Johann Schröder voit le jour à Salzuflen en Rhénanie-du-Nord-Westphalie. En 1618, il fait ses humanités à Helmstedt en Basse-Saxe. Schröder poursuit ses études à l'Université de Rostock, où il se forme en médecine. En 1624, il se perfectionne à l'Université de Copenhague. Il entre ensuite au service du comte suédois Gustaf Horn. En 1630, il termine ses études de médecine à l'Université de Leyde aux Pays-Bas. Puis il retourne au service de Gustaf Horn, qui guerroie dans l'empire, notamment en Alsace. Après la Bataille de Nördlingen (1634), Schröder se trouve sans ressources.