終戦直後の1945年10月9日、洪水被害によって導水路が崩壊、土砂が流入して発電不能となる被害を受けるが、翌1946年（昭和16年）2月13日に復旧・再開された。続いて、残工事である三浦貯水池からの放水を受け取る王滝川導水路の完成が急がれ、1947年（昭和22年）12月下旬に通水可能な状態まで工事が進められた。1948年（昭和23年）2月11日2号機が竣工し、一部導水路工事中のため暫定的に出力3万9,300キロワットでの運転を開始する。導水路の補修を待って同年12月20日に発電所出力は4万4,000キロワットへと増強された。また前後して、戦時設計のため柱以外は木造であった発電所建屋が鉄筋コンクリート構造に改築された。1949年（昭和24年）11月には西野川導水路の改良工事も完成している。