All'atto dell'entrata in guerra dell'Italia, il 10 giugno 1940, il 9º Stormo si trova basato sull'aeroporto di Viterbo, operante in forza alla 4ª Squadra aerea. Nel mese di settembre lo stormo partì da Alghero per l'Africa settentrionale italiana, assegnato alla 5ª Squadra aerea. Rientrato in Italia al seguito dei resti del 9º Stormo, praticamente decimato nel corso delle operazioni belliche riprese subito a combattere sul fronte greco meritandosi una terza Medaglia d'argento al valor militare.