À la veille de la Seconde Guerre mondiale, Richard von Bothmer est affecté dans le " Infanterie-Regiment", où il restera jusqu’en . Il est affecté ensuite à Naples d’ à . Envoyé sur le Front de l’Est, Bothmer est nommé "Feldkommandeur (768)" dans l’Oblast de Rostov, poste qu’il occupe jusqu’en . Il est ensuite mis à disposition dans la Führerreserve jusqu’au , date à laquelle il est nommé "Feldkommandeur (1032)" dans le nord-ouest de la Grèce à Janina. Le , Bothmer est promu Generalmajor à ce poste. Mis à disposition dans la Führerreserve en , Bothmer est nommé une dernière fois commandant en chef à Bonn en Rhénanie, le . Il reprend notamment les responsabilités du général Botsch dans le secteur de Remagen, où la situation est désespérée et dont le pont sera pris par les Américains le . Sachant la guerre perdue, Richard von Bothmer est arrêté le , pour abandon de poste et insubordination. Déshonoré, il est, le jour même, poussé au « suicide ».