1944年の1月から9月までのボイシは、主にニューギニア島の北部海岸沿いで、南西太平洋連合軍総司令官ダグラス・マッカーサー大将の作戦に参加した。この方面で活動していたアメリカ海軍は、マッカーサー大将の指揮下で行動する第7艦隊（トーマス・C・キンケイド中将）であった。本艦は、姉妹艦フェニックス (') やナッシュビル (') などと共に、ニューギニアの戦い（飛び石作戦）に従事する。その中にはマダンへの砲撃（1月25日、26日）、ホーランジアの戦いにともなうフンボルト湾上陸作戦支援（4月22日）、ワクデ島砲撃（4月29日、30日）およびワクデ島上陸（5月15日 - 25日）、ビアク島上陸（5月25日 - 6月10日）、上陸（7月1日、2日）、サンサポア岬上陸（7月27日 - 8月31日）、モロタイ島占領（9月1日 - 30日）が含まれる。