После завоевания в 1868 году Российской империей территорий Бухарского эмирата было создано административное образование в составе Среднеазиатских владений Российской империи — Зеравшанский округ. В состав данного округа вошли города: Самарканд, Ургут, Каттакурган, Чилек и Пайшанба. Таким образом, впервые территория сегодняшнего Самаркандского района вошла в чётко определённое административное образование. 1 января 1887 года Зеравшанский округ был упразднён, и его территория была включена в состав новообразованной Самаркандской области. Данная область делилась на четыре уезда: Джизакский, Катта-Курганский, Самаркандский и Ходжентский. Территория сегодняшнего Самаркандского района входила в состав Самаркандского уезда области.