El Instituto Nacional se destaca por participar en sucesos importantes de la historia de Panamá. La primera gesta patriótica que realizaron los estudiantes del Instituto fue la “Jornada Heroica” del 12 de diciembre de 1947, debido al rechazo del Tratado Filós-Hines, relacionado con la ilegalidad de las bases militares implantadas en Panamá por los Estados Unidos durante la Segunda Guerra Mundial, con el pretexto de brindar seguridad a la Zona del Canal de Panamá. También se destaca el “Movimiento Cívico“ realizado el 19 de marzo de 1958. Otra de las gestas la comprende la Operación Soberanía del 2 de mayo de 1958, donde se depositaron unas 75 banderas panameñas en la Antigua Zona del Canal de Panamá.