Сведений о ранней жизни Анри Кристофа чрезвычайно мало. Место рождения точно неизвестно, возможно, он родился на о. Гренада или на о. Сент-Китс. Кристоф был сыном рабыни и свободного, также по имени Кристоф. В раннем возрасте был доставлен в качестве раба в северную часть французской колонии Сан-Доминго. По некоторым данным в 1779 году служил барабанщиком в и принимал участие в осаде Саванны во время Войны за независимость США. Есть сведения, что Кристоф был ранен в этом сражении.