标题：黑衣组织
组织简介
黑衣组织自漫画《名侦探柯南》开始就已经出现。主角工藤新一正是因为看到了组织进行非法交易的场面而被服下毒药（APTX-4869）灭口，身体缩小成为一个七岁男孩。他化名为江户川柯南，借住在青梅竹马毛利兰家的毛利事务所，调查黑衣组织。
  黑衣组织这个组织的真实名称一直是一个谜，在片中往往以“黑衣（黑暗）组织”、“组织”代称，组织的组成结构和目的也不明显。但可以肯定的是黑衣组织是一个在全球都有分支部的大型犯罪组织，势力遍布日本和西方国家，并且有雄厚的遍布全球的产业。并且在日本政界、经济界和科学界有很深的人脉。似乎还在研究可以使人长生不老和“使时光倒流”的技术。组织里的颜色是黑色，组织里的人穿着“如乌鸦般漆黑”的衣服（宫野明美语）。除Boss外，核心成员都以酒名作为代号。内部似乎有很严格的纪律。不合格的成员、暴露组织身份的成员和背叛组织的成员都会被铲除。美国联邦调查局（FBI）和中央情报局（CIA）都介入了对组织的调查。
组织的成立时间不少于半个世纪。表现在TV 130《竞技场无差别胁迫事件（前篇）》灰原的自言自语：“工藤君，也许你不知道，你已经深深地介入到我们组织从半世纪前就开始的秘密计划当中了”中（漫画Vol.19 File.9《被狙击的球》）。
另外，青山刚昌已明确表明黑衣组织与另一部作品《魔术快斗》中暗杀黑羽盗一、夺取命运之石“潘多拉”的“神秘组织”不是同一个组织。
登场人物
除Boss外，黑衣组织目前在《名侦探柯南》漫画原作剧情中共出现19名成员，剧场版、漫画特别篇等其他作品中登场6名（以下只列举原作中登场成员，  黑衣组织成员其他人物请见“其他成员”部分）：
核心成员：琴酒（Gin）、伏特加（Vodka）、贝尔摩德（Vermouth，真名莎隆·温亚德，同时也是克莉丝·温亚德）、基尔（Kir，即水无怜奈，原名本堂瑛海，CIA在组织中的卧底，被FBI送入医院后昏迷不醒，醒来后重新回到组织里为FBI刺探情报）、基安蒂（Chianti）、科恩（Korn）、波本（Bourbon；安室透）。
已脱离组织：雪莉（Sherry，宫野志保，即灰原哀，已背叛组织）、Rye（赤井秀一，FBI成员，为了调查情报而进入组织卧底，已被识破。被基尔射杀，之后生死不明）、沼渊己一郎（逃离组织，被警方逮捕）。
已死亡：龙舌兰（Tequila，已被炸死）、卡尔瓦多斯（Calvados，被赤井秀一打断双腿后自杀）、皮斯克（Pisco，被琴酒所枪杀）、宫野明美（化名广田雅美，灰原哀的姐姐，想要带妹妹脱离组织，被Gin枪杀）、宫野厚司（宫野志保的父亲）、宫野艾莲娜（宫野志保的母亲）、吞口重彦、楠田陆道（在赤井秀一追击途中自杀）、伊森·本堂（水无怜奈、本堂瑛佑的父亲，为保护女儿自杀）。其中宫野厚司和宫野艾莲娜的死亡故事为口传。
注：右图中16位组织成员从左往右依次为：科恩、琴酒、基尔、卡尔瓦多斯、伏特加、贝尔摩德、基安蒂、宫野厚司、皮斯克、龙舌兰、雪莉、宫野明美、沼渊己一郎、原佳明、宫野艾琳娜、吞口重彦。
组织计划
1.开发利用APTX-4869，原本想让人永葆青春，使时间倒流，死人复生。
名言：We can be both of God and the Devil. 我们既是上帝也是魔鬼。
Since we are trying to raise the dead against the stream of time. 因为我们要逆转时间的洪流让死去的人从黄泉之路再度复活
2.委托他人（如板仓卓）开发一款用途不明系统软件。板仓卓透露，自己“为了全人类”而决定终止软件开发。
成员简介
首脑BOSS
代号：无[1]
称呼：Boss、那位先生/那位大人（あの方）
姓名：不明
性别：不明
宠爱的人：贝尔摩德（Vermouth）
欣赏/害怕的人：赤井秀一（FBI搜查官、王牌）
简述：“那位先生”即组织内成员对黑衣组织首领人称呼。没有任何代号，其他成员的酒类代号就是他所命名。[1]身份一直是一个谜，即使在漫画中也从未以组织首领的身份露面或者有过一个剪影。现在已知他所“宠爱的女人”是Vermouth。而且其邮箱地址的按键音旋律为《七个孩子》，被柯南听到，查出组织的首领邮箱地址在鸟取县（TV 387）从而得知，但因其危险性，被哀劝阻，所以柯南并没有拨打此号码。
初登场：未知，据作者青山所说已登场并出现全名[2]核心成员Gin
代号：琴酒（Gin、ジン，也译阿进、金恩）
  琴酒性别：男
简述：黑衣组织高级成员。伏特加的大哥，是组织中最早出现的人物之一。冷酷残忍，头脑冷静，似乎可以毫不犹豫地杀死任何人。给新一灌下毒药使其身体变小的罪魁祸首。是江户川柯南（工藤新一）最难缠的对手之一。
永远都是一身黑色长风衣，黑色的帽沿下披散的金色长发（后来版本中多是银白色长发）。残酷无情，极度冷静，有着冷酷的眼神，眼睛闪着寒光。在组织里似乎有极高的地位，貌似经常见到“那位先生”。
主要负责很危险的暗杀和重要交易，作案时几乎不留下什么线索，也是很好的狙击手。和雪莉似乎有很深的关系。是个智能型的罪犯，和柯南多次交手均未曾吃亏。有一辆德国进口的老爷车——黑色保时捷356A。是个左撇子。
劲敌：赤井秀一等FBI、工藤新一（江户川柯南）、CIA等。
声优：堀之纪
初登场：Vol.1 File.1《平成的福尔摩斯》，TV 1《云霄飞车杀人事件》
Vodka
代号：伏特加（Vodka、ウォ  伏特加ッカ）
性别：男
简述：琴酒的助手，是组织中最早出现的人物之一。总是带着墨镜，极端残忍但头脑简单，做事稍嫌不细密。完全服从Gin且一起行动，尊称琴酒为“大哥”。有时险些中了柯南的计谋而暴露组织的秘密，幸由琴酒发现而得以弥补。
