Após a Rendição do Japão, Matsui foi julgado pelo Tribunal Militar Internacional para o Extremo Oriente, pela sua inação durante o abate de Nanquim. Matsui expressa vergonha para o abate de Nanking, mas indiretamente culpou o príncipe Asaka Yasuhiko e Tenente-General Yanagawa Heisuke, comandante do 10º Exército, os assassinatos, por não prender os homens sob seu comando direto. Matsui afirmou que alguns oficiais riram quando manifestou indignação pelo ocorrido, e que ao encontrar-se enfermo, ele não poderia intervir.