No obstante, la situación en Chuquisaca se agravó y el 25 de mayo de 1809 los oidores de Audiencia de Charcas, movidos por su rencor, depusieron al presidente, alegando sospechas de connivencia con los portugueses, y mandaron comisionados a diversas ciudades de la audiencia. Únicamente en La Paz se produjo una sublevación el 16 de julio para constituir su propia junta de gobierno con el nombre de Junta Tuitiva. Ambas proclamaron salvaguardar los derechos del prisionero Fernando VII.