affected مش كامل، mild يعني مش صحيح زي اللي بيكون
اللي هو homozygous شوف، يعني المبدأ لموضوع إنه
autosomal dominant ماشي المبدأ إنه هو اللي بيظهر
بس على شرط إن الصفر هذه تعتمد فقطعلى جين واحد
أحيانًا الأمور أعقد من هيك واللي هو بنبدأ ندخل
أكتر في الـ Polygenic اللي كنا نتكلم عنه قبل شوية
الأسبوع، مش المحاضرة اللي فاتت، اللي قبلها لما
نكون أكتر من جين وEpigenetic Control وكده وهيك ففي
أحيانًا الـ Dominanceبيرتبط بـ Sticks حكينا مثال
الصلع الصلع في جين معين في الذكور dominant في الـ
females recessive يعني مش دايماً لما نقول dominant
يعني دايماً dominant وفي كل الحالات dominant وكذا
حتى لو إنه على الـ autosomal genes يعني ما هو مش
على الـ sex linked genes هدولة بس مرتبط بالجنة
فالآن في صفتينإضافيات على كلمة الـ Dominant بدت
تفهم إنه أحيانًا Dominance بيسموه مش كامل يعني
صحيح هو موجود بس مش 100% يعني مش هيظهر في 100% من
الناس أو 100% من الدرجة الشدة يعني ممكن يكون مثلًا
واحد اللي عنده الأتزامة الـ Dominant إذا فرضنا صفة
معينةبتلاقيها طارت 100% بينما ممكن و الـ
heterozygous بتتوقع أنه يكون 50% مثلا عنده مثلًا
نفترض إشي معين فاللي بتلاقيه autosomal dominance
بتلاقي incomplete penetrance يعني ما بيظهر بشكل
كامل يعني ممكن ما يظهرش و في العكس ممكن اتغير
النسباللي تشوفه إنه لو autosomal dominance و
lethal يعني مرض شديد كتير كتير كتير بحيث إنه ما في
إنسان يولد فيه بعيش سواء في فترة الـ embryonic
period أو الجن أو يعني فيتغير النسب اللي بتلاقيها
فاهم عليك كده؟ففيه Lethal وDominant في بعضها
Lethal وبعضها Incomplete Venetrance والأصل الـ
Classical اللي أنت بهيك كمفهوم عام بيقول إنه الـ
Trait هادي أو الصفة هادي بهذا الشكل هي الـ
Dominant فمعناه كذا، فهذا المقصود بمثل هيك أشياء
بفرجوكي إياها الآن بدك ترجع تفهم مرة ثانية شغلةحتى
لما اتكلمنا بنأول على موضوع اللي
هو اللي بيسموه الـ Reference Sequence أنت تتكلم عن
أحيانًا دراسة معينة عملوها في لحظة معينة على
مجموعة معينة على عيلة معينة، كده فضمن هذه المعطيات
اللي هي هذه العيلةكان الظاهرة
الموجودة واللي بحثناها بهذا الشكل فبنستنتجها
والاستنتاج فاهم عليك كده؟ فانت كلمة «dominant» لا
تعني dominant مطلق هيك نفس المستوى لكل الجينات وكل
العائلات وكل الناس، لأ، بتلاقي الأمر، إيش اسمه،
فيه تفاوضفي أسئلة أخرى إن شاء الله أجاوب عليها بس
خليني أسأل أسئلة بقى نعم أسأل سؤال تاني بس أتفضل،
أتفضل، أتفضل، أتفضل، أتفضل، أتفضل، أتفضل، أتفضل،
أتفضل، أتفضل، أتفضل، أتفضل، أتفضل، أتفضل، أتفضل، أ
وهذا بيكون complete، اللي هو مثلا نفترض إنه دي دي
كcapital والناس ال male اللي مش maintain و ال
female برضه هادة نفترض إنها Tigers، لإنه ممكن تكون
دي قدر المسموعة ‏-أنا أتبقى من ال picture ‏-صحيح؟
‏-اشو، اسمع علي، بس كافي عن الصحيحة
الـ «إيه» أنا مش شايفها، شايف اللي حاطف عليها
«إيه» وين 100% بيكون، بس الـ «بديجري» اللي تبع
العيلة هذه «أكندروبلازيا»، «incompletely dominant
trait»، بكون لما أنا شوف انت عنيه؟ أنا و«جزوف»
بتتكلم عنه؟ عن
صوت بيه؟B ما لها؟ ماشي الـ الـ الان شو المشكلة هنا
المشكلة إنه إذا هذا الـ dominant و أثنين أشخاص
عندهم أكندربلازيا، ماشي؟ ماشي الحال معايا؟ إذا كان
طيب خلّيني ا share screen خلّيني
ا .. بس عشان لأنهم بيسألوا شو الصورة اللي بنحكي
عنها بحكي لصورة زي هيك ال .. ده .. الأعناء هي عالي
ودول اثنين يعني ال .. اثنين همزلمة ومرة عندهم
أكندربلازيا وكانت أنا فحصتهم ولقيتهم dominant
ولقيت two copies الأصل لو فيه two copies ماشي يعني
لو بقدر واحد يحسبها لو واحد بس شخص مصعب الاحتمالي
المفروض تكون نص بس إذا اثنين مصعبين لازم تكون أكتر
واحتمالواحد منهم كان يعني يعني ده اثنين اتزوجوا
هيك ليش الفرد هذا البنت هذه طلعت طبيعية ماشي فالآن
يعني أنا اللي بتحكيلكيها لصور زي هيك بدك تدخل يعني
صعب أكتر أشرحلك يعني ده المبدأ أنت فاهمه من ناحية
ماذا يعني Dominant؟ ماذا يعني Resistive؟ ماذا يعني
Autosomal؟ وماذا يعني الـ X-Links؟ الـ Patterns
للـ Inheritance، إذا أنت فاهمها الآن هنا إثنين
مصابين، كيف يطلع لهم ابن طبيعي؟ هذا يجب أن يكون
الواحد يتكلم على إنه فيه Incomplete Dominance
ماشي، أو Semi-dominant trait، يعني هذا كنوع من
التفسير ممكن إنهم إثنين هم Heterozygous، وهذا طلع
من الـ Recessive trait شو اسمه اللي هنا Normal
طلعت واحدة منهم يعني اللي هي الرُبع لما نكون
Recessive trait بس هذه الـ Recessive trait هنا
بمعنى إن الـ Disease هو dominant فالـ Normal هو
الـ Recessive فبيّن إشي أو إنه يمكن هذا شخص عنده
الـ Geneبس مش مبين لأنه مش Completely Dominant
Incompletely Dominant يعني أو Semi-dominant فاهم
عليك كده؟ فالآن يعني ما بتقدر يعني خد الفكرة من
الـ Pedigree الـ Pedigree العيلة هدولة عيلتين
مختلفتين صار فيهم mutation لموقع
معينسوّت هذا المرض شخصين عندما دول المرض اتزوجوا
الأصل أنه كل ولادهم بناتهم يكونوا يعني مش كلهم بدل
واحد 75% على الأقل يطلعوا إذا أثنانهم بيكونوا
heterozygous بيطلعوا affected وده أنت درستعلى
موضوع شو اسمه درست على موضوع المستوى الجيني بتلاقي
أحيانًا ممكن الجين المصاب عند هذا الشخص بصي شيء
مبين عليه هذه النقطة – صحيح – ماشي نكمل – خليني بس
أسأل الـ type عندها و نشوف صح و لا خطأ – إيش هو؟ –
لإن أنا أسفة تقريبًا مصدش، بدي أكتب الـgenotype و
أنت شوف صح و لا خطأ، تقريبًا سؤالي مصدش – أنا
الصورة هنا الـM شايفةالـ «إيه» مش شايفة «هل دي
كمتل» «هل دي كمتل» «هل
دي كمتل» «هل دي كمتل» «هل دي كمتل» «هل دي كمتل»
«هل دي كمتل» «هل دي كمتل» «هل دي كمتل» «هل دي
كمتل» «هل دي كمتل» «هل دي كمتل» «هل دي كمتل» «هل
دي كمتل» «هل دي كمتل» «هل دي كمتل» «هل دي كمتل»
«هل دي كمتل» «هل دي كمتل» «هل دي كمتل» «هل دي
كمتل» «ه
