Wybuch I wojny berberyjskiej spowodował, że został skierowany – jako porucznik na pokładzie fregaty "Adams" – na Morze Śródziemne. Później dowodził szkunerem "Enterprise" i brygiem "Argus", awansując w roku 1804 na stopień komandora porucznika, a w 1806 komandora. Przez kilka następnych lat nadzorował budowę kanonierek, a od roku 1809 dowodził kolejno fregatami "Chesapeake", "President" i "Constitution".