El año de 1989 fue uno de los más exitosos en su carrera profesional, ya que dirigiendo al Atlético Nacional ganó la Copa Libertadores en tiros desde el punto penal contra el Club Olimpia de Paraguay, con una destacada actuación del arquero René Higuita. Ese mismo año Maturana siguió al frente de la selección para la Copa América 1989 y las eliminatorias al mundial de fútbol. En la Copa América, Colombia se quedó en primera ronda. Sin embargo, lograba la clasificación de la selección nacional de Colombia al mundial (el segundo en su historia para Colombia) después de 28 años de ausencia. Esta se logró ganando el grupo B con el derecho a repechaje ante Israel, a la cual se superó 1-0 en Barranquilla el 15 de octubre de 1989 y un empate sin goles en Tel Aviv el 30 de ese mes significaron el ansiado regreso al Mundial.