De bouw van het stenen Kremlin van Nizjni Novgorod begon in 1500 met de bouw van de Ivanovskaja-toren; de belangrijkste werkzaamheden begonnen in 1508 en tegen 1515 was een grandioos gebouw voltooid. De eiken muren die de oude vestingwerken vormden, werden verwoest door een enorme brand in 1513. De twee kilometer lange muur werd versterkt door 13 torens (een ervan - Zatsjatskaja - bevond zich aan de oever van de Wolga; niet bewaard gebleven, maar werd herbouwd in 2012) . Deze "stenen stad" had een permanent garnizoen met solide artilleriewapens. Met de val van Kazan verloor het kremlin van Nizjni Novgorod zijn militaire betekenis en later huisvestte het de stad en de provinciale autoriteiten.