Клуб відновлений німецькою владою в роки Другої світової війни, яка мала намір зробити його німецькою вітриною футбольної Сілезії та залучила до команди ряд гравців, таких як Евальд Дитко, Ервін Ниц та Ернест Вілімовський. Однак клуб не досяг значних успіхів у змаганнях Гауліги. У сезоні 1941 року клуб посів 4 місце, у сезоні 1942 року — 7 місце, у сезоні 1943 року — 8 місце, а в сезоні 1944 року знову посіла 7 місце. Ряд гравців покинули команду, Ервін Ниц та Евальд Дитко були мобілізовані до Вермахту. В останньому незавершеному сезоні 1945 року «1. ФК Катовіце» посідала перше місце у турнірній таблиці. Клуб припинив своє існування того ж року у зв'язку з окупацією Німеччини Червоною армією.