Phillips évolue de 2002 à 2005 pour les Indians de Cleveland et fait sa marque avec les Reds de Cincinnati, pour qui il joue de 2006 à 2016. Il compte trois sélections au match des étoiles (2010, 2011,2013), a remporté quatre Gants dorés (2008, 2010, 2011, 2013) comme meilleur joueur de deuxième but défensif de la Ligue nationale et un Bâton d'argent (2011) comme meilleur deuxième but offensif. Il passe aux Braves d'Atlanta puis aux Angels de Los Angeles en 2017.