南北戦争の間、アメリカ連合国同調者集団がラセルビルで会して、ケンタッキー州連合国政府を形成した。この政府がフランクフォートの州政府と置き換わることは無かったが、知事として2人が選出された。すなわちジョージ・ジョンソンが1861年11月20日からシャイローの戦いで戦死した1862年4月8日まで、リチャード・ホーズが南軍の降伏した1865年4月9日まで務めた。1865年に終戦になってから間もなく、ケンタッキー州連合国政府は解体された。