Im Jahr 1940 begann der Griechisch-Italienische Krieg, als Griechenland sich weigerte, vor den Achsenmächten zu kapitulieren. Obwohl Prokopiou 64 Jahre alt und an Bronchitis erkrankt war, ging er zum Kriegsministerium und bat um eine Entsendung an die Front. Schließlich schrieb er an Premierminister Ioannis Metaxas, dass er sich schäme, zu Hause zu bleiben, wenn seine beiden Söhne für Griechenland kämpften. Metaxas stimmte seiner Bitte zu und Prokopiou reiste nach Albanien, um sich der griechischen Gegenoffensive anzuschließen. Dort traf er seinen Sohn Angelos und begann sofort zu zeichnen und zu fotografieren. Prokopiou starb er in der Nacht des 20. Dezember 1940 an Herzversagen. Er erhielt den posthumen Rang eines Oberst, wurde nach Athen zurückgebracht und mit vollen militärischen Ehren bestattet.