Газета "Jaunākās Ziņas" последний раз вышла 9 августа 1940 года, где решительно выступила за преимущества парламентских систем с критикой тоталитаризма и коммунизма. Чтобы обеспечить Эмилии дипломатическую защиту, посол Швеции в Латвии предложил жениться на ней, но она отказалась по причине невозможности предоставления защиты её приёмным детям. Её младшая сестра Айхер через контакты её мужа с Иоахимом Риббентропом пыталась организовать Эмилии немецкое гражданство, но Генрих Гиммлер счёл её врагом Рейха. Её бывший сотрудник Вилис Лацис, который получал от Эмилии гонорары за свою работу в "Jaunākās Ziņas", став Председателем Совнаркома Латвийской ССР- главой нового советского правительства, не только не помог Эмилии Беньямин, но и способствовал её гонениям. Сначала она была переселена в небольшую квартиру, а 17 июня 1941 года была депортирована в Усольлаг (город Соликамск), где 23 сентября 1941 года умерла от голода и дизентерии.