PERBANDINGAN PROFIL TOTAL DNA DURIAN (Durio zibethinus Murr ) VARIETAS MENOREH KUNING HASIL ISOLASI DENGAN METODE DETERGEN DAN KIT KOMERSIAL
Tara Puri Ducha Rahmani 1 *, Budi Setiadi Daryono 2 , Ismail 3
1 Program Studi Biologi, Fakultas Sains dan Teknologi Universitas Islam Negeri Walisongo Semarang Jl. Prof. Dr. Hamka (Kampus III), Semarang, Jawa Tengah, Indonesia. 50185 *E-mail: tara@walisongo.ac.id
2 Program Studi Biologi Fakultas Biologi Universitas Gadjah Mada Jl. Teknika Selatan, Sleman, D.I. Yogyakarta, Indonesia. 55281
3 Program Studi Pendidikan Biologi Fakultas Sains dan Teknologi Universitas Islam Negeri Walisongo Semarang Jl. Prof. Dr. Hamka (Kampus III), Semarang, Jawa Tengah, Indonesia. 50185
Abstrak: Durian ( Durio zibethinus Murr) kultivar Menoreh Kuning adalah salah  satu  plasma  nutfah  Indonesia  yang  berasal  dari  Provinsi  Daerah Istimewa  Yogyakarta.  Pedagang  durian  umumnya  menjual  durian dagangannya dengan mengakuinya sebagai Durian Menoreh. Oleh karena itu, untuk  mengidentifikasi  kultivar  Durian  Menoreh  tersebut  diperlukan  suatu metode  yang  akurat,  yaitu  isolasi  DNA  sebagai  langkah  awal.  Terdapat beberapa metode isolasi DNA yaitu metode yang menggunakan detergen dan kit  komersial.  Penelitian  ini  bertujuan  untuk  membandingkan  profil  total DNA Durian Menoreh Kuning hasil isolasi dengan detergen dan kit komersial ( Nucleon TM Phytopure TM Genomic DNA Extraction Kits ) secara kualitatif dan kuantitatif.  Metode  isolasi  DNA  dilakukan  dengan  detergen  dan  kit komersial. Pelet DNA daun Durian Menoreh Kuning dilarutkan dalam 50 µL TE kemudian masing-masing 5 µL sampel dielektroforesis dalam agarose 1% selama 30 menit. Hasil elektroforesis kemudian di- staining dengan ethidium bromide  lalu  diamati  di  bawah  transluminator-UV.  Hasil  kedua  metode isolasi  dibandingkan  berdasarkan  profil  total  DNA  setelah  dielektroforesis dalam 1% agarose, berat pelet (total DNA), dan hasil Optical Density dari DNA tersebut. Hasil penelitian menunjukkan bahwa DNA Durian Menoreh Kuning  yang  diisolasi  dengan  detergen  dan  kit  komersial  dapat  terlihat  di bawah transluminator-UV. Berat pelet DNA yang diisolasi dengan detergen adalah  0,004  gram  dan  yang  diisolasi  dengan  kit  komersial  adalah  0,0004 gram.  Hasil  OD  untuk  DNA  yang  diisolasi  dengan  detergen  menunjukkan nilai  absorbansi  2,658  AU,  rasio  1,057,  konsentrasi  6645,6  µ  gr/mL  dan protein  93,9  milligram/mL.  Sedangkan  hasil  isolasi  DNA  dengan  kit komersial adalah 2,760 AU untuk absorbansi, rasio 1,339, konsentrasi 6900,6 µ gr/mL, dan protein 54,8 milligram/mL. Berdasarkan hasil penelitian dapat diambil  kesimpulan  bahwa  DNA  Durian  Menoreh  Kuning  dapat  diisolasi dengan  detergen  dan  kit  komersial.  Profil  DNA  yang  diisolasi  dengan  kit komersial  menunjukkan  hasil  yang  lebih  baik  dibandingkan  dengan  profil DNA yang diisolasi dengan detergen.
