随后塞巴斯蒂亚尼被调到了巴黎任职，他支持拿破仑的政治行动，11月9日他参与发动了雾月政变。1800年他同预备军团一起翻越了阿尔卑斯山，并参加了马伦哥战役。1801年1月塞巴斯蒂亚尼占领了特拉维索，在马尔蒙的帮助下他同奥地利人进行了停战协商。