En 1830, la Monarchie de Juillet instaure un pouvoir plus centralisateur en France et à Lyon, qui suscite de vives réticences au sein de l'administration des Hospices civils de Lyon. Malgré des tentatives de la part des représentants du roi de prendre en main l'institution, celle-ci reste toutefois largement indépendante. La Révolution de juillet entraîne également une modification du collège des administrateurs, qui perd progressivement ces personnalités civiles pour se peupler de médecins. Les nouveaux entrants sont plus libérauxet cette évolution entraîne également un amoindrissement des liens entre le conseil d'administration et les organes de pouvoir locaux, mairie, conseil général et préfecture.