През 2008 година отново е пилот на Ред Бул като за втора година негов съотборник е Дейвид Култард. През този сезон Уебър се представя малко по-убедително като записва 9 състезания в зоната на точките. От тях се откроява едно 4-то място в Монако. Завършва 11-и в генералното класиране с 21 точки. След края на сезона, на 22 ноември 2008 г., Марк Уебър претърпява инцидент по време на участието си в благотворително спортно мероприятие в Тасмания. 32-годишният австралиец е карал велосипед близо до Порт Артур в южната част на острова, когато го удря лек автомобил. Няма опасност за живота му. Джоф Донохю обяснява, че е твърде рано да се преценява дали травмите могат да се отразят на подготовката на Марк Уебър за сезон 2009 във Формула 1.