Президент Месич поддерживал хорошие отношения с Муаммаром Каддафи, и в связи с гражданская война в Ливии он публично заявил, что сомневается, что «его друг» Каддафи сам приказал стрелять в демонстрантов и не будет откладывать планы посещения. К началу марта из страны были эвакуированы более 400 граждан Хорватии. Правительство Хорватии поддержало военное вмешательство в Ливию в 2011 году, которое началось в конце марта, и одновременно временно закрыло посольство в Триполи. Позже Месич сделал заявления, свидетельствующие о подозрениях в отношении мотивов НАТО при создании бесполётной зоны, что, в свою очередь, возмутило Министерство иностранных дел. В конце мая ливийский дипломат в Загребе сделал публичные заявления в поддержку режима Каддафи и раскритиковал Хорватию за поддержку резолюции № 1973 Совета Безопасности ООН. Министерство иностранных дел Хорватии, в свою очередь, лишило его дипломатического статуса. В конце июня Хорватия официально предоставила дипломатическое признание Национальному переходному совету Ливии.