Im Konsistorium vom 13. Februar 1690 nahm Papst Alexander VIII. ihn als Kardinalpriester in das Kardinalskollegium auf. Den roten Hut erhielt er am 16. Februar desselben Jahres und "San Tommaso in Parione" als Titelkirche am 10. April 1690. Bandino Panciatichi nahm am Konklave 1691 teil, das Innozenz XII. zum Papst wählte. Dieser bestätigte ihn am 14. Juli 1691 als Pro-Datar. Er wechselte am 8. August 1601 zur Titelkirche "San Pancrazio". Von 1699 bis zum 3. Februar 1700 war er Kämmerer des Heiligen Kardinalskollegiums. Er war Teilnehmer des Konklaves 1700, aus dem Clemens XI. als Papst hervorging. Wegen seines fortgeschrittenen Alters lehnte er die ihm von Clemens XI. angebotene Ernennung zum Kardinalstaatssekretär ab. Ab dem 4. Dezember 1700 war er Präfekt der Konzilskongregation und blieb dies bis zu seinem Tod. Am 19. Februar 1710 wechselte er zur Titelkirche "Santa Prassede".