Восени 1941 року А. Кірк попросив звільнити його на цій посаді та був призначений ескадрою есмінців Атлантичного флоту США. Протягом 1942—1944 років безпосередньо брав участь у плануванні та проведення амфібійних операцій союзних сил у Середземному морі (висадки союзників на Сицилію та в Італії). На час проведення операції «Нептун» був керівником усіх військово-морських сил США, що залучалися до проведення операції, командуючи з борту важкого крейсера «Огаста» підтримкою висадки морського десанту в Нормандії.