À Saint-Raphaël, lors des championnats de France en grand bassin, elle remporte deux titres, le nage libre et quatre nages, et termine deuxième derrière Balmy sur le nage libre. Favorite du quatre nages des championnats d'Europe 2010 à Budapest, course où elle annonce viser la médaille d'or, elle est encore en tête après la brasse, troisième discipline, mais se fait remonter par la Hongroise Katinka Hosszú qui l'emporte, la Française terminant finalement quatrième. Le même jour, le relais français du nage libre composé de Coralie Balmy, Ophélie-Cyrielle Étienne, Margaux Farrell et Muffat terminent deuxième derrière les Hongroises, la Hongroise Evelyn Verraszto prenant le meilleur sur Camille Muffat lors du dernier relais. Deux jours plus tard, elle termine à nouveau quatrième, sur le nage libre, course remportée par l'Italienne Federica Pellegrini.