Pendant l'insurrection de Kościuszko de 1794, Dombrowski participe à la défense de Varsovie et organise un soulèvement en Grande-Pologne, à la demande Tadeusz Kościuszko. Dombrowski bat les Prussiens et leur prend Gniezno puis la forteresse de Bydgoszcz. Ses actions militaires désorganisent l'administration prussienne.