A igreja começou em 1605 com uma capela dedicada a São Paulo utilizada pelos carmelitas descalços. Depois da vitória católica na Batalha da Montanha Branca em 1620, que interrompeu o avanço da Reforma na Boêmia, a igreja foi rededicada à Nossa Senhora. Estandartes otomanos capturados no Cerco de Viena (1683) estão pendurados na igreja como parte do tema da "Vitória".