ALP：胆汁淤积和胆道损伤的标志物血清ALP的活性是提示胆汁淤积症的间接标志。研究表明，血清ALP的活性对患者的远期预后，以及熊去氧胆酸(UDCA)治疗原发性胆汁肝硬化（又名原发性胆汁性胆管炎）(PBC)和原发性硬化性胆管炎（PSC)应答效果有良好的提示作用。因此，血清ALP活性在临床试验中可作为评价新治疗方法的终点指标，以及评估病情严重程度的替代指标。部分PBC和PSC的患者对于药物治疗无应答，这与该类疾病炎症反应的发生以及发展的机制相关。尽管这两种胆道炎症性疾病都具有“自身免疫”的特点，但免疫抑制疗法无法改善病情。
相反，UDCA在治疗PBC上有明显疗效，同样对PSC的治疗也有一定效果。这与之前所提到的自身免疫相关理论是相矛盾的。UDCA的主要作用在于刺激肝细胞和胆管分泌胆汁，其良好的治疗效果可能与这两种“自身免疫性”疾病发生、发展的微环境相关。
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生理条件下的ALP和肝脏ALP
ALP是糖基化磷脂酰肌醇(GPI)锚胞外磷酸单酯酶的多个亚型在不同组织表达的产物。它可以改变来源于宿主的核苷酸如ATP、ADP和尿苷二磷酸的水解磷酸酶和磷酸变位酶活性，具有广谱的病原体相关分子模式(PAMP)和危险相关分子模式