2009-10 sezonu öncesinde, Supercopa de España ve UEFA Süper Kupası'nda Athletic Bilbao ve Shakhtar Donetsk takımlarına karşı oynadı, ama fırsatları iyi değerlendiremedi. Fontàs sesonun büyük çoğunluğunu rezerv takımda oynayarak geçirdi. Asıl mevkiisi ön liberoydu, ama eski bir Barcelona oyuncusu olan rezerv takım teknik direktörü Luis Enrique defans olarak oynattı.