Atak Niemiec w 1939 roku i okupacja uniemożliwiły dalsze funkcjonowanie oddziału. Niemcy zniszczyli bogatą bibliotekę, zlikwidowano muzeum, zdołano zabezpieczyć tylko niektóre eksponaty w tym "skarb kunowski" – 73 dukatów złotych i 843 srebrnych monet. Hitlerowcy zamordowali głównych działaczy Stanisława Saskiego i Stanisława Żakowskiego, w Oświęcimiu zginął Franciszek Kubala. Wielu innych zmarło lub wyjechało z Ostrowca. Działalność zamarła na dziesięć lat, a jej wznowienie nastąpiło 23 kwietnia 1948 roku z inicjatywy przedwojennych działaczy: Maryli Żakowskiej, Stanisława Jeżewskiego i Jana Szymańskiego.