## ISOLASI BAKTERI PATOGEN OPORTUNISTIK DARI TAMBAK UDANG SUMATERA UTARA

## ISOLATION OF OPPORTUNISTIC PATHOGEN BACTERIA FROM NORTH SUMATERA SHRIMP AQUACULTURE
Yusnita Wahyuni 1 , It Jamilah 2 , Dwi Suryanto 2
E-mail yusnita_wahyuni@yahoo.com
1 Staf Pengajar Fakultas Pertanian Universitas Muhammadiyah Tapanui Selatan Jl Raja Inal Siregar – Tanggal No 32, Padangsidimpuan 22716
2 Staf pengajar Departemen Biologi Fakultas MIPA USU

## ABSTRAK
Bakteri patogen oportunistik merupakan bakteri yang secara alami bukan berada di habitat suatu  lingkungan  tetapi  masuk  akibat  tercemarnya  lingkungan  tersebut  dengan  limbah manusia.  Keberadaan  bakteri  patogen  oportunistik  di  tambak  udang  disebabkan  karena tercemarnya  air  tambak  oleh  limbah  industri  maupun  domestik.  Penelitian  ini  bertujuan untuk mengetahui keberadaan bakteri patogen oportunistik pada tambak udang di Sumatera Utara (Percut, Pantai Labu, Pantai Cermin). Bakteri patogen oportunistik diisolasi dari usus udang,  sedimen  dan  air  tambak  udang  dengan  menggunakan  media  selektif/diferensial. Dari  hasil  isolasi  ditemukan  adanya  bakteri Escherichia  coli,  Salmonella sp.,  dan Staphylococcus sp.  Jumlah  tertinggi  dari  ketiga  bakteri  tersebut ditemukan  pada  sampel yang berasal dari daerah Percut.
Kata kunci: limbah, isolasi, Escherichia coli, Salmonella, Staphylococcus

## ABSTRACT
Opportunistic  pathogenic  bacteria  are  bacteria  that  are  naturally  not  present  in  an environment that, but it dues to contamination of the environment by human waste.  The existence of opportunistic pathogen bacteria in shrimp culture is resulted by contamination shrimp  water from  industrial  and domestic waste. The aims of this  study is  to  know the existence  of  opportunistic  pathogen  bacteria  in  North  Sumatera    shrimp  aquaculture (Percut, Pantai Labu, Pantai Cermin). Opportunistic pathogen bacteria were isolated from the gut of shrimp, sediment and water of shrimp aquaculture by using selective/differential media. From the results of isolation found the presence of Escherichia coli, Salmonella sp., and Staphylococcus sp.  The highest  number of third bacteria  was  found  in  sample from Percut area.
Key words: waste, isolation, Escherichia coli, Salmonella, Staphylococcus

## PENDAHULUAN
Udang  merupakan  salah  satu komoditi ekspor yang penting bagi pereko- nomian  Indonesia.  Budi  daya  udang khususnya  udang  windu  ( Panaeus  mono- don )  di  Indonesia  telah  dilakukan  sejak
tahun  70-an,  namun  pada  tahun  1990-an budi  daya udang di  Indonesia tidak stabil bahkan  mengalami  penurunan  yang  fatal (Muliani et  al .,  2003).  Pergantian  spesies kultur P.  monodon dengan P.  vanname memberi  harapan  baru  bagi  industri  budi daya  udang  Indonesia,  tapi  pasang  surut
kembali terjadi setelah itu karena munculnya penyakit udang dan penolakan negara tujuan ekspor (Kementrian Kelaut- an dan Perikanan 2009).
Kasus  penolakan  dan  penahanan ekspor  produk  perikanan  sering  terjadi  di Indonesia. Amerika Serikat yang dikenda- likan  oleh  FDA  (Food  Drug  Adminis- tration) membuka fakta bahwa sejak tahun 2003  sampai  tahun  2008  ditemukan  lebih dari  100  kasus  penahanan  produk  udang setiap  tahunnya,  puncaknya  pada  tahun 2004  ditemukan  sebanyak  442  kasus. Alasan  penolakan  produk  udang  tersebut sebagian  besar  disebabkan  oleh  masalah mutu  dan  keamanan  yang  dianggap  tidak memenuhi persyaratan internasional seper- ti  masalah sanitasi dan keberadaan bakteri (Rinto,  2010).  Pencemaran  bakteri  pada produk pangan merupakan masalah serius yang harus ditangani, karena setiap pangan memiliki batas maksimum cemaran mikroba.  Standar  Nasional  Indonesia (SNI)  menetapkan  jumlah  mikroba  yang ada  pada  ikan  termasuk  udang  seperti Eschericia  coli maksimum  5  x  10 5 /g, Salmonella sp.  negatif/25  g, Staphylo- coccus  aureus maksimum 1x10 3 /g  dan Vibrio sp. negatif/25 g (SNI 2009).
Bakteri patogen oportunistik meru- pakan  bakteri  yang  secara  alami  bukan berada  di  habitat  suatu  lingkungan  tetapi masuk  akibat  tercemarnya  lingkungan dengan limbah manuasia. Kehadiran bak- teri  patogen  oportunistik  pada  produk akuakultur  seperti  ikan,  kepiting,  dan udang  sangat  berbahaya  karena    produk tersebut  dapat  terlibat  secara  aktif  dan pasif dalam menularkan penyakit terhadap manusia. Harish et al. (2003) melaporkan telah mengisolasi Vibrio sp. , S. aureus, E.
coli, dan Salmonella sp.  sebagai  patogen oportunistik  dari  lokasi  pembudidayaan udang di India.
Tujuan  penelian  ini  adalah  untuk mengetahui  keberadaan  bakteri  patogen oportunistik pada beberapa tambak udang di Sumatera Utara

