标题：中国科学院微生物研究所
简介
中国科学院微生物研究所于1958年12月3日由中国科学院应用真菌研究所和北京微生物研究室合并成立。40多年来，研究所已发展成为我国微生物学研究领域中学科齐全、水平最高的国家级研究机构  中国科学院微生物研究所。现有在职职工人数290余人，包括中国科学院院士5人，专业技术人员240人左右；在学研究生300余人及部分客座流动人员。以微生物所第一任所长戴芳澜院士以及邓叔群院士、阎逊初院士为代表的老一辈科学家，是我国真菌学、放线菌分类学的创始人和奠基人，他们的研究成果和经典著作至今仍在微生物学界具有很高的权威性；以方心芳院士为代表的老一辈工业微生物学家为我国微生物发酵产业作出了奠基性贡献。多年来，我所科学家在植物病毒、医学与动物病毒以及免疫学研究方面在国际国内做出了自己的特色，颇有造诣。
发展目标
根据中科院创新试点工程的要求和微生物所的长远发展目标，确定了以微生物资源、工业与应用微生物、病原微生物与生物安全及免疫为主要研究领域，旨在建立从资源开发、技术创新到成果转化的研发体系，努力为提升我国微生物产业创新发展能力做出基础性、战略性和前瞻性贡献。
研究资源
目前研究所拥有微生物资源前期开发国家重点实验室、植物基因组学国家重点实验室（与遗传与发育生物学研究 所共建）和中国科学院真菌、地衣系统学重点实验室；设有微生物资源、能源与工业生物  中国科学院微生物研究所技术、微生物基因组研究、环境生物技术、微生物代谢工程、分子病毒和分子免疫等研究中心和一个为科研服务的技术与信息中心。拥有亚洲最大的具有40万号标本的菌物标本馆和一个国内最大的具有17000多株菌种的微生物菌种保藏中心，是世界知识产权组织批准的布达佩斯条约国际保藏单位。同时还有一个藏书6万余册的专业性图书馆。
所获成就
40多年来，研究所共获省部级以上科技奖170项，其中国家奖29项。发表论文3000余篇，其中SCI论文250余篇，包括国际顶级学术杂志《Cell》和《Science》等，出版专著100余部；申请专利100多项，授权62项。
90年代世界上第一篇“系统遗传学（system genetics）”概念与术语和世界上第一篇转基因禽类输卵管生物反应器（oviduct bioreactor）论文。中国最早引进质粒、DNA合成与测序仪、mRNA差异显示仪的生物技术实验室，参与组织96年第一届国际转基因动物学术研讨会引入系统论方法的生物技术研究，也是90年代国际上最早论述生物系统论和实验、计算与工程方法整合的生物系统、人工生物系统研究 - 现代系统生物学概念的实验室，国际系统生物学、合成生物学兴起于21世纪初。
相关单位
在微生物研究所挂靠的单位有中国微生物学会、中国菌物学会、中国生物工程学会。微生物所和上述有关学  中国科学院微生物研究所会编辑出版的学术刊物有《微生物学报》 、 《微生物学通报》 、 《菌物学报》及《生物工程学报》 。
学术委员会
微生物所第八届学术委员会
主任:方荣祥 副主任：刘双江 东秀珠
学位委员会
主席：谭华荣 副主席：庄文颖
委员：
方荣祥 车永胜 东秀珠 田波 庄文颖 刘双江
刘文军 张树政 郑儒永 金城 夏桂先 高福
黄力 谭华荣 魏江春  中国科学院微生物研究所
分子病毒研究中心
分子病毒研究中心主要从事人与动物重要病毒、尤其是突发与新生病毒或动物源性病毒的分子进化、致病性、跨物种传播以及抗病毒药物等方面的研究。 具体研究方向分为：
（1）乙型肝炎T-细胞分子免疫及囊膜病毒融合机制和融合抑制剂的研究。  中国科学院微生物研究所（2）禽流感病毒的感染机理及基质蛋白M1与人类宿主蛋白之间相互作用的研究；
（3）猪流感病毒、鸡传染性支气管炎病毒、鸡传染性法氏囊病毒等几种主要畜禽病毒病原的分子进化研究平台的建立；
（4）抗病毒药物的研究，包括猫ω干扰素及其它宠物干扰素的开发和改造以及新型纳米抗体等多种新型抗病毒药物的研究；
