Двоюродный брат математика и бактериолога Людвика Райхмана. Изучал медицину в Вюрцбургском университете и в Берлине. Один из создателей института гигиены в Варшаве. С 1924 года заведовал кафедрой в Варшавском университете. В годы гитлеровской оккупации был брошен в варшавское гетто. Руководил там отделением по профилактике эпидемий. Организовал тайные медицинские курсы. Был католиком по вероисповеданию, посещал католический приход для евреев-католиков на территории гетто. С началом депортации евреев из гетто в Треблинку в июле 1942 года Гиршфельд сумел сбежать и скрывался под чужим именем. В 1944 году в Люблине был одним из основателей Университета Марии Склодовской-Кюри. В 1945 году перебрался во Вроцлав, где преподавал в местном университете, а затем в 1952 году основал Институт иммунологии и экспериментальной терапии Польской академии наук.