Na de politieke veranderingen in Tsjecho-Slowakije als gevolg van de Fluwelen Revolutie (november 1989), trad de oude partijleiding van de indertijd met de Communistische Partij van Tsjecho-Slowakije collaborerende Tsjecho-Slowaakse Volkspartij af en kwam er een nieuw partijbestuur. Sacher trad opnieuw toe tot de CSL en werd eerste secretaris van de partij. In de regering van de hervormingsgezinde communist, Marián Čalfa, werd Sacher de eerste niet-communistische federale minister van Binnenlandse Zaken van Tsjecho-Slowakije sinds 1945. Sachers voornaamste taak was het hervormen van het onder het ministerie van Binnenlandse Zaken geplaatste Directoraat voor Staatsveiligheid (FBIS, het voormalige StB). Deze taak bleek niet gemakkelijk, daar het nieuwe directoraat nog steeds werd beheerst door communisten van de harde lijn.