Narodil se 15. října 1947 v Chomutově v rodině básníka, novináře a spisovatele Vladimíra Sainera. Chomutov patřil v poválečném Československu k místům s nejznečištěnějším ovzduším a proto když bylo Iljovi Sainerovi 5 let, přestěhovala se rodina kvůli jeho astmatu a alergiím do Prahy. Otec po srpnové okupaci roku 1968 ztratil místo novináře a roku 1969 založil pod hlavičkou Spolku bibliofilů "Nejmenší Nezávislé Nakladatelství", kde vydával malé náklady knih poezie a prózy. Maminka, rozená Hönigová, pocházela z předválečné obchodnické rodiny a pracovala jako prodavačka textilu.