Journal Homepage : https://journal.ibrahimy.ac.id/index.php/JSAPI
http://dx.doi.org/10.35316/jsapi.v14i1.2396
Filogeografi Trigonopoma  gracile dari Sungai Gedong, Bangka dan Catatan di Paparan Sunda berdasarkan gen COI
Phylogeography of Trigonopoma  gracile from Sungai Gedong, Bangka and Records in Sundaland based on the COI gene
Ardiansyah Kurniawan 1) , Rina Apriyanti 1) , Alya Maisan Safitri 1) , Siti Puan NIK Almaghribi 1) , Ahmad Fahrul Syarif 1) ,  Andri Kurniawan 1) ,
1) Jurusan Akuakultur, Fakultas Pertanian Perikanan dan Biologi, Universitas Bangka Belitung, Kampus Teradu Balunijuk, Merawang, Bangka.
Korespondensi : email : ardian_turen@yahoo.co.id
(Diterima November 2022 /Disetujui Maret 2023)

## ABSTRAK
Trigonopoma    gracile merupakan  salah  satu  speies  ikan  air  tawar  yang  ditemukan  hidup  di perairan  Pulau  Bangka  yang  terdampak  penambangan  timah.  Perlu  dilakukan  kajian  terkait hubungan  genetik  ikan  ini  dengan  wilayah  lainnya  di  paparan  Sunda.  Sampel  ikan  dari  Sungai Gedong, Bangka diidentifikasi karakteristik molekulernya dengan menggunakan gen COI (sitokrom oksidase I) dan dibandingkan dengan temuan di wilayah Sundaland lainnya. Trigonopoma gracile dari  Sungai  Gedong,  Bangka  memiliki  hubungan  yang  dekat  dengan  ikan  T.  gracile  dari Kalimantan  Barat,  Serawak,  Belitung,  dan  Sempan,  Bangka  dengan  jarak  antara  0,93  –  1,89  %, namun  berbeda  kluster  dengan  Selangor,  Bangka  Selatan,  Kemuja-Bangka,  Trengganu,dan Serawak  dengan  jarak  genetik  3,69  –  5,44  %.  Hubungan  antar  pulau  pada  T. gracile diprediksi terjadi akibat hubungan sunga purba Sunda Utara dimasa lampau. Variasi genetik yang muncul di Pulau Bangka dimungkinkan sebagai adaptasi terhadap kondisi lingkungannya.
Kata kunci : trigonopoma  gracile, DNA barcoding, bangka, sundaland

## ABSTRACT
Trigonopoma  gracile  is  one  of  the  freshwater  fish  species  found  living  in  the  waters  of  Bangka Island  which is affected  by tin mining. It  is necessary to study the genetic relationship of this fish with other areas in the Sunda Shelf. Fish samples from the Gedong River, Bangka identified DNA barcoding  using  the  COI  (cytochrome  oxidase  I)  gene  and  compared  with  findings  from  other Sundaland  areas.  Trigonopoma  gracile  from  the  Gedong  River,  Bangka  has  a  close  relationship with fish from the Kapuas River - West Kalimantan, Sarawak, Belitung, and Sempan, Bangka with a  distance  between  0.93  -  1.89%,  but  different  clusters  with  Selangor,  South  Bangka,  Kemuja- Bangka,  Trengganu,  and  Sarawak  with  a  genetic  distance  of  3.69  –  5.44%.  The  relationship between  islands in  T.  gracile is  predicted  to  occur due  to  the  connection  of  ancient  North  Sunda rivers in the past. Genetic variation that appears on Bangka Island is possible as an adaptation to environmental conditions.
