В 1997 году в Конго разразилась гражданская война, в которой Йомби-Опанго поддерживал президента Лиссубу. Несколько близких родственников Йомби-Опанго были убиты боевиками Сассу-Нгессо из ополчения «Кобры». После поражения Лиссубы от войск Сассу-Нгессо, поддержанных ангольской интервенцией, Йомби-Опанго вынужден был эмигрировать в Габон, затем в Кот д’Ивуар и во Францию.