IPB Biodiversity Informatics (IPBiotics) untuk Pembangunan Berkelanjutan

## IPB BIODIVERSITY INFORMATICS (IPBIOTICS) UNTUK PEMBANGUNAN BERKELANJUTAN
IPB Biodiversity Informatics (IPBIOTICS) for Sustainable Development
E RVIZAL A.M Z UHUD 1) , Y ENI H ERDIYENI 2) , A GUS H IKMAT 3) , A BDUL H ARIS M USTARI 4) , A RYA A. M ETANANDA 5) , D ESTA S. P RAVISTA 6) , M AYANDA M EGA 7) , R AHMAT S ETIAWAN 8)
1,3,4,5) Departemen Konservasi Sumberdaya Hutan dan Ekowisata, Fakultas Kehutanan, IPB
2,6,7,8) Departemen Ilmu Komputer, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, IPB
Diterima 24 Februari 2014 / Disetujui 29 Maret 2014

## ABSTRACT
Indonesia  is  the  country  with  the  second  highest  biodiversity  in  the  world.  It  is  not  only  the  diversity  of  biodiversity,  but  also  diversity  of indigenous knowledge such as functional foods and other traditional ingredients. IPB as one of the leading university in Indonesia has important role in  the  management  of  natural  resources  of  biodiversity.  Currently,  management  of  biodiversity  resource  require  an  integrated  and  holistic  system using computer science and technology which develop rapidly at this time. This study developed a system of biodiversity informatics IPB (IPBiotics) for biodiversity information management of indonesia’s natural resources in order to improve the knowledge management (knowledge management), exploration,  analysis,  synthesis  and  interpretation  of  data  ranging  from  the  level  of  genomic  biodiversity,  species  level  to  the  ecosystem  level. Activities undertaken in this research include exploration of organism, biodiversity database development and biodiversity informatics infrastructure using  model  Resources  Descriptions  framework  RDF  with  biodiversity  data  standards.  Taxonomic  Databases  Working  Group  (TDWG).  IPBiotics participatory and integrated. Some of the features of the application that was developed in organism such as IPBiotics system, location mapping and exploration missions. IPBiotics also uses computer vision technology in application development. By IPBiotics we hope that the data information and knowledge  of  indonesian  natural wealth can be  utilized appropriately and  optimally,  so  that  the preservation  of natural  resources can  be  properly maintained.
Keywords: Biodiversity informatics, Computer vision, Databases, IPBiotics, Sustainability.

## ABSTRAK
Indonesia  adalah  negara  dengan  keanekaragaman  hayati  tertinggi  kedua  di  dunia.  Hal  ini  tidak  hanya  keragaman  hayati,  tetapi  juga keragaman kearifan lokal seperti makanan fungsional dan bahan tradisional lainnya. IPB sebagai salah satu perguruan tinggi terkemuka di Indonesia memiliki  peran  penting  dalam  pengelolaan  sumber  daya  alam  keanekaragaman  hayati.  Saat  ini,  pengelolaan  sumber  daya  keanekaragaman  hayati memerlukan sistem yang terintegrasi dan holistik dengan menggunakan ilmu komputer dan teknologi yang berkembang pesat saat ini. Penelitian ini mengembangkan sistem informatika keanekaragaman hayati IPB (IPBiotics) untuk manajemen informasi keanekaragaman hayati sumber daya alam Indonesia  dalam  rangka  meningkatkan  manajemen  pengetahuan  (manajemen  pengetahuan),  eksplorasi,  analisis,  sintesis  dan  interpretasi  data  mulai dari  tingkat  keanekaragaman  hayati  tingkat  gen,  spesies  sampai  ke  tingkat  ekosistem.  Kegiatan  yang  dilakukan  dalam  penelitian  ini  meliputi eksplorasi organisme, pengembangan database keanekaragaman hayati dan infrastruktur informatika keanekaragaman hayati menggunakan Resources Descriptiom Framework (RDF) dengan standar data keanekaragaman hayati. Taksonomi Kelompok Kerja Database (TDWG).  IPBiotics partisipatif dan  terpadu.  Beberapa  fitur  aplikasi yang  dikembangkan  dalam organisme  seperti  sistem  IPBiotics, pemetaan lokasi  dan  misi  eksplorasi.  IPBiotics juga  menggunakan  teknologi  komputer  dalam  pengembangan  aplikasi.  Dengan  IPBiotics  kami  berharap  bahwa  informasi  mengenai  data  dan pengetahuan  kekayaan  alam  Indonesia  dapat  dimanfaatkan  secara  tepat  dan  optimal,  sehingga  kelestarian  sumber  daya  alam  dapat  terjaga  dengan baik.
Kata kunci: Basis data, Keanekaragaman Hayati informatika, Keberlanjutan, IPBiotics, Visi komputer

