В 1640 году Альтона была занята датчанами, их владычество продолжалось более двухсот лет. Король Фредерик III даровал ей статус города, таможенные привилегии, свободу поселения и вероисповедания. В 1938 году Альтона, как и ещё несколько близлежащих городов, стала частью Гамбурга. Историческая часть города была разрушена бомбардировками 1943 года и с тех пор не восстанавливалась.