ISSN: 1907-9931 (print), 2476-9991 (online)
IDENTIFIKASI IKAN SARDIN KOMERSIAL (Dussumieria elopsoides) YANG DIDARATKAN DI PASAR MUARA ANGKE, JAKARTA MENGGUNAKAN PENGAMATAN MORFOLOGI, MORFOMETRIK DAN DNA BARCODING
IDENTIFICATION OF COMMERCIAL SARDIN FISH (Dussumieria elopsoides) IN MUARA
ANGKE MARKET, JAKARTA USING MORPHOLOGY, MORPHOMETRIC AND DNA
BARCODING OBSERVATIONS
Zakiyah Rahim*, Hawis Madduppa
Departemen Ilmu dan Teknologi Kelautan, FPIK IPB, Bogor, 16680, Indonesia *Corresponden author e-mail: 040496zakiyahrahim@ipb.ac.id
Submitted: 09 January 2020 / Revised: 09 July 2020 / Accepted: 09 July 2020 http://doi.org/ 10.21107/jk.v13i2.6397

## ABSTRACT
Sardines  are  an  important  commodity  in  import  activities.  Excessive  imports  and  lack  of  catch  data are feared to reduce fish stocks. To complete the fish catch data required knowledge of body type and size.  This  study  aims  to  identify  and  confirm  commercial  sardines  species  landed  at  Muara  Angke Market,  Jakarta  using  morphological,  morphometric,  and  DNA  barcoding  methods  targeting  the Mitochondrial  Cytochrome  c  oxidase-I  (COI)  gene.  The  results  of  morphological  and  morphometric analysis  showed  that  the  samples  are  the  genus  Dussumieria  originating  from  the  Dussumieriidae family,  the  Order  Clupeidae,  having  silver-colored  body  characteristics  with  reflections  resembling rainbows, slender bodies and rounded stomachs with a maximum length of up to 14.4 cm, then less abdominal fins advance from the midsection. Based on the relationship of body weight length, this fish is negative allometric. Molecular DNA barcoding analysis using COI, obtained by type of Dussumieria elopsoides fish with local name of rainbow sardines, similarity level with Query Cover percentage was 94% and Per percentage. Ident of 91.64%. DNA barcoding analysis has corroborated morphological and morphometric observations by obtaining fish samples identified as Dussumieria elopsoides.
Keywords: Morphology, Morphometrics, DNA Barcoding, Dussumiera elopsoides.

## ABSTRAK
Ikan sardin merupakan komoditas penting dalam kegiatan impor. Impor berlebih serta kurangnya data penangkapan  dikhawatirkan  dapat  menurunkan  stok  ikan.  Untuk  melengkapi  data  tangkapan  ikan diperlukan  pengetahuan  mengenai  jenis  dan  ukuran  tubuhnya.  Penelitian  ini  bertujuan  untuk mengidentifikasi dan memastikan jenis ikan sardin komersial yang didaratkan di Pasar Muara Angke, Jakarta  dengan  menggunakan  studi  morfologi,  morfometrik,  dan  metode  DNA  barcoding  dengan target  gen  Mitokondrial  Cytochrome  c  oxidase-I  (COI).  Hasil  analisa  morfologi  dan  morfometrik menunjukkan bahwa sampel merupakan genus Dussumieria berasal dari famili Dussumieriidae, Ordo Clupeidae,  memiliki  karakteristik  tubuh  yang  berwarna  silver  dengan  pantulan  menyerupai  pelangi, tubuh  ramping  dan  perut  membulat  dengan  panjang  maksimal  dapat  mencapai  14,4  cm,  kemudian sirip  bagian  perut  kurang  maju  dari  bagian  tengah  tubuhnya.  Berdasarkan  hubungan  panjang  berat badan,  ikan  ini  bersifat  alometrik  negatif.  Analisis  DNA  barcoding  secara  molekuler  menggunakan COI, didapatkan ikan berjenis Dussumieria elopsoides dengan nama lokal ikan sardin pelangi, tingkat kemiripan dengan presentase Query Cover sebesar 94% dan presentase Per. Ident sebesar 91,64%. Analisis  DNA  Barcoding  telah  menguatkan  pengamatan  morfologi  dan  morfometrik  dengan didapatkan sampel ikan yang teridentifikasi berjenis Dussumieria elopsoides.
Kata Kunci: Morfologi, Morfometrik, DNA Barcoding, Dussumiera elopsoides.

