Le dernier grand succès de Jessica-Jane Applegate avant les Jeux paralympiques de 2012, a été sa participation au British International Disability Swimming Championships, où elle a remporté trois médailles. Elle a remporté l'argent aux 50m et 100m nage libre, et puis le dernier jour du tournoi, dans une course très serrée avec l'irlandaise Béthanie Firth, elle a remporté la médaille d'or avec un temps de 2:15.23. Ses résultats lui ont permis de se qualifier pour les jeux paralympiques de 2012 à la fois aux 200m nage libre et aux 100m dos crawlé.