Muggia se trouve à la frontière italo-slovène de l'Union européenne. Cette frontière est ouverte le lors de l'adhésion de fait de la Slovénie au traité de Schengen. Muggia n'est donc plus coupée de son arrière-pays dont elle avait été séparée en 1947, mais la crise migratoire de 2015 a amené l'Italie à rétablir les contrôles.