Bis 1939/40 wurde in der Woche, montags bis sonnabends, regelmäßig zwischen fünf und sechs, gelegentlich auch sieben Stunden unterrichtet. Dieses Maß wurde jedoch mit Beginn des Schuljahres ab Ostern 1940 drastisch auf täglich vier Stunden reduziert, und zwar wöchentlich abwechselnd vormittags und nachmittags. In der Hegestraße hospitierten ab diesem Zeitpunkt, im entgegengesetzten Unterrichtsturnus, die Schülerinnen des Lyzeums Curschmannstraße, dessen Gebäude wegen der Ausweitung des Krieges und im Hinblick auf die Nachbarschaft zum Allgemeinen Krankenhaus Eppendorf als Reservelazarett eingerichtet wurde. Ein Teil der Schülerschaft ging klassenweise mit ihren Lehrern in die Kinderlandverschickung (KLV) nach Bistritz im Bayerischen Wald. Während des Bombenkrieges blieb der Schulkomplex Hegestraße weitgehend verschont. Im Flügel am Hegestieg sind Brandbomben gefallen, ohne größeren Schaden anzurichten.