Après avoir raté la phase finale de Super 14 en 2008 et 2009, il parvient à faire progresser la défense de la franchise. La Western Province termine la saison de la Currie Cup 2009 avec le meilleur bilan défensif. En 2010, l'équipe termine deuxième après la saison régulière, après avoir concédé seulement en , de moins que les Waratahs, qui avaient la deuxième meilleure défense. L'équipe atteint la finale, où ils s'inclinent contre leurs compatriotes sud-africains des Bulls. La Western Province réalise le même exploit au niveau national, avant de perdre contre les Natal Sharks lors de la finale de Currie Cup. Le travail de Nienaber en tant qu'entraîneur de la défense est noté par l'équipe nationale sud-africaine et il est alors approché pour rejoindre leur encadrement.