Dne 5. května 2016 tým Red Bull oznámil, že jezdec týmu Toro Rosso Max Verstappen nahradí Kvjata v sedačce Red Bull od Velké ceny Španělska, přičemž se Kvjat se vrací do Toro Rosso. Jeho týmovým kolegou byl Carlos Sainz Jr.. Ve Velké ceně Španělska se mu podařilo zajet nejrychlejší kolo a obsadil desáté místo. Bodovat se mu podařilo ještě v Německu a v Singapuru. Po Velké ceně USA byl Kvjat potvrzen jako jezdec týmu Toro Rosso i v sezóně 2017. Celkově v sezóně obsadil 14. místo s dvaceti pěti body.