V roce 2006 se stal závodním pilotem týmu Super Aguri F1, když při Grand Prix Evropy 2006 nahradil japonského pilota Júdži Ideho, kterému byla odebrána superlicence. Odjel celkem 7 závodů a svého nejlepšího umístění (16.) dosáhl při Grand Prix Monaka 2006 a při domácí Grand Prix Francie 2006, která byla zatím jeho poslední velkou cenou F1. Pro zbytek sezony byl angažován další japonský pilot Sakon Jamamoto a Montagny se stal pouze třetím a testovacím pilotem. V pořadí jezdců skončil na 27. místě bez bodu.