Erste internationale Erfahrungen sammelte Bonface Ontuga Mweresa bei den Juniorenweltmeisterschaften 2012 in Barcelona, bei denen er mit 46,50 s den siebten Platz im 400-Meter-Lauf belegte. Anschließend nahm er mit der kenianischen 4-mal-400-Meter-Staffel an den Olympischen Spielen in London teil und wurde dort im Vorlauf wegen einer Kollision disqualifiziert. 2015 nahm er an den World Relays auf den Bahamas teil und wurde dort mit der 4-mal-400-Meter-Staffel erneut im B-Finale disqualifiziert. Bei den Afrikaspielen in Brazzaville gewann er im Einzelbewerb über 400 Meter in 45,01 s die Silbermedaille hinter dem Botswaner Isaac Makwala. Zudem gewann er mit der Staffel in 3:00,34 min die Goldmedaille. 2016 qualifizierte er sich für die Hallenweltmeisterschaften in Portland, bei denen er im Finale mit 46,86 s den fünften Platz belegte. Bei den Afrikameisterschaften in Durban gewann er in 3:04,25 min die Silbermedaille mit der Staffel hinter Botswana.