Au regard des grands espoirs fondés par cette équipe, cette élimination prématurée fut un véritable traumatisme, et Bielsa subit une avalanche de critiques. Pourtant, il fut tout de même reconduit dans ses fonctions, et en profita pour obtenir deux résultats majeurs : une finale de Copa América, perdue contre le Brésil (2-2, 2-4 t.a.b) ; une médaille d'or aux Jeux olympiques d'Athènes, succès inédit pour le football argentin. C'est finalement à la surprise générale "qu'El Loco" démissionne de son poste à la rentrée 2004, après un succès 3-1 au Pérou en qualifications pour la Coupe du monde 2006.