Pred začetkom , je Honda najavila svoj odhod iz karavane. Zatem je ekipo odkupil Ross Brawn ter jo poimenoval Brawn GP F1 Team. Uspelo jim je zadržati oba dirkača; Rubensa Barrichella in Buttna. Na prvi dirki sezone, Veliki nagradi Avstralije, je Button osvojil najboljši štartni položaj in nato tudi zelo suvereno zmagal (vodil je od začetka do konca). Na Veliki nagradi Malezije 2009 je ponovil uspeh in po ¾ dirke zmagal. Dirka je bila prekinjena zaradi močnega tropskega naliva, zato so dirkači dobili samo polovico točk, kot pa bi jih sicer. Na dirki za Veliko nagrado Kitajske, zaznamovani z močnim dežjem skozi celotno dirko, je Button dosegel tretje mesto. Za tem je dosegel še štiri zaporedne zmage na dirkah za , , in . V drugem delu sezone je padla forma tako moštvu Brawn, kot tudi Buttonu, ki je na zadnjih desetih dirkah sezone dosegel le še dve uvrstitvi na stopničke, več točk je v tem delu zbral tudi njegov moštveni kolega Rubens Barrichello. Barrichello in Sebastian Vettel iz moštva Red Bull Racing sta bila do predzadnje dirke za v igri za naslov prvaka, ko si je Button naslov zagotovil s petim mestom, moštvo Brawna pa je osvojilo tudi konstruktorski naslov prvaka.