http://journal.ipb.ac.id/index.php/jurnalikt
e-ISSN       : 2620-309X
STRUKTUR GENETIK POPULASI IKAN CAKALANG, Katsuwonus pelamis (Linneaus, 1758) DI PERAIRAN LAUT MALUKU UTARA, INDONESIA
GENETIC STRUCTURE POPULATIONS SKIPJACK, Katsuwonus pelamis (Linneaus, 1758 ) IN NORTH MALUKU SEA, INDONESIA
Nebuchadnezzar Akbar 1* & Rusmawati Labenua 2
1 Ilmu Kelautan, FPIK, Universitas Khairun, Ternate, 97719, Indonesia
2 Manajemen Sumberdaya Perairan, FPIK, Universitas Khairun, Ternate, 97719, Indonesia *E-mail: nezzarnebuchad@yahoo.co.id

## ABSTRACT
Genetic is key substantial approach conservation, managament and sustainability.  This study aims to genetic  structure  populations  Skipjack  tuna  in  North  Maluku  Sea.  Samples  collection  in  Morotai Island  (n=10),  Central  Halmahera  District,  Weda  (n=10)  dan  South  Halmahera  District,  Bacan, (n=10) and secondary data (n=4) in March-May 2018. Molecular analysis through stages extraction, PCR, electrophoresis and sequencing DNA. DNA sequences analysis used MEGA 5 (Genetic distance and  phylogenetic)  and  arlequin  (Fixation  index).  The  result  found  that  fragment  length  546  (base pairs)  in  control  mitocondrial  DNA.  Genetic  distance  analysis  Skipjact  tuna  population  based  on primary (North Maluku) and secondary data  (Sulu-Celebes and South China Sea, Bali, Indian coast, Kyushu  Island  Japan)  show  close  genetic  0.037-0.056.  Fixation  indices  (Fst)  analysis  value  0.801- 0.936  the  show  that  weak  genetic  differentiation  between  populations.  High  genetic  flow  between populations  based  on  genetic  distance  and  Fst.  The  result  show  that  genetic  distance  and  Fst  show that genetic structure populations Skipjack tuna in North Maluku Sea undistrubed. The Skipjack tuna data obtained can uses data base to preserve and sustainability fish resource.
Keywords : conservation, genetic, North Maluku, skipjack

## ABSTRAK
Genetik merupakan suatu pendekatan untuk pemanfaatan, pengelolaan dan keberlanjutan yang bersifat konservasi. Tujuan  penelitian  adalah  struktur  populasi  genetik  ikan  cakalang  di  perairan  laut  Maluku Utara.  Koleksi  sampel  dilakukan  pada  Pulau  Morotai  (n=10),  Weda,  Kabupaten  Halmahera  Tengah (n=10), Bacan, Kabupaten Halmahera Selatan (n=10) dan data sekunder (n=4), pada Maret hingga Mei 2018.  Analisis  molekuler  melalui  tahapan  ektraksi,  PCR,  elektroforesis  dan  pengurutan  DNA (sekuensing  DNA). Sekuen  DNA  kemudian  dianalisis  menggunakan  MEGA  5  (jarak  genetik  dan filogenetik)  serta Arlequin 3.5  (fiksasi  indeks).  Hasil  penelitian  menemukan  panjang  fragmen  DNA 546 ( base pairse ) di daerah lokus control region DNA Mitokondria (mtDNA). Analisis jarak genetik populasi  berdasarkan  data  primer  (Maluku  Utara)  dan  sekunder  (Sulu-Celebes  dan South  China Sea , Bali, Indian  coast,  Kyushu  Island  Japan )  dengan  nilai  0,037-0,056.  Analisis  fiksasi  indeks  ( Fst ) diperoleh  nilai  0,801-0,936  yang  menunjukkan  bahwa  tidak  terdapat  diferensiasi  genetik  antar populasi.  Aliran  genetik  yang  besar  antar  populasi  berdasarkan  hasil  analisis  jarak  genetik  dan  Fst. Hasil analisis  menunjukkan bahwa struktur genetik populasi ikan cakalang di perairan Maluku belum terganggu.  Data  genetik  ikan  cakalang  yang  diperoleh  dapat  dijadikan  sebagai  basis  data  untuk melestarikan dan menjaga keberlanjutan sumber daya ikan.
Kata kunci : Cakalang, genetik, konservasi, Maluku Utara

## I. PENDAHULUAN
Perairan  Maluku  Utara  adalah  daerah potensial  penangkapan  ikan  pelagis.  Daerah
ini  dipengaruhi  oleh  arus  lintas  Indonesia yang  membawa  massa  air  subur  dari Samudra Pasifik masuk ke perairan Indonesia dan  mengalir  hingga  Samudra  Hindia.
Kementerian  Kelautan  dan  Perikanan  pada tahun  2015  menyebutkan  bahwa  s alah  satu sumber  daya  perikanan  yang  dieksploitasi  di peraiaran  ini  adalah  ikan  cakalang  ( K. pelamis ).  Ikan  cakalang  memiliki  total produksi 57.126,3  ton  di  perairan  Maluku Utara . Kementerian  Kelautan  dan  Perikanan pada tahun 2015 menyebutkan bahwa potensi sumber  daya  cakalang di Maluku  Utara baru di manfaatkan sekitar 48,54%. Ikan Cakalang merupakan  target  dalam  dalam  operasi  pe- nangkapan di daerah Indonesia. Setiap tahun- nya  produksi  ikan  cakalang  di  Indonesia meningkat,  sehubungan  dengan  kebutuhan permintaan  pasar.  Kegiatan  seperti  ini  dapat memberikan  dampak  terhadap  kualitas  dan kuantitas  sumber  daya  ikan  cakalang.  Sektor perikanan  merupakan  sumber  daya  dapat pulih  ( renewable  resources ), akan tetapi  laju pemanfaatan tidak seimbang terhadap tingkat kecepatan  pertumbuhan  pemulihan.  Maluku Utara  masuk  dalam  WPP-RI  714-716, sehingga  perlu  suatu  pendekatan  untuk meminimalisir  terjadinya  degradasi  populasi ikan  cakalang.  Beberapa  daerah  potensial ikan  cakalang  seperti  Pulau  Bacan,  Obi, Morotai  dan  Ternate  telah  memberikan indikasi  dan  dugaan  adanya  penurunan  hasil tangkap dan ukuran ikan tertangkap.
