Walaupun Syarikat Penerbangan Air Macau berfungsi sebagai kapal induk Pembawa Bandera Wilayah Pentadbiran Khas Makau, bendera Kawasan Pentadbiran Khas Macau tidak pernah muncul di mana-mana pesawatnya, mirip dengan Syarikat Penerbangan Cathay Pacific dari Hong Kong . Namun, tidak seperti Cathay Pacific, yang membawa Union Jack di pesawatnya sebelum penyerahan SAR Hong Kong pada Tahun 1997, bendera Portugal tidak pernah muncul di mana-mana pesawat Syarikat Penerbangan Air Macau sebelum penyerahan tahun 1999 .