У лавах Червоної армії з 1918 року. В період Громадянської війни Чибісов був командиром взводу, роти, батальйону, стрілецького полку, помічником начальника і начальником штабу стрілецької бригади і дивізії, брав участь в боях проти Білої гвардії на Карельському перешийку, під Нарвою, Псковом, в Білорусі, керував каральними загонами у боротьбі з повстанцями в Тамбовській і Воронезькій губернії.