Keywords: trigonopoma  gracile, DNA barcoding, bangka, sundaland

## PENDAHULUAN
Kepulauan  Bangka  Belitung  merupakan  salah  satu  daerah  tambang  timah  yang  mempunyai banyak  sekali  kolong-kolong  pasca  tambang  timah.  Kolong  adalah  lubang  yang  berbentuk cekungan  bekas  pertambangan  timah  yang  berisi  air.  Perairan  terdampak  penambangan  timah umumnya  memiliki  pH  yang  cenderung  rendah  atau  asam  (Muslih et  al., 2016).  Mentari et  al. (2017)  memaparkan  bahwa  sungai  yng  tercemar  penambangan  timah  dalam  kategori  sedang
Samakia: Jurnal Ilmu Perikanan Volume 14, No. 1, April 2023 ISSN:2086-3861 E-ISSN: 2503-2283
Journal Homepage : https://journal.ibrahimy.ac.id/index.php/JSAPI
http://dx.doi.org/10.35316/jsapi.v14i1.2396
mengalami  peningkatan  kandungan Total  Dissolved  Solid ,  logam  berat  Cu  dan  Zn.  Kondisi perairan  asam  dengan  kandungan  logam  berat  yang  tinggi  tentunya  juga  didapati  pada  kolong belas penambangan timah. Kondisi ini menandakan bahwa perairan pada kolong pasca tambang timah memiliki kualitas air yang buruk untuk kehidupan organisme akuatik (Asriani dan Kurniawan, 2015;  Sukarman et  al .  2020).  Perairan  kolong  pasca  tambang  timah  secara  umum  memiliki  pH bersifat  asam,  yaitu  mencapai  pH  <  3,  oksigen  terlarut  sangat  rendah  dan  memiliki  tingkat kontaminasi logam berat yang tinggi  (Hashim et al . 2018; Kurniawan dan Mustikasari,. 2019).
Pada  kondisi  perairan  kolong  tersebut  dapat  menjadi  faktor  pemicu  tekanan  lingkungan  ekstrem yang serius bagi kehidupan organisme akuatik (Thompson et al . 2017; Igiri et al . 2018). Namun, ada beberapa ikan yang ditemukan pada perairan pasca tambang timah seperti ikan Kepala Timah ( Aplocheilus sp.),  Tempala  ( Betta sp.),  Cere  ( Gambusia sp.),  Seluang  ( Rasbora sp.),  Selinca ( Belontia sp.),  Berenet  ( Brevibora sp.),  Mata  Tiga  ( Oryzias sp.),  Kemuring  ( Puntius sp.),  Betok ( Anabas sp.) dan Sepat Rawa ( Trichogaster sp.) (Kurniawan dan Kurniawan, 2012; Kurniawan et al . 2020).  Adanya  sejumlah ikan yang dapat  beradaptasi dan hidup dilingkungan perairan pasca tambang  timah  yang  termasuk  jenis  perairan  ekstrem  dikelompokkan  sebagai  ikan  ekstremofil. Berdasarkan temuan tersebut, ikan seluang ( Trigonopoma garcile ) merupakan salah satu spesies ikan  yang  termasuk  dalam  kelompok  ikan  ekstremofil. T.  gracile merupakan  spesies  ikan  lokal yang berpotensi untuk dikembangkan sebagai ikan hias lokal dan menjadi salah satu spesies khas utama kepulauan Bangka Belitung (Syarif & Prasetyono, 2019).
Keberadaan organisme tersebut mendorong peneliti untuk mengkaji terkait hubungan kekerabatan dari  spesies  ikan  seluang  yaitu Trigonopoma    gracile asal  Pulau  Bangka  dan  hubungan kekerabatannya  dengan  spesies  yang  sama  dari  wilayah  lainnya.  Suatu  spesies  pada  umumnya dapat dipelajari secara pendekatan morfologi (Rafsanjani, 2011). Namun, pada pendekatan secara morfologi memiliki tingkat subjektifitas yang sangat tinggi, sehingga tingkat keakuratannya sangat rendah  (Lee  dan  Palci,  2015).  Oleh  karena  itu,  perlu  dilakukan  pendekatan  secara  genetik. Pendekatan ini menggunakan metode DNA Barcoding yang memanfaatkan gen COI (Cytochrome Oxidase  Subunit I)  sebagai  penanda  genetik  yang  sering  digunakan  untuk mengetahui  diversitas genetik hingga kekerabatan organisme (Hajibabaei et al ., 2006).

