29 ноября 1816 года полковник Чуйкевич вышел в отставку с мундиром. Спустя четыре года, 21 октября 1820, он вновь поступил на службу и был причислен к канцелярии Главного штаба. В 1821 году командирован «по особенному поручению» на международный конгресс в Лайбахе (ныне Любляна). 12 декабря 1823 года Чуйкевич получил чин генерал-майора. Последняя должность, которую он занимал с 25 октября 1829 по 17 августа 1831 года, — начальник штаба Отдельного Оренбургского корпуса.