1953 konzentrierte sich Fonara auf den Giro d’Italia. Nach einem Etappensieg konnte er die Bergwertung für sich entscheiden und wurde zudem Gesamtdritter, 1954 nahm er dann an den beiden wichtigsten Rundfahrten, dem Giro und der Tour de France, teil. Bei der Tour verpasste er als Vierter um 71 Sekunden einen Podiumsplatz, beim Giro wurde er, wie auch beim WM-Straßenrennen dieses Jahres, Siebter. Zum zweiten Mal gewann er die Tour de Suisse.