La nave tornò operativa in settembre, quando in forza alla TF 77 appoggiò lo sbarco a Morotai. Assegnato alla grande armata navale alleata incaricata di liberare le Filippine dall'occupazione giapponese, il "Warramunga" fu presente all'atto di apertura della campagna, lo sbarco a Leyte il 20 ottobre 1944, subendo vari attacchi aerei e abbattendo un velivolo nemico; il 24 ottobre seguente il cacciatorpediniere prese parte anche alla decisiva vittoria alleata nella battaglia del Golfo di Leyte contro la flotta giapponese. Tra novembre e dicembre il "Warramunga" continuò a operare nelle acque attorno a Leyte, subendo anche attacchi di "kamikaze" giapponesi ma senza subire danni; il 15 dicembre appoggiò lo sbarco di reparti alleati a Mindoro, mentre il 6 gennaio 1945 partecipò all'invasione del Golfo di Lingayen a Luzon venendo mancato di poco da un "kamikaze". Il "Warramunga" operò al largo di Luzon fino a febbraio, compiendo missioni di scorta e supporto di fuoco; in marzo fu richiamato per prendere parte alla campagna del Borneo, e il 1º maggio fornì fuoco di copertura durante lo sbarco a Tarakan; dopo aver condotto altre missioni di bombardamento nella zona del Borneo, alla fine di maggio il cacciatorpediniere tornò a Sydney per nuovi lavori di manutenzione.