Papst Johannes XXIII. nahm José Garibi Rivera am 15. Dezember 1958 als Kardinalpriester mit der Titelkirche "Sant’Onofrio" in das Kardinalskollegium auf. José Garibi Kardinal Rivera nahm in den Jahren 1962 bis 1965 am Zweiten Vatikanischen Konzil und am Konklave 1963 teil. Die Leitung der Erzdiözese Guadalajara legte er 1969 aus Altersgründen nieder.