Em 1543, passa ao título de São Clemente. Em 1544, foi nomeado pelo Sacro Imperador administrador apostólico de Agrigento, cargo que exerceria até a morte. No mesmo ano, passa ao título de Santa Maria em Trastevere. Por conta de uma doença, não pode comparecer ao consistório de 8 de janeiro de 1546. Participa do Conclave de 1549–1550, que elegeu o Papa Júlio III. Passa a ordem dos cardeais-bispos, com o título de bispo de Albano e menos de um mês depois, passa ao título de bispo de Frascati onde fica até 1555, quando é transferido para Porto e Santa Rufina. Participa dos dois conclaves de 1555, de abril que elegeu o Papa Marcelo II e de maio, que elegeu o Papa Paulo IV. Participa do Conclave de 1559, que elegeu o Papa Pio IV. Em 1562, torna-se Decano do Colégio dos Cardeais e bispo de Óstia-Velletri.