À la suite du débarquement américain en Afrique du Nord, le , les troupes allemandes franchissent la ligne de démarcation et Marseille se retrouve occupée le , comme le reste de la Zone libre. La ville souffre grandement de l'occupation et en particulier, lors de la Rafle de Marseille, le quartier du Panier au nord du Vieux-Port qualifié de « quartier criminel » par les nazis. Dans la nuit du , plusieurs milliers de personnes sont arrêtées et deux jours plus tard, le , le général SS Oberg, assisté du préfet René Bousquet, ordonne aux habitants du quartier du Vieux-Port d'évacuer leur domicile dans les deux heures, avec de bagages. sont expulsées. Dans les deux semaines qui suivent, sont dynamités, laissant un champ de ruines jusqu'à la Libération. Marseille subit également plusieurs alertes aériennes. Le bombardement américain du est particulièrement dévastateur et cause la mort de plus de , en blessant environ . Près de des troupes d'occupation trouvèrent également la mort.