François Le Fort, Sohn des Kaufmanns und Drogisten Jacques Le Fort und Françoise Lect, Tochter des Generalstaatsanwalts Pierre Lect, war der jüngere Bruder von Ami Le Fort. 1678, während des Russisch-Türkischen Krieges (1676–1681), heiratete er Elisabeth Souhay, Tochter von Francois Souhay, einem französischen Oberst im Dienst des Zaren.