Neben dieser zivilen Forschung waren jedoch von Beginn an auch Arbeiten zu biologischen Waffen vorgesehen. Ob und in welchem Umfang entsprechende Pläne in dem Institut tatsächlich realisiert wurden, ist jedoch bisher nicht sicher bekannt. Das Institut bestand von Juni 1942 bis zur Eroberung Posens durch die Rote Armee Anfang 1945 und blieb hinsichtlich seiner baulichen Ausstattung und seiner Organisationsstruktur zum größten Teil unvollendet.