È stato convocato 31 volte nella Nazionale brasiliana, debuttandovi il 3 agosto 1988 in amichevole contro l' (2-0 per il Brasile il finale). Ha segnato il suo unico gol in Nazionale contro l' in un'amichevole disputata il 14 ottobre 1989 a Bologna. Con la "Seleção" ha giocato la Coppa America del 1989, svoltasi in Brasile e vinta dai "verde-oro" (una sola presenza), e del 1995 (4 presenze, tra cui quella nella finale persa contro l'Uruguay). È inoltre stato convocato anche per il Mondiale 1998 svoltosi in Francia, nel quale il Brasile ha perso la finale contro i pradroni di casa la ma non è mai sceso in campo nel corso della manifestazione. L'ultima partita giocata da André Cruz in Nazionale è stata l'amichevole del 3 giugno 1998 contro disputata a Parigi.