Finalizada la Segunda Guerra Mundial, Pirenne continuó la redacción de "Grandes corrientes de la Historia Universal" y durante cinco años tuvo una actividad intensa al servicio del Leopoldo III. Así, como secretario del rey, estuvo activo en la agitada política belga de ese periodo. Durante esos años dejó de lado su trabajo sobre Egipto antiguo para centrarse en la historia universal. Cuando el rey abdicó en 1950, Pirenne fue nombrado conde.