Sophia Hayden est surtout connue pour la conception du Pavillon de la femme ("Woman's Building"), réalisé dans le cadre de l'Exposition universelle de 1893. Elle n'a alors que . Le bâtiment est l'enjeu d'un concours de design architectural, le plus important pour les femmes à l'époque. Il doit accueillir des espaces d'exposition internationaux, présentant les réalisations de femmes par pays. Pour ce projet, Sophia Hayden s'inspire de son projet de thèse, un « Musée Renaissance des Beaux-Arts », qui prend la forme d'un grand bâtiment composé de deux espaces, avec des pavillons, plusieurs arches, des terrasses à colonnades, et d'autres caractéristiques classiques, qui tiennent compte de l'influence du style Beaux-Arts. Il est néanmoins critiqué, de nombreuses femmes se plaignant que leurs travaux soient exposés dans une structure séparée en deux espaces.