Die &lt;a href="Snooker-Saison%202016/17"&gt;Saison 2016/17&lt;/a&gt; begann schwächer und bis zur UK Championship kam er bei keinem Turnier über die dritte Runde hinaus. Im Barbican Centre von York erreichte er aber mit dem Halbfinale sein zweitbestes Ergebnis bei diesem Turnier. Anschließend erreichte er bei den Scottish Open und mit einem 9:4-Sieg über den Weltranglistendritten John Higgins bei dessen Heimatturnier holte er sich seinen dritten Sieg bei einem Ranglistenturnier. Beim Masters kam er direkt danach ein weiteres Mal ins Halbfinale. Wie schon bei der UK Championship zuvor vereitelte Ronnie O’Sullivan seinen zweiten Finaleinzug. Das dritte Halbfinalergebnis in der Saisonstatistik erzielte er beim World Grand Prix. Damit war er auch für die Players Championship qualifiziert, die ab diesem Jahr ein Turnier für die Top 16 der Ein-Jahres-Rangliste war. Dort gelang ihm nach zuletzt fünf Niederlagen in Folge wieder ein Sieg gegen die Nummer 1 Mark Selby und nach einem 6:5-Sieg über Ding Junhui der Finaleinzug. Judd Trump drehte einen 2:5-Rückstand in eine 8:5-Führung und gewann das Endspiel schließlich mit 10:8. Die Saison rundete Marco Fu mit dem Erreichen des Viertelfinals bei der Weltmeisterschaft ab, das er diesmal deutlich mit 3:13 gegen Titelverteidiger Mark Selby verlor, der anschließend zum dritten Mal Weltmeister wurde. Für Fu bedeutete es die Rückkehr auf Platz 6 der Rangliste und mit 39 Jahren das beste Ergebnis seiner Karriere.