Im 15. Jahrhundert wurden Dorf und Kirche durch die Hussiten zerstört. In der Folgezeit wieder aufgebaut, wurde sie im Verlaufe des Dreißigjährigen Krieges vollständig eingeäschert. Ein abermaliger Neubau der Kirche wurde vermutlich etwa 1656 vollendet, zunächst noch ohne Turm. Die Errichtung des Kirchturms war 1756 vollendet. Kirchenpatron war zu jener Zeit Friedrich Wilhelm von Brühl, welcher neben dem Schloss Martinskirchen unter anderem auch das in Altbelgern befindliche Lehnsgut besaß. Im Verlauf der Befreiungskriege zerstörte schließlich im Jahre 1813 abermals ein Brand die Kirche. Im Dorf einquartierte Kosaken bereiteten auf dem Pfarrhof ein offenes Feuer, welches außer Kontrolle geriet und schließlich eine Scheune in Brand setzte. Anschließend griff das Feuer auf die Kirche, das Pfarrhaus und weitere Gebäude über.