"মাটির ময়না" ষাটের দশকের শেষভাগে ঊনসত্তরের গণঅভ্যুত্থান থেকে ১৯৭১ সালে পাকিস্তানের বিরুদ্ধে বাংলাদেশের স্বাধীনতা যুদ্ধের পূর্বের অশান্ত সময়ের পটভূমিতে যুদ্ধ ও ধর্মের কারণে বিচ্ছিন্ন একটি পরিবারের গল্প। পরিচালকের মাসুদের ছেলেবেলার প্রেক্ষাপটে নির্মিত আত্মজীবনীমূলক চলচ্চিত্রটি আনু (নুরুল ইসলাম বাবলু) নামের এক কিশোর চরিত্রের জীবনের গল্পের মধ্যে তুলে ধরা হয়েছে। আনুর বাবা কাজি (জয়ন্ত চট্টোপাধ্যায়) একজন ধর্মান্ধ মুসলিম, যিনি হোমিওপ্যাথিক ওষুধের অনুশীলন করতেন। আনুর মা আয়েশা (রোকেয়া প্রাচী) একসময় প্রফুল্ল মেয়ে ছিলেন, যিনি বিবাহের পর কাজির ধর্মান্ধতার কারণে ক্রমশ বশীভূত হয়ে পড়েন। আনুর ছোট বোন আসমা। কাজির কনিষ্ঠ ভাই মিলন পাকিস্তানের সামরিক শাসনের বিরুদ্ধে প্রতিবাদ করে এমন স্থানীয় রাজনীতিতে জড়িত। যিনি বামপন্থী চিন্তার অনুসারি। কাজির অপছন্দ স্বত্তেও তিনি আনুকে হিন্দু উৎসব আর নৌকা বাইচ দেখাতে নিয়ে যান। চলচ্চিত্রে লোকগান, পুঁথিপাঠ, চৈত্রসংক্রান্তি তথা চড়ক পূজা, সূচিকর্ম, গ্রামীণ মেলা, বাহাস ইত্যাদি আবহমান ধর্মনিরপেক্ষ বাংলার সংস্কৃতি চিত্র দেখানো হয়।