С началом войны с получением приказа о расформировании авиабаз майор Полятков в июле приступил к формированию Гуляй-Польского стрелкового полка и с этим полком выступил под Синельниково, где принял первый бой. Затем полк прикрывал отход войск фронта от Днепропетровска до Павлограда, где вошел в подчинение группы полковника Пушкина. При отходе на Краматорск полк был передан в состав 230-й стрелковой дивизии и переименован в 988-й стрелковый. В последующем Полятков командиром этого полка воевал в 12-й армии Южного фронта, участвовал в Донбасской оборонительной, Ростовских оборонительной и наступательной, Барвенково-Лозовской наступательной операциях. 1 февраля 1942 года переведен на должность командира 974-го стрелкового полка 261-й стрелковой дивизии.