How to cite: Khairunnisah,  Fatimah  Azh  Zhahro  Bagis,  Fitri  Andriani,  Khairil  Anwar,  Zaid  AL  Gifari,  Anwar  Rosyidi, Muhamad  Ali  (2022)  Isolasi,  Identifikasi,  dan  Karakterisasi  Pediococcus  spp.  dan  Lactobacillus  spp.  dari Saluran Pencernaan Entok (Cairina moschata) Sebagai Kandidat Probiotik Unggas, Syntax Literate : Jurnal
Ilmiah Indonesia (7)12, http://dx.doi.org/10.36418/syntax-literate.v7i12.10835 E-ISSN: 2548-1398
Published by:
Ridwan Institute
Syntax  Literate:  Jurnal  Ilmiah  Indonesia  p–ISSN:  2541-0849  e- ISSN: 2548-1398 Vol. 7, No. 12, Desember 2022

## ISOLASI,  IDENTIFIKASI,  DAN  KARAKTERISASI  Pediococcus  spp.  DAN
Lactobacillus  spp.  DARI  SALURAN  PENCERNAAN  ENTOK  (Cairina  moschata) SEBAGAI KANDIDAT PROBIOTIK UNGGAS
Khairunnisah, Fatimah Azh Zhahro Bagis, Fitri Andriani, Khairil Anwar, Zaid AL Gifari, Anwar Rosyidi, Muhamad Ali Universitas Mataram, Indonesia Email: khairunnisah@gmail.com

## Abstrak
Probiotik  merupakan  mikroorganisme  hidup  yang  dapat  berguna  untuk  meningkatkan produktivitas  ternak  baik  kecernaan  pakan  maupun  kesehatan.  Saluran  pencernaan merupakan  salah  satu  sumber  probiotik.  Bakteri  asam  laktat  (BAL)  merupakan mikroorganisme  yang banyak dimafaatkan sebagai probiotik untuk ternak unggas dan mempunyai  keunggulan  mampu  menghasilkan  enzim  ekstraseluler.  Penelitian  ini dilakukan dengan mengisolasi bakteri dari saluran pencernaan Entok (Cairina moschata) untuk mendapatkan bakteri asam laktat dari genus Pediococcus spp. dan Lactobacillus spp. sebagai kandidat probiotik unggas. Isolasi dilakukan dengan mengambil isi dalam pada  saluran  pencernaan  kemudian  diencerkan  dengan  pengenceran  bertingkat  dan dibiakkan dengan metode pour plate pada media MRS. Kemudian dipilih koloni bakteri yang  berbeda  untuk  isolasi  lebih  lanjut.  Isolat  bakteri  diambil  dari  3  sumber  yakni proventrikulus,  duodenum,  dan  ileum.  Identifikasi  dilakukan  secara  morfologi  dan fisiologi.  Identifikasi  morfologi  meliputi  identifikasi  koloni  bakteri  dan  sel  bakteri. Identifikasi  secara  fisiologi  dilakukan  dengan  uji  katalase,  pembentukan  gas  H2S, produksi  indol,  motilitas,  dan  kemampuan  memfermentasi  karbohidrat.  Kakteristik bakteri  Pediococcus  spp.  dan  Lactobacillus  spp.  sebagai  kandidat  probiotik  unggas dilihat kemampuan menghasilkan enzim fitase dan protease, serta aktivitas antimikroba patogen  Escherichia  coli  ATCC  25922  dan  Staphylococcus  aureus.  Berdasarkan  hasil identifikasi  secara  morfologi,  fisiologi,  kemampuan  dalam  menghasilkan  enzim  fitase dan  protease,  serta  aktivitas  antimikroba  5  isolat  untuk  identifikasi  berdasarkan  gen sekuen  16S  rRNA.  Hasil  sekuensing  menunjukkan  isolat  D3  merupakan  Pediococcus pentosaceus strain AM26, isolat P2 merupakan Pediococcus pentosaceus strain L1, dan isolat  M1S  dan  M8S  merupakan  Lactobacillus  salivarius  strain  RBL73,  serta  M3S merupakan Lactobacillus salivarius strain 2968.
Kata Kunci :  isolasi,  entok,  Pediococcus  spp.,  Lactobacillus  spp.  probiotik,    bakteri  asam laktat.

