1944年8月、戦隊とともにタイに後退したのち、10月12日には比島決戦に参加するためマニラへ転進した。ただちにマニラ防空と、マニラ湾に入泊した船団の直衛に当たった。アメリカ軍のレイテ湾上陸に対し、10月18日にネグロス島北部へ前進、レイテ決戦に参加したが、戦隊は戦力の大部分を失った。12月、戦隊は戦力回復のため内地への帰還を余儀なくされ、水戸で機種改変（一式戦闘機三型）と操縦者の補充をおこなった。