Несколько месяцев 1863 года Сергей Андреевич Райковский провел в Северо-Западном крае, где участвовал в усмирении польского восстания 1863 года. 3 августа 1863 года он был произведён в капитаны, а 21 ноября 1865 года — в подполковники.