In seguito alla porpora divenne ponente e sottodecano della Consulta. Pio VI lo nominò membro delle congregazioni cardinalizie dei Vescovi e regolari, dell'Immunità ecclesiastica, del Concilio, delle Indulgenze e delle Reliquie, ma la partecipazione nelle congregazioni fu saltuaria poiché Ranuzzi rimase stabilmente presente nella sede della sua residenza episcopale. Ad Ancona abitò nel palazzo oggi chiamato Mei. Di questo periodo resta una lettera pastorale al popolo fedele del 1786. Sempre ad Ancona, durante la Rivoluzione Francese, diede ospitalità a numerosi ecclesiastici refrattari o in esilio. Fu pertanto onorato dagli stranieri ed amatissimo dal popolo. Intanto Ranuzzi andava declinando con la salute tanto da non poter partecipare al Conclave di Venezia, per l'elezione del pontefice essendo morto il 29 agosto 1799 a Valence Pio VI. Nel clima repubblicano e giacobino che dominava l'Italia quasi tutti i cardinali viventi si erano stabiliti a Venezia sotto la protezione dell'Austria. L'imperatore Francesco II fece predisporre il monastero dell'isola di San Giorgio Maggiore. Il conclave iniziò il 1º dicembre e il 14 marzo 1800 si raggiunse l'unanimità dei voti nella persona del cardinale Barnaba Chiaramonti che assunse il nome di Pio VII. L'imperatore non gradì quella nomina tanto che dispose che l'incoronazione non si svolgesse nella basilica di San Marco, ma nella chiesa di San Giorgio Maggiore: ciò avvenne il 21 marzo.