Mitte März 1813 kehrte er als freiwilliger Jäger in das Regiment zurück und avancierte bis Anfang Juni 1813 zum Sekondeleutnant. Während der Befreiungskriege wurde er in der Schlacht bei Großgörschen verwundet, kämpfte dann bei Bautzen, Katzbach und Wavre. Für Ligny wurde ihm das Eiserne Kreuz II. Klasse verliehen. Schenckendorf nahm außerdem am Übergang bei Wartenburg sowie den Gefechten bei Königswartha, Bunzlau und St. Germain teil und wurde bei Freyburg verwundet.