Identifikasi Caesio cuning berdasarkan Karakterisasi Morfometrik dan DNA Barcoding yang didaratkan di Pasar Ikan Muara Baru, Jakarta

## Muhammad Fahmi Zuhdi* dan Hawis Madduppa
Departemen Ilmu dan Teknologi Kelautan, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, IPB University Jl. Raya Dramaga, Kampus IPB Dramaga Bogor, Jawa Barat 16680 Email: fahmizuhdi@apps.ipb.ac.id

## Abstract

## Identification of  Caesio cuning using Morphometric characteristic and DNA barcoding Analysis
(COI Gene) Landed in Muara Baru Market, Jakarta
Yellow-tailed fish (Caesio cuning) have morphologically similarities with Lutjanidae families, it causes  ambiguity  on  species  authentication  process.  The  process  of  species  identification  using morphological  characteristic  does  not  provide  a  precise  information  related  to  the  species.This study was aimed to identify the morphometric and molecular of Yellow-tailed fish (Caesio cuning) which landed on Muara Baru Fish Market, Jakarta using COI gene. A total 30 fishes were observed their  nineteen  morphometric  characters,  and  1  fish  sample  was  taken  from  the  fins  for  DNA extraction,  amplification  using  PCR  method,  electrphoresis  visualization,  and  sequensing.  Sample was  analyzed  by  MEGA  6  software.  Based  on  morphological  analysis  showed  that  sampel  are Yellow-tailed fish which part of Caesio genus and Caesionidae family. While, genetic analysis using COI  gene  showed  has  similarities  with  database  of  Genbank  NCBI.  It  can  be  concluded  that identification  using  morphological  character  and  DNA  barcoding  methode  showed  the  species belong to Yellow-tailed fish (Caesio cunning).
Keywords : Morphometric; DNA Barcodin; Caesio cuning

## Abstrak
Ikan  Ekor  Kuning (Caesio  cuning )  memiliki  kemiripan  morfologi  dengan  anggota  famili Lutjanidae  lainnya,  hal  tersebut  menyebabkan  kesulitan  dalam  proses  autentikasinya.    Proses identifikasi  pada  suatu  spesies  menggunakan  karakteristik  morfologinya  belum  mampu memberikan  informasi  yang  akurat  terkait  spesies  tersebut.  Penelitian  ini  bertujuan  untuk mengidentifikasi  ikan  ekor  kuning  ( Caesio  cuning )  yang  didaratkan  di  Pasar  Muara  Baru,  Jakarta melalui kajian karakteristikmorfometrik dan DNA barcoding menggunakan marka gen COI. Total 30 ikan diamati karakter morfometriknya, dan 1 sampel ikan diambil bagian siripnya untuk dilakukan ekstraksi  DNA,  amplifikasi  PCR,  elektroforesis,  sekuensing  dan  dianalisis  menggunakan  aplikasi MEGA 6. Hasil analisis morfologi menunjukkan sampel ikan berasal dari genus Caesio dan termasuk famili  Caesionidae.  Sedangkan  berdasarkan  analisis  secara  molekuler  menggunakan  marka  gen COI,  didapatkan  hasil  bahwa  spesies  yang  diamati  (Caesio  cuning)  memiliki  kemiripan  dengan database  GenBank  NCBI.  Dapat  simpulkan  bahwa  identifikasi  secara  morfologi  dan  DNA menunjukkan bahwa spesies yang di peroleh yaitu Ikan ekor kuning ( Caesio cuning ).
Kata Kunci : Morfometrik; DNA barcoding ; Caesio cuning

## PENDAHULUAN
Ikan  demersal  merupakan  salah  satu sumber  daya  ikan  yang  menjadi  primadona
untuk  ditangkap  dan  dijadikan  sebagai bahan konsumsi. Ditjen Perikanan (1998) lebih lanjut  mengungkapkan  bahwa  perairan karang di Indonesia memiliki paling sedikit 10
famili utama
penyumbang
produksi perikanan  yaitu  Holocentridae,  Serranidae,
Siganidae, Scaridae, Lethirindae, Priachantidae, Labridae,
Lutjanidae,
Haemulidae  dan  Caesionidae.  Di  antara beberapa famili tersebut, Caesionidae seperti ikan  ekor  kuning  merupakan  kelompok  ikan yang  dapat  dieksploitasi  secara  komersil. Data  BPS  (2008)  melaporkan  kenaikan produksi  ikan  ekor  kuning  mengalami peningkatan 262 ton dari tahun 2003 sampai tahun
2007.