声优：立木文彦
初登场：Vol.1 File.1《平成的福尔摩斯》、TV 1《云霄飞车杀人事件》
Bourbon
代号：波本（Bourbon、  波本バーボン）
姓名：安室透
简述：黑衣组织高级成员。最早的“登场”来自于水无怜奈（Kir）在返回组织后给FBI的一通电话中，提到组织为寻找雪莉而派出了强大的侦探，具有一流的情报收集能力、观察力以及洞察力，代号为“波本”（Bourbon，一种烈性美国威士忌）。在随后的剧情中，可以感受到波本已经出现在柯南的周围，但并没有被明确地指出。他比Gin还讨厌赤井秀一，一直不相信赤井秀一已死，曾扬言只有他能杀死赤井秀一。Gin称之为“与贝尔摩德一样的秘密主义者”。
在File.823中，安室透揭晓自己就是波本。曾与诸星大（赤井秀一卧底进入组织时所用的化名）在组织中是竞争对手，彼此都反感对方。坚信赤井未死和“只有自己能杀死赤井”。在基尔事件上发现毛利侦探可能与雪莉有关联，因此接近毛利并与贝尔摩德合作[3]。为了验证赤井秀一是否死亡，请贝尔摩德将自己伪装成“伤疤赤井”并进行活动[4]。打算将雪莉带回组织，但最后任务失败。并向贝尔摩德提出重新查看赤井秀一死亡前后的详细资料，从头开始调查。
以安室透身份初登场：Vol.75 File.9《私家侦探》、TV 667《婚礼前夜（前篇）》
以伤疤赤井形象初登场：Vol.65 File.3《命中注定之人》、TV 563《侦探团VS强盗团（骚乱）》
声优：古谷彻
Sherry
代号：雪莉（Sherry、シェリー） 
姓名：宫野志保
化名：灰原哀
年龄：18岁，变小后为7岁
简述：作品主要人物之一，黑衣组织的核心科学家。科学家宫野厚司的次女。美国留学后在组织里负责开  雪莉发APTX-4869。“在组织里算是少数头脑顶尖的人”——琴酒。但在组织杀害她的姐姐宫野明美后以放弃研制作为抗议。在被组织处决前服下APTX-4869自杀，却变回小孩并逃出组织。现在化名灰原哀，住在阿笠博士家中，就读于帝丹小学一年级B班。曾经在一次追悼会中被皮斯克认出，并在短暂变回宫野志保时被琴酒枪击，后在柯南的帮助才得以逃生。后来在TV 339《四台保时捷》中身份暴露，被Vermouth发现。但是至今为止不为Gin等其他成员所知。
博学聪慧，平常十分冷静而理性化。大部分时间用于在博士家的地下室进行APTX4869的解药和其他研究。并曾多次帮助柯南隐瞒真实身份。
初登场：Vol.18 File.6《转学生》、TV 129《来自黑衣组织的女子 大学教授杀人事件》
声优：林原惠美
Vermouth
代号  贝尔摩德：贝尔摩德（Vermouth、ベルモット，也译苦艾酒） 
真实身份：莎朗·温亚德（Sharon Vineyard），同时也是克里斯·温亚德（Chris Vineyard）
年龄：外表年龄29岁，真实年龄推测在50岁左右
职业：演员（已隐退）
擅长：易容、射击、变声
名言：A secret makes a woman woman（秘密使女人更有女人味）。
简述：黑衣组织高级成员。长得非常漂亮，头脑冷静，枪法、身手、智慧都堪与琴酒媲美，比起琴酒的执行力，贝尔摩德更偏向军师型，是组织里最被boss信任的人。负责收集重要的情报，习惯单独行动，是个“秘密主义者”。深受组织“那位先生”的宠爱。
真实身份为美国女星莎朗·温亚德。因某种原因恢复年轻（原因不详），而后对外宣称为莎朗女儿克丽丝·温亚德，自己也坦然扮年纪大的人很幸苦。精通易容术和变声术，且水平极高，被称作“千面魔女”。曾变装成新出医生，得知灰原哀身份，准备除之，曾在纽约事件中曾变装成银发杀人魔。早年与工藤有希子在黑羽盗一（第一代怪盗基德）门下学习易容，成为朋友。曾易容后为杀人魔后被新一、小兰救下。因此对柯南和小兰极力地保护。知道柯南真实身份的人之一，很欣赏新一的能力，认为他是可以深入组织的“银色子弹”，似乎期待他摧毁组织一样而没有上报组织（但根据最新的漫画表示，没有上报的原因似乎与板仓有一定的关系）。
声优：小山茉美
初登场：Vol.24 File.8《漆黑的葬丧行列》、TV 176《与黑衣组织的再会（灰原篇）》
Pisco
代号：皮斯克（Pisco、 ピスコ，死亡）
姓名：枡山宪三
年龄：71岁
职业：汽车公司董事长
简述：黑衣组织元老  匹斯可级成员，靠着组织的力量成为成功的企业家，且与BOSS关系密切。他和宫野厚司和宫野艾雷娜交情深厚，了解到一些开发中的药物的事情，并对Sherry小时候的模样有印象。在一次举枪射杀政治家吞口重彦的行动时被摄影师到，留下重要杀人证据，后在BOSS的要求下被琴酒灭口。曾一度认出灰原哀为宫野志保，并暗杀其未遂。
初登场：Vol.24 File.8《漆黑的葬丧行列》、TV 176《与黑衣组织的再会（灰原篇）》
声优：村松康雄
Tequila
代号：龙舌兰（Tequila、テキーラ，死亡）  龙舌兰
简述：组织人物之一，关西口音的大汉，在一次在和满天堂公司职员交易的时候因拿错箱子而被误炸而死。曾与电脑工程师板仓卓接触过。
初登场：Vol.12 File.4 《突如其来的遭遇》、TV 54《电玩公司杀人事件》 
声优：广田行生 
Calvados
代号：卡尔瓦多斯（Calvados、カルバドス，死亡）  卡尔瓦多斯
简述：组织人物之一，是个枪法很准的狙击手，345集中作了Vermouth的助手，喜欢Vermouth（425集中Korn叙述）。所持来福枪、手枪、猎枪等各种武器。最喜欢用的是霰弹枪。被赤井秀一击伤后自杀。