## MATERI DAN METODE
Penelitian dilakukan pada bulan Agustus  hingga November 2022. Satu sampel ikan diperoleh dari aliran  Sungai Gedong, Desa Banyu Asin,  Kecamatan Riau  Silip,  Kabupaten  Bangka (Gambar 1). Ekstraksi DNA pada sampel ikan dilakukan di Laboratorium Biologi, Fakultas Pertanian, Perikanan dan  Biologi  Universitas  Bangka  Belitung.  Sampel  ikan Trigonopoma  gracile ditangkap menggunakan  bubu  dengan  umpan  kelapa  sawit.  sampel  yang  didapatkan  dari  Sungai  Gedong Desa  Banyu  Asin  Kecamatan  Riau  Silip  Kabupaten  Bangka  selanjutnya  dimasukkan  ke  dalam Alkohol 95% dan disimpan pada suhu dingin untuk analisis DNA.
Gambar 1. Lokasi sampling Trigonopoma  gracile di Sungai Gedong, Riau Silip, Bangka
Journal Homepage : https://journal.ibrahimy.ac.id/index.php/JSAPI
http://dx.doi.org/10.35316/jsapi.v14i1.2396
Ekstraksi  DNA  menggunakan  Nexpro  DNA  Kit. Hasil  ekstraksi  diamplifikasi  di  lokus  COI (cytochrome  C  oxidase  I)  menggunakan  Polymerase  Chain  Reaction  (PCR).  Proses  amplifikasi melalui tahapan pre-denaturasi 95˚ selama 2 menit, denaturasi pada suhu 94˚C selama 30 detik, anneling  pada  suhu  54˚C  selama  30  detik,  ekstensi  pada  suhu  72˚C  selama  60  detik  dan  post ekstensi  72˚C  selama  10  menit,  proses  PCR  diulang  sebanyak  35  siklus.  Pada  metode  ini menggunakan sepasang primer yaitu primer
forward FISH F1 : TCAACCAACCACAAAGACATTGGACAC dan primer reverse FISH R1 :
TAGACTTCTGGGTGGCCAAAGAATCA  (Ward et  al .,  2005).  PCR  produk  disekuensing  di  1st Base.
Sekuens  nukleotida  yang  diperoleh  dilakukan  penjajaran  kemudian  di  masukan  ke  GenBank  di NCBI  (National  Center  for  Biotechnology  Information)  dan  dilakukan  pembandingan  untuk meningkatkan  akurasi  data  melalui  metode  BLAST  (Basic  Local  Alignment  Search  Tool- nucleotide). Hasil penyejajaran sekuens yang diperoleh dianalisis menggunakan aplikasi MEGA 11 (Molecular Evolutionary Genetic Analysis).  Konstruksi filogenetik menggunakan metode Maximum Likelihood  model  evolusi  Temura  Nei  model  dengan  boots  trap  sebanyak  1000x.    Terdapat  14 skuens yang di unduh sebagai pembanding termasuk (1) outgroup (Tabel 1).
Tabel 1 . Sekuen Pembanding Untuk Kontruksi Filogenetik
No Accession number Sumber Asal 1 ADY4282 BoldSystem  Sempan, Bangka, Indonesia 2 ADO0069 BoldSystem Sungai Kapuas, Semitau, Kalimantan Barat, Indonesia 3 MN869096.1 NCBI Sungai Kapuas, Semitau, Kalimantan Barat, Indonesia 4 MN869347.1 NCBI Badau, Belitung, Indonesia 5 MN86707.1 NCBI Malaysia, Sarawak 6 MN869649.1 NCBI Putussibau, Kalimantan Barat, Indonesia 7 MW232488.1 NCBI Malaysia, Johor 8 MN869327 NCBI Trengganu, Malaysia 9 MN869833 NCBI Trengganu, Malaysia 10  MN869585 NCBI Selangor, Malaysia 11  MN869371 NCBI Bangka, Selatan 12  MN869495 NCBI Kemuja_Bangka 13  MN869193 NCBI Kemuja_Bangka 14  MN869015.1 NCBI Rasbora_pauciperforata_Jambi

## HASIL DAN PEMBAHASAN
Hasil  elektroforesis  pada  produk  PCR  menunjukan  DNA  T. gracile dari  Sungai  Gedong,  Bangka tervisualisasi  dengan  pita  yang  tebal  (Gambar2).  Hasil  sekuensing  dibandingkan  dengan  data genbank  melalui  proses  BLAST  pada  NCBI  menunjukkan  T. gracile memiliki  persentase  tingkat kemiripan  tertinggi  dengan  query  cover  99%  dan  nilai  per  ident  97,35%.  Hasil  BLAST  sampel  T. gracile dapat dilihat pada Tabel 2.