## PENDAHULUAN
Ikan  Sardin  merupakan  salah  satu  komoditas perikanan yang banyak diminati oleh masyarakat  secara  global  khususnya  di Indonesia.  Terbukti  dengan  meningkatnya tingkat  konsumsi  ikan  di  Indonesia  dari  tahun ke tahun, hingga meningkatnya jumlah ekspor ikan sardin ke negara tetangga. Perkembangan  impor  ikan  sardin  mengalami peningkatan  sebanyak  137,49%  pada  periode 2016-2017  (Sekjen  KKP  RI,  2018).  Tingginya minat  beli  masyarakat  terhadap  ikan  ini, menjadikan  ikan  ini  sebagai  komoditas  ikan yang penting dalam meningkatkan
perekonomian Indonesia. Namun
penangkapan  ikan  yang  berlebihan  dan  tidak terkendali  dapat  menurunkan  nilai  stok perikanan,  contohnya  terjadi  pada  negara India, dimana pada tahun 1943 daerah Madras di  India  mengalami  penurunan  dan  jatuhnya stok ikan sardin akibat overfishing (Kripa et al., 2018).ekplorasi sumberdaya yang terus meningkat, makadiperlukan usaha untuk mengetahui  dan  mengevaluasi  terjadinya penururnan  stok  dan  kepunahan  dari  suatu spesies.
Penelitian  biologi  perikanan  sangat  penting dilakukan  untuk  pendugaan  dari  probabilitas suatu  spesies  di  perairan.  Salah  satu  ilmu pada  bidang  biologi  perikanan  yang  dapat dimanfaatkan dalam pendugaan dan pendataan  suatu  spesies  di  perairan  yaitu dengan menggunakan studi morfologi, morfometrik  dan  metode  DNA  barcoding  yang telah  dilakukan  pada  ikan Dussumieria elopsoides (Keskin dan Atar, 2013). Penggunaan  data  morfometrik  dinilai  penting untuk menentukan apakah ikan yang tertangkap sudah layak untuk diambil, sedangkan penggunaan DNA barcoding dilakukan  untuk  memverifikasi  apakah  ada kesalahan  atau  tidak  dalam  penentuan taksonomi ikan yang diteliti, karena selama ini beberapa  spesies  ikan  mengalami  ambiguitas dalam  taksonomi  (Ko et  al., 2013).  Contoh kesalahan  yang  terjadi  dalam  identifikasi secara morfologi yaitu pada penelitian Abdullah dan Rehbein (2016), dimana terdapat 6  spesies  ikan  pari  teridentifikasi  sebagai Eusphyra  blochii ,  namun  setelah  diidentifikasi menggunakan  genetika  molekuler  spesies tersebut  merupakan Sphyrna  lewisi. Genetika molekuler dibutuhkan terkait dengan ketepatan mengidentifikasi spesies dan mendukung hasil identifikasi berdasarkan sifat morfologi. Identifikasi secara akurat pada suatu organisme dari tingkat genus hingga
subspesies  secara  morfologi  sulit  dibedakan dan  menimbulkan  ambiguitas,  sehingga dapat menggunakan  DNA  barcoding  (Hebert et  al., 2003).  Ambiguitas  dan  kesalahan  dalam identifikasi  suatu  spesies  dapat  menjadi ancaman  bagi  kegiatan  konservasi  maupun perikanan  berkelanjutan  (Sembiring et  al., 2015).  Beberapa  penelitian  telah  mampu mengidentifikasi  ikan  komersil  dari  perairan Indonesia menggunakan teknik genetika molekuler  diantaranya  pada  ikan  kakap (Lutjanus),  kerapu  ( Epinephelus ) ,  makarel (Scomberomorus),  tuna  (Thunnus)  (Abdullah dan Rehbein 2016; Jefri et al., 2015; Maulid et al., 2016  Nurimala et  al., 2016  :  Akbar  dan Labenua,  2018).  Manfaat  studi  morfometrik sendiri yaitu dapat mengetahui dan mendeskripsikan pola pola keragaman morfologis  dan  pola  pertumbuhan  baik  itu antar  populasi  ataupun  spesies  (Strauss  & Bond, 1990).
Penerapan metode yang sesuai untuk identifikasi ikan yang akurat dan cepat, sangat penting  untuk  membantu  dalam  mengelola perikanan keberlanjutan dalam jangka panjang dan diharapkan mampu meningkatkan ketersedian  di  ekosistemnya,  serta  mampu meningkatkan  nilai  konservasi.  Tujuan  dari penelitian  ini  yaitu  untuk  mengetahui  spesies ikan  sardin  yang  tertangkap  berdasarkan pengamatan morfologi pengukuran morfometrik  dan  memverifikasi  jenis  spesies sampel  menggunakan  DNA  barcoding,  serta untuk  mengetahui  hubungan  panjang  dan berat tubuhnya. Dengan adanya penelitian ini, diharapkan  mampu  membantu  pemerintah dalam  mendapatkan  informasi  mengenai perikanan  tangkap  maupun  upaya  dalam konservasi  sumber  daya  perikanan  laut, terutama pada bidang genetika molekuler.

