Envoyé à la Grande Armée dès le commencement de 1812, il y commande avec distinction l'artillerie du , et reçoit au début de la campagne de Russie le 18 juin 1812, la décoration de commandant de la Légion d'honneur. Passé au commandement de l'artillerie du de la Grande Armée le 28 août 1812, il prend une part honorable aux batailles de Smolensk, de Polotsk les 17 et 18 août, de Valutino, de la Moskowa, et à celle de Wiazma le 3 novembre suivant. Aubry reçoit le brevet de général de division le 21 novembre 1812.