标题：根腐菌
简介
学名：Phytophthora cinnamomi Ronds (1922)
同种异名：
俗名：phytophthora root rot(English), Phytophthora Faeule der Scheinzypresse(German)
类别：真菌
根腐菌是一个广泛分布的土壤病菌，会传染木本植物引起根部腐烂与溃疡。它需要潮溼的土壤与温暖的温度，特别容易侵害敏感植物(例如夏季乾旱受损植物)。根腐菌威胁林业、园艺业与水果业，而且超过 900个木本多年生的树种被传染。诊断的技术很昂贵而且需要专家的确认。一般用预防与化学方法来减少根腐菌的冲击。
物种描述：
Pryce等人(2002)报告说， P. cinnamomi是一个毁灭性、广泛分布的土壤病菌，能感染多种树木(Zentmyer 1980)。 P. cinnamomi能藉著厚膜孢子传播，也能在水中藉著游动孢子传布。藉著土壤或者根部的实验室分析，虽然可以找出这种大型真菌，但它对破坏植物的影响显著易见(Parks and Wildlife, 2004)传染时常造成植物死亡，早期的症状包括枯萎、枯黄与树叶变乾，与嫩根变黑，有时连大的根也变黑。因为它的根被损害，所以不能从土壤吸收足够的水份，结果可能死亡(Botanic Gardens Trust, UNDATED)。 Robin 等人(2001)报告说， P. cinnamomi引起水缺乏症状能造成树死亡，伴随著慢或突然的衰退。在( Q. rubra与 Q. robur)病原体引起的初期症状，包括细根损害，进而损害较大的根与树干引起溃烂，但是没有描述到缺水的情况(Moreau & Moreau, 1952; Robin等人, 1992)。 Bergot等人(2004)报告说， 最初的伤害在树根、髓心逐渐往树干中上发展，而且疾病造成典型地树干溃疡渗出组织液，因此命名『 墨水疾病 』 。由於P. cinnamomi事实上是在在内皮层组织中发展，而不是木质中，橡树保持过去传染的疤痕在形成层中形成坏死(疤痕)。
相似种：Phytophthora katsurae, Phytophthora manoana, Phytophthora nicotianae var. parasitica, Phytophthora colocasiae, Phytophthora palmivora, Phytophthora cambivora, Phytophthora drechsleri, Phytophthora parasitica, Phytophthora cactorum, Phytophthora castaneae, Phytophthora citrophthora, Phytophthora infestans, 
栖地描述：
P. cinnamomi活动需要湿润的土壤条件和温暖的气候，但疾病造成的损害往往发生在夏季，植物受乾旱所苦的时候。Menge(1998)指出，排水欠佳，粘土含量高，水位高，底部坚硬，黏性高的土壤或灌溉、降雨后的水池，在历史上一直与P. cinnamomi的严重危害有关。
一项1995年至1998年期间进行的调查研究，在四个葡萄牙地区调查有无 P. cinnamomi。树木衰退的严重程度，猝死和地区特性，在各种条件下进行评估。分析调查结果显示：有56%的调查植物感染了真菌病原体； 主要是杜鹃花科，半日花科和豆科的植物； 真菌病原体的恢复较常见於浅的土壤中； 生产力与矿物质含量低的土壤，特别是磷含量低时，似乎特别容易受传染，此外面向南方的地点也出现较多的 P. cinnamomi，山坡坡与山谷也比山顶多(Moreira&Martin, 2005)。
主要影响
根腐菌(Phytophthora cinnamomi)是 Phytophthora属中最具毁灭性的种，会造成林业、园林与水果植物，以及大约 900种多年生木本植物的族群消减(Ferraris等人, 2004)。
商业企业例如农业项目与相关的植物业，受到 P. cinnamomi真菌不利的影响，例如，在意大利，它被越来越频繁地报导：首先发现在栗色灌木林与杜鹃属的植物上，也发现在苗圃及最近发现在栗子和扁柏苗圃和鳄梨、橡木、胡桃木和高灌蓝莓。 P. cinnamomi会感染橡树，推测 P. cinnamomi在一般的地中海区域与橡树的严重衰微有关(Robin 等人, 2001)。病原体也在非洲大陆造成严重的损害，被认为是南非鳄梨果园最严重的疾病，造成根部腐烂，严重减少农作物生产量(Bezuidenhout等人,1987)。
P. cinnamomi对原生植物的影响间接影响野生动物。根据 Rudman(Undated)，到现在为止，澳洲塔斯梅尼亚181种植物，已经被记录为 P. cinnamomi的宿主。塔斯梅尼亚受威胁植物至少 39 种易受 P. cinnamomi感染，受传染区域的本土物种可能会快速死亡，无法再生。这种情况在其他地区有很大的差异，P. cinnamomi的不同宿主，有些显示出抵抗性，有些则非常脆弱。
