Главным успехом в карьере Элисабет Боннир стала серебряная медаль, завоёванная на чемпионате Европы в 1950 году на 200-метровке брассом. В 1952 году голландская спортсменка приняла участие в летних Олимпийских играх в Хельсинки. В первом раунде на дистанции 200 метров брассом Боннир показала 7-й результат. В полуфинальном заплыве спортсменка показала результат 3:00,06, но показанного времени не хватило для попадания в финал.