Les exemplaires du "Siku quanshu" conservés dans les provinces de Zhenjiang et Yangzhou ont été détruits au cours de la Révolte des Taiping. En 1860, au cours de la Seconde guerre de l'opium, le corps expéditionnaire franco-anglais détruisit l'essentiel des livres entreposés dans l’Ancien palais d'été. Les quatre copies restantes ont quelque peu souffert au cours de la Seconde Guerre mondiale : elles sont aujourd'hui conservées à la Bibliothèque nationale de Chine à Pékin, au Musée national du palais à Taipei, à la bibliothèque du Gansu de Lanzhou, et à la bibliothèque du Zhejiang à Hangzhou.