Analisis Variasi Bentuk Karapaks Kuya Batok ( Cuora amboinensis Daudin,
1802) dan Bajuku ( Orlitia borneensis Gray, 1873) dengan Metode Elliptic
Fourier Descriptors

## Tony Febri Qurniawan, Dina Rusiana, dan Abdul Rachman
Laboratorium Anatomi Hewan, Fakultas Biologi Universitas Gadjah Mada Email: tony_qurniawan@yahoo.com

## Diterima Februari 2011 disetujui untuk diterbitkan September 2011

## Abstract
Turtles is easily identified because of its shield. The dorsal shield or commonly called carapace is one of characteristics that can be used for turtle's identification.  People  and researchers usually  can distinguish the turtles just by looking at the carapace valve, but not in carapace shape. Both of them sometimes have their own interpretation about it, because carapace shape has a variation. This research was aimed to obtain some information about differences of carapace shape variation between Coura amboinensis and Orlitia borneensis quantitatively and also to investigate about characteristic of variation on carapace shape of a species. The specimens were taken from Pusat Penyelamatan Satwa Jogja. The picture of carapace shape of the turtles was changed into bitmap then processed used SHAPE ver 1.3. The variation of carapace contour were extracted by image processing, described and analyzed by Elliptic Fourier Descriptors. Mathematically independent shape characteristics were then indentified by Principal Component Analysis of The Elliptic Fourier Descriptors. Principal components represented the aspect ratio of the broad size, length size, and curve or roundness margin of the carapace. Based on result showed that intraspecies variation shape of carapace on C. amboinensis and on O. borneensis can be analysis  into  3  principal  component.  The  principal  component  1st  (PC1),  2nd  (PC2)  and  3rd  (PC3) components accounted for 82.77%, 10.3% and 4.73%   of total shape variation on C. amboinensis . The 1st, 2nd and 3rd components accounted for 88.1%, 7.02% and 3.71% of total shape variation on O. borneensis . The contribution ratio of PC1 was over 80% on both of species, showing that most of the variation on carapace shape could be explained by the aspect ratio. The PC2 and PC3 were less than 20%, indicated that there is small asymmetric variation degree of roundness on carapace.
Keywords: Cuora amboinensis , Orlitia borneensis , carapace, Eliptical Fourier Deskriptors (EFDs).

## Abstrak
Indonesia merupakan habitat 10% dari jenis penyu di seluruh dunia. Hewan ini mudah diidentifikasi karena perisai nya. Perisai punggung atau biasa disebut karapas merupakan salah satu karakteristik yang dapat digunakan untuk identifikasi penyu. Orang biasanya tidak dapat membedakan penyu hanya dengan melihat carapace. Bahkan peneliti kadang-kadang memiliki interpretasi mereka sendiri tentang hal  itu.  Penelitian  ini  bertujuan  untuk  mendapatkan  beberapa  informasi  tentang  perbedaan  antara karapas  perisai Coura  amboinensis dan Orlitia  borneensis kuantitatif  dan  tepat,  dan  juga  untuk mendapatkan  informasi  tentang  variasi  bentuk  karapas  suatu  spesies.  Spesimen  diambil  dari  Pusat Penyelamatan Satwa Jogja atau PPSJ (Jogja Wild Animal Rescue Center). Gambar perisai karapas kura- kura diubah menjadi bitmap kemudian diolah dengan perangkat lunak komputer yang disebut SHAPE ver 1.3.  Hasilnya  digunakan  untuk  menganalisis  karapas  penyu  berdasarkan  Deskriptor  Fourier  Elliptic (EFDs). Analisis  EFDs  menunjukkan  bahwa  variasi  karapas  perisai  terbesar  adalah  pada  komponen utama 1 (PC1), yang 82,77% untuk C. amboinensis dan 88,1% untuk O. borneensis . Variasi berikutnya adalah pada PC2 10,3% ( C. amboinensis ) dan 7,02% ( O. borneensis ). Sementara itu pada PC3 hasilnya adalah 4,73% ( C. amboinensis ) dan 3,71% ( O. borneensis ) pada variasi karapas nya. Berdasarkan hasil ini, kita dapat menyimpulkan bahwa ada variasi dalam kedua spesies di panjang, posterior anterior, dan lebar karapas tersebut. Intraspesies variasi karapas dapat diidentifikasi dari bentuk bagian posterior dan lebar karapas tersebut.
Kata kunci: Cuora amboinensis , Orlitia borneensis , karapas, eliptical Fourier Deskriptors (EFDs)
merupakan habitat bagi 10% jenis kura-kura Pendahuluan
air tawar yang ada di seluruh dunia (Barbour,
Indonesia  memiliki  kekayaan  alam
1992;  Iskandar,  2000).  Kura-kura  yang berupa  keanekaragaman  fauna,  salah
terdapat di Indonesia saat ini berjumlah 41 satunya  adalah  kura-kura.  Indonesia
jenis.  Diperkirakan  populasinya  akan
semakin  berkurang  seiring  meningkatnya Marcus, 1993). kerusakan  habitat  alami  kura-kura. Apalagi
S a l a h   s a t u   m e t o d e   s t a t i s t i k a
beberapa  jenis  kura-kura  Indonesia  yang multivariat yang berhasil efektif diaplikasikan
bersifat  endemik  misalnya  seperti Orlithia untuk  mengevaluasi  dan  menganalisis borneensis sudah  termasuk  Appendix  II variasi  dan  kovariasi  kontur  suatu  bentuk
dengan status vunarable . adalah metode  Principal Component Elliptic Bangsa  kura-kura  merupakan  suatu fourier  deskriptors (EFDs)  (Iwata  &  Ukai, kelompok  yang  sangat  terkenal.  Telur  dan
2002).  EFDs  bekerja  menggunakan  digital d a g i n g   k u r a - k u r a   d i k o n s u m s i   o l e h image sebagai input dan akan menganalisis masyarakat.  Selain  itu,  kura-kura  semakin
kontur bentuknya secara matematis dengan
diminati  oleh  masyarakat  umum  untuk merubahnya menjadi variasi koordinat X dan dijadikan  hewan  peliharaan  (Pough et  al. ,
Y  (Truong et  al., 2005).  Metode  ini  telah
1998;  Hutchins,  2003).  Hewan  tersebut
banyak    dilakukan  untuk  meneliti  variasi m u d a h   d i k e n a l i   d a r i   p e r i s a i   y a n g
morfologi  secara  kuantitatif  pada  organ m e m b u n g k u s   t u b u h n y a   K a r a p a k s tanaman dan masih sedikit diterapkan pada merupakan perisai yang membungkus pada hewan.  Beberapa  peneliti  seperti  Rohlf  & b a g i a n   d o r s a l   s e d a n g k a n   p l a s t r o n
Archie  (1984),  Baltanas et  al. (2000), merupakan  perisai  yang  membungkus Deagling & Jungers (200), Loy et al. (2000), bagian ventral. Jumlah lempeng sisik pada Monti et  al. (2001),  Bertin et  al. (2002), karapaks  digunakan  oleh  ilmuan  untuk  ciri
Domergues et  al. (2003),  Christensen identifikasi  selain  secara  morfometri  (de (2004),  Tracey et  al. (2006),  Juliandi  &
Rooij,  1915).  Namun,  masyarakat  awam Farajallah (2007), Kamilari & Sfenthourakis sedikit  sekali  yang  dapat  membedakan
(2009)  dan  de  Aranzamendi et  al. (2010) C.amboinensis dan O. borneensis melalui
telah  membuktikan  metode  EFDs  efektif jumlah  lempeng  sisik  pada  karapaksnya.
digunakan  dalam  meneliti  variasi  morfologi
Umumnya  mereka  membedakan  melalui
pada hewan.
pola  bentuk  karapaks  dan  warnanya. Penelitian  ini  diharapkan  mampu Padahal  bentuk  karapaks  tiap  anggota m e n g a n a l i s i s   v a r i a s i   k a r a p a k s C . familia kura-kura  ternyata  bervariasi.
amboinensis dan O.  borneensis secara Bahkan terkadang dikalangan para peneliti kuantitatif  sehingga  dapat  mengevaluasi pun  sering  terjadi  perbedaan  interpretasi. karakter  variasi  bentuk  karapaks  pada Selama  ini  karakter  morfometri  yang masing-masing  jenis  yang  dapat  dijadikan digunakan selain ukuran panjang dan lebar, sebagai  karakter  pembeda.  Mengingat digunakan  karakteristik  berupa  bentuk/ bentuk  karapaks  bersifat  kualitatif k o n t u r   ( k u r v a ,   b u l a t ,   o v a l ,   d a n
(tergantung persepsi subyek) jika dianalisis kelengkungan).  Karakter  pembeda  berupa langsung  menggunakan  mata.  Apalagi bentuk  karapaks  ini  memiliki  kekurangan keduanya masih berada dalam satu familia tidak  dapat  mengkover  variasi  karapaks
Geoemydidae  sehingga  cirri-ciri  morfologi secara  objektif  dan  bersifat  kualitatif
terutama bentuk karapaksnya hampir sama tergantung  interpretasi  masing-masing
dan  mata  manusia  memiliki  keterbatasan pendeskripsi.  Pola  variasi  kontur/bentuk untuk  menganalisis  karakter  variasi  bentuk karapaks  pada  anggota  tiap familia masih karapaks pada keduanya. sedikit  dipelajari  karena  keterbatasan metode untuk menelitinya secara kuantitatif. Materi dan metode Kekurangan  tersebut  dapat  ditutupi
Spesimen dan Foto Karapaks d e n g a n   m e n g g u n a k a n   m o r f o m e t r i
Spesimen C.  ambonensis dan O. geometris  (Kuhl  &  Giardina,  1982).
borneensis yang  diteliti  karapaksnya Morfometri  geometris  adalah  penggunaan
diperoleh  dari  Pusat  Penyelamatan  Satwa metode  statistika  multivariat  untuk
Jogja  (PPSJ),  Kulonprogo.  Masing-masing menganalisa  data  lokasi  titik-titik  yang
jenis diseleksi dan diambil sembilan sampel mewakili bentuk. Kelebihan dari morfometri
dengan    ukuran  panjang  plastronya  yang
geometris  antaralain  yaitu    pengambilan
sama  yaitu  27  –  28  cm.  Setelah  itu  setiap
data yang lebih fleksibel, data lokasi titik-titik
jenis  difoto  karapaksnya  ditempat  khusus mengandung informasi bentuk dan ukuran,
dengan kamera digital dengan ketinggian 1 bentuk dapat direkonstruksi kapan saja dan
m dari objek, sudut pandang tegak lurus 90°
grafis  lebih  mudah  dimengerti  (Rohlf  &
dari objek dan format foto yang sama yaitu
. 153
Qurniawan dkk.,
:  152 - 158
Analisis Variasi Bentuk Karapaks Kuya Batok

