Prentl wurde am 1. August 1940 zum Oberleutnant befördert. Es folgte dann zum 5. November 1940 eine Versetzung zur Luftkriegsschule 8 in Göppingen, wo er als Taktik- und Waffenlehrer tätig war. Juni 1941 wurde er nach Brest zur 3./Reserve-Flak-Abteilung 391 versetzt, wo er Batteriechef war. Im Mai 1942 wurde Prentl als Batteriechef zur 2. Batterie des Flak-Regiments 231 versetzt, mit der er am Krieg gegen die Sowjetunion teilnahm. In den Kämpfen um den Brückenkopf Woronesch wurden durch seine Batterie am 24. und 25. Juli 1942 25 Panzer und drei Flugzeuge abgeschossen. Er sollte hierfür am 21. Oktober 1942 das Ritterkreuz des Eisernen Kreuzes erhalten.