Nachdem er schon für die U-21 Schwedens aktiv war, kam Farnerud 2002 zu seinen ersten Einsätzen in der A-Mannschaft und wurde im WM-Kader 2002 berücksichtigt, ohne eingesetzt zu werden. In den folgenden beiden Jahren gehörte er zum erweiterten Aufgebot, kam jedoch nur unregelmäßig zum Einsatz. Bei der Europameisterschaft 2004 wurde er abermals in den Kader berufen, blieb jedoch erneut ohne Turniereinsatz. Erst 2010 wurde er nach sechs Jahren Pause erneut berufen und kam in zwei Freundschaftsspielen zum Einsatz.