Em 11 de agosto de 2012, Buffon levantou seu primeiro troféu como o novo capitão da Juventus, após Alessandro Del Piero. A Juve derrotou o Napoli por 4 a 2 na prorrogação da Supercopa da Itália, disputada em Pequim. Buffon sofreu uma pequena lesão e não foi capaz de participar da primeira partida da Serie A da temporada 2012–13, contra o , no dia 25 de agosto. Ele foi substituído por Marco Storari e a Juventus venceu a partida por 2 a 0. Ele voltou a ser titular na próxima partida, contra a , em Udine, no dia 2 de setembro, usando a braçadeira de capitão. A Juventus venceu por 4 a 1.