Button jatkoi McLarenilla kaudella 2016. Button ajoi pistesijoille Venäjällä, Espanjassa ja Monacossa. Button ajoi vaihtelevissa keliolosuhteissa Itävallassa itsensä ruutuun kolme, mutta tippui kuivankelin kilpailussa kuudenneksi. Belgian GP:ssä Pascal Wehrlein törmäsi Buttoniin avauskierroksella, jonka seurauksena molemmat kuskit keskeyttivät kilpailun. Button ajoi pisteille Malesiassa ja Yhdysvalloissa ja saavutti viimeisellä F1-kaudellaan 21 pistettä.