Le ministre des Affaires étrangères de la Tchécoslovaquie a fondé l'Institut des Relations Internationales en 1970 pour remplacer l'Institut pour la Politique Internationale et l’Économie établi en 1957. Le monument historique nommé “The House of the White Horse", (en français “La Maison du Cheval Blanc”) qui se trouve rue Nerudova à Malá Strana, est devenu son siège et il l’est resté jusqu’à présent. Pendant les années 1970, la liberté de la société tchèque a été réduite à cause d’une augmentation progressive de la pression idéologique, du contrôle gouvernemental et de la censure. Les changements clés dans le fonctionnement de l'IRI ont eu lieu après les évènements du 1989. Pour l'IRI la Révolution de Velours a été un processus pour devenir une vraie institution scientifique indépendante. Dans les années suivantes, l'IRI a subi une perte d’idéologie et une dépolitisation radicale, contraposées à une mise en relief de ses relations actives avec les autres pays. Outre les nouveaux objectifs fixés, l'IRI a poursuivi son soutien à la politique étrangère de la nouvelle République tchèque. En 2007 l'IRI a été transformé dans une institution de recherche publique, et des éléments d’autonomie ont été intégrés à son organisation.