Чемпіонат 1990 року в Алжирі проходив у дуже напруженій політичній атмосфері: керівництво країни вело боротьбу з ісламістами, і лише за кілька місяців до початку змагань армія розстріляла у столиці студентську демонстрацію. Єгипет відмовився брати участь у чемпіонаті, але під тиском з боку КАФ і загрозою санкцій все ж таки погодився прислати команду, яка, однак, програла усі матчі групового турніру і покинула змагання. У фіналі збірна Нігерії знову, як і десять років тому, зустрілася зі збірною Алжиру, але подолати господарів турніру виявилася неспроможною, поступившись з рахунком 0:1.