Marín è stato anche un membro della Squadra Nazionale della Costa Rica con la quale ha giocato dal 1993 al 2007 e collezionato 124 presenze, record centroamericano, ha competuto nella Coppa del Mondo FIFA del 2002 in Giappone e Corea del Sud (dove fu autore di un'autorete contro il Brasile) e nella Coppa del Mondo FIFA del 2006 in Germania, inoltre partecipò alla Coppa America 1997 in Bolivia, alla Coppa America 2001 in Colombia e alla Coppa America 2004 in Perù.