标题：马英九
个人档案
  马英九求学时代照片姓名： 马英九[1-2]
祖籍：父亲籍贯：湖南衡山；母亲籍贯：湖南长沙
祖先：东汉开国功臣、新息侯、著名军事家马援
生肖： 虎 
血型： O型 
星座： 巨蟹座
身高：1.78米
运动与休闲： 慢跑、篮球、游泳、骑脚踏车；读书、听音乐、担任公益义工与代  马英九和夫人言人、浏览专业网站。 
拿手的歌： 古月照今尘、爱拼才会赢。 
喜欢的食物： 最喜欢吃的是蚵仔面线、蚵仔煎、荫豉蚵仔等台湾地方小吃,也酷爱喝大陆的铁观音。
饲养的宠物： 自1999年领养流浪犬“马小九”迄今。 
小时候的理想： 当火车司机、交通警察。 
感谢的师长： 方南强（马的语言老师）
家庭情况：夫人周美青，有两女，长女马唯中，次女马元中。
从政理念： 尊重国家典章制度，奉行法治规范，同时具有执著核心价值与开展新局的意志力，也就是“给我什么舞台，我都会演好”。 座右铭：唯天下之至诚，胜天下之至伪；唯天下之至拙，胜天下之至巧（此句是洋务运动代表人物曾国藩所说） 
学历： 
1972年，“国立”台湾大学法律系毕业 
1976年， 美国的纽约大学法学硕士 
1981年， 美国哈佛大学法学博士
军事背景：
服务：台湾地区“海军陆战队” 
服役期间：1972年－1974年 
役别：海军陆战队。
后备役官阶：海军少校。
家庭人员
祖辈
马立安
父辈
父，马鹤淩，抗日战争时加入青年军，曾任台湾“行政院”青年辅导委员会处长，中国国民党中央考纪会副主委。
母，秦厚修，曾任台湾“中央银行”外汇局科长。
兄弟姊妹
大姐，马以南。
二姐，马乃西。
三姐，马自东（马冰如）。
马英九
妹，马定北（马莉君）。
妻子
妻，周美青。
子女
长女，马唯中。
幼女，马元中。
生平简介
  马英九马英九，1950年7月13日出生于香港，祖籍湖南省衡山县，1952年随家人移居台湾。1967年加入中国国民党。1972年台湾大学法律系毕业。后赴美留学，获美国纽约大学法学硕士、哈佛大学法学博士学位。
马英九曾在美短暂工作，1981年后，历任美国马里兰大学法学院研究顾问，美国波士顿第一银行法律顾问，美国纽约华尔街柯尔迪兹律师事务所实习律师，后返回台湾担任“总统府”第一局副局长，兼政治大学法律研究所副教授。
1982年，马英九出任蒋经国英语翻译。在1984年后的十五年中，他先后出任国民党中央副秘书长及多种行政职务。1998年12月当选为台北市市长，2002年12月连任台北市市长。
马英九是国民党第十三、十四届中央委员。1999年8月、2001年7月分别当选国民党中央常务委员。2003年3月，当选为国民党副主席。2005年7月，以72.36%的得票率当选为中国国民党新一任党主席。 
2007年2月13日，因在台北市长任内“特别费”的使用，而被台湾“高等法院检察署”起诉，马英九曾承诺若遭起诉即辞去中国国民党主席职务，乃于同日请辞党主席并将化悲愤为力量，正式宣布参选2008年台湾“大选”。2008年04月24日，马英九特别费案台“最高法院”驳回检方上诉，判决马英九无罪。
2008年3月22日，马英九在台湾地区领导人选举中，以765.87万张票(58.45%得票率)击败民进党的谢长廷，并于2008年5月20日就任。
2009年7月26日，中国国民党举行党主席和党代表选举，马英九当选党主席，获得285354票，得票率为93.87%。10月17日，中国国民党举行第18届党代表大会，马英九宣誓就任党主席。
2011年4月7日，马英九委托他人到国民党中央党部领表，成为国民党2012台湾地区领导人选举的唯一参选人。7月2日，国民党举行第18次代表大会第2次会议，正式通过提名马英九、吴敦义搭档，参加2012年台湾选举。
2011年11月21日，马英九前往台湾选务机构正式登记参加台湾“大选”。[3]
2012年1月14日，在台湾地区领导人选举中获胜，继而获得连任。
个人经历
祖籍地  马英九马英九祖籍应为原来的湘潭县白石乡马家堰﹐1969年衡山县拆分为目前的衡山县+衡东县+南岳区，衡山北部乡镇划分给湘潭县，其中包括马家堰。而现居湘潭城里的老中医刘肇礼副教授，是马英九的嫡亲表兄。记者在小巷深处的“刘肇礼医寓”见到他时，这位63岁的老人正在给一位街坊看病。医寓墙上，马鹤凌苍劲有力的书法撰写的四幅条幅很引人注目。“这是舅舅为了怀念我的母亲含泪写下来的。”刘肇礼说。如今靠着常年不断的书信和电话与马家沟通的刘肇礼，1990年曾前往台湾探亲，这期间在马家一住就是3个月。“马英九的母亲是长沙人，舅舅、舅妈、英九表弟居家生活，讲的都是地道的长沙话。”刘肇礼说。[4]教育经历马英九曾在美国短暂工作，1981年后，历任美国马里兰大学法学院研究顾问，美国波士顿第一银行法律顾问，美国纽约华尔街柯尔迪兹律师事务所实习律师，后返回台湾担任“总统府第一局副局长”，兼政治大学法律研究所副教授。
学历：
1.惠幼托儿所。　　
  马英九2.静心幼稚园。 
3.龙潭三坑国民学校。 
4.女师附小（一九六二年毕业）。 
5.大安初中（一九六五年毕业）。 
6.建国中学（一九六八年毕业）。 
