В том же, 1673 году, Василий Панин назначен воеводой в Севск. Как раз шла война с турками за правобережную Украйну, Севск был важным опорным пунктом, где складировались «магазины» для действующих на юге русских войск. Но Панин с задачей снабжения стрелецких полков провизией не справился. В августе 1674 он даже получил из Москвы "выговор". Возможно, ему помешала жестокая болезнь. В архивах Аптекарского приказа сохранились записи об обращении Панина за лекарствами и в 1673, и в 1674 годах. Буквально через месяц после выговора в Севске он умер.