À la suite de cette saison, il retourne jouer avec son club formateur pour la saison 1998-1999 alors que l'équipe évolue dans le championnat d'Allemagne, la "". Müller reste deux saisons avec son équipe en élite alors qu'elle finit dans la deuxième moitié du classement. En , il est sélectionné pour la première fois avec l'équipe nationale pour jouer le championnat du monde 1999 en division B. En , il participe avec l'équipe junior d'Allemagne au championnat du monde ; l'Allemagne ne perd qu'une seule rencontre du tournoi mais c'est suffisant pour lui interdire la montée qui est décrochée par le Belarus. Avec 93,75 % d'arrêts, Müller est le meilleur gardien du tournoi. Quelques mois plus tard, en , Müller est un des trois gardiens de l'équipe nationale au cours du championnat du monde. L'Allemagne finit à la première place du classement de la division B et gagne ainsi sa place pour la saison suivante en élite.