Durant la guerre civile de 2011, Zeidan est le représentant en Europe du Conseil national de transition, ainsi que le porte-parole de la branche libyenne de la Fédération internationale des ligues des droits de l'Homme. Il contribue à convaincre le président français Nicolas Sarkozy de réaliser une intervention en Libye en soutien à la rébellion contre Kadhafi.