Исмаил Обиди родился в 1880 году в уйгурском городе Кульджа Илийского края, в семье сотрудника посольства Российской империи, который был родом из Ферганской долины. После смерти своего отца в 1890 году, вместе с матерью переехал в Казань и поступил в местное училище. Начал увлекаться идеями джадидизма, познакомился с татарскими и башкирскими джадидистами. В Казани стал одним из лидеров молодёжи, которая имела революционные настроения. В 1900 году Исмаил был выслан в Пишпек из-за убеждений и «отрицательного влияния на татарскую молодёжь». Через год после ссылки, тайно уехал в Санкт-Петербург и поступил в учебное заведение скульпторов и архитекторов. В 1905 году был приговорён к трём годам ссылки из Санкт-Петербурга в Ташкент из-за участия в беспорядках в этом городе, по одним данным из-за так называемого Кровавого воскресенья, по другим, из-за беспорядков в ходе Первой русской революции.