Von Wernich dituduh berpartisipasi dalam Perang Kotor, dan bekerja sama dalam penyiksaan tahanan politik. Dia menyatakan ketidakbersalahannya pada Pengadilan Juntas pada 1985, dua tahun setelah kembalinya demokrasi. Wernich bekerja di Direksi Investigasi Miguel Etchecolatz bagian dari polisi provinsi.