## Jurnal Biologi Edukasi Edisi 31, Volume 15 Nomor 2, Desember 2023, hal 96-104
Isolasi dan Identifikasi Mikroba pada Tanah Bekas Pertumbuhan Bawang Merah ( Allium cepa L.)
Isolation and Identification of Microorganisms from Onion-Used Soil (Allium cepa L.)
Eva Nauli Taib, Hasrida Maya, Raihan Shabirah, dan Fadilah Rahmawati Siregar Program Studi Pendidikan Biologi, Fakultas Tarbiyah & Keguruan, UIN Ar-Raniry, Jl. Syech Abdurrauf, KOPELMA Darussalam, Kec. Syiah Kuala, Kota Banda Aceh, Indonesia Email : evanaulitaib@ar-raniry.ac.id

## Abstrak
Isolasi  mikroba  adalah  memisahkan  mikroba  tersebut  dari  lingkungannya  dan menumbuhkannya  sebagai  biakan  murni  dalam  medium  buatan.  Pewarnaan  bakteri  penting  dalam identifikasi  dan  klasifikasi  bakteri,  karena  membantu  membedakan  antara  satu  jenis  bakteri  dengan jenis  lainnya  dan  mempermudah  pengamatan  mikroorganisme  bakteri  dibawah  mikroskop.  Tujuan penelitian  untuk  mengisolasi  dan  mengidentifikasi  jenis  miroba  tanah  yang  terdapat  didalam  tanah bekas  pertumbuhan  bawang  merah  .  Penelitian  ini  menggunakan  metode  uji  isolasi  dan  identifikasi dengan menggunakan media Touge Ekstrak Agar (TEA) yang dilanjutkan dengan uji pewarnaan gram. Analisis data dengan teknik purposive sampling untuk mengidentifikasi jenis mikroba yang terdapat pada  tanah  penanaman.  Manfaat  dari  penelitian  ini  dapat  memberikan  informasi  mengenai  jenis mikroba  dalam  tanah  yang  berpotensi  dapat  meningkatkan  unsur  hara  tanah  dan  meningkatkan pertumbuhan bawang merah.
Kata kunci : Isolasi, mikroba tanah, jenis tanah, bawang merah

## Abstract
Microbial isolation is separating the microbes from their environment and growing them into pure  cultures  in  an  artificial  medium.  Bacterial  staining  is  important  in  the  identification  and classification of bacteria, because it helps differentiate one type of bacteria from another and makes it easier to microscope bacteria under a microscope. The aim of the research was to isolate and identify the types of soil microbes found in the soil used to grow onions. This research uses an isolation and identification test  method using  Touge  Extract  Agar  (TEA)  media  followed  by a  gram  staining  test. Data  analysis  using  purposive  sampling  technique  to  identify  the  types  of  microbes  found  in  the planting soil. The benefit of this research is that it can provide information about the types of microbes in the soil that have the potential to increase soil nutrients and increase the growth of onions.
Keywords : Isolation, soil microbes, type of soil, shallots
Taib dkk: Isolasi dan Identifikasi Mikroba pada ………

