1913年5月20日に C-5 は大西洋艦隊潜水小艦隊第1グループの姉妹艦と共にバージニア州ノーフォークを出航した。部隊は C-3 ("USS C-3, SS-14") 艦長R・S・エドワーズ中尉によって指揮され、キャスティン ("USS Castine, PG-6") およびマーズ ("USS Mars, AC-6") に牽引されてキューバのグアンタナモ湾に向かった。C-5 は5月29日に到着し、1913年12月7日までキューバ海域で水雷訓練に従事した。12月7日に C-5 は姉妹艦と共に第1分艦隊に配属され、4隻の水上艦艇に護衛されてパナマ運河地帯のクリストバルに向かった。5日後に艦隊は700マイルの距離を通過し、これは当時のアメリカ潜水艦が自力で航行した最長の距離となった。