Sammetsrevolutionen i början av 1990-talet ledde till privatiseringar i Tjeckoslovakien och staten beslöt att ta in en utländsk partner i Škoda som därmed blev en del av Volkswagen-koncernen. Under Volkswagens ledning vidareutvecklades Škoda Favorit till 1990-talets storsäljare Škoda Felicia. Škoda har som en del av Volkswagen-koncernen dragit stor nytta av moderna komponenter som är gemensamma inom koncernen.