1945年，中華民國政府開始接管台灣，並設臺灣省。其統治政府則變成了臺灣省行政長官公署，1947年改制成臺灣省政府。1948年到1950年，國共內戰最激烈期間，台灣政府大部分是指則為臺灣省政府；而自1949年起，中華民國政府遷往台灣並後，台灣政府被一些人用作中華民國政府的代名詞。自1991年起，中華民國國會立法院在臺灣全面改選；1996年起，中華民國總統及副總統在臺灣由公民直接選舉，認同中華民國政府者認為中華民國政府在台灣因而擁有更強的合法性與正當性，並讓台灣從威權轉化為落實主權在民精神的真正民主地方，在政治層面落實台灣本土化運動，使中華民國成為真正的民主共和國，台灣成為真正主權獨立的國家，擁有自己的國家政府代表性。不認同中華民國在臺灣之合法性的人士則依據國際法主張中華民國無法藉由舉辦選舉而在臺灣就地合法。