L'histoire du "Codex Regius" est inconnue jusqu'en 1643, année où Brynjólfur Sveinsson, futur évêque de Skálholt, entra en sa possession avant de le léguer, ainsi que le "Livre de Flatey" en 1662 à Frédéric III, roi du Danemark. Il fut conservé dans la toute nouvelle bibliothèque royale du Danemark sous la cote "GKS 2365 4to" et échappa au grand incendie de Copenhague du 20 octobre 1728.