Dal marzo 2005 al 19 dicembre 2020 il presidente è stato Gianpietro Pagnoncelli, il quale al termine del suo mandato è stato conferito del titolo di presidente onorario della federazione. Gli anni della sua presidenza sono stati caratterizzati dall'organizzazione dell'edizione del 2006 delle Olimpiadi degli scacchi, disputata a Torino e dalla parentesi nella federazione italiana del Super GM Fabiano Caruana (tornato dal 2015 a rappresentare federazione statunitense).