Khashoggi entrou no consulado da Arábia Saudita em Istambul em 02 de outubro de 2018 e não foi visto saindo do prédio. Fontes anônimas da polícia turca alegaram que ele foi assassinado e desmembrado dentro do consulado. O governo da Arábia Saudita alegou inicialmente que Khashoggi deixou o consulado vivo por meio de uma entrada traseira, mas a polícia turca diz que nenhum circuito fechado de televisão o registrou saindo do consulado. Em 15 de outubro, uma inspeção do consulado foi conduzida por autoridades sauditas e turcas. As autoridades turcas encontraram evidências do assassinato e adulteração durante a busca pelo corpo de Khashoggi. Sua morte não foi confirmada por autoridades da Arábia Saudita, mas algumas fontes informaram à imprensa que ele morreu enquanto era interrogado por agentes da família real da Arábia Saudita. Após grande desgaste diplomático, em 20 de outubro, o governo da Arábia Saudita admitiu que o jornalista morreu em uma briga após ter sido estrangulado.Em novembro, um relatório da CIA, divulgado na imprensa americana, concluiu Mohammad bin Salman de ter ordenado a morte de Khashoggi, o que causou furor internacional e tensões diplomáticas.