Florian Eisath dispute ses premières courses FIS en 2000 puis débute en Coupe d'Europe en 2003. Enfin, il apparait dans la Coupe du monde pour la première fois dans un slalom géant à Alta Badia en décembre 2004 et marque ses premiers points un an plus tard. En 2008, il se classe onzième d'un super combiné, ce qui est son meilleur résultat dans l'élite jusqu'à il obtienne son premier "top 10" en janvier 2015 avec une sixième place en slalom géant à Adelboden. Il est ensuite huitième aux Championnats du monde de Beaver Creek en slalom géant. Il monte sur le premier podium de sa carrière le 18 décembre 2016, lors du slalom géant d'Alta Badia.