Після 1945 року Нікіш переїхав в радянську зону окупації і згодом став громадянином НДР. До 1953 року викладав соціологію в Берлінському університеті ім. Гумбольдта. У 1953 році в знак протесту проти придушення робітничого повстання в НДР 17 червня 1953 року емігрував на Захід.