En 2016, Khalili dispute sa première compétition internationale lors des Jeux olympiques de la jeunesse organisés à Lillehammer en Norvège, réussissant à remporter la médaille de bronze de la poursuite. Il participe en 2017 aux Championnats du monde de la jeunesse à Brezno-Osrblie en Slovaquie, où il remporte la médaille d'argent sur l'individuel et le relais. Un an plus tard, il glane la médaille de bronze sur l'individuel et remporte la médaille d'or lors des Championnats du monde juniors à Otepää en Estonnie. Il est également champion d'Europe junior à Pokljuka ce même hiver dans l'individuel et vice-champion au sprint. De nouveau faisant partie de la sélection russe pour les championnats du monde juniors en 2019, Khalili prend la médaille d'argent sur le sprint et remporte le titre mondial du relais.