Le père Thomas Rosica a reçu plusieurs prix de la part du gouvernement italien et de l'État d'Israël, ainsi que deux médailles du jubilé de la reine Élisabeth II pour son rôle auprès des jeunes. En 2003, lui est décernée la médaille "Pro Ecclesia et Pontifice" pour son implication lors des Journées mondiales de la jeunesse en 2002. En , il reçoit la médaille John Carroll de la .