En 1810, il met les voiles vers le cap de Bonne-Espérance pour prendre le commandement en chef de la station. Il dirige les opérations permettant la capture de Java le , quant l'établissement hollandais de Batavia capitule devant Stopford et le Lieutenant général Sir Samuel Auchmuty. La flotte britannique est composée de quelque 100 navires, y compris huit croiseurs de l'East India Company. Il est nommé Commander-in-Chief, Portsmouth en 1827.