Outrora uma igreja que temia ter sido abandonada por boa parte da população nacional, voltou a ser sob o pontificado de Elias II a mais influente instituição do país, com 95% dos habitantes declarando ter opiniões positivas dela. O Patriarca é conhecido por suas frequentes exortações pela paz entre a Geórgia e seus países vizinhos, especialmente a Rússia. Em 9 de abril de 1989, juntou-se à população que protestava contra o jugo soviético nas ruas de Tiblíssi, pedindo que os manifestantes deixassem a Avenida Rustaveli e refugiassem-se em uma igreja, não obstante os tanques soviéticos matando 22 pessoas. Durante a Guerra Russo-Georgiana em 2008, chamou a atenção para esta ser uma guerra entre cristãos ortodoxos e encontrou-se com o então presidente russo Dmitri Medvedev.