С 1979 по 1992 год в Сальвадоре была гражданская война. Во время войны несколько тысяч сальвадорцев бежали в Мексику, где многие остались жить или продолжили путь в США. В 1992 году сальвадорское правительство и Фронт национального освобождения имени Фарабундо Марти подписали мирное соглашение в Мехико, известное как Чапультепекские мирные соглашения, что привело к прекращению гражданской войны. Обе страны сотрудничают в борьбе с незаконным оборотом наркотиков и бандитизмом, в том числе противодействуют Бригаде сальвадорских бродячих муравьёв .