С июля 1942 года Ф. А. Бобров — командир 42-й гвардейской стрелковой дивизии, формирующейся в Московском военном округе. С начала августа 1942 года дивизия воевала в составе 5-й, 20-й, 31-й, 5-й гвардейской, 40-й армий Западного, Воронежского, Степного и 1-го Украинского фронтов. Во главе дивизии участвовал в первой Ржевско-Сычёвской операции, второй Ржевско-Вяземской операции, в Курской битве, в битве за Днепр, в Киевской наступательной и Киевской оборонительной операциях, в Корсунь-Шевченковской, Уманско-Ботошанской и Ясско-Кишинёвской наступательных операциях.