A revolução egípcia foi a mais desafiadora crise de política externa para o governo Obama. A resposta pública de Hillary rapidamente evoluiu de uma avaliação inicial de que o governo de Hosni Mubarak era "estável" para uma posição de que era preciso haver uma "transição ordenada a um governo democrático e participativo", e a uma condenação da violência contra os manifestantes. Como os protestos da Primavera Árabe se espalharam por toda a região, esteve a frente de uma resposta norte-americana para a crise, a qual reconheceu que era por vezes contraditória, uma vez que apoiava alguns regimes, mas era contra outros. Quando a Guerra Civil Líbia iniciou, passou a ser favorável a uma intervenção militar naquele país, o que ocorreu em março de 2011 e resultou na derrubada do governo de Muammar al-Gaddafi. O pós Guerra Civil da Líbia viu o país se tornar um estado falido, e as interpretações sobre a intervenção e o que ocorreu posteriormente se tornaram o tema de um amplo debate.