## MATERI DAN METODE Lokasi Pengambilan Sampel
Sampel diambil di Pasar Muara Angke Jakarta Utara  pada  bulan  Oktober  2019.  Pengukuran dilakukan  di  lapangan  sedangkan  analisis morfometrikk dan analisisi molekuler dilakukan di  Laboratorium  Biosistematik  dan  Genetika Kelautan, Departemen Ilmu Kelautan, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Institusi Pertanian Bogor.

## Pengamatan Morfologi dan Morfometrik
Sebanyak  30  ekor  sampel  dikumpulkan menggunakan metode sampling acak. Sampel diambil  dari  tengkulak  ikan  yang  terdapat  di Pasar  Muara  Angke.  30  individu  kemudian
diamati
morfologinya. 22 karakter morfometrikk diukur pada tiap 30 ekor sampel (Myers,  2013).  Karakter  morfometrikk  sampel yang  diukur  yaitu  1.  Panjang  Total  (PT),  2. Panjang  Standar  (PS),  3.  Panjang  Kepala (PK),  4.  Panjang  Sebelum  Sirip  Dorsal (PSSD),  5.  Panjang  Sebelum  Sirip  Ventral (PSSV),  6.  Panjang  Sebelum  Sirip  Anus (PSSA),  7.  Tinggi  Kepala  (TK),  8.  Tinggi Badan (TB), 9. Tinggi Pangkal Ekor (TPE), 10. Panjang  Batang  Ekor  (PBE),  11.  Panjang Dasar Sirip Dorsal (PDSD), 12. Panjang Dasar Sirip  Anus  (PDSA),  13.  Panjang  Dasar  Sirip Ventral  (PDSV),  14.  Panjang  Dasar  Sirip Pektoral  (PDSP),  15.  Panjang  Sirip  Ekor
Bagian  Atas  (PSEA),  16.  Panjang  Sirip  Ekor Bagian  Tengah  (PSET),  17.  Panjang  Sirip Ekor  Bagian  Bawah  (PSEB),  18.  Panjang Moncong  (PM),  19.  Diameter  Mata  (DM),  20. Jarak Mata ke Tutup Insang (JMTI), 21. Jarak Antar  Mata  (JAM),  22.  Lebar  Badan  (LB). Perhitungan  Morfometrik  ditampilkan  pada Gambar  1.  Setiap  sampel  yang  telah  diukur morfometriknya menggunakan jangaka sorong kemudian ditimbang lalu difoto untuk kemudian  didigitasi  menggunakan  CorelDraw. Salah  satu  sampel  ikan  diambil  bagian ekornya lalu dipreservasi menggunakan etanol 96% untuk digunakan dalam anaisis molekuler (DNA barcoding).
Gambar 1. Pengukuran Morfometrik (Myers, 2013)

## Molekuler
Tahapan  yang  dilakukan  dalam  analisis molekuler  yaitu  meliputi  ekstraksi  DNA, amplifikasi  DNA  menggunakan Polymerase Chain  Reaction (PCR),  visualisasi  fragmen DNA menggunakan elektroforesis, dan sequensing  DNA.  Jaringan  ekor  ikan  yang telah dipreservasi kemudian dijadikan sebagai bahan  ekstraksi  DNA.  Ekstraksi  DNA  25  mg sampel  ikan  mengunakan  gSYNC  DNA Extraction    Kit  (Geneaid,  Taiwan)  dan mengikuti prosedur manualnya. Hasil ekstraksi  kemudian  digunakan  dalam  proses amplifikasi. Amplifikasi
DNA dengan menggunakan PCR pada Mitochondrial Cytochrome  C  Oxidase  Subunit  I  (COI). Komponen  yang  digunakan  dalam  proses PCR  yiatu  DNA  template  1  µl,  Primer  1,25  µl, DDH2O 9 µl, dan MyTaq 12,5 µl. Primer yang digunakan yaitu
F ishF1 (5’- TCAACCAACCACAAAGACATTGGCAC- 3’) dan FishR1 (5’- TAGACTTCTGGGTGGCCAAAGAAT CA- 3’
(Ward et  al., 2005).  Proses  PCR  mengikuti manual Geneaid dan menggunakan alat DIAB Mastercycler  DNA  Engine  Thermal  Cycle. PCR dilakukan dengan proses denaturasi awal den gan  suhu  94˚C  selama  30  detik,  diikuti
dengan  38  siklus  amplifikasi  (denaturasi  pada suhu  94  ˚C  selama  30  detik,  anneling  pada suhu 50 ˚C selama 1 menit, dan elongasi pada 72 ˚C selama 1 menit) dan elongasi akhir pada 72  ˚C  selama  7  menit,  kemudian  diikuti pendinginan  pada  suhu  4  ˚C  selama  5  menit. Hasil  dari  proses  PCR  kemudian  divisualisasi mengguakan  elektroforesis  dalam  1%  gel agarose.  Hasil  visualisasi  DNA  yang  terlihat jelas  dalam  UV  transilluminator,  diyakini memiliki  kualitas  yang  baik  dan  dapat dilanjutkan  ke  tahap  sequensing  DNA.  Hasil amplifikasi  kemudian  dikirim  dan  dianalisis  ke The  1st  BASE®  service  di  Singapore  untuk mengetahui  urutan  basa  nukleotida  dari  DNA tersebut.

