Nachdem Lemberg nach dem deutschen Überfall auf die Sowjetunion im Juni 1941 von deutschen Truppen besetzt worden war, ging Rudnicki nach Warschau, nahm unter dem Namen "Leonard Herynga" am Widerstand gegen die deutsche Besatzung teil und hielt Kontakt zum Jüdischen Nationalkomitee "Zydowska Komitet Narodowy", einer Vereinigung aller linksgerichteten und zentristischen zionistischen Jugendorganisationen und der Kommunisten. Als Angehöriger der Polnischen Heimatarmee kämpfte er im Warschauer Aufstand und ging nach dessen Niederschlagung nach Milanowek sowie weiter nach Lublin und Anfang 1945 nach Lodz.