## Karakter Isolat Bakteri P1 dari Rhizosfer Tanaman Tebu ( Saccharum officinarum)
R. N Maudy, E. Zulaika dan M. Shovitri
Departemen Biologi, Fakultas Sains, Institut Teknologi Sepuluh Nopember (ITS) Surabaya
e-mail : ennyzulaika123@gmail.com
Abstrak — Rhizosfer  tanaman  tebu  merupakan  daerah  yang ideal  bagi  bermacam-macam  mikroorganisme  tanah,  salah satunya  adalah  bakteri.  Tujuan  dari  penelitian  adalah karakterisasi  isolat  bakteri  dan  genus  dari  kawasan  rhizosfer tanaman  tebu.  Isolat  yang  digunakan  adalah  isolat  yang diisolasi dari rhizosfer tanaman tebu. Selanjutnya dikarakterisasi  bentuk  koloni,  bentuk  sel,  uji  fisiologi  dan reaksi  biokimianya.  Isolat  bakteri  P1  kemudian  diidentifikasi genus  dengan  metode  generic  assignment  menggunakan Bergey’s  Mannual  of  Determinative  Bacteriology.    Hasil identifikasi genus isolat bakteri P1 yaitu genus Bacillus.
Kata Kunci — Bacillus, bakteri,  identifikasi, rhizosfer

## I. PENDAHULUAN
HIZOSFER  merupakan daerah yang ideal bagi tumbuh dan  berkembangnya  mikroorganisme  tanah.  Potensi bakteri  pada  rhizosfer  tanah  sangat  bervariasi,  diantaranya mampu  melarutkan  fosfat,  mampu  menskresikan  fosfatase yang berperan dalam proses pengubahan P organik menjadi P anorganik dan memfiksasi nitrogen [1].
Bakteri rhizosfer merupakan suatu kelompok bakteri yang hidup  secara  saprofit,  simbiosis  mutualistik,  komensalistik, dan  parasitik  pada  daerah  rhizosfer  [2].  Semakin  besar keanekaragaman bakteri di dalam tanah dapat menyebabkan kondisi  tanah  semakin  sehat.  Keanekaragaman  dan identifikasi  bakteri  secara  morfologi  tidak  semudah mengidentifikasi  spesimen  tumbuhan  dan  hewan  sebab struktur  bakteri  angat  sederhana  dan  sulit  dibedakan  hanya berdasarkan  morfologi  saja..    Tanah  kawasan  mangrove telah  diketahui  keberadaan  bakteri  melalui  pendekatan taksonomi  numerik,  dimana  bakteri  tersebut  dapat melarutkan fosfat, mengasilkan hormon IAA, dan mendegradai senyawa organik [3]. Pada penelitian [4], telah diisolasi  bakteri dari rhizosfer tanaman tebu  yaitu isolat P1. Isolat  tersebut  mempunyai  potensi  mengikat  nitrogen, melarutkan  fosfat  dan  menghasilkan  hormon  IAA  tetapi secara  rinci  belum  diketahui  potensi  sebagai  agen biofertilizer.  Berdasarkan  karakter  biokimia  isolat  P1, cenderung  masuk  ke  grup  Bacillus  dengan  karakter  kunci yaitu sel berbentuk batang, Gram positif, motilitas, memiliki endospora,  bersifat  aerob  atau  fakultatuf  anaerob  dan katalase positif
Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui genus isolat  bakteri  P1  dari  rhizosfer  tanaman  tebu  di  daerah rhizosfer dengan karakter biokimia bakteri P1.

## II. METODOLOGI

## A. Waktu dan Tempat Penelitian
Penelitian  dilakukan  pada  bulan  Januari  sampai  April 2019  di  Laboratorium  Mikrobiologi  dan  Bioteknologi,
Departemen Biologi, Fakultas Ilmu Alam Institut Teknologi Sepuluh Nopember Surabaya.

## B. Subkultur dan Purifikasi Isolat
Isolat  bakteri  dari  stok  gliserol  diambil  sebanyak  1  tetes kemudian  diinokulasikan  pada  medium  NA  datar  pada cawan  Petri  dengan  metode spread  plate secara  aseptis. Kultur  diinkubasi  selama  24  jam  pada  suhu  ruang.  Isolat bakteri  yang telah di subkultur dan  terbentuk sebuah koloni kemudian  di  purifikasi.  Kultur  diinkubasi  selama  24  jam. Koloni  yang  tumbuh  diamati  sampai  diperoleh  koloni  yang seragam.

## C. Karakterisasi Fenotipik
Data  fenotipik  yang  berasal  dari  bakteri  dikumpulkan meliputi  karakter  umum  yaitu  karakter  morfologi,  reaksi biokimia  dan  respon  fisiologi.  Karakter  yang  diperoleh diubah  menjadi  nilai  (+)  apabila  menunjukkan  hasil  positif, dan  nilai  (-)  apabila  menunjukkan  hasil  negative.  Data ditabulasikan  kedalam  matrik  n  x  t  (n  adalah  jumlah  isolat

## R
Tabel 1.
Identifikasi dengan Profile Matching berdasarkan karakter kunci genus Bacillus . No Morfologi, Fisiologi dan Uji Biokimia 1 Morfologi Koloni Putih 3 Bentuk Sel Basil 4 Pewarnaan Gram Gram positif 5 Pewarnaan Endospora Endospora 6 Kebutuhan Oksigen Aerob Obligat 7 Fermentasi Karbohidrat
Glukosa Galaktosa Xylosa Manosa Maltosa Sukrosa Laktosa Manitol Sorbitol
8 Sifat Oksidasi dan Fermentasi Fermentasi 9 Uji Resistensi terhadap NaCl NaCl 6,5% 10 Uji Fisiologi
Uji Katalase Uji Oksidase Hidrolisis Lipid Hidrolisis Amilum Hidrolisis Kasein Hidrolisis Gelatin Uji Sitrat Uji MR Uji VP Uji H₂S Uji Indol
bakteri,  t  adalah  jumlah  karakter).  Data  matrik  n  x  t  diedit menggunakan program PFE ( Programmer’s File Editor ) [5].

