Public procurement notice: Additional Information
Published: 2019-09-20
Buyer: Den Europæiske Fødevaresikkerhedsautoritet (EFSA)
Country: IT
Contract type: Services
Procedure: Open procedure
CPV classification: 72262000: Software development services
Submission deadline: 2019-10-30
Award criteria: The most economic tender

Technical requirements: Formålet er at udvikle et softwareværktøj til peptid-modellering vedrørende den kapacitet, som et givent protein/peptid binder til HLA-DQ2- eller HLA-DQ8-molekyler, og som genkendes af T-celler. Som beskrevet i EFSA's vejledning foreligger der detaljeret viden, som indikerer, hvilke aminosyrer i gluten-peptiderne der er ansvarlige for en højaffinitetsbinding til HLA-DQ-molekylerne, og som sandsynligvis vil formidle en specifik interaktion med T-cellereceptoren.
Das Ziel ist die Entwicklung eines Software-Tools für die Peptid-Modellierung in Hinblick auf die Fähigkeit, dass ein gegebenes Protein/Peptid sich mit HLA-DQ2 oder HLA-DQ8-Molekülen verbindet und von T-Zellen erkannt wird. Wie im Leitfaden der EFSA beschrieben, steht detailliertes Wissen zur Verfügung, was darauf hinweist, dass Aminosäuren und Glutenpeptide für die hohe Bindungsaffinität zu HLA-DQ-Molekülen verantwortlich sind und wahrscheinlich die spezifischen Interaktionen mit dem T-Zellenrezeptor vermitteln.
The objective is to develop a software tool for peptide modelling with regard to the capacity that a given protein/peptide will bind to HLA-DQ2 or HLA-DQ8 molecules and will be recognised by T cells. As described in the EFSA guidance document, detailed knowledge is available indicating which amino acids in the gluten peptides are responsible for the high-affinity binding to HLA-DQ molecules and likely to mediate specific interaction with the T-cell receptor.
El objetivo es desarrollar una herramienta de software para la elaboración de modelos de péptidos en función de la capacidad con que una determinada proteína o péptido se unirá a las moléculas HLA-DQ2 o HLA-DQ8 y será reconocida por las células T. Según se describe en el documento con las pautas de la EFSA, hay disponible información detallada que indica qué aminoácidos en los péptidos de gluten son responsables de la unión de alta afinidad a las moléculas HLA-DQ y pueden mediar en la interacción específica con el receptor de la célula T.
Tavoitteena on kehittää ohjelmistotyökalu peptidimallinnukseen, joka koskee kapasiteettia, jolla tietty proteiini/peptidi sitoutuu HLA-DQ2- tai HLA-DQ8-molekyyleihin ja jonka T-solut tunnistavat. EFSA:n ohjeasiakirjassa kuvatun mukaisesti on saatavilla yksityiskohtaisia tietoja, jotka osoittavat, mitkä gluteenipeptidien aminohapot ovat vastuussa korkean affiniteetin sitoutumisesta HLA-DQ-molekyyleihin ja todennäköisesti välittävät erityistä vuorovaikutusta T-solureseptorin kanssa.
L’objectif est de développer un outil logiciel pour la modélisation du peptide par rapport à la capacité qu’a une protéine/un peptide donné de se lier aux molécules HLA-DQ2 ou HLA-DQ8 et d’être reconnu(e) par les cellules T. Comme décrit dans le document de référence de l’EFSA, des informations détaillées sont disponibles et indiquent quels acides aminés dans les peptides de gluten sont responsables d’une forte affinité de liaison aux molécules HLA-DQ et susceptibles de jouer le rôle d’intermédiaires dans l’interaction avec le récepteur de cellule T.
Στόχος είναι ανάπτυξη ενός εργαλείου λογισμικού για μοντελοποίηση πεπτιδίου ως απόδειξη της ιδιότητας ότι μια δεδομένη πρωτεΐνη/ένα πεπτίδιο θα ενώνεται με μόρια HLA-DQ2 ή HLA-DQ8 και θα αναγνωρίζεται από Τ-κύτταρα. Όπως περιγράφεται στο έγγραφο καθοδήγησης της EFSA, διατίθενται λεπτομερείς γνώσεις οι οποίες καταδεικνύουν ποια αμινοξέα στα πεπτίδια γλουτένης ευθύνονται για την υψηλή συγγένεια με τα μόρια HLA-DQ και πιθανόν να διαμεσολαβήσουν σε συγκεκριμένη αλληλεπίδραση με τον υποδοχέα Τ-κυττάρου.
