Em 1938, a família Oberth deixou a cidade de Sibiu na Romênia, primeiro em direção à Áustria, depois para a Alemanha Nazista, e mais tarde para os Estados Unidos, e finalmente de volta para uma Alemanha livre. Oberth foi primeiro para a Universidade Técnica de Viena, depois, para a Universidade Técnica de Dresden. Esses institutos técnicos, naquela época, ofereciam treinamento profissional avançado em áreas críticas e selecionadas, estando também engajada em pesquisas de base como uma universidade. Oberth foi para Peenemünde na Alemanha em 1941 para trabalhar em projetos de foguetes da Alemanha Nazista, incluindo a arma V-2, e em Setembro de 1943, ele foi condecorado com a Cruz de Mérito de Guerra de 1a classe, por seu "comportamento excepcionalmente corajoso ... durante o ataque" à Peenemünde da operação Hydra, parte da operação Crossbow.