Po powrocie do Iranu w 1949 wstąpił do Frontu Narodowego. W ciągu kolejnych kilku lat nie odgrywał jednak pierwszoplanowej roli politycznej. W okresie sprawowania urzędu premiera przez Mohammada Mosaddegha był jedynie podsekretarzem w ministerstwie pracy. Po obaleniu rządu Mossadegha, w czym decydującą rolę odegrały wywiady amerykański i brytyjski, Szapur Bachtijar znalazł się w więzieniu, szybko jednak został zwolniony. Podjął pracę jako menedżer i doradca, równocześnie pozostawał aktywny w nielegalnych (do 1961) strukturach Frontu Narodowego. Kiedy w 1961 premier Ali Amini zliberalizował politykę wewnętrzną i zezwolił na legalne działanie Frontu, Szapur Bachtijar był w grupie działaczy organizacji, którzy opowiadali się za współpracą z rządem. Znalazł się jednak w mniejszości; Front Narodowy nie wprowadził swoich przedstawicieli do rządu.