Наиболее «громкими» расследованиями ФБК, в которых принимала участие Мария, были истории о связи главы ВТБ Андрея Костина с журналисткой Наилей Аскер-Заде, о команде отравителей Алексея Навального, о резиденции на мысе Идокопас, документальным фильмом «Дворец для Путина. История самой большой взятки», а также фильм «Он вам не Димон».