V roce 1620 se stal toledským arcibiskupem. Po smrti své tety Isabely byl od roku 1634 byl generálním guvernérem jižního Nizozemí. Do Antverp, kde se ujal vlády, přijel roku 1635 s velkou slávou. Přitom stihl na cestě z Milána, se svou armádou v bitvě u Nördlingenu, porazit švédská vojska.