In 1661 werd het gebied herdijkt, waardoor de plaats in de Nieuwerkerkepolder kwam te liggen. Deze polder werd regelmatig getroffen door overstromingen, zoals in 1682, 1703, 1807 en in 1953. Alhoewel de kerk al lang verdwenen was, bleef de plaats waar deze gestaan had bekend als 'oud kerkhof'. Tijdens herkaveling in 1963 werden hier oude graven en puinsleuven gevonden. In 1986 kwamen bij archeologische opgravingen de resten naar boven van een mottekasteel uit de 14e eeuw dat ongeveer 150 meter ten westen van Nieuwerkerke heeft gestaan. Dit kasteel had een afmeting van 10 bij 7 meter en was omgeven door een gracht van 5 tot 8 meter breed.