## PENDAHULUAN

## 1. Latar Belakang
Indonesia  merupakan  negara  dengan  kekayaan biodiversitas  tertinggi  kedua  di  dunia  setelah  Brazil (Wahyono  &  Shalahuddin  2011).  Jumlah  keaneka- ragaman hayati yang dimiliki Indonesia lebih dari 38.000 spesies  (Bappenas  2003).  Keanekaragaman  Indonesia bukan  hanya  pada  keanekargaman  hayati,  namun  juga kaya  akan  keragaman indigenous  knowledge seperti pangan  fungsional  dan  ramuan  tradisional  lainnya. Sangat  disayangkan  pengetahuan  ini  tidak  banyak  yang tercatat,  namun  hanya  diturunkan  dari  satu  generasi  ke generasi berikutnya. Akibatnya pengetahuan ini kian hari
kian  luntur,  karena  tidak  banyak  kajian  ilmiah  yang membuktikan keampuhannya.
Sumberdaya alam keanekaragaman hayati ( biodiversitas ) dan sumberdaya manusia yang Pancasilais merupakan  unggulan  Indonesia  terhadap  dunia  global yang  berupa initial  endowment (anugerah  awal)  dari Tuhan  YME.  IPB  merupakan  lembaga  perguruan  tinggi yang  ikut  dominan  bertanggung  jawab  dibidang pengembangan IPTEKS dan SDM agar initial endowment keanekaragaman hayati terestrial dan bahari Indonesia  tersebut  dapat  terpelihara,  berkembang, bernilai  tambah  dan  bermanfaat  secara  maksimal berkelanjutan bagi pendukung kesejahteraan dan
kemakmuran  bangsa  Indonesia,  bahkan  sampai  kepada masyarakat dunia global.
IPB  adalah University  of  Education,  Research  and Development  for  Management  and  Conservation  of Indonesian Biodiversity (terrestrial and marine)
Resources yang  sangat  strategis  bagi  kehidupan  dan kesejahteraan bangsa Indonesia, maupun bagi masyarakat  dunia  global.  Hal  ini  merupakan  unggulan IPB yang sepatutnya menjadi komitmen sepenuhnya oleh para pengambil keputusan kebijakan nasional di republik ini,  maupun  oleh  masyarakat  untuk  mendukungnya.  Hal tersebut  memerlukan  advokasi,  sosialisasi  dan  promosi yang  gigih,  sistematis,  efektif,  cerdas,  berkelanjutan  dan sabar.
IPB telah membuat Rencana Induk Penelitian (RIP) untuk  tahun  2012  -2025,  yaitu  meliputi  5  bidang  utama yaitu: (1) Bidang Pangan, (2) Bidang Energi, (3) Bidang Ekologi,  (4)  Bidang  Penanggulangan  Kemiskinan,  dan (5)  Bidang  Biomedis.  Kelima  bidang  penelitian  ini sangat  terkait  dengan  pengembangan  dan  pelestarian sumberdaya  alam  biodiversitas    Indonesia.  Percepatan pelaksanaan  RIP-IPB  ini  secara  holistik,  efisien  dan efektif  sangat  dapat  dibantu  dengan  teknologi  berbasis komputer.
Para  peneliti  di  IPB,  maupun  Indonesia  lainnya sudah  banyak  yang  melakukan  penelitian  potensi biodiversitas  Indonesia.  Namun  sebagian  besar  hasil penelitian masih disimpan dalam bentuk makalah/paper/buku.  Masih  sangat  sedikit  sekali  jumlah data yang tersimpan dalam bentuk digital.
