Les renforts qui arrivent de Veracruz, comprennent 300 "marines" qui sont organisés en une nouvelle brigade commandée par le colonel Watson. Une nouvelle division est créée, qui comprend la brigade des volontaires commandée par Shields et les marines de Watson, elle se nommera , commandée par Quitman. C'est à ce poste qu'il combat lors des batailles de Contreras et Churubusco. Il commande l'assaut par le sud lors de la bataille de Chapultepec et reçoit la reddition de la citadelle de Mexico. Après la chute de Mexico, le général Scott nomme Quitman gouverneur militaire de Mexico pendant l'occupation américaine — "the only American who ever ruled in the halls of the Montezumas."