Дворцовый комплекс возведён в эпохе мусульманского Ренессанса для Средней Азии по приказу Караханида Шамс аль мулька, сына Ибрахима, правившего в Самарканде в 1068—1080 годах. С XIII века, после монгольского завоевания Средней Азии, вплоть до начала XVIII века Рабат-и Малик выполнял роль караван-сарая для остановки торговых караванов.