El huracán de 12 de agosto de 1956, Santa Clara, también conocido como Betsy, trajo una gran crecida de su río que se adentró en la zona urbana arrastrando casas y el puente de la carretera número tres. El huracán Donna, que pasó cerca de Puerto Rico, creó unas inundaciones del río Humacao que mató a unas 200 personas (1960). El Huracán María del 20 de septiembre de 2017 fue el peor huracán que ha sufrido Humacao, seguido por el Huracán San Felipe II, Huracán Hugo y el Huracán George.