В начале войны со Швецией (1655) Пётр Гембицкий вместе с краковским капитулом уехал в Спишское староство в Силезии. Он был сторонником избрания на польским трон шведского короля Карла Х Густава при условии, что он примет католичество, гарантирует привилегии духовенства и примет участие в войне против украинских казаков и русских.