7.台大法律系法学组（一九七二年毕业）。 
8.美国纽约大学（New York University, NYU）
法学硕士（LL.M）(一九七六年) 。 
9.哈佛大学法学博士。政治经历  马英九“行政院大陆工作会报执行秘书”（1988年-） 
“国家统一委员会研究委员”（1990年-） 
“国民大会”（全国不分区）代表（1991年-） 
“行政院大陆委员会委员”（1991年1月31日-1996年6月25日） 
“行政院大陆委员会副主任委员”（1991年6月1日-1993年2月27日） 
“行政院大陆委员会发言人”（1991年-1993年） 
“法务部（第十一任）部长”（1993年2月27日-1996年6月10日） 
中国国民党中央委员会（第十四届）中央委员（1993年-） 
“中央选举委员会委员”（1993年3月11日-1996年7月8日） 
“行政院政务委员”（1996年6月10日-1997年） 
“国立政治大学”法律系副教授（-1998年12月25日） 
台北市市长（直辖市民选第二任）（1998年12月25日-2002年12月22日） 
台北市市长（直辖市民选第三任）（2002年12月25日-2006年12月24日） 
中国国民党（第四任）主席（2005年8月19日-2007年2月13日）
台湾当局（第十二任）领导人（2008年5月20日-至今）
中国国民党（第四任）主席（2009年10月17日-至今）早年生活  马英九马英九祖籍湖南省湘潭县马家堰（另一说法是湖南省衡山县，因为马的祖母向太夫人曾改嫁同样姓马的男子，继祖父祖籍衡山，故跟继祖父改籍贯），出生于英属香港九龙广华医院，曾居于调景岭。父亲马鹤凌，在抗日战争时加入青年军，后则从事公务；最高公职为行政院青辅会十二职等处长，退休前的职务是国民党中央考纪会副主委。母亲秦厚修曾任中央银行外汇局科长，家中育有5个子女，马英九是唯一的儿子。马英九的名字是源自于马家族谱，“英”为“上尊大人，英才继起” ，“九”则是希望能以“九思立身”并且“体健九如”。
他在一岁时随双亲搬来台湾，初中时就读台北大安初中，高中时就读台北市的建国中学，台湾大学法律系毕业后，旋服预备军官役（军种为海军陆战队），任职左营海军后勤司令部[5]。
1974年，考取中国国民党中山奖学金赴美国攻读法律，获得纽约大学法学硕士及哈佛大学法学博士学位。1976年在纽约大学政治系教授，也同时是马鹤凌老友熊玠的指导之下，获得纽约大学法学硕士（LL.M.）。1981年在指导教授孔杰荣之下获得哈佛大学法学博士（S.J.D.）学位。自大学三年级（民国六十年四、五月 一九七一）听丘宏达先生的演讲之后，马英九决心对有关钓鱼台（即钓鱼岛）的国际法问题、尝试进行更深入的研究，并写下《怒海油争：东海海床划界及外人投资之法律问题》。此后，丘宏达先生持续发挥对他的影响力，也是他当选后第一通国际长途电话致电的对象。 在研究国际法的过程中，马英九认为影响他最大的老师有两位。一位是哈佛大学法学院的宋恩教授(Professor Emeritus Louis B. Sohn)，另一位是纽约大学法学院的楼文斐教授(Professor Andreas F. Lowenfeld)。前一位指导他撰写博士论文，训练他一丝不苟的治学精神；后一位领他进入国际经济法的殿堂，并使他建立公法与经济法并重的观念。
马英九在美国留学期间和周美青结婚，后育有两位女儿，马唯中、马元中；同时，参加了由国民党组织的右派的反共爱国联盟。马英九在哈佛时，课余也兼任《波士顿通讯》的主编。列引几段马英九当时的文章与左派斗争，同时与国民党外对抗。该刊物，如同大陆的“内参”一样，是当时在台湾的每一位部会首长必看，他在海外的种种爱国表现，蒋经国都注意到。 同时，他也是纽约市柯尔迪兹法律事务所的实习律师，马里兰大学法学院的研究顾问。由于曾任政治立场偏国民党《波士顿通讯》的主编，民进党批马是职业学生，不过马英九透过幕僚郑重否认此指控，并解释马英九撰写文章之动机为“爱国与反‘台独’”。
政治生涯
蒋经国幕僚1981年，马英九回到台湾，适逢钱复正在为蒋经国寻觅英文秘书，马英九经人介绍与其他数人被列于候选名单之中，蒋经国因马英九家世简单清白，遂把他安排在身边担任英文秘书，从事翻译工作。1982年马英九担任台湾当局“总统府”第一局副局长。1984年，接下陈履安的工作，出任国民党中央党部第三副秘书长，负责政党“外交”工作，致力于突破中共的外交封锁。 1986年通过甲等特考。
“入阁”
1988年任“行政院研考会”主委兼大陆工作会报（陆委会前身）执行秘书，1990年任国家统一委员会研究员。1991年马英九升任陆委会副主委兼发言人，且当选国民党不分区国民大会代表。 
1993年连战出任"行政院"院长，马英九受邀出任“法务部”部长，以严办地方上的黑金势力受到瞩目。由于办案力度过猛，成为党内的箭靶，当时李登辉曾言：“差点把国民党搞垮！”结果由于强大压力下，1996年，马英九转任为不管部会的“政务委员”。1997年，连战“内阁”饱受白晓燕命案等政治风雨，马英九提出“辞官退隐”声明，不参选1998年台北市市长选举，在程序争议下（在截止日期后月余提出申请），取得政治大学法律系的专任教职，并表示以后专心教育，不再涉足政事，不参与台北市市长选举。台北市长1997年底的县市长选举之中，陈水扁以台北市长的身份领军组成“宝岛 
