4月15日、に向けてラバウルを出港する。4月23日、測量中に敵双発機に襲撃されるも被害なし。4月下旬、第八根拠地隊はMO作戦の準備に入る（珊瑚海海戦）。宗谷の任務はニューギニア島東部の水路調査であった。