## Genetika Populasi dan Strategi Konservasi Badak Jawa
(Rhinoceros sondaicus Desmarest 1822)

## Population Genetics  of Javan Rhino
(Rhinoceros sondaicus Desmarest 1822 ) and It’s Conservation Strategy

## U  Mamat  Rahmat
Kantor Seksi Pengelolaan Taman Nasional Wilayah II, Taman Nasional Ujung Kulon Pandeglang, Banten

## Pendahuluan
Badak jawa ( Rhinoceros sondaicus Desmarest 1822) merupakan spesies yang paling langka di antara 5 spesies badak yang ada di dunia sehingga dikategorikan sebagai critically endangered atau terancam punah dalam Red List  Data  Book yan g  dikeluar kan   oleh   IUCN ( International  Union  for  Conservation  of  Nature  and Natural Resources ) tahun 1978 dan mendapat prioritas utama untuk diselamatkan dari ancaman kepunahan. Selain itu, badak jawa juga terdaftar dalam Apendiks I CITES ( Convention  on  International  Trade  in  Endangered Spesies of Wild Fauna and Flora ) tahun 1975. Jenis yang termasuk dalam Apendiks I adalah jenis yang jumlahnya di  alam  sudah  sangat  sedikit  dan  dikhawatirkan  akan punah.
Pada saat ini penyebaran badak jawa di dunia terbatas di dua negara saja, yakni di Indonesia dan Vietnam. Di Indonesia, badak jawa hanya terdapat di Taman Nasional Ujung Kulon (TNUK) dengan populasi yang relatif kecil, yakni sekitar  59-69  ekor  (TNUK  2007).  Di Vietnam, populasi badak jawa hanya terdapat di Taman Nasional Cat Tien yang diperkirakan tinggal 5-8 ekor (Polet and Mui 1999). Populasi kecil yang hanya terdapat di satu areal memiliki resiko kepunahan yang tinggi, sehingga
upaya  untuk  menjamin  kelestarian  populasi  badak  jawa dalam  jangka  panjang  merupakan  salah  satu  prioritas program konservasi badak jawa di Indonesia.
Secar a  alami  badak  jawa  tidak  akan   mampu mempertahankan  eksistensinya  dalam  jangka  panjang. Eksistensi badak jawa juga dinilai sangat rawan terhadap terjadinya  bencana  alam,  degradasi  habitat, inbreeding , penyakit, dan perburuan. Tanpa tindakan pengelolaan yang tepat  dan  direncanakan  secara  matang  untuk  jangka panjang, populasi badak jawa akan mengalami kepunahan. Selain itu, dinamika ekosistem alam di habitat badak jawa diduga  akan  memberikan  pengaruh  negatif  terhadap eksistensi populasinya.
Kelangsungan  hidup  badak  jawa  di  TNUK  masih terancam oleh berbagai faktor. Sebagai satwa yang memiliki sebaran terbatas, badak jawa lebih rentan (dibanding satwa lain yang tersebar luas) terhadap bahaya-bahaya bencana alam, misalnya ledakan Gunung Krakatau, gempa bumi dan tsunami.  Sementara  itu,  badak  jawa  juga  menghadapi ancaman yang semakin meningkat dari manusia. Perluasan pemukiman,  perladangan  liar,  perambahan  hutan  dan kehadiran manusia berpotensi menimbulkan resiko penyakit baru dan menurunnya kualitas habitat. Badak jawa juga menghadapi ancaman yang paling besar yaitu diburu oleh manusia  untuk  diambil  culanya.  Ancaman  terbesar  ini

## Abstract
Javan rhino (Rhinoceros sondaicus Desmarest 1822) of which spread is limited in Indonesia and Vietnam is  the  rarest  species  among  5  species  of  rhino  in  the  world.  Without  appropriate  and  long-term  well organized management action, the population of javan rhino will be in extinction. This research studies about the usage potential of  javan rhino population genetics data in designing  javan rhino conservation program. The application of genetics study in conservation problem is based on the population genetics theory.  The  population  genetics  is  one  of  population  biology  branch  which  studies  about  the  factors determining genetic composition of population and how they play role in evolution process. The genetic characteristic identification can help to give the characteristic genetic information which has function as genetic marker or gen in javan rhino management. It can also help to do translocation the javan rhino especially for  breeding management  effort to  avoid inbreeding  and to  improve the  heterozygosis.  The analyzing  result  shows  that  the  management  of  conservation  strategy  which  can  make  javan  rhino population reaches the population viable minimum number is needed urgently. Furthermore, it also shows that translocation and reintroduction to build the second population of  javan rhino is also important to do.
