В XIII веке города Южного Казахстана подверглись разрушению во время монгольского нашествия (1219—1224). Были завоеваны и частично разрушены Отырар, Женд, Ашнас и множество другие населенные пункты. Горожане оказывали захватчикам героическое сопротивление. Особенно упорно сражались жители Отырара, которые в течение полугода отбивались от превосходящих сил противника. Во 2-й половине XIII века в результате многочисленных междоусобных распрей Чингизидов пришли в упадок города Жетысу (Шуская, Таласская, Илейская долины). В конце XIII века жизнь в них прекратилась и они превратились в развалины. Иначе складывалась судьба сырдарьинских городов: Отырара, Сыганака, Саурана, Созака, Сайрама, Туркистана. Постепенно возрождаясь, они к концу XIII века вновь становятся крупными экономическими, политическими, и культурными центрами. Эти города в XIII — начале XIV в. играли важную роль в жизни Ак-Орды, а затем Казахского ханства (с XV века).