Na počátku chorvatské války za nezávislost se v roce 1991 Erdut stal součástí mezinárodně neuznané Republiky Srbská krajina. Po vojenské operaci "Oluja" v roce 1995 zde byla uzavřena Erdutská dohoda mezi krajinskými Srby a chorvatskou vládou, v níž namísto vojenského dobytí okupovaných částí Chorvatska upravila mírové začlenění východní Slavonie do suverénního Chorvatska. Po přechodném období správy na základě mandátu OSN (UNTAES) byl roku 1998 Erdut integrován zpět do Chorvatska.