Mehdi Karrubi si è iscritto come candidato alle elezioni presidenziali del 2009. Ha chiesto elezioni libere, senza alcun intervento dei Guardiani della Rivoluzione islamica ("pasdaran" ), che egli pensa siano stati decisivi per la sua precedente sconfitta del 2005. Karrubi ha ugualmente criticato Aḥmadinežād per le sue dichiarazioni riguardanti la realtà della Shoah. Secondo i risultati ufficiali (ampiamente contestati da manifestazioni che hanno portato alla morte di alcune persone), ha ottenuto appena lo 0,85% dei voti e anch'egli (come Mir Hosein Musavi) ha protestato contro l'assai dubbia rielezione del Presidente uscente Aḥmadineżād.