Martín se mantuvo con el mismo equipo para el 2016. Esta temporada consiguió su primer podio en el mundial en el Gran Premio de la República Checa, donde terminó segundo detrás del británico John McPhee. Además en esta temporada se vio obligado a perderse el Gran Premio de los Países Bajos debido a tres fracturas distintas en su mano derecha ocurridas en el Gran Premio de Cataluña y el Gran Premio de San Marino debido a la fractura del quinto metatarsiano del pie derecho ocurrida en la clasifiacción del gran premio. Terminó la temporada en el decimosexto lugar con 72 puntos.