La "Midway" lanciò il primo aereo il 15 settembre, giorno dello sbarco su Morotai, e proseguì supportando alle truppe impegnate in battaglia e fornendo copertura aerea alle navi che portavano rifornimenti sull'isola fino al 22 settembre. Dopo aver fatto rifornimento di carburante alla base di Mios Woendi, riprese le operazioni aeree su Morotai.