После прихода А. Гитлера к власти в 1933 году над городом был установлен контроль НСДАП. В 1938 году Эрфурт относился к самым большим гарнизонным городам Германии. Во время всегерманского еврейского погрома в ночь с 9 на 10 ноября 1938 года была сожжена Большая синагога и депортировано примерно 800 еврейских жителей. Между 1939 и 1945 годами на военных предприятиях города принудительно трудились 10 000 — 15 000 военнопленных, а также женщины и мужчины из различных захваченных Германией стран.