Jurnal Perikanan Tropis
Volume 7, Nomor 2, 2020 http://jurnal.utu.ac.id/jptropis ISSN: 2355-5564, E-ISSN: 2355-5572

## IDENTIFIKASI BAKTERI PADA SERASAH DAUN MANGROVE YANG TERDEKOMPOSISI DI BANDAR BAKAU KOTA DUMAI

## IDENTIFICATION OF BACTERIA BY MANGROVE LITTER LEAF DECOMPOSING IN BANDAR BAKAU, DUMAI
Putri Wening Ratrinia 1* , Nirmala Efri Hasibuan 1 , Aulia Azka 1 , Sumartini 1 , Apri Mujiyanti 1 , Kurnia Sada Harahap 1 , Muh Suryono 1
1 Program Studi Pengolahan Hasil Laut, Politeknik Kelautan dan Perikanan Dumai, Dumai
*Korespondensi : p.weningratrinia@gmail.com

## Abstract
Bacteria  are  very  important  in  decomposition  and  productivity  activities  in mangrove  ecosystems.  Research  has  been  carried  out  to  determine    Total  Plate Count  and to identify the  dominant bacterial species in the  decomposition process of Rizhopora sp, Xylocarpus sp, dan Avicennia sp litter in Dumai. The isolation of bacteria was carried out by  pour plate method which is used in total calculation of total bacteria is  the Total Plate Count (TPC), Total bacteria in Avicennia sp leaf litter is 0,64 x 10 5 Cfu/ml. Rhizopora sp leaf litter has a colony number   is 0,55 x 10 5 ±  0,01  Cfu/ml. .  The  dominant  bacterial  types  in  the  three  mangrove  species ( Rizhopora  sp,  Xylocarpus  sp,  and  Avicennia  sp)  are  Micrococcus  sp  and Aerococcus sp.
Keywords : Total Plate Count, Micrococcus sp, Aerococcus sp, Organic Matterial

## I. Pendahuluan
Ekosistem  mangrove  merupakan  salah  satu  ekosistem  yang  memiliki produktivitas  tinggi.  Aktivitas  dekomposisi  serasah  mangrove  merupakan penyumbang  utama  ketersediaan  bahan  organik  pada  ekosistem  mangrove. Menurut Sinatryani et al . (2014), ekosistem hutan mangrove merupakan salah satu ekosistem yang memiliki produktivitas tinggi dibandingkan ekosistem lain dengan dekomposisi  bahan  organik  yang  tinggi,  dan  menjadikannya  sebagai  mata  rantai ekologis yang sangat penting bagi kehidupan mahluk hidup yang berada di perairan sekitarnya. Materi organik menjadikan ekosistem mangrove sebagai tempat sumber makanan dan habitat berbagai biota seperti ikan, udang dan kepiting.
Dekomposisi  serasah  mangrove  sangat  tergantung  dari  peran  aktif  bakteri. (Lyla dkk, 2006). Bakteri akan menguraikan serasah secara enzimatik yaitu melalui enzim  proteolitik,  selulolitik  dan  kitinoklastik.  Bakteri  proteolitik  seperti Pseudomonas berperan dalam proses penguraian  protein, bakteri selulolitik seperti Cytophaga, Sporacytophaga yang berperan dalam proses penguraian selulosa dan bakteri  kitinoklastik  seperti Bacillus,  Pseudomonas  dan  Vibri o  berperan  dalam penguraian kitin.
Salah  satu  kawasan  ekosistem  mangrove  yang  terdapat  di  Dumai  adalah Bandar Bakau Dumai dengan luas 22 ha. Jenis mangrove yang terdapat di ekosistem tersebut  antara  lain Avicennia sp, Rhizopora sp, Xylocarpus sp,  dan  lainnya. Identifikasi jenis bakteri pada serasah mangrove di Dumai belum pernah dilakukan. Keberadaan  bakteri  di  ekosistem  mangrove  merupakan  hal  yang  penting  proses
Jurnal Perikanan Tropis
Volume 7, Nomor 2, 2020 http://jurnal.utu.ac.id/jptropis ISSN: 2355-5564, E-ISSN: 2355-5572
dekomposisi  bahan  organik  yang  dimanfaatkan  oleh  organisme  di  ekosistem mangrove  tersebut.  Berdasarkan  hal  tersebut,  identifikasi  bakteri  pada  serasah mangrove  dilakukan  untuk  mengetahui  jenis  bakteri  pengurai  di  ekosistem mangrove  Bandar  Bakau  kota  Dumai.  Hal  tersebut  bersifat  eksplorasi  dan  dapat dijadikan  informasi  penting  terkait  peran  bakteri  dalam  produktivitas  ekosistem maupun lingkungan secara umum.
Tujuan dari penelitian ini adalah mengindentifikasi jenis bakteri yang dominan dan menghitung total bakteri yang ada pada ekosistem mangrove di Bandar Bakau Kota Dumai pada spesies Rizhopora sp, Xylocarpus sp, dan Avicennia sp. Penelitian ini  diharapkan  dapat  menjadi  dasar  kajian  dalam  penelitian  selanjutnya  terkait dengan pemanfaatan bakteri serasah mangrove.
II. Metode Penelitian

