作戦終了後、第一航空艦隊では夕闇迫るインド洋上の飛行甲板に整列して、戦死した戦友のために一分間の黙とうを捧げた後、進路を東にとって内地に帰還した。途中、第五航空戦隊（空母〈瑞鶴、翔鶴〉、警戒艦〈萩風、舞風、秋雲〉）はMO作戦のため台湾に向けて分離した。五航戦はドーリットル空襲に対処したあと兵力を再編してMO機動部隊（本隊〔第五戦隊〈妙高、羽黒〉、第7駆逐隊1小隊〈潮、曙〉〕、航空部隊〔五航戦〈瑞鶴、翔鶴〉、第27駆逐隊〈時雨、白露、有明、夕暮〉〕、補給部隊〔東邦丸〕）となり、南洋部隊（指揮官井上成美第四艦隊司令長官）に編入されて珊瑚海へむかった（珊瑚海海戦）。