В 1807 году Иоганн Христиан Фабриций, находясь во Франции, получил неожиданное и печальное известие о начале англо-датской войны и бомбардировке Копенгагена. Это сообщение заставило его поспешно отправиться на родину, но волнение, связанное с этими событиями, отрицательно сказалось на здоровье учёного и привели к его преждевременной кончине 3 марта 1808 в Киле.