Como esta rebelión amenazaba con cortar las comunicaciones entre Goyeneche y el Perú, el virrey José Fernando de Abascal ordenó al gobernador de Puno, Manuel Quimper, organizar a los reclutas de Arequipa, Lampa, Azángaro, Tacna, Cuzco, Pucara y Guancané para sofocarla. Finalmente, se envió con el grado de coroneles a los caciques Mateo Pumacahua de Chincheros y José Manuel Choquehuanca de Azángaro, quienes combatieron contra la rebelión de Túpac Amaru II, con 3.500 a 5.000 (algunos hablan de 20.000) quechuas por el río Desaguadero. Estos devastaron las aldeas aimaras a su paso por Omasuyos, Larecajas, Carangas y Sicasica. Aquella turba entró en La Paz el 11 de noviembre, saqueando la ciudad y cometiendo brutales excesos hasta salir el 13.