En agosto de 2005, Bakshi-Doron, junto con los rabinos ortodoxos modernos Norman Lamm y Aharon Lichtenstein, condenó los llamados de otros rabinos prominentes para que los soldados de las Fuerzas de Defensa israelíes desobedecieran sus órdenes de desmantelar asentamientos judíos como parte de la retirada de Gaza.