## Keberadaan Bakteri E. coli dan Salmonella spp. Berdasarkan Bagian-bagian Usus Broiler di Pasar Payakumbuh
(The presence of E. coli and Salmonella spp. Based on the Broiler Intestine Parts at the Payakumbuh Market)
Sujatmiko, Prima Silvia Noor, Ramond Siregar, Yurni Sari Amir, Ulva Mohtar Lutfi, Delli Lefiana, Engki Zelpina, dan Suliha
Program Studi Paramedik Veteriner, Politeknik Pertanian Negeri Payakumbuh
Email: drh.sujatmiko@gmail.com
Diterima : 10 Oktober 2023/Disetujui : 30 Nopember 2023

## ABSTRAK
Kolibasilosis  dan  Salmonellosis  adalah  penyakit  bakteri  utama  yang  berdampak  pada  industri  ayam dengan potensi zoonosis karena dapat menular ke manusia. Kolibasilosis disebabkan oleh Escherichia coli sedangkan Salmonellosis disebabkan oleh Salmonella spp. Penelitian ini bertujuan mengeksplorasi keberadaan bakteri E. coli dan Salmonella spp. di dalam saluran cerna ayam sebagai referensi untuk pengendalian penyakit dan pencegahan kontaminasi mikroba pada daging atau karkas ayam. Metode penelitian  yang  digunakan  adalah  deskriptif  eksploratif,  dengan  pengambilan  sampel  menggunakan teknik purposive sampling . Sampel yang digunakan adalah massa di dalam lumen usus ayam broiler yang dibeli di pasar tradisional Payakumbuh. Ayam yang digunakan berjumlah 25 ekor yang diambil secara acak dari lima pedagang berbeda, dengan berat badan berkisar 1,5 - 1,8 kg dan tanpa tampilan klinis sakit. Peubah yang diamati dalam penelitian ini adalah keberadaan bakteri E. coli dan Salmonella berdasarkan  bagian  usus,  yang  dinyatakan  dalam  persentase.  Hasil  penelitian  ini  menunjukkan keberadaan bakteri E. coli tertinggi ditemukan pada bagian ileum dan kolon dengan persentase 90%, sedangkan keberadaan bakteri Salmonella tertinggi ditemukan pada bagian sekum dengan persentase 36%.
Kata Kunci : E. coli , Salmonella , Broiler, Usus, Zoonosis

## ABSTRACT
Colibacillosis  and  Salmonellosis  are  major  bacterial  diseases  impacting  the  poultry  industry  with zoonotic potential, as they can be transmitted to humans. Colibacillosis is caused by Escherichia coli , while Salmonella spp  causes  Salmonellosis.  This  study  aims  to  explore  the  presence  of E.  coli and Salmonella spp.  bacteria  in  the  chicken  gastrointestinal  tract  as  a  reference  for  disease  control  and prevention  of  microbial  contamination  in  chicken  meat  or  carcasses.  The  research  methodology employed  is  descriptive-exploratory,  with  sample  collection  using  purposive  sampling.  The  samples used  are  masses  from  the  lumen  of  broiler  chicken  intestines  purchased  from  the  Payakumbuh Traditional Market. A total of 25 chickens were randomly selected from five different vendors, with a weight range of 1.5 - 1.8 kg and no clinical signs of illness. The variables observed in this study are the presence  of E.  coli and Salmonella based  on  intestinal  parts,  expressed  as  percentages.  This  study showed that the highest presence of E. coli bacteria was found in the ileum and colon part with a ratio of 90%. In comparison, the highest presence of Salmonella bacteria was found in the cecum part, with a ratio of 36%.
Keywords : E. coli , Salmonella , Broiler, Intestines, Zoonosis

