Nach dem Ende der Präsidentschaft von Augusto B. Leguía y Salcedo am 27. August 1930 zog sich Arana aus der Politik zurück. Die Peruvian Amazon Rubber Company bestand als Unternehmen bis 1920, doch Arana selbst betrieb seine Geschäfte mit Kautschuk in der Region bis zum Kolumbianisch-Peruanischen Krieg 1932, in dessen Folge Peru 1934 auf seine Ansprüche auf Land nördlich des Putumayu verzichten musste. Arana musste seine an Kolumbien gefallenen Besitzungen nördlich des Putumayu und in Leticia an die kolumbianische Regierung abtreten, wofür er und seine Familie 160.000 US-Dollar Entschädigung erhielten.