Правители империи Цин, сменившей Мин, также проявляли определённый уровень уважения к гробницам императоров предшествующей эпохи. Императоры Канси и Цяньлун посещали Сяолин во время своих знаменитых «поездок на юг». Попечением мавзолея в эту эпоху занималась бригада из двух евнухов и 40 служащих Восьмизнамённой армии. Хотя мавзолейный комплекс, как и многие другие памятники архитектуры Нанкина, сильно пострадал во время Восстания тайпинов, после подавления восстания цинское правительство приняло определённые меры к его починке.