Während des Ilinden-Aufstandes war Capari, neben den Dörfern Gjavoto und Smilevo, Zentrum der Aufständischen in der revolutionären Region Bitola. 96 Aufständische aus Capari kamen während des Aufstands ums Leben. Hier wurden auch die letzten Kämpfen mit der osmanischen Armee in der Region ausgetragen. 1906 wurde im Hofe der Georgskirche ein Mahnmal mit den Gebeinen errichtet. Nach der blutigen Niederschlagung des Aufstands durch die Osmanen emigrierte ein Großteil der Bevölkerung nach Bulgarien, vor allem jedoch in die USA.