In de onmiddellijke nasleep van de Deepwater Horizon-olieramp in 2010 in de Golf van Mexico werd Kayyem belast met de supervisie over de samenwerking van alle betrokken instanties en de intergouvernementele aangelegenheden voor het National Incident Command. Zij gaf namens het Witte Huis en het ministerie van Binnenlandse Veiligheid leiding aan de diverse samenwerkende instanties en de interdisciplinaire staf bij het vinden van een antwoord op onvoorziene uitdagingen, waaronder publieke beveiliging, publiek engagement, milieubescherming, en juridische schikkingen. Voor haar werk ontving zij de hoogste civiele onderscheiding die de Coast Guard kent.