Sau khi được sửa chữa tại Leyte, Philippines, "Harry F. Bauer" đi đến Okinawa vào ngày 15 tháng 8, vào đúng ngày Nhật Bản chấp nhận đầu hàng. Nó lại lên đường vào ngày 20 tháng 8 để đi sang biển Hoa Đông, nơi nó tham gia vào nhiệm vụ rà quét vô số bãi thủy lôi còn lại sau chiến tranh. Con tàu đi đến Sasebo, Nhật Bản vào ngày 28 tháng 10, rồi lên đường bốn ngày sau đó để quay trở về Hoa Kỳ, về đến San Diego vào ngày 22 tháng 12.