Houvenaghel è cresciuta ad Upperlands vicino a Maghera. Ha frequentato la scuola elementare della contea di Ampertaine ad Upperlands e la Rainey Endowed Grammar School di Magherafelt. Ha studiato odontoiatria all'università di Dundee, dove ha incontrato suo marito. Dopo le gli esami, divenne dentista presso la Royal Air Force, commissionata come luogotenente di volo presso una Commissione di servizio il 6 agosto 1998 e promossa a capo squadra il 6 agosto 2003. Completando la sua commissione nell'agosto 2004, Houvenaghel ha assunto un posto part-time presso un ambulatorio dentale locale per contribuire a finanziare le sue ambizioni come ciclista. Ha gareggiato sia su strada che su pista, anche se è specializzata in quest'ultima. Ha rappresentato la Gran Bretagna in vari campionati mondiali di ciclismo e ai Giochi olimpici del 2008, in particolare vincendo la medaglia d'argento ai Giochi olimpici di Pechino e l'oro nell'inseguimento a squadre ai Campionati mondiali di pista 2008, 2009 e 2011. Ha anche vinto molti titoli nazionali britannici e rappresentato l'Inghilterra ai Giochi del Commonwealth 2006 e l'Irlanda del Nord ai Giochi del Commonwealth 2010. Houvenaghel abita in Cornovaglia, in Inghilterra.