Maria meurt lors de l'accouchement de leur premier-né, le bébé ne survit pas non plus. Peu de temps après cette tragédie personnelle, Molteno quitte son domaine et rejoint un kommando boer. Il prendre ainsi part à la guerre d'Amatola de 1846-1847 , une guerre qui se termine par l'annexion des territoires Xhosa par l'empire britannique.