Близостта на манастира до центъра на Прага е причината той да вземе дейно участие във всички важни исторически събития в средновековния град - Хуситските войни от 1420-1434 г., Тридесетгодишната война през XVII в., когато шведите оплячкосват манастира, отнасяйки много ценни предмети и ръкописи, разрушението му от френските войски, окопали се в манастирската градина през 1742 г., атаката на града от пруската армия и т.н.