У америчком грађанском рату командовао је армијом Југа у првој бици на Бул Рану све до доласка генерала Алберта Џонстона. Затим је учествовао у операцијама у Тенесију. У бици код Шајлоуа преузео је команду после Џонстонове погибије; после извесних успеха првог дана битке морао се повући на Коринт, који је бранио до краја маја 1862. Бранио је Чарлстон од септембра 1862. до априла 1864, а у бици код Друрис Блафа (), 12-16. маја 1864, спречио је даље напредовање снага Севера. Доцније је узалуд покушавао да заустави надирање Виљема Шермана током Шермановог похода на море. Предао се снагама Севера 26. априла 1865. код Гринсбороа ().