Pendekatan  pengelolaan,  pelestarian dan  pemanfaatan  secara  bekelanjutan  dapat dimulai  melalui  kajian  substansial  seperti genetik.  Informasi  struktur  genetik  dapat  di- gunakan  untuk  melihat  kestabilan  dan  status kesehatan populasi. Penelitian tentang geneti- ka populasi itu sendiri, terutama menyangkut keragaman  genetika  ikan  di  Indonesia,  telah dilakukan diantaranya studi genetika popula- si  ikan  kakap  merah  ( Lutjanus  malabaricus ) yang  berasal  dari  beberapa  daerah  penang- kapan  Pantai  Utara  Jawa  dan  Laut  Jawa bagian  timur  (Soewardi  &  Suwarso,  2006), tuna  sirip  kuning  ( Thunnus  albacores )  dari daerah  Bali,  Maluku  Utara  dan  Sulawesi Utara (Permana et  al., 2007),  kajian  struktur populasi  tuna  mata  besar  di  Samudra  Hindia bagian  Sumatra  Barat,  Selatan  Jawa  dan Nusa  Tenggara  yang  dilakukan  oleh  Suman
et  al. (2013),  studi  variasi  genetik  pada  tuna sirip  kuning  yang  di  kaji  berdasarkan  dua populasi di laut Maluku, Indonesia (Akbar et al., 2014).
Penelitian  struktur  populasi  ikan cakalang  berdasarkan  tingkat  populasi  telah dilakukan  oleh  Toatubun et  al. (2015)  di perairan  Manado.  Sedangkan  penelitian tentang genetik ikan cakalang baru dilakukan oleh  Fakhri et  al. (2015)  dari  Kabupaten Jembrana  dan  Karangasem,  Bali”.  Penelitian Akbar et  al. (2018)  tentang  keragaman genetik  ikan  cakalang  di  perairan  Maluku Utara, namun informasi tentang ikan cakalang khususnya struktur genetik populasi belum  tersedia.  Kajian  tentang  struktur genetik  penting,  karena  dapat  memberikan informasi  pertukaran  genetik  pada  populasi berbeda,  dengan  demikian  status  populasi dapat  ditentukan.  Selain  itu  pengetahuan tentang  struktur  genetik  populasi  sangatlah baik  untuk  keberlanjutan  dan  efektifitas manajemen  sumber  daya  (Chiang et  al., 2006; Chiang et al., 2008). Hal ini mendasari dilakukanya  penelitian  mengenai  struktur genetik  populasi  ikan  cakalang  ( K.  pelamis ). Penelitian  bertujuan  mengetahui  struktur genetik populasi ikan cakalang ( K. pelamis ).

## II. METODE PENELITIAN

## 2.1. Waktu, Lokasi Penelitian dan Koleksi Sampel
Tahapan  penelitian  meliputi  pengam- bilan  sampel,  pengambilan  sampel,  penger- jaan laboratorium dan analisis data. Pengam- bilan  sampel  pada  Maret-Mei  2018  ( Figure 1 ).  Koleksi  material  DNA  pada  30  sampel ikan (pectoral  fins) di  lokasi  Pulau  Morotai (n=10), Weda, Kabupaten Halmahera Tengah (n=10),  Bacan  dan  Kabupaten  Halmahera Selatan  (n=10).  Sampel  yang  diperoleh kemudian  difoto  dan  diambil  bagian  sirip dada  sepanjang  3  cm,  setelah  itu  disimpan dalam  tabung  yang  telah  terisi  etanol  90% (Akbar et al., 2018). Data sekunder diperoleh melalui  GenBank  dengan accession  number untuk keperluan komparasi ( Table 1 ).
Figure 1. Research locations (Source: Akbar dan Labenua, 2018).
Table 1. Yellowfin tuna secondary data and accession number (GenBank).
No. Authors Years Accession number 1 A Rahim, M., Basir, S., Musel, J., Mohd Saleh, M.F. and Abdullah, A.W. 2016 KY353356.1 2 Yamashita, H., Yanagimoto,T., Kimura, T. and Kurosaka, K. 2014 AB907398.1 3 Fakhri, F., Mahardika, G.N.K., Narayani, I., Dewi, N.M.R.K., Cahyani, N.K.D., Prayoga, I.M.A. and Yusmalinda, N.L.A. 2014 KM094131.1 4 Menezes, M.R., Kumar G, Kunal SP 2012 JF752061.1 2.2. Ekstraksi, Polymerase Chain
Reaction (PCR), Elektroforesis dan

## Sekuensing DNA
Sampel  genetik  diekstraksi  dengan cairan Chelex 10% (Walsh et al., 1991). Sirip pektoral  kemudian  di  ekstraksi  untuk  mem- peroleh  sampel  DNA  (Akbar et  al., 2018). Tahapan  ekstraksi  dimulai  dengan  mema- sukkan  sampel  ke  dalam tube, setelah  itu proses vortex dan sentrifuge selama  +  20 detik,  setelah  itu  dilanjutkan  pada  tahapan heating  blok (pemanasan)  dengan suhu 95°C selama + 45 menit. Proses berikutnya adalah tube divortex  dan  disentrifuge  ±  20  detik (Akbar et  al ., 2014).  Amplifikasi DNA pada lokus control  region menggunakan  metode DNA sequencing dengan  primer  CRK-CRE (Lee et  al., 1995).  Proses  PCR  dimulai  pada fase  denaturasi  awal  94  °C  ±  15  detik, denaturasi  94  °C  selama  30  detik, annealing pada 50 °C ± 30 detik dan extension pada 72 °C  ±  45  detik  dan  selama  72  °C  untuk  5
menit  berikutnya  dan  pengulangan  terjadi pada proses ini sebanyak 38 siklus.
Hasil  amplifikasi  DNA  kemudian  di- lakukan  elektroforesis  untuk  memperoleh kualitas  produk  DNA  (Akbar et  al., 2018). Elektroforesis  dilakukan  menggunakan gel agarose 1% melalui proses pencampuran 1 g agarosa  pada erlenmeyer dan  ditambahkan 100  mL  TAE  1X,  kemudian  campuran diletakan pada microwave untuk dipanaskan. Larutan  yang  telah  merata  kemudian  ditam- bahkan  4  uL  EtBr. Gel  agarose yang  telah jadi  selanjutnya  dituangkan  pada  cetakan yang  sebelumnya  telah  diletakan  alat  pem- buat  sumur  kemudian  didiamkan  selama  30 menit.
Elektroforesis  DNA  melalui  proses visualisasi  menggunakan  mesin  ultraviolet (voltase 200 V dan arus 400 mA) ± 15 menit. Fragmentasi  DNA  yang  telah  berhasil selanjutnya  disekuensing  (Sanger et  al., 1977).
