Er begann seine internationale Karriere als Lead im Schweizer Team von Skip Roger Gulka beim Europäischen Olympischen Jugendfestival 2009, wo er die Goldmedaille gewann. Bei der Juniorenweltmeisterschaft 2010 war er als Ersatzspieler im Team von Peter de Cruz dabei. Die Schweizer gewannen nach einem Finalsieg gegen das schottische Team um Ally Fraser die Goldmedaille. Im darauffolgenden Jahr kam Märki mit dem Team de Cruz als Ersatzspieler wieder in das Finale, unterlag dort aber Schweden mit Skip Oskar Eriksson. 2012 führte Märki das Schweizer Juniorenteam als Skip; er kam mit seiner Mannschaft auf den sechsten Platz.