Zakon Maltański i Niemcy nawiązały stosunki dyplomatyczne w 2017, jednak historia stosunków roboczych jest dłuższa. Nawiązanie stosunków dyplomatycznych było wyrazem uznania rządu RFN dla działalności charytatywnej Zakonu, zwłaszcza w czasie kryzysu uchodźczego w 2015. Współpraca Zakonu Maltańskiego i Niemiec dotyczy przede wszystkim kwestii pomocy humanitarnej.