Sistem tarif Shinkansen terintegrasi dengan jalur kereta api antar kota reguler, tetapi perlu biaya tambahan untuk menaiki Shinkansen. Di gambar ini, tiket biasa dari Tokyo ke Takamatsu digabungkan dengan tiket tambahan Shinkansen dari Tokyo ke Okayama , memungkinkan penggunaan Shinkansen dari Tokyo ke Okayama dan penggunaan jalur lokal dari Okayama ke Takamatsu. Untuk perjalanan eksklusif dengan satu Shinkansen, tarif biasa dan biaya tambahan Shinkansen dapat digabungkan dalam satu tiket.