## PENDAHULUAN
Kolibasilosis  dan  Salmonellosis pada  ayam  dianggap  sebagai  penyakit
bakteri utama yang mempengaruhi industri unggas  secara  global.  Kedua  penyakit  ini termasuk  dalam  penyakit  unggas  yang
paling umum dan memiliki potensi menular ke manusia (Lutful, 2010).
Kolibasilosis disebabkan oleh bakteri Escherichia  coli ( E.  coli ).  Bakteri ini  merupakan  flora  normal  saluran  cerna yang bersifat  komensal,  namun  genotifnya dapat  bergeser  dari  komensal  menjadi patogen. E.  coli bersifat  patogen  yang disebut sebagai Avian pathogenic Escherichia  coli (APEC)  adalah  penyebab utama  kolibasilosis  pada  unggas  broiler dengan kerugian ekonomi yang signifikan. Penelitian  menunjukkan  bahwa  APEC memiliki  tingkat  mortalitas  tinggi  (35%) (Apostolakos et al., 2021).
E.  coli termasuk © -proteobacteria yang  pada  kondisi  fisiologis  populasinya relatif  rendah  dalam  usus  ayam  sepanjang hidup  hewan  tersebut.  Beberapa  strain E. coli dapat  menyebabkan  infeksi  sekunder oportunis pada ayam setelah terjadi infeksi patogen  lain  seperti  infeksi  pada  saluran pernapasan  oleh  virus  bronkitis  infeksius atau Mycoplasma gallisepticum yang dipicu oleh tingkat amonia tinggi di kandang ayam (Oakley et al., 2014).
Salmonellosis disebabkan oleh bakteri Salmonella spp . Salmonella adalah patogen  zoonotik  penting,  dan  ayam merupakan  salah  satu  inang  utamanya. Setiap  tahun,  infeksi Salmonella menjadi ancaman  serius  bagi  industri  unggas  di negara  berkembang. Salmonella dapat dijumpai pada usus  ayam,  walaupun ayam
tersebut  tidak  menunjukkan  gejala  sakit (Wang et al., 2020).
Konsumsi daging ayam ras mengalami peningkatan secara berkesinambungan seiring dengan peningkatan  populasi,  status  ekonomi  dan kesukaan  konsumen.  Data  statistik  pada tahun 2019 menunjukkan konsumsi daging ayam  ras  mencapai  5,683  kg  per kapita/tahun,  atau  mengalami  kenaikan sebesar  1,87  %  dari  konsumsi  tahun sebelumnya (5,579 kg per kapita per tahun) (Ramadhany dan Ermansyah, 2020). Konsumsi  daging  ayam  yang  terus meningkat ini menuntut kepastian keamanan  dari  kontaminasi  mikroba  pada karkas (Rouger et al, 2017).
Dari  uraian  di  atas  terlihat  bahwa salah satu sumber kontaminasi karkas ayam adalah  massa  pada  saluran  cerna.  Pada penelitian ini dilakukan eksplorasi keberadaan  bakteri  patogen  berdasarkan bagian-bagian usus. Hasil dari penelitian ini dapat  digunakan  sebagai  referensi  pada pengolahan  pasca  pemotongan  sebagai tindakan  preventif  cemaran  mikroba  pada karkas.

## MATERI DAN METODE PENELITIAN

## Waktu dan Tempat
Penelitian  ini  dilaksanakan  pada
bulan September-Oktober 2023 di Laboratorium  Kesehatan  dan  Penyakit
Hewan Politeknik Pertanian Negeri
Payakumbuh.
Alat dan Bahan
Alat yang digunakan adalah peralatan  gelas,  autoklaf,  laminar,  ose, bunsen,  gunting,  inkubator,  oven,  dan timbangan analitik.
Bahan yang digunakan adalah ayam broiler dari Pasar Tradisional Payakumbuh, Media Eosin-Methylene Blue Agar
(EMBA)  (Oxoid  ),  Media Salmonella-
Shigella  Agar (SSA)  (Oxoid  ),  spiritus, alkohol 70%, dan salin.

## Metode Penelitian
Penelitian ini menggunakan metode deskriptif eksploratif. Pengambilan sampel menggunakan  teknik  purposive  sampling. Sampel  yang  digunakan  adalah  massa  di dalam lumen usus ayam broiler yang dibeli di  Pasar  Tradisional  Payakumbuh.  Ayam yang  digunakan  sebanyak  25  ekor  yang diambil  secara  acak  dari  lima  pedagang berbeda,  yang  diberi  kode  selanjutnya dengan  A,  B,  C,  D  dan  E  untuk  masing- masing pedagang. Ayam tersebut memiliki berat  badan  dengan  kisaran  1,5  –  1,8  kg dengan tampilan klinis  tidak menunjukkan sakit.