Pulau Morotai Halmahera Selatan, Bacan Halmahera Tengah, Weda
2.3. Analisis Data Genetik
Analisis  sekuen  DNA  menggunakan MEGA5  ( Molecular  Evolutionary  Genetic Analysis )  untuk  rekonstruksi  pohon  filo- genetik,  analisis  jarak  genetik,  distribusi  dan probabilitas  substitusi  nukeotida  (Tamura et al .,  2011),  dan  Arlequin  3.5  (Excoffier  & Lischer, 2010) untuk  melihat besarnya aliran genetik antar populasi (fiksasi indeks ( Fst )).

## III. HASIL DAN PEMBAHASAN

## 3.1. Karakteristik Molekuler
Karakteristik molekuler  diperoleh pada 30 (data  primer), 4  (data sekunder) dan 1  (sampel out  group ) sampel  ikan  cakalang memperoleh 546 panjang basa (bp) di daerah lokus control  region DNA  Mitokondria (mtDNA)  ( Table  2 ).  Panjang  fragmen  yang mirip  juga  ditemukan  Chow  &  Kishino, (1995), Dammanggoda et al . (2011), Menezes et al . (2012), Jackson et al . (2014), Johnson et  al. (2015)  dan  Fakhri et  al. (2015).
Panjang fragmen yang ditemukan jika dibandingkan,  maka  lebih  panjang  dengan penelitian  lainnya  ( Table  2 ).  Panjang  basa (bp)  yang  berbeda  dimungkinkan  jumlah sampel  berbeda,  produk  kualitas  DNA, primer  yang  belum  spesifik,  panjang  ukuran dan  komposisi  basa  primer,  pengaruh  ling- kungan,  kualitas  makanan  serta  faktor hereditas,  namun  tidak  menunjukkan  penga- ruh  dari  hasil  sekuen  (Williams et  al .,  1990;
Shizuka  &  Lyon,  2008;  Akbar et  al. ,  2014; Jefri et al ., 2015; Akbar et al. , 2018). Mutasi genetik  juga  dapat  memengaruhi  perbedaan panjang  basa  DNA  pada  spesies.  Hal  ini biasanya  disebut  mutasi  titik  dikarenakan banyaknya  nukleotida  yang  bermutasi  pada nukleotida  tunggal  (Xiao et  al. ,  2007). Subtitusi  nukelotida  ditemukan  pada  setiap individu  berdasarkan  hasil  pengamatan (Akbar et al. , 2018)

## 3.2. Struktur Populasi Genetik
Informasi  populasi  genetik  diperoleh melaui  informasi  jarak  genetik  dan Amova population  pairwise ( Fst ).  Jarak  genetik dalam  populasi  ikan  cakalang  Morotai  yakni 0,009,  Bacan  dengan  nilai  0,023  dan Halmahera  Tengah  yaitu  0,007,  sedangkan secara  keseluruhan  analisis  jarak  genetik dalam  populasi  ikan  cakalang  di  perairan Maluku  Utara  adalah  0,014  ( Table  3 ). Kedekatan  genetik  pada  ikan  sejenis  juga dilaporkan  Graves et  al . (1984)  di  Atlantik dan Pasifik, Ely et al . (2005) di Atlantik dan Pasifik, Dammannagoda et  al .  (2011) Samudra India.
Analisis  jarak  genetik  antar  populasi ikan  cakalang  berdasarkan  data  primer  dan sekunder  menunjukkan  kedekatan  genetik antar  populasi  ( Table  3 ).  Kedekatan  genetik memberikan  dugaan  populasi  ikan  cakalang merupakan  satu  keturunan.  Analisis  jarak genetik  antar  populasi  ikan  cakalang  data sekunder  dan  data  primer  ( Tabel  3 )  ditemu-
Table 2. Samples, total samples, base pairs (bp), location and research sources.
Sample Total samples Base pairs (bp) Locations Research Sources Skipjack 30 546 North Maluku Sea Research result, 2018 4 400 East Hindia Ocean Chow & Kishino, 1995 115 394 Atlantic and Pasific Ely et al. , 2005 324 488 North west Indian Ocean Dammanggoda et al ., 2011 315 508 India Sea Menezes et al. , 2012 177 400 Indonesia islands Jackson et al. , 2014 35 500 Tanzania Coastal Johnson et al. , 2015 60 532 Bali Fakhri et al. , 2015 1 517 North Maluku Sea Akbar et al. , 2018
kan  bahwa  jarak  genetik  Morotai  dengan Sulu-Celebes  dan South  China  Sea yaitu 0,037,  Morotai  dengan  Bali  yaitu  0,052, Morotai  dengan Indian  Coast yakni  0,005 dan  Morotai  dengan Kyushu  Island  Japan sebesar 0,056. Hasil analisis lainnya ditemukan jarak genetik antar populasi Bacan dengan  Sulu-Celebes  dan South  China  Sea yakni 0,038, Bacan dengan Bali dengan nilai 0,052,  Bacan  dengan Indian  Coast yaitu 0,014  dan  Bacan  dengan Kyushu  Island Japan sebesar  0,056.  Jarak  genetik  antar populasi  Halmahera  Tengah  dengan  Sulu- Celebes  dan South  China  Sea sebesar  0,035, Halmahera Tengah dengan Bali  yakni 0,050, Halmahera  Tengah  dengan Indian  Coast yaitu  0,004  dan  Halmahera  Tengah  dengan Kyushu Island Jepang adalah 0,054.
Analisis  jarak  genetik  antar  populasi data sekunder ditemukan bahwa jarak genetik Sulu-Celebes  dan South  China dengan  Bali adalah 0,043, Sulu-Celebes dan South  China dengan Indian  Coast dengan  nilai  0,031, Sulu-  Celebes  dan South  China dengan Kyushu  Island  Japan sebesar  0,039.  Jarak genetik  antar  populasi  Bali  dengan Indian Coast yaitu  0,046, Indian  Coast dengan Kyushu  Island  Japan adalah  0,050  dan  Bali dengan Kyushu  Island  Japan sebesar  0,055. Letak  geografis  ternyata  tidak  memberikan pengaruh  terhadap  aliran  genetik  populasi ikan  cakalang.  Populasi  yang  tersebar  secara
geografis memiliki hubungan struktur genetik  satu  dengan  lainnya  (Michels et  al ., 2001).  Toha et  al .  (2014)  sampel  genetik yang  acak  setiap  kelompok  populasi  me- nunjukan terdapat aliran gen dari satu daerah ke  yang  lainnya.  Secara  keseluruhan  hasil yang  diperoleh  menunjukkan  tidak  terdapat diferensiasi  genetik  antar  populasi  ikan cakalang,  meskipun  memiliki  jarak  lokasi yang  berbeda-beda.  Sehingga  memberikan gambaran  bahwa  terdapat  kedekatan  yang kuat  antar  populasi.  Kedekatakan  genetik dimungkinkan  akibat  dari  sifat  migrasi  yang tinggi  pada  ikan  cakalang  sehingga  mem- berikan  peluang  bertemu  dengan  populasi lain dan melakukan perkawinan. Hal ini akan mengakibatkan  terciptanya  aliran  genetik antar  populasi.  Selain  itu  bisa  diakibatkan karena  jumlah  populasi  yang  sangat  besar  di perairan  sehingga  terdistribusi  secara  luas  di semua perairan.