Dengan  besarnya  jumlah  prosentase  dokumen dalam  bentuk  bukan  digital  menyebabkan  data  dan informasi mengenai keanekaragaman hayati sulit diakses. Kondisi ini akan menyebabkan informasi dan pengetahuan  tidak  dapat  disebarluaskan  dengan  baik akibatnya  akan  mengancam  keberlangsungan  sumber daya alam hayati.
Tabel  1  ditunjukkan  beberapa  portal biodiversitas informatics yang  sudah  dikembangkan  di  beberapa negara  seperti  Australia,  Eropa  dan  Amerika.  Sampai saat  ini  Indonesia  belum  memiliki  portal  biodiversitas yang terintegrasi dengan baik.
Informasi  biodiversitas  sangat  penting  untuk  kajian ilmiah/penelitian, pendidikan, dan pengambilan keputusan.  Dalam  pengelolaan  sumberdaya  alam, informasi biodiversitas sangat diperlukan untuk  menjaga keberlangsungan pemanfaatan species, eksplorasi potensi hayati  dan  monitoring  spesies  beserta  ekologi,  membuat kebijakan,  dan  untuk  pengembangan  inovasi  biotek- nologi.  Mengingat  begitu  pentingnya  peran  informasi bodiversitas, maka perlu dikembangkan sebuah teknologi berbasis komputer  yang dapat mengelola data, informasi dan  pengetahuan  keanekaragaman  hayati  dengan  baik dan  efisien  sehingga  dapat  digunakan  untuk  eksplorasi,
analisis,  sintesis,  dan  interpretasi  potensi  kekayaan keanekaragaman hayati.
Tabel 1.  Contoh Portal Biodiversitas yang ada di dunia
Nama Portal Negara URL Atlas of living Australia (ALA) Australia http://www.anbg.gov.au/c pbr/program/hb/index. html Australian Virtual herbarium Australia http://www.ersa.edu.au/ avh/index.jsp Encyclopedia of Life (EOL) USA http://www.eol.org/home Global Biodiversity Information Facility (GBIF) Europe http://www.gbif.orf Ispecies Europe http://darwinzoology.gla. ac.uk/rpage/ispecies/ index.php LifeWatch Europe http://www.lifewatch.eu/ index.php?id=411 Ocean Biogeographic Information System (OBIS) USA http://v2.iobis.org SpeciesBase Europe http://www.speciesbase. org/ Ubio USA http://www.ubio.org
Penelitian ini mengembangkan IPBiotics yaitu IPB- Biodivesity  Informatics .  IPBiotics  adalah  pengembangan teknologi berbasis komputer untuk pengelolaan informasi biodiversitas  sumber  daya  alam  Indonesia  dalam  rangka meningkatkan  pengelolaan  pengetahuan  ( knowledge management ),  eksplorasi,  analisis,  sintesis  dan  inter- pretasi data biodiversitas mulai dari level genomic, level species sampai dengan level ekosistem.

## 2. Tujuan
Penelitian  ini  bertujuan  untuk  mengembangkan sistem  biodiversitas  informatics  untuk  kekayaan  alam hayati  di  Indonesia  yang  diberi  nama  IPB  Biodiversitas Informatics, diringkas IPBiotics.

## METODE PENELITIAN
Rencana  kegiatan  penelitian  ini  diusulkan  terdiri dari  3  tahap  kegiatan,  selama  3  tahun  sejak  tahun  2013 seperti pada Tabel 2 berikut ini.

