Nach dem Waffenstillstand von Compiègne (1940) und der Deutschen Besetzung Frankreichs war zunächst der Flottenchef für die Sicherung der eroberten Küsten verantwortlich. Der B.S.W. wurde im Oktober 1940 durch die Verlegung des gesamten Stabs des Befehlshabers der Sicherung der Ostsee gebildet. Truppendienstlich unterstand er dem Kommandierenden Admiral Frankreich, einsatzmäßig dem Marinegruppenkommando West. Das Stabsquartier lag in Trouville in der Normandie. Am 8. April 1941 wurde es nach Paris verlegt.