Mitte 1990er Jahren übernahm Kurt Dittrich als Cheftrainer den Club und bereits 1999 errang die Damenmannschaft den Staatsmeistertitel, im Jahr 2000 qualifizierte sich Petra Zahrl für die Europameisterschaft in Helsinki, für die Olympischen Sommerspiele 2000 in Sydney und für die Kurzbahneuropameisterschaft in Valencia, bei der sie die Bronzemedaille über 200 m Schmetterling holte. In diesem Jahr holte der Verein in der Damenstaffel über 4×100 und 4×200 m Freistil den Staatsmeistertitel. Im September 2002 wechselte Kurt Dittrich zum SVS Simmering und mit ihm beendete oder wechselten Schwimmer zu anderen Wiener Vereinen.