## Abstract
Probiotics  are  live  microorganisms  that  can  be  useful  for  increasing  livestock productivity, both feed digestibility and health. The digestive tract is one of the sources of  probiotics.  Lactic  acid  bacteria  (LAB)  is  a  microorganism  that  is  widely  used  as probiotics  for  poultry  and  has  the  advantage  of  being  able  to  produce  extracellular enzymes.  This  study  was  conducted  by  isolating  bacteria  from  the  Digestive  Tract  of Entok (Cairina moschata) to obtain lactic acid bacteria, namely Pediococcus spp. and Lactobacillus  spp.    as  a  candidate  for  poultry  probiotics.  Isolation  is  carried  out  by taking the deep contents of the gastrointestinal tract then diluted with stratified dilution and bred by the pour platemethod  on MRS media. Then different  colonies of  bacteria are selected for further isolation. Bacterial isolates are taken from 5 sources, namely proventriculus,  duodenum,  ileum,  cecum,  and  empedal.  Identification  is  carried  out morphologically  and  physiologically.  Morphological  identification  includes  the identification of colonies of bacteria and bacterial cells. Physiological identification is carried out by catalase tests, H2 S gas formation, indole production, motility, and the ability  to  ferment  carbohydrates.  Characteristics  Pediococcus  spp.  and  Lactobacillus spp.  as a poultry probiotic candidate seen in the ability to produce phytase and protease enzymes,  as  well  as  the  antimicrobial  activity  of  pathogenic  Escherichia  coli  ATCC 25922 and Staphylococcus aureus.  Based on the results of identification in morphology, physiology, ability to  producephytase and protease enzymes, as  well as antimicrobial activity,  4  isolates  were  selected  for  identification  based  on  the  16S    rRNA  sequence gene. The sequencing results showed that the D3 isolate was Pediococcuspentosaceus strain  AM 26, P2 isolate  was  Pediococcuspentosaceus strain  L1, the isolate MIS and M8S was Lactobacillus salivarius strain RBL73, and the isolate M3S was Lactobacillus salivarius strain 2968.
Keywords: isolation, entok, Pediococcus spp., probiotics, lactic acid bacteria.

