Pierwszy sukces w karierze Gong Jinjie osiągnęła w 2006 roku, kiedy na igrzyskach azjatyckich w Ad-Dausze zdobyła srebrny medal w sprincie indywidualnym. Dwa lata później brała udział w mistrzostwach świata w Manchesterze, gdzie razem z Zheng Lulu zdobyła srebrny medal w sprincie drużynowym. Wynik ten Gong powtórzyła dwa lata później, podczas mistrzostw świata w Kopenhadze (tym razem w drużynie z Lin Junhong). W tej samej konkurencji, startując z Guo Shuang, zdobywała brązowe medale na mistrzostwach świata w Apeldoorn w 2011 roku i mistrzostwach w Melbourne w 2012 roku oraz srebrne na igrzyskach olimpijskich w Londynie w 2012 roku i rozgrywanych rok później mistrzostwach świata w Mińsku.