Også i Bamberg overtog det tyske naziparti NSDAP magten, og mange borgere deltog i forfølgensen af de jødiske medborgere. Den jødiske jurist Wilhelm Aron (1907-1933), blev den 10. marts 1933 indsat i beskyttelsesarrest og derefter den 19. maj 1933 myrdet i koncentrationslejren Dachau. Seks uger efter nazisternes bogbrænding den 10. maj 1933 i Berlin, blev der i Bambergs folkepark brændt bøger. Nazisternes bogbrænding var en kampagne iværksat af myndighederne i Nazi-Tyskland for at bræbe bøger som ikke var overens med nazisternes ideologi. Den fra 1910 færdigbygget Bamberger Synagoge blev under Krystalnatten den 9. november 1938 ødelagt. fra november 1941 begyndte man at deportere de in Bamberg boende jøder. Den jødiske kirkegård blev nedlagt. I alt mistede 630 jøder født i Bamberg eller som havde boet der gennem længere tid livet på grund af den nationalsocialistiske jødeforfølgelse også betegnet som Holocaust.