Die Österreicher gaben nach der Schlacht ihre Verluste mit 659 Gefallenen, 1445 Verwundeten und 2171 Gefangenen an, sowie zwei an die Franzosen verlorene Feldgeschütze. Die Franzosen wiederum gaben ihre Verluste lediglich mit 600 Verlusten an, eine realistischere Schätzung beläuft sich jedoch auf 3000 Verluste. Zwar gefährdete die Schlacht von Montebello Melas' Lage nicht ausschlaggebend. Seine Strategie, seine Truppen zu konzentrieren und danach anzugreifen, blieb vernünftig. Andererseits erlitt die österreichische Moral einen ernsten Rückschlag, und Melas verblieb wie hypnotisiert für die nächsten fünf Tage in Alessandria, ohne irgendeine Bewegung von Bedeutung zu machen, darauf wartend, dass seine Truppen die Konzentration abschließen. Das nächste Treffen sollte die entscheidende Schlacht bei Marengo am 14. Juni 1800 sein. Jean Lannes hob sich durch seine Leistungen und Tapferkeit während der Schlacht besonders hervor, was dazu führte, dass ihm 1808 der Sieger-Titel "Herzog von Montebello" ("duc de Montebello") verliehen wurde.