Nach dem Anschluss Österreichs stellte sich Papen ab dem Frühjahr 1938 dem NS-Regime mit dem Titel "Botschafter zur besonderen Verwendung" weiter zur Verfügung. Ende April 1939 übernahm er den Botschafterposten in Ankara, den er gegenüber dem neuen Reichsaußenminister Joachim von Ribbentrop laut eigenen Aussagen mehrfach abgelehnt hatte. Die gewachsene Bedeutung der Türkei nach der italienischen Besetzung Albaniens Anfang April 1939 war schließlich ausschlaggebend. Anders als in Wien unterstand Papen in Ankara dem Außenminister und nicht Hitler, den er allerdings mehr als ein Dutzend Mal zu Gesprächen aufsuchte. Den Weisungen Berlins folgend bemühte sich Papen in Ankara vergeblich, die Türkei von ihrer „aktiven Neutralität“ abzubringen und für ein „Neues Europa“ unter Führung des Deutschen Reichs zu gewinnen.