Stutterheim trat 1773 als Gefreiterkorporal in das Infanterieregiment „von Bülow“ der preußischen Armee ein. Er avancierte 1774 zum Portepeefähnrich und 1776 zum Fähnrich. In diesem Rang nahm er mit dem Regiment am bayerischen Erbfolgekrieg teil. Bis 1792 avancierte er zum Stabskapitän und rückte mit dem preußischen Kontingent nach Polen aus, um den Kościuszko-Aufstand mit niederzuwerfen. 1797 wurde er Kapitän und Kompaniechef in Infanterieregiment „von Courbière“, wonach seine Beförderung zum Major 1803 erfolgte. Im Vierten Koalitionskrieg geriet er beim Gefecht bei Christburg unverschuldet in französische Gefangenschaft. Erst 1808 konnte er zum 2. Westpreußischen Infanterieregiment (Nr. 7) zurückkehren.