Appese le scarpe al chiodo nel 1975, Perani rimase a vivere a Bologna e lavorò nella società come allenatore delle squadre giovanili. I buoni risultati ottenuti indussero il presidente Conti, nel gennaio del 1979, ad affidargli la prima squadra dopo l'esonero di Bruno Pesaola. Ma dopo sole sette partite caratterizzate da risultati negativi Perani fu avvicendato da Cesarino Cervellati, che portò la squadra alla salvezza,pareggiando l'ìultima partita con Il Perugia per 2-2. Con decisione un po' a sorpresa, per il campionato successivo, quello del 1979-1980, la nuova dirigenza affidò proprio a Perani la panchina della squadra; il traguardo della salvezza fu raggiunto senza patemi, ma comunque a fine stagione Perani fu sollevato dall'incarico.