Blessé en 1848, Jean Durand de Villers est promu officier de la Légion d'honneur le . Il est alors nommé chef de bataillon en 1851. Officier d'ordonnance du maréchal de Saint-Arnaud, il le suit en Crimée, se signale à la Bataille de l'Alma et, après la mort du maréchal, reste à l'état-major de Canrobert, puis à celui de Pétissier; Il participe au Siège de Sébastopol (1854). Promu lieutenant-colonel en 1855, Jean Durand de Villers est nommé chef d'état-major du génie.