El grueso de los primeros pobladores de Manchay fueron migrantes desplazados por la guerra interna que durante la década de 1980 arreciaba en Huanta y Ayacucho. Numerosas familias que huyeron de la violencia, pobreza y el abandono hicieron sus primeros hogares con los restos de los viejos tranvías limeños desechados en dicho ambiente desértico. Debido a su marginalidad física y social, Manchay fue elegido como refugio de los desplazados, quienes lo fueron poblando gradual y silenciosamente. En 1990 ya era un pueblo grande donde se hablaba quechua y se trabajaba en paz, pero donde había carencia de todo.