"Gjøa" ripartì da Gjoa Haven il 13 agosto 1905, navigando i pericolosi stretti a sud dell'isola Victoria, e da qui ad ovest nel mare di Beaufort. Ad ottobre la "Gjøa" era nuovamente bloccata dai ghiacci, stavolta nei pressi di Herschel Island nello Yukon. Amundsen lasciò a bordo i propri uomini passando buona parte dell'inverno sciando per quasi 800 km verso sud fino a Eagle, in Alaska, per telegrafare notizie sui successi della spedizione. Tornò a marzo, ma la "Gjøa" rimase bloccata fino all'11 luglio. La "Gjøa" raggiunse Nome il 31 agosto 1906. Ripartì verso una San Francisco scossa dal terremoto, dove la spedizione giunse il 19 ottobre.