Entre 1939 et 1945, la pénurie de main-d'œuvre causée par la mobilisation des soldats durant la Seconde Guerre mondiale a mené à une série de politiques officielles visant au recrutement de Coréens pour les faire travailler au Japon. Ces politiques ont évolué vers une conscription obligatoire en 1944. Au total, environ ont été recrutés, dont plus d'un million ont été déportés au Japon, y compris dans la préfecture de Karafuto (actuelle Sakhaline). Les Coréens déportés au Japon étaient souvent affectés aux usines de munitions et aux mines de charbon, où ils travaillaient dans des conditions misérables. Sur ces centaines de milliers de migrants, environ sont morts entre 1939 et 1945, du fait des mauvais traitements et des conditions de travail inhumaines. Si la plupart sont retournés en Corée après la guerre, plusieurs sont aussi restés au Japon. Par exemple, les qui se trouvaient à Karafuto se sont vu refuser le rapatriement sur la péninsule coréenne, parce que l'île de Sakhaline a été occupée par l’Union soviétique juste avant la reddition du Japon. Selon , les Coréens qui ont subi la conscription de 1944 représenteraient 13,3 % des Zainichi de première génération.