Natalja Borisovna Sjipilova (russisk: Наталья Борисовна Шипилова; født 31. desember 1979 i Volgograd) er en russisk håndballspiller, som spiller for klubben HC Lada Toljatti og det russiske landslaget. Hun har spilt for det russiske landslaget siden 2001, og har vunnet gull i VM 2007, samt sølv i EM 2006 og OL 2008. På klubbnivå har hun vunnet det russiske mesterskapet flere ganger med Lada. Hun var også med å vinne Champions League i 2007-2008 med klubben Zvezda Zvenigorod.