6. aprila je bila Jugoslavija napadena in okupirana s strani več držav, Stopno je tako kot celotna Štajerska, prešlo pod nemško okupacijo in ostalo pod njo do konca vojne. Leta 1945 je v Stopnem nastal krajevni ljudski odbor (KLO), ki se je leta 1952 združil v občinski ljudski odbor Makole. Stopno je bilo v SFRJ del Ptujskega okraja in po njegovi ukinitvi leta 1965, Mariborskega okraja vse do osamosvojitve leta 1991.