初登场：Vol.42 File.9《假面下的真实》、TV 345《直面黑色组织的对决！满月之夜的双重迷案》
Chianti 
代号：基安蒂（Chianti、キアンティ）
简述：组织的优秀狙击手，狙击上限为600码。因为Vermouth的行动害死了卡尔瓦多斯，所以对Vermouth非常反感。
初登场：Vol.48 File.10《新黑衣人》、TV 425《黑色冲击！组织魔爪伸来的瞬间》
座驾：道奇蝰蛇跑车
武器：PSG
声优：井上喜久子 
Korn
代号：科恩（Kor  基安蒂与科恩n、コルン）
简述：组织的优秀狙击手，性格沉郁寡言，对Vermouth没有好感，但服从Gin的安排。狙击距离的极限是600码，总是和Chianti并肩作战，参与过多次暗杀活动。
初登场：Vol.48 File.10《新黑衣人》、TV 425《黑色冲击！组织魔爪伸来的瞬间》
声优：木下浩之
宫野厚司（みやの あつし，死亡）
代号：未知 
简述：黑衣组织科学家，宫野明美与宫野志保的父亲。在科学界以“被业界驱逐的疯狂科学家”而知名。在发表会类的活动中遇到过阿笠博士，并表示过对阿笠博士的发明的兴趣，是个相当直爽的人。在组织中与妻子一起进行“使死者复活的秘密药物”（可能为APTX-4869前身）的研究，被组织称为“因事故死亡”。
宫野·艾莲娜（宫野エレーナ、みやの エレーナ，死亡）
代号：未知
简述：黑衣组织科学家，宫野明美与宫野志保的母亲，英国人。和宫野厚司一样是化学家，但性格沉默少语。被人们称为“落入地狱的天使”（Hell Angel）。和宫野厚司一同死亡。曾经对自己的死去有所察觉，并且为尚且年幼的女儿志保留下了几盘录音。
声优：铃木弘子卧底Kir
代号：基尔（Kir、キール）
姓名：本堂瑛海
化名：水无怜奈
年龄：27岁 
身份：日卖电视台主持人（已辞职）、黑衣组织成员、CIA特工
简述：CIA派入组织的卧底，化名为水无怜奈。她的父亲  基尔伊森·本堂也是侦办组织的CIA特工，为保护女儿的卧底身份不暴露而牺牲，并造成“审问基尔却反被她所杀”的假象，使水无躲过了组织的怀疑并得到Boss的垂青[5-6]。平时身份为日卖电视台的主持人（重回组织后已辞职）。在一次暗杀政要的行动中因为事故被FBI当作真正组织成员擒获，并一直在医院昏迷。直到她苏醒后，FBI才知道她的真实身份，并且将她送回组织继续完成任务。但在刚回去不久，在“那位先生”和琴酒的要求下被迫杀死赤井秀一，赤井“貌似”死亡。
初登场：Vol.48 File.9《恶作剧的门铃声》、TV 425《黑色的冲击！组织魔爪伸来的瞬间》
声优：三石琴乃
Rye 
代号：黑麦威士忌 / 莱伊（Rye、ライ  赤井秀一）
姓名：赤井秀一（あかい しゅういち，akai shuichi）
化名：诸星大
年龄：不详
身份：FBI搜查官
爱车：雪佛兰C-1500
简述：FBI中实力强劲的搜查官，曾经在黑衣组织卧底三年，逐渐崭露头角成为重要骨干，得到BOSS的赏识并获得代号“Rye”，又因FBI安德雷·卡迈尔的失误被迫逃离组织，之后回到纽约，追击Vermouth。宫野明美的前男友，为进入组织曾接近明美，不过假戏真做陷入情网，后明美被Gin杀害。似与明美的妹妹志保有很深的关系。
与黑衣组织的几次交手都呈现较大的优势，Boss认为他是可以射穿组织心脏的银色子弹（Silver Bullet）。具有极强的狙击能力（可以在700码以外打中狙击步枪的瞄准镜）和情报搜集、分析能力，车技一流。平时总戴黑色针织帽，和Gin同为左撇子。
在TV 504《红与黑的碰撞 殉职》中为保护水无怜奈的卧底身份不被泄漏牺牲。之后出现了面带伤疤、疑似赤井的人物，后证明此人为波本（安室透）假扮[4]。有迹象表明赤井未死、研究生冲矢昴的真实身份就是赤井[4]，但具体情况仍有待观察。
初登场：Vol.29 File.3《看不见的恐怖》、TV 230《神秘的乘客（前篇）》
声优：池田秀一（玉川纱己子的丈夫）
伊桑·本堂（イーサン·本堂，死亡）
代号：未知
年龄：不详（去世时在45～50岁左右）
现状：四年前去世
身份：CIA的间谍
亲人：本堂瑛佑（儿子）、本堂瑛海（化名为水无怜奈，女儿），妻子（十年前去世，生前在杯户町奥平家做保姆）
简述：第二代日裔美国人，30年前加入CIA，成为谍报人员[7]。一个不太爱说话的人，使用多个假名。曾潜入组织，四年前为了保护自己的女儿（水无怜奈）卧底身份不暴露而自杀[5]。
声优：小山力也底层成员  宫野明美姓名：宫野明美（死亡）
化名：广田雅美
年龄：24-25岁
简述：宫野志保的姐姐，黑衣组织的基层成员，赤井秀一的女友。因父母都是组织成员而被迫加入组织。因为是基层成员，所以可以像正常人一样生活，但其实是在组织的监控下。为了逃避组织的追查，自己有一间秘密住所，后被组织发现。为了自己和妹妹能够脱离组织，参与了抢劫10亿元的案件，最后被Gin枪杀。（多出现在回忆中）
初登场：Vol.2 File.6 《追踪高大的男人》、TV 13《奇怪的寻亲事件》
声优：玉川砂记子（池田秀一的妻子）
姓名：楠田陆道（死亡）
简述：组织排出的的卧底，为了寻找失踪的基尔而被组织安排装病住进杯户中央医院进行秘密调查。被FBI发现而驾车逃亡，发觉追踪者是赤井秀一后举枪自杀。
初登场：Vol.57 File.10 《第2条线索》、TV 496《红与黑的碰撞 入侵》
姓名：吞口重彦（死亡）
职业：政治家
简介：由于受贿而被警方调查，被Pisco杀死。
初登场：漫画：Vol.24 File.8 《漆黑的葬丧行列》TV：176—178 与黑衣组织的再会。
姓名：沼渊己一郎（被捕）
