1910 erhielt Wellcome die britische Staatsangehörigkeit. Im selben Jahr reiste er in die Panamakanalzone, um einen Bericht über die dortigen sanitären Einrichtungen zu verfassen. 1924 führte Wellcome seine kommerziellen und nicht-kommerziellen Aktivitäten in der Holding "The Wellcome Foundation Ltd" zusammen. 1932 wurde er zum Ritter geschlagen und zum "Honorary Fellow" der Royal College of Surgeons of England ernannt. Er starb 1936 im Alter von 82 Jahren in einem Londoner Krankenhaus an Lungenentzündung. Nach seinem Tod wurde der Wellcome Trust gegründet.