; LLVM IR from alexzheng42/sDMD :: src (ToolFunctions)

; Unoptimized IR (clang -disable-llvm-passes):
target datalayout = "e-m:e-p270:32:32-p271:32:32-p272:64:64-i64:64-i128:128-f80:128-n8:16:32:64-S128"
target triple = "x86_64-unknown-linux-gnu"

%struct.AtomStr = type { ptr, ptr }
%struct.DynamicStr = type { [4 x i32], [4 x double], [4 x double], %struct.HBStr, %struct.HBNeighborStr, %struct.InteractionEventStr }
%struct.HBStr = type { i32, i32, i8, i32 }
%struct.HBNeighborStr = type { [5 x i32], i32, i32 }
%struct.InteractionEventStr = type { i32, i64, i64, double, double, i32, i32 }

@atomnum = external global i32, align 4
@atom = external global ptr, align 8
@.str = external hidden unnamed_addr constant [10 x i8], align 1
@.str.3 = external hidden unnamed_addr constant [11 x i8], align 1
@.str.5 = external hidden unnamed_addr constant [3 x i8], align 1
@.str.6 = external hidden unnamed_addr constant [9 x i8], align 1
@connectionMap = external global ptr, align 8
@__const.CalPotenE.x = external hidden unnamed_addr constant [27 x i32], align 16
@__const.CalPotenE.y = external hidden unnamed_addr constant [27 x i32], align 16
@__const.CalPotenE.z = external hidden unnamed_addr constant [27 x i32], align 16
@cellnum = external global [4 x i32], align 16
@boxDimension = external global [4 x double], align 16
@celllist = external global ptr, align 8
@cutoffr = external global double, align 8

; Function Attrs: nocallback nofree nosync nounwind willreturn memory(argmem: readwrite)
declare void @llvm.lifetime.start.p0(i64 immarg, ptr nocapture) #0

; Function Attrs: nocallback nofree nosync nounwind willreturn memory(argmem: readwrite)
declare void @llvm.lifetime.end.p0(i64 immarg, ptr nocapture) #0

; Function Attrs: nocallback nofree nosync nounwind speculatable willreturn memory(none)
declare double @llvm.fmuladd.f64(double, double, double) #1

; Function Attrs: nounwind uwtable
declare dso_local i32 @FindPair(ptr noundef, ptr noundef, ptr noundef, double noundef, double noundef, ptr noundef, ptr noundef, ptr noundef, ptr noundef, ptr noundef, ptr noundef, i32 noundef) #2

; Function Attrs: nounwind
declare i32 @sprintf(ptr noundef, ptr noundef, ...) #3

; Function Attrs: nocallback nofree nounwind willreturn memory(argmem: write)
declare void @llvm.memset.p0.i64(ptr nocapture writeonly, i8, i64, i1 immarg) #4

; Function Attrs: nocallback nofree nounwind willreturn memory(argmem: readwrite)
declare void @llvm.memcpy.p0.p0.i64(ptr noalias nocapture writeonly, ptr noalias nocapture readonly, i64, i1 immarg) #5

; Function Attrs: nounwind uwtable
define dso_local double @CalPotenE() #2 {
  %1 = alloca [27 x i32], align 16
  %2 = alloca [27 x i32], align 16
  %3 = alloca [27 x i32], align 16
  %4 = alloca i32, align 4
  %5 = alloca i32, align 4
  %6 = alloca i32, align 4
  %7 = alloca i32, align 4
  %8 = alloca [4 x i32], align 16
  %9 = alloca i32, align 4
  %10 = alloca ptr, align 8
  %11 = alloca [20 x i8], align 16
  %12 = alloca double, align 8
  %13 = alloca [4 x double], align 16
  %14 = alloca [4 x double], align 16
  %15 = alloca [4 x double], align 16
  %16 = alloca [4 x double], align 16
  %17 = alloca [4 x double], align 16
  %18 = alloca double, align 8
  %19 = alloca double, align 8
  %20 = alloca double, align 8
  %21 = alloca double, align 8
  %22 = alloca [4 x double], align 16
  %23 = alloca ptr, align 8
  %24 = alloca i32, align 4
  %25 = alloca i32, align 4
  %26 = alloca i32, align 4
  %27 = alloca i32, align 4
  call void @llvm.lifetime.start.p0(i64 108, ptr %1) #7
  call void @llvm.memcpy.p0.p0.i64(ptr align 16 %1, ptr align 16 @__const.CalPotenE.x, i64 108, i1 false)
  call void @llvm.lifetime.start.p0(i64 108, ptr %2) #7
  call void @llvm.memcpy.p0.p0.i64(ptr align 16 %2, ptr align 16 @__const.CalPotenE.y, i64 108, i1 false)
  call void @llvm.lifetime.start.p0(i64 108, ptr %3) #7
  call void @llvm.memcpy.p0.p0.i64(ptr align 16 %3, ptr align 16 @__const.CalPotenE.z, i64 108, i1 false)
  call void @llvm.lifetime.start.p0(i64 4, ptr %4) #7
  call void @llvm.lifetime.start.p0(i64 4, ptr %5) #7
  call void @llvm.lifetime.start.p0(i64 4, ptr %6) #7
  call void @llvm.lifetime.start.p0(i64 4, ptr %7) #7
  call void @llvm.lifetime.start.p0(i64 16, ptr %8) #7
  call void @llvm.lifetime.start.p0(i64 4, ptr %9) #7
  call void @llvm.lifetime.start.p0(i64 8, ptr %10) #7
  call void @llvm.lifetime.start.p0(i64 20, ptr %11) #7
  call void @llvm.lifetime.start.p0(i64 8, ptr %12) #7
  call void @llvm.lifetime.start.p0(i64 32, ptr %13) #7
  call void @llvm.lifetime.start.p0(i64 32, ptr %14) #7
  call void @llvm.lifetime.start.p0(i64 32, ptr %15) #7
  call void @llvm.lifetime.start.p0(i64 32, ptr %16) #7
  call void @llvm.lifetime.start.p0(i64 32, ptr %17) #7
  call void @llvm.lifetime.start.p0(i64 8, ptr %18) #7
  call void @llvm.lifetime.start.p0(i64 8, ptr %19) #7
  call void @llvm.lifetime.start.p0(i64 8, ptr %20) #7
  store double 0.000000e+00, ptr %20, align 8, !tbaa !5
  call void @llvm.lifetime.start.p0(i64 8, ptr %21) #7
  store double 0.000000e+00, ptr %21, align 8, !tbaa !5
  call void @llvm.lifetime.start.p0(i64 32, ptr %22) #7
  call void @llvm.memset.p0.i64(ptr align 16 %22, i8 0, i64 32, i1 false)
  call void @llvm.lifetime.start.p0(i64 8, ptr %23) #7
  call void @llvm.lifetime.start.p0(i64 4, ptr %24) #7
  store i32 1, ptr %24, align 4, !tbaa !9
  br label %28

28:                                               ; preds = %516, %0
  %29 = load i32, ptr %24, align 4, !tbaa !9
  %30 = load i32, ptr @atomnum, align 4, !tbaa !9
  %31 = icmp sle i32 %29, %30
  br i1 %31, label %33, label %32

32:                                               ; preds = %28
  store i32 2, ptr %25, align 4
  call void @llvm.lifetime.end.p0(i64 4, ptr %24) #7
  br label %519

33:                                               ; preds = %28
  %34 = load ptr, ptr @atom, align 8, !tbaa !11
  %35 = load i32, ptr %24, align 4, !tbaa !9
  %36 = sext i32 %35 to i64
  %37 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %34, i64 %36
  %38 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %37, i32 0, i32 1
  %39 = load ptr, ptr %38, align 8, !tbaa !13
  %40 = getelementptr inbounds %struct.DynamicStr, ptr %39, i32 0, i32 0
  %41 = getelementptr inbounds [4 x i32], ptr %40, i64 0, i64 0
  store ptr %41, ptr %10, align 8, !tbaa !11
  call void @llvm.lifetime.start.p0(i64 4, ptr %26) #7
  store i32 0, ptr %26, align 4, !tbaa !9
  br label %42

42:                                               ; preds = %512, %33
  %43 = load i32, ptr %26, align 4, !tbaa !9
  %44 = icmp sle i32 %43, 26
  br i1 %44, label %46, label %45

45:                                               ; preds = %42
  store i32 5, ptr %25, align 4
  call void @llvm.lifetime.end.p0(i64 4, ptr %26) #7
  br label %515