Hal tersebut tentu mengakibatkan  turunnya  populasi  ikan  dan mengancam  kelestarian  sumber  daya  ikan tersebut.
Famili Caesinoidae merupakan anggota dari ordo Perciformes yang hidup di perairan  laut  dan  hanya  ditemukan  di perairan  tropis  Indo-Pasifik  (Carpenter,  2001). Jenis  ikan  dari  famili  Caesionidae,  salah satunya  ikan  ekor  kuning  yang  memiliki karakteristik  khusus  berupa  warna  yang mencolok, sebagian besar memiliki garis-garis berwarna  kuning.  Selain  itu,  ikan  ekor  kuning sering  membentuk  gerombol  (Carpenter, 1998). Menurut Jhonson (1980) ikan dari famili Caesionidae memiliki hubungan yang sangat dekat  ( sister  group )  dengan  ikan-ikan  dari famili Lutjanidae. Karena kemiripan morfologinya  yang  sangat  mirip    tersebut, membuat  masyarakat  sulit  membedakan antara kedua ikan tersebut.
Karakteristik  morfologi  ikan  ekor  kuning yang hampir sama tersebut dapat menimbulkan kekeliruan dalam proses identifikasi spesies. Proses tersebut memerlukan  akurasi  yang  tinggi  untuk menghindari  kesalahan  dalam  autentikasi spesies  ikan.  Oleh  karena  itu,  metode DNA Barcoding digunakan karena mampu membantu  proses  identifikasi  spesies  secara cepat  dan  tepat.  Salah  satu  metode  yang dikembangkan  oleh  Herbert et  al .  (2003) untuk validasi spesies adalah marka gen COI, yang  terletak  pada  segmen  mitokondria sehingga  mampu  menelusuri  variasi  basa nukleotida  pada  setiap  spesies.  Tujuan penelitian ini adalah mengidentifikasi karakter morfometrik  dan  DNA  ikan  ekor  kuning ( Caesio  cuning )  menggunakan  marka  gen COI.

## MATERI DAN METODE
Pengambilan  sampel  ikan  dilakukan  di Pasar  Ikan  Modern  Muara  Baru,  Jakarta. Analisis  morfometrik  ikan  dilakukan  di  Pasar Ikan  Modern  Muara  Baru,  Jakarta.  Analisis molekuler  ikan  dilakukan  di  Laboratorium Biodiversitas  dan  Biosistematika  Kelautan Fakultas  Perikanan  dan  Ilmu  Kelautan  Institut Pertanian Bogor.
Pengambilan  sampel  ikan  dilakukan dengan  mengambil  langsung  di  Pasar  Ikan Modern  Muara  Baru.  Setiap  sampel  ikan  di ambil    foto  morfologinya  menggunakan kamera, kemudian diukur karakter morfometriknya.  Satu  sampel  ikan  di  ambil jaringan  bagian  sirip  ekor  dan  diawetkan menggunakan  etanol  96%.  Sampel  ikan kemudian  di  simpan  di  Laboratorium dibawah  suhu  -20 O C  untuk  dilakukan pengamatan DNA ikan.
Analisis  morfologi  ikan  ekor  kuning dilakukan  dengan  cara  identifikasi  secara visual  yaitu  mengamati  ciri-ciri  morfologi berupa  bentuk  tubuh,  warna  dan  ukuran tubuh  ikan.  Identifikasi  spesies  ikan  mengacu pada  buku  identifikasi  (Carpenter,  1998), (White et al . 2013).
Total  30  sampel  ikan  diamati  karakter morfometriknya  berdasarkan  metode  dari Fitriadi et  al., (2012).  Adapun  karakter morfometrik  yang  diamati  antara  lain: panjang  total  (TL),  panjang  standard  (PS), panjang kepala (PK), tinggi badan (TB), tinggi pangkal  ekor  (TPE),  diameter  mata  (DM), jarak  antar  mata  (JAM),  lebar  badan  (LB), panjang sebelum sirip dorsal (PSSD), panjang sebelum sirip ventral (PSSV), panjang sebelum sirip  anal  (PSSA),  panjang  dasar  sirip  dorsal (PDSD),  panjang  dasar  sirip  ventral  (PDSV), panjang  dasar  sirip  anal  (PDSA),  panjang dasar sirip pectoral (PDSP), panjang sirip ekor atas  (PSEA),  panjang  sirip  ekor  tengah  (PSET) dan  panjang  sirip  ekor  bawah  (PSEB) (Gambar 1).
