标题：杜红丽
个人简介
杜红丽，[1]1995.9－1999.7：华南农业大学 畜牧 学士
1999.9－2002.7：华南农业大学 动物遗传育种 硕士
2002.9－2005.7：华南农业大学 动物遗传育种 博士
2003.8－2003.10：华中农业大学动物遗传国家重点实验室学习基因组相关技术
2006.1－2009.8 华南理工大学 讲师
2006.5－2006.8 中国医学科学院生物技术研究所进修
2009.9－至今 华南理工大学 副教授
教学科研情况：
博士期间利用比较基因组学将21个功能基因定位在猪繁殖性状的QTL区间。2006年1月至2009年8月，主要从事工业酶理性设计和改造研究，通过蛋白质结构生物信息全理性设计将木糖还原酶依赖的辅酶从NADP改成NAD。2009年9月定职为华南理工大学副教授，主要从事食蟹猴功能基因组学和生物信息学的研究。参与了华南新药创制中心、华大、华南理工大学等单位合作的食蟹猴和中国恒河猴基因组项目，并以重要作者身份在《Nature Biotechnology》发表论文。继食蟹猴基因组项目完成之后，与国际几乎同步开展利用人外显子芯片测食蟹猴外显子组的研究，文章已投到PloS ONE。迄今为止，共发表论文38篇，其中SCI论文17篇。参与编写《食品与基因工程》论著，3.5万字。主持或完成了1项国家级、2项省级、1项市级和3项校级科研项目，参与了多项国家自然科学基金和863项目。主讲《生物化学》、《分子生物学、《系统生物学》等课程。
研究兴趣：
本人先后经历过动物分子遗传和基因组、蛋白质结构生物信息学和酶分子改造、基因组生物信息学和生物医学等多方面的研究和学习，目前随着基因组技术的发展，积累了海量的全基因组或表达谱数据，基于此，我主要的研究兴趣有两方面：（1）食蟹猴功能基因组和疾病模型相关的研究；（2）利用交叉学科的思维和生物信息学的方法研究热点、难点生物学（或生物医学）问题的分子机理。
发表论文：
1. Li Y, Zheng H, Luo R, Wu H, Zhu H, Li R, Cao H, Wu B, Huang S, Shao H, Ma H,Zhang F, Feng S, Zhang W, Du H, Tian G, Li J, Zhang X, Li S, Bolund L,Kristiansen K, de Smith AJ, Blakemore AI, Coin LJ, Yang H, Wang J, Wang J. Structural variation in two human genomes mapped at single-nucleotide resolution by whole genome de novo assembly. Nature Biotechnology. 2011,29(8):723-730（SCI IF=31.1）
2. Yan G, Zhang G, Fang X, Zhang Y, Li C, Ling F, Cooper DN, Li Q, Li Y, van Gool AJ, Du H, Chen J, Chen R, Zhang P, Huang Z, Thompson JR, Meng Y, Bai Y, Wang J, Zhuo M, Wang T, Huang Y, Wei L, Li J, Wang Z, Hu H, Yang P, Le L, Stenson PD, Li B, Liu X, Ball EV, An N, Huang Q, Zhang Y, Fan W, Zhang X, Li Y, Wang W, Katze MG, Su B, Nielsen R, Yang H, Wang J, Wang X, Wang J. Genome sequencing and comparison of two nonhuman primate animal models, the cynomolgus and Chinese rhesus macaques. Nature Biotechnology. 2011, 29(11):1019-23. （SCI IF=31.1）
3. Du H, Hu H, Meng Y, Zheng W, Ling F, Wang J, Zhang X, Nie Q, Wang X. The correlation coefficient of GC content of the genome-wide genes is positively correlated with animal evolutionary relationships. FEBS Letter. 2010, 584(18):3990-4（SCI IF=3.5）
4. Du HL, Chen J, Cui JX, Wang XN and Zhang XQ. Polymorphisms on SSC15q21-q26 containing QTL for reproduction in swine and its association with litter size. Genetics and Molecular Biology, 2009, 32(1):69-74（SCI）
5. Du HL, Chen J, Zhang YS, Zhang XQ. Molecular cloning, mapping, and polymorphism of the porcine SCG2 gene. Biochem Genet, 2008, 46 (3): 369-379.（SCI）
6. Du HL, Chen J, Cui JX, Zhang YS, Yerle M, Milan D, Zhang XQ. Radiation hybrid mapping and sequence analysis of 21 genes on porcine chromosome 15. Anim Genet, 2006, 37(2):181-183.（SCI IF=2.6）