Analisis fiksasi indeks ( Fst ) ( Table 4 ) menunjukkan  bahwa  tidak  terdapat  diferen- siasi  genetik  antar  populasi.  Tingginya  nilai fiksasi  indeks ( Fst )  menunjukkan  bahwa ter- jadi aliran genetik yang tinggi antar populasi. Hasil  analisis  diperoleh  fiksasi  indeks  ( Fst ) Morotai  dengan  Bacan  yaitu  0,995,  Morotai dengan  Halmahera  Tengah  yakni  0,991, Bacan  dengan  Halmahera  Tengah  yaitu 0,921.  Sedangkan  nilai  ( Fst )  antar  data primer  dan  data  sekunder  memperlihatkan
Table 3.   Genetic  distance  between  population  skipjack  in  North  Maluku  Sea  and secondaries  data.  Secondaries  data: Sulu-Celebes  and  South  China  Sea,  Bali,  Indian coast, Kyushu Island Japan.
No. Locations Between populations Mo Ba HT Su BL IC KI 1 Morotai - - - - - - - 2 Bacan 0.017 - - - - - - 3 Halmahera Tengah 0.009 0.018 - - - - - 4 Sulu-Celebes and South Cina 0.037 0.038  0.035 - - - - 5 Bali 0.052 0.052  0.050  0.043 - - - 6 Iindian Coast 0.005 0.014  0.004  0.031  0.046 - - 7 Kyushu Island Japan 0.056 0.056  0.054  0.039  0.055  0.050 -
Information:  Mo=  Morotai; Ba= Bacan;  HT=  Halmahera  Tengah;  Su=  Sulu-Celebes  and South China Sea; BL= Bali; IC= Indian Coast; KI= Kyushu Island Japan.
hal yang sama dimana terdapat aliran genetik yang besar. Nilai ( Fst ) Morotai dengan Sulu- Celebes  dan South  China  Sea yaitu  0,902, Morotai  dengan  Bali  adalah  0,923,  Morotai dengan India Coast yakni 0,801 dan Morotai dengan Kyushu  Island  Japan sebesar  0,818 ( Table  4). Nilai  ( Fst )  antar  populasi  Bacan dengan  Sulu-Celebes  dan South  China  Sea yaitu 0,908, Bacan dengan Bali adalah 0,934, Bacan  dengan Kyushu  Island  Japan yakni 0,812  ( Table  4 ).  Aliran  genetik  berdasarkan nilai  ( Fst )  diperoleh  populasi  Halmahera Tengah  dengan Kyushu  Island  Japan adalah 0,901, Halmahera tengah dengan Bali dengan nilai  0,936,  Halmahera  Tengah  dengan Indian  Coast  yakni  0,810  dan  Halmahera Tengah  dengan Kyushu  Island  Japan yakni 0,854.
Hasil  analisis  fiksasi  indeks  ( Fst ) pada  setiap  data  sekunder  diperoleh Kyushu Island  Japan dengan  Bali  adalah  0,878, Kyushu  Island  Japan dengan Indian  Coast yakni  0,898,  Sulu-Celebes  dan South  China Sea  dengan  Bali  yaitu  0,818,  Sulu-Celebes dan South  China  Sea dengan Indian  Coast yakni  0,823,  Sulu-Celebes  dan South  China Sea dengan Kyushu Island Japan yaitu 0,834, India Coast dengan Bali sebesar 0,844 ( Table 4 ).  Beberapa  penelitian  menunjukkan  hasil yang  sama,  Dammannagoda,  (2007)  diper- airan  Sri  Lanka,  Menezes et  al .  (2012)  di Indian  Coast,  dan  Jackson et  al .  (2014)  di
beberapa kepulauan Indonesia.
Aliran  genetik  yang  ditemukan  dari ikan  cakalang  menggambarkan  bahwa  ke- suluruhan  populasi  saling  memberikan  pe- ngaruh.  Distribusi  besar  di  daerah  Samudra mengindikasikan  bahwa  ukuran  populasi yang  besar  pada  ikan  cakalang  (Menezes et al ., 2012). Hal ini tentunya memberikan efek aliran  genetik  antar  populasi.  Fakhri et  al . (2015) mengatakan  pola umum genetik  yang ditemukan  merupakan  ciri  populasi  ikan cakalang  dunia  yang  sangat  bervariasi  dan terjadi pencampuran antar populasi pada saat migrasi dalam rentang laut yang luas. Namun beberapa  faktor  pembatas  aliran  genetik  se- perti  pola  arus,  perubahan  temperatur  dan salinitas  atau  pembatas  alam  ( physical barrier )  antar  kontinen  atau  masa  tanah Samudra  (Chow & Ushiama, 1995; Menezes et al., 2012).
Perairan  dunia  dipengaruhi  sistem pola  arus  yang  bergerak  melintasi  perairan antar  Samudra.  Pergerakan  arus  menyusuri perairan setiap negara kemudian terdistribusi secara  lokal  di  setiap  daerah.  Indonesia dipengaruhi Arus Lintas Indonesia ( Indonesian  throughflow )  yang  masuk  me- lewati  Samudra  Pasifik  hingga  menjulur  ke Samudra  Hindia  (Gordon  &  Fine,  1996). Aliran masa air Arus Lintas Indonesia masuk melalui  dua  jalur  utama  yang  bersentuhan langsung  dengan  perairan  Maluku  Utara
Table 4.   Fixation  index  analysis  (Fst)  between  populations  North  Maluku  Sea  and secondaries data.
