Este periodo está comprendido entre la promulgación del Manifiesto del 20 de julio de 1810 y el inicio del Régimen del Terror en 1816. Dicho período estuvo marcado por la división, los conflictos entre provincias, las guerras internas y el desorden institucional. Para controlar la administración de la república naciente, se recurrió a la conformación de Juntas de Gobierno Provinciales y de ellas, nombrar representantes para conformar la Suprema Junta, bajo cuya responsabilidad se organizaría el Congreso y de él nacerían las organizaciones administrativas del estado. De estas nacieron las Provincias Unidas de la Nueva Granada y el Estado Libre de Cundinamarca.