Muchos de los trabajos de Vieira Lusitano se perdieron en el terrible terremoto de 1755, siendo el más notable de todos ellos el del techo de la Iglesia de los Mártires, pintado en 1750, y en el que se veía representada la toma de Lisboa por D. Afonso Henriques. De las obras que escaparon al terremoto, citaremos dos paneles en la iglesia de San Roque, "Santo Antonio predicando a los peces" y "Santo Antonio postrado ante Nuestra Señora"; un "San Agustín", en la portería del convento de la Gracia, de 1736; unos cuadros de "San Antonio", "S. Pedro", "S. Pablo", la "Sagrada Familia" y "Santa Bárbara", pertenecientes a la Casa de Povolide y ejecutados entre 1736 y 1740; otra "Sagrada Familia", perteneciente al conde de Assumar; un gran panel representando a San Francisco, del Convento del Niño de Dios; un cuadro de la capilla de la Cartuja; los cuadros de S. Francisco de Paula, en la capilla de su iglesia, y en las capillas laterales, los de "Nuestra Señora de la Conceição", de la "Sagrada Familia" y "Santo António", todos ejecutados en 1765. La capilla de los 7 altares de la iglesia de Mafra tiene un gran cuadro de la "Sagrada Familia"; en la capilla de S. Joaquim al Calvário, hay otro cuadro de la "Sagrada Familia", colocado encima del altar, que pasa por ser uno de sus más bellos trabajos; por último, una "Nuestra Señora de la Concepción", que estuvo en la Junta del Comercio.