Tabel 2. Hasil Blast Trigonopoma  gracile Spesies Query Cover E Value Per;ident Accession Trigonopoma  gracile 99% 0,0 97.35% NC_063898.1 Trigonopoma  gracile 95% 0,0 98.01% MN869831.1 Trigonopoma  gracile 95% 0,0 98.01% MN869096.1 Trigonopoma  gracile 96% 0,0 98,17% MN869137.1 Trigonopoma  gracile 96% 0,0 97,71% MN869347.1
Journal Homepage : https://journal.ibrahimy.ac.id/index.php/JSAPI
http://dx.doi.org/10.35316/jsapi.v14i1.2396
Gambar 2. Tampilan hasil elektroforesis DNA Trigonopoma gracile dari Sungai Gedong, Bangka Sampel ikan seluang dari Sungai Gedong memiliki kemiripan dengan T. gracile yang ditemukan di Sempan  dengan  daratan  yang  sama  yaitu  Pulau  Bangka  senilai  98,17%.  Similaritas  yang  tinggi hingga  98,1%  juga  ditemukan  pada  perbandingan  terhadap T.  gracile dari  Kalimantan  Barat. Kondisi  ini  menunjukan  bahwa T. gracile di  Bangka  dan  Kalimantan  Barat  memiliki  kemiripan genetik yang sangat dekat. Hal ini sesuai dengan Maduppa et al . (2017) yang menyatakan bahwa semakin  tinggi  nilai presentase  identity  antarspesies  maka menunjukkan kesamaan  genetik  yang sangat dekat. Nilai  identity  yang  lebih besar dari 95% dan mendekati 100% menunjukkan tingkat kesamaan genetik antar spesies yang tinggi. T.  gracile yang ditemukan di Perairan Pulau Bangka memiliki  kesamaan  dengan T.    gracile yang  ditemukan  di  Perairan  Kalimantan  Barat.  Hal  itu dikarenakan Kepulauan Bangka Belitung dan Kalimantan pernah terhubung dimasa lampau dalam daratan yang sama yaitu paparan Sunda. Voris (2000) menyatakan bahwa daerah Sumatra, Jawa dan Kalimantan merupakan Sundaland.
Gambar 3. Pohon filogenetik Trigonopoma gracile dari Sungai Gedong, Bangka dan catatan lainnya di Paparan Sunda.
Journal Homepage : https://journal.ibrahimy.ac.id/index.php/JSAPI
http://dx.doi.org/10.35316/jsapi.v14i1.2396
Tabel 3. Jarak Genetik T. gracile di Paparan Sunda 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 1 Sungai_Gedong 2 Sempan_Bangka 0,0093 3 Kapuas_Kalbar 0,0103  0,0110 4 Kapuas_Kalbar 0,0113  0,0120  0,0010 5 Belitung 0,0124  0,0110  0,0120  0,0131 6 Serawak_Malaysia 0,0189  0,0182  0,0172  0,0173  0,0193 7 Putussibau_Kalbar 0,0369  0,0364  0,0329  0,0330  0,0365  0,0343 8 Trengganu_Malaysia 0,0509  0,0570  0,0503  0,0515  0,0546  0,0561  0,0729
9 Trengganu_Malaysia 0,0521  0,0581  0,0514  0,0527  0,0558  0,0584  0,0741  0,0020
10  Selangor_Malaysia 0,0533  0,0616  0,0548  0,0561  0,0568  0,0630  0,0728  0,0110  0,0110 11  Bangka_Selatan 0,0533  0,0616  0,0548  0,0561  0,0568  0,0630  0,0728  0,0110  0,0110  0,0000 12  Kemuja_Bangka 0,0544  0,0604  0,0537  0,0550  0,0557  0,0618  0,0740  0,0120  0,0120  0,0010  0,0010 13  Kemuja_Bangka 0,0544  0,0604  0,0537  0,0550  0,0557  0,0618  0,0740  0,0120  0,0120  0,0010  0,0010  0,0000
