W 1912 roku Carnegie Institution za namową jej członka komitetu wykonawczego Williama Parsonsa ogłosił, że wesprze wydział antropologii w School of American Archaeology. Ponieważ potrzebny był odpowiedni projekt, złożono trzy wnioski, w tym jeden należący do Morleya, który dotyczył badań i wykopalisk w Chichén Itzá. W grudniu 1913 roku instytut przyjął jego propozycję i mianował kierownikiem projektu, jednakże niestabilna sytuacja na półwyspie Jukatan spowodowana rewolucją meksykańską i wybuch I wojny światowej przesunęły pracę o dziesięć lat i rozpoczęto je w sezonie 1923-24.