## Tabel 2.  Peta penelitian IPBiotics
Tahun ke-1 Tahun ke-2 Tahun ke-3 1. Eksplorasi in-situ (observasi langsung) dan akuisisi data biodiversitas Indonesia (data citra digital dan dokumen/pengetahuan biodiversitas) di wilayah Palu, Kampus Darmaga, Kebun Raya Bogor 2. Pembangunan database Biodiversity Indonesia
3. Pembangunan
infrastruktur Biodiversity Informatics
4. Pembangunan aplikasi berbasis web 1. Eksplorasi in-situ (observasi langsung) dan akuisisi data biodiversitas Indonesia (data citra digita dan dokumen/pengetahuan biodiversitas) di wilayah Meru Betiri Jember, Jawa Timur dan kebun koleksi BPTO Tawangmangu Solo.
2. Integrasi database biodiversitas dengan database standar internasional.
3. Analisis pemetaan biodiversitas Indonesia
4. Perancangan dan pembangunan sistem Pemetaan Biodiversitas Indonesia ( Indonesia Biodiversity
Mapping ).
1. Eksplorasi in-situ (observasi langsung) dan akuisisi data biodiversitas Indonesia (data citra digita dan dokumen/pengetahuan biodiversitas) di wiayah Taman Nasional Gunung Pangrango dan Taman Nasional
Bromo Tengger Semeru
2. Perancangan algoritme sistem cerdas analisis data biodiversitas berbasis data mining.
3. Pengembangan aplikasi/ tools sistem cerdas untuk analisis data (sistem cerdas identifikasi/karakterisasi species, sistem cerdas search engine (mesin pencari) data biodiversitas).
Biodiversity  Informatics  (BI)  merupakan  bagian dari  kajian/study biological  diversity .  Dalam biological diversity ,  terdapat  tiga  tingkat diversity yaitu genetic diversity,  species  diversity  dan  ecosystem  diversity (Gaikwad  2011)  (Gambar  1).  Studi  biodiversity informatics  mengkaji  semua  level  mulai  dari  level genetika sampai ekosistem.
Gambar 1. Biodiversity informatics.

## HASIL DAN PEMBAHASAN
Kegiatan penelitian yang telah dilakukan yaitu:
1. Melakukan eksplorasi melalui insitu study
(observasi
langsung) untuk melakukan pengumpulan data tumbuhan obat.
Kegiatan  eksplorasi  tumbuhan  obat  dilakukan  di tiga  wilayah  yaitu  Daerah  Ampana  Sulawesi  Tengah, Kampus  IPB  Darmaga  Bogor  dan  Kebun  Raya  Bogor.
Dalam  kegiatan  penelitian  ini,  dilakukan  pengumpulan data digital tumbuhan obat yang terdiri dari akar, batang, daun  dan  bunga.  Selain  itu,  dilakukan  juga  wawancara dengan  penduduk  mengenai  pemanfaatan  tumbuhan untuk pengobatan dan penyebaran tumbuhan obat.

