15 декабря 1942 года генерал-майор Кокорев назначен начальником штаба 2-й ударной армии. С конца февраля до середины июля 1943 года войска армии в составе Ленинградского, Волховского (с 9 марта) и вновь Ленинградского (с 18 апреля) фронтов обороняла рубеж юго-восточнее Шлиссельбурга. В 1944 году армия участвовала в Красносельско-Ропшинской, Нарвской и Таллинской наступательных операциях. 5 октября 1944 года Кокореву было присвоено воинское звание - генерал-лейтенант. В 1945 году составе 2-го Белорусского фронта армия принимала участие в Млавско-Эльбингской, Восточно-Померанской и Берлинской наступательных операциях.