Le Second Empire enrichit considérablement le fonds de la chalcographie. 14 fac-similés de dessins et de nombreuses planches furent commandés aux grands graveurs de l’époque, d’après les chefs-d’œuvre de peinture du musée du Louvre. Ainsi, à la suite de l’Exposition universelle de 1853, l'empereur commanda pour francs de gravures d’interprétation. Par ailleurs, le ministère de l'Instruction publique lui donna la "Statistique monumentale de Paris" d’Albert Lenoir et des monographies des "Cathédrales de Chartres et de Noyon" par Jean-Baptiste-Antoine Lassus et Daniel Ramée ; la ville de Paris lui céda l’œuvre de Baltard sur "les Monuments de Paris, Fontainebleau, etc." ; et la bibliothèque impériale lui remit les 907 planches de la "Description de l’Egypte". De plus, d’importantes planches anciennes furent acquises, notamment les deux séries de Jacques Callot, les plus anciennes planches du fonds de la Chalcographie du Louvre : "Siège de l’Isle de Ré" et "Siège de la Rochelle", gravées entre 1628 et 1630 à la demande de Louis XIII. Enfin, le surintendant des Beaux-Arts décida, en 1864, d’affecter à la chalcographie tous les envois de Rome et grands prix de gravure.