Hülegün johtamant mongolit valtasivat Masyafin joksikin aikaa vuonna 1260, mutta he joutuivat vetäytymään kärsittyään tappion Egyptin malekueille Ain Jalutin taistelussa. Sittemmin mamelukkisulttaani Baibars alkoi vaatia ismailiiteilta tribuuttia. Masyaf liitettiin kokonaan mamelukkien valtakuntaan vuonna 1270. Abu'l-Fida kuvaili paikkaa vuonna 1320 "tärkeäksi kaupungiksi". Ibn Battuta vieraili paikalla puolestaan vuonna 1355 mainiten sen vieressä sijaitsevan viisi ismailiittien linnaketta. Osmanien valtakunta valloitti alueen 1500-luvulla.