Emanuele fait ses débuts en athlétisme à l'âge de 13 ans. Grâce au soutien de son coach Adriano Santi, il se passionne pour ce sport qu'il prend d'abord comme un jeu. Il se spécialise en cross-country et en course en montagne. En 1992, Il devient champion cadet d'Italie de course en montagne, puis décroche une quatrième place en junior lors du Trophée mondial de course en montagne 1995 à Édimbourg. Cette année, il prend également part aux championnats du monde de cross-country à Durham où il se classe .