Nach dem Tod von Papst Urban VIII. nahm Girolamo Colonna am Konklave 1644 teil, in welchem Papst Innozenz X. gewählt wurde. Er war Erzpriester der Lateranbasilika und "Legatus a latere" für die Öffnung und Schließung der Heiligen Pforte in der Lateranbasilika im Jahr des Giubileo universale 1650. Auch am Konklave 1655, in welchem Papst Alexander VII. gewählt wurde, war er beteiligt.