## Bahan dan Alat
Alat yang digunakan dalam penelitian meliputi jaring penampung (litter trap) , jaring  serasah (litter  bag) ,  tali,  kantong  plastik,  meteran,  aluminium  foil,  oven, timbangan analitik, inkubator, mikroskop, alat-alat gelas.
Bahan  yang  digunakan  dalam  penelitian  meliputi  serasah  daun  mangrove (Rizhopora sp, Xylocarpus sp, dan Avicennia sp. ), air laut, Plate Count Agar (PCA), larutan Gram’s iodine, larutan Hucker’s counterstrain , ethanol 95%.

## Tahapan Penelitian
Penelitian  ini  dilakukan  dengan  dua  tahapan,  yaitu  tahap  pertama  preparasi pengambilan  serasah  daun  mangrove,  dilanjutkan  dengan  pengujian  TPC  dan identifikasi  bakteri  dominan  pada  serasah  daun  mangrove  spesies Rizhopora sp, Xylocarpus sp, dan Avicennia sp.

## Preparasi dan Pengambilan Serasah Daun Mangrove
Litter-trap merupakan  metode  yang  digunakan  untuk  menampung  serasah daun  mangrove  yang  gugur  (Brown,  1984). Litter-trap berukuran  2x2  m  dengan mesh  size 1  mm  dan  terbuat  dari  nilon  serta  dibagian  bawahnya  diberi  pemberat untuk menjaga posisi tetap stabil. Litter-trap dipasang pada ketinggian di atas garis pasang  tertinggi.  Setiap  satu  stasiun  pengamatan  dipasang litter  trap sebanyak  3 buah.  Setelah  serasah  mangrove  didapatkan,  prosedur  selanjutnya  adalah  daun serasah mangrove dikeringkan dan dimasukkan ke dalam litter-bag masing-masing sebanyak 20 g dengan ukuran 30x30 cm dan mesh size 1 mm. Litter bag kemudian diikatkan  pada  akar  mangrove.  Setelah  56  hari,  serasah  mangrove  yang  telah terdekomposisi  dibersihkan  dan  dikeringkan  kemudian  dilanjutkan  dengan pengujian laboratorium.

