"Endicott" hộ tống một đoàn tàu vận tải đi sang Oran vào giữa tháng 4, rồi đi đến Xưởng hải quân Charleston để được cải biến thành một tàu quét mìn cao tốc. Nó được xếp lại lớp với ký hiệu lườn mới DMS-35 vào ngày 30 tháng 5 năm 1945. Được phái sang khu vực Thái Bình Dương, nó đi đến San Diego ba ngày sau khi Nhật Bản chấp nhận đầu hàng. Trình diện để phục vụ cùng Lực lượng Đặc nhiệm 52 tại Okinawa vào ngày 23 tháng 9, nó hoạt động quét mìn tại Hoàng Hải, được cử làm soái hạm của đội quét mìn, và sau đó tiến hành các hoạt động tương tự tại vùng biển nội địa Nhật Bản và khu vực Kure.