Vaikka Daytonin rauhansopimuksen pääkohdista oli keskusteltu jo vuodesta 1992 asti, neuvottelut käynnistyivät vasta sen jälkeen kun kroaatit ja bosniakit olivat toteuttaneet Operaatio Myrskyn ja hallituksen joukot hyökänneet Serbiaan NATO:n operaatio "Deliberate Force"n tukemana. Neuvotteluja varjostivat Srebrenican verilöyly ja syytökset Bosnian serbijohtajia kohtaan. Syyskuun ja elokuun 1995 aikana erityisesti Yhdysvallat ja Venäjä alkoivat painostaa kolmen osapuolen johtajia osallistumaan neuvotteluihin Daytonissa.