Universität Regensburg er universitetet i Regensburg i Bayern. Det ble grunnlagt 18. juli 1962 av den bayerske landdagen. Dermed gikk et gammelt ønske i oppfyllelse; allerede i 1487 hadde hertug Albrecht IV av Bayern sammen med byens råd søkt paven om tillatelse til å opprette et universitet i Regensburg. Den senere pave Benedikt XVI var professor ved universitetet fra 1969 til 1977. Han er fremdeles oppført som honorærprofessor ved universitetet, og under sin apostoliske reise til Bayern i 2006 besøkte han universitetet den 12. september og holdt i dets store aula en forelesning over «Glaube, Vernunft und Universität» (se Regensburgforelesningen).