Il 2 giugno 1796, con l'approssimarsi del pericolo dovuto all'inizio della campagna d'invasione dell'Italia da parte delle truppe francesi al comando del generale Napoleone Bonaparte il Senato veneziano istituì la carica di Provveditore alle Lagune e ai Lidi che fu affidata a Jacopo Nani. Condulmer gli lasciò il comando dell'Armata Grossa di stanza a Corfù, e il 23 giugno 1796 affiancò il Nani in qualità di luogotenente.