Через год, 8 декабря 1800 г., он снова принят на службу с зачислением по армии и 18 ноября 1804 г. назначен шефом Харьковского драгунского полка. В 1805 г. Гижицкий со своим полком принимал участие в войне с Наполеоном. При Аустерлице он командовал бригадой и был ранен. За отличие в этом сражении Гижицкий был награждён орденом св. Владимира 3 ст. Во время обратного похода он командовал кавалерийской колонной. В 1806 г. Гижицкий, оставаясь шефом полка, получил в командование бригаду из полков Харьковского и Черниговского драгунских и Ахтырского гусарского.