L'11 novembre il "Janus" fece da scorta alla portaerei inviata ad attaccare Taranto, e il 22 dicembre, mentre copriva il transito del canale di Sicilia da parte della corazzata "Malaya" diretta a Gibilterra, affondò il relitto del cacciatorpediniere saltato su una mina. Nel gennaio 1941 l'unità partecipò all'operazione Excess per poi essere dislocata nella baia di Suda per compiti di protezione del traffico britannico nel mar Egeo; tra il 27 e il 28 marzo il "Janus" partecipò alla battaglia di Capo Matapan mentre il 16 aprile seguente, dopo essere stato dislocato a Malta, prese parte alla battaglia del convoglio Tarigo e il 21 aprile coprì il bombardamento di Tripoli ad opera delle navi da battaglia della Mediterranean Fleet. Il 24 aprile il "Janus" intercettò, durante un pattugliamento al largo di Tripoli, il mercantile armato italiano "Ego" che fu affondato, mentre ai primi di maggio rientrò ad Alessandria scortando un convoglio di rifornimenti per le truppe britanniche in Egitto (operazione Tiger); il 18 maggio salpò per Creta per prendere parte alle missioni di appoggio alle truppe a terra durante la battaglia di Creta: il 21 maggio partecipò all'attacco a un convoglio tedesco scortato dalla torpediniera italiana "Lupo" che si concluse con l'affondamento di dieci unità nemiche, mentre a fine mese contribuì alle operazioni di evacuazione delle truppe britanniche da Creta.