Más tarde, en el contexto de la Guerra de Sucesión española, Pedro II (1667-1706) determinó modernizar las defensas del castillo, que recibió líneas abaluartadas, adaptándolo al tiro de artillería. En el siglo XVIII la estructura del castillo quedó seriamente dañada por el terremoto de 1755. Aun así, se mantuvo ocupado por los hermanos de Palmela hasta 1834, con a extinción de las Órdenes Religiosas en Portugal. Fue entonces ocupado por un contingente del Ejército portugués; así nació allí el explorador Brito Capelo (1841), hijo del comandante de la guarnición.