En 1943, après le débarquement allié en Sicile et la chute de Mussolini, Leone se rend à Rome laissant sa famille dans les Abbruzes. En septembre, lorsque les nazis envahissent le pays, Natalia Ginzburg et ses trois enfants fuient Pizzoli à bord d'un camion allemand, racontant au conducteur qu'ils étaient des réfugiés de guerre qui avaient perdu leurs papiers. Ils retrouvent Leone et ils se cachent dans la capitale italienne. Vingt jours plus tard, Leone Ginzburg est arrêté à Rome, mais cette fois par la Gestapo. On lui inflige des tortures dans la section allemande de la prison romaine de "Regina Coeli" où il meurt des suites de ses blessures.