbürgerschaften. Sie wuchs in Wien auf, verbrachte aber von 1996 bis 1998 mit ihren Eltern auch einige Zeit in Boston (USA). Dort spielte sie Fußball in einer Mädchenmannschaft, zurück in Österreich schloss sie sich dem Leichtathletikverein "LCC Wien" an. Ab 2004 gewann Pauer über verschiedene Strecken mehrere österreichische Meistertitel und weitere Medaillen in den Altersklassen U20 und U23, im Februar 2006 triumphierte sie mit 19 Jahren bei den Österreichischen Hallen-Staatsmeisterschaften über 3000 Meter in 9:52,20 min das erste Mal auch bei den Erwachsenen. Im selben Jahr belegte sie national auf Aktivenebene sowohl im Crosslauf als auch über 5000 Meter (16:57,54 min) und 10 Kilometer (35:32 min) Platz 2, bei ihrem ersten internationalen Einsatz wurde sie Ende Juni 2006 in der 2. Liga des Europacups 2006 in Novi Sad über 3000 Meter in 9:43,45 min ebenfalls Zweite. Im Folgejahr lief sie in Bestzeit von 9:41,28 min bei den Österreichischen Hallen-Staatsmeisterschaften abermals auf den Silberrang und wurde bei den Deutschen Crosslaufmeisterschaften 2007 außer Wertung startend Gesamtvierte. Nachdem sie bereits das restliche Jahr keine Wettkämpfe mehr bestreiten konnte, hörte sie 2008 aufgrund von Rückenproblemen mit dem Laufsport zunächst auf.