Confirmé dans son grade de divisionnaire le , Macquard reçoit le commandement de la division de l'armée d'Italie en mars de l'année suivante, avec quartier général à Breil. À la même époque, un nouveau général en chef est dépêché sur place en la personne de Napoléon Bonaparte : la division Macquard, forte de hommes répartis en deux brigades sous les généraux Jean-Antoine David et Claude Dallemagne, stationne alors au col de Tende avec la division du général Garnier. Il prend part à la campagne de Bonaparte en Italie, même si, lors de la première phase des opérations qui culmine à la bataille de Montenotte, sa division n'est pas engagée ; lui-même est fait commandant de la place de Coni le 28 avril 1796.