Dal 1803 divenne residenza reale fino alla conquista napoleonica. Infatti con la Battaglia di Austerlitz del 1805 Napoleone annetté la Baviera. Nel 1809, in seguito alla vittoria riportata nella Battaglia di Wagram, Napoleone nominò Principe di Wagram il fidato maresciallo Louis Alexandre Berthier, che ricevette fra l'altro la Nuova Residenza di Bamberga. Con la capitolazione di Napoleone, Berthier passò al seguito del re Luigi XVIII di Francia e fece ritorno a Bamberga. Ma dopo aver appreso la notizia della fuga di Napoleone dall'Elba, il 1º giugno 1815, Berthier si gettò da una finestra del terzo piano della Nuova Residenza e morì. Una lapide commemora l'evento.