En cuanto a Copas América, Alianza aportó jugadores en todas las ediciones en las que participó el elenco peruano con excepción de la edición de 1929, donde la Federación Peruana de Fútbol sancionó al club por negarse a prestar jugadores en aquel torneo, ya que la institución atravesaba, por ese entonces, una difícil situación económica. La Copa América 2004 fue la edición en las que hubo más presencias "aliancistas" con un total de ocho seleccionados. En cambio, en las Copas América de 1989 y 1995 solo fue convocado un jugador "aliancista": Juan Reynoso y Juan Jayo respectivamente.