Erste internationale Erfahrungen sammelte Michal Desenský im Jahr 2012, als er bei den Juniorenweltmeisterschaften in Barcelona im 200-Meter-Lauf mit 21,57 s im Halbfinale ausschied und mit der tschechischen 4-mal-100-Meter-Staffel in der Vorrunde nicht ins Ziel gelangte. Im Jahr darauf belegte er bei den U23-Europameisterschaften in Tampere mit der 4-mal-100-Meter-Staffel in 39,23 s den fünften Platz und mit der 4-mal-400-Meter-Staffel erreichte er in 3;05,82 min Rang sechs. 2014 startete er bei den Europameisterschaften in Zürich mit der 4-mal-400-Meter-Staffel und klassierte sich dort in 3:04,56 min auf dem siebten Platz. Im darauffolgenden Jahr schied er bei den U23-Europameisterschaften in Tallinn im 400-Meter-Lauf mit 46,39 s in der ersten Runde aus und gewann mit der 4-mal-100-Meter-Staffel in 39,38 s die Silbermedaille hinter dem Team aus Frankreich. Zudem belegte er mit der 4-mal-400-Meter-Staffel in 3:07,27 min Rang vier. 2016 wurde er bei den Europameisterschaften in Amsterdam mit der 4-mal-400-Meter-Staffel in 3:03,86 min ebenfalls Vierter und bei den IAAF World Relays 2017 in Nassau wurde er in 3:08,17 min Vierter im B-Finale. Im Jahr darauf belegte er bei den Hallenweltmeisterschaften in Birmingham in 3:04,87 min den fünften Platz. Im Sommer schied er dann bei den Europameisterschaften in Berlin mit 46,68 s in der ersten Runde über 400 Meter aus und verhalf der Staffel mit 3:02,52 min zum Finaleinzug.