Depois desse sucesso diplomático, Witte foi chamado de volta ao processo de tomada de decisões do governo, para ajudar a lidar com a perturbação civil que se seguiu à guerra e ao Domingo Sangrento (1905). Durante a Revolução Russa de 1905, Witte defendeu a criação de um parlamento eleito, a formação de uma monarquia constitucional e o estabelecimento de uma declaração dos direitos dos cidadãos através do Manifesto de Outubro. Muitas de suas reformas foram colocadas em prática, mas falharam em dar fim à agitação. Isso, e principalmente as vitórias de partidos políticos esquerdistas no primeiro parlamento russo, a Duma Estatal, forçaram Witte a abdicar da Presidência do Conselho de Ministros.