Den Namen hat das Bernerhaus aus jener Zeit, als es den Ehrengesandten – oder Syndikatsherren wie man sie auch nannte – als Unterkunft diente. 1460 wurde die Landgrafschaft Thurgau von den sieben eidgenössischen Orten Zürich, Luzern, Uri, Schwyz, Unterwalden, Zug und Glarus erobert. In der Folge musste diese «Gemeine Herrschaft» verwaltet, regiert und gerichtet werden, was anfänglich durch eidgenössische Vögte, in denen sich die Stände abwechselten, sichergestellt wurde. Nach dem Zweiten Villmergerkrieg 1712 erzwangen die reformierte Kantone eine neue Zusammensetzung der regierenden Orte in den deutschen Gemeinen Vogteien, zu denen auch der mehrheitlich reformierte Thurgau gehörte. Damit oblag die Verwaltung innerhalb der Alten Eidgenossenschaft den «VIII Alten Orten» wozu auch der Stand Bern gehörte, obwohl er an der Eroberung nicht teilgenommen hatte.