Sein Debüt im Dress der mexikanischen Nationalmannschaft feierte Medina am 22. September 1993 in einem Testspiel gegen Kamerun, das 1:0 gewonnen wurde. Die letzten vier seiner insgesamt sechs Länderspieleinsätze bestritt Medina im Februar 1998 im Rahmen des CONCACAF Gold Cup 1998 in den USA. Sein letztes Spiel war der 1:0-Finalsieg gegen den Gastgeber und Mexikos Erzrivalen USA am 15. Februar 1998.