## Biosfera 28 (3) September 2011
Analisis Variasi Bentuk Karapaks Kuya Batok ( Cuora amboinensis Daudin,
1802) dan Bajuku ( Orlitia borneensis Gray, 1873) dengan Metode Elliptic

## Fourier Descriptors

## Tony Febri Qurniawan, Dina Rusiana, dan Abdul Rachman
Laboratorium Anatomi Hewan, Fakultas Biologi Universitas Gadjah Mada Email: tony_qurniawan@yahoo.com

## Diterima Februari 2011 disetujui untuk diterbitkan September 2011

## Abstract
Turtles is easily identified because of its shield. The dorsal shield or commonly called carapace is one of characteristics that can be used for turtle's identification.  People  and researchers usually  can distinguish the turtles just by looking at the carapace valve, but not in carapace shape. Both of them sometimes have their own interpretation about it, because carapace shape has a variation. This research was aimed to obtain some information about differences of carapace shape variation between Coura amboinensis and Orlitia borneensis quantitatively and also to investigate about characteristic of variation on carapace shape of a species. The specimens were taken from Pusat Penyelamatan Satwa Jogja. The picture of carapace shape of the turtles was changed into bitmap then processed used SHAPE ver 1.3.
The variation of carapace contour were extracted by image processing, described and analyzed by Elliptic Fourier Descriptors. Mathematically independent shape characteristics were then indentified by Principal Component Analysis of The Elliptic Fourier Descriptors. Principal components represented the aspect ratio of the broad size, length size, and curve or roundness margin of the carapace. Based on result showed that intraspecies variation shape of carapace on C. amboinensis and on O. borneensis can be analysis  into  3  principal  component.  The  principal  component  1st  (PC1),  2nd  (PC2)  and  3rd  (PC3) components accounted for 82.77%, 10.3% and 4.73%   of total shape variation on C. amboinensis . The 1st, 2nd and 3rd components accounted for 88.1%, 7.02% and 3.71% of total shape variation on O. borneensis . The contribution ratio of PC1 was over 80% on both of species, showing that most of the variation on carapace shape could be explained by the aspect ratio. The PC2 and PC3 were less than 20%, indicated that there is small asymmetric variation degree of roundness on carapace.
Keywords: Cuora amboinensis , Orlitia borneensis , carapace, Eliptical Fourier Deskriptors (EFDs).

