Ari Purno Wahyu Wibowo, Rian Andrivani Jurnal Ilmiah Teknologi Informasi Terapan Volume II, No 3, 15 Agustus 2016

## PERHITUNGAN JUMLAH BAKTERI ESCHERICHIA COLI DENGAN PENGOLAHAN CITRA MELALUI METODE THRESHOLDING DAN COUNTING MORPHOLOGY
1) Ari Purno Wahyu Wibowo, 2) Rian Andrivani
1) Universitas Widyatama, Jl.Cikutra No.204 A Bandung 40124
2) STMIK “Amik Bandung”, Jl.Ters Jakarta No 28 Bandung
1) ari.purno@widyatama.ac.id, 2) rianandrivani@gmail.com

## Abstrak
Salah  satu permasalahan  yang terdapat di bidang kesehatan  adalah  tingkat  tingginya  kontaminasi bakteri  pada  makanan  yang  dijual/disajikan  oleh pihak penjual, mulai dari Pedagang Kaki Lima (PKL), restoran,  dan  industri  makanan.  Jika  makanan  kita terkontaminasi  bakteri  akan  memberikan  dampak negatif  bagi  kita  dan  masyarakat  yang  mengonsumsi makanan  terkontaminasi.  Dan  salah  satu  alasan makanan  tersebut  terkontaminasi  karena  adanya bakteri  yang  tumbuh  pada  makanan  tersebut  yang melebihi  batas  pencemaran  maksimum.  Salah  satu bakteri  yang  dapat  menyebabkan  makanan  tersebut terkontaminasi adalah bakteri Escherichia coli.
Salah  satu  solusi  yang  dapat  diambil  yaitu, dengan  menyediakan  sistem  perhitungan  bakteri Escherichia  coli .  Dimana  dengan  sistem  tersebut dapat  mengetahui  berapa  jumlah  bakteri Escherichia coli yang  terdapat  pada  makanan  yang  diteliti  agar diketahui  apakah  makanan  tersebut  layak  dijual  atau tidak berdasarkan jumlah batas pencemaran maksimum  dengan  jumlah  bakteri  yang  mencemari makanan  yang  diteliti.  Dalam  perkembangbiakannya bakteri  ini  dapat  tumbuh  secara morfological dimana bakteri  ini    tumbuh  secara  acak  dengan  bentuk  yang sama  yaitu  dalam  bentuk  batang  namun  tumbuh dengan posisi secara acak.
Dalam  perancangan  system  tersebut  penulis menggunakan bahasa pemrograman C disertai dengan perangkat lunak yang membantu dalam pembuatannya  yaitu  Matlab.  Setelah  implementasi sistem  ini  akan  diuji  coba  hasilnya  adalah  para  ahli industi  makanan  dapat  menentukan  apakah  makanan yang  diteliti  tersebut  layak  dijual  atau  tidak  sesuai dengan  tingkat  pencemaran  yang  terdapat  pada makanan tersebut.
Kata Kunci: Bakteri Escherichia coli. Morphological, Makanan, Perhitungan bakteri

## Abstract
One  of  the  issues  contained  in  the  health  sector is  the  high  level  of  bacterial  contamination  of  food sold  or  served  by  the  sellers  from  the  street  food restaurants  and  the  food  industry.  If  our  food contaminated  with  the  bacteria  will  adversely  affect us  and  the  people  who  eat  contaminated  foods.  And one of the reasons that food contaminated by bacteria that  grow  on  the  food  that  exceeds  the  maximum contamination  limit.  One  of  the  bacteria  that  can cause  food  that  is  contaminated  with  the  bacteria Escherichia coli.
One  solution  that  can  be  taken  is,  by  providing the  calculation  system  of  Escherichia  coli.  Where  in the  system  can  determine  how  the  number  of Escherichia  coli  bacteria  found  in  foods  studied  in order  to  know  whether  the  food  is  decent  for  sale  or not  based  on  the  amount  of  the  maximum contamination  limit  to  the  number  of  bacteria  that contaminate  food  studied.  In  the  breeding  of  bacteria can  grow  morfological  where  these  bacteria  grow randomly with the same shape in the form of rods but growing at random positions.
In  designing  the  system,  the  author  uses  the  C programming  language  comes  with  software  that helps    and  using  in  Matlab.  After  implementation  of this  system  will  be  tested  the  result  is  the  food industry,  experts  can  determine  whether  the  foods studied  eligible  or  not  for  sale  according  with  the level of pollution contained in these foods.
Keywords: Bacterai Escherichia coli. Morphological, foods, calculation
Ari Purno Wahyu Wibowo, Rian Andrivani Jurnal Ilmiah Teknologi Informasi Terapan Volume II, No 3, 15 Agustus 2016