No. Fixation index analysis (Fst) Locations Primer data Secondaries data Mo Ba HT Su BL IC KI 1 Morotai - - - - - - - 2 Bacan 0.995 - - - - - - 3 Halmahera Tengah 0.991  0.921 - - - - - 4 Sulu-Celebes and South Cina 0.902  0.908  0.901 - - - - 5 Bali 0.923  0.934  0.936  0.818 - - - 6 Iindian Coast 0.801  0.889  0.810  0.823  0.844 - - 7 Kyushu Island Japan 0.818  0.812  0.854  0.834  0.878  0.898 -
Information:  Mo=  Morotai; Ba= Bacan;  HT=  Halmahera  Tengah;  Su=  Sulu-Celebes  and South China Sea; BL= Bali; IC= Indian Coast; KI= Kyushu Island Japan.
yakni  Laut  Maluku  dan  Laut  Halmahera ( Figure  2 ).  Masuknya  aliran  massa  air  ini diduga  membawa  air  bersuhu  hangat,  dari Samudra  Pasifik  di  lapisan  termoklin (Atmadipoera  &  Mubaraq,  2016).  Hal  ini tentunya  memberikan  keuntungan  bagi  per- airan  Maluku  Utara,  dikarenakan  faktor fisika  dan  kimia  mambantu  ikan  pelagis seperti  tuna  dan  cakalang  untuk  menjadikan perairan  ini  sebagai  habitat  untuk  hidup menetap ataupun sebagai jalur migrasi. Bahri et  al. (2017)  mengatakan  kepulauan  bagian timur  sangatlah  unik  karena  ada  sejumlah faktor  fisik  dan  kimia  yang  dipengaruhi Samudra  Pasifik  karena  daerah  ini  memang berbatasan langsung dengan Samudra ini.
Keseluruhan  hasil  analisis  struktur genetik memperlihatkan kondisi ikan cakalang  dalam  keadaan  normal  ( strong) di perairan  Maluku  Utara,  walaupun  tingkat ekploitasi  cukup  tinggi,  namun  kebugaran ( fitness )  ikan  secara  genetik  masih  sangat baik.  Aliran  genetik  yang  tinggi  memperli- hatkan bahwa keadaan populasi sangat stabil. Pengetahuan  akan  populasi  genetik  sangat penting,  untuk  melihat  seberapa  besar  popu-
lasi  dapat  bertahan  dari  perubahan  lingku- ngan  yang  terjadi.  Pengetahuan  nilai  bio- massa merupakan unsur utama dalam penen- tuan  stok,  potensi  perikanan  dan  sebagai dasar  dalam  penentuan  upaya  pengelolaan perikanan  kedepan  (Ma’mun et  al., 2018). Aktivitas perikanan tangkap merupakan tem- pat  bergantung  kehidupan  nelayan,  sehingga perlu dikelola untuk keberlanjutan dan keles- tarian  perikanan  (Yulianto et  al., 2016). Aktivitas tangkap  yang dilakukan  berlebihan turut memberikan dampak terhadap populasi. Wigati et  al. (2003)  mengatakan  kegiatan penangkapan  secara  terus  menerus  tanpa  re- gulasi  yang  kuat  memberikan  ancaman  pada lingkungan, populasi dan variasi genetik.

## 3.3. Genetik Sebagai Basis Data Konservasi
Informasi  genetik  populasi  ikan cakalang memperlihatkan tidak terdapat dife- rensiasi  antar  populasi  dan  aliran  genetik tinggi antar populasi ( Table 3 dan 4 ). Hal ini menunjukkan  bahwa  ikan  cakalang  merupa- kan  populasi panmictic .  Populasi panmictic adalah  suatu  kondisi  dimana  semua  individu
Figure 2. Indonesia through flow (Gordon & Fine, 1996).
berpotensi menjadi pasangan, tidak ada ham- batan  perkawinan  baik  secara  genetik  mau pun  tingkah  laku  sehingga  memungkinan semua  kombinasi  (Bahagiawati et  al., 2006; 2010).  Penelitian  yang  menemukan  bahwa kelompok ikan tuna adalah populasi panmictic (Chiang et  al., 2008) Akbar et  al.,
2014;  Aris et  al .,  2017  dan  juga  pada  ikan cakalang (Fakhri et al., 2015).
Status  ikan  cakalang  berdasarkan IUCN belum masuk dalam kategori apendiks spesies  ( Table  5 ).  Aktivitas  penangkapan tinggi  setiap  tahun,  perlu  diperhatikan  di- karenakan  dapat  mengakibatkan  keberlanju- tan  dan  kelestarian  sumber  daya  tidak  seim- bang.  Intensitas  penangkapan  yang  tinggi dapat  menurunkan  populasi.  Tindakan  untuk mengantisipasi  hal  tersebut  diperlukan  suatu program  konservasi  untuk  melindungi  ikan dari kelangkaan  dan dapat dilakukan  melalui konservasi  genetik.  Status  ikan  tuna  yang masuk  kategori  apendiks  I  dan  II,  mem- berikan gambaran bahwa spesies yang sering diekploitasi  dalam  skala  besar  untuk  komer- sial,  namun  berbeda  dengan  ikan  cakalang yang  belum  masuk  dalam  kategori  apendiks, akan tetapi ekploitasi ikan ini sangat tinggi di Indonesia.  KKP  (2015)  melaporkan  bahwa komoditas  perikanan  penyumbang  nilai  eks- por perikanan Indonesia adalah tuna, tongkol dan  cakalang.  Aktivitas  tangkap  yang  ber- lebih  memberikan  peluang  penurunan  popu- lasi  ikan.  Jamal et  al. (2014)  mengatakan bahwa  Tingkat  pemanfaatan  ikan  Cakalang
dengan  alat  tangkap pole  and  line di  Kab. Luwu  telah  melampui  nilai Maximum Sustainable  Yield (MSY).  Gigentika et  al. (2014)  menemukan  produksi  yang  menurun dan  kekhawatiran  terhadap  status  sumber daya ikan cakalang di Kab. Lombok Timur.
Data  genetik  yang  diperoleh  pada penelitian  yang  dilakukan  dapat  dijadikan sebagai  basis  data  untuk  kelestarian  yang berkelanjutan  pada  sumber  daya  hayati. Pemeliharaan  genetik  diatur  dalam  Permen No.  60  tahun  2007  berkaitan  konservasi sumber  daya  ikan.  Penjelasan  PP  No.  60 Tahun  2007  bahwa  konservasi  sumber  daya ikan  dilakukan  berdasarkan  asas  manfaat, keadilan,  kemitraan,  pemerataan,  keterpadu- an,  keterbukaan,  efisiensi  dan  kelestarian yang  berkelanjutan.  Selain  itu  dijelaskan proses  pembiakan  pada  ikan  dilindungi  dan jenis  ikan  tidak  dilindungi  dilakukan  untuk menjaga kemurnian genetik  ikan (PP No.  60 Tahun 2007).
