Un infortunio rimediato nell'estate del 2012, durante il Trofeo TIM, costringe l'uruguaiano a saltare la vittoriosa trasferta cinese della Supercoppa italiana. Il 20 ottobre successivo realizza di testa la sua prima rete stagionale, nella vittoria casalinga in campionato per 2-0 contro il . Il 5 maggio 2013, grazie al successo interno della Juventus sul per 1-0, conquista con tre giornate d'anticipo il secondo scudetto consecutivo.