T2K a commencé à prendre des données de neutrinos pour une analyse de physique en , initialement avec un détecteur ND280 incomplet, puis, à partir de , dans sa configuration finale. La prise de données a été interrompue pendant un an en raison du Séisme de la côte Pacifique du Tohoku en . Depuis, la puissance du faisceau de proton, et par conséquent l’intensité du faisceau de neutrinos n’a cessé d’augmenter, atteignant en une puissance de 515 kW et un total de 3.64×1021 protons accumulés sur la cible , avec 55% de données en mode neutrino et 45% en mode anti-neutrino.