Tersedia  online  di:  http://ejournal-balitbang.kkp.go.id/index.php/jra
# Korespondensi:  Balai  Riset  Perikanan  Budidaya  Air  Tawar  dan Penyuluhan  Perikanan.
Jl.  Sempur  No.  1,  Bogor  16129,  Indonesia Tel.  +  62  251  8313200 E-mail:  wahyulia.cahyanti@gmail.com

## KERAGAMAN  GENETIK  DAN  BIOREPRODUKSI  EMPAT  POPULASI  IKAN  MATA  MERAH
(Puntius orphoides Valenciennes, 1842)
Wahyulia  Cahyanti # ,  Fera Permata  Putri, Sri  Sundari, dan  Anang Hari  Kristanto
Balai Riset Perikanan Budidaya Air Tawar dan Penyuluhan Perikanan Jl. Sempur  No. 1, Bogor 16129
(Naskah diterima: 1 April 2020; Revisi final: 29 April 2020; Disetujui publikasi: 30 April 2020)

## ABSTRAK
Ikan mata merah merupakan ikan konsumsi yang berkerabat dekat dengan ikan tawes yang terdistribusi luas di kawasan tropis. Analisis keragaman genetik dan performa reproduksi ikan mata merah, baik jantan maupun betina belum tersedia secara lengkap dan valid. Tujuan penelitian ini adalah untuk menentukan keragaman genetik  ikan mata merah  dari berbagai lokasi,  dan mengkaji bioreproduksinya.  Ikan sampel yang diperoleh dari nelayan dan pengumpul di empat lokasi berbeda yaitu: Jawa Barat (Tasikmalaya dan Cianjur), Jawa Tengah (Purwokerto), dan Jawa Timur (Umbulan, Pasuruan), ditampung di Balai Benih Ikan lokal, kemudian ditransportasikan ke Instalasi Plasma Nutfah,  Cijeruk, Bogor. Sampel ikan dari berbagai ukuran digunakan untuk analisis keragaman genetik melalui analisis morfometrik dan RAPD, sedangkan untuk  kajian  bioreproduksi  ikan  yang  digunakan  adalah  calon  dan  induk  ikan  mata  merah  jantan  dan betina. Hasil analisis menunjukkan bahwa keragaman genetik populasi Purwokerto dan Umbulan memiliki perbedaan  dengan  nilai  sharing  component  intraspesies  tertinggi,  yaitu  100,0%.  Polimorfisme  empat populasi  ikan  mata  merah  berkisar  antara  1,92%-17,30%  dengan  kisaran  tingkat  heterozigositas  0,0088- 0,0678. Populasi Purwokerto memiliki jarak genetik terjauh (0,0678) dari populasi lainnya. Pada pengamatan kinerja reproduksi hanya dua populasi yang matang gonad dan bisa dipijahkan, yaitu populasi Tasikmalaya dari 10 ekor matang gonad, tiga ekor berhasil memijah, dan Cianjur dari sembilan ekor matang gonad, tiga ekor berhasil memijah dengan nilai derajat pembuahan kedua populasi sebesar 100% dan derajat penetasan yang  masih  cukup tinggi  Tasikmalaya  84,32 ±  7,38 a %  dan  Cianjur 73,15  ±  3,78 a %.  Volume  sperma  ikan jantan diperoleh sebanyak 0,1 mL; dengan jumlah spermatozoa sebanyak 75 x 10 8 sel.
KATA KUNCI: bioreproduksi; fenotipe, genotipe; ikan mata merah; morfometrik; RAPD
ABSTRACT: Genetic  diversity  and  bioreproduction  in  four  red-eye  fish  populations  (Puntius  orphoides Valenciennes,  1842).  By:  Wahyulia  Cahyanti,  Fera  Permata  Putri,  Sri  Sundari,  and  Anang Hari  Kristanto
Red-eye  fish  is  a  fish  species  closely  related  to  tawes/silver  barb/Java  barb  and  widely  distributed  in  tropical regions.  As  of  now,  information  on  genetic  diversity  and  reproductive  performance  of  red-eye  fish,  both male  and  female,  have  not  yet  been  completed.  Thus,  this  study  was  conducted  to  determine  the  genetic diversity  of  red-eye  fish  populations  from  different  locations  and  study  their  bioreproduction.  Live  fish were  obtained  from  fishermen  and  collectors  in  four  different  areas  namely  West  Java  (Tasikmalaya  and Cianjur),  Central  Java  (Purwokerto),  and  East  Java  (Umbulan,  Pasuruan).  The  collected  fish  were  temporarily stored  in  each  local  fish  seed  center  before  transported  to  the  Germplasm  Installation,  Cijeruk,  Bogor.  Fish samples  of  various  sizes  were  used  for  genetic  diversity  analysis  through  morphometric  analysis  and  RAPD. In  bioreproduction  observation,  the  fish  used  were  prospectively  matured  and  matured  male  and  female of  red-eye  fish.  The  results  of  the  genetic  study  showed  that  the  Purwokerto  and  Umbulan  populations have  genetic  diversity  differences  with  the  highest  intraspecies  sharing  component  value  of  100.0%.  The polymorphism  of  four  red-eye  fish  populations  ranged  from  1.92%-17.30%  with  a  range  of  heterozygosity levels  of  0.0088-0.0678.  Purwokerto  population  has  the  farthest  genetic  distance  (0.0678)  from  the  other
populations.  The  observation  of  reproductive  performance  found  only  two  populations  having  mature gonad  fish  and  could  subsequently  be  artificially  spawned.  The  populations  were  Tasikmalaya  population with  ten  mature  gonad  fish,  of  which  three  fish  successfully  spawned  and  Cianjur  population  with  nine mature gonad fish,  of which three successfully spawned.  The fertilization rate of the  two spawned populations was  100%.  The  hatching  rateof  eggs  from  Tasikmalaya  and  Cianjur  populations  were  relatively  high  of 84.32  ±  7.38 a %  and  73.15  ±  3.78 a %,  respectively.  The  maximum  volume  of  sperm  produced  by  each  male fish  from  both  populations  was  0.1  mL,  with  the  total  number  of  spermatozoa  of  75-10 8 cells.
KEYWORDS: bioreproduction;  genotype;  phenotype;  red-eye  fish;  morphometric;  RAPD

