Trascorse gli ultimi anni a Roma confortato dalle sue ricchezze e dedicandosi all'amministrazione dei beni di Casa Bonelli-Ghislieri. Finanziò importanti interventi al suo palazzo ai Ss. Apostoli, opponendosi alla vendita caldeggiatagli dai familiari a Olimpia Maidalchini, cognata di papa Innocenzo X. Partecipò ai conclavi del 1667 e del 1669-1670 sostenendo la candidatura dello zio Lorenzo Imperiali. Non prese parte al conclave del 1676, morendo durante la sede vacante, il 27 agosto 1676 nel suo palazzo ai Santi XII Apostoli.