Début aout, aux championnats d'Europe de Budapest (Hongrie), Gilot participe avec Yannick Agnel, William Meynard et Alain Bernard au relais 4 × nage libre favori au départ et dont Gilot est premier relayeur. Il termine son relais en 48 s 47 à deux dixièmes du Russe Evgeny Lagunov (48 s 23). Par la suite, les Français ne parviennent pas à combler leur retard sur des Russes qui remportent le titre européen, les bleus devant se contenter comme souvent de la médaille d'argent. Il remporte le dernier jour de compétition la médaille de bronze du nage libre en 21 s 76. Course dominée par Frédérick Bousquet son compère du Cercle des nageurs de Marseille en 21 s 49. Une heure plus tard, il prend part avec ses coéquipiers Camille Lacourt, Hugues Duboscq et Frédérick Bousquet au relais 4 × quatre nages dont il conclut avec un chrono lancé de 47 s 35 une course maitrisée de bout en bout par les Français qui remportent avec deux secondes d'avance sur la Russie, le premier titre européen du relais quatre nages. Ce titre représente ainsi le premier pour Fabien Gilot en grand bassin qui au terme de cette journée riche déclare « En relais, j'avais à cœur de valider la progression de cette année. J'ai su à midi que je ferai la course (à la place d'Alain Bernard). On peut mettre des nageurs le matin, d'autres le soir. On est en train de devenir une grande nation. Je viens du donc progresser sur était vraiment significatif. Je commence à comprendre le , c'est bien pour le  ».