## BAHAN DAN METODE
Penelitian  ini dilakukan  di  Instalasi Riset  Plasma Nutfah Perikanan Air Tawar, Cijeruk. Ikan sampel yang diperoleh dari  pembudidaya setempat  dikumpulkan oleh  petugas  di  Balai  Benih  Ikan  di  Jawa  Barat (Tasikmalaya dan Cianjur), Jawa Tengah (Purwokerto), dan Jawa Timur (Umbulan, Pasuruan). Sampel kemudian ditransportasikan  ke  Instalasi  Riset  Plasma  Nutfah Perikanan Air Tawar, Cijeruk, Bogor. Sampel ikan mata merah dari berbagai ukuran digunakan untuk analisis fenotipe  dan  genotipe  melalui  analisis  truss- morfometrik dan RAPD, sedangkan induk dan calon induk  jantan  dan  betina  digunakan  untuk  kajian bioreproduksi.

## Karakterisasi  Truss-Morfometrik  Ikan  Mata Merah
Pengukuran  truss-morfometrik  mengacu  metode Arifin et al. (2015) yang dimodifikasi dengan Software ImageJ. Setiap populasi ikan mata merah diambil 30 ekor, terdiri atas 15 ekor jantan dan 15 ekor betina. Ikan  dibius  menggunakan  phenoxyethanol  dengan dosis  0,3  mL  L -1 air,  kemudian  diletakkan  pada  alas putih  dan  penggaris  sebagai  standar  ukuran  yang sebenarnya.  Selanjutnya  ikan  difoto  menggunakan kamera digital 108 PENTAX, 16,0 megapiksel. Titik- titik truss-morfometrik ikan ditandai kemudian saling dihubungkan,  serta  diukur  jarak  antara  titik-titik menggunakan Software ImageJ. Metode pengukuran truss-morfometrik mengacu pada Li et al. (1993) yaitu meliputi 21 karakter biometrik. Data yang diperoleh kemudian  diolah  menggunakan  SPSS  untuk mendapatkan koefisien variasi, canonical discriminant, dan  sharing  component.

## Analisis  Random  Amplified  Polymorphism DNA  (RAPD)
Sampel sirip yang digunakan sebanyak 10 ekor ikan untuk masing-masing populasi. Sampel sirip tersebut ditempatkan dalam tabung effendorf yang telah diisi alkohol  90%.  Sebelum  dilakukan  uji  RAPD,  terlebih dahulu dilakukan screening (penapisan) primer melalui amplifikasi  DNA  ikan  mata  merah.  Primer  yang digunakan pada optimasi sebanyak 20 primer, yakni

## PENDAHULUAN
Ikan  mata  merah  Puntius  orphoides  termasuk  ke dalam  Suku  Cyprinidae  (carps)  atau  disebut  juga dengan  Java  barb  dan  terdistribusi  luas  di  kawasan tropis dengan kisaran suhu air 22°C-25°C. Resistansi terhadap penyakit ikan ini termasuk sedang, dengan vulnerability index 38,56 (Boyd, 1982; Brotowidjoyo et al.,  1990).  Sebaran  ikan  P.  orphoides  di  Asia,  yaitu ditemukan di Chao Phraya, Mekong, dan Lembah Mae Khlong,  Semenanjung  Malaya  dan  Indonesia (Hadisusanto  & Suryaningsih,  2011). Menurut  IUCN (2019),  ikan  mata  merah  masuk  dalam  zona  merah spesies  terancam.
Mengingat  potensi  ikan  mata  merah  yang merupakan ikan ekonomis tinggi, dan sampai saat ini budidayanya belum berkembang, maka perlu dilakukan pengelolaan  dengan  baik  dan  berkelanjutan.  Dalam rangka mendukung upaya pengelolaan tersebut, telah dilakukan  beberapa  penelitian  terkait  ikan  mata merah. Suryaningsih et al. (2014) mengkarakterisasi ikan  mata  merah  jantan  dan  betina  menggunakan metode  truss-morfometrik.  Suryaningsih  (2006) meneliti perkembangan gonad ikan mata merah betina yang diperoleh dari hasil tangkapan di alam. Herawati et al. (2014) menyatakan bahwa ikan mata merah betina lebih  cepat  matang  gonad  daripada  jantan.  Hampir semua penelitian tersebut dilakukan pada ikan-ikan tangkapan alam dan hanya  pada satu populasi saja, padahal  Indonesia  memiliki  banyak  sekali  potensi populasi ikan mata merah. Penggunaan metode truss- morfometrik  dan  RAPD  dalam  proses  karakterisasi keragaman  genetik  karena  kedua  metode  tersebut relatif mudah dan murah bila dibandingkan metode lainnya,  namun  tetap  mampu  menggambarkan keragaman genetik yang diinginkan.
Selain itu, data terkait hubungan kekerabatan ikan mata  merah  dan  performa  reproduksi,  baik  jantan maupun betina belum tersedia secara lengkap. Tujuan penelitian ini adalah menganalisis keragaman genetik ikan mata merah dari berbagai lokasi, dan mengkaji bioreproduksinya. Hasil penelitian ini diharapkan dapat sebagai dasar pertimbangan dalam pengelolaan ikan mata merah secara berkelanjutan.
OPA-01—OPA-20. Tiga primer (OPA-08, OPA-10, dan OPA-17)  yang  memperlihatkan  hasil  yang  optimal (bagus) dipilih  untuk digunakan  analisis RAPD  pada semua sampel. Metode RAPD yang digunakan mengacu pada  Nugroho  et  al.  (1997).  Keragaman  genetik dianalisis  dengan  menggunakan  program  tools  for population  genetic  analysis  (TFPGA)  (Nei  &  Tajima, 1981). Hubungan kekerabatan interpopulasi dianalisis berdasarkan  jarak  genetik  dengan  program unweighted  pair  group  method  with  arithmetic  mean (UPGMA).

