Ottiene un successo strepitoso per il quarto romanzo "Captain Corelli's Mandolin" ("Il Mandolino del Capitano Corelli", precedentemente "Una vita in debito"), che nel 2001 John Madden porta sullo schermo, proponendo il Premio Oscar Nicolas Cage nel ruolo del "Capitano" e Penélope Cruz come "Pelagia". A questo romanzo in particolare è legato il suo nome, che diviene improvvisamente prestigiosissimo: riesce quasi a far dimenticare la "polemica Márquez". La storia, ambientata in Cefalonia - Grecia - durante l'occupazione italo-tedesca, narra del Capitano Corelli, appartenente ovviamente all'esercito invasore, e di Pelagia, la figlia dello stimato "Dottor Iannis", che non vede troppo bene i Fascisti invasori e il Totalitarismo in generale; tra i due nasce una storia d'amore che sfocia nella tragedia nel finale, quando il Capitano e tutti i suoi sottoposti vengono sterminati dai Nazisti nell'Eccidio di Cefalonia (8 settembre 1943). Per il "Corelli's Mandolin" vince il Commonwealth Writers' Prize nel 1995; in precedenza, nel 1994, lo si era proposto per il Sunday Express Book of the Year.