Données relatives aux personnes vaccinées contre la Covid-19
Organisation : Santé publique France

🆕**24/11/2022**
Publication de nouveaux indicateurs à compter de ce jour :
1. Couverture vaccinale du vaccin contre la COVID-19, personnes vaccinées avec trois doses de rappel (`n_3_rappel`, `couv_3_rappel`)
2. Couverture vaccinale du vaccin contre la COVID-19, personnes vaccinées avec un rappel adapté aux variants Omicron (`n_rappel_biv`, `n_cum_rappel_biv`, `couv__rappel_biv`)  

Santé publique France met à jour les référentiels géographiques et de population, utilisés pour la production et la diffusion des indicateurs de suivi de l’épidémie de COVID-19. Cette actualisation sera effective le **7 juillet 2022** . Elle est amenée à être renouvelée chaque année.

**MAJ 01/07/2021**
Ces ressources ne sont actualisées que les **jours ouvrés**.

### Vaccination contre la COVID-19 

Dès le lancement de la campagne de vaccination, les autorités sanitaires ont disposé d’informations permettant un suivi quotidien de l’avancée et du déploiement de la campagne sur le territoire. Celles-ci, recueillies auprès des établissements pour personnes âgées et des centres de vaccination, étaient transmises par les Agences régionales de santé. 

Parallèlement, l’Assurance maladie a élaboré le système d’information Vaccin Covid (VAC-SI), qui est depuis pleinement opérationnel après un travail d’analyse de l’exhaustivité et de la complétude des données.

Le système d’information Vaccin Covid est alimenté par les professionnels de santé réalisant les vaccinations. 

Sur la base de l’exploitation de ces données, Santé Publique France publie en open data les indicateurs de couverture vaccinale sur data.gouv, sur [Geodes](https://geodes.santepubliquefrance.fr/#c=home) ainsi que sur un dashboard disponible sur le site de santé Publique France : [InfoCovidFrance](https://www.santepubliquefrance.fr/dossiers/coronavirus-covid-19/coronavirus-chiffres-cles-et-evolution-de-la-covid-19-en-france-et-dans-le-monde)

#### Quelles données ? 

Les données issues du système d’information Vaccin Covid permettent de dénombrer en temps quasi réel (J-1), le nombre de personnes ayant reçu une injection de vaccin anti-covid en tenant compte du nombre de doses reçues, du vaccin, de l’âge, du sexe ainsi que du niveau géographique (national, régional et départemental). Les données sont disponibles par lieu de résidence.

#### Précaution d’usage des données
Il existe des rattrapages de saisies dans Vaccin Covid et pour un jour donné, toutes les injections n’ont pas forcément été saisies en temps réel et peuvent être saisies dans les jours suivant. Les fichiers par date permettent de rendre compte de ce rattrapage. 

Dans les fichiers départementaux, si une ligne pour un nombre de vaccinés à une date donnée est absente, c’est qu’il n’y a pas eu de vacciné ce jour-là dans le département.

