Der 1,94 m grosse Augustin Maillefer gewann 2010 bei den Junioren-Weltmeisterschaften den Titel im Vierer mit Steuermann. Bei den Olympischen Jugendspielen 2010 in Singapur trat Maillefer im Einer an und belegte den neunten Platz. 2011 erreichte er im Einer den sechsten Platz bei den Junioren-Weltmeisterschaften. 2012 ersetzte er im Schweizer Doppelvierer seinen älteren Bruder Jérémy Maillefer. In der Besetzung Florian Stofer, Nico Stahlberg, André Vonarburg und Augustin Maillefer belegte die Schweizer Crew den zwölften Platz bei den Olympischen Spielen 2012.