В 1976 году Яннис Мочос был репатриирован и обосновался в Афинах. В течение 18 месяцев был безработным. Три года проработал в частной школе . В 1980—1984 году работал исследователем в Университете Крита, с 1984 года преподавал в Университете Крита, в 1986 году стал доцентом на отделении новогреческой филологии. До 1997 года преподавал греческую и иностранную литературу, теорию литературы, тексты и народные песни. Впервые в греческих университетах он преподал курс греческой литературы периода итало-греческой войны, оккупации и Движения Сопротивления. В течение трёх лет он преподавал греческую литературу в Софийском университете.