Argentiinan maajoukkueessa Abbondanzieri pelasi 49 ottelua vuosina 2004–2008. Hän oli joukkueen ykkösmaalivahti vuoden 2006 MM-kilpailuissa, joissa hän loukkaantui tappioon päättyneessä puolivälieräottelussa Saksaa vastaan ja joutui vaihtoon Argentiinan vielä johtaessa ottelua, sekä vuosien 2004 ja 2007 Copa Américassa.