Keene també s'ha implicat en l'organització de diversos matxs finals del Campionat del món. Va organitzar la primera meitat del Campionat del món de 1986 (matx de revenja) entre Kaspàrov i Kàrpov a Londres, un matx que va acabar generant pèrdues per la Federació Britànica d'Escacs (BCF) cosa que va provocar que en Keene dimitís del seu càrrec a l'organisme poc després. Va organitzar també el matx pel Campionat del món de 1933 de la PCA entre Kaspàrov i Nigel Short a Londres, in en fou un dels comentaristes oficials, conjuntament amb els Grans Mestres Jonathan Speelman i Daniel King. En Keene fou també la força instrumental rere 'Brain Games', que organitzà el matx pel Campionat del món clàssic de 2000 entre Kaspàrov i Vladímir Kràmnik. Després del match, però, va retenir el trofeu per compensar els diners que segons ell s'havia guanyat treballant per Brain Games: en Kràmnik no el va rebre fins al 2008. Brain Games posteriorment es va esfondrar en circumstàncies controvertides.