Ağustos 2001'deki İkinci İntifada sırasında, dönemin İsrail başbakanı Ariel Şaron, İsraillilerin Orient House'un varlığına büyük bir tepki göstereceklerini bekliyordu, İsrail'in Orient House'u zorla kapatması için koşullar her zamankinden daha elverişliydi. Sbarro restoranınındaki intihar saldırısından iki gün sonra İsrail kabinesi Orient House'un kapatılmasına karar verdi ve bina İsrail güvenlik güçleri tarafından basıldı. Kudüs'te Filistinli güvenlik görevlileri tarafından gözaltına alınan Arap sakinlerinin listesi de dahil olmak üzere, Filistin güvenlik servislerinin yasadışı olarak faaliyet gösterdiğini kanıtlayan belgeler bulundu. Çalıntı bir hafif makineli tüfek (Uzi) de bulundu. İsrail yetkilileri tarafından el konulan eşyalar arasında kişisel eşyalar, Kudüs meselesiyle ilgili gizli bilgiler ve 1991 Madrid Konferansı ve Arap Çalışmaları Derneği fotoğraf koleksiyonuna atıfta bulunan belgeler yer alıyordu. Faysal Hüseyni'nin kişisel kitaplarına ve belgelerine de el konuldu. Kudüs'teki Vali Konağı ve Kuvvet 17 karargahı gibi diğer Filistin kurumları da aynı operasyonda basıldı ve kapatıldı.