Papst Johannes Paul II. ernannte ihn am 5. März 1997 zum Koadjutorpatriarchen von Lissabon. Mit dem Tod Kardinal Ribeiros am 24. März 1998 trat er dessen Nachfolge als Patriarch von Lissabon an. Er war Großkanzler der Katholischen Universität Portugal und Präsident der Bischofskonferenz seines Landes. Papst Johannes Paul II. nahm ihn am 21. Februar 2001 als Kardinalpriester mit der Titelkirche Sant’Antonio in Campo Marzio in das Kardinalskollegium auf. Er nahm an den Konklaven 2005 und 2013 teil.