Un mes después de lo acontecido en el mar del Coral, entre el 4 y 7 de junio, se llevó a cabo la batalla de Midway. La compleja Operación MI tendría como objetivo principal la ocupación de las islas Midway para así poder atraer a los portaaviones estadounidenses a una «batalla decisiva» y ampliar su campo defensivo. A su vez, una flota menor tendría que distraer atacando las islas Aleutianas —la 5.ª Flota fue asignada para esta operación—. Mientras, la 1.ª Flota Aérea «"Kidō Butai"» al mando del vicealmirante Chūichi Nagumo, serviría como la vanguardia del "grueso" de la flota de Yamamoto. El "grueso" de Yamamoto comprendía de dos flotas: la 1.ª Flota al mando de él mismo a bordo del "Yamato" y la 2.ª Flota del vicealmirante Nobutake Kondō —la flota de Kondō sería la encargada de desembarcar las tropas para la invasión—.