## METODE PENELITIAN

## Isolasi Bakteri
Sampel  diambil  dari  3  lokasi tambak  udang  di  Sumatera  Utara  yaitu Pantai  Labu,  Pantai  Cermin  dan  daerah Percut. Pada masing-masing tambak, bak- teri diisolasi dari air, sedimen dan udang. Sampel  air  diambil  sebanyak  100  ml  di masing-masing  lokasi,  dimasukkan  ke dalam  botol  sampel  kaca  steril.  Sedimen diambil sebanyak 100 gram dan dimasuk- kan  ke  dalam  botol  sampel,  kemudian semua  sampel    disimpan  dalam  kotak  es sampai  dibawa  ke  laboratorium  dalam waktu kurang dari 4 jam. Di laboratorium semua  sampel  bakteri  disimpan  dalam lemari es (4 0 C).

## Penghitungan Sel Bakteri
Sampel  (air,  sedimen,  udang  dari tambak udang) diencerkan dalam NaCl 0,9 % kemudian 0,1 ml suspensi disebar pada media PCA dan media selektif/diferensial, diinkubasi  selama  12-24  jam,  kemudian dihitung koloni bakteri yang tumbuh pada media.  Media  selektif  akan  menghambat pertumbuhan bakteri lain. Sehingga bakte- ri yang tumbuh hanya bakteri yang mampu memanfaatkan  media  tersebut  sebagai sumber nutrisi. Isolat E. coli akan tumbuh pada  media  EMB, Salmonella sp.  pada SSA, Staphylococcus sp.  pada  media MSA.
Jumlah  sel  pada  masing-masing media  selektif  dihitung  dalam  CFU/ml. Isolat  dimurnikan  dengan  penggoresan pada  media  SWC,  kemudian  koloni tunggal  digores  pada  media  SWC  miring dan  disimpan  dalam  lemari  es  (4 0 C) sampai digunakan.