## Kajian  Bioreproduksi  Ikan  Mata  Merah
Sebanyak 10 ekor calon induk betina dan 10 jantan ikan mata merah dari masing-masing populasi calon induk  dan  induk  ikan  mata  merah  dipelihara  dan diadaptasikan pada waring dengan kepadatan 2 ekor/ m 3 yang diletakkan pada kolam besar, selama kurang lebih dua bulan. Ikan diberi pakan komersil dengan kandungan protein 28%-30% sebesar 3%-5% bobot per hari,  dengan  pemberian  dua  kali  sehari  setiap  pagi dan  sore  hari.  Ikan  dipasang  tagging  chipelectronic dan setiap dua minggu sekali diukur panjang (standar dan total) dan bobot, serta diamati kondisi keberadaan telur pada ikan betina dan sperma pada ikan jantan.
Ikan  betina  yang  matang  gonad  (TKG-III  dan  IV) disuntik menggunakan hormon LHRHa + anti dopamin (merk dagang Ovaprim) dengan dosis 0,5 mL kg -1 bobot ikan, kemudian dipijahkan. Untuk ikan jantan dilakukan pengecekan  volume  sperma  melalui  striping  dan penyedotan  dengan  menggunakan  spuit.  Parameter yang  diamati  adalah  bobot  badan  (g),  jumlah  telur, fekunditas, derajat pembuahan, dan derajat penetasan, sedangkan  untuk  ikan  jantan,  yang  diukur  volume spermanya  (mL)  melalui  striping  dan  penyedotan dengan menggunakan suntikan dan jumlah spematozoa dihitung menggunakan hemositometer. Untuk status reproduksi ikan dianalisis secara deskriptif, sedangkan untuk  fekunditas,  FR,  dan  HR  dianalisis  dengan menggunakan SPSS.

