17 апреля 1863 года он стал командовать 3-й дивизией XIV корпуса Камберлендской армии. В 1864 году стал командиром Огайской армии (после травмы у Джона Фостера) и участвовал в битве за Атланту под руководством Шермана. В сражении при Ресаке его фронтальная атака позиций противника провалилась, но в сражении у горы Кеннесо именно наступление его корпуса создало реальную угрозу Теннессийской армии и заставило Джонстона оставить позиции.