Kata Kunci: detergen; durian; isolasi DNA; kit komersial; Menoreh Kuning
Abstract: Menoreh  Kuning  Durian  ( Durio  zibethinus Murr)  cultivar  is originated  from  Dusun  Promasan,  Banjaroyo  Village,  Kalibawang Subdistrict, Kulonprogo Regency, Province of Yogyakarta, Indonesia. Durian seller  usually  claimed  their  durian  to  be  Menoreh  Kuning.  Therefore,  an accurate method is needed to identify that cultivar. One of the most accurate methods  is  DNA  isolation  as  the  first  step.  This  research  was  aimed  to compare the total DNA profile of Menoreh Kuning Durian using detergent and commercial kit (Nucleon TM Phytopure TM Genomic DNA Extraction Kits) qualitatively and quantitatively. The method used in this research was DNA isolation  method  using  detergent  and  commercial  kit  (Nucleon TM Phytopure TM Genomic DNA Extraction Kits). DNA source came from leaves Menoreh Kuning Durian. DNA pellet then was dissolved in 50 µL TE, after that  each  of  5  µL  sampel  was  electrophoresized  in  1  %  of  agarose  for  30 minutes.  The  result  of  eletcrophoresis  then  was  stained  with  ethidium bromide and finally was observed under transluminator-UV. The results of both isolation methods were compared based on the total DNA profil after electrophoresis,  total  mass  of  DNA  pellet,  and  the  result  of  DNA  Optical Density. The research result had shown that the DNA of Menoreh Kuning Durian isolated using detergent and commercial kit can be observed under transluminator-UV.  The  mass  of  DNA  pellet  isolated  using  detergent  was 0,004 gram while using kit was 0,0004 gram. The optical density results for DNA isolated using detergent were 2,658 AU of absorbance, ratio of 1,057, concentration of 6645,6 µ gr/mL, and protein of 93,9 milligram/mL. As for the DNA isolated using commercial kit had shown the optical density results of 2,760 AU for absorbance, ratio of 1,339, concentration of 6900,6 µ gr/mL, and  protein  of  54,8  milligram/mL.  Based  on  the  research  result,  can  be concluded that the DNA of Menoreh Kuning Durian can be isolated using detergent and commercial kit. The DNA profile isolated using commercial kit had shown a better result than the DNA profile isolated using detergent.
Keywords: commercial  kit;  detergent;  DNA  isolation;  durian;  Menoreh Kuning

## PENDAHULUAN
urian  ( Durio  zibethinus )  lokal  merupakan  salah  satu  buah  yang  merupakan plasma nutfah Indonesia. Durian merupakan buah tropis, yaitu buah yang banyak tumbuh di daerah dengan iklim tropis. Durian merupakan buah yang unik karena memiliki aroma dan rasa yang khas, sehingga membuatnya menjadi buah yang banyak disukai  orang.  Karena  keunikannya  tersebut,  durian  juga  sering  disebut  sebagai  "Raja Buah" atau " The King of Fruit "(Widyayanti et al., 2021). Persebaran durian di Indonesia dapat ditemukan di Pulau Jawa, Kalimantan, Bali, Maluku, Sulawesi, dan Sumatra, serta sekelilingnya. Jenis durian Durio zibethinus Murray dapat ditemukan dan beradaptasi di Pulau Jawa, Sulawesi, Sumatra dan Maluku. Untuk di Pulau Jawa, daerah yang banyak menghasilkan produksi durian Durio zibethinus Murray adalah Kabupaten Kulon Progo di Provinsi Daerah Istimewa Yogyakarta (Uji, 2005).
D
Salah satu durian lokal Indonesia yaitu  durian menoreh yang berasal dari Dusun Promasan, Desa Banjaroyo, Kabupaten  Kulonprogo, Kecamatan Kalibawang, Provinsi Daerah Istimewa Yogyakarta.  Durian menoreh terbagi menjadi dua jenis, yaitu  durian menoreh  kuning  dan  durian  menoreh  jambon.  Jenis  durian  menoreh  kuning  memiliki warna daging buah yang berwarna kuning seperti mentega, daging buahnya bertekstur seperti  berserat  halus,  rasanya  manis  legit  serta  aromanya  harum  menyengat.  Untuk durian menoreh jambon memiliki ciri yang hampir sama dengan menoreh kuning, namun berbeda di bagian warna daging buah yang berwarna sesuai namanya, yaitu jambon atau merah jambu (Jogja Benih, 2011b, 2011a).