## HASIL DAN BAHASAN

## Truss-Morfometrik  Ikan  Mata  Merah
Uji  banding  koefisien  variasi  interspesifik  21 fenotipe morfometrik yang ditampilkan pada Tabel 1, menunjukkan  adanya  perbedaan  yang  nyata  pada seluruh  karakter.  Beberapa  karakter  pembeda didapatkan pada populasi Umbulan dan yang paling banyak pada populasi Purwokerto.
Keragaman morfometrik dinyatakan dalam bentuk koefisien  keragaman  karakter  (CV).  Koefisien keragaman pada penelitian ini tergolong rendah, yaitu tidak <0,2. Koefisien keragaman populasi Tasikmalaya
0,025-0,100;  Cianjur  0,023-0,114;  Umbulan  0,020- 0,161; dan Purwokerto 0,022-0,165. Rendahnya nilai koefisien keragaman bukanlah hal yang luar biasa untuk jenis-jenis ikan  air tawar  dalam domestikasi  seperti yang teramati sebelumnya pada ikan nilem (Mulyasari, 2010),  yaitu  berkisar  antara  3,38%  hingga  10,35%. Sedangkan  untuk  gabus  nilai  koefisien  keragaman berkisar  antara  0,024-0,329  (Oktaviani,  2013). Rendahnya nilai koefisien keragaman ini kemungkinan disebabkan oleh laju migrasi ikan yang relatif sempit sehingga peluang terjadinya pertukaran gen dengan populasi lain juga relatif kecil (Sugama et al., 1996). Koefisien  keragaman  mengindikasikan  tingkat variabilitas,  dan  tingkat  variabilitas  fenotipe menggambarkan  variabilitas  genotipe  populasi (Gjedrem,  2005).  Perbedaan  fenotipe  biasanya dipengaruhi oleh faktor genetik dan lingkungan, serta interaksi antar keduanya (Li et al., 1993; Tave, 1993). Karakter C4 pada populasi Purwokerto memiliki nilai koefisien  keragaman  tertinggi  yaitu  sebesar  0,165; sedangkan karakter A3 populasi Umbulan memiliki nilai koefisien keragaman terendah yaitu sebesar 0,020.
Berdasarkan analisis diskriminan kanonikal sebaran 21  fenotipe  truss-morfometrik  empat  populasi  ikan mata  merah  (Gambar  1)  memperlihatkan pengelompokan  interspesifik  yang  saling  terpaut antara populasi Tasikmalaya dengan Cianjur (mayoritas di kuadran III), dengan hanya sedikit sekali titik yang terpisah  (kuadran  I  untuk Cianjur  dan  kuadran  II-IV untuk  Tasikmalaya).  Gambaran  pengelompokan interspesifik untuk populasi Umbulan (kuadran II-IV) dan Purwokerto (kuadran I-II) saling terpisah.
Persentase  sharing  component  fenotipe interpopulasi Tasikmalaya dan Cianjur berkisar antara 10%-20%  lebih  besar  dibandingkan  baik  dengan Umbulan maupun Purwokerto, sedangkan sharing com- ponent  intrapopulasi  tertinggi  diperoleh  populasi Umbulan dan Purwokerto (100%) diikuti Tasikmalaya (90%)  dan  terendah  Cianjur  (80%).  Nilai  tersebut disajikan pada Tabel 2.
Hasil  analisis  diskriminan  fenotipe  truss- morfometrik pada ilustrasi kanonikal memperlihatkan bahwa  populasi  Purwokerto  dan  Umbulan  memiliki perbedaan yang paling jauh dengan dua populasi lainnya dengan nilai sharing component intraspesies tertinggi, yaitu 100,0%; sedangkan antara populasi Tasikmalaya dengan  Cianjur  berbagi  komponen  genetik  sebesar 10,0%-90,0% (Tabel 2).  Persentase sharing  component dipengaruhi oleh aliran sumber genetik pembentuknya, semakin  tinggi  persentase  sharing  component intrapopulasi menunjukkan eksklusivitas populasi atau diduga merupakan populasi tertutup (Setijaningsih et al., 2007).
Tabel 1. Koefisien variasi 21 fenotipe morfometrik empat populasi ikan mata merah Table 1. Coefficient of variation of 21 morphometric phenotypes of the four populations of red-eye fish
Tasikmalaya Cianjur Umbulan Purwokerto A1 0.092 0.114 0.074 0.089 .000 A2 0.068 0.078 0.060 0.053 .000 A3 0.037 0.038 0.020 0.029 .000 A4 0.057 0.060 0.045 0.054 .000 A5 0.066 0.046 0.053 0.048 .000 A6 0.045 0.042 0.033 0.034 .000 B1 0.059 0.059 0.065 0.030 .000 B2 0.025 0.023 0.028 0.022 .000 B3 0.095 0.055 0.030 0.049 .000 B4 0.051 0.047 0.083 0.062 .000 B5 0.053 0.036 0.041 0.037 .000 C1 0.100 0.107 0.106 0.079 .000 C2 0.039 0.039 0.054 0.038 .000 C3 0.065 0.051 0.035 0.053 .000 C4 0.079 0.109 0.161 0.165 .000 C5 0.071 0.059 0.046 0.061 .000 D1 0.065 0.068 0.054 0.054 .000 D2 0.049 0.101 0.033 0.053 .000 D3 0.066 0.089 0.068 0.044 .000 D4 0.086 0.101 0.093 0.057 .000 D5 0.079 0.068 0.057 0.054 .000
Karakter morfometrik Morphometric character
Signifikansi
Significancy
Koefisien keragaman Coefficient of variation  (%)
Gambar 1. Analisis diskriminan kanonikal sebaran fenotipe morfometrik empat populasi ikan mata merah. Figure 1. Canonical  discriminant  analysis  of  the  morphometric  distribution  of  the  four red-eye fish populations.
1. Tasikmalaya
2. Cianjur 3. Umbulan 4. Purwokerto Groupe Centroid Populasi (Population): 6 3 0 -3 -6 -6             -3              0              3              6

