Bürgermeister Reinhard Boos, der als Verächter der Religion galt, hatte nicht nur eine antisemitische Einstellung entsprechend der NS-Rassenlehre, sondern war auch gegenüber dem Judentum als Religion besonders feindlich eingestellt. Viele damals in Lörrach wohnende Juden flohen bereits im Jahr der „Machtergreifung“ Hitlers 1933 in die Schweiz. 1935 verloren die ansässigen Juden durch die Nürnberger Gesetze ihre Bürgerrechte. Der als Reichskristallnacht bekannte 9. November 1938 brachte auch in Lörrach dem jüdischen Geschäftsleben das Ende. Zwischen 30 und 40 Männer, darunter der damalige Leiter des städtischen Werkhofs und seine Bediensteten, verschafften sich Zutritt in die rund 130 Jahre alte Synagoge und zertrümmerten die Einrichtung. Die verwüstete Synagoge musste später abgebrochen werden. Die Stadt versuchte, die Zerstörung und den anschließenden Abriss zu relativieren, indem sie den Zustand des Dachstuhls als ohnehin renovierungsbedürftig darstellte.