In der Russischen Revolution 1905 am Tag nach dem Petersburger Blutsonntag streikten die Studenten. Eine Woche später forderte der Studentenrat des Technologischen Instituts einen öffentlichen Prozess gegen die für tödlichen Schüsse Verantwortlichen und eine Verfassung für das russische Kaiserreich, worauf das Institut zusammen mit den sechs anderen St. Petersburger Hochschulen geschlossen wurde. Schischmarjow und die anderen Studentenführer wurden exmatrikuliert. In diesen Tagen wurde Schischmarjow Mitglied der Partei der Sozialrevolutionäre (SR). Nach der Niederschlagung des Aufstands der Matrosen des Panzerkreuzers "Otschakow" unter der Führung Pjotr Petrowitsch Schmidts, dem sich die Matrosen weiterer Schiffe und Arbeiter in Sewastopol im November 1905 angeschlossen hatten, begab sich Schischmarjow mit seiner Familie im Januar 1906 auf die Krim und stellte sich dem Sewastopol-Komitee der SR zur Verfügung, zu dessen Leitern sein Onkel Sergei Andrejewitsch Nikonow gehörte. Während des Prozesses gegen Pjotr Petrowitsch Schmidt befand sich Schischmarjow in Otschakiw. Nach der Hinrichtung Schmidts wurde er vom Sewastopol-Komitee wegen seiner technischen und chemischen Kenntnisse beauftragt, auf dem Bauernhof des SR K. I. Stalberg in Kara-Koba bei Sewastopol unter strengster Geheimhaltung ein Laboratorium für den Bau von Sprengkörpern einzurichten. Bis zum Herbst 1906 entstanden mehr als 200 Sprengkörper eigener Konstruktion für die Kampftruppe der Krim, so dass Schischmarjow nun der SR-Kampforganisation angehörte.