Au second tour le taux de participation est de 53,27 % soit votants, donnant Igor Dodon gagnant avec 52,18 % des voix () contre 47,82% pour Maia Sandu (, soit une différence de ). Il semble que les multiples signaux de faiblesse de l'Union européenne et de l'OTAN (attitude vis-à-vis de la Grèce, non-intervention dans le drame ukrainien, Brexit, passage de relais à la Russie en Syrie, accueil fait aux migrants, déclarations isolationnistes de divers dirigeants européens et de Donald Trump...) auraient inspiré ce résultat, que la Moldavie partage d'ailleurs avec la Bulgarie dont les électeurs ont, eux aussi, élu également le 13 novembre 2016 un candidat eurosceptique pro-russe, Roumen Radev.