Он стал управлять своими силезскими владениями, в том числе занимался расширением замка в Трахенберге. Его семья владела этим замком до 1945 года. В 1657 году Мельхиор фон Гацфельдт вернулся на императорскую службу и был назначен командующим имперской армии (16 тыс. чел.), отправленной на помощь Речи Посполитой в борьбе против шведских оккупантов. Он вынудил шведов покинуть осаждённый Краков. Во время польской экспедиции он заболел и умер через несколько месяцев в своих силезских владениях.