В настоящее время Моджтаба преподает богословие в религиозном центре города Кум. Являлся последовательным сторонником бывшего президента Ирана Махмуда Ахмадинежада, поддержал его на выборах 2005 и 2009 годов. Влияние последнего на дела страны пытался ослабить его отец, рахбар Ирана Али Хаменеи. По данным одного из источников, в связи с этим расхождением Моджтаба был якобы замешан в покушении на верховного лидера страны, из-за подозрений был арестован. После того как в 2013 году Ахмадинежад обвинил его в хищении государственных средств, аналитики стали говорить о конце их политического союза.