À partir de l'EuroBasket 1997 en Espagne, c'est une nouvelle génération de joueurs croates qui joue en sélection. Elle ne finit que onzième du tournoi. Les résultats qui suivent se révèlent insuffisants pour se qualifier pour les Jeux olympiques ou les championnats du monde jusqu'à l'EuroBasket 2007, à nouveau en Espagne, où l'équipe termine sixième et se qualifie pour les Jeux olympiques de 2008 à Pékin. Elle y termine sixième, tout comme à l'EuroBasket 2009. Elle se classe quatorzième lors du championnat du monde 2010 et se classe difficilement treizième lors de l'EuroBasket suivant, manquant du même coup sa qualification pour les Jeux olympiques de 2012 à Londres.