Los radicalizados por los acontecimientos recientes, los reformadores, en el área aún nominalmente de la Mancomunidad y en el exilio, pronto estaban trabajando en los preparativos nacionales de insurrección. Tadeusz Kościuszko fue elegido como su líder; el general popular vino del extranjero y el 24 de marzo de 1794 en Cracovia declaró un levantamiento nacional bajo su mando. Kościuszko emancipó e inscribió en su ejército a muchos campesinos, pero la insurrección luchada, fuertemente apoyada también por las masas plebeyas urbanas, demostró ser incapaz de generar la necesaria colaboración y ayuda extranjeras. Terminó suprimida por las fuerzas de Rusia y Prusia, con Varsovia capturada en noviembre. La tercera y última partición de la Commonwealth fue emprendida de nuevo por las tres potencias de partición, y en 1795 la Mancomunidad polaco-lituana dejó de existir.