Ao forçar os austríacos a desdobrar vastas forças contra ele em Gênova, Masséna tornou possível para Bonaparte cruzar o Passo do Grande São Bernardo, surpreender os austríacos e, finalmente, derrotar o exército austríaco do general Michael von Melas em Marengo antes que reforços suficientes pudessem ser transferidos de o local do cerco. Menos de três semanas após a evacuação, Bonaparte escreveu a Masséna: ""Não posso dar-lhe uma marca maior da confiança que tenho em você do que dando-lhe o comando do primeiro exército da República [Exército da Itália]"." Até os austríacos reconheceram a importância da defesa de Masséna; o chefe do estado-maior austríaco declarou com firmeza: ""Você venceu a batalha, não na frente de Alexandria, mas na frente de Gênova"." Masséna foi nomeado comandante das forças francesas na Itália, embora mais tarde tenha sido demitido por Napoleão. Apesar do elogio, Napoleão também criticou Massena por capitular muito cedo em suas memórias, contrastando suas ações com as dos gauleses sob Vercingetórix quando sitiados por Júlio César na Batalha de Alesia.