C'est le que le désormais "Hauptmann" Specht rejoint la onzième escadre de chasse, JG 11, en tant que "Gruppenkommandeur" du groupe II. Il remportera des victoires sur Bf 109 Gustav contre des "Viermot", nom donné aux bombardiers quadrimoteurs. Durant cette même année, il se fera de plus en plus critique envers le faible armement des Bf-109, tout en remportant 17 victoires, y compris contre des chasseurs américains P-47, P-38 et P-51. En février 1944 Günther Specht, contraint par une avarie technique, crashe son Bf 109G sur l'île Ærø et s'en sort une nouvelle fois. En mars, son escadrille perd huit appareils et l'unité est arrêtée pour rééquipement. Entre-temps, Specht reçoit le la "Ritterkreuz des Eisernen Kreuzes" pour ses 31 victoires avant d'être remplacé par le "Major" Günther Rall pendant sa formation, en vue de devenir "Geschwaderkommodore". Après la blessure de Hermann Graf, le , la Luftwaffe le réaffecte d'urgence à la JG 11. En juillet, il se crashe à nouveau, très sérieusement blessé à la tête, mais reste au combat pour abattre à nouveau deux appareils pendant l'Opération Market Garden de septembre, avant d'abattre deux Typhoon le même mois.