V roce 1420 byl hrad dobyt husitským vojskem. Klášter později využil panství hradu k úhradě pohledávek Viléma z Nečtin a na Žluticích a ten jej před rokem 1447 prodal Burianovi z Gutštejna. Páni z Gutštejna na hradě obvykle nesídlili, ale udržovali jej a měli na něm vojenskou posádku. V roce 1478 Komberk nejspíše dobylo vojsko Jana Planknara z Kynšperka. Podle Tomáše Durdíka byl poté hrad opuštěn, ale Miloslav Bělohlávek uvádí, že na Komberku sídlil Jan z Gutštejna, který ho v roce 1509 nebo krátce předtím Komberk prodal Albrechtovi z Kolovrat. Po něm zdědili majetek bratři Jan a Bernart z Valdštejna, kteří Komberk a Dolní Bělou prodali Václavovi z Roupova. Potom byl hrad pravděpodobně ponechán svému osudu a roku 1558 se připomíná jako pustý.