W 1791 roku Pétion został na miejsce Sylvaina Bailly’ego wybrany merem Paryża, pokonując w bezpośrednim głosowaniu powszechnym królewskiego kandydata markiza generała La Fayette. Otwarcie krytykował monarchię jako ustrój i króla Francji jako władcę, świadomie pozwolił sankiulotom wedrzeć się do pałacu Tuileries 20 czerwca 1792 i zdemolować jego wnętrza oraz znieważyć rodzinę królewską, a 3 sierpnia w imieniu władz miasta zażądał detronizacji Ludwika XVI. Stało się to zresztą w tydzień później drogą ludowego powstania, które Pétion gorąco poparł, niemniej nie wziął w nim osobistego udziału.