Den 21 februari 1998 upphöjde påve Johannes Paulus II Jaworski till kardinal "in pectore"; tre år senare erhöll han San Sisto som titelkyrka. Kardinal Jaworski gav påve Johannes Paulus II de sjukas smörjelse på dennes dödsbädd. Han deltog i konklaven 2005, vilken valde Benedikt XVI till ny påve.