46:                                               ; preds = %42
  %47 = load ptr, ptr %10, align 8, !tbaa !11
  %48 = getelementptr inbounds i32, ptr %47, i64 3
  %49 = load i32, ptr %48, align 4, !tbaa !9
  %50 = load i32, ptr %26, align 4, !tbaa !9
  %51 = sext i32 %50 to i64
  %52 = getelementptr inbounds [27 x i32], ptr %3, i64 0, i64 %51
  %53 = load i32, ptr %52, align 4, !tbaa !9
  %54 = add nsw i32 %49, %53
  %55 = getelementptr inbounds [4 x i32], ptr %8, i64 0, i64 3
  store i32 %54, ptr %55, align 4, !tbaa !9
  %56 = load ptr, ptr %10, align 8, !tbaa !11
  %57 = getelementptr inbounds i32, ptr %56, i64 2
  %58 = load i32, ptr %57, align 4, !tbaa !9
  %59 = load i32, ptr %26, align 4, !tbaa !9
  %60 = sext i32 %59 to i64
  %61 = getelementptr inbounds [27 x i32], ptr %2, i64 0, i64 %60
  %62 = load i32, ptr %61, align 4, !tbaa !9
  %63 = add nsw i32 %58, %62
  %64 = getelementptr inbounds [4 x i32], ptr %8, i64 0, i64 2
  store i32 %63, ptr %64, align 8, !tbaa !9
  %65 = load ptr, ptr %10, align 8, !tbaa !11
  %66 = getelementptr inbounds i32, ptr %65, i64 1
  %67 = load i32, ptr %66, align 4, !tbaa !9
  %68 = load i32, ptr %26, align 4, !tbaa !9
  %69 = sext i32 %68 to i64
  %70 = getelementptr inbounds [27 x i32], ptr %1, i64 0, i64 %69
  %71 = load i32, ptr %70, align 4, !tbaa !9
  %72 = add nsw i32 %67, %71
  %73 = getelementptr inbounds [4 x i32], ptr %8, i64 0, i64 1
  store i32 %72, ptr %73, align 4, !tbaa !9
  call void @llvm.lifetime.start.p0(i64 4, ptr %27) #7
  store i32 1, ptr %27, align 4, !tbaa !9
  br label %74

74:                                               ; preds = %127, %46
  %75 = load i32, ptr %27, align 4, !tbaa !9
  %76 = icmp sle i32 %75, 3
  br i1 %76, label %78, label %77

77:                                               ; preds = %74
  store i32 8, ptr %25, align 4
  call void @llvm.lifetime.end.p0(i64 4, ptr %27) #7
  br label %130

78:                                               ; preds = %74
  %79 = load i32, ptr %27, align 4, !tbaa !9
  %80 = sext i32 %79 to i64
  %81 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %22, i64 0, i64 %80
  store double 0.000000e+00, ptr %81, align 8, !tbaa !5
  %82 = load i32, ptr %27, align 4, !tbaa !9
  %83 = sext i32 %82 to i64
  %84 = getelementptr inbounds [4 x i32], ptr %8, i64 0, i64 %83
  %85 = load i32, ptr %84, align 4, !tbaa !9
  %86 = icmp slt i32 %85, 0
  br i1 %86, label %87, label %104

87:                                               ; preds = %78
  %88 = load i32, ptr %27, align 4, !tbaa !9
  %89 = sext i32 %88 to i64
  %90 = getelementptr inbounds [4 x i32], ptr @cellnum, i64 0, i64 %89
  %91 = load i32, ptr %90, align 4, !tbaa !9
  %92 = sub nsw i32 %91, 1
  %93 = load i32, ptr %27, align 4, !tbaa !9
  %94 = sext i32 %93 to i64
  %95 = getelementptr inbounds [4 x i32], ptr %8, i64 0, i64 %94
  store i32 %92, ptr %95, align 4, !tbaa !9
  %96 = load i32, ptr %27, align 4, !tbaa !9
  %97 = sext i32 %96 to i64
  %98 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr @boxDimension, i64 0, i64 %97
  %99 = load double, ptr %98, align 8, !tbaa !5
  %100 = fmul double -1.000000e+00, %99
  %101 = load i32, ptr %27, align 4, !tbaa !9
  %102 = sext i32 %101 to i64
  %103 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %22, i64 0, i64 %102
  store double %100, ptr %103, align 8, !tbaa !5
  br label %126

104:                                              ; preds = %78
  %105 = load i32, ptr %27, align 4, !tbaa !9
  %106 = sext i32 %105 to i64
  %107 = getelementptr inbounds [4 x i32], ptr %8, i64 0, i64 %106
  %108 = load i32, ptr %107, align 4, !tbaa !9
  %109 = load i32, ptr %27, align 4, !tbaa !9
  %110 = sext i32 %109 to i64
  %111 = getelementptr inbounds [4 x i32], ptr @cellnum, i64 0, i64 %110
  %112 = load i32, ptr %111, align 4, !tbaa !9
  %113 = icmp sge i32 %108, %112
  br i1 %113, label %114, label %125

114:                                              ; preds = %104
  %115 = load i32, ptr %27, align 4, !tbaa !9
  %116 = sext i32 %115 to i64
  %117 = getelementptr inbounds [4 x i32], ptr %8, i64 0, i64 %116
  store i32 0, ptr %117, align 4, !tbaa !9
  %118 = load i32, ptr %27, align 4, !tbaa !9
  %119 = sext i32 %118 to i64
  %120 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr @boxDimension, i64 0, i64 %119
  %121 = load double, ptr %120, align 8, !tbaa !5
  %122 = load i32, ptr %27, align 4, !tbaa !9
  %123 = sext i32 %122 to i64
  %124 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %22, i64 0, i64 %123
  store double %121, ptr %124, align 8, !tbaa !5
  br label %125

125:                                              ; preds = %114, %104
  br label %126

126:                                              ; preds = %125, %87
  br label %127

127:                                              ; preds = %126
  %128 = load i32, ptr %27, align 4, !tbaa !9
  %129 = add nsw i32 %128, 1
  store i32 %129, ptr %27, align 4, !tbaa !9
  br label %74, !llvm.loop !15

130:                                              ; preds = %77
  %131 = getelementptr inbounds [4 x i32], ptr %8, i64 0, i64 3
  %132 = load i32, ptr %131, align 4, !tbaa !9
  %133 = load i32, ptr getelementptr inbounds ([4 x i32], ptr @cellnum, i64 0, i64 1), align 4, !tbaa !9
  %134 = mul nsw i32 %132, %133
  %135 = load i32, ptr getelementptr inbounds ([4 x i32], ptr @cellnum, i64 0, i64 2), align 8, !tbaa !9
  %136 = mul nsw i32 %134, %135
  %137 = getelementptr inbounds [4 x i32], ptr %8, i64 0, i64 2
  %138 = load i32, ptr %137, align 8, !tbaa !9
  %139 = load i32, ptr getelementptr inbounds ([4 x i32], ptr @cellnum, i64 0, i64 1), align 4, !tbaa !9
  %140 = mul nsw i32 %138, %139
  %141 = add nsw i32 %136, %140
  %142 = getelementptr inbounds [4 x i32], ptr %8, i64 0, i64 1
  %143 = load i32, ptr %142, align 4, !tbaa !9
  %144 = add nsw i32 %141, %143
  %145 = add nsw i32 %144, 1
  store i32 %145, ptr %9, align 4, !tbaa !9
  %146 = load ptr, ptr @celllist, align 8, !tbaa !11
  %147 = load i32, ptr @atomnum, align 4, !tbaa !9
  %148 = load i32, ptr %9, align 4, !tbaa !9
  %149 = add nsw i32 %147, %148
  %150 = sext i32 %149 to i64
  %151 = getelementptr inbounds i32, ptr %146, i64 %150
  %152 = load i32, ptr %151, align 4, !tbaa !9
  store i32 %152, ptr %7, align 4, !tbaa !9
  br label %153

153:                                              ; preds = %505, %130
  %154 = load i32, ptr %7, align 4, !tbaa !9
  %155 = icmp ne i32 %154, 0
  br i1 %155, label %156, label %511

156:                                              ; preds = %153
  %157 = load i32, ptr %7, align 4, !tbaa !9
  %158 = load i32, ptr %24, align 4, !tbaa !9
  %159 = icmp sgt i32 %157, %158
  br i1 %159, label %160, label %505

