Le , il obtient son premier succès en Coupe du monde en remportant la dernière épreuve de la saison 2008-2009, une mass start organisée à Khanty-Mansiïsk. Durant l'hiver, en plus de ses premiers podiums individuels, il décroche une première récompense lors des Championnats du monde. À Pyeongchang, en effet, il fait partie du quatuor autrichien sacré vice-champion du monde de relais masculin. Il y est aussi huitième du sprint et de la mass-start. Lors de la saison 2009-2010, Eder fait son entrée dans le top dix du classement général de la Coupe du monde avec le huitième rang, montant notamment sur un podium devant son public à Hochfilzen, où il est aussi deuxième un an plus tard, pour son seul podium personnel, jusqu'à l'individuel d'Östersund en fin d'année 2013.