## PengabdianMu: Jurnal Ilmiah Pengabdian kepada Masyarakat
Volume 9, Issue 4, Pages 682-687 April  2024
How  to  cite: Sasmita,  R.,  Hidayaturrahmah.,  Badruzsaufari.,  Firnanda,  M,  R.,  &  Fitri,  M.  (2024).  Introduksi  Teknologi  DNA Barcoding kepada Staf UPTD Perikanan Budidaya Air Payau dan Laut Karang Intan. PengabdianMu: Jurnal Ilmiah Pengabdian kepada Masyarakat , 9 (4), 682-687. https://doi.org/10.33084/pengabdianmu.v9i4.7056

## PENDAHULUAN
UPTD  Perikanan  Budidaya  Air  Payau  dan  Laut  Karang  Intan  merupakan  salah  satu  unit  kerja  di  bawah  Provinsi Kalimantan Selatan yang bergerak di bidang budidaya perikanan air payau dan laut, seperti jenis ikan Nila salin dan udang. Selain menjadi tempat budidaya komoditas air payau dan laut, unit kerja ini juga melakukan pembenihan untuk

## Introduksi Teknologi DNA Barcoding kepada Staf UPTD Perikanan Budidaya Air Payau dan Laut Karang Intan

## Introduction of DNA Barcoding Technology to UPTD Staff of Brackish and Marine
Aquaculture Karang Intan
Rani Sasmita *
Hidayaturrahmah
Badruzsaufari Muhammad Riyan Firnanda Muhammad Fitri
Department  of  Biology,  Faculty  of Mathematics  and  Natural  Science, Universitas  Lambung  Mangkurat, South Kalimantan, Indonesia
email: ranisasmita@ulm.ac.id

## Kata Kunci
DNA Barcoding Ikan
Keywords : DNA
Barcoding
Fish
Received :  December 2023 Accepted :  January 2024 Published : April 2024

## Abstrak
Mitra  dalam  kegiatan  pengabdian  kepada  masyarakat  adalah  UPTD Perikanan Budidaya Air Payau dan Laut Karang Intan, salah satu balai di bawah  Provinsi  Kalimantan  Selatan  yang  khusus  bergerak  di  bidang pembenihan  ikan  lokal  seperti  haruan  (Channa  striata),  mas  (Cyprinus carpio), dan papuyu (Anabas testudineus).  Permasalahan di tempat mitra adalah  budidaya  ikan  yang  masih  mengandalkan  bibit  dari  alam,  yang menimbulkan  beberapa  permasalahan  seperti  pertumbuhan  benih  yang lambat,  penurunan  kualitas  produksi,  serangan  penyakit  dan  kelainan keturunan  yang  semakin  tinggi  akibat  kawin  sekerabat.    Atas  dasar tersebut,  tim  pengabdian  berkolaborasi  dengan  UPTD  Perikanan Budidaya  Air  Payau  dan  Laut  Karang  Intan  guna  meningkatkan  mutu genetik benih ikan melalui teknik DNA barcoding khususnya pada tahap pemijahan.  Kegiatan  introduksi  teknologi  DNA  barcoding  dilakukan dengan  cara  (1)  penyuluhan  klasikal  dan  diskusi  kelompok,  2)  pelatihan dan  pendampingan  meliputi  aspek  teknis  DNA  barcoding  (isolasi  DNA ikan,  amplifikasi  DNA,  visualisasi  produk  PCR  dengan  elektroforesis, hingga  tahap  sekuensing).    Berdasarkan  hasil  evaluasi,  100%  peserta sangat  antusias  dan  menyadari  akan  pentingnya  teknik  DNA  barcoding dalam  upaya  menghasilkan  indukan  dan  benih  ikan  unggul,  khususnya untuk komoditas budidaya ikan haruan, mas, dan papuyu

