2006 fuhr die "Whidbey Island" im Rahmen der Operation Enduring Freedom, wurde jedoch nach Ausbruch des Libanonkriegs ins Mittelmeer gerufen und nahm dort an der Evakuierung von Zivilisten teil. Im Anschluss kehrte das Schiff zurück in den Persischen Golf. 2007/2008 fuhr sie vor Somalia, um dort die Piraterie zu bekämpfen. Im März 2011 gehörte das Schiff zur Kampfgruppe um die "USS Bataan (LHD-5)", die im Rahmen der Operation Odyssey Dawn ins Mittelmeer verlegte.