След капитулацията на Япония от 2 септември 1945 г., Тоджо се прострелва в гърдите на 11 септември 1945 г. в опит да се самоубие, но е спасен с медицински грижи. На 29 април 1946 г., заедно с други японски военачалници, Тоджо е обвинен във военни престъпления от международен военен трибунал в Токио в хода на т.нар. Токийски процес. Намерен е за виновен и е обесен на 23 декември 1948 г.