## Abstract
Partners  in  community  service  activity  are  UPTD  Brackish  and  Marine Aquaculture, Karang Intan, one of the centers under South Kalimantan Province that  specializes in  the hatchery  of  local  fish  such  as snakehead (Channa  striata), common  carp  (Cyprinus  carpio),  and  climbing  perch  (Anabas  testudineus).  The problem in the partner is fish farming that still relies on seeds from nature, which causes several problems, such as slow seed growth, decreased production quality, disease  attacks  and  hereditary  abnormalities  that  are  getting  higher  due  to interbreeding. Based on these problems, the team collaborated with the UPTD for Brackish and Marine Aquaculture, Karang Intan, to improve the genetic quality of  fish  by  introducing  DNA  barcoding  techniques,  especially  at  the  spawning stage. The introduction of DNA barcoding technology is carried out through (1) classical  counseling  and  group  discussions,  2)  training  and  assistance  covering technical  aspects  of  DNA  barcoding  (fish  DNA  isolation,  DNA  amplification, visualization of PCR products with electrophoresis, to the sequencing). Based on the  evaluation,  100%  of  the  participants  were  enthusiastic  and  realized  the importance of DNA barcoding techniques to produce superior broodstock and fish fry, especially for snakehead, common carp, and climbing perch commodities.
©  2024  Rani  Sasmita,  Hidayaturrahmah,  Badruzsaufari,  Muhammad  Riyan  Firnanda,  Muhammad  Fitri. Published by Institute for Research and Community Services Universitas Muhammadiyah Palangkaraya . This is Open  Access  article  under  the  CC-BY-SA  License  ( http://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ).  DOI: https://doi.org/10.33084/pengabdianmu.v9i4.7056
ikan air tawar khas Kalimantan Selatan, seperti ikan gabus (haruan), ikan betok (papuyu) dan ikan mas. Budidaya ketiga jenis komoditas perikanan air tawar ini tetap dilakukan, mengingat tingginya permintaan benih ikan tersebut oleh masyarakat.  Kelimpahan benih ikan yang menjadi tuntutan pasar, mengharuskan UPTD Perikanan Budidaya Air Payau  dan  Laut  Karang  Intan  melakukan  langkah  antisipasi  seperti  menyeleksi  indukan  ikan  yang  unggul  bebas penyakit dan mampu bereproduksi buatan 6 kali dalam setahun.  Proses seleksi induk yang unggul sangat penting demi keberlangsungan pasokan benih ikan di Kalimantan Selatan pada khususnya.
Indukan ikan yang unggul untuk pembenihan dapat dilakuan screening garis keturunannya dengan memanfaatkan teknologi biologi molekuler yaitu DNA barcoding (Harada et al., 2015; Hofmann et al., 2017; Suryaningtyas, 2017; Victor et al., 2009).  Metode ini selain mampu memastikan induk ikan adalah unggul, juga dapat mengidentifikasi ikan sampai tingkat spesies, sehingga induk ikan tersebut dapat dipastikan berasal dari daerah Karang Intan, bukan introduksi dari wilayah lain.  Aplikasi dari teknik pemijahan dengan pendekatan molekuler ini, belum dikuasai oleh staf di UPTD Perikanan Budidaya Air Payau dan Laut Karang Intan.  Sehingga peningkatan produksi benih ikan di UPTD Perikanan Budidaya Air Payau dan Laut Karang Intan yang tidak di sertai dengan peningkatan kualitas benihnya (benih unggul) akan  menimbulkan  beberapa  permasalahan  seperti  1)  pertumbuhan  benih  yang    lambat,  2)  penurunan  kualitas produksi, 3) serangan penyakit dan kelainan keturunan yang semakin tinggi akibat kawin sekerabat, 4) penurunan daya beli benih dan tingkat kepercayaan konsumen, 5) konsumen akan beralih ke breeder lain, yang memiliki kualitas benih lebih unggul.
Ketepatan  identifikasi  spesies  merupakan  masalah  utama  dalam  budidaya    ikan  (Rahayu et  al., 2019),  baik  ikan introduksi  maupun  endemik.  Status  taksonomi  ikan  merupakan  tahap  awal  budidaya  ikan.  Saat  ini,  semakin berkembangnya teknologi di bidang biologi molekuler menjadikan terobosan baru identifikasi spesies menggunakan marka  genetik.    Saleky et  al, (2021)  melaporkan  penggunaan  gen  COI  untuk  mendukung  perikanan  berkelanjutan khusunya untuk komoditas ikan Nila ( O. niloticus ) dan Mujaer ( O. mossambicus ) di Merauke, Papua.  Lebih lanjut Hebert et al, ( 2003), menjelaskan bahwa gen cytochrome oxydase oxidase sub unit I (COI) merupakan barcode genetik untuk semua makhluk hidup yang belum diketahui jenisnya. Peran DNA barcoding dalam studi taksonomi ikan dapat diaplikasikan pada semua tingkatan stadia dari telur hingga dewasa pada ikan budidaya. Sayangnya teknologi DNA barcoding ini belum pernah diadopsi di UPTD Perikanan Budidaya Air Payau dan Laut Karang Intan.  Oleh karena itu, pada rencana kegiatan PKM ini, tim pengusul akan melakukan bimbingan praktis mengenai “Introduksi Teknik DNA Barcoding untuk Pemijahan Ikan bagi Staf UPTD Perikanan Budidaya Air Payau dan Laut Karang Intan”.

