Utredaren ska i arbetet samråda med de myndigheter och organisationer som berörs av uppdraget , särskilt Boverket , Havs- och vattenmyndigheten , Kemikalieinspektionen , Livsmedelsverket , Naturvårdsverket , Statens jordbruksverk , Sveriges geologiska undersökning , Sveriges meteorologiska och hydrologiska institut , och de länsstyrelser som är vattenmyndigheter .