В 2016 году Нолан выбил 41 хоум-ран и 133 RBI, второй раз подряд получив награду Сильвер Слаггер. Действия в защите, где он стал лучшим инфилдером по показателю DRS (, количество потенциальных ранов, предотвращённых защитником), принесли ему четвёртую подряд Золотую перчатку. В гостевых матчах Аренадо отличился 16 хоум-ранами, дав ответ критикам, считавшим что его достижения на бите связаны в первую очередь с высокогорным домашним стадионом. По общему показателю полезности rWAR Нолан стал вторым в Национальной лиге, уступив только лидеру победителей Мировой серии «Чикаго Кабс» Крису Брайанту. В голосовании, определявшем Самого ценного игрока лиги, он занял пятое место. В ноябре 2016 года Аренадо объявил, что в играх Мировой бейсбольной классики 2017 года он будет выступать в составе сборной США, отдав ей предпочтение перед командой Пуэрто-Рико.