Anteriormente, se le conocía con el nombre de «Santa María de Jesús» o «La Visitación de Nuestra Señora». El topónimo hace alusión a uno de los misterios de la fe cristiana; el nombre del municipio de Santa María Visitación se origina con la introducción de la evangelización en la época de la Conquista de Guatemala, basado en un pasaje bíblico del evangelio de San Lucas, donde la Virgen María, se dirigió a una ciudad ubicada en los cerros de Judá para visitar a su prima Isabel, después de producirse la concepción de Jesús. Así pues, por la ubicación del poblado en tierras altas, le fue puesto el nombre en honor a la «Visitación de Santa María», consignada en el Nuevo Testamento.