## Pendahuluan
Mikroorganisme  yang  terdapat  dalam  saluran  pencernaan  unggas  berperan  penting dalam  berbagai  genus  mikroflora  bagi  kehidupan  makhluk  hidup.  Keseimbangan  antara mikroba-mikroba  yang  menguntungkan  dan  merugikan  dalam  saluran  pencernaan  harus diperhatikan  agar  produktivitas  ternak  tidak  menurun. ( Soeharsono,  2010 ) ,  menjelaskan bahwa keseimbangan mikroba tercapai bila saluran pencernaan didominasi oleh kelompok bakteri non patogen. Pengaruh dominasi bakteri indigenous atau asli pada saluran pencernaan yang sering disebut “Friendly bacteria” menandakan bahwa pencernaan dalam kondisi sehat. Salauran pencernaan yang sehat merupakan pendukung utama kesehatan tubuh ternak secara keseluruhan.  Sehingga  dapat  dikatakan  bahwa  keseimbangan  mikroba  dalam  saluran pencernaan  memiliki  peranan  penting  dalam  menjaga  kesehatan  ternak.  Salah  satu  cara memodifikasi keseimbangan  mikroba dalam  saluran pencernaan adalah dengan pemberian pakan tambahan (feed additive).
Probiotik  merupakan  mikroorganisme  yang  non-patogen  yang  hidup  dapat memberikan  dampak  positif  bagi  inangnya  apabila  diberikan  dalam  jumlah  yang  cukup
(Watson dan Preedy, 2015) . Mikroba yang berpotensi dijadikan probiotik adalah kelompok bakteri asam laktat (BAL). BAL memiliki kemampuan untuk merombak senyawa komplek menjadi  sederhana  dan  menjadikannya  asam  laktat.  Produk  asam  dapat  menghambat pertumbuhan  mikroba  patogen  (Natalia  dan  Priadi,  2006).  Hal  ini  menjadi  salah  satu karakteristik kandidat bakteri untuk dijadikan probiotik.  (Rahayu et al., 2004) menjelaskan bahwa,  pertumbuhan Salmonella dan Staphylococcus aureus dapat dihambat apabila pada bahan  terdapat  BAL.  Selain  menghambat  pertumbuhan  patogen,  probiotik  juga  mampu menyeimbangkan mikroflora, meningkatkan efisiensi penyerapan pakan, dan meningkatkan daya  tahan  tubuh  apabila  diberikan  pada  ternak  unggas  (Salminen  dan  Loveren,  2012). Dilaporkan  oleh  (Rehman  et  al  (2020),  penggunaan  probiotik  pada  ternak  unggas  dapat meningkatkan  produktivitas  dan  kesehatan  ternak.  Pemanfaatan  probiotik  juga  untuk meningkatkan kecernaan pakan.
Salah  satu  bakteri  kelompok  BAL  ialah  Pediococcus.  dan  Lactobacillus    Bakteri bakteri Pediococcus biasa digunakan pada industri pangan untuk pengolahan daging. Namun selain  itu,  pengguanaan  bakteri  Pediococcus  pada  beberapa  penelitian  menunjukkan kemampuan  untuk  dijadikan  probiotik.  Penelitian  yang  dilakukan  oleh  (Wijayanto,  2014) dan  (Edi,  2017)  membuktikan  bahwa  pemberian  P.  Pentosaceus  mampu  meningkatkan konsumsi  pakan  dan  menurunkan  angka  konversi  pakan  pada  ayam  pedanging.  Menurut (Sumarsih  (2012),  tidak  semua  bakteri  asam  laktat  dapat  menjadi  probiotik.  Bakteri  asam laktat yang menjadi probiotik yakni dapat berguna sebagai suplemen pakan dan bermanfaat bagi  kesehatan  ternak.  Hal  tersebut  menunjukkan  bahwa  bakteri  dari  genus  Lactobacillus berdampak positif dalam mempengaruhi peningkatan kesehatan karena mampu menstimulasi respon imun dan menghambat patogen serta kemampuan Lactobacillus dalam menghambat pertumbuhan bakteri patogen, merangsang pembentukan antibodi.
Berbagai  banyak  sumber  bakteri  probiotik,  salah  satunya  pada  saluran  pencernaan entok. Entok  (Cairina  moschata)  merupakan  ternak  pedaging  yang  paling  besar  dibanding itik  lain,  yang  memiliki  lemak karkas  lebih rendah dari  itik, tahan terhadap penyakit  yang biasa menyerang unggas, dan memiliki kemampuan adaptasi yang tinggi (Tanwiriah, 2011). Berdasarkan uraian tersebut, maka penelitian ini dilakukan bertujuan untuk mengidentifikasi dan mengetahui kemampuan Pediococcus spp. dan Lactobacillus spp.  dalam menghidrolisis asam  fitat  dan  protein,  serta  aktivitas  antimikroba  yang  diisolasi  dari  saluran  pencernaan entok terhadap E. coli dan S. aureus.

## Metode Penelitian
Penelitian  ini  diawali  dengan  mengisolasi  dari  saluran  pencernaan  entok  yang berumur ± 9 bulan pada organ proventrikulus, duodenum, dan ileum. Isi organ-organ tersebut dimasukkan pada PBS steril dan diencerkan dengan teknik pengenceran berseri. Dilakukan 4  kali  pengenceran  yaitu  10-1,  10-2,  10-3,  dan  10-4  dengan  masing-masing  tabung  berisi larutan PBS (Phosphate Buffered Saline) 9  mL.  Kemudian ditumbuhkan pada MRS padat
menggunakan  metode pour plate dan diinkubasi  selama 24  jam dengan suhu 37º C secara anaerob.  Kemudian  dilanjutkan  dengan  pengamatan  morfologi  koloni  bakteri.  Selanjutkan identifikasi  dilanjutkan  dengan  pengecatan  gram,  uji  katalase,  uji  pada  media  SIM,  uji kemampuan  fermentasi  glukosa,  uji  kemampuan  enzimatis  (fitase  dan  protease),  dan  uji kemampuan  aktivitas  antimikroba.  Setelah  serangkaian  pengujian  yang  dilakukan  4  isolat terbaik dipilih untuk dilanjutkan untuk sekuensing dengan gen 16S rRNA.

