Creato cardinale presbitero nel concistorio del 18 dicembre 1587, ricevette la berretta ed il titolo cardinalizio di San Silvestro in Capite il 23 maggio 1588. Ambasciatore francese nuovamente presso la Santa Sede, presiedette gli stati generali tenutisi a Blois nel 1588. Egli non prese parte al primo conclave del 1590 che elesse papa Urbano VII e nemmeno al secondo conclave che in quell'anno elesse Gregorio XIV. Tantomeno prese parte a quello del 1591 che elesse Innocenzo IX né a quello del 1592 che elesse Clemente VIII. Pianificò un suo viaggio a Roma per perorare la causa dell'assoluzione di Enrico IV di Francia ma papa Clemente VIII gli proibì di entrare negli Stati Pontifici in quanto egli stava supportando unicamente la causa regia; egli scrisse dal canto suo una lettera al pontefice giustificando la sua condotta e pertanto gli venne concesso il permesso di recarsi a Roma. Provvisore dell'Università la Sorbona di Parigi dal 1594, con la solenne cerimonia tenutasi il 14 settembre 1594 ricevette re Enrico IV nella cattedrale di Notre-Dame di Parigi dopo la sua riconciliazione con la Chiesa cattolica. Partecipò all'Assemblea del Clero che si tenne a Parigi nel 1595 e presiedette gli Stati Generali di Rouen del 1596.