Rekontruksi  pohon  filogenetik  merupakan  salah  satu  cara  menentukan  hubungan  genetik  antar spesies  dalam  satu  populasi  dan  antar  populasi  (Pramono et  al .,  2017;  Saleky et  al .,  2021). T. gracile dari  Sungai  Gedong,  Bangka  berada  pada  cabang  yang  sama  dengan  ikan  dari  Sungai Kapuas - Kalimantan Barat, Serawak, Belitung, dan Sempan, Bangka dengan jarak genetik antara 0,93 – 1,89 %. Namun T. gracile dari Selangor, Bangka Selatan, Kemuja-Bangka, Trengganu,dan Serawak  berada  pada  cabang  berbeda  dengan  jarak  genetik  3,69  –  5,44  %.  Perbedaan  ini menunjukkan  adanya  variasi  genetik  pada  spesies  ini.  Semakin  tinggi  nilai  matriks  antarspesies menunjukkan bahwa kekerabatan genetik tersebut semakin jauh, begitupun sebaliknya (Juliantari 2015).  Jarak  genetik  antarspesies  yang  terpisahkan  pulau  berbeda  menunjukan  variasi  genetik juga terjadi pada sesama famili Cyprinidae, Osteochilus spilurus, yang jarak genetiknya mencapai 8% (Kurniawan et al ., 2022). Terdapat hubungan intraspesifik antara populasi Sungai Gedong dan Sempan  Bangka  dengan  Badau-Belitung  dan  Kapuas-Kalimantan  Barat.  Aminan et  al .    (2020) menyatakan hubungan intraspesifik terjadi pada jarak genetik dibawah 3%.
Penyebaran T. gracile diprediksi  terjadi  akibat  hubungan  sungai  purba  Sunda  Utara  di  masa lampau.  Hal  ini dibuktikan dengan  tidak  ditemukannya  temuan  spesies  ikan  ini  di Jawa,  Bali dan Kalimantan bagian selatan dan timur. Sungai purba Sunda Utara memiliki jangkauan di Kalimantan Barat,  Bangka,  Belitung,  Jambi,  dan  Riau  (Hutama et  al .,  2016).  Temuan  di  Selangor  dan Trengganu  dimungkinkan  juga  akibat  hubungan  dengan  sungai  purba  tersebut.  Berdasarkan pendapat  Harrison et  al. (2006),  terdapat  anak  sungai  purba  Sunda  Utara  yang  mengarah  ke Semenanjung  Malaya  (Gambar  4).  Luasnya  sebaran T.  gracile juga  disebabkan  kemampuan spesies ini beradaptasi pada lingkungan dengan keasaman tinggi (Inocencia et al ., 2021).
Gambar 4 . Jangkauan wilayah Sungai Purba Sunda Utara (Harrison et al ., 2006).
Journal Homepage : https://journal.ibrahimy.ac.id/index.php/JSAPI
http://dx.doi.org/10.35316/jsapi.v14i1.2396
Variasi genetik yang muncul antara T. gracile dari Sungai Gedong dan Sempan dengan T. gracile dari  Kemuja  dan  Bangka  Selatan  dimungkinkan  adanya  kriptik  spesies.  Penamaan  spesies berdasarkan  morfologi  yang  belum  dideskripskan  secara  akurat  diprediksi  menyebabkan  adanya perbedaan  klaster  dari  pulau  yang  sama  ini.  Bangka  termasuk  dalam  paparan  Sunda  yang menurut Ng dan Tan (2021) memiliki jumlah temuan kriptik spesies tinggi akibat deskripsi holotipe spesies  yang  kurang  kritis  berdasarkan  catatan  lama.  Identifikasi  molekuler  yang  berkembang lebih akurat menunjukkan gap taksonomi yang lebar sebagai kriptik diversitas (Hubert et al., 2019). Beberapa  genus  Cyprinidae  masuk  dalam  wilayah  abu-abu  atau  meragukan  dalam  penentuan spesies  akibat  kriptik  (Kottelat  dan  Lim,  2021). T.  gracile merupakan  salah  satu  diantara Cyprinidae  yang  memiliki  perbedaan  genetik  yang  besar  hingga  13%  dan  memunculkan  kriptik spesies (Sholihah et al., 2020).

