В 1794 году Павел Ежи Грабовский принял активное участие в польском восстании под предводительством Тадеуша Костюшко. 16 мая того же года получил от Костюшко патент генерал-лейтенанта. Вначале командовал 5-м литовским полком в составе дивизий А. Хлевинского и К. Сераковского. 26 июня принял участие в битве с русскими . До 30 июня его подразделение входило в состав корпуса генерал-лейтенанта Антония Хлевинского, позднее вместе с Хлевинским входил в состав дивизии Кароля Сераковского. 5 августа Павел Ежи Грабовский был назначен командиром отдельной литовской дивизии в Полесье. В начале августа 1794 года временно руководил обороной Вильно, а после подавления восстания в ВКЛ с остатками литовских войск отступил в окрестности Бельска. Затем командовал дивизией в составе корпуса Станислава Мокроновского, отступающего под Варшаву.