Public procurement notice: Contract Award Notice
Published: 2019-10-15
Buyer: Freistaat Bayern vertreten durch die Universität Regensburg, vertreten durch den Kanzler
Country: DE
Contract type: Supplies
Procedure: Negotiated without a prior call for competition
CPV classification: 33100000
Estimated value: 257004.81 EUR
Award criteria: The most economic tender

Technical requirements: Das Institut für Humangenetik der Universität Regensburg baut seine vorhandene Sequenzierpipeline aus Kapazitätsgründen weiter aus. Die erforderlichen Sequenzierleistungen müssen den Bedarf im Bereich der molekulargenetischen Diagnostik, aber auch für alle anfallenden Arbeiten im Forschungsbereich abdecken. Die existente Sequenzierpipeline am Institut beruht ausschließlich auf Geräten und Technologien der Fa. Illumina und besteht gegenwärtig aus einem MiSeq-Gerät der Firma Illumina, das eine Sequenzierkapazität von 15 GigaBasen pro Lauf besitzt und über eine Sequencing-by-Synthesis Technologie mit hoher Genauigkeit und hochqualitativen Daten verfügt. Diese Technologie wurde nach einer aufwendigen und langwierigen Erprobungsphase etabliert, gerade um die geforderte Genauigkeit und Zuverlässigkeit bei diagnostischen Mutationsanalysen, aber auch im Forschungsbereich, zu erreichen. Ein wachsendes Probenaufkommen macht es nun erforderlich, dass:
Die komplette Sequenzierpipeline des Instituts ist Dakks-akkreditiert, was insbesondere die Etablierung des Workflows, die Proben-Vorbereitung über Enrichment-basierte Methoden, sowie die Replizierbarkeit von Ergebnissen, voraussetzt. Eine Geräteergänzung bzw. -aufstockung der Pipeline muss daher eine vollumfängliche Kompatibilität mit dem vorhandenen MiSeq Sequenziergerät und der dafür etablierten Sequenzierplattform erlauben. Alternative Geräte für Hochdurchsatzsequenzierungen benutzen sehr unterschiedliche Chemien und z. T. sehr unterschiedliche Workflows und sind daher mit der etablierten Illumina-basierten Gerätepipeline nicht vereinbar.
Aufgrund der benötigten Kapazitäten benötigt das Institut ein Gerät aus der erweiterten Serie der Illumina-Sequenzierer, das sogenannte NextSeq550. Dieses Gerät erfüllt in vollem Umfang die oben erwähnten Voraussetzungen für eine Kompatibilität mit unserer existenten Pipeline. Es erlaubt darüber hinaus eine Skalierbarkeit mit Durchsätzen von 20-120 Gigabasen in einem einzigen Sequenzierlauf und ist damit ideal für unsere Anforderungen an höchste Flexibilität. Auf beiden Geräten, MiSeq und NextGen550, kann die identische Chemie angewendet werden, was für ein Backup-System mittels zweier Geräte unverzichtbar ist. Die Einführung einer unabhängigen Sequenzierpipeline einschließlich einer neuen Sequenzierchemie wäre finanziell nicht zumutbar und im automatisierten Analyseablauf personell nicht abzubilden.
Zusammengefasst lässt sich feststellen, dass eine Erweiterung der Sequenzierkapazitäten bei Vorhandensein einer akkreditierten Pipeline, die auf dem System der Firma Illumina aufgebaut, die unbedingte Notwendigkeit einer maximalen Kompatibilität der Sequenzierprozesse, einschließlich der Probenvorbereitung, erforderlich macht. Damit schließt sich eine alternative Sequenziertechnologie gegenwärtig aus. Dies macht es erforderlich, dass ausschließlich ein Sequenziergerät aus der Serie des Anbieters Illumina mit Nutzung der identischen Sequenzierchemie beschafft wird.


Winner: Illumina GmbH
Award value: 257004.81
Number of bids: 1