כחודש לאחר האולימפיאדה השתתף פיסטוריוס במשחקים הפאראלימפיים בלונדון. הוא זכה במדליית זהב בריצת 400 מטר, במדליית זהב במירוץ השליחים ל-4X100 מטר, במדליית כסף במירוץ ל-200 מטר ובמקום הרביעי במירוץ ל-100 מטר. לאחר ההפסד במירוץ ל-200 מטר לברזילאי אוליביירה, טען פיסטוריוס שהמירוץ לא היה הוגן מאחר שאוליביירה רץ עם רגליים מלאכותיות ארוכות יותר; לאחר מספר ימים התנצל על טענה זו.