En asuntos extranjeros, Clinton votó en octubre de 2002 a favor de la autorización para el uso de la fuerza militar contra Irak, un voto que luego "lamentó". Ella prefería armar a los combatientes rebeldes de Siria en 2012 y ha pedido la destitución del presidente sirio Bashar al-Assad. Apoyó el bombardeo de la OTAN a Yugoslavia en 1999 y la intervención militar liderada por la OTAN en Libia para expulsar al exlíder libio Muammar Gaddafi en 2011. Clinton está a favor de mantener la influencia estadounidense en el Medio Oriente. Ella dijo ante el Comité de Asuntos Públicos de Israel de Estados Unidos: "Estados Unidos nunca puede ser neutral cuando se trata de la seguridad y la supervivencia de Israel". Clinton expresó su apoyo al derecho de Israel a defenderse durante la guerra del Líbano de 2006 y el conflicto de Israel y Gaza de 2014. En abril de 2017, Clinton llamó a atacar los campos de aviación sirios.