По окончании сезона-2012/13 состоялась встреча Александра Чёрного с представителем спонсора клуба, на которой было объявлено, что в связи с сокращением объёмов финансирования команда прекратит участие в чемпионате России. 31 июля 2013 года на совещании в министерстве спорта Самарской области достигнута договорённость о возобновлении финансирования и сохранении профессионального статуса. Первый сезон обновлённая «Нова» завершила на 6-м месте, а по его завершении укрепила все основные позиции игроками с опытом выступления в Суперлиге. Клуб подписал контракты со связующим Валентином Стрильчуком, центральным Владимиром Съёмщиковым, доигровщиками Дмитрием Макаренко и Олегом Хмелевским, а по ходу сезона — с заслуженным мастером спорта диагональным Романом Яковлевым. В первенстве высшей лиги «А»-2014/15 «Нова» финишировала третьей и стала участником переходного турнира, по результатам которого получила право вернуться в Суперлигу. В августе 2015 года воспитанник клуба Иван Подребинкин в составе старшей молодёжной сборной России стал победителем чемпионата мира U23 в Дубае.