Miejscowość Sadżur jest utożsamiana ze starożytną osadą "Sagur", która znajduje się na liście miast zdobytych przez faraona Ramzesa II. W I wieku o żydowskiej miejscowości Sadżur wspominał Talmud i Miszna. Współczesna osada druzyjska została założona w XVIII wieku. Pod koniec XIX wieku francuski podróżnik Victor Guérin opisał Sadżur jako małą wieś druzyjską położoną na wzgórzu otoczonym gajami oliwnymi, oraz uprawami granatów i fig. W wyniku I wojny światowej w 1918 roku cała Palestyna przeszła pod panowanie Brytyjczyków. Przyjęta 29 listopada 1947 roku Rezolucja Zgromadzenia Ogólnego ONZ nr 181 w sprawie podziału Palestyny przyznawała rejon wioski Sadżur państwu arabskiemu. Podczas wojny domowej w Mandacie Palestyny na początku 1948 roku do wsi wkroczyły siły Arabskiej Armii Wyzwoleńczej, które paraliżowały żydowską komunikację w całym obszarze Galilei. Podczas I wojny izraelsko-arabskiej w październiku 1948 roku Izraelczycy przeprowadzili w tym rejonie operację „Hiram”, i 30 października zajęli Sadżur. W izraelskiej armii służyła już wówczas druzyjska jednostka wojskowa, dlatego oszczędzono Sadżur, nie wysiedlając jej mieszkańców. Dzięki temu wieś zachowała swój pierwotny charakter. W 1992 roku Sadżur otrzymała status samorządu lokalnego.