Latarnia zbudowana została na ruinach klasztoru ("Convento de San Francisco Javier") wzniesionego przez Portugalczyków w 1682 roku. Budowa latarni rozpoczęła się w 1845 roku, ale została przerwana przez przedłużającą się wojnę domową, która ostatecznie zakończyła się w 1852 roku. Do użytku została oddana w styczniu 1857.