С февраля 2006 по март 2007 года корабль прошёл средний ремонт на судоремонтном заводе в Новороссийске. В начале 2008 года возвращён в состав сил постоянной готовности и с 18 по 20 марта в районе Новороссийска сдал комплекс задач совместного плавания и ведения морского боя совместно с БПК «Керчь». С 8 августа 2008 года участвовал в вооружённом конфликте в Южной Осетии. При ночной заправке 22 августа 2008 года произошёл разрыв трубопровода с попаданием топлива на газотурбинный генератор, пожаром в кормовом машинном отделении и гибелью матроса С. С. Николенко. После частичного устранения последствий аварии 2 сентября «Сметливый» самостоятельно вернулся в Севастополь.