Biodiversitas Mikroba Rizosfer Tanaman Jeruk Keprok Borneo Prima ( Citrus reticulata cv Borneo Prima )
Biodiversity of Rizhosfer Microbe Borneo Prima Orange Plant (Citrus reticulata cv Borneo Prima)
Purwati 1 , Hamidah 1
1 Tenaga Pendidik Program Studi Agroteknologi, Fakultas Pertanian, Universitas Widya Gama Mahakam Jl. KH. Wahid Hasyim, Sempaja, Samarinda, Kalimantan Timur, Indonesia email : purwati@uwgm.ac.id, hamidah@uwgm.ac.id
Diterima : 22 Agustus 2018 Disetujui : 12 Oktober 2018

## ABSTRACT
Borneo Prima tangerine (Citrus reticulata cv Borneo Prima) is an indigenous plant from Tanjung Labu Village, Rantau Pulung District, East Kutai District, East Kalimantan Province. In the cultivation of these plants, there are pathogens that can cause a decrease in crop yields. This study aims to identify the diversity of rhizosphere microbial populations  in  Borneo  Prima  tangerine  plants.  The  study  was  conducted  at  the  Laboratory  of  Plant  Pests  and Diseases of the Faculty of Agriculture, Mulawarman University Samarinda in February-April 2018. This study was descriptive, using a survey method. The study consisted of two stages, namely  (1)  soil sampling on Borneo Prima tangerine  citrus  land  in  Makroman  Village,  Kutai  Kartanegara  Regency,  East  Kalimantan  (2)  isolation, characterization, identification, gram test, in the Laboratory of Pests and Plant Diseases. The data obtained were analyzed using quantitative descriptive analysis. The results of the study of the isolation of rhizosphere microbes in Borneo Prima tangerine citrus plants obtained 1 family of bacteria namely Azotobacteraceae and 4 fungal genera including Aspergilus, Mucor, Penicillium and Trichoderma. Microbes that belong to the group that benefit the soil ecosystem are Azotobacteraceae because they play a role in fixing (fixation) N2 or as biofertilizers. While the genus Mucor and Penicillium act as decomposers and Trichoderma acts as a controller of pathogens or biological agents and biological pesticides (biopestiside).
Key words: Biodiversity, Rhizosfer, Borneo Prima Orange

## PENDAHULUAN
Jeruk  keprok  Borneo  Prima  merupakan salah satu komoditas hortikultura unggulan baru di Kalimantan Timur, yang memiliki keunggulan sebagai jeruk keprok dataran rendah dengan  kulit  buah  berwarna  jingga  (BPPMD Kaltim, 2009).
Rhizosfer  merupakan  bagian  tanah  yang berada  di  sekitar  perakaran  tanaman.  Populasi mikroba  pada  rhizosfer  umumnya  lebih  banyak dan  beragam  dibandingkan  pada  tanah  non- rhizosfer.  Aktivitas  mikroba  pada  rhizosfer dipengaruhi  oleh  eksudat  yang  dihasilkan  oleh perakaran  tanaman.  Beberapa  mikroba  pada rhizosfer  berperan  dalam  siklus  hara,  proses pembentukan  tanah,  pertumbuhan  tanaman, mempengaruhi  aktivitas  mikroorganisme,  dan sebagai pengendali hayati terhadap patogen akar (Simatupang, 2008).
Upaya  penggalian  jenis  mikroba  pada rhizosfer  tanaman  jeruk  keprok  Borneo  Prima tersebut  belum  banyak  dilakukan.  Untuk  itu dilakukan  penelitian  mengenai  potensi  mikroba terutama  yang  berhubungan  dengan  kesuburan tanah dan pengendali patogen tanah. Identifikasi merupakan  suatu  kegiatan  yang  sangat  penting mengingat banyak jenis mikroba belum
diketahui jumlah dan jenisnya. Tingkat kesuburan tanah  di  lahan  jeruk  keprok  Borneo  Prima  perlu diketahui sehingga perlu didukung dengan data dan informasi  tentang  mikroba  tanah  yang  terdapat  di lahan tersebut.
Bakteri  yang  berperan  dalam  meningkatkan kesuburan  tanah  dikenal  sebagai  biofertilizer karena dapat meningkatkan efisiensi penggunaan  pupuk  anorganik,  sehingga  sangat menunjang  sistem  pertanian  yang  berwawasan lingkungan  (Susilowati et  al., 2003).  Dalam  hal penyediaan  dan  penyerapan  unsur  hara  bagi tanaman,  aktivitas    mikroba    diperlukan    untuk menjaga  ketersediaan  tiga  unsur  hara  yang penting  bagi  tanaman  antara  lain,  nitrogen  (N), fosfat    (P),    dan    kalium    (K).    Kurang  lebih 80%   kandungan   udara   adalah   N (Metasari, 2011).
