Für Kroatien nahm Plahutar im Juniorenbereich an der U18-C-Europameisterschaft 1998 und der Europa-Division I der U18-Weltmeisterschaft 1999 sowie der U20-D-Weltmeisterschaft 2000 und der U20-Weltmeisterschaft der Division II 2001 teil. Im Seniorenbereich stand er im Aufgebot seines Landes bei der C-Weltmeisterschaft 2000 und nach Umstellung auf das heutige Divisionensystem bei den Weltmeisterschaften der Division I 2001, 2002, 2003 und 2006 sowie bei den Weltmeisterschaften der Division II 2004, 2005, 2007 und 2011. Des Weiteren spielte er für Kroatien bei der Qualifikation zu den Olympischen Winterspielen in Turin 2006.