Als erster Abschnitt ging am 21. Dezember 1997 die Strecke vom Bahnhof Milano Nord Bovisa der Ferrovie Nord Milano (FNM) über Lancetti, Porta Garibaldi und Repubblica bis Porta Venezia in Betrieb. Ende Mai 1999 folgte die Anbindung an die FS-Strecke bei Milano Certosa. 2002 gingen die Verlängerung der unterirdischen Strecke bis Milano Dateo und der zusätzliche Bahnhof Milano Villapizzone am Ast nach Milano Certosa in Betrieb. Im Dezember 2004 wurde die Strecke bis zum Bahnhof Milano Porta Vittoria in Betrieb genommen. Ab dem gleichen Datum erfolgte auch die Inbetriebnahme des Stadtschnellbahnnetzes mit den mit "S" gekennzeichneten Linien. Im Sommer 2008 erreichte die Passante den Bahnhof Milano Rogoredo, wo Verbindung zur bestehenden Strecke in Richtung Bologna besteht. Zur Expo 2015 wurde im Mai 2015 die Abzweigung von Porta Vittoria über Forlanini bis zur Anbindung an die Strecke in Richtung Venedig in Betrieb genommen.