Berdasarkan  uraian  tersebut,  maka  perlu dilakukan  penelitian  untuk  mengidentifikasi biodiversitas  populasi  mikroba  rizosfer  pada tanaman  jeruk  keprok  Borneo  Prima  sehingga dapat  digunakan  sebagai  pengelolaan  teknik budidaya  yang  tepat.  Penelitian  ini  bertujuan untuk  mengetahui  biodiversitas  mikroba  baik jumlah  dan  jenisnya  serta  untuk  mendapatkan
isolat  murni  yang  dapat  dikembangkan  sebagai sumber  plasma  nutfah  mikroba  penyubur  tanah
dan  pengendali  pathogen  tanah  pada  tanaman jeruk keprok Borneo Prima.

## BAHAN DAN METODE
Penelitian dilakukan dengan  metode  isolasi tanah  rhizosfer  secara  langsung  dari    daerah perakaran  /  rhizosfer  tanaman  jeruk  keprok Borneo Prima dari lahan perkebunan masyarakat di  Kelurahan  Makroman  Kabupaten  Kutai Kartanegara Provinsi Kalimantan Timur. Pemurnian jamur dan identifikasinya
dilakukan  di Laboratorium  Hama dan Penyakit,
Fakultas  Pertanian,  Universitas  Mulawarman
Samarinda.  Mulai  bulan  Februari-April  2018. Bahan  yang  digunakan  dalam  penelitian  ini adalah tanah dari rizosfer tanaman jeruk keprok
Borneo Prima, Alkohol 70%, NaOCl 5%, media Potato  Dextrose  Agar (PDA),  spirtus,  dan aquades  steril.Penelitian  menggunakan  metode deskriptif. Penelitian terdiri dari dua tahap, yaitu (1)  pengambilan  sampel  tanah  pada  lahan pertanaman  pisang  rutai  di  Kecamatan  Muara Badak Kabupaten Kutai Kartanegara, Kalimantan Timur (2) isolasi dan identifikasi di Laboratorium HPT Unmul. Pengamatan dilakukan  terhadap  keragaman  mikroba  tanah pada  rhizosfer  tanaman  jeruk  keprok  Borneo Prima  yaitu  keragaman  bakteri  dan  jamur meliputi jenis dan jumlah populasi.

## HASIL DAN PEMBAHASAN
Hasil  penelitian  isolasi  mikroba  rizosfer tanaman jeruk keprok Borneo Prima diperoleh 1 famili  bakteri  yaitu  Azotobacteraceae  dan  4 genus  jamur  meliputi  Aspergilus,  Mucor, Penicillium  dan  Trichoderma.  Hasil  isolasi mikroba  pada  rhizosfer  tanaman  jeruk  keprok Borneo  Prima  dapat  dilihat  pada  Gambar  1  dan Gambar  2.  Mikroba  merupakan  alternatif  dalam pengendalian hama dan penyakit tanaman  yang sangat  potensial  sehingga  dapat  dimanfaatkan sebagai pengganti pestisida. Keuntungan penggunaan pestisida hayati yaitu ekonomis dan ramah  lingkungan.  Ditambahkan  oleh  Powell  & Faull  (1989)  bahwa  pertimbangan  dalam memilih agen pengendali hayati yaitu kemampuan  biopestisida  bertahan  dalam  waktu lama dan tidak memerlukan tempat penyimpanan khusus.
Sifat  fisik  dan  kimia  yang  baik  memiliki ciri-ciri  mengandung  berbagai  macam  mikroba. Pada  umumnya  mikroba  yang  terdapat  dalam tanah antara lain bakteri penambat nitrogen non- simbiotik.
Mikroba  yang  berperan  dalam  penyedia unsur  hara  di  dalam  tanah  (biofertilizer)  yaitu dikelompokkan  sebagai  penyedia  unsur  N  dan pelarut  P  (Phosphorus  solubilizing  organism). Mikroorganisme  bakteri  yang  terdapat  pada rhizosfer tanaman pisang rutai yang tergolong ke dalam  kelompok  penyedia  unsur  N  adalah Azotobacteraceae  sedangkan  yang  tergolong  ke dalam  kelompok  pelarut  P  adalah  Bacillaceae (Prihartini, 1990 dalam Syarifudin, 2002).
