揭“中国百慕大”人畜失踪、指南针失灵之谜……黑竹沟的谜团还有更多专家们实地调查时，指南针、罗盘靠近玄武质火山岩体时，其指向会明显偏离磁北方向。　刘忠俊　摄
在网络上，“人畜进入黑竹沟屡屡出现失踪和死亡”，被列为黑竹沟六大未解之谜之首。而据黑竹沟景区管委会主任郭云城介绍，“这些都是有据可查的事情”。
1950年
国民党胡宗南残部30余人穿越黑竹沟后无一人生还。
1966年
解放军某部测绘队派出3名战士购粮途经黑竹沟失踪。
1976年
四川森堪一大队三名队员失踪于黑竹沟。
2007年7月
央视《走近科学》栏目摄制组在黑竹沟拍摄《北纬30°》系列节目，拍摄组挑选了4只品种优良的信鸽到沟口景区放飞，但7天过去，信鸽始终没有飞回来，就这样无声无息地消失了。
2014年8月
5名驴友前往黑竹沟探险，其中3名驴友在黑竹沟失联。搜救40多天后，搜救人员先后发现其中两名失联驴友的遗体，但该探险队队长李静至今杳无音讯。
2015年8月
重庆小伙李某某独自前往黑竹沟景区探险后失联。景区及家属方组织了20多支队伍，上百人前往搜救，至今无任何线索。
黑竹沟石门关地磁异常空间变化大
此外，在黑竹沟里还曾发生过指南针大幅偏差、摄像机电池突