International cubain de 1995 à 2004 (46 sélections et 12 buts marqués), Hernández participe à la Gold Cup 1998 () ainsi qu'aux Coupes caribéennes des nations de 1995 (demi-finaliste) et 1999 (finaliste). Il dispute aussi les qualifications aux Coupes du monde de 1998, 2002 et 2006 (18 matchs, un but).