Blažek có trận ra mắt tuyển quốc gia vào ngày 29 tháng 3 năm 2000 trong một trận đấu giao hữu với tuyển Úc, kết thúc với chiến thắng 3–1. Tuy nhiên anh không thể chiếm suất bắt chính do chỉ là lựa chọn số hai sau Petr Čech. Anh nằm trong thành phần tuyển Séc dự cả Giải vô địch bóng đá châu Âu 2000 và Giải vô địch bóng đá châu Âu 2004, nhưng chỉ chơi một trận trong cả hai giải đấu trên. Anh cũng cùng tuyển Séc dự Giải vô địch bóng đá thế giới 2006.