（5）基因治疗药物的研发。
分子病毒研究中心在研项目共20项，其中国家973项目6项、国家攻关项目4项、国家自然科学基金项目1项、横向合作5项，国际合作4项。
2005-2006年期间，于国内外学术刊物发表论文共38篇，其中SCI论文35篇。申请专利14项，授权1项。
微生物资源研究中心
中科院微生物所微生物资源中心是由"微生物资源前期开发国家重点实验室"、"中科院真菌地衣系统学开放实验室"和"微生物菌种保藏中心"三部分组成。在系统调查、收集和保藏不同环境微生物(包括细菌、古菌和菌物)及其基因资源的基础上，开展微生物多样性、系统发育学、群落结构以及模式微生物基础生物学的研究；筛选具有应用前景的微生物功能及产物，促进微生物资源在工业、农业、医药、能源和环境等领域的应用。 主要研究方向为：(1)细菌、放线菌、极端微生物和菌物物种资源的研究；（2）微生物来源的生物活性物质的研究；（3）菌物物种和基因资源储备的研究（4）微生物资源数据库及网络系统的建立。  中国科学院微生物研究所微生物资源中心承担多个与微生物资源研究有关的国家自然科学基金重大、重点及面上项目，数项国家"863"项目、国家攻关、国家重点项目，数项中科院重大、重点项目。发表微生物新种300多个，新属30多个，编写《中国真菌志和地衣志》10卷、《常见细菌系统鉴定手册》，并分别于1980年、1987年和1997年出版了第一、第二和第三版菌种目录，还分别于1982年和1992年参加了第一和第二版中国菌种目录的出版工作，第四版菌种目录将于2002年下半年出版发行。还获得多项国家科技进步奖、国家技术发明奖，中科院发明奖、中科院科技进步奖，及其它各类奖多项。
能源与工业生物技术研究中心
开展工业微生物细胞与分子的功能优化与改造研究、微生物发酵及其下游工艺研究，利用生物质可再生资源，开发生物能源、生物材料以及生物基化学品，进行新型生物催化剂的开发与利用。
微生物资源前期开发国家重点实验室
实验室简史：中国科学院微生物研究所于1989年3月正式向中国科学院和国家计委申请利用世界银行贷款建立微生物资源国家重点实验室，同年6月获得批准。1991年12月，实验室的建设工作正式  中国科学院微生物研究所启动；1993年12月，经专家组论证、中科院批准，实验室正式对外开放；1995年12月，实验室通过了国家计委验收；1998年3月中科院对实验室进行了评估，1999年7月实验室进入了中科院知识创新工程；2001年6月实验室通过了国家评估。 实验室研究方向与内容：微生物资源国家重点实验室的研究方向是：微生物资源的收集、评估和生物学基础研究以及微生物资源开发利用的前期研究。目前实验室主要在以下四个领域开展工作：
（1）极端微生物资源的研究；
（2）微生物来源生物活性物质的研究；
（3）生物化工；
（4）微生物资源数据库及网络系统的建立。  中国科学院微生物研究所研究队伍：本研究室现有在职人员20名，其中研究员7人，助理研究员7人，初级职称6人。在读研究生共28人，其中博士生22人，硕士生6人。客座人员3人
研究成果：本年度该室在国内外核心刊物发表论文27篇，其中被SCI收录论文有7篇；参加编写专著4部；获省部级奖2项；技术转让3项；申请专利4项、批准专利3项。
技术支撑
网络信息中心 承担着中国科学院生物标本馆网络信息系统综合数据中心、中国生物多样性信息中心微生物学分中心、国际微生物菌种数据网络中国国家节点，致力于对微生物信息资源的收集、整理和网络共享  中国科学院微生物研究所，承担着国家科学数据共享工程、国家科学数字图书馆、院信息化专项等多项任务，已经建立了一系列微生物资源数据库和菌物数字标本馆，将生物信息学平台与微生物资源数据紧密结合，先后主持开发了中国微生物资源信息网、中国生物技术信息网、中国生物镜像网、中国生物网格（Bio-Grid）、禽流感信息网，网上可共享信息超过1TB，是我国微生物领域最大的门户网站。
