父岛守军终日对美军即将到来的进攻殚精竭虑，但进攻最终没有发生，因为根据跳島戰術，父岛并不在美军的登陆目标内。1945年8月15日，日本宣布无条件投降，父岛守军放下武器，悉数向美军投降。9月3日，中将和森国造少将分别代表日本陆海軍签署投降文书。投降后，美国海军陆战队上校普雷斯利·里西（Presley Rixey）向日军将领询问当时在父岛落难的美军飞行员的下落。日军一方面谎称他们在美军的空袭中被炸死，另一方面加紧毁尸灭迹的工作。尽管日军将领统一了口徑，但其手下的士官关于战俘问题却闪烁其词，引起了里西上校的怀疑。通过大范围走访和搜索，美军逐渐掌握了日军杀害并分食美军飞行员的犯罪事实。1946年1月1日，在堀江芳孝陆军少佐的协助下，参与食人事件的相关军官被美军悉数逮捕，并在关岛成立搜集证据的“调查委员会”和审判的“战犯委员会”，负责进一步检察工作。