مجهر بتروغرافي  المجهر البتروغرافي هو أهم أنواع المجاهر المستخدمة في دراسة الشرائح الرقيقة للصخور والمعادن، وكذلك في دراسة حبيبات المعادن المغمورة في السوائل، كما يتم استخدام المجهر البتروغرافي أيضا في معامل الكيمياء وعلم التربة وعلم الأدوية وعلم الفلزات. ويشترك المجهر البتروغرافي مع مختلف المجاهر في نفس التصميم، وأسس العمل، والتركيب.  يتكون المجهر البتروغرافي من ثلاثة أجزاء رئيسية وهي: ويشمل كل الأجزاء الميكانيكية الخاصة بالمجهر تقريبا، والتي تشمل القاعدة والذراع المسرح، ويوجد ببعض المكروسكوبات مِفصل أسفل الذراع يمكن بواسطته إمالة أنبوبة الميكروسكوب والمسرح بحيث يناسب مستوى العين لأي فرد يعمل به، وفي بعض الميكروسكوبات يوجد مشبك وهو عبارة عن مسمار لولبي لتثبيت المسرح عند أي وضع مطلوب، كما يوجد فوق المسرح مشبكان لمسك المقطع عند اختباره، وتتصل أنبوبة المجهر ببقية الحامل بواسطة جدار مسنن متين تتحرك عليه الأنبوبة بسهولة، ويتم ذلك بواسطة زوجين من العجل، أحدهما كبير ويسمى باسم الضابط التقريبي ، وزوج آخر يعرف بالضابط الدقيق ، فعند ضبط المسافة بين العدسة الشيئية وشريحة المعدن تكون الشريحة واضحة الرؤية وذلك لأنه يتم تحريك الضابط التقريبي أولا، ثم بعده الضابط الدقيق لكي تظهر جميع تفاصيل الشريحة بوضوح تام. وفي بعض الميكروسكوبات تنتهي تلك الأنبوبة بإطار متحرك في دائرة ومثبتاً به شيئيتان أو أكثر مختلفة القوى، حيث يكون البعد البؤري لهذه الشيئيات مضبوطا بحيث يمكن تغييرها دون الحاجة إلى إعادة ضبط العدسة الشيئية الجديدة إلا بحركة بسيطة للضابط الدقيق، وخصوصا إذا تم استعمال عدسة شيئية عالية القوة.  يوجد بجميع أنواع المجاهر المختلفة مجموعة بصرية تشمل على مرآه عاكسة أو مصدر ضوء، وعدسات شيئية مختلفة القوى وكذلك العدسات العينية لأن استعمال القوى المختلفة للعدسات يؤدي إلى الحصول على تكبيرات مختلفة لصورة الشريحة، بالإضافة لعدسة برتراند.  من الأمور الضرورية لكي تكون جميع الأجزاء البصرية في المجهر على خط واحد ينطبق مع محور أنبوبة المجهر، وهذه الخاصية لا بد من توافرها خاصة بالنسبة لمجهر له مسرح يدور، وهذا يعني أنه عندما يدور المسرح يجب أن يبقى أي جسم موجود عند تقاطع الشعرتين المتعامدتين، مثلا في مكانه، لكن إذا تحرك الجسم من مكانه مع دوران المسرح فهذا يعني أن المجهر أو المسرح يكون غير متمركز (أي أن محور دورانه لا ينطبق مع محور أنبوبة المجهر)، ويلزم لمركزة المجهر أو المسرح عندئذ إما ضبط محور المسرح على محور الشيئية أو العكس.  وتتم المركزة بإحدى الطريقين بواسطة مسمارين يعرفا باسم مسماري المركزة حيث أن في بعض الميكروسكوبات تكون المركزة بالنسبة للمسرح الدوار، وفي أنواع أخرى تكون بالنسبة للشيئية، وتتم عملية المركزة في كل الحالات بتحريك العدسات من جانب لآخر بواسطتهما.  