En las Revoluciones de 1848, el frágil gobierno colapsó. El 13 de marzo, el Príncipe Metternich dimitió. Pillersdorf se convirtió en Ministro del Interior bajo el gobierno del Conde Kolowrat el 20 de marzo, y presentó la Constitución de Pillersdorf el 25 de abril. Fue elegido el 4 de mayo. Si tuvo esperanzas por un momento de ser capaz de calmar y gradualmente reorganizar el gobierno, todo conspiró contra sus honestas intenciones —confusión en Lombardía y Hungría, disturbios en Viena, y las relaciones con los estados de la Confederación Germánica—. La inesperada huida del emperador Fernando I convirtió en cuestión de honor para el primer ministro no dimitir, y Pillersdorf permaneció fiel a su puesto. Se mantuvo firme en la concesiones hechas por la corona, pero la resistencia que ofreció a las nuevas demandas que surgían fue demasiado débil. Evitó la convocatoria de las fuentes de influencia del gobierno. Mientras tanto, los asuntos públicos alcanzaron tal confusión y desorden, y Pillersdorf mostró ser incapaz de manejarlos y crear orden, que finalmente dimitió el 8 de julio.