Ekstraksi DNA bertujuan untuk menghancurkan  sel  dan  memisahkan  DNA pada  sampel.  Pada  penelitian  ini  25  mg jaringan  diambil  untuk  diekstraksi  DNA-nya menggunakan  gSYNCTM  DNA  Extraction  Kit. Lokus gen yang digunakan yaitu
mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I (COI). Amplifikasi DNA menggunakan metode Polymerize  Chain  Reaction (PCR) merupakan  reaksi  memperbanyak  (replikasi) DNA secara enzimatik. Primer yang digunakan  untuk  amplifikasi  ikan  yaitu  FishF1 (5’ -TCAACCAACCACAAAGACATTGGCAC- 3’);  FishR1  (5’ -TAGACTTCTGGGTGGCCAA AGAATCA- 3’)  (Ward et  al .  2005). Komponen dalam PCR Mix adalah 12,5 µl My taq, 1,25 µl Primer, 9 µl ddH20, 1 µl DNA Template. Proses amplifikasi
DNA
menggunakan DIAB Mastercycler  DNA  Engine  Thermal  Cycler. Proses  awal  amplifikasi  DNA  yaitu  Tahap denaturasi  pada  suhu  94 ˚ C  selama  30  detik, penempelan  primer  (annealing)  pada  suhu 50 ˚ C  selama  1  menit,  pemanjangan  segmen DNA  (extension)  pada  suhu  72 ˚ C  selama  1 menit, dan tahap akhir ( final extension ) pada suhu 72 ˚ C selama 7 menit dengan 38 siklus.
Elektroforesis adalah pemurnian molekul dengan  cara  pemisahan  senyawa  kimia berdasarkan  laju  pergerakan  molekul  dalam aliran listrik yang bertujuan untuk mengetahui kualitas  DNA  dari  hasil  PCR  (Madduppa, 2014).  Proses  elektroforesis  dimulai  dengan membuat gel  agarose 1%  menggunakan pewarna  GelRedTM  (Biotium®)  sebagai media  elektroforesis.  Hasil  PCR  dipreparasi dalam  sumur agarose, kemudian  dilakukan elektroforesis  menggunakan  tegangan  120 volt selama 20 menit. Hasil PCR dapat dilihat di Geldoc dengan  menggunakan  sinar  UV transluminator.
Produk  PCR  kemudian  dikirim  ke FirstBase  Singapura  untuk  dianalisis  secara langsung.  Hasil  sekuensing  DNA  yang diperoleh, kemudian dianalisis menggunakan aplikasi MEGA 6.0 (Tamura et al . 2011) urutan sekuen yang dihasilkan kemudian diidentifikasi  dengan  menyelaraskan  dengan data  yang  tersedia  di  Gene  Bank  di  NCBI menggunakan BLAST dan kemudian membandingkan dengan urutan referensi.

## HASIL DAN PEMBAHASAN
Bentuk  morfologi  Ikan  Ekor  Kuning  ( C . cuning )  yang  di  daratkan  di  Pasar  Muara Baru,  Jakarta  Utara  dapat  dilihat  pada Gambar  2.  Berdasarkan  hasil  pengamatan karakter  morfologi,  Ikan  ekor  kuning  memiliki tubuh  yang  besar  dan  agak  memanjang. Peristiwady  (2006)  menyatakan  bahwa  ikan ekor  kuning  ( Caesio  cuning )  memiliki  tubuh yang  tinggi,  agak  panjang  dan  pipih.  Mulut kecil  dan  terdapat  sedikit  gigi  pada  rahang, pada  bagian  depan  rahang  memiliki  gigi berbentuk  taring.  Tubuh  bagian  atas berwarna  biru  agak  kehitaman  sedangkan pada bagian bawah rahang berwarna putih kebiruan.  Sirip  dada  dan  perut  berwarna kemerahan.  Ikan  ekor  kuning  ( C . cuning ) memiliki rahang atas tunggal, biasanya 11 jari lunak  pada  sirip  dubur,  45-51  sisik  gurat  sisi, tubuh  lebar,  biru  keabu-abuan  dengan  sirip ekor  dan  punggung  bagian  atas  berwarna kuning, sisi bagian bawah dan kepala merah mudah  dengan  tanda  kuning  (White, et  al .
