Tuttavia l'operato di questo corpo non fu privo di pesanti critiche da parte dell'opinione pubblica specialmente in seguito al massacro di Kafr Qasim, nel quale persero la vita 48 civili palestinesi, tra i quali vi erano anche donne e bambini. La portata eclatante dell'evento fu tale da scuotere l'opinione pubblica al punto che fu avviata una indagine che portò ad una condanna dei responsabili da parte della corte suprema israeliana. Nonostante questo grave accaduto il corpo non fu disciolto e venne anche impiegato durante la crisi del canale di Suez nel 1956 e più tardi durante la Guerra dei sei giorni. In tali occasioni le forze di questo corpo operarono in cooperazione con le diverse forze armate israeliane. Nel 1974 fu poi fondata una unità apposita del MAGAV per contrastare il terrorismo, la "Yamam unit". Da allora il MAGAV ha partecipato a tutte le maggiori operazioni di antiterrorismo messe in atto sul territorio dello stato di Israele, comprese le operazioni nel corso del 2005 per contrastare la seconda intifada.