Ab 15. Dezember 1863 war Colomier Führer der Artillerie des kombinierten Armeekorps im Krieg gegen Dänemark. In dieser Funktion führte er die preußische Feldartillerie im Gefecht von Missunde und führte die gesamte preußisch-österreichische Artillerie bei Belagerung und Sturm der Düppeler Schanzen sowie beim Übergang nach Alsen. Für die erfolgreiche Erstürmung der Düppeler Schanzen, die nach Colomiers Angriffsplan erfolgte, wurde er mit dem Orden Pour le Mérite ausgezeichnet, vorzugsweise zum Generalmajor befördert und anlässlich des siegreichen Einmarsches der Truppen in Berlin am 7. Dezember 1864 in den erblichen preußischen Adelsstand erhoben.