## Analisa Total Bakteri Serasah Daun Mangrove
Analisa total bakteri pada serasah daun mangrove menggunakan media Plate Count  Agar (PCA).  Pemeriksaan  kelimpahan  bakteri  menggunakan  metode perhitungan cawan (ALT) (Yuspita et al . 2018). Proses pengenceran serasah daun mangrove  dilakukan  dengan  menimbang  1  gram  serasah  daun  mangrove  dari
Jurnal Perikanan Tropis
Volume 7, Nomor 2, 2020 http://jurnal.utu.ac.id/jptropis ISSN: 2355-5564, E-ISSN: 2355-5572
beberapa  stasiun.  Langkah  selanjutnya  adalah  menyiapkan  3  tabung  reaksi  yang telah diberi label masing-masing 10 -1 , 10 -2 dan    10 -3 . Air laut steril dimasukkan ke  dalam  3  tabung  reaksi.  Banyaknya  air  laut  steril  yang  dimasukan  ke  dalam tabung  adalah  9  ml.  Sampel  serasah  daun  mangrove  yang  telah  ditimbang dimasukkan kedalam tabung reaksi yang berisi air laut steril. Perbandingan sampel serasah daun mangrove dengan air laut yang digunakan dalam pengenceran adalah 1:9 yang berarti 1 g serasah daun mangrove dilarutkan dalam 9 ml air laut setril. Setelah pengenceran pada tabung pertama selesai, 1 ml sampel dituang ke dalam tabung  kedua  menggunakan  mikropipet,  kemudian  divortex  dan  menuang  1  ml sampel dari tabung kedua ke tabung ketiga.
Penanaman bakteri pada media PCA menggunakan teknik pour plate . Metode pour plate dilakukan dengan cara menuangkan 1 ml sampel dari setiap pengenceran pada  cawan  petri  yang  kosong,  kemudian  menuangkan  media  yang  masih  cair sehingga  media  dengan  sampel  tercampur.  cawan  petri    di  putar  mengikuti  pola angka delapan dan inkubasi pada suhu 37⁰C selama 1 x 24 jam (Yunita et al . 2015). Cawan petri yang dihitung adalah cawan petri yang memiliki jumlah koloni bakteri 25 – 250 koloni bakteri (Tyas et al. , 2018)

## Identifikasi Bakteri Dominan Serasah Mangrove
Metode  identifikasi  bakteri  menggunakan  pewarnaan  gram  (Cowan    dkk, 1974). tujuannya adalah untuk mengetahui bentuk bakteri (basil, kokus, atau spiral), dan penentuan bakteri jenis Gram positif atau Gram negatif pada saat pengamatan mikroskop.

## III. Hasil dan Pembahasan Total Bakteri Serasah Daun Mangrove
Pengujian total bakteri serasah daun mangrove dilakukan dengan pembuatan media agar (PCA), pengenceran, isolasi bakteri pada media agar PCA yang telah diencerkan, dan perhitungan total bakteri dengan metode Total Plate Count (TPC). Hasil  pengujian  TPC  pada Rizhopora sp, Xylocarpus sp,  dan Avicennia sp  dapat dilihat pada table berikut :
Tabel 1. Kandungan TPC serasah daun Mangrove Rizhopora sp, Xylocarpus sp, dan
Avicennia sp di Bandar Bakau Kota Dumai No Nama Spesies TPC (Cfu/ml) 1 Rizhopora sp 0,55 x 10 5 ± 0,01 2 Xylocarpus sp 0,63 x 10 5 ± 0,01 3 Avicennia sp 0,64 x 10 5 ± 0,01
Berdasarkan  hasil  pengujian  TPC,  diperoleh  hasil  nilai  TPC  tertinggi  pada serasah daun mangrove yaitu dari jenis Avicennia sp yaitu 0,64 x 10 5 ± 0,01 Cfu/ml. Hal  tersebut  mengindikasikan bahwa dalam 1 ml larutan serasah daun mangrove Avicennia sp memiliki kandungan bakteri 0,64 x 10 5 koloni bakteri. Sementara pada
Jurnal Perikanan Tropis
Volume 7, Nomor 2, 2020 http://jurnal.utu.ac.id/jptropis ISSN: 2355-5564, E-ISSN: 2355-5572
serasah  daun  mangrove  jenis Rhizopora sp  memiliki  jumlah  koloni  yang  lebih rendah yaitu 0,55 x 10 5 ± 0,01 Cfu/ml.
Bahan  organik,  faktor  fisika  dan  kimia  suatu  lingkungan  ekosistem  dapat berpengaruh  pada  jumlah  total  kandungan  bakteri  pada  serasah  daun  mangrove. Menurut  Tyas,  Widyorini,  dan  Solichin  (2018),secara  teori  kandungan  bahan organik pada suatu kawasan akan berhubungan erat dengan populasi bakteri yang ada pada kawasan tersebut. Hal ini dikarenakan bahan organik sebagai bahan atau nutrisi  bagi  bakteri  untuk  hidup.  Bakteri  yang  mendiami  kawasan  tersebut  akan mendekomposisi  bahan  organik  menjadi  bahan-bahan  lain  yang  akan  digunakan untuk makhluk hidup lain.
Jumlah  total  bakteri  yang  terkandung  pada  serasah  daun  mangrove mempengaruhi  terhadap  kesuburan  ekosistem,  karena  tanah  yang  subur menandakan  bahwa  bakterinya  tinggi  dan  total  mikroba  dalam  tanah  digunakan sebagai  indeks  kesuburan  tanah  (Hanafiah,  2007),  populasi  bakteri  yang  tinggi menggambarkan adanya suplai makanan atau energi yang cukup.

