11 апреля 1968 Болеслав Хоха был назначен начальником Генерального штаба Народного Войска Польского. Первой крупной акцией на этом посту стало участие в планировании и реализации вторжения войск Организации Варшавского договора в Чехословакию для подавления Пражской весны. В то же время, по воспоминаниям Рышарда Куклинского, Болеслав Хоха был недоволен подчинением ПНР Советскому Союзу, считал такое положение унизительным, вредным и опасным для Польши. Особую тревогу вызывала у него перспектива столкновения с НАТО, в которое Польша могла быть втянута на стороне СССР. Однако это недовольство не выходило за рамки осторожных частных разговоров или туманных намёков тому же Куклинскому.