Фессалия была в целом мирной страной, но время от времени сталкивалась с конфликтами. Так, в 1570 году венецианцы совершили набег на область Фенарбекир (Фанари), и неудавшиеся греческие восстания произошли в 1600—1601 и 1612 годах, первое при Дионисии Философе, митрополите-епископе Ларисы, а второе — по наущению герцога Неверского, претендовавшего на византийский престол. Греки также восстали в различных областях во время Морейской войны 1684—1699 годов и снова во время Орловского восстания, но эти восстания были быстро подавлены .