160:                                              ; preds = %156
  %161 = load ptr, ptr @atom, align 8, !tbaa !11
  %162 = load i32, ptr %7, align 4, !tbaa !9
  %163 = sext i32 %162 to i64
  %164 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %161, i64 %163
  %165 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %164, i32 0, i32 1
  %166 = load ptr, ptr %165, align 8, !tbaa !13
  %167 = getelementptr inbounds %struct.DynamicStr, ptr %166, i32 0, i32 1
  %168 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %167, i64 0, i64 1
  %169 = load double, ptr %168, align 8, !tbaa !5
  %170 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %22, i64 0, i64 1
  %171 = load double, ptr %170, align 8, !tbaa !5
  %172 = fadd double %169, %171
  %173 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %13, i64 0, i64 1
  store double %172, ptr %173, align 8, !tbaa !5
  %174 = load ptr, ptr @atom, align 8, !tbaa !11
  %175 = load i32, ptr %7, align 4, !tbaa !9
  %176 = sext i32 %175 to i64
  %177 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %174, i64 %176
  %178 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %177, i32 0, i32 1
  %179 = load ptr, ptr %178, align 8, !tbaa !13
  %180 = getelementptr inbounds %struct.DynamicStr, ptr %179, i32 0, i32 1
  %181 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %180, i64 0, i64 2
  %182 = load double, ptr %181, align 8, !tbaa !5
  %183 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %22, i64 0, i64 2
  %184 = load double, ptr %183, align 16, !tbaa !5
  %185 = fadd double %182, %184
  %186 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %13, i64 0, i64 2
  store double %185, ptr %186, align 16, !tbaa !5
  %187 = load ptr, ptr @atom, align 8, !tbaa !11
  %188 = load i32, ptr %7, align 4, !tbaa !9
  %189 = sext i32 %188 to i64
  %190 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %187, i64 %189
  %191 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %190, i32 0, i32 1
  %192 = load ptr, ptr %191, align 8, !tbaa !13
  %193 = getelementptr inbounds %struct.DynamicStr, ptr %192, i32 0, i32 1
  %194 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %193, i64 0, i64 3
  %195 = load double, ptr %194, align 8, !tbaa !5
  %196 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %22, i64 0, i64 3
  %197 = load double, ptr %196, align 8, !tbaa !5
  %198 = fadd double %195, %197
  %199 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %13, i64 0, i64 3
  store double %198, ptr %199, align 8, !tbaa !5
  %200 = load ptr, ptr @atom, align 8, !tbaa !11
  %201 = load i32, ptr %24, align 4, !tbaa !9
  %202 = sext i32 %201 to i64
  %203 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %200, i64 %202
  %204 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %203, i32 0, i32 1
  %205 = load ptr, ptr %204, align 8, !tbaa !13
  %206 = getelementptr inbounds %struct.DynamicStr, ptr %205, i32 0, i32 1
  %207 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %206, i64 0, i64 1
  %208 = load double, ptr %207, align 8, !tbaa !5
  %209 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %13, i64 0, i64 1
  %210 = load double, ptr %209, align 8, !tbaa !5
  %211 = fsub double %208, %210
  %212 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %16, i64 0, i64 1
  store double %211, ptr %212, align 8, !tbaa !5
  %213 = load ptr, ptr @atom, align 8, !tbaa !11
  %214 = load i32, ptr %24, align 4, !tbaa !9
  %215 = sext i32 %214 to i64
  %216 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %213, i64 %215
  %217 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %216, i32 0, i32 1
  %218 = load ptr, ptr %217, align 8, !tbaa !13
  %219 = getelementptr inbounds %struct.DynamicStr, ptr %218, i32 0, i32 1
  %220 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %219, i64 0, i64 2
  %221 = load double, ptr %220, align 8, !tbaa !5
  %222 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %13, i64 0, i64 2
  %223 = load double, ptr %222, align 16, !tbaa !5
  %224 = fsub double %221, %223
  %225 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %16, i64 0, i64 2
  store double %224, ptr %225, align 16, !tbaa !5
  %226 = load ptr, ptr @atom, align 8, !tbaa !11
  %227 = load i32, ptr %24, align 4, !tbaa !9
  %228 = sext i32 %227 to i64
  %229 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %226, i64 %228
  %230 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %229, i32 0, i32 1
  %231 = load ptr, ptr %230, align 8, !tbaa !13
  %232 = getelementptr inbounds %struct.DynamicStr, ptr %231, i32 0, i32 1
  %233 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %232, i64 0, i64 3
  %234 = load double, ptr %233, align 8, !tbaa !5
  %235 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %13, i64 0, i64 3
  %236 = load double, ptr %235, align 8, !tbaa !5
  %237 = fsub double %234, %236
  %238 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %16, i64 0, i64 3
  store double %237, ptr %238, align 8, !tbaa !5
  %239 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %16, i64 0, i64 1
  %240 = load double, ptr %239, align 8, !tbaa !5
  %241 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %16, i64 0, i64 1
  %242 = load double, ptr %241, align 8, !tbaa !5
  %243 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %16, i64 0, i64 2
  %244 = load double, ptr %243, align 16, !tbaa !5
  %245 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %16, i64 0, i64 2
  %246 = load double, ptr %245, align 16, !tbaa !5
  %247 = fmul double %244, %246
  %248 = call double @llvm.fmuladd.f64(double %240, double %242, double %247)
  %249 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %16, i64 0, i64 3
  %250 = load double, ptr %249, align 8, !tbaa !5
  %251 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %16, i64 0, i64 3
  %252 = load double, ptr %251, align 8, !tbaa !5
  %253 = call double @llvm.fmuladd.f64(double %250, double %252, double %248)
  store double %253, ptr %19, align 8, !tbaa !5
  %254 = load double, ptr %19, align 8, !tbaa !5
  %255 = load double, ptr @cutoffr, align 8, !tbaa !5
  %256 = load double, ptr @cutoffr, align 8, !tbaa !5
  %257 = fmul double %255, %256
  %258 = fcmp ole double %254, %257
  br i1 %258, label %259, label %504

259:                                              ; preds = %160
  %260 = load ptr, ptr @connectionMap, align 8, !tbaa !11
  %261 = load i32, ptr %24, align 4, !tbaa !9
  %262 = sext i32 %261 to i64
  %263 = getelementptr inbounds ptr, ptr %260, i64 %262
  %264 = load ptr, ptr %263, align 8, !tbaa !11
  %265 = load i32, ptr %7, align 4, !tbaa !9
  %266 = sext i32 %265 to i64
  %267 = getelementptr inbounds i32, ptr %264, i64 %266
  %268 = load i32, ptr %267, align 4, !tbaa !9
  %269 = and i32 %268, 1
  %270 = icmp ne i32 %269, 0
  br i1 %270, label %504, label %271

271:                                              ; preds = %259
  %272 = load i32, ptr %24, align 4, !tbaa !9
  store i32 %272, ptr %4, align 4, !tbaa !9
  %273 = load i32, ptr %7, align 4, !tbaa !9
  store i32 %273, ptr %5, align 4, !tbaa !9
  store ptr null, ptr %23, align 8, !tbaa !11
  %274 = load ptr, ptr @connectionMap, align 8, !tbaa !11
  %275 = load i32, ptr %4, align 4, !tbaa !9
  %276 = sext i32 %275 to i64
  %277 = getelementptr inbounds ptr, ptr %274, i64 %276
  %278 = load ptr, ptr %277, align 8, !tbaa !11
  %279 = load i32, ptr %5, align 4, !tbaa !9
  %280 = sext i32 %279 to i64
  %281 = getelementptr inbounds i32, ptr %278, i64 %280
  %282 = load i32, ptr %281, align 4, !tbaa !9
  %283 = and i32 %282, 4
  %284 = icmp ne i32 %283, 0
  br i1 %284, label %285, label %299

285:                                              ; preds = %271
  %286 = getelementptr inbounds [20 x i8], ptr %11, i64 0, i64 0
  %287 = call i32 (ptr, ptr, ...) @sprintf(ptr noundef %286, ptr noundef @.str.5) #7
  %288 = load ptr, ptr @atom, align 8, !tbaa !11
  %289 = load i32, ptr %4, align 4, !tbaa !9
  %290 = sext i32 %289 to i64
  %291 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %288, i64 %290
  %292 = load ptr, ptr @atom, align 8, !tbaa !11
  %293 = load i32, ptr %5, align 4, !tbaa !9
  %294 = sext i32 %293 to i64
  %295 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %292, i64 %294
  %296 = call double @HBBarrier(ptr noundef %291, ptr noundef %295)
  %297 = load double, ptr %20, align 8, !tbaa !5
  %298 = fsub double %297, %296
  store double %298, ptr %20, align 8, !tbaa !5
  br label %370

