В скором времени после случившегося пожара гуситская война (1419-1434) определила конец Колину как процветающему центру немецких торговцев, отсюда же и настала пауза в последующих переменах истории храма. Небольшие корректировки произошли на рубеже XV—XVI веков, которые коснулись башен, а именно — вида крыш. Последующие три столетия изменения не происходили, были лишь жалобы на то, что храм находится в плачевном состоянии.