La branche des ducs de Palatinat-Soulzbach définitivement séparée des ducs de Palatinat-Neubourg, ceux-ci héritent du Palatinat électoral à l'extinction de la branche de Palatinat-Simmern, qui survient à la mort de Charles II du Palatinat en 1685 : alors Philippe-Guillaume de Neubourg, duc de Palatinat-Neubourg, de Juliers et de Berg, fils de Wolfgang-Guillaume de Neubourg, devient électeur palatin. Sa sœur aînée ayant épousé l'empereur en 1676, ses cadettes épouseront le roi d'Espagne, le roi du Portuagal et le duc de Parme, de sorte que le sang des Neubourg irriguera les veines de tous les princes et princesses catholiques. La lignée des ducs de Palatinat-Neubourg s'éteint en 1742, et toutes les possessions de cette branche (Palatinat électoral, Palatinat-Neubourg Juliers et Berg) reviennent à la branche cadette des ducs de Sulzbach (Charles-Théodore). En 1777, la mort sans héritier mâle de l'électeur Maximilien III Joseph de Bavière, après des tentatives d'échanges territoriaux avec la maison d'Autriche, permet la réunion de la quasi-totalité des terres de la maison de Bavière sous un seul sceptre. L'ensemble de ces principautés passe à nouveau dans une branche cadette en 1799 (les Palatinat-Deux-Ponts-Birkenfeld-Bischwiller, avec Maximilien), qui donnera la lignée des rois de Bavière. En 1808, le duché est finalement intégré dans le nouveau royaume de Bavière.