Choupo-Moting vaihtoi aikuistasolle Kamerunin riveihin, ja hän pelasi ensimmäisen ottelunsa Kamerunin jalkapallomaajoukkueessa vuonna 2010. Hänet valittiin samana vuonna myös 23-henkiseen miehistöön maailmanmestaruuskilpailuihin, joissa hän pelasi kahdessa ottelussa. Choupo-Moting kuului myös Kamerunin joukkueeseen vuoden 2014 MM-kilpailuissa. Hän pelasi Kamerunin kaikissa kolmessa ottelussa. Afrikan-mestaruuskilpailuissa hän on pelannut kolme ottelua 2015 ja neljä ottelua 2019.