Am 6. Dezember 1906 ernannte ihn Papst Pius X. zum Bischof von Cassano all’Jonio. Die Bischofsweihe spendete ihm am 23. Dezember desselben Jahres der Generalvikar von Rom, Kardinal Pietro Respighi; Mitkonsekratoren waren Antonio Maria Grasselli, Erzbischof "ad personam" und Bischof von Viterbo e Tuscania, sowie Raffaele Virili, Titularbischof von "Troas". 1907 ernannte ihn der Papst zum Apostolischen Visitator der Priesterseminare Kalabriens, 1908 zum Vikar der Lateranbasilika. 1909 wurde er Berater der Kommission für die Kodifizierung des Codex Iuris Canonici. Ab 1910 arbeitete Pietro La Fontaine als Sekretär der Ritenkongregation und wurde zum Titularbischof von "Carystus" ernannt. Am 5. März 1915 berief ihn Papst Benedikt XV. zum Patriarchen von Venedig. Ein Jahr, am 4. Dezember 1916, darauf nahm er ihn als Kardinalpriester mit der Titelkirche "Santi Nereo e Achilleo" in das Kardinalskollegium auf, er wechselte jedoch 1921 zur Titelkirche "Santi XII Apostoli". Pietro La Fontaine vertrat den Papst als päpstlicher Legat bei mehreren Feierlichkeiten in Italien und im Ausland, darunter bei vier Eucharistischen Kongressen zwischen 1923 und 1933. Zudem nahm er am Konklave 1922 teil, das Pius XI. zum Papst wählte.