Pada tahun 2005, Trulli berpasangan dengan Ralf Schumacher di Toyota. Ia langsung mempersembahkan pole pertama bagi Toyota di AS. Namun ternyata posisi pole Trulli dicurigai dengan bahan bakar ringan yang bukan untuk lomba, dan besoknya ternyata seluruh pemakai ban Michelin (termasuk Toyota) mundur dari balapan dengan alasan keamanan. Di paruh pertama musim 2005, Trulli mempersembahkan podium untuk Toyota, tepatnya di Malaysia dan Bahrain namun kembali memasuki paruh musim kedua, Trulli kalah dari Ralf Schumacher yang hanya mempersembahkan podium di Hongaria.