Keywords: javan rhino, population genetics, translocation, second population
*Penulis untuk korespondensi, e-mail: umat_rahmat@yahoo.com
ISSN:  0215-157X

## Tabel 1  Deskripsi ukuran tubuh badak jawa
Komponen yang diukur Ukuran Satuan Sumber 168–175 cm Hoogerwerf (1970) Tinggi badan 128–160 cm Ramono (1973) ±392 cm Hoogerwerf (1970) Panjang badan dari ujung moncong hingga ujung ekor 251–315 cm Ramono (1973) Berat tubuh 1600–2070 kg Ramono (1973) ±2280 kg Hoogerwerf (1970) Panjang kepala ±70 cm Hoogerwerf (1970) Rata-rata lebar kaki 27–28 cm Hoogerwerf (1970) Tapak kaki (dari kuku-kuku paling luar) 23/25–29/30 cm Ramono (1973)
Gambar 1 Badak jawa ( Rhinoceros sondaicus Desmarest 1822).
disebabkan oleh berkembangnya anggapan bahwa cula badak mempunyai khasiat dalam pengobatan tradisional Cina. Selain itu, sebagai satwa yang memiliki sebaran terbatas, potensi terjadinya inbreeding menjadi semakin besar,  yang  pada  akh irnya  dapat  mengakibatkan terjadinya penurunan kualitas genetik badak.
Dengan demikian, penyelamatan kehidupan badak jawa  di  TNUK  merupakan upaya  yang  memiliki  nilai strategis. Upaya ini perlu didukung oleh langkah strategis dan rencana tindakan konservasi dalam jangka panjang secar a  in situ  yan g  secar a  oper asion al  mampu mempertahankan dan mengembangkan populasi tersebut pada suatu tingkat yang aman dari ancaman kepunahan. Untuk  pemecahan  masalah  secara  tuntas  diperlukan kebijakan jangka panjang yang memperhatikan pula aspek lainnya. Mengingat badak jawa merupakan satu dari 5 spesies  badak  di  dunia  yang  paling  langka,  maka keanekaragaman genetik badak menurut populasi yang ada perlu untuk diketahui dan dilestarikan melalui kegiatan pengelolaan dalam jangka panjang.

## Bio-ekologi  Badak  Jawa
Klasifikasi dan morfologi Badak jawa termasuk dalam golongan binatang berkuku ganjil atau Perissodactyla . Menurut Lekagul & McNelly (1977), badak jawa secara taksonomi dapat diklasifikasikan dalam kingdom animalia, phylum  chordata,  sub  phylum  vertebrata,  super  kelas gnatostomata, kelas mammalia, super ordo mesaxonia, ordo perissodactyla, super famili rhinocerotidea, famili rhinocerotidae,  genus Rhinoceros Linnaeus  1758  dan spesies Rhinoceros sondaicus Desmarest 1822. Menurut Hoogerwerf (1970), panjang kepala badak jawa mencapai 70 cm dengan rata-rata lebar kaki 27-28 cm, sedangkan menurut Ramono (1973) ukuran tapak kaki diukur dari kuku-kuku yang paling luar berkisar antara 23/25-29/30  cm.  Deskripsi  ukuran  tubuh  badak  jawa disajikan pada Tabel 1.
Berdasarkan hasil pengamatan visual di lapangan, badak jawa memiliki bibir atas yang lebih panjang dari bibir  bawah  dan  berbentuk  lancip  menyerupai  belalai pendek yang berfungsi untuk merenggut makanan. Selain itu, individu badak jawa jantan mempunyai cula tunggal
Pemikiran Konseptual
Gambar 2  Penemuan dan penyebaran badak.
64 24 57 50 25 25 28 38 44 42 47 50 48 48 52 58 64 56 64 52 52 57 47 57 60 55 50 57 55 58 0 10 20 30 40 50 60 70 19 67 19 68 19 69 19 71 19 72 19 73 19 74 19 75 19 76 19 77 19 78 19 80 19 81 19 82 19 83 19 84 19 85 19 90 19 93 19 95 19 96 19 97 19 99 20 01 20 02 20 03 20 04 20 05 20 06 20 07 Tahun Ju m la h b a d ak
Gambar 3 Grafik distribusi hasil inventarisasi populasi badak jawa tahun 1967–2007.
yang tumbuh di bagian depan kepala yang sering disebut sebagai cula melati. Hoogerwerf (1970) menyatakan bahwa panjang maksimum cula jantan 27 cm dan panjang rata- rata cula jantan dewasa 21 cm. Individu badak jantan yang baru berumur kira-kira 11 bulan sudah mempunyai cula sepanjang 5-7 cm.
Sejarah ringkas penemuan dan penyebaran Orang yang pertama kali menyatakan bahwa badak yang hidup di Jawa tidak identik dengan badak india ( Rhinoceros unicornis ) adalah  Camper  (1772)  seorang  profesor  zoologi  di
Groningen. Menurut Raffles (1817) dan Marsden (1811), spesies badak jawa juga terdapat di Sumatera yang hidup secara simpatrik dengan badak sumatera ( Didermoceros atau Dicerorhinus sumatrensis ). Risalah ilmiah secara terinci  tentang  spesies  badak  jawa  ini  dilakukan  oleh Desmarest (1822) dan diberi nama Rhinoceros sondaicus (Sody 1941, Sody 1959, Guggisberg 1966 dalam Muntasib 2002). Spesimen-spesimen yang diteliti oleh Desmarest dinyatakan  berasal  dari  Sumatera,  tetapi  kemudian dipercaya bahwa  asal  spesimen tersebut dari  Jawa. Di
Sumatera, Malaya, dan Burma Selatan, spesies ini sering disamakan dengan badak sumatera, sedangkan lebih ke utara dan timur lagi spesies ini sering dinyatakan identik dengan badak india (Gambar 2).
