Noord-Afrika, samen met Sardinië, Corsica en de Balearen werd heroverd door generaal Belisarius tijdens de Vandaalse Oorlog van 533, en gereorganiseerd als de pretoriaanse prefectuur van Afrika door Justinianus I. Het omvatte de provincies Africa, Byzacena, Tripolitania, Numidia, Mauretanië Caesariensis en Mauretanië Sitifensis, met als hoofdstad Carthago. Na de herovering, door generaal Gennadius, van enkele verloren provincies in Noordwest-Afrika en delen van het zuiden van Spanje (Spania) rond 580, kreeg de prefectuur een nieuwe administratieve indeling onder de naam 'exarchaat van Afrika'. De eerste exarch was generaal Gennadius.