Однак через 4 місяці, 1825 року, військові невдачі примусили уряд звільнити Колокотроніса і поставити його на чолі 10 000-го корпусу. В 1825—27 роках Колокотроніс, будучи головнокомандувачем грецькими військами Пелопоннесу, з успіхом застосував тактику партизанської війни проти переважаючих сил єгипетського полководця Ібрагіма-паші. Однак і його військовий талант виявився б заслабким, якби не переломне значення Наваринської битви.