Соммер начал вызываться в сборную США в 1992 году, но выйти на поле ему удалось только 7 сентября 1994 года в товарищеском матче против сборной Англии. В летом 1994 года он был включен в заявку национальной команды на участие в домашнем чемпионате мира, но на турнире Соммер был дублером Тони Меолы и на поле не появился. В 1998 году Юрген во второй раз поехал на первенство мира, но и на этот раз он смотрел бесславное выступление своей команды из-за спины Брэда Фриделя. Между чемпионатами мира Соммер ездил на Кубок Америки и участвовал в Золотом кубке КОНКАКАФ, но и там ему не удалось ни разу выйти на поле.