Участвует в осаде Лиона, а затем — в осаде Тулона, городов, где роялисты, сторонники династии Бурбонов, подняли мятеж. После подавления сопротивления роялистов в Лионе и Тулоне, Шарбоннеля направляют в армию Альп, затем на Рейн, затем в Люксембург.