Saccharibacteria

SaccharibacteriaframelessCa. Nanosynbacter lyticus (TM7x, yashil) va bakterial xostlar (qizil).Biologik tasnifiOlam:BacteriaTartibi:CPR groupTip:SaccharibacteriaAlbertsen et al. 2013Sinf:"Saccharimonadia"corrig. McLean et al. 2020Turkum:"Saccharimonadales"corrig. McLean et al. 2020Tipga mansub oilalar „Nanogingivalaceae“
 „Nanoperiodontomorbaceae“
 „Nanosynbacteraceae“
 „Nanosyncoccaceae“
 „Saccharimonadaceae“Sinonimlari Candidate division TM7

Saccharibacteria — yumaloq bakteriyalar guruhiga mansub boʻlgan bakteriyalarning yirik guruhi boʻlib, ilgari TM7 nomi bilan tanilgan' name="Saccharibacteria"> asosiy bakterial guruhidir. U 16S rRNK tanlash orqali kashf etilgan.

 Uchrashi 
Odamning ogʻiz boʻshligʻidan TM7x uchraydi va TM7x juda kichik kokk o‘lchamiga ega bo‘lib (200-300 nm ekanligini aniqladi), insoniyatga maʼlum boʻlgan mikroblarda ilgari kuzatilmagan oʻziga xos hayot tarziga ega boʻlgan. Bu bakteriyalar turli xildagi tuzilishga ega boʻlib, epibiontikligi, jumladan Actinomyces odontolyticus shtammi (XH001), parazitar fazaga ega boʻlishi bilan farqlanadi. Toʻliq genom ketma-ketligi juda kamaygan (705 kB) va aminokislotalarning biosintetik qobiliyatining toʻliq yetishmasligini aniqlangan. 2014-yilda ogʻiz boʻshligʻidan TM7x aksenik hayot sikli haqida xabar berilgan.

Candidate Phylum TM6 bilan bir qatorda, 1994-yilda Germaniyadagi torf botqogʻining tuproq namunasini atrof-muhitni oʻrganishda olingan namunalar ketma-ketliklari sharafiga nomlangan boʻlib, bu yerda 262 PCR kuchaytirilgan 16S rDNK fragmentlari uchun TM klonlari deb nomlangan plazmid vektoriga klonlangan. (lit. torf, oʻrta qatlam). U bir nechta muhitda topilgan, masalan, botqoqliklardan, suv tozalash inshootlaridan name="fish">Hugenholtz, P.; Tyson, G. W.; Webb, R. I.; Wagner, A. M.; Blackall, L. L. (2001). „Investigation of Candidate Division TM7, a Recently Recognized Major Lineage of the Domain Bacteria with No Known Pure-Culture Representatives“. Applied and Environmental Microbiology. 67 (1): 411-419. Bibcode:2001ApEnM..67..411H. doi:10.1128/AEM.67.1.411-419.2001. PMC 92593. PMID 11133473., tropik oʻrmon tuprogʻidan, inson soʻlagidan, gubkalar bilan bogʻliq holatlardan, suvaraklardan, oltin konlaridan, asetat bilan oʻzgartirilgan suvli qatlam choʻkindilaridan va boshqa muhitlardan topilgan (bar termofil). Yaqinda TM7 rDNK va butun hujayralar inson terisiga 99,7% TM7 va 98,6% inson ogʻziga TM7a bilan oʻxshashlik bilan tuproqlarda aniqlandi name="pmid21701585">, atrof-muhit joylarida metabolik faol TM7 izolatlari model organizmlar boʻlib xizmat qilishi mumkin. TM7 ning inson salomatligidagi rolini oʻrganilmoqda.

 Xususiyatlari 
TM7 oʻziga xos FISH problari bioreaktor loyidan aniqlangan ni gram-musbat hujayra konvertlari va bir nechta morfotiplar mavjudligini aniqladi: qobiqli filament (koʻp), qisqa zanjirlarda uchraydigan tayoqchalari, qalin filament va kokklari; birinchisi Eikelboom 0041 turining sababi boʻlishi mumkin (faollashtirilgan shtammlarining koʻpayishi bilan bogʻliq muammolar) name="fish">. Bakteriyalar oilasining aksariyati gram-manfiy didermalar koʻrinishida boʻlib, faqat Bacillota, Actinomycetota va Chloroflexota monodermlari koʻp uchraydi name="giovannoni">. Saccharibacteria guruhiga oid 50 dan ortiq turli xil filotiplar aniqlangan boʻlibRappe, M. S.; Giovannoni, S. J. (2003). „The Uncultured Microbial Majority“. Annual Review of Microbiology. 57: 369-394. doi:10.1146/annurev.micro.57.030502.090759. PMID 14527284. u nisbatan oddiy intradivizion 16S rDNK ketma-ketligi 17% ni tashkil qiladi, bu koʻrsatgich 13 dan 33% gachaHugenholtz, P.; Tyson, G. W.; Webb, R. I.; Wagner, A. M.; Blackall, L. L. (2001). „Investigation of Candidate Division TM7, a Recently Recognized Major Lineage of the Domain Bacteria with No Known Pure-Culture Representatives“. Applied and Environmental Microbiology. 67 (1): 411-419. Bibcode:2001ApEnM..67..411H. doi:10.1128/AEM.67.1.411-419.2001. PMC 92593. PMID 11133473. jsPhyloSVGDinis, J. M.; Barton, D. E.; Ghadiri, J.; Surendar, D.; Reddy, K.; Velasquez, F.; Chaffee, C. L.; Lee, M. C. W.; Gavrilova, H.; Ozuna, H.; Smits, S. A.; Ouverney, C. C. (2011). Yang, Ching-Hong (ed.). „In Search of an Uncultured Human-Associated TM7 Bacterium in the Environment“. PLOS ONE. 6 (6): e21280. Bibcode:2011PLoSO…621280D. doi:10.1371/journal.pone.0021280. PMC 3118805. PMID 21701585. qurilgan TM7 ning interaktiv filogenetik daraxti GenBank ketma-ketliklariga va daraxt shoxlari orasidagi masofa matritsasi hisoblariga tez kirish imkoniyatini berishi oʻziga xos xususiyatidir.