## Hasil dan Pembahasan

## Isolasi dan Identifikasi Bakteri
Pengambilan  bakteri  dari  lingkungan  asal  yang  kemudian  dibiakkan  pada  medium buatan disebut  isolasi. Isolasi pada penelitian  ini  menggunakan  media selektif  yakni MRS (de Man Rogosa Shaped). Isolat bakteri bersumber dari saluran pencernaan entok (Cairina moschata). Bakteri diisolasi dari 3 sumber organ yaitu 1) proventrikulus; 2) duodenum; dan 3) ileum. Selanjutnya isolat diidentifikasi secara morfologi dan fisiologi yang disajikan pada Tabel 1 dan Tabel 2.
Identifikasi  isolat  dilakukan  dengan  dua  cara  yakni  secara  morfologi  dan  fisiologi. Identifikasi  morfologi  meliputi  pengamatan  secara  makroskopis  dan  mikroskopis. Pengamatan makroskopis dilakukan dengan melihat bentuk koloni, warna, tepian, dan sudut elevasi dari koloni yang tumbuh pada media agar (Ibrahim et al., 2017). Proses ini merupakan tahapan  awal untuk membedakan antar koloni campuran untuk memperoleh  biakan  murni (single  colony).  Penelitian  yang  dilakukan  (Rina  et  al.  (2020)  menunjukkan  karakteristik morfologi  bakteri asam  laktat  yang diisolasi dari  saluran pencernaan entok yaitu  memiliki bentuk bulat atau bergerigi, permukaan datar atau cembung, warna putih atau krim.
Identifikasi secara mikroskopis dibantu dengan mikroskop. Identifikasi ini dilakukan dengan pewarnaan Gram pada bakteri untuk melihat Gram dan morfologi sel bakteri (Ibrahim et al., 2017). Bakteri Gram positif ditandai dengan warna ungu dari zat warna gentian violet yang dapat  dipertahankan.  Warna  ungu  tersebut  mampu  dipertahankan  karena  pada  dinding  sel bakteri  Gram  positif  mengandung  peptidoglikan  (Dheta,  2019).  Peptidoglikan  yang  tebal pada dinding sel bakteri menyerap zat warna pertama walaupun dilunturkan dengan etanol. Sehingga zat warna  selanjutnya (safranin) tidak dapat terserap dan warna sel  bakteri akan tetap  berwarna  seperti  zat  pewarna  pertama  (Ibrahim  et  al.,  2017).  Identifikasi  secara fisiologis  meliputi  uji  katalase,  uji  indol,  motilitas,  dan  uji  kemampuan  bakteri  dalam memfermentasi  karbohidrat  (Yulvizar,  2013;  Laily  et  al.,  2013).  Hasil  uji  katalase  pada penelitian ini menunjukkan 2 isolat (D3 dan P2) dan 3 isolat (M1S, M3S, dan M8S) tidak memiliki  aktifitas    katalase.  Aktivitas  enzim  katalase  ditunjukkan    dengan  terbentuknya gelembung  gas.    Bakteri  asam  laktat    tidak  memproduksi  enzim  katalase  yang  dapat mengubah    hidrogen  peroksida  dan  oksigen  (Dheta,  2019).  Identifikasi  secara  fisiologis dilanjutkan  dengan    uji  pada  media  SIM  (sulfide  indol  motility).  Menurut  (Herdian  et  al, 2018), karakteristik bakteri asam laktat yang cocok dijadikan bakteri probiotik adalah Gram positif,  katalase  negatif,  bentuk  batang  atau  bulat,  dan  non-motil.  Hasil  pada  media  SIM
menunjukkan seluruh isolat tidak memproduksi gas H2S, tidak membentuk indol, dan non- motil.
Identifikasi  selanjutnya  dilakukan  dengan  melihat  kemampuan  bakteri  untuk memfermentasi  gula.  Hasil  uji  fermentasi  gula  dari  bakteri  asam  laktat  yang  sebagian teridentifikasi  dari  genus  Pediococcus  spp.  menunjukkan  isolat  (D3,  P2,)  mampu memfermentasi laktosa, arabinosa, maltosa, dan glukosa tanpa menghasilkan gas, sedangkan uji  fermentasi  gula  dari  bakteri  yang  terindentifikasi  dari  genus  Lactobacillus  spp.  isolat (MIS,  M3S  DAN  M8S)  menunjukkan  hasil  yang  sama  bahwa  mampu  menfermentasi glukosa,  sukrosa,  maltosa,  laktosa,  arabinosa  tetapi  tidak  dapat  memfermentasi  ramnosa. Penelitian  yang dilakukan  (Sujaya et al. (2001)  mendapatkan hasil  bahwa Pediococcus sp. tidak mampu memfermentasi laktosa. Namun penelitian  yang dilakukan  (Porto et al (2017) menerangkan bahwa Pediococcus pentosaceus JCM 5890 mampu memfermentasi laktosa.
How to cite:
Khairunnisah,  Fatimah  Azh  Zhahro  Bagis,  Fitri  Andriani,  Khairil  Anwar,  Zaid  AL  Gifari,  Anwar  Rosyidi, Muhamad  Ali  (2022)  Isolasi,  Identifikasi,  dan  Karakterisasi  Pediococcus  spp.  dan  Lactobacillus  spp.  dari Saluran Pencernaan Entok (Cairina moschata) Sebagai Kandidat Probiotik Unggas, Syntax Literate : Jurnal
Ilmiah Indonesia (7)12, http://dx.doi.org/10.36418/syntax-literate.v7i12.10835 E-ISSN: 2548-1398
Published by:
Ridwan Institute

