Во избежание конфликтов Хукер вместе с 11-м и 12-м корпусами армии Потомака был переброшен на Западный фронт боевых действий. Здесь Хукер вновь проявил себя как прекрасный командир корпусного уровня. Его солдаты отличились в битве при Чаттануге и в битве за Атланту. В сражении при Ресаке его корпус, хотя и с опозданием, всё же прибыл на левый фланг федеральной армии и успел спасти корпус Ховарда, попавший под фланговую атаку.