Trường hợp được xác nhận đầu tiên về đại dịch do bệnh virus corona 2019 gây ra bởi SARS-CoV-2. Vào ngày 9 tháng 3 năm 2020, một trường hợp nhiễm virus thứ hai đã được báo cáo tại Ewekoro, Bang Ogun - công dân Nigeria có liên hệ với công dân Ý. Tính đến ngày 31 tháng 12 năm 2022, Nigeria ghi nhận 266,381 trường hợp nhiễm COVID-19 và 3,155 trường hợp tử vong. Vào ngày 28 tháng 1 năm 2020, Chính phủ Liên bang Nigeria đảm bảo công dân của đất nước sẵn sàng tăng cường giám sát tại năm sân bay quốc tế trong nước để ngăn chặn sự lây lan của virus corona. Chính phủ đã công bố các sân bay là ở Enugu, Lagos, Rivers, Kano và FCT. Trung tâm kiểm soát và phòng ngừa dịch bệnh Nigeria cũng tuyên bố cùng ngày họ đã thành lập nhóm phản ứng với virus corona và sẵn sàng kích hoạt hệ thống sự cố của mình nếu có bất kỳ trường hợp nào xảy ra ở Nigeria. Vào ngày 31 tháng 1 năm 2020, sau khi dịch COVID-19 phát triển ở Trung Quốc đại lục và các quốc gia khác trên toàn thế giới, chính phủ liên bang Nigeria đã thành lập Nhóm phòng chống coronavirus để giảm thiểu tác động của virus nếu nó lây lan sang đất nước. Cùng ngày, Tổ chức Y tế Thế giới đã liệt kê Nigeria trong số 13 quốc gia châu Phi khác được xác định là có nguy cơ cao lây lan virus. Vào ngày 26 tháng 2 năm 2020, một công dân Trung Quốc đã trình diện với Chính quyền bang Lagos vì nghi ngờ bị nhiễm COVID-19. Anh được đưa vào Bệnh viện Reddington và được ra việc vào ngày hôm sau sau khi xét nghiệm âm tính. Vào ngày 27 tháng 2 năm 2020, Nigeria đã xác nhận trường hợp đầu tiên, một công dân Ý làm ​​việc tại Nigeria đã trở về vào ngày 25 tháng 2 từ Milan, Ý thông qua Sân bay quốc tế Murtala Muhammed, bị ốm vào ngày 26 tháng 2 và được chuyển đến Cơ sở an toàn sinh học bang Lagos để cách ly và xét nghiệm. Vào ngày 9 tháng 3 năm 2020, trường hợp thứ hai đã được xác nhận, một công dân Nigeria ở Ewekoro, bang Ogun có liên hệ với công dân Ý. Vào ngày 13 tháng 3 năm 2020, Nigeria đã xác nhận rằng trường hợp thứ hai đã xét nghiệm âm tính. Vào ngày 17 tháng 3 năm 2020, Bộ Y tế Bang Lagos đã xác nhận trường hợp thứ ba, một nữ công dân Nigeria 30 tuổi trở về vào ngày 13 tháng 3 năm 2020 từ Vương quốc Anh. Đầu tháng 3, Bộ trưởng Bộ Y tế (Nigeria) ở Nigeria, Osagie Ehanire, tuyên bố rằng 60 người đã tiếp xúc với bệnh nhân người Ý đang bị cách ly, 40 người ở bang Ogun và 20 người ở bang Lagos. Vào ngày 1 tháng 3 năm 2020, bốn công dân Trung Quốc đã bị cách ly tại Bang Plateau, tất cả họ đều được xét nghiệm âm tính vào ngày hôm sau. Vào ngày 3 tháng 3 năm 2020, thống đốc bang Lagos, Babajide Sanwo-Olu, tiết lộ rằng hai công dân nước ngoài từ một quốc gia châu Á giấu tên đã xét nghiệm âm tính với virus. Vào ngày 6 tháng 3 năm 2020, chính phủ bang Anambra tuyên bố rằng năm công dân Trung Quốc đã có kết quả âm tính với virus này. Trung tâm kiểm soát và phòng ngừa dịch bệnh Nigeria cũng báo cáo rằng tổng cộng có 219 trường hợp F1 và F2 đã được xác định và đang được theo dõi tích cực. Vào ngày 9 tháng 3 năm 2020, Tổng thống Nigeria, Muhammadu Buhari, đã thành lập một Lực lượng đặc nhiệm của Tổng thống để kiểm soát virus tại quốc gia này. Vào ngày 10 tháng 3 năm 2020, Hãng hàng không Thổ Nhĩ Kỳ đã hủy tất cả các chuyến bay của họ đến Nigeria do sự bùng phát virus.