12 czerwca 1903 został mianowany biskupem Nueva Segovia na Filipinach. Sakrę przyjął dwa dni później w Rzymie. Udzielił jej kardynał Francesco Satolli. Po pięciu latach przeniesiony na biskupstwo Jaro. Do kraju powrócił w 1915, objął diecezję Buffalo. Jego rządy w tej diecezji nie trwały zbyt długo, bowiem 1 maja 1918 został arcybiskupem Filadelfii, a trzy lata później otrzymał z rąk Benedykta XV kapelusz kardynalski z tytułem prezbitera SS. Nereo e Achilleo. Był pierwszym arcybiskupem Filadelfii, który otrzymał godność kardynała. W Konklawe 1922 nie brał udziału, ponieważ dotarł do Rzymu zbyt późno. Wyboru już dokonano. Dopiero w 1939 dane mu było wziąć udział w głosowaniu, gdyż wydłużono okres przygotowawczy po śmierci papieża. Zmarł na udar mózgu tuż po zakończeniu mszy z okazji sześćdziesiątej pierwszej rocznicy jego święceń kapłańskich. Pochowany został w katedrze w Filadelfii.