Pada pertengahan abad ke-19, kondisi spesies badak jawa telah mendekati kepunahan di sebagian besar wilayah distribusinya. Hal ini menyebabkan sulitnya menentukan batas  daerah  penyebaran  badak  jawa  pada  saat  itu. Sampai saat ini masih  dipertanyakan apakah badak jawa pernah hidup secara bersama-sama ( simpatrik ) dengan badak  india  di  Lembah  Brahmaputra  (Irrawady)  atau apakah  spesies  ini  pernah  hidup  di  sebelah  Utara Brahmaputra,  misalnya di Sikkin. Namun demikian, secara pasti  diketahui  bahwa  badak  jawa  pernah  terdapat  di Bengal ( Sunderbans ), Assam, Thailand, Indocina, Cina Tenggara  dan  pada  abad  XX  masih  ditemukan  dalam jumlah kecil di Burma, Malaya dan Sumatera (Schenkel & Schenkel-Hulliger 1969).
Kondisi populasi Hoogerwerf (1970) menyatakan bahwa pertumbuhan populasi badak jawa mengalami peningkatan sejak tahun 1937, walaupun kegiatan inventarisasi dan sensus baru dilaksanakan secara berkesinambungan sejak tahun 1967. Schenkel mulai melakukan sensus populasi badak jawa pada tahun 1967 dan diduga terdapat populasi sebanyak 25 ekor (Schenkel & Schenkel-Hulliger 1969). Berdasarkan hasil sensus yang dilakukan mulai tahun 1967 sampai  sekarang  maka  diketahui  bahwa  pertumbuhan populasi badak  mengalami peningkatan  dari  tahun  ke tahun. Perkembangan populasi badak jawa berdasarkan hasil inventarisasi yang dilakukan di Semenanjung Ujung Kulon disajikan pada Gambar 3. Sampai tahun 1981, laju pertumbuhan populasi badak jawa menunjukkan tingkat perkembangan yang relatif baik karena banyak dijumpai badak muda dan dewasa. Selain itu masih dijumpai juga 7 induk betina bersama anaknya  (Sadjudin 1983).
Dugaan  populasi  terbesar  diperoleh  dari  hasil inventarisasi pada tahun 1983, yakni berkisar antara 58- 69 individu, disusul hasil inventarisasi tahun 1984 yang diduga sebanyak 52 individu (Sadjudin 1983). Selanjutnya Sadjudin (1983) menyatakan bahwa pertumbuhan populasi badak jawa di Ujung Kulon termasuk rendah karena pada periode 1980-1983 hanya dapat dijumpai satu individu muda  yang  tergolong  bayi.  Inventarisasi  badak  jawa terakhir yang dilakukan pada bulan Juli 2007 menunjukkan kisaran populasi sebesar 59-69 individu (TNUK 2007).
Pemantauan populasi badak jawa yang dilakukan oleh TNUK  dan  WWF  Ujung  Kulon  pada  tahun  2001 menemukan 3 individu badak yang baru lahir di daerah Cikeusik Barat, Citadahan Timur, dan Citadahan. Namun demikian, pada tahun 2003 terjadi kematian satu individu badak jawa yang ditemukan di padang penggembalaan Cibunar.  Hasil  otopsi  oleh  Dinas  Peternakan  Provinsi Banten  menunjukkan  bahwa  kematian  badak  tersebut terjadi secara wajar karena usia yang sudah tua. Kelahiran badak jawa berikutnya diketahui terjadi pada bulan Juli
2006  yang  dibuktikan  dengan  ditemukannya  empat individu anak badak jawa melalui camera trap (Rahmat 2007). Berdasarkan hasil inventarisasi tahunan badak jawa, pada saat ini konsentrasi  penyebaran badak jawa pada umumnya di daerah bagian selatan Semenanjung Ujung Kulon, yakni di daerah Cibandawoh, Cikeusik, Citadahan, dan  Cibunar.  Sedangkan  di  sebelah  utara  terdapat  di daerah Cigenter dan sekitarnya.
Perilaku makan, sosial, dan kawin Hoogerwerf (1970) menyatakan bahwa badak jawa adalah salah satu jenis mamalia  herbivora  besar   dan   berdasarkan   jenis makanannya  dapat  digolongkan  dalam  jenis  satwa browser . Jenis makanannya adalah pucuk-pucuk daun baik tumbuhan pohon maupun semak belukar, ranting, kulit kayu, dan liana. Diameter cabang yang dimakan bervariasi antara 10-17 mm. Diameter pohon yang dicabut dengan akarnya atau dirobohkan umumnya bervariasi antara 10- 15 cm. Pada umumnya pohon yang bagian tumbuhannya diambil  oleh  badak  sebagai  makanannya  tidak  mati melainkan tumbuh kembali sehingga diduga badak jawa memiliki mekanisme memelihara dan melestarikan sumber pakan nya  (Sch en kel  &  Schenkel-Hulliger  1969, Hoogerwerf 1970, Sadjudin & Djaja 1984). Pohon dan semak  belukar  yang  roboh  seringkali  tetap  hidup  dan tumbuh pucuk-pucuk baru (jika pucuk lama dipatahkan) akan tumbuh terus dalam arah mendatar bila akar-akarnya tercabut. Ini semuanya menjadi tanda khas bagi kehadiran satwa tersebut selain jejak, kotoran, dan lain-lain.
