La Cronometro femminile Junior dei Campionati europei di ciclismo su strada 2012 si è svolta il 10 agosto 2012 a Goes, nei Paesi Bassi, per un percorso di 14,8 km. La gara è stata vinta dall'olandese Corine van der Zijden, che ha terminato la gara in 19'52", alla media di 44,691 km/h.