Le , Ramiro Funes Mori honore sa première sélection avec l'équipe d'Argentine lors d'un match amical face au Salvador (victoire 0-2). Régulièrement titularisé par le sélectionneur Gerardo Martino, il participe à l'intégralité de la campagne de l"'Albiceleste" lors de la Copa América 2016 jusqu'à la finale perdue face au Chili à l'issue de la séance des tirs au but. Il conserve sa place de titulaire au sein de la défense centrale à la suite de l'arrivée du nouveau sélectionneur Edgardo Bauza et inscrit son premier but avec l'Argentine le à l'occasion du match comptant pour les face au Pérou (2-2).