Durante il terremoto che colpì anche Messina la sede fu danneggiata gravemente e fu necessario utilizzare una sede provvisoria in legno. Con la ricostruzione post-sisma fu approvato il nuovo progetto per la sua ricostruzione ma lo scoppio della prima guerra mondiale bloccò ogni cantiere. Con la fine del conflitto i lavori poterono essere intrapresi e la nuova sede dell'istituto fu pronta. La solenne inaugurazione avvenne alla presenza del sindaco e dell'allora ministro del Tesoro Giuseppe De Nava all'inizio del 1922. Con la ripresa delle attività didattiche la nuova sede ospitò per un breve periodo anche il liceo scientifico Leonardo da Vinci, istituito il 1 ottobre 1924.