Des de l'octubre de 1990, vuit mesos abans que Croàcia declarés la seva independència (el 25 de juny del 1991) de Iugoslàvia, Knin es convertí en la fortalesa principal dels serbis a la regió, convertint-se finalment en la capital no reconeguda internacionalment de la República Sèrbia de Krajina el 1991. Els líders de Krajina eren natius de Knin: Milan Martić, un antic inspector de policia més endavant sentenciat a 35 anys de presó pels crims de guerra, i Milan Babić, un dentista que després de declarar-se culpable de diversos crims de guerra se suïcidà. Els serbis tingueren el poder de la ciutat fins que fou envaïda per les forces croates durant l'Operació Tempesta el 5 d'agost de 1995.