Sau khi hoàn tất việc chạy thử máy huấn luyện tại khu vực vịnh Guantánamo, Cuba, "Perkins" đi đến Xưởng hải quân Norfolk để được cải biến thành một tàu khu trục cột mốc radar. Nó tiếp tục huấn luyện ôn tập trong tháng 7 năm 1945 trước khi gặp gỡ tàu sân bay vào ngày 20 tháng 7 để cùng đi sang khu vực Thái Bình Dương. Nó gia nhập cùng Đội khu trục 52 tại Trân Châu Cảng, và khởi hành đi sang Viễn Đông vào ngày 19 tháng 8. Con tàu đi đến vịnh Tokyo vào đúng ngày 2 tháng 9, ngày diễn ra lễ ký kết chính thức văn kiện đầu hàng, và sang ngày hôm sau đã gia nhập Lực lượng Đặc nhiệm 38. Chiếc tàu khu trục hoạt động tại các khu vực quần đảo Marshall, Mariana và vùng biển chung quanh Nhật Bản cho đến tháng 4 năm 1946, khi nó lên đường quay trở về Trân Châu Cảng. Con tàu đi đến San Diego, California vào ngày 28 tháng 4, nơi nó đặt căn cứ hoạt động trong hai năm tiếp theo.