Nach dem Anschlag in Charleston, South Carolina am 17. Juni 2015, bei dem der 21-jährige Dylann Roof neun schwarze Mitglieder der Emanuel African Methodist Episcopal Church erschoss, sprach sich Haley dagegen aus, die Flagge der Konföderierten Staaten von Amerika – die heute als Symbol der früher Sklaverei befürwortenden Südstaaten umstritten ist – auf staatlichem Gelände zu verwenden.