Mirip dengan 2018, Pérez bernasib jauh lebih baik selama paruh kedua musim ini. Kecuali tersingkir di Singapura karena kebocoran oli, ia mencetak poin di setiap balapan setelah liburan musim panas, termasuk finis di posisi ke-6 di Belgia, lomba dibayangi kematian Anthoine Hubert yang terlibat kecelakaan fatal dengan Juan Manuel Correa pada hari sebelumnya di perlombaan fitur Formula 2 dan sebelum kematian Afridza Munandar di Asia Talent Cup seri Sepang 2019 di Sirkuit Internasional Sepang, Malaysia yang terlibat kecelakaan fatal dengan Shinji Ogo. Banyak dari titik finis ini berasal dari posisi grid awal yang rendah, termasuk finis ke-7 di Italia setelah start dari posisi ke-18, ke-8 di Jepang dari posisi ke-17, dan ke-10 di Amerika Serikat setelah start dari jalur pit. Dia menyelesaikan musim di tempat ke-10 di kejuaraan dengan 52 poin, nyaman di depan rekan setimnya Stroll.