## Peubah Amatan
Peubah yang diamati adalah
keberadaan  bakteri E.  coli dan Salmonella berdasarkan  bagian  usus  yang  dinyatakan deskriptif dalam persen (%).

## Prosedur Kerja
Massa  di  dalam  lumen  usus  ayam diambil  dan  berdasarkan  bagian-bagian
usus,  yakni  duodenum,  jejunum,  ileum, sekum dan kolon yang dipisahkan menggunakan  gunting  stainless  yang  telah disterilkan. Masing-masing sampel tersebut ditempatkan di dalam beaker glass 100 mL yang telah disterilkan, kemudian dilakukan pengenceran  10-1.    Sampel  dari  beaker glass  diambil  sebanyak  0,1  mL  kemudian dikultur  pada  media  EMBA  dan  SSA menggunakan  metode  agar  tuang.  Metode penanaman  Media  EMBA  adalah  media selektif untuk E. coli sedangkan media SSA adalah media selektif untuk Salmonella spp . Kultur pada media EMBA diinkubasi pada 37 0 C selama 24 jam, sedangkan kultur pada SSA diinkubasi pada 27 0 C selama 48 jam. Keberadaan bakteri E. coli ditandai dengan tumbuhnya koloni berwarna hijau metalik, sedangkan Salmonella ditandai  dengan tumbuhnya koloni cembung, agak transparan  dan  terdapat  warna  hitam  di sekitar pusat koloni.

