Po vpádu varšavských vojsk do Československa 21. srpna 1968 se Josef Khýn jakožto zásadový a čestný člověk postavil za revoltující studenty. Tento postoj vedl posléze k odvolání z funkce 30. dubna 1970. Jednalo se s určitostí jen o záminku, neboť bezpartijního ředitele nemohli normalizátoři potřebovat.