Во время Второй мировой войны Боуэр был в штабе воздушно-десантного корпуса в Северо-Западной Европе, участвовал в операции «Маркет Гарден». Участвовал в битве за Арнем в 1944 году в составе 1-го воздушно-десантного корпуса. В 1945 году командовал 1-й воздушно-десантной бригадой в Норвегии во время разоружения немецких частей. После войны командовал 6-й воздушно-десантной бригадой в Палестине с 1945 по 1946 годы и был комендантом Гамбурга с 1948 по 1949 годы.