Nach dem italienischen Einmarsch in das Königreich Albanien leitete er eine der ersten Guerillaorganisationen gegen die Besatzer, brandmarkte das faschistische Italien als antiislamisch und knüpfte Kontakte mit der kommunistischen albanischen Partisanenbewegung. Er wurde dadurch zu einem der meistgesuchten Männer im Land. In seinen Memoiren schrieb Enver Hoxha, dass der Baba während des Krieges David Smiley beschreibt Baba Faja als eine liebenswerte „Kanaille“, der