Sapir Academic College byla založena v roce 1963. Pojmenována je podle izraelského politika Pinchase Sapira. Původně šlo o večerní školu pro doplňkové vzdělávání dospělých. Umístěna byla do prostoru bývalé základny izraelské armády, jež byla opuštěna armádou po Suezské krizi roku 1956. Lokalita ale nebyla vhodná a proto se vedení Oblastní radě Ša'ar ha-Negev rozhodlo přesunout školu do blízkosti již existující regionální střední školy, na jižním okraji nově budovaného města Sderot. Od počátku škola spolupracovala s Ben Gurionovou univerzitou v Beerševě.