Il 26 marzo 2012, a 36 anni, subentra all'esonerato Claudio Ranieri alla guida della prima squadra dell'Inter, diventando il più giovane allenatore della Serie A 2011-2012, 6º della storia dell'Inter. In una intervista a Tuttosport rivela che il presidente Massimo Moratti, oltre a essere incuriosito dai 7 gol subiti a Londra col in NextGen Series, inizia a chiamarlo dopo la gara con lo Sporting Lisbona a novembre. Nelle ultime gare Moratti si sarebbe messo dietro la panchina, soprattutto per sentire quello che diceva.