1969 wechselte Beltoise zu "Matra International". Er wurde Teamkollege von Jackie Stewart, der in diesem Jahr erstmals die Formel-1-Weltmeisterschaft gewann. Beltoise beendete sein Heimrennen auf der Charade in Clermont-Ferrand auf Rang zwei hinter Stewart. In Spanien und Italien wurde er jeweils Dritter. In diesem Jahr fuhr er einmalig den allradgetriebenen Matra MS84, erreichte aber keine Zielankunft in den Punkterängen. Mit 21 Punkten erreichte Beltoise in diesem Jahr Rang fünf der Fahrerwertung, das beste Ergebnis in seiner Formel-1-Karriere.