Papst Alexander VII. nahm ihn im Konsistorium vom 14. Januar 1664 als Kardinalpriester in das Kardinalskollegium auf und verlieh ihm am 11. Februar desselben Jahres den Kardinalshut sowie die Titelkirche "Santi Pietro e Marcellino". Kardinal Boncompagni nahm am Konklave 1667 teil, das Papst Clemens IX. wählte. Später nahm er am &lt;a href="Konklave%201669%E2%80%931670"&gt;Konklave von 1669/70&lt;/a&gt; teil, aus dem Clemens X. als Papst hervorging. Er war auch Teilnehmer des Konklave 1676, das Innozenz XI. zum Papst wählte.