Гюнтер Герсо родился в Мехико во время Мексиканской революции. Его родителями были Оскар Герцо (, венгерский иммигрант, и Доре Вендланд, немка по рождению. После смерти отца, случившейся через несколько месяцев после рождения Гюнтера, его мать вышла замуж за немецкого ювелира. Экономический кризис во время революции заставил семью бежать в Европу в 1922 году. Семья вернулась в Мексику через два года, а его мать развелась. Не будучи в состоянии обеспечить детей, она отправила Гюнтера в Лугано (Швейцария), чтобы тот жил со своим дядей-доктором, Гансом Вендландом, который также был влиятельным человеком в мире искусства. Гюнтер, будучи ещё подростком, познакомился с Паулем Клее и жил среди коллекции картин своего дяди, которая включала в себя работы Пьера Боннара, Рембрандта, Поля Сезанна, Эжена Делакруа и Тициана. Во время своего пребывания в Лугано Герсо также встретил Нандо Тамберлани, известного сценографа, познакомившего его с миром театра.