同年2月8日，周恩来在怀仁堂召开中央政治局碰头会。会上，徐向前同陈伯达就刘志坚问题发生严重争执。2月11日，徐和叶剑英等与陈伯达、康生、张春桥就军队稳定问题发生争执。2月16日，军方与文革小组的冲突达到顶峰，谭震林、陈毅、李先念纷纷发言怒斥文革小组。会后中共文革小组向毛泽东汇报，经毛泽东表态，文革小组开始制造“二月逆流案”。同年4月上旬的军委扩大会议上，徐向前被迫在会上作检讨被批判。16日、17日，家里被两度抄家；而因为事先叶剑英通知，徐向前暂时在西山避难。7月29日，蒯大富率人第三次抄徐向前家。9月16日，徐向前请辞免除全军文革组长的职务，毛泽东并未批准。1968年10月，中共八届十二中全会召开，朱德、陈云、叶剑英、徐向前、陈毅、聂荣臻等人被分为不同小组，进行批判。1969年1月3日，毛泽东表示为二月逆流案平反。然而在同年4月中国共产党第九次全国代表大会上，朱德、陈毅、徐向前等元帅继续被分组批判。