Dopo essere stato scelto in seconda posizione assoluta dagli Hartford Whalers durante l'NHL Entry Draft 1993 Pronger esordì in NHL con Hartford, giocando poi per i St. Louis Blues, gli Edmonton Oilers e gli Anaheim Ducks; dalla stagione 2009-10 gioca per i Philadelphia Flyers. In carriera è giunto per tre volte alla finale della Stanley Cup con altrettante squadre (Edmonton, Anaheim e Philadelphia), riuscendo a vincere il titolo con i Ducks nel 2007. Pronger nel 2000 vinse l'Hart Memorial Trophy come MVP della lega, primo difensore capace in tale impresa dopo Bobby Orr nel 1972. Con la maglia del Canada Pronger ha vinto due titoli olimpici ed un titolo mondiale. Dopo la vittoria della Stanley Cup è entrato a far parte del Triple Gold Club.