Schubert stand erstmals in einer deutschen Auswahl bei der U18-Junioren-Weltmeisterschaft 2000. Es folgten zwei weitere Einsätze im Juniorenbereich bei den U20-Junioren-Weltmeisterschaften 2001 und 2002. Für die A-Nationalmannschaft gab er sein internationales Debüt bei der Weltmeisterschaft 2001. Weitere Nominierungen erfolgten zu den Weltmeisterschaften 2002, 2005, 2008, 2009 und 2012, den Olympischen Winterspielen 2002 und 2006 und dem World Cup of Hockey 2004.