Soupçonné de double jeu par ses chefs vichystes et muté à Sétif, il en revient pour participer avec les responsables du réseau AFR à l'ultime préparation des opérations destinées à faciliter de l'intérieur le débarquement anglo-saxon en Afrique du Nord qui est au départ prévu pour s'étendre jusqu'à Bône (département de Constantine ; Annaba aujourd'hui). Il travaille alors de longue date avec José Aboulker. Dans la nuit du débarquement, le , il organise l'installation des résistants au commissariat central d'Alger, qui sera décoré de la Médaille de Résistance. Avec l'aide d'une grande majorité des agents, il y établira le PC de la résistance. Il fera incarcérer là tous les adversaires vichystes interpellés par les Volontaires de place ou les policiers. Il fera aussi du Commissariat le central radio au profit des résistants, ayant fait couper avec son collègue Bringard toutes les autres communications téléphoniques de la ville. En , à la suite de l'exécution de l'amiral Darlan, il contribue à brouiller l'enquête et manque de peu de se faire fusiller par les giraudistes aux ordres du général Bergeret : arrêté par les gardes, il sera déporté à Laghouat, puis libéré grâce au colonel Paillole. Il créera alors à Guyotville une école du Renseignement. Mobilisé au début de 1943, il fait du renseignement lors de la campagne de Tunisie, puis lors du débarquement en Corse. En , De Gaulle le décore de la médaille de la Résistance. En 1944, il est détaché à la Direction générale des services spéciaux comme conseiller de Jacques Soustelle, et débarque en France avec le régiment de choc.