З 1942 по 1945 рік воював у складі 106-го батальйону зв'язку 41-ї стрілецької дивізії 69-ї армії, яка брала участь у боях на Орловсько-Курській дузі. Служив рядовим, потім парторгом роти та батальйону зв'язку, командиром взводу. Дивізія звільняла Орел, Харків, Гомель, Варшаву. На річці Одер Іван Григорович Кісенко був поранений, після лікування знову повернувся у свою військову частину. Іван Кісенко дійшов до Берліна, розписався на рейхстазі. Нагороджений орденами Червоної Зірки та Вітчизняної війни І-ІІ ступенів, медалями.