Os trezentos anos que se seguiram, até o meio do , foram muito prósperos para a cidade. Os prédios históricos mais importantes foram construídos nesse período. Seus anos dourados terminaram em 1655 quando as forças suecas capturaram a cidade durante o Dilúvio, um período negro da história da Polônia. Depois de curta permanência na cidade, os suecos retiraram-se após explodirem o castelo e causarem sérios danos a outros edifícios. Nos próximos 100 anos a economia da Polônia sofreu um declínio, que também afetou a cidade. Um grande incêndio em 1757 e a primeira partição da Polônia em 1772, que passou Sandomierz para o domínio da Áustria, reduziram sua importância. Em conseqüência, Sandomierz perdeu o seu papel de capital administrativa.