## KESIMPULAN DAN SARAN
Trigonopoma    gracile dari  Sungai  Gedong,  Bangka  memiliki  hubungan  kekerabatan  yang  dekat dengan  ikan  dari  Sungai  Kapuas  -  Kalimantan  Barat,  Serawak,  Belitung,  dan  Sempan,  Bangka dengan  jarak  antara  0,93  –  1,89  %,    namun  berbeda  kluster  dengan  Selangor,  Bangka  Selatan, Kemuja-Bangka,  Trengganu,dan  Serawak  dengan  jarak  genetik  3,69  –  5,44  %.  Hubungan antarpulau  pada  T. gracile diprediksi  terjadi  akibat  hubungan  sungai  purba  Sunda  Utara  dimasa lampau.  Variasi  genetik  yang  muncul  di  Pulau  Bangka  dimungkinkan  sebagai  adaptasi  terhadap kondisi lingkungannya. Perlu penambahan wilayah sampling genetik spesies ini untuk memberikan gambaran filogeografinya lebih lengkap.

## REFERENSI
Aminan, A. W., Kit, L. L. W., Hui, C. H., & Sulaiman, B. (2020). Morphometric Analysis and Genetic Relationship  of  Rasbora  spp.  in  Sarawak,  Malaysia.  Tropical  life  sciences  research,  31(2), 33.
Asriani, E., & Kurniawan, A. (2015). Determinasi nilai pH untuk memprediksi kualitas perairan pada kolong pascatambang timah di Pulau Bangka. Journal of Aquatropica Asia, 1(2).
Harrison,  T.,  Krigbaum,  J.,  &  Manser,  J.  2006.  Primate  biogeography  and  ecology  on  the  Sunda Shelf Islands: a paleontological and zooarchaeological perspective. In Primate biogeography (pp. 331-372). Springer, Boston, MA.
Hashim,  M.,  Nayan,  N.,  Saleh,  Y.,  Mahat,  H.,  Shiang,  W.  F.  2018.  Water  quality  assessment  of former tin mining  lakes for recreational purposes in  Ipoh  City, Perak,  Malaysia.  Indonesian Journal of Geography 50(1): 25- 33
Hubert,  N.,  Lumbantobing,  D.,  Sholihah,  A.,  Dahruddin,  H.,  Delrieu-Trottin,  E.,  Busson,  F.,  ...  & Keith,  P.  (2019).  Revisiting  species  boundaries  and  distribution  ranges  of  Nemacheilus spp.(Cypriniformes:  Nemacheilidae)  and  Rasbora  spp.(Cypriniformes:  Cyprinidae)  in  Java, Bali  and  Lombok  through  DNA  barcodes:  implications  for  conservation  in  a  biodiversity hotspot. Conservation Genetics, 20, 517-529.
Hutama  A.A.  Hadiaty  R.K.,  &  Hubert  N.  2016.  Biogeography  Of  Indonesian  Freshwater  Fishes:
Current Progress. Treubia. 43: 17–30
Igiri, B.E., Okoduwa, S.I., Idoko, G.O., Akabuogu, E.P., Adeyi, A.O., Ejiogu, I.K. 2018. Toxicity and bioremediation of heavy metals contaminated ecosystem from tannery wastewater: a review. Journal of Toxicology 2018: 1-16
Inocencia, A., Gonggoli, A. D., Rangin, A. R., Dendie, D., Putra, E. D., Lorensi, M., ... & Kadafi, A. M.  (2021).  Inventarisasi  Jenis  Ikan  Air  Tawar  di  Kawasan  Kampus  Universitas  Palangka Raya, Kalimantan Tengah. Jurnal Ilmu Hayat, 5(1), 35-42.
Juliantari  E.  2015.  Studi  Filogenetik  Mangifera  Sumatera  Tengah  Berdasarkan  Sekuen  rbcL [Skripsi]. Pekanbaru: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Riau.
Kottelat,  M.,  &  Lim,  K.  K.  (2021).  Two  new  species  of  Barbodes  from  the  Malay  Peninsula  and comments  on  ‘cryptic  species’  in  the  B.  binotatus  group  (Teleostei:  Cyprinidae). RAFFLES BULLETIN OF ZOOLOGY , 69 (1), 522-540.
