לאחר כניעת האימפריה היפנית נפתח בית הדין הבינלאומי הצבאי למזרח הרחוק אשר החל להתחקות אחר מפקדים יפנים במהלך המלחמה ומשתפי פעולה עם מדינות הציר. האטא נעצר והועמד לדין בגין פשעי מלחמה זמן קצר לאחר הכניעה. בשנת 1948 הוא נידון על ידי בית הדין למאסר עולם בגין: