托马斯·加里格·马萨里克勋章最早由捷克和斯洛伐克聯邦共和國政府于1990年建立。当时正值天鵝絨革命后的捷克斯洛伐克社会主义共和国政权垮台时期。1994年，随着捷克与斯洛伐克的分离，该勋章被捷克共和国政府重新建立。