1997年3月，立法院通過《香港澳門關係條例》，预备香港、澳门主权移交中华人民共和国后，规范与两地间的往来事宜。自此，中华民国政府方面，将港澳地區定位为“有別大陸其他地區之特別區域”，不再是侨区。僑務委員會不再向港澳居民核发“役政用華僑身分證明書或護照加簽僑居身分”。港澳居民待遇与外国人相类。进出台湾本岛时，陆港澳居民使用臺灣地區入出境許可證。