Solo tres años el recinto fue propiedad de la diócesis, ya que en 1914 fue confiscado y nunca más regresó a la iglesia. En 1910 había estallado la guerra de la Revolución mexicana en el país y en 1914 las tropas revolucionarias del general Joaquín Amaro Domínguez en su entrada a la ciudad de Zamora ocuparon el inmueble confiscándolo.