Namun reformasi yang terinspirasi oleh gagasan Pencerahan ini terbukti gagal memuaskan keinginan koloni-koloni Spanyol di Amerika. Sejarah "virreinato" ini dihantui oleh kerusuhan dan ketidakstabilan politik. Pemberontakan Túpac Amaru II dari tahun 1780 hingga 1782 memicu pemberontakan Aymara di dataran Peru Hulu dan menunjukkan kemarahan kelompok mestizo dan penduduk asli. Dua puluh lima tahun kemudian, Criollo berhasil mempertahankan diri dari dua serangan Britania. Peristiwa ini memperkuat kekuasaan dan otonomi mereka ketika pasukan Spanyol tidak dapat membantu.