  马英九演讲希望助选团”全台助选，造成国民党拱手让出逾半数的县市执政权，展现“以地方包围中央”的执政雄心，国民党在此情势之下渴望出现一位可以对抗陈水扁的从政党员。1998年，经多人劝进与其父马鹤凌的劝说，马参加台北市市长选举国民党内初选，当时马被党内认为是唯一有希望击败陈水扁的强棒。马在国民党初选中胜出，成为该届台北市市长国民党籍候选人。此次选举是马英九首次接受民意考验，在投入选战之前，马英九从来没有参选的实战经验，反观马英九的对手，则是寻求连任的陈水扁市长，在担任市长前，陈水扁还历经台北市议员、“立委”、县长选战洗礼，已是选举沙场老将。虽然1996年陈水扁在一场婚礼致词时表示1994年最怕就是马英九会出来选，但陈水扁挟有出色政绩、具有战斗力的幕僚团队，马英九虽有国民党在中央执政的庞大资源，两人的声势始终维持在伯仲之间。除了陈水扁外，马英九还面对新党籍的前“立法委员”王建煊可能瓜分蓝营选票的挑战，在前一次市长选举之中，尽管台北市选民结构蓝大于绿，陈水扁获胜的原因多少与新党赵少康、国民党黄大洲同室操戈有关。在这次选举中，民进党的叶菊兰以“新卖台集团的棋子”批评马英九，而陈水扁也以“台湾土狗对上香港贵宾狗”比喻他与马英九的竞争，但在选前数日，时任“总统”与国民党党主席的李登辉在造势晚会中问马未来要走什么路，马英九答称“走李‘总统’民主改革的路”，随后李登辉牵起马英九的手高喊“新台湾人！”，此举被认为让马英九拉住了本省族群选票。最后，在王建煊展现“成功不必在我”的陪选态度下，弃保效应发生，马英九以51.13%的得票率击败陈水扁（得票率45.91%）、王建煊（得票率2.97%）等对手而获得胜选。
虽然马英九在当选市长之后不久，即宣布将争取连任，但在2002年台北市市长选举前，有传闻指马英九可能不参选以备角逐2004年的“总统”选举。最后马英九仍然参与该年的台北市市长选举以寻求连任。他并于参选同时，宣布要以“不一样的方式”来打这场选战，因此选举方式着重于发表政见，举行各种与市民的讨论会等，其竞选对手民主进步党所推派的候选人李应元也着重于政见发表。由于出生地的关系，当时的“总统”陈水扁，在为同党籍候选人李应元站台的演说中，以“香港脚走香港路”、是在选“台北特首”严厉批评马英九。最后结果马英九以64.11%的得票率击败民进党籍候选人李应元（得票率35.89%）获得连任。中国国民党主席2009年7月，马英九以28万5354票当选新任国民党主席，得票率为92.51%[6]。
由于只有马英九一人参选，因此选举过程并没有太大悬念，但这一结果势必对台湾局势和两岸关系产生影响。
马英九竞选总部之后将举行记者会，由马英九说明对改革国民党的理念和想法，随即转往国民党中央党部致意。
这是马英九第二次参选国民党主席。他曾于2005年台北市长任内首次当选国民党主席，2007年2月13日，因特别费的使用被起诉(后经法院宣判无罪)，他曾承诺若遭起诉即辞去国民党主席职务，乃于同日请辞党主席，正式宣布参选2008年“大选”，并于次年顺利当选。台湾最高领导人2008年3月22日，马英九在台湾地区领导人选举中，以765.87万张票(58.45%得票率)击败民进党的谢长廷，并于2008年5月20日就任。
2012年1月14日分台湾地区领导人选举今晚揭晓结果。晚间20时13分，在太太周美青的陪同下，马英九登上胜选舞台，顺利连任。[7]
公众形象
马英九身高178厘米，容姿英俊斯文，许多媒体都曾以年轻俊秀的政治明星来报道马英九，而马英九本人亦以长期持续的晨跑及积极参与运动活动来建立健康活力的正面公众形象。在一些针对台湾女性与同志的票选活动中，马英九曾被评为政治人物类的“梦中情人”，媒体惯以“小马哥”昵称之。有些调查认为马英九出色的外在条件是他于台湾政坛崛起的最大因素，《新新闻》将该因素解读为“马英九神话”。在性格上，马英九具有正直自律、俭朴清廉、依法行事的形象，并且极力避免涉入任何有可能惹人非议的应酬与聚会，因而有“政治不沾锅”、“政治洁癖”等可正可反的评价。认同这种行事作风的人会认为马英九比较温和理性，不认同的人则会批评马英九虚伪或缺乏勇于带头领众的魄力。
马英九作为泛蓝阵营的政治人物，常遭亲泛绿阵营的媒体撰文批评，而亲泛蓝媒体则相对友善，《新台湾新闻周刊》将此现象批评为“（媒体）造神运动”。另外，马英九也常遭反对阵营批评忽视台湾本土精神，《自由时报》曾以“马英九英语比台语好”及“马英九对中国比对台湾好”上下联批评马英九。
1999年，马英九在台北市政府及行政院农业委员会所合办的流浪犬认养活动中，认养一只混种犬，并取名马小九。在经过健康检查、驱虫及认养程序后，马小九与马英九家人一同居住于市长官邸，其生活大多由马英九的太太周美青照料。虽然马小九在被认养后，于台湾已具有一定之知名度，但真正使其声名大噪的，则是在2006年间，因为它的健检及医疗费系用首长特支费来支付的，因而引爆特支费案。
