Höfl-Riesch entschied zu Beginn der &lt;a href="Alpiner%20Skiweltcup%202012/13"&gt;Saison 2012/13&lt;/a&gt; den Slalom von Levi für sich, erreichte aber in den folgenden drei Monaten nur noch einen weiteren Podestplatz. Zwar etablierte sie sich auf dem zweiten Platz der Gesamtwertung, doch verlor sie gegenüber der überragenden Tina Maze rasch an Boden und lag Ende Januar bereits mehr als 800 Punkte zurück. Nachdem sie kurz vor Beginn der Weltmeisterschaft 2013 zweimal hintereinander in einem Weltcupslalom ausgeschieden war, wurde sie am 8. Februar 2013 in Schladming vor Maze Weltmeisterin in der Super-Kombination. Zwei Tage später gewann sie die Bronzemedaille in der Abfahrt, wie schon zwei Jahre zuvor in Garmisch-Partenkirchen. Mit der Mannschaft reichte es am 12. Februar 2013 ebenfalls für Bronze. In den letzten Weltcuprennen nach der Weltmeisterschaft folgten noch drei Podestplätze. In der Endabrechnung der Weltcupsaison wurde sie Zweite mit einem Rückstand von 1.313 Punkten auf Tina Maze.