Gambar 1 . Parameter Morfometrik Ikan Ekor Kuning ( Caesio cuning ) (Fitriadi et., 2012).
2013).  Ikan  ekor  kuning  banyak  terdapat pada  area  terumbu  karang  yang  dicirikan dengan  keadaan  bawah  air  dengan visibilitas  yang  rendah. Caesio  cuning merupakan  spesies  yang  paling  toleran terhadap  air  keruh  dan  biasanya  ditemukan
di  daerah  karang.  spesies  ini  tersebar  luas  di daerah terumbu karang hingga ke dalam 60 m (Carpenter, 1998).Hasil analisis pengukuran dan  perhitungan  karakter  morfometrik  ikan ekor  kuning  ( Caesio  cuning )  dapat  dilihat pada Tabel 1.
Gambar 2 . Morfologi Ikan Ekor Kuning ( Caesio cuning )
Tabel 1 . Hasil analisis karakter morfometrik
Kode Pengukuran Min-Max (cm) Mean±SD PT Panjang Total 9,0 -15,5 13,3±1,23 PS Panjang Standar 8,5 – 11,6 9,76±0,69 PK Panjang Kepala 2,5 – 3,3 2,95±0,21 TK Tinggi Kepala 1,9 – 3.5 2,87±0,43 TB Tinggi Badan 3,2 – 5,5 3,96±0,62 TPE Tinggi Pangkal Ekor 0,8 – 1,8 1,09±0,18 DM Diameter Mata 0,6 – 1,0 0,82±0,11 JAM Jarak Antar Mata 1,0 – 1,8 1,23±0,16 LB Lebar Badan 1,2 – 1,9 1,45±0,17 PSSD Panjang Sebelum Sirip Dorsal 2,5 – 4,0 3,34±0,42 PSSV Panjang Sebelum Sirip Ventral 2 – 3,8 3,13±0,42 PSSA Panjang Sebelum Sirip Anal 2,5 – 7,9 6,28±0,42 PDSD Panjang Dasar Sirip Dorsal 4,7 – 6,3 5,62±0,42 PDSA Panjang Dasar Sirip Anal 1,5 – 2,9 2,31±0,34 PDSV Panjang Dasar Sirip Ventral 1,4 – 2,8 2,02±0,31 PDSP Panjang Dasar Sirip Pectoral 2,1 – 3,5 2,94±0,31 PSEA Panjang Sirip Ekor Atas 2,8 – 3,8 3,22±0,22 PSET Panjang Sirip Ekor Tengah 0,5 – 1,9 1,39±0,40 PSEB Panjang Sirip Ekor Bawah 2,9 – 3,8 3,27±0,25
Berdasarkan  hasil  pengukuran  panjang total  (PT)  sampel  ikan  ekor  kuning  yang didaratkan  di  Pasar  Muara  Baru,  Jakarta Utara  memiliki  kisaran  panjang  antara  9-15,5 cm  dengan  rata-rata  13,3±1,23.  Sebelumnya Padate et  al. (2010)  menemukan  ukuran panjang  total  ikan  ekor  kuning  di  Perairan India  dengan  kisaran  7,49-10,05  cm.  Dilokasi lain  Gustomi et  al. (2019)  menemukan panjang total ikan ekor kuning dalam kisaran 12-18,3 cm dengan rata-rata 14,94 cm. Selain itu,  Zamani et  al. (2011)  melaporkan  kisaran panjang ikan ekor kuning di Kepulauan Seribu yaitu  11,30-33,10  cm. Sebelumnya  Indarsyah et al. (2010) melaporkan kisaran panjang ikan ekor  kuning  di  Kepulauan  Seribu  yaitu  7,0-28 cm  menggunakan  alat  tangkap  jaring muroami.  Perbedaan  ukuran  ikan  yang ditemukan di setiap lokasi diduga disebabkan  karena  perbedaan  karakteristik pada lokasi pengambilan sampel.
