1939年初於戈登斯通畢業后，菲利普在达特茅斯皇家海军学院完成了一个学期的学员培训，隨後返回希臘，在那年夏天与病情減緩的母亲在雅典生活了一个月左右。在他的堂兄希腊国王乔治二世的要求下于9月回到英國，並继续接受皇家海军的训练直到第二年作为课程中“最优秀的学员”从达特茅斯毕业。 第二次世界大战期间，他继续在皇家海軍中服役，菲利普于1940年1月被任命为中尉。他在“拉米利斯号”战列舰上執行了4个月的任務，該戰艦負責在印度洋保护澳大利亚远征军的船队，随后也在「肯特号」、「什罗普郡号」和锡兰等地作了短期的派驻。 1940年10月在意大利入侵其故國希腊后，他從印度洋被調往地中海舰队的「英勇号」战列舰上與敵軍作戰。