Nach dem Waffenstillstand nahm er seinen Abschied von der Armee und schloss sich dem Widerstand in der Dordogne an. Über Léon Faye (1899–1945), der damals schon Mitglied des "Réseau Alliance" war, lernte er Marie-Madeleine Méric kennen, die das Netzwerk der Résistance im Bereich Toulouse organisierte. Seit Juni 1942 war er in der Region Südwest aktiv und wurde bald Chef des Spionagedienstes der Alliance. Am 21. September 1943 wurde Kauffmann vom Vichy SD mit elf seiner Agenten festgenommen, am 16. Dezember 1943 in das Gefängnis von Kehl (Baden-Württemberg) verlegt und am 28. November 1944 im Gefängnis von Freiburg im Breisgau hingerichtet.