El 14 de enero de 2016, se confirmó su vuelta a la AS Roma. Se hizo cargo del equipo italiano cuando marchaba como 5º clasificado recién terminada la primera vuelta de la Serie A, y aunque sólo consiguió un punto en sus dos primeros partidos, luego el equipo romano encadenó 8 victorias consecutivas que lo catapultaron al puesto de la clasificación. No pudo evitar la eliminación en octavos de final de la Champions frente al Real Madrid (futuro campeón del torneo), pero terminó la temporada llevando a la Roma a la 3ª posición (clasificatoria para la ronda previa de la Champions) de la Serie A, sumando 80 puntos, sólo dos menos que el subcampeón. El conjunto "giallorosso", bajo el mando de Spalletti, sólo perdió un partido en toda la segunda vuelta del campeonato doméstico (contra el campeón Juventus), consiguió enlazar una racha de 8 y otra de 5 victorias consecutivas, y sumó 46 puntos de 57 posibles.