儘管《苏德互不侵犯条约》中的秘密條文在二戰結束後的纽伦堡审判時曝光，但蘇聯一直否認這些條文存在。蘇聯的政治宣傳也堅稱，三國的國民議會代表各國人民意願，向苏联最高苏维埃提請加入蘇聯──故此，蘇聯認為，三國是自願加盟蘇聯，而非蘇聯佔領三國。三國則宣稱他們是被蘇聯以武力非法合併的。一般認為，蘇德兩國簽訂的密約證明三國是被非法佔據的。只要能指出蘇聯佔領和蘇德條約之間的關係，就可宣告蘇聯對三國的統治無法律基礎，1940年起在當地實施的蘇聯法律自動無效，到了1941年蘇德戰爭時苏軍在波羅的海行動未能阻擋德軍攻勢，納粹德國軍事佔領了波羅的海三國，直到苏联在1944年波羅的海攻勢打敗德軍后收回三國。若這种說法成立，即自動解決重奪主權或爭取自治的爭議，因為波羅的海國家從來沒有在法律上屬於蘇聯；三國在兩戰期間原為獨立國家，也可以合法恢復原有地位，宣告蘇聯法律對三國無效力，使三國無須再遵守《蘇聯憲法》，也省卻正式的脫離程序。