Høyden var under USAs administrasjon, som en del av Panamakanalsonen, i store deler av 1900-tallet. Residensen til Panamakanalsonens guvernør befant seg et stykke opp i bakken. Cerro Ancón ble tilbakeført til Panama i 1977. Til tross for sin sentrale beliggenhet er høyden nesten ubebygd, og har et variert dyre- og planteliv.