Teile von RAAF und RAN nahmen auch an der Rückeroberung der Philippinen teil. Die Transportschiffe HMAS "Kanimbla", HMAS "Manoora" und HMAS "Westralia" sowie eine Reihe kleinerer Schiffe nahmen an der amerikanischen Landung im Golf von Leyte am 20. Oktober 1944 teil. Einige australische Historiker vertreten die Ansicht, dass die ebenfalls in der Region kreuzende HMAS "Australia" am 21. Oktober das erste Schiff war, das durch Kamikaze-Flieger der Shimpū Tokkōtai attackiert wurde. Der amerikanische Historiker Samuel Eliot Morison stellt dies jedoch in Zweifel. Die "Australia" nahm gemeinsam mit anderen australischen Schiffen an der See- und Luftschlacht im Golf von Leyte teil, wobei die "Arunta" und die "Shropshire" am 25. Oktober in ein Feuergefecht mit japanischen Schiffen in der Surigaostraße verwickelt wurden. Im Januar 1945 deckten Schiffe der RAN die alliierte Landung im Golf von Lingayen, wobei die "Australia" von insgesamt fünf Kamikaze getroffen wurde und 44 Mann ihrer Besatzung verlor. Die Treffer beschädigten sie so schwer, dass sie sich zurückziehen und für Reparaturarbeiten eine Werft anlaufen musste. Nachschubkonvois der US Navy wurden während der Kämpfe auf den Philippinen regelmäßig von australischen Schiffen eskortiert. Eine Pionier- und eine Fernmeldeeinheit der RAAF landeten zur Unterstützung der amerikanischen Truppen auf den Philippinen und die 1TAF griff wiederholt Ziele im Süden des Archipels an.