Secara  ekologi  badak  jawa  termasuk  satwa  yang soliter kecuali pada saat musim kawin dan mengasuh anak. Perilaku sosial umumnya hanya ditunjukkan pada masa berkembang biak, yakni sering dijumpai individu badak jawa dalam kelompok-kelompok kecil yang terdiri atas jantan dan betina atau jantan, betina, dan anak (Schenkel &  Schenkel-Hulliger  1969).  Lama  waktu  berkumpul tersebut sampai saat ini belum banyak diketahui sehingga aktivitas berkelompok sering diduga berdasarkan dari lama waktu berkumpul badak india, yakni 5 bulan (Gee 1952 dalam Lekagul & McNeely 1977).
Menurut  Schenkel & Schenkel-Hulliger (1969), biologi reproduksi badak jawa hampir mirip dengan badak india ( Rhinoceros unicornis ). Oleh karena itu, sampai saat ini perilaku kawin badak jawa diduga sama dengan perilaku kawin  badak  india.  Berdasarkan  pengamatan  petugas TNUK bulan perkawinan badak jawa terjadi pada Agustus dan September. Menurut Gee (1964) dalam Lekagul & McNeely (1977), masa kawin badak india diduga berkisar antara 46 sampai 48 hari. Periode menyusui dan memelihara anak berkisar antara 1 sampai 2 tahun dan lama kebuntingan sekitar 16 bulan. Interval melahirkan adalah satu kali dalam 4-5 tahun dengan jumlah anak yang dilahirkan satu ekor. Badak  betina dapat  digolongkan  dewasa apabila  telah berumur 3-4 tahun,  sedangkan jantan  sekitar umur  6 tah un .  Umur   maksimum  badak  betin a  mampu menghasilkan keturunan adalah 30 tahun.
Perilaku berkubang atau mandi Berkubang atau mandi merupakan salah satu aktivitas yang sangat penting bagi badak jawa. Tujuan dari aktivitas ini adalah sebagai sarana untuk beristirahat, menjaga kesehatan tubuh dari gigitan serangga, menurunkan suhu tubuh, serta membersihkan tubuh  dari  kotoran,  hama,  dan  penyakit.  Aktivitas berkubang  atau  mandi,  baik  langsung  maupun  tidak langsung  sangat  tergantung  pada  ketersediaan  air  di habitatnya.  Oleh  karena  itu,  aktivitas  berkubang  bagi badak jawa di TNUK dipengaruhi oleh musim. Pada waktu musim hujan badak jawa relatif lebih sering melakukan aktivitas berkubang, yang  disebabkan ketersediaan  air tawar yang relatif merata di seluruh kawasan Semenanjung Ujung Kulon, sedangkan aktivitas mandi lebih banyak dilakukan pada waktu musim kemarau.
Hoogerwerf  (1970)  menyatakan  bahwa  tempat kubangan  tidak  hanya  berfungsi  untuk  berkubang, melainkan  juga  berfungsi  sebagai  tempat  minum  dan membuang air seni. Perilaku membuang air seni di tempat kubangan  ini  berfungsi  sebagai  alat  untuk  menandai daerah  jelajahnya.  Rahmat  (2007)  menyatakan  bahwa membuang urin atau kotoran ada kecenderungan dilakukan setelah  berkubang.  Artinya  badak  akan  berkubang sepuasnya dan setelah selesai baru kencing atau buang kotoran. Hal ini terlihat dari air kencing atau kotoran yang ditinggalkan di dalam kubangan masih dalam kondisi utuh belum bercampur dengan lumpur.
Habitat badak jawa Muntasib (2002) menyatakan bahwa habitat badak jawa terdiri atas komponen fisik, biologis, dan sosial.  Komponen fisik habitat badak jawa adalah ketinggian,  kelerengan, kubangan, dan  air (neraca  air tanah, kualitas air, ketersediaan air, kondisi air permukaan). Komponen biologis habitat badak jawa adalah struktur vegetasi, pakan badak, dan satwa besar lain. Badak jawa menyukai daerah yang rendah yang memanjang di sekitar pantai, rawa-rawa mangrove, dan hutan sekunder. Akan tetapi, di daerah perbukitan dan hutan primer jarang sekali ditemukan jejak badak (Hoogerwerf 1970). Badak jawa lebih beradaptasi di lingkungan dataran rendah ketimbang daerah  pegunungan,  khususnya  apabila  mereka  hidup simpatrik  dengan  badak  sumatera  ( Dicerorhinus sumatrensis ) yang lebih beradaptasi dengan lingkungan pegunungan. Bila hanya badak jawa yang ditemukan di suatu  wilayah,  misalnya  Pulau  Jawa,  mereka  juga menempati  habitat  pegunungan.  Pada  tahun  1839, Junghun bertemu dengan dua ekor badak jawa di puncak Gunung Pangrango (Van Steenis 1972 dalam Muntasib 2002).
