Het 49e Bergkorps werd al tijdens de Slag om Frankrijk gevormd op 20 juni 1940. Zelfs vóór het korps definitief opgericht was, werd het al op 1 juli 1940 ontbonden als gevolg van de snelle Wapenstilstand van 22 juni 1940. Uiteindelijk werd het korps eind oktober 1940 rond Besançon alsnog gevormd uit delen van het 18e Legerkorps. Sommige stafafdelingen en korpstroepen werden gebruikt voor de oprichting en op 25 oktober 1940 nam de eerste commandant Generalleutnant Ludwig Kübler het bevel op zich.