Public procurement notice: Additional Information
Published: 2021-03-31
Buyer: Uniwersytet Łódzki
Country: PL
Contract type: Supplies
Procedure: Open procedure
CPV classification: 33696300 | 38540000 | 72253200: Computer systems support services | 72254000: Software testing | 72265000: Software configuration services
Submission deadline: 2021-04-12
Award criteria: The most economic tender

Technical requirements: Dostawa i instalacja infrastruktury sekwenatora nowej generacji dla Pracowni Biobank Uniwersytetu Łódzkiego
4.1. Przedmiotem zamówienia jest dostawa i instalacja infrastruktury sekwenatora nowej generacji (składającej się z sekwenatora nowej generacji oraz narzędzi analitycznych) umożliwiającego wygenerowanie pełnogenomowych (WGS) i pełnoegzomowych (WES) sekwencji ludzkiego DNA dla Pracowni Biobank Uniwersytetu Łódzkiego.
4.1. Przedmiotem zamówienia jest dostawa i instalacja infrastruktury sekwenatora nowej generacji (składającej się z sekwenatora nowej generacji oraz narzędzi analitycznych) umożliwiającego wygenerowanie pełnogenomowych (WGS) i pełnoegzomowych (WES) sekwencji ludzkiego DNA dla Pracowni Biobank Uniwersytetu Łódzkiego. Urządzenie powinno pozwalać na uzyskanie sparowanych odczytów co najmniej w trybach 2x150 bp. Sekwenator powinien umożliwiać uzyskanie co najmniej 7,5 miliardów odczytów w trybie pojedynczych odczytów, tj. 15 miliardów w trybie sparowanych odczytów, w ciągu jednego przebiegu. Urządzenie umożliwia sekwencjonowanie co najmniej 4 odrębnych pul bibliotek równolegle. Na wyposażeniu aparatury system umożliwiający nanoszenie bibliotek i ich amplifikacji. Wraz z urządzeniem należy zapewnić sukcesywną dostawę odczynników i materiałów niezbędnych do uzyskania 300 WGS i 450 WES w pokryciu odpowiednio 50x i 100x (należy uwzględnić min. 20 % margines na rzecz wykonania niezbędnych powtórek) oraz narzędzia analityczne pozwalające na przetworzenie surowych danych i tzw. złożenie genomu (ang. genome assembly), w oparciu o sekwencjonowanie de novo jak i resekwencjonowanie (ang. alignment) a także zapewnić opiekę serwisową (kontrakt serwisowy) dostarczonej infrastruktury przez okres min. 2 lat z zastrzeżeniem, iż płatności za drugi rok odbywać się będą sukcesywnie przed rozpoczęciem następnego okresu. W ramach dostawy Wykonawca dokona instalacji, kalibracji oraz uruchomienia dostarczanego sprzętu. Na koszt Wykonawcy zostanie wykonane również uruchomienia reakcji testowej oraz wykonanie kwalifikacji instalacyjnej i operacyjnej.
4.2. Szczegółowy opis przedmiotu zamówienia zamieszczony jest w Arkuszu asortymentowo-cenowym stanowiącym załącznik nr 2 do SWZ.
4.4. Autoryzowany serwis urządzenia musi być zlokalizowany na terytorium UE. W przypadku gdy działania serwisowe wymagają fizycznej obecności w siedzibie Zamawiającego, realizacje zadań serwisowych musi rozpocząć się w ciągu 48 godzin od otrzymania zgłoszenia.
4.5. Zamawiający nie dopuszcza możliwość składania ofert częściowych (zamówienie nie jest podzielone na części z uwagi na fakt, że przedmiot zamówienia stanowi jedną nierozerwalną całość i nie może on zostać z przyczyn technicznych i funkcjonalnych podzielony na części).
4.6. Pod pojęciem dostawa sprzętu należy rozumieć dostarczenie na własny koszt i ryzyko przedmiotu zamówienia wymaganego przez Zamawiającego, jego instalacja w miejscu wskazanym przez Zamawiającego wraz z uruchomieniem wszystkich urządzeń ze sprawdzeniem ich poprawnego działania i nadanie im właściwej konfiguracji oraz dokonanie przeszkolenia personelu Zamawiającego.
