Der aktuell (Stand: 16. Juni 2010) mit 57 Treffern beste honduranische Nationalspieler aller Zeiten absolvierte sein erstes Länderspiel für sein Heimatland im Jahre 1993. Dabei kam er in einem Gruppenspiel des CONCACAF Gold Cups 1993 gegen die Vereinigten Staaten in der 81. Spielminute für Nicolas Suazo auf den Rasen; das Spiel endete in einer 0:1-Niederlage durch ein Tor von Alexi Lalas. Zu seinem ersten Treffer im Trikot der Honduraner kam Pavón bei seinem erst fünften Länderspiel am 29. November 1995 in einem Gruppenspiel des UNCAF Nations Cups 1995 beim 2:0-Erfolg über Panama. Im Laufe des Turniers erzielte Pavón weitere zwei Tore und wurde mit insgesamt drei Treffern zum Torschützenkönig des Wettbewerbs gewählt. Außerdem gewann er mit der Mannschaft nach 1993 zum zweiten Mal in Folge das zentralamerikanische Turnier, das zur Qualifikation für den CONCACAF Gold Cup des jeweils darauffolgenden Jahres dient.