Im September 1944 wurde von den griechischen Widerstandsgruppen EDES und ELAS sowie den Briten im Hauptquartier des Allied Forces Headquarters die Vereinbarung von Caserta getroffen, die die Besatzung Griechenlands durch britische Truppen vorsah und den Briten den Oberbefehl über alle griechischen Partisanengruppen einräumte. Scobie wurde von seiner Regierung zum Kommandeur der Besatzungstruppen ernannt, die wenig später auf dem Peloponnes landeten und im Oktober 1944 Athen erreichten. Hier kam es im Dezember 1944 zur Machtprobe der rivalisierenden Gruppen des späteren Griechischen Bürgerkriegs in der Schlacht um Athen, bei der die Briten die Truppen der zurückgekehrten Regierung gegen die pro-kommunistische EAM-ELAS unterstützten. Erst um Mitternacht des 15. Januar trat ein Waffenstillstand in Kraft. Im Abkommen von Varkiza vom Februar 1945 musste die EAM-ELAS ihrer Entwaffnung zustimmen.