Dieses Kloster musste mehrmals seinen Ort verlegen: Im 16. Jahrhundert ließ Karl V. das alte Kloster abreißen, um an dessen Stelle eine Festung zu errichten, und ein neues Kloster an der Stelle aufbauen, an der heute das Museo Regionale di Messina steht. Nach der Erhebung des Archimandritats zu einem eigenständigen Bistum im Jahre 1635 wurde die Klosterkirche zur Kathedrale. Das Kloster und die Kathedrale wurden bei dem Erdbeben von Messina 1908 vollständig zerstört.