Zunächst war Hermann von Buxthoeven Abt des Paulsklosters vor Bremen, bevor er am 10. April 1220 zum Bischof von Leal (Lihula) ernannt wurde. Am 21. Juli 1224 gelang es seinem Bruder Albrecht von Buxthoeven, dem Bischof von Riga, seinen Einfluss gegen König Waldemar von Dänemark und den Schwertbrüderorden auch in Estland durchzusetzen und Hermann dort als Bischof von Dorpat (Tartu) einzusetzen. Hermann gründete die Kathedrale in Dorpat und führte 1242 in der Schlacht auf dem Peipussee eine Streitmacht aus deutschen und dänischen Kreuzrittern, lokalen Hilfstruppen und Rittern des Deutschen Ordens gegen Alexander Newski, die er verlor.