Synthèse des indicateurs de suivi de l’épidémie COVID-19
Organisation : Santé publique France

**Dans un contexte d’épidémie favorable, à compter du 1er juillet 2023, le cadre juridique actuellement en cours prévoit l’arrêt du traitement des données personnelles issues de SI-DEP. Par conséquent, après une période transitoire d’ajustement de deux semaines, les nouveaux indicateurs de surveillance virologique seront publiés aux niveaux national, régional et départemental) à une fréquence hebdomadaire. 
Les consignes de saisie spécifiques dans SI-VIC seront levées à partir de cette date, les indicateurs hospitaliers ne seront plus disponibles. 
Santé publique France maintient la surveillance de l’épidémie à travers son dispositif multi-sources. Les indicateurs relatifs à la surveillance génomique, aux recours aux associations SOS Médecins, aux urgences hospitalières et aux décès resteront disponibles.** 


### INFORMATION 25/01/2023

Suite à une erreur de saisie, le nombre de décès survenus en semaine 03 en ESMS a été revu à la baisse. Les corrections nécessaires ont été apportées et expliquent la baisse artificielle du nombre de décès total survenus depuis le début de l’épidémie.

⚠️  **15/11/2022** Suite à la suspension de l’activité par une partie des Laboratoires de biologie médicale privés depuis le 14 novembre, le nombre de « Nouveaux cas confirmés depuis la veille » est sous-estimé à compter du mardi 15/11. De même le taux d’incidence et le taux de dépistage seront sous-estimés à compter du jeudi 17/11. Les équipes de Santé publique France restent mobilisées pour assurer le suivi de l’épidémie qui repose sur une surveillance multi-sources. 

**08/06/2022**
**Compte tenu de la tendance actuelle favorable et la baisse des principaux indicateurs, à partir du 11 juin 2022, les indicateurs COVID-19 produits par Santé publique France seront actualisés sur Géodes et data.gouv.fr tous les jours à l’exception des week-end et des jours fériés.**


### Description du jeu de données

**Ce jeu de données comprends l'essentiel des indicateurs de synthèse permettant le suivi de l'épidémie de COVID-19 en France.** Un inventaire des données relatives au COVID-19 sur data.gouv.fr est disponible [ici](https://www.data.gouv.fr/fr/pages/donnees_covid).

Ces données sont notamment exposées sur l'onglet *vue d'ensemble* du [tableau de bord de suivi de l'épidémie disponible sur gouvernement.fr](https://www.gouvernement.fr/info-coronavirus/carte-et-donnees). Ce dernier présente depuis le 28 mars 2020 les données relatives à l’épidémie de COVID-19 en France. 

Cet outil dont le [code source est libre](https://github.com/etalab/covid19-dashboard), a été développé sous l’impulsion d’Etalab et avec la collaboration de la société civile. Il propose une vision consolidée des données officielles disponibles. 

## Description des données

Les données contenues dans le jeu de données sont publiées quotidiennement. 

### Données contextuelles : 
- ```'date'``` = Date 

- ```'dep'```= Département

- ```'reg'```= Région

- ```'lib_dep'```= libellé département 

- ```'lib_reg'```= libellé région 

### Données relatives à la situation hospitalière 
- ```'hosp'```= Nombre de patients actuellement hospitalisés pour COVID-19.
-  ```'incid_hosp'```= Nombre de nouveaux patients hospitalisés au cours des dernières 24h.

- ```'rea'```= Nombre de patients actuellement en réanimation ou en soins intensifs.
- ```'incid_rea'```= Nombre de nouveaux patients admis en réanimation au cours des dernières 24h.

- ```'rad'```= Nombre cumulé de patients ayant été hospitalisés pour COVID-19 et de retour à domicile en raison de l'amélioration de leur état de santé.
- ```'incid_rad'```= Nouveaux retours à domicile au cours des dernières 24h.

### Données relatives au décès pour cause de COVID-19

- ```'dchosp'```= Décès à l’hôpital
-  ```'incid_dchosp'```= Nouveaux patients décédés à l’hôpital au cours des dernières 24h.

- ```'esms_dc'```= Décès en ESMS

- ```'dc_tot'```= Cumul des décès (cumul des décès constatés à l'hôpital et en EMS)

### Données relatives aux tests
- ```'conf'```= Nombre de cas confirmés
- ```'conf_j1'```= Nombre de nouveaux cas confirmés (J-1 date de résultats)
- ```'pos'```= Nombre de personnes déclarées positives (J-3 date de prélèvement)
- ```'pos_7j'``` = Nombre de personnes déclarées positives sur une semaine (J-3 date de prélèvement)

- ```'esms_cas'``` = Cas confirmés en ESMS

### Données relatives aux indicateurs de suivi de l’épidémie de COVID-19

- ```'tx_pos'```= **Taux de positivité** des tests virologiques (Le taux de positivité correspond au nombre de personnes testées positives (RT-PCR et test antigénique) pour la première fois depuis plus de 60 jours rapporté au nombre total de personnes testées positives ou négatives sur une période donnée ; et qui n‘ont jamais été testées positive dans les 60 jours précédents.)

- ```'tx_incid'```= **Taux d'incidence** (activité épidémique : Le taux d'incidence correspond au nombre de personnes testées positives (RT-PCR et test antigénique) pour la première fois depuis plus de 60 jours rapporté à la taille de la population. Il est exprimé pour 100 000 habitants)

- ```'TO'```= **Taux d'occupation** : tension hospitalière sur la capacité en réanimation (Proportion de patients atteints de COVID-19 actuellement en réanimation, en soins intensifs, ou en unité de surveillance continue rapportée au total des lits en capacité initiale, c’est-à-dire avant d’augmenter les capacités de lits de réanimation dans un hôpital).

- ```'R'```= **Facteur de reproduction du virus** (évolution du R0 : Le nombre de reproduction du virus : c’est le nombre moyen de personnes qu’une personne infectée peut contaminer. Si le R effectif est supérieur à 1, l’épidémie se développe ; s’il est inférieur à 1, l’épidémie régresse) 


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**Points d'attentions**  : 
- Les méthodes de collecte des données ont évoluées dans le temps ; 
- Au cours de l'été 2020, les données n'ont pas été publiées durant les week-end et jours fériés. 

### **Ressources**
- **[Consulter le tableau de bord](https://www.gouvernement.fr/info-coronavirus/carte-et-donnees)** 
- **[Consulter l'inventaire des données relatives au COVID-19 sur data.gouv.fr](https://www.data.gouv.fr/fr/pages/donnees_covid)** 
- **[Consulter les données de Santé publique France](https://www.data.gouv.fr/fr/organizations/sante-publique-france/)** 
- **[Consulter les données du ministère des Solidarités et de la Santé](https://www.data.gouv.fr/fr/organizations/ministere-des-solidarites-et-de-la-sante/)** 

Mots-clés : coronavirus,covid,covid19