## Bakteri Dominan pada Serasah Daun Mangrove
Micrococcus sp
Berdasarkan hasil penelitian, jenis bakteri yang dominan di serasah mangrove Rhizopora sp, Xylocarpus sp,  dan Avicennia sp  adalah Micrococcus sp.  Jumlah bakteri Micrococcus sp yang tumbuh secara dominan dapat dilihat pada Gambar 1. bakteri Micrococcus sp  adalah  dapat  ditemukan  di  lingkungan  akuatik,  tanah, produk  susu,  dan  kulit  manusia  (Harrow  dkk,  2003)  Bakteri Micrococcus sp merupakan bakteri fakultatif yang dapat hidup pada suhu 1-60 o C, berbentuk sel bulat berukuran diameter ± 0,1-0,3  µm,  non  motil,  oksidasi  negatif,  katalase  positif,  dan  uji motilitas negatif, termasuk gram positif, bersifat aerob yang tersebar luas di  berbagai lingkungan baik perairan maupun daratan (Holt et al. , 1994),.
Gambar 1. Koloni bakteri Micrococcus sp
Bakteri Micrococcus sp  merupakan  jenis  bakteri  selulotik  yang  salah  satu habitat hidupnya adalah di perairan. Jenis bakteri ini mampu mendegradasi selulosa menjadi  senyawa-senyawa  selulosa  yang  lebih  sederhana.  Hal  tersebut  didukung oleh yang menyatakan bahwa dalam proses degradasi selulosa, Micrococcus dapat menghasilkan β-glukanase, β-xylanase, endoglukonase, dan xylanase.  (Paul  dkk, 1993).  β-glukanase  dan  β-xylanase  diproduksi  secara  intraseluler  sedangkan endoglukanase  dan  xylanase  diproduksi  secara  ekstraseluler.  Selain  itu,  Ritonga
Jurnal Perikanan Tropis
Volume 7, Nomor 2, 2020 http://jurnal.utu.ac.id/jptropis ISSN: 2355-5564, E-ISSN: 2355-5572
(2012) telah mengidentifikasi dan mengisolasi  18 jenis bakteri  dari serasah daun Rhizopora  apiculata di  kawasan hutan  mangrove  Kota  Pari  Pantai  Cermin
Sumatera Utara, hasil penelitian ditemukan 2 jenis bakteri Micrococcus. Penelitian Nofu et al . (2014) menemukan bakteri Micrococcus sp termasuk salah satu jenis bakteri  pendegradasi  selulosa.  Karakterisasi  bakteri  pendegradasi  selulosa dilakukan melalui uji morfologi dan biokimia.
Menurut Reanida (2012), daun yang gugur di atas tanah memungkinkan bahwa kandungan selulosa di tanah tersebut tinggi, maka besar kemungkinan untuk dapat menemukan bakteri pendegradasi selulosa di dalam ekosistem mangrove. Bakteri di dalam tanah akan mendegradasi selulosa menjadi molekul monosakarida yang mudah  diserap  oleh  tanaman  yang  kemudian  akan  digunakan  untuk pertumbuhannya dan sebagai cadangan makanan pada prose fotosintesis (Reanida, 2012: Singh dlk 1995).
Selain  sebagai  pendegradasi  selulosa,  genus Micrococcus juga  merupakan bakteri pendegradasi fenol dan logam berat pada limbah cair (Khusnuryani et al. , 2015), di tanah area pertambangan (Suryani, 2011).

