Pohon evolusi yang menunjukkan divergensi spesies-spesies modern dari nenek moyang bersama yang berada di tengah [177] Tiga domain diwarnai berbeda, dengan warna biru adalah bakteri , hijau adalah arkaea , dan merah adalah eukariota .
Pohon filogenetik yang menunjukkan hubungan antara Archaea dan domain lain dari kehidupan. Eukariota berwarna merah, arkea hijau dan bakteri biru. Diadaptasi dari Ciccarelli et al. (2006) [68]