マニラ・ベイは第77.4任務群（トーマス・L・スプレイグ少将）に加わり、10月12日にフィリピン沿岸に向けて出撃した。上陸作戦を前に、マニラ・ベイの航空機はレイテ島、サマール島およびセブ方面で日本軍の地上施設を見つけては破壊していった。10月20日に行われたレイテ島上陸作戦の後は、地上部隊支援と空中哨戒のため戦闘機と攻撃機を繰り返し発進させた。