Em maio de 2019, Chukwueze foi convidado a representar a seleção principal da Nigéria na Campeonato das Nações Africanas e a seleção Sub-20 na Copa do Mundo Sub-20. No entanto, o seu clube Villarreal disse que só poderia jogar em um dos torneios. Ele fez parte da seleção nigeriana para a Copa das Nações Africanas de 2019, sediada no Egito. Ele marcou seu primeiro gol pela seleção principal na vitória por 2 a 1 sobre a África do Sul, nas quartas de final.