6 апреля 1941 года в 7 часов 10 минут, в ходе немецких бомбардировок, двор церкви, на котором во рву укрывались люди, подвергся авиаудару. Храм был частично разрушен, а хвойные деревья, посаженные в 1906 году, были вырваны из земли. Спустя двадцать дней немцы согнали военнопленных и евреев для поиска останков. Всего было вывезено около 180 погибших, похороненных на Новом кладбище.