Werder wurde im Jahr 1783 Schüler des Joachimsthaler Gymnasiums. Am 1. Februar 1786 kam er als Standartenjunker in das Leibkarabinerregiment. Am 1. Dezember 1786 wurde er als Kornett in das Kürassierregiment „von Kalckreuth“ versetzt. Dort wurde er am 19. März 1792 Sekondeleutnant. Während des Ersten Koalitionskrieges nahm Werder an den Belagerungen von Longwy, Verdun und Mainz teil. Bei letzterer wurde er verwundet. Ferner kämpfte er bei der Kanonade von Valmy sowie den Schlachten bei Pirmasens und Kaiserslautern. Für das Gefecht bei Hochheim wurde Werder am 7. Januar 1793 mit dem Orden Pour le Mérite ausgezeichnet.