Journal Homepage : https://journal.ibrahimy.ac.id/index.php/JSAPI
http://dx.doi.org/10.35316/jsapi.v14i1.2396
Kurniawan, A., & Mustikasari, D. (2019). Review: Mekanisme akumulasi logam berat di ekosistem pascatambang timah. Jurnal Ilmu Lingkungan, 17(3), 408-415.
Kurniawan,  A.,  Kurniawan,  A.  2012.  Analisis  variasi  genetik  ikan  di  kolong  pascatambang  timah dengan metode elektroforesis. Akuatik: Jurnal Sumberdaya Perairan 6(2): 6-10
Kurniawan,  A.,  Kurniawan,  A.,  Hariati,  A.  M.,  Kurniawan,  N.,  Nugroho,  T.  W.,  Bidayani,  E.,  ...  & Wiadnya,  D.  G.  R.  (2022).  Genetic  diversity  analysis  and  phylogeography  of  Osteochilus spilurus  (Cyprinidae:  Labeoninae)  from  Bangka,  Belitung,  and  Kalimantan  Islands  using Cytochrome b gene. Biodiversitas Journal of Biological Diversity, 23(9).
Lee, M. S., & Palci,  A. (2015). Morphological  phylogenetics in  the genomic age. Current Biology, 25(19), R922-R929.
Mentari, M., Umroh, U., & Kurniawan, K. (2017). Pengaruh aktivitas penambangan timah terhadap kualitas  air  di  Sungai  Baturusa  Kabupaten  Bangka.  Akuatik:  Jurnal  Sumberdaya  Perairan, 11(2), 23-30.
Muslih,  K.,  Adiwilaga,  E.  M.,  &  Adiwibowo,  S.  2016.  Pengaruh  penambangan  timah  terhadap keanekaragaman  ikan  sungai  dan  kearifan  lokal  masyarakat  di  Kabupaten  Bangka. Limnotek: perairan darat tropis di Indonesia, 21(1).
Ng, C. K. C., & Tan, J. (2021). Cryptic species and grey zone speciation of the Barbodes binotatus complex (Teleostei, Cyprinidae) in Sundaland. Journal of fish biology, 99(4), 1256-1273.
Pramono,  T.B.,  Arfiati,  D.A.,  Widodo,  M.S.,  Yanuhar,  U.Y.,  2017.  Identifikasi  Ikan  Genus  Mystus Dengan Pendekatan Genetik. Jurnal Kelautan Tropis. 24(1):141-150
Rafsanjani, A., 2011. Analisis Keragaman Genetic Ikan Mas (Cyprinus carpio) Di Waduk Saguling Dengan Menggunakan Metode Rapd-Pcr. Skripsi. Universitas Padjajaran.
Sholihah,  A.,  Delrieu-Trottin,  E.,  Sukmono,  T.,  Dahruddin,  H.,  Risdawati,  R.,  Elvyra,  R.,  ...  & Hubert, N. (2020). Disentangling the taxonomy of the subfamily Rasborinae (Cypriniformes, Danionidae) in Sundaland using DNA barcodes. Scientific reports, 10(1), 1-14.
Sukarman., Gani, R.A., Asmarhansyah. 2020. Tin mining process and its effects on soils in Bangka Belitung  Islands  Province,  Indonesia.  Sains  Tanah  Journal  of  Soil  Science  and Agroclimatology, 17(2): 180-189
Syarif  A.  F.  &  Prasetiyono  E.  (2019).  Karakter  morfometrik,  pertumbuhan,  dan  sintasan  tiga spesies ikan seluang (Famili: Cyprinidae) asal Pulau Bangka. Media Akuakultur, 14 (1), 1-7.
Thompson,  A.W.,  Hayes,  A.,  Podrabsky,  J.E.,  Orti,  G.  2017.  Gene  expression  during  delayed hatching in fish-out-ofwater. Ecological Genetics and Genomics 3-5(2-17): 52-59.
Voris, 2000. Maps of Pleistocene sea levels in Southeast Asia: shorelines, river systems and time durations. Journal of Biogeography, 27, 1153–1167
Ward R.D., Zemlak T.S., Innes B.H., Last P. and Hebert P.D.N. (2005). DNA Barcoding Australia’s Fish Species. Phil. Trans. R. Soc. B 360: 1847-1857.