## HASIL DAN PEMBAHASAN
Tabel 1 memperlihatkan persentase keberadaan  bakteri E.  coli berdasarkan bagian-bagian usus, baik bagian usus halus (duodenum,  jejunum,  ileum)  serta  usus besar (sekum, kolon).
Pada  tabel  tersebut  dapat  dilihat bahwa  persentase  keberadaan  bakteri E.
coli tertinggi (90%) ditemukan pada ileum dan  kolon,  sedangkan  persentase  terendah ditemukan  pada  duodenum  (24%).  Ileum adalah bagian paling caudal dari usus halus. Berdasarkan  gejala  klinis,  ayam  yang
diperoleh dari Pasar
Tradisional Payakumbuh  tidak  menunjukkan  gejala sakit. Demikian juga ketika ayam dipotong dan  dibuka  bagian  abdomennya  untuk diambil saluran cerna, tidak terdapat tanda- tanda  patologis.  Walaupun  bakteri E.  coli
ditemukan sampai bagian duodenum (24% dari seluruh sampel yang diperiksa), namun ayam tidak menunjukkan gejala klinis sakit. Hal  ini  kemungkinan  bakteri E.  coli yang ditemukan  tersebut  tergolong  komensal, bukan dari strain patogen intestinal.
Tabel 1. Keberadaan bakteri E. coli pada bagian-bagian usus ayam broiler di Pasar
Tradisional Payakumbuh Bagian Usus Persentase keberadaan bakteri E. coli* Persentase A B C D E Rata-rata Duodenum 20 60 20 20 0 24 Jejunum 80 60 20 60 40 52 Ileum 100 60 100 100 90 90 Sekum 80 60 50 50 80 64 Kolon 100 100 80 70 100 90
* A, B, C, D, dan E adalah ayam yang dibeli dari pedagang berbeda
Meskipun  banyak  strain E.  coli
tidak berbahaya sebagai komensal, sebagian strain dapat menyebabkan penyakit pada usus maupun ekstraintestinal. Strain E.  coli patogen  extraintestinal (ExPEC)  menyebabkan  berbagai  infeksi diluar saluran pencernaan pada manusia dan hewan.  Berdasarkan  inang  dan  tempat infeksi, strain-strain ExPEC diklasifikasikan  sebagai E.  coli meningitis neonatal  (NMEC)  yang  menyebabkan meningitis  pada  bayi  baru  lahir, E.  coli penyebab sepsis (SEPEC), E. coli uropathogenic (UPEC) yang menyebabkan infeksi  saluran  kemih  (ISK),  dan E.  coli patogen  avian  (APEC),  yang  terutama menyebabkan  penyakit  pernapasan  dan sistemik  pada  unggas.  Infeksi  ExPEC berbahaya  bagi  kesehatan  manusia.  Strain ExPEC  dapat  mengkolonisasi  usus,  mirip dengan E.  coli komensal  non-patogen,
tetapi  dilengkapi  dengan  faktor-faktor virulensi  yang  memungkinkan E.  coli menyebabkan penyakit ekstraintestinal (Mellata,  2013;  Ewers  et  al.,  2009; Stromberg et al., 2017).
Stromberg  et  al.  (2017),  telah melakukan  penelitian  virulensi  bakteri E. coli yang  diisolasi  dari  feses  ayam  sehat.
Dia  mengungkapkan  bahwa  ditemukan 13%  isolat E.  coli asal  feses  ayam  sehat diidentifikasi  sebagai  ExPEC,  sedangkan yang  lainnya  sebagai  APEC  dan E.  coli uropatogenik.
Persentase terkecil ditemukannya E. coli adalah  pada  duodenum  (24%)  (Tabel
1).  Pada  dasarnya  seluruh  bagian  saluran pencernaan ayam broiler dihuni oleh bakteri yang  berspesialisasi  sesuai  dengan  kondisi fisiko-kimia,  fisiologi  inang,  dan  nutrisi yang  tersedia  di  habitat  tertentu.  Pada bagian usus kecil bakteri yang
mendominasi  adalah  bakteri  asam  laktat. Dominasi tersebut karena kebutuhan bakteri  ini  akan  asam  amino  untuk pertumbuhannya  sangat  bergantung  pada ketersediaan  asam  amino  dari  nutrisi
inangnya  yang  banyak  terdapat  pada  usus halus.  Dominasi  ini  menyebabkan  bakteri lain  mendapatkan  ruang  kolonisasi  yang lebih kecil (Apajalahti and Vienola, 2016).
Tabel 2. Keberadaan bakteri Salmonella pada bagian-bagian usus ayam Broiler di Pasar
Tradisional Payakumbuh Bagian Usus Persentase keberadaan bakteri Salmonella* Persentase A B C D E Rata-rata Duodenum 0 0 20 0 20 8 Jejunum 0 0 0 20 0 4 Ileum 20 0 0 20 20 12 Sekum 20 40 40 40 40 36 Kolon 20 20 0 40 0 16
* A, B, C, D, dan E adalah ayam yang dibeli dari pedagang berbeda
