In der Zeit der Bosnischen Annexionskrise 1908/09 wurde er reaktiviert und auf seinen alten Posten als Assistent Putniks zurückgesetzt. Als solcher war er an der Vorbereitung des Ersten Balkankrieges beteiligt. Nach dem serbischen Sieg in der "Schlacht von Kumanovo" wurde er zum General ernannt. Im Zweiten Balkankrieg war der Sieg über Bulgarien an der Bregalnica wesentlich seiner Beharrlichkeit zu verdanken. Nach dem Ende des Krieges ging Mišić zum zweiten Mal in den Ruhestand.