Будущий начальник экспедиции Сирасэ Нобу имел экспедиционный опыт, проведя в 1893 году зимовку в ледяной пещере на острове Шумшу, побывав там и в 1895 году. После демобилизации в звании лейтенанта некоторое время жил на Карафуто. В начале XX века он стал планировать экспедицию к Северному полюсу, но после сообщений Кука и Пири, в 1909 году он начал организацию экспедиции на Южный полюс. Экспедиция не получила поддержки государства, поскольку премьер-министр Кацура Таро и председатель Ассоциации поддержки экспедиции Окума Сигэнобу были политическими противниками. Снаряжать экспедицию пришлось на добровольные пожертвования, была объявлена национальная подписка, в которой участвовали 10 000 человек. Экспедиция была крайне стеснена в средствах, снаряжение было более чем скудным. Например, провиант включал 3000 штук сушеной трески для собак, 11 тысяч сушеных гребешков, 660 кг сахара, 2500 банок мясных консервов, 562,5 кг тофу, 18 000 кг риса, 2500 банок фруктовых консервов, 2000 банок приправы и т. д. Существенной частью снаряжения были 30 курильских ездовых лаек, отданных под попечение каюров-айнов Ямабэ Ясуносукэ (айнское имя Яёманэку) и Ханамори Синкити (айнское имя Сисиратока). Первоначально предполагалось использовать лошадей (Сирасэ консультировался с участниками экспедиции Шеклтона), но места для конюшен и корма не оказалось на борту экспедиционного судна.