Jahn überlebte die Deutsche Besetzung Polens 1939–1945, indem er als Mitarbeiter von Rudolf Weigl am Institut für Fleckfieber- und Virusforschung in Lemberg arbeitete und Weigl bei dessen Arbeit an Typhusimpfstoffen unterstützte, indem er infizierte Läuse mit seinem Blut „fütterte“ (als „Läusefütterer“, polnisch: „Karmiciel wszy“). Die Arbeit an den Impfstoffen wurde von den deutschen Besatzern als „kriegswichtig“ eingestuft.