Po jeho smrti se ujal vedení jeho nejmladší syn, Jiří Fragner, který na žádost své matky a sourozenců předčasně ukončil svůj původně zamýšlený několikaletý pobyt v USA a vrátil se do Československa. Firma pod názvem B. Fragner se nadále zdárně rozvíjela, ve 30. letech 20. století pak v Dolních Měcholupech u Prahy vystavěla moderní výrobní farmaceutický závod podle návrhu nejstaršího syna, architekta Jaroslava Fragnera. Po únoru 1948 byl podnik znárodněn a přejmenován na SPOFA, na jehož základě po roce 1989 vznikla farmaceutická firma Zentiva.