تصفيات كأس العالم 2018 – إفريقيا المرحلة الثانية  لعبت المرحلة الثانية من مباريات أفريقيا لتصفيات كأس العالم لكرة القدم 2018 في الفترة من 11 إلى 17 نوفمبر 2015.  لعب 40 منتخباً (المصنفين من 1–27 في قائمة المشاركين و13 فائز من المرحلة الأولى) مباراتي ذهاب وإياب. وصعدت المنتخبات العشرين الفائز إلى المرحلة الثالثة.  أجريت قرعة المرحلة الثانية تزامناً مع القرعة التمهيدية لكأس العالم لكرة القدم 2018 يوم 25 يوليو 2015، حيث انطلقت الساعة 18:00 بتوقيت موسكو ()، في قصر كونستانتينوفسكي في ستريلنا، سانت بطرسبرغ، روسيا.  يستند التصنيف على تصنيف فيفا العالمي الصادر في شهر أبريل 2015 . المنتخبات ال27 المتأهلة مباشرة تم تصنيفهم إلى ثلاث مستويات:  ضمت كل مواجهة فريقاً من المستوى الأول وفائز من المرحلة الأولى (في أول 13 مواجهة لعب فائز المرحلة الأولى 1 أولى مواجهاته في المرحلة الثانية، إلخ)، أو فريق من المستوى الثاني وفريق من المستوى الثالث (آخر سبع مواجهات)، على أن يستضيف الفريق صاحب المستوى الأول أو الثاني مباراة الإياب.  ملاحظة: هوية الفائزين من المرحلة الأولى لم تكن معروفة عند إجراء القرعة.  <onlyinclude>  </div id="النيجر × الكاميرون"> </div id="الكاميرون × النيجر"> فازت الكاميرون 3–0 بمجموع المباراتين وتقدمت إلى المرحلة الثالثة. </div id="موريتانيا × تونس"> </div id="تونس × موريتانيا"> فازت تونس 4–2 بمجموع المباراتين وتقدمت إلى المرحلة الثالثة. </div id="ناميبيا × غينيا"> </div id="غينيا × ناميبيا"> فازت غينيا 3–0 بمجموع المباراتين وتقدمت إلى المرحلة الثالثة. </div id="إثيوبيا × الكونغو"> </div id="الكونغو × إثيوبيا"> فازت الكونغو 6–4 بمجموع المباراتين وتقدمت إلى المرحلة الثالثة. </div id="تشاد × مصر"> </div id="مصر × تشاد"> فازت مصر 4–1 بمجموع المباراتين وتقدمت إلى المرحلة الثالثة. </div id="جزر القمر × غانا"> </div id="غانا × جزر القمر"> فازت غانا 2–0 بمجموع المباراتين وتقدمت إلى المرحلة الثالثة. </div id="سوازيلاند × نيجيريا"> </div id="نيجيريا × سوازيلاند"> فازت نيجيريا 2–0 بمجموع المباراتين وتقدمت إلى المرحلة الثالثة. </div id="بوتسوانا × مالي"> </div id="مالي × بوتسوانا"> فازت مالي 3–2 بمجموع المباراتين وتقدمت إلى المرحلة الثالثة. </div id="بوروندي × جمهورية الكونغو الديمقراطية"> </div id="جمهورية الكونغو الديمقراطية × بوروندي"> فازت جمهورية الكونغو الديمقراطية 5–4 بمجموع المباراتين وتقدمت إلى المرحلة الثالثة. </div id="ليبيريا × ساحل العاج"> </div id="ساحل العاج × ليبيريا"> فازت ساحل العاج 4–0 بمجموع المباراتين وتقدمت إلى المرحلة الثالثة. </div id="مدغشقر × السنغال"> </div id="السنغال × مدغشقر"> فازت السنغال 5–2 بمجموع المباراتين وتقدمت إلى المرحلة الثالثة. </div id="كينيا × الرأس الأخضر"> </div id="الرأس الأخضر × كينيا"> فازت الرأس الأخضر 2–1 بمجموع المباراتين وتقدمت إلى المرحلة الثالثة. </div id="تنزانيا × الجزائر"> </div id="الجزائر × تنزانيا"> فازت الجزائر 9–2 بمجموع المباراتين وتقدمت إلى المرحلة الثالثة. </div id="السودان × زامبيا"> </div id="زامبيا × السودان"> فازت زامبيا 3–0 بمجموع المباراتين وتقدمت إلى المرحلة الثالثة. </div id="ليبيا × رواندا"> </div id="رواندا × ليبيا"> فازت ليبيا 4–1 بمجموع المباراتين وتقدمت إلى المرحلة الثالثة. </div id="المغرب × غينيا الاستوائية"> </div id="غينيا الاستوائية × المغرب"> فازت المغرب 2–1 بمجموع المباراتين وتقدمت إلى المرحلة الثالثة. </div id="موزمبيق × الغابون"> </div id="الغابون × موزمبيق"> 1–1 بمجموع المباراتين. فازت الغابون بركلات الجزاء الترجيحية 4–3 وتقدمت إلى المرحلة الثالثة. </div id="بنين × بوركينا فاسو"> </div id="بوركينا فاسو × بنين"> فازت بوركينا فاسو 3–2 بمجموع المباراتين وتقدمت إلى المرحلة الثالثة. </div id="توغو × أوغندا"> </div id="أوغندا × توغو"> فازت أوغندا 4–0 بمجموع المباراتين وتقدمت إلى المرحلة الثالثة. </div id="أنغولا × جنوب أفريقيا"> </div id="جنوب أفريقيا × أنغولا"> فازت جنوب أفريقيا 4–1 بمجموع المباراتين وتقدمت إلى المرحلة الثالثة.  تم تسجيل 97 هدف في 40 مباراة، بمعدل هدف لكل مباراة.