Pada musim 2006, Alonso berhasil mempertahankan gelar juara dunianya, di tengah kabar bahwa ia pindah ke tim McLaren mulai musim 2007. Alonso mengawali musim ini dengan memenangi lomba di Bahrain dan Australia. Di Malaysia, Fisichella ganti memenangi lomba, dan Alonso finish di posisi kedua. Dengan hasil ini, maka tim Renault berhasil menjadi juara balapan 1-2 yang pertama sejak Rene Arnoux dan Alain Prost di musim 1982. Tim Renault lantas merayakan balapan F1 ke-200nya di Grand Prix Inggris, dengan hasil kemenangan dari Alonso. Sama seperti musim sebelumnya, gelar juara dunia pembalap dan konstruktor baru bisa dipastikan di seri terakhir di Brasil, pada saat Fernando Alonso finish di posisi kedua tepat di belakang pembalap lokal yang kelak akan menjadi partnernya, yakni Felipe Massa.