Основная часть его коллекции пострадала во время Копенгагенского пожара 1728 года, когда дом Арни был объят пламенем. Друзья помогли ему спасти большую часть рукописей, но многое было утрачено (в т. ч. почти все старопечатные исландские книги). Копиист после пожара восстановил по памяти текст одной из рукописей, ибо как оригинал, так и только что выполненная им копия погибли в огне.