АМССР включала левобережную часть юридической территории современной Молдавии (бо́льшая часть Приднестровья) и часть современной Украины. В 1940 году, после присоединения Бессарабии к Союзу ССР, Молдавская Автономная Советская Социалистическая Республика (за исключением некоторых районов) совместно с Бессарабией (за исключением нескольких уездов) вошла в созданную Молдавскую ССР, а 8 восточных (левобережных) районов МАССР — в состав Одесской области УССР.