En aquella època Eötvös ja era considerat com un dels principals escriptors i polítics d'Hongria. La Revolució hongaresa de 1848 va suposar que es dugués a la pràctica gran part de les idees que defensava Eötvös, que va estar al càrrec del ministeri d'ensenyament i religió pública, en el primer ministeri responsable d'Hongria. La seva influència, tanmateix, anava més enllà d'aquesta àrea: ell, juntament amb Ferenc Deák i István Széchenyi, representava la tendència pacífica i moderada dins el consell de ministres. Quan el president Luis Batthyány va dimitir, Eötvös, desil·lusionat, s'exilià durant una temporada a Munic durant la turbulenta època de la Guerra d'Independència.