Rooney debytoi arvokilpailuissa EM-kilpailujen 2004 ottelussa Ranskaa vastaan. Alkulohkon kahdessa muussa ottelussa Sveitsiä ja Kroatiaa vastaan hän teki kaksi maalia kummassakin. Tappiollisessa puolivälierässä Portugalia vastaan hän joutui jättämään kentän jo 27 minuutin jälkeen.