简述：运用组织教他一系列的杀人手法，协助优秀的杀手作案。但是他达不到预期的培养效用，就被送到宫野志保处来作实验对象。后来在作人体实验前逃跑，并制造了一系列的连环杀人案。最后被警察逮捕，目前在监狱中服刑。
初登场：漫画：Vol.19 File.7 《钱包疑云》TV：118 浪花连续杀人事件被组织利用的人姓名：中岛英明
性别：男
简介：他与黑衣组织的龙舌兰进行过交易，组织用高价从他手里买了一些偷来的程序。但是龙舌兰拿错了箱子后被误炸死，这次交易没有成功。柯南忠告他最好和警方合作，争取得到警方的保护。他的后续内容没有再交代。
初登场：漫画：Vol.12 File.4 《突如其来的遭遇》TV：054 电玩公司杀人事件
姓名：板仓卓（死亡）
性别：男
简述：与龙舌兰接触过的电脑游戏工程师，被胁迫制作一种系统软件，曾透露自己“为了全人类”而放弃软件开发。卷入杀人案被害。
初登场：TV 307 没有声音的证词
姓名：不详（曾化装成狼人）（被捕）
性别：男
年龄：不详
简述：一个对某导演不满的网民在网上发布了对该导演的不满信息，被贝尔摩德发现后，黑衣组织对他进行骚扰（向他家里寄了很多他的个人隐私，组织的威力通过这个侧面展示出来），迫使他就范，协助组织杀人以吸引柯南的注意力，给贝尔摩德机会除掉雪莉。他的杀人手法被服部平次识破后被捕。（这个人太马虎了，居然扔掉了贝尔摩德寄信的发票，使警方失去了追捕贝尔摩德的机会）
初登场：漫画：File.433 《面具下的真相》TV：345 直面黑色组织的对决！满月之夜的二元神秘事件其他成员（注：本部分收录剧场版、漫画特别篇等非原作中出现的正式组织成员）
代号：爱尔兰（Irish、アイ  爱尔兰リッシュ，死亡）
简述：在剧场版《漆黑的追踪者》中登场，琴酒的手下，由Vermouth帮助其化妆混入警视厅搜查小组，任务为找回存入组织成员名单的SD卡，根据指纹对比确定柯南的真正身份。视已故成员皮斯克同父亲一般，对于杀死皮斯克的琴酒相当不满，打算活捉柯南向Boss举发Gin没有成功。后因被警察包围，连同到手的SD卡被Gin消灭，死前以身保护柯南，说柯南是唯一一个可以和组织抗衡的人。
初登场：M 13《漆黑的追踪者》（只1次）
声优：干本雄之
姓名：原佳明（死亡）
年龄：32
简述：日本的游戏工程师。因为入侵黑衣组织电脑而被GIN杀害。
初登场：M 5《通往天国的倒计时》（只1次）
姓名：冈仓政明（死亡）
简述：组织间谍（NOC），擅自拷贝了黑衣组织所有NOC名单在SD卡并带在身上，因此成为黑衣组织的暗杀对象。因卷入了一起杀人案，被本上和树杀害。
初登场：M 13《漆黑的追踪者》（未正式登场，只是作为被害人被提到）
姓名：阿米林（死亡）
代号：阿拉克
简述：黑衣组织的职业杀手，暗杀文莱公主未遂后被柯南设计逮捕。但押回警局途中自杀。
登场：漫画特别篇第26卷 File.9～10《寄托于飞艇的愿望》（只1次）
姓名：本田
代号：朱奈瑞克
简述：黑衣组织的科学家，曾和灰原是同事，比灰原小一岁。为了从组织里脱离故意将自己变小，还开发出抹消记忆的药物。打算让灰原也服用使灰原成为自己家人。但因元太的干涉反而使自己丧失了记忆。后被普通家庭收养过上正常人的生活。
登场：漫画特别篇第26卷 File.11～12《黑衣组织——出现》（只1次）
姓名：不详（死亡）
代号：不详
简述：真人版单发第二部《工藤新一的复活 黑衣组织的对决》中出现的黑衣组织成员，受命暗杀宫野志保，被小兰击倒后落荒而逃，之后被琴酒枪杀。
登场：真人版单发第二部《工藤新一的复活 黑衣组织的对决》（只1次）
出场集数
注：带*表示虽然有黑衣组织的成员登场，但是与黑衣组织本身无太大关联TV 版001 云霄飞车杀人事件
054 电玩公司杀人事件
128 黑衣组织十亿元抢劫事件
129 来自黑衣组织的女子 大学教授杀人事件
176 与黑衣组织的再会（灰原篇）
177 与黑衣组织的再会（柯南篇）
178 与黑衣组织的再会（解决篇）
230 神秘的乘客（前篇）
231 神秘的乘客（后篇）
271 隐藏匆忙中的省略（前篇）
272 隐藏匆忙中的省略（后篇）
286 工藤新一NY事件（事件篇）
288 工藤新一NY事件（解决篇）
289 光彦森林迷失记（前篇）*
290 光彦森林迷失记（后篇）*
307 遗留的无声证言（前篇）
308 遗留的无声证言（后篇）
309 与黑衣组织的接触（交涉篇）
310 与黑衣组织的接触（追迹篇）
311 与黑衣组织的接触（决死篇）
338 四台保时捷（前篇）
339 四台保时捷（后篇）
340 厕所里隐藏的秘密（前篇）
341 厕所里隐藏的秘密（后篇）
345 与黑衣组织的直面对决 满月之夜的二元推理
425 黑色冲击！黑衣组织的魔爪伸来的瞬间
462 黑衣组织的影子 年幼的目击者
463 黑衣组织的影子 奇妙的照明
464 黑衣组织的影子 谜样的高额报酬
465 黑衣组织的影子 珍珠的流星
491 红与黑的碰撞 开端
492 红与黑的碰撞 血缘
493 红与黑的碰撞 疾呼
494 红与黑的碰撞 冥土
495 红与黑的碰撞 昏睡
496 红与黑的碰撞 侵入
497 红与黑的碰撞 觉醒
498 红与黑的碰撞 搅乱
499 红与黑的碰撞 伪装
500 红与黑的碰撞 遗言
501 红与黑的碰撞 嫌疑
502 红与黑的碰撞 洁白
503 红与黑的碰撞 决死
504 红与黑的碰撞 殉职
563 侦探团VS劫匪团 骚动
564 侦探团VS劫匪团 沉默
578 召唤危机的红色前兆
579 黑色与13的暗示
580 逼近的黑之时限
