З цягам часу горад паступова адрадзіўся. У 1773 г. пасля ліквідацыі езуіцкага ордэна заснавана Адукацыйная камісія, якая рэарганізавала сістэму адукацыі на ўсёй тэрыторыі ВКЛ. Вільня з’яўлялася адным з цэнтраў паўстання 1794 г. 22 — 23 красавіка 1794 г. паўстанцы адваявалі горад у рускіх і ўтрымлівалі яго да 11 жніўня (: Віленскае паўстанне, 1794).