Fue considerado por el presidente confederado Jefferson Davis como el mejor (y la clasificación de segundo más alto) oficial general de la Confederación antes de la aparición de Robert E. Lee. Fue muerto a principios de la Guerra de Secesión en la Batalla de Shiloh, y es considerado el oficial de más alto rango, de la Unión o Confederación, muerto durante toda la guerra. Davis llegó a alegar que la pérdida de Johnston "fue el punto de inflexión hacia nuestro destino".