Public procurement notice: Voluntary Ex Ante Transparency Notice
Published: 2023-05-16
Buyer: Universitätsklinikum Magdeburg A.ö.R.
Country: DE
Contract type: Supplies
Procedure: Negotiated without a prior call for competition
CPV classification: 33100000
Estimated value: 1 EUR
Award criteria: Lowest price

Technical requirements: Beschaffung eines Genomsequenzierers mit Short Read SBS Technologie in das vorhande NGS-Konzept der Universitätsklinik Magdeburg.
Beschaffung eines Genomsequenzierers mit Short Read SBS Technologie der Klasse NovaSeq X Plus. Im Zuge der Erweiterung der NGS-Systeme muss eine kompatibilität zu den vorhandenen Systemem NextSeq 550, MiSeq und MiniSeq der Core-Facility gegeben sein.
Mit dieser Beschaffung sollen weitere NGS-Sequenzierungen (Sequenzierung von Genomen/Plasmiden); Metagenomik und Überwachung von Infektionskrankheiten; Chip-Sequenzierung und DNA-Methylierungs-Sequenzierung; RNA-Sequenzierung (RNA-Seq), einschließlich mRNA-Sequenzierung und Gesamt-RNA-Sequenzierung
(kodierend und nicht kodierend); Multiomik-Methoden, einschließlich Einzelzell-Genexpression und ATAC-Seq und zusätzlich Anwendungen nach Entwicklungsstand abgedeckt werden.
Der Gesamtwert der Beschaffung (Ziff. II.1.7, V.2.4) ist zur Wahrung von Betriebs- und Geschäftsgeheimnissen des Auftragnehmers nicht bekanntzumachen, § 39
Abs. 6 VgV. Er wird daher fiktiv mit 1,00 EUR angegeben. Das benannte Datum (Ziff. V.2.1) ist das, an dem entschieden wurde, den Vertrag mit dem benannten
Für eine optimale Auslastung der verfügbaren NGS-Geräte, eine flexiblere Probenbearbeitung/wirtschaftlichere Nutzung (Auslastung; Laufplanung, Wartung) in Verbindung mit der am Standort im Aufbau befindlichen NGS Core Facility zu erreichen, muss ein bezüglich der Sequenzierspezifikationen zu den bestehenden NGS-Systemen (Illumina NextSeq 550/mittleren bis hohen Probendurchsat; Illumina MiSeq/geringen bis mittleren Probendurchsatz; Illumina MiniSeq/geringen Probendurchsatz kompatibler Genomsequenzierer für den (sehr) hohen Probendurchsatz (Population-scale) beschafft werden, um die diagnostische Leistungserbringung weiterhin vor Ort (Standort des UMMD) durchführen und abrechnen zu können und die gesetzlichen Forderung zur Teilnahme am Modellvorhaben Genomsequenzierung nach § 64e SGB V zu erfüllen.
- 40 bis 600 humane Exome mit durchschnittlich 100-facher Abdeckung pro Fließzelle in einem Lauf (Output ≥ 8 Gb pro Exom; ≥ 500 Gb bis ca. 8 Tb pro Fließzelle je nach Format)
- 4 bis 64 humane Genome mit durchschnittlich 30-facher Abdeckung pro Fließzelle in einem Lauf (Output ≥ 120 Gb pro Genom; ≥ 500 Gb bis ca. 8 Tb pro Fließzelle je nach Format)
- 30 bis 500 Transkriptome pro Fließzelle in einem Lauf (Output je ≥ 50 Mio. Reads; ≥ 500 Gb bis ca. 8 Tb pro Fließzelle je nach Format)
- Laufzeit (vom Start des Laufs, einschließlich der Clusterbildung im Gerät, bis zum Abschluss des Waschlaufes): maximalen Output (PE 2 x 150 bp, 8 TB pro Fließzelle) ~48 Stunden; mittleren Durchsatz (PE 2 x 150 bp, ca. 3 TB pro Fließzelle) ~24 Stunden; geringer Durchsatz (PE 2 x 150 bp; ca. 500 GB) < 22 Stunden
- skalierbarer Output mittels Fließzellenformate und/oder Reagenzienkonfigurationen für unterschiedliche Anwendungen und Analysen
- Sequenzierung mit unterschiedlichen Leselängen frei wählbar bis zu 2 x 150 bp (single und PE; mind. je 75 bp, 100 bp, 150 bp)
- hohe Sequenzierqualität: ≥ 85 % der Basen mit Qualitätsbewertungen ≥Q30 für PE 2 x 100 bp und PE 2 x 150 bp und ≥ 90 % der Basen mit Qualitätsbewertungen ≥Q30 für PE 2 x 50 bp
Eine Markterkundung der Auftraggeber hat ergeben, dass keiner der potentiellen Mitbewerber in der Lage ist, einen vergleichbaren am Markt verfügbaren Population-Scale Genonsequenzierer dieser Leistungsklasse und Wirtschaftlichkeit zur Verfügung zu stellen. Hierzu ist allein die Fa.


Winner: Illumina GmbH
Award value: 1