1808年にはナポレオン戦争から逃れ、最大の植民地ブラジルに宮廷を移した（ポルトガル・ブラジル及びアルガルヴェ連合王国）。1821年に宮廷は本国に復帰したが、ブラジル帝国の独立を許すこととなった。1828年には王位継承をめぐってポルトガル内戦が勃発し、1834年まで続いた。以降も内政の混乱が続いて共和主義者が台頭し、1910年の共和政革命によって王国は消滅した。