Alkibiades begab sich zunächst auf seine Besitzungen nach Thrakien. Trotz der bereits mehrfachen Verbannung aus seinem Vaterland war seine Verbundenheit zu Athen stets vorhanden. So auch, als der athenische Feldherr Philokles (Strategos) mit einer neuen Flotte in See stach und zum Hellespont führte. Alkibiades, auch von seinen Gegnern als fähiger Feldherr anerkannt, versuchte Philokles bei seiner strategischen Kriegsführung zu beraten, doch dieser und seine Mitstrategen lehnten seinen Rat verachtungsvoll ab. Dies wurde zum Verhängnis der athenischen Flotte, Alkibiades Befürchtungen wurden bald bestätigt. Die spartanisch-peloponnesische Flotte unter Lysander besiegte die Athener in der Schlacht bei Aigospotamoi (September 405 v. Chr.). Nach der Niederlage floh Alkibiades an den Hof des persischen Satrapen Pharnabazos nach Daskyleion. Auf Betreiben des spartanischen Befehlshabers Lysander und im Einvernehmen mit den in Athen eingesetzten Dreißig Tyrannen wurde Alkibiades 404 v. Chr. auf der Flucht in der phrygischen Ortschaft Melissa ermordet. Seine Geliebte, die Hetäre Timandra, soll ihn bestattet haben.