581 摇曳的红色目标
667 婚礼前夜（前篇）*
668 婚礼前夜（后篇）*
671 侦探们的夜想曲（案件）*
672 侦探们的夜想曲（绑架）*
673 侦探们的夜想曲（推理）*
674 侦探们的夜想曲（波本）
681 命悬一线的恋爱转播（转播开始）*
683 命悬一线的恋爱转播（现场突入）*漫画版01/01 001 现代的福尔摩斯 
01/02 002 变成小孩子的名侦探
02/04 014 行踪不明的男子
02/05 015 可怜的少女
02/06 016 追踪高大的男人
02/07 017 恶魔一样的主谋 
04/04 033 黑色公事包之谜
12/04 114 突如其来的遭遇 
12/05 115 炸弹的下落 
12/06 116 柯南失算了 
18/06 176 转学生 
18/07 177 黑衣女郎 
18/08 178 秘密组织成员·代号雪莉
18/09 179 伪装的少女 
18/10 180 将死 
19/01 181 为什么？ 
19/09 189 被狙击的球！ 
19/10 190 5万6千名人质 
20/01 191 远方之眼 
24/07 238 背叛的街角 
24/08 239 漆黑的丧葬行列 
24/09 240 不告而别 
24/10 241 来自过去的子弹 
24/11 242 白色世界 
29/03 287 看不见的恐怖 
29/04 288 危险讯号 
29/05 289 光天化日下的埋伏
34/11 350 金苹果①
35/01 351 金苹果②
35/02 352 金苹果③
35/03 353 金苹果④
35/04 354 金苹果⑤
37/05 377 黑暗的足迹①
37/06 378 黑暗的足迹②
37/07 379 黑暗的足迹③
37/08 380 白雪…黑影… 
37/09 381 危险的相遇 
37/10 382 顺风车 
38/01 383 新兵器！ 
41/10 423 到访者留下的谜 
41/11 424 小小密室的秘密 
42/01 425 隐藏的真相 
42/05 429 月圆之夜和黑宴 
42/06 430 染血的幽灵船 
42/07 431 隐形人出现 
42/08 432 工藤新一登场 
42/09 433 面具下的真相 
42/10 434 腐坏的苹果 
46/07 475 封印
48/09 499 门铃怪客 
48/10 500 新黑衣人
49/01 501 追踪目标
49/02 502 新的指令
49/03 503 黑衣组织vsFBI ① 
49/04 504 黑衣组织vsFBI ②
53/07 550 目击者一人 
53/08 551 钉子与蛇 
53/09 552 锤子的真面目 
53/10 553 不可思议的兼职 
54/01 554 晚餐的菜单 
54/02 555 梦中之星
57/09 595 乌鸦之歌
57/10 596 第二条线
57/11 597 假患者
58/01 598 跟踪，然后……
58/02 599 赤井的过去
58/03 600 孤注一掷
58/04 601 伪装
58/05 602 最终手段
58/06 603 任务
58/07 604 姐弟
58/08 605 意外的嫌疑人
58/09 606 13日又是星期五
58/10 607 卡迈尔的过去
58/11 608 魔法的咒语
59/01 609 钢楔
60/03 622 红白黄色
60/04 623 黑白君
60/05 624 新邻居
64/01 664 一角岩
64/03 666 杀气
65/03 677 命运之人 
65/04 678 陷阱
65/05 679 摇摆的心
65/06 680 与危险的二人同行
67/03 699 期待明天 
67/04 700 危险地带
67/05 701 赤与13的暗示
67/06 702 炸弹犯的目的
67/07 703 暴风雪中的真相
67/08 704 寂静的战争
72/04 755 通话代码
74/02 775 视频网站
74/03 776 罐子和猫
74/04 777 步美的痕迹
75/09 793 私家侦探 *
75/10 794 遗传信息 *
75/11 795 回归于火焰的命运 *
76/01 796 相约科伦坡 *
76/02 797 错综复杂的谎言与谜题 *
76/03 798 侦探们的夜想曲 *
76/04 799 小孩的好奇心和侦探的探究心 *
76/05 800 立体交错的思绪
76/06 801 完全不笑的人
76/07 802 别摆出那副表情
76/09 804 高木警官送来的礼物 *
77/02 808 迟到的扫墓 *
77/09 815 自己的地盘
77/11 817 灯下的孤影
78/01 818 神秘列车（启程）
78/02 819 神秘列车（隧道）
78/03 820 神秘列车（一等）
78/04 821 神秘列车（交叉）　
78/05 822 神秘列车（拦截）　
78/06 823 神秘列车（冒烟）　
78/07 824 神秘列车（终点）
78/08 825 特别教练 *
78/09 826 消失的密室钥匙 *
78/10 827 解谜的钥匙
未发行单行本漫画
File.842 猫的宅急便 *
File.843 送往工藤家的快递 *
File.850 波本的目的
File.851 茱蒂的追忆 *
File.852 赤井秀一的消息剧场版M 5 通往天国的倒计时（2001年） 
M 13 漆黑的追踪者（2009年）真人版单发第二部 工藤新一的复活 黑衣组织的对决漫画特别篇26/09 寄托于飞艇的愿望（前篇） 
