Am 29. Juli 1989 erlitt er in einem Spiel gegen Argentinien eine schwere Knieverletzung, woraufhin er fast ein ganzes Jahr lang pausieren musste. Bei der WM 1991 erzielte Jones wieder den ersten Versuch des Turniers und erreichte schließlich den dritten Schlussrang. Für die WM 1995 wurde Jones hingegen nicht mehr aufgeboten, da er weiterhin nicht an Sonntagen spielen wollte und so im Viertelfinale und im Halbfinale nicht hätte eingesetzt werden können. Sein letztes Spiel für die All Blacks absolvierte er am 1. August 1998 in Christchurch.