В ноябре 1805 года корабли эскадры доставили войска в Неаполь, однако после Аустерлица возвратили их обратно на Корфу. С 12 февраля по 5 марта 1806 года «Святая Елена» конвоировала английские транспортные суда на Мальту. 15 марта в составе отряда вице-адмирала Д. Н. Сенявина корабль прибыл в Кастельново. 30 марта корабли отряда обстреляли крепость Курцало, которая была вынуждена капитулировать. В апреле 1806 года «Святая Елена» сопровождала транспортные суда в Триест и с фрегатом «Венус» блокировала Венецию. В мае 1806 года «Святая Елена» действовала у Новой Рагузы.