Zur Saison 2011/12 wurde Granato als Cheftrainer für das USA Hockey National Team Development Program (NTDP) verpflichtet, die zentrale Talenteschmiede des US-amerikanischen Verbandes USA Hockey. In den fünf Jahren, in denen er diese Funktion innehatte, nahm er mit den U17- und U18-Nationalmannschaften an zahlreichen internationalen Turnieren teil, wobei die Juniorenteams eine Reihe von Erfolgen feierten. Bei World U-17 Hockey Challenges gewann man eine Silber- und eine Goldmedaille in den Jahren 2012 und Januar 2014, während in ähnlicher Weise eine Silber- und eine Goldmedaille bei den U18-Weltmeisterschaften 2013 und 2015 folgten. Außerdem nahm er als Assistenztrainer mit der A-Nationalmannschaft der USA an den Weltmeisterschaften 2014 und 2018 teil, wobei 2018 eine Bronzemedaille gewonnen wurde.