Regensburška sinagoga je bila uničena na Kristalno noč leta 1938. Med vojno sta se v Regensburgu nahajali tovarna lovskih letal Messerschmitt Bf 109 in rafinerija nafte, ki so ju leta 1943 bombandirale zaveznice. Kljub bombandiranju je Regensburg utrpel majhno škodo, srednjeveško mesto središče pa je ostalo skoraj nedotaknjeno in danes sodi na seznam UNESCOve kulturne dediščine. Počasna gospodarska okrevanja po vojni so zagotovila, da zgodovinskih stavb niso porušili in zamenjali z novimi.