主要政绩
交通建设在马英九担任市长任期内，属于大众运输的台北捷运6条路线，包括新店线、小南门线、小碧潭支线、南港线、板桥线、土城线完工通车，8年来每日载客量成长为6.3倍，并在Nova及CoMET会员系统中可靠性达到第一（2004年、2005年）。不过2001年纳莉台风来袭时，由于马市府防洪评估错误，造成抽水站失效，台北市区汪洋一片，大水并涌入捷运隧道，并让台北捷运蓝线停驶、捷运台北车站停用长达3个月，对台北交通造成影响。事后，监察院通过纠正案纠正台北市政府，认为台北市政府在纳莉风灾期间，捷运设施事前未加强防洪整备及紧急应变演练，以及工务局、台北市政府捷运工程局与台北大众捷运股份有限公司横向联系不足，导致捷运系统淹水受创且扩大灾情，确有违失。 马英九在台北市长任内增加公共汽车专用道设置，鼓励民众搭乘公共运输。但其中罗斯福路及忠孝东西路公共汽车专用道设置，原本是希望能提高市民利用大众运输系统，不过由于路线规划与周围交通评估失当，罗斯福路公共汽车专用道在启用后对道路交通产生负面影响，造成民怨不断，而罗斯福路沿线里长都连署反对，罗斯福路已被讥为全国最易肇事的路段。忠孝西路公共汽车专用道至今仍未启用，而忠孝东路公共汽车专用道的实施已停止。
道路方面，马英九任内完成连结福高三甲与市区的信义快速道路，以及复兴北路车行地下道，为台湾在营运中机场跑道地下进行施工的首例。此外还有环东大道的通车，南京东路正气桥的改建，以及在万华车站铁路地下化后，开通艋舺大道与华翠大桥，并整建基隆河百龄桥、承德桥、民权大桥、麦帅一桥、麦帅二桥与中山新桥等6座桥梁，进行照明美化与景观改善工程。并且完成120公里脚踏车道，95年度串联台北县市河滨脚踏车道。
台北猫空缆车初期故障频传2007年猫空空中缆车完工通车，兼具观光以及大众运输功能，成为台湾的热门新景点。不过猫空缆车上线初期曾经出现过数次运转中断的状况，由台北市研考会在营运一个多月后发布的调查显示，市民对于猫空缆车满意者仅14%，不满意者达32%。台湾环境资讯协会批评猫空缆车的设置，凸显出马英九的政策缺乏全面的考量。一些市议员直指是“台北最大违建”，并与立委并提出渎职控告，甚至当时亦有媒体评论这将冲击马英九的总统选情。
北市府于1999年规划，采“政府带头，民间建置和经营”的BOT模式，由政府提供公共场所、业者出资建置经营的方式，打造“无线宽带网络城市”。 这项建设也让台北市政府获得2006年美国“智慧社区论坛”(Intelligent Community Forum, ICF)的智慧城市首奖，击败美国克里夫兰、英国曼彻斯特、中国天津等入围城市。无线宽带的硬件建设为台北赢得全球最大无线网络城市的殊荣，使用率却屡受外界批评。然而，面临使用人数偏低、讯号不稳定、加值服务内容不够吸引人等批评，以及面临3G、HSDPA技术的威胁，负责营运的安源资讯还是深具信心。经济投资在经济投资方面，马英九政府整合了东区商业资源，如台北101、台北世贸等，举办各式展览招商。进行全市无线网络系统Wifly的架设，虽然Wifly让台北市晋升为世界最大的无线网络都市，但因收费问题令使用人数不如预期，截至2006年7月的使用人数只有4万人，不到全市人口3%。任内全力推动之台北内湖科技园区2006年全年营收达新台币22,933亿元（总公司设于内科之所有公司营收总和，非单纯内科所创造营收，故此说法过于夸大。），南港软件工业园区营收亦达1,448亿元[38]。体育事业在体育方面，在原台北市立棒球场位置兴建了台北小巨蛋。市政府也推动一行政区一市民运动中心的政策，整建暨有的体育场馆，设立五座运动中心委外经营，以平价的价钱的提供运动空间。 ? 2001年台北市举办亚洲杯女子足球赛，台北市议员段宜康等人指控台北市员警取缔并没收民众自行携入的中华民国国旗，却放任中国五星红旗十二面在场内挥舞而未受到警方干扰[39]。台北市政府的回应是台北市政府只是协办单位，实际的执行都是配和主办单位中华民国足球协会。而中华足协同意台北市政府的说法，承认是自己要求警察配合，并强调这是“奥会模式”（奥会模式规范观众不能带非参赛奥委会成员会旗，中华民国以"中华台北"名义加入国际奥委会，会旗为白底梅花纹章），以柔性劝导民众收起国旗并无不妥，并称因为段宜康的批评，暂时不愿再申办国际比赛。2009年台北听障奥运标志2003年，由听障者体育运动协会与台北市政府合组的申办团，代表台湾，以52票比32票，击败希腊雅典取得2009年夏季听障奥林匹克运动会，预计有来自超过一百个国家和地区的上万名运动员参赛。台北市政府是在马英九担任市长任内成立体育处。文化建设在文化方面，文化局在马英九任内建立，龙应台担任首任文化局长，范畴包括古迹建筑、历史建筑、老树保护、文化人才、公共艺术、街头艺人，任内并通过台北艺术中心开发计划。市政府除了举办大型艺文活动，也加速华山艺文特区、建国啤酒厂、宝藏巖聚落等的重整与再生。猫空空中缆车与北投空中缆车的计划，将提升地区观光效益。此外在南港与万华两地设有新移民会馆分馆，提供休闲聚会场所给外籍新移民。 2003年台北市议会通过由文化局推动的台北市树木保护自治条例之立法，让台北市的老树、大树、有意义的树，都获得法律的保障。在古迹的保存上，台北市府将国民政府时期要员故居——士林官邸、七海官邸、孙运璇故宅、李国鼎故宅、严家淦故宅、钱穆故宅列为市定古迹，以及南海学园科学馆、牯岭街南菜园日式宿舍、万华三水街新富市场、万华助顺将军庙等。
