Professional des del 2005 a l'equip Designa Køkken, Jakob Fuglsang disputa tant competicions en ruta com en BTT. Campió del món amateur de camp a través, va representar Dinamarca en aquesta disciplina als Jocs Olímpics de Pequín de 2008. Aquest mateix any comença a despuntar en curses en ruta, pujant al podi en tres curses franceses (els Tres dies de Vaucluse, la Ronde de l'Oise i la París-Troyes), i a l'agost s'imposà a la Volta a Dinamarca.