26/10 寄托于飞艇的愿望（后篇） 
26/11 黑衣组织——出现（前篇） 
26/12 黑衣组织——出现（后篇）
使用枪械
PSG-1狙击步枪：
狙击手基安蒂所使用的狙击枪，也可能为PSG-2或3。
伯莱塔M92F（Beretta M92F）：
琴酒的配枪。
勃朗宁大威力M1935手枪：
伏特加的配枪。
雷明顿700步枪：
狙击手科恩所使用。
SIG-P220手枪：
M 13《漆黑的追踪者》中，爱尔兰所使用的枪支。
首脑猜想
对黑衣组织首领身份的猜测，一直集中在旧剧情人物和未出现新人物两点上。《朝日新闻》2006年初的一篇青山刚昌访谈使第一种观点获得了较多支持。并且近期青山刚昌再次透露黑衣组织首脑是已登场人物[2]。人们普遍认为黑暗组织首领会出自以下几个人物：
名侦探柯南里绝对聪明的人有哪些？黑羽盗一（已失踪）、工藤优作、本堂瑛祐（大智若愚）、冲矢昴、黑羽快斗、赤井秀一、阿笠博士、灰原哀、妃英理、詹姆斯·布莱克、琴酒、贝尔摩德、毛利小五郎（大智若愚型，爆发时甚至比柯南还强）、服部平次、世良真纯、羽田秀吉
谁绝对不可能？  黑衣组织1.本堂瑛祐的父亲被组织杀害，且极不熟知内情，否则不会冒冒失失的跑到医院去找他姐姐，所以本堂被排除。 
2. 黑羽快斗只是一个高中少年，心理也不阴暗，成立不了那样一个恶贯满盈的组织，并且在《魔术快斗》中他是因为神秘组织的追查才做起怪盗的（这样警察天天围着他转）。排除。
3.灰原千方百计脱离了杀害她姐姐的组织，还被迫变成小孩子，所以一样排除。 
4.博士已正式否定。 
5.服部平次也一定不可能，但他的身份来历都很清楚，再说如果他是，柯南还能活到现在？
6.琴酒和贝尔摩德都是成员，Boss应该不会自己出马执行任务。琴酒曾因Boss被迫改变行动，而贝尔摩德更是将兰视作自己的天使，并存 在着叛变组织的倾向，把柯南看作银色子弹，所以不可能。 
7.虽说冲矢昴这个人身上的疑点重重，但是柯南对他极度信任，让他住在自己家，甚至说出“福尔摩斯的粉丝绝对不可能是坏人”这样的话，柯南做事很谨慎，再说他家旁边住着好友阿笠博士，柯南不会这么冒险让自己的好朋友和一个不知道底细的人做邻居。
8.世良真纯是新出场的人物，出场次数不多，但是从最近几次出场来看，推理能力和柯南相当，甚至有些事的做法比柯南还不谨慎（似乎是故意作出错误推理来观察柯南的反应），如果真的是Boss，不可能只是柯南的程度。且漫画821、822话中确定世良为赤井秀一的妹妹。一样不可能。
黑羽盗一 
在工藤新一纽约事件中，我们得知有希子和贝尔摩德在一个著名日本魔术师手下成为同门师姐妹，这个魔术师教会了她们化妆术，并多教了贝尔摩德一项技艺：变声。从TV 472～473中可知这个魔术师正是黑羽盗一。 
这样一想，黑羽盗一便存在着许多嫌疑。 
他是宠爱贝尔摩德的，否则不会只教给她变声术，却不教给有希子。 
组织Boss的邮箱，和“七只乌鸦”这首歌有关。其中的信息指明了乌鸦，乌鸦的羽毛是黑色的，自然是黑羽。而且，有一个细节可以参考。柯南是在“奇异屋宇的大冒险”这一集的开头发现boss邮箱秘密，而在这一集的结尾，怪盗基德意外现身，或许是青山有意埋下的伏笔。
在漫画《魔术快斗》的第一集当中，黑羽快斗在17岁的时候发现了父亲的密室,知道了父亲的秘密.而这里面有一个明显的问题，盗一是被人杀死的，那为什么会有这个密室里面那盒说明自己基德身份的磁带？难道盗一未卜先知，知道自己会被人杀了，所以提前做好准备？
怪盗基德被称之为“平成时代的亚森罗平”。亚森罗平是莫理斯·卢布朗笔下的侠盗。而在《怪盗亚森罗平》这本书中， 他的父亲泰奥弗拉斯特·罗平并不像儿子想象的那样是个正人君子。
盗一一开始就很少正面出现，73也未明确盗一未死，只是失踪，另一部漫画《魔术快斗》里，说快斗的父亲是因为一个神秘组织才销声匿迹，可能是他通过这个组织把自己隐藏起来，只是失踪了一样。
不过盗一是另一部漫画中的主要人物，将自己创作的别部漫画中的人物来作为大作《名侦探柯南》中的最终Boss，总觉得不大合乎常理，不过也不排除“借尸还魂”的可能，众所周知，《魔术快斗》首次刊登是在昭和62年SUNDAY26期上，自那以后在SUNDAY本刊或增刊上时有刊登，是不定期连载作品。直到现在还是未完成作品。正因如此，也可以清楚的看出青山老师的画风变化。而《名侦探柯南》中大量引入怪盗基德、黑羽盗一、中森银三、白马探等角色，似乎有将两部作品同化之嫌，怪盗基德的生日与青山刚昌的同属一天，更看出青山对《魔术快斗》难以割舍的感情。
但除非《魔术快斗》和《名侦探柯南》合并，否则黑羽盗一不可能是组织Boss。
工藤优作
具有超过柯南的推理能力，还有在美国的神秘生活。组织磁盘中存有以他作品主人公相似命名的“暗夜男爵”病毒，还有他的妻子有希子是组织成员苦艾酒的好友。种种迹象表明，工藤优作和组织似乎也有一些瓜葛。另外柯南每每能够在与组织对抗的绝境中不可思议的逃生，是不是因为组织成员得到优作的授意不得伤害柯南呢？另外，灰原哀的那句话，“你（新一）早在半个世纪前就在组织的计划中了”也让人颇费思量。半个世纪前，新一肯定没出生，那就只能证明组织和工藤优作有着某种联系。（半个世纪就是50年，优作才39～45岁，50年前也没有他吧？）而且没有必要给新一灌下APTX4869，这样岂不是让新一发现了组织的存在成为组织的劲敌，使这个神秘的组织遭到危险。而且琴酒本人是见过那位先生的，没有必要这样对待BOSS的儿子，而且M13中爱尔兰说如果不把你带去见BOSS，他是不会相信的，工藤优作不是早已知道新一变小的事情了吗？
其他可疑人物：
