В Смутное время Курский кремль выдержал польские осады 1612 и 1616 годов. В благодарность за спасение во время осады 1612 года, приписываемое небесному заступничеству, куряне основали в кремле Знаменский монастырь. На заключительном этапе Смоленской войны в 1634 году Курск подвергся ещё одному рейду польских войск под руководством Иеремии Вишневецкого. Осада 1634 года, продолжавшаяся несколько дней, также не имела успеха для поляков. Неоднократно нападали на город крымские татары и ногайцы, но крепость так и не была взята. Деревянный кремль сильно пострадал от пожара в 1781 году и в силу утраты прежнего военно-стратегического значения больше не восстанавливался.