299:                                              ; preds = %271
  %300 = load ptr, ptr @connectionMap, align 8, !tbaa !11
  %301 = load i32, ptr %4, align 4, !tbaa !9
  %302 = sext i32 %301 to i64
  %303 = getelementptr inbounds ptr, ptr %300, i64 %302
  %304 = load ptr, ptr %303, align 8, !tbaa !11
  %305 = load i32, ptr %5, align 4, !tbaa !9
  %306 = sext i32 %305 to i64
  %307 = getelementptr inbounds i32, ptr %304, i64 %306
  %308 = load i32, ptr %307, align 4, !tbaa !9
  %309 = and i32 %308, 2
  %310 = icmp ne i32 %309, 0
  br i1 %310, label %311, label %314

311:                                              ; preds = %299
  %312 = getelementptr inbounds [20 x i8], ptr %11, i64 0, i64 0
  %313 = call i32 (ptr, ptr, ...) @sprintf(ptr noundef %312, ptr noundef @.str.3) #7
  br label %369

314:                                              ; preds = %299
  %315 = load ptr, ptr @connectionMap, align 8, !tbaa !11
  %316 = load i32, ptr %4, align 4, !tbaa !9
  %317 = sext i32 %316 to i64
  %318 = getelementptr inbounds ptr, ptr %315, i64 %317
  %319 = load ptr, ptr %318, align 8, !tbaa !11
  %320 = load i32, ptr %5, align 4, !tbaa !9
  %321 = sext i32 %320 to i64
  %322 = getelementptr inbounds i32, ptr %319, i64 %321
  %323 = load i32, ptr %322, align 4, !tbaa !9
  %324 = and i32 %323, 8
  %325 = icmp ne i32 %324, 0
  br i1 %325, label %326, label %365

326:                                              ; preds = %314
  %327 = load ptr, ptr @atom, align 8, !tbaa !11
  %328 = load ptr, ptr @atom, align 8, !tbaa !11
  %329 = load i32, ptr %4, align 4, !tbaa !9
  %330 = sext i32 %329 to i64
  %331 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %328, i64 %330
  %332 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %331, i32 0, i32 1
  %333 = load ptr, ptr %332, align 8, !tbaa !13
  %334 = getelementptr inbounds %struct.DynamicStr, ptr %333, i32 0, i32 3
  %335 = getelementptr inbounds %struct.HBStr, ptr %334, i32 0, i32 0
  %336 = load i32, ptr %335, align 8, !tbaa !17
  %337 = sext i32 %336 to i64
  %338 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %327, i64 %337
  %339 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %338, i32 0, i32 1
  %340 = load ptr, ptr %339, align 8, !tbaa !13
  %341 = getelementptr inbounds %struct.DynamicStr, ptr %340, i32 0, i32 3
  %342 = getelementptr inbounds %struct.HBStr, ptr %341, i32 0, i32 1
  %343 = load i32, ptr %342, align 4, !tbaa !23
  %344 = load i32, ptr %5, align 4, !tbaa !9
  %345 = icmp eq i32 %343, %344
  br i1 %345, label %346, label %350

346:                                              ; preds = %326
  %347 = load i32, ptr %4, align 4, !tbaa !9
  store i32 %347, ptr %6, align 4, !tbaa !9
  %348 = load i32, ptr %5, align 4, !tbaa !9
  store i32 %348, ptr %4, align 4, !tbaa !9
  %349 = load i32, ptr %6, align 4, !tbaa !9
  store i32 %349, ptr %5, align 4, !tbaa !9
  br label %350

350:                                              ; preds = %346, %326
  %351 = load ptr, ptr @atom, align 8, !tbaa !11
  %352 = load ptr, ptr @atom, align 8, !tbaa !11
  %353 = load i32, ptr %5, align 4, !tbaa !9
  %354 = sext i32 %353 to i64
  %355 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %352, i64 %354
  %356 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %355, i32 0, i32 1
  %357 = load ptr, ptr %356, align 8, !tbaa !13
  %358 = getelementptr inbounds %struct.DynamicStr, ptr %357, i32 0, i32 3
  %359 = getelementptr inbounds %struct.HBStr, ptr %358, i32 0, i32 0
  %360 = load i32, ptr %359, align 8, !tbaa !17
  %361 = sext i32 %360 to i64
  %362 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %351, i64 %361
  store ptr %362, ptr %23, align 8, !tbaa !11
  %363 = getelementptr inbounds [20 x i8], ptr %11, i64 0, i64 0
  %364 = call i32 (ptr, ptr, ...) @sprintf(ptr noundef %363, ptr noundef @.str.6) #7
  br label %368

365:                                              ; preds = %314
  %366 = getelementptr inbounds [20 x i8], ptr %11, i64 0, i64 0
  %367 = call i32 (ptr, ptr, ...) @sprintf(ptr noundef %366, ptr noundef @.str) #7
  br label %368

368:                                              ; preds = %365, %350
  br label %369

369:                                              ; preds = %368, %311
  br label %370