## Abstrak
Indonesia merupakan habitat 10% dari jenis penyu di seluruh dunia. Hewan ini mudah diidentifikasi karena perisai nya. Perisai punggung atau biasa disebut karapas merupakan salah satu karakteristik yang dapat digunakan untuk identifikasi penyu. Orang biasanya tidak dapat membedakan penyu hanya dengan melihat carapace. Bahkan peneliti kadang-kadang memiliki interpretasi mereka sendiri tentang hal  itu.  Penelitian  ini  bertujuan  untuk  mendapatkan  beberapa  informasi  tentang  perbedaan  antara karapas  perisai Coura  amboinensis dan Orlitia  borneensis kuantitatif  dan  tepat,  dan  juga  untuk mendapatkan  informasi  tentang  variasi  bentuk  karapas  suatu  spesies.  Spesimen  diambil  dari  Pusat Penyelamatan Satwa Jogja atau PPSJ (Jogja Wild Animal Rescue Center). Gambar perisai karapas kura- kura diubah menjadi bitmap kemudian diolah dengan perangkat lunak komputer yang disebut SHAPE ver 1.3.  Hasilnya  digunakan  untuk  menganalisis  karapas  penyu  berdasarkan  Deskriptor  Fourier  Elliptic (EFDs). Analisis  EFDs  menunjukkan  bahwa  variasi  karapas  perisai  terbesar  adalah  pada  komponen utama 1 (PC1), yang 82,77% untuk C. amboinensis dan 88,1% untuk O. borneensis . Variasi berikutnya adalah pada PC2 10,3% ( C. amboinensis ) dan 7,02% ( O. borneensis ). Sementara itu pada PC3 hasilnya adalah 4,73% ( C. amboinensis ) dan 3,71% ( O. borneensis ) pada variasi karapas nya. Berdasarkan hasil ini, kita dapat menyimpulkan bahwa ada variasi dalam kedua spesies di panjang, posterior anterior, dan lebar karapas tersebut. Intraspesies variasi karapas dapat diidentifikasi dari bentuk bagian posterior dan lebar karapas tersebut.
Kata kunci: Cuora amboinensis , Orlitia borneensis , karapas, eliptical Fourier Deskriptors (EFDs)
merupakan habitat bagi 10% jenis kura-kura Pendahuluan
air tawar yang ada di seluruh dunia (Barbour,
Indonesia  memiliki  kekayaan  alam
1992;  Iskandar,  2000).  Kura-kura  yang berupa  keanekaragaman  fauna,  salah
terdapat di Indonesia saat ini berjumlah 41 satunya  adalah  kura-kura.  Indonesia
jenis.  Diperkirakan  populasinya  akan
semakin  berkurang  seiring  meningkatnya Marcus, 1993).
kerusakan  habitat  alami  kura-kura. Apalagi S a l a h   s a t u   m e t o d e   s t a t i s t i k a
beberapa  jenis  kura-kura  Indonesia  yang
multivariat yang berhasil efektif diaplikasikan
bersifat  endemik  misalnya  seperti Orlithia
untuk  mengevaluasi  dan  menganalisis borneensis sudah  termasuk  Appendix  II
variasi  dan  kovariasi  kontur  suatu  bentuk dengan status vunarable .
adalah metode  Principal Component Elliptic Bangsa  kura-kura  merupakan  suatu
fourier  deskriptors (EFDs)  (Iwata  &  Ukai,
kelompok  yang  sangat  terkenal.  Telur  dan
2002).  EFDs  bekerja  menggunakan  digital d a g i n g   k u r a - k u r a   d i k o n s u m s i   o l e h
image sebagai input dan akan menganalisis masyarakat.  Selain  itu,  kura-kura  semakin
kontur bentuknya secara matematis dengan
diminati  oleh  masyarakat  umum  untuk
merubahnya menjadi variasi koordinat X dan
dijadikan  hewan  peliharaan  (Pough et  al. , Y  (Truong et  al., 2005).  Metode  ini  telah 1998;  Hutchins,  2003).  Hewan  tersebut
banyak    dilakukan  untuk  meneliti  variasi
m u d a h   d i k e n a l i   d a r i   p e r i s a i   y a n g
morfologi  secara  kuantitatif  pada  organ
m e m b u n g k u s   t u b u h n y a   K a r a p a k s
tanaman dan masih sedikit diterapkan pada merupakan perisai yang membungkus pada
hewan.  Beberapa  peneliti  seperti  Rohlf  &
b a g i a n   d o r s a l   s e d a n g k a n   p l a s t r o n
Archie  (1984),  Baltanas et  al. (2000), merupakan  perisai  yang  membungkus
Deagling & Jungers (200), Loy et al. (2000), bagian ventral. Jumlah lempeng sisik pada
Monti et  al. (2001),  Bertin et  al. (2002), karapaks  digunakan  oleh  ilmuan  untuk  ciri
Domergues et  al. (2003),  Christensen identifikasi  selain  secara  morfometri  (de
(2004),  Tracey et  al. (2006),  Juliandi  & Rooij,  1915).  Namun,  masyarakat  awam Farajallah (2007), Kamilari & Sfenthourakis sedikit  sekali  yang  dapat  membedakan
(2009)  dan  de  Aranzamendi et  al. (2010) C.amboinensis dan O. borneensis melalui telah  membuktikan  metode  EFDs  efektif jumlah  lempeng  sisik  pada  karapaksnya.
digunakan  dalam  meneliti  variasi  morfologi
Umumnya  mereka  membedakan  melalui
pada hewan.
pola  bentuk  karapaks  dan  warnanya.
Penelitian  ini  diharapkan  mampu
Padahal  bentuk  karapaks  tiap  anggota
m e n g a n a l i s i s   v a r i a s i   k a r a p a k s C . familia kura-kura  ternyata  bervariasi.
amboinensis dan O.  borneensis secara Bahkan terkadang dikalangan para peneliti
kuantitatif  sehingga  dapat  mengevaluasi
pun  sering  terjadi  perbedaan  interpretasi.
karakter  variasi  bentuk  karapaks  pada
Selama  ini  karakter  morfometri  yang
masing-masing  jenis  yang  dapat  dijadikan
digunakan selain ukuran panjang dan lebar,
sebagai  karakter  pembeda.  Mengingat
digunakan  karakteristik  berupa  bentuk/
bentuk  karapaks  bersifat  kualitatif
k o n t u r   ( k u r v a ,   b u l a t ,   o v a l ,   d a n
(tergantung persepsi subyek) jika dianalisis
kelengkungan).  Karakter  pembeda  berupa
langsung  menggunakan  mata.  Apalagi
bentuk  karapaks  ini  memiliki  kekurangan
keduanya masih berada dalam satu familia tidak  dapat  mengkover  variasi  karapaks Geoemydidae  sehingga  cirri-ciri  morfologi
secara  objektif  dan  bersifat  kualitatif
terutama bentuk karapaksnya hampir sama tergantung  interpretasi  masing-masing dan  mata  manusia  memiliki  keterbatasan
pendeskripsi.  Pola  variasi  kontur/bentuk
untuk  menganalisis  karakter  variasi  bentuk
karapaks  pada  anggota  tiap familia masih karapaks pada keduanya.
sedikit  dipelajari  karena  keterbatasan metode untuk menelitinya secara kuantitatif.

## Materi dan metode
Kekurangan  tersebut  dapat  ditutupi
Spesimen dan Foto Karapaks
d e n g a n   m e n g g u n a k a n   m o r f o m e t r i
Spesimen C.  ambonensis dan O. geometris  (Kuhl  &  Giardina,  1982).
borneensis yang  diteliti  karapaksnya Morfometri  geometris  adalah  penggunaan
diperoleh  dari  Pusat  Penyelamatan  Satwa
metode  statistika  multivariat  untuk
Jogja  (PPSJ),  Kulonprogo.  Masing-masing
menganalisa  data  lokasi  titik-titik  yang
jenis diseleksi dan diambil sembilan sampel
mewakili bentuk. Kelebihan dari morfometri
dengan    ukuran  panjang  plastronya  yang
geometris  antaralain  yaitu    pengambilan
sama  yaitu  27  –  28  cm.  Setelah  itu  setiap
data yang lebih fleksibel, data lokasi titik-titik
jenis  difoto  karapaksnya  ditempat  khusus
mengandung informasi bentuk dan ukuran,
dengan kamera digital dengan ketinggian 1
bentuk dapat direkonstruksi kapan saja dan
m dari objek, sudut pandang tegak lurus 90°
grafis  lebih  mudah  dimengerti  (Rohlf  &
dari objek dan format foto yang sama yaitu
.

