加賀は当初ポートモレスビー攻略を狙うMO作戦に参加する予定であった。その場合、第四艦隊（南洋部隊）に編入される戦力は空母加賀、第五戦隊（妙高、羽黒）、水上機母艦瑞穂、第27駆逐隊（時雨、白露、有明、夕暮）を予定していた。しかし基地航空隊の兵力整備が整わないため、敵基地航空兵力撃滅・輸送船団掩護・敵機動部隊警戒および撃滅の総てを加賀1隻が担わねばならず、大型空母の本艦でも兵力不足と認定される。そこで第四艦隊（司令長官井上成美中将）は第二航空戦隊（蒼龍、飛龍）の派遣を希望するが、連合艦隊（司令長官山本五十六大将）は第五航空戦隊（翔鶴、瑞鶴）の練度向上を狙って、第四艦隊の要求を拒否した。結局、ポートモレスビー作戦に投入された空母は合計3隻（第五航空戦隊《翔鶴、瑞鶴》、南洋部隊《祥鳳》）となり、本艦の参加は見送られた。そのためセイロン沖海戦、珊瑚海海戦に参加した他の空母ほど搭乗員を消耗させることはなかった。もっとも人事異動によって艦乗組員、各飛行隊ともかなりの転出者が出ている。