Tubas ha sido identificada como el antiguo pueblo de Thebez, un poblado cananita famoso por su revuelta contra el rey Abimelech; sin embargo, la ciudad moderna fue fundada a fines de los años 1800 durante el dominio otomano de Palestina, por clanes árabes que vivían en el valle del Jordán. Tras su fundación, se convirtió en el poblado más importante de la Gobernación de Nablus, particularmente conocido por su madera y queso. Pasó a formar parte del Mandato Británico de Palestina en 1917, fue anexado por Jordania después de su captura en la Guerra árabe-israelí de 1948, aunque luego fue ocupado por Israel como resultado de la Guerra de los Seis Días de 1967. La Autoridad Nacional Palestina ha mantenido el completo control de Tubas desde que fue transferida en 1995.