اللي بتوفي هاد، مكتوب في السؤال «dominant
-complete»، فمعدل ولادة مباشرة، إنما الليل اللي مش
توفي هاد، هذا «incomplete-dominant»، فبقى عايش حتى
الآن. بفهم من هيك إن الأم هدولة بيكونوا
«incomplete-dominant»، والدليل إنه أعطوا بنت خانة
مش مصالبة من الأساس، فمتوقع إن هد بيكون مثلًا
«decapital»، «de-small»،«welcome to this world» و
«this world» و «this world» منهم اللي هو الصفة
المفترضة صحيح، ما هي اللي كنت حاولتها صحيح؟ آه،
صحيح أنا بدي أسأل الفكرة هذه، إنه الأب، الميل،
والأبوين، بالنسبة لهذا، الأصل تبعهم فوق، مفيش فيه
إصابات، يعني هم مفيش إصابة بالمرة، كيف هروصلتهم
الإصابة، خاصة الطلين؟ آه، آهوهذه إذا كانت عندهم
الصفحة هان فطبيعي لازم تكون ظاهرة عند أحد الأبوين
فورا وبالتالي شو ال conclusion؟ إن هدول بشر صارت
عندهم ال mutation هي بدأت in بضبط أنا بس ال
mutation طلعت عند الأب و الأم فمان مع بعض صحيح؟
إيش هو؟ ال mutation طلعت عند الأب و الأم مع بعض
اللي هو الجيل الثاني أه أه أههو هنا يعني عيلتين
أكندرو بلايزيا بتعرف صورتهم كيف حجم جسمهم طبيعي بس
أطرافهم قصيرة جدا فبكونوا بالـ Circus بكونوا
بالأفلام بتشوفهم أحيانا كذا ولا هيك لو من عيلتين
مختلفتين شخصين بهذه الصفات حبوا بعض و اتجوزوا بعض
بتصير فاهم عليك؟ ألا لما يكونوا زي هيتوقعنا إنه
الـ 75% من الـ من الأطفال
اللي بيطلعوا راح يكونوا برضه أكندربلازيا ماشي،
واللي
عنده 25% اللي هي الـ 25% اللي هي الـ Double اللي
بيكون homozygous، dominantيمكن يكون lethal فاهم
عليك كيف؟ فبالتالي بيعيشش هذا مفتوح دكتور أه بس في
مفتوح ثاني برضه مش في هذه الصورة هلجيتها في جزيرة
ال X inactivation عند الفميل؟ نعم ممكن هو يعمل X
inactivation لبعض الجنة مش كله يعمل X inactivation
إيه شو؟الـ Chromosome X لما يحصل Deactivation عند
الثمن آه، مش كله بيحصل Deactivation بيحصل
Expiration لبعض جينات المنسية لأ، المقصود في الـ
Random Deactivation للجينات
اللي احنا بنحكي عنه الـ Ionization بتلاقي الجين
كامل مش شغال، مش مفروضكيف شكله على الميكروسكوب لما
تتطلع عليه لما قعدنا نفحص اللي بيكون بار بيديز
ماشي في الـ meiosis و الـ mitosis أو الـ mitosis
في الـ meiosis في الفيميل بيكون بيسموه في إيه إشي
بيسموه الـ polar body هذا بيكون خلية كاملة هي
نفسها بتكون زي النقطةأما بالنسبة للـ X-Chromosome
بتلاقي بشكل عشوائي مرة هاد ومرة هاد، ما هو ما فيه
اتنين بالـ Female واحد بس شغال والتاني مسكر فاهم
عليك كيف؟ فبنشوفه لما تعمل Bar Body Study بتشوف
النقطة تبع الـ X-Chromosome وبكون Inactive كلهمش
بعض الجينات شغالة من هذا وبعض الجينات شغالة من هذا
واضح؟
طيب، في أسئلة كمان أنا بقترح اكتبوا الأسئلة
وخلّينا سواء بأول المحاضرة أو بآخر المحاضرة نحطهم
كلهم وش اسمه؟ ويعني نشوف، ماشي؟دكتور في سؤال من
دكتور علمازي قول شو الفرق بين ال semi-dominant و
ال pure-dominant و ال co-dominant ال co-dominant
لما ال two traits بتكون زي بعض رأس برأس اتنين هم
بتظهروا يعني زي ال ABO system ال A و ال B على بعض
co-dominant يعنيلو واحد عنده A و B، إثنين بدهم
يظهروا تبعتهم، فاهم عليك كيف؟ فهذه الإسمة Co
-dominant أما الـ A و الـ O أو الـ B و الـ O الـ A
و الـ B هم الـ dominant على الـ O يعني الـ O مافيش
منه إشي، مابيبينش إشي فيه فبالتالي بكون بس الـ A
أو الـ B هو اللي موجودماشي، فشو اسمه؟
يعني
شو اسمه؟ الأن الموضوع الثالث أنه حتى لو dominant
أحياناً درجاته بتختلف وإذا هنا يعني درجاته بتختلف
بصير الواحد كأنه بدي يدخل على مواضيع الـ Polygenic
Disorders يعني يمكن يكون الصفة هذه أكثر من جين
بتحكم فيها مش جين واحد اللي أنا بدرسه فاهم عليك
كيف؟ فكلمة Incomplete Dominance أو Lethal أو أنواع
ثانية بتتكلم على يعني variationتغييرها على يعني في
أن بعض الجينات ما بتكون 100% Classical هذا يُعطى
كنوع من التفسير لظاهر أحنا بنشوفها فاهم عليك كيف؟
بحيث أن أحيانًا بكون الـdominance مش كامل أدل إن
واحد يصله في أسئلة كمان؟ خلّينا نمشي في المحاضرة
وكل الأسئلة يعني إذا بنحطها على الـ Group بتكون
بشكل أوضح بالذات كـ Concept إذا فيها مشكلة يعني
بنتكلم عنها البداية
المحاضرة اليوم بتعطيكم homework خدوه وش اسمه يعني
فكروا فيهوالأسبوع الجاي بنحله وبنشوف شو الـ الـ
نتاج سبحته الملخص المحاضرة اللي فاتت أنه الـ الـ
في حالة الـ steady state في حالة أنه مافيش هجرات
مافيش mutations مافيش يعنيسيلكشن في الزواج لمجموعة
معينة دون أن عن الأخرى الـ Frequency لـ الـ Two
Alleles اللي بدنا نشتغل عليهم بيكون الـ P و الـ Q
و P و Q مجموعهم يساوي واحد اللي هي نسبة اللي
موجودة في الـ Population والمثال اللي حطوه الـ
CCR5الـ Mutated CCR5 Receptor Mutations اللي حكينا
عنها فالمعادلة الثانية، بدنا نتذكر إن واحد يساوي B
تربيع زائد اثنين BQ زائد Q تربيع هذولة المحاضرتين،
هذولة المعدلتين أنا بتوقع يعني مهمات كثير، الواحد
يفهمهمفأنا بدي أعقد الموضوع وأعطيكم إياه إمتحان أو
سؤال لنشوف للأسبوع اللي جاي يشتغلوا عليه أنتم
ويعطوني
الـ Results تبعتكم أفرض أنا مسكتكم كلكم 200 طالب
وطالبة وفحصت الـ ABO Systemالـ A-type في الـ
medical students in Islamic University of Gaza and
found the frequencies as are follows الـ A-type 20
% الـ B-type 24% الـ A-B-type 26% الـ O-type 30%
فالسؤال What are the frequencies of the alleles in
this population؟هنا عقدت الموضوع زيادة يعني لو الـ
AB كان كله يعني الـ AB لو إنه كان موجود بهذا الشكل
يعني لو كان كروموزومت أليل واحد كانت راح تكون
تماماً Classical حسب المعادلات بس هنا أنا حطيت
الأثنين فكروا فيها
لكل قليل اللي هو الـ A والـ B والـ O أعطيني الـ
Frequency تبعتهم الآن محاضرت اليوم يعني
كيف أنا بدي أفهم العلاقة
الوراثة
والـالـ Genetics تبعات أي إنسان وبين إنه يحدث معاه
