У складі збірної був учасником двох чемпіонатів світу: 1986 року у Мексиці та 1990 року в Італії, а також чотирьох розіграшів Кубка Америки: 1983 року, 1987 року в Аргентині, 1993 року в Еквадорі та 1995 року в Уругваї. На трьох з чотирьох континентальних першостях, участь у яких брав Франческолі, уругвайці ставали найсильнішою збірною континенту.