После войны продолжал служить в 26-й стрелковой дивизии в должностях помощника командира и врид командира 232-го и 231-го стрелковых полков, с июля 1922 года – помощником командира и врид командира 78-го и 76-го стрелковых полков. В апреле 1923 года назначен командиром 20-го отдельного Тулуновского батальона особого назначения. Участвовал в ликвидации банды Замасчикова в Зиминском уезде Иркутской губернии. С января 1925 года командовал сначала 1-м отдельным Омским батальоном местных стрелковых войск, затем 6-м отдельным батальоном местных стрелковых войск СибВО. В период с 27 октября 1926 года по 15 августа 1927 года прошел подготовку на стрелково-тактических КУКС РККА «Выстрел». В январе 1928 года он был назначен командиром батальона 61-го Осинского стрелкового полка 21-й стрелковой дивизии. В его составе участвовал в боях на КВЖД. С января 1930 года исполнял должность помощника командира по строевой части 6-го отдельного стрелкового территориального полка. С 15 ноября 1931 года – командир и комиссар 62-го Новороссийского Краснознаменного стрелкового полка 21-й стрелковой Пермской Краснознаменной дивизии ОКДВА. В августе 1937 года полковник Заикин был назначен командиром 34-й стрелковой дивизии. 23 июля 1938 года освобожден от должности и зачислен в распоряжение отдела по командно-начальствующему составу фронта. 18 сентября 1938 года комбриг Заикин уволен из РККА по ст. 44 п. «в». В периоде 19 сентября 1938 года по 13 августа 1940 года находился под следствием, затем был освобожден в связи с прекращением дела. В сентябре 1940 года назначен старшим преподавателем Высшей школы штабной службы Красной армии. С марта 1941 года исполнял должность старшего преподавателя кафедры общей тактики в Военной академии РККА им. М. В. Фрунзе.