В составе сборной Бразилии Луис Энрике дебютировал 8 ноября 1990 года в матче с Чили. Годом позже он поехал на Кубок Америки, где бразильцы заняли второе место. Но сам футболист на поле не выходил. Два года спустя игрок поехал на свой второй южноамериканский кубок, но и там не появился на полях турнира. Луис Энрике был кандидатом на поездку на чемпионат мира 1994, но получил травму и на соревнование не поехал. В общей сложности за национальную команду форвард провёл 22 игры (13 побед 5 ничьих и 4 поражения) и забил 6 голов.