Принял активное участие в ликвидации последствий наводнения в Петербурге в 1824 г. В декабре 1825 г. Комаровский организовал вверенными ему силами конвоирование арестованных декабристов с Сенатской площади в Петропавловскую крепость. В 1826 г. был назначен членом Верховного уголовного суда по делу декабристов. 25 июля 1828 произведён в генералы от инфантерии «за отличия по службе». 18 октября отставлен от должности командира ОКВС по возрасту с назначением сенатором. В апреле 1829 предоставлен продолжительный отпуск «до излечения болезни» с постоянным проживанием в собственном имении Городище.