Ajdukiewicz war der Sohn einer k. k. Beamten. Er begann 1868 seine Ausbildung bei Władysław Łuszczkiewicz an der Akademie der Schönen Künste in Krakau. Später setzte er sein Studium an der Wiener Akademie und ab dem 30. Oktober 1873 in der Antikenklasse der Münchner Akademie fort. In München wurde er unter anderem durch Joseph T. Brandt und unter Otto Seitz und Alexander Wagner unterrichtet. 1874 trat er mit Szenen aus dem Polnischen Aufstand von 1863 an die Öffentlichkeit. Längere Studienreisen führten ihn nach Ägypten, Kleinasien und ins südliche Russland. 1877 stellte er Bilder mit einigen zu der Zeit sehr beliebten orientalischen Motiven aus, wie "Karwane", "Markt in Kairo" (1884), "Ufer des Nils" (1885) und "Gebet in der Wüste" (1888). 1879 malte er in Warschau Porträts mehrerer Schauspielerinnen und Sängerinnen.