Aunque todavía estaba sana y activa, su carrera comenzó a desacelerarse en la década de 1890. Sin embargo, creó una versión más grande de "Roma" para el Palacio de Bellas Artes en la Exposición Mundial Colombina de Chicago de 1893. Para la misma exposición, también creó "Child with Calla Lily Leaves", una fuente de bronce con un querubín alado en un tallo sobre un lavabo decorado con hojas y parras representativas del emergente estilo Art Nouveau. Esto se exhibió en el centro del Pabellón de Honor del Edificio de la Mujer en la exposición. Una réplica de esta fuente fue hecha a petición de Mariana Porter, y está ubicada en West Newton, MA en la esquina de Chestnut y Highland Streets, instalada en memoria de la amiga íntima de Whitney, Catherine Porter Lambert (1817-1900). Su última gran obra de arte fue la creación de la escultura a partir del modelo de la escultura de Charles Sumner de 1875. Fue terminado en 1902 y está instalado en Harvard Square.