René Margotton non conobbe suo padre, talentuoso disegnatore e violinista morto nel 1915 sul campo di battaglia della Marna. Fin dalla prima infanzia fu appassionato di disegno e dipinse i suoi primi oli a Marsiglia. Visse a Roanne con sua madre e suo fratello Henri, e anticipando la chiamata alle armi, entrò nell'Armée française. Mobilitato nel 1939, l'armistizio gli consentì di tornare a casa e riprendere il suo lavoro. Dipinse molto e partecipò a diverse mostre nelle province. Trascorso il periodo difficile dell'occupazione, si trasferì a Parigi nel 1945 in un appartamento del XVII arrondissement con sua moglie e i due figli, Roland e Bernard (Bernard Romain).