25 июля 1861 года армия Шенандоа была реорганизована и в итоге 6-й северокаролинский попал в 3-ю бригаду II корпуса Потомакской армии. Этой бригадой командовал генерал Уильям Уайтинг. 15 августа командиром полка стал Уильям Дурси Пендер, который возглавлял полк до весны 1862 и командовал им во время сражения при Севен-Пайнс. После сражения полковник Пендер стал бригадным генералом, а Исаак Эвери стал подполковником, а через две недели, 18 июня, Эвери было присвоено звание полковника 6-го северокаролинского. Командование бригадой весной 1862 года перешло к Эвандеру Лоу.