Durante la Crisis de 1383-1385, el entonces Prior del Hospital, D.Pedro Pereira, reconoció a principios de 1384 la autoridad de doña Beatriz, hija de D.Fernando, y, como tal, heredera legítima del trono portugués. El castillo da Amieira, junto con otros de la Orden, obedeció a la reina, situación que se modificó unos meses después, por influencia del condestable D.Nuno Álvares Pereira, hermano del Prior, que partió para Castilla.