Julien Vauclair begann seine Karriere als Eishockeyspieler beim HC Ajoie, für den er in der Saison 1996/97 sein Debüt in der Nationalliga B gab. Anschliessend wechselte er zum HC Lugano, für den er die folgenden vier Spielzeiten lang in der Nationalliga A aktiv war und mit dem er 1999 erstmals Schweizer Meister wurde. Der Verteidiger wurde 1998 sowohl im CHL Import Draft von den Brandon Wheat Kings (in Runde zwei als insgesamt 69. Spieler) als auch im NHL Entry Draft, dort in der dritten Runde als insgesamt 74. Spieler, von den Ottawa Senators ausgewählt. Für Ottawa bestritt er in der Saison 2003/04 lediglich ein einziges Spiel. Die restliche Zeit verbrachte Vauclair von 2001 bis 2004 bei Ottawas Farmteams aus der American Hockey League, den Grand Rapids Griffins und Binghamton Senators.