El campamento de Deir Ammar se estableció en 1949 en una parcela de tierra que pertenecía a los habitantes del vecino pueblo de Deir Ammar. A cambio, los servicios e instalaciones que UNRWA gestiona en el campamento se hicieron también extensivos para sus vecinos sin estatus de refugiados. El objetivo inicial de los campamentos de UNRWA fue el de dar cobijo a cientos de miles de refugiados palestinos que habían huido o habían sido expulsados de sus tierras por el avance de las tropas israelíes durante la Guerra Árabe-Israelí de 1948, en lo que el mundo árabe ha dado en llamar la Nakba. En concreto, en el campamento de Deir Ammar se establecieron refugiados provenientes de diversas aldeas (Bayt Nabala, Der Tareef, Tiret Dandan o Sakiya, entre otras) destruidas del área de Jaffa, Ramla y Lod, lugares estos últimos donde el ejército israelí desarrolló una campaña de limpieza étnica. Tras finalizar dicha guerra, toda Cisjordania quedó bajo un régimen de ocupación jordana.