Seit dem 20. Juli 1801 war er Kardinalpriester der Titelkirche "Santa Maria sopra Minerva". Da er 1810 der Hochzeit Napoleon Bonapartes mit Erzherzogin Marie-Louise von Österreich die Anerkennung verweigerte, verbot Napoleon ihm das Tragen seiner Amtskleidung, und Kardinal della Somaglia wurde einer der dreizehn sogenannten "Schwarzen Kardinäle". Nachdem er im April 1814 aus der französischen Gefangenschaft freigelassen wurde, wurde er nach der Restituierung des Kirchenstaates schon einen Monat später Sekretär der Kongregation der römischen und allgemeinen Inquisition. Am 26. September 1814 zum Kardinalbischof von Frascati erkoren, war er zudem seit dem 2. Oktober 1818 Kardinalpriester der Titelkirche "San Lorenzo in Damaso" in commendam. Nachdem er am 21. Dezember 1818 als Kardinalbischof nach Porto e Santa Rufina gewechselt war, wurde er am 29. Mai 1820 Kardinalbischof von Ostia und zugleich Kardinaldekan. Als solcher leitete er die Papstwahlen der Jahre 1823 und 1829. Unter Papst Leo XII. bekleidete Kardinal della Somaglia dann von 1823 bis Anfang 1828 das Amt des Kardinalstaatssekretärs. Zugleich hatte er aber noch weitere Kurienämter inne; so leitete er zwischen 1824 und 1826 die Kongregation "De Propaganda Fide".