В августе 2008 года, во время вооружённого конфликта в Южной Осетии, Навальный поддержал российскую сторону и назвал российских военнослужащих «молодцами»; в своём блоге в ЖЖ выступил с предложением ввести полную блокаду Грузии, прекратить с ней любое сообщение и связи, сбивать все воздушные суда, попадающие на территорию Южной Осетии, и запустить ракеты в сторону грузинского генштаба. Призывал к депортации всех граждан Грузии с территории России и оказанию поддержки непризнанным республикам Южная Осетия и Абхазия. Помимо этого, в своих заявлениях оппозиционер оскорбительно высказывался о грузинах, называя их «грызунами».