## a. Eksplorasi Tumbuhan Obat di Sulawesi Tengah
Kegiatan  eksplorasi  tumbuhan  obat  di  lakukan  di Kabupaten Tojo Una-Una, Propinsi Sulawesi Tengah. Kegiatan  ini  berlangsung  selama  enam  hari  mulai tanggal  28  Juni  -  3  Juli  2013.Wilayah  eksplorasi dibagi menjadi tiga ekosistem yaitu ekosistem pesisir, daratan, dan pegunungan.
a.1 Ekosistem Pesisir Eksplorasi tumbuhan obat untuk wilayah ekosistem pesisir dilakukan di kawasan pesisir Gugus Pulau  Togean  Taman  Nasional  Kepulauan  Togen (TNKT), Kabupaten Tojo Una-Una, Provinsi
Sulawesi  Tengah.  Eksplorasi  tumbuhan  obat  di wilayah pesisir difokuskan pada tumbuhan mangrove. Kegiatan  pengumpulan  data  tumbuhan  Mangrove dilakukan di desa Lembanato Kepulauan Togean dan wilayah Hutan Mangrove TNKT.
Sulawesi  Tengah  merupakan  provinsi  terbesar dengan luas wilayah daratan 68,033 kilometer persegi dan  luas  laut  mencapai  189,480  kilometer  persegi yang  mencakup  semenanjung  bagian  timur  dan sebagian  semenanjung  bagian  utara  serta  Kepulauan Togean di Teluk Tomini dan pulau-pulau di Banggai Kepulauan  di  Teluk  Tolo.  Kepulauan  Togean merupakan  salah  satu  taman  nasional  yang  relatif baru di Indonesia, terbentuk melalui Surat Keputusan Menteri  Kehutanan  RI  No.  418/Menhut-II/2004

## Pembangunan Sistem IPB Biodiversity Informatics (IPBiotics)
tanggal  19  Oktober  2004  tentang  Perubahan  Fungsi dan  Penunjukan  Hutan  Lindung,  Hutan  Produksi Terbatas, Hutan Produksi Tetap, Hutan Produksi yang dapat dikonversi dan wilayah perairan laut Kepulauan Togean  di  Kabupaten  Tojo  Una-Una,  Provinsi Sulawesi Tengah seluas ±362.605 hektar (Laapo et al . 2010).
Menurut data BKSDA dan BAPPEDA Poso tahun 2001,  luas  hutan  mangrove  Kepulauan  Togean diperkirakan  sekitar  4.800  ha  yang  tersebar  di beberapa  pulau  besar  seperti  Talatakoh,  Togean, Batudaka, dan sebagian pulau Walea Bahi.
Kegiatan  penelitian  yang  dilakukan  diantaranya wawancara  dan  observasi  eks-situ  hutan  mangrove. Kegiatan  wawancara  dengan  penduduk  untuk menggali informasi mengenai pemanfaatan tumbuhan mangrove.  Kegiatan  wawancara  dilakukan  di  Desa Lembanato  dengan  melibatkan  20  orang  penduduk yang  memahami  pemanfaatan  tumbuhan  obat. Gambar  2  menunjukkan  kegiatan  wawancara  dengan penduduk di rumah Sekretaris Desa Lembanato.
Dalam  kegiatan  wawancara,  penduduk  diberi pertanyaan seputar tumbuhan mangrove dan pemanfaatannya  untuk  pengobatan.  Setiap  orang diberi kuesioner yang telah disiapkan.
Setelah  melakukan  wawancara dengan penduduk, selanjutnya  melakukan eksplorasi hutan  mangrove di Taman  Nasional  Kepulauan  Togean  (TNKT).  Pada kegiatan  observasi  ini  dikumpulkan  informasi mengenai species tumbuhan mangrove dan penyebaran  tumbuhan  mangrove.  Selain  informasi mengenai pemanfaatan tumbuhan mangrove, beberapa  informasi  yang  dikumpulkan  yaitu  foto digital  daun,  bunga,  buah  dan  akar  tumbuhan mangrove.  Gambar  3  menunjukkan  foto  kegiatan observasi di hutan mangrove.
Gambar 3.  Observasi hutan mangrove TNKT.

