Em maio de 1944, o capitão Asakura foi promovido a contra-almirante e "Musashi" partiu de Kure para Okinawa em 10 de maio, depois para Tawi-Tawi em 12 de maio. Foi designado para a 1ª Frota Móvel, sob o comando do vice-almirante Jisaburō Ozawa, com sua nau irmã. Em 10 de junho, os navios de guerra partiram de Tawi-Tawi para Bacan, sob o comando do vice-almirante Matome Ugaki, em preparação para a "Operação Kon", um contra-ataque planejado contra a invasão americana de Biak. Dois dias depois, quando Ugaki chegou a notícia de ataques americanos a Saipan, sua força foi desviada para as Ilhas Marianas. Depois de se encontrarem com a força principal de Ozawa em 16 de junho, os navios de guerra foram designados para a 2ª Frota do Vice-Almirante Takeo Kurita. Durante a Batalha do Mar das Filipinas, "Musashi" não foi atacado. Após a derrota desastrosa do Japão na batalha (que ficou conhecida como "The Great Marianas Turkey Shoot"), a Segunda Frota retornou ao Japão. Em 8 de julho, "Musashi" e sua nau irmã embarcaram 3.522 homens e equipamentos do 106º Regimento de Infantaria do Exército da 49ª Divisão de Infantaria e navegaram para a Ilha Lingga, onde chegaram em 17 de julho.