3月23日のカーンズタウンの戦いはジャクソン軍の敗北に終わったが、リンカーンに首都ワシントンの防衛上の不安を与え、北軍部隊の一部を前線から引き抜かせたことで戦略的には勝利といえた。そしてこれはバレー戦役におけるジャクソンの唯一の敗北であった。増援を得たジャクソン軍は、まずマクドウェルの戦い（5月8日-9日）でミルロイとシェンクの部隊を撃破。次いでバンクスの軍をフロントロイヤルの戦い（5月23日）と第一次ウィンチェスターの戦い（5月25日）で撃破する。ジャクソン軍の活動に驚愕したリンカーンはフレモントの率いる軍を向かわせるが、ジャクソンはこれに対してもクロスキーズの戦い（6月8日）とポートリパブリックの戦い（6月9日）で勝利し、北軍をシェナンドー・バレーから駆逐した。