Zur &lt;a href="3.%20Fu%C3%9Fball-Liga%202021/22"&gt;Saison 2021/22&lt;/a&gt; wechselte Papadopoulos zur zweiten Mannschaft von Borussia Dortmund, die zuvor in die 3. Liga aufgestiegen war. Da während der Sommervorbereitung diverse EM-Teilnehmer fehlten, darunter die Innenverteidiger Manuel Akanji und Mats Hummels, absolvierte Papadopoulos diese unter deren neuem Trainer Marco Rose mit der ersten Mannschaft. In den meisten Testspielen bildete der Defensivspieler gemeinsam mit Lennard Maloney, der ebenfalls von der U23 rekrutiert worden war, die zentrale Verteidigung. Da Hummels beim 3:0-Sieg in der ersten Runde des DFB-Pokals gegen den Drittligisten SV Wehen Wiesbaden weiterhin nicht zur Verfügung stand, spielte Papadopoulos neben Akanji in der Innenverteidigung. Teamintern hatte der Aushilfsverteidiger die zweitmeisten Ballkontakte und fing die meisten gegnerischen Bälle ab. Eine Woche später folgte sein Debüt in der Bundesliga als Einwechselspieler.