Prosper Giquel pertama kali tiba di Tiongkok pada tahun 1857 sebagai bagian dari pasukan serangan sekutu Perang Panah. Mengambil kesempatan bahwa dinas dalam pasukan pendudukan Kanton diizinkan, Giquel mulai mempelajari bahasa Mandarin. Pada akhir 1861 ia bergabung dengan Pelayanan Bea Cukai Kekaisaran di bawah Robert Hart, sebagai direktur kantor Ningpo dan tetap di sana sampai kota itu ditangkap oleh pasukan Pemberontakan Taiping pada bulan Desember 1861. Ia kembali menjadi Komisaris Bea Cukai untuk Ningpo pada tahun 1864.