قائمة أئمة الإسماعيلية  الإمام عند الشيعة الإسماعيلية هو خليفة النبي محمد نبي الإسلام والمرجع الرئيس للمسلمين طبقا للمفهوم الشيعي للإمامة. عهد الأئمة المستورين هو عهد ظهر بعد وفاة جعفر الصادق وتبعه الأئمة المستورين الذين لا يعلمهم إلا خواص الشيعة الإسماعيلية وهم: محمد الكتوم، الوافي أحمد، التقي محمد، الزكي عبد الله وانتهى هذا الدور بظهور عبيد الله المهدي في المغرب وتأسيس الدولة الفاطمية. وتبعه عدة عدة أئمة ظهور وهم حكام الدولة الفاطمية.  ولكن هنالك خلاف في الإمام تبدأ من الحاكم بأمر الله الذي أعلنه أتباعه وأنصاره أنه في غيبة وأنه المهدي المنتظر سيظهر ويملأ الأرض عدلا وقسطا كما ملأت ظلما وجورا وهم يسمون الدروز  ونشب خلاف آخر في من هو الإمام بعد المستنصر بالله حيث انتخب البعض نزار كإمام بينما انتخب البعض شقيقة الأصغر أحمد المستعلي بالله كإمام  وهرب ابن نزار علي الهادي بن نزار إلى قلعة آلموت وأعلن داعيته حسن الصباح أن الهادي بن نزار إمام مستور  وحصل انقسام آخر في من هو الإمام بعد الآمر بأحكام الله فمنهم من انتخب ولي عهد الآمر وهو الطيب أبي القاسم كإمام بينما انتخب البعض الحافظ لدين الله كإمام  وعندما هرب الطيب أبي القاسم إلى اليمن أعلن أنه إمام مستور وأن نسله مستور لحين قيام المهدي من نسله وهم يسمون البهرة  ومرت إمامة النزارية في آلموت مستورة وهم بالترتيب التالي:   وظهر الإمام المستور من نسل نزار المصطفى لدين الله وحصل انقسام آخر في النزارية بعد استسلام ركن الدين خورشاه ابن علاء الدين محمد الثالث، استسلم لهولاكو خان سنة 1256 وقتل أثناء عودته من عند قوبلاي خان وتبعه شمس الدين محمد شاه الأول الذي إنقسمت النزارية من بعده  بعد سقوط ألموت على أيدي المغول إنقسمت النزارية إلى فرق تتبع كل منها إماما من سلالة أئمة ألموت وهم مؤمنية وأغاخانية  المؤمنية الّتي ذهبت إلى إمامة علاء الدين مؤمن شاه بن شمس الدين محمد شاه الأول ثم توالت الإمامة في نسله عبر العصور إلى أن انتقلت إلى الإمام محمد الباقر الثاني بن حيدر المطهر (الأمير الباقر) (1179 ـ 1210 هـ)وقالت أنه مستور،  يؤمن الإسماعيليون الفاطميون بأن الإمامة استمرت من بعد إسماعيل ابن جعفر وابنه محمد بن إسماعيل بخلاف الإسماعيلية السبعية الواقفة والقرامطة، وفيما يلي أسماء أئمتهم:  توفي الإمام المستنصر بالله الفاطمي بشكل مفاجئ ولم يعين من يخلفه في الإمامة من أبنائه فنشب خلاف بين من رؤوا أن ابنه نزار هو الأحق بالخلافة وبين من رؤوا أن أحمد المستعلي بالله هو الأحق. كان وزير المستنصر بالله الفاطمي القوي الأفضل شاهنشاه مؤيدا للمستعلي بالله وأكثر الأطراف المتنازعة نفوذا، مما حسم الخلاف لصالح هذا الأخير وأدى إلى سجن نزار المصطفى لدين الله وموته لاحقا في السجن وخروج ابنه علي الهادي بالله بن نزار وأتباعه إلى آسيا الوسطى محدثين بذلك انشقاقا جديدا في الإمامة، بين مستعلية ونزارية.  