## Qurniawan dkk.,

## Analisis Variasi Bentuk Karapaks Kuya Batok
3264 x 2448 pixel, 24 bit dengan mode no utama  secara  kuantitatif.  Nilai  kuantitaif flash dan balance kontras. Dalam penelitian variasi  hasil  PCA  selanjutnya  diuji  ANOVA ini  digunakan  kamera  digital  Canon untuk mengetahui signifikan dari tiap variasi powershoot A580. Selain itu digunakan pula
yang terwakilkan ke dalam PCA. Dari hasil software photoshop  CS  2  untuk  mengedit berupa nilai komponen utama serta gambar foto dari bentuk JPEG menjadi bitmap (BMP) hasil PCA inilah perbedaan karakter variasi dengan  format  256 grey  level per  chanel karapaks  masing-masing  jenis  dapat warna (merah, hijau, biru).
diketahui. Dengan diketahui karakter variasi karapaks  secara  kuantitatif  diharapkan Analisis Principal Component Elliptic Fourier dapat  membantu  dalam  mengidentifikasi Descriptor keduanya. Selanjutnya  variasi  bentuk  karapaks d i a n a l i s i s   m e n g g u n a k a n p r i n c i p a l Hasil dan Pembahasan
component  elliptic  fourier  descriptor yang
Analisis  variasi  bentuk  dalam  studi
terdapat pada program SHAPE ver 1.3 oleh
biologi  termasuk  hal  yang  penting  untuk
Iwata & Ukai (2002). Langkah pertama yang
dipelajari karena variasi bentuk setiap jenis
dilakukan  adalah  merubah  format  foto
makhluk  hidup  memiliki  kharakter  yang karapaks menjadi bitmap, lalu foto tersebut
khas,  kompleks  terhadap  pengaruh dibuat hitam dengan background putih atau
lingkungan  dan  diturunkan  (Iwata et  al. , dapat  dibuat  sebaliknya  menggunakan
2002; de Aranzamendi et al. 2010). Namun
ChainCoder dengan pilihan binary image 78.
analisis  variasi  bentuk  sulit  untuk  dipelajari
ChainCoder merupakan  applikasi  yang
secara kuantitatif jika diteliti secara manual terdapat  dalam  software  SHAPE ver 1.3
dengan mata karena mata manusia memiliki untuk  mengubah  gambar  penuh  warna
keterbatasan.  Apalagi  untuk  mengamati
menjadi binary (hitam dan putih) (Iwata et al. , adanya  variasi  /perbedaan  yang  detail  dan
2002).  Hal  ini  berguna  untuk  mengurangi
ukurannya kecil.
kesalahan,  mencatat  kontur  objek  dan
Elliptic  fourier  deskriptors (EFDs)
mendiskripsikan  informasi  kontur  sebagai
sebagai  salah  satu  perkembangan  metode
chain-code . Chain-code merupakan  suatu
untuk  menganalisis  bentuk  dengan sistem  pengkode  untuk  mendiskripsikan
mengkonversi  input  suatu  gambar  menjadi informasi  geometrik. Chain-code tersebut
nilai kuantitatif yang matematis, telah sering dimasukkan ke dalam applikasi selanjutnya,
digunakan  untuk  menganalisis  variasi yaitu Chc2Nef. Chc2Nef menghitung EFDs
bentuk  organ  suatu  jenis  atau  kelompok yang  ternormalisasi  dari  info chain-code . makhluk  hidup.  Dalam  penelitian  ini  salah Normalisasi  penting  dilakukan  untuk
satunya  digunakan  untuk  menganalisis merubah  info  kontur  pada  gambar  menjadi
karakter  variasi  karapaks C.  amboinensis koefisien matematis dengan menjadikannya dan O.  borneensis .  Variasi  dan  kovariasi data  berupa  koordinat  x  dan  y  serta
bentuk  yang  ada  antar  individu  oleh  EFDs
menganalisisnya  menggunakan  rumus
akan diwujudkan/diwakilkan 100% ke dalam matematis  multivariat  yang  secara  jelas
beberapa  komponen  utama Principal
dijelaskan  oleh  Kuhl  &  Giardiana  (1982)
Component (PC)  yang  efektif  dengan  diuji dalam publikasinya. Chc2Nef menghasilkan
ANOVA.  Hasil  penelitian  ini  diperoleh
output berupa normalized  EFDs (*.nef) file analisis  PC  teramati  sebanyak  20  variasi yang  akan  menjadi input pada  program
bentuk  yang  ada  pada  karapaks C. selanjutnya,  yaitu PrinComp (Iwata et  al. , amboinensis dan O. borneensis dan setelah 2004).
diuji  anova  diperoleh  hanya  3  PC  yang
Program ini akan menganalisis variasi
signifikan  mewakili  variasi  yang  ada  pada
dan kovariasi yang ada antara individu dan
karapaks  di  kedua  jenis  (seperti  disajikan
mewakilkannya ke dalam beberapa principal
dalam tabel 1). component analysis (PCA) atau komponen
154
Tabel 1.  Hasil  anova  dan  kontribusi  masing-masing  komponen  utama untuk  variasi  yang diwakilkan
Table 1.  Anova results and contribution of each principal component for variation represented
S e t i a p   P C   y a n g   a d a   a k a n merepresentasikan  variasi  yang  berbeda dan tidak berkaitan dengan PC selanjutnya ( s i f a t n y a   o r t h o g o n a l ) .   P C 1   a k a n merepresentasikan variasi terbesar, disusul PC 2, dan seterusnya pada PC 3 hingga total variasi  100%  terwakilkan.  Variasi  bentuk hasil analisis PC ini meliputi dua komponen variasi
bentuk  yaitu  variasi  bentuk  simetri  dan asimetri.  Nilai  PC  ini  diperoleh  dari  nilai eigenvalues sebagai  data  penunjang. Sedangkan  hasil  berupa  visualisasi  dari variasi  bentuk  karapaks  diperolah  dengan menggunakan  nilai  mean  dan  standar deviasi  (SD)  ±  2  dari  hasil  analisis  EFDs seperti yang disajikan dalam Gambar 1 dan 2.
Komponen (PC) Eigenvalue -4 (10 ) Proporsi (%) Kumulatif (%) Mean P (anova) Simetri Asimetri A 1 56,71 82,77 82,77 0,50 0,46 <0,0001* 2 70,55 10,29 93,1 0,001 0,0009 0,00017* 3 32,39 4,72 97,79 0,007 0,0065 <0,0001* B 1 41,32 88,18 88,18 0,50 0,45 <0,0001* 2 32,88 7,02 95,21 0,0006 0,0025 <0,0001* 3 17,37 3,71 98,91 0,0001 0,0618 <0,0001* Komponen (PC) Eigenvalue (10 -4 ) Proporsi (%) Kumulatif (%) Mean P (anova) Simetri Asimetri A 1 56,71 82,77 82,77 0,50 0,46 <0,0001* 2 70,55 10,29 93,1 0,001 0,0009 0,00017* 3 32,39 4,72 97,79 0,007 0,0065 <0,0001* B 1 41,32 88,18 88,18 0,50 0,45 <0,0001* 2 32,88 7,02 95,21 0,0006 0,0025 <0,0001* 3 17,37 3,71 98,91 0,0001 0,0618 <0,0001*
PC 1 PC 2 PC 3 -2S D +2S D
Mean
Gambar 1. Visualisasi PC variasi bentuk karapaks Cuora amboinensis Figure 1. PC Visualisation of carapac shape variation Cuora amboinensis
155 Qurniawan dkk.,
:  152 - 158
Biosfera 28 (3) September 2011
3264 x 2448 pixel, 24 bit dengan mode no utama  secara  kuantitatif.  Nilai  kuantitaif flash dan balance kontras. Dalam penelitian variasi  hasil  PCA  selanjutnya  diuji  ANOVA ini  digunakan  kamera  digital  Canon untuk mengetahui signifikan dari tiap variasi
powershoot A580. Selain itu digunakan pula yang terwakilkan ke dalam PCA. Dari hasil software photoshop  CS  2  untuk  mengedit berupa nilai komponen utama serta gambar foto dari bentuk JPEG menjadi bitmap (BMP) hasil PCA inilah perbedaan karakter variasi dengan  format  256 grey  level per  chanel karapaks  masing-masing  jenis  dapat
warna (merah, hijau, biru). diketahui. Dengan diketahui karakter variasi karapaks  secara  kuantitatif  diharapkan Analisis Principal Component Elliptic Fourier dapat  membantu  dalam  mengidentifikasi Descriptor keduanya. Selanjutnya  variasi  bentuk  karapaks d i a n a l i s i s   m e n g g u n a k a n p r i n c i p a l Hasil dan Pembahasan component  elliptic  fourier  descriptor yang
Analisis  variasi  bentuk  dalam  studi terdapat pada program SHAPE ver 1.3 oleh biologi  termasuk  hal  yang  penting  untuk Iwata & Ukai (2002). Langkah pertama yang
dipelajari karena variasi bentuk setiap jenis dilakukan  adalah  merubah  format  foto
makhluk  hidup  memiliki  kharakter  yang karapaks menjadi bitmap, lalu foto tersebut
khas,  kompleks  terhadap  pengaruh dibuat hitam dengan background putih atau lingkungan  dan  diturunkan  (Iwata et  al. , dapat  dibuat  sebaliknya  menggunakan
