Björn Kuipers arbitre notamment la finale du championnat d'Europe de football des moins de 17 ans 2006 et du championnat d'Europe de football espoirs 2009. Il est aussi présent lors des compétitions inter-clubs européennes depuis 2006 et arbitre la première demi-finale de Coupe du monde de football des clubs 2010 ainsi que la Supercoupe de l'UEFA 2011. Le , l'UEFA dévoile qu'il sera l'arbitre de la finale de la Ligue Europa opposant Chelsea au Benfica dans son propre pays, à l'Amsterdam ArenA. Il dirige la finale de la Coupe des confédérations 2013.