Принимал участи в Великой Отечественной войне с июля 1942 года. Ранен в голову и правое плечо в октябре 1942 года. Заместитель командира 272-го стрелкового полка 10-й стрелковой дивизии ВВ НКВД, с августа 1943 — заместитель командира 288-го стрелкового полка 181-й стрелковой дивизии. С 1944 года подполковник Яковлев В. Ф. — командир 340-го гвардейского стрелкового полка 121-й стрелковой дивизии. Принимал участие в сражениях на Сталинградском, Центральном и 1-м Украинском фронтах. Участвовал в Сталинградской и Курской битвах. Был участником операций по освобождению Белоруссии, Украины, Польши, Чехословакии. Завершил войну на территории Германии. Четыре раза получал ранения, в том числе дважды был ранен тяжело.