In der Saison 1998/99 gewann Yokoyama bei den Winter-Asienspiele 1999 in Gangwon jeweils die Silbermedaille über 10 km Freistil und mit der Staffel und die Goldmedaille über 5 km klassisch und belegte bei den nordischen Skiweltmeisterschaften 1999 in Ramsau am Dachstein den 48. Platz über 15 km Freistil, den 38. Rang in der Verfolgung und den 27. Platz über 5 km klassisch. Zudem errang sie dort zusammen mit Tomomi Otaka, Kumiko Yokoyama und Midori Furusawa den 12. Platz in der Staffel. In der folgenden Saison kam sie achtmal in die Punkteränge und erreichte damit den 41. Platz im Gesamtweltcup, ihr bis dahin bestes Gesamtergebnis. Ihre besten Resultate bei den nordischen Skiweltmeisterschaften 2001 in Lahti waren der 22. Platz über 10 km klassisch und der zehnte Rang mit der Staffel und bei den Olympischen Winterspielen im Februar 2002 in Salt Lake City der 22. Platz über 30 km klassisch und zusammen mit Kanoko Goto, Madoka Natsumi und Nobuko Fukuda der zehnte Rang in der Staffel. Zu Beginn der Saison 2002/03 erreichte sie in Kiruna mit dem zehnten Platz über 5 km Freistil ihre beste Einzelplatzierung im Weltcup. Es folgten fünf Ergebnisse in den Punkterängen, darunter Platz 11 über 10 km Freistil in Nové Město und errang damit den 41. Platz im Gesamtweltcup. Im Februar 2003 holte sie bei den Winter-Asienspielen in der Präfektur Aomori, nach Platz sieben über 5 km klassisch und Rang fünf über 10 km Freistil, die Silbermedaille mit der Staffel und lief bei den nordischen Skiweltmeisterschaften im Val di Fiemme auf den 32. Platz im Skiathlon, auf den 30. Rang über 10 km klassisch und auf den 19. Platz im 15-km-Massenstartrennen. Zudem errang sie dort den 12. Platz mit der Staffel.