مرض طبعاً يعني بتتدخل فيها مواضيع كثيرة والأمر
يعني أحياناً
حتى الواحد يشوفه بتكون فيه ظواهر كثيرة يعني قضايا
مهمة بالنسبة لـجزء من الـ الـ يعني احنا الأسهل
أحيانًا كتير بنتكلم عن الـ الـ الـ الجين الواحد
على إنه هذا من الأب و هذا من الأم على كرموزوم كامل
وإن الأمور يعني كل كرموزوم بيظلوا زي ما هو الحقيقة
أعقد من هيك بكتير أحيانًااللي بيصير إنه لو أخذنا
الجيل الأجداد، الجيل الأول ذكروا أنثى، اتزوجوا،
وإذا افترضنا كل واحد منهم كان الـChromosome تبعه
بهذا الشكل ولوّننا على إن هاي الـTwo copies تبعات
الجينات تبعات هذا الإنسان في هذا الموقعوعنا كل
واحد منها Two copies لما أنا باجي بدرس ترتيب
الجينات تبعات الأبناء والبنات ماشي أحياناً يعني
باعتمد على بالذات إذا الأماكن بعيدة عن بعض ماشي،
في الـ DNAبلاقي إنه بتصير ظاهرة بنسميها الـ
recombination الـ recombination إنه بيصير خلال
فترات الـ cell division بيبدأ تكون بالـ gametes
يعني بالـ ova و بالـ sperms لما يصير عملية الـ
segregation لما يصير عملية الانفصال
الـ Two copies عن بعضها، ماشي؟
شو
اسمه؟ بالنسبة ل، لو فرضنا هنا، هاي بدهم يطلعوا على
الـDNA بالذات للـX-Chromosome مثلا بالنسبة للإنسان
هذابنلاقي إنه صحيح حجم الـ «DNA» كاملاً هيك متساوي
ويعني
متشابه بس حقيقةً في قطع في كل كروموزوم بيكون من
الـ يعني من النسختين اللي قبل يعني هسة الـ «high»
الصور الأصلية للـChromosomes تبعات ذكر الأمتى
عندما نأخذ البنت الأولى هذا الـChromosome أخذته من
أبوها بس صحيح كان في الغالبهذه النسخة من الـ
Chromosome هذا ما هي اللي أخذته؟ بس في البنت بعض
القطع من الجينات من النسخة الثانية، ماشي؟ وهي
نتيجة أن بين هذه وهذه النسختين إن شاء الله أنكم
بتشوفوا المؤشر اللي بتكلم عنه صارت عملية
Recombination يطلعليالـ Chromosome من الأب بهذا
الشكل فيه الغالبين العظمى الأصل لهذا الـ
Chromosome بس أخد شوية من القطع من الـ Chromosome
الثاني هذه ظاهرة بنسميها Recombination يعني
بالذات إذا الـ Chromosome طويلوكان يعني من
الكرموزومات الكبيرة مش الصغيرة بتلاقي إن الظاهرة
هذه بتكون نسبتها أعلى ويكون إنها بتحدث وبتكون إنه
ما بنفصل هذولة تماماً عن بعض بشكل مستقل تماماً
وإنما وإنما بيصير عملية Recombination وهي في كل
الجينات ولكل الكرموزومات بحيث إنه لما نصل بعد ثالث
generation حقيقة إذا بنلاحظ هنا إنه لما نيجي نربط
الكرموزوم تبع الجيل الثالث الواحد منهم موجود في
خواصالأربع كروموزومات من الأبوين من الجدين في نفس
الكروموزوم فأتأمل أن هذه الخطيئة واضحة أنه عند الـ
Cell Division وبالذات في الـ Gametes عشان يتم
نقلها يكون هناك اشتراكوعملية ظاهرة الـ
Recombination هي كمان ظاهرة مهمة على مستوى الـ
Chromosome بس بتأثر على يعني شو المادة الوراثية
اللي بيأخذها أي ابن أو بنت من أبائه وأمهاته
واجداده بالطريقة هذه فهنا، ظاهرة الـ Recombination
وهنا يعني الأصل
ماشي اللي بيسموه الـ Independent Assortment إذا
كان عندنا يعني حكيت يمكن أنا جملة انتبهت عليها
قضية إنه النتائج مندل على الثمان صفات اللي درسها
الورد من فوق، لون الحب خضر أو صفر أو مجعلك أو
مستديرة الصفات هذه كانت بالصدفة هيك بالنسبة لكل
دراساته أنه كل صفة على كروموزوم مختلف فالأصل أن كل
كروموزوم يعني يتم انفصاله بشكلمنفصل تماماً معاه عن
الآخر بس أحياناً يعني المبدأ اللي أول شيء بنفكر
فيه قضية Independent Assortment يعني إذا أنا عندي
صفة وراثية A capital و small a على locus one على
كرموزوم معينوفيه عندي صفة B على كرموزوم ثاني
وبمثلها capital B small b الأصل بما أن هدولا
الصفتين على كرموزمين مختلفين الأصل أنه لما يصير
assortment يعني انفصال بين الكرموزوماتالأصل أنه
يعني إذا مثلًا يكون مثلًا عندنا الـ Individual هذا
إذا بنشوف كيف هذا أخذ الـ Capital A الـ G
الـChromosome اللي فيه عنده Capital A وأخذالـ
Chromosome اللي عنده كابيتل B ماشي الآن
احنا هنا اللي بنحكي عنه في ظاهرة الـ Meiosis يعني
عند تحدوط الإنقسام المنصي يعني هدولة الثنتين اللي
بنحكي عنهم هنا هم الـ Ova والـ Spareفالـ Ova أو
الـ Sperm هنا الـ Sperm هذا الحيوان المنوي هذا أخذ
الـ Chromosome الـ Capital A والـ Capital B مثلا
الاحتمال
الثاني أنههذه المجالات كلها مستحيلة لأن كل واحد
عندما تقوم بالانفصال بينهم ليس كل الانفصالات
تماماً مثل بعض
اللي فيها capital A أو نسميها من الأب كمصدر أصلي
بنتج عنها أنه
في الـSperm ثاني الـA أخد تبع الأب والـB أخد تبع
الأم، ماشي؟ فهنا الصورة هذه، ماشي؟ بتبين الأصل في
الـIndependent Assortmentيعني الأصل لو الأمور
تمامًا يعني أخدناها هنا على صفتين ورافقتين على
كرموزمين مختلفين الأصل أنه ما في علاقة بين هذه
والثانية، ماشي؟الأمر ممكن يتعقد أكثر من هيك أنه
أحيانًا لما أدرس مثلًا صفتين، واحدة هنا A والافترض
بالطرف الثاني C من تحت الـA والـC مع بعض وSmall A
وSmall C مع بعض، هيك الأصل بلاقي أنه مع
الـRecombination وقضية الـ
الـ Recombination هذه كظاهرة ممكن تجعلنا أنه يعني
هنا صحيح الجامعات
هنا في Capital A وهنا Capital B وهنا Small A
وSmall B بس هذه طلعت Capital A وSmall B وهذه Small
A وCapital Bإنه بالأخير ممكن شو اسمه الـ الـ الـ
هنا الـ combination أو الـ recombination طلع بشكل
مختلف وبكون هنا شو اسمه؟ بكون هنا بطريقة مختلفة
ثانية ماشي ال .. ال ..الـ Recombination يعني هي
ظاهرة بتحدث بيكون فيها خلال الـ Cell Division
ويروح ويجي وكل مرة بتنقسم الخلايا اللفة الخيط أو
لفة الحبل اللي أنا مطلوب في الـ Chromosome أفصله
بشكل نظيف وبشكل كاملبصير أنه بصير تبادل في قطع من
الـ DNA وبصير عن نتيجة الأمر هذا يعني أنه مش ظاهر
أو بيكون Independent Assortment فهي يعني الأصل في
الـ Assortment أنه يكون كامل، هيك بنفكر بس في
الحقيقة بيكون في عنا اسمها Recombination الأمر هذا
مربوط أو مهمفي قضايا إنه لما يكون عندي أكثر من صفة
