Au début de la saison, le club de Metz fait parler de lui en équipant ses joueuses de jupes en remplacement du short traditionnel, sous l'impulsion de son président Thierry Weizman. Le , Metz Handball devient le premier club français féminin à accéder au tour principal de la Ligue des champions féminine de l'EHF (2 poules de 4 clubs). En , la demi-centre Kristina Liščević rejoint le Metz-Handball, en tant que joker médical à la suite de la blessure d'Allison Pineau, blessée au genou lors du championnat du monde 2011. La fin de saison est difficile pour le club, qui ne remporte finalement aucun titre pour la première fois depuis la saison 2000-2001. Cet échec coûte sa place à l'entraîneur du club, Sébastien Gardillou, remplacé par Sandor Rac. À la fin de la saison, quatre internationales françaises quittent également le club (Amandine Leynaud, Claudine Mendy, Allison Pineau et Marion Limal) qui se reconstruit en misant sur de jeunes joueuses comme Marie Prudhomme ou Lara González Ortega. Le club parvient également à faire signer l'ailière internationale Paule Baudouin.