O "Nagato" só foi participar de um novo combate em junho de 1944, quando foi atacado por aeronaves norte-americanas na Batalha do Mar das Filipinas. Ele também esteve presente na Batalha do Golfo de Leyte em outubro, sendo levemente danificado e retornando para o Japão. Pela escassez de combustível na época, a Marinha Imperial decidiu não concertá-lo completamente e o couraçado assim foi usado como uma plataforma antiaérea flutuante. O "Nagato" foi tomado pelos Estados Unidos depois do fim da guerra e usado em julho de 1946 como alvo nos testes nucleares da Operação Crossroads; ele sobreviveu ao primeiro teste com poucos danos, porém foi afundado no segundo.