На юниорском уровне Лафуэнте начала выступать в сезоне 2005—2006 и тогда же впервые приняла участие в чемпионате мира среди юниоров, став там 30-й. В 2006 году, на этапе Гран-при среди юниоров в Мексике Соня завоевала серебряную медаль, и это первая в истории испанская медаль этапа юниорского Гран-при. Наивысшим достижением Лафуэнте на чемпионатах мира среди юниоров было 12-е место в 2008 году. В том же сезоне она дебютировала на чемпионате Европы (20-е место) и на чемпионате мира (30-е).