## Aerococcus sp
Salah satu jenis bakteri dominan yang ditemukan pada serasah daun mangrove di  kawasan  Bandar  Bakau  Dumai  adalah  genus Aerococcus .    Koloni  bakteri Aerococcus sp  dapat  dilihat  pada  Gambar  2.  Genus  ini  juga  ditemukan  pada ekosistem  mangrove  di  Karankadu,  India.  Menurut  Saseeswari et  al. (2016), sebanyak  27  koloni  bakteri  jenis  berbeda  diisolasi  dari  hutan  Karankadu,  India, salah satu genus bakteri dominan yang ditemukan adalah genus Aerococcus . Selain itu, genus Aerococcus juga ditemukan di ekosistem mangrove di wilayah Sri Lanka di kota Negombo. Menurut Gunathunga dan Rathnayake (2017), genus Aerococcus dan Micrococcus ditemukan  sebagai  organisme  endofit  pada  serasah  daun mangrove pada spesies bakau Avicennia marina, Brugeira gymnorhiza, Lumnitzera racemosa dan Rhizophora mucronate di Hutan Bakau Kadol kale, Sri Lanka.
Gambar 2. Koloni Bakteri Aerococcus sp Genus Aerococcus merupakan jenis Bakteri Asam Laktat (BAL). Berdasarkan penelitian Hwanhlem et al . (2013), sebanyak 386 isolat bakteri asam laktat diisolasi dari hutan bakau di Thailand. Hasil dari isolasi tersebut menghasilkan bakteriosin yang  dapat  diaplikasikan  sebagai  pengawet  alami  untuk  menghambat  proses pembusukan  pada  makanan  dan  bakteri  patogen  pada  makanan.  Berdasarkan
Jurnal Perikanan Tropis
Volume 7, Nomor 2, 2020 http://jurnal.utu.ac.id/jptropis ISSN: 2355-5564, E-ISSN: 2355-5572
penelitian  Harpeni  (2007),  menunjukkan  bahwa  bakteri Aerococcus sp  mampu menghasilkan  senyawa  bioaktif  antibakteri . Senyawa  bioaktif  yang  bersifat antibakteri  dihasilkan  oleh  jenis  bakteri  asam  laktat  karena  bakteri  asam  laktat mempunyai efek pengawetan karena menghasilkan senyawa senyawa yang mampu menghambat  pertumbuhan  berbagai  mikroba.  Menurut  De  Vuyst  dan  Vadamme (1994),  sebagian  besar  efek  antimikroba  ini  disebabkan  oleh  pembentukan  asam laktat dan asam asetat serta penurunan pH yang dihasilkan. Selain itu bakteri asam laktat  juga  menghasilkan  senyawa-senyawa  penghambat  lain  seperti  hidrogen peroksida, diasetil, karbondioksida, reuterin dan bakteriosin.

## IV. Kesimpulan
Berdasarkan  hasil  penelitian,  dapat  disimpulkan  bahwa  jumlah  total  bakteri pada  serasah  daun  mangrove  jenis Rizhopora sp 0,55x10 5 cfu/ml, Xylocarpus sp 0,63x10 5 cfu/ml, dan Avicennia sp adalah 0,64x10 5 cfu/ml. Selain itu, dari hasil uji identifikasi bakteri pada serasah daun mangrove Rizhopora sp, Xylocarpus sp, dan Avicennia sp, jenis bakteri yang dominan adalah Micrococcus sp dan Aerococcus sp.