## Analisis  Random  Amplified  Polymorphism DNA
Hasil  analisis  TFPGA  menunjukkan  polimorfisme empat populasi ikan mata merah berkisar antara 1,92%- 17,30% dengan kisaran tingkat heterozigositas 0,0088- 0,0678 (Tabel 3). Tinggi rendahnya polimorfisme dan heterozigositas berbanding lurus dengan keragaman genetiknya. Populasi ikan dengan keragaman genetik yang  lebih  tinggi  umumnya  lebih  adaptif  terhadap lingkungan (Iskandariyah, 2014). Nilai heterozigositas yang semakin tinggi menunjukkan semakin banyak gen yang berperan dalam kebugaran suatu populasi (Tave, 1993).  Nilai  polimorfisme  pada  penelitian  ini tergolong rendah (< 50%), di mana nilai polimorfisme yang rendah akan menghambat pertukaran gen oleh faktor  lingkungan  atau  ukuran  populasi.  Akibatnya ragam genetik intra populasi akan tereduksi (Kusmini et al., 2011). Uji perbandingan berpasangan Fst empat populasi  ikan  mata  merah  menunjukkan  tingkat polimorfisme  yang  tidak  berbeda  nyata  antara Umbulan  dan  Cianjur,  serta  antara  Tasikmalaya  dan Cianjur (Tabel 4).
Hubungan kekerabatan interpopulasi berdasarkan perhitungan  jarak  genetik  menunjukkan  bahwa populasi Purwokerto yang paling jauh dibandingkan dengan populasi lainnya (Tabel 5). Dendrogram empat populasi ikan mata merah ditunjukkan pada Gambar 2.
Secara umum terdapat korelasi antara hasil analisis RAPD dan analisis truss-morfometrik. Nilai keragaman genetik yang rendah (terendah populasi Tasikmalaya dan  tertinggi  Purwokerto)  pada  hasil  analisis  RAPD juga  didukung  oleh  data  koefisien  keragaman  yang rendah pada  hasil analisis  truss-morfometrik.  Untuk kekerabatan  terjauh  sama-sama  ditempati  populasi Purwokerto,  namun  ada  perbedaan  antara  hasil  uji fenotipe di mana populasi Cianjur lebih dekat dengan populasi Tasikmalaya, sedangkan pada analisis genotipe justru populasi Cianjur lebih dekat dengan Umbulan. Hal tersebut diduga akibat dari perbedaan lingkungan hidupnya di alam sebelum diadaptasikan, khususnya pada  fenotipenya.  Perbedaan  fenotipe  biasanya dipengaruhi  oleh  dua  faktor,  yaitu  genetik  dan lingkungan, serta interaksi antar keduanya (Li et al.,
Tabel 2. Nilai persentase sharing component empat populasi ikan mata merah Table 2. The percentage value of sharing component for the four red-eye fish populations
Populasi Population Tasikmalaya Cianjur Umbulan Purwokerto Jumlah total Total number Tasikmalaya 90.0 10.0 .0 .0 100.0 Cianjur 20.0 80.0 .0 .0 100.0 Umbulan .0 .0 100.0 .0 100.0 Purwokerto .0 .0 .0 100.0 100.0 Populasi (Population ) Cianjur Tasikmalaya Umbulan Purwokerto Heterozigositas Heterozygosity 0.0114 0.0088 0.0265 0.0678 Persentase polimorfisme Percentage polymorphic 3.8464 1.9231 7.6923 17.3077 Tabel 3. Nilai heterozigositas dan persentase polimorfisme DNA ikan mata merah Table 3. Heterozygosity  value  and  percentage  of  DNA  polymorphic  of  the  four  red-eye  fish populations
Tabel 4. Analisis Fst berpasangan empat populasi ikan mata merah Table 4. Paired Fst analysis of the four red-eye fish populations
Populasi (Population ) Cianjur Tasikmalaya Umbulan Purwokerto Cianjur ***** Tasikmalaya 0.5729 ***** Umbulan 0.9919 0.0002 ***** Purwokerto 0.0000 0.0000 0.0000 *****
1993;  Tave,  1993).  Perbedaan  yang  ada  pada  hasil penelitian ini diduga lebih disebabkan oleh genetik, mengingat  kondisi  lingkungan  pemeliharaan  yang relatif sama.
Perbedaan  tersebut  diduga  oleh  adanya kemungkinan bahwa pada ikan mata merah terdapat karakteristik fenotipe yang berbeda antara jantan dan betina, di mana pada  populasi Umbulan belum bisa dipastikan  jenis  kelaminnya.  Hal  tersebut mengakibatkan data truss-morfometrik pada populasi Umbulan  menjadi  tidak  se-heterogen  dibandingkan tiga populasi lainnya. Perbedaan bentuk badan antara ikan  jantan  dan  betina  merupakan  faktor  penting untuk membedakan jenis kelamin dalam satu spesies maupun  antar  spesies  ikan  (Wijayanti  et  al.,  2017). Menurut Turan et al. (2004), teknik truss-morfometrik dapat  mengidentifikasi  kemungkinan  terjadinya perbedaan  morfologi  organisme  yang  mempunyai hubungan  kekerabatan  dekat,  baik  inter-spesies maupun  intra-spesies,  termasuk  perbedaan  antara hewan jantan dan betina.

