Поборски је наступао још и на Европским првенствима 2000. и 2004. када је Чешка Република стигла до полуфинала, и на Светском првенству 2006. Укупно је одиграо 118 мечева и постигао 8 голова за Чешку Републику, и тренутни је рекордер по броју одиграних утакмица за репрезентацију.