但有些古迹拆除引发争议，如太古巢遗址 ，临济寺神道、兰州街派出所、中山桥等，引起北台湾文化守护联盟与大龙峒文史工作室连署“反对以北大同文化园区都市更新计划为名，消灭文物、窜改历史古迹原貌”。不过，拆除中山桥是为降低当地淹水风险，拆除后，目前在寻找适当地方重组，台北市文化局也针对其他争议古迹说明：一、太古巢位于圆山遗址保存范围，并未遭到破坏；二、临济寺于1984年捷运工程时，将大雄宝殿拆解重组，台北市政府并补助寺方修复山门与大雄宝殿，并未破坏；三、兰州街派出所是1945年以后的建筑。
改建后的建成圆环，更名为“台北圆环”，2009年6月营运。马英九的市政府团队对于老旧市场更新，也常常因为事先规划不当，造成改建后使用效果不彰。其中建成圆环花2亿改建失败、滨江果菜市场花30亿改建，屋顶排烟窗漏水、西门市场花1亿5千万改建失败熄灯、民福市场花10亿改建，各楼层天花板偷工减料高度严重缩水、大桥市场花1亿2千万改建失败熄灯、士林夜市花1亿6千万迁至临时摊位，业绩滑落50%，因而广受各界批评。公共卫生公共卫生方面，在没有中央政府补助的状况下，台北市的家户接管普及率由1998年的28.8%提升到2008年五月的88%，改善大台北地区的河川污染问题。而与水费分开收取的垃圾费随袋征收实施，提高了台北市资源回收率，以回收比率来看，1999年，也就是实施垃圾费随袋征收前，资源回收比率是7.83%，实施垃圾费随袋征收后，2003年底资源回收比率成长到28%；从开始实施垃圾费随袋征收后，台北市的总废弃物量，也从1999年的26公吨，减少到2004年的12公吨。 2003年SARS期间和平医院爆发严重院内感染，北市府组成专案调查小组，检讨出院内感染的主要原因有三点: 一、在刘姓洗衣工发病后至通报前未采适当隔离措施。二、警觉性不够。三、防护措施未能严格落实执行。因而导致院内感染而封院，并且召回医护人员。在行政院要求下，和平医院即召回九百卅名员工，集中隔离，相关人员家属则采居家隔离，和平医院医护人员及员工计有57人疑似感染，其中7人死亡，50人住院，民众部分则有97人疑似感染，24人死亡。当时的市立和平医院林重威医师在治疗染煞洗衣工时，受感染而牺牲，林父要求台北市政府为封院政策不当道歉，并求偿一元。最后法律判决，由国家赔偿748万元。
马英九市府推动市立医院整并，将10家市立医院整并成一家市立联合医院，市医整并之后因为议价能力提高，一年的药价成本节省了6亿5000万元。不过，台北市立联合医院成立不久却发生了邱小妹妹人球案，遭受邱父虐伤的邱小妹妹无法在拥有丰沛医疗资源的台北市救治，转送到台中县童综合医院急救而脑死，卫生局长张珩为此下台负责。
特别费案
事件回顾2007年2月13日，台北“地检署”依“贪污治罪条例”中“利用职务机会诈取财物”将马英九起诉，前台北市府秘书余文被依贪污及伪造文书罪起诉。台北地院8月14日一审宣判马英九无罪。检方不服一审判决结果提起上诉。二审10月初开始审理后，经3次开庭，在11月30日辩论终结，于12月28日宣判马英九无罪。检方提起上诉。2008年4月24日“最高法院”驳回上诉，维持二审无罪判决。审理大事记[8]二零零七年二月十三日，检方侦结。依照起诉书所述，马英九遭起诉罪名是 
  马英九特费案贪污治罪条例“利用职务机会诈取财物”，认定贪污所得总计新台币一千一百一十七万六千二百余元。前台北市府秘书余文被查出涉嫌贪污七十六万元，依贪污及伪造文书罪起诉。此外，廖鲤、李克齐、孙振妮、方惠中、张钧纶等市府员工，则遭缓起诉处分。
四月三日，台北法院首度开庭，马英九以“被告”身份陈述答辩意旨，包括自始认为以领据核销特别费不是公款，更没有在检方讯问中“翻供”。
四月十七日，检、辩提列证据清单，证人供述证据力检辩展开攻防。
五月八日，台北法院合议庭裁定包括法务部门发布咨询意见书、马英九在去年九月七日接受中天新闻专访、九月十八日接受台北市议员颜圣冠议会答询内容，以及马英九办公室主任廖鲤等证人证词都具有证据能力。
五月二十二日，台北法院合议庭裁准检辩传唤包括前“行政院”副主计长张哲琛在内十四位证人。
六月五日，张哲琛出庭，检辩诘问充斥火药味。公诉检察官怀疑证人、被告及律师事先套招；律师回应实施预审制度时，检辩接触证人，了解证人对待证事实了解到怎样的程度有其必要。
七月三日，台北法院传唤马英九担任市长时的三位前后任秘书孙振妮、方惠中、孙丽珠作证。
七月十日，台北法院传唤刘静蓉、吴丽洳与赵小菁三位前后任经手特别费的台北市政府秘书处出纳。其中吴丽洳在回答律师诘问时提及“检方笔录未能将她的陈述做完整记载”，因此律师向合议庭要求勘验检方讯问光盘。
