Он был политическим лидером консервативных сил в течение войны 1829 года и после отказа занять президентский пост сотрудничал с правительством , пытаясь примирить правительство с оппозицией. Диего Порталес видел угрозу для Чили в перуанской-боливийской конфедерации, в результате он организовал войну против неё, благодаря чему конфедерация распалась. Однако эта война вызвала военное восстание в Чили, которое стоило ему жизни.