مشتركة مع بعض يعني مثلاً اللي هي بيسموها Linked
disequilibrium وراح نتكلم عنها بعدين اللي هي إنه
إذا الصفة capital A بتيجي معاها إشي معين ظاهرة
الـRecombination بتكون مؤثرة وأوضح لما تكون القطع
من الـDNAالقطع أو الجينات على الكروموزوم بعاد عن
بعض وفي طول في الكروموزوم فإنه يكون قصير والجينات
جانب بعض في الغالب بتركب مع بعض وبتظلها مع بعض
فهنا الـ Crossing over بتلاقي يعني ممكن واحد
يدرسها خلّينا منيعني هذه النقاط تفاصيلها بالنسبة
للـ يعني الـ بالنسبة لتفاصيلها بدنا شيها كتير يعني
الـ
إذا افترضنا إن الـ
لما يكون فيه عندى أكثر من قليل A وB بالنسبة
للمشاكل اللي حصلت عندنا الـ Crossing over ماشي إذا
افترضنا إنه بالصدفة هنا Capital A و Capital B وهنا
Small a و Small b لما يصير عندى هيك الأصليات أو
هيك أنا لقيت إشي معين فيه مرات بلاقي إن الـ
Productسيكون small a مع capital B أو capital A مع
small b ممكن تكون موجودة يعني ماشي يعني يمكن لو
يعني
ممكن أحيانًا أكثر ظاهرة يعني أنا يعني بفكر فيها
بتحدث فيه هذه الشغلة بالنسبة مثلا لـ «HLA Antigen»
اللي هم تبعات المناعة اللي هو الـ «MHC Molecules»
في عندنا الـ «MHC Molecules» أو الـ «HLA Antigens»
الـ «Class I» والـ «Class II» ويكونيعني حتى لقينا
أنه لما نيجي نفحص الـ HLA Class I نفحص الـ A والـ
B وما نفحصش الـ C السبب أنه لقوا أن الـ B بيمشي
معاه C معين فبحيث أنه يعني في الغالب أن الواحد
يدرس ويتغلب أنه يدرس الـ HLA C مافيش داعي له يعني
سريرياً وعلمياًفي حالات معينة بسبب ظاهرة نسميها
«linkage disequilibrium» إنه إذا عندي كابيتال A
معين بيكون عندي الـ B كابيتال كمان وإذا الـ B الـ
A صغير بلاقي الأليل اللي معاه الـ B صغير مثلا،
نفترض ذلك فهذه يعني قضايا
أحيانًا زي ظاهرة الـ linkage disequilibrium بتكون
نتيجتها إنه يعني راح تكون راح
تكون نتيجتها إنه يعني في مجال إنه يتغيروا بحيث إنه
كل ما كانوا الجينات
مواقعهم قريبة مع بعض راح يكونوا بيمشوا مع بعض وكل
ما كانوا مجال إنه يكونوا بعاد عن بعض راح تكون
الاحتمالية
الـ Recombination ويكون إنه فيه اختلافات أكبر
بكثير، ماشي؟ هنا حاطين يعني تقييم للي حكينا
الـStrong linkage disequilibriumوالمثال اللي حطيه
لكم إياه «ظاهرة الريتينايتس بيجمنتوزا» نفس الـ
«جين» المسؤول عنه شكله فيه صعوبة أننا نفحصه أو
إحنا مش فاهمين شو دوره وشو هو ولا كده بس اللي
بيصير أنه ندرس عن طريق اللي هو بيسموه «marker
locus 2»يعني أنه
أحيانًا يعني إذا تخيلنا هنا الـ «ريتينايتس
بيجمينتوزا» الجين اللي هو الـD هذا فهذا الإنسان
هنا هي Female مصابة وعندها الـD Capital لأنه شكله
اتزامل dominant، ماشي؟والجين الثاني أو النسخة
الثانية طبيعية اللي هي Normal Small Capital تزوجت
شخص طبيعي فالآن هاي
الجين اللي هو مسبب للمرض ماشي أنا فيه صعوب أني
أدرسه فيه لسبب ما مشكلة أني أبحث عليه فإذا
لقيت
Two markers يعني جينات ثانية أنا وجدت المكافئة لها
بحيث أني بقدر أعلم عليها بقدر أعمل زي ما حكينا
fluorescence immunofluorescence
in-cyto-hybridization اللي هي الـFish مثلا على إنه
علاقة موجودة أو لا مش موجودة النسخة اللي أنا بدي
إياهافالفكرة أنه في حالة هذا الجين المسبب للمرض
هنا إذا عندي Two Markers بحب أستخدمهم الأحسن ليه
أنه أستخدم الـ Marker اللي هو الـ B لأن هذا قريب
لما يكون قريب إذا كانت Capital B وشفتهامعناته أه
والله في الغالب capital D وU وفيه احتمالية أن ..
يعني أن نكون ماشيين مع بعض الـ capital A هنا
البعيد كـ marker مش كويس السبب أنه مش دائما بمشي
معاه هذا يعني حتى في one generation افرض هذول الـ
Dodge خلفوا ثمانين وجيت أنا درستالـ Capital D
دائماً
بيجي معاها Capital B الأصل هنا الـ Capital D أجت
معاها Small B، ماشي؟ فهنا صار Recombination بين
هذا وهذا، ماشي؟ وهي الـ Capital D أجت معاها
Capital B، فهنا من اثنينمن ثلاث مصابين عندهم الـ
Capital D ماشي أثنين كان عندهم Capital B وواحد كان
Small B فمن ثلاث، أثنين طلعوا الـ Positive مع
الشكل المطلوب بينما المصابين، الأسف، الطبيعيين
اللي هم الخمس الثانيين، ماشي اللي عندهم Small D،
ماشيراح نلاقي إنه هاي «أ» متوقع الأصلي هنا «أ» هنا
«أ» هنا «أ» هنا «أ» اللي راح يكون نتيجة الأمر هذا
إنه بالنسبة لـ «D» مع الـ «D» ماشيالـ الـ الـ كان
الأصل capital A تكون موجودة بس أثنين من ثلاثة كانت
موجودة بينما الـ capital A موجودة في غالبية اللي
ماعندهم مش الـ disease فاللي بنقوله هنا يعني الـ
conclusion أنه الـ الـ marker B ماشيأحسن من الـ
Marker A لتشخيص هذا الجين المُصاب، ماشي؟ والظاهرة
بنسميها Linkage Dysequilibrium يعني إنه شو
احتمالية الـ Two copies أو Two alleles من الـ Same
gene يجي دايماً مع بعض، ماشي؟ والأمر مربوط يعني
إنه أحياناًحتى لو أنا يعني فاهم أنه متوقع أنه فيه
Mendelian disease وفيه mutation معينة نفس الـ
mutation اللي مسبب للمرض أنا أحيانًا ما بستطيع
أحددها، ما بكون قادر أعرفها بينما إشي قريب منه
مربوط معاه دائمًا مافيش الـ recombination between
themممكن أستفيد منه في قضية التشخيص
وبالتالي أقدر أعرف يعني مثال على ذلك الـ HLA
-antigen typing بنسوي الـ typing للـ A والـ B وفي
الـ HLA-C الـ C لأنه إذا مثلا الـ B كانت بشكل معين
الـ C بتكون بشكل محدد كمان معاها يعني فبالتالي
لاقوا إنه مافي فايدة بإنه أنا أبحث على الـ C السبب
إنه فيه linkage disequilibrium الـ A و الـ B بعد
عن بعض فبالتالي في احتمالية كبيرة إذا بلاقي إشي
معينالـ A والـ B ما بقدر أحدد شو هو مش قادر أعرف
شو هو أو ما بعرف مافيش يعني الترابط بينهم الأتنين
فهي
نتيجة قضية الـ Recombination أنه أنا عندي
Recombination في أسئلة
الـ Recombination يعني بدنا .. يعني أنت .. يعني هي
ظاهرة يعني أحيانًا لما نيجي ندرس ال population أو
البشر كيف أو كده كيف بتم توريثها، كيف بكون ال ..
