Eisenman a mené campagne pour libérer l'accès aux manuscrits de la mer Morte dans les années 1980-90. Il estime que le mouvement chrétien est le continuateur des Esséniens auteurs des manuscrits retrouvés à Qumrân et que leur messianisme et leur opposition (nom de code des Romains) les a conduits à être très actifs dans la grande révolte juive de 66-70. Cette théorie est en opposition avec le consensus des spécialistes.