Cảm giác phân biệt chủng tộc tồn tại giữa các công dân Pakistan đối với công dân Bangladesh. Một chế độ chống người Pakistan gốc Bengal trong thời gian Chiến tranh giải phóng Bangladesh đã được thúc đẩy mạnh mẽ bởi những người phân biệt chủng tộc bài Bengal trong quá trình lập quốc, đặc biệt là so với đồng thiểu số Bengal theo Ấn độ giáo. Xung đột này quay trở lại khi một phần Ấn Độ lần đầu tiên được tách thành Tây Pakistan và Đông Pakistan khi công dân Pakistan ngày nay chi phối chính phủ Pakistan gốc. Từ 300.000 đến 3 triệu "người" đã bị giết trong cuộc xung đột kéo dài 9 tháng vào năm 1971. Chính phủ Bangladesh yêu cầu một lời xin lỗi chính thức cho những hành động tàn bạo đó từ nguyên thủ quốc gia Pakistan, cũng như đưa ra xét xử các cựu lãnh đạo quân sự và chính trị, những người đã đóng một vai trò trong hành động quân sự ở Đông Pakistan. Pakistan đã tiếp tục bỏ qua yêu cầu này.