Kunieda första paralympiska insats var i dubbel vid de paralympiska spelen 2004 i Aten. Där han vann guldmedalj tillsammans med Satoshi Saida. Vid de paralympiska spelen 2008 i Peking erövrade han guldmedalj i singel och bronsmedalj i dubbel, åter tillsammans med Satoshi Saida. Singelguldet blev Kunieda förste manlige rullstolstennisspelare att försvara, genom att vinna guld i singel också vid de paraolympiska spelen 2012 i London. Ny paralympisk erövrade Kunieda sedan vid de paraolympiska spelen 2016 i Rio de Janeiro där han åter spelade tillsammans med Saida och erövrade brons.