デ・ヤング美術館は1894年に開かれた万国博（）の際に建てられたファイン・アート・ビルディングを利用して1895年に開館。その時の委員会の委員長を務めたのがサンフランシスコ・クロニクルを創刊したマイケル・ハリー・デヤング（）であったため、「デ・ヤング美術館」となった。当初の建物は1906年のサンフランシスコ地震で被害を受け、修復に1年半かかった。