В июле он был зачислен в резерв Ставки ВГК, затем назначен командиром 381-й стрелковой дивизии 3-й ударной армии Калининского фронта. В сентябре того же года дивизия принимала участие в Духовщино-Демидовской наступательной операции. С октября она входила в состав 4-й ударной армии этого же Калининского (с 20 октября 1943 г. — 1-го Прибалтийского) фронта и участвовала в Невельской наступательной операции, в освобождении города Невель. В декабре дивизия успешно действовала в Городокской наступательной операции, в разгроме городокской группировки противника. 17 января 1944 года Якушову присвоено воинское звание генерал-майор. В мае 1944 года она вошла в состав 97-го стрелкового корпуса 21-й армии Ленинградского фронта, затем в июне была подчинена 98-му стрелковому корпусу и участвовала в Выборгской наступательной операции. С конца сентября дивизия в составе этого же корпуса 2-й ударной армии вела боевые действия на 2-м Белорусском фронте. До января 1945 года она находилась в резерве фронта, затем участвовала в Восточно-Прусской и Млавско-Эльбинской наступательных операциях. С февраля 1945 года ее части успешно действовали в Восточно-Померанской наступательной операции, при овладении городами Эльбинг (Эльблонг), Грудзендз и Данциг (Гданьск). С 5 мая дивизия вошла в 19-ю армию этого же 2-го Белорусского фронта и участвовала на заключительном этапе Берлинской наступательной операции.