La construcció primitiva, d'estil gòtic, començà el 1295, amb els arquitectes Antão Martins i Afonso Martins; al segle XVII, l'intervingué fra João Turriano, monjo benedictí, enginyer del regne. A causa dels danys causats pel terratrèmol de 1755, de la construcció gòtica inicial resten només alguns fragments dels claustres i la capçalera de l'església –amb el portal lateral sud–, constituïda per l'absis i capelles laterals, amb voltes de nervis. El monestir reflecteix la diversitat estilística de les successives intervencions a què ha estat sotmés: elements gòtics, manuelins, barrocs i neoclàssics.