En 1994, il devient ingénieur en chef pour la motorisation des écuries de Formule 1 avec un nouveau moteur Peugeot V10 (3,5 litres, 700 chevaux à 14 250 tr/min). McLaren Racing, le premier client, obtient huit podiums sur la saison. Jordan Grand Prix lui succède de 1995 à 1997 avec moins de succès. En 1996, Jean-Pierre Boudy devient directeur technique de Peugeot sport. De 1998 à 2000, Peugeot équipe Prost Grand Prix avec pour meilleure performance une sixième place au Grand Prix de Belgique 1998. Jean-Pierre Boudy quitte Peugeot Sport avec l'arrêt de la motorisation des Formule 1 : son dernier moteur (A20) de 3 litres de cylindrée, développait 800 chevaux à 16 200 tr/min.