Repêché au neuvième tour par les Flyers de Philadelphie lors du repêchage de 1985 alors qu'il évolue pour les Generals d'Oshawa de la Ligue de hockey de l'Ontario, Murphy poursuit son cheminement au niveau junior avec ces derniers jusqu'en 1987, année où il aide les Generals à atteindre la finale de la Coupe Memorial.