El 15 de marzo de 1809, transferido al cuerpo del marqués de La Romana con cuartel general en Gijón, hizo viaje hasta Cádiz y tomó el barco para llegar a su destino pero entretanto la ciudad cayó en manos de los franceses y tuvo que volver atrás y solicitar un nuevo destino. Finalmente el general pasó al ejército del duque del Parque y con él participó en la victoria española de Tamames el 18 de octubre. Dos días después se convirtió en gobernador de Ciudad Rodrigo. Pérez de Herrasti dirigió la defensa de dicha plaza del sitio realizado entre el 26 de abril y el 9 de julio de 1810 por tropas francesas y comandadas por el mariscal de campo Michel Ney. Las tropas francesas estaban compuestas por 65.000 miembros, mientras la guarnición defensora de la ciudad eran 5500 españoles.