Seu governo destacou-se pelo caráter inovador e a participação de "escritores, jornalistas, advogados e elementos ligados ao meio cultural cuiabano", o financiamento a expedições científicas e a participação na Exposição Universal de 1904 nos Estados Unidos, para atrair capitais estrangeiros. Foi, porém, enviesado em favor de Cuiabá, em detrimento do sul do estado. Diante da crise financeira do estado após as lutas políticas, procurou em 1904 crédito no exterior, como faziam São Paulo e Rio de Janeiro. O principal credor nas crises, o Banco Rio e Mato Grosso, ligado aos Murtinho, estava em processo de liquidação. No ano seguinte anunciou reformas administrativas e judiciárias. Os impostos da borracha mato-grossense, que era escoada pelo Amazonas, seriam coletados em Manaus numa Recebedoria de Rendas interestadual. Propôs uma 2ª Diretoria de Obras Públicas, Terras, Minas e Colonização, responsável pelo sul do estado. Além de aumentar a arrecadação de impostos, a Diretoria defenderia os colonos da região, muitos dos quais eram gaúchos que chegaram nos anos 1890 para explorar a erva-mate. Isso ameaçava os interesses da Companhia Matte Larangeira, que tinha monopólio e conflitos pela posse da terra. O desenvolvimento prometido pelo governo Pais de Barros poderia desestabilizar os interesses estabelecidos, como a Companhia.