## Daftar Pustaka
Brown MS. 1984. Mangrove litter production and dynamics. 7n:Snedaker, C.S. J.S. Snedaker  eds.  The  mangrove  ecosystem  Research  methods  monograph  on oceanographic methodology . Paris: UNESCO
Cowan  ST.  1974. Cowan  and  Steel’s  Manual  for  the  Identification  of  Medical
Bacteria. 2nd Edition . Cambridge : Cambridge Univ Press
Das S, Lyla PS, Khan S. 2006. Marine microbial diversity and ecology: importance and future perspective. Journal of Current Science . 90(10) : 1325- 1335
De  Vuyst  L,  Vandamme  EJ.  1994. Bacteriocins  of  Lactic  Acid  Bacteria :
Microbilogy, Genetics and Applications . Springer US.
Gunathunga  SU,  Rathnayake  IVN.  2017.  Endophytic  Bacterial  Diversity  of Mangrove Leaves. International Research Symposium on Pure and Applied Science. Faculty of Science, University of Kelaniya. BO-27
Hanafiah KA. 2007. Dasar-Dasar  Ilmu  Tanah .  Jakarta : Raja Grafindo Persada
Harpeni E. 2007. Eksplorasi bakteri yang berasosiasi dengan karang lunak sebagai alternatif  sumber  senyawa  bioaktif  uji  hayati  antibakteri.  Journal Biosfera . 24(3):113-119
Harrow GI,  Feltham RKA. 2003. Cowan and Steel’s Manual for The Identification of Medical Bacteria. 3th ed . United Kingdom: Cambridge University Press Holt JG, Krieg NR, Sneath PHA, Staley JT dan Williams ST. 1994. Gram negative aerobic  microaerophili  rods  and  cocci.  Group  4,  In:  "Bergey's  Manual  of Determinative Bacteriology, 9th ed." . Baltimore: Williams & Wilkins Hwanhlem N, Biscola V, El-Gaish S, Jaffres E, Dousset X, Heartle T, Chobert J, H-kittikun A. 2014. Bacteriocin-producing lactic acid bacteria isolated from mangrove  forests  in  southern  thailand  as  potential  bio-control  agents:
Jurnal Perikanan Tropis
Volume 7, Nomor 2, 2020 http://jurnal.utu.ac.id/jptropis ISSN: 2355-5564, E-ISSN: 2355-5572
purification  and  characterization  of  bacteriocin  produced  by Lactococcus lactis subsp. lactis KT2W2L. Probiotics Antimicrob Proteins . 5(4):264-278.
Sinatryani  D,  Alamsjah  MA.  Sudarno,  Pursetyo  KT.  2014.  Kelimpahan  bakteri selulotik di muara sungai Gunung Anyar Surabaya dan Bacaran Bangkalan. Jurnal Ilmiah Perikanan dan Kelautan . 6(2):143-148
Khusnuryani  A,  Martani  E,  Wibawa  T,  Widada  J.  2015.  Karakterisasi  bakteri pendegradasi fenol dan pembentuk biofilm dari sumber alami dan artifisial. Jurnal Kaunia. 11(1): 40-50
Nofu K, Khotimah S, Lovadi I. 2014. Isolasi dan karakteristik bakteri pendegradasi selulosa pada ampas tebu kuning (bagasse). Jurnal Protobiont. 3(1): 25 – 33.
Paul J dan Varma AK. 1993. Hydrolytic enzyme production in micrococcus roseus growing  on  different  cellulosic subtrates.  Journal of Applied Microbiology . 16: 167-169.
Reanida PP. 2012. Eksplorasi Bakteri Selulolitik dari Tanah Mangrove Wonorejo, Surabaya [Skripsi]. Surabaya : Universitas Airlangga
Ritonga DW. 2012. Keanekargaman Bakteri Serasah Daun Rhizophora apiculata yang Mengalami Dekomposisi Pada Berbagai Tingkat Salinitas di Kota Pari Pantai Cermin Sumatera Utara.[Tesis]. Universitas Sumatera Utara. Medan
Saseeswari A, Kanimozhi G, Panneerselvam A. 2016. Bacterial diversity of soil in karankadu  from  east  coast  of  Tamil  Nadu,  India. International  Journal  of Current Microbiology and Applied Sciences . 5(4):. 750-756
Singh  A,  Hayashi  K.  1995.  Microbial  cellulase,  protein  architecture,  molecular properties and biosynthesis. Advance Applied Microbiology . 40: 1-44.
Suryani Y. 2011. Bioremediasi limbah merkuri dengan menggunakan mikroba pada lingkungan  yang  tercemar. Jurnal  Kajian  Islam,  Sains,  dan  Teknologi . 5(1):139-148
Tyas DE, Widyorini N, Solichin A. 2018. Perbedaan jumlah bakteri dalam sedimen pada kawasan bermangrove dan tidak bermangrove di perairan desa Bedono, Demak. Jurnal Maquares . 7(2):189-196
Yunita  M,  Hendrawan  Y,  Yulianingsih  R.  2015.  Analisis  kualitatif  mikrobiologi pada makanan penerbangan (aerofood acs) Garuda Indonesia berdasarkan tpc (total  plate  count)  dengan  metode  pour  plate. Jurnal  Keteknikan  Pertanian Tropis dan Biosistem . 3(3): 237-248.
Yuspita  NLE,  Putra IDNN, Suteja  Y. 2018. Bahan organik  total  dan kelimpahan bakteri di perairan teluk Benoa, Bali. Jurnal of Marine and Aquatic Sciences . 4(1): 129-140.