En août 1939, son unité est envoyée sur le Rhin. En , après que les troupes allemandes aient pénétré en Belgique (Campagne des 18 jours), violant sa neutralité, le général Champon est immédiatement envoyé comme chef de la mission française auprès du roi des Belges, Léopold III qui est alors le chef des armées de son pays. Après la percée des Allemands dans les Ardennes et l'encerclement des troupes Alliées en Belgique et dans le nord de la France, le général Champon est évacué vers l'Angleterre et rentre en France. Il prend le commandement le du d'armée, alors situé entre les Vosges et le Rhin, il résiste sur la ligne Maginot au-delà de l'Armistice du 22 juin. Il est cité à l'ordre de la .