Em 66, após uma revolta zelote ter destruído a guarnição romana em Jerusalém, a XII "Fulminata", com "vexillationes" da IV "Cítica" e VI "Ferrata" foram enviadas para retaliar, mas foram impedidas por Caio Céstio Galo, legado imperial da Síria, quando ele percebeu que a revolta era fraca. Em seu caminho de volta, a XII "Fulminata" foi emboscada e derrotada por Eleazar ben Simon na Batalha de Beth Horon e perdeu a sua Águia. Porém, a XII "Fulminata" lutou bem na parte final da guerra e apoiou seu comandante, T. Flávio Vespasiano, na bem-sucedida tentativa de tomar o trono imperial. Ao final da guerra, a XII "Fulminata" e a XVI "Flavia Firma" foram enviadas para guardar a borda do Eufrates, no vau perto de Melitene.