En los últimos años de la colonia, la casa fue propiedad del brigadier Mateo García Pumacahua quien luchó contra Túpac Amaru II durante su rebelión y posteriormente participó activamente en la Rebelión del Cuzco junto a los hermanos Angulo. A inicios del siglo XX, la casa fue adquirida por el estado peruano y alojó, primero, un colegio de señoritas y luego a la Comisaría del Cusco que sigue ocupando el inmueble en la actualidad.