マクファーソン郡（）は、アメリカ合衆国カンザス州の中央部に位置する郡である。2010年国勢調査での人口は29,180人であり、2000年の29,554人から1.3%減少した。郡庁所在地はマクファーソン市（人口13,155人）であり、同郡で人口最大の都市でもある。マクファーソン郡は、その全体でマクファーソン小都市圏を構成している。郡名は南北戦争に北軍で参戦し、アトランタの戦いで戦死したジェイムズ・B・マクファーソン将軍に因んで名付けられた。