Пізніше, Єспер грав ключову роль в команді Мортена Ольсена, зігравши у всіх чотирьох матчах збірної на чемпіонаті світу 2002 року, а також забивши переможний гол в ворота збірної Норвегії, що дозволив кваліфікуватися Данії на чемпіонат Європи 2004 року в Поругаліі, де він взяв участь в трьох матчах своєї команди, пропустивши лише одну гру через смерть матері.