2月25日にリック・ワイズとの交換トレードでフィラデルフィア・フィリーズに移籍。同年は5月に5連敗を喫するが、6月7日から5完封を含む15連勝。いずれもリーグトップの27勝（10敗）・防御率1.97・310奪三振・41先発・30完投・346.1イニング・被安打257を記録し、最多勝・最優秀防御率・最多奪三振の投手三冠を達成。チームは59勝97敗で最下位に終わったが、チーム勝利の46%を1人で挙げた。これは20世紀以降ではメジャー最高記録である。サイ・ヤング賞を初受賞し、MVPの投票でも5位に入った。「最高のスポーツ選手」としてヒコック・ベルトを獲得。トレーニングに東洋武術を取り入れるなど、ユニークな肉体管理法も確立する。は293.1イニング・18完投はリーグトップだったものの、20敗・293被安打・127失点はいずれもリーグワーストと一転して不調に陥る。メディアから「奇妙な」トレーニング法について詰問され、その後取材を一切拒否することになる。はリーグワーストの136四球だったが、16勝13敗・防御率3.22・240奪三振の成績で最多奪三振を獲得。は20勝を挙げてチームの地区優勝に貢献。シンシナティ・レッズとのリーグチャンピオンシップシリーズでは第1戦に先発するが、8回途中5失点で敗戦投手となり、チームも3連敗で敗退した。は23勝10敗・防御率2.64を記録して最多勝のタイトルを獲得し、チームは2年連続地区優勝。ロサンゼルス・ドジャースとのリーグチャンピオンシップシリーズでは第1戦に先発し7回途中5失点、第4戦では5回4失点と振るわず、1勝3敗で敗退。オフに2度目のサイ・ヤング賞を受賞。は16勝を挙げ、チームは地区3連覇。前年に続きドジャースと対戦したリーグチャンピオンシップシリーズでは第3戦に先発して4失点完投勝利を挙げるが、チームは1勝3敗で3年連続で敗退した。