Postavena byla v roce 1880 podle plánů architekta Alwina Köhlera v orientálním slohu, jako eklektická vysoká stavba s ženskou galerií, a její stavba byla financovaná ze zdrojů členů obce. Počátkem 20. století byla budova rozšířena a doplněna o varhany od firmy Rieger. Koncem září 1938 bylo Ústí nad Labem společně se Sudety připojeno k Německé říši. Synagoga sice přečkala Křišťálovou noc, nakonec však byla 31. prosince 1938 vypálena. Zbyly jen obvodové zdi a přízemí zakoupila v roce 1940 řeznická firma, která zde zbudovala výrobnu a řeznické učiliště. To bylo při bombardování města v roce 1945 částečně poškozeno. V poválečném období zřídil místní městský národní výbor v 50. letech v původním sklepě synagogy veřejné záchodky. K roku 2012 místo synagogy nic nepřipomíná. Do roku 2006 stávala v blízkosti původní lokality synagogy tzv. nová tržnice a od roku 2009 se na tomto místě nachází obchodní centrum Forum.