## III. HASIL DAN PEMBAHASAN

## A. Karakterisasi Isolat
Isolat  bakteri  yang  telah  dikarakterisasi  kemudian disatukan dalam format tabel n x t sebelum diklasifikasikan dengan pendekatan taksonomi numerik fenetik. Karakterisasi  fenotipik  yang  diujikan  pada  penelitian  ini meliputi  pengamatan  makroskopis  meliputi  pngamatan morfologi  koloni,  pengamatan  mikroskopis  meliputi  bentuk sel dan pewarnaan sel,  uji  biokimiawi  seperti  uji  kebutuhan oksigen,  kemampuan  fermentasi  karbohidrat,  uji  resistensi terhadap NaCl, uji enzim dan fisiologis terdiri dari uji sitrat, MR-VP, uji H 2 S dan uji Indol. Data karakter fenotipik isolat bakteri  diberi  skor,  yaitu  angka  1  untuk  unit  karakter  yang positif  dan  angka  0    untuk  unit  karakter  yang  negatif. Karakter  biokimia  dan  morfologi  isolat  bakteri  P1  dapat dilihat pada Tabel 1 [6].

## B. Identifikasi Genus dengan Generic Assignment
Isolat  bakteri  P1 kemudian  diidentifikasi  berdasarkan Generic Assignment. Identifikasi  isolat bakteri P1 dilakukan menggunakan panduan dari Bergey’s  manual  of determinative  bacteriology [6].  Identifikasi  terhadap  isolat menggunakan metode profile matcing dengan karakter kunci sesuai  dengan  genus  masing-masing.  Hasil  identifikasi selengkapnya dapat dilihat pada Tabel 2 [6].
Berdasarkan  Tabel  2,    isolat  P  1  diidentifikasi  sebagai genus Bacillus karena  mempunyai  karakter  sel  berbentuk
batang,  Gram  positif,  motil,  memiliki  endospora,  bersifat aerob/fakultatif  anaerob,  kemoorganotrof  dan  katalase positif.  Genus Bacillus mempunyai  karakter  kunci  yaitu  sel berbentuk batang, Gram positif,  motil,  memiliki endospora, bersifat  aerob/  fakultatif  anaerob,  kemoorganotrof  dan katalase positif. [6].

## 1V. KESIMPULAN
Berdasarkan  karakterisasi  menggunaan  uji  biokimia  dan pengamatan morfologi serta identifikasi menggunakan profil matching karakter  kunci  didapatkan  hasil    bahwa  isolat bakteri P1 termasuk dalam genus Bacillus.

## UCAPAN TERIMAKASIH
Penulis  Rahma  Nadia  Maudy  mengucapkan  terima  kasih sebesar-besarnya atas dukungan melalui pendanaan Pengabdian  Kepada  Masyarakat  Berbasis  Penelitian  ITS sesuai dengan nomor kontrak 1317/PKS/ITS/2019.

## DAFTAR PUSTAKA
[1]
T.  George,  M.  Gregory,  D.  Read,  and  R.  Buresh,  “Phosphatase Activity  And  Organis  Acids  In  The  Rhizosphere  Of  Potential Agroforestry Species And Maize,” Soil Biol Biochem , vol. 34, pp. 1487–1494, 2002.
[2] G.  Sutariati  and  A.  Whab,  “Karakter  Fisiologis  Dan Kemangkusan Rizobakteri Indigenus Sulawesi Tenggara Sebagai Pemacu Pertumbuhan Tanaman Cabai,” J. Hortik. , vol. 22, no. 1, pp. 57–65, 2012.
[3] D. Rositawati and E. Zulaika, “Keanekaragaman Bakteri Pelarut Fosfat  Dari  Kawasan  Mangrove  Wonorejo  Dengan  Pendekatan Taksonomi Numerik Fenetik,” in Seminar Nasional Biodiversitas VI , 2016.
[4] S.  Sugianto  and  M.  Shovitri,  “Potensi  Rhizobakteri  Sebagai Pupuk  Hayati  Dalam  Media  Pembawa  Vinase-Molase,” Surabaya, 2017.
[5] L.  Sembiring,  “Peranan  Biosistematika  Dalam  Menunjang Pemanfaatan  Keanekaragaman  Hayati,”  in Seminar  Nasional
Biologi , 2004.
[6] J.  G.  Holt,  N.  R.  Krieg,  P.  H.  A.  Sneath,  J.  .  Staley,  and  S.  . Williams, Bergey’s  Manual  of  Determinative  Bacteriology .
Philadelphia: Lippincot Williams & Wilkins, 1994.
Tabel  2. Identifikasi dengan Profile Matching berdasarkan karakter kunci genus
Bacillus . No Karakter Kunci Bacillus Bacillus P 1 1. Sel batang + +
2. Gram
+ + 3. Motilitas + + 4. Endospora + + 5. Aerob/Fakultatif anaerob
+ +
6. Katalase +
+