"Niitaka" osallistui Venäjän–Japanin sodan alussa 2. helmikuuta 1904 Chemulponlahden taisteluun Venäjän keisarikunnan laivaston risteilijä "Varjagia" vastaan. Alus osallistui 9. maaliskuuta Port Arthurin taistelussa rannikkokohteiden tulittamiseen. Huhtikuusta alkaen alus kuului Koreansalmea ja Japaninmerta valvoviin risteilijöihin, mutta se ei osallistunut Ulsanin taisteluun 14. elokuuta. Alus kuitenkin osallistui taistelussa upotetun "Rurikin" miehistön pelastustöihin. Keltaisenmeren taistelussa "Niitaka" kuului Japanin 2. laivaston 4. laivueeseen, joka taisteli "Askoldia" vastaan.