A nivel internacional, Edmundo jugó 42 partidos con Brasil entre 1992 y 2000, anotando 10 goles. Formó parte del equipo que ganó la Copa América de 1997 y también hizo dos apariciones como suplente en la Copa Mundial de la FIFA de 1998, incluida la final en la que el equipo perdió 3-0 ante Francia. Adicional a ello fue integrante de la escuadra de Brasil que participó en los campeonatos de la Copa América de 1993 y 1995, obteniendo una medalla de subcampeón en esta última edición; también ganó una medalla de bronce en la Copa de Oro de la Concacaf 1998. Además participó en dos torneos de exhibición con la selección brasileña, ganando la Copa Umbro de 1995 y finalizando segundo en el torneo de Francia. Sin embargo a pesar de su talento, se cree que el estilo de vida turbulento de Edmundo fuera del campo, así como la extensa competencia de varios delanteros brasileños de talla mundial (incluidos Bebeto, Romário y Ronaldo), han limitado su tiempo de juego a nivel internacional.