À la naissance de la première République portugaise, en 1911, il dessina le drapeau et de 1914 à 1927 il a été directeur du Musée de l'art moderne de Lisbonne (Musée du Chiado – MNAC). Una partie de ses œuvres est conservée au Museu nacional António Soares dos Reis, de Porto. Dans l'exposition, organisée au Musée Chiado - du 2 décembre 2010 au 27 mars 2011 - pour célébrer le premier centenaire de la République portugaise, étaient présentes des œuvres de Columbano Bordalo Pinheiro.