2002; de Aranzamendi et al. 2010). Namun
ChainCoder dengan pilihan binary image 78.
analisis  variasi  bentuk  sulit  untuk  dipelajari ChainCoder merupakan  applikasi  yang
secara kuantitatif jika diteliti secara manual terdapat  dalam  software  SHAPE ver 1.3 dengan mata karena mata manusia memiliki untuk  mengubah  gambar  penuh  warna
keterbatasan.  Apalagi  untuk  mengamati menjadi binary (hitam dan putih) (Iwata et al. , adanya  variasi  /perbedaan  yang  detail  dan
2002).  Hal  ini  berguna  untuk  mengurangi
ukurannya kecil.
kesalahan,  mencatat  kontur  objek  dan
Elliptic  fourier  deskriptors (EFDs)
mendiskripsikan  informasi  kontur  sebagai
sebagai  salah  satu  perkembangan  metode chain-code . Chain-code merupakan  suatu untuk  menganalisis  bentuk  dengan sistem  pengkode  untuk  mendiskripsikan
mengkonversi  input  suatu  gambar  menjadi informasi  geometrik. Chain-code tersebut nilai kuantitatif yang matematis, telah sering dimasukkan ke dalam applikasi selanjutnya,
digunakan  untuk  menganalisis  variasi yaitu Chc2Nef. Chc2Nef menghitung EFDs bentuk  organ  suatu  jenis  atau  kelompok yang  ternormalisasi  dari  info chain-code . makhluk  hidup.  Dalam  penelitian  ini  salah
Normalisasi  penting  dilakukan  untuk
satunya  digunakan  untuk  menganalisis merubah  info  kontur  pada  gambar  menjadi
karakter  variasi  karapaks C.  amboinensis koefisien matematis dengan menjadikannya
dan O.  borneensis .  Variasi  dan  kovariasi data  berupa  koordinat  x  dan  y  serta
bentuk  yang  ada  antar  individu  oleh  EFDs
menganalisisnya  menggunakan  rumus
akan diwujudkan/diwakilkan 100% ke dalam matematis  multivariat  yang  secara  jelas
beberapa  komponen  utama Principal dijelaskan  oleh  Kuhl  &  Giardiana  (1982)
Component (PC)  yang  efektif  dengan  diuji dalam publikasinya. Chc2Nef menghasilkan
ANOVA.  Hasil  penelitian  ini  diperoleh output berupa normalized  EFDs (*.nef) file analisis  PC  teramati  sebanyak  20  variasi yang  akan  menjadi input pada  program bentuk  yang  ada  pada  karapaks C. selanjutnya,  yaitu PrinComp (Iwata et  al. , amboinensis dan O. borneensis dan setelah 2004).
diuji  anova  diperoleh  hanya  3  PC  yang Program ini akan menganalisis variasi
signifikan  mewakili  variasi  yang  ada  pada dan kovariasi yang ada antara individu dan
karapaks  di  kedua  jenis  (seperti  disajikan
mewakilkannya ke dalam beberapa principal dalam tabel 1).
component analysis (PCA) atau komponen
154
Tabel 1.  Hasil  anova  dan  kontribusi  masing-masing  komponen  utama untuk  variasi  yang diwakilkan
Table 1.  Anova results and contribution of each principal component for variation represented
S e t i a p   P C   y a n g   a d a   a k a n merepresentasikan  variasi  yang  berbeda dan tidak berkaitan dengan PC selanjutnya ( s i f a t n y a   o r t h o g o n a l ) .   P C 1   a k a n merepresentasikan variasi terbesar, disusul PC 2, dan seterusnya pada PC 3 hingga total variasi  100%  terwakilkan.  Variasi  bentuk hasil analisis PC ini meliputi dua komponen variasi
bentuk  yaitu  variasi  bentuk  simetri  dan asimetri.  Nilai  PC  ini  diperoleh  dari  nilai eigenvalues sebagai  data  penunjang. Sedangkan  hasil  berupa  visualisasi  dari variasi  bentuk  karapaks  diperolah  dengan menggunakan  nilai  mean  dan  standar deviasi  (SD)  ±  2  dari  hasil  analisis  EFDs seperti yang disajikan dalam Gambar 1 dan 2.
Komponen (PC) Eigenvalue -4 (10 ) Proporsi (%) Kumulatif (%) Mean P (anova) Simetri Asimetri A 1 56,71 82,77 82,77 0,50 0,46 <0,0001* 2 70,55 10,29 93,1 0,001 0,0009 0,00017* 3 32,39 4,72 97,79 0,007 0,0065 <0,0001* B 1 41,32 88,18 88,18 0,50 0,45 <0,0001* 2 32,88 7,02 95,21 0,0006 0,0025 <0,0001* 3 17,37 3,71 98,91 0,0001 0,0618 <0,0001* Komponen (PC) Eigenvalue (10 -4 ) Proporsi (%) Kumulatif (%) Mean P (anova) Simetri Asimetri A 1 56,71 82,77 82,77 0,50 0,46 <0,0001* 2 70,55 10,29 93,1 0,001 0,0009 0,00017* 3 32,39 4,72 97,79 0,007 0,0065 <0,0001* B 1 41,32 88,18 88,18 0,50 0,45 <0,0001* 2 32,88 7,02 95,21 0,0006 0,0025 <0,0001* 3 17,37 3,71 98,91 0,0001 0,0618 <0,0001*
PC 1 PC 2 PC 3 -2S D +2S D Mean
155 Qurniawan dkk., :  152 - 158 Analisis Variasi Bentuk Karapaks Kuya Batok
Gambar 2. Visualisasi PC variasi bentuk karapaks Orlitia borneensis Figure 2. PC Visualisation of carapac shape variation of Orlitia borneensis
PC 1 PC 2 PC 3 -2S D +2S D Mean
Berdasarkan  table  1.  nilai  komponen utama yang diperoleh PC1 (82,77%)   pada C. amboinensis dan PC1 (88,18%) pada O. borneensis.  PC1  merupakan  hasil  analisis perwakilan  variasi  terbesar yang terdeteksi pada  karapaks  untuk  kedua  jenis.  PC1 menyatakan  bahwa  variasi  karapaks  yang paling  jelas  terdeteksi  adalah  pada  rasio antara    lebar  karapaks  dengan  panjang karapaks. Nilai PC1 yang lebih besar pada C. amboinensis menunjukkan bahwa variasi rasio antara lebar karapaks dengan panjang karapaks  pada C.  amboinensis variasinya lebih  besar  dibandingkan  pada  O. borneensis. Visualisasi variasi PC1 (gambar 1  dan  2)  ditunjukkan  oleh  standar  deviasi (SD) ± 2, dimana dalam satu spesies dapat memiliki lebar lebih 2  atau kurang 2 dari nilai rata-rata. Pada C. amboinensis nilai SD +2 akan  terlihat  karapaks  yang  lebarnya  lebih dari panjang karapaks. Pada O. borneensis, nilai  SD  +2  akan  menunjukkan  karapaks yang membulat dengan bagian anterior dan posterior yang juga membulat. Namun, SD - 2  perbedaan  karapaks  kedua  kura-kura tersebut hampir tak terlihat.
Variasi  selanjutnya  yang  telah berhasilterdeteksi  pada  karapaks  C. amboinensis  dan O. borneensis diwakilkan oleh  PC2  dan  PC3.  PC2  mewakili  variasi bentuk  pada  bagian  caudal/posterior karapaks  dan  PC3  mewakili  variasi  bentuk pada daerah cranial/anterior karapaks. Nilai PC2 dan PC3 C. amboinensis adalah 10,3% dan  4,73%  sedangkan  PC2  dan  PC3  O. borneensis  adalah  7,02%  dan  3,71%.  Nilai PC2  dan  PC3  yang  tidak  lebih  dari  10% menunjukkan variasi ini akan sulit dideteksi secara  manual  dengan  mata  atau  perlu kejelian  dan  ketelitian  untuk  dapat
mengetahuinya.  Namun  dengan  EFDs  kita dapat mengetahuinya dengan mudah.
Pada C. amboinensis, PC2 lebih besar dibandingkan  pada O.  borneensis .  Hal  ini menunjukkan  bahwa  bentuk  bagian posterior  karapak C.  amboinensis lebih bervariasi sebesar 3% saja. Serta jika dilihat dari perbedaan nilai mean asimetri dengan simetri  yang  lebih  besar  pada  PC2  C. amboinensis  menunjukkan  adanya  variasi bentuk  posterior  karapaks  yang  khas  pada C.  amboinensis .  Maka  bentuk  karapaks pada bagian   posterior dari C. amboinensis dapat  dijadikan  karakter  khas  sebagai identifikasi.  Visualisasi  yang  didapat (gambar  1  dan  2)  terlihat C.  amboinensis menunjukkan  bagian  posterior  yang  tidak membulat  dan  asimetris  hanya  pada  sisi tertentu.  Sedangkan  pada O.  borneensis tidak  menunjukkan  adanya  variasi  bentuk karapaks  yang  khas  yang  dapat  dijadikan sebagai identifikasi. Terakhir, variasi terlihat pada  PC3  yaitu  pada  bagian  anterior karapaks.  Dari  nilai  PC3  makan  dapat diketahui  bahwa C.  amboinensis memiliki variasi yang lebih besar pada O. borneensis perbedaannya  yaitu  sebesar  3%. Hal  ini menunjukkan  bahwa bentuk karapaks pada bagian anterior pada C. amboinensis dapat dijadikan  karakter  khas  untuk  membantu identifikasi.

