Durante la Guerra Árabe-Israelí de 1948, Nablus y toda Cisjordania quedaron bajo control jordano. Cientos de miles de palestinos tuvieron que abandonar o fueron expulsados de sus hogares y sus tierras ante el avance de las tropas israelíes en lo que se conoció como la Nakba. Miles de ellos llegaron a Nablus y se asentaron en varios campos de refugiados organizados por UNRWA, lo que hizo que la población de Nablus se doblase y que sus recursos se viesen drásticamente reducidos. A día de hoy quedan tres campos de refugiados palestinos dentro del territorio municipal de Nablusː Beit Ilma, Balata y Askar. Durante el periodo de ocupación jordana, las aldeas vecinas de Rafidia, Balata al-Balad, al-Juneid y Askar se incorporaron al municipio de Nablus.