Der Markt Rohr gehörte zum Augustinerchorherrenstift Rohr. Der Ort war Teil des Kurfürstentums Bayern, bildete aber eine geschlossene Hofmark, deren Sitz das Stift war. Als Teil dieser Hofmark konnte Rohr nur einen geringen Teil seines Marktrechts, welches 1347 durch Kaiser Ludwig IV. verliehen wurde, geltend machen. 1803 wurde das Kloster aufgehoben. Als es 1809 zur Schlacht bei Abensberg kam, übernachteten zunächst der österreichische Erzherzog Karl und dann der französische Kaiser Napoléon Bonaparte am 18. bzw. 20. April im selben Gasthaus in Rohr.