Con el asesinato de su marido por Leon Czolgosz en Búfalo, Nueva York en septiembre de 1901, la señora McKinley perdió la voluntad de vivir. A pesar de que se portó bien en los días entre el tiroteo y la muerte del presidente, no fue capaz de asistir al funeral. Con la salud deteriorada se retiró a la seguridad de su casa y recuerdos en Canton. Fue cuidada por su hermana menor. El presidente permaneció enterrado en el Werts Receiving Vault en el West Lawn Cemetery hasta que su mausoleo fue construido. Ida lo visitaba diariamente hasta su propia muerte.[9] Sobrevivió a su esposo menos de seis años, muriendo el 26 de mayo de 1907. Fue enterrada junto a él y sus dos hijas en el McKinley Memorial Mausoleum de Canton.