В ноябре 1941 года принял командование 239-м кавалерийским полком 79-й кавалерийской дивизией и в составе кавалерийской группы генерал-майора А. А. Гречко воевал с ней на Южном фронте. Участвовал в оборонительных боях в районе Барвенково, затем в Барвенково-Лозовской наступательной операции. 16 января 1942 года в боях за г. Барвенково был ранен в грудь, но остался в строю. Приказом по войскам Южного фронта от 13.2.1942 Муратов был награжден орденом Красного Знамени.