František se v Čechách usadil již v předbělohorské době a jako císařský plukovník a jeden z vítězných velitelů Bitvy na Bílé Hoře si dále budoval vojenskou kariéru. V letech 1628-1629 dokončil zakoupení poddanského panství Strážnice, což mu umožnila jak smrt bývalého vlastníka Jana Jetřicha ze Žerotína, který byl zkompromitován stavovským povstáním, tak dlouhodobě trvající zadluženost panství a odhadnutá nízká cena kvůli zpustošení. Ke změně majitele nakonec došlo tzv. postupnou konfiskací. Tato změna majitelů panství namísto rodu Žerotínů měla trvání pro dalších více než 300 let, rod Magnisů totiž sídlil ve Strážnici s malými výjimkami až do roku 1945.