Für Slowenien nahm er von 1998 bis 2010 an sieben aufeinanderfolgenden Schacholympiaden (+32 =25 −18) und zwischen 1997 und 2013 an acht Europameisterschaften (+13 =34 −11) teil. Auch beim Mitropa-Cup war er erfolgreich. Bei sieben Teilnahmen (+23 =32 −7) holte er dreimal Mannschaftsgold (1997 in Montecatini Terme an Brett 2, 2002 in Leipzig an Brett 2 und 2005 in Steinbrunn an Brett 1) sowie zweimal die Mannschaftsbronzemedaille (1998 in Portorož an Brett 2 und 2003 in Pula an Brett 1). 1997 holte er beim Mitropa-Cup zusätzlich eine Einzelgoldmedaille für sein Ergebnis von 6 aus 9. Bei der Schacholympiade 2012 in Istanbul war Pavasovič nichtspielender Mannschaftskapitän der slowenischen Nationalmannschaft.