Burnett enchaîne deux difficiles saisons où est la cible des critiques des partisans des Yankees. En 2010, il remporte 10 victoires contre 15 défaites et affiche une moyenne de points mérités de 5,26 en 186,2 manches lancées. Il effectue 16 mauvais lancers et est le lanceur des majeures qui atteint le plus grand nombre de frappeurs (19). Il est malmené par les Rangers du Texas et subit la défaite à sa seule partie éliminatoire jouée, en Série de championnat.