21 мая 2021 года депутаты Каталонского парламента избрали Арагонеса президентом Женералитета. Он получил поддержку 33 своих однопартийцев, а также 32 голоса депутатов партии Карлеса Пучдемона «» и 9 депутатов от партии «Кандидатура народного единства». Накануне голосования в программном заявлении высказал свою позицию о необходимости подготовки двадцати законов и порядка десяти общенациональных испанских правовых актов, следствием которых должно стать национальное соглашение и новый референдум о самоопределении Каталонии, организованный по образцу шотландского референдума 2014 года — с согласия центральных властей.