Значну частину фондів музею складають матеріали про трипільські поселення-гіганти Володимирівка та Небелівка, золотоординське місто Ябгу, битву на Синіх Водах та Уманський котел. Вони були отримані в результаті історичних, археологічних, пошукових досліджень, які проводяться на території Новоархангельщини.