Vanaf 1938 tot aan het uitbreken van de oorlog speelde Van Den Wouwer 8 wedstrijden met het Belgisch voetbalelftal. Hij wist hierbij tweemaal te scoren, in 1938 in de thuiswedstrijd tegen Joegoslavië en in 1940 in de thuiswedstrijd tegen Nederland. Tijdens het Wereldkampioenschap voetbal 1938 in Frankrijk speelde hij mee in één wedstrijd. Na de oorlog werd hij niet meer opgeroepen voor de nationale voetbalploeg.