Klubben grundades 1916 på östfronten i den ukrainska byn Kostyukhnivka under första världskriget av polska legionärer som tillhörde Österrike-Ungerns militär. Under Brusilovoffensiven och den efterföljande reträtten bröt sig fotbollsklubben loss från armén och startade upp verksamheten i Warszawa. Laget hette till en början WKS Warszawa, vilket stod för Wojskowy klub sportowy (Militära sportklubben) men kallades för legionärerna. Genom en sammanslagning 1922 med den lokala klubben Korona antogs namnet Legia Warszawa. Klubben har under sin historia fått mycket stöd från den polska militären.