Huanta gehört zu den Städten, in denen während des bewaffneten Konflikts in Peru in den 1980er und 1990er Jahren die meisten Menschen starben. Nach den von der Kommission für Wahrheit und Versöhnung registrierten Augenzeugenberichten waren 47,4 % der namentlich registrierten Todesopfer aus Ayacucho und von diesen über die Hälfte – 5186 Tote und „Verschwundene“ – aus den Provinzen Huanta und La Mar.