Bei Kriegsende nahm er die Kapitulation der japanischen Truppen in Rabaul entgegen. Als einer der ranghöchsten australischen Offiziere folgte er im Dezember 1945 auf General Thomas Blamey als Commander-in-Chief (Oberbefehlshaber) of the Australian Military Forces. Im Folgejahr wurde er zum zweiten Mal Chief of the General Staff und blieb dies bis zu seiner Pensionierung im Jahr 1950. Während seiner zweiten Amtszeit überwachte er die Demobilisierung der Landstreitkräfte und koordinierte den australischen Beitrag zur British Commonwealth Occupation Force (Besatzungskräfte des Britischen Commonwealth, BCOF) in Japan. Führend war Sturdee an der Strukturreform des Heeres beteiligt, das nach dem Krieg erstmals über permanente Kampfeinheiten verfügte und mit der Australian Regular Army ein Berufssoldatentum erhielt, das im Kern noch heute existiert.