Zasáhla ho však okupace roku 1968 a během normalizace byl za své názory režimem perzekvován. Na počátku roku 1969 kritizoval v tisku invazi vojsk Varšavské smlouvy do Československa. I když své stanovisko záhy změnil, byl v roce 1970 vyloučen z KSČ. Katedra filozofie a metodologie věd, jejímž byl vedoucím, byla zrušena.