В мае 1792 года отправился в Польшу, где 1 января 1793 года получил чин секунд-майора. Находясь в Варшаве, был свидетелем бунта, вспыхнувшего 5 апреля 1794 года и спасся от смерти благодаря великодушию одного знакомого польского семейства, которое с огромным риском для себя укрыло его в своем доме. Затем, переодетый, с большой опасностью для жизни добрался до русской батареи, где принял команду над сборным отрядом, с которым и отступил из города и соединился с генералом Игельстромом. Генерал Ферзен, обложив Варшаву, назначил Г. батальонным командиром в Екатеринославский егерский корпус. В сражении под Мациевицами Гангеблов с небольшим отрядом выбил неприятельских стрелков из леса, за что получил чин премьер-майора (29 сентября). На Прагском приступе 24 октября С. Г. Гангеблов находился со своим батальоном в голове колонны генерал-майора Тормасова и в назначенный для приступа час со стрелками пошел впереди колонны, под сильным огнём врага бросился на вал и овладел неприятельской батареей, затем ударил на отступавших поляков в штыки и прежде всех прибыл к мосту, соединявшему Прагу с Варшавой. Узнав о подвиге Гангеблова, Александр Суворов потребовал его к себе и поздравил подполковником (произведен в этот чин 28 июня 1795 года); кроме того, Гангеблов получил золотой знак в память Прагского приступа. После покорения Варшавы Гангеблов находился в корпусе Ферзена, преследовавшего неприятельские войска, спасшиеся из Варшавы, под начальством Вавржецкого.