Les variables des différents jeux de données sont les suivantes :
* `jour` : date de l’injection
* `fra`, `dep`, `reg` : niveau géographique
* `clage_vacsi` : classes d’âge
* `vaccin` : type de vaccin
* `sexe` : sexe
* `n_dose1` : Nombre de personnes ayant reçu une 1ere injection de vaccin  
* `n_dose2` : Nombre de personnes ayant reçu une 2e  injection de vaccin
* `n_dose3` : Nombre de personnes ayant reçu une 3e injection de vaccin
* `n_dose4` : Nombre de personnes ayant reçu une 4e injection de vaccin 
* `n_complet` : Nombre de personnes ayant une primo-vaccination complète. Cette information est directement fournie par la base Vaccin Covid, à l’issue d’un algorithme propre à la Cnam ou par déclaration par le professionnel de santé injecteur. Les personnes avec une primo-vaccination complète sont notamment : personnes vaccinées par deux doses par les vaccins nécessitant deux doses (ex : vaccins Pfizer, Moderna ou Astra-Zeneca), personnes vaccinées par une dose par les vaccins nécessitant une seule dose (ex : vaccin Janssen), personnes vaccinées par une dose par les vaccins Pfizer, Moderna ou Astra-Zeneca en cas d’antécédent de COVID-19, personnes immunodéprimées pouvant recevoir 3 à 4 doses.
* `n_rappel` : Nombre de personnes avec une primo-vaccination complète ayant reçu au moins une dose avec un motif de rappel défini par le professionnel de santé vaccinateur en population générale ou spécifique
* `n_2_rappel` : Nombre de personnes avec une primo-vaccination complète et une première dose de rappel ayant reçu une seconde dose avec un motif rappel défini par le professionnel de santé vaccinateur
* `n_3_rappel` : Nombre de personnes avec une primo-vaccination complète et deux doses de rappel ayant reçu une troisième dose avec un motif rappel défini par le professionnel de santé vaccinateur
* `n_rappel_biv` : Nombre de personnes vaccinées avec rappel adapté aux variants Omicron.
* `n_cum_dose1` : Nombre cumulé de personnes ayant reçu 1 injection de vaccin
* `n_cum_dose2` : Nombre cumulé de personnes ayant reçu 2 injections de vaccin
* `n_cum_dose3` :  Nombre cumulé de personnes ayant reçu 3 injections de vaccin
* `n_cum_dose4` :  Nombre cumulé de personnes ayant reçu 4 injections de vaccin
* `n_cum_complet` : Nombre cumulé de personnes ayant une primovaccination complète schéma vaccinal complet. Cette information est directement fournie par la base Vaccin Covid, à l’issue d’un algorithme propre à la Cnam ou par déclaration par le professionnel de santé injecteur. Les personnes avec une primo-vaccination complète sont notamment : personnes vaccinées par deux doses par les vaccins nécessitant deux doses (ex : vaccins Pfizer, Moderna ou Astra-Zeneca), personnes vaccinées par une dose par les vaccins nécessitant une seule dose (ex : vaccin Janssen), personnes vaccinées par une dose par les vaccins Pfizer, Moderna ou Astra-Zeneca en cas d’antécédent de COVID-19, personnes immunodéprimées pouvant recevoir 3 à 4 doses.
* `n_cum_rappel` : Nombre cumulé de personnes avec une primo-vaccination complète ayant reçu au moins une dose avec un motif de rappel défini par le professionnel de santé vaccinateur en population générale ou spécifique
* `n_cum_rappel_biv` : Nombre cumulé de personnes vaccinées avec rappel adapté aux variants Omicron.
* `couv_dose1` : Couverture vaccinale dans la population de la première dose de  vaccin contre la COVID-19 (= couverture vaccinale au  moins une dose = n_cum_dose1/pop).
* `couv_complet` : Couverture vaccinale dans la population de la primovaccination complète du  vaccin contre la COVID-19 (ie nombre de personnes complètement primovaccinées / population  = n_cum_complet/pop). Les personnes avec une primo-vaccination complète sont notamment : personnes vaccinées par deux doses par les vaccins nécessitant deux doses (ex : vaccins Pfizer, Moderna ou Astra-Zeneca), personnes vaccinées par une dose par les vaccins nécessitant une seule dose (ex : vaccin Janssen), personnes vaccinées par une dose par les vaccins Pfizer, Moderna ou Astra-Zeneca en cas d’antécédent de COVID-19, personnes immunodéprimées pouvant recevoir 3 à 4 doses.
* `couv_rappel` : Couverture vaccinale dans la population du 1er rappel du vaccin contre la COVID-19, (ie couverture primo-vaccination COVID19 complète et avec une dose de rappel = n_cum_rappel/pop)
* `couv_2_rappel` : Couverture vaccinale dans la population du second rappel du vaccin contre la COVID-19, (ie couverture primo-vaccination COVID19 complète et deux doses de rappel = n_cum_2_ rappel/pop)
* `couv_3_rappel` : Couverture vaccinale dans la population du troisième rappel du vaccin contre la COVID-19
* `couv__rappel_biv` : Couverture vaccinale du vaccin contre la COVID-19, personnes vaccinées avec un rappel adapté aux variants Omicron

La population de référence utilisée est issue de l’Insee : Estimations localisées de population, données Insee du 1er janvier 2020  pour les données de 2020, données Insee du 1er janvier 2021 pour les données de 2021, données Insee du 1er janvier 2022 pour les données de 2022.

Les classes d'âge utilisées sont les suivantes : 
* `0` : Tous âges
* `04` : 0-4
* `09` : 5-9
* `11` : 10-11
* `17` : 12-17
* `24` : 18-24
* `29` : 25-29
* `39` : 30-39
* `49` : 40-49
* `59` : 50-59
* `64` : 60-64
* `69` : 65-69
* `74` : 70-74
* `79` : 75-79
* `80` : 80 et +


Le sexe est codifié de la façon suivante : 
* `0` : hommes + femmes + Non renseigné
* `1` : homme
* `2` : femme

La région (colonne « reg ») suit la codification du [Code Officiel Géographique de l’INSEE](https://www.insee.fr/fr/information/4316069), elle est codifiée de la manière suivante : 
* `01` : Guadeloupe
* `02` : Martinique
* `03` : Guyane
* `04` : La Réunion
* `11` : Ile-de-France
* `24` : Centre-Val de Loire
* `27` : Bourgogne-Franche-Comté
* `28` : Normandie
* `32` : Hauts-de-France
* `44` : Grand Est
* `52` : Pays de la Loire
* `53` : Bretagne
* `75` : Nouvelle-Aquitaine
* `76` : Occitanie
* `84` : Auvergne-Rhône-Alpes
* `93` : Provence-Alpes-Côte d’Azur
* `94` : Corse
* `05` : Saint-Pierre-et-Miquelon
* `06` : Mayotte
* `07` : Saint-Barthélemy
* `08` : Saint-Martin


Les vaccins sont codifiés de la façon suivante : 
* `0` : Tous vaccins
* `1` : COMIRNATY-30-adulte (Pfizer/BioNTech)
* `2` : Spikevax (Moderna)
* `3` : Vaxzevria (AstraZeneca)
* `4` : Janssen (Johnson&Johnson)
* `5` : COMIRNATY-10-enfant (Pfizer/BioNTech)
* `6` : NUVAXOVID (Novavax)
* `9` : Spikevax Bivalent (Moderna)
* `10` : Sanofi VidPrevtyn Beta
* `11` : COMIRNATY-3 pédiatrique 6 m-4a (Pfizer/BioNTech)
* `12` : Spikevax Bivalent Ori/Omi BA.5 (Moderna)


Un certain nombre de ressources sont disponibles sur ce jeu de données. Il est listé ci-dessous le contenu de chacun d’entre eux : 

#### Données globales

Fichiers avec le nombre de personnes ayant reçu au moins une dose, 2 doses, 3 doses, 4 doses, une dose de rappel ou complètement vaccinées, arrêté à la dernière date disponible  :
- vacsi-tot-fra-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle nationale)
- vacsi-tot-reg-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle régionale)
- vacsi-tot-dep-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle départementale)

Fichiers avec le nombre quotidien de personnes ayant reçu au moins une dose, 2 doses, 3 doses, 4 doses, une dose de rappel ou par date d’injection :
- vacsi-fra-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle nationale)
- vacsi-reg-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle régionale)
- vacsi-dep-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle départementale).

