При отступлении Красной армии в 1941 году имущество детского дома и его воспитанники были перевезены в другое место, а бывшее главное здание мызы сожжено. Быстро отходившие советские войска в волости Вайвара имели хорошие укрепления и оказали наступающим немецким войскам сильное сопротивление, что причинило мызе большой ущерб. В ходе последующих сражений на Синимяэских высотах в 1944 году большинство вспомогательных зданий мызы и остатки первого этажа господского дома были окончательно разрушены.