СКИТ

СКИТ — суперкомпьютерный вычислительный комплекс Института кибернетики имени В. М. Глушкова НАН Украины. Проект первого суперкомпьютера СКИТ был разработан в 2002 году совместно с компанией «Юстар».

Суперкомпьютер СКИТ состоит из четырех вычислительных кластеров: СКИТ-1, СКИТ-2, СКИТ-3, СКИТ-4.

СКИТ-1 

СКИТ-1 — 24-узловой кластер на микропроцессорах Intel Xeon.

Технические характеристики кластера СКИТ-1 
Пиковая производительность кластера — 255 Гфлопс.

Реальная производительность — 189 Гфлопс.

Тип процессора — одноядерный 32-разрядный Intel Xeon (тактовая частота — 2,67 ГГц, кэш — 512 Кбайт, потребляемая мощность 60-100 Вт, число процессоров в узле кластера — 2).

Число ядер-процессоров в узле — 2.

Оперативная память узла — 2 Гбайта.

Система хранения данных — обслуживает все кластеры, типа RAID5, глобальная файловая система общим объемом 20 Тбайт.

Общая потребляемая мощность — 8 кВА от сети 380 В.

Сети — высокоскоростная сеть InfiniBand (пропускная способность канала 800 Мбайт/с), сеть Gigabit Ethernet (пропускная способность канала до 1000 Мбит/с).

СКИТ-2 

СКИТ-2 — 32-узловой кластер на микропроцессорах Intel Itanium2.

Технические характеристики кластера СКИТ-2 
Пиковая производительность кластера — 360 Гфлопс.

Реальная производительность — 280 Гфлопс.

Тип процессора — одноядерный 64-разрядный Intel Itanium2 (тактовая частота — 1,4 ГГц, кэш — 3 Мбайт, потребляемая мощность 135 Вт, число процессоров в узле кластера — 2).

Оперативная память узла — 2 Гбайта.

Число ядер-процессоров в узле — 2.

Система хранения данных — типа RAID5, глобальная файловая система общим объёмом 20 Тбайт.

Общая потребляемая мощность — 20 кВА от сети 380 В.

Сети — высокоскоростная сеть SCI (пропускная способность канала 350 Мбайт/с), сеть Gigabit Ethernet (пропускная способность канала до 1000 Мбит/с).

СКИТ-3 

СКИТ-3 — 127-узловой кластер на многоядерных процессорах (75 узлов на двухъядерных процессорах Intel Xeon 5160 и 52 узла на четырехъядерных процессорах Xeon 5345).

Технические характеристики кластера СКИТ-3 
Пиковая производительность кластера — 7500 Гфлопс.

Реальная подтверждённая производительность (на 125 узлах) — 5317 Гфлопс.

Тип процессоров — двухъядерный Intel Xeon 5160 и четырёхъядерный Intel Xeon 5345 с архитектурой EM64T (тактовая частота соответственно — 3,0 ГГц и 2,2 ГГц, кэш — 4 Мбайт, потребляемая мощность 80 Вт, число процессоров в узле кластера — 2).

Оперативная память узла — 2 Гбайта на ядро, соответственно, 8 и 16 Гбайт.

Число ядер-процессоров в узле соответственно — 4 и 8, всего в кластере 716 ядер.

Система хранения данных — типа RAID5, глобальная файловая система Lustre общим объёмом (в зеркале) 20 Тбайт.

Общая потребляемая мощность — 60 кВА от сети 380 В.

Сети — высокоскоростная сеть InfiniBand (пропускная способность канала до 900 Мбайт/с), сеть Gigabit Ethernet (пропускная способность канала до 1000 Мбит/с).

СКИТ-4 
В 2012 году комплекс СКИТ был расширен новым суперкомпьютером СКИТ-4.

СКИТ-4 — 12-узловой кластер на многоядерных процессорах Intel Xeon E5-2600.

Кластер базируется на новейшей платформе HP ProLiant Gen8 BladeSystems и имеет следующие характеристики:
 кластер состоит из 12 узлов на базе центральных процессоров Intel Xeon E5-2600 с частотой 2.6 ГГц, имеет 192 вычислительных ядра, 36 ускорителей NVidia Tesla M2075, 768 ГБ оперативной памяти;
 интегрирован с общим хранилищем данных кластерного комплекса объёмом 100 ТБ;
 сеть передачи данных между узлами Infiniband FDR 56 Гбит/с.

Каждый узел имеет реальную производительность 1 ТФлопс, 16 физических ядер (32 логических в режиме HyperThreading), 64 ГБ оперативной памяти, 3 ускорителя NVidia Tesla M2075.

В общем кластер имеет следующие характеристики производительности:
 пиковая производительность 25,6 ТФлопс;
 реальная производительность 10 ТФлопс.

СКИТ-4 в 2 раза мощнее, чем СКИТ-3, при этом меньше по размерам и потребляет значительно меньше электроэнергии — 15 кВт против 60 кВт для СКИТ-3.

В 2013 году модернизирован до 28,3 / 18 ТФлопс.

Применение суперкомпьютера СКИТ 

Суперкомпьютер СКИТ используется для высокопроизводительных вычислений в таких областях, как квантовая химия, квантовая механика, молекулярная динамика, наноструктуры, экология, геофизика, метеорология.

Прикладное программное обеспечение СКИТ 
Пакеты для расчётов электронных структур в квантовой механике: GAMESS (US), NWCHEM, ABINIT.

Пакеты для моделирования в молекулярной динамике: GROMACS.

Система управления суперкомпьютером СКИТ 

Система управления суперкомпьютером СКИТ реализована сотрудниками Института кибернетики имени В. М. Глушкова НАН Украины совместно с компанией «Мелкон».

Система управления представляет собой веб-портал, на котором зарегистрированные пользователи могут ставить на выполнение свои задачи. Реализована возможность просмотра и анализа статистики использования ресурсов кластера.

Примечания

Ссылки 

 Сайт суперкомпьютера СКИТ
 Система управления суперкомпьютером СКИТ
 Украинский суперкомпьютерный интернет-дайджест
 Форум украинского суперкомпьютерного сообщества

Суперкомпьютеры Украины