2015年にサウスカロライナ州チャールストンで発生した教会銃乱射事件では、エマニュエルアフリカンメソジストエピスコパル教会の黒人信者9人がで白人至上主義者のディラン・ルーフによって殺害された。これを受けて、南部の各州が公式の場での南軍旗の使用をやめるようになった。これは、ミシシッピ州の州旗に対する批判の高まりにも繋がった。ミシシッピ州の8つ全ての公立大学と、ビロクシなどのいくつかの市・郡は、現在、南軍旗が取り除かれるまで州旗を掲揚することを拒否している。ニュージャージー州、オレゴン州、ペンシルベニア州フィラデルフィアにおける50州の全ての州旗の展示では、ミシシッピ州旗が除去されている。