## Analisis Data
Identifikasi berdasarkan morfologi dan morfometrik  dianalisa  dengan  menggunakan buku  identifikasi  FAO  Species  Catalog  Vol.  7 Clupeoid  Fishes  Of  The  World  (Whitehead, 1985).  Analisis  hubugan  panjang  dan  berat tubuh  menggunakan  metode  Santos  et  al. (2002) yaitu dengan menggunakan persamaan Linear Allomatric Model.
W= (aL b ) W = berat ikan (gram)
L = panjang ikan (cm) a = intercept regresi linear b = koefisien regresi
Hasil  sequensing  amplifikasi  DNA  berupa urutan  basa  kemudian  diedit  secara  manual menggunakan  MEGA  6.0.  Urutan  basa  yang sudah diedit kemudian dicocokan kemiripannya  di  Gene  Bank  pada  halaman web NCBI dengan menggunakan BLAST serta membandingkan dengan referensi hasil sequensing lainnya.

## HASIL DAN PEMBAHASAN Morfologi dan Morfometrik
Setelah
diidentifikasi berdasarkan morfologinya  dengan  menggunakan  buku identifikasi  FAO  Species  Catalog  Vol.  7 Clupeoid  Fishes  Of  The  World (Whitehead,
1985),  30  spesimen  ikan  yang  diambil  dari
Pasar  Ikan  Muara  Angke  diperkirakan  masuk ke dalam famili Dussumieriidae , Ordo Clupeidae ,  yaitu  golongan  ikan  sardin.  Genus dari  famili  ini  yang  terdapat  di  Indonesia  yaitu Dussumieria dan Spratelloides .  Berdasarkan bentuk  dan  ukuran  tubuh  serta  ornamen  di tubuhnya,  ikan  ini  masuk  ke  dalam  genus Dussumieria ,  terlihat  bahwa  ikan  memiliki tubuh  yang  ramping  dan  memanjang  seperti cerutu dengan panjang berkisar hingga 14 cm dengan maksimal panjang dapat mencapai 20 cm  (Whitehead,  1985),  dengan  perut  yang membulat,  tidak  memiliki  pre  dan  post  pelvic scute, sedangkan pelvic scute berbentuk huruf “W”, scute  terletak  diantara  sirip  perut  dan dubur .  Sirip  perut  dan  punggung  lebih mendekati  ekor  dibandingkan  dengan  kepala, kemudian  sirip  bagian  perut  kurang  maju  dari bagian tengah tubuhnya.
Gambar 2. Dussumieria elopoides (Dokumentasi pribadi, 2019)
Ciri  lainnya  yaitu  memiliki  tubuh  yang berwarna silver atau keperakan dengan warna punggung hijau kebiruan,sehingga memberikan  pantulan  warna  tubuh  yang menyerupai  pelangi,  sebab itu  ikan ini  dikenal sebagai ikan sardin pelangi. Beberapa nelayan memberikan  nama  lokal  pada  ikan  ini  seperti Tembang  Jawa,  Tamban  Buluh,  Tamban Bulat,  Tamban  Bines,  Tembang  Bines  dan Janggul. Ikan ini tidak memiliki duri punggung, namun memiliki sirip lunak punggung sejumlah 16  hingga  18  buah,  kemudian  terdapat  sirip lunak anal sebanyak 14 hingga 18 buah, tidak ada striae pada bagian sisik posterior. Ikan ini merupakan  ikan  pelagis  yang  berkoloni  atau schooling dan banyak tersebar di daerah Indo- pasific  terkhusus  di  Perairan  Indonesia (Sumatera,  Utara  Jawa  dan  Kalimantan). Makanan  utamanya  adalah  plankton  (Bukit et al., 2017). Genus Dussumieria sendiri memiliki 2  spesies  yang  sedikit  sulit  untuk  dibedakan yaitu D. acuta dimana bentuk tubuh spesies ini lebih  lebar  dan  pendek  dibandingkan  dengan D.  elopsoides yang  terlihat  lebih  silindris. Berdasarkan  penjelasan  morfologi  tersebut dapat  ditentukan  bahwa  ikan  yang  dimaksud merupakan  jenis D.  elopsoides (Bleeker,
1849).  Hal  tersebut  juga  dikuatkan  dengan pengecekan  molekuler  menggunakan  DNA barcoding  pada Cytochrome  C  Oxydase Subunit I (COI).
