Měsíc poté, co byl jeho nástupce uveden do úřadu, Somoza použil armádu k provedení puče. Prezident byl parlamentem prohlášen za „neschopného vykonávat úřad“ a místo něj sloužil Somoza. Ten se pak vrátil do úřadu v roce 1951, dohodl se s konzervativci a železnou rukou ovládal svou vlastní liberální stranu; nečelil tedy žádné opozici. To mu dalo možnost, aby nashromáždil obrovské osobní jmění. Dne 21. září 1956 byl postřelen básníkem Rigobertem Lópezem Pérezem. Smrtelně raněný byl letecky převezen do Panamského průplavovévho pásma, kde o týden později zemřel. Jeho nejstarší syn Luis Somoza Debayle, který byl v době otcovy smrti předsedou sněmovny, převzal vládu, v roce 1957 byl sám zvolen do funkce prezidenta a vláda rodiny Somozů pak pokračovala až do roku 1979.