En 1991, la course est déplacée sur le circuit de Nevers Magny-Cours, où elle se déroula durant 17 ans. Le transfert à Magny-Cours avait pour but de stimuler l'économie de la région, mais beaucoup dans la Formule 1 se sont plaints de la nature éloignée du circuit. Parmi les faits marquants de l'arrivée de Magny-Cours au Grand Prix de France, on peut citer la finale de Prost lors de 6 victoires à domicile en 1993 et la victoire de Michael Schumacher au championnat 2002 après seulement 11 courses. Les courses de 2004 et 2005 ont été mises en doute en raison de problèmes financiers et de l'ajout de nouveaux circuits au calendrier de Formule 1. Ces courses se sont déroulées comme prévu, mais l'avenir était encore incertain.