Louis M'Fédé revient alors au Cameroun, où il retourne dans les rangs de son ancien club du Canon Yaoundé. En , lui et l'équipe nationale camerounaise prennent leur revanche en remportant la Coupe d'Afrique des nations 1988, battant le Nigeria à l'issue d'une finale où il est titulaire, et dont Emmanuel Kundé est l'unique buteur. Qualifié pour la Coupe du monde 1990 en Italie, il participe au parcours de son pays jusqu'en quarts de finale, titularisé lors de chacune des cinq rencontres jouées par le Cameroun. Replacé au milieu de terrain, il y est associé à Cyrille Makanaky.