Pada tahun 1944, Wakaba ikut berpartisipasi dalam Pertempuran Teluk Leyte. Pada pertempuran tersebut, ia berperan dalam operasi transport bersama dan . Ia tenggelam sebelum pertempuran dimulai pada 24 Oktober 1944 di dekat Panay, Filipina () akibat serangan udara oleh pesawat dari . menyelamatkan 78 krunya, sedangkan menyelamatkan 74 orang.