Jens-Erik Madsen (Randers, Jutlàndia Central, 30 de març de 1981) és un ciclista danès professional des del 2004 fins al 2012. També ha combinat amb el ciclisme en pista on va aconseguir una medalla de plata als Jocs Olímpics de Pequín en la prova de Persecució per equips tres medalles al Campionat del món de Persecució per equips.