Public procurement notice: Voluntary Ex Ante Transparency Notice
Published: 2018-11-29
Buyer: Medizinische Universität Graz
Country: AT
Contract type: Supplies
Procedure: Contract award without prior publication
CPV classification: 33000000 | 33190000 | 38000000 | 38500000
Estimated value: 302962 EUR
Award criteria: Lowest price

Technical requirements: Ex-Ante-Transparenzbekanntmachung über die Lieferung und Installation eines Next Gerenation Sequencing Systems
Ex-Ante Transparenzbekanntmachung gemäß § 36 Abs 1 Z 3 lit a BVergG: Lieferung und Installation eines Next Generation Sequencing Systems
Ex-Ante Transparenzbekanntmachung über die Lieferung und Installation eines Next Generation Sequencing Systems
Der Grund für die Durchführung eines Verhandlungsverfahrens ohne vorherige Bekanntmachung ist, dass die Leistung nach § 36 Abs 1 Z 3 lit a BVergG aus technischen Gründen nur von Illumina erbracht werden kann: 1: Skalierbarkeit (20-120 Gb) der zu generierenden Sequenzen zur Unterstützung eines breiten Spektrums von Anwendungen. Es ist das einzige Desktop NGS-System, das in der Lage ist, ein menschliches Genom mit 30x Abdeckung in einem einzigen Durchgang zu sequenzieren. Diese Anforderung ist unabdingbar, da das Institut einerseits Genom Sequenzierung durchführt aber auch mit unterschiedlich großen Genpanels arbeitet, die unterschiedliche Outputs benötigen und andererseits das Probenaufkommen variieren kann, womit eine Flexibilität der Skalierung zwingend gegeben sein muss. 2: integrierte Plattform, die massiv parallele Sequenziertechnologie für die genetische Analyse und funktionelle Genomik nutzt; diese Eigenschaft ermöglicht Sequenzierungsläufe, einschließlich der Generierung von On-Board-Clustern, die in 12-30 Stunden abgeschlossen sind. Diese Anforderung ist unabdingbar, da häufig auch dringende Fälle (bspw. Schwangerschaft oder Therapierelevanz) bearbeitet werden, und das Testergebnis innerhalb weniger Tage zu Verfügung stehen muss. 3: Vollautomatische On-Board-Clustergenerierung; es beinhaltet eine Reihe von speziellen Durchflusszellen- und Reagenzienkonfigurationen, um bis zu 400 Millionen Cluster-Passing-Filter (bis zu 120 Gb) in der High Output-Konfiguration und bis zu 130 Millionen Cluster-Passing-Filter (bis zu 40 Gb) in der Mid Output-Konfiguration zu erzeugen. Dadurch wird sichergestellt, dass das Kontaminationsrisiko auf einem minimalen Niveau gehalten wird, da die klonale Amplifikation der Library-Fragmente bereits im System stattfindet, und kein zusätzlicher Amplifikationsschritt wie bei anderen Technologien nötig ist. 4: Hohe Genauigkeit der Sequenzierung durch Verwendung von Illumina SBS speziell bei der Sequenzierung von Homopolymeren. Diese Anforderung ist unabdingbar, da die Sequenzierung von Keimbahn-DNA im Rahmen von genetischen Testungen die höchst mögliche Präzision erfordert. 5: Automatisiertes BeadChip-Array-Scannen und Erzeugen von Bilddateien; es ist das einzige Desktop-System, das sowohl Sequenzierung als auch BeadChip-Array-Scanning ermöglicht und nahtlos zwischen den beiden Technologien übergeht. Dies ermöglicht es, das Gerät auch zum Scannen von BeadChip-Array zur Detektion von Kopienzahlveränderungen durchführen.
Ex-Ante Transparenzbekanntmachung über die Lieferung und Installation eines Next Generation Sequencing Systems


Winner: Illumina Netherlands BV
Award value: 302962