## Kajian  Bioreproduksi  Ikan  Mata  Merah
Pada kajian bioreproduksi ikan mata merah hanya dua populasi yang berhasil dipijahkan, yaitu populasi Cianjur  (tiga  dari  10  ekor  ikan  matang  gonad)  dan Tasikmalaya (tiga dari sembilan ekor ikan matang go-
nad),  sedangkan  kedua  populasi  lainnya  tidak mengalami perkembangan gonad selama pemeliharaan. Kurang berhasilnya proses pemijahan diduga terkait dengan  nilai  polimorfisme  yang  cukup  rendah, sehingga  proses  reproduksi  yang  kurang  efektif. Menurut Poerba & Martanti (2008), nilai polimorfisme yang  tinggi  yaitu  >50%  menunjukkan  efektivitas individu dalam seleksi dan reproduksi. Keberhasilan pemijahan populasi Cianjur  dan Tasikmalaya diduga kuat karena kondisi induk yang diperoleh cukup baik. Sedangkan Purwokerto mengalami kendala penyakit saat awal diadaptasikan. Untuk populasi Umbulan tidak dapat dipijahkan dikarenakan umur dan ukuran ikan yang masih belum bisa dibedakan antara jantan dan betina.  Hasil  pengamatan  bioreproduksi  ikan  mata merah disajikan pada Tabel 6 dan 7. Pada ikan jantan dilakukan pengecekan volume sperma melalui strip- ing dan penyedotan dengan menggunakan spuit. Hasil pengecekan sperma ikan jantan diperoleh volume rata- rata sperma yang 0,1 mL; dengan jumlah spermato- zoa sebanyak 75 x 10 8 sel.
Ikan  mata  merah  yang  dikumpulkan  dari  empat lokasi  memiliki  ukuran  yang  bervariasi,  di  mana ukuran betina lebih besar dibandingkan jantan. Untuk ikan populasi Umbulan belum dapat dibedakan antara jantan dan betina dikarenakan ukuran ikan yang masih kecil.  Ukuran  ikan  terbesar  adalah  populasi  dari
Tabel 5. Jarak genetik empat populasi ikan mata merah Table 5. Genetic distance of the four red-eye fish populations
Gambar 2. Dendrogram populasi ikan mata merah berdasarkan analisis RAPD. Figure  2. Dendrogram  of  red-eye  fish  populations  based  on  RAPD  analysis.
Populasi (Population )
Cianjur Tasikmalaya Umbulan Purwokerto Cianjur ***** Tasikmalaya 0.3060 ***** Umbulan 0.2393 0.3905 ***** Purwokerto 0.6242 0.6334 0.5737 ***** 0.700 0.525 0.350 0.175 0.000
1 Cianjur 3 Tasikmalaya 2 Umbulan 4 Purwokerto
Tasikmalaya  dan  yang  terkecil  dari  Umbulan.  Hal tersebut  diduga  karena  status  keberadaan  ikan  di perairan  daerah-daerah  tersebut  berbeda.  Semakin sulitnya  mencari  ikan  mata  merah  juga  berdampak pada semakin sedikitnya jumlah ikan, serta semakin kecilnya  ikan  yang  berhasil  ditangkap.  Menurut Sukamsipoetro (2003), di Sungai Klawing Purbalingga, Jawa  Tengah,  P.  orphoides  dikhawatirkan eksistensinya, karena produksinya terus menurun dan ukurannya semakin kecil.
Dari hasil yang diperoleh, ikan ukuran betina yang sedikit  lebih  besar  dibanding jantan.  Hal  ini  sedikit berbeda dengan penelitian Herawati et al. (2014) yang menyatakan bahwa ikan betina mata merah lebih cepat matang gonad daripada jantan. Tingkat kematangan gonad ikan jantan ikan beureum panon jantan awal
Tabel 6. Profil panjang, bobot dan status reproduksi ikan mata merah populasi Tasikmalaya, Cianjur, Umbulan dan Purwokerto
Table  6. Length profile, weight and reproductive status of red-eye fish populations of Tasikmalaya, Cianjur, Umbulan and Purwokerto populations
Tabel 7. Hasil pemijahan ikan mata merah populasi Tasikmalaya, Cianjur, Umbulan, dan Purwokerto Table 7. Results of spawning of the red-eye fish populations of Tasikmalaya, Cianjur, Umbulan, and Purwokerto
matang gonad pada kisaran kelompok panjang antara 14,8-15,8 cm.
Untuk proses pemijahan dua populasi (Tasikmalaya dan  Cianjur)  berhasil  diduga  karena  ukurannya memenuhi syarat matang gonad. Hal tersebut sejalan dengan hasil penelitian Herawati et al. (2014) di mana ikan betina yang diamati sebanyak tiga ekor dengan kisaran panjang 16,0-18,0 cm dan bobot 128-174 g, pada  saat  matang  gonad  mempunyai  bobot  gonad dengan  14,29-24,45  g;  dengan  indeks  kematangan gonad 11,16%-14,05%.
