1931 wurde Pedro Segura y Sáenz von der republikanischen Regierung Spaniens zum Verlassen des Landes gezwungen und floh nach Rom. Er legte die Leitung des Erzbistums Toledo nieder. 1937 konnte er in den im Spanischen Bürgerkrieg von Truppen Francos gehaltenen „nationalen“ Teil Spaniens zurückkehren und wurde Erzbischof von Sevilla. Pedro Segura y Sáenz nahm am Konklave des Jahres 1939 teil.