Karierę reprezentacyjną rozpoczął 4 grudnia 1932 w meczu przeciwko Niemcom, w którym jego zespół wygrał 2:0. W 1934 został powołany przez trenera Boba Glendenninga na Mistrzostwa Świata 1934 we Włoszech. Jego reprezentacja poległa w pierwszej rundzie ze Szwajcarią 2:3, a Pellikaan rozegrał pełne 90 minut. Jego ostatni mecz w reprezentacji miał miejsce po II wojnie światowej. 10 marca 1946 Holandia wygrała na wyjeździe z Luksemburgiem 6:2. Łącznie w latach 1932–1946 Pellikaan zagrał w 13 spotkaniach reprezentacji Holandii.