「瑞穂」はミッドウェー島攻略を目指すミッドウェー作戦に参加予定だったが、本艦喪失により第十一航空戦隊は「千歳」1隻となった。そこで5月20日附（瑞穂除籍と同日）で特設水上機母艦神川丸が、代艦として編入された。第十一航空戦隊（千歳、神川丸）は、駆逐艦早潮（第15駆逐隊）・第35号哨戒艇〔旧駆逐艦蔦〕・海軍陸戦隊1個小隊をもって『航空隊』を編成、ミッドウェー作戦に参加する。