1848年にハンガリーに帰国した。フランスの2月革命の影響を受けて1849年にハンガリー議会が独立を宣言すると、ハイナルドはこれに反対し、職を解雇され、1851年に革命戦争が終わるまでセーチェーニュに戻った。トランシルヴァニアの司教ニコラス・コヴァーチ（Nicholas Kovács）の助手となり、1852年にトランシルヴァニアの司教となった。政治的には、トランシルヴァニアとハンガリーの統一を強く主張したため、ウィーンの政府と対立し、1834年に司教を解任された。ローマ教皇ピウス9世はローマにハイナルドを召喚し、カルタゴの名目上の大司教に任命した。