Nachdem er sich in mehreren Schlachten bewährt hatte, wurde Kirgener 1805 das Kommando über ein Ingenieur-Korps in Marschall Jean Lannes’ Armee übertragen. Seine Erfolge in der Schlacht bei Austerlitz am 2. Dezember desselben Jahres führten am 25. Dezember zur Beförderung zum Général de brigade.