Setelah beberapa tawaran selanjutnya dari Majlis Qing, Yuan akhirnya setuju dan segera meninggalkan desanya lalu menuju ke Beijing pada 30 Oktober. Beliau lalu menjadi Perdana Menteri pada 1 November 1911. Setelah itu beliau memerintahkan Putera Chun untuk mundur dari segala jabatan politiknya. Pengunduran diri Zaifeng ini memberi jalan pada Yuan untuk membuat kabinet yang didominasi oleh orang-orang dari etnis Han dan hanya terdiri dari satu orang Manchu yang memegang jabatan "Menteri Penjajahan". Selain itu, kerana kesetiannya kepada Majlis Qing, Maharani Balu Longyu memberi Yuan gelar kebangsawanan Adipati Peringkat Pertama (一等侯), sebuah gelar yang sebelumnya pernah diberikan kepada Jeneral Zeng Guofan bersama Tentara Xiang-nya dalam menumpas Pemberontakan Taiping.