Für Juli 1997 beabsichtigte er erneut bei der Präsidentschaftswahl zu kandidieren. Nachdem es bereits im Juni 1997 zu Gefechten zwischen Truppen Lissoubas und Einheiten Sassou-Nguessos gekommen war (siehe Bürgerkrieg in der Republik Kongo), versuchte er zwischen den verfeindeten Lagern zu vermitteln, um so eine friedliche Einigung zu erzielen. Am 12. September 1997 nahm er das Angebot an, unter diesem das Amt des Premierministers zu übernehmen, und bot in seiner Regierung der nationalen Einheit auch den Anhängern von Sassou-Nguesso Ministerämter an, was jedoch von Sassou-Nguesso abgelehnt wurde.