## Tabel 1.
Hasil identifikasi morfologi bakteri saluran pencernaan entok No. Kode Isolat Sumber Isolat Morfologi Koloni Morfologi Sel Margin Permukaan Ukuran Warna Gram Bentuk Sel 1. D3 Duodenum Bergerigi Datar Kecil Putih + Bulat 2. P2 Proventrikulus Bergerigi Cembung Kecil Putih kekuningan + Bulat 3. M1S Duodenum Halus Umbonate Kecil Putih kekuningan + Bulat 4. M3S Duodenum Halus Umbonate Kecil Putih kekuningan + Lonjong 5. M8S Ileum Halus Cembung Kecil Putih + Lonjong
Sumber Data Primer Diolah Tahun 2022
Tabel 2. Hasil identifikasi fisiologi  bakteri saluran pencernaan entok
No. Kode Isolat Katalase Poduksi H 2 S Indol  Motilitas Kemampuan Fermentasi Gula Gas dari Glukosa Sukrosa  Laktosa  Arabinosa  Maltosa  Ramnosa  Glukosa 1. D3 - - - - - + (lemah) + + - + - 2. P2 - - - - - + (lemah) + + - + - 3. M1S - - - - + + + + - + - 4. M3S - - - - + + + + - + - 5. M8S - - - - + + + + - + -
Sumber Data Primer Diolah Tahun 2022
How to cite: Khairunnisah,  Fatimah  Azh  Zhahro  Bagis,  Fitri  Andriani,  Khairil  Anwar,  Zaid  AL  Gifari,  Anwar  Rosyidi, Muhamad  Ali  (2022)  Isolasi,  Identifikasi,  dan  Karakterisasi  Pediococcus  spp.  dan  Lactobacillus  spp.  dari Saluran Pencernaan Entok (Cairina moschata) Sebagai Kandidat Probiotik Unggas, Syntax Literate : Jurnal
Ilmiah Indonesia (7)12, http://dx.doi.org/10.36418/syntax-literate.v7i12.10835 E-ISSN: 2548-1398
Published by:
Ridwan Institute

