Eugen a fost educat de Johann Georg Schlosser, un frate al lui Johann Wolfgang von Goethe. Prințul a intrat în armată prusacă. În Războiul celei de-a Patra Coaliții, în Bătălia de la Jena-Auerstedt el a comandat cavaleria de rezervă a armatei prusace. La 18 octombrie 1806 a luptat în Bătălia de la Halle unde a fost învins de mareșalul Jean Bernadotte (mai târziu a devenit regele Carol al XIV-lea Ioan al Suediei).