Participó en el cónclave de 1549-50 en que fue elegido papa Julio III, y desde esa misma fecha perteneció al Santo Oficio creado ocho años antes, en cuyas funciones intervino en los procesos seguidos contra Giovanni Morone, Reginald Pole, Lodovico Castelvetro o los barnabitas. Fue gobernador de Alatri en 1550, de Patrimonio en 1551, cardenal obispo de Albano y de Frascati ese mismo año, y de Porto en 1555. También tomó parte en los cónclaves de abril y mayo de 1555 en que fueron elegidos Marcelo II y Paulo IV; en el de 1559 fue papable con el apoyo del partido español, pero finalmente fue elegido Pío IV.