UU  No.  5  Tahun  1990  menjelaskan tiga  sasaran  konservasi,  yaitu  1).  Menjamin terpeliharanya  proses  ekologis  yang  menun- jang  sistem  penyangga  kehidupan  bagi  ke- langsungan  pembangunan  dan  kesejahteraan manusia  (perlindungan  sistem  penyangga kehidupan); 2). Menjamin terpeliharanya ke- anekaragaman  sumber  genetik  dan  tipe-tipe ekosistemnya  sehingga  mampu  menunjang pembangunan,  ilmu pengetahuan, dan tekno- gi  untuk  kebutuhan  manusia  dalam  meng- gunakan  sumber  daya  alam  hayati  bagi  ke-
Table 5.  Tuna status in Red List International Union for Conservation of Nature (IUCN).
Category Species Tuna Status Extinct - Extinct in the wild - Critically endangered Thunnus orientalis Apendix I Endangered Thunnus thynnus and Thunnus maccoyii Vulnerable Thunnus obesus Apendix II Near threatened Thunnus albacares Least concern - Data deficient - Not evaluated Katsuwonus pelamis
sejahteraan  (pengawetan  sumber  plasma nutfah); 3). Mengendalikan cara pemanfaatan sumber  daya  alam  hayati  sehingga  terjamin kelestariannya.  Akibat sampingan ilmu pengetahuan  dan  teknologi  yang  kurang bijaksana,  belum  harmonisnya  penggunaan dan  peruntukan  tanah  serta  belum  ber- hasilnya  sasaran  konservasi  secara  optimal, baik  di  darat  maupun  di  perairan  dapat mengakibatkan timbulnya gejala erosi genetik,  polusi,  dan  penurunan  potensi sumber daya alam hayati.
Tingginya  keragaman  genetik  pada ikan cakalang  di wilayah  laut Maluku Utara, memberikan informasi bahwa populasi cakalag  memiliki  kemampuan  berdaptasi lingkungan  yang  dinamis  dan  tekanan ekploitasi.  Variasi  genetik  tinggi  membe- rikan  gambaran  terhadap  stuktur  genetik populasi yang belum terganggu. Data genetik ikan  cakalang  yang  diperoleh  perlu  men- dapatkan  perhatian  sebagai  upaya  menjaga, melestarikan  dan  melanjutkan  keberlang- sungan sumber daya ikan di perairan Maluku Utara.  Data  genetik  juga  dijadikan  sebagai basis  data  dan  pengelolaan  berkelanjutan, dikarenakan  dapat  memberikan  penjelasan tentang  kondisi  ikan  saat  ini.  Adanya  ber- bagai  macam  gen  dari  individu-individu  di dalam  populasi panmictic menambah  ke- mampuan  populasi  dalam  merespon  peruba- han lingkungan.
Strategi  dalam  upaya  mempertahan- kan  kualitas  genetik  perlu  dilakukan  dengan cara melestarikan keragaman genetik dengan menerapkan  regulasi  tentang  pelaksanaan batas  ukuran  minimum  tangkapan  pada  se- tiap  operasi  penangkapan.  Ikan  yang  dapat dimanfaatkan  telah  memasuki  fase  dewasa berdasarkan  biomorfologi.  Kedua  adalah regulasi  waktu  tangkap,  sebagai  contoh operasi  tangkap  dilakukan  pada  musim puncak atau dapat dilakukan selama 6 bulan. Penerapan  seperti  ini  dapat overfishing , sehingga  stok  sumber  daya  tetap  terjamin kelestarianya.  Ketiga  adalah  penetapan  ka- wasan  reservasi  ( reservation  region )  yang dibentuk  berdasarkan  kesepakatan  masyara-
kat lokal dan peraturan pemerintah. Pemben- tukan  wilayah  reservasi  diperlukan  dan bersifat  penting  untuk  kegiatan  konservasi genetik,  dengan  bertanggung  jawat  terhadap kelangsungan hidup populasi ikan.

## IV. KESIMPULAN
Hasil penelitian karakteristik moleku- ler  diperoleh  pada  30  (data  primer),  4  (data sekunder)  dan  1  (sampel out  group )  sampel ikan  cakalang  memperoleh  546  ( base  pairs ) di control region DNA Mitokondria (mtDNA).  Secara  keseluruhan  hasil  analisis jarak  genetik  antar  populasi  ikan  cakalang berdasarkan  data  primer  dan  sekunder menunjukkan adanya kedekatan jarak genetik antar  populasi  dan  aliran  genetik  yang  kuat. Data  genetik  yang  diperoleh  dapat  dijadikan sebagai  basis  data  konservasi  untuk  keber- lanjutan  dan  pelestarian  populasi  ikan cakalang di masa akan datang.

## UCAPAN TERIMA KASIH
Terima  kasih  kepada  Kemenristek- dikti yang telah memberikan hibah Penelitian Dosen  Pemula  (PDP)  tahun  2018.  Penulis juga  menyampaikan  terima  kasih  kepada Pemerintah Daerah di Provinsi Maluku Utara atas bantuannya dalam pelaksanaan penelitian.  Tak  lupa  Peneliti  mengucapkan terima  kasih  secara  khusus  kepada  Bapak Sukarmin  Idrus  S.Pi.,  M.Si.,  Rudi  Mansur, S.Pi.  dan  Muhajirin  Ahmad,  S.Pi.  atas kontribusinya dalam penelitian.

## DAFTAR PUSTAKA
Akbar,  N.,  N.P.  Zamani,  &  H.H.  Madduppa. 2014.  Keragaman  genetik  ikan  tuna sirip kuning ( Thunnus albacares ) dari dua  populasi  di Laut  Maluku, Indonesia. J. Depik , 3(1): 65-73. http://doi.org/10.13170/depik.3.1.130 4
Akbar,  N.,  M.  Aris,  M.  Irfan,  I.  Tahir,  A. Baksir,  Surahman,  H.H.  Madduppa,
&  R.  Kotta.  2018.  Filogenetik  ikan tuna  ( Thunnus spp.)  di  Perairan Maluku  Utara,  Indonesia. J.  Iktiologi Indonesia , 18(1): 1-11.
http://doi.org/10.32491/jii.v18i1.37 Akbar,  N.  &  R.  Labenua.  2018.  Keragaman genetik  ikan  cakalang  (Katsuwonus pelamis  )  di  Perairan  Laut  Maluku Utara. J. Depik , 7(2): 164-176.
http://doi.org/10.13170/depik.7.2.111 56
Aris,  M.,  N.  Akbar,  &  R.  Labenua.  2017.
