La 27 iunie 1991, la două zile după obținerea independenței Sloveniei față de Iugoslavia, Armata Populară Iugoslavă și-a început operațiunile militare în țară. Aeroportul a fost bombardat în prima zi a războiului. La 28 iunie, a doua zi, doi jurnaliști din Austria și Germania, pe nume Nikolas Vogel și Norbert Werner, au fost uciși de o rachetă care a lovit mașina pe care ei o conduceau în apropierea aeroportului în acel moment. Patru avioane Adria Airways au suferit daune grave în urma raidului Forțelor Aeriene iugoslave. În cele din urmă, pe 29 iunie, soldații iugoslavi s-au predat forțelor slovene, care au înconjurat întregul aeroport peste noapte. Lupta s-a încheiat la 7 iulie cu acordul de la Brioni.