À partir de 1364, Metlika appartenait au duché de Carniole au sein des territoires héréditaires des Habsbourg. La forteresse avait une grande importance pendant les guerres ottomanes aux , notamment après le siège de Vienne en 1529, lorsque la région fut dévastée par les Turcs et qu'un grand nombre de personnes a été obligé de fuir les combats. En 1705, un incendie détruisit presque toutes les maisons de la ville.