Les Astros se qualifient pour les séries éliminatoires comme meilleurs deuxièmes de la Ligue nationale et éliminent les Braves d'Atlanta au premier tour du tournoi menant à la Série mondiale. Lidge est envoyé au monticule dans trois des cinq parties de la Série de division : il réussit six retraits sur des prises en quatre manches et un tiers lancées et affiche une moyenne de points mérités de 2,08. Il protège la victoire des Astros dans la troisième partie le 9 octobre à Houston. Après avoir perdu les deux premiers matchs de la Série de championnat 2004 de la Ligue nationale contre les Cards de Saint-Louis, Houston aligne trois victoires consécutives : Lidge est crédité du sauvetage dans les et et reçoit la victoire dans la . Les Astros s'avouent vaincus en sept parties, mais Lidge n'a accordé aucun point et un seul coup sûr à l'adversaire en huit manches lancées. En quatre matchs joués, il retire 14 Cardinals sur des prises.