En septiembre de 1944, el Sexto Ejército fue liberado de las operaciones en Nueva Guinea por el Octavo Ejército de los Estados Unidos. El 20 de octubre de 1944, el X Cuerpo y XXIV Cuerpo, mediante el Sexto Ejército, invadieron Leyte en Filipinas. Sobre diciembre, Leyte fue asegurado, y el Sexto Ejército fue relevado de nuevo al Octavo Ejército para preparar la invasión de Luzón. Como preludio a la invasión, la isla de Mindoro fue invadida por el Fuerza Operativa de las Bisayas Occidentales que comprendía el 19.º y el 503.º regimientos de combate. El Sexto Ejército tomó parte en la invasión del golfo de Lingayen, el 9 de enero de 1945 con las unidades subordinadas del I y XIV cuerpos. Las unidades Sexto Ejército lucharon hacia el sur hasta que se encontraron al Octavo Ejército avanzando desde alrededor de Manila. El Sexto Ejército continuó para despejar el norte de Luzón hasta el final de la guerra. Hubiera proporcionado las fuerzas de tierra para la primera fase de la invasión de Japón, pero la rendición provocó su cancelación.