  马英九七月十九日，报载节录检方光盘讯问笔录内容，引发“笔录制作不实”争议；检辩庭外动作互呛。
七月二十三日，台北法院合议庭当庭勘验光盘。对吴丽洳检方证述笔录争议，审判长谕知判决书会交代。
七月二十四日，台北法院提示相关证卷。包括逐一提示二十九位检方证人的供述证据、三十六项的非供述证据等。
七月三十一日，台北法院辩论终结。公诉检方在论告阶段，增列论罪法条，将“公务背信罪”纳入，希望合议庭审酌马英九是否涉及“公务背信罪”，并加重其刑至二分之一。
八月十四日，台北法院宣判马英九无罪。 
同时因为被依贪污及伪造文书罪起诉的台北市府秘书余文应执行有期徒刑两年四个月，减为有期徒刑一年两个月。
十二月二十八日，台“高法”二审宣判，判马英九无罪。余文应执行一年有期徒刑。
二零零八年一月九日，台湾检方认为，因本案判决攸关首长特别费性质的认定，未来确定判决的法律见解对侦审同类型案件具有关键性的指导作用，宜由“最高法院”就此争议问题做出统一见解，较能避免同类案件的用法歧异，因此提起上诉。
三月大选揭晓后，“最高法院”书记官长林志斌表示，马英九特别费案的审理是审判独立的问题，结果由承审法官自行定夺。 
四月二十四日，台湾“最高法院”召开记者会说明判决结果。台“最高法院”刑事审判发言人宣布，驳回检方上诉，马英九无罪定谳；此外，余文上诉部分也被驳回。
主要著作
《从新海洋法论钓鱼台列屿与东海划界问题》，台北市：正中书局，1986年。 
《钓鱼台列屿主权争议回顾与展望》，台北市：“反共爱国联盟”，1991年。 
《两岸关系的回顾与前瞻》，台北市：“行政院大陆委员会”，1992年。 
《法务部新加坡考察报告》，台北市：“行政院法务部”，1995年。 
《考察泰国、马来西亚反毒、肃贪、狱政工作报告》，台北市：“行政院法务部”，1996年。 
《原乡精神－台湾的典范故事》，天下文化出版社，2007年，ISBN 9789864179534 
《治国：台湾赢的新策略》，商周出版，2007年，ISBN 9789861249810 
《沉默的魄力》，天下文化出版社，2008年，ISBN 9789862160732
就职演说
2008就职马英九于2008年“中华民国”“总统”选举中，以中国国民党籍候选 人身分参选该次“总统”选举并当选，于2008年5月20日正式就任并发表了如下“就职演说”[9]内容：
各位友邦元首、各位贵宾、各位侨胞、各位乡亲父老、各位电视机前与网路上的朋友，大家早安，大家好！
二次政党轮替的历史意义
  马英九政党演说今年三月二十二日“中华民国总统”选举，台湾人民投下了改变台湾未来的一票。今天，我们在这里不是庆祝政党或个人的胜利，而是一起见证，台湾的民主已经跨越了一个历史性的里程碑。
我们的民主走过了一段颠簸的道路，现在终于有机会迈向成熟的坦途。在过去这一段波折的岁月里，人民对“政府”的信赖跌到谷底，政治操作扭曲了社会的核心价值，人民失去了经济安全感，台湾的国际支持也受到空前的折损。值得庆幸的是，跟很多年轻的民主国家相比，我们民主成长的阵痛期并不算长，台湾人民却能展现日趋成熟的民主风范，在关键时刻，作出明确的抉择：人民选择政治清廉、经济开放、族群和谐、两岸和平与迎向未来。
尤其重要的是，台湾人民一同找回了善良、正直、勤奋、诚信、包容、进取这一些传统的核心价值。这一段不平凡的民主成长经验，让我们获得了“台湾是亚洲和世界民主的灯塔”的赞誉，值得所有台湾人引以为傲。显然，“中华民国”已经成为一个受国际社会尊敬的民主“国家”。
不过，我们不会以此自满。我们要进一步追求民主品质的提升与民主内涵的充实，让台湾大步迈向“优质的民主”：在宪政主义的原则下，人权获得保障、法治得到贯彻、司法独立而公正、公民社会得以蓬勃发展。台湾的民主将不会再有非法监听、选择性办案、以及政治干预媒体或选务机关的现象。这是我们共同的愿景，也是我们下一阶段民主改革的目标。
在开票当天，全球有数亿的华人透过电视与网路的直播，密切关注选举的结果。因为台湾是全球唯一在中华文化土壤中，顺利完成二次政党轮替的民主范例，是全球华人寄以厚望的政治实验。如果这个政治实验能够成功，我们将为全球华人的民主发展作出史无前例的贡献，这是我们无法推卸的历史责任。
新时代的任务
未来新“政府”最紧迫的任务，就是带领台湾勇敢地迎接全球化带来的挑战。当前全球经济正处于巨变之中，新兴国家迅速崛起，我们必须快速提升台湾的国际竞争力，挽回过去流失的机会。当前全球经济环境的不稳定，将是我们振兴经济必须克服的困难。但是，我们深信，只要我们的战略正确、决心坚定，我们一定能达成我们的预定目标。
台湾是一个海岛，开放则兴盛、闭锁则衰败，这是历史的铁律。所以我们要坚持开放、大幅松绑、释放民间的活力、发挥台湾的优势；我们要引道企业立足台湾、联结亚太、布局全球；我们要协助劳工适应快速的科技变迁与产业调整；我们还要用心培育我们的下一代，让他们具有健全人格、公民素养、国际视野与终身学习的能力，同时要排除各种意识形态对教育的不当干扰。我们在回应全球化挑战的同时，一定要维护弱势群体的基本保障与发展的机会，也一定要兼顾台湾与全球生态环境的永续经营。
