La terminación del conflicto hizo que pasara ese mismo año a medio desarme en la Boca del Riachuelo al mando de Juan Lamberti. Por razones presupuestarias fue arrendado a particulares para el tráfico de cabotaje hasta que en noviembre de 1864 fue enviado al río Uruguay al mando sucesivo del capitán Lino Adolfo Neves y del teniente Tomás Rebollo ante la situación de guerra civil y la intervención militar brasileña, asistiendo pasivamente al bombardeo de Paysandú.