ドイツ降伏後の1945年5月23日、マイスナーは連合国軍に逮捕され、ニュルンベルク裁判に証人として出廷させられた。1947年7月には法務次官の弁護人尋問に証人として出廷。1948年1月から1949年4月にかけてアメリカ合衆国により行われたニュルンベルク継続裁判の一つである大臣裁判では自己批判し、4月19日に無罪判決を受けた。直後にミュンヘン控訴裁判所に告訴されたが、1952年に却下されて審理は停止された。1950年に三代の元首に仕えた経験を記した回顧録を出版。なお法制やエルザス＝ロートリンゲン地方に関する著作もある。間もなくミュンヘンで死去した。