Durante la Guerra Civil salvadoreña, Canadá aceptó a miles de refugiados salvadoreños que huían de la guerra. En 1981, Canadá cortó la ayuda a El Salvador debido a las preocupaciones sobre los escuadrones de la muerte en el país. La ayuda fue renovada en 1985. Después de la firma de los Acuerdos de Paz de Chapultepec en enero de 1992; Canadá prometió hasta $5 millones de dólares para el alivio de la pobreza, la promoción de los derechos humanos y la democratización en El Salvador.