Dueñas tok over som landslagssjef for det spanske kvinnelandslaget i 2007, og ledet landslaget for første gang i Håndball-VM 2007 for kvinner. Han ledet Spania til sølvmedalje i Håndball-EM 2008 for kvinner, da de slo Tyskland 32–29 i semifinalen, men tapte 21–34 mot Norge i finalen.