Minami-Sōma kärsi pahoin Tōhokun maanjäristyksestä ja sen aiheuttaman tsunamin tuhoista 11. maaliskuuta 2011. Kaupungissa sai surmansa 1 043 ihmistä, ja 2 323 asuinrakennusta tuhoutui kokonaan. Kaupungin eteläpuolella tapahtuneen Fukushima I -voimalan ydinonnettomuuden vuoksi voimalaa ympäröivä alue eristettiin, ja kaupungin etelä- ja länsiosat jouduttiin evakuoimaan. Lähes kaikki evakuointimääräykset peruttiin vuoteen 2016 mennessä, mutta vielä vuonna 2019 yli 5 000 henkeä asui evakossa kaupungin ulkopuolella.