Trong thời kỳ Đức chiếm đóng vùng đất của Séc, tất cả tài sản của cộng đồng Do Thái ở Séc đều cất giữ trong hội đường. Sau Thế chiến thứ hai, hội đường đã trở thành nhà kho của Bảo tàng Do Thái ở Praha. Trong những năm 60, hội đường được khôi phục lại. Sau đó hội đường Do Thái đóng cửa vì tình trạng xuống cấp tồi tệ và gần như không có khả năng cải thiện được vì thiếu hụt tài chính. Cuộc cách mạng Nhung mở ra cơ hội cho việc tu sửa hội đường có thể thực hiện và hội đường Do Thái sau đó được mở cửa cho du khách vào năm 1996. Việc tái mở cửa hội đường là một bước ngoặt lịch sử của xã hội Do Thái ở vùng đất Séc từ đầu (thế kỷ 9) cho đến Thời kỳ Khai sáng. Sau lần phục hồi hội đường Do Thái Maisel gần đây, các cuộc triển lãm ngày càng trở nên phong phú bởi các yếu tố hiện đại và tương tác được thêm vào, tuy nhiên, giá trị cốt lõi của nó vẫn được giữ nguyên.