После русско-прусско-французской войны 1806—1807 годов по итогам Тильзитского мира (1807) Южная Пруссия и Новая Восточная Пруссия были снова утеряны в пользу новообразованного Варшавского герцогства, куда вошли также и принадлежащие Западной Пруссии Нетцкий округ и Кульмерланд вместе с городом Торн. Кроме того, Западная Пруссия также потеряла Данциг, который был преобразован в самостоятельную Данцигскую республику. Однако в ходе последующих освободительных войн (1813—1815) Данциг и Кульмерланд снова перешли под контроль Пруссии, что было окончательно закреплено Венским конгрессом в 1815 году.