Ronaldo vynechal prvé tri zápasy Realu Madrid v &lt;a href="La%20Liga%202016/2017"&gt;sezóne 2016/2017&lt;/a&gt;, vrátane Superpoháru UEFA proti Seville, kvôli pokračujúcej rehabilitácii zraneného kolena zo zápasu proti Francúzsku vo finále Eura 2016. 15. septembra, v zápase Ligy majstrov UEFA proti Sportingu CP neoslavoval svoj gól z priameho kopu, čo odôvodnil tým, keď povedal, že „oni ma spravili tým, kým som.“ 19, septembra strelil hetrik pri vonkajšej výhre 3:0 nad Atléticom Madrid, čím sa stal najlepším strelcom v histórii v Madridskom derby s 18 gólmi. 15. decembra strelil Ronaldo 500. klubový gól v kariére pri výhre 2:0 nad Club América v semifinále Majstrovstiev klubov FIFA. Vo finále strelil hetrik pri výhre 4:2 nad japonským Kashima Antlers. Ronaldo ukončil turnaj ako najlepší strelec so štyrmi gólmi a stal sa taktiež hráčom turnaja. Po štvrtýkrát vyhral Zlatú loptu a inauguračnú cenu FIFA The Best, ktorej predchodcom bola cena Futbalista roka FIFA, predovšetkým kvôli úspechom s Portugalskom na Eure 2016.