В 2002 году Уэйр был отчислен из состава сборной за критику главного тренера команды Берти Фогтса после отборочного матча к Евро 2004 с Фарерскими островами. Новый наставник шотландцев, Уолтер Смит, в декабре 2004 года сумел уговорить Дэвида вернуться в национальную команду.