В 2003 году Бабицкий выступал свидетелем защиты на процессе по экстрадиции Ахмеда Закаева. Он опроверг факт своего знакомства c Закаевым, приписывавшийся ему российской Генеральной прокуратурой. 1 сентября 2004 года, немедленно после известия о захвате заложников в Беслане, Бабицкий собрался вылететь в Осетию, чтобы выступить посредником в их освобождении, но был задержан в аэропорту Внуково «за хулиганство».