В ночь с 3 на 4 декабря 1968 года на мюнхенской вилле Грюбера двадцатилетняя Яна Новакова была застрелена (по другим сведениям — задушена) мужем, сразу после убийства жены покончившим с собой. В качестве наиболее вероятного мотива преступления рассматривалась ревность пожилого супруга к молодой актрисе; не исключалась связь между убийством и возможной причастностью Грюбера к международному шпионажу и торговле оружием. Известие о смерти Новаковой осталось почти незамеченным в Чехословакии на фоне ввода советских войск и последовавших за ним общественно-политических событий. Истинные причины и обстоятельства убийства остаются невыясненными.