Pada tahun 1678, Galdan menerima gelar Boshogtu Khan dari Dalai Lama. Hal ini memastikan Zunghar sebagai penguasa baru suku-suku Oirat. Setelah kematian Galdan Boshogtu Khan dan Tsewang Rabtan, Kekhanan Zunghar mulai mengalami kemunduran, dan akhirnya dianeksasi oleh Dinasti Qing pada 1756-59 dalam perang Dzungar-Qing.