Nachdem Staatspräsident Tandja im Februar 2010 abgesetzt worden war, kehrte Ag Boula nach Niamey zurück. Er wollte gegenüber den neuen Machthabern die Integration seiner ehemaligen Kämpfer in die nigrischen Streitkräfte vorantreiben und sich selbst erneut als Tuareg-Vertreter ins Spiel bringen. Er wurde festgenommen, jedoch nach wenigen Monaten auf Druck von Muammar al-Gaddafi wieder freigelassen, der als Druckmittel Immigranten aus Niger in Tripolis auf Grundlage erfundener Vorwürfe festnehmen ließ. Ag Boula flüchtete danach nach Libyen. Er unterstützte al-Gaddafi im libyschen Bürgerkrieg und beim internationalen Militäreinsatz in Libyen. Nach dem Sturz al-Gaddafis im September 2011 lud der neue nigrische Staatspräsident Mahamadou Issoufou Ag Boula zurück nach Niger ein und ernannte ihn in der Absicht, ein Zeichen der Versöhnung gegenüber den ehemaligen Tuareg-Paramilitärs zu setzen, zu seinem Sonderberater. Beim gewaltsamen Konflikt in Nordmali, den Tuareg-Gruppen 2012 gegen die Regierung Malis begannen, sprach sich Rhissa Ag Boula für eine gewaltfreie Lösung aus. Staatspräsident Issoufou holte Ag Boula 2016 als Minister bei der Präsidentschaftskanzlei erneut in die Regierung. Dieses Amt behielt er auch in der von Mahamadous Issoufous Nachfolger Mohamed Bazoum 2021 ernannten Regierung bei.