Przed sezonem 2013 z zespołu Citroëna odszedł Sébastien Loeb. Hirvonen został więc mianowany liderem zespołu, a jego nowym partnerem został Hiszpan Daniel Sordo. W pierwszym rajdzie sezonu, Rajdzie Monte Carlo, Hirvonen zajął 4. miejsce. W lutowym Rajdzie Szwecji, na drugim odcinku specjalnym, Hirvonen wypadł z trasy, w miejscu w którym było jedynie dwóch kibiców zdolnych do wyciągnięcia samochodu ze śniegowej zaspy, w efekcie czego Fin stracił 24 minuty i spadł na ostatnią pozycję w rajdzie. Ostatecznie zajął 17. pozycję w szwedzkim rajdzie. W marcu, w Rajdzie Meksyku, Hirvonen był drugi. Dojechał do mety ze stratą ponad 3 minut do zwycięzcy, Sébastiena Ogiera. W Rajdzie Portugalii również był drugi i również przegrał z Ogierem. W kolejnych dwóch występach Hirvonen w ogóle nie stanął na podium. W Rajdzie Argentyny dojechał na 6. pozycji, a w Rajdzie Grecji był ósmy. W czerwcowym Rajdzie Sardynii od 1. odcinka specjalnego jechał na 2. pozycji, jednak na 10. odcinku wypadł z trasy. Uszkodzenia były na tyle poważne, że Fin nie powrócił do rywalizacji. W kolejnych sześciu rajdach sezonu 2013 Hirvonen trzykrotnie stawał na podium. Był trzeci w Rajdzie Niemiec, Rajdzie Australii i Rajdzie Hiszpanii. Sezon ukończył na 4. miejscu, przegrywając kolejno z Ogierem, Thierrym Neuville'm i Jarim-Mattim Latvalą.