370:                                              ; preds = %369, %285
  %371 = load ptr, ptr @atom, align 8, !tbaa !11
  %372 = load i32, ptr %4, align 4, !tbaa !9
  %373 = sext i32 %372 to i64
  %374 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %371, i64 %373
  %375 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %374, i32 0, i32 1
  %376 = load ptr, ptr %375, align 8, !tbaa !13
  %377 = getelementptr inbounds %struct.DynamicStr, ptr %376, i32 0, i32 2
  %378 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %377, i64 0, i64 0
  %379 = load double, ptr %378, align 8, !tbaa !5
  %380 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %14, i64 0, i64 0
  store double %379, ptr %380, align 16, !tbaa !5
  %381 = load ptr, ptr @atom, align 8, !tbaa !11
  %382 = load i32, ptr %4, align 4, !tbaa !9
  %383 = sext i32 %382 to i64
  %384 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %381, i64 %383
  %385 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %384, i32 0, i32 1
  %386 = load ptr, ptr %385, align 8, !tbaa !13
  %387 = getelementptr inbounds %struct.DynamicStr, ptr %386, i32 0, i32 2
  %388 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %387, i64 0, i64 1
  %389 = load double, ptr %388, align 8, !tbaa !5
  %390 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %14, i64 0, i64 1
  store double %389, ptr %390, align 8, !tbaa !5
  %391 = load ptr, ptr @atom, align 8, !tbaa !11
  %392 = load i32, ptr %4, align 4, !tbaa !9
  %393 = sext i32 %392 to i64
  %394 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %391, i64 %393
  %395 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %394, i32 0, i32 1
  %396 = load ptr, ptr %395, align 8, !tbaa !13
  %397 = getelementptr inbounds %struct.DynamicStr, ptr %396, i32 0, i32 2
  %398 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %397, i64 0, i64 2
  %399 = load double, ptr %398, align 8, !tbaa !5
  %400 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %14, i64 0, i64 2
  store double %399, ptr %400, align 16, !tbaa !5
  %401 = load ptr, ptr @atom, align 8, !tbaa !11
  %402 = load i32, ptr %4, align 4, !tbaa !9
  %403 = sext i32 %402 to i64
  %404 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %401, i64 %403
  %405 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %404, i32 0, i32 1
  %406 = load ptr, ptr %405, align 8, !tbaa !13
  %407 = getelementptr inbounds %struct.DynamicStr, ptr %406, i32 0, i32 2
  %408 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %407, i64 0, i64 3
  %409 = load double, ptr %408, align 8, !tbaa !5
  %410 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %14, i64 0, i64 3
  store double %409, ptr %410, align 8, !tbaa !5
  %411 = load ptr, ptr @atom, align 8, !tbaa !11
  %412 = load i32, ptr %5, align 4, !tbaa !9
  %413 = sext i32 %412 to i64
  %414 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %411, i64 %413
  %415 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %414, i32 0, i32 1
  %416 = load ptr, ptr %415, align 8, !tbaa !13
  %417 = getelementptr inbounds %struct.DynamicStr, ptr %416, i32 0, i32 2
  %418 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %417, i64 0, i64 0
  %419 = load double, ptr %418, align 8, !tbaa !5
  %420 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %15, i64 0, i64 0
  store double %419, ptr %420, align 16, !tbaa !5
  %421 = load ptr, ptr @atom, align 8, !tbaa !11
  %422 = load i32, ptr %5, align 4, !tbaa !9
  %423 = sext i32 %422 to i64
  %424 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %421, i64 %423
  %425 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %424, i32 0, i32 1
  %426 = load ptr, ptr %425, align 8, !tbaa !13
  %427 = getelementptr inbounds %struct.DynamicStr, ptr %426, i32 0, i32 2
  %428 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %427, i64 0, i64 1
  %429 = load double, ptr %428, align 8, !tbaa !5
  %430 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %15, i64 0, i64 1
  store double %429, ptr %430, align 8, !tbaa !5
  %431 = load ptr, ptr @atom, align 8, !tbaa !11
  %432 = load i32, ptr %5, align 4, !tbaa !9
  %433 = sext i32 %432 to i64
  %434 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %431, i64 %433
  %435 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %434, i32 0, i32 1
  %436 = load ptr, ptr %435, align 8, !tbaa !13
  %437 = getelementptr inbounds %struct.DynamicStr, ptr %436, i32 0, i32 2
  %438 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %437, i64 0, i64 2
  %439 = load double, ptr %438, align 8, !tbaa !5
  %440 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %15, i64 0, i64 2
  store double %439, ptr %440, align 16, !tbaa !5
  %441 = load ptr, ptr @atom, align 8, !tbaa !11
  %442 = load i32, ptr %5, align 4, !tbaa !9
  %443 = sext i32 %442 to i64
  %444 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %441, i64 %443
  %445 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %444, i32 0, i32 1
  %446 = load ptr, ptr %445, align 8, !tbaa !13
  %447 = getelementptr inbounds %struct.DynamicStr, ptr %446, i32 0, i32 2
  %448 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %447, i64 0, i64 3
  %449 = load double, ptr %448, align 8, !tbaa !5
  %450 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %15, i64 0, i64 3
  store double %449, ptr %450, align 8, !tbaa !5
  %451 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %14, i64 0, i64 1
  %452 = load double, ptr %451, align 8, !tbaa !5
  %453 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %15, i64 0, i64 1
  %454 = load double, ptr %453, align 8, !tbaa !5
  %455 = fsub double %452, %454
  %456 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %17, i64 0, i64 1
  store double %455, ptr %456, align 8, !tbaa !5
  %457 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %14, i64 0, i64 2
  %458 = load double, ptr %457, align 16, !tbaa !5
  %459 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %15, i64 0, i64 2
  %460 = load double, ptr %459, align 16, !tbaa !5
  %461 = fsub double %458, %460
  %462 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %17, i64 0, i64 2
  store double %461, ptr %462, align 16, !tbaa !5
  %463 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %14, i64 0, i64 3
  %464 = load double, ptr %463, align 8, !tbaa !5
  %465 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %15, i64 0, i64 3
  %466 = load double, ptr %465, align 8, !tbaa !5
  %467 = fsub double %464, %466
  %468 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %17, i64 0, i64 3
  store double %467, ptr %468, align 8, !tbaa !5
  %469 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %16, i64 0, i64 1
  %470 = load double, ptr %469, align 8, !tbaa !5
  %471 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %17, i64 0, i64 1
  %472 = load double, ptr %471, align 8, !tbaa !5
  %473 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %16, i64 0, i64 2
  %474 = load double, ptr %473, align 16, !tbaa !5
  %475 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %17, i64 0, i64 2
  %476 = load double, ptr %475, align 16, !tbaa !5
  %477 = fmul double %474, %476
  %478 = call double @llvm.fmuladd.f64(double %470, double %472, double %477)
  %479 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %16, i64 0, i64 3
  %480 = load double, ptr %479, align 8, !tbaa !5
  %481 = getelementptr inbounds [4 x double], ptr %17, i64 0, i64 3
  %482 = load double, ptr %481, align 8, !tbaa !5
  %483 = call double @llvm.fmuladd.f64(double %480, double %482, double %478)
  store double %483, ptr %18, align 8, !tbaa !5
  %484 = load ptr, ptr @atom, align 8, !tbaa !11
  %485 = load i32, ptr %4, align 4, !tbaa !9
  %486 = sext i32 %485 to i64
  %487 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %484, i64 %486
  %488 = load ptr, ptr @atom, align 8, !tbaa !11
  %489 = load i32, ptr %5, align 4, !tbaa !9
  %490 = sext i32 %489 to i64
  %491 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %488, i64 %490
  %492 = getelementptr inbounds [20 x i8], ptr %11, i64 0, i64 0
  %493 = load double, ptr %18, align 8, !tbaa !5
  %494 = load double, ptr %19, align 8, !tbaa !5
  %495 = load ptr, ptr %23, align 8, !tbaa !11
  %496 = call i32 @FindPair(ptr noundef %487, ptr noundef %491, ptr noundef %492, double noundef %493, double noundef %494, ptr noundef %12, ptr noundef %12, ptr noundef %12, ptr noundef %12, ptr noundef %21, ptr noundef %495, i32 noundef 0)
  %497 = load double, ptr %21, align 8, !tbaa !5
  %498 = fcmp olt double %497, 5.000000e+07
  br i1 %498, label %499, label %503

499:                                              ; preds = %370
  %500 = load double, ptr %21, align 8, !tbaa !5
  %501 = load double, ptr %20, align 8, !tbaa !5
  %502 = fadd double %501, %500
  store double %502, ptr %20, align 8, !tbaa !5
  br label %503

503:                                              ; preds = %499, %370
  br label %504

504:                                              ; preds = %503, %259, %160
  br label %505

505:                                              ; preds = %504, %156
  %506 = load ptr, ptr @celllist, align 8, !tbaa !11
  %507 = load i32, ptr %7, align 4, !tbaa !9
  %508 = sext i32 %507 to i64
  %509 = getelementptr inbounds i32, ptr %506, i64 %508
  %510 = load i32, ptr %509, align 4, !tbaa !9
  store i32 %510, ptr %7, align 4, !tbaa !9
  br label %153, !llvm.loop !24

511:                                              ; preds = %153
  br label %512

512:                                              ; preds = %511
  %513 = load i32, ptr %26, align 4, !tbaa !9
  %514 = add nsw i32 %513, 1
  store i32 %514, ptr %26, align 4, !tbaa !9
  br label %42, !llvm.loop !25

515:                                              ; preds = %45
  br label %516

516:                                              ; preds = %515
  %517 = load i32, ptr %24, align 4, !tbaa !9
  %518 = add nsw i32 %517, 1
  store i32 %518, ptr %24, align 4, !tbaa !9
  br label %28, !llvm.loop !26

519:                                              ; preds = %32
  %520 = load double, ptr %20, align 8, !tbaa !5
  store i32 1, ptr %25, align 4
  call void @llvm.lifetime.end.p0(i64 8, ptr %23) #7
  call void @llvm.lifetime.end.p0(i64 32, ptr %22) #7
  call void @llvm.lifetime.end.p0(i64 8, ptr %21) #7
  call void @llvm.lifetime.end.p0(i64 8, ptr %20) #7
  call void @llvm.lifetime.end.p0(i64 8, ptr %19) #7
  call void @llvm.lifetime.end.p0(i64 8, ptr %18) #7
  call void @llvm.lifetime.end.p0(i64 32, ptr %17) #7
  call void @llvm.lifetime.end.p0(i64 32, ptr %16) #7
  call void @llvm.lifetime.end.p0(i64 32, ptr %15) #7
  call void @llvm.lifetime.end.p0(i64 32, ptr %14) #7
  call void @llvm.lifetime.end.p0(i64 32, ptr %13) #7
  call void @llvm.lifetime.end.p0(i64 8, ptr %12) #7
  call void @llvm.lifetime.end.p0(i64 20, ptr %11) #7
  call void @llvm.lifetime.end.p0(i64 8, ptr %10) #7
  call void @llvm.lifetime.end.p0(i64 4, ptr %9) #7
  call void @llvm.lifetime.end.p0(i64 16, ptr %8) #7
  call void @llvm.lifetime.end.p0(i64 4, ptr %7) #7
  call void @llvm.lifetime.end.p0(i64 4, ptr %6) #7
  call void @llvm.lifetime.end.p0(i64 4, ptr %5) #7
  call void @llvm.lifetime.end.p0(i64 4, ptr %4) #7
  call void @llvm.lifetime.end.p0(i64 108, ptr %3) #7
  call void @llvm.lifetime.end.p0(i64 108, ptr %2) #7
  call void @llvm.lifetime.end.p0(i64 108, ptr %1) #7
  ret double %520
}

declare double @HBBarrier(ptr noundef, ptr noundef) #6

attributes #0 = { nocallback nofree nosync nounwind willreturn memory(argmem: readwrite) }
attributes #1 = { nocallback nofree nosync nounwind speculatable willreturn memory(none) }
attributes #2 = { nounwind uwtable "min-legal-vector-width"="0" "no-trapping-math"="true" "stack-protector-buffer-size"="8" "target-cpu"="x86-64" "target-features"="+cmov,+cx8,+fxsr,+mmx,+sse,+sse2,+x87" "tune-cpu"="generic" }
attributes #3 = { nounwind "no-trapping-math"="true" "stack-protector-buffer-size"="8" "target-cpu"="x86-64" "target-features"="+cmov,+cx8,+fxsr,+mmx,+sse,+sse2,+x87" "tune-cpu"="generic" }
attributes #4 = { nocallback nofree nounwind willreturn memory(argmem: write) }
attributes #5 = { nocallback nofree nounwind willreturn memory(argmem: readwrite) }
attributes #6 = { "no-trapping-math"="true" "stack-protector-buffer-size"="8" "target-cpu"="x86-64" "target-features"="+cmov,+cx8,+fxsr,+mmx,+sse,+sse2,+x87" "tune-cpu"="generic" }
attributes #7 = { nounwind }