## Kesimpulan
Perbedaan  variasi  bentuk  karapaks pada C.  amboinensis dan O.  borneensis t e l a h   b e r h a s i l   d i a n a l i s i s   d e n g a n menggunakan  metode Elliptic  fourier deskriptors (EFDs). Variasi bentuk karapaks signifikan  diwakilkan  ke  dalam  3  PC
156
(principal component) , yaitu PC1 82,77% (C. amboinensis) dan  88,1%  ( O.  borneensis ) mewakili  variasi  rasio  antara  lebar  dengan panjang  karapaks,  PC2  10,3% (C.
amboinensis) dan  7,02%  ( O.  borneensis ) yang  mewakili  variasi  bentuk  pada  bagian posterior karapaks dan terakhir PC3 4,73%
(C. amboinensis) dan 3,71% ( O. borneensis ) yang mewakili variasi pada bagian anterior karapaks.

## Ucapan Terimakasih
Ucapan terimaksih kepada Bpk. Hartono, manajer PPSJ yang telah memberi izin untuk mengambil data, kepada Berry Juliandi dari Departemen  Biologi  FMIPA  Universitas Pertanian  Bogor  yang  telah  bersedia membagi ilmu dan program SHAPE ver.1.3 dan kepada Fuad Uli Addien dari Kelompok Studi Herpetologi Biologi UGM yang telah banyak membantu selama penelitian.

## Daftar Pustaka
Barbour, R. and C. Ernst. 1992. Turtles of the World. Smithsonian Institute Press. pp:
280
Baltanas,  A.,  M.  Otero,  L.  Aqueros,  G.
Rossetti  and  Valeria  Rosii.  2000. Ontogenic  changes  in  the  carapace shape  of  the  non-marine  ostracod Eucypris  virens (Jurine). Hydrobiologia 419: 65-72
Bertin, A., David B., Cezilly F., and Alibert P.
2 0 0 2 .   Q u a n t i f i c a t i o n   o f   s e x u a l dimorphism  in  Asellus  aquaticus (Crustacea:  Isopoda)  using  outline approaches. Biol  J  Linn  Soc 77:
523–533
Christensen,  A.M.  2004.  Assessing  the variation  in  individual  frontal  sinus outlines. Am  J  Phys  Anthropol 127: 291–295
Daegling,  D.J.  and  W.L.  Jungers.  2000. Elliptical Fourier analysis of symphyseal shape  in  great  ape  mandibles. J  Hum Evol 39: 107–122 de Aranzamendi, M.C., J.J. Martinez, and R. Sahade. 2010. Shape differentiation and c h a r a c t h e r i z a t i o n   i n   t h e   t w o morphotypes  of  the  Antartic  limpet Nacella  concina using  elliptical  Fourier anlysis  of  shells. Polar  biol 33:  1163- 1170
de  Rooij,  N.  1915.  The  Reptiles  of  The Indo–Australian Archipelago,  Lacertilia. Chelonia,  Emydosauria.  Volume  I.  E  J Brill Ltd. Leiden Dommergues  E.,  J.L.  Dommergues,  F. Magniez, P. Neige and E.P. Verrecchia. 2003. Geometric measurement analysis versus Fourier series analysis for shape characterization  using  the  gastropod shell (Trivia) as an example. Math Geol 35: 887–894 Hutchins, M., J.B. Murphy and N. Schlager. 2 0 0 3 . G r i z i m e k ' s   A n i m a l   L i f e Encyclopedia s e c o n d   e d i t i o n
Volume  7  Reptiles. Gale  Group. Farmington Hill
Iskandar, D.T. 2000. Kura-kura dan Buaya. PAL Media Citra.  Bandung.
Iwata, H., N. Hirohisa, N. Seishi, T. Yasushi and U. Yasuo. 2002. Diallel   Analysis of Leaf Shape Variations of Citrus Varieties on  Elliptic  Fourier  Descriptor.  Breeding Science 52: 89-94
Iwata, H., H. Nesumi, M. Seiji, T. Yasushi and U.  Yasuo.  2002. The  evaluation  of Genotype x Environment Interactions of Citrus  leaf  Morphology  using  Image A n a l y s i s   a n d   E l l i p t i c a l   F o u r i e r Descriptors. Breeding Science 52: 243- 251
Iwata, H., Satoshi, N., Seiji, M., Yasushi, T. and Yasuo, U. 2004. Interaction between Genetic Effects and Soil Type in diallel Analysis  of  Root  Shape  and  Size  of Japanese  Radish  (Raphanus  sativus L. ). Breeding Science 54: 313-318
Kamilari,  M.  and  S.  Sfenthourakis.  2009. A m o r p h o m e t r i c   a p p r o a c h   t o   t h e geographic  variation  of  the  terrestrial isopod  species Armadillo  tuberculatus (Isopoda:  Oniscidea). J  Zool  Syst  Evol Res 47: 219–226
Kuhl,  F.P.  and  C.R.  Giardina.  1982.  Elliptic Fourier  features  of  a  closed  counter. Comp. Graph. Ima. Proc. 18: 236-258 Loy A., S. Busilacchi, C. Costa, F. Ferlin and S.  Cataudella.  2000.  Comparing geometric  morphometrics  and  outline fitting  methods to  monitor  fish  shape variability  of  Diplodus  puntazzo (Teleostea: Sparidae). Aquacult Eng 21: 271–283
Monti, L., M. Baylac and B. Lalane-Cassou. 2001. Elliptic Fourier analysis of the form
157 Qurniawan dkk.,
:  152 - 158
Biosfera 28 (3) September 2011
Gambar 2. Visualisasi PC variasi bentuk karapaks Orlitia borneensis
Figure 2. PC Visualisation of carapac shape variation of Orlitia borneensis
PC 1 PC 2 PC 3 -2S D +2S D Mean
Berdasarkan  table  1.  nilai  komponen utama yang diperoleh PC1 (82,77%)   pada C. amboinensis dan PC1 (88,18%) pada O. borneensis.  PC1  merupakan  hasil  analisis perwakilan  variasi  terbesar yang terdeteksi pada  karapaks  untuk  kedua  jenis.  PC1 menyatakan  bahwa  variasi  karapaks  yang paling  jelas  terdeteksi  adalah  pada  rasio antara    lebar  karapaks  dengan  panjang karapaks. Nilai PC1 yang lebih besar pada C. amboinensis menunjukkan bahwa variasi rasio antara lebar karapaks dengan panjang karapaks  pada C.  amboinensis variasinya lebih  besar  dibandingkan  pada  O. borneensis. Visualisasi variasi PC1 (gambar 1  dan  2)  ditunjukkan  oleh  standar  deviasi (SD) ± 2, dimana dalam satu spesies dapat memiliki lebar lebih 2  atau kurang 2 dari nilai rata-rata. Pada C. amboinensis nilai SD +2 akan  terlihat  karapaks  yang  lebarnya  lebih dari panjang karapaks. Pada O. borneensis, nilai  SD  +2  akan  menunjukkan  karapaks yang membulat dengan bagian anterior dan posterior yang juga membulat. Namun, SD - 2  perbedaan  karapaks  kedua  kura-kura tersebut hampir tak terlihat.
Variasi  selanjutnya  yang  telah berhasilterdeteksi  pada  karapaks  C. amboinensis  dan O. borneensis diwakilkan oleh  PC2  dan  PC3.  PC2  mewakili  variasi bentuk  pada  bagian  caudal/posterior karapaks  dan  PC3  mewakili  variasi  bentuk pada daerah cranial/anterior karapaks. Nilai PC2 dan PC3 C. amboinensis adalah 10,3% dan  4,73%  sedangkan  PC2  dan  PC3  O. borneensis  adalah  7,02%  dan  3,71%.  Nilai PC2  dan  PC3  yang  tidak  lebih  dari  10% menunjukkan variasi ini akan sulit dideteksi secara  manual  dengan  mata  atau  perlu kejelian  dan  ketelitian  untuk  dapat
mengetahuinya.  Namun  dengan  EFDs  kita dapat mengetahuinya dengan mudah.
Pada C. amboinensis, PC2 lebih besar dibandingkan  pada O.  borneensis .  Hal  ini menunjukkan  bahwa  bentuk  bagian posterior  karapak C.  amboinensis lebih bervariasi sebesar 3% saja. Serta jika dilihat dari perbedaan nilai mean asimetri dengan simetri  yang  lebih  besar  pada  PC2  C. amboinensis  menunjukkan  adanya  variasi bentuk  posterior  karapaks  yang  khas  pada C.  amboinensis .  Maka  bentuk  karapaks pada bagian   posterior dari C. amboinensis dapat  dijadikan  karakter  khas  sebagai identifikasi.  Visualisasi  yang  didapat (gambar  1  dan  2)  terlihat C.  amboinensis menunjukkan  bagian  posterior  yang  tidak membulat  dan  asimetris  hanya  pada  sisi tertentu.  Sedangkan  pada O.  borneensis tidak  menunjukkan  adanya  variasi  bentuk karapaks  yang  khas  yang  dapat  dijadikan sebagai identifikasi. Terakhir, variasi terlihat pada  PC3  yaitu  pada  bagian  anterior karapaks.  Dari  nilai  PC3  makan  dapat diketahui  bahwa C.  amboinensis memiliki variasi yang lebih besar pada O. borneensis perbedaannya  yaitu  sebesar  3%. Hal  ini menunjukkan  bahwa bentuk karapaks pada bagian anterior pada C. amboinensis dapat dijadikan  karakter  khas  untuk  membantu identifikasi.

