Після чемпіонату світу Клеберсон зберіг свою стартову позицію в збірній під керівництвом нового тренера Карлоса Альберто Паррейри і був також включений до заявки на Кубок конфедерацій 2003 року у Франції, де Бразилія несподівано не змогла вийти з групи. Того ж літа Клеберсон переїхав до «Манчестер Юнайтед», де нерегулярно виходив на поле, і в результаті він втратив місце в основі збірної. Проте йому все ж вдалося погтрапити в заяку збірної Бразилії на Кубок Америки 2004 року у Перу. Він зіграв у 5 матчах на турнірі і допоміг бразильцям всьоме в історії виграти турнір.