Yazour est dépeuplé quelques semaines avant le déclenchement de la guerre arabo-israélienne de 1948 consécutif à la déclaration d'indépendance d'Israël, lors de l'Opération Hametz lancée par la Haganah le 28–. Cette opération vise un groupe de villages à l'est de Jaffa, dont Yazour. Selon les ordres préparatoires, l'objectif est "d'ouvrir la voie [aux forces juives] de Lydda". Bien qu'il n'y ait pas de mention explicite du sort à réserver aux villageois, l'ordre indique qu'il faut "nettoyer la région" ["tihur hashetah"]. L’ordre opérationnel final indique : "Les habitants civils des localités conquises seront autorisés à quitter les lieux après la recherche d’armes." Les soldats reçoivent pour instruction de ne pas blesser les femmes et les enfants "dans la mesure du possible" et de ne pas piller les villages capturés.