Thubten Ngodup est né en 1938 à Gyatso dans la région de Shigatsé. Il devient moine au monastère de Tashilhunpo à Shigatsé. En 1959, il fui le Tibet en passant par le Sikkim. Il travaille comme ouvrier routier à Bomdila pendant un an. Il se rend ensuite dans la colonie tibétaine de Bylakuppe, dans le sud de l'Inde. En octobre 1963, il s'enrôle dans la Special Frontier Force, l'aile tibétaine de l'armée indienne et sert dans les parachutistes durant la guerre d'indépendance du Bangladesh en 1971. Il prend sa retraite de l'armée en 1986. Il rejoint Dharamsala vers 1988 et travaille comme vacher pour le monastère de Dip Tsechokling, où il est aussi parfois cuisinier. Le monastère lui donne un petit terrain où il construit une petite hutte. En avril 1996, il rejoint le ministère de la sécurité en tant que messager-nettoyeur. Il démissionne de son poste en décembre 1996 pour participer à la marche tibétaine pour la paix en 1996. Il avait participé à la marche pour la paix de Dharamsala à New Delhi en mars 1995. Vers la fin de l'année 1996, il est admis à la maison de retraite pour anciens militaires à près de Dehra Dun.