In der Nationalmannschaft seines Heimatlandes kam Echeberría 4 Mal zum Einsatz. Mit Spanien nahm er an der Weltmeisterschaft 1962 in Chile teil, wo die zu den Mitfavoriten zählenden Iberer jedoch sang- und klanglos in der Vorrunde scheiterten. Ein zweites WM-Turnier blieb dem Verteidiger verwehrt, er machte sein letztes Spiel für Spanien bereits 1963. Für die Fußball-Europameisterschaft 1964 wurde er nominiert, kam aber nicht zum Einsatz.