Em 17 de setembro de 1593, o consistório nomeou Cinzio cardeal-diácono de São Jorge em Velabro graças à intercessão de Ippolito no Colégio de Cardeais. Governador de Spoleto de 4 de fevereiro de 1595 até 21 de fevereiro de 1607, Cinzio tornou-se prefeito da "Tribunale della Segnatura Apostolica" a partir de de 23 de dezembro de 1599. Entre 1601 e 1607, foi legado papal a Avinhão e participou nos conclaves de março, abril e maio. Em 1605, foi criado cardeal penitenciário pelo papa Leão XI, mas subitamente teve que renunciar por não ter sido antes ordenado — o que aconteceu em 1605 e ele pôde reassumir a posição, quando recebeu o título de São Pedro Acorrentado.