Во время мексикано-американской войны был помощником генерала Закари Тейлора, участвовал в сражениях при Пало-Альто и при Ресака-да-ла-Пальма, отличился во время сражения при Монтерее, после которого, 23 сентября 1846 года, получил временное звание майора. В сентябре-октябре 1846 года ездил в Вашингтон с донесением, а когда вернулся, принял участие в сражении при Буэна-Виста. За храбрость при Буэна-Виста Итон 23 февраля 1847 года получил временное звание подполковника.