В действующей армии Колесников с июня 1941 года. Воевал в должности командира пулемётной роты на Западном и Воронежском фронтах. 27 августа получил первое осколочное ранение в правую ногу. В октябре 1941 года участвовал в оборонительных боях в районе города Дорогобуж Смоленской области. В августе 1942 года пулемётчики взвода Колесникова стояли насмерть на Дону в районе станицы Цимлянской, затем отражали танковое наступление противника на Сталинград на реке Аксай. Здесь Колесников в одном из боёв был второй раз ранен и лечился в госпитале. Летом 1943 года на Курской дуге.