Durante la seconda guerra mondiale Kuala Lumpur fu occupata, dopo una breve battaglia, dall'esercito imperiale giapponese l'11 gennaio 1942. Nonostante che i danni subiti durante la battaglia contro l'operazione di occupazione giapponese fossero stati lievi, nel periodo in cui la città subì il dominio giapponese (gennaio 1942 – agosto 1945) essa vide la perdita di un gran numero di vite umane. Almeno 5000 cinesi furono uccisi a Kuala Lumpur nelle prime settimane di occupazione e migliaia di indiani furono inviati ai lavori forzati per la costruzione della ferrovia di Burma, nel corso dei quali un gran numero di essi morì. I giapponesi occuparono la città fino al 15 agosto 1945, quando il comandante in capo della Settima Armata Giapponese a Singapore e in Malesia, Seishirō Itagaki si arrese agli Inglesi a seguito dei bombardamenti atomici di Hiroshima e Nagasaki.