El primer registro escrito sobre la localidad data de 1291, cuando Heinrich Vok von Borek und Husinec (Jindřich Vok z Borku a Husince) declaró sus derechos sobre el área en el Tribunal de Distrito. En 1359, el pueblo se convirtió en una ciudad. Un castillo fue construido en el siglo XIV. El 8 de septiembre de 1441, los señores enojados de Prachatice incendiaron el castillo y demolieron los restos carbonizados. En 1601, la Casa de Kolowrat compró la ciudad, seguida de Hans Ulrich von Eggenberg, al servicio de Fernando II de Habsburgo, en 1630. Después de la Batalla de la Montaña Blanca, muchos residentes de Husinec, que eran seguidores del reformador Jan Hus y sus enseñanzas, emigraron al extranjero. De 1655 a 1848, Husinec cayó bajo el control de la Casa de Schwarzenberg, en cuyo poder permanecería formalmente hasta 1848.