Nach dem Ausbruch der Unruhen und der Sezession des Nordteils von Mali unter dem Namen Azawad wurde Diarra durch die seit dem Putsch im März 2012 regierende Militärregierung am 17. April 2012 zum Premierminister einer malischen Übergangsregierung ernannt. Die von ihm gebildete Regierung der nationalen Einheit hatte als erstes Ziel die Wiederherstellung der staatlichen Ordnung in allen Teilen des Landes und die anschließende Abhaltung von freien Wahlen.