В ноябре 2010 года Милан заявил, что решил представлять на международном уровне Канаду, несмотря на интерес к нему со стороны Сербии. 3 февраля 2011 года Борян был вызван в состав основной сборной Канады на товарищеский матч против Греции. В этом матче, который прошёл в Ларисе и завершился поражением канадцев со счётом 0:1, Борян дебютировал в составе команды. Борян стал одним из трёх игроков сборной Канады, которые дебютировали на международном уровне в матче против Греции — двумя другими стали Тозейнт Рикеттс и Дэвид Эдгар. Летом того же года Милан попал в заявку на Золотой кубок КОНКАКАФ 2011, который стал для него первым международным турниром. 1 июня года Борян впервые сыграл на домашнем поле на стадионе «Бимо Филд» в матче против сборной Эквадора, который завершился вничью 2:2. Милан дебютировал в Золотом кубке 11 июня в матче против Гваделупы на стадионе имени Реймонда Джеймса, в котором канадцы одержали победу со счётом 1:0. 12 июня 2012 года он вышел в стартовом составе в завершившемся ничьей 0:0 отборочном матче чемпионата мира 2014 против Гондураса из-за отсутствия основного вратаря Ларса Хиршфельда. Борян был включён в состав сборной Канады на Золотой кубок КОНКАКАФ 2019.