Nell'aprile del 1898, mentre la guerra d'indipendenza cubana e la rivoluzione filippina erano ancora in atto, gli Stati Uniti approfittarono dell'incidente diplomatico nato dall'affondamento del Maine per dichiarare guerra alla Spagna, dando inizio alla Guerra ispano-americana. In soli quattro mesi le forze armate statunitensi sbaragliarono l'esercito spagnolo, ponendo fine al conflitto. Il Trattato di Parigi del 1898, infine, non sancì l'indipendenza di Cuba, Porto Rico, Guam e Filippine, ma sancì il loro passaggio agli Stati Uniti. L'accordo non venne ovviamente accettato dal neonato Governo filippino che, dopo l'arrivo a Manila di una flotta statunitense, il 2 giugno 1899 dichiarò guerra agli Stati Uniti. La Guerra filippino-americana causò ingenti perdite umane ai filippini; il leader filippino Emilio Aguinaldo fu catturato nel 1901 e il Governo degli Stati Uniti dichiarò il conflitto ufficialmente concluso nel 1902. I leader filippini, per la maggior parte, dichiararono fedeltà agli statunitensi, anche se una guerriglia strisciante continuò fino al 1913.