Im Oktober 1459 (Schlacht von Ludlow) und im Juli 1460 (Schlacht von Northampton) kämpfte er auf der Seite der Yorks, zusammen mit den Truppen von Richard Neville, 16. Earl of Warwick. Bei dem entscheidenden Sieg des Hauses York in der Schlacht von Towton kämpfte Baron Clinton an der Seite von Edward, Earl of March, dem späteren Eduard IV.