Çubuk Şehir Müzesi; Ankara'nın Çubuk ilçesinde bulunan bir müzedir. İlçedeki birkaç tarihi yapıdan biri olan ve zamanın zengin ailelerinden birine ait olan Bekir Ağalar Konağı'nın 2013 yılında restore edilip düzenlenmesiyle oluşturulan müze; 2015 yılında sergi salonu olarak açılmış, 2017 yılında ise Kültür ve Turizm Bakanlığı tarafından kent müzesi unvanıyla tescillenmiştir. Bekir Ağalar Konağı, Mustafa Kemal Atatürk'ün 1933 yılında ilçeye yaptığı ziyaret esnasında konakladığı yer olarak da ayrı bir önem ve değer taşımaktadır. Müzede; 1402 Ankara Savaşı'nı ve 1900'lü yıllardaki yaşantıyı anlatan maketlerle, bir kısmı satın alma, bir kısmı da bağış yoluyla toplanan tarihi eşya sergilenmektedir.