La reina Beatriz otorgó tres testamentos y un codicilio: el primero en marzo de 1349; después un codicilio en diciembre de 1354; el segundo testamento en 1357; y el definitivo el 29 de diciembre de 1358. Falleció en Lisboa a los 66 años de edad el 25 de octubre de 1359, dos años después de la muerte del rey Alfonso IV de Portugal y según sus disposiciones testamentarias, fue enterrada en la Catedral de Lisboa junto a su difunto marido. Originalmente, mientras se construía la sepultura definitiva, ambos estuvieron enterrados en el coro de la iglesia y no fue hasta el reinado de Juan I de Portugal que fueron trasladados a las nuevas sepulturas en la capilla mayor de la catedral. Sus túmulos fueron destruidos en 1755 cuando la ciudad sufrió un gran terremoto y fueron reemplazados por otros en el . Los "Livros do Cartóiro da Sé", redactados entre 1710 y 1716, contienen una descripción del enterramiento de Beatriz, parecido al de su marido «con una estatua yacente y figuras pequeñas en el arca, donde se podía leer "Beatriz Portugaliae Regina / Affonsi Quarti Uxor"».