Признанный совершеннолетним императором Фердинандом II, Эберхард с 8 мая 1633 года правил в Вюртемберге самостоятельно и вступил в Гейльброннский союз протестантских сословий, потерпевший жёсткое поражение в битве при Нёрдлингене 6 сентября 1634 года. Вюртемберг был разграблен и сожжён. Герцог Эберхард спешно бежал со всем двором в Страсбург. Барбара София умерла в Страсбурге в 1636 году и похоронена в монастырской церкви Штутгарта.