Pada saat ini, Semenanjung Ujung Kulon merupakan satu-satunya  habitat  bagi  populasi  badak  Jawa  yang “ viable ” di dunia.  Secara umum vegetasi di Semenanjung Ujung Kulon  dipengaruhi oleh dua faktor, yaitu manusia dan letusan Gunung Krakatau pada 1883. Selain itu, tidak semua kawasan Semenanjung Ujung Kulon ditempati oleh badak jawa dan menjadi habitat terpilih. Hal ini menunjukkan
bahwa habitat yang sesuai belum tentu disukai oleh badak jawa menjadi habitat terpilih. Ada faktor-faktor tertentu dari komponen fisik maupun biotik habitat yang menjadi preferensi bagi badak jawa untuk menempati suatu ruang habitat tertentu. Kehadiran badak jawa pada suatu habitat sangat dipengaruhi oleh faktor fisik dan biotik habitat itu sendiri.  Komponen  habitat  yang  paling  dominan mempengaruhi frekuensi kehadiran badak jawa pada suatu habitat yang disukai di TNUK adalah kandungan garam mineral (salinitas) dan pH tanah. Areal yang disukai oleh badak  jawa  di  TNUK  adalah  areal  yang  memiliki karakteristik kandungan garam mineral sumber-sumber air yang berkisar antara 0,25-0,35 o / o , pH tanah berkisar antara 4,3-5,45, jarak dari pantai berkisar antara 0-600 meter, dan kandungan garam mineral pada permukaan dedaunan pakan badak adalah 0,35 o / o (Rahmat 2007).

## Keanekaragaman  Genetik  pada  Satwa  Liar
Peranan  studi  genetika  dalam  kegiatan  konservasi Keragaman hayati ( biodiversity ) dibagi menjadi 3 kategori dasar, yaitu keragaman genetik, keragaman spesies, dan keragaman ekosistem. Keragaman  genetik merupakan variasi genetik didalam setiap  spesies yang mencakup aspek  biokimia,  struktur,  dan  sifat  organisme  yang diturunkan secara fisik dari induknya dan dibentuk dari DNA.  Keragaman  spesies  merupakan  variasi  seluruh tumbuhan,  hewan,  fungi,  dan  mikroorganisme  yang masing-masing  tumbuh  dan  berkembangbiak  sesuai dengan karakteristiknya. Keragaman ekosistem merupakan variasi  ekosistem  yang  merupakan  unit  ekologis  yang mempunyai  komponen  biotik  dan  abiotik  yang  saling berinteraksi dan perpindahan energi. Kegiatan konservasi diperlukan guna mempertahankan keanekaragaman hayati tersebut,  yang  semakin  terancam  oleh  kerusakan lingkungan akibat ulah manusia. Kerusakan lingkungan ini tidak hanya dapat mengurangi populasi spesies hewan dan tumbuhan, tetapi juga menyebabkan spesies-spesies tersebut terancam punah.
Ilmu konservasi biologi mempelajari individu  dan populasi yang sudah terpengaruh oleh kerusakan habitat, eksploitasi,  dan  perubahan  lingkungan.  Informasi  ini digunakan untuk membuat suatu keputusan yang dapat mempertahankan keberadaan suatu spesies di alam. Sudah lebih dari satu dekade ini, studi genetik digunakan untuk mendapatkan  informasi  yang  lebih  mendalam  dalam pengambilan keputusan tersebut. Dengan studi genetik, maka informasi tentang keragaman antar individu di dalam dan antar populasi, terutama pada spesies-spesies yang terancam punah dapat diketahui. Perkembangan teknik molekuler  sekarang  ini  seperti  penemuan  teknik  PCR ( Polymerase  Chain  Reaction )  yan g  mampu mengamplifikasi untai DNA hingga mencapai konsentrasi tertentu,  penggunaan  untai  DNA  lestari  ( conserved ) sebagai  penanda  dalam  proses  PCR,  penemuan  lokus mikrosatelit yang hipervariable , dan penemuan metode
sekuensing  DNA,  telah  menyebabkan  ilmu  genetik molekuler mempunyai pengaruh yang sangat besar dalam studi  biologi  suatu  populasi.  Terobosan-terobosan  ini bersamaan  dengan  berkembangnya  teknik  pemodelan matematika melalui program-program komputer, telah mempermudah  para  peneliti  untuk  mendapatkan  data genetik  suatu  populasi  yang  sangat  berguna  dalam merancang program konservasi suatu spesies tertentu.
