Nach Ausbruch des Peloponnesischen Krieges zwischen den griechischen Hegemonialmächten Athen und Sparta blieb die Stadt weiterhin im Attischen Seebund, obwohl die meisten Poleis der chalkidischen Halbinsel von Athen abfielen. Erst als die Stadt 424 v. Chr. durch Truppen des spartanischen Heerführers Brasidas bedroht wurde, wechselte Akanthos die Seiten. 421 v. Chr. einigten sich Athen und Sparta die kriegerischen Auseinandersetzungen zu beenden. Der Nikiasfrieden sah zwar die Autonomie der Polis vor, jedoch war Akanthos verpflichtet Tribute an Athen zu leisten. Die völlige Freiheit gewann Akanthos wohl erst nach 405 v. Chr. mit der Niederlage Athens bei Aigospotamoi in dem wiederaufgeflammten Krieg gegen Sparta.