Під командуванням Шереметєва у 1702 році брав участь в боях під Гуммельсгофе, при облозі Нієншанца, Тарту та Нарви. Підвищений до звання генерал-майор. У липні 1705 року Бауер захопив Мітаву. Допомагав Меншикову, в жовтні 1706 року, здобути перемогу в битві під Каліші.