1939 році Г'юїтт став контрадміралом і командував оперативними групами Атлантичного флоту в нейтральних патрулях та конвоях з 1941 року до того, як у квітні 1942 року став командувачем амфібійними силами Атлантичного флоту. У листопаді 1942 року очолював американські військово-морські сили, що висаджувалися у Марокко та Алжирі під час операції «Смолоскип». Командував американськими військово-морськими силами в битві при Касабланці, перебуваючи на флагманському кораблі «Огаста». Пізніше командував Західною оперативною групою під час вторгнення на Сицилію, і командував усіма десантними військами союзників під час вторгнення в Італію, а пізніше в морській десантній операції в Анціо та вторгненні на південь Франції.