## Aktivitas Enzim Ekstraseluler Bakteri Kandidat Probiotik
Seleksi bakteri kandidat probiotik unggas penghasil enzim ekstraseluler bersumber dari saluran  pencernaan  entok  dilakukan  berdasarkan  kemampuan  bakteri  dalam  memecah protein  dan  asam  fitat.  Protein  merupakan  kumpulan  asam-asam  amino  yang  diikat  oleh ikatan peptida. Sedangkan asam fitat merupakan senyawa organik yang mengandung fosfat dengan bersifat anti nutrisi yang menghambat pencernaan protein dan mineral pada unggas. Hasil  kemampuan  bakteri  dalam  menghasilkan  enzim  protease  dan  fitase  disajikan  pada Tabel  3 .
Tabel 3. Hasil aktivitas enzim ekstraseluler bakteri kandidat probiotik
No. Kode isolat Aktivitas Enzim Ekstraseluler Fitase Protease 1. D3 + (5 mm)
+
(8 mm)
2. P2
+ (8 mm)
+
(8 mm)
3.
M1S + (9 mm)
+++
(26 mm)
4.
M3S + (10 mm) + (3 mm)
5.
M8S + (8 mm) + (10)
Keterangan : mengikuti prosedur Penaloza (2019), aktivitas enzim ekstraseluler dinilai dari diameter  zona  bening  yakni  -  :  tidak  terdapat  zona  bening;  +  :  diameter  6-10  mm;  ++  : diameter 11-20 mm; dan +++ : diameter  20 mm.

## Aktivitas Antimikroba Bakteri Kandidat Probiotik
Kemampuan  BAL  dalam  menghambat  pertumbuhan  bakteri  patogen  menjadi  salah satu landasan untuk menyeleksi bakteri untuk dijadikan probiotik. Aktivitas antimikroba dari BAL berfungsi untuk menjaga keseimbangan mikroflora dalam usus unggas (Shokryazdan et  al. ,  2014).  Uji  aktivitas  antimikroba  merupakan  pengujian  yang  dilakukan  untuk mengetahui  aktivitas  isolat  bakteri  dalam  menghambat  pertumbuhan Escherichia  coli dan Staphylococcus aureus . Penghambatan pertumbuhan dari E.coli dan S. aureus terjadi karena bakteri  isolat  mampu  menghasilkan  senyawa  antibakteri  (Oktavia  dan  Pujiyanto,  2018). Pengujian  aktivitas  antimikroba  terhadap  patogen E.  coli  ATCC  25922 mewakili  bakteri Gram negatif dan S. aureus mewakili Gram positif. Hasil uji aktivitas antimikroba disajikan pada Tabel 4 .
Tabel 4. Hasil aktivitas antimikroba bakteri terhadap patogen
No. Kode Isolat Aktivitas Antimikroba Escherichia coli ATCC 25922 Staphylococcus aureus 1. D3 + ++
(6 mm) (10 mm) 2. P2 + (8 mm)
++
(10 mm)
3. MIS ++ (9 mm)
+ (7 mm) 4.
M3S ++ (10 mm) +
(4 mm) 5.
M8S + (5 mm) + (4 mm) Keterangan : Diameter zona jernih dinilai berdasarkan prosedur dari (Bao et al. , (2012). -: ≤ 0 mm, ±: 0-4 mm, +: 4-8 mm, ++ 8-12 mm, dan +++: 12 mm.

## Identifikasi  Bakteri Secara Molekuler
Identifikasi dilanjutkan dengan amplifikasi dan sekuensing gen 16S rRNA dari isolat bakteri.  Berdasarkan  pengamatan  secara  morfologi,  fisiologi,  kemampuan  dalam menghasilkan enzim ekstraseluler, dan kemampuan antimikroba terhadap patogen dipilihlah 2 isolat yakni D3 dan P2 dari genus Pedicoccus spp. dan 3 isolat dari genus Lactobacillus spp. yaitu MIS, M3S dan M8S.
Produk  PCR  yang  sudah  terbukti  bagus  dilanjutkan  dengan  sekuensing  DNA.    Data sekuensing disejajarkan  dengan data base 16S rRNA yang tersedia pada BLAST-N ( Basic Local Alignment Search Tool – Nucleotide ) pada GenBank NCBI. Bakteri yang diidentifikasi dengan  gen    16S rRNA  dengan  skor  kemiripian  97%  diklasifikasikan  sebagai  genus  yang sama  dan  skor  kemiripan  99%  diklasifikasikan  sebagai  spesies  yang  sama  (Reller et  al. , 2007). Setelah disejajarkan, dari genus Pediococcus spp. isolat D3 memiliki kemiripan 100% dengan Pediococcus  pentosaceus  strain  AM26 dan  isolat  P2  memiliki  kemiripan  100% Pediococcus pentosaceus strain L1 dan dari genus Lactobacillus spp . isolat MIS dan M8S memiliki  kemiripan  100%  dengan Lactobacillus  salivarius  strain  RBL73 serta  isolat  M3S memiliki  kemiripan  dengan Lactobacillus  salivarius  strain  2968 Tabel  5. menunjukkan perbandingan sekuen 16S rRNA dengan database  pada GenBank.
Tabel 5. Perbandingan sekuen Gen 16S rRNA dengan database Genbank Kode Isolat Nama Strain Acc. No Query Coverage Max. Identity D3 Pediococcus pentosaceus strainAM26 ON739193.1 100,00% 100,00% P2 Pediococcus pentosaceus strain L1 MW673723.1 100,00% 100,00% MIS Lactobacillus salivarius strain RBL73 ON090426.1 100.00% 99,88% M3S Lactobacillus salivarius strain 2968 MT611904.1 100.00% 99,88% M8S Lactobacillus salivarius strain RBL73 ON090426.1 100.00% 100,00%
Sumber Data Primer Diolah Tahun 2022