يعنيانتقالها من شخص لشخص وكيف بيكون مجموعة الصفات
بتيجي مع بعض وهي أحيانًا يعني من الظواهر اللي أحنا
بنحكي عنه مرات اللي هي انه Polygenetic Disorders
أو Conditions أكثر بكثير بتكون أنه الـ … بتكون أنه
الـ Recombinationحدث أو ممكن يحدث بس كل ما كانوا
القطعتين بعيد عن بعض بيصير الـ Recombination أكثر
كل ما كانوا قريبات على بعض بيكون الإمكانية إنه
يمشوا اثنين مع بعض أكثر فهذه يعني ظاهرة بتحدث،
ظاهرة يعني أحياناً بتكون مهم إن الواحد يتذكرها
ويعني أحياناً بتكون له أهمية سريريةمن ناحية كيف
نتعامل مع الموضوع هذا فيه أسئلة نفس
الفكرة كل ما أبعدوا الجينات عن بعض على الـ DNA على
الـ Chromosome احتمال إن يكونوا الـ Alleles
مختلفين على البعض بتكون النسبة أكبر فتفاصيل الأمور
بتديشيها يعنيtoo much details ماشي الـ load score
اللي هو logarithmic نسيت اختصار يعني اللي هو معامل
احتمالية
انتقال الأليل مع بعض ماشي فهنا
three families
شو اسمه؟ تفاصيلها خلاص، بلا منها ماشي، تسألونيش
يعني بالنسبة ده بدنا ندخل بتفاصيل هنا يعني الـ
«take home message» الرسالة اللي بدنا إياها إنه
رياضياً أنا ممكن أعبر عن ارتباط قليل معينبأليل
آخر، والقصد في الموضوع اللي هي الظاهرة اللي هنا
اللي هي أنه أنا ببدأ يعني بالـChromosomes
وعليها الأليل في الـLocus مثلا A1 بشكل معين
وChromosome ثاني بكون بشكل آخر الـLocus 2 وفيه
Capital B وSmall bبالأخير اللي موجود بعد مرور كذا
generation وبسبب الـRecombination الأمور راح تكون
أنه أي قطعة بتكون الأصول من كل الأصول بتلاقيها
موجودة يعني اللي هي كمان هنا اللي هي أنه بيصير هذا
الإنسان الـthird generationالـ Chromosome الأول،
مع أنه بالأول الواحد هيك بيحب أنه يفكر أنه الـ DNA
والـ Cell Division هيك يعني نظيف وكامل وبينفصل
بشكل تم إلا أنه الأمور أعقد من هيك وأنه بتصير
عملية الـ Recombination ونتيجتها اللي هي Linked
Disequilibrium يعني أنه الـ Lociأو المكان على الـ
DNA إذا كان قريب مع بعض هنا في الغالب هيمشوا مع
بعض بينما لما نكون بأد راح يصير الاختلاف إن هنا
مثلًا هاي كابيتل A كابيتل small a في الـ Locus 1
وهنا كابيتل B small b في الـ Locus 2النتيجة إذا
صار عندي عملية الـ Recombination ماشي هنا هذه
النسخة شبيهة بالأصلي بينما هذه جلبه فصار الـ
capital A مع small b و الـ small a مع الـ capital
B تصير عملية الـ Recombination ماشيتفاصيلها كيف كل
واحدة يعني شون
الـ non-recombinant و الـ recoisant و الـ
recombinant هدولة أثنتين زي بعض بس المهم أنه جلب
صارت عملية recombination هنا ماشي بس إذا كانوا
قريبين على بعضلا يوجد تجاربًا مرتبطًا، بيبقى كما
هو بيبقى .. يعني عندما ندرس باستخدام الـ two loci
هذولة بما أنهم قريبين على بعض احتمالية أنه يمشوا
مع بعض أكبر بكتير كل ما أبعده بيصير فيه احتمالية
أكبر أنه يصير عملية الـ recombination ماشي
يعني هنا حاطين أن أحيانًا القطع واللصق بالنسبة للـ
Recombination بنتج عنه أنه الكمية
أكبر، يعني عدد الخلايا اللي فيها دول أثنين مهشت مع
بعض
يعني إن السنتين الذولة ماشيت مع بعض أكثر مش في
مثلا كل الخلايا أو نص الخلايا أو كده يعني إن شاء
الله هذه الفكرة تكون واضحة وتأثيراتها في قضية إنه
أحيانًا أنا ماعندي الـ الـ الـ الـ issue محدد للـ
gene causing diseaseبكون عندي إشي لإشي قريب منه
فإذا عندي الإشي للقريب منه بهمني إنه يكون هذا
الإشي قريب جدا على طول ملزق فيه لأنه إذا كان على
طول ملزق فيه احتمالية إنه يكون بينهم Recombination
قليلة من كل مكان أبعد بيكون الأمور أصعب في أسئلة؟
كاريم بده يتكلم يا دكتور، مش عارف يبدو عنده سؤال
نعم، فضل حقيقة أنت كنت في سنة وصار هناك
combination بين الجنات تصبح فرصة أصعب إنه يمشوا
الجنات مع بعض وينتقلوا مع بعض؟ لما أنا أتكلم على،
أسا أنا بتكلم على two low sides، يعني مكانينعلى
الـ يعني مثلًا أنا بتكلم خاصية الـ ABO group مثلًا
مع الـ Rh group ماشي لفصيلة الدم بس إذا الـ ABO
Locus قريب Locus يعني محل ما هذا الـ gene موجود
الـ Rh قريب كثير عنشو راح يصير؟ بيصير مافي داعي
تفحص الـ RH فاهم عليك أيه؟ أو تفحص الـ Ebio
بيكفيني واحد لأنه ثاني بلزق فيه جاي معاه يعني كل
ما كانوا أبعد ماشي ال .. كل ما كانوا أبعد احتمالية
ان يصير الـ recombination أكبر يعني لو جيت في
generation معينة أنا عيلة معينة درست عليهاالـ ABO
و الـ Rh و روحت دورت وين ما كان الـ «جين» هذا ماشي
إذا قريبات كتير على بعض راح ألاقي إنه فيه ارتباط و
إنه بيصير هو يعني الـ «ماركر» اللي هو عنديا
أستخدمه كمان عشان أدرس هذه الظاهرة بيكون مفيد كتير
لأنه قريب كتيرومافيش Recombination وبنسميه فيه
Linked Disequilibrium هذه الكلمة اللي بدي إياها
اللي هي إنه في عندنا ارتباط بين الـ الـ الـ الـ
إذا الأليل هذا A Capital بيجي معاه مثلا الـ B
Capital أو بيجي معاه إشي محدد فأنا هيبقى أستفيد من
هذه الظاهرة، ماشي؟
يعني استخدام هذا المفهوم بروري أحيانًا سريرياً ليش
ندرس بشكل معين وأحيانًا أنه أنا ممكن تجينة عالية
عندها مرض مايكنش عنده الـ Marker الـ Exact للجين
المسبب للمرض فمضطر أنا أستخدمماركر لجين إشي قريب
منه إذا الإشي القريب منه هذا اللي استخدمته يعني ما
هي الفكرة أنه لما يكون عند عيلة عندها الحالة يعني
زي مثلا ما اتكلمنا على إن افترض الـ Retinitis
Pigmentosa بهذا الشكل ماشي أب و أم الأم صابة جابوا
ثمان أفرادثلاثة مصابين وخمسة مش مصابين هذه الحالة
المثالية اللي أنا بروح بدرس ودلقيت عيل زي هيك أنا
لما فرجتكم شوفتم تذكروا صورة العقل اللي إيديهم
عنده قلنا سمناه أقرب شيء له زي الـInfantile
Digital Fibromatosis اللي هي صورة الإدانة بشكل
معين فلما تجيني عقل زي هيكأنا في عندى إشكالية إنه
أنا ما بعرف مية بالمية الـGene و الـLocus اللي هو
مسبب للمرض أنا ما بعرفه بس ممكن أستفيدإذا فيه إشي
قريب جدا عليه كأنه أستخدمه كـ Marker بعدين مثلا
خلفه جابه شخص يعني صار يعني الإمرأة هذه حملت جابت
التاسع يسألوك هذا بدي يطلع مصاب ولا مش مصاب مثلا
بدك تدرس وتستفيد من ظاهرة الـ linkage
disequilibriumأتكون متأكد، الـ Marker اللي أنا
هستخدمه أنا مش متأكد إنه للـ Disease 100% إنما أنا
بتوقع إن هو عشان قريب من الـ Disease بقدر أستفيد
منه فضمن الدراسة فالـ في الحالة هذه بستخدم
الـ Marker وبكون يعني بدأ أكون منتبه إنهالـ Marker
اللي لاقيته قداش دقيق في أنه يكون قريب من الـ
Disease Gene حيث أنه يكون إذا Marker كويس بيكون
الـ Load تبعه ماشي اللي هو المعامل الإرتباط تبعه
Code-Theor فهذه النقطة اللي بدنا يحصل
دكتور في سؤال من Carmel بتقول إيش الفرق ما بين الـ
recombination و ال crossing over هم نفسهم هم نفسهم
ال crossing over يعني عملية حدوث انتقال من ال DNA
كقطعة من جهة إلى جهة أخرى ماشي النتيجة الأمر هذا
أنه هيصير عنديrecombination إنه يعني هو نتيجة
نتيجة الحدث هذا يعني المتشابهات يعني ماشي ال
crossing over هي الظاهرة اللي بتسببلي القضية
بتسببلي
قضية ال recombination ماشيالـ يعني تتذكروا لما
حكينا مثلا حتى عن زي الـ Down Syndrome الـ
Crossing Over ماشي بقطع و لثق في الـ DNA من قطع مش
المفروض تكون مع بعض، ماشي؟ فالقطع واللثق أحيانًا
بيكونش متساوي أو القطع واللثق راح ينتج عنه إنه فيه
قطعة كبيرة زيادة وفيه قطعة صغيرة فهنا شو صار عندي؟
هنا صار عندي Crossing Over بس الـ Recombination هي
المحصلة النهائية لما يكونوا Balanced لما يكونوا
متوازنين لما تكون يعنيبالأخير يقدر ينقر الصفات
الوراثية ويولد جنين ويولد طفل ويولد يوجد إنسان
جديد فالـ Recombination يعني آليتها الـ Crossing
Over بس الـ Crossing Over ممكن يسبب مشاكل غير الـ
Recombination أو يعني ظواهر أشد وغير يعنيأسأل،
يعني أتمنى يكون الأمر واضح أيوة كريم، إذا عنده
سؤال بالنسبة
لما ندرس دواهر زي هيك يعني حقيقة من الاشياء
اللي عم بيستفيدوا منها هي قضية الـGenome-wide
Association Study الـGWAS لما
نكون
عندنا إمكانية نعمل Sequencing لكل الـDNA لكل 9
ملياراتنكليوتايد مرة واحدة وأجي أنا أعملهم، ماشي
لما يكون حاجة زي هيك بإمكاني
معاها أدرس و أكون يعنيمحدد إذا كان عندي Markers
كويسة لبعض الـ Diseases بسير أشوف احتمالية حدوث
أمراض معينة وهذه عادة، يعني هذه عبارة عن خدمة
متوفرة في الدول المتقدمة يعني مثلًا في أمريكا
تعطيهم عينة دم تبعتك، ماشي
اللي بيعملوا genome-wide association study اللي
اسمه الـ GWAS النتيجة بتاعتها بيسموها «ايمان هاتن
بلوت» بيادا الشكل الفكرة أنه يعني
نتيجة تبع الأمر هذا أنهسواءً عندي الـ Marker للـ
Gene نفسه المصاد والطبيعي وبقدر أفرق بينهم أو
Marker لإيش قريب منه بحيث أنه يكون في ارتباط مع
الـ Disease معينة بقدر أعطي الإنسان تقرير بحيث أنه
يعنيإذا الواحد بيشوف الأشياء اللي موجودة، ماشي
مثلًا SF1 اللي هو Cystic Fibrosis Inheritance
مثلًا Adams، فيه Adams 13 تبع مثلًا الـTTP اللي هو
«Thrombotic Thrombocytopenic Fever» مش عارف كده
فالفكرة أنه من الاستفادات لقضية الـ Recombination
ومن الاستفادات في بالذات اللي بيسموه الـ
Individualized Medicine يعني إن أنا أحاول أدرس
التركيب الجيني تبع الإنسان اللي أماميبحيث أفهم هو
محتمل أكثر يصيبوا إيش وما يصيبوش إيش بهذا الشكل
بأستخدم كلمة بدي إياكم تتذكروها اسمها «Genome-wide
Association Studies» GWAAS هذه مبدأ تقني مبدأ
مختبري بيعمل بطريقة معينةبدور على هنا الـ Single
Nucleotide Polymorphism Alleles على إشي معين
بالأخر يعني شفت أنا تقارير الـ Report اللي طلعوا
زي ما كنا في مرة من قبل يعني شبيه بأنه يعطيكوالله
انت 60% أو 50% قوقازي 40% أسياوي، 6% أفريقي مش
عارف من وين انت جيت يعني زي هذه الظاهرة بعطيني
كمان تقرير على إنه عندك احتمالية مثلًا 20% يكون
معاك سكري عندك احتمالية 10%
يكون معاك مثلاً ضغط عندك نسبة واحد بالمائة يكون
عندك Alzheimer عندك واحد بالمائة نسبة كذا يعني
بعطيك الاحتماليات
وبكون
يعني هذه بدك تدخل بتفاصيل دقيقة كيف انعملت وشو
اللي انعملزي ما انتوا شايفين هنا يعني هنا اللي هما
الـ 22 كروميزون والـ
X والـ Y المفروض يكونوا كمان موجودين وبيعطيك تقرير
انت شو متوقع الأمراض اللي انت تكون تعاني منها أو
إلك احتمالية يكون عندك فيها وشكله الـ Report
بيعطيك فكرةإنه كام قرب هذا الـ Crow أليل بهذا
الشكل مع الـ Disease بيعطيك نسبة احتمالية إنك يكون
عندك هذا الـ Disease يعني و أنا 300 مرة أكثر من
الإنسان الطبيعي أو يعني مضاعف و شكل لغريثمي و أنا
القراءة فـيعني أنه الآن الفكرة أنه باستخدام الـ
Linkage Disequilibrium أو الـ Recombination
Studying وإذا عندي آليات
أو تقنية أو آلات تقدر تعمل Whole Genome Sequencing
كامل لكل الـ DNA بإمكاني أني بالأخير أطلعاحتمالات
logarithmية أو احتمال الإصابة
كاريم
بيسأل، بقول، يعني بناء على شو بيعطي احتمالية حدوث
المرض يعني افسدوا احتمالية حدوث المرض، ايش بيجيس؟
لأ، الامر بتكلم على انه انا عندي أداءعندى tool
بستفيد منها هاي في دول اللي فاضين وعندهم إمكانات
يعملوا أشياء زي هيك بدك أنت يعني بشكل مسبق بشكل
يعني استشراف للمستقبل لشوه احتمالية أنه إنسان يكون
عنده الحالة اللي فلانية فاهم عليك كده؟
فالموضوع أنه أنت عندك الـ Tool أنك تقدر تفحص كل
الجينات أو كل الـ DNA وتقراها كلها بضاربة واحدة،
