2004 року Бобич у складі збірної поїхав на чемпіонат Європи 2004 року у Португалії, де провів два матч з Нідерландами та Латвією. Другий матч, зіграний 19 червня, став останньою грою Бобича у складі «бундестім». Всього протягом кар'єри у національній команді, яка тривала 11 років, провів у формі головної команди країни 37 матчів, забивши 10 голів.