Kurz nach Ausbruch des Krieges hatte Bierce sich bei einem Regiment in Indiana gemeldet und war dort als Scout eingesetzt worden. Er beteiligte sich an den Vorbereitungen der Schlachten von Shiloh und Chickamauga, wurde zweimal verwundet (so am 23. Juni 1864 während des Atlanta-Feldzugs am Kennesaw Mountain) und für seine Tapferkeit mehrfach befördert, so dass er am Ende des Krieges den Rang eines Titularmajors innehatte.