## a.2 Ekosistem Daratan
Eksplorasi  tumbuhan  obat  untuk  ekosistem dataratan  dilakukan  di  sekitar  Kecamatan  Ampana dan Desa Pakuli (Desa obat) Kabupaten Sigi. Daerah ini  umumnya  dihuni  oleh  etnis  bajo.  Tumbuhan pangan  dan  obat  yang  ditemukan  sebagaian  besar berasal dari pekarangan warga dan kebun Poga/Toga. Potensi  tumbuhan  yang  ditemukan  sebagian  besar merupakan jenis umum yang digunakan dan diketahui oleh  masyarakat di kota lainnya atau  suku lainnya di Indonesia.
Di  Desa  Pakuli,  Kec.  Gumbasa  Kab.  Sigi ditemukan  taman  obat  herbal  milik  Pak  Haji  Sahlan DJ.  Taman  yang  menempati  luas  ±3  Ha  dengan jumlah  tumbuhan  obat  mencapai  47  jenis.  Foto kegiatan  eksplorasi  di  wilayah  daratan  ditunjukkan pada Gambar 4 berikut ini.

## a.3 Ekosistem Pegunungan
Eksplorasi  tumbuhan  obat  untuk  ekosistem pegunungan  dilakukan  di  Kecamatan  Ampana  Tete, Desa  Mpoa  dan  Daratan  Bulan,  Propinsi  Sulawesi Tengah.  Desa  ini  berada  di  ketinggian  ±  600  mdpl. Pada  daerah  tersebut  terdapat  Suku  Ta  dan  Suku Wana  (Suku  Asli  Sulawesi  Tengah).  Sebagian  besar warga  kecamatan  ini  merupakan  campuran  berbagai suku.  Mereka  merupakan  warga  transmigran  dari berbagai  daerah  termasuk  Pulau  Jawa,  Sumatera  dan Nusa  Tenggara.  Adapun  Suku  Ta  dan  Suku  Wana sendiri  keberadaannya  mulai  terdesak  dan  tersebar secara acak di pegunungan-pegunungan di sekitar.
Kebiasaan  hidup  nomaden  di  dalam  hutan sehingga  sulit  menemui  satu  per  satu  masyarakat Suku  Wana.  Adapun  Suku  Ta  saat  ini  mulai  modern dengan hidup melebur dengan masyarakat transmigran. Jumlahnya tidak lebih dari 25 KK.
Berdasarkan  hasil  inventarisasi,  tidak  banyak informasi  yang  didapatkan  karena  keterbatasan bahasa  dan  sikap  tertutup  dari  Suku  Wana,  ataupun Suku Ta. Teridentifikasi sebanyak 51 jenis tumbuhan obat,  21  jenis  diantaranya  merupakan  tumbuhan pangan.  Foto  kegiatan  eksplorasi  di  wilayah pegunungan ditunjukkan pada Gambar 5 berikut ini.
Gambar 3.  Kegiatan  wawancara  dengan  penduduk desa Lembanato, Togean.
Gambar 2.  Kegiatan  eksplorasi  tumbuhan  obat pada  ekosistem  daratan  di  Kecamatan Ampana dan Kabupaten Sigi.

## b. Eksplorasi Tumbuhan Obat di Kebun Raya Bogor
Eksplorasi  tumbuhan  obat  di  Taman  Koleksi Tumbuhan Obat Kebun Raya dilakukan pada hari jum`at, 21   Juni   2013.   Dalam   kegiatan   eksplorasi   ini   juga dilakukan pemotretan tumbuhan obat pada bagian batang, daun,  akar  dan  bunga.  Selain  pengambilan  data  digital, juga  dilakukan  pengambilan  data  lokasi  GPS  untuk mengetahui  lokasi  penyebaran  tumbuhan  obat  di  Kebun Raya  Bogor.  Berdasarkan  hasil  eksplorasi  di  kebun  raya berhasil  dikumpulkan  foto  digital  dari  118  jenis tumbuhan obat.
Gambar 4.  Kegiatan  eksplorasi  tumbuhan  obat  pada ekosistem pegunungan di Kecamatan
Ampana Tete, Desa Mpoa dan Daratan Bulan.

