Pátzcuaro stand während des Reformkriegs (1858–1861) aufseiten der Konservativen und des Kaiserreichs. 1886 wurde die Eisenbahn nach Morelia eröffnet. Die Mexikanische Revolution erreichte Pátzcuaro am 21. April 1913. 1940 wurde vom 14. bis 24. April in Pátzcuaro die First Inter-American Conference on Indian Life (deutsch etwa: „Erste Gesamtamerikanische Konferenz über Indianisches Leben“) abgehalten.