Une fois en Tunisie, il y fait venir des armes de Libye, alors en pleine guerre civile, pour armer les djihadistes tunisiens. Il planifie le meurtre de deux opposants politiques à Ennahdha, le parti islamiste au pouvoir, afin de faire basculer dans le chaos la transition démocratique tunisienne. L'avocat Chokri Belaïd est assassiné par balles le devant chez lui à Tunis. Cinq mois plus tard, le , Mohamed Brahmi, est tué sous les yeux de sa famille.