Tras la tercera partición de la Mancomunidad de Polonia-Lituania en 1795, Bialystok perteneció primero al reino de Prusia y, tras el tratado de Tilsit, firmado en 1807, pasó al Zarato de Polonia anexionado por el Imperio ruso. Como resultado de las particiones de Polonia, la educación polaca intensamente desarrollada dejó de existir. Durante el siglo XIX la ciudad se convirtió en un gran centro de la industria textil. Después de los levantamientos polacos perdidos en noviembre de 1830 y en enero de 1863, los rusos intensificaron las represiones anti-polacas y rusificación, y en 1870 introdujeron una prohibición sobre el uso del idioma polaco en lugares públicos.