Under sina studier i Kabul engagerade han sig i den islamiska ungdomsorganisationen Sazman-i jawanan-i musulman, som var motståndare till det ökande sovjetiska inflytandet i landet. Efter statskuppen 1978 (den så kallade Aprilrevolutionen), avbröt Massoud sina arkitekturstudier och anslöt sig till rebellrörelsen.