El 1 de julio de 2015, Luxemburgo asumió la presidencia del Consejo de la Unión Europea por un periodo de seis meses, relevando a Letonia. Bettel, en una de sus primeras ruedas de prensa como Presidente del Consejo de la UE, destacó que “para poder construir un puente hace falta querer desde ambas orillas y la presidencia luxemburguesa quiere mantener a Grecia en la Eurozona y al Reino Unido en el seno de la UE“ buscando evitar el “Brexit” que finalmente se produciría en 2020. Además se refirió a las “urgencias humanitarias” como la gestión de la migración. Finalmente, el 13 de julio siguiente, después de 17 horas de negociaciones Bettel logró cerrar un acuerdo que garantizó la permanencia de Grecia en la Eurozona.