El club "bianconero" derrotó por marcador de 4-2 al Napoli en la Supercopa de Italia disputada en Pekín. Buffon sufrió una lesión menor y no pudo estar presente en el primer partido de la liga en la temporada 2012-13 ante el Parma el 25 de agosto. Fue reemplazado por Marco Storari y ganaron el partido por 2-0. Regresó a la alineación titular para el próximo encuentro contra el Udinese Calcio en condición de visitante. El 20 de septiembre, en el primer partido de la Liga de Campeones de la UEFA ante el Chelsea, disputó su partido número 400 con la camiseta de la Juventus en todas las competiciones. El encuentro finalizó con empate 2-2.