Вернувшись в Лион после перемирия 22 июня 1940 года, он отказался от должности министра здравоохранения, которую предложил ему председатель Совета министров Франции, Филипп Петен. Он, правда, принял президентский Национальный Ордена Врача, созданный в октябре 1940 года при режиме Виши, который усилил государственный контроль организации медицинской службы, поддерживал numerus clausus (ограничение доли представителей какой-либо группы населения в общей численности студентов учебных заведений. Такие ограничения могли иметь расовое, национальное или религиозное основание) в медицинской сфере, и сыграл важную роль в исключении еврейских врачей, путями доносов и особенно за счет процесса опустошительным «свободных» практик. Через несколько лет после войны, он сказал, что он ушёл в отставку, потому что он не согласен с директивой государства. Он оправдывал свое отношение, заявив, как и другие защитники, что режим служил щитом против оккупантов. Как и много людей, которые сотрудничали с Виши, он был сильно обеспокоен и минимизировал свое участие.