Am 19. August 2016 wurde er zum ersten Mal in die Major League berufen. In elf Spielen der MLB hatte Peña 2016 eine Earned Run Average (ERA) von 4.00. Die Chicago Cubs schafften es in die Postseason und gewannen schließlich die World Series. Peña nahm nicht an der Postseason teil, sondern stand zum Zeitpunkt des Sieges der Cubs auf dem 40-Man-Roster.