Als Ibrahim Baré Maïnassara 1996 durch einen Militärputsch den demokratisch gewählten Staatspräsidenten Mahamane Ousmane absetzte und sich bei den umstrittenen Präsidentschaftswahlen von 1996 selbst zum Staatsoberhaupt wählen ließ, schloss sich Idi Ango Omar dem neuen Machthaber an. Er wurde in der am 23. August 1996 gebildeten Regierung Innenminister. Die Parlamentswahlen von 1996 wurden von den großen Oppositionsparteien boykottiert. Dem PMT-Albarka gelang erstmals der Einzug in die Nationalversammlung, wo die Partei zwei von 83 Sitzen gewann. In der am 1. Dezember 1997 neu zusammengestellten Regierung wurde Idi Ango Omar Minister für Landwirtschaft und Viehzucht im Rang eines Staatsministers. Staatspräsident Baré Maïnassara und seine Regierung wurden 1999 bei einem weiteren Militärputsch gestürzt. Das Militär übergab die Macht an den bei den Präsidentschaftswahlen von 1999 gewählten Politiker Mamadou Tandja von der Partei MNSD-Nassara. Bei den Parlamentswahlen von 1999, an denen die Opposition wieder geschlossen teilnahm, verlor der PMT-Albarka seine Sitze in der Nationalversammlung. An der Parteispitze kam es zu einem Wechsel. Abdoulkarim Mamalo übernahm von Idi Ango Omar das Amt des Vorsitzenden.