В октябре 1806 года Одюбон отправился в Нью-Йорк, чтобы работать в офисе Бенджамина Бэйквелла ("Benjamin Bakewell") — дяди Люси, который экспортировал в Европу крупы, кофе, сахар и индиго, ввозил обратно европейские товары и был особенно рад установлению отношений с отцом Розье. Вместе с Джоном Одюбоном у Бенджамина Бэйквелла работали сын Уильяма Бэйквелла и брат Люси Томас Вудхауз Бэйквелл ("Thomas Woodhouse Bakewell"), племянник жены Б. Бэйквелла Томас Пирс ("Thomas Pears"), сын Б. Бэйквелла Томас Бэйквелл ("Thomas Bakewell"). По совету старшего Розье партнёры основали собственное дело и начали вести торговлю. Бенджамин Бэйквелл предоставил им по малой цене товар, с которым они отправились на запад в Луисвилл в Кентукки и в сентябре 1807 года открыли там лавку. Розье и Одюбон отметили удачное расположение города, дружелюбие его жителей, а также большое количество рыбы и птиц, и решили остаться в Луисвилле. Торговле помешала война между Англией и Францией: 22 декабря 1807 года сохранявшее нейтралитет американское правительство во главе с президентом Томасом Джефферсоном подписали эмбарго, полностью закрыв экспорт и введя суровые ограничения на импорт.