Przed wyborem w drafcie NHL 2007, Brendan Smith występował w zespole Ontario Provincial Junior A Hockey League – St. Michael's Buzzers. W 2007 roku skończył swój drugi sezon w barwach Buzzers jako najlepiej punktujący obrońca – uzyskał 36 punktów. Został także wybrany do meczu gwiazd CJAHL. W tym samym roku Smith zaczął uczęszczać do Uniwersytetu Wisconsin.