研究所院士
戴芳澜院士
(1893-1973) 微生物研究所的创始人
著名的植物病理学家和真菌学家
主要履历及经历
戴芳澜教授1893-1973)作为一位著名的  戴芳澜院士真菌学家和植物病理学家是中国真菌学和植物病理学的创始人之一。
他曾是第一,二,三届全国人民代表大会代表。自1956年起,他被选为中国科学院院士及特别研究教授,并于1958至1973年担任微生物所所长。
1914年至1919年,戴教授在美国学习植物病理学和真菌学。回国后,他把自己的全身心贡献给真菌学和植物病理学的研究和教学工作。他为中国科学的这些分支学科的创建和发展上作出了巨大的贡献。在他的指导下,一代一代的真菌学家和植物病理学家成长了起来。戴教授在国内外发表了五十多篇科学论文。
1979年科学出版社出版了他的综述"SYLLOGEFUNGORUMSINICORUM"。该书对从事真菌学研究和真菌资源应用的科学工作者及具参考和实用价值。
创新文化建设
创新文化建设是知识创新工程的五大目标之一，是践行“三个代表”重要思想的具体体现，坚持科学发展观，坚持“依法办所，以德治所”。创新文化是研究所出成果、出人才的重要保证，是研究所可持续发展的根本保障。 创新文化是一种氛围，一种精神，通过回顾微生物所发展史，总结成功经验，进行案例剖析，以增强研究所的凝聚力，激发创造力，成立创新文化建设和所史办公室，其职责在于：在主页上开辟专栏，宣传在科技创新、人才培养、院地合作、创新文化建设进展和成绩。观念的创新、制度的规范和精神的力量是  中国科学院微生物研究所创新文化的源泉。坚持科学发展观，以人为本，以科学推动管理，以管理促进效益，积极营造健康向上、和谐舒适的人文环境，弘扬“艰苦奋斗，自强不息”的微生物所人精神，为顺利推动知识创新工程，全面提高研究所整体竞争实力提供有效保证。
现任领导
黄力：常务副所长
刘松林：党委书记
刘双江：副所长
历届党委书记：
林一大
赵默山
陈钦峰
张永庆
周培瑾
洪俊华
谭华荣
  刘双江:副所长  刘松林:党委书记  黄力:常务副所长
历史沿革
中国科学院于1949年11月1日宣告成立。它是以原中央研究院、北平研究院的部分研究机构为基础，汇集了当时中国最优秀的科技专家，是新中国最高的学术研究机构，随后各下属机构逐渐建立。从1954年起，中国科学院的高层领导和专家就开始酝酿组建微生物研究所事宜。1955年10月6日中科院生物学地学部向院常务会议提出“建立微生物研究所筹备委员会的意见”。院务会议同意成立筹备委员会，该委员会由戴芳澜、方心芳等12位科学家组成，戴芳澜任组长。1956年1月16日陈毅副总理对相关报告批示：“拟予同意”，并送刘少奇、陈云和邓小平圈阅。1958年9月26日经院第11次院务会议通过并经科学技术委员会批准成立中国科学院微生物研究所。1958年12月3日中国科学院正式行文，组建微生物研究所。 
2008年12月3日，微生物所迎来自己的50华诞。 
在历史的长河中，50年只是短暂的一瞬，但对微生物所来说，是不平凡的50年，是艰苦奋斗的50年，也是迈向辉煌的50年。在党中央的亲切关怀和科学院的领导下，微生物所科技人员无私奉献，团结合作，努力攀登，在跟踪中赶先进，在拼搏中谋发展，在探索中求创新。它经历了组建、发展、文革、改革开放和创新工程的不同发展阶段。在每一个不同的历史阶段，不管是一路顺风还是风雨兼程，都留下了广大科技人员艰苦奋斗的汗水和足迹，都展示出他们对科技事业的无比执著和热爱。 
汇聚贤才 迈出创业坚实一步（1958-1966）
1958年12月3日中国科学院发文（院厅秘字第454号），“兹经院第十一次院常务会议通过并经科学技术委员会批准应用真菌研究所和北京微生物研究室合并成立微生物研究所，由戴芳澜任所长，邓叔群、林一夫、方心芳任副所长。” 
