Durante la Intifada de Al-Aqsa Se hicieron llamamientos para una renovación del boicot y el consejo boicot finalmente se reunió de nuevo. Sin embargo, estas reuniones no llegaron a nada. En el 2005, poco después del Plan de retirada unilateral israelí, Baréin anunció que se retiraba del boicot. La retirada de Baréin del boicot fue con el fin de facilitar la aprobación de los acuerdos de libre comercio entre Baréin y los Estados Unidos. La decisión de abandonar el boicot provocó duras críticas de este movimiento por parte del público de Baréin, y el 11 de octubre, el parlamento de Baréin votó a favor de una resolución no vinculante pidiendo a Baréin para volver a participar en el boicot.