Vuonna 1970 Yunus meni Yhdysvaltoihin opiskelemaan ja seuraavana vuonna alkoi Bangladeshin itsenäisyyssota Pakistania vastaan. Yunus tuki sotaa ja alkoi kerätä rahaa sen tukemiseen. Bangladeshilaiset jotka asuivat Yhdysvalloissa perustivat Yunuksen kanssa "Vapaa Bangladesh" -komitean joka tuki bangladeshilaisia kotimaassaan. Myöhemmin he auttoivat bangladeshilaisia virkamiehiä pakenemaan Pakistanin suurlähetystöstä. Yunus oli myös mukana Bangladeshin puolustusliitossa, jonka perusti Yhdysvalloissa asuva bangladeshilainen arkkitehti tohtori Fazlur Rahman Khan.