Under åren i Sävehof mästerskapsdebuterade Karin Isakson i landslaget. Det var EM 2008 i Makedonien, som blev hennes första turnering. 2009 spelade hon sedan bland annat kvalet till VM 2009 i Kina. Isakson blev också uttagen till VM 2009 i Kina. Det blev hennes enda två mästerskapsturneringar. Hon spelade sammanlagt 24 landskamper 2006–2009.