Genetic  and  phylogenetic  variations of yellowfin
tuna ( Thunnus
albacares )  as  a  basis  for  sustainable fishery  resources  management  in North  Moluccas. International  J. Pharma Bio Science , 8(4): 419-426. http://doi.org/10.22376/ijpbs.2017.8.4 .b419-426
Atmadipoera,  S.A.  &  G.I.  Mubaraq.  2016. Struktur  dan  variabilitas  arlindo  di laut  Sulawesi. J.  Kelautan  Nasional,
11(3): 159-174. http://doi.org/10.15578/jkn.v11i3.611
6
Bahagiawati, D.W., Buchari, Nurindah, H.H. Rizjaani,  D.W.  Utami,  B.  Sahari,  &
A.  Sari.  2006.  Struktur  populasi Trichogrammatoidea armigera , parasitoid telur Helicoverpa
armigera, berdasarkan analisis RAPD-PCR. J. AgroBiogen, 2(2): 52- 58. http://doi.org/10.21082/jbio.v2n2.200 6.p5259
Bahagiawati,  D.W.,  Utami,  &  D.  Buchari.
2010.  Pengelompokan  dan  struktur populasi parasitoid telur Trichogrammatoidea armigera pada telur Helicoverpa  armigera pada jagung berdasarkan karakter molekuler. J.  Entomologi  Indonesia , 7(1): 54-65. http://doi.org/10.5994/jei.7.1.54
Bahri,  S.,  A.S.  Atmadipoera,  &  H.H.
Madduppa. 2017.  Keragaman genetik penyu  lekang Lepidochelys  olivacea
dengan pola arus di teluk Cendrawasih,  Papua. J.  Ilmu  dan Teknologi Kelautan Tropis , 9(2): 747- 760. http://doi.org/10.29244/jitkt.v9i2.193 07
Chiang, H.C., C.C. Hsu,  H.D.  Lin,  G.C.  Ma, T.Y.  Chiang,  &  H.Y.  Yang.  2006. Population  structure  of  bigeye  tuna ( Thunnus  obesus )  in  the  South  China Sea,  Philippine  Sea  and  western
Pacific Ocean inferred from mitochondrial DNA. Fisheries Research , 79(1): 219-225. http://doi.org/10.1016/j.fishres.2005.1 1.026 Chiang,  H.C.,  C.C.  Hsu,  G.C.C.  Wu,  S.K. Chang, & H.Y. Yang. 2008.
Population  structure  of  bigeye  tuna ( Thunnus  Obesus )  in  the  Indian Ocean  inferred  from  mitochondrial DNA. Fisheries  Research ,  90(1): 305-312.
http://doi.org/10.1016/j.fishres.2007.1 1.006
Chow,  S.  &  H.  Kishino.  1995.  Phylogenetic
relationships  between  tuna  species  of the  genus Thunnus ( Scombridae: Teleostei ):  inconsistent  implications from morphology, nuclear and mitochondrial genomes. J. of Moleculer Evolution , 41(6): 741-748. http://doi.org/10.1007/BF00350321
Chow,  S.  &  H.  Ushiama.  1995.  Global population  structure  of  albacore ( Thunnus alalunga ) inferred by RFLP analysis of the mitochondrial ATPase gene. Marine  Biology , 123(1):  39-45. http://doi.org/10.1007/BF0035021
Dammannagoda,  S.T.,  D.A.  Hurwood,  & P.B.  Mather.  2011.  Genetic  analysis reveals  two  stocks  of  skipjack  tuna ( Katsuwonus pelamis ) in the northwestern Indian Ocean. Canadian J.  of  Fisheries  and  Aquatic  Sciences ,
68(2): 210-223.
http://doi.org/10.1139/F10-136
Ely, B., J. Vinas, J.R.A. Bremer, D. Black, L. Lucas, K. Covello, A.V. Labrie, & E. Thelen.  2005.  Consequences  of  the historical  demography  on  the  global population  structure  of  two  highly migratory cosmopolitan marine fishes:  the  yellowfin  tuna  ( Thunnus albacares )  and  the  skipjack  tuna
( Katsuwonus pelamis ). BMC Evolutionary  Biology ,  5(19):  1-9. http://doi.org/10.1186/1471-2148-5- 19 Excoffier,  L.  &  H.E.L.  Lischer.  2010.
Arlequin suite ver 3.5; a new series of program to perform population genetik  analysis  under  linux  and windows . Molecular Ecology Resources , 10(3): 564-56.
http://doi.org/10.1111/j.1755-
0988.2010.02847.x
Fakhri,  F.,  I.  Narayani,  &  I.G.N.K.
Mahardika. 2015. Keragaman genetik ikan  cakalang  ( Katsuwonus  Pelamis ) dari Kabupaten Jembrana dan Karangasem,  Bali. J.  Biologi ,  19(1): 11-14. http://ojs.unud.ac.id/index.php/BIO/ar ticle/view/16493
Gigentika,  S.,  S.H.  Wisudo,  &  Mustaruddin.
2014. Strategi pengembangan perikanan  cakalang  di  Kabupaten Lombok Timur Provinsi Nusa Tenggara  Barat. Marine  Fisheries , 5(1): 27-40. http://doi.org/10.29244/jmf.5.1.27-40
Gordon,  A.L.  &  R.A.  Fine.  1996.  Pathways of  water  between  the  Pacific  and Indian  oceans  in  the  Indonesian  seas.
Nature, 379(6561): 146-149. http://doi.org/10.1038/379146a0
Graves,  J.E.,  S.D.  Ferris,  &  A.E.  Dizon.
1984.  Close  genetic  similarity  of Atlantic  and  Pacific  skipjack  tuna (Katsuwonus  pelamis) demonstrated with restriction endonuclease analysis of mitochondrial DNA. Marine
Biology, 79(3): 315-319. http://doi.org/10.1007/BF00393264
Jackson, A.M., M.V. Ambariyanto, Erdmann, A.H.A. Toha, L.A.
Stevens,  &  P.H.  Barber.  2014.
Phylogeography  of  commercial  tuna and  mackerel  in  the  Indonesian Archipelago. Bulletin Marine Science , 90(1): 471–492. http://doi.org/10.5343/bms.2012.1097
Jamal,  M.,  Hasrun,  &  Ernaningsih.  2014.
