2016 bildeten Vettel und Räikkönen erneut das Ferrari-Fahrerduo. Vettel führte das erste Rennen in Australien in der ersten Hälfte an und wurde schließlich Dritter. Beim anschließenden Großen Preis von Bahrain fiel er bereits vor dem Start aus. Zwei Wochen später erreichte er den zweiten Platz in China. In Spanien wurde er erneut Dritter. Bei den aufeinander folgenden Rennen in Kanada und Europa erzielte er jeweils den zweiten Platz. Im Ferrari-Heimrennen in Italien und beim Saisonabschluss in Abu Dhabi erreichte er mit Platz drei ebenfalls das Podest. Vettel behauptete sich intern mit 212 zu 186 Punkten gegenüber Räikkönen und wurde Vierter im Gesamtklassement. Beide Ferrari-Fahrer blieben in diesem Jahr ohne Sieg.