Zu DDR-Zeiten musste Nils Rudolph 1983 nach unerlaubten Kontakten während eines Schwimm-Wettkampfes mit der DDR-Nachwuchsmannschaft in Italien eine vierjährige Zwangspause vom Leistungssport hinnehmen. Er wurde der Kinder- und Jugendsportschule verwiesen, das Ablegen des Abiturs wurde ihm verwehrt. 1987 kehrte Rudolph zum Leistungssport zurück. Bei den Europameisterschaften 1989 in Bonn belegte er über 50 m Freistil den Bronze-Rang. Nach der Wende startete er in der ersten gemeinsamen deutschen Schwimm-Mannschaft bei den Weltmeisterschaften 1991 in Perth.