## I. P ENDAHULUAN
Kesehatan  adalah  hal  yang  sangat  penting  bagi kelangsungan  hidup  manusia  salah  satu  cara memperoleh kesehatan adalah dengan memberi nutrisi pada tubuh misalnya dengan asupan makanan. Namun makanan yang dijual oleh para pedagang belum tentu terjamin  kesehatan  dan  kebersihannya,  seperti makanan  yang  telah  terkontaminasi  oleh  bakteri Escherichia  coli yang  dapat  membahayakan  organ tubuh  manusia.  Apabila  makanan  yang  dikonsumsi sudah  terkontaminasi  oleh  bakteri  ini  yang  tumbuh pada  makanan  tersebut  dengan  jumlah  diluar  batas maksimum pencemaran makanan.
Sebenarnya bakteri Escherichia coli ini memiliki manfaat  tersendiri  bagi  tubuh  manusia  diantaranya bakteri  ini  berfungsi  untuk  menekan  pertumbuhan bakteri  jahat,  selain  itu  bakteri  ini  pun  dapat membantu dalam proses pencernaan sisa-sisa makanan  pada  usus  besar  manusia.  Fungsi  utama bakteri  ini  adalah  membantu  vitamin  K  pada  proses pembusukan sisa-sisa makanan, namun dalam jumlah yang  besar  bakteri  ini  dapat  menimbulkan  bahaya seperti  diare  dan  dapat  membuat  beberapa  organ tubuh manusia terinfeksi.

## Gambar 1. Bakteri Escherichia coli
Untuk  menentukan  berapa  jumlah  maksimum bakteri Escherichia  coli Badan  Standarisasi  Nasional (BSN)  pada  SNI  7388:2009  telah  menetapkan  batas maksimum  tingkat  pencemaran  suatu  makanan  oleh bakteri  ini,  yaitu  1x10 2 MPN/g,  melalui  perhitungan Most Probable Number (MPN) (Juwita Usna; Haryani Yuli; Jose Christine, 2014)
Untuk  saat  ini  perhitungan  jumlah  bakteri  masih belum  dilakukan  secara  komputerisasi.  Perhitungan bakteri  saat  ini  masih  dilakukan  secara  manual
dimana  para  ahli  menggunakan  dua  cara  untuk menghitung jumlah bakteri yaitu perhitungan langsung dan tidak langsung (Jiwanjaya Yoga , 2016)

## I.1 Identifikasi Masalah
Berdasarkan  latar  belakang  di  atas,  penulis mengidentifikasikan  beberapa  masalah  yang  ada sebagai berikut :
1. Belum ditemukan metode perhitungan komposisi  bakteri  secara  otomatis  yang  dapat memudahkan para ahli.
2. Jumlah  bakteri  yang  terdapat  pada  suatu produk  makanan  masih  dilakukan  perhitungan secara  manual,  sehingga  para  ahli  di  bidang industri  makanan  cukup  kesulitan  menentukan tingkat  pencemaran  yang  disebabkan  oleh banyaknya  jumlah  bakteri  pada  makanan tersebut.
3. Dengan  perhitungan  manual  yang  dilakukan seperti  sekarang,  untuk  menentukan  berapa jumlah  detail  bakteri  yang  diteliti  sangatlah sulit dikarenakan perhitungan dilakukan dengan  mencampuradukan  antara  bakteri  yang masih hidup dan bakteri yang telah mati.

## I.2 Rumusan Masalah
Rumusan  masalah  yang  akan  dibahas  adalah sebagai berikut:
1. Bagaimana  membangun  sistem  perhitungan bakteri  secara  otomatis  dengan  akurat  dan  cepat yang  dapat  memudahkan  kinerja  para  peneliti bakteri Escherichia coli ?
2. Bagaimana  membangun  sistem  perhitungan bakteri otomatis dengan metode Threshoding dan Counting Morphology ?

