Во время Второй мировой войны территория Австралии находилась под прямой угрозой японского вторжения. Японские войска атаковали Дарвин в Северной Австралии и Сидней-Харбор. В 1941 году этнические японцы в Австралии были интернированы, и в конце войны большинство из них было депортировано обратно в Японию. Австралийские силы играли активную боевую роль в боях на территории Юго-Восточной Азии и юго-западной части Тихого океана на театре Второй мировой войны. Наиболее заметными событиями войны между обеими сторонами были Битва за Кокоду и Сандаканские марши смерти (за которые в 2014 году премьер-министр Японии Синдзо Абэ выразил свои искренние соболезнования от имени японского народа парламенту Австралии). Австралийские войска также сыграли значительную роль в послевоенной оккупации Японии.