Il suo esordio avviene comunque il 29 marzo 2003, in un'amichevole proprio contro i verdeoro nella quale, entrato al posto di Sergio Conceicao, realizzò su punizione il gol vittoria. Questa fu la prima vittoria del Portogallo contro il Brasile dopo la Coppa del mondo del 1966. Da quel momento, le proteste sulla convocazione di Deco cessarono fino all'europeo del 2004, dove il suo connazionale Luis Figo criticò aspramente l'inclusione di Deco affermando: "Se sei cinese, nato in Cina, devi giocare per la Cina". Dopo aver ottenuto il secondo posto nella competizione, Deco, essendo comunque uno dei calciatori principali della nazionale portoghese,