En 1837 — l’indépendance belge leur permettant de travailler ouvertement dans le pays — les jésuites rachètent une partie de l’abbaye pour y installer leur noviciat (jusqu’alors clandestin). En 1848, ils acquièrent l’ensemble du domaine. Pendant plus d’un siècle (jusqu’en 1968) Tronchiennes sera une maison de formation importante de la Compagnie de Jésus en Belgique : noviciat et Troisième An. Une autre aile du bâtiment y reçoit des retraitants et ceux qui souhaitent faire les Exercices spirituels de Saint Ignace. Le noviciat est aujourd’hui fermé, mais "Oude Abdij" reste un centre spirituel actif.