W maju 2006 De la Torre objął zespół Jaguares de Chiapas z siedzibą w Tuxtla Gutiérrez, który prowadził przez następne dziewięć miesięcy. W latach 2007–2009 pracował w zarządzie stołecznego klubu Cruz Azul, w którym pełnił rolę wiceprezydenta, zaś do pracy trenerskiej powrócił w 2010 roku, kiedy to został asystentem Luisa Fernando Teny w swojej byłej ekipie, Jaguares. W latach 2011–2013 był natomiast członkiem sztabu szkoleniowego swojego kuzyna José Manuela de la Torre w reprezentacji Meksyku. Ich współpraca zaowocowała zdobyciem Złotego Pucharu CONCACAF w 2011 roku. W styczniu 2014 zastąpił Carlosa Bustosa na stanowisku trenera zespołu Monarcas Morelia, jednak został zwolniony zaledwie miesiąc później, po tym, jak w ostatnich sześciu spotkaniach zanotował zaledwie jedno zwycięstwo, w międzyczasie odpadając z rozgrywek Copa Libertadores już w rundzie wstępnej.