Однако продержался Напоут на этих должностях лишь до декабря того же года, когда волна коррупционного скандала дошла и до него. Напоут, находившийся в Цюрихе, был арестован швейцарской полицией по запросу властей США 2 декабря. Чиновника обвинили в получении взяток от телекомпании Datisa в 2013 году. Кроме того, вопросы вызвало распределение 100 млн долларов между руководителями южноамериканских ассоциаций за права на трансляцию Кубка Америки столетия, который был запланирован и проведён в 2016 году в США. Напоуту полагалось 7,5 млн долларов из этой суммы. Парагваец был обвинён в отмывании денег, создании преступного сообщества и коррупции.