После начала Январского восстания в 1863 году вернулся на родину. Участвовал в восстании в чине подполковника, командовал подразделением мятежников. Отряд был разгромлен русскими частями, тогда же Э. Габих бежал в Краков (Австрийская империя). В начале октября был назначен комиссаром польского национального правительства. Позже эмигрировал во Францию.