Durante la guerra, las esclusas de Gatún fueron rodeadas por 26 pies de vallas de acero de metal corrugado sólidos y globos de barrera fueron anclado por encima. Varios edificios o partes de estos, que podrían tener riesgo de incendio, fueron derribados para evitar que se quemen e iluminaran las esclusas. Las luces se apagaban por 23:00, se retiraron las luces de la calle y se conducían los autos con los faros oscurecidos. Se construyeron refugios antiaéreos y se llevaron a cabo simulacros de ataque aéreo. En 1945, la guerra se desplazó al Pacífico y Gatún y la Zona del Canal volvió a su forma normal de vida.