## I.3 Batasan Masalah
Batasan  masalah  bertujuan  untuk  memberikan arah  serta  untuk  menyederhanakan  dan  membatasi permasalahan.  Batasan  masalah  dari  penelitian  ini adalah sebagai berikut :
1. Bakteri  dalam  penelitian  ini  hanya  melibatkan bakteri Escherichia coli .
2. Penelitian  yang  dilakukan  hanya  menghitung jumlah bakteri tanpa ada proses lanjutan.
3. Adapun  data  yang  diambil  untuk  dijadikan penelitian yakni berupa sebuah video .
Ari Purno Wahyu Wibowo, Rian Andrivani Jurnal Ilmiah Teknologi Informasi Terapan Volume II, No 3, 15 Agustus 2016

## I.4 Maksud dan Tujuan Penelitian
Adapun  maksud  dari  penelitian  ini  adalah membangun  system  perhitungan  jumlah  bakteri Escherichia coli secara otomatis.
Tujuan  yang  ingin  dicapai  melalui  penelitian  ini adalah untuk menghasilkan sebuah sistem yang dapat memberikan  tanda  pada  setiap  objek  bakteri Escherichia  coli yang muncul.  Menghasilkan  sistem perhitungan  bakteri Escherichia  coli dengan  tingkat hasil keakuratan yang cukup tinggi.

## I.5 Manfaat Penelitian
Manfaat  sistem  perhitungan  bakteri  secara otomatis  ini  diharapkan  dapat  mempermudah  para peneliti  bakteri Escherichia  coli sehingga  para peneliti  dapat  dengan  mudah  mengambil  sebuah tindakan lanjutan.

## II. L ANDASAN T EORI

## II.1 Pengertian Bakteri
Makhluk  hidup  bersel  satu prokariotik ,  yaitu sel  yang  tidak  memiliki  membran Nukleus (Inti  sel). Bakteri  dapat  hidup  bebas  dan  dapat  ditemukan  di beberapa  lingkungan  seperti  udara,  tanah,  debu,  air dalam  tubuh  manusia  bahkan  hewan  nama  bakteri berasal  dari  bahasa  Yunani  dari  kata bacterion yang berarti batang kecil (Imam., 2016). Berikut merupakan struktur sel  dari bakteri  :
1. Kapsul ( Kapsula )
Kapsula adalah  lapisan  mukus  (lendir)  yang melapisi sel da  terbentuk dari hasil metabolisme sel Kapsula berfungsi  untuk  menempel  pada substrat dan memberikan resistensi dan perlindungan  terhadap  sistem  pertahanan  inang.
Kapsula  bergelatin  juga  sebagai  pengikat  antara sel-sel pada bakteri untuk membentuk koloni
2. Dinding sel
Dindingsel disebut sel ini bersifat juga peptidoglikan atau murein dinding tebal dan kaku  sehingga  berfungsi  untuk  mempertahankan bentuk  sel,  perlindungan  fisik/mekanis,  dan menjaga  agar  sel  tidak  pecah  dalam  media hipertonis (lebih kental).
3. Membran Plasma
Membran plasma tersusun dari senyawa fosfolipid dan protein yang  bersifat  selektif permeabel atau  (bisa zat-zat tertentu). Fungsinya untuk  membungkus  sitoplasma,  serta  mengatur pertukaran  dengan  zat  yang  ada  zat  yang  berada di dalam sel diluar sel.

