In 2012 und 2013 bestritt Vanaken insgesamt vier Länderspiele für die belgische U-20 bzw. U-21-Nationalmannschaft. Sein erstes Länderspiel in der A-Nationalmannschaft erfolgte am 7. September 2018 im Rahmen eines Freundschaftsspieles gegen Schottland. Zur infolge der COVID-19-Pandemie erst 2021 ausgetragener Europameisterschaft 2020 wurde er in den belgischen Kader berufen. Tatsächlich stand er aber nur im dritten Gruppenspiel gegen Finnland, bei dem Belgien bereits für das Achtelfinale qualifiziert war, wenige Minuten auf dem Platz.