W 1920 ochraniał obrady kongresu w Lushnji, który przywrócił państwowość albańską, a następnie uczestniczył w walkach z Włochami o Wlorę, wchodząc w skład sztabu powstańców albańskich. W latach 1920-1924 pełnił służbę w armii albańskiej. W czerwcu 1924 był komendantem garnizonu w Përmecie, w stopniu podpułkownika. Po zamachu stanu, zorganizowanym przez zwolenników Fana Noliego, Qafëzezi przyłączył się do rebeliantów i 10 czerwca zajął na czele wiernych mu jednostek stolicę kraju. W tym samym miesiącu otrzymał stanowisko ministra obrony. Po upadku rządu Noliego w grudniu 1924 uciekł z Albanii do Włoch. W 1927 powrócił do kraju korzystając z dobrodziejstwa amnestii i ostatnie lata życia spędził w Beracie, gdzie zmarł.