Am 1. April 1936 trat er zur Luftwaffe über. Er diente bis Ende August 1943 als Referent und Gruppenleiter im Reichsluftfahrtministerium. Am 1. September 1943 wurde Deutsch zum Kommandeur des Flak-Regiments 25 ernannt, das mit der Luftverteidigung des Großraumes Hannover betraut war. Ihm unterstanden dabei die schweren Flak-Abteilungen 461, 521, 801, 428 (Eisenbahnflak) sowie die leichte Flak-Abteilung 871. Im Januar 1944 verfügte das Regiment über 18 schwere und 9 mittlere/leichte Flakbatterien. Im Januar 1944 wurde Deutsch zum Kommandeur der Flakgruppe Halle-Merseburg (Flak-Regiment 33) ernannt, das die Industrieobjekte im Großraum Halle und die Raffinerien um die Leuna-Werke sicherte. Am 30. April 1944 wurde Deutsch zum Kommandeur der 16. Flak-Division ernannt, die er bis zur Umwandlung des Divisionskommandos in das Generalkommando des VI. Flak-Korps am 9. Februar 1945 an der Westfront kommandierte, unter anderem bei der Schlacht um Arnheim. Am 10. Februar 1945 wurde Deutsch zum "Luftwaffen-Kommando-West" versetzt, wo er im März 1945 zum Kampfkommandanten von Wesel ernannt wurde. Dort fiel er am 27. März 1945.