В ноябре 1815 года Триумвират был упразднён, а вместо него введён пост президента, который занял Камило Торрес Тенорио; Хосе Мария дель Кастильо стал председателем Конгресса Соединённых Провинций. Когда в марте 1816 года президентом стал Хосе Фернандес Мадрид, то Хосе Мария дель Кастильо стал министром обороны. Когда испанские войска ликвидировали независимость Новой Гранады, то Хосе Мария дель Кастильо, как и многие другие функционеры Соединённых Провинций, был арестован, однако в отличие от большинства прочих руководителей страны он не был казнён, смертная казнь была для него заменена тюремным заключением.