L'esercito Federale bloccò i tentativi per mettere a punto un piano per formare la "Repubblica del Pacifico" nei territori di California e Oregon ed il Brig. Gen. Albert Sidney Johnston, che comandava le truppe federali del Dipartimento del Pacifico, accusato di collaborazione con i secessionisti si dimise dall'incarico. Raggiunta Richmond, Johnston si unì alla causa confederata, raggiungendo il secondo grado più alto fra i Generali confederati, ma venne ferito mortalmente nella Battaglia di Shiloh.