Svartahavsflottan anses ha grundats av Grigorij Potemkin den 13 maj 1783 och deltog 1790 i krig mot turkarna. Staden Novorossijsk kom att grundas 1838 som en östlig bas för svartahavsflottan på initiativ av amiralerna Michail Lazarev och Nikolaj Rajevski efter det att kustlinjen blivit rysk 1829 genom Rysk-turkiska kriget (1828–1829). Flottan deltog även aktivt mot osmanerna under första världskriget, rumänerna under andra världskriget, och georgierna under 2008 Sydossetienkriget.