Thời trẻ, Schubert học trường Trung học Chính quy ("Gymnasium") ở Ostrowo và vào ngày 1 tháng 10 năm 1865, ông nhập ngũ quân đội Phổ vào ngày 1 tháng 10 năm 1865 với tư cách là lính tình nguyện một năm ("Einjährig-Freiwilliger") trong Tiểu đoàn Công binh số 7 tại Koblenz. Cùng với đơn vị này, ông đã tham gia cuộc Chiến tranh Bảy tuần năm 1866 với cấp bậc Hạ sĩ và chiến đấu trong các trận đánh lớn ở Münchengrätz và Königgrätz. Đến ngày 9 tháng 11 năm 1867, ông được đổi vào Cục Thanh tra Công binh 3 với quân hàm Thiếu úy. Không lâu sau đó, kể từ ngày 1 tháng 10 năm 1868 cho đến ngày 16 tháng 7 năm 1870, ông học tại Trường Kỹ thuật và Pháo binh Tổng hợp ("Vereinigte Artillerie- und Ingenieurschule"). Trong cuộc tổng động viên quân đội khi Chiến tranh Pháp-Đức (1870 – 1871), Schubert được thuyên chuyển vào Tiểu đoàn Công binh số 11 Tuyển hầu quốc Hessen. Với tiểu đoàn này, ông đã tham chiến trong các trận đánh lớn ở Wissembourg, Wœrth, Sedan và cả cuộc vây hãm Paris. Schubert bị thương tại Sedan và để ghi nhận những thành tích của ông trong cuộc chiến, ông được tặng thưởng Huân chương Thập tự Sắt hạng II vào ngày 26 tháng 9 năm 1870.