!llvm.module.flags = !{!0, !1, !2, !3}
!llvm.ident = !{!4}

!0 = !{i32 1, !"wchar_size", i32 4}
!1 = !{i32 8, !"PIC Level", i32 2}
!2 = !{i32 7, !"PIE Level", i32 2}
!3 = !{i32 7, !"uwtable", i32 2}
!4 = !{!"clang version 19.1.0 (git@github.com:llvm/llvm-project.git a4bf6cd7cfb1a1421ba92bca9d017b49936c55e4)"}
!5 = !{!6, !6, i64 0}
!6 = !{!"double", !7, i64 0}
!7 = !{!"omnipotent char", !8, i64 0}
!8 = !{!"Simple C/C++ TBAA"}
!9 = !{!10, !10, i64 0}
!10 = !{!"int", !7, i64 0}
!11 = !{!12, !12, i64 0}
!12 = !{!"any pointer", !7, i64 0}
!13 = !{!14, !12, i64 8}
!14 = !{!"AtomStr", !12, i64 0, !12, i64 8}
!15 = distinct !{!15, !16}
!16 = !{!"llvm.loop.mustprogress"}
!17 = !{!18, !10, i64 80}
!18 = !{!"DynamicStr", !7, i64 0, !7, i64 16, !7, i64 48, !19, i64 80, !20, i64 96, !21, i64 128}
!19 = !{!"HBStr", !10, i64 0, !10, i64 4, !7, i64 8, !10, i64 12}
!20 = !{!"HBNeighborStr", !7, i64 0, !10, i64 20, !10, i64 24}
!21 = !{!"InteractionEventStr", !10, i64 0, !22, i64 8, !22, i64 16, !6, i64 24, !6, i64 32, !10, i64 40, !10, i64 44}
!22 = !{!"long", !7, i64 0}
!23 = !{!18, !10, i64 84}
!24 = distinct !{!24, !16}
!25 = distinct !{!25, !16}
!26 = distinct !{!26, !16}


; Optimized IR (opt -passes='default<O3>'):
target datalayout = "e-m:e-p270:32:32-p271:32:32-p272:64:64-i64:64-i128:128-f80:128-n8:16:32:64-S128"
target triple = "x86_64-unknown-linux-gnu"

%struct.AtomStr = type { ptr, ptr }

@atomnum = external local_unnamed_addr global i32, align 4
@atom = external local_unnamed_addr global ptr, align 8
@.str = external hidden unnamed_addr constant [10 x i8], align 1
@.str.3 = external hidden unnamed_addr constant [11 x i8], align 1
@.str.5 = external hidden unnamed_addr constant [3 x i8], align 1
@.str.6 = external hidden unnamed_addr constant [9 x i8], align 1
@connectionMap = external local_unnamed_addr global ptr, align 8
@__const.CalPotenE.x = external hidden unnamed_addr constant [27 x i32], align 16
@__const.CalPotenE.y = external hidden unnamed_addr constant [27 x i32], align 16
@__const.CalPotenE.z = external hidden unnamed_addr constant [27 x i32], align 16
@cellnum = external local_unnamed_addr global [4 x i32], align 16
@boxDimension = external local_unnamed_addr global [4 x double], align 16
@celllist = external local_unnamed_addr global ptr, align 8
@cutoffr = external local_unnamed_addr global double, align 8

; Function Attrs: mustprogress nocallback nofree nosync nounwind willreturn memory(argmem: readwrite)
declare void @llvm.lifetime.start.p0(i64 immarg, ptr nocapture) #0

; Function Attrs: mustprogress nocallback nofree nosync nounwind willreturn memory(argmem: readwrite)
declare void @llvm.lifetime.end.p0(i64 immarg, ptr nocapture) #0

; Function Attrs: mustprogress nocallback nofree nosync nounwind speculatable willreturn memory(none)
declare double @llvm.fmuladd.f64(double, double, double) #1

; Function Attrs: nounwind uwtable
declare dso_local i32 @FindPair(ptr noundef, ptr noundef, ptr noundef, double noundef, double noundef, ptr noundef, ptr noundef, ptr noundef, ptr noundef, ptr noundef, ptr noundef, i32 noundef) local_unnamed_addr #2

; Function Attrs: nofree nounwind
declare noundef i32 @sprintf(ptr noalias nocapture noundef writeonly, ptr nocapture noundef readonly, ...) local_unnamed_addr #3

; Function Attrs: nounwind uwtable
define dso_local double @CalPotenE() local_unnamed_addr #2 {
  %1 = alloca [20 x i8], align 16
  %2 = alloca double, align 8
  %3 = alloca double, align 8
  call void @llvm.lifetime.start.p0(i64 20, ptr nonnull %1) #5
  call void @llvm.lifetime.start.p0(i64 8, ptr nonnull %2) #5
  call void @llvm.lifetime.start.p0(i64 8, ptr nonnull %3) #5
  store double 0.000000e+00, ptr %3, align 8, !tbaa !5
  %4 = load i32, ptr @atomnum, align 4, !tbaa !9
  %.not114 = icmp slt i32 %4, 1
  br i1 %.not114, label %._crit_edge119, label %.lr.ph118

._crit_edge119:                                   ; preds = %12, %0
  %.090.lcssa = phi double [ 0.000000e+00, %0 ], [ %.2.lcssa, %12 ]
  call void @llvm.lifetime.end.p0(i64 8, ptr nonnull %3) #5
  call void @llvm.lifetime.end.p0(i64 8, ptr nonnull %2) #5
  call void @llvm.lifetime.end.p0(i64 20, ptr nonnull %1) #5
  ret double %.090.lcssa

.lr.ph118:                                        ; preds = %0, %12
  %indvars.iv123 = phi i64 [ %indvars.iv.next124, %12 ], [ 1, %0 ]
  %.090115 = phi double [ %.2.lcssa, %12 ], [ 0.000000e+00, %0 ]
  %5 = load ptr, ptr @atom, align 8, !tbaa !11
  %6 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %5, i64 %indvars.iv123, i32 1
  %7 = load ptr, ptr %6, align 8, !tbaa !13
  %8 = getelementptr inbounds i8, ptr %7, i64 12
  %9 = getelementptr inbounds i8, ptr %7, i64 8
  %10 = getelementptr inbounds i8, ptr %7, i64 4
  %11 = trunc nuw nsw i64 %indvars.iv123 to i32
  br label %15

12:                                               ; preds = %._crit_edge
  %indvars.iv.next124 = add nuw nsw i64 %indvars.iv123, 1
  %13 = load i32, ptr @atomnum, align 4, !tbaa !9
  %14 = sext i32 %13 to i64
  %.not.not = icmp slt i64 %indvars.iv123, %14
  br i1 %.not.not, label %.lr.ph118, label %._crit_edge119, !llvm.loop !15

15:                                               ; preds = %.lr.ph118, %._crit_edge
  %indvars.iv = phi i64 [ 0, %.lr.ph118 ], [ %indvars.iv.next, %._crit_edge ]
  %.1112 = phi double [ %.090115, %.lr.ph118 ], [ %.2.lcssa, %._crit_edge ]
  %16 = load i32, ptr %8, align 4, !tbaa !9
  %17 = getelementptr inbounds [27 x i32], ptr @__const.CalPotenE.z, i64 0, i64 %indvars.iv
  %18 = load i32, ptr %17, align 4, !tbaa !9
  %19 = add nsw i32 %18, %16
  %20 = load i32, ptr %9, align 4, !tbaa !9
  %21 = getelementptr inbounds [27 x i32], ptr @__const.CalPotenE.y, i64 0, i64 %indvars.iv
  %22 = load i32, ptr %21, align 4, !tbaa !9
  %23 = add nsw i32 %22, %20
  %24 = load i32, ptr %10, align 4, !tbaa !9
  %25 = getelementptr inbounds [27 x i32], ptr @__const.CalPotenE.x, i64 0, i64 %indvars.iv
  %26 = load i32, ptr %25, align 4, !tbaa !9
  %27 = add nsw i32 %26, %24
  %28 = icmp slt i32 %27, 0
  %29 = load i32, ptr getelementptr inbounds (i8, ptr @cellnum, i64 4), align 4, !tbaa !9
  br i1 %28, label %30, label %34