## HASIL DAN PEMBAHASAN

## Isolasi Bakteri Patogen Oportunistik
Hasil  isolasi  bakteri  patogen oportunistik  dari  ketiga  tambak  udang yaitu  Pantai  Labu,  Percut  dan  Pantai
Cermin  ditemukan  bakteri E.  coli,
Satphylococcus sp.  dan Salmonella sp. tetapi  bakteri Vibrio sp.  tidak  ditemukan (Tabel 1).
Tabel 1  Jumlah sel bakteri yang diisolasi dari tambak udang
Lokasi Tambak Bagian Jumlah Sel (CFU/ml) E. coli Staphylococcus sp. Salmonella sp. Pantai Labu Sedimen 2,27x 10 4 1,56x 10 4 0,15x 10 4 Air 1,32x 10 4 0,23x 10 3 0,09x 10 3 Usus Udang 2,44x 10 4 0,09x 10 3 0,05x 10 3 Percut Sedimen 0,46x 10 5 0,19x 10 5 0,37x 10 4 Air 1,03x 10 4 0,37x 10 4 0,98x 10 3 Usus Udang 0,57x 10 5 0,16x 10 4 0,17x 10 3 Pantai Cermin Sedimen 0,07x 10 4 0,19x 10 5 0,09x 10 4 Air 0,01x 10 4 0,27x 10 3 0,02x 10 4 Usus Udang - - - Ket (-) tidak ditemukan bakteri
Tabel  1  menunjukkan  bahwa sampel  dari  daerah  Percut  mengandung jumlah  bakteri  terbanyak  jika  dibanding- kan dengan kedua daerah lainnya. E. coli mencapai  0,57  x  10 5 CFU/ml  yang diisolasi  dari  usus  udang, Staphylococcus sp. 0,19 x10 5 CFU/ml berasal  dari bagian sedimen  dan Salmonella sp.  0,37  x10 4
CFU/ml  dari  bagian  sedimen.  Tingginya jumlah  bakteri  di  tambak  udang  daerah Percut  disebabkan  karena    merupakan lokasi  tambak  yang  paling  dekat  dengan kawasan  industri,  rumah  penduduk,  dan merupakan muara Sungai Deli  yang telah tercemar  oleh  limbah  domestik  yang diduga masuk ke tambak  melalui pasokan air  dari  sungai.  Pada  tambak  di  daerah Pantai  Cermin  sedikit  ditemukan  bakteri karena tambak tersebut merupakan tambak intensif yang penanganannya sudah cukup baik.  Kunarso  (1987)  menyatakan  bahwa adanya bakteri Salmonella sp. dan E. coli di  perairan  tawar  dan  laut  berasal  dari limbah domestik dan industri yang bersifat organik.  Laut merupakan tempat buangan akhir untuk berbagai limbah hasil kegiatan daratan,  hal  ini  tidak  terkecuali  untuk limbah  domestik.  Tentunya  ini  sangat membahayakan,  karena  limbah  domestik sangat  potensial  membawa  berbagai  jenis bakteri  patogen.  Menurut  Darmayanti et al. (2009)  bakteri  patogen  oportunistik
yang  hidup  di  perairan  ketika  kontak dengan tubuh manusia dapat menimbulkan infeksi dan penyakit.
Dari  Tabel  1  juga  dapat  dilihat bahwa bakteri pada sedimen lebih banyak jika dibanding dengan bakteri yang berada pada air. Hal ini disebabkan karena nutrisi atau  senyawa  organik  lebih  banyak terakumulasi  pada  bagian  dasar  perairan sehingga  bakteri  lebih  banyak  ditemukan pada bagian tersebut. Bakteri E. coli lebih banyak  ditemukan  pada  bagian  usus karena E.  coli merupakan  flora  normal pada usus manusia dan hewan tapi dalam jumlah  yang  banyak  bakteri  ini  dapat menyebabkan  penyakit  seperti  diare (Pelczar & Chan 2008).
Setiap  isolat  bakteri  patogen oportunistik  diremajakan  pada  media selektif/diferensial  yang  bertujuan  untuk melihat  kemurnian  isolat.  Biakan E.  coli akan berwarna kilat logam kehijauan pada media  EMB  (Gambar  1A).  Medium  ini bersifat  selektif  terhadap  mikroorganisme Gram  negatif  karena  zat  warna  yang terkandung di dalamnya melancarkan efek bakteristatik terhadap bakteri Gram positif. Selama  pertumbuhannya  dalam  medium tersebut, bakteri Gram negatif  yang dapat memfermentasi  laktosa  akan  mengambil sebagian  dari  zat  yang  terkandung  di dalam  medium  sehingga  koloninya  akan
tampak ungu atau gelap dibagian tengahnya (Lestari 2008).
Indikasi adanya pertumbuhan bakteri Salmonella dan Shigella pada media  SSA  dapat  dilihat  dengan  adanya perubahan  media  (Gambar  1  A  dan  B). Koloni Salmonella sp. memiliki ciri seperti warna bening sampai buram dengan bintik hitam  di  tengah.  Adanya  bintik  hitam  di tengah disebabkan karena bakteri tersebut dapat  menghasilkan  H 2 S  (Astuti  2012). Kontaminasi  bakteri Salmonella sp.  di
lingkungan  laut  umumnya  berasal  dari limbah  domestik  yang  bersifat  organik seperti sampah, tinja manusia atau hewan dan  bangkai,  sedangkan  dari  limbah industri  berasal  dari  pengolahan  bahan makanan  kaleng  seperti  ikan,  udang, kerang-kerangan  dan  daging. Salmonella sp.  dapat  menyebabkan  penyakit  yang disebut salmonellosis ditandai  dengan demam,  sakit  kepala  dan  mual,  sehingga diupayakan  setiap  produk  pangan  bebas dari Salmonella sp. (Hatmanti et al . 2009).
Gambar 1  Bakteri patogen oportunistik pada media selektif, A) E. coli pada EMB inkubasi 2 hari, suhu 28 0 C, B) Staphylococcus sp. pada MSA inkubasi 1 hari, suhu 28 0 C, C) Salmonella sp. pada SSA inkubasi 1 hari, suhu 28 0 C, D) Pewarnaan E.  coli dengan  safranin,  E)  Pewarnaan Staphylococcus sp.  dengan metylen blue , F) Pewarnaan Salmonella sp. dengan safranin
Staphylococus sp.  dapat  dilihat pada media MSA. MSA merupakan media yang  mengandung  NaCl  7,5  %,  manitol dan  merah  fenol.  Media  ini  terutama digunakan  untuk  membedakan Staphylo- coccus sp. yang bersifat patogen dan yang tidak  patogen.  Media  ini  mengandung kadar NaCl tinggi, sehingga akan menghambat  pertumbuhan  bakteri  selain Staphylococcus sp.  Pada  umumnya S. aureus bersifat  patogen  akan  membentuk
zona  kuning  disebabkan  oleh  fermentasi manitol  disertai  dengan  pembentukan asam  (Gambar  1B). Staphylococcus sp. tidak  patogen  akan  membentuk  zona merah disebabkan oleh manitol yang tidak di  fermentasikan  merah  fenol  merupakan indikator untuk melihat adanya pembentu- kan asam (Lay 1994).
S.  aureus sering  ditemukan  pada makanan yang mengandung protein tinggi. Keberadaan S. aureus dalam makanan bisa
bersumber  dari  kulit,  mulut,  atau  rongga hidung pengolah pangan, sehingga mudah mencemari  makanan  (Pelczar  &  Chan 2008).  Pertumbuhan bakteri S. aureus pa- da  pangan  dan  olahannya  dapat  mengan- cam  kesehatan  masyarakat  karena  bebe- rapa galur S. aureus memproduksi entero- toksin  yang  dapat  menyebabkan  kasus keracunan pangan. Pangan  yang tercemar atau  mengandung S.  aureus enterotok- sigenik  sangat  berbahaya  bagi  kesehatan konsumen.  Enterotoksin  yang  diproduksi S.  aureus lebih  tahan  terhadap  panas dibandingkan  sel  bakterinya  (Semesta 2011).

