Nizami a gravi les échelons de la branche du Pakistan oriental de Jamaat-e-Islami dans les années 1960, après avoir dirigé l'organisation étudiante, Islamic Chhatro Shango (maintenant Bangladesh Islami Chhatra Shibir). Après l'indépendance du Bangladesh, le sheikh Mujibur Rahman, le premier président, a interdit à Jamaat de participer à la vie politique car elle s'était opposée à la guerre de libération, et nombre de ses membres ont collaboré avec l'armée pakistanaise pendant le conflit. Nizami et d'autres dirigeants ont quitté le pays.