Dans la première série (1963-1989), le Docteur est un Seigneur du Temps parmi d'autres, alors que dans la seconde série (depuis 2005), il se présente comme le dernier survivant de sa race. Il aurait mis fin à la Guerre du Temps entre les Daleks et les Seigneurs du Temps. Cependant, on découvre peu après dans la série que les Daleks ont survécu (nouvelle série, saison 1 épisode 6), ainsi que les Seigneurs du Temps (épisode Le Jour du Docteur entre la saison 7 et la saison 8).