## KESIMPULAN
Dari  hasil  penelitian  yang  telah dilakukan  dapat  disimpulkan  bahwa tambak  udang  di  daerah  Percut,  Pantai Labu  dan  Pantai  Cermin  tercemar  oleh bakteri  patogen  oportunistik E.  coli ,
Staphylococcus sp.  dan Salmonella sp. Diantara  tambak  udang  tersebut  daerah yang  paling  tinggi  cemaran  bakteri patogen  oportunistiknya  adalah  daerah Percut

## DAFTAR PUSTAKA
Astuti  T.  2012.  Studi  kandungan  bakteri Salmonella sp.  pada  minuman  susu telur  madu  jahe  (STMJ)  di  Taman Kota  Damay  Kecamatan  Kota Gorontalo. Skripsi.
Gorontalo: FKM. Universitas Negeri Gorontalo. hlm. 8. Darmayanti DHK, Ruyitno. 2009. Dinamika bakteri indikator pencemaran  di  Perairan  Estuari Cisadane. Oseanologi  Limnologi
Indones . 35: 273-290.
Harish RKS, Hatha AAM. 2003. Prevalence  of  oportunistic  shrimp farm  adjoining  Vambanadu  lake,
Kerala, India . Asian  Fisheries Science . 16: 187-189. Hatmanti ANR & Dewi J. 2009. Screening bakteri  penghambat  untuk  bakteri
penyebab  penyakit  pada  budi  daya ikan kerapu dari Perairan Banten dan Lampung . Makara Sains . 13: 81-83.
Kementerian  Kelautan  dan  Perikanan. 2009. Kelautan dan perikanan dalam angka.  Jakarta  Pusat  Data  Statistik dan Informasi. hlm. 28.
Kunarso  DH.  1987.  Beberapa  catatan tentang bakteri Salmonella . J. Oseana . 12: 79-90.
Lay  BW.  1994.  Analisis  mikroba  di laboratorium. Jakarta: Rajawali Press. hlm. 111.
Lestari  D.  2008.  Isolasi  dan  seleksi Bacillus sp.  untuk  biokontrol  pada tambak  udang.  Skripsi.  Bogor: Biologi FMIPA. IPB. hlm. 4-7.
Muliani  E,  Susiangsih,  Nurbaya.  2003. Pengaruh  komposisi  jenis  dan  rasio bakteri  probiotik terhdap perubahan kualitas air dan kelangsungan hidup (udang windu) dalam skala laboratorium , J. Penelt. Pert. Indones . 9:83-87.
Pelczar MJ, Chan ECS. 2008. Dasar-dasar mikrobiologi. Jilid I. Jakarta: Universitas Indonesia Press. hlm. 35. Semesta  FM.  2011.  Tingkatan  cemaran mikroorganisme  pada  daging  ayam dan daging sapi dari pasar tradisional di  Provinsi  Jawa  Barat  berdasarkan jumlah total mikroorganisme
Staphylococcus aureus dan Escherichia  coli .  Skripsi.  Bogor: IPB. hlm. 23.
SNI  7388.  2009.  Batas  maksimum cemaran mikroba pada pangan.