毛利小五郎
也有人相信毛利小五郎才是黑衣组织的首领。一个很好笑的理由是组织的成员代号都是酒名，而毛利大叔很喜欢喝酒……此外毛利大叔有时忽然爆发的推理能力也使人生疑，觉得他一直在装糊涂或者是大智若愚。
其实毛利大叔的嫌疑是最小的。在TV425中，琴酒曾下令枪杀毛利小五郎。见过“那位先生”本人的琴酒，恐怕不会下令杀死组织的首领吧……
詹姆斯·布莱克
作为赤井秀一和茱蒂的上司，FBI探员詹姆士也有些奇怪的地方。例如在他初登场时，柯南注意到他的名字和莫里亚蒂教授同名而且生于伦敦，同时又来自曾经黑帮横行的芝加哥，而姓氏恰恰是英语的单词“黑”（詹姆士·布莱克，即James Black ）。之后詹姆士也有一些奇怪的行为，使人产生一些联想。
难道黑衣组织老大在FBI，还要指挥FBI打自己的组织吗？最重要的是詹姆斯知道水无怜奈的身份，为什么会不除掉？当然原因有可能是因为FBI和黑衣组织都是詹姆斯实现利益的工具，而他不除掉水无的原因很可能为了以此掌握CIA在日本的活动。
常盘荣策
425集中提到的东京大学教授，曾开发多种药物而备受好评，还是黑暗组织刺杀对象——土门康辉的政敌。有足够动机和社会关系构建一个巨大组织。
山村美砂绘
山村警官的祖母,现居住在鸟取。而苦艾酒与上级联络时地址正出自鸟取。年龄也符合半个世纪前的说法。
乌丸莲耶
219集里侦探们提及的大富豪，此人从未正式出场，但有很多地方相当可疑
1）乌丸莲耶死于半个世纪前，和组织在50年前就开始行动的说法很相近
2）乌丸莲耶的家徽是乌鸦，乌鸦是黑色，组织的颜色也是黑色，并且BOSS的邮件地址按键音是《七子之歌》（又叫《七只乌鸦》），组织又称为乌鸦军团
3）乌丸莲耶对外宣称百岁死亡，实际建立组织开发能使自己“长生不老”的药物而隐匿于世，该药物的半成品可能就是APTX4869
4）乌丸莲耶是大富翁，有资本建立一个具有一定规模的恐怖组织
5）小哀曾经和柯南提到过，组织在半个世纪以前就和他们有着千丝万缕的联系了……同第一点猜测，乌丸莲耶因此极有可能是组织创始者。
6) 从千间降代的话中可以推测这个乌丸莲耶是个心狠手辣之人。如果他请来的科学家们没有解开谜团他就要通通杀光，这样凶狠的做法不是与“宁可错杀一千不可放过一个”组织作风极其相似么？
在日本拥有很大权力的人
每次黑衣组织犯案，为什么警察不知道或者没有制止呢？这说明在黑衣组织背后拥有很大权力的人。而美国政府或者FBI的人却知道，并且深入内部调查，如果黑衣组织背后的人没有很大权力，美国是不会理睬这件事的。
其他可疑对象：
远山银司郎（远山和叶的父亲）、铃木史郎（园子父亲，有组织大型黑帮的本钱）、Mr.正影（406集中提到的知名魔术师，目前柯南唯一的失踪者）、服部平藏（是警官，而且还很聪明）、木之下芙纱绘、植松龙司郎（帝丹学校校长）、乌丸莲耶或其后人、羽田秀吉、妃英理、京极真、警视总监（有足够权力终止对黑暗组织调查）、日本政府。
主线剧情
Gin&Vodka初次登场，让新一一夜之间缩小变成了柯南，住进了小兰家里。（《云霄飞车杀人事件》）
《奇怪的寻亲杀人事件》中宫野明美第一次也是最后一次正面出场。柯南对组织有了初步认识。
兰第一次怀疑柯南的身份，阿笠博士帮忙解围。（《每月一份礼物威胁事件》）
Gin&Vodka再次登场，柯南知道了二人的代号。
新一再次登场！就此知道了感冒+白干能使他恢复原状，不过时间不长。
Tequila登场，旋即被炸死。原来组织在寻找程序设计员。
小兰再一次怀疑柯南身份，这次是有工藤有希子帮的忙。
（Kid闪亮登场。究竟基德在柯南里只是客串还是最终会和主线联系上还是未知数）
灰原登场亮相。柯南第一次知道了药的名字是APTX4869。药的资料却由于病毒“暗夜公爵”灰飞烟灭了。
从灰原那里得知了组织的计划始于半个世纪前，但究竟是什么不得而知了。“人是不能违逆时光洪流的”，这句话在后面还会出现。
新出医生登场，谁也不会想到，一场看似普通的谋杀案竟然会为近二十卷之后才出现的情节埋下伏笔。
峰回路转，高潮迭起的《与黑衣组织的再次重逢》！灰原解释了APTX-4869原来是细胞程序性死亡。Vermouth在这里第一次露面。皮斯克与灰原的父母很熟悉，药的开发在灰原父亲的时代就开始了。GIN提到了“那位先生”，在以后会经常出现。柯南官网-黑衣组织事件簿(10张)
兰再一次怀疑柯南的身份，这一次的情节被很多柯迷奉为经典。
茱蒂老师登场，身份可疑的外国女人。
在人鱼岛上发现了宫野志保的签名，究竟有何隐情？
Vermouth再次露面，“黑的和黑的混在一起，只会变得更黑”。茱蒂，新出同时出现在了巴士上，令灰原感到了前所未有的恐惧。赤井秀一第一次登场。
熊猫车事件，Mr Black登场。灰原在与赤井擦肩而过的瞬间竟然露出了恐惧。
赤井出现在了佐藤相亲的地方，继而又在监视侦探事务所，究竟有何目的？茱蒂老师提到“FBI”。
Vermouth的箭靶上贴上了柯南，兰，灰原的照片。柯南和平次去拜访茱蒂老师，可是神秘的女人还真不容易参透。 （《英语教师VS西部名侦探》）
金苹果事件隆重登场！时间回到一年前，当时的赤井还是一头长发。沙朗登场，她和有希子曾经同门学过易容。新一和兰救了杀人魔，一处精心准备的伏笔。（《工藤新一纽约事件》）
白色的雪，黑暗的影子，黑衣组织再度出场，这次他们的目标是程序设计师板仓。柯南和GIN的第一次正面交手，柯南一度陷入危机，可最后不知是GIN放水还是疏忽，柯南侥幸逃过一劫。板仓的日记里内容丰富，有“态度高傲讨厌猫的女王”，还有“我们要违逆时光的洪流，让死人复活”。组织的目的起始浮出水面。（《与黑衣组织的接触》）