Barqaror izotoplarni tekshirish tadqiqotlari ushbu turlarning baʼzi aʼzolari toluolni parchalashi mumkinligini aniqlaganlar.

 Taksonomiyasi 

Hozirgi vaqtda qabul qilingan taksonomiya Nomenklaturasida (LPSN) va Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi (NCBI)Sayers; et al. „Saccharibacteria“. National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Retrieved 2021-03-20. bilan prokariotik nomlar roʻyxatiga asoslanadi.

 " Saxarimonadiya „ sinfi . McLean va boshqalar. 2020 “Nanoperiodontomorbia" korrig. McLean va boshqalar. 2020 ; „Nanosinkoksiya“ korrigiyasi. McLean va boshqalar. 2020 
 Ordeni " Saccharimonadales „ McLean va boshqalar. 2020 “Nanogingivalales" korrig. McLean va boshqalar. 2020 ; „Nanoperiodontomorbales“ korrigiyasi. McLean va boshqalar. 2020 ; „Nanosinbakterallar“ McLean va boshqalar. 2020 ; „Nanosyncoccales“ McLean va boshqalar. 2020 
 "Ka. Chaera " korrig . Lemos va boshqalar. 2019
 "C. C. Renei " korrig. Lemos va boshqalar. 2019
 " Ca. Minimicrobia " Ibrohim va boshqalar. 2021 yil
 „ Ca. M. naudis“ Ibrohim va boshqalar. 2021 yil
 „ Ca. M. vallesae“ Ibrohim va boshqalar. 2021 yil
 " Ca. Mycosynbacter " Batinovic va boshqalar. 2021 (JR1)
 „ Ca. M. amalyticus“ Batinovich va boshqalar. 2021 yil
 "Ka. Nanosynsaccharibacterium " korrig . McLean va boshqalar. 2020
 Oila " Nanogingivalaceae " McLean va boshqalar. 2020
 " Ca. Nanogingivalis " McLean va boshqalar. 2020 (CMJM_G6_1_HOT_870; UMGS1907)
 „ C. N. gingivitcus“ McLean va boshqalar. 2020
 Oila " Nanoperiodontomorbaceae " korrig. McLean va boshqalar. 2020
 "Ka. Nanoperiodontomorbus " korrig . McLean va boshqalar. 2020 (EAM_G5_1_HOT_356; UBA1103)
 „ Ca. N. periodonticus“ korrigiyasi. McLean va boshqalar. 2020
 Oila " Nanosinbakteraceae " McLean va boshqalar. 2020
 „ Ka. Nanosinbakter “ McLean va boshqalar. 2020 (TM7x)
 „ Ca. N. lyticus“ McLean va boshqalar. 2020
 Oila " Nanosinkoccaceae " McLean va boshqalar. 2020
 " Ca. Nanosyncoccus " McLean va boshqalar. 2020 (G3_2_Rum_HOT_351B; UBA2866)
 „ Ka . N. alces“ McLean va boshqalar. 2020
 „ Ca. N. nanoralicus“ McLean va boshqalar. 2020
 Oila " Saccharimonadaceae " McLean va boshqalar. 2020
 " Ca. Saccharimonas " Albertsen va boshqalar. 2013 yil
 „ Ka . S.“ Albertsen va boshqalar. 2013 yil
 Oila UBA1547
 "Ka. Microsaccharimonas " korrig . Lemos va boshqalar. 2019 (AMD02; UBA6175)
 „ Ca. M. sossegonensis“ korrigiyasi. Lemos va boshqalar. 2019

 Filogeniyasi 
 TM7 filumining va uning eng yaqin qarindoshlarining munosabati name=giovannoni> Dinis va boshqalarga koʻra nomlangan kichik guruhlarning soddalashtirilgan filogenetik daraxti. 2011-yil.

 Yana qarang 
 Bakteriyalar avlodlari roʻyxati

 

 

 Er osti suvlarida topilgan oʻta kichik, parazit bakteriyalar, itlar, mushuklar — Va siz; kuni: SciTechDaily; 2020 yil 21 iyul; Manba: Forsit instituti
 Jeffri S. Maklin, Batbileg Bor, Kristofer A. Kerns, Kelli Rayton, Venyuan Shi, Xuesong Xe va boshqalar . al. : Ultra-kichik parazit reduksiyalangan genomli bakteriyalarni sutemizuvchilar xostlariga olish va moslashtirish; ichida: CellRep 32, 107939; 2020 yil 21 iyul; doi:10.1016/j.celrep.2020.107939
 Jeffri S. McLean, Batbileg Bor, Thao T. To, Quanhui Liu, Kristofer A. Kerns, Lindsey Solden, Kelly Wrighton, Xuesong He, Wenyuan Shi: mustaqil ravishda sotib olish va juda kichik bakteriyalarni inson xostlariga moslashtirishning yuqori darajadagi dalili. Saccharibacteria filumining xilma-xil, ammo qisqartirilgan genomlari; ustida: bioRxiv; 2018 yil 02 fevral; doi: 10.1101/258137 (PrePrint)
Turkum:Bakteriyalar
Turkum:Bakteriyalar tasnifi
Turkum:Mikrobiologiya
Turkum:Saccharibacteria