Diseñado especialmente para operaciones en las aguas de la costa de Trípoli, "Vixen se" unió al escuadrón del comodoro Edward Preble para el servicio en la Primera Guerra de Berbería (1801 – 1805) inmediatamente después de su puesta en servicio. Zarpó de Baltimore el 3 de agosto de 1803 bajo el mando del teniente John Smith y se desplegó con el escuadrón frente a Gibraltar el 14 de septiembre. El comodoro Preble envió a "Vixen" y la fragata en octubre para establecer un bloqueo de Trípoli. Sin embargo, "Vixen" pronto partió en busca de dos buques de guerra tripolitanos y no estuvo presente cuando "Filadelfia" aterrizó y fue capturada el 30 de septiembre. En cambio, llevó los despachos que anunciaban la pérdida de la fragata y el encarcelamiento del capitán William Bainbridge, sus oficiales y la tripulación de regreso a Gibraltar en diciembre.