En 1945, Rougier retourne rétrospectivement le reproche de la stratégie d'affamer les peuples contre Adolf Hitler en usant pour la décrire d'une expression nouvelle: la « guerre zoologique », formule ambiguë qui, redécouverte dans les années 2010, donnera lieu à un malentendu tenace. En effet, à partir de son ouvrage "Les Hommes de Pétain", paru en 2011 - ouvrage d'ailleurs critiqué (avec ceux de Philippe Randa) par Bénédicte Vergez-Chaignon, spécialiste de la Seconde Guerre mondiale et de l'Occupation - le politologue et essayiste Philippe Valode soutiendra invariablement que Rougier, pour critiquer les nazis, est allé « jusqu'à utiliser l'expression de guerre zoologique, ce qui signifie, sans doute, dans son esprit, que les nazis tuent les Juifs comme des animaux ». Cependant, Rougier n'utilise apparemment cette expression qu'à la fin ou après la fin de la Seconde Guerre mondiale en Europe, dans un ouvrage paru au Canada, "Créance morale de la France" (1945), et l'universitaire Mathieu Marion, spécialiste de Rougier, l'interprète dans un tout autre sens. D'après lui, ce que Rougier condamne, c'est « la stratégie mise en oeuvre par Hitler pour affamer des nations entières (d'Europe de l'Est) afin de les affaiblir et d'élargir ainsi le Lebensraum du Reich allemand ».