В составе первой сборной он дебютировал 8 апреля 1986 года в товарищеской игре с ГДР. В 1986 году он поехал на чемпионат мира, там провёл все 5 игр. В 1/4 финала с Францией, в серии послематчевых пенальти, Жулио Сезар последним бил с 11-метровой отметки, но попал в штангу. На следующий год он поехал со сборной на Кубок Америки, но там провёл только 1 игру. Всего за сборную Жулио Сезар сыграл 14 матчей.