En los años siguientes se presentó como médico de campo y de nuevo al servicio del sueco Horn, quien después de la muerte del rey Gustavo II Adolfo en 1632 estuvo al mando del ejército sueco en Alemania. En la batalla de Nördlingen, el 6 de septiembre de 1634, los suecos perdieron y el general Horn fue encarcelado. Al perder su empleo, Schröder buscó ahora un trabajo civil y se asentó como médico en Marburgo, donde la peste causaba estragos.