La squadra disputò la Prima Divisione 1924-1925 classificandosi al 1º posto nel campionato regionale, ed al 4º posto nel girone B delle semifinali di Lega. Al termine della stagione successiva retrocesse in Seconda Divisione, dove rimase fino alla stagione 1927-28. Nel 1928, a seguito di una crisi dirigenziale, l'U.S. Messinese cambiò il proprio organico societario assumendo la nuova denominazione di Associazione Calcio Messina.