Alus osallistui 1940 Tanskan valtaamiseen, mutta ajoi karille Iso-Beltissä jo operaatio Weserübungin alussa. Sen jälkeen "Schleswig-Holstein" toimi koululaivana. Syyskuun alkuun 1944 mennessä siitä oli tehty ilmatorjunta-alus, mutta saman kuukauden 18. päivänä brittilentokoneet pommittivat sitä osuen kolmesti. Alus syttyi palamaan ja upposi Gdyniassa 12 metrin syvyyteen. Neuvostoliiton laivasto nosti aluksen ja hinasi sen Tallinnaan 26. syyskuuta 1946. Alus oli kuitenkin vahingoittunut liian pahasti, jotta sitä olisi kannattanut korjata. Se upotettiin lähelle Osmussaarta 25. heinäkuuta 1947. Punalaivasto antoi sille uuden nimen "Borodino" ja käytti sitä maalialuksena ammuntaharjoituksissa vuoteen 1955 saakka. Laivan hylkyä suojelee Viron kansallisperintölautakunta. Laivan kello on esillä Dresdenissä Bundeswehrin sotahistoriallisessa museossa.