Em 20 de janeiro de 1800, contudo, chega a Paris a notícia de que o Primeiro Cônsul havia sido derrotado na Campanha da Itália; rapidamente os ministros e conselheiros confabulam sua substituição, sendo Carnot o mais afoito. Mostrando seu gênio militar, Bonaparte reverte a derrota certa, sagrando-se vitorioso e consolidando sua fama militar. Fouché não se manifestara ostensivamente, mas tem-se este obscuro episódio como o marco a partir do qual perdera a confiança de Napoleão.