Durch Pater Pius Kolb erfuhr nicht nur die Bibliothek eine reiche Vermehrung, sondern auch das Münzkabinett. Er erlangte vertiefte Kenntnisse der Handschriften, sodass unter seiner Hand mehrere Werke aus dem frühen und hohen Mittelalter wieder auftauchten. Auch legte Pius Kolb einen Katalog an, den Franz Weidmann, ein Chronist und Nachfolger Kolbs, mit folgenden Worten lobt: «Sein vortreffliches Handschriftenverzeichnis [ist] jedem Forscher des Althertums gleichsam das sehende Auge und die leitende Hand.» Allein die Handschriften, die von den Zürchern im Zuge des Zweiten Villmergerkrieges 1712 entwendet worden waren, konnte er nicht zurückgewinnen. Er begleitete seine Handschriften nach Rorschach, als die Bibliothek in St. Gallen umgebaut wurde, wo er bis zu seiner Erkrankung blieb und u. a. Bekanntschaft mit dem später berühmt gewordenen Abt von St. Blasien schloss, Abt Martin Gerbert.