Sonia Pertlova a joué pour l'équipe nationale tchèque lors de l'Olympiade d'échecs de 2008 à Dresde, en Allemagne. Elle a marqué 4 points en 6 matchs tout en étant traitée pour un cancer. Elle joue aussi lors des championnats d'Europe d'échecs des nations féminins en 2005 et 2009.