30:                                               ; preds = %15
  %31 = add nsw i32 %29, -1
  %32 = load double, ptr getelementptr inbounds (i8, ptr @boxDimension, i64 8), align 8, !tbaa !5
  %33 = fneg double %32
  br label %37

34:                                               ; preds = %15
  %.not104 = icmp slt i32 %27, %29
  br i1 %.not104, label %37, label %35

35:                                               ; preds = %34
  %36 = load double, ptr getelementptr inbounds (i8, ptr @boxDimension, i64 8), align 8, !tbaa !5
  br label %37

37:                                               ; preds = %30, %35, %34
  %.sroa.2.0 = phi i32 [ %31, %30 ], [ %27, %34 ], [ 0, %35 ]
  %.sroa.3.0 = phi double [ %33, %30 ], [ 0.000000e+00, %34 ], [ %36, %35 ]
  %38 = icmp slt i32 %23, 0
  %39 = load i32, ptr getelementptr inbounds (i8, ptr @cellnum, i64 8), align 8, !tbaa !9
  br i1 %38, label %43, label %40

40:                                               ; preds = %37
  %.not104.1 = icmp slt i32 %23, %39
  br i1 %.not104.1, label %47, label %41

41:                                               ; preds = %40
  %42 = load double, ptr getelementptr inbounds (i8, ptr @boxDimension, i64 16), align 16, !tbaa !5
  br label %47

43:                                               ; preds = %37
  %44 = add nsw i32 %39, -1
  %45 = load double, ptr getelementptr inbounds (i8, ptr @boxDimension, i64 16), align 16, !tbaa !5
  %46 = fneg double %45
  br label %47

47:                                               ; preds = %43, %41, %40
  %.sroa.7128.0 = phi i32 [ %44, %43 ], [ %23, %40 ], [ 0, %41 ]
  %.sroa.7.0 = phi double [ %46, %43 ], [ 0.000000e+00, %40 ], [ %42, %41 ]
  %48 = icmp slt i32 %19, 0
  %49 = load i32, ptr getelementptr inbounds (i8, ptr @cellnum, i64 12), align 4, !tbaa !9
  br i1 %48, label %53, label %50

50:                                               ; preds = %47
  %.not104.2 = icmp slt i32 %19, %49
  br i1 %.not104.2, label %57, label %51

51:                                               ; preds = %50
  %52 = load double, ptr getelementptr inbounds (i8, ptr @boxDimension, i64 24), align 8, !tbaa !5
  br label %57

53:                                               ; preds = %47
  %54 = add nsw i32 %49, -1
  %55 = load double, ptr getelementptr inbounds (i8, ptr @boxDimension, i64 24), align 8, !tbaa !5
  %56 = fneg double %55
  br label %57

57:                                               ; preds = %53, %51, %50
  %.sroa.12.0 = phi i32 [ %54, %53 ], [ %19, %50 ], [ 0, %51 ]
  %.sroa.11.0 = phi double [ %56, %53 ], [ 0.000000e+00, %50 ], [ %52, %51 ]
  %58 = mul i32 %39, %.sroa.12.0
  %59 = load ptr, ptr @celllist, align 8, !tbaa !11
  %60 = load i32, ptr @atomnum, align 4, !tbaa !9
  %reass.add = add i32 %.sroa.7128.0, %58
  %reass.mul = mul i32 %reass.add, %29
  %61 = add nsw i32 %.sroa.2.0, 1
  %62 = add i32 %61, %reass.mul
  %63 = add i32 %62, %60
  %64 = sext i32 %63 to i64
  %65 = getelementptr inbounds i32, ptr %59, i64 %64
  %.095107 = load i32, ptr %65, align 4, !tbaa !9
  %.not99108 = icmp eq i32 %.095107, 0
  br i1 %.not99108, label %._crit_edge, label %.lr.ph

.lr.ph:                                           ; preds = %57, %171
  %.095110 = phi i32 [ %.095, %171 ], [ %.095107, %57 ]
  %.2109 = phi double [ %.4, %171 ], [ %.1112, %57 ]
  %66 = sext i32 %.095110 to i64
  %67 = icmp slt i64 %indvars.iv123, %66
  br i1 %67, label %68, label %171

68:                                               ; preds = %.lr.ph
  %69 = load ptr, ptr @atom, align 8, !tbaa !11
  %70 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %69, i64 %66, i32 1
  %71 = load ptr, ptr %70, align 8, !tbaa !13
  %72 = getelementptr inbounds i8, ptr %71, i64 24
  %73 = load double, ptr %72, align 8, !tbaa !5
  %74 = fadd double %73, %.sroa.3.0
  %75 = getelementptr inbounds i8, ptr %71, i64 32
  %76 = load double, ptr %75, align 8, !tbaa !5
  %77 = fadd double %76, %.sroa.7.0
  %78 = getelementptr inbounds i8, ptr %71, i64 40
  %79 = load double, ptr %78, align 8, !tbaa !5
  %80 = fadd double %79, %.sroa.11.0
  %81 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %69, i64 %indvars.iv123, i32 1
  %82 = load ptr, ptr %81, align 8, !tbaa !13
  %83 = getelementptr inbounds i8, ptr %82, i64 24
  %84 = load double, ptr %83, align 8, !tbaa !5
  %85 = fsub double %84, %74
  %86 = getelementptr inbounds i8, ptr %82, i64 32
  %87 = load double, ptr %86, align 8, !tbaa !5
  %88 = fsub double %87, %77
  %89 = getelementptr inbounds i8, ptr %82, i64 40
  %90 = load double, ptr %89, align 8, !tbaa !5
  %91 = fsub double %90, %80
  %92 = fmul double %88, %88
  %93 = call double @llvm.fmuladd.f64(double %85, double %85, double %92)
  %94 = call double @llvm.fmuladd.f64(double %91, double %91, double %93)
  %95 = load double, ptr @cutoffr, align 8, !tbaa !5
  %96 = fmul double %95, %95
  %97 = fcmp ugt double %94, %96
  br i1 %97, label %171, label %98

98:                                               ; preds = %68
  %99 = load ptr, ptr @connectionMap, align 8, !tbaa !11
  %100 = getelementptr inbounds ptr, ptr %99, i64 %indvars.iv123
  %101 = load ptr, ptr %100, align 8, !tbaa !11
  %102 = getelementptr inbounds i32, ptr %101, i64 %66
  %103 = load i32, ptr %102, align 4, !tbaa !9
  %104 = and i32 %103, 1
  %.not100 = icmp eq i32 %104, 0
  br i1 %.not100, label %105, label %171

105:                                              ; preds = %98
  %106 = and i32 %103, 4
  %.not101 = icmp eq i32 %106, 0
  br i1 %.not101, label %114, label %107

107:                                              ; preds = %105
  %108 = call i32 (ptr, ptr, ...) @sprintf(ptr noundef nonnull dereferenceable(1) %1, ptr noundef nonnull dereferenceable(1) @.str.5) #5
  %109 = load ptr, ptr @atom, align 8, !tbaa !11
  %110 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %109, i64 %indvars.iv123
  %111 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %109, i64 %66
  %112 = call double @HBBarrier(ptr noundef nonnull %110, ptr noundef nonnull %111) #5
  %113 = fsub double %.2109, %112
  br label %139

114:                                              ; preds = %105
  %115 = and i32 %103, 2
  %.not102 = icmp eq i32 %115, 0
  br i1 %.not102, label %118, label %116

116:                                              ; preds = %114
  %117 = call i32 (ptr, ptr, ...) @sprintf(ptr noundef nonnull dereferenceable(1) %1, ptr noundef nonnull dereferenceable(1) @.str.3) #5
  br label %139

118:                                              ; preds = %114
  %119 = and i32 %103, 8
  %.not103 = icmp eq i32 %119, 0
  br i1 %.not103, label %137, label %120

