V šedesátých letech došlo opět k rozšíření využití letiště pro vojenské účely. V roce 1962 přišel do Olomouce 2. vrtulníkový pluk. Byla naplánována dostavba a rozšíření letiště. Práce však přerušila sovětská okupace v roce 1968. Letiště obsadila sovětská vojska. Vrtulníkový pluk byl nucen se přesídlit do Prostějova a brzy na to odešel i Hanácký Aeroklub na letiště do Vyškova.