Hughes passe quelques-unes de ses années junior au Canada alors qu'il vit à Toronto où son père avait trouvé du travail avec les Maple Leafs. Par la suite, il rejoint le United States National Development Team. À la suite de son passage avec le programme de développement, il rejoint en 2017 les Wolverines, formation représentant l'Université du Michigan. En prévision du repêchage de 2018, il est classé quatrième meilleur espoir nord-américain chez les patineurs à la mi-saison. Il est poussé à la sixième place lors du classement final.