Johnny Gaudreau został wybrany przez Calgary Flames z numerem 104 w czwartej rundzie NHL Entry Draft 2011. 11 kwietnia 2014 otrzymał Hobey Baker Award dla najlepszego hokeisty rozgrywek NCAA; tego samego dnia podpisał kontrakt z Calgary Flames. W swoim pierwszym pełnym sezonie NHL 2014-15 został wybrany do Meczu Gwiazd NHL w 2015 roku. Wystąpił również w jego trzech kolejnych edycjach: 2016, 2017 i 2018. W październiku 2016 zawodnik podpisał z drużyną z Calgary 6-letni kontrakt warty 40,5 mln dolarów. Nosi przydomek „Johnny Hockey”, który został zarejestrowany przez Urząd Patentów i Znaków Towarowych Stanów Zjednoczonych.