Po zakończeniu działań wojennych Urquhart przeszedł do służby cywilnej. W 1945 roku był z ramienia Wielkiej Brytanii jednym z członków komisji przygotowującej powołanie Organizacji Narodów Zjednoczonych. W tym samym roku został zatrudniony w Sekretariacie ONZ. W 1948 roku został osobistym doradcą Sekretarza Generalnego ONZ Trygve Lie, a później jego następcy, Daga Hammarskjölda. Był odpowiedzialny za organizowanie sił pokojowych ONZ oraz pracował przy powstaniu Międzynarodowej Agencji Energii Atomowej. Jako jedyna osoba z wojskowym doświadczeniem w otoczeniu Hammarskjölda wziął kluczowy udział w negocjacjach pokojowych podczas kryzysu sueskiego i kongijskiego. Następnie pracował nad organizacją misji pokojowych ONZ na Cyprze, w Kaszmirze i na Bliskim Wschodzie. Był bliskim współpracownikiem Zastępcy Sekretarza Generalnego ONZ ds. politycznych Ralpha Bunche, a po jego rezygnacji zastąpił go na tym stanowisku. Piastował je do 1985 roku, kiedy w 40-lecie swojej pracy w ONZ postanowił przejść na emeryturę.