Ab 1977 spielte Pappert in der Nationalmannschaft und absolvierte insgesamt 169 Länderspiele. Höhepunkt der internationalen Karriere war die Teilnahme als Mannschaftskapitän an den Olympischen Spielen 1984. Pappert wirkte in acht Spielen mit, erzielte 58 Punkte und belegte am Ende mit der deutschen Mannschaft den achten Rang. Außerdem nahm Pappert drei Mal an FIBA Europameisterschaftsendrunden teil: 1981 belegte er mit der Nationalmannschaft Rang zehn, 1983 Rang acht und 1987 Rang sechs. Bei der EM 1981 in der Tschechoslowakei war er mit 18,5 Punkten je Begegnung bester Korbjäger der bundesdeutschen Mannschaft und zwei Jahre später bei der EM in Frankreich zweitbester Punktesammler (14,9/Spiel) der BRD-Mannschaft hinter Detlef Schrempf. 1988 verabschiedete sich Pappert bei einem Turnier in Brasilien aus der Nationalmannschaft des DBB.