Кунде знову поїхав на Кубок африканських націй, що відбувся в Алжирі в 1990 році. Цього разу це був справжній провал: Камерун навіть не пройшов груповий етап. Вже через кілька місяців Емманюель відправився з командою на чемпіонат світу 1990 року, що пройшов в Італії. Камерун досяг стадії чвертьфіналу, встановивши новий рекорд Африки. На шляху до цього Камерун посів перше місце в групі B, здолавши збірні Аргентини і Румунії, переміг збірну Колумбії в 1/8 фіналу, але поступився в додатковий час збірної Англії з рахунком 2:3. У цій зустрічі Емманюель Кюнде реалізував призначений у ворота англійців пенальті, зрівнявши рахунок у матчі. на самому турнірі він зіграв у чотирьох матчах з п'яти.