## Pendahuluan
Tanah  merupakan  suatu  media  yang digunakan sebagai tempat hidup dan pertumbuhan mikroorganisme secara kompleks. Mikroba  dapat  hidup  di  tanah  dengan memanfaatkan  semua  nutrien  yang  ada  di dalamnya  dan  dapat  dimanfaatkan  dalam pertanian ataupun perkebunan. Peranan terpenting  mikroba  tanah  ialah  fungsinya  yang membawa  perubahan  kimiawi  pada  substansi- substansi  di  dalam  tanah,  terutama  perubahan senyawa  organik  yang  mengandung  karbon, nitrogen,  sulfur,  dan  fosfor  menjadi  senyawa anorganik. Proses ini disebut dengan mineralisasi,  dimana  di  dalamnya  terlibat sejumlah  besar  perubahan  kimiawi  dengan peranan  berbagai  macam  mikroorganisme. Proses  tersebut  dapat  diawali  dengan  siklus nitrogen  yang  terdapat  di  dalam  tanah  yang dapat  mengubah  senyawa  anorganik  menjadi senyawa organik oleh mikroorganisme (Pelczar, MJ & Chan, 2005)
Mikroba  tanah    melakukan  berbagai aktivitas  yang  saling  berinteraksi  dengan sesama mikroorganisme lain. Peranan mikrooganisme  di  dalam  tanah  sangat  besar bagi  kehidupan  mengingat  semua  proses dekomposisi  dan  mineralisasi  serasah  bahan organik menjadi bahan anorganik terjadi karena peranan  mikroorganisme  yang  ada  di  dalam tanah.  Mikroorganisme  mememegang  peranan penting  dalam  ekosistem  karena  menguraikan sisa  organik  yang  telah  mati  menjadi  unsur- unsur yang dikembalikan ke dalam tanah seperti Nitrogen  (N)  Fosfor  (P),  Kalium  (K),  Calsium (Ca),  Mangan  (Mn)  dan  keatmosfer (CH4  atau CO¬2)  sebagai  hara  yang  dapat  digunakan kembali oleh tanaman (Agus & Subiksa, 2008).
Keanekaragaman  mikroorganisme  tanah merupakan salah satu penentu kesuburan tanah, selain  dari  sifat  kimia  tanah  itu  sendiri, mikroorganisme  yang  menghuni  tanah  dapat dikelompokkan menjadi bakteri, aktinomycetes, jamur,  alga  dan  protozoa  (Rao,  1994). Mikroorganisme  ini  secara  bersama-sama membentuk  kumpulan  mikroorganisme  yang dapat mencapai jumlah total sampai bermilyar- milyar organisme per gram tanah.
Isolasi mikro organisme mengandung arti proses  pengambilan  mikroorganisme  dari lingkungannya  untuk  kemudian  ditumbuhkan dalam  suatu  medium.  Prinsip  isolasi  mikroba adalah  memisahkan  satu  jenis  mikroba  dan mikroba  lainnya  yang  berasal  dari  bermacam-
macam  campuran  mikroba.  Dalam  seleksi mikroorganisme  dari  lingkungan,  media  yang digunakan adalah Medium Touge Ekstrak Agar (TEA).
Beberapa faktor yang perlu dipertimbangkan  dalam  melakukan  isolasi mikroba  antara  lain;  sifat  setiap  jenis  mikroba yang  akan  di  isolasi,  tempat  hidup  atau  asal mikroba,  media  pertumbuhan  yang  tepat,  cara menginokulasi  mikroba,  bagaimana  cara menetaskan  mikroba,  cara  menguji  bahwa mikroba  yang  terisolasi  telah  dalam  bentuk kultur  murni  dan  sesuai  dengan  apa  yang dimaksudkan,  bagaimana  mempertahankan bahwa mikroba yang telah diisolasi tetap murni kultur (Jufri, 2020).
Pewarnaan  gram  merupakan  salah  satu reaksi  pewarnaan  yang  paling  berguna  untuk identifikasi  bakteri.  Bakteri  dalam  suspensi difiksasi  ke  slide  kaca  dengan  pemanasan singkat  dan  kemudian  terkena  dua  pewarna yang  bergabung  untukmembentuk  kompleks pewarna  biru  besar  di  dalam  setiap  sel.  Ketika slide  dibilas  dengan  larutan  alkohol,  bakteri gram  positif  mempertahankan  warna  biru  dan bakteri  gram  negatif  kehilangan  warna  biru. Slide  kemudian  diwarnai  dengan  pewarnaan merah  muda  yang  lebih  lemah  yang menyebabkan  bakteri  gram  negatif  menjadi merah  muda,  sedangkan  bakteri  gram  positif tetap  biru.  pewarnaan  gram  bereaksi  terhadap perbedaan  struktur  permukaan  sel  bakteri perbedaan  yang  terlihat  ketika  sel  dilihat  di bawahmikroskop elektron (Harahap, 2021)
Bawang  Merah  (Allium  cepa  L.)  adalah jenis  tanaman  semusim  atau  sering  disebut tanaman annual termasuk dari famili Liliaceae, yang  memiliki  umbi  berlapis,  dan  berakar  ser- abut dengan daun berbentuk silinder berongga. Bawang  merah  termasuk  tanaman  yang memiliki  nilai  ekonomis  yang  tinggi.  Bawang merah  dapat  di  budidayakan  secara  luas  di seluruh  penjuru  dunia  terutama  di  Asia  dan Eropa,  bawang  merah  sekarang  ini  semakin mendapat  perhatian  dari  masyarakat  dan pemerintah.  Dalam  beberapa  tahun  terakhir bawang  merah  menjadi  komoditas  enam  besar sayuran  yang  diekspor  ke  negara-negara  di belahan  dunia  dengan  cabai,  kentang,  tomat, kubis,  blunkol  (kubis  bunga).  Bawang  merah banyak  diekspor  bukan  hanya  bentuk  sayuran segar, namun dapat juga olahan bawang goreng.
Bawang  merah  merupakan  salah  satu komoditas  sayuran  yang  mempunyai  arti penting  bagi  masyarakat.  Meskipun  disadari
Jurnal Biologi Edukasi Edisi 31, Volume 15 Nomor 2, Desember 2023, hal 96-104
tanaman  bawang  merah  bukan  merupakan kebutuhan  pokok,  akan  tetapi  hampir  tidak dapat  dihindari  oleh  konsumen  rumah  tangga sabagai  pelengkap  bumbu  masak  sehari-hari. Akhir-akhir ini, permintaan akan bawang merah di  pasaran  semakin  meningkat,  tetapi  tidak dapat  diimbangi  dengan  produksi  tanaman bawang  merah  ditingkat  pertanian.  Hal  ini dipengaruhi oleh produktivitas tanah pada lahan pertanian  penanaman  bawang  merah  yang semakin hari semakin menurun yang disebabkan  oleh  penggunaan  pupuk  anorganik yang  berlebihan  yang  berdampak  pada kerusakan struktur tanah (Rukmana , 1995).
Penelitian  yang  dilakukan  oleh  Mukhlis (2012)  dengan  pengaruh  berbagai  jenis miroorganisme local (MOL) terhadap pertumbuhan  dan  hasil  bawang  merah  pada tanah alluvial, hasil penelitian ini menunjukkan bahwa  pemberian  berbgai  jenis  MOL memberikan pertumbuhan dan hasil yang sama terhadap  tanaman  bawang  merah  pada  tanah alluvial,  pemberian  kombinasi  MOL  dengan penambahan  sayuran+  buahan  yang  paling efektif  untuk  diberikan  pada  tanaman  bawang merah.
Manfaat  dari  penelitian  ini  dapat memberikan informasi mengenai jenis mikroba dalam tanah yang berpotensi dapat meningkatkan unsur hara tanah dan meningkatkan pertumbuhan bawang merah.

