Papst Pius XII. übertrug Clément-Émile Roques im Jahre 1940 die Leitung des Erzbistums Rennes und nahm ihn am 18. Februar 1946 als Kardinalpriester mit der Titelkirche "Santa Balbina" in das Kardinalskollegium auf. Clément-Émile Kardinal Roques vertrat als Päpstlicher Legat den Papst bei mehreren Feierlichkeiten und nahm am Konklave 1958 teil, dass Johannes XXII. wählte. Kardinal Roques war zudem in den Jahren 1962 und 1963 Teilnehmer der ersten beiden Sessionen des Zweiten Vatikanischen Konzils. Ebenso nahm er am Konklave des Jahres 1963 teil, aus dem Paul VI. als Papst hervorging.