Toujours en 1899, il fut nommé au Conservatoire d'Anvers comme professeur de musique ancienne ; en 1901 suivit sa nomination comme professeur d'harmonie, succédant à Jan Blockx, qui avait accédé au poste de directeur, et, l'année suivante, il devint inspecteur des écoles de musique belges, ceci au détriment de sa participation active à la vie musicale flamande. En 1905, à l'occasion du de l'indépendance de la Belgique, il écrivit une nouvelle orchestration de "la Brabançonne" ('), dédiée au roi Léopold II, et il composa trois autres œuvres, dont la cantate ' ("Au pays des Belges"), exécutée à Bruxelles par les chœurs réunis du Conservatoire, de la cathédrale Saints-Michel-et-Gudule et de l'orchestre de la Monnaie. En 1909, Arras accueillit la première de son oratorio "Jeanne d'Arc", qui fut ensuite exécuté à São Paulo et à Montréal. En 1911, il tenta en vain d'obtenir la direction du Conservatoire royal de Liège. En 1912, lorsque Jan Blockx eut pris sa retraite comme directeur du Conservatoire royal d'Anvers, Wambach lui succéda en dépit des protestations violentes de certains flamingants préférant Mortelmans ou Keurvels à la tête de cette institution, plutôt que quelqu'un ayant des racines en Wallonie. On lui reprochait, entre autres, une certaine hésitation dans la composition, ses ambitions liégeoises manquées et le fait qu'il parlait français en famille.