Wie sein Vater wurde John 1442 zum Vogt von Richmondshire ernannt. Vor Mai 1447 wurde er zum Ritter geschlagen, und im November 1448 wurde er für ein Jahr Sheriff von Yorkshire. Wie sein Vater war John ein Gefolgsmann von Richard Neville, 5. Earl of Salisbury, einem der führenden Anhänger des Duke of York. Im Gegensatz zu seinem alten Vater wurde er damit in die Rosenkriege gegen die Lancastrianer verwickelt. Im Gefolge der Nevilles gehörte er dem Heer des Duke of York an, das 1459 in der Schlacht von Ludlow geschlagen wurde. Während des folgenden Parlaments in Coventry wurde er als Verräter angeklagt. Wie Thomas Harrington konnte er seinen Besitz retten, indem er das Erbe seiner Frau an Treuhänder übergab, die für die siegreichen Lancastrianer akzeptabel waren. Nach dem Sieg der Yorkisten in der Schlacht bei Towton 1461 wurden die Anklagen gegen ihn fallengelassen und er erhielt seinen Besitz zurück.