В 1844 году Жуковский был назначен старшим адъютантом главного штаба действующей армии и произведен в полковники, а в 1847 году получил должность начальника 4-го отделения в Управлении генерал-квартирмейстера армии. Во время Венгерского мятежа участвовал при взятии Бартфельда, Эпериеша, Кашау, и в сражениях при Вайцене и Дебрецене.