Войну с Австрией Жакино встретил бригадным генералом (с 10 марта 1809). В битве при Абенсберге его конные егеря (1-й и 2-й полк) смяли и рассеяли по окрестным лесам пехоту из бригады генерала Тьерри, а также разбили драгун Левенера и гусар Отта. За храбрость, проявленную в сражении при Ваграме, Жакино был произведён в комманданы Ордена Почётного легиона. После окончательного разгрома австрийской армии и подписания Шёнбруннского мира некоторое время квартировал в Германии, а затем отбыл во Францию (23 июня 1810). В 1811 года занимал должность губернатора Кюстрина и Глогау.