Pada abad ke-15, kekuasaan negara-kota telah melemah. Peperangan di Lombardia dari tahun 1423 hingga 1454 semakin mengurangi jumlah negara yang bersaing di Italia. Perdamaian lalu berlangsung selama empat puluh tahun berikutnya, tetapi pada tahun 1494 Semenanjung Italia diserbu oleh Kerajaan Prancis. Peperangan Italia Raya berlangsung pada tahun 1559 dan sebagian besar negara-negara Italia diserahkan kepada Raja Felipe II dari Spanyol. Perdamaian Westfalen pada tahun 1648 secara resmi mengakhiri kekuasaan Kaisar Romawi Suci di Italia, tetapi Dinasti Habsburg cabang Spanyol (dinasti yang sama yang menjadi Kaisar Romawi Suci) masih menguasai Italia selama Perang Penerus Spanyol (1701–14). Seusai diberlakukannya "Reformatio imperii" pada tahun 1495–1512, wilayah Kerajaan Italia menjadi wilayah yang berada di luar lingkaran kekaisaran di sebelah selatan Pegunungan Alpen. Secara yuridis kaisar memiliki kepentingan untuk mempertahankan Kerajaan Italia, tetapi "pemerintahan" kerajaan hanya terdiri dari utusan kaisar yang diangkat untuk mewakilinya dan gubernur yang ia nobatkan sebagai penguasa negara-negara Italia. Kekuasaan Habsburg di Italia berakhir setelah wilayah tersebut ditaklukkan oleh Prancis setelah masa revolusi pada tahun 1792–9. Beberapa negara boneka Prancis lalu didirikan, dan pada tahun 1806 Kekaisaran Romawi Suci dibubarkan oleh kaisar terakhirnya, Franz II, seusai kemenangan Napoleon dalam Pertempuran Austerlitz.