Pengukuran  morfometrik  dapat  membantu dalam  identifikasi  suatu  spesies  dan  dapat melihat  pula  pola  pertumbuannya.  Hasil pengukuran  morfometrik  yang  telah  dilakukan berdasarkan Myers (2013) (Tabel 1).
Menurut  Nair  (1982) D.  elopsoides sendiri memiliki lebar  tubuh  yang  jauh lebih  kecil  dari panjang  kepala,  hal  tersebut  sesuai  dengan data  pengukuran  morfometrik  yaitu  dengan lebar  tubuh  1,8  cm  dan  panjang  kepala 3  cm. Nair (1982) juga menyebutkan bahwa panjang sirip  ekor  selalu  kurang  dari  panjang  kepala, dan  hampir  tiga  kali  lipat  diameter  matanya. Hal  tersebut  sesuai  dengan  data  pengukuran morfometrik  yaitu  panjang  sirip  ekor  (2,7-2,8 cm),  panjang  kepala  (3  cm),  dan  diameter matanya (0,8 cm).
Terjadi  penurunan  nilai  panjang  total  badan ikan D. elopsoides . Menurut Whitehead (1985) panjang standar tubuh spesies ini yaitu bekisar
20  cm,  sedangkan  rerata  yang  didapat  dari hasil  pengukuran  yaitu  12,3  ±  1,1  (Tabel  1). Whitehead  (1985)  juga  mengatakan  bahwa lebar  badan  berkisar  16  hingga  22  %  dari panjang  total  tubuh  namun  yang  ditemukan hanya  memiliki  presentase  10%  dari  panjang total  tubuhnya.  Dari  hasil  tersebut  dapat dikatakan  bahwa  terdapat  penurunan  bobot ikan D.  elopsoides yang  ditangkap  pada  saat ini.  Hal  ini  dapat  dikarenakan  oleh  gangguan lingkungan,  ketersediaan  makanan,  maupun
akibat dari tekanan aktivitas perikanan (Pauly, 2010).  Berdasarkan  perhitungan  hubungan panjang  berat,  nilai  koefisien  b  yang  didapat yaitu 2,7234. Jadi, pola pertumbuhannya yaitu Alometrik Negatif yang ditunjukan dengan nilai b  kurang  dari  3  (b<3).  Adapun  untuk  b<3 menunjukkan  bahwa  pertambahan  berat  tidak secepat  pertambahan  panjang,  b  =  3  artinya pertambahan  panjang  dan  berat  seimbang, dan  untuk  nilai  b>3  pertambahan  panjang lebih lambat dari pertambahan bobot.

## Tabel 1. Hasil Pengukuran Morfometrik
NO Karakter Ukuran Maks. (cm) Rerata (cm) ± SD 1 Panjang total 14,4 12,3 ± 1,1 2 Panjang standar 11,7 9,95 ± 1,0 3 Panjang kepala 3 2,51 ± 0,2 4 Panjang sebelum sirip dorsal 6,8 5,4 ± 0,6 5 Panjang sebelum sirip ventral 7,4 5,83 ± 0,7 6 Panjang sebelum sirip anus 9,6 7,93 ± 0,8 7 Tinggi kepala 1,5 1,24 ± 0,1 8 Tinggi badan 2,5 1,96 ± 0,2 9 Tinggi pangkal ekor 1,4 0,92 ± 0,1 10 Panjang batang ekor 1,7 4,16 ± 0,2 11 Panjang dasar sirip dorsal 1,8 1,38 ± 0,2 12 Panjang dasar sirip anus 1,2 0,91 ± 0,1 13 Panjang dasar sirip ventral 0,4 0,32 ± 0,1 14 Panjang dasar sirip pektoral 1,5 1,14 ± 0,2 15 Panjang sirip ekor bagian atas 2,7 2,37 ± 0,2 16 Panjang sirip ekor bagian tengah 0,7 0,45 ± 0,1 17 Panjang sirip ekor bagian bawah 2,8 2,37 ± 0,2 18 Panjang moncong 1 0,8 ± 0,1 19 Diameter mata 0,8 0,66 ± 0,1 20 Jarak mata ke tutup insang 1,9 1,69 ± 0,2 21 Jarak antar dua mata 0,6 0,51 ± 0,1 22 Lebar badan 1,8 1,22 ± 0,2 23 Berat Total 25 (gr) 17,1± 4 (gr) DNA Barcoding DNA  Mitokondrial  COI  dijadikan  sebagai daerah tercoding yang penting dalam identifikasi  sampel,  hal  ini  dikarenakan  DNA Mitokondrial  memiliki  laju  mutasi  yang  lebih tinggi  dibandingkan  DNA  nukleus,  jumlah salinan  yang  lebih  tinggi,  juga  gen  diwariskan langsung  yang  hanya  berasal  dari  induk (Amorim et  al., 2019).  Hasil  analisis  yang
diperoleh  yaitu  panjang  pasang  basa  yang berasal  dari  DNA D.  elopsoides yaitu sebanyak  682  bp  ( base  pair ),  hal  tersebut dikarenakan  primer  yang  digunakan  pada target dengan panjang basa sebanyak 600 bp, hal  ini  juga  dapat  terlihat  saat  melakukan visualisasi  kualitas  ekstraksi  DNA  pada  hasil elektroforesis (Gambar 3).