新“政府”另外一项重要任务就是道正政治风气，恢复人民对“政府”的信赖。我们将共同努力创造一个尊重人性、崇尚理性、保障多元、和解共生的环境。我们将促进族群以及新旧移民间的和谐，倡道政党良性竞争，并充分尊重媒体的监督与新闻自由。
新“政府”将树立廉能政治的新典范，严格要求官员的清廉与效能，并重建政商互动规范，防范金权政治的污染。我希望每一位行使公权力的公仆，都要牢牢记住“权力使人腐化，绝对的权力使人绝对的腐化”这一句著名的警语。我们将身体力行诚信政治，实践国民党“完全执政、完全负责”的政见。新“政府”所有的施政都要从全民福祉的高度出发，超越党派利益，贯彻行政中立。我们要让政府不再是拖累社会进步的绊脚石，而是领道台湾进步的发动机。
我坚信，“中华民国总统”最神圣的职责就是守护宪法。在一个年轻的民主“国家”，遵宪与行宪比修宪更重要。身为“总统”，我的首要任务就是树立“宪法”的权威与彰显守宪的价值。我一定会以身作则，严守宪政分际，真正落实权责相符的宪政体制。我们一定要做到：“政府”全面依法行政，“行政院”依法对“立法院”负责，司法机关落实法治人权，“考试院”健全文官体制，监察院纠弹违法失职。现在是我们建立优良宪政传统的最好机会，我们一定要牢牢把握。
我们要让台湾成为国际社会中受人敬重的成员。我们将以“尊严、自主、务实、灵活”作为处理对外关系与争取国际空间的指道原则。“中华民国”将善尽她国际公民的责任，在维护自由经济秩序、禁止核子扩散、防制全球暖化、遏阻恐怖活动、以及加强人道援助等全球议题上，承担我们应负的责任。我们要积极参与亚太区域合作，进一步加强与主要贸易夥伴的经贸关系，全面融入东亚经济整合，并对东亚的和平与繁荣作出积极贡献。
我们要强化与美国这一位安全盟友及贸易伙伴的合作关系；我们也要珍惜“邦交国”的情谊，信守相互的承诺；我们更要与所有理念相通的国家和衷共济，扩大合作。我们有防卫台湾安全的决心，将编列合理的国防预算，并采购必要的防卫性武器，以打造一支坚实的国防劲旅。追求两岸和平与维持区域稳定，是我们不变的目标。台湾未来一定要成为和平的缔造者，让国际社会刮目相看。
英九由衷的盼望，海峡两岸能抓住当前难得的历史机遇，从今天开始，共同开启和平共荣的历史新页。我们将以最符合台湾主流民意的“不统、不独、不武”的理念，在“中华民国宪法”架构下，维持台湾海峡的现状。一九九二年，两岸曾经达成“一中各表”的共识，随后并完成多次协商，促成两岸关系顺利的发展。英九在此重申，我们今后将继续在“九二共识”的基础上，尽早恢复协商，并秉持四月十二日在博鳌论坛中提出的“正视现实，开创未来；搁置争议，追求双赢”，寻求共同利益的平衡点。两岸走向双赢的起点，是经贸往来与文化交流的全面正常化，我们已经做好协商的准备。希望七月即将开始的周末包机直航与大陆观光客来台，能让两岸关系跨入一个崭新的时代。
未来我们也将与大陆就台湾国际空间与两岸和平协议进行协商。台湾要安全、要繁荣、更要尊严！唯有台湾在国际上不被孤立，两岸关系才能够向前发展。我们注意到胡锦涛先生最近三次有关两岸关系的谈话，分别是三月二十六日与美国布什总统谈到“九二共识”、四月十二日在博鳌论坛提出“四个继续”、以及四月二十九日主张两岸要“建立互信、搁置争议、求同存异、共创双赢”，这些观点都与我方的理念相当的一致。因此，英九愿意在此诚恳的呼吁：两岸不论在台湾海峡或国际社会，都应该和解休兵，并在国际组织及活动中相互协助、彼此尊重。两岸人民同属中华民族，本应各尽所能，齐头并进，共同贡献国际社会，而非恶性竞争、虚耗资源。我深信，以世界之大、中华民族智慧之高，台湾与大陆一定可以找到和平共荣之道。
英九坚信，两岸问题最终解决的关键不在主权争议，而在生活方式与核心价值。我们真诚关心大陆十三亿同胞的福祉，由衷盼望中国大陆能继续走向自由、民主与均富的大道，为两岸关系的长远和平发展，创造双赢的历史条件。
最近四川发生大地震，灾情十分的惨重，台湾人民不分党派，都表达由衷的关切，并愿意提供即时的援助，希望救灾工作顺利，灾民安置与灾区重建早日完成。
台湾的传承与愿景
从宣誓就职的这一刻开始，英九深知个人已经肩负二千三百万人民的付托，这是我一生最光荣的职务，也是我一生最重大的责任。英九虽然不是在台湾出生，但台湾是我成长的故乡，是我亲人埋骨的所在。我尤其感念台湾社会对我这样一个战后新移民的包容之义、栽培之恩与拥抱之情。我义无反顾，别无悬念，只有勇往直前，全力以赴！
四百多年来，台湾这块土地一直慷慨的接纳著先来后到的移民，滋养、庇护著我们，提供我们及后代子孙安身立命的空间，并以高峻的山峰、壮阔的大海，充实、淬砺著我们的心灵。我们继承的种种历史文化，不但在这片土地上得到延续，更得到扩充与创新，进而开创出丰盛多元的人文风景。
