Nonostante la riacquistata indipendenza nel 1640, la corona portoghese fu costretta a rinunciare alle sue mire su Ceuta, in favore della Spagna, in seguito alla firma del Trattato di Lisbona (1668). Dopo di esso il Portogallo ha mantenuto solo tre enclave in Nord Africa: Tangeri, Casablanca e El Jadida. Tangeri fu ceduta all'Inghilterra nel 1661 ai sensi del Marriage Treaty come parte della dote di Caterina di Braganza, e Casablanca fu abbandonata dopo il terremoto di Lisbona del 1755. Sotto l'assedio di Muhammad III, fu infine evacuata anche El Jadida il 10 Marzo 1769, ponendo fine alla presenza portoghese in Nord Africa.