René Pontoni machte zwischen 1942 und 1947 neunzehn Länderspiele in der argentinischen Fußballnationalmannschaft und erzielte dabei neunzehn Tore, was einer Torquote von durchschnittlich einem Tor je Spiel entspricht. Mit Argentiniens Nationalelf nahm er an drei Südamerikameisterschaften teil, eine Weltmeisterschaft verpasste er aufgrund des Zweiten Weltkrieges und der damit verbundenen Pause für Fußball-Weltmeisterschaften zwischen 1938 und 1950. Dafür nahm er dreimal an der Copa América teil, und sowohl 1945 in Chile, 1946 im eigenen Land und 1947 in Ecuador beendete die argentinische Mannschaft das Turnier als Sieger.