当德国舰队抵达时，北京的外国公使馆之围已经由八国联军的其他成员部队所解除。腓特烈·威廉选帝侯号及舰队余部遂于9月初被转移至黄海，在那里，已被任命为八国联军总司令的瓦西德计划对中国北方的港口采取更为强硬的行动。9月3－4日，俾斯麦首爵号作为东亚分舰队的旗舰，对山海关及秦皇岛的海港实施了侦察。随后，腓特烈·威廉选帝侯号前往山海关，并派出100人的登陆部队上岸，而它的鱼雷组船员则负责清理中国的雷区。腓特烈·威廉选帝侯号然后返回吴淞口锚区，而东亚分舰队的舰只则仍然停留在两个港口。随着局势日趋平静，四艘勃兰登堡级舰只于1901年初被分别送往香港或日本的长崎进行大修；其中腓特烈·威廉选帝侯号是在1月4日至23日去往长崎。3月，远征舰队在青岛重新集结，并进行了射击和战术演练。