Fils d'un officier d'infanterie, Thomières s'engage en en tant que volontaire au de volontaires de l'Hérault. Élu capitaine dans ce bataillon, il sert, de 1793 à 1795, à l'armée des Pyrénées-Orientales et devient adjoint à l'état-major général en . En , il devient adjoint du général François Lanusse à l'armée d'Italie. Thomières se distingue aux batailles de Dego, de Mondovi, de Lodi, de Bassano et du pont d'Arcole. Devenu aide de camp du général Victor en , il sert en Italie, devient chef de bataillon en et combat à Montebello et Marengo. Il est fait chevalier de la Légion d'honneur le .