Nach dem Überfall auf Polen wurde Wille während der Deutschen Besetzung Polens „Generalreferent für politische Strafsachen“. Ab Ende Oktober 1939 war Wille durchgehend bis Anfang 1945 Hauptabteilungsleiter des Hauptamtes Justiz bei der Regierung des Generalgouvernements (GG). Ab Mitte Mai 1942 führte er in dieser Funktion den Titel "Präsident des Hauptamts Justiz".