Wegen der großen wirtschaftlichen Bedeutung der Pipeline betrachten die westlichen Länder aufmerksam die politische Stabilität und Sicherheit in den Herkunfts- und Transitländern. Insbesondere in der Zeit politischer Unruhen in Algerien in den 1990er-Jahren und während der Unruhen des „Arabischen Frühlings“ Anfang der 2010er-Jahre in Algerien und in Tunesien gab es Sorge, Teile der Pipeline könnten unter die Kontrolle von islamistischen Extremisten fallen, die die Versorgung unterbrechen könnten. Tatsächlich waren die algerischen Gasversorgungsanlagen schon mindestens zwei Mal Ziel von Terroranschlägen: Im Jahr 1997 war die Transmed-Pipeline für fünf Tage außer Betrieb, nachdem Terroristen sie mit einer Bombe beschädigt hatten. Im Jahr 2013 ereignete sich die Geiselnahme von In Aménas, die zwar nicht die Transmed-Leitung direkt, aber die vorgeschaltete Förderung betraf.