Thomé murhattiin vuoden 1918 sisällissodan aikana Vihdissä yhdessä veljiensä Williamin ja Ivarin kanssa; heidät murhasi Lauri Karan johtama punakaartilaisten komppania. Kuolintavoiksi on Kansallisarkiston sotasurmat -sivustossa ilmoitettu sekä pistimenhaava vatsassa että ampuminen. William Thomé oli ammatiltaan metsänhoitaja. Veljessarjan neljäs, taiteilija Verner Thomé, ei ollut veljiensä mukana tuona traagisena päivänä.