Karadžić var ledare för de bosnienserbiska ultranationalisterna under Bosnienkriget och för den serbiska utbrytarregionen Republika Srpska. Han avgick från den posten 1996 efter förlusten i Operation Storm och att Nato inledde bombningar av Republika Srpska. Han misstänks vara skyldig till organiserandet av etnisk rensning och folkmord riktat mot bosniaker i Bosnien, bland annat i staden Srebrenica där omkring 8 000 bosniaker mördades i juli 1995 av serbisk militär under ledning av generalen Ratko Mladić, befälhavare för de bosnienserbiska styrkorna.