Pendant le Déluge, le prince Jerzy Sebastian Lubomirski est un des rares aristocrates polonais à ne pas prêter serment à Charles X Gustave. Au contraire, il donne abri à Jean II Casimir Vasa sur son domaine à Lubowla (aujourd'hui en Slovaquie) et lance une contre-offensive des troupes polonaises. Il prête son armée privée, qui combat la bataille de Warka, et reprend Varsovie et Toruń, occupés par les Suédois. En 1660, à la tête des armées privées et royales, le prince Jerzy Sebastian Lubomirski mène une campagne éclair qui prend fin avec la défaite des forces russes à Cudnów et Połonka. En 1661, les relations avec le roi se dégradent et lance une rébellion. Après son échec il se retire en Silésie et est dégradé par le tribunal de la Diète.