## METODE
Metode  kegiatan  pengabdian  yang  telah  dilakukan  yaitu  pemberian  kuliah  singkat,  pemutaran  video  tutorial, demonstrasi dan praktik teknik DNA barcoding .   Rincian dari tahap-tahap kegiatan pengabdiaan dijabarkan dalam penjelasan di bawah ini:
1. Tahap Persiapan
Pada tahap persiapan, tim pengabdian melakukan koordinasi dengan Kepala dan Staf UPTD Perikanan Budidaya Air Payau dan Laut Karang Intan perihal waktu, tempat, dan persiapan pelaksanaan pelatihan.  Sesuai kesepakatan dengan pihak mitra, maka pelatihan dilaksanakan pada hari Selasa tanggal 27 September 2022.  Langkah selanjutnya adalah  mengurus  perizinan  pelaksanaan  kegiatan.    Tim  pengabdian  juga  mempersiapkan  alat  dan  bahan  yang diperlukan saat kegiatan, bahan materi berupa power point dan rekaman video yang berisi teori dan prosedur DNA barcoding untuk pemijahan ikan.
2. Tahap Pelaksanaan
Tahap kedua dari kegiatan pengabdian adalah pelaksanaan, dengan serangkaian kegiatan meliputi:
a. Kuliah singkat tentang teknik DNA barcoding untuk pemijahan ikan
b. Pemutaran  video  tutorial  teknik  isolasi  dan  amplifikasi  DNA  ikan,  hingga  tahap  visualisasi  dengan elektroforesis.
c. Praktik langsung amplifikasi DNA ikan dengan metode Polymerase Chain Reaction (PCR) dan elektroforesis.
3. Tahap Evaluasi Evaluasi kegiatan dilakukan dengan pengisian kuesioner post pelaksanaan.

