При этом в 1987—1990 гг. одновременно возглавлял и сборную Колумбии. Матурана четырежды назначался главным тренером национальной команды Колумбии в 1980-е — 2000-е годы. Он вывел Колумбию в финальную стадию чемпионатов мира 1990 (впервые за 28 лет) и 1994 годов и руководил ей на тех турнирах. Кроме того, руководил этой сборной на Кубках Америки 1993, 1995, 1997, 2001. В последнем случае привёл Колумбию к первому континентальному чемпионству в истории страны. В 2003 году довёл колумбийцев до полуфинала Кубка конфедераций.