Самир Джааджаа был видным командиром «Ливанских сил» в столкновениях с «левомусульманскими» силами ООП, ПСП, ЛКП, в Стодневной войне 1978 и Битве при Захле 1981 против сирийских войск. Также он участвовал в междоусобной борьбе внутри правохристианского лагеря. Особенно обострились эти противоречия в 1977 году, когда часть правохристиан — прежде всего клан Франжье и движение Марада — вступил в союз с Сирией, а фалангисты заняли националистическую антисирийскую позицию. Предполагается, что 13 июня 1978 именно «спецназ» Самира Джааджаа совершил Эденскую резню — убийство Тони Франжье (сын президента Сулеймана Франжье), его жены и дочери. Джааджаа признаёт своё участие в бою с движением Марада, но отрицает причастность к расправе с семьёй Франжье.