I Ungern gjorde Ferrari ett misstag när man lät Schumacher behålla sina regndäck ute på den nästan torra banan istället för att byta till torrdäck och ändå klara en andraplats. Han blev omkörd av Pedro de la Rosa och Nick Heidfeld och krockade då med den senare och skadade bilen och slutade djupt besviken och arg på åttonde plats. I Turkiet vann stallkamraten Felipe Massa före Alonso och Schumacher, som hamnat bakom Alonso då säkerhetsbilen var ute och sedan inte kunnat avancera. I Italien vann Schumacher sin 90:e F1-lopp samtidigt som Alonsos motor gick upp i rök. Detta innebar att han nu var två poäng efter Alonso sammanlagt. Efter loppet meddelade Schumacher vemodigt att han skulle sluta tävla i F1 efter säsongen. Han vann sedan i Kina trots dåliga däck i början men han grundlurade sedan Renault i mitten av racet. Schumacher ledde nu mästerskapet och var på väg mot VM-titeln. I Japan såg det också ut så, tills hans motor gick upp i rök. I Brasilien lyckades Schumacher trots stora problem komma fyra och därmed bli tvåa i förarmästerskapet bakom Alonso.