7. Zeng QK, Du HL（并列第一）, Wang JF, Wei DQ, Wang XN, Li YX, Lin Y. Reversal of Coenzyme Specificity and Improvement of Catalytic Efficiency of Pichia Stipitis Xylose Reductase by the Rational Site-directed Mutagenesis. Biotechnol Lett. 2009, 31(7):1025-9（SCI）
8. Fang M, Du H, Hu Y, Zhou X, Ouyang H, Zhang W, Jia X, Li J, Wang Y, Nie Q, Zhang X. Identification and Characterization of the Pig ABIN-1 Gene and Investigation of its Association with Reproduction Traits. J Genetic. 2011, 90(1):e10-20
9. Zhang YS, Du HL, Chen J, Yang GF, Zhang XQ. Porcine growth differentiation factor 9 gene polymorphisms and their associations with litter size. J Genet Genomics, 2008, 35 (3): 163-169.（SCI）
10. Cui JX, Du HL, Liang Y, Deng XM, Li N, Zhang XQ. Association of Polymorphisms in the Promoter Region of Chicken Prolactin with Egg Production．Poultry science. 2006, 85(1):26-31.（SCI Impact Factor=2.1）
11. Zhen FS, Du HL, Xu HP, Luo QB, Zhang XQ. Tissue and allelic-specific expression of hsp70 gene in chickens: basal and heat-stress-induced mRNA level quantified with real-time reverse transcriptase polymerase chain reaction. British Poultry science. 2006, 47(4):449-455.（SCI Impact Factor=1.3）
12. Wang JF, Wei DQ, Lin Y, Wang YH, Du HL, Li YX, Chou KC. Insights from modeling the 3D structure of NAD(P)H-dependent d-xylose reductase of Pichia stipitis and its binding interactions with NAD and NADP. Biochem Bioph Res Co. 2007, 359(2):323-329.（SCI Impact Factor=3.0）
13. Ling F, Li J, Chen Y, Du H, Mei Y, Mo D, Wang C. Cloning and characterization of the 5'-flanking region of the pig adiponectin gene. Biochem Biophys Res Commun, 2009, 381(2):236-240（SCI IF=2.8）
14. Jin X, He M, Meng Y, Sun F, Du H, Wang J, Wang X. Sequencing of Cynomolgus/crab-eating monkey and Chimpanzee reveals successfully use of human based exome chip in non-human primates. PLoS ONE. Submitted, 通讯作者
15. 杜红丽，王靖方，曾琦锴， 凌飞，魏冬青，林影，王小宁．木糖还原酶定点突变设计的生物信息学分析．华南理工大学学报(自然科学版), 2008, 36(12):122-127. 
16. 杜红丽，陈静，张玉山，崔建勋，张细权．二花脸与杜洛克繁殖相关基因表达差异分析．华南农业大学学报, 2008, 29(2):99-103
17. 杜红丽，崔建勋，张细权．利用DNA池和测序技术快速筛查候选效应单倍型．农业生物技术学报, 2008, 16(2):281-285
18. 曾琦锴，林影，翟志臣，林小琼， 杜红丽．木糖还原酶Lysine270突变的理性设计．华南理工大学学报(自然科学版), 2009,37(6):79-83（通讯作者）
19. 郑维豪， 杜红丽，林志强，闪莹，王小宁． 猪肺泡巨噬细胞感染PRRSV进程中差异表达基因及基因功能富集分析．基因组学与应用生物学, 2010, 1039-1046 （通讯作者）
20. 郑维豪，林志强，卓敏，杜红丽，王小宁．抗流感病毒小RNAs研究进展． 遗传, 接收（通讯作者）
主持项目：
1. 广东省自然科学基金：木糖还原酶和木糖醇脱氢酶定向分子进化研究（2006.10-2009.10）
2. 国家“863”项目：药物代谢酶SNPs与药物的类药性一体化预测软件的研究与开发（2008.1-2011.12）
3. 华南理工大学中央高校基本科研业务面上项目：鸡输卵管组织特异性启动子分离鉴定（2010.1-2011.12）
4. 广东省科技计划项目：食蟹猴免疫和疾病相关基因库及MHC等位基因信息库的建立（2010.10-2012.10）
5. 华南理工大学中央高校基本科研业务费重点项目：食蟹猴2型糖尿病模型构建的遗传标记研究（2011.01-2012.12）
6. 十二五重大专项：人类重大疾病灵长类动物模型资源平台的建设（2011－2013）