En la temporada 1993 regresó a Flamengo, donde jugó seis partidos y marcó cuatro goles en la Supercopa Sudamericana, que perdieron contra São Paulo en la final. En la edición de ese año del Torneo Río-São Paulo, durante un encuentro ante Fluminense que terminó en derrota por 3-2, tuvo una pelea con su compañero Djalminha que derivó en la expulsión de este último del club. En dicha competición, quedaron terceros en el grupo B, por lo que no accedieron a la fase siguiente. En el Campeonato Carioca, donde su equipo quedó tercero, el brasileño marcó siete goles. En el campeonato brasileño, participó en doce partidos y marcó cuatro goles, y Flamengo quedó en la octava posición. En copa nacional, llegaron hasta la semifinal y Grêmio los venció. Portaluppi fue titular en la mayoría de partidos de Copa Libertadores, donde jugó nueve veces y anotó tres goles, y el club carioca perdió en cuartos de final con São Paulo. No lo convocaron a la Copa América y jugó su último encuentro para la selección el 16 de diciembre de ese año, un amistoso frente a México disputado en Guadalajara que terminó 1-0 a su favor. Como internacional, jugó 41 partidos y anotó cinco tantos. En 1994, se unió a Atlético Mineiro, donde tuvo un breve paso. Sufrió algunas lesiones y fue partícipe del llamado «Selegalo», un rotundo fracaso para el equipo dado que, al tener muchos jugadores de renombre, se había generado una alta expectativa y, sin embargo, no se encontró un estilo de juego definido. Tiempo después, Portaluppi opinó que el pobre funcionamiento radicó en el alto promedio de edad del plantel. A Valdir Espinosa lo reemplazó Levir Culpi, que usó un esquema 4–4–2 donde combinó en la delantera la experiencia de Portaluppi y la juventud de Reinaldo. El jugador disputó quince partidos y marcó cuatro goles.