Tingkat  pemanfaatan  dan  estimasi potensi  ikan  cakalang  ( Katsuwonus pelamis )  di  kawasan  teluk  Bone.
Torani , 24(2): 20-28. http://doi.org/10.35911/torani.v24i2.2
25
Johnson,  M.G.,  Y.D.  Mgaya,  &  Y.W.
Shaghude. 2015. Mitochondrial DNA analysis  reveals  a  single  stocks  of frigate tuna Auxis thazard (Lacepède, 1800)  in  the  northern  coastal  waters of  Tanzania.  Indian  Ocean  Tuna Commission-2015-WPNT05-16. 12
p.
Lee,  W.J.,  J.  Conroy,  W.H.  Howell,  &  T.D.
Kocher. 1995. Structure and evolution  of  teleost  mitochondrial control  regions. Moleculer  Evolution , 41(1): 54-66.
http://doi.org/10.1007/BF00174041
Ma’mun,  A.,  A.  Priatna,  Suwarso,  &  M.
Natsir.  2018.  Potensi  dan  distribusi spasial  ikan  demersal  di  Laut  Jawa (WPPNRI-712) dengan menggunakan teknoogi  hidroakustik. J.  Ilmu  dan Teknologi  Kelautan  Tropis ,  10(2):
489-500.
http://doi.org/1029244/jitkt.v10i2.215 49
Menezes,  M.R.,  G.  Kumar,  &  S.P.  Kunal. 2012.  Population  genetic  structure  of skipjack  tuna  Katsuwonus  pelamis from  the  Indian  coast  using  sequence analysis  of  the  mitochondrial  DNA D-loop region. J. Fish Biology , 80(6):
2198-2212. http://doi.org/10.1111/j.1095-
8649.2012.03270.x
Michels,  E.,  K.  Cottenie,  L.  Neys,  K.  De Gelas,  P.  Coppin,  &  L.  De  Meester. 2001.  Geographical  and  genetic distances among zooplankton
populations  in a set of  interconnected ponds: a plea for using GIS modelling of the effective geographical distance.
Molecular  Ecology ,  10(8):  1929- 1938. http://doi.org/10.1046/j.1365- 294X.2001.01340.x
Permana,  G.N.,  J.H.  Hutapea,  Haryanti,  & S.B.M.  Sembiring.  2007. Variasi genetik  ikan  tuna  sirip  kuning ( Thunnus  albaceras )  dengan  analisis elektroforesis  allozyme  dan  mtDNA . J. Riset Akuakultur , 2(1): 41-50. http://doi.org/10.15578/jra.2.1.2007.4
1-50
Sanger,  F.,  S.  Nicklen,  &  A.R.  Coulson.
1977.  DNA  sequencing  with  chain- terminating inhibitors. National
Academical  Science, United Stated of America , 74(12): 5463-5467.
http://doi.org/10.1073/pnas.74.12.546
3
Shizuka,  D.  &  B.E.  Lyon.  2008.  Improving the  reliability  of  molecular  sexing using a W-specific marker. Molecular Ecology Resources , 8(6): 1249-1253. http://doi.org/10.1111/j.1755- 0998.2008.02342.x
Soewardi,  K.  &  Suwarso.  2006.  Variasi geografik  dalam  struktur  genetik populasi  ikan  kakap  merah, Lutjanus malabaricus (Lutjanidae) dan interaksi  lingkungan  di  laut  Jawa. J.
Ilmu-Ilmu  Perairan  dan  Perikanan Indonesia, 13(1): 69-75.
Suman  A.,  H.E.  Irianto,  K.  Amri,  &  B. Nugraha.  2013.  Population  structure and  reproduction  of  bigeye  tuna ( Thunnus Obesus )  in Indian Ocean at western part  of Sumatera and southern  part  of  Java  and  Nusa
Tenggara. Indian Ocean Tuna Commission ,  8  oktober  2013.  1-14
pp.
Tamura,  K.,  D.  Peterson,  N.  Peterson,  G. Stecher,  M.  Nei,  &  S.  Kumar.  2011. Mega  5:  molecular  evolutionary genetics  analysis  using  maximum likehood,  evolutionary  distance  and maximum parsimony method. Moleculer  Biology  Evolution, 28(10): 2731-2739. http://doi.org/10.1093/molbev/msr12
1
Toha,  A.H.A.,  R.  Binur,  Suhaemi,  Lutfi,  L.
Hakim, N. Widodo, & S.B.
Sumitro.2014.  Genetic  aspects  of  the commercially used sea urchin Tripneustes  gratilla .  A  review. J.  of Biological  Researches, 20(2):  12-17. http://doi.org/10.23869/bphjr.20.1.20 143
Toatubun,  N.,  J.  Wenno,  &  I.L.  Labaro. 2015. Struktur populasi ikan cakalang hasil  tangkapan  pukat  cincin  yang didaratkan  di  pelabuhan  perikanan pantai  Tumumpa  Kota  Manado. J.
Ilmu dan Teknologi Perikanan
Tangkap , 2(2): 73-77.
http://doi.org/10.35800/jitpt.2.2.2015.
9234
Walsh,  P.S.,  D.A.  Metzger,  &  R.  Higuchi. 1991.  Chelex-100  as  a  medium  for simple  extraction  of  DNA  for  PCR based  typing  from  forensic  material.
Biotechniques , 10(4): 506-513. http://doi.org/10.2144/000114018 Wigati,  E.,  Sutarno,  &  Haryanti.  2003.
Variasi genetik ikan anggoli ( Pristipomoides multidens ) berdasarkan pola pita allozim.
Biodiversitas , 4(2): 73-79. http://doi.org/10.13057/biodiv/d0402 01.
Williams,  J.G.K.,  A.R.  Kubelik,  K.J.  Livak, J.A.  Rafalski,  &  S.V.  Tingey.  1990. DNA  polymorphism  amplified  by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nucleic  Acids  Research , 18(22): 6531-6535.
http://doi.org/10.1093/nar/18.22.6531
Xiao,  M.,  P.M.  Gordon,  A.  Phong,  C.  Ha,
T.F.  Chan,  D.  Cai,  P.R.  Selvin,  &  Y.
Kwok. 2007. Determination of haplotype  for single DNA  molecules:
a  method  for  single  molecules barcoding. Human  Mutation ,  28(9):
913-921.
http://doi.org.10.1002/humu.20528
Received  : 21 January 2020 Reviewed : 7 May 2020 Accepted  : 24 July 2020