С 1960 Ванг Пао возглавил систему антикоммунистической вооружённой борьбы против движения Патет Лао, поддерживаемого ДРВ и Вьетконгом. Он сформировал и возглавил «Секретную армию», действовавшую в тесном сотрудничестве с ЦРУ США. Гражданская война в Лаосе продолжалась около пятнадцати лет. Авторитет Ванг Пао среди хмонгов превратил эту народность в ударную силу лаосского антикоммунизма. Директор ЦРУ Уильям Колби характеризовал Ванг Пао как «героя Вьетнамской войны».