Auch intern gab es Meinungsverschiedenheiten, die zu schwierigen Konflikten führten. So unterließ die Koalition während der Annexionskrise 1908 jegliche Stellungnahme zur Zukunft Bosnien-Herzegowinas, weil dies zur Spaltung des Bündnisses geführt hätte. Im folgenden Jahr arbeitete Pribićević auf einen Kompromiss mit der ungarischen Regierung hin. Supilo war gegen Verhandlungen und er verließ deshalb 1910 die Koalition, in der nun die Serben zunehmend die Oberhand gewannen.