V roce 1984 se stal známou osobností v souvislosti s aférou Autobus 300, při níž došlo k zabití dvou palestinských únosců izraelského autobusu a následnému ubití dvou dalších zajatých palestinských únosců. Mordechajovi, v té době veliteli paradesantních a dělostřeleckých sil bylo prokázáno, že oba únosce bil. Později, při vyšetřování se Šin Bet pokusila křivými výpověďmi svých agentů svalit vinu za smrt dvou zadržených na Mordechaje. Mordechajovi přátelé ale sehnali svědky, kteří dosvědčili, že zajatí únosci byli biti a následně ještě živí odvezeni pryč agenty Šin Bet.. Mordechaj byl očistěn. V roce 1986 byl povýšen do hodnosti generálmajora a stal známým jako "Generál tří distriktů" poté, co sloužil postupně jako velitel všech tří distriktů; Severního, Centrálního a Jižního. Při vypuknutí První Intifády v roce 1988 velel Jižnímu distriktu, Severnímu velel v roce 1993.