ماشي؟ يعني زي تقول، إذا الواحد بتذكر أيام زمان
الكمبيوترات كانت بطيقةالان الكمبيوترات سريعة وقوية
جداً جداً جداً فانت عندك زي هيك يعني زي ما تقول
كنت زمان اتدور على نرجع على قضية القصائد والكلمات
والأحرف كنت بدك مثلا لو عندك مكتب ورقيهوأقولك بيت
الشعر الفلاني مين جابه؟ مين عمله؟ مين قاله؟ بتتغلب
جداً ومليارات يعني آلاف الكتب وكيف بدك تدور عليه
فينما حسة لما يكون عندك زي Google Search بتحط
الكلمتين تلاتي بتطلعلك خيارات خلال seconds أو
milliseconds أو nanosecondsخلال فترة قصيرة جدا
بتجيبك احتمالية بيفهم عليك من وين على شو أنت بتدور
يعني فالفكرة شبيهة في هذه الحدث يعني أنه أنا الـ
DNA عبارة عن كلمات وأحرف وكذا الآن أحياناً الكلمة
هذه في بيت الشعر هذا في البروتين هذا في القصيدة
الفلانيةأحيانًا مش هو نفسه المسبب للمرض 100% أنا
قد لا أكون متأكد من هذا الموضوع بس بيظل إنه إذا
بقدر أعمل Search لكل إنسان أو للإنسان اللي بيجي
عندى، ماشي، على المستشفى، بكون، شو اسمه؟ بكون عندى
آليات أحسن إني أدرس الموضوع هذا، ماشي؟
الموضوع مش إنه أنا بكون واثق إن هذا الإنسان راح
يصيب المرض الإفلاني ما بقدر أحكي الكلام هذا الكلام
يعني الاستنتاج اللي راح يجيه إنه فيه احتمالية بقدر
أعطيها نسب أو حسب قربها وحسب ثقة بالنسبة للموضوع
هذا بعطيها نسب يا إما عالي كتير يا إما واطي أو أقل
أو كدهماشي بالنسبة
لـ .. يعني أحياناً
يعني خلّينا نتذكر نقطة وأنا باعتبر يعني الأهم هي
وجود المفاهيم إذا أنا شكيت أنه فيه disease
chromosomal أو disease
يعني sub-chromosome أو باند فيها مشكلة شو بدي
أعمل؟ إذا أنا شكيت في عيلة عندها شغل زي هيك بروح
بعملهم بينقصين الـ karyotype الـ karyotype هو اللي
بيخليني أشوف الـ chromosome كله وبقدر أشوف إذا فيه
باند ضايعة باند منقولة باند صار فيها مشكلةوممكن
أستفيد من هذا الموضوع كـ Band في تشخيص أشياء معينة
النوع
الثاني من عمليات الـ Search بتكون باستخدام قطعة
يعني مثلًا أنا الـ الـ الـ الـ اللي حكينا الـ
Nucleotides زي الأحرففلما أجي أعمل Search بدي على
مستوى أن أحط كلمة ماشي و أدور عليها بقدر أسوي هيك
إذا أنا متأكد وين هي بس أنا عندى تسع مليارات حرف و
أني أدور فيهم كلهم بهذه الطريقة أحياناً صعب و
بيبقى عندى احتمالات كبيرة و لأي إنسان الـ Snapاللي
هي Single Nucleotide Polymorphism يعني اختلالات أو
اختلافات في Single Nucleotide عشر ملايين اختلال
عادة في أي إنسان منها فبتصير الأمور صعبة وبصير
يعني أني أكون بثقة متأكد من هذا الموضوع صعب
فالأمور اللي سووها كثير من العلماء لما ييجوا
يدرسوا أمراض معينة ووراثيةبيصير زي مثلًا Retinitis
Pigmentosa هذا النوع من الـ Disease Retinitis
Pigmentosa أنا بطلعلها Marker يعني أنا بكون درست
من قبل وين الجين وأحيانًا صعد علي أني أشوف حتى لو
يعني حتى لو بشوف أنه في منطقة فيها ارتباط أقوى
أحياناً بكون عندي صعوبة أن أتأكد أنه هل هو فعلاً
هذا الأمر هو المهم المثال هنا اللي بدي أحطهنيا
اللي هو أنه لما أنت تيجيك حالة وتيجيك عيلة أنت
بتكون من الـ pedigree يعني شاكك أن هذا مرض وراثي
وهذا مرض جينيوإذا بالذات يعني بكون يعني هذا مرض
وراثي وجيني بدي أفكر كيف بدي أجي أنا أعمل الأحسن
أنه أعمل Whole Genome Sequencing بكون قريت لكل
الناس إذا بالذات أنا بتكلم عن الأسرة اللي عندها
المرضوعندي أفراد مصابين وأفراد مش مصابين، ماشي؟
لما يكون عندي الـ Whole Genome Sequencing أني
أقارن بينهم أحياناً يعني راح يكون الأمر يعني صعب
جداً حتى على أقوى كمبيوتر أنه يسوي، ماشي؟ اللي
بتكلموا عنه هناإنه افرض أنك لقيت عيلة وعندك مجموعة
أفراد مصابين ومجموعة أفراد مش مصابين وقريت الـ
«هول
جينوم» الـ Sequence تبعهم وعندك إياهم وعندك
الكمبيوتر زي «جوجل سيرتش» بيقدر يعملك البحث بحيث
أنه يقارن بين المصابين وغير المصابينعندما تكون
عمياناً من الأول تقدر أنه ستجد حوالي أربع ملايين
اختلاف بين المصابين وغير المصابين يعني هذولة عدد
هائل جداً من الاختلافات والاحتمالية الكبرى يعني
إذا تتذكروا كلمة حكيتها من قبلإن حوالي 94% من الـ
«DNA» في الإنسان هو «Non-coding DNA» يعني
«Intervening DNA» الـ «DNA» ما لهوش دخل بالـ
Transcription و Translation و تكوين بروتين ويمكن
شوية له دور في الـ Regulation يعني إذا ماكنش
coding 100% بعضه يعني على أساس بيعتبروه بيحمي ضد
الـ Mutations ولو صارتخريب في هذا المكان، بس هو مش
مهم، مالوش قيمة فلما بتقدر أنه فيه أربع ملايين
اختلاف لما تلاقي، يعني تيجي تحاول تدرس أكثر مين
قريب على بروتين يمكن إله وظيفة مين قريب على منطقة
معروفة من قبل، كذا ممكن أحددهم لـ 80 ألفلما ألاقى
الـ 180 ألف اختلاف بحاول أشوف إذا فيه لهم نتائج
على الـ Messenger RNA
بحاول أني أقلل أو أدرس من الـ Public databases هنا
إذا شوه إشي معروف من قبل قريب مرتبط مع هذه الحالة
أو هذا المرض أو إشي قريب منه وبظلني بعدين يعني
أركز في الدراسة لحد ما أحاول إذا بقدر أني أحددالـ
Variants، أحدد ما هي الـ Alleles أو أكون بينتج عن
هذا الجهد كله بالأخير Segment اللي يمكن نسميه
Marker واللي بيسموه Candidate Gene Methodology
يعني اللي هي أني أنا أدور على أنهار جين اللي مرتبط
بقوة كاختلاق بين المصابين وبين الطبيعيين في
العائلة هذه في المرض هذا في الحالة هذه يعني شغل
نستخدمها وأحياناً في بعض الأمراض بعض العائلات بعض
الـ populations نشتغل هذا الشغل فمن هذا الشغل إذا
استطعت أجيب Marker متخصص لـ Disease معينة بصير أنا
بعدين كفي دراسات أخرى زي الـ Whole Genomes
Association Genome-Wide Association Studiesماشي
بسير
أشوف إذا الـ Marker هذا موجود بقول أه والله