Durian menoreh kuning merupakan kultivar durian yang memiliki potensi untuk dikembangkan  melalui  proses  pembibitan.  Saat  ini  proses  pembibitan  durian  menoreh kuning  dilakukan  dengan  metode  okulasi.  Proses  pembibitan  juga  dapat  mengalami kendala  berupa  hama  yang  dapat  mengganggu  pertumbuhan  tanaman  durian  menoreh kuning,  diantaranya  disebabkan  oleh Tetranychus sp., Valanga sp., llocaridara sp., Xyleborus sp., Coptotermes sp.,  dan Atractomorpha sp.  Selain  hama  tanaman, pertumbuhan  bibit  durian  menoreh  kuning  juga  dapat  terganggu  oleh  infeksi  penyakit tanaman  yang  diantaranya  adalah  layu  oleh Phytophthora sp.,  antraknosa  oleh Colletotrichum sp., hawar daun oleh Rhizoctonia sp., bercak daun oleh Corynespora sp., embun hitam oleh Meliola sp., alga oleh Cephaleuros sp., serta mati pucuk (Triwidodo et al., 2020).
Pedagang durian umumnya menjual durian dagangannya sebagai durian menoreh, sehingga diperlukan suatu metode yang akurat untuk mengidentifikasi kultivar-kultivar durian. Metode yang paling akurat adalah identifikasi DNA. Pertama kali harus dilakukan isolasi  DNA  untuk  mengidentifikasi  suatu  DNA.  Prinsip  umum  metode  isolasi  DNA adalah pelisisan sel, penghilangan protein dan kontaminan, serta pemurnian DNA. Ada beberapa  metode  isolasi  DNA  yaitu  metode  sederhana  dengan  menggunakan  detergen dan  metode  yang  menggunakan  kit  komersial.  Metode  yang  dipilih  tergantung  pada beberapa hal yaitu jumlah dan berat molekular, tingkat kemurnian dan biaya serta waktu yang  diperlukan.  Selain  dengan  metode  konvensional  (menggunakan  detergen),  salah satu  metode  praktis  isolasi  DNA  adalah  menggunakan  suatu  kit  komersial,  yaitu NucleonTM  PhytopureTM  Genomic  DNA  Extraction  Kits yang  diproduksi  oleh Amersham Life Sciences® (Pramono, 2008). Kedua metode tersebut dapat dibandingkan hasilnya,  baik  secara  kualitatif  maupun  kuantitatif,  dan  pada  akhirnya  akan  dapat diaplikasikan untuk mengidentifikasi DNA kultivar-kultivar durian.
Berdasarkan  uraian  latar  belakang  maka  penelitian  ini  bertujuan  untuk membandingkan profil total DNA durian menoreh kuning hasil isolasi dengan detergen dan  kit  komersial  ( Nucleon TM Phytopure TM Genomic  DNA  Extraction  Kits )  secara kualitatif  dan  kuantitatif.  Hasil  analisis  yang  diperoleh  dapat  digunakan  untuk menentukan  metode  isolasi  DNA  yang  paling  akurat  untuk  mengidentifikasi  kultivar durian menorah dan kultivar durian lainnya untuk tujuan pengembangan potensi budidaya tanaman tersebut.

## METODE PENELITIAN
Penelitian dilaksanakan di Fakultas Biologi Universitas Gadjah Mada, Yogyakarta, Indonesia. Bahan tanaman yang digunakan adalah daun durian ( Durio zibethinus ) varietas menoreh kuning. Bahan kimia yang digunakan dalam penelitian ini yaitu, akuades, kertas filter, kertas parafilm, es batu, detergen, NaCl, NaHCO 3 , kloroform dingin, ethanol 70%, buffer TBE 10x, DH 2 O, loading dye, ethidium bromide, agarose, potato dextrose agar
(PDA) dan reagen Phytopure . Alat yang digunakan dalam penelitian ini yaitu seperangkat alat  gelas,  pisau/ scalpel ,  timbangan,  mortar,  dan  penumbuk, tube 1,5  µl, waterbath, sentrifuge , pipet, corong gelas, propipet, spektrofotometer, kuvet, aparatus elektroforesis, transluminator  UV,  cetakan  gel  dan tray ,  mikropipet  beserta  tip, magnetic  stirrer, microwave, Optical Density dan kamera digital.