120:                                              ; preds = %118
  %121 = getelementptr inbounds i8, ptr %82, i64 80
  %122 = load i32, ptr %121, align 8, !tbaa !17
  %123 = sext i32 %122 to i64
  %124 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %69, i64 %123, i32 1
  %125 = load ptr, ptr %124, align 8, !tbaa !13
  %126 = getelementptr inbounds i8, ptr %125, i64 84
  %127 = load i32, ptr %126, align 4, !tbaa !23
  %128 = icmp eq i32 %127, %.095110
  %spec.select = select i1 %128, i32 %11, i32 %.095110
  %spec.select105 = select i1 %128, i32 %.095110, i32 %11
  %129 = sext i32 %spec.select to i64
  %130 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %69, i64 %129, i32 1
  %131 = load ptr, ptr %130, align 8, !tbaa !13
  %132 = getelementptr inbounds i8, ptr %131, i64 80
  %133 = load i32, ptr %132, align 8, !tbaa !17
  %134 = sext i32 %133 to i64
  %135 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %69, i64 %134
  %136 = call i32 (ptr, ptr, ...) @sprintf(ptr noundef nonnull dereferenceable(1) %1, ptr noundef nonnull dereferenceable(1) @.str.6) #5
  br label %139

137:                                              ; preds = %118
  %138 = call i32 (ptr, ptr, ...) @sprintf(ptr noundef nonnull dereferenceable(1) %1, ptr noundef nonnull dereferenceable(1) @.str) #5
  br label %139

139:                                              ; preds = %116, %137, %120, %107
  %.pre-phi = phi i64 [ %66, %116 ], [ %66, %137 ], [ %129, %120 ], [ %66, %107 ]
  %.192 = phi i32 [ %11, %116 ], [ %11, %137 ], [ %spec.select105, %120 ], [ %11, %107 ]
  %.3 = phi double [ %.2109, %116 ], [ %.2109, %137 ], [ %.2109, %120 ], [ %113, %107 ]
  %.089 = phi ptr [ null, %116 ], [ null, %137 ], [ %135, %120 ], [ null, %107 ]
  %140 = load ptr, ptr @atom, align 8, !tbaa !11
  %141 = sext i32 %.192 to i64
  %142 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %140, i64 %141
  %143 = getelementptr inbounds i8, ptr %142, i64 8
  %144 = load ptr, ptr %143, align 8, !tbaa !13
  %145 = getelementptr inbounds i8, ptr %144, i64 56
  %146 = load double, ptr %145, align 8, !tbaa !5
  %147 = getelementptr inbounds i8, ptr %144, i64 64
  %148 = load double, ptr %147, align 8, !tbaa !5
  %149 = getelementptr inbounds i8, ptr %144, i64 72
  %150 = load double, ptr %149, align 8, !tbaa !5
  %151 = getelementptr inbounds %struct.AtomStr, ptr %140, i64 %.pre-phi
  %152 = getelementptr inbounds i8, ptr %151, i64 8
  %153 = load ptr, ptr %152, align 8, !tbaa !13
  %154 = getelementptr inbounds i8, ptr %153, i64 56
  %155 = load double, ptr %154, align 8, !tbaa !5
  %156 = getelementptr inbounds i8, ptr %153, i64 64
  %157 = load double, ptr %156, align 8, !tbaa !5
  %158 = getelementptr inbounds i8, ptr %153, i64 72
  %159 = load double, ptr %158, align 8, !tbaa !5
  %160 = fsub double %146, %155
  %161 = fsub double %148, %157
  %162 = fsub double %150, %159
  %163 = fmul double %88, %161
  %164 = call double @llvm.fmuladd.f64(double %85, double %160, double %163)
  %165 = call double @llvm.fmuladd.f64(double %91, double %162, double %164)
  %166 = call i32 @FindPair(ptr noundef %142, ptr noundef %151, ptr noundef nonnull %1, double noundef %165, double noundef %94, ptr noundef nonnull %2, ptr noundef nonnull %2, ptr noundef nonnull %2, ptr noundef nonnull %2, ptr noundef nonnull %3, ptr noundef %.089, i32 noundef 0)
  %167 = load double, ptr %3, align 8, !tbaa !5
  %168 = fcmp olt double %167, 5.000000e+07
  br i1 %168, label %169, label %171

169:                                              ; preds = %139
  %170 = fadd double %.3, %167
  br label %171

171:                                              ; preds = %68, %98, %169, %139, %.lr.ph
  %.4 = phi double [ %.2109, %98 ], [ %170, %169 ], [ %.3, %139 ], [ %.2109, %68 ], [ %.2109, %.lr.ph ]
  %172 = load ptr, ptr @celllist, align 8, !tbaa !11
  %173 = getelementptr inbounds i32, ptr %172, i64 %66
  %.095 = load i32, ptr %173, align 4, !tbaa !9
  %.not99 = icmp eq i32 %.095, 0
  br i1 %.not99, label %._crit_edge, label %.lr.ph, !llvm.loop !24

._crit_edge:                                      ; preds = %171, %57
  %.2.lcssa = phi double [ %.1112, %57 ], [ %.4, %171 ]
  %indvars.iv.next = add nuw nsw i64 %indvars.iv, 1
  %exitcond.not = icmp eq i64 %indvars.iv.next, 27
  br i1 %exitcond.not, label %12, label %15, !llvm.loop !25
}

declare double @HBBarrier(ptr noundef, ptr noundef) local_unnamed_addr #4

attributes #0 = { mustprogress nocallback nofree nosync nounwind willreturn memory(argmem: readwrite) }
attributes #1 = { mustprogress nocallback nofree nosync nounwind speculatable willreturn memory(none) }
attributes #2 = { nounwind uwtable "min-legal-vector-width"="0" "no-trapping-math"="true" "stack-protector-buffer-size"="8" "target-cpu"="x86-64" "target-features"="+cmov,+cx8,+fxsr,+mmx,+sse,+sse2,+x87" "tune-cpu"="generic" }
attributes #3 = { nofree nounwind "no-trapping-math"="true" "stack-protector-buffer-size"="8" "target-cpu"="x86-64" "target-features"="+cmov,+cx8,+fxsr,+mmx,+sse,+sse2,+x87" "tune-cpu"="generic" }
attributes #4 = { "no-trapping-math"="true" "stack-protector-buffer-size"="8" "target-cpu"="x86-64" "target-features"="+cmov,+cx8,+fxsr,+mmx,+sse,+sse2,+x87" "tune-cpu"="generic" }
attributes #5 = { nounwind }

!llvm.module.flags = !{!0, !1, !2, !3}
!llvm.ident = !{!4}

!0 = !{i32 1, !"wchar_size", i32 4}
!1 = !{i32 8, !"PIC Level", i32 2}
!2 = !{i32 7, !"PIE Level", i32 2}
!3 = !{i32 7, !"uwtable", i32 2}
!4 = !{!"clang version 19.1.0 (git@github.com:llvm/llvm-project.git a4bf6cd7cfb1a1421ba92bca9d017b49936c55e4)"}
!5 = !{!6, !6, i64 0}
!6 = !{!"double", !7, i64 0}
!7 = !{!"omnipotent char", !8, i64 0}
!8 = !{!"Simple C/C++ TBAA"}
!9 = !{!10, !10, i64 0}
!10 = !{!"int", !7, i64 0}
!11 = !{!12, !12, i64 0}
!12 = !{!"any pointer", !7, i64 0}
!13 = !{!14, !12, i64 8}
!14 = !{!"AtomStr", !12, i64 0, !12, i64 8}
!15 = distinct !{!15, !16}
!16 = !{!"llvm.loop.mustprogress"}
!17 = !{!18, !10, i64 80}
!18 = !{!"DynamicStr", !7, i64 0, !7, i64 16, !7, i64 48, !19, i64 80, !20, i64 96, !21, i64 128}
!19 = !{!"HBStr", !10, i64 0, !10, i64 4, !7, i64 8, !10, i64 12}
!20 = !{!"HBNeighborStr", !7, i64 0, !10, i64 20, !10, i64 24}
!21 = !{!"InteractionEventStr", !10, i64 0, !22, i64 8, !22, i64 16, !6, i64 24, !6, i64 32, !10, i64 40, !10, i64 44}
!22 = !{!"long", !7, i64 0}
!23 = !{!18, !10, i64 84}
!24 = distinct !{!24, !16}
!25 = distinct !{!25, !16}


; Effective O3 passes: BDCEPass,CorrelatedValuePropagationPass,EarlyCSEPass,GVNPass,GlobalOptPass,IndVarSimplifyPass,InferAlignmentPass,InferFunctionAttrsPass,InstCombinePass,InstSimplifyPass,JumpThreadingPass,LCSSAPass,LICMPass,LoopInstSimplifyPass,LoopRotatePass,LoopSimplifyPass,LoopUnrollPass,ReassociatePass,SROAPass,SimplifyCFGPass