En 1491, la ciudad participó en la guerra de las Rosas cuando Perkin Warbeck —que decía ser Ricardo de Shrewsbury, segundo hijo varón de Eduardo IV— llegó en busca de aliados para derrocar a Enrique VII. El alcalde y otros ciudadanos importantes lo acompañaron a Inglaterra, pero fueron capturados y ejecutados después de que la rebelión fracasara. Por el apoyo de muchos de sus habitantes a los miembros de la Casa de York durante la guerra, Cork fue apodada "la ciudad rebelde" ("the rebel city").