Wharton begann seine Karriere in der &lt;a href="OHL%202002/03"&gt;Saison 2002/03&lt;/a&gt; bei den Ottawa 67’s in der kanadischen Juniorenliga Ontario Hockey League. Nach drei Spielzeiten dort schloss er sich während der &lt;a href="OHL%202005/06"&gt;Saison 2005/06&lt;/a&gt; dem Ligakonkurrenten Sault Ste. Marie Greyhounds an, ehe er in der darauffolgenden Spielzeit innerhalb der Liga zu Guelph Storm wechselte. Im Sommer 2006 nahmen die Columbus Blue Jackets aus der National Hockey League den Kanadier unter Vertrag, diese hatten sich zuvor die Transferrechte an ihm im Rahmen des NHL Draft 2004 gesichert. In Columbus wurde er zunächst an das Farmteam, die Syracuse Crunch aus der American Hockey League, abgegeben und nach zwei Partien anschließend bis Saisonende in die Deutsche Eishockey Liga an die Eisbären Berlin ausgeliehen.