När Vinterkriget började låg Rautus som gränskommun genast i krigszonen. De små finska trupperna drog sig snabbt tillbaka till huvudförsvarslinjerna. Man ville inte lämna kyrkan i ryssarnas händer utan sprängde den innan man drog sig tillbaka. Under fortsättningskriget byggdes ingen ny kyrka i Rautus. Av kyrkan återstår bara trapporna som ingår i det ryska kulturhuset.