Brabec pelasi useissa Tšekin nuorisomaajoukkueissa. Hän pelasi ensimmäisen kerran Tšekin A-maajoukkueessa maaliskuussa 2016 ystävyysottelussa Ruotsia vastaan. Hän on kesän 2021 EM-kilpailujen päättyessä pelannut 22 A-maaottelua, joissa 18 kertaa avauskokoonpanossa. Ainoan maaottelumaalinsa hän on tehnyt lokakuussa 2019 voitokkaassa EM-karsintaottelussa Englantia vastaan. Kesän 2021 EM-kilpailuissa hän pelasi puolivälierässä Tanskaa vastaan tultuaan 65. minuutilla vaihdosta kentälle loukkaantuneen Ondřej Čelůstkan tilalle.