К началу Отечественной войны 1812 года полковник Кутузов командовал батальоном в лейб-гвардии Измайловском полку. Во время Бородинского сражения принял командование над всем полком, а затем возглавил 2-ю бригаду гвардейской пехотной дивизии. В кампании 1813 года в сражении под Лютценом был тяжело контужен и оставил армию, за боевые отличия произведён в генерал-майоры. По излечении вернулся в действующую армию вскоре после взятия Парижа.