מלזיה משתתפת במשחקים האולימפיים לנוער מאז היווסדם באולימפיאדת הנוער סינגפור (2010). לאורך השנים צברו ספורטאי הנוער המלזים שישה מדליות, מתוכן שתי מדליות זהב. מלזיה משתתפת במשחקי החורף החל מאולימפיאדת הנוער לילהאמר (2016). אולם, עד כה לא זכה ספורטאי נוער אולימפי מלזי במדליה במשחקי החורף.