În 1806 autoritățile franceze de ocupație din Țările de Jos au retrogradat Universitatea din Utrecht la rangul de "école secondaire" (liceu), dar după înființarea Regatului Unit al Țărilor de Jos în 1813 și-a recăpătat fostul ei statut. Leiden, Louvain, Groningen, Utrecht și Gent erau cele cinci universități (în ) ale noului stat, iar Universitatea din Leiden a primit titlul de "eerste hoge school" („prima universitate”). Două dintre universități (Louvain și Gent) au fost incluse pe teritoriului noului stat belgian după separarea acestuia de Regatul Țările de Jos în 1830. Acest lucru a făcut ca Universitatea din Utrecht să fie una din cele trei universități neerlandeze.