Його брат, який був правителем Ліхтенштейну від 1781, помер у березні 1805, передавши трон Йоганну. Останній в цей час командував армійським корпусом під час чергової війни із Францією. У грудні 1805 брав участь у битві під Аустерліцом, очолюючи імперську кавалерію.