El 30 de junio de 1989, oficiales militares bajo las órdenes del coronel Omar al Bashir, con apoyo e instigación del Frente Islámico Nacional (FIN), orquestaron un golpe militar que reemplazó a Sadiq al-Mahdi y su gabinete por una junta militar con el Consejo de Mando Revolucionario para la Salvación Nacional, quién clamaba que estaba salvando al país de los "partidos políticos podridos" El resultado fue un régimen dictatorial que ha sumido a la nación africana en una extrema pobreza y aislamiento internacional. La dictadura de Omar al Bashir ha estado empañada por importantes crisis y su figura ha generado profundas divisiones por su forma de abordar las numerosos conflictos internos, sus abusos contra los derechos humanos y por su enfrentamiento con Occidente. El país ha sufrido largos períodos de aislamiento desde que Estados Unidos incorporó en 1993 al país africano a su lista de estados patrocinadores del terrorismo por dar refugio a terroristas islamistas como Osama bin Laden y Carlos El Chacal. Unas de esas crisis fue ocasionada por la imposición la ley islámica, la sharía, agravando el resentimiento de las provincias del sur, de religiones cristiana y animista, alimentando una guerra que se desató en 1983 y solo se cerró en 2005, con un acuerdo que conduciría a la independencia de Sudán del Sur en 2011 y provocaría el fin de buenos ingresos petroleros al país.