## c. Eksplorasi  Tumbuhan  Obat  di  Kampus  Dramaga IPB
Eksplorasi  potensi  tumbuhan  obat  di  kampus  IPB Darmaga  dilakukan  selama  4  hari  (tanggal  5,14,15  dan 16  Juli  2013).  Pada  kegiatan  eksplorasi  ini  juga dilakukan  pengambilan  foto  digital  tumbuhan  obat  serta melakukan  pengambilan  data  lokasi  GPS  untuk mengetahui lokasi penyebaran tumbuhan obat di Kampus IPB  Darmaga.  Dari  kegiatan  eksplorasi  ini,  data  yang berhasil  di  kumpulkan  berjumlah  162  jenis  tumbuhan obat.  Jumlah  tersebut  akan  terus  bertambah  mengingat masih luasnya lokasi Kampus IPB Darmaga yang belum dieksplorasi.  Sampai  dengan  saat  ini  daerah  yang  telah dieksplorasi  ialah  sekitar  Fakultas  Kehutanan,  sekitar Alhuriyah,  Perumahan  Dosen,  Asrama  Putri  dan  sekitar Gymnasium.

## 2. Studi  literatur  dan  digitasi  literatur  (citra  dan dokumen)
Setelah  melakukan  kegiatan  eksplorasi  tumbuhan obat  selanjutnya  dilakukan  juga  kegiatan  studi  literature (kajian  pustaka)  untuk  melengkapi  data  dan  informasi dari  lapang.  Tidak  hanya  tumbuhan  obat,  kajian  pustaka juga  dilakukan  untuk  mengumpulkan  data  jamur,  kupu- kupu, mamalia, mangrove, burung dan herpetofauna.
Setelah melakukan kajian pustaka dilakukan digitasi gambar dan dokumen dari buku literature untuk database sistem  informasi  biodiversitas.  Beberapa  buku  yang sudah didigitasi yaitu:
1. Dalimartha S. 2000. Atlas Tumbuhan Obat Indonesia, Jilid II. Jakarta (ID): Trubus Agriwidya.
2. Dalimartha S. 2000. Atlas Tumbuhan Obat Indonesia, Jilid IV. Jakarta (ID): Trubus Agriwidya.
3. Hariana  A.  2009.  Tumbuhan  Obat  dan  Khasiatnya, Seri 1. Jakarta (ID): Swadaya.
4. Hariana  A.  2009.  Tumbuhan  Obat  dan  Khasiatnya, Seri 3. Jakarta (ID): Swadaya.
5. Heyne  K.  1987.  Tumbuhan  Berguna  Indonesia,  Jilid I-III. Badan Litbang Kehutanan (Penerjemah). Jakarta (ID): Yayasan Sarana Wana Jaya.
6. [FAHUTAN  UGM]  Fakultas  Kehutanan  Universitas Gadjah Mada dan Yayasan Sarana Wana Jaya. 2003. Buku Acuan Umum Tumbuhan Obat Indonesia, Jilid I-X. Jakarta (ID): Yayasan Sarana Wana Jaya.
7. Widyaningrum H, Tim Solusi Alternatif. 2011. Kitab Tumbuhan  Obat  Nusantara.  Yogyakarta  (ID):
MedPress. 8. [BKKT] Bagian Konservasi Keanekaragaman
Tumbuhan.  2010.  Fieldguide  Tumbuhan  Obat Kampus  Konservasi  Keanekaragaman  Hayati  IPB Dramaga.  A  Hikmat  dan  EAM  Zuhud  (Penyunting). Bogor  (ID):  Bagian  Konservasi  Keanekaragaman Tumbuhan,  Departemen  Konservasi  Sumberdaya Hutan dan Ekowisata, Fakultas Kehutanan IPB.
9. Widodo,  Fitriana.  2008.  Olahan  Sehat  Berhkasiat Obat.  Karanganyar  (ID):  Balai  Besar  Penelitian  dan Pengembangan Tanaman Obat dan Tanaman Tradisional.
Tabel  3  di  atas  menunjukan  keseluruhan  jumlah organisme  yang  berhasil  dikumpulkan  melalui  kegiatan eksplorasi,  studi  pustaka  dan  digitasi  citra.  Setelah melakukan digitasi buku literature selanjutnya dilakukan entry  data  ke  dalam  database  serta  melakukan pengolahan citra digital.
Tabel 3.  Jumlah data hasil eksplorasi dan digitasi
Jenis Eksplorasi Data Eksplorasi Jumlah Dokumen Jumlah Spesies Jumlah Foto Digital Tumbuhan Obat 873 340 2000 Jamur 91 91 91 Kupu-kupu 10 10 10 Mamalia 20 20 20 Mangrove 33 33 241 Burung 87 87 87 Herpetofauna 19 32 32 Total 1133 613 2481