Tabel  2  menunjukkan  persentase keberadaan bakteri Salmonella berdasarkan bagian  usus  ayam  broiler.  Persentase tertinggi  (36%)  terdapat  pada  bagian sekum,  sedangkan  persentase  terendah terdapat pada bagian jejunum.
Data dari Tabel 2 tersebut menunjukkan persentase keberadaan bakteri Salmonella pada ayam broiler yang diperoleh dari Pasar
Tradisional Payakumbuh masih tinggi jika dibandingkan hasil penelitian lain.
Witkowska  et  al.  (2018)  dalam  studi prevalensi Salmonella spp .  dengan sampel feses  yang  berasal  dari  kawanan  ayam broiler di  utara Polandia pada tahun 2014- 2016 menemukan bahwa prevalensi
Salmonella spp . hanya sebesar 2,19% pada tahun 2014 dan 1,22% pada tahun 2016. S.
Enteritidis dan S. Typhimurium adalah dua serotipe Salmonella yang  paling  umum diidentifikasi, masing-masing dengan
prevalensi  1,18%  dan  0,12%.  Kedua serotipe  ini  terdeteksi  dalam  1,29%  dari kawanan ayam. Selain S. Enteritidis dan S. Typhimurium ,  serotipe  lain  seperti S.
Mbandaka (0,14%) dan S. Infantis (0,07%) juga  ditemukan,  bersama  dengan S. Kentucky dan S.  Anatum yang  muncul secara sporadis. Witkowska juga menunjukkan  bahwa  terdapat  korelasi antara  insiden  salmonellosis  manusia dengan  persentase  kawanan  ayam  broiler yang  terinfeksi  di  wilayah  yang  dianalisis, sehingga  keberadaan Salmonella  spp .  dan serotipe  tertentu  pada  ayam  broiler memiliki implikasi penting terhadap kesehatan masyarakat.
Limawongpranee  et  al.  (1999), dalam  penelitiannya  dari  sampel  ayam  di rumah  potong  ayam  di  Tochigi,  Jepang, dengan  sampel  berupa  massa  sekum  ayam menemukan  bahwa  prevalensi Salmonella sebesar  14,3%.  Serotipe Salmonella yang
diidentifikasi  meliputi  delapan  serotipe yang  berbeda  yakni  serotipe S.  Blockley mendominasi dengan 72,0%, diikuti oleh S. Hadar (17,9%), S.  Bredeney (4,5%), S. Schwarzengrund (2,7%), S. Anatum (1,2%),
S. Enteritidis (0,9%), S. Ohio (0,6%), dan S.
Livingstone (0,3%).  Studi  ini  memberikan gambaran  tentang  prevalensi Salmonella dan  keragaman  serotipe  di  antara  ayam broiler  dalam  lingkungan  peternakan, sehingga mengingatkan kita betapa pentingnya  pemantauan  dan  pengelolaan kebersihan  serta  tindakan  pencegahan infeksi Salmonella dalam industri peternakan ayam broiler.
Salmonella sering menjadi kontaminan daging ayam bersama Campylobacter . Dua patogen dapat menyebabkan keracunan makanan.
Meskipun telah dilakukan sejumlah perbaikan  dalam  pengolahan  ayam  untuk mengurangi  prevalensi  patogen-patogen ini, Salmonella dan Campylobacter .
Keberadaan Salmonella pada saluran  cerna  ayam  dapat  berdampak kualitas  daging.  Kontaminasi  daging  saat pemrosesan  dapat  saja  terjadi  karena prosedur  yang  tidak  baik.  Thames  et  al. (2022)  pada  penelitiannya  yang  dilakukan di  Mississippi  dan  Alabama,  USA, menemukan  bahwa  18,8%  daging  ayam yang diperiksa terkontaminasi oleh Salmonella .
Hasil  penelitian  ini  menunjukkan bahwa  keberadaan  bakteri  patogen  tidak
serta  merta  menimbulkan  penyakit  pada ayam.  Hal  ini  disebabkan  karena  saluran pencernaan pada ayam banyak dihuni oleh berbagai mikroorganisme yang berinteraksi secara  erat  dan  intensif  dengan  inangnya dan juga dengan makanan yang dikonsumsi.  Banyak  juga  mikroorganisme usus  memberikan  manfaat  bagi  inang dengan  menyediakan  nutrisi  dari  substrat makanan yang sebelumnya sulit digunakan dan  mengatur  perkembangan  serta  fungsi sistem pencernaan dan kekebalan. Sebagai imbalan-nya,  inang  menyediakan  habitat yang  memungkinkan  dan  nutrisi  untuk kolonisasi dan pertumbuhan bakteri. Selama  mikroorganisme  masih  berada dalam  keseimbangan,  kondisi  kesehatan ayam  masih  akan  dapat  dipertahankan dengan baik (Pan and Yu, 2014).

