I gruppi delle qualificazioni al campionato europeo di calcio Under-21 2004, ove possibile, sono stati creati in abbinamento ai gruppi di qualificazione delle squadre maggiori partecipanti agli Europei del 2004 con l'eccezione di Andorra, Isole Fær Øer, Liechtenstein e Irlanda del Nord, che non disponevano di rappresentative Under-21, e del Portogallo, la cui squadra maggiore non partecipava alle qualificazioni degli Europei in quanto paese ospitante.