Jeszcze w tym samym roku – jako ostatni ocalały okręt swojego typu – „Enterprise” wziął udział w walkach o wyspy Gilberta, w 1944 roku w walkach na Marianach – w tym w bitwie na Morzu Filipińskim, a także w walkach pod Leyte, w tym w bitwie w Zatoce Leyte. Wspierał później operacje desantowe pod Iwo Jimą. Do grudnia tego roku został wyposażony w samoloty przystosowane do działań nocnych. 14 maja 1945 roku, w trakcie walk o Okinawę, „Enterprise” został po raz ostatni uszkodzony, w ataku japońskich samolotów kamikaze, które uderzyły w jego przednią windę. Zmusiło to okręt do powrotu celem napraw na Zachodnie Wybrzeże, co zakończyło karierę wojenną jednostki. Ostatecznie okręt został wyprowadzony ze służby w marynarce wojennej w 1947 roku, zaś mimo starań m.in. adm. Williama Halseya, o uczynienie USS „Enterprise” okrętem-muzeum, w lipcu 1958 roku najliczniej udekorowany – 20 gwiazdami Battle Star, dwukrotnie Presidential Unit Citation, Navy Unit Commendation oraz jako jedyna zagraniczna jednostka brytyjskim British Admiralty Pennant – okręt w historii amerykańskiej marynarki wojennej został sprzedany na złom.