На президентских выборах 2009 года Совет решил поддержать 76-го премьер-министра Ирана (1981—1989) Мир-Хосейна Мусави. Уверенную победу одержал действующий президент Махмуд Ахмадинежад, но сторонники Мусави не поверили в результаты выборов. Совет призвал к ненасильственным протестам против правительства. После несколько дней массовых выступлений оппозиции ситуация в стране резко обострилась, поскольку члены народного ополчения «Басидж», лояльные властям Исламской Республики, начали нападать на протестующих, и наоборот. Некоторые протестующие даже стали призывать к свержению режима. Протесты длились нескольких месяцев, получив название «Зелёное движение».