Im Winter 2002/03 gelang es Schlütter nicht mehr, an den Erfolg aus der Vorsaison anzuknüpfen. Nach einem 26. Platz im ersten Weltcup in Kiruna konnte er an gleicher Stelle einen Tag später mit der Staffel als Dritter erstmals das Weltcup-Podium erreichen. Mit dem vierten Platz in Kuusamo verpasste er ein erstes Einzelpodium nur knapp. In Nové Město na Moravě wiederholte die Staffel ihren Erfolg von Kiruna und wurde erneut Dritter. Bei den Weltmeisterschaften 2003 im Val di Fiemme gewann er mit der Staffel die Silbermedaille. Zuvor war er über 30 km und über die 15 km jeweils auf den fünften Platz gelaufen. Anfang April startete Schlütter bei der Militär-Skiweltmeisterschaft 2003 in Rovaniemi. Dort lief er 15-km-Freistilrennen als 25. ins Ziel. Die Saison 2002/03 beendete er wie bereits 1999 als 28. der Gesamtwertung.