Electriciens sans frontières intervient également lors de crises humanitaires. Cela a notamment été le cas aux Philippines en 2013 et 2015 à la suite des typhons Haiyan et Ruby ; en 2015 au Vanuatu après le passage du cyclone Pam ; au Népal après le tremblement de terre ; en Haïti après le séisme en 2010 et 2016 ; et en 2017 à Saint Martin et en Dominique à la suite du passage des ouragans Irma et Maria. Depuis le 19 décembre 2017, Electriciens sans frontières est partenaire du Centre de crise et de soutien pour intervenir en cas de crise humanitaire. L'ONG est ainsi intervenue en Indonésie en 2018, après le séisme à Célèbes, au Mozambique en 2018, après le passage du cyclone Idai, et au Liban en 2020, après les explosions dans le port de Beyrouth.