В 1854 году Джон Чэмпион отправился в Крым. В сентябре он участвовал в сражении на Альме, в ноябре был тяжело ранен в Инкерманском сражении. 30 ноября 1854 года от полученных ран он скончался. Незадолго до смерти Чэмпион был награждён орденом Бани и возведён в подполковники.