Dal 1983 fino al 1986 ha fatto parte dell'amministrazione Reagan nello staff del Consiglio per la sicurezza nazionale, in qualità di coordinatore anti-terrorismo. Durante il suo servizio nell'amministrazione Reagan, North è intervenuto in diverse e importanti azioni militari. Nel 1983 ha pianificato l'invasione di Grenada, affidata a reparti Marines, per rovesciare il governo comunista dell'isola. Nel 1985 ha invece ricoperto un importante ruolo nell'arresto di un gruppo di terroristi che aveva dirottato la Achille Lauro, mentre il 15 aprile 1986 ha preso parte all'organizzazione del blitz contro le basi terroristiche in Libia di Mu'ammar Gheddafi. Le "covert operations" condotte in quel periodo avrebbero contemplato anche il finanziamento di attività militari mediante il traffico di droga.