二战爆发一年后，他被任命为俾斯麦号的舰长，该舰是当时世界上最大的战列舰，也是战争海军（纳粹德国海军）的骄傲。1941年5月，林德曼在莱茵演习行动中指挥俾斯麦号。俾斯麦号和重巡洋舰欧根亲王号组成了一支特遣部队，受海军上将京特·吕特晏斯指挥。他们接到命令，要从德占波兰的基地出发，袭击英国在大西洋的商船航线。特遣部队的首场主要交锋是丹麦海峡海战，致使英国战列巡洋舰胡德号沉没。不到一周后，即5月27日，林德曼与他的大部分船员都在俾斯麦号的最后一战中丧生。他在死后获追授予骑士铁十字勋章，这是当时纳粹德国军事和准军事部队的最高荣誉。1942年1月6日，勋章由他的遗孀希尔德加德代领。