1963 lämnade Wyer Aston Martin för att bli chef för Ford Advanced Vehicles (FAV) och leda utvecklingen av Ford GT40. Satsningen ledde till två vinster på Le Mans, 1966 och 1967 och seger i Sportvagns-VM för Ford 1966 och 1967 i klassen S+2.0, (sportvagnar med motorer över två liters slagvolym).