Severin Blindenbacher a débuté en Ligue nationale A en 2000, avec les Kloten Flyers. L'année suivante, il a été repêché en au total par les Coyotes de Phoenix de la Ligue nationale de hockey, mais il a néanmoins évolué avec Kloten jusqu'en 2005. Il signe alors un contrat en faveur des ZSC Lions, avec lesquels il remporte un titre de champion de Suisse en 2008 et un titre de champion d'Europe en 2009.