Peron meninggal dunia pada 1 Julai, 1974 dan jawatannya telah diambilalih oleh Isabel Martínez. Namun pada 24 Mac 1976 suatu rampasan kuasa tentera telah menggulingkan kerajaan Peron. Kerajaan militari junta telah mengenakan tindakan yang tegas terhadap para pengganas dan mereka yang bersimpati dengannya melalui operasi yang dipanggil "El Proceso," atau "Proses Penyusunan Semula Nasional". Sebaik sahaja kudeta itu dilancarkan bermulalah detik hitam dalam sejarah Argentina iaitu Perang Kotor. Walaupun ia berjaya mengembalikan keamanan tetapi ramai rakyatnya telah menjadi mangsa. Dianggarkan antara 10,000 hingga 30,000 orang telah "lesap" di antara tahun 1976-83. Masalah ekonomi yang semakin meruncing, tuduhan rasuah yang kian meningkat, kebencian rakyat terhadap pelanggaran hak asasi manusia serta kekalahan negara ditangan tentera British sewaktu perang Falkland telah menjatuhkan imej kerajaan militari di Argentina. Akhirnya junta ini terpaksa menarik balik pengharaman terhadap parti politik dan mengembalikan kebebasan berpolitik.