Aquando do terramoto de 1755, a igreja do Convento de Santana ruiu parcialmente, tal como o sector dos dormitórios. São efectuadas reconstruções a partir de 1778, durante o reinado de D. Maria I, até à extinção das ordens religiosas em 1834. O Convento extingue-se finalmente em 4 de Maio de 1884, por morte da sua última religiosa, Madre Maria da Conceição.