标题：EVA-ANIMA
作品由来
从2008年1月至今一直在DHM日版连载的EVA官方同人小说。
这部作品会出现的起因主要是在2004年末，导演庵野秀明向EVA机设的山下いくと聊起今后EVA的各种构想开始。而其中一种构想就是「希望让EVA像《钢弹》那样多元化」。听到这话的山下也随性跟庵野说起他曾经有想过原创的EVA企划，那是跳脱EVA原本的故事型态“偏向科幻作品那样、朝着宇宙前进” 这样的内容。
庵野就对山下说「随你去做吧，反正贞本那边（漫画）也在随自己意思画了，使用EVA的标题也可以」这样干脆的放手让山下去玩。
其结果就是现在这个《ANIMA》，以山下いくと为总指挥兼机设、曾经做过动画板原画与在同人界各方面都出名的うたたねひろゆき来做人设、以及架空战记作家，以对战车很有爱的阴山琢磨来执笔。
《ANIMA》,是指“灵魂所在”。
故事设定《ANIMA》的故事设定。是以「『人类补完计划』没有发动的世界3年后」作为舞台。
主要剧情分歧点在于TV板24话完结的时候，从这个点开始与旧剧场板新25、26话走向不同的剧情进展。(「24话结束时分歧故事」是日WiKi的资料，因为来源不明所以只能认为该WiKi笔者是以24话是渚薫死亡才作此判断。)
而内容最主要分歧点，是以加持的努力成果为最大关键，一切都是因为他逃过谍报部的追杀，活下来揭露SEELE的内幕给国联和日本政府，故事才因此整个大转弯。
进而导致SEELE所发动的人类补完计划失败，全人类都活下来的世界，以及真嗣他们17岁开始的崭新故事。
故事梗概因为NERV特殊调查部所属的加持的活跃，SEELE打算用战略自卫队强制占领NERV、使用EVA量产机强制执行人类补完计划的事全都在事前就被察觉。
SEELE打算执行『人类补完计划』、以及其计划的全貌内容(全人类变LCL)这两件事冲击了国联和日本政府，预定要侵攻NERV日本本部的战略自卫队被介入中止。
不过因为内部有SEELE的间牒的关系，国连与日本政府陷入了混乱状态，在支援对策迟迟无法决定的情况下，NERV日本本部只能独力应对不知何时会造访的与SEELE的决战。
得知SEELE的奇袭战力是九架量产机和复制的朗机努司之枪，对于目前NERV日本本部只有初号机能迎击，零号机再生中、二号机驾驶精神崩溃的情况，可说是很绝望的战力差。
于是，NERV日本本部只好开始加速实用化原本因为SEELE怕造反而阻止、冻结的「AT领域制御用实验机－通称F型EVA」的研究。
在初号机与零号机换上F型装备时，量产机来袭了。这时原本为了避难而丢到湖底的二号机和明日香，因发现二号机中着"母亲"而觉醒，并且紧急应对量产机。不过结果还是旧剧场版一样，AT力场抵挡不了量产机所拥有的复制版朗努基斯之枪，二号机被爆头钉在地上。
在这个关键时刻，F型EVA;初号机与零号机就赶来救援，二号机才没有遭受量产机啃食。
剧透在正式故事开始前的三年间，发生了各种事。
首先就是，由於SEELE的崩坏，让NERV日本本部的政治立场变的相当微妙。当下的NERV日本本部是世界唯一保有三架能实用的EVA、以及与其有关的各种研究情报的组织。不过NERV日本本部因为与SEELE的战斗，人员与本部设施都损伤惨重，继续保持独力运作性是困难的。所以各国政丨防和谐丨府与旗下的NERV支部都提出了提出了接收的邀请。但是基於中央教条区内那「被冻结的人类补完计划遗物」是怎样也不能交给其他组织的考量，都被驳回。在加上，量产机残骸消失的问题。原本有三台量产机於本国进行解体，而剩下的就委托给他国的NERV分部，但却在运送过程中消失了。驳回其他组织的邀请、量产机残骸的消失、加上SEELE的存在是否真的完全消灭也无法确认。他者威胁性依然高的可怕。即使有3架EVA的战力，但不见得就能面对各种兵科的全面饱和攻击。所以为了争取重建时间，比起加速重建，NERV日本本部更优先选择加速武装的强化。第一个出现的企划，就是「达摩克里斯之剑」建造在第三新东京市上空的卫星轨道上，保护第三新东京市的超远距离狙击要塞。号称能够把对陆海空各种领域侵略的敌人击破的战力。而「达摩克里斯之剑」内容其实就是三架新造的零号机改，正式名称为「零号机试制II式改?领域制压机利用了在本部防卫战中所获得的EVA量产机残骸，加上移植试作零号机的组件，所新造出来的三架零号机改。有著AT领域这种对现代兵器的无敌之盾，以及量产机的S2机关再活性化后所获得的无限能源与无限制丨防和谐丨作战时间。
