В задачи Сиббюро входили сбор информации о положении на территориях, занятых белыми, поддержание связей с партийными организациями Сибири, оказание им помощи кадрами, деньгами, оружием, литературой. В 1919 году в связи с весенним наступлением Колчака деятельность Сиббюро была приостановлена, а его члены направлены в политотделы армии. Руководство партийным подпольем и партизанским движением в этот период осуществлял Сибирский областной подпольный комитет РКП (б), избранный в марте 1919 на 3-й Сибирской конференции РКП (б) в Омске. После развёртывания контрнаступления Восточного фронта весной 1919 года работа Сиббюро возобновилась. По мере освобождения территорий Сибири Сиббюро занималось на них созданием временных губернских, уездных и волостных бюро РКП (б), комсомольских организаций, органов Советской власти, налаживанием хозяйственной деятельности. В середине декабря 1919 года с участием Сиббюро было образовано Омское губбюро РКП(б), 18 декабря — Алтайское, в январе 1920 — Ново-Николаевское (Томское) и другие.