Следуя этим принципами, а также благодаря энергии Карно и комиссаров Конвента,Франция в 1794 году очистила свои границы от неприятеля и перешла в наступление. 8 марта 1793 года — бригадный генерал, Дюбуа-Крансе и сам был в числе комиссаров в альпийской армии, а потом при осаде Лиона, конца которой он не дождался. 28 октября 1793 года — дивизионный генерал. В дни термидора он был противником Робеспьера, при Директории состоял членом Совета Пятисот, в 1799 году — военным министром. Он был противником брюмерского переворота, и потому в эпоху консульства и Первой империи остался не у дел.