Лисандр был снова привлечён к командованию. Хотя он и не был назначен навархом, но фактически командование кораблями перешло в его руки. Афинские стратеги заняли не слишком удачную позицию на берегу Херсонеса Фракийского у устья реки Эгоспотамы (зима 405 года до н. э.) Лисандр дождался удобного момента и напал на афинян, когда они того не ожидали. Афинские корабли стояли у берега без экипажа, и спартанцы без труда овладели 170 из общего количества 180 кораблей. 3000 афинян, которые попали в плен, были преданы казни.