Dopo l'armistizio di Compiègne del 22 giugno 1940, come gran parte della flotta francese l"Algérie" rimase ancorato a Tolone senza prendere parte ad altri impieghi bellici. Il 27 novembre 1942, davanti al tentativo dei tedeschi di catturare Tolone dopo l'invasione della Francia di Vichy, l'incrociatore si autoaffondò in porto assieme al resto della flotta francese; lo scafo fu riportato a galla dalle forze italiane occupanti il 18 marzo 1943, ma non venne avviato alcun lavoro per ripristinare l'unità che fu infine avviata alla demolizione al termine della guerra.