Penerapan  studi  genetik  dalam  permasalahan konservasi didasari oleh teori genetika populasi. Genetika populasi  merupakan  salah  satu  cabang  ilmu  biologi populasi  yang mempelajari  tentang faktor-faktor  yang menentukan  komposisi  genetik  suatu  populasi  dan bagaimana faktor-faktor tersebut berperan dalam proses evolusi. Genetika populasi juga meliputi studi terhadap berbagai faktor yang membentuk struktur genetik suatu populasi  dan  menyebabkan  perubahan-perubahan evolusioner  suatu  spesies  sepanjang  waktu.  Anggota suatu populasi satwa mempunyai sejumlah lokus yang terdiri  atas  pasangan  alel.  Jumlah  semua  alel  yang berlainan  disebut  lengkang  gen  ( gene  pool ).  Gen-gen dalam lengkang mempunyai hubungan dinamis dengan alel lainnya dan dengan lingkungan tempat populasi itu hidup. Faktor-faktor lingkungan memiliki kecenderungan untuk  merubah  frekuensi  gen  sehingga  menyebabkan terjadinya evolusi dalam populasi (Thohari dkk. 1995).
Prinsip dasar dalam genetika populasi adalah prinsip Hardy-Weinberg  yang  menduga  bahwa  dalam  kondisi tertentu, frekuensi alel dan genotype akan tetap konstan dalam suatu populasi dan keduanya saling berhubungan satu sama lain. Kondisi-kondisi tertentu yang dimaksud dalam prinsip Hardy-Weinberg meliputi reproduksi antar individu yang dilakukan secara seksual dan acak, tidak ada seleksi alam, kejadian mutasi diabaikan, tidak ada individu yang keluar atau masuk dari suatu populasi, dan ukuran  populasi  yang  cukup  besar.  Jika  kondisi  ini terpenuhi oleh  suatu populasi,  maka  populasi  tersebut disebut  sebagai  populasi  yan g  ber ada  dalam keseimbangan  Hardy-Weinberg  ( Hardy-Weinberg Equilibrium ).  Keseimbangan  Hardy-weinberg  sangat penting dalam konservasi dan kejadian evolusi genetik karena penyimpangan dari keseimbangan ini merupakan dasar untuk mendeteksi kejadian inbreeding , fragmentasi populasi, migrasi, dan seleksi.
Ukuran populasi minimum yang mampu bertahan hidup Pengelolaan suatu populasi satwa liar harus didasarkan pada ukuran populasi minimum yang mampu bertahan hidup ( minimum viable population ). Menurut Gilpin dan Soul (1986) dalam Thohari dkk. (1995), suatu populasi akan bertahan dalam kondisi hidup untuk suatu interval waktu tertentu. Populasi yang terdiri atas sejumlah kecil individu akan membawa resiko biologis yang sangat besar dalam hal pengurangan variabilitas  genetik dan peningkatan inbreeding .  Pen ingkatan inbreeding kh ususn ya berhubungan  dengan  masalah  kelangsungan  hidup
populasi,  karena  sering  menimbulkan  tekanan  yaitu pengurangan  ketahanan  hidup,  berat  kelahiran,  dan kesuburan, yang secara langsung akan membahayakan kemampuan hidup dari seluruh populasi (Templeton and Read 1983 dalam Thohari dkk 1995).
Untuk  mencegah  terjadinya inbreeding ,  langkah- langkah yang harus diambil adalah menghindarkan ukuran kecil  populasi  awal  dan  membatasi  perubahan  dalam koefisien inbreeding (tidak lebih dari 1% per generasi). Ukuran  efektif  populasi  adalah  fungsi  dari  sejumlah individu yang secara nyata memberikan kontribusi gamet- gamet kepada generasi berikutnya dalam kondisi ideal yang tinggi. Secara umum, ukuran populasi efektif adalah berkisar antara 1 / 3 - 1 / 4 dari ukuran populasi sebenarnya. Den gan   demikian ,  kebutuh an   minimum  un tuk pemeliharaan  jangka  pendek  dikonversikan  dalam populasi  yang  berjumlah  tidak  kurang  dari  150-200 individu. Selanjutnya, untuk pemeliharaan jangka panjang dari  populasi  tertutup,  ukuran  populasi  efektif  harus berjumlah minimum 500 individu (Thohari dkk. 1995).
Peranan penanda DNA dalam konservasi genetik Analisis keragaman genetik pada level DNA akan memberikan keuntungan yang berlipat ganda dibandingkan dengan analisis  yang  dilakukan  pada  level  protein  karena informasi yang terdapat pada sekuens DNA jauh lebih banyak daripada informasi yang terdapat pada sekuens protein. Beberapa penanda DNA telah digunakan dalam analisis genetik suatu populasi yaitu DNA mitokondria, lokus Major Histocompatibility Complex (MHC), Single Nucleotida Polymorphism (SNP), dan mikrosatelit pada kromosom Y yang diperoleh secara biparental. Beberapa hal yang perlu diperhatikan dalam memilih penanda DNA dalam analisis keragaman genetik suatu populasi adalah bahwa polimorfisme yang terdapat dalam penanda DNA bersifat netral dan keragaman genomik suatu populasi dapat diwakili hanya dengan penggunaan sejumlah lokus bebas.
