Nel 1794 morì Lorenzo Taverna e gli succedettero dapprima il primogenito Costanzo e poco dopo il figlio minore Giacomo. Quest'ultimo fu testimone delle imprese di Napoleone Bonaparte, che dal 1796 guidò la campagna d'Italia, alla quale seguì la firma del trattato di Campoformio (ottobre 1797). Con tale documento venne riconosciuta l'esistenza della repubblica Cisalpina (comprendente anche la Lombardia) e vennero annullati i diritti feudali in Italia: i Conti Taverna persero ogni privilegio con un editto emanato il 20 luglio 1798. Dopo la conquista da parte di Napoleone, alcune delle storiche confraternite vennero accorpate e per questo nacque la Confraternita del SS. Sacramento, ovvero l'unione della confraternita presso la chiesa del Carmine con quelle dei Santi Rocco e Cristoforo.