## KESIMPULAN DAN SARAN
Berdasarkan  penelitian  ini  dapat disimpulkan  bahwa  keberadaan  bakteri E. coli dan Salmonella  spp .  di  Pasar
Tradisional  Payakumbuh  masih  cukup tinggi  meskipun  ayam  yang  menjadi sumber  sampel  tidak  menunjukkan  gejala sakit.  Hal  ini  perlu  mendapat  perhatian karena  kedua  bakteri  tersebut  merupakan patogen  zoonosis  penting.    Upaya-upaya pemantauan yang ketat, tindakan pencegahan,  dan  peningkatan  kebersihan dalam  industri  peternakan  dan  pengolahan hasil ayam  broiler hendaknya ditingkatkan untuk  mengurangi  risiko  kontaminasi bakteri  patogen  seperti E.  coli dan
Salmonella ,  serta  memastikan  keamanan daging ayam yang dihasilkan.

## DAFTAR PUSTAKA
Apajalahti,  J.  and  Vienola,  K.  (2016)
‘Interaction between chicken
intestinal  microbiota  and  protein digestion’, Animal  Feed Science and Technology ,  221,  pp.  323–330.  doi: 10.1016/j.anifeedsci.2016.05.004.
Apostolakos, I. et al. (2021) ‘Occurrence of Colibacillosis  in  Broilers  and  Its Relationship  with  Avian  Pathogenic
Escherichia  coli  (APEC)  Population Structure and Molecular Characteristics’, Frontiers in Veterinary  Science ,  8(September), pp. 1–13.
doi:
10.3389/fvets.2021.737720.
Ewers,  C. et  al. (2009)  ‘Intestine  and environment  of  the  chicken  as reservoirs for extraintestinal pathogenic  Escherichia  coli  strains with zoonotic potential’, Applied and Environmental  Microbiology ,  75(1), pp. 184–192. doi:
10.1128/AEM.01324-08.
Limawongpranee, S. et al. (1999) ‘Prevalence  and  Persistence  of
Salmonella in Broiler Chicken Flocks’, Journal of Veterinary Medical Science , 61(3), pp. 255–259. doi: 10.1292/jvms.61.255.
Lutful  Kabir,  S.  M.  (2010)  ‘Avian colibacillosis  and  salmonellosis:  A closer look at epidemiology, pathogenesis,  diagnosis,  control  and public health concerns’, International Journal  of  Environmental  Research and Public Health , 7(1), pp. 89–114. doi: 10.3390/ijerph7010089.
Mellata,  M.  (2013)  ‘Human  and  avian extraintestinal pathogenic escherichia coli:  Infections,  zoonotic  risks,  and antibiotic resistance trends’, Foodborne  Pathogens  and  Disease , 10(11), pp. 916–932. doi:
10.1089/fpd.2013.1533.
Oakley,  B.  B. et  al. (2014)  ‘The  chicken gastrointestinal  microbiome’, FEMS Microbiology  Letters ,  360(2),  pp.
100–112. doi: 10.1111/1574- 6968.12608.
Pan,  D.  and  Yu,  Z.  (2014)  ‘Intestinal microbiome  of  poultry  and  its interaction  with  host  and  diet’, Gut Microbes ,  5(1),  pp.  108–119.  doi:
10.4161/gmic.26945.
Ramadhany  A.,  dan  Ermansyah , L.  (2020) Statistik  Peternakan  dan  Kesehatan Hewan  2020 , Direktorat  Jenderal Peternakan  dan  Kesehatan  Hewan Kementerian Pertanian . Available at: https://pusvetma.ditjenpkh.pertanian. go.id/upload/statistik/1615509509.st atistik 2020.pdf.
Rouger,  A.,  Tresse,  O.  and  Zagorec,  M.
(2017)  ‘Bacterial  contaminants  of poultry  meat:  Sources,  species,  and dynamics’, Microorganisms ,  5(3). doi:
10.3390/microorganisms5030050.
Stromberg, Z. R. et  al. (2017) ‘Evaluation of  Escherichia  coli  isolates  from healthy  chickens  to  determine  their potential  risk  to  poultry  and  human health’, PLoS ONE , 12(7), pp. 1–18. doi: 10.1371/journal.pone.0180599.
Thames, H. T. et al. (2022) ‘The Prevalence of Salmonella and Campylobacter on Broiler  Meat  at  Different  Stages  of Commercial  Poultry  Processing’, Animals ,  12(18),  pp.  1–13.  doi:
10.3390/ani12182460.
Wang, X. et al. (2020) ‘Characterization of Salmonella spp. isolated from chickens  in  Central  China’, BMC Veterinary Research , 16(1), pp. 1–9.
doi: 10.1186/s12917-020-02513-1.
Witkowska, D. et al. (2018) ‘Prevalence of salmonella  spp.  In  broiler  chicken flocks  in  northern  Poland  in  2014– 2016’, Annals  of  Agricultural  and Environmental  Medicine ,  25(4),  pp. 693–697. doi: 10.26444/aaem/99528.