可疑的人物的活动更加频繁了，看不见的包围圈正一步一步缩小，于是灰原又感冒了。明美在人们的回忆里再度登场，留给了妹妹几盘录音带，可是内容只有灰原知道了（尤其是最后使哀吃惊的留言）。灰原的父母浮出水面，“Hell Angel”由此而来。 （《厕所里隐藏的秘密》）
满月之夜的二元推理！精彩的高潮，揭开了很多的谜题，许多人物的身份水落石出，但是又提出了新的悬疑。vermouth的手机按键音成了日后剧情发展的新线索。
原来那个手机按键音是《七个孩子》的开头音乐。
与黑衣组织魔掌碰触的瞬间，组织的成员Kir、Chianti、Korn登场。本堂瑛佑登场，在以后的发展中，他和水无怜奈成为了主要线索。 （《黑暗冲击！组织魔爪伸出的瞬间》）
血型疑案自此而始。
红与黑系列，新的高潮出现。小兰的新同班同学本堂瑛佑总给柯南不好的感觉，他四处寻找自己的姐姐本堂瑛海，本堂瑛海与水无怜奈长相一摸一样，但是血型不对。黑衣组织四处寻找水无怜奈，得到FBI帮助的水无怜奈假装昏迷不醒，被本堂瑛佑袭击后不得不说出真实身份，原来水无怜奈就是本堂瑛海，代替被杀的父亲成为CIA的卧底，水无怜奈答应赤井秀一重新返回组织，但是接到的第一个任务就是杀死赤井秀一。赤井秀一疑似牺牲。
水无怜奈向茱蒂透露情报，组织派出了一个厉害的侦探波本。工藤新一的房子里搬来新房客，名为冲矢昴。据灰原哀反应来看此人来头不小。他到底是组织的卧底波本还是重生的赤井秀一？
脸上带着烧伤的伤疤、疑似赤井秀一的人出现，右眼有着明显的被火烧伤的伤疤。在最后此人捡起了抢劫犯的手枪，在柯南被抢劫犯劫持的紧张时刻，开枪救了柯南。根据漫画，此人为右撇子。
真秀一又给在商场的茱蒂老师留下“这里很危险，快逃”的字条。此时冲矢昴也在商场，昴首次见到了伤疤男。而伤疤秀一将在商场发生的案件的推理用别人的手机发给了毛利小五郎。伤疤秀一在被基安蒂瞄准时对着瞄准镜露出诡异的笑容，使基安蒂大为惊讶。之后琴酒下令撤退，并通过最后一句话暗示出，琴酒已相信秀一已死。
在之后，世良真纯出场，行为十分诡异，和FBI很熟。疑似赤井妹妹。接着，安室透登场，成为小五郎弟子。
当柯南被劫持时，世良、安室、冲矢昴共同出现并平复危机。灰原在此过程中，感到一种恐怖的力量。在拦截犯人后，安室一句“为什么会在这？”令人费解。是针对冲矢昴的出现，还是另有其人。同时，冲矢昴、世良、安室的手机同时响起。架桥上，Vermouth对着电话的那头说道“Bourbon”。Bourbon已在这三人之中，越来越接近着灰原和柯南。（《侦探们的夜想曲》）
高木警官在去坟墓前看望死去的前辈时，安室透在后面盯着。　　
在一次事件中，少年侦探团被困在房间里，房间里的斧头只有大人才有力量使用，于是灰原服用APTX4869解药恢复。但是被少年侦探团用手机找下了照片，少年侦探团为了感谢救他们的人，便把照片发送给小五郎，让他帮忙查，但是却被安室透看到。同时也被世良真纯以及冲矢昴看到。又因为照片上灰原戴着“神秘的巴士指环”，所以，此时3人都已经知道了灰原接下来的行踪！
少年侦探团、小兰、世良真纯、安室透、冲矢昴齐聚在“贝尔茨利”（神秘列车）！灰原在不经意间看到了脸上带有烧伤疤痕的“赤井秀一”，此处也间接证明了汇源之前认识赤井。而冲矢昴和一个“神秘女子”在同一个房间。而就在此时，Gin&Vodka在此次列车的终点站“迎接”雪莉！
灰原接到了Vermouth给自己发的短信，内容为：做好觉悟了么？于是灰原一个人出去，对着APTX4869回忆起了一段妈妈的留言。她妈妈留言主要是说APTX这种药是不能被制造的！
冲矢昴看到了灰原，并且说“不愧是姐妹啊，对你的行为了如指掌，来吧，快到我的地盘来！”灰原以为自己会被杀，努力的逃跑......　　
在列车的走廊上，伤疤男“赤井秀一”与“神秘女子”交错。之后世良真纯跑了过来，质问伤疤男是谁，伤疤男说世良还是老样子没变。于是世良叫出了：“秀、秀哥哥，可是我听说你不是死了么？”这样一句话。但伤疤男之后就把世良真纯电晕，并说：“我也想知道这是为什么”　　
第一现场：此时的柯南正在解决杀人案件。第二现场：伤疤男准备跳下火车。在这时，神秘女子进来。两个人的身份也揭晓，神秘女子就是柯南的妈妈藤峰有希子，而伤疤男就是Vermouth。在两人的谈话中，揭示了：1.莎朗就是Vermouth。2.Vermouth不跟组织交代柯南变小的事情还有一个很大的原因。第三现场：冲矢昴把世良真纯抬进了房间。
Vermouth在此时释放了一个烟雾弹，让所有人以为是火灾。此时，安室透出现了，并对着“恢复”成“宫野志保”样子的“灰原”说：我就是Bourbon。烟雾中，又出现一个人，赤井秀一！
就在神秘列车事件之后不久，柯南与安室透再度相遇，这一次柯南引起了安室透的注意……
有一次少年侦探团为了追一只猫误入一辆装有尸体的运货车中，中途柯南曾通过那只猫将信息传递给安室透，后来因安室透迟迟无动静，柯南又将碰巧在车上的送往博士家的蛋糕的运送地址改为自家的地址，显然是希望冲矢昴能察觉此事，结果最后安室透找到了被风吹走的信息并赶到工藤宅前救了大家。最后安室透走时冲矢昴透过窗户目送他离去，目光中似有深意……
最新的漫画中茱蒂老师又出场了，这次柯南告诉了她关于之前的伤疤赤井的真相。安室透则化装成之前在银行劫案中出现过的一个人质出现，寻机往茱蒂的袖口中装入窃听器，而后贝尔摩德又不动声色地回收了窃听器。安室透说自己听到了意料之外的内情，“意料之外的内情”究竟指什么？他又称柯南为“可怕的男子”，是否发现了什么？当茱蒂对着商场事件中“赤井”给她留下的字条沉思时柯南在心中默默说出“对不起”且脸露微笑，这又是为了什么？