Con todavía un año más de contrato en Turín, el equipo italiano buscó la opción de vender el pase del jugador, que regresaba como campeón de la Copa Centenario con Chile. Durante la pretemporada 2016-17 los principales equipos interesados en contar con Isla fueron el Sevilla y el Cagliari. Finalmente, el club de la región de Cerdeña se hizo con sus servicios por tres años tras pagar cerca de €4 millones a Juventus. Su primer partido oficial en su regreso a Italia fue el 15 de agosto de 2016 en la victoria por 5-1 contra el SPAL en Copa Italia.