Gambar 3. Penjejaran hasil sequen gen COI jenis Dussumieria elopsoides yang dikoleksi dari Pasar Ikan Muara Angke, Jakarta.
CCCTTTAAGTATTTGGTGCTTGAGCAGGGATAATTGGAACAGCCCTAAGCCTTTTA ATTCGGGCAGAGCTAAGCCAACCAGGAGCACTCCTAGGAGATGATCAAATCTATA ATGTCATCGTCACTGCGCACGCTTTTGTAATAATTTTCTTCATAGTAATGCCTATCC TGATCGGTGGCTTTGGAAACTGGCTTGTGCCTCTTATAATCGGGGCCCCAGATAT GGCATTCCCACGAATGAACAACATGAGCTTCTGACTTCTACCTCCTTCCTTTCTCC TTTTATTAGCTTCTTCTGGAGTTGAAGCTGGGGCAGGAACTGGCTGAACAGTATAC CCCCCTTTAGCAGGAAATCTAGCACATGCTGGTGCCTCAGTCGATCTAGCCATTTT CTCCCTCCACTTGGCAGGTATTTCCTCCATTCTAGGGGCTATTAATTTCATTACTAC AATTATTAACATGAAACCCCCCGCAATTTCACAATATCAAACACCGCTGTTCGTCT GAGCCGTACTTGTAACAGCCGTGCTTCTTCTCCTATCCCTACCCGTACTAGCCGCT GGAATTACCATGCTACTCACAGATCGTAACTTAAATACCACTTTCTTTGACCCAGC AGGGGGAGGAGACCCCATCCTTTACCAGCACTTATTCTGATTCTTTGGCCACCAG AAAGTCTAAAA
Komposisi  basa  nukleotida  dalam  satu  utas DNA  lebih  banyak  mengandung  pirimidin dibandingkan  purin.  682  pasang  basa  yang dimaksud  memiliki komposisi nukleotida Timin sebanyak 202 (29,62%), Citosin 184 (26,98%), Adenin 168 (24,63%), dan Guanin 128 (18,77). Basa  nukleotida  yang  mendominasi  yaitu Timin yang mencapai 29,62%.