## Kesimpulan
Perbedaan  variasi  bentuk  karapaks pada C.  amboinensis dan O.  borneensis t e l a h   b e r h a s i l   d i a n a l i s i s   d e n g a n menggunakan  metode Elliptic  fourier deskriptors (EFDs). Variasi bentuk karapaks signifikan  diwakilkan  ke  dalam  3  PC
(principal component) , yaitu PC1 82,77% (C. amboinensis) dan  88,1%  ( O.  borneensis ) mewakili  variasi  rasio  antara  lebar  dengan panjang  karapaks,  PC2  10,3% (C. amboinensis) dan  7,02%  ( O.  borneensis ) yang  mewakili  variasi  bentuk  pada  bagian posterior karapaks dan terakhir PC3 4,73% (C. amboinensis) dan 3,71% ( O. borneensis ) yang mewakili variasi pada bagian anterior karapaks.

## Ucapan Terimakasih
Ucapan terimaksih kepada Bpk. Hartono, manajer PPSJ yang telah memberi izin untuk mengambil data, kepada Berry Juliandi dari Departemen  Biologi  FMIPA  Universitas Pertanian  Bogor  yang  telah  bersedia membagi ilmu dan program SHAPE ver.1.3 dan kepada Fuad Uli Addien dari Kelompok Studi Herpetologi Biologi UGM yang telah banyak membantu selama penelitian.