احتمالية المرض هذا بنسبة هالقدة أكثر من الناس
الطبيعية فهي يعني يعني برجع مرة ثانية الأهم واحد
يكون فاهم المبدأ يمكن مايكونش عندنا إمكانية نطبق
هذه الأشياءوصراحة مرات يعني .. يعني بتكون .. شو
بده أسميها؟ يعني بتكون مضيعة للقدرات إن الواحد
يدرس أشياء كثيرة وبيكون زي ما بيقولوا Big Data
يكون عندك أرقام كثيرة ومعلومات كثيرة الآن إذا
تخيلنا الـالـ Google Search مثلاً كيف بدورلك على
الكلمة وبتجيبلك إياها في أي قصيدة، في أي إشي قدر
هو مفيد، ممكن بس هي الفكرة أن هذا الموضوع لسه
بحاجة لتطوير أكثر، مشاركة أكثر وانتباه للاختلافات
يعني حتى لو لقينا إشي يمكن زابط كنسبة في الأمركام
في البيض في السود في كده قد لا يكون بالضرورة هو
اللي عنا إحنا كمثلًا عرب أو في منطقة الشرق الأوسط
أو بلاد الشام أو كده يعني هذه اختلافات بدي الواحد
يتنبأ إليها الأهم من هيك يكون الواحد منناعنده تصور
على معنى اللي بيقراه وبيشوفه لما نتكلموا على إن
هذا Marker للـ Disease يعني يفهمها الواحد، ونتيجة
الـ Marker نتيجة حدوث ظاهرة الـ Recombination و
الـ Crossover و الـ Linkage Dysequilibrium في
تفاوت بين الـ Markers، يعنيقد لا يكون الـ Marker
اللي بتستخدمه هو السليم أحكوا، ده فيه أسئلة؟ إيه،
كريم بده يتكلم في استفسارين؟ نعم، فضل يا كريم
باعظك
صورة في الـ chats ممكن برضه مقال ممكن تعرفي شوفها
شول أحكي أحكيها كمبدأ يعني ما الصورة هيك أثبت ده
قد أنزله كدهلأن جيتها في الـ «بديجري» ‏- أه ‏- في
حالة الـ «بديجري» ‏- أه ‏- لما تكون مثلا في ميل
محطومك تحتها ساهم واحد ‏- أه ‏- بدون ما تكون عاملة
تزاوج ‏- أه ‏- مع ميل الآخر ‏- خليني أشوف ‏- أه ‏-
عرضت الصورة أنا يا دكتور ‏- أه ‏- حملتها وعرضتها
أنا ‏- أههي موجودة أكتر من قديم، مش الموضوع الـ X
-linked dominant inheritance disorder الـ X-linked
dominant inheritance disorder الـ X-linked
dominant inheritance disorder الـ X-linkedلما
يعطيك حالة في الحالة هذه يقول لك اللي هو ال female
أنا تزوجها اللي معها يكون افترضه دايما سليم ولا
ممكن يكون mutant عادي؟ ما هو ليش ماحطهاش؟ لأنه
ماعنديش معلومة فاهم عليك كيف؟ يعني هنا الـ بكتير
احسانات نعم
كتير في صور زيكي في الكتاب بيكون حاطة كل .. بقولك
كتير في صور تكون في الكتاب حاطة نفس ال .. الوصف
نفسها معين في degree وعمل بس أفره زيكي من دون أن
يعمل تزاوج فاهمت أنها .. هذي بتكون ال .. أنه مش
عارف ال .. ال .. ال .. ال .. ال .. ال .. ال .. ال
.. ال .. ال .. ال .. ال .. ال .. ال .. ال .. ال ..
ال .. ال .. ال .. ال .. ال .. ال .. ال .. ال .. ال
.. ال .. ال .. ال .. ال .. ال .. ال .. ال .. ال ..
ال .. ال .. ال .. ال .. ال .. ال .. ال .. ال .. ال
.. ال .. ال .. ال .. ال .. ال .. ال .. ال .. ال ..
ال .. ال .. ال .. ال .. ال .. ال .. ال .. ال .. ال
.. ال .. ال .. ال .. الماوصلتوش، فاهم علي؟ يعني
أنا جيت أعملت دراسة على عائلة معينة والأبو مسافر،
مش في البلد، مش في المنطقة، فأه الفكرة أنه ماعنديش
معلومة عنه، بس طبعاً لازم عشان خلفت، لازم اتزوجت
مع شخص آخر، و بفترض أنه سليم، ماشي؟لو كنت عرفت
منها إنه مصاب من نفس الإصابة بدا أحطه بس الفكرة
هنا إنه هذه كـ Disease أو بـ degree لظاهرة إنه إذا
في صفة X-linked dominant إذا الـ X-linked dominant
إحنا عادة نتكلم X-linked recessive الـ X-linked
dominant الأنثى لو عنده نسخة واحدةبتلاقيها يعني
نسخة واحدة مصابة والثاني سليمة بتلاقيها بنتج على
أنه عندها المرض بينما الذكر لما يكون مصاب ماشي بس
ماعندهوش نسخة ثانية تكون سليمة يعني تمشيه فاللي
بيصير عنده زي هيك الـ Inheritance بيكون أنه الذكر
lethalيعني مافيش ذكر مصاب بهذا المرض اللي لما
يطلعوا بهذا الشكل بيكونوا high autism X-linked
dominant، ماشي؟ يعني هاي اللي انه ال females كلها
مصابات مش carriers، ماشي؟ مع أنه عندها one copy بس
مصابة وال .. وال males وال females ال males كلهم
الموجودينفيش حد مصاب، ماشي؟ وبالتالي يعني كلهم
لازم يكونوا normal، واضحة؟ تمام، الـ Homework اللي
حصلت عليها اليوم ال assignment كل قليل القصة و
لحاله يعني الـA لحاله، الـB لحاله، الـC لحاله،
الـD لحاله، الـE لحاله يعني هي الموضوع أعقد من
الطبيعي، ماشي؟الـ «A» والـ «B» بدنا نفصلهم عن بعض،
بدك تتأكد بالرياضيات إنه الفصل بالمعادلة سليم، آه
«A» هياخد مثلا اللي هو الـ «B» ورمز «B» والـ «A»
والـ «S» هو اللي هياخد الـ «Q»، صحيح؟ الـ «B» اللي
هو راح يكون الـ «A» والـ «B» مع بعض، بدك تحسبها
هيك، ماشي؟والـ AB هو الـ Heterozygous ماشي؟ يعني
تجربها و بيخليها للمرة الجاية بنحلنا كلها و بنشوف
شو بيطلع معاكم و أنا بقولكم شو النتيجة و بنشوف شو
بيطلع معايا أنا كمان خليني أشوفها يعني أسهل إشي
للـ O أسهل إشي للـ O لأن أنا Recessive
أه طيبالله يحضرك اللي هيطلع يعني لكل نسبتين
نسبتين؟ أه يحضر اللي هيطلع لكل قليل نسبتين لأ كيف
لكل قليل نسبتين الـ O بدك تطلع لكل قليل نسبتين
وبعدين تحسب لـ A و لـ B تفصلهم عن بعض هو الـ code
of general الـ S4 و الـ B4 نعم
مافيش a small و b small فاهم عليك؟ في a و o دول ال
capital A و small a هيك بدك تاخدهم و ال capital B
و small بيه مش small بيه فيه o ماشي بدك تجربها
شوفها ماشي الله يعطيكم العافية يعطيك ألف عافية
دكتورالله يرضى عليك جمال بدك الأسئلة على ال word
صح؟ وكل واحدة عليها الإجابة ان شاء الله رب
العالمين لسه شغال عليها و بس أخلص و أبعتلك إياها
تمام يا عزيزي يا عزيزي الله يسهل
الله يسهل الله يسهل الله يسهل الله يسهل الله يسهل
الله يسهل الله يسهل الله يسهل الله يسهلالعزيزي