Após os britânicos anunciarem sua retirada da Palestina e as Nações Unidas aprovarem a partição da, a Guerra civil no Mandato da Palestina (1947-48) estourou. O Haganá teve um papel fundamental na guerra de Yishuv contra árabes palestinos. Inicialmente, o grupo concentrou-se na defesa de áreas judaicas de ataques árabes, mas depois que o perigo da intervenção britânica diminuiu com a retirada dos britânicos, o Haganá partiu para a ofensiva e tomou mais território. Após a Declaração de Independência do Estado de Israel e o começo da Guerra árabe-israelense de 1948, o Haganá, agora agindo como o exército oficial do novo Estado, combateu os exércitos invasores das nações árabes.