Am 29. August 1802 zum Général de division befördert, nahm Walther an den Kämpfen in der Schlacht bei Ulm (16./19. Oktober 1805) und der Schlacht bei Austerlitz (2. Dezember 1805) teil und wurde in beiden Schlachten schwer verwundet. Nach seiner Genesung wurde er auch zum Kammerherrn Napoleons ernannt.