Несмотря на давние связи с Акбаром Хашеми-Рафсанджани, на выборах 2005 Натек-Нури поддерживал Махмуда Ахмадинежада. Однако на выборах 2009 поддерживал Мир-Хосейна Мусави против президента Ахмадинежада, которого упрекал в дестабилизации государственной системы. Ответом Ахмадинежада стало преследование членов семьи Натек-Нури. Радикальные сторонники президента организовывали уличные акции против Натек-Нури.