Maflin dispute sa troisième demi-finale de rang en tout début de la saison 2019-2020 lors des Masters de Riga. Il connait un parcours relativement tranquille jusqu'en demi-finale où il perd à la manche décisive contre Mark Joyce au terme d'une partie très accrochée. Plus tard dans la saison, il atteint les quarts de finale du championnat de Chine en battant au passage les deux anciens champions du monde écossais Graeme Dott et John Higgins. Il est également huitième de finaliste du championnat du Royaume-Uni, battu de justesse par Mark Allen (6-5). Il tire une nouvelle fois son épingle du jeu en fin de saison puisqu'il atteint les quarts de finale du championnat du monde pour la première fois. Après avoir éliminé coup sur coup David Gilbert (demi-finaliste de l'édition précédente) et John Higgins (quadruple champion), Maflin passe un peu à côté de sa rencontre qui l'oppose à Anthony McGill, cédant sur le score de 13-10. Il finit la saison au meilleur classement de sa carrière.