Con l'avvento di Napoleone, la città divenne il centro direttivo per i paesi vicini: Stalettì, Borgia, Girifalco, Amaroni e Sant'Elia. Caduto l'impero francese, il Sud d'Italia tornò, grazie al Congresso di Vienna, sotto la giurisdizione borbonica. Squillace perse ogni diritto sui paesi vicini, restando legato solo il paesino di Amaroni. I moti del 1820 - 1821, che sconvolsero l'Europa, trovarono in varie città della Calabria ionica molti sostenitori, tra cui Squillace, dove le idee risorgimentali trovano la loro massima espressioni in tre illustri personaggi che contribuiranno all'unità d'Italia: il gen. Guglielmo Pepe, il gen. Florestano Pepe e Damiano Assanti. Guglielmo Pepe già a sedici anni si fece notare come valoroso combattente e difensore di ideali patriottici, forse pari a quelli del Mazzini e del Garibaldi. Il gen. Pepe con la legione italica affronta in battaglia gli austriaci a Marengo. Dopo un breve ritorno a Squillace si pone contro i Borboni, ma viene arrestato e, pur rimanendovi solo tre anni, venne condannato a vita nella "Fossa del Marittimo".