האתר נקרא על שם מבצר מצדה שבנמצא בנגב הישראלי, במבצר מצדה במהלך המרד היהודי הגדול נגד האימפריה הרומית, נלחמה קבוצה המכונה סייקרים ברומאים, קבוצה זו החליטה לא להיכנע לצבא הרומי ולבסוף כל יושבי מצדה התאבדו, לדברי מייסדי האתר הארגון נועד כדי להתמודד עם אתרים שמציגים דעות אנטי-ישראליות", הם הוסיפו ואמרו כי האתר "יחשוף יהודים פרוגרסיביים העוסקים בצדק חברתי לכל אוכלוסיית המדינה מלבד הזו היהודית וכן יהודים שמבזים את היהדות".