#### Données par âge et sexe
Fichiers avec la couverture vaccinale et le nombre (journalier et cumulé) de personnes ayant reçu au moins une dose, une dose de rappel, une deuxième dose de rappel ou complètement vaccinées, par sexe (Hommes = _h ; Femmes = _f ; Tous sexes confondus = _e) et par classes d’âge, arrêté à la dernière date disponible :
- vacsi-s-a-fra-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle nationale)
- vacsi-s-a-reg-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle régionale)
- vacsi-s-a-dep-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle départementale)


#### Données par sexe
Fichiers avec le nombre de personnes ayant reçu au moins une dose, 2 doses, 3 doses, 4 doses, une dose de rappel ou complètement vaccinées, par sexe, arrêté à la dernière date disponible :
- vacsi-tot-s-fra-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle nationale)
- vacsi-tot-s-reg-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle régionale)
- vacsi-tot-s-dep-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle départementale)

Fichiers avec le nombre quotidien de personnes ayant reçu au moins une dose, 2 doses, 3 doses, 4 doses, une dose de rappel ou complétement vaccinés par sexe, et par date d’injection :
- vacsi-s-fra-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle nationale)
- vacsi-s-reg-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle régionale)
- vacsi-s-dep-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle départementale).

#### Données par classes d'âge

Fichiers avec le nombre de personnes ayant reçu au moins une dose, 2 doses, 3 doses, 4 doses, une dose de rappel ou complètement vaccinées, par classes d’âge, arrêté à la dernière date disponible :
- vacsi-tot-a-fra-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle nationale)
- vacsi-tot-a-reg-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle régionale)
- vacsi-tot-a-dep-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle départementale)

Fichiers avec le nombre de personnes ayant reçu au moins une dose, 2 doses, 3 doses, 4 doses, une dose de rappel ou complètement vaccinées, par classes d’âge, et par date d’injection :
- vacsi-a-fra-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle nationale)
- vacsi-a-reg-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle régionale)
- vacsi-a-dep-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle départementale).

#### Données par vaccin

Fichiers avec le nombre de personnes ayant reçu au moins une dose, ou deux doses, ou trois doses par vaccin, arrêté à la dernière date disponible :
- vacsi-tot-v-fra-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle nationale)
- vacsi-tot-v-reg-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle régionale)
- vacsi-tot-v-dep-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle départementale)

Fichiers avec le nombre quotidien de personnes ayant reçu au moins une dose, 2 doses, 3 doses ou 4 doses par vaccin, et par date d’injection :
- vacsi-v-fra-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle nationale)
- vacsi-v-reg-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle régionale)
- vacsi-v-dep-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle départementale).


Remarques :
* Des troisièmes doses de vaccin sont saisies dans vaccin COVID à une date antérieure à la recommandation de vaccination des personnes immunodéprimées. II ne peut être déterminé si les données ainsi saisies correspondent à des erreurs de saisie ou à de véritables injections de vaccin en troisième dose.
* L’analyse des données issues de vaccin COVID rapporte des seconde ou troisième doses de vaccin comme ayant été réalisées avec un vaccin Janssen. Pour les personnes concernées, le vaccin administré en première dose était un vaccin autre que Janssen (AstraZeneca, Pfizer ou Moderna). Le vaccin Janssen est un vaccin monodose. Il ne peut être déterminé si les données ainsi saisies correspondent à des erreurs de saisie ou à de véritables injections de vaccin Janssen en seconde dose.
* Les vaccinations observées chez les enfants de moins de 5 ans correspondent probablement à des enfants à très haut risque de forme grave de COVID. Il ne peut cependant être exclu des erreurs de saisies sur certains dossiers.

Santé publique France ne réalise aucun retraitement de données issues de la base Vaccin Covid :  les informations disponibles dans la base ne permettent pas de connaitre les différentes situations personnelles des personnes recevant des injections, ni les raisons de ces dernières (personnes immunodéprimées, personnes ayant eu la covid…).


Mots-clés : coronavirus,covid,covid19,vac-si,vaccination,vaccins