Zwemmer Chad le Clos won twee zilveren medailles in het zwemtoernooi. Het zilver dat hij won op de 100 meter vlinderslag moest hij delen met twee anderen – zowel Michael Phelps als de Hongaar László Cseh. De Singaporees Joseph Schooling won het eerste goud ooit voor zijn land. Het was voor het eerst in de geschiedenis van de Olympische Spelen dat drie zwemmers gelijktijdig als tweede eindigden en drie zilveren medailles werden uitgereikt. Met zijn twee medailles in 2016 werd Le Clos de succesvolste Zuid-Afrikaanse olympiër aller tijden, met een totaalaantal van één gouden en drie zilveren medailles. Andere opvallende prestaties waren het brons van triatleet Henri Schoeman bij de mannen, die als eerste Zuid-Afrikaan een medaille in de triatlon won, en het brons van het mannenrugbyteam.