Nach den Erfolgen der deutschen Frühjahrsoffensive 1918 an der Aisne löste er im Juni General Denis Auguste Duchêne als Oberbefehlshaber der 6. Armee ab, mit der er an der Zweiten Marneschlacht teilnahm. Ab September 1918 diente Degoutte in Flandern als Chef des Stabes des belgischen Königs Albert I. Nach dem Waffenstillstand übernahm er erneut die 6. Armee, mit der er das linke Rheinufer besetzte.