Ahn Jung-hwan debutó por la Selección Nacional el 23 de abril de 1997, en un partido amistoso contra la selección de fútbol de China. La primera Copa Internacional de Ahn fue una Copa de Oro de la Concacaf en el año 2000, en la cual Corea había sido en primera fase. El 4 de junio de 2002, Ahn hizo su debut por primera vez en una Copa Mundial contra en un triunfo de Corea por 2-0, entrando desde la banca por Hwang Sun-hong en el minuto 51'.