Hasil  sequensing  yang  telah  dicocokkan kemiripannya pada GenBank
NCBI
menunjukkan  hasil  kemiripan  paling  tinggi sebesar  91.64%  dengan  spesies Dussumieria elopsoides .  Data  teratas  dari  proses Basic
Local Alignment Search Tool ( BLAST ) menggunakan  Mitochondrial  Cytochrome  C Oxidase  Subunit  I  (COI)  sebagai  target.  Hasil Basic  Local  Alignment  Search  Tool ( BLAST ) (Tabel 2)
Tabel 2. Hasil BLAST Basa Nukleotida pada GenBank
Description Max Score Total Score Query Cover E value Per. Ident Accession Dussumieria elopsoides voucher NBFGR:Dsht-B cytochrome oxidase subunit I (COI) gene, partial cds; mitochondrial 894 894 94% 0.0 91.64% FJ347960.1 Dussumieria elopsoides voucher TR651EK cytochrome oxidase subunit 1 (COI) gene, partial cds; mitochondrial 889 889 94% 0.0 91.49% KC500614.1 Dussumieria elopsoides voucher NBFGR:Dsht-A cytochrome oxidase subunit I (COI) gene, partial cds; mitochondrial 883 883 94% 0.0 91,33% FJ347959.1 Dussumieria elopsoides voucher TR650EK cytochrome oxidase subunit 1 (COI) gene, partial cds; mitochondrial 878 878 94% 0.0 91,18% KC500613.1
Hasil sequensing yang telah didapat, kemudian  dibandingkan  dengan  database GenBank NCBI ( National Center for Biotechnologi  Information )  dan  didapatkan kemiripan tertinggi dengan spesies D. elopsoides dengan Max Score dan Total Score 894,  Query  Cover  94%,  E-value  0.0,  dan  nilai Per. Ident sebesar 91.64%. Menurut Triandiza dan  Madduppa  (2018),  kemiripan  tertinggi pada  Genbank,  dapat  dicirikan  dengan  nilai max score dan total score yang sama, nilai E- value  yang  bernilai  0,  serta  nilai  query  cover dan  nilai  Per.  Ident  yang  mendekati  100. Walaupun  nilai  Per.Ident  sebesar  91.64% nanum ia tetap dikatagorikan memiliki kemiripan  yang  cukup  tinggi.  Nilai  E-value  0 juga  menunjukkan hasil perbandingan dengan spesies  lainnya  bersifat  identik  dan  nilai kepercayaan yang tinggi.

## KESIMPULAN DAN SARAN
Hasil penelitian menunjukan bahwa pengamatan morfologi, pengukuran morfometrik,  maupun  verifikasi  menggunakan DNA  Barcoding  pada  spesimen  ikan  sardin yang  dikoleksi  dari  Pasar  Ikan  Muara  Angke, Jakarta  merupakan  jenis  ikan Dussumieria elopsoides dengan  presentase  Query  Cover sebesar  94%  dan  Per.  Ident  sebesar  91,64%. Terdapat  penurunan  massa  dan  panjang badan yang siginifikan dari sampel
dibandingkan  dengan  literatur  yang  diacu. Hubungan  antara  panjang  dan  berat  badan bersifat Alometrik negatif dimana pertambahan berat  tidak  secepat  pertambahan  panjang. Kedepannya penulis menyarankan studi lanjut berdasarkan  genetika  populasi Dussumieria elopsoides di beberapa wilayah di Indonesia.

## UCAPAN TERIMA KASIH
Penulis  mengucapkan  banyak  terima  kasih kepada rekan-rekan Pascasarjana Ilmu Kelautan  Institut  Pertanian  Bogor  angkatan 2019,  dan  Asisten  Mata  Kuliah  Biodiversitas Laut  yang  telah  membantu    dalam    penelitian dan penulisan artikel ini.

## DAFTAR PUSTAKA
Akbar,  N.  N.,  &  Labenua,  R.  (2018). Keragaman  genetik  Ikan  Cakalang (Katsuwonus  pelamis)  di  Perairan  Laut Maluku  Utara. DEPIK  Jurnal  Ilmu-Ilmu Perairan,  Pesisir  dan  Perikanan , 7 (2), 164-176.
Abdullah,  A.,  &  Rehbein,  H.  (2016).  DNA Barcoding for The Species Identification of  Commercially Important  Fishery Products in Indonesian Markets.
International  Journal  of  Food  Science and Technology .
Amorim,  A.,  Fernandes,  T.,  &  Taveira,  N.
(2019).  Mitochondrial  DNA  in  human identification: a review. PeerJ , 7 , e7314. Bukit, S. T. A. K., Affandi, R., Simanjuntak, C.
P., Rahardjo, M. F., Zahid, A., Asriansyah,  A.,  &  Aditriawan,  R.  M. (2017).  Makanan  ikan  famili  Clupeidae di  Teluk  Pabean,  Indramayu. In:  Hadie W,  Hadiaty  RK,  Lusiastuti  AM,  Syafei LS,  Hadie  LE,  Simanjuntak  CPH, Haryono,  Rahardjo  MF,  Affandi  R (Editors).  Dalam:  Prosiding  Simposium
Nasional Ikan dan Perikanan.
Masyarakat  Iktiologi  Indonesia,  Bogor , 12-13.
Hebert,  P.  D.,  Cywinska,  A.,  Ball,  S.  L.,  & Dewaard,  J.  R.  (2003).  Biological identifications  through  DNA  barcodes. Proceedings  of  the  Royal  Society  of London.  Series  B:  Biological  Sciences , 270 (1512), 313-321.
