La stagione 2013-2014 si apre con i Grand Prix estivi, ove la Malsiner coglie quali migliori risultati tre 21esimi posti ad Almaty e Nižnij Tagil; in Coppa del Mondo ottiene diversi piazzamenti a punti (raccogliendone in totale 58), con il 18º posto di Zaō come miglior risultato. Convocata per i mondiali giovanili in Val di Fiemme, chiude 19^ la gara individuale. Conquista inoltre la medaglia d'argento ai campionati italiani. Un infortunio occorsole sul trampolino di Planica la costringe tuttavia a chiudere anzitempo la stagione.