Nach dem Putsch, welcher Efraín Ríos Montt im März 1982 an die Macht brachte, ging er ins Exil. Von 1983 bis 1989 war er in Miami. 1989 erhielt er eine Aufenthaltsgenehmigung in Mexiko. Seit dem 10. Dezember 2003 gibt es einen Haftbefehl für Álvarez von der Audiencia Nacional de España. Die Delikte, die Alvarez Ruiz heute angelastet werden, sind Folter, Völkermord und Staatsterror während des guatemaltekischen Bürgerkrieges.