Im Verlauf des Bürgerkriegs berichteten libysche Zeitungen am 1. März 2011, dass Gaddafi ihn von seinen Aufgaben entbunden habe. Am 16. März 2011 beantragte der Chefankläger des Internationalen Strafgerichtshofs, Luis Moreno Ocampo, Haftbefehl gegen ihn wegen Verbrechen gegen die Menschlichkeit. Am 9. September 2011 wurde er, gemeinsam mit Muammar al-Ghadhafi und dessen Sohn Saif al-Islam, von Interpol zur Fahndung ausgeschrieben und soll am 20. November 2011 festgenommen worden sein. Verteidigungsminister Usama al-Dschuwaili bestritt am 24. November jedoch seine Festnahme.