В мае 1943 года во время битвы на Сутьеске 2-я дивизия вела бои против 1-й горнострелковой дивизии вермахта в районе Мойковаца и Колашина, позднее образовала плацдармы у Вучево и Яворка. В боях в долине Сутьеске бригады дивизии участвовали в нападении на Кошур и обороне Баре. Во время прорыва на Зеленгоре велись тяжёлые оборонительные бои на Любином-гробе и Кошуте, а также шёл прорыв линии Фоча-Калиновик. В октябре Дапчевич был назначен уже командиром 2-го ударного корпуса НОАЮ, который стал элитным подразделением партизан. Осенью 1943 года были освобождены территории Черногории, Герцеговины и Санджака. Корпус участвовал в 1944 году в боях за Черногорию, а именно: в Лимско-Дринской, Мойковацкой и Андриевицкой операциях. В июле 1944 года Пеко назначается командиром Оперативной группы дивизий, с которой освобождает часть Сербии между реками Южная и Западная Морава. В сентябре 1944 года принимает командование 1-й армейской группой, которая участвовала в боях за Западную Шумадию и Белградской операции; под Ужице Дапчевич нанёс серьёзное поражение четникам.