Филатов был задрафтован в 2008 году под 6-м номером. В первом сезоне он играл в основном за фарм-клуб «Блю Джекетс» — «Сиракьюз». Но и в НХЛ Никите удалось себя проявить. Первую шайбу он забросил 18 октября во встрече против «Нэшвилла» (5:3). 10 января 2009 года в матче против «Миннесоты Уайлд» отметился своим первым хет-триком в НХЛ.