Löhr fou capturat pels partisans iugoslaus el 9 de maig de 1945 i intentà negociar el pas segur de les seves tropes a Àustria, la qual cosa fou rebutjada. Va aconseguir escapar de la seva custòdia i va ser recapturat el 13 de maig. Posteriorment, va ser jutjat i condemnat per crims de guerra pel govern iugoslau per les represàlies antipartisanes comeses sota el seu comandament i el bombardeig de Belgrad el 1941. Va ser executat mitjançant un escamot d'afusellament el 26 de febrer de 1947 a Belgrad, Iugoslàvia.