เมื่อวันที่ 15 กรกฎาคม พ.ศ. 2563 เขาได้ประท้วงการเดินทางเยือนจังหวัดระยองของนายกรัฐมนตรี ประยุทธ์ จันทร์โอชา เพื่อแก้ไขปัญหา เหตุการณ์ไวรัสโคโรนาจังหวัดระยอง ซึ่งเขาถูกจับกุม เมื่อวันที่ 18 กรกฎาคมภานุพงศ์เป็นส่วนหนึ่งของการประท้วงขบวนการเยาวชนเสรี 18 กรกฎาคมที่ อนุสาวรีย์ประชาธิปไตย ในกรุงเทพฯซึ่งอ่าน "สามข้อเรียกร้อง" ต่อหน้าผู้ประท้วงราว 1,000 คนซึ่งเป็นกลุ่มที่ใหญ่ที่สุดนับตั้งแต่ รัฐประหาร 2557 เมื่อวันที่ 7 สิงหาคมภานุพงศ์และทนายความด้านสิทธิมนุษยชน อานนท์ นำภา ถูกจับกุมในข้อหากล่าวสุนทรพจน์ในการชุมนุมหลายครั้งในช่วงการประท้วงของไทยในปี พ.ศ. 2563 รวมถึงการปลุกระดมการประท้วงและที่สถานีตำรวจที่จัดขึ้น และแถลงการณ์ของ แอมเนสตี้ อินเตอร์เนชั่นแนล และ ฮิวแมนไรตส์วอตช์ เรียกร้องให้ปล่อยตัวภานุพงศ์และผู้ประท้วงนักศึกษาคนอื่น ๆ และให้ทิ้งข้อหา พวกเขาได้รับการปล่อยตัวในเวลาต่อมา