## Daftar Pustaka
Barbour, R. and C. Ernst. 1992. Turtles of the World. Smithsonian Institute Press. pp: 280
Baltanas,  A.,  M.  Otero,  L.  Aqueros,  G. Rossetti  and  Valeria  Rosii.  2000. Ontogenic  changes  in  the  carapace shape  of  the  non-marine  ostracod Eucypris  virens (Jurine). Hydrobiologia 419: 65-72
Bertin, A., David B., Cezilly F., and Alibert P. 2 0 0 2 .   Q u a n t i f i c a t i o n   o f   s e x u a l dimorphism  in  Asellus  aquaticus
(Crustacea:  Isopoda)  using  outline approaches. Biol  J  Linn  Soc 77: 523–533
Christensen,  A.M.  2004.  Assessing  the variation  in  individual  frontal  sinus outlines. Am  J  Phys  Anthropol 127: 291–295
Daegling,  D.J.  and  W.L.  Jungers.  2000. Elliptical Fourier analysis of symphyseal shape  in  great  ape  mandibles. J  Hum
Evol 39: 107–122
de Aranzamendi, M.C., J.J. Martinez, and R. Sahade. 2010. Shape differentiation and c h a r a c t h e r i z a t i o n   i n   t h e   t w o morphotypes  of  the  Antartic  limpet Nacella  concina using  elliptical  Fourier anlysis  of  shells. Polar  biol 33:  1163- 1170
de  Rooij,  N.  1915.  The  Reptiles  of  The Indo–Australian Archipelago,  Lacertilia. Chelonia,  Emydosauria.  Volume  I.  E  J Brill Ltd. Leiden
Dommergues  E.,  J.L.  Dommergues,  F. Magniez, P. Neige and E.P. Verrecchia. 2003. Geometric measurement analysis versus Fourier series analysis for shape characterization  using  the  gastropod shell (Trivia) as an example. Math Geol
35: 887–894
Hutchins, M., J.B. Murphy and N. Schlager. 2 0 0 3 . G r i z i m e k ' s   A n i m a l   L i f e Encyclopedia s e c o n d   e d i t i o n Volume  7  Reptiles. Gale  Group.
Farmington Hill
Iskandar, D.T. 2000. Kura-kura dan Buaya. PAL Media Citra.  Bandung.
Iwata, H., N. Hirohisa, N. Seishi, T. Yasushi and U. Yasuo. 2002. Diallel   Analysis of Leaf Shape Variations of Citrus Varieties on  Elliptic  Fourier  Descriptor.  Breeding Science 52: 89-94
Iwata, H., H. Nesumi, M. Seiji, T. Yasushi and U.  Yasuo.  2002. The  evaluation  of Genotype x Environment Interactions of Citrus  leaf  Morphology  using  Image A n a l y s i s   a n d   E l l i p t i c a l   F o u r i e r Descriptors. Breeding Science 52: 243- 251
Iwata, H., Satoshi, N., Seiji, M., Yasushi, T. and Yasuo, U. 2004. Interaction between Genetic Effects and Soil Type in diallel Analysis  of  Root  Shape  and  Size  of Japanese  Radish  (Raphanus  sativus
L. ). Breeding Science 54: 313-318
Kamilari,  M.  and  S.  Sfenthourakis.  2009. A m o r p h o m e t r i c   a p p r o a c h   t o   t h e geographic  variation  of  the  terrestrial isopod  species Armadillo  tuberculatus (Isopoda:  Oniscidea). J  Zool  Syst  Evol Res 47: 219–226
Kuhl,  F.P.  and  C.R.  Giardina.  1982.  Elliptic Fourier  features  of  a  closed  counter. Comp. Graph. Ima. Proc. 18: 236-258
Loy A., S. Busilacchi, C. Costa, F. Ferlin and S.  Cataudella.  2000.  Comparing geometric  morphometrics  and  outline fitting  methods to  monitor  fish  shape variability  of  Diplodus  puntazzo (Teleostea: Sparidae). Aquacult Eng 21: 271–283
Monti, L., M. Baylac and B. Lalane-Cassou. 2001. Elliptic Fourier analysis of the form
157 Qurniawan dkk., :  152 - 158 Analisis Variasi Bentuk Karapaks Kuya Batok
of  genitalia  in  two  Spodoptera  species and  their  hybrids  (Lepidoptera: Noctuidae). Biol J Linn Soc 72: 391–400
Pough, F.H., R.M. Andrews, J.E. Cadle, M.L.
Crump,  A.H.  Savitzky  and  K.D.  Wells. 1998. Herpetology. New  Jersey:
Prentice-Hall, Inc.
Rohlf,  F.J.  and  J.W.  Archie.  1984.  A comparison  of  Fourier  methods  for  the description of wing shape in mosquitoes ( Dipter  culicidae ). Syst.  Zool .  33:  302- 317.
Rohlf,  F.J.  and  L.F.  Marcus.  1993.  A revolution in morphometrics. Tree 8(4): 129–132.
Truong, T.N., J.G. Gwang, Y.J. Park and S.H.
Lee. 2005. Genetic Diversity of Soybean Pod  Shape  Based  on  Elliptic  Fourier Descriptors. Korean J. Crop Sci 50 (1)
Yoshioka,  Y.,  H.  Iwata,  R.  Oshawa  and  S. Ninomiya. 2004. Analysis of Petal Shape Variation  of  Primula  sieboldii  by  Elliptic Forurier  Descriptors  and  Principal Component Analysis. Annals of Botany
94: 657-664
Juliandi,  B.  dan  F.  Ahmad.  2007.  Analisis Va r i a s i   B e n t u k   K a r a p a s C u o r a amboinensis (Daudin,  1802)  dan Cyclemys  dentata (Gray,  1831) ( B a t a g u r i d a e ;   T e s t u d i n a t a ) Menggunakan  Deskriptor  Fourier
Eliptikal. Seminar Nasional Herpetologi
Institut Pertanian Bogor.
Tracey, S.R., M.L. Jeremy and D. Guy. 2006. Application of Elliptical Fourier Analysis of  Otolith  Form  as  a  Tool  for  Stock Identification. Fisheries  Research 77: 138-147

## 158

## Pendahuluan
Serangan  Organisme  Penganggu Tanaman  (OPT)  sampai  saat  ini  tetap menjadi masalah yang cukup penting dalam bidang  usaha  pertanian.  Salah  satu organisme  yang  banyak  meng-ganggu t a n a m a n   d a n   p e r l u   d i p e r h a t i k a n keberadaannya  adalah  serangga  hama Spodoptera litura .
Spodoptera  litura (Lepidoptera, Noctuidae) atau lebih dikenal dengan nama ulat  grayak  merupakan  serangga  yang banyak  ditemukan dan  menjadi  hama penting di daerah tropis. Biasanya serangga ini terdapat pada tanaman pertanian seperti jagung, sorgum, tomat, cabai, kapas, kubis, kedelai, kacang tanah, ubi jalar dan lain-lain (Kalshoven  1981).  Bagian  tumbuhan  yang diserang  adalah    daun,  batang  bahkan buahnya.  Kehadiran  ulat  tersebut  pada
tanaman  kedelai  telah  mengakibatkan kehilangan hasil panen sekitar 85% bahkan dapat  menyebabkan  kegagalan  panen (puso) (Arifin 1993) . Pengendalian  terhadap  ulat  grayak pada  tingkat  petani  pada  umumnya  masih menggunakan insektisida yang berasal dari senyawa kimia dengan menghabiskan dana yang  cukup  besar.  Permasalahan  tersebut rupanya  semakin  banyak  menimbulkan persoalan  karena  penggunaan  insek-tisida kimia  yang  menjadi  andalan  dalam p e m b e r a n t a s a n   h a m a   s e m a k i n menunjukkan  penurunan  efektivitas (Novizan  2004).
Timbulnya  gagasan  untuk  mene- rapkan Pengendalian Hama Terpadu (PHT) d i d o r o n g   o l e h   p e n g a - l a m a n   y a n g menunjukkan  bahwa  cara  pengendalian hama  yang  terlalu  menitikberatkan  pada penggunaan pestisida dapat menimbul-kan
Kajian Histologis Infeksi LD50 SLNPV terhadap Kerusakan Membran Peritrofik Larva Spodoptera litura Fabricius 1) 2) Yayan Sanjaya, Nanin Diah  dan  Wardono Niloperbowo
1) Progam Studi Biologi-Universitas Pendidikan Indonesia,
2) KPP Ilmu Hayati-Institut Teknologi Bandung
Diterima September 2010 disetujui untuk diterbitkan September 2011

## Abstrack
The effect of SlNPV infection on  peritrophic membrane  of Spodoptera litura has been carried out. The  damage  of  histological  structure  caused  by  SlNPV  (0,  315,  390,  465,  540  and  615  PIB/ml)  was investigated after 0, 12, 24 ,72 and 96 hours post infection. The histological material was prepared by using parafin method after fixation with Bouin Solution, then sliced into 7 m m and stained with Hematoxilin- Eosin.     The descriptive obsevation on structural intact of peritrophic membrane histology caused by SlNPV infection shows a tendency to decrease, while in control, there was no damage at all.  The longer the exposition of virion in the midgut lumen the more damage on peritrophic membrane occurred. The severest  damage  occurred  96  hour  after  infection.  The  result  prove  that  haNPV  virion  can  destroy histological structure of midgut.
Key words: SlNPV, Spirulina litura , peritrophic membrane

## Abstrak
Pengaruh infeksi SlNPV pada membran peritrophic Spodoptera litura telah dilakukan. Kerusakan struktur histologis disebabkan oleh SlNPV (0, 315, 390, 465, 540 dan 615 PIB/ml) telah diamati setelah 0,12 24,72 dan 96 jam pasca infeksi.   Materi histologis dibuat dengan metode parafin setelah fiksasi dengan  Solusi  Bouin,  kemudian  diiris  menjadi  7 m m  dan  diwarnai  dengan  Hematoxilin-Eosin.    Hasil pengamatan deskriptif struktur histologi utuh   pada membran peritrofik disebabkan oleh infeksi SlNPV menunjukkan  kecenderungan  menurun, sedangkan  pada  kontrol,  tidak  ada  kerusakan  sama  sekali. Semakin lama pemaparan virion di dalam lumen usus, kerusakan lebih banyak terjadi pada membran peritrofik.  Kerusakan terparah terjadi pada 96 jam setelah infeksi.  Hasil penelitian membuktikan bahwa virion HaNPV dapat menghancurkan struktur histologis dari usus tengah.
Kata kunci: SlNPV, Spirulina litura , membran peritrofik