## Gambar  2.  Struktur sel Bakteri
4. Mesosom
Mesosom  adalah  organel  sel  yang  memiliki sitoplasma  penonjolan  pada  membran  plasma  ke arah  dalam.  Fungsinya  untuk  menghasilkan energi,  membentuk  dinding  sel  menerima DNA pada  saat  terjadi  pembelahan  sel  dan konjugasi.
5. Sitoplasma
Sitoplasma  bakteri  adalah  cairan  organik  seperti lemak atau disebut juga koloid yang mengandung molekul  protein,  karbohidrat,  dan  garam-garam mineral,  enzim,  DNA,  ribosom  klorosom,  yang sebagai  tempat  metabolisme  sel  saat  terjadinya reaksi-reaksi.
6. Ribosom
Ribosom adalah organel-organel kecil sitoplasma RNA ( ribonukleic acid )yang   tediri dari  senyawa protein  dan  Jumlah  ribosom  di  dalam  suatu  sel bakteri  mencapai  ribuan    agar  mensintesis protein.
7. DNA ( D eoxyribonucleic acid )
Berdasarkan  fungsinya,  bakteri  memiliki  2 macam DNA, yaitu:
Ari Purno Wahyu Wibowo, Rian Andrivani Jurnal Ilmiah Teknologi Informasi Terapan Volume II, No 3, 15 Agustus 2016
a. Kromosom DNA adalah materi genetik yang menentukan  sebagian  besar  dari  sifat-sifat metabolisme bakteri.
b. DNA  non-kromosom  hanya  menentukan sifat-sifat  tertentu,  ( plasmid )  yang  sifat patogen,  kemampuan  dalam  bereproduksi secara  seksual,  atau  sifat  fertilitas  dan  sifat kekebalan terhadap zat antibiotik tertentu.
8. Vakuola Gas
Dengan mengatur jumlah gas dalam bakteri dapat meningkatkan  atau  mengurang  vakuola  gasnya, kepadatan  sel  mereka  secara  keseluruhan  dan bergerak ke atas atau ke bawah dalam air.
9. Granula Gas
Granula gas berfungsi sebagai
tempat
penyimpanan  cadangan  makanan  atau  senyawa- senyawa lain yang dihasilkannya.
10. Klorosom
Klorosom  adalah  suatu  struktur  lipatan  yang  ada di  bawah  membran  pigmen  fotosintetik  plasma yang berisi klorofil dan lainnya.
Fungsinya adalah  untuk  fotosintesis  yang  hanya terdapat pada bakteri fotosintetik.
11. Flagela
Flagela  adalah  struktur  kompleks  yang  tersusun atas bermacam-macam protein termasuk membuat flagela flagelin yang  berbentuk  seperti tabung  cambuk  dan  protein  kompleks  yang memanjangkan  dinding  sel  dan  membran  yang menyebabkan flagela berotasi   untuk membentuk motor. Flagela berbentuk  seperti  cambuk. Flagela digunakan bakteri sebagai alat gerak.
12. Fimbrian
Fimbria adalah  tabung  protein  yang  menonjol dari  membran  pdaada  banyak  spesies  dari Proteobacteria .  Dan  terdapat  pada  semua  sel bakteri. Fimbria hanya  ditemukan  pada  bakteri gram  negatif,  dimana peptidoglikan tersebut memiliki  lapisan  yang  tipis  pada  dinding  bakteri selnya.
13. Pili
Struktur pili mirip sel bakteri dengan fimbria dan ada  di  permukaan  namun  tidak  banyak.  Pili berperan dalam konjugasi bakteri.
14. Plasmid
Plasmid dapat dengan mudah didapat oleh bakteri Pada umumnya bakteri memiliki plasmid.Namun, bakteri  juga  mudah  dalam  bentuk  transfer  gen horizontal.

## II.2 IMAGE PROCESSING
Teknik pembacaan berdasarkan image prosessing bisa
didesain secara otomatis untuk mengklasifikasikan  beberapa  jenis  bakteri,  image bakteri  bisa  di  perjelas  dengan    mengurangi  gambar noise yang  ada  pada  latar  belakang  image.  Dengan menggunakan  algoritma  image  processing  data backteri  bisa  ditampilan  secara  statistik  langkah pertama  adalah  dengan  mengisolasi  cell  bakteri    dari data background atau  dikenal  dengan  teknik segmentasi warna (Bo Yang Yu; Caglar Elbuken;Carolyn L. Ren; Jan P. Huissoon, 2011).
Proses  meningkatkan  atau  menajamkan  sebuah image  dengan  metode threshold bisa  membaca jumlah  cell  yang  saling  berdekatan  dan  sangat banyak. Pengambilan gambar dengan image processing  bisa  menggunakan  mikroskop  dengan pengambilan  gambar  rata-rata  20  x  20,  bisa mengahailkan  jumlah  pixel  pada  background  yang akan  dihilangkan,  metode  ini  dikenal  dengan generalized  euclidean  distance (GED)  atau  disebut juga mahalonibit distance (MD) (O. Dzyubachyk; W. A. van Cappellen; J. Essers;W. J. Niessen;, 2010).

## II.3 METODE THRESHOLDING
Suatu metode Thresholding merupakan cara yang digunakan  untuk  memisahkan  antara  objek  dan  latar belakangnya  ( Background ). Thresholding merupakan teknik  yang  cukup  efektif  untuk  proses  segmentasi citra.  Melalui  metode Thresholding ini  sistem  dapat membedakan  mana  objek  yang  dianggap  harus dihitung  dan  mana  latar  belakang  ( Background ) (Gonzalez, R. C;Woods, R. E.,, 2002).