Herawati  et  al.  (2014)  juga  menyatakan  bahwa kisaran fekunditas 15.120-24.574 butir/ekor. Hal ini sedikit  berbeda  bila  dibandingkan  dengan  hasil penelitian  ini.  Jumlah  telur  yang  dihasilkan  pada penelitian  ini  adalah  antara  35.000-90.000  butir.
Telur (Eggs ) Sperma (Sperm ) Jantan (Male ) +++ 16.00 ± 1.414 19.13 ± 1.887 131.48 ± 9.085 Betina (Female  ) +++ 16.59 ± 2.558 19.55 ± 3.530 158.07 ± 73.500 Jantan (Male ) +++ 14.45 ± 1.066 17.35 ± 1.292 83.55 ± 17.230 Betina (Female  ) +++ 16.20 ± 0.919 19.45 ± 1.165 120.91 ± 15.775 Umbulan * - - 5.34 ± 0.329 6.80 ± 0.407 3.70 ± 0.705 Jantan (Male ) - 13.50 ± 0.632 16.98 ± 0.640 50.15 ± 1.877 Betina (Female  ) - 15.17 ± 0.650 19.18 ± 0.801 71.98 ± 7.287 Purwokerto Tasikmalaya Populasi Population Status reproduksi Reproduction status Panjang standar Standard length (cm) Panjang total Total length (cm) Bobot total Total weight (g) Jenis kelamin Sex Cianjur Populasi betina
Female population Bobot total Total weight (g) Jumlah telur (butir) Number of eggs Fekunditas (butir/g bobot induk) Fecundity (egg/g female weight) Derajat pembuahan Fertilization rate  (%) Derajat penetasan Hatching rate  (%)
Tasikmalaya 158.07 ± 73.50 90.562.00 ± 28.335.92 572.92 ± 179.26 a 100.00 ± 0.00 a 84.32 ± 7.38 a Cianjur 120.91 ± 15.775 35.267.67 ± 903.44 245.52 ± 35.26 b 100.00 ± 0.00 a 73.15 ± 3.78 a Umbulan 3.70 ± 0.705 - - - - Purwokerto 71.98 ± 7.287 - - - - Keterangan: (+++) terdapat telur/sperma pada TKG yang sama (III/IV); (*) belum bisa dibedakan jantan betina; (-) TKG (0-I) Note: (+++)  eggs/sperm  at the same  stage of  Gonad maturitylevel (III/IV);  (*) could not  be distinguished  male  or female; (-) stage of  Gonad maturity level (0-I)
Keterangan: Huruf superskrip dibalik nilai standar deviasi yang berbeda di kolom yang sama menunjukkan efek yang berbeda secara signifikan (P<0,05)
Note:
Different  superscript  letters  in  the  same  column  indicate  significant  differences  (P<0.05)
Dengan  fekunditas  yang  berbeda  nyata  pada  dua populasi.  Populasi  Tasikmalaya  mencapai  572,92  ± 179,26  butir/g  bobot  induk;  sedangkan  populasi Cianjur hanya 245,52 ± 35,26 butir/g bobot induk. Nilai  tersebut  memang  sangat  dinamis,  mengingat banyak faktor yang memengaruhi fekunditas. Muchlisin et al. (2011) menyatakan bahwa fekunditas bervariasi antar spesies dan individu, tergantung pada kondisi induk  seperti  ukuran  (panjang,  bobot,  dan  umur), genetik, ketersediaan makanan, dan faktor lingkungan.
Derajat pembuahan dan penetasan yang dihasilkan pada  penelitian  ini  cukup  tinggi  dan  tidak  berbeda nyata.  Hal  ini  menunjukkan  bahwa  berbagai  syarat pemijahan ikan mata merah telah terpenuhi. Meskipun tidak  dilakukan  pengamatan  kualitas  air  secara periodik,  namun  karena  pemijahan  dilakukan  pada media resirkulasi dan telah teruji kualitas airnya maka media  pemeliharaan  dianggap  layak.  Menurut Woynarovich & Horvath  (1980), derajat pembuahan pada ikan sangat ditentukan oleh kualitas telur, sper- matozoa, media, penanganan manusia, dan hormon. Telur ikan biasanya berkembang normal jika kondisi bak  penetasan  meliputi  oksigen,  suhu,  dan  pH terpenuhi. Kondisi telur dan sperma yang telah benar- benar siap juga menjadi penentu tingginya nilai derajat pembuahan. Padahal penggunaan hormon (sGnRHa + antidopamin) mendorong induk untuk ovulasi, di mana hormon GnRH yang disuntikkan seakan-akan adalah informasi  GnRH  alamiah  dari  dalam  tubuh  ikan, sedangkan  antidopamin  akan  menghalau  dopamin untuk  memblokir  GnRH  sehingga  kondisi  GnRH terkontrol (I’tishom, 2008); sedangkan menurut Nur et al. (2017) penggunaan hormon dapat mempercepat pematangan gonad,  serta membantu  ovulasi, tetapi kualitas telur yang dihasilkan kurang baik.

