15 мая 1992 года Славко Лисица присоединился к Войску Республики Сербской. Летом—осенью того же года принимал участие в операции «Коридор». В ВРС возглавлял 2-ю бронетанковую бригаду, тактическую группу 1-го Краинского корпуса, оперативную группу «Добой». 3 мая 1993 года был произведен в генерал-майоры. Летом того же года создал и возглавил Центр военных школ ВРС им. Райко Балача. 30 сентября 1994 года был отправлен на пенсию.