Menurut  Fijaya  (2002)  salah  satu  faktor yang  menyebabkan  pertumbuhan  yaitu habitat  yang  ditempati  oleh  ikan  itu  sendiri. Jumlah  individu  yang  ada  di  ekosistem  ikan sangat memberi pengaruh terhadap pertumbuhan,  karena  adanya  kompetensi dalam  mendapatkan  makanan.  Selain  itu, ada  beberapa  faktor  lain  yang  dapat mempengaruhi  pertumbuhan  ikan  antara lain keturunan, jenis kelamin dan faktor umur dari ikan itu sendiri. Hasil sekuensing DNA ikan Ekor  Kuning  ( Caesio  cuning )  menggunakan MEGA  6.0  (Tamura et  al .  2011)  menunjukkan bahwa terdapat 682 bp (Gambar 3).
Hasil  BLAST  menunjukkan  komposisi pasangan  basa  masing-masing,  T  sebesar 27.4%, C sebesar 28.3%, A sebesar 25.7%, dan G  sebesar  18.6%.  Persentase  kemiripan species  dengan  data GenBank sebesar 99.10% (Tabel 2).
Berdasarkan  gambar  3  jumlah  urutan basa  nukleotida  pada  hasil  sekuensing  yaitu 682  pasangan  basa.  Hal  ini  dikarenakan primer yang digunakan pada target memiliki panjang  basa  600  bp.  Peneliti  sebelumnya juga  mendapatkan  urutan  pasangan  basa pada ikan yaitu 650 bp untuk marka gen COI yang secara luas digunakan untuk identifikasi spesies,  khususnya  pada  spesies  kriptik  dan identifikasi  karakteristik  morfologi  yang  masih membingungkan (Hubert et al. 2008; Aquilino et  al .  2011;  Sangciangco et  al .  2011). Perbedaan panjang pasangan basa disebabkan  oleh  pemakaian  jumlah  sampel yang  berbeda,  namun  hasil  analisis  sekuens pada  sampel  menunjukkan  perubahan (Madduppa et al ., 2016).
Berdasarkan  hasil  BLAST  pada  tabel  2 menunjukkan  bahwa  tingkat  kemiripan C . cuning dengan  database Gen  Bank NCBI sebesar  99.10%.  Nilai max similaritas  sebesar 99-100%  menunjukkan  penjajaran  yang signifikan  bahwa  ikan  ekor  kuning  yang didapatkan  di  Pasar  Muara  Baru  adalah genus  dan  spesies  yang  sama  (Tindi et  al. 2017).  Selain  itu, max  score dan total  score memiliki  nilai  yang  sama  yaitu  1199, query cover 97 dan E-Value 0.0. Menurut Triandiza

## Tabel 2 . Hasil BLAST GenBank NCBI
Deskripsi Max Score Total Score Query Cover Kemiripan Akses NCBI Caesio cuning cytochrome oxidase subunit 1 (COI) gene, partiall cds; mitochondrial 1199 1199 97 99,10 KF809392,1 Caesio cuning voucher UG0044 cytochrome oxidase subunit 1 (COI) gene, partial cds; mitochondrial 1184 1184 95 99,54 KP194254,1 Caesio cuning voucher BW-A8720 cytochrome oxidase subunit 1 (COI) gene, partial cds; mitochondrial 1173 1173 95 99,23 HQ565446,1
dan  Maddupa  (2018)  bahwa  sekuen  Bank gen  yang  paling  mirip  dicirikan  dengan Max score dan Total score sama, Query coverage mendekati  100%, E-value mendekati  0,  dan Ident mendekati 100% pada setiap database.  Hal  ini  menunjukkan  bahwa spesies  yang  teridentifikasi  berdasarkan marka gen COI merupakan ikan ekor kuning ( Caesio  cuning )  dan  termasuk  dalam  famili caesionidae.
Kemiripan  hasil  DNA  yang  diperoleh dengan database
Gen Bank NCBI
menunjukkan bahwa DNA barcoding merupakan  salah  satu  alat  alternatif  yang dapat  digunakan  dalam  proses  identifikasi suatu  spesies.  Beberapa  negara lain melaporkan teknik DNA telah sukses digunakan  dalam  autentikasi  suatu  spesies, seperti  proses  identifikasi  115  ikan  di  Perairan India  (Lakra et  al .,  2011),  121  spesies  di Perairan  Chnia  (Zhang et  al .,  2011)  dan  207 spesies ikan di Austaralia (Ward, et al., 2007). Oleh  karena  itu,  DNA  barcoding  memiliki peran yang penting dalam proses identifikasi spesies dengan akurat.