Azotobacteraceae dapat  dijumpai  pada semua  tanah  sehingga  dapat  dikatakan  sebagai spesies  yang  umum  terdapat  di  rhizosfer tanaman pisang rutai. Bakteri ini berperan dalam mengikat (fiksasi) N 2 di udara (biofertilizer) dan
memacu  pertumbuhan  tanaman  (Goenadi,  1997 dalam Syarifudin, 2002). Famili
Azotobacteraceae, memiliki ciri-ciri meliputi sel serupa batang, bola atau telur, tidak mempunyai endospora, gram negatif, aerob, dan hidup bebas dalam tanah.
Gambar 1. Bakteri : Famili Azotobacteraceae
2a 2b 2c
2d
Gambar 2. Jamur : Genus Aspergilus (2a),
Mucor  (2b),  Penicillium  (2c) dan Trichoderma (2d).
Azotobacter memiliki
kelebihan dibandingkan  dengan  bakteri  penambat  N  non- simbiotik  lainnya  karena  mampu  mensintesis hormon  seperti  IAA  (Indole  Acetic  Acid) sehingga  dapat  memacu  pertumbuhan  tanaman (Widiastuti dkk, 2010).
Kemampuan bakteri penambat nitrogen non- simbiotik pada rhizosfer tanaman untuk mengikat  nitrogen  lebih  maksimal  dipengaruhi oleh  faktor-faktor  diantaranya  pH  tanah,  aerasi, drainase  yang  baik,  kelembaban,  kandungan bahan organik, serta kondisi perakaran tumbuhan  tingkat  tinggi  tempatnya  hidup  juga akan  memengaruhi  keragaman  dan  populasi bakteri  penambat  N  non-simbiotik  (Agustian  et al. 2012).
Jamur Trichoderma sp  dapat  dimanfaatkan sebagai  jamur  antagonis  patogen  tanah  dapat berkembang  biak  dengan  cepat  pada  daerah perakaran tanaman. Beberapa penelitian menunjukkan  bahwa Trichoderma , Penicillium dan Aspergillus adalah  jamur  antagonis  yang dapat  berperan  sebagai biopesticide maupun biofertilizer karena  mengeluarkan  zat  sejenis antibiotik tertentu atau metabolit sekunder untuk menekan perkembangan patogen. Selain itu juga dapat  berperan  sebagai  deKomposer  untuk meningkatkan kesuburan tanah sehingga memicu  pertumbuhan  tanaman  (Khan et  al ., 2008;  Vinale et  al .,  2008;  Song et  al .,  2010;
Sudantha dkk., 2011).
Mekanisme  yang  dilakukan  oleh  jamur antagonis Trichoderma sp.  terhadap  patogen adalah  mikoparasit  yaitu  mampu  menekan
aktivitas  patogen  tular  tanah  dan  kompetitor baik  ruang  maupun  nutrisi  (Sudantha  dkk . , 2011).  Jamur Trichoderma sp.  memiliki beberapa  kelebihan  yaitu  mudah  diisolasi, daya  adaptasi  luas,  dapat  tumbuh  dengan cepat pada berbagai substrat, memiliki kisaran mikroparasitisme  yang luas  dan tidak bersifat patogen pada tanaman (Arwiyanto, 2003). Erwanti (2003) menyatakan bahwa, pengendalian  hayati  bersifat  spesifik  lokal yaitu    mikroorganisme    antagonis    yang terdapat  di  suatu  daerah  hanya  akan memberikan  hasil  yang  baik  di  daerah asalnya.    Jamur  adalah  Aspergilus  sp tergolong  ke  dalam  kelompok  pelarut  P (Prihartini,  1990  dalam  Syarifudin,  2002). Goenadi  (1997)  dalam  Syarifudin  (2002) menjelaskan  bahwa  Aspergilus  sp  berperan dalam  meningkatkan  efisiensi  penyerapan unsur  hara  oleh  akar  tanaman  melalui peningkatan  kelarutan  unsur  hara  yang dibutuhkan oleh tanaman.
Mikroba  memiliki  kemampuan  menempati berbagai  habitat  sehingga  memiliki  kesempatan untuk  berkembang  biak.  Di  sekitar  perakaran terdapat  bahan-bahan  organik  dari  eksudat  akar tanaman yang dapat digunakan mikroba sebagai sumber  makanan.  Jumlah  dan  jenis  mikroba pada  tanah  disebabkan  oleh  faktor  suhu, keterbatasan  makanan  dan  aktivitas  manusia diantaranya pemupukan dan penggunaan pestisida  yang  terus-menerus  di  lahan  pertanian sehingga kehidupan mikroorganisme terganggu.

