1618年以后，由于反宗教改革而引發第二次布拉格拋窗事件，隨後造成神聖羅馬帝國皇帝費迪南二世與當地新教領主的衝突，進而引發三十年战争的波西米亞階段。白山戰役後，先前支持他们的当地贵族被處決或驅逐，由親天主教的領主所取代，弟兄会被迫转入地下，散布到低地国家，主教夸美纽斯在那里尝试指导一次复兴。残余的最大的一个波西米亚弟兄会位于波兰的莱什诺(德語: Lissa) ，那里在历史上与捷克联系密切，在摩拉維亞还有一些孤立的小团体。