Вопрос: Как правильно перевести всю инфраструктуру на виртуализацию?

Лучший ответ:
1) Поддерживаю ораторов, которые говорят о разворачивании машин с нуля в виртуалке, без попыток конвертации P2V. При конвертации могут разные артефакты всплывать, ну нафиг. Грамотно спланированный перенос не потребует даже даунтайма сервисов.
2) СХД отдать только под виртуализацию, никаких бэкапов там. В вашем случае -- это примерно как из пушки по воробьям. Под бэкапы -- вытащить все винты из ваших пролиантов и сложить их на один какой-то сервак, и на его основе сделать бэкапохранилку. ESX может грузиться и по iSCSI, и с флэшки. У пролиантов есть отсек для SD-карточки, можете туда флэшку с ESX воткнуть. Иными словами -- для хостов виртуализации жёсткие диски не нужны.
3) Kerio -- фу-фу-фу! :-) Карточки вам не нужны, аппаратный роутер, в принципе, тоже. Каждого провайдера в отдельный VLAN, оба VLAN -- в виртуалку, на виртуальный сервер с FreeBSD, например. И всё, маршрутизируйте как угодно.
4) QNAP в качестве СХД -- фу-фу-фу! Уж лучше самосбор какой-нибудь (сервак с большой дисковой корзиной, или отдельно пара серверов+корзинка DAS), с FreeBSD и ZFS внутри, да даже с виндой. Оно и дешевле обойдётся, и обслуживать проще. У NAS-ов из дешёвого сегмента артефакты бывают очень разнообразные и зело причудливые. Отваливаются LUNы, слетают права, вообще из сети пропадает. Короче, нахлебались, было дело.
5) Подумайте в сторону винды. Учтите, что Windows 2012 R2 Standard в качестве хоста виртуализации (Hyper-V) даёт возможность внутри себя виртуализовать 2 виндовых сервера по этой же лицензии. Иными словами, если у вас 3 лицензионных Win2012 R2 стоят на хостах, то с их помощью вы можете виртуализовать 6 серверов с виндой, не покупая никаких доп. лицензий.
Hyper-V умеет запускать виртуалки прямо на файловых шарах SMB 3.0. То есть, не нужно iSCSI, FC и прочих модных технологий из области NAS/SAN. Достаточно Win2012 R2 и открытой файловой шарой на нём. Винда умеет технологию Storage Spaces. Которая (технология) умеет даже автоматически tiering, причём из коробки. QNAP, который это умеет, будет стоить тысяч под 300 рублей. Это без дисков.
Исходя из набора сервисов, который у вас есть в сети, вам, в принципе, СХД и не нужна. Не те скорости, не те объёмы. У вас же нет 10-гигабитных линков, правильно я понимаю? Посмотрите вместо СХД на какие-нибудь сервера с большими корзинками. Ну, допустим, от 8 до 24 дисков. 8 есть практически у всех, у Dell есть 10 и 20 дисков, у STSS есть сервера с корзиной на 24 диска (вот так оно выглядит). Либо на DAS (direct attached storage). Нужен сервер (практически любой), в сервер SAS-HBA адаптер с парой внешних портов, и корзинка DAS, которая SAS-кабелями подключается к этому адаптеру.
Примите во внимание также, что брендовые СХД (даже QNAP) -- это вещь в себе, и диагностику там провести достаточно сложно. Поэтому обычно покупается поддержка у вендора. А она стоит тоже порядком денег. А без поддержки самому лазить в потроха СХД -- чревато граблями вооооооот такого размера. Самосбор же проще диагностировать и проще чинить (менять компоненты), если вдруг что.

Худший ответ:
А зачем вам сфера, когда у винды Hyper-V есть? Кстати помнится MS не рекомендует вертуализировать AD.