## II.4 COUNTING MORPHOLOGY
Counting  Morphology adalah  metode  yang dikembangkan  untuk  menjadikan  proses    morfologi berfungsi  agar  dapat  melakukan  proses  perhitungan. Melalui  metode Counting  Morphology, sistem  akan mendeteksi  setiap  objek  bakteri  yang  muncul
Ari Purno Wahyu Wibowo, Rian Andrivani Jurnal Ilmiah Teknologi Informasi Terapan Volume II, No 3, 15 Agustus 2016
berdasarkan  rentang  waktu  tertentu  dan  setelah pendeteksian berakhir, sistem akan mengkalkulasikan berapa  objek  yang  terhitung,  lalu  menampilkan  hasil perhitungan yang telah diproses.

## II.5  ESCHERICHIA COLI
Escherichia coli adalah nama sejenis bakteri yang hidup  di  dalam  usus  hewan  dan  manusia.  Meskipun sebagian  besar  jenis  E.  coli  tidak  berbahaya,  namun ada  beberapa  jenis  yang  dapat  merugikan  manusia. Diberi  nama  berdasarkan  penemunya Theodor Escherichia , Escherichia  coli adalah  bakteri  Gram Escherichia coli tumbuh di usus bawah endotermik – organisme berdarah panas (Citra, 2016).
Bakteri  ini  dapat  memberikan  beberapa  manfaat bagi manusia diantaranya dapat menekan pertumbuhan  bakteri  jahat  pada  usus  besar  manusia dan  juga  membantu  dalam  proses  pencernaan  usus besar  manusia  termasuk  pembusukan  sisa-sisa makanan  dalam.  Manfaat  lain  dari  bakteri  ini  yaitu dapat  membantu  memproduksi  vitamin  K  melalui proses pembusukan  sisa  makan.  Vitamin K berfungsi ntuk pembekuan darah misalkan saat terjadi.
Dalam  jumlah  yang  berlebihan  bakteri  ini  dapat mengakibatkan  diare  (Saputra;  Rochmat,  2013),  dan bila  bakteri  ini  menjalar  dan  dapat  menyebabkan infeksi pada tubuh. Seperti kencing dapat mengakibatkan  infeksi  saluran  kemih/kencing  pada saluran kencing (Putra, 2016)
Selain  akibat  terdapat  beberapa  dampak  negatif dari bakteri ini :
1. Infeksi Otak ( Meningitis )
Infeksi  otak } yang  disebabkan  oleh E.coli umumnya  terjadi  pada  bayi,  dengan  gangguan saraf,  kuning  gejala  demam,  dan  pertumbuhan, pada  tubuh,  penurunan  asupan  makanan,  dan periode  henti  napas.  Pada  bayi  gejala  berupa rewel di bawah umur 1 tahun, tampak mengantuk terus – menerus, muntah, tidak  nafsu makan, dan kejang.  Gejala  pada  orang  dewasa  antara  lain nyeri  kepala,  muntah,  bingung  dan  penurunan kesadaran
2. Infeksi Paru-paru ( Pneumonia )
Pada  penderita  pneumonia E.coli didapatkan demam, peningkatan lendir, jalan napas dan cepat
3. Infeksi pada rongga perut
Infeksi  pada  kantung  dan  saluran  empedu ( kolelitiasis,  kolangitis )  menimbulkan  gejala demam tinggi dengan atau tanpa menggigil, nyeri pada  perut  kanan  atas,  dan  kuning  pada  tubuh. Pada  infeksi  berat,  dapat  terjadi  penurunan tekanan  darah  dan  penurunan  kesadaran.  Selain itu, E.coli dapat  menyebabkan  infeksi  dengan kumpulan  nanah  ( abses )  pada  rongga  perut dengan gejala demam tidak tinggi dan nyeri perut (Natharina, 2016)

## III. M ETODOLOGI P ENELITIAN
Pada  bab  ini  akan  dijelaskan  mengenai  kerangka penelitian  dan  langkah  –  langkah  penelitian  dalam mendeteksi  objek  bergerak  yaitu  bakteri  pada  video pengolahan  citra  dengan  metode Thresholding dan Counting Morphology

## III.1 Tahapan Metodologi Penelitian
Untuk  menjelaskan  sistem  yang  dibuat  oleh penulis  akan  dijelaskan  dalam  diagram  alur  sebagai berikut :
start Segmentasi warna Proses morfological Objek Counting Bacteria End Bakteri dihitung ya tidak

## Gambar 3. Metode Penelitian
1. Segmentasi warna pada metode ini data dipisahkan dalam dua bagian,  dibuat  penajaman  warna  dan  area,
Ari Purno Wahyu Wibowo, Rian Andrivani Jurnal Ilmiah Teknologi Informasi Terapan Volume II, No 3, 15 Agustus 2016
objek yang tidak terpakai akan dihilangkan,algoritma  segmentasi  warna menggunakan dua metode discontinuity and similarity
2. Proses Morfological
Pada  tahapan morfological menggunakan teknik  image    processing  dengan  teknik penajaman gambar, metode yang digunakan adalah morfological dilasi .
3. Proses Penajaman Warna Pada tahapan ini objek yang sudah tajamkan dengan menghilangkan noise yang ada pada background  objek  dari  bacteri  dihitung dengan  metode Bounding  Box  Output  Port sehingga  bacteri  yang  terhitung  diberi marker  agar  sistem  bisa  terus  menghitung jika ada penambahan bacteria

## IV. A NALISIS DAN P ERANCANGAN
Pada  bab  ini  akan  dijelaskan  mengenai  analisis sistem  perhitungan  bakteri  yang  pernah  digunakan oleh  para  ahli.  Berdasarkan  hasil  pengumpulan  data yang  di  dapat  oleh  penulis  dari  berbagai  sumber, penulis mendapatkan informasi tentang cara perhitungan bakteri. Untuk dapat  menentukan jumlah bakteri,  para  peneliti  biasa  menggunakan  dua  cara, yaitu  metode  perhitungan  bakteri  dengan  metode secara  langsung  dan  tidak  langsung.  Berikut merupakan penjelasan dari kedua metode perhitungan bakteri tersebut
IV.1 Perhitungan Jumlah Bakteri Secara Langsung
a. Counting Chamber
 Centrifuge
 Turbidimetri (Kekeruhan)
 Electronic C
 Counter (Perhitungan Elektronik)
 Analisis senyawa Kimia
 Analisa Berat Kering
 Pengenceran
 Most Probable Number (MPN)
 Metode Cawan
 Jumlah Koloni
b. Cara  Pengamatan Mikroskopik
c. Filter Membran

## IV.2 Perhitungan Jumlah Bakteri Secara Tidak langsung
Jumlah  bakteri  dihitung  secara  keseluruhan  baik yang  mati  atau  yang  hidup  atau  hanya  untuk menentukan  jumlah  mikroba  yang  hidup  saja,  ini tergantung cara-cara yang digunakan. Untuk menentukan  jumlah  bakteri  yang  hidup  dapat dilakukan  setelah  larutan  bahan  atau  biakan  bakteri diencerkan  dengan  faktor  pengenceran  tertentu  dan ditumbuhkan  dalam  media  dengan  cara-cara  tertentu tergantung dari macam dan sifat-sifat bakterinya.
Jumlah  bakteri  masih  belum  mendekati  hasil maksimal, dikarenakan setiap cara perhitungan diatas masih  ada  kelemahan  masing-masing  mulai  dari perhitungan  yang  melibatkan  sel  hidup  dan  sel  mati bakteri,  keterbatasan  alat,  keperluan  persiapan  yang cukup  panjang,  ketelitian  penelitian  dan  lain-lain. Untuk  menjawab  persoalan  diatas,  maka  penulis membuat  solusi  dengan  membangun  sebuah  sistem perhitungan  bakteri  yang  dapat  memberikan  tanda ( Mark )  terhadap  bakteri  yang  muncul  pada  setiap rentang  waktu  tertentu,  sehingga  setiap  bakteri  yang tumbuh  bertambah  banyak,  sistem  akan  selalu memberi  tanda  ( Mark )  pada  setiap  bakteri  yang muncul  Setelah  pendeteksian  objek  bakteri  selesai, sistem  akan  mengkalkulasikan  jumlah  keseluruhan bakteri yang terdeteksi.
Diharapkan  dengan  sistem  perhitungan  bakteri secara otomatis yang diusulkan oleh penulis ini dapat memudahkan  kinerja para peneliti bakteri,  khususnya bakteri Escherichia  coli .  Dengan  adanya  sistem perhitungan  bakteri  secara  otomatis  ini,  para  peneliti bisa  mengetahui  jumlah  pasti  bakteri  yang  dihitung tanpa  harus  mengeluarkan  banyak  peralatan,  biaya dan tenaga serta menghemat waktu untuk kepentingan penelitian bakteri ini