Dalam pemilihan penanda DNA harus disesuaikan dengan tujuan analisis yang ingin dicapai. Untuk analisis keragaman genetik dan struktur populasi, maka marker DNA  yang  umum  digunakan  lebih  dari  satu  dekade terakhir  adalah  mikrosatelit  karena  sifatnya  yang polimorfik dan kodominan. Mikrosatelit dapat digunakan untuk  sejumlah  analisa  molekuler  seperti  pemetaan genetik, linkage analysis dalam kaitannya dengan gen penyebab penyakit tertentu, dan sejumlah analisis genetik populasi. Dalam analisis genetik populasi, keragaman lokus  mikrosatelit  telah  digunakan  untuk  mengetahui keberadaan hibridasi antar spesies. Perbandingan derajat keragaman mikrosatelit antar spesies dan populasi juga berguna  dalam  penilaian  keragaman  genetik  secara keseluruhan. Mikrosatelit  juga dapat digunakan untuk menduga ukuran populasi, derajat substruktur populasi termasuk  jumlah  migrasi  antar  subpopulasi  serta hubungan genetik di antara subpopulasi yang berbeda.
Selain itu, mikrosatelit juga dapat digunakan dalam analisis silsilah dan kekerabatan serta sejarah populasi. Data yang diperoleh  dari  analisa  genetik  populasi  inilah  yang kemudian digunakan sebagai landasan untuk merancang program  konservasi  terhadap  suatu  spesies  tertentu terutama bagi spesies-spesies yang terancam punah.
Manfaat konservasi genetik Sampai saat ini, penelaahan atau  identifikasi  sifat  genetik  dari  jenis-jenis  yang dilindungi  baik  flora  maupun  fauna  belum  mendapat perhatian  yang  mendalam,  baik  untuk  kepentingan pelestarian  maupun  kepentingan  pemanfaatannya. Padahal pada era teknologi canggih dewasa ini, orang makin menyadari betapa pentingnya sumber daya genetik dalam menunjang pemecahan berbagai permasalahan dan kebutuhan hidup dan kehidupan umat manusia seperti untuk pengobatan, peningkatan produktivitas hasil-hasil pertanian  dalam  arti  luas,  dan  pemantauan  dinamika populasi sumberdaya hayati tersebut.
Menurut  Masyud  (1992),  dalam  rangka  upaya konservasi sumber daya alam hayati terutama bagi satwa- satwa yang dilindungi, aplikasi dari hasil identifikasi sifat- sifat genetik ini mempunyai manfaat yang sangat besar dan strategis. Hasil identifikasi sifat-sifat genetik dapat membantu  memberikan  informasi  mengenai  tingkat kelangkaan atau tingkat kekritisan spesies yaitu dengan melihat heterosigositas atau derajat polimorfisme. Hasil identifikasi  sifat-sifat  genetik  juga  dapat  membantu menentukan  jumlah  populasi  minimum  atau  jumlah populasi efektif yang dapat dibenarkan harus ada pada suatu lokasi  guna menjamin kelestarian jenis tersebut. Dalam hal ini, jumlah populasi efektif ( Ne ) adalah jumlah in dividu  dalam  suatu  populasi  yan g  dian ggap menurunkan gen-gennya secara efektif. Ne biasanya jauh lebih  kecil  dari N (jumlah  total  dalam  populasinya). Identifikasi  sifat-sifat  genetik  juga  dapat  membantu memberikan suatu informasi genetik khas yang berfungsi sebagai  genetik  penciri  atau  gen-gen  penanda  dalam pengelolaan satwa liar, seperti untuk mengidentifikasi asal usul satwa hasil sitaan, mencirikan kekebalan terhadap suatu penyakit, atau menentukan kuota pemanenan lestari. Kegunaan lainnya adalah dapat membantu upaya-upaya penangkaran,  seperti  untuk  mengatur  perkawinan  agar terhindar dari inbreeding dan meningkatkan heterosigositas, serta dapat membantu upaya restocking dan pendistribusian ulang satwa hasil penangkaran dan atau hasil sitaan ke habitat aslinya di alam guna mencegah kemungkinan polusi genetik yaitu melalui informasi sifat genetik tersebut dapat digunakan sebagai bahan rujukan dalam menentukan individu-individu yang secara genetik dapat dibenarkan untuk restocking dan pendistribusian ulang.
Berdasarkan hasil penelitian Fernado et al . (2006) yang  melakukan  penelitian  tentang  keanekaragaman
genetik, sejarah evolusi (silsilah) dan konservasi badak jawa  dengan  cara  menganalisis  DNA  mitokondria (mtDNA) dari 2 populasi badak jawa yang masih hidup di TNUK dan di Taman Nasional Cat Tien (TNCT) di Vietnam. Oleh karena statusnya yang terancam punah, maka dalam pengambilan  con toh  badak  jawa  san gat  terbatas sehingga DNA yang diekstrak berasal dari kotorannya (feses). Bagian-bagian dari mtDNA gen 12S rRNA dan D- Loop kemudian diamplifikasi dengan PCR dan disekuen.
