Im Zuge des Westfeldzuges wurde am 20. Juni 1940 das Generalkommando des XXXXIX. Gebirgs-Korps aufgestellt. Noch vor der abschließenden Aufstellung wurde der Stab infolge des schnell erreichten Waffenstillstandes von Compiegne am 1. Juli wieder aufgelöst. Schließlich wurde das Generalkommando Ende Oktober 1940 im Raum Besançon aus Teilen des XVIII. Armeekorps nochmals gebildet. Die Quartiermeisterabteilung und Teile der Korpstruppen des XVIII. Armeekorps wurde zur Bildung verwendet und das Generalkommando am 25. Oktober 1940 dem ersten Kommandeur Generalleutnant Ludwig Kübler unterstellt.