Därefter började en ny uppblomstring fram till den för förödande jordbävningen 1 november 1755 då 2/3 av staden lades i ruiner och 20-30.000 människor omkom. Jordbävningen och Brasiliens självständighet i början av 1800-talet ledde till en period av ekonomiskt förfall, som Lissabon först i början av 1900-talet började återhämta sig från.