## HASIL DAN PEMBAHASAN
Kegiatan pelatihan ”Introduksi DNA Barcoding untuk Pemijahan Ikan bagi Staf UPTD Perikanan Budidaya Air Payau dan  Laut  Karang  Intan”  telah  dilaksanakan  selama  satu  hari,  yaitu  pada  hari  Selasa  tanggal  27  September  2022 bertempat di Laboratorium Genetika dan Biologi Molekuler FMIPA Universitas Lambung Mangkurat (ULM).  Peserta yang mengikuti kegiatan pengabdian berjumlah 10 orang dari Staf UPTD Perikanan Budidaya Air Payau dan Laut Karang Intan.  Dokumentasi sebelum pelaksanaan, ditampilkan pada Gambar 1.
Gambar 1. Dokumentasi peserta dan tim pengabdian di Laboratorium Genetika dan Biologi Molekuler FMIPA Universitas Lambung Mangkurat.
Kegiatan  mulai  dengan  registrasi  peserta  pada  pukul  08.00-08.30  WITA.  Kemudian  dilanjutkan  dengan sambutan  dari  ketua  pelaksana,  yaitu  Ibu  Hidayaturrahmah,  S.Si.,  M.Si.    Penyampaian  materi  “Teknik DNA  barcoding  untuk  Pemijahan  Ikan”  dibawakan  oleh  Dr.  Ir.  Badruzsaufari,  M.Sc.,  dan  diteruskan dengan  sesi  diskusi  selama  15  menit.    Acara  disambung  dengan  pemutaran  video  tutorial  yang  telah disiapkan  panitia,  mengenai  teknik  isolasi  DNA  ikan,  amplifikasi  DNA/PCR,  hingga  visualisasi  produk PCR.    Selama  2  jam  kemudian,  peserta  melakukan  praktik  atau  hands  on  teknik  amplifikasi  DNA  ikan dengan PCR, yang dibimbing oleh Ibu Rani Sasmita, S.Si., M.P., M.Sc., Muhammad Riyan Firnanda, dan Muhammad  Fitri.    Selesai  waktu  ishoma,  kegiatan  pelaksanaan  pengabdian  diisi  dengan  praktik  teknik elektroforesis produk PCR yang sebelumnya telah dikerjakan oleh peserta.  Sesi ini juga dipandu langsung oleh  tim  pengabdian  di  laboratorium.  Sesi  pelatihan  ditutup  dengan  pengisian  kuesioner  sebagai  tahap evaluasi  rangkaian  kegiatan  pengabdian  yang  telah  berjalan.    Rangkaian  dokumentasi  pelaksanaan pengabdian  ditampilkan  pada  Gambar  2.  Kegiatan  evaluasi  terhadap  pelaksanaan  pelatihan  dilakukan
secara  langsung  dengan  membagikan  kuesioner  kepada  mitra/peserta  pengabdian.    Sebanyak  10  orang peserta telah mengisi kuesioner kepuasan mitra pengabdian, yang hasilnya ditampilkan pada Tabel 1.
Gambar 2. Pelaksanaan pengabdian. Keterangan: 1 = Registrasi peserta; 2 = Pembukaan ketua pengabdian; 3 = Pemaparan materi; 4 = Pemutaran video tutorial; 5 dan 6 = Penjelasan materi praktik amplifikasi DNA ikan.
Gambar 3. Hasil running produk PCR dengan teknik elektroforesis yang dikerjakan peserta pelatihan.
Tabel I. Respon peserta sebelum dan sesudah kegiatan pengabdian.
Teknik DNA Barcoding Sebelum Sesudah Y a Ragu Tida k Ya Ragu Tidak Pengetahuan metode DNA barcoding 0 0 100 10 0 0 0 Pengetahuan teknik isolasi DNA ikan 0 0 100 10 0 0 0 Pengetahuan teknik amplifikasi DNA ikan 0 0 100 10 0 0 0 Pengetahuan teknik elektroforesis 0 0 100 10 0 0 0 Pengetahuan teknik sequencing DNA 0 0 100 10 0 0 0
Berdasarkan  hasil  pelatihan,  semua  peserta  sangat  antusias  untuk  mengikuti  jalannya  acara  sampai  selesai. Pengetahuan teknik DNA barcoding dari tahap isolasi DNA hingga sekuensing dapat peserta kuasi setelah pelatihan. Peserta  menyatakan  dalam  kuesioner,  jika  sangat  puas  dengan  metode  dan  cara  penyampaian  narasumber,  dan mendapati  jika  kegiatan  pelatihan  sangat  bermanfaat.  Semua  peserta  menyadari  akan  pentingnya  teknik  DNA barcoding dalam upaya menghasilkan indukan ikan unggul, baik untuk komoditas budidaya ikan haruan, mas, dan papuyu yang diproduksi oleh UPTD Perikanan Budidaya Air Payau dan Laut Karang Intan.  Berdasarkan laporan dari Victor et al. (2009), teknik DNA barcoding sangat aplikatif di bidang perikanan, terutama dalam mengidentifikasi larva dan juvenil dari ikan jenis snapper yaitu Lutjanus cyanopterus.  Diketahui  pula bahwa DNA barcoding adalah metode yang dapat diandalkan untuk mengidentifikasi telur ikan secara akurat, khususnya pada ikan jenis S. scombrus, T. trachurus,  dan M. merluccius (Hofmann et al., 2017).  Riset yang dilakukan oleh Panprommin et al. (2021), menunjukkan pentingnya teknik DNA barcoding untuk mengidentifikasi tempat pemijahan bagi larva ikan di Sungai Ing, Thailand.

