1997 folgte der vierte Sieg bei den Panamerikameisterschaften. Im Finale der Judo-Weltmeisterschaften 1997 unterlag Savón einmal mehr gegen Tamura. Bei den Mannschaftsweltmeisterschaften 1998 siegten die Kubanerinnen vor den Französinnen. Zwei Monate später gewann Savón zum fünften Mal bei den Panamerikameisterschaften. Im Jahr darauf siegte sie zum zweiten Mal bei den Panamerikanischen Spielen. Bei den Judo-Weltmeisterschaften 1999 gewann Ryōko Tamura ihren vierten Titel, wie 1997 erhielt Savón die Silbermedaille. 2000 nahm Amarilis Savón zum dritten Mal an Olympischen Spielen teil, nach einer Viertelfinalniederlage gegen die Russin Ljubow Bruletowa und einer Niederlage in der Hoffnungsrunde gegen die Belgierin Ann Simons belegte die Kubanerin den siebten Platz.