Yule ritornò in Inghilterra nel 1843 e sposò sua cugina Anna Maria (m. 1875), figlia del maggior generale Martin White della Fanteria del Bengala (m. 1856). Nel novembre 1843 ella lo riaccompagnò in India, ma ritornò per via della salute cagionevole. Egli fu nominato in un comitato incaricato di indagare la relazione tra l'irrigazione del progettato Canale del Gange e il suo impatto sulla salute pubblica nell'area. Prestò servizio in entrambe le guerre sikh (1845-6 e 1848-9). Nel 1849 prese tre anni congedo prolungato e ritornò a vivere a Edimburgo con sua moglie. Tenne lezioni alla Scottish Naval and Military Academy e scrisse un volume sulle fortificazioni (1851).