طالب ألفونسو الخامس بالعرش قشتالة من خلال زوجته خوانا التي هي أبنة جوان وإنريكي الرابع ولكن الملكان الكاثوليكيان انتصروا في النهاية بعد أن طعنه الفرنسيين وأيضا أُعلن أبنه جواو نفسه ملك البرتغال ولكن هذا لم يستمر أكثر من أسبوعين واستمر كذلك حتى وفاته، فــ"جواو الثاني" حدا من سلطة النبلاء البرتغال الذين تمتعوا بسلطات خلال عهد والده إما باعدام أو النفي أو بالطاعة، وفي أواخر عهده تم تقسيم العالم في 7 يونيو 1494 بينه وبين القشتاليين، خلفه أبن عمه مانويل الأول الذي يعتبر من أعظم ملوك البرتغال حيث اتسع الإمبراطورية في عهده وعهد أبنه اتساعاً لم يشهد لم مثيل، وبعد هبوب الضعف صبت على الإمبراطورية عند وفاة سبستيان الأول عام 1578 وبعد عامين أي عام 1580 دخلت البرتغال في أزمة خلافة فيما يعرف تاريخياً بـ"أزمة خلافة البرتغالية (1580)" وخرجت أسرة هابسبورغ هي المنتصرة في أخر المطاف تم تحقيق الأحلام لتوحيد التي بدأت منذ أواخر القرن الرابع عشر فيما عرف تاريخياً بـ"أزمة 1383-1385".