В августе 2005 года, накануне начала выполнения плана размежевания, Нетаньяху в знак протеста ушёл из правительства и стал во главе внутрипартийной оппозиции. В сентябре 2005 года Шарон с группой сторонников вышел из Ликуда и создал новую партию «Кадима». На выборах лидера Ликуда в ноябре Нетаньяху легко одержал победу и вновь стал лидером партии и кандидатом на пост премьер-министра от неё. В марте 2006 года партия Ликуд получила всего 12 мест на выборах в парламент и отказалась вступить в коалицию Эхуда Ольмерта. После формирования правительства Нетаньяху стал лидером оппозиции. По опросам общественного мнения после второй ливанской войны пользовался наиболее высоким рейтингом как кандидат на пост премьер-министра. В рамках своей должности Нетаньяху выступал по всем основным вопросам повестки дня на основных общественных форумах.