При цьому, за рішенням руської шляхти, більшість руських земель (Підляшшя, Волинь, Поділля, Брацлавщина, Київщина) відійшли від ВКЛ до Польщі. Під час правління Сигізмунда II Августа відбулась низка війн та прикордонних конфліктів з Московським царством, зокрема Лівонська війна. В Україні-Русі, в пониззі Дніпра, на острові Мала Хортиця, було збудовано замок з метою слідкувати за діяльністю незалежної від Речі Посполитої Запорозької Січі і посилити оборону південних кордонів Речі Посполитої від нападів татар.