ثم شارك مع زملائه في تصفيات كأس العالم 2018 بعد اثني عشر عاماً من الغياب. في النهائيات، هو قائد الكتيبة التونسية في هزيمة (1–2) في المباراة الأولى في روسيا ضد إنجلترا، ثم سجل هدفًا ضد بلجيكا في وقت متأخر من المباراة، ثم قام بقيادة فريقه للفوز ضد بنما. أصبح أول لاعب تونسي في التاريخ يسجل مرتين على التوالي في كأس العالم. سجل هدف له مع المنتخب التونسي يوم 28 يونيو 2019 في ملعب السويس ضد منتخب مالي ضمن دور مجموعات كأس الأمم الأفريقية 2019 من ركلة حرة مباشرة في الدقيقة 70 انتهت المباراة بالتعادل 1–1. في 15 نوفمبر 2019 لأول مرة في مسيرته الدولية يسجل وهبي خزري هدفين في مباراة واحدة ضد منتخب ليبيا في تصفيات كأس الأمم الأفريقية 2021 جاء الهدف الأول من ضربة جزاء تصدى لها الحارس ثم أكملها خزري بتسديدة أخرى، والهدف الثاني عبر تسديدة بالرجل اليسرى بعد تمريرة من زميله أنيس بدري.