Im November 1942 wurde er Kommandeur des 18. Infanterie-Regiments der “Acqui”-Division in Korfu, das seit dem Griechisch-Italienischen Krieg von Italien besetzt war. Am 8. September 1943, nachdem die Verhandlungen mit dem Oberkommando der Wehrmacht gescheitert waren, lehnte er es ab, sich unehrenhaft zu ergeben und organisierte die Verteidigung der Insel mit Hilfe der griechischen Partisanen der Papas Spiru. Die Regierung Badoglio sandte jedoch nicht die versprochene Hilfe, sodass Lusignani, ohne weitere Befehle erhalten zu haben, nach zwölf Tagen durch Angriffe der Wehrmacht überwältigt und am 25. September gefangen genommen wurde. Zusammen mit seinen Offizieren wurde er in der alten Festung Angelokastro der Stadt Korfu erschossen. Die Leichen der Offiziere wurden auf Befehl von Hubert Lanz „mit dem Schiff auf das Meer hinausgefahren und beschwert an mehreren Stellen versenkt“. Der Leichnam wurde nie gefunden.