NF-κB
caption: Mekanisme aksi NF-κB . Pada gambar ini, heterodimer NF-κB antara protein Rel dan p50 digunakan sebagai contoh. Saat keadaan tidak aktif, NF-κB berada di sitosol yang membentuk kompleks dengan protein penghambat IκBα . Melalui intermediasi reseptor membran integral, berbagai sinyal ekstraselular dapat mengaktifkan enzim IκB kinase (IKK). IKK, pada gilirannya, memfosforilasi protein IκBα, yang menghasilkan ubiquitinasi , disosiasi IκBα dari NF-κB, dan akhirnya degradasi IκBα oleh proteosom . NF-κB yang diaktifkan kemudian pindah ke dalam nukleus tempat ia mengikat urutan spesifik DNA yang disebut respon elemen (RE). Kompleks DNA/NF-κB kemudian merekrut protein lain seperti koaktivator dan RNA polimerase , yang mentranskripsi DNA ke dalam mRNA. Selanjutnya, mRNA diterjemahkan ke dalam protein, menghasilkan perubahan fungsi sel. [1] [2] [3]
caption: Diagram skematika struktur protein NF-κB . Ada dua kelas struktural protein NF-κB: kelas I (atas) dan kelas II (bawah). Kedua kelas protein mengandung N-terminal domain pengikat DNA (DBD), yang juga berfungsi sebagai antarmuka dimerisasi ke faktor transkripsi NF-κB lainnya dan juga mengikat protein penghambat IκBα . C-terminal protein kelas I berisi sejumlah pengulangan ankyrin dan memiliki aktivitas transrepresi. Sebaliknya, protein C kelas II memiliki fungsi transaktivasi . [1] [2] [3]
caption: Tampilan atas struktur kristalografi ( PDB: 1SVC ​ ) dari homodimer protein NFKB1 (hijau dan magenta) yang terikat pada DNA (coklat).
caption: Tampilan samping struktur kristalografi ( PDB: 2RAM ​ ) dari homodimer protein RELA (hijau dan magenta) yang terikat pada DNA (coklat).