戴芳澜（1893-1973），著名的真菌学家和植物病理学家、中国科学院院士，在真菌分类学、真菌形态学、真菌遗传学以及植物病理学等方面做出了突出的贡献。他的《中国真菌总汇》对推动我国真菌学研究和发展、真菌资源的利用和开发有着极其重要的意义。邓叔群（1902-1970），我国著名真菌学家、植物病理学家和森林学家、中国科学院院士，在高等真菌分类学上卓有成就。他编写了我国最早的一部真菌学专著——《中国高等真菌》，为我国高等真菌研究奠定了基础。方心芳（1907-1992），应用微生物学家、中国科学院院士，我国现代工业微生物学开拓者、应用现代微生物学理论和方法研究传统发酵产品的先驱者之一，为我国传统发酵工业的建设和发展做出了重要贡献。 
微生物所人就是在以他们为代表的老一辈科学家带领下，肩负着国家的希望和人民的重托，在“大跃进”的岁月中踏上了新的历史征程。 
十年浩劫 苦守岗位期盼天明（1966-1976）
在文化大革命的十年中（1966—1976），中国科技界在周恩来总理的亲切关怀和指导下，凭着科学家的敏感和良知，悄悄地关注和跟踪国际研究前沿，始终不忘攀登科学高峰，始终不忘为工农业生产服务，艰难地度过了那段动乱的岁月。 
改革开放 探索新型运行模式（1976-1998） 
1976年10月6日党中央一举粉碎了“四人帮”，持续了10年的文化大革命宣告结束 。我国的社主义革命和建设进入了一个崭新的历史时期，我国科学技术事业的发展和进步也翻开了新的一页。 
务实创新 奋力开拓美好前程（1998-2008）
1998年6月国务院科教领导小组决定启动国家知识创新工程试点，中科院的知识创新工程试点（一期）也正式开始了。 
一、 重点实验室率先进入知识创新工程试点 
微生物所为尽早进入中国科学院知识创新工程，遵照院党组的战略部署，以凝练科技创新目标为导向，积极推进研究所的机制转变和结构调整：为优化学科，提高科技竞争力，进行了研究员A 、B岗位的分类设岗，对不适合发展的课题组进行调整，将原来的80个课题组减并为52个，调整和补充了知识化、年轻化的课题负责人；对管理部门进行整合，6个职能处室缩减到3个部门：综合办、科技处和行政资产处。管理人员实行竞争上岗，不能胜任岗位人员转岗分流等措施。根据创新工程需要，为改善科研条件和工作环境，购置大型科研仪器，尽力解决职工住房问题。经过这些准备，领导班子在所层面上全面深刻剖析过去基础、现在优势和未来发展的基础上制订了适合我所发展的宏伟蓝图，力争在5年内将微生物所建设成世界一流的微生物学科研机构和高技术研究与发展基地型研究所。 
微生物所的三个重点实验室：微生物资源前期开发国家重点实验室、真菌地衣开放实验室和中国科学院植物生物技术开放实验室，它们在成立之初已经集中了研究所优势学科和研究人员，财力物力和实验条件具有充分的保障，经过了专家的认证和主管部门领导批准，已经符合创新工程的要求，于1999年率先进入创新工程试点。 
2001年1月，国务院审议通过了中国科学院“知识创新工程全面推进阶段（即知识创新工程二期）计划”。同年，8月15日院长办公会议正式通过我所创新工程试点工作方案，以方荣祥为所长的新一届领导班子带领微生物所整体进入中科院创新工程试点序列，翻开了微生物所发展史上又一个崭新的篇章。 
二、二期创新的重点领域和研究方向 
二期创新的重点学科领域和主要研究方向是： 
微生物资源：加强极端环境微生物、难培养微生物和海洋微生物的调查和研究，建成具权威性的、亚洲最大的微生物菌种保藏中心和菌物标本馆；开展微生物多样性及其系统进化的研究，提出新分类系统；加强微生物资源的前期开发，以发现新型的医用和农用抗生素及新型工业用酶为目标，建立高通量的筛选模型，提供有价值的先导物质。 
