Die Universität wurde 1909 während der französischen Kolonialherrschaft als erste Universität Französisch-Algeriens gegründet (per Gesetz vom 30. Dezember 1909). Die Gründung war das Resultat einer Reihe akademischer Bemühungen, von denen besonders das Gesetz von 1879, welches die Gründung von fünf spezialisierten Schulen – Medizin, Pharmazie, Wissenschaft, Literatur, und Jura – festsetzte, hervorzuheben ist. Während und nach der Unabhängigkeit Algeriens hielt die Universität von Algier ihre Lehrtätigkeit aufrecht, machte aber zahlreiche Änderungen in Bezug auf ihre Organisation und Struktur durch.