Hasil  isolasi  total  DNA  dengan  metode  menggunakan  detergen  dan  metode  kit komersial  dibandingkan  secara  kualitatif  dengan  elektroforesis  dan  secara  kuantitatif dengan melihat hasil Optical Density . Bahan yang digunakan dalam elektroforesis berupa gel agarose dan buffer TBE.
Isolasi total DNA dengan metode detergen berdasarkan metode DeBoer et al (2000) (Pramono, 2008). Dua gram daun durian menoreh kuning dihaluskan dan dimasukkan ke dalam flakon. Larutan buffer 4 ml ditambahkan ke dalam jus selanjutnya campuran jus- buffer dimasukkan  ke  dalam  flakon-cup  dan  disentrifus  selama  15  menit  dengan kecepatan 2500 rpm ( rotation per minute ) sampai 3000 rpm dan akan terbentuk lapisan bening (supernatan) dan keruh. Corong gelas dengan kertas filter disiapkan di atas gelas beaker 10  ml  bersih  di  atas  es  batu.  Supernatan  bening  dituang  ke  atas  kertas filter . Isopropanol dingin sebanyak dua kali volume supernatan ditambahkan secara perlahan- lahan dengan pipet melalui dinding gelas beker. Gelas pengaduk dimasukkan ke dalam larutan kemudian diaduk dengan cara memutar ke satu arah secara perlahan. Pada lapisan yang jernih tampak benang-benang halus yang menggulung pada gelas pengaduk, yaitu benang-benang DNA berupa nukleosom. Filtrat jernih yang mengandung DNA diambil dan dimasukkan ke dalam tabung dan disentrifus (7000 rpm) untuk mendapatkan pelet DNA. Pelet DNA dilarutkan dengan TE dan digunakan sebagai sampel total DNA.
Metode Nucleon TM Phytopure TM Genomic DNA Extraction Kits dilakukan dengan cara  daun  tanaman  durian  menoreh  kuning  dipotong  dengan  scalpel/  pisau  steril  dan ditimbang  seberat  0.1-0.5  gram.  Daun  sampel  diletakkan  di  dalam  mortar  dan  diberi nitrogen cair kemudian digerus dengan pestel (apabila tidak ada nitrogen cair, sebaiknya sampel  daun,  mortar,  dan  pestel  diletakkan  di freezer selama  10-15  menit).  Setelah digerus,  sampel  dimasukkan  ke  dalam  tube  1,5  µL  serta  dikocok  dengan  lembut menggunakan tangan. Sampel ditambahkan reagen NucleonTM PhytopureTM Genomic DNA  Extraction  Kits dan  dikocok  dengan  lembut  menggunakan  tangan.  Sampel diinkubasi selama 10 menit di dalam air bersuhu 65 ° C. Setelah itu, sampel diletakkan di dalam es selama 20 menit. Sampel ditambahkan dengan 400-500 µL kloroform dingin yang sebelumnya disimpan dalam lemari es. Resin NucleonTM PhytopureTM Genomic DNA  Extraction  Kits ditambahkan  dengan  hati-hati.  Sampel  disentrifus  (3000  rpm) selama 10 menit. Bagian supernatan dipindah ke dalam tube berukuran 1,5 ml dengan hati-hati dan isopropanol dingin ditambahkan sebanyak volume supernatan dan dikocok perlahan-lahan  dengan  tangan.  Sampel  disentrifus  lagi  (10.000  rpm)  selama  10  menit. Supernatan hasil sentrifugasi dibuang dan diambil peletnya yang berwarna putih. Pelet DNA  dicuci  dengan  menambahkan  100  µL  ethanol  70  %  dan  disentrifus  dengan kecepatan 10.000 rpm selama 5 menit. sisa ethanol dibuang sampai bersih dan pelet DNA dikeringanginkan. Setelah kering dari ethanol, pelet ditambahkan dengan DH 2 O sebanyak 1000 µL. Sampel disimpan dalam lemari pendingin agar dapat digunakan untuk langkah selanjutnya.
