Згодом Г. Шірмер отримав звання оберст-лейтенант та перейняв під своє командування 16-й парашутний полк у Гальберштадті (з лютого 1943 року частина була офіційно перейменована в "3-й парашутно-танковий гренадерський полк «Герман Герінг»"), який був перекинутий до Литви в липні 1944 року. Брав активну участь у боях у Балтійських країнах. За вміле керівництво військами в боях за Неммерсдорф та Голдап, Г. Шірмер відзначений дубовим листям до Лицарського хреста.