التحق الحزب، الذي أصبح يسمى منظمة حزب البعث العربي الاشتراكي لتفريقه عن الجناح الآخر، بالحركة الوطنية اللبنانية لكنه ما لبث أن دخل في خلاف مع كمال جنبلاط رئيس الحركة. زاد نفوذ الحزب مع دخول الجيش السوري لبنان في يونيو 1976، وساندت ميليشيا الحزب، التي كان قوامها حوالي 3,000 عنصر ومناطق نفوذها البقاع، القوات السورية في معاركها طوال سنوات الحرب. أسس الجناح العسكري للحزب عام 1979 أمين شعبة بيروت ورئيس المكتب الطلابي والعسكري والسياسي لفرع بيروت د. محمد سعيد عكام(أبو فهد) شاركت الكتيبة بفعالية عالية بمختلف المعارك وعلى مختلف الجبهات وبشكل خاص معركة الجبل 1983 والعمل الفدائي انطلاقا من تلة السلطان يعقوب ومعارك الاستنزاف في منطقة رأس النبع 1984/1985 سقط لها 100 بين قتيل وجريح في تلك المنطقة. كما انّه كان للحزب مشاركة فعّالة في جبهة المقاومة الوطنية اللبنانية التي تأسّست في 16 ايلول 1982 حيث أقدم الجناح العسكري على العديد من العمليات الفدائية ضد الاحتلال الإسرائيلي.