1848年から1849年の第二次シク戦争後、総督ダルハウジー伯爵ジェイムズ・ラムゼイにパンジャーブ併合を進言し、その決断を下させた。その後、兄を議長とするパンジャーブ委員会の委員の一人となる。この委員会はローレンス兄弟によって取り仕切られており、兄弟はパンジャーブにおいて絶大な権力を握った。兄弟は法体系・法制度を整えることより「温情的専制政治」を行うことを好み、やがて「パンジャーブ派」と呼ばれるようになった。しかし後にシク貴族に対する処置をめぐって兄ヘンリーと対立を深め、総督ダルハウジー伯爵の裁定によりヘンリーはラージプターナへ転勤となり、ジョンがパンジャブ長官に就任した。1852年から1858年にかけてその地位に在職した。