Cmentarz powstał jako miejsce spoczynku osadników niemieckich z okolic wsi Augustówek, stanowiącej część dzisiejszej warszawskiej dzielnicy Białołęka. Niemieccy osadnicy zamieszkiwali te tereny do 1941, kiedy to zostali przesiedleni przez władze okupacyjne, najprawdopodobniej na Pomorze, co wiązało się z zamknięciem cmentarza. W 2012 przy ul. Ruskowy Bród utworzono lapidarium z płytami nagrobnymi z kilku ewangelickich cmentarzy Białołęki.