En la temporada 2011-12 regresó al Atlético de Madrid recibiendo el alta de su lesión algo más de seis meses después de que sucediera. El 17 de agosto de 2011 volvió a entrar en una convocatoria aunque finalmente fue descartado viendo el partido desde la grada. El 15 de septiembre, volvió a estar en un banquillo en el primer encuentro de la fase de grupos de la Europa League ante el Celtic de Glasgow. Volvió a los terrenos de juego el 26 de noviembre cuando saltó al Santiago Bernabéu en el derbi madrileño cuando Thibaut Courtois fue expulsado. Encajó cuatro goles siendo el resultado del partido cuatro a uno favorable al Madrid. El 9 de mayo de 2012 ganó su segunda Europa League en Bucarest frente al Athletic derrotando su equipo a éste por tres a cero. El 31 de agosto de 2012 consiguió su segunda Supercopa de Europa al vencer al Chelsea, campeón de la Champions League, por cuatro goles a uno.