In april 2008 raakte hij in gevecht met troepen van Ramzan Kadyrov, waarbij 18 doden vielen. Hierop volgde een bitter conflict tussen beide mannen, waarbij Jamadajev uiteindelijk het onderspit dolf. Hij werd op 1 augustus 2008 tot 'crimineel' verklaard en er verscheen een opsporingsbevel voor "moord, ontvoering van mensen en andere grote misdaden". Ook zijn broers werden gezocht. Toch was hij in augustus militair bevelhebber over een van de Russische troepeneenheden tijdens de Oorlog in Zuid-Ossetië. Op 22 augustus werd het opsporingsbevel weer ingetrokken, officieel omdat hij was 'gevonden'. Hij zou in Moskou verblijven. Op dezelfde dag werd hij ontheven als bevelhebber over het Vostok-bataljon. Op 24 september 2008 werd zijn broer Roeslan Jamadajev, die eerder afgevaardigde was in de staatsdoema, in Moskou geliquideerd.