Во время польского восстания под руководством Тадеуша Костюшко Войцех Скаршевский был арестован и 11 февраля 1794 года приговорен военным судом к смертной казни. Избежал казни благодаря личному вмешательству папского нунция Лоренцо Литты и Тадеуша Костюшко.