Uma "villa", chamada "do peristilo", parcialmente escavada, permite conhecer melhor a arquitetura residencial em Áptera. Datada do período romano — final do ou início do — o que dela se descobriu permite supor que os padrões arquitetónicos de Áptera seguem os do período helenístico nas ilhas do Egeu e Ásia Menor. A "villa" é baseada nesses padrões e possui um peristilo interior e uma álea originalmente coberta com um teto de telhas. Este teto é suportado por colunas de tipo dórico. A "villa" terá sido destruída pelo terramoto de 365. No seu átrio principal foram encontradas uma pequena estátua de Afrodite em mármore, um busto de Hermes proveniente de uma estela, moedas e peças de olaria de uso quotidiano. Esse átrio é o centro da casa, em volta do qual se organizava o resto do edifício. Há um segundo átrio na parte sul do edifício, onde há restos de um poço, alimentado por canalizações que recolhiam a água da chuva. A inexistência de nascentes na colina de Áptera levou os habitantes da cidade a construírem poços e cisternas individuais para as necessidades pessoais e infraestruturas maiores para as necessidades gerais da cidades. Perto do poço da "villa" encontra-se um reservatório em pedra bem como um balde e uma prensa de azeitonas em pedra. Noutras divisões da "villa" foram encontradas peças de olaria de uso quotidiano e partes metálicas de portas e janelas.