所有一切在查理四世的儿子，软弱的国王瓦茨拉夫四世在位时期—（1378年至1419年）都发生了变化。大学校长扬·胡斯在布拉格的伯利恒礼拜堂，使用捷克语布道，以尽可能扩大他的教会改革思想的影响。他在1415年以异端罪名在康士坦茲被处以火刑，四年后胡斯战争爆发，战争始于布拉格的第一次拋窗事件，布拉格神父扬·柴利夫斯基指挥了这次反抗，将市长及市议员共7人从新市政厅的窗户扔向楼下。16天后国王瓦茨拉夫四世逝世。他的同父异母弟弟匈牙利國王西吉斯蒙德是王位合法的继承者。但胡斯派反对西吉斯蒙德，因此他带领3万军队来到布拉格。（正是西吉斯蒙德邀请扬·胡斯前往康士坦茲为自己作异端辩护，并答应给他豁免权，但没有信守诺言）。1420年，著名将军扬·杰斯卡领导的农民武装，和胡斯派军队一起，在中击败了西吉斯蒙德。西吉斯蒙德派出了更多的十字军，但是都以失败而告终。杰斯卡去世后，胡斯派分裂，温和派和天主教徒联合，在1434年的中最激进的胡斯派最终战败。西吉斯蒙德成为波希米亚国王。