## KESIMPULAN
Berdasarkan  hasil  morfologi  ikan  ekor kuning  memiliki  ciri  khas  dengan  warna kuning  di  ekornya,  analisis  morfometrik menunjukkan  ikan  yang  ditangkap  masih berada  pada  fase  juvenil.  Analisis  DNA  ikan ekor  kuning  memiliki  persentase  kemiripan
sebesar  99.10%  dengan  database GenBank NCBI.  Metode  DNA  barcoding  merupakan salah  satu  alternatif  yang  sangat  efektif dalam melakukan identifikasi suatu spesies.

## DAFTAR PUSTAKA
Aquilino,  S.V.,  Tango,  J.M.,  Fontanilla,  I.K., Pagulayan, R.C., Basiao, Z.U., Ong, P.S. & Quilang, J.P. 2011. DNA barcoding of the ichthyofauna  of  Taal  Lake,  Philippines. Mol.  Ecol.  Res. 11:  612-619.  doi: 10.1111/j.1755-0998.2011.03000.x .
[BPS]  Badan  Pusat  Statistik.  2008. Kepulauan Seribu  dalam  Angka  2007 .  Jakarta: Badan Pusat Statistik. 167 hlm.
Carpenter,  K.C.  1998.  Fusilier  fishes  of  the world.  An  annotated  and  illustrated catalogue of caesionid species known to date .  FAO  Fisheries  Synopsis (125)  Vol.  8: 75 p.
Carpenter,  K.E.  2001.  Caesionidae  (Fussiler). The  Living  Marine  Resources  of  the Western  Central  Pacific.  Volume  5.  Bony Fishes Part 3 (Menidae to
Pomacentridae).  Food  and  Agriculture Organization of theUnited Nations, Rome. [DEPTAN]  Departemen  Pertanian.  1998.
Perikanan  Musim  Penangkapan  Ikan . Buletin  Warta  Mina  No.  65,  66,  68,  71,  72 dan 73. Jakarta: Dirjen Perikanan.
Fijaya,  Y.  2002.  Fisiologi  Ikan.  Direktorat Jenderal  Pendidikan  Tinggi  Depdiknas: Jakarta.
Fitriadi  A.F,  R.  Elvyra  &  Yusfiati.  2012. Morfometrik  dan  Meristik  ikan  parang – parang  (Chirocentrus  dorab  Forsskal, 1775)  di  perairan  Bengkalis.  Biologi, Universitas Riau.
Gustomi,  A.,  Arizona,  A.  &  Akhrianti,  I.  2019.
The Study of  Morfometric and Meristic of Yellow  Tail  Fish  Landed  in  Nusantara Fishery  Harbour  of  Sungailiat. Earth Environ.  Sci., 353.    doi:  10.1088/17551315 /353/1/012057.
Hebert, N., Ratnasingham, S. & DeWaard, J.R. 2003. Barcoding animal life: Cytochrome c  oxidase  subunit  1  divergences  among closely  related  species. Proc.  Royal  Soc. Biol. Sci., 270(SUPPL. 1):96-99. doi: 10.1098/ rsbl.2003.0025.
Hubert. N,, Hanner. R. Holm, E., Mandrak, N.E.,
&  Taylor,  E.  2008.  Identifying  Canadian freshwater fishes  through DNA barcodes. PLoS  One, 3(6):e2490.  doi:  10.1371/jour nal.pone.0002490.
Indarsyah,  I.J.,  Hartati,  S.T.  &  Wahyuni,  I.S., 2010.  Pertumbuhan,  sebaran  ukuran panjang,  dan  kematangan  gonad  ikan ekor  kuning  ( Caesio  cuning )  di  perairan Kepulauan  Seribu. Prosiding  seminar Nasional Ikan VI dan Kongres Masyarakat Ikhtiologi Indonesia III,
Cibinong,
September 8.
Johnson,  G.D.,  1980.  The  limits  and relationships  of  the  Lutjanidae  an associated families. Bulletin of the Scripps Institution of Oceanography: University of California.
Lakra,  W.S.,  Verma,  M.S.,  Goswami,  M.,  Lal,
K.K.,
Mohindra, V., Punia, P., Gopalakrishman, A., Singh, K.V., Ward, R. D. & Hebert, P.N.D. 2011. DNA barcoding Indian  marine  fishes. Mol.  Ecol.  Res. , 10:60-71.  doi:  10.1111/j.17550998.2010.02 894.x.
