McCarthy coi mình là người vô thần. Lớn lên như một người Cộng sản, ông trở thành một đảng Cộng hòa bảo thủ sau chuyến thăm hai ngày tới Tiệp Khắc năm 1968 sau cuộc xâm lược của Liên Xô. McCarthy qua đời tại nhà riêng ở Stanford vào ngày 24 tháng 10 năm 2011