Ma dipindahkan bersama saudaranya Ma Fuxiang dan beberapa sepupunya untuk berdinas sebagai perwira di bawah pimpinan Jenderal Dong Fuxiang di Beijing pada 1898. Selama Reformasi Seratus Hari pada 1898, Dong Fuxiang, Ma Anliang dan Ma Haiyan bersama dengan Ma Fulu dan Ma Fuxiang dipanggil ke Beijing untuk membantu mengakhiri gerakan reformasi. Selama Pemberontakan Boxer, pasukan Muslim kemudian dikenal sebagai "Tentara Gansu" (甘軍/甘军) atau dalam bahasa Inggris disebut "Kansu Braves" dan bertempur melawan Aliansi Delapan Negara. Ma Fulu dan Ma Fuxiang keduanya berpartisipasi dalam menyergap dan mengusir pasukan Aliansi dalam Pertempuran Langfang selama Ekspedisi Seymour, memimpin pasukan Muslim Hui, Dongxiang dan Baoan untuk mengusir Aliansi kembali ke Tianjin dan secara pribadi memimpin pasukan kavaleri, menebas pasukan musuh dengan pedangnya. Ma Fulu dan empat sepupunya tewas dalam sebuah pertempuran berdarah di Gerbang Zhengyang ketika melawan orang asing di Beijing pada 1900 selama Pertempuran Peking. Sepupu dari pihak ayahnya, Ma Fugui 馬福貴, Ma Fuquan 馬福全 dan keponakan dari pihak ayahnya, Ma Yaotu 馬耀圖 dan Ma Zhaotu 馬兆圖 juga tewas dalam pertempuran ini. 100 rekan prajurit Hui dan Dongxiang dari desa asalnya gugur dalam tugas di Gerbang Zhengyang selama Pengepungan Peking. Saat kejadian dia masih menjadi komandan sebuah brigade, saudaranya Ma Fuxiang mengambil alih posisinya setelah kematiannya. Ma Fuxiang mewarisi pasukan Ma Fulu.