Alla mobilitazione, fissata per il 5 giugno 1943, non seguì una effettiva operatività. Il deteriorarsi delle relazioni italo-croate, soprattutto in favore di quelle con la Germania nazista, portarono a vere e proprie operazioni di sabotaggio delle attività di arruolamento da parte di Ustascia e Domobranci. Con lo sbarco alleato in Sicilia in giugno e la destituzione di Mussolini il 25 luglio, le priorità italiane cambiarono radicalmente, in modo tale che venne meno ogni interesse ed ogni possibilità di attivare la seconda legione croata. Con l'annuncio dell'armistizio dell'8 settembre, i tedeschi provvidero a disarmare, oltre ai reparti italiani, anche i croati ancora in forza al deposito della "Legione" di Riva. Gli uomini che non si congendarono confluirono così nelle divisioni croate dello Heer.