Sotto osservazione dei Brumbies, Hooper si infortunò a una caviglia a 18 anni e, pur potendo tentare il recupero, decise di sottoporsi a un intervento, perdendo anche l'opportunità di partecipare al campionato mondiale giovanile in Argentina; la dirigenza dei Brumbies ebbe comunque fiducia in lui e il giocatore, recuperato, fu schierato nel corso del Super 14 2010 quando George Smith, fino ad allora titolare inamovibile nel ruolo, dovette a sua volta dare "forfait" per infortunio.