Apesar da mesquita nunca ter sido terminada, pelo menos conforme os planos originais, alguns autores referem que nela teria existido uma sala de orações com um teto em madeira de cedro que foi utilizada até 1755, quando foi destruída pelo mesmo terramoto que arrasou Lisboa e que também derrubou as colunas centrais. Os materiais da mesquita foram usados ao longo dos séculos pelos habitantes locais para construírem as suas casas e algumas fontes referem que as colunas que atualmente existem são metade das que existiam originalmente.