## Metode Penelitian

## Teknik Analisis Data
Penelitian  ini  menggunakan  metode deskriptif dengan menggunakan teknik purposive  sampling  yaitu  salah  satu  teknik sampling  non  random  (Elvina,  et  al.  2020). Pengambilan  sampel  dilakukan  dengan  cara mengambil  3  jenis  tanah  di  tiga  titik  yang berberda.  pada  setiap  tanah  akan  dijadikan sampel  kemudian  dilanjutkan  dengan  isolasi dan identifikasi mikroorganisme di Laboratorium  mikrobiologi  yang  terdapat  di UIN Ar-Raniry.

## Waktu dan Tempat Penelitian
Penelitian  ini  telah  dilaksanakan  pada bulan  Oktober  2023  yang  bertempat  di Greenhouse  Laboratorium  Pendidikan  Biologi FTK UIN Ar-Raniry Banda Aceh.

## Bahan dan Alat
Bahan-bahan dalam percobaan ini adalah benih  bawang  merah  merek  Sanren  F1  ,  tanah
biasa,  tanah  sampah,  dan  pupuk  NPK. Sedangkan  alat  yang  digunakan  adalah  gelas plastik bekas air mineral, cangkul, ember, pisau, timbangan digital, meteran dan alat tulis.

## Rancangan Penelitian
Penelitian  ini  dilakukan  Penelitian  ini menggunakan metode uji isolasi dan identifikasi dengan menggunakan media Touge Ekstrak  Agar  (TEA)  yang  dilanjutkan  dengan uji dan pewarnaan Gram (Ningsih, et al., 2023) Parameter  penelitian  mengidentifikasi jenis mikroorganisme yang terdapat pada tanah bekas penanaman.

## Pelaksanaan Kegiatan
Adapun rincian kegiatan dalam penelitian ini diuraikan dengan beberapa kegiatan berikut.

## a. Penanaman
Penanaman dilakukan dengan melakukan pembersihan  kulit  umbi  yang  paling  luar  yang telah  mengering,  kemudian  umbi  dipotong  ⅓ bagian  secara  melintang  pada  ujung  umbi, tujuan  dilakukannya  pemotongan  umbi  yaitu untuk  penghentian  masa  dormansi  pada  umbi tersebut sehingga mempercepat proses pertunasan. Setelah itu, umbi direndam dengan air  selama  ±15  menit,  lalu  ditanam  ke  dalam wadah  semai  berupa  gelas  plastik  bekas  air mineral  yang  telah  disediakan,  dan  dalam  1 gelas  bekas  terdapat  1  umbi  bawang  merah yang  merupakan  bahan  tanaman,  umbi  ditutup ¾  bagian  dengan  menggunakan  tanah  halus, Penanaman sebaiknya dilakukan pada sore hari agar  umbi  bawang  merah  yang  di  tanam  tidak langsung kering. Pemberian Label Pemasangan label  dapat  dilakukan  sebelum  tanam  guna untuk  mempermudah  dan  menandai  perlakuan tiap gelas bekas sesuai dengan layout.

## b. Pemeliharaan
Pemeliharan  tanaman  bawang  merah terdiri dari kegiatan-kegiatan berikut.
Penyiraman
Penyiraman
dilakukan
dengan menggunakan  hand  sprayer  dengan  sistem penyiraman pada daun dan pada lubang tanam. Waktu  penyiraman  pada  pagi  hari  jam  07.00 s/d10.00  WIB.  Jika  turun  hujan,  maka  tidak perlu dilakukan penyiraman.

## Penyulaman
Penyulaman dilakukan pada bibit bawang merah  yang  pertumbuhannya  jelek,  atau  mati.
Taib dkk: Isolasi dan Identifikasi Mikroba pada ………
Waktu  penyulamannya  dilakukan  sampai berumur 2 minggu setelah tanam.

## Pemupukan
Pemupukan  dengan  menggunakan  NPK dilakukan  pertama  kali  ketika  saat  penanaman kemudian  ditambahkan  lagi  selama  sekali seminggu setelah tanam.

## c. Panen
Bawang  merah  dapat  dipanen  setelah umurnya cukup tua, biasanya pada umur 60 – 70 hari.  Tanaman  bawang  merah  dipanen  setelah terlihat  tanda-tanda  berupa  leher  batang  60% lunak,  tanaman  rebah  dan  daun  menguning. Pemanenan  sebaiknya  dilaksanakan  pada keadaan  tanah  kering  dan  cuaca  yang  cerah untuk mencegah serangan penyakit busuk umbi di Gudang (Sumarni et al., 2012).
d. Pembuatan Medium Touge Ekstrak Agar
(TEA)
Disipakan Tauge 250 gram direbus dalam 1  liter  air  hingga  2  jam  setelah  menddidih. Diambil sarinya dan disaring. Untuk pembuatan 1 liter media digunakan1 liter air rebusan tauge dan  ditambahkan  20  gram  gula  pasir  dan  20 gram agar-agar. Dipanaskan dan diaduk hingga homogen.

## e. Pengenceran
Pengenceran  digunakan  karena  untuk menumbuhkan koloni bakteri pada media yang terbatas tidak mungkin dilakukan penghitungan bakteri yang berjumlah puluhan  ribu. Pengenceran ini dimaksudkan untuk mengurangi  kepadatan  bakteri  pada  sampel. Pengenceran dilakukan selama 7 kali pengulangan.