## Kesimpulan
Berdasarkan hasil penelitian yang telah dilakukan, didapatkan sebanyak 5 isolat yang bersumber  dari  saluran  pencernaan  entok  (Cairina  moschata).  Seluruh  isolat  memiliki keunggulan  dalam  menghidrolisis  asam  fitat  dan  protein.  Kemampuan  isolat  dalam menghasilkan  senyawa  antimikroba  ditunjukkan  oleh  isolat  (D3,  dan  P2)  dari  genus Pediococcus spp. dan isolat (MIS, M3S dan M8S) dari genus Lactobacillus spp. yang mampu menghambat  pertumbuhan  E.coli  dan  seluruh  isolat  mampu  menghambat  pertumbuhan  S. aureus.  Serangkaian  identifikasi  yang  dilakukan  (morfologi,  fisiologi,  kemampuan menghasilkan enzim fitase dan protease, serta aktivitas antimikroba) menjadi landasan untuk memilih  isolat  penghasil  probiotik  pada  saluran  pencernaan  entok  yakni  D3  dan  P2  serta MIS,  M3S,  M8S  untuk  dilanjutkan  tahap  identifikasi  berdasarkan  gen  16S  rRNA.  Hasil identifikasi  membuktikan  isolat  D3  merupakan  Pediococcus  pentosaceus  strainAM26  dan isolat P2 merupakan Pediococcus pentosaceus strain L1, isolat MIS merupakan Lactobacillus salivarius  strain  RBL73,  isolat  M3S  merupakan  Lactobacillus  salivarius  strain  2968  serta isolat M8S merupakan Lactobacillus salivarius strain RBL73.

