11 января 1825 года назначен штаб-офицером по искусственной части при Киевском арсенале. В 1826 году Эйзен-фон-Шварценберг привлекался к следствию по делу декабристов, его принадлежность к Южному обществу не подтвердилась. Подозревался в принадлежности к Киевскому тайному обществу.