En 2007, il frappe 16 circuits et produit 83 points. Son jeu est récompensé du Gant doré du meilleur joueur de premier but défensif de l'Américaine. Champions de la division Est, les Red Sox remportent la Série mondiale 2007. Dans la Série de championnat qui la précède, Youkilis frappe pour ,500 de moyenne au bâton avec 14 coups sûrs, 3 circuits, 7 points produits et 10 points marqués en 7 matchs face aux Indians de Cleveland.