Железнодорожная система сильно пострадала от заброшенности в период Мексиканской революции. После революции вся мексиканская железнодорожная система была национализирована в 1929—1937 годах. В 1987 году правительство объединило пять своих региональных железных дорог в компанию FNM. В более поздний период национальной собственности FNM испытывала значительные финансовые трудности, столкнувшись с операционным дефицитом в размере 552 млн долларов (37 процентов ее операционного бюджета) в 1991 году. Конкуренция со стороны грузовых перевозок и судоходства снизила долю железных дорог в общем рынке грузовых перевозок примерно до 9 процентов, или около половины доли железных дорог десятилетием ранее.