Fernández bestritt 177 Länderspiele für die spanische Nationalmannschaft, in denen sie 371 Treffer erzielte. Mit Spanien zog sie bei der Europameisterschaft 2008 ins Finale ein, das Norwegen souverän mit 34:21 gewann. Ein Jahr später gehörte sie dem spanischen Aufgebot bei der Weltmeisterschaft in der Volksrepublik China an. Im Sommer 2012 nahm Fernández an den Olympischen Spielen in London teil, wo sie die Bronzemedaille gewann. 2014 gewann sie bei der Europameisterschaft die Silbermedaille.