En l’an VI et en l’an VII, il sert aux armées d’Angleterre et du Rhin, avant de retourner à l’armée d’Italie, où il fait les campagnes de l’an VIII et de l’an IX. Le , à la bataille de Marengo, il reçoit un coup de feu à la hanche gauche. Le , il se fait remarquer au passage du Mincio, où il reprend le village de Pozzolo avec une audace digne d’être citée. Ayant ordonné au porte-drapeau de le suivre à la tête du bataillon, il franchit avec lui un fossé plein d’eau, et place le drapeau à sa gauche : « "Camarades", dit-il à ses soldats, "voilà une nouvelle occasion de nous signaler, marchons à la gloire" ; la charge bat, et Courtois s’élance sur l’ennemi, son bataillon le suit et les autrichiens sont culbutés en un instant abandonnant le village et 400 prisonniers parmi lesquels se trouvent 15 officiers.