Le origini del War Doctor sono narrate nel mini-episodio "La notte del Dottore", ambientato durante la Guerra del tempo nominata nella serie. Dopo che l'Ottavo Dottore (Paul McGann) muore nello schianto di un'astronave mentre cercava di salvare una donna innocente, che rifiuta il suo aiuto perché considera i Signori del Tempo e i Dalek equamente nemici a causa della distruzione da loro provocata durante la guerra, è temporaneamente riportato in vita da La Sorellanza di Karn ("The Brain of Morbius") e esortato a prendere posizione e partecipare alla guerra. Gli viene offerto un elisir progettato per innescare una rigenerazione di sua scelta. Ritenendo che l'universo non abbia più bisogno di un dottore, richiede di diventare un guerriero. Dopo essersi rigenerato nel War Doctor, ripudia il nome del Dottore, tramite le prime parole della nuova incarnazione "Doctor no more".