## f. Isolasi bakteri
Ambilah  cawan  Petri  yang  telah  terisi medium Touge Ekstrak Agar (TEA), kemudian tuang  hasil  pengenceran  tersebut,  lalu  gores menggunakan  metode  tuang.  Inkubasi  pada suhu ruang 20-25OC selama 5-7 hari. Lakukan pengamatan  makroskopik  dan  mikroskopik terhadap koloni bakteri yang tumbuh.

## g. Pewarnaan bakteri
Pewarnaan gram dapat dilakukan dengan cara  membuat  apusan  isolasi  mikroba menggunakan kaca preparat diatasnya. Kemudian  dibiarkan  kering,  dan  lalu  itu  diberi
kristal  violet  dan  membiarkan  selama  1  menit dan  dicuci  dengan  botol  pijit.  Setelah  itu diwarnai dengan safranin dan etil akohol secara bergantian  selama  45  detik  dengan  masing- masing tahap dicuci dengan air kran. Kemudian di  keringkan  dengan  kertas  saring  dan mengamati  bentuk  dan  jenis  bakteri  di  bawah mikroskop.  Sedangkan,  untuk  pewarnaan sederhana  yaitu  menyiapkan  kaca  objek, menenteskan  satu  tetes  air,  mengambil  biakan bakteri  dan  campur  dengan  air  di  kaca objek,menyebarkan biakan tersebut lalu biarkan mengering, kemudian difiksasi, memberikan zat pewarna lalu mencuci pulasan dan dikeringkan. Serta mengamati dibawah mikroskop.