Berdasarkan hasil penelitian tersebut dapat diketahui bahwa pada Lokus 12S, semua sampel dari TNUK dan museum Bogor memiliki haplotipe yang identik. Semua contoh dari TNCT adalah haplotipe tunggal yang berbeda dari haplotipe TNUK dengan 4 transisi. Rangkaian badak jawa yang dipublikasikan (Tougard et al . 2001) identik dengan haplotipe dari TNUK. Metode yang berbeda dari analisis filogenetik semuanya menempatkan badak jawa dan badak india sebagai anggota yang kekerabatannya jauh dari clade badak bercula satu (Gambar 1). Perbedaan rangkaian interspecies yang teramati antara badak jawa dan badak india adalah 3,3-3,5% dan antara 2 genera badak afrika adalah 4,0-4,7%.  Perbedaan rangkaian pada segmen 12S antara 2 haplotipe badak jawa dari TNUK dan TNCT adalah 0,5%, perbedaan antara subspesies dari badak putih ( C. s. simum dan C. s. cottoni ) adalah 0,9% dan antara badak hitam ( D. b. michaeli dan D. b. minor ) adalah 0,5%. Tidak ada perbedaan rangkaian yang teramati pada adaptif adalah hal yang harus segera dilakukan guna pen yelamatan   badak  jawa  ter sebut.  Jika  kita mengkonservasikan badak jawa, komunitas konservasi internasional  juga  perlu  memainkan  peran  penting, terutama dalam masalah penyediaan dana dan mendukung serta mendampingi kearifan lokal dalam konservasi dan manajemen badak jawa. Apabila kita tidak melakukan upaya  yang  cepat,  ini  akan  sungguh-sungguh  tragis karena kita membiarkan badak jawa punah di depan mata.

## Kesimpulan
Dalam rangka menunjang upaya-upaya konservasi badak  jawa,  maka  usaha  identifikasi  keanekaragaman genetik badak jawa mempunyai arti dan manfaat yang sangat penting. Data yang diperoleh dari analisis genetik populasi  ini  dapat  digunakan  sebagai  landasan  untuk merancang program konservasi terhadap suatu spesies tertentu  terutama  bagi  spesies-spesies  yang  terancam punah termasuk badak jawa.
Berdasarkan  hasil  studi,  maka  perlu  dilakukan pengaturan strategi yang tepat agar populasi badak jawa mencapai angka minimum viable population . Selain itu, perlu  dilakukan  kegiatan  translokasi  dan  reintroduksi untuk membangun populasi kedua ( second population ) .

## Daftar  Pustaka
Masy’ud  B.  1992.  Identifikasi  Sifat  Genetik  Satwa Dilindungi:  Sisi  Penting  Kegiatan  Konservasi Keanekaragaman Hayati. Media Konservasi 3(4): 41-46.
Fernando P et al. 2006. Genetic Diversity, Phylogeny and Conservation  of  the  Javan  Rhinoceros  (Rhinoceros sondaicus). http://www.ingentaconnect.com/content/ klu/coge/2006/00000007/00000003/00009139; jsessionid=4jcef1vt1nd0j.alice?format=print.  [18 Nopember 2008].
Hoogerwerf  A. 1970. Udjung Kulon: The Land of the Last Javan Rhinoceros. E.J. Brill Leiden. hlm 286-296.
Lekagul B, McNeely J.  1977. Mammals of Thailand.  The Association  for  the  Conservation    of  Wildlife. Bangkok.
Muntasib H.  2002. Penggunaan Ruang Habitat oleh Badak Jawa ( Rhinoceros  sondaicu s Desm. 1822) di Taman Nasion al  Ujung  Kulon  [Disertasi].  Fakultas Kehutanan, Institut Pertanian Bogor. Bogor.
Polet  G, Mui TV.  1999. Javan  rhinoceros in Vietnam. Ho Chi Minh City. Vietnam: Publishing House.
Rahmat UM. 2007. Analisis Tipologi Habitat Preferensial
Badak  Jawa  ( Rhinoceros  sondaicus Desmarest 1822)  di  Taman  Nasional  Ujung  Kulon  [Tesis]. Fakultas Kehutanan, Institut Pertanian Bogor.
Ramono WS.  1973. Javan rhinoceros in Udjung Kulon.
Direktorat PPA. Bogor.
Sadjudin HR, Djaja B.  1984. Monitoring Populasi Badak Jawa  ( Rhinoceros  sondaicus Desm.,  1822)  di Semenanjung  Ujung  Kulon.  Fakultas  Biologi Universitas Nasional.
Sadjudin HR. 1983. Dasar-dasar Pemikiran bagi Pengelola Badak Jawa ( Rhinoceros sondaicus Desm., 1822) di  Ujung  Kulon. Taman  Nasional  Ujung Kulon. Labuan.
Schenkel  R,  Schenkel  L.-Hulliger.    1969.  The  Javan rhinoceros ( Rhinoceros sondaicus Desm., 1822) in Udjung  Kulon  Nature  Reserve,  Its  Ecology  and Behavior. Field Study 1967 and 1968. Acta Tropica Separatum 26 (2).
Taman  Nasional  Ujung  Kulon.  2007.  Laporan  Sensus Badak  Jawa  ( Rhinoceros  sondaicus Desmarest, 1822) di Taman Nasional Ujung Kulon. Pandeglang.
Thohari M et al .  1995.  Genetika Populasi Gajah Sumatera ( Elephas  maximus  sumatranus )  dan  Konsep Pengelolaan  Populasinya  Secara  Lestari. Media Konservasi 4(4): 209-221.
Pemikiran Konseptual