En 1270, en raison du départ de ses parents pour la Neuvième croisade, la jeune Aliénor est éduquée aux côtés de son frère Henri et son cousin Jean de Bretagne au château de Windsor, auprès de leur grand-mère paternelle Éléonore de Provence. Pendant l'absence de ses parents, leur grand-père Henri III meurt le et leur père devient roi d'Angleterre sous le nom d'Édouard . Elle reste très proche de son frère jusqu'à sa mort prématurée en octobre 1274 ainsi que de sa grand-mère, avec laquelle elle est plus proche que ses parents, qu'elle ne revoit qu'à leur retour de croisade en . Un registre royal précise qu'à l'occasion d'une Pentecôte, des perdrix sont achetées pour Aliénor et Henri, et qu'Aliénor reçoit également de l'huile d'amande et de la violette « pour son usage spécial ».