In der Pogromnacht vom 9. November 1938 wurde die Synagoge geplündert und alle Torarollen wurden auf der Straße verbrannt. Am 18. November 1938 verfügte die Baupolizei den Abriss der Synagoge, der am folgenden Tag begann. Die Abrisskosten musste die jüdische Gemeinde Halberstadt bezahlen.