Vienna telah lama menjadi aspirasi strategik kerajaan Uthmaniyah, disebabkan oleh penguasaan teguh kerajaan ini terhadaap Danubian (Laut Hitam ke barat Eropah) selatan Eropah dan laluan perdagangan (Timuran Mediterranean hingga Jerman). Pada tahun sebelum pertempuran kedua ini, pertempuran pertama telah berlaku pada 1529 Pengepungan Vienna di bawah naungan penguasa hebat daripada Keluarga Köprülü yang berpengaruh, Empayar Uthmaniyah telah mengadakan persiapan logistik yang luas, termasuk pembaikan dan penubuhan jalan serta jambatan bagi memasuki Empayar Rom Suci dan pusat logistiknya, serta penerusan peluru, meriam, dan sumber-sumber lain dari seluruh empayar ke pusat-pusat ini dan ke Balkans. Sejak tahun 1679, wabak penyakit telah tercetus di Vienna. Sejak 1679 wabak ini telah merebak di Vienna.