Vaněček nahm mit der U18-Auswahl seines Heimatlandes am Ivan Hlinka Memorial Tournament 2013 sowie an der U18-Weltmeisterschaft 2014 teil und gewann dabei mit dem Team eine Bronze- sowie eine Silbermedaille. Anschließend gehörte er zum Aufgebot der tschechischen U20-Nationalmannschaft bei den U20-Weltmeisterschaften 2015 und 2016, wobei man die Medaillenränge mit einem sechsten und einem fünften Platz jeweils verpasste.