## KESIMPULAN
Berdasarkan  hasil  pelaksanakan  pengabdian,  yaitu  introduksi  teknik  DNA barcoding bagi  Staf  UPTD  Perikanan Budidaya Air Payau dan Laut Karang Intan, telah terjadi peningkatan pengetahuan dan keterampilan semua peserta mengenai tahapan identifikasi ikan menggunakan pendekatan molekuler.

## UCAPAN TERIMA KASIH
Tim pelaksana pengabdian menyampaikan terima kasih kepada Kepala dan Staf UPTD Perikanan Budidaya Air Payau dan Laut Karang Intan yang bersedia menjadi mitra di kegiatan pengabdian.  Tim pengabdian juga mengucapkan terima  kasih  kepada  Universitas  Lambung  Mangkurat  melalui  Lembaga  Penelitian  dan  Pengabdian  Masyarakat dengan Program Dosen Wajib Mengabdi (PDWA) Tahun 2022, karena telah memberikan sumber pendanaan kegiatan pengabdian ini.

## REFERENSI
Hebert,  P.  D.,  Ratnasingham,  S.,  &  deWaard,  J.  R.  2003.  Barcoding  Animal  Life:  Cytochrome  c  Oxidase  Subunit  1 Divergences  among  Closely  Related  Species.  Proceedings  Biological  Sciences,  270(1):S96 – S99. https://doi.org/10.1098/rsbl.2003.0025 .
Harada,  A.  E.,  Lindgren,  E.  A.,  Hermsmeier,  M.  C.,  Rogowski,  P.  A.,  Terrill,  E.,  Burton,  R.  S.,  &  Bernardi,  G.  2015. Monitoring Spawning Activity in a Southern California Marine Protected Area using Molecular Identification of Fish Eggs. PLoS ONE, 10(8):1 – 21. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0134647 .
Hofmann,  T.,  Knebelsberger,  T.,  Kloppmann,  M.,  Ulleweit,  J.,  &  Raupach,  M.  J.  2017.  Egg  Identification  of  Three Economical Important Fish Species using DNA Barcoding in Comparison to a Morphological Determination. Journal of Applied Ichthyology, 33(5):925 – 932. https://doi.org/10.1111/jai.13389 .
Panprommin,  D.,  Soontornprasit,  K.,  Tuncharoen,  S.,  &  Iamchuen,  N.  2021.  Efficacy  of  DNA  Barcoding  for  the Identification  of  Larval  Fish  Species  in  the  Upper  and  Middle  Ing  River,  Thailand.  Gene  Reports,  23(12): 101057. https://doi.org/10.1016/j.genrep.2021.101057 .
Rahayu, D, Q., Nugroho, E, D., & Listyorini, D. (2019). DNA Barcoding Ikan Introduksi Khas Telaga Sari, Kabupaten
Pasuruan. Biotropika Journal of Tropical Biology 7 (2):51-62 .
http://dx.doi.org/10.21776/ub.biotropika.2019.007.02.2
Saleky,  D., Sianturi,  R.,  Dailami,  M.,  &  Kusuma,  A. B. 2021.  Kajian  Molekuler  Ikan  Oreochromis  spp.  dari  Perairan Daratan Merauke-Papua, Berdasarkan DNA Mitokondria Fragmen Gen Sitokrom Oksidase Subunit I. Jurnal Perikanan Universitas Gadjah Mada, 23(1):37. https://doi.org/10.22146/jfs.61026 .
Suryaningtyas,  T.  I.  2017.  Aplikasi  Bioteknologi  Molekuler  dalam  Budidaya  Perairan.  Oseana,  42(4):13 – 24. https://doi.org/10.14203/oseana.2017.Vol.42No.4.70 .
Victor, B. C., Hanner, R., Shivji, M., Hyde, J., & Caldow, C. 2009. Identification of the Larval and Juvenile Stages of the Cubera  Snapper,  Lutjanus  cyanoptems,  using  DNA  Barcoding.  Zootaxa,  36(2215):24 – 36. https://doi.org/10.11646/zootaxa.2215.1.2 .