## Hasil Penelitian dan Pembahasan
Bahan-bahan organik diperlukan mikroorganisme  untuk  proses  metabolisme,  di dalam  tanah  komponen-komponen  bahan organik  ini  merupakan  salah  satu  penyusun tanah  selain  mineral-mineral  organik  lainnya. Baik  secara  langsung  maupun  tidak  langsung komponen-komponen  bahan  organik  diperoleh dari  sisa  manusia  dan  hewan,  serta  jaringan tumbuhan  yang  dibuang  atau  dikubur  dalam tanah.  Setelah  beberapa  lama,  bahan-bahan tersebut akan mengalami penguraian kemudian berubah  menjadi  komponen  organik  dan beberapa  komponen  organik  tanah  (Irianto, 2006).
Populasi  mikrobiologis  tanah  terbagi dalam tiga golonggan besar, yaitu:
1 Autochthonous, golongan ini dapat dikatakan  sebagai  mikroba  setempat  atau pribumi  pada  tanah  tertentu,  selalu  hidup dan  berkembang  di  tanah  tersebut  dan  atau selalu diperkirakan ada ditemukan di dalam tanah tersebut.
2 Mikroba zimogenik, golongan mikroba yang berkembang  di  bawah  pengaruh  perlakuan perlakuan  khusus  pada  tanah,  seperti penambahan bahan bahan organik, pemupukan.
3 Mikroba  transient  (penetap  sementara), terdiri  dari  organisme  organisme  yang ditambahkan  ke  dalam  tanah,  secara disengaja seperti dengan inokulasi leguminosa, atau yang tidak secara disengaja seperti  dalam  kasus  unsur  unsur  penghasil penyakit tanaman dan hewan, organisme ini kemungkinan akan segera mati atau bertahan untuk  sementara  waktu  setelah  berada  di dalam tanah (Campbel et al, 2003).
Jurnal Biologi Edukasi Edisi 31, Volume 15 Nomor 2, Desember 2023, hal 96-104
Bakteri  merupakan  organisme  yang paling besar jumlahnya di dalam tanah sehingga dalam  satu  gram  tanah  dapat  diketemukan kurang lebih 109 bakteri. Dalam keadaan yang menguntungkan,  bakteri  dapat  berkembang dengan cepat, sebab lama kelamaan nutrisi yang ada  di  sekitarnya  juga  berkurang  jumlahnya, padahal bahan-bahan tersebut sangat diperlukan untuk  pertumbuhan  dan  perkem-  bangannya. Reproduksi  yang  cepat  pada  bakteri  memberi petunjuk  bahwa  bakteri  itu  dapat  berkompetisi dengan  baik  terhadap  organisme  lain  untuk memperoleh  sumber-sumber  makanan  yang baru.
Jenis-jenis  bakteri  yang  diketemukan  di dalam  tanah  pada  umumnya  bakteri  yang berbentuk  batang.  Beberapa  di  antaranya  ada yang  berflagel  yang  berguna  untuk  bergerak pada  tempat  yang  berair.  Di  samping  itu  pada bakteri  sering  dijumpai  adanya  pembungkus yang berupa kapsul, yang meru- pakan senyawa kompleks  yang  disekresikan  pada  bagian membran  sel.  Kapsul  berfungsi  melindungi bakteri  dari  gang-  guan  luar.  Adanya  sejumlah besar  timbunan  kapsul  bakteri  dalam  tanah, akan memperbaiki struktur tanah karena adanya pengikatan partikel-partikel humus dan bahanbahan  mineral.  Bakteri  mempunyai kemampuan menguraikan pestisida dan herbisida  sehingga  mencegah  timbunan  bahan- bahan tersebut di dalam tanah, juga melakukan metobolisme dan mineralisasi berbagai senyawa organik  yang  berat  molekulnya  rendah (Yulipriyanto, 2010).
Selain itu, dapat melakukan metabolisme dan  menghancurkan  berbagai  bahan  organik baik  alami  maupun  buatan.  Peristiwa  tersebut tampak jelas, misalnya dalam mengoksidasi dan mereduksi  ion  nitrogen,  sulfur,  besi  dan mangan. Bakteri merupakan anggota mikroorganisme  tanah  yang  dominan  bila lingkungannya kurang oksigen, sebab banyak di antaranya  yang  mampu  hidup  pada  kondisi yang  minim  oksigen  atau  bersifat  aerob fakultatif.  Beberapa  genus  bakteri  tanah  yang penting,  misalnya Clostridium, dan Rhizobium Pseudomonas, Agrobacterium, Flavobacterium, Bacillus.
Prinsip
isolasi
mikroba adalah
memisahkan  satu  jenis  mikroba  dengan mikroba  lain  yang  berasal  dari  campuran berbagai  mikroba.  Ini  bisa  dilakukan  dengan menumbuhkannya  di media  padat,  sel  mikroba akan  membentuk  koloni  sel  yang  tetap ditempatnya.  Pentingnya  mengisolasi  mikroba
dari  lingkungan,  seperti  makanan  (substrat padat),  minuman  (substrat  cair),  dan  diri  Anda sendiri  karena  banyaknya  mikroba  yang  sulit diamati  atau  dibedakan  secara  langsung menggunakan  panca  indera.  Sehingga  isolasi akan  membuat  lebih  mudah  untuk  melihat  dan mengamati bentuk-bentuk pertumbuhan mikroba  dalam  beberapa  media  dan  dapat melihat  morfologi  mikroba,  yaitu  inokulasi yang merupakan (Lestari & Hartati, 2017).
Pewarnaan  gram  merupakan  pewarnaan yang  biasa  digunakan  dilaboratorium  untuk dapat  membedakan  bakteri  gram  negatif  dan gram  positif.  Pewarnaan  gram  pada  bakteri menggunakan  beberapa  bahan  yaitu  gentien violet, lugol, alkohol dan safranin. Bakteri gram positif  adalah  bakteri  yang  menyerap  warna primer (gentien violet) sedangkan bakteri gram negatif  akan  menyerap  warna  sekunder (safranin).
Safranin  merupakan  pewarna  yang digunakan  dalam  beberapa  pewarnaan  preparat salah  satunya  yaitu  pewarnaan  gram  pada bakteri  dan  memberikan  warna  merah  preparat khusunya  pada  bakteri  gram  negatif.  Pada bakteri  gram  negatif  bakteri  memiliki peptidoglikan  yang  tipis  dan  lapisan  lemak yang tebal pada dinding bakteri, sehingga pada saat berikatan dengan gentian violet ikatan yang terjadi  adalah  ikatan  yang  lemah,  ketika dilunturkan  dengan alkohol maka  lemak luntur dan  warna  gentien  violet  pun  luntur.  Karena tidak  terwarnai  maka  bakteri  akan  menyerap warna  safranin  yaitu  merah.  Penggunaan safranin  memiliki  beberapa  kelemahan  yaitu harganya  yang  mahal,  sulit  terserap  pada preparat tertentu, sulit dalam penyimpanan serta mudah rusak (Nurhidayat & Yusianti, S., 2022).
Taib dkk: Isolasi dan Identifikasi Mikroba pada ………
Gambar 2: Isolat bakteri
pengenceran tanah sampah
Gambar  3.  Isolat  bakteri pengenceran tanah + pupuk
Gambar  4.  Hasil  pewarnaan gram positif
Gambar  5.  Isolat  bakteri pengenceran tanah biasa Gambar  6.  Hasil  pewarnaan gram negatif Tabel 1. Identifikasi jenis bakteri pada 3 varian tanah Jenis tanah Bentuk bakteri Tepi Jenis bakteri Tanah biasa Coccus  Bergerigi Streptomyces sp. Tanah sampah Coccus  bergerigi dan berkarang Escherichia Tanah biasa + pupuk Coccus  Rata Streptococcus
Tanah  biasa  merupakan  tanah  yang terbentuk  dari  pelapukan  tumbuh-tumbuhan. Mengandung  banyak  unsur  hara  dan  mineral dan  sangat  subur.  Karakteristik  Tanah  biasa sangat  baik  untuk  melakukan  cocok  tanam karena  kandungannya  yang  sangat  subur  dan baik  untuk  tanaman.  Tanah  ini  memiliki  unsur hara  dan  mineral  yang  banyak  karena pelapukkan  tumbuhan  hingga  warnanya  agak kehitam-hitaman (Handayanto, et al. 2017).
Tanah  Pupuk  adalah  setiap  bahan  yang diberikan  ke  dalam  tanah  atau  disemprotkan pada tanaman dengan maksud menambah unsur hara  yang  diperlukan  oleh  tanaman  .  Sehingga tanah  pupuk  adalah  tanah  yang  mengandung unsur berguna bertujuan menambah persediaan nutrisi  vang  dibutuhkan  oleh  tanaman  untuk peninakatan  produksi  dan  mutu hasil tanaman (Yulipriyanto, 2010).
Pupuk NPK merupakan salah satu pupuk anorganik  yang  mengandung  lebih  dari  satu unsur  hara,  sehingga  pupuk  ini  disebut  juga pupuk  majemuk.  Pupuk  NPK  mengandung unsur hara, nitrogen, fospor, dan kalium. Pupuk ini  sangat  baik  untuk  mendukung  masa pertumbuhan tanaman. Selain itu keuntunganya adalah  unsur  hara  yang  disumbangkan  dapat memenuhi  kebutuhan  hara  tanaman  takaran
Jurnal Biologi Edukasi Edisi 31, Volume 15 Nomor 2, Desember 2023, hal 96-104
NPK yang terbaik 250 kg NPK ha-1 (45 gNPK petak-1) terbaik pertumbuhan dan hasil ( Wijaya A & Purnamawati, H, 2011 .).
Widiatmoko  (2006)  mengatakan  bahwa Tanah  sampah  adalah  tanah  yang  berasal  dari pembakaran  sampah.  Tanah  ini  terbentuk  dari hasil perombakan bahan organik oleh mikroba. Mengandung unsur hara yang dapat meningkatkan  pertumbuhan  tanaman.  Adapun unsur yang terkandung yaitu N, P, K, S dan lain sebagainya.
Hasil  identifikasi  jenis  mikroba  tanah secara  mikroskopis  dari  sampel  3  varian  tanah diperoleh hasil sebagai berikut.
a. Bakteri Genus Streptomyces
Genus Streptomyces memiliki karakteristik  koloni  berbentuk  bulat  kecil hingga  bulat  memanjang  dengan  tepian bergerigi,  koloni  berwarna  putih,  sel  bakteri berbentuk  coccus  dengan  gram  negative  yang bersifat anaerob fakultatif, mampu memfermentasikan  laktosa  dan  sukrosa,  tidak menghasilkan gas dan H2S dalam metabolismenya,  menggunakan  sitrat  sebagai sumber  karbon  dan  bersifat  motil.  Klasifikasi bakteri ini berdasarkan buku identifikasi bakteri Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology Seventh Edition (Robert S. Breed et  al,  1957)  adalah  Division  Actinobacteria, Classis  Actinocetes,  Ordo  Actinomycetales,
Familia Streptomycetaceae,
Genus Streptomyces.
Beberapa  penelitian  telah  menemukan bakteri Streptomyces,  seperti  Ateng Supriyatna (2012)  menemukan  bakteri  Streptomyces  pada sampah  sayuran  dan  buahan.  Menurut Puryatiningsih  (2009)  menjelaskan  bahwa bakteri  ini  umumnya  memproduksi  antibiotik yang dipakai manusia dalam bidang kedokteran dan pertanian. Temperature optimum tumbuhnya bakteri ini berkisar antara 25-35 ℃ . Beberapa  spesies  tumbuh  pada  temperature rentang  psikrofilik  dan  termofilik.  Melimpah pada  habitat  tanah  dan  kompos.  Beberapa spesies  bersifat  patogen.  Streptomyces  yang diisolasi  sebagian  besar  memiliki  kemampuan dalam  mendegradasiselulosa  dan  melarutkan posfat.  Genus  ini  paling  efisien  dalam mendegredasikan  selulosa  dan  melarutkan posfat  karena  kecepatan  pertumbuhannya  dan aktifitas  yang  tinggi  dibandingkan  genus  lain (Nurkanto, 2007).
Manfaat
Streptomycetes
bagi
pertumbuhan  bawang  merah  sebagai  metabolit
yang meningkatkan kebugaran dan pertumbuhan  tanaman  bawang  merah,  serta mengurangi  gejala  penyakit  yang  disebabkan oleh  patogen  tanaman  atau  berbagai  tekanan lingkungan (Shimizu.M, 2011).

