Кладбище сильно пострадало во время оккупации Польши нацистской Германией во время Второй мировой войны, как из-за целенаправленного его использования немецкой администрацией в качестве источника строительных материалов, так из-за ущерба связанного с военными действиями. После войны кладбище стало местом массового захоронения тел евреев, эксгумированых во время восстановления Варшавы; официально кладбище было закрыто в 1950 году. С тех пор кладбище постепенно приходит в упадок, получая от местной администрации только незначительную поддержку. С 1984 по 2010 годы кладбище находилось под управлением Фонда Ниссенбаума.