Участвовал в операции по окончательному снятию блокады Ленинграда. Умело анализировал боевой опыт, большое внимание уделял вопросам оперативно-тактической подготовки и повышения квалификации офицерского состава. Только за период с 16 мая по 1 июля 1944 года части бригады Тимченко потопили и уничтожили 49 боевых и вспомогательных кораблей врага, поставили 250 мин, сбили 3 самолёта противника. Лично осуществлял планирование и руководил проведением десантных операций на острова Тютере, Нарган, Даго, Эзель, портов Кунда, Локоу, Палдиски, а также на косу Фрише-Нерунг под Кёнигсбергом. Благодаря его действиям потери в десантных группах были сведены к минимуму.