## KESIMPULAN
1. Hasil  isolasi  mikroba  rizosfer  tanaman  jeruk keprok Borneo Prima diperoleh bakteri yaitu Famili  Azotobacteraceae  dan  Jamur  terdapat 4 genus meliputi Aspergilus, Mucor, Penicillium dan Trichoderma.
2. Famili  Azotobacteraceae  berperan  dalam penambatan  (fiksasi)  N 2 atau  sebagai biofertilizer
3. Genus  Mucor  dan  Penicillium  berperan sebagai decomposer serta  Trichoderma berperan  sebagai  pengendali  patogen  atau sebagai  ( biological  agens )  dan  pestisida hayati ( biopestiside ).
1. sebagai  pengendali  patogen  (biological agens) dan sebagai pestisida hayati (biopestide).

## DAFTAR PUSTAKA
Agustian, Syafei R, Maira L. 2012. Keragaman Bakteri Penambat N pada Rhizosfer Titonia
(Tithonia  Diversifolia)  yang  Tumbuh  pada Tanah  Masam  Ultisol .  Jurnal  Solum,  9  (2):
98-105.
Arwiyanto  T.  2003. Pengendalian  Hayati Penyakit  Layu  Bakteri  Tembakau .  Jurnal Perlindungan  Tanaman  Indonesia  3(1):  54- 60.
Badan  Perumahan  dan  Penanaman  Modal Daerah  Propinsi  Kalimantan  Timur.  2009. Investasi  Budidaya  Jeruk  Borneo  Prima . Samarinda (ID): BPPMD.
Erwanti,  2003. Potensi  Mikroorganisme  Tanah Antagonis  Untuk  Menekan  Pseudomonas sollanacearum pada Tanaman Pisang Secara  in  vitro  di  Pulau  Lombok .  Makalah Falsafah Sains Program Pasca Sarjana  (S3).
(Tidak dipublikasikan). Goenadi,  D.H.  dan  R.  Saraswati.  1993. Kemampuan Melarutkan Fosfat Dari
Beberapa  Isolat  Fungi  Pelarut  Fosfat . Menara Perkebunan 61(3):61-66.
Metasari, K. 2011. Eksplorasi Bakteri Penambat Nitrogen Non Simbiosis dari Tanah Kawasan  Mangrove  Wonorejo  Surabaya. Skripsi  Thesis.  Universitas  Airlangga. http://repository.unair.ac.id . Diunduh tanggal 11 Februari 2016. Powell  KA,  Faull  JL.  1989. Commercial
Approaches to the use of Biological Control Agents.  In  Biotechnology  Of  Fungi  For Improving  Plant  Growth.  Ed.  Whipp  jm, Lumsden  rd .  Cambridge  University  Press. Cambridge. 259-275. Simatupang DS. 2008. Berbagai Mikroorganisme  Rhizosfer  pada  Tanaman Pepaya (Carica papaya L.) di Pusat Kajian
Buah-buahan  Tropika  (PKBT)  IPB  Desa Ciomas,  Kecamatan  Pasirkuda,  Kabupaten Bogor,  Jawa  Barat .  [Skripsi].  Institut Pertanian Bogor, Bogor.
Sudantha  IM,  Kesratarta  I,  Sudana.  2011. Uji antagonisme beberapa jenis jamur saprofit terhadap    fusarium    oxysporum    f. Sp .
Cubense  penyebab  penyakit  layu  pada
tanaman  pisang  serta  potensinya  sebagai agens pengurai serasah .   UNRAM,   NTB. Jurnal   Agroteksos  21 (2): 2-3.
Susilowati,  D.N.,  Rosmimik,  R.  Saraswati., R.D.M. Siman un gkalit  dan  L.  Gunar to. 2003. Koleksi,  Karakter  isasi dan Preservasi  Mikroba  Penyubur  Tanah dan  Perombak Bahan Organik .  Prosiding Seminar  Hasil  Penelitian  Rintisan  dan Biotehnologi Tanaman, Bogor.
Widiastuti  H,  Siswanto,  Suharyanto.  2010.
Karakterisasi  dan  Seleksi  Beberapa  Isolat Azotobacter sp. untuk Meningkatkan
Perkecambahan  Benih  dan  Pertumbuhan Tanaman .  Buletin  Plasma  Nutfah  16  (2): 160- 167.