Tahap elektroforesis terdiri dari 3 langkah yaitu pembuatan larutan buffer TBE ( Tris Borat EDTA ), pembuatan gel agarose 1 % dan analisis elektroforesis . Pembuatan larutan buffer TBE ( Tris Borat EDTA ) dilakukan dengan cara 54 gram tris dan 27,5 gram asam borat dimasukkan ke dalam gelas beaker 500 ml, ditambah akuades steril hingga kira-
271_ Teknosains: Media Informasi Sains dan Teknologi, Volume 16, Nomor 2, Mei-Agustus 2022, hlm. 267-274
kira 300 ml. Larutan tersebut diaduk dengan magnetic stirrer hingga homogen. setelah itu  dimasukkan  20  ml  0,5  M  EDTA  dan  diaduk  kembali  dengan magnetic  stirrer , kemudian larutan dimasukkan ke dalam labu ukur 500 ml. Penambahan akuades sampai volume 500 ml dan larutan dihomogenkan.
Pembuatan  gel  agarose  1  %  dilakukan  dengan  cara  agarose  seberat  2  gram dilarutkan dalam 200 ml larutan TBE 1x dan didiamkan pada suhu kamar selama 1 menit. Larutan dipanaskan sampai terlarut sempurna. Larutan didiamkan pada suhu kamar agar agarose tidak terlalu panas (± 70 ºC). Larutan agarose dituang pada cetakan dengan sisir yang telah terpasang untuk membuat sumuran pada gel. Larutan didiamkan selama 15 menit agar gel memadat. Larutan TBE 1x ditambahkan pada permukaan gel yang telah padat dan sisir diangkat dengan hati-hati sehingga terbentuk sumuran-sumuran pada gel untuk  tempat  sampel  DNA.  Cetakan  berisi  gel  agarose  diletakkan  pada  tangki  mesin elektroforesis  dalam  keadaan  terendam  larutan  TBE  1x.  Larutan buffer yang  tersedia adalah larutan buffer 10x (pekat). untuk mendapatkan larutan buffer 1x, larutan buffer 10x diambil 100 ml dan dimasukkan ke dalam labu ukur 1000 ml dan ditambahkan akuades sampai volume 1000 ml, kemudian dihomogen.
Analisis elektroforesis dilakukan dengan cara menyiapkan DNA sampel dan marker yang akan digunakan. DNA marker sebanyak 2 µl dimasukkan ke dalam sumuran di tepi paling kiri. DNA sampel yang telah diencerkan dalam DH 2 O 1000 µl diambil masing- masing sebanyak 2 µl, 3 µl, dan 4 µl, kemudian dicampur dengan 1 µl loading dye , lalu dimasukkan  ke  sumuran  ke-2  sampai  dengan  seterusnya.  Setelah  semua  sampel dimasukkan ke dalam sumuran, apparatus elektroforesis ditutup dan dihubungkan dengan sumber listrik. Power supply diatur pada 100 V selama maksimal 30 menit, kemudian alat dinyalakan dengan menekan tombol ON. Setelah selesai digunakan, alat dimatikan. Gel dikeluarkan  beserta  cetakannya  dari  apparatus  elektroforesis.  Gel  diwarnai  dengan ethidium  bromida  selama  2-5  menit,  lalu  dibilas  dengan  akuades.  Gel  diamati  dengan transiluminator  UV.  Pita-pita  DNA  akan  tampak  berpendar.  Hasil  ini  kemudian didokumentasikan dengan kamera digital Canon Powershot A480 3,3 x Optical Zoom . Data yang diperoleh selanjutnya dianalisis dengan membuat perbandingan secara kuantitatif  dan  kualitatif  antara  profil  kedua  hasil  isolasi  DNA.  Faktor-  faktor  yang diperbandingkan meliputi faktor kualitatif (yang dibandingkan adalah hasil elektroforesis kedua  hasil  isolasi  DNA)  serta  faktor  kuantitatif  (faktor-faktor  kuantitatif  yang dibandingkan adalah berat pelet total DNA beserta hasil optical density dari kedua profil DNA yang meliputi absorbansi, rasio, konsentrasi, dan protein.