## b. Bakteri Genus Eschericia
Bakteri  genus  Escherechia  memiliki koloni  berbentuk  coccus  dan  basil  dengan tepian bergerigi dan berkarang, berwarna  putih hingga  putih  kekuningan,  sel  bakteri  bersifat gram  negative,  tidak  menghasilkan  gas  dalam metabolismenya,  tidak  menggunakan  sitrat sebagai  sumber  karbon  dan  bersifat  motil. Klasifikasi  bakteri  ini  berdasarkan  buku identifikasi  bakteri  Bergey’s  Manual  of Determinative  Bacteriology  Seventh  Edition (Robert  S.  Breed  et  al,  1957)  adalah  Division Proteobacteria,  Classis,  Gammaproteria,  Ordo Enterobacteriales,  Familia  Entero  bacteriaceae, Genus Escherichia.
Penelitian yang dilakukan oleh Mohamad Abdul  Khamid  et  al.  (2012)  telah  menemukan genus  Escherichia  pada  lindi  sampah  dapur didusun  sukunan  Yogyakarta,  Ia  juga menjelaskan  bahwa  genus  Escherichia  ini berbentuk  batang  dan  bulat,  bakteri  gram negative dan bersifat motil dan terdapat banyak pada jenis sampah dan makanan.
Escherichia  merupakan  mikroorganisme yang dapat meningkatkan pertumbuhan tanaman bawang merah. mampu meningkatkan hasil  rerata  tertinggi  pada  tinggi  tanaman. Dikarenakan  hifa  ini  mampu  membantu penyerapan  unsur  hara  tanah  terutama  unsur fosfor menjadi lebih besar dibandingkan dengan tanaman  tidak  bermikoriza  (Méric  G  et  al, 2013)