## V. T AHAPAN P ERANCANGAN S ISTEM
Berikut  ini  akan  dijelaskan  tahapan  perancangan sistem    pengambilan  data  bacteri  diambil  dalam bentuk  data  image  atau  vidio    hasil  pengamatan  dari sample makanan menggunakan mikroskop digital data tersebut  bisa  direkam  dalam  file  film  dengan  format mp4  sehingga  data  hasil  pengamatan  bisa  disimpan dan digunakan untuk penelitian selanjutnya
Pada  tahapan thresholding data bacteria akan dianalisa  dengan  menghilangkan  gambar  background
Ari Purno Wahyu Wibowo, Rian Andrivani Jurnal Ilmiah Teknologi Informasi Terapan Volume II, No 3, 15 Agustus 2016
pada  critra  bakteria  fungsi thresholding adalah  untuk menghilangkan  image noise dan  dirubah  kedalam tampilan  abu  abu  sehingga  gambar  bacteri  dan background terlihat  jelas.  Kemudian  pada  metode counting  Morfologi jumlah  bacteri  secara  otomatis akan terhitung  dan diberi tanda oleh sistem atau mark berwarna  hijau,  sehingga  penambahan  jumlah  bacteri bisa terus dimonitoring apakah masuk ke dalam batas jumlah normal atau tidak

## 1. Sample Data
Pada proses awal pembuatan sistem ini dilakukan pengumpulan  sample  data.  Sample  data  ini berupa  sample video, karena  pada  penelitian  ini objek yang akan dideteksi bersumber dari sebuah video ,penelitian dapat dilakukan dengan menggunakan sample  tersebut.

## 2. Metode Thresholding
Pada  kode  program  matlab  dibawah  berfungsi untuk  merubah  dan  menkonversi  sebuah  citra biner  dengan  fungsi  im2bw  menjadi  level treshlold
imCPU = imread( 'image.png' ); imGPU = gpuArray(imCPU); imGPUgray = rgb2gray(imGPU); imtool(gather(imGPUgray)); imWaterGPU = imGPUgray<70; figure;imshow(imWaterGPU);
pada  metode  tresholding  pixel  image  akan    yang memiliki  nilai  0    aka  diganti  dengan  1  dari  hasil citra  biner  yang  telah  dikonversi  sebelumnya pada mode grayscale

## 3. Metode Counting Morphology
Metode  morfologi  adalah  sebuah  cara  untuk mengektrasi sebuah
citra
yang merepresentasikan  sebuah  objek  dalam  bentuk area  lain  dengan    variable boundaries , skeleton dan convex ,    morfologi  bisa  disebut    sebagai suatu  teknik  untuk  merubah  bentuk  pada  suatu citra,  teknik  yang  digunakan    pada  metode  ini adalah erosi dan dilasi.

## VI. P EMBAHASAN
Pada pembahasan ini penulis menggunakan salah satu teknik morpological denga metode dilate dengan mengghilangkan noise atau background pada gambar objek yang tidak digunakan dengan menggunakan dua properti.

## VI.1 Propery Neighborhoodsource
Proses penghilangan background image
berdasarkan  inputan  data  dan  proses    perhitungan pada  image  lebih  spesifikasi,  jika  variable  data memenuhi  property  dari  algoritma  dilasi  atau clone maka  objek  dari  gambar  bakteri  akan  dihitung kembali.

