Кладовище виникло приблизно на місці поховань нижніх чинів доби Першої світової війни на філії Лук'янівського кладовища. Нинішній некрополь заснований у 1943 році, спершу для упорядкування поховань з військових шпиталів, облік поховань ведеться з 1944 року. Сюди також було перенесено прах учасників оборони та здобуття Києва, похованих на різних місцях.