## HASIL DAN PEMBAHASAN
Prinsip umum metode isolasi DNA adalah pelisisan sel, penghilangan protein dan kontaminan,  serta  pemurnian  DNA.  Ada  beberapa  metode  isolasi  DNA  yaitu  metode sederhana dengan menggunakan detergen dan metode yang menggunakan kit komersial. Pada isolasi dengan menggunakan detergen, dinding sel dilisiskan dengan larutan buffer yang mengandung garam dan detergen. Fungsi garam adalah untuk menciptakan tekanan osmotik lingkungan  luar sel yang hipertonik dibandingkan dengan tekanan osmotik di dalam sel, sehingga sel akan mengalami plasmolisis. Sedangkan penambahan detergen akan  mengemulsikan  membran  sel  yang  berupa  fosfolipid  ke  dalam  larutan  berair, sehingga melisiskan sel secara total. Sampel DNA disentrifus selama 15 menit dengan kecepatan 2500-3000 rpm hingga membentuk dua material. Perlakuan ini berfungsi untuk memisahkan debris sel (pelet) sisa pelisisan sel dengan bagian yang mengandung DNA (supernatan). Supernatan kemudian disaring dengan kertas saring dan ditampung dalam
gelas beker yang diletakkan di dalam es. Setelah itu ditambahkan etanol dalam sampel. Penambahan  etanol  dilakukan  dalam  suasana  dingin  untuk  menghindari  penguapan etanol. Dalam keadaan ini, etanol dan air bersaing untuk mengikat DNA sehingga DNA terpresipitasi diantara keduanya. Benang-benang DNA yang sangat lengket akan melekat di  gelas  pengaduk  saat  dilakukan  pengadukan.  Benang-benang  inilah  yang  kemudian disentrifus untuk mendapatkan pelet total DNA (Pramono, 2008).
Pada  isolasi  dengan Nucleon TM Phytopure TM Genomic  DNA  Extraction  Kits , pelisisan dinding sel dilakukan oleh reagen Phytopure I . Reagen ini befungsi hampir sama dengan buffer pada metode detergen, sedangkan pelisisan membran nukleus dilakukan oleh reagen Phytopure II . Setelah dilakukan inkubasi pada suhu 65 °C dan di dalam es, ditambahkan kloroform dan resin Phytopure lalu disentrifus pada kecepatan 3000 rpm sehingga  terbentuk  tiga  lapisan.  Resin Phytopure memiliki  dua  fungsi  utama  yaitu mengikat secara kovalen polisakarida yang merupakan pengotor dengan gugus – B(OH) 2 bebas pada permukaannya dan membentuk lapisan semisolid yang memisahkan bagian yang mengandung DNA dengan debris sel. Langkah-langkah yang dilakukan selanjutnya berfungsi untuk membersihkan pelet dari pengotor (Pramono, 2008).
Hasil penimbangan massa pelet DNA hasil isolasi dengan detergen dan Nucleon TM Phytopure TM Genomic DNA Extraction Kits dapat dilihat pada Tabel 1.
Tabel 1. Berat pelet total DNA daun Durio zibethinus kultivar menoreh kuning hasil isolasi
Metode Isolasi Berat Pelet DNA Durio zibethinus Nucleon TM Phytopure TM Genomic DNA Extraction Kits 0,0004 gram Metode Detergen 0,004 gram
Pelet  yang  diperoleh  dari  metode  detergen  lebih  banyak  dibanding  dengan  pelet hasil isolasi dengan Nucleon TM Phytopure TM Genomic DNA Extraction Kits . Pelet yang didapat dari metode detergen diduga masih mengandung protein pengotor. Hasil isolasi dengan Nucleon TM Phytopure TM Genomic  DNA  Extraction  Kits dan  dengan  detergen dibandingkan berdasarkan profil total DNA setelah dielektroforesis dalam 1 % agarose dapat diamati pada Gambar 1.
Gambar 1. DNA total hasil isolasi dengan (A) Nucleon TM Phytopure TM Genomic DNA Extraction Kits dan (B) Detergent

## A  B
273_ Teknosains: Media Informasi Sains dan Teknologi, Volume 16, Nomor 2, Mei-Agustus 2022, hlm. 267-274
Hasil elektroforesis menunjukkan adanya smear pada bagian bawah sampel hasil isolasi dengan kedua metode. Smear berasal dari molekul yang memiliki berat jenis dan ukuran  molekul  yang  kecil,  yaitu  RNA.  Adanya  RNA  disebabkan  karena  pada  kedua metode  isolasi  tersebut  tidak  ada  langkah  yang  berfungsi  untuk  menghilangkan  RNA, sehingga  untuk  mendapatkan  hasil  yang  lebih  murni  perlu  ditambahkan  RNAse.  Dari Gambar  5  dapat  dilihat  bahwa  pada  profil  hasil  elektroforesis  metode  detergen  lebih banyak smear yang  menandakan  bahwa  apabila  dibandingkan  dengan  isolasi menggunakan Nucleon TM Phytopure TM Genomic  DNA  Extraction  Kits ,  isolasi  dengan detergen hasilnya kurang murni karena DNA yang ada masih banyak mengandung RNA dan  protein,  karena  itulah  berat  pelet  DNA  hasil  isolasi  dengan  detergen  lebih  tinggi. Hasil isolasi dengan Nucleon TM Phytopure TM Genomic DNA Extraction Kits dan dengan detergen dibandingkan berdasarkan optical density dapat diamati pada Tabel 2.
