"Robert K. Huntington" gia nhập Hạm đội Thái Bình Dương vào ngày 31 tháng 5 năm 1945, và từ ngày 27 tháng 6 đến ngày 16 tháng 8 đã hộ tống tàu bè đi lại giữa Eniwetok và Ulithi. Vào ngày 28 tháng 8, nó gia nhập Lực lượng Đặc nhiệm 38 ngoài khơi bờ biển Nhật Bản, và là một trong số các tàu hộ tống bảo vệ cho thiết giáp hạm tiến vào vịnh Tokyo để tiếp nhận sự đầu hàng chính thức của Đế quốc Nhật Bản. Sau đó nó lên đường quay trở về San Diego, California, chở theo 100 binh lính Thủy quân Lục chiến hồi hương. Đến mùa Xuân năm 1946, chiếc tàu khu trục đi đến khu vực quần đảo Marshall trong thành phần Lực lượng Đặc nhiệm 1 để tham gia Chiến dịch Crossroads, cuộc thử nghiệm bom nguyên tử tại đảo san hô Bikini trong tháng 7.