## c. Bakteri Genus Streptococcus
Streptococcus  memiliki  karakteristik koloni  berbentuk  bulat  dengan  tepian  rata  dan warna  koloni  putih  sampai  putih  kekuningan, sel  bakteri  berbentuk  coccus  dengan  gram positif, mampu memfermentasikan sukrosa dan laktosa,  menghasilkan  gas  pada  umumnya dalam  proses  metabolismenya,  menggunakan sitrat sebagai sumber karbon dan bersifat motil. Klasifikasi  bakteri  Streptococcus  berdasarkan buku  identifikasi  bakteri  Bergey’s  Manual  of Determinative  Bacteriology  Seventh  Edition (Robert  S.  Breed  et  al,  1957)  adalah  Division Firmicutes, Classis Bacili, Ordo Lactobacialles, Familia  Streptococcaceae, Genus  Streptococus. Bakteri Genus
Streptococcus menurut
Taib dkk: Isolasi dan Identifikasi Mikroba pada ………
Wijayanti  (2008)  merupakan  sel  yang berbentuk  bulat,  tersusun  berpasangan  atau dalam  bentuk  rantai.  Bakteri  Streptococcus adalah  bakteri  dengan  golongan  gram  positif yang  heterogen,  semua  spesiesnya  bersifat nonmotil,  non  spora  dan  fakultatif  anaerob. Tidak dapat mereduksi nitrat, dapat memfermentasikan  glukosa  dengan  produk utama  adalah  asam  laktat,  dan  dapat mendegredasi selulosa pada limbah pertanian.
Pembentukan  zona  hambat  terhadap pertumbuhan  bakteri  Streptococcus  dapat menghambat  pertumbuhan  dari  bawang  merah jika  terlalu  banyak  terdapat  jenis  bakteri streptococcus  kelompok  konsentrasi  tinggi dalam berpengaruh pada ekstrak bawang merah ( Allium  cepa L)  dalam  pembentukanzona hambat pertumbuhan (Defni Roza, et al., 2017).
Berdasarkan  hasil  yang  diperoleh  ketiga jenis  tanah  bekas  pertumbuhan  bawang  merah ( Allium  cepa L)  menunjukkan  adanya  mikroba tanah yang menguntungkan seperti
Streptomyces dan Escherichia ,  dan  mikroba yang  merugikan  bagi  pertumbuhan  bawang merah ( Allium cepa L) seperti Streptococcus.

## Simpulan dan Saran

## Simpulan
Isolasi  mikroba  adalah  memisahkan mikroba dari lingkungannya dan menumbuhkannya sebagai biakan murni dalam medium  buatan.  Isolasi  berguna  untuk  dapat mengindentifikasi  mikroba  pada  ketiga  jenis tanah  bekas  pertumbuhan  bawang  merah ( Allium  cepa L)  dengan  menggunakan pewarnaan  gram  agar  dapat  menunjukkan adanya  mikroba  yang  berada  didalam  tanah tersebut.  Jenis  mikroorganisme  yang  terdapat pada  tanah  biasa Streptomyces .  Pada  tanah sampah terdapat microba Escherichia sedangkan  tanah  bekas  pertumbuhan  bawanag merah yang dicampur pupuk ditemukan bakteri Streptococcus .

## Saran
Penelitian  selanjutnya  diharapkan  untuk dapat memfokuskan pada pengaruh mikroorganisme  tanah  terhadap  pertumbuhan bawang merah.

