Mère Marie sillonnait le arrondissement, où beaucoup d'émigrés défavorisés avaient trouvé refuge, ainsi que les quartiers de Boulogne-Billancourt et de la banlieue ouest, où des Russes travaillaient comme ouvriers d'usine, cherchant à soulager spirituellement et financièrement leur situation, et celle de leur famille. Lorsque Paris fut occupé par l'armée allemande, en , Mère Marie comprit tout de suite les principes de ce régime, et ses dangers non seulement pour la capitale qui l'avait accueillie elle-même, Slave devenue parisienne, mais aussi pour son ancienne patrie. C'est en chrétienne qu'elle entra en résistance, en se servant de ses multiples allées et venues pour des actions de renseignement et de dénonciations des mesures prises par l'occupant, tout en continuant sa mission d'évangélisatrice. Elle sauva ainsi des Juifs de la déportation, en les cachant dans un centre provisoire, le centre Lourmel, puis en leur trouvant des refuges durables. En , elle sauve trois enfants juifs du Vélodrome d'hiver à Paris. Son fils Georges (Youra), âgé de vingt-deux ans, et le père Dimitri Klépinine furent arrêtés par la Gestapo en . Peu après, dénoncée, ce fut à son tour de l'être. Elle s'était préparée spirituellement. Elle fut déportée à Ravensbrück. Elle mourut au camp le , Vendredi saint dans le calendrier julien, après avoir pris la place d'une femme juive destinée à la chambre à gaz.