En su cuarta temporada, conquistó la Liga Europa tras superar al Olympique Marsella en la final por 3-0.A diferencia de 2012, Saúl fue titular en la final y durante casi todo el torneo, además de lograr tres goles en la segunda competición continental.Por otro lado, alcanzó los 200 partidos oficiales con el club rojiblanco en el partido ante el Arsenal disputado el 3 de mayo en el Wanda Metropolitano.Inició la siguiente temporada logrando la Supercopa de Europa ante el Real Madrid por 2-4, anotando el 2-3 en el minuto 98 de la prórroga con un disparo de volea.