В 2001 году в Республике Македония разгорелся межэтнический конфликт. Талат Джафери в это время был старшим офицером вооружённых сил Республики Македония и проходил службу в воинской части Тетово. 28 апреля 2001 года в день столкновений в Вейце он был командующим воинским подразделением македонской армии. Затем, спустя несколько дней Талат Джафери дезертировал и вступил в албанскую повстанческую Армию национального освобождения, став командиром 116-й бригады под позывным — «командир Форино». После окончания боевых действий попал под амнистию в соответствии с Охридским соглашением.