Відомості про будівництво собору Святої Варвари можна знайти у папських списках, буллах. Все починається з дозволу на будівництво в 1381 році. Будівництво велося в кілька етапів і в значній мірі було пов'язано з процвітанням срібних копалень у місті Кутна Гора. Будівельні роботи почалися в 1388 році на пагорбі за міськими стінами з прекрасним краєвидом на долину річки Врхліце. Раніше це місце було заселене шахтарями, тут була каплиця, освячена на честь Святої Варвари — покровительки шахтарів. Першим будівельником був Ян з родини Парлерж (з якої походив і архітектор Собору святого Віта у Празі Петро), син якого в 1389 році в Кутній Горі навіть одружився. Будівельним матеріалом в цей час слугавав кутногірський пісковик з довколишніх кар'єрів. Під час Гуситських воєн будівництво було призупинено протягом тривалого часу і лише у вісімдесяті роки 15-го століття багаті містяни знайшли можливість для продовження роботи, яка мала бути покладена на місцевих мулярів Ганушів, які стали головними проектантами. Під їхнім керівництвом були закінчені перехресне склепіння, кільцева каплиця на хорах і трансепт.