Il faut attendre 1990 pour qu'Unser Jr parvienne enfin à se défaire de son image de perdant magnifique. Cette année-là, il remporte son premier titre en CART. Puis, en 1992, il s'impose enfin aux d'Indianapolis, à l'issue d'un duel resté fameux avec le Canadien Scott Goodyear (plus faible écart jamais enregistré entre les deux premiers de la course: 0,043 seconde d'avance). Mais l'apogée de la carrière de Unser Jr a lieu en 1994, année où il remporte la moitié des courses de la saison, dont l'Indy 500 pour la deuxième fois. Il coiffe également son deuxième titre de champion CART.