Абізаїд отримав звання другого лейтенанта піхотного полку після закінчення Військової академії США у Вест-Пойнті, Нью-Йорк. Він почав свою військову кар'єру в 504-му парашутно-десантному полку 82-ї повітрянодесантної дивізії у Форт Бреггу, Північна Кароліна. Абізаїд командував 2-м і 1-м батальйонами рейнджерів в ході вторгнення в Гренаду. Джон також командував 3-м батальйоном 325-го повітрянодесантного полку бойової групи у Віченці, Італія, під час війни в Перській затоці, і розгорнув свій батальйон у Північному Іраку, щоб забезпечити прикриття для курдів.