亨利·艾林1901年出生于墨西哥奇瓦瓦州小镇科洛尼亚华雷斯的一个牧场并在那里度过了他11年的童年。1912年7月，艾林全家因墨西哥革命中的骚乱而随其他4200余人一起迁移到美国得克萨斯州艾爾帕索，一年后艾林家又搬迁到亚利桑那州的皮玛。在皮玛，艾林完成了自己的高中学业，在校期间表现出了他在数学和自然科学方面的天赋。