В сборной Перу Хорхе Сото дебютировал в 1992 году и выступал за неё на протяжении 15 лет. Принимал участие в пяти розыгрышах Копа Америка (1993, 1995, 1999, 2001 и домашний турнир в 2004 году). В 2000 году выиграл «бронзу» в Золотом кубке КОНКАКАФ.