Mancilla fait partie de l'effectif chilien à la Copa América 2004. Après son départ pour le championnat mexicain, il perd sa place d'international dans son pays. Sa grande forme à Toluca lui permet d'être rappelé en équipe du Chili. Il est sur le banc et entre en jeu lors d'une victoire 2-0 contre le Paraguay le , sa en cinq ans. Il joue également trois jours plus tard contre la Bolivie.