“中华民国”也在台湾得到了新生。在我任内，我们将庆祝“中华民国”“开国”一百周年。这一个亚洲最早诞生的民主共和国，在大陆的时间只有三十八年，在台湾的岁月却将超过一甲子。在这将近六十年间，“中华民国”与台湾的命运已经紧紧的结合在一起，共同经历了艰难险阻与悲欢岁月，更在追求民主的曲折道路上，有了长足的进步。“国父”孙中山先生的民主宪政理想，当年在中国大陆没有能够实现，但今天在台湾终于生根、开花、结果。
面对台湾的未来，英九充满了信心。多年来我走遍台湾各个角落，在与各行各业的互动当中，让我感受最深刻的就是：地无分南北，人无分老幼，善良、正直、勤奋、诚信、包容、进取这一些传统的核心价值，不但洋溢在台湾人的生活言行，也早已深植在台湾人的本性里。这是台湾一切进步力量的泉源，也是“台湾精神”的真谛。
盱衡时局，环顾东亚，台湾拥有绝佳的地理位置、珍贵的文化资产、深厚的人文素养、日渐成熟的民主、活力创新的企业、多元和谐的社会、活跃海内外的民间组织、遍布全球的爱乡侨民，以及来自世界各地的新移民。只要我们秉持“台湾精神”，善用我们的优势，并坚持“以台湾为主，对人民有利”的施政原则，我们一定可以将台澎金马建设为举世称羡的乐土、我们引以为傲的美丽家园。
台湾的振兴不只要靠“政府”的努力，更要靠人民的力量；需要借重民间的智慧、需要朝野协商合作、需要所有社会成员积极的投入。各位亲爱的父老兄弟姊妹们，我们要从此刻开始，卷起袖子，立即行动，打造美丽家园，为子孙奠定百年盛世的基础。让我们心连心、手牵手，大家一起来奋斗！2012连任2012年5月20日马英九在台北就任新一届台湾当局领导人，开始第二个任期。
他在就职演说中表示，过去四年，我们改善两岸关系，降低台海紧张，带来和平与繁荣，获得广大民众的支持。我们依循“先急后缓，先易后难，先经后政”的原则推动两岸交流，在经贸、交通、卫生、文化、教育、司法、金融等各方面都创下历史新高。
马英九强调，两岸人民同属中华民族，都是炎黄子孙，拥有共同的血缘、历史与文化，也都同样尊崇孙中山先生。未来四年，两岸要开拓新的合作领域，继续巩固和平、扩大繁荣、深化互信。
马英九表示，未来四年将以强化经济成长动能、创造就业与落实社会正义、打造低碳绿能环境、厚植文化实力以及积极培育延揽人才作为五大支柱，“打造幸福台湾”。这是他第二任期的施政目标。[10]
个人观点
钓鱼岛问题2010年10月22日，马英九接受美联社专访时强调，钓鱼岛“从地理与地质上言，都属于台湾”。
据台湾《联合报》报道，马英九10月19日接受美联社专访。据台当局公布录音与全文纪录，马英九逐一诠释两岸和“外交政策”意涵。至于统一问题，马称就政治层面而言台湾格外谨慎，目前倾向于把大陆当作贸易伙伴，一个从事生意、求学及文化教育交流的地方。
马英九说，如果台湾位于夏威夷的位置，也许可以与大陆保持距离，但台湾与大陆紧密相连，两岸经济自然密不可分。目前两岸已签署14项经济协议，双方已建立一定程度的互信，合作前景非常好。
在专访过程中，马英九还罕见地论述了钓鱼岛“主权”，他列举自己写过三本“保钓书”，强调钓鱼岛“从地理与地质上言，都属于台湾”，并主张钓鱼岛事件“解决方案”就是“共同开发、资源共享”。[11]两岸问题想到大陆祭祖父
据台湾媒体报道，马英九2011年01月18日晚到宜兰传艺中心与大专学生座谈，畅谈过去的求学经验，有学生问他，如果有机会到大陆，最想去那里。马英九回答说，想去看看祖父墓地。
据报道，宜兰传艺中心昨晚办演讲会，邀请马英九担任主讲人，活动结束后，马英九赠送学生红包袋当礼物。学生陈冠妤转述说，马英九谈起求学历程，台湾大学毕业后赴美留学，学成返台担任蒋经国翻译，受蒋经国影响很大。
马英九讲完后，开放大学生提问。学生问题五花八门，其中一名学生问马英九，若有机会想去大陆那个城市？马英九稍作停顿，接着回答说，想去看看祖父墓地。[12]
解决两岸争端需要耐心、爱心与恒心
据“中央社”报道，台湾当局领导人马英九2011年01月28日表示，两岸都需要经过一段很长的历史阶段，透过深度交流，在中华文化智慧导引下，找出解决两岸争端的方法。这不是简单工程，需要耐心、爱心与恒心。
马英九今天上午在台北出席台湾当局“陆委会”20周年会庆茶会时做上述表示。他说，当局现在的两岸政策是“双赢且良性循环”。他说，对等、互惠与尊严是两岸协商原则，六次“陈江会谈”签订的协议与共识，没有一个字损害台湾尊严，开拓一条新道路，目的希望达到两岸和平繁荣。
他表示，大陆已是全球第二大经济体，对台湾有什么影响，不论喜欢与否，都必须面对，更要以务实态度，找出双方都接受的合作方式，发挥台湾实力，这才是大陆政策与两岸关系最主要目标。
马英九还说，欣慰推动新的大陆政策后，和解气氛愈来愈浓，两岸人民同属中华民族，都是炎黄子孙，希望往后两岸人民永远不要再兵戎相见。[13]
名字的来历
马英九的名字是“根据上尊大人，英才继起”的族谱而来；取名“九”字，则是希望能以“九思”立身，意即：视思明、听思聪、色思温、貌思恭、言思忠、事思敬、疑思问、忿思难、见得思义。 另希望身体如“九如”般健康之意，意即：如山如阜、如冈如陵、如山之方至、如月之恒、如日之升、如南山之寿、如松柏之茂。但另有说法指马英九生于香港九龙广华医院，便取即“英殖民地”和“九龙”的简语，称“英九”。[14]