A igreja deste santuário foi destruída no terremoto de 1755, tendo resistido apenas o transepto e a capela-mor, exemplar testemunho do maneirismo português, com a sua abóbada com caixotões marmóreos, as ilhargas em mármore com nicho albergando estátuas, a sepultura da infanta D. Maria e o magnífico retábulo em talha dourada com pinturas de Francisco Venegas e Diogo Teixeira. Também de interesse são as pinturas dos altares laterais e os vestígios manuelinos na fonte. O túmulo da infanta D. Maria foi classificado como monumento nacional em 1910 e a capela-mor em 1923.