معظم المجاهر الحديثة مجهزة بإضاءة صناعية مثبتة في قاعدة المجهر لتكون للضوء النافذ خلال شرائح المعادن والصخور، فالضوء من مصباح كهربائي موجه إلى أعلى المجهر، مع وجود مجموعة من العدسات والمرايا التي تمرر الضوء خلال أنبوبة المجهر، وتستخدم قطعة من الزجاج الأزرق (مرشح أزرق) كي يجعل الضوء الأصفر اللون ضوءاً أبيضاً يقارب ضوء الشمس، ويمكن التحكم في شدة الإضاءة باستخدام ريوستات التحكم ، أو باستخدام مرشحات الضوء.  كما أن بعض المجاهر تكون مجهزة بحاجب الضوء مثبت بقاعدة المجهر، ويستخدم في تحديد حجم منطقة الإضاءة في الشريحة المدروسة.  بعض المجاهر القديمة كان يُستخدم مرآة تكون عادة ذات سطحين، أحدهما مقعر والآخر مستوي، وتستعمل المرآه لاستقبال الضوء الطبيعي من نافذة مفتوحة مثلا أو من مصدر ضوئي كمصباح كهربائي.  وهي من المكونات الأساسية لجميع أنواع المجاهر المختلفة، وهي عبارة عن وسائل بصرية لانكسار الضوء أثناء مروره بها، وتصنع من مواد شفافة أيزوتروبية كالزجاج، ولها أسطح كروية حيث يكون سطحا العدسة إما متساويا الانحناء أو مختلفي الانحناء، وذلك طبقا للغرض الذي تستخدم العدسة لأجله، ويعرف الخط الواصل بين مركزي الانحناء في العدسة الواحدة باسم «محور العدسة»، وطبقا لكيفية انكسار ومرور الضوء في العدسة ونوعية الصور الناتجة عنها، فهي توصف بأنها عدسة محدبة (مجمعة) أو مقعرة (مفرقة).  العدسات الموجودة في المجهر المستقطب هي عدسات شيئية، وعدسات عينية، وعدسة برتراند.   وهما منشوارن أحدهما المنشور السفلي (والذي تم إيضاحه ضمن مكونات العدسات المجمعة تحت المسرح)، والآخر المنشور العلوي ويعرف أيضا باسم المُحلل . يقع المنشور (أو المستقطب) العلوي فوق العدسة الشيئية، وهو موضوع داخل شريحة معدن متحركة لكي يمكن بسهولة إدخالها أو إزاحتها من مسار الضوء. وتتركب من نوعية جيدة من فيلم مستقطب بصريا، على الرغم من أن منشور نيكول أو مكافئاته تم استخدامها في العديد من المجاهر القديمة. ويمكن ضبط اتجاه الذبذبة في المستقطب العلوي في بعض المجاهر. ولكن في العديد من المجاهر يكون اتجاه الذبذبة في المستقطب العلوي ثابتا، ولا يمكن تغيير اتجاهه.  اتجاه الذبذبة في المستقطبين السفلي والعلوي موضوع بحيث يكونا متعامدين على بعضهما البعض. عند إدخال المستقطب العلوي (المُحلل) في مسار الضوء، فإن النيكولين أو المستقطبين يكونا في حالة «تعامد». وفي عدم وجود أي شيء على مسرح المجهر، فإن مجال الرؤية في المجهر يكون مظلما (اسود)، وذلك لأن الضوء المستقطب المستوي الذي يمر من المستقطب السفلي يُمتص (يُمنع مروره) من خلال المُحلل. إذا أزيل المستقطب العلوي:، فإن المستقطبين يكونا غير متعامدين وتكون الرؤية خلال المجهر مضيئة، لأن الضوء الذي يصل لعين المشاهد من خلال المجهر هو المستقطب السفلي فقط، وهو ضوء مستقطب مستوي.  وهي مجموعة من الشرائح المعادلة، حيث توجد فتحة في أنبوبة المجهر فوق العدسات الشيئية مباشرة، وذلك لإدخال الشرائح المساعدة، ولكل شريحة من هؤلاء إطار من المعدن حيث يوجد العنصر البصري في ثقباً دائرياً بمنتصف الشريحة المعدنية، وأهم الشرائح المساعدة التي يتم استخدامها (شريحة الجبس، وشريحة الميكا، وإسفين الكوارتز).        يختلف المجهر المستقطب عن المجهر المتستخدم في الدراسات الحيوية في عدة أشياء: