Kualitas Air Pasca Pengerukan Alur Transportasi Batu Kapur di Sungai Donan Cilacap

## Moh. Husein Sastranegara  dan  Sri Lestari
Fakultas Biologi Universitas Jenderal Soedirman Purwokerto

## Abstract
River   Donan   has   the   potential   of   international   ship’s   channel   due   to   the   availability   of industry. Unfortunately, the  drift  gill  net operation  was predicted causing  river shallowness and disturbing the limestone transportation channel. The aim of research was to know the water quality based on physic, chemical, and biological aspects at the north, central, and south area of dredging; and   sediment   texture,   benthos   and   plankton   as   proponent.  Survey   was   done   at   all   areas   of dredging  from January to  March 2008.  Water samples were  taken  according to  PPRI  Number 82/2001 and the procedure of SNI. Data was analised as descriptive and supported by Sorensen similarity index. The result showed that the concentration of TDS, NH 3 , Mn and Fe was above levels considered as water quality standard at all areas; even the concentration decreases. On the other   hand,   increasing   the   concentration   of   H 2 S   was   only   at   the   central   area,   whereas   the concentration of Pb, silty clay sediment texture, and domination of benthic of Rhinoclavis asper and plankton  of Lyngbya   spirulinoides were   at  the   central  and  south  areas  (similarity  index  of  this research was 95.14%; the research before was 99.15%). The conclusion showed that the dredging did not change the high concentration of TDS because it which was taken along tide was hampered by  the  net.   In  addition,  the   concentration  of  Pb,  silty  clay  sediment  texture,  and  the  dominant benthic and plankton have the same tendencies at the central and south areas.
Key words : water quality, dredging, River Donan, Cilacap

## Pendahuluan
Sungai   Donan   yang   membujur   dari   utara   ke   selatan   berpotensi   sebagai   alur pelayaran internasional karena keberadaan PT Holcim Indonesia Tbk., Kawasan Industri Cilacap, PT UP IV Pertamina, dan Pelabuhan Intan (White et al ., 1989). Industri turut menyumbang permasalahan perubahan iklim dari kualitas udara seperti debu partikel dan TSP,   SO x ,   CO x ,   NO x ,   O x ,   HC,   serta   Pb   (Gubernur   Jawa   Tengah,   2001),   sehingga mempengaruhi kualitas air (Odum, 1971). Pengoperasian jaring apung di Sungai Donan ditengarai   juga   sebagai   penyebab   pendangkalan   sungai   dan   mengganggu   alur transportasi batu kapur, sehingga tim penertiban alur pelayaran dan pembinaan kepada masyarakat nelayan di Kabupaten Cilacap dibentuk (Bupati Cilacap, 2002). Tindak lanjut program   yang   berkaitan   langsung   dengan   nelayan   jaring   apung   dilakukan   dengan program advokasi (PT Semen Cibinong Tbk., 2005a) pada 435 nelayan (Rosyadi, 2006).
Kegiatan   transportasi   batu   kapur   di   Sungai   Donan   dilakukan   oleh   PT   Holcim Indonesia Tbk. yang merupakan unit usaha dalam memproduksi semen dan beton untuk keperluan   pembangunan   infrastuktur   dengan   lokasi   unit   pengolahan   di   Kabupaten Cilacap.   Untuk   memperlancar   pengangkutan   bahan   baku   maupun   produk   melalui transportasi   angkutan   air,   PT   Holcim   Indonesia   Tbk.   telah   melakukan   kegiatan Maintenance Dredging Alur Transportasi Batu Kapur di Perairan Sungai Donan Cilacap dalam rangka penyusunan dokumen  Upaya Pengelolaan Lingkungan Hidup dan Upaya Pemantauan   Lingkungan   Hidup   (UKL dan   UPL).  Kegiatan Maintenance   Dredging Alur Transportasi   Batu   Kapur   di   Perairan   Sungai   Donan   Cilacap  dilakukan   antara   bulan September 2006 dan Mei 2007 pada alur Sungai Donan dari segmen Bouy 30 sampai 34. Pada   segmen   sepanjang   1,3   km   tersebut,   volume   sedimen   perairan   yang   dikeruk mencapai   ±   350.000   m 3 .   Material   sedimen   hasil   kerukan   ditempatkan   di   lahan   yang terletak di tepian sungai pada segmen yang sama pada lahan Kawasan Industri milik Kawasan Industri Cilacap (KIC) dan lahan Kawasan Industri milik PT Holcim Indonesia
Tbk. Kegiatan penempatan hasil keruk ( dumping ) memerlukan lahan seluas 11,2 ha yang digunakan untuk mengurug lahan Kawasan Industri milik KIC seluas 8,3 ha dan Lahan Kawasan Industri milik PT Holcim Indonesia Tbk. seluas 2,9 ha  (PT Holcim Indonesia Tbk., 2007).
Kadar Total   Dissolved   Solid (TDS)   selalu   tidak   memenuhi   baku   mutu   yang dipersyaratkan baik  pada  saat  (pra-operasi,   operasi,  dan  post-operasi)  maupun pasca pengerukan. Oleh karena itu, penelitian dengan judul ”Kualitas Air Pasca Pengerukan Alur Transportasi batu kapur di Sungai Donan Cilacap” perlu dilakukan dengan tujuan untuk mengetahui kualitas air ditinjau dari aspek fisik, kimiawi dan biologik pada daerah utara, tengah dan selatan pengerukan. Tekstur sedimen, bentos dan plankton juga diteliti untuk menunjang data kualitas air.

## Materi dan Metode
Bahan   penelitian   berupa   contoh   air   (fisika,   kimia,   dan   mikrobiologi),   substrat, bentos, dan plankton. Cara kerjanya mengacu pada SNI untuk pengujian kualitas air dan limbah (BSN, 2004) yang merujuk pada Standard methods for the examination of water and waste water (APHA, AWWA, and WEF, 1992).
Sumber: PT Holcim Indonesia Tbk. (2007)
Gambar 1. Lokasi penelitian Figure 1. Research location
Metode penelitian dilakukan secara survai di daerah utara (stasiun 1 berada dekat Bouy 34 sebagai kontrol dengan jarak 1 km dari batas terluar daerah pengerukan dengan koordinat 07°41’01,0’’ LS dan 109°00’49,6” BT), tengah (stasiun 2 berada antara Bouy 30 dan   34   yaitu   tengah   lokasi   pengerukan   dengan   koordinat   07°41’04,7’’   LS   dan 109°00’40,0” BT) dan selatan (stasiun 3 berada dekat Bouy 30 sebagai arah surut dengan jarak 1 km dari batas terluar daerah pengerukan dengan koordinat 07°41’36,2’’ LS dan
108°59’90,2” BT, Gambar 1) yang dilakukan  pada saat bulan purnama penuh dengan kondisi     air   pasang   terendah   dapat   dilihat   dengan   program WXTide32   Version   4.0 (Hopper, 2004) sebagai berikut: (a) ulangan pertama pada tanggal 24 Januari 2008 pada pukul 15:27 W.I.B., (b) ulangan kedua pada tanggal 22 Februari 2008 pada pukul 15:10 W.I.B.,   dan   (c)   ulangan   ketiga   pada   tanggal   23   Maret   2008   pada   pukul   15:13   W.I.B. Pengambilan contoh air dilakukan sesuai dengan persyaratan paket parameter kualitas air   kelas   II   pada   Peraturan   Pemerintah   Republik   Indonesia   Nomor   82   Tahun   2001 (Presiden Republik Indonesia, 2001).
Data dianalisis secara deskriptif yaitu dibandingkan dengan dokumen UKL dan UPL (PT Holcim Indonesia Tbk., 2007), serta baku mutu (Presiden Republik Indonesia, 2001). Selain   itu,   indeks   similaritas   Sorensen   beserta   dendrogramnya   dipakai   juga   sebagai penunjang analisis.

## Hasil dan Pembahasan
Beberapa   variabel   kualitas   air   seperti   kadar   TDS,   NH 3 ,   Mn   dan   Fe   selalu   tidak memenuhi   baku   mutu   yang   dipersyaratkan   baik   pada   daerah   utara,   tengah   maupun selatan (Tabel 1); meskipun kadarnya berkurang (perbandingan data pada Tabel 1 dan PT Holcim Indonesia Tbk.,  2007). TDS dalam air yang pasang surut berpotensi terhambat oleh   jaring   apung   dan   mengendap   ke   dasar   sungai,   sehingga   TDS   masih   tetap melampaui ambang batas yang diperbolehkan (Sastranegara dan Winarni, 2009).
Kadar  NH 3 yang tinggi di  Sungai  Donan relatif  masih tergolong  lebih  rendah   di kawasan Segara  Anakan Cilacap. Menurut Yuwono et al. (2007), NH 3 merupakan salah satu nitrogen anorganik terlarut yang perlu mendapat perhatian bersama dengan nitrogen anorganik terlarut lain seperti NO 3 dan NO 2 . Peningkatan   kadar   H 2 S   di   perairan   berada   di   tengah   saja   (Tabel   1)   dan   ini mengindikasikan PT Holcim Indonesia Tbk. berpeluang membuang limbah SOx. Odum (1971) menyatakan bahwa H 2 S di perairan dapat berasal dari H 2 S di tanah dan sedimen, serta   H 2 S   di   atmosfir.  Holcim   Group   Support   Ltd.  (2004)   melaporkan   bahwa   H 2 S   di atmosfir dihasilkan olehnya dan instalasi pembuangan SO 2 basah yang hanya mampu memotong   emisi   gas   SO 2 sampai   70%.   Pada   saat   ini,   hasil   sampingan   dimanfaatkan untuk pembuatan gipsum. Pemilik sebelumnya, PT Semen Cibinong Tbk. (2005b) telah melaksanakan   kegiatan   pemantauan   terhadap   parameter   ini   dalam   dokumen  Analisis Mengenai Dampak Lingkungan (AMDAL).
Peningkatan   kadar   Pb   berada   di   daerah   tengah   dan   selatan   (Tabel   1)   dengan tekstur sedimen berupa silty clay .  Hal ini ditunjang oleh data indeks similaritas tertinggi pada kelompok ini (95,14%; Tabel 2a), serta juga penelitian  sebelumnya (99,15%;  PT Holcim Indonesia Tbk., 2007).
Menurut NOAA (2003), Pb merupakan salah satu logam berat yang perlu mendapat perhatian bersama dengan logam berat lain seperti Hg, Cd, Zn, dan Cu. Cd di daerah yang sama pernah melampaui ambang batas yang diperbolehkan (Sastranegara, 2004; Sastranegara   dan   Winarni,   2009)   dan   akumulasinya   terdeteksi   pada   kerang   totok Polymesoda erosa (Nurlaeli, 2007) dan ikan (Hartoyo dan Mahdiana, 2007). Everaats et al .   (1989)   juga   mendapatkan   akumulasi   Cd   pada   komunitas   bentos   secara   umum. Menurut  Anonimous   (2003),   Cd   dapat   berasal   dari   industri   dan   aktivitas   pemupukan. Industri dan aktivitas pemupukan terjadi juga di Sungai Donan. Menurut Sastranegara dan Winarni   (2009),   logam   berat   yang   perlu   mendapat   perhatian   pada   pasca   pengerukan adalah   Pb,   Cd,   Zn,   dan   Cu;   sedangkan   Hg   mulai   berada   pada   ambang   batas   yang diperbolehkan.   Sayangnya,   logam   berat   B   mulai   melampaui   ambang   batas   yang diperbolehkan.
Pengelompokan   indeks   similaritas   pada   pasca   pengerukan   (Tabel   2a)   memiliki kemiripan lebih dari 50% yang ditunjukkan oleh semua kelompok dengan urutan tertinggi pada kelompok antara stasiun bagian tengah daerah pengerukan serta stasiun bagian selatan dan di luar daerah pengerukan; diikuti oleh kelompok antara stasiun bagian utara dan di luar  daerah pengerukan serta stasiun bagian tengah daerah pengerukan; serta antara stasiun bagian utara dan di luar daerah pengerukan serta stasiun bagian selatan
dan di luar daerah pengerukan sebagaimana tampilan dendrogram (Gambar 2a).
Pengelompokan  indeks   similaritas   pada   saat   pengerukan  (PT   Holcim   Indonesia Tbk.,  2007) memiliki kemiripan lebih dari 50% yang ditunjukkan oleh kelompok dengan urutan tertinggi pada kelompok antara stasiun bagian tengah daerah pengerukan pada saat pasca-operasi serta stasiun bagian selatan dan di luar daerah pengerukan pada saat pasca-operasi; serta diikuti oleh kelompok lain sampai yang terendah seperti kelompok antara stasiun bagian tengah daerah pengerukan pada saat operasi serta stasiun bagian selatan  dan di luar  daerah pengerukan pada saat pasca-operasi sebagaimana tampilan dendrogram (Gambar 3).
Tabel 1. Kualitas air Sungai Donan pasca pengerukan Table 1. Water quality at River Donan after dredging operation
No. Variabel Unit Hasil Standar* Stasiun U Stasiun P Stasiun S I. Fisik 1. Suhu °C 29 29 29 Deviasi 3 2. TDS mg/l 13,942 19,574 23,248 1,000 3. TSS mg/l 14 16 12 50 II. Kimia Anorganik 4. pH 7,02 7,14 7,24 6 – 9 5. BOD 5 mg/l 8,39 3,52 2,30 3 6. COD mg/l 54,59 22,74 19,71 25 7. DO mg/l 4,24 4,08 4,42 > 4 8. PO 4 mg/l 0,081 0,033 0,024 0,2 9. NO 3 mg/l 0,169 0,121 0,133 10 10. NH 3 mg/l 0,236 0,216 0,111 ttd 11. Mn mg/l 0,053 < 0,010 < 0,010 ttd 12. Fe mg/l 0,106 < 0,010 < 0,221 ttd 13. Cd mg/l < 0,005 < 0,005 0,006 0,01 14. Cr mg/l 0,010 0,004 0,004 0,05 15. Cu mg/l 0,008 0,050 0,023 0,02 16. Pb mg/l < 0,030 2,535 8,466 0,03 17. Hg mg/l < 0,001 < 0,001 < 0,001 0,002 18. Zn mg/l < 0,010 0,010 0,022 0,05 19. CN mg/l < 0,002 < 0,002 < 0,002 0,02 20. NO 2 mg/l < 0,001 < 0,001 < 0,009 0,06 21. Chlorin bebas mg/l < 0,002 < 0,002 < 0,002 0,03 22. H 2 S mg/l < 0,002 0,055 0,002 0,002 III. Kimia Organik 23. Oil and fat µg/l < 50 < 50 < 50 1.000 24. Phenol µg/l < 1 < 1 6 1 IV. Mikrobiologi 25. Fecal coliform ind/100 ml 23 43 23 1.000 26. Total coliform ind/100 ml 0 0 0 5.000
Catatan: ttd = tidak terdeteksi; U = utara; P = pengerukan; dan S = selatan
Indeks   similaritas   (Tabel   2)   dan   dendrogramnya   (Gambar   2   dan   3)   menunjukan bahwa stasiun bagian utara dan di luar daerah pengerukan (U) cenderung berbeda dari
stasiun bagian tengah daerah pengerukan (P) serta stasiun bagian selatan dan di luar daerah pengerukan (S) baik pada pasca pengerukan maupun saat pengerukan, kecuali pada daerah pengerukan pada saat operasi. Pada daerah pengerukan pada saat operasi, stasiun   bagian   pengerukan   berbeda   dari   stasiun   pada   bagian   utara   dan   selatannya karena proses pengerukan, terutama menghasilkan TDS yang sangat tinggi (Tabel 1 dan PT Holcim Indonesia Tbk.,  2007). Stasiun bagian utara dan di luar  daerah pengerukan cenderung berbeda dari ke dua stasiun lainnya karena TDS yang tinggi di stasiun bagian tengah pengerukan terbawa ke stasiun bagian selatan dan di luar pada saat air pasang terendah   (Tabel   1).   Secara   umum,   aktivitas   manusia   yang   mengganggu   dasar   suatu perairan dapat mengganggu komunitas bentos (Hatcher et al ., 1989; Sastranegara, 2004; Gunarto, 2004; Nordhaus, 2007).
Tabel 2. Indeks similaritas Sungai Donan pasca pengerukan Table 2. Similarity index at River Donan after dredging operation
a. Stasiu n U P S U 0 0 0 P 91,42 0 0 S 86,98 95,14 0 b. Stasiu n U P S U 0 0 0 P 17,73 0 0 S 15,04 63,16 0 c. Stasiun U P S U 0 0 0 P 50,34 0 0 S 39,78 78,41 0 Catatan: a = Kualitas air b = Benthos c = Plankton
U = Stasiun 1 pada daerah utara dan di luar daerah pengerukan ( Bouy 34) P = Stasiun 2 pada bagian tengah di daerah pengerukan (antara Bouy 30 dan 34) S = Stasiun 3 pada daerah selatan dan di luar daerah pengerukan (Bouy 30)
Distribusi dan kelimpahan bentos berkaitan dengan karakteristik sedimen (Frusher et al. , 1994), sehingga spesies dominan akan mencirikan kondisi yang ada (Dittmann, 2002).   Oleh   karena   itu,   dominansi   bentos Rhinoclavis   asper di   Sungai   Donan   diduga karena kesesuaian sedimen silty clay yang ada. Penelitian sebelumnya di daerah yang sama pada Sungai Donan menunjukkan sedimen yang sama (Djohan, 1982). Oleh karena itu,   pengerukan   tidak   merubah   tekstur   sedimen.   Penelitian   lain   menunjukkan   bahwa sedimen   tepi   dan   dasar   sungai   adalah   sama   (Sastranegara,   2004),   sehingga   ombak pasang surut mempercepat pendangkalan.
a.
b. c.
Gambar 2. Dendrogram Sungai Donan pasca pengerukan

## Figure 2. Dendrogram at River Donan after dredging operation
Plankton Lyngbya   spirulinoides dijumpai   dominan.   Sastranegara   dan   Andriyani (2006)   juga   mendapatkannya,   meskipun   bukan   spesies   dominan.   Oleh   karena   itu, perubahan komposisi dan kelimpahan plankton berjalan seiring dengan waktu. Spesies lain   yang   didapatkan   di   Sungai   Donan   dan   berhubungan   secara   negatif   dengan   NH 3 menurut   model   asimtotik   adalah Chaetoceros   densum , Thallasiothrix   nitzchioides ,   dan Nitzschia vermicularis (Sastranegara et al ., 1996).

## Gambar 3. Dendrogram Sungai Donan saat pengerukan Figure 3. Dendrogram at River Donan on dredging operation
Kadar Pb, sedimen silty clay , serta dominasi bentos Rhinoclavis asper (Tabel 3) dan plankton Lyngbya spirulinoides (Tabel 4) mempunyai kecenderungan yang sama pada kelompok antara daerah tengah dan selatan. Hal ini ditunjang oleh data indeks similaritas tertinggi pada kelompok ini (95,14%), serta juga penelitian sebelumnya (99,15%).
U P S 85 90 95 100 U P S 0 20 40 60 80 100 U P S 40 60 80 100 UC PC SC PB UB SB UA PA SA 20 40 60 80 100 Persentase (%)
Persentase (%) Persentase (%) Persentase (%)
Pada kelompok antara daerah tengah serta selatan  dan di luar, peningkatan Pb (Tabel 1) diikuti oleh penurunan kekayaan spesies bentos (Tabel 3) dan plankton (Tabel 4). Kecenderungan yang sama juga dijumpai pada penelitian Sudarso et al . (2008) dan bahkan   indeks   Shannon   kurang   sensitif   dalam   mendeteksi   perubahan   ekosistem. Sastranegara (2004) menyatakan bahwa indeks Shannon  juga kurang sensitif  dengan dua   indeks   seperti   Fisher’s  Alpha   dan   Simpson   karena   keberadaan   dominansi   suatu spesies.

## Tabel 3. Bentos Sungai Donan pasca pengerukan Table 3. Benthos at River Donan after dredging operation
No. Taxa Unit Hasil Stasiun 1 Stasiun 2 Stasiun 3 1. Tellina sp. ind/l 1 0 0 2. Modiolus sp. ind/l 1 0 0 3. Polymesoda erosa ind/l 2 0 1 4. Anadara moculosa ind/l 1 0 0 5. Neanthes sp. ind/l 2 0 0 6. Rhinoclavis asper ind/l 0 6 7 7. Thiara scraba ind/l 1 1 0 8. Chrysallida eppersoni ind/l 0 0 2 9. Clithon bicolor ind/l 0 1 2
Tabel 4. Plankton Sungai Donan pasca pengerukan

## Table 4. Plankton at River Donan after dredging operation
No. Taxa Unit Hasil Stasiun 1 Stasiun 2 Stasiun 3 1. Asterionella japonica * ind/l 0 0 243 2. Chaetoceros elmorei * ind/l 324 648 810 3. Coscinodiscus lacustris ind/l 0 0 162 4. Gyrosigma kuetzingii ind/l 162 0 0 5. Navicula platystoma ind/l 972 81 0 6. Pleurosigma delicatulum ind/l 81 0 0 7. Thallassiothrix nitzschioides ind/l 162 0 0 8. Chlorella variegatus ind/l 729 0 0 9. Spirogyra sp. ind/l 405 0 0 10. Lyngbya spirulinoides ind/l 567 2.187 2.268 11. Oscillatoria limnosa ind/l 405 81 0 12. Acartia sp. ind/l 324 405 486 13. Brachionus plicatilis ind/l 162 81 162 14. Eurytemora sp. ind/l 405 0 0
Catatan: * = Koloni

## Kesimpulan dan Saran
Kesimpulan menunjukkan bahwa pengerukan tidak merubah kualitas air, terutama TDS yang tetap tinggi di Sungai Donan karena TDS yang terbawa oleh pasang surut berpotensi terhambat oleh keberadaan jaring apung. Selain itu, kadar Pb, sedimen silty clay ,   serta   dominasi  bentos Rhinoclavis   asper dan   plankton Lyngbya   spirulinoides mempunyai   kecenderungan   yang   sama   pada   kelompok   antara   daerah   tengah   serta
selatan   dan   di   luar   daerah   pengerukan.   Oleh   karena   itu,   saran   yang   dapat dipertimbangkan adalah pencemaran Sungai Donan dan keberadaan jaring apung perlu mendapat perhatian serius.

## Daftar Pustaka
Anonimous,   2003.   Inventory   of   chemical   information   sources.   United   Nations Environment  Program. http://dbserver.irptc.unep.cl:8887/metadb/owa/mt.BrowseInventory?iinvid=5123 (diakses pada tanggal 15 Oktober 2008).
APHA,  AWWA,  and  WEF.,  1992.  Standard  methods  for the examination  of  water and waste   water.   American   Public   Health   Association,   American   Water   Works Association, and Water Environment Federation, Washington.
BSN., 2004. SNI 06-6989.1-2004: Pengujian kualitas air sumber dan limbah cair. Badan Standar Nasional, Jakarta.
Bupati Cilacap, 2002. Keputusan Bupati Cilacap Nomor 615/136/17/Tahun 2002 tentang pembentukan tim penertiban alur pelayaran dan pembinaan kepada masyarakat nelayan di Kabupaten Cilacap. Pemerintah Kabupaten Cilacap, Cilacap.
Dittmann,   S.,   2002.   Benthic   fauna   in   tropical   tidal   flats   –   a   comparative   perspective. Wetlands Ecology and Management, 10: 189-195.
Djohan, T.S., 1982. Species diversity of mangrove forest floor fauna in Segara Anakan and the Donan River. In : E.C.F. Bird, A. Soegiarto, K.A. Soegiarto (eds.) Workshop on coastal resources management in the Cilacap region, The Indonesian Institute of Sciences and the United Nations University, Jakarta.
Everaarts, J.M., Boon, J.P., Kastoro, W., Fischer, C.V., Razak, H., and Sumanta, I., 1989. Copper, zinc and cadmium in benthic organisms from the Java Sea and estuarine and coastal areas around East Java. Netherlands Journal of Sea Research, 23: 415-426.
Frusher,  S.T.,   Giddins,   R.L.,   and   Smith   III,   T.J.,   1994.   Distribution   and   abundance   of grapsid   crabs   (Grapsidae)   in   a   mangrove   estuary:   effects   of   sediment characteristics,   salinity   tolerances,   and   osmoregulatory   ability.  Estuaries,   17(3): 647-654.
Gubernur Jawa Tengah, 2001. Surat Keputusan Gubernur Jawa Tengah Nomor 8 Tahun 2001   tentang   baku   mutu   udara   ambien   di   Provinsi   Jawa   Tengah.   Pemerintah Provinsi Jawa Tengah, Semarang.
Gunarto,   2004.   Konservasi   mangrove   sebagai   pendukung   sumber   hayati   perikanan pantai. Jurnal Litbang Pertanian, 23(1): 15-21.
Hartoyo   dan   Mahdiana,   A.,   2007.   Analisis   resiko   kontaminasi   cadmium   pada   ikan terhadap   masyarakat   pesisir   Sungai   Donan   Kabupaten   Cilacap.   Jurnal   Sains Akuatik, 10(2): 96-104.
Hatcher, B.G., Johannes, R.E., and Robertson, A.I., 1989. Review of research relevant to the   conservation   of   shallow   tropical   marine   ecosystems.   Oceanogr.   Mar.   Biol. Annu. Rev., 27: 337-414.
Holcim Group Support Ltd.,  2004. Holcim as a group to the top of the industry: Holcim news report – technical meeting 2004. Holcim Group Support Ltd., Holderbank.
Hopper, M., 2004. WXTide32 Version 4.0. Free Software Foundation Inc., Cambridge.
NOAA.,   2003.   Mangrove   ecology.   National   Oceanic   and   Atmospheric   Administration. http://response.restoration.noaa.gov/oilaids/mangroves/pdfs/chapter1.pdf  (diakses pada tanggal 15 Oktober 2008).
Nordhaus,   I.,   2007.   The   benthic   community   in   the   Segara   Anakan   lagoon,   Java, Indonesia. In :   E.   Yuwono,   T.  Jennerjahn,   M.H.   Sastranegara,   and   P.  Sukardi (editors) Synopsis of ecological and socio-economic aspects of tropical  coastal ecosystem with special reference to Segara Anakan, Research Institute  Jenderal Soedirman University, Purwokerto.
Nurlaeli, A., 2007. Kandungan logam berat cadmium (Cd) pada kerang totok ( Polymesoda erosa )   di   Segara   Anakan   Cilacap.   Fakultas   Biologi     Universitas   Jenderal Soedirman, Purwokerto.
Odum,   P.E.,   1971.   Fundamentals   of   ecology.   Third   edition.   W.B.   Saunders   Co., Philadelphia.
Presiden Republik Indonesia, 2001. Peraturan Pemerintah Republik Indonesia Nomor 82 Tahun 2001 tentang pengelolaan kualitas air dan pengendalian pencemaran air. Sekretariat Negara, Jakarta.
PT   Semen   Cibinong   Tbk.,   2005a.   Program   advokasi   dan   pendampingan   masyarakat nelayan jaring apung di Kelurahan Kutawaru dan Karangtalun, Kabupaten Cilacap. PT Semen Cibinong Tbk., Cilacap.
______________________,  2005b. Pemantauan lingkungan  biotis dan kualitas air. PT Semen Cibinong Tbk., Cilacap.
PT Holcim Indonesia Tbk.,  2007. Maintenance dredging alur transportasi batu kapur di perairan Kali Donan Cilacap. PT Holcim Indonesia Tbk., Cilacap.
Rosyadi,   S.,   2006.   Tata   kelola   sumberdaya   perairan   Kali   Donan   Cilacap. Laporan Penelitian Tripartit. Universitas Jenderal Soedirman, Purwokerto.
Sastranegara, M.H., 2004. The impact of forest use on the intertidal crab community in managed mangroves of Cilacap, Central Java, Indonesia. Cuvillier, Göttingen.
Sastranegara,   M.H.   dan  Andriyani,   N.,   2006.   Keragaman   dan   kelimpahan   plankton   di Segara   Anakan   Cilacap.   Fakultas   Biologi   Universitas   Jenderal   Soedirman, Purwokerto.
Sastranegara, M.H., Eidman, M., Suratmo, G., dan Widjaja, F., 1996. Hubungan antara ketersediaan   unsur   hara   dengan   keragaman   dan   kelimpahan   fitoplankton   di Segara Anakan Cilacap. Majalah Ilmiah UNSOED, 4(12): 10-21.
Sastranegara, M.H. dan Winarni, E.T., 2009. Dampak kerusakan hutan bakau terhadap komunitas krustasea yang dapat dimakan di Segara Anakan Cilacap. Prosiding seminar  nasional  biologi   “Peran  biosistematika  dalam  pengelolaan  sumberdaya hayati   Indonesia”   di   Universitas   Jenderal   Soedirman,   12   Desember   2009.   Hal. 424-428.
Sudarso,   Y.,   Gunawan,   Yoga,   P.,   dan   Suryono,   T.,   2008.   Respon   komunitas makroavertebrata   terhadap   kontaminasi   logam   berat   di   sedimen   dari   Waduk Saguling. In: H.   Wibowo   (editor)   Perairan   darat   dan   perubahan   iklim,   Pusat Penelitian Limnologi  Lembaga Ilmu Pengetahuan Indonesia, Bogor.
White,  A.T.,   Martosubroto,   P.,   and   Sadorra,   M.S.M.,   1989.   The   coastal   environmental profile of Segara Anakan - Cilacap, South Java, Indonesia. International Center for Living Aquatic Resources Management, Manila.
Yuwono, E., Jennerjahn, T.C., Nordhaus, I., Ardli, E.R., Sastranegara, M.H., and Pribadi, R.,   2007.   Ecological   status   of   Segara   Anakan,   Java,   Indonesia,   a   mangrove- fringed lagoon affected by human activities. Asian Journal of Water, Environment & Pollution, 4: 61-70.