Pandolfo fu scelto dai New Jersey Devils in 32ª posizione assoluta nel 1993 dopo la sua prima stagione trascorsa presso la Boston University. Pandolfo avrebbe giocato lì anche per le tre successive stagioni, collezionando 133 presenze con 78 reti e 89 assist per un totale di 167 punti. Nella sua ultima stagione guidò la Hockey East per reti realizzate con 38 gol, conquistando il titolo di giocatore dell'anno della lega.