La carriera da professionista di Miyuki Takahashi inizia nel 1997, con la maglia delle NEC Red Rockets. Già nella stagione 1999-00, Miyuki riesce a vincere il campionato giapponese. Al termine del campionato, viene convocata per la prima volta in nazionale. Nel 2001 con la nazionale vince la medaglia di bronzo al Montreux Volley Masters e partecipa alla Grand Champions Cup, dove viene premiata per il miglior servizio. Nella stagione 2002-03 vince nuovamente il campionato giapponese. Nell'estate del 2003 perde la finale del campionato asiatico e oceaniano, ma viene eletta miglior schiacciatrice della manifestazione. Un anno dopo vince la medaglia di bronzo al Trofeo Valle d'Aosta. Nella stagione 2004-05 vince il suo terzo campionato giapponese. Al World Grand Prix 2005 viene premiata come miglior realizzatrice, mentre al Campionato asiatico e oceaniano dello stesso anno vince la medaglia di bronzo.