Jefri,  E.,  Zamani,  N.  P.,  Subhan,  B.,  & Madduppa,  H.  H.  (2015).  Molecular phylogeny  inferred  from  mitochondrial DNA of the grouper Epinephelus spp. in Indonesia  collected  from  local  fish market. Biodiversitas
Journal of Biological Diversity , 16 (2)., 254-263. Keskİn,  E.,  &  Atar,  H.  H.  (2013).  DNA barcoding  commercially  important  fish species  of  T  urkey. Molecular  ecology resources , 13 (5), 788-797. Ko, H. L., Wang, Y. T., Chiu, T. S., Lee, M. A., Leu, M. Y., Chang, K. Z., ... & Shao, K. T.  (2013).  Evaluating  the  accuracy  of morphological  identification  of  larval fishes  by  applying  DNA  barcoding. PLoS One , 8 (1), e53451. Kripa,  V.,  Mohamed,  K.  S.,  Koya,  K.  P., Jeyabaskaran,  R.,  Prema,  D.,  Padua, S.,  ...  &  Dhanya,  A.  M.  (2018). Overfishing  and  climate  drives  changes in  biology  and  recruitment  of  the  indian oil  sardine  sardinella  longiceps  in Southeastern  Arabian  Sea. Frontiers  in Marine Science , 5 , 443, 1-20
Maulid,  D.  Y.,  Nurilmala,  M.,  Nurjanah,  N.,  & Maddupa, H. (2016). Molecular Characteristics  of  Cytochrome  B  for Mackerel Barcoding. Jurnal Pengolahan Hasil Perikanan Indonesia , 19 (1), 9-16. Myers,  P.,  R.  Espinosa et  al., (2013).  http:// animal    diversity.    ummz.    umich.    Edu /collections/contributors/Grzimek_fish/Cl upeiformes/Chirocentrus_dorab/. [accessed date : 06 Desember 2019
Nair,  P.  N.  (1982).  On  the  systematics  of rainbow sardines
Dussumieria
spp.(Family:  Dussumieriidae,  Pisces)
from  Indian  waters. Journal  of  the Marine  Biological  Association  of  India ,
24 (1&2), 80-91.
Nurilmala,  M., Widyastuti,  U.,  Kusuma,  W.  A., Nurjanaha, N., Wulansari, N., & Widyatuti, Y. (2016). DNA barcoding for identification  of  processed  tuna  fish  in Indonesian  market. Jurnal  Teknologi ,
78 (4-2), 115 –118. Pauly,  D.  (2010). Gasping  fish  and  panting squids:  oxygen,  temperature  and  the growth  of  water-breathing  animals.  In: Excellence  in  Ecology .  Book  22.  O. Kinne (Ed.). International Ecology
Institute, Oldendorf/Luhe, 216 p Santos, M. N., Gaspar, M. B., Vasconcelos, P.,
& Monteiro, C. C. (2002). Weight –length relationships for 50 selected fish species of the Algarve coast (southern Portugal).
Fisheries research , 59 (1-2), 289-295. Sekretaris  Jenderal  Kementerian  Kelautan
Perikanan  Republik  Indonesia.  (2018). Buku Laporan Tahunan 2017 Kementerian  Kelautan  dan  Perikanan Republik Indonesia. Sembiring, A., Pertiwi, N. P. D., Mahardini, A.,
Wulandari, R., Kurniasih, E. M., Kuncoro,  A.  W.,  ...  &  Carpenter,  K.  E. (2015). DNA barcoding reveals targeted fisheries  for  endangered  sharks  in Indonesia. Fisheries  Research , 164 , 130-134.
Strauss,  R.  E.,  &  Bond,  C.  E.  (1990).
Taxonomic  methods:  Morphology  in Methods  for  Fish  Biology :  C.  B.  Shreck
&  P.  B  Moyle  (Eds).  Am.  Fish.  Soc. Bethesda, Maryland. USA.
Triandiza, T., & Madduppa, H. (2018). Aplikasi Analisa  Morfologi  dan  DNA  Barcoding
Pada Penentuan Jenis Kepiting Porcelain (Pisidia sp.) Yang Berasal dari Pulau Tunda, Banten. Jurnal
Sumberdaya Akuatik Indopasifik , 2 (2). Ward, R. D., Zemlak, T. S., Innes, B. H., Last, P.  R.,  &  Hebert,  P.  D.  (2005).  DNA barcoding Australia's fish species.
Philosophical  Transactions  of  the  Royal Society B: Biological Sciences , 360 (1462), 1847-1857.
Whitehead,  P.  J.  P.  (1985).  FAO  species catalogue, Vol. 7. Clupeoid fishes of the world.  An  annotated  and  illustrated catalogue  of  the  herrings,  sardines, pilchards,  sprats,  anchovies  and  wolf herrings. Part 1-Chirocentridae, Clupeidae  and  Pristigasteridae. FAO Fish. Synop. , 125 , 303.