Území Panamského průplavového pásma bylo od 18. listopadu 1903 na základě smlouvy Hay–Bunau-Varilla mezi nově vzniklou Panamskou republikou a Spojenými státy americkými do roku 1979 pod správou USA, poté až do 31. prosince 1999 pod společnou správou Panamy a USA. Od roku 1903 do roku 1962 se na tomto teritoriu užívala pouze vlajka USA (v různých historických variantách), poté se mohla vyvěšovat spolu s vlajkou USA i vlajka panamská. V roce 2000 přešel průplav i okolní půda pod suverenitu Panamy.