武器上原本是打算利用在防卫战活跃的「天使的背骨(脊椎)」，但F型零号机当初在制丨防和谐丨作中发生大规模的精神污染事故，被判断量产困难。於是就转用了γ线雷射炮装备，虽说是现代兵器，但只要有S2机关的超绝出力，仍然有可能达到贯通使徒等级的AT领域的威力。尽管有各种困难，但「达摩克里斯之剑」的计划在一年内几乎就实战化了。预料之外的反而是操纵员的问题。三架零号机改都只接受第一适格者绫波零的操控，并不接受真嗣、明日香、以及冬二的操控。而模拟插入栓又有暴走与各种问题所以不打算使用。计划虽然遇到了重大的问题，但后来却以意外的方式解决了。因为绫波零还有三个人。由於调整槽被赤木律子破坏的关系，大半的绫波零克隆体都消灭了，但却有两位因为双胞胎实验用活性化而逃过一劫，以及后来才生产的一位。虽然不知什麼原因克隆体居然产生了人格，而他们这些零波克隆体可以与绫波零(第三人)互相做零时差的远隔精神感应(知觉同调)。在这之后两年，三架新的零号机，与被称为カトル(q丨防和谐丨uatre/4)、サンク(cinq/5)、シス(six/6)的三位零克隆体就以绝对守护君临於第三新东京市的空域。第二个就是「NERV日本本部」的解散，与「NERV JAN」的改组与成丨防和谐丨立。主要改组原因是因为考虑到旧NERV的组织型态很容易受其他组织的加害与压迫(特别是与最大的后盾SEELE翻脸还反将一军之后，保有EVA等各种令人忌妒的东西的现在)。因此，以美理为中心，NERV彻底进行改组，以武力为背景，让权限扩大，最后以「NERV JAN」重生。
  
剧情人物
碇真嗣
第三适格者
第三新东京市 市立第一高等学校的17岁少年，班长，初号机的驾驶员。碇真嗣三年后逐渐变得稳重的真嗣，除了留起小马尾外，也和加持一样以种西瓜为兴趣,看来受加持荼毒很深。。。
显然，受加持的影响很大。  碇真嗣绫波零(第三人/No.トロワ)
第一适格者
第三新东京市 市立第一高等学校的17岁少女，零号机驾驶员。虽然是第三人，但经过三年洗礼后，个性也变的比较像个人了。
三年后与三年前最大的差别就是——她在看小说。
尽管我除了被创造的灵魂之外便一无所有。
而灵魂是否为承袭之物?
倘若如此，妹妹们 你们并不孤独
第二位我的思念 一定会守护着(你们)...
  凌波零惣流·明日香·兰葛雷
第二适格者
第三新东京市 市立第一高等学校的17岁少女，二号机的驾驶员。与绫波也不再如此针眼相对的明日香在NERV日本本部防卫战那次觉醒之后，近乎失去的EVA驾驶资格也拿回来了。
虽说绫波(第三人)发育良好，但是依然赢不过明日香啊。。。
  惣流·明日香·兰葛雷三位绫波零克隆体 
「EVA」三机的驾驶员。为了长期任务而被改造过。绫波零：No.カトル(右)、绫波零：No.サンク(左)
与既存的第三位绫波零同生产日期的双胞胎。因为额外的实验而逃过了律子毁掉调整槽的劫难。
为了外表分辨，カトル染了银发，サンク剪了短发。另外カトル的战斗服是黑色系。
  三位绫波零克隆体绫波零Noシス
被美里称呼为“小波”
外表看似5岁，但实际年龄是17岁。原本生产时有打算要做17岁加龄处理，不过不知道会对身体造成什么影响，最后还是维持现状。三位零波克隆体为了分辨，名称上都以法语的数字称呼(因为"绫波零"主要是在称呼第三人)カトル(quatre)是法语的4，サンク(cinq)是5，シス(six)是6。另外第三位零有时也会被称呼No.トロワ(trois)，也就是3。
  绫波零Noシス葛城美里
日本NERV总司令 32岁
战略自卫队的阶级是将军。原总司令碇源堂在本部攻防战中被认定KIA(死亡)而在三年间担任了司令代理，后来正式晋升为总司令。
现在可说是NERV目前最核心的人物。
  葛城美里铃原冬二
第四适格者
第三新东京市 市立第一高等学校的17岁少年。虽然因为使徒引起的三号机暴走事故而负伤，但靠着人体生物组织技术与人造义肢而复归。因为与各个EVA驾驶员都沟通得很不错，所以被委任NERV副司令代理，尽管那关西幽默偶尔会大大冷场。也因为是第四适格者的关系，平时也帮助EVA器材做实验。
  伊吹摩耶
日本NERV的技术开发部技术局一课负责人。
战略自卫队的阶级是三佐。管辖了在攻防战中被认定KIA(死亡)的前辈赤木律子负责的所有任务与技术。EVA开发也是由她在负责。与三年前不同的是她带了眼镜，那是前辈赤木律子的遗物。
表面上是继承律子的技术部目前最核心的人，然而私底下心灵依然脆弱。
  加持良治
所属日本NERV间谍部。为了搜索潜伏的SEELE残党，与相田剑介在世界各国旅行中。。。
  冬月耕造
原NERV日本本部副司令。在原NERV解体时，因为隐瞒“人类补完计划”等情报而处以国家叛逆罪而入狱。一年后因为生病疗养出狱，而后回到京都隐居。