## VI.2 Neighborhood
Proses  pembacaan  dari  nilai  elemen  dimana pengaturan  dlakukan  oleh  algoritma clone dengan perubahan properti matrik dari 0 dan 1 hasil dari clone dilasi bisa dilihat pada tabel 1.
VI.3 Pengaturan Property Vision Blob Analysis
Proses property  blob analisis  disini  untuk menampilkan  grafik  komputasi  dari  data  image  yang telah  dirubah  dalam  bentuk  biner  berdasarkan  data spesifikasi  bebarapa property yang  digunakan  seperti pada tabel 2
Tabel  1.  Proses Morpologicaldilate
Gambar Image Proses Morfological dilate
Ari Purno Wahyu Wibowo, Rian Andrivani Jurnal Ilmiah Teknologi Informasi Terapan Volume II, No 3, 15 Agustus 2016
Tabel 2. pengaturan property pada blob Analysis . AreaOutputPort Penilian  variable  dengan nilai True dan False CentroidOutputPort Metode perhitungan secara  acak    berdasarkan kemunculan dari image BoundingBoxOutputPort Set
koordinat dari bouding  dengan  nilai  set propoerty True dan False

## VI.4 Penerapan Metode Mofological Dilate
Inputan  data  berupa  video  bacteria  hasil perhitungan  bisa  dilihat  pada  tabel  3    dibawah  ini dimana  jumlah  bakteri  yang  telah  dihitung  diberi tanda atau marker sehingga oleh sistem

## Tabel  3. Perhitungan Jumlah Bacteri
Data image Data Dilate Jumlah bakteri Frame : 512 Bacteri: 648
Frame:125 Bacteria :670
Keterangan :
Pada  tabel  diatas  menunjukan  perhitungan bacteri ecoli dengam  sample  pertama  terhitung  648  bacteri dan  sample  yang  kedua  670  bacteri  jumlah  frame menunjukan  jumlah  frame  image  yang  di  ambil  dari data video.

## VII. K ESIMPULAN
Dari  hasil  percobaan  dapat  disimpulkan  bahwa perhitungan bacteria  e-coli dengan  menggunakan metode motfological dilate  bisa  diimplemtasikan  dan mengatasi perhitungan secara manual, dengan metode ini maka kita bisa melakukan perhitungan secara tepat dan cepat tentang jumlah perkembangan bacteri e-coli dalam  suatu  bahan  makanan  bisa  digolongkan  pada level aman  atau bahaya.
Untuk  penilitian selanjutnya  digunakan data dan sample    yang  lebih  banyak,  data  bisa  berupa  vidio atau  berupa  image  dan  sistem  perhitungan  bacteri e- coli dibuat dalam bentuk GUI ( Grafik User Interface ) agar memudahkan pengguna

## R EFERENSI
Advantages of Standardized Usability Questionnairres Amazine 12  Fakta  dan  Informasi  Menarik  tentang Bakteri e Coli,
Assessing the Reliability, Validity and Adaptability of PSSUQ2005 9th  Americas  Conference  on Information Systems Omaha, Nebraska

## Bagian-bagian  Penyusun  Struktur  Sel  Bakteri  dan Fungsinya
Bo Yang Yu; Caglar Elbuken;Carolyn L. Ren; Jan P. HuissoonImage processing and classification algorithm  for  yeast  cell  morphology  in  a
Ari Purno Wahyu Wibowo, Rian Andrivani Jurnal Ilmiah Teknologi Informasi Terapan Volume II, No 3, 15 Agustus 2016
microfluidic  chip Journal  of  Biomedical Optics 16
C. Zimmer, E. Labruyere; V. Meas-Yedid;N. Guillen; J.  C.  Olivo-Marin2010Segmentation  and tracking of migrating cells in videomicroscopywith parametric active
contours: IEEE Trans. Med. Imaging
21(10) 1212-122121
Gonzalez, R. C;Woods, R. E.,2002Digital ImageProcessing  Second  Edition,  Pearson EducationNew Jersey
Jiwanjaya Yoga Metode Perhitungan Bakteri
Juwita  Usna;  Haryani  Yuli;  Jose  Christine2014umlah Bakteri  Coliform  dan  Deteksi  Escherichia coli Pada Daging Ayam di Pekanbaru1

## Manfaat dan Bahaya E. Coli – Escherichia Coli
O. Dzyubachyk; W. A. van Cappellen; J. Essers;W. J.
Niessen;2010Advanced  level-set-based  cell tracking in time-lapse fluorescence microscopy IEEE  Trans.  Med.  Imaging 29 1331-1331
Saputra;  Rochmat2013 Perhitungan  Jumlah  Mikroba T12: Standardized Usability Questionarry
X.Wang;W.  He;  D.  Metaxas2007Cell  segmentation and  tracking  using  texture-adaptive  snakes 4th  IEEE  Int.  Symp.  on  Biomedical Imaging:Macro  to  Nano  (ISBI  2007)1 101– 104