W reprezentacji Boliwii Moreno zadebiutował w 1991 roku w wieku 17 lat. W 1994 roku został powołany przez selekcjonera Xabiera Azkargortę do kadry na Mistrzostwa Świata w USA. Tam jako rezerwowy wystąpił w dwóch grupowych spotkaniach: przegranych 0:1 z Niemcami oraz 1:3 z Hiszpanią. W 1997 roku wystąpił na turnieju Copa América 1997, którego gospodarzem była Boliwia. Wywalczył wraz z kadrą wicemistrzostwo Ameryki Południowej, a w turnieju zdobył jedną bramkę, w półfinale z Meksykiem (3:1). W 2007 roku zaliczył Copa América 2007 i strzelił na nim dwa gole: z Wenezuelą (2:2) oraz z Peru (2:2). W 2008 roku zakończył reprezentacyjną karierę, a w kadrze narodowej rozegrał 74 mecze, w których zdobył 8 bramek.