Clint Jones wuchs in Steamboat Springs auf und stand im Alter von zwei Jahren das erste Mal auf Skiern. Über seinen Bruder Robbie kam er als Fünfjähriger zum Skispringen und wurde in dieser Disziplin im Jahre 1999 der jüngste amerikanische Meister der Geschichte. Am 26. Februar 2000 startete Jones erstmals im Weltcup und verpasste als 32. seine ersten Punkte nur knapp. Ende November 2001 holte er mit dem neunten Platz in Kuopio das beste Weltcup-Ergebnis seiner Karriere. Bei den Weltmeisterschaften 2001 im finnischen Lahti wurde er 38. von der Groß- und 37. von der Normalschanze. Zwei Jahre später erreichte er bei den Weltmeisterschaften 2003 im italienischen Predazzo wurde er von der Normalschanze 32. und erreichte von der Großschanze den 40. Platz.