近年東アフリカではブルンジ内戦(1993–2006)、アメリカ大使館爆破事件及びルワンダ民族浄化(ルワンダ虐殺)(1994)などの紛争が起きている。ウガンダ内戦(神の抵抗軍の反乱)やダルフール紛争は2017年9月時点でも継続している