Dopo aver disputato alcune stagioni nelle serie minori giovanili dell'Ontario Giroux nel Draft 1994 fu scelto all'ottavo giro dai Philadelphia Flyers. Nelle quattro stagioni successive studio presso la Università di Yale, militando nella ECAC Hockey. Si impose come principale difensore della squadra, conquistando all'ultimo anno alcuni trofei individuali, incluso quello di giocatore dell'anno.