Durante il celebre assedio della Mirandola del 1511 da parte di papa Giulio II, 17 gennaio un proiettile "grande come una testa d'uomo" sparato da una mezza colubrina dal castello colpì la cucina della canonica, situata a fianco della camera in cui alloggiava il papa, ferendo 4 soldati, di cui uno gravissimo. A guerra finita il proiettile venne donato dal papa come "ex voto" per essere scampato alla morte al santuario di Loreto, dove è conservata appesa all'interno della Santa Casa di Nazareth, sul lato meridionale. Al termine dell'assedio la chiesa, insieme al "borgo di sotto", venne completamente rasa al suolo nel 1512 da Giovanni Francesco II Pico della Mirandola e ricostruita un chilometro più a nord; ben presto demolita a sua volta per ragioni belliche e poi riedificata nell'attuale posizione.