2009 belegte Ndiku bei den Jugendweltmeisterschaften hinter seinem Trainingspartner Gideon Kiage Mageka den zweiten Platz im 1500-Meter-Lauf. Bei den Crosslauf-Weltmeisterschaften 2010 in Bydgoszcz gewann er den Titel im Juniorenrennen und führte Kenia zum Sieg in der Mannschaftswertung. In persönlicher Bestleistung von 3:37,30 Minuten holte er über 1500 Meter die Goldmedaille bei den Juniorenweltmeisterschaften 2010 in Moncton.