In februari 1953 kwam de kerk tijdens de Watersnood onder water te staan. Daardoor raakte de kerk zodanig beschadigd dat besloten werd om een nieuwe kerk te laten bouwen aan de Geersdijkseweg, tegenover de Hervormde kerk. Deze werd in 1959 in gebruik genomen. Tot januari 1961 is de kerk nog gebruikt door de hervormde gemeente omdat het oude kerkgebouw van deze gemeente werd vervangen. Hierna is het gebouw in gebruik genomen als pakhuis. Tijdens een augustusstorm is het kleine torentje van de gevel gewaaid. Tussen 1979 en 2000 is het bovenste deel van het gebouw gesloopt en het zadeldak vervangen voor een plat dak.