Nachdem der Herzog von Anjou 1574 König von Frankreich geworden war, wurde Philibert de La Guiche am 6. Juli 1578 – nach der Demission des Marschalls Biron – zum Großmeister der Artillerie von Frankreich ernannt, das Amt übte er bis zu seinem Rücktritt 1596 aus. Ende 1578 wurde er zum Ritter im Orden vom Heiligen Geist ernannt. 1587/88 war er Premier Gentilhomme de la Chambre du Roi. Als der König Heinrich von Navarra als seinen Nachfolger anerkannt hatte, kämpfte er auf dessen Seite gegen die Katholische Liga, und nahm an der Schlacht von Arques (1589) und der Schlacht bei Ivry (1590) teil.