Die Phoker traten dann vergeblich gegen die projektierte Autonomieerklärung von Delphi auf und hatten 421 v. Chr. den zwischen den Kriegsgegnern geschlossenen Nikiasfrieden zu akzeptieren, obwohl in diesem die Unabhängigkeit des Heiligtums proklamiert war. Im Sommer 421 v. Chr. führten die Phoker eine siegreiche militärische Auseinandersetzung gegen die westlichen Lokrer, doch sind hierzu keine Einzelheiten überliefert. An der Schlacht von Mantineia sollte 418 v. Chr. auch ein phokisches Kontingent auf Seiten Spartas teilnehmen, kam aber zu spät am Kriegsschauplatz an. Als die Spartaner 413 v. Chr. ein Geschwader aufstellten, steuerten die Phoker und Lokrer 15 Schiffe bei, deren gegen Ende des Peloponnesischen Kriegs erfolgter Einsatz in der für Athen mit einer entscheidenden Niederlage endenden Schlacht bei Aigospotamoi (405 v. Chr.) belegt ist. Im folgenden Jahr 404 v. Chr. fanden Unterhandlungen über das künftige Los Athens statt; und die Phoker legten hierbei Fürsprache für die Kriegsverlierer ein.