Tabel 2. Hasil optical density total DNA daun Durio zibethinus kultivar menoreh kuning hasil isolasi Metode Nucleon TM Phytopure TM Genomic DNA Extraction Kits Metode Detergen Absorbansi (AU) 2,760 2,658 Rasio 1,339 1,057 Konsentrasi (µgr/mL) 6900,6 6645,6 Protein (milligram/mL) 54,8 93,9
Berdasarkan Tabel 2 didapatkan bahwa konsentrasi dan rasio dengan kit komersial lebih  baik  dibandingkan  dengan  detergen  karena  nilai  absorbansi,  konsentrasi  dan rasionya  lebih  besar,  sehingga  dapat  disimpulkan  bahwa  hasil  isolasi  DNA  durian menoreh  kuning  menunjukkan  hasil  yang  lebih  baik  apabila  diisolasi  dengan  kit komersial.

## KESIMPULAN
Berdasarkan  penelitian  Perbandingan  profil  total  DNA  Durian  ( Durio  zibethinus Murr) varietas menoreh kuning hasil isolasi dengan metode detergen dan kit komersial, dapat  disimpulkan  bahwa  DNA  durian  menoreh  kuning  dapat  diisolasi  menggunakan detergen  dan  kit  komersial.  Hasil  isolasi  DNA  durian  menoreh  kuning  dengan  kit komersial  menunjukkan  hasil  yang  lebih  baik  dibandingkan  dengan  hasil  isolasi menggunakan  detergen.  Untuk  memastikan  hasil  penelitian  yang  lebih  akurat  dalam memeriksa  originalitas  kultivar,  diperlukan  penelitian  lebih  lanjut  dengan  PCR  untuk mengamplifikasi DNA durian menoreh kuning.

## UCAPAN TERIMA KASIH
Penulis  mengucapkan  terima  kasih  kepada  segenap  staf  Laboratorium  Genetika Fakultas Biologi UGM beserta seluruh pihak yang terlibat dalam penelitian ini.

## DAFTAR PUSTAKA
DeBoer, L. R., Sobieski, R. J., & Crupper, S. S. (2000). Isolation and restriction endonuclease digestion of onion DNA in the Junior College-High School Biology Laboratory. Bioscene: Journal of College Biology Teaching , 26(3), 15–17.
Jogja  Benih. (2011a). Durian Menoreh Jambon - Website Resmi Jogja Benih  D.I. Yogyakarta .https://jogjabenih.jogjaprov.go.id/. Jogja  Benih.  (2011b). Durian  Menoreh  Kuning  -  Website  Resmi  Jogja  Benih  D.I.  Yogyakarta . https://jogjabenih.jogjaprov.go.id/.
Triwidodo, H., Wiyono, S., & Ayuwati, P. B. (2020). Teknik pembibitan dan organisme pengganggu bibit durian  menoreh  kuning  di  Kecamatan  Kalibawang,  Kulon  Progo. Agrovigor:  Jurnal Agroekoteknologi , 13(1), 43–50. https://doi.org/10.21107/agrovigor.v13i1.6061.
Uji, T. (2005). Keanekaragaman jenis dan sumber plasma nutfah Durion ( Durio spp.) di Indonesia. Bulletin Plasma Nutfah , 11, 28-33.
Widyayanti, S., Wirasti, C. A., & Kristamtini. (2021). Morphology characteristic of some local durian from Kulon Progo Daerah  Istimewa Yogyakarta. Journal  of  Physics: Conference Series , 1918(5), 1-6. https://doi.org/10.1088/1742-6596/1918/5/052035.