## BIBLIOGRAFI
Detha,  A.,  2019.  Karakteristik  bakteri  asam  laktat  yang  diisolasi  dari  susu  kuda  sumba. Jurnal Kajian Veteriner, 7(1), pp.85-92.
Edi, K., 2017. Pengaruh Pemberian Probiotik Bakteri Asam Laktat Lactococcus plantarum dan  Pediococcus  pentosaceus  Menggunakan  Pengemban  Ubi  Jalar  Ungu  Terhadap Performan Broiler (Doctoral dissertation, Universitas Andalas).
Herdian, H., Istiqomah, L., Damayanti, E., Suryani, A.E., Anggraeni, A.S., Rosyada, N. dan Susilowati, A., 2018. Isolation of cellulolytic  lactic-acid bacteria  from Mentok (Anas moschata) gastro-intestinal tract. Tropical Animal Science Journal, 41(3), pp.200-206.
Ibrahim, A., Fridayanti, A. dan Delvia, F., 2017. Isolasi dan identifikasi bakteri asam laktat (BAL) dari buah mangga (Mangifera indica L.). Jurnal Ilmiah Manuntung, 1(2), pp.159- 163.
Laily, I.N., Utami, R. dan Widowati, E., 2013. Isolasi dan karakterisasi bakteri asam laktat penghasil Riboflavin dari produk fermentasi sawi asin. Jurnal aplikasi teknologi pangan, 2(4).
Natalia,  L.  dan  Priadi,  A.,  2006.  Sifat  Lactobacilli  yang  diisolasi  dari  usus  ayam  sebagai probiotik. In Seminar Nasional Teknologi Peternakan dan Veteriner.
Oktavia, N. dan Pujiyanto, S., 2018. Isolasi dan uji antagonisme bakteri endofit tapak dara (Catharanthus Roseus, L.) terhadap bakteri Escherichia coli dan Staphylococcus aureus. Berkala Bioteknologi.
Porto,  M.C.W.,  Kuniyoshi,  T.M.,  Azevedo,  P.O.S.,  Vitolo,  M.  dan  Oliveira,  R.S.,  2017. Pediococcus spp.: An  important  genus of lactic acid bacteria and pediocin producers. Biotechnology Advances, 35(3), pp.361-374.
Rehman,  A.,  Arif,  M.,  Sajjad,  N.,  Al-Ghadi,  M.Q.,  Alagawany,  M.,  Abd  El-Hack,  M.E., Alhimaidi, A.R., Elnesr, S.S., Almutairi, B.O., Amran, R.A. dan Hussein, E.O.S., 2020. Dietary  effect  of  probiotics  and  prebiotics  on  broiler  performance,  carcass,  and immunity. Poultry Science, 99(12), pp.6946-6953.
Reller,  L.B.,  Weinstein,  M.P.  dan  Petti,  C.A.,  2007.  Detection  and  identification  of microorganisms  by  gene  amplification  and  sequencing.  Clinical  infectious  diseases, 44(8), pp.1108-1114.
Risa,  Y.K.,  Harimurti,  S.  dan  Widodo,  W.,  2020.  Screening  for  probiotic  of  lactic  acid bacteria isolated from the digestive tract of a native Aceh duck (Anas platyrhynchos). Biodiversitas Journal of Biological Diversity, 21(7).
Salminen,  S.  dan  van  Loveren,  H.,  2012.  Probiotics  and  prebiotics:  health  claim substantiation. Microbial Ecology in Health and Disease, 23(1), p.18568.
Shokryazdan, P., Sieo, C.C., Kalavathy, R., Liang, J.B., Alitheen, N.B., Faseleh Jahromi, M. dan  Ho,  Y.W.,  2014.  Probiotic  potential  of  Lactobacillus  strains  with  antimicrobial activity against some human pathogenic strains. BioMed research international, 2014.
Soeharsono.  2010.  Probiotik.  Basis  Ilmiah,  Aplikasi  dan  Aspek  Praktis.  Bandung:  Widya Padjajaran.
Sujaya,  I.N.,  Amachi,  S.,  Yokota,  A.,  Asano,  K.  dan  Tomita,  F.,  2001.  Identification  and characterization of lactic acid bacteria in ragi tape. World Journal of Microbiology and Biotechnology, 17(4), pp.349-357.
Tanwiriah,  W.,  2011.  Performansi  Entog  (Cairina  moschata)  Jantan  yang  Diberi  Ransum Berbagai Imbangan Energi/Protein pada Sistem Kandang Berbeda. Indonesian Journal of Applied Sciences, 1(1).
Watson, R.R. dan Preedy, V.R. eds., 2015. Probiotics, prebiotics, and synbiotics: bioactive foods in health promotion. Academic Press.
Wijayanto, A., 2014. Pengaruh Penambahan Whey Keju Dengan Bakteri Asam Laktat (Bal) Pediococcus Pentosaceus Dalam Pakan Terhadap Penampilan Produksi Ayam Pedaging (Doctoral dissertation, Universitas Brawijaya).
Yulvizar, C., 2013. Isolasi dan Identifikasi Bakteri Probiotik pada Rastrelliger sp. biospecies, 6(2).

## Copyright holder:
Khairunnisah, Fatimah Azh Zhahro Bagis, Fitri Andriani, Khairil Anwar, Zaid AL Gifari, Anwar Rosyidi, Muhamad Ali (2022)

## First publication right:
Syntax Literate: Jurnal Ilmiah Indonesia
This article is licensed under: