За період 1998—2018 роки Руслан Пономарьов зіграв за збірну України у 17-ти турнірах, зокрема: шахова олімпіада — 9 разів, командний чемпіонат світу — 4 рази, командний чемпіонат Європи — 4 рази. Руслан дворазовий переможець шахових олімпіад 2004 та 2010 років, переможець командного чемпіонату світу 2001 року, багаторазовий призер шахових олімпіад, командних чемпіонатів світу та Європи. Також у нього п'ять індивідуальних нагород (три золоті та дві срібні).