Sep Visser évolue aux Pays-Bas dans le club de RC Hilversum, le club où a évolué son père et son frère, Tim. Il rejoint l'Académie de rugby des Newcastle Falcons et évolue avec l'équipe de jeunes. Puis il évolue en National Division 1 avec le Tynedale RFC pendant une saison. Il rejoint le club d'Édimbourg Rugby en 2011. Son frère, Tim Visser, avait rejoint l'équipe d'Édimbourg en 2009. Leur père Marc a été le capitaine de l'équipe des Pays-Bas plusieurs fois dans une carrière de 15 ans pour un total de 67 sélections. Sep Visser débute quatre rencontres du Pro12 en 2012.