Face au mouvement de protestations qui se relance dans le Bengale oriental, l'armée a de nouveau recours à la répression. Alors que Sheikh Mujibur Rahman proclame l'indépendance du Bangladesh et créé un mouvement armé le , l'armée pakistanaise lance une opération militaire, dans le but affiché de mettre fin aux violences touchant les Biharis, réputés fidèles au pouvoir central. Les militaires pakistanais répondent à l'insurrection indépendantiste par des massacres de masse qui tuent à trois millions de personnes selon les sources et obligent au moins dix millions à quitter le pays. Plus d'un millier d'intellectuels bengalis sont exécutés, principalement des universitaires ayant pris part au mouvement de 1968. L'intervention indienne le conduit à la défaite du Pakistan en deux semaines.