Die Insel wurde 1185 von den Normannen erobert und gehörte anschließend zur Pfalzgrafschaft Kefalonia und Zakynthos des Margaritos von Brindisi. Nach dessen Blendung 1194 fiel sie an seinen Schwiegersohn Maio Orsini, der sich schließlich 1209 Venedig unterwarf. In Anlehnung an die Nachbarinsel Kefalonia, mit der Ithaka kulturell verbunden ist, wurde die Insel von den Venezianern "Cefalogna Piccola" genannt. Große Schäden richtete das Erdbeben im August 1953 an.