1632年、リュッツェンの戦いでグスタフ・アドルフが戦死すると、アクセル・オクセンシェルナによってホルンはスウェーデン軍の指揮を任された。しかし、同僚のベルンハルト・フォン・ザクセン＝ヴァイマルと意見が合わず、両者は何度か対立した。1634年9月6日、ネルトリンゲンの戦いでは、この両者の対立が敗因の一つとなった。この戦いで、スウェーデン軍は壊滅的な打撃を被り、ホルンは皇帝軍に捕らえられた。ホルンが捕虜交換で解放されたのはようやく1642年のことであった。