Mäkäräinen deltok i alle verdensmesterskap fra 2005 til 2020. Bortsett fra en fjerdeplass i jaktstart i 2009 oppnådde hun ingen gode plasseringer før i 2011 i Khanty-Mansijsk. Her ble hun verdensmester i jaktstart og vant sølvmedaljen i sprint. Året etter fikk hun bronse på fellesstarten i Ruhpolding. Hun har også bronse på normaldistansen i 2015 i Kontiolax, fellesstarten i 2016 i Oslo og fellesstarten i Hochfilzen i 2017.