Innviertel on Ylä-Itävallan nuorin Viertel eli neljännes. Nimensä alue sai vuonna 1779, kun Baijerin perimyssodan päättyessä solmittiin Teschenin rauha, Innviertel liitettiin Itävaltaan ja Innistä tuli Ylä-Itävallan länsiraja. Tuolloin Ennsin arkkiherttuakunta (nykyinen Ylä-Itävalta) oli jaettu neljään osaan ja sen vuoksi tulokasta aluksi kutsuttiin nimellä ”viides neljännes”. Kun Mühlviertel ja Machlandviertel yhdistyivät, uusin alue nimettiin lopulta Innvierteliksi. Vuonna 1809 tehdyssä Schönbrunnin rauhassa Itävalta joutui luovuttamaan Innviertelin Napoleonin liittolaiselle Baijerille. Baijeri otti alueen haltuunsa vuonna 1810, jolloin siitä tuli Baijerin ala-Tonavan alue. Wienin kongressi vuonna 1815 päätti alueen palauttamisesta Itävallalle. Baijerin kuningaskunta luovutti Innviertelin yhdessä muiden alueiden kanssa takaisin Itävallalle Münchenin sopimuksella 1. toukokuuta 1816.