Beneckendorff kam am 6. Februar 1788 als Junker in das Dragonerregiment „von Borstell“ der Preußischen Armee. Dort wurde er am 18. März 1789 Fähnrich und am 8. Mai 1791 Sekondeleutnant. Während des Feldzuges in Polen kämpft er 1794 bei der Belagerung von Warschau und dem Gefecht bei Kapinocz. Am 14. Juli 1801 wurde er zum Premierleutnant befördert, am 4. September 1802 wurde zur Militärparade der Sachsen nach Dresden geschickt. Am 30. Oktober 1804 wurde er dann zum Stabskapitän befördert. Während des Vierten Koalitionskrieges kämpfte er nach den Gefechten bei Halle, Waren und Lychen. Nach der Kapitulation bei Lübeck wurde er inaktiv gestellt. Am 8. Februar 1808 wurde er auf Halbsold gesetzt und eine Wiederanstellung in Aussicht gestellt. Am 29. Juni 1808 wurde er noch zum Major befördert, verzichtete aber auf seinen Sold. Am 22. März 1810 erhielt er seine Demission mit der Erlaubnis, seine alte Uniform tragen zu dürfen. Er lebte daraufhin auf dem Gut Limbsee.