הטורניר האחרון של פארדו בנבחרת היה גביע הזהב 2007, תחת המאמן הוגו סאנצ'ס, בו סיימה הנבחרת במקום השני לאחר הפסד 2-1 בגמר ל. לקראת סיום הטורניר הודיע פארדו, יחד עם חברו לשטוטגרט באותה התקופה ריקרדו אוסוריו, כי לא ייטול חלק במשחקיה של מקסיקו בקופה אמריקה 2007, עקב עייפות פיזית ומנטלית. המהלך התקבל בביקורת רבה במקסיקו, ופארדו נענש על ידי סאנצ'ס בכך שלא זומן יותר לנבחרת באותה השנה.