清嘉庆之前，贾鲁河为南北漕运干线。江淮物资除海运外，一部分也由长江入淮，溯贾鲁河至华北各地。嘉庆以后，因黄河泛滥使得贾鲁河淤塞严重，另一方面，海运的发展和会通河的开通使得南北交通不再经过贾鲁河，贾鲁河因而逐渐淤废。至清末年间，随着铁路的开通，贾鲁河最终废弃。现在的贾鲁河是1938年花园口决堤事件后疏浚的新河道。