Фактически на флоте было двое командующих. Перед вторжением персов руководство греческими силами было возложено на Спарту. Большую часть флота составляли афинские корабли. Главнокомандующим со стороны спартанцев был Леотихид II, афинян — Ксантипп. Между ними сложились хорошие взаимоотношения. Они даже заключили союз гостеприимства-побратимства ксению, которая действовала и между их потомками. Союзный флот отплыл сначала на Делос, а затем к Самосу. Когда персы узнали, что греки на подходе, их флот не рискнул вступить в бой и отплыл из Самоса к материковому побережью. Там экипаж судов соединился с армией, оставленной Ксерксом в Ионии под руководством Тиграна. Персы вытащили корабли на берег и построили укрепление. Узнав о бегстве персов, эллины были в нерешительности относительно дальнейших действий. Одни считали, что нужно плыть домой, другие предлагали направиться к стратегически важному Геллеспонту — проливу между Европой и Азией. В конечном итоге греки решили плыть к материку и сразиться с персами. После этого эллины высадились на берег и стали готовиться к сражению. Во время битвы при Микале Ксантипп проявил себя с наилучшей стороны. Именно возглавляемые им афиняне первыми приняли бой и обратили персов в бегство.