## KESIMPULAN
Keragaman genetik ikan mata merah pada populasi Purwokerto dan Umbulan memiliki perbedaan dengan nilai  sharing  component  intraspesies  tertinggi  yaitu 100,0%. Populasi Purwokerto memiliki jarak genetik terjauh  (0,0678)  sekaligus  memiliki  keragaman genetik  terbesar  berdasarkan  nilai  polimorfismenya (17,3077%). Hanya dua populasi yang matang gonad dan  bisa  dipijahkan  yaitu  populasi  Tasikmalaya  dan Cianjur dengan nilai FR dan HR yang cukup tinggi.

## UCAPAN TERIMA KASIH
Penelitian  ini  terselenggara  atas  pendanaan  dari DIPA  Balai  Riset  Perikanan  Budidaya  Air  Tawar  dan Penyuluhan Perikanan Tahun Anggaran 2019. Terima kasih  penulis  sampaikan  kepada  Kepala  BRPBATPP. Terima  kasih  juga  kepada  Heppy  Aprilistianto,  Yudi Mulyadi, dan Reinaldi; serta semua pihak yang telah
membantu  dalam  pelaksanaan  penelitian  maupun penulisan makalah ini.

## DAFTAR  ACUAN
Arifin,  O.Z.,  Subagja,  J.,  &  Hadie,  W.  (2015).

## Karakterisasi biometrik tiga populasi ikan semah
Tor  douronensis  (Valenciennes,  1842)  dalam mendukung  konservasi  sumber  daya  genetik. Jurnal Iktiologi Indonesia, 15(2), 143-154.
Boyd, C.E. (1982). Water quality in warm water fish pond. Craffmaster Printers Inc. Opelika, Alabama.
Brotowidjoyo, M.D., Tribawono, D., & Mulbyantoro, E.  (1990).  Pengantar  lingkungan  perairan  dan budidaya air. Yogyakarta: Liberty.
Gjedrem, T. (2005). Selection and breeding program in  aquaculture.  Norwegia  (NO):  Akvaforsk, As.Norway.
Hadisusanto,  S.  &  Suryaningsih,  S.  (2011).  Puntius orphoides Valenciennes, 1842: Kajian ekologi dan potensi untuk domestikasi. Journal of Biota, 16(2), 214-220. https://doi.org/10.24002/biota.v16i2.102.
Herawati, T., Yustiati, A., & Andriani, Y. (2014). Relasi panjang berat dan aspek reproduksi ikan beureum panon (Puntius orphoides) hasil domestikasi di Balai Pelestarian Perikanan Umum dan Pengembangan Ikan  Hias  (BPPPU)  Cianjur  Jawa  Barat.  Prosiding Seminar Nasional Ikan Ke-8, hlm. 393-400.
Iskandariyah.  (2014).  Keragaman  genetik  populasi sepat  siam  dari  Pulau  Sumatera,  Jawa,  dan Kalimantan  untuk  program  pemuliaan  ikan budidaya. Institut Pertanian Bogor (IPB), Bogor.
IUCN. (2019). Daftar merah  spesies terancam IUCN. Versi 2019-2. Diunduh pada 23 Juli 2019.
I’tishom, R. (2008). Pengaruh sGnRHa + Domperidon dengan dosis pemberian yang berbeda terhadap ovulasi ikan mas (Cyprinus carpio l.) strain punten. Berkala Ilmiah Perikanan, 3(1), 9-16.
Kusmini,  I.I.,  Gustiano,  R.,  &  Mulyasari.  (2011). Karakterisasi  genetik  ikan  kelabau  (Osteochilus kelabau) dari berbagai lokasi di Kalimantan Barat menggunakan analisis RAPD. Berita Biologi, 10(4), 449-454.
Li.  S.,  Cai,  W.,  &  Zhou,  B.  (1993).  Variation  in  mor- phology and biochemical genetic markers among populations of blunt snout bream (Megalobrama amblycephala).  Aquaculture,  111(1-4),  117-127. https://doi.org/10.1016/0044-8486(93)90030-3.
Muchlisin, Z.A., Musman, M., Fadli, N., & Siti-Azizah, M.N.  (2011). Fecundity  and spawning  frequency of Rasbora  tawarensis  (Pisces:  Cyprinidae)  an  en- demic species from Lake Laut Tawar, Aceh, Indo-
nesia.  AACL  Bioflux,  4(3),  273-279.  http:// www.bioflux.com.ro/aacl.
Mulyasari.  (2010).  Karakteristik  fenotipe morfomeristik  dan  keragaman  genotipe  RAPD (Random Amplified Polymorphism DNA) ikan nilem (Osteochilus hasselti). Institut Pertanian Bogor (IPB). Bogor.
Nugroho, E., Takagi, M., & Taniguchi, N. (1997). Prac- tical manual on detection of DNA polymorphism in fish population study. Bulletin of Marine Sciences and Fisheries Kochi University, 17: 109-129.
Nei,  M. &  Tajima,  F.  (1981). DNA  polymorphism  de- tectable  by  restriction  endonucleases.  Genetics, p. 145-163.
Nur,  B.,  Permana,  A.,  Priyadi,  A.,  Mustofa,  S.Z.,  & Murniasih, S. (2017). Induksi ovulasi dan pemijahan ikan  agamysis  (Agamyxis  albomaculatus) menggunakan hormon yang berbeda. Jurnal Riset Akuakultur,  12(2),  169-177.  https://doi.org/ 10.15578/jra.12.2.2017.
Oktaviani,  T.  (2013).  Analisis  ragam  genotipe  RAPD dan fenotipe truss morfometrik tiga populasi ikan gabus  Channa  Striata  (Bloch,  1793).  Institut Pertanian Bogor (IPB). Bogor.
Poerba, Y.S. & Martanti, D. (2008) Keragaman genetik berdasarkan marka random amplified polymorphic DNA pada Amorphophallus muelleri Blume di Jawa. Biodiversitas, 9(4), 245-249.
Setijaningsih, L., Arifin, O. Z., & Gustiano, R. (2007).
Karakterisasi tiga strain ikan gurame (Osphronemus gouramy  Lac.)  Berdasarkan  metode  truss morfometriks.  Jurnal  Iktiologi  Indonesia,  7(1), 23-30.
Sugama, K., Haryanti, & Cholik, F. (1996). Biochemi- cal  genetics  of  tiger  shrimp  Penaeus  monodon: Description of electrophoretic detectable loci. In- ternational Forestry Review Journal, 2(1), 19-28.
Sukamsipoetro,  S.  (2003).  Ekologi  ikan  baceman (Mystus  nemurus  CV)  di  Sungai  Klawing, Purbalinggga, dan beberapa faktor yang berkaitan dengan  domestikasinya.  Universitas  Jenderal Soedirman,  Purwokerto.
Suryaningsih, S. (2006). Hubungan kekerabatan genetik spesies ikan di Sungai Klawing, Purbalingga, Jawa Tengah.  Universitas  Jenderal  Soedirman, Purwokerto. 58 hlm.
Suryaningsih, S., Sagi, M., Nitimulyo, K.H., & Suwarno, H. (2014). Sexing pada ikan brek Puntius orphoides (Valenciennes, 1863) menggunakan metode truss morfometrics. Biosfera, 31, 8-16.
Tave, D. (1993). Genetic for fish hatchery managers. Netherlands (NL): Kluwer Academic Publisher.
Turan, C., Denis, E., Turan, F., & Erguden, M. (2004). Genetic  and  morfometric  structure  of  Liza  abu (Heckel,  1843).  Population  from  the  Rivers Orontes. Eupharates and Tigris. Turkish Journal of Veterinary and Animal Sciences, 28(1), 729-734.
Wijayanti,  T.,  Suryaningsih,  S.,  &  Sukmaningrum,  S. (2017). Analisis karakter truss morfometrik pada ikan  kemprit  (Ilisha  megaloptera)  familia pristigasteridae.  Scripta  Biologica,  4(2),  109-112. https://doi.org/10.20884/1.sb.2017.4.2.400.
Woynarovich,  E.  &  Horvart,  L.  (1980).  The  artificial propagation of warm-water finfishes a manual for extention. FAO Fish. Tech. Pap., 201 pp.