Nach dem Ende seiner Karriere als aktiver Profi arbeitete Günthardt weiterhin im Tennisbereich. Er war für die Schweizer Sportvermarktungsfirma Marc Biver Development, die 1992 von IMG übernommen wurde tätig und baute er den Tennisbereich auf. In dieser Zeit nahm er unter anderem die deutschen Davis-Cup-Spieler Michael Stich und Carl-Uwe Steeb unter Vertrag. Mit der von ihm aufgebauten Sportmarketing-Agentur Vision Sports &amp; Events arbeitete Günthardt unter anderem an der Olympia-Bewerbung von Madrid für die Spiele 2012 mit und war als Berater für die Organisatoren der Schwimmeuropameisterschaften 2004 in Madrid tätig.