Матильда Геттер сотрудничала с польским движением сопротивления, передавая подполью фальшивые документы для лиц, преследуемых нацистскими оккупантами. В детских домах конгрегации в Анине, Бялоленке, Хотомуве, Плудахе и Варшаве настоятельница скрывала детей евреев из Варшавского гетто. В 1942 году она приняла решение, что институт примет каждого ребенка, нуждающегося в помощи. Во время оккупации монахини спасли от 250 до 550 детей из гетто. Матильда Геттер рисковала своей жизнью, принимая их в детские дома и скрывая взрослых евреев под видом работников института. Она взяла на себя ответственность за подготовку фальшивых свидетельств о рождении. Спасённые ею дети называли её «матушкой».