Nach der Schlacht bei Novi (25. August 1799) kehrte Guieu wieder nach Frankreich zurück. In den folgenden Jahren übernahm Guieu nur noch administrative Aufgaben in der Militärverwaltung. 1803 wurde er offiziell in den Ruhestand verabschiedet und er ließ sich in Châteauroux nieder. Er starb fünf Tage nach seinem 59. Geburtstag am 5. Oktober 1817 und fand dort auch seine letzte Ruhestätte.