В 1794 году Франтишек Белинский принял участие в польском восстании под предводительством Тадеуша Костюшко. Был назначен генеральным комиссаром по провианту и фуражу с чином генерал-майора (22 августа 1794). Организовывал обеспечение и вооружение повстанческой армии, фактически являлся главным квартирмейстером армии. Позднее возглавлял генеральный комиссариат, созданный 6 сентября 1794 года Тадеушем Костюшко для контроля за обеспечением всех дивизий, расквартированных под Варшавой.