Τελικά ο Θοδωράκης εκτελέστηκε από τους Τούρκους ως αντίποινα για την μη λύση της πολιορκίας της Τρίπολης και πέθανε στις 20 Σεπτεμβρίου[1821, λίγες ώρες πριν την άλωση της πόλης.