Bonaly comenzó la temporada con dos medallas internacionales senior: oro en el Gran Prix Internacional de París en 1990 y bronce en los Skate Electric de 1990. En su última actuación como junior, se alzó en lo alto del podio de Campeonato Mundial de 1991 en Budapest, Hungría. Después de obtener su tercer título nacional, compitió en el Europeo de 1991 en Sofía, Bulgaria. Logró la medalla de oro por delante de dos patinadoras alemanas, Evelyn Großmann y Marina Kielmann.