Cousin de Alonso de Alvarado et plus jeune frère de Pedro de Alvarado, il participe sous les ordres de celui-ci, comme capitaine d'artillerie, à la Conquête du Guatemala. En , lors de la bataille de Háwikuh, il sauve la vie de son commandant Francisco Vásquez de Coronado puis à partir du , explore la région du Rio Grande (Pueblo de Taos, Tiguex).