Ese mismo año, sin embargo, consiguieron la medalla de bronce en los celebrados en México. Ubicado en un difícil grupo con la selección española, campeona de Europa en 1964, la selección brasileña, doble campeona mundial, y la selección nigeriana. Logró vencer a esta última por 3-1, lo que sumado a los empates con Brasil (1-1) y España (0-0), les valdría para pasar de ronda. En los cuartos de final derrotaron a la selección francesa por 3-1, lo que les daba un puesto para intentar conseguir un puesto en la final. Una contundente derrota por 5-0 a manos de la selección húngara, una de las más potentes de la actualidad, les privaría de ello. El 24 de octubre de 1968, superó a la anfitriona selección mexicana en la disputa por el tercer puesto y medalla de bronce por 2-0, logrando su primer gran éxito en una de las grandes citas a nivel futbolístico. La plantilla del logro estuvo compuesta por Yokohama, Katayama, Yamaguchi, Kamata, Mori, Ogi, Miyamoto, Watanabe, Kamamoto, Matsumoto, Sugiyama. El héroe del evento fue Kunishige Kamamoto, que se convertiría en el goleador más grande de la historia de Japón, con 55 goles marcados en 61 partidos entre 1964 y 1977 (una media de 0,9 goles por partido). El seleccionador era el japonés Okano Shunichiro.