## Daftar Pustaka
Agus,  F.  &  Subiksa,  I.  G.  M.  (2008). Lahan gambut:  potensi  untuk  pertanian  dan aspek  lingkungan .  Balai  Penelitian
Tanah dan World Agroforestry Centre (ICRAF). Bogor: Indonesia.
Breed,  R  S,  Murray,  E.G.D.  &  Smith,  N.R (1957). Bergey's manual of determinative bacteriology
7 t.h Edaltimore, Wiliams & Wilkins Co. Campbell,  N.A.  (2003). Biologi  Edisi  Kelima Jilid II . Jakarta: Erlangga.
Handayanto,  E.,  Nurul,  M,  &  Amrullah  F.
(2017). Pengelolaan kesuburan tanah. Malang: Universitas Brawijaya Press.
Harahap,  D.  G.  S.,  Ariyani,  N,  Rudy,  H.,  Nur, A. Y., & Endik, D., N. (2021). Dasar- dasar
Mikrobiologi dan
Penerapannya. Bandung:  Widina Bhakti Persada Bandung. Irianto,  K.  (2006). Mikrobiologi:  Menguak Dunia  Mikroorganisme  Jilid  1, Bandung: Yrama Widya. Jufri, R. F. (2020). Microbial Isolation. Journal
La Lifesci , 1 (1), 18-23. https://doi.org/10.37899/journallalifes ci.v1i1.33.
Khamid,  M.  A.,  Surahma,  A.  M.    (2013). Identifikasi  bakteri  aerob  pada  lindi hasil sampah dapur di Dusun Sukunan Yogyakarta. Jurnal Kesehatan Masyarakat. 6(1) http://dx.doi.org/10.12928/kesmas.v6i 1.1066 Lestari,  P.  B.  &  Hartati,  T.  W.  (2017). Mikrobiologi Berbasis Inkuiry . Malang: Gunung Samudera.
Maliq,  E.,  R.  Salamiah,  S.,  &  Yusriadi,  M. (2020).  Eksplorasi  dan  identifikasi mikroba  rhizosfer  bawang  merah (Allium ascalonicum L) yang diaplikasikan pestisida nabati di lahan gambut  Landasan  Ulin  Kalimantan Selatan, Jurnal  Agroekotek.  3 (2),  15- 27.
doi: https://doi.org/10.20527/agtview.v3i2.
2171
Méric, G., Kemsley, E. K., Falush, D., Saggers, E.  J.,  &  Lucchini,  S.  (2013). Phylogenetic  distribution  of  traits associated  with  plant  colonization  in Escherichia coli. Environmental microbiology , 15 (2), 487 – 501. https://doi.org/10.1111/j.1462- 2920.2012.02852.x
Mukhlis,  Purwaningsih,  &  Anggorowati,  D. (2012).    Pengaruh  berbagai  jenis mikroorganisme  lokal  (mol)  terhadap pertumbuhan dan hasil bawang merah
Jurnal Biologi Edukasi Edisi 31, Volume 15 Nomor 2, Desember 2023, hal 96-104
pada  tanah  aluvial. Jurnal  Sains Pertanian Equator, 1 (1). https://jurnal.untan.ac.id/index.php/jsp p/article/view/1183
Napitupulu,  D.  &  Loso,  W.  (2009).  Pengaruh Pemberian Pupuk N Dan K Terhadap Pertumbuhan  Dan  Produksi  Bawang
Merah.  Balai  Pengkajian  Teknologi Pertanian  Sumatera  Utara .  J-Hort.  20 (1), 22-35 . https://dx.doi.org/10.21082/jhort.v20n 1.2010.p%25p
Ningsih, P.A, Shintia, H, Putri, O., & Tesya W. (2023).  Identifikasi  mikroba  udara isolate pink di laboratorium mikrobiologi. Prosiding  SEMNAS UIN  Raden  Fatah  Palembang. https://doi.org/10.24036/prosemnasbi o/vol3/595
Nizar,  M.  (2011).  Pengaruh  beberapa  jenis bahan  organik  terhadap  pertumbuhan dan  hasil  padi  dengan  metode  SRI. Diakses dari
(http://faperta.unand.ac.id/solum/v081 -03-p19-26.pdf).
Nurhidayat,  &  Yusianti,  S.  (2022).  Pengaruh penambahan  oksidator  pada  air rendaman  angkak  dan  daun  jati terhadap  hasil  modifikasi  pewarnaan gram. Jurnal  Analisis  Kesehatan 11(2),85-91. Nurkanto A., (2007). Identifikasi Actinomycetes  tanah  hutan  pasca kebakaran bukit bangkirai Kalimantan Timur dan potensinya sebagai pendegradasi  sellulosa  dan  pelarut fostat. Jurnal Biodiversitas , 8(4): 314- 319.
Pelczar, M. J., & Chan, E. C. S., (2005). Dasar- dasar mikrobiologi . Jakarta:
Universitas Indonesia Press.
Puryantiningsih.  (2009).  Isolasi  streptomyces dari  rhizofer  familia  poacee  yang berpotensi  menghasilkan  antibiotik terhadap  Escherichia  coli.  (Skripsi, tidak  dipublikasikan).  Universitas Muhammadiyah. Surakarta. Rao,  S.  (1994). Mikroorganisme  tanah  dan pertumbuhan tanaman. Ed II. Jakarta: Universitas Indonesia
Roza,  D.,  Kornialia,  K.  Edrizal,  E.  (2017).  Uji aktivitas  antibakteri  ekstrak  etanol bawang  merah  ( Allium  cepa L.) terhadap  zona  hambat  pertumbuhan
streptococcus viridians. Jurnal Kedokteran Gigi Universitas Baiturrahman . 4 (2), 83-95. Shimizu,  M.  (2011). Chapter  11:  Endofitic actinomycet:  Biocontrol  agent  and growth promoter. bacteria in agrobiology:  plant  growth  responses . Springer-Verlag: Berlin Heidelberg. Sudaryono.  (2000).  Tingkat  pencemaran  air permukaan  di  kodya  Yogyakarta.. Jurnal  Teknologi  Lingkungan.    1  (3), 247-252. https://doi.org/10.29122/jtl.v1i3.187 Sumarni,  N.,  Rosliani,  R.,  Basuki,  R.  S.,& Hilman  Y.  (2012).  Pengaruh  varietas tanah, status K-tanah dan dosis pupuk kalium  terhadap  pertumbuhan  hasil umbi,  dan  serapan  hara  K  tanaman bawang  merah. J-Hort  22  (3)  :  233- 241.
Supriyatna, A., Ida, R. Yani, S., & Sumiyati, S. (2012).  Isolation  and identification  of cellulolytic  bacteria  from  waste organik  vegetables  and  fruits  for  role in  making  materials  biogas. Jurnal ISTEK 6(1-2)10-20. Susanto, R. (2002). Penerapan  pertanian organik . Kanisius. Yogyakarta.
Widiatmoko,  G.,  (2006).  Pengaruh  pemberian dosis pupuk kompos sampah kota dan konsentrasi richodermakoning II terhadap  pertembuhan  dan  hasil tanaman nilam. Jurnal Departemen of Agronomy Universitas Muhammadyah Malang. http:/student- research.umm.ac.id
Wijaya A & Purnamawati, H. (2011). Pengaruh pemupukan  dan  pemberian  kapur terhadap  pertumbuhan  dan  daya  hasil kacang  tanah  (Arachis  hypogaea,  L.) http://repository.ipb.ac.id/handle/1234 56789/48092
Wijayanti, W. A. (2008). Pengelolaan tanaman tebu  (saccharum  officinarum  l.)  di pabrik  gula tjoekir  PTPN X  Jombang
Jawa
Timur. (Skripsi, tidak dipublikasikan).  Institut  Pertanian Bogor. Bogor.
Yulipriyanto,  H.  (2010). Biologi  tanah  dan strategi  pengelolaannya .  Yogyakarta: Graha Ilmu .