P. cinnamomi有可能对北美原生生物群落造成重大生态破坏，从加州到阿巴拉契亚山脉。举例来说，一项 Ione 石兰科常绿灌木( Arctostaphylos myrtifolia)枯死的科学研究发现， P. cinnamomi病原体是致死的元凶。病原体引起原生植物枯萎，树叶乾枯与根部坏疽，一般相信它会严重影响已经濒危的 A. myrtifolia(Swiecki and Bernhardt 2003)。(Ione 石兰科常绿灌木是在内华达山脉的山麓小丘，加州中被局限於 Ione 形成土壤的一个稀有、透过皮肤发生作用、以及常绿的灌木)。另一个案例是 P. cinnamomi正在影响本地加州湖霍奇周围的森林， 27% 的生存於海岸地区的橡树(Quercus agrifolia)，依显示疾病症状而推测感染病原体(Garbelotto 、 Huberli 与 Shaw 2006)。美国西部的所有自然橡木森林都可能因病原体而濒临生态损害的危险，Garbelotto, Huberli and Shaw(2006)的研究，有助於瞭解疾病因子(敏感度，其他害虫)，最终可能会有助於减少疾病的传播。美国其他地方的病原体也造成生态破坏。例如北美东部的阿巴拉契亚森林，板栗森林在正在挣扎求生，这种情况部分归因於 P. cinnamomi的影响。虽然栗疫病历来与板栗枯死关系密切，板栗复原的主要障碍是Phytophthora属的卵菌病原体。最近在阿巴拉契亚森林种植的板栗幼苗死亡率很高，经由标准的诊断方法诊断出Phytophthora(Rhoades等人, 2003)。
注解说明
Robin等人(2001)报告说，田野中的积水增加 P. cinnamomi引发疾病的严重性(Fagg等人, 1986)。在实验控制下，当积水增加或者在接种的时候积水，会使 P. cinnamomi引起的病变长度增加(Davison&Tay, 1987)。而且，积水加上缺氧，会直接影响P. cinnamomi，减少菌丝生长与胞子囊生产(Davison&Tay, 1986)。野外骤雨造成偶然的积水，加上夏季的乾旱，这种情况可能连续发生，所以当被P. cinnamomi感染的时候，橡树很容易致病，导致其衰退的命运。
Bergot等人(2004)报告说，疾病发展容易被寒冬阻碍，已知 P. cinnamomi对冰点以下的低温敏感(Benson, 1982)。在病原体上的致命的霜冻影响，被 Delatour 提出可能是在橡树中限制疾病范围的主要的因素(1986)。
地理分布：
原生地：东南亚.(Bergotet al.2004)
已知引进地区：大洋洲-太平洋、欧洲、北美洲与南非.(Hansen, 2003; Bezuidenhout等人, 1987)
管理资讯：
Drenth等人, 2006 描述发展与一个能发现，而且确认 27 不同的 Phytophthora物种的以 DNA 为基础诊断的化验的确认。
有关预防方法，化学、物理,生物控制选择, 请参阅 管理资料.
食物营养：
P. cinnamomi的食物来源是活体植物的根与基生茎组织(Department of Primary Industries, Water and Environment, 2004)。
繁殖资讯：
Botanic Gardens Trust(Undated)提到，小型游走芽胞被释放，吸附到植物根部，通常在根顶端后面。P. cinnamomi所有的孢子与结构很小，肉眼看不到。光靠视觉，无法判定土壤中是否有病原体。 P. cinnamomi经由根部生长，破坏组织，使其无法吸收水与养份。更进一步，孢子囊释放出游走孢子，特别是当土壤潮溼、温暖时，游走孢子随即释入土壤中。因此，游走孢子的数量迅速增加。游走孢子在水中移动，进而传染附近的植物，尤其是传染源下坡的植物。这些孢子容易经由暴风雨、河水、受污染的土壤、工具、鞋类与车辆传播。还有两种孢子类型可能被生产出来：厚膜胞子与卵胞子，那是当食物来源被用尽或低温、乾旱的不利情况发生时，产生的生存结构。这些孢子能够长时间存活，当情况变好时，他们会发芽、更新生命周期。这种能力，让 P. cinnamomi可以在死亡的植物组织内，存活好几年 。
生命周期：
澳洲土地保护管理局(2003)提到：菌丝线(或者菌丝)在情况温暖、潮溼时会在土壤中或植物宿主中，形成真菌体，以无性生殖的方式，生产微孢子袋叫作孢子囊与厚膜孢子。不同交配类型的菌丝可能长在一起，生产厚壁有性孢子叫作卵孢子。游走孢子具有鞭毛，能使他们游动非常短的距离(25~35 mm)，在静止的水域中或者在土壤毛孔中。水流可以把他们带到长距离之外。游走孢子的生命期短又脆弱，但是产量很大，可导致大量新的传染。当游走孢子移动经过土壤，他会吸附到植物的根尖，在根尖定居、形成胞囊与发芽产生发芽管穿透根。然后菌丝在受害植物的根里面生长，并可能经植物根部连结点传播开来。从根部传播是 P. cinnamomi的主要传布方式。厚膜孢子是大型孢子，生命力强、寿命长。(在死的植物与土壤里面)他们在乾燥时，从植物根部长出来，是耐久的，休眠真菌。他们可能是在根部或土壤传播，然后发芽引起一个新传染，当他们遇到温暖、潮溼的情况。发芽的厚膜孢子可以生产孢子囊、更多的厚膜孢子，或菌丝，直接传染给植物的根。在传染之后，菌丝经由根部组生长，引起细胞崩溃与腐烂。病原体延伸到受害植物的主根内，而且可能环绕树干的基底。由於根的运送系统阻塞，植物出现死亡。各种不同的环境因素控制根里面菌丝的生长率。举例来说，当植物组织的含水量在 80% 之下的时候，很少生长。非常受害的植物，例如山茂木，可能数星期即死亡，而在一般的受害植物，例如 jarrah，传染后可能会在一年后才死亡。一般的受害植物有能力阻绝更进一步的传染，避免菌丝的传布，成功率不一而定。[1]