Nel 1998 la squadra ottenne il suo miglior risultato di sempre quando i piloti Damon Hill e Ralf Schumacher arrivarono primo e secondo nel Gran Premio del Belgio. Nel 1999, Jordan raggiunse il suo apice in F1 quando Heinz-Harald Frentzen lottò per il campionato, finendo terzo, il miglior piazzamento di sempre per un pilota Jordan e accumulando due vittorie di gara durante la stagione. Frentzen era in testa nel Gran Premio d'Europa, ma fu costretto al ritiro a causa di problemi elettrici. Se avesse vinto la gara, Frentzen sarebbe stato a un punto dalla testa del campionato piloti con due gran premi rimasti.