4.7. Dostawa przedmiotu zamówienia współfinansowany w ramach projektu: „Genomowa mapa Polski w otwartym dostępie – digitalizacja zasobów Pracowni Biobank UŁ”.
4.11. Zamawiający nie zamierza dokonać wyboru najkorzystniejszej oferty z zastosowaniem aukcji elektronicznej.
4.1. Przedmiotem zamówienia jest dostawa i instalacja infrastruktury sekwenatora nowej generacji (składającej się z sekwenatora nowej generacji oraz narzędzi analitycznych) umożliwiającego wygenerowanie pełnogenomowych (WGS) i pełnoegzomowych (WES) sekwencji ludzkiego DNA dla Pracowni Biobank Uniwersytetu Łódzkiego. Urządzenie powinno pozwalać na uzyskanie sparowanych odczytów co najmniej w trybach 2x150 bp. Sekwenator powinien umożliwiać uzyskanie co najmniej 7,5 miliardów odczytów w trybie pojedynczych odczytów, tj. 15 miliardów w trybie sparowanych odczytów, w ciągu jednego przebiegu. Urządzenie umożliwia sekwencjonowanie co najmniej 4 odrębnych pul bibliotek równolegle. Na wyposażeniu aparatury system umożliwiający nanoszenie bibliotek i ich amplifikacji. Wraz z urządzeniem należy zapewnić sukcesywną dostawę odczynników i materiałów niezbędnych do uzyskania 300 WGS i 450 WES w pokryciu odpowiednio 50x i 100x (należy uwzględnić min. 20 % margines na rzecz wykonania niezbędnych powtórek) oraz narzędzia analityczne pozwalające na przetworzenie surowych danych i tzw. złożenie genomu (ang. genome assembly), w oparciu o sekwencjonowanie de novo jak i resekwencjonowanie (ang. alignment), a także zapewnić opiekę serwisową (kontrakt serwisowy) dostarczonej infrastruktury przez okres 1 roku, z zastrzeżeniem możliwości przedłużenia okresu gwarancji o kolejne 12 mies. w ramach prawa opcji. W ramach dostawy Wykonawca dokona instalacji, kalibracji oraz uruchomienia dostarczanego sprzętu. Na koszt wykonawcy zostanie wykonane również uruchomienia reakcji testowej oraz wykonanie kwalifikacji instalacyjnej i operacyjnej.
4.2. Szczegółowy opis przedmiotu zamówienia zamieszczony jest w arkuszu asortymentowo-cenowym stanowiącym załącznik nr 2 do SWZ.
4.4. Autoryzowany serwis urządzenia musi być zlokalizowany na terytorium UE. W przypadku gdy działania serwisowe wymagają fizycznej obecności w siedzibie Zamawiającego, realizacje zadań serwisowych musi rozpocząć się w ciągu 48 godzin od otrzymania zgłoszenia.
4.5. Zamawiający nie dopuszcza możliwość składania ofert częściowych (zamówienie nie jest podzielone na części z uwagi na fakt, że przedmiot zamówienia stanowi jedną nierozerwalną całość i nie może on zostać z przyczyn technicznych i funkcjonalnych podzielony na części).
4.6. Pod pojęciem „dostawa sprzętu” należy rozumieć dostarczenie na własny koszt i ryzyko przedmiotu zamówienia wymaganego przez Zamawiającego, jego instalację w miejscu wskazanym przez Zamawiającego wraz z uruchomieniem wszystkich urządzeń ze sprawdzeniem ich poprawnego działania i nadanie im właściwej konfiguracji oraz dokonanie przeszkolenia personelu Zamawiającego.
4.7. Dostawa przedmiotu zamówienia współfinansowany w ramach projektu: „Genomowa mapa Polski w otwartym dostępie – digitalizacja zasobów Pracowni Biobank UŁ”.