Джон Буршье был женат на Марджори Бернерс. В этом браке родились дочери Джоан (жена сэра Генри Невилла) и Элизабет (жена Роберта Уэллса, 8-го барона Уиллоуби де Эрзби) и сын Хамфри, погибший при жизни отца в 1471 году, в битве при Барнете. Наследником Джона стал внук, носивший то же имя.