В чине полковника Юрий Балабан участвовал в войнах Речи Посполитой против Русского государства и Швеции. В сентябре 1655 года в битве под Городком он был взят в плен казаками. В том же году его выменяли за молодого Бутурлина после победы русских и казаков в битве под Озёрной. В январе 1656 года вместе с другими польскими магнатами подписал акт Тышовецкой конфедерации, сражался со шведами, отличился в битве под Варшавой.