L'obiettivo è sviluppare uno strumento software per la modellizzazione dei peptidi per quanto riguarda la capacità di una determinata proteina/peptide di legarsi alle molecole HLA-DQ2 o HLA-DQ8 e di essere riconosciuta dalle cellule T. Come descritto nel documento orientativo dell'EFSA, sono disponibili conoscenze dettagliate che indicano quali amminoacidi nei peptidi del glutine sono responsabili del legame ad alta affinità con le molecole HLA-DQ e possono mediare l'interazione specifica con il recettore delle cellule T.
De opdracht beoogt de ontwikkeling van een softwaretool voor peptidemodellering in het kader van in hoeverre een bepaald eiwit/peptide zich bindt aan moleculen van HLA-DQ2 of HLA-DQ8 en door T-cellen wordt herkend. Zoals vermeld in het begeleidende document van EFSA is er gedetailleerde kennis beschikbaar die aangeeft welke aminozuren in de gluten van peptiden verantwoordelijk zijn voor de hoge bindende affiniteit met HLA-DQ-moleculen en bemiddelen waarschijnlijk de specifieke interactie met de T-celreceptor.
O objetivo é desenvolver uma ferramenta de software para modelação de peptídeos relativamente à capacidade que uma determinada proteína/peptídeo se ligará às moléculas HLA-DQ2 ou HLA-DQ8 e será reconhecida pelas células T. Conforme descrito no documento de orientação da EFSA, está disponível um conhecimento pormenorizado que indica quais os aminoácidos nos péptidos do glúten que são responsáveis pela ligação de alta afinidade às moléculas de HLA-DQ e que provavelmente medeiam a interação específica com o recetor da célula-T.
Målet är att utveckla ett programvaruverktyg för modellering av peptid, med avseende på kapaciteten för ett givet protein/peptid att bindas till HLA-DQ2- eller HLA-DQ8-molekyler samt accepteras av T-celler. Som beskrivs i Efsas vägledande dokument, finns detaljerad kunskap tillgänglig som anger vilka aminosyror i glutenpeptiderna som är ansvariga för bindningarna med hög affinitet till HLA-DQ-molekyler och sannolikt förmedlar särskilda interaktioner med T-cellsreceptorn.
Cílem je vyvinout softwarový nástroj pro modelování peptidů s ohledem na kapacitu, kterou daný protein / peptid bude vázat na molekuly HLA-DQ2 nebo HLA-DQ8 a bude rozpoznán buňkami typu T. Jak je popsáno v pokynech úřadu EFSA, jsou k dispozici podrobné znalosti o tom, které aminokyseliny v glutenových peptidech jsou odpovědné za vysokou afinitu vázanou k molekulám HLA-DQ a pravděpodobně zprostředkovávají specifickou interakci s receptorem T-buněk.
Eesmärk on töötada välja tarkvaravahend peptiidide modelleerimiseks seonduvalt võimega, et etteantud proteiin/peptiid seob ennast inimese leukotsüüdi antigeeni tüüpi proteiiniga (HLA-DQ2) või HLA-DQ8 molekulidega ja tuntakse ära T-rakkude poolt. EFSA juhisdokumendis esitatud kirjeldusest lähtub, et saadaval on üksikasjalikud teadmised, mis annavad märku sellest, millised aminohapped vastutavad gluteenpeptiidides HLA-DQ molekulidega kõrgafiinsusega sidumise eest ja vahendavad tõenäoliselt erilist vastastikmõju T-raku retseptoriga.
A cél egy szoftvereszköz kifejlesztése peptidmodellezés céljából arra vonatkozóan, hogy egy adott fehérje/peptid hogyan kötődik HLA-DQ2 vagy HLA-DQ8 típusú molekulákhoz és hogyan ismerik fel a T-sejtek. Az EFSA útmutató dokumentumában leírtaknak megfelelően részletes ismeretek állnak rendelkezésre arra vonatkozóan, hogy a gluténpepdidekben megtalálható mely aminosavak felelősek a HLA-DQ-molekulákhoz kötődésre való erős hajlamért, és közvetítenek valószínűleg specifikus kölcsönhatást a T-sejt receptorral.
Tikslas yra sukurti programinės įrangos programą, skirtą peptidams modeliuoti, susijusią su konkretaus baltymo / peptido gebėjimu prisijungti prie HLA-DQ2 arba HLA-DQ8 molekulių ir būti atpažintam kaip T ląstelė. Kaip aprašyta EFSA rekomendaciniame dokumente, turima išsamių žinių, kurios amino rūgštys glitimo peptiduose yra atsakingos už labai giminingą susijungimą su HLA-DQ molekulėmis ir greičiausiai tarpininkauja specifinei sąveikai su T ląstelės receptoriumi.