## 3. Desain database dan semantic web RDF.
Setelah  melakukan  studi  literatur  diperoleh  entitas atau  atribut  yang  diperlukan  untuk  database.  Atribut tersebut yaitu untuk tumbuhan: ID_Tumb,
CommonName,  Species,  LocalName,  Desc,  DistrIndo, Budidaya, Sifat_Orga, Ramuan,
Habitus, Bagianygdigunakan,  Manfaat,  KandunganKim,  Lokasi,
Latitude,  Longitude,  Foto.  Untuk  Satwa:  ID_Hewan  ,
CommonName,
LocalName, Desc, DistrIndo, DistriKamp,  Lokasi,  Latitude,  Longitude,  Foto  dan StatusPerlind.  Adapun  struktur  RDF  yang  telah  dibuat adalah sebagai berikut.
Gambar 6.  Struktur Graf Dokumen Flora RDF.
Gambar 7.  Struktur Graf Dokumen Fauna RDF.
Gambar 8.  Struktur Graf Biodiversitas RDF.
Sistem IPBiotics dapat dilihat di URL http://apps.cs.ipb.ac.id/ipbiotics .  Beberapa  fitur  aplikasi yang  dikembangkan  pada  sistem  IPBiotics  diantaranya organisme, lokasi pemetaan dan  misi eksplorasi. Berikut desain aplikasi web yang sudah dibuat.
Halaman Home
Halaman Organisme
Halaman Detail Organisme

## Halaman Misi Eksplorasi

## KESIMPULAN
IPBiotics  adalah  sistem Biodiversitas  Informatics yang  mengelola  data  dan  informasi  biodiversitas  secara terintegrasi  menggunakan  teknologi  komputasi  modern. Sistem  ini  diharapkan  menjadi  motor  pengembangan biodiversitas Indonesia untuk pembangunan dan kesejahteraan masyarakat yang berkelanjutan.
Sampai  dengan  saat  ini  program  IPBiotics  telah mencapai  tahap  desain  web  dan  telah  diujicobakan
melalui
URL
http://apps.cs.ipb.ac.id/ipbiotics.
Selanjuntnya  program  ini  akan  terus  dikembangan dengan  menambahkan  data  biodiversitas  maupun pemetaan  spasial  biodiversitas  tersebut  dalam  bentuk web.

## DAFTAR PUSTAKA
Bappenas. 2003. Indonesia Biodiversitas and Action Plan 2003-2020. Jakarta. Bappenas
Gaikwad  JA.  2011.  Digitisation  and  analysis  of customary  medicinal  plant  knowledge    using biodiversity  informatics.  Tesis.    Department  of Chemistry  and  Biomoleculer  Science  Macquaire University Sydney.
Laapo  A,  Fahrudin  A,  Bengen  DG,  Damar.  2009. Pengaruh  aktivitas  wisata  bahari  terhadap  kualitas perairan  laut  di  kawasan  wisata  Gugus  Pulau Togean. Ilmu Kelautan. 14 (4): hal. 1-7.
Wahyono  S,  Shalahuddin  L.  2011.  Direktori  Penelitian Asing  di  Indonesia.  Sekretariat  Perijinan  Penelitian Asin.  Biro  Hukum  dan  Humas,  Kementrian  Riset dan Teknologi. ISSN 2088-1916.