Mit dem Ende der Feindseligkeiten nach der Kapitulation Japans trat die "Lionfish" den Rückmarsch an und beendete am 22. August 1945 ihre zweite und letzte Feindfahrt im Zweiten Weltkrieg. Sie fuhr weiter nach San Francisco und wurde schließlich am 16. Januar 1946 außer Dienst gestellt und der Reserveflotte in Mare Island übergeben.