Первым проектировщиком и строителем собора Святой Варвары стал Ян Парлерж, сын строителя собора Святого Вита Петра Парлержа. Ян Парлерж построил самую старую часть здания по образцу соборов французской готики. Первоначально построенный трехнеф вскоре был расширен широкими внешними нефами, но с появлением гуситских войн, строительство в первый раз было приостановлено на шестьдесят лет. До тех пор он достиг почти половины своей сегодняшней высоты, однако центральный трехнеф не был сводчатый. До начала строительства в 1547 году здесь не было сводов и собор не был защищён от дождя. Он был построен из песчаника, собранного из близлежащих шахт. Возведение базилики началось в 1388 г.