سنة 524ھ (1130م) اغتال النزاريةُ منصور الآمر بأحكام الله بن أحمد المستعلي بالله انتقاما لما يعتقدون أنه اغتصاب للعرش الفاطمي، ولم يكن قد سَمَّى خليفة، فاختلف البيت الفاطمي في مصر فيمن يخلفه، فرأى بعضهم أن الطيب أبي القاسم ابن مالآمر هو الإمام فعرفوا بالطيِّبية، بينما بايع آخرون الحافظ لدين الله ابن عم الآمر بأحكام الله، فعرفوا بالحافظية. وبموت آخر إمام للحافظية وهو الإمام سليمان بدر الدين في السجن دون أن يخلف أبناء سنة 1248 انهت قائمة الأئمة الحافظية واندثرت طائفتهم مع نهاية القرن الرابع عشر، أما الطيبية فقد تحول أسمهم مع مرور الوقت إلى البهرة وهي كلمة ب اللغة الهندية وتعني التاجر لأنهم تركوا السياسة وعملوا في التجارة وانتقل مركزهم من اليمن إلى الهند نتيجة التجارة بين اليمن والهند ، وانقسموا فيما بينهم إلى بهرة داودية وسليمانية وعلوية.  بعد وفاة الإمام شمس الدين محمد شاه الأول إنقسمت النزارية إلى فريقين الأول يسمى «المؤمنية» أي أتباع الإمام علاء الدين الثالث مؤمن شاه الابن الأكبر لشمس الدين محمد شاه الأول والثاني «القاسمية»، يرى المؤمنية أن الإمام شمس الدين محمد شاه الأول توفي دون أن يختار واحد من أبنائه ليرث عنه الإمامة وبذلك تنتقل الإمامة إلى ابنه الأكبر الإمام علاء الدين الثالث مؤمن شاه مثلما حصل سابقا بعد موت المستنصر بالله الفاطمي دون التنصيص على الإمام من بعده فاختار النزارية الإمام نزار المصطفى لدين الله لكونه الابن الأكبر، في حين ترفض القاسمية هدا الموقف. يرى المؤمنيون أن الإمامة مع الإمام محمد الباقر الثاني دخلت في مرحلة الستر وأن الأئمة المستورين لايزالون متواصلون إلى يومنا هذا وأنه سأيتي اليوم الدي يخرجون فيه من دور الستر الثالث إلى الإمامة العلنية حتى أنهم أرسلوا رسلا إلى الهند عام 1887 إلا أنهم لم يتمكنوا من الاتصال بأي من السلالة. لا يزال أتباع هده الطائفة موجودون في مصياف وجبل قدموس بسوريا.  في تونس توجد أسرة تنتسب للإمام محمد الباقر الثاني ويقولون أنهم الورثاء الشرعيون للإمامة من بعده ويعتقدون أنهم في مرحلة الستر الثالث من زمن الإمام محمد الباقر الثاني، ترى هذه الأسرة أن الأئمة الآغاخانية هم أئمة استيداع وليس أئمة استقرار تماما مثل أئمة الإثني عشرية كما ويعارضونهم في عدة قرارات جوهرية مشت عليها الأسرة الآغاخانية من بروزها على حساب الأسرة المؤمنية، وقائمة أئمتهم كالآتي:  وهنا لابد من الإشارة إلى أن أغلب الشيعة الإسماعيلية النزارية كانوا حتى بداية القرن التاسع عشر مؤمنيين نظرا لكون مؤسس المؤمنية أي الإمام علاء الدين الثالث مؤمن شاه هو الابن الأكبر لشمس الدين محمد شاه الأول الذي لم يوصي بخليفة له في الإمامة بالإضافة إلى كون أئمة القاسمية مستورين مند دخولهم تحت غطاء الصفويين، وبدخول أئمة المؤمنية في دور الستر وإعلان آغا خان الأول عن إمامته وخروجه بها عن الستر ابتدأ النزاريون بالتحول شيئا فشيئا من المؤمنية إلى القاسمية الآغاخانية ليصبح اليوم أغلب النزاريين من الآغاخانية.