Madduppa,
H. 2014. Bioekologi dan Biosistematika Ikan Terumbu. PT IPB Press: Bogor.
Madduppa, H., Ayuningtyas, R. U., Subhan, B.
&  Arafat,  D.  2016.  Exploited  but unevaluated:    DNA  barcoding  reveals skates and stingrays (Chordata,
Chondrichtyes)  species  landed  in  the Indonesia  fish  market. International  J.
Mar.  Sci. ,  21(2):  77-84.  doi:  10.14710/ik. ijms.21.2.77-84.
Padate, V.P., Rivonker, C.U., Anil, A.C. 2010. A note  on  the  occurrence  of  reef inhabiting,  red-bellied  yellow  tail  fusilier, Caesio  cuning  from  outside  its  known geographical array. Mar. Biodiv. Rec., (3): 1 – 7.  doi:  10.11609/jott.3620.1013.12844-12
846
Peristiwady,  T.  2006 . Ikan-ikan  Laut  Ekonomis Penting  di  Indonesia.  LIPI  Press:  Jakarta, Indonesia. 270 hal.
Sanciangco,  M.D.,  Rocha,  L.A.  &  Carpenter, K.E.  2011.  A  molecular  phylogeny  of  the Grunts
(Perciformes: Haemulidae) inferred  using mitochondrial and nuclear genes .  Zootaxa, 2966(7):37-50.  doi: 10.11646/zootaxa.2966.1.4 . Tindi, M., Mamangkey, N.G.F. & Wulur, S. 2017.
DNA  barcode  dan  analisis  filogenetik molekuler  beberapa  jenis  bivalvia  asal perairan Sulawesi Utara berdasarkan gen COI. J.  Pesisir  Laut  Tropis .,  (2):  32-39. doi: 10.35800/jplt.5.2.2017.15050. Triandiza,  T.  &  Madduppa,  H.  2018.  Aplikasi Analisa  Morfologi  dan  Dna  Barcoding Pada Penentuan Jenis Kepiting Porcelain ( Pisidia sp.)  Yang  Berasal  Dari  Pulau Tunda,  Banten. Jurnal  Sumberdaya Akuatik Indopasifik . 2(2):81-90.
Tamura, K., Peterson, D., Peterson, N., Stecher, G.,  Nei,  M.  &  Kumar,  S.  2011.  Mega  5: Molecular  Evolutionary  Genetics  Analysis Using  Maximum  Likelihood,  Evolutionary Distance,  And  Maximum  Parsimony Methdos. Mol. Biol. Evol. ,28(10):2731-2739. doi: 10.1093/molbev/msr121.
Ward, R.D., Zemlak, T.S., Innes, B.H., Last, P.R., Hebert,  P.D.N.  2005.  DNA  barcoding Australia’s  fish  species . Philosophic.
Transac.  Royal  Soc.  Biol.  Sci., 360
(1462):1847 – 1857. doi: 10.3354/ab00068 . Ward,  R.D.,  Connel,  A.D.,  Holmes,  B.H.  & Steinke,  D.  2008.  DNA  barcoding  of shared  fish  species  from  the  North Atlantic and Autralasia: minimal divergence for most taxa, but Zeus faber and Lepidopus caudatus each probably consititute two species. Aqua. Biol. (3):71- 78.
White,  W.T.,  Last,  P.R.,  Dharmadi,  Faizah,  R., Chodrijah.  U.,  Prisantoso,  B.  I.,  Pognoski. J.J.,  Puckridge,  M.  &  Blaber,  S.J.M.  2013. Market fishes of Indonesia (jenis-jenis ikan di Indonesia). ACIAR Monograph No. 155.
Australian Centre for
International Agricultural Research: Canbera. 438 pp. Zamani, N.P., Wardiatno, Y. & Nggajo, R. 2011. Strategi  Pengembangan  Pengelolaan Sumberdaya  Ikan  Ekor  Kuning  ( Caesio cuning ) Pada Ekosistem Terumbu Karang
Di  Kepulauan  Seribu. J.  Sains    Teknol. Perikan., 6(2):38 – 51.
Zhang,  J.  2011.  Species  identification  of marine  fishes  in  China  with  DNA barcoding. Evid.  Based  Complementary Altern. Med. , 10:1-10. doi: 10.1155/2011/9
78253