În octombrie 1908, după anexarea Bosniei de către Austria-Ungaria, au izbucnit proteste masive în Serbia și Muntenegru. Un număr mare de cetățeni sârbi au cerut declararea războiului împotriva Austro-Ungariei. Ministrul Stepanović a avertizat că Serbia și Armata Sârbă nu erau pregătite pentru război cu o mare putere și a răspuns că trebuiau întreprinse o serie de pregătiri diplomatice, financiare și militare. Declarațiile sale au provocat un val de critici în rândul oamenilor politici de diferite orientări și chiar și în presa sârbă. În consecință, Stepanović a fost demis din funcția de ministru al apărării și a devenit ministru fără portofoliu la începutul anului 1909. Câtva timp mai târziu, în cursul aceluiași an, el l-a asistat activ pe Putnik în pregătirea Armatei Sârbe pentru un viitor război. La începutul anului 1910, Stepanović a devenit comandantul diviziei din zona Morava și și-a asumat sarcina de a pregăti divizia pentru luptă armată.