在英國的情報機關秘密情報局的支持下，中情局策動1953年伊朗政變，受此影響，民族陣線被定性為非法組織，其最高領導人遭到逮捕，接受軍事法庭的審訊。雖然身為總理的法茲盧拉·扎赫迪（他被中情局收買協助推翻摩薩台，並幫助沙阿鞏固權力）在名義上掌權，但這次軍事政變奠定了穆罕默德-禮薩·巴勒維成為伊朗最高領導人的地位。在受到全面打壓之下，多位原來是民族陣線的黨員（主要是低級的領導人）成立了一個叫伊朗民族抵抗運動的地下組織。未來的伊朗總理邁赫迪·巴扎爾甘及沙普爾·巴赫蒂亞爾也是這個組織的成員，他們的目的是通過競逐自由公平的選舉來重建民主。他們的活動大抵都只是局限於派發宣傳單張及試圖參選1954年的議會選舉（但選舉存在舞弊，令支持沙阿的議員得益）。不過，伊朗民族抵抗運動在當局的施壓下很快就瓦解。民族陣線在1960年得以重新成立，當中有不少知名的人物，如卡里姆·桑賈比、邁赫迪·巴扎爾甘、阿拉-亞爾·薩利赫、沙普爾·巴赫蒂亞爾、阿迪布·博魯曼德、阿斯加爾·帕爾薩、達瑞許·福魯哈爾、古拉姆·侯賽因·薩迪吉、穆罕默德·阿里·松吉等，他們的目的是扶助摩薩台重新上台，重建君主立憲制。最初，民族陣線看似愈加壯大，但各位領導對於民族陣線的組織、對抗沙阿政權的手段、追求的政體等問題存在分歧。這些紛爭導致民族陣線的高層與激進的學生陷入緊張的關係。巴扎爾甘、馬哈茂德·塔萊加尼（知名的伊斯蘭教士）等人成立了伊朗自由運動，他們的理想是建立一個民主的伊朗，而伊斯蘭教則會在國家和社會上扮演重要的角色（與民族陣線的世俗主義有所不同）。