9 stycznia 1940, bez porozumienia z władzami wprowadził stan gotowości bojowej duńskich wojsk na granicy z III Rzeszą, został jednak później za to ukarany. 8 kwietnia, dzień przez atakiem III Rzeszy na Danię sugerowano, że w związku z konfliktami z rządem Prior miał problemy psychiczne. Podczas inwazji usilnie próbował przekonać rządzących do tego, żeby pozwolono wojskowym aktywnie bronić kraju.