Seit 1986 wurde Flandin im Biathlon-Weltcup eingesetzt und er lief 1987 das erste Mal für sein Team bei Weltmeisterschaften. In Lake Placid wurde er im Einzel 13. und im Sprint 20. Bei den nächsten Weltmeisterschaften 1989 belegt er im Einzel Platz 25 und im Sprint Platz 36. Die für Flandin erfolgreichsten Weltmeisterschaften waren die wegen Wetterkapriolen über mehrere Austragungsorte verteilten Titelkämpfe 1990. Im Einzel in Minsk noch Achter, gewann er mit der Mannschaft (Dumont, Bouthiaux, Flandin, Gerbier) in Oslo seine erste Medaille, eine bronzene. Zwei Tage später beim Sprint über 7,5 km verpasste er den Bronzerang trotz fehlerfreiem Schießen um 16 Sekunden, dieser vierte Rang blieb insgesamt seine beste Platzierung in einem Solorennen bei Weltmeisterschaften. Beim erneut verschobenen Staffelrennen, das letztendlich am 18. März 1990 in Kontiolahti ausgetragen wurde, wurde er an dritter Stelle laufend mit Christian Dumont, Xavier Blond und Thierry Gerbier Vizeweltmeister hinter Überraschungssieger Italien und vor der letztmals antretenden Staffel der DDR. In Lahti 1991 war die französische Staffel in der Besetzung Blond, Marguet, Dumont und Flandin Sechste. Die nächsten Weltmeisterschaften lief Flandin 1995, beim Sieg seines Landsmanns Patrice Bailly-Salins im Einzel belegte er Rang sieben, im Sprint wurde es Rang 16 und in der Staffel gewann er zum Abschluss erneut den Vizeweltmeistertitel, lediglich dreizehn Sekunden lagen die Franzosen gegen Deutschland zurück. Die Staffel lief in der Besetzung Lionel Laurent, Patrice Bailly-Salins, Thierry Dusserre und Hervé Flandin. Seinen letzten Auftritt bei Weltmeisterschaften hatte er 1996 in Ruhpolding, dort platzierte er sich im Sprint als 45. und mit der Staffel (Perrot, Poirée, Dusserre, Flandin) auf Rang fünf.