Група армій «С» сформована 26 серпня 1939 року у Франкфурті-на-Майні як 2-ге командування групи армій (). Сформована група армій була передислокована на Західний фронт. У період кампанії в Польщі вона стояла на південній ділянці західного кордону Німеччини. Під час Французької кампанії група армій «С» фронтальним ударом прорвала лінію Мажино, чим сприяла успіху сусідніх з нею груп армій. У листопаді 1940 року вона була передислокована до кордонів СРСР, а 20 квітня 1941 року перейменована в «Штаб району Східна Пруссія» (). 20 червня 1941 року перейменована в групу армій «Північ».