分子微生物学：开展基因组学和重要基因功能的研究，发现新基因和新活性物质，提出病害防治新策略；开展微生物发育分化和次级代谢的研究，为定向改良生产菌和获得新的代谢产物提供理论指导；研究重要的人和动植物病毒结构与功能及宿主免疫系统保护功能的分子机制，为相关疾病的治疗和新药开发奠定基础。 
微生物生物技术：提升微生物产业发展与能力，为国家目标、企业需求和传统微生物工业的技术改造提供关键技术；开展油田土壤污染和工业废水的微生物整治、可生物降解塑料的研制等；发展微生物分子育种的新技术与新方法，为有重要应用价值微生物的深层次研究和开发利用提供技术平台；根据发展“绿色农业”的需要，在微生物农药和微生物肥料研究方面作新的部署。 
为了实现和达到二期科技创新目标，进行了组织机构的调整，取消原研究室的编制，按三个重点领域组建三个研究中心，即微生物资源研究中心、分子微生物学研究中心、微生物生物技术研究中心。全所设35个研究组，遴选出19个研究方向、24名课题组长，原植物生物技术实验室按北京生命科学研究基地规划与遗传与发育所整合成为中国科学院植物生物技术开放实验室（该实验室于2004年1月获得国家科技部批准，升级为“植物基因组学国家重点实验室”）。 
三、科技创新，关键在人 
在用好现有人才的基础上，有计划、有步骤、多渠道、多形式地引进国内 
外优秀人才。除执行院人才引进政策外，还自筹资金引入百人计划和杰出人才，凝聚了一批来自国内外的优秀人才。包括获得院首批百人计划资助者、院首批以团队形式引进的分子免疫团队人员、获得院青年科学家小组计划支持者等。他们给研究所带来了新的学科生长点、增加了新的研究领域和创新思维，使研究所呈现出新的发展势头。 
面向国内外公开招聘研究所所长是改革创新的又一举措，2004年3月来自牛津大学的高福博士通过院人教局组织的竞聘答辩，成为微生物所第一个海外直接招聘的所长，并组建了新一届行政领导班子。 
进入二期创新后研究生招生数量成倍增加，加上每年还有一定数量非本所招收的研究生和来自第三世界国家的留学人员、进修访问学者等，在所的学生人数远远超过在职职工人数，青年学生队伍成为科研主战场一支强大的生力军和后备力量。在加强研究生队伍和流动队伍建设同时还注重对本所优秀青年人才的培养，设立了研究所青年基金，提供一定数量的研究经费为他们的成长成才搭建舞台。 
四、园区和支撑条件建设 
为了营造适合科技创新的文化氛围，根据院整体规划我所在北郊奥林匹克科技园区内建新所址，建筑面积23336平方米，其中科研楼18098平方米、菌物标本楼3241平方米、发酵实验楼1987平方米，总投资10446.45万元，其中创新专项6650万元，标本馆专项2220万元，自筹资金1576万元，于2004年2月开工，2005年12月竣工。工程获北京市结构长城杯金质奖和建筑长城杯金质奖。 
为配合学科发展和研究工作需要，研究所更新添置了一批科研仪器设备，加强了重点实验室装备建设，包括购置大批先进仪器和装备，仪器管理配备专人，提高仪器的完好率和使用率。建立起不同层次的关键技术平台，成为创新发展的依托和支撑。 
强化了微生物资源的信息化和生物多样性信息化建设，建立了我国微生物领域最大的网络站点。路甬祥院长在参观我所时说. "在微生物所我第一次看到了真正的、活的、可以真正为科研提供服务的、可以与世界接轨的网络资源库。"并专门题词. "一流的科技创新需要一流的技术支撑与服务"。 
图书馆和杂志社编辑出版《微生物学报》、《生物工程学报》、《微生物学通报》及《菌物学报》期刊，也为提高我国微生物学研究水平和提升我国在微生物学领域的国际研究地位提供支撑服务。 
创新的准备阶段和二期创新工程的实施，使微生物经过一次较大的变革，它克服了原先微生物学科布局过窄、学科发展缓慢的痼疾，也经历了从被动地改革到自觉改革创新和发展的变化过程。 
五、着眼长远，与时俱进