Ostern 1379 ernannten die Barone Sudbury zu einem Mitglied des Komitees, das die Arbeit der Regierung untersuchen sollte, und nach dem Rücktritt von Kanzler Sir Richard Scrope wurde Sudbury im Januar 1380 zum neuen Kanzler ernannt, möglicherweise gegen seinen eigenen Willen. Mit seiner ihm eigenen Gewissenhaftigkeit nahm Sudbury sein neues Amt wahr. Im November 1380 stimmte das House of Commons der weiteren Amtsausübung von ihm und den anderen Great Officers of State zu. Als Kanzler war Sudbury offiziell für die Erhebung der Kopfsteuer verantwortlich, der das Parlament im November 1380 in Northampton zugestimmt hatte. Damit wurde er zu einem Hauptziel des Bauernaufstands von 1381. Am 10. Juni 1381 stürmten aufständische Bauern aus Kent die Kathedrale von Canterbury und forderten die Mönche des Kathedralkapitels auf, einen neuen Erzbischof zu wählen. Sudbury solle dagegen als Verräter für seine Missetaten hingerichtet werden. Als die Revolte London erreichte, zog sich Sudbury mit dem jungen Richard II. und anderen hohen Beamten in den Tower of London zurück, wo sie von den Rebellen belagert wurden. Angeblich war Sudbury dabei gegen jegliche Zugeständnisse gegenüber den Rebellen. Als der König am 14. Juni den Rebellen bei Mile End gegenübertrat, versprach er ihnen, gegen alle Verräter in seiner Umgebung vorzugehen. Daraufhin drang eine Gruppe der Rebellen in den Tower ein, ergriff Sudbury zusammen mit dem Treasurer Robert Hales und enthauptete beide auf dem Tower Hill. Sudburys Leiche blieb zwei Tage unbeerdigt, während auf seinem abgeschlagenen Schädel eine Bischofsmitra angenagelt wurde und der Schädel anschließend auf einer Lanze aufgespießt über der London Bridge zur Schau gestellt wurde. Nach der Niederschlagung der Revolte wurde sein Körper in der Kathedrale von Canterbury beigesetzt, während sein Kopf in der von ihm gestifteten Kollegiatkirche von Sudbury beigesetzt wurde.