Politisch geriet Justus in Gegnerschaft zu Josephus, als dieser zu Beginn des Jüdischen Aufstands in Galiläa erschien und dort die Kontrolle der Aufständischen erweitern wollte. Ob Justus römerfeindlich gesinnt war, ist aber zumindest zweifelhaft. Denn die Angaben in der Vita des Josephus, denen zufolge Justus ein Anhänger des Aufstands war, sind nicht unbedingt vertrauenswürdig. Josephus nahm seinen eigenen Angaben zufolge in Tiberias Verhaftungen vor, Justus kam jedoch schließlich frei. Er floh aus Galiläa, so dass er die dortigen Kampfhandlungen nicht selbst erlebte, und wurde Privatsekretär König Agrippas.