A tempestade atingiu o sudoeste do Haiti perto do pico de intensidade, virou-se para o oeste e desembarcou em Cuba por quatro dias antes de virar para o nordeste. Flora passou pelas Bahamas e acelerou para o nordeste, tornando-se um ciclone extratropical em 12 de outubro. Devido ao